JP2001519660A - 心臓血管の状態を評価するための方法およびそれを用いるための組成物 - Google Patents
心臓血管の状態を評価するための方法およびそれを用いるための組成物Info
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、アンギオテンシン変換酵素(ACE)、アンギオテンシノゲン(AGT)、および/または1型アンギオテンシンIIレセプター(AT1)をコードするヒト遺伝子内の一つ以上の多型部位における配列を決定することを含む、個人の心臓血管状態を評価する方法を提供する。また、本発明は、ACE、AGTおよびAT1多型性をコードする単離された核酸、多型部位にハイブリダイズする核酸プローブ、心臓血管状態の予測のためのキット、および候補の心臓血管剤を同定する際に用いられる核酸およびペプチドターゲットも提供する。
Description
【発明の詳細な説明】
心臓血管の状態を評価するための方法およびそれを用いるための組成物
本願は、1997年4月3日に出願された、米国仮出願シリアル番号60/0
42930に基づいて米国特許法第119条の下に優先権を主張する。
発明の分野
本発明は、ヒトの心臓血管の状態を評価するために用いられる遺伝的多型に関
する。
発明の背景
レニン−アンギオテンシン−アルドステロン系(RAAS)は、哺乳動物の心
臓血管生理学において重要な役割を演じる。特に、RAASは、塩−水ホメオス
タシスおよび血管の正常状態の維持を制御する。このシステムの刺激または阻害
は、それぞれ血圧を上昇または低下させ、このシステムにおける障害は、例えば
、高血圧、発作および心筋梗塞の病因と関連しうる。また、RAAS系は、例え
ば、細胞成長の制御のような別の機能をも有するかもしれない。レニン−アンギ
オテンシン系は、少なくともレニン、アンギオテンシン変換酵素(ACE)、ア
ンギオテンシノゲン(AGT)、1型アンギオテンシンIIレセプター(AT1)
および2型アンギオテンシンIIレセプター(AT2)を含む。
AGTは、レニン、アスパルチルプロテアーゼの特異的な基質である。ヒトA
GT遺伝子は、5つのエキソンと13Kbにおよぶ4つのイントロンを含む(Ga
illardら,DNA 8:87-99,1989;Fukamizuら,J.Biol.Chem.265:7576-7582,1990
)。最初のエキソン(37bp)はmRNAの5’非翻訳領域をコードする。第
二のエキソンはシグナルペプチドと、成熟タンパクの最初の252アミノ酸をコ
ードする。エキソン3および4はより短く、それぞれ90および48アミノ酸を
コードする。エキソン5は、短いコード配列(62アミノ酸)と3’−非翻訳領
域を含む。
血漿AGTは、主に肝臓において合成され、その発現は、エストロゲン、グル
ココルチコイド、甲状腺ホルモンおよびアンギオテンシンII(AngII)によっ
て正の制御を受ける(Clauserら,Am.J.Hypertension 2:403-410,1989)。レ二
ンによるAGTのアミノ末端セグメントの切断により、デカペプチドプロホルモ
ン、アンギオテンシン−Iが放出され、これは、アンギオテンシン変換酵素(A
CE)と称されるジペプチジルカルボキシペプチダーゼによって、活性なオクタ
ペプチドアンギオテンシンIIへとさらに処理される。レニンによるAGTの切断
は、レニン−アンギオテンシン系の活性化の律速段階である。
いくつかの疫学的観察は、血圧制御におけるAGTの可能性のある役割を示唆
する。血漿AGT濃度と血圧との間の非常に意義深い関係が、疫学的研究におい
て見出された(Walkerら,J.Hypertension 1:287-291,1979)。興味深いこと
に、多数の対立遺伝子の二型性がAGT遺伝子に同定された。それらの少なくと
も二つ(174Mと235T)の頻度は、部分的に特徴が決定され、一部の集団
では、高血圧患者において顕著に増大されていることが示された(Jeunemaitre
ら,Cell 71:169-180,1992)。さらに、特定の多型性である235Tは、冠状
アテローム硬化症に直接関連すると示唆されている(Ishigamiら,Circulation
91:951-4,1995)。さらに、AGT制御領域の部位1218におけるAまたはG
の存在が、この遺伝子のインビトロ転写能力における差異と関連づけられた(In
uoeら,J.Clin.Invest.99:1786,1997)。
また、ヒトACE遺伝子は、高血圧および心筋梗塞のマーカーの候補である。
ACEインヒビターは、ヒト高血圧のコントロールにおいて重要かつ効果的な治
療的アプローチを構成する(Sassahoら,Am.J.Med.83:227-235,1987)。血
漿中および内皮細胞の表面において、ACEは不活性なアンギオテンシンI分子
(AngI)を活性なアンギオテンシンII(AngII)に変換する(Bottariら
,Front.Neuroendocrinology 14:123-171,1993)。その他のACE基質は、潜
在的な血管拡張薬であり平滑筋細胞増殖のインヒビターであるブラジキニンであ
り、これはACEによって不活性化される(Ehlersら,Biochemistry 28:5311-5
318,1989;Erdos,E.G.,Hypertension 16:363-370,1990;Johnston,C.I.Drug
s(補足1)39:21-31,1990)。
ACEのレベルは、個人内では非常に安定であるが、個人間では大きく異なる
。血漿ACEレベルは、ACE遺伝子内またはその近くに位置する、二対立遺伝
子(diallelic)多型性の結果として遺伝学的に調べられることが示唆された。本
発明の前には、多型性と高血圧または血圧との間に決定的な関連性は示されなか
った。しかしながら、心筋梗塞の大きな危険性が、ACE−DDと称されるAC
E多型性を有する一群の患者において同定され(Cambienら,Nature 359:641-64
4,1992)、心筋梗塞の12倍大きな危険性が、ACE多型性ACE−DDと上
記AGT多型性の一つ(235T)の組み合わせを有する患者のサブグループに
同定された(Kamitaniら,Hypertension 24:381,1994)。最近になって、6つ
のACE多型性が同定され、特徴が決定されている(Villardら,Am.J.Human
Genet.58:1268-1278,1996)。
AngIIの血管収縮、細胞成長促進および塩保存作用は、アンギオテンシンレ
セプターに対する結合およびその活性化を介して媒介され、そのうちの少なくと
も二つのタイプがクローン化された(AT1およびAT2)。Gタンパク結合型
膜7回貫通ドメインタンパクである1型AngIIレセプター(AT1)は、体中
に広く分布し、ほぼ全てが解明されたAngII効果を媒介する(Fyhrquistら,J
.Hum.Hypertension 5:519-524,1995)。
いくつかの多型性が、AT1レセプター遺伝子に同定された。当初の研究は、
それらの少なくとも一つが高血圧患者に頻繁に見られることを示唆した(AT11 66
C)(Bonnardeauxら,Hypertension 24:63-69,1994)。この多型性は、AC
E−DD多型性と組み合わせて、心筋梗塞の危険性と強く関連することが示され
た(Tiretら,Lancet 344:910-913,1994)。
心臓血管の疾患に関連する高い罹患率および死亡率が、心臓血管疾患の患者に
最も絶対的な治療結果をもたらす治療方法の決定および/または予測を可能にす
る方法および組成物の当該技術分野における必要性を示している。これは、例え
ば、心臓血管疾患を治療するために通常用いられる特定の薬剤を含めた特定の治
療方法に対して、多少敏感な個人の同定を含む。また、早期介入および疾患予防
を容易にするために、例えば、心筋梗塞、高血圧症、アテローム硬化症および発
作のような心臓血管疾患に対する疾病素質を有する個人の同定を可能にする方法
および組成物に関する当該技術分野における要求も存在する。
発明の概要
本発明は、ヒト個人の心臓血管の状態を評価する方法を提供する。心臓血管の
状態とは、一つ以上の状態マーカーに反映される心臓血管システムの生理的状態
である。状態マーカーは、非限定的に、例えば血圧または心電図プロフィールの
ような臨床パラメーター、並びに、急性心筋梗塞、無症状心筋梗塞、発作および
アテローム硬化症のような熟練した医師によってなされた心臓血管状態の診断を
含む。また、状態マーカーの時間変化も、心臓血管状態の評価に含まれる。本発
明の方法は、以下の工程:
(i)個人の多型パターンを確立するために、その個人のアンギオテンシン変
換酵素(ACE)、アンギオテンシノグン(AGT)、および1型アンギオテン
シンIIレセプター(AT1)をコードする一つ以上の遺伝子内の一つ以上の多型
部位の配列を調べ;かつ、
(ii)(i)において確立された多型パターンを、心臓血管状態の所定のマー
カーを示す個人の多型パターンと比較することによって行われる。その個人の多
型パターンは、特定の状態マーカー、心臓血管症候群、および/または治療的介
入に対する応答の特定のパターンを示す個人の多型パターンと、好ましくは高度
に類似、最も好ましくは同一である。
例えば、個人の多型パターンと、特定の治療的介入に対し異なる反応を示す個
人の多型パターンとの比較は、そのような介入に対する個人の反応性の程度を予
想するために用いることができる。同様に、本発明の方法は、種々の心臓血管症
候群に対する疾病素質を予想するために用いることができる。
また、本発明は、少なくとも一つの多型部位を含む個人のACE、AGT、お
よびAT1をコードする単離された核酸を提供する。好ましい実施態様では、多
型部位は、単独で、あるいはヒトACE、AGTまたはAT1の配列中の、また
は一つ以上の別のヒト遺伝子中の、別の多型部位と組み合わせて、所定の治療に
対する反応性の特定レベルを予想し、かつ/または心臓血管疾患に関連する一つ
以上の臨床的症候群に対する疾病素質を示す。
本発明に係る単離された核酸(以下の表1に示された番号を用いて記載されて
いる)は、非限定的に以下を含む。
(i)5106と番号が付された制御領域中の部位;375、582、731
、1060、2741、3132、3387、3503および3906と番号が
付されたコード領域中の部位;および、GenbankエントリーX62855におい
て番号が付された部位1451に、一つ以上の多型部位を有するACEをコード
する核酸。好ましい実施態様では、ACE制御領域における多型部位の配列は、
一つ以上の5106Cおよび5106Tであり;かつ、コード領域における多型
部位の配列は、一つ以上の375A、375C、582C、582T、731A
、731G、1060G、1060A、2741G、2741T、3132C、
3132T、3387T、3387C、3503G、3503C、3906G、
および3906Aである。また、本発明は、GenbankエントリーX62855に
おいて番号が付されたヌクレオチド1451−1783の欠失をコードする核酸
を包含する。
(ii)395、412、432、449、692、839、1007、107
2および1204と番号が付された制御領域中の部位;273、912、997
、1116および1174と番号が付されたコード領域中の部位;および、Genb
ankエントリーM24688において番号が付された部位49に、一つ以上の多
型部位を有するAGTをコードする核酸。好ましい実施態様でば、AGT制御領
域における多型部位の配列は、一つ以上の395T、395A、412C、41
2T、432G、432A、449T、449C、692C、692T、839
G、839A、1007G、1007A、1072G、1072A、1204C
および1204Aであり;コード領域における多型部位の配列は、一つ以上の2
73C、273T、912C、912T、997G、997C、1116G、1
116A、1174Cおよび1174Aであり;また、GenbankエントリーM2
4688の49位の配列がAまたはGである。
(iii)1427、1756、1853、2046、2354、2355およ
び2415と番号が付された制御領域中の部位;および449と番号が付された
コード領域中の部位に一つ以上の多型部位を有するAT1をコードする核酸。好
ま
しい実施態様では、AT1制御領域における多型部位の配列は、一つ以上の14
27A、1427T、1756T、1756A、1853T、1853G、20
46T、2046C、2354A、2354C、2355G、2355C、24
15Aおよび2415Gであり;かつ、コード領域における多型部位の配列は、
一つ以上の449G、449C、678T、678C、1167A、1167G
、1271Aおよび1271Cである。
また、本発明は、単離された核酸配列のライブラリーを含み、ライブラリーの
各配列は、非限定的に、ここに開示された多型部位と配列を含めた、ヒトACE
、AGT、またはAT1をコードする遺伝子に一つ以上の多型部位を含む。また
、同定された多型部位に特異的にハイブリダイズする核酸ブローブ;多型部位を
含むペプチドおよびポリペプチド;および多型性特異的抗体、すなわちACE、
AGTまたはAT1ポリペプチドの多型変異体に特異的に結合し、好ましくは特
定の多型変異体を同定するために使用することができる配列特異的抗体も提供す
る。
