HU220116B - A Neisseria meningitidis transzferin-receptorának Tbp2-fragmentumai - Google Patents

A Neisseria meningitidis transzferin-receptorának Tbp2-fragmentumai Download PDF

Info

Publication number
HU220116B
HU220116B HU9600210A HU9600210A HU220116B HU 220116 B HU220116 B HU 220116B HU 9600210 A HU9600210 A HU 9600210A HU 9600210 A HU9600210 A HU 9600210A HU 220116 B HU220116 B HU 220116B
Authority
HU
Hungary
Prior art keywords
sequence
amino acid
polypeptide
tbp2 subunit
type
Prior art date
Application number
HU9600210A
Other languages
English (en)
Other versions
HUT75992A (en
Inventor
Eric Jacobs
Michele Legrain
Ling Lissolo
Véronique Mazarin
Marie-José Bernadette Jacqueline Millet
Original Assignee
Pasteur Merieux Serums Vaccins
Transgene S.A.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Pasteur Merieux Serums Vaccins, Transgene S.A. filed Critical Pasteur Merieux Serums Vaccins
Publication of HUT75992A publication Critical patent/HUT75992A/hu
Publication of HU220116B publication Critical patent/HU220116B/hu

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/22—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Neisseriaceae (F)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Description

A találmány tárgyát Neisseria meningitidis transzferrin-receptorának Tbp2 alegységéből származó polipeptidek képezik, továbbá a polipeptideket kódoló izolált DNS-fragmentumok, a polipeptideket tartalmazó gyógyászati készítmények, valamint a polipeptidek első do- 5 ménjében található, meghatározott epitópokat felismerni képes monoklonális ellenanyagok.
A fenti polipeptidek alkalmazhatók terápiás célra, különösen bakteriális eredetű agyhártyagyulladás elleni vakcinázás céljára.
Általánosságban, az agyhártyagyulladás (meningitis) lehet vírus vagy bakteriális eredetű. A baktériumok közül elsősorban a N. meningitidis és a Haemophilus influenzáé tehető felelőssé, amelyek külön-külön a bakteriális eredetű meningitis esetek körülbelül 40%-át, illetve 50%-át okozzák. Franciaországban évente körülbelül 600-800 N. meningitidis okozta agyhártyagyulladásos esetet jegyeznek fel. Az Egyesült Államokban az esetek száma évente körülbelül 2500-3000.
A N meningitidis fajt a tokpoliszacharidák természe- 20 te alapján szerocsoportokra osztjuk. Bár tucatnyi szerocsoport létezik, az agyhártyagyulladásos esetek 90%-át 3 szerocsoport, az A, B és C szerocsoport okozza.
Az N meningitidis A és C szerocsoportok által okozott agyhártyagyulladás megelőzésére hatékony, 25 tokpoliszacharidákon alapuló vakcinák állnak rendelkezésre. Ezek a poliszacharidák 2 év alatti gyerekekben kismértékű immunogenitással rendelkeznek, vagy egyáltalán nem rendelkeznek immunogén hatással, és nem hoznak létre immunmemóriát. Ezek a hátrányok áthidal- 30 hatók azonban oly módon, hogy a fenti poliszacharidokat hordozóproteinekkel konjugáljuk.
Ezzel szemben, a N. meningitidis B csoportjának poliszacharidája emberben kismértékű immunogenitást mutat vagy egyáltalán nem immunogén, függetlenül at- 35 tói, hogy az konjugált formában van-e. Igen előnyös lenne tehát N. meningitidis, különösen a B csoport által okozott agyhártyagyulladással szemben alkalmazható, nem poliszacharidán alapuló vakcinák kifejlesztése.
A fenti célra javasolták különböző, N. meningitidis 40 külső membránproteinek alkalmazását. Ebben az összefüggésben, kitüntetett figyelem irányult a humán transzferrin membránreceptorára.
Általánosságban, a baktériumok nagy része szaporodásához vasat igényel, és ennek a fémnek a megszerző- 45 sére specifikus rendszerek fejlődtek ki. Ami közelebbről a N. meningitidist illeti, amely szigorúan emberi kórokozó, a vas csak humán vastranszport-proteinekről, például transzferrinről vagy laktoferrinről szerezhető meg, mivel a szabad formában található vas mennyisé- 50 ge emberben elhanyagolható (10~18 mol/l nagyságrendben van) - mindenesetre nem elegendő a baktériumok szaporodásának elősegítésére.
A N meningitidis receptorral rendelkezik tehát a humán transzferrin és a humán lakotoferrin számára, amely lehetővé teszi számára a fenti vaskelátor proteinek megkötését, majd a növekedéséhez szükséges vas felvételét.
A N. meningitidis B16B6 törzs transzferrin-receptorát Schryvers és munkatársai membránkivonatból tisztí10 tották (WO 90/12591). Ez a protein tisztított állapotban, úgy tűnik lényegében két típusú polipeptidből áll: egy magasabb, 100 kDa látszólagos molekulatömeggel rendelkező polipeptidből, valamint egy alacsonyabb, körülbelül 70 kDa látszólagos molekulatömeggel rendelkező 15 polipeptidből, amint azt SDS jelenlétében végzett poliakril-amid-gélelektroforézis alapján meghatározták.
A közelebbről Schryvers által végzett tisztítási eljárás termékét önkényes meghatározás alapján, a leírásban transzferrin-receptomak, az azt alkotó polipeptideket pedig alegységeknek nevezzük. Az alábbi leírásban a nagyobb molekulatömeggel rendelkező alegységet Tbp 1-nek, az alacsonyabb molekulatömeggel rendelkező alegységet Tbp2-nek nevezzük.
Ezenfelül, Schryvers és munkatársai úttörő munkássága óta kimutatták, hogy legalább két, eltérő felépítésű transzferrin-receptorral rendelkező törzstípus létezik. Ezt néhányszor tíz, különböző eredetű N. meningitidis törzsből készített membránextraktum vizsgálatával mutatták ki. A fenti membránextraktumokat először SDS jelenlétében poliakrilamid-gélelektroforézisnek vetették alá, majd elektrotranszferes eljárással nitrocellulóz membránokra vitték át. A fenti nitrocellulóz membránokat az alábbi körülmények mellett inkubálták:
a) a B16B6 jelű, másképp IM2394 jelű N. meningitidis törzsből tisztított transzferrin-receptorral szemben nyúlóan előállított antiszérum jelenlétében;
b) az M982 jelű, másképp IM2169 jelű N. meningitidis törzsből tisztított transzferrin-receptorral szemben nyúlban előállított antiszérum jelenlétében; vagy
c) peroxidázzal konjugált humán transzferrin jelenlétében.
Az a) és b) esetekben, a transzferrinreceptor-alegységek felismerését peroxidázzal konjugált, antinyúl-immunglobulin ellenanyag, majd az enzim szubsztrátjának hozzáadásával tettük láthatóvá.
Az alábbi, 1. és 2. táblázatok néhány, a szemléltetést szolgáló törzs SDS jelenlétében, 7,5%-os gélen végzett poliakrilamid-gélelektroforézise alapján meghatározott profilját mutatják. A csíkokat kilodaltonban (kD) kifejezett látszólagos molekulatömegükkel jellemeztük.
1. táblázat
Törzsek
2394 (B; 2a; P1.2:L2,3) 2228 (B; nd) 2170 (B; 2a:Pl.l:L3) 2234 (Y; nd) 2154 (C; nd) 2448 (B; nd) 550 (C; 2a:) 179 (C; 2a:Pl,2)
Kimutatás Anti-2394-receptor antiszérummal 93 93 99
68 69 69
HU 220 116 Β
7. táblázat (folytatás)
Törzsek
2394(B; 2a; Pl.2:L2,3) 2228 (B; nd) 2170 (B; 2a:Pl.l:L3) 2234 (Y; nd) 2154 (C; nd) 2448 (B; nd) 550 (C; 2a:) 179 (C; 2a:Pl,2)
Kimutatás anti-2169-receptor antiszérummal 93 93 99
Kimutatás peroxidáz-transzferrinnel 68 69 69
Megjegyzés: a zárójelekben sorrendben az alábbi adatokat jelöltük: szerocsoport, szerotípus, altípus és immunotípus. n. d.: nem tipizált.
2. táblázat
Törzsek
2169 (B:9:P1.9) 1000 (B:nd) 1604 (B:nd) 132 (C:15:P1.16) 1001 (A:4:P1.9) 876 (B:19:P1.6) 1951 (A:nd) 2449 (B:nd) 867 (B:2b:P1.2)
Kimutatás anti- 2399-receptor antiszérummal 96 98 98 98 98 96 94 94 93
Kimutatás 96 98 98 98 98 96 94 94 93
Anti- 2169-receptor antiszérummal 87 85 83 81 79 88 87 85 85
Kimutatás peroxidáz- transzferrinnel 87 85 83 81 79 88 87 85 85
Megjegyzés: a zárójelekben sorrendben az alábbi adatokat jelöltük: szerocsoport,, szerotípus,, altípus és immunotípus.
A táblázatok első két sorában bemutatott eredmények szerint, két típusú törzs létezik: az első típusba (1. táblázat) olyan törzsek tartoznak, amelyekben az antiIM2394-receptor antiszérum az alkalmazott kísérleti körülmények mellett mindkét alegységet felismeri, míg az anti-IM2169-receptor antiszérum csak a magasabb molekulatömegű alegységet ismeri fel.
A második típus (2. táblázat) olyan törzseket tartalmaz, amelyekben az anti-IM2169-receptor antiszérum az alkalmazott kísérleti körülmények mellett mindkét alegységet felismeri, míg az anti-IM2394-receptor antiszérum csak a magasabb molekulatömegű alegységet ismeri fel.
Következésképp, az alacsonyabb molekulatömegű alegység vonatkozásában antigénszerkezeti változatosság mutatható ki. Ez a változatosság azonban korlátozott, mivel - szemben Griffiths és munkatársai javaslatával [FEMS Microbiol. Lett. 69, 31 (1990)] - a törzsek két fő típus közt oszlanak meg.
A fentiekkel összhangban, az alábbi leírásban IM2169 típusú vagy IM2394 típusú törzsekről beszélünk.
A 2. táblázatban említett törzsek mellett, IM2169 típusú törzsek például a következő törzsek: S3032 (12, Pl.12.16), 6940 (19, Pl. 6), M978 (8, Pl. 1, 7) 2223 (B: nd), 1610 (B: nd)C708 (A: 4,P1.7), M981(B:4), amelyet 891 törzsnek is nevezünk, valamint a 2996 törzs (B: 2b, P1.2). A S3032, M978 és M981 törzseket Dr. J. Poolmantól kaptuk ajándékba (RIVM, Bilthoven,
Hollandia), a C708 törzset pedig Dr. Achtmantól kaptuk ajándékba (Max Planck Institute, Berlin, Németország).
Az IM2154 törzset (C szerocsoport), mint IM2394 típusú törzset, példaként említjük.
A fenti eredmények alapján lehetségesnek látszott az a feltevés, hogy a nagyobb molekulatömegű alegységből valamennyi N. meningitidis fertőzéssel szemben hatékony vakcina állítható elő, függetlenül attól a törzstől, amelyből a receptor származik, mivel ezt az alegységet mindkét típusú antiszérum felismeri. Úgy tűnik azonban, hogy nem ez a helyzet, amennyiben a nagy molekulatömegű alegység nem képes neutralizáló típusú ellenanyagok képződését kiváltani. A két receptoralegység közül csak a kisebbik (Tbp2) képes betölteni ezt a funkciót.
Az IM2169 és az IM2394 törzsek Tbp2 alegységeinek aminosavszekvenciáját, valamint a megfelelő DNS-fragmentumok szekvenciáját az EPA 586 266 számú európai közzétételi irat tárja fel (a bejelentés napja: 1994. március 9.). Ezek a szekvenciák megismétlődnek a találmány szerinti 1-4. azonosító számú szekvenciákban.
Az 5-10. azonosító számú szekvenciák az IM2169 típusú törzsek Tbp2 alegységeinek, nevezetesen, az M978, 6940 és S3032 törzsek Tbp2 alegységeinek szekvenciáit tartalmazzák.
Kimutattuk továbbá, hogy az IM2154 (IM2394 típusú) Tbp2 alegység szekvenciája két aminosav vonatko3
HU 220 116 Β zásában, a 306. és 510. pozíciókban eltér az IM2394 Tbp2 alegység szekvenciájától.
Azt találtuk, hogy a Tbp2 alegység, függetlenül attól a törzstől, amelyből származik, strukturális értelemben három fő doménból áll, melyek közül legalább egy specifikus tulajdonságokkal kapcsolatos. Az IM2169 Tbp2 és IM2394 Tbp2 doménjainak meghatározását az alábbi táblázatban adtuk meg, a különböző doménokat határoló aminosavak pozíciók megjelölésével, az 1. és 3. azonosító számú szekvenciák szerinti számozás alkalmazásával.
Tbp2 IM2169 Tbp2 IM2394
N-terminális dómén, vagy első dómén 1-345 1-325
Kapocs („hinge”) dómén, vagy második dómén 346-543 326-442
C-terminális dómén, vagy harmadik dómén 544-691 443-579
Ez a meghatározás hasonlóképp vonatkoztatható valamennyi IM2169 típusú vagy IM2394 típusú Tbp2 alegységre, miután egy IM2169 típusú vagy IM2394 típusú szekvenciát a referenciaszekvenciával a maximális homológia elérésig egybevetettünk. A szemléltetés kedvéért, és az 1. ábrára utalva tehát, az M978 törzs Tbp2 alegységét alkotó doménok pozíciói a következők: első dómén (1-346.), második dómén (347-557.), harmadik dómén (558-705.).
Kimutattuk továbbá, hogy az N-terminális dómén vagy első dómén és/vagy a kapocsdomén vagy második dómén szükséges és elegendő emberben vakcinázás hatásainak kiváltásához; tehát nem szükséges a Tbp2 teljes formájának alkalmazása. Közelebbről azt találtuk, hogy az első dómén gyakorlatilag a teljes transzferrinkötő helyet tartalmazza, igen valószínű tehát, hogy a külvilággal érintkezik, következésképp, vakcinázás céljára alkalmas összetevő.
Végül azt találtuk, hogy az IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjának bizonyos régiói általában variábilisak és immundominánsak. Vakcinák előállításának vonatkozásában két megközelítési mód lehetséges : vagy úgy tekintjük, hogy az immundomináns epitóp elfedheti a vakcinázás szempontjából lényeges egyéb epitópokat, következésképp azokat deletáljuk; vagy a fenti variabilitást felhasználjuk úgy, hogy csak a fenti régiókat tartjuk meg a vakcinában.
A találmány tárgyát képezik tehát egy IM2169 vagy IM2394 típusú N. meningitidis törzs transzferrin-receptorát alkotó Tbp2 alegység aminosavszekvenciájából származó aminosavszekvenciával rendelkező polipeptidek, amelyekben az első, második és harmadik dómén pozícióját a megfelelő, találmány szerinti törzs - az IM2169 vagy IM2394 törzs Tbp2 alegységének szekvenciájával a maximális homológia eléréséig történő egyeztetés alapján határoztuk meg; és amelyekben az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység doménjainak legalább egyikét teljes egészében vagy részben deletáltuk, feltéve, hogy az első és második dómén nem deletált egyidejűleg teljes egészében.
„Egy másik szekvenciából származó szekvenciának” nyilvánvalóan olyan szekvenciát nevezünk, amelyet az említett szekvenciából elméleti következtetés útján kaptunk.
Közelebbről, a találmány szerinti polipeptid egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység aminosavszekvenciájából származó aminosavszekvenciával rendelkezik, amely szekvenciát a következő módokon kaphatjuk meg:
(i) az említett Tbp2 alegységet alkotó, felsorolt doménok legalább egyikének teljes vagy részleges deletálásával, közelebbről a második vagy harmadik dómén deletálásával; előnyösen a harmadik dómén, vagy a második és harmadik dómén teljes vagy részleges deletálásával;
(ii) az első és harmadik dómén teljes deletálásával; vagy (iii) a harmadik dómén teljes deletálásával, és az első dómén részleges deletálásával, adott esetben a második dómén részleges deletálásával.
A találmány szerinti polipeptid előnyösen a harmadik dómén részleges, csaknem teljes vagy teljes delécióját, előnyösebben teljes delécióját tartalmazza. Ebben az esetben, az első és második dómén egymástól függetlenül teljes egészében megtartható, vagy részlegesen vagy teljes egészében deletálható.
A következő kombinációk lehetségesek (feltéve, hogy 1, 2 és 3 az első, második és harmadik teljes domént jelenti, és O, valamint Δ részleges vagy teljes deléciót jelentenek).
1,2, Δ3; 1, 02, Δ3; 1, Δ2, Δ3;
01,2, Δ3; 01, 02, Δ3; 01, Δ2, Δ3;
Δ1,2, Δ3; Δ1, 02, Δ3;
1,2, 03; 1,02, 03; 1,Δ2, 03;
01,2, 03; 01, 02, 03; 01, Δ2,03;
Δ1,2,03;Δ1,Ο2, 03.
A találmány tárgyához tartoznak ezenfelül olyan polipeptidek, amelyeket egy IM2169 típusú Tbp2 alegységből a második dómén részleges deléciójával kaptunk, amely teljes egészében vagy gyakorlatilag teljes egészében tartalmazza az első és harmadik domént; azaz, egy „1,02, 3” kombináció. („Gyakorlatilag teljes egészében megtartott dómén” alatt itt, és az ezt követő leírásban, igen kisszámú pozícióban, körülbelül ötnél nem több pozícióban módosított domént értünk.) A találmány szerinti polipeptid megfelelhet a következő kombinációnak is: „01, 02, 3”; az első dómén részleges deléciója előnyösen az IM2169 törzs Tbp2 alegységével homológ, az 1. aminosavpozíciótól körülbelül a 40. aminosavpozícióig teijedő régiót érinti.
Amennyiben a találmány szerinti polipeptid egy IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjának részleges deléciójából származik, ez a részleges deléció előnyösen a második dómén egy vagy több olyan régióját érinti, amely (amelyek) homológ (homológok) az IM2169 törzs szekvenciájának alábbi régióival:
(i) a 362-379. aminosavpozíciók közti régióval;
(ii) a 418-444. aminosavpozíciók közti régióval;
(iii) a 465-481. aminosavpozíciók közti régióval;
(iv) az 500-520. aminosavpozíciók közti régióval.
HU 220 116 Β
A részleges deléció előnyösen egyidejűleg érinti mind a négy fenti, (i)—(iv) jelű régiót.
Amennyiben a találmány szerinti polipeptidet egy IM2169 típusú Tbp2 alegység harmadik doménjának teljes, valamint második doménjának gyakorlatilag teljes deléciójával kaptuk, és a polipeptid tartalmazza a teljes első domént, vagy abban az első dómén N-terminális végét deletáltuk, a második dómén gyakorlatilag teljes deléciója a következő régiókat fedi át:
- abban az esetben, ha a polipeptid egy IM2169 típusú Tbp2 alegységből van származtatva, az IM2169 Tbp2 alegység második doménjának 346-361. aminosavpozícióitól az 543. aminosavpozícióig terjedő régiókkal homológ régiókat;
- abban az esetben, ha a polipeptid egy IM2394 típusú Tbp2 alegységből van származtatva, az IM2394 Tbp2 alegység második doménjának 326-341. aminosavpozícióitól a 442. aminosavpozícióig terjedő régiókkal homológ régiókat.
Amennyiben a találmány szerinti polipeptid egy IM2169 típusú vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjának részleges deléciójából származik, ez a részleges deléció előnyösen a dómén egészét vagy egy olyan részét érinti, amely régió:
(i) az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység első doménjának 1-281. aminosavpozíciói közti régiójával homológ; vagy (ii) az említett IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjának 1-266. aminosavpozíciói közti régiójával homológ.
Az előbbiek szemléltetésére a következő régiókat érintő, találmány szerinti deléciókat említjük:
(i) az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység első doménjával homológ, az 1. aminosavpozíciótól a körülbelül 40. aminosavpozícióig terjedő régiót; vagy (ii) az említett IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjával homológ, az 1. aminosavpozíciótól a körülbelül 45. aminosavpozícióig terjedő régiót.
Az IM2169 típusú vagy IM2394 típusú szekvencia, amelyből a találmány szerinti polipeptid származik, bizonyos fokú homológiát mutat a megfelelő, IM2169 vagy IM2394 szekvenciával, előnyösen legalább 70-75%-os homológiát, előnyösebben legalább 80%os homológiát, és még előnyösebben legalább 90%-os homológiát.
A találmány legelőnyösebb megvalósítási módja szerint, a találmány szerinti polipeptid az, IM2169 vagy IM2394 Tbp2 alegység szekvenciájával rendelkezik.
A homológia foka könnyen meghatározható oly módon, hogy a szekvenciákat úgy állítjuk egymás mellé, hogy a lehető legnagyobb fokú homológiát érjük el; ebből a célból szükség lehet üres pozíciók mesterséges beiktatására, amint azt az 1-4. ábrákon, valamint a 8-10. ábrákon látjuk. Miután optimális homológiát értünk el, a homológia fokát úgy határozzuk meg, hogy összeszámoljuk azokat a pozíciókat, amelyekben a két szekvenciában azonos aminosavak találhatók, és ezt a pozíciók számának teljes összegéhez viszonyítjuk.
A kombinációk különösen nagy száma következtében nehézkes lenne a homológ szekvenciáknak az általánostól eltérő módon történő leírása. Szakember számára ismertek azonban azok az általános szabályok, amelyek lehetővé teszik egy aminosavnak másik aminosavval történő helyettesítését anélkül, hogy a protein biológiai vagy immunológiai funkciói károsodnának.
A találmány szerinti polipeptidek szekvenciája előnyösen legalább 70-75%-os homológiát, előnyösebben legalább 80%-os homológiát, még előnyösebben legalább 90%-os homológiát és legelőnyösebben 100%-os homológiát mutat a következő szekvenciákkal:
(i) az 1. azonosító számú szekvencia szerinti 1-345. aminosavpozíciók közti szekvenciával;
(ii) a 3. azonosító számú szekvencia szerinti 1-442. aminosavpozíciók közti szekvenciával;
(iii) az 1. azonosító számú szekvencia szerinti 1-691. vagy 1-543. aminosavpozíciók közti szekvenciákkal, amelyekben a 362-379., 418-444., 465-481. és 500-520. pozícióknak megfelelő régiók deletáltak;
(iv) az 1. azonosító számú szekvencia szerinti 346-543. aminosavpozíciók közti szekvenciával.
A fenti meghatározás szerint, a találmány tárgyát képezik az alábbi jellemzőkkel rendelkező polipeptidek:
(i) olyan találmány szerinti polipeptidek, amelyek szekvenciája lényegében megegyezik az 1., 5., 7., 9., 36. vagy 38. azonosító számú szekvencia szekvenciájával, az 1. aminosavpozíciótól a 350., 351., 354., 358., 322. vagy 346. aminosavpozícióig terjedően;
(ii) olyan találmány szerinti polipeptidek, amelyek szekvenciája lényegében megegyezik az 3. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 330. aminosavpozícióig terjedő szekvenciával;
(iii) olyan találmány szerinti polipeptidek, amelyek szekvenciája lényegében megegyezik:
az 1. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 691. aminosavpozícióig teijedő szekvenciával, amelyből azonban a 362-379., 418-444., 465-481. és 500-520. aminosavpozícióknak megfelelő régiók deletáltak;
az 5. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 705. aminosavpozícióig teijedő szekvenciával, amelyből azonban a 365-382.,
421- 453., 474-495. és 514-534. aminosavpozícióknak megfelelő régiók deletáltak;
a 7. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 693. aminosavpozícióig teijedő szekvenciával, amelyből azonban a 366-383.,
422- 448., 469-485. és 504-524. aminosavpozícióknak megfelelő régiók deletáltak;
a 9. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 699. aminosavpozícióig teijedő szekvenciával, amelyből azonban a 372-389., 428-454., 475-491. és 510-529. aminosavpozícióknak megfelelő régiók deletáltak;
a 36. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 699. aminosavpozícióig teijedő szekvenciával, amelyből azonban a 339-356., 395-421., 443-458. és 477-497. aminosavpozícióknak megfelelő régiók deletáltak; vagy a 38. azonosító számú szekvencia szerinti, az 1. aminosavpozíciótól a 699. aminosavpozícióig teijedő
HU 220 116 Β szekvenciával, amelyből azonban a 363-380., 429-445., 467-482. és 501-521. aminosavpozícióknak megfelelő régiók deletáltak.
(iv) olyan találmány szerinti polipeptidek, amelyek szekvenciája lényegében megegyezik:
az 1. azonosító számú szekvencia szerinti
346- 543. aminosavpozícióknak megfelelő szekvenciával;
az 5. azonosító számú szekvencia szerinti
347- 557. aminosavpozícióknak megfelelő szekvenciával;
a 7. azonosító számú szekvencia szerinti 350-557. aminosavpozícióknak megfelelő szekvenciával;
a 9. azonosító számú szekvencia szerinti 354-551. aminosavpozícióknak megfelelő szekvenciával;
a 36. azonosító számú szekvencia szerinti 323-521, aminosavpozícióknak megfelelő szekvenciával;
a 38. azonosító számú szekvencia szerinti 345-544. aminosavpozícióknak megfelelő szekvenciával.
Az (i)—(iv) pontok szerinti meghatározásoknak megfelelő polipeptideket ismertetünk az alábbi példákban.
A találmány szerinti polipeptid legalább 10 aminosavból álló szekvenciát, előnyösen legalább 20 aminosavból álló szekvenciát, előnyösebben legalább 50 aminosavból álló szekvenciát, és legelőnyösebben legalább 100 aminosavból álló szekvenciát tartalmaz.
Nyilvánvaló, hogy a találmány szerinti polipeptidek tartalmazhatnak egyéb szekvenciákat is, amelyek nem mutatnak homológiát az IM2169 és IM2394 törzsek Tbp2 alegységeinek szekvenciáival; mely utóbbi szekvenciákat az 1. és 3. azonosító számú szekvenciák ismertetnek, az 1. pozícióban található aminosavtól a Cterminális pozícióban található aminosavig terjedően.
Általánosságban, az egyéb szekvencia lehet bármely, a Tbp2 alegységtől eltérő polipeptid szekvenciája.
Ilyen egyéb szekvencia lehet például egy, a találmány szerinti polipeptid N-terminális végén található szignálpeptidet kódoló szekvencia. Szignálpeptideket ismertetnek például az 1 -4. azonosító számú szekvenciák. Kiemelendő továbbá, hogy alkalmas heterológ szignálszekvencia lehet például egy lipoproteint kódoló gén szignálszekvenciája.
A találmány tárgyát képezik továbbá:
(i) a találmány szerinti polipeptideket kódoló izolált DN S-fragmentumok;
(ii) a találmány szerinti DNS-fragmentumok legalább egyikét tartalmazó expressziós kazetták, amelyekben a DNS-fragmentumok megfelelő gazdasejtben történő expresszálódásukat lehetővé tevő elemek szabályozása alatt állnak;
(iii) eljárások a találmány szerinti polipeptidek előállítására, amely eljárások szerint, a találmány szerinti expressziós kazettát tartalmazó gazdasejteket tenyésztünk.
„Izolált DNS-fragmentum” alatt azt értjük, hogy a találmány szerinti DNS-fragmentum nincs beépülve a teljes Tbp2 alegységet kódoló DNS-fragmentumba.
Egy expressziós kazettában a találmány szerinti DNS-fragmentum kombinálva lehet egy heterológ szignálpeptidet kódoló DNS-régióval vagy az említett DNS-fragmentum által kódolt polipeptiddel, attól függően, hogy a polipeptid szekretálódását el kívánjuk-e érni. Előnyösen szekréciót kívánunk elérni.
Az említett elemek, például heterológ szignálpeptidet (szignálrégiót) vagy promotert kódoló DNS-régiók nagyszámban léteznek, és azok szakember számára ismertek. Szakembert általános ismeretei képessé teszik adott szignálrégiók vagy promoterek kiválasztására, amelyek olyan gazdasejtben alkalmazhatók, amelyben az expresszálódást el kívánjuk érni.
A találmány szerinti eljárás céljára alkalmazható gazdasejt lehet emlőssejt, baktérium vagy élesztő, melyek közül a két utóbbi előnyös. Az adott sejtvonal kiválasztása ebben az esetben is szakemberen múlik.
A találmány tárgyát képezik ezen felül monoklonális ellenanyagok:
(i) amelyek képesek felismerni egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjében található epitópot; ahol az említett epitóp szekvenciahomológiát mutat az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található valamely felsorolt epitóp szekvenciájával: YKGTW (32. azonosító számú szekvencia), EFEVDFSDKTIKGTL (33. azonosító számú szekvencia), EGGFYGPKGEEL (34. azonosító számú szekvencia), valamint AVFGAK (35. azonosító számú szekvencia); és adott esetben, (ii) nem képesek felismerni az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység harmadik doménjében található olyan epitópokat, amelyek szekvenciája homológ az első doménban felismert epitópéval.
A fenti (ii) pont szemléltetésére kiemelhetjük például, hogy az IM2394 törzs Tbp2 alegységének harmadik doménjében található, az első doménban található fenti szekvenciákkal egyenként homológiát mutató szekvenciák a következő pozíciókban találhatók: 443-447., 472-485., 537-548. és 568-573.
A találmány szerinti monoklonális ellenanyagok előnyösen:
