JP2002542826A - 腫瘍壊死因子α(TNF−α)シグナル伝達経路のインヒビターとして働くTRAF2の改変体 - Google Patents

腫瘍壊死因子α(TNF−α)シグナル伝達経路のインヒビターとして働くTRAF2の改変体

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、TNFαシグナル伝達系路を阻害する能力を示すTRAF2の改変体に関する。特に、出願人は、TRAF2のスプライス改変体(本明細書中以降、「TRAF2短縮型」または「TRAF2TR」という)およびドミナントネガティブ特性が増強されたTRAF2発現構築物(本明細書中以降、「TRAF2短縮−欠失型」または「TRAF2TD」という)を単離した。TRAF2TRおよびTRAF2TDは共に、TNFαシグナル伝達系路を阻害する能力を有し、そしてTRAF2TDにおいては、この能力は非常に増強されており、TNFα結合に対する応答が非常に減少している。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 腫瘍壊死因子α(TNFα)は、活性化マクロファージおよび単球を含む、種
々の細胞により生成される免疫応答の細胞内メディエーターである。TNFαに
より誘発される応答は、2つの異なるTNFαの細胞表面レセプター(TNFα
R1およびTNFαR2)との相互作用を通じて開始される。TNFαは、これ
らの細胞表面レセプターに結合し、そして転写因子(例えば、核因子κB(NF
κB))の活性化を誘発し、この転写因子は、種々の免疫および炎症応答遺伝子
の発現を調節する。
【0002】 TNFαの結合に際して、TNFαレセプターは、それらの細胞質ドメインを
通じて、種々の細胞内シグナル翻訳タンパク質(intracellular
signal translation protein)と相互作用する。T
NFαレセプターと会合することが公知の細胞内シグナル翻訳タンパク質の1つ
の群は、「TRAF」ファミリーのレセプタータンパク質として公知の腫瘍壊死
因子レセプター会合因子である。TRAFファミリーは、構造的特徴を共有し、
そしてTNFαレセプタータンパク質と会合し、かつTNFαからのシグナルを
伝達する多くの相同性タンパク質から構成される。TRAFタンパク質は、酵素
活性モチーフを欠き、そして代わりに下流のシグナル伝達カスケードにレセプタ
ーを共役するアダプタータンパク質として機能するようである。このファミリー
の1つのメンバーであるTRAF2は、多くのTNFαレセプターファミリータ
ンパク質と会合する。このTNFαレセプターファミリータンパク質としては、
TNFαR1、TNFαR2、CD40およびCD30が挙げられる。TRAF
2に関しては、少なくとも8つの細胞内分子が直接結合することが同定されてい
る。TRAF2は、種々の転写因子、特にNFκβおよびC−jun N末端キ
ナーゼ(JNK/SAPK)のTNFα媒介活性化について重要であり、そして
これらの転写因子は、次いで、免疫/炎症応答の発現を担うことが示されている
【0003】 TNFα結合により制御される調節経路に関連した種々の疾患状態が存在する
。いくつかの例において、TNFα結合は、疾患状態を最終的に生じる炎症応答
を誘発する。従って、TNFαレセプター結合に関連した疾患を予防するための
手段を開発することは望ましい。そうでなければ、TNFα活性化により開始さ
れる炎症応答の活性化を予防する方法を見出すことは特に望ましい。本発明は、
TNFα結合に関連した疾患を処置および予防するために、TRAF2に基づき
、かつTNFαシグナル伝達系路を阻害し得るポリペプチドを提供する。
【0004】 (報告された発展) TRAFタンパク質の一般的構造は記載されており、そして図1に総体的に図
示され、ここでは図の形態で全長TRAF2(TRAF2−FL)が示される。
これらのタンパク質は、ジンク環状フィンガーモチーフを有するN末端領域を有
し、ジンクフィンガー様構造のアレイが続く。このジンクフィンガー領域に続い
て、保存性(TRAF)ドメインが存在し、これは、2つのサブドメイン(N末
端ドメインおよびC末端ドメイン)からなる。C末端ドメインは、レセプター結
合およびTRAFのホモオリゴマー化、ならびにTRAFのヘテロオリゴマー化
に関与し、そして種々の他のシグナル伝達タンパク質のためのドッキング部位と
して働く。
【0005】 TRAF2は、上記のTRAFタンパク質の一般的構造に従う。多数の研究が
、TRAF2タンパク質の構造的なサブドメインとタンパク質の機能とを相関さ
せるために試みられてきた。
【0006】 Takeuchiらは、TRAF2の広範な変異分析を実行した(Takeu
chiら、J.Biol.Chem.271(33)19935−42(199
6))。これらの研究は、TRAF2が、別個の活性を媒介するモジュラードメ
インから構成されることを示唆する。この著者らは、TRAF2のN末端環状フ
ィンガーおよび2つの隣接するジンクフィンガーがNFκB活性化に必要とされ
ること、およびTRAFドメイン中の別個のTRAF−NサブドメインおよびT
RAF−Cサブドメインが独立して自己結合およびTRAFとの相互作用を媒介
するらしいことを決定した。
【0007】 Songら(Proc.Natl.Acad.Sci.USA、94,979
2−9796(1997))は、続いて、TNFαによって誘導されたNFκB
およびc−jun N末端キナーゼ(JNK/SAPK)の活性化が、TRAF
2を必要とすることを示す研究である。この著者らは、TRAF2が、NFκB
およびJNKの活性化をもたらす2つのキナーゼカスケードの分岐点であること
を示した。この観察は、並行する下流の応答を開始するさらなるシグナル伝達タ
ンパク質についてのドッキング部位を有するアダプタータンパク質としてのTR
AF2および他のTRAFファミリーのメンバーについての機能的モデルを支持
する。
【0008】 Minら(J.Immunology、159,3508−3518(199
7))は、TRAFタンパク質の役割を分析するためのトランスフェクション/
過剰発現ストラテジーを使用した。TRAFドメインを含むがアミノ末端残基1
−80を欠くTRAF2は、TNFα誘導されるNFκB活性化を阻害すること
が以前に示された。この著者らは、このTRAF2改変体もまた、TNFαによ
るJNK活性化をブロックすることを実証した。
【0009】 Brinkら(J.Biol.Chem.273、7、4129−4134(
1998))は、彼らが「TRAF2A」と呼ぶTRAF2のスプライシング改
変体を記載した。TRAF2AのcDNAは、TRAF2A環状フィンガードメ
イン中の7アミノ酸インサートをコードする21bpの余分の配列を例外として
、TRAF2と同一である。この著者らは、TRAF2A mRNA発現は、組
織特異的様式で調節され、そしてTRAF2Aタンパク質は、TNFαR2の細
胞質ドメインに結合し得ることを見出した。彼らはまた、TRAF2と対照的に
、TRAF2Aは、293細胞中で過剰発現された場合に、NFκB活性を刺激
し得ず、そしてTNFαR2依存的NFκB活性化の優勢なインヒビターとして
働く。
【0010】 多くの研究が、炎症性プロセスおよびTNFαを、主要な心臓血管の疾患状態
と関連付けてきた(Bryantら、Circulation、97(14):
1375−81(1998);Kubotaら、Circ.Res.、81(4
):627−35(1997);Muller Werdanら、Eur.Cy
tokine Netw.、9(4)689−91(1998);Aukrus
tら、Am.J.Cardiol.、83(3):376−82(1999))
。過去5年間にわたって、局所的なTNFαのレベルの上昇が:(a)心臓血管
の虚血性再灌流障害、これは、心筋梗塞、冠状動脈バイパス手術、心臓移植また
は発作後のCNSにおける虚血性再灌流障害に続く;(b)進行した冠動脈アテ
ローム硬化斑の進行および破裂;(c)うっ血性心不全の発症および進行;およ
び(d)バルーン血管形成術後の内皮細胞障害と関連することを示す証拠が蓄積
している。さらに、最近の知見は、アポトーシス性の細胞死が、心不全または梗
塞形成の間の心筋の細胞死の病態生理学において重要な因子であり得ることを示
す。TNFαは、筋細胞アポトーシスを誘導し得ることが知られている。
【0011】 上述の心臓血管疾患状態に加えて、その病因がTNFαに連結している種々の
他の疾患状態が存在する。これらの疾患状態には、クローン病、乾癬、慢性関節
リウマチ、対宿主性移植片病、炎症性腸疾患、インスリン非依存性糖尿病、およ
び神経変性性疾患(例えば、パーキンソン病)が含まれる。
【0012】 TNFαと上記に議論したような種々の疾患との間に関連性があるならば、こ
れらの疾患状態を阻害および処置するための組成物および方法を提供することが
望ましい。
【0013】 (発明の要旨) 本発明に従って、TRAF2の改変体、特に、天然に存在するスプライシング
のバリエーションを含む改変体(TRAF2TR)および天然に存在するスプラ
イシングのバリエーションおよびTRAF2のN末端領域の欠失を含む改変体(
TRAF2TD)が、TNFαシグナル伝達および関連する免疫炎症応答の阻害
を提供することが見出された。
【0014】 本発明の1つの実施形態に従って、図2aに示されるような配列を含むTRA
F2TRをコードするDNA配列が提供される。
【0015】 本発明の別の実施形態に従って、図3aに示されるような配列を含むTRAF
2TDをコードするDNA配列がまた、提供される。
【0016】 好ましい実施形態において、TRAF2TR DNAおよびTRAF2TD
DNAは、cDNAである。
【0017】 他の実施形態において、本発明は、図2bにおいて示されるようなアミノ酸配
列を含む、腫瘍壊死因子α(TNFα)調節性経路を阻害し得るTRAF2TR
ポリペプチド、および図3bにおいて示されるようなアミノ酸配列を含む、TN
Fα調節性経路を阻害し得るTRAF2TDポリペプチドを提供する。
【0018】 本発明の別の局面は、患者においてTNFα調節性経路を阻害するための方法
を提供し、この方法は、患者の身体に組成物を導入する工程を包含し、この組成
物は、TNFα調節性経路を阻害し得、そして、TRAF2TRポリペプチドを
発現し得る発現ベクターを含む。この発現ベクターは、TRAF2TDポリペプ
チド、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリア、または
TRAF2TDポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを発現し得る。
【0019】 本発明のなお別の局面は、TNFαの過剰産生を含む疾患を阻害する方法を提
供し、この方法は、TNFα調節性経路を阻害し得、そしてTRAF2TRを発
現し得る発現ベクターを含む組成物を患者に投与する工程を包含し、そしてこの
発現ベクターは、TRAF2TD、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的に
受容可能なキャリア、またはTRAF2TDポリペプチドおよび薬学的に受容可
能なキャリアを発現し得る。
【0020】 本発明のなお別の局面は、核因子κB(NFκB)依存性遺伝子の過剰活性化
を含むTNFα病理を阻害する方法を提供し、この方法は、TNFα調節性経路
を阻害し得、そしてTRAF2TRを発現し得る発現ベクターを含む組成物を患
者に投与する工程を包含し、そしてこの発現ベクターは、TRAF2TD、TR
AF2TRポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリア、またはTRAF2
TDポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを発現し得る。
【0021】 本発明はまた、腫瘍壊死因子αを含む炎症性プロセスを阻害する方法を提供し
、この方法は、TNFα調節性経路を阻害し得、そしてTRAF2TRを発現し
得る発現ベクターを含む組成物を患者に投与する工程を包含し、そしてこの発現
ベクターは、TRAF2TD、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的に受容
可能なキャリア、またはTRAF2TRポリペプチドおよび薬学的に受容可能な
キャリアを発現し得る。
【0022】 特定の実施形態において、その炎症性プロセスは、クローン病、乾癬、慢性関
節リウマチ、対宿主性移植片病、炎症性腸疾患、インスリン非依存性糖尿病、お
よび神経変性性疾患からなる群より選択される。
【0023】 なお別の実施形態において、その炎症性プロセスは、(a)心筋梗塞、冠状動
脈バイパス手術、心臓移植、または発作後のCNSにおける虚血性再灌流障害後
の心臓血管の虚血性再灌流障害;(b)進行した冠動脈アテローム硬化プラーク
の進行および破裂;(c)うっ血性心不全の発症および進行;(d)バルーン血
管形成術後の内皮細胞傷害;および(e)心筋細胞のアポトーシス性細胞死から
なる群より選択される心臓血管疾患である。
【0024】 本発明のなお別の実施形態において、TRAF2TR/2TD改変体をコード
するDNA配列が提供される。
【0025】 本発明の別の局面は、TNFα調節性経路を阻害し得るTRAF2TR/2T
D改変体ポリペプチドを提供する。
【0026】 本発明は、これらの疾患状態(すなわち、TNFαシグナル伝達)に一般的で
ある初期のイベントを妨害する天然に存在するタンパク質の改変体を使用して、
広範な種々の疾患状態を処置し得る利点を提供する。
【0027】 (発明の詳細な説明) 本明細書以下では、本明細書において使用される用語の定義および本発明の好
ましい実施形態の説明を示す。
【0028】 (定義) 「クローニングベクター」は、別のDNAセグメントが、付着されたセグメン
トの複製を生じるように、付着され得るレプリコン(例えば、プラスミド、ファ
ージまたはコスミド)である。「レプリコン」は、インビボでDNA複製の自己
ユニットとして機能する(すなわち、それ自身の制御下で複製し得る)任意の遺
伝子エレメント(例えば、プラスミド、染色体、ウイルス)である。クローニン
グベクターは、1つの細胞型における複製および別の細胞において発現が可能で
あり得る(「シャトルベクター」)。本発明の好ましい実施形態において、クロ
ーニングベクターは、宿主細胞における発現が可能であり、そして「発現ベクタ
ー」は、TRAF2TRまたはTRAF2TDを、細胞中でTNFα調節性経路
を妨害するのに充分なレベルで発現し得る。
【0029】 「カセット」は、1つ以上の特異的制限部位でベクター中に挿入され得るDN
