JP2002539796A - 腫瘍細胞誘導転写因子の制御の下にある毒素遺伝子を含む抗新生物ウイルス剤 - Google Patents
腫瘍細胞誘導転写因子の制御の下にある毒素遺伝子を含む抗新生物ウイルス剤Info
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Abstract
(57)【要約】
1種類またはそれ以上の野生型転写因子結合部位の代わりに1種類またはそれ以上の腫瘍特異的転写因子結合部位を、ウイルスの核酸複製を司る早期遺伝子の発現を制御するプロモーター領域に作動的に位置して有するウイルスDNA構築体、及びそれらによってコードされるウイルスが提供される。好ましい構築体は、腫瘍特異的転写因子結合部位をDNAポリメラーゼ、DNA末端タンパク質及び/又はDNA結合タンパク質に対して作動的に配置する。好ましくは治療において用いるための、組成物及びそこに含まれる構築体が提供される。新生物患者の治療方法も提供される。
Description
【0001】 本発明は新生物、例えば腫瘍、特には結腸細胞から誘導される腫瘍、さらには
結腸細胞原発性腫瘍の転移である肝臓腫瘍の治療に用途があるウイルス剤を提供
する。特には、腫瘍細胞中に存在する転写活性化因子に応答して選択的に複製す
る複製が効率的なアデノウイルスが提供され、これらの因子は他の細胞と比較し
て腫瘍細胞中に排他的に、又は高レベルで存在し、したがって、腫瘍細胞の死及
び細胞溶解につながる。
結腸細胞原発性腫瘍の転移である肝臓腫瘍の治療に用途があるウイルス剤を提供
する。特には、腫瘍細胞中に存在する転写活性化因子に応答して選択的に複製す
る複製が効率的なアデノウイルスが提供され、これらの因子は他の細胞と比較し
て腫瘍細胞中に排他的に、又は高レベルで存在し、したがって、腫瘍細胞の死及
び細胞溶解につながる。
【0002】 これらのウイルス剤を肝臓に局所的に注射することにより、結腸癌患者におけ
る罹患の主因である肝臓転移を治療することが可能である。これを越えて、例え
ば、他の部位及び他の腫瘍、例えば、結腸直腸癌及びメラノーマまでの適用も提
供される。
る罹患の主因である肝臓転移を治療することが可能である。これを越えて、例え
ば、他の部位及び他の腫瘍、例えば、結腸直腸癌及びメラノーマまでの適用も提
供される。
【0003】 結腸癌はほとんどの患者において局所的に進行した、又は転移性の疾患と共に
存在する。大部分の患者は、原発性腫瘍の切除後の唯一の疾患部位として肝臓転
移を有したままである。部分的な肝臓の切除で治癒するのは患者の約10%のみ
であり、これに対して両肝臓葉に多発性の転移を伴う患者においては切除は不可
能であり、化学療法での領域移動(loco-regional)又は全身治療が指示される
(Labiancaら、1997)。5−フルオロウラシル及びロイコボリンもしくはイリノ
テカンを用いる全身化学療法で生じる応答率は僅か20%である(Cunninghamら
、1998;Stuppら、1998)。
存在する。大部分の患者は、原発性腫瘍の切除後の唯一の疾患部位として肝臓転
移を有したままである。部分的な肝臓の切除で治癒するのは患者の約10%のみ
であり、これに対して両肝臓葉に多発性の転移を伴う患者においては切除は不可
能であり、化学療法での領域移動(loco-regional)又は全身治療が指示される
(Labiancaら、1997)。5−フルオロウラシル及びロイコボリンもしくはイリノ
テカンを用いる全身化学療法で生じる応答率は僅か20%である(Cunninghamら
、1998;Stuppら、1998)。
【0004】 肝臓の領域移動化学療法は15年にわたって調査されている。ほとんどの肝臓
転移は肝動脈によって血液と共に供給され、したがって、動脈内肝化学療法(I
AHC)が転移を細胞毒性薬物により多く露出することを可能にする。正常肝臓
の高い抽出率は全身の薬物濃度を減少させ、それが60%を上回る応答率が繰り
返し示されているIAHCでの低い毒性を生じる(Kemenyら、1987;Kemenyら、
1992;Patt及びMavligit、1991)。
転移は肝動脈によって血液と共に供給され、したがって、動脈内肝化学療法(I
AHC)が転移を細胞毒性薬物により多く露出することを可能にする。正常肝臓
の高い抽出率は全身の薬物濃度を減少させ、それが60%を上回る応答率が繰り
返し示されているIAHCでの低い毒性を生じる(Kemenyら、1987;Kemenyら、
1992;Patt及びMavligit、1991)。
【0005】 腫瘍細胞に特定の欠陥が正常細胞に害を及ぼすことなく腫瘍細胞を標的とする
ための合理的な方策をたてることを可能にする。抗血管形成治療を除いて、これ
は通常腫瘍細胞への外来性DNAの導入を必要とし、これを行うための最も効率
的な方法はウイルスを用いるものである。例えば、US 5,698,443 には、前立腺
癌細胞を標的とする腫瘍特異的アデノウイルスが記載されている。このウイルス
はウイルスE1遺伝子を駆動する前立腺特異的エンハンサー配列を利用しており
、この特許は標的細胞内での毒素の特異的な発現へのその使用を示唆している。
ための合理的な方策をたてることを可能にする。抗血管形成治療を除いて、これ
は通常腫瘍細胞への外来性DNAの導入を必要とし、これを行うための最も効率
的な方法はウイルスを用いるものである。例えば、US 5,698,443 には、前立腺
癌細胞を標的とする腫瘍特異的アデノウイルスが記載されている。このウイルス
はウイルスE1遺伝子を駆動する前立腺特異的エンハンサー配列を利用しており
、この特許は標的細胞内での毒素の特異的な発現へのその使用を示唆している。
【0006】 腫瘍細胞において選択的に複製するウイルスは癌の遺伝子治療の大きな可能性
を有する。原理的には、選択的に複製する細胞毒性ウイルスは腫瘍全体にわたっ
てその細胞の全てが破壊されるまで漸次広がることができる。これは、従来の置
換遺伝子治療に対する主な制限である、ウイルスを注射したときに全ての腫瘍細
胞に感染させる必要性を克服する。なぜならば、原理的には、ウイルスは残留す
る腫瘍細胞がなくなるまで産生され続け、新たなウイルスの放出と同時に細胞を
溶解するためである。したがって、癌遺伝子治療との重要な基本的な相違は、非
複製性ウイルスを用いる単ヒットアプローチと複製性ウイルスを用いる多ヒット
アプローチとの間にある。
を有する。原理的には、選択的に複製する細胞毒性ウイルスは腫瘍全体にわたっ
てその細胞の全てが破壊されるまで漸次広がることができる。これは、従来の置
換遺伝子治療に対する主な制限である、ウイルスを注射したときに全ての腫瘍細
胞に感染させる必要性を克服する。なぜならば、原理的には、ウイルスは残留す
る腫瘍細胞がなくなるまで産生され続け、新たなウイルスの放出と同時に細胞を
溶解するためである。したがって、癌遺伝子治療との重要な基本的な相違は、非
複製性ウイルスを用いる単ヒットアプローチと複製性ウイルスを用いる多ヒット
アプローチとの間にある。
【0007】 単ヒットアプローチは腫瘍細胞に毒性遺伝子を直接形質導入することによって
作用する;バイスタンダー効果(bystander effects)を無視すると、1つのウ
イルス粒子が1つの細胞を殺す。例には腫瘍サプレッサー遺伝子の発現の回復及
び腫瘍特異的プロモーターを用いる毒素の条件発現が含まれる。単ヒットアプロ
ーチについては、注入されるウイルスの量が重要な制限因子である。多ヒットア
プローチは、腫瘍細胞に対する免疫反応を刺激するか、又は腫瘍内で複製するウ
イルスを用いることによってこの制限を回避する。大部分の腫瘍細胞は注入され
たウイルスそれ自体では殺されないため、注入されるウイルスの量は治療応答を
制限する重要な因子ではないはずである。
作用する;バイスタンダー効果(bystander effects)を無視すると、1つのウ
イルス粒子が1つの細胞を殺す。例には腫瘍サプレッサー遺伝子の発現の回復及
び腫瘍特異的プロモーターを用いる毒素の条件発現が含まれる。単ヒットアプロ
ーチについては、注入されるウイルスの量が重要な制限因子である。多ヒットア
プローチは、腫瘍細胞に対する免疫反応を刺激するか、又は腫瘍内で複製するウ
イルスを用いることによってこの制限を回避する。大部分の腫瘍細胞は注入され
たウイルスそれ自体では殺されないため、注入されるウイルスの量は治療応答を
制限する重要な因子ではないはずである。
【0008】 古典的な遺伝子置換治療はp53を発現するレトロウイルスを用いて行われて
いる(Rothら、1996)。p53は読み取り枠の500を越える部位での突然変異
によってその癌遺伝子形態に変換され得るため(Flamanら、1994)、レトロウイ
ルスの突然変異は少なくとも1%の形質導入p53をそのような望ましくない変
異体形態に変換する。これは、各々の患者が、約2,500万の変異体p53を
発現するウイルスの感染性ユニットを受けていたことを意味する(Estreicher及
びIggo、1996)。
いる(Rothら、1996)。p53は読み取り枠の500を越える部位での突然変異
によってその癌遺伝子形態に変換され得るため(Flamanら、1994)、レトロウイ
ルスの突然変異は少なくとも1%の形質導入p53をそのような望ましくない変
異体形態に変換する。これは、各々の患者が、約2,500万の変異体p53を
発現するウイルスの感染性ユニットを受けていたことを意味する(Estreicher及
びIggo、1996)。
【0009】 アデノウイルスAd−CMV−p53を用いて野生型p53を発現させること
により有望なアプローチが頭部及び頸部癌において臨床的に示されており、現在
は肺、結腸及び肝臓癌において研究中である(Claymanら、1998)。アデノウイ
ルスは比較的安定であり、高力価で産生させることが可能であり、かつ多くの異
なる型の静止状態細胞及び分割細胞の両者に感染することができる。全体的には
、Ad−CMV−p53は例外的に非毒性ではあるが、おそらくは単一の剤とし
ては無効であるものと思われる;したがって、より攻撃的な第2世代ウイルスの
余地がある。
により有望なアプローチが頭部及び頸部癌において臨床的に示されており、現在
は肺、結腸及び肝臓癌において研究中である(Claymanら、1998)。アデノウイ
ルスは比較的安定であり、高力価で産生させることが可能であり、かつ多くの異
なる型の静止状態細胞及び分割細胞の両者に感染することができる。全体的には
、Ad−CMV−p53は例外的に非毒性ではあるが、おそらくは単一の剤とし
ては無効であるものと思われる;したがって、より攻撃的な第2世代ウイルスの
余地がある。
【0010】 さらなる標的特異的な欠陥は、G1/S制御の喪失を生じる網膜芽細胞腫経路
におけるp16、cdk4、サイクリンD又はRbの突然変異(Bartekら、1997
)であり、本質的に全ての腫瘍がこれらを有する。唯一の重要な例外が結腸癌で
あり、Rb経路における突然変異それ自体が希である。これらの欠陥の正味の結
果はE2F活性の増加であり、これはE2Fによって調節されるプロモーターか
ら毒性遺伝子を発現するウイルスがその腫瘍を選択的に標的とし得ることを意味
する。これは、そのようなプロモーターからHSVチミジンキナーゼ遺伝子を発
現するアデノウイルスを用いて示されている(Parrら、1997);Rb経路の突然
変異を含む細胞はtkを発現し、ガンシクロビルで殺すことができる。このよう
なアプローチは腫瘍細胞内での特定の転写因子の活性の増加を頼りにしている。
におけるp16、cdk4、サイクリンD又はRbの突然変異(Bartekら、1997
)であり、本質的に全ての腫瘍がこれらを有する。唯一の重要な例外が結腸癌で
あり、Rb経路における突然変異それ自体が希である。これらの欠陥の正味の結
果はE2F活性の増加であり、これはE2Fによって調節されるプロモーターか
ら毒性遺伝子を発現するウイルスがその腫瘍を選択的に標的とし得ることを意味
する。これは、そのようなプロモーターからHSVチミジンキナーゼ遺伝子を発
現するアデノウイルスを用いて示されている(Parrら、1997);Rb経路の突然
変異を含む細胞はtkを発現し、ガンシクロビルで殺すことができる。このよう
なアプローチは腫瘍細胞内での特定の転写因子の活性の増加を頼りにしている。
【0011】 腫瘍ターゲッティングの合理的な基礎はp53よりも非複製性E2Fターゲッ
ティングウイルスについてより良好に理解されるが、両者は依然として単ヒット
アプローチであり、いったい如何にしてそれらを局所疾患の治療以上のものに用
いることができるのかを理解するのは非常に困難である。後期疾患における腫瘍
負荷は約1012細胞であり、したがって、1つの治療を有効感染効率で実施する
ことは可能ではあるが、体内分布及び受容体の問題が意味するところはさらに大
幅に高い効率を必要とするということである。
ティングウイルスについてより良好に理解されるが、両者は依然として単ヒット
アプローチであり、いったい如何にしてそれらを局所疾患の治療以上のものに用
いることができるのかを理解するのは非常に困難である。後期疾患における腫瘍
負荷は約1012細胞であり、したがって、1つの治療を有効感染効率で実施する
ことは可能ではあるが、体内分布及び受容体の問題が意味するところはさらに大
幅に高い効率を必要とするということである。
【0012】 この制限を回避するための洗練された方法の1つは免疫系を増強して腫瘍細胞
を殺すことである。遺伝子治療ウイルスの役割は単に免疫応答を刺激又は強化す
ることである。腫瘍は新たな抗原を発現するが、癌患者においては明らかに免疫
系が腫瘍の形成を阻止できないでいるという多くの証拠が存在する。現在試みら
れている多くの技術は単一の抗原を標的とするが(例えば、メラノーマにおける
MAGA抗原に対する細胞毒性T細胞の産生)、治療の目的は複数の異なる抗原
に対する同時応答を誘発することでなければならず、これは、腫瘍における遺伝
的不安定性が意味するところが、腫瘍細胞の数が突然変異率を上回るために単一
抗原のターゲッティングが持続する応答を生成することがなさそうだということ
であるためである。したがって、免疫療法に対する獲得耐性は共通である。
を殺すことである。遺伝子治療ウイルスの役割は単に免疫応答を刺激又は強化す
ることである。腫瘍は新たな抗原を発現するが、癌患者においては明らかに免疫
系が腫瘍の形成を阻止できないでいるという多くの証拠が存在する。現在試みら
れている多くの技術は単一の抗原を標的とするが(例えば、メラノーマにおける
MAGA抗原に対する細胞毒性T細胞の産生)、治療の目的は複数の異なる抗原
に対する同時応答を誘発することでなければならず、これは、腫瘍における遺伝
的不安定性が意味するところが、腫瘍細胞の数が突然変異率を上回るために単一
抗原のターゲッティングが持続する応答を生成することがなさそうだということ
であるためである。したがって、免疫療法に対する獲得耐性は共通である。
【0013】 単ヒットの問題の魅力的な解決法は腫瘍内でウイルスを産生させることである
。これはレトロウイルス産生細胞系を腫瘍床に注入することによって達成するこ
とができ、これはグリア芽細胞腫の臨床試験において現在試験されている方策で
ある(Roth及びCristiano、1997によって概説されている)。これは洗練されて
はいるが、移植細胞の即時拒絶の回避をCNSにおける免疫特権に頼り、かつ腫
瘍ターゲッティングがレトロウイルスは非分割性の正常脳細胞には感染しないと
いう事実に依存するため、制限されたアプローチである。これは、産生されるウ
イルスそれ自体が複製適格ではなく、かつウイルスの産生が腫瘍細胞の存在より
もパッケージング細胞の生存に依存するため、腫瘍細胞特異的ウイルス複製の目
的に及ばない。
。これはレトロウイルス産生細胞系を腫瘍床に注入することによって達成するこ
とができ、これはグリア芽細胞腫の臨床試験において現在試験されている方策で
ある(Roth及びCristiano、1997によって概説されている)。これは洗練されて
はいるが、移植細胞の即時拒絶の回避をCNSにおける免疫特権に頼り、かつ腫
瘍ターゲッティングがレトロウイルスは非分割性の正常脳細胞には感染しないと
いう事実に依存するため、制限されたアプローチである。これは、産生されるウ
イルスそれ自体が複製適格ではなく、かつウイルスの産生が腫瘍細胞の存在より
もパッケージング細胞の生存に依存するため、腫瘍細胞特異的ウイルス複製の目
的に及ばない。
【0014】 プロトタイプ腫瘍選択性ウイルスはE1B 55K遺伝子を欠く欠損アデノウ
イルスである(dl 1520/ONYX 015、Bischoffら、1996)。正常
アデノウイルスにおいては55Kがp53を不活性化し、したがって、p53が
変異体である細胞においてはそれは必要ないはずである。実際には、野生型p5
3を含む多くの細胞がこのウイルスによって殺される(Heiseら、1997)。本発
明者らはテトラサイクリン調節プロモーターの下に野生型p53を含むH129
9 p53−ヌル肺カルチノーマにおいてこれを試験しており、dl 1520
が野生型p53の存在下に加えてその不在下においても複製することを見出して
いる。p53のターゲッティングに加えて、E1B 55Kは選択的なウイルス
RNAの移行に必要とされ(Shenk、1996)、p53の喪失が如何にしてこの機
能に置き換わるのかは直ちに明らかではない。現在、dl 1520がp53の
欠損を標的とするという納得のいく証拠はない(Goodrum 1997、Goodrum 1998
、Hall 1998、Rothman 1998、Turnell 1999)。
イルスである(dl 1520/ONYX 015、Bischoffら、1996)。正常
アデノウイルスにおいては55Kがp53を不活性化し、したがって、p53が
変異体である細胞においてはそれは必要ないはずである。実際には、野生型p5
3を含む多くの細胞がこのウイルスによって殺される(Heiseら、1997)。本発
明者らはテトラサイクリン調節プロモーターの下に野生型p53を含むH129
9 p53−ヌル肺カルチノーマにおいてこれを試験しており、dl 1520
が野生型p53の存在下に加えてその不在下においても複製することを見出して
いる。p53のターゲッティングに加えて、E1B 55Kは選択的なウイルス
RNAの移行に必要とされ(Shenk、1996)、p53の喪失が如何にしてこの機
能に置き換わるのかは直ちに明らかではない。現在、dl 1520がp53の
欠損を標的とするという納得のいく証拠はない(Goodrum 1997、Goodrum 1998
、Hall 1998、Rothman 1998、Turnell 1999)。
【0015】 p53発現ウイルスと同様に、化学療法及びdl 1520を用いる組み合わ
せ療法はイン・ビトロ及び異種移植片の両者においてより良好な結果をもたらす
(Heiseら、1997)。原理的には、このウイルスは残留腫瘍細胞がなくなるまで
複数回複製され、各感染細胞が103ないし104個の新たなウイルス粒子を産生
するため、投入ウイルスの量は制限されるべきではない。実際には、注入される
dl 1520ウイルスの必要量はAd−CMV−p53での治療に匹敵する。
これは、このウイルスが複製するウイルスに期待されるものほどには機能しない
ことを意味し、その理由もまたおそらく非常に複雑である。アデノウイルスは、
通常、表在粘膜感染を生じ、これは小滴含有感染細胞(droplets containing in
fected cells)によって広がる。感染細胞は子孫細胞を保持する。溶解細胞から
の有効ウイルスの放出がないことは、ウイルスが腫瘍の全ての部分に侵入する場
合の目的である深い伝播性感染の生成を妨げる。
せ療法はイン・ビトロ及び異種移植片の両者においてより良好な結果をもたらす
(Heiseら、1997)。原理的には、このウイルスは残留腫瘍細胞がなくなるまで
複数回複製され、各感染細胞が103ないし104個の新たなウイルス粒子を産生
するため、投入ウイルスの量は制限されるべきではない。実際には、注入される
dl 1520ウイルスの必要量はAd−CMV−p53での治療に匹敵する。
これは、このウイルスが複製するウイルスに期待されるものほどには機能しない
ことを意味し、その理由もまたおそらく非常に複雑である。アデノウイルスは、
通常、表在粘膜感染を生じ、これは小滴含有感染細胞(droplets containing in
fected cells)によって広がる。感染細胞は子孫細胞を保持する。溶解細胞から
の有効ウイルスの放出がないことは、ウイルスが腫瘍の全ての部分に侵入する場
合の目的である深い伝播性感染の生成を妨げる。
【0016】 E2F欠損の合理的なターゲッティングは、そのライフサイクルの一部として
アデノウイルスがE2Fを標的とするタンパク質(E1A及びE4 orf6/
7)を既に産生するという事実によって複雑化している。E1A及びorf6/
7が多機能性タンパク質であるため、E1A及びorf6/7変異体の効果は複
雑で予測不能である。
アデノウイルスがE2Fを標的とするタンパク質(E1A及びE4 orf6/
7)を既に産生するという事実によって複雑化している。E1A及びorf6/
7が多機能性タンパク質であるため、E1A及びorf6/7変異体の効果は複
雑で予測不能である。
【0017】 E2F及びp53に加えて、腫瘍内でその活性が増加することが知られる4つ
の転写因子が存在する。これらはTcf4、RBPJκ及びGli−1(これら
はwnt、ノッチ(notch)、及びヘッジホッグ(hedgehog)シグナル伝達経路
の終末点を表す(Dahmaneら、1997;Jarriaultら、1995;van de Weteringら、1
997))並びにHIF1アルファ(これは、Von Hippel Lindau腫瘍サプレッサー
遺伝子における突然変異によって安定化される(Maxwellら、1999))である。
APC又はβ−カテニンにおける突然変異は結腸癌における普遍的な欠陥である
(Korinekら、1997;Morinら、1997);しかしながら、これらは他の腫瘍、例え
ば、メラノーマにおいてもより低い頻度で生じる(Rubinfeldら、1997)。この