(i) képesek felismerni egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjében található régiót; amelynek szekvenciája homológ az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található EGGFYGPKGEEL-szekvenciával; és adott esetben, (ii) nem képesek felismerni az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység harmadik doménjében található, a felismert epitópnak megfelelő epitópot, amelynek szekvenciája homológ az IM2394 törzs Tbp2 alegységének harmadik doménjében található SGGFYGKNAIEM-szekvenciával.
A találmány szerinti előnyös monoklonális ellenanyagok:
(i) képesek felismerni az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található GFYGPK-epitópot; és (ii) nem képesek felismerni az említett IM2394 törzs Tbp2 alegységének harmadik doménjében található megfelelő epitópot.
HU 220 116 Β
Ilyen monoklonális ellenanyagokról kimutattuk, hogy azok baktericid hatásúak, következésképp, alkalmazhatók lehetnek aktív hatóanyagként passzív immunoterápiában felhasznált gyógyászati készítményekben, N. meningitidis-fertőzés leküzdésére.
Végül, a találmány tárgyát képezik aktív hatóanyagként a találmány szerinti polipeptidek legalább egyikét tartalmazó gyógyászati készítmények.
A találmány szerinti gyógyászati készítmények alkalmazhatók emberben N. meningitidisszel szembeni immunválasz kiváltására, többek között, vakcinázással kiváltható hatás elérésére, hogy emberben N. meningztózj-fertőzéssel szemben - megelőzés vagy terápia során - védettséget hozzunk létre.
A találmány szerinti készítmények aktív hatóanyagként előnyösen legalább két találmány szerinti polipeptidet tartalmaznak; azaz, legalább egy olyan első polipeptidet, amelynek szekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegységből van származtatva, és legalább egy olyan második polipeptidet, amelynek szekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva. További lehetőség szerint, a találmány szerinti készítmény tartalmazhat legalább egy olyan polipeptidet, amelynek szekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegységből van származtatva, valamint legalább egy IM2394 típusú Tbp2 alegységet.
Az IM2394 típusú polipeptid, mint a gyógyászati készítmény összetevője vonatkozásában, igen előnyös, ha ez a polipeptid az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjával homológ szekvencia egészét vagy annak egy részét tartalmazza az adott törzsből, amelyből származik. A szekvencia előnyösen megtartandó része az IM2394 törzs Tbp2 alegysége 267-325. aminosavpozícióinak megfelelő régióval homológ régió. Egy ilyen polipeptid szekvenciája származhat egy IM2394 típusú Tbp2 alegységből, közelebbről, azt megkaphatjuk az IM2394 típusú Tbp2 alegység második vagy harmadik doménjét alkotó régió teljes vagy részleges deletálásával.
A két típusú összetevőt (IM2394 típusú és IM2169 típusú összetevőt) tartalmazó gyógyászati készítmény céljára tehát a következő IM2394 típusú polipeptidek alkalmazása különösen előnyös:
1,2, 03; 1, 2, Δ3; 1,02, Δ3; 1, Δ2, Δ3;
01,2, 03; 01, 2, Δ3; 01, 02, Δ3, 01, Δ2, Δ3.
Az IM2169 típusú polipeptid, mint a gyógyászati készítmény összetevője vonatkozásában két előnyös megoldás lehetséges:
(A) - Az IM2394 típusú polipeptidet egy olyan polipeptiddel kombináljuk, amely az IM2169 Tbp2 alegység első doménjával homológ szekvencia egészét vagy részét tartalmazza az adott törzsből, amelyből származik. Ebben az esetben, a szekvencia előnyösen megtartandó része az IM2169 törzs Tbp2 alegységének a 282. aminosavpozíciótól a 345. aminosavpozícióig terjedő régiójával homológ régió. Egy ilyen polipeptid szekvenciája származhat egy IM2169 típusú Tbp2 alegységből, közelebbről, azt megkaphatjuk az IM2169 típusú Tbp2 alegység második vagy harmadik doménjét alkotó régió teljes vagy részleges deletálásával.
Ennek a lehetőségnek megfelelően, és a két típusú összetevőt (IM2394 típusú és IM2169 típusú összetevőt) tartalmazó gyógyászati készítmény céljára tehát a következő IM2169 típusú polipeptidek alkalmazása különösen előnyös:
1, 2, 03; 1, 2, Δ3; 1, 02, Δ3; 1, Δ2, Δ3;
01, 2, 03; 01,2, Δ3; 01, 02, Δ3; ΟΙ, Δ2, Δ3;
1, 02, 3; 01, 02, 3.
A két utóbbi lehetőség vonatkozásában (1, 02, 3; és Ol, 02, 3), a második dómén részleges deletálása igen előnyösen a második doménnek egy vagy több olyan régióját érinti, amely az IM2169 szekvencia következő régióival homológ:
(i) a 362-379. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
(ii) a 428-444. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
(iii) a 465-481. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
(iv) az 500-520. aminosavpozícióknak megfelelő régióval.
Előnyösen, a részleges deletálás mind a négy, (i)—(iv) jelű fenti régiót egyidejűleg érinti.
(B) - Egy további lehetőség szerint, az IM2394 típusú polipeptidet egy olyan polipeptiddel kombináljuk, amelynek szekvenciáját az IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjának részleges, és az első vagy harmadik doménjának teljes, vagy csaknem teljes deletálásával kaptuk, amely azonban a második domént teljes egészében tartalmazza (Δ1, 2, Δ3). A fenti megoldás szerint, a két típusú összetevőt (IM2394 típusú és IM2169 típusú összetevőt) tartalmazó gyógyászati készítmény előnyösen több IM2169 típusú (Δ1, 2, Δ3) polipeptidet tartalmazhat; például a következő törzsekből származó két vagy több, (Δ1, 2, Δ3) típusú polipeptidet: IM2169, M978,6940 és S3032.
A találmány szerinti gyógyászati készítményt előállíthatjuk szokásos eljárásokkal. Közelebbről, a találmány szerinti polipeptidet (polipeptideket) gyógyászatilag elfogadható adjuvánssal, hígítóanyaggal vagy hordozó-segédanyaggal kombinálhatjuk. A találmány szerinti készítményeket bármely, vakcinák esetében szokásos módon beadhatjuk, elsősorban bőr alá, izomba vagy vénába, például injektálható szuszpenzió formájában. Az adagolást végezhetjük egyetlen dózis során, vagy bizonyos időközöket követően egy vagy több alkalommal ismételt dózisokban. A megfelelő dózis különböző paraméterektől függ, például a kezelendő egyéntől vagy az adagolás módjától.
A találmány tárgya megvalósíthatóságának vonatkozásában megemlíthetjük, hogy az IM2394 és IM2169 jelű N. meningitidis törzsek mindenki számára hozzáférhetőek a „Collection Nationale de Culture des Microorganismes” (Mikroorganizmus Tenyészetek Nemzeti Gyűjteménye, CNCM) gyűjteményéből („Pasteur Institute”, 25 rue du Dr Roux 75015, Párizs), LNP N 1511 és LNP N 1520 nyilvántartási szám alatt.
A találmány szerinti megoldást a pontosabb értelmezhetőség céljából a továbbiakban konkrét megvalósí7
HU 220 116 Β tási példákon, valamint a csatolt, 1-10. ábrákon keresztül kívánjuk szemléltetni.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a leírásokhoz csatolt ábrákat.
Az 1-3., 8. és 9. ábrák az M978, 6940, S3032, 5 BZ83 és BZ163 törzsek Tbp2 szekvenciáinak az IM2169 törzs Tbp2 szekvenciájával történő egyeztetését ábrázolják úgy, hogy maximális homológiát érjünk el.
A homológia foka az egyes esetekben a következő volt: 78,9%, 81,2%, 79,6%, 71,3% és 81,8%.
A 4. ábra az IM2169 (1), 6940 (2), 2223 (3), C708 (4), M978 (5), 1610 (6), 867 (7), S3032 (8) és 891 (9) törzsek Tbp2 alegységeinek kapocs- („hinge”) doménját (második doménját) alkotó szekvenciák egyeztetését ábrázolja úgy, hogy maximális homoló- 15 giát éqünk el. Az IM2169 szekvencia 2. azonosító számú szekvencia szerinti számozását dőlt számjegyekkel jelöltük. A találmány előnyös megvalósítási módjai szerint deletálható szekvenciákat vastag betűkkel jelöltük. „(C)” a konszenzusszekvenciát jelöli.
Az 5-7. ábrák a pTG5782, pTG5755 és pTG5783 plazmidok előállításának menetét ismertetik.
A 10. ábra az IM2169 (1), 2223 (2), 708 (3), M528 (4), 6940 (5), M978 (6), 1610 (7), S3032 (8), 867 (9), BZ83 (10), és BZ163 (11) törzsek Tbp2 alegységeinek 25 kapocs- („hinge”) doménját (második doménját) alkotó szekvenciák egyeztetését ábrázolja úgy, hogy maximális homológiát érjünk el. Az IM2169 szekvencia 2. azonosító számú szekvencia szerinti számozását dőlt számjegyekkel jelöltük. A találmány előnyös megvalósítási módjai szerint deletálható szekvenciákat vastag betűkkel jelöltük. „(C)” a konszenzus szekvenciát jelöli.
1. példa
Az 1. azonosító számú szekvencia szerinti szekvenciát 10 (IM2169) az 1. aminosavpoziciótól a 350. aminosavpozícióig terjedően tartalmazó T/2169 polipeptid (1,
02, Δ3; 1-350.)
l.A - A T/2169 polipeptidet (1-350.) kódoló DNSfragmentum előállítása A pTG 5782 vektor előállítása
Az EPA 586 266 számú európai közzétételi iratban ismertetett pTG3721 plazmidba helyspecifikus mutagenezissel egy HindlII restrikciós helyet iktattunk be a Tbp2 alegységet kódoló szekvenciától 3’-irányba, így kaptuk a pTG4704 plazmidot.
A pTG3721 plazmidból az RlpB jelű, szekréciós szignált kódoló szekvenciát tartalmazó fragmentumot, valamint az érett Tbp2 alegységet kódoló szekvencia elejétől a belső Haell-helyig terjedő fragmentumot PCReljárással amplifikáltuk, az OTG4915 és OTG4651 jelű láncindító oligonukleotidok alkalmazásával:
OTG4 915: AAACCCGGATCCGTTGCCAGCGCTGCCGT
Hae 11
OTG4651:
BspHI
TTTTTTCATC AGA Met Arg
CTG
Leu
TAT
Tyr
CTG
Leu
GCA Al a
ACA
Thr
TTG
Leu
TTG
Leu
TTA
Leu
TCT
Ser
GCG GTG TTA ATC ACC GCC GGG TGC CTG GGT GGC
Al a Val Leu Ile Thr Al a Gly Cys Leu Gly...
A szignálpeptidhasítási helye
GGC GGC AGT TTC
Ezt követően a PCR-fragmentumot BspHI és Haell enzimekkel emésztettük, és a pTG4704 plazmidnak a 40 Tbp2 alegységet kódoló régió 3’-végi részét tartalmazó HaelI-HindlII fragmentumával egyidejűleg, az EPA 586 266 közzétételi iratban ismertetett, Ncol és HindlII enzimekkel emésztett pTG3704 plazmidba inszertáltuk, így nyertük a pTG5768 plazmidot. 45
A pTG3721 plazmidból a Tbp2 alegység Nterminális részét kódoló szekvenciát tartalmazó fragmentumot PCR-eljárással amplifikáltuk, az OTG4928 és OTG5011 jelű láncindító oligonukleotidok alkalmazásával.
Sphl
OTG4928: GTG TTT TTG TTG AGT GCA TGC CTG GGT GGC Val Phe Leu Leu Ser Alá Cys Leu Gly Gly - a szignálpeptid hasítási helye.
OTG5011: TGCGCAAGCTTACAGTTTGTCTTTGGTTTTCGCGCTGCCG HindlII
A fenti PCR-fragmentumot Sphl és HindlII enzimekkel emésztettük, majd az EPA 586 266 közzétételi iratban ismertetett pTG4710 plazmidba inszertáltuk, így nyertük a pTG5740 plazmidot.
A pTG5740 plazmidnak a humán transzferrin- (hTf-) kötő domént kódoló szekvencia 3’-végi részét (az első domént kódoló régió 3’-részét) tartalmazó HaelI-HindlII fragmentumát, a pTG5768 plazmidnak az araB-promotert, az RlpB jelű szignálszekvenciát, valamint a Tbp2 alegység kódoló szekvenciájának elejét tartalmazó BamHI-Haell fragmentumával együtt, a BamHI és HindlII enzimekkel emésztett pTG3704 plazmidba inszertáltuk; így kaptuk a pTG5782 plazmidot. Ez a vektor tartalmazza az araB-promotert, valamint az RlpB jelű
HU 220 116 Β szekréciós szignált kódoló szekvenciát, a Tbp2 alegység N-terminális doménját kódoló szekvenciával (1-350.) fuzionáltatva.
l.B - A T/2169 polipeptid (1-350.) előállítása és tisztítása
A pTG5782 plazmiddal egy E. coli törzset (Xac-I) transzformáltunk. A transzformánsokat 37 °C-on, 0,5% szukcináttal, 50 pg/ml argininnel, és 100 pg/ml ampicillinnel kiegészített M9 tápfolyadékban tenyésztettük. Az exponenciális fázis elértével a tenyészethez 0,2 arabinózt (indukálószert) adtunk. Egyórás indukálást követően, a sejteket eltávolítottuk, és extraktumot állítottunk elő. Westem-blot-analízissel, a csíkok hTF-peroxidázzal történő láthatóvá tételét követően, kimutatható volt a fő esik, amelynek molekulatömege megfelelt a Tbp2 alegység csonka formája számított molekulatömegének.
A WO93/6861 számú közzétételi irat 4. példájában (bejelentés dátuma: 1993. április 15.) ismertetett teszt szerint, a tisztított T/2169 polipeptid képes baktericid ellenanyagok termelődésének kiváltására, következésképp, alkalmazható lehet vakcinázásra.
2. példa
A 2. azonosító számú szekvencia szerinti szekvenciát (IM2394) az 1. aminosavpozíciótól a 340. aminosavpozicióig terjedően tartalmazó T/2394 polipeptid (1, 02, A3; 1-340.)
2.A - A T/2394 polipeptidet (1-340.) kódoló DNSfragmentum előállítása A pTG 5755 vektor előállítása
Az EPA 586 266 közzétételi iratban ismertetett pTG4710 plazmidból a hTf-kötő domént kódoló szek15 vencia C-terminális részét kódoló szekvenciát tartalmazó fragmentumot PCR-eljárással amplifikáltuk, az OTG4873 és OTG4877 jelű láncindító oligonukleotidok alkalmazásával:
OTG4 8 7 3: AAAAAGCATGCATAAAAACTACGCGTTACACCATTCAAGC Miül
OTG4 8 7 7: TATATAAGCTTACGTTGCAGGCCCTGCCGCGTTTTCCCC Hindi 11
A pTG4710 plazmidot Miül és HindlII enzimekkel 25 emésztettük. A Tbp2 alegység 3’-végi részét kódoló szekvenciát tartalmazó MluI-HindlII fragmentumot a hTf-kötő dómén C-terminális részét kódoló PCR-fragmentummal helyettesítettük. így nyertük a pTG5707 plazmidot. Ezt követően, a pTG5707 plazmidban az 30 araB-promotert, valamint a Tbp2 alegységet kódoló szekvencia elejét tartalmazó BamHI-MluI fragmentumot az EPA 586 266 számú közzétételi iratban ismertetett pTG4764 plazmid BamHI-MluI fragmentumával helyettesítettük, amely tartalmazta az araB-promotert, 35 valamint az RlpB jelű szekréciós szignált kódoló szekvenciát, a Tbp2 alegység N-terminális doménját kódoló szekvenciával fuzionáltatva. A fenti módon kaptuk a pTG5755 plazmidot. Ez a vektor tartalmazza az araBpromotert, valamint az RlpB jelű szekréciós szignált 40 kódoló szekvenciát, a Tbp2 alegység N-terminális doménját kódoló szekvenciával (1-340.) fuzionáltatva.
2.B - A T/2394 polipeptid (1-340.) előállítása és tisztítása
A T/2394 polipeptidet (1-340.) az l.B példában is- 45 mertetettek szerint állítottuk elő és tisztítottuk.
A WO93/6861 számú közzétételi irat 4. példájában (bejelentés dátuma: 1993. április 15.) ismertetett teszt szerint, a tisztított T/2394 polipeptid képes baktericid ellenanyagok termelődésének kiváltására, következésképp, alkalmazható lehet vakcinázásra.
3. példa
A D4/2169 polipeptid (1, 02, 3), amelynek szekvenciája az 1-691. aminosavpozicióknak megfelelően azonos az 1. azonosító számú szekvenciával, amelyből azonban a 362—379., 418—444., 465-481. és 500—520. aminosavaknak megfelelő régiók deletáltak
3.A - A D4/2169 polipeptidet kódoló DNS-fragmentum előállítása
1.1 A DNS-fragmentum klónozása
Az IM2169 jelű N. meningitidis törzs Tbp2 alegységét kódoló DNS-fragmentumot PCR-eljárással (polimeráz-láncreakciós eljárással) amplifikáltuk, az 5’- és 3’-régiókkal komplementer specifikus láncindító oligonukleotidok (A5’ és A3’) alkalmazásával, az IM2169 baktériumtörzs tenyészetéből izolált 10 ng genomi DNS alapján.
A5’ : 5’-CCCGAATTCTGCCGTCTGAAGCCTTATTC- 3’ A3 ’ : 5’-CCCGAATTCTGCTATGGTGCTGCCTGTG- 3’
A fenti eljárással kapott DNS-fragmentum EcoRI enzimmel történő emésztést követően 2150 nukleotidot tartalmazott. Ezt az EcoRI-fragmentumot pBluescriptSK(-)-fagemid (Stratagene) defoszforilezett EcoRI-végeihez ligáltuk, így kaptuk a pSK/2169tbp2 jelű rekombináns fagemidet.
1.2. Deléciók létrehozása
Az M982 törzs tbp2 szekvenciáit tartalmazó pSK/2169tbp2 kiónt Kunkel technikájával deletáltuk [PNAS 82, 448 (1985)].
Röviden, a pSK/2169tbp2 jelű rekombináns fagemid fág formáját VCS-M13 jelű „helper’-fággal nyertük ki, az eredeti vektort forgalmazó Stratagene cég utasításai szerint eljárva, és azzal CJ236 jelű baktérium55 törzset fertőztünk. A CJ236 törzs által hordozott dut- és wng-mutációk következtében olyan DNS-molekulák szintetizálódnak, amelyekbe a dUTP-nukleotid-prekurzor beépül.
A fágokat összegyűjtöttük, és fenol/kloroform eleggyel az egyszálú DNS-t extraháltuk. Ezt a DNS-t
HU 220 116 Β standard körülmények mellett a következő oligonukleotidokkal hibridizáltattuk:
216 9 d1: 5’-CGCATCCAAAACCGTACCTGTGCTGCCTGA- 3’ 2 16 9 d 2: 5’-TTTATCACTTTCCGGGGGCAGGAGCGGAAT- 3’ 216 9 d 3 : 5’-GTTGGAACAGCAGACAGCGGTTTGCGCCCC- 3’ 216 9 d 4 : 5’-GAACATACTTTGTTCGTTTTTGCGCGTCAA- 3’
A hibridizációs reakciót 30 percig végeztük, eközben a hőmérsékletet 70 °C-ról 30 °C-ra csökkentettük.
Ezt követően, a teljes szál szintézisével előállítottuk a komplementer második szálat, a négy dezoxinukleotid, T4-DNS-polimeráz és T4-DNS-ligáz jelenlétében, szokásos körülmények alkalmazásával.
A fenti módon kapott DNS-sel E. coli SURE törzset (Stratagene) transzformáltunk. Ebben a törzsben a dUTP-t hordozó, nem mutált molekulák elpusztulnak.
A kapott fágokat plazmid-DNS gyors előállításával és azok megfelelő restrikciós enzimekkel történő emésztésével, szokásos technikák alkalmazásával analizáltuk. A kívánt mutációk jelenlétét ezután nukleotidszekvenálással igazoltuk.
A négy mutációt (Δ1203-1256., Δ1371-1451., Δ1512-1562. és Δ1617-1679.) tartalmazó pSK2169#7 kiónt választottuk további vizsgálat céljára.
3.B - A pTG5783 jelű expressziós vektor előállítása
A fent ismertetett pTG5768 plazmidot Hpal és Xcml enzimekkel emésztettük. A pTG5768 plazmid XcmI-Xcml fragmentumát és a pSK/2169ed#7 plazmid Hpal-Xcml fragmentumát egyidejűleg ebbe a vektorba 30 inszertáltuk, így kaptuk a pTG5783 plazmidot. Ez vektor tartalmazta az araB-promotert, valamint az RlpB jelű szekréciós szignált kódoló szekvenciát, a módosított (dl -d4-deléciókat hordozó) Tbp2 szekvenciával fuzionáltatva. 35
3.C - A D4/2169 polipeptid előállítása és tisztítása
A D4/2169 polipeptidet az l.B példában ismertetettek szerint állítottuk elő és tisztítottuk.
A WO93/6861 számú közzétételi irat 4. példájában (bejelentés dátuma: 1993. április 15.) ismertetett teszt 40 szerint, a tisztított T/2394 polipeptid képes baktericid ellenanyagok termelődésének kiváltására, következésképp, alkalmazható lehet vakcinázásra.
4-8. példák 45
A különböző törzsek Tbp2 alegységei második (kapocs-, „hinge-”) doménjának megfelelő C/2223 (4. példa), C/M981 (5. példa), C/1610 (6. példa), C/M978 (7. példa) és C/708 (8. példa) polipeptidek
A 2223, M981, 1610, M978 és C708 jelű N. menin- 50 gitidis törzsek Tbp2 alegységeit kódoló DNS-fragmentumokat PCR-eljárással, a 3.A példában leírtak szerint amplifikáltuk, ugyanazon két láncindító oligonukleotid alkalmazásával. Hasonlóképp, a fenti fragmentumokat pBluescriptSK(-)-fagemid EcoRI vagy EcoRI/BamHI 55 helyeire inszertáltuk. A második domént kódoló régiót szekvenáltuk; az egyes szekvenciák alapján következtetett aminosavszekvenciákat a 4. ábrán mutatjuk be.
Az egyes nukleotidszekvenciák alapján, a két doménra specifikus láncindító oligonukleotidokat állítot- 60 tünk elő megfelelő hasítási helyek beiktatásával, hogy az araB-promoter szabályozása alatt, az RlpB szignálszekvenciával történő, leolvasási fázisba illeszkedő további klónozást megkönnyítsük. A fenti láncindító oligonukleotidok alkalmazásával, PCR-eljárással az egyes Tbp2 alegységek második doménjait kódoló régiókat amplifikáltuk. Ezeket a régiókat a fent ismertetettek szerint, az araB-promoter szabályozása alatt, az rlpB szignálszekvenciát tartalmazó plazmidba klónoztuk.
A peptidek expresszálását az l.B példában leírtak szerint végeztük.
9. példa
Vakcinakészítmény (T/2169-T/2394) N. meningitidisfertözések megelőzésére
Az l.B és 2.B példákban ismertetettek szerint tisztított, steril T/2169 és T/2394 oldatokat felolvasztottunk. Az egyes aktív hatóanyagokból 100 pg/ml mennyiséget tartalmazó, egy liter térfogatú vakcina előállításához steril körülmények mellett a következő oldatokat elegyítettük:
- C pufferben (500 mmol/1 foszfátpuffer, pH=8; 0,05% Sarkosyl) oldott, 1 mg/ml koncentrációjú T/2394 oldat: 100 ml;
- C pufferben oldott, 1 mg/ml koncentrációjú T/2169 oldat: 100 ml;
- puffereit fiziológiás oldat (PBS), pH=6,0: 300 ml;
- milliliterenként 10 mg Al+ + +-t tartalmazó alumínium-hidroxid: 50 ml;
- 1% (tömeg/térfogat) merthiolát
PBS-ben: 10 ml;
-PBS szükség szerint: 1000 ml-ig.
10. példa
Vakcinakészitmény (D4/2169-Tbp2/2394) N. meningitidis-fertőzések megelőzésére
A 3.C példában ismertetettek szerint tisztított, steril D4/2169 oldatot felolvasztottunk. Az EPA 586 266 számú közzétételi irat 3. példájában leírtak szerint előállított és tisztított steril Tbp2/2394 oldatot hasonlóképp kezeltünk. Az egyes aktív hatóanyagokból 100 pg/ml mennyiséget tartalmazó, egy liter térfogatú vakcina előállításához steril körülmények mellett a következő oldatokat elegyítettük:
- C pufferben oldott, 1 mg/ml koncentrációjú Tbp2/2394 oldat: 100 ml;
- C pufferben oldott, 1 mg/ml koncentrációjú D4/2169 oldat: 100 ml;
- puffereit fiziológiás oldat (PBS), pH=6,0: 300 ml;
HU 220 116 Β
- milliliterenként 10 mg Al+++-t tartalmazó alumínium-hidroxid. 50 ml;
- 1% (tömeg/térfogat) merthiolát
PBS-ben: 10 ml;
- PBS szükség szerint: 1000 ml-ig.
11. példa
Az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található GFYGPKGE-epitóp felismerésére képes ellenanyagok előállítása
11.A - Egerek immunizálása, és hibridómák előállítása
MRL/Lpr egereket, amelyekről ismert, hogy a Balb/C egereknél több IgG2a-t, IgG2b-t és IgG3-at termelnek [J. Immunoi. Methods 144, 165 (1991)], először intraperitoneálisan (hasüregbe) injektáltunk 50 pg, IM2394 törzsből származó membránfrakcióval, Freundféle komplett adjuváns jelenlétében. A felhasznált membránfrakciót a következőképp állítottuk elő:
A liofilizált formában tárolt IM2394 törzset elővettük, és egy éjszakán át, 37 °C-on, 20% CO2-t tartalmazó légtérben, Mueller-Hinton-agaron tenyésztettük. A baktériumréteget összegyűjtöttük, és azzal 30 pmol/l EDDA-val kiegészített [etilén-diamin-di(orto-hidroxiecetsav), Sigma] Mueller-Hinton-táptalajt tartalmazó Erlenmeyer-lombikokat oltottunk be. Öt órán át, 37 °Con körkörös rázás mellett végzett inkubálást követően, a tenyészetet centrifugáltuk. Az üledéket Tris-HCl-pufferben (pH = 8,0) szuszpendáltuk, és a szuszpenziót nagy nyomás mellett működő ultrahangkészülékkel (Rannie, 8.30H-modell) lizáltattuk. A kapott szuszpenziót a sejttörmelék eltávolítása céljából alacsony fordulatszám mellett centrifugáltuk, és a membránokat ultracentrifúgálással (140 000xg, 75 perc, 4 °C) összegyűjtöttük. Végül a membránfrakciót 50 mmol/1 Tris-HClpufferben szuszpendáltuk (pH=8,0), és a proteinkoncentrációt meghatároztuk.
Ezt az első injektálást 21 és 49 nappal később, két emlékeztető oltás követte. Az emlékeztető dózisok 25 pg, az EPA 586 266 számú közzétételi irat 3. példájában leírtak szerint tisztított Tbp2 proteint tartalmaztak, Freund-féle inkomplett adjuvánsban, emulzió formájában.
Ötvenhat (56) nappal később, a legmagasabb ellenanyagtiterrel rendelkező egereket (az immunszérumok ELISA-eljárással történő követésével) kiválasztottuk, specifikus monoklonális ellenanyagok előállítására. Ezek az egerek még egy végső emlékeztető oltásban részesültek (78 nappal az első injektálást követően), mely során azokat intravénásán és intraperitoneálisan 25 pg, az EPA 586 266 számú közzétételi irat 3. példájában leírtak szerint tisztított Tbp2 proteinnel oltottuk be. Három (3) nappal később, az állatok lépét eltávolítottuk, és a lépsejteket P3 χ 63Ag8653 jelű, egér-mielómasejtekkel fúzionáltattuk, 1:4 mielómasejt: lépsejt arány mellett. A fúziós eljárás azon az eljáráson alapult, amelyet elsőként G. Köhler és C. Milstein által írtak le [Natúré 256, 495 (1975)]. A fúziót követően, a sejteket tápláló sejtréteggel fedett steril mikromélyületekbe (Nunc) osztottuk szét; egy mélyületbe 100 000 sejtet tettünk, 200 pl szelektív tápfolyadékban [20% FCS-t (totális borjúszérumot) és 2% (térfogat/térfogat) koncentrációban hipoxantin/azaszerin/timidin elegyet tartalmazó DMEM-tápfolyadékban (Gibco, katalógus szám: 043-0106ÖH)]. A szelektív tápfolyadékot hat nap elteltével nem szelektív tápfolyadékra cseréltük [20% FCS-t (fötális borjúszérumot) és 2% (térfogat/térfogat) koncentrációban hipoxantin/timidin elegyet tartalmazó DMEM-tápfolyadékban (Gibco, katalógus szám: 043-01065ÖH)].
11.B - A hibridómák szűrése
A hibridómák tenyészetének felülúszóját ELISA-eljárással teszteltük, a következő eljárás szerint:
ELISA-lemezek mikromélyületeibe, amelyeket egy éjszakán át, +4 °C-on 100 pl, karbonátpufferben (50 mmol/1, pH=9,6) 5 pg/ml RT. 2394-et tartalmazó oldattal „érzékenyitettünk”, majd 1 órán át, 37 °C-on, 200 pl, 1 (tömeg/térfogat) szarvasmarha-szérumalbumint tartalmazó 0,1 mol/1 foszfátpufferrel (PBS-BSA pufferrel) blokkoltunk (telítettünk), 100 pl hibridómatenyészet-felülúszót [vagy 0,05% Tween-20-at tartalmazó PBS-BSA pufferben (PBS-T-BA) készített immunszérum-hígításokat] mértünk. Egy óra harminc percen át, 37 °C-on végzett további inkubálást, majd PBSTween pufferrel öt alkalommal végzett mosást követően a mélyületekhez 100 pl, egér IgG2a-, IgG2b- és IgG3 izotípusra specifikus, alkalikus-foszfatázzal (APvel) konjugált kevert ellenanyagoldatot adtunk, hogy csak olyan hibridómákra szelektáljunk, amelyek a baktericid hatást vizsgáló tesztben fúnkcionális, specifikus ellenanyagokat szekretálnak. A konjugált ellenanyagokat tartalmazó kevert oldatot a következő három, kecskében termelt immunszérum 1:1500 arányú hígításával állítottuk elő, PBS-T-BA pufferben: kecskében termelt anti-IgG2a-AP (Caltag), kecskében termelt anti-IgG2bAP (Caltag), valamint kecskében termelt anti-lgG3-AP (Caltag). A konjugált ellenanyagokat tartalmazó oldattal egy óra harminc percen át, 37 °C-on végzett inkubálást, majd alkalommal végzett mosást követően, az enzimreakciót 100 pl térfogatú, 0,1 mol/1 dietanolamin-pufferben (pH=9,8) 5 mg/ml paranitro-fenil-foszfátot tartalmazó oldattal tettük láthatóvá. A reakció előhívását 30 perc elteltével, 50 pl, 1 normál/1 nátriumhidroxid hozzáadásával leállítottuk, majd 405 nm-es hullámhosszon spektrofotometriás analízist végeztünk.
A fenti első szűréssel pozitívnak bizonyult kolóniákat Westem-blot-vizsgálattal a Tbp2 alegységet felismerő képességre analizáltuk.
E célból, az IM2394 törzs transzferrin-receptorát (0,863 mg/ml) és az IM2169 törzs transzferrin-receptorát (0,782 mg/ml), amelyeket aWO93/6861 számú közzétételi irat 1. és 2. példájában ismertetettek szerint állítottunk elő, 1 mol/1 Tris-pufferben (pH=6,8) 1/10 arányban hígítottuk, majd 10% (térfogat/térfogat), TEpufferben (100 mmol/1 Tris-HCl, 10 mmol/1 EDTA, pH=8,0) készített 25%-os SDS-oldat, valamint 5% (térfogat/térfogat) β-merkapto-etanol hozzáadásával denaturáltuk. Tizenöt (15) percig, 56 °C-on végzett kezelést követően 110 pl térfogatú, denaturált IM2394 vagy IM2169 törzs eredetű transzferrin-receptort tartalmazó mintát vittünk föl egy 7,5%-os poliakrilamid-gélre.
