JP2001120270A - 高温耐性コリネ型細菌の耐熱性リジン生合成系酵素遺伝子 - Google Patents

高温耐性コリネ型細菌の耐熱性リジン生合成系酵素遺伝子

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JP2001120270A
JP2001120270A JP31114899A JP31114899A JP2001120270A JP 2001120270 A JP2001120270 A JP 2001120270A JP 31114899 A JP31114899 A JP 31114899A JP 31114899 A JP31114899 A JP 31114899A JP 2001120270 A JP2001120270 A JP 2001120270A
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Hiroshi Itaya
寛 板屋
Eiichiro Kimura
英一郎 木村
Yoshio Kawahara
義雄 河原
Shinichi Sugimoto
愼一 杉本
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Abstract

(57)【要約】 【課題】コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス由来
のL−リジン生合成系酵素、好ましくはコリネバクテリ
ウム・グルタミカムよりも高い温度で機能する酵素をコ
ードする遺伝子を提供する。 【解決手段】 目的とする遺伝子に対応する種々の微生
物の既知の遺伝子配列の間でアミノ酸レベルで保存され
ている領域に基づいて設計した複数組のプライマーとし
て、コリネバクテリウム・サーモアミノゲネスの染色体
DNAを鋳型としてPCRを行い、増幅断片が得られた
プライマーをスクリーニング用プライマーに用いて、コ
リネバクテリウム・サーモアミノゲネスの染色体DNA
のプラスミドライブラリーから、目的とするDNA断片
を含むクローンを選択する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、高温耐性コリネ型
細菌であるコリネバクテリウム・サーモアミノゲネスの
耐熱性酵素遺伝子、特にL−リジン生合成系及び排出系
酵素遺伝子に関する。
【0002】
【従来の技術】現在、L−リジン等のL−アミノ酸の製
造は、コリネ型細菌による発酵生産が主流となってい
る。L−アミノ酸の発酵生産は、生産能に優れた菌株の
育種や発酵技術の開発によって、コストダウンが図られ
ている。従来、コストダウン実現の方向性は、高収率化
が主なものであるが、発酵におけるコストとしては、原
料以外にも培養中に発生する発酵熱の冷却エネルギーを
無視することはできない。すなわち、発酵に用いられて
いる通常の微生物は、発酵中に自らが発生する発酵熱に
より培地の温度が上昇し、発酵に必要な酵素が失活した
り生産菌が死滅したりするために、発酵中に培地を冷却
することが必要となっている。したがって、冷却費用を
低減するために、高温での発酵に関する検討が古くから
行われている。また、高温で発酵を行うことが可能とな
れば、反応速度を向上させることができる可能性もあ
る。しかし、これまでのところ、L−アミノ酸発酵にお
いて、有効な高温培養は実現していない。
【0003】コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス
(Corynebacterium thermoaminogenes)は、L−アミノ
酸の発酵に汎用されているコリネバクテリウム・グルタ
ミカム(Corynebacterium glutamicum)(ブレビバクテ
リウム・ラクトファーメンタム(Brevibacterium lacto
fermentum))等と同様にコリネ型細菌に分類される細
菌であるが、生育至適温度はコリネバクテリウム・グル
タミカムの30〜35℃に対して37〜43℃と高く、L−グル
タミン酸生成の至適温度も42〜45℃とかなり高温側にシ
フトしている(特開昭63−240779号)。
【0004】ところで、コリネバクテリウム属またはブ
レビバクテリウム属細菌において、エシェリヒア・コリ
又はコリネバクテリウム・グルタミクム由来のL−リジ
ン合成系酵素をコードする遺伝子を導入することによ
り、L−リジンの生産能を増強する技術が開発されてい
る。
【0005】L−リジン生合成遺伝子としては、例え
ば、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ遺伝子(特開平
7-75578)、ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ遺伝
子(Ishino, S. et al., Nucleic Acids Res., 15, 391
7 (1987))、ホスホエノールピルビン酸カルボキシラー
ゼ遺伝子(特開昭60-87788)、ジヒドロジピコリン酸シ
ンターゼ遺伝子(特公平6-55149)、ジアミノピメリン
酸デカルボキシラーゼ遺伝子(特開昭60-62994)等が知
られている。
【0006】しかし、高温耐性のコリネ型細菌由来のL
−アミノ酸生合成酵素及びそれらをコードする遺伝子は
報告されていない。
【0007】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、コリネバク
テリウム・サーモアミノゲネス由来のL−リジン生合成
系酵素、好ましくはコリネバクテリウム・グルタミカム
よりも高い温度で機能する酵素をコードする遺伝子を提
供することを課題とする。
【0008】
【課題を解決するための手段】本発明者は、上記課題を
解決するために鋭意検討を行った結果、コリネバクテリ
ウム・サーモアミノゲネスのL−リジン生合成系酵素を
コードする遺伝子、又はL−リジンの細胞外への排出に
関与するタンパク質をコードする遺伝子を単離すること
に成功し、本発明を完成するに至った。すなわち本発明
は、以下のとおりである。
【0009】(1)配列番号2に記載のアミノ酸配列を
有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1
若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又
は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、アスパラギ
ン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ活性を有するタン
パク質をコードするDNA。
【0010】(2)配列番号4に記載のアミノ酸配列を
有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1
若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又
は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジアミノピ
メリン酸デヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質をコ
ードするDNA。
【0011】(3)配列番号6に記載のアミノ酸配列を
有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1
若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又
は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジヒドロジ
ピコリン酸シンターゼ活性を有するタンパク質をコード
するDNA。
【0012】(4)配列番号8に記載のアミノ酸配列を
有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1
若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又
は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジヒドロジ
ピコリン酸レダクターゼ活性を有するタンパク質をコー
ドするDNA。
【0013】(5)配列番号10に記載のアミノ酸配列
を有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、
1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、
又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジアミノ
ピメリン酸デカルボキシラーゼ活性を有するタンパク質
をコードするDNA。
【0014】(6)配列番号12に記載のアミノ酸配列
を有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、
1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、
又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、アスパル
トキナーゼ活性を有するタンパク質をコードするDN
A。
【0015】(7)配列番号14に記載のアミノ酸配列
を有するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、
1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、
又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、リジンの
細胞外への排出に関与する機能を有するタンパク質をコ
ードするDNA。
【0016】以下、上記の各DNAのいずれか、又はこ
れらを総称して、本発明のDNAということがある。
【0017】
【発明の実施の形態】以下、本発明を詳細に説明する。
本発明のDNAの塩基配列及び遺伝子名、並びに本発明
のDNAがコードするタンパク質を以下に示す。
【0018】
【表1】
【0019】尚、配列番号11におけるオープン・リー
ディング・フレーム(ORF)はGTGから始まってい
る。配列表にはこのGTGによりコードされるアミノ酸は
バリンとして記載されているが、メチオニンである可能
性がある。
【0020】上記の各DNAは、コリネバクテリウム・
サーモアミノゲネスAJ12310株(FERM BP-1542)の染色
体DNAから単離されたものである。配列番号1に示す
塩基配列は、asdの部分配列であって、配列番号2に示
すアスパラギン酸セミアルデヒドデヒドロゲナーゼの部
分アミノ酸配列をコードしている。
【0021】目的とする遺伝子の部分断片を含むDNA
は、すでに報告されているブレビバクテリウム・ラクト
ファーメンタム等の種々の微生物の目的とする遺伝子の
塩基配列の比較を行い、塩基配列がよく保存されている
領域を選択し、その領域の塩基配列に基づいて設計した
プライマーを用い、コリネバクテリウム・サーモアミノ
ゲネスの染色体DNAを鋳型とするPCRを行うことに
よって、取得することができる。得られたDNA断片又
はその配列に基づいて作製したプローブを用いたハイブ
リダイゼーションにより、コリネバクテリウム・サーモ
アミノゲネスの染色体DNAライブラリーをスクリーニ
ングすることによって、目的とする遺伝子全長を含むD
NA断片を得ることができる。また、得られた遺伝子の
部分断片を用いてゲノムウォーキングを行うことによっ
ても、目的とする遺伝子全長を含むDNA断片を得るこ
とができる。ゲノムウォーキングと、市販のキット、例
えばTaKaRa LA PCR in vitro Cloning Kit(宝酒造
(株)製)を用いて行うことができる。