Aのセグメントをいう。DNAのセグメントは、目的のポリペプチドをコードし
、そしてカセットおよび制限部位は、転写および翻訳のための適切なリーディン
グフレームにおけるそのカセットの挿入を確実にするために設計される。
【0030】 細胞は、外因性または異種のDNAによって、そのようなDNAがその細胞の
中に導入されている場合、「トランスフェクト」されている。細胞は、トランス
フェクトされたDNAが表現型変化をもたらす場合、外因性または異種のDNA
によって「形質転換」されている。形質転換DNAは、その細胞のゲノムを形成
している染色体DNA中に(共有結合されて)組み込まれ得る。
【0031】 「核酸分子」とは、リボヌクレオシド(アデノシン、グアノシン、ウリジン、
またはシチジン;「RNA分子」)またはデオキシリボヌクレオシド(デオキシ
アデノシン、デオキシグアノシン、デオキシチミジン、またはデオキシシチジン
;「DNA分子」)の、またはこれらの任意のリン酸エステルアナログ(例えば
、ホスホロチオエートおよびチオエステル)の、一本鎖形態または二本鎖へリッ
クスのいずれかのリン酸エステルポリマー形態をいう。二本鎖DNA−DNA、
DNA−RNA、およびRNA−RNAへリックスが可能である。用語「核酸分
子」および特にDNAまたはRNA分子は、その分子の一次および二次構造のみ
をいい、そしてそれは任意の特定の三次形態に限定されない。したがって、この
用語は、とりわけ、直線状または環状DNA分子(例えば、制限フラグメント)
、プラスミド、および染色体に見出される二本鎖DNAを含む。特定の二本鎖D
NA分子の構造を議論するにおいて、配列は、本明細書において、DNAの転写
されない鎖(すなわち、mRNAと相同な配列を有する鎖)に沿って5’から3
’の方向にのみ与えられるという通常の約束に従って、記載され得る。「組換え
DNA分子」は、分子生物学的操作を経たDNA分子である。
【0032】 核酸分子は、一本鎖形態の核酸分子が、温度および溶液イオン強度の適切な条
件下で(Sambrookら、前出を参照)、他の核酸分子にアニールし得る場
合、別の核酸分子(例えば、cDNA、ゲノムDNA、またはRNA)に「ハイ
ブリダイズ可能」である。温度およびイオン強度の条件は、ハイブリダイゼーシ
ョンの「ストリンジェンシー」を決定する。ハイブリダイゼーションは、ハイブ
リダイゼーションのストリンジェンシーに依存して塩基間でミスマッチが可能で
あるが、2つの核酸が相補配列を含有することを必要とする。核酸をハイブリダ
イズするための適切なストリンジェンシーは、核酸の長さおよび相補性の程度、
当該分野で公知の変数に依存する。
【0033】 本明細書で使用する用語「オリゴヌクレオチド」は、一般に、少なくとも18
ヌクレオチドであり、TRAF2をコードするゲノムDNA分子、cDNA分子
、またはmRNA分子にハイブリダイズすることができる核酸をいう。オリゴヌ
クレオチドは、例えば、32P−ヌクレオチドまたは標識(例えば、ビオチン)が
共有結合したヌクレオチドで標識され得る。1つの実施形態において、標識され
たオリゴヌクレオチドは、TRAF2をコードする核酸の存在を検出するための
プローブとして使用され得る。別の実施形態において、オリゴヌクレオチドは(
その1つまたは両方が標識され得る)は、TRAF2の全長またはフラグメント
をクローニングするため、またはTRAF2をコードする核酸の存在を検出する
ためのいずれかのためのPCRプライマーとして使用され得る。更なる実施形態
において、オリゴヌクレオチドは、TRAF2 DNA分子を有する3重へリッ
クスを形成し得る。一般に、オリゴヌクレオチドは、好ましくは、核酸合成機に
おいて合成的に調製される。したがって、オリゴヌクレオチドは、天然に生じな
いホスホエステルアナログ結合(例えば、チオエステル結合など)を有して調製
され得る。
【0034】 DNA「コード配列」は、適切な調節配列の制御下におかれた場合、細胞にお
いて、インビトロまたはインビボで、転写され、そしてポリペプチドに翻訳され
る二重鎖DNA配列である。DNAコード配列および適切な調節配列は、好まし
くは、発現ベクターにおいて提供される。コード配列の境界は、5’(アミノ)
末端で開始コドンによって、および3’(カルボキシル)末端で翻訳終結コドン
によって決定される。コード配列は、原核生物配列、真核生物mRNAからのc
DNA、真核生物(例えば、哺乳動物)DNAからのゲノムDNA配列、および
さらに合成DNA配列を含み得るがこれらに限定されない。コード配列が、真核
生物細胞中で発現されることが意図される場合、ポリアデニル化シグナルおよび
転写終結配列は、通常、コード配列の3’に位置される。
【0035】 転写および翻訳の制御配列は、宿主においてコード配列の発現を提供するDN
A調節配列(例えば、プロモーター、エンハンサー、およびターミネーター)で
ある。真核生物細胞において、原核生物シグナルは、調節配列である。
【0036】 「プロモーター配列」は、細胞においてRNAポリメラーゼを結合し得、そし
て下流(3’方向)のコード配列の転写を開始し得るDNA調節領域である。本
発明を規定する目的で、そのプロモーター配列は、その3’末端に転写開始部位
によって結合し、そして上流(5’方向)に伸長し、バックグラウンドを超えて
検出可能なレベルで転写を開始するために必要な最小数の塩基またはエレメント
を包含する。プロモーター配列内に、転写開始部位(例えば、ヌクレアーゼS1
を用いてマップすることによって都合良く規定される)、さらにRNAポリメラ
ーゼの結合を担うタンパク質結合ドメイン(コンセンサス配列)が見出される。
【0037】 コード配列は、RNAポリメラーゼがコード配列をmRNA中に転写する場合
、細胞中で転写および翻訳の調節配列の「制御下」にある。mRNAは、次いで
、スプライスされ(もしコード配列がイントロンを包含する場合)、そしてその
コード配列によってコードされるタンパク質に翻訳される。
【0038】 本明細書において使用される場合、用語「相同な」は、「共通の進化の起源」
を有するタンパク質間の関係をいう。このようなタンパク質(およびそれらのコ
ード遺伝子)は、それらの高度の配列類似性によって反映されるように、配列相
同性を有する。用語「配列類似性」は、共通の進化の起源を有し得るか有さない
かもしれないタンパク質の核酸間またはアミノ酸配列間の同一性または対応性の
程度をいう。しかし、一般的に使用されそして本明細書にて使用されるように、
用語「相同な」は、「高度に」の様な副詞によって修飾された場合、配列の類似
性をいい、共通の進化的起源をいわないこともあり得る。
【0039】 用語「TNFα調節性経路」および関連する用語は、腫瘍壊死因子レセプター
ファミリー(TNFR)のメンバーに対するTNFαの結合に関与するシグナル
伝達経路をいう。
【0040】 用語「対応する」は、本明細書中で使用される場合、正確な位置が、類似性ま
たは相同性が測定される分子と同一であるかまたは異なる、類似または相同な配
列をいう。核酸またはアミノ酸配列アラインメントは、スペースを含み得る。し
たがって、用語「に対応する」は、配列類似性をいい、そしてアミノ酸残基また
はヌクレオチド塩基の番号付けをいわない。
【0041】 用語「スプライス改変体」とは、遺伝子の全長mRNAに対して1つ以上の欠
失を含有するmRNAを生じる遺伝子によってコードされる全長mRNAの選択
的プロセシングによって産生されるmRNAによってコードされるポリペプチド
をいう。
【0042】 (本発明の実施形態) 本発明は、TRAF2の2つの改変体に関し、それらはTNFαシグナル伝達
経路を阻害する。1つの実施形態は、TRAR2のRNAプロセシングスプライ
ス改変体であり、本明細書中で「TRAF2短縮型」または「TRAF2TR」
と呼ばれる。別の実施形態は、TRAF2TRに相対的なアミノ酸残基1〜87
の欠失を有するTRAF2基づき、そして「TRAF2短縮欠失型」または「T
RAF2TD」と言われる。TRAF2TRおよびTRAF2TDの両方は、T
NFαシグナル伝達経路を阻害する能力を有する。TRAF2TDは、特に好ま
しい実施形態である。TNFα結合に対する応答を劇的に減少するその能力のた
めにである。
【0043】 本明細書中で、これらの2つの実施形態に構造の記載があり、これらの実施形
態の調製方法の議論が続く。
【0044】 (TRAF2TR実施形態の構造および調製) このスプライス改変体についてのcDNA配列は、図2aに提示され、そして
アミノ酸配列は、図2bに提示される。TRAF2TAを概略的に示す図1を参
照すると、欠失は、TRAF2FLのアミノ酸残記載123〜201を除去する
ことが理解され得、Znフィンガードメイン1のC末端部分およびZnフィンガ
ー2および3のすべて、ならびにZnフィンガー4のN末端残基を含む。
【0045】 本発明のTRAF2TR実施形態は、任意の適切な方法によって調製され得、
これらの方法は、当業者に公知の種々の方法を含む。DNAの単離、クローニン
グおよび配列決定の教示は、種々の出所において見出され得る。当業者にとって
、一般的な分子生物学、微生物学および組換えDNA技術は、文献に十分に説明
される。例えば、Sambrook,FritschおよびManiasts,
Molecular Cloning:A Laboratory Manua
l,第2版(1989)Cold Spring Harbor Labora
tory Press,Cold Spring Harbor,New Yo
rk(本明細書中で「Sambrookら、1989’’」);DNA Clo
ning:A Practical Approach,第IおよびII巻(D
.N.Glover編、1985);Oligonucleotide Syn
thesis(M.J.Gait編、1984);Nucleic Acid
Hybridization[B.D.HamesおよびS.J.Higgin
s編(1985)]Transcription And Translati
on[B.D.HamesおよびS.J.Higgins,編(1984)];
Animal Cell Culture[R.I.Freshney,編(1
986)];Immobilized Cell And Enzymes[I
RL Press,(1986)];B.Perbal,A Practica
l Guide To Molecular Cloning(1984);F
.M.Ausubelら、(編)、Current Protocols in
Molecular Biology、John WileyおよびSons
,Inc、(1994)を参照のこと。
【0046】 TRAF2TRのDNA配列およびcDNAを得るための当該分野で公知の方
法についての本明細書中に記載される情報を考慮すると、TRAF2TRおよび
TRAF2TDをコードするヌクレオチド配列は、野生型TRAF2から容易に
クローン化され得るか、または調製され得、そしてこれらのタンパク質をインビ
トロまたはインビボで発現するための適切なベクターに挿入され得る。cDNA
のクローニングおよび発現ベクターに関する方法の記載については、Sambr
ookら、1989、前出を参照のこと。
【0047】 TRAF2をコードする遺伝子(ゲノムDNAまたはcDNAのどちらか)は
、ヒトゲノムライブラリーまたはcDNAライブラリーより単離され得る。本明
細書中に提示されるDNA配列を情報与えられた遺伝子を得るための方法は、当
該分野で周知である。TRAF2 DNAは、クローン化されたDNA(例えば
、DNA「ライブラリー」)より、当該分野で公知の標準手順によって得られ得
る。好ましくは、タンパク質の高レベルの発現を有する組織から調製されるcD
NAライブラリーより得られる(例えば、リンパ由来の細胞、特にB細胞または
骨肉腫細胞株、例えばTRAF2またはTRAF2TRの高レベルの発現を示す
ヒト骨肉腫SAOS−2(ATCC番号HTB−85))。DNAはまた、所望
の細胞から精製されたゲノムDNA、またはそのフラグメントのクローニングに
よって(例えば、Sambrookら;1989、前出;Glover,D.M
.(編)、1985、DNA Cloning:A Practical Ap
proach,MRL Press,Ltd.、Oxford,U.K.第I、
II巻を参照のこと)、または化学合成によって得られ得る。ゲノムDNAに由
来するクローンは、コード領域に加えて、調節およびイントロンDNA領域を含
み得る;cDNAに由来するクローンは、イントロン配列を含まない。本発明が
、全長TRAF2のスプライス改変体(TRAF2TR)の単離に部分的に基づ
くことを考慮すると、TRAF2TR配列をコードするcDNAを得ることが望
ましい。
【0048】 cDNAを得るための方法は、当該分野で周知である。簡単には、これらの方
法としては、真核生物細胞からメッセンジャーRNA(mRNA)の混合物を単
離し、そして一連の酵素学的反応を使用し、単離されたmRNAに相補的な2重
鎖DNAコピー(cDNA)を合成することが挙げられる。
【0049】 本明細書中の実施例1に提示されるように、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(R
T−PCR)クローニングが、TRAF2TRスプライス改変体を含むcDNA
を単離するに有効な方法であることが見出されている。RT−PCRは、酵素逆
転写酵素を用いる細胞mRNAの逆転写、続いて生じたDNA産物をPCRを使
用する増幅に供することを含む。
【0050】 所望のcDNAを得るために使用される方法に関係なく、2重鎖cDNA混合
物は、多くの公知の技術の任意の1つによってクローニングビヒクルに挿入され
る。この技術は、使用される特定のビヒクルの少なくとも1部に依存する。Me
thods in Enzymology,68,16−18(1980)、な
らびにSambrookら、1989、前出に、種々の挿入方法が、非常に詳細
に議論される。
【0051】 一旦、DNAセグメントが、クローニングビヒクルの挿入されると、クローニ
ングビヒクルは、適切な宿主の形質転換に使用される。通常、これらのクローニ
ングビヒクルは、宿主に抗生物質耐性形質を与える。このような宿主は、一般的
に、原核生物細胞であり、宿主細胞のほんのわずかが所望のDNAを含む。トラ
ンスフェクトされた宿主細胞は、遺伝子「ライブラリー」を構成し、mRNAが
単離された細胞内に存在するmRNAの代表的なサンプルを提供する。
【0052】 本明細書中に提供されるTRAF2についての配列情報を考慮すると、適切な
オリゴヌクレオチド配列が調製され得、好ましくは上記のように合成され得、そ