ような突然変異は罹患細胞におけるTcf活性の増加につながる。ヘッジホッグ
経路は基底細胞癌におけるパッチ化及び平滑化タンパク質の突然変異によって活
性化される(Stoneら、1996;Xieら、1998)。ノッチ突然変異は幾つかの白血病
において生じる(Ellisenら、1991)。テロメラーゼ活性は癌の特徴の1つであ
り(Hanahan D.及びWeinberg RA. The hallmarks of cancer. Cell. 100, 57-70
, 2000)、機構は不明ではあるが、テロメラーゼプロモーターの活性の増加から
生じる。Cong YSら(1999、HMG 8、137-42)によると、プロモーター活性を司る
要素はATGの330bp上流からその遺伝子の第2エクソンにまで延びる領域内
に含まれ、したがって、この配列は本発明のウイルス構築体及びウイルスにおけ
る使用にさらに適するプロモーター配列である。
の転写因子が存在する。これらはTcf4、RBPJκ及びGli−1(これら
はwnt、ノッチ(notch)、及びヘッジホッグ(hedgehog)シグナル伝達経路
の終末点を表す(Dahmaneら、1997;Jarriaultら、1995;van de Weteringら、1
997))並びにHIF1アルファ(これは、Von Hippel Lindau腫瘍サプレッサー
遺伝子における突然変異によって安定化される(Maxwellら、1999))である。
APC又はβ−カテニンにおける突然変異は結腸癌における普遍的な欠陥である
(Korinekら、1997;Morinら、1997);しかしながら、これらは他の腫瘍、例え
ば、メラノーマにおいてもより低い頻度で生じる(Rubinfeldら、1997)。この
ような突然変異は罹患細胞におけるTcf活性の増加につながる。ヘッジホッグ
経路は基底細胞癌におけるパッチ化及び平滑化タンパク質の突然変異によって活
性化される(Stoneら、1996;Xieら、1998)。ノッチ突然変異は幾つかの白血病
において生じる(Ellisenら、1991)。テロメラーゼ活性は癌の特徴の1つであ
り(Hanahan D.及びWeinberg RA. The hallmarks of cancer. Cell. 100, 57-70
, 2000)、機構は不明ではあるが、テロメラーゼプロモーターの活性の増加から
生じる。Cong YSら(1999、HMG 8、137-42)によると、プロモーター活性を司る
要素はATGの330bp上流からその遺伝子の第2エクソンにまで延びる領域内
に含まれ、したがって、この配列は本発明のウイルス構築体及びウイルスにおけ
る使用にさらに適するプロモーター配列である。
【0018】 今や、本発明者らはウイルスDNA構築体及びそれらによってコードされる、
好ましくは組換えウイルス構築体及びウイルスの形態の複製性ウイルスを設計及
び産生しており、これらは腫瘍における公知の原因癌遺伝子転写酵素(caus
al oncogenic transcrition)の欠陥を、ウイルス核
酸の複製に機構的に直接関与するタンパク質をコードする1つまたはそれ以上の
早期ウイルス遺伝子の転写の制御にこれらを用いることにより、合理的に標的と
する(このような遺伝子の例については、例えば、DePamphilis, ML, Concepts
in Eukaryotic DNA Replication pp 481-484 and 488-491, 1999 Cold Spring H
arbor Laboratory Press, New Yorkを参照のこと。これは参照することにより本
明細書に組み込まれる)。好ましくは、これらのウイルス遺伝子は、ポリメラー
ゼ、プリマーゼ、ヌクレアーゼ、ヘリカーゼ、リガーゼ、末端タンパク質及び核
酸結合性タンパク質遺伝子からなる群より選択される。これらの遺伝子のうちの
5つの好ましい酵素産生物は以下の Enzyme Commission分類に分類される:ポリ
メラーゼ(EC2.7.7.7)、プリマーゼ(EC2.7.7.6)、ヌクレ
アーゼ(EC3.1.11−25)、ヘリカーゼ(EC3.6.1.3)及びリ
ガーゼ(EC6.5.1.1−2)。これらの分類は、例えば、パルボウイルス
、例えばアデノ随伴ウイルス(AAV)(これらはNS1/Repタンパク質を
含む)において変化することがあり、これらは複製に必須のヌクレアーゼ及びヘ
リカーゼ活性を有する。
好ましくは組換えウイルス構築体及びウイルスの形態の複製性ウイルスを設計及
び産生しており、これらは腫瘍における公知の原因癌遺伝子転写酵素(caus
al oncogenic transcrition)の欠陥を、ウイルス核
酸の複製に機構的に直接関与するタンパク質をコードする1つまたはそれ以上の
早期ウイルス遺伝子の転写の制御にこれらを用いることにより、合理的に標的と
する(このような遺伝子の例については、例えば、DePamphilis, ML, Concepts
in Eukaryotic DNA Replication pp 481-484 and 488-491, 1999 Cold Spring H
arbor Laboratory Press, New Yorkを参照のこと。これは参照することにより本
明細書に組み込まれる)。好ましくは、これらのウイルス遺伝子は、ポリメラー
ゼ、プリマーゼ、ヌクレアーゼ、ヘリカーゼ、リガーゼ、末端タンパク質及び核
酸結合性タンパク質遺伝子からなる群より選択される。これらの遺伝子のうちの
5つの好ましい酵素産生物は以下の Enzyme Commission分類に分類される:ポリ
メラーゼ(EC2.7.7.7)、プリマーゼ(EC2.7.7.6)、ヌクレ
アーゼ(EC3.1.11−25)、ヘリカーゼ(EC3.6.1.3)及びリ
ガーゼ(EC6.5.1.1−2)。これらの分類は、例えば、パルボウイルス
、例えばアデノ随伴ウイルス(AAV)(これらはNS1/Repタンパク質を
含む)において変化することがあり、これらは複製に必須のヌクレアーゼ及びヘ
リカーゼ活性を有する。
【0019】 本発明によって産生される好ましい構築体及びウイルスにおいては、これらの
遺伝は、特には、ウイルスDNAポリメラーゼ、ウイルスDNA末端タンパク質
及び/又はウイルスDNA結合性タンパク質遺伝子である。好ましいウイルスは
、E1、E2及びE3ウイルス転写ユニットを有するもの、例えば、アデノウイ
ルスである。少なくともウイルスのE2転写ユニットが、標的腫瘍細胞内にレベ
ルが増加するかもしくは活性が増加した状態で存在し、又はその細胞内のみに存
在する要素を司るように変更されていることが特に好ましい。Rittnerら(J. Vi
rol (1997) p 3307-3311)は、主要後期読み取り枠L4との重複のため、キャッ
プ部位に近いE2プロモーターを操作することが不可能であることを教示してい
る。しかしながら、本発明者らは、この操作が実際には可能であって有利な結果
が伴うことを見出している。
遺伝は、特には、ウイルスDNAポリメラーゼ、ウイルスDNA末端タンパク質
及び/又はウイルスDNA結合性タンパク質遺伝子である。好ましいウイルスは
、E1、E2及びE3ウイルス転写ユニットを有するもの、例えば、アデノウイ
ルスである。少なくともウイルスのE2転写ユニットが、標的腫瘍細胞内にレベ
ルが増加するかもしくは活性が増加した状態で存在し、又はその細胞内のみに存
在する要素を司るように変更されていることが特に好ましい。Rittnerら(J. Vi
rol (1997) p 3307-3311)は、主要後期読み取り枠L4との重複のため、キャッ
プ部位に近いE2プロモーターを操作することが不可能であることを教示してい
る。しかしながら、本発明者らは、この操作が実際には可能であって有利な結果
が伴うことを見出している。
【0020】 したがって、RNA移行能力(export capability)又は組
換え遺伝子の挿入による毒性のような因子よりもむしろ核酸複製能力を制御する
ことにより、本発明者らが腫瘍細胞に対する細胞毒性効果の選択性を提供できる
ことが決定されている。
換え遺伝子の挿入による毒性のような因子よりもむしろ核酸複製能力を制御する
ことにより、本発明者らが腫瘍細胞に対する細胞毒性効果の選択性を提供できる
ことが決定されている。
【0021】 最も重要かつ有利なことには、本発明者らは、野生型ウイルスタンパク質のみ
をコードし、その発現が腫瘍細胞内で優先的に、又は排他的に活性化される転写
因子によって特異的に調節されるウイルスを用いて腫瘍細胞を標的とすることを
可能にしている。好ましいウイルスは野生型タンパク質のフルセットをコードす
る。このようなウイルスは、ウイルスタンパク質の突然変異又は特定の組織起源
の細胞、例えば、前立腺のターゲッティングに頼っている従来技術のウイルス剤
よりも良好な結果を得るのに用いることができる。
をコードし、その発現が腫瘍細胞内で優先的に、又は排他的に活性化される転写
因子によって特異的に調節されるウイルスを用いて腫瘍細胞を標的とすることを
可能にしている。好ましいウイルスは野生型タンパク質のフルセットをコードす
る。このようなウイルスは、ウイルスタンパク質の突然変異又は特定の組織起源
の細胞、例えば、前立腺のターゲッティングに頼っている従来技術のウイルス剤
よりも良好な結果を得るのに用いることができる。
【0022】 したがって、本発明の第1の側面においては、ヒト又は動物の腫瘍細胞型にお
いて複製が可能であり、かつその型の腫瘍細胞を死に至らしめるウイルスをコー
ドするウイルスDNA構築体であって、1種類またはそれ以上の選択された転写
因子結合部位を、早期ウイルス性タンパク質をコードする読み取り枠と共に、か
つその発現を促進するような作動的な位置に含むことを特徴とし、その読み取り
枠のタンパク質産生物がウイルス構築体の核酸複製に機構的に直接関与し、選択
された転写因子結合部位が、同じ型の正常ヒト又は動物細胞に対してヒト又は動
物腫瘍細胞においてレベル又は活性が増加している転写因子のためのものである
ウイルスDNA構築体が提供される。
いて複製が可能であり、かつその型の腫瘍細胞を死に至らしめるウイルスをコー
ドするウイルスDNA構築体であって、1種類またはそれ以上の選択された転写
因子結合部位を、早期ウイルス性タンパク質をコードする読み取り枠と共に、か
つその発現を促進するような作動的な位置に含むことを特徴とし、その読み取り
枠のタンパク質産生物がウイルス構築体の核酸複製に機構的に直接関与し、選択
された転写因子結合部位が、同じ型の正常ヒト又は動物細胞に対してヒト又は動
物腫瘍細胞においてレベル又は活性が増加している転写因子のためのものである
ウイルスDNA構築体が提供される。
【0023】 好ましい本発明の構築体は野生型ウイルスの配列に相当する核酸配列を有し、
この野生型ウイルスの配列は1つまたはそれ以上の選択された転写因子結合部位
で置換されている1つまたはそれ以上の野生型転写因子結合部位を有することを
特徴とし、これらの部位が早期遺伝子の発現を制御するプロモーター領域におい
てその遺伝子の読み取り枠の発現を促進するように作動的に位置し、それらの遺
伝子のタンパク質産生物がウイルスの核酸複製に機構的に直接関与し、 選択された転写因子結合部位は、同じ型の正常ヒト又は動物細胞に対してヒト
又は動物腫瘍細胞においてレベル又は活性が増加している転写因子のためのもの
である。
この野生型ウイルスの配列は1つまたはそれ以上の選択された転写因子結合部位
で置換されている1つまたはそれ以上の野生型転写因子結合部位を有することを
特徴とし、これらの部位が早期遺伝子の発現を制御するプロモーター領域におい
てその遺伝子の読み取り枠の発現を促進するように作動的に位置し、それらの遺
伝子のタンパク質産生物がウイルスの核酸複製に機構的に直接関与し、 選択された転写因子結合部位は、同じ型の正常ヒト又は動物細胞に対してヒト
又は動物腫瘍細胞においてレベル又は活性が増加している転写因子のためのもの
である。
【0024】 好ましくは、このウイルスDNA構築体は、前記早期遺伝子の発現を制御する
野生型転写因子部位を置換する部位が原因癌遺伝子突然変異によって活性又はレ
ベルが特異的に増加する転写因子のものであることを特徴とする。
野生型転写因子部位を置換する部位が原因癌遺伝子突然変異によって活性又はレ
ベルが特異的に増加する転写因子のものであることを特徴とする。
【0025】 制御された読み取り枠又は遺伝子はポリメラーゼ、プリマーゼ、ヌクレアーゼ
、ヘリカーゼ及びリガーゼのうちの1つまたはそれ以上であり得るが、好ましく
は、それらはDNAポリメラーゼ、DNA末端タンパク質及び/又はDNA結合
タンパク質のうちの1つまたはそれ以上である。より好ましくは、構築体又はウ
イルスは、E1、E2及びE3領域を有し、かつ腫瘍特異的転写因子結合部位が
野生型E2転写因子結合部位を置換しているようなものである。
、ヘリカーゼ及びリガーゼのうちの1つまたはそれ以上であり得るが、好ましく
は、それらはDNAポリメラーゼ、DNA末端タンパク質及び/又はDNA結合
タンパク質のうちの1つまたはそれ以上である。より好ましくは、構築体又はウ
イルスは、E1、E2及びE3領域を有し、かつ腫瘍特異的転写因子結合部位が
野生型E2転写因子結合部位を置換しているようなものである。
【0026】 好ましくは、ウイルスDNA構築体は、機能的ウイルスRNA移行能力をコー
ドすることを特徴とする。アデノウイルスについては、これはE1及びE4領域
、特にはE1B 55K及びE4 orf6遺伝子においてコードされる。した
がって、好ましくは、エンコードされたウイルスは、腫瘍細胞におけるこれらの
遺伝子の発現に関して野生型のものである。最も好ましくは、E1B 55K及
びE4 orf6読み取り枠は、対応する野生型ウイルス内に存在する場合、機
能的及び/又は無傷(intact)である。
ドすることを特徴とする。アデノウイルスについては、これはE1及びE4領域
、特にはE1B 55K及びE4 orf6遺伝子においてコードされる。した
がって、好ましくは、エンコードされたウイルスは、腫瘍細胞におけるこれらの
遺伝子の発現に関して野生型のものである。最も好ましくは、E1B 55K及
びE4 orf6読み取り枠は、対応する野生型ウイルス内に存在する場合、機
能的及び/又は無傷(intact)である。
【0027】 腫瘍細胞に対して潜在的に毒性であるあらゆるウイルスを本発明のウイルス構
築体の産生において用いることができることを当業者は理解するであろう。特に
は、その例にはアデノウイルス、レンチウイルス、ポリオーマウイルス、ワクチ
ニアウイルス、ヘルペスウイルス及びパルボウイルスが含まれ得る。好ましくは
、ウイルスはアデノウイルスであり、より好ましくは、標的腫瘍細胞型、例えば
、結腸腫瘍型に対する高い特異性を有するアデノウイルスである。
築体の産生において用いることができることを当業者は理解するであろう。特に
は、その例にはアデノウイルス、レンチウイルス、ポリオーマウイルス、ワクチ
ニアウイルス、ヘルペスウイルス及びパルボウイルスが含まれ得る。好ましくは
、ウイルスはアデノウイルスであり、より好ましくは、標的腫瘍細胞型、例えば
、結腸腫瘍型に対する高い特異性を有するアデノウイルスである。
【0028】 好ましい結腸腫瘍特異的アデノウイルスは、Ad5又は上述の通りに改変され
た腸内アデノウイルスAd40及びAd41のうちの1種類またはそれ以上のD
NA配列に対応するウイルスDNA構築体によってコードされる。Ad40及び
Ad41(これらはATCCから入手可能である)は結腸細胞について選択的で
あり、Ad5との重要な相違の1つはさらなる線維タンパク質が存在することで
ある。この線維タンパク質は、Ad5についてはコクサッキー・アデノ受容体(
coxsackie-adeno receptor)もしくはCARと呼ばれる細胞表面受容体に結合す
る。結腸細胞はAd5が感染に適合する肺細胞よりもCARが少ない。Ad40
及びAd41は2種類の線維タンパク質を有し、それらが2種類の異なる受容体
を用いることができる可能性を伴う。ウイルス療法に対する予想される耐性形態
は受容体の喪失であり、これは明らかに感染を妨げる。腫瘍における遺伝的不安
定性はこれが幾らか合理的な頻度で生じることを意味する;1億個の細胞中に約
1個、108中1の突然変異率。2種類の受容体を欠失させなければならない場
合、この確率を掛け合わせる;すなわち、両者の喪失は1016個の細胞中1個で
生じる。腫瘍は109ないし1012個の細胞を含む。したがって、ウイルスが2
種類以上の受容体を用いる場合、耐性が発生することはほとんどありそうもない
。Ad40及び41における線維タンパク質の一方はCARを用いるが、他方に
よって用いられる受容体は未だに不明である。
た腸内アデノウイルスAd40及びAd41のうちの1種類またはそれ以上のD
NA配列に対応するウイルスDNA構築体によってコードされる。Ad40及び
Ad41(これらはATCCから入手可能である)は結腸細胞について選択的で
あり、Ad5との重要な相違の1つはさらなる線維タンパク質が存在することで
ある。この線維タンパク質は、Ad5についてはコクサッキー・アデノ受容体(
coxsackie-adeno receptor)もしくはCARと呼ばれる細胞表面受容体に結合す
る。結腸細胞はAd5が感染に適合する肺細胞よりもCARが少ない。Ad40
及びAd41は2種類の線維タンパク質を有し、それらが2種類の異なる受容体
を用いることができる可能性を伴う。ウイルス療法に対する予想される耐性形態
は受容体の喪失であり、これは明らかに感染を妨げる。腫瘍における遺伝的不安
定性はこれが幾らか合理的な頻度で生じることを意味する;1億個の細胞中に約
1個、108中1の突然変異率。2種類の受容体を欠失させなければならない場
合、この確率を掛け合わせる;すなわち、両者の喪失は1016個の細胞中1個で
生じる。腫瘍は109ないし1012個の細胞を含む。したがって、ウイルスが2
種類以上の受容体を用いる場合、耐性が発生することはほとんどありそうもない
。Ad40及び41における線維タンパク質の一方はCARを用いるが、他方に
よって用いられる受容体は未だに不明である。
【0029】 有利なことに、本発明の構築体の、好ましくはそれらによってコードされるウ
イルスの形態での、肝臓転移の治療への使用は、肝臓内でのウイルスの良好な伝
播が効率的な複製によって補助されるのであれば、化学療法と比較して比較的非
毒性である。
イルスの形態での、肝臓転移の治療への使用は、肝臓内でのウイルスの良好な伝
播が効率的な複製によって補助されるのであれば、化学療法と比較して比較的非
毒性である。
【0030】 好ましい本発明のウイルス構築体はアデノウイルス又はパルボウイルスゲノム
DNA、より好ましくはアデノウイルスゲノムDNAから誘導され、E2ウイル
ス転写ユニットによってコードされる必須ウイルス遺伝子の転写が腫瘍細胞にお
ける癌遺伝子突然変異の存在に依存するように突然変異を受ける。好ましくは、
これらの癌遺伝子突然変異を含む細胞のみがウイルスE2遺伝子の転写を活性化
することができる。E2ユニットはウイルスDNAポリメラーゼ、DNA末端タ
ンパク質及びDNA結合タンパク質をコードするため、このウイルスは腫瘍細胞
においてのみ複製することができる。E2早期プロモーター転写因子結合部位が
腫瘍細胞特異的転写因子結合部位によって置換されていることが好ましい。
DNA、より好ましくはアデノウイルスゲノムDNAから誘導され、E2ウイル
ス転写ユニットによってコードされる必須ウイルス遺伝子の転写が腫瘍細胞にお
ける癌遺伝子突然変異の存在に依存するように突然変異を受ける。好ましくは、
これらの癌遺伝子突然変異を含む細胞のみがウイルスE2遺伝子の転写を活性化
することができる。E2ユニットはウイルスDNAポリメラーゼ、DNA末端タ
ンパク質及びDNA結合タンパク質をコードするため、このウイルスは腫瘍細胞
においてのみ複製することができる。E2早期プロモーター転写因子結合部位が
腫瘍細胞特異的転写因子結合部位によって置換されていることが好ましい。
【0031】 野生型部位の代わりに用いられる好ましい腫瘍特異的転写因子結合部位は、T
cf−4、HIF1アルファ、RBPJκ及びGli−1部位として上述される
もの、並びに腫瘍特異的転写を付与するテロメラーゼプロモーターの断片である
。最も好ましい転写因子結合部位は、US 5,851,775においてVogelsteinらによっ
て記載されるようにTcf−4に結合し、かつヘテロダイマーβ−カテニン/T
cf−4転写因子を司るものである。そのようなものとして、この転写因子結合
部位は、APC又はβ−カテニンの突然変異によって生じるβ−カテニンのレベ
ルの増加に応答して遺伝子の転写を増加させる。テロメラーゼプロモーターはWu
KJ.ら(1999, Nat Genet 21, 220-4)及びCong YS.ら(1999, HumMol Genet 8,
137-42)によって記載されている。さらに好ましい結合部位は、Maxwell PH.ら
(1999, Nature 399, 271-5)によって記載されるように、HIF1アルファの
ものである。HIF1アルファ調節ウイルスを、低酸素症に対する正常な生理学
的応答であるために経路に突然変異がない腫瘍の低酸素領域を標的とするのに用
いることができ、又は同じウイルスを家族性VHL癌症候群又は散発性腎細胞カ
ルチノーマ(これもVHL突然変異を有する)のいずれかにおいてVHL突然変
異を有する細胞を標的とするのに用いることができる。虚血において低酸素症を
標的とするのにHIFプロモーターを用いるレトロウイルスがBoast K.ら(1999
Hum Gene Ther 10, 2197-208)によって既に記載されている。
cf−4、HIF1アルファ、RBPJκ及びGli−1部位として上述される
もの、並びに腫瘍特異的転写を付与するテロメラーゼプロモーターの断片である
。最も好ましい転写因子結合部位は、US 5,851,775においてVogelsteinらによっ
て記載されるようにTcf−4に結合し、かつヘテロダイマーβ−カテニン/T
cf−4転写因子を司るものである。そのようなものとして、この転写因子結合