別の態様では、本発明は、個人のACE、AGT、および/またはAT1遺伝
子における多型パターンの測定のためのキットを提供する。このキットは、非限
定的に、多型部位あるいはその近くにハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプ
ローブおよび多型性特異的抗体を含む、多型配列を検出するための手段を含む。
さらに別の態様では、本発明は、候補の心臓血管剤を同定するための選別方法
において使用される核酸およびポリペプチドターゲットを提供する。核酸ターゲ
ットは、例えば、DNAまたはRNAであってもよく、好ましくは少なくとも約
10、そして最も好ましくは少なくとも約15残基の長さであり、一つ以上の多
型部位を含む。ペプチドターゲットは、少なくとも約5アミノ酸の長さであり、
全長のACE、AGTまたはAT1ポリペプチドと同じかそれより大きくてもよ
い。
発明の詳細な説明
ここに引用されている全ての特許、特許出願、刊行物およびその他の資料の全
体を、参照としてここに含める。矛盾する場合には、定義を含む本願の記載が優
先する。
定義:
1.ここで用いられる“多型性”とは、個人の遺伝子の配列における変化を示
す。“多型部位”とは、多型性が位置する、遺伝子の配列中の所定のヌクレオチ
ド部位またはポリペプチドの配列中の所定のアミノ酸部位である。特定の多型性
の個人の“ホモ接合”は、遺伝子の両方のコピーが多型部位において同じ配列を
含むものである。特定の多型性の個人の“ヘテロ接合”は、遺伝子の二つのコピ
ーが多型部位において異なる配列を含むものである。
2.ここに用いられる“多型性パターン”は、一つ以上の多型性のセットを示
し、単一の遺伝子または複数の遺伝子の配列に含まれてもよい。多型性パターン
は、ヌクレオチドまたはアミノ酸多型性を含んでもよい。
3.ここで用いられる“核酸”または“ポリヌクレオチド”は、あらゆる長さ
のプリン−およびビリミジン含有ポリマー、ポリリボヌクレオチドまたはポリデ
オキシリボヌクレオチド、もしくは混合されたポリリボ−ポリデオキシリボヌク
レオチドを指す。核酸は、非限定的に、一本鎖および二本鎖分子、すなわちDN
A−DNA、DNA−RNAおよびRNA−RNAハイブリッド、並びに、アミ
ノ酸骨格に塩基を結合することによって形成された“タンパク核酸”(PNA)
を含む。また、修飾された塩基を含む核酸を含む。
4.ここで用いられる“単離された”核酸またはポリペプチドは、起源の環境
から除去された核酸またはポリペプチドを指す(例えば、それが天然に生じるの
であれば、その天然環境)。単離された核酸またはポリペプチドは、本来的に結
合していた細胞性成分の約50%未満、好ましくは約75%末満、最も好ましく
は約90%末満を含む。
5.指定された配列“から誘導された”核酸またはポリペプチド配列は、指定
された配列の領域に対応する配列を指す。核酸配列について、これは、配列に相
同または相補的な配列を含む。
6.“ブローブ”は、ターゲットの核酸の配列と、プローブの少なくとも一つ
の配列との相補性により、ターゲットの核酸の配列とハイブリッド構造を形成す
る核酸またはオリゴヌクレオチドを指す。
7.核酸は、核酸の少なくとも一つの鎖が、所定の厳密な条件下で別の核酸鎖
にアニールすることができる場合に、互いに“ハイブリダイズ可能”である。ハ
イブリダイゼーションの厳密性は、例えば、a)ハイブリダイゼーションおよび
/または洗浄が行われる温度、b)ハイブリダイゼーションおよび洗浄溶液のイ
オン強度および極性(例えばホルムアミド)、およびその他のパラメーターによ
って決定される。ハイブリダイゼーションは、二つの核酸が実質的に相補的な配
列を含むことを必要とする;ハイブリダイゼーションの厳密性に依存して、ミス
マッチが寛容されてもよい。核酸をハイブリダイズさせるための適切な厳密性は
、当該技術分野において周知の変数である、核酸の長さおよび相補性の程度に依
存する。例えば、ここで用いられる“高度の厳密性”は、0.2XSSC中68
℃、50%ホルムアミド、4XSSC中42℃、あるいは、これら二つの条件の
いずれかにおいて観察されたものと等価のハイブリダイゼーションレベルを示す
条件下における、ハイブリダイゼーションおよび/または洗浄を指す。
8.ここで用いられた特定のタンパクの“遺伝子”とは、(i)エキソン(す
なわち、ポリペプチド配列をコードする配列または“タンパクコード配列”)、
イントロン、およびエキソンとイントロンの間の接続部の配列を含む“コード領
域”;並びに(ii)コード領域の5’および3’末端の両方に隣接する制御配列
を含む、ゲノムに存在する配列に対応する隣接する核酸配列を指す。例えば、こ
こで用いられる“ACE遺伝子”は、アンギオテンシン変換酵素をコードするヒ
ト遺伝子の制御およびコード領域を含む。同様に、“AGT遺伝子”は、アンギ
オテンシノゲンをコードするヒト遺伝子の制御およびコード領域を含み、“AT
1遺伝子”は1型アンギオテンシンIIレセプターをコードするヒト遺伝子の制御
およびコード領域を含む。通常、本発明に係る制御配列は、コード領域セグメン
トの5’(すなわち上流)に位置する。Genbankから入手され、本発明を実施す
る際に用いられる参照配列は、表1に記載されている。 本願発明者らは、単独または組み合わせて、心臓血管状態を評価するために用
いることができる、ACE、AGTおよびAT1をコードするヒト遺伝子内の遺
伝的多型性の存在を、驚くべきことに、そして予期せぬことに知見した。本発明
によれば、個人のACE、AGTおよび/またはAT1配列の多型パターンは、
特定の治療的介入に対する個人の反応を予想することができ、種々の形態の心臓
血管疾患に対する疾病素質の指標として利用することができる。本発明は、個人
における多型パターンを検出することによって心臓血管状態を評価する方法を提
供する。また、本発明は、多型部位に特異的にハイブリダイズするプローブを含
む、上記の多型性を含むACE、AGTおよびAT1遺伝子から誘導された単離
された核酸;多型残基を含む単離されたポリペプチドおよびペプチド;および、
一つ以上の多型アミノ酸を含むACE、AGTまたはAT1ポリペプチドを特異
的に認識する抗体を提供する。
心臓血管状態を評価する方法
本発明は、ヒト個人の心臓血管状態を評価する診断方法を提供する。ここで用
いられる心臓血管状態とは、一つ以上のマーカーまたは指標に反映されるような
個人の心臓血管システムの生理学的状態を指す。状態マーカーは、非限定的に、
例えば血圧、心電図プロフィール、並びに、分化型血流分析のような臨床的測定
値を含む。本発明に係る状態マーカーは、例えば、高血圧、急性心筋梗塞、無症
状心筋梗塞、発作およびアテローム硬化症のような一つ以上の心臓血管症候群の
診断を含む。医師によってなされた心臓血管症候群の診断は、臨床的測定値およ
び医学的判断を含むと解される。本発明に係る状態マーカーは、当該技術分野で
周知の慣例的な方法を用いて評価される。心臓血管状態の評価には、例えば、特
定の治療方法に対する患者の反応の測定において用いられるような、時間に伴っ
た状態マーカーの定性または定量的な変化も含まれる。
この方法は、以下の工程:
(i)個人の多型パターンを確立するために、個人のアンギオテンシン変換酵
素(ACE)、アンギオテンシノゲン(AGT)、および1型アンギオテンシン
IIレセプター(AT1)をコードする一つ以上の遺伝子内の一つ以上の多型部位
の
配列を決定する工程;および、
(ii)(i)において確立された多型パターンを、心臓血管状態の種々のマー
カーを示すヒトの多型パターンと比較する工程によって行われる。個人の多型パ
タ一ンは、特定の状態マーカー、心臓血管症候群、および/または治療的介入に
対する応答の特定のパターンを示す個人の多型パターンと、好ましくは高度に類
似、最も好ましくは同一である。また、多型パターンは、ACE、AGTまたは
AT1における一つ以上の多型部位と組み合わせて、特定の状態マーカーの存在
と関連することが示されている別の遺伝子の多型部位を含んでもよい。
一つの実施態様では、この方法は、個人の多型パターンを、特定の治療方法に
肯定的または否定的に反応することが示された個人の多型パターンと比較するこ
とを含む。ここで用いられる治療方法は、心臓血管疾患と関連する症状および事
象の除去または改善を目的とした治療に関する。係る治療は、非限定的に、食事
、ライフスタイルおよび運動療法における一つ以上の変更;アテレクトミー、血
管形成および冠状動脈バイパス手術のような侵襲性または非侵襲性の外科的技術
;並びに、ACEインヒビター、アンギオテンシンIIレセプターアンタゴニスト
、利尿薬、アルファーアドレノレセプターアンタゴニスト、強心配糖体、ホスホ
ジエステラーゼインヒビター、ベーターアドレノレセプターアンタゴニスト、カ
ルシウムチャネルブロッカー、HMG−CoAレダクターゼインヒビター、イミ
ダゾリンレセプターブロッカー、エンドセリンレセプターブロッカー、および有
機的亜硝酸塩の投与のような薬学的介入を含む。活性が心臓血管疾患に関連する
特定の多型パターンと関連することが末知の薬剤を用いた介入も含まれる。本願
発明者らは、特定の多型パターンがACEインヒビターに対する個人の反応性と
関連することを見出した(例えば、以下の実施例3参照)。例えば、特定の治療
方法の候補である患者が、その特定の治療法に対する反応性と関連する多型パタ
ーンについて選別されることが考えられる。
好ましい実施態様においては、ACE 2193A/G、AGR 1072 G
/G、およびAT1 1167 A/A(以下参照)を含む多型パターンの個人に
おける存在または不在が、ACEインヒビターに対する個人の反応性を同定する
ために調べられる。
別の実施態様では、この方法は、個人の多型パターンを、例えば、高血圧症、
異常心電図波形プロフィール、心筋梗塞、発作またはアテローム硬化症のような
心臓血管疾患の一つ以上のマーカーを示す、または示していた個人の多型パター
ンと比較することを含む(例えば、以下の実施例2参照)。
本発明の方法を実施する際に、個人の多型パターンは、個人からDNAを得る
こと、および、上述したようなACE、AGT、およびAT1の所定の多型部位
の配列を決定することによって確立することができる。
DNAは、あらゆる細胞源から得ることができる。臨床的に入手できる細胞源
の非限定的な例は、血液細胞、頬の細胞、腟頸管動脈細胞、尿中の上皮細胞、胎
児細胞またはバイオプシーによって得られた組織中に存在するあらゆる細胞を含
む。細胞は、非限定的に、血液、唾液、汗、尿、脳脊髄液、糞便、および感染ま
たは炎症部位における組織滲出液を含む体液からも得ることができる。DNAは
、当該技術分野において標準的な多数の方法のいずれかを用いて細胞源または体
液から抽出される。DNAを抽出するために用いられる特定の方法は、起源の性
質に依存すると解される。
ACE、AGTおよび/またはAT1遺伝子における多型部位における抽出さ
れたDNAの配列の決定は、直接的配列決定、対立遺伝子特異的オリゴヌクレオ
チドとのハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的PCR、リガーゼPCR、
HOT切断、変性勾配ゲル電気泳動(DDGE)、および一本鎖コンホメーショ
ン多型性(SSCP)を含むが、これらに限定されない当該技術分野において知
られたあらゆる手段によって達成される。直接的配列決定は、非限定的に、マク
サム−ギルバート法を用いた化学的配列決定;サンガー法を用いた酵素学的配列
決定;質量分析配列決定;およびチップベース技術(chip-based technology)を
用いた配列決定を含むあらゆる方法によって達成されてもよい。例えば、Little
ら,Genet.Anal.6:151,1996参照。好ましくは、患者のDNAは、最初に、特
異的な増幅プライマーを用いてポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅さ
れる。
別の実施態様では、バイオプシー組織が患者から得られる。異なる多型形態A
CE、AGTおよび/またはAT1間を区別することができる抗体は、抗体によ
って特定された多型形態の存在または不在を調べるために組織のサンプルに適用
される。抗体はポリクローナルまたはモノクローナルであってもよいが、好まし
くはモノクローナルである。細胞に結合する特異的抗体の測定は、例えば、定量
的フローサイトメトリー、もしくは酵素結合または蛍光結合イムノアッセイのよ
うな既知の方法によって達成されてもよい。特定の多型性または多型パターンの
存在または不在、およびその対立遺伝子分布(すなわち、ホモ接合対ヘテロ接合
)は、患者から得られた値と、既知の多型パターンを備える患者の集団から確立
された標準とを比較することによって調べられる。
別の実施態様では、RNAは、グアニジウムチオシアナート−フェノール−ク
ロロホルム抽出(Chomocyznskiら,1987,Anal.Biochem.,162:156)のような
当業者に周知の標準的な方法を用いてバイオプシー組織から単離される。単離さ
れたRNAは、特定のオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、ポリメラーゼ連
鎖反応による組み合わされた逆転写および増幅(RT−PCR)が行われる。プ
ライマーアニーリングの条件は、確実に特異的逆転写および増幅するように選択
され;増幅産物の出現は、特定の対立遺伝子の存在の特徴である。別の実施態様