してTRAF2配列を含むクローンを同定するため使用され得る。TRAF2配
列を含むクローンを同定するために、形質転換された個体または形質転換された
細胞は、コロニーとして、ニトロセルロースフィルターペーパー上で増殖される
。コロニーは溶解され、そしてDNAは、加熱することによってフィルターペー
パーに固く結合される。次いで、フィルターペーパーを、TRAF2に相補的な
標識されたオリゴヌクレオチドプローブとインキュベートした。TRAF2に実
質的に相同なDNAフラグメントは、プローブにハイブリダイズする。相同性の
程度が高くなるにつれて、よりストリンジェントなハイブリダイゼーション条件
が使用され得る。
【0053】 プローブは、相補的なcDNAにハイブリダイズする。それは、プローブの存
在を同定するオートラジオグラフィーまたは化学反応によって同定され得る。対
応するクローンは特徴付けられ、クローンの1つまたは組み合わせを同定する。
それらのクローンは、所望のタンパク質についての構造的情報のすべてを含む。
目的のタンパク質をコードする核酸配列は単離され、そして発現ベクター内に再
び挿入される。発現ベクターは、ds−cDNAの効率的な発現(転写および翻
訳)を可能にする特定の原核生物または真核生物コントロールエレメントの制御
コントロール下でクローン化された遺伝子を有する。
【0054】 さらなる選択が、遺伝子の特性に基礎について行われ得る。例えば、等電の、
電気泳動のアミノ酸組成物または本明細書中に開示されるTRAF2タンパク質
の部分的なアミノ酸発現を有するタンパク質産物を、遺伝子がコードする場合、
従って、遺伝子の存在が検出され得る。その発現された産物の物理的、化学的、
または免疫学的特性に基づいたアッセイによって、検出され得る。例えば、cD
NAクローン、またはDNAクローンは、タンパク質を産生するクローンが選択
され得る。このタンパク質は、電気泳動移動、等電点電気泳動、非平衡pHゲル
電気泳動、タンパク質分解消化、または抗原性に関してTRAF2TRと類似ま
たは同じ特性を有する。
【0055】 (TRAF2TD実施形態の構造および調製) TRAF2TRに関連して、TRAF2TDは、アミノ酸1〜87およびこれ
らのアミノ酸をコードする対応するヌクレオチドの欠失を有する。TRAF2T
DについてのDNA配列は、図3aに提示され、そしてアミノ酸配列は、図3b
に提示される。
【0056】 任意の適切な方法が、TRAF2TD実施形態を調製するために使用され得、
例えば、上記の情報に基づく種々の方法を含む。特に、アミノ酸1〜87の欠失
を含むTRAF2TRの短縮型バージョンを作製するための多くの方法が存在す
る。調製の好ましい方法において、TRAF2TR cDNAは、TRAF2全
長コード配列(ATGAGTTCGGCCTTCCCAGAT、ここでATGコ
ドンは、翻訳開始部位を作製するために含まれた)のヌクレオチド262〜28
0を含む5’プライマー;を使用するPCRの鋳型として使用される;3’プラ
イマーは、TTA TAG CCC TGT CAG GTC CACであった
。生じた構築物は、全長TRAF2のアミノ酸88で始まり、そしてTRAF2
TRの123〜201のアミノ酸欠損を有する。
【0057】 TRAF2TRのさらなる改変体は、TRAF2TDの調製について上記の方
法のような方法を使用して調製され得る。
【0058】 (TRAF2TR/2TD改変体) 本発明は、その範囲内に、対立形質改変体、置換体、付加および欠失変異改変
体、アナログ、およびTRAF2TRまたはTRAF2TDの誘導体(本明細書
で、「TRAF2TR/2TD改変体」と呼ばれる)およびTRAF2TRと同
じかまたは相同な機能的活性を有する他の種由来の相同体を含む。好ましい実施
形態において、TNFαシグナル伝達経路を阻害する能力を増加する欠失または
置換を有する遺伝子は、本発明の実行において利用される。TRAF2TR/2
TD改変体の調製または単離は、本発明の範囲内である。従って、本発明の範囲
は、機能的に活性な(すなわち、TRAF2TRと関連した1以上の機能的活性
を示し得る)TRAF2TR/2TD改変体を含む。
【0059】 TRAF2TR/2TD改変体は、機能的に等価な分子を提供する、置換、付
加または欠失による核酸配列のコード化を変化させることによって、作製され得
る。好ましくは、TRAF2TRまたはTRAF2TDに関連して、増大したま
たは増加した機能的活性を有するTRAF2TR/2TD実施形態が形成される
【0060】 ヌクレオチドコード配列の縮重に起因して、TRAF2TRと実質的に同じア
ミノ酸配列(1つのアミノ酸改変体を含むアミノ酸配列を含む)をコードする他
のDNA配列が、本発明の実施において使用され得る。このような配列としては
、対立遺伝子、他の種由来の相同性遺伝子、および配列内で同じアミノ酸残基を
コードする異なるコドンの置換によって変化し、従って、サイレントな変化を生
じる、TRAF2TRのすべてまたは一部を含むヌクレオチド配列が挙げられる
が、これらに限定されない。同様に、本発明のTRAF2TR/2TD改変体と
しては、一次アミノ酸配列として、機能的に等価なアミノ酸残基を配列内の残基
について置換され、保存的アミノ酸置換を生じる変化した配列を含む、TRAF
2TRタンパク質のアミノ酸配列のすべてまたは一部を含む配列が挙げられるが
、これらに限定されない。例えば、配列内の1つ以上のアミノ酸残基を、類似の
極性の別のアミノ酸で置換し得、この別のアミノ酸は、機能的等価物として作用
し、サイレントな変化を生じる。配列内のアミノ酸についての置換は、アミノ酸
が属するクラスの他のメンバーから選択され得る。例えば、非極性(疎水性)ア
ミノ酸としては、アラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、プロリン、フェ
ニルアラニン、トリプトファンおよびメチオニンが挙げられる。芳香族環構造を
含むアミノ酸は、フェニルアラニン、トリプトファンおよびチロシンである。極
性の中性アミノ酸としては、グリシン、セリン、トレオニン、システイン、チロ
シン、アスパラギンおよびグルタミンが挙げられる。正電荷(塩基性)アミノ酸
としては、アルギニン、リシンおよびヒスチジンが挙げられる。負電荷(酸性)
アミノ酸としては、アスパラギン酸およびグルタミン酸が挙げられる。このよう
な変化は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動または等電点電気泳動によって決定
されるような、見かけの分子量に影響を及ぼすことは予期されない。
【0061】 特に好ましい置換は以下の通りである: −LysをArgで置換、そして逆もまた同様である。その結果、正電荷が維
持され得る; −GluをAspで置換、そして逆もまた同様である。その結果、負電荷が維
持され得る; −SerをThrで置換。その結果、遊離の−OHが維持され得る;および −GlnをAsnで置換。その結果、遊離のCONH2が維持され得る。
【0062】 アミノ酸置換がまた導入されて、特に好ましい性質を有するアミノ酸を置換し
得る。例えば、Cysは、別のCysとジスルフィド架橋する可能性のある部位
を導入され得る。Hisは、特に、「触媒」部位として導入され得る(すなわち
、Hisは、酸または塩基として作用し得、そして生化学的触媒において最も共
通のアミノ酸である)。Proは、その特に平面構造のために、導入され得、こ
の構造は、タンパク質の構造にβターンを誘導する。
【0063】 本発明のTRAF2TR/2TD改変体をコードする遺伝子は、当該分野で公
知の種々の方法によって産生され得る。その産生を生じる操作は、遺伝子レベル
またはタンパク質レベルで生じ得る。例えば、クローニングされたTRAF2遺
伝子配列は、当該分野で公知の多数の戦略のいずれかによって改変され得る(S
ambrookら、1989、前出)。この配列は、制限エンドヌクレアーゼを
用いて適切な部位で切断され得、その後、さらなる酵素的改変が行われ、所望で
あれば、インビトロで単離され、そして連結される。TRAF2TR/2TD実
施形態をコードする遺伝子の産生において、改変された遺伝子が、所望の活性が
コードされる場合の遺伝子領域において、翻訳停止シグナルによって遮断されな
いTRAF2TR遺伝子と同じ翻訳リーディングフレーム内に維持することを確
実にすることに注意するべきである。
【0064】 さらに、TRAF2TR/2TDをコードする核酸配列は、インビトロまたは
インビボで変異し得、翻訳配列、開始配列および/もしくは終結配列を作製およ
び/もしくは破壊するか、または、コード領域に変異を作製し、ならびに/ある
いは新規の制限エンドヌクレアーゼ部位を形成するか、または既存の制限エンド
ヌクレアーゼ部位を破壊し、インビトロでの改変をさらに容易にする。好ましく
は、このような変異は、変異したTRAF2TR遺伝子産物の機能的活性を増大
する。当該分野で公知の変異誘発のための任意の技術(インビトロ部位特異的変
異誘発(Hutchinson,C.,ら、1978,J.Biol.Chem
.253:6551;ZollerおよびSmith,1984,DNA 3:
479−488;Oliphantら、1986,Gene 44:177;H
utchinsonら、1986,Proc.Natl.Acad.Sci.U
.S.A.83:710)、「TAB」リンカー(Pharmacia)の使用
などを含むが、これらに限定されない)が使用され得る。PCR技術は、部位特
異的変異誘発に好ましい(Higuchi,1989,「Using PCR
to Engineer DNA」PCR Technology:Princ
iples and Applications for DNA Ampli
fication,H.Erlich,編、Stockton Press,第
6章、61−70頁を参照のこと)。
【0065】 続く議論は、所望のポリペプチドをコードするDNAの操作および発現に関し
、TRAF2TRおよびTRAF2TDの両方ならびにTRAF2TR/2TD
改変体に共通である。
【0066】 (クローニング/発現ベクターへのTRAF2TR、TRAF2TDおよびT
RAF2TR/2TD改変体のクローニング) 同定され、そして単離されたDNA配列は、適切なクローニング/発現ベクタ
ー(以下、「ベクター」)に挿入されて、タンパク質の配列または発現に対する
改変を容易にし得る。これらのベクターは、代表的に、マルチクローニング部位
(multiple cloning site)、プロモーター、宿主細胞に
おける複製を容易にする配列、および選択マーカーを含む。
【0067】 任意の適切なベクターが使用され得る。当該分野で公知の多くのベクターが存
在する。使用され得るベクターの例としては、プラスミドまたは改変ウイルスが
挙げられるが、これらに限定されない。ベクターは、代表的には、ベクターが導
入されて、ベクターの複製およびコードされたタンパク質の発現を容易にする所
定の宿主細胞に適合する。所定のベクターへのDNA配列の挿入は、例えば、相
補的付着末端を有するクローニングベクターへのDNAフラグメントの連結によ
って果たされ得る。しかし、DNAを断片化するために使用される相補的制限部
位が、クローニングベクター内に存在しない場合、DNA分子の末端が、酵素学
的に改変され得る。あるいは、所望される任意の部位が、DNA末端上へのヌク
レオチド配列(リンカー)の連結によって生成され得る;これらの連結されたリ
ンカーは、制限エンドヌクレアーゼ認識配列をコードする、特定の化学的に合成
されたオリゴヌクレオチドを含み得る。有用なベクターは、染色体DNA配列の
セグメント、非染色体DNA配列のセグメントおよび合成DNA配列のセグメン
トからなり得る。本発明の実施に有用な特定のベクターの例としては、以下が挙
げられるがこれらに限定されない:E.coliバクテリオファージ(例えば、
ラムダ誘導体)またはプラスミド(例えば、pBR322誘導体もしくはpUC
プラスミド誘導体(例えば、pmal−c、pFLAG、SV40の誘導体およ
び公知の細菌性プラスミド(例えば、E.coliプラスミドであるcolE1
、pCR1、pMal−C2、pET、pGEX(Smithら、1988,G
ene 67:31−40)pMB9およびそれらの誘導体)、RP4のような
プラスミド)));ファージDNA(例えば、ファージ1の多数の誘導体(例え
ば、NM989および他のファージDNA(例えば、M13および線維状一本鎖
ファージDNA)));酵母ベクター(例えば、2μmプラスミドまたはその誘
導体);真核生物細胞に有用なベクター(例えば、バキュロウイルスベクターの
ような昆虫細胞に有用なベクター、哺乳動物細胞に有用なベクター);プラスミ
ドおよびファージDNAの組み合わせに由来するベクター;改変されて、ファー
ジDNAまたは他の発現制御配列を利用するプラスミド;など。
【0068】 本発明に従って使用され得る酵母ベクターとしては、以下が挙げられるがこれ
らに限定されない:非融合pYES2ベクター(XbaIクローニング部位、S
phIクローニング部位、ShoIクローニング部位、NotIクローニング部
位、GstXIクローニング部位、EcoRIクローニング部位、BstXIク
ローニング部位、BamH1クローニング部位、SacIクローニング部位、K
pn1クローニング部位およびHindIIIクローニング部位;Invitr
ogen)または融合pYESHisA、B、C(XbaIクローニング部位、
SphIクローニング部位、ShoIクローニング部位、NotIクローニング
部位、BstXIクローニング部位、EcoRIクローニング部位、BamH1
クローニング部位、SacIクローニング部位、KpnIクローニング部位およ
びHindIIIクローニング部位、ProBond樹脂を用いて精製され、そ
してエンテロキナーゼを用いて切断された、N末端ペプチド;Invitrog
en)。
【0069】 本発明の実施において使用され得るバキュロウイルスベクターとしては、種々
のベクター(非融合伝達(transfer)ベクター(例えば、pVL941
(BamH1クローニング部位;Summers)、pVL1393(BamH
1クローニング部位、SmaIクローニング部位、XbaIクローニング部位、
EcoR1クローニング部位、NotIクローニング部位、XmaIIIクロー
ニング部位、BglIIクローニング部位およびPstIクローニング部位;I
nvitrogen)、pVL1392(BglIIクローニング部位、Pst
Iクローニング部位、NotIクローニング部位、XmaIIIクローニング部
位、EcoRIクローニング部位、XbaIクローニング部位、SmaIクロー
ニング部位およびBamH1クローニング部位;SummersおよびInvi
