JP2003507042A - ヒト前立腺癌において発現されるc型レクチン膜貫通抗原およびその使用 - Google Patents

ヒト前立腺癌において発現されるc型レクチン膜貫通抗原およびその使用

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Abstract

(57)【要約】 前立腺癌において高度に過剰発現される新規な遺伝子(PC−LECTINと命名)が、記載される。そしてその遺伝子にコードされるタンパク質が、記載される。正常なヒト組織におけるPC−LECTINは、精巣に制限される。しかし、PC−LECTINは、前立腺癌において高度に発現される。結果的に、PC−LECTINは、前立腺癌についての診断標的を提供し、そして/またはPC−LECTINは、前立腺癌についての治療標的を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 本出願は、米国仮特許出願第60/148,935号(1999年8月12日
出願)に対して優先権を主張し、この仮出願の全体が本明細書において参考とし
て援用される。
【0002】 (発明の分野) 本明細書に記載される発明は、新規な遺伝子およびそのコードされたタンパク
質であってPC−LECTINと呼ばれるもの、およびPC−LECTINを発
現する種々の癌(特に、前立腺癌)の管理において有用である診断および治療の
方法および組成物に関する。
【0003】 (発明の背景) 癌は、冠状動脈疾患に次いで2番目の、ヒトの死の主たる原因である。世界中
で何百万の人々が毎年癌で死ぬ。米国のみに限っては、癌は、毎年50万人を優
に超える人々の死を引き起こし、140万程の新たな症例が毎年診断されている
。心臓疾患からの死が有意に減少してきている一方、癌による死は、概して上昇
傾向にある。次の世紀の初期には、癌は、死の主たる原因になることが予想され
る。
【0004】 世界中で、いくつかの癌が主たる死の原因として突出している。特に、肺癌、
前立腺癌、乳癌、結腸癌、膵臓癌、および卵巣癌は、癌による死の主な原因の代
表である。これらおよび実質的に全ての他の癌は、共通の致死的特徴を共有する
。非常に数少ない例外はあるが、癌に由来する転移性の疾患は、致死的である。
さらに、最初にそれらの原発性の癌を生き延びた癌患者についてさえも、それら
の生存は劇的に変更されることは、一般的な経験が示している。多くの癌患者は
、再発または処置の失敗の可能性を知っていることによりかき立てられる強力な
不安を経験する。多くの癌患者は、処置後に身体的な衰弱を経験する。多くの癌
患者は、再発を経験する。
【0005】 世界中で、前立腺癌は、男性において4番目に最も蔓延している癌である。こ
れは、北アメリカおよび北ヨーロッパにおいて、これまでに最も一般的な男性の
癌であり、そして男性における癌による死の第2位のリーディングケースである
。合衆国単独において、40,000人を優に超える男性が、毎年この疾患によ
り死亡しており、肺癌に続く2番目である。これらの数字の大きさにも関わらず
、転移性の前立腺癌のための効果的な処置はいまだにない。外科的な前立腺切除
、放射線療法、ホルモン切除治療、および化学療法は、主たる治療態様であり続
けている。不運にも、これらの処置は、多くの人にとって効果が無く、そしてし
ばしば所望でない結果に関連している。
【0006】 診断の領域において、初期段階局在化腫瘍を正確に検出し得る前立腺癌マーカ
ーの欠如は、この疾患の管理を依然として有意に制限するものである。血清PS
Aアッセイは、非常に有用な道具であったが、その特異性および一般的な有用性
は、広汎に、いくつかの重要な局面における欠如としてみなされている。
【0007】 前立腺癌のさらなる特異的なマーカーを同定するにおける進展は、マウスにお
けるその疾患の異なる段階を再び捕捉し得る前立腺癌異種移植片の生成によって
改善されている。LAPC(Los Angeles Prostate Ca
ncer)異種移植片は、重篤な組み合わせ免疫不全(SCID)マウスにおけ
る継代を生存した前立腺癌異種移植片であり、そして疾患の進行(アンドロゲン
依存性からアンドロゲン非依存性への転移および転移病変の発症を含む)を模倣
する能力を示している(Kleinら、1997,Nat.Med.3:402
)。より最近に同定された前立腺癌マーカーには、PCTA−1(Suら、19
96,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:7252)、前
立腺幹細胞抗原(PSCA)(Reiterら、1998,Proc.Natl
.Acad.Sci.USA 95:1735)、およびSTEAP(Hube
rtら、1999,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 96:1
4523)が含まれる。
【0008】 以前に同定されたマーカー(例えば、PSA、PSM、PCTA、およびPS
CA)は、前立腺癌を診断および処置する努力を促進してきた一方、診断および
治療をさらに改善するために、前立腺癌および関連する癌についてのさらなるマ
ーカーおよび治療標的を同定する必要性が存在する。
【0009】 (発明の要旨) 本発明は、一般に、ヒト前立腺癌において発現される新規な膜貫通抗原(PC
−LECTINと命名する)に関する。PC−LECTIN抗原は、C型レクチ
ンタンパク質のメンバーであるハムスターライリン(layilin)(Bor
owskyおよびHynes,J.Cell Biol.143:429−42
、1998)に構造的に関連する。しかし、PC−LECTINは、ライリンに
見出される機能的タリン会合ドメインを含有せず、それゆえ、異なるかまたは改
変された機能を有するようである。PC−LECTINの構造的特徴により、そ
れは、細胞外N−末端および細胞内C末端を有する1a型膜貫通タンパク質とし
て同定される。さらに、PC−LECTIN遺伝子産物は、N末端シグナル配列
を含有する。PC−LECTINタンパク質の膜貫通位相幾何学はまた、実験的
に確立されている。
【0010】 正常ヒト組織におけるPC−LECTIN遺伝子発現の分布は、正常精巣に高
度に制限されている。ヒト前立腺癌において、PC−LECTIN遺伝子は、高
度に過剰発現される。なぜなら、検出可能なこの遺伝子の発現が正常前立腺にお
いて生じるからである。したがって、PC−LECTIN遺伝子は、前立腺癌抗
原をコードし、これは、診断および/または予防マーカーとして有用であり、お
よび/または種々の治療アプローチ(例えば、抗体、ワクチン、および低分子治
療)のための優れた標的として作用し得る。
【0011】 機能的に、PC−LECTINは、侵襲、接着、マーカー移動に関与し得る。
PC−LECTIN抗原は、レクチンのように、糖部分に結合し、治療的アプロ
ーチのためのさらなる可能性を開く。1つのアプローチにおいて、糖質分子は、
PC−LECTIN生物学的活性を阻害するために使用され得る。精巣の免疫寛
容組織(血液精巣関門が存在する)に限定されたPC−LECTINの発現は、
免疫学的治療ストラテジーおよびその他のPC−LECTIN特異的治療ストラ
テジー(例えば、糖質阻害)のネガティブなバックグラウンド効果が最少である
ことを示唆する。高レベルの発現が前立腺癌において観察された場合、PC−L
ECTINはまた、他のヒト癌において発現されることが可能であり、その限り
において、同様にそのような他の癌の診断および/または予防マーカーとして有
用であり得、および/またはこのような他の癌の処置のための腫瘍抗原標的とし
て機能し得る。PC−LECTINはまた、いくつかの公知のレセプター(L−
セレクチンを含む)において観察されているように、リガンドの結合または活性
化後に血清中に流出し得(総説については、Tedderら、1991,Am.
J.Respir.Cell.Mol.Biol.5:305−306を参照の
こと)、それにより血清の検出および関連する診断法に対する可能性を開く。P
C−LECTINのバックグラウンドレベルは、血液精巣関門、および他の正常
組織での発現の不在に鑑みて、低いかまたは存在しないことが予想され、これは
、血清中でのPC−LECTINの検出が、腫瘍の存在と特異的に相関すること
を示唆する。
【0012】 本発明は、好ましくは、単離された形態の、PC−LECTIN遺伝子、mR
NA、および/またはコード配列の全てまたは一部に対応するかまたはそれに相
補的であるポリヌクレオチド(PC−LECTINタンパク質をコードするポリ
ヌクレオチド、そのフラグメント、DNA、RNA、DNA/RNAハイブリッ
ド、および関連する分子、PC−LECTIN遺伝子またはmRNA配列または
その一部に相補的なポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド、ならびにPC
−LECTIN遺伝子、mRNA、またはPC−LECTINコードポリヌクレ
オチドにハイブリダイズするポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドを含む
)を提供する。PC−LECTINをコードするcDNAおよび遺伝子を単離す
るための手段もまた提供される。PC−LECTINポリヌクレオチドを含有す
る組換えDNA分子、このような分子で形質転換された細胞または形質導入され
た細胞、ならびにPC−LECTIN遺伝子産物の発現のための宿主ベクター系
もまた提供される。
【0013】 本発明はさらに、PC−LECTINタンパク質およびそのポリペプチドフラ
グメント、ならびにPC−LECTINタンパク質およびそのポリペプチドフラ
グメントに結合する抗体を提供する。本発明の抗体には、ポリクローナル抗体お
よびモノクローナル抗体、ネズミおよびその他の哺乳動物抗体、キメラ抗体、ヒ
ト化抗体および完全にヒトの抗体、検出可能なマーカーで標識された抗体、放射
性核種、トキシン、その他の治療組成物に結合体化された抗体が含まれる。
【0014】 本発明はさらに、種々の生物学的サンプル中のPC−LECTINポリヌクレ
オチドおよびタンパク質の存在を検出するための方法、ならびにPC−LECT
INを発現する細胞を同定するための方法を提供する。本発明はさらに、前立腺
癌を処置するための種々の治療組成物およびストラテジー(特に、抗体、ワクチ
ン、および低分子治療を含む)を提供する。
【0015】 (発明の詳細な説明) 本発明は、PC−LECTINと命名された新規な膜貫通抗原を提供する。こ
れは、前立腺癌において過剰発現され、そしてタンパク質のC型レクチンファミ
リーのメンバーである。正常成体組織における発現は、精巣に限定される。発現
は、前立腺癌異種移植片において見出され、アンドロゲン依存性前立腺癌異種移
植片においてより高レベルであり、そしてアンドロゲン依存性異種移植片におい
てより低レベルである。この発現パターンは、前立腺癌におけるPC−LECT
IN発現が、アンドロゲンの存在に依存していることを示唆する。PC−LEC
TINはまた、レクチンコンカナバリンAに観察されるものと類似の糖質結合特
異性を示す。
【0016】 そうでないと規定されない限り、本明細書に使用される当該分野の全ての用語
、表記法、およびその他の化学的用語法は、本発明が属する分野の当業者によっ
て一般に理解される意味を有することが意図される。いくつかの場合には、一般
的に理解される意味を有する用語は、明確さおよび/または容易な参照のために
本明細書において定義され、そしてそのような定義を本明細書に含ませることは
、当該分野で一般に理解されるものに対する実質的な差異を表すものと必ずしも
解釈されべきではない。本明細書において記載されそして参照される技術および
手順は、一般に、十分に理解されており、そして当業者によって従来の方法(例
えば、Sambrookら、Molecular Cloning:A Lab
oratory Manual 第2版(1989)Cold Spring
Harbor Laboratory Press,Cold Spring
Harbor,N.Y.に記載される広汎に利用される分子クローニング法)を
使用して一般に利用される。適切であれば、市販されるキットおよび試薬の使用
を含む手順は、そうでないと注記されない限り、一般に、製造業者によって規定
されるプロトコルおよび/またはパラメータに従って行われる。
【0017】 本明細書中で使用される場合、用語「進行した前立腺癌」、「局所的に進行し
た前立腺癌」、「進行した疾患」、および「局所的に進行した疾患」は、前立腺
嚢(prostate capsule)を通して拡張した前立腺癌を意味し、
そしてアメリカ泌尿器科協会(AUA)システムにおけるC段階の疾患、Whi
tmore−JewettシステムにおいてC1−C2段階の疾患、およびTN
M(腫瘍、結節、転移)システムにおいてT3−T4段階およびN+の疾患を含
むことを意味する。一般に、外科は、局所的に進行した疾患を有する患者にとっ
て推奨されておらず、そしてこれらの患者は、臨床的に局在化した(器官に限定
された)前立腺癌を有する患者と比較して実質的により有利でない結果を有する
。局所的に進行した疾患は、前立腺の側縁を超えての誘導または前立腺のベース
を超えての非対称もしくは誘導の明白な証拠によって臨床的に同定される。局所
的に進行した前立腺癌は、腫瘍が前立腺嚢を侵襲または貫通し、外科的余地に拡
張するか、または精嚢を侵襲した場合、現在、過激な前立腺削除後に病理学的に
診断される。
【0018】 本発明において使用される場合、用語「転移性前立腺癌」および「転移性疾患
」は、領域性のリンパ節または離れた部位に広がっている前立腺癌を意味し、そ
してAUAシステム下でのD段階の疾患およびTNMシステム下でのTxNxM
+段階を含むことを意味する。局所的に進行した前立腺癌の場合と同様に、外科
手術は、一般的に、転移性疾患を有する患者のために指示されておらず、そして
体液性(アンドロゲン切除)治療は、好ましい処置態様である。転移性の前立腺
癌を有する患者は、最終的には、処置の開始後12〜18ヶ月内にアンドロゲン
抵抗性の状態を発症し、そしてこれらの患者の約半分がその後6ヶ月以内に死亡
する。前立腺癌転移についての最も一般的な部位は、骨である。前立腺癌の骨転
移は、全てを考慮して、特徴的には、溶骨性であるというよりむしろ造骨細胞的
である(正味の骨形成を生じる)。骨転移は、脊椎において最も頻繁に見出され
、続いて大腿、骨盤、胸郭、頭蓋骨、および上腕骨である。転移についての他の
一般的な部位には、リンパ節、肺、肝臓、および脳が含まれる。転移性前立腺癌
は、代表的には、オープンまたは腹腔鏡検査胎盤リンパ節切除、全身放射核種ス
キャン、骨格ラジオグラフィー、および/または骨病変生検によって診断される
【0019】 本明細書において使用される場合、用語「ポリヌクレオチド」は、リボヌクレ
オチドもしくはデオキシリボヌクレオチドのいずれかまたはいずれかの型のヌク
レオチドの改変された形態の、少なくとも10塩基または塩基対長のヌクレオチ
ドのポリマー形態を意味し、そしてDNAの一本鎖および二本鎖の形態を含むこ
とを意味する。
【0020】 本明細書において使用される場合、用語「ポリペプチド」は、少なくとも10
個のアミノ酸のポリマーを意味する。本明細書の全体を通じて、アミノ酸につい
ての標準的な3文字または1文字標記が使用される。
【0021】 本明細書で使用される場合、ポリヌクレオチドの状況で使用される用語「ハイ
ブリダイズ(hybridize)」、「ハイブリダイズする(hybridi
zing)」、「ハイブリダイズする(hybridizes)」などは、従来
のハイブリダイゼーション条件、好ましくは、例えば、50%ホルミルアミド/
6×SSC/0.1%SDS/100μg/ml ssDNA中でのハイブリダ
イゼーション(ここで、ハイブリダイゼーションの温度は、37℃を超え、そし
て0.1×SSC/0.1%SSC/0.1%SDSにおける洗浄についての温
度は55℃を超える)、そして最も好ましくは、ストリンジェントなハイブリダ
イゼーション条件をいうことを意味する。
【0022】 ハイブリダイゼーション反応の「ストリンジェンシー」は、当業者によって容
易に決定可能であり、そして一般に、プローブ長、洗浄温度、および塩濃度に依
存する経験的な計算である。一般に、より長いプローブは、適切なアニーリング
のためにより高い温度を必要とする一方、より短いプローブは、より低い温度を
必要とする。ハイブリダイゼーションは、一般に、相補的な鎖が、溶融温度より
低い環境に存在する場合、再アニーリングする変性したDNAの能力に依存する
。プローブとハイブリダイズ可能な配列との間の所望の相同性の程度が高いほど
、使用され得る相対的な温度は高くなる。結果として、より高い相対的温度は、
よりストリンジェントな反応条件を作成する傾向がある一方、より低い温度はそ
のような傾向は少ない。ハイブリダイゼーション反応のストリンジェンシーのさ
らなる詳細および説明については、Ausubelら、Current Pro
tocols in Molecular Biology,Wiley In
terscience Publishers(1995)を参照のこと。 本明細書中に規定される場合、「ストリンジェントな条件」または「高ストリ
ンジェンシー条件」は、以下の条件によって同定され得る:(1)洗浄のために
低いイオン強度および高い温度を使用する条件(例えば、0.015M 塩化ナ
トリウム/0.0015M クエン酸ナトリウム/0.1%ドデシル硫酸ナトリ
ウム、50℃);(2)ハイブリダイゼーションの間に変性剤(例えば、ホルム
アミド)を使用する条件(例えば、50%(v/v)ホルムアミドおよび0.1
%ウシ血清アルブミン/0.1%Ficoll/0.1%ポリビニルピロリドン
/50mM リン酸ナトリウム緩衝液(pH 6.5)および750mM 塩化
ナトリウム、75mM クエン酸ナトリウム、42℃);または(3)50%ホ
ルムアミド、5×SSC(0.75M NaCl、0.075M クエン酸ナト
リウム)、50mM リン酸ナトリウム(pH 6.8)、0.1%ピロリン酸
ナトリウム、5×Denhardt’s溶液、超音波処理したサケ精子DNA(
50μg/ml)、0.1%SDS、および10%硫酸デキストラン、42℃、
さらに以下の洗浄工程、42℃において0.2×SSC(塩化ナトリウム/クエ
ン酸ナトリウム)および50%ホルムアミド、55℃、続いて、高ストリンジェ
ンシー洗浄(EDTAを含む0.1×SSCからなる、55℃)を使用する条件
【0023】 「中程度にストリンジェントな条件」は、Sambrookら、Molecu
lar Cloning:A Laboratory Manual,New
York:Cold Spring Harbor Press,1989によ
って記載されたように同定され得、そして洗浄溶液およびハイブリダイゼーショ
ン条件(例えば、温度、イオン強度、およびSDS)の使用を含む。これは、上
記に記載されたものよりもよりストリンジェントではない。中程度にストリンジ
ェントな条件の例は、以下を含む溶液中での37℃、一晩のインキュベーション
である:20%ホルムアミド、5×SSC(150mM NaCl、15mM
クエン酸三ナトリウム)、50mM リン酸ナトリウム(pH7.6)、5×D
enhardt’s溶液、10% 硫酸デキストラン、および20mg/ml変
性剪断サケ精子DNA、続いて約37℃〜50℃で1×SSC中でフィルターを
洗浄する。当業者は、温度、イオン強度などを、因子(例えば、プローブ長など
)を適応させるのに必要なように調整する方法を認識する。
【0024】 アミノ酸比較の状況において、用語「同一性」は、同一である同じ相対的位置
のアミノ酸残基のパーセンテージを表現するために使用される。この状況におい
てはまた、用語「相同性」は、BLAST分析の保存性アミノ酸の判断基準を使
用して、当該分野において一般的に理解されるように、同一であるかまたは類似
であるかのいずれかである、同じ相対位置でのアミノ酸残基のパーセンテージを
表現するために使用される。例えば、同一性%の値は、WU−BLAST−2(
Altschulら、Methods in Enzymology,266:
460−480(1996);http://blast.wustl/edu
/blast/README.html)によって生成され得る。アミノ酸置換
(これは、このような判断基準の下では保存性であると見なされる)に関するさ
らなる詳細は以下に提供される。
【0025】 さらなる定義が、引き続くサブセクションを通して提供される。
【0026】 (PC−LECTINポリヌクレオチド) 本発明の一つの局面は、PC−LECTIN遺伝子、mRNAおよび/または
コード配列(好ましくは、PC−LECTINタンパク質およびそのフラグメン
ト、DNA、RNA、DNA/RNAハイブリッドならびに関連分子をコードす
るポリヌクレオチド、PC−LECTIN遺伝子もしくはmRNA配列またはそ
の一部分に相補的な、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド、ならびにP
C−LECTIN遺伝子、mRNAもしくはPC−LECTINをコードするポ
リヌクレオチド(集合的に、「PC−LECTINポリヌクレオチド」)にハイ
ブリダイズする、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドを含む単離形態に
おける)のすべてもしくは一部分に対応するか、またはそのすべてもしくは一部
分に相補的なポリヌクレオチドを提供する。本明細書中で使用される場合、PC
−LECTIN遺伝子およびタンパク質は、本明細書中で具体的に記載されるP
C−LECTIN遺伝子およびタンパク質、ならびに他のPC−LECTINタ
ンパク質および前述の構造的に類似の改変体に対応する、遺伝子およびタンパク
質を含むことが意味される。このような他のPC−LECTINタンパク質およ
び改変体は、一般的に、PC−LECTINコード配列に高度に相同なコード配
列を有し、そして好ましくは、少なくとも約50%のアミノ酸同一性、そして少
なくとも約60%のアミノ酸相同性を共有し(BLAST標準を使用して)、よ
り好ましくは、70%以上の相同性を共有する(BLAST標準を使用して)。
【0027】 PC−LECTINポリヌクレオチドの1つの実施形態は、図1A〜1D(配
列番号1)に示される配列を有するPC−LECTINポリヌクレオチドである
。PC−LECTINポリヌクレオチドは、図1A〜1D(配列番号1)に示さ
れるようなヒトPC−LECTINのヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチ
ド(ここで、Tはまた、Uであり得る);PC−LECTINタンパク質のすべ
てまたは一部分をコードするポリヌクレオチド;前述のポリヌクレオチドに相補
的な配列;あるいは前述のうちのいずれかのポリヌクレオチドフラグメントを含
み得る。別の実施形態は、図1A〜1D(配列番号1)に示されるような、ヌク
レオチド残基番号380〜ヌクレオチド残基番号1201の配列、ヌクレオチド
残基番号443〜ヌクレオチド残基番号1018、またはヌクレオチド残基番号
443〜ヌクレオチド残基番号1201の配列を有するポリヌクレオチドを含み
、ここで、Tはまた、Uであり得る。別の実施形態は、配列が、America
n Type Culture Collectionに登録番号207152
として1999年3月10日に寄託された、プラスミドp58P1D12−2に
含まれるcDNAによってコードされる、PC−LECTINポリペプチドをコ
ードするポリヌクレオチドを含む。別の実施形態は、ストリンジェントなハイブ
リダイゼーション条件下で、図1A〜1D(配列番号1)に示されるヒトPC−
LECTIN cDNA、またはそのポリヌクレオチドフラグメントにハイブリ
ダイズし得るポリヌクレオチドを含む。
【0028】 本明細書中で開示される本発明の代表的な実施形態は、PC−LECTIN
mRNA配列の特定の一部分をコードするPC−LECTINポリヌクレオチド
(例えば、タンパク質およびそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド)
を含む。例えば、本明細書中で開示される本発明の代表的な実施形態は、以下を
含む:図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質の
およそアミノ酸1〜およそアミノ酸10をコードするポリヌクレオチド、図1A
〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質のおよそアミノ
酸20〜およそアミノ酸30をコードするポリヌクレオチド、図1A〜1D(配
列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質のおよそアミノ酸30〜お
よそアミノ酸40をコードするポリヌクレオチド、図1A〜1D(配列番号2)
に示されるPC−LECTINタンパク質のおよそアミノ酸40〜およそアミノ
酸50をコードするポリヌクレオチド、図1A〜1D(配列番号2)に示される
PC−LECTINタンパク質のおよそアミノ酸50〜およそアミノ酸60をコ
ードするポリヌクレオチド、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LE
CTINタンパク質のおよそアミノ酸60〜およそアミノ酸70をコードするポ
リヌクレオチド、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタ
ンパク質のおよそアミノ酸70〜およそアミノ酸80をコードするポリヌクレオ
チド、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質の
およそアミノ酸80〜およそアミノ酸90をコードするポリヌクレオチド、およ
び図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質のおよ
そアミノ酸90〜およそアミノ酸100をコードするポリヌクレオチドなど。こ
のスキームの後、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタ
ンパク質のアミノ酸100〜273のアミノ酸配列の一部分をコードするポリヌ
クレオチド(少なくとも10アミノ酸の)は、本発明の代表的な実施形態である
。PC−LECTINタンパク質のより大きな部分をコードするポリヌクレオチ
ドがまた意図される。例えば、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−L
ECTINタンパク質のおよそアミノ酸1(または20、または30、または4
0など)〜およそアミノ酸20(または30、または40、または50など)を
コードするポリヌクレオチドは、当該分野で周知の種々の技術によって生成され
得る。
【0029】 本明細書中で開示される本発明のさらなる例示的な実施形態は、PC−LEC
TINタンパク質配列内に含まれる、1つ以上の生物学的モチーフをコードする
PC−LECTINポリヌクレオチドフラグメントを含む。1つの実施形態にお
いて、本発明の代表的なポリヌクレオチドフラグメントは、ハムスターレイリン
(layilin)との相同性を示すPC−LECTINの1つ以上の領域をコ
ードし得る。本発明の別の実施形態において、代表的なポリヌクレオチドフラグ
メントは、PC−LECTINタンパク質およびポリペプチドを議論する以の本
文において非常に詳細に開示されるように、PC−LECTIN C型レクチン
ドメインまたは膜貫通ドメインの1つ以上をコードし得る。本発明のさらに別の
実施形態において、代表的なポリヌクレオチドフラグメントは、1つ以上のPC
−LECTIN選択的スプライシング改変体に独特である配列をコードし得る。
【0030】 前述の段落のポリヌクレオチドは、多くの異なる特定の使用を有する。PC−
LECTINは、前立腺癌において過剰発現されることが示されるので、これら
のポリヌクレオチドは、正常な組織対癌性組織におけるPC−LECTIN遺伝
子産物の状態を評価する方法において使用され得る。代表的には、PC−LEC
TINタンパク質の特定の領域をコードするポリヌクレオチドが使用されて、P
C−LECTIN遺伝子産物の特定の領域(膜貫通ドメインを含むような領域)
において、混乱状態(例えば、欠失、挿入、点変異など)の存在を評価し得る。
例示的なアッセイは、RT−PCRアッセイ、ならびに一本鎖高次構造多型(S