HU 220 116 Β
A minta vándorlását követően (1 óra, 200 V, Biorad gélfuttató készülék), a proteineket elektrotranszferes eljárással nitrocellulóz membránra vittük át (100 V, 50 perc). A membránt egy éjszakán át, szobahőmérsékleten, a következő összetételű oldattal telítettük: 5% (tömeg/térfogat) fölözött tejpor, 20 mmol/1 Tris-puffer, 137 mmol/1 NaCl, (pH=7,6), (TBS); majd „minibiot” készülékre vittük át. A tesztelt ellenanyagokat 1% (tömeg/térfogat) fölözött tejport tartalmazó TBS-pufferben 25 pg/ml koncentrációra állítottuk be, majd azokat 50-50 pl mennyiségben az egyes mélyületekhez adtuk.
Negyvenöt (45) percig tartó inkubálást, majd 1% tejport tartalmazó TBS-pufferben végzett mosást követően, az egyes mélyületekhez 50 pl, nyúlban termelt, alkalikus foszfatázzal konjugált, előzetesen 1% fölözött tejport tartalmazó TBS-pufferben 1:1000 arányban hígított antiegér-IgG.A.M-immunszérumot (Zymed) adtunk.
Negyvenöt (45) percig tartó további inkubálást, majd mosásokat követően, az enzimreakciót kromogén szubsztrát (BCIP/NBT, Sigma Fást R) alkalmazásával előhívtuk. A reakciót 15 perc elteltével, desztillált vízbe történő bemártással leállítottuk. Pozitív kiónokat annak alapján határoztunk meg, hogy azok az IM2394 transzferrin-receptor nitrocellulóz membránra történő elektrotranszferét követően képesek voltak egy, körülbelül 69 kD molekulatömegnek (Tbp2 alegységnek) megfelelő proteincsík felismerésére.
Ezt a második, Westem-blot-eljárással végzett szűrést követően, a kiónokat ELISA-rendszerben, a GFYGPKGE-peptidszekvenciával reagálni képes immunglobulinok termelésére nézve analizáltuk; a fent ismertetettel megegyező módszert alkalmaztunk, azzal az eltéréssel, hogy a lemezek érzékenyítését az egyes mélyületekhez 100 pl, 2 pg/ml GFYGPKGE-peptidet tartalmazó oldat hozzáadásával végeztük.
A tesztelt hibridómák közül kiválasztottunk egy, a peptiddel reagálni képes hibridómát; ezt sorozatos klónozásokkal (legalább 2 klónozással) stabilizáltuk; az első klónozás során az egyes mélyületekhez 5 sejtet, az azt követő klónozások során pedig az egyes mélyületekhez 1 sejtet adtunk.
l.C - A monoklonális ellenanyagok előállítása és tisztítása
A monoklonális ellenanyagokat hím, „nude” Swissegerek hasűri folyadékában (aszciteszében) állítottuk elő.
Ötszáz (500) pl prisztán intraperitoneális injektálását követően 15 nappal, a „nude”-egereket 7 millió, hibridóma eredetű sejttel egy második intraperitoneális oltásban részesítettük.
A hasűri folyadékot steril körülmények között visszaszívtuk, majd G-protein-oszlopon, affinitásos kromatográfiával tisztítottuk. Az 1/5 arányban, 0,1 mol/1 foszfátpufferben (pH=7,4) hígított, és 0,22 pm áteresztőképességű Millipore-szűrőn átszűrt hasűri folyadékot a fentivel megegyező összetételű pufferrel előzőleg ekvilibrált G-protein-oszlopon engedtük át, 40 ml/óra áramlási sebesség mellett.
Az oszlophoz kötődött ellenanyagokat 0,1 mol/1 glicinpufferrel (pH=2,7) eluáltuk. Az eluált frakciókat mol/1 Tris-pufferrel (pH = 8,0) azonnal neutralizáltuk (10 térfogat eluátumhoz 1 térfogat Tris-puffert adtunk).
Az eluátumot ezután egy éjszakán át, +4 °C-on
0,1 mol/1 foszfátpufferben (pH=7,4) dializáltuk, egyenlő térfogatú mintákra osztottuk, és lefagyasztottuk.
Az ellenanyag tisztaságát 7,5%-os poliakrilamid-gélen végzett elektroforézissel, valamint Superose- 12-oszlopon végzett molekulaszűrő kromatográfiával ellenőriztük. A tisztaság foka általában nagyobb volt mint 95%.
A fenti eljárás alkalmazásával, és körülbelül 800 hibridóma szűrésével, sikerült egy olyan monoklonális ellenanyagot kiválasztanunk, amely képes volt a Tbp2 alegység első doménjében található GFYGPKGE-epitóp felismerésére, de nem volt képes a harmadik doménban található megfelelő epitóp, (azaz a GFYGKNAIepitóp) felismerésére. Ez a monoklonális ellenanyag, (amelyet 475 E7-nek neveztünk), egy IgG2b-izotípusba tartozó ellenanyagnak bizonyult, melynek izoelektromos pontja 7,8-8,1 közé esik, és baktericid titere 512.
A fenti titert a következő módon határoztuk meg.
A 475 E7-MAb (monoklonális ellenanyag) oldatából felező hígításokat készítettünk, és azokat 50 pl, lxlO4 CFU/ml (telepképző egység/ml) meningococcus-szuszpenzió, valamint 50 pl, fiatal nyúlból származó komplement jelenlétében inkubáltuk [a baktériumszuszpenziót a B16B6 jelű N. meningitidis törzs 37 °Con, 5 órán át, 30 pmol/1 EDDA-t [etilén-diamin-di(orto-hidroxi-fenil-ecetsav)-at, Sigma] tartalmazó Mueller-Hinton-Difco folyékony táptalajban történő tenyésztésével kaptuk].
Egy óráig tartó, 37 °C-on végzett inkubálást követően, 25 pl elegyet kivettünk, és azt kiegészített Mueller-Hinton-agaron tenyésztettük. Az agarlemezeket egy éjszakán át, 37 °C-on inkubáltuk, 10% CO2-t tartalmazó légtérben. A telepeket megszámoltuk, és a baktericid titert annak a végső hígításnak a reciprokával fejeztük ki, amelynek jelenlétében a kontrolihoz viszonyítva a baktériumok 50%-a vagy annál több lizálódott.
A fenti körülmények alkalmazása mellett megállapítottuk, hogy a MAb-475 E7 baktericid titere 512 volt.
12. példa
A T/2169 proteinre (1-350.) specifikus immunglobulinok baktericid hatásának kimutatása különböző N. meningitidis törzsekkel szemben
12.A - A T/2169 protein (1-350.) előállítása és tisztítása
Egy E. coli B törzset az 1. példában ismertetett pTG5782 plazmiddal transzformáltunk. A szelektált transzformánsokat felszaporítottuk, hogy beoltásra alkalmas tenyészeteket kapjunk. A pTG5782 plazmiddal transzformált E. coli B törzset tartalmazó csőből a tenyészet felszaporítását 0,5% szukcinátot tartalmazó M9 tápfolyadékban végeztük. A tenyésztést 20-1-fermentorban végeztük.
Az exponenciális fázisban a tenyészethez arabinózt (expressziót indukáló szert) adtunk. Egyórás inkubálást követően a sejteket összegyűjtöttük, nagy nyomás mellett működő készülékkel (Rannie) roncsoltuk, majd a membránffakciót centrifugálással összegyűjtöttük.
HU 220116 Β
Westem-blot-analízis, majd transzferrin-peroxidázzal végzett előhívás lehetővé tette a fő csík kimutatását, amelynek molekulatömege megfelelt a fenti csonka forma várt molekulatömegének. A proteint 10%-os akrilamid-gélből preparatív SDS-PAGE-eljárással tisztítottuk
12.B - A 172169proteinre (1-350.) specifikus immunglobulinok előállítása
Az így kapott proteinfrakcióval nyulakat immunizáltunk. Röviden, nyulakat („New Zealand White”) immunizáltunk: (i) a 0. napon 50 pg, a 12.A példában leírtak szerint előállított T/2169 proteinnel, Freund-féle komplett adjuváns jelenlétében, és (ii) a 21. és 42. napokon, 50 pg T/2169 proteinnel, Freund-féle inkomplett adjuváns jelenlétében. Az 56. napon a nyulakat leöltük, és a szérumot összegyűjtöttük. Ebből a szérumból az immunglobulinokat affmitásos kromatográfiával tisztítottuk, protein-A-Sepharose-töltetet tartalmazó oszlopon (Pharmacia). A tisztítást a gyártó utasításai szerint végeztük. A tisztított IgG-frakciót liofílizáltuk, és a liofilizátumot meghatározott térfogatban felszuszpendáltuk úgy, hogy az oldat végső proteinkoncentrációja 25 mg/ml nagyságrendbe essen.
12.C - A baktericid hatás vizsgálata
A T/2169 protein tisztításával párhuzamosan, preparatív SDS-PAGE-eljárással proteinfrakciót tisztítottunk pTG3704 plazmiddal (a pTG5782 plazmiddal megegyező, de Tbp2 szekvenciákat nem tartalmazó vektorral) transzformált E. coli B törzsből. A preparatív SDS-PAGE-eljárással kapott proteinfrakcióval a fent ismertetettek szerint nyulakat immunizáltunk, és az IgG-ket az összegyűjtött szérumból tisztítottuk.
Ily módon két szérumfrakciót nyertünk, melyeket T/2169 IgG-nek és kontroll-IgG-nek neveztünk. Ezeket baktericid hatás vizsgálatára alkalmas tesztben, különböző N. meningitidis törzseket lizálóképességre nézve analizáltuk, a WO 93/6861 számú közzétételi irat 4. példájában leírtak szerint (bejelentés napja: 1993. április 15.).
A különböző izolátumok esetében kapott eredményeket az alábbi táblázatban összegeztük - ezek szerint, a tisztított T/2169 protein képes több, IM2169 típusú csoportba tartozó törzzsel szemben baktericid hatású ellenanyagok termelődését kiváltani. Ez a keresztbaktericid hatás azt jelenti, hogy a T/2169 protein alkalmazható lehet vakcinázásra.
A T/2169 proteinre specifikus immunglobulinok baktericid hatásának meghatározása kontroli-immunglobulinokkal összehasonlítva, hat N. meningitidis törzs vonatkozásában
Törzs Szerocsoport szerotípus/al- típus Baktericid titer*
Kontroll-IgG T/2169 IgG
2169 B:9;P1.9 <4 128
RH 873 B; 8; Pl.1.7 <4 16
RH 876 B; 19, P1.6 <4 64
Törzs Szerocsoport szerotipus/al- típus Baktericid titer*
Kontroll-IgG T/2169 IgG
351 B:NT;P1.7 <4 256
NGG40 B; 1:- <4 512
EG 328 B; NT;- <4 64
*: A baktericid titereket annak a hígításnak a reciprokával fejeztük ki, amelynek jelenlétében a kiindulási telepek 50%-ának lizálódása volt megfigyelhető.
NT: nem tipizált.
13. példa
A D4/2169proteinre specifikus immunglobulinok baktericid hatásának kimutatása különböző N. meningitidis törzsek vonatkozásában
13.A - A D4/2169 protein előállítása és tisztítása
A D4/2169 proteint a 12.A példában leírtak szerint állítottuk elő és tisztítottuk
13.B — A D4/2169 proteinre specifikus immunglobulinok előállítása
A tisztítást a 12.B példában leírtakhoz hasonló módon végeztük.
13. C - baktericid hatás vizsgálata
Két immunglobulin-frakciót kaptunk, amelyeket D4/2169 IgG-frakciónak és kontroll-IgG-ffakciónak neveztünk. Ezeket baktericid hatás vizsgálatára alkalmas tesztben, különböző N. meningitidis törzseket lizálóképességre nézve analizáltuk, a WO 93/6861 számú közzétételi irat 4. példájában leírtak szerint (bejelentés napja: 1993.04 15.).
A különböző izolátumok esetében kapott eredményeket az alábbi táblázatban összegeztük, ezek szerint a tisztított D4/2169 protein képes több törzs vonatkozásában baktericid hatású ellenanyagok termelődését kiváltani, következésképp, alkalmazható lehet vakcinázásra.
A D4/2169proteinre specifikus immunglobulinok baktericid hatásának meghatározása kontroli-immunglobulinokkal összehasonlítva, hat N. meningitidis törzs vonatkozásában
Törzs Szerocsoport szerotípus/al- típus Baktericid titer*
Kontroll-IgG T/2169 IgG
2169 B:9;P1.9 <4 32
RH 873 B; 8; Pl.1.7 <4 8
RH 876 B; 19, P1.6 <4 16
351 B:NT;P1.7 <4 128
NGG40 B;l:- <4 64
EG 328 B;NT;- <4 16
*: A baktericid titereket annak a hígításnak a reciprokával fejeztük ki, amelynek jelenlétében a kiindulási telepek 50%-ának lizálódása volt megfigyelhető.
NT: nem tipizált.
HU 220 116 Β
SZEKVENCIALISTA
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 3639 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomiDNS
EREDETI FORRÁS
ÉLŐLÉNY: Neisseria meningitidis
TÖRZS: IM2169
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: sig_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 60-119
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 120-2192
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS :60-2192
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: miscfeature
ELHELYEZKEDÉS: 120-1154
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: misc feature
ELHELYEZKEDÉS: 1155-1748
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: misc feature
ELHELYEZKEDÉS: 1749-2192
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: miscbinding
ELHELYEZKEDÉS: 127-1169
AZ 1. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATTTGTTAAA AATAAATAAA ATAATAATCC TTATCATTCT TTAATTGAAT TGGGTTTAT 59
ATG AAC AAT CCA TTG GTA AAT CAG GCT GCT ATG GTG CTG CCT GTG TTT Phe -5 107
Me t -20 Asn Asn Pro Leu Val -15 Asn Gin Alá Al a Me t -10 Val Leu Pro Val
TTG TTG AGT GCC TGT CTG GGC GGC GGC GGC AGT TTC GAT CTT GAT TCT 155
Leu Leu Ser Al a Cy s Leu Gly Gly Gly Gly Ser Phe As p Leu As p Ser
1 5 10
GTC GAT ACC GAA GCC CCG CGT CCC GCG CCA AAG TAT CAA GAT GTT TCT 203
Val As p Thr Glu Al a Pro Arg Pro Al a Pro Ly s Tyr Gin As p Val Ser
15 20 25
TCC GAA AAA CCG CAA GCC CAA AAA GAC CAA GGC GGA TAC GGT TTT GCG 251
Ser Glu Lys Pro Gin Al a Gin Ly s As p Gin Gly Gly Tyr Gly Phe Al a
30 35 40
ATG AGG TTG AAA CGG AGG AAT TGG TAT CCG GGG GCA GAA GAA AGC GAG 299
Me t Arg Leu Lys Arg Arg Asn Trp Tyr Pro Gly Al a Glu Glu Ser Glu
45 50 55 60
GTT AAA CTG AAC GAG AGT GAT TGG GAG GCG ACG GGA TTG CCG ACA AAA 347
Val Ly s Leu Asn Gl u Ser As p Trp Glu Al a Thr Gly Leu Pro Thr Ly s
65 70 75
HU 220 116 Β
CCC Pro AAG Lys GAA Glu CTT CCT AAA CGG CAA AAA Ly s 85 TCG GTT ATT GAA AAA GTA GAA Glu 395
Leu 80 Pro Lys Arg Gin Ser Va 1 Ile G1 u Ly s 90 Val
ACA GAC GGC GAC AGC GAT ATT TAT TCT TCC CCC TAT CTC ACA CCA TCA 443
Thr Asp Gly 95 As p Ser Asp Ile Tyr 100 Ser Ser Pro Tyr Leu 105 Thr Pro Ser
AAC CAT CAA AAC GGC AGC GCT GGC AAC GGT GTA AAT CAA CCT AAA AAT 491
Asn Hi s 110 Gin As n Gly Ser Al a 115 Gly Asn Gly Va 1 Asn 120 Gin Pro Ly s Asn
CAG GCA ACA GGT CAC GAA AAT TTC CAA TAT GTT TAT TCC GGT TGG TTT 539
Gin 125 Al a Thr Gly Hi s Glu 130 Asn Phe Gin Tyr Va 1 135 Tyr Ser Gly Trp Phe 140
TAT AAA CAT GCA GCG AGT GAA AAA GAT TTC AGT AAC AAA AAA ATT AAG 587
Tyr Ly s Hi s Alá Al a 145 Ser Glu Ly s As p Phe 150 Ser Asn Ly s Ly s Ile 155 Lys
TCA GGC GAC GAT GGT TAT ATC TTC TAT CAC GGT GAA AAA CCT TCC CGA 635
Ser Gly Asp As p 160 Gly Tyr Ile Phe Tyr 165 Hi s Gly Glu Lys Pro 170 Ser Arg
CAA CTT CCT GCT TCT GGA AAA GTT ATC TAC AAA GGT GTG TGG CAT TTT 683
Gin Leu Pro 175 Al a Ser Gly Lys Va 1 180 Ile Tyr Ly s Gly Val 185 Trp Hi s Phe
GTA ACC GAT ACA AAA AAG GGT CAA GAT TTT CGT GAA ATT ATC CAG CCT 731
Val Thr 190 Asp Thr Lys Lys Gly 195 Gin Asp Phe Arg Glu 200 Ile Ile Gin Pro
TCA AAA AAA CAA GGC GAC AGG TAT AGC GGA TTT TCT GGT GAT GGC AGC 779
Ser 205 Ly s Ly s Gin Gly Asp 210 Arg Tyr Ser Gly Phe 215 Ser Gly Asp Gly Ser 220
GAA GAA TAT TCC AAC AAA AAC GAA TCC ACG CTG AAA GAT GAT CAC GAG 827
Glu Glu Tyr Ser Asn 225 Ly s Asn Glu Ser Thr 230 Leu Lys Asp Asp Hi s 235 Glu
GGT TAT GGT TTT ACC TCG AAT TTA GAA GTG GAT TTC GGC AAT AAG AAA 875
Gly Tyr Gly Phe 240 Thr Ser Asn Leu Glu 245 Val As p Phe Gly As n 250 Ly s Ly s
TTG ACG GGT AAA TTA ATA CGC AAT AAT GCG AGC CTA AAT AAT AAT ACT 923
Leu Thr Gly 255 Ly s Leu Ile Arg Asn 260 Asn Al a Ser Leu Asn 265 Asn Asn Thr
AAT AAT GAC AAA CAT ACC ACC CAA TAC TAC AGC CTT GAT GCA CAA ATA 971
Asn Asn 270 As p Lys Hi s Thr Thr 275 Gin Tyr Tyr Ser Leu 280 Asp Al a Gin Ile
ACA GGC AAC CGC TTC AAC GGC ACG GCA ACG GCA ACT GAC AAA AAA GAG 1019
Thr 285 G1 y Asn Arg Phe Asn 290 Gly Thr Al a Thr Al a 295 Thr Asp Lys Lys Glu 300
AAT GAA ACC AAA CTA CAT CCC TTT GTT TCC GAC TCG TCT TCT TTG AGC 1067
Asn Glu Thr Ly s Leu 305 Hi s Pro Phe Val Ser 310 As p Ser Ser Ser Leu 315 Ser
HU 220 116 Β
GGC GGC Gly Gly TTT TTC GGC CCG CAG GGT GAG GAA TTG GGT Gly TTC Phe CGC TTT TTG Leu 1115
Phe Phe 320 Gly Pro Gin Gly Glu 325 Glu Leu Arg 330 Phe
AGC GAC GAT CAA AAA GTT GCC GTT GTC GGC AGC GCG AAA ACC AAA GAC 1163
Ser Asp Asp Gin Ly s Va 1 Al a Val Val Gly Ser Al a Ly s Thr Ly s Asp
335 340 345
AAA CTG GAA AAT GGC GCG GCG GCT TCA GGC AGC ACA GGT GCG GCA GCA 1211
Lys Leu Glu Asn Gly Al a Al a Al a Ser Gly Ser Thr Gly Al a Al a Al a
350 355 360
TCG GGC GGT GCG GCA GGC ACG TCG TCT GAA AAC AGT AAG CTG ACC ACG 1259
Ser Gly Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu Asn Ser Ly s Leu Thr Thr
365 370 375 380
GTT TTG GAT GCG GTT GAA TTG ACA CTA AAC GAC AAG AAA ATC AAA AAT 1307
Val Leu Asp Al a Va 1 Glu Leu Thr Leu Asn As p Lys Ly s 1 le Lys Asn
385 390 395
CTC GAC AAC TTC AGC AAT GCC GCC CAA CTG GTT GTC GAC GGC ATT ATG 1355
Leu Asp Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Va 1 Va 1 As p Gly Ile Me t
400 405 410
ATT CCG CTC CTG CCC AAG GAT TCC GAA AGC GGG AAC ACT CAG GCA GAT 1403
Ile Pro Leu Leu Pro Ly s Asp Ser Glu Ser Gly Asn Thr Gin Al a Asp
915 420 425
AAA GGT AAA AAC GGC GGA ACA GAA TTT ACC CGC AAA TTT GAA CAC ACG 1451
Lys Gly Lys Asn Gly Gly Thr Glu Phe Thr Arg Lys Phe Glu Hi s Thr
430 435 490
CCG GAA AGT GAT AAA AAA GAC GCC CAA GCA GGT ACG CAG ACG AAT GGG 1499
Pro Glu Ser Asp Ly s Ly s Asp Alá Gin Al a Gly Thr Gin Thr Asn Gly
445 450 455 460
GCG CAA ACC GCT TCA AAT ACG GCA GGT GAT ACC AAT GGC AAA ACA AAA 1547
Alá Gin Thr Al a Ser Asn Thr Al a Gly As p Thr As n Gly Lys Thr Lys
465 470 475
ACC TAT GAA GTC GAA GTC TGC TGT TCC AAC CTC AAT TAT CTG AAA TAC 1595
Thr Tyr Glu Val Glu Va 1 Cy s Cy s Ser Asn Leu Asn Tyr Leu Lys Tyr
480 485 490
GGA ATG TTG ACG CGC AAA AAC AGC AAG TCC GCG ATG CAG GCA GGA GGA 1643
Gly Met Leu Thr Arg Lys Asn Ser Lys Ser Al a Me t Gin Al a Gly Gly
495 500 505
AAC AGT AGT CAA GCT GAT GCT AAA ACG GAA CAA GTT GAA CAA AGT ATG 1691
Asn Ser Ser Gin Al a Asp Al a Ly s Thr Glu Gin Val Glu Gin Ser Me t
510 515 520
TTC CTC CAA GGC GAG CGT ACC GAT GAA AAA GAG ATT CCA ACC GAC CAA 1739
Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr As p Glu Ly s Glu Ile Pro Thr Asp Gin
525 530 535 540
AAC GTC GTT TAT CGG GGG TCT TGG TAC GGG CAT ATT GCC AAC GGC ACA 1787
Asn Val Val Tyr Arg Gly Ser Trp Tyr Gly Hi s Ile Al a Asn Gly Thr
545 550 555
HU 220 116 Β
AGC TGG AGC GGC AAT Asn GCT Al a TCT Ser GAT Asp AAA GAG GGC Gly GGC AAC Gly Asn AGG Arg 570 GCG Alá GAA Glu 1835
Ser Trp Ser Gly 560 Ly s 565 Glu
TTT ACT GTG AAT TTT GCC GAT AAA AAA ATT ACC GGC AAG TTA ACC GCT 1883
Phe Thr Val 575 Asn Phe Al a Asp Ly s 580 Lys Ile Thr Gly Lys 585 Leu Thr Alá
GAA AAC AGG CAG GCG CAA ACC TTT ACC ATT GAG GGA ATG ATT CAG GGC 1931
Glu Asn 590 Arg Gin Al a Gl n Thr 595 Phe Thr Ile Glu G1 y Me t 600 Ile Gin Gly
AAC GGC TTT GAA GGT ACG GCG AAA ACT GCT GAG TCA GGT TTT GAT CTC 1979
Asn 605 Gly Phe Glu Gly Thr 610 Al a Ly s Thr Al a Glu 615 Ser Gly Phe Asp Leu 620
GAT CAA AAA AAT ACC ACC CGC ACG CCT AAG GCA TAT ATC ACA GAT GCC 2027
Asp Gin Lys Asn Thr 625 Thr Arg Thr Pro Lys 630 Al a Tyr Ile Thr Asp 635 Al a
AAG GTA AAG GGC GGT TTT TAC GGG CCT AAA GCC GAA GAG TTG GGC GGA 2075
Lys Val Ly s Gly 640 Gly Phe Tyr Gl y Pro 695 Ly s Al a Glu Glu Leu 650 Gly Gly
TGG TTT GCC TAT CCG GGC GAT AAA CAA ACG GAA AAG GCA ACA GCT ACA 2123
Trp Phe Al a 655 Tyr Pro Gly As p Ly s 660 Gin Thr Glu Lys Alá 665 Thr Al a Thr
TCC AGC GAT GGA AAT TCA GCA AGC AGC GCG ACC GTG GTA TTC GGT GCG 2171
Ser Ser 670 Asp Gly Asn Ser Al a 675 Ser Ser Al a Thr Val Val 680 Phe Gly Al a
AAA Lys CGC Arg CAA Gin CAG Gin CCT Pro GTG Val CAA Gin TAAGCACGGT TGCCGAACAA TCAAGAATAA 2222
685 690
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 711 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 2. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Me t -20 As n Asn Pro Leu Val -15 Asn Gin Al a Al a Me t -10 Val Leu Pro Val Phe -5
Leu Leu Ser Al a Cys 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Ser Phe Asp Leu 10 Asp Ser
Val As p Thr 15 Gl u Al a Pro Arg Pro 20 Al a Pro Ly s Tyr Gin 25 Asp Val Ser
Ser Gl u 30 Lys Pro Gin Al a Gin 35 Ly s As p Gin Gly Gly 40 Tyr Gly Phe Al a
Me t 45 Arg Leu Ly s Arg Arg 50 Asn Trp Tyr Pro Gly 55 Al a Glu Glu Ser Glu 60
HU 220 116 Β
Val Lys
Pro Lys
Thr Asp
Asn His 110
Gin Alá 125
Tyr Lys
Ser Gly
Gin Leu
Val Thr 190
Ser Lys 205
Glu Glu
Gly Tyr
Leu Thr
Asn Asn 270
Thr Gly 285
Asn Glu
Gly Gly
Ser Asp
Lys Leu 350
Ser Gly 365
Leu Asn
Glu Leu 80
Gly Asp 95
Gin Asn
Thr Gly
His Alá
Asp Asp 160
Pro Alá 175
Asp Thr
Lys Gin
Tyr Ser
Gly Phe 240
Gly Lys 255
Asp Lys
Asn Arg
Thr Lys
Phe Phe 320
Asp Gin 335
Glu Asn
Gly Alá
Glu Ser 65
Pro Lys
Ser Asp
Gly Ser
His Glu 1 30
Alá Ser 145
Gly Tyr
Ser Gly
Lys Lys
Gly Asp 210
Asn Lys 225
Thr Ser
Leu Ile
His Thr
Phe Asn 290
Leu His 305
Gly Pro
Lys Val
Gly Alá
Alá Gly 370
As p
Arg
Ile
Al a 115
Asn
Glu
Ile
Ly s
Gly 195
Arg
Asn
Asn
Arg
Thr Gin 275
Gly
Pro
Gin
Al a
Al a 355
Thr
Trp
G1 n
Tyr
100
Gly
Phe
Ly s
Phe
Va 1 180
Gin
Tyr
Glu
Leu
As n 260
Thr
Phe
Gly
Val
340
Al a
Ser
Glu
Ly s 85
Ser
Asn
Gin
Asp
Tyr
165
I le
As p
Ser
Ser
Glu
245
Asn
Al a 70
Ser
Ser
Gly
Tyr
Phe
150
Hi s
Tyr
Phe
Gly
Thr
230
Val
Al a
Tyr Tyr
Alá
Val
Glu
325
Val
Ser
Ser
Thr
Ser
310
Glu
Gly
Gly
Glu
Thr
Va 1
Gly
Ile
Pro Tyr
Asn 120
Tyr
Asn
Glu
Gly
Glu 200
Ser
Ly s
Phe
Ser Leu
Ser Leu 280
Thr
Ser
Gly
Al a
Thr 360
Ser
Va 1
Val
135
Ser
Gly
Ly s
Arg
Phe
215
Le u
As p
Al a 295
As p
Leu
Ser
Ser
Asn
375
Leu Pro
Glu Lys 90
Leu Thr 105
Gin Pro
Ser Gly
Lys Lys
Lys Pro 170
Val Trp 185
Ile Ile
Gly Asp
Asp Asp
Gly Asn 250
Asn Asn 265
Asp Alá
Asp Lys
Ser Ser
Phe Arg 330
Lys Thr 345
Gly Alá
Lys Leu
Thr 75 Ly s
Val Glu
Pro Ser
Ly s Asn
Trp Phe 140
Ile 155 Ly s
Ser Arg
Hi s Phe
Gin Pro
Gly Ser 220
Hi s 235 Glu
Ly s Lys
Asn Thr
Gin Ile
Lys Glu 300
Leu 315 Ser
Phe Leu
Lys Asp
Al a Al a
Thr Thr 380
HU 220 116 Β
Val Leu As p Al a Val 385 Glu Leu Thr Leu Asn 390 As p Ly s Ly s Ile Ly s 395 Asn
Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Va 1 Val Asp Gly Ile Me t
400 405 410
Ile Pro Leu Leu Pro Lys Asp Ser Glu Ser Gly Asn Thr Gin Alá Asp
415 420 425
Ly s Gly Lys Asn Gly Gly Thr Gl u Phe Thr Arg Lys Phe Glu Hi s Thr
430 435 440
Pro Glu Ser As p Ly s Ly s As p Alá Gin Al a Gly Thr Gin Thr Asn Gly
495 450 455 460
Al a Gin Thr Al a Ser Asn Thr Al a Gly Asp Thr As n Gly Ly s Thr Ly s
465 470 475
Thr Tyr Glu Val Glu Val Cys Cys Ser Asn Leu Asn Tyr Leu Lys Tyr
480 485 490
Gly Me t Leu Thr Arg Lys Asn Ser Ly s Ser Al a Me t Gin Alá Gly Gly
495 500 505
Asn Ser Ser Gin Al a Asp Al a Ly s Thr Glu Gin Val Glu Gin Ser Me t
510 515 520
Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr As p Glu Ly s Glu Ile Pro Thr As p Gin
525 530 535 540
Asn Va 1 Va 1 Tyr Arg Gly Ser Trp Tyr Gly Hi s Ile Al a Asn Gly Thr
595 550 555
Ser Trp Ser Gly Asn Al a Ser As p Lys Glu Gly Gly Asn Arg Al a Glu
560 565 570
Phe Thr Val Asn Phe Al a Asp Ly s Ly s Ile Thr Gly Lys Leu Thr Al a
575 580 585
Glu Asn Arg Gin Al a Gin Thr Ph e Thr Ile Glu Gly Me t Ile Gin Gly
590 595 600
Asn Gly Phe Glu Gly Thr Alá Ly s Thr Al a Glu Ser Gly Phe Asp Leu
605 610 615 620
Asp Gin Lys Asn Thr Thr Arg Thr Pro Ly s Al a Tyr Ile Thr As p Alá
625 630 635
Lys Val Lys Gly Gly Phe Tyr Gly Pro Lys Al a Glu Glu Leu Gly Gly
640 645 650
Trp Phe Al a Tyr Pro Gly As p Ly s Gin Thr Glu Lys Al a Thr Al a Thr
655 660 665
Ser Ser Asp Gly Asn Ser Al a Ser Ser Al a Thr Val Val Phe Gly Al a
670 675 680
Ly s Arg Gin Gin Pro Val Gin
685 690
HU 220 116 Β
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 1808 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: genomi DNS EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS :IM2394
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: sig_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 1-60
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 61 -1797
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHEL YEZKEDÉS :1-1797
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: miscfeature
ELHELYEZKEDÉS: 61-1035
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: misc feature
ELHELYEZKEDÉS: 1036-1386
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: misc feature
ELHELYEZKEDÉS: 1387-1797
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: misc_binding
ELHELYEZKEDÉS: 46-1050
A 3. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
ATG AAC AAT CCA TTG GTA AAT Asn CAG GCT GCT ATG GTG CTG Leu CCT GTG TTT 48
Me t -20 As n Asn Pro Leu Va 1 -15 Gin Al a Al a Me t -10 Val Pro Val Phe -5
TTG TTG AGT GCT TGT CTG GGT GGC GGC GGC AGT TTC GAT TTG GAC AGC 96
Leu Leu Ser Al a Cy s 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Ser Phe As p Leu 10 Asp Ser
GTG GAA ACC GTG CAA GAT ATG CAC TCC AAA CCT AAG TAT GAG GAT GAA 144
Va 1 Gl u Thr 15 Val Gin As p Me t Hi s 20 Ser Lys Pro Lys Tyr 25 Glu Asp Glu
AAA AGC CAG CCT GAA AGC CAA CAG GAT GTA TCG GAA AAC AGC GGC GCG 192
Lys Ser 30 Gin Pro Glu Ser Gin 35 Gin As p Val Ser Glu 40 Asn Ser Gly Al a
GCT TAT GGC TTT GCA GTA AAA CTA CCT CGC CGG AAT GCA CAT TTT AAT 240
Al a 45 Tyr Gly Phe Al a Val 50 Lys Leu Pro Arg Arg 55 Asn Al a Hi s Phe Asn 60
CCT AAA TAT AAG GAA AAG CAC AAA CCA TTG GGT TCA ATG GAT TGG AAA 288
Pro Ly s Tyr Ly s Glu 65 Lys Hi s Ly s Pro Leu 70 Gly Ser Me t Asp Trp 75 Lys
AAA CTG CAA AGA GGA GAA CCA AAT AGT TTT AGT GAG AGG GAT GAA TTG 336
Lys Leu Gin Arg 80 Gly Glu Pro Asn Ser 85 Phe Ser Glu Arg As p 90 Gl u Leu
HU 220 116 Β
GAA AAA AAA CGG GGT AGT TCT GAA CTT ATT GAA TCA AAA TGG GAA GAT 384
Glu Ly s Ly s 95 Arg Gly Ser Ser Glu 100 Leu I le Glu Ser Lys 105 Trp Glu Asp
GGG CAA AGT CGT GTA GTT GGT TAT ACA AAT TTC ACT TAT GTC CGT TCG 432
Gl y Gin 110 Ser Arg Va 1 Val Gly 115 Tyr Thr Asn Phe Thr 120 Tyr Va 1 Arg Ser
GGA TAT GTT TAC CTT AAT AAA AAT AAT ATT GAT ATT AAG AAT AAT ATA 480
Gly 125 Tyr Va 1 Tyr Leu Asn 130 Lys Asn Asn I le As p 135 I le Lys Asn Asn I le 140
GTT CTT TTT GGA CCT GAC GGA TAT CTT TAC TAT AAA GGG AAA GAA CCT 528
Val Leu Phe Gly Pro 145 As p Gly Tyr Leu Tyr 150 Tyr Ly s Gly Ly s Glu 155 Pro
TCC AAG GAG CTG CCA TCG GAA AAG ATA ACT TAT AAA GGT ACT TGG GAT 576
Ser Ly s Glu Leu 160 Pro Ser Glu Ly s I le 165 Thr Tyr Lys Gly Thr 170 Trp Asp
TAT GTT ACT GAT GCT ATG GAA AAA CAA AGG TTT GAA GGA TTG GGT AGT 624
Tyr Va 1 Thr 175 As p Al a Me t Glu Ly s 180 Gin Arg Phe Glu Gly 185 Le u Gly Ser
GCA GCA GGA GGA GAT AAA TCG GGG GCG TTG TCT GCA TTA GAA GAA GGG 672
Al a Al a 190 Gly Gly As p Ly s Ser 195 Gly Al a Leu Ser Al a 200 Leu Glu Glu Gly
GTA TTG CGT AAT CAG GCA GAG GCA TCA TCC GGT CAT ACC GAT TTT GGT 720
Va 1 205 Leu Arg Asn Gin Al a 210 Glu Al a Ser Ser Gly 215 Hi s Thr As p Phe Gly 220
ATG ACT AGT GAG TTT GAG GTT GAT TTT TCT GAT AAA ACA ATA AAG GGC 768
Me t Thr Ser Glu Phe 225 Glu Val As p Phe Ser 230 Asp Lys Thr I le Lys 235 Gly
ACA CTT TAT CGT AAC AAC CGT ATT ACT CAA AAT AAT AGT GAA AAC AAA 816
Thr Leu Tyr Arg 240 As n Asn Arg 11 e Thr 245 Gin As n Asn Ser Glu 250 Asn Lys
CAA ATA AAA ACT ACG CGT TAC ACC ATT CAA GCA ACT CTT CAC GGC AAC 864
Gin I le Ly s 255 Thr Thr Arg Tyr Thr 260 I le Gl n Al a Thr Leu 265 Hi s Gly Asn
CGT TTC AAA GGT AAG GCG TTG GCG GCA GAT AAA GGT GCA ACA AAT GGA 912
Arg Phe 270 Lys Gly Ly s Al a Leu 275 Al a Al a As p Ly s Gly 280 Al a Thr Asn Gly
AGT CAT CCC TTT ATT TCC GAC TCC GAC AGT TTG GAA GGC GGA TTT TAC 960
Ser 285 Hi s Pro Phe I le Ser 290 Asp Ser Asp Ser Leu 295 Glu Gly Gly Phe Tyr 300
GGG CCG AAA GGC GAG GAA CTT GCC GGT AAA TTC TTG AGC AAC GAC AAC 1008
Gly Pro Ly s Gly Glu 305 Glu Leu Al a Gly Ly s 310 Phe Leu Ser Asn As p 315 Asn