trogen)およびpBlueBacIII(BamH1クローニング部位、
BglIIクローニング部位、PstIクローニング部位、NcoIクローニン
グ部位およびHindIIIクローニング部位、青色/白色組換えスクリーニン
グを有し得る;Invitrogen))、ならびに融合移入ベクター(例えば
、pAc700(BamH1クローニング部位およびKpnIクローニング部位
であって、BamH1認識部位が、開始コドンから始まる;Summers)、
pAc701およびpAc702(pAc700と同じであり、異なるリーディ
ングフレームを有する)、pAc360(ポリヘドリン開始コドンの36塩基対
下流のBamH1クローニング部位;Invitrogen(195))および
pBlueBacHisA、B、C(3つの異なるリーディングフレームであっ
て、BamH1クローニング部位、BglIIクローニング部位、PstIクロ
ーニング部位、NcoIクローニング部位およびHindIIIクローニング部
位、ProBond精製のためのN末端ペプチド、ならびにプラークの青色/白
色組換えスクリーニングを有する;Invitrogen)の両方を含む))が
挙げられ、使用され得る。
【0070】 本発明における使用が意図される哺乳動物ベクターとしては、例えば以下が挙
げられる:誘導性プロモーター(例えば、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR
)プロモーター)を有するベクター(例えば、DHFR発現ベクターまたはDH
FR/メトトレキサート同時増幅ベクター(例えば、pED(PstIクローニ
ング部位、SalIクローニング部位、SbaIクローニング部位、SmaIク
ローニング部位およびEcoRIクローニング部位であって、クローニングされ
た遺伝子およびDHFRの両方を発現するベクターを有する;Kaufman,
Current Protocols in Molecular Biolo
gy,16.12(1991)を参照のこと)を有する任意の発現ベクター))
を有するベクター。あるいは、グルタミンシンテターゼ/メチオニンスルホキシ
イミン同時増幅ベクター(例えば、pEE14(HindIIIクローニング部
位、XbaIクローニング部位、SmaIクローニング部位、SbaIクローニ
ング部位、EcoRIクローニング部位およびBclIクローニング部位であっ
て、ベクターが、グルタミンシンテターゼおよびクローニングされた遺伝子を発
現する;Celltech)。別の実施形態において、Epstein Bar
r Virus(EBV)の制御下でエピソーム発現を指向するベクター(例え
ば、pREP4(BamH1クローニング部位、SfiIクローニング部位、X
hoIクローニング部位、NotIクローニング部位、NheIクローニング部
位、HindIIIクローニング部位、NheIクローニング部位、PvuII
クローニング部位およびKpnIクローニング部位、構成的ラウス肉腫ウイルス
の長い末端反復配列(RSV−LTR)プロモーター、ハイグロマイシン選択マ
ーカー;Invitrogen)、pCEP4(BamH1クローニング部位、
SfiIクローニング部位、XhoIクローニング部位、NotIクローニング
部位、NheIクローニング部位、HindIIIクローニング部位、NheI
クローニング部位、PvuIIクローニング部位およびKpnIクローニング部
位、構成的ヒトサイトメガロウイルス(hCMV)極初期遺伝子、ハイグロマイ
シン選択マーカー;Invitrogen)、pMEP4(KpnIクローニン
グ部位、PvuIクローニング部位、NheIクローニング部位、HindII
Iクローニング部位、NotIクローニング部位、XhoIクローニング部位、
SfiIクローニング部位、BamH1クローニング部位、誘導性メタロチオネ
インIIa遺伝子プロモーター、ハイグロマイシン選択マーカー;Invitr
ogen)、pREP8(BamH1クローニング部位、XhoIクローニング
部位、NotIクローニング部位、HindIIIクローニング部位、NheI
クローニング部位およびKpnIクローニング部位、RSV−LTRプロモータ
ー、ヒスチジノール選択マーカー;Invitrogen)、pREP9(Kp
nIクローニング部位、NheIクローニング部位、HindIIIクローニン
グ部位、NotIクローニング部位、XhoIクローニング部位、SfiIクロ
ーニング部位およびBamHIクローニング部位、RSV−LTRプロモーター
、G418選択マーカー;Invitrogen)およびpEBVHis(RS
V−LTRプロモーター、ハイグロマイシン選択マーカー、ProBond樹脂
を介して精製可能であり、そしてエンテロキナーゼによって切断されるN末端ペ
プチド;Invitrogen))が使用され得る。本発明の使用のための選択
可能な哺乳動物発現ベクターはとしては以下が挙げられる:pRc/CMV(H
indIIIクローニング部位、BstXIクローニング部位、NotIクロー
ニング部位、SbaIクローニング部位およびApaIクローニング部位、G4
18選択;Invitrogen)、pRc/RSV(HindIIIクローニ
ング部位、SpeIクローニング部位、BstXIクローニング部位、NotI
クローニング部位、XbaIクローニング部位、G418選択;Invitro
gen)、pcDNA3(HindIIIクローニング部位、KpnIクローニ
ング部位、BamHIクローニング部位、BstXIクローニング部位、Eco
RIクローニング部位、EcoRVクローニング部位、BstXIクローニング
部位(反復)、NotIクローニング部位、XhoIクローニング部位、Xba
Iクローニング部位、ApaIクローニング部位、G418アンピシリン選択;
Invitrogen)など。本発明に従う使用のためのワクシニアウイルス哺
乳動物発現ベクター(Kaufman,1991、前出を参照のこと)としては
、以下が挙げられるがこれらに限定されない:pSC11(SmaIクローニン
グ部位、TK−galおよびβ−gal選択)、pMJ601(SalIクロー
ニング部位、SmaIクローニング部位、AflIクローニング部位、NarI
クローニング部位、BspMIIクローニング部位、BamHIクローニング部
位、ApaIクローニング部位、NheIクローニング部位、SacIIクロー
ニング部位、KpnIクローニング部位およびHindIIIクローニング部位
;TK−galおよびβ−gal選択)ならびにpTKgptF1S(EcoR
Iクローニング部位、PstIクローニング部位、SalIクローニング部位、
AccIクローニング部位、HindIIクローニング部位、SbaIクローニ
ング部位、BamHIクローニング部位およびHpaクローニング部位、TKま
たはXPRT選択)。
【0071】 種々の方法が使用されて、TRAF2TR、TRAF2TDまたはTRAF2
TR/2TD改変体をコードする所望のDNA配列が、ベクターにクローニング
されたことを確認し得る。一般的に、1つ以上の以下のアプローチが使用される
:(a)所望のプラスミドDNAまたは特定のmRNAのPCR増幅、(b)核
酸ハイブリダイゼーション、(c)選択マーカー遺伝子機能の存在または非存在
、(d)適切な制限エンドヌクレアーゼを用いた分析、および(e)挿入配列の
発現。第一のアプローチにおいて、核酸がPCRによって増幅されて、増幅産物
の検出を提供し得る。第二のアプローチにおいて、発現ベクターに挿入された外
来遺伝子の存在が、挿入されたマーカー遺伝子に相同な配列を含むプローブを使
用して、核酸ハイブリダイゼーションによって検出され得る。第三のアプローチ
において、組換えベクター/宿主系が、ベクターへの外来遺伝子の挿入によって
引き起こされる特定の「選択マーカー」遺伝子機能(例えば、βガラクトシダー
ゼ活性、チミジンキナーゼ活性、抗体への耐性、形質転換表現型、バキュロウイ
ルスにおける閉塞体(occlusion body)形成など)の存在または
非存在に基づいて同定され得そして選択され得る。別の例において、TRAF2
TRをコードする核酸が、ベクターの「選択マーカー」遺伝子配列内に挿入され
る場合、TRAF2TR挿入物を含む組換え体は、選択マーカーの遺伝子機能の
非存在によって同定され得る。第四のアプローチにおいて、組換え発現ベクター
は、適切な制限酵素を用いて消化することによって同定される。第四のアプロー
チにおいて、発現されたタンパク質が、機能的に活性な立体配座をとるならば、
組換え発現ベクターは、組換え体によって発現される遺伝子産物の、活性、生化
学的特徴または免疫学的特徴についてのアッセイによって同定され得る。
【0072】 (プロモーター) TRAF2TRまたはTRAF2TDあるいはそのTRAF2TR/2TD改
変体をコードするヌクレオチド配列は、挿入されたタンパク質コード配列の転写
および翻訳に必要なエレメントを含む発現ベクターに挿入され得る。このような
エレメントを、本明細書中で「プロモーター」と呼ぶ。従って、本発明のポリペ
プチドをコードする核酸は、本発明の発現ベクターにおけるプロモーターと操作
上結合する。cDNAおよびゲノム配列の両方が、このような調節配列の制御下
でクローニングされ得、そして発現され得る。発現ベクターはまた、好ましくは
、複製起点を含む。必要な転写シグナルおよび翻訳シグナルは、組換え発現ベク
ター上に提供され得るか、あるいはこれらのシグナルは、TRAF2および/ま
たはその隣接領域をコードするネイティブ遺伝子によって供給され得る。クロー
ニングベクターへのDNAフラグメントの挿入について以前に記載された方法の
いずれかを使用して、適切な転写/翻訳制御シグナルならびにタンパク質コード
配列からなる遺伝子を含む発現ベクターを構築し得る。これらの方法としては、
インビトロ組換えDNAおよび合成技術、ならびにインビボ組換え(遺伝的組換
え)が挙げられ得る。
【0073】 発現は、当該分野において公知の任意のプロモーターエレメント/エンハンサ
ーエレメントによって制御され得る。しかし、これらの制御エレメントは、発現
のために選択された宿主において機能的でなければならない。TRAF2TR遺
伝子発現を制御するために使用され得るプロモーターとしては、いかが挙げられ
るがそれらに限定されない:tSV40 初期プロモーター領域(Benois
t and Chambon、1981、Nature 290:304−31
0)、ラウス肉腫ウイルスの31長末端反復プロモーター(Yamamoto、
et al.、1980、Cell 22:787−797).、ヘルペスチミ
ジンキナーゼプロモーター(Wagner et al.、1981、Proc
.Natl.Acad、Sci、U.S,A、78:1441−1445)、メ
タロチオネイン遺伝子の制御配列(Brinster et al.、1982
、Nature296:39−42);原核生物発現ベクター(例えば、βラク
タマーゼプロモーター(Villa−Kamaroff、et al.、197
8、Proc,Natl、Acad、Sci.U,S,A,、75:3727−
3731)、またはtacプロモーター(DeBoer、et al.、198
3、Proc.Natl.Acad.sci.U.S.A.、80:21−5
25);以下もまた参照のこと:「Useful proteins from
−recombinant bacteria,、in Scientific
American、1980、242:74−94;例えば以下のような酵母
または他の真菌からのプロモーターエレメント:Gal 4 プロモーター、A
DC(アルコールデヒドロゲナーゼ)プロモーター、PGK(ホスホグリセロキ
ナーゼ)プロモーター、アルカリホスファターゼプロモーター;および動物の転
写制御領域(これは、組織特異性を示し、そしてトランスジェニック動物におい
て利用されている);エラスターゼI遺伝子制御領域(これは、膵臓細胞におい
て活性である)(Swift et al.、1984、Cell 38:63
9−646;Ornitz et al.、1986、Cold Spring
Harbor Symp.Quant、Biol.、50:399−409;
MacDonald、1987、Hepatology 7:425−515)
;インスリン遺伝子制御領域(これは、膵臓β細胞において活性である)(Ha
nahan,,1985、Nature 315:115−122)、免疫グロ
ブリン遺伝子制御領域(これは、リンパ細胞において活性である)(Gross
chedl et al.、1984,Cell 38:647−658;Ad
ames et al.、1985、Nature 318:533−538;
Alexander et al.、1987、Mol.Cell.Biol,
、7:1436−1444)、マウス乳腺腫瘍ウイルス制御領域(これは、精巣
、乳房、リンパ細胞およびマスト細胞において活性である)(Leder et
al.,1986f Cell 45:485−495)、アルブミン−遺伝
子制御領域(これは、肝臓において活性である)(Pinkert et al
.、1987、Genes and Devel,1:268−276)、α−
フェトタンパク質遺伝子制御領域(これは、肝臓において活性である)(Kru
mlauf et al.、1985、Mol、Cell.Biol.,5:1
639−1648;Hammer et al.、1987、Science
235:53−58)、αアンチトリプシン遺伝子制御領域(これは、肝臓にお
いて活性である)(Kelsey et al.、1987、Genes an
d Devel,、1:161−171)、β−グロビン遺伝子制御領域(これ
は、骨髄細胞において活性である)(Mogram et al.,、1985
,、Nature 315:338−340;Kollias et al.、
1986、Cell 46:89−94)、ミエリン塩基性タンパク質遺伝子制
御領域(これは、脳内の希突起膠細胞において活性である)(Readhead
et al.、1987、Cell 48:703−712)、ミオシン軽鎖
−2遺伝子制御領域(これは、骨格筋において活性である)(Sani、198
5、Nature 314:283−286)、ならびに性腺刺激放出ホルモン
遺伝子制御領域(これは、視床下部において活性である)(Mason et
al.、1986、Science 234:1372−1378)。
【0074】 (宿主細胞へのベクターの導入) ベクターを宿主細胞へ、以下を含む任意の適切な方法によって導入し得る:例
えば、トランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクシ
ョン、形質導入、細胞融合、DEAEデキストラン、リン酸カルシウム沈降、リ