SCP)分析(例えば、Marrogiら、J.Cutan.Pathol.2
6(8):369−378(1999)を参照のこと)の両方を含み、これらの
両方は、タンパク質の特定の領域をコードするポリヌクレオチドを利用して、タ
ンパク質内のこれらの領域を試験する。
【0031】 本明細書中で開示される本発明の他の具体的に意図された実施形態は、ゲノム
DNA、cDNA、リボザイムおよびアンチセンス分子、ならびに天然の供給源
または合成由来にせよ、代替の骨格に基づくか、または代替の塩基を含む核酸分
子である。例えば、アンチセンス分子は、RNA、あるいは他の分子(ペプチド
核酸(PNA)または塩基対依存様式でDNAもしくはRNAに特異的に結合す
る非核酸分子(例えば、ホスホロチオエート誘導体)を含む)であり得る。当業
者は、PC−LECTINポリヌクレオチドおよび本明細書中で開示されるポリ
ヌクレオチド配列を使用して、核酸分子のこれらのクラスを容易に獲得し得る。
【0032】 アンチセンス技術は、細胞内部に位置する標的ポリヌクレオチドに結合する外
因性オリゴヌクレオチドの投与を必然的に伴う。用語「アンチセンス」は、この
ようなオリゴヌクレオチドが、その細胞内標的(例えば、PC−LECTIN)
に相補的であるという事実をいう。例えば、Jack Cohen,OLIGO
DEOXYNUCLEOTIDES,Antisense Inhibitor
s of Gene Expression,CRC Press,1989;
およびSynthesis 1:1−5(1988)を参照のこと。本発明のP
C−LECTINアンチセンスオリゴヌクレオチドは、Sオリゴヌクレオチド(
ホスホロチオエート誘導体またはS−オリゴ、Jack Cohen、前出を参
照のこと)のような誘導体を含み、この誘導体は、癌細胞増殖阻害作用の増大を
示す。S−オリゴ(ヌクレオシドホスホロチオエート)は、オリゴヌクレオチド
(O−オリゴ)の等電子アナログであり、リン酸基の非架橋酸素原子は、硫酸原
子に置換される。本発明のS−オリゴは、3H−1,2−ベンゾジチオール−3
−オン−1,1−ジオキシド(これは、硫酸転移試薬である)での対応するO−
オリゴの処理によって調製され得る。Iyer,R.P.ら、J.Org.Ch
em.55:4693−4698(1990);およびIyer,R.P.ら、
J.Am.Chem.Soc.112:1253−1254(1990)(これ
らの開示は、本明細書中で参考として完全に援用される)を参照のこと。本発明
のさらなるPC−LECTINアンチセンスオリゴヌクレオチドは、当該分野で
公知のモルホリノアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む(Partrigeら
、1996,Antisense&Nucleic Acid Drug De
velopment 6:169−175を参照のこと)。
【0033】 本発明のPC−LECTINアンチセンスオリゴヌクレオチドは、代表的に、
PC−LECTINゲノムもしくは対応するmRNAの、最初の100個のN末
端コドンまたは最後の100個のC末端コドンに相補的であり、そしてこれらの
コドンと安定にハイブリダイズする、RNAまたはDNAであり得る。完全な相
補性は必要ではないが、高い程度の相補性が好ましい。この領域に相補的なオリ
ゴヌクレオチドの使用は、PC−LECTIN mRNAへの選択的ハイブリダ
イゼーションを可能にし、そしてタンパク質キナーゼの他の調節サブユニットを
特定するmRNAへの選択的ハイブリダイゼーションを可能にしない。好ましく
は、本発明のPC−LECTINアンチセンスオリゴヌクレオチドは、PC−L
ECTIN mRNAにハイブリダイズする配列を有するアンチセンスDNA分
子の15〜30merフラグメントである。必要に応じて、PC−LECTIN
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、PC−LECTINの最初の10個のN末
端コドンおよび最後の10個のC末端コドンにおける領域に相補的な30mer
オリゴヌクレオチドである。あるいは、アンチセンス分子は、PC−LECTI
N発現の阻害において、リボザイムを利用するように改変される。L.A.Co
utureおよびD.T.Stinchcomb;Trends Genet
12:510−515(1996)。
【0034】 本発明のこの局面のさらなる特定の実施形態は、プライマーおよびプライマー
ペアを含み、これは、本発明のポリヌクレオチドまたはその任意の特定の部分の
特異的増幅、および本発明の核酸分子またはその任意の部分に選択的もしくは特
異的にハイブリダイズするプローブの特異的増幅を可能にする。プローブは、検
出可能なマーカー(例えば、放射性同位体、蛍光化合物、生体発光化合物、化学
発光化合物、金属キレート剤または酵素のような)で標識され得る。このような
プローブおよびプライマーが、サンプルにおけるPC−LECTINポリヌクレ
オチドの存在を検出するために使用され得、そしてPC−LECTINタンパク
質を発現する細胞を検出するための手段として使用され得る。
【0035】 このようなプローブの例としては、図1A〜1D(配列番号1)に示されるヒ
トPC−LECTIN cDNA配列の、すべてまたは一部分を含むポリペプチ
ドが挙げられる。PC−LECTIN mRNAを特異的に増幅し得るプライマ
ーペアの例はまた、続く実施例において記載される。当業者に理解されるように
、非常に多くの異なるプライマーおよびプローブが、本明細書中に提供される配
列に基づいて調製され得、そしてPC−LECTIN mRNAを有効に増幅お
よび/または検出するために使用され得る。
【0036】 本明細書中で使用される場合、ポリヌクレオチドは、PC−LECTIN遺伝
子ではない遺伝子に、対応するかまたは相補的である混入ポリヌクレオチド、ま
たはPC−LECTIN遺伝子産物もしくはそのフラグメントではないポリペプ
チドをコードする混入ポリヌクレオチドから実質的に分離されている場合、「単
離された」と言われる。当業者は、容易に核酸単離手順を利用して、単離された
PC−LECTINポリヌクレオチドを獲得し得る。
【0037】 本発明のPC−LECTINポリヌクレオチドは、種々の目的に有用である。
この目的としては、PC−LECTIN遺伝子、mRNAまたはそのフラグメン
トの、増幅および/または検出のための、プローブおよびプライマーとしての使
用;前立腺癌および他の癌の、診断および/または予後のための試薬としての使
用;前立腺細胞へのカルシウムの侵入を特異的に阻害する分子を同定するための
手段としての使用;PC−LECTINポリペプチドの発現を指向し得るコード
配列としての使用;PC−LECTIN遺伝子の発現および/またはPC−LE
CTIN転写物の翻訳を、調節または阻害するための手段としての使用;ならび
に治療薬としての使用が挙げられるが、これらに限定されない。 (PC−LECTINの分子的特徴および生化学的特徴) 以下の実施例においてさらに記載されるように、PC−LECTIN遺伝子お
よびタンパク質は、種々の方法で特徴付けられてきた。例えば、ヌクレオチドコ
ード配列およびアミノ酸配列の分析は、PC−LECTIN配列内の保存された
構造的要素、位相幾何学的特徴、および潜在的に関連する分子を同定するために
行われた。PC−LECTIN mRNA発現のPT−PCRおよびノーザンブ
ロット分析は、種々のPC−LECTINメッセージを発現する正常な組織およ
び癌組織の範囲を確立するために行われた。実験的にトランスフェクトした細胞
におけるPC−LECTINタンパク質発現のウエスタンブロット分析は、細胞
表面局在化を決定するために行われた。
【0038】 PC−LECTINタンパク質は、「ライリン(layilin)」と称され
るハムスタータンパク質(これは、次いでC型レクチンと相同性を共有する(B
rowskyおよびHynes,J.C II Biol:143:429−4
2,1998))に対して相同性を有する、約252アミノ酸の1a型膜貫通細
胞表面タンパク質(前駆体タンパク質を含む273アミノ酸のシグナル配列とし
て最初に発現される)である。PC−LECTINはまた、身体壁損傷後にSa
rcophaga peregrina幼生の血リンパから最初に精製されたガ
ラクトース結合タンパク質のレクチンドメイン(Sarcophagaレクチン
という)に対して相同性を示し(Komanoら、980,J.Biol.Ch
em.255:2919−2924)、続いてクローン化された(Takaha
shiら、1885,J.Biol.Chem.22:12228−12233
;Kobayashiら、1989,Biochimica et Bioph
ysica Acta 009:244−250)。PC−LECTINタンパ
ク質の細胞表面位置は、以下の実施例の節においてさらに記載されるように、実
験的に確認された。
【0039】 ヒトPC−LECTINのcDNAヌクレオチド配列および推定アミノ酸配列
は、図1A〜D(配列番号1、2)に示される。PC−LECTIN抗原のアミ
ノ酸配列(配列番号2)とハムスターライリンの報告された配列(配列番号3)
との整列を、図2に示す。PC−LECTINは、ハムスターライリンと近接し
た相同性を有する(265残基の重複にわたって、約44.9%同一)が、ライ
リンタンパク質に対して提案された重要な機能ドメインにおいては著しく異なる
。詳細には、PC−LECTINタンパク質は、ライリン構造において見出され
た約10アミノ酸配列を有さず、この配列は、ライリンタンパク質の細胞膜のひ
だ(ruffule)における細胞骨格タンパク質タリンとの結合に関与すると
考えられているドメインを表す(BorowskyおよびHynes,J.Ce
ll Biol:143:429−42,1998;Crithleyら、Bi
ochem Soc Symp 65:79−99,1999)。遺伝子レベル
では、2550pbのPC−LECTIN cDNAとハムスターライリンcD
NAの1747bpのcDNAとの整列は、591bpの領域にわたって相同性
を示す。PC−LECTIN領域の残りは、ライリンと著しく異なり、これは細
胞外ドメインのc末端の半分および全細胞質ドメインのアミノ酸配列における違
いを示す。このことは、PC−LECTINおよびライリンは、レクチンのサブ
ファミリーに関連し、おそらく構成するが、PC−LECTINは、ライリンの
ヒト形態ではなさそうであるということを示唆する。
【0040】 タリンとのライリンの結合は、細胞運動性において機能すると仮定される。P
C−LECTIN構造におけるタリン結合ドメインの非存在は、ライリンと同じ
様式でPC−LECTINがタリンまたは細胞骨格と相互作用し得ないというこ
とを示唆する。タリン結合ドメインの非存在に加えて、PC−LECTIN構造
は、ライリン構造に対する挿入された配列ストレッチおよび欠失した配列ストレ
ッチを含む。PC−LECTIN発現プロフィールはまた、報告されたライリン
の発現プロフィールと異なる。ライリンは、複数のマウス組織(例えば、卵巣、
肺、脾臓、心臓、肝臓、膀胱、リンパ節、乳腺、脳、甲状腺および腎臓)および
細胞株において発現されることが報告され、PC−LECTINは、正常なヒト
組織の中でも精巣に非常に特異的であるようであり、そして前立腺癌において上
方制御される。このことは、PC−LECTINが、前立腺癌および潜在的に他
の癌において、転移および侵襲における細胞接着分子として機能し得ることを示
唆する。ライリンおよび他のC型レクチンとの構造的関係が与えられると、PC
−LECTINは、確認されたように、糖質部分に結合すると予想される。従っ
て、PC−LECTIN活性を妨げるための、PC−LECTIN結合糖質分子
を用いる治療戦略は、PC−LECTINを発現する癌の処置において治療的に
有用であり得る。
【0041】 PC−LECTIN発現は、RT−PCRおよびノーザンブロット分析の両方
によって決定されるように、正常なヒト組織において、本質的に精巣特異的であ
る。癌においては、PC−LECTIN mRNAは、SCIDマウスにおいて
増殖されたヒト前立腺腫瘍異種移植片において過剰発現され、そしてある場合に
おいては、非常に高レベルの発現が見られる。従って、前立腺癌におけるその細
胞表面局在化およびその高レベルの発現を与えられると、PC−LECTINは
、前立腺癌の処置のための優れた治療標的の顕著な特徴のすべてを有する。これ
らの同じ理由のために、PC−LECTINはまた、特に診断画像化と関連して
、理想的な診断マーカーを示し得る。さらに、PC−LECTIN発現が疾患の
進行とともに、および/または非常に攻撃的な腫瘍の発生とともに増加する。こ
の点で、PC−LECTINの非常に高レベルの発現が検出されたLAPC−9
前立腺腫瘍異種移植片は、前立腺癌の非常に攻撃的な骨芽細胞の骨転移により誘
導された。
【0042】 (PC−LECTINをコードする核酸分子の単離) 本明細書中に記載されるPC−LECTIN cDNA配列は、PC−LEC
TIN遺伝子産物をコードする他のポリヌクレオチドの単離、ならびにPC−L
ECTIN遺伝子産物ホモログ、選択的にスプライシングされたアイソフォーム
、対立遺伝子改変体、およびPC−LECTIN遺伝子産物の変異体形態をコー
ドするポリヌクレオチドの単離を可能にする。PC−LECTIN遺伝子をコー
ドする全長cDNAを単離するために利用され得る種々の分子クローニング方法
は、周知である(例えば、Sambrook,J.ら、Molecular C
loning:A Laboratory Manual,第2版、Cold
Spring Harbor Press,New York,1989;Cu
rrent Protocols in Molecular Biology
.Ausubelら編、Wiley and Sons,1995を参照のこと
)。例えば、λファージクローニング方法論が、市販のクローニング系を使用し
て慣用的に利用され得る(例えば、Lambda ZAP Express,S
tratagene)。PC−LECTIN遺伝子cDNAを含むファージクロ
ーンは、標識されたPC−LECTIN cDNAまたはそのフラグメントを用
いて調べることにより同定され得る。例えば、一つの実施形態において、PC−
LECTIN cDNA(図1A〜1D;配列番号1)またはその一部分が、合
成され、そしてプローブとして使用されて、PC−LECTIN遺伝子に対応す
る重複するcDNAおよびPC−LECTIN遺伝子に対応する全長cDNAを
回収し得る。PC−LECTIN遺伝子自体は、PC−LECTIN DNAプ
ローブまたはプライマーを使用して、ゲノムDNAライブラリー、細菌人工染色
体ライブラリー(BAC)、酵母人工染色体ライブラリー(YAC)などをスク
リーニングすることによって単離され得る。
【0043】 (組換えDNA分子および宿主−ベクター系) 本発明はまた、PC−LECTINポリヌクレオチドを含む組換えDNAまた
はRNA分子(これには、当該分野において周知のファージ、プラスミド、ファ
ージミド、コスミド、YAC、BAC、ならびに種々のウイルス性および非ウイ
ルス性ベクターが含まれるが、これらに限定されない)、およびこのような組換
えDNAまたはRNA分子で形質転換またはトランスフェクトされた細胞を提供
する。本明細書中で使用される場合、組換えDNAまたはRNA分子は、インビ
トロでの分子操作に供されたDNAまたはRNA分子である。このような分子を
生成するための方法は周知である(例えば、Sambrookら、1989(前
出)を参照のこと)。
【0044】 本発明はさらに、適切な原核生物宿主細胞または真核生物宿主細胞においてP
C−LECTINポリヌクレオチドを含む組換えDNA分子を含む、宿主−ベク
ター系を提供する。適切な真核生物宿主細胞の例としては、酵母細胞、植物細胞
、または動物細胞(例えば、哺乳動物細胞または昆虫細胞(例えば、バキュロウ
イルス感染可能細胞(例えば、Sf9細胞)))が挙げられる。適切な哺乳動物
細胞の例としては、種々の前立腺癌細胞株(例えば、LnCaP、PC3、DU
145、LAPC4、TsuPr1、他のトランスフェクト可能であるかまたは
形質導入可能な前立腺細胞株)、ならびに組換えタンパク質の発現のために慣用
的に使用される多くの哺乳動物細胞(例えば、COS細胞、CHO細胞、293
細胞、293T細胞)が挙げられる。より詳細には、PC−LECTINのコー
ド配列を含むポリヌクレオチドを使用し、当該分野で慣用的に使用され、そして
広く知られたかなり多数の宿主−ベクター系を用いて、PC−LECTINタン
パク質またはそれらのフラグメントを生成し得る。
【0045】 PC−LECTINタンパク質またはそれらのフラグメントの発現に適切な広
範な種々の宿主−ベクター系が利用可能である(例えば、Sambrookら、
1989(前出);Current Protocols in Molecu
lar Biology、1995(前出)を参照のこと)。哺乳動物での発現
に好ましいベクターとしては、pcDNA 3.1 myc−His−tag(
Invitrogen)およびレトロウイルスベクターpSRαtkneo(M
ullerら、1991、MCB 11:1785)が挙げられるが、これらに
限定されない。これらの発現ベクターを使用して、PC−LECTINは、好ま
しくは、いくつかの前立腺癌細胞株および非前立腺癌細胞株(例えば、293、
293T、rat−1、NIH3T3、PC3、LNCaPおよびTsuPr1
を含む)において発現させ得る。本発明の宿主−ベクター系は、PC−LECT
INタンパク質またはそれらのフラグメントの産生のために有用である。このよ
うな宿主−ベクター系は、PC−LECTINおよびPC−LECTIN変異の
機能的特性を研究するために使用され得る。
【0046】 PC−LECTIN遺伝子またはそれらのフラグメントによってコードされる
タンパク質は、種々の用途を有する。これには、以下が挙げられるが、これらに
限定されない:抗体の産生、およびPC−LECTIN遺伝子産物に結合する、
リガンドおよび他の因子および細胞構成要素を同定するための方法において。P
C−LECTINタンパク質またはそれらのフラグメントに対して惹起された抗
体は、診断および予後アッセイにおいて、画像化方法(特に、癌画像化方法を含
む)において、そしてPC−LECTINタンパク質の発現によって特徴付けら
れるヒト癌(前立腺の癌を含むが、これに限定されない)の管理における治療方
法において有用であり得る。PC−LECTINタンパク質の検出のために有用
な種々の免疫学的アッセイが意図され、これには、種々の型のラジオイムノアッ
セイ、酵素結合イムノソルベント検定法(ELISA)、酵素結合免疫蛍光アッ
セイ(ELIFA)、免疫細胞学的方法などが挙げられるが、これらに限定され
ない。このような抗体は、標識され得、そして前立腺細胞を検出し得る免疫学的
画像化試薬として使用され得る(例えば、ラジオシンチグラフィ(radios
cintigraphic)画像化方法において)。PC−LECTINタンパ
ク質はまた、以下にさらに記載されるように、癌ワクチンを生成するにおいて特
に有用であり得る。
【0047】 (PC−LECTINタンパク質) 本発明の別の局面は、PC−LECTINタンパク質およびそのポリペプチド
フラグメントを提供する。本発明のPC−LECTINタンパク質としては、本
明細書中で特に同定されたタンパク質、ならびに対立遺伝子改変体、保存的置換
改変体およびホモログ(このような改変体およびホモログが以下に概説される方
法に従って過度な実験を伴わずに単離/生成および特徴付けされ得る限り)が挙
げられる。異なるPC−LECTINタンパク質またはそのフラグメントの部分
を組合せる融合タンパク質、ならびにPC−LECTINタンパク質および異種
ポリペプチドの融合タンパク質もまた含まれる。このようなPC−LECTIN
タンパク質は、集合的に、PC−LECTINタンパク質、本発明のタンパク質
、またはPC−LECTINという。本明細書中で使用される場合、用語「PC
−LECTINポリペプチド」は、少なくとも10個のアミノ酸(好ましくは、
少なくとも15個のアミノ酸)のポリペプチドフラグメントまたはPC−LEC
TINタンパク質をいう。
【0048】 PC−LECTINタンパク質の特定の実施形態は、図1A〜D(配列番号2
)に示されるようなヒトPC−LECTINのアミノ酸配列(そこに示されるよ
うに、アミノ酸残基番号1〜おおよそアミノ酸残基番号273)を有するポリペ
プチドを含む。PC−LECTINタンパク質の別の特定の実施形態は、図1A
〜D(配列番号2)に示されるようなヒトPC−LECTINのアミノ酸配列(
そこに示されるように、おおよそアミノ酸残基番号22からおおよそアミノ酸残
基番号273)を有するポリペプチドを含む。PC−LECTINフラグメント
の特定の実施形態は、WIGFTYKTA、ATGEHQAFT、FGNCVR
ELQA、NCVELQASA、およびDNHGFGNCV(それぞれ、配列番
号6〜10)からなる群より選択されるペプチド、またはGLWRNGDGQT
SGAC(配列番号25)、GGPYLYQWNDDRCNM(配列番号26)
、EARLACESEGGVLL(配列番号27)、およびPC−LECTIN
の細胞外ドメイン(配列番号2のアミノ酸22〜213)からなる群より選択さ
れるペプチドを含む。他の特定の実施形態は、C型レクチンドメインおよび/ま
たは図1A〜D(配列番号2)で同定される膜貫通ドメインのうちの1つまたは
両方を含む。
【0049】 一般的に、ヒトPC−LECTINの天然に存在する対立遺伝子改変体は、高
い程度の構造的同一性および相同性(例えば、90%以上の同一性)を共有する
。代表的に、PC−LECTINタンパク質の対立遺伝子改変体は、本明細書中
に記載されるPC−LECTIN配列内に保存的アミノ酸置換を含むか、または
PC−LECTINホモログにおいて対応する位置に由来するアミノ酸の置換を
含む。PC−LECTIN対立遺伝子改変体の1つのクラスは、特定のPC−L
ECTINアミノ酸配列の少なくとも小さな領域と高い程度の相同性を共有する
が、この配列とは根本的な背反(例えば、非保存的置換、短縮化(trunca
tion)、挿入、またはフレームシフト)をさらに含むタンパク質である。
【0050】 保存的アミノ酸置換はしばしば、タンパク質のコンフォメーションも機能も変
更することなく、タンパク質中で作製され得る。このような変化としては、以下
が挙げられる:任意のイソロイシン(I)、バリン(V)、およびロイシン(L
)の、任意の他のこれらの疎水性アミノ酸についての置換;グルタミン酸(E)
に対するアスパラギン酸(D)、およびその逆の置換;アスパラギン(N)に対
するグルタミン(Q)、およびその逆の置換;ならびに、スレオニン(T)に対
するセリン(S)、およびその逆の置換。他の置換はまた、タンパク質の三次元
構造における特定のアミノ酸の環境およびその役割に依存して、保存的とみなさ
れ得る。例えば、グリシン(G)およびアラニン(A)は、しばしば交換可能で
あり得、アラニン(A)およびバリン(V)も同様であり得る。比較的疎水性で
あるメチオニン(M)はしばしば、ロイシンおよびイソロイシンと交換可能であ
り得、そして時としてバリンと交換可能であり得る。リシン(K)およびアルギ
ニン(R)はしばしば、そのアミノ酸残基の重要な特徴がその電荷であり、そし
てこれら2つのアミノ酸残基の異なるpKが重要でない位置において、交換可能
である。さらに他の変化が、特定の状況において、「保存的」とみなされ得る。
【0051】 PC−LECTIN(改変体を含む)は、図1(配列番号2)のアミノ酸配列
を有するPC−LECTINタンパク質と共通の少なくとも1つのエピトープを
含み、その結果、PC−LECTINタンパク質に特異的に結合する抗体はまた
、図1(配列番号2)のアミノ酸配列を有するPC−LECTINタンパク質に
特異的に結合する。PC−LECTINタンパク質改変体の1つのクラスは、図
1(配列番号2)のアミノ酸配列と90%以上の同一性を共有する。PC−LE
CTINタンパク質改変体のより特定のクラスは、C型レクチンドメインを含む
。好ましいPC−LECTINタンパク質改変体は、糖質部分と、特に高マンノ
ース残基および/またはN−アセチルグルコサミンに対して特異的に結合し得る
【0052】 PC−LECTINタンパク質は、多くの形態、好ましくは単離された形態で
具体化され得る。本明細書中で使用される場合、このタンパク質と正常に関連す
る細胞構成成分からPC−LECTINタンパク質を取り出すために、物理的方
法、機械的方法または化学的方法が使用される場合、タンパク質は「単離された
」という。当業者は、単離されたPC−LECTINを得るために、標準的な精
製方法を容易に使用し得る。精製されたPC−LECTINタンパク質分子は、
抗体または他のリガンドへのPC−LECTINの結合を損なう他のタンパク質
または分子を実質的に含まない。単離および精製の性質および程度は、意図され
る用途に依存する。PC−LECTINタンパク質の実施形態は、精製されたP
C−LECTINおよび機能的な可溶性PC−LECTINタンパク質を含む。
1つの形態においては、このような機能的な可溶性PC−LECTINタンパク
質またはそのフラグメントは、抗体または他のリガンドに結合する能力を保持す
る。
【0053】 本発明はまた、PC−LECTINアミノ酸配列の生物学的に活性なフラグメ
ントを含むPC−LECTINポリペプチド(例えば、図1A〜D(配列番号2
)に示されるようなPC−LECTINのアミノ酸配列の部分に対応するポリペ
プチド)を提供する。本発明のこのようなポリペプチドは、PC−LECTIN
タンパク質の特性(例えば、PC−LECTINタンパク質に関連するエピトー
プに特異的に結合する抗体の産生を誘発する能力)を示す。
【0054】 本明細書中に開示される本発明の実施形態は、広範な種々の当該分野で認めら
れたPC−LECTINタンパク質の改変体(例えば、アミノ酸の挿入、欠失お
よび置換を有するポリペプチド)を含む。PC−LECTIN改変体は、当該分
野において公知の方法(例えば、部位特異的変異誘発、アラニンスキャニング(
alanine scanning)、およびPCR変異誘発)を使用して作製
され得る。部位特異的変異誘発[Carterら、Nud.Acids Res
.13:4331(1986);Zollerら、Nud.Acids Res
.10:6487(1987)]、カセット式変異誘発[Wellら、Gene
34:315(1985)]、制限選択的変異誘発[Wellsら、Phil
os.Trans.R.Soc.London SerA 317:415(1
986)]または他の公知技術を、クローン化されたDNAにおいて実施し、P
C−LECTIN改変体DNAを産生し得る。走査型アミノ酸分析もまた、連続
配列に沿って1以上のアミノ酸を同定するために使用され得る。とりわけ好まし
い走査アミノ酸は、比較的小さい中性アミノ酸である。このようなアミノ酸とし
ては、アラニン、グリシン、セリン、およびシステインが挙げられる。アラニン
が、代表的に、この群の中で好ましい走査アミノ酸である。なぜなら、アラニン
は、β炭素を越えて側鎖を排除し、そして改変体の主鎖コンフォメーションを変
更する可能性が低いからである。アラニンもまた、代表的に好ましい。なぜなら
、アラニンは、最も一般的なアミノ酸であるからである。さらに、埋没位置およ
び露出位置の両方において、頻繁に見出される[Creighton、The
Proteins(W.H.Freeman&Co.、NY);Chothia
、J.Mol.Biol.150:1(1976)]。アラニン置換が適切な量
の改変体を生じない場合には、同配体アミノ酸が使用され得る。
【0055】 上記で考察したように、特許請求された本発明の実施形態は、図1A〜1D(
配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質の273未満のアミノ酸
配列を含むポリペプチドを含む。例えば、本明細書中に開示される本発明の代表
的な実施形態は、以下が挙げられる:図1A〜1D(配列番号2)に示されるP
C−LECTINタンパク質の約アミノ酸1個〜約アミノ酸10個からなるポリ
ペプチド、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク
質の約アミノ酸20個〜約アミノ酸30個からなるポリペプチド、図1A〜1D
(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質の約アミノ酸30個〜
