JP2004298085A - ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 - Google Patents
ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2004298085A JP2004298085A JP2003095199A JP2003095199A JP2004298085A JP 2004298085 A JP2004298085 A JP 2004298085A JP 2003095199 A JP2003095199 A JP 2003095199A JP 2003095199 A JP2003095199 A JP 2003095199A JP 2004298085 A JP2004298085 A JP 2004298085A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- mutation
- human mitochondrial
- gene
- ins
- mutations
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
【解決手段】各々96名の糖尿病患者および肥満者におけるミトコンドリアゲノム全塩基配列を直接塩基配列決定法により解析した。その結果、糖尿病患者群と肥満者群の多型頻度を比較した結果、糖尿病患者群に確認された545ヶ所の変異のうち、コーディング領域には343ヶ所の変異が、rRNA及びtRNA遺伝子領域には70ヶ所の変異が、非コード領域には131ヶ所の変異が、L鎖複製開始領域には1ヶ所の変異が確認された。また、コーディング領域に見られた変異のうち、約70%は同義置換であり、残りの約30%は非同義置換であった。
【選択図】 なし
Description
【発明の属する技術分野】
本発明は、ヒトミトコンドリアDNA(mtDNA)の多型に関するものであり、そのmtDNA多型を利用して、ある人が糖尿病となり得るか否かに関して有用な情報を与える検出方法、或いは個人識別方法(例えば、法医学、親子鑑定、疫学調査、考古学調査等)などに応用することができる。
【0002】
【従来の技術】
糖尿病は、遺伝的素因を含む多因子性の疾患であると考えられており、日本を含む先進国において大きな問題となっている疾患である。特に、2型糖尿病は、成人において、様々な健康障害の一因になっていることは周知の事実である。糖尿病の防止は、公衆衛生の重要な最終目標地点である。糖尿病に関する遺伝学の研究や候補遺伝子の解析は、ヒト遺伝子解析プログラムの進展とも伴って、飛躍的な進歩を見せている。
【0003】
ヒトミトコンドリア遺伝子(以下、mtDNAという)は、ミトコンドリア中に存在し、母系性遺伝を行うことが知られている。ミトコンドリアでは、主としてエネルギー代謝に関する反応が行われていることから、一部の糖尿病との関連が疑われている。
本発明者らは、継続してmtDNAの多型に関する研究を行っているが(例えば、特開平11−113597)、mtDNAの多型と糖尿病との間の詳細な関係を解析した従来技術については、確認していない。
【特許文献1】特開平11−113597号公報
【0004】
【発明が解決しようとする課題】
ゲノム多型は、人種や民族により異なるので、各々の人種や民族で糖尿病に関連したミトコンドリアゲノム多型データベースの構築をすることは重要である。
本発明は、上記した事情に鑑みてなされたものであり、その目的は糖尿病に関連するミトコンドリアゲノム多型を探索することにより、糖尿病の予防に貢献することにあり、また他の目的は、ミトコンドリアゲノム多型に基づいた個人識別方法を提供することにある。
【0005】
【課題を解決するための手段、発明の作用、及び発明の効果】
本発明者らは、それぞれ96名づつの2型糖尿病患者(以下、単に「糖尿病患者」ということがある)、及び肥満者のヒトミトコンドリアDNAの全塩基配列(16569塩基対)を全て解読し、変異(置換、欠失、付加)を解析することにより、基本的には本発明を完成するに至った。
両群のヒトミトコンドリアDNAの変異を比較することにより、(1)肥満者であっても糖尿病となる危険の少ない者、(2)肥満者であり糖尿病となる危険のある者、(3)肥満者でなくても糖尿病となる危険のある者などを判断するための資料を与えることができる。
【0006】
すなわち、上記の課題を解決するために第1の発明は、ヒトミトコンドリアDNAにおいて、T10C , C41T , 42insC , T63C , C64T , 65insG , G68A , G69A , G75A , A93G , G94A , G103A , T131C , G143A , T146C , C150T , C151T , T152C , A153G , A183G , G185A , A189G , C194T , T195C , T195A , T199C , A200G , A202G , G203A , T204C , G207A , A210G , A214G , G228A , A234G , A235G , A248del , A249G , G255A , G260A , A272G , T279C , A281G , 285insA , W303−317hvr1 , T318C , G322A , T334C , C338T , C345T , A373G , A384G , C431T , C456T , C481T , T482C , T489C , G499A , G513A , W514insCA2 , W514delCA2 , G545A , C548T , W568Cn−ins , T593C , T629C , A663G , T681C , C702T , G709A , C752T , C770T , A814G , A827G , A856G , G951A , W956Cn−ins , T961C , C983T , C1009T , A1041G , C1048T , T1107C , T1119C , T1189C , A1299G , G1303A , C1310T , A1382C , T1391C , G1393A , C1405T , G1438A , G1442A , C1508T , T1520C , G1598A , G1664A , C1734T , A1736G , T1766C , T1819C , T1822C , G1888A , A1892G , A1978G , G2056A , C2079T , 2150Ains , C2218T , A2223G , A2246G , T2330C , G2361A , T2416C , A2550T , T2626C , G2706A , C2766T , C2772T , G2831A , C2835T , T2857C , T2887C , G3010A , T3083C , A3145G , 3167Cins , C3206T , A3221G , T3290C , G3316A , T3336C , G3337A , T3338C , T3368C , T3372C , T3394C , A3395G , T3398C , G3421A , G3496T , C3497T , T3504C , G3531A , T3535C , A3537G , T3593C , T3644C , T3645C , C3696T , A3744G , A3759G , T3786C , T3801C , A3816G , G3882A , C3897T , G3915A , C3970T , A3981G , C4025T , G4048A , C4071T , C4086T , G4113A , T4117C , A4129G , C4140T , C4161T , A4164G , C4186T , T4209C , T4248C , A4343G , T4386C , A4435G , T4452C , G4491A , C4505T , C4538T , T4612C , C4625T , G4655A , G4659A , C4670T , A4704C , T4705C , C4712T , A4715G , A4732G , A4793G , G4820A , A4824G , A4833G , C4850T , T4859C , C4883T , A4895G , T4907C , A4958G , G4959A , G4991A , T5021C , T5048C , C5049T , T5108C , A5127G , G5147A , A5153G , C5178T , C5178A , G5231A , G5237A , G5261A , C5263T , A5301G , A5319G , A5351G , G5417A , A5441G , T5442C , G5460A , T5465C , A5539G , A5582G , G5585A , A5592G , C5601T , T5628C , T5655C , G5744A , G5773A , G5777A , G5821A , G5824A , W5895Cn−ins , C5899T , A5951G , T5964C , C6005T , G6023A , T6086C , A6146G , T6176C , G6179A , T6185C , T6221C , T6253C , G6260A , G6261A , A6332G , T6345C , T6392C , C6410T , T6413C , C6455T , A6494G , A6503C , C6551T , A6599G , T6620C , T6671C , T6680C , C6689T , C6713T , T6719C , A6737G , A6752G , T6827C , G6899A , T6941C , T6956C , G6962A , A6969G , A7083G , A7091G , A7124G , C7196A , T7220C , A7250G , T7270C , T7319C , T7334C , A7364G , T7389C , G7600A , T7621C , G7637A , G7664A , A7673G , T7684C , T7738C , G7757A , G7789A , A7822G , G7830A , G7853A , G7859A , T7861C , C7867T , C7909T , C7948T , A7960G , T7964C , T8005C , G8020A , G8075A , G8078A , A8149G , A8158G , T8167C , A8188G , T8200C , G8206A , G8251A , W8272−del , A8296G , T8383C , G8392A , C8414T , T8419C , A8435G , T8450C , A8453G , T8473C , A8479G , A8563G , A8566G , G8584A , T8614C , C8628T , G8669C , C8684T , A8701G , C8727T , T8757C , G8764A , A8784G , T8793C , C8794T , A8812G , C8829T , C8844T , G8854A , G8856A , A8894T , A8919G , A8923G , G8950A , A8962G , C8964T , G8989A , C8991T , C9004T , G9053A , C9081T , T9090C , T9117C , G9123A , T9165C , A9180G , G9182A , A9197G , A9242G , A9254G , C9296T , A9299G , G9329A , C9332T , A9355G , A9377G , A9410G , A9422T , C9431T , G9477A , T9479C , T9495C , T9498C , C9536T , T9540C , G9548A , G9554A , G9575A , T9661C , A9664T , C9711T , G9713A , T9824C , T9824A , T9833C , C9851T , T9856C , G9932A , T9938C , T9950C , G9962A , T9977C , A10005G , T10084C , A10103G , C10104T , C10181T , C10211T , T10235C , T10238C , G10310A , G10325A , T10345C , G10373A , A10397G , A10398G , C10400T , T10410C , A10411G , G10427A , T10454C , T10463C , C10607T , T10609C , G10646A , G10685A , T10790C , G10801A , T10873C , T10907C , T10915C , C10976T , T11009C , G11016A , T11017C , A11038G , A11084G , A11092G , A11101G , C11146T , T11147C , G11149A , C11151T , A11167G , G11176A , C11215T , T11253C , T11255C , C11389T , T11437C , G11440A , C11536T , T11569C , C11647T , C11647G , C11665T , C11668T , G11696A , T11701C , T11722C , A11746G , G11914A , T11935C , T11944C , A11959G , G11963A , G11969A , A12026G , A12033G , C12085T , T12091C , C12153T , A12172G , G12192A , A12234G , A12280G , T12311C , T12354C , A12358G , C12360T , A12361G , G12372A , T12396C , C12405T , G12406A , T12408C , A12451G , G12501A , C12549T , A12612G , G12630A , C12633T , T12696C , C12705T , G12771A , T12811C , C12853T , T12880C , C12882T , A12909G , T12957C , C13029T , A13050G , A13083T , A13092G , A13104G , A13105G , G13135A , A13140G , T13143C , A13152G , A13183G , A13221G , A13278G , T13437C , T13461C , G13477A , T13500C , A13512G , A13527G , A13563G , T13581C , G13590A , T13602C , A13614G , T13617C , A13629G , A13651G , G13708A , C13720T , C13737T , G13759A , C13800T , T13819C , A13827G , T13830C , C13855T , A13857G , T13879C , A13887G , G13928C , C13934T , G13968A , A14002G , C14003T , G14016A , C14052T , T14063C , A14091G , C14103A , A14118G , A14133G , C14142T , A14148G , C14149T , C14158T , T14178C , T14180C , T14200C , C14281T , G14305A , T14308C , T14311C , T14325C , C14337T , G14364A , T14371C , T14470C , G14476A , T14502C , G14569A , A14605G , C14629T , T14634G , C14668T , A14692G , A14693G , A14696G , A14750G , A14755G , T14783C , A14870G , A14893G , A14914G , A14927G , C14944T , T14971C , T14979C , C14990T , C15022T , C15040T , G15043A , G15047A , A15052G , A15061G , T15067C , T15071C , T15099C , G15106A , G15148A , T15164C , T15184C , G15217A , A15218G , G15221A , C15223T , A15235G , A15236G , A15244G , C15286T , T15299C , G15301A , G15314A , G15323A , C15331A , T15341C , G15346A , G15355A , A15380G , C15402T , A15422G , A15427G , T15440C , C15455T , A15487T , G15497A , C15508T , C15518T , A15524G , C15535T , G15553A , T15586C , T15618C , T15622C , C15632A , A15662G , T15670C , T15697C , A15724G , A15746G , A15758G , A15769C , T15784C , T15787C , A15805G , T15850C , A15851G , A15860G , C15868T , A15874G , G15884A , A15924G , G15927A , G15928A , A15936G , T15940C , T15941C , A15951G , A15954G , T15983C , A16066G , T16086C , T16092C , T16093C , T16102C , C16111T , T16126C , G16129A , T16136C , T16140C , G16145A , A16146G , T16154C , A16160G , A16162G , A16164G , C16167T , C16168T , T16172C , C16174T , C16176T , W16180−95−hvr2 , A16207G , T16209C , A16212G , G16213A , C16214T , A16216G , T16217C , C16218T , C16223T , T16224C , A16227G , T16231C , C16232A , C16234T , A16241G , T16243C , C16245T , T16249C , C16250T , A16254G , C16256T , C16257A , C16259T , C16260T , C16261T , T16263C , A16265G , A16265C , C16266A , C16266T , C16268T , A16269G , T16271C , G16274A , A16275G , C16278T , A16284G , C16286T , C16287T , T16288C , C16290T , C16291T , C16292T , C16292G , C16294T , C16295T , T16297C , T16298C , A16299G , A16300G , T16304C , A16309G , T16311C , A16316G , A16318T , G16319A , C16320T , T16324C , T16325C , C16344T , T16352C , C16355T , T16357C , C16360T , T16362C , T16368C , T16381C , G16390A , A16399G , A16463G , G16470A , G16471A , A16497G , T16519C , G16526Aのうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、個人識別することを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく個人識別法である。
【0007】
糖尿病患者群においては545個の変異が、肥満者群においては521個の変異が確認された。上記の753個の変異は、それらの重複ヶ所を除いた全てのものである。
本発明において、変異とは、いわゆる「改訂版ケンブリッジ標準配列」、或いは本発明者らが見出した日本人におけるコンセンサスシークエンス(JCS:表2を参照)に比べて、特定の塩基が変異していることを意味している。なお、本明細書中において、「変異」とは、塩基の置換、挿入、または欠失を含む。
また、本明細書中においては、塩基置換については、▲1▼数字の後ろに二つの英文字が矢印(→)を挟んだ状態、又は▲2▼2種類の英文字が数字を挟んだ状態で示している。上記▲1▼の場合には、数字は塩基置換が行われた位置を示し、始めの英文字が置換前の塩基を後の英文字が置換後の塩基を示している。例えば、「10235T→C」は、10235番目のチミンがシトシンに変異したことを示している。また上記▲2▼の場合には、数字が塩基置換が行われた位置を示し、始めの英文字が置換前の塩基を後の英文字が置換後の塩基を示している。例えば、「T3336C」は、3336番目のチミンがシトシンに変異したことを示している。
【0008】
また、塩基挿入については、例えば「7465 ins C」、或いは「7465 C−ins」のように、挿入がなされた位置を数字で示した後に、挿入の意味を示す「ins」と、挿入された塩基とを記述して示す。塩基欠失については、例えば「248 del A」、或いは「248 A del」のように、欠失がなされた位置を数字で示した後に、欠失の意味を示す「del」と、欠失された塩基とを記述して示す。
また、アミノ酸置換については、タンパク質の種類と、2種類の英文字(アミノ酸の3文字表記)が数字を挟んだ記号とで示している。この場合に、英文字と数字の意味は、始めの英文字が置換前のアミノ酸を示し、後ろの英文字が置換後のアミノ酸を示している。また、数字は、対象となるタンパク質において、アミノ酸置換が行われた位置を示している。例えば、「Cytb, Leu237Phe」は、Cytbにおいて、237番目のロイシンがフェニルアラニンに置換した変異であることを意味している。
【0009】
また、「hvr」は、高頻度変異部位(hyper variable region)を意味しており、hvr1(303−317)及びhvr2(16180−16195)の2ヶ所がある。また、「W」は、野生型塩基配列(Wild−type sequence)を意味しており、標準となる改訂版ケンブリッジリファレンスシークエンス(rCRS, revised Cambridge reference sequence ; Andrews R.M., Kubacka I., Chinnery P.F., Lightowlers R.N., Turnbull D.M., Howell N. Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA. Nat Genet 1999; 23: 147.)と同じ配列を意味している。「W」を付した位置として、高頻度変異部位1(hvr1−303−317)を「W303−317hvr1」、CAリピート(CA−514−523)を「W514insCA2」または「W514delCA2」、Cストレッチ1(C1−568−573)を「W568Cn−ins」、12S rRNA(956−965)を「W956Cn−ins」、Cストレッチ2(C2−5895−5899)を「W5895Cn−ins」、9bp欠失/挿入(9−bp del/ins−8272−8289)を「W8272−del」、高頻度変異部位2(hvr2−16180−16195)を「W16180−95−hvr2」ということがある。これらの部位は、rCRSと各個人との間に(或いは、各個人間においても)高度に変異が認められる(後述する)。
【0010】
遺伝子変異を検出する方法としては、当業者にとって公知の方法、例えばDNAシークエンス、多重APLP法、DNAマイクロアレイ等を使用したハブリダイゼーション法、Invader法、Taqmanプローブ法、 Masscodeタグ法、対立遺伝子特異的PCR法、RFLP法、多様固相蛍光ミニシークエンス法、免疫化シークエンス特異的オリゴヌクレオチドプローブアッセイ法などを例示することができるが、これらの方法に限定されることなく、将来的に開発される各種のDNA解析法を用いることが出来る。
第1の発明によれば、ヒトミトコンドリアDNAの変異に基づいて、個人識別を行うことができる。
【0011】
第2の発明は、ヒトミトコンドリアDNAにおいて、T10C , C41T , 42insC , T63C , C64T , G68A , G69A , A93G , G94A , G103A , T131C , G143A , T146C , C150T , C151T , T152C , A153G , A183G , G185A , C194T , T195C , T195A , T199C , A200G , A202G , T204C , G207A , A210G , A214G , G228A , A234G , A235G , A248del , A249G , G260A , A272G , A281G , W303−317hvr1 , T334C , C338T , A373G , C456T , T482C , T489C , G499A , G513A , W514insCA2 , W514delCA2 , C548T , W568Cn−ins , T629C , A663G , T681C , G709A , C752T , C770T , A827G , A856G , G951A , W956Cn−ins , T961C , C983T , C1009T , A1041G , C1048T , T1107C , A1299G , C1310T , A1382C , G1393A , C1405T , G1438A , G1442A , T1520C , G1598A , C1734T , A1736G , 2150Ains , C2218T , A2246G , T2330C , T2416C , T2626C , C2766T , C2772T , G2831A , C2835T , T2857C , G3010A , T3083C , A3145G , C3206T , T3290C , G3316A , T3336C , T3368C , T3372C , T3394C , T3398C , G3421A , G3496T , G3531A , T3535C , A3537G , T3644C , T3645C , C3696T , A3759G , G3882A , C3897T , C3970T , G4048A , C4071T , C4086T , T4117C , C4140T , A4164G , T4209C , T4248C , A4343G , T4386C , A4435G , T4452C , G4491A , C4505T , T4612C , G4655A , G4659A , C4670T , T4705C , A4715G , A4732G , A4793G , G4820A , A4824G , A4833G , C4850T , C4883T , A4895G , A4958G , G4959A , T5021C , T5048C , C5049T , T5108C , A5127G , G5147A , A5153G , C5178A , G5231A , G5261A , C5263T , A5301G , A5319G , A5351G , G5417A , T5442C , G5460A , A5539G , A5582G , C5601T , T5628C , T5655C , G5744A , G5773A , G5821A , G5824A , W5895Cn−ins , A5951G , T5964C , C6005T , G6023A , T6086C , A6146G , T6176C , G6179A , T6185C , T6221C , T6253C , G6261A , A6332G , T6345C , T6392C , T6413C , C6455T , A6494G , T6671C , T6680C , T6719C , A6737G , A6752G , T6827C , G6899A , T6941C , G6962A , A6969G , A7124G , C7196A , T7220C , A7250G , T7319C , T7334C , T7389C , G7600A , T7621C , G7637A , T7684C , T7738C , G7830A , G7853A , G7859A , T7861C , C7867T , C7909T , C7948T , A7960G , T7964C , T8005C , G8020A , G8078A , A8158G , A8188G , T8200C , G8206A , G8251A , W8272−del , A8296G , T8383C , G8392A , C8414T , T8419C , T8450C , A8453G , T8473C , A8479G , A8563G , A8566G , G8584A , C8684T , A8701G , C8727T , T8757C , A8784G , T8793C , C8794T , A8812G , C8829T , G8854A , G8856A , A8923G , A8962G , C8964T , G8989A , G9053A , C9081T , T9090C , T9165C , A9180G , A9242G , C9296T , A9299G , G9329A , C9332T , A9355G , A9377G , A9422T , C9431T , T9495C , C9536T , T9540C , G9548A , G9554A , G9575A , C9711T , T9824C , T9824A , T9833C , T9856C , T9950C , G9962A , A10005G , C10104T , C10181T , C10211T , T10235C , G10310A , G10325A , T10345C , G10373A , A10397G , A10398G , C10400T , T10410C , G10427A , T10463C , C10607T , T10609C , G10646A , G10801A , T10873C , T10915C , C10976T , G11016A , T11017C , A11038G , A11084G , C11146T , G11149A , C11151T , A11167G , G11176A , C11215T , C11389T , T11437C , G11440A , C11536T , C11647T , C11647G , C11665T , G11696A , T11722C , G11914A , T11935C , T11944C , G11963A , G11969A , A12026G , T12091C , C12153T , G12192A , A12234G , T12311C , A12358G , A12361G , G12372A , T12396C , C12405T , G12406A , T12408C , G12501A , C12549T , G12630A , C12633T , T12696C , C12705T , G12771A , T12811C , T12880C , C12882T , A12909G , T12957C , A13050G , A13092G , A13104G , A13105G , G13135A , A13140G , A13152G , A13183G , A13278G , T13461C , G13477A , T13500C , A13563G , T13581C , G13590A , T13602C , A13614G , T13617C , A13651G , G13708A , C13720T , C13737T , G13759A , C13800T , T13819C , A13827G , T13830C , G13928C , A14002G , G14016A , A14091G , C14103A , A14118G , A14148G , C14149T , C14158T , T14178C , T14180C , T14200C , C14281T , T14308C , T14311C , T14325C , C14337T , G14364A , T14371C , T14470C , G14476A , T14502C , G14569A , A14605G , C14668T , A14692G , A14693G , A14696G , A14755G , T14783C , A14870G , A14893G , A14914G , A14927G , C14944T , T14979C , C15022T , C15040T , G15043A , G15047A , A15052G , T15067C , T15071C , T15099C , G15106A , G15148A , T15164C , T15184C , G15217A , A15218G , C15223T , A15235G , A15236G , A15244G , C15286T , G15301A , G15314A , G15323A , C15331A , T15341C , G15355A , A15380G , C15402T , A15422G , T15440C , A15487T , G15497A , C15508T , C15518T , A15524G , C15535T , T15618C , T15622C , A15662G , T15670C , T15697C , A15724G , A15746G , A15769C , T15784C , T15787C , A15805G , T15850C , A15851G , A15860G , C15868T , A15874G , A15924G , G15927A , T15941C , A15951G , A15954G , T16092C , T16093C , C16111T , T16126C , G16129A , T16136C , T16140C , G16145A , A16146G , A16162G , A16164G , C16168T , T16172C , C16174T , C16176T , W16180−95−hvr2 , A16207G , T16209C , G16213A , A16216G , T16217C , C16223T , T16224C , T16231C , C16232A , C16234T , T16243C , C16245T , T16249C , C16256T , C16257A , C16260T , C16261T , T16263C , A16265C , C16266T , C16266A , A16269G , T16271C , G16274A , A16275G , C16278T , A16284G , C16286T , C16290T , C16291T , C16292T , C16292G , C16294T , C16295T , T16297C , T16298C , A16299G , A16300G , T16304C , A16309G , T16311C , A16316G , A16318T , G16319A , T16324C , T16325C , C16344T , C16355T , T16357C , T16362C , T16368C , G16390A , A16399G , A16463G , G16470A , G16471A , A16497G , T16519C , G16526Aのうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法である。
【0012】
糖尿病患者群においては、545個の変異が確認された。第2の発明では、これら545ヶ所の変異のいずれか(一つ、または二つ以上)を検出することにより、その者が糖尿病となるか否かを判断するための資料を与えることができる。なお、第2の発明において、好ましくは、 T10C , C64T , A93G , G94A , T146C , T152C , C194T , A248del , W303−317hvr1 , T489C , W514insCA2 , W514delCA2 , C752T , W956Cn−ins , T961C , A1041G , T1107C , C1310T , A1382C , G1438A , G1442A , T2626C , C2772T , G3010A , G3316A , C3970T , C4140T , T4386C , G4491A , A4715G , A4793G , C4883T , A4958G , C5178A , A5301G , W5895Cn−ins , T5964C , T6392C , G6962A , C7196A , A7250G , C7867T , G8020A , T8200C , C8414T , T8473C , G8584A , A8701G , A8784G , T8793C , C8964T , G9053A , A9180G , A9242G , C9296T , A9299G , C9536T , T9540C , T9824A , G10310A , A10397G , A10398G , C10400T , T10410C , T10609C , G10646A , T10873C , T11017C , A11084G , C11146T , C11647T , T11722C , G11914A , T11944C , G11963A , A12026G , G12406A , C12549T , C12705T , G12771A , C12882T , A13152G , G13759A , G13928C , T14308C , T14470C , T14502C , A14605G , C14668T , T14783C , T14979C , C15040T , G15043A , T15071C , G15301A , G15323A , G15355A , A15487T , G15497A , A15860G , A15924G , A15954G , T16093C , G16129A , T16172C , C16176T , T16209C , C16223T , C16266A , C16266T , G16274A , C16290T , C16294T , T16304C , A16309G , A16316G , G16319A , T16325C , C16355T , T16362C , G16390A , A16497G のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づくことができる。
本発明者らの解析によれば、肥満者に比べて糖尿病患者に多く確認された122ヶ所の変異(オッズ比(Odds ratio)が1より小さい変異)の有無を確認することにより、その者が糖尿病患者となる可能性が高いか否かについての判断資料を与えることができる。
【0013】
また、第2の発明において、好ましくは、 T63C , G69A , G143A , C151T , G185A , G228A , A234G , A249G , A272G , A281G , T334C , C338T , A373G , T482C , G513A , C548T , T629C , C770T , G951A , C983T , C1009T , G1393A , C1405T , T1520C , C1734T , C2218T , A2246G , T2330C , T2416C , C2835T , T2857C , T3083C , A3145G , T3290C , T3368C , T3372C , T3398C , G3421A , G3531A , T3535C , T3645C , C3696T , A3759G , G3882A , C3897T , C4086T , A4435G , T4452C , C4505T , T4612C , G4659A , C4670T , T4705C , C4850T , G4959A , T5021C , C5049T , A5127G , G5261A , C5263T , T5442C , A5582G , T5628C , T5655C , G5821A , G5824A , A5951G , T6086C , A6146G , T6176C , G6179A , T6221C , G6261A , A6332G , T6345C , A6494G , T6671C , T6719C , A6737G , T6827C , G6899A , T6941C , A6969G , A7124G , T7220C , T7319C , T7334C , T7389C , T7621C , G7637A , T7738C , G7830A , G7859A , T7861C , C7909T , C7948T , A7960G , T7964C , T8005C , G8078A , A8158G , A8188G , A8296G , G8392A , T8450C , A8453G , A8479G , A8566G , C8684T , C8727T , T8757C , A8812G , G8854A , A8923G , A8962G , G8989A , C9081T , T9165C , G9329A , C9332T , A9355G , A9422T , T9495C , G9548A , G9554A , C9711T , T9833C , T9856C , A10005G , C10211T , G10325A , G10427A , T10463C , A11038G , G11176A , C11389T , G11440A , C11647G , C11665T , T11935C , G11969A , T12091C , C12153T , G12192A , A12234G , T12311C , T12396C , T12408C , G12630A , T12696C , A12909G , T12957C , A13050G , A13092G , A13105G , A13140G , T13461C , T13500C , T13581C , T13602C , A13614G , T13617C , A13651G , C13720T , C13737T , C13800T , T13819C , A13827G , T13830C , A14002G , G14016A , A14091G , C14103A , A14118G , A14148G , T14178C , T14180C , C14281T , T14311C , C14337T , T14371C , A14696G , A14755G , A14870G , A14914G , A14927G , C15022T , G15047A , A15052G , T15099C , G15106A , G15148A , T15164C , T15184C , G15217A , A15218G , C15286T , G15314A , T15341C , A15380G , C15402T , A15422G , T15618C , T15622C , T15670C , T15697C , A15746G , A15769C , T15787C , A15805G , C15868T , T16126C , A16146G , A16162G , C16168T , A16207G , G16213A , A16216G , T16263C , A16269G , T16271C , A16275G , C16286T , C16292G , C16295T , A16299G , A16300G , A16318T , T16368C , G16470A , G16471A , G16526A のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づくことができる。