ポフェクション(リソソーム融合)、遺伝子銃の使用、またはDNAベクタート
ランスポーター(例えば、以下を参照のこと:Wu et al.、1992、
LT.Biol、Chem.267.963−967;Wu and Wu、1
988、J.Biol.Chem.263:14621−14624;Hart
mut et al.、カナダ特許出願第2,012,311号(1990年3
月1日出願)。その結果、多くのコピー数の遺伝子配列が生成される。好ましく
は、クローニングされた遺伝子は、シャトルベクタープラスミドに含まれる。こ
れは、クローニング細胞において拡張される(例えば、E.coli)。そして
、これは、適切な発現細胞株への次の挿入のための精製を容易にする。例えば、
シャトルベクター(これは、1つ超える型の生物において複製し得るベクターで
ある)は、E.coliプラスミドからの配列を酵母2μmプラスミドからの配
列と連結することによって、E.coliおよびSaccharomyces
cerevisiaeの両方における複製のために調製され得る。
【0075】 (宿主細胞系) 潜在的な宿主細胞系としては以下が挙げられるがそれらに限定されない:ウイ
ルス(例えば、ワクシニアウイルス、アデノウイルスなど)に感染した哺乳動物
宿主細胞系;ウイルス(例えば、バキュロウイルス)に感染した昆虫宿主細胞系
;酵母ベクターを含む酵母のような微生物;またはバクテリオファージDNA、
プラスミドDNA、またはコスミドDNAで形質転換された細菌。ベクターの発
現エレメントは、その強度および特異性を変動する。利用される宿主系に依存し
て、多数の適切な転写エレメントおよび翻訳エレメントのいずれかが使用され得
る。
【0076】 さらに、挿入される配列の発現を調節するか、または所望の特性の様式で遺伝
子産物を改変およびプロセシングする宿主細胞株が選択され得る。異なる宿主細
胞は、タンパク質の翻訳および翻訳後のプロセシングおよび改変についての特徴
および特異的機構を有する。適切な細胞株または宿主系を選択して、発現される
外来タンパク質の所望の改変およびプロセシングを確実にし得る。酵母における
発現は、生物学的に活性な産物を生成し得る。真核生物における発現は、「ネイ
ティブ」の折り畳みの確立を増加させ得る。さらに、哺乳動物細胞における発現
は、TRAF2TRインヒビター活性の再構成または構成のためのツールを提供
し得る。さらに、異なるベクター/宿主の発現系は、プロセシング反応に影響を
与え得る(例えば、異なる程度でのタンパク質加水分解の開裂)。本発明の発現
ベクターは、ともに、上記に指摘するように使用されて、TRAF2TR活性の
調節因子のスクリーニングまたは生物学的試験のための細胞をトランスフェクト
させ得る。
【0077】 本発明の組換えTRAF2TR、TRAF2TDまたはTRAF2TR/2T
Dの改変体は、コード配列の組換えによる組込みの後に染色体で発現され得る。
この点において、多数の増殖系のいずれかを用いて高レベルの安定な遺伝子発現
を達成し得る(以下を参照のこと:Sambrook et al.、1989
、前出)。
【0078】 TRAF2TRをコードする核酸を含む組換えベクターが導入される細胞は、
適切な細胞培養培地中で、細胞によるTRAF2TRの発現を提供する条件下で
培養される。
【0079】 一旦適切な宿主細胞および増殖条件が樹立されると、組換え発現ベクターは、
増殖され得そして多量に調製され得る。そのタンパク質の可溶性形態は、上記の
ように、培養流体を収集することによって、または封入体を可溶化する(例えば
、界面活性剤および所望の場合、超音波処理または他の機械的プロセスでの処理
による)ことによって得られ得る。可溶化されたタンパク質または可溶性タンパ
ク質は、種々の技術を用いて単離され得る(ポリアクリルアミドゲル電気泳動(
PAGE),等電点フォーカシング、二次元ゲル電気泳動クロマトグラフィー(
例えば、イオン交換アフィニティー、イムノアフィニティー、およびサイズ排除
カラムクロマトグラフィー)、遠心分離、示差可溶性、免疫沈降、またはタンパ
ク質の精製のための任意の他の標準的な技術)。
【0080】 上記のように、「ベクター」とは、本発明に従う核酸の宿主細胞への移入のた
めの任意の手段である。好ましいベクターは、ウイルスベクター(例えば、レト
ロウイルス、ヘルペスウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス)
である。従って、本発明のタンパク質またはそのポリペプチドドメインをコード
する遺伝子は、インビボ、エキソビボまたはインビトロでウイルスベクターを介
して、またはDNAの直接導入を介して導入される。標的化された組織における
発現は、特定の細胞へトランスジェニックベクターを標的化すること(例えば、
ウイルスベクターまたはレセプターリガンドを用いる)、または組織特異的プロ
モーターを用いることあるいはその両方によって行われ得る。
【0081】 (ウイルスベクター系のエキソビボおよびインビボでの処置方法のための使用
) インビボおよびエキソビボでの標的化および治療手順のために一般に使用され
るウイルスベクターは、DNAベースのベクターおよびレトロウイルスベクター
である。ウイルスベクターを構築および用いるための方法は、当該分野において
公知である(例えば、以下を参照のこと:Miller and Rosman
,BioTechniques 7:980−990(1992))。好ましく
は、ウイルスベクターは、複製欠損である。つまり、それらは、標的細胞におい
て自立的に複製し得ない。一般に、本発明の範囲内に使用される複製欠損ウイル
スベクターのゲノムは、感染された細胞におけるウイルスの複製のために必要な
少なくとも1つの領域を欠如する。これらの領域は、除去(全部または部分的)
されてい得るか、または当業者に公知の任意の技術によって非機能的にされてい
得るかのいずれかであり得る。これらの技術としては、全部の除去、置換(他の
配列、特に挿入された核酸による)、必須(複製のために)領域の部分的欠損ま
たは1つ以上の塩基の付加が挙げられる。そのような技術は、インビトロ(単離
されたDNA上で)またはインサイチュで、遺伝子操作の技術を用いるかまたは
変異誘発薬剤での処理によって行われ得る。好ましくは、その複製欠損ウイルス
は、ウイルス粒子をカプセル化するために必要であるそのゲノムの配列を保持す
る。
【0082】 DNAウイルスベクターとしては以下が挙げられる:減弱化されたDNAウイ
ルスまたは欠損DNAウイルス(例えば、非限定的な例として以下:単純ヘルペ
ス(HSV)、パピローマウイルス、エプスタインバーウイルス(EBV)、ア
デノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、ワクシニアウイルスなど。ウイ
ルス遺伝子の全体または殆ど全体を欠如する欠損ウイルスが好ましい。欠損ウイ
ルスは、細胞への導入後には複製能を有しない。従って、それは、増殖性ウイル
ス感染を引き起こさない。欠損性ウイルスベクターの使用は、特異的であるが局
所化された領域において、そのベクターが他の細胞に感染する心配をせずに細胞
へと投与することを可能にする。従って、特異的組織は、特異的に標的化され得
る。特定のベクターの例としては、以下が挙げられるがそれらに限定されない:
欠損ヘルペスウイルス1(HSV1)ベクター(Kaplitt et al.
、Molec.Cell、Neurosci、2:320−330(1991)
)、糖タンパク質L遺伝子を欠如する欠損ヘルペスウイルスベクター(特許公報
RD 371005 A)、または他の欠損ヘルペスウイルスベクター(国際特
許公開WO 94/21807,1994年9月29日公開;国際特許公開WO
92/05263、1994年4月2日公開);減弱化されたアデノウイルスベ
クター(例えば、Stratford−Perricaudetらによって記載
されるベクター)(J.Clin.Xnvest.90:626−630(19
92);以下もまた参照のこと:La−Salle et al..、Scie
nce 259:988−990(1993));ならびに欠損アデノ随伴ウイ
ルスベクター(Samulski et al.、J、Virol.61:30
96−3101(1987);Samulski et al.、J、Viro
l、63:3822−3828(1989);Lebkowski etal.
、Mol、Cell、Biol.8:3988−3996(1988))。
【0083】 好ましくは、インビボ投与のために、適切な免疫抑制処置がウイルスベクター
(例えば、アデノウイルスベクター)と共に用いられて、ウイルスベクターおよ
びトランスフェクトされた細胞の免疫脱活性化を回避し得る。例えば、免疫抑制
サイトカイン(例えば、インターロイキン−12(IL−12)、インターフェ
ロン−γ(IFN−γ)、または抗CD4抗体)は、ウイルスベクターに対する
体液性または細胞性の目ね気応答をブロックするように投与され得る(例えば、
以下を参照のこと:Wilson、Nature Medicine(1995
))。さらに、最小限数の抗原を発現するように走査されたウイルスベクターを
使用することが有利である。
【0084】 当然、本発明は、遺伝子両方適用のためにTRAF2TRの治療有効量を発現
するベクターの送達を企図する。用語「治療有効量」とは、本明細書において用
いられて、TNFα結合に関連する疾患の臨床的に顕著な症状を生じる免疫応答
を減少または最も好ましくは予防するに充分な量を意味する。あるいは、治療有
効量は、その宿主における臨床的に顕著な状態における改善を生じるに充分であ
る。
【0085】 (エキソビボおよびインビボの処置方法で使用される好ましいウイルスベクタ
ー) 特定のウイルスベクター系は、当該分野において充分に開発されており、そし
て本発明の処置方法に適合されている。
【0086】 (a.アデノウイルスベクター系) 好ましい実施形態において、そのベクターは、アデノウイルスベクターである
。アデノウイルスベクターは、本発明の核酸を種々の細胞型へと効率的に送達す
るように改変され得る真核生物DNAウイルスである。種々の血清型のアデノウ
イルスが存在する。これらの血清型のうち、本発明の範囲内で、2型または5型
のヒトアデノウイルス(Ad2またはAd5)あるいは動物起源のアデノウイル
ス(WO094/26914を参照のこと)を用いることについて優先性が与え
られる。本発明の範囲内において使用され得る動物起源のこれらのアデノウイル
スとしては、以下が挙げられる:イヌ、ウシ、マウスのアデノウイルス(例:M
avl、Beard et al.、Virology 75(1990) 8
1)、ヒツジ、ブタ、トリまたはサル(例:SAV)の起源のもの。好ましくは
、動物起源のアデノウイルスは、イヌアデノウイルスであり、より好ましくは、
CAV2アデノウイルス(例えば、Manhattan株またはA26/61株
(ATCC VR−800))。
【0087】 好ましくは、本発明の複製欠損アデノウイルスベクターは、ITR、キャプシ
ド化配列および目的の核酸を含む。なおより好ましくは、少なくともアデノウイ
ルスベクターのE1領域が非機能性である。E1領域における欠損は、好ましく
は、Ad5アデノウイルスの配列においてヌクレオチド455−3329(Pv
uII−BglIIフラグメント) または 382 から3446(Hinf
Ii−Sau3Aフラグメント)からのびる。他の領域もまた、特にE3領域(
WO95/02697)、E2領域(WO94/28938)、E4領域(WO
94/28152、W094/12649およびWO95/02697)におい
てあるいは後期遺伝子L1−L5のいずれかにおいて改変され得る。
【0088】 好ましい実施形態において、アデノウイルスは、E1領域において欠損を有す
る(Ad1.0)。E1欠損アデノウイルスの例は、EP185,573におい
て開示されている。その内容は、本明細書において参考として援用される。別の
好ましい実施形態において、アデノウイルスは、E1およびE4領域において欠
損を有する(Ad3.0)。E1/E4欠損アデノウイルスの例は、W095/
02697およびWO96/22378に開示されている。その内容は、本明細
書において参考として援用される。なお別の好ましい実施形態において、そのア
デノウイルスは、E1領域において欠損を有し、その中にE4領域および核酸配
列が挿入されている(以下を参照のこと:FR94 13355、その内容は、
本明細書において参考として援用される)。
【0089】 本発明に従う複製欠損組換えアデノウイルスは、当業者に公知の任意の技術に
よって調製され得る(Levreroら、Gene 101(1991)195
、EP185,573;Graham,EMBO J.3(1984)2917
)。特に、これらは、アデノウイルスとプラスミド(特に、目的のDNAを保持
する)との間の相同組換えによって調製され得る。相同組換えは、適切な細胞株
へのアデノウイルスおよびプラスミドの同時トランスフェクション後にもたらさ
れる。使用される細胞株は、好ましくは、(i)前記エレメントによって形質転
換可能であり、そして(ii)複製欠損アデノウイルスのゲノムのその部分を相
補し得る配列を、好ましくは、組換えの危険性を回避するために、組み込まれた
形態で含むべきである。使用され得る細胞株の例は、ヒト胚性腎臓細胞株293
(Grahamら、J.Gen.Virol.36(1977)59)(これは
、そのゲノム内に組み込まれた、Ad5アデノウイルスのゲノムの左側部分(1
2%)を含む)、およびE1およびE4機能を相補し得る細胞株(特許出願WO
94/26914およびWO95/02697に記載されるような)である。組
換えアデノウイルスは、当業者に周知の標準的な生物学的技術を使用して、回収
および精製される。
【0090】 (b.アデノ随伴ウイルスベクター系) アデノ随伴ウイルス(AAV)は、比較的小さいサイズのDNAウイルスであ
り、これは、安定かつ部位特異的な様式で、それらが感染する細胞のゲノム内に
組み込まれ得る。これらは、細胞の増殖、形態または分化にいかなる影響も誘導
することなく、広範な種の細胞を感染し得、そしてこれらは、ヒト病理に関連す
ることはないようである。AAVゲノムは、クローニングされ、配列決定され、
そして特徴付けられている。それは、約4700塩基を含み、そして各末端に約
145塩基の逆方向末端反復(ITR)領域を含み、これらは、このウイルスの
複製起点として作用する。ゲノムの残りの部分は、以下の、カプセル化機能を保
持する2つの必須領域に分けられる:ゲノムの左側部分。これは、ウイルス複製
およびウイルス遺伝子の発現に関するrep遺伝子を含む;およびゲノムの右側