約アミノ酸40個からなるポリペプチド、図1A〜1D(配列番号2)に示され
るPC−LECTINタンパク質の約アミノ酸40個〜約アミノ酸50個からな
るポリペプチド、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタ
ンパク質の約アミノ酸50個〜約アミノ酸60個からなるポリペプチド、図1A
〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質の約アミノ酸6
0個〜約アミノ酸70個からなるポリペプチド、図1A〜1D(配列番号2)に
示されるPC−LECTINタンパク質の約アミノ酸70個〜約アミノ酸80個
からなるポリペプチド、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECT
INタンパク質の約アミノ酸80個〜約アミノ酸90個からなるポリペプチド、
および図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタンパク質の
約アミノ酸90個〜約アミノ酸100個からなるポリペプチドなど。このスキー
ムに従って、PC−LECTINタンパク質のアミノ酸100〜273のアミノ
酸配列の部分からなるポリペプチドが、本発明の代表的な実施形態である。PC
−LECTINタンパク質のより大きな部分からなるポリペプチドもまた意図さ
れる。例えば、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−LECTINタン
パク質の約アミノ酸1(または、20もしくは30もしくは40など)個〜約ア
ミノ酸20(または、30もしくは40もしくは50など)個からなるポリペプ
チドが、当該分野において周知の種々の技術によって生成され得る。
【0056】 本明細書中に開示される本発明のさらなる例示的な実施形態は、図1A(配列
番号2)に示されるようなPC−LECTINポリペプチド配列内に含まれる1
以上の生物学的モチーフのアミノ酸残基を含むPC−LECTINポリペプチド
を含む。1つの実施形態では、本発明の代表的ポリペプチドは、図1A〜1D(
配列番号2)で同定されるハムスターライリン、および/または1以上の膜貫通
領域もしくはC型レクチンドメインに対して相同性を示すPC−LECTINの
1以上の領域を含み得る。別の実施形態では、本発明の代表的ポリペプチドは、
残基86〜89(図1に示される最初のアミノ酸残基から番号付ける)でNLT
K(配列番号33)、および/または残基255〜258におけるNQST(配
列番号34)のような1以上のPC−LECTIN N−グリコシル化部位を含
み得る。別の実施形態では、本発明の代表的ポリペプチドは、残基266〜26
9におけるRKES(配列番号35)のような1以上のPC−LECTIN c
AMP/cGMP依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位を含み得る。別の実施
形態では、本発明の代表的ポリペプチドは、残基49〜51におけるSSR、残
基141〜143におけるSEK、残基264〜266におけるSTR、および
/または残基264〜267におけるTRKのような1以上のPC−LECTI
Nタンパク質キナーゼCリン酸化部位を含み得る。別の実施形態では、本発明の
代表的ポリペプチドは、残基53〜56でSFQE(配列番号36)、残基95
〜98におけるSDGD(配列番号37)、残基265〜268におけるTRK
E(配列番号38)、および/または残基269〜272におけるSGME(配
列番号39)のような1以上のPC−LECTINカゼインキナーゼIIリン酸
化部位を含み得る。別の実施形態では、本発明の代表的ポリペプチドは、残基2
7〜32におけるGQKVCF(配列番号40)、残基66〜71におけるGV
LLSL(配列番号71)、残基91〜96におけるGTGISD(配列番号4
2)、残基93〜98におけるGISDGD(配列番号43)、残基102〜1
07におけるGLWRNG(配列番号44)、残基109〜114におけるGQ
TSGA(配列番号45)、残基140〜145におけるGSEKCV(配列番
号46)、および/または残基212〜217におけるGIIPNL(配列番号
47)のような1以上のN−ミリストイル化部位を含み得る。これらの本発明の
関連した実施形態としては、上記で考察された異なるモチーフの組合せを含むポ
リペプチドが挙げられ、好ましい実施形態は、これらのポリペプチドのモチーフ
または介在配列のいずれにも、挿入も欠失も置換も含んでいないポリペプチドで
ある。
【0057】 PC−LECTINポリペプチドは、本明細書中に開示されるヒトPC−LE
CTINタンパク質のアミノ酸配列に基づいて、当該分野において周知の、標準
的なペプチド合成技術または化学切断方法を使用して生成され得る。あるいは、
組換え方法を使用して、PC−LECTINタンパク質のポリペプチドフラグメ
ントをコードする核酸分子を生成し得る、この点において、本明細書中に記載さ
れるPC−LECTINコード核酸分子は、PC−LECTINタンパク質の規
定のフラグメントを生成するために手段を提供する。PC−LECTINポリペ
プチドは、ドメイン特異的抗体(例えば、PC−LECTINタンパク質の細胞
外エピトープおよび細胞内エピトープを認識する抗体)の生成および特徴付け、
PC−LECTINまたはその特定の構造ドメインに結合する薬剤または細胞因
子の同定、および種々の治療状況(癌ワクチンを含むが、これらに限定されない
)において、特に有用である。特定の興味深い構造を含むPC−LECTINポ
リペプチドは、例えば、以下:Chou−Fasman、Garnier−Ro
bson、Kyte−Doolittle、Eisenberg、Karplu
s−SchultzまたはJameson−Wolf分析の方法を含む、当該分
野で周知の種々の分析技術を使用するか、または免疫原性に基づいて、予測およ
び/または同定され得る。このような構造を含むフラグメントは、サブユニット
特異的抗PC−LECTIN抗体の生成、またはPC−LECTINに結合する
細胞因子の同定において、特に有用である。
【0058】 以下の実施例に記載される特定の実施形態において、PC−LECTINの分
泌形態は、C末端6×HisおよびMYCタグを含む、PC−LECTINをコ
ードするCMV駆動発現ベクター(pcDNA3.1/mycHIS、Imvi
trogen))でトランスフェクトされた293T細胞において、簡便に発現
され得る。培養培地中の分泌されたHISタグ化PSCAは、標準的な技術を使
用して、ニッケルカラムを使用して精製され得る。あるいは、AP−タグ系が使
用され得る(実施例7を参照のこと)。
【0059】 PC−LECTINの改変(例えば、共有結合性改変)は、本発明の範囲内に
含まれる。1つの型の共有結合性改変としては、PC−LECTINの選択され
た側鎖あるいはN末端残基またはC末端残基と反応し得る有機誘導体化薬剤での
、PC−LECTINポリペプチドの標的化されたアミノ酸残基の反応が挙げら
れる。本発明の範囲内のPC−LECTINポリペプチドの別の型の共有結合性
改変としては、このポリペプチドのネイティブなグリコシル化パターンの変更が
挙げられる。「ネイティブなグリコシル化パターンの変更」は、本明細書中の目
的のために、ネイティブ配列PC−LECTINに見い出される1以上の糖質部
分の欠失(基礎となるグリコシル化部位の除去、または化学的手段および/また
は酵素的手段によるグリコシル化の欠失のいずれかによって)、および/または
ネイティブ配列PC−LECTINに存在しない、1以上のグリコシル化部位の
付加を意味することが意図される。さらに、この句は、存在する種々の糖質部分
の性質および割合の変更を含む、ネイティブタンパク質のグリコシル化の質的変
化を含む。PC−LECTINの別の型の共有結合性改変としては、米国特許第
4,640,835号、同第4,496,689号、同第4,301,144号
、同第4,670,417号、同第4,791,192号または同第4,179
,337号に示されるような様式の、種々の非タンパク質様ポリマー(例えば、
ポリエチレングリコール(PEG)、ポリプロピレングリコールまたはポリオキ
シアルキレン)のうちの1つへの、PC−LECTINポリペプチドの連結が挙
げられる。 本発明のPC−LECTINはまた、別の異種ポリペプチドまたはアミノ酸配
列に融合されたPC−LECTINを含むキメラ分子を形成する様式で、改変さ
れ得る。1つの実施形態において、このようなキメラ分子としては、ポリヒスチ
ジンエピトープタグを有するPC−LECTINの融合体が挙げられ、このタグ
は、固定されたニッケルが選択的に結合し得るエピトープを提供する。このエピ
トープタグは、一般に、PC−LECTINのアミノ末端またはカルボキシル末
端に配置される。代替的実施形態において、このキメラ分子は、PC−LECT
INの免疫グロブリンまたは免疫グロブリンの特定の領域との融合体を含み得る
。キメラ分子の二価形態(「免疫付着因子(immunoadhesin)」と
も呼ばれる)について、このような融合体は、IgG分子のFc領域に対するも
のであり得る。このIg融合体は、好ましくは、Ig分子内の少なくとも1つの
可変領域の代わりに、PC−LECTINポリペプチドの可溶性(膜貫通ドメイ
ンを欠失または不活性化した)形態での置換を含む。特に好ましい実施形態にお
いて、免疫グロブリン融合体は、IgGI分子のヒンジ領域、CH2領域および
CH3領域、またはヒンジ領域、CH1領域、CH2領域およびCH3領域を含
む。免疫グロブリン融合体の産生については、米国特許第5,428,130号
(1995年6月27日公布)もまた参照のこと。
【0060】 (PC−LECTIN抗体) 本発明の別の局面は、PC−LECTINタンパク質およびポリペプチドに結
合する抗体を提供する。最も好ましい抗体は、PC−LECTINタンパク質に
選択的に結合し、そして非PC−LECTINタンパク質およびポリペプチドに
結合しない(または、弱く結合する)。特に意図される抗PC−LECTIN抗
体としては、モノクローナル抗体およびポリクローナル抗体、ならびにこれらの
抗体の抗原結合ドメインおよび/または1以上の相補性決定領域を含むフラグメ
ントが挙げられる。本明細書中で使用される場合、抗体フラグメントは、その標
的に結合する免疫グロブリン分子の可変領域(すなわち、抗原結合領域)の少な
くとも一部として定義される。
【0061】 いくつかの適用のために、特定のPC−LECTINタンパク質および/また
は特定の構造ドメイン内のエピトープと特異的に反応する抗体を産生することが
所望され得る。例えば、癌治療および画像診断の目的に有用である好ましい抗体
は、癌細胞において発現されるようなPC−LECTINタンパク質の細胞外領
域におけるエピトープと反応する抗体である。このような抗体は、免疫原として
、本明細書中に記載されたPC−LECTINを使用することによってかまたは
予想されるその細胞外ドメインから誘導されるペプチドを使用することによって
産生され得る。これに関連して、図1に示されるPC−LECTINタンパク質
配列を参照すると、膜貫通ドメインに関するアミノ末端配列中の領域は、細胞外
特異的PC−LECTIN抗体を産生および選択するために、適切な免疫原およ
びスクリーニング薬剤を設計するために使用する場合に選択され得る。
【0062】 本発明のPC−LECTIN抗体は、前立腺癌の治療戦略、診断アッセイおよ
び予後アッセイ、ならびに画像化方法において特に有用であり得る。同様に、こ
のような抗体は、PC−LECTINが他の型の癌でもまた発現または過剰発現
される限り、他の癌の処置、診断および/または予後に有用であり得る。本発明
はまた、PC−LECTINおよび変異体PC−LECTINのタンパク質およ
びポリペプチドの、検出および定量に有用な種々の免疫学的アッセイを提供する
。このようなアッセイは、一般に、適切には、PC−LECTINまたは変異体
PC−LECTINタンパク質を認識および結合し得る、1以上のPC−LEC
TIN抗体を含み、そして、以下を含むが、これらに限定されない当該分野で周
知の種々の免疫学的アッセイ形式で行われ得る:種々の型のラジオイムノアッセ
イ、酵素連結免疫吸着アッセイ(ELISA)、酵素連結免疫蛍光アッセイ(E
LIFA)など。さらに、前立腺癌を検出し得る、免疫学的画像化方法もまた、
本発明によって提供され、これらには、標識したPC−LECTIN抗体を使用
するラジオシンチグラフィー画像化方法が挙げられるが、これらに限定されない
。このようなアッセイは、前立腺癌の検出、モニタリングおよび予後において、
臨床的に有用であり得る。
【0063】 PC−LECTIN抗体はまた、PC−LECTINおよび変異体PC−LE
CTINのタンパク質およびポリペプチドの精製、ならびにPC−LECTIN
ホモログおよび関連分子の単離のための方法において使用され得る。例えば、1
つの実施形態において、PC−LECTINタンパク質を精製する方法は、PC
−LECTIN抗体(これは、固体マトリックスに結合されている)を、PC−
LECTINを含有する溶解物または他の溶液と共に、このPC−LECTIN
抗体がPC−LECTINに結合するのを可能にする条件下でインキュベートす
る工程;固体マトリックスを洗浄して不純物を除去する工程;およびPC−LE
CTINをその結合された抗体から溶出する工程を包含する。本発明のPC−L
ECTIN抗体の他の用途としては、PC−LECTINタンパク質を模倣する
抗イディオタイプ抗体の生成が挙げられる。
【0064】 PC−LECTIN抗体はまた、例えば、PC−LECTINタンパク質の生
物学的な活性を調節もしくは阻害することによって、またはPC−LECTIN
タンパク質を発現する前立腺癌細胞を標的もしくは破壊することによることによ
って治療学的に使用され得る。前立腺癌および他の癌の抗体治療は、以下の別々
の小段落により具体的に記載されている。
【0065】 抗体の調製のための種々の方法が、当該分野で周知である。例えば、抗体は、
単離または免疫結合体化された形態の、PC−LECTINのタンパク質、ペプ
チドまたはフラグメントを使用して、適切な哺乳動物宿主を免疫することによっ
て調製され得る(Antibodies:A Laboratory Manu
al,CSH Press編、HarlowおよびLane(1988);Ha
rlow、Antibodies,Cold Spring Harbor P
ress,NY(1989))。タンパク質免疫原の例としては、組換えPC−
LECTIN(バキュロウイル系、哺乳動物系などにおいて発現される)、PC
−LECTIN細胞外ドメイン、AP−タグ化PC−LECTINなどが挙げら
れる。さらに、PC−LECTINの融合タンパク質(例えば、PC−LECT
IN GST融合タンパク質)もまた使用され得る。特定の実施形態において、
図1A〜1D(配列番号2)のオープンリーディングフレームアミノ酸配列の全
てまたはほとんどを含むGST融合タンパク質が生成され得、そして適切な抗体
を生成するための免疫原として使用され得る。PC−LECTINを発現または
過剰発現する細胞が使用され得る。同様に、PC−LECTINを発現するため
に操作される任意の細胞が、使用され得る。このような戦略により、結果として
、内因性PC−LECTINを認識する増強した能力を有する、モノクローナル
抗体の産物が得られ得る。別の有用な免疫原は、ヒツジの赤血球の原形質膜に結
合するPC−LECTINペプチドを含む。
【0066】 図1A〜1D(配列番号2)に示されるようなPC−LECTINのアミノ酸
配列を使用して、抗体を生成するためにPC−LECTINタンパク質の特定の
領域を選択し得る。例えば、PC−LECTINアミノ酸配列の疎水性および親
水性分析を使用して、PC−LECTIN構造の疎水性領域を同定し得る。免疫
原性構造を示すPC−LECTINタンパク質の領域、ならびに他の領域および
ドメインは、以下のような当該分野で公知の種々の他の方法を使用して容易に同
定され得る:Chou−Fasman、Garnier−Robson、Kyt
e−Doolittle、Eisenberg、Karplus−Schult
zまたはJameson−Wolf分析。HLA−A2(例えば、WIGFTY
KTA(配列番号6)、ATGEHQAFT(配列番号7)、FGNCVELQ
A(配列番号8)、NCVELQASA(配列番号9)、およびDNHGFGN
CV(配列番号10))と結合すると予想されるPC−LECTINのペプチド
は、抗体の産生のために選択され得る。以下の実施例に記載されるように、免疫
原性は、ペプチドであるGLWRNGDGQTSGAC(配列番号25)、GG
PYLYQWNDDRCNM(配列番号26)、EARLACESEGGVLL
(配列番号27)、およびPC−LECTINの細胞外ドメイン(配列番号2の
アミノ酸22−213)を用いて証明され、これは、それぞれウサギおよびマウ
スを使用するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を産生するために使
用された。
【0067】 免疫原としての使用のためのタンパク質またはポリペプチドを調製するための
方法、およびキャリア(例えば、BSA、KLHまたは他のキャリアタンパク質
)とのタンパク質の免疫結合体を調製するための方法は、当該分野で周知である
。いくつかの状況下で、例えば、カルボジイミド試薬を使用する直接的な結合体
化が使用され得;他の例において、連結試薬(例えば、Pierce Chem
ical Co.,Rockford,ILによって供給される連結試薬)が、
効果的であり得る。PC−LECTIN免疫原の投与は一般に、当該分野で一般
に理解されるように、適切な期間にわたって、適切なアジュバントの使用を伴う
注射によって行われ得る。免疫スケジュールの間、抗体の力価は、抗体形成の能
力(adequacy)を決定することによって理解され得る。
【0068】 PC−LECTINモノクローナル抗体が好ましく、そして当該分野で周知の
種々の手段によって産生され得る。例えば、所望のモノクローナル抗体を分泌す
る不死化細胞株が、一般に公知のように、KohlerおよびMilstein
の標準的なハイブリドーマ技術、または産生性(producing)B細胞を
不死化する改変を使用して調製され得る。所望の抗体を分泌する不死化細胞株は
、抗原がPC−LECTINタンパク質またはPC−LECTINフラグメント
である免疫アッセイによってスクリーニングされる。所望の抗体を分泌する適切
な不死化細胞培養物が同定される場合、これらの細胞を拡大し、そしてインビト
ロ培養物または腹水のいずれかから抗体が産生され得る。
【0069】 抗体またはフラグメントはまた、現在の技術を使用する、組換え手順によって
産生され得る。PC−LECTINタンパク質の所望の領域に特異的に結合する
領域はまた、複数の種起源のキメラ抗体またはCDR移植化(grafted)
抗体の状況下で産生され得る。ヒト化PC−LECTIN抗体またはヒトPC−
LECTIN抗体もまた産生され得、そして治療的状況下での使用のために好ま
しい。1以上の非ヒト抗体CDRを対応するヒト抗体配列と置換することによる
、マウス抗体および他の非ヒト抗体をヒト化するための方法は、周知である(例
えば、Jonesら、1986、Nature 321:522−525;Ri
echmannら、1988、Nature 332:323−327;Ver
hoeyenら、1988、Science 239:1534−1536を参
照のこと)。Carterら、1993、Proc.Natl.Acad.Sc
i.USA 89:4285、およびSimsら、1993、J.Immuno
l.151:2296もまた参照のこと。完全なヒトモノクローナル抗体を産生
するための方法としては、ファージディスプレイ法およびトランスジェニック動
物法が挙げられる(概要について、Vaughanら、1998、Nature
Biotechnology 16:535−539を参照のこと)。
【0070】 完全なヒトPC−LECTINモノクローナル抗体は、大きいヒトIg遺伝子
コンビナトリアルライブラリー(すなわち、ファージディスプレイ)を使用する
クローニング技術を使用して生成され得る(Protein Engineer
ing of Antibody Molecules for Prophy
lactic and Therapeutic Applications(
Man.Clark,M.編)、Nottingham Academic、4
5−64頁(1993)のGriffithsおよびHoogenboom、B
uilding an in vitro immune system:hu
man antibodies from phage display li
braries;BurtonおよびBarbas、Human Antibo
dies from combinatorial libraries(同書
)65−82頁)。完全なヒトPC−LECTINモノクローナル抗体はまた、
PCT特許出願WO98/24893(KucherlapatiおよびJak
obovitsら、1997年12月3日提出)に記載されるように、ヒト免疫
グロブリン遺伝子座を含むように操作されたトランスジェニックマウスを使用し
て産生され得る(Jakobovits、1998、Exp.Opin.Inv
est.Drugs 7(4):607−614もまた参照のこと)。この方法
は、ファージディスプレイ技術に必要とされるインビトロ操作を回避し、そして
高親和性の真正ヒト抗体を効率的に産生する。
【0071】 PC−LECTIN抗体のPC−LECTINタンパク質との反応性は、適切
には、PC−LECTINタンパク質、PC−LECTINペプチド、PC−L
ECTIN発現細胞またはその抽出物を使用する、多くの周知の手段(ウエスタ
ンブロット、免疫沈降、ELISAおよびFACS分析を含む)によって確証さ
れ得る。
【0072】 本発明のPC−LECTIN抗体またはそのフラグメントは、検出可能なマー
カーで標識され得るか、または第2の分子(例えば、細胞傷害性薬剤)に結合体
化され、そして第2の分子をPC−LECTIN陽性細胞に標的するために使用
され得る(Vitetta,E.S.ら、1993、Immunotoxin
therapy,in DeVita,Jr.,V.T.ら編、Cancer:
Principles and Practice of Oncology,
第4版,J.B.Lippoincott Co.,Philadelphia
,2624−2636)。細胞毒性薬剤の例としては、以下が挙げられが、これ
らに限定されない:リシン、リシンA鎖、ドキソルビシン、ダウノルビシン、タ
キソール、エチジウムブロマイド、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド(
tenoposide)、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ジヒ
ドロキシアントラセンジオン、アクチノマイシン、ジフテリア毒素、プセウドモ
ナス体外毒素(PE)A、PE40、アブリン、アブリンA鎖、モデシン(mo
deccin)A鎖、α−サルシン(sarcin)、ジェロニン(gelon
in)、マイトゲリン(mitogellin)、リトストリクトシン(ret
strictocin)、フェノマイシン、エノマイシン、クリシン(curi
cin)、クロチン(crotin)、カリケアマイシン(calicheam
icin、サパオナリア(sapaonaria)薬用インヒビター、グルココ
ルチコイド、および他の化学療法剤、ならびに放射性同位体(例えば、212Bi
131I、131In、90Y、および186Re)。適切な検出可能なマーカーとして
は、放射性同位体、蛍光化合物、生体発光化合物、化学発光化合物、金属キレー
ト剤または酵素が挙げられるが、これらに限定されない。抗体はまた、プロドラ
ックをその活性形態に変換し得る、抗癌プロドラック活性酵素に結合され得る。
例えば、米国特許第4,975,287号を参照のこと。
【0073】 さらに、2以上のPC−LECTINエピトープに特異的な二特異的抗体が、
当該分野で一般に公知の方法を使用して生成され得る。さらに、抗体効果機能は
、癌細胞上でのPC−LECTIN抗体の治療効果を増強するために改変され得
る。例えば、システイン残基は、Fc領域に操作され得、鎖間のジスルフィド結
合の形成、内在化、ADCCおよび/または補体媒介細胞死の能力を増強し得る
ホモダイマーの産生を可能にする(例えば、Caronら、1992、J,Ex
p.Med.176:1191−1195,Shopes,1992,J.Im
munol.148:2918−2922を参照のこと)。ホモダイマー性の抗
体もまた、当該分野で公知の架橋技術によって生成され得る(例えば、Wolf
fら、Cancer Res.53:2560−2565)。
【0074】 (PC−LECTINトランスジェニック動物) PC−LECTINまたはその改変形態をコードする核酸はまた、トランスジ
ェニック動物または「ノックアウト」動物のいずれかを生成するために使用され
得、これらの動物は、次いで、治療的に有用な試薬の開発およびスクリーニング
において有用である。トランスジェニック動物(例えば、マウスまたはラット)
は、導入遺伝子を含む細胞を有する動物であり、その導入遺伝子は、その動物に
、または出生前(例えば、胚段階)でその動物の祖先に導入される。導入遺伝子
は、細胞のゲノム内に組み込まれるDNAであり、トランスジェニック動物は、
その細胞から発生する。1つの実施形態において、PC−LECTINをコード
するcDNAが、確立された技術に従って、PC−LECTINコードするゲノ
ムDNAをクローニングするために使用され得、そしてそのゲノム配列は、PC
−LECTINをコードするDNAを発現する細胞を含むトランスジェニック動
物を生成するために使用され得る。
【0075】 トランスジェニック動物(特に、マウスまたはラットのような動物)を生成す
るための方法は、当該分野で慣用的となり、そして例えば、米国特許第4,73
6,866号および4,870,009号に記載される。代表的に、特定の細胞
が、組織特異的エンハンサーと共にPC−LECTIN導入遺伝子の組み込みの
ために標的化される。胚段階の動物の生殖系列に導入された、PC−LECTI
Nをコードする1コピーの導入遺伝子を含むトランスジェニック動物を使用して
、PC−LECTINをコードするDNAの発現の増大の効果を試験し得る。こ
のような動物は、例えば、その過剰発現と関連する病理学的状態からの防御を付
与することが考えられる試薬についての、試験動物として使用され得る。本発明
のこの局面に従って、動物をその試薬で処置し、そしてこの導入遺伝子を保有す
る処置していない動物と比較した、その病理学的状態の発生率の減少は、その病
理学的状態についての潜在的な治療的介入を示す。
【0076】 あるいは、PC−LECTINの非ヒトホモログを使用して、PC−LECT
IN「ノックアウト」動物を構築し得、この動物は、PC−LECTINをコー
ドする内因性遺伝子とその動物の胚細胞に導入されたPC−LECTINをコー
ドする改変ゲノムDNAと間の相同組換えの結果として、PC−LECTINを
コードする欠損性または改変型遺伝子を有する。例えば、PC−LECTINを
コードするcDNAを使用して、確立された技術に従って、PC−LECTIN
をコードするゲノムDNAをクローニングし得る。PC−LECTINをコード
するゲノムDNAの一部は、欠失され得るか、または別の遺伝子(例えば、組み
込みをモニターするために使用され得る、選択マーカーをコードする遺伝子)で
置換され得る。
【0077】 代表的に、数キロベースの変更されていない隣接DNA(5’末端および3’
末端の両方)が、そのベクターに含まれる(相同組換えベクターの記載について
は、例えば、ThomasおよびCapecchi、1987、Cell、51
:503を参照のこと)。このベクターは、胚性幹細胞株に(例えば、エレクト
ロポレーションによって)導入され、そして導入されたDNAが内因性のDNA
と相同組換えした細胞が、選択される(例えば、Liら、Cell、1992、
69:915を参照のこと)。次いで、この選択された細胞を、動物(例えば、
マウスまたはラット)の胚盤胞に導入し、凝集キメラを形成させる(例えば、B
radley、Teratocarcinomas and Embryoni
c Stem Cells:A Practical Approach、E.
