JP2001046063A - ユーバクテリウム属及びフソバクテリウム・バリウムグループ細菌用プライマー - Google Patents
ユーバクテリウム属及びフソバクテリウム・バリウムグループ細菌用プライマーInfo
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Abstract
又は該塩基配列に相補的な配列を有するユーバクテリウ
ム属細菌用及びフソバクテリウム・バリウムグループ細
菌用プライマー又はプローブ、並びにこのプライマーを
使用するユーバクテリウム属細菌菌種及びフソバクテリ
ウム・バリウムグループの同定・検出法。 【効果】 菌の培養が不要で、迅速、簡便にユーバクテ
リウム属細菌菌種等の同定・検出を行うことができる。
Description
内、口腔内に生息するユーバクテリウム(Eubacteriu
m)属細菌菌種及びフソバクテリウム・バリウム(Fusob
acterium varium)グループの同定に有用なDNAプラ
イマー及びこれを用いるユーバクテリウム属細菌菌種及
びフソバクテリウム・バリウムの同定・検出方法に関す
るものである。
常在し複雑な腸内菌叢を形成している。これらは宿主が
健康でありさえすれば、安定した状態であることが知ら
れている。その腸内菌叢を形成する最優勢菌群の1つと
してユーバクテリウム属細菌が挙げられる。
離されることも多いが、主にヒトや動物の腸管や臨床材
料から分離される。また、ユーバクテリウム属細菌の動
向は腸内の有用細菌であるビフィドバクテリウム属細菌
と類似していることもわかっている。
陰性嫌気性桿菌であり、非運動性で、口腔に常在する
が、腸管に見出されることがある。
おけるユーバクテリウム属細菌やフソバクテリウム属細
菌の動向は、生体の健康状態に密接に係わっているもの
と考えられている。このため、これらの菌に関するさら
なる研究を行い、生理作用等の知見を蓄積することが要
望されている。また、糞便等からユーバクテリウム属細
菌等を迅速且つ正確に検出し、その動向から個体の健康
状態を把握することも可能であると考えられている。
ウム属細菌やフソバクテリウム属細菌は、菌の形態や発
酵性状等により分類されているのみであり、生理活性等
未知の部分の多い細菌である。また、その検出同定は、
主にコロニー形状や顕微鏡観察、糖分解性状を検査する
ことにより行われており、このような表現形質を元にし
た同定方法は、操作が煩雑であり、試験者の熟練を要す
るものであった。
ーによる判定も行われるようになっている。(Collins,
M.D.,et al(1989)INTERNATIONAL JOURNAL of SYSTEMATI
C BACTERIOLOGY 39,105-108)。しかしながら、この同
定法も長時間を必要とし、迅速な菌種同定を行うには好
ましいものではなかった。
同定方法の試みとして、ある種の菌に特異的なプライマ
ーを用い、検体から抽出した細菌由来のDNAのPCR
反応により、菌の検出同定を行う方法が見出された(特
開平11−123093号公報)。
びフソバクテリウム属細菌の同定等に使用するプライマ
ーを見出すには、遺伝子のシークエンシング、アライメ
ント等かなりの手間がかかる作業が必要であり、かつ、
このようにして設計された配列でプライマーを合成して
も他の菌と反応してしまい、上記細菌のみに特異的なプ
ライマーを合成することは困難であった。
は、ヒト腸内や口腔内にて検出されるユーバクテリウム
属細菌やフソバクテリウム属細菌の菌種グループを特異
的に同定できるプライマーを合成し、このプライマーを
用いて該菌を迅速、簡便に同定・解析する方法を提供す
ることにある。
者は、多大な労力を投入し該遺伝子のシークエンシン
グ、アライメント等々煩雑な作業を行った結果、ユーバ
クテリウム属細菌の菌種及びフソバクテリウム・バリウ
ムグループに特異的な塩基配列を有するDNAプライマ
ーを見出し、これを用いれば、細菌の糖分解性状の確認
など煩雑な操作を行うことなく、検体から抽出した細菌
由来のDNAのPCR反応により、迅速かつ簡便に菌の
検出同定が可能となることを見出し本発明を完成した。
1〜19から選ばれる塩基配列又は該塩基配列に相補的
な配列を有するユーバクテリウム属細菌用プライマー又
はプローブ、並びに配列番号10の塩基配列又は該塩基
配列に相補的な配列を有するフソバクテリウム・バリウ
ムグループ細菌用プライマー又はプローブを提供するも
のである。また、本発明は、配列番号1又は2と11又
は12、3と13、4と14、5と15、6と16、7
と17、8と18及び9と19から選ばれる塩基配列の
組合せ又はこれらの塩基配列の組合せに相補的な配列の
組合せを有するユーバクテリウム属細菌菌種検出用プラ
イマーを提供するものである。
2以上を使用することを特徴とするユーバクテリウム属
細菌菌種又はフソバクテリウム・バリウムグループ細菌
の同定方法を提供するものである。
Aを抽出する工程及び(2)上記プライマーの1又は2
以上を用いてPCR反応を行を工程を含むユーバクテリ
ウム属細菌菌種又はフソバクテリウム・バリウムグルー
プ細菌の検出方法を提供するものである。
用プライマーとは、具体的にはユーバクテリウム・レン
タム(Eubacterium lentum)、ユーバクテリウム・リモ
ーザム(Eubacterium limosum)、ユーバクテリウム・
レクターレ(Eubacterium rectale)、ユーバクテリウ