【0022】また、本発明により、各遺伝子の塩基配列
が明らかとなったので、それらの塩基配列に基づいて作
製したプライマーを用いたPCRによって、コリネバク
テリウム・サーモアミノゲネスの染色体DNA又は染色
体DNAライブラリーから取得することもできる。
【0023】染色体DNAの調製、染色体DNAライブ
ラリーの作製、ハイブリダイゼーション、PCR、プラ
スミドDNAの調製、DNAの切断及び連結、形質転換
等の方法は、Sambrook,J.,Fritsch,E.F.,Maniatis,T.,M
olecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory Pr
ess,1.21(1989)に記載されている。
【0024】次に、本発明のDNAを取得する具体的な
方法を例示する。まず、コリネバクテリウム・サーモア
ミノゲネスの染色体DNAを、適当な制限酵素、例えば
Sau3AIで消化し、アガロースゲル電気泳動により分画し
て約4〜6kbのDNAフラグメントを取得する。得られたD
NAフラグメントをpHSG399等のクローニングベクター
に挿入し、得られた組換えプラスミドでエシェリヒア・
コリを形質転換して、染色体DNAのプラスミドライブ
ラリーを作製する。
【0025】一方、プラスミドライブラリーから目的の
遺伝子を含むクローンをPCRにより選択するために用
いるプライマーを作製する。このプライマーは、目的と
する遺伝子に対応する種々の微生物の既知の遺伝子配列
の間でアミノ酸レベルで保存されている領域に基づいて
設計する。その際、コリネ型細菌のコドンユーセージを
考慮してプライマーを複数組づつ設計する。
【0026】次に、作製されたプライマーの適正を調べ
るために、これらのプライマーを用いて、コリネバクテ
リウム・サーモアミノゲネスの染色体DNAを鋳型とし
てPCRを行う。そして、増幅断片が得られたプライマ
ーをスクリーニング用プライマーとして用い、プラスミ
ドライブラリーから調製した組換えプラスミドを鋳型と
してPCRを行い、目的とするDNA断片を含むクロー
ンを選択する。この操作は、一次スクリーニングとして
形質転換体数十株を含むバッチ毎に行い、二次スクリー
ニングとして増幅断片が得られたバッチについてコロニ
ーPCRを行うことにより、迅速に行うことができる。
尚、増幅された遺伝子の断片長は、表2に記載した。
【0027】上記のようにして選択された形質転換体か
ら組換えDNAを調製し、挿入断片の塩基配列をダイ・
デオキシ・ターミネーション法等により決定し、塩基配
列を既知の遺伝子配列と比較することによって、目的の
遺伝子を含むことを確認する。
【0028】得られたDNA断片が、目的とする遺伝子
の一部を含んでいる場合には、ゲノムウォーキングによ
り欠失部分を取得する。尚、asdは、lysCを含むDNA
断片の5’末端側に、lysCとは別のORFが見い出され、a
sdの部分配列であることが判明した。
【0029】また、dapB、dapAおよびddhは、上記のPCR
法では取得できなかったため、エシェリヒア・コリの栄
養要求性変異株を用いて、相補性により目的遺伝子を持
つクローンをプラスミドライブラリーから選択した。具
体的には、それぞれの要求性変異を持つエシェリヒア・
コリを上記のプラスミドライブラリーを用いて形質転換
し、DAP要求性(dapA、dapB)、又はL−リジン要求性(d
dh)を指標に、ポジティブセレクションにより、目的遺
伝子を運ぶプラスミドを持つクローンを選択した。dapB
およびddhはこうして取得された。また、dapBを含むD
NA断片の5’末端側に、dapBとは別のORFが見い出さ
れたため、LAクローニングによりさらに下流を取得し
たところ、dapAであることが判明した。
【0030】さらに、lysEについては、相同遺伝子が他
に一つも知られておらず、明確な要求性を示すエシェリ
ヒア・コリ等の変異株の利用も困難であるため、実施例
では、lysEは上記とは別の方法を用いて取得された。具
体的には、コリネバクテリウム・グルタミカムではlysE
の上流に存在することが知られているlysE発現の調節因
子であるlysGに着目し、DNA結合蛋白であるlysG発現産
物の保存領域を基にプライマーを作製し、lysE内部に結
合するようにランダムに作製したプライマーと組み合わ
せて、増幅断片の取得を試みた。その結果、表2記載の
プライマーにより、目的の遺伝子断片を取得することに
成功した。
【0031】本発明のDNAは、コードされるタンパク
質が本来の機能を有する限り、1若しくは複数の位置で
の1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付
加、又は逆位を含むタンパク質をコードするものであっ
てもよい。ここで、「数個」とは、アミノ酸残基のタン
パク質の立体構造における位置や種類によっても異なる
が、一般的に、それぞれのタンパク質のアミノ酸配列全
体に対し、30から40%以上、好ましくは55〜65
%以上の相同性を有することが好ましい。具体的には、
前記「数個」は、2〜数百個、好ましくは、2〜数十
個、より好ましくは2〜10個である。
【0032】上記のような本来のタンパク質と実質的に
同一のタンパク質をコードするDNAは、例えば部位特
異的変異法によって、特定の部位のアミノ酸残基が置
換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むように、それぞ
れのタンパク質をコードするDNAの塩基配列を改変す
ることによって得られる。また、上記のような改変され
たDNAは、従来知られている変異処理によっても取得
され得る。変異処理としては、目的の遺伝子をコードす
るDNAをヒドロキシルアミン等でインビトロ処理する
方法、及び目的の遺伝子をコードするDNAを保持する
微生物、例えばエシェリヒア属細菌を、紫外線照射また
はN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン(NT
G)もしくは亜硝酸等の通常変異処理に用いられている
変異剤によって処理する方法が挙げられる。
【0033】また、上記のような塩基の置換、欠失、挿
入、付加、又は逆位等には、コリネバクテリウム・サー
モアミノゲネスの菌株の違い等に基づく場合などの天然
に生じる変異(mutant又はvariant)も含まれる。
【0034】変異を有するDNAを、適当な細胞で発現
させ、発現産物のタンパク質の活性又は機能を調べるこ
とにより、本来のタンパク質と実質的に同一のタンパク
質をコードするDNAが得られる。また、そのようなD
NAは、変異を有するタンパク質をコードするDNAま
たはこれを保持する細胞から、例えば表1に示す各配列
番号の塩基配列を有するDNA又はその塩基配列から調
製されるプローブとストリンジェントな条件下でハイブ
リダイズし、かつ、当該タンパク質が本来有する活性を
示すタンパク質をコードするDNAを単離することによ
っても得ることができる。
【0035】上記プローブは、表1に示す各配列番号の
塩基配列を有するDNA、又はそれらの塩基配列を有す
るDNAから、適当なプライマーを用いてPCRにより
調製することができる。
【0036】上記でいう「ストリンジェントな条件」と
は、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異
的なハイブリッドが形成されない条件をいう。この条件
を明確に数値化することは困難であるが、一例を示せ
ば、相同性が高いDNA同士、例えば50%以上の相同
性を有するDNA同士がハイブリダイズし、それより相
同性が低いDNA同士がハイブリダイズしない条件、あ
るいは通常のサザンハイブリダイゼーションの洗いの条
件である60℃、1×SSC,0.1%SDS、好まし
くは、0.1×SSC、0.1%SDSに相当する塩濃
度でハイブリダイズする条件が挙げられる。
【0037】このような条件でハイブリダイズする遺伝
子の中には途中にストップコドンが発生したものや、活
性中心の変異により活性を失ったものも含まれるが、そ
れらについては、市販の活性発現ベクターにつなぎ、活
性又は機能を調べることによって容易に取り除くことが
できる。
【0038】本発明のDNAを、適当な宿主−ベクター
系を用いて発現させることにより、それぞれのDNAに
対応したタンパク質を製造することができる。遺伝子の
発現に用いる宿主としては、ブレビバクテリウム・ラク
トファーメンタム(コリネバクテリウム・グルタミカ
ム)、コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス等のコ
リネ型細菌、エシェリヒア・コリ、バチルス・ズブチリ
スをはじめとする種々の原核細胞、サッカロマイセス・
セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)をはじめとす
る種々の真核細胞、動物細胞、植物細胞が挙げられる
が、これらの中では原核細胞、特にコリネ型細菌及びエ
シェリヒア・コリが好ましい。
【0039】本発明のDNAは、エシェリヒア・コリ及
び/又はコリネ型細菌等の細胞内において自律複製可能
なベクターDNAに接続して組換えDNAを調製し、こ
れをエシェリヒア・コリ細胞に導入しておくと、後の操
作がしやすくなる。エシェリヒア・コリ細胞内において
自律複製可能なベクターとしては、プラスミドベクター
が好ましく、宿主の細胞内で自立複製可能なものが好ま
しく、例えば pUC19、pUC18、pBR322、pHSG299、pHSG39
9、pHSG398、RSF1010等が挙げられる。
【0040】コリネ型細菌の細胞内において自律複製可
能なベクターとしては、pAM330(特開昭58-67699号公報
参照)、pHM1519(特開昭58-77895号公報参照)等が挙
げられる。また、これらのベクターからコリネ型細菌中
でプラスミドを自律複製可能にする能力を持つDNA断
片を取り出し、前記エシェリヒア・コリ用のベクターに
挿入すると、エシェリヒア・コリ及びコリネ型細菌の両
方で自律複製可能ないわゆるシャトルベクターとして使
用することができる。
【0041】このようなシャトルベクターとしては、以
下のものが挙げられる。尚、それぞれのベクターを保持
する微生物及び国際寄託機関の受託番号をかっこ内に示
した。
【0042】本発明のDNAとコリネ型細菌で機能する
ベクターを連結して組み換えDNAを調製するには、本
発明のDNAの末端に合うような制限酵素でベクターを
切断する。連結は、T4DNAリガーゼ等のリガーゼを
用いて行うのが普通である。
【0043】上記のように調製した組み換えDNAをコ
リネ型細菌等の宿主に導入するには、これまでに報告さ
れている形質転換法に従って行えばよい。例えば、エシ
ェリヒア・コリ K−12について報告されているよう
な、受容菌細胞を塩化カルシウム(Mandel,M.and Higa,
A.,J. Mol. Biol., 53, 159 (1970))又は塩化ルビジウ
ム(Sambrook,J.,Fritsch,E.F.,Maniatis,T.,Molecular
Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1st
Ed. p.252-253 (1982))で処理してDNAの透過性を
増す方法があり、バチルス・ズブチリスについて報告さ
れているような、増殖段階の細胞からコンピテントセル
を調製してDNAを導入する方法( Duncan,C.H.,Wilso
n,G.A.and Young,F.E., Gene, 1, 153 (1977))があ
る。あるいは、バチルス・ズブチリス、放線菌類及び酵
母について知られているような、DNA受容菌の細胞
を、組換えDNAを容易に取り込むプロトプラストまた
はスフェロプラストの状態にして組換えDNAをDNA
受容菌に導入する方法( Chang,S.and Choen,S.N.,Mole
c. Gen. Genet., 168, 111 (1979);Bibb,M.J.,Ward,J.