J.Robertson編(IRL,Oxford、1987)、113−15
2頁を参照のこと)。
【0078】 次いで、キメラ性の胚を、適切な偽妊娠雌性養母動物に移植し、そしてその胚
は、満期まで育成させて、「ノックアウト」動物を作製し得る。生殖細胞中に相
同組換えされたDNAを有する子孫は、標準的な技術によって同定され得、そし
てその子孫を用いて、全ての細胞が相同組換えDNAを含む動物を育種し得る。
ノックアウト動物は、例えば、PC−LECTINポリペプチドの非存在に起因
する、特定の病理学的状態に対して防御する能力および病理学的状態の発生につ
いて、特徴付けられ得る。
【0079】 (PC−LECTINの検出のための方法) 本発明の別の局面は、PC−LECTINポリヌクレオチドおよびPC−LE
CTINタンパク質ならびにそれらの改変体を検出するための方法、ならびにP
C−LECTINを発現する細胞を同定するための方法に関する。PC−LEC
TINは、前立腺癌のリンパ節転移および骨転移に由来するLAPC異種移植片
において発現されるようであり、そしてPC−LECTINの発現プロフィール
は、それを転移された疾患についての潜在的な診断マーカーにする。この状況に
おいて、PC−LECTIN遺伝子産物の状態は、進行した状態の疾患に対する
感受性、進行速度および/または腫瘍の凝集性を含む、種々の因子を予測するた
めに有用な情報を提供し得る。以下で詳細に議論されるように、患者サンプル中
のPC−LECTIN遺伝子産物の状態は、以下を含む当該分野で周知の種々の
プロトコルによって分析され得る:免疫組織化学分析、インサイチュハイブリダ
イゼーションを含む種々のノーザンブロット技術、RT−PCR分析(例えば、
レーザー捕捉微小分析サンプルに対して)、ウエスタンブロット分析および組織
アレイ分析。
【0080】 より詳細には、本発明は、生物学的サンプル(例えば、血清、骨、前立腺およ
び他の組織、尿、精液、細胞調製物など)中のPC−LECTINポリヌクレオ
チドの検出のためのアッセイを提供する。検出可能なPC−LECTINポリヌ
クレオチドとしては、例えば、PC−LECTIN遺伝子またはそのフラグメン
ト、PC−LECTIN mRNA、選択的スプライシング改変体PC−LEC
TIN mRNA、およびPC−LECTINポリヌクレオチドを含む組換えD
NAもしくはRNA分子が挙げられる。PC−LECTINポリヌクレオチドを
増幅し、そして/またはPC−LECTINポリヌクレオチドの存在を検出する
ための多くの方法は、当該分野において周知であり、そして本発明のこの局面の
実施に用いられ得る。
【0081】 1つの実施形態において、生物学的サンプル中のPC−LECTIN mRN
Aを検出するための方法は、少なくとも1つのプライマーを使用して、逆転写に
よってサンプルからcDNAを産生する工程;その中のPC−LECTIN c
DNAを増幅するために、センスおよびアンチセンスのプライマーとしてPC−
LECTINポリヌクレオチドを使用して、そのように産生されたcDNAを増
幅する工程;および増幅されたPC−LECTIN cDNAの存在を検出する
工程、を包含する。必要に応じて、増幅されたPC−LECTIN cDNAの
配列が、決定され得る。別の実施形態において、生物学的サンプル中のPC−L
ECTIN遺伝子を検出する方法は、サンプルからゲノムDNAを最初に単離す
る工程;その中のPC−LECTIN遺伝子を増幅するために、センスおよびア
ンチセンスのプライマーとしてPC−LECTINポリヌクレオチドを使用して
単離されたゲノムDNAを増幅する工程;および増幅されたPC−LECTIN
遺伝子の存在を検出する工程、を包含する。任意の多くの適切なセンスプローブ
およびアンチセンスプローブの組合せが、PC−LECTINについて提供され
るヌクレオチド配列(図1A〜1D;配列番号1)から設計され、そしてこの目
的のために使用され得る。
【0082】 本発明はまた、他の生物学的サンプルの組織(例えば、血清、骨、前立腺、お
よび他の組織、尿、細胞調製物など)中のPC−LECTINタンパク質の存在
を検出するためのアッセイを提供する。PC−LECTINタンパク質を検出す
るための方法もまた、周知であり、そして例えば、免疫沈降、免疫組織化学分析
、ウエスタンブロット分析、分子結合アッセイ、ELISA、ELIFAなどが
挙げられる。例えば、1つの実施形態において、生物学的サンプル中のPC−L
ECTINタンパク質の存在を検出する方法は、PC−LECTIN抗体、その
PC−LECTIN反応性フラグメント、またはPC−LECTIN抗体の抗原
結合領域を含む組換えタンパク質と、サンプルとを最初に接触させる工程;なら
びに次いで、それに対するサンプル中のPC−LECTINタンパク質の結合を
検出する工程、を包含する。
【0083】 PC−LECTINを発現する細胞を同定するための方法もまた、提供される
。1つの実施形態において、PC−LECTIN遺伝子を発現する細胞を同定す
るためのアッセイは、細胞中のPC−LECTIN mRNAの存在を検出する
ための工程を包含する。細胞中の特定のmRNAを検出するための方法は、周知
であり、そして例えば、相補DNAプローブを使用するハイブリダイゼーション
アッセイ(例えば、標識されたPC−LECTINリボプローブを使用するイン
サイチュハイブリダイゼーション、ノーザンブロットおよび関連技術)ならびに
種々の核酸増幅アッセイ(例えば、PC−LECTINに特異的な相補プライマ
ーを使用するRT−PCR、および例えば、分岐DNA、SISBA、TMAな
どの他の増幅型検出方法)が挙げられる。あるいは、PC−LECTIN遺伝子
を発現する細胞を同定するためのアッセイは、細胞中のPC−LECTINSタ
ンパク質または細胞によって分泌されたPC−LECTINタンパク質の存在を
検出する工程を包含する。タンパク質を検出するための種々の方法が、当該分野
において周知であり、そしてPC−LECTINタンパク質およびPC−LEC
TIN発現細胞の検出のために用いられ得る。
【0084】 PC−LECTIN発現分析はまた、PC−LECTIN遺伝子発現を調節す
る薬剤を同定かつ評価するためにツールとして有用であり得る。例えば、PC−
LECTIN発現は、正常な精巣および前立腺癌に限定され、そしてPC−LE
CTINはまた、他の癌において発現され得る。癌細胞でのPC−LECTIN
発現または過剰発現を阻害し得る分子または生物学的薬剤の同定は、治療上の価
値があり得る。このような薬剤は、RT−PCR、核酸ハイブリダイゼーション
または抗体結合によってPC−LECTIN発現を定量するスクリーニングを使
用して、同定され得る。
【0085】 (PC−LECTINおよびその産物の状態のモニタリング) 個体におけるPC−LECTIN遺伝子およびPC−LECTIN遺伝子産物
の状態を評価するアッセイは、この個体に由来する生物学的サンプルの増殖また
は腫瘍能力に関する情報を提供し得る。例えば、PC−LECTIN mRNA
は、正常組織に比べて前立腺癌においてかなり多く発現されるので、生物学的サ
ンプル中のPC−LECTIN mRNA転写物またはタンパク質の相対レベル
を評価するアッセイは、PC−LECTIN調節不全と関連する疾患(例えば、
癌)を診断するために使用され得、そして適切な治療オプションを規定するに有
用である予後情報を提供し得る。同様に、生物学的サンプルにおけるPC−LE
CTINヌクレオチドおよびアミノ配列の完全性を評価するアッセイもまた、こ
の状況において使用され得る。
【0086】 PC−LECTIN mRNAが前立腺癌においてかなり多く発現され、そし
て正常組織においてほとんど発現されないという知見は、この遺伝子が細胞増殖
の調節不全に関連するという証拠を提供し、それによってこの遺伝子およびその
産物を、当業者がPC−LECTIN調節不全に関連する疾患を有することが疑
われる個体由来の生物学的サンプルを評価するために使用し得る標的として同定
する。別の例において、PC−LECTINの発現が精巣に限定されるので、転
移の指標としてPC−LECTIN発現を検出するために、他の組織から採取し
た生物学的サンプルを評価し得る。この状況において、PC−LECTIN遺伝
子およびその産物の発現状態の評価は、組織サンプルに潜在的な疾患に関する情
報を得るために使用され得る。この状況における用語「発現状態」は、遺伝子お
よびその産物の発現、機能および調節(例えば、mRNA発現レベル、発現され
た遺伝子産物(例えば、核酸およびアミノ酸配列)の完全性、ならびにこれらの
分子に対する転写改変および翻訳改変)に関与する種々の因子を広範にいうため
に使用される。
【0087】 PC−LECTINの発現状態は、特定の疾患の状態、進行および/または腫
瘍攻撃性に対する感受性を推定するために有用な情報を提供し得る。本発明は、
PC−LECTIN発現状態を決定し、そしてPC−LECTINを発現する癌
(例えば、前立腺癌、乳癌、膀胱癌、肺癌、骨の癌、結腸癌、膵臓癌、精巣癌、
子宮頸部癌および卵巣癌)を診断するための方法およびアッセイを提供する。特
定のサンプルにおけるPC−LECTIN発現状態は、当該分野で周知の多数の
手段(免疫組織化学的分析、インサイチュハイブリダイゼーション、レーザ捕捉
マイクロ精査(micro−dessected)サンプルに対するRT−PC
R分析、臨床サンプルおよび細胞株のウエスタンブロット分析、ならびに組織ア
レイ分析が挙げられるがこれらに限定されない)によって分析され得る。PC−
LECTIN遺伝子および遺伝子産物の発現状態を評価するための代表的なプロ
トコルは、例えば、Current Protocols In Molecu
lar Biology,Units 2[Northern Blottin
g],4[Southern Blotting],15[Immunoblo
tting]および18[PCR Analysis],Frederick
M.Ausubulら(編)(1995)に見出され得る。 1つの局面において、本発明は、細胞増殖の調節不全と関連する疾患(例えば
、過形成または癌)を有すると疑われる個体に由来する試験組織サンプル中の細
胞によって発現されるPC−LECTIN遺伝子産物の状態を決定して、次いで
そのように決定された状態を、対応する正常サンプル中のPC−LECTIN遺
伝子産物の状態に対して比較することによってPC−LECTIN遺伝子産物を
モニタリングするための方法であって、正常サンプルと比較して試験サンプルに
おける異常なPC−LECTIN遺伝子産物の存在は、この個体の細胞において
細胞増殖の調節不全の存在を指標を提供する、方法を提供する。
【0088】 別の局面において、本発明は、個体における癌の存在の決定に有用なアッセイ
を提供する。このアッセイは、対応する正常細胞または組織における発現レベル
と比べて、試験細胞サンプルまたは組織サンプルにおけるPC−LECTIN
mRNAまたはタンパク質の発現における有意な増加を検出する工程を包含する
。PC−LECTIN mRNAの存在は、例えば、組織サンプル(結腸、肺、
前立腺、膵臓、膀胱、乳房、卵巣、頸部、精巣、頭部および首、脳、胃、骨など
が挙げられるが、これらに限定されない)において評価され得る。任意のこれら
の組織におけるPC−LECTINの有意な発現の存在は、これらの癌の発生、
存在および/または重篤度、または別の組織に由来する癌の転移を示すために有
用であり得る。なぜなら、対応する正常組織は、PC−LECTIN mRNA
を発現しないか、またはこれを低レベルで発現するからである。
【0089】 関連する実施形態において、PC−LECTIN発現状態は、核酸レベルでは
なくタンパク質レベルで決定され得る。例えば、このような方法またはアッセイ
は、試験組織サンプル中の細胞によって発現されるPC−LECTINタンパク
質のレベルを決定する工程、およびそのように決定されたレベルを、対応する正
常サンプルにおいて発現されるPC−LECTINのレベルに対して比較する工
程を包含する。1つの実施形態において、PC−LECTINタンパク質の存在
は、例えば、免疫組織化学方法を使用して評価される。PC−LECTINタン
パク質発現を検出し得るPC−LECTIN抗体または結合パートナーが、この
目的のために、当該分野で周知の種々のアッセイ形式で使用され得る。
【0090】 他の関連する局面において、これらの分子の構造における混乱(pertur
bation)(例えば、挿入、欠失、置換など)を同定するために、生物学的
サンプル中のPC−LECTINヌクレオチドおよびアミノ酸配列の完全性を評
価し得る。このような実施形態は、有用である。なぜなら、ヌクレオチドおよび
アミノ酸配列における混乱は、増殖調節不全の表現型と関連する多くのタンパク
質で観察されるからである(例えば、Marrogiら、J.Cutan.Pa
thol.26(8):369〜378(1999)を参照のこと)。この状況
において、ヌクレオチドおよびアミノ酸配列における混乱を観察するための広範
な種々のアッセイが、当該分野において周知である。例えば、PC−LECTI
N遺伝子産物の核酸配列またはアミノ酸配列のサイズおよび構造は、本明細書中
で議論されるノーザン、サザン、ウエスタン、PCRおよびDNA配列決定プロ
トコルによって観察され得る。さらに、ヌクレオチドおよびアミノ酸配列におけ
る混乱を観察するための他の方法(例えば、一本鎖高次構造多型分析)が、当該
分野で周知である(例えば、米国特許第5,382,510号および同第5,9
52,170号を参照のこと)。
【0091】 別の実施形態において、生物学的サンプル中のPC−LECTIN遺伝子のメ
チル化状態を試験し得る。遺伝子の5’調節領域におけるCpG島の異常な脱メ
チル化および/または過メチル化(hypermethylation)はしば
しば、不死化され形質転換された細胞において生じ、そして様々な遺伝子の改変
された発現を生じ得る。例えば、パイクラスのグルタチオンS−トランスフェラ
ーゼ(正常な前立腺において発現されるが、前立腺癌の90%より多くでは発現
されないタンパク質)のプロモーターの過メチル化は、この遺伝子の転写を永久
的に止めるようであり、前立腺癌において最も頻繁に検出されるゲノム変化であ
る(De Marzoら、Am.J.Pathol.155(6):1985〜
1992(1999))。さらに、この変化は、高度な前立腺上皮新形成(PI
N)の少なくとも70%の場合に存在する(Brooksら、Cancer E
pidemiol.Biomarkers Prev.,1998,7:531
〜536)。
【0092】 別の例において、LAGE−I腫瘍特異的遺伝子(これは、正常な前立腺にお
いて発現しないが、25〜50%の前立腺癌において発現する)の発現は、リン
パ芽球腫細胞中のデオキシアザシチジンによって引き起こされ、このことは腫瘍
発現が脱メチル化に起因することを示唆している(Letheら、1998,I
nt.J.Cancer 76(6):903〜908)。この状況において、
遺伝子のメチル化状態を試験するための様々なアッセイが、当該分野で周知であ
る。例えば、サザンハイブリダイゼーションアプローチにおいて、CpG島の全
メチル化状態を評価するために、メチル化CpG部位を含む配列を切断し得ない
メチル化感受性制限酵素を使用し得る。
【0093】 さらに、MSP(メチル化特異的PCR)は、所定の遺伝子のCpG島に存在
する全てのCpG部位のメチル化状態を迅速にプロフィールし得る。この手順は
、重亜硫酸ナトリウムによるDNAの最初の改変(これは、全てのメチル化され
ていないシトシンをウラシルに変換する)、続いてメチル化されたDNA対メチ
ル化されていないDNAに対して特異的なプライマーを使用する増幅を包含する
。メチル化の妨害を包含するプロトコルはまた、Current Protoc
ols In Molecular Biology,Units 12,Fr
ederick M.Ausubelら編、1995の実施例に見出され得る。
【0094】 別の関連する実施形態において、本発明は、個体における癌の存在の決定に有
用なアッセイを提供する。このアッセイは、対応する正常細胞または組織におけ
る発現レベルに対して、試験細胞サンプルまたは組織サンプル中に発現されるP
C−LECTIN選択的スプライシング改変体における有意な変化を検出する工
程を包含する。PC−LECTIN選択的スプライシング改変体のモニタリング
は、有用である。なぜなら、タンパク質の選択的スプライシングの変化は、癌の
進行を引き起こす一連の事象における段階の1つとして示唆されるからである(
例えば、Garstensら、Oncogene 15(250:3059〜3
065(1997)を参照のこと)。
【0095】 遺伝子増幅は、PC−LECTINの状態を評価するさらなる方法を提供する
。遺伝子増幅は、サンプルにおいて、例えば、本明細書中に提供される配列に基
づいて、適切な標識プローブを使用して、従来のサザンブロッティング、mRN
Aの転写を定量するノーザンブロッティング[Thomas,Proc.Nat
l.Acad.Sci.USA,77:5201〜5205(1980)]、ド
ットブロッティング(DNA分析)、またはインサイチュハイブリダイゼーショ
ンによって直接的に測定され得る。あるいは、特定の二重鎖(例えば、DNA二
重鎖、RNA二重鎖、およびDNA−RNAハイブリッド二重鎖またはDNA−
タンパク質二重鎖を含む)を認識し得る抗体が、用いられ得る。次いで、この抗
体が、標識され得、そしてアッセイ(ここで二重鎖が表面に結合され、その結果
、この表面上での二重鎖の形成により、二重鎖に結合した抗体の存在が検出され
得る)が、行われ得る。
【0096】 上記で議論される組織に加えて、末梢血が、PC−LECTIN発現を検出す
るためにRT−PCRを使用して、癌細胞(前立腺癌を含むがこれに限定されな
い)の存在について従来通りにアッセイされ得る。RT−PCRにより増幅可能
なPC−LECTIN mRNAの存在は、癌の存在の指標を提供する。末梢血
中の腫瘍細胞についてのRT−PCR検出アッセイは、多数のヒト固形腫瘍の診
断および管理における使用について現在評価されている。前立腺癌の分野におい
て、これらは、PSAおよびPSMを発現する細胞の検出のためのRT−PCR
アッセイを含む(Verkaikら、1997、Urol.Res.25:37
3〜384:Ghosseinら,1995,J.Clin.Oncol.13
:1195〜2000;Hestonら,1995,Clin.Chem.41
:1687〜1688)。RT−PCRアッセイは、当該分野で周知である。
【0097】 本発明の関連する局面は、個体における癌の発症の感受性の推定に関する。1
つの実施形態において、癌に対する感受性を推定するための方法は、組織サンプ
ル中のPC−LECTIN mRNAまたはPC−LECTINタンパク質を検
出する工程であって、その存在が、癌に対する感受性を示し、ここで存在するP
C−LECTIN mRNA発現の程度が感受性の程度に比例する、工程を提供
する。特定の実施形態において、前立腺組織中のPC−LECTINの存在が、
試験され、ここでこのサンプル中のPC−LECTINの存在は、前立腺癌の感
受性(または前立腺腫瘍の発生もしくは存在)の指標を提供する。密接に関連す
る実施形態において、これらの分子の構造における混乱(例えば、挿入、欠失、
置換など)を同定するために、生物学的サンプルにおけるPC−LECTINヌ
クレオチドおよびアミノ酸配列の完全性を評価し得、ここでサンプル中のPC−
LECTIN遺伝子産物における1以上の混乱の存在が、癌の感受性(または前
立腺腫瘍の発生もしくは存在)の指標を提供する。
【0098】 本発明のなお別の関連する局面は、腫瘍攻撃性を測定するための方法に関する
。1つの実施形態において、腫瘍の攻撃性を測定するための方法は、腫瘍サンプ
ル中の細胞によって発現されるPC−LECTIN mRNAまたはPC−LE
CTINタンパク質のレベルを決定する工程、そのように決定されたレベルを、
同じ個体から採取された対応する正常組織または正常組織参照サンプル中に発現
されるPC−LECTIN mRNAまたはPC−LECTINタンパク質のレ
ベルに対して比較する工程であって、ここで正常サンプルに対する腫瘍サンプル
におけるPC−LECTIN mRNAまたはPC−LECTINタンパク質発
現の程度が、攻撃性の程度を示す、工程を包含する。特定の実施形態において、
前立腺腫瘍の攻撃性は、PC−LECTINが腫瘍細胞中に発現される程度を決
定することによって評価され、ここでより高い発現レベルは、より攻撃性の腫瘍
を示す。密接に関連する実施形態において、これらの分子の構造における混乱(
例えば、挿入、欠失、置換など)を同定するために、生物学的サンプルにおける
PC−LECTINヌクレオチドおよびアミノ酸配列の完全性を評価し得、ここ
で1以上の混乱の存在は、より攻撃性の腫瘍を示す。
【0099】 本発明のなお別の関連する局面は、個体の悪性疾患の進行を経時的に観察する
ための方法に関する。1つの実施形態において、個体における悪性疾患の進行を
経時的に観察するための方法は、腫瘍サンプル中の細胞によって発現されるPC
−LECTIN mRNAまたはPC−LECTINタンパク質のレベルを決定
する工程、そのように決定されたレベルを、同じ個体から異なる時間に採取され
た等価な組織サンプル中に発現されるPC−LECTIN mRNAまたはPC
−LECTINタンパク質のレベルに対して比較する工程であって、ここで腫瘍
サンプルにおける経時的なPC−LECTIN mRNAまたはPC−LECT
INタンパク質発現の程度が、癌の進行に関する情報を提供する、工程を包含す
る。特定の実施形態において、癌の進行は、腫瘍細胞におけるPC−LECTI
N発現が経時的に変化する程度を決定することによって評価され、ここでより高
い発現レベルは、癌の進行を示す。密接に関連する実施形態において、これらの
分子の構造における混乱(例えば、挿入、欠失、置換など)を同定するために、
生物学的サンプル中のPC−LECTINヌクレオチドおよびアミノ酸配列の完
全性を評価し得、ここで1以上の混乱の存在は、癌の進行を示す。
【0100】 上記の診断アプローチは、当該分野で公知の種々の予後プロトコルおよび診断
プロトコルのいずれか1つと組み合わされ得る。例えば、本明細書中に開示され
る本発明の別の実施形態は、組織サンプルの状態を診断し、かつ予後を判定する
手段として、PC−LECTIN遺伝子およびPC−LECTIN遺伝子産物の
発現(またはPC−LECTIN遺伝子およびPC−LECTIN遺伝子産物に
おける混乱)と、悪性疾患に関連する因子との間の一致を観察するための方法に
関する。この状況において、悪性疾患に関連する広範な種々の因子(例えば、そ
うでなければ悪性疾患と関連する遺伝子の発現(PSA、PSCAおよびPSM
発現を含む))および肉眼的細胞学的観察(例えば、Bockingら,Ana
l Quant Cytol.6(2):74〜88(1984);Eptse
in,Hum Pathol.1995年2月;26(2)223〜9(199
5);Thorsonら,Mod Pathol.1998;11(6):54
3〜51;Baisdenら,Am.J.Surg Pathol.23(8)
:918〜24(1999)を参照のこと)が、利用され得る。PC−LECT
IN遺伝子およびPC−LECTIN遺伝子産物の発現(またはPC−LECT
IN遺伝子およびPC−LECTIN遺伝子産物における混乱)と、悪性疾患に
関連するさらなる因子との間の一致を観察するための方法が、有用である。なぜ
なら、例えば、一致する一連のまたは一群の特定の因子の存在は、組織サンプル
の状態を診断し、かつ予後を判定するために重要な情報を提供するからである。
【0101】 代表的な実施形態において、PC−LECTIN遺伝子およびPC−LECT
IN遺伝子産物の発現(またはPC−LECTIN遺伝子およびPC−LECT
IN遺伝子産物における混乱)と、悪性疾患に関連する因子との間の一致を観察
するための方法は、組織サンプルにおいて、PC−LECTIN mRNAまた
はタンパク質の過剰発現を検出する工程、組織サンプルにおいてPSA mRN
Aまたはタンパク質の過剰発現を検出する工程、ならびにPC−LECTIN
mRNAまたはタンパク質の過剰発現とPSA mRNAまたはタンパク質の過
剰発現との一致を観察する工程を包含する。特定の実施形態において、前立腺組
織におけるPC−LECTIN mRNAおよびPSA mRNAの発現が、試
験される。好ましい実施形態において、サンプルにおけるPC−LECTIN
mRNA過剰発現とPSA mRNA過剰発現との一致は、前立腺癌、前立腺癌
感受性、または前立腺腫瘍の発生もしくは存在の指標を提供する。
【0102】 PC−LECTIN mRNAまたはタンパク質の発現を検出および定量する
ための方法が、本明細書中に開示され、そして標準的な核酸およびタンパク質の
検出技術および定量技術の使用が、当該分野において周知である。PC−LEC
TIN mRNAの検出および定量のための標準的な方法としては、標識された
PC−LECTINリボプローブを使用するインサイチュハイブリダイゼーショ
ン、PC−LECTINポリヌクレオチドプローブを使用するノーザンブロット
および関連する技術、PC−LECTINに特異的なプライマーを使用するRT
−PCR分析、ならびに他の増幅型検出方法(例えば、分岐DNA、SISBA
、TMAなど)が挙げられる。特定の実施形態において、半定量的RT−PCR
が、以下の実施例に記載されるように、PC−LECTIN mRNA発現を検
出および定量するために使用され得る。PC−LECTINを増幅し得る任意の
数のプライマー(本明細書中に詳細に記載される種々のプライマーセットを含む
がこれらに限定されない)が、この目的のために使用され得る。タンパク質の検
出および定量のための標準的な方法が、この目的のために使用され得る。特定の
実施形態において、野生型PC−LECTINタンパク質と特異的に反応するポ
リクローナル抗体またはモノクローナル抗体が、生検組織の免疫組織化学的アッ
セイにおいて使用され得る。
【0103】 (PC−LECTINと相互作用する分子の同定) 本明細書中に開示されるPC−LECTINタンパク質配列により、当業者は
、種々の当該分野で受け入れられるプロトコルのいずれか1つを通じて、この配
列と相互作用する分子を同定し得る。例えば、種々のいわゆる相互作用捕捉系(
「ツーハイブリッドアッセイ」ともいわれる)のうちの1つを利用し得る。この
ような系において、相互作用する分子は、転写因子およびレポーター遺伝子の直
接的な発現を再構成し、次いで、その発現をアッセイする。代表的な系は、真核
生物転写アクチベーターの再構成を通じて、インビボでタンパク質間相互作用を
同定し、そして例えば、米国特許第5,955,280号、同第5,925,5
23号、同第5,846,722号および同第6,004,746号に開示され
ている。
【0104】 あるいは、ペプチドライブラリーをスクリーニングすることによって、PC−
LECTINタンパク質配列と相互作用する分子を同定し得る。このような方法
において、選択されたレセプター分子(例えば、PC−LECTIN)に結合す
るペプチドが、アミノ酸の無作為または制御された収集物をコードするライブラ
リーをスクリーニングすることによって同定される。このライブラリーによって
コードされるペプチドは、バクテリオファージコートタンパク質の融合タンパク
質として発現され、次いで、バクテリオファージ粒子が、目的のレセプターに対
してスクリーニングされる。それによって、広範な種々の使用(例えば、治療用
試薬または診断用試薬)を有するペプチドが、予期されるリガンド分子またはレ
セプター分子の構造に関する任意の予備情報を必要することなく同定され得る。
PC−LECTINタンパク質配列と相互作用する分子を同定するために使用さ
れ得る代表的なペプチドライブラリーおよびスクリーニング方法が、例えば、米
国特許第5,723,286号および同第5,773,731号に開示されてい
る。
【0105】 あるいは、PC−LECTINを発現する細胞株が、PC−LECTINによ