部位は、APC又はβ−カテニンの突然変異によって生じるβ−カテニンのレベ
ルの増加に応答して遺伝子の転写を増加させる。テロメラーゼプロモーターはWu
KJ.ら(1999, Nat Genet 21, 220-4)及びCong YS.ら(1999, HumMol Genet 8,
137-42)によって記載されている。さらに好ましい結合部位は、Maxwell PH.ら
(1999, Nature 399, 271-5)によって記載されるように、HIF1アルファの
ものである。HIF1アルファ調節ウイルスを、低酸素症に対する正常な生理学
的応答であるために経路に突然変異がない腫瘍の低酸素領域を標的とするのに用
いることができ、又は同じウイルスを家族性VHL癌症候群又は散発性腎細胞カ
ルチノーマ(これもVHL突然変異を有する)のいずれかにおいてVHL突然変
異を有する細胞を標的とするのに用いることができる。虚血において低酸素症を
標的とするのにHIFプロモーターを用いるレトロウイルスがBoast K.ら(1999
Hum Gene Ther 10, 2197-208)によって既に記載されている。
【0032】 特には、本発明者らは今や、上述の早期遺伝子読み取り枠と作動上の関係(o
perational relationship)にある上で言及されるTc
f転写因子結合部位を、特には野生型転写因子結合部位の代わりにE2プロモー
ターに含むウイルスDNA構築体、及びそれらによってコードされるウイルスを
提供し、これらが癌遺伝子APC及びβ−カテニン突然変異を含む腫瘍細胞に対
して選択的であることを示している。Tcf−4及びそのヘテロダイマーは本明
細書でTcfと呼ばれる部位に結合する。好ましいそのような置換部位は、例え
ば2ないし20、より好ましくは2ないし6、最も好都合には2、3又は4つの
Tcf部位を含む、単一もしくは複数のTcf結合配列である。
perational relationship)にある上で言及されるTc
f転写因子結合部位を、特には野生型転写因子結合部位の代わりにE2プロモー
ターに含むウイルスDNA構築体、及びそれらによってコードされるウイルスを
提供し、これらが癌遺伝子APC及びβ−カテニン突然変異を含む腫瘍細胞に対
して選択的であることを示している。Tcf−4及びそのヘテロダイマーは本明
細書でTcfと呼ばれる部位に結合する。好ましいそのような置換部位は、例え
ば2ないし20、より好ましくは2ないし6、最も好都合には2、3又は4つの
Tcf部位を含む、単一もしくは複数のTcf結合配列である。
【0033】 特別なTcf部位はコンセンサス配列(A/T)(A/T)CAA(A/T)GGを有す
るもの(Roose, J., and Clevers, H. (1999 Biochim Biophys Acta 1424, M23-
37)を参照)であるが、より好ましくは本明細書で例に示される通りである。
るもの(Roose, J., and Clevers, H. (1999 Biochim Biophys Acta 1424, M23-
37)を参照)であるが、より好ましくは本明細書で例に示される通りである。
【0034】 より好ましい本発明のウイルス構築体及びウイルスはE3ドメインを有するも
のであり、E3プロモーターのNF1、NFκB、AP1及び/又はATF領域
内の1つまたはそれ以上の残基に突然変異を有し、より好ましくはE3プロモー
ターの活性によって生じるE2遺伝子の転写を減少させる突然変異を有すること
を特徴とする。本発明者らは、特には、沈黙突然変異を提供しており、これらは
あらゆるウイルス性タンパク質の推定タンパク質配列を変更せず、鍵となるウイ
ルス性タンパク質の活性を変更するようなものである。
のであり、E3プロモーターのNF1、NFκB、AP1及び/又はATF領域
内の1つまたはそれ以上の残基に突然変異を有し、より好ましくはE3プロモー
ターの活性によって生じるE2遺伝子の転写を減少させる突然変異を有すること
を特徴とする。本発明者らは、特には、沈黙突然変異を提供しており、これらは
あらゆるウイルス性タンパク質の推定タンパク質配列を変更せず、鍵となるウイ
ルス性タンパク質の活性を変更するようなものである。
【0035】 NFκBは再生肝細胞(regenerating liver cells)、すなわち、肝細胞(he
patocytes)において強力に誘導される(Brenner et al J. Clin. Invest. 101
p802-811)。腫瘍によって空けられた空間を充填する肝臓の再生は転移の治療の
成功に続いて生じるように思われる。加えて、正常肝細胞の分割の裏で生じる肝
臓癌を治療しようと願う場合、NFκB部位の破壊が潜在的に有利である。
patocytes)において強力に誘導される(Brenner et al J. Clin. Invest. 101
p802-811)。腫瘍によって空けられた空間を充填する肝臓の再生は転移の治療の
成功に続いて生じるように思われる。加えて、正常肝細胞の分割の裏で生じる肝
臓癌を治療しようと願う場合、NFκB部位の破壊が潜在的に有利である。
【0036】 本発明の第1の側面の好ましい態様において、本発明者らは、コーディング配
列が重複していないE2早期プロモーターの短領域を複数のTcf結合部位、よ
り好ましくは3つもしくは4つのそのような部位、最も好ましくは4つの部位で
置換している。その結果生じる好ましいウイルス構築体の1つ及びコードされた
ウイルスを本明細書ではAd−Tcf3(3つのそのような部位を有する)と呼
び、これらのウイルスはE2遺伝子産生物を発現し、かつ肺腫瘍細胞よりも結腸
においてより良好に複製する(実施例を参照)。これは、記述される型の突然変
異が、ウイルスのライフサイクルの他の側面に対する都合の悪い効果なしに、E
2プロモーターの活性を望ましい方法で改変し得ることを示す。これは経験的に
は明らかなものではなく、それは、E2プロモーターをコードすることに加えて
、この領域がpVIIIタンパク質RNAの5’−非翻訳領域においては転写されて
そこに保持され、L5後期RNAでは転写されるがスプライスで除外され、かつ
33kタンパク質RNAの3’−非翻訳領域の一部を形成するためである。
列が重複していないE2早期プロモーターの短領域を複数のTcf結合部位、よ
り好ましくは3つもしくは4つのそのような部位、最も好ましくは4つの部位で
置換している。その結果生じる好ましいウイルス構築体の1つ及びコードされた
ウイルスを本明細書ではAd−Tcf3(3つのそのような部位を有する)と呼
び、これらのウイルスはE2遺伝子産生物を発現し、かつ肺腫瘍細胞よりも結腸
においてより良好に複製する(実施例を参照)。これは、記述される型の突然変
異が、ウイルスのライフサイクルの他の側面に対する都合の悪い効果なしに、E
2プロモーターの活性を望ましい方法で改変し得ることを示す。これは経験的に
は明らかなものではなく、それは、E2プロモーターをコードすることに加えて
、この領域がpVIIIタンパク質RNAの5’−非翻訳領域においては転写されて
そこに保持され、L5後期RNAでは転写されるがスプライスで除外され、かつ
33kタンパク質RNAの3’−非翻訳領域の一部を形成するためである。
【0037】 Ad−Tcf3は肺腫瘍細胞よりも結腸においてより良好に複製するが、その
差は約10倍だけである。Ad−Tcf3におけるE2突然変異をE1B 55
K欠失と組み合わせた本発明のウイルスであるLGCは、約1000倍の結腸癌
細胞に対する選択性を示す。正常E2プロモーターを有する同一のウイルス(L
GM)は結腸細胞に対する特異性を示さないため、これはE2プロモーターの活
性をウイルスの複製のために制限できることを示す。E2プロモーターの活性を
滴定することによって結腸特異的ウイルスを作製できることを意味することから
、これは結腸ターゲッティング策のために重要な結果である、 LGCの選択性の有望な説明は、E1B 55kタンパク質がE2 DBP後
期RNAを含む後期ウイルスRNAの核外移行に必要であり、かつE2プロモー
ターにおいて正常転写因子結合部位の代わりにTcf部位を挿入することによっ
てE2 RNA産生物を増加させることにより、E1B 55K不全ウイルスに
おけるE2 RNA移行の欠陥を克服することができるというものである。
差は約10倍だけである。Ad−Tcf3におけるE2突然変異をE1B 55
K欠失と組み合わせた本発明のウイルスであるLGCは、約1000倍の結腸癌
細胞に対する選択性を示す。正常E2プロモーターを有する同一のウイルス(L
GM)は結腸細胞に対する特異性を示さないため、これはE2プロモーターの活
性をウイルスの複製のために制限できることを示す。E2プロモーターの活性を
滴定することによって結腸特異的ウイルスを作製できることを意味することから
、これは結腸ターゲッティング策のために重要な結果である、 LGCの選択性の有望な説明は、E1B 55kタンパク質がE2 DBP後
期RNAを含む後期ウイルスRNAの核外移行に必要であり、かつE2プロモー
ターにおいて正常転写因子結合部位の代わりにTcf部位を挿入することによっ
てE2 RNA産生物を増加させることにより、E1B 55K不全ウイルスに
おけるE2 RNA移行の欠陥を克服することができるというものである。
【0038】 本発明のAdTcf3、及び類似の3×Tcf誘導E2ウイルスの結腸腫瘍に
対する選択性を増加させるための方法の1つは、非結腸細胞におけるそのE2プ
ロモーター活性を減少させることである。これを行うための可能性のある方法の
1つは、Tcf部位の数を変更することである。Tcf部位の数を2つに減少さ
せることで非特異的膜透過性異常を減少させることができるが、非結腸細胞にお
いてはTcfプロモーターがグルーチョ(groucho)(Fisher及びCaudy、1998)
及びアセチル化(Waltzer、1998)によって積極的に抑制されるため、おそらく
はその部位を増加させることでプロモーターのより厳密な調節がもたらされる。
これは、その部位が多ければ多いほどより多くのリプレッサーが非結腸細胞にお
いて結合するためである。
対する選択性を増加させるための方法の1つは、非結腸細胞におけるそのE2プ
ロモーター活性を減少させることである。これを行うための可能性のある方法の
1つは、Tcf部位の数を変更することである。Tcf部位の数を2つに減少さ
せることで非特異的膜透過性異常を減少させることができるが、非結腸細胞にお
いてはTcfプロモーターがグルーチョ(groucho)(Fisher及びCaudy、1998)
及びアセチル化(Waltzer、1998)によって積極的に抑制されるため、おそらく
はその部位を増加させることでプロモーターのより厳密な調節がもたらされる。
これは、その部位が多ければ多いほどより多くのリプレッサーが非結腸細胞にお
いて結合するためである。
【0039】 E1Aは、通常、ATF部位を介してE2プロモーターを活性化する。そのよ
うなターゲッティングがない状態においては、例えばp300/CBPをキレー
ト化することにより、E1Aはプロモーターを抑制する。Tcf変異体E2プロ
モーターにおいてはこのATF部位が欠失しているため、このウイルスによって
産生されるE1Aは全ての細胞型において変異体E2プロモーターの一般的な膜
透過性異常を減少させるはずである。E3プロモーターはE2プロモーターと背
中合わせであり、それらの区別は定義されるが機能的には任意である。したがっ
て、E3プロモーターにおける転写因子結合部位を修飾又は欠失させることによ
り、変異体E2プロモーターの活性をさらに減少させることが可能である。E3
プロモーターはコーディング配列内にあるため、欠失させることはできない。そ
の代わりに、本発明者らは、公知NF1、NFκB、AP1及びATF部位(Hu
rst and Jones, 1987, Genes Dev 1, 1132-46、参考文献として本明細書中に援
用される)内の重要な残基を変更する16までの沈黙置換をもたらしている。
うなターゲッティングがない状態においては、例えばp300/CBPをキレー
ト化することにより、E1Aはプロモーターを抑制する。Tcf変異体E2プロ
モーターにおいてはこのATF部位が欠失しているため、このウイルスによって
産生されるE1Aは全ての細胞型において変異体E2プロモーターの一般的な膜
透過性異常を減少させるはずである。E3プロモーターはE2プロモーターと背
中合わせであり、それらの区別は定義されるが機能的には任意である。したがっ
て、E3プロモーターにおける転写因子結合部位を修飾又は欠失させることによ
り、変異体E2プロモーターの活性をさらに減少させることが可能である。E3
プロモーターはコーディング配列内にあるため、欠失させることはできない。そ
の代わりに、本発明者らは、公知NF1、NFκB、AP1及びATF部位(Hu
rst and Jones, 1987, Genes Dev 1, 1132-46、参考文献として本明細書中に援
用される)内の重要な残基を変更する16までの沈黙置換をもたらしている。
【0040】 本発明のさらなるウイルス構築体はアデノウイルスのE2後期プロモーターを
修飾することによって提供され得る。E2早期プロモーターはDNAポリメラー
ゼ(pol)、DNA結合タンパク質(DBP)及びプレターミナル(pretermi
nal)タンパク質(pTP)を制御する。E2後期プロモーターに突然変異を生
成させることにより、同様の効果、すなわち、少なくとも部分的には、E1B欠
失に対する同様の効果を持たせることが可能であり、これは、E1B欠失がE2
後期プロモーターから発現されるDBP RNAの移行を減少させるためである
。DBPはDNAの複製に化学量論的に必要とされ、そのため、正常細胞におけ
るDBP産生の減少は望ましいものである。E2後期プロモーターは100kタ
ンパク質コーディング配列内にあり、欠失させることはできない。その代わりに
、本発明者らは、公知転写因子結合部以内の重要な残基を変更する沈黙突然変異
でそれを不活性化できることを決定している。
修飾することによって提供され得る。E2早期プロモーターはDNAポリメラー
ゼ(pol)、DNA結合タンパク質(DBP)及びプレターミナル(pretermi
nal)タンパク質(pTP)を制御する。E2後期プロモーターに突然変異を生
成させることにより、同様の効果、すなわち、少なくとも部分的には、E1B欠
失に対する同様の効果を持たせることが可能であり、これは、E1B欠失がE2
後期プロモーターから発現されるDBP RNAの移行を減少させるためである
。DBPはDNAの複製に化学量論的に必要とされ、そのため、正常細胞におけ
るDBP産生の減少は望ましいものである。E2後期プロモーターは100kタ
ンパク質コーディング配列内にあり、欠失させることはできない。その代わりに
、本発明者らは、公知転写因子結合部以内の重要な残基を変更する沈黙突然変異
でそれを不活性化できることを決定している。
【0041】 E2後期プロモーター内の転写因子結合部位はDNアーゼIフットプリント法
によって同定された(本明細書の図4においてI−IVとマークされている;Godi
ng et al, 1987, NAR 15, 7761-7780)。最も重要なものはフットプリントIIに
存在するCCAATボックスである。このCCAATボックスの突然変異は、CATアッセ
イにおいてE2後期プロモーターの活性を100倍低下させる(Bhat et al, 19
87, EMBO J, 6, 2045-2052)。そのような突然変異の1つはマークされたCCAAT
ボックスの配列GAC CAA TCCをGAT CAG TCCに変更する(下記図4を参照)。これ
は、100kタンパク質の配列を変更することなく、CCAATボックス結合因子の
結合を無効にするように設計されている。活性をさらに低下させるのに他のフッ
トプリントにおいてさらなる沈黙突然変異を用いることができる。
によって同定された(本明細書の図4においてI−IVとマークされている;Godi
ng et al, 1987, NAR 15, 7761-7780)。最も重要なものはフットプリントIIに
存在するCCAATボックスである。このCCAATボックスの突然変異は、CATアッセ
イにおいてE2後期プロモーターの活性を100倍低下させる(Bhat et al, 19
87, EMBO J, 6, 2045-2052)。そのような突然変異の1つはマークされたCCAAT
ボックスの配列GAC CAA TCCをGAT CAG TCCに変更する(下記図4を参照)。これ
は、100kタンパク質の配列を変更することなく、CCAATボックス結合因子の
結合を無効にするように設計されている。活性をさらに低下させるのに他のフッ
トプリントにおいてさらなる沈黙突然変異を用いることができる。
【0042】 可能性のある代わりの、又はさらなる突然変異はE1Bプロモーターに突然変
異を生成させることによってE1B転写の発現を調節することである。これは、
前立腺特異的プロモーターがE1B転写の調節に用いられているウイルスを用い
て、ウイルスの複製を減少させることが示されている(Yu, D. C., et al 1999
Cancer Research 59, 1498-504)。E1B 55Kの発現を腫瘍特異的な方法で
調節するさらなる利点は正常組織に対する炎症性損傷の危険性が低下することで
ある(Ginsberg, H. S., et al 199 PNAS 96, 10409-11)。本発明者らは、この
提案を試験するため、E1BプロモーターSp1部位を置換するTcf部位を有
するウイルスを産生している。
異を生成させることによってE1B転写の発現を調節することである。これは、
前立腺特異的プロモーターがE1B転写の調節に用いられているウイルスを用い
て、ウイルスの複製を減少させることが示されている(Yu, D. C., et al 1999
Cancer Research 59, 1498-504)。E1B 55Kの発現を腫瘍特異的な方法で
調節するさらなる利点は正常組織に対する炎症性損傷の危険性が低下することで
ある(Ginsberg, H. S., et al 199 PNAS 96, 10409-11)。本発明者らは、この
提案を試験するため、E1BプロモーターSp1部位を置換するTcf部位を有
するウイルスを産生している。
【0043】 さらなる態様には以下の可能性のある修飾が含まれる。複製をさらに制限する
ため、E1Aプロモーターにさらなる腫瘍特異的、例えばTcf、部位を挿入す
ることができる。短オリゴヌクレオチドを挿入することによる調節を達成するに
は、E1Aプロモーター内の既存の調節配列を欠失させなければならない。これ
は、逆位末端反復の両者の同時突然変異及び他所での、例えばE4領域への、パ
ッケージ化シグナルの伝達を必要とする。例えばカリドン(Calydon)ウイルス
とは対照的に、本発明者らのウイルスの設計は、アデノウイルス遺伝子の完全な
相補性を保持するにもかかわらず予備のパッケージ化能力を利用することが可能
であることを意味し、これは条件的毒素、例えば、プロドラッグ活性化酵素HS
Vチミジンキナーゼ(tk)の発現に用いることができる。これは、例えば、E
3プロモーター(その活性は幾つのウイルスにおいて調節される)から発現させ
て腫瘍ターゲッティングのさらなるレベルを提供することができる。あるいは、
構成プロモーターから発現させて安全性の特徴として作用させることができる。
これは、そうすることでガンシクロビルがそのウイルスを殺すことができるため
である。E1B不全ウイルスにおける構成tkの発現も、複製を犠牲にはするが
、腫瘍殺傷効果を高める(Wildner, O., et al 1999 Gene Therapy 6, 57-62)
。発現させる代わりのプロドラッグ活性化酵素はシトシンデアミナーゼ(Crysta
l, R. G., et al 1997 Hum Gene Ther 8, 985-1001)であり、これは5FCを5
FUに変換する。5FUは目的とする治療標的である肝臓転移に対して活性であ
る数種類の薬物のうちの1つであるが、幾らかの患者においては胆汁分泌を生じ
るため、これには利点がある。
ため、E1Aプロモーターにさらなる腫瘍特異的、例えばTcf、部位を挿入す
ることができる。短オリゴヌクレオチドを挿入することによる調節を達成するに
は、E1Aプロモーター内の既存の調節配列を欠失させなければならない。これ
は、逆位末端反復の両者の同時突然変異及び他所での、例えばE4領域への、パ
ッケージ化シグナルの伝達を必要とする。例えばカリドン(Calydon)ウイルス
とは対照的に、本発明者らのウイルスの設計は、アデノウイルス遺伝子の完全な
相補性を保持するにもかかわらず予備のパッケージ化能力を利用することが可能
であることを意味し、これは条件的毒素、例えば、プロドラッグ活性化酵素HS
Vチミジンキナーゼ(tk)の発現に用いることができる。これは、例えば、E
3プロモーター(その活性は幾つのウイルスにおいて調節される)から発現させ
て腫瘍ターゲッティングのさらなるレベルを提供することができる。あるいは、
構成プロモーターから発現させて安全性の特徴として作用させることができる。
これは、そうすることでガンシクロビルがそのウイルスを殺すことができるため
である。E1B不全ウイルスにおける構成tkの発現も、複製を犠牲にはするが
、腫瘍殺傷効果を高める(Wildner, O., et al 1999 Gene Therapy 6, 57-62)
。発現させる代わりのプロドラッグ活性化酵素はシトシンデアミナーゼ(Crysta
l, R. G., et al 1997 Hum Gene Ther 8, 985-1001)であり、これは5FCを5
FUに変換する。5FUは目的とする治療標的である肝臓転移に対して活性であ
る数種類の薬物のうちの1つであるが、幾らかの患者においては胆汁分泌を生じ
るため、これには利点がある。
【0044】 E1Aのアミノ末端には、p300、一般的な転写因子として機能するヒスト
ンアセチラーゼに結合するE1Aの領域が含まれる。E1Aが遺伝子を活性化す
る方法の1つはp300をプロモーターに導くことによるものである。これを行