ム・シリンドロイデス(Eubacterium cylindroides)、
ユーバクテリウム・トートーサム(Eubacterium tortuo
sum)、ユーバクテリウム・ドリカム(Eubacterium dol
ichum)、ユーバクテリウム・ビフォルメ(Eubacterium
biforme)、ユーバクテリウム・エリジェンス(Eubacte
rium eligens)に菌種特異的プライマーである。
クテリウム・バリウムグループに特異的なプライマーを
作成するにあたり、そのターゲットには、系統分類の指
標として信頼性の高い16SrRNA遺伝子を用い、同
定・解析には、PCR法等の手段が必要となるため、R
NAでなくDNAを用いた。
行って得た塩基配列とデータベース(DDBJ、Gen
bank等)とを比較・検討することにより得たもので
ある。ここで本発明者が比較対象として新たに16Sr
RNA遺伝子のシークエンスを行った菌種は、具体的に
は、ユーバクテリウム・レンタムJCM9979株であ
る。この配列は、遺伝研データベースDDBJに登録し
ている。
なる菌とその近縁の菌を配列をアライメントした。すな
わち、ユーバクテリウム属細菌の菌種、及びフソバクテ
リウム・バリウムグループそれぞれに対しバリエーショ
ンのある領域をターゲットとしてPCRプライマーを設
計した。
マーによって異なっており、20〜22b.pとなって
いる。これらは操作上最も好適な長さであるが、使用に
際しては、各々の16SrRNA遺伝子中において、該
オリゴヌクレオチドに隣接する数〜十数b.pの塩基配
列を増減させたものを用いても良い。
ち、配列番号1、2、11及び12記載の塩基配列を有
するものは、ユーバクテリウム・レンタムに特異的なD
NAオリゴヌクレオチドであり、菌種の同定、解析を行
うためのプライマーやプローブとして使用することがで
きる。プライマーとしては、公知のユニバーサルプライ
マー等と組合せて用いることも可能であるが、その組合
せによっては種特異的な検出を行えないものもあるの
で、配列番号1又は2と11又は12の組合せを用いる
ことが望ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・リモーザムに特異
的なオリゴヌクレオチドである。このため、プライマー
としては両者を組合せて用いることが好ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・レクターレに特異
的なオリゴヌクレオチドである。このため、プライマー
としては両者を組合せて用いることが好ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・シリンドロイデス
に特異的なオリゴヌクレオチドである。このため、プラ
イマーとしては両者を組合せて用いることが好ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・トートーサムに特
異的なオリゴヌクレオチドである。このため、プライマ
ーとしては両者を組合せて用いることが好ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・ドリカムに特異的
なオリゴヌクレオチドである。このため、プライマーと
しては両者を組合せて用いることが好ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・ビフォルメに特異
的なオリゴヌクレオチドである。このため、プライマー
としては両者を組合せて用いることが好ましい。
を有するものは、ユーバクテリウム・エリジェンスに特
異的なオリゴヌクレオチドである。このため、プライマ
ーとしては両者を組合せて用いることが好ましい。
るものは、フソバクテリウム・バリウムグループに特異
的なオリゴヌクレオチドである。このプライマーは公知
のユニバーサルプライマー等と組合せて用いることで特
異的な検出を行うことができる。
プライマーは、その塩基配列に従い、DNA合成機によ
り、人工的に合成される。その特異性は、以下の実施例
に示す近縁種のDNAに対する、プライマーのバンド形
成能を指標として確認した。結果として、上記全ての菌
種の特異性に問題はなかった。
ことにより、配列番号1〜19に示す配列以外にも種特
異的な配列が見出されている。しかしながら、これらの
配列や他の公知のプライマーで同定を行っても、別の種
に属する株と反応したり、目的とする種の株と反応しな
い場合も多く、使用上好ましいものではなかった。この
ようなプライマーを用いてもPCR反応時の条件設定に
よって種特異的な反応性は達成されるものと考えられる
が、現状ではそのような条件は見出されていない。
も検討を行った。すなわち、アニーリング温度を種々変
化させ、サイクル数も25及び30サイクルの2種類で
検討した。その結果、ユーバクテリウム・ドリカムでは
60℃、25サイクルが、他のものでは63℃、25サ
イクルが最も好適な条件であった。本発明のプライマー
は、このようにユーバクテリウム属細菌菌種及びフソバ
クテリウム・バリウムグループへの特異性を有するた
め、これらを用いて腸内細菌、口腔細菌、組織切片等の
菌を迅速に同定できる。また、各菌の選択培地(例えば
ユーバクテリウム属細菌であれば、EG培地(栄研社
製)等)に形成されたコロニーから直接、あるいは培養
した菌体からDNAを抽出し、各プライマーとの反応性