では、RNAは、逆転写および増幅され、その後に増幅配列が例えば直接的配列
決定によって同定される。
本発明を実施する際に、心臓疾患状態の特定のマーカーを示す多数の個人の多
型パターンの分布が、上記方法のいずれかによって調べられ、かつ、年齢、人種
的起源、および/または別のあらゆる統計的または医学的関連パラメーターが適
合し、質的または量的に種々の状態マーカーを示す患者の多型パターンの分布と
比較される。対比は、名目上の論理的回帰または標準最小二乗回帰分析を含む、
当該技術分野において知られたあらゆる方法を用いて達成される。この方法では
、特定の多型パターンと特定の心臓血管状態との間の、統計学的に重要な相関関
係を確立することが可能である。さらに、特定の多型パターンと、例えば、特定
の治療方法から生じるような心臓血管状態における変化との間の統計学的に重要
な相関関係を確立することも可能である。この方法では、多型パターンと、特定
の治療に対する反応性とを相関させることが可能である。
ACE、AGTおよびAT1をコードする遺伝子における多型部位
本発明に含まれるACE、AGTおよびAT1をコードする遺伝子の多型部位
は、集団の個人の多型性におけるACE、AGTおよび/またはAT1遺伝子の
全てまたは一部のDNA配列を決定することによって同定される。DNA配列の
決定は、例えば化学的または酵素学的配列決定を含むあらゆる慣例的な方法を用
いて達成されてもよい。
本発明の多型部位は、非限定的に、以下に記載されたものを含み、付された番
号は表1に掲載されたGenbank配列に対応する。
(i)ACE:5106、5349、および5496と番号が付された制御領
域の部位(ACRと称する);375、582、731、1060、1215、
2193、2328、2741、3132、3387、3503および3906
と番号が付されたコード領域中の部位(ACEと称する);および、Genbankエ
ントリーX62855において番号が付された部位1451。
(ii)AGT:395、412、432、449、692、839、1007
、1072、1204および1218と番号が付された制御領域中の部位(AG
Rと称する);273、620、803、912、997、1116および11
74と番号が付されたコード領域中の部位(AGTと称する);および、Genban
kエントリーM24688において番号が付された部位49。
(iii)AT1:1427、1756、1853、2046、2354、23
55および2415と番号が付された制御領域中の部位(ATRと称する);お
よび449、678、1167および1271と番号が付されたコード領域中の
部位(AT1と称する)。
好ましい実施態様では、上記多型部位のそれぞれの配列は、以下を含む。
(i)ACE制御領域:5106C、5106T、5349A、5349T、
5496T、および5496C;
(ii)ACEコード領域:375A、375C、582C、582T、731
A、731G、1060G、1060A、1215C、1215T、2193G
、2193A、2328A、2328G、2741G、2741T、3132C
、3132T、3387T、3387C、3503G、3503C、3906G
、および3906A;および、GenbankエントリーX62855において番号が
付されたヌクレオチド1451−1783の欠失;
(iii)AGT制御領域:395T、395A、412C、412T、432
G、432A、449T、449C、692C、692T、839G、839A
、1007G、1007A、1072G、1072A、1204C、1204A
、1218A、1218G;
(iv)AGTコード領域:273C、273T、620C、620T、803
T、803C、912C、912T、997G、997C、1116G、111
6A、1174Cおよび1174A;GenbankエントリーM24688の49位
のAまたはG;
(v)AT1制御領域:1427A、1427T、1756T、1756A、
1853T、1853G、2046T、2046C、2354A、2354C、
2355G、2355C、2415Aおよび2415G;かつ、
(vi)AT1コード領域:449G、449C、678T、678C、116
7A、1167G、1271Aおよび1271C。
個人は、特定の多型部位のホモ接合またはヘテロ接合であってもよい(例えば
、以下の表6を参照)。
本発明に係るACE、AGTおよび/またはAT1遺伝子における一つ以上の
多型性を含む多型パターンの非限定的な例は、ACR 5349 A/T、AGR
1218 A;ACR 5496 C、AGR 1204 A/C;ACR 5496
C/T、AGR 1218 A、AGT 620C/T;ACE 2193 A、A
GR 1204 C、ACE 2328 G;ACE 2193 A、AGR 120
4 A/C;ACE 3387 T、AGR 1218 A;ACE 3387 T、
AGT 620 C/T;AGR 1204 A/C、AT1 678 C/T;AG
R 1204 A/C、AT1 1271 A/C;ACE 1215 C、AGR
1204 A/C;AGR 1204 A/C、AT1 1167 A、ACE 39
06 A/G;AGR 1204 A、AGT 620 C、AT1 1271 A、
AT1 1167 A、AGR 395 A/T;AGR 1204 A/C、AGT
620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A、AGR 39
5 T;AGR 1204 A/C
、AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A/G、
AGR 395 T;AGR 1204 A、AT1 678 C、AT1 1167
A、AGR 395 A/T;AGR 1204 A/C、AT1 678 C/T、
AT1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、AT1 12
71 A/C、AT1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T
、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A/G、AGR 395 T;AG
T 620 C、AT11271 A、AT1 1167 A、AGR 395 A/
T;AGT 620 C、AT1 678 A、AT1 1167 A、AGR 39
5 A/T;AGT 620 C/T、AT1 678 C/T;AT1 1167
A、AGR 395 T;ACE 2193 A、AGR 1218 A、AGT 8
03 A;ACE 2193 A、AGT 620 C/T;ACE 2328 G、
AGT 620 C/T;ACE 3387 T、AGR 1204 A/C;ACE
2193 A、ACE 2328 G、AGR 1204 C;およびACE 21
93 A/G、AGR 1072 G/G、AT11167 A/Aを含み、これら
は心臓血管疾患の臨床的徴候の増大した原因と相関する。
単離された多型核酸、プローブおよびベクター
本発明は、ヒトACE、AGTおよびAT1遺伝子に関する上記多型部位を含
む単離された核酸;当該核酸を含むベクター;および当該ベクターを含むトラン
スフォームされた宿主細胞を提供する。また、本発明は、これらの多型性を検出
するために用いられるプローブを提供する。
本発明を実施する際に、分子生物学、微生物学、および組み換えDNAにおけ
る多くの慣例的な技術が用いられる。このような技術は、周知であり、例えば、
Sambrookら,1989,Holecular Cloning:A Laboratory Manual,Second Edition
,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York;DNAC
loning:A Practical Approach,Volumes IとII,1985(D.N.Glover ed.);Ol
igonucleotide Synthesis,1984,(M.L.Gait ed.);Nucleic Acid Hybridization
,1985,(HamesとHiggins);Ausubelら,Current Protocols in MolecularBiolog
y,1997,(John WileyとSons);およびHethods in Enzymology Vol.1
54とVol.155(それぞれ、WuとGrossman,およびWu,eds.)に完全に説朋されてい
る。
ベクターへの本発明の配列を含む核酸(通常はDNA)の挿入は、DNAとベ
クターの両方の末端が適合する制限部位を有する場合に容易に行われる。もしこ
れを行うことができない場合には、平滑末端を生じるために、制限エンドヌクレ
アーゼ切断によって産生された一本鎖DNAオーバーハングを切断することによ
りDNAおよび/またはベクターの末端を修飾する必要、または、適切なDNA
ポリメラーゼで一本鎖末端を満たすことによって同じ結論を得る必要があるかも
しれない。
あるいは、所望のあらゆる部位が、例えば、末端にヌクレオチド配列(リンカ
ー)をリゲートすることによって作製されてもよい。このようなリンカーは、所
望の制限部位を定義する特定のオリゴヌクレオチド配列を含んでもよい。制限部
位は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)の使用によっても産生することができる
。例えば、Saikiら,1988,Science 239:48を参照。切断されたベクターとDN
Aフラグメントは、必要であればホモポリマーテーリングによって修飾されても
よい。
核酸は細胞から直接単離されてもよく、既知の方法を用いて化学的に合成され
てもよい。あるいは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法は、鋳型として、化学
的に合成された鎖またはゲノム物質を用いて本発明の核酸を産生するために用い
られる。PCRに用いられるプライマーは、ここに記載された配列情報を用いて
合成することができ、さらに、必要であれば組み換え発現用の所定のベクターへ
の取り込みを容易にするために、適切な新たな制限部位を導入するように設計す
ることができる。
本発明の核酸は、天然のACE、AGTまたはAT1遺伝子配列が隣接しても
よく、プロモーター、エンハンサー、応答成分、シグナル配列、ポリアデニレー
ション配列、イントロン、5’−および3’−非コード領域等を含む異種配列と
結合してもよい。核酸は、当該技術分野において知られた多くの手段によって修
飾されてもよい。このような修飾の非限定的な例は、メチル化、“キャップ”、
アナログを用いた一つ以上の天然に生じたヌクレオチドの置換、例えば非チャー
ジ結合(例えば、メチルホスホナート、ホスホトリエステル、ホスホロアミダー
ト、カルバマート等)およびチャージ結合(例えば、ホスホロチオアート、ホス
ホロジチオアート等)を有するもののようなヌクレオチド間修飾を含む。核酸は
、例えば、タンパク(例えば、ヌクレアーゼ、トキシン、抗体、シグナルペプチ
ド、ポリ−L−リシン等)、挿入剤(例えば、アクリジン、ソラレン等)、キレ
ート剤(例えば、金属、放射性金属、鉄、酸化金属等)およびアルキル化剤のよ
うな一つ以上の付加的な共有結合分子を含んでもよい。PNAも含まれる。核酸
は、メチルまたはエチルホスホトリエステルあるいはアルキルホスホルアミダー
ト(phosphoramidate)結合の形成によって誘導されてもよい。さらに、本発明の
核酸配列は、直接または間接的に検出可能なシグナルを提供することができるラ
ベルで修飾されてもよい。典型的なラベルは、ラジオアイソトープ、蛍光分子、
ビオチン等を含む。
また本発明は、開示されたACE、AGTおよびAT1誘導遺伝子配列もしく
はその誘導体またはフラグメントを含む核酸ベクターを提供する。プラスミドと
真菌のベクターを含む多数のベクターは、種々の原核性および真核性宿主におけ
る複製および/または発現について記載されており、遺伝子治療、並びに簡単な
クローニングまたはタンパク発現のために用いられてもよい。適切なベクターの
非限定的な例は、ここに記載または引用された方法もしくは関連する技術分野の
当業者に知られた方法を用いて、pUCプラスミド、pETプラスミド(Novage
n,Inc.,Madison,WI)もしくは、pRSETまたはpREP(Invitrogen,Sa
n Diego,CA)、並びに多くの適切な宿主細胞を含む。ベクター/宿主の特定の
選択は、本発明の実施に重要なものではない。
適切な宿主細胞は、電気穿孔法、CaCl2媒介DNA取り込み、真菌または
ウイルス感染、微量注入、微量射出または他の確立された方法を含む適切なあら
ゆる方法によって適切にトランスフォーム/トランスフェクト/感染されてもよ
い。適切な宿主細胞は、細菌、原始細菌(archebacteria)、真菌、特に酵母、お
よび植物および動物細胞、特に哺乳動物細胞を含む。多数の転写開始および終結
制御領域が単離され、種々の宿主における異種タンパクの転写および翻訳に効果
的であることが示された。これらの領域の例、単離方法、操作方法等は、当該技
術分
野において知られている。適切な発現条件下では、宿主細胞は、組み換えによっ