って媒介されるタンパク質間相互作用を同定するために使用され得る。この可能
性は、他の研究者によって示されるような免疫沈降技術(Hamilton B
Jら、Biochem.Biophys.Res.Commun.1999,2
61:646〜51)を使用して試験され得る。代表的には、PC−LECTI
Nタンパク質は、抗PC−LECTIN抗体を使用して、PC−LECTINを
発現している前立腺癌細胞株から免疫沈降され得る。あるいは、Hisタグに対
する抗体が、(例えば、上記のベクターを使用して)PC−LECTINを発現
するように操作された細胞株において使用され得る。免疫沈降した複合体は、ウ
エスタンブロッティング、タンパク質の35S−メチオニン標識、タンパク質微量
配列決定、銀染色および2次元ゲル電気泳動のような手順によってタンパク質の
結合に対して試験され得る。
【0106】 このようなスクリーニングアッセイの関連する実施形態としては、PC−LE
CTINと相互作用する低分子を同定するための方法が挙げられる。代表的な方
法は、例えば、米国特許第5,928,868号に議論されており、そして少な
くとも1つのリガンドが低分子であるハイブリッドリガンドを形成するための方
法が挙げられる。例示的な実施形態において、このハイブリッドリガンドは、細
胞中に導入され、次いでこの細胞は、第1および第2の発現ベクターを含む。各
発現ベクターは、転写モジュールについてのコード配列に連結された標的タンパ
ク質をコードするハイブリッドタンパク質を発現するためのDNAを含む。各細
胞は、レポーター遺伝子をさらに含み、その発現は、第1および第2のハイブリ
ッドタンパク質の互いに対する近接性の条件下に置かれており、ハイブリッドリ
ガンドが、両方のハイブリッドタンパク質上の標的部位に結合する場合のみに、
事象が生じる。レポーター遺伝子を発現するそれらの細胞が選択され、そして未
知の低分子または未知のハイブリッドタンパク質が、同定される。
【0107】 本発明の代表的な実施形態は、図1A〜1D(配列番号2)に示されるPC−
LECTINアミノ酸配列と相互作用する分子についてスクリーニングする方法
からなる。この方法は、分子集団とPC−LECTINアミノ酸配列とを接触さ
せる工程、相互作用を促進する条件下で、分子集団とPC−LECTINアミノ
酸配列とを相互作用させる工程、PC−LECTINアミノ酸配列と相互作用す
る分子の存在を決定する工程、次いでPC−LECTINアミノ酸配列と相互作
用する分子からPC−LECTINアミノ酸配列と相互作用しない分子を分離す
る工程を包含する。特定の実施形態において、この方法はさらに、PC−LEC
TINアミノ酸配列と相互作用する分子を精製する工程を包含する。好ましい実
施形態において、PC−LECTINアミノ酸配列は、ペプチドのライブラリー
と接触される。
【0108】 (治療方法および組成物) PC−LECTINの前立腺腫瘍関連タンパク質としての同定は、このような
癌の処置に対する多くの治療アプローチを開放する。上記で議論されるように、
PC−LECTINは、糖部分に結合し、そして侵撃、接着または転移に関与し
得る。さらに、PC−LECTINな、治療のために標的とされ得る細胞表面上
にエピトープを提示する。
【0109】 PC−LECTINの発現プロフィールは、MAGE、PSA、およびPMS
Aを暗示し、MAGE、PSA、およびPMSAは、黒色腫および他の癌にてア
ップレギュレートされる、組織特異的遺伝子である(Van de Eynde
およびBoon、Int J Clin Lab Res.27:81〜86、
1997)。癌におけるその組織特異的発現および高レベル発現に起因して、こ
れらの分子は、癌ワクチンについての標的として現在調査されている(Durr
ant、Anticancer Drugs 8:727〜733、1997;
Reynoldsら、Int J Cancer 72:972〜976、19
97)。PC−LECTINの発現パターンは、PC−LECTINが同様に、
前立腺癌および他の癌に対する癌ワクチンアプローチのための潜在的標的である
という証拠を提供する。なぜなら、その発現が最も正常な組織に限定されるから
である。潜在的レセプターとしてのその構造的特徴もまた、PC−LECTIN
が、低分子標的であり得ること、ならびに抗体に基づく治療ストラテジーのため
の標的であり得ることの証拠を提供する。この治療ストラテジーは、分子のカル
シウム輸送機能を阻害するかまたはPC−LECTIN分子自体を標的化するよ
うに設計され得る。
【0110】 従って、PC−LECTINの細胞外部分を標的とする治療アプローチまたは
PC−LECTINタンパク質の活性を阻害することを目指す治療アプローチが
、前立腺癌、精巣癌、およびPC−LECTINを発現する他の癌に罹患する患
者に有用であることが予期される。PC−LECTINタンパク質の活性を阻害
することを目指す治療アプローチは、一般的に、2つの種類に分類される。1つ
の種類は、その結合パートナーまたは他のタンパク質との、PC−LECTIN
タンパク質の結合または会合を阻害するための、種々の方法を包含する。別の種
類は、PC−LECTIN遺伝子の転写またはPC−LECTIN mRNAの
翻訳を阻害するための、種々の方法を包含する。
【0111】 (抗体に基づく治療のための細胞表面標的としてのPC−LECTIN) PC−LECTINの構造的特徴は、この分子がおそらく細胞表面抗原である
ことを示し、抗体に基づく治療ストラテジーのための魅力的な標的を提供する。
PC−LECTINは最も正常な細胞では発現されず、癌細胞にて発現されるの
で、PC−LECTIN免疫反応性組成物の全身投与は、非標的器官および非標
的組織へのその免疫治療分子の結合により引き起こされる、毒性効果、非特異的
効果および/または非標的効果のない、良好な感受性を示すことが予期される。
PC−LECTINの細胞外ドメインと特異的に反応性である抗体は、毒素また
は治療薬剤との結合体、あるいは細胞の増殖または機能を阻害し得る裸の抗体の
いずれかとして、PC−LECTINを発現する癌を全身的に処置するために有
用であり得る。
【0112】 PC−LECTIN抗体は、癌細胞上のPC−LECTINにその抗体が結合
しかつ細胞および腫瘍の破壊を媒介し、かつ/または細胞もしくは腫瘍の増殖を
阻害するように、患者に導入され得る。このような抗体が治療効果を発揮する機
構は、補体媒介性細胞溶解、抗体依存性細胞性細胞傷害、PC−LECTINの
生理学的機能を調節すること、リガンド結合またはシグナル伝達経路を阻害する
こと、腫瘍細胞分化を調節すること、腫瘍脈管形成因子プロフィールを変化させ
ること、および/またはアポトーシスを誘導することを包含し得る。PC−LE
CTIN抗体は、毒性薬剤または治療薬剤に結合され得、そしてPC−LECT
INを保有する腫瘍細胞に直接その毒性薬剤または治療薬剤を送達するために使
用され得る。毒性薬剤の例としては、カルケマイシン(calchemicin
)、マイタンシノイド(maytansinoid)、放射性同位体(例えば、 131 I、イットリウム、およびビスマス)が挙げられるが、これらに限定されな
い。
【0113】 抗PC−LECTIN抗体を使用する癌免疫治療法は、以下を含むがこれらに
限定されない、他の型の癌の処置にて首尾良く使用されている種々のアプローチ
から生じる技術に従い得る:結腸癌(Arlenら、1998、Crit.Re
v.Immunol.18:133〜138)、多発性骨髄腫(Ozakiら、
1997、Blood 90:3179〜3186;Tsunenariら、1
997、Blood 90:2437〜2444)、胃癌(Kasprzykら
、1992、Cancer Res.52:2771〜2776)、B細胞リン
パ腫(Funakoshiら、1996、J.Immunother.Emph
asis Tumor Immunol.19:903〜101)、白血病(Z
hongら、1996、Leuk.Res.20:581〜589)、結腸直腸
癌(Mounら、1994、Cancer Res.54:6160〜6166
;Veldersら、1995、Cancer Res.55:4398〜44
03)、および乳癌(Shepardら、1991、J.Clin.Immun
ol.11:117〜127)。いくつかの治療アプローチは、毒素への裸の抗
体の結合(例えば、抗CD20抗体への131Iの結合(例えば、RituxanT M 、IDEC Pharmaceuticals Corp.)を含むが、一方
他のアプローチは、抗体と他の治療薬剤との(例えば、HerceptinTM
トラスツズマブ(trastuzumab)とパクリタキセル(Genente
ch,Inc.)との)同時投与を含む。前立腺癌の処置のために、例えば、P
C−LECTIN抗体が、照射、化学療法またはホルモン切除と組み合わせて、
投与され得る。
【0114】 PC−LECTIN抗体治療は癌のすべての病期について有用であり得るが、
抗体治療は、進行性または転移性の癌にて特に適切であり得る。本発明の抗体療
法での処置は、以前に1つ以上の化学療法を受けている患者に示され得、一方、
化学療法レジメンまたは照射レジメンと本発明の抗体療法を組み合わせることが
、化学療法処置を受けていない患者に好ましくあり得る。さらに、抗体療法は、
減少した投薬量の同時化学療法の使用を、特に、非常に十分にはその化学療法薬
剤の毒性を許容しない患者にとって、可能にし得る。 好ましくは、腫瘍組織の免疫組織化学的評価、定量的PC−LECTIN画像
化、またはPC−LECTIN発現の存在および程度を確かに示し得る他の技術
を使用して、何人かの癌患者がPC−LECTIN発現の存在およびレベルにつ
いて評価されることは、好ましくあり得る。腫瘍生検または外科的生検の免疫組
織化学分析が、この目的に好ましくあり得る。腫瘍組織の免疫組織化学的分析の
ための方法が、当該分野で周知である。
【0115】 前立腺癌および他の癌を処置する際に有用な抗PC−LECTINモノクロー
ナル抗体としては、その腫瘍に対する強力な免疫応答を示し得る抗体、および直
接細胞傷害性であり得る抗体が挙げられる。これに関して、抗PC−LECTI
Nモノクローナル抗体(mAb)は、補体媒介性細胞傷害または抗体依存性細胞
傷害(ADCC)のいずれかの機構によって、腫瘍細胞溶解を惹起し得、これら
の機構の両方が、エフェクター細胞Fcレセプター部位または補体タンパク質と
の相互作用のために、その免疫グロブリン分子のインタクトなFc部分を必要と
する。さらに、腫瘍増殖に対する直接の生物学的効果を発揮する抗PC−LEC
TIN mAbが、本発明の実施にて有用である。このような直接細胞傷害性の
モノクローナル抗体が作用し得る可能な機構としては、細胞増殖の阻害、細胞分
化の調節、腫瘍脈管形成因子プロフィールの調節、およびアポトーシスの誘導が
、挙げられる。特定の抗PC−LECTIN mAbが抗腫瘍効果を発揮する機
構は、当該分野で一般的に知られているように、ADCC、ASMCC、補体媒
介性細胞溶解などを決定するように設計されたかなり多数のインビトロアッセイ
を使用して、評価され得る。
【0116】 マウスまたは他の非ヒトのモノクローナル抗体の使用、あるいはヒト/マウス
キメラ mAb抗体の使用が、何人かの患者で、中程度から強力な免疫応答を誘
導し得る。いくつかの場合において、これは、循環からの抗体のクリアランスお
よび減少した効力をもたらす。最も深刻な場合において、このような免疫応答は
、潜在的に腎不全を引き起こし得る、免疫複合体の広範な形成をもたらし得る。
従って、本発明の治療法の実施にて使用される好ましいモノクローナル抗体は、
高い親和性で標的PC−LECTIN抗原に特異的に結合するが、患者において
低い抗原性を示すかまたは全く抗原性を示さない、完全にヒトであるかまたはヒ
ト化されているかのいずれかである抗体である。
【0117】 本発明の治療法は、単一の抗PC−LECTIN mAb抗体の投与、ならび
に異なるmAb抗体の組み合わせまたはカクテルの投与を意図する。このような
mAbカクテルは、それらが、異なるエピトープを標的とするmAbを含むか、
異なるエフェクター機構を使用するか、または免疫エフェクター機能性に依存す
るmAbと直接細胞傷害性mAbを組み合わせるのと同じ程度だけ、特定の利点
を有し得る。組み合わせたこのようなmAbは、相乗的治療効果を示し得る。さ
らに、抗PC−LECTIN mAbの投与は、種々の化学療法薬剤、アンドロ
ゲン遮断薬、および免疫モジュレーター(例えば、IL−2、GM−CSF)を
含むがこれらに限定されない、他の治療薬剤と組合され得る。抗PC−LECT
IN mAbは、その「裸」の形態または非結合形態で投与され得るし、または
それらに結合した治療薬剤を有し得る。
【0118】 抗PC−LECTIN抗体処方物は、腫瘍部位にその抗体を送達し得る任意の
経路を介して投与され得る。投与の潜在的に有効な経路としては、静脈内経路、
腹腔内経路、筋肉内経路、腫瘍内経路、皮内経路などが挙げられるが、これらに
限定されない。処置は一般的に、受容可能な投与経路(例えば、静脈注射(IV
))を介する、代表的には約0.1〜約10mg/kg体重の範囲の用量での、
抗PC−LECTIN抗体調製物の反復投与を包含する。10〜500mg m
Ab/週の範囲の用量が、効果的であり得かつ十分に許容され得る。
【0119】 転移性乳癌の処置においてHerceptin mAbを用いる臨床実験に基
づいて、初回負荷量約4mg/kg患者の体重のIVに続いての、毎週の用量約
2mg/kgの抗PC−LECTIN mAb調製物のIVが、受容可能な投薬
レジメンを示し得る。好ましくは、この初回負荷量が、90分以上注入として投
与される。周期的維持用量は、30分以上の注入として投与され得るが、ただし
、その初回量が十分に許容された場合に限る。しかし、当業者が理解するように
、種々の因子が、特定の場合における初回量レジメンに影響する。このような因
子としては、例えば、使用される抗体(Ab)またはモノクローナル抗体(mA
b)の結合親和性および半減期、患者におけるPC−LECTIN発現の程度、
循環する落ちた(shed)PC−LECTIN抗原の程度、所望される安定状
態の抗体濃度レベル、処置の頻度、ならびに本発明の処置方法と組み合わせて使
用される化学療法薬剤の影響が、挙げられ得る。
【0120】 必要に応じて、患者は、最も有効な投薬レジメンおよび関連因子の決定を補助
するために、血清中の循環する落ちたPC−LECTIN抗原のレベルについて
評価されるべきである。このような評価はまた、治療を通じモニターする目的の
ために使用され得、そして他のパラメーター(例えば、前立腺癌治療における血
清PSAレベル)を評価することと組み合わせて、治療の成功を判断するために
有用であり得る。
【0121】 (PC−LECTINタンパク質機能の阻害) 本発明は、その結合パートナーまたはリガンドへのPC−LECTINの結合
あるいは他のタンパク質とのPC−LECTINの会合を阻害するための、種々
の方法および組成物、ならびにPC−LECTIN機能を阻害するための方法を
包含する。
【0122】 (細胞内抗体を用いるPC−LECTINの阻害) 1つのアプローチにおいて、PC−LECTINに特異的に結合する単鎖抗体
をコードする組換えベクターが、PC−LECTINを発現する細胞中へと遺伝
子移入技術を介して導入され得、その遺伝子移入技術において、そのコードされ
る単鎖抗PC−LECTIN抗体が細胞内発現され、PC−LECTINタンパ
ク質に結合し、そしてそれによりPC−LECTINタンパク質の機能を阻害す
る。このような細胞内単鎖抗体を操作するための方法は、周知である。このよう
な細胞内抗体(「内部抗体(intrabody)」としても公知)は、その細
胞内の特定の区画に特異的に標的化され得、その処置の阻害活性が焦点を合わせ
る制御を提供する。この技術は、当該分野で首尾良く適用されている(概説とし
て、RichardsonおよびMarasco、1995、TIBTECH、
第13巻を参照のこと)。内部抗体は、他に豊富な細胞表面レセプターの発現を
事実上除去することが示されている。例えば、Richardsonら、199
5、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:3137〜314
1;Beerliら、1994、J.Biol.Chem.289:23931
〜23936;Deshaneら、1994、Gene Ther.1:332
〜337を参照のこと。
【0123】 単鎖抗体は、可撓性のリンカーポリペプチドにより結合された、重鎖および軽
鎖の可変ドメインを含み、そして単一のポリペプチドとして発現される。必要に
応じて、単鎖抗体は、その軽鎖定常領域に結合された単鎖可変領域フラグメント
として発現され得る。周知の細胞内輸送シグナルが、発現される内部抗体を所望
の細胞内区画に正確に標的化するために、このような単鎖抗体をコードする組換
えポリヌクレオチドベクター中に操作され得る。例えば、小胞体(ER)に標的
化された内部抗体は、リーダーペプチドを組み込むように、そして必要に応じて
C末端ER保持シグナル(例えば、KDELアミノ酸モチーフ)を組み込むよう
に、操作され得る。核において活性を発揮することが意図される内部抗体は、核
局在化シグナルを含むように操作され得る。脂質部分が、原形質膜の細胞質ゾル
側に内部抗体をつなぐために、その内部抗体に結合され得る。内部抗体はまた、
細胞質ゾルにおいて機能を発揮するように標的化され得る。例えば、細胞質内部
抗体が、細胞質ゾル内に因子を隔離し、それによりそれらの因子がその天然での
細胞での終着点に輸送されることを防ぐために、使用され得る。
【0124】 1つの実施形態では、PC−LECTIN内部抗体は、特定のPC−LECT
INドメインに特異的に結合するように設計される。例えば、PC−LECTI
Nタンパク質に特異的に結合する細胞質ゾル内部抗体は、PC−LECTINが
核へアクセスすることを防ぎ、それによりPC−LECTINが核内で任意の生
物学的活性を及ぼすのを防ぐ(例えば、PC−LECTINが他の因子と転写複
合体を形成するのを防ぐ)ために使用され得る。
【0125】 このような内部抗体の発現を特定の腫瘍細胞に特異的に向けるために、その内
部抗体の転写が、適切な腫瘍特異的プロモーターおよび/またはプロモーターの
調節制御下に配置され得る。前立腺に特異的に内部抗体発現を標的化するために
、例えば、PSAプロモーターおよび/またはプロモーター/エンハンサーが、
利用され得る(例えば、米国特許第5,919,652号を参照のこと)。
【0126】 (組換えタンパク質を用いるPC−LECTINの阻害) 別のアプローチにおいて、PC−LECTINに結合し得、それによりPC−
LECTINがその結合パートナーに接近/結合することまたは他のタンパク質
と会合することを妨げ得る、組換え分子が、PC−LECTIN機能を阻害する
ために使用される。このような組換え分子は、例えば、PC−LECTIN特異
的抗体分子の反応性部分を含み得る。特定の実施形態において、PC−LECT
IN結合パートナーのPC−LECTIN結合ドメインが、ヒトIgG(例えば
、ヒトIgG1)のFc部分に連結された2つのPC−LECTINリガンド結
合ドメインを含む、二量体融合タンパク質へと操作され得る。このようなIgG
部分は、例えば、GH2ドメインおよびGH3ドメインならびにヒンジ領域を含み
得るが、GH1ドメインは含まないかもしれない。このような二量体融合タンパ
ク質は、可溶性形態で、PC−LECTINの発現と関係する癌(前立腺癌、乳
癌、膀胱癌、肺癌、骨癌、大腸癌、膵臓癌、精巣癌、子宮頸部癌および卵巣癌が
挙げられるがこれらに限定されない)に罹患する患者に投与され得、ここでこの
二量体タンパク質はPC−LECTINに特異的に結合し、それにより結合パー
トナーとのPC−LECTINの相互作用をブロックする。このような二量体融
合タンパク質は、公知の抗体連結技術を使用してさらに組み合わされて、多量体
タンパク質にされ得る。
【0127】 (PC−LECTINの転写または翻訳の阻害) 別の種類の治療アプローチにおいて、本発明は、PC−LECTIN遺伝子の
転写を阻害するための、種々の方法および組成物を提供する。同様に、本発明は
また、PC−LECTIN mRNAからタンパク質への翻訳を阻害するための
、方法および組成物も提供する。
【0128】 1つのアプローチにおいて、PC−LECTIN遺伝子の転写を阻害する方法
は、PC−LECTIN遺伝子をPC−LECTINアンチセンスポリヌクレオ
チドと接触させる工程を包含する。別のアプローチにおいて、PC−LECTI
N mRNAの翻訳を阻害する方法は、PC−LECTIN mRNAをアンチ
センスポリヌクレオチドと接触させる工程を包含する。別のアプローチにおいて
、PC−LECTIN特異的リボザイムが、PC−LECTINメッセージを切
断し、それにより翻訳を阻害するために使用され得る。このようなアンチセンス
に基づく方法およびリボザイムに基づく方法はまた、PC−LECTIN遺伝子
の調節領域(例えば、PC−LECTINプロモーターエレメントおよび/また
はエンハンサーエレメント)に関し得る。同様に、PC−LECTIN遺伝子転
写因子を阻害し得るタンパク質が、PC−LECTIN mRNA転写を阻害す
るために使用され得る。上述の方法において有用な種々のポリヌクレオチドおよ
び組成物が、上記に記載されている。転写および翻訳を阻害するためのアンチセ
ンス分子およびリボザイム分子の使用は、当該分野で周知である。
【0129】 PC−LECTIN転写活性化を妨害することを介してPC−LECTINの
転写を阻害する他の因子もまた、PC−LECTINを発現する癌の処置に有用
であり得る。同様に、PC−LECTINのプロセシングを妨害し得る因子は、
PC−LECTINを発現する癌の処置に有用であり得る。このような因子を利
用する癌の処置方法もまた、本発明の範囲内にある。
【0130】 (治療ストラテジーについての一般的な考慮) 遺伝子移入および遺伝子治療の技術は、PC−LECTINを合成している腫
瘍細胞に、治療用ポリヌクレオチド分子(すなわち、アンチセンス、リボザイム
、内部抗体をコードするポリヌクレオチドおよび他のPC−LECTIN阻害分
子)を送達するために使用され得る。多数の遺伝子治療アプローチが、当該分野
で公知である。PC−LECTINアンチセンスポリヌクレオチド、リボザイム
、PC−LECTIN転写を妨害し得る因子などをコードする組換えベクターは
、このような遺伝子治療アプローチを使用して標的腫瘍細胞に送達され得る。
【0131】 上記の治療アプローチは、広範な種々の化学療法または放射線療法のレジメン
のいずれか1つと組み合わされ得る。これらの治療アプローチはまた、特に、化
学療法剤の毒性に十分に寛容ではない患者において、化学療法の投薬量の減少、
および/またはより頻度の少ない投与の使用を可能にし得る。
【0132】 特定の組成物(例えば、アンチセンス、リボザイム、内部抗体)、またはこの
ような組成物の組合せの抗腫瘍活性は、種々のインビトロおよびインビボアッセ
イ系を使用して評価され得る。治療の可能性を評価するためのインビトロアッセ
イとしては、細胞増殖アッセイ、軟質ゲルアッセイおよび腫瘍促進活性を示す他
のアッセイ、治療用組成物が結合パートナーへのPC−LECTINの結合を阻
害する程度を決定し得る結合アッセイなどが挙げられる。
【0133】 インビボでは、PC−LECTIN治療用組成物の効果は、適切な動物モデル
において評価され得る。例えば、外因性前立腺癌モデル(ここで、ヒト前立腺癌
外植片または継代された異種移植組織が、免疫無防備動物(例えば、ヌードマウ
スまたはSCIDマウス)に導入される)は、前立腺癌に関して適切であり、そ
して記載されている(Kleinら、1997,Nature Medicin
e 3:402〜408)。例えば、PCT特許出願WO98/16628,S
awyersら(1998年4月23日公開)は、原発性腫瘍の発生、微小転移
、および後期段階疾患の特徴である骨芽細胞性転移の形成を要約し得る、ヒト前
立腺癌の種々の異種移植モデルを記載している。効力は、腫瘍形成、腫瘍後退ま
たは転移などの阻害を測定するアッセイを使用して推定され得る。以下の実施例
もまた参照のこと。
【0134】 アポトーシスの促進を和らげる(qualify)インビボアッセイもまた、
潜在的な治療用組成物の評価において有用であり得る。1つの実施形態において
、治療用組成物で処置された保有マウス由来の異種移植片は、アポトーシス病巣
の存在について試験され得、そして未処置のコントロール異種移殖片保有マウス
に比較され得る。アポトーシス病巣が処置マウスの腫瘍に見出される程度は、こ
の組成物の治療効力の指標を提供する。
【0135】 前述の方法の実施において使用される治療用組成物は、所望の送達方法に適切
なキャリアを含む薬学的組成物中に処方され得る。適切なキャリアとしては、治
療用組成物と組み合わされる場合に、治療用組成物の抗腫瘍機能を保持し、かつ
患者の免疫系と非反応性である、任意の物質が挙げられる。例としては、任意の
多数の標準的な薬学的キャリア(例えば、滅菌リン酸緩衝化生理食塩水溶液、静
菌水など)が挙げられるがこれらに限定されない(一般には、Remingto
n’s Pharmaceutical Sciences(第16版),A.
Osal.編,1980を参照のこと)。
【0136】 治療用処方物は、可溶化され得、そして腫瘍部位に治療用組成物を送達させ得
る任意の経路を通じて投与され得る。潜在的に効果的な投与経路としては、静脈
内、非経口、腹腔内、筋肉内、腫瘍内、皮内、器官内、眼内などが挙げられるが
これらに限定されない。静脈内注射に好ましい処方物は、保存された静菌水、滅
菌非保存水の溶液における治療用組成物を含み、そして/または注射用0.9%
滅菌塩化ナトリウム(USP)を含むポリビニルクロリドまたはポリエチレンバ
ッグに希釈される。治療用タンパク質調製物は、凍結乾燥され得、そして滅菌粉
末として、好ましくは減圧下で貯蔵され得、次いで注射する前に、例えば、ベン
ジルアルコール保存剤を含む静菌水中に、または滅菌水中に再構成され得る。
【0137】 前述の方法を使用する癌の処置についての投薬量および投与プロトコルは、方
法および標的の癌とともに変化し、そして一般に、当該分野で理解される多数の
他の因子に依存する。
【0138】 (癌ワクチン) 本発明はさらに、PC−LECTINタンパク質またはそのフラグメントを含
む癌ワクチン、およびDNAベースのワクチンを提供する。PC−LECTIN
の腫瘍により制限される発現を考慮すると、PC−LECTIN癌ワクチンは、
非標的組織に対して非特異的効果を生成することなく、PC−LECTINを発
現している癌の特異的な予防および/または処置に効果的であることが予期され
る。抗癌療法での使用について、液性免疫および細胞媒介性免疫を生成するワク
チンにおける腫瘍抗原の使用は、当該分野で周知であり、そしてヒトPSMAお
よびげっ歯類PAP免疫原を使用して、前立腺癌に使用されている(Hodge
ら、1995,Int.J.Cancer 63:231〜237;Fongら
、1997、J.Immunol.159:3113〜3117)。このような
方法は、PC−LECTINタンパク質もしくはそのフラグメント、またはPC
−LECTINをコードする核酸分子、およびPC−LECTIN免疫原を発現
し、かつ適切に提示し得る組換えベクターを用いることによって容易に実施され
得る。
【0139】 例えば、ウイルス遺伝子送達系は、PC−LECTINをコードする核酸分子
を送達するために用いられ得る。本発明のこの局面の実施において使用され得る
種々のウイルス遺伝子送達系は、以下を包含するが、これらに限定されない:ワ
クシニアウイルス、鶏痘ウイルス、カナリア痘ウイルス、アデノウイルス、イン
フルエンザウイルス、ポリオウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、
およびシンドビスウイルス(Restifo、1996、Curr.Opin.