を調べることによって菌の簡易同定を行うことができ
る。
養を行うことなく糞便や組織切片等からの菌の同定を行
うことが可能である。例えば、まず、サンプル1mLを遠
心分離して得られるペレットからDNAを抽出し、これ
を鋳型DNAとする。DNAを抽出する方法としては、
定法であるMaraur法、その変法である酵素法、及
び簡便法である塩化ベンジル法が好ましい。これらの方
法は多少煩雑になるものの、酵素法において、幅広い菌
種から収率よくDNAを抽出できる。また、純粋培養し
た細菌等から抽出したDNAに対しては、前述の方法の
他、フェノール法等も好適に使用しうる。この鋳型DN
Aに本発明のプライマーを組合せ、増幅反応を行うこと
により、菌に特異的なDNA配列(PCR産物)を得る
ことができる。このようにして得られたDNAを電気泳
動すれば、バンドの有無と用いたプライマーから菌を同
定することができる。
ら抽出したDNAを鋳型とし、本発明のプライマーを用
いて菌の同定を行うと、従来の方法では検出限界以下で
あった菌株や種の判別が困難であった菌株も簡便に検出
することが可能であった。また、PCRを行う際に、鋳
型のDNA量を段階希釈し同様の解析を行い、一方で従
来の方法により菌の同定、定量を行い、両者を比較すれ
ば、目的とする菌の定量化も可能である。
ローブとして使用できる。これらは他の公知のユニバー
サルプライマーやオリゴヌクレオチド等と組合せても用
いることができる。
ト、動物等の腸内細菌叢等の解析を行える。すなわち、
上記ビフィドバクテリウム属細菌用プライマーやその他
の多岐にわたる細菌のプライマーと組合せて用いれば、
細菌叢の全体像を把握することも可能である。
培養することなく、迅速、簡便、低コスト且つ高精度に
ユーバクテリウム属細菌及びフソバクテリウムの同定を
行うことができる。また、他の菌に特異的なプライマー
等と組合せて使用することで、腸内細菌叢の解析等をも
行うことができる。更に、同定、解析の結果から病変部
位の菌や消化管等の状態を把握できるため、種々の疾病
等の予防・治療が容易になる。
明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
種の16SrRNA遺伝子配列と、本発明者らが解読し
た上記の16SrRNA遺伝子配列を元に、ユーバクテ
リウム属細菌菌種特異的なプライマーの設計を行った。
その際、塩基数20程度、GC含量が約50%となる部
分を探索した。その結果、フォワード及びリバースのプ
ライマーとして8菌種各9組が設計された(表1)。こ
うして設計した塩基配列に従い、プライマーはPhar
macia Biotech Oligo Expre
ssTMに発注し合成した。
プ特異的プライマー 系統学的に近隣の位置にあるフソバクテリウム属の各菌
種の16SrRNA遺伝子配列の16SrRNA遺伝子
配列を元に、フソバクテリウム・バリウムグループに特
異的なプライマーの設計を行った。その際、塩基数20
程度、GC含量が約50%となる部分を探索した。その
結果、1種のプライマーが設計された(表2)。こうし
て設計した塩基配列に従い、プライマーはPharma
ciaBiotech Oligo ExpressTM
に発注し合成した。
異的プライマーの特異性の確認 本発明のプライマーが、実際に特異性を有しているかを
確認するため、近縁の細菌の(基準株及び分離株)とプ
ライマーとの反応性を検討した。 (1)菌株の純粋培養及びコロニーの単離 表3に示す、19菌種19株のユーバクテリウム属細菌
をEG培地(栄研社製)にて嫌気的に二晩純粋培養し
た。こうして得た菌体19種類各々のコロニーをかきと
り、0.5mLのエッペンドルフチューブを用いて、滅菌
水に懸濁した。これを100℃で5分間ボイルし、熱変
性させた後に本発明のプライマーを用いてPCR反応を
行った。
8.3)、50mM KCl 1.5mM MgCl2、2
00μM dNTP mixtureに、各々0.2p
Mプライマー、2.5U Taq DNA polym
erase(タカラ社製)、鋳型DNAを含む反応液
で、DNAサーマルサイクラー(Perkin−Elm
ercetus,Norwalk,conn.)によ
り、94℃3分の後、94℃30秒、63℃1分30
秒、72℃2分を25サイクルのPCR反応を行った。
無によりプライマーと各菌株のDNAとの結合能を確認
し、プライマーの特異性を判定した。2%Agaros
e TypeII(シグマ社製)で、ミューピットにより
100V、25分電気泳動し、ethidim Bro
mideで染色後、UVランプ下でバンドを観察した。
その結果、プライマーはユーバクテリウム属細菌の各菌
種特異的にバンドを形成した(表3)。
イオサイエンス研究財団(KABUSHIKI KAISHA YAKULT HON