本発明者らの解析によれば、肥満者群には認められず、糖尿病患者にのみ確認された232ヶ所の変異(オッズ比が0の変異)の有無を確認することにより、その者が糖尿病患者となる可能性が高いか否かについての判断資料を与えることができる。
【0014】
肥満者群においては、521個の変異が確認された。これら521ヶ所の変異のうち、肥満者群に多く見られた110ヶ所の変異(オッズ比が1より大の変異)のいずれか(一つ、または二つ以上)、または糖尿病患者群には認められず肥満者群にのみ確認された208ヶ所の変異(オッズ比が無限大(inf)の変異)を検出することにより、その者が糖尿病となるか否かを判断するための資料を与えることができる。
こうして、第3の発明は、ヒトミトコンドリアDNAにおいて、 T131C , C150T , T195C , T195A , T199C , A200G , A202G , T204C , G207A , G499A , W568Cn−ins , G709A , A827G , A856G , G1598A , C2766T , G2831A , T3394C , T3644C , G4048A , C4071T , T4117C , A4164G , A4343G , G4820A , A4895G , T5108C , G5231A , A5351G , G5417A , G5460A , C5601T , G5744A , G5773A , G6023A , T6253C , T6413C , C6455T , T6680C , G7600A , T7684C , G7853A , G8206A , G8251A , W8272−del , T8419C , C8829T , A9377G , G9575A , T9824C , T9950C , G9962A , T10345C , G10373A , C10607T , G10801A , T10915C , G11016A , C11536T , A12358G , A12361G , G12372A , C12405T , G12501A , T12811C , T12880C , A13104G , A13183G , A13563G , G13590A , G13708A , T14200C , G14569A , A14692G , A14893G , C14944T , C15223T , A15236G , C15508T , C15518T , C15535T , A15662G , T15850C , A15851G , A15874G , G15927A , T15941C , C16111T , T16136C , T16140C , G16145A , C16174T , W16180−95−hvr2 , T16217C , T16224C , C16234T , T16243C , C16245T , C16256T , C16257A , C16261T , A16265C , C16278T , A16284G , C16292T , T16297C , T16311C , A16399G , A16463G , T16519C のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法である。これら110ヶ所の変異は、糖尿病患者群に比べて、肥満者群に多く見られた変異である。
【0015】
また、第4の発明は、ヒトミトコンドリアDNAにおいて、65insG , G75A , A189G , G203A , G255A , T279C , 285insA , T318C , G322A , C345T , A384G , C431T , C481T , G545A , T593C , C702T , A814G , T1119C , T1189C , G1303A , T1391C , C1508T , G1664A , T1766C , T1819C , T1822C , G1888A , A1892G , A1978G , G2056A , C2079T , A2223G , G2361A , A2550T , G2706A , T2887C , 3167Cins , A3221G , G3337A , T3338C , A3395G , C3497T , T3504C , T3593C , A3744G , T3786C , T3801C , A3816G , G3915A , A3981G , C4025T , G4113A , A4129G , C4161T , C4186T , C4538T , C4625T , A4704C , C4712T , T4859C , T4907C , G4991A , C5178T , G5237A , A5441G , T5465C , G5585A , A5592G , G5777A , C5899T , G6260A , C6410T , A6503C , C6551T , A6599G , T6620C , C6689T , C6713T , T6956C , A7083G , A7091G , T7270C , A7364G , G7664A , A7673G , G7757A , G7789A , A7822G , G8075A , A8149G , T8167C , A8435G , T8614C , C8628T , G8669C , G8764A , C8844T , A8894T , A8919G , G8950A , C8991T , C9004T , T9117C , G9123A , G9182A , A9197G , A9254G , A9410G , G9477A , T9479C , T9498C , T9661C , A9664T , G9713A , C9851T , G9932A , T9938C , T9977C , T10084C , A10103G , T10238C , A10411G , T10454C , G10685A , T10790C , T10907C , T11009C , A11092G , A11101G , T11147C , T11253C , T11255C , T11569C , C11668T , T11701C , A11746G , A11959G , A12033G , C12085T , A12172G , A12280G , T12354C , C12360T , A12451G , A12612G , C12853T , C13029T , A13083T , T13143C , A13221G , T13437C , A13512G , A13527G , A13629G , C13855T , A13857G , T13879C , A13887G , C13934T , G13968A , C14003T , C14052T , T14063C , A14133G , C14142T , G14305A , C14629T , T14634G , A14750G , T14971C , C14990T , A15061G , G15221A , T15299C , G15346A , A15427G , C15455T , G15553A , T15586C , C15632A , A15758G , G15884A , G15928A , A15936G , T15940C , T15983C , A16066G , T16086C , T16102C , T16154C , A16160G , C16167T , A16212G , C16214T , C16218T , A16227G , A16241G , C16250T , A16254G , C16259T , A16265G , C16268T , C16287T , T16288C , C16320T , T16352C , C16360T , T16381Cのうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法である。これら208ヶ所の変異は、糖尿病患者群に比べて、肥満者群に多く見られた変異である。
【0016】
また、全ての変異のうち、危険率(p)の範囲(例えば、0<p<0.05、0<p<0.10、0<p<0.20)、または/かつオッズ比の範囲を組み合わせて、適当な変異個所を選択することにより、その肥満者が糖尿病となる可能性についての判断資料を精度良く与えることもできる。
また、本研究の結果、日本人のヒトミトコンドリアDNAの塩基配列と、rCRSとにおいて高度に相違する部位、或いは、個人個人において高度に相違する部位が確認された。すなわち、表23〜表28に示す高頻度変異部位1(hvr1−303−317)、CAリピート(CA−514−523)、Cストレッチ1(C1−568−573)、12S rRNA(956−965)、Cストレッチ2(C2−5895−5899)、9bp欠失/挿入(9−bp del/ins−8272−8289)、高頻度変異部位2(hvr2−16180−16195)である(なお、表23〜表25は、糖尿病患者の塩基配列、表26〜表28は、肥満者群の塩基配列である)。これらの部位は、rCRSと各個人との間に(或いは、各個人間においても)高度に変異が認められた。このため、これらの位置の塩基配列を確認することにより、個人識別を行うことができる。
【0017】
こうして、第5の発明の発明は、ヒトミトコンドリアDNAにおいて、hvr1−303−317、CA−514−523、C1−568−573、12S rRNA−956−965、C2−5895−5899、9−bp del/ins−8272−8289、hvr2−16180−16195のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、個人識別することを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく個人識別法である。
【0018】
【発明の実施の形態】
次に、本発明の一実施形態について、図表を参照しつつ詳細に説明するが、本発明の技術的範囲は、下記の実施形態によって限定されるものではなく、その要旨を変更することなく、様々に改変して実施することができる。また、本発明の技術的範囲は、均等の範囲にまで及ぶものである。
<対象>
各々96名の2型糖尿病患者群及び、肥満者群[BMI:14.0〜24.3 kg/m2 (20.2±2.3 kg/m2)、年齢18〜25歳(20±2歳)]のミトコンドリアゲノム全塩基配列(13個のmRNA(タンパクコーディング領域)、22個のtRNA、及び2個のrRNAを含む。図1を参照。)を解析した。BMI(kg/m2)は体重と身長から算出した。全ての被験者は本研究への参加に同意した。また、本研究は名古屋大学総合保健体育科学センターの倫理委員会で承認された。
【0019】
<方法>
各被験者から静脈血2mLを50mM EDTAを含有した採血管に集めた。総DNAは、MagExtractor System MFX−2000(Toyobo、大阪)を用いて血液から抽出した。ミトコンドリアゲノム全てを既報に示す通り(Masashi Tanaka, Mika Hayakawa, and Takayuki Ozawa, Automated Sequencing of Mitochondrial DNA, Methods in Enzymology, Volume 264, 407−421,1996:特開平11−113597号公報)、1度目のPCR(polymerase chain reaction,1st PCR)で6つの断片を増幅し、その後、2度目のPCR(2nd PCR)で互いにオーバーラップする60の領域を増幅した。
すなわち、ミトコンドリアゲノムは、表1に示したプライマー対(L1およびH1プライマー)を用いたPCR法により、約3.0kbの領域(フラグメントA〜F)として増幅した。各プライマーの塩基配列は、次の通りである(なお、表1に記載されているプライマーのうち、L5545,FL8053,FL8635,FL9213,FL12600,FL16221,H3082,H9235,H342を除く各プライマーの塩基配列は、上記既報に開示されているので、重複を避けるため記載を省略する)。L5545は、5’−ACAGCTAAGGACTGCAAAAC−3’ (配列番号1)、FL8053は、5’−TGTAAAACGACGGCCAGTACAAGACGTCTTGCACTCAT−3’(配列番号2)、FL8635は、5’−TGTAAAACGACGGCCAGTCTCATCAACAACCGACTAAT−3’(配列番号3)、FL9213は、5’−TGTAAAACGACGGCCAGTCACCAATCACATGCCTATCA−3’(配列番号4)、FL12600は、5’−TGTAAAACGACGGCCAGTATTCATCCCTGTAGCATTGT−3’(配列番号5)、FL16221は、5’−TGTAAAACGACGGCCAGTCCCTCAACTATCACACATCA−3’(配列番号6)、H3082は、5’−TAGAAACCGACCTGGATTAC−3’(配列番号7)、H9235は、5’−TCATGGGCTGGGTTTTACTA−3’(配列番号8)、H342は、5’−TTTTTGGGGTTTGGCAGAGA−3’(配列番号9)である。
【0020】
【表1】
【0021】
PCR法の条件は、94℃で5分間の熱変性から開始し、94℃で15秒の熱変性、60℃で15秒のアニーリング、および72℃で3分の伸長反応を40サイクル行い、最後に72℃で10分の伸長反応を行った。1st PCR増幅産物は、1%アガロースゲルで電気泳動した後、エチジウムブロマイドで視覚化することにより確認した。
その後、フラグメントA〜Fを表1に示したプライマー対(FL2およびH2プライマー)を用いたPCR法により、約600〜1000bpの60の小領域に分けて増幅した(2nd PCR)。2nd PCRのフォーワード(Forword)プライマーは、38塩基のオリゴヌクレオチドであり、20塩基のL鎖特異的な配列の5’末端側に、ユニバーサルシークエンスプライマー(−21M13 , 5’−TGTAAAACGACGGCCAGT−3’:配列番号10)の配列18塩基を結合したものである。PCR法の条件は、94℃で15秒の熱変性、60℃で15秒のアニーリング、および72℃で3分の伸長反応を40サイクル行い、その後72℃で10分の伸長反応を行った。これらの2nd PCR DNAは、MultiScreenーPCRプレート(Millipore, Bedford, MA)を用いて精製した。精製後のDNAの質は、Ready−To−Run Separation Unit(Amersham Pharmacia Biotech AB, San Francisco, CA)を用いたエチジウムブロマイドを含む1.5%アガロースゲル電気泳動で確認した。
【0022】