部分。これは、ウイルスのキャプシドタンパク質をコードするcap遺伝子を含
む。
【0091】 インビトロおよびインビボで遺伝子を移入するためのAAV由来のベクターの
使用は、記載されている(WO91/18088;WO93/09239;米国
特許第4,797,368号、米国特許第5,139,941号、EP488
528を参照のこと)。これらの刊行物は、rep遺伝子および/またはcap
遺伝子が欠失されており、そして目的の遺伝子によって置換されている、種々の
AAV由来構築物、ならびにインビトロ(培養細胞内)またはインビボ(生物内
に直接的に)で、この目的の遺伝子を移入するためのこれらの構築物の使用を記
載する。本発明に従う複製欠損組換えAAVは、2つのAAV逆方向末端反復(
ITR)領域によって隣接されている目的の核酸配列を含むプラスミド、および
AAVカプセル化遺伝子(rep遺伝子およびcap遺伝子)を保持するプラス
ミドを、ヒトヘルパーウイルス(例えば、アデノウイルス)を感染させている細
胞株内に同時トランスフェクトすることによって調製され得る。次いで、生成さ
れるこのAAV組換え体を、標準的な技術によって精製する。
【0092】 従って、本発明はまた、AAV由来組換えウイルスに関連し、ここで、このウ
イルスのゲノムは、このAAV ITRによって隣接されている、TRAF2T
RまたはTRAF2TDをコードする核酸をコードする配列を含む。本発明はま
た、AAV由来の2つのITRによって隣接されている、TRAF2TRまたは
TRAF2TDをコードする核酸をコードする配列を含む、プラスミドに関する
。このようなプラスミドは、このプラスミド(適切な場合、リポソームベクター
に取り込まれている(偽ウイルス))によって、この核酸配列を移入するために
使用されるように、使用され得る。
【0093】 (c.レトロウイルスベクター系) 別の実施形態において、この遺伝子は、レトロウイルスベクターに導入され得
る(例えば、Andersonら、米国特許第5,399,346号;Mann
ら、1983、Cell 33:153;Teminら、米国特許第4,650
,764;Teminら、米国特許第4,980,289号;Markowit
zら、1988、J.Virol.62:1120;Teminら、米国特許第
5,124,263;EP 453242、EP178220;Bernste
inら、Genet.Eng.7(1985)235;McCormick,B
ioTechnology 3(1985)689;Doughertyらによ
る、国際特許公開番号WO95/07358(1995年3月16日公開);お
よびKuoら、1993、Blood 82:845に記載されるように)。こ
れらのレトロウイルスは、分裂細胞を感染する組み込みウイルスである。このレ
トロウイルスゲノムは、2つのLTR、1つのカプセル化配列および3つのコー
ド領域(gag、polおよびenv)を含む。組換えレトロウイルスベクター
において、gag、polおよびenv遺伝子は、一般に、全体または部分的に
欠失され、そして目的の異種核酸配列で置換される。これらのベクターは、以下
のような異なる型のレトロウイルスから構築され得る:HIV、MoMuLV(
「マウスモロニー白血病ウイルス」、MSV(「マウスモロニー肉腫ウイルス」
)、HaSV(「ハーベイ(Harvey)肉腫ウイルス」);SNV(「脾臓
壊死ウイルス」);RSV(「ラウス肉腫ウイルス」)、およびフレンドウイル
ス。欠損性レトロウイルスベクターは、WO95/02697に開示される。
【0094】 一般に、核酸配列を含む組換えレトロウイルスを構築するために、LTR、カ
プセル化配列およびコード配列を含むプラスミドが、構築される。この構築物を
使用して、パッケージング細胞株をトランスフェクトし、この細胞株は、このプ
ラスミド中に欠損しているレトロウイルス機能をトランスで(in trans
)供給し得る。一般に、従って、パッケージング細胞株は、gag、polおよ
びenv遺伝子を発現し得る。このようなパッケージング細胞株は、先行技術に
おいて記載されている:特に、細胞株PA317(米国特許第4,861,71
9号);PsiCRIP細胞株(WO90/02806)およびGP+envA
m−12細胞株(WO89/07150)。さらに、この組換えレトロウイルス
ベクターは、転写活性を抑制するためのLTR内の改変、およびgag遺伝子の
一部を含み得る広範なカプセル化配列を含み得る(Benderら、J.Vir
ol.61(1987)1639)。組換えレトロウイルスベクターは、当業者
に公知の標準的な技術によって精製される。
【0095】 レトロウイルスベクターは、感染性の粒子として機能するように、または一回
のトランスフェクションを受けるように構築され得る。前者の場合、このウイル
スは、腫瘍形成性の形質転換特性を担う部分を除く、この遺伝子の全ての部分を
保持するように、そして異種遺伝子を発現するように改変される。非感染性ウイ
ルスベクターは、このウイルスのパッケージングシグナルを破壊するように調製
されるが、異種遺伝子およびこのパッケージングシグナルを含むよう操作された
、同時導入されたウイルスをパッケージングするために必要とされる構造遺伝子
を保持する。従って、産生されるウイルス粒子は、さらなるウイルスを産生し得
ない。標的化された遺伝子送達は、国際特許公開WO95/28494(199
5年10月公開)に記載される。
【0096】 (エキソビボおよびインビボ処置方法に使用される非ウイルス系) 特定の非ウイルス系は、当該分野で使用されており、そして本発明のポリペプ
チドをコードするDNAの所望の標的細胞への導入を容易にし得る。
【0097】 (a.リポフェクチン送達系) ベクターは、リポフェクチンによってインビボで導入され得る。過去十年の間
、インビトロでの核酸のカプセル化およびトランスフェクションのための、リポ
ソームの使用が増加してきた。リポソーム媒介トランスフェクションによって遭
遇される困難性および危険性を制限するように設計された合成カチオン性脂質は
、マーカーをコードする遺伝子のインビボトランスフェクションのためのリポソ
ームを調製するために使用され得る[Felgnerら、Proc.Natl.
Acad.Sci.U.S.A.84:7413−7414(1987);Ma
ckeyら、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85:80
27−8031(1988);Ulmerら、Science 259:174
5−1748(1993)を参照のこと]。カチオン性脂質の使用は、負に荷電
した核酸のカプセル化を促進し得、そしてまた、負に荷電した細胞膜との融合を
促進し得る[FelgnerおよびRingold、Science 337:
387−388(1989)]。核酸の移入のための特に有用な脂質化合物およ
び組成物は、国際特許公開WO95/18863およびWO96/17823、
ならびに米国特許第5,459,127号に記載される。外因性遺伝子を特定の
器官にインビボで導入するためのリポフェクチンの使用は、特定の実用上の利点
を有する。特定の細胞へのリポソームの分子標的化は、利点の一面を表す。特定
の細胞型へトランスフェクションを指向することは、細胞異質性を有する組織(
例えば、膵臓、肝臓、腎臓、および脳)において特に有利であることが明らかで
ある。脂質は、標的化の目的のために他の分子に化学的に結合され得る[Mac
keyら、前出を参照のこと]。標的化されるペプチド(例えば、ホルモンまた
は神経伝達物質)およびタンパク質(例えば、抗体)、または非ペプチド分子が
、リポソームに化学的に結合され得る。
【0098】 他の分子もまた、インビボでの核酸のトランスフェクションを容易にするため
に有用である:例えば、カチオン性オリゴペプチド(例えば、国際特許公開WO
95/21931)、DNA結合タンパク質由来ペプチド(例えば、国際特許公
開WO96/25508)、またはカチオン性ポリマー(例えば、国際特許公開
WO95/21931)。
【0099】 (b.裸のDNA送達系) ベクターを裸のDNAプラスミドとしてインビボで導入することもまた、可能
である(例えば、米国特許第5,693,622号、同第5,589,466号
および同第5,580,859号を参照のこと)。遺伝子治療のための裸のDN
Aベクターは、例えば、以下の当該分野で公知の方法によって所望の宿主細胞内
に導入され得る:トランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロイ
ンジェンクション、形質導入、細胞融合、DEAEデキストラン、リン酸カルシ
ウム沈殿、遺伝子銃の使用、またはDNAベクタートランスポーターの使用[例
えば、Wuら、J.Biol.Chem.267:963−967(1992)
;WuおよびWu、J.Biol.Chem.263:14621−14624
(1988);Hartmutら、カナダ特許出願第2,012,311号(1
990年3月15日出願);Williamsら、Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA 88:2726−2740(1991)を参照のこと]。
レセプター媒介DNA送達アプローチもまた、使用され得る[Curielら、
Hum.Gene.Ther.3:147−154(1992);WuおよびW
u、J.Biol.Chem.262:4429−4432(1987)]。
【0100】 (TRAF2TRの治療的に有用な改変体を同定するための方法) TNFα調節性経路が疾患状態に関与するか否かを決定するため、および本発
明のポリペプチドのこれらの経路に対する効果を決定するために使用され得る種
々の方法がある。例えば、NFκB調節におけるTRAF2TRの役割を研究す
るために、電気泳動易動度シフトアッセイ(EMSA)分析は、プローブとして
NFκB UASを使用して実行された(図7)。FL TRAFを過剰発現す
る細胞由来の核抽出物(レーン3および4)は、TNFα誘導シフトがコントロ
ールと比較して有意に大きいことを示す(レーン1および2)。TRAF2TR
過剰発現は、NFκBの形成を遮断し、そして結果として、TNFα刺激細胞に
おいてシフトは検出されなかった(レーン5および6)。これらの結果は、シフ
トバンドがTNFα刺激細胞において見られなかったので、NFκB形成の強力
な阻害を示唆した。NFκB結合活性の量の増加は、TNFαを用いた刺激の後
に、全長TRAF2を過剰発現する細胞において提示される(レーン4)。
【0101】 本明細書中上で議論されるタイプの実験は、疾患状態と関連した所与の経路が
、本発明の組成物を使用して処置され得るか否かを決定するために利用され得る
。一般的に、上記実験は、改変体がTNFα調節性経路を阻害する能力を有する
か否かを決定するために、TRAF2またはTRAF2TDの代わりに、TRA
F2の単離されたかまたは調製された改変体を用いて実施され得る。
【0102】 (TNFα調節性経路に関連する疾患状態) 上で議論されるように、本発明は、TNFα調節性経路を阻害するためのTR
AF2TRおよびTRAF2TDならびにそれらの改変体の使用に関する。特に
、本発明は、いくつかの転写因子(NFκBおよびAP−1を含む)のTNFα
誘導活性化を効果的に遮断するための前述のものを使用することに関する。TR
AF2TRおよびTRAF2TDならびにそれらの改変体は、TNFαの過剰産
生およびNFκB依存性遺伝子の過剰活性化に関連する病理におけるTNFαシ
グナル伝達経路を阻害する際に有用である。種々の疾患は、TNFα調節性経路
に関連することが明らかであり、これらの疾患に対する病理的基礎は、TNFα
の過剰産生またはNFκB依存性遺伝子の過剰活性化を含み得る。これらの疾患
は、TRAF2TRタンパク質およびTRAF2TDタンパク質ならびにそれら
の改変体を使用して処置され得る。
【0103】 炎症プロセスが全ての主要な心臓血管疾患状態の病理に非常に寄与するという
証拠を考え、上昇したTNFαレベルがこれらの炎症のプロセスと関連すると考
えると、種々の主要な心臓血管疾患状態が、本発明の組成物および方法を使用し
て処置され得ると考えられ得る。これらの疾患には、心臓血管疾患状態(心筋梗
塞、冠状動脈バイパス手術、心臓移植に続く心臓虚血−再灌流障害、または発作
に続くCNSにおける虚血−再還流障害;進行性冠動脈アテローム動脈硬化斑の
進行および破裂;うっ血性心不全の発生および進行;ならびにバルーン血管形成
術に続く内皮細胞損傷を含む)が挙げられるが、これには限定されない。さらに
、本発明は、心不全または梗塞の間の心筋細胞のアポトーシス細胞死を予防する
ために、そして筋細胞アポトーシスを避けるために使用され得る。
【0104】 TNFαレセプターシグナル伝達を遮断することによって、TRAF2TRま
たはTRAF2TDあるいはそれらの改変体を使用する遺伝子治療アプローチは
、これらの疾患を処置するために使用され得る。TRAF2TDの使用は、TN
Fα調節性経路についてのその高い効率的な阻害を考えると、好ましい。
【0105】 同様に、TNFαレセプターシグナル伝達によって、TRAF2TRまたはT
RAF2TDあるいはそれらの改変体を使用する遺伝子治療は、TNFαが病原
に関連する他の疾患状態を処置するために使用され得る。これらの疾患状態には
、クローン病、乾癬、慢性関節リウマチ、対宿主性移植片病、炎症性腸疾患、非
インシュリン依存性糖尿病、および神経変性疾患(例えば、パーキンソン病)が
挙げられるが、これらには限定されない。
【0106】 さらに、TRAF2TDは、TRAF2依存性シグナル伝達経路の機構を研究
するために種々のアッセイに使用され得る。
【0107】 (治療組成物および投薬) 使用において、本発明の任意のベクター(ウイルス性、または非ウイルス性)
は、好ましくは、薬学的に受容可能なビヒクルまたはキャリア中でインビボで導
入される。成句「薬学的に受容可能」は、分子性の実体および組成物を示し、こ
れらは、ヒトに投与される場合、生理学的に許容可能であり、典型的には有意な
アレルギー性または類似の好ましくない反応(例えば、胃の不調およびめまいな
ど)を作り出さない。好ましくは、本明細書中で使用される場合、用語「薬学的
に受容可能」は、動物、より詳細にはヒトにおける使用のために、連邦政府また
は州政府の監督官庁、または米国薬局方または他の一般的に認識される薬局方に
列挙される監督官庁によって認証されていることを意味する。用語「キャリア」
は、化合物が投与される希釈剤、アジュバント、賦形剤、またはビヒクルを示す
。このような薬学的キャリアは、滅菌性液体(例えば、水および油(石油、動物
、植物または合成起源(例えば、ピーナッツ油、ダイズ油、鉱油、ゴマ油など)