AAA GTT GCA GCG GTG TTT GGT GCG AAG CAG AAA GAT AAG AAG GAT GGG 1056
Ly s Val Al a Al a 320 Va 1 Phe Gly Al a Lys 325 Gin Ly s Asp Ly s Ly s 330 Asp Gly
HU 220116 Β
GAA AAC GCG GCA GGG Gly CCT GCA ACG GAA ACC GTG ATA GAT GCA Al a TAC Tyr CGT Arg 1104
Glu Asn Al a 335 Al a Pro Alá Thr 340 Glu Thr Val Ile Asp 345
ATT ACC GGC GAG GAG TTT AAG AAA GAG CAA ATA GAC AGT TTT GGA GAT 1152
Ile Thr Gly Glu Glu Phe Ly s Ly s Glu Gin Ile Asp Ser Phe Gly As p
350 355 360
GTG AAA AAG CTG CTG GTT GAC GGA GTG GAG CTT TCA CTG CTG CCG TCT 1200
Val Ly s Lys Leu Leu Val Asp Gly Va 1 Glu Leu Ser Leu Leu Pro Ser
365 370 375 380
GAG GGC AAT AAG GCG GCA TTT CAG CAC GAG ATT GAG CAA AAC GGC GTG 1248
Glu Gly Asn Lys Alá Al a Phe Gin Hi s Glu Ile Glu Gin Asn Gly Val
385 390 395
AAG GCA ACG GTG TGT TGT TCC AAC TTG GAT TAC ATG AGT TTT GGG AAG 1296
Lys Al a Thr Val Cy s Cys Ser Asn Leu Asp Tyr Me t Ser Phe Gly Ly s
400 405 410
CTG TCA AAA GAA AAT AAA GAC GAT ATG TTC CTG CAA GGT GTC CGC ACT 1344
Leu Ser Lys Glu Asn Ly s As p As p Me t Phe Leu Gin Gly Val Arg Thr
415 420 425
CCA GTA TCC GAT GTG GCG GCA AGG ACG GAG GCA AAC GCC AAA TAT CGC 1392
Pro Val Ser As p Va 1 Al a Al a Arg Thr Glu Al a Asn Al a Ly s Tyr Arg
430 435 440
GGT ACT TGG TAC GGA TAT ATT GCC AAC GGC ACA AGC TGG AGC GGC GAA 1440
Gly Thr Trp Tyr Gl y Tyr Ile Al a As n Gly Thr Ser Trp Ser Gly Glu
445 450 455 460
GCC TCC AAT CAG GAA GGT GGT AAT AGG GCA GAG TTT GAC GTG GAT TTT 1488
Al a Ser Asn Gin Glu Gly Gly Asn Arg Al a Glu Phe As p Val Asp Phe
465 470 475
TCC ACT AAA AAA ATC AGT GGC ACA CTG ACG GCA AAA GAC CGT ACG TCT 1536
Ser Thr Lys Ly s Ile Ser Gly Thr Leu Thr Al a Ly s Asp Arg Thr Ser
480 485 490
CCT GCG TTT ACT ATT ACT GCC ATG ATT AAG GAC AAC GGT TTT TCA GGT 1584
Pro Al a Phe Thr Ile Thr Al a Me t Ile Ly s As p Asn Gly Phe Ser Gly
495 500 505
GTG GCG AAA ACC GGT GAA AAC GGC TTT GCG CTG GAT CCG CAA AAT ACC 1632
Val Al a Lys Thr Gly Glu Asn Gly Phe Al a Leu Asp Pro Gin Asn Thr
510 515 520
GGA AAT TCC CAC TAT ACG CAT ATT GAA GCC ACT GTA TCC GGC GGT TTC 1680
Gly Asn Ser Hi s Tyr Thr Hi s Ile Glu Al a Thr Va 1 Ser Gly Gly Phe
525 530 535 540
TAC GGC AAA AAC GCC ATC GAG ATG GGC GGA TCG TTC TCA TTT CCG GGA 1728
Tyr Gly Lys Asn Al a Ile Glu Me t Gly Gly Ser Phe Ser Phe Pro Gly
545 550 555
AAT GCA CCA GAG GGA AAA CAA GAA AAA GCA TCG GTG GTA TTC GGT GCG 1776
Asn Al a Pro Glu Gly Lys Gin Glu Lys Al a Ser Va 1 Val Phe Gly Al a
560 565 570
HU 220 116 Β
AAA CGC CAA CAG CTT GTG CAA TAAGCACGGC T 1808 Lys Arg Gin Gin Leu Val Gin
575
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 599 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 4. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Me t -20 Asn Asn Pro Leu Val -15 Asn Gin Al a Al a Me t -10 Val Leu Pro Val Phe -5
Leu Leu Ser Al a Cy s 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Ser Phe Asp Leu 10 Asp Ser
Val Glu Thr 15 Val Gin As p Me t Hi s 20 Ser Ly s Pro Lys Tyr 25 Glu Asp Glu
Lys Ser 30 Gin Pro Glu Ser Gin 35 Gin As p Val Ser Glu 40 Asn Ser Gly Al a
Al a 45 Tyr Gly Phe Al a Va 1 50 Ly s Leu Pro Arg Arg 55 Asn Al a Hi s Phe Asn 60
Pro Lys Tyr Ly s Gl u 65 Lys Hi s Ly s Pro Leu 70 Gly Ser Me t As p Trp 75 Lys
Lys Leu Gin Arg 80 Gly Glu Pro As n Ser 85 Phe Ser Glu Arg As p 90 Glu Leu
Glu Lys Lys 95 Arg Gly Ser Ser Glu 100 Leu Ile Glu Ser Lys 105 Trp Glu Asp
Gly Gin 110 Ser Arg Va 1 Va 1 Gly 115 Tyr Thr Asn Phe Thr 120 Tyr Va 1 Arg Ser
Gly 125 Tyr Val Tyr Leu Asn 130 Ly s Asn Asn Ile As p 135 Ile Ly s Asn Asn Ile 140
Va 1 Leu Phe Gly Pro 145 Asp Gly Tyr Leu Tyr 150 Tyr Ly s Gly Ly s Glu 155 Pro
Ser Ly s Glu Leu 160 Pro Ser Glu Ly s Ile 165 Thr Tyr Lys Gly Thr 170 Trp Asp
Tyr Val Thr 175 Asp Al a Me t Gl u Lys 180 Gin Arg Phe Glu Gly 185 Leu Gly Ser
Al a Alá 190 Gly Gly As p Lys Ser 195 Gly Al a Leu Ser Alá 200 Leu Glu Glu Gly
Va 1 205 Leu Arg Asn Gin Alá 210 Glu Al a Ser Ser Gly 215 Hi s Thr As p Phe Gly 220
Me t Thr Ser Glu Phe 225 Glu Va 1 As p Phe Ser 230 As p Ly s Thr Ile Lys 235 Gly
HU 220 116 Β
Thr Leu
Gin Ile
Arg Phe 270
Ser His 285
Gly Pro
Lys Val
Glu Asn le Thr 350
Val Lys 365
Glu Gly
Lys Alá
Leu Ser
Pro Val 430
Gly Thr 445
Alá Ser
Ser Thr
Pro Alá
Val Alá 510
Gly Asn 525
Tyr Gly
Tyr Arg 240
Ly s 255 Thr
Lys Gly
Pro Phe
Lys Gly
Al a Al a 320
Al a 335 Al a
Gly Glu
Lys Leu
Asn Ly s
Thr Va 1 400
Ly s 415 Glu
Ser As p
Trp Tyr
Asn Gin
Ly s Lys 480
Phe 495 Thr
Lys Thr
Ser Hi s
Lys Asn
Asn Asn
Thr Arg
Lys Alá
Ile Ser 290
Glu Glu 305
Val Phe
Gly Pro
Glu Phe
Leu Val 370
Alá Alá 385
Cys Cys
Asn Lys
Val Alá
Gly Tyr 450
Glu Gly 465
Ile Ser
Ile Thr
Gly Glu
Tyr Thr 530
Alá Ile 545
Arg Ile
Tyr Thr 260
Leu Alá 275
Asp Ser
Leu Alá
Gly Alá
Alá Thr 340
Lys Lys 355
Asp Gly
Phe Gin
Ser Asn
Asp Asp 420
Alá Arg 435
Ile Alá
Gly Asn
Gly Thr
Alá Met 500
Asn Gly 515
His Ile
G1 u Me t
Thr Gin 245
Ile Gin
Alá Asp
Asp Ser
Gly Lys 310
Lys Gin 325
Glu Thr
Glu Gin
Val Glu
His Glu 390
Leu Asp 405
Met Phe
Thr Glu
Asn Gly
Arg Alá 470
Leu Thr 485
Ile Lys
Phe Alá
Glu Alá
Gly Gly 550
Asn Asn
Alá Thr
Lys Gly 280
Leu Glu 295
Phe Leu
Lys Asp
Val Ile
Ile Asp 360
Leu Ser 375
He Glu
Tyr Me t
Leu Gin
Alá Asn 440
Thr Ser 455
Glu Phe
Alá Lys
Asp Asn
Leu Asp 520
Thr Val 535
Ser Phe
Ser Glu 250
Leu Hi s 265
Alá Thr
Gly Gly
Ser Asn
Lys Lys 330
Asp Alá 345
Ser Phe
Leu Leu
Gin Asn
Ser Phe 410
Gly Val 425
Alá Lys
Trp Ser
Asp Val
Asp Arg 490
Gly Phe 505
Pro Gin
Ser Gly
Ser Phe
Asn Ly s
Gly Asn
Asn Gly
Phe Tyr 300
Asp 315 Asn
As p Gly
Tyr Arg
Gly As p
Pro Ser 380
Gly 395 Val
Gly Ly s
Arg Thr
Tyr Arg
Gly Glu 460
Asp 475 Phe
Thr Ser
Ser Gly
Asn Thr
Gly Phe 540
Pro 555 Gly
HU 220 116 Β
Asn Alá Pro Glu Gly Lys Gin Glu Lys Alá Ser Val Val Phe Gly Alá 560 565 570
Lys Arg Gin Gin Leu Val Gin 575
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 2255 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS: M978
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS :1-2115
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-2115
AZ 5. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
TGT CTG GGT GGC GGC GGC ACG TTC GAT CTT GAT TCT GTC GAT ACC GAA
Cy s 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Thr Phe Asp Leu 10 As p Ser Val As p Thr 15 Glu
GCC CCG CGT CCC GCC CCA AAA TAT CAA GAT GTT TCT TCC GAA AAA CCG
Al a Pro Arg Pro 20 Al a Pro Ly s Tyr Gin 25 Asp Val Ser Ser Glu 30 Lys Pro
CAA GCC CAA AAA GAC CAA GGC GGA TAC GGT TTT GCA ATG CGC CTC AAG
Gin Al a Gin 35 Lys Asp Gin Gly Gly 40 Tyr Gly Phe Al a Me t 45 Arg Leu Lys
CGG CGG AAT TGG CAT CCG CAG GCA AAT CCT AAA GAA GAT GAG ATA AAA
Arg Arg 50 Asn Trp Hi s Pro Gin 55 Al a Asn Pro Ly s Glu 60 As p Glu Ile Ly s
CTT TCT GAA AAT GAT TGG GAG GCG ACA GGA TTG CCA GGC AAT CCC AAA
Leu 65 Ser Glu Asn Asp Trp 70 Glu Al a Thr Gly Leu 75 Pro Gly As n Pro Ly s 80
AAC TTA CCT GAG CGA CAG AAA TCG GTT ATT GAA AAA GTA AAA ACA GGC
Asn Leu Pro Glu Arg 85 Gin Ly s Ser Val Ile 90 Glu Lys Val Ly s Thr 95 Gly
AGC GAC AGC AAT ATT TAT TCT TCC CCC TAT CTC ACG CAA TCA AAC CAT
Ser As p Ser Asn 100 Ile Tyr Ser Ser Pro 105 Tyr Leu Thr Gin Ser 110 Asn Hi s
CAA AAC GGC AGT GCA AAC CAA CCA AAA AAT GAA GTA AAA GAT TAT AAA
Gin Asn Gly 115 Ser Al a Asn Gin Pro 120 Ly s Asn Glu Val Lys 125 Asp Tyr Lys
GAG TTC AAA TAT GTT TAT TCC GGT TGG TTT TAC AAA CAC GCT AAA CTC
Glu Phe Ly s Tyr Val Tyr Ser Gly Trp Phe Tyr Lys Hi s Al a Ly s Leu
130 135 140
144
192
240
288
336
384
432
HU 220 116 Β
GAA Glu 145 ATC Ile ATA Ile AAA Lys GAA Glu AAC Asn 150 AAC Asn TTA ATT AAG GGT GCA AAG Ly s AGC GGC GAC Asp 160 480
Leu Ile Lys Gly 155 Al a Ser Gly
GAC GGT TAT ATC TTT TAT CAC GGT GAA AAA CCT TCC CGA CAA CTT CCC 528
Asp Gly Tyr Ile Phe 165 Tyr Hi s Gly Glu Ly s 170 Pro Ser Arg Gin Leu 175 Pro
GTT TCT GGA GAA GTT ACC TAC AAA GGC GTA TGG CAT TTT GTA ACC GAT 576
Val Ser Gly Glu 180 Va 1 Thr Tyr Ly s Gly 185 Va 1 Trp Hi s Phe Va 1 190 Thr As p
ACG AAA CAG GGA CAA AAA TTT AAC GAT ATT CTT GGA ACC TCA AAA AAA 624
Thr Ly s Gin 195 Gly Gin Lys Phe Asn 200 Asp Ile Leu Gly Thr 205 Ser Ly s Ly s
CAA GGC GAC AGG TAT AGC GGA TTT CCG GGT GAT GAC GGC GAA GAA TAT 672
Gin Gly 210 Asp Arg Tyr Ser Gly 215 Phe Pro Gly As p Asp 220 Gly Glu Glu Tyr
TCC AAT AAA AAT GAA GCG ACT TTA CAA GGC AGT CAA GAG GGT TAT GGT 720
Ser 225 Asn Lys Asn Glu Al a 230 Thr Leu Gin Gly Ser 235 Gin Glu Gly Tyr Gly 290
TTT ACC TCA AAT TTA AAA GTG GAT TTC AAT AAG AAA AAA TTG ACG GGT 768
Phe Thr Ser Asn Leu 245 Ly s Va 1 As p Phe Asn 250 Ly s Ly s Lys Leu Thr 255 Gly
GAA TTG ATA CGC AAT AAT AGA GTT ACA AAC GCT ACT GCT AAC GAT AAA 816
Glu Leu Ile Arg 260 Asn Asn Arg Val Thr 265 Asn Al a Thr Alá As n 270 As p Lys
TAC ACC ACC CAA TAT TAC AGC CTT GAG GCT CAA GTA ACA GGC AAC CGC 864
Tyr Thr Thr 275 Gin Tyr Tyr Ser Leu 280 Glu Al a Gl n Val Thr 285 Gly Asn Arg
TTC AAC GGC AAG GCA ACG GCA ACC GAC AAA CCT GGC ACT GGA GAA ACC 912
Phe Asn 290 Gl y Lys Al a Thr Al a 295 Thr Asp Ly s Pro Gly 300 Thr Gly Glu Thr
AAA CAA CAT CCC TTT GTT TCC GAC TCG TCT TCT TTG AGC GGC GGC TTT 960
Ly s 305 Gin Hi s Pro Phe Val 310 Ser As p Ser Ser Ser 315 Leu Ser Gly Gly Phe 320
TTC GGC CCG AAG GGT GAG GAA TTG GGT TTC CGC TTT TTG AGC AAC GAT 1008
Phe Gly Pro Ly s Gly 325 Glu Glu Le u Gly Phe 330 Arg Phe Leu Ser Asn 335 As p
CAA AAA GTT GCC GTT GTC GGC AGC GCG AAA ACC CAA GAC AAA GCC GCA 1056
Gin Ly s Va 1 Al a 340 Va 1 Val Gly Ser Al a 345 Ly s Thr Gin Asp Ly s 350 Al a Al a
AAT GGC AAT ACT GCG GCG GCT TCA GGC GGC ACA GAT GCG GCA GCA TCA 1104
Asn Gly Asn 355 Thr Al a Al a Al a Ser 360 Gly Gly Thr Asp Al a 365 Al a Al a Ser
AAC GGT GCG GCA GGC ACG TCG TCT GAA AAC AGT AAG CTG ACC ACG GTT 1152
Asn Gly 370 Al a Al a Gl y Thr Ser 375 Ser Glu As n Ser Ly s 380 Leu Thr Thr Val
HU 220 116 Β
TTG GAT GCG GTT Val GAA Glu TTG ACA CTA AAC GAC AAG AAA Lys ATC Ile AAAAAAT CTC Leu 400 1200
Leu 385 Asp Alá Leu 390 Thr Leu Asn Asp Lys 395 Lys Asn
GAC AAC TTC AGC AAT GCC GCC CAA CTG GTT GTC GAC GGC ATT ATG ATT 1248
Asp Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Va 1 Va 1 As p Gly Ile Me t Ile
405 410 415
CCG CTC CTG CCC GAG ACT TCC GAA AGT GGG AGC AAT CAG GCA GAT AAA 1296
Pro Leu Leu Pro Glu Thr Ser Glu Ser Gly Ser Asn Gin Al a As p Ly s
420 425 430
GGT AAA AAA GGT AAA AAC GGT AAA AAC GGC GGA ACA GAC TTT ACC TAC 1349
Gly Ly s Lys Gly Lys Asn Gly Ly s Asn Gly Gly Thr As p Phe Thr Tyr
435 440 445
AAA ACA ACC TAC ACG CCG AAA AAC GAT GAC AAA GAT ACC AAA GCC CAA 1392
Lys Thr Thr Tyr Thr Pro Ly s Asn Asp As p Ly s Asp Thr Ly s Al a Gin
450 455 460
ACA GGT GCG GCA GGC TCT AGC GGC GCA CAA ACC GAT TTG GGT AAG GCG 1440
Thr Gly Al a Al a Gly Ser Ser Gly Al a Gin Thr As p Leu Gly Lys Al a
465 470 475 480
GAC GTT AAC GGC GGT AAG GCA GAA ACA AAA ACC TAT GAA GTC GAA GTC 1488
As p Val Asn Gly Gly Lys Al a Glu Thr Lys Thr Tyr Glu Va 1 Glu Val
485 490 495
TGC TGT TCC AAC CTC AAT TAT CTG AAA TAC GGA ATG TTG ACG CGT AAA 1536
Cys Cys Ser Asn Leu Asn Tyr Le u Lys Tyr Gly Me t Leu Thr Arg Lys
500 505 510
AAC AGC AAG TCC GCG ATG CAG GCA GGA GGA AAC AGT AGT CAA GCT GAT 1584
Asn Ser Lys Ser Al a Me t Gin Al a Gly Gly Asn Ser Ser Gin Al a Asp
515 520 525
GCT AAA ACG GAA CAA GTT GAA CAA AGT ATG TTC CTC CAA GGC GAG CGT 1632
Al a Ly s Thr Glu Gin Val Glu Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg
530 535 540
ACC GAT GAA AAA GAG ATT CCA AAC GAC CAA AAC GTC GTT TAT CGG GGG 1680
Thr As p Glu Lys Glu Ile Pro Asn As p Gin Asn Val Va 1 Tyr Arg Gly
545 550 555 560
TCT TGG TAC GGG CAT ATT GCC AGC AGC ACA AGC TGG AGC GGC AAT GCT 1728
Ser Trp Tyr Gly Hi s I le Al a Ser Ser Thr Ser Trp Ser Gly Asn Al a
565 570 575
TCC AAT GCA ACG AGT GGC AAC AGG GCG GAA TTT ACT GTG AAT TTC G.AT 1776
Ser Asn Al a Thr Ser Gly Asn Arg Alá Glu Phe Thr Val Asn Phe Asp
580 585 590
ACG AAA AAA ATT AAC GGC ACG TTA ACC GCT GAA AAC AGG CAG GAG GCA 1824
Thr Ly s Lys Ile Asn Gly Thr Leu Thr Al a Glu Asn Arg Gin Glu Al a
595 600 605
ACC TTT ACC ATT GAT GGT AAG ATT GAG GGC AAC GGT TTT TCC GGT ACG 1872
Thr Phe Thr Ile Asp Gly Ly s Ile Glu Gly Asn Gly Phe Ser Gly Thr
610 615 620
HU 220116 Β
GCA AAA ACT GCT GAC TTA GGT TTT GAT CTC GAT CAA AGC AAT ACC ACC
Al a 625 Lys Thr Al a Asp Leu 630 Gly Phe Asp Leu As p 635 Gin Ser Asn Thr Thr 640
GGC ACG CCT AAG GCA TAT ATC ACA GAT GCC AAG GTG CAG GGC GGT TTT
Gly Thr Pro Lys Alá 645 Tyr Ile Thr Asp Al a 650 Ly s Val Gin Gly Gly 655 Phe
TAC GGG CCT AAA GCC GAA GAG TTG GGC GGA TGG TTT GCC TAT CCG GGC
Tyr Gly Pro Ly s 660 Al a Glu Glu Leu Gly 665 Gly Trp Phe Al a Tyr 670 Pro Gly
GAT AAA CAA ACG GAA AAG GCA ACG GTT GCA TCC GGC GAT GGA AAT TCA
As p Lys Gin 675 Thr Glu Lys Al a Thr 680 Val Al a Ser Gly Asp 685 Gly Asn Ser
GCA AGC AGC GCG ACC GTG GTA TTC GGT GCG AAA CGC CAA CAG CCT GTG
Al a Ser Ser Al a Thr Val Val Phe Gly Al a Ly s Arg Gin Gin Pro Val
690 695 700
CAA TAACTAAATG AAGTTGTCTG GGTGGCGGCG GCACGTTCGA TCTTGATTCT
Gin
705
GTCGATACCG AAGCCCCGCG TCCCGCCCCA AAATATCAAG ATGTTTCTTC CGAAAAACCG
CAAGCCCAAA AAGACCAAGG CGGATACGGT
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 705 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 6. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
1920
1968
2016
2064
2112
2165
2225
2255
Cys 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Thr Phe Asp Leu 10 As p Ser Val As p Thr 15 Glu
Al a Pro Arg Pro Al a Pro Lys Tyr Gin Asp Va 1 Ser Ser Glu Ly s Pro
20 25 30
Gin Al a Gin Ly s As p Gin Gly Gly Tyr Gly Phe Al a Me t Arg Leu Ly s
35 40 45
Arg Arg Asn Trp Hi s Pro Gin Al a Asn Pro Ly s G1 u As p Glu Ile Lys
50 55 60
Leu Ser Glu Asn Asp Trp Glu Al a Thr Gly Leu Pro Gly Asn Pro Lys
65 70 75 80
Asn Leu Pro Glu Arg Gin Ly s Ser Va 1 Ile Glu Lys Val Ly s Thr Gly
85 90 95
Ser As p Ser Asn Ile Tyr Ser Ser Pro Tyr Leu Thr Gin Ser As n Hi s
100 105 110
Gin Asn Gly Ser Al a Asn Gin Pro Lys Asn Glu Val Ly s As p Tyr Lys
115 120 125
HU 220 116 Β
Glu Phe 130 Lys Tyr Va 1 Tyr Ser 135 Gly Trp Phe Tyr Lys 140 Hi s Al a Lys Leu
Glu 145 Ile Ile Ly s Glu Asn 150 Asn Leu Ile Lys Gly 155 Al a Ly s Ser Gly Asp 160
As p Gly Tyr Ile Phe 165 Tyr Hi s Gl y Glu Ly s 170 Pro Ser Arg Gin Leu 175 Pro
Val Ser Gly Glu 180 Val Thr Tyr Ly s Gly 185 Val Trp Hi s Phe Val 190 Thr Asp
Thr Lys Gin 195 Gly Gin Lys Phe As n 200 As p Ile Leu Gly Thr 205 Ser Lys Lys
Gin Gly 210 As p Arg Tyr Ser Gly 215 Phe Pro Gly As p Asp 220 Gly Glu Glu Tyr
Ser 225 Asn Lys Asn Glu Al a 230 Thr Leu Gin Gly Ser 235 Gin Glu Gly Tyr Gly 240
Phe Thr Ser Asn Leu 245 Ly s Val As p Phe As n 250 Ly s Ly s Ly s Leu Thr 255 Gly
Glu Leu Ile Arg 260 Asn Asn Arg Va 1 Thr 265 Asn Al a Thr Al a Asn 270 Asp Ly s
Tyr Thr Thr 275 Gin Tyr Tyr Ser Leu 280 Glu Al a Gin Val Thr 285 Gly Asn Arg
Phe As n 290 Gly Lys Al a Thr Al a 295 Thr Asp Lys Pro Gly 300 Thr Gly Glu Thr
Ly s 305 Gin Hi s Pro Phe Val 310 Ser Asp Ser Ser Ser 315 Leu Ser Gly Gly Phe 320
Phe Gly Pro Lys Gly 325 Glu Glu Leu Gly Phe 330 Arg Phe Leu Ser Asn 335 Asp
Gin Ly s Va 1 Al a 340 Val Val Gly Ser Al a 345 Ly s Thr Gin Asp Ly s 350 Al a Al a
Asn Gl y Asn 355 Thr Al a Al a Al a Ser 360 Gly Gly Thr Asp Al a 365 Al a Al a Ser
Asn Gly 370 Al a Al a Gly Thr Ser 375 Ser Glu Asn Ser Ly s 380 Leu Thr Thr Val
Leu 385 Asp Alá Val Glu Leu 390 Thr Leu Asn Asp Ly s 395 Lys Ile Lys Asn Leu 400
Asp Asn Phe Ser Asn 405 Al a Alá Gin Leu Val 410 Va 1 As p Gly Ile Me t 415 Ile
Pro Leu Leu Pro 420 Glu Thr Ser Glu Ser 425 Gly Ser Asn Gin Al a 430 Asp Lys
Gly Ly s Ly s 435 Gly Ly s Asn Gly Ly s 440 Asn Gly Gl y Thr As p 445 Phe Thr Tyr
HU 220 116 Β
Lys Thr 450 Thr Tyr Thr Pro Lys 455 As n Asp Asp Ly s Asp 460 Thr Ly s Al a Gin
Thr 465 Gly Al a Al a Gly Ser 470 Ser Gly Al a Gin Thr 475 As p Leu Gly Ly s Al a 480
Asp Va 1 Asn Gly Gly 485 Lys Al a Glu Thr Ly s 490 Thr Tyr Glu Val Glu 495 Val
Cy s Cy s Ser Asn 500 Leu Asn Tyr Leu Ly s 505 Tyr Gly Me t Leu Thr 510 Arg Lys
Asn Ser Lys 515 Ser Alá Me t Gin Alá 520 Gly Gl y As n Ser Ser 525 Gin Al a Asp
Al a Ly s 530 Thr Glu Gin Va 1 Glu 535 Gin Ser Me t Phe Leu 540 Gin Gly Glu Arg
Thr 545 Asp Glu Lys Glu Ile 550 Pro Asn Asp Gin As n 555 Val Val Tyr Arg Gly 560
Ser Trp Tyr Gly Hi s 565 Ile Al a Ser Ser Thr 570 Ser Trp Ser Gly Asn 575 Al a
Ser Asn Al a Thr 580 Ser Gly Asn Arg Al a 585 Gl u Phe Thr Va 1 Asn 590 Phe As p
Thr Ly s Lys 595 Ile Asn Gly Thr Leu 600 Thr Al a Glu Asn Arg 605 Gl n Glu Al a
Thr Phe 610 Thr Ile As p Gly Lys 615 Ile Glu Gly As n Gly 620 Phe Ser Gly Thr
Al a 625 Lys Thr Al a Asp Leu 630 Gly Phe Asp Leu As p 635 Gin Ser Asn Thr Thr 640
Gly Thr Pro Lys Al a 645 Tyr Ile Thr Asp Al a 650 Ly s Va 1 Gin Gly Gly 655 Phe
Tyr Gly Pro Lys 660 Al a Glu Glu Leu Gly 665 Gly Trp Phe Al a Tyr 670 Pro Gly
Asp Lys Gin 675 Thr Glu Lys Al a Thr 680 Va 1 Al a Ser Gly Asp 685 Gly Asn Ser
Al a Ser 690 Ser Al a Thr Val Val 695 Phe Gly Al a Ly s Arg 700 Gin Gin Pro Val
Gin
705
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 2114 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: genomi DNS EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
HU 220 116 Β
TÖRZS: 6940
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 1-2079
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1 -2079
A 7. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
TGT TTG GGT GGC GGC Gly 5 GGC Gly ACG Thr TTC Phe GAT As p CTT GAT TCT GTC GAT ACC GAA Glu 48
Cys 1 Leu Gly Gly Leu 10 As p Ser Val Asp Thr 15
GCC CCG CGT CCC GAC CCA AAG TAT CAA GAT GTT TCT TCC GAA AAA CCG 96
Al a Pro Arg Pro As p Pro Lys Tyr Gin Asp Va 1 Ser Ser Glu Lys Pro
20 25 30
CAA GCC CAA AAA GAC CAA GGC GGA TAC GGT TTT GCG ATG AGG TTG AAA 144
Gin Al a Gin Ly s Asp Gin Gly Gly Tyr Gly Phe Al a Me t Arg Leu Ly s
35 40 45
CGG AGG AAT TGG TAT TCC GCA GCA AAA GAA GAC GAG GTT AAA CTG AAC 192
Arg Arg Asn Trp Tyr Ser Al a Al a Ly s Glu As p Glu Val Ly s Leu Asn
50 55 60
GAG AGT GAT TGG GAG ACG ACA GGA TTG CCG ACA GAA CCC AAG AAA CTG 240
Glu Ser As p Trp Glu Thr Thr Gly Leu Pro Thr Glu Pro Ly s Ly s Leu
65 70 75 80
CCA TTA AAA CAA GAA TCC GTC ATT TCA AAA GTA CAA GCA AAC AAT GGC 288
Pro Leu Lys Gin Glu Ser Val lle Ser Ly s Va 1 Gin Al a Asn Asn Gly
85 90 95
GAC AAC AAT ATT TAC ACT TCC CCC TAT CTC ACG CAA TCA AAC CAT CAA 336
Asp Asn Asn lle Tyr Thr Ser Pro Tyr Leu Thr Gin Ser Asn Hi s Gin
100 105 110
AAT AGC AGC ATT AAT GGC GGT GCA AAC CTG CCA AAA AAC GAA GTA ACA 384
Asn Ser Ser lle Asn Gly Gly Al a As n Leu Pro Lys Asn Glu Val Thr
115 120 125
AAT TAT AAA GAT TTC AAA TAT GTT TAT TCC GGC TGG TTT TAT AAA CAT 432
Asn Tyr Ly s Asp Phe Ly s Tyr Va 1 Tyr Ser Gly Trp Phe Tyr Ly s Hi s
130 135 140
GCT AAA AAC GAA ATC ATA AGA GAA AAC AGC TCA ATT AAG GGT GCA AAG 480
Al a Lys Asn Glu lle lle Arg Gl u Asn Ser Ser lle Ly s Gly Aaa Ly s
145 150 155 160
AAC GGC GAC GAC GGC TAT ATC TTT TAT CAC GGC AAA GAA CCT TCC CGA 528
Asn Gly Asp Asp Gly Tyr lle Phe Tyr Hi s Gly Lys Glu Pro Ser Arg
165 170 175
CAA CTT CCC GCT TCT GGA ACA GTT ACC TAT AAA GGT GTG TGG CAT TTT 576
Gin Leu Pro Al a Ser Gly Thr Va 1 Thr Tyr Ly s Gly Val Trp Hi s Phe
180 185 190
GCG ACC GAT GTC AAA AAA TCC CAA AAT TTT CGC GAT ATT ATC CAG CCT 624
Alá Thr Asp Va 1 Ly s Ly s Ser Gin Asn Phe Arg Asp lle lle Gin Pro
195 200 205
HU 220 116 Β
TCG Ser AAA Ly s 210 AAA Lys CAA Gin GGC GAC AGG Arg 215 TAT AGC GGA TTT Phe TCG GGC GAT GAT GAT 672
Gly Asp Tyr Ser Gly Ser 220 Gly Asp As p Asp
GAA CAA TAT TCT AAT AAA AAC GAA TCC ATG CTG AAA GAT GGT CAA GAG 720
Glu 225 Gin Tyr Ser Asn Lys 230 Asn Glu Ser Me t Leu 235 Ly s Asp Gly Gin Glu 240
GGT TAT GGT TTT ACC TCG AAT TTA GAA GTG GAT TTC GGC AGT AAA AAA 768
Gly Tyr Gly Phe Thr 245 Ser Asn Le u Glu Val 250 As p Phe Gly Ser Lys 255 Ly s
TTG ACG GGT AAA TTA ATA CGC AAT AAT AGA GTT ACA AAC GCT CCT ACT 816
Leu Thr Gly Ly s 260 Leu lle Arg As n Asn 265 Arg Va 1 Thr Asn Al a 270 Pro Thr
AAC GAT AAA TAC ACC ACC CAA TAC TAC AGC CTT GAT GCC CAA ATA ACA 864
Asn Asp Ly s 275 Tyr Thr Thr Gin Tyr 280 Tyr Ser Leu As p Al a 285 Gin lle Thr
GGC AAC CGC TTC AAC GGT AAG GCG ATA CGG ACC GAC AAA CCC GAC ACT 912
Gly Asn 290 Arg Phe Asn Gly Lys 295 Al a lle Arg Thr As p 300 Ly s Pro As p Thr
GGA GGA ACC AAA CTA CAT CCC TTT GTT TCC GAC TCG TCT TCT TTG AGC 960
Gl y 305 Gly Thr Ly s Leu H i s 310 Pro Phe Val Ser Asp 315 Ser Ser Ser Leu Ser 320
GGC GGC TTT TTC GGT CCG AAG GGT GAG GAA TTG GGT TTC CGC TTT TTG 1008
Gly Gly Phe Phe Gly 325 Pro Lys Gly Glu Glu 330 Leu Gly Phe Arg Phe 335 Leu
AGC GAC GAT AAA AAA GTT GCG GTT GTC GGC AGC GCG AAA ACC AAA GAC 1056
Ser Asp Asp Ly s 340 Lys Val Al a Val Val 345 Gly Ser Al a Ly s Thr 350 Lys Asp
AAA ACG GAA AAT GGC GCG GTG GCT TCA GGC GGC ACA GAT GCG GCA GCA 1104
Ly s Thr Glu 355 Asn Gly Alá Val Alá 360 Ser Gly Gly Thr Asp 365 Al a Al a Alá
TCA AAC GGT GCG GCA GGC ACG TCG TCT GAA AAC AGT AAG CTG ACC ACG 1152
Ser Asn 370 Gly Al a Al a Gly Thr 375 Ser Ser Glu Asn Ser 380 Ly s Leu Thr Thr
GTT TTG GAT GCG GTC GAG CTG AAA TTG GGC GAT AAG GAA GTC CAA AAG 1200
Val 385 Leu As p Al a Val Glu 390 Leu Ly s Leu Gl y Asp 345 Lys Glu Va 1 Gin Ly s 400
CTC GAC AAC TTC AGC AAC GCC GCC CAA CTG GTT GTC GAC GGC ATT ATG 1248
Leu Asp Asn Phe Ser 405 Asn Al a Al a Gin Leu 410 Val Val Asp Gly lle 415 Me t
ATT CCG CTC TTG CCC GAG GCT TCC GAA AGT GGG AAC AAT CAA GCC AAT 1296
lle Pro Leu Leu 420 Pro Glu Al a Ser Glu 425 Ser Gly Asn Asn Gin 430 Al a Asn
CAA GGT ACA AAT GGC GGA ACA GCC TTT ACC CGC AAA TTT GAC CAC ACG 1344
Gin Gly Thr 435 Asn Gly Gly Thr Al a 440 Phe Thr Arg Ly s Phe 445 As p Hi s Thr
HU 220 116 Β
CCG GAA AGT Ser GAT AAA AAA Lys GAC GCC CAA GCA GGT ACG CAG ACG AAT Asn GGG Gly 1392
Pro Glu 450 Asp Lys As p 455 Al a Gin Alá Gly Thr 460 Gin Thr
GCG CAA ACC GCT TCA AAT ACG GCA GGT GAT ACC AAT GGC AAA ACA AAA 1440
Al a 465 Gin Thr Alá Ser Asn 470 Thr Al a Gly As p Thr 475 Asn Gly Ly s Thr Lys 480
ACC TAT GAA GTC GAA GTC TGC TGT TCC AAC CTC AAT TAT CTG AAA TAC 1488
Thr Tyr Glu Val Glu 485 Val Cys Cy s Ser Asn 490 Leu Asn Tyr Leu Lys 495 Tyr
GGA ATG TTG ACG CGC AAA AAC AGC AAG TCC GCG ATG CAG GCA GGA GAA 1536
Gly Me t Leu Thr 500 Arg Ly s Asn Ser Ly s 505 Ser Al a Me t Gin Al a 510 Gly Glu
AGC AGT AGT CAA GCT GAT GCT AAA ACG GAA CAA GTT GAA CAA AGT ATG 1584
Ser Ser Ser 515 Gin Al a Asp Al a Ly s 520 Thr Glu Gin Val Glu 525 Gin Ser Me t
TTC CTC CAA GGC GAG CGC ACC GAT GAA AAA GAG ATT CCA AGC GAG CAA 1632
Phe Leu 530 Gin Gly Glu Arg Thr 535 As p Glu Lys Glu Ile 540 Pro Ser Glu Gin
AAC ATC GTT TAT CGG GGG TCT TGG TAC GGA TAT ATT GCC AAC GAC AAA 1680
Asn 545 Ile Va 1 Tyr Arg Gly 550 Ser Trp Tyr Gly Tyr 555 Ile Al a Asn As p Lys 560
AGC ACA AGC TGG AGC GGC AAT GCT TCC AAT GCA ACG AGT GGC AAC AGG 1728
Ser Thr Ser Trp Ser 565 Gly Asn Al a Ser Asn 570 Al a Thr Ser Gly Asn 575 Arg
GCG GAA TTT ACT GTG AAT TTT GCC GAT AAA AAA ATT ACT GGT ACG TTA 1776
Al a Glu Phe Thr 580 Val Asn Phe Al a Asp 585 Lys Lys Ile Thr Gly 590 Thr Leu
ACC GCT GAC AAC AGG CAG GAG GCA ACC TTT ACC ATT GAT GGT AAT ATT 1824
Thr Al a Asp 595 Asn Arg Gin Glu Al a 600 Thr Phe Thr I le Asp 605 Gly Asn Ile
AAG GAC AAC GGC TTT GAA GGT ACG GCG AAA ACT GCT GAG TCA GGT TTT 1872
Lys Asp 610 Asn Gly Phe Glu Gly 615 Thr Al a Ly s Thr Al a 620 Glu Ser Gly Phe
GAT CTC GAT CAA AGC AAT ACC ACC CGC ACG CCT AAG GCA TAT ATC ACA 1920
As p 625 Leu Asp Gin Ser Asn 630 Thr Thr Arg Thr Pro 635 Ly s Al a Tyr Ile Thr 640
GAT GCC AAG GTG CAG GGC GGT TTT TAC GGG CCC AAA GCC GAA GAG TTG 1968
Asp Al a Lys Va 1 Gin 645 Gly Gly Phe Tyr Gly 650 Pro Lys Al a Glu Glu 655 Leu
GGC GGA TGG TTT GCC TAT CCG GGC GAT AAA CAA ACG AAA AAT GCA ACA 2016
G1 y Gly Trp Phe 660 Al a Tyr Pro Gly Asp 665 Ly s Gin Thr Ly s Asn 670 Al a Thr
AAT GCA TCC GGC AAT AGC AGT GCA ACT GTC GTA TTC GGT GCG AAA CGC 2064
Asn Al a Ser 675 Gly Asn Ser Ser Al a 680 Thr Va 1 Va 1 Phe Gly 685 Al a Ly s Arg
HU 220 116 Β
CAA CAG CCT GTG CGA TAACGCAAGC CCAAAAAGAC CAAGGCGGAT ACGGT Gin Gin Pro Val Arg
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 693 bázispár
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 8. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
2114
Cy s 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Thr Phe As p Leu 10 As p Ser Val Asp Thr 15 Glu
Al a Pro Arg Pro 20 Asp Pro Lys Tyr Gin 25 Asp Val Ser Ser Glu 30 Ly s Pro
Gin Al a Gin 35 Lys As p Gin Gly Gly 40 Tyr Gly Phe Al a Me t 45 Arg Leu Lys
Arg Arg 50 Asn Trp Tyr Ser Al a 55 Al a Ly s Glu As p Glu 60 Val Lys Leu Asn
Glu 65 Ser Asp Trp Glu Thr 70 Thr Gly Leu Pro Thr 75 Glu Pro Lys Lys Leu 80
Pro Leu Lys Gin Glu 85 Ser Val Ile Ser Ly s 90 Va 1 Gin Al a Asn Asn 95 Gly
Asp Asn Asn Ile 100 Tyr Thr Ser Pro Tyr 105 Leu Thr Gin Ser As n 110 Hi s Gin
Asn Ser Ser 115 Ile Asn Gly Gly Al a 120 Asn Leu Pro Ly s Asn 125 Glu Val Thr
Asn Tyr 130 Lys Asp Phe Lys Tyr 135 Val Tyr Ser Gly Trp 140 Phe Tyr Lys Hi s
Al a 145 Ly s Asn Glu Ile Ile 150 Arg Glu Asn Ser Ser 155 Ile Lys Gly Al a Lys 160
Asn Gly Asp As p Gly 165 Tyr Ile Phe Tyr Hi s 170 Gly Lys Glu Pro Ser 175 Arg
Gin Leu Pro Al a 180 Ser Gly Thr Va 1 Thr 185 Tyr Ly s Gly Val Trp 190 Hi s Phe
Al a Thr Asp 195 Val Ly s Ly s Ser Gin 200 Asn Phe Arg Asp Ile 205 Ile Gin Pro
Ser Lys 210 Lys Gin Gly Asp Arg 215 Tyr Ser Gly Phe Ser 220 Gly Asp Asp Asp
Glu 225 Gin Tyr Ser Asn Ly s 230 Asn Glu Ser Me t Leu 235 Ly s Asp Gly Gin Glu 240
Gly Tyr Gly Phe Thr 245 Ser Asn Leu Gl u Val 250 Asp Phe Gly Ser Lys 255 Ly s
HU 220 116 Β
Leu Thr Gly Ly s 260 Leu Ile Arg Asn Asn 265 Arg Va 1 Thr Asn Al a 270 Pro Thr
Asn Asp Lys 275 Tyr Thr Thr Gin Tyr 280 Tyr Ser Le u Asp Al a 285 Gin Ile Thr
Gly Asn 290 Arg Phe As n Gly Lys 295 Al a Ile Arg Thr As p 300 Ly s Pro Asp Thr
Gly 305 Gly Thr Ly s Leu Hi s 310 Pro Phe Val Ser Asp 315 Ser Ser Ser Leu Ser 320
Gly Gly Phe Phe Gly 325 Pro Lys Gly Glu Glu 330 Leu Gly Phe Arg Phe 335 Leu
Ser Asp Asp Lys 340 Ly s Val Al a Va 1 Val 345 Gly Ser Al a Lys Thr 350 Ly s Asp
Ly s Thr Glu 355 As n Gly Alá Va 1 Al a 360 Ser Gly Gly Thr Asp 365 Al a Al a Al a
Ser Asn 370 Gly Alá Al a Gly Thr 375 Ser Ser Glu As n Ser 380 Lys Leu Thr Thr
Val 385 Leu Asp Al a Va 1 Glu 390 Leu Ly s Leu Gly Asp 395 Ly s Glu Val Gin Lys 400
Leu As p Asn Phe Ser 405 Asn Al a Al a Gin Leu 410 Val Val Asp Gly Ile 415 Me t
Ile Pro Leu Leu 420 Pro Glu Al a Ser Glu 425 Ser Gly Asn Asn Gl n 430 Al a Asn
Gin Gly Thr 435 Asn Gly Gly Thr Al a 440 Phe Thr Arg Lys Phe 445 Asp Hi s Thr
Pro Glu 450 Ser As p Lys Ly s Asp 455 Al a Gin Al a Gly Thr 460 Gin Thr Asn Gly
Al a 465 Gin Thr Al a Ser Asn 470 Thr Al a Gly Asp Thr 475 Asn Gly Ly s Thr Lys 480