シークエンス反応は、2nd PCR DNA、−21M13ユニバーサルプライマー、およびBigDye Terminator Cycle Sequence Ready Reaction Kit 1.0または3.0 (Applied Biosystems, Foster City, CA)を用いて行った。PCR条件は、まず96℃で5分間の熱変性をし、次に96℃で10秒の熱変性、50℃で5秒のアニーリング、および62℃で3分の伸長反応を25サイクル行い、最後に62℃で3分の伸長反応を行った。シークエンス反応の後、過剰なDye TerminatorをMultiScreen−PCR HVプレート(Millipore)を用いたゲルろ過によって除去した。精製されたDNAサンプルは、乾燥させた後にtemplate suppression reagent (TSR, Applied Biosystems)、またはホルムアミド (Applied Biosystems)に溶解させた。溶解させたDNAサンプルは、95℃で2分間熱変性させ、直ちに氷上に移した。DNAシークエンスは、自動DNAシークエンサー310または377(Applied Biosystems)を用いて分析した。
シークエンス解析は、Sequencing Analysis Program version 4.1 (Applied Biosystems)を用いて行った。シークエンス断片は、シークエンス解析ソフトウェアSequencher 3.1.1 (Gene Codes, Ann Arbor, MI)を用いて整列させ、一塩基変異多型(以下、「SNP」(single nucleotide polymorphisms)という)の場所の同定に用いた。各々のSNPは目で再確認した。なお、DNAの増幅は、互いにオーバーラップさせたので、少なくても2つの領域で各々のSNPを確認した。
【0023】
各々のmtDNA配列は、オリジナルケンブリッジリファレンスシークエンス(oCRS)及び改訂版ケンブリッジリファレンスシークエンス(rCRS)(Andrews R.M., Kubacka I., Chinnery P.F., Lightowlers R.N., Turnbull D.M., Howell N. Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA. Nat Genet 1999; 23: 147.)と比較した。
【0024】
<結果>
1.日本人におけるコンセンサスシークエンス(Japanese consensus sequence (JCS))
本研究において、SNPはrCRSとの比較により解析したが、その頻度が100%、若しくはそれに近い場合には、その塩基配列を日本人におけるコンセンサスシークエンス(JCS)とし、標準塩基配列として用いた(表2)。
【0025】
【表2】
【0026】
2.塩基置換、挿入、および欠失数について
96名の糖尿病患者において、ミトコンドリアゲノム全体で545個の多型が見つかり、蛋白質コーディング領域では343カ所に多型があった。その内、239カ所(69.7%)は同義置換(synonymous substitution;塩基置換がアミノ酸の置換を伴わないもの)であり、104カ所(30.3%)は非同義置換(nonsynonymous substitution;塩基配列がアミノ酸の置換を伴うもの)であった。また、2個のrRNA及び22個のtRNAの塩基置換(置換、挿入、および欠失)は、それぞれ41ヶ所、及び29カ所で認められた。さらに、非コーディング領域においては、131カ所に多型が見つかり、L鎖複製開始領域で、1カ所の多型があった。
96名の肥満者において、ミトコンドリアゲノム全体で521個の多型が見つかり、蛋白質コーディング領域では319カ所に多型があった。その内、224カ所(70.2%)が同義置換であり、95カ所(29.8%)が非同義置換であった。また、2個のrRNA及び22個のtRNAの塩基変異(置換、挿入、および欠失)は、それぞれ47ヶ所、及び24カ所で認められた。さらに、非コーディング領域においては、130カ所に多型が見つかり、L鎖複製開始領域で、1カ所の多型があった。
【0027】
表3〜表22には、コーディング領域、RNA遺伝子領域、及び非コーディング領域において、糖尿病患者(Diabetes)及び肥満者(Non−obese)に確認された変異(置換、挿入、及び欠失)の全てを示した。
すなわち、(1)タンパク質コーディング領域において、糖尿病患者群(A)および肥満者群(B)の間に生じた同義置換の頻度比較について、表3〜表10に示した。
なお、表中、「Variant frequency」は変異度(全96例中のうち、変異したmtDNAを有していた数)を、「Odds ratio」はオッズ比を、「P value」はP値を示す。また、糖尿病患者と肥満者との間に、危険率5%未満で有意さが認められた変異については「#」を、危険率1%未満で有意さが認められた変異については「##」を付した。
【0028】
【表3】
【0029】
【表4】
【0030】
【表5】
【0031】
【表6】
【0032】
【表7】
【0033】
【表8】
【0034】
【表9】
【0035】
【表10】
【0036】
(2)タンパク質コーディング領域における非同義置換の頻度について、表11〜表15に示した。
【表11】
【0037】
【表12】
【0038】
【表13】
【0039】
【表14】
【0040】
【表15】
【0041】
(3)また、糖尿病患者群(A)および肥満者群(B)の両群から検出された2個のrRNA、及び22個のtRNAにおける塩基置換について、表16〜表18に示した。
【表16】
【0042】
【表17】
【0043】
【表18】
【0044】
(4)糖尿病患者群及び肥満者群の両群から検出されたメジャー非コード領域(Major non−coding region)、およびマイナー非コード領域(Minor non−coding region)における塩基置換を表19〜表22に示した。
【表19】
【0045】
【表20】
【0046】
【表21】
【0047】
【表22】
【0048】
3.L鎖複製開始点の塩基置換
2名の肥満者(BMI 36.0および36.7 kg/m2)、及び1名の糖尿病患者でL鎖複製開始点の近傍にG5744Aが認められた(表20)。
なお必要であれば、これらの表から、糖尿病者群でのみ認められる変異、肥満者群よりも糖尿病者群において高い頻度で認められる変異、肥満者群でのみ認められる変異、及び糖尿病者群よりも肥満者群において高い頻度で認められる変異(更には、それらの変異のうち、同義置換または非同義置換)を容易に抽出することができる。
【0049】
表23〜表28には、rCRSと日本人のミトコンドリアDNAとの間において、特に高度に変異が認められた7ヶ所(高頻度変異部位1(hvr1−303−317)を「W303−317hvr1」、CAリピート(CA−514−523)を「W514insCA2」または「W514delCA2」、Cストレッチ1(C1−568−573)を「W568Cn−ins」、12S rRNA(956−965)を「W956Cn−ins」、Cストレッチ2(C2−5895−5899)を「W5895Cn−ins」、9bp欠失/挿入(9−bp del/ins−8272−8289)を「W8272−del」、高頻度変異部位2(hvr2−16180−16195)を「W16180−95−hvr2」)に関する192名の塩基配列を示した。
rCRSにおける上記各位置の塩基配列は、次の通りである。Hypervariable region 1 (303−317)は「CCCCCCCTCCCCCGC(配列番号11)」、CA repeat (514−523)は「CACACACACA(配列番号12)」、C stretch 1(568−573)は「CCCCCC(配列番号13)」、12S rRNA (956−965)は「CCCCCTCCCC(配列番号14)」、C stretch 2 (5895−5899)は「CCCCC(配列番号15)、9−bp deletion/insertion (8272−8289)は「CCCCCTCTACCCCCTCTA(配列番号16)」、Hypervariable region 2 (16180−16195)は「AAAACCCCCTCCCCAT(配列番号17)」である。
これらの部位の変異に基づいて、個人識別を行うこともできる。
【0050】
【表23】
【0051】
【表24】
【0052】
【表25】
【0053】
【表26】
【0054】
【表27】
【0055】
【表28】
【0056】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】ヒトミトコンドリアDNAの遺伝子の配置を示す図である。
Claims (7)
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、T10C , C41T , 42insC , T63C , C64T , 65insG , G68A , G69A , G75A , A93G , G94A , G103A , T131C , G143A , T146C , C150T , C151T , T152C , A153G , A183G , G185A , A189G , C194T , T195C , T195A , T199C , A200G , A202G , G203A , T204C , G207A , A210G , A214G , G228A , A234G , A235G , A248del , A249G , G255A , G260A , A272G , T279C , A281G , 285insA , W303−317hvr1 , T318C , G322A , T334C , C338T , C345T , A373G , A384G , C431T , C456T , C481T , T482C , T489C , G499A , G513A , W514insCA2 , W514delCA2 , G545A , C548T , W568Cn−ins , T593C , T629C , A663G , T681C , C702T , G709A , C752T , C770T , A814G , A827G , A856G , G951A , W956Cn−ins , T961C , C983T , C1009T , A1041G , C1048T , T1107C , T1119C , T1189C , A1299G , G1303A , C1310T , A1382C , T1391C , G1393A , C1405T , G1438A , G1442A , C1508T , T1520C , G1598A , G1664A , C1734T , A1736G , T1766C , T1819C , T1822C , G1888A , A1892G , A1978G , G2056A , C2079T , 2150Ains , C2218T , A2223G , A2246G , T2330C , G2361A , T2416C , A2550T , T2626C , G2706A , C2766T , C2772T , G2831A , C2835T , T2857C , T2887C , G3010A , T3083C , A3145G , 3167Cins , C3206T , A3221G , T3290C , G3316A , T3336C , G3337A , T3338C , T3368C , T3372C , T3394C , A3395G , T3398C , G3421A , G3496T , C3497T , T3504C , G3531A , T3535C , A3537G , T3593C , T3644C , T3645C , C3696T , A3744G , A3759G , T3786C , T3801C , A3816G , G3882A , C3897T , G3915A , C3970T , A3981G , C4025T , G4048A , C4071T , C4086T , G4113A , T4117C , A4129G , C4140T , C4161T , A4164G , C4186T , T4209C , T4248C , A4343G , T4386C , A4435G , T4452C , G4491A , C4505T , C4538T , T4612C , C4625T , G4655A , G4659A , C4670T , A4704C , T4705C , C4712T , A4715G , A4732G , A4793G , G4820A , A4824G , A4833G , C4850T , T4859C , C4883T , A4895G , T4907C , A4958G , G4959A , G4991A , T5021C , T5048C , C5049T , T5108C , A5127G , G5147A , A5153G , C5178T , C5178A , G5231A , G5237A , G5261A , C5263T , A5301G , A5319G , A5351G , G5417A , A5441G , T5442C , G5460A , T5465C , A5539G , A5582G , G5585A , A5592G , C5601T , T5628C , T5655C , G5744A , G5773A , G5777A , G5821A , G5824A , W5895Cn−ins , C5899T , A5951G , T5964C , C6005T , G6023A , T6086C , A6146G , T6176C , G6179A , T6185C , T6221C , T6253C , G6260A , G6261A , A6332G , T6345C , T6392C , C6410T , T6413C , C6455T , A6494G , A6503C , C6551T , A6599G , T6620C , T6671C , T6680C , C6689T , C6713T , T6719C , A6737G , A6752G , T6827C , G6899A , T6941C , T6956C , G6962A , A6969G , A7083G , A7091G , A7124G , C7196A , T7220C , A7250G , T7270C , T7319C , T7334C , A7364G , T7389C , G7600A , T7621C , G7637A , G7664A , A7673G , T7684C , T7738C , G7757A , G7789A , A7822G , G7830A , G7853A , G7859A , T7861C , C7867T , C7909T , C7948T , A7960G , T7964C , T8005C , G8020A , G8075A , G8078A , A8149G , A8158G , T8167C , A8188G , T8200C , G8206A , G8251A , W8272−del , A8296G , T8383C , G8392A , C8414T , T8419C , A8435G , T8450C , A8453G , T8473C , A8479G , A8563G , A8566G , G8584A , T8614C , C8628T , G8669C , C8684T , A8701G , C8727T , T8757C , G8764A , A8784G , T8793C , C8794T , A8812G , C8829T , C8844T , G8854A , G8856A , A8894T , A8919G , A8923G , G8950A , A8962G , C8964T , G8989A , C8991T , C9004T , G9053A , C9081T , T9090C , T9117C , G9123A , T9165C , A9180G , G9182A , A9197G , A9242G , A9254G , C9296T , A9299G , G9329A , C9332T , A9355G , A9377G , A9410G , A9422T , C9431T , G9477A , T9479C , T9495C , T9498C , C9536T , T9540C , G9548A , G9554A , G9575A , T9661C , A9664T , C9711T , G9713A , T9824C , T9824A , T9833C , C9851T , T9856C , G9932A , T9938C , T9950C , G9962A , T9977C , A10005G , T10084C , A10103G , C10104T , C10181T , C10211T , T10235C , T10238C , G10310A , G10325A , T10345C , G10373A , A10397G , A10398G , C10400T , T10410C , A10411G , G10427A , T10454C , T10463C , C10607T , T10609C , G10646A , G10685A , T10790C , G10801A , T10873C , T10907C , T10915C , C10976T , T11009C , G11016A , T11017C , A11038G , A11084G , A11092G , A11101G , C11146T , T11147C , G11149A , C11151T , A11167G , G11176A , C11215T , T11253C , T11255C , C11389T , T11437C , G11440A , C11536T , T11569C , C11647T , C11647G , C11665T , C11668T , G11696A , T11701C , T11722C , A11746G , G11914A , T11935C , T11944C , A11959G , G11963A , G11969A , A12026G , A12033G , C12085T , T12091C , C12153T , A12172G , G12192A , A12234G , A12280G , T12311C , T12354C , A12358G , C12360T , A12361G , G12372A , T12396C , C12405T , G12406A , T12408C , A12451G , G12501A , C12549T , A12612G , G12630A , C12633T , T12696C , C12705T , G12771A , T12811C , C12853T , T12880C , C12882T , A12909G , T12957C , C13029T , A13050G , A13083T , A13092G , A13104G , A13105G , G13135A , A13140G , T13143C , A13152G , A13183G , A13221G , A13278G , T13437C , T13461C , G13477A , T13500C , A13512G , A13527G , A13563G , T13581C , G13590A , T13602C , A13614G , T13617C , A13629G , A13651G , G13708A , C13720T , C13737T , G13759A , C13800T , T13819C , A13827G , T13830C , C13855T , A13857G , T13879C , A13887G , G13928C , C13934T , G13968A , A14002G , C14003T , G14016A , C14052T , T14063C , A14091G , C14103A , A14118G , A14133G , C14142T , A14148G , C14149T , C14158T , T14178C , T14180C , T14200C , C14281T , G14305A , T14308C , T14311C , T14325C , C14337T , G14364A , T14371C , T14470C , G14476A , T14502C , G14569A , A14605G , C14629T , T14634G , C14668T , A14692G , A14693G , A14696G , A14750G , A14755G , T14783C , A14870G , A14893G , A14914G , A14927G , C14944T , T14971C , T14979C , C14990T , C15022T , C15040T , G15043A , G15047A , A15052G , A15061G , T15067C , T15071C , T15099C , G15106A , G15148A , T15164C , T15184C , G15217A , A15218G , G15221A , C15223T , A15235G , A15236G , A15244G , C15286T , T15299C , G15301A , G15314A , G15323A , C15331A , T15341C , G15346A , G15355A , A15380G , C15402T , A15422G , A15427G , T15440C , C15455T , A15487T , G15497A , C15508T , C15518T , A15524G , C15535T , G15553A , T15586C , T15618C , T15622C , C15632A , A15662G , T15670C , T15697C , A15724G , A15746G , A15758G , A15769C , T15784C , T15787C , A15805G , T15850C , A15851G , A15860G , C15868T , A15874G , G15884A , A15924G , G15927A , G15928A , A15936G , T15940C , T15941C , A15951G , A15954G , T15983C , A16066G , T16086C , T16092C , T16093C , T16102C , C16111T , T16126C , G16129A , T16136C , T16140C , G16145A , A16146G , T16154C , A16160G , A16162G , A16164G , C16167T , C16168T , T16172C , C16174T , C16176T , W16180−95−hvr2 , A16207G , T16209C , A16212G , G16213A , C16214T , A16216G , T16217C , C16218T , C16223T , T16224C , A16227G , T16231C , C16232A , C16234T , A16241G , T16243C , C16245T , T16249C , C16250T , A16254G , C16256T , C16257A , C16259T , C16260T , C16261T , T16263C , A16265G , A16265C , C16266A , C16266T , C16268T , A16269G , T16271C , G16274A , A16275G , C16278T , A16284G , C16286T , C16287T , T16288C , C16290T , C16291T , C16292T , C16292G , C16294T , C16295T , T16297C , T16298C , A16299G , A16300G , T16304C , A16309G , T16311C , A16316G , A16318T , G16319A , C16320T , T16324C , T16325C , C16344T , T16352C , C16355T , T16357C , C16360T , T16362C , T16368C , T16381C , G16390A , A16399G , A16463G , G16470A , G16471A , A16497G , T16519C , G16526A のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、個人識別することを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく個人識別法。
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、T10C , C41T , 42insC , T63C , C64T , G68A , G69A , A93G , G94A , G103A , T131C , G143A , T146C , C150T , C151T , T152C , A153G , A183G , G185A , C194T , T195C , T195A , T199C , A200G , A202G , T204C , G207A , A210G , A214G , G228A , A234G , A235G , A248del , A249G , G260A , A272G , A281G , W303−317hvr1 , T334C , C338T , A373G , C456T , T482C , T489C , G499A , G513A , W514insCA2 , W514delCA2 , C548T , W568Cn−ins , T629C , A663G , T681C , G709A , C752T , C770T , A827G , A856G , G951A , W956Cn−ins , T961C , C983T , C1009T , A1041G , C1048T , T1107C , A1299G , C1310T , A1382C , G1393A , C1405T , G1438A , G1442A , T1520C , G1598A , C1734T , A1736G , 2150Ains , C2218T , A2246G , T2330C , T2416C , T2626C , C2766T , C2772T , G2831A , C2835T , T2857C , G3010A , T3083C , A3145G , C3206T , T3290C , G3316A , T3336C , T3368C , T3372C , T3394C , T3398C , G3421A , G3496T , G3531A , T3535C , A3537G , T3644C , T3645C , C3696T , A3759G , G3882A , C3897T , C3970T , G4048A , C4071T , C4086T , T4117C , C4140T , A4164G , T4209C , T4248C , A4343G , T4386C , A4435G , T4452C , G4491A , C4505T , T4612C , G4655A , G4659A , C4670T , T4705C , A4715G , A4732G , A4793G , G4820A , A4824G , A4833G , C4850T , C4883T , A4895G , A4958G , G4959A , T5021C , T5048C , C5049T , T5108C , A5127G , G5147A , A5153G , C5178A , G5231A , G5261A , C5263T , A5301G , A5319G , A5351G , G5417A , T5442C , G5460A , A5539G , A5582G , C5601T , T5628C , T5655C , G5744A , G5773A , G5821A , G5824A , W5895Cn−ins , A5951G , T5964C , C6005T , G6023A , T6086C , A6146G , T6176C , G6179A , T6185C , T6221C , T6253C , G6261A , A6332G , T6345C , T6392C , T6413C , C6455T , A6494G , T6671C , T6680C , T6719C , A6737G , A6752G , T6827C , G6899A , T6941C , G6962A , A6969G , A7124G , C7196A , T7220C , A7250G , T7319C , T7334C , T7389C , G7600A , T7621C , G7637A , T7684C , T7738C , G7830A , G7853A , G7859A , T7861C , C7867T , C7909T , C7948T , A7960G , T7964C , T8005C , G8020A , G8078A , A8158G , A8188G , T8200C , G8206A , G8251A , W8272−del , A8296G , T8383C , G8392A , C8414T , T8419C , T8450C , A8453G , T8473C , A8479G , A8563G , A8566G , G8584A , C8684T , A8701G , C8727T , T8757C , A8784G , T8793C , C8794T , A8812G , C8829T , G8854A , G8856A , A8923G , A8962G , C8964T , G8989A , G9053A , C9081T , T9090C , T9165C , A9180G , A9242G , C9296T , A9299G , G9329A , C9332T , A9355G , A9377G , A9422T , C9431T , T9495C , C9536T , T9540C , G9548A , G9554A , G9575A , C9711T , T9824C , T9824A , T9833C , T9856C , T9950C , G9962A , A10005G , C10104T , C10181T , C10211T , T10235C , G10310A , G10325A , T10345C , G10373A , A10397G , A10398G , C10400T , T10410C , G10427A , T10463C , C10607T , T10609C , G10646A , G10801A , T10873C , T10915C , C10976T , G11016A , T11017C , A11038G , A11084G , C11146T , G11149A , C11151T , A11167G , G11176A , C11215T , C11389T , T11437C , G11440A , C11536T , C11647T , C11647G , C11665T , G11696A , T11722C , G11914A , T11935C , T11944C , G11963A , G11969A , A12026G , T12091C , C12153T , G12192A , A12234G , T12311C , A12358G , A12361G , G12372A , T12396C , C12405T , G12406A , T12408C , G12501A , C12549T , G12630A , C12633T , T12696C , C12705T , G12771A , T12811C , T12880C , C12882T , A12909G , T12957C , A13050G , A13092G , A13104G , A13105G , G13135A , A13140G , A13152G , A13183G , A13278G , T13461C , G13477A , T13500C , A13563G , T13581C , G13590A , T13602C , A13614G , T13617C , A13651G , G13708A , C13720T , C13737T , G13759A , C13800T , T13819C , A13827G , T13830C , G13928C , A14002G , G14016A , A14091G , C14103A , A14118G , A14148G , C14149T , C14158T , T14178C , T14180C , T14200C , C14281T , T14308C , T14311C , T14325C , C14337T , G14364A , T14371C , T14470C , G14476A , T14502C , G14569A , A14605G , C14668T , A14692G , A14693G , A14696G , A14755G , T14783C , A14870G , A14893G , A14914G , A14927G , C14944T , T14979C , C15022T , C15040T , G15043A , G15047A , A15052G , T15067C , T15071C , T15099C , G15106A , G15148A , T15164C , T15184C , G15217A , A15218G , C15223T , A15235G , A15236G , A15244G , C15286T , G15301A , G15314A , G15323A , C15331A , T15341C , G15355A , A15380G , C15402T , A15422G , T15440C , A15487T , G15497A , C15508T , C15518T , A15524G , C15535T , T15618C , T15622C , A15662G , T15670C , T15697C , A15724G , A15746G , A15769C , T15784C , T15787C , A15805G , T15850C , A15851G , A15860G , C15868T , A15874G , A15924G , G15927A , T15941C , A15951G , A15954G , T16092C , T16093C , C16111T , T16126C , G16129A , T16136C , T16140C , G16145A , A16146G , A16162G , A16164G , C16168T , T16172C , C16174T , C16176T , W16180−95−hvr2 , A16207G , T16209C , G16213A , A16216G , T16217C , C16223T , T16224C , T16231C , C16232A , C16234T , T16243C , C16245T , T16249C , C16256T , C16257A , C16260T , C16261T , T16263C , A16265C , C16266T , C16266A , A16269G , T16271C , G16274A , A16275G , C16278T , A16284G , C16286T , C16290T , C16291T , C16292T , C16292G , C16294T , C16295T , T16297C , T16298C , A16299G , A16300G , T16304C , A16309G , T16311C , A16316G , A16318T , G16319A , T16324C , T16325C , C16344T , C16355T , T16357C , T16362C , T16368C , G16390A , A16399G , A16463G , G16470A , G16471A , A16497G , T16519C , G16526A のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法。
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、T10C , C64T , A93G , G94A , T146C , T152C , C194T , A248del , W303−317hvr1 , T489C , W514insCA2 , W514delCA2 , C752T , W956Cn−ins , T961C , A1041G , T1107C , C1310T , A1382C , G1438A , G1442A , T2626C , C2772T , G3010A , G3316A , C3970T , C4140T , T4386C , G4491A , A4715G , A4793G , C4883T , A4958G , C5178A , A5301G , W5895Cn−ins , T5964C , T6392C , G6962A , C7196A , A7250G , C7867T , G8020A , T8200C , C8414T , T8473C , G8584A , A8701G , A8784G , T8793C , C8964T , G9053A , A9180G , A9242G , C9296T , A9299G , C9536T , T9540C , T9824A , G10310A , A10397G , A10398G , C10400T , T10410C , T10609C , G10646A , T10873C , T11017C , A11084G , C11146T , C11647T , T11722C , G11914A , T11944C , G11963A , A12026G , G12406A , C12549T , C12705T , G12771A , C12882T , A13152G , G13759A , G13928C , T14308C , T14470C , T14502C , A14605G , C14668T , T14783C , T14979C , C15040T , G15043A , T15071C , G15301A , G15323A , G15355A , A15487T , G15497A , A15860G , A15924G , A15954G , T16093C , G16129A , T16172C , C16176T , T16209C , C16223T , C16266A , C16266T , G16274A , C16290T , C16294T , T16304C , A16309G , A16316G , G16319A , T16325C , C16355T , T16362C , G16390A , A16497G のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とする請求項2に記載のヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法。
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、T63C , G69A , G143A , C151T , G185A , G228A , A234G , A249G , A272G , A281G , T334C , C338T , A373G , T482C , G513A , C548T , T629C , C770T , G951A , C983T , C1009T , G1393A , C1405T , T1520C , C1734T , C2218T , A2246G , T2330C , T2416C , C2835T , T2857C , T3083C , A3145G , T3290C , T3368C , T3372C , T3398C , G3421A , G3531A , T3535C , T3645C , C3696T , A3759G , G3882A , C3897T , C4086T , A4435G , T4452C , C4505T , T4612C , G4659A , C4670T , T4705C , C4850T , G4959A , T5021C , C5049T , A5127G , G5261A , C5263T , T5442C , A5582G , T5628C , T5655C , G5821A , G5824A , A5951G , T6086C , A6146G , T6176C , G6179A , T6221C , G6261A , A6332G , T6345C , A6494G , T6671C , T6719C , A6737G , T6827C , G6899A , T6941C , A6969G , A7124G , T7220C , T7319C , T7334C , T7389C , T7621C , G7637A , T7738C , G7830A , G7859A , T7861C , C7909T , C7948T , A7960G , T7964C , T8005C , G8078A , A8158G , A8188G , A8296G , G8392A , T8450C , A8453G , A8479G , A8566G , C8684T , C8727T , T8757C , A8812G , G8854A , A8923G , A8962G , G8989A , C9081T , T9165C , G9329A , C9332T , A9355G , A9422T , T9495C , G9548A , G9554A , C9711T , T9833C , T9856C , A10005G , C10211T , G10325A , G10427A , T10463C , A11038G , G11176A , C11389T , G11440A , C11647G , C11665T , T11935C , G11969A , T12091C , C12153T , G12192A , A12234G , T12311C , T12396C , T12408C , G12630A , T12696C , A12909G , T12957C , A13050G , A13092G , A13105G , A13140G , T13461C , T13500C , T13581C , T13602C , A13614G , T13617C , A13651G , C13720T , C13737T , C13800T , T13819C , A13827G , T13830C , A14002G , G14016A , A14091G , C14103A , A14118G , A14148G , T14178C , T14180C , C14281T , T14311C , C14337T , T14371C , A14696G , A14755G , A14870G , A14914G , A14927G , C15022T , G15047A , A15052G , T15099C , G15106A , G15148A , T15164C , T15184C , G15217A , A15218G , C15286T , G15314A , T15341C , A15380G , C15402T , A15422G , T15618C , T15622C , T15670C , T15697C , A15746G , A15769C , T15787C , A15805G , C15868T , T16126C , A16146G , A16162G , C16168T , A16207G , G16213A , A16216G , T16263C , A16269G , T16271C , A16275G , C16286T , C16292G , C16295T , A16299G , A16300G , A16318T , T16368C , G16470A , G16471A , G16526A のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とする請求項2に記載のヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法。