SHA;ZAIDAN HOJIN YAKULT・BIO SCIENCEKENKYU ZAIDAN) 理化学研究所(RIKEN) <120> Primer for Eubacterium and Fusobacterium <130> P <160> 20 <210> 1 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 1 catgaagtgg cgaacgggtg a 21 <210> 2 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 2 cttgctccgg acaaccttgg ga 22 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 3 tggatccttc gggtgacatt 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 4 cattgcttct cggtgccgtc 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 5 gagagatcgc atgaactttc 20 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 6 ggtaacctac ccatgtaact 20 <210> 7 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 7 ggcttcgagg catctcggag ac 22 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 8 ataggtagca gacaagcatt 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 9 ccgcataagc gcacaatgtt 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 10 taccggatat tatgactgag 20 <210> 11 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 11 cttctgcagg taccgtcgaa tt 22 <210> 12 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 12 tctaccgaac tcgagcctcc ca 22 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 13 ctcattgggt accgtcattc 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 14 atttgctcgg cttcacagct 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 15 acggatcatt ccctatccgt 20 <210> 16 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 16 ggtaagctac cgtcacttgt 20 <210> 17 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 17 actatcatgt cattccctac 20 <210> 18 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 18 gaacagtttc cagagccagt ac 22 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 19 ccctcctgca ctccagcctt 20
4)
AIDAN HOJIN YAKULT・BIO SCIENCE KENKYU ZAIDAN) 理化学研究所(RIKEN) <120> Primer for Eubacterium and Fusobacterium <130> P03281108 <160> 19 <210> 1 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 1 catgaagtgg cgaacgggtg a 21 <210> 2 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 2 cttgctccgg acaaccttgg ga 22 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 3 tggatccttc gggtgacatt 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 4 cattgcttct cggtgccgtc 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 5 gagagatcgc atgaactttc 20 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 6 ggtaacctac ccatgtaact 20 <210> 7 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 7 ggcttcgagg catctcggag ac 22 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 8 ataggtagca gacaagcatt 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 9 ccgcataagc gcacaatgtt 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 10 