HUE030490T2 - DNS célzott megváltoztatása - Google Patents
DNS célzott megváltoztatása Download PDFInfo
- Publication number
- HUE030490T2 HUE030490T2 HUE14195788A HUE14195788A HUE030490T2 HU E030490 T2 HUE030490 T2 HU E030490T2 HU E14195788 A HUE14195788 A HU E14195788A HU E14195788 A HUE14195788 A HU E14195788A HU E030490 T2 HUE030490 T2 HU E030490T2
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- oligonucleotide
- dna
- nucleotide
- mismatch
- sequence
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1082—Preparation or screening gene libraries by chromosomal integration of polynucleotide sequences, HR-, site-specific-recombination, transposons, viral vectors
Landscapes
- Genetics & Genomics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Virology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Claims (8)
- ON!S célzott megváltoztatása S/AR Μ) M MI IGÉNY PON IOK R feljárás egy duplex akecptor DN$ fâplji. megváltoztatásé# egy növényi első DNS stïéiiyepeiatyfâlùîRlPt egy második DNS szekvenciát, tmmly az: első-DNI:szekvencia&omi?tateïlt>.κ. azzal jdk mezve, hog\ a/ eljárá» rmtahruz/a adoptez ákéeptor DNS szekvencia köölMnálfeit egy donor sáigonakfettddal, ahol az oiigonukleotid táRalmaz legalább egy doménty tipp. hlferldMÓdnl az első DNS szekvenciával, amely dómén tartalmaz, vagy kötetlenül szomszédos, legalább eg\, az első DNS szekvencilböz viszönyR tott helytelen illeszkedéssel, és ahol a szóban forgó legalább egy helytelen illeszkedés legfeljebb 2, előnyösen legfeljebb 1 nukleotid tavolságmhélyezkedíh el a szóban forgó nukleotid 3' végétök legelőnyösebben a szóban íbrgó legalább egy helytelen illeszkedés az olígennkfeoíid 3’ végén van. :2, Az i, Igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a donor nnkleoil komplemen-fer m első DNS székveneíávak a helytelen illészkedés kivételével.
- 3. Az előző igénypontok bánnelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az ollgo-nukleotid ieualábh egy szakaszt tartalmaz, anielv leaalább euv módosított nukleotídot tartalmaz, amely módosítást a következő csoportból választhatjuk ki; bázis módosítás, egy 3' és-Vagy 5’ végi bázis módosítás, eg> gerinc módosítás, vagy egv cukor módosítás. 4. A 3. rglnypat szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a módosított: nuMeotldnál nagyobb a: kötési aünttása a természetben: előforduló A, €R T vágy G rmkleotidokhoz a komplementer mikleptidjivak és almi a mődóshoít; nukleotid erősebben kötődik az első DNS szekvencia egy szemben levő pozíciójában levő nnkleotídhoz, mint egy természetben előforduló nukleotid, amely komplementer az első DNS szekvencia egy szemben levő pozíciójában levő nukleotiddal, és/vagy ahol á wfodósiőtt nnkleotid egy uPkleáz-rezisztens nukleotid, 5. A 3-4. igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy á módosított öukleotidot a következő csoportból \41^^to|ik::teí-iLNSi;yá^ foszforonoát kötésekkel fondelkezö nukleotidok.
- 6. Az előző igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az oilgöntikleothi legalább két, három, négy, vagy öt módosított nukleotídot tartalmaz.
- 7. Az előző: igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a helytelen
- 8, Λζ elo/o igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a módosi-tölt íMkleotid legalább egy npklenbd távolságra van p legalább egy helytelen illeszkedéstől, amely legl&jjébb :¾ eliipősendegfeljább 1 nuk lentid távolságra van a szóbanförgő oljgonukleotid 3* végétől:, jégejihyöséhtsen a szóban Hugó legalább egy helytelen illeszkedés az oligonukleoíid 3’ vegén van, % Áz előző igénypontok bárnieh tke iszerinti eljárás, azzal jëliemézye, bogy az oligöndMeoÄI*, 3, vagy négy helytelen iUeszkedésilatâalnÂ. Il:, előző: igénypontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hegy a valíoZfá- tás lepllib egy ntíkleőtíd deiéciója, szubsztitúciója és/vagy inszereiója. II,. Az előző igén> pontok bármelyike szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy a duplex: akceptor DNS egy genomiábs DNS~böl, lineáris DNS-böl, mesterséges nővén) í kromoszómákból,; sejtmag kromoszómáim DNS-bŐl, sejtszerv DNS-böl, plazmid DNS-böl Vágy episzömális DNS-böl származik·