うため、E1AはATFのような転写因子に結合する。したがって、E1AはA
TF部位を含むプロモーターを活性化する。本明細書におけるウイルスvMB1
3はE3プロモーター内にATF部位を保持しており、これに関する利点を提供
する。プロモーターがATF部位を有していない場合、E1Aはp300を結合
することによってそれを抑制することが問題である。これはp53に関して生じ
ることである:E1AはE1A内にp300結合部位を必要とする方法でp53
依存性転写を遮断する。E1AによるTcf抑制は幾つかの細胞系において起こ
り得ることであり、そのためE1A p300結合部位の突然変異はそのような
治療に好ましいものであり得る。
ンアセチラーゼに結合するE1Aの領域が含まれる。E1Aが遺伝子を活性化す
る方法の1つはp300をプロモーターに導くことによるものである。これを行
うため、E1AはATFのような転写因子に結合する。したがって、E1AはA
TF部位を含むプロモーターを活性化する。本明細書におけるウイルスvMB1
3はE3プロモーター内にATF部位を保持しており、これに関する利点を提供
する。プロモーターがATF部位を有していない場合、E1Aはp300を結合
することによってそれを抑制することが問題である。これはp53に関して生じ
ることである:E1AはE1A内にp300結合部位を必要とする方法でp53
依存性転写を遮断する。E1AによるTcf抑制は幾つかの細胞系において起こ
り得ることであり、そのためE1A p300結合部位の突然変異はそのような
治療に好ましいものであり得る。
【0045】 本発明者らはHCT116細胞においてvMB13及びvMB14の相違を見
出しており、これら2種類のウイルスの唯一の相違はE3プロモーターのATF
部位に存在する。したがって、vMB14におけるE1A p300結合部位の
突然変異は有利であり得る。あるいは、この相違はATF部位の直接的な活性化
によるものである可能性がある。これは、Xu Lら(2000, Genes Dev 14, 585-59
5)が、機構は不明であるものの、ATF/CREB部位をwntシグナルによ
って活性化できることを報告しているためである。
出しており、これら2種類のウイルスの唯一の相違はE3プロモーターのATF
部位に存在する。したがって、vMB14におけるE1A p300結合部位の
突然変異は有利であり得る。あるいは、この相違はATF部位の直接的な活性化
によるものである可能性がある。これは、Xu Lら(2000, Genes Dev 14, 585-59
5)が、機構は不明であるものの、ATF/CREB部位をwntシグナルによ
って活性化できることを報告しているためである。
【0046】 正常細胞における複製を防止又は終止させる1つまたはそれ以上のレベルの調
節を備えるウイルスが産生されており、受容体レベルでの感染効率を改善するこ
とがさらに好ましく、かつ有利である。アデノウイルス用の正常細胞性受容体、
CARは幾つかの結腸腫瘍細胞では発現が不十分である。幾つかの、例えば15
ないし25、より好ましくは約20のリジン残基をアデノ線維タンパク質(天然
CARリガンド)の末端に付加することでこのウイルスに硫酸ヘパリン糖タンパ
ク質を受容体として用いさせることができ、その結果、より広範囲の細胞の効率
的な感染が生じる。これは、E1B不全ウイルスの細胞変性効果及び異種移植片
治癒率を高めることが示されている(Shinoura, H., et al 1999 Cancer Res 59
, 3411-3416、参照することにより本明細書に組み込まれる)。
節を備えるウイルスが産生されており、受容体レベルでの感染効率を改善するこ
とがさらに好ましく、かつ有利である。アデノウイルス用の正常細胞性受容体、
CARは幾つかの結腸腫瘍細胞では発現が不十分である。幾つかの、例えば15
ないし25、より好ましくは約20のリジン残基をアデノ線維タンパク質(天然
CARリガンド)の末端に付加することでこのウイルスに硫酸ヘパリン糖タンパ
ク質を受容体として用いさせることができ、その結果、より広範囲の細胞の効率
的な感染が生じる。これは、E1B不全ウイルスの細胞変性効果及び異種移植片
治癒率を高めることが示されている(Shinoura, H., et al 1999 Cancer Res 59
, 3411-3416、参照することにより本明細書に組み込まれる)。
【0047】 代わりの方策は、Ad40及び/又はAd41線維をコードするcDNAを上
述のように本発明の構築体に組み込むことである。EMBL及びGenbankのデー
タベースにはそのような配列が列挙されており、さらに、Kidd et al Virology
(1989) 172(1), 134-144;Pieniazek et al Nucleic Acids Res. (1989) Nov 25
; 17-20, 9474;Davison et al J. Mol. Biol (1993) 234(4) 1308-16;Kidd et
al Virology (1990) 179(1) pl39-150(これら全ては参照することにより本明
細書に組み込まれる)に記述されている。
述のように本発明の構築体に組み込むことである。EMBL及びGenbankのデー
タベースにはそのような配列が列挙されており、さらに、Kidd et al Virology
(1989) 172(1), 134-144;Pieniazek et al Nucleic Acids Res. (1989) Nov 25
; 17-20, 9474;Davison et al J. Mol. Biol (1993) 234(4) 1308-16;Kidd et
al Virology (1990) 179(1) pl39-150(これら全ては参照することにより本明
細書に組み込まれる)に記述されている。
【0048】 本発明の第2の側面においては、治療、特には新生物、例えば悪性腫瘍、特に
は結腸直腸腫瘍、最も詳しくは結腸直腸転移の患者の治療において用いるための
、本発明のウイルスDNA構築体が、特にはそれらによってコードされるウイル
スの形態で提供される。最も好ましくは、この治療は結腸直腸腫瘍の転移である
肝臓腫瘍のためのものである。
は結腸直腸腫瘍、最も詳しくは結腸直腸転移の患者の治療において用いるための
、本発明のウイルスDNA構築体が、特にはそれらによってコードされるウイル
スの形態で提供される。最も好ましくは、この治療は結腸直腸腫瘍の転移である
肝臓腫瘍のためのものである。
【0049】 第3の側面においては、新生物、例えば悪性腫瘍、特には結腸直腸腫瘍、最も
詳しくは結腸直腸転移の治療のための医薬の製造における、本発明のウイルスD
NA構築体の、特にはそれらによってコードされるウイルスの形態での使用が提
供される。最も好ましくは、この治療は結腸直腸腫瘍の転移である肝臓腫瘍のた
めのものである。
詳しくは結腸直腸転移の治療のための医薬の製造における、本発明のウイルスD
NA構築体の、特にはそれらによってコードされるウイルスの形態での使用が提
供される。最も好ましくは、この治療は結腸直腸腫瘍の転移である肝臓腫瘍のた
めのものである。
【0050】 本発明の第4の側面においては、本発明のウイルスDNA構築体を、特にはそ
れらによってコードされるウイルスの形態で、生理学的に許容し得る担体と共に
含む組成物が提供される。このような担体は典型的には無菌で発熱物質を含まず
、したがって、この組成物は、ウイルス構築体成分又はそのコードされたウイル
スの存在を除いて、無菌で発熱物質を含まない。典型的には担体は、生理的に受
容可能な食塩水であろう。
れらによってコードされるウイルスの形態で、生理学的に許容し得る担体と共に
含む組成物が提供される。このような担体は典型的には無菌で発熱物質を含まず
、したがって、この組成物は、ウイルス構築体成分又はそのコードされたウイル
スの存在を除いて、無菌で発熱物質を含まない。典型的には担体は、生理的に受
容可能な食塩水であろう。
【0051】 本発明の第5の側面においては、本発明のウイルスDNA構築体の、特にはそ
れらによってコードされるウイルスの形態での製造方法であって、野生型転写因
子結合部位、特には第1の側面について定義されるものを有するウイルスゲノム
DNA、特にはアデノウイルスのものを形質転換し、そのタンパク質産生物がウ
イルス核酸の複製に直接機構的に関与する遺伝子の転写を、これらの部位が腫瘍
特異的転写因子結合部位によって作動的に置換されるように、特には、それらが
Tcf転写因子結合部位によって置換されるように制御することを含む方法が提
供される。作動的置換には野生型部位の部分的な、又は完全な欠失が含まれ得る
。好ましくは、この形質転換は2つ以上、より好ましくは3つもしくは4つのT
cf−4転写因子結合部位を挿入するものである。より好ましくは、この形質転
換は、ウイルスゲノムのE3プロモーター領域におけるF1、NFκB、AP1
及び/又はATF結合部位の1つまたはそれ以上の残基にさらなる突然変異を導
入するものである。このような突然変異は、好ましくは、E3によるE2活性の
妨害を排除し、正常細胞及び非結腸細胞におけるE2プロモーター駆動遺伝子の
発現を減少させるものであるべきである。相反的に、これはE3の正常調節をE
2プロモーター近傍に結合したTcfによる調節に好ましく置き換える。
れらによってコードされるウイルスの形態での製造方法であって、野生型転写因
子結合部位、特には第1の側面について定義されるものを有するウイルスゲノム
DNA、特にはアデノウイルスのものを形質転換し、そのタンパク質産生物がウ
イルス核酸の複製に直接機構的に関与する遺伝子の転写を、これらの部位が腫瘍
特異的転写因子結合部位によって作動的に置換されるように、特には、それらが
Tcf転写因子結合部位によって置換されるように制御することを含む方法が提
供される。作動的置換には野生型部位の部分的な、又は完全な欠失が含まれ得る
。好ましくは、この形質転換は2つ以上、より好ましくは3つもしくは4つのT
cf−4転写因子結合部位を挿入するものである。より好ましくは、この形質転
換は、ウイルスゲノムのE3プロモーター領域におけるF1、NFκB、AP1
及び/又はATF結合部位の1つまたはそれ以上の残基にさらなる突然変異を導
入するものである。このような突然変異は、好ましくは、E3によるE2活性の
妨害を排除し、正常細胞及び非結腸細胞におけるE2プロモーター駆動遺伝子の
発現を減少させるものであるべきである。相反的に、これはE3の正常調節をE
2プロモーター近傍に結合したTcfによる調節に好ましく置き換える。
【0052】 アデノウイルスを改変するための伝統的な方法は、相同組換えによるウイルス
ゲノムのイン・ビボ再構築、次いで複数回のプラーク精製を必要とする。この理
由は、伝統的なクローン化技術を用いる36kdアデノウイルスゲノムの操作の
困難性である。この問題を回避する、特にはE1置換ベクター用の、新たなアプ
ローチが開発されている。Transgene及びVogelstein群はウイルスを改変するの
に細胞におけるギャップ修復を用いる(Chartierら、1996;Heら、1998)。これ
は改変しようとする各領域に特異的である巨大ベクターの構築を必要とする。こ
れらのベクターはE1置換に利用可能であるため、これらのアプローチは単純な
アデノウイルス発現ベクターの構築に非常に魅力的である。Ketnerは、アデノウ
イルスゲノムをYACにおいてクローン化し、2工程遺伝子置換によって改変す
る酵母ベースのシステムを開発した(Ketnerら、1994)。このYACアプローチ
の利点は、これまで従来の組換えDNA技術を用いて操作されているウイルスD
NAの非常に小さい断片のみが必要とされることである。都合の良いことに、改
変しようとする領域のいずれかの側の数百塩基対が提供され、一方の側には独特
の制限部位が存在するはずであるが、このプラスミドは非常に小さいため、これ
は問題にならない。Ketnerのアプローチの不利な点は、YAC DNAの収率が
低いことである。
ゲノムのイン・ビボ再構築、次いで複数回のプラーク精製を必要とする。この理
由は、伝統的なクローン化技術を用いる36kdアデノウイルスゲノムの操作の
困難性である。この問題を回避する、特にはE1置換ベクター用の、新たなアプ
ローチが開発されている。Transgene及びVogelstein群はウイルスを改変するの
に細胞におけるギャップ修復を用いる(Chartierら、1996;Heら、1998)。これ
は改変しようとする各領域に特異的である巨大ベクターの構築を必要とする。こ
れらのベクターはE1置換に利用可能であるため、これらのアプローチは単純な
アデノウイルス発現ベクターの構築に非常に魅力的である。Ketnerは、アデノウ
イルスゲノムをYACにおいてクローン化し、2工程遺伝子置換によって改変す
る酵母ベースのシステムを開発した(Ketnerら、1994)。このYACアプローチ
の利点は、これまで従来の組換えDNA技術を用いて操作されているウイルスD
NAの非常に小さい断片のみが必要とされることである。都合の良いことに、改
変しようとする領域のいずれかの側の数百塩基対が提供され、一方の側には独特
の制限部位が存在するはずであるが、このプラスミドは非常に小さいため、これ
は問題にならない。Ketnerのアプローチの不利な点は、YAC DNAの収率が
低いことである。
【0053】 本発明者らはこれらの細菌及び酵母アプローチを組み合わせている。具体的に
は、酵母における環状YAC/BACでのギャップ修復によってウイルスゲノム
をクローン化し、2工程遺伝子置換によってそれを改変した後、多量のウイルス
ゲノムDNAを産生させるためにそれを細菌に移している。後者の工程はウイル
スに変換する前に改変ゲノムを直接配列決定することを可能にすることから有用
であり、多量のゲノムDNAが利用可能であることからウイルス産生の効率が高
い。細菌におけるウイルスゲノムの再配置を回避するのにBAC起点が用いられ
ている。このアプローチにはより多くの工程があるが、純粋細菌又は酵母技術の
全ての利点を併せ持ち、不利な点は含まない。
は、酵母における環状YAC/BACでのギャップ修復によってウイルスゲノム
をクローン化し、2工程遺伝子置換によってそれを改変した後、多量のウイルス
ゲノムDNAを産生させるためにそれを細菌に移している。後者の工程はウイル
スに変換する前に改変ゲノムを直接配列決定することを可能にすることから有用
であり、多量のゲノムDNAが利用可能であることからウイルス産生の効率が高
い。細菌におけるウイルスゲノムの再配置を回避するのにBAC起点が用いられ
ている。このアプローチにはより多くの工程があるが、純粋細菌又は酵母技術の
全ての利点を併せ持ち、不利な点は含まない。
【0054】 これをE1置換ウイルスの作製に用いることは可能であり、本発明者らは、酵
母切除工程における望ましい組換え体のシクロヘキシミド選択を可能にしてこの
作業を単純化するYAC/BACを構築しているが、このアプローチの主な長所
はウイルスゲノム全体を通して意のままに突然変異を導入できることである。こ
のYAC/BACのさらなる詳細は、本発明者らにより、Gagnebin et al (1999
) Gene Therapy 6, 1742-1750(これは、参考文献として本明細書中に援用され
る)に対する貢献として提供されている。複数の異なる部位での連続改変も、イ
ン・ビトロで巨大DNA中間体を扱うことなしに、可能である。
母切除工程における望ましい組換え体のシクロヘキシミド選択を可能にしてこの
作業を単純化するYAC/BACを構築しているが、このアプローチの主な長所
はウイルスゲノム全体を通して意のままに突然変異を導入できることである。こ
のYAC/BACのさらなる詳細は、本発明者らにより、Gagnebin et al (1999
) Gene Therapy 6, 1742-1750(これは、参考文献として本明細書中に援用され
る)に対する貢献として提供されている。複数の異なる部位での連続改変も、イ
ン・ビトロで巨大DNA中間体を扱うことなしに、可能である。
【0055】 本発明の方法を用いて突然変異を生成させようとするアデノウイルス株は、好
ましくは、野生型アデノウイルスである。ATCCからVR5として入手可能で
あるアデノウイルス5(Ad5)が都合良く用いられる。ウイルスゲノムは、好
ましくは、この方法によって改変される領域の他は完全に野生型であるが、腫瘍
特異的毒性異種遺伝子、例えばp53、又はガンシクロビルによる細胞破壊を可
能にするチミジンキナーゼのようなプロドラッグ活性化酵素をコードする遺伝子
の送達に用いることができる。しかしながら、この方法はまた、改善された組織
親和性を有するアデノウイルス型(例えば、Ad40及びAd41)に由来する
ウイルスゲノムDNAを用いて都合良く適用される。
ましくは、野生型アデノウイルスである。ATCCからVR5として入手可能で
あるアデノウイルス5(Ad5)が都合良く用いられる。ウイルスゲノムは、好
ましくは、この方法によって改変される領域の他は完全に野生型であるが、腫瘍
特異的毒性異種遺伝子、例えばp53、又はガンシクロビルによる細胞破壊を可
能にするチミジンキナーゼのようなプロドラッグ活性化酵素をコードする遺伝子
の送達に用いることができる。しかしながら、この方法はまた、改善された組織
親和性を有するアデノウイルス型(例えば、Ad40及びAd41)に由来する
ウイルスゲノムDNAを用いて都合良く適用される。
【0056】 本発明の第6の側面においては、新生物の患者の治療方法であって、本発明の
ウイルスDNA構築体を、特にはそれらによってコードされるウイルスの形態で
生じさせて新生物のものを含むかもしくはそれに限定される患者の組織に感染さ
せ、新生物細胞が殺されるように複製させる方法が提供される。
ウイルスDNA構築体を、特にはそれらによってコードされるウイルスの形態で
生じさせて新生物のものを含むかもしくはそれに限定される患者の組織に感染さ
せ、新生物細胞が殺されるように複製させる方法が提供される。
【0057】 本発明者は、さらに、結腸ターゲッティング複製性アデノウイルスを事前投与
することによって現在の動脈内肝臓化学療法を改善することを試みている。DN
A損傷及び代謝拮抗性化学療法は、動物モデルにおいて、腫瘍細胞を他の複製性
アデノウイルスに対して感受性にすることが知られている(Heiseら、1997)。
例えば、毒性及び安全性を決定するため、第1サイクルの間に本発明の組換えア
デノウイルスを単独で投与することができる。第2サイクル以降に、組換えアデ
ノウイルスを同時化学療法と共に投与することができる。好ましくは、安全性及
び効力を評価した後に第1サイクルの応答と比較するが、患者は彼もしくは彼女
自身の対照として働く。
することによって現在の動脈内肝臓化学療法を改善することを試みている。DN
A損傷及び代謝拮抗性化学療法は、動物モデルにおいて、腫瘍細胞を他の複製性
アデノウイルスに対して感受性にすることが知られている(Heiseら、1997)。
例えば、毒性及び安全性を決定するため、第1サイクルの間に本発明の組換えア
デノウイルスを単独で投与することができる。第2サイクル以降に、組換えアデ
ノウイルスを同時化学療法と共に投与することができる。好ましくは、安全性及
び効力を評価した後に第1サイクルの応答と比較するが、患者は彼もしくは彼女
自身の対照として働く。
【0058】 投与経路は患者の必要性に従って変化することがあり、US 5,698,443の第6欄
(これは参考文献として本明細書中に援用される)に記述されるもののような類
似のウイルスについて記述される経路のいずれによるものであってもよい。本発
明の複製性ウイルスに適する用量は、理論上は、非常に少ないものであり得る。
例えば、102ないし1013、より好ましくは104ないし1011のオーダーのも
のであり得、感染効率は一般には0.001ないし100の範囲である。
(これは参考文献として本明細書中に援用される)に記述されるもののような類
似のウイルスについて記述される経路のいずれによるものであってもよい。本発
明の複製性ウイルスに適する用量は、理論上は、非常に少ないものであり得る。
例えば、102ないし1013、より好ましくは104ないし1011のオーダーのも
のであり得、感染効率は一般には0.001ないし100の範囲である。
【0059】 治療には、好ましくは、肝動脈カテーテル、例えば、port-a-cathを移植する
。この手順は十分確立されており、眼のメラノーマ及び結腸癌患者の局所肝臓化
学療法のために肝臓カテーテルが規則正しく配置される。基礎生検は術中に行う
ことができる。
。この手順は十分確立されており、眼のメラノーマ及び結腸癌患者の局所肝臓化
学療法のために肝臓カテーテルが規則正しく配置される。基礎生検は術中に行う
ことができる。
【0060】 典型的な治療レジメは以下のものを含む: サイクル1:第1、2及び3日の、肝動脈カテーテルを介する、100ml生
理食塩水に希釈したアデノウイルス構築体の投与。
理食塩水に希釈したアデノウイルス構築体の投与。
【0061】 サイクル2(第29日):4週間毎に繰り返される、標準ポータブル輸液ポン
プ(例えば、Pharmacia又はMelody)による、14日間の連続注入としてのFU
DR 0.3mg/kg/dの同時投与を伴う第1、2、及び3日のアデノウイ
ルス構築体の投与。
プ(例えば、Pharmacia又はMelody)による、14日間の連続注入としてのFU
DR 0.3mg/kg/dの同時投与を伴う第1、2、及び3日のアデノウイ
ルス構築体の投与。
【0062】 ウイルス剤(virus agent)の毒性、したがって適切な用量は、3
名の患者の同齢集団におけるウイルス接種物の標準第I相用量増大によって決定
することができる。1名の患者においてグレードIII/IV毒性が生じる場合、現
在の用量レベルで合計6名の患者について登録を継続する。患者の≧50%にお
けるグレードIII/IV毒性によって用量制限毒性(DLT)を決定し、それを下
回る用量レベルが最大耐量(MTD)とみなされ、第2相治験においてさらに調
べることができる。
