FR2861087A1 - Procede de transformation d'epoxydes porteurs de groupes trifluoromethyle - Google Patents
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Abstract
L'invention a trait à un procédé d'hydrolyse d'un époxyde fluoré comportant un ou plusieurs groupes CF3, procédé dans lequel on traite l'époxyde en présence d'eau avec une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3 de manière à induire l'ouverture de l'époxyde et la formation du diol vicinal. Ce procédé permet de favoriser l'hydrolyse de l'un des isomères (R) et (S) et cette hydrolyse énantiosélective peut être mise à profit pour la séparation de ces isomères et la préparation d'époxydes ou de diols énantiopurs ou énantiomériquement enrichis. En variante, le procédé peut être utilisé pour une hydrolyse peu ou pas énantiosélective, pour la transformation d'un époxyde racémique ou non racémique en diol racémique ou non racémique
Description
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La présente invention a pour objet un procédé d'hydrolyse des époxydes fluorés comportant un ou plusieurs groupements CF3, et plus particulièrement un procédé permettant de traiter un mélange d'énantiomères -(R) et (S) de tels époxydes fluorés, de manière à enrichir le mélange en l'un des énantiomères de cet époxyde et à obtenir en parallèle le diol vicinal correspondant à l'autre énantiomère. Elle a en particulier pour objet un procédé permettant la séparation des énantiomères (R) et (S) et plus particulièrement un procédé permettant l'enrichissement en isomère de configuration absolue (S) et en diol de configuration (R), ou inversement, l'enrichissement en isomère de configuration absolue (R) et en diol de configuration (S). L'invention a aussi pour objet un procédé permettant de produire les énantiomères et/ou les diols vicinaux sous forme énantiopure ou énantiomériquement enrichie.
Une autre application de ce procédé est la biohydrolyse non énantioselective d'un époxide racémique ou non racémique.
Les époxydes sont des intermédiaires très importants en synthèse organique car ils possèdent une grande réactivité. Ils combinent en effet l'intérêt de posséder une tension de cycle importante et d'avoir un atome d'oxygène nucléofuge. La présence d'un carbone asymétrique conduit à des molécules possédant deux formes stéréoisomériques (énantiomères) distinctes, la forme (R) et la forme (S), l'une étant l'image de l'autre dans un miroir. Il peut être important, dans certains cas, de disposer uniquement de l'une de ces formes et il convient alors de disposer de moyens pour séparer ces deux stéréoisomères ou pour synthétiser spécifiquement le stéréoisomère désiré.
Les molécules fluorées ont un positionnement intéressant aussi bien en agrochimie qu'en pharmacie. L'accès aux époxydes et diols vicinaux fluorés de configuration (R) ou (S) présente donc un intérêt, notamment en temps qu'intermédiaire de synthèse de ces molécules fluorées.
L'utilisation de champignons microscopiques et de protéines d'origine fongique a été décrite comme pouvant servir à la séparation des stéréoisomères de certains époxydes.
Ainsi, EP-A-0 611 826 décrit un procédé de production d'époxydes optiquement enrichis utilisant des champignons microscopiques choisis dans divers genres. Suivant le champignon utilisé, la réaction permet de préparer la forme (R) ou la forme (S) d'un époxyde.
WO-A-0068394 décrit l'isolement, le clonage et la sur-expression d'une enzyme dite époxyde hydrolase à partir d'un champignon du genre Aspergillus et l'utilisation de cette époxyde hydrolase pour la préparation de molécules énantiomériquement enrichies à partir de mélanges d'isomères de composés époxydes décrits en des termes très généraux. Une étude réalisée sur l'oxyde de para-nitrostyrène a révélé une plus forte affinité et une constante catalytique de l'enzyme supérieure pour l'énantiomère (R) par rapport à l'énantiomère (S), conduisant à l'hydrolyse rapide de l'isomère (R) en son diol
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correspondant. Ce document divulgue la séquence protéique et la séquence nucléotidique de l'époxyde hydrolase d'un champignon Aspergillus niger, ce qui permet à ce document de proposer la production de l'enzyme par génie génétique.
Comme le rappelle le document EP-A-0 611 826, il existe de nombreuses classes d'époxydes. Le procédé est exemplifié dans ce document sur un nombre restreint de composés, à savoir l'oxyde de 3-chlorostyrène, le glycidol, l'allyl glycidyl éther, le 3,4-époxy-
1-butène, le 1,2-époxyhexane, le 2,3-époxypropylebenzène et l'oxyde de styrène, alors que la variété des époxydes et des groupements réactifs qu'ils sont susceptibles de porter, est très vaste.
1-butène, le 1,2-époxyhexane, le 2,3-époxypropylebenzène et l'oxyde de styrène, alors que la variété des époxydes et des groupements réactifs qu'ils sont susceptibles de porter, est très vaste.
Une activité époxyde hydrolase, et en particulier une activité époxyde hydrolase énantiosélective, sur des époxydes comportant un ou plusieurs groupes CF3 n'a jamais été démontrée. Compte tenu du caractère particulier des époxydes comportant un ou plusieurs groupes CF3, en particulier du fait de l'électronégativité importante du fluor, il était notoirement impossible à l'homme du métier de prévoir la réactivité et la spécificité d'une enzyme particulière selon l'invention par rapport à ce type de substrat.
La présente invention a donc pour objectif principal de proposer un procédé permettant l'hydrolyse d'époxydes porteurs de motifs trifluorométhyle.
Elle a plus particulièrement pour objet un tel procédé permettant la séparation des énantiomères (R) et (S) d'époxydes porteurs de motifs trifluorométhyle à partir d'un mélange -racémique ou non racémique- d'énantiomères dudit époxyde.
Un autre objectif de l'invention est de proposer un tel procédé utilisable pour la préparation d'époxydes ou de diols comme intermédiaires pour la synthèse de produits pharmaceutiques, agrochimiques ou phytosanitaires.
Les demandeurs ont pu démontrer pour la première fois que des époxydes porteurs de motifs trifluorométhyle peuvent être hydrolysés avec ouverture de l'époxyde et formation d'un diol, et en outre que ces époxydes peuvent être séparés de manière énantiosélective, en utilisant une époxyde hydrolase telle que celle d'Aspergillus niger LCP521. Ceci leur a permis de mettre au point un procédé permettant la transformation énantiosélective d'époxydes-racémiques ou non racémiques- à CF3, basé sur l'emploi de cette époxyde hydrolase ou d'une protéine ou polypeptide analogue ayant une activité époxyde hydrolase sur des époxydes à motif trifluorométhyle.
Suivant une variante de l'invention, et comme on le verra infra, la transformation peut être conduite dans des conditions qui ne sont pas ou peu énantiosélectives, et cette variante peut être mise à profit pour une hydrolyse non ou peu énantiosélective d'époxydes.
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La présente invention a donc pour objet un procédé d'hydrolyse d'un époxyde fluoré comportant un ou plusieurs groupes CF3, de préférence un époxyde de formule (I) telle que décrit ci-après, procédé dans lequel on traite l'époxyde en présence d'eau avec une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3 de manière à induire l'ouverture de l'époxyde et la formation du diol vicinal. L'époxyde peut être un isomère (R) ou (S), ou un mélange, racémique ou non racémique, de ces isomères.
La présente invention a plus particulièrement pour objet un procédé permettant de transformer un mélange d'énantiomères (R) et (S) d'un époxyde fluoré comportant un ou plusieurs groupes CF3,@ de préférence un époxyde de formule (1), en un mélange enrichi en l'un des isomères et en diol correspondant à l'autre isomère, procédé dans lequel on traite: (A) un mélange d'énantiomères (R) et (S) de l'époxyde selon l'invention avec (B) une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3, le procédé conduisant à l'ouverture préférentielle soit de l'époxyde (R) en diol (R) soit de l'époxyde (S) en diol (S).
Par définition, l'ouverture d'un époxyde par une molécule d'eau est dite préférentielle , en ce sens que la protéine a une affinité et une constante catalytique supérieures pour l'un des énantiomères par rapport à l'autre, ce qui se traduit par une vitesse d'hydrolyse supérieure de cet énantiomère. Il est donc possible, en contrôlant la réaction d'hydrolyse, notamment en stoppant cette réaction au moment opportun, d'obtenir à un instant donné une composition enrichie en époxyde (R) ou (S) et en diol de configuration absolue opposée.
Le procédé selon l'invention conduit généralement à une réaction de dédoublement dans laquelle un énantiomère de l'époxyde de configuration (R) ou (S) est ouvert pour donner le diol correspondant. L'époxyde hydrolase conforme à l'invention peut donc induire une hydrolyse énantiosélective de ces époxydes particuliers, dans des proportions remarquables et inattendues. La transformation a un caractère d'énantiosélectivité particulièrement intéressant lorsque le coefficient d'énantiosélectivité (E) (voir infra) est supérieur ou égal à 10, de préférence supérieur ou égal à 30. En fonction du substrat époxyde, l'EH peut hydrolyser préférentiellement soit l'isomère (R), soit l'isomère (S). Il s'avère qu'avec la majorité des époxydes, l'EH hydrolyse préférentiellement l'isomère (R).
Par convention, dans le présent exposé, les termes ou expressions enzyme , enzyme à activité époxyde hydrolase et protéine à activité époxyde hydrolase sont synonymes et sont employés indifféremment.
Le procédé peut comporter une étape subséquente de séparation de l'époxyde (S) du diol (R) ou inversement la séparation de l'époxyde (R) du diol (S), de manière à récupérer d'une part une composition énantiomériquement enrichie en époxyde et d'autre part une composition enrichie en diol. Avec une hydrolyse préférentielle de l'isomère (R), l'étape de
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séparation conduit à récupérer une composition enrichie en époxyde (S) et une composition enrichie en diol (R). Avec une hydrolyse préférentielle de l'isomère (S), l'étape de séparation conduit à récupérer une composition enrichie en époxyde (R) et une composition enrichie en diol (S). On peut procéder au besoin à au moins un autre traitement de la composition enrichie en époxyde par l'enzyme, puis extraction et séparation.
La composition enrichie en diol (R) ou (S) peut être soumise à une cyclisation du diol (R) ou (S) en époxyde (R) ou (S), puis au besoin à au moins un autre traitement par l'enzyme, suivi d'une nouvelle cyclisation.
L'objectif de traitements successifs (2 ou plus) est d'améliorer au besoin l'excès énantiomérique de l'énantiomère correspondant.
Définition des époxydes
Les époxydes visés par l'invention comportent un ou plusieurs groupes CF3, de préférence de 1 à 3, et de manière préférée, ils répondent à la formule (I) :
dans laquelle : - le groupe R représente un groupe alkyle, alcényle, cycloalkyle, aryle ou aralkyle, éventuellement substitué par alkyle, alcoxy, alkylthio ou halogène; les substituants alkyle, alcoxy, alkylthio comportant une chaîne hydrocarbonée en Ci-Ce, de préférence en C,-C3, linéaire, ramifié ou cyclique et comportant éventuellement un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - le groupe R' représente H ou un alkyle linéaire, ramifié ou cyclique en C1-C10, de préférence en C1, C2 ou C3 et comportant éventuellement un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - étant entendu que l'un au moins des radicaux R et R' est, ou comporte, un ou plusieurs, de préférence de 1 à 3, groupements trifluorométhyle (CF3) ; avec (B) une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3.