M.and Hopwood,O.A.,Nature, 274, 398 (1978);Hinnen,
A.,Hicks,J.B.and Fink,G.R.,Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 75 1929 (1978))も応用できる。コリネ型細菌に
おいては、電気パルス法(特開平2−207791号公
報参照)が有効である。
【0044】本発明のDNAに含まれる遺伝子の発現を
効率的に実施するために、これらの遺伝子のコード領域
の上流に、宿主細胞内で働くlac、trp、PL等の
プロモーターを連結してもよい。ベクターとして、プロ
モーターを含むベクターを用いると、各遺伝子と、ベク
ター及びプロモーターとの連結を一度に行うことができ
る。
【0045】上記のようにして製造されるタンパク質
は、必要に応じて、菌体抽出液又は培地からイオン交換
クロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィー、吸
着クロマトグラフィー、塩析、溶媒沈殿等、通常の酵素
の精製法を用いて精製することができる。
【0046】本発明のDNAは、コリネ型細菌等のL−
アミノ酸生産菌に導入することによって、L−リジン生
産能を高めることができる。また、本発明のDNAが導
入されたコリネ型細菌は、通常よりも高い温度でのL−
リジンの生産が可能となることが期待される。
【0047】
【実施例】以下、本発明を実施例によりさらに具体的に
説明する。
【0048】<1>コリネバクテリウム・サーモアミノ
ゲネスのプラスミドライブラリーの作製 コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス AJ12310株
を、CM2B液体培地(イーストエキストラクト(Difco社
製)1g/dl、ポリペプトン(日本製薬製)1g/dl、NaCl
0.5g/dl、ビオチン 10μg/dl、pH 7.0 (KOHで調整))で
37℃にて15時間培養し、10mlの培養液から、染色体DNA
を染色体DNA抽出キット(Bacterial Genome DNA Purifi
cation Kit (Advanced Genetic Technologies社製)を用
いて取得した。取得したDNAを、制限酵素Sau3AIを用い
て部分消化し、0.8%アガロースゲル電気泳動を行い、D
NAを分画した後に、約4〜6kbのDNAフラグメントをゲル
から切り出し、宝酒造社製DNAゲル抽出キットを用い
て、目的サイズのDNA断片を取得した。
【0049】プラスミドpHSG399(宝酒造(株)製)をB
amHIで完全消化し、末端をアルカリフォスファターゼ
(CIAP;宝酒造(株)製)を用いて脱リン酸化した。こ
のベクター断片と、上記の染色体DNA断片を宝酒造社製D
NAライゲーションキットを用いて連結し、得られた組換
えベクターを用いてエシェリヒア・コリ JM109を形質転
換した。形質転換体の選択は、30μg/mlのクロラムフェ
ニコール、0.04mg/mlのIPTG(イソプロピル−β−D−
チオガラクトピラノシド)、0.04mg/mlのX-Gal(5−ブ
ロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−ガラクト
シド)を含むLB寒天培地(寒天 1.5g/dlを含む)上にて
行い、白色コロニーを約4000コロニー取得した。
【0050】<2>各遺伝子断片増幅用プライマーの設
定 上記で得られたプラスミドライブラリーから目的の遺伝
子を含むクローンをPCRにより選択するために用いる
プライマーを設計した。目的とする遺伝子は前記のとお
りである。
【0051】プライマーは、コリネ型細菌の既知の遺伝
子配列をベースとして、他の微生物の相当する遺伝子と
の間でアミノ酸レベルで保存されている領域に基づいて
設計した。その際、コリネ型細菌のコドンユーセージを
考慮してプライマーを複数組づつ設計した。
【0052】作製されたプライマーの適正を調べるため
に、これらのプライマーを用いて、コリネバクテリウム
・サーモアミノゲネスAJ12310株の染色体DNAを鋳型
としてPCRを行い、遺伝子断片を増幅した。その結
果、lysA、lysC及びlysEでは、表2の上段に示すプライ
マーを用い、各表中に「部分断片取得のPCR」として示
した条件及びポリメラーゼでPCRを行った場合に、増
幅断片が認められた。尚、lysEについては、相同遺伝子
が他に一つも知られていないため、コリネバクテリウム
・グルタミカムにおいてlysEの上流に存在することが知
られているlysE発現の調節因子であるlysGに着目し、ly
sGの保存領域を基にプライマーを作製し、lysE内部に結
合するようにランダムに作製したプライマーと組み合わ
せてPCRを行った。各プライマーの末尾のカッコ内の
数字は、配列表中の配列番号を示す。これらのプライマ
ーを、後述のスクリーニング用プライマーとして用い
た。
【0053】
【表2】
【0054】<3>PCRによるプラスミドライブラリ
ーのスクリーニング 前記のプラスミドライブラリーから目的の遺伝子を含む
クローンを、PCRにより選択した。プラスミドライブ
ラリーから、コロニーを60個ずつピックアップし、2
枚づつのCM2B寒天培地プレートにレプリカした。各プレ
ートのコロニー60個づつをまとめて、4mlのCM2B液体
培地を含む試験管に接種し、15時間培養した後、プロメ
ガ社製プラスミドDNA抽出キットを用いてそれぞれプラ
スミドの混合物を取得した。このプラスミド混合物を鋳
型とし、各目的遺伝子毎に作製したスクリーニング用プ
ライマーを用いて、各表中に「スクリーニングPCRの条
件」として示した条件でPCRを行い、染色体DNAを
鋳型とするPCRと同じ大きさのDNA断片が増幅される
クローンを選択した。
【0055】増幅されたDNA断片は、パーキンエルマー
社製ビッグダイ・ダイターミネーターサイクルシークエ
ンスキットを用いて塩基配列を決定し、既知の遺伝子情
報との相同性を比較することにより、目的遺伝子の取得
の成否を確認した。
【0056】<4>コロニーPCRによる目的遺伝子保
持クローンの選択 目的の遺伝子断片の増幅が確認されたプラスミド混合物
が由来するプレートを用いて、コロニーPCRを行い、
遺伝子断片を含むクローンを選択した。コロニーPCR
は、表2に示す条件で行った。
【0057】選択された形質転換体からプラスミドDN
Aを回収し、挿入DNA断片の塩基配列を決定した。挿
入DNA断片に目的遺伝子の全長が挿入されておらず、
遺伝子の上流域、下流域またはこれらの両方が欠失して
いる場合は、判明した塩基配列を利用してプライマーを
作製し、TaKaRa LA PCR in vitro Cloning Kit(宝酒造
(株))を用いて、目的遺伝子の全領域の遺伝子断片を
取得し、塩基配列を決定した。
【0058】LA PCRクローニングの概要は以下のとおり
である。挿入DNA断片のうち2つの領域の塩基配列を
有する2種のプライマーを作製する。コリネバクテリウ
ム・サーモアミノゲネスAJ12310株の染色体DNAを各
種制限酵素で切断し、各制限酵素に対応したカセットプ
ライマーと連結する。これを鋳型として、作製されたプ
ライマーのうち欠失部分から遠い位置に対応するプライ
マー(S1)と、カセットプライマーの外側の位置に対
応するカセットプライマー(C1)を用いてPCRを行
う。次に、作製されたプライマーのうち欠失部分に近い
位置に対応するプライマー(S2)と、カセットプライ
マーの内側の位置に対応するカセットプライマー(C
2)を用いてPCRを行う。こうして、欠失部分を含む
DNA断片が得られる。得られたDNA断片と既に取得
されいるDNA断片を連結することにより、目的遺伝子
全長を含むDNA断片を得ることができる。尚、カセッ
トの5’末端にはリン酸基が付いていないので、DNA
断片の3’末端とカセットの5’末端との接続部位には
ニックができる。そのため、1回目のPCRではプライ
マーC1からのDNA合成はこの接続部分でストップ
し、非特異的な増幅は起こらないため、特異的な増幅を
行うことができる。
【0059】LA PCRクローニングに用いたプライマーと
反応条件は、表2に示した。表中「(N')」は上流側の欠
失部分のクローニングに用いたプライマーを、「(C')」
は下流側の欠失部分のクローニングに用いたプライマー
を、それぞれ示す。また、PCR反応はLA PCRクローニ
ングキットの説明書に従い、2回行った。表に示したプ
ライマーのうち、上段には1回目の反応に用いたプライ
マー(S1)を、下段には2回目の反応に用いたプライ
マー(S2)を示す。
【0060】<5>エシェリヒア・コリ変異株を用いた
相補性による目的遺伝子のクローニング dapB、dapAおよびddhは、上記のPCR法では取得できなか
ったため、エシェリヒア・コリの栄養要求性変異株を用
いて、相補性により目的遺伝子を持つクローンをプラス
ミドライブラリーから選択した。
【0061】ジアミノピメリン酸要求変異株であるエシ
ェリヒア・コリAT999株を、上記のプラスミドライブラ
リーから調製した組換えプラスミドを用いて形質転換
し、形質転換株をジアミノピメリン酸を含まないLB寒
天培地で培養し、コロニーを形成する株を選択した。
【0062】同様に、L−リジン要求性変異株であるエ
シェリヒア・コリAT986株を、同様にプラスミドライブ
ラリーから調製した組換えプラスミドで形質転換し、L
−リジンを含まないLB培地で培養し、コロニーを形成
する株を選択した。
【0063】上記のようにして得られた各遺伝子を含む
DNA断片の塩基配列を、前記と同様にして決定した。
それらの塩基配列及び同塩基配列がコードし得るアミノ
酸配列を、配列番号1〜14に示す。各配列番号に記載
された配列は、下記のとおりである。尚、dapAは、dapB
を含むDNA断片の5’末端側に存在する、dapBとは別
のORFとして取得された。また、asdは、lysCを含むDN
A断片の5’末端側に存在する、lysCとは別のORFとし
て取得された。さらに、lysGの部分断片は、lysEの5’
末端側に、別のORF(配列番号13において塩基番号7
16〜1)として取得された。
【0064】各遺伝子は、既知の遺伝子との相同性の比
較から、目的とする遺伝子であることが確認された。
【0065】(配列表の説明) 配列番号1: asd 塩基配列 配列番号2: asd アミノ酸配列 配列番号3: ddh 塩基配列 配列番号4: ddh アミノ酸配列 配列番号5: dapA 塩基配列 配列番号5: dapA アミノ酸配列 配列番号7: dapB 塩基配列 配列番号8: dapB アミノ酸配列 配列番号9: lysA 塩基配列 配列番号10: lysA アミノ酸配列 配列番号11: lysC 塩基配列 配列番号12: lysC アミノ酸配列 配列番号13: lysE 塩基配列 配列番号14: lysE アミノ酸配列
【0066】
【発明の効果】本発明により、コリネバクテリウム・サ
ーモアミノゲネスのL−リジン生合成系酵素をコードす
る遺伝子、又はL−リジンの細胞外への排出に関与する
タンパク質をコードする遺伝子が提供される。本発明の
遺伝子は、前記酵素又はタンパク質の製造、又はアミノ
酸生産菌の育種に利用することができる。
【0067】
【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> 味の素株式会社 <120> 高温耐性コリネ型細菌の耐熱性リジン生合成系酵素遺伝子 <130> P-6911 <140> <141> 1999-11-01 <160> 26 <170> PatentIn Ver. 2.0
【0068】 <210> 1 <211> 248 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (99)..(248) <400> 1 tcaccggacc ttgatccccg ggcgttgagc cccgcctccc tcaccccacg ctttcccctg 60 tcaggacccc aggaccatct ttaaggagca ggttttcc atg acc acc atc gct gtt 116 Met Thr Thr Ile Ala Val 1 5 gtc ggc gcc acc ggc cag gtc ggc cag gtt atg cgc acc ctt ctg gag 164 Val Gly Ala Thr Gly Gln Val Gly Gln Val Met Arg Thr Leu Leu Glu 10 15 20 cag cgc gac ttc ccg gct gat tcc gtc cgt ttc ttc gcc tcc cca cgc 212 Gln Arg Asp Phe Pro Ala Asp Ser Val Arg Phe Phe Ala Ser Pro Arg 25 30 35 tcc gcc ggt agg aag ctc gat ttc cgc ggc agg aga 248 Ser Ala Gly Arg Lys Leu Asp Phe Arg Gly Arg Arg 40 45 50
【0069】 <210> 2 <211> 50 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 2 Met Thr Thr Ile Ala Val Val Gly Ala Thr Gly Gln Val Gly Gln Val 1 5 10 15 Met Arg Thr Leu Leu Glu Gln Arg Asp Phe Pro Ala Asp Ser Val Arg 20 25 30 Phe Phe Ala Ser Pro Arg Ser Ala Gly Arg Lys Leu Asp Phe Arg Gly 35 40 45 Arg Arg 50