て生成されたACE−、AGT−またはAT1−誘導ペプチドおよびポリペプチ
ドの出所として用いることができる。
また、ACE−、AGT−またはAT1−誘導遺伝子配列をコードする核酸が
組み換えによって細胞中に導入されてもよい。例えば、このような配列を細胞に
導入することができ、それによってその遺伝子と実質的に同じ内在性遺伝子の部
位または配列において相同的組み換えが生じる。また、非相同的組み換えまたは
相同的組み換えによる丙因性遺伝子の除去のような別の組み換えをベースとする
方法が使用されてもよい。
本発明の核酸は、遺伝的多型性の検出用プローブとしての使用、並びに、正常
または変異体ACE−、AGT−、またはAT1−誘導ペプチドまたはポリペプ
チドの組み換え生成のための鋳型としての使用を見出す。
本発明に係るプローブは、非限定的に、約10−100bp、好ましくは15
−75bp、最も好ましくは17−25pbの長さの単離された核酸を含み、こ
のプローブは、高度の厳密(ストリンジェント)性で、ここに記載された一つ以上のAC
E、AGTまたはAT1遺伝子誘導多型配列、または多型部位に隣接する配列に
ハイブリダイズする。さらに、一部の実施態様において、全長の遺伝子配列がプ
ローブとして用いられてもよい。一連の実施態様において、プローブは、上記A
CE、AGTまたはAT1遺伝子の多型部位にまたがる。別の一連の実施態様に
おいては、プローブは、多型部位に隣接する配列に対応する。
多型ACE、AGTおよびAT1ポリペプチドおよび多型性特異的抗体
本発明は、上記多型部位を含むACE、AGTおよびAT1をコードする単離
されたペプチドおよびポリペプチドを含む。好ましい実施態様においては、ペプ
チドおよびポリペプチドは、心臓血管剤を同定するための使用可能な選別ターゲ
ットである。別の好ましい実施態様では、ペプチドおよびポリペプチドは、多型
部位を含むポリペプチドと特異的に反応し、かつ、そのポリペプチドを前記部位
に異なる配列を有する別のポリベブチドから区別する抗体を適切な宿主動物にお
いて誘導することができる。
本発明に係るポリペプチドは、好ましくは少なくとも5残基以上の長さ、さら
に好ましくは少なくとも15残基である。これらのポリペプチドを得る方法は、
以下に記載されている。タンパク生化学および免疫学における多くの慣例的な技
術を用いることができる。係る技術は周知であり、Immunochemical Methods in
Cell and Molecular Biology,1987(MayerとWaler,eds;Academic Press,Londo
n);Scopes,1987,Protein Purification:Principles and Practice,Second Edi
tion(Springer-Verlag,N.Y.)およびHandbook of Experimental Immunology,
1986,Volumes I-IV(WeirとBlackwell eds.)に説明されている。
タンパクをコードする配列を含む核酸は、完全な細胞または細胞を含まない翻
訳システムにおいてACE−、AGT、またはAT1−誘導ポリペプチドの組み
換え発現を指示するために用いることができる。所望により所定の宿主生物にお
けるより効率的な発現をするように設計された既知の遺伝コードは、所望のアミ
ノ酸配列をコードするオリゴヌクレオチドを合成するために用いることができる
。このポリペプチドは、適切なタンパクコード配列が導入および発現されたヒト
細胞、または異種生物または細胞(細菌、真菌、昆虫、植物および哺乳動物細胞
を含むが、これらに限定されない)から単離されてもよい。さらに、ポリペプチ
ドは組み換え融合タンパクの一部であってもよい。
ペプチドおよびポリペプチドは、非限定的に、排除的固相合成法、部分的固相
法、断片濃縮または古典的溶液合成を含む商業的に入手できる自動化された方法
によって化学的に合成されてもよい。ポリペプチドは、好ましくはMerrifield,
1963,J.Am.Chem.Soc.85:2149に記載された固相ペブチド合成によって調製
される。
ポリペプチド精製の方法は、当該技術分野において周知であり、非限定的に、
調製用ディスクーゲル電気泳動、等電点電気泳動、HPLC、逆相HPLC、ゲ
ルろ過、イオン交換および分配クロマトグラフィー、および向流分配を含む。一
部の目的のために、タンパクが、非限定的に、ポリヒスチジン配列のような精製
を容易にする付加的配列タグを含むような組み換えシステムにおいて、ポリペプ
チドを生成することが好ましい。ポリペプチドは、適切な固相マトリックスにお
けるクロマトグラフィーによって宿主細胞の粗製の溶解物から精製することがで
きる。あるいは、ACE、AGTまたはAT1、もしくはこれらから誘導された
ペプチドに対して生成された抗体は、精製試薬として使用することができる。別
の精製方法も可能である。
本発明は、ポリペプチドの誘導体および相同体も含む。一部の目的のために、
ペプチドをコードする核酸配列は、機能的に等価な分子、すなわち機能保存変異
体を提供する置換、付加、または欠失によって変更されてもよい。例えば、配列
内部の一つ以上のアミノ酸残基は、例えば正に帯電したアミノ酸(アルギニン、
リシン、およびヒスチジン);負に帯電したアミノ酸(アスパラギン酸塩および
グルタミン酸塩);極性中性アミノ酸;および非極性アミノ酸のような類似した
特性の別のアミノ酸によって置換することができる。
単離されたポリペプチドは、例えば、リン酸化、硫酸化、アシル化または別の
タンパク修飾によって修飾されてもよい。また、非限定的に、ラジオアイソトー
プおよび蛍光化合物を含む、直接または間接的に検出可能なシグナルを提供する
ことができるラベルを用いて修飾されてもよい。
また、本発明は、本発明の多型部位を特異的に認識し、その部位に異なる配列
を含むものから特定の多型性を含むペプチドまたはポリペプチドを区別する抗体
を含む。このような本発明に係る多型部位特異的抗体は、ポリクローナルおよび
モノクローナル抗体を含む。抗体は、ACE、AGTまたはAT1誘導免疫原性
成分を用いて免疫することにより動物宿主中に誘導されてもよく、また、免疫細
胞のインビトロにおける免疫によって形成されてもよい。抗体を誘導するために
用いられる免疫原性成分は、ヒト細胞から単離されてもよく、また組み換えシス
テムにおいて産生されてもよい。抗体は、適切な抗体をコードするDNAを用い
てプログラムされた組み換えシステムにおいて産生されてもよい。あるいは、抗
体は、精製された重鎖および軽鎖の生化学的再構成によって構成されてもよい。
この抗体は、ハイブリッド抗体(すなわち、二つのセットの重鎖/軽鎖の組み合
わせを含み、それぞれが異なる抗原を認識する)、キメラ抗体(すなわち、重鎖
、軽鎖、あるいはその両方が融合タンパクである)、および一価抗体(すなわち
、第二重鎖の定常領域に結合した重鎖/軽鎖複合体からなる)を含む。抗体のF
ab’およびF(ab)2フラグメントを含むFabフラグメントも含まれる。
全
ての上記のタイプの抗体および誘導体の産生方法は、当該技術分野において周知
であり、以下により詳細に記載する。例えば、ポリクローナル抗血清を産生およ
び処理するための技術は、MayerとWalker,1987,Immunochemical Methods in C
ell and Molecular Biology,(Academic Press,London)に記載されている。ハ
イブリドーマによるモノクローナル抗体の作製のための一般的な方法は周知であ
る。不死の抗体産生細胞系は、細胞融合によって、並びに、腫瘍DNAを用いた
Bリンパ球の直接的トランスフォーメーション、またはエプスタイン-バーウイ
ルスを用いたトランスフェクションのような別の技術によって製造することがで
きる。例えば、Schreierら,1980,Hybridoma Techniques;U.S.Patent Nos.434
1761;4399121;4427783;4444887;4466917;4472500;4491632;および4493890を参照
。ACE、AGTまたはAT1−誘導エピトープに対して産生された一群のモノ
クローナル抗体は、種々の特性、すなわちアイソタイプ、エピトープ親和性等に
ついて選別することができる。
本発明の抗体は、非限定的に、調製用ディスクーゲル電気泳動、等電点電気泳
動、HPLC、逆相HPLC、ゲルろ過、イオン交換および分配クロマトグラフ
ィー、および向流分配を含む標準的な方法によって精製することができる。抗体
の精製方法は、例えば、The Artof Antibody Purification,1989,Amicon Divi
sion,W.R.Grace & Co.に開示されている。一般的なタンパク精製法は、Protei
n Purification:Principles and Practice,R.K.Scopes,Ed.,1987,Springer-
Verlag,New York,NYに記載されている。
開示された配列の免疫原性能、および得られた配列特異的抗体と免疫細胞の特
徴を調べる方法は、当該技術分野において周知である。例えば、特定の多型配列
を含むペプチドに応答して誘導された抗体は、多型配列を特異的に認識する能力
、すなわち、多型配列を含むペプチドまたはポリペプチドに特異的に結合し、か
くして同じ部位に異なる配列を含む類似のペプチドまたはポリペプチドからそれ
を区別する能力について試験することができる。
診断方法およびキット
本発明は、個人のACE、AGTおよびAT1遺伝子内の多型部位における配
列を決定するためのキットを提供する。このキットは、一つ以上の多型部位にお
ける配列を決定するための手段を含み、多型パターンの分析のためのデータを任
意に含んでもよい。配列決定のための手段は、適切な核酸をベースとする免疫学
的試薬を含んでもよい(以下参照)。好ましくは、このキットは、適切なバッフ
ァー、適切なコントロール試薬、多型部位の配列を調べるための説明書も含む。
このキットは、特定の多型パターンと望ましい処置法または別の指標との関係に
関するデータも含む。
核酸をベースとする診断方法およびキット:
本発明は、生物学的サンプルにおける多型パターンを検出するための核酸をベ
ースとする方法を提供する。ACE、AGTおよび/またはAT1をコードする
遺伝子の特定の多型部位における配列は、非限定的に、多型性特異的プローブを
用いたハイブリダイゼーションと直接的配列決定を含む、当該技術分野において
知られたあらゆる適切な手段を用いて調べられる。
また、本発明は、核酸をベースとする診断的適用に適したキットを提供する。
ある実施態様では、診断キットは、以下の成分を含む:
(i)プローブDNA:プローブDNAは、予め標識されていてもよく、また
、プローブDNAは末標識であって、標識化のための成分がそのキットの別個の
容器中に含まれていてもよい;および
(ii)ハイブリダイゼーション試薬:このキットは、適切であれば固相マト
リックスおよび標準を含む、特定のハイブリダイゼーションプロトコルに必要な
別の適切に収容された試薬および材料を含んでもよい。
別の実施態様では、診断キットは、
(i)配列決定プライマー:配列決定プライマーは、予め標識されていても、
親和的精製または付着分子を含んでいてもよい;および
(ii)配列決定試薬:を含む。このキットは、特定の配列決定プロトコルに必
要な別の適切に収容された試薬および物質を含んでもよい。好ましい実施態様の
一つでは、このキットは、ACE 2193 A/G、AGR 1072 G/G、
AT1 1167 A/Aの多型部位に隣接する配列に対応する一群の配列決定プ
ライマー、並びに、各多型配列の存在を検出するための手段を含む。
抗体をベースとする診断方法およびキット:
本発明は、生物学的サンプルにおける多型パターンを検出するための抗体をベ
ースとする方法も提供する。この方法は、(i)安定な抗原−抗体複合体が抗体
とサンプル中の抗原性成分との間に形成される条件下で、各抗体調製物がACE
、AGTまたはAT1の特定の多型形態に特異的である一つ以上の抗体調製物と
サンプルとを接触させる工程;および(ii)複合体の検出がサンプルにおける特
定の多型形態の存在を示す、当該技術分野で知られたあらゆる適切な手段を用い
て工程(i)で形成された抗原−抗体複合体を検出する工程を含む。
典型的に、イムノアッセイは、標識された抗体か標識された抗原性成分(例え
ば、抗体に対する結合についてサンプル中の抗原と競合するもの)のいずれかを
用いる。適切な標識は、非限定的に、酵素をベースとする、蛍光、化学発光、放
射活性または染料分子を含む。例えば、ビオチンとアビジンを利用するもの、お
よびELISAアッセイのような酵素標識イムノアッセイのような、プローブか
らのシグナルを増幅するアッセイも知られている。
また、本発明は、抗体をベースとする診断的適用に適したキットを提供する。
診断キットは、典型的に以下の一つ以上の成分を含む:
(i)多型性特異的抗体:抗体は、予め標識されていてもよく、また、抗体は
未標識であって、標識化のための成分がキットの別個の容器中に含まれてもよく
、あるいは、第二の標識化抗体が提供される;および
(ii)反応成分:このキットは、適切であれば固相マトリックスおよび標準を
含む、特定のイムノアッセイプロトコルに必要な別の適切に収容された試薬およ
び物質を含んでもよい。
上記のキットは、試験を行うための説明書を含んでもよい。さらに、好ましい