名の患者の同齢集団におけるウイルス接種物の標準第I相用量増大によって決定
することができる。1名の患者においてグレードIII/IV毒性が生じる場合、現
在の用量レベルで合計6名の患者について登録を継続する。患者の≧50%にお
けるグレードIII/IV毒性によって用量制限毒性(DLT)を決定し、それを下
回る用量レベルが最大耐量(MTD)とみなされ、第2相治験においてさらに調
べることができる。
【0063】 規制認可が必要である場合にはGMPグレードのウイルスが用いられることは
理解されるであろう。 治療用アデノウイルスの投与には、例えばサイトカインの放出に関連し得る、
炎症及び/又は他の有害免疫学的現象が伴い得ることを当業者は理解するであろ
う。本発明によるウイルスの幾つかも、特にE1Bの活性が弱毒化されていない
場合、これを刺激することがある。そのようなウイルスがこの副作用を欠くもの
の少なくとも幾つかを上回る有利な抗腫瘍活性を有し得ることがさらに理解され
るであろう。この現象においては、免疫抑制性、抗炎症性又は他の方法での抗サ
イトカイン薬物療法を、例えば、ウイルス投与の前、後又はその最中に施すこと
が適切である。そのような薬物療法の典型はステロイド、例えば、プレドニゾロ
ンもしくはデキサメタゾン、又は抗TNF剤、例えば、抗TNF抗体もしくは可
溶性TNF受容体であり、適切な投与レジメは自己免疫治療において用いられる
ものに類似する。例えば、関節リューマチ(WO 93/07899を参照)又は多発性硬
化症(WO 93/10817)を治療するために投与されるステロイドの用量を参照のこ
と。これらの両者は、それらがUS対応出願を有する限り、参照文献として本明
細書中に援用される。
理解されるであろう。 治療用アデノウイルスの投与には、例えばサイトカインの放出に関連し得る、
炎症及び/又は他の有害免疫学的現象が伴い得ることを当業者は理解するであろ
う。本発明によるウイルスの幾つかも、特にE1Bの活性が弱毒化されていない
場合、これを刺激することがある。そのようなウイルスがこの副作用を欠くもの
の少なくとも幾つかを上回る有利な抗腫瘍活性を有し得ることがさらに理解され
るであろう。この現象においては、免疫抑制性、抗炎症性又は他の方法での抗サ
イトカイン薬物療法を、例えば、ウイルス投与の前、後又はその最中に施すこと
が適切である。そのような薬物療法の典型はステロイド、例えば、プレドニゾロ
ンもしくはデキサメタゾン、又は抗TNF剤、例えば、抗TNF抗体もしくは可
溶性TNF受容体であり、適切な投与レジメは自己免疫治療において用いられる
ものに類似する。例えば、関節リューマチ(WO 93/07899を参照)又は多発性硬
化症(WO 93/10817)を治療するために投与されるステロイドの用量を参照のこ
と。これらの両者は、それらがUS対応出願を有する限り、参照文献として本明
細書中に援用される。
【0064】 以下の非限定性の配列、図面及び実施例を参照することにより、本発明を説明
のみの目的で記述する。当業者は、これらを考慮することで、請求の範囲の範囲
内にあるさらなる態様がわかるであろう。 配列表 配列番号1は、野生型E2プロモーターの代わりに4×Tcfが挿入された、
本発明に従って図2に示されるように突然変異が生成されたE2及びE3転写部
位を有するAd5のDNA配列である。
のみの目的で記述する。当業者は、これらを考慮することで、請求の範囲の範囲
内にあるさらなる態様がわかるであろう。 配列表 配列番号1は、野生型E2プロモーターの代わりに4×Tcfが挿入された、
本発明に従って図2に示されるように突然変異が生成されたE2及びE3転写部
位を有するAd5のDNA配列である。
【0065】 配列番号2は、野生型E2プロモーターに代わるTcfの挿入による影響を受
けていない、配列番号1にコードされる33kタンパク質の部分アミノ酸配列で
ある。
けていない、配列番号1にコードされる33kタンパク質の部分アミノ酸配列で
ある。
【0066】 配列番号3は、野生型プロモーターに代わるTcfの挿入による影響を受けて
いない、配列番号1にコードされるpVIIIタンパク質の部分アミノ酸配列である
。
いない、配列番号1にコードされるpVIIIタンパク質の部分アミノ酸配列である
。
【0067】 配列番号4は、野生型アデノウイルスVR5のE2/E3領域におけるもので
ある。 配列番号5は、図4に示されるように本発明の好ましいウイルスにおいて変更
されたE2後期プロモーターのDNA配列である。
ある。 配列番号5は、図4に示されるように本発明の好ましいウイルスにおいて変更
されたE2後期プロモーターのDNA配列である。
【0068】 配列番号6は、後期プロモーターにおける突然変異の影響を受けていない配列
番号5にコードされる100kタンパク質の部分アミノ酸配列である。 配列番号7は、図20に示されるように本発明の好ましいウイルスにおいて突
然変異を受けているE1BプロモーターのDNA配列である。
番号5にコードされる100kタンパク質の部分アミノ酸配列である。 配列番号7は、図20に示されるように本発明の好ましいウイルスにおいて突
然変異を受けているE1BプロモーターのDNA配列である。
【0069】 配列番号8は、本明細書で例示されるTcf部位の代わりに用いることができ
るテロメラーゼプロモーター部位の一部のものである。 配列番号9ないし25は、本明細書の実施例において記載されるプライマーG
61ないしG101のものである。
るテロメラーゼプロモーター部位の一部のものである。 配列番号9ないし25は、本明細書の実施例において記載されるプライマーG
61ないしG101のものである。
【0070】 配列番号26は、単一のTcf結合部位のものである。 配列番号27は、本明細書に記載される好ましいウイルスにおいて見出される
、2Tcf部位及び隣接アデノウイルスDNAのものである。
、2Tcf部位及び隣接アデノウイルスDNAのものである。
【0071】 配列番号28は、隣接ウイルスDNA及び不活性Tcf部位を伴う変異体3T
cf部位配列のものである。 配列番号29は、本発明の好ましいウイルスにおいて用いられる、隣接ウイル
スDNAを伴う変異体4Tcf部位配列のものである。
cf部位配列のものである。 配列番号29は、本発明の好ましいウイルスにおいて用いられる、隣接ウイル
スDNAを伴う変異体4Tcf部位配列のものである。
【0072】 配列番号30及び31は、本発明の好ましいウイルスにおいてEIBプロモー
ターに突然変異を生成させるための正及び逆プライマーである。 配列番号32、33及び34は、それぞれ、TaqmanプロトコルにおけるE2の
発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。
ターに突然変異を生成させるための正及び逆プライマーである。 配列番号32、33及び34は、それぞれ、TaqmanプロトコルにおけるE2の
発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。
【0073】 配列番号35、36及び37は、それぞれ、TaqmanプロトコルにおけるE3の
発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。 配列番号38、39及び40は、それぞれ、TaqmanプロトコルにおけるEIB
の発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。
発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。 配列番号38、39及び40は、それぞれ、TaqmanプロトコルにおけるEIB
の発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。
【0074】 配列番号41、42及び43は、それぞれ、TaqmanプロトコルにおけるE4の
発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。 配列番号44及び45は、線維発現測定のための正及び逆プライマーである。
発現の定量的PCR測定のための正及び逆プライマー並びにプローブである。 配列番号44及び45は、線維発現測定のための正及び逆プライマーである。
【0075】 配列は、プライマー及び最終構築ウイルスの配列並びにそれらの関心のある特
徴を示す以下の実施例及び図面にも提示されている。 実施例 本発明者らは、GFPに融合したE1B 55Kのアミノ末端を用いて(比較
ウイルスLGM)、3つのTcf部位によるE2プロモーターの置換を用いて(
ウイルスAd−Tcf3)、及びこの2つを組み合わせて(ウイルスLGC)、
ウイルスを構築している。また、本発明者らは、4つのTcf部位によるE2プ
ロモーターの置換のみを用いて(ウイルスvMB12)、4つのTcf部位によ
るE2プロモーターの置換をE3プロモーター、特にはNF1、NFκB、AP
1、及びATF部位における沈黙突然変異を組み合わせて(ウイルスvMB14
)、及び4つのTcf部位によるE2プロモーターの置換をE3プロモーター、
特にはNF1、NFκB、AP1ではあるがATF部位ではない沈黙突然変異を
組み合わせて(ウイルスvMB13)、ウイルスを構築している。また、本発明
者らは、E1BプロモーターのSp1部位を野生型アデノウイルス骨格(ウイル
スvMB23)、vMB12骨格(ウイルスvMB27)、vMB13骨格(ウ
イルスvMB31)及びvMB14骨格(ウイルスvMB19)の4つのTcf
部位で置換してウイルスを構築している。 鍵となる構築体の簡単な説明: Ad Tcf3 YAC/BAC(pMB36)の構築に用いられるギャップ
修復及び2工程遺伝子置換は図5に示されている(示される全ての工程は酵母細
胞内部で行われる)。pNKBAC39及びp680のマップは図6及び7に示
されている。材料の入手可能性:pUC19(Clontech)、Bluescript(Strata
gene)、pEGFP−C1(Clontech)、phGFP−S65T(Clontech)及
びpRS406(Stratagene)。
徴を示す以下の実施例及び図面にも提示されている。 実施例 本発明者らは、GFPに融合したE1B 55Kのアミノ末端を用いて(比較
ウイルスLGM)、3つのTcf部位によるE2プロモーターの置換を用いて(
ウイルスAd−Tcf3)、及びこの2つを組み合わせて(ウイルスLGC)、
ウイルスを構築している。また、本発明者らは、4つのTcf部位によるE2プ
ロモーターの置換のみを用いて(ウイルスvMB12)、4つのTcf部位によ
るE2プロモーターの置換をE3プロモーター、特にはNF1、NFκB、AP
1、及びATF部位における沈黙突然変異を組み合わせて(ウイルスvMB14
)、及び4つのTcf部位によるE2プロモーターの置換をE3プロモーター、
特にはNF1、NFκB、AP1ではあるがATF部位ではない沈黙突然変異を
組み合わせて(ウイルスvMB13)、ウイルスを構築している。また、本発明
者らは、E1BプロモーターのSp1部位を野生型アデノウイルス骨格(ウイル
スvMB23)、vMB12骨格(ウイルスvMB27)、vMB13骨格(ウ
イルスvMB31)及びvMB14骨格(ウイルスvMB19)の4つのTcf
部位で置換してウイルスを構築している。 鍵となる構築体の簡単な説明: Ad Tcf3 YAC/BAC(pMB36)の構築に用いられるギャップ
修復及び2工程遺伝子置換は図5に示されている(示される全ての工程は酵母細
胞内部で行われる)。pNKBAC39及びp680のマップは図6及び7に示
されている。材料の入手可能性:pUC19(Clontech)、Bluescript(Strata
gene)、pEGFP−C1(Clontech)、phGFP−S65T(Clontech)及
びpRS406(Stratagene)。
【0076】 YAC/BAC(pMB19):アデノウイルスゲノムを、巨大プラスミドに
おいて、細菌性人工染色体(F’)複製起点、酵母セントロメア及び複製起点、
並びに酵母及び細菌の選択可能なマーカー(HIS3、クロラムフェニコール耐
性遺伝子)で改変した。
おいて、細菌性人工染色体(F’)複製起点、酵母セントロメア及び複製起点、
並びに酵母及び細菌の選択可能なマーカー(HIS3、クロラムフェニコール耐
性遺伝子)で改変した。
【0077】 Ad5 YAC/BAC(pMB20):ATCCから入手したアデノウイル
ス5型(VR5)からゲノムDNAを調製した。小さい末端断片をPCRで増幅
し、YAC/BACにクローン化した。このベクターを2つの末端Ad5断片間
の部位で直線化し、完全長Ad5ゲノムDNAと共に酵母に形質移入した。相同
組換え(ギャップ修復)によってプラスミドを再環化し、YAC/BACにクロ
ーン化された完全長Ad5ゲノムDNAを得た。
ス5型(VR5)からゲノムDNAを調製した。小さい末端断片をPCRで増幅
し、YAC/BACにクローン化した。このベクターを2つの末端Ad5断片間
の部位で直線化し、完全長Ad5ゲノムDNAと共に酵母に形質移入した。相同
組換え(ギャップ修復)によってプラスミドを再環化し、YAC/BACにクロ
ーン化された完全長Ad5ゲノムDNAを得た。
【0078】 E1B::GFP融合(pMB25):E1B 19kと重複するE1B 5
5kの一部を含むAd5断片をPCRによって増幅し、EGFPの5’−末端に
融合させた。次に、酵母における選択及び対抗選択のためのLEU2及びCYH
2を含むベクターにおいて、これをより大きなAd5断片に埋め込むことでE1
B::GFP融合の両側にAd5配列を隣接させた。
5kの一部を含むAd5断片をPCRによって増幅し、EGFPの5’−末端に
融合させた。次に、酵母における選択及び対抗選択のためのLEU2及びCYH
2を含むベクターにおいて、これをより大きなAd5断片に埋め込むことでE1
B::GFP融合の両側にAd5配列を隣接させた。
【0079】 LGM YAC/BAC(pMB26):pMB25内のE1B::GFP融
合を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入した。生じたプラ
スミドを大腸菌に移入して配列決定及び哺乳動物細胞への形質移入に十分なDN
Aを産生させた。大腸菌からのプラスミドをPacIで切断してAd5インサー
トを放出させた後、293細胞に形質移入してウイルスを作製した。
合を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入した。生じたプラ
スミドを大腸菌に移入して配列決定及び哺乳動物細胞への形質移入に十分なDN
Aを産生させた。大腸菌からのプラスミドをPacIで切断してAd5インサー
トを放出させた後、293細胞に形質移入してウイルスを作製した。
【0080】 E2−Tcfx3/4突然変異(pMB33/69):E2領域を含むAd5
断片を、酵母における選択及び対抗選択のためのURA3を含むベクターにクロ
ーン化した。E2プロモーターを逆PCRによって置換した。pMB33は3つ
のTcf部位を含む;pMB69は4つのTcf部位を含む。
断片を、酵母における選択及び対抗選択のためのURA3を含むベクターにクロ
ーン化した。E2プロモーターを逆PCRによって置換した。pMB33は3つ
のTcf部位を含む;pMB69は4つのTcf部位を含む。
【0081】 Ad−Tcfx3 YAC/BAC(pMB36):pMB33内のE2−T
cfx3置換配列を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入し
た。次に、このYAC/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作
製した。生じたウイルスをAd−Tcf3と呼ぶ。
cfx3置換配列を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入し
た。次に、このYAC/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作
製した。生じたウイルスをAd−Tcf3と呼ぶ。
【0082】 Ad−Tcfx4 YAC/BAC(pMB74):pMB69内のE2−T
cfx4置換配列を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入し
た。次に、このYAC/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作
製した。生じたウイルスをvMB12と呼ぶ。
cfx4置換配列を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入し
た。次に、このYAC/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作
製した。生じたウイルスをvMB12と呼ぶ。
【0083】 LGC YAC/BAC(pMB37):pMB33内のE2−Tcfx3変
異体を2工程遺伝子置換によってLGM YAC/BACに挿入した。次に、こ
のYAC/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作製した。
異体を2工程遺伝子置換によってLGM YAC/BACに挿入した。次に、こ
のYAC/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作製した。
【0084】 E2−Tcfx4/E3突然変異(pMB66):3回の連続する逆PCRに
おいてE2及びE3突然変異を導入した。E2の変化はpMB33と同様ではあ
るが4つのTcf部位を用いて作製した。2工程遺伝子置換を可能にするため、
幾つかの追加Ad5配列をE3プロモーターの3’に付加した。
おいてE2及びE3突然変異を導入した。E2の変化はpMB33と同様ではあ
るが4つのTcf部位を用いて作製した。2工程遺伝子置換を可能にするため、
幾つかの追加Ad5配列をE3プロモーターの3’に付加した。
【0085】 Ad−Tcfx4/mutE3 YAC/BAC(pMB75):pMB66
内のE3突然変異及びE2−Tcfx4置換を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入した。次に、このYAC/BACを大腸菌及び293細
胞に移入してウイルスを作製した。生じたウイルスをvMB14と呼ぶ。
内のE3突然変異及びE2−Tcfx4置換を2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入した。次に、このYAC/BACを大腸菌及び293細
胞に移入してウイルスを作製した。生じたウイルスをvMB14と呼ぶ。
【0086】 Ad−Tcfx4/mutE3+ATF YAC/BAC(pMB73):p
MB66内のATF突然変異を除くE3突然変異及びE2−Tcfx4置換を2
工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入した。次に、このYAC
/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作製した。生じたウイル
スをvMB13と呼ぶ。
MB66内のATF突然変異を除くE3突然変異及びE2−Tcfx4置換を2
工程遺伝子置換によってAd5 YAC/BACに挿入した。次に、このYAC
/BACを大腸菌及び293細胞に移入してウイルスを作製した。生じたウイル
スをvMB13と呼ぶ。
【0087】 注:pMB73及び75の両者は2工程遺伝子置換によってAd5 YAC/
BACにおいてpMB66を用いて作製した。組み込み部位近傍の突然変異は2
工程遺伝子置換によっては常に移入されることはない。ATF部位は組み込み部
位に最も近いため、pMB73はATF部位の突然変異を欠いている。 詳細な手順: pMB20:Ad5ゲノムDNAをSalIで切断したpMB19にギャップ
修復で組み込んだ。pMB19は、酵母複製起点(pH4ARS由来、Bouton及
びSmith、1986)を既に末端Ad5断片を含むベクター(pMB10)のSac
I部位に挿入することによって作製した。出発ベクター(pNKBAC39、La
rionovら、1996)はARSを必要としないことが期待されたが、この仮定は間違
っていることが立証された。最初にPCRによってAd5末端断片をpUC19
誘導ベクターにクローン化し(pMB1及びpMB2を得る)、次にpNKBA
C39のBamHI/Bsu36I部位に連続的に移入した。PacI部位はp
MB1及びpMB2の作製に用いたG76プライマーに存在していた(プライマ
ーG74−G76及びG75−G76を用いるPCRは390及び356bpの
Ad5断片をもたらす)。
BACにおいてpMB66を用いて作製した。組み込み部位近傍の突然変異は2
工程遺伝子置換によっては常に移入されることはない。ATF部位は組み込み部
位に最も近いため、pMB73はATF部位の突然変異を欠いている。 詳細な手順: pMB20:Ad5ゲノムDNAをSalIで切断したpMB19にギャップ
修復で組み込んだ。pMB19は、酵母複製起点(pH4ARS由来、Bouton及
びSmith、1986)を既に末端Ad5断片を含むベクター(pMB10)のSac
I部位に挿入することによって作製した。出発ベクター(pNKBAC39、La
rionovら、1996)はARSを必要としないことが期待されたが、この仮定は間違
っていることが立証された。最初にPCRによってAd5末端断片をpUC19
誘導ベクターにクローン化し(pMB1及びpMB2を得る)、次にpNKBA
C39のBamHI/Bsu36I部位に連続的に移入した。PacI部位はp
MB1及びpMB2の作製に用いたG76プライマーに存在していた(プライマ
ーG74−G76及びG75−G76を用いるPCRは390及び356bpの
Ad5断片をもたらす)。
【0088】 pMB25:EGFPベクターはClontechからの改変ベクターである。これは
pEGFP−C1に由来するGFPの5’末端及びphGFP−S65Tに由来