【0070】 <210> 3 <211> 1273 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (178)..(1137) <400> 3 ggattgttgg gatccgtgga agaacaccag aagggtatct gagggttgtt ccggctcgat 60 gatggtgaag gtgcgttcgt ggccctggtg ttccaaagat cccctgatca tgacaccagt 120 atgcacggca gtatgctcgg gggagaaact tgccaccatc atcctggagg ataggaa 177 atg tcg aag atc cgc gca gca atc gtt ggt tat gga aat ctg ggg aag 225 Met Ser Lys Ile Arg Ala Ala Ile Val Gly Tyr Gly Asn Leu Gly Lys 1 5 10 15 agc gtc gag aag ctc atc gtc cag caa ccg gac atg gaa ctg gtg ggg 273 Ser Val Glu Lys Leu Ile Val Gln Gln Pro Asp Met Glu Leu Val Gly 20 25 30 atc ttc tcc cgc cgc gac acc ctg gac acc gac acc ccc gtg ttc aac 321 Ile Phe Ser Arg Arg Asp Thr Leu Asp Thr Asp Thr Pro Val Phe Asn 35 40 45 gtc gcc gag acg gag aag cac acc ggc gat gtt gat ctc ctc ttc ctc 369 Val Ala Glu Thr Glu Lys His Thr Gly Asp Val Asp Leu Leu Phe Leu 50 55 60 tgc atg ggt tcc gcc act gac atc ccg gag cag gcc ccg ggt ttt gcg 417 Cys Met Gly Ser Ala Thr Asp Ile Pro Glu Gln Ala Pro Gly Phe Ala 65 70 75 80 gca ttc gcc tgc acc gtg gac acc tat gac aac cac cgg gac atc ccg 465 Ala Phe Ala Cys Thr Val Asp Thr Tyr Asp Asn His Arg Asp Ile Pro 85 90 95 cgt cac cgt cag gtg atg gat gag gcc gcc cgt gcc gcc ggc aat gtc 513 Arg His Arg Gln Val Met Asp Glu Ala Ala Arg Ala Ala Gly Asn Val 100 105 110 tct gtt gtc gcc acc ggt tgg gat ccg ggg atg ttc tcc atc aac cgc 561 Ser Val Val Ala Thr Gly Trp Asp Pro Gly Met Phe Ser Ile Asn Arg 115 120 125 gtg tac ggc gca gcc ctg ctc gcc gat cac cag cag cac acc ttc tgg 609 Val Tyr Gly Ala Ala Leu Leu Ala Asp His Gln Gln His Thr Phe Trp 130 135 140 gga ccg ggt ctg tcc cag ggc cac tcc gat gcc ttg cga cgc atc gac 657 Gly Pro Gly Leu Ser Gln Gly His Ser Asp Ala Leu Arg Arg Ile Asp 145 150 155 160 ggc gtc gag aag gcc gtc cag tac acc ctg cct tcc gag gat gcc ctg 705 Gly Val Glu Lys Ala Val Gln Tyr Thr Leu Pro Ser Glu Asp Ala Leu 165 170 175 gag aag gca cgc cgc ggt gag gct gag ggg ctg acc ggt aaa cag acc 753 Glu Lys Ala Arg Arg Gly Glu Ala Glu Gly Leu Thr Gly Lys Gln Thr 180 185 190 cac aag cgt cag tgt ttc gtg gtc gcc ccg gag tcc gag cac gag cgc 801 His Lys Arg Gln Cys Phe Val Val Ala Pro Glu Ser Glu His Glu Arg 195 200 205 atc gag aat gag atc cgc acc atg gct gac tac ttc gtc ggc tat gag 849 Ile Glu Asn Glu Ile Arg Thr Met Ala Asp Tyr Phe Val Gly Tyr Glu 210 215 220 gtg gag gtc aac ttc atc gat gag gct acc ttc gat tcc gag cac acc 897 Val Glu Val Asn Phe Ile Asp Glu Ala Thr Phe Asp Ser Glu His Thr 225 230 235 240 gga atg ccc cac ggc ggt cat gtg atc acc acc ggt gac acc ggc ggt 945 Gly Met Pro His Gly Gly His Val Ile Thr Thr Gly Asp Thr Gly Gly 245 250 255 ttc cac cac act gtg gag tac acc ctg aag ctg gat cgc aac cct gac 993 Phe His His Thr Val Glu Tyr Thr Leu Lys Leu Asp Arg Asn Pro Asp 260 265 270 ttc acc gcc tcc tcc cag att gcg ttc gga cgt gct gcc tac cga ctg 1041 Phe Thr Ala Ser Ser Gln Ile Ala Phe Gly Arg Ala Ala Tyr Arg Leu 275 280 285 aag gaa gca ggt cag gct ggg gca ttc acc gtt ctg gag gtc gct ccc 1089 Lys Glu Ala Gly Gln Ala Gly Ala Phe Thr Val Leu Glu Val Ala Pro 290 295 300 tac ctc ctg tcc ccg aca cca ctc gat gac ctg atc gcc cgc gac gtc 1137 Tyr Leu Leu Ser Pro Thr Pro Leu Asp Asp Leu Ile Ala Arg Asp Val 305 310 315 320 tagaacggtg gctcgtcggc ctgggtttca gcggttcctt tcgctgccgc cctcgcctcg 1197 gctctagcct cagccgccca gcgcttacgg tgcgcggtgc ggtactggga gacggtctgt 1257 gcccacctgg cgctgg 1273
【0071】 <210> 4 <211> 320 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 4 Met Ser Lys Ile Arg Ala Ala Ile Val Gly Tyr Gly Asn Leu Gly Lys 1 5 10 15 Ser Val Glu Lys Leu Ile Val Gln Gln Pro Asp Met Glu Leu Val Gly 20 25 30 Ile Phe Ser Arg Arg Asp Thr Leu Asp Thr Asp Thr Pro Val Phe Asn 35 40 45 Val Ala Glu Thr Glu Lys His Thr Gly Asp Val Asp Leu Leu Phe Leu 50 55 60 Cys Met Gly Ser Ala Thr Asp Ile Pro Glu Gln Ala Pro Gly Phe Ala 65 70 75 80 Ala Phe Ala Cys Thr Val Asp Thr Tyr Asp Asn His Arg Asp Ile Pro 85 90 95 Arg His Arg Gln Val Met Asp Glu Ala Ala Arg Ala Ala Gly Asn Val 100 105 110 Ser Val Val Ala Thr Gly Trp Asp Pro Gly Met Phe Ser Ile Asn Arg 115 120 125 Val Tyr Gly Ala Ala Leu Leu Ala Asp His Gln Gln His Thr Phe Trp 130 135 140 Gly Pro Gly Leu Ser Gln Gly His Ser Asp Ala Leu Arg Arg Ile Asp 145 150 155 160 Gly Val Glu Lys Ala Val Gln Tyr Thr Leu Pro Ser Glu Asp Ala Leu 165 170 175 Glu Lys Ala Arg Arg Gly Glu Ala Glu Gly Leu Thr Gly Lys Gln Thr 180 185 190 His Lys Arg Gln Cys Phe Val Val Ala Pro Glu Ser Glu His Glu Arg 195 200 205 Ile Glu Asn Glu Ile Arg Thr Met Ala Asp Tyr Phe Val Gly Tyr Glu 210 215 220 Val Glu Val Asn Phe Ile Asp Glu Ala Thr Phe Asp Ser Glu His Thr 225 230 235 240 Gly Met Pro His Gly Gly His Val Ile Thr Thr Gly Asp Thr Gly Gly 245 250 255 Phe His His Thr Val Glu Tyr Thr Leu Lys Leu Asp Arg Asn Pro Asp 260 265 270 Phe Thr Ala Ser Ser Gln Ile Ala Phe Gly Arg Ala Ala Tyr Arg Leu 275 280 285 Lys Glu Ala Gly Gln Ala Gly Ala Phe Thr Val Leu Glu Val Ala Pro 290 295 300 Tyr Leu Leu Ser Pro Thr Pro Leu Asp Asp Leu Ile Ala Arg Asp Val 305 310 315 320
【0072】 <210> 5 <211> 1333 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (299)..(1201) <400> 5 agatccgcgc ggtggctgtg gcctgcctgg agaaactgaa gcagcaggcc ccgaccgtgt 60 tcggggattt ccaggtggaa acgcttgccg acggtacaca gatggccacc agcccctatg 120 tgaccgattt ctagatcccc gttcctccgc gacgggcggg tatcattcca ggtaacgcag 180 cccggccgga gttggggagt gcccccggtt gtccgtgggg gacggtattt tgcaaacagt 240 acagaaatta cggggttggt gaaccccgac ctaagagaag aaggtaacct tggtgtcc 298 atg agc aca ggt tta aca gcg aag acc gga gtt gag cat ttc ggt acg 346 Met Ser Thr Gly Leu Thr Ala Lys Thr Gly Val Glu His Phe Gly Thr 1 5 10 15 gtc gga gtg gcc atg gtc acc ccg ttc act gaa tcc ggc gac ctt gat 394 Val Gly Val Ala Met Val Thr Pro Phe Thr Glu Ser Gly Asp Leu Asp 20 25 30 gtc gcc gcg ggc cgc gag atc gcg gca cac ctg gtg gac aac ggg gtg 442 Val Ala Ala Gly Arg Glu Ile Ala Ala His Leu Val Asp Asn Gly Val 35 40 45 gat gcc ctg atc ctg gcc gga acc acc ggc gaa tcc ccg acc gtc acc 490 Asp Ala Leu Ile Leu Ala Gly Thr Thr Gly Glu Ser Pro Thr Val Thr 50 55 60 acc gct gag aaa ctt acc ctg ctc aag ccc gtc cgc gag gaa gtt ggt 538 Thr Ala Glu Lys Leu Thr Leu Leu Lys Pro Val Arg Glu Glu Val Gly 65 70 75 80 gac cgt gcc aag ctc atc gcg ggt gcc ggc act aac aac aca cgt tca 586 Asp Arg Ala Lys Leu Ile Ala Gly Ala Gly Thr Asn Asn Thr Arg Ser 85 90 95 tct gtt gag ctc gct gag gcc ttc gcc gag gtt ggc gca gac ggc ctt 634 Ser Val Glu Leu Ala Glu Ala Phe Ala Glu Val Gly Ala Asp Gly Leu 100 105 110 ctg gtg gtc aca ccc tac tac tcc aag ccg agt cag gag gga ctg gtc 682 Leu Val Val Thr Pro Tyr Tyr Ser Lys Pro Ser Gln Glu Gly Leu Val 115 120 125 cgc cat ttc acg gag atc gca cag gcc acc gac ctg ccg atc tgt ctc 730 Arg His Phe Thr Glu Ile Ala Gln Ala Thr Asp Leu Pro Ile Cys Leu 130 135 140 tac gat att ccg gga cgt tca ggt att ccc att gag tct gat acc atc 778 Tyr Asp Ile Pro Gly Arg Ser Gly Ile Pro Ile Glu Ser Asp Thr Ile 145 150 155 160 aga cgt ctc agc gaa tta ccc acg atc ctc gcg atg aaa gat gcg aag 826 Arg Arg Leu Ser Glu Leu Pro Thr Ile Leu Ala Met Lys Asp Ala Lys 165 170 175 ggt gat gtc gtt gca gct gca ccg ctg att gag gag acc ggt ctc gcc 874 Gly Asp Val Val Ala Ala Ala Pro Leu Ile Glu Glu Thr Gly Leu Ala 180 185 190 tgg tac tcg ggt gac gac ccg ctc aat ctc gtg tgg ctt gcc ctg gga 922 Trp Tyr Ser Gly Asp Asp Pro Leu Asn Leu Val Trp Leu Ala Leu Gly 195 200 205 ggg tca ggc ttc atc tcc gtc atc gga cat gcc gcc ccc aat gct ctg 970 Gly Ser Gly Phe Ile Ser Val Ile Gly His Ala Ala Pro Asn Ala Leu 210 215 220 cgt gag ctg tac aca agc ttc gag gaa ggc gac ctc gcc cgt gcg cgg 1018 Arg Glu Leu Tyr Thr Ser Phe Glu Glu Gly Asp Leu Ala Arg Ala Arg 225 230 235 240 gaa atc aac gcc aca cta tcc ccg ctg gtc gcg gcc cag ggt cgc ctg 1066 Glu Ile Asn Ala Thr Leu Ser Pro Leu Val Ala Ala Gln Gly Arg Leu 245 250 255 ggt ggt gtc agc atg gca aaa gcc gcc ctg cgt ctg cag ggc atc aac 1114 Gly Gly Val Ser Met Ala Lys Ala Ala Leu Arg Leu Gln Gly Ile Asn 260 265 270 gta gga gat ccc cgc ctt ccg att gtc gct ccc aat gag cag gaa ctt 1162 Val Gly Asp Pro Arg Leu Pro Ile Val Ala Pro Asn Glu Gln Glu Leu 275 280 285 gag gat ctc cgt gca gat atg aaa aaa gct gga gtt cta taaatatgaa 1211 Glu Asp Leu Arg Ala Asp Met Lys Lys Ala Gly Val Leu 290 295 300 tgaatcccga aaccgccccc ggaaggtcac ccgcaaggcg ggcccaccgg aggctggcca 1271 ggatgctgtt gtggaaacgc ctgtcttcca ggctcctgaa gcatcaaaca gccagaccac 1331 cc 1333