実施態様においては、診断キットは高処理能力および/または自動操作に適合す
るものである。
薬剤ターゲットおよび選別方法
本発明に従って、ACE、AGTおよびAT1をコードする遺伝子から誘導さ
れたヌクレオチド配列と、ACE、AGTおよびAT1ポリベブチドから誘導さ
れたペプチド配列、特に一つ以上の多型配列を含むものは、心臓血管剤、すなわ
ち心臓血管疾患の一つ以上の臨床的徴候を処置するのに効果的な化合物を同定す
るのに使用できるターゲットを含む。
薬剤ターゲットは、非限定的に、(i)ACE、AGTおよびAT1をコード
する遺伝子から誘導された単離された核酸、および(ii)ACE、AGTおよび
AT1ポリペプチドから誘導された単離されたペプチドおよびポリペプチドを含
み、いずれも一つ以上の多型部位を含む。
インビトロ選別方法:
一連の実施態様において、一つ以上の多型部位を含む単離された核酸は、配列
特異的に試験化合物を結合する能力についてインビトロで試験される。この方法
は:
(i)多型部位に特定の配列を含む第一の核酸と、前記多型部位の異なる配列
を除いて第一の核酸の配列と同一である第二の核酸とを提供し: (ii)結合に
適した条件下で、当該核酸と多数の試験化合物とを接触させ;かつ
(iii)第一または第二の核酸配列に選択的に結合する化合物を同定すること
を含む。
ここで用いられる選択的結合は、例えば、結合親和性、結合能力等のような結
合のあらゆるパラメーターにおけるあらゆる測定可能な差異を指す。
別の一連の実施態様では、一つ以上の多型部位を含む単離されたペプチドまた
はポリペプチドは、配列特異的な方法で試験化合物を結合する能力についてイン
ビトロで試験される。配列決定方法は、
(i)多型部位において特定の配列を含む第一のペプチドまたはポリペプチド
と、前記多型部位の異なる配列を除いて配列が第一のペプチドまたはポリペプチ
ドと同一である第二のペプチドまたはポリペプチドを提供し;
(ii)結合に適した条件下で、前記ポリペプチドと多数の試験化合物とを接触
させ;かつ、
(iii)核酸配列の一つに選択的に結合する化合物を同定することを含む。
好ましい実施態様において、高処理能力選別プロトコルは、配列特異的に上記
遺伝子またはペプチドを結合する能力について、大量の試験化合物を調べるため
に用いられる。
試験化合物は、合成または天然の化合物の巨大なライブラリーから選別される
。現在、多数の手段が、糖、ペプチドおよび核酸をベースとする化合物のランダ
ムおよび方向性のある合成のために用いられている。合成化合物ライブラリーは
、Maybridge Chemical Co.(Trevillet,Cornwall,UK),Comgenex(Princeton,
NJ),Brandon Associates(Merrimack,NH)およびMicrosource(New Milford,CT)
から商業的に入手できる。微量化学ライブラリーは、Aldrich(Hilwaukee,WI)か
ら入手できる。あるいは、細菌、真菌、植物および動物抽出物の形態の天然化合
物のライブラリーは、例えばPan Laboratories(Bothell,WA)またはMycoSearch(
NC)から入手することができ、あるいは容易に製造できる。さらに、天然および
合成により製造されたライブラリーおよび化合物は、慣例的な化学的、物理的お
よび生化学的手段を介して容易に修飾される。
インビボ選別方法:
ACE、AGTおよび/またはAT1をコードする遺伝子の多型変異体を発現
する完全な細胞または完全な動物は、候補の心臓血管剤を同定する選別方法にお
いて用いることができる。
一連の実施態様では、永久細胞系は、特定の多型パターンを示す個人から確立
される。あるいは、細胞(非限定的に、哺乳動物、昆虫、酵母または細菌細胞を
含む)は、適切なDNAの導入により一つ以上の多型配列を含む遺伝子を発現す
るようにプログラムされる。候補化合物の同定は、非限定的に、(i)ACE、
AGTまたはAT1の特定の多型変異体に対する試験化合物の選択的結合を測定
するアッセイ;(ii)ACE、AGTまたはAT1の測定可能な活性または機能
を修正(すなわち、阻害または増強)する試験化合物の能力を測定するアッセイ
;および(iii)ACE、AGTまたはAT1遺伝子のプロモーター(すなわち
、制
御)領域から誘導された配列の転写活性を修正(すなわち、阻害または増強)す
る化合物の能力を測定するアッセイを含む、あらゆる適切なアッセイを用いて行
うことができる。
別の一連の実施態様では、(i)特定の多型部位において異なる配列を有する
一つ以上のヒトACE、AGTまたはAT1遺伝子がトランスジェニック動物の
ゲノムに安定に挿入された;および/または(ii)内在性ACE、AGTおよび
/またはAT1遺伝子が特定の多型部位において異なる配列を有するヒトACE
、AGTおよび/またはAT1遺伝子を用いて不活性化および置換された、トラ
ンスジェニック動物が産生される。例えば、Coffman,Semin.Nephrol.17:404
,1997;Estherら,Lab.Invest.74:953,1996;Murakamiら,Blood Press.Supp
l.2:36,1996を参照。このような動物は、候補化合物を用いて処理することが
でき、心臓血管の状態の一つ以上の臨床的なマーカーについて観察することがで
きる。
実施例1:ACE、AGTおよびAT1をコードするヒト遺伝子の多型部位の同
定方法
以下の研究は、ヒトACE、AGTおよびAT1をコードする遺伝子内の多型
残基を同定するために行われた。
DNAサンプルは、277人から得られた。これらの個人は、1920年から
1924年の間にスウェーデンのウプサラで生まれたカフカス人男性であった。
個人は、身体歴に基づいてテスト集団に選択され、すなわち、それぞれ(i)健
康、心臓血管疾患の徴候がない者(100);または(ii)急性心筋梗塞(68
)、無症状心筋梗塞(34)、発作(18)、発作および急性心筋梗塞(19)
、あるいは50歳で高血圧症(39)の一つを有する者のいずれかに選択された
。DNAサンプルは各個人から得られた。
(i)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いてACE、AGTおよびAT1
遺伝子のいずれかの短いフラグメントを増幅すること、および(ii)増幅された
フラグメントを配列決定することによって、DNA配列分析を行った。各個人か
ら得られた配列を、既知のACE、AGTおよびAT1ゲノム配列と比較した(
表
1参照)。
(i)増幅:PCR反応は、以下の表2に示されたプライマーを用いた。 記載されている場合には、プライマーは以下の一つで修飾された:(i)ビオ
チン分子が記載された配列の5’末端に結合されている(B);(ii)M13か
ら誘導されたヌクレオチドの配列、5’−CAGGAAACAGCTATGAC
T−3’が記載された配列の5’末端に付加されている(MT);あるいは、(
iii)配列5’−AGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAG
T−3’が記載された配列の5’末端に付加されている(T=テール)。ヌクレ
オチドは、表1に記載されたGenbank配列に従って番号が付されている。関連す
る配列が公然と入手できない場合には、以下の例のように番号付けした:記載“
i−4:1−200”は、プライマー配列が、エキソン4の最初のコードヌクレ
オチドのすぐ上流のヌクレオチドを含み、かつその200bp上流に延びる配列
内に位置することを示す。同様に、記載“i+4:1−200”は、プライマー
配列が、エキソン4の最後のコードヌクレオチドのすぐ下流に位置するヌクレオ
チドから200bp延びる配列内に位置することを示す。いずれの場合にも、プ
ライマー配列の特定の位置が、表2の“ヌクレオチド”と記載された欄に記載さ
れている。
PCRに用いられた反応成分が、以下の表3に記載されている。 全てのPCR産物(フラグメントACEDI、AT1−spec.1およびAT1
−spec.2を除く)を、Pharmacia Biotechから商業的に入手できるプロトコルに
従って固相配列決定した。配列決定反応は、表2に記載された“テール”配列に
相補的な配列を有する配列決定プライマーを用いて行われる。この配列決定プラ
イマーのヌクレオチド配列は、5’−CGACGTTGTAAAACGACGG
CCAGT−3’であり、このプライマーは5’−ヌクレオチドにCy−5−分
子を用いて蛍光標識された。遺伝的変異を有する部位は、Pharmacia Biotechか
ら商業的に入手できるALFexpressTMシステムの使用によってヌクレオチド配列の
決定により同定された。
フラグメントACEDIの検出は、増幅されたフラグメントの大きさをゲル電
気泳動によって分析することによって行われ、短いPCR産物(192塩基対)
の存在は、D−対立遺伝子を示し、長いPCR産物(479塩基対)はI−対立
遺伝子を示した。両方のバンドの存在は、二つの対立遺伝子のヘテロ接合体を示
した。部位AT1−1271の対立遺伝子特異的反応の検出は、別個に、同一の
サンプルに対して二つの並行PCR反応を行い、増幅されたフラグメントの大き
さを比較することによって行われた。501塩基対のPCR産物が、両方の並行
反応における対照として常に存在すべきであるが、AT1−spec.1と称される
反応における378塩基対のPCR産物の存在が、この部位におけるAの存在を
示した。AT1−spec.2と称される反応における378塩基対のPCR産物の
存在は、この部位にCを示した。短いPCR産物が両方の反応に存在する場合に
は、その個人はAとCのヘテロ接合体である。
結果:
上記分析は、ACE、AGTおよびAT1をコードするヒト遺伝子の制御およ
びコード/イントロンセグメント内の多型部位の同定を可能にした。多型部位、
各部位に見出された変異ヌクレオチド、および多型性が同定されたPCRフラグ
メントが、以下の表6に示されている。90人の集団における各遺伝子型の頻度
も示されており、その遺伝子型を有する研究集団のパーセントとして示されてい
る。ACE、AGTまたはAT1に選択的なアミノ酸を生じる多型性も示されて
いる。以下に用いるように、名称“AGR”、“ACR”および“ATR”は、
それぞれ、ヒトAGT、ACE、およびAT1遺伝子の制御領域を指し、名称“
AGT”、“ACE”および“AT1”は、AGT、ACEおよびAT1遺伝子
のコード領域を指す。 これらの多型部位のサブセットは、さらなる187人においてさらに分析され
た。表7は、土記実施例1に記載された277人の集団における、多型部位、こ
れらの部位における配列、および各部位の遺伝子型頻度を示す。
実施例2:多型パターンと心臓血管疾患との関係
実施例1に同定された多型部位を、研究集団:心筋梗塞(MI);発作;およ
び高血圧に存在する心臓血管状態の以下のマーカーと相関させた。これらのマー
カーの一つ以上と統計学的に有意の相関関係を示す多型パターン、すなわち特定
の多型部位における配列の組み合わせが、以下に示されている。
先の三つの多型パターンの概要(同じ多型部位を含む):先の二つの多型パターンの概要:
先の三つの多型パターンの概要:
先の二つの多型パターンの概要:
実施例3:特異的多型パターンと治療反応との間の関係
以下の研究は、心臓血管疾患の治療の効力を予想する、ヒトACE、AGTお
よび/またはAT1遺伝子における多型パターンを定義するために行われた。
第一のグループは41人、第二のグループは20人である、二つのグループの
高血圧症の患者を研究した。このグループを、独立および組み合わせて分析した
この集団の患者は、以下の5つのACEインヒビター:カプトプリル、トラン
ドラプリル(Trandolapril)、リジノプリル、フォジノブリル(Fosinopril)または
エナラブリルの一つを用いてそれぞれ処置された。平均動脈血圧に対する薬剤の
効果を定量した。平均動脈血圧は、拡張期血圧の2/3+収縮期血圧の1/3と
して定義された。また、個人は、“高反応者”、すなわちACEインヒビター薬
剤を用いた治療の間に16mmHgより多くの低減を示す者、および“低反応者”、
すなわち16mmHgより多くの低減を示さない者として分類された。
第一の研究集団の51%に存在するある特定の多型パターン、ACE2193
A/G、AGR1072G/G、AT11167A/Aは、高反応者と低反応者
とを区別した。20人の第二のグループでは、このパターンは優勢でなかったが
(25%)、低減された血圧との相関は明白であった。この多型パターンを有す
る者(以下“1”と称する)は、この多型パターンを欠失した者(以下“0”と
称する)よりも、より大きな血圧の低減を示した。
さらに、高反応者と低反応者の配分(定義は上述)は以下の通りであった:
これらをまとめると、二つのグループの結果は、この多型パターンの存在が、
この多型パターンを持たない個人と比較して6.4−7.3mmHgの増分低減と関
係することを示す。
この多型パターンの普及率は、この高血圧集団の41%であった。これは、高
血圧患者におけるこの多型パターンについて試験し、この多型パターンを有する
患者にのみACEインヒビターを処方することが、本発明の方法に従って選択さ
れた高血圧集団において43%(一般における高血圧集団の)から76%まで反
応率を増加することができたことを示唆する。
【手続補正書】特許法第184条の8第1項