Immunol.8:658−663)。非ウイルス送達系もまた、抗腫瘍応答
を誘導するために患者に導入される(例えば筋内で)、PC−LECTINタン
パク質またはそのフラグメントをコードする裸のDNAを用いることにより用い
られ得る。1つの実施形態では、全長ヒトPC−LECTIN cDNAが用い
られ得る。
【0140】 1つの実施形態では、PC−LECTIN癌ワクチンは、図1A〜D(SEQ
ID NO:2)に示されるPC−LECTINアミノ酸配列内の免疫原性ペ
プチドの同一性に基づく。以下の実施例でさらに議論するように、PC−LEC
TINの特定の部分は、T細胞またはB細胞の応答を増加させることが示されて
いる。PC−LECTINの細胞外ドメイン(図1A〜D(SEQ ID NO
:2)のアミノ酸22〜213)は、モノクローナル抗体の産生のためのマウス
における免疫応答を生じさせるために使用され;そしてこのドメイン内のペプチ
ド(GLWRNGDGQTSGAC(SEQ ID NO:25))、(GGP
YLYQWNDDRCNM(SEQ ID NO:26))、(EARLACE
SEGGVLL(SEQ ID NO:27))は、ポリクローナル抗体の産生
のために、ウサギにおける免疫応答を生じさせるために使用されてきた。従って
、PC−LECTINのこれらの特定の部分およびこれらの部分をコードするポ
リヌクレオチドは、癌ワクチンの生成のために選択され得る。
【0141】 別の実施形態では、特定の細胞傷害性Tリンパ球(CTL)エピトープをコー
ドするPC−LECTIN核酸分子が用いられ得る。CTLエピトープは、特定
化されたHLA対立遺伝子に最適に結合し得る、PC−LECTINタンパク質
内のペプチドを同定するための特定のアルゴリズム(例えば、Epimer、B
rown University)を用いて決定され得る。1つの適切なアルゴ
リズムは、Bioinformatics and Molecular An
alysis Section(BIMAS)ウェブサイト(http://b
imas.dcrt.nih.gov/)において利用可能であるHLA Pe
ptide Motif Searchアルゴリズムである。このアルゴリズム
は、HLAクラスI分子そして具体的にはHLA−A2の溝における特定のペプ
チド配列の結合に基づく(Flakら、1991、Nature 351;29
0−6;Huntら、1992、Science 255:1261−3;Pa
rkerら、1992、J.Immunol.149:3580−7;Park
erら、1994、J.Immunol.152:163−75)。HLA P
eptide Motif Searchアルゴリズムは、HLA−A2および
他のクラスI分子への推定される結合について、完全タンパク質配列からの8マ
ー、9マーおよび10マーのペプチドの配置および順位を可能にする。ほとんど
のHLA−A2結合ペプチドは、9マーであり、好適には、2位でロイシンを含
み、そして9位でバリンまたはロイシンを含む(Parkerら、1992、J
.Immunol.149:3580−7)。
【0142】 以下の実施例で議論されるように、PC−LECTINについての推定結合ペ
プチドは、WIGFTYKTA、ATGEHQAFT、FGNCVELQA、N
CVELQASAおよびDNHGFGNCV(それぞれ、SEQ ID NO:
6〜10)を含む。HLA−A2へのペプチドの実際の結合は、抗原プロセシン
グ欠損細胞株T2上のHLA−A2発現の安定化により評価され得る(Xueら
、1997、Prostate 30:73−8;Peshwaら、1998、P
rostate 36:129−38)。特定のペプチドの免疫現性は、樹状細
胞の存在下でのCD8+CTLの刺激によりインビトロで評価され得る(Xue
ら;Peshwaら、前出)。
【0143】 種々のエキソビボストラテジーが、用いられ得る。1つのアプローチは、患者
の免疫系にPC−LECTIN抗原を呈示するための樹状細胞の使用を包含する
。樹状細胞は、MHCクラスIおよびII、B7副刺激因子(co−stimu
lator)、およびIL−12を発現し、そして従って高度に特化された抗原
提示細胞である。前立腺癌では、前立腺特異的膜抗原(PSMA)のペプチドで
パルスされた自己樹状細胞が、第I相臨床試験において、前立腺癌患者の免疫系
を刺激するために使用されている(Tjoaら、1996、Prostate
28:65−69;Murphyら、1996、Prostate 29:37
1−380)。樹状細胞は、MHCクラスI分子およびクラスII分子の関連に
おいてT細胞に対してPC−LECTINペプチドを提示するために使用され得
る。1つの実施形態では、自己樹状細胞は、MHC分子に結合し得るPC−LE
CTINペプチドでパルスされる。別の実施形態では、樹状細胞は、完全PC−
LECTINタンパク質でパルスされる。さらに別の実施形態は、当該分野で公
知の種々の実行ベクター(例えば、アデノウイルス(Arthurら、1997
、Cancer Gene Ther.4:17−25)、レトロウイルス(H
endersonら、1996、Cancer Res.56:3763−37
70)、レンチウイルス、アデノ随伴ウイルス、DNAトランスフェクション(
Ribasら、1997、Cancer Res.57:2865−2869)
、および腫瘍由来RNAトランスフェクション(Ashleyら、1997、J
.Exp.Med.186:1177−1182))を用いて樹状細胞における
PC−LECTIN遺伝子の過剰発現を操作することを含む。PC−LECTI
Nを発現する細胞は、免疫調節因子(例えば、GM−CSF)を発現するように
操作され得、そして免疫剤として使用され得る。
【0144】 抗イディオタイプ抗PC−LECTIN抗体もまた、抗癌療法において、PC
−LECTINタンパク質を発現する細胞に対する免疫応答を惹起するためのワ
クチンとして使用され得る。詳細には、抗イディオタイプ抗体の生成は、当該分
野で周知であり、そしてPC−LECTINタンパク質上のエピトープを模倣す
る抗イディオタイプ抗PC−LECTIN抗体を生成するように容易に適合され
得る(例えば、Wagnerら、1997、Hybridoma 16:33−
40;Foonら、1995、J Clin Invest 96:334−3
42;Herlynら、1996、Cancer Immunol Immun
other 43:65−76を参照のこと)。このような抗イディオタイプ抗
体は、癌ワクチンストラテジーにおいて使用され得る。
【0145】 遺伝子免疫法は、PC−LECTINを発現する癌細胞に対する予防的または
治療的な体液性免疫応答および細胞性免疫応答を生成するために使用され得る。
PC−LECTINタンパク質/免疫原をコードするDNAおよび適切な調節配
列を含む構築物は、個体の筋肉または皮膚に直接的に注射され得、それにより、
筋肉または皮膚の細胞が、この構築物を取り込み、そしてコードされたPC−L
ECTINタンパク質/免疫原を発現する。PC−LECTINタンパク質免疫
原の発現は、前立腺癌、乳癌、膀胱癌、肺癌、骨癌、大腸癌、膵臓癌、精巣癌、
子宮頸部癌および卵巣癌に対する予防的または治療的な体液性免疫および細胞性
免疫の生成を生じる。当該分野で公知の種々の予防的および治療的遺伝子免疫技
術が使用され得る(検討のために、インターネットアドレスwww.genwe
b.comで公開されている情報および参考文献を参照のこと)。
【0146】 (キット) 上記で記載または示唆された診断適用および治療適用における使用のために、
本発明によって、キットもまた提供される。このようなキットは、1つ以上のコ
ンテナ手段(例えば、バイアル、チューブなど)を厳重に閉じ込めて受容するよ
うに区画化されるキャリア手段を備え得る。コンテナ手段のそれぞれは、本方法
において、使用されるべき別々の要素の1つを含む。例えば、コンテナ手段の1
つは、検出可能に標識された、または検出可能に標識され得るプローブを含み得
る。このようなプローブは、それぞれPC−LECTINタンパク質もしくはP
C−LECTIN遺伝子またはメッセージに特異的な抗体またはポリヌクレオチ
ドであり得る。キットが、標的核酸配列を検出するために核酸ハイブリダイゼー
ションを利用する場合、キットはまた、標的核酸配列の増幅用のヌクレオチドを
含むコンテナ、および/またはレポーター分子(例えば、酵素標識、蛍光標識、
または放射性同位体標識)に結合されるレポーター手段(例えば、ビオチン結合
タンパク質(例えば、アビジンまたはストレプトアビジン)を含むコンテナを有
し得る。
【0147】 本発明のキットは、代表的には、上記コンテナ、および使用説明書と共に、市
販および使用者の観点で所望の材料(緩衝液、希釈剤、フィルター、ニードル、
シリンジ、およびパッケージ挿入物を含む)を含む1つ以上の他のコンテナを含
む。表示は、組成物が、特定の治療または非治療適用について使用されることを
示し、そしてまたインビボまたはインビトロのいずれかの使用(例えば、上記の
使用)についての説明を示し得るために、コンテナ上に存在し得る。
【0148】 PC−LECTIN cDNAは、ブダペスト条約の下でアメリカンタイプカ
ルチャーコレクション(ATCC;10801 University Blv
d.Manassas、VA 20110−2209 USA)に、プラスミド
p58P1D12−2として1999年3月10日に寄託され、そしてATCC
受託番号207152で承認されている。 (実施例) 本発明の種々の局面を、以下に続くいくつかの例によってさらに記載および例
示する。これらはいずれも、本発明の範囲の制限を意図するものではない。
【0149】 (実施例1:PC−LECTIN遺伝子のcDNAフラグメントのSSH生成
単離) (材料および方法) (LAPC異種移植片) LAPC異種移植片を、Charles Sawyers博士(UCLA)か
ら入手し、記載のように生成した(Kleinら、1997、Nature M
ed.3:402−408;Craftら、1999、Cancer Res.
59:5030−5036)。アンドロゲン依存性LAPC−4異種移植片およ
びアンドロゲン非依存性LAPC−4異種移植片(それぞれLAPC−4 AD
およびAI)ならびにアンドロゲン依存性LAPC−9異種移植片およびアンド
ロゲン非依存性LACP−9異種移植片(それぞれLACP−9 ADおよびA
I)をそれぞれインタクトな雄SCIDマウスまたは雄去勢マウスにおいて増殖
させ、そしてレシピエント雄に小組織塊として継代させた。LAPC−4 AI
異種移植片は、LAPC−4 AD腫瘍から誘導し、LAPC−9 AI異種移
植片は、LAPC−9 AD腫瘍から誘導した。AI異種移植片を生成するため
に、LAPC AD腫瘍を有する雄マウスを去勢し、そして2〜3ヶ月間飼育し
た。LAPC腫瘍が再増殖した後、この腫瘍を採集し、そして去勢雄SCIDマ
ウスにおいてまたは雌SCIDマウスにおいて継代させた。
【0150】 (細胞株) ヒト細胞株(例えば、HeLa)を、ATCCから入手し、そして10%ウシ
胎児血清を有するDMEM中で維持した。
【0151】 (RNA単離) 腫瘍組織および細胞株を、10ml/g組織または10ml/108細胞を用
いてTrizol試薬(Life Technologies、Gibco B
RL)においてホモジナイズし、総RNAを単離した。ポリA RNAを、Qi
agen’s Oligotex mRNA MiniキットおよびMidiキ
ットを用いて総RNAから精製した。総RNAおよびmRNAを、分光光度計分
析(O.D. 260/280nm)によって定量し、そしてゲル電気泳動によ
って分析した。
【0152】 (オリゴヌクレオチド) 以下のHPLC精製オリゴヌクレオチドを使用した。
【0153】
【化1】 (抑制サブトラクティブ(suppression subtractive
)ハイブリダイゼーション) 抑制サブトラクティブハイブリダイゼーション(SSH)を使用して、アンド
ロゲン非依存性癌と比較して、アンドロゲン依存性前立腺癌でアップレギュレー
トされ得る遺伝子に対応するcDNAを同定した。
【0154】 LAPC−9 AD異種移植片(テスター)およびLAPC−9 AI組織(
ドライバー)に対応する二本鎖cDNAを、CLONTECHのPCR−Sel
ect cDNA Subtraction Kitおよびプライマーとして1
ngのオリゴヌクレオチドDPNCDNを使用して、上記のように、異種移植片
組織から単離された2μgのポリ(A)’RNAから合成した。第一鎖および第
二鎖合成を、キットの使用者マニュアルプロトコル(CLONTECHプロトコ
ール番号PT1117−1、カタログ番号K1804−1)に記載のように実施
した。得られたcDNAをDpnIIで37℃で3時間消化した。消化したcD
NAをフェノール/クロロホルム(1:1)で抽出し、そしてエタノール沈殿し
た。
【0155】 ドライバー(diriver)cDNA(LAPC−9AI)を、1:1比で
、DpnII消化LAPC−9AI cDNAを、BPH組織、およびヒト細胞
株HeLa、293、A431、Colo 205、およびマウス肝臓由来の消
化cDNAの混合物と組み合わせることにより生成し、マウス遺伝子が、テスタ
ーcDNA(LACD−9 AD)から差し引きされることを確実にした。
【0156】 テスター(tester)cDNA(LAPC−9 AD)を、5μlの水中
に1μlのDpnII消化LAPC−9 AD cDNA(400ng)を希釈
することにより生成した。次いで、希釈したcDNA(2μl、160ng)を
、総容量10μlで16℃で一晩、400uのT4 DNAリガーゼ(CLON
TECH)を用いて、別の連結反応中で、2μlのアダプター1およびアダプタ
ー2(10μM)に連結した。連結を、1μlの0.2M EDTAで、そして
72℃で5分間加熱して終結させた。
【0157】 第一のハイブリダイゼーションは、1.5μl(600ng)のドライバーc
DNAを、1.5μl(20ng)のアダプター1連結のおよびアダプター2連
結のテスターcDNAを含む2つの各チューブに添加することにより実施した。
4μlの最終容量で、サンプルに鉱油を重層し、MJ Research サー
マルサイクラー中で、98℃で1.5分間変性し、次いで、68℃で8時間ハイ
ブリダイズさせた。次いで、2つのハイブリダイゼーションを、さらなる1μl
の新鮮な変性ドライバーcDNAと一緒に混合し、そして68℃で一晩ハイブリ
ダイズさせた。次いで、第二のハイブリダイゼーションを、200μlの20m
M Hepes、pH8.3、50mM NaCl、0.2mM EDTA中で
希釈し、70℃で7分間加熱し、そして−20℃で貯蔵した。
【0158】 (SSHから生成した遺伝子フラグメントのPCR増幅、クローニング、およ
び配列決定) SSH反応から生じる遺伝子フラグメントを増幅するために、2つのPCR増
幅を行った。第一のPCR反応において、1μlの希釈最終ハイブリダイゼーシ
ョン混合物を、最終容量25μlの1μlのPCRプライマー1(10μM)、
0.5μl dNTP混合物(10μM)、2.5μlの10×反応緩衝液(C
LONTECH)、および0.5μlの50×Advantage cDNA
polymerase Mix(CLONTECH)に添加した。PCR1を、
以下の条件を用いて実施した:75℃で5分、94℃で25秒、次いで27サイ
クルの94℃で10秒、66℃で30秒、72℃で1.5分。5つの別の第一の
PCR反応を各実験について行った。産物をプールし、そして水で1:10に希
釈した。第二のPCR反応については、プールし、そして希釈した第一のPCR
反応物からの1μlを、プライマーNP1およびNP2(10μM)をPCRプ
ライマー1の代わりに使用したことを除き、PCR1について用いたものと同じ
反応混合物に添加した。PCR2を、10〜12サイクルの94℃で10秒、6
8℃で30秒、72℃で1.5分を用いて実施した。PCR産物を、2%アガロ
ースゲル電気泳動を用いて分析した。
【0159】 PCR産物を、T/Aベクタークローニングキット(Invitrogen)
を用いてpCR2.1に挿入した。形質転換E.coliを青/白およびアンピ
シリン選択に供した。白色コロニーを釣り上げ、96ウェルプレート中に並べ、
そして液体培養中で一晩増殖させた。挿入物を同定するために、PCR増幅をP
CR1の条件ならびにプライマーとしてNP1およびNP2を用いて1mlの細
菌培養物において実施した。PCR産物を2%アガロースゲル電気泳動を用いて
分析した。
【0160】 96ウェルフォーマットで20%グリセロール中に細菌クローンを貯蔵した。
プラスミドDNAを調製し、配列決定し、そしてGenBank、dBest、
およびNCI−CGAPデータベースの核酸相同性検索に供した。
【0161】 (RT−PCR発現分析) 第一鎖cDNAを、Gibco−BRL Superscript Prea
mplificationシステムを用いるオリゴ(dT)12〜18プライミ
ングによって1μgのmRNAから生成した。製造者プロトコルを使用し、そし
てこれは、42℃で50分間の逆転写酵素とのインキュベーション、続いて37
℃で20分間のRNAse H処理を包含した。反応を完了した後、この容積を
、標準化の前に水で200μlに増大させた。16の異なる正常ヒト組織からの
第一鎖cDNAを、Clontechから入手した。
【0162】 複数の組織からの第一鎖cDNAの標準化を、プライマー5’atatcgc
cgcgctcgtcgtcgacaa3’(配列番号19)および5’agc
cacacgcagctcattgtagaagg3’(配列番号20)を用い
てβアクチンを増幅することにより実施した。第一鎖cDNA(5μl)を、0
.4μMプライマー、0.2μM各dNTP、1×PCR緩衝液(Clonte
ch、10mM Tris−HCL、1.5mM MgCl2、50mM KC
l、pH8.3)、および1×Klentaq DNAポリメラーゼ(Clon
tech)を含む総容量50μlで増幅した。18サイクル、20サイクルおよ
び22サイクルで、5μlのPCR反応物を取り出し、そしてアガロース電気泳
動のために使用した。PCRを、以下の条件下で、MJ Researchサー
マルサイクラーを用いて実施した:初期変性は94℃で15秒間であり、続いて
18サイクル、20サイクル、および22サイクルの94℃で15、65℃で2
分、72℃で5秒。72℃での最終伸長を2分間行った。アガロースゲル電気泳
動後、複数の組織からの283bpのβアクチンバンドのバンド強度を可視検査
によって比較した。22サイクルのPCR後に全ての組織において等しいβアク
チンバンド強度を生じるように、第一鎖cDNAの希釈因数を算定した。22サ
イクルのPCR後に全ての組織において等しいバンド強度を達成するには、3ラ
ウンドの標準化が必要であった。
【0163】 PC−LECTIN遺伝子の発現レベルを決定するために、5μlの標準化さ
れた第一鎖cDNAを、以下のプライマー対を用いる25、30、および35サ
イクルの増幅を用いるPCRによって分析した。これらプライマーは、(MIT
;詳細については、www.genome.wi.mit.eduを参照のこと
)の補助により設計した(それぞれ、配列番号21および22):
【0164】
【化2】 半定量発現分析を、軽度のバンド強度を与えるサイクル数でPCR産物を比較
することにより達成した。 (結果) いくつかのSSH実験を上記の材料および方法に記載されるとおりに行い、そ
して多数の候補遺伝子フラグメントクローンの単離がもたらされた。すべての候
補クローンを配列決定し、そして主要な公の遺伝子およびESTのデータベース
におけるすべての配列に対して相同性分析を行って、対応する遺伝子の同一性に
ついての情報を提供し、そして示差的発現のための特定の遺伝子を分析するため
の決定をガイドすることを支援した。一般に、検索した任意のデータベースにお
ける任意の公知配列に何ら相同性を有せず、従って新規遺伝子をあらわすと考え
られる遺伝子フラグメント、およびこれまでに配列決定された発現配列タグ(E
ST)に対して相同性を示す遺伝子フラグメントを、RT−PCRおよび/また
はノーザン分析による示差的発現分析にかけた。
【0165】 cDNAクローンの1つの58P1D12と呼ばれるものは、427bp長で
あり、そしてブタ筋肉に由来するESTに対して弱い相同性、およびC型レクチ
ンに対して相同性を有する細胞表面分子であるハムスターライリン(layil
in)に対して顕著な相同性を示した。SSHフラグメントは、129アミノ酸
のORFを含んでおり、これはライリンに対して有意な相同性を示した。このフ
ラグメントのORFは、ライリンの中央領域に対応し、そして膜貫通ドメインを
含む。続いて、58P1D12遺伝子をコードする全長cDNAをこのcDNA
を用いて単離し、そして構造分析し(実施例2、下記)、そしてPC−LECT
INと再命名した。
【0166】 PC−LECTIN SSHクローンに由来するプライマーを用いたRT−P
CRによるディファレンシャル発現分析は、58P1D12/PC−LECTI
N遺伝子が、試験した正常精巣および前立腺腫瘍外植片において本質的に発現さ
れることを示した(図3)。より高いサイクルの増幅(すなわち、30より多い
)では、より低いレベルの発現が、前立腺、脾臓および胎盤において検出された
。全長PC−LECTIN cDNAをプローブとして用いたノーザンブロット
分析(図3を参照のこと、下記)により、正常精巣およびLAPC9 AD R
NAにおいてのみ1.8kbおよび3.0kbの転写物の発現が示された(図4
)、より低い発現レベルが、LAPC−4AD、LAPC−4AIおよびLAP
C−9 AIにおいて検出される。
【0167】 (実施例2:全長PC−LECTIN PC−LECTINコードcDNAの
単離) 427bpの58PlD12/PC−LECTIN遺伝子フラグメント(実施
例1)を用いてPC−LECTIN遺伝子をコードする、30のさらなるcDN
Aを単離した。PC−LECTINに対する全長cDNAを、LAPC−9 A
Dライブラリーから単離した。cDNA(クローン2)は、25510bp長で
あり、そして274アミノ酸のORFをコードするORFの分析により、N末端
のシグナル配列および膜貫通ドメインが同定され、これは、PC−LECTIN
が1a型膜貫通タンパク質であり、N末端が外側にあり、そしてC末端は細胞質
内にあることを示す。全長PC−LECTIN cDNAは、American
Type Culture Collection(「ATCC」) (Ma
nnassas,VA)に、プラスミドp58PlD12−2に1999年3月
10日にATCC受託番号207152として寄託された。その中にあるPC−
LECTIN cDNAクローンは、EcoRIIXbaI 2連の消化(5’
末端にはEcoRI、3’末端にはXbaI)を用いてそこから切り出され得る
【0168】 PC−LECTIN配列とハムスターライリンとのアミノ酸整列により、ライ
リンとの関係が示された(図2A)。しかし、PC−LECTINは、タリン関
連ドメインを示さず、このことは、PC−LECTINがライリンと同じ様式で
細胞骨格と相互作用しないことを示唆する。他の構造的相違もまた、明白である
(図2A)。2550bpのPC−LECTIN cDNAと1747bpのハ
ムスターライリンcDNAcDNAとの整列により、591bp領域に亘る相同
性が示された(図2B)。PC−LECTINの残りの領域は、ライリンとは顕
著に異なり、このことは、細胞外ドメインのC末端の半分および細胞質ドメイン
全体のアミノ酸配列における相違を反映する。このことは、PC−LECTIN
およびライリンが関連し、そしてレクチンのサブファミリーをおそらく構成する
ものの、PC−LECTINがヒト形態のライリンではないようであることを示
唆する。
【0169】 (実施例3:PC−LECTIN遺伝子発現分析) 正常ヒト組織におけるPC−LECTIN mRNA発現の初期の分析は、C
lontech(Palo Alto, California)から得られた
2つの多重組織ブロットをノーザンブロットすることによって行った。このブロ
ットは、標識されたPC−LECTIN cDNAをプローブとして用いた合計
16の正常ヒト組織を含む。発現は、正常精巣にのみ検出された。これらのノー
ザンブロットにより、およそ1.8kbおよび3.0kbの2つの転写物が示さ
れた。
【0170】 この初期の分析は、PC−LECTINプローブを用いて50の正常ヒト組織
(Clontech, Palo Alto, CA,; Human Mas
ter BlotTM)のRNAドットブロットマトリクスを分析した。この結果
は、精巣および胎児脾臓においてのみ強力なPC−LECTIN発現を示す(図
14)。より低いレベルの発現は、唾液腺および胎児腎臓において検出された。
以下においては発現は検出されなかった:脳、扁桃、尾状核、小脳、大脳皮質、
前葉、海馬、延髄、後頭葉、被核、黒質、側頭葉、視床、視床下部核、脊髄、心
臓、動脈、骨格筋、結腸、膀胱、子宮、前立腺、胃、卵巣、膵臓、下垂体腺、副
腎、甲状腺、乳腺、腎臓、肝臓、小腸、脾臓、胸腺、末梢白血球、リンパ節、骨
髄、盲腸、肺、気管、胎盤、胎児脳、胎児心臓、胎児肝臓、胎児胸腺、胎児肺。
【0171】 ヒト前立腺癌組織におけるPC−LECTIN発現を分析するために、ヒト前
立腺癌外植片由来のRNAもまた分析した。すべてのRNAサンプルを、エチジ
ウムブロミド染色および続いて標識されたβアクチンプローブでの分析により定
量的に正規化した。この結果(図4C)は、特にLAPC−9 AD外植片にお
いて高レベルのPC−LECTIN発現を示し、より低いが有意なレベルの発現
が残りの外植片において検出された。
【0172】 PC−LECTIN SSHフラグメントプローブを用いたノーザンブロット
分析は、PC−LECTINがマウス骨内で皮下(sc;図5;レーン2)また
は脛骨内(it;図5;レーン1)のいずれかで増殖することを示す。PC−L
ECTIN発現がアンドロゲンの存在に依存するかどうかを調べるために、LA
PC−9 AD腫瘍を雄性SCIDマウスにおいて成長させた。このマウスを去
勢し、そして腫瘍を28日後に採取した。28日後に去勢した雄性マウスの腫瘍
におけるPC−LECTIN発現を、インタクトの雄性マウスの腫瘍における発
現と比較した。この結果は、PC−LECTIN発現が去勢した雄性からの腫瘍
が劇的に減少することを示す(図6)。コントロールとして、公知のアンドロゲ
ンにより調節される遺伝子TMPRSS2(WO99/62942を参照のこと
)の発現もまた、去勢後に下方調節されることが示された(図6)。これらのデ
ータは、前立腺腫瘍におけるPC−LECTIN発現がアンドロゲンの存在に依
存することを示す。
【0173】 さらに、RT−PCRを用いて患者由来の癌を含む種々の組織におけるPC−
LECTINの発現を分析した。第一の鎖のcDNAを、1gのmRNAから、
オリゴ(dT)12−18プライミングを用い、Gibco−BRL Supe
rscript Preamplification系を使用して作製した。製
造者のプロトコールが用いられ得、そしてこれは、42℃で逆転写酵素と50分
間インキュベーション、続いて20分間に亘り37℃でのRNAse処理を包含
する。反応を完了した後、その容量を水で200μlにまで増加させた後正規化
した。第一の鎖のcDNAを、目的の種々の組織から調製した。正規化は、アク
チンおよびGAPDHに対するプライマーを用いたPCRにより行った。半定量
的PCRを、PC−LECTINに対するプライマーを用いて行った。
【0174】 (実施例4:PC−LECTINタンパク質の生化学的特徴づけ) PC−LECTINタンパク質を最初に特徴付けるため、PC−LECTIN
cDNAを、6Hisタグをカルボキシ末端含むpcDNA3.1 myc−
His−プラスミド(Invitrogen)中にクローニングし、293T細
胞中にトランスフェクトし、そして生の細胞から除外される水溶性ビオチン化試
薬で標識する。ビオチン化細胞表面タンパク質を、ストレプトアビジン−sep
haroseでアフィニティー精製し、そしてトランスフェクトした293T細
胞中のPC−LECTINの抗His抗体でプローブした(図7)。PC−LE
CTINタンパク質は、非ビオチン化のトランスフェクトされた細胞からのスト
レプトアビジン沈降物中には検出されなかった(図7)。
【0175】 (実施例5:哺乳動物系における組換えPC−LECTINタンパク質の発現
) 哺乳動物発現のために、PC−LECTIN cDNAをpcDNA3.1
Myc−His−tag(Invitrogen)、およびレトロウイルス発現
ベクターpSRαtkneo(Muller et al.、1991、MCB
11:1785)を含む、いくつかのベクター中に中にクローニングし得る。
これらの発現ベクターを用いて、PC−LECTINを、PC−3、NIH 3
T3、マウスL細胞線維芽細胞および293Tを含む、いくつかの細胞株中に発
現させ得る。
【0176】 PC−LECTINタンパク質をコードする組換えレトロウイルスを、ヒト2
93T細胞(Pear et al.1993、PNAS 90:8392−8
396)中に作製し、そしてこれを用いてNIH 3T3細胞に感染させ、これ
を、2週間にわたりG418中で選択して安定株を生成した。PC−LECTI