【0073】 <210> 6 <211> 301 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 6 Met Ser Thr Gly Leu Thr Ala Lys Thr Gly Val Glu His Phe Gly Thr 1 5 10 15 Val Gly Val Ala Met Val Thr Pro Phe Thr Glu Ser Gly Asp Leu Asp 20 25 30 Val Ala Ala Gly Arg Glu Ile Ala Ala His Leu Val Asp Asn Gly Val 35 40 45 Asp Ala Leu Ile Leu Ala Gly Thr Thr Gly Glu Ser Pro Thr Val Thr 50 55 60 Thr Ala Glu Lys Leu Thr Leu Leu Lys Pro Val Arg Glu Glu Val Gly 65 70 75 80 Asp Arg Ala Lys Leu Ile Ala Gly Ala Gly Thr Asn Asn Thr Arg Ser 85 90 95 Ser Val Glu Leu Ala Glu Ala Phe Ala Glu Val Gly Ala Asp Gly Leu 100 105 110 Leu Val Val Thr Pro Tyr Tyr Ser Lys Pro Ser Gln Glu Gly Leu Val 115 120 125 Arg His Phe Thr Glu Ile Ala Gln Ala Thr Asp Leu Pro Ile Cys Leu 130 135 140 Tyr Asp Ile Pro Gly Arg Ser Gly Ile Pro Ile Glu Ser Asp Thr Ile 145 150 155 160 Arg Arg Leu Ser Glu Leu Pro Thr Ile Leu Ala Met Lys Asp Ala Lys 165 170 175 Gly Asp Val Val Ala Ala Ala Pro Leu Ile Glu Glu Thr Gly Leu Ala 180 185 190 Trp Tyr Ser Gly Asp Asp Pro Leu Asn Leu Val Trp Leu Ala Leu Gly 195 200 205 Gly Ser Gly Phe Ile Ser Val Ile Gly His Ala Ala Pro Asn Ala Leu 210 215 220 Arg Glu Leu Tyr Thr Ser Phe Glu Glu Gly Asp Leu Ala Arg Ala Arg 225 230 235 240 Glu Ile Asn Ala Thr Leu Ser Pro Leu Val Ala Ala Gln Gly Arg Leu 245 250 255 Gly Gly Val Ser Met Ala Lys Ala Ala Leu Arg Leu Gln Gly Ile Asn 260 265 270 Val Gly Asp Pro Arg Leu Pro Ile Val Ala Pro Asn Glu Gln Glu Leu 275 280 285 Glu Asp Leu Arg Ala Asp Met Lys Lys Ala Gly Val Leu 290 295 300
【0074】 <210> 7 <211> 1322 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (306)..(1049) <400> 7 gtgctggtgg gagccgtggt ggtgatcgtc gtgggcccgg ttgagccacc atcaccgttg 60 cagccggcca cgccggccag cagggcggtg gtgaacagtg caagggttat ggtttttgca 120 ttcataacct aaccttatgc tttttatccg tcggtaagaa gggttaggtc tcaactgttg 180 gggaattgtt agctggacac ggcagtgggt tcaccgtcat ggccggatgc cgtggcgcac 240 gccggggtgt ttgggccatc cgtctagact ggtggggatc aaccacacaa cgagaaggag 300 ttttc atg gca atc aag gtt ggc gtc ctg ggt gcg aag ggg cgc gtg ggt 350 Met Ala Ile Lys Val Gly Val Leu Gly Ala Lys Gly Arg Val Gly 1 5 10 15 cag acc atc gtc gct gcg gtg aat gac acc gat gat ctc gaa ctg gtg 398 Gln Thr Ile Val Ala Ala Val Asn Asp Thr Asp Asp Leu Glu Leu Val 20 25 30 gcg gag gtc gat cac gat gat gat ctc tcc ctg ctg gtg gac agc ggt 446 Ala Glu Val Asp His Asp Asp Asp Leu Ser Leu Leu Val Asp Ser Gly 35 40 45 gcc gag gtg gtg gtg gat ttc acc aca ccg aat gcg gtc atg ggc aac 494 Ala Glu Val Val Val Asp Phe Thr Thr Pro Asn Ala Val Met Gly Asn 50 55 60 ctt gaa ttc tgc atc aac aac ggc atc tcc gcc gtc gtg gga acc acc 542 Leu Glu Phe Cys Ile Asn Asn Gly Ile Ser Ala Val Val Gly Thr Thr 65 70 75 ggt ttt gat gag gac cgc ctg gcg cag gtc cgt tcc tgg tgt gca tcg 590 Gly Phe Asp Glu Asp Arg Leu Ala Gln Val Arg Ser Trp Cys Ala Ser 80 85 90 95 aat gag ggt gtc ggt gtg ctc atc gcc ccc aat ttc gcc atc tca gcc 638 Asn Glu Gly Val Gly Val Leu Ile Ala Pro Asn Phe Ala Ile Ser Ala 100 105 110 gtg cta acc atg gtt ttc gcg cgg cag gcc gcc cgt ttc ttc gaa tcc 686 Val Leu Thr Met Val Phe Ala Arg Gln Ala Ala Arg Phe Phe Glu Ser 115 120 125 gcc gag gtc atc gag ctt cac cac ccg aac aag ctg gat gca ccc tcc 734 Ala Glu Val Ile Glu Leu His His Pro Asn Lys Leu Asp Ala Pro Ser 130 135 140 ggt acc gcc atc cac acc gcc cag ggc att gcc gag gcg cgt cgt gaa 782 Gly Thr Ala Ile His Thr Ala Gln Gly Ile Ala Glu Ala Arg Arg Glu 145 150 155 gcc ggc atg gct gca cag ccg gac gcc acg gaa cag gcc ctg gac ggt 830 Ala Gly Met Ala Ala Gln Pro Asp Ala Thr Glu Gln Ala Leu Asp Gly 160 165 170 175 tcc cgt ggt gct gat gtc gac ggc atc ccc gtt cac gcc gtg cgc atg 878 Ser Arg Gly Ala Asp Val Asp Gly Ile Pro Val His Ala Val Arg Met 180 185 190 agt ggc atg gtc gcc cac gag gcc gtc atc ttc ggc acc cag gga cag 926 Ser Gly Met Val Ala His Glu Ala Val Ile Phe Gly Thr Gln Gly Gln 195 200 205 acc ctg acc atc aag cag gac tcc tac gat cgc aac tcc ttc gca ccc 974 Thr Leu Thr Ile Lys Gln Asp Ser Tyr Asp Arg Asn Ser Phe Ala Pro 210 215 220 ggt gtg ctg gtg ggc atc cgc aac atc gcc cag cac ccg ggc ctg acc 1022 Gly Val Leu Val Gly Ile Arg Asn Ile Ala Gln His Pro Gly Leu Thr 225 230 235 gtc ggt ctg gaa cac tac ctg gac ctc tagaccggtc cgcccatcac 1069 Val Gly Leu Glu His Tyr Leu Asp Leu 240 245 cgcacactgg attttcccga gaatttaagg agccgaacaa gcgtgaccga accggtcgaa 1129 ctgtcagttg agctcatcgc ctgctcatcg ttcaccccac ccgcgtccgt ggcgtgggac 1189 acggatgcac acggggcgga ggcgctcgtt gaattcgcgg gcagggcctg ctatgagacc 1249 ttcgacaagc ccaacccccg gaccgccacc aatgcggcct acctccggca catcatggag 1309 gtcggtcaca ccg 1322
【0075】 <210> 8 <211> 248 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 8 Met Ala Ile Lys Val Gly Val Leu Gly Ala Lys Gly Arg Val Gly Gln 1 5 10 15 Thr Ile Val Ala Ala Val Asn Asp Thr Asp Asp Leu Glu Leu Val Ala 20 25 30 Glu Val Asp His Asp Asp Asp Leu Ser Leu Leu Val Asp Ser Gly Ala 35 40 45 Glu Val Val Val Asp Phe Thr Thr Pro Asn Ala Val Met Gly Asn Leu 50 55 60 Glu Phe Cys Ile Asn Asn Gly Ile Ser Ala Val Val Gly Thr Thr Gly 65 70 75 80 Phe Asp Glu Asp Arg Leu Ala Gln Val Arg Ser Trp Cys Ala Ser Asn 85 90 95 Glu Gly Val Gly Val Leu Ile Ala Pro Asn Phe Ala Ile Ser Ala Val 100 105 110 Leu Thr Met Val Phe Ala Arg Gln Ala Ala Arg Phe Phe Glu Ser Ala 115 120 125 Glu Val Ile Glu Leu His His Pro Asn Lys Leu Asp Ala Pro Ser Gly 130 135 140 Thr Ala Ile His Thr Ala Gln Gly Ile Ala Glu Ala Arg Arg Glu Ala 145 150 155 160 Gly Met Ala Ala Gln Pro Asp Ala Thr Glu Gln Ala Leu Asp Gly Ser 165 170 175 Arg Gly Ala Asp Val Asp Gly Ile Pro Val His Ala Val Arg Met Ser 180 185 190 Gly Met Val Ala His Glu Ala Val Ile Phe Gly Thr Gln Gly Gln Thr 195 200 205 Leu Thr Ile Lys Gln Asp Ser Tyr Asp Arg Asn Ser Phe Ala Pro Gly 210 215 220 Val Leu Val Gly Ile Arg Asn Ile Ala Gln His Pro Gly Leu Thr Val 225 230 235 240 Gly Leu Glu His Tyr Leu Asp Leu 245