Thr Tyr Glu Val Glu 485 Val Cys Cy s Ser Asn 490 Leu Asn Tyr Leu Lys 495 Tyr
Gly Me t Leu Thr 500 Arg Lys Asn Ser Ly s 505 Ser Al a Me t Gin Al a 510 Gly Glu
Ser Ser Ser 515 Gin Al a As p Al a Ly s 520 Thr Glu Gin Val Glu 525 Gin Ser Me t
Phe Leu 530 Gin Gly Glu Arg Thr 535 As p Glu Ly s Glu Ile 540 Pro Ser Glu Gin
Asn 545 lle Val Tyr Arg Gly 550 Ser Trp Tyr Gl y Tyr 555 Ile Al a Asn Asp Lys 560
Ser Thr Ser Trp Ser 565 Gly Asn Al a Ser Asn 570 Al a Thr Ser Gly Asn 575 Arg
HU 220 116 Β
Al a Glu Phe Thr 580 Val Asn Phe Al a Asp 585 Lys Lys Ile Thr G1 y 590 Thr Leu
Thr Al a Asp 595 Asn Arg Gin Glu Al a 600 Thr Phe Thr Ile As p 605 Gly Asn Ile
Lys As p 610 Asn Gly Phe Glu Gly 615 Thr Al a Lys Thr Al a 620 Glu Ser Gly Phe
As p 625 Leu Asp Gin Ser Asn 630 Thr Thr Arg Thr Pro 635 Ly s Al a Tyr Ile Thr 640
Asp Al a Lys Val Gin 645 Gly Gly Phe Tyr Gly 650 Pro Lys Al a Glu Glu 655 Leu
Gly Gly Trp Phe 660 Al a Tyr Pro Gly Asp 665 Ly s Gin Thr Ly s Asn 670 Al a Thr
Asn Al a Ser 675 Gly Asn Ser Ser Al a 680 Thr Val Val Phe Gly 685 Al a Lys Arg
Gin Gin Pro Val Arg 690
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 2114 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: egy TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: genomiDNS EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: S3032
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 1 -2097
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1 -2097
A 9. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
TGT TTG GGC GGA GGC GGC GGC AGT TTC GAT CTT GAT TCT GTC GAT ACC
Cy s 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Gly Ser Phe Asp 10 Leu Asp Ser Val Asp 15 Thr
GAA GCC CCG CGT CCC GCG CCA AAG TAT CAA GAT GTT TCT TCC GAA AAA
Glu Al a Pro Arg 20 Pro Al a Pro Lys Tyr 25 Gin As p Val Ser Ser 30 Glu Lys
CCG CAA GCC CAA AAA GAC CAA GGC GGA TAC GGT TTT GCG ATG AGG TTG
Pro Gin Alá 35 Gin Ly s Asp Gin Gly 40 Gly Tyr Gly Phe Al a 45 Me t Arg Leu
AAA CGG AGG AAT TGG TAT CCG TCG GCA AAA GAA AAC GAG GTT AAA CTG
Lys Arg 50 Arg Asn Trp Tyr Pro 55 Ser Al a Ly s Glu As n 60 Glu Val Ly s Leu
144
192
HU 220 116 Β
AAT GAG AGT Ser GAT As p TGG Trp GAG ACG ACA Thr GGA Gly TTG CCA AGC AAT CCC AAA AAC 240
Asn 65 Glu Glu 70 Thr Leu Pro 75 Ser Asn Pro Lys Asn 80
TTA CCT GAG CGA CAG AAA TCG GTT ATT GAT CAA GTA GAA ACA GAT GGC 288
Leu Pro Glu Arg Gin 85 Ly s Ser Val Ile Asp 90 Gl n Val Glu Thr As p 95 Gly
GAC AGC AAT AAC AGC AAT ATT TAT TCT TCC CCC TAT CTC ACG CAA TCA 336
As p Ser Asn Asn 100 Ser Asn Ile Tyr Ser 105 Ser Pro Tyr Leu Thr 110 Gin Ser
AAC CAT CAA AAC GGC AAC ACT GGC AAC GGT GTA AAC CAA CCA AAA AAC 384
Asn Hi s Gin 115 Asn Gly Asn Thr Gly 120 Asn Gly Va 1 Asn Gin 125 Pro Ly s Asn
GAA GTA ACA GAT TAC AAA AAT TTT AAA TAT GTT TAT TCC GGC TGG TTT 432
Glu Va 1 130 Thr Asp Tyr Lys Asn 135 Phe Ly s Tyr Va 1 Tyr 140 Ser Gly Trp Phe
TAC AAA CAC GCC AAA CGA GAG GTT AAC TTA GCG GTG GAA CCT AAA ATT 480
Tyr 145 Ly s Hi s Al a Lys Arg 150 Glu Val Asn Leu Al a 155 Val Glu Pro Lys Ile 160
GCA AAA AAC GGC GAC GAC GGT TAT ATC TTC TAT CAC GGT AAA GAC CCT 528
Al a Ly s Asn Gly As p 165 Asp Gly Tyr Ile Phe 170 Tyr Hi s Gly Ly s As p 175 Pro
TCC CGA CAA CTT CCC GCT TCT GGA AAA ATT ACC TAT AAA GGT GTG TGG 576
Ser Arg Gin Leu 180 Pro Al a Ser Gly Lys 185 Ile Thr Tyr Lys Gly 190 Val Trp
CAT TTT GCG ACC GAT ACA AAA AGG GGT CAA AAA TTT CGT GAA ATT ATC 624
Hi s Phe Al a 195 Thr As p Thr Ly s Arg 200 Gly Gin Lys Phe Arg 205 Glu Ile Ile
CAA CCT TCA AAA AAT CAA GGC GAC AGA TAT AGC GGA TTT TCG GGT GAT 672
Gin Pro 210 Ser Ly s As n Gin Gly 215 As p Arg Tyr Ser Gly 220 Phe Ser Gly Asp
GAT GAT GAA CAA TAT TCT AAT AAA AAC GAA TCC ATG CTG AAA GAT GGT 720
As p 225 As p Glu Gin Tyr Ser 230 Asn Ly s As n Glu Ser 235 Me t Leu Ly s Asp Gly 240
CAT GAA GGT TAT GGT TTT GCC TCG AAT TTA GAA GTG GAT TTC GAC AAT 768
Hi s Glu Gly Tyr Gly 245 Phe Al a Ser Asn Leu 250 Glu Val Asp Ph e As p 255 Asn
AAA AAA TTG ACG GGT AAA TTA ATA CGC AAT AAT GCG AAC CAA AAT AAT 816
Lys Ly s Leu Thr 260 Gly Ly s Leu Ile Arg 265 Asn Asn Al a As n Gin 270 Asn Asn
AAT ACT AAT AAT GAC AAA CAC ACC ACC CAA TAC TAC AGC CTT GAT GCG 864
Asn Thr Asn 275 Asn As p Lys Hi s Thr 280 Thr Gin Tyr Tyr Ser 285 Leu Asp Al a
ACG CTT AAG GGA AAC CGC TTC AGC GGA AAA GCG GAA GCA ACC GAC AAA 912
Thr Leu 290 Ly s Gly Asn Arg Phe 295 Ser Gly Ly s Al a Glu 300 Al a Thr Asp Ly s
HU 220 116 Β
CCC AAA AAC GAC GGC GAA ACC AAG GAA CAT CCC Pro 315 TTT Phe GTT Val TCC Ser GAC As p TCG Ser 320 960
Pro 305 Ly s Asn Asp Gly Glu 310 Thr Ly s Glu Hi s
TCT TCT TTG AGC GGC GGC TTT TTC GGC CCG CAG GGT GAG GAA TTG GGT 1008
Ser Ser Leu Se r Gly Gly Phe Phe Gly Pro Gin Gly Glu Glu Leu Gly
325 330 335
TTC CGC TTT TTG AGC AAC GAT CAA AAA GTT GCC GTT GTC GGC AGC GCG 1056
Phe Arg Phe Leu Ser Asn As p Gin Lys Va 1 Al a Val Va 1 Gly Ser Al a
340 345 350
AAA ACC AAA GAC AAA CCC GCA AAT GGC AAT ACT GCG GAG GCT TCA GGC 1104
Lys Thr Lys As p Ly s Pro Al a As n Gly Asn Thr Al a Glu Al a Ser Gly
355 360 365
GGC ACA GAT GCG GCA GCA TCG GGC GGT GCG GCA GGC ACG TCG TCT GAA 1152
Gly Thr As p Al a Al a Al a Ser Gly Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu
370 375 380
AAC AGT AAG CTG ACC ACG GTT TTG GAT GCG GTC GAG CTG ACG CAC GGC 1200
Asn Ser Lys Leu Thr Thr Val Le u Asp Al a Va 1 Glu Leu Thr Hi s Gly
385 390 395 400
GGC ACA GCA ATC AAA AAT CTC GAC AAC TTC AGC AAT GCC GCC CAA CTG 1248
Gly Thr Al a Ile Lys Asn Leu As p Asn Phe Ser As n Al a Al a Gin Leu
405 410 415
GTT GTC GAC GGC ATT ATG ATT CCG CTC CTG CCT CAA AAT TCA ACA GGC 1296
Val Val Asp Gly Ile Me t Ile Pro Leu Leu Pro Gin Asn Ser Thr Gly
420 425 430
AAA AAT AAT CAG CCC GAT CAA GGT AAA AAC GGC GGA ACA GCC TTT ATC 1344
Lys Asn Asn Gin Pro Asp Gin Gly Ly s Asn Gly Gly Thr Al a Phe Ile
435 440 445
TAT AAA ACG ACC TAC ACG CCG AAA AAC GAT GAC AAA GAT ACC AAA GCC 1392
Tyr Ly s Thr Thr Tyr Thr Pro Ly s Asn As p As p Ly s Asp Thr Ly s Al a
450 455 460
CAA ACA GTC ACG GGC GGC ACG CAA ACC GCT TCA AAT ACG GCA GGT GAT 1440
Gin Thr Val Thr Gly Gly Thr Gl n^Th r Al a Ser Asn Thr Al a Gly As p
465 470 475 480
GCC AAT GGC AAA ACA AAA ACC TAT GAA GTC GAA GTC TGC TGT TCC AAC 1488
Al a Asn Gly Ly s Thr Ly s Thr Tyr Glu Val Glu Val Cy s Cy s Ser Asn
485 490 495
CTC AAT TAT CTG AAA TAC GGG TTG CTG ACG CGC AAA ACT GCC GGC AAC 1536
Leu Asn Tyr Leu Ly s Tyr Gly Leu Leu Thr Arg Ly s Thr Al a Gly Asn
500 505 510
ACG GTG GGA AGC GGC AAC AGC AGC CCA ACC GCC GCC GCC CAA ACG GAC 1584
Thr Va 1 Gly Ser Gly Asn Ser Ser Pro Thr Al a Al a Al a Gin Thr Asp
515 520 525
GCG CAG AGT ATG TTC CTC CAA GGC GAG CGC ACC GAT GAA AAC AAG ATT 1632
Al a Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr As p Glu As n Ly s Ile
530 535 540
HU 220 116 Β
CCA Pro 545 AGC Ser GAG CAA AAC GTC Val 550 GTT TAT CGG GGG TCT TGG TAC Tyr GGG CAT Gly His ATT Ile 560 1680
Glu Gin Asn Val Tyr Arg Gly Ser 555 Trp
GCC AGC AGC ACA AGC TGG AGC GGC AAT GCT TCT GAT AAA GAG GGC GGC 1728
Al a Ser Ser Thr Ser Trp Ser Gly Asn Al a Ser Asp Lys Glu Gly Gly
565 570 575
AAC AGG GCG GAA TTT ACT GTG AAT TTT GGC GAG AAA AAA ATT ACC GGC 1776
Asn Arg Alá Glu Phe Thr Val Asn Phe Gly Glu Lys Ly s Ile Thr Gly
580 585 590
ACG TTA ACC GCT GAA AAC AGG CAG GAG GCA ACC TTT ACC ATT GAT GGT 1824
Thr Leu Thr Al a Glu Asn Arg Gin Glu Al a Thr Phe Thr Ile As p Gly
595 600 605
AAG ATT GAG GGC AAC GGT TTT TCC GGT ACG GCA AAA ACT GCT GAA TTA 1872
Lys Ile Glu Gly Asn Gly Phe Ser Gly Thr Al a Lys Thr Al a Glu Leu
610 615 620
GGT TTT GAT CTC GAT CAA AAA AAT ACC ACC CGC ACG CCT AAG GCA TAT 1920
Gly Phe Asp Leu Asp Gin Lys As n Thr Thr Arg Thr Pro Lys Alá Tyr
625 630 635 640
ATC ACA GAT GCC AAG GTA AAG GGC GGT TTT TAC GGG CCC AAA GCC GAA 1968
Ile Thr As p Al a Ly s Va 1 Lys Gly Gly Phe Tyr Gly Pro Ly s Al a Glu
645 650 655
GAG TTG GGC GGA TGG TTT GCC TAT TCG GAC GAT AAA CAA ACG AAA AAT 2016
Glu Leu Gly Gly Trp Phe Al a Tyr Ser As p As p Lys Gin Thr Lys Asn
660 665 670
GCA ACA GAT GCA TCC GGC AAT GGA AAT TCA GCA AGC AGT GCA ACT GTC 2064
Al a Thr Asp Al a Ser Gly Asn Gly Asn Ser Al a Ser Ser Al a Thr Val
675 680 685
GTA TTC GGT GCG AAA CGC CAA CAG CCT GTG CAA TAAACCAAGG CGGATAC 2114
Val Phe Gly Al a Lys Arg Gin Gin Pro Val Gin
690 695
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 699 bázispár TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 10. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Cys Leu Gly Gly Gly Gly Gly Ser Phe Asp Leu Asp Ser Val Asp Thr
1 5 10 15
Glu Al a Pro Arg Pro Al a Pro Lys Tyr Gin As p Val Ser Ser Glu Ly s
20 25 30
Pro Gin Al a Gin Ly s As p Gin Gly Gly Tyr Gly Phe Al a Me t Arg Leu
35 40 45
Ly s Arg Arg Asn Trp Tyr Pro Ser Al a Lys Glu Asn Glu Va 1 Ly s Leu
55 60
HU 220 116 Β
Asn 65 Glu Ser Asp Trp Glu 70 Thr Thr Gly Leu Pro 75 Ser Asn Pro Ly s Asn 80
Leu Pro Glu Arg Gin 85 Ly s Ser Val Ile As p 90 Gin Val Glu Thr As p 95 Gly
As p Ser Asn Asn 100 Ser Asn Ile Tyr Ser 105 Ser Pro Tyr Leu Thr 110 Gin Ser
Asn Hi s Gl n 115 Asn Gly Asn Thr Gly 120 Asn Gly Val Asn Gin 125 Pro Lys Asn
Glu Val 130 Thr Asp Tyr Ly s Asn 135 Phe Ly s Tyr Val Tyr 140 Ser Gly Trp Phe
Tyr 145 Ly s Hi s Al a Ly s Arg 150 Glu Va 1 Asn Leu Al a 155 Va 1 Glu Pro Lys Ile 160
Al a Lys Asn Gly As p 165 Asp Gly Tyr Ile Phe 170 Tyr Hi s Gly Ly s Asp 175 Pro
Ser Arg Gin Leu 180 Pro Al a Ser Gly Ly s 185 Ile Thr Tyr Lys Gly 190 Va 1 Trp
Hi s Phe Alá 195 Thr As p Thr Ly s Arg 200 Gly Gin Ly s Phe Arg 205 Gl u Ile Ile
Gin Pro 210 Ser Lys Asn Gin Gly 215 As p Arg Tyr Ser Gly 220 Phe Ser Gly Asp
As p 225 As p Glu Gin Tyr Ser 230 Asn Ly s Asn Glu Ser 235 Me t Leu Ly s Asp Gly 240
Hi s Glu Gly Tyr Gly 245 Phe Al a Ser Asn Leu 250 Glu Val Asp Phe As p 255 Asn
Lys Ly s Leu Thr 260 Gly Lys Leu Ile Arg 265 Asn As n Al a Asn Gin 270 Asn Asn
Asn Thr Asn 275 Asn Asp Lys Hi s Thr 280 Thr Gin Tyr Tyr Ser 285 Leu Asp Al a
Thr Leu 290 Ly s Gly As n Ar q Phe 295 Ser Gly Lys Al a Glu 300 Al a Thr Asp Lys
Pro 305 Ly s Asn As p Gly Glu 310 Thr Ly s Glu Hi s Pro 315 Phe Val Ser As p Ser 320
Ser Ser Leu Ser Gly 325 Gly Phe Phe Gl y Pro 330 Gin Gly Glu Glu Leu 335 Gly
Phe Arg Phe Leu 340 Ser Asn Asp Gin Lys 345 Val Al a Va 1 Va 1 Gly 350 Ser Al a
Lys Thr Ly s 355 Asp Ly s Pro Al a As n 360 Gly Asn Thr Al a Glu 365 Al a Ser Gly
Gly Thr Asp Al a Al a Al a Ser Gly Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu
370 375 380
HU 220 116 Β
Asn Ser Ly s Leu Thr Thr Val Leu Asp Al a Va 1 Glu Leu Thr Hi s Gly
385 390 395 400
Gly Thr Al a I le Ly s Asn Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu
405 410 415
Val Val Asp Gly I le Me t I le Pro Leu Leu Pro Gin Asn Ser Thr Gly
420 425 430
Lys Asn Asn Gin Pro Asp Gin Gl y Ly s Asn Gly Gly Thr Al a Phe I le
435 440 445
Tyr Ly s Thr Thr Tyr Thr Pro Ly s Asn Asp As p Ly s Asp Thr Ly s Al a
450 455 460
Gin Thr Val Thr Gly Gly Thr Gin Thr Alá Ser Asn Thr Al a Gly Asp
465 470 475 480
Al a Asn Gly Ly s Thr Ly s Thr Tyr Glu Val Glu Val Cy s Cy s Ser Asn
485 490 495
Leu Asn Tyr Leu Ly s Tyr Gly Leu Leu Thr Arg Ly s Thr Al a Gly Asn
500 505 510
Thr Val Gly Ser Gly As n Ser Ser Pro Thr Al a Al a Al a Gin Thr Asp
515 520 525
Al a Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr Asp Glu As n Ly s I le
530 535 540
Pro Ser Glu Gin Asn Val Val Tyr Arg Gly Ser Trp Tyr Gly Hi s I le
545 550 555 560
Al a Se r Ser Thr Ser Trp Ser Gly Asn Al a Ser Asp Lys Glu Gly Gly
565 570 575
Asn Arg Al a Glu Phe Thr Val Asn Phe Gly Glu Lys Ly s I le Thr Gly
580 585 590
Thr Leu Thr Al a Glu Asn Arg Gin Glu Al a Thr Phe Thr I 1 e Asp Gly
595 600 605
Ly s I le Glu Gly Asn Gly Phe Ser Gly Thr Al a Ly s Thr Al a Glu Leu
610 615 620
Gly Phe Asp Leu As p Gin Ly s Asn Thr Thr Arg Thr Pro Ly s Al a Tyr
625 630 635 640
1 le Thr Asp Al a Ly s Val Lys Gly Gly Phe Tyr Gly Pro Ly s Al a Glu
645 650 655
Glu Leu Gly Gl y Trp Phe Al a Tyr Ser As p As p Lys Gin Thr Ly s Asn
660 665 670
Al a Thr As p Al a Ser Gly Asn Gly Asn Ser Al a Ser Ser Al a Thr Val
675 680 685
Val Phe Gly Al a Ly s Arg Gin Gl n Pro Val Gin
690
695
HU 220 116 Β
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: peptid EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: IM2169
All. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr 1 Ly s Asp Ly s Leu 5 Glu Asn Gly Al a Alá 10 Al a Ser Gly Ser Thr 15 Gly
Alá Al a Alá Ser 20 Gly Gly 25 30
Leu Thr Thr 35 Val Leu Asp Al a Val 40 Glu Leu Thr Leu Asn 45 As p Lys Ly s
Ile Ly s 50 Asn Leu Asp Asn Phe 55 Ser Asn Al a Al a Gin 60 Leu Va 1 Va 1 Asp
Gly 65 Ile Me t Ile Pro Leu 70 Leu Pro Ly s Asp Ser 75 Glu Ser G1 y Asn Thr 80
Gin Al a As p Ly s Gly 85 Lys Asn Gly Gly Thr 90 Glu Phe Thr Arg Lys 95 Phe
Glu Hi s Thr Pro 100 Glu Ser Asp Lys Lys 105 Asp Al a Gin Al a Gly 110 Thr Gin
Thr Asn Gly 115 Al a Gin Thr Al a Ser 120 Asn Thr Al a Gly Asp 125 Thr Asn Gly
Lys Thr 130 Lys Thr Tyr Glu Val 135 Glu Val Cys Cy s Ser 140 Asn Leu Asn Tyr
Leu 145 Ly s Tyr Gly Me t Leu 150 Thr Arg Lys Asn Ser 155 Ly s Ser Al a Me t Gin 160
Al a Gly Gly As n Ser 165 Ser Gin Al a Asp Al a 170 Ly s Thr Glu Gin Val 175 Glu
Gin Ser Me t Phe 180 Leu Gin Gly Glu Arg 185 Thr As p Glu Lys Glu 190 Ile Pro
Thr As p Gin 195 Asn Va 1 Val
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: peptid EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: 6940
HU 220 116 Β
A 12. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr 1 Lys Asp Lys Thr 5 Glu Asn Gly
Al a Al a Al a Ser 20 Asn Gly Al a Al a
Leu Thr Thr 35 Val Leu Asp Al a Va 1 40
Val Gin 50 Lys Leu As p Asn Phe 55 Ser
Gly 65 Ile Me t Ile Pro Leu 70 Leu Pro
Gin Al a Asn Gin Gly 85 Thr Asn Gly
As p Hi s Thr Pro 100 Glu Ser As p Ly s
Thr As n Gly 115 Alá Gin Thr Al a Ser 120
Ly s Thr 130 Lys Thr Tyr Glu Va 1 135 Glu
Leu 145 Ly s Tyr Gly Me t Leu 150 Thr Arg
Al a Gly Glu Ser Ser 165 Ser Gin Al a
Gin Ser Me t Phe 180 Leu Gin Gly Glu
Ser Glu Gin Asn Ile Val
195
Al a Va 1 10 Al a Ser Gly Gly Thr 15 Asp
Gly 25 Thr Ser Ser Glu As n 30 Ser Lys
Glu Leu Ly s Leu Gly 45 As p Ly s Glu
Asn Al a Al a Gin 60 Leu Va 1 Va 1 Asp
Glu Al a Ser 75 Glu Ser Gly Asn Asn 80
Gly Thr 90 Al a Phe Thr Arg Ly s 95 Phe
Ly s 105 As p Al a Gin Al a Gly 110 Thr Gin
Asn Thr Alá Gly Asp 125 Thr Asn Gly
Va 1 Cy s Cy s Ser 140 Asn Leu Asn Tyr
Lys As n Ser 155 Lys Ser Al a Me t Gin 160
As p Al a 170 Lys Thr Glu Gin Val 175 Glu
Arg 185 Thr As p Glu Lys Glu 190 Ile Pro
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: peptid EREDETI FORRÁS ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: 2223
A 13. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr 1 Lys Asp Lys Thr 5 Glu Asn Gly Al a Val 10 Al a Ser Gly Gly Thr 15 Asp
Al a Al a Al a Se r As n Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu Asn Ser Ly s
20 25 30
Leu Thr Thr Va 1 Leu Asp Al a Va 1 Glu Leu Ly s Leu Gly As p Lys Glu
35 40 45
HU 220 116 Β
Val Gin 50 Lys Leu As p Asn Phe 55 Ser Asn Al a Al a Gin 60 Leu Va 1 Va 1 Asp
Gly Ile Me t Ile Pro Leu Leu Pro Glu Al a Ser Glu Ser Gly Asn Asn
65 70 75 80
Gin Al a Asn Gin Gly Thr Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Ly s Phe
85 90 95
Asp Hi s Thr Pro Glu Ser As p Lys Lys Asp Alá Gin Al a Gly Thr Gin
100 105 110
Alá Asn Gly Al a Gin Thr Al a Ser Asn Thr Al a Gly As p Thr Asn Gly
115 120 125
Lys Thr Lys Thr Tyr Glu Va 1 Glu Val Cy s Cy s Ser Asn Leu As n Tyr
130 135 140
Leu Ly s Tyr Gly Me t Leu Thr Arg Ly s Asn Ser Lys Ser Al a Me t Gin
145 150 155 160
Al a Gly Glu Ser Ser Ser Gin Al a As p Al a Ly s Thr Glu Gin Val Gly
165 170 175
Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr As p Glu Lys Glu Ile Pro
180 185 190
Ser Glu Gin Asn Ile Val
195
A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: peptid EREDETI FORRÁS: ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: C708 A 14. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr Gin Asp Lys Pro Arg Asn Gly Al a Val Al a Ser Gly Gly Thr Gly
1 5 10 15
Alá Alá Arg Ser Asn Gly Al a Al a Gly Gin Ser Ser Glu Asn Ser Ly s
20 25 30
Leu Thr Thr Val Leu Asp Al a Va 1 Glu Leu Thr Leu Asn Asp Ly s Ly s
35 40 45
Ile Lys Asn Leu Asp Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Val Val Asp
50 55 60
Gly Ile Me t Ile Pro Leu Leu Pro Glu Alá Ser Glu Ser Gly Lys Asn
65 70 75 80
Gin Alá Asn Gin Gly Thr Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Ly s Phe
85 90 95
HU 220 116B
Asn Hi s Thr Pro 100 Ly s Ser Asp Glu Lys 105 As p Thr Gin Al a Gly 110 Thr Al a
Glu Asn Gly 115 Asn Pro Al a Al a Ser 120 Asn Thr Al a Gly As p 125 Al a Asn Gly
Ly s Thr 130 Ly s Thr Tyr Glu Va 1 135 Glu Val Cy s Cy s Ser 140 Asn Leu Asn Tyr
Leu 145 Ly s Tyr Gly Me t Leu 150 Thr Arg Lys Asn Ser 155 Lys Ser Al a Me t Gin 160
Al a Gly Glu Ser Ser 165 Ser Gin Al a As p Al a 170 Ly s Thr Glu Gin Val 175 Gly
Gin Ser Me t Phe 180 Leu Gin Gly Glu Arg 185 Thr Asp Glu Ly s Glu 190 Ile Pro
Asn Asp Gin 195 Asn Va 1 Va 1
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 211 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS: M978
A 15. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr 1 Gin Asp Ly s Al a 5 Al a Asn Gly Asn Thr 10 Al a Al a Al a Ser Gly 15 Gly
Thr Asp Al a Al a 20 Al a Ser Asn Gly Al a 25 Al a Gly Thr Ser Ser 30 Glu Asn
Ser Ly s Leu 35 Thr Thr Va 1 Leu Asp 40 Al a Val Glu Leu Thr 45 Leu Asn Asp
Ly s Ly s 50 Ile Lys Asn Leu Asp 55 Asn Phe Ser Asn Al a 60 Al a Gin Leu Val
Val 65 Asp Gly Ile Me t Ile 70 Pro Leu Leu Pro G1 u 75 Thr Ser Glu Ser Gly 80
Ser Asn Gin Al a Asp 85 Ly s Gly Lys Ly s Gly 90 Ly s Asn Gly Ly s Asn 95 Gly
Gly Thr Asp Phe 100 Thr Tyr Lys Thr Thr 105 Tyr Thr Pro Lys Asn 110 Asp Asp
Lys As p Thr 115 Ly s Al a Gin Thr Gly 120 Al a Al a Gly Ser Ser 125 Gly Alá Gin
Thr Asp 130 Leu Gly Ly s Al a Asp 135 Va 1 Asn Gly Gly Ly s 140 Al a Glu Thr Ly s
HU 220 116 Β
Thr 145 Tyr Glu Va 1 Glu Val 150 Cys Cy s Ser Asn Leu 155 Asn Tyr Leu Ly s Tyr 160
Gly Me t Leu Thr Arg 165 Ly s Asn Ser Ly s Ser 170 Al a Me t Gin Al a Gly 175 Gly
Asn Ser Ser Gin 180 Al a Asp Al a Ly s Thr 185 Glu Gin Val Glu Gin 190 Ser Me t
Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr As p Glu Lys Glu Ile Pro Asn Asp Gin
195 200 205
Asn Val Val 210
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 200 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: peptid EREDETI FORRÁS ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: 1610
A 16. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Ly s 1 Arg As p Lys Al a 5 Glu Ser Gly Gly Gly 10 Asn Gly Al a Ser Gly 15 Gly
Thr Asp Al a Al a 20 Al a Ser Asn Gly Al a 25 Al a Gly Thr Ser Ser 30 Glu Asn
Ser Ly s Leu 35 Thr Thr Val Leu As p 40 Al a Val Glu Leu Ly s 45 Ser Gly Gly
Lys Glu 50 Va 1 Lys Asn Leu Asp 55 Asn Phe Ser Asn Al a 60 Al a Gin Leu Val
Val 65 Asp Gly Ile Me t Ile 70 Pro Leu Leu Pro Ly s 75 Asp Ser Glu Ser Gly 80
Asn Thr Gin Al a Asp 85 Ly s Gly Ly s Asn Gly 90 Gly Thr Lys Phe Thr 95 Arg
Lys Phe Glu Hi s 100 Thr Pro Glu Ser As p 105 Lys Ly s Asp Al a Gin 110 Al a Gly
Thr Gin Thr 115 Asn Gly Al a Gin Thr 120 Al a Ser Asn Thr Al a 125 Gly Asp Thr
Asn Gly 130 Lys Thr Lys Thr Tyr 135 Glu Val Glu Va 1 Cy s 140 Cys Ser Asn Leu
Asn 145 Tyr Leu Ly s Tyr Gly 150 Leu Leu Thr Arg Ly s 155 Thr Al a Gly Asn Thr 160
Gly Glu Gl y Gly Asn 165 Gly Ser Gin Thr Al a 170 Al a Al a Gin Thr Al a 175 Gin
HU 220 116 Β
Gly Al a Gin Ser 180 Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg 185 Thr Asp Glu Lys Glu 190
Ile Pro Ser Glu Gin Asn Val Va 1
195 200
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 200 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: peptid EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis TÖRZS: 867
A 17. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr 1 Ly s As p Ly s Pro Arg Asn Gly Alá 5 Va 1 10 Al a Ser Gly Gly Thr 15 Asp
Al a Al a Al a Ser As n Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu Asn Gl y Ly s
20 25 30
Leu Thr Thr Val Leu Asp Al a Va 1 Glu Leu Thr Leu Asn Asp Lys Lys
35 40 45
Ile Ly s Asn Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Val Val Ser
50 55 60
Gly Ile Me t Ile Pro Leu Me t Pro Glu Thr Ser Glu Ser Gly Asn Asn
65 70 75 80
Gin Al a Asp Lys Gly Lys Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Lys Phe
85 90 95
Asp Hi s Thr Pro Lys Ser Asp Glu Lys Asp Thr Gin Alá Gly Thr Pro
100 105 110
Thr Asn Gly Al a Gin Thr Al a Se r Gly Thr Al a Gly Va 1 Thr Gly Gly
115 120 125
Gin Al a Gly Ly s Thr Tyr Al a Va 1 Glu Val Cys Cys Ser Asn Leu Asn
130 135 140
Tyr Leu Ly s Tyr Gly Leu Leu Thr Arg Lys Thr Al a As p Asn Thr Val
145 150 155 160
Gly Ser Gly Asn Gly Ser Ser Thr Al a Al a Al a Gin Thr Al a Gin Gly
165 170 175
Al a Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr Asp Glu Lys Glu Ile
180 185 190
Pro Ly s Glu Gin Gin Asp Ile Va 1
195 200
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav TÍPUSA: aminosav
HU 220 116 Β
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS: 53032
A 18. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Thr 1 Ly s As p Lys Pro 5 Al a Asn Gly Asn Thr 10 Al a Glu Al a Ser Gly 15 Gly
Thr As p Al a Al a 20 Al a Ser Gly Gly Al a 25 Al a Gly Thr Ser Ser 30 Glu Asn
Ser Lys Leu 35 Thr Thr Va 1 Leu Asp 40 Al a Va 1 Glu Leu Thr 45 Hi s Gly Gly
Thr Al a 50 Ile Lys Asn Leu Asp 55 Asn Phe Ser Asn Al a 60 Al a Gin Leu Val
Val 65 As p Gly Ile Me t I le 70 Pro Leu Leu Pro Gin 75 Asn Ser Thr Gly Ly s 80
Asn Asn Gin Pro As p 85 Gin Gly Ly s Asn Gly 90 Gly Thr Al a Phe Ile 95 Tyr
Lys Thr Thr Tyr 100 Thr Pro Ly s Asn Asp 105 As p Ly s Asp Thr Ly s 110 Al a Gin
Thr Va 1 Thr 115 Gly Gly Thr Gin Thr 120 Alá Ser Asn Thr Al a 125 Gly As p Al a
Asn Gly 130 Lys Thr Ly s Thr Tyr 135 Glu Val Glu Val Cys 140 Cys Ser Asn Leu
Asn 145 Tyr Leu Ly s Tyr Gly 150 Leu Leu Thr Arg Ly s 155 Thr Al a Gly Asn Thr 160
Val Gly Ser Gly Asn 165 Ser Ser Pro Thr Al a 170 Al a Al a Gin Thr Asp 175 Al a
Gin Ser Me t Phe 180 Leu Gin Gly Glu Arg 185 Thr As p Glu Asn Ly s 190 Ile Pro
Ser Glu Gin Asn Val Val 195
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 195 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS: 891
A 19. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Thr Lys Asp Lys Pro Gly Asn Gly Alá Arg Leu Gin Alá Alá Arg Cys 15 10 15
HU 220 116 Β
Gly Thr Ser Asn 20 Gly Al a Al a Gly Gin 25 Ser Ser Glu Asn Ser 30 Ly s Leu
Thr Thr Val 35 Leu As p Al a Va 1 Glu 40 Leu Ly s Leu G1 y Asp 45 Ly s Glu Val
Gin Ly s 50 Leu Asp As n Phe Ser 55 Asn Al a Al a Gin Leu 60 Val Va 1 As p Gly
Ile 65 Me t Ile Pro Leu Leu 70 Pro Ly s As p Ser Glu 75 Ser Gly Ly s Asn Gin 80
Al a As p Lys Gly Lys 85 Asn Gly Glu Thr Glu 90 Phe Thr Arg Ly s Phe 95 Glu
Hi s Thr Pro Glu 100 Ser Asp Glu Ly s Asp 105 Al a Gin Al a Gly Thr 110 Pro Ser
Asn Gly Al a 115 Gin Thr Al a Ser Asn 120 Thr Al a Gly Asp Thr 125 Asn Gly Ly s
Thr Ly s 130 Thr Tyr Glu Val Asn 135 Leu Cy s Ser Asn Leu 140 Asn Tyr Leu Ly s
Tyr 145 Gly Leu Leu Thr Arg 150 Ly s Thr Alá Gly Asn 155 Thr Gly Glu Gly Gly 160
Asn Ser Ser Pro Thr 165 Al a Al a Gin Thr Al a 170 Gin G1 y Al a G1 n Ser 175 Me t
Phe Leu Gin Gly 180 Glu Arg Thr As p Glu 185 Lys Glu Ile Pro Asn 190 Asp Gin
Asn Val Val 195
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 29 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomiDNS
A 20. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
AAACCCGGAT CCGTTGCCAG CGCTGCCGT 29
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 85 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 21. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
TTTTTTCATG AGATATCTGG CAACATTGTT GTTATCTCTG GCGGTGTTAA TCACCGCCGG 60
GTGCCTGGGT GGCGGCGGCA GTTTC 85
HU 220 116 Β
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 30bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 22. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
GTGTTTTTGT TGAGTGCATG CCTGGGTGGC 30
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 40bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 23. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
TGCGCAAGCT TACAGTTTGT CTTTGGTTTT CGCGCTGCCG 40
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 40 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 24. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
AAAAAGCATG CATAAAAACT ACGCGTTACA CCATTGAAGC 40
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 39bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 25. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
TATATAAGCT TACGTTGCAG GCCCTGCCGC GTTTTCCCC 39
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 29 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
A 26. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
CCCGAATTCT GCCGTCTGAA GCCTTATTC 29
A 27. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 28 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
HU 220 116 Β
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomiDNS
A 27. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
CCCGAATTCT GCTATGGTGC TGCCTGTG 28
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 30bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomiDNS
A 28. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
CGCATCCAAA ACCGTACCTG TGCTGCCTGA 30
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 30bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomiDNS
A 29. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
TTTATCACTT TCCGGGGGCA GGAGCGGAAT 30
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 30bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomiDNS
A 30. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
GTTGGAACAG CAGACAGCGG TTTGCGCCCC 30
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 30bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: egy
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS :genomi DNS
A 31. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
GAACATACTT TGTTCGTTTT TGCGCGTCAA 30
A 32. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 5 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS :IM2394
HU 220 116B
A 32. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Tyr Lys Gly Thr Trp
5
A 33. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 15 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS :IM2394
A 33. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Glu Phe Glu Val Asp Phe Ser Asp Lys Thr Ile Lys Gly Thr Leu