するGFPの3’末端を有する。そのAd5 PCR断片(nt2019−22
61、プライマーG77−78)をEGFPの5’末端のNheI及びAgeI
部位にクローン化し、pMB7を得た。E1領域を含むSmaI Ad5断片(
nt1007−3940)をBluescriptにクローン化し、pMB22を得た。E
1B::GFP融合(NotI/KpnI)をpMB22(BglII/Kpn
I)にクローン化し、pMB24を得た。Ad5インサートを含むpMB24の
XhoI/BamHI断片をp680(Ketnerら、1994)にクローン化し、pM
B25を得た。
pEGFP−C1に由来するGFPの5’末端及びphGFP−S65Tに由来
するGFPの3’末端を有する。そのAd5 PCR断片(nt2019−22
61、プライマーG77−78)をEGFPの5’末端のNheI及びAgeI
部位にクローン化し、pMB7を得た。E1領域を含むSmaI Ad5断片(
nt1007−3940)をBluescriptにクローン化し、pMB22を得た。E
1B::GFP融合(NotI/KpnI)をpMB22(BglII/Kpn
I)にクローン化し、pMB24を得た。Ad5インサートを含むpMB24の
XhoI/BamHI断片をp680(Ketnerら、1994)にクローン化し、pM
B25を得た。
【0089】 pMB33:Ad5 PCR断片(nt26688−27593、プライマー
G61−G62を用いるPCR、産生物をSacI/KpnIで切断)をpRS
406のKpnI/SacI部位にクローン化し、pMB32を得た。これを、
プライマーG63−G64を用いてTcf部位を挿入する逆PCRによって変異
誘発した。これらのプライマーは4つのTcf部位をもたらすはずであったが、
それに続いて最初のTcf部位は突然変異を含むことが見出され、そのため最終
ベクターは3つのTcf部位のみを含む。
G61−G62を用いるPCR、産生物をSacI/KpnIで切断)をpRS
406のKpnI/SacI部位にクローン化し、pMB32を得た。これを、
プライマーG63−G64を用いてTcf部位を挿入する逆PCRによって変異
誘発した。これらのプライマーは4つのTcf部位をもたらすはずであったが、
それに続いて最初のTcf部位は突然変異を含むことが見出され、そのため最終
ベクターは3つのTcf部位のみを含む。
【0090】 pMB66:4つの正しいTcf部位を有するpMB33をpMB69と呼ぶ
。pMB69をプライマーG89及びG90を用いる逆PCRによって変異誘発
し、pMB46を得た。pMB46をプライマーG87及びG88を用いる逆P
CRによって変異誘発し、E2に4つのTcf部位及びE3に全ての望ましい突
然変異を含むpMB49を得た。2工程遺伝置換を容易にするのに用いられるA
d5 PCR断片(nt27331−27689、プライマーG100−G10
1)をEcoRI及びPstIで切断し、Bluescriptにクローン化してpMB5
8を得た。まず、この3’伸長を、E2に4つのTcf部位を有し、かつ野生型
E3プロモーターを有するベクターの創出に用い(pMB58に由来するEco
RI/PstI断片をpMB49のEcoRI/SacI部位に挿入した)、p
MB63を得た。次に、E3突然変異をこのベクターにクローン化して戻し(p
MB49に由来するSacI/KpnI断片をpMB63のSacI/KpnI
部位にクローン化した)、pMB66を得た。
。pMB69をプライマーG89及びG90を用いる逆PCRによって変異誘発
し、pMB46を得た。pMB46をプライマーG87及びG88を用いる逆P
CRによって変異誘発し、E2に4つのTcf部位及びE3に全ての望ましい突
然変異を含むpMB49を得た。2工程遺伝置換を容易にするのに用いられるA
d5 PCR断片(nt27331−27689、プライマーG100−G10
1)をEcoRI及びPstIで切断し、Bluescriptにクローン化してpMB5
8を得た。まず、この3’伸長を、E2に4つのTcf部位を有し、かつ野生型
E3プロモーターを有するベクターの創出に用い(pMB58に由来するEco
RI/PstI断片をpMB49のEcoRI/SacI部位に挿入した)、p
MB63を得た。次に、E3突然変異をこのベクターにクローン化して戻し(p
MB49に由来するSacI/KpnI断片をpMB63のSacI/KpnI
部位にクローン化した)、pMB66を得た。
【0091】 pMB67:2つのTcf部位を有するE2プロモーターを、pMB33と同
様ではあるがプライマーG91及びG92を逆PCRに用いて構築し、pMB4
5を得た。2つのTcf部位を含むEcoRI/Eco47III断片をpMB
45からpMB66に移入し、pMB67を得た。
様ではあるがプライマーG91及びG92を逆PCRに用いて構築し、pMB4
5を得た。2つのTcf部位を含むEcoRI/Eco47III断片をpMB
45からpMB66に移入し、pMB67を得た。
【0092】
【化1】
【0093】
【0094】
【0095】 手順に関する以下の文献は、参考文献として本明細書中に援用される。
【0096】
【表1】
【0097】
【化2】
【0098】
【0099】 注:3TcfベクターはPCRクローン化人工産物から生じる4Tcfベクタ
ーの変異体形態である(第1Tcf部位に1つのA欠失が存在する)。これはA
d−Tcf3及びLGCウイルス内に存在する配列である。 E3プロモーター結合部位 4つの部位がE3プロモーター内でDNアーゼIフットプリント法によってH
ela細胞において同定されている(Garcia 1987、Hurst 1987)。部位1はTAT
Aボックスをカバーし、残りの部位(図1ないし3において下線が付され、H2
−H4とマークされている)にはATF、AP1及びNF1が結合している。2
つの部位がDNアーゼIフットプリント法によってリンパ細胞において同定され
ており(Williams 1990)(図1ないし3において下線が付され、L1及びL2
とマークされている)、これらはNFκBファミリーのメンバーと結合する。
ーの変異体形態である(第1Tcf部位に1つのA欠失が存在する)。これはA
d−Tcf3及びLGCウイルス内に存在する配列である。 E3プロモーター結合部位 4つの部位がE3プロモーター内でDNアーゼIフットプリント法によってH
ela細胞において同定されている(Garcia 1987、Hurst 1987)。部位1はTAT
Aボックスをカバーし、残りの部位(図1ないし3において下線が付され、H2
−H4とマークされている)にはATF、AP1及びNF1が結合している。2
つの部位がDNアーゼIフットプリント法によってリンパ細胞において同定され
ており(Williams 1990)(図1ないし3において下線が付され、L1及びL2
とマークされている)、これらはNFκBファミリーのメンバーと結合する。
【0100】 このプロモーターを不活性化するため、逆PCRによって突然変異を導入した
。TATAボックスを除く全ての部位が少なくとも1つの突然変異を含む。これらの
突然変異はタンパク質レベルでは沈黙している。L1、L2及びH2ボックスは
高度に保存された残基の複数の置換を含む。H4ボックスは、代替コドンの選択
の制限のため、比較的保存が不十分な残基に1つの突然変異を含む。H4部位の
突然変異は、この部位の欠失がHela細胞におけるE3の転写に対して何ら効
果がないため、重要なものではなかった(Garcia 1987)。公開されたAP1部
位(TGAC)における最も保存された残基のあらゆる修飾がタンパク質配列を変化
させるため、H3ボックス内の比較的弱く保存された残基のみに突然変異を誘発
した。公開された部位の僅かに3’側 (依然として公開されたフットプリント
内)にAP1部位とのより良好な一致が存在する;導入された突然変異はこの部
位を完全に破壊する。 E1Bプロモーターを制御する4Tcf部位を含むウイルスの構築 pMB22(BluescriptにおけるE1領域)はLGMウイルスの構築において
説明される。
。TATAボックスを除く全ての部位が少なくとも1つの突然変異を含む。これらの
突然変異はタンパク質レベルでは沈黙している。L1、L2及びH2ボックスは
高度に保存された残基の複数の置換を含む。H4ボックスは、代替コドンの選択
の制限のため、比較的保存が不十分な残基に1つの突然変異を含む。H4部位の
突然変異は、この部位の欠失がHela細胞におけるE3の転写に対して何ら効
果がないため、重要なものではなかった(Garcia 1987)。公開されたAP1部
位(TGAC)における最も保存された残基のあらゆる修飾がタンパク質配列を変化
させるため、H3ボックス内の比較的弱く保存された残基のみに突然変異を誘発
した。公開された部位の僅かに3’側 (依然として公開されたフットプリント
内)にAP1部位とのより良好な一致が存在する;導入された突然変異はこの部
位を完全に破壊する。 E1Bプロモーターを制御する4Tcf部位を含むウイルスの構築 pMB22(BluescriptにおけるE1領域)はLGMウイルスの構築において
説明される。
【0101】 1.pRDI−238 = pMB22から、逆PCRにより、Tcf部位を
挿入してSp1部位を欠失させる。 プライマー:
挿入してSp1部位を欠失させる。 プライマー:
【0102】
【化3】 tCCCTTTGATCTccaaCCCTTTGATCTAGTCCtatataatgcgccgtg 及び tccAGATCAAAGGGattaAGATCAAAGGGatttaacacgccatgcaa。 Tcf部位とTATAボックスとの間の下線が付された配列はE2プロモーターにお
けるものと同一である(すなわち、E1Bプロモーター配列ではない)。これは
、この間隔及び配列がこのプロモーターの良好な調節に適合することを我々が知
っていたためである。
けるものと同一である(すなわち、E1Bプロモーター配列ではない)。これは
、この間隔及び配列がこのプロモーターの良好な調節に適合することを我々が知
っていたためである。
【0103】 2.pRDI−239 = Tcf突然変異を含む小断片を酵母組み込みベク
ター(integrating vector)に移入する。pRDI−238 EcoRI/Sa
cI断片をpRS406の同じ部位にクローン化した。
ター(integrating vector)に移入する。pRDI−238 EcoRI/Sa
cI断片をpRS406の同じ部位にクローン化した。
【0104】 3.pRDI−241 = E1B−Tcf酵母組み込みベクター。pMB2
2に由来するE1B含有2kb SacI断片をpRDI−239の同じ部位に
クローン化し、YAC/BACでの組換えのためのさらなる配列を得た。
2に由来するE1B含有2kb SacI断片をpRDI−239の同じ部位に
クローン化し、YAC/BACでの組換えのためのさらなる配列を得た。
【0105】 4.YAC/BACにおける2工程遺伝子置換。pRDI−241をXbaI
で切断し、アデノYAC/BACを含む酵母(yMB株)に移入した。組み込み
及び切除について選択するため、形質転換体をura−、次いで5−FOA培地
で平板培養した。その後、プラスミドをDH10Bに回収した: pRDI−243=yMB2(野生型Ad5)に由来する組換え体 pRDI−268=yMB15(4xTcf−E2、wtE3)に由来する
組換え体 pRDI−254=yMB13(4xTcf−E2、変異体E3+wtAT
F)に由来する組換え体 pRDI−264=yMB17(4xTcf−E2、完全変異体E3)に由
来する組換え体 5.これらのプラスミドをPacIで切断し、活性化Tcf(ΔNβ−カテニ
ン、Dr H Cleversからの供給を受けた)を含む293細胞(ATCC CRL1
573)に移入して組換えアデノウイルスを産生した: vMB15=pRDI−243の形質移入から誘導されるウイルスプール vMB16=pRDI−268の形質移入から誘導されるウイルスプール vMB17=pRDI−254の形質移入から誘導されるウイルスプール vMB18=pRDI−264の形質移入から誘導されるウイルスプール 6.ウイルスをSW480細胞でプラーク精製した。これは、これらの細胞が
活性Tcfを含み、かつウイルスゲノムが使用して組換え可能である内在性E1
B配列をもたないためである。次に、ウイルスをSW480で増幅させ、Cs結
合によって精製し、E1B及びE2/E3領域における制限消化及び配列決定に
よってチェックした。プラーク精製ウイルスには以下の名称を与えた: vMB23=E1Bプロモーター内に4xTcf部位を有するAd5 vMB27=E1B及びE2プロモーターの両者に4xTcf部位を有する
Ad5 vMB31=E1B及びE2プロモーター内に4xTcf部位を有し、かつ
野生型ATF部位を有する変異体E3プロモーターを伴うAd5 vMB19=E1B及びE2プロモーター内に4xTcf部位を有し、かつ
完全な変異体E3プロモーターを伴うAd5 結果: Tcfレポーターを用いるルシフェラーゼアッセイでは、p53変異体肺カル
チノーマ細胞(H1299)がTcf活性を欠き、p53変異体結腸カルチノー
マ細胞(SW480)が強いTcf活性を有することが示される。したがって、
Tcf活性を含む細胞に対して選択的なウイルスはSW480では複製するが、
H1299では複製しないはずである。本発明者らは、Tcf変異体E2プロモ
ーターを有する適合ウイルスがE2遺伝子産生物を優先的に発現することをウェ
スタンブロット法により;より良好に複製することをスロットブロット法及び定
量的PCRにより;並びにH1299よりもSW480においてより高い細胞変
性効果を有することを示している。E2プロモーターの突然変異単独での比較的
穏やかな効果は、ウイルスがE1B 55kをも欠くとき、大幅に増強される。
E1B 55kの突然変異は、E2後期プロモーターから転写されるDBP m
RNAの核外移行を減少させる。DBPは早期及び後期E2プロモーターの両者
から発現され得る。本発明者らは、DBPの発現におけるE1B 55k依存性
の減少がE2早期プロモーターにおけるTcf突然変異によって救われることを
示している。これと一致して、LGCから発現されるDBPのレベルはH129
9において大きく低下する。このE1B 55kの効果は、いずれの細胞系もp
53を含まないという事実から明らかなように、p53とは全く無関係である。 ウェスタンブロット H1299及びSW480に0.2のmoiで野生型Ad5、Ad−Tcf3
、LGM及びLGCを感染させた。ウェスタンブロット測定のために細胞を24
、48及び72時間後に収集した。ブロットをDBPに対する抗体で探索した。
野生型Ad5はSW480及びH1299において比較し得るタンパク質の発現
をもたらした。Ad−Tcf3はH1299よりもSW480においてDBPの
僅かに強い発現をもたらした。Ad−Tcf3はSW480において24時間後
に野生型Ad5よりも高いDBPの発現をもたらしたが、48及び72時間後に
は野生型Ad5と同様であった。DBPはH12299においてはLGCよりも
LGMによってより良好に発現したが、両ウイルスはSW480においては匹敵
するDBPの発現をもたらした。
で切断し、アデノYAC/BACを含む酵母(yMB株)に移入した。組み込み
及び切除について選択するため、形質転換体をura−、次いで5−FOA培地
で平板培養した。その後、プラスミドをDH10Bに回収した: pRDI−243=yMB2(野生型Ad5)に由来する組換え体 pRDI−268=yMB15(4xTcf−E2、wtE3)に由来する
組換え体 pRDI−254=yMB13(4xTcf−E2、変異体E3+wtAT
F)に由来する組換え体 pRDI−264=yMB17(4xTcf−E2、完全変異体E3)に由
来する組換え体 5.これらのプラスミドをPacIで切断し、活性化Tcf(ΔNβ−カテニ
ン、Dr H Cleversからの供給を受けた)を含む293細胞(ATCC CRL1
573)に移入して組換えアデノウイルスを産生した: vMB15=pRDI−243の形質移入から誘導されるウイルスプール vMB16=pRDI−268の形質移入から誘導されるウイルスプール vMB17=pRDI−254の形質移入から誘導されるウイルスプール vMB18=pRDI−264の形質移入から誘導されるウイルスプール 6.ウイルスをSW480細胞でプラーク精製した。これは、これらの細胞が
活性Tcfを含み、かつウイルスゲノムが使用して組換え可能である内在性E1
B配列をもたないためである。次に、ウイルスをSW480で増幅させ、Cs結
合によって精製し、E1B及びE2/E3領域における制限消化及び配列決定に
よってチェックした。プラーク精製ウイルスには以下の名称を与えた: vMB23=E1Bプロモーター内に4xTcf部位を有するAd5 vMB27=E1B及びE2プロモーターの両者に4xTcf部位を有する
Ad5 vMB31=E1B及びE2プロモーター内に4xTcf部位を有し、かつ
野生型ATF部位を有する変異体E3プロモーターを伴うAd5 vMB19=E1B及びE2プロモーター内に4xTcf部位を有し、かつ
完全な変異体E3プロモーターを伴うAd5 結果: Tcfレポーターを用いるルシフェラーゼアッセイでは、p53変異体肺カル
チノーマ細胞(H1299)がTcf活性を欠き、p53変異体結腸カルチノー
マ細胞(SW480)が強いTcf活性を有することが示される。したがって、
Tcf活性を含む細胞に対して選択的なウイルスはSW480では複製するが、
H1299では複製しないはずである。本発明者らは、Tcf変異体E2プロモ
ーターを有する適合ウイルスがE2遺伝子産生物を優先的に発現することをウェ
スタンブロット法により;より良好に複製することをスロットブロット法及び定
量的PCRにより;並びにH1299よりもSW480においてより高い細胞変
性効果を有することを示している。E2プロモーターの突然変異単独での比較的
穏やかな効果は、ウイルスがE1B 55kをも欠くとき、大幅に増強される。
E1B 55kの突然変異は、E2後期プロモーターから転写されるDBP m
RNAの核外移行を減少させる。DBPは早期及び後期E2プロモーターの両者
から発現され得る。本発明者らは、DBPの発現におけるE1B 55k依存性
の減少がE2早期プロモーターにおけるTcf突然変異によって救われることを
示している。これと一致して、LGCから発現されるDBPのレベルはH129
9において大きく低下する。このE1B 55kの効果は、いずれの細胞系もp
53を含まないという事実から明らかなように、p53とは全く無関係である。 ウェスタンブロット H1299及びSW480に0.2のmoiで野生型Ad5、Ad−Tcf3
、LGM及びLGCを感染させた。ウェスタンブロット測定のために細胞を24
、48及び72時間後に収集した。ブロットをDBPに対する抗体で探索した。
野生型Ad5はSW480及びH1299において比較し得るタンパク質の発現
をもたらした。Ad−Tcf3はH1299よりもSW480においてDBPの
僅かに強い発現をもたらした。Ad−Tcf3はSW480において24時間後
に野生型Ad5よりも高いDBPの発現をもたらしたが、48及び72時間後に
は野生型Ad5と同様であった。DBPはH12299においてはLGCよりも
LGMによってより良好に発現したが、両ウイルスはSW480においては匹敵
するDBPの発現をもたらした。
【0106】 これらの結果は、肺細胞よりも結腸細胞においてより強力に活性化されるTc
f変異体E2プロモーターと一致する。 ウイルスDNA複製アッセイ H1299及びSW480に0.2のmoiで野生型Ad5、Ad−Tcf3
、LGM及びLGCを感染させた。DNA抽出のため、細胞を0、24、48及
び72時間後に収集した。全ての試料をスロットブロット処理し、32P標識アデ
ノウイルスDNA(図8A)又は対照ヒトゲノムDNA(図8B)とハイブリダ
イズさせた。これによりLGMの複製は両細胞系において示されたが、LGCの
複製はSW480においてのみ示された(ホスホイメージャー(phosphorimager
)によって測定された実際の値は背景に等しい)。差をより正確に算出するため
、Ad5プライマー(図9)を用いるTaqman定量PCRアッセイ(Perkin Elmer
)によって72時間試料を試験した。これによりスロットブロットの結果が確認
された:LGCはSW480においては野生型Ad5よりも2倍劣るが、H129
9においては3000倍劣る。LGMはSW480においては野生型Ad5より
も10倍劣るが、H1299においては4倍劣る。Ad−Tcf3も、劇的では
ないものの、SW480に対する幾らかの選択性を示す:SW480においては
野生型Ad5よりも1.3倍勝るが、H1299においては7.4倍劣る。
f変異体E2プロモーターと一致する。 ウイルスDNA複製アッセイ H1299及びSW480に0.2のmoiで野生型Ad5、Ad−Tcf3
、LGM及びLGCを感染させた。DNA抽出のため、細胞を0、24、48及
び72時間後に収集した。全ての試料をスロットブロット処理し、32P標識アデ
ノウイルスDNA(図8A)又は対照ヒトゲノムDNA(図8B)とハイブリダ
イズさせた。これによりLGMの複製は両細胞系において示されたが、LGCの
複製はSW480においてのみ示された(ホスホイメージャー(phosphorimager
)によって測定された実際の値は背景に等しい)。差をより正確に算出するため
、Ad5プライマー(図9)を用いるTaqman定量PCRアッセイ(Perkin Elmer
)によって72時間試料を試験した。これによりスロットブロットの結果が確認
された:LGCはSW480においては野生型Ad5よりも2倍劣るが、H129
9においては3000倍劣る。LGMはSW480においては野生型Ad5より
も10倍劣るが、H1299においては4倍劣る。Ad−Tcf3も、劇的では
ないものの、SW480に対する幾らかの選択性を示す:SW480においては
野生型Ad5よりも1.3倍勝るが、H1299においては7.4倍劣る。