【提出日】平成11年5月24日(1999.5.24)
【補正内容】
請求の範囲
1. 個人の一つ以上のACE、AGTまたはAT1遺伝子内の一つ以上の多型
部位において確立された多型パターンと、心臓血管の治療方法に対して既知の反
応を示すヒトの前記と同じ多型部位の多型パターンとを比較することを含む、ヒ
ト個人の心臓血管症候群の治療方法に対する反応性を評価する方法。
2. 治療方法が、食事、ライフスタイル、および/または運動における変更;
侵襲性または非侵襲性の外科的技術;もしくは、薬学的介入である、請求項1記
載の方法。
3. 前記症候群が、心筋梗塞、高血圧、アテローム硬化症および発作からなる
群から選択された、請求項1記載の方法。
4. 前記治療方法が薬学的介入である、請求項2記載の方法。
5. 前記治療方法が、ACEインヒビター、アンギオテンシンIIレセプターア
ンタゴニスト、利尿薬、アルファーアドレノレセプターアンタゴニスト、強心配
糖体、ホスホジエステラーゼインヒビター、ベータ−アドレノレセプターアンタ
ゴニスト、カルシウムチャネルブロッカー、HMG−CoAレダクターゼインヒ
ビター、イミダゾリンレセプターブロッカー、エンドセリンレセプターブロッカ
ー、および有機亜硝酸塩からなる群から選択された心臓血管剤の投与を含む、請
求項4記載の方法。
6. 前記多型部位が、ACE 2193、AGR 1072およびAT1 11
67を含む、請求項5記載の方法。
7. 前記多型パターンが、ACE 2193 A/G、AGR 1072 G/G
およびAT1 1167 A/Aを含む、請求項6記載の方法。
8. (a)コード領域の部位2193におけるACE遺伝子;(b)制御領域
の部位1072におけるAGT遺伝子;コード領域の部位1167におけるAT
1遺伝子の配列を決定することによって確立された多型パターンと、ACEイン
ヒビターに対して種々の反応性を示すヒトの前記多型パターンとを比較すること
を含む、ACEインヒビターを用いて処置するために、心臓血管症候群の患者の
反応を予測するための、請求項1記載の方法。
9. 前記多型パターンが、ACE 2193 A/G、AGR 1072 G/G
、AT1 1167 A/Aを含む、請求項8記載の方法。
10. 多型部位が、5106、5349、および5496と番号が付されたA
CE制御領域の部位;375、582、731、1060、1215、2193
、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が
付されたACEコード領域中の部位;および、GenbankエントリーX62855
において番号が付されたACE遺伝子の部位1451;395、412、432
、449、692、839、1007、1072、1204および1218と番
号が付されたAGT制御領域中の部位;273、620、803、912、99
7、1116および1174と番号が付されたAGTコード領域中の部位;Genb
ankエントリーM24688において番号が付されたAGT遺伝子の部位49;
1427、1756、1853、2046、2354、2355および2415
と番号が付されたAT1制御領域中の部位;449、678、1167および1
271と番号が付されたAT1コード領域中の部位;並びに土記いずれかの組み
合わせからなる群から選択された、請求項1記載の方法。
11. 多型パターンが、ACE 5349 A/T、AGR 1218 A;AC
E 5496 C、AGR 1204 A/C;ACE 5496 C/T、AGR
1218 A、AGT 620 C/T;ACE 2193 A、AGR 1204
C、ACE 2328 G;ACE 2193 A、AGR 1204 A/C;AC
E 3387
T、AGR 1218 A;ACE 3387 T、AGT 620 C/T;AG
R1204 A/C、AT1 678 C/T;AGR 1204 A/C、AT1
1271 A/C;ACE 1215 C、AGR 1204 A/C;AGR 12
04 A/C、AT1 1167 A、ACE 3906 A/G;AGR 1204
A、AGT 620 C、AT1 1271 A、AT1 1167 A、AGR 3
95 A/T;AGR 1204 A/C、AGT 620 C/T、AT1 127
1 A/C、AT11167 A、AGR 395 T;AGR 1204 A/C、
AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A/G、A
GR 395 T;AGR 1204 A、AT1 678 C、AT1 1167 A
、AGR 395 A/T;AGR 1204 A/C、AT1 678 C/T、A
T1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、AT1 127
1 A/C、AT1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、
AT1 1271 A/C、AT1 1167 A/G、AGR 395 T;AGT
620 C、AT1 1271 A、AT1 1167 A、AGR 395 A/T
;AGT 620 C、AT1 678 A、AT11167 A、AGR 395
A/T;AGT 620 C/T、AT1 678 C/T;AT1 1167 A、
AGR 395 T;ACE 2193 A、AGR 1218 A,AGT 803
A;ACE 2193 A、AGT 620 C/T;ACE 2328 G、AGT
620 C/T;ACE 3387 T、AGR 1204 A/C;ACE 21
93 A、ACE 2328 G、AGR 1204 C;およびACE 2193
A/G、AGR 1072G/G、AT1 1167A/Aからなる群から選択さ
れた、請求項10記載の方法。
12. 核酸が多型部位を含み、前記多型部位の存在から、単独で、あるいはヒ
トACEの配列または一つ以上の別のヒト遺伝子における別の多型部位と組み合
わせて、心臓血管症候群の治療方法に対する個人の反応性を予測する、個人にお
いてACEをコードする単離された核酸。
13. 核酸が多型部位を含み、前記多型部位の存在から、単独で、あるいはヒ
トAGTの配列または一つ以上の別のヒト遺伝子における別の多型部位と組み合
わせて、心臓血管症候群の治療方法に対する個人の反応性を予測する、個人にお
いてAGTをコードする単離された核酸。
14. 核酸が多型部位を含み、前記多型部位の存在から、単独で、あるいはヒ
トAT1の配列または一つ以上の別のヒト遺伝子における別の多型部位と組み合
わせて、心臓血管症候群の治療方法に対する個人の反応性を予測する、個人にお
いてAT1をコードする単離された核酸。
15. 5106と番号が付された制御領域中の部位;375、582、731
、1060、2741、3132、3387、3503および3906と番号が
付されたコード領域中の部位;および上記いずれかの組み合わせからなる群から
選択された多型部位を含む、アンギオテンシン変換酵素(ACE)をコードする
ヒト遺伝子から誘導された単離された核酸。
16. 制御領域における多型部位の配列が、5106Cおよび5106Tから
なる群から選択され;かつ、コード領域における多型部位の配列が、Genbankエ
ントリーX62855において番号が付された、375A、375C、582C
、582T、731A、731G、1060G、1060A、2741G、27
41T、3132C、3132T、3387T、3387C、3503G、35
03C、3906G、3906Aからなる群から選択された、請求項15記載の
核酸。
17. 請求項15に記載された多型部位に高い厳密性でハイブリダイズするプ
ローブ。
18. 395、412、432、449、692、839、1007、107
2および1204と番号が付された制御領域中の部位;273、912、997
、1116、1174と番号が付されたコード領域中の部位、および、Genbank
エントリーM24688の部位49;並びに上記のいずれかの組み合わせからな
る
群から選択された多型部位を含む、アンギオテンシノゲン(AGT)をコードす
るヒト遺伝子を含む単離された核酸。
19. 制御領域における多型部位の配列が、395T、395A、412C、
412T、432G、432A、449T、449C、692C、692T、8
39G、839A、1007G、1007A、1072G、1072A、120
4Cおよび1204Aからなる群から選択され;コード領域における多型部位の
配列が、273C、273T、912C、912T、997G、997C、11
16G、1116A、1174Cおよび1174Aからなる群から選択され、Ge
nbankエントリーM24688の49位がAまたはGである、請求項18記載の
核酸。
20. 請求項18に記載された多型部位に高い厳密性でハイブリダイズするプ
ローブ。
21. 1427、1756、1853、2046、2354、2355および
2415と番号が付された制御領域中の部位;449と番号か付されたコード/
イントロン領域中の部位;およびこれらの組み合わせからなる群から選択された
多型部位を含む、I型アンギオテンシンIIレセプター(AT1)をコードするヒ
ト遺伝子を含む単離された核酸。
22. 制御領域における多型部位の配列が、1427A、1427T、175
6T、1756A、1853T、1853G、2046T、2046C、235
4A、2354C、2355G、2355C、2415Aおよび2415Gから
なる群から選択され;かつ、コード/イントロン領域における多型部位の配列が
、449Gおよび449Cからなる群から選択される、請求項21記載の核酸。
23. 請求項21に記載された多型部位に高い厳密性でハイブリダイズするプ
ローブ。
24. 多型部位が、GenbankエントリーX62855において番号が付された
ACE遺伝子の、5106、5349、および5496と番号が付されたACE
制御領域中の部位;375、582、731、1060、1215、2193、
2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が付
されたACEコード領域中の部位からなる群から選択された、ヒトACE遺伝子
内の一つ以上の多型部位を含む核酸のライブラリー。
25. 制御領域における多型部位の配列が、5106C、5106T、534
9A、5349T、5496Tおよび5496Cからなる群から選択され;かつ
、コード領域における多型部位の配列が、375A、375C、582C、58
2T、731A、731G、1060G、1060A、1215C、1215T
、2193G、2193A、2328A、2328G、2741G、2741T
、3132C、3132T、3387T、3387C、3503G、3503C
、3906G、3906A、およびGenbankエントリーX62855において番
号が付されたヌクレオチド1451−1783の欠失からなる群から選択される
、請求項24記載のライブラリー。
26. 多型部位が、395、412、432、449、692、839、10
07、1072、1204および1218と番号が付された制御領域中の部位;
273、620、803、912、997、1116および1174と番号が付
されたコード領域中の部位、および、GenbankエントリーM24688において
番号が付されたAGT遺伝子の部位49からなる群から選択される、ヒトAGT
遺伝子内の一つ以上の多型部位を含む核酸のライブラリー。
27. 制御領域における多型部位の配列が、395T、395A、412C、
412T、432G、432A、449T、449C、692C、692T、8
39G、839A、1007G、1007A、1072G、1072A、120
4C、1204A、1218A、1218Gからなる群から選択され;かつ、コ
ード領域における多型部位の配列が、273C、273T、620C、620T
、803T、803C、912C、912T、997G、997C、1116G
、1116A、1174C、1174A、およびGenbankエントリーM2468
8の49位のAまたはGからなる群から選択される、請求項26記載のライブラ
リー。
28. 多型部位が、1427、1756、1853、2046、2354、2
355および2415と番号が付された制御領域中の部位;および449、67
8、1167および1271と番号が付されたコード領域中の部位からなる群か
ら選択される、ヒトAT1遺伝子内の一つ以上の多型部位を含む核酸のライブラ
リー。
29. 制御領域における多型部位の配列が、1427A、1427T、175
6T、1756A、1853T、1853G、2046T、2046C、235
4A、2354C、2355G、2355C、2415Aおよび2415Gから
なる群から選択され;かつ、コード領域における多型部位の配列が、449G、
449C、678T、678C、1167A、1167G、1271A、および
1271Cからなる群から選択される、請求項28記載のライブラリー。
30. ACE 5349 A/T、AGR 1218A;ACE 5496 C、
AGR 1204 A/C;ACE 5496 C/T、AGR 1218 A、AG
T 620 C/T;ACE 2193 A、AGR 1204 C、ACE 232
8 G;ACE 2193 A、AGR 1204 A/C;ACE 3387 T、