10 15
A 34. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 12 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS: IM2394
A 34. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Glu Gly Gly Phe Tyr Gly Pro Lys Gly Glu Glu Leu
5 10
A 35. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 6 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: peptid
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: N. meningitidis
TÖRZS : IM2394
A 35. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA
Alá Val Phe Gly Alá Lys
I 5
A 36. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 2070 bázispár
TÍPUSA: nukleinsav
HÁNY SZÁLÚ: kettős
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: genomi DNS
EREDETI FORRÁS:
ÉLŐLÉNY: Neisseria meningitidis
TÖRZS: BZ83
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: sig_peptid
ELHELYEZKEDÉS :1-60
HU 220 116 Β
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 60-2067
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-2067
A 36. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATG AAC AAT CCA Pro TTG GTA AAT CAG GCT GCT Al a ATG Me t -10 GTG Val CTG CCT GTG TTT 48
Me t -20 Asn Asn Leu Val -15 Asn Gin Alá Leu Pro Val Phe -5
TTG TTG AGT GCT TGT CTG GGC GGA GGC GGC AGT TTC GAT CTT GAT TCT 96
Leu Leu Ser Al a Cys Leu Gly Gly Gly Gly Ser Phe Asp Leu Asp Ser
1 5 10
GTC GAT ACC GAA GCC CCG CGT CCC GCG CCA AAG TAT CAA GAT GTT TCT 144
Val Asp Thr Glu Al a Pro Arg Pro Al a Pro Ly s Tyr Gin As p Val Ser
15 20 25
TCC GAA ACA CCG CAA GCC CAA AAA GAC CAA GGC GGA TAC GGT TTT GCA 192
Ser Glu Thr Pro Gin Al a Gin Ly s Asp Gin Gly Gly Tyr Gly Phe Alá
30 35 40
ATG CGC TTC AAG CGG CGG AAT TGG TAC CCA AAA AAT GAA GAA GAT CAT 240
Me t Arg Phe Lys Arg Arg As n Trp Tyr Pro Ly s Asn Glu Glu As p Hi s
45 50 55 60
AAG GCA TTA TCA GAA GCG GAT TGG GAG AAG TTA GGT GCG GGT AAG CCA 288
Lys Al a Leu Ser Glu Al a Asp Trp Gl u Lys Leu Gly Al a Gly Lys Pro
65 70 75
GAT GAG TTT CCC CAA AGG AAT GAA ATA TTG AAT ATG ACT GAC GGA ATT 336
As p Glu Phe Pro Gin Arg Asn Glu Ile Leu Asn Me t Thr Asp Gly Ile
80 85 90
CTG AGT GAG TCT CTT CAG CTG GGT GAG GGC GGC AAA AGC CGC GTA GAA 384
Leu Ser Glu Ser Le u Gin Leu Gly Glu Gly Gly Lys Ser Arg Va 1 Glu
95 100 105
GGA TAC ACG GAT TTC CAA TAT GTC CGC TCG GGC TAT ATC TAC CGC AAC 432
Gly Tyr Thr Asp Phe Gin Tyr Val Arg Ser Gly Tyr Ile Tyr Arg Asn
110 115 120
GGT GCC AAT AAA ATC GAT TTC CAA AAA AAA ATC GCC CTT TCC GGT CCG 480
Gly Al a Asn Lys Ile Asp Phe Gin Lys Lys Ile Al a Leu Ser Gly Pro
125 130 135 140
GAC GGC TAC CTT TTC TAC AAA GGC AGC AAT CCT TCC CAA GCT CTG CCG 528
As p Gly Tyr Leu Phe Tyr Ly s Gly Ser Asn Pro Ser Gin Al a Leu Pro
145 150 155
ATG GGT AAG GTA GGT TAT AAA GGT ACT TGG GAT TAT GTA ACC GAT GCC 576
Me t Gly Lys Val Gly Tyr Ly s Gly Thr Trp As p Tyr Va 1 Thr Asp Al a
160 165 170
AAG ATG GGA CAA AAA TTT TCC CAG TTG GCT GGT TTT CCA GCG GGG GAT 624
Lys Me t Gly Gin Ly s Phe Ser Gl n Leu Al a Gly Phe Pro Al a Gly Asp
175 180 185
HU 220 116 Β
672
AGG TAT GGG GCT TTG TCT GCC GAG GAA GCG GAT GTG TTG CGC AAC AAA
Arg Tyr 190 Gly Al a Leu Ser Al a 195 Glu Glu Al a As p Val 200 Leu Arg Asn Ly s
AGC GAG GCA CAG CAA GGT CAG ACC GAT TTC GGG CTG ACC AGC GAG TTT
Ser 205 Glu Al a Gin Gin Gly 210 Gin Thr As p Phe Gly 215 Leu Thr Ser Glu Phe 220
GAG GTG GAT TTC GCC GCC AAG ACC ATG ACC GGC GCG CTC TAC CGC AAT
Glu Va 1 Asp Phe Al a 225 Alá Lys Thr Me t Thr 230 Gly Al a Leu Tyr Arg 235 Asn
AAC CGG ATT ACT AAT AAC GAA ACC GAA AAT AAA GCC AAA CAA ATT AAA
Asn Arg Ile Thr 240 Asn Asn Glu Thr Gl u 245 Asn Ly s Al a Ly s Gin 250 Ile Ly s
CGT TAC GAC ATT CAG GCT GAC CTG CAC GGT AAC CGC TTC AGC GGC AAG
Arg Tyr Asp 255 Ile Gl n Al a As p Leu 260 Hi s Gly Asn Arg Phe 265 Ser Gly Ly s
GCA ACG GCA ACC GAC AAA CCC AAA AAC GAC GAA ACC AAG GAA CAT CCC
Alá Thr 270 Al a Thr As p Ly s Pro 275 Ly s Asn Asp Glu Thr 280 Lys Glu Hi s Pro
TTT GTT TCC GAC TCG TCT TCT TTG AGC GGC GGC TTT TTC GGT CCG AAG
Phe 285 Val Ser As p Ser Ser 290 Ser Leu Ser Gly Gly 295 Phe Phe Gl y Pro Lys 300
GGT GAG GAA TTG GGT TTC CGC TTT TTG AGC GAC GAT CAA AAA GTT GCC
Gly Glu Glu Leu Gly 305 Phe Arg Phe Leu Ser 310 Asp Asp Gin Lys Val 315 Al a
GTT GTC GGC AGC GCG AAA ACC AAA GAC AAA CTG GAA AAT GGC GCG GCG
Val Val Gly Ser 320 Al a Lys Thr Ly s Asp 325 Lys Leu Glu Asn Gly 330 Alá Al a
GCT TCA GGC AGC ACA GGT GCG GCA GCA TCG GGC GGT GCG GCA GAT ATG
Al a Ser Gly 335 Se r Thr Gly Alá Al a 340 Al a Ser Gly Gly Al a 345 Al a Asp Me t
CCG TCT GAA AAC GGT AAG CTG ACC ACG GTT TTG GAT GCG GTT GAG CTG
Pro Ser 350 Glu Asn Gly Ly s Leu 355 Thr Thr Val Leu Asp 360 Al a Va 1 Glu Leu
AAA TCT GGC GGT AAG GAA GTC AAA AAT CTC GAC AAC TTC AGC AAT GCC
Lys 365 Ser Gly Gly Ly s Glu 370 Val Ly s Asn Leu As p 375 Asn Phe Ser Asn Al a 380
GCC CAA CTG GTT GTC GAC GGC ATT ATG ATT CCG CTC CTG CCC AAG AAT
Al a Gin Leu Va 1 Val 385 Asp Gly Ile Me t Ile 390 Pro Leu Leu Pro Ly s 395 Asn
TCC GAA AGC GAG AGC AAT CAG GCA GAT AAA GGT AAA AAC GGC GGA ACA
Ser Glu Ser Glu 400 Ser Asn Gin Al a Asp 405 Ly s Gly Lys Asn Gly 410 Gly Thr
GCC TTT ACC CGC AAA TTT GAA CAC ACG CCG GAA AGT GAT AAA AAA GAC
Al a Phe Thr Arg Ly s Phe Glu Hi s Thr Pro Glu Ser Asp Ly s Ly s Asp
415 420 425
720
768
816
864
912
960
1008
1056
1104
1152
1200
1248
1296
1344
HU 220 116 Β
ACC Thr CAA GCA Gin Alá 430 GGT ACG GCG Al a GAG AAT GGC AAT CCA GCC GCT Al a TCA Ser AAT Asn ACG Thr 1392
Gly Thr Glu 435 Asn Gly Asn Pro Al a 440
GCA GGT GAT ACC AAT GGC AAA ACA AAA ACC TAT GAA GTC GAA GTC TGC 1440
Al a Gly Asp Thr Asn Gly Ly s Thr Ly s Thr Tyr Glu Val Gl u Val Cys
445 450 455 460
TGT TCC AAC CTC AAT TAT CTG AAA TAC GGA ATG TTG ACG CGT AAA AAC 1488
Cy s Ser Asn Leu Asn Tyr Leu Ly s Tyr Gly Me t Leu Thr Arg Lys Asn
465 470 475
AGC AAG TCC GCG ATG CAG GCA GGC GAA AAC GGT AGT CTA GCT GAC GCT 1536
Ser Lys Ser Al a Me t Gin Alá Gly Glu Asn Gly Ser Leu Al a Asp Al a
480 485 490
AAA ACG GAA CAA GTT GAA CAA AGT ATG TTC CTC CAA GGC GAG CGC ACC 1584
Lys Thr Glu Gin Va 1 Glu Gin Ser Me t Phe Le u Gin Gly Glu Arg Thr
495 500 505
GAT GAA AAA GAG ATT CCA AAA GAG CAA CAA GAC ATC GTT TAT CGG GGG 1632
Asp Glu Lys Glu Ile Pro Lys Glu Gin Gin Asp Ile Val Tyr Arg Gly
510 515 520
TCT TGG TAC GGG CAT ATT GCC AAC GAC ACA AGC TGG AGC GGC AAT GCT 1680
Ser Trp Tyr Gly Hi s Ile Al a Asn As p Thr Ser Trp Ser Gly Asn Al a
525 530 535 540
TCA GAT AGA GAG GGC GGC AAC AGG GCG GAC TTT ACC GTG AAT TTT GGT 1728
Ser Asp Arg Glu Gly Gly Asn Arg Al a As p Phe Thr Val Asn Phe Gly
545 550 555
ACG AAA AAA ATT AAC GGA ACG TTA ACC GCT GAA AAC AGG CAG GAG GCA 1776
Thr Lys Lys Ile Asn Gly Thr Leu Thr Al a Glu Asn Arg Gin Glu Al a
560 565 570
ACC TTT ACC ATT GTG GGC GAT ATT AAG GAC AAC GGC TTT GAA GGT ACG 1824
Thr Phe Thr Ile Va 1 Gly Asp Ile Ly s Asp Asn Gly Phe Glu Gly Thr
575 580 585
GCG AAA ACT GCT GAC TCA GGT TTT GAT CTC GAT CAA AGC AAT ACC ACC 1872
Al a Ly s Thr Al a As p Ser Gly Phe Asp Leu As p Gin Ser Asn Thr Thr
590 595 600
CGC ACG CCT AAG GCA TAT ATC ACA GAT GCC AAG GTG AAG GGC GGT TTT 1920
Arg Thr Pro Ly s Al a Tyr Ile Thr Asp Al a Lys Val Ly s Gly Gly Phe
605 610 615 620
TAC GGG CCT AAA GCC GAA GAG TTG GGC GGA TGG TTT GCC TAT CCG GGC 1968
Tyr Gly Pro Lys Al a Glu Glu Leu Gly Gly Trp Phe Al a Tyr Pro Gly
625 630 635
GAT AAA CAA ACG GAA AAG GCA ACG GTT ACA TCC GGC GAT GGA AAT TCA 2016
As p Ly s Gin Thr Glu Lys Al a Thr Va 1 Thr Ser Gly Asp Gl y Asn Ser
640 645 650
GCA AGC AGT GCA ACT GTC GTA TTC GGT GCG AAA CGC CAA AAG CCT GTG 2064
Al a Ser Ser Al a Thr Va 1 Val Phe Gly Al a Ly s Arg Gin Ly s Pro Val
655 660 665
HU 220 116 Β
CAA TAAAGTTTCG ATCTTGATTC TGTCGATACC GAAGCCCCGC GTCCCGCGCC AAATAAAA 2125 Gin
A 37. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 669 aminosav
TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris
MOLEKULATÍPUS: protein
A 37. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Me t -20 Asn Asn Pro Leu Val -15 Asn Gin Alá Al a Me t -10 Va 1 Leu Pro Val Phe -5
Leu Leu Ser Alá Cys 1 Leu Gly Gly Gly 5 Gly Ser Phe Asp Leu 10 Asp Ser
Va 1 Asp Thr 15 Glu Al a Pro Arg Pro 20 Al a Pro Ly s Tyr Gin 25 As p Val Ser
Ser Glu 30 Thr Pro Gin Alá Gin 35 Ly s As p Gl n Gly Gly 40 Tyr Gly Phe Al a
Me t 45 Arg Phe Ly s Arg Arg 50 Asn Trp Tyr Pro Ly s 55 Asn Glu Glu Asp Hi s 60
Lys Al a Leu Ser Glu 65 Alá As p Trp Glu Lys 70 Leu Gly Al a Gly Lys 75 Pro
Asp Glu Phe Pro 80 Gin Arg Asn Glu Ile 85 Leu Asn Me t Thr Asp 90 Gly Ile
Leu Ser Glu 95 Ser Leu Gin Leu Gly 100 Glu Gly Gly Lys Ser 105 Arg Val Glu
Gly Tyr 110 Thr Asp Phe Gin Tyr 115 Va 1 Arg Ser Gly Tyr 120 Ile Tyr Arg Asn
Gly 125 Al a Asn Lys Ile Asp 130 Phe Gin Lys Lys Ile 135 Al a Leu Ser Gly Pro 140
As p Gly Tyr Leu Phe 145 Tyr Ly s Gly Ser Asn 150 Pro Ser Gin Al a Leu 155 Pro
Me t Gly Lys Val 160 Gly Tyr Lys Gly Thr 165 Trp As p Tyr Val Thr 170 Asp Al a
Lys Me t Gly 175 Gin Ly s Phe Ser Gin 180 Leu Al a Gly Phe Pro 185 Al a Gly Asp
Arg Tyr 190 Gly Al a Leu Ser Al a 195 Gl u Glu Al a Asp Val 200 Leu Arg Asn Lys
Ser 205 Glu Al a Gl n Gin Gly 210 Gin Thr Asp Phe Gl y 215 Leu Thr Ser Glu Phe 220
Glu Val Asp Phe Al a 225 Al a Lys Thr Me t Thr 230 Gly Al a Leu Tyr Arg 235 Asn
HU 220 116 Β
Asn Arg I le Thr 240 Asn Asn Glu Thr Glu 245 As n Ly s Al a Lys Gin 250 1 le Lys
Arg Tyr Asp I le Gin Al a Asp Leu Hi s Gly As n Arg Phe Ser Gly Ly s
255 260 265
Al a Thr Al a Thr Asp Lys Pro Ly s Asn As p Glu Thr Lys Glu Hi s Pro
270 275 280
Phe Val Ser Asp Ser Ser Ser Leu Ser Gly Gly Phe Phe Gly Pro Lys
285 290 295 300
Gly Glu Glu Leu Gly Phe Arg Phe Leu Ser As p Asp Gin Lys Val Alá
305 310 315
Val Va 1 Gly Ser Al a Lys Thr Ly s As p Lys Leu Glu Asn Gly Al a Al a
320 325 330
Al a Se r Gly Ser Thr Gly Al a Al a Al a Ser Gly Gly Al a Al a As p Me t
335 340 345
Pro Ser Glu Asn Gly Ly s Leu Thr Thr Val Leu Asp Al a Val Glu Leu
350 355 360
Lys Ser Gly Gly Ly s Glu Val Ly s Asn Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a
365 370 375 380
Al a Gin Leu Val Val Asp Gly I le Me t I le Pro Leu Leu Pro Lys Asn
385 390 395
Ser Glu Ser Gl u Ser Asn Gin Alá Asp Ly s Gly Ly s Asn Gly Gly Thr
400 405 410
Al a Phe Thr Arg Ly s Phe Glu Hi s Thr Pro Glu Ser Asp Lys Lys Asp
415 420 425
Thr Gin Al a Gly Thr Al a Glu Asn Gly Asn Pro Al a Al a Ser Asn Thr
430 435 440
Al a Gly Asp Thr Asn Gly Lys Thr Lys Thr Tyr Glu Val Glu Val Cy s
445 450 455 460
Cys Ser Asn Leu Asn Tyr Leu Ly s Tyr Gly Me t Leu Thr Arg Ly s Asn
465 470 475
Ser Ly s Ser Al a Me t Gin Al a Gly Glu Asn Gly Ser Leu Al a As p Al a
480 485 490
Lys Thr Glu Gin Val Glu Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr
495 500 505
Asp Glu Lys Glu I le Pro Lys Gl u Gin Gin Asp I le Va 1 Tyr Arg Gly
510 515 520
Ser Trp Tyr Gly Hi s I le Alá As n Asp Thr Ser Trp Ser Gly Asn Al a
525 530 535 540
Ser As p Arg Glu Gly Gly Asn Arg Al a As p Phe Thr Val Asn Phe Gly
545 550 555
HU 220 116 Β
Thr Ly s Ly s lle 560 Asn Gly Thr Leu Thr 565
Thr Phe Thr 575 lle Va 1 Gly Asp lle 580 Lys
Al a Ly s 590 Thr Al a As p Ser Gly 595 Phe Asp
Arg 605 Thr Pro Lys Al a Tyr 610 lle Thr As p
Tyr Gly Pro Ly s Al a 625 Glu Glu Leu Gly
As p Ly s Gin Thr 640 Glu Ly s Al a Thr Val 645
Al a Ser Ser 655 Al a Thr Val Val Phe 660 Gly
Al a Glu Asn Arg Gin 570 Glu Al a
As p As n Gly Phe 585 Glu Gly Thr
Leu As p Gin 600 Ser Asn Thr Thr
Al a Ly s 615 Va 1 Lys Gly Gly Phe 620
Gly 630 Trp Phe Al a Tyr Pro 635 Gly
Thr Ser Gly As p Gly 650 Asn Ser
Al a Lys Arg Gin Lys Pro Val
665
Gin
A 38. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 2136 bázispár TÍPUSA: nukleinsav HÁNY SZÁLÚ: kettő TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: genomi DNS EREDETI FORRÁS ÉLŐLÉNY: Neisseria meningitidis TÖRZS: BZ163
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: sig_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 1-60
SAJÁTSÁG:
NÉV/MEGJELÖLÉS: mat_peptid
ELHELYEZKEDÉS: 61-2133
SAJÁTSÁG:
NÉVMEGJELÖLÉS: CDS
ELHELYEZKEDÉS: 1-2133
A 38. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATG AAC AAT CCA TTG GTA AAT CAG GCT
Me t -20 As n Asn Pro Leu Val -15 Asn Gin Al a
TTG TTG AGT GCT TGT TTG GGC GGA GGC
Leu Leu Ser Al a Cy s 1 Leu Gly Gly Gly 5
GTC GAT ACC GAA GCC CCG CGT CCC GCG
Va 1 As p Thr 15 Glu Al a Pro Arg Pro 20 Al a
TCC GAA AAA CCG CAA GCC CAA AAA GAC
Ser Glu 30 Ly s Pro Gin Al a Gin 35 Ly s As p
GCT Al a ATG Me t -10 GTG Va 1 CTG Leu CCT Pro GTG Val TTT Phe -5 48
GGC AGT TTC GAT CTT GAT TCT 96
Gly Ser Phe Asp Leu 10 Asp Ser
CCA AAA TAT CAA GAT GTT TCT 144
Pro Ly s Tyr Gin 25 As p Val Ser
CAA GGC GGA TAC GGT TTT GCG 192
Gin Gly Gly Tyr Gly Phe Alá
HU 220 116 Β
ATG Me t 45 AGG Arg TTG Leu AAA Lys CGG AGG AAT Asn CGG CAT CCG CAG GCA AAA GAA GAC AAA Lys 60 240
Arg Arg 50 Arg Hi s Pro Gin 55 Al a Lys Glu Asp
GTT GAA CTA AAC CCA AAT GAT TGG GAG GAG ACA GGA TTG CCG AGC AAG 288
Val G1 u Leu Asn Pro 65 Asn Asp Trp Glu Glu 70 Thr Gly Leu Pro Ser 75 Ly s
CCC CAA AAC TTA CCC GAG CGA CAG CAA TCG GTT ATT GAT AAA GTA AAA 3 36
Pro Gin Asn Leu 80 Pro Glu Arg Gin Gin 85 Ser Va 1 Ile As p Ly s 90 Val Ly s
ACA GAC GAT GGC AGC AAT ATT TAC ACT TCC CCT TAT CTC ACG CAA TCA 384
Thr As p Asp 95 Gly Ser Asn Ile Tyr 100 Thr Ser Pro Tyr Leu 105 Thr Gin Ser
AAC CAT CAA AAC GGC AGC ACT AAT AGC GGT GCA AAC CAA CCA AAA AAC 432
Asn Hi s 110 G1 n Asn Gly Ser Thr 115 Asn Ser Gly Al a Asn 120 Gin Pro Ly s Asn
GAA GTA AAA GAT TAC AAA AAT TTC AAA TAT GTT TAT TCC GGC TGG TTT 480
Glu 125 Va 1 Lys Asp Tyr Ly s 130 Asn Phe Ly s Tyr Va 1 135 Tyr Ser Gly Trp Phe 140
TAT AAA CAT GCA GAG AGT GAA AGA GAA TTC AGT AAA ATC AAA TTT AAG 528
Tyr Ly s Hi s Al a Glu 145 Ser Glu Arg Glu Phe 150 Ser Ly s Ile Ly s Phe 155 Ly s
TCA GGC GAC GAC GGC TAT ATT TTT TAT CAC GGT AAA GAC CCT TCC CGA 576
Ser Gly As p Asp 160 Gly Tyr Ile Phe Tyr 165 Hi s Gly Lys Asp Pro 170 Ser Arg
CAA CTT CCC ACT TCT GAA AAA GTT ATC TAC AAA GGC GTA TGG CAT TTT 624
Gin Leu Pro 175 Thr Ser Glu Lys Val 180 Ile Tyr Lys Gly Val 185 Trp Hi s Phe
GTA ACC GAT ACT GAA AAG GGA CAA AAA TTT AAC GAT ATT CTT GAA ACC 672
Val Thr 190 Asp Thr Glu Lys Gly 195 Gin Ly s Phe Asn Asp 200 Ile Leu Glu Thr
TCA AAA GGG CAA GGC GAC AGA TAC AGC GGA TTT TCG GGC GAT GAC GGC 720
Ser 205 Ly s Gly Gin Gly Asp 210 Arg Tyr Ser Gly Phe 215 Ser Gly As p Asp Gly 220
GAA ACA ACT TCC AAT AGA ACT GAT TCC AAC CTT AAT GAT AAG CAC GAG 768
Glu Thr Thr Ser Asn 225 Arg Thr As p Ser Asn 230 Leu Asn As p Ly s Hi s 235 Glu
GGT TAT GGT TTT ACC TCG AAT TTA GAA GTG GAT TTC GGC AGT AAA AAA 816
G1 y Tyr Gly Phe 240 Thr Ser Asn Leu Glu 245 Val Asp Phe Gly Ser 250 Ly s Ly s
TTG ACG GGT AAA TTA ATA CGC AAT AAT AGA GTT ACA AAC GCT ACT ACT 864
Leu Thr Gly 255 Ly s Leu Ile Arg As n 260 Asn Arg Val Thr Asn 265 Al a Thr Thr
AAC GAT AAA TAC ACC ACC CAA TAC TAC AGC CTT GAT GCC CAA ATA ACA 912
Asn As p 270 Lys Tyr Thr Thr Gin 275 Tyr Tyr Ser Leu As p 280 Al a G1 n Ile Thr
HU 220 116 Β
GGC AAC CGC TTC AAC GGT Gly 290 AAG Lys GCG Al a ATA GCG ACC GAC AAA Ly s CCC Pro GAC As p ACT Thr 300 960
Gly 285 Asn Arg Phe Asn Ile Al a Thr 295 Asp
GGA GGA ACC AAA CTA CAT CCC TTT GTT TCC GAC TCG TCT TCT TTG AGC 1008
Gly Gly Thr Ly s Leu Hi s Pro Phe Va 1 Ser As p Ser Ser Ser Leu Ser
305 310 315
GGC GGC TTT TTC GGT CCG AAG GGT GAG GAA TTG GGT TTC CGC TTT TTG 1056
Gly Gly Phe Phe Gly Pro Lys Gl y Glu Glu Leu Gly Phe Arg Phe Leu
320 325 330
AGC GAC GAT AAA AAA GTT GCG GTT GTC GGC AGC GCG AAA ACC AAA GAC 1104
Ser As p Asp Lys Ly s Val Al a Va 1 Val Gly Ser Al a Lys Thr Lys As p
335 340 345
AAA ACG GAA AAT GGC GCG GTG GCT TCA GGC GGC ACA GAT GCG GCA GCA 1152
Lys Thr Glu Asn Gly Alá Va 1 Al a Ser Gly Gly Thr Asp Al a Al a Al a
350 355 360
TCA AAC GGT GCG GCA GGC ACG TCG TCT GAA AAC AGT AAG CTG ACC ACG 1200
Ser Asn Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Gl u As n Ser Lys Leu Thr Thr
365 370 375 380
GTT TTG GAT GCG GTC GAG CTG AAA TTG GGC GAT AAG GAA GTC CAA AAG 1248
Val Leu Asp Al a Val Glu Leu Ly s Leu Gly As p Lys Glu Va 1 Gin Ly s
385 390 395
CTC GAC AAC TTC AGC AAC GCC GCC CAA CTG GTT GTC GAC GGC ATT ATG 1296
Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Val Va 1 Asp Gly Ile Me t
400 405 410
ATT CCG CTC TTG CCC GAG ACT TCC GAA AGT GGG AAC AAT CAA GCC AAT 1344
Ile Pro Leu Leu Pro Glu Thr Ser Glu Ser Gly Asn Asn Gin Al a Asn
415 420 425
CAA GGT ACA AAT GGC GGA ACA GCC TTT ACC CGC AAA TTT GAC CAC ACG 1392
Gin Gly Thr Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Ly s Phe Asp Hi s Thr
430 435 440
CCG GAA AGT GAT AAA AAA GAC GCC CAA GCA GGT ACG CAG ACG AAT GGG 1440
Pro Gl u Ser As p Ly s Lys As p Al a Gin Al a Gly Thr Gin Thr Asn Gly
445 450 455 460
GCG CAA ACC GCT TCA AAT ACG GCA GGT GAT ACC AAT GGC AAA ACA AAA 1488
Al a Gl n Thr Al a Ser Asn Thr Al a Gly As p Thr Asn Gly Ly s Thr Ly s
465 470 475
ACC TAT GAA GTC GAA GTC TGC TGT TCC AAC CTC AAT TAT CTG AAA TAC 1536
Thr Tyr Glu Val Glu Val Cys Cy s Ser Asn Leu Asn Tyr Le u Ly s Tyr
480 485 490
GGA ATG TTG ACG CGC AAA AAC AGC AAG TCC GCG ATG CAG GCA GGA GAA 1584
Gly Me t Leu Thr Arg Lys Asn Ser Ly s Ser Al a Me t Gin Al a Gly Glu
495 500 505
AGC AGT AGT CAA GCT GAT GCT AAA ACG GAA CAA GTT GGA CAA AGT ATG 1632
Ser Ser Ser Gin Al a As p Al a Ly s Thr Glu Gl n Val Gly Gin Ser Me t
510 515 520
HU 220 116 Β
TTC Phe 525 CTC Leu CAA Gin GGC GAG CGC ACC GAT GAA AAA GAG ATT CCA AGC GAG CAA 1680
Gly Glu Arg 530 Thr Asp Glu Lys Glu 535 Ile Pro Ser Glu Gin 540
AAC ATC GTT TAT CGG GGG TCT TGG TAC GGG CAT ATT GCC AGC AGC ACA 1728
Asn Ile Va 1 Tyr Arg Gly Ser Trp Tyr Gly Hi s Ile Al a Ser Ser Thr
545 550 555
AGC TGG AGC GGC AAT GCT TCT GAT AAA GAG GGC GGC AAC AGG GCG GAA 1776
Ser Trp Ser Gly As n Alá Ser As p Ly s Glu Gly Gly Asn Arg Al a Glu
560 565 570
TTT ACT GTG AAT TTT GGC GAG AAA AAA ATT ACC GGC ACG TTA ACC GCT 1824
Phe Thr Val Asn Phe Gly Glu Ly s Ly s Ile Thr Gly Thr Leu Thr Al a
575 580 585
GAA AAC AGG CAG GAG GCA ACC TTT ACC ATT GAT GGT AAG ATT GAG GGC 1872
Glu Asn Arg Gin Glu Alá Thr Phe Thr Ile Asp Gly Lys Ile Glu Gly
590 595 600
AAC GGT TTT TCC GGT ACG GCA AAA ACT GCT GAA TTA GGT TTT GAT CTC 1920
Asn Gly Phe Ser Gly Thr Al a Ly s Thr Al a Glu Leu Gly Phe As p Leu
605 610 615 620
GAT CAA AAA AAT ACC ACC CGC ACG CCT AAG GCA TAT ATC ACA GAT GCC 1968
As p Gin Lys Asn Thr Thr Arg Thr Pro Lys Al a Tyr Ile Thr Asp Al a
625 630 635
AAG GTG CAG GGC GGT TTT TAC GGG CCC AAA GCC GAA GAG TTG GGC GGA 2016
Lys Va 1 Gin Gly Gly Phe Tyr Gly Pro Ly s Al a Glu Glu Leu Gly Gly
640 645 650
TGG TTT GCC TAT CAG GGC GAT AAA CAA ACG GAA AAT ACA ACA GTT GCA 2064
Trp Phe Al a Tyr G1 n Gly Asp Ly s Gin Thr Glu Asn Thr Thr Val Al a
655 660 665
TCC GGC AAT GGA AAT TCA GCA AGC AGT GCA ACT GTC GTA TTC GGT GCG 2112
Ser Gly Asn G1 y As n Ser Al a Ser Ser Al a Thr Va 1 Val Phe Gly Al a
670 675 680
AAA CGC CAA AAG CCT GTG CAA TAAAGTAAAA 2143
Ly s Arg Gin Ly s Pro Va 1 Gin
685 690
A 39. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 692 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 39. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Me t Asn Asn Pro Leu Val Asn Gin Al a Al a Me t Val Leu Pro Val Phe
-20 -15 -10 -5
Le u Leu Ser Al a Cy s Leu Gly Gly G1 y Gly Ser Phe Asp Leu As p Ser
1 5 10
Val As p Thr Glu Al a Pro Arg Pro Al a Pro Ly s Tyr Gin As p Val Ser
15 20 25
HU 220 116 Β
Ser Glu 30 Ly s Pro Gin Al a Gin 35 Ly s As p Gin Gly Gly 40 Tyr Gly Phe Al a
Me t 45 Arg Leu Ly s Arg Arg 50 Asn Arg Hi s Pro Gin 55 Al a Ly s Glu As p Ly s 60
Va 1 Glu Leu Asn Pro 65 Asn Asp Trp Glu Glu 70 Thr Gly Leu Pro Ser 75 Lys
Pro Gin Asn Leu 80 Pro Glu Arg Gin Gin 85 Ser Val Ile Asp Ly s 90 Val Ly s
Thr Asp Asp 95 Gly Ser Asn Ile Tyr 100 Thr Ser Pro Tyr Leu 105 Thr Gin Ser
Asn Hi s 110 Gin Asn Gly Ser Thr 115 Asn Ser Gly Al a Asn 120 Gin Pro Ly s Asn
Glu 125 Val Lys As p Tyr Lys 130 Asn Phe Ly s Tyr Val 135 Tyr Ser Gly Trp Phe 140
Tyr Ly s Hi s Al a Glu 145 Ser Glu Arg Glu Phe 150 Ser Lys Ile Lys Phe 155 Lys
Ser Gly Asp Asp 160 Gly Tyr Ile Phe Tyr 165 Hi s Gly Lys As p Pro 170 Ser Arg
Gin Leu Pro 175 Thr Ser Glu Ly s Val 180 Ile Tyr Ly s Gly Val 185 Trp Hi s Phe
Val Thr 190 Asp Thr Glu Lys Gly 195 Gin Ly s Phe As n Asp 200 Ile Leu Glu Thr
Ser 205 Ly s Gly Gin Gly Asp 210 Arg Tyr Ser Gly Phe 215 Ser Gly Asp Asp Gly 220
Glu Thr Thr Ser Asn 225 Arg Thr Asp Ser Asn 230 Leu Asn As p Ly s Hi s 235 Glu
Gly Tyr Gly Phe 240 Thr Ser Asn Leu Glu 245 Val As p Phe Gly Ser 250 Lys Ly s
Leu Thr Gly 255 Lys Leu Ile Arg As n 260 Asn Arg Val Thr Asn 265 Al a Thr Thr
Asn As p 270 Lys Tyr Thr Thr Gin 275 Tyr Tyr Ser Le u Asp 280 Al a Gin Ile Thr
Gly 285 Asn Arg Phe Asn Gly 290 Lys Al a Ile Al a Thr 295 Asp Lys Pro Asp Thr 300
Gly Gly Thr Lys Leu 305 Hi s Pro Phe Val Ser 310 As p Ser Ser Ser Leu 315 Ser
Gly Gly Phe Phe 320 Gly Pro Ly s Gly Glu 325 Glu Leu Gly Phe Arg 330 Phe Leu
Ser As p Asp 335 Ly s Ly s Val Al a Val 340 Val Gly Ser Al a Ly s 345 Thr Ly s Asp
HU 220 116 Β
Lys Thr 350 Glu Asn Gly Alá Va 1 355 Al a Ser Gly Gly Thr 360 Asp Al a Al a Al a
Ser As n Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu As n Ser Lys Leu Thr Thr
365 370 375 380
Val Le u Asp Al a Va 1 Glu Leu Ly s Leu Gly As p Lys Glu Val Gin Ly s
385 390 395
Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a Al a Gin Leu Val Val As p Gly I 1 e Me t
400 405 410
Ile Pro Leu Leu Pro Glu Thr Ser Glu Ser Gly Asn Asn Gin Al a Asn
415 420 425
Gin Gly Thr Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Lys Phe As p Hi s Thr
430 435 440
Pro Glu Ser Asp Lys Lys Asp Al a Gin Al a Gly Thr Gin Thr Asn Gly
445 450 455 460
Al a Gin Thr Al a Ser Asn Thr Al a Gly As p Thr Asn Gly Ly s Thr Ly s
465 470 475
Thr Tyr Glu Val Gl u Va 1 Cys Cy s Ser As n Leu Asn Tyr Leu Ly s Tyr
480 485 490
Gly Me t Leu Thr Arg Ly s Asn Ser Lys Ser Al a Me t Gin Al a Gly Glu
495 500 505
Ser Ser Ser Gin Al a As p Al a Ly s Thr Glu Gin Val Gly Gin Ser Me t
510 515 520
Phe Leu Gin Gly Gl u Arg Thr Asp Glu Lys Glu Ile Pro Ser Glu Gin
525 530 535 540
Asn Ile Val Tyr Arg Gly Ser Trp Tyr Gly Hi s Ile Alá Ser Ser Thr
545 550 555
Ser Trp Ser Gly Asn Al a Ser Asp Ly s Gl u Gly Gly Asn Arg Al a Glu
560 565 570
Phe Thr Val As n Phe Gly Glu Ly s Ly s Ile Thr Gly Thr Le u Thr Al a
575 580 585
Glu Asn Arg Gin Glu Al a Thr Phe Thr Ile As p Gly Lys Ile Glu Gly
590 595 600
Asn Gly Phe Ser Gly Thr Al a Lys Thr Al a Glu Leu Gly Phe Asp Leu
605 610 615 620
As p Gin Ly s Asn Thr Thr Arg Thr Pro Ly s Al a Tyr Ile Thr Asp Al a
625 630 635
Ly s Va 1 Gin Gly Gly Phe Tyr Gly Pro Lys Alá Glu Glu Leu Gly Gly
640 645 650
Trp Phe Al a Tyr Gin Gly Asp Ly s Gin Thr Glu Asn Thr Thr Va 1 Al a
655 660 665
HU 220 116 Β
Ser Gly 670 Asn Gly As n Ser Alá Ser Ser Alá Thr Val Val 675 680
Lys Arg Gl n Ly s Pro Val Gin
685 690
Phe Gly Alá
A 40. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 199 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 40. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Al a Al a Al a Ser 20 Gly Gly Alá Al a Asp 25 Me t Pro Ser Glu Asn 30 Gly Lys
Leu Thr Thr Val Leu Asp Al a Val Glu Leu Ly s Ser Gly Gly Lys Glu
35 40 45
Val Ly s Asn Leu As p Asn Phe Ser Asn Al a Alá Gin Leu Va 1 Val Asp
50 55 60
Gly lle Me t lle Pro Leu Leu Pro Ly s Asn Ser Glu Ser Gl u Ser Asn
65 70 75 80
Gin Al a Asp Ly s Gly Ly s Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Lys Phe
85 90 95
Glu Hi s Thr Pro Glu Ser Asp Ly s Ly s Asp Thr Gin Al a Gl y Thr Al a
100 105 110
Glu Asn Gly Asn Pro Alá Al a Ser Asn Thr Al a Gly Asp Thr Asn Gly
115 120 125
Ly s Thr Ly s Thr Tyr Glu Val Glu Val Cys Cy s Ser Asn Leu Asn Tyr
130 135 140
Leu Lys Tyr Gly Me t Leu Thr Arg Ly s Asn Ser Lys Ser Al a Me t Gin
145 150 155 160
Al a Gly Glu Asn Gly Ser Leu Al a Asp Al a Ly s Thr Glu Gin Va 1 Glu
165 170 175
Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gly Glu Arg Thr Asp Glu Ly s Glu lle Pro
180 185 190
Ly s Glu Gin Gin As p lle Val
195
A 41. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 198 aminosav TÍPUSA: aminosav TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje
A 41. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Thr Lys Asp Lys Thr Glu Asn Gly Alá Val 1 5 10
Alá Ser Gly Gly Thr Asp 15
HU 220 116 Β
Al a Al a Al a Ser 20 Asn Gly Alá Al a Gly 25 Thr Ser Ser Glu Asn 30 Ser Ly s
Leu Thr Thr Va 1 Leu As p Al a Va 1 Glu Leu Ly s Leu Gly Asp Lys Glu
35 40 45
Val Gin Lys Leu As p As n Phe Ser Asn Al a Al a Gl n Leu Val Val Asp
50 55 60
Gly Ile Me t Ile Pro Leu Leu Pro Gl u Thr Ser Glu Ser Gly Asn Asn
65 70 75 80
Gin Alá Asn Gin Gly Thr Asn Gly Gly Thr Al a Phe Thr Arg Ly s Phe
85 90 95
Asp Hi s Thr Pro Glu Ser As p Ly s Lys As p Al a Gin Al a Gly Thr Gin
100 105 110
Thr Asn Gly Al a Gin Thr Al a Ser Asn Thr Al a Gly Asp Thr Asn Gly
115 120 125
Lys Thr Lys Thr Tyr Glu Val Glu Va 1 Cy s Cy s Ser Asn Leu Asn Tyr
130 135 140
Leu Ly s Tyr Gly Me t Leu Thr Arg Ly s Asn Ser Ly s Ser Al a Me t Gin
145 150 155 160
Al a Gly Glu Ser Ser Ser Gin Alá Asp Al a Ly s Thr Glu Gin Val Gly
165 170 175
Gin Ser Me t Phe Leu Gin Gl y Glu Arg Thr As p Glu Ly s Glu Ile Pro
180 185 190
Ser Glu Gin Asn Ile Val
195
A 42. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
HOSSZA: 199 aminosav TÍPUSA: aminosav
TOPOLÓGIÁJA: lineáris MOLEKULATÍPUS: fehérje A 42. AZONOSÍTÓ SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Thr Ly s Asp Asn Thr Al a Asn Gly Asn Thr Al a Al a Al a Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr As p Al a Alá Alá Ser Asn Gly Al a Al a Gly Thr Ser Ser Glu Asn
20 25 30
Gly Ly s Leu Thr Thr Val Leu Asp Al a Val Gl u Leu Thr Leu Asn Asp
35 40 45
Ly s Ly s Ile Lys Asn Leu Asp Asn Phe Ser As n Al a Al a Gin Leu Val
50 55 60
Va 1 As p Gly Ile Met I le Pro Leu Leu Pro Glu Al a Ser Glu Ser Gly
65 70 75 80
HU 220 116 Β
Asn As n Gin Al a Asn 85 Gin Gly Thr Asn Gly 90 Gly Thr Alá Phe Thr 95 Arg
Ly s Phe Alá Hi s 100 Thr Pro Ly s Ser As p 105 Glu Ly s As p Thr Hi s 110 Al a Gly
Thr Al a Al a 115 Asn Gly As p Gin Al a 120 Al a Ser Asn Thr Al a 125 Gly Asp Thr
Asn Gly 130 Lys Thr Ly s Thr Tyr 135 Glu Val Glu Val Cy s 140 Cy s Ser Asn Leu
Asn 145 Tyr Leu Lys Tyr Gly 150 Leu Leu Thr Arg Ly s 155 Thr Al a Gly Asn Thr 160
Gly Glu Gly Gly Asn 165 Gly Ser Gin Thr Alá 170 Al a Al a Gin Thr Al a 175 Gin
Gly Al a Gin Ser 180 Me t Phe Leu Gin Gly 185 Glu Arg Thr Asp Glu 190 Lys G1 u
Ile Pro Ser Glu G1 n Asn Val
195