Les époxydes visés par l'invention comportent un ou plusieurs groupes CF3, de préférence de 1 à 3, et de manière préférée, ils répondent à la formule (I) :
dans laquelle : - le groupe R représente un groupe alkyle, alcényle, cycloalkyle, aryle ou aralkyle, éventuellement substitué par alkyle, alcoxy, alkylthio ou halogène; les substituants alkyle, alcoxy, alkylthio comportant une chaîne hydrocarbonée en Ci-Ce, de préférence en C,-C3, linéaire, ramifié ou cyclique et comportant éventuellement un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - le groupe R' représente H ou un alkyle linéaire, ramifié ou cyclique en C1-C10, de préférence en C1, C2 ou C3 et comportant éventuellement un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - étant entendu que l'un au moins des radicaux R et R' est, ou comporte, un ou plusieurs, de préférence de 1 à 3, groupements trifluorométhyle (CF3) ; avec (B) une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3.
Suivant un mode de réalisation préféré, l'époxyde de formule (I) est tel que R' est H ou un alkyle linéaire en C1, C2 ou C3, mieux encore R' est H ou alkyle en C1 éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogènes, de préférence F, par exemple substitué par 3 atomes de F.
Les groupes R peuvent comporter de 1 à 20 C, notamment de 1 à 12 C.
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Lorsque R est un alkyle substitué par un halogène, R peut être CF3.
Les groupes R peuvent être substitués par de 1 à 3 groupes choisis parmi trifluorométhyle, trifluorométhoxy et trifluorométhylthio.
Les groupes alkyles R peuvent être linéaires ou ramifiés. Ils comportent de préférence de 1 à 10 C, plus préférentiellement de 1 à 6 C. Par exemple : méthyle, propyle, isopropyle, butyle, isobutyle, pentyle, isopentyle, hexyle ou isohexyle, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. De préférence, le groupe alkyle R comporte de 1 à 3 groupements CF3
Les groupes cycloalkyle R comportent de préférence de 3 à 10 C, de préférence de 3 à 8 C, mieux encore 5 à 7 C. Par exemple : cyclopropyle, cyclobutyle, cyclopentyle, cyclohexyle ou cyclooctyle, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. De préférence, le groupe cycloalkyl R comporte de 1 à 3 groupements CF3.
Les groupes cycloalkyle R comportent de préférence de 3 à 10 C, de préférence de 3 à 8 C, mieux encore 5 à 7 C. Par exemple : cyclopropyle, cyclobutyle, cyclopentyle, cyclohexyle ou cyclooctyle, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. De préférence, le groupe cycloalkyl R comporte de 1 à 3 groupements CF3.
Les groupes aryle R peuvent être par exemple les groupes phényle et naphtyle, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. De préférence, le groupe aryle R comporte de 1 à 3 groupements CF3. Les groupes phényle ainsi substitués sont des modalités préférées.
Les groupes aralkyle R peuvent notamment comprendre de 7 à 18 C. A titre d'exemples, on peut citer les groupes benzyle, 1-méthylbenzyle, 2-phényléthyle, 3phénylpropyle, 4-phénylbutyle, 1-naphtylméthyle, 2-naphtylméthyle, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. De préférence, le groupe aralkyle R comporte de 1 à 3 groupements CF3
Les époxydes comportant un radical R phényle comportant un groupe phényle portant de 1 à 3, de préférence 1 ou 2 groupements CF3, éventuellement trifluorométhoxy ou trifluorométhylthio sont des modalités préférées de l'invention. On peut encore préciser que ces groupements peuvent être en para, ortho ou méta par rapport au carbone du phényle relié à l'oxirane. On préfère cependant une substitution en para ou méta, et plus préférentiellement encore en para. Ces époxydes préférés, peuvent encore comporter une gem-disubstitution avec un R' choisi de préférence parmi les alkyles en C1-C3, de préférence CH3. Ces époxydes peuvent aussi être éventuellement substitués par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. Plusieurs exemples intéressants de phényl-oxiranes substitués par CF3 en positions 2,3, 4 et 3,5, ou substitués par -0-CF3 ou S-CF3 en position 4, R' étant H ou CH3, sont décrits dans les exemples.
Les époxydes comportant un radical R phényle comportant un groupe phényle portant de 1 à 3, de préférence 1 ou 2 groupements CF3, éventuellement trifluorométhoxy ou trifluorométhylthio sont des modalités préférées de l'invention. On peut encore préciser que ces groupements peuvent être en para, ortho ou méta par rapport au carbone du phényle relié à l'oxirane. On préfère cependant une substitution en para ou méta, et plus préférentiellement encore en para. Ces époxydes préférés, peuvent encore comporter une gem-disubstitution avec un R' choisi de préférence parmi les alkyles en C1-C3, de préférence CH3. Ces époxydes peuvent aussi être éventuellement substitués par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F. Plusieurs exemples intéressants de phényl-oxiranes substitués par CF3 en positions 2,3, 4 et 3,5, ou substitués par -0-CF3 ou S-CF3 en position 4, R' étant H ou CH3, sont décrits dans les exemples.
L'époxyde hydrolase
Une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3 est représentée par la protéine ayant pour séquence en acides aminés la séquence décrite à la
Une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3 est représentée par la protéine ayant pour séquence en acides aminés la séquence décrite à la
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SEQ ID NO : 2. Cette protéine est l'époxyde hydrolase de l'Aspergillus niger enregistrée au
Museum d'Histoire Naturelle (Paris) sous le numéro LCP521 (Laboratoire de Cryptogamie,
12 rue Buffon, 75005 Paris, France). Cette protéine a été décrite dans la publication WO-A-
00 68394, à laquelle l'homme du métier peut se référer au besoin. Cette protéine constitue pour les besoins de la présente invention, la protéine de référence, et constitue en même temps un mode de réalisation préféré.
Museum d'Histoire Naturelle (Paris) sous le numéro LCP521 (Laboratoire de Cryptogamie,
12 rue Buffon, 75005 Paris, France). Cette protéine a été décrite dans la publication WO-A-
00 68394, à laquelle l'homme du métier peut se référer au besoin. Cette protéine constitue pour les besoins de la présente invention, la protéine de référence, et constitue en même temps un mode de réalisation préféré.
La protéine peut aussi être un variant , homologue , ou dérivé de la protéine de référence, qui par définition présente, comme la protéine de référence, une activité EH sur un époxyde à CF3, et de préférence une activité biologique au moins identique, similaire ou analogue à la protéine de référence sur le même substrat.
Dans le cas d'application à une hydrolyse énantiosélective, les protéines préférées sont celles présentant pour un substrat donné, un coefficient d'énantiosélectivité E supérieur ou égal à 10, de préférence à 30, de manière plus préférée à 50, et mieux encore à 100 , le coefficient d'énantiosélectivité E étant défini par la formule suivante : # = In [(1-c)(1-ees)]
In [(1-c)(1+ees)] avec c : taux de conversion ees : excès énantiomérique du substrat résiduel après hydrolyse enzymatique.
In [(1-c)(1+ees)] avec c : taux de conversion ees : excès énantiomérique du substrat résiduel après hydrolyse enzymatique.
La présente invention définit ci-après, et met en #uvre dans les exemples, un procédé dit monophasique et un procédé dit biphasique, qui correspondent à deux modes de réalisation. L'activité EH de la protéine de référence, comme celle d'un variant , homologue , ou dérivé , peut être évaluée pour un substrat donné, sur la base de ces procédés, et une comparaison peut être réalisée entre les performances de la protéine de référence et celles de la ou des autres protéines testées.
On peut aussi faire l'évaluation d'une protéine EH (protéine de référence, variant , homologue , ou dérivé ) en reproduisant le test suivant : 5,0 mg de substrat époxyde sont dissous dans 3 mL de DMSO ; on ajoute 3 L de 3-(trifluorométhyl)-acétophénone (étalon interne) et 7,9 mL d'eau distillée ; une solution enzymatique est préparée : par exemple, 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH à évaluer (pureté de l'ordre de 25%) sont dissous dans 2,320 mLd'eau distillée ; les solutions sont placées à 27 C pendant 30 min ; on ajoute ensuite 100 L de solution enzymatique au milieu réactionnel ; des prélèvements réguliers du milieu réactionnel permettent de suivre au cours de la réaction la formation du diol : 400 L du milieu réactionnel sont ajoutés à 200 L d'acétonitrile ; après agitation au vortex, extraire par 400 L d'isooctane ; pour chaque prélèvement la phase organique est injectée en GC chirale pour mesurer l'excès énantiomèrique de l'époxyde résiduel et la
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phase aqueuse est injectée sur HPLC phase inverse pour doser la formation du diol (Colonne Nucleodur Chrompack ; Eluant :~CH3CN/H2O 60/40 ; débit 0.5 mL.min-1 ; # = 264 nm ; injection 30 L) ; on a par cette méthode accès aux paramètres ee et c, ce qui permet de calculer la valeur de E ; a aussi accès à l'activité (diol formé). Une comparaison peut être réalisée entre les performances de la protéine de référence et celles de la ou des autres protéines testées.
Suivant un mode de réalisation avantageux, un tel test, ou un test similaire e.g. élaboré à partir de la présente description, permet de déterminer, dans un panel d'au moins deux protéines à activité EH, celle (ou celles) qui s'avère la plus performante sur un substrat donné. Plus largement, un tel test ou un test similaire permet de déterminer les protéines, les variants , homologues , et dérivés aptes à conduire, pour un substrat donné, à un coefficient E supérieur ou égal à 10, de préférence à 30. La présente invention permet donc à l'homme du métier de sélectionner l'enzyme la mieux adaptée au substrat qu'il souhaite transformer. Un tel test ou un test similaire permet aussi à l'homme du métier d'évaluer l'impact de modifications apportées à la séquence de l'enzyme, e. g. à la séquence SEQ ID NO : 2, et donc notamment de pouvoir évaluer les modifications et mutations faites à des fins d'amélioration des performances de l'enzyme.
De manière tout à fait préférée, la protéine possède une activité EH sur un époxyde à CF3 qui est identique ou sensiblement identique à l'époxyde hydrolase de référence.
Comme on le verra infra, une telle protéine peut être d'origine naturelle, provenant par exemple d'un organisme du genre Aspergillus, d'un autre champignon microscopique ou de toute autre source vivante (bactérie, levure, plante etc. ) ou encore d'origine synthétique ou recombinante. Une protéine d'origine naturelle peut avoir été modifiée pour donner une protéine ou un polypeptide dérivé synthétique ou recombinant.
Les protéines variantes , homologues , ou dérivées peuvent être définies comme comprenant : i. les séquences ayant un pourcentage d'homologie égal ou supérieur à 40 %, de préférence à 80 %, de manière plus préférée à 85 %, de manière encore plus préférée à 90 %, et mieux encore à 95, 96, 97, 98 ou 99 % avec la SEQ ID NO : 2, la protéine ainsi définie ayant une activité EH sur les époxydes à CF3 ; ii.les séquences comprenant au moins 10, de préférence au moins 20, de manière plus préférée au moins 50 ou 100 acides aminés consécutifs de la SEQ ID NO : 2 ou d'une séquence telle que définie sous i, la protéine ainsi définie ayant une activité
EH sur les époxydes à CF3.
EH sur les époxydes à CF3.
Suivant un mode de réalisation préféré, l'invention emploie une telle protéine variante , homologue , ou dérivée qui présente pour un substrat donné, un coefficient d'énantiosélectivité E supérieur ou égal à 10, de préférence à 30.
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Le terme "homologie" se réfère de préférence à l'identité entre les acides aminés comparés.