AGR 1218 A;ACE 3387 T、AGT 620 C/T;AGR 1
204 A/C、AT1 678 C/T;AGR 1204 A/C、AT1 12
71 A/C;ACE 1215 C、AGR 1204 A/C;AGR 1204
A/C、AT1 1167 A、ACE 3906 A/G;AGR 1204 A
、AGT 620 C、AT11271 A、AT1 1167 A、AGR395
A/T;AGR 1204 A/C、AGT 620 C/T、AT1 1271 A
/C、AT1 1167 A、AG
R 395 T;AGR 1204 A/C、AGT 620 C/T、AT1 12
71A/C、AT1 1167 A/G、AGR 395 T;AGR 1204 A
、AT1 678 C、AT1 1167 A、AGR 395 A/T;AGR 1
204 A/C、AT1 678 C/T、AT1 1167 A、AGR 395
T;AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A、A
GR 395 T;AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1
167 A/G、AGR 395 T;AGT 620 C、AT1 1271 A、
AT1 1167 A、AGR395 A/T;AGT 620 C、AT1 678
A、AT1 1167 A、AGR 395 A/T;AGT 620 C/T、A
T1 678 C/T;AT1 1167 A、AGR 395 T;ACE 219
3 A、AGR 1218 A、AGT 803 A;ACE 2193 A、AGT
620 C/T;ACE 2328 G、AGT 620 C/T;ACE 3387
T、AGR 1204 A/C;ACE 2193 A、ACE 2328 G、A
GR 1204 C;およびACE 2193 A/G、AGR 1072 G/G、
AT1 1167A/Aからなる群から選択されたメンバーを含む、ヒトACE
、AGTおよび/またはAT1遺伝子における多型パターンのライブラリー。
31. 多型部位が、375、582、731、1060、1215、2193
、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が
付されたACEコード領域中のヌクレオチド部位からなる群から選択されたヌク
レオチドにコードされる、ACEポリペプチド配列における一つ以上の多型部位
を含む単離されたペプチドを含む、心臓血管剤のターゲットのライブラリー。
32. 多型部位が、273、620、803、912、997、1116およ
び1174と番号が付されたヌクレオチド部位からなる群から選択されたヌクレ
オチドにコードされる、AGTポリペプチドにおける一つ以上の多型部位を含む
単離されたペプチドを含む、心臓血管剤のターゲットのライブラリー。
33. 多型部位が、449、678、1167および1271と番号が付され
たヌクレオチド部位からなる群から選択されたヌクレオチドにコードされる、A
T1ポリペプチドにおける一つ以上の多型部位を含む単離されたペプチドを含む
、心臓血管剤のターゲットのライブラリー。
34. (i)配列決定プライマー、および
(ii)配列決定試薬を含み、
前記プライマーが、ヒトACE、AGTまたはAT1遺伝子の多型部位にハイ
ブリダイズするプライマー;およびヒトACE、AGTまたはAT1遺伝子の多
型部位に隣接してハイブリダイズするプライマーからなる群から選択され、前記
多型部位が心臓血管症候群の心臓血管治療方法に対する個人の反応性を予測する
ものである、心臓血管症候群の治療方法に対する個人の反応性を評価するための
キット。
35. 多型部位が、5106、5349、および5496と番号が付されたA
CE制御領域の部位;375、582、731、1060、1215、2193
、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が
付されたACEコード領域中の部位;GenbankエントリーX62855において
番号が付されたACE遺伝子の部位1451;395、412、432、449
、692、839、1007、1072、1204および1218と番号が付さ
れたAGT制御領域中の部位;273、620、803、912、997、11
16および1174と番号が付されたAGTコード領域中の部位;Genbankエン
トリーM24688において番号が付されたAGT遺伝子の部位49;1427
、1756、1853、2046、2354、2355および2415と番号が
付されたAT1制御領域中の部位;449、678、1167および1271と
番号が付されたAT1コード領域中の部位;並びに上記いずれかの組み合わせか
らなる群から選択された、請求項34記載のキット。
36. ヒトACE、AGTまたはAT1ポリペプチド内の多型部位に特異的な
一つ以上の抗体を含む、心臓血管状態を評価するためのキット。
37. 多型部位が、375、582、731、1060、1215、2193
、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が
付されたACEコード領域中のヌクレオチド部位;273、620、803、9
12、997、1116および1174と番号が付されたAGTコード領域中の
ヌクレオチド部位;449、678、1167および1271と番号が付された
AT1コード領域中の部位;並びに上記いずれかの組み合わせからなる群から選
択されたヌクレオチドによってコードされる、請求項36記載のキット。
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フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
A61P 9/12 A61P 9/12
C12N 15/09 ZNA C12N 15/00 ZNAA
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY,
DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I
T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ
,CF,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,
NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,L
S,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ
,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AL
,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,
BY,CA,CH,CN,CU,CY,CZ,DE,D
K,EE,ES,FI,GB,GE,GW,HU,ID
,IL,IS,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,
LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV,MD,M
G,MK,MN,MW,MX,NO,NZ,PL,PT
,RO,RU,SD,SE,SG,SI,SK,SL,
TJ,TM,TR,TT,UA,UG,US,UZ,V
N,YU,ZW
(72)発明者 リントシュトレーム,ペール ハリー ル
トガー
スウェーデン国 エス―756 53 ウップ
サラ スヴァンケールスヴェーゲン 26
アー
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1. (i)個人の多型パターンを確立するためにその個人の一つ以上のACE 、AGTまたはAT1遺伝子内の一つ以上の多型部位の配列を決定し、かつ (ii)(i)で確立された多型パターンを、心臓血管状態の所定のマーカーを示 すヒトの多型パターンと比較することを含む、ヒト個人の心臓血管状態を評価す る方法。 2. 前記所定の状態マーカーが、血圧、心電図プロフィール、および心臓血管 症候群の診断からなる群から選択された、請求項1記載の方法。 3. 前記症候群が、心筋梗塞、高血圧、アテローム硬化症および発作からなる 群から選択された、請求項2記載の方法。 4. 前記所定の状態マーカーが、心臓血管治療方法に対する応答を示す、請求 項2記載の方法。 5. 前記治療方法が、ACEインヒビター、アンギオテンシンIIレセプターア ンタゴニスト、利尿薬、アルファ−アドレノレセプターアンタゴニスト、強心配 糖体、ホスホジエステラーゼインヒビター、ベーターアドレノレセプターアンタ ゴニスト、カルシウムチャネルブロッカー、HMG−CoAレダクターゼインヒ ビター、イミダゾリンレセプターブロッカー、エンドセリンレセプターブロッカ ー、および有機亜硝酸塩からなる群から選択された心臓血管剤の投与を含む、請 求項4記載の方法。 6. 前記一つ以上の多型部位が、ACE 2193、AGR 1072およびA T1 1167を含む、請求項5記載の方法。 7. 前記多型パターンが、ACE 2193A/G、AGR 1072G/G およびAT1 1167 A/Aを含む、請求項6記載の方法。 8. (i)個人の多型パターンを確立するために、(a)コード領域における 部位2193におけるACE遺伝子;(b)制御領域における部位1072にお けるAGT遺伝子;および(c)コード領域における部位1167におけるAT 1遺伝子の配列を決定し;かつ、 (ii)(i)で確立された多型パターンを、前記ACEインヒビターに対して種 々の反応性を示すヒトの多型パターンと比較することを含む、ACEインヒビタ ーを用いた治療に対する、心臓血管症候群患者の反応を予測する方法。 9. 前記多型パターンが、ACE 2193 A/G、AGR 1072G/G 、AT1 1167 A/Aを含む、請求項8記載の方法。 10. 多型部位が、5106、5349、および5496と番号が付されたA CE制御領域の部位;375、582、731、1060、1215、2193 、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が 付されたACEコード領域中の部位;および、GenbankエントリーX62855 において番号が付されたACE遺伝子の部位1451;395、412、432 、449、692、839、1007、1072、1204および1218と番 号が付されたAGT制御領域中の部位;273、620、803、912、99 7、1116および1174と番号が付されたAGTコード領域中の部位;Genb ankエントリーM24688において番号が付されたAGT遺伝子の部位49; 1427、1756、1853、2046、2354、2355および2415 と番号が付されたAT1制御領域中の部位;449、678、1167および1 271と番号が付されたAT1コード領域中の部位;並びに上記いずれかの組み 合わせからなる群から選択された、請求項1記載の方法。 11. 多型パターンが、ACR 5349 A/T、AGR 1218 A;AC R 5496 C、AGR 1204A/C;ACR 5496 C/T、AGR 1 21 8 A、AGT 620 C/T;ACE 2193 A、AGR 1204 C、A CE 2328 G;ACE 2193 A、AGR 1204 A/C;ACE 3 387 T、AGR 1218 A;ACE 3387 T、AGT 620 C/T ;AGR 1204 A/C、AT1 678 C/T;AGR 1204 A/C、 AT1 1271 A/C;ACE 1215 C、AGR 1204 A/C;AG R 1204 A/C、AT1 1167 A、ACE 3906 A/G;AGR 1204 A、AGT 620C、AT1 1271 A、AT1 1167 A、A GR 395 A/T;AGR 1204 A/C、AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT11167 A、AGR 395 T;AGR 1204 A/C、AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A /G、AGR 395 T;AGR 1204 A、AT1 678 C、AT1 1 167 A、AGR 395 A/T;AGR 1204 A/C、AT1 678 C/T、AT1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、AT 1 1271 A/C、AT1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A/G、AGR 395 T ;AGT 620 C、AT1 1271 A、AT1 1167 A、AGR 39 5 A/T;AGT 620 C、AT1 678 A、AT11167 A、AGR 395 A/T;AGT 620 C/T、AT1 678 C/T;AT1 11 67A、AGR 395T;ACE 2193 A、AGR 1218 A、AGT 803 A;ACE 2193 A、AGT 620 C/T;ACE 2328 G 、AGT 620 C/T;ACE 3387 T、AGR 1204 A/C;AC E 2193 A、ACE 2328 G、AGR 1204 C;およびACE 2 193 A/G、AGR 1072 G/G、AT1 1167 A/Aからなる群 から選択された、請求項10記載の方法。 