Claims (53)

  1. SZABADALMI IGÉNYPONTOK
    1. Polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú N. meningitidis törzs transzferrin-receptora Tbp2 alegységének szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység doménjainak legalább egyike teljesen vagy részlegesen deletálva van, feltéve, hogy az első és második dómén egyidejűleg nincs teljes egészében deletálva.
  2. 2. Az 1. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység harmadik doménja részlegesen deletálva van.
  3. 3. Az 1. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység harmadik doménja teljes egészében deletálva van.
  4. 4. A 2. vagy 3. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy teljes egészében tartalmazza annak a szekvenciának a második doménját, amelyből származtatva van.
  5. 5. A 2. vagy 3. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, második és harmadik doménja közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység második doménja részlegesen deletálva van.
  6. 6. A 2. vagy 3. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység második doménja teljes egészében deletálva van.
  7. 7. A 4., 5. és 6. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy teljes egészében tartalmazza annak a szekvenciának az első doménját, amelyből származtatva van.
  8. 8. A 4., 5. és 6. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménja részlegesen deletálva van.
  9. 9. A 4. vagy 5. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménja teljes egészében deletálva van.
  10. 10. A 2., 3., 4. és 7. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  11. 11. A 2., 3., 4. és 7. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  12. 12. A 2., 3., 4. és 8. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekven66
    HU 220 116 Β ciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  13. 13. A 2., 3., 4. és 8. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  14. 14. A 12. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, amelynek első, második és harmadik doménja az IM2169 referenciatörzs Tbp2 alegységének szekvenciájával a maximális homológia eléréséig történő egyeztetés alapján van meghatározva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység első doménjében található, az 1-281. aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók teljes egészében vagy részben deletálva vannak.
  15. 15. A 13. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjében található, az 1-266. aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók teljes egészében vagy részben deletálva vannak.
  16. 16. A 2., 3., 4. és 9. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  17. 17. A 2., 3., 4. és 9. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  18. 18. A 2., 3., 5. és 7. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  19. 19. A 2., 3., 5. és 7. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  20. 20. A 2., 3., 5. és 8. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  21. 21. A 2., 3., 5. és 8. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  22. 22. A 18. vagy 20. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjében található, az IM2169 törzs Tbp2 alegységének második doménját alkotó, a 346-361. aminosavpozíciók valamelyikétől az 543. aminosavpozícióig teijedő szekvenciának megfelelő régiókkal homológ régió deletálva van.
  23. 23. A 19. vagy 21. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2394 típusú Tbp2 alegység második doménjében található, az IM2394 törzs Tbp2 alegységének második doménját alkotó, a 326-341. aminosavpozíciók valamelyikétől a 442. aminosavpozícióig teijedő szekvenciának megfelelő régiókkal homológ régió deletálva van.
  24. 24. A 18. vagy 20. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjében található, az IM2169 törzs Tbp2 alegységében a következő aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók legalább egyike deletálva van:
    (i) a 362-379. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (ii) a 418-444. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (iii) a 465-481. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (iv) az 500-520. aminosavpozícióknak megfelelő régióval.
  25. 25. A 24. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjében található, az IM2169 törzs Tbp2 alegysége (i)—(iv) régióinak megfelelő régiókkal homológ régiók deletálva vannak.
  26. 26. A 20. vagy 24. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az IM2169 típusú Tbp2 alegység első doménjében található, az 1-281. aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók teljes egészében vagy részben deletálva vannak.
  27. 27. A 3., 6. és 7. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  28. 28. A 3., 6. és 7. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  29. 29. A 3., 6. és 8. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  30. 30. A 3., 6. és 8. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  31. 31. Az 1. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménja részben deletálva van, közelebbről, az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménját képező, az IM2169 törzs Tbp2
    HU 220 116 Β alegységében a következő aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók legalább egyike deletálva van:
    (i) a 362-379. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (ii) a 418-444. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (iii) a 465-481. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (iv) az 500-520. aminosavpozícióknak megfelelő régióval; továbbá tartalmazza annak a szekvenciának a teljes első és harmadik doménját, amelyből származtatva van.
  32. 32. Az 1. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménja részben deletálva van, közelebbről, az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység első doménja részben deletálva van, és annak második doménját képező, az IM2169 törzs Tbp2 alegységében a következő aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók legalább egyike deletálva van:
    (i) a 362-379. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (ii) a 418-444. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (iii) a 465-481. aminosavpozícióknak megfelelő régióval;
    (iv) az 500-520. aminosavpozícióknak megfelelő régióval; továbbá tartalmazza annak a szekvenciának a teljes harmadik doménját, amelyből származtatva van.
  33. 33. A 32. igénypont szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az IM2169 típusú Tbp2 alegység első doménjében található, az 1-281. aminosavpozícióknak megfelelő régiókkal homológ régiók teljes egészében vagy részben deletálva vannak.
  34. 34. A 31-33. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, közelebbről oly módon, hogy abban az említett IM2169 típusú Tbp2 alegység második doménjében található, az IM2169 törzs Tbp2 alegysége említett (i)—(iv) régióinak megfelelő régiókkal homológ régiók deletálva vannak.
  35. 35. A 10., 12., 14., 16., 18., 20., 22., 24-27., 29. és 31-33. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  36. 36. A 11., 13., 15., 17., 19., 21., 23., 28. és 30. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  37. 37. Az 1-36. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid, azzal jellemezve, hogy szekvenciája legalább 50 aminosavból áll.
  38. 38. Izolált DNS-fragmentum, azzal jellemezve, hogy az 1-37. igénypontok valamelyike szerinti polipeptidet kódol.
  39. 39. Gyógyászati készítmény N. meningitidis-íeztózéssel szembeni immunválasz kiváltására, azzal jellemezve, hogy aktív hatóanyagként az 1-37. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidek közül legalább egyet tartalmaz.
  40. 40. A 39. igénypont szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy aktív hatóanyagként legalább egy első és legalább egy második 1-37. igénypontok bármelyike szerinti polipeptidet tartalmaz; továbbá az első polipeptid szekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva, a második polipeptid szekvenciája pedig egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  41. 41. A 40. igénypont szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy a második polipeptid a
    11., 13., 15., 19., 21., 23., 28. és 30. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid.
  42. 42. A 41. igénypont szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy a második polipeptid a
    11., 19., 23. és 28. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid.
  43. 43. A 40., 41. vagy 42. igénypontok bármelyike szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy a második polipeptid aminosavszekvenciája egy IM2394 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  44. 44. A 40-43. igénypontok bármelyike szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy az első polipeptid a 10., 12., 14., 18., 20., 22., 27. és 29. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid.
  45. 45. A 44. igénypont szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy az első polipeptid a 10.,
    18., 22. és 27. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid.
  46. 46. A 40-43. igénypontok bármelyike szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy az első polipeptid a 31-34. igénypontok bármelyike szerinti polipeptid.
  47. 47. A 40-43. igénypontok bármelyike szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy az első polipeptid 16. igénypont szerinti polipeptid.
  48. 48. A 44-47. igénypontok bármelyike szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy az első polipeptid aminosavszekvenciája egy IM2169 típusú Tbp2 alegység szekvenciájából van származtatva.
  49. 49. A 47. igénypont szerinti gyógyászati készítmény, azzal jellemezve, hogy legalább egy harmadik, 16. igénypont szerinti polipeptidet is tartalmaz.
  50. 50. Monoklonális ellenanyag, azzal jellemezve, hogy: (i) képes felismerni egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjében található epitópot; ahol az említett epitóp az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található YKGTW, EFEVDFSDKTIKGTL, EGGFYGPKGEEL és AVFGAK szekvenciák bármelyikével homológ szekvenciájú; és (ii) nem képes felismerni az említett
    HU 220 116 Β
    IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység harmadik doménjében található epitópot, amelynek szekvenciája homológ az általa felismert, első doménban található szekvenciával.
  51. 51. Az 50. igénypont szerinti monoklonális ellen- 5 anyag, azzal jellemezve, hogy:
    (i) képes felismerni egy IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység első doménjében található régiót; amelynek szekvenciája az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található EGGFYGPKGEEL 10 szekvenciával homológ; és (ii) nem képes felismerni az említett IM2169 vagy IM2394 típusú Tbp2 alegység harmadik doménjében található, az általa felismert epitópnak megfelelő epitópot, amelynek szekvenciája homológ az IM2394 törzs
    Tbp2 alegységének harmadik doménjében található SGGFYGKNAIEM-szekvenciával.
  52. 52. Az 51. igénypont szerinti monoklonális ellenanyag, azzal jellemezve, hogy:
    (i) képes felismerni az IM2394 törzs Tbp2 alegységének első doménjében található, a GFYGPK-szekvenciával rendelkező epitópot; és (ii) nem képes felismerni az IM2394 törzs Tbp2 alegységének harmadik doménjében található ekvivalens epitópot.
  53. 53. Gyógyászati készítmény N. meningitidis-iertőzés passzív immunterápiával történő kezelésére, azzal jellemezve, hogy aktív hatóanyagként az 50-52. igénypontok bármelyike szerinti monoklonális ellenanyagot
    15 tartalmaz.
HU9600210A 1994-05-31 1995-05-30 A Neisseria meningitidis transzferin-receptorának Tbp2-fragmentumai HU220116B (hu)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9406594A FR2720408B1 (fr) 1994-05-31 1994-05-31 Fragments Tbp2 de Neisseria meningitidis.
PCT/FR1995/000701 WO1995033049A2 (fr) 1994-05-31 1995-05-30 FRAGMENTS Tbp2 DU RECEPTEUR TRANSFERRINE DE NEISSERIA MENINGITIDIS