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、 T131C , C150T , T195C , T195A , T199C , A200G , A202G , T204C , G207A , G499A , W568Cn−ins , G709A , A827G , A856G , G1598A , C2766T , G2831A , T3394C , T3644C , G4048A , C4071T , T4117C , A4164G , A4343G , G4820A , A4895G , T5108C , G5231A , A5351G , G5417A , G5460A , C5601T , G5744A , G5773A , G6023A , T6253C , T6413C , C6455T , T6680C , G7600A , T7684C , G7853A , G8206A , G8251A , W8272−del , T8419C , C8829T , A9377G , G9575A , T9824C , T9950C , G9962A , T10345C , G10373A , C10607T , G10801A , T10915C , G11016A , C11536T , A12358G , A12361G , G12372A , C12405T , G12501A , T12811C , T12880C , A13104G , A13183G , A13563G , G13590A , G13708A , T14200C , G14569A , A14692G , A14893G , C14944T , C15223T , A15236G , C15508T , C15518T , C15535T , A15662G , T15850C , A15851G , A15874G , G15927A , T15941C , C16111T , T16136C , T16140C , G16145A , C16174T , W16180−95−hvr2 , T16217C , T16224C , C16234T , T16243C , C16245T , C16256T , C16257A , C16261T , A16265C , C16278T , A16284G , C16292T , T16297C , T16311C , A16399G , A16463G , T16519C のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法。
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、65insG , G75A , A189G , G203A , G255A , T279C , 285insA , T318C , G322A , C345T , A384G , C431T , C481T , G545A , T593C , C702T , A814G , T1119C , T1189C , G1303A , T1391C , C1508T , G1664A , T1766C , T1819C , T1822C , G1888A , A1892G , A1978G , G2056A , C2079T , A2223G , G2361A , A2550T , G2706A , T2887C , 3167Cins , A3221G , G3337A , T3338C , A3395G , C3497T , T3504C , T3593C , A3744G , T3786C , T3801C , A3816G , G3915A , A3981G , C4025T , G4113A , A4129G , C4161T , C4186T , C4538T , C4625T , A4704C , C4712T , T4859C , T4907C , G4991A , C5178T , G5237A , A5441G , T5465C , G5585A , A5592G , G5777A , C5899T , G6260A , C6410T , A6503C , C6551T , A6599G , T6620C , C6689T , C6713T , T6956C , A7083G , A7091G , T7270C , A7364G , G7664A , A7673G , G7757A , G7789A , A7822G , G8075A , A8149G , T8167C , A8435G , T8614C , C8628T , G8669C , G8764A , C8844T , A8894T , A8919G , G8950A , C8991T , C9004T , T9117C , G9123A , G9182A , A9197G , A9254G , A9410G , G9477A , T9479C , T9498C , T9661C , A9664T , G9713A , C9851T , G9932A , T9938C , T9977C , T10084C , A10103G , T10238C , A10411G , T10454C , G10685A , T10790C , T10907C , T11009C , A11092G , A11101G , T11147C , T11253C , T11255C , T11569C , C11668T , T11701C , A11746G , A11959G , A12033G , C12085T , A12172G , A12280G , T12354C , C12360T , A12451G , A12612G , C12853T , C13029T , A13083T , T13143C , A13221G , T13437C , A13512G , A13527G , A13629G , C13855T , A13857G , T13879C , A13887G , C13934T , G13968A , C14003T , C14052T , T14063C , A14133G , C14142T , G14305A , C14629T , T14634G , A14750G , T14971C , C14990T , A15061G , G15221A , T15299C , G15346A , A15427G , C15455T , G15553A , T15586C , C15632A , A15758G , G15884A , G15928A , A15936G , T15940C , T15983C , A16066G , T16086C , T16102C , T16154C , A16160G , C16167T , A16212G , C16214T , C16218T , A16227G , A16241G , C16250T , A16254G , C16259T , A16265G , C16268T , C16287T , T16288C , C16320T , T16352C , C16360T , T16381Cのうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、その者が糖尿病となるか否かについての判断資料を与えることを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法。
- ヒトミトコンドリアDNAにおいて、hvr1−303−317、CA−514−523、C1−568−573、12S rRNA−956−965、C2−5895−5899、9−bp del/ins−8272−8289、hvr2−16180−16195のうちの少なくとも一つ、または二つ以上の塩基の変異に基づいて、個人識別することを特徴とするヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく個人識別法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003095199A JP2004298085A (ja) | 2003-03-31 | 2003-03-31 | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003095199A JP2004298085A (ja) | 2003-03-31 | 2003-03-31 | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2004298085A true JP2004298085A (ja) | 2004-10-28 |
Family
ID=33407579
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2003095199A Pending JP2004298085A (ja) | 2003-03-31 | 2003-03-31 | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP2004298085A (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1769089A2 (en) * | 2004-03-29 | 2007-04-04 | The Regents of the University of California | Methods and compositions for pre-symptomatic or post-symptomatic diagnosis of alzheimer's disease and other neurodegenerative disorders |
-
2003
- 2003-03-31 JP JP2003095199A patent/JP2004298085A/ja active Pending
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1769089A2 (en) * | 2004-03-29 | 2007-04-04 | The Regents of the University of California | Methods and compositions for pre-symptomatic or post-symptomatic diagnosis of alzheimer's disease and other neurodegenerative disorders |
EP1769089A4 (en) * | 2004-03-29 | 2009-04-15 | Univ California | METHODS AND COMPOSITIONS FOR PRE-SYMPTOMATIC OR POST-SYMPTOMATIC DIAGNOSIS OF ALZHEIMER'S DISEASE AND OTHER NEURODEGENERATIVE DISORDERS |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN106119363B (zh) | 用于抗结核药物肝损伤易感基因型检测的snp组合、检测方法和试剂盒 | |
WO2012114075A1 (en) | Method for processing maternal and fetal dna | |
JP6346557B2 (ja) | Hla−a*31:01アレルの検出方法 | |
Farkas et al. | The suitability of matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry in a laboratory developed test using cystic fibrosis carrier screening as a model | |
TWI567202B (zh) | 檢測酒精代謝基因之方法及套組 | |
CA3074244A1 (en) | Method to confirm variants in ngs panel testing by snp genotyping | |
JP2004298085A (ja) | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 | |
CN110029162B (zh) | 一种用于检测系统性红斑狼疮易感性位于非编码基因区的snp标志物及其应用 | |
JP2004298086A (ja) | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 | |
JP4491276B2 (ja) | 標的dna配列において一塩基変異多型の存在を検出する方法及びキット | |
JP6233022B2 (ja) | Hla−a*24グループの判定方法 | |
JP5866669B2 (ja) | 乳がん発症感受性の判定方法 | |
Zhu et al. | Genetic analysis of STR markers on chromosome 21 in a Han population from southeast China | |
JP2004321041A (ja) | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 | |
JP2005000044A (ja) | ヒトミトコンドリア遺伝子変異に基づく遺伝子検出法 | |
JP6245796B2 (ja) | 原発性胆汁性肝硬変の発症リスク予測マーカー、プローブ、プライマー及びキット並びに原発性胆汁性肝硬変の発症リスク予測方法 | |
US7226742B2 (en) | Method for detecting base mutation | |
KR102511596B1 (ko) | 단일염기다형성을 이용한 안지오텐신 전환효소억제제 이상반응 진단용 조성물 및 이를 이용한 방법 | |
CN110423808B (zh) | 何首乌所致肝损伤snp位点以及在疾病预测与诊断中的应用 | |
KR102156699B1 (ko) | 소음인 판별용 조성물 | |
CN109694911B (zh) | 一种原发性开角型青光眼的筛查试剂盒 | |
KR101881817B1 (ko) | 운동 반응도 예측용 바이오마커 | |
KR101881812B1 (ko) | 운동 반응도 예측용 바이오마커 | |
KR101881809B1 (ko) | 운동 반응도 예측용 바이오마커 | |
KR101899235B1 (ko) | 한국인의 주의력결핍 과잉행동장애 진단을 위한 프라이머 세트, 이를 포함하는 진단용 키트, 및 이를 이용한 한국인의 주의력결핍 과잉행동장애 위험도 예측 방법 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20050111 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20050314 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20050927 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Effective date: 20070810 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 |
|
A521 | Written amendment |
Effective date: 20070810 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 |