Cette notion d'homologie peut aussi prendre en compte les substitutions conservatives qui sont des substitutions d'acides aminés de même classe, telles que des substitutions d'acides aminés aux chaînes latérales non chargées (tels que l'asparagine, la glutamine, la sérine, la thréonine, et la tyrosine), d'acides aminés aux chaînes latérales basiques (tels que la lysine, l'arginine, et l'histidine), d'acides aminés aux chaînes latérales acides (tels que l'acide aspartique et l'acide glutamique), d'acides aminés aux chaînes latérales apolaires (tels que la glycine, l'alanine, la valine, la leucine, l'isoleucine, la proline, la phénylalanine, la méthionine, le tryptophane, et la cystéine), ces substitutions par des acides aminés similaires ne portant pas significativement atteinte à l'activité biologique de la protéine de référence, et conduisant de préférence à une protéine conservant ou accroissant l'activité biologique de la protéine de référence
Plus généralement, par séquence d'acides aminés variante, homologue, ou dérivée , on entend donc toute séquence d'acides aminés qui diffère de la séquence de référence par substitution, délétion et/ou insertion d'un acide aminé ou de plusieurs acides aminés, cette séquence constituant une protéine ou un polypeptide ayant une activité EH sur des époxydes à CF3, les modifications ne portant pas significativement atteinte à l'activité biologique de la protéine de référence, et de préférence conservant l'activité biologique de la protéine de référence ou accroissant l'activité biologique par rapport à la protéine de référence
Il peut donc s'agir d'une protéine ou polypeptide comprenant ou essentiellement constitué d'un fragment de la SEQ ID NO : 2 ou d'une séquence telle que définie sous i, par exemple d'un fragment formé par les acides aminés 1-339 ou une séquence homologue.
Plus généralement, par séquence d'acides aminés variante, homologue, ou dérivée , on entend donc toute séquence d'acides aminés qui diffère de la séquence de référence par substitution, délétion et/ou insertion d'un acide aminé ou de plusieurs acides aminés, cette séquence constituant une protéine ou un polypeptide ayant une activité EH sur des époxydes à CF3, les modifications ne portant pas significativement atteinte à l'activité biologique de la protéine de référence, et de préférence conservant l'activité biologique de la protéine de référence ou accroissant l'activité biologique par rapport à la protéine de référence
Il peut donc s'agir d'une protéine ou polypeptide comprenant ou essentiellement constitué d'un fragment de la SEQ ID NO : 2 ou d'une séquence telle que définie sous i, par exemple d'un fragment formé par les acides aminés 1-339 ou une séquence homologue.
L'homologie est généralement déterminée en utilisant un logiciel d'analyse de séquence (par exemple, Blast Software, National Center for Biotechnology Information, U.S.
National Library of Medicine, 8600 Rockville Pike, Bethesda, MD 20894, USA ; ou Séquence Analysis Software Package of the Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center, 1710 University Avenue, Madison, Wl 53705). Des séquences d'acides aminés sont alignées pour obtenir le maximum de degré d'homologie (i.e. identité ou similitude). A cette fin, il peut être nécessaire d'introduire de manière artificielle des espaces ( gaps ) dans la séquence. Une fois l'alignement optimal réalisé, le degré d'homologie est établi par enregistrement de toutes les positions pour lesquelles les acides aminés des deux séquences comparées sont identiques ou similaires, par rapport au nombre total de positions.
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De préférence, les protéines ou polypeptides variants , homologues , ou dérivés sont de même longueur ou sensiblement de même longueur que les séquences de référence.
Sont également considérés comme homologues les variants alléliques issus ou dérivés de souches de microorganismes, e.g. d'A. niger, qui ont une activité biologique similaire à la protéine de référence.
Conformément à l'invention, les protéines ou polypeptides peuvent être par ailleurs modifiés chimiquement ou enzymatiquement pour améliorer leur stabilité ou leur biodisponibilité.
Production de l'époxyde hydrolase
Suivant un premier mode de réalisation, la protéine est apportée sous la forme d'une préparation concentrée et/ou purifiée, obtenue à partir d'une culture d'un microorganisme producteur, notamment champignon microscopique, e.g. A. niger, en particulier LCP521. On parle alors de protéine naturelle . Une telle préparation peut être obtenue par une étape d'extraction de l'enzyme à partir d'une culture cellulaire, e. g. par lyse mécanique (par exemple passage dans une presse de French) ou chimique (y compris enzymatique), suivie d'une étape d'élimination des débris cellulaires et de récupération de la phase liquide, ce qui peut comprendre une étape de centrifugation (de préférence à faible vitesse, e. g. de l'ordre de 10 000 g) et/ou de filtration appropriée, avec récupération du surnageant de centrifugation ou du filtrat. On préfère ensuite concentrer l'enzyme, e. g. par ultrafiltration. Il est également préféré de procéder à une purification de l'enzyme et cela peut être effectué par des méthodes de chromatographie, notamment par passages successifs sur des colonnes d'échange d'ions et/ou d'exclusion, comme par exemple DEAE-Sepharose, PhénylSepharose, Mono Q et Superose 12, etc. Typiquement, la préparation est issue d'une extraction, suivie de centrifugation, récupération du surnageant, puis concentration et de préférence purification. Le microorganisme producteur peut être modifié par génie génétique pour sur-exprimer l'enzyme, comme décrit infra.
Suivant un premier mode de réalisation, la protéine est apportée sous la forme d'une préparation concentrée et/ou purifiée, obtenue à partir d'une culture d'un microorganisme producteur, notamment champignon microscopique, e.g. A. niger, en particulier LCP521. On parle alors de protéine naturelle . Une telle préparation peut être obtenue par une étape d'extraction de l'enzyme à partir d'une culture cellulaire, e. g. par lyse mécanique (par exemple passage dans une presse de French) ou chimique (y compris enzymatique), suivie d'une étape d'élimination des débris cellulaires et de récupération de la phase liquide, ce qui peut comprendre une étape de centrifugation (de préférence à faible vitesse, e. g. de l'ordre de 10 000 g) et/ou de filtration appropriée, avec récupération du surnageant de centrifugation ou du filtrat. On préfère ensuite concentrer l'enzyme, e. g. par ultrafiltration. Il est également préféré de procéder à une purification de l'enzyme et cela peut être effectué par des méthodes de chromatographie, notamment par passages successifs sur des colonnes d'échange d'ions et/ou d'exclusion, comme par exemple DEAE-Sepharose, PhénylSepharose, Mono Q et Superose 12, etc. Typiquement, la préparation est issue d'une extraction, suivie de centrifugation, récupération du surnageant, puis concentration et de préférence purification. Le microorganisme producteur peut être modifié par génie génétique pour sur-exprimer l'enzyme, comme décrit infra.
Suivant un deuxième mode de réalisation, la protéine est une protéine dite recombinante , et cette protéine recombinante peut éventuellement être sous forme de protéine fusion. Une protéine recombinante peut être produite par un procédé dans lequel un vecteur contenant un acide nucléique codant pour la protéine est transféré dans une cellule hôte qui est mise en culture dans des conditions permettant l'expression de la protéine correspondante. La protéine recombinante produite peut ensuite être récupérée et purifiée.
De telles protéines peuvent être produites dans des systèmes eucaryotes ou procaryotes suivant les techniques usuelles de biologie moléculaire, microbiologie et de l'ADN recombinant, qui sont parfaitement connues de l'homme du métier. Ces techniques
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sont expliquées en détail dans la littérature. On peut se référer par exemple à : Sambrook,
Fritsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition (1989) Cold
Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York (herein "Sambrook et al.,
1989") ; DNA Cloning: A Practical Approach, Volumes # and Il (D. N. Glover ed. 1985) ;
Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait ed. 1984) ; Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach [B.D. Hames & S. J. Higgins eds. (1985) IRL Press, Oxford] ; Transcription and Translation [B.D. Hames & S. J. Higgins eds. (1984) IRL Press, Oxford] ; Animal Cell Culture [R. I. Freshney, ed. (1986) ] ; Immobilized Cells and Enzymes [IRL Press, (1986) ] ; B. Perbal, A Practical Guide To Molecular Cloning (1984) ; F.M. Ausubel et al. (eds. ), Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc. (1994).
Fritsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition (1989) Cold
Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York (herein "Sambrook et al.,
1989") ; DNA Cloning: A Practical Approach, Volumes # and Il (D. N. Glover ed. 1985) ;
Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait ed. 1984) ; Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach [B.D. Hames & S. J. Higgins eds. (1985) IRL Press, Oxford] ; Transcription and Translation [B.D. Hames & S. J. Higgins eds. (1984) IRL Press, Oxford] ; Animal Cell Culture [R. I. Freshney, ed. (1986) ] ; Immobilized Cells and Enzymes [IRL Press, (1986) ] ; B. Perbal, A Practical Guide To Molecular Cloning (1984) ; F.M. Ausubel et al. (eds. ), Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc. (1994).
Ce mode de réalisation prévoit l'expression de la protéine, dans les cellules hôtes eucaryotes ou procaryotes, à partir d'une séquence nucléotidique codant pour cette protéine.
Une telle séquence nucléotidique (ou acide nucléique) est notamment représentée par : (a) une séquence nucléotidique comprenant la séquence nucléotidique représentée à la SEQ ID NO : 1 (qui code pour l'EH ayant la séquence SEQ
ID NO : 2, c'est-à-dire pour la protéine de référence) ; (b) une séquence nucléotidique qui code pour l'EH ayant la séquence d'acides aminés SEQ ID NO : 2 ; (c) une séquence nucléotidique qui diffère de la séquence selon (a) ou (b) par dégénérescence du code; ou par une séquence nucléotidique codant pour une protéine variante , homologue , ou dérivée , notamment comme défini supra, et par exemple : (d) une séquence nucléotidique s'hybridant a une séquence selon (a), (b) ou (c), et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3; (e) une séquence nucléotidique ayant un pourcentage d'identité égal ou supérieur à 45 %, de préférence à 80 %, de manière plus préférée à 85 %, de manière encore plus préférée à 90 %, et mieux encore à 95,96, 97,98 ou 99 % avec la SEQ ID NO : 1, et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3; (f) un fragment d'une séquence nucléotidique selon (a), (b), (c), (d) ou (e), comprenant au moins 30, de préférence au moins 60, de manière plus préférée au moins 150 ou 300 nucléotides consécutifs, et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3.
ID NO : 2, c'est-à-dire pour la protéine de référence) ; (b) une séquence nucléotidique qui code pour l'EH ayant la séquence d'acides aminés SEQ ID NO : 2 ; (c) une séquence nucléotidique qui diffère de la séquence selon (a) ou (b) par dégénérescence du code; ou par une séquence nucléotidique codant pour une protéine variante , homologue , ou dérivée , notamment comme défini supra, et par exemple : (d) une séquence nucléotidique s'hybridant a une séquence selon (a), (b) ou (c), et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3; (e) une séquence nucléotidique ayant un pourcentage d'identité égal ou supérieur à 45 %, de préférence à 80 %, de manière plus préférée à 85 %, de manière encore plus préférée à 90 %, et mieux encore à 95,96, 97,98 ou 99 % avec la SEQ ID NO : 1, et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3; (f) un fragment d'une séquence nucléotidique selon (a), (b), (c), (d) ou (e), comprenant au moins 30, de préférence au moins 60, de manière plus préférée au moins 150 ou 300 nucléotides consécutifs, et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3.
Les protéines ainsi codées ont une activité EH sur un époxyde à CF3, et de préférence une activité biologique au moins identique, similaire ou analogue à la protéine de référence sur le même substrat. Dans le cas d'application à une hydrolyse énantiosélective, les
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protéines préférées sont celles présentant pour un substrat donné, un coefficient d'énantiosélectivité E supérieur ou égal à 10, de préférence à 30.