Publications (2)

Publication Number Publication Date
HUT75992A HUT75992A (en) 1997-05-28
HU220116B true HU220116B (hu) 2001-11-28

Family

ID=9463680

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
HU9600210A HU220116B (hu) 1994-05-31 1995-05-30 A Neisseria meningitidis transzferin-receptorának Tbp2-fragmentumai

Country Status (9)

Country Link
EP (1) EP0720653A1 (hu)
JP (1) JPH09501059A (hu)
AU (1) AU706090B2 (hu)
CA (1) CA2167936A1 (hu)
FI (1) FI960428A (hu)
FR (1) FR2720408B1 (hu)
HU (1) HU220116B (hu)
NO (1) NO960332L (hu)
WO (1) WO1995033049A2 (hu)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2739624B1 (fr) * 1995-10-10 1997-12-05 Pasteur Merieux Serums Vacc Nouvelle sous-unite tbp2 de neisseria meningitidis
US6090576A (en) * 1996-03-08 2000-07-18 Connaught Laboratories Limited DNA encoding a transferrin receptor of Moraxella
US6440701B1 (en) 1996-03-08 2002-08-27 Aventis Pasteur Limited Transferrin receptor genes of Moraxella
FR2767060B1 (fr) * 1997-08-07 2000-02-11 Pasteur Merieux Serums Vacc Vaccin meningocoque comportant la valence de souche bz83
IL134436A0 (en) * 1997-08-15 2001-04-30 Univ Utrecht Neisseria lactoferrin binding protein
SG152917A1 (en) * 1998-01-14 2009-06-29 Chiron Srl Neisseria meningitidis antigens
EP2261347A3 (en) 1998-05-01 2012-01-11 Novartis Vaccines and Diagnostics, Inc. Neisseria meningitidis antigens and compositions
FR2785293B1 (fr) * 1998-10-30 2002-07-05 Pasteur Merieux Serums Vacc Acides nucleiques et polypeptides specifiques des souches pathogenes du genre neisseria
US6391316B1 (en) 1999-03-10 2002-05-21 University Of Saskatchewan Vaccine compositions comprising Haemophilus somnus transferrin-binding proteins and methods of use
US7241449B1 (en) 1999-04-12 2007-07-10 Aventis Pasteur Limited Transferrin receptor genes of moraxella
NZ581940A (en) 1999-04-30 2011-07-29 Novartis Vaccines & Diagnostic Conserved neisserial antigens
EP1179072A2 (en) 1999-05-19 2002-02-13 Chiron S.P.A. Combination neisserial compositions
GB9928196D0 (en) 1999-11-29 2000-01-26 Chiron Spa Combinations of B, C and other antigens
PT1947187E (pt) 2000-02-28 2011-07-04 Novartis Vaccines & Diagnostic Expressões híbridas de proteínas de neisseria
GB0121591D0 (en) 2001-09-06 2001-10-24 Chiron Spa Hybrid and tandem expression of neisserial proteins
SI2351579T1 (sl) 2002-10-11 2017-05-31 Glaxosmithkline Biologicals Sa Polipeptidna cepiva za široko zaščito proti hipervirulentnim meningokoknim linijam
GB0408977D0 (en) 2004-04-22 2004-05-26 Chiron Srl Immunising against meningococcal serogroup Y using proteins
BR112013005626B1 (pt) 2010-09-10 2022-07-26 Glaxosmithkline Biologicals Sa Meningococo, processo para a preparação de uma cepa meningocócica, vesículas de membrana externa, composição farmacêutica imunogênica, e, uso de uma composição
NZ630133A (en) 2012-06-14 2016-10-28 Novartis Ag Vaccines for serogroup x meningococcus

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2682041B1 (fr) * 1991-10-03 1994-01-14 Pasteur Merieux Serums Vaccins Vaccin contre les infections a neisseria meningitidis.
FR2682114B1 (fr) * 1991-10-03 1996-02-23 Pasteur Merieux Serums Vacc Vaccin de sous-unite contre les infections a neisseria meningitidis et sous-unites correspondantes a l'etat purifie.
FR2692592B1 (fr) * 1992-06-19 1995-03-31 Pasteur Merieux Serums Vacc Fragments d'ADN codant pour les sous-unités du récepteur de la transferrine de Neisseria meningitidis et procédés les exprimant.
CA2122630A1 (en) * 1992-08-31 1994-03-17 Global Tek, Inc. Monoclonal antibody to cell surface protein of the bacterium neisseria meningitidis

Also Published As

Publication number Publication date
NO960332L (no) 1996-03-21
WO1995033049A3 (fr) 1996-01-04
NO960332D0 (no) 1996-01-26
FR2720408A1 (fr) 1995-12-01
EP0720653A1 (fr) 1996-07-10
HUT75992A (en) 1997-05-28
AU2675795A (en) 1995-12-21
FI960428A0 (fi) 1996-01-30
CA2167936A1 (fr) 1995-12-07
WO1995033049A2 (fr) 1995-12-07
FI960428A (fi) 1996-03-28
FR2720408B1 (fr) 1996-08-14
JPH09501059A (ja) 1997-02-04
AU706090B2 (en) 1999-06-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2047681C (en) Vaccines for nontypable haemophilus influenzae
HU220116B (hu) A Neisseria meningitidis transzferin-receptorának Tbp2-fragmentumai
DK175788B1 (da) Vaccine imod meningococcussygdomme, deri indgående komponenter, disses anvendelse og rekombinanter, som eksprimerer dem
AU683435B2 (en) Haemophilus outer membrane protein
JP5566684B2 (ja) Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍｄｉｆｆｉｃｉｌｅに対する、組換え毒素Ａ／毒素Ｂワクチン
SK168497A3 (en) Streptococcal heat shock proteins members of the hsp70 family
RU2194757C2 (ru) ФРАГМЕНТ ДНК, КОДИРУЮЩИЙ ФРАГМЕНТ БЕЛКА РЕЦЕПТОРА ТРАНСФЕРРИНА ШТАММА Haemophilus (ВАРИАНТЫ), ПЛАЗМИДНЫЙ ВЕКТОР (ВАРИАНТЫ), РЕКОМБИНАНТНЫЙ БЕЛОК (ВАРИАНТЫ), ВЫДЕЛЕННЫЙ И ОЧИЩЕННЫЙ БЕЛОК (ВАРИАНТЫ), ИММУНОГЕННАЯ КОМПОЗИЦИЯ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ВЫДЕЛЕННОГО И ОЧИЩЕННОГО БЕЛКА
US5521072A (en) Actinobacillus pleuropneumoniae transferrin binding proteins and uses thereof
AU642650B2 (en) Compositions and treatments for pneumonia in animals
US6939548B2 (en) Methods to produce high levels of C. difficile toxins
US6004562A (en) Outer membrane protein B1 of Moraxella catarrhalis
EP0815236A1 (en) Haemophilus adhesion proteins
US7118749B2 (en) Transferrin receptor genes
WO1994008013A1 (en) Pilin variants and uses thereof
WO1994008013A9 (en) Pilin variants and uses thereof
CA2133441C (en) Haemophilus somnus immunogenic proteins
EP0500576A1 (en) OUTER MEMBRANE PROTEIN P1 AND PEPTIDES FROM HAEMOPHILUS INFLUENZAE TYPE B.
AU775996B2 (en) Cloning and expression of Haemophilus Somnus transferrin-binding proteins
KR100216390B1 (ko) 헤모필루스 외부막 단백질
US6500435B1 (en) Recombinant vaccine for prevention and/or treatment of pleuropneumonia infections
KR100394454B1 (ko) 트랜스페린수용체유전자들

Legal Events

Date Code Title Description
HMM4 Cancellation of final prot. due to non-payment of fee