taccggatat tatgactgag 20 <210> 11 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 11 cttctgcagg taccgtcgaa tt 22 <210> 12 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 12 tctaccgaac tcgagcctcc ca 22 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 13 ctcattgggt accgtcattc 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 14 atttgctcgg cttcacagct 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 15 acggatcatt ccctatccgt 20 <210> 16 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 16 ggtaagctac cgtcacttgt 20 <210> 17 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 17 actatcatgt cattccctac 20 <210> 18 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 18 gaacagtttc cagagccagt ac 22 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 19 ccctcctgca ctccagcctt 20
Claims (5)
- 【請求項1】 配列番号1〜9及び11〜19から選ば
れる塩基配列又は該塩基配列に相補的な配列を有するユ
ーバクテリウム属細菌用プライマー又はプローブ。 - 【請求項2】 配列番号10の塩基配列又は該塩基配列
に相補的な配列を有するフソバクテリウム・バリウムグ
ループ細菌用プライマー又はプローブ。 - 【請求項3】 配列番号1又は2と11又は12、3と
13、4と14、5と15、6と16、7と17、8と
18及び9と19から選ばれる塩基配列の組合せ又はこ
れらの塩基配列の組合せに相補的な配列の組合せを有す
るユーバクテリウム属細菌菌種検出用プライマー。 - 【請求項4】 請求項1、2又は3記載のプライマーの
1又は2以上を使用することを特徴とするユーバクテリ
ウム属細菌菌種又はフソバクテリウム・バリウムグルー
プ細菌の同定方法。 - 【請求項5】 (1)検体中のDNAを抽出する工程及
び(2)請求項1、2又は3記載のプライマーの1又は
2以上を用いてPCR反応を行う工程を含むユーバクテ
リウム属細菌菌種又はフソバクテリウム・バリウムグル
ープ細菌の検出方法。
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2006525812A (ja) | 2003-05-19 | 2006-11-16 | ジェン−プロウブ インコーポレイテッド | 試験サンプルにおいてtrichomonasvaginalisの存在を決定するための組成物、方法およびキット |
JP2007020423A (ja) * | 2005-07-12 | 2007-02-01 | Yakult Honsha Co Ltd | 腸内細菌群検出用核酸断片 |
CN102940652A (zh) * | 2008-05-28 | 2013-02-27 | 青岛东海药业有限公司 | 两形真杆菌制剂及其应用 |
JP2015188359A (ja) * | 2014-03-27 | 2015-11-02 | 三菱重工業株式会社 | スフィンゴモナス属細菌の検出方法及びそのプライマー、生物処理槽の活性予測方法 |
-
1999
- 1999-08-10 JP JP11226176A patent/JP2001046063A/ja active Pending
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2006525812A (ja) | 2003-05-19 | 2006-11-16 | ジェン−プロウブ インコーポレイテッド | 試験サンプルにおいてtrichomonasvaginalisの存在を決定するための組成物、方法およびキット |
JP2007020423A (ja) * | 2005-07-12 | 2007-02-01 | Yakult Honsha Co Ltd | 腸内細菌群検出用核酸断片 |
CN102940652A (zh) * | 2008-05-28 | 2013-02-27 | 青岛东海药业有限公司 | 两形真杆菌制剂及其应用 |
CN102940652B (zh) * | 2008-05-28 | 2015-03-25 | 青岛东海药业有限公司 | 两形真杆菌制剂及其应用 |
JP2015188359A (ja) * | 2014-03-27 | 2015-11-02 | 三菱重工業株式会社 | スフィンゴモナス属細菌の検出方法及びそのプライマー、生物処理槽の活性予測方法 |
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