- 12. Az előző: igénypantől: hlrmeiyike szerinti eljárás egy mutáció kijavításira, á: vad-típus helyreállimsára, egy mutáció tndukálására, egy enzim inaktiválására a kódoló régió elrontás!" val, egy enzim biológiai aktivitásának a módosítására à kódoló régió megváltoztatásával, vágy égy íehétje módosításáraá: kódoló régió: elroptásávaL
- 13. Az 1:42:¾. igénypomök bármelyike szerinti öigonukleotid alkalmazása égy duplex ákeeptor DNS mégváltöztatására egy növényi protoplaszthaíi, előnyösen a mutáció kijavítására a vadAípus helyreállításával, egy mutáció indukálására, egy enzim inaktiválására a kódoló régió Φ .rontásával, egy enzim biológiai aktivitásának a módosítására a kódoló régió megváltoztatásává}, vagy egy lebérje módosítására a kedpió régió elrontásával, a helytelen illeszkedés javítására, a növényi germíikal aupf célzott megváltüzíatásira, beleért ve a gén-mutádöt,a célzott gépjavítást vagy gén-ki ütést,
- 14. Növényi proioplaszf, amely a következőkét tartalmazza: - duplex ákeeptor DNS szekvencia, amely tartalmim egy első szekvenciát és égy második szék-vénet át, amely: az :első:Í3NS s zek vettet a ko mp I ern entere ; és - egy oiigotmliéóddivtdiPl az oUgomrkkoikl tartalmaz legalább egy domém, amely képes Itibri- dizálódni az első DNS szekvefíeilvál atsely dómén közvetlenül szomszédos legalább egy, az első DNS szekvenciához viszonyított helytelenIlleszkedéssel, és ahol a szóban forgó legalább egy helytelen illeszkedés a szóban Ntgö otígőmlkleotid 3' végétől legfeljebb 2, előnyösen legfeljebb 1 nukíeotid távolságban van, legelőnyösebben a szóban forgó legalább egy helytelen illeszkedés íz ölt goœ Is végén van. \ V
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US41917910P | 2010-12-02 | 2010-12-02 | |
| NL2005808 | 2010-12-03 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| HUE030490T2 true HUE030490T2 (hu) | 2017-05-29 |
Family
ID=44193925
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| HUE14195788A HUE030490T2 (hu) | 2010-12-02 | 2011-11-25 | DNS célzott megváltoztatása |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US9150854B2 (hu) |
| EP (2) | EP2857512B1 (hu) |
| JP (1) | JP6084929B2 (hu) |
| CN (1) | CN103459596B (hu) |
| AU (1) | AU2011337323B2 (hu) |
| CA (1) | CA2819423C (hu) |
| DK (2) | DK2857512T3 (hu) |
| ES (2) | ES2588482T3 (hu) |
| HU (1) | HUE030490T2 (hu) |
| IL (1) | IL226536A (hu) |
| WO (1) | WO2012074385A1 (hu) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN103502449B (zh) | 2010-12-02 | 2016-08-10 | 关键基因股份有限公司 | 用寡核苷酸靶向改变dna |
| US20150064149A1 (en) * | 2013-09-04 | 2015-03-05 | Mice With Horns, LLC. | Materials and methods for correcting recessive mutations in animals |
| WO2016105185A1 (en) | 2014-12-22 | 2016-06-30 | Keygene N.V. | Plant callus populations |
| WO2018115389A1 (en) | 2016-12-22 | 2018-06-28 | Keygene N.V. | Methods of targeted genetic alteration in plant cells |
| EP3684929A1 (en) * | 2017-09-19 | 2020-07-29 | Tropic Biosciences UK Limited | Modifying the specificity of non-coding rna molecules for silencing gene expression in eukaryotic cells |
| US20210238612A1 (en) | 2018-07-12 | 2021-08-05 | Keygene N.V. | Type v crispr/nuclease-system for genome editing in plant cells |
| JP2022505440A (ja) | 2018-11-01 | 2022-01-14 | キージーン ナムローゼ フェンノートシャップ | 植物細胞におけるＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓゲノム編集のためのデュアルガイドＲＮＡ |
Family Cites Families (22)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US579597A (en) | 1897-03-30 | Apparatus for heating blooms or other articles of metal | ||
| US5556747A (en) * | 1990-07-09 | 1996-09-17 | E. R. Squibb & Sons, Inc. | Method for site-directed mutagenesis |
| US6136601A (en) | 1991-08-21 | 2000-10-24 | Epoch Pharmaceuticals, Inc. | Targeted mutagenesis in living cells using modified oligonucleotides |
| US5594121A (en) | 1991-11-07 | 1997-01-14 | Gilead Sciences, Inc. | Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified purines |
| US5731181A (en) | 1996-06-17 | 1998-03-24 | Thomas Jefferson University | Chimeric mutational vectors having non-natural nucleotides |
| ES2192672T3 (es) | 1996-11-18 | 2003-10-16 | Takeshi Imanishi | Nuevos analogos de nucleotidos. |