Nの発現は、PC−LECTIN cDNAプローブを用いてノーザンブロット
を行うことによって確認した。
【0177】 PC−LECTINを発現する哺乳動物細胞株を、インビトロおよびインビボ
のいくつかのアッセイ(組織培養における細胞増殖、アポトーシスシグナルの活
性化、SCIDマウスにおける腫瘍形成、および膜侵入培養系(MICS)を用
いたインビトロ侵入を含む)において用いた。
【0178】 (実施例6:バキュロウイルス系における組換えPC−LECTINの生成) バキュロウイルス発現系において組換えPC−LECTINタンパク質を生成
するために、PC−LECTIN cDNAをバキュロウイルス移入ベクターp
BlueBac4.5(Invitrogen)中にクローニングした。このベ
クターは、N末端にHisタグを提供する。具体的には、pBlueBac−−
PC−LECTINを、ヘルパープラスミドpBac−N−Blue(Invi
trogen)とともにSF9(Spodoptera frugiperda
)昆虫細胞中へ同時トランスフェクトして、組換えバキュロウイルスを生成した
(詳細はInvitrogen指示マニュアルを参照のこと)。ついで、バキュ
ロウイルスを細胞上清から収集し、そしてプラークアッセイにより精製した。
【0179】 次いで、組換えPC−LECTINタンパク質を、精製されたバキュロウイル
スでのHighFive昆虫細胞(InVitrogen)の感染により作製し
た。組換えPC−LECTINタンパク質を、抗PC−LECTIN抗体を用い
て検出し得る。PC−LECTINタンパク質が精製され得、種々の細胞ベース
のアッセイにおいて使用され得るか、または免疫原として使用されて、PC−L
ECTInに対して特異的なポリクローナルまたはモノクローナルの抗体を精製
し得る。
【0180】 (実施例7:分泌された組換えPC−LECTINアルカリホスファターゼ融
合タンパク質の生成) PC−LECTINと相互作用するタンパク質の同定により、機能の割り当て
の補助となり得、そして前立腺癌についての新規治療標的および診断マーカーを
同定し得る。アルカリホスファターゼ−PC−LECTIN融合タンパク質の構
築を用いて、PC−LETCINと相互作用するタンパク質を検出および同定し
得、他方でモノクローナル抗体およびポリクローナル抗体の生成のための免疫原
を生成し得る。
【0181】 GenHunter Corporation(Nashville、TN,
cat#Q202)からのAP−TAG系を利用して、その融合タンパク質を作
製し得、PC−LECTIN結合を検出し得る。シグナル配列のないPC−LE
CTIN cDNA(配列番号1A〜D;配列番号1)をpAPtag−5(G
enHunter Corp.Nashville、TN)中にクローニングし
た。以下に示すPC−LECTIN.HindIIIおよびPC−LECTIN
.BamHIプライマーを用いて、プラスミドテンプレートであるPC−LEC
TINクローン2から、アミノ酸22から213までのPC−LECTINオー
プンリーディングフレームを増幅した。このHindIIIおよびBamHI消
化されたPCR産物を、IgGKシグナル配列、PC−LECTIN ORFお
よびアルカリホスファターゼをすべてインフレームに保持しながらHindII
IおよびBglII消化したpAPtag−5へと連結した。このPC−LEC
TIN−AP融合タンパク質は、アルカリホスファターゼのカルボキシ末端にお
いてmyc/Hisタグに沿った分泌を促進するためにIgGKシグナル配列を
含む。 PC−LECTINHINDIII プライマー(配列番号23): GTGTAAGCTTCCCGCCGCGTGGTCAGCGGC PC−LECTIN. BAMHI プライマー(配列番号24): CACAGGATCCTATACCTGCTTCAGTAAC。 このPC−LECTIN−AP融合タンパク質構築物を、293T細胞をトラ
ンスフェクトするために使用し、そして培養培地中へ分泌される融合タンパク質
の存在を、抗アルカリホスファターゼ抗体および抗HIS抗体を使用するウェス
タンブロット分析によってモニターした。この分析の結果は、図8に示され、こ
れは、馴化培地中でのトランスフェクトされた293T細胞の約100kDa融
合タンパク質の検出を示す。
【0182】 アミノ酸22〜213もまた、制限酵素HindIIIおよびXhoIを含む
プライマーを用いるPCRを使用して、pAPTag−5ベクター中にクローニ
ングして、PC−LECTIN細胞外ドメインのN末端にIgGKシグナル配列
融合およびC末端にmyc/Hisタグを生成した。この構築物は、上記58P
1D12pAPtagと類似するが、AP融合を含まない。
【0183】 PC−LECTIN(アミノ酸1〜273)のコード配列全体を、pSRaに
クローニングした。ORFならびに制限部位EcoRIおよびXbaIをコード
するプライマーは、PC−LECTINクローン2(pBK.CMV)からイン
サートを増幅した。このインサートを、EcoRIおよびXbaIの両方での消
化の後、pSRaに連結した。この構築物を使用して、ウイルスを生成し、そし
てPC−LECTINタンパク質を安定に発現する細胞株を生成した。
【0184】 PC−LECTIN(アミノ酸1〜273)のコード配列全体を、pcDNA
3.1/myc−HIS(Invitrogen)にクローニングした。ORF
および制限部位EcoRIおよびXbaIをコードするプライマーは、PC−L
ECTINクローン2(pBK.CMV)からインサートを増幅した。このイン
サートを、EcoRIおよびXbaIの両方での消化の後、pcDNA3.1/
myc−HIS(Invitrogen)に連結した。ウェスタンブロット分析
により、293T細胞をこの構築物でトランスフェクトした場合の、PC−LE
CTINタンパク質の発現を確認した。
【0185】 (実施例8:PC−LECTIN結合パートナーの検出およびクローニング) PC−LECTINは、結合パートナータンパク質と相互作用し得るレクチン
C型ドメインを含む、膜貫通タンパク質である。PC−LECTINレセプター
結合を検出するために、いくつかの細胞株、組織、ならびに糖タンパク質(例え
ば、ヒトIgGもしくはマウスIgG、ウシRNアーゼ、オボアルブミン、ヒト
トランスフェリン、フェチュイン(fetuin)グリコホリン、シアログリコ
ホリン)でコートされたプレートを、ChengおよびFlanagan、19
94、Cell 79:157〜168における手順を使用して、PC−LEC
TIN−AP融合タンパク質とともインキュベートする。その細胞を洗浄しそし
てAP基質BCIP(脱リン酸化の際に不溶性青色沈殿を形成する)を添加した
後、細胞表面レセプターへのPC−LECTIN結合を、青に染まっている細胞
を探すために顕微鏡を使用して、検出し得る。スクリーニングし得る細胞株とし
ては、LNCaP、PC−3、DU145、TSUPR、PREC、LAPC4
、293T、NIH3T3および他の癌細胞株が挙げられる。LAPC異種移植
片、前立腺組織および前立腺癌のような組織もまたスクリーニングし得る。一旦
、PC−LECTIN−AP細胞表面結合が観察されると、平衡解離速度定数を
、結合相互作用の強度を評価するために算出し得る。さらに、細胞あたりの細胞
表面レセプターの数を決定し得る。次いで、PC−LECTINの最高の結合能
力を有する細胞株または組織を使用して、レセプターをクローニングし得る。特
定の等部分へのPC−LECTINの結合を、低濃度の特定の関連単糖による結
合阻害を示すことによって確認し得る。
【0186】 Tartagilaら、1995、Cell 83:12631271、Ch
engおよびFlanaganなどに記載される戦略のような、発現クローニン
グ戦略を使用して、PC−LECTINについてのレセプターをクローニングし
得る。1つのアプローチにおいて、発現ライブラリーを、PC−LECTINー
AP結合を示す細胞から構築する。このライブラリーを、約1000クローンの
プールとして作製し、そして同胞選択(sib selection)手順によ
りスクリーニングする。各プール由来のDNAによるCOS細胞の一過性トラン
スフェクション、およびその後のPC−LECTIN−AP結合、洗浄および染
色を用いたAP活性についてのスクリーニングによって、PC−LECTINを
結合する細胞および結果的なPC−LECTINレセプターの発現を同定する。
連続する回のプール部分分割およびスクリーニングの後、PC−LECTIN−
APに結合する単コロニーを同定する。
【0187】 あるいは、発現ライブラリーを、標準的技術(Stone J.、Curre
nt Protocols in Molecular Biology(19
97):20.3.1−20.3.9)を使用して、ファージ中に生成する。膜
リフトを、実施例6に従ってPC−LECTIN−AP融合タンパク質を使用し
てプロービングし、そしてBCIPアルカリホスファターゼアッセイを検出に使
用する。PC−LECTIN−APを結合しかつ青色沈殿を生成するプラークを
選択し、そしてそのレセプターについての遺伝子を含むプラスミドを切り出す。
このアプローチの重要な利点は、PC−LECTINと相互作用する細胞質タン
パク質または分泌タンパク質もまた同定することである。
【0188】 (実施例9:PC−LECTIN細胞外ドメインの発現および精製) 293T細胞を、C末端6×HisタグとともにPC−LECTINの細胞外
ドメイン(アミノ酸22〜213)をコードするTag5分泌発現ベクターでト
ランスフェクトした。次いで、安定な細胞株を、ゼオシン選択により生成した。
この細胞株を、293 SFMII無血清培地(Gibco)中でスピナー(s
pinner)培養にて増殖させ、そして馴化培地を精製用に収集した。馴化培
地を濃縮し、そして緩衝液を結合緩衝液(50mMリン酸ナトリウム緩衝液(p
H8.0)、500mM NaCl、および10mMイミダゾール)に交換し、
そしてNi−NTAアガロース(Qiagen)を使用する固定化金属アフィニ
ティークロマトグラフィーに供した。出発馴化培地、フロースルー、および溶出
した精製物質を、10〜20% SDS−PAGEゲル上で泳動し、そして銀染
色した(図9A)か、またはニトロセルロースにトランスファーして抗Hisポ
リクローナル抗体(pAb)を使用するウェスタンブロットに供した(図9B)
【0189】 (実施例10:PC−LECTINに対するポリクローナル抗体およびモノク
ローナル抗体) PC−LECTINに対するポリクローナル抗体を生成するために、3つの異
なるペプチドを、PC−LECTINの細胞外ドメインに対して作製した。この
ペプチド配列は、以下である: GLWRNGDGQTSGAC(14マー、配列番号25)、 GGPYLYQWNDDRCNM(15マー、配列番号26)、および EARLACESEGGVLL(14マー、配列番号27)。
【0190】 これらのペプチドを、KLH(キーホールリンペットヘモシアニン)に結合し
、そしてウサギを免疫するために使用した。これらのウサギ由来の血清を、細胞
溶解物のウェスタンブロッティングおよび全細胞に対するFACSを使用して、
PC−LECTINタンパク質に対する反応性について試験した(下記実施例1
1を参照のこと)。力価を、そのペプチドに対するELISAおよびPC−LE
CTIN cDNAを発現する組換え細胞株を使用するウェスタンブロットによ
って、モニターした。続く実験を、PC−LECTINタンパク質のアミノ酸2
04〜217(GLWRNGDGQTSGAC(配列番号25))から生成した
抗体を用いて実施した。
【0191】 モノクローナル抗体を生成するために、PC−LECTINの細胞外ドメイン
を有効に発現させ、そして上記実施例9に記載されるようなTg5 PC−LE
CTIN分泌ベクターを発現する293T細胞の馴化培地から精製した。この精
製したタンパク質を、BalbCマウスを免疫するために使用した。マウスに、
完全フロイントアジュバント中のタンパク質50μgを最初に腹腔内注射し、そ
して3週間後に、不完全フロイントアジュバント中のタンパク質50μgでブー
ストした。次いで、2週間免疫スケジュールでブーストを続け、そして免疫した
マウス血清の力価を、標的としてTag5 PC−LECTINを使用するEL
ISA、ならびに細胞株および組織溶解物のウェスタンブロット分析による特異
性によって、モニターした。
【0192】 (実施例11:組換え細胞株および精巣におけるPC−LECTIN発現) 免疫したマウスの血清を使用して、組換え細胞株および正常な精巣の細胞溶解
物を使用する、ウェスタンブロットおよび免疫沈降によって、PC−LECTI
N発現を分析した。さらに、Rat1−PC−LECTIN細胞の細胞表面上の
PC−LECTIN発現を、その免疫したマウスの血清を使用するフローサイト
メトリーによって分析した。
【0193】 neoコントロールウイルスまたはPC−LECTINをコードするウイルス
のいずれかに安定に感染したRat1細胞を、RIPA緩衝液(25mM Tr
is(pH7.5)、150mM NaCl、1% Triton X−100
、0.5%デオキシコール酸ナトリウム、0.1% SDS、2mM EDTA
、100μg/ml PMSF、および2μMロイペプチン)中に溶解した。次
いで、溶解物200μgを、精製Tag5−PC−LECTINタンパク質で免
疫したマウス由来の血清を用いる免疫沈降に供した。手短かに言えば、血清3μ
lを、溶解物(1ml中200μgタンパク質)とともにインキュベートし、そ
して4℃で一晩インキュベートした。次いで、RIPA緩衝液中のプロテインG
ビーズの50%スラリー50μlを添加し、そして室温で1時間、さらにインキ
ュベートした。免疫沈降物を、RIPA緩衝液で4回洗浄し、そして3×SDS
−PAGEサンプル緩衝液40μl中に溶解し、そして100℃で加熱した。可
溶化した免疫沈降物25μlまたは示したRIPA溶解物25μgを、10〜2
0% SDS−PAGEゲル上で分離し、そしてニトロセルロースにトランスフ
ァーした。
【0194】 次いで、ウェスタンブロット分析を、アフィニティー精製したウサギ抗PC−
LECTINペプチドポリクローナル抗体(pAb)(2μg/ml、図10A
)を用いてか、または0.15% Tween−20を含むTris緩衝化生理
食塩水(TBS−T、pH7.5)および1%脱脂乳中に希釈した免疫したマウ
スの血清の1:1000希釈物を用いて(図10B)のいずれかで実行した。ブ
ロットを、血清とともに室温で2時間インキュベートし、次いで、TBS−Tで
3回洗浄した。次いで、免疫反応性バンドを、抗ウサギIgまたは抗マウスIg
G HRP結合体化二次抗体(Ab)のいずれかとのインキュベーションにより
発色させ、そして、増強化学発光基質(ECL、Amersham)とのインキ
ュベーションおよびオートラジオグラフフィルムへの曝露により可視化した。
【0195】 pCDNA3.1 Myc/His PC−LECTINまたは空のベクター
のいずれかで一過性トランスフェクトした293T細胞の細胞溶解物、およびn
eoコントロールまたはPC−LECTINレトロウイルスのいずれかに安定に
感染したRat1細胞の細胞溶解物、および正常な精巣の細胞溶解物を、SDS
−PAGEにより分離し、そしてニトロセルロースにトランスファーした。次い
で、ウェスタン分析を上記のように実行した。結果を、図11に示す。矢印で示
すのは、全長PC−LECTINを示す47kDバンド、40kD細胞外ドメイ
ン、および55kD Myc/Hisタグ化タンパク質である。
【0196】 Tag5 PC−LECTINで免疫したマウスの血清によるRat1細胞上
のPC−LECTINの細胞表面認識を、フローサイトメトリーにより分析した
。Rat1−neo細胞またはRat1−PC−LECTIN細胞(5×105
)を、1% FBSおよび0.002% NaN3を含むPBS(フロー緩衝液
)中のTag5 PC−LECTINで免疫したマウスの血清の1:2000希
釈物とともに氷上で1時間インキュベートした。細胞を、氷冷フロー緩衝液で2
回洗浄し、次いで抗マウスIgG−FITC結合体の1:2000希釈物ととも
に氷上で30分間インキュベートした。細胞を、フロー緩衝液で2回洗浄し、そ
して1%パラホルムアルデヒドを含むPBS中に再懸濁した。次いで、各サンプ
ル由来の3,000個の細胞を、PC−LECTINの細胞表面染色についてフ
ローサイトメトリーにより分析した。結果を図12に示す。
【0197】 PC−LECTINの細胞表面発現を、ホルマリン固定しパラフィン包埋した
細胞ペレットの免疫組織化学分析を使用してさらに分析した。PC−LECTI
Nでトランスフェクトした293T細胞を、7.5μg/mlのウサギポリクロ
ーナル抗体(SHIER II前処理)で標識した。PC−LECTINの細胞
表面発現を、図13に示すように検出した。この抗体は、親293T細胞を染色
しなかった。
【0198】 (実施例12:PC−LECTINの糖質結合特異性) PC−LECTINを、馴化培地から精製したPC−LECTINのTag5
細胞外ドメインを使用する96ウェルマイクロアッセイを使用して、糖質結合
特異性について分析した。精製タンパク質調製物上の種々の糖質部分にPC−L
ECTINが結合する能力の分析は、高マンノース残基ならびにN−アセチルグ
ルコサミンについての特異性を示す。この特異性は、レクチン コンカナバリン
Aについて観察される特異性と同様である。
【0199】 96ウェルマイクロタイタープレートのウェルを、PBS中1μg/ウェルの
適切な糖タンパク質でコートし、そして37℃で一晩インキュベートする。この
ウェルを、1×Tris緩衝化生理食塩水(TBS)で1回洗浄し、次いでPB
S中3%BSA(Sigma)で1時間、揺らしながらブロックした。このウェ
ルを、緩衝液コントロール、あるいは2mM CaCl2を補充した1×TBS
中の50ngのPC−LECTINまたは50ngのコンカナバリンA(Con
A)のいずれかとともにインキュベートした。次いで、このプレートを、室温で
2時間、揺らしながらインキュベートした。次いで、このプレートを、TBS、
2mM CaCl2、0.05% Tween−20で3回洗浄し、そしてTB
S、2mM CaCl2で1回洗浄した。次いで、このウェルを、室温で1時間
、各々TBS、2mM CaCl2+1% BSA中で1/1000に希釈した
、抗His6ウサギポリクローナル抗体(pAb)(Santa Cruz B
iotechnology)(PC−LECTIN検出のため)または抗CoA
ウサギポリクローナル抗体(Vector Laboratories)(Co
nA検出のため)のいずれかとともにインキュベートした。このウェルを、上記
のように洗浄した。次いで、このウェルを、TBS、2mM CaCl2+1%
BSAで1/3,000に希釈した抗ウサギIg HRP結合体とともにイン
キュベートした。このウェルをまた洗浄し、次いで、製造業者の指針に従って、
TMB ELISA(GIBCO−BRL)を使用して発色し、そしてその光学
密度を、450nMにて測定した。データが、表1に示され、このデータは、2
連決定の平均値を示す。
【0200】 (表1.PC−LECTIN糖質結合特異性)
【0201】
【表1】 −:試験せず ConA:コンカナバリンA 1:C−7913カルボキシエチルチオエチル2−アセトアミド−2−デオキ
シ−4−o−B−s−ガラクトピラノシル−b−d−グルコピラノシドBSA GlcNAc:N−アセチルグルコサミン GalNAc:N−アセチルガラクトサミン GalB1:ガラクトースβ 1結合。
【0202】 (実施例13:HLA−A2へのPC−LECTINペプチドの推定結合) ヒトMHCクラスI分子HLA−A2に結合すると推定されるPC−LECT
INペプチドを同定するために、58P1D12(PC−LECTIN)−F3
C4ファミリーメンバータンパク質の完全アミノ酸を、Bioinformat
ics and Mlecular Analysis Section(BI
MAS)ウェブサイト(http://bimas.dcrt.nih.gov
/)中に見出されるHLA Peptide Motif Searchアルゴ
リズムに入力した。58P1D12−F3C4推定結合ペプチドの結果を、表2
に示す。トップ5にランクする候補を、その位置、各特定のペプチドのアミノ酸
配列、および推定結合スコアとともに示す。この結合スコアは、37℃、pH6
.5におけるそのペプチドを含む複合体の解離の推定半減期に対応する。最高の
結合スコアを有するペプチドは、細胞表面上のHLAクラスIに最も緊密に結合
しており、従って、T細胞認識についての最良の免疫原性標的を示すと推定され
る。HLA−A2へのペプチドの実際の結合は、抗原プロセッシング欠損細胞株
T2上でのHLA−A2発現の安定性により評価し得る(Xueら、1997、
Prostate 30:73〜8;Peshwaら、1998、Prosta
te 36:129〜38)。特定のペプチドの免疫原性を、樹状細胞の存在下
でのCD8+細胞傷害性Tリンパ球(CTL)の刺激によって、インビトロで評
価し得る(Xueら、1997、Prostate 30:73〜8;Pesh
waら、1998、Prostate 36:129〜38)。
【0203】 (表2.推定ペプチド結合スコア)
【0204】
【表2】 (実施例14:潜在的なシグナル伝達経路の同定) PC−LECTINが細胞中の既知のシグナル伝達経路を直接的または間接的
に活性化するか否かを決定するために、ルシフェラーゼ(luc)を基礎にした
転写レポーターアッセイを、PC−LECTINを発現する細胞中で実施する。
これらの転写レポーターは、良く特徴付けられたシグナル伝達経路の下流にある
、既知の転写因子のためのコンセンサス結合部位を含む。これらのレポーターお
よびそれらの関連転写因子、シグナル伝達経路、および活性化刺激物の例を、以
下に列挙する。 1.NFκB−luc、NFκB/Rel;Ik−キナーゼ/SAPK;成長/
アポトーシス/ストレス 2.SRE−luc、SRF/TCF/ELK1;MAPK/SAPK;成長/
分化 3.AP−1−luc、FOS/JUN;MAPK/SAPK/PKC;成長/
アポトーシス/ストレス 4.ARE−luc、アンドロゲンレセプター;ステロイド類/MAPK;成長
/分化/アポトーシス 5.p53−luc、p53;SAPK;成長/分化/アポトーシス 6.CRE−luc、CREB/ATF2;PKA/p38;成長/アポトーシ
ス/ストレス。
【0205】 PC−LECTIN媒介効果を、mRNA発現を示す細胞中でアッセイし得る
。ルシフェラーゼレポータープラスミドを、脂質媒介トランスフェクション(T
FX−50、Promega)により導入し得る。ルシフェラーゼ活性(相対的
転写活性の指標)を、ルシフェリン基質との細胞抽出物のインキュベーションに
より測定し、そして反応の化学発光がルミノメーター中でモニターする。
【0206】 (実施例15:PC−LECTIN機能のインビトロアッセイ) 前立腺癌におけるPC−LECTINの発現は、この遺伝子が腫瘍進行および
/または腫瘍開始において機能的役割を有するという証拠を提供する。PC−L
ECTINが、増殖シグナルを活性化することに関与するレセプターとして機能
する可能性がある。PC−LECTIN機能を、インビトロアプローチを用いて
哺乳動物細胞中で評価し得る。哺乳動物発現には、PC−LECTINを、pc
DNA 3.1 myc−His−タグおよびレトロウイルスベクターpSRα
tkneo(Mullerら、1991、MCB 11:1785)を含む多く
の適切なベクター中にクローン化し得る。このような発現ベクターを用い、PC
−LECTINを、PC−3、NIH3T3、LNCaPおよび293Tを含む
いくつかの細胞株で発現し得る。PC−LECTINの発現を、抗−PC−LE
CTIN抗体およびノザンブロット分析を用いてモニターし得る。
【0207】 PC−LECTINを発現する哺乳動物細胞株を、いくつかのインビトロアッ
セイおよびインビボアッセイで試験し得、このアッセイには、組織培養中の細胞
増殖,アポトーシスシグナルの活性化、SCIDマウスにおける腫瘍形成、およ
び膜侵襲培養系を用いるインビトロ侵襲(MICS;Welchら、Int.J
.Cancer 43:449−457)が含まれる。PC−LECTIN細胞
表現型を、PC−LECTINの発現を欠く細胞の表現型と比較する。
【0208】 PC−LECTINを発現する細胞株はまた、マトリゲルでコートされた多孔
性膜チャンバ(Becton Dickinson)を通る細胞の通過を測定す
ることにより、侵襲特性および遊走特性の改変についてアッセイし得る。向かい
合う側への膜を通る細胞の通過を、カルセイン−Am(Molecular P
robes)を負荷したインジケーター(indicator)細胞を用いる蛍
光アッセイ(Becton Dickinson Technical Bul
letin #428)を用いてモニターする。分析される細胞株は、親および
PC−LECTINを過剰発現する、PC3細胞、NIH3T3細胞ならびにL
NCaP細胞を含む。PC−LECTIN発現細胞が化学誘引物質の性質を有す
るか否かを決定するために、インジケーター細胞を、コントロール培地に比較し
てPC−LECTIN馴化培地の勾配に向かっての多孔性膜を通る通過について
モニターする。このアッセイはまた、候補の癌治療組成物によるPC−LECT
INで誘導される効果の特異的中和を定性および定量するために用い得る。
【0209】 PC−LECTINの機能は、上記の種々の機能的アッセイ(例えば、成長、
侵襲および移動)と連結された抗アンチセンスRNA技術を用いて評価し得る。
アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを、PC−LECTIN発現細胞中に導
入し得、それによってPC−LECTINの発現を防ぐ。コントロール細胞およ
びアンチセンス含有細胞を、増殖、侵襲、遊走、アポトーシスおよび転写能力に
ついて分析し得る。PC−LECTIN発現の損失の局所効果および全身効果を
評価し得る。
【0210】 (実施例16:PC−LECTIN腫瘍成長促進についてのインビボアッセイ
) 腫瘍細胞増殖に対するPC−LECTINタンパク質の影響を、腫瘍をもつマ
ウス中の遺伝子過剰発現によりインビボで評価し得る。例えば、SCIDマウス
に、各脇腹上に、tkNeo空ベクターまたはPC−LECTINを含む、PC
3、TSUPR1、またはDU145細胞のいずれか1×106を皮下注射し得
る。少なくとも以下の2つの戦略を用い得る:(1)ポリオーマウイルス、鶏痘
ウイルス(1989年7月5日に公開されたUK2,211,504)、アデノ
ウイルス(例えば、アデノウイルス2)、ウシパピローマウイルス、トリ肉腫ウ
イルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルスおよびシミ
アンウイルス40(SV40)のようなウイルスのゲノムから得られた構成的プ
ロモーター、または異種哺乳動物プロモーター(例えばアクチンプロモーターま
たは免疫グロブリンプロモーター(このようなプロモーターが宿主細胞系と適合
するという条件で)から得られた構成的プロモーターのような、プロモーターの
調節下での構成的PC−LECTIN発現、および(2)(このようなプロモー
ターが宿主細胞系と適合するという条件で)ecdysone、tetなどのよ
うな、誘導性ベクター系の制御下の調節発現。次いで、腫瘍容積を、触知可能な
腫瘍の出現時にモニターし、そして、経時的に、PC−LECTIN発現細胞が
、より速い速度で成長するか否か、およびPC−LECTIN発現細胞により生
成される腫瘍が、改変された攻撃性の特徴(例えば、増大した転移、血管形成、
化学的治療薬物に対して減少した応答性)を示すか否かを測定する。さらに、マ
ウスに、1×105の同じ細胞を同所移植し得、PC−LECTINが、前立腺
における局所成長に対する影響、または特に肺、リンパ節、および骨髄に転移す
る細胞の能力に対する影響を、有するか否かを決定する。
【0211】 このアッセイはまた、PC−LECTIN内部抗体(intrabody)、
PC−LECTINアンチセンス分子およびリボザイムのような、候補治療組成
物のPC−LECTIN阻害効果を決定するために有用である。
【0212】 (実施例17:細胞下(subcellular)画分中のPC−LECTI
N発現のウェスタン分析) PC−LECTINの配列分析は、2つのC型レクチンドメインおよび膜貫通
ドメインの存在を示した。PC−LECTINの細胞位置は、細胞生物学で広く
用いられる細胞下分画技法を用いて評価し得る(Storrie Bら、Met
hods Enzymol.1990;182:203−25)。前立腺細胞株
を、核画分、細胞質ゾル画分および膜画分に分離し得る。異なる画分中のPC−
LECTIN発現を、ウェスタンブロッティング技法を用いて試験し得る。
【0213】 あるいは、PC−LECTINの細胞下局在化を決定するために、293T細
胞を、HISタグ化PC−LECTINをコードする発現ベクター(PCDNA
3.1 MYC/HIS、Invitrogen)でトランスフェクトし得る
。このトランスフェクトされた細胞を収集し、そして先に記載のように(Pem
berton、P.A.ら、1997、J of Histochemistr