【0076】 <210> 9 <211> 1704 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (267)..(1643) <400> 9 agggcgacct catccgcacc ctgggtgaat tccccgccgt catccgtgcc gccgcggatc 60 tgcgcgaacc acaccgtatc gcccgctacg ctgaggagct ggcaggaacc ttccaccggt 120 tctacgattc ctgtcagatc ctgcccaagg ccgatgagga gaaggcgccg atccacgcgg 180 cccgtctggc tctcgccgcc gccacccgcc agacactggc caacgccctc gcgctggtcg 240 gagtatccgc accggagaag atgtaa atg acc gct gag aca gaa aca ggc atc 293 Met Thr Ala Glu Thr Glu Thr Gly Ile 1 5 cca ggc gtc cca ggc aca caa gcc gcc gac cag ttc aat gag ctg ccc 341 Pro Gly Val Pro Gly Thr Gln Ala Ala Asp Gln Phe Asn Glu Leu Pro 10 15 20 25 gcc cac gtc tgg cca cgc aac gcg gtg cgc cag gag gac ggc gtg gtc 389 Ala His Val Trp Pro Arg Asn Ala Val Arg Gln Glu Asp Gly Val Val 30 35 40 acc gtc gcc ggt gtc ccc ctg ccg gac ctg gcc gag gaa tac ggc acc 437 Thr Val Ala Gly Val Pro Leu Pro Asp Leu Ala Glu Glu Tyr Gly Thr 45 50 55 ccg ctg ttc gtg gtg gac gag gat gat ttc cgt gcc cgc tgc cgc gac 485 Pro Leu Phe Val Val Asp Glu Asp Asp Phe Arg Ala Arg Cys Arg Asp 60 65 70 atg gcc tcc gcc ttc ggt ggt ccc gac cgt gtc cac tac gcc tcc aag 533 Met Ala Ser Ala Phe Gly Gly Pro Asp Arg Val His Tyr Ala Ser Lys 75 80 85 gcc ttc ctc agc aaa acg gtt gcc cgc tgg gtg gac gag gag ggg ctg 581 Ala Phe Leu Ser Lys Thr Val Ala Arg Trp Val Asp Glu Glu Gly Leu 90 95 100 105 tcc ctg gac atc gcc tcc gaa aat gaa ctc ggc atc gcc ctg gcc gcc 629 Ser Leu Asp Ile Ala Ser Glu Asn Glu Leu Gly Ile Ala Leu Ala Ala 110 115 120 gat ttc ccc ggt gaa cgc atc acc gcg cat ggc aac aac aag gac gcc 677 Asp Phe Pro Gly Glu Arg Ile Thr Ala His Gly Asn Asn Lys Asp Ala 125 130 135 tcc ttc ctg cgg gcc tgc gta cgc aac aac ctg ggc cac gtg gtg ctg 725 Ser Phe Leu Arg Ala Cys Val Arg Asn Asn Leu Gly His Val Val Leu 140 145 150 gac tcc gcg cag gaa ctc gag ctg ctg gat tac atc gcc gcc ggc gag 773 Asp Ser Ala Gln Glu Leu Glu Leu Leu Asp Tyr Ile Ala Ala Gly Glu 155 160 165 ggc aag gtc cag ccg gtg ctg atc cgg gtg aag ccg ggt atc gag gcc 821 Gly Lys Val Gln Pro Val Leu Ile Arg Val Lys Pro Gly Ile Glu Ala 170 175 180 185 cac acc cat gag ttc atc gcc acc agc cac gag gat cag aaa ttc ggc 869 His Thr His Glu Phe Ile Ala Thr Ser His Glu Asp Gln Lys Phe Gly 190 195 200 ttc tcc ctc gcc tcc ggt gca gcc ttc gac gcc gca cgt gcc gcc gtg 917 Phe Ser Leu Ala Ser Gly Ala Ala Phe Asp Ala Ala Arg Ala Ala Val 205 210 215 aac gcc gag aac ctc gag ctg gtg ggc ctg cac tgc cat gtc ggt tcc 965 Asn Ala Glu Asn Leu Glu Leu Val Gly Leu His Cys His Val Gly Ser 220 225 230 cag gtg ttt gac gcc cag ggt ttc tcc ctg gcc gcc gag cgt gtc ctg 1013 Gln Val Phe Asp Ala Gln Gly Phe Ser Leu Ala Ala Glu Arg Val Leu 235 240 245 gag ctg tac tcg cgc atc cac gat gag ctg ggt gtc acc ctc gcg gag 1061 Glu Leu Tyr Ser Arg Ile His Asp Glu Leu Gly Val Thr Leu Ala Glu 250 255 260 265 ctg gat ctg ggt ggt ggg tac ggc atc gcc tac acc gcg gct gag gag 1109 Leu Asp Leu Gly Gly Gly Tyr Gly Ile Ala Tyr Thr Ala Ala Glu Glu 270 275 280 ccc ctc aac gtc gtc gag gtg gcg cac gat ctg ctc acc gcc gtg ggt 1157 Pro Leu Asn Val Val Glu Val Ala His Asp Leu Leu Thr Ala Val Gly 285 290 295 aag acc gcc gcg gag ctc ggc atc gag gca ccg acc gtg ctg gtc gag 1205 Lys Thr Ala Ala Glu Leu Gly Ile Glu Ala Pro Thr Val Leu Val Glu 300 305 310 ccc ggc cgt gcc atc gcc ggc ccg tcc acc gtc acc gtc tat gag gtg 1253 Pro Gly Arg Ala Ile Ala Gly Pro Ser Thr Val Thr Val Tyr Glu Val 315 320 325 ggc acc atc aag gac gtc gat gtc gac gat gag acc acc cgt cgc tat 1301 Gly Thr Ile Lys Asp Val Asp Val Asp Asp Glu Thr Thr Arg Arg Tyr 330 335 340 345 atc tcc gtc gat ggt ggc atg tcc gac aac atc cgc ccg gcg ctc tac 1349 Ile Ser Val Asp Gly Gly Met Ser Asp Asn Ile Arg Pro Ala Leu Tyr 350 355 360 ggc gcg gaa tac gat gcc cgc gtg gtc tcc cgg ttc acg gag ggg gag 1397 Gly Ala Glu Tyr Asp Ala Arg Val Val Ser Arg Phe Thr Glu Gly Glu 365 370 375 acc acc aac acc cgt gtg gtg ggt tcg cac tgc gag tcc ggt gac atc 1445 Thr Thr Asn Thr Arg Val Val Gly Ser His Cys Glu Ser Gly Asp Ile 380 385 390 ctc atc aac gag gcg acc tac ccc tcc gat atc cac acc ggg gac ctc 1493 Leu Ile Asn Glu Ala Thr Tyr Pro Ser Asp Ile His Thr Gly Asp Leu 395 400 405 ctg gcc ctg gcc gcc acc ggc gcg tac tgc tac gcc atg agc tcg cgc 1541 Leu Ala Leu Ala Ala Thr Gly Ala Tyr Cys Tyr Ala Met Ser Ser Arg 410 415 420 425 tac aac gcc ttc gcc cgc ccc gcg gtg gtg tcc gtg cgc gct ggt gcc 1589 Tyr Asn Ala Phe Ala Arg Pro Ala Val Val Ser Val Arg Ala Gly Ala 430 435 440 gcg aag ctg atg ctg cgc cgc gag acc ctc gac gac atc ctg tct ctc 1637 Ala Lys Leu Met Leu Arg Arg Glu Thr Leu Asp Asp Ile Leu Ser Leu 445 450 455 gag gtc tagaacaacg cttgtcgacg cacaccgccg ccacccctga caggggtggc 1693 Glu Val ggcggtgtgc g 1704
【0077】 <210> 10 <211> 459 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 10 Met Thr Ala Glu Thr Glu Thr Gly Ile Pro Gly Val Pro Gly Thr Gln 1 5 10 15 Ala Ala Asp Gln Phe Asn Glu Leu Pro Ala His Val Trp Pro Arg Asn 20 25 30 Ala Val Arg Gln Glu Asp Gly Val Val Thr Val Ala Gly Val Pro Leu 35 40 45 Pro Asp Leu Ala Glu Glu Tyr Gly Thr Pro Leu Phe Val Val Asp Glu 50 55 60 Asp Asp Phe Arg Ala Arg Cys Arg Asp Met Ala Ser Ala Phe Gly Gly 65 70 75 80 Pro Asp Arg Val His Tyr Ala Ser Lys Ala Phe Leu Ser Lys Thr Val 85 90 95 Ala Arg Trp Val Asp Glu Glu Gly Leu Ser Leu Asp Ile Ala Ser Glu 100 105 110 Asn Glu Leu Gly Ile Ala Leu Ala Ala Asp Phe Pro Gly Glu Arg Ile 115 120 125 Thr Ala His Gly Asn Asn Lys Asp Ala Ser Phe Leu Arg Ala Cys Val 130 135 140 Arg Asn Asn Leu Gly His Val Val Leu Asp Ser Ala Gln Glu Leu Glu 145 150 155 160 Leu Leu Asp Tyr Ile Ala Ala Gly Glu Gly Lys Val Gln Pro Val Leu 165 170 175 Ile Arg Val Lys Pro Gly Ile Glu Ala His Thr His Glu Phe Ile Ala 180 185 190 Thr Ser His Glu Asp Gln Lys Phe Gly Phe Ser Leu Ala Ser Gly Ala 195 200 205 Ala Phe Asp Ala Ala Arg Ala Ala Val Asn Ala Glu Asn Leu Glu Leu 210 215 220 Val Gly Leu His Cys His Val Gly Ser Gln Val Phe Asp Ala Gln Gly 225 230 235 240 Phe Ser Leu Ala Ala Glu Arg Val Leu Glu Leu Tyr Ser Arg Ile His 245 250 255 Asp Glu Leu Gly Val Thr Leu Ala Glu Leu Asp Leu Gly Gly Gly Tyr 260 265 270 Gly Ile Ala Tyr Thr Ala Ala Glu Glu Pro Leu Asn Val Val Glu Val 275 280 285 Ala His Asp Leu Leu Thr Ala Val Gly Lys Thr Ala Ala Glu Leu Gly 290 295 300 Ile Glu Ala Pro Thr Val Leu Val Glu Pro Gly Arg Ala Ile Ala Gly 305 310 315 320 Pro Ser Thr Val Thr Val Tyr Glu Val Gly Thr Ile Lys Asp Val Asp 325 330 335 Val Asp Asp Glu Thr Thr Arg Arg Tyr Ile Ser Val Asp Gly Gly Met 340 345 350 Ser Asp Asn Ile Arg Pro Ala Leu Tyr Gly Ala Glu Tyr Asp Ala Arg 355 360 365 Val Val Ser Arg Phe Thr Glu Gly Glu Thr Thr Asn Thr Arg Val Val 370 375 380 Gly Ser His Cys Glu Ser Gly Asp Ile Leu Ile Asn Glu Ala Thr Tyr 385 390 395 400 Pro Ser Asp Ile His Thr Gly Asp Leu Leu Ala Leu Ala Ala Thr Gly 405 410 415 Ala Tyr Cys Tyr Ala Met Ser Ser Arg Tyr Asn Ala Phe Ala Arg Pro 420 425 430 Ala Val Val Ser Val Arg Ala Gly Ala Ala Lys Leu Met Leu Arg Arg 435 440 445 Glu Thr Leu Asp Asp Ile Leu Ser Leu Glu Val 450 455