| JP3756313B2 (ja) | 1997-03-07 | 2006-03-15 | 武 今西 | 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体 |
| EP1557424A1 (en) | 1997-09-12 | 2005-07-27 | Exiqon A/S | Bi-cyclic nucleoside, nucleotide and oligonucleoide analogues |
| US6010907A (en) | 1998-05-12 | 2000-01-04 | Kimeragen, Inc. | Eukaryotic use of non-chimeric mutational vectors |
| EP1161439B1 (en) | 1999-03-18 | 2010-04-21 | Exiqon A/S | Xylo-lna analogues |
| ES2283298T3 (es) | 1999-05-04 | 2007-11-01 | Santaris Pharma A/S | Analogos de l-ribo-lna. |
| WO2001073002A2 (en) | 2000-03-27 | 2001-10-04 | University Of Delaware | Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides |
| US6936467B2 (en) | 2000-03-27 | 2005-08-30 | University Of Delaware | Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides |
| AU2001263271A1 (en) | 2000-05-17 | 2001-11-26 | University Of Delaware | Plant gene targeting using oligonucleotides |
| WO2002026967A2 (en) | 2000-09-25 | 2002-04-04 | Thomas Jefferson University | Targeted gene correction by single-stranded oligodeoxynucleotides |
| WO2003013226A2 (en) | 2001-08-09 | 2003-02-20 | Cibus Genetics | Non-transgenic herbicide resistant plants |
| WO2003027265A2 (en) | 2001-09-27 | 2003-04-03 | University Of Delaware | Composition and methods for enhancing oligonucleotide-directed nucleic acid sequence alteration |
| JP4883447B2 (ja) * | 2004-12-13 | 2012-02-22 | 浩之 紙谷 | 核酸構築物及びそれを利用した標的領域への変異導入方法 |
| WO2007073149A1 (en) | 2005-12-22 | 2007-06-28 | Keygene N.V. | Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange |
| WO2009002150A1 (en) | 2007-06-22 | 2008-12-31 | Keygene N.V. | Targeted nucleotide exchange with improved modified oligonucleotides |
| CN102119226B (zh) | 2008-08-12 | 2013-10-30 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | 校对引物延伸 |
| CN103502449B (zh) | 2010-12-02 | 2016-08-10 | 关键基因股份有限公司 | 用寡核苷酸靶向改变dna |
-
2011
- 2011-11-25 ES ES14195788.6T patent/ES2588482T3/es active Active
- 2011-11-25 EP EP14195788.6A patent/EP2857512B1/en active Active
- 2011-11-25 AU AU2011337323A patent/AU2011337323B2/en not_active Ceased
- 2011-11-25 WO PCT/NL2011/050804 patent/WO2012074385A1/en active Application Filing
- 2011-11-25 US US13/991,060 patent/US9150854B2/en active Active
- 2011-11-25 EP EP11791641.1A patent/EP2646549B1/en active Active
- 2011-11-25 CN CN201180066385.6A patent/CN103459596B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2011-11-25 CA CA2819423A patent/CA2819423C/en active Active
- 2011-11-25 ES ES11791641.1T patent/ES2536638T3/es active Active
- 2011-11-25 JP JP2013541944A patent/JP6084929B2/ja active Active
- 2011-11-25 HU HUE14195788A patent/HUE030490T2/hu unknown
- 2011-11-25 DK DK14195788.6T patent/DK2857512T3/en active
- 2011-11-25 DK DK11791641.1T patent/DK2646549T3/en active
-
2013
- 2013-05-23 IL IL226536A patent/IL226536A/en active IP Right Grant
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2011337323B2 (en) | 2015-11-26 |
| CA2819423C (en) | 2020-12-22 |
| AU2011337323A1 (en) | 2013-06-20 |
| EP2857512B1 (en) | 2016-06-29 |
| JP2014500727A (ja) | 2014-01-16 |
| US20140004607A1 (en) | 2014-01-02 |
| CN103459596A (zh) | 2013-12-18 |
| AU2011337323A2 (en) | 2013-07-11 |
| DK2857512T3 (en) | 2016-10-03 |
| JP6084929B2 (ja) | 2017-02-22 |
| US9150854B2 (en) | 2015-10-06 |
| CN103459596B (zh) | 2016-12-14 |
| EP2857512A1 (en) | 2015-04-08 |
| DK2646549T3 (en) | 2015-05-26 |
| ES2536638T3 (es) | 2015-05-27 |
| WO2012074385A1 (en) | 2012-06-07 |
| EP2646549B1 (en) | 2015-02-18 |
| IL226536A (en) | 2016-03-31 |
| CA2819423A1 (en) | 2012-06-07 |
| EP2646549A1 (en) | 2013-10-09 |
| ES2588482T3 (es) | 2016-11-03 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP1963505B1 (en) | Improved targeted nucleotide exchange with propynyl modified oligonucleotides | |
| DK2646549T3 (en) | Targeted DNA change | |
| US20100223691A1 (en) | Targeted nucleotide exchange with improved modified oligonucleotides | |
| US20170121706A1 (en) | Targeted alteration of dna with oligonucleotides | |
| US20110312094A1 (en) | Use of double stranded rna to increase the efficiency of targeted gene alteration in plant protoplasts | |
| WO2011078662A1 (en) | Dsrna for improved genetic modification of plant dna |