y and Cytochemistry、45:1697−1706)、差次
的細胞下分画プロトコルに供し得る。このプロトコルは、細胞を、核、重い膜(
リソソーム、ペルオキシソーム、およびミトコンドリア)、軽い膜(原形質膜お
よび小胞体)、および可溶性タンパク質について濃縮された画分に分割する。
【0214】 本出願を通じて、種々の刊行物が参照されている。これらの刊行物の開示は、
それらの全体が本明細書に参考として援用されている。
【0215】 本発明は、本明細書に開示される実施形態により範囲を限定されるべきではな
い。これら実施形態は、本発明の個々の局面の単なる例示として意図され、そし
て機能的に等価であるすべてのものが、本発明の範囲内にある。本明細書に記載
のモデルおよび方法に加えて、本発明のモデルおよび方法に対する種々の改変が
、上記の記述および教示から当業者に明らかとなり、そして本発明の範囲内にあ
ることが同様に意図される。このような改変またはその他の実施の形態は、本発
明の真の範囲および趣旨から逸脱することなく実施され得る。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 PC−LECTIN遺伝子をコードする全長cDNAのヌクレオチド(配列番
号1)および推定アミノ酸(配列番号2)の配列。開始メチオニンおよび推定K
ozak配列は、太字で示し、N末端シグナル配列は、四角で囲んで示し、C型
レクチンドメインは、四角で囲んで影を付し、膜貫通ドメインには下線を付した
【図2A】 ヒトPC−LECTIN遺伝子のアミノ酸配列(配列番号2)の、ハムスター
ライリンの報告された配列(配列番号3;BorowskyおよびHynes、
J.Cell Biol:143:42−42,1998)とのアラインメント
【図2B】 ヒトPC−LECTINのcDNA(配列番号4)のハムスターライリン(配
列番号5;BorowskyおよびHynes、J.Cell Biol:14
3:42−42,1998)の報告されたcDNA配列とのヌクレオチド配列ア
ラインメント(BCM Search LauncherからのLALIGNを
使用)。
【図2C】 ヒトPC−LECTINのcDNA(配列番号4)のハムスターライリン(配
列番号5;BorowskyおよびHynes、J.Cell Biol:14
3:42−42,1998)の報告されたcDNA配列とのヌクレオチド配列ア
ラインメント(BCM Search LauncherからのLALIGNを
使用)。
【図3A】 前立腺癌異種移植片、正常前立腺、ならびに他の組織および細胞株におけるP
C−LECTIN遺伝子発現のRT−PCR分析。前立腺癌異種移植片における
発現を示す。レーン1は脳である;レーン2は前立腺である;レーン3はLAP
C−4 ADである;レーン4はLAPC−4 AIである;レーン5はLAP
C−9 ADである;レーン6はLAPC−9 AIである;レーン7はHeL
a細胞である;そしてレーン8はネガティブコントロールである。
【図3B】 種々の組織におけるPC−LECTIN遺伝子発現のRT−PCR分析。30
サイクルでの胎盤における低レベルの発現を示す。レーン1は脳である;レーン
2は心臓である;レーン3は腎臓である;レーン4は肝臓である;レーン5は肺
である;レーン6は膵臓である;レーン7は胎盤である;そしてレーン8は骨格
筋である。
【図3C】 正常前立腺およびその他の組織におけるPC−LECTIN遺伝子発現のRT
−PCR分析。増幅の25サイクルでの正常精巣のみにおける発現および30サ
イクルでの前立腺および脾臓における低レベルの発現を示す。レーン1は結腸で
ある;レーン2は卵巣である;レーン3は白血球である;レーン4は前立腺であ
る;レーン5は小腸である;レーン6は脾臓である;レーン7は精巣である;そ
してレーン8は胸腺である。
【図4A】 種々の正常ヒト組織におけるPC−LECTIN発現のノーザンブロット分析
。これらの正常組織においてPC−LECTINの発現がないことを示す。レー
ン1は心臓である;レーン2は脳である;レーン3は胎盤である;レーン4は肺
である;レーン5は肝臓である;レーン6は骨格筋である;レーン7は腎臓であ
る;そしてレーン8は膵臓である。
【図4B】 種々の正常ヒト組織におけるPC−LECTIN発現のノーザンブロット分析
。正常組織におけるPC−LECTINの精巣特異的発現を示す。レーン1は脾
臓である;レーン2は胸腺である;レーン3は前立腺である;レーン4は精巣で
ある;レーン5は卵巣である;レーン6は小腸である;レーン7は結腸である;
そしてレーン8は白血球である。
【図4C】 前立腺癌異種移植片におけるPC−LECTIN発現のノーザンブロット分析
。全ての前立腺癌異種移植片において高レベルの発現を示し、進行した転移前立
腺癌異種移植片LAPC−9 ADにおいて極めて高レベルの発現を示す。レー
ン1はLAPC−4 ADである;レーン2はLAPC−4 AIである;レー
ン3はLAPC−9 ADである;そしてレーン4はLAPC−9 AIである
【図5】 SSHフラグメントプローブを使用しての前立腺癌異種移植片におけるPC−
LECTINのノーザンブロット分析。結果は、PC−LECTINが、マウス
の骨内において皮下(sc)または脛骨内(it)のいずれかで増殖させた腫瘍
において高度に発現されていることを示す。レーン1〜3はLAPG−9 AD
scである;レーン4〜6はLAPC−9ADitである。
【図6】 去勢後28日の雄(レーン2)の腫瘍におけるPC−LECTIN/58P1
D12のノーザンブロット発現分析を、インタクトな雄(レーン1)の腫瘍にお
ける発現と比較した。発現は、去勢した雄由来の腫瘍において劇的に減少した。
コントロールとして、公知のアンドロゲン調節遺伝子、TMPRSS2の発現も
また、去勢後にダウンレギュレートされていることを示した。これらのデータは
、前立腺腫瘍におけるPC−LECTIN発現が、アンドロゲンの存在に依存し
ていることを示唆する。
【図7】 PC−LECTIN抗原の細胞表面局在化。抗Hisモノクローナル抗体を使
用して、6Hisタグ化PC−LECTIN(レーン2)をコードするcDNA
を含有するベクターでトランスフェクトしたストレプトアビジンセファロース精
製した細胞表面ビオチン化293T細胞の現像したウエスタンブロットの写真で
ある。PC−LECTINタンパク質は、同じベクター(レーン1)でトランス
フェクトした非ビオチン化細胞由来のストレプトアビジン沈降物において検出さ
れなかった。分子量マーカーは、キロダルトン(kD)で示す。
【図8A】 馴化培地において抗HIS抗体は分泌した組換えPC−LECTIN/58P
1D12−AP融合タンパク質を認識することを示すウエスタンブロット。レー
ンには、培地取り替え後4時間で回収したPC−LECTIN/58P1D12
−APでトランスフェクトした非改変293T細胞または293T細胞由来の2
0μlの馴化培地が含まれる。
【図8B】 抗アルカリホスファターゼ抗体もまた、馴化培地中に分泌された組換えPC−
LECTIN/58P1D12−AP融合タンパク質を認識することを示すウエ
スタンブロット。レーンは、図8Aに示されるように、培地取り替え後4時間で
回収したPC−LECTIN/58P1D12−APでトランスフェクトした非
改変293T細胞または293T細胞由来の20μlの馴化培地を含有する。
【図9】 (図9A)PC−LECTINの細胞外ドメインの発現および精製。293T
細胞を、C末端6×Hisタグを有するPC−LECTINの細胞外ドメインを
コードするTag5分泌発現ベクターでトランスフェクトした。馴化培地を、N
i−NTAアガロース(Qiagen)を使用して、固定化金属アフィニティー
クロマトグラフィーに供した。出発馴化培地、フロースルー、および溶出した精
製材料を、10〜20%のSDS−PAGEゲルおよび銀染色上で泳動した。(
図9B)図9Aについて記載されたようにトランスフェクトした293T細胞由
来の馴化培地を、10〜20%のSDS−PAGEゲル上にて泳動し、そしてニ
トロセルロースに移し、そして抗HispAbを使用してウエスタンブロットに
供した。
【図10A】 Rat1−PC−LECTIN細胞由来のPC−LECTINの免疫沈降。n
eoコントロールウイルスまたはPC−LECTINをコードするウイルスのい
ずれかに安定に感染したRat1細胞を、精製したTag5−PC−LECTI
Nタンパク質で精製したマウス由来の血清により免疫沈降に供した。ウエスタン
ブロット分析を、アフィニティー精製ウサギ抗PC−LECTINペプチドpA
bを使用して行った。
【図10B】 ウエスタンブロット分析が1:1000希釈の免疫化マウス血清で行われたこ
とを除き、図10Aに記載されるようなRat1−PC−LECTIN細胞由来
のPC−LECTINの免疫沈降。
【図11】 組換え細胞株および精巣におけるPC−LECTINの発現。pCDNA3.
1Myc/His PC−LECTINまたは空のベクターのいずれかで一過的
にトランスフェクトされた293T細胞の細胞溶解物およびneoコントロール
もしくはPC−LECTINレトロウイルスのいずれかに安定に感染したRat
1細胞の細胞溶解物および正常精巣の細胞溶解物を、SDS−PAGEによって
分離し、そしてウエスタンブロット分析のためにニトロセルロースに移した。矢
印で示したのは、全長PC−LECTINを表す47kDのバンド、40kDの
細胞外ドメイン、および55kDのMyc/Hisタグ化タンパク質である。
【図12】 フローサイトメトリーを使用したRat1細胞上でのTag5 PC−LEC
TIN免疫化マウス血清でのPC−LECTINの細胞表面認識。Rat1−n
eo(空白部分)またはRat1−PC−LECTIN細胞(5×105;影を
付した部分)のいずれかを、1:2000希釈のTag5 PC−LECTIN
免疫化マウス血清とともにインキュベートした。各サンプルからの3,000個
の細胞を、PC−LECTINの細胞表面染色についてフローサイトメトリーに
よって分析した。事象の数は、相対的な蛍光の関数としてプロットされる。
【図13】 ウサギポリクローナル抗体で標識したPC−LECTINトランスフェクト2
93T細胞の免疫組織化学分析。これは、PC−LECTINの細胞表面発現を
示す。抗体は、親293T細胞を染色しない。
【図14】 多組織RNAドットブロット(50サンプル)を使用して分析したPC−LE
CTINの発現。結果は、精巣中での58P1D12のみの有意な発現を示す。
より低い発現もまた、唾液腺、胎児腎臓、および胎児脾臓において検出された。
そのブロットもまた、その他の領域において外来性のシグナルを示し、それらは
特異的シグナルの列および行の間にあるから、非特異的であるようである。位置
は、以下の組織を表す:A1脳;A2扁桃体;A3尾状核;A4小脳;A5大脳
皮質;A6前頭葉;A7海馬;A8延髄;B1後頭葉;B2被殻;B3黒質;B
4側頭葉;B5視床;B6視床下核;B7脊髄;C1心臓;C2大動脈;C3骨
格筋;C4結腸;C5膀胱;C6子宮;C7前立腺;C8胃;D1精巣;D2卵
巣;D3膵臓;D4下垂体;D5副腎;D6甲状腺;D7唾液腺;D8乳腺;E
1腎臓;E2肝臓;E3小腸;E4脾臓;E5胸腺;E6末梢白血球;E7リン
パ節;E8骨髄;F1虫垂;F2肺;F3気管;F4胎盤;G1胎児脳;G2胎
児心臓;G3胎児腎臓;G4胎児肝臓;G5胎児脾臓;G6胎児胸腺;G7胎児
肺。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 39/395 A61K 48/00 4C085 48/00 A61P 35/00 4C086 A61P 35/00 C07K 14/47 4C087 C07K 14/47 16/18 4H045 16/18 C12N 1/15 C12N 1/15 1/19 1/19 1/21 1/21 C12P 21/02 C 5/10 21/08 C12P 21/02 C12Q 1/02 21/08 1/68 A C12Q 1/02 G01N 33/53 D 1/68 M G01N 33/53 33/566 C12N 15/00 ZNAA 33/566 5/00 A B (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ,UG ,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD, RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT, AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,BZ,C A,CH,CN,CR,CU,CZ,DE,DK,DM ,DZ,EE,ES,FI,GB,GD,GE,GH, GM,HR,HU,ID,IL,IN,IS,JP,K E,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS ,LT,LU,LV,MA,MD,MG,MK,MN, MW,MX,MZ,NO,NZ,PL,PT,RO,R U,SD,SE,SG,SI,SK,SL,TJ,TM ,TR,TT,TZ,UA,UG,UZ,VN,YU, ZA,ZW (72)発明者 ジャコボヴィツ, アヤ アメリカ合衆国 カリフォルニア 90210, ビバリー ヒルズ, ハットン ドライ ブ 3135 (72)発明者 ライタノ, アーサー ビー. アメリカ合衆国 カリフォルニア 90064, ロス アンゼルス, クシュドン アベ ニュー 10807 Fターム(参考) 4B024 AA01 BA21 CA04 CA06 DA02 EA02 EA04 FA02 FA10 GA11 HA17 4B063 QA01 QQ43 QR32 QR55 QS34 4B064 AG02 AG27 CA10 CA19 CC24 DA01 DA14 4B065 AA90X AA99Y AB01 AC14 BA02 CA24 CA25 CA44 4C084 AA02 AA06 AA07 AA13 BA35 CA53 CA56 DA31 MA17 MA66 NA14 ZB261 4C085 AA03 AA14 BB01 BB11 CC05 DD22 DD23 DD61 EE01 4C086 AA01 AA02 AA03 EA16 MA04 MA66 NA14 ZB26 4C087 AA01 AA02 AA03 BB64 BB65 BC83 MA66 NA14 ZB26 4H045 AA10 AA11 AA30 BA10 CA41 DA01 DA75 EA22 EA28 EA51 FA74

Claims (39)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 PC−LECTINポリペプチドをコードするポリヌクレオ
    チドであって、該ポリヌクレオチドが以下からなる群より選択される、ポリヌク
    レオチド: (a)配列番号1に示される配列を有するポリヌクレオチドであって、TがU
    でもあり得る、ポリヌクレオチド; (b)配列番号1に示される配列のヌクレオチド残基番号201〜ヌクレオチ
    ド残基番号2378を有するポリヌクレオチドであって、TがUでもあり得る、
    ポリヌクレオチド; (c)PC−LECTINポリペプチドをコードするポリヌクレオチドであっ
    て、該ポリペプチドの配列が、アメリカンタイプカルチャーコレクションに受託
    番号207152として寄託されたp58P1D12−2と称されるプラスミド
    に含まれるcDNAによりコードされる、ポリヌクレオチド; (d)配列番号2に示されるアミノ酸配列を有するPC−LECTINタンパ
    ク質をコードするポリヌクレオチド;および (e)(a)〜(d)のいずれか1つのポリヌクレオチドに十分相補的なポリ
    ヌクレオチド。
  2. 【請求項2】 配列番号2に示されるアミノ酸配列に対してその長さ全体に
    わたり少なくとも90%同一であるポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチ
    ド。
  3. 【請求項3】 請求項1に記載のポリヌクレオチドのフラグメントであって
    、以下を含む、ポリヌクレオチド: (a)配列番号1に示される配列の、ヌクレオチド残基番号443〜ヌクレオ
    チド残基番号1018、ヌクレオチド残基番号443〜ヌクレオチド残基番号1
    201、ヌクレオチド残基番号509〜ヌクレオチド残基番号562、ヌクレオ
    チド残基番号872〜ヌクレオチド残基番号913、またはヌクレオチド残基番
    号1019〜ヌクレオチド残基番号1087を有する、ポリヌクレオチド; (b)長さが少なくとも20ヌクレオチド塩基である(a)のポリヌクレオチ
    ドのフラグメントである、ポリヌクレオチド;あるいは (c)(a)または(b)のポリヌクレオチドにストリンジェントな条件下で
    選択的にハイブリダイズする、ポリヌクレオチド。
  4. 【請求項4】 PC−LECTINポリペプチドをコードするポリヌクレオ
    チドであって、該ポリペプチドは以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を
    含む、ポリヌクレオチド:NLTK(配列番号33)、NQST(配列番号34
    )、RKES(配列番号35)、SSR、SEK、STR、TRK、SFQE(
    配列番号36)、SDGD(配列番号37)、TRKE(配列番号38)、SG
    ME(配列番号39)、GQKVCF(配列番号40)、GVLLSL(配列番
    号71)、GTGISD(配列番号42)、GISDGD(配列番号43)、G
    LWRNG(配列番号44)、GQTSGA(配列番号45)、GSEKCV(
    配列番号46)、GIIPNL(配列番号47)、GLWRNGDGQTSGA
    C(配列番号25)、GGPYLYQWNDDRCNM(配列番号26)、EA
    RLACESEGGVLL(配列番号27)、WIGFTYKTA(配列番号6
    )、ATGEHQAFT(配列番号7)、FGNCVELQA(配列番号8)、
    NCVELQASA(配列番号9)、およびDNHGFGNCV(配列番号10
    )。
  5. 【請求項5】 検出可能なマーカーで標識されている、請求項1〜4のいず
    れか1項に記載のポリヌクレオチド。
  6. 【請求項6】 請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドを含
    む、組換え発現ベクター。
  7. 【請求項7】 請求項6に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
  8. 【請求項8】 PC−LECTINポリペプチドを生成するためのプロセス
    であって、請求項7に記載の宿主細胞を該ポリペプチドの生成に十分な条件下で
    培養する工程を包含する、プロセス。
  9. 【請求項9】 前記のように生成された前記PC−LECTINポリペプチ
    ドを回収する工程をさらに包含する、請求項8に記載のプロセス。
  10. 【請求項10】 請求項8に記載のプロセスにより生成された、PC−LE
    CTINポリペプチド。
  11. 【請求項11】 請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドに
    よりコードされるPC−LECTINポリペプチド。
  12. 【請求項12】 請求項11に記載のポリペプチドのうちの少なくとも15
    個連続するアミノ酸を含む、ポリペプチド。
  13. 【請求項13】 請求項10〜12のいずれか1項に記載のPC−LECT
    INポリペプチドに特異的に結合する、抗体またはそのフラグメント。
  14. 【請求項14】 モノクローナルである、請求項13に記載の抗体またはそ
    のフラグメント。
  15. 【請求項15】 請求項14に記載のモノクローナル抗体の抗原結合領域を
    含む、組換えタンパク質
  16. 【請求項16】 検出可能なマーカーで標識されている、請求項13もしく
    は14に記載の抗体またはそのフラグメント、あるいは請求項15に記載の組換
    えタンパク質。
  17. 【請求項17】 請求項16に記載の抗体またはそのフラグメントあるいは
    組換えタンパク質であって、前記検出可能なマーカーが、放射性同位体、蛍光化
    合物、生体発光化合物、化学発光化合物、金属キレート剤および酵素からなる群
    より選択される、抗体またはそのフラグメントあるいは組換えタンパク質。
  18. 【請求項18】 Fabフラグメント、F(ab’)2フラグメント、Fv
    フラグメントまたはsFvフラグメントである、請求項13に記載の抗体フラグ
    メント。
  19. 【請求項19】 ヒト抗体である、請求項13〜18のいずれか1項に記載
    の抗体またはそのフラグメント。
  20. 【請求項20】 毒素または治療薬剤に結合体化されている、請求項13〜
    18のいずれか1項に記載の抗体またはそのフラグメント。
  21. 【請求項21】 マウス抗原結合領域残基およびヒト抗体残基を含む、請求
    項13〜16のいずれか1項に記載の抗体。
  22. 【請求項22】 請求項14に記載のモノクローナル抗体を生成する、トラ
    ンスジェニック動物。
  23. 【請求項23】 請求項14に記載のモノクローナル抗体を生成する、ハイ
    ブリドーマ。
  24. 【請求項24】 請求項14に記載のモノクローナル抗体の重鎖の可変ドメ
    インおよび軽鎖の可変ドメインを含む、単鎖モノクローナル抗体。
  25. 【請求項25】 請求項24に記載の単鎖モノクローナル抗体をコードする
    ポリヌクレオチドを含む、ベクター。
  26. 【請求項26】 生物学的サンプルにおけるPC−LECTINタンパク質
    の存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイは、該サンプルと、請求
    項16または17に記載の抗体またはそのフラグメントあるいは組換えタンパク
    質とを接触させる工程、および該抗体またはそのフラグメントあるいは組換えタ
    ンパク質への、該サンプルにおけるPC−LECTINタンパク質の結合を検出
    する工程、を包含する、アッセイ。
  27. 【請求項27】 生物学的サンプルにおけるPC−LECTINポリヌクレ
    オチドの存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイは、以下の工程: (a)該サンプルと、請求項1に記載のポリヌクレオチドに特異的にハイブリ
    ダイズするポリヌクレオチドプローブとを接触させる工程;および (b)該プローブと該サンプル中のPC−LECTINポリヌクレオチドとの
    該ハイブリダイゼーションにより形成されたハイブリダイゼーション複合体の存
    在を検出する工程であって、該ハイブリダイゼーション複合体の存在が該サンプ
    ル内のPC−LECTINポリヌクレオチドの存在を示す、工程、 を包含する、アッセイ。
  28. 【請求項28】 生物学的サンプルにおけるPC−LECTIN mRNA
    の存在を検出するためのアッセイであって、該アッセイは、以下: (a)少なくとも1つのプライマーを用いて逆転写することにより、該サンプ
    ルからcDNAを生成する工程; (b)該サンプル中でPC−LECTIN cDNAを増幅するためのセンス
    プライマーおよびアンチセンスプライマーとしてPC−LECTINポリヌクレ
    オチドを使用して、上記のように生成した該cDNAを増幅する工程; (c)該増幅したPC−LECTIN cDNAの存在を検出する工程、 を包含し、 該センスプローブおよびアンチセンスプローブとして使用される該PC−LEC
    TINポリヌクレオチドが、アメリカンタイプカルチャーコレクションに受託番
    号207152として寄託されたプラスミドp58P1D12−2内に含まれる
    PC−LECTIN cDNAを増幅し得る、アッセイ。
  29. 【請求項29】 PC−LECTINタンパク質を発現する癌の存在を検出
    する方法であって、該方法は、個体由来の試験組織サンプル中の細胞により発現
    されたPC−LECTINタンパク質のレベルを決定する工程、および上記のよ
    うに決定されたレベルを、対応する正常サンプルにおいて発現されたPC−LE
    CTINのレベルと比較する工程を包含し、該試験サンプルにおける、該正常サ
    ンプルに対して上昇したPC−LECTINタンパク質の存在が、該個体におけ
    るこのような癌の存在の指標を提供する、方法。
  30. 【請求項30】 PC−LECTIN遺伝子産物をモニターする方法であっ
    て、該方法は、個体由来の試験組織サンプル中の細胞により発現されたPC−L
    ECTIN遺伝子産物の状態を決定する工程、および上記のように決定された該
    状態を、対応する正常サンプルにおけるPC−LECTIN遺伝子産物の状態と
    比較する工程を包含し、該試験サンプルにおける、該正常サンプルに対して異常
    なPC−LECTIN遺伝子産物の存在が該個体内の細胞増殖の調節不全の指標
    を提供する、方法。
  31. 【請求項31】 個体における癌の存在を診断するためのデータを提供する
    方法であって、該方法は、以下の工程: (a)該個体から得られた試験サンプルにおいて発現されたPC−LECTI
    N mRNAのレベルを決定する工程;および (b)上記のように決定されたレベルを、既知の比較用正常組織サンプルにお
    いて発現されたPC−LECTIN mRNAのレベルと比較する工程、 を包含し、該試験サンプルにおける、該正常組織サンプルに対して上昇したPC
    −LECTIN mRNA発現の存在が癌の存在の指標を提供する、方法。
  32. 【請求項32】 個体における癌の存在を診断するためのデータを提供する
    方法であって、該方法は、以下の工程: (a)該個体から得られた試験サンプルにおいて発現されたPC−LECTI
    Nタンパク質のレベルを決定する工程;および (b)上記のように決定されたレベルを、既知の比較用正常組織サンプルにお
    いて発現されたPC−LECTINタンパク質のレベルと比較する工程、 を包含し、該試験サンプルにおける、該正常組織サンプルに対して上昇したPC
    −LECTINタンパク質の存在が癌の存在の指標を提供する、方法。
  33. 【請求項33】 請求項31または32に記載の方法であって、前記癌が前
    立腺癌であり、そして前記試験組織サンプルおよび正常組織サンプルが、前立腺
    組織、骨組織、リンパ組織、血清、血液および精液からなる群より選択される、
    方法。
  34. 【請求項34】 PC−LECTINを発現する癌に罹患した患者を処置す
    るための組成物の調製のための、請求項25のベクターの使用、請求項1に記載
    のポリヌクレオチドに相補的なアンチセンスポリヌクレオチドの使用、請求項1
    に記載のポリヌクレオチドを切断し得るリボザイムの使用、または請求項13〜
    21のうちのいずれか1項に記載の抗体もしくはそのフラグメントの使用。
  35. 【請求項35】 PC−LECTINを発現する癌を処置するための組成物
    の調製のための、請求項10もしくは11に記載のPC−LECTINポリペプ
    チドまたはその免疫原性部分の使用。
  36. 【請求項36】 請求項34または35に記載の使用であって、前記癌が、
    前立腺癌、乳癌、膀胱癌、肺癌、骨の癌、結腸癌、膵臓癌、精巣癌、子宮頸部癌
    および卵巣癌からなる群より選択される、使用。
  37. 【請求項37】 薬学的組成物であって、 請求項10もしくは11に記載のPC−LECTINポリペプチドまたはその
    免疫原性部分、請求項25に記載のベクター、請求項1に記載のポリヌクレオチ
    ドに相補的なアンチセンスポリヌクレオチド、請求項1に記載のポリヌクレオチ
    ドを切断し得るリボザイム、あるいは請求項13〜20のうちのいずれか1項に
    記載の抗体またはそのフラグメント を含む、薬学的組成物。
  38. 【請求項38】 PC−LECTINを発現する癌の処置のためのワクチン
    組成物であって、請求項10もしくは11に記載のPC−LECTINポリペプ
    チドの免疫原性部分を含有する、ワクチン組成物。
  39. 【請求項39】 請求項37に記載の薬学的組成物または請求項38に記載
    のワクチン組成物であって、生理学的に受容可能なキャリアをさらに含有する、
    組成物。
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JP2008509700A (ja) * 2004-08-16 2008-04-03 アジェンシス, インコーポレイテッド 癌の処置および検出において有用な58p1d12と称される核酸および対応するタンパク質

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