【0078】 <210> 11 <211> 1375 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (28)..(1290) <400> 1 agtaccgtga acgaaaggtg cgcaagg gtg gcc cta gtc gta cag aaa tat ggc 54 Val Ala Leu Val Val Gln Lys Tyr Gly 1 5 ggt tcc tca ctg gag agt gcg gaa cgc atc cgg aat gtt gct gaa cgg 102 Gly Ser Ser Leu Glu Ser Ala Glu Arg Ile Arg Asn Val Ala Glu Arg 10 15 20 25 att gtt gcc acc aag aag gcc gga aat gat gtc gtc gtg gtc tgt tcc 150 Ile Val Ala Thr Lys Lys Ala Gly Asn Asp Val Val Val Val Cys Ser 30 35 40 gcg atg ggc gac acc acc gat gaa ctc ctt gat ctt gcc gcg gcc gtc 198 Ala Met Gly Asp Thr Thr Asp Glu Leu Leu Asp Leu Ala Ala Ala Val 45 50 55 aac ccg gtt cca ccc gcc cgt gag atg gat atg ctc ctg acc gcc ggc 246 Asn Pro Val Pro Pro Ala Arg Glu Met Asp Met Leu Leu Thr Ala Gly 60 65 70 gag cgg atc tcg aac gca ctg gtg gcc atg gcc att gaa tcc ctc ggc 294 Glu Arg Ile Ser Asn Ala Leu Val Ala Met Ala Ile Glu Ser Leu Gly 75 80 85 gcc gag gcc cag tcg ttc acc ggt tcc cag gcc ggt gtg ctc acc acc 342 Ala Glu Ala Gln Ser Phe Thr Gly Ser Gln Ala Gly Val Leu Thr Thr 90 95 100 105 gaa cgt cac ggc aac gcc cgg atc gtg gat gtc acc ccg ggg cgt gtg 390 Glu Arg His Gly Asn Ala Arg Ile Val Asp Val Thr Pro Gly Arg Val 110 115 120 cgt gag gcg ctc gat gag ggc aag atc tgc atc gtc gcc ggt ttc cag 438 Arg Glu Ala Leu Asp Glu Gly Lys Ile Cys Ile Val Ala Gly Phe Gln 125 130 135 ggt gtg aac aag gaa acc cgt gat gtg acc acg cta ggt cgc ggc ggt 486 Gly Val Asn Lys Glu Thr Arg Asp Val Thr Thr Leu Gly Arg Gly Gly 140 145 150 tcc gat acc acg gca gtt gcg ctg gcg gca gcg ctc ggg gcc gat gtc 534 Ser Asp Thr Thr Ala Val Ala Leu Ala Ala Ala Leu Gly Ala Asp Val 155 160 165 tgc gag atc tac tcc gat gtg gat ggt gtc tac acc gct gat ccc cgc 582 Cys Glu Ile Tyr Ser Asp Val Asp Gly Val Tyr Thr Ala Asp Pro Arg 170 175 180 185 atc gtc ccc aat gca cag aag ctg gag cgc ctc tcc ttc gag gag atg 630 Ile Val Pro Asn Ala Gln Lys Leu Glu Arg Leu Ser Phe Glu Glu Met 190 195 200 ctg gaa ctg gcg gcc gtc ggt tcc aag atc ctg gtg ctg cgc agc gtt 678 Leu Glu Leu Ala Ala Val Gly Ser Lys Ile Leu Val Leu Arg Ser Val 205 210 215 gag tat gcc cgt gca ttc aat gtt ccg atg cgc gtc cgt tcg tcc tat 726 Glu Tyr Ala Arg Ala Phe Asn Val Pro Met Arg Val Arg Ser Ser Tyr 220 225 230 agc aat gac ccc ggc acc ctg atc gcc ggt tcg atg gag gat att cct 774 Ser Asn Asp Pro Gly Thr Leu Ile Ala Gly Ser Met Glu Asp Ile Pro 235 240 245 atg gaa gaa gca gtt ctc acc ggt gta gcc acc gac aag tcc gag gcc 822 Met Glu Glu Ala Val Leu Thr Gly Val Ala Thr Asp Lys Ser Glu Ala 250 255 260 265 aag gtc acc gtt ctg ggt atc ccc gac aag ccg ggt gag gcc gcc aag 870 Lys Val Thr Val Leu Gly Ile Pro Asp Lys Pro Gly Glu Ala Ala Lys 270 275 280 gtc ttc cgt gcg ctt gcc gac gcc gag atc aac atc gac atg gtc ctg 918 Val Phe Arg Ala Leu Ala Asp Ala Glu Ile Asn Ile Asp Met Val Leu 285 290 295 cag aac gtc tcc tcc gtc gag gac ggc acc acc gac atc act ttc acc 966 Gln Asn Val Ser Ser Val Glu Asp Gly Thr Thr Asp Ile Thr Phe Thr 300 305 310 tgc ccc cgg tcc gac gga cca cgc gcc atg gag ctg ctc aag aag atg 1014 Cys Pro Arg Ser Asp Gly Pro Arg Ala Met Glu Leu Leu Lys Lys Met 315 320 325 cag cag cag ggt gac tgg acc aac gtg ctc tac gac gat cag gtg ggt 1062 Gln Gln Gln Gly Asp Trp Thr Asn Val Leu Tyr Asp Asp Gln Val Gly 330 335 340 345 aag gtc tca ctc gtc ggc gcc ggc atg aag tcc cac ccg ggt gtc acc 1110 Lys Val Ser Leu Val Gly Ala Gly Met Lys Ser His Pro Gly Val Thr 350 355 360 gcc gag ttc atg gag gct ctc cgt gac gtc aac gtc aac gtc gaa ctg 1158 Ala Glu Phe Met Glu Ala Leu Arg Asp Val Asn Val Asn Val Glu Leu 365 370 375 atc tcc acc tcc gag atc cgc atc tcc gtg ctc atc cgt gag gat gac 1206 Ile Ser Thr Ser Glu Ile Arg Ile Ser Val Leu Ile Arg Glu Asp Asp 380 385 390 ctg gat aag tcc gcg aag gca ctg cac gag aag ttc cag ctc ggt ggc 1254 Leu Asp Lys Ser Ala Lys Ala Leu His Glu Lys Phe Gln Leu Gly Gly 395 400 405 gat gag gaa gcc acc gtc tac gcc ggc acc ggg cgt taatcaccgg 1300 Asp Glu Glu Ala Thr Val Tyr Ala Gly Thr Gly Arg 410 415 420 accttgatcc ccgggcgttg agccccgcct ccctcacccc acgctttccc ctgtcaggac 1360 cccaggacca tcttt 1375 420
【0079】 <210> 12 <211> 421 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 2 Val Ala Leu Val Val Gln Lys Tyr Gly Gly Ser Ser Leu Glu Ser Ala 1 5 10 15 Glu Arg Ile Arg Asn Val Ala Glu Arg Ile Val Ala Thr Lys Lys Ala 20 25 30 Gly Asn Asp Val Val Val Val Cys Ser Ala Met Gly Asp Thr Thr Asp 35 40 45 Glu Leu Leu Asp Leu Ala Ala Ala Val Asn Pro Val Pro Pro Ala Arg 50 55 60 Glu Met Asp Met Leu Leu Thr Ala Gly Glu Arg Ile Ser Asn Ala Leu 65 70 75 80 Val Ala Met Ala Ile Glu Ser Leu Gly Ala Glu Ala Gln Ser Phe Thr 85 90 95 Gly Ser Gln Ala Gly Val Leu Thr Thr Glu Arg His Gly Asn Ala Arg 100 105 110 Ile Val Asp Val Thr Pro Gly Arg Val Arg Glu Ala Leu Asp Glu Gly 115 120 125 Lys Ile Cys Ile Val Ala Gly Phe Gln Gly Val Asn Lys Glu Thr Arg 130 135 140 Asp Val Thr Thr Leu Gly Arg Gly Gly Ser Asp Thr Thr Ala Val Ala 145 150 155 160 Leu Ala Ala Ala Leu Gly Ala Asp Val Cys Glu Ile Tyr Ser Asp Val 165 170 175 Asp Gly Val Tyr Thr Ala Asp Pro Arg Ile Val Pro Asn Ala Gln Lys 180 185 190 Leu Glu Arg Leu Ser Phe Glu Glu Met Leu Glu Leu Ala Ala Val Gly 195 200 205 Ser Lys Ile Leu Val Leu Arg Ser Val Glu Tyr Ala Arg Ala Phe Asn 210 215 220 Val Pro Met Arg Val Arg Ser Ser Tyr Ser Asn Asp Pro Gly Thr Leu 225 230 235 240 Ile Ala Gly Ser Met Glu Asp Ile Pro Met Glu Glu Ala Val Leu Thr 245 250 255 Gly Val Ala Thr Asp Lys Ser Glu Ala Lys Val Thr Val Leu Gly Ile 260 265 270 Pro Asp Lys Pro Gly Glu Ala Ala Lys Val Phe Arg Ala Leu Ala Asp 275 280 285 Ala Glu Ile Asn Ile Asp Met Val Leu Gln Asn Val Ser Ser Val Glu 290 295 300 Asp Gly Thr Thr Asp Ile Thr Phe Thr Cys Pro Arg Ser Asp Gly Pro 305 310 315 320 Arg Ala Met Glu Leu Leu Lys Lys Met Gln Gln Gln Gly Asp Trp Thr 325 330 335 Asn Val Leu Tyr Asp Asp Gln Val Gly Lys Val Ser Leu Val Gly Ala 340 345 350 Gly Met Lys Ser His Pro Gly Val Thr Ala Glu Phe Met Glu Ala Leu 355 360 365 Arg Asp Val Asn Val Asn Val Glu Leu Ile Ser Thr Ser Glu Ile Arg 370 375 380 Ile Ser Val Leu Ile Arg Glu Asp Asp Leu Asp Lys Ser Ala Lys Ala 385 390 395 400 Leu His Glu Lys Phe Gln Leu Gly Gly Asp Glu Glu Ala Thr Val Tyr 405 410 415 Ala Gly Thr Gly Arg
【0080】 <210> 13 <211> 1568 <212> DNA <213> Corynebacterium thermoaminogenes <220> <221> CDS <222> (778)..(1470) <400> 13 gggcctcggg cagcaggccc caccccaggc cgagtcgcac cgcctccccg aaaccctccg 60 cagacggcac caccgagaca cggcgcctgg cgacggctcc gtcgaccctg ccctcgagat 120 cgcggtcctg cagcacatca ttcgggccga aacgcagtac cggcatgcgc acccaagtcg 180 ggttggccat ccacggtgta ccgtgcctca gttccggggg tggccaccgg caggtgtctc 240 atgaccccga ggcgtaggac ctcacacccg gcaacggggt ccgcctcgcg ggtcacggcc 300 ccgagcacgg aaccgcggcg caacagggac agggtgtggg cctcgtcctc cacacgcagc 360 gtcagggtga ccgcacccca atgtgcaacc tcggcgaaca cgggcgggaa ccaggtggac 420 agggaatcgg cgttgatagc cacggtcagg gggatctcgt caagccgttc cgccagttgc 480 tcacgggtct ccgcctgcag cagcgccatc ttgcgggccg cctggaccag cacctccccg 540 gcttcggtgg caaccgccgg ctgggtgcgc gacaccagta cccgaccgac ggatttctcc 600 agtgccttga tgcgctggct gaccgccgag ggggagatcg acagtgcgag ggaggcgttc 660 tcgaagctgc cctcgtcgat gatggtcaga agggtgtcca ggtggatcgg gttcatgaag 720 caattctaaa ccatgttcag tctctatcat tttacttaat gtggtttgtg cgcgaac 777 atg cgg gac atg gaa atc ttt gtc acc ggt ttg ttg ttg gga gcc agt 825 Met Arg Asp Met Glu Ile Phe Val Thr Gly Leu Leu Leu Gly Ala Ser 1 5 10 15 ctg ctg ttg gcc atc ggc cca cag aat gtc ctg gtg atc aaa cag ggc 873 Leu Leu Leu Ala Ile Gly Pro Gln Asn Val Leu Val Ile Lys Gln Gly 20 25 30 atc aaa cgc gag ggc atc acg gcc gtc atc atc gtc tgt ctg ctg tcc 921 Ile Lys Arg Glu Gly Ile Thr Ala Val Ile Ile Val Cys Leu Leu Ser 35 40 45 gac gtg gtc ctg ttc acc ctc ggc acc ctc ggg gtc ggc ctg atc tcc 969 Asp Val Val Leu Phe Thr Leu Gly Thr Leu Gly Val Gly Leu Ile Ser 50 55 60 gac acc gcc