))であり得る。水および水性溶液生理食塩溶液ならびに水性ブドウ糖およびグ
リセロール溶液は、好ましくは、キャリアとして、特に注射可能溶液のために使
用される。適切な薬学的キャリアは、E.W.Martinによる「Remin
gton’s Pharmaceutical Sciences」に記載され
る。
【0108】 本発明は、本発明の組成物の有効量のヒトまたは他の動物への投与を含む、治
療方法を提供する。
【0109】 有効な量は、年齢、処置されるべき状態のタイプおよび重篤度、体重、処置の
望ましい期間、投与の方法、および他のパラメーターに依存して変わり得る。有
効な量は、医師または他の資格のある医療専門家によって決定される。
【0110】 本発明に従うポリペプチドが、1日当たり体重1kg当たり約0.01mg〜
約100mgの用量で非常に広く使用される。好ましい用量は、約0.1mg/
kg〜約50mg/kgであり、1日当たり体重1kg当たり約1mg〜約10
0mgの用量がより好ましい。
【0111】 本発明に従う組換えウイルスは、一般的に、約104と約1014pfuの間の
用量の形態で処方され投与される。AAVおよびアデノウイルスの場合、約10 6 〜約1011pfuの用量が好ましくは使用される。用語「pfu」(「プラー
ク形成単位」)は、ビリオンの懸濁液の感染能力に対応し、適切な細胞培養物を
感染することおよび形成されるプラークの数を測定することによって決定される
。ウイルス溶液のpfu力価を決定するための技術は、先行技術において十分記
載されている。
【0112】 以下の実施例は、本発明の例示である。
【0113】 (実施例) (実施例1−cDNAコードTRAF2TRの単離) TRF2スプライス改変体、TRAF2TRは、ヒト骨肉腫細胞株(OSA1
)由来のmRNAを使用して全長TRAF2のRT PCRクローニング(Cu
rrent Protocols in Molecular Biology
、1996)の間に単離された。全長TRAF2 cDNAを産生するためのプ
ライマーを使用する間、より小さなPCR産物が観測される。フラグメントが切
り出され、独立してクローン化される。RT PCRに使用される5’プライマ
ーは、ATGGCTGCAGCTAGCGTGACCでありそして3’プライマ
ーがTTATAGCCCTGTCAGGTCCACであった。
【0114】 このより小さなクローン(TRAF2TR)の配列決定時に、アミノ酸残基1
23〜201をコードするコドンのインフレーム欠失が同定された。図4aおよ
び4bは、全長TRAF2およびTRAF2TRの核酸配列およびアミノ酸配列
を比較する。
【0115】 体内の種々の組織は、TRAF2TR mRNAの供給源として同定されてお
り、上記プロトコルを使用してTRAF2TR mRNAを単離するために使用
され得る。TRAF2TRの組織分布を決定するために、RT−PCRを、スプ
ライスされた領域の外側の一対のプライマーを使用して行った。欠失の5’側鎖
上のプライマーは、GGTGGAGAGCCTGCCGGCCGであり、そして
欠失の3’側鎖上のプライマーは、GGCAGCCGATGGCGTGGAAT
CTGであり、そしてcDNAは、異なる組織由来の総RNAからのオリゴ−d
Tを使用して生成された。cDNAは、寒天電気泳動によって分離され、そして
ニトロセルロースに移された。ハイブリダイゼーションを、スプライスされた領
域の5’末端に隣接するTRAF2配列(5’GATGCACCTGGAAGG
GGACCCTGAAAT−3’)由来の特異的なプローブを使用して行った。
このプローブは、TRAF2のスプライシングされていない改変体とスプライシ
ングされた改変体との両方を認識する。スプライシングされていない改変体(T
RAF2FL)についての期待されるサイズは、373bpであり、スプライシ
ングされた改変体(TRAF2TR)については、136bpである。ここで、
図5を参照する。レーン:1−コントロールTRAF2−FL cDNA;2−
コントロールTRAF2スプライシングされた改変体cDNA;3−ジャーカッ
ト;4−HeLa細胞株;5−胸腺;6−胎盤;7−胸腺;8−脾臓;9−卵巣
【0116】 種々の細胞供給源由来の溶解物のウェスタンブロット分析は、発現されたタン
パク質のレベルで短縮型のTRAF2改変体の存在を明確には検出しない。タン
パク質の高レベル発現および産生が、細胞型依存性の様式で、発生的に、一時的
に、限定されるか、または定義されない機構によって制御される(例えば、Ge
rminalセンターにおけるB細胞変異)。
【0117】 スプライス改変体TRAF2TRにおける欠失が、オープンリーディングフレ
ームを保持し、そして5’スプライス境界が標準的なスプライス供与配列と一致
する。欠失は、WT TRAF2のアミノ酸残基123〜201を除去し、これ
は、ジンクフィンガードメイン1のC末端部分およびジンクフィンガー2および
3の全てならびにジンクフィンガー4のN末端残基を含む(図1)。この欠失は
、おそらく、ジンクフィンガー領域の機能を破壊し、Takeuchiら、J.
Biol.Chem.271(33)、19935−19942(1996)に
よって作製される欠失に類似し、彼らが報告するこれは、TNFα誘導NFκB
活性化に対する優性なネガティブな効果を示す。
【0118】 (実施例2−TRAF2TDの調製) TRAF2のN−アミノ酸末端87アミノ酸の欠失(環指ドメインを表す。図
1を参照のこと)が、TNFα依存性NFκB活性化の優性なインヒビター(優
性なネガティブ)として作用するタンパク質を作製する(Takeuchiら、
J.Biol.Chem.271(33)、19935−19942(1996
))。N末端欠失がTRAF2TRの活性に影響するか否かを決定するために、
タンパク質のN末端から87アミノ酸(残基1〜87)の欠失したTRAF2T
Rを表す構築物を調製した。このTRAF2TRの改変体を調製するために、T
RAF2TR cDNAは、TRAF2全長コード配列のヌクレオチド262〜
280を含む5’プライマー(ATGAGTTCGGCCTTCCCAGAT)
を使用するPCRのための鋳型として使用され、ここで、ATGコドンが、翻訳
開始部位を作製するために含まれ;3’プライマーは、TTATAGCCCTG
TCAGGTCCACであった。得られた構築物は、全長TRAF2のアミノ酸
88において開始し、そしてTRAF2TRの123〜201アミノ酸欠失を含
む(「二重欠失」構築物の場合)。構築物は、DNA配列決定によって確認され
、哺乳動物発現ベクター(pcDNA、Invitrogen)にクローン化さ
れた。
【0119】 (実施例3−TRAF2TRでのHeLa細胞の形質転換) NFκB活性化へのTRAF2TRの効果を決定するために、短縮型TRAF
2および全長(FL)TRAF2を、哺乳動物発現ベクター(pcDNA3、I
NVITROGEN)中にN−Mycアフィニティータグを用いて構築した。N
−Myc融合構築物を調製するために、5’PCRプライマーを合成した。この
プライマーは、開始メチオニン(MetGluGlnLysLeuIleSer
GluGluAspLeuAsn)とともに、Mycタグの配列を含み、その後
に、以下のTRAF2 cDNAの最初の20ヌクレオチドを含む:5’−AT
G GAG CAG AAA TTG ATT TCC GAG GAA GA
T CTG AAC ATG GCT GCA GCT AGC GTG AC −3−’。3’PCRプライマー配列は、以下であった:5’−TTAGAG
CCCTGTCAGGTCCACAA−3’。PCR産物を精製し、そして標準
的技術を用いてpcDNA3ベクター中にクローニングした。
【0120】 LipoFectamine(BRL,Gibco)試薬を用いて、pcDN
A3−myc TRAF2構築物により、HeLa細胞を形質転換した。この形
質転換には、試薬の供給業者により提供されたプロトコールを用いた。簡略に言
えば、4mlのLipoFectamineを、1mgのDNAを含有する無血
清DMEM(BRL)培地と混合し、そしてその混合物とともに3×105細胞
を含有する60mmのペトリ皿を5%CO2インキュベーターで37℃で一晩、
インキュベートした。形質転換の24時間後、細胞をリン酸緩衝化生理食塩水で
洗浄し、そして200mlのSDS電気泳動サンプル緩衝液(SIGMA)中で
リンスした。10mlの溶解液を電気泳動によって分離し、そしてニトロセルロ
ースフィルターにウエスタンブロットした。抗体供給業者の推奨に従って、免疫
染色およびECL(AMERSHAM)検出を実行した。
【0121】 抗Myc抗体(BABCO,Berkeley)により、pcDNA−TRA
F2FLおよびpcDNA−TRAF2TRで形質転換したHeLa細胞におい
て、予期されたサイズのタンパク質を検出した(図6)。
【0122】 図6に示す結果は、形質転換されたHeLa細胞におけるMyc−融合TRA
F2FLおよびTRAF2TRの免疫検出を示す。Lipofectamine
(Gibco BFL)を用いて、TRAF−FLおよびTRAF−TRの発現
構築物により、HeLa細胞を形質転換した。その24時間後、細胞をSDSロ
ーディング緩衝液中で溶解した。抗myc AbおよびECL検出システムを用
いて、Myc融合タンパク質を検出した。各レーンは以下のとおり;1:pcD
NA3ベクター;2:myc−TRAF2FL;3:myc−TRAF2TR。
【0123】 (実施例4−NFκBレポーターシステム) NFκB調節の遺伝子発現に対するTRAF2TR、TRAF2TDまたはこ
れらのポリペプチドの改変体の効果を決定するため、NFκBレポーターシステ
ムが用いられ得る。このシステムは、Takeuchiら、J.Biol.ch
em.271(33)、19935〜42(1996)において利用され、そし
て記載されているようなシステムである。NFκBレポーター活性化システムは
、適切な細胞(例えば、293細胞、COS7細胞またはHeLa細胞)と結合
されて利用され得る。実施例3に考察したLipofectamineプロトコ
ールを用いて、この細胞を、異なるTRAF2構築物(すなわち、全長TRAF
2、TRAF2TRおよびTRAF2TD)で形質転換する。次いで、同時トラ
ンスフェクトされたNFκBレポーターの活性化に対する、異なるTRAF2フ
ラグメントの効果を比較して、最も効果的なインヒビター種を同定し得る。例え
ば、TRAF2構築物(全長TRAF2、TRAF2TR、およびTRAF2T
D、ならびにTRAF2TRおよびTRAF2TDの改変体を含む)は、293
細胞中に形質転換され得、そしてTNFαの存在下または非存在下においてNF
κBレポーター活性のレベルが、モニターされ得る。全長TRAF2は、同時形
質転換されたNFκBレポーターを活性化することが期待されるが、他のTRA
F2構築物は、NFκBレポーターのTNFα媒介活性化合物を、様々な程度ま
でブロックするとは思われない。
【0124】 (実施例5−エキソビボ処置方法) エキソビボ遺伝子治療の方法は、当該分野で公知であり、そして一般に4つの
段階を含む。第1の段階においては、所定の型の細胞を、処置されるべき患者か
ら収集する。第2段階では、所望の遺伝子を単離された細胞中に形質転換する。
第3段階では、所望の遺伝子を取り込んだ細胞を選択し、そして増殖させる。第
4段階では、細胞を患者に導入するかまたは患者に移植して戻し、患者に、所望
の遺伝子を発現させ、そして疾患を処置する。
【0125】 本発明を利用するエキソビボ処置方法の最初の段階では、患者から細胞を得る
。細胞の選択は、多くの要因(主に、処置されるべき特定の疾患)に基づく。こ
れらの標的細胞における活性化のブロックは、炎症促進型サイトカインおよび炎
症プロセスに関与する他のタンパク質(心血管系の疾患状態の徴候に関する)の
発現を阻害する。
【0126】 第2の段階では、TRAF2TRもしくはTRAF2TDまたは改変cDNA
を、適切な哺乳動物発現ベクターにクローニングする。リポフェクチン、発現ベ
クター(例えば、pcDNA3)を含む形質転換プロトコールが用いられ得る。
好ましい実施形態において、TRAF2TDがTNFα結合効果を阻害する増強
された能力を考慮して、pcDNA3、または別の適切な哺乳動物発現ベクター
にTRAF2TDをクローニングする。発現ベクターにおいて利用されるプロモ
ーターを、形質転換されるべき細胞の型、および発現のレベルを調節するための
望ましい方法に基いて選択する。適切なプロモーターは、上記で考察したプロモ
ーターの中から選択され得る。心臓疾患の遺伝子治療のために、以下のプロモー
ター、例えば、2MHC(Palermoら、Circ.Res.,78(3)
,504〜9(1996)を参照のこと)、MLC2(Sani、Nature
,314:283〜286(1985)を参照のこと)、CARP(Jeyas
eelanら、J.Biol.Chem.272(36)、22800〜8(1
997)を参照のこと)をTRAF2TDのcDNAの上流に挿入する。発現ベ
クターを含有するTRAF2TDのcDNAを、次いで、供給業者のプロトコー
ルを用いて、Lipofectamine(BRL,Gibco)試薬を利用す
るリポソーム媒介トランスフェクションにおいて用いる。ウイルス形質導入を用
いるトランスフェクションプロトコールのためには、エキソビボ処理プロトコー
ルの第2段階で、組換えアデノウイルスベクターシステムを利用する。このプロ
トコールにおいては、TRAF2TD cDNAを、アデノウイルス発現ベクタ
ー(例えば、アデノ−クエストpQBI−AdBN/NB(QUANTUM B
iotechnologies Inc.)にクローニングする。このアデノウ
イルス移入ベクター(ここではTRAF2TD cDNAを含有する)を、次い
で、アデノウイルスのウイルスDNAとともに、293細胞中に同時トランスフ
ェクトする。プラーク単離および陽性クローン選択後、TRAF2TD cDN
Aを含有する組換えアデノウイルスを増幅し、次いで、従来のCsCl段階勾配
精製を用い、その後適切な緩衝液(例えば、リン酸緩衝化生理食塩水)を用いる
透析により精製する。次いで、組換えアデノウイルスを用い、エキソビボで標的
細胞をトランスフェクトする。
【0127】 本発明による組換えウイルスは、約104pfuと約1014pfuの間の用量
の形態で、処方され、投与される。AAVおよびアデノウイルスの場合、約10 6 pfuと約1011pfuの間の用量が好ましくは用いられる。用語「pfu」
(「プラーク形成単位(plaque−forming unit)」 は、ビリオンの懸濁液の感染力価に対応し、そしてこれは、適切な細胞培養物を
感染することにより、および形成されたプラークの数を計数することにより決定