Suivant la caractéristique d), la séquence nucléotidique peut être une séquence nucléotidique s'hybridant a une séquence selon (a), (b) ou (c), et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3 ; les conditions d'hybridation sont de préférence des conditions de stringence élevées, terme dont la définition est bien connue de l'homme du métier, qui peut se référer aux ouvrages généraux tels que Sambrook et al.,
1989 et Hames & Higgins (1985) supra.
1989 et Hames & Higgins (1985) supra.
En ce qui concerne la caractéristique e), l'identité entre séquences nucléotidiques est généralement déterminée en utilisant un logiciel d'analyse de séquence (par exemple, Blast
Software ou Sequence Analysis Software Package mentionnés supra) qui tient compte des nucléotides qui diffèrent entre deux séquences comparées et des nucléotides manquants sur l'une des deux séquences. La valeur de pourcentage est donnée à partir du nombre de nucléotides identiques sur le nombre total de nucléotides de la séquence de référence.
Software ou Sequence Analysis Software Package mentionnés supra) qui tient compte des nucléotides qui diffèrent entre deux séquences comparées et des nucléotides manquants sur l'une des deux séquences. La valeur de pourcentage est donnée à partir du nombre de nucléotides identiques sur le nombre total de nucléotides de la séquence de référence.
Une séquence nucléotidique homologue inclut donc toute séquence nucléotidique qui diffère de la séquence SEQ ID NO : 1 par mutation, insertion, délétion ou substitution d'une ou plusieurs bases, ou par la dégénérescence du code génétique, pour autant qu'elle code pour un peptide présentant l'activité EH sur des époxydes à CF3. les modifications ne portant pas significativement atteinte à l'activité biologique de la protéine de référence, et de préférence conservant l'activité biologique de la protéine de référence ou accroissant l'activité biologique par rapport à la protéine de référence.
Suivant un mode de réalisation préféré, il est fait usage de la séquence nucléotidique suivant la caractéristique (a) ou (b), plus préférentiellement encore suivant la caractéristique (a). Il peut aussi s'agir d'une séquence comprenant ou constituée essentiellement d'un fragment d'une telle séquence (a) ou (b), par exemple nucléotides 1-1197.
Comme cela est parfaitement connu en soi (voir références supra), la séquence nucléotidique peut être insérée dans un vecteur d'expression, dans lequel elle est liée de manière opérante à un ou des élément(s) permettant son expression ou la régulation de son expression, tels que notamment des promoteurs, activateurs et/ou terminateurs de transcription.
Les signaux contrôlant l'expression des séquences nucléotidiques (promoteurs, activateurs, séquences de terminaison...) sont choisis en fonction de l'hôte cellulaire utilisé. A cet effet, les séquences nucléotidiques selon l'invention peuvent être insérées dans des vecteurs à réplication autonome au sein de l'hôte choisi, ou des vecteurs intégratifs de l'hôte choisi. De tels vecteurs seront préparés selon les méthodes couramment utilisées par l'homme du métier, et les clones en résultant peuvent être introduits dans un hôte approprié
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par des méthodes standard, telles que par exemple l'électroporation ou la précipitation au phosphate de calcium.
Les cellules hôtes peuvent être transfectées de manière transitoire ou stable, par ces vecteurs d'expression. Ces cellules peuvent être obtenues par l'introduction dans des cellules hôtes, procaryotes ou eucaryotes, d'une séquence nucléotidique insérée dans un vecteur tel que défini ci-dessus, puis la mise en culture desdites cellules dans des conditions permettant la réplication et/ou l'expression de la séquence nucléotidique transfectée.
Des exemples de cellules hôtes incluent notamment des cellules de mammifères, telles que les cellules COS-7,293, MDCK, des cellules d'insectes telles que les cellules SF9, des bactéries telles que E. coli et des souches de levures telles que Saccharomyces cerevisiae ou des champignons filamenteux comme Aspergillus niger.
Les procédés de purification utilisés sont connus de l'homme du métier. La protéine recombinante obtenue peut être purifiée à partir de lysats et extraits cellulaires, du surnageant du milieu de culture, par des méthodes utilisées individuellement ou en combinaison, telles que le fractionnement, les méthodes de chromatographie, les techniques d'immunoaffinité à l'aide d'anticorps mono- ou polyclonaux spécifiques, etc.
Une époxyde hydrolase recombinante correspondant à l'enzyme de A. niger LCP521 est commercialement disponible sous la référence Epoxide Hydrolase, Aspergillus niger sp., recombinant from Aspergillus niger , BioChemika, catalogue Fluka, code 71832.
La protéine à activité EH peut encore être produite par synthèse chimique. A cet effet, on peut recourir à n'importe quelle méthode bien connue de l'homme du métier. Le peptide de l'invention peut par exemple être synthétisé par les techniques de la chimie de synthèse, telles que la synthèse de type Merrifield qui est avantageuse pour des raisons de pureté, de spécificité antigénique, d'absence de produits secondaires non désirés et pour sa facilité de production.
Pour son usage dans le procédé de transformation de l'invention, la protéine peut être en solution ou immobilisée sur un support solide approprié, tel que par exemple le DEAE cellulose ou le DEAE Sepharose, Eupergit ou Eupergit modifié (C. Mateo et al., Org.
Biomol. Chem., 1, 2739-2743 (2003)).
On peut encore utiliser directement dans le procédé, des cellules entières du champignon tel que Aspergillus niger, modifié génétiquement de manière à sur-exprimer l'époxyde hydrolase à un niveau satisfaisant. Ceci peut être réalise en insérant, de manière opérante dans le génome du champignon, une ou plusieurs cassettes d'expression contenant la séquence codante définie plus haut, sous la dépendance d'un ou des élément(s) permettant son
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expression ou la régulation de son expression, tels que notamment des promoteurs, activateurs et/ou terminateurs de transcription. On peut aussi choisir de modifier le niveau d'expression du gène codant pour l'époxyde hydrolase, par exemple par insertion d'un promoteur hétérologue fort et/ou un activateur pour contrôler le gène in situ. Enfin, on peut aussi introduire dans le champignon un vecteur d'expression non intégratif, comme décrit supra. Comme décrit supra, un tel microorganisme recombiné peut aussi être utilisé pour la production d'enzyme in vitro, auquel cas le procédé d'extraction de l'enzyme produite est ensuite mis en oeuvre.
Conditions du procédé de transformation
Le substrat époxyde à transformer est de préférence mis en solution dans un solvant, de préférence organique, approprié. Le substrat peut être un époxyde racémique ou un époxyde non racémique.
Le substrat époxyde à transformer est de préférence mis en solution dans un solvant, de préférence organique, approprié. Le substrat peut être un époxyde racémique ou un époxyde non racémique.
Suivant un premier mode de réalisation, le solvant du substrat est un solvant organique miscible à l'eau et le procédé est dit monophasique . Ce solvant est par définition capable de dissoudre le substrat époxyde et est compatible avec l'enzyme (le solvant ne dégrade pas notablement l'enzyme ni son activité d'époxyde hydrolase vis-à-vis de l'époxyde à CF3). Le substrat peut être employé en toute concentration, dans les limites de sa solubilité dans le solvant.
Des exemples de solvants pour le système monophasique comprennent le DMSO (diméthylsulfoxyde), le DMF (diméthylformamide), l'acétone, le THF (tetrahydrofurane), le dioxane, le propanol. Les solvants préférés sont le DMSO, le DMF (diméthylformamide) et l'acétone. Deux ou plus de ces solvants peuvent être employés en mélange.
La méthode comprend ensuite le mélange de la solution de substrat et de l'enzyme, de préférence de l'enzyme en solution tamponnée et de préférence dans l'eau.
L'enzyme isolée est de préférence employée en solution aqueuse, notamment de l'eau, e. g. eau distillée et/ou purifiée. De ce fait, lorsqu'elle se présente sous forme solide, e. g. pulvérulente, elle est d'abord dissoute dans la solution aqueuse.
Les concentrations optimales en enzyme peuvent être déterminées pour chaque substrat et peuvent varier dans d'assez larges proportions. De manière générale, on peut travailler en système monophasique avec de faibles concentrations en enzyme, par exemple de l'ordre de 1 à 60 mg d'enzyme par litre de milieu réactionnel, de préférence de 5 à 30 mg/l.
Pour chaque substrat il est possible de contrôler en continu la durée de la réaction d'hydrolyse. Pour un nouveau substrat, une étude préliminaire expérimentale permet d'accéder aux paramètres de contrôle. L'énantiosélectivité de la réaction d'hydrolyse par
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l'enzyme est due à une plus forte affinité et une constante catalytique supérieure pour l'énantiomère (R) par rapport à l'énantiomère (S), ou selon le cas pour l'énantiomère (S) par rapport à l'énantiomère (R). Les deux énantiomères peuvent être hydrolysés, mais la vitesse d'hydrolyse de l'un des énantiomères étant considérablement supérieure, le contrôle de la durée de la réaction permet de piloter la réaction. Il est donc bien évident que l'homme du métier est à même de déterminer facilement les conditions de durée optimales pour un substrat donné. Ceci peut être réalisé en réalisant des prélèvements réguliers du milieu réactionnel sur lesquels on évalue l'évolution de l'excès énantiomérique (ee) et le taux de conversion (c). Les exemples donnent un mode opératoire utilisant de l'acétonitrile pour arrêter la réaction (voir infra) dans chaque échantillon prélevé et une extraction à l'isooctane pour passage en chromatographie en phase gazeuse (CPG). Si la durée de la phase d'hydrolyse peut varier dans de larges proportions en fonction notamment du substrat considéré et de la concentration en enzyme, on peut néanmoins préciser à titre indicatif que la durée de la phase d'hydrolyse pourra être généralement comprise entre 10 et 300 min, de préférence entre 25 et 80 minutes.
L'arrêt de la réaction de transformation peut être réalisé par tout moyen chimique ou physique approprié, comme par exemple: ajout d'un solvant toxique pour l'EH (acétonitrile par exemple) ;addition de base ou d'acide, de détergent, de sels etc. ; ou encore par congélation, chauffage, micro-onde, microfiltration etc.
Suivant un deuxième mode de réalisation, le solvant du substrat est un solvant organique qui n'est pas miscible à l'eau et le procédé est dit biphasique . Ce solvant est par définition capable de dissoudre le substrat époxyde et est compatible avec l'enzyme (le solvant ne dégrade pas notablement l'enzyme ni son activité d'époxyde hydrolase vis-à-vis de l'époxyde à CF3).
Ces solvants non miscibles à l'eau peuvent être choisis parmi les alcanes, par exemple l'iso-octane et l'hexane, les cycloalcanes (cyclohexane par exemple) et les aromatiques (toluène par exemple). Deux ou plus de ces solvants peuvent être employés en mélange.
Dans ce deuxième mode de réalisation, une modalité particulière consiste à utiliser en plus un solvant organique miscible à l'eau, notamment un solvant tel que défini pour le système monophasique.
Dans ce deuxième mode de réalisation, une émulsion est de préférence formée à partir de la solution d'époxyde et de la solution d'enzyme. L'émulsion peut être formée au moment du mélange entre la solution de substrat (phase organique) et une solution aqueuse de l'enzyme (phase aqueuse). Il est aussi possible de former une pré-émulsion par mélange de la solution de substrat (phase organique) avec de l'eau ou une solution aqueuse
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appropriée, cette émulsion étant ensuite mélangée à le solution aqueuse de l'enzyme. Les moyens de mélange sont tels qu'une émulsion peut se former.