ccg atc att ctc gac atc ctg cgc tgg tgc ggc atc gcc 1017 Asp Thr Ala Pro Ile Ile Leu Asp Ile Leu Arg Trp Cys Gly Ile Ala 65 70 75 80 tac ctg ctg tgg ttc gcg gtg atg gcg gcg cgc gac gcc ctg cgc gcc 1065 Tyr Leu Leu Trp Phe Ala Val Met Ala Ala Arg Asp Ala Leu Arg Ala 85 90 95 cgc acc gag gta acc ttt gtc gag cat tcc gaa ccc gtt gcg gca gcg 1113 Arg Thr Glu Val Thr Phe Val Glu His Ser Glu Pro Val Ala Ala Ala 100 105 110 tcc gcc tcc ggc ggg ggc gtg acg acg aaa caa cga ccc cgg ctc cgc 1161 Ser Ala Ser Gly Gly Gly Val Thr Thr Lys Gln Arg Pro Arg Leu Arg 115 120 125 atc aca tca ggc acc cgg cag gtc tgg gtc agg ccc atg ctc atg gcc 1209 Ile Thr Ser Gly Thr Arg Gln Val Trp Val Arg Pro Met Leu Met Ala 130 135 140 att gtg ctg acc tgg ctc aat ccc aat gcc tac ctg gat gcc ttc gtc 1257 Ile Val Leu Thr Trp Leu Asn Pro Asn Ala Tyr Leu Asp Ala Phe Val 145 150 155 160 ttc atc ggt ggt gtc gga gcc cag tac ggg gag acc ggt cgg tgg atc 1305 Phe Ile Gly Gly Val Gly Ala Gln Tyr Gly Glu Thr Gly Arg Trp Ile 165 170 175 ttc gct gcg ggt gcc ttc gcc gcc agc ctg gtc tgg ttc cca ctg gtc 1353 Phe Ala Ala Gly Ala Phe Ala Ala Ser Leu Val Trp Phe Pro Leu Val 180 185 190 ggt tac ggc gcg gcc gca ctg tcg cgt ccc ctg tcc agc ccg cgg gtc 1401 Gly Tyr Gly Ala Ala Ala Leu Ser Arg Pro Leu Ser Ser Pro Arg Val 195 200 205 tgg cgc tgg atc aac ata ggt gtg gcc gtg gtg ctc acc gga ttg gcc 1449 Trp Arg Trp Ile Asn Ile Gly Val Ala Val Val Leu Thr Gly Leu Ala 210 215 220 gtg aag ctg atc ctg atg ggt taacccacca atcccagctc ataggctctg 1500 Val Lys Leu Ile Leu Met Gly 225 230 atgacggcct ggacccggct ggtcaatccc aatttcatca gcaccctgcc gaagtgggtt 1560 ttcaccgt 1568
【0081】 <210> 14 <211> 231 <212> PRT <213> Corynebacterium thermoaminogenes <400> 4 Met Arg Asp Met Glu Ile Phe Val Thr Gly Leu Leu Leu Gly Ala Ser 1 5 10 15 Leu Leu Leu Ala Ile Gly Pro Gln Asn Val Leu Val Ile Lys Gln Gly 20 25 30 Ile Lys Arg Glu Gly Ile Thr Ala Val Ile Ile Val Cys Leu Leu Ser 35 40 45 Asp Val Val Leu Phe Thr Leu Gly Thr Leu Gly Val Gly Leu Ile Ser 50 55 60 Asp Thr Ala Pro Ile Ile Leu Asp Ile Leu Arg Trp Cys Gly Ile Ala 65 70 75 80 Tyr Leu Leu Trp Phe Ala Val Met Ala Ala Arg Asp Ala Leu Arg Ala 85 90 95 Arg Thr Glu Val Thr Phe Val Glu His Ser Glu Pro Val Ala Ala Ala 100 105 110 Ser Ala Ser Gly Gly Gly Val Thr Thr Lys Gln Arg Pro Arg Leu Arg 115 120 125 Ile Thr Ser Gly Thr Arg Gln Val Trp Val Arg Pro Met Leu Met Ala 130 135 140 Ile Val Leu Thr Trp Leu Asn Pro Asn Ala Tyr Leu Asp Ala Phe Val 145 150 155 160 Phe Ile Gly Gly Val Gly Ala Gln Tyr Gly Glu Thr Gly Arg Trp Ile 165 170 175 Phe Ala Ala Gly Ala Phe Ala Ala Ser Leu Val Trp Phe Pro Leu Val 180 185 190 Gly Tyr Gly Ala Ala Ala Leu Ser Arg Pro Leu Ser Ser Pro Arg Val 195 200 205 Trp Arg Trp Ile Asn Ile Gly Val Ala Val Val Leu Thr Gly Leu Ala 210 215 220 Val Lys Leu Ile Leu Met Gly 225 230
【0082】 <210> 15 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for lysA <400> 15 ctcgctgaag aatacggaac ccc 23
【0083】 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for lysA <400> 16 gtagagtgct gggcggatgt t 21
【0084】 <210> 17 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for lysC
【0085】 <400> 17 cgygghgght cygayacyac yg 22
【0086】 <210> 18 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for lysC <400> 18 cagcacggaa atacgaatct c 21
【0087】 <210> 19 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for lysG <400> 19 gycgccarcg ytgccarta 19
【0088】 <210> 20 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for lysE <400> 20 aaatccaccg tccggtgtc 19
【0089】 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for LA cloning of dapA <400> 21 tggcgcagac ggccttctgg 20
【0090】 <210> 22 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for LA cloning of dapA <400> 22 cacaagcttc gaggaagg 18
【0091】 <210> 23 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for LA cloning of lysE <400> 23 aggtaacctt tgtcgagc 18
【0092】 <210> 24 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for LA cloning of lysE <400> 24 cgtgacgacg aaacaacg 18
【0093】 <210> 25 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for LA cloning of lysA <400> 25 tgtaggcgat gccgtaccc 19
【0094】 <210> 26 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: primer for LA cloning of lysA <400> 26 tttctgatcc tcgtggc 17
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 河原 義雄 神奈川県川崎市川崎区鈴木町1−1味の素 株式会社発酵技術研究所内 (72)発明者 杉本 愼一 神奈川県川崎市川崎区鈴木町1−1味の素 株式会社発酵技術研究所内 Fターム(参考) 4B024 AA03 AA05 BA07 BA08 BA10 BA80 CA03 CA20 DA06 EA04 GA11 GA19 GA27

Claims (7)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号2に記載のアミノ酸配列を有す
    るタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若し
    くは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆
    位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、アスパラギン酸
    セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク
    質をコードするDNA。
  2. 【請求項2】 配列番号4に記載のアミノ酸配列を有す
    るタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若し
    くは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆
    位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジアミノピメリ
    ン酸デヒドロゲナーゼ活性を有するタンパク質をコード
    するDNA。
  3. 【請求項3】 配列番号6に記載のアミノ酸配列を有す
    るタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若し
    くは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆
    位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジヒドロジピコ
    リン酸シンターゼ活性を有するタンパク質をコードする
    DNA。
  4. 【請求項4】 配列番号8に記載のアミノ酸配列を有す
    るタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若し
    くは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆
    位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジヒドロジピコ
    リン酸レダクターゼ活性を有するタンパク質をコードす
    るDNA。
  5. 【請求項5】 配列番号10に記載のアミノ酸配列を有
    するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若
    しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は
    逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、ジアミノピメ
    リン酸デカルボキシラーゼ活性を有するタンパク質をコ
    ードするDNA。
  6. 【請求項6】 配列番号12に記載のアミノ酸配列を有
    するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若
    しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は
    逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、アスパルトキ
    ナーゼ活性を有するタンパク質をコードするDNA。
  7. 【請求項7】 配列番号14に記載のアミノ酸配列を有
    するタンパク質、又は、同アミノ酸配列において、1若
    しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は
    逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、リジンの細胞
    外への排出に関与する機能を有するタンパク質をコード
    するDNA。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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EP2940144A1 (de) * 2014-04-30 2015-11-04 Evonik Degussa GmbH Verfahren zur Produktion von L-Lysin unter Verwendung eines alkaliphilen Bakteriums

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EP2940144A1 (de) * 2014-04-30 2015-11-04 Evonik Degussa GmbH Verfahren zur Produktion von L-Lysin unter Verwendung eines alkaliphilen Bakteriums
WO2015165743A1 (de) * 2014-04-30 2015-11-05 Evonik Degussa Gmbh Verfahren zur produktion von l-lysin unter verwendung eines alkaliphilen bakteriums

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