【0107】 これらの結果は、より多いウイルスの複製を生じることになる、結腸細胞にお
けるTcf変異体E2プロモーターのpol及びpTPのより強い発現と一致す
る。加えて、このデータは、E2プロモーターの突然変異とE1B 55kの欠
失との組み合わせがTcf活性を欠く細胞において例外的に少ない複製を生じる
ことを示す。 細胞変性効果(CPE)アッセイ H1299及びSW480に5倍希釈の野生型Ad5、Ad−Tcf3、LG
M及びLGCを感染させた(ウェル1において0.6のmoi、ウェル5におい
て0.001のmoi)。8日後に皿をクリスタルバイオレッドで染色した。H
1299における野生型Ad5では最高希釈でさえCPEが明らかである。野生
型Ad5はSW480においてはH1299よりも活性が5倍劣る。
けるTcf変異体E2プロモーターのpol及びpTPのより強い発現と一致す
る。加えて、このデータは、E2プロモーターの突然変異とE1B 55kの欠
失との組み合わせがTcf活性を欠く細胞において例外的に少ない複製を生じる
ことを示す。 細胞変性効果(CPE)アッセイ H1299及びSW480に5倍希釈の野生型Ad5、Ad−Tcf3、LG
M及びLGCを感染させた(ウェル1において0.6のmoi、ウェル5におい
て0.001のmoi)。8日後に皿をクリスタルバイオレッドで染色した。H
1299における野生型Ad5では最高希釈でさえCPEが明らかである。野生
型Ad5はSW480においてはH1299よりも活性が5倍劣る。
【0108】 Ad−Tcf3はH1299においては野生型Ad5よりも活性が5倍劣る。
LGMはH1299においては野生型Ad5よりも活性が125倍劣る。LGC
はH1299においては野生型Ad5よりも活性が625倍劣る。したがって、
E2プロモーターにおけるTcf3突然変異は、H1299において、CPEの
5倍の減少を生じる。Ad−Tcf3はSW480においては野生型Ad5に類
似し、Tcf活性を含む細胞においては活性が5倍増加することが示される。L
GCは、SW480においては、LGMよりも5倍活性である。
LGMはH1299においては野生型Ad5よりも活性が125倍劣る。LGC
はH1299においては野生型Ad5よりも活性が625倍劣る。したがって、
E2プロモーターにおけるTcf3突然変異は、H1299において、CPEの
5倍の減少を生じる。Ad−Tcf3はSW480においては野生型Ad5に類
似し、Tcf活性を含む細胞においては活性が5倍増加することが示される。L
GCは、SW480においては、LGMよりも5倍活性である。
【0109】 LGCはTcf活性を欠く細胞においては野生型Ad5よりも活性が625倍
劣るが、Tcf活性を含む細胞においては活性が5倍劣るだけである。これは、
結腸細胞に対する125倍の選択性、及び単純E1B 55k不全ウイルスより
も5倍高い活性を表す。
劣るが、Tcf活性を含む細胞においては活性が5倍劣るだけである。これは、
結腸細胞に対する125倍の選択性、及び単純E1B 55k不全ウイルスより
も5倍高い活性を表す。
【0110】 さらなるCPEアッセイを、上述のウイルスAd−Tcf3、LGM及びLG
Cを用いて、SW480細胞及び正常肺線維芽細胞で行った。Ad−Tcf3は
SW480では野生型の活性をもたらしたが、正常線維芽細胞では活性が5倍劣
っていた。この実験においては、LGM及びLGCの両者は、SW480では野
生型Ad5よりも約125倍劣る活性をもたらしたが、正常線維芽細胞ではそれ
ぞれ5倍及び>125倍劣る活性をもたらした。
Cを用いて、SW480細胞及び正常肺線維芽細胞で行った。Ad−Tcf3は
SW480では野生型の活性をもたらしたが、正常線維芽細胞では活性が5倍劣
っていた。この実験においては、LGM及びLGCの両者は、SW480では野
生型Ad5よりも約125倍劣る活性をもたらしたが、正常線維芽細胞ではそれ
ぞれ5倍及び>125倍劣る活性をもたらした。
【0111】 Ad−Tcf3の選択性及び効力は、それ自体ONYX−015ウイルスと同
じ特性を本質的に有するLGMよりも大きいことが示される。 4xTcfウイルスvMB12、13、14及び19 方法:細胞系:SW480及びCol15結腸直腸カルチノーマ細胞はDr B Sor
datによる供給を受けた。WI38細胞はATCCによる供給を受けた。H12
99細胞はDr C Privesによる供給を受けたものであり、tet−VP16トラ
ンス活性化因子が組み込まれている(Chen, X., et al. 1996. Genes Dev 10, 2
438-51)。 Taqmanアッセイ DMEM10%FCS中において、300(SW480及びH1299)又は
1000(WI38)ウイルス粒子/細胞で細胞を感染させた。感染の2時間後
、培地を除去し、10mMヒドロキシ尿素を含む2mlの新鮮なDMEM10%
FCSで置き換えた。感染の24時間後、細胞を1×PBSで洗浄し、RNA抽
出用のバッファRLT(Qiagen RNeasy Mini Kit、Ref. 74104から)又はDNA
抽出用の、1×PBS、バッファAL及びプロテイナーゼK溶液を含む混合液(
Qiagen DNeasy Tissue Kit、Ref. 69504から)のいずれかで溶解する。RNA及
びDNAの抽出は製造者の指示に従って行った。1μgの全RNA及びMMLV Sup
erscript Core Reagents(LifeTechnologies、Ref. 18064022)を用いて20μ
lの反応容積で逆転写(RT)を行った。TaqMan Universal PCR Master Mix Ki
t(Perkin Elmer、Ref. 4304447)、900nMのプライマー(Microsynth and
Eurogentec)及び500nMのTaqManプローブ(Eurogentec)を用いてTaqMan
PCR反応を行った。Sybr green Universal PCR Master Mix Kit(Perkin Elme
r、Ref. 4309155)及び900nMの線維遺伝子プライマー(fibre gene primer
s)(Eurogentec)を用いてSybr green PCR反応を行った。このPCR反応に
用いられるテンプレートの量は1μgのゲノムDNA又は5μlのRT反応容積
であった。DNAの結果はOD260に対して正規化し、RNAの結果はリボソー
ムRNA(Ribosomal RNA Control、Perkin Elmer、ref 4310893E)に対して正
規化した。定量PCR用のプライマー及びプローブは以下の通りであった。
じ特性を本質的に有するLGMよりも大きいことが示される。 4xTcfウイルスvMB12、13、14及び19 方法:細胞系:SW480及びCol15結腸直腸カルチノーマ細胞はDr B Sor
datによる供給を受けた。WI38細胞はATCCによる供給を受けた。H12
99細胞はDr C Privesによる供給を受けたものであり、tet−VP16トラ
ンス活性化因子が組み込まれている(Chen, X., et al. 1996. Genes Dev 10, 2
438-51)。 Taqmanアッセイ DMEM10%FCS中において、300(SW480及びH1299)又は
1000(WI38)ウイルス粒子/細胞で細胞を感染させた。感染の2時間後
、培地を除去し、10mMヒドロキシ尿素を含む2mlの新鮮なDMEM10%
FCSで置き換えた。感染の24時間後、細胞を1×PBSで洗浄し、RNA抽
出用のバッファRLT(Qiagen RNeasy Mini Kit、Ref. 74104から)又はDNA
抽出用の、1×PBS、バッファAL及びプロテイナーゼK溶液を含む混合液(
Qiagen DNeasy Tissue Kit、Ref. 69504から)のいずれかで溶解する。RNA及
びDNAの抽出は製造者の指示に従って行った。1μgの全RNA及びMMLV Sup
erscript Core Reagents(LifeTechnologies、Ref. 18064022)を用いて20μ
lの反応容積で逆転写(RT)を行った。TaqMan Universal PCR Master Mix Ki
t(Perkin Elmer、Ref. 4304447)、900nMのプライマー(Microsynth and
Eurogentec)及び500nMのTaqManプローブ(Eurogentec)を用いてTaqMan
PCR反応を行った。Sybr green Universal PCR Master Mix Kit(Perkin Elme
r、Ref. 4309155)及び900nMの線維遺伝子プライマー(fibre gene primer
s)(Eurogentec)を用いてSybr green PCR反応を行った。このPCR反応に
用いられるテンプレートの量は1μgのゲノムDNA又は5μlのRT反応容積
であった。DNAの結果はOD260に対して正規化し、RNAの結果はリボソー
ムRNA(Ribosomal RNA Control、Perkin Elmer、ref 4310893E)に対して正
規化した。定量PCR用のプライマー及びプローブは以下の通りであった。
【0112】
【化4】 E2早期正プライマー:TTCGCTTTTGTGATACAGGCA E2早期逆プライマー:GTCTTGGACGCGACGAGAAG E2プローブ:CGGAGCGTTTGCCGCGC E3正プライマー:AGCTCGGAGAGGTTCTCTCGTAG E3逆プライマー:AACACCTGGTCCACTGTCGC E3プローブ:CCGCGACTCCGTTTCAACCCAGA E1B−55k正プライマー:TGCTTCCATCAAACGAGTTGG E1B−55k逆プライマー:GCGCTGAGTTTGGCTCTAGC E1B−55kプローブ:CGGCGGCTGCTCAATCTGTATCTTCA E4正プライマー:GGTTGATTCATCGGTCAGTGC E4逆プライマー:ACGCCTGCGGGTATGTATTC E4プローブ:AAAAGCGACCGAAATAGCCCG 線維正プライマー:TGATGTTTGACGCTACAGCCATA 線維逆プライマー:GGGATTTGTGTTTGGTGCATTAG
【0113】 ウェスタンブロット分析 DMEM10%FCS中において、300(SW480及びH1299)又は
1000(WI38)ウイルス粒子/細胞のいずれかで細胞を感染させた。感染
の2時間後、培地を除去し、2mlの新鮮なDMEM10%FCSで置き換えた
。感染の24時間後に細胞を収集した。免疫ブロットをHarlow及びLaneによって
記述される通りに行った(Antibodies: A laboratory manual, New York: Cold
Spring Harbor Laboratory Press, 1988、参照することにより本明細書に組み込
まれる)。2A6抗E1B55K抗体(Sarnow P. et al. Virology, 1982, 120
: 510-517)及びB6抗DBF抗体(Reich N. et al. Virology, 1983, 128: 48
0-484)の両者はDr. A. Levineが提供した。検出はHRP結合ウサギ抗マウスI
gG(DAKO A/S、デンマーク)及び化学発光(Amersham、Little Chalfont、U
K)で行った。 プラークアッセイ DMEM10%FCS中において、300(SW480及びH1299)又は
1000(WI38)ウイルス粒子/細胞のいずれかで細胞を2回感染させた。
37℃で2時間インキュベートした後、培地を除去し、2mlの新鮮なDMEM
10%FCSで置き換えた。さらに48時間後、細胞を培養培地内に擦り落とし
、3サイクルの凍結−解凍によって溶解した。複製された時点の各々の上清を、
プラークアッセイを半固体アガロースの下で8−10日間、SW480細胞で3
回行うことにより、ウイルスの産生について試験した。 細胞変性効果アッセイ 細胞変性効果アッセイのため、SW480及びH1299細胞を96ウェルプ
レートに3通りに塗布し、1000ないし0.06ウイルス粒子/細胞の5倍希
釈のウイルスで感染させた。37℃で2時間インキュベートした後、さらに10
0μlのDMEM10%FCSを各ウェルに添加した。6日後、アッセイを終了
し、BCA Protein Assay Kit(Pierce、Rockford、IL、USA)を製造者の指
示に従って用いて各ウェル内のタンパク質含量を測定した。
1000(WI38)ウイルス粒子/細胞のいずれかで細胞を感染させた。感染
の2時間後、培地を除去し、2mlの新鮮なDMEM10%FCSで置き換えた
。感染の24時間後に細胞を収集した。免疫ブロットをHarlow及びLaneによって
記述される通りに行った(Antibodies: A laboratory manual, New York: Cold
Spring Harbor Laboratory Press, 1988、参照することにより本明細書に組み込
まれる)。2A6抗E1B55K抗体(Sarnow P. et al. Virology, 1982, 120
: 510-517)及びB6抗DBF抗体(Reich N. et al. Virology, 1983, 128: 48
0-484)の両者はDr. A. Levineが提供した。検出はHRP結合ウサギ抗マウスI
gG(DAKO A/S、デンマーク)及び化学発光(Amersham、Little Chalfont、U
K)で行った。 プラークアッセイ DMEM10%FCS中において、300(SW480及びH1299)又は
1000(WI38)ウイルス粒子/細胞のいずれかで細胞を2回感染させた。
37℃で2時間インキュベートした後、培地を除去し、2mlの新鮮なDMEM
10%FCSで置き換えた。さらに48時間後、細胞を培養培地内に擦り落とし
、3サイクルの凍結−解凍によって溶解した。複製された時点の各々の上清を、
プラークアッセイを半固体アガロースの下で8−10日間、SW480細胞で3
回行うことにより、ウイルスの産生について試験した。 細胞変性効果アッセイ 細胞変性効果アッセイのため、SW480及びH1299細胞を96ウェルプ
レートに3通りに塗布し、1000ないし0.06ウイルス粒子/細胞の5倍希
釈のウイルスで感染させた。37℃で2時間インキュベートした後、さらに10
0μlのDMEM10%FCSを各ウェルに添加した。6日後、アッセイを終了
し、BCA Protein Assay Kit(Pierce、Rockford、IL、USA)を製造者の指
示に従って用いて各ウェル内のタンパク質含量を測定した。
【0114】 異種移植片 100万個のCo115細胞をヌードマウスの横腹に皮下注射した。注射後4
−8日に、3×1010粒子のウイルス又はバッファを腫瘍に直接注射した。腫瘍
サイズをカリパスを用いて2次元で測定し、式:容積=0.4×長さ×幅2を用
いて腫瘍容積を算出した。 コットンラット(cotton rat)の肺 バッファ50μl中に3×1010粒子のウイルスを用いて、コットンラットの
鼻腔内に感染させた。3日後、これらの動物をイソフルランで殺し、肺の4つの
断片(左及び右上及び下葉から)を各動物から採取した。Qiagen DNeasy Tissue
Kitを用いてDNAを抽出し、各動物からの試料をプールした。ウイルスDNA
含量を、上述のように、E4プライマー及びプローブを用いるTaqman PCRに
より100ngの入力DNAを用いて決定した。
−8日に、3×1010粒子のウイルス又はバッファを腫瘍に直接注射した。腫瘍
サイズをカリパスを用いて2次元で測定し、式:容積=0.4×長さ×幅2を用
いて腫瘍容積を算出した。 コットンラット(cotton rat)の肺 バッファ50μl中に3×1010粒子のウイルスを用いて、コットンラットの
鼻腔内に感染させた。3日後、これらの動物をイソフルランで殺し、肺の4つの
断片(左及び右上及び下葉から)を各動物から採取した。Qiagen DNeasy Tissue
Kitを用いてDNAを抽出し、各動物からの試料をプールした。ウイルスDNA
含量を、上述のように、E4プライマー及びプローブを用いるTaqman PCRに
より100ngの入力DNAを用いて決定した。
【0115】 結果:vMB12、13、14及び19 E2プロモーターに4つのTcf部位を有するウイルスをSW480、H12
99及びWI38細胞において試験した。感染の24時間後に細胞を収集した。
DBPのウェスタンブロットは、SW480においては少なくとも野生型による
ものと同程度に変異体ウイルスによってDBPが発現するが、H1299及びW
I38細胞においてはかなり劣ることを示した: Taqman RT−PCR転写アッセイ(図10を参照)は、変異体ウイルスがS
W480細胞においては野生型レベルのE2 mRNAを有するものの、H12
99細胞においてはレベルが減少することを示す: Taqmanアッセイは、さらに、vMB14におけるE3プロモーターの突然変異
がE2(図10)及びE3 mRNA(図11)の両者のレベルを低下させるこ
とを示す: DNAの複製がプロモーターの突然変異によって影響を受けるかどうかを決定
するため、SW480及びH1299細胞に野生型、vMB12、13及び14
を感染させ、24時間で収集した。線維領域に由来するプライマーを用いるSybr
green PCRアッセイは、DNAの複製がSW480においては正常であるが
、H1299細胞においては減少することを示す(図12): ウイルスの複製がプロモーターの突然変異によって影響を受けるかどうかを決
定するため、SW480及びH1299細胞に野生型、vMB12、13及び1
4を感染させ、48時間で収集した。凍結−乾燥によって細胞を溶解し、SW4
80細胞でのプラーク形成アッセイによってウイルスの産生を測定した。これは
、変異体ウイルスがSW480においては野生型に匹敵するか、又はそれを上回
るが、H1299及びWI38細胞においては不完全であることを示した(図1
3を参照): ウイルスが結腸細胞に対する選択的毒性を示すかどうかを決定するため、細胞
変性効果アッセイをSW480及びH1299細胞に対して行った。これは、変
異体ウイルスがSW480細胞においては野生型に匹敵する(図14)ことを示
したが、H1299細胞においては細胞変性効果の低下を示した(図15): ウイルスがイン・ビボで治療効果を示すかどうかを決定するため、それらをヌ
ードマウスにおけるCo115結腸カルチノーマ異種移植片に注入した。これは
、全てのウイルスの腫瘍内注入が異種移植された結腸腫瘍の成長を遅延させ、ヌ
ードマウスの生存を長期化することを示した。vMB12及び13はvMB14
よりも有効であった(図16): E1Bの発現は、コットンラットの肺において、アデノウイルスによる炎症性
損傷の誘発に必要である(Ginsberg, H. S., et al 1999. PNAS 96, 10409-11)
。炎症反応の危険性を低下させるため、Tcf部位をE1Bプロモーターにクロ
ーン化した。生じるウイルスはE1B遺伝子産生物を結腸腫瘍細胞において発現
し、正常細胞においては発現しないはずである。炎症反応の危険性を低下させる
ことに加えて、これは、E1B 55kがE2後期mRNAの外部移行に必要で
あることが報告されているため、E2後期mRNAからのE2遺伝子産生物の発
現を減少させることも可能である。vMB14骨格にクローン化された変異体E
1Bプロモーターを有するウイルスはvMB19と呼ばれる。野生型、vMB1
4及びvMB19をSW480及びH1299細胞において試験した。感染の2
4時間後に細胞を収集した。E1B及びDBPのウェスタンブロットは、E1B
55kがSW480においては発現するが、H1299においては発現しない
ことを示した。vMB14及び19はH1299細胞において同様のDBP発現
をもたらし、この細胞系において少なくとも24時間の時点ではDBP後期mR
NAの外部移行に対するE1Bの高い効果は存在しないことが示唆される: 感染の24時間後のTaqman RT−PCR転写アッセイでは、vMB19がS
W480細胞においては野生型レベルのE1B、E2及びE3 mRNAを有す
るが、H1299細胞においてはレベルが低下していることが確認された(図1
7、18及び19): 感染の24時間後に、線維プライマーを用いるSybr green 定量PCRによっ
てウイルスDNAの複製を試験した。これは、両変異体ウイルスの複製がSW4
80細胞においては正常であるが、H1299細胞においては不完全であること
を示した。両変異体ウイルスは匹敵するものであり、ここでもやはり、この実験
においては、E1B 55kの発現の証明された減少(documented
reduction)には顕著な効果がないことが示唆される(図20): vMB19がイン・ビボの設定において正常細胞におけるDNAの複製の減少
を示すかどうかを決定するため、コットンラットの鼻腔内にウイルスを感染させ
、3日後に肺からDNAを抽出した。ラットは各ウイルスについて5匹の群で処
理した。E4プライマーを用いるTaqman 定量PCRは、野生型と比較して、v
MB19でウイルスDNA濃度の中央値50倍の減少を示した。 結論:vMB12、13、14及び19 これらのデータは以下のことを示す。
99及びWI38細胞において試験した。感染の24時間後に細胞を収集した。
DBPのウェスタンブロットは、SW480においては少なくとも野生型による
ものと同程度に変異体ウイルスによってDBPが発現するが、H1299及びW
I38細胞においてはかなり劣ることを示した: Taqman RT−PCR転写アッセイ(図10を参照)は、変異体ウイルスがS
W480細胞においては野生型レベルのE2 mRNAを有するものの、H12
99細胞においてはレベルが減少することを示す: Taqmanアッセイは、さらに、vMB14におけるE3プロモーターの突然変異
がE2(図10)及びE3 mRNA(図11)の両者のレベルを低下させるこ
とを示す: DNAの複製がプロモーターの突然変異によって影響を受けるかどうかを決定