12. 核酸が多型部位を含み、前記多型部位の存在から、単独で、あるいはヒ トACEの配列または一つ以上の別のヒト遺伝子における別の多型部位と組み合 わせて、個人の心臓血管状態を予測する、個人においてACEをコードする単離 された核酸。 13. 核酸が多型部位を含み、前記多型部位の存在から、単独で、あるいはヒ トAGTの配列または一つ以上の別のヒト遺伝子における別の多型部位と紐み合 わせて、個人の心臓血管状態を予測する、個人においてAGTをコードする単離 された核酸。 14. 核酸が多型部位を含み、前記多型部位の存在から、単独で、あるいはヒ トAT1の配列または一つ以上の別のヒト遺伝子における別の多型部位と組み合 わせて、個人の心臓血管状態を予測する、個人においてAT1をコードする単離 された核酸。 15. 5106と番号が付された制御領域中の部位;375、582、731 、1060、2741、3132、3387、3503および3906と番号が 付されたコード領域中の部位;GenbankエントリーX62855において番号が 付された部位1451;および上記いずれかの組み合わせからなる群から選択さ れた多型部位を含む、アンギオテンシン変換酵素(ACE)をコードするヒト遺 伝子から誘導された単離された核酸。 16. 制御領域における多型部位の配列が、5106Cおよび5106Tから なる群から選択され;かつ、コード領域における多型部位の配列が、375A、 375C、582C、582T、731A、731G、1060G、1060A 、2741G、2741T、3132C、3132T、3387T、3387C 、3503G、3503C、3906G、3906A、およびGenbankエントリ ーX62855において番号が付されたヌクレオチド1451−1783の欠失 からなる群から選択される、請求項15記載の核酸。 17. 請求項15に記載された多型部位に高い厳密性でハイブリダイズするプ ローブ。 18. 395、412、432、449、692、839、1007、107 2および1204と番号が付された制御領域中の部位;273、912、997 、1116、1174と番号が付されたコード領域中の部位、および、Genbank エントリーM24688の部位49;並びに上記のいずれかの組み合わせからな る群から選択された多型部位を含む、アンキオテンシノゲン(AGT)をコード するヒト遺伝子を含む単離された核酸。 19. 制御領域における多型部位の配列が、395T、395A、412C、 412T、432G、432A、449T、449C、692C、692T、8 39G、839A、1007G、1007A、1072G、1072A、120 4Cおよび1204Aからなる群から選択され;コード領域における多型部位の 配列が、273C、273T、912C、912T、997G、997C、11 16G、1116A、1174Cおよび1174Aからなる群から選択され、Ge nbankエントリーM24688の49位がAまたはGである、請求項18記載の 核酸。 20. 請求項18に記載された多型部位に高い厳密性でハイブリダイズするブ ローブ。 21. 1427、1756、1853、2046、2354、2355および 2415と番号が付された制御領域中の部位;449と番号が付されたコード/ イントロン領域中の部位;およびこれらの組み合わせからなる群から選択された 多型部位を含む、I型アンギオテンシンIIレセプター(AT1)をコードするヒ ト遺伝子を含む単離された核酸。 22. 制御領域における多型部位の配列が、1427A、1427T、175 6T、1756A、1853T、1853G、2046T、2046C、235 4A、2354C、2355G、2355C、2415Aおよび2415Gから なる群から選択され;かつ、コード/イントロン領域における多型部位の配列が 、449Gおよび449Cからなる群から選択される、請求項21記載の核酸。 23. 請求項21に記載された多型部位に高い厳密性でハイブリダイズするプ ローブ。 24. 多型部位が、5106、5349、および5496と番号が付されたA CE制御領域中の部位;375、582、731、1060、1215、219 3、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号 が付されたACEコード領域中の部位;並びにGenbankエントリーX62855 において番号が付されたACE遺伝子の部位1451からなる群から選択された 、ヒトACE遺伝子内の一つ以上の多型部位を含む核酸のライブラリー。 25. 制御領域における多型部位の配列が、5106C、5106T、534 9A、5349T、5496Tおよび5496Cからなる群から選択され;かつ 、コード領域における多型部位の配列が、375A、375C、582C、58 2T、731A、731G、1060G、1060A、1215C、1215T 、2193G、2193A、2328A、2328G、2741G、2741T 、3132C、3132T、3387T、3387C、3503G、3503C 、3906G、3906A、およびGenbankエントリーX62855において番 号が付されたヌクレオチド1451−1783の欠失からなる群から選択される 、請求項24記載のライブラリー。 26. 多型部位が、395、412、432、449、692、839、10 07、1072、1204および1218と番号が付された制御領域中の部位; 273、620、803、912、997、1116および1174と番号が付 されたコード領域中の部位、および、GenbankエントリーM24688において 番号が付されたAGT遺伝子の部位49からなる群から選択される、ヒトAGT 遺伝子内の一つ以上の多型部位を含む核酸のライブラリー。 27. 制御領域における多型部位の配列が、395T、395A、412C、 412T、432G、432A、449T、449C、692C、692T、8 39G、839A、1007G、1007A、1072G、1072A、120 4C、1204A、1218A、1218Gからなる群から選択され;かつ、コ ード領域における多型部位の配列が、273C、273T、620C、620T 、803T、803C、912C、912T、997G、997C、1116G 、1116A、1174C、1174A、およびGenbankエントリーM2468 8の49位のAまたはGからなる群から選択される、請求項26記載のライブラ リー。 28. 多型部位が、1427、1756、1853、2046、2354、2 355および2415と番号か付された制御領域中の部位;および449、67 8、1167および1271と番号が付されたコード領域中の部位からなる群か ら選択される、ヒトAT1遺伝子内の一つ以上の多型部位を含む核酸のライブラ リー。 29. 制御領域における多型部位の配列が、1427A、1427T、175 6T、1756A、1853T、1853G、2046T、2046C、235 4A、2354C、2355G、2355C、2415Aおよび2415Gから なる群から選択され;かつ、コード領域における多型部位の配列が、449G、 449C、678TN678C、1167A、1167G、1271A、および 1271Cからなる群から選択される、請求項28記載のライブラリー。 30. ACR 5349 A/T、AGR 1218 A;ACR 5496 C、 AGR 1204 A/C;ACR 5496 C/T、AGR 1218 A、AG T 620 C/T;ACE 2193 A、AGR 1204 C、ACE 232 8 G;ACE 2193 A、AGR 1204 A/C;ACE 3387 T、 AGR 1218 A;ACE 3387 T、AGT 620 C/T;AGR 1 204 A/C、AT1 678 C/T;AGR 1204 A/C、AT1 12 71 A/C;ACE1215 C、AGR 1204 A/C;AGR 1204 A/C、AT1 116 7 A、ACE 3906 A/G;AGR 1204 A、AGT 620 C、A T1 1271 A AT1 1167 A、AGR 395 A/T;AGR 120 4 A/C、AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 1167 A、AGR 395 T;AGR 1204 A/C、AGT 620 C/T、A T1 1271 A/C、AT1 1167 A/G、AGR 395 T;AGR 1204A、AT1 678C、AT1 1167 A、AGR 395 A/T; AGR 1204 A/C、AT1 678 C/T、AT1 1167 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、AT1 116 7 A、AGR 395 T;AGT 620 C/T、AT1 1271 A/C、 AT1 1167 A/G、AGR395 T;AGT 620 C、AT1 127 1 A、AT1 1167 A、AGR 395 A/T;AGT 620 C、AT 1 678 A、AT1 1167 A、AGR 395 A/T;AGT 620 C /T、AT1 678 C/T;AT1 1167 A、AGR 395 T;ACE 2193 A、AGR 1218 A、AGT 803 A;ACE 2193 A、 AGT 620 C/T;ACE 2328 G、AGT 620 C/T;ACE 3387 T、AGR 1204 A/C;ACE 2193 A、ACE 2328 G、AGR 1204 C;およびACE 2193 A/G、AGR 1072 G/G、AT1 1167 A/Aからなる群から選択されたメンバーを含む、ヒ トACE、AGTおよび/またはAT1遺伝子における多型パターンのライブラ リー。 31. 多型部位が、375、582、731、1060、1215、2193 、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が 付されたACEコード領域中のヌクレオチド部位からなる群から選択されたヌク レオチドにコードされる、ACEポリペプチド配列における一つ以上の多型部位 を含む単離されたペプチドを含む、心臓血管剤のターゲットのライブラリー。 32. 多型部位が、273、620、803、912、997、1116およ び1174と番号が付されたヌクレオチド部位からなる群から選択されたヌクレ オチドにコードされる、AGTポリペプチドにおける一つ以上の多型部位を含む 単離されたペプチドを含む、心臓血管剤のターゲットのライブラリー。 33. 多型部位が、449、678、1167および1271と番号が付され たヌクレオチド部位からなる群から選択されたヌクレオチドにコードされる、A T1ポリペプチドにおける一つ以上の多型部位を含む単離されたペプチドを含む 、心臓血管剤のターゲットのライブラリー。 34. (i)配列決定プライマー、および (ii)配列決定試薬を含み、 前記プライマーが、ヒトACE、AGTまたはAT1遺伝子の多型部位にハイ ブリダイズするプライマー;およびヒトACE、AGTまたはAT1遺伝子の多 型部位に隣接してハイブリダイズするプライマーからなる群から選択される、心 臓血管状態を評価するためのキット。 35. 多型部位が、5106、5349、および5496と番号が付されたA CE制御領域の部位;375、582、731、1060、1215、2193 、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が 付されたACEコード領域中の部位;GenbankエントリーX62855において 番号が付されたACE遺伝子の部位1451;395、412、432、449 、692、839、1007、1072、1204および1218と番号が付さ れたAGT制御領域中の部位;273、620、803、912、997、11 16および1174と番号が付されたAGTコード領域中の部位;Genbankエン トリーM24688において番号が付されたAGT遺伝子の部位49;1427 、1756、1853、2046、2354、2355および2415と番号が 付されたAT1制御領域中の部位;449、678、1167および1271と 番号が付されたAT1コード領域中の部位;並びに上記いずれかの組み合わせか らなる群から選択された、請求項34記載のキット。 36. ヒトACE、AGTまたはAT1ポリペプチド内の多型部位に特異的な 一つ以上の抗体を含む、心臓血管状態を評価するためのキット。 37. 多型部位が、375、582、731、1060、1215、2193 、2328、2741、3132、3387、3503および3906と番号が 付されたACEコード領域中のヌクレオチド部位;273、620、803、9 12、997、1116および1174と番号が付されたAGTコード領域中の ヌクレオチド部位;449、678、1167および1271と番号が付された AT1コード領域中の部位;並びに土記いずれかの組み合わせからなる群から選 択されたヌクレオチドによってコードされる、請求項36記載のキット。
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