Les substrats époxyde ont en général des coefficients de solubilité supérieurs dans les solvants organiques utilisés dans ce mode de réalisation que dans une solution aqueuse contenant des solvants miscibles à l'eau du mode monophasique. La concentration en époxyde peut donc être supérieure, et par exemple être comprise entre 1 et 1000 g d'époxyde par litre de milieu réactionnel, de préférence entre 10 et 500 g/l.
La phase organique représente avantageusement de 1 à 60 %, de préférence de 5 à 50 % du volume total de l'émulsion. Les ratios compris entre 1 et 20%, de préférence entre 5 et 15 %, sont principalement utilisés lorsque la concentration en époxyde dans le milieu réactionnel est inférieure ou égale à 100 g/l. Au-dessus, on utilise préférentiellement les ratios compris entre 20 et 60 %, de préférence entre 20 et 40 %.
La concentration en enzyme dans la phase aqueuse peut varier dans de larges proportions. Elle se situe entre 0,002 et 3 g d'enzyme pure par litre et de préférence entre 0. 002 et 0.5 g/L.
Dans ce mode de réalisation biphasique, il est aussi possible de déterminer à l'avance et/ou de contrôler en continu la durée de la réaction d'hydrolyse pour un substrat donné. Comme décrit supra, ceci peut être réalisé en effectuant des prélèvements réguliers du milieu réactionnel sur lesquels on évalue l'évolution de l'excès énantiomérique et le taux de conversion. Les exemples donnent un mode opératoire utilisant de l'acétate d'éthyle et un passage en CPG, que l'on peut appliquer sur chaque échantillon prélevé pour suivre l'évolution de la réaction. La durée de la phase d'hydrolyse peut varier dans de larges proportions, en fonction des conditions opératoires, notamment de la quantité d'enzyme mise en oeuvre, et du substrat à transformer. On peut néanmoins préciser que la durée de la phase d'hydrolyse pourra être généralement comprise entre quelques minutes, e. g de l'ordre de 15 à 30 minutes, et plusieurs jours.
L'arrêt de la réaction de transformation peut être réalisé par tout moyen adapté, tel que ajout d'acétate d'éthyle, d' éther éthylique, de dichlorométhane, etc., ou encore par les moyens et techniques mentionnés pour le système monophasique.
Dans le procédé de l'invention, et notamment dans les deux modes de réalisation qui viennent d'être décrits, la température lors de la phase d'hydrolyse est généralement maintenue entre 4 et 50 C, de préférence entre 25 et 30 C .
La phase d'hydrolyse est conduite dans un réacteur approprié muni de moyens d'agitation ou de mélange adaptés. Les paramètres de mélange ou d'agitation sont choisis pour optimiser la phase d'hydrolyse. Suivant une modalité particulière, il est procédé à un contrôle continu ou à intervalles réguliers des conditions d'agitation, notamment de la vitesse
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de rotation des moyens d'agitation. Dans le système bi-phasique, ce contrôle permet notamment d'assurer le maintien du milieu réactionnel sous la forme d'une émulsion appropriée.
Suivant une modalité préférée, l'agitation est maintenue tout au long de la phase d'hydrolyse.
Le pH peut être maintenu entre 6 et 9, de préférence entre 6,5 à 7,5.
Des co-réactifs peuvent être utilisés pour accroître la stabilité de l'EH. On peut citer à titre préféré des agents de réduction tels que le ss-mercaptoéthanol ou la cystéine.
A l'issue de la phase d'hydrolyse, le substrat (mélange d'époxyde et de diol) peut être extrait par des méthodes classiques connues de l'homme du métier, comme par exemple l'extraction directe ou l'extraction en continu etc.
A partir du produit de l'hydrolyse, éventuellement d'un extrait de celui-ci, l'époxyde résiduel et le diol peuvent être séparés par des méthodes classiques connues de l'homme du métier, par exemple par distillation ou chromatographie sur colonne etc. Des opérations de ce type sont détaillées par exemple dans l'exemple numéro 23.
Comme mentionné supra, le diol énantiomériquement enrichi peut être cyclisé en son époxyde. Pour la cyclisation du diol (R) ou (S), on peut utiliser toute méthode connue. A titre d'exemple, la cyclisation peut être réalisée en deux étapes, par ajout de 1 équivalent de chlorure de tosyle (TsCI) en présence de tétrahydrofurane (THF), puis d'hydrure de sodium (NaH). L'opération d'hydrolyse énantiomérique et de cyclisation peut être reconduite une ou plusieurs fois, de façon à accroître l'excès énantiomérique en époxyde (R) ou (S) ou en diol.
La présente invention permet donc de préparer des mélanges comportant de forts excès énantiomériques en époxyde (S) et diol (R), [ou inversement en époxyde (R ) et diol (S) ] des préparations à fort excès énantiomérique en époxyde (S), [ou inversement en époxyde (R)] des préparations à fort excès énantiomérique en diol ou en époxyde (R) [ou inversement (S) ]. Ces préparations peuvent être énantiopures ou essentiellement énantiopures, i.e. présenter un excès énantiomérique supérieur ou égal à 97%.
La présente invention a donc aussi pour objet l'utilisation d'une protéine à activité EH sur un époxyde à CF3 conforme à l'invention, pour la préparation de tels mélanges et préparations, à partir d'un époxyde racémique ou non racémique. Suivant une mode de réalisation préféré, l'époxyde hydrolase de l'Aspergillus niger LCP521 est utilisée, par exemple une protéine d'extraction, une protéine recombinante ou une protéine produite par synthèse chimique. Suivant un autre mode de réalisation, on utilise une protéine d'une autre origine, ou un variant , homologue ou dérivé de l'époxyde hydrolase de l'Aspergillus niger LCP521, qui a une activité EH sur un époxyde à CF3, et de préférence une activité biologique identique, similaire ou analogue à l'époxyde hydrolase de l'Aspergillus niger LCP521 sur le même substrat, voire une activité EH supérieure à cette dernière. De
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manière préférée, cette protéine à activité EH présente pour un substrat donné, un coefficient d'énantiosélectivité E supérieur ou égal à 10, de préférence à 30.
Suivant un autre mode de réalisation, l'hydrolyse est non ou peu énantiosélective.
L'invention peut alors concerner entre autres un procédé d'hydrolyse non énantiosélective d'un mélange racémique ou non racémique, d'époxyde en diol procédé dans lequel la réaction est conduite en système monophasique ou biphasique comme décrit supra. Suivant une modalité particulière, on transforme un époxyde racémique en diol racémique. Ce procédé peut être conduit de manière remarquable, dans des conditions expérimentales particulièrement douces et économiques, évitant en particulier l'utilisation d'un milieu acide ou basique minéral plus ou moins concentré. La sélection d'une protéine à activité EH peut être facilement réalisée sur la base du test décrit supra, ou d'un test similaire, l'objectif étant cette fois de déterminer et sélectionner les protéines conduisant, pour un substrat donné, à un coefficient E inférieur à 10.
Certains des époxydes et diols selon l'invention sont des intermédiaires utiles comme intermédiaires de synthèse de composés pharmaceutiquement actifs. Un autre objet de l'invention est donc l'application du procédé selon l'invention pour la préparation d'intermédiaires de synthèse de composés pharmaceutiquement actifs ou pour la préparation de tels composés pharmaceutiquement actifs, se présentant sous la forme époxyde et/ou diol, de préférence sous la forme époxyde (R) ou (S), de préférence énantiopure ou énantiomériquement enrichie (i.e. présentant un excès énantiomérique supérieur ou égal à 97%), ou sous la forme diol (R) ou (S), de préférence énantiopure ou énantiomériquement enrichie (i.e. présentant un excès énantiomérique supérieur ou égal à 97%).
Plus généralement, l'invention s'applique à la production de produits d'intérêt industriel doués d'activité biologique, ou d'intermédiaires de tels produits, par exemple dans les domaines phytosanitaires et agrochimiques, e. g. produits insecticides, anti-parasitaires, etc.
Comme composés pharmaceutiquement actifs pouvant être obtenus à partir des époxydes et des diols selon l'invention, on peut citer par exemple :
BRL-35113 (CAS 90730-95-3) ;
Clofuperol Hydrochloride (CAS 17230-8764) - S-15511(AN-2000-47942 ; J. Pharmacol. Exp. Ther. 295, N 2, 753-60, 2000) ; - Aprepitant (CAS 170729-80-3) ; - Flumaxedol Hydrochloride (C11H13CIF3NO); - Iralukast (CAS 15181-24-7 ; Novartis AG) ;
BRL-35113 (CAS 90730-95-3) ;
Clofuperol Hydrochloride (CAS 17230-8764) - S-15511(AN-2000-47942 ; J. Pharmacol. Exp. Ther. 295, N 2, 753-60, 2000) ; - Aprepitant (CAS 170729-80-3) ; - Flumaxedol Hydrochloride (C11H13CIF3NO); - Iralukast (CAS 15181-24-7 ; Novartis AG) ;
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Mabuterol Hydrochloride (C13H19Cl2F3N2O) ;
Oxaflozane Hydrochloride (CAS 26629-86-7) ;
S-15261 (AN-94-44449 ; Diabetologia 37, N 10, 969-75, 1994) ;
Fludorex (CAS 15221-81-5) ;
Flumetramide (CAS 7125-73-7);
Fluminorex (CAS 720-76-3) ; L-709210, L-732138, L-733060, L-636281, L-740141, L-741671, L-742311, L-742694, ou L-758298 (Merck&Co Inc).
Oxaflozane Hydrochloride (CAS 26629-86-7) ;
S-15261 (AN-94-44449 ; Diabetologia 37, N 10, 969-75, 1994) ;
Fludorex (CAS 15221-81-5) ;
Flumetramide (CAS 7125-73-7);
Fluminorex (CAS 720-76-3) ; L-709210, L-732138, L-733060, L-636281, L-740141, L-741671, L-742311, L-742694, ou L-758298 (Merck&Co Inc).
L'invention va être maintenant décrite plus en détail à l'aide d'exemples d'application non limitatifs.
Exemples
Dans les exemples qui suivent, l'enzyme utilisée est l'époxyde hydrolase d'A. niger (EH d'An) de la souche LCP521. Cette enzyme est une protéine recombinante produite dans une souche d'Aspergillus niger conformément au procédé décrit sous la partie B) Clonage et caractérisation de l'époxyde hydrolase soluble d'Aspergillus niger qui est apparentée aux époxydes hydrolase microsomales de mammifère dans WO-A-00 68394. Une enzyme ainsi produite est commercialement disponible comme mentionné supra.
Dans les exemples qui suivent, l'enzyme utilisée est l'époxyde hydrolase d'A. niger (EH d'An) de la souche LCP521. Cette enzyme est une protéine recombinante produite dans une souche d'Aspergillus niger conformément au procédé décrit sous la partie B) Clonage et caractérisation de l'époxyde hydrolase soluble d'Aspergillus niger qui est apparentée aux époxydes hydrolase microsomales de mammifère dans WO-A-00 68394. Une enzyme ainsi produite est commercialement disponible comme mentionné supra.
Résolution cinétique par l'EH d'An - Système monophasique
Exemple Résolution cinétique du 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par l'EH d'An - Système monophasique
5,1 mg de 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane sont dissous dans 3 mL de DMSO. On ajoute 3 .IL de 3-(trifluorométhyl)-acétophénone (étalon interne) et 7,9 mL d'eau distillée ([4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane]=2,5 mM ; %DMSO=30). Une solution enzymatique est préparée : 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) sont dissous dans 4,550 mL d'eau distillée. Les solutions sont placées à 27 C pendant 30 min. On ajoute ensuite 100uL de solution enzymatique au milieu réactionnel.