される。ウイルス溶液のpfu力価を決定する技術は、先行技術において十分に
立証されている。
【0128】 第3段階では、リポフェクチンまたは組換えアデノウイルス感染のいずれかに
より得られた形質転換細胞を、培養液中で増殖させ、形質転換された細胞を選択
する。選択は、種々の方法で行われ得る。この方法は、発現ベクターを組み込ん
だ細胞のみを生存させ、増殖させる薬物マーカーを用いることを包含する。
【0129】 第4段階では、処置されるべき組織の近位か、またはTRAF2TD cDN
A産物が循環中に放出されることを可能にする位置のいずれかに、形質転換され
た細胞を患者に導入するか、または直接移植して、TNFα結合による活性化に
対して細胞被検体を相互作用させる。送達手段としては、直接注入、またはカテ
ーテル、インフュージョンポンプ、もしくはステントによる送達が挙げられるが
これらに限定されない。
【0130】 (実施例6−インビボ処置方法) インビボ処置方法は、種々の異なるウイルスベクターを利用し得る。ウイルス
ベクターとしては、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、お
よびレトロウイルスベクターが挙げられる。本発明の好ましいインビボ処置方法
においては、アデノウイルスシステムを用いて、宿主細胞にTRAF2TRまた
はTRAF2TDのcDNAを導入する。TRAF2TD cDNAがTNFα
結合活性を阻害する比較的大きい能力を考慮すれば、アデノウイルス発現ベクタ
ーにおいてTRAF2TD cDNAを用いることが好ましい。この方法では、
TRAF2TD cDNAを、アデノウイルス移入ベクター、例えば、アデノ−
クエスト(Quest)pQBI−AdBN/NB(QUANTUM Biot
echnologies Inc.)、または上記の別のアデノウイルスベクタ
ーにクローニングする。発現ベクターにおいて利用されるプロモーターを、形質
転換されるべき細胞の型、および発現のレベルを調節するための望ましい方法に
基いて選択する。適切なプロモーターは、上記で考察したプロモーターの中から
選択され得る。
【0131】 所望のプロモーターおよびTRAF2TD cDNAを含有するアデノウイル
ス移入ベクターを、アデノウイルスのウイルスDNAとともに、293細胞中に
同時トランスフェクトする。プラーク単離および陽性クローン選択後、TRAF
2TD cDNAを含有する組換えアデノウイルスを増幅し、次いで、従来のC
sCl段階勾配精製を用い、その後適切な緩衝液(例えば、リン酸緩衝化生理食
塩水)を用いる透析により精製する。
【0132】 インビボで細胞をトランスフェクトする前に、ウイルス粒子の力価を決定し、
そしてインビトロ実験を実行して、タンパク質発現のレベルおよび組織培養感染
用量(TCID50)を決定する。本発明による組換えウイルスは、約104
fuと約1014pfuの間の用量の形態で、処方され、投与される。AAVおよ
びアデノウイルスの場合、約106pfuと約1011pfuの間の用量が好まし
くは用いられる。用語「pfu」(「プラーク形成単位(plaque−for
ming unit)」は、ビリオンの懸濁液の感染力価に対応し、そしてこれ
は、適切な細胞培養物を感染することにより、および形成されたプラークの数を
計数することにより決定される。ウイルス溶液のpfu力価を決定する技術は、
先行技術において十分に立証されている。
【0133】 次いで、組換えアデノウイルスを用いて、約106pfuと約1011pfuの
間の用量で患者を感染させる。組換えアデノウイルスは、吸入、注入、外科的移
植、直接注入、またはカテーテル、注入ポンプもしくはステントによる送達によ
り導入され得る。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 図1は、全長TRAF2(TRAF2−FL)およびオルタナティブスプライ
ス改変体TRAF2TRの模式的構造である。
【図2】 図2aおよび図2bは、TRAF2TR cDNAの核酸配列(2a)および
TRAF2TR(2b)のアミノ酸配列である。
【図3】 図3aおよび3bは、TRAF2TD(3a)の核酸配列およびTRAF2T
D(3b)のアミノ酸配列である。
【図4a】 図4aおよび図4bは、スプライスされたTRAF2(TRAF2TR)およ
び全長TRAF2の核酸(4a)およびアミノ酸(4b)アラインメントである
【図4b】 図4aおよび図4bは、スプライスされたTRAF2(TRAF2TR)およ
び全長TRAF2の核酸(4a)およびアミノ酸(4b)アラインメントである
【図5】 図5は、TRAF2TR改変体mRNAの組織分布を例示する。レーン:1−
コントロールTRAF2FL cDNA;2−コントロールTRAF2スプライ
ス改変体(TRAF2TR)cDNA;3−Jurkat;4−HeLa細胞株
;5−胸腺;6−胎盤;7−胸腺;8−脾臓;9−卵巣;10−コントロールT
RAF2FL。
【図6】 図6は、トランスフェクトされたHeLa細胞におけるMyc融合TRAF2
FLおよびTRAF2TRの免疫検出を例示する。レーン:1−pcDNA3ベ
クター;2−myc−TRAF2FL;3−myc−TRAF2TR。
【図7】 図7は、NFKB UASプローブを使用して行われた電気泳動移動度のシフ
トアッセイ(EMSA)を例示する。FL TRAF2(レーン3および4)を
過剰発現する細胞からの核抽出物は、コントロール(レーン1および2)と比較
して優位により強力なTNF−αにより誘導されたシフトを示す。TRAF2−
TR過剰発現は、NF−κBの形成をブロックし、その結果、シフトは、TNF
α刺激細胞(レーン5および6)において検出されていない。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 3/10 A61P 9/08 9/00 9/10 9/08 17/02 9/10 19/02 17/02 25/28 19/02 29/00 25/28 101 29/00 37/02 101 43/00 111 37/02 C07K 14/47 43/00 111 C12P 21/02 C C07K 14/47 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/02 A61K 37/02 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT,AU, AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,C N,CR,CU,CZ,DE,DK,DM,DZ,EE ,ES,FI,GB,GD,GE,GH,GM,HR, HU,ID,IL,IN,IS,JP,KE,KG,K P,KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU ,LV,MA,MD,MG,MK,MN,MW,MX, NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,S G,SI,SK,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ ,UA,UG,US,UZ,VN,YU,ZA,ZW (72)発明者 パグノニ, マルコ エフ. アメリカ合衆国 ペンシルベニア 19403, ノリスタウン, ステリジア ストリー ト 2029 (72)発明者 イバシュチェンコ, ユリ ディー. アメリカ合衆国 ペンシルベニア 19525, ノリスタウン, ハンプトン コート 11 (72)発明者 グオ, クン アメリカ合衆国 ペンシルベニア 19403, イーグルビル, アパートメント ナン バー21, イーグル ストリーム ドライ ブ 103 (72)発明者 クラーク, ケニス エル. イギリス国 エスジー1 4エイエス ハ ートフォードシェア, スティーブンエイ ジ, グランビー ロード 34 Fターム(参考) 4B024 AA01 BA80 CA04 DA02 EA02 EA04 GA11 HA01 HA12 HA17 4B064 AG01 CA10 CA19 CC24 DA01 DA08 4C084 AA02 AA07 AA13 AA14 AA17 BA01 BA08 BA22 BA23 BA35 BA44 CA53 CA56 DA01 DC50 MA66 NA01 NA13 NA14 ZA182 ZA362 ZA392 ZA402 ZA452 ZA662 ZA892 ZA962 ZB072 ZB112 ZB152 ZC352 4H045 AA10 AA30 BA10 CA41 EA22 EA28 FA74

Claims (32)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 図2aに示される配列を含むTRAF2TRをコードするD
    NA配列。
  2. 【請求項2】 図3aに示される配列を含むTRAF2TDをコードするD
    NA配列。
  3. 【請求項3】 前記DNAがcDNAである、請求項1に記載のDNA。
  4. 【請求項4】 前記DNAがcDNAである、請求項2に記載のDNA。
  5. 【請求項5】 TNFα調節性経路を阻害し得、かつ図2bに示されるアミ
    ノ酸配列を含む、単離され、そして精製されたTRAF2TRポリペプチド。
  6. 【請求項6】 TNFα調節性経路を阻害し得、かつ図3bに示されるアミ
    ノ酸配列を含む、TRAF2TDポリペプチド。
  7. 【請求項7】 患者におけるTNFα調節性経路を阻害する方法であって、
    該方法が、TNFα調節性経路を阻害し得る組成物を該患者の身体に導入する工
    程を包含する、方法。
  8. 【請求項8】 前記組成物が、TRAF2TRポリペプチドを発現し得る発
    現ベクターである、請求項7に記載の方法。
  9. 【請求項9】 前記組成物が、TRAF2TDポリペプチドを発現し得る発
    現ベクターである、請求項7に記載の方法。
  10. 【請求項10】 前記組成物が、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアを含有する、請求項7に記載の方法。
  11. 【請求項11】 前記組成物が、TRAF2TDポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアを含有する、請求項7に記載の方法。
  12. 【請求項12】 TNFαの過剰生成が関与する疾患を阻害する方法であっ
    て、該方法が、TNFα調節性経路を阻害し得る組成物を患者の身体に導入する
    工程を包含する、方法。
  13. 【請求項13】 前記組成物が、TRAF2TRを発現し得る発現ベクター
    を含む、請求項12に記載の方法。
  14. 【請求項14】 前記組成物が、TRAF2TDを発現し得る発現ベクター
    を含む、請求項12に記載の方法。
  15. 【請求項15】 前記組成物が、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアである、請求項12に記載の方法。
  16. 【請求項16】 前記組成物が、TRAF2TDポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアである、請求項12に記載の方法。
  17. 【請求項17】 核因子κβ(NFKB)依存性遺伝子の過剰活性化が関与
    するTNFα病理を阻害する方法であって、該方法は、TNFα調節性経路を阻
    害し得る組成物を患者に導入する工程を包含する、方法。
  18. 【請求項18】 前記組成物が、TRAF2TRを発現し得る発現ベクター
    である、請求項17に記載の方法。
  19. 【請求項19】 前記組成物が、TRAF2TDを発現し得る発現ベクター
    である、請求項17に記載の方法。
  20. 【請求項20】 前記組成物が、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアである、請求項17に記載の方法。
  21. 【請求項21】 前記組成物が、TRAF2TDポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアである、請求項17に記載の方法。
  22. 【請求項22】 TNFαが関与する炎症性プロセスを阻害する方法であっ
    て、該方法は、TNFα調節性経路を阻害し得る組成物を患者の身体に導入する
    工程を包含する、方法。
  23. 【請求項23】 前記組成物が、TRAF2TRを発現し得る発現ベクター
    である、請求項22に記載の方法。
  24. 【請求項24】 前記組成物が、TRAF2TDを発現し得る発現ベクター
    である、請求項22に記載の方法。
  25. 【請求項25】 前記組成物が、TRAF2TRポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアである、請求項22に記載の方法。
  26. 【請求項26】 前記組成物が、TRAF2TDポリペプチドおよび薬学的
    に受容可能なキャリアである、請求項22に記載の方法。
  27. 【請求項27】 前記TNFαが関与する炎症性プロセスが、クーロン病、
    乾癬、慢性関節リウマチ、対宿主性移植片病、炎症性腸疾患、非インスリン依存
    性糖尿病および神経変性疾患からなる群より選択される、請求項22に記載の方
    法。
  28. 【請求項28】 前記TNFαが関与する炎症性プロセスが、心臓血管性疾
    患である、請求項22に記載の方法。
  29. 【請求項29】 前記心臓血管性疾患が、(a)心筋梗塞後の心臓虚血性再
    灌流傷害、冠状動脈バイパス手術、心臓移植、または発作後のCNSにおける虚
    血性再灌流傷害;(b)進行性冠動脈アテローム硬化斑の進行および破裂;(c
    )うっ血性心不全の発症および進行;(d)バルーン血管形成術後の内皮細胞傷
    害;ならびに(e)心筋細胞のアポトーシス性細胞死からなる群より選択される
    、請求項28に記載の方法。
  30. 【請求項30】 TRAF2TR/2TD改変体をコードするDNA配列。
  31. 【請求項31】 前記DNA配列が、保存的アミノ酸置換を含む、請求項3
    0に記載のDNA配列。
  32. 【請求項32】 TNFα調節性経路を阻害し得るTRAF2TR/2TD
    改変体ポリペプチド。
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