するため、SW480及びH1299細胞に野生型、vMB12、13及び14
を感染させ、24時間で収集した。線維領域に由来するプライマーを用いるSybr
green PCRアッセイは、DNAの複製がSW480においては正常であるが
、H1299細胞においては減少することを示す(図12): ウイルスの複製がプロモーターの突然変異によって影響を受けるかどうかを決
定するため、SW480及びH1299細胞に野生型、vMB12、13及び1
4を感染させ、48時間で収集した。凍結−乾燥によって細胞を溶解し、SW4
80細胞でのプラーク形成アッセイによってウイルスの産生を測定した。これは
、変異体ウイルスがSW480においては野生型に匹敵するか、又はそれを上回
るが、H1299及びWI38細胞においては不完全であることを示した(図1
3を参照): ウイルスが結腸細胞に対する選択的毒性を示すかどうかを決定するため、細胞
変性効果アッセイをSW480及びH1299細胞に対して行った。これは、変
異体ウイルスがSW480細胞においては野生型に匹敵する(図14)ことを示
したが、H1299細胞においては細胞変性効果の低下を示した(図15): ウイルスがイン・ビボで治療効果を示すかどうかを決定するため、それらをヌ
ードマウスにおけるCo115結腸カルチノーマ異種移植片に注入した。これは
、全てのウイルスの腫瘍内注入が異種移植された結腸腫瘍の成長を遅延させ、ヌ
ードマウスの生存を長期化することを示した。vMB12及び13はvMB14
よりも有効であった(図16): E1Bの発現は、コットンラットの肺において、アデノウイルスによる炎症性
損傷の誘発に必要である(Ginsberg, H. S., et al 1999. PNAS 96, 10409-11)
。炎症反応の危険性を低下させるため、Tcf部位をE1Bプロモーターにクロ
ーン化した。生じるウイルスはE1B遺伝子産生物を結腸腫瘍細胞において発現
し、正常細胞においては発現しないはずである。炎症反応の危険性を低下させる
ことに加えて、これは、E1B 55kがE2後期mRNAの外部移行に必要で
あることが報告されているため、E2後期mRNAからのE2遺伝子産生物の発
現を減少させることも可能である。vMB14骨格にクローン化された変異体E
1Bプロモーターを有するウイルスはvMB19と呼ばれる。野生型、vMB1
4及びvMB19をSW480及びH1299細胞において試験した。感染の2
4時間後に細胞を収集した。E1B及びDBPのウェスタンブロットは、E1B
55kがSW480においては発現するが、H1299においては発現しない
ことを示した。vMB14及び19はH1299細胞において同様のDBP発現
をもたらし、この細胞系において少なくとも24時間の時点ではDBP後期mR
NAの外部移行に対するE1Bの高い効果は存在しないことが示唆される: 感染の24時間後のTaqman RT−PCR転写アッセイでは、vMB19がS
W480細胞においては野生型レベルのE1B、E2及びE3 mRNAを有す
るが、H1299細胞においてはレベルが低下していることが確認された(図1
7、18及び19): 感染の24時間後に、線維プライマーを用いるSybr green 定量PCRによっ
てウイルスDNAの複製を試験した。これは、両変異体ウイルスの複製がSW4
80細胞においては正常であるが、H1299細胞においては不完全であること
を示した。両変異体ウイルスは匹敵するものであり、ここでもやはり、この実験
においては、E1B 55kの発現の証明された減少(documented
reduction)には顕著な効果がないことが示唆される(図20): vMB19がイン・ビボの設定において正常細胞におけるDNAの複製の減少
を示すかどうかを決定するため、コットンラットの鼻腔内にウイルスを感染させ
、3日後に肺からDNAを抽出した。ラットは各ウイルスについて5匹の群で処
理した。E4プライマーを用いるTaqman 定量PCRは、野生型と比較して、v
MB19でウイルスDNA濃度の中央値50倍の減少を示した。 結論:vMB12、13、14及び19 これらのデータは以下のことを示す。
【0116】 1.E2プロモーターでのTcfの挿入は生存可能なアデノウイルスの産生に
適合する 2.変異体E2プロモーターは非結腸腫瘍細胞よりも結腸腫瘍細胞において活
性である 3.E3プロモーターの突然変異は非結腸腫瘍細胞におけるE2活性をさらに
低下させる 4.これらの突然変異は非結腸腫瘍細胞におけるウイルスDNAの複製、ウイ
ルスの複製及び細胞変性効果を減少させる 5.変異体ウイルスはヌードマウスにおける異種移植片の成長を損なう 6.E1BプロモーターでのTcf部位の挿入は生存可能なアデノウイルスの
産生に適合する 7.変異体E1Bプロモーターは非結腸腫瘍細胞よりも結腸腫瘍細胞において
活性である 8.これまで試験されたモデルにおいて、E1Bプロモーターの突然変異はウ
イルスの複製に影響を及ばさない 9.E1B及びE2/E3プロモーターの突然変異を組み合わせて有するウイ
ルスはコットンラットの肺における複製の減少を示し、E2/E3突然変異のみ
を有するウイルスよりも生成する炎症性損傷が少ないものと期待される。
適合する 2.変異体E2プロモーターは非結腸腫瘍細胞よりも結腸腫瘍細胞において活
性である 3.E3プロモーターの突然変異は非結腸腫瘍細胞におけるE2活性をさらに
低下させる 4.これらの突然変異は非結腸腫瘍細胞におけるウイルスDNAの複製、ウイ
ルスの複製及び細胞変性効果を減少させる 5.変異体ウイルスはヌードマウスにおける異種移植片の成長を損なう 6.E1BプロモーターでのTcf部位の挿入は生存可能なアデノウイルスの
産生に適合する 7.変異体E1Bプロモーターは非結腸腫瘍細胞よりも結腸腫瘍細胞において
活性である 8.これまで試験されたモデルにおいて、E1Bプロモーターの突然変異はウ
イルスの複製に影響を及ばさない 9.E1B及びE2/E3プロモーターの突然変異を組み合わせて有するウイ
ルスはコットンラットの肺における複製の減少を示し、E2/E3突然変異のみ
を有するウイルスよりも生成する炎症性損傷が少ないものと期待される。
【0117】 参考文献
【0118】
【表2】
【0119】
【0120】
【0121】
【0122】
【0123】
【0124】
【配列表】
【図1】 図1は、本発明の好ましいアデノウイルスにおいて転写因子部位が挿入されて
いる野生型E2領域の位置を示す。
いる野生型E2領域の位置を示す。
【図2】 図2は、好ましいウイルスにおけるE3領域の野生型ウイルスへの変化を示す
。
。
【図3】 図3は、野生型ウイルスのE2/E3領域を示す。
【図4】 図4は、さらに好ましいウイルスにおけるE2後期プロモーターの野生型への
変化を示す。
変化を示す。
【図5】 図5は、本発明のウイルスの産生において行われる工程を説明する図を示す。
【図6】 図6は、プラスミドpNKBAC39の図示である。
【図7】 図7は、プラスミドp680の図示である。
【図8】 図8は、アデノウイルスDNA(A)又はヒトゲノムDNA(負荷対照B)で
探索したウイルス感染細胞のスロット・ブロットである。
探索したウイルス感染細胞のスロット・ブロットである。
【図9】 図9は、ウイルス感染細胞に由来するウイルスDNAの定量的PCRの結果の
グラフ図である。
グラフ図である。
【図10】 図10は、Taqman RT−PCRによって測定した、野生型Ad5、並びに本
発明のvMB12、vMB13及びvMB14に感染したSW480及びH12
99細胞系におけるE2発現を示すヒストグラムである。
発明のvMB12、vMB13及びvMB14に感染したSW480及びH12
99細胞系におけるE2発現を示すヒストグラムである。
【図11】 図11は、Taqman RT−PCRによって測定した、野生型Ad5、並びに本
発明のvMB12、vMB13及びvMB14に感染したSW480及びH12
99細胞系におけるE3発現を示すヒストグラムである。
発明のvMB12、vMB13及びvMB14に感染したSW480及びH12
99細胞系におけるE3発現を示すヒストグラムである。
【図12】 図12は、Taqman RT−PCRによって測定した、SW480及びH129
9細胞系における野生型Ad5、並びに本発明のvMB12、vMB13及びv
MB14のDNA複製を示すヒストグラムである。
9細胞系における野生型Ad5、並びに本発明のvMB12、vMB13及びv
MB14のDNA複製を示すヒストグラムである。
【図13】 図13は、SW480、H1299及びWI38(線維芽細胞)細胞系におけ
る野生型Ad5、並びに本発明のvMB12、vMB13及びvMB14でのバ
ーストサイズ(任意単位)を示すヒストグラムである。
る野生型Ad5、並びに本発明のvMB12、vMB13及びvMB14でのバ
ーストサイズ(任意単位)を示すヒストグラムである。
【図14】 図14は、SW480における野生型Ad5、並びに本発明のvMB12、v
MB13及びvMB14のCPEの結果%v粒子/細胞を示すグラフである。
MB13及びvMB14のCPEの結果%v粒子/細胞を示すグラフである。
【図15】 図15は、H1299における野生型Ad5、並びに本発明のvMB12、v
MB13及びvMB14のCPEの結果%v粒子/細胞を示すグラフである。
MB13及びvMB14のCPEの結果%v粒子/細胞を示すグラフである。
【図16】 図16は、Co115異種移植片におけるバッファ、vMB12、vMB13
及びvMB14の投与後の腫瘍容積v日数のプロットである。
及びvMB14の投与後の腫瘍容積v日数のプロットである。
【図17】 図17は、wt Ad5、本発明のvMB14及びvMB19が感染したSW
480及びH1299細胞系におけるE1B−55kの発現を示すヒストグラム
である。
480及びH1299細胞系におけるE1B−55kの発現を示すヒストグラム
である。
【図18】 図18、19及び20は、それぞれ、SW480及びH1299細胞における
E2及びE3の早期発現並びにDNA複製のヒストグラムである。
E2及びE3の早期発現並びにDNA複製のヒストグラムである。
【図19】 図18、19及び20は、それぞれ、SW480及びH1299細胞における
E2及びE3の早期発現並びにDNA複製のヒストグラムである。
E2及びE3の早期発現並びにDNA複製のヒストグラムである。
【図20】 図18、19及び20は、それぞれ、SW480及びH1299細胞における
E2及びE3の早期発現並びにDNA複製のヒストグラムである。
E2及びE3の早期発現並びにDNA複製のヒストグラムである。
【図21】 図21は、本発明の好ましい構築体又はウイルスにおけるAd5と比較したE
IBプロモーターの変化のものである。
IBプロモーターの変化のものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AL,AM,AT,AU,AZ, BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,C R,CU,CZ,DE,DK,DM,EE,ES,FI ,GB,GD,GE,GH,GM,HR,HU,ID, IL,IN,IS,JP,KE,KG,KP,KR,K Z,LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV,MA ,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ, PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI,S K,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG ,US,UZ,VN,YU,ZA,ZW Fターム(参考) 4B024 AA01 BA32 CA04 DA02 HA17 4B065 AA93X AA95Y AB01 CA29 CA44 4C084 AA02 AA03 AA13 AA17 BA44 CA01 CA53 MA17 MA66 NA14 ZB262 ZC412 4C087 AA01 AA02 BC83 CA09 CA12 MA17 MA66 NA14 ZB26 ZC41
Claims (36)
- 【請求項1】 ヒト又は動物の腫瘍細胞において複製が可能であり、かつそのような腫瘍細胞
を死に至らしめるウイルスをコードするウイルスDNA構築体であって、1種類
またはそれ以上の選択された転写因子結合部位を、1種類またはそれ以上の早期
ウイルス性タンパク質遺伝子読み取り枠と共に、該選択された転写因子の存在下
でこれらの読み取り枠の発現を促進するような作動的な位置に含むことを特徴と
し、それらの読み取り枠のタンパク質産生物がウイルス構築体の核酸複製に機構
的に直接関与し、選択された転写因子結合部位が、同じ型の正常ヒト又は動物細
胞に対してヒト又は動物腫瘍細胞においてレベル又は活性が増加している転写因
子のためのものである、前記ウイルスDNA構築体。 - 【請求項2】 野生型ウイルスの配列に相当する核酸配列を有する請求項1に記載のウイルス
DNA構築体であって、1つまたはそれ以上の選択された転写因子結合部位で置
換されている1つまたはそれ以上の野生型転写因子結合部位を有することを特徴
とし、これらの選択された部位は早期遺伝子の発現を制御する1つまたはそれ以
上のプロモーター領域において該選択された転写因子の存在下での発現を促進す
るように作動的に位置し、それらの遺伝子のタンパク質産生物はウイルスの核酸
複製に機構的に直接関与し、及び選択された転写因子結合部位は、同じ型の正常
ヒト又は動物細胞に対してヒト又は動物腫瘍細胞においてレベル又は活性が増加
している転写因子のためのものである、前記ウイルスDNA構築体。 - 【請求項3】 選択された転写因子結合部位が原因癌遺伝子突然変異によって活性又はレベル
が特異的に増加する転写因子のものであることを特徴とする、請求項1又は2に
記載のウイルスDNA構築体。 - 【請求項4】 核酸配列が、早期ウイルス遺伝子の発現を制御するように作動的に位置する選
択された転写因子結合部位を有する、アデノウイルス、レンチウイルス、ポリオ
ーマウイルス、ワクチニアウイルス、ヘルペスウイルス又はパルボウイルスのゲ
ノムのものに相当することを特徴とする、請求項2又は3に記載の構築体。 - 【請求項5】 核酸配列が、選択された部位を除いて、アデノウイルスAd5、Ad40もし
くはAd41のゲノムのものに相当するか、又は15ないし25個のリジンが末
端に付加されていてもよい、Ad5、Ad40もしくはAd41に由来する線維
タンパク質をコードするDNAを組み込むことを特徴とする、請求項1ないし4
のいずれか1つに記載の構築体。 - 【請求項6】 腫瘍特異的転写因子結合部位によって制御される遺伝子がDNAポリメラーゼ
、DNA末端タンパク質及び/又はDNA結合タンパク質であることを特徴とす
る、請求項1ないし5のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項7】 核酸配列が、腫瘍細胞特異的転写因子結合部位で置換されている野生型E2早
期プロモーター転写因子結合部位を有するアデノウイルスのものに相当すること
を特徴とする、請求項1ないし6のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項8】 機能的ウイルスRNA移行能力をコードすることを特徴とする、請求項1ない
し7のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項9】 E1B 55K遺伝子が機能的及び/又は無傷であるE1領域を有する、請求
項1ないし8のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項10】 野生型部位の代わりに用いられる腫瘍特異的転写因子結合部位がTcf−4、
RBPJκ、Gli−1、HIF1アルファ及びテロメラーゼプロモーター結合
部位から選択されることを特徴とする、請求項1ないし9に記載の構築体。 - 【請求項11】 置換された転写因子結合部位が癌遺伝子APC及びβ−カテニン変異体を含む
腫瘍細胞において選択的に活性化されることを特徴とする、請求項1ないし10
のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項12】 置換部位が単一又は複数のTcf−4結合部位配列であることを特徴とする、
請求項1ないし11のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項13】 置換プロモーター部位の各々に2ないし12のTcf−4結合部位配列を含む
ことを特徴とする請求項12に記載の構築体。 - 【請求項14】 その配列が、E3プロモーターのNF1、NFκB、AP1及びATF領域に
おける1つまたはそれ以上の残基に突然変異を有するアデノウイルスゲノムのも
のに相当することを特徴とする、請求項1ないし13のいずれか1項に記載の構
築体。 - 【請求項15】 突然変異がE3プロモーターの活性によって生じるE2遺伝子転写を減少させ
ることを特徴とする、請求項14に記載の構築体。 - 【請求項16】 突然変異が、いかなるウイルス性タンパク質の推定タンパク質配列も変更はし
ないが、1種類またはそれ以上のウイルスプロモーターの活性を変更する沈黙突
然変異であることを特徴とする、請求項14又は15に記載の構築体。 - 【請求項17】 その配列が、コーディング配列が重複していないE2早期プロモーター内の領
域が複数のTcf−4結合部位配列で置換されているアデノウイルスゲノムのも
のに相当することを特徴とする、請求項1ないし16のいずれか1項に記載の構
築体。 - 【請求項18】 その配列が、E3プロモーター内の転写因子結合部位が改変又は欠失されてい
るアデノウイルスゲノムのものに相当することを特徴とする、請求項1ないし1
7のいずれか1項に記載の構築体。 - 【請求項19】 その配列が、E2後期プロモーターが沈黙突然変異で不活性化されているアデ
ノウイルスゲノムのものに相当することを特徴とする、請求項1ないし18項の
いずれか1項に記載の構築体 - 【請求項20】 請求項1ないし19のいずれか1項に記載のDNA構築体を含むか、又はそれ
によってコードされるウイルス。 - 【請求項21】 治療において用いるための、1種類またはそれ以上の任意の非野生型非細胞毒
性マーカータンパク質以外には野生型タンパク質のみをコードするウイルス。 - 【請求項22】 治療において用いるための、請求項1ないし20のいずれか1項に記載のウイ
ルスDNA構築体、又はウイルス。 - 【請求項23】 治療が新生物を有する患者のものであることを特徴とする、請求項21又は2
2に記載のウイルスDNA構築体、又はウイルス。 - 【請求項24】 1種類またはそれ以上の任意の非野生型非細胞毒性マーカータンパク質以外に
は野生型タンパク質のみをコードするウイルスDNA構築体、又はウイルスの、
新生物を治療するための医薬の製造における使用。 - 【請求項25】 請求項1ないし22のいずれか1項に記載のウイルス構築体、又はウイルスの
、新生物を治療するための医薬の製造における使用。 - 【請求項26】 1種類またはそれ以上の任意の非野生型非細胞毒性マーカータンパク質以外に
は野生型タンパク質のみをコードするウイルスDNA構築体、又はそれらによっ
てコードされるウイルスを生理学的に許容し得る担体と共に含む医薬組成物であ
って、該DNA又はそれらによってコードされるウイルスの存在を除いて、無菌
で発熱物質を含まない医薬組成物。 - 【請求項27】 請求項1ないし21のいずれか1項に記載のウイルス構築体、又はウイルスを
生理学的に許容し得る担体と共に含む組成物。 - 【請求項28】 ウイルス構築体又はそれらによってコードされるウイルスの存在を除いて、無
菌で発熱物質を含まないことを特徴とする、請求項27に記載の組成物。 - 【請求項29】 担体が生理学的に許容し得る生理食塩水であることを特徴とする、請求項27
ないし29のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項30】 請求項1ないし19のいずれか1項に記載のウイルスDNA構築体又はそれら
によってコードされるウイルスの製造方法であって、遺伝子の転写を制御する1
つまたはそれ以上の野生型転写因子結合部位を有し、該遺伝子がウイルス核酸の
複製に直接機構的に関与するタンパク質産生物を有するゲノムを、これらのうち
の1つまたはそれ以上が腫瘍特異的転写因子結合部位によって置換されるように
形質転換することを含むことを特徴とする、前記方法。 - 【請求項31】 ウイルスゲノムがギャップ修復により、環状YAC/BACにおいて、酵母内
でクローン化されることを特徴とする、請求項30に記載の方法。 - 【請求項32】 ゲノムが2工程遺伝子置換によって改変されることを特徴とする、請求項30
又は31に記載の方法。 - 【請求項33】 ウイルス構築体DNAを産生するために改変ゲノムを原核生物に移入すること
を特徴とする、請求項30、31又は32に記載の方法。 - 【請求項34】 ウイルスの製造方法であって、請求項30ないし33のいずれか1項に記載の
方法によって産生されたウイルス構築体DNAを、ウイルスを産生させるために
哺乳動物細胞に移入することを特徴とする、前記方法。 - 【請求項35】 新生物の患者を治療するための方法であって、1種類またはそれ以上の任意の
非野生型非毒性マーカータンパク質以外は野生型タンパク質のみをコードするウ
イルスを、新生物を含むか、もしくはそれに限定される患者の組織に感染させ、
及び新生物細胞が殺されるように複製させる、前記方法。 - 【請求項36】 新生物の患者を治療するための方法であって、請求項1ないし22のいずれか
1項に記載のウイルスDNA構築体又はウイルスを、新生物を含むか、もしくは
それに限定される患者の組織に感染させ、及び新生物細胞が殺されるように複製
させる、前記方法。
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