Exemple Résolution cinétique du 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par l'EH d'An - Système monophasique
5,1 mg de 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane sont dissous dans 3 mL de DMSO. On ajoute 3 .IL de 3-(trifluorométhyl)-acétophénone (étalon interne) et 7,9 mL d'eau distillée ([4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane]=2,5 mM ; %DMSO=30). Une solution enzymatique est préparée : 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) sont dissous dans 4,550 mL d'eau distillée. Les solutions sont placées à 27 C pendant 30 min. On ajoute ensuite 100uL de solution enzymatique au milieu réactionnel.
Des prélèvements réguliers du milieu réactionnel permettent de suivre au cours de la réaction l'excès énantiomérique du substrat résiduel et son taux de conversion (400 .IL du milieu réactionnel sont ajoutés à 200 L d'acétonitrile. Après agitation au vortex, extraire par
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400 L d'iso-octane et injecter 2 L de la phase organique sur CPG chirale). Les valeurs obtenues correspondent à une valeur du coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 30.
Le coefficient d'énantiosélectivité E est défini comme étant :
E = In [(1-c)(1-ees)]
In [(1-c)(1+ees)] Avec c : taux de conversion ees : Excès énantiomérique du substrat résiduel après hydrolyse enzymatique.
E = In [(1-c)(1-ees)]
In [(1-c)(1+ees)] Avec c : taux de conversion ees : Excès énantiomérique du substrat résiduel après hydrolyse enzymatique.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=120 C ; tr=4,4 min et 4,8 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=3,9 min pour l'étalon interne)
Exemple 2 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (4,7 mg soit [2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,5 mM), en présence de 25 % de DMSO.
Exemple 2 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (4,7 mg soit [2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,5 mM), en présence de 25 % de DMSO.
La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 2,470 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 5.
Analyses réalisées sur une colonne type Lipodex E (T=100 C ; tr=3,8 min et 4,8 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr= 4,3 pour l'étalon interne)
Exemple 3 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (5,0 mg soit [3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,66 mM) , en présence de 20 % de DMSO.
Exemple 3 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (5,0 mg soit [3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,66 mM) , en présence de 20 % de DMSO.
La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 2.680 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité de 10.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=90 C ; tr=13,2 min et 13,7 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=10,4 min pour l'étalon interne)
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Exemple 4
La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (4,7 mg soit [4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,5 mM) , en présence de 20 % de DMSO.
La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (4,7 mg soit [4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,5 mM) , en présence de 20 % de DMSO.
La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 2.470 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 50.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=120 C ; tr=9,7 min et 10,7 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=3,9 min pour l'étalon interne)
Exemple 5 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 3,5-(bistrifluorométhyl-phényl)oxirane (0,77 mg soit [3,5-(bistrifluorométhyl-phényl)-oxirane] =0,3 mM) , en présence de 25 % de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 15.065 mL d'eau distillée.
Exemple 5 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 3,5-(bistrifluorométhyl-phényl)oxirane (0,77 mg soit [3,5-(bistrifluorométhyl-phényl)-oxirane] =0,3 mM) , en présence de 25 % de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 15.065 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 4.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=80 C ; tr=9,8 min et 10,1 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=17,1 min pour l'étalon interne)
Exemple 6 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)oxirane (5,0 mg soit [méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,5 mM), en présence de 30 % de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 2. 320 mL d'eau distillée.
Exemple 6 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)oxirane (5,0 mg soit [méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =2,5 mM), en présence de 30 % de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 2. 320 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité de 25.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=100 C ; tr=8,5 min et 9,1 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=6,9 min pour l'étalon interne)
Exemple 7 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)oxirane (3,6 mg soit [méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =1,8 mM), en présence de 30
Exemple 7 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)oxirane (3,6 mg soit [méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)-oxirane] =1,8 mM), en présence de 30
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% de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 3. 222 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 30.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=120 C ; tr=6,4 min et 7,1 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=3,9 min pour l'étalon interne)
Exemple 8 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 4-(trifluorométhylthio-phényl)-oxirane (4,4 mg soit [4-(trifluorométhylthio-phényl)-oxirane] =2 mM), en présence de 30 % de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 5. 273 mL d'eau distillée.
Exemple 8 La procédure décrite dans l'exemple 1 est appliquée au 4-(trifluorométhylthio-phényl)-oxirane (4,4 mg soit [4-(trifluorométhylthio-phényl)-oxirane] =2 mM), en présence de 30 % de DMSO. La solution enzymatique ajoutée (100uL) contient 2 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (caractérisée comme ayant une pureté de l'ordre de 25%) dans 5. 273 mL d'eau distillée.
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 160.
Analyses réalisées sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=130 C ; tr=7,2 min et 7,6 min pour les deux énantiomères de l'époxyde ; tr=2,8 min pour l'étalon interne) Résolution cinétique par l'EH d'An - Système biphasique - échelle analytique
Exemple 9 Résolution cinétique du 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par l'EN dAn - Système biphasique ; échelle analytique
Dans un tube haut et étroit à fond plat (diamètre 15 mm), 100 mg de 4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane sont placés dans 100 uL d'iso-octane. On ajoute 20 uL de 3-(trifluorométhyl)-acétophénone (étalon interne) et 850 uL d'eau distillée. Le flacon est bouché, muni d'une violente agitation magnétique (formation d'une émulsion) et placé à 27 C. Avant l'ajout de 0,86 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %) en solution dans 50 L d'eau distillée, l'agitation est stoppée, 1 L de la phase organique est prélevé et l'agitation est relancée. Le prélèvement est dilué par de l'acétate d'éthyle et injecté en CPG chirale. Ce type de prélèvement, répété au cours du temps, permet de suivre l'évolution de l'excès énantiomèrique du substrat résiduel et du taux de conversion de l'époxyde. Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 160.
Exemple 9 Résolution cinétique du 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par l'EN dAn - Système biphasique ; échelle analytique
Dans un tube haut et étroit à fond plat (diamètre 15 mm), 100 mg de 4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane sont placés dans 100 uL d'iso-octane. On ajoute 20 uL de 3-(trifluorométhyl)-acétophénone (étalon interne) et 850 uL d'eau distillée. Le flacon est bouché, muni d'une violente agitation magnétique (formation d'une émulsion) et placé à 27 C. Avant l'ajout de 0,86 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %) en solution dans 50 L d'eau distillée, l'agitation est stoppée, 1 L de la phase organique est prélevé et l'agitation est relancée. Le prélèvement est dilué par de l'acétate d'éthyle et injecté en CPG chirale. Ce type de prélèvement, répété au cours du temps, permet de suivre l'évolution de l'excès énantiomèrique du substrat résiduel et du taux de conversion de l'époxyde. Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 160.
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Analyses réalisés sur une colonne type Chirasil-Dex CB (T=120 C ; tr=4,4 min et 4,8 min pour les deux énantiomères de l'époxyde; tr=3,9 min pour l'étalon interne)
Exemple 10 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au 2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane.
Exemple 10 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au 2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane.
Dans ce cas, pour 100 mg de substrat sont ajoutés 1,7 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %).
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 20.
Exemple 11 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au 3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane.
Dans ce cas, pour 100 mg de substrat sont ajoutés 1,7 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %).
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 10.
Exemple 12 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au 4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane.
Dans ce cas, pour 100 mg de substrat sont ajoutés 1,7 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %).
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 270.
Exemple 13 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au (3,5-bistrifluorométhyl-phényl)oxirane. Dans ce cas, pour 100 mg de substrat sont ajoutés 1,7 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %).
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 17.
Exemple 14 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)oxirane. Dans ce cas, pour 100 mg de substrat sont ajoutés 1,7 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %).
Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 25.
Exemple 15 La procédure décrite dans l'exemple 9 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)oxirane. Dans ce cas, pour 100 mg de substrat sont ajoutés 1,7 mg d'extrait enzymatique de l'EH d'An recombinante (pureté 25 %).
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Les valeurs obtenues correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 50.
Résolution cinétique par méthode chimique (comparatif)
Exemple 16 Résolution cinétique de 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par méthode chimique Dans un mini-réacteur de 1 mL muni d'une agitation magnétique, 204 mg (1 mmole) de 4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane sont ajoutés à 4,76 mg (0.007 mmole) de (R,R)(Salen)Co(OAc). On introduit en une seule fois 9,9 L d'eau (0.55 mmol) à température ambiante. Le système est placé pendant 48h sous agitation à température ambiante. On extrait ensuite la totalité du milieu réactionnel par 10 mL d'iso-octane. 1 mL de la phase organique est alors prélevé. On lui ajoute 1 mL de solution d'iso-octane contenant de l'étalon 3-(trifluorométhyl)-acétophénone à 5 g.L-1. 0. 2 L de ce mélange est injecté en GC chirale.
Exemple 16 Résolution cinétique de 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par méthode chimique Dans un mini-réacteur de 1 mL muni d'une agitation magnétique, 204 mg (1 mmole) de 4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane sont ajoutés à 4,76 mg (0.007 mmole) de (R,R)(Salen)Co(OAc). On introduit en une seule fois 9,9 L d'eau (0.55 mmol) à température ambiante. Le système est placé pendant 48h sous agitation à température ambiante. On extrait ensuite la totalité du milieu réactionnel par 10 mL d'iso-octane. 1 mL de la phase organique est alors prélevé. On lui ajoute 1 mL de solution d'iso-octane contenant de l'étalon 3-(trifluorométhyl)-acétophénone à 5 g.L-1. 0. 2 L de ce mélange est injecté en GC chirale.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde résiduel=98,6 % ; eediol forme=89,0 %) correspondent à un coefficient d'énantiosélectivté E apparent de 84.
Exemple 17 La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au (2-trifluorométhyl-phényl)-oxirane à l'échelle de la millimole.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde résiduel=23,3 % ; c=77,7 %) correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 1.4.
Exemple 18 La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au (3-trifluorométhyl-phényl)-oxirane à l'échelle de la millimole.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde residuel=100 % ; c=61 %) correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent supérieur ou égal à 33.
Exemple 19 La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au (4-trifluorométhyl-phényl)-oxirane à l'échelle de la millimole.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde résiduel=97,8 % ; eediol formé =79,3 %) correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 38.
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Exemple 20
La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)- oxirane à l'échelle de la millimole.
La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)- oxirane à l'échelle de la millimole.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde résiduel= 0,1 % ; c =2,0 %) correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 1.
Exemple 21
La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)- oxirane à l'échelle de la millimole.
La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)- oxirane à l'échelle de la millimole.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde résiduel=0,2 % ; c =19,4 %) correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent proche de 1.
Exemple 22
La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au 4-(trifluorométhylthio-phényl)oxirane à l'échelle de la millimole.
La procédure décrite dans l'exemple 16 est appliquée au 4-(trifluorométhylthio-phényl)oxirane à l'échelle de la millimole.
Les valeurs obtenues (eeépoxyde résiduel= 99,6 % ; eediol formé = 89,4 %), correspondent à un coefficient d'énantiosélectivité E apparent de 110.
Résolution cinétique par l'EH d'An - Système biphasique Echelle préparative
Exemple 23 Résolution cinétique de 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par l'EH d'An - Système biphasique ; échelle préparative.
Exemple 23 Résolution cinétique de 4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane par l'EH d'An - Système biphasique ; échelle préparative.
Dans un flacon muni d'une agitation mécanique, on place 1,25 g de 4-(trifluorométhoxyphényl)-oxirane racémique (soit 6,13 mmoles) dans 2,5 mL d'iso-octane. On ajoute 21,5 mL d'eau distillée. L'ensemble est placé sous agitation dans un bain thermostaté à 27 c.
Pendant ce temps, on prépare une solution enzymatique contenant 12,5 mg par mL d'eau d'extrait enzymatique EH d'An recombinante (pureté 25 %). Cette solution est elle aussi placée à 27 C. Après 30 minutes, on ajoute au milieu réactionnel 1 mL de la solution enzymatique précédemment préparée. Ce moment correspond au temps to.
La réaction est suivie par GC chirale. On prélève régulièrement 1 L au milieu réactionnel que l'on ajoute à 40 L d'acétate d'éthyle placés au préalable dans un eppendorf. Après agitation au vortex et centrifugation, on injecte en GC chirale pour mesurer l'excès énantiomèrique de l'époxyde résiduel. Lorsqu'il atteint une valeur suffisante (excès
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énantiomèrique>97 %), on stoppe la réaction par ajout de 30 mL d'acétate d'éthyle. On laisse décanter, récupère la phase organique et extrait par 2x50 mL d'acétate d'éthyle la phase aqueuse. Les phases organiques sont réunies, lavées par 30 mL de solution aqueuse saturée en NaCI, séchées sur MgS04 et concentrées sous pression réduite. L'époxyde résiduel et le diol formé sont séparés par chromatographie flash sur gel de silice (50 parties ; éluant : hexane / acétate d'éthyle 90/10 jusqu'à acétate d'éthyle pur). En vue de la mesure des pouvoirs rotatoires, chaque produit isolé subit ensuite une purification au four à boules pour éliminer toute trace de solvant et de silice. On obtient 615 mg de (R)-(4trifluoromethoxy-phenyl)-ethane-1,2-diol (rdt= 45,6% ; ee= 94,5%) et 543 mg de (S)-4- (trifluorométhoxy-phényl)-oxirane (rdt= 43,4% ; ee = 98,6%).
Analyse structurale (S)-4-(trifluorométhoxy-phényl)-oxirane
RMN'H 1 CDC13: 5 2,79 (dd, 1 H, @ 3JHH = 2,5 Hz,'JHH = 5,3 Hz, Hl), 5 3,19 (dd, 1H, 3JHH = 4,0 Hz,'JHH = 5,3 Hz, Hl), 5 3,92 (dd, 1H, 0 3JHH = 2,5 Hz, 3JHH = 4,0 Hz, H2), 5 7,38-7,65 (m, 4H, H4,6,7,$).
RMN'H 1 CDC13: 5 2,79 (dd, 1 H, @ 3JHH = 2,5 Hz,'JHH = 5,3 Hz, Hl), 5 3,19 (dd, 1H, 3JHH = 4,0 Hz,'JHH = 5,3 Hz, Hl), 5 3,92 (dd, 1H, 0 3JHH = 2,5 Hz, 3JHH = 4,0 Hz, H2), 5 7,38-7,65 (m, 4H, H4,6,7,$).
3 RMN'3C l CDCl3: 8 51,3 {C), b 51,7 {C2), ô 120,4 (q,'JF=265,5 'cF3 6 i Hz, Ci,), 5 121,1 (C4 et C8), 5 126,9 (C5 et C7), ô 136,4 (C3), 5 10 149,1 {q, J=1,9 Hz, C6).
[ajo22= +13.7 (c=1,58 ; CHCI3 (R)-(4-trifluoromethoxy-phenyl)-ethane-1,2-diol
RMN 1H 1 CDC13 : 2,13 (s, 1 H, H10 ou Ho 2,69 (s, 1 H, H10 ou "on H9), ô 3,70 (m, 2H, H11,), S 4,84 (m, 1 H, H2), S 7,21 (d, 2H, 3JHH = 5 fi L | 8,75 Hz, H4.8), ses 7,41 (d, 2H, 3JHH = 8,5 Hz, H5,). il CF,"o 36 [ait22= -41,5 (c=1,04 ; Choc13 ) CF3'-O 6 7 9oH [a]D22= -41,5 (c=1,04 ; CHCI3 )
Exemple 24 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au 2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane. On obtient le (S)-2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=34,5% ; ee=97,9%) et le (R) -2trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol (rdt=59,2% ; ee=77,3%).
RMN 1H 1 CDC13 : 2,13 (s, 1 H, H10 ou Ho 2,69 (s, 1 H, H10 ou "on H9), ô 3,70 (m, 2H, H11,), S 4,84 (m, 1 H, H2), S 7,21 (d, 2H, 3JHH = 5 fi L | 8,75 Hz, H4.8), ses 7,41 (d, 2H, 3JHH = 8,5 Hz, H5,). il CF,"o 36 [ait22= -41,5 (c=1,04 ; Choc13 ) CF3'-O 6 7 9oH [a]D22= -41,5 (c=1,04 ; CHCI3 )
Exemple 24 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au 2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane. On obtient le (S)-2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=34,5% ; ee=97,9%) et le (R) -2trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol (rdt=59,2% ; ee=77,3%).
Analyse structurale (S)-2-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane
RMN 1H 1 DMSO-d6: 5 2,75 (dd, 1H, 1JHH = 5,5 Hz, 3JHH = 2,5 Hz, FÓF F à Hi), ô 3,21 (dd, 1H, 1JHH = 5,5 Hz, 3JHH = 4,25 Hz H1,), 5 4,15 (m, 5 ",,=::,,}Ü, 6 Ó 7
RMN 1H 1 DMSO-d6: 5 2,75 (dd, 1H, 1JHH = 5,5 Hz, 3JHH = 2,5 Hz, FÓF F à Hi), ô 3,21 (dd, 1H, 1JHH = 5,5 Hz, 3JHH = 4,25 Hz H1,), 5 4,15 (m, 5 ",,=::,,}Ü, 6 Ó 7
<Desc/Clms Page number 26>
1 H, H2), 5 7,44 (d, 1 H, 3JHH = 7,75 Hz, H8), # 7,54 (t, 3JHH = 7,5 Hz,
H7), # 7,63 (t, 1H,3JHH = 7,5 Hz, H6), 5 7,75 (d, 1H,3JHH = 7,75 Hz,
H5).
H7), # 7,63 (t, 1H,3JHH = 7,5 Hz, H6), 5 7,75 (d, 1H,3JHH = 7,75 Hz,
H5).
RMN 13C / DMSO-d6 : # 48,5 (q, 4JCF=2,7 Hz, C2), # 50,2 (Ci), #
124,3 (q, 'JcF=273,5, C10), # 125,5 (q, 3JCF=5,4 Hz, C5), # 125,55 (C6 et C8), # 126,9 (q, 2JcF=30,7 Hz, C4), 5 128,2 (C7),5 136,2 (m,
C3).
124,3 (q, 'JcF=273,5, C10), # 125,5 (q, 3JCF=5,4 Hz, C5), # 125,55 (C6 et C8), # 126,9 (q, 2JcF=30,7 Hz, C4), 5 128,2 (C7),5 136,2 (m,
C3).
[[alpha]]D22= +62,4 (c=0,89 ; CHCl3) (R)-2-(trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol
RMN 1H / CDCI3: 5 2,45 (s, 1H, Hg ou H1O), 5 3,00 (s, 1H, Hg ou H1O), 5 3,67 (massif, 2H, Ht r), 5 5,23 (massif, 1 H, H2) 5 7,44-7,65 F .. (m, 4H, H4,6,,$).
RMN 1H / CDCI3: 5 2,45 (s, 1H, Hg ou H1O), 5 3,00 (s, 1H, Hg ou H1O), 5 3,67 (massif, 2H, Ht r), 5 5,23 (massif, 1 H, H2) 5 7,44-7,65 F .. (m, 4H, H4,6,,$).
F-J# F OH , RMN 13C / CDOs : 5 67,8 (Ci), 5 74,4 (C2), 5 125,6 (q, 3JF=5,8 .[! on Hz, Cs). 5 124,2 (q, 'jazz=273,7 Hz, C11), 5 127,3 (q, 2JCF=30,3 Hz, ' C4), 6 128,0 (Ce ou Ce), 5 128,2 (C6 ou C8), 5 132,2 (C7), 5 139,2 (C3).
[[alpha]]D22= -47,9 (c=0,98 ; CHCI3 )
Exemple 25 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au 3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane. On obtient le (S)-3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=11,4%; ee=98,7%) et le (R)-3- (trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol (rdt=84,9% ; ee=13,2%).
Exemple 25 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au 3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane. On obtient le (S)-3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=11,4%; ee=98,7%) et le (R)-3- (trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol (rdt=84,9% ; ee=13,2%).
Analyse structurale (S)-3-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane
RMN'H 1 CDC13 : ô 2,79 (dd, 1 H, 3JHH = 2,5 Hz,'JH,., = 5,3 Hz, Hl), 5 3,19 (dd, 1H, 3JHH = 4,0 Hz, 'JHH = 5,3 Hz, H1), ô 3,92 (dd, 1H, F F F 0 g 3JHH = 2,5 Hz, 3JHH = 4,0 Hz, Hz), ô 7,38-7,65 (m, 4H, H4,6,l,a).
RMN'H 1 CDC13 : ô 2,79 (dd, 1 H, 3JHH = 2,5 Hz,'JH,., = 5,3 Hz, Hl), 5 3,19 (dd, 1H, 3JHH = 4,0 Hz, 'JHH = 5,3 Hz, H1), ô 3,92 (dd, 1H, F F F 0 g 3JHH = 2,5 Hz, 3JHH = 4,0 Hz, Hz), ô 7,38-7,65 (m, 4H, H4,6,l,a).
10 6 r 4 :". 2,L.....:!. RMN '3C 1 CDC13 : ô 51,4 (Ci), ô 51,7 (C2), ô 122,3 (q, 3JCF=3,8 7 Hz, C4), Ô 124,0 (q, 1JCF=272,0 Hz, Clo), ô 125,0 (q, 3JF=3,7 Hz, Ce), 5 129,0 (Clou C8), Ô 129,8 (C7 OU C8), 5 131,0 (q, 2JcF=32,4 Hz, C5), S 138,8 (C3). RMN 19F / CDCl3 : # 12,9
<Desc/Clms Page number 27>
[a]D22= + 9,1 (c=0,92 ; CHCI3 ). configuration (S) d'après Ferris, M.
J., Arylethanolamine derivatives and their use in pharmaceutical compositions, EP 40,000,1981.
J., Arylethanolamine derivatives and their use in pharmaceutical compositions, EP 40,000,1981.
Exemple 26 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au 4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane. On obtient le (S)-4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=37,4% ; ee=97,9%) et le (R) -4- (trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol (rdt=51,3% ;ee=84,3%).
Analyse structurale (S)-4-(trifluorométhyl-phényl)-oxirane
(R)-4-(trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol
(R)-4-(trifluoromethyl-phenyl)-ethane-1,2-diol
<Desc/Clms Page number 28>
Asymmetric synthesis of 1-Aryl-1,2-ethanediols from Arylcetylenes by Palladium-Catalysed asymmetric hydrosilylation as a key step,
J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 1584-1585.
J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 1584-1585.
Exemple 27 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)oxirane. On obtient le (S)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=32,7% ; ee=98,3%) et le (R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol (rdt=64,1% ; ee=59,0%).
Analyse structurale (S)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-oxirane
[[alpha]]D22=+8,3 (c=1,00 ; CHCl3)
(R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol
[[alpha]]D22=-5,9 (c=1,25 ; CHCl3)
Exemple 28 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)oxirane. On obtient le (S)-méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=35,0% ; ee=99,1%)
et le (R)-méthyl-(4-trif(uorométhyl-phényi)-ethane-1,2-diol (rdt=58,0% ; ee=88,3%). Analyse structurale
[[alpha]]D22=+8,3 (c=1,00 ; CHCl3)
(R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol
[[alpha]]D22=-5,9 (c=1,25 ; CHCl3)
Exemple 28 La procédure décrite dans l'exemple 23 est appliquée au méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)oxirane. On obtient le (S)-méthyl-(4-trifluorométhyl-phényl)-oxirane (rdt=35,0% ; ee=99,1%)
et le (R)-méthyl-(4-trif(uorométhyl-phényi)-ethane-1,2-diol (rdt=58,0% ; ee=88,3%). Analyse structurale
<Desc/Clms Page number 29>
Exemple 29 Dans un flacon muni d'une agitation mécanique, on place 645 mg de 4-(trifluorométhylthiophényl)-oxirane racémique (soit 2,93 mmoles) dans 6,45 mL d'iso-octane. On ajoute 57,05 mL d'eau distillée. L'ensemble est placé sous agitation dans un bain thermostaté à 27 C.
Pendant ce temps, on prépare une solution enzymatique contenant 12,9 mg par mL d'eau d'extrait enzymatique EH d'An recombinante (pureté 25 %). Cette solution est elle aussi placée à 27 c. Après 30 minutes, on ajoute au milieu réactionnel 1 mL de la solution enzymatique précédemment préparée. Ce moment correspond au temps to.
Le suivi et le traitement de la réaction retenus sont ceux présentés dans l'exemple 23.
On obtient le (S)-4-(trifluorométhylthio-phényl)-oxirane (rdt=37,2% ; ee=98,0%) et le (R) -4- (trifluorométhylthio-phényl)-ethane-1,2-diol (rdt=38,9% ; ee=85,0%).
<Desc/Clms Page number 30>
RMN 13C / DMSO-de : 5 66,9 (Ci), 5 73,1 (C2), # 124,0 (q, J=1,9
Hz, Ce), # 127,9 (C4 et C8), # 129,6 (q, 1JCF=307.6 Hz, C11), #
135,7 (C5 et C7), # 147,4 (C3).
Hz, Ce), # 127,9 (C4 et C8), # 129,6 (q, 1JCF=307.6 Hz, C11), #
135,7 (C5 et C7), # 147,4 (C3).
Détermination des configurations absolues
Diols non décrits dans la littérature Nous avons appliqué une méthode utilisant le dichroïsme circulaire décrite sur des substrats du même type, par Bar, L. D.; Pescitelli, G.; Pratelli, C.; Pini, D.; Salvadori, P., Determination of absolute configuration of acyclic 1,2-diols with Mo2(OAc)4. Snatzke's method revisited, J. Org. Chem., 2001, 66, 4819-4825.
Diols non décrits dans la littérature Nous avons appliqué une méthode utilisant le dichroïsme circulaire décrite sur des substrats du même type, par Bar, L. D.; Pescitelli, G.; Pratelli, C.; Pini, D.; Salvadori, P., Determination of absolute configuration of acyclic 1,2-diols with Mo2(OAc)4. Snatzke's method revisited, J. Org. Chem., 2001, 66, 4819-4825.
Protocole expérimental :
A une solution d'environ 0,6 à 0,7 mg.mL-1 de Mo2(AcO)4 commercial dans le DMSO, une quantité de diol est ajoutée de telle sorte que le ratio ligand/métal soit compris entre 0,6 :1,2 (pour les substrats de faible pureté optique). Le premier ICD (induced Circular Dichroism) est mesuré immédiatement après le mélange et un contrôle est effectué toutes les dix minutes jusqu'à stabilisation (40-50 min).
A une solution d'environ 0,6 à 0,7 mg.mL-1 de Mo2(AcO)4 commercial dans le DMSO, une quantité de diol est ajoutée de telle sorte que le ratio ligand/métal soit compris entre 0,6 :1,2 (pour les substrats de faible pureté optique). Le premier ICD (induced Circular Dichroism) est mesuré immédiatement après le mélange et un contrôle est effectué toutes les dix minutes jusqu'à stabilisation (40-50 min).
<Desc/Clms Page number 31>
<tb>
<tb> 24 <SEP> 77 <SEP> 0.375 <SEP> 1 <SEP> 280 <SEP> (0. <SEP> 12) <SEP> 305 <SEP> (-0. <SEP> 66) <SEP> 348 <SEP> (0. <SEP> 06) <SEP> 385 <SEP> (-0.18)
<tb> 25 <SEP> 13. <SEP> 2 <SEP> 0. <SEP> 75 <SEP> 1 <SEP> 279 <SEP> (0.04) <SEP> 301 <SEP> (-0.14)352 <SEP> (-0. <SEP> 01) <SEP> 375 <SEP> (- <SEP>
<tb> 0. <SEP> 05)
<tb> 27 <SEP> 59 <SEP> 0. <SEP> 75 <SEP> 1 <SEP> 277 <SEP> (0.15) <SEP> 316 <SEP> (-0.22) <SEP> 342 <SEP> (-0.01) <SEP> 385 <SEP> (-0. <SEP> 05)
<tb> 26 <SEP> 84. <SEP> 3 <SEP> 0. <SEP> 375 <SEP> 1 <SEP> 270 <SEP> (0. <SEP> 07) <SEP> 308 <SEP> (-0.60)350 <SEP> (-0.12)381 <SEP> (-0. <SEP> 20)
<tb> 28 <SEP> 88. <SEP> 3 <SEP> 0. <SEP> 375 <SEP> 1 <SEP> 273 <SEP> (0. <SEP> 15) <SEP> 308 <SEP> (-0. <SEP> 18) <SEP> 350 <SEP> (0. <SEP> 02) <SEP> 379 <SEP> (-0.06)
<tb> 29 <SEP> nd <SEP> 1. <SEP> 5 <SEP> 1 <SEP> nd <SEP> nd <SEP> nd <SEP> nd
<tb> 23 <SEP> 94. <SEP> 5 <SEP> 0. <SEP> 375 <SEP> 1 <SEP> 272 <SEP> (0. <SEP> 26) <SEP> 310 <SEP> (-1.22)352 <SEP> (-0.22)375 <SEP> (-0.33)
<tb>
<tb> 24 <SEP> 77 <SEP> 0.375 <SEP> 1 <SEP> 280 <SEP> (0. <SEP> 12) <SEP> 305 <SEP> (-0. <SEP> 66) <SEP> 348 <SEP> (0. <SEP> 06) <SEP> 385 <SEP> (-0.18)
<tb> 25 <SEP> 13. <SEP> 2 <SEP> 0. <SEP> 75 <SEP> 1 <SEP> 279 <SEP> (0.04) <SEP> 301 <SEP> (-0.14)352 <SEP> (-0. <SEP> 01) <SEP> 375 <SEP> (- <SEP>
<tb> 0. <SEP> 05)
<tb> 27 <SEP> 59 <SEP> 0. <SEP> 75 <SEP> 1 <SEP> 277 <SEP> (0.15) <SEP> 316 <SEP> (-0.22) <SEP> 342 <SEP> (-0.01) <SEP> 385 <SEP> (-0. <SEP> 05)
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<tb> 28 <SEP> 88. <SEP> 3 <SEP> 0. <SEP> 375 <SEP> 1 <SEP> 273 <SEP> (0. <SEP> 15) <SEP> 308 <SEP> (-0. <SEP> 18) <SEP> 350 <SEP> (0. <SEP> 02) <SEP> 379 <SEP> (-0.06)
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<tb>
Dichroïsme circulaire ; conditions & résultats expérimentaux (## normalisé par rapport à la concentration en dio!)
Selon les régies décrites par Snatzke, tous les diols testés sont de configuration absolue (R).
Selon les régies décrites par Snatzke, tous les diols testés sont de configuration absolue (R).
Epoxydes non décrits dans la littérature
On obtient la configuration absolue des époxydes par corrélation chimique. Les diols sont cyclisés en époxyde avec rétention de configuration (méthode décrite ci-dessous dans l'exemple 30. L'injection en GC chirale permet par comparaison du chromatogramme obtenu avec l'époxyde issu de la réaction enzymatique de déduire la configuration absolue de l'époxyde.
On obtient la configuration absolue des époxydes par corrélation chimique. Les diols sont cyclisés en époxyde avec rétention de configuration (méthode décrite ci-dessous dans l'exemple 30. L'injection en GC chirale permet par comparaison du chromatogramme obtenu avec l'époxyde issu de la réaction enzymatique de déduire la configuration absolue de l'époxyde.
Exemple 30
Cyclisation du (R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol
Dans un mini-réacteur conique de 3 mL muni d'une agitation magnétique, on place 11,0 mg (1 mmole) de (R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol (ee=88,3%) et 500 L de THF. On ajoute un équivalent de chlorure de tosyle en solution dans 500 L de
Cyclisation du (R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol
Dans un mini-réacteur conique de 3 mL muni d'une agitation magnétique, on place 11,0 mg (1 mmole) de (R)-méthyl-(3-trifluorométhyl-phényl)-ethane-1,2-diol (ee=88,3%) et 500 L de THF. On ajoute un équivalent de chlorure de tosyle en solution dans 500 L de
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THF. Après une heure d'agitation à température ambiante, on ajoute 6 équivalents d'hydrure de sodium. Après 12h d'agitation, on ajoute 100 L d'eau et extrait par 1 mL d'éther éthylique. On injecte la phase organique en GC chirale.
Cette technique a permis de montrer que tous les époxydes résiduels décrits dans les exemples 23 à 29 étaient de configuration absolue (S).
Il doit être bien compris que l'invention définie par les revendications annexées n'est pas limitée aux modes de réalisation particuliers indiqués dans la description ci-dessus, mais en englobe les variantes qui ne sortent ni du cadre ni de l'esprit de la présente invention.
Claims (29)
1- Procédé d'hydrolyse d'un époxyde fluoré comportant un ou plusieurs groupes CF3, procédé dans lequel on traite l'époxyde en présence d'eau avec une protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3 de manière à induire l'ouverture de l'époxyde et la formation du diol vicinal.
2- Procédé selon la revendication 1, dans lequel la protéine ayant une activité époxyde hydrolase (EH) sur les époxydes à CF3 comporte la séquence en acides aminés suivante : i. la séquence en acides aminés SEQ ID NO :2 ; ou ii. une séquence ayant un pourcentage d'homologie égal ou supérieur à 40 %, de préférence à 80 %, de manière plus préférée à 85 %, de manière encore plus préférée à 90 %, et mieux encore à 95,96, 97,98 ou 99 % avec la SEQ ID NO : 2, la protéine ainsi définie ayant une activité EH sur les époxydes à CF3 ; iii. une séquence comprenant au moins 10, de préférence au moins 20, de manière plus préférée au moins 50 ou 100 acides aminés consécutifs de la SEQ ID NO : 2 ou d'une séquence telle que définie sous ii, la protéine ainsi définie ayant une activité EH sur les époxydes à CF3.
3- Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel la protéine est codée par un acide nucléique comprenant la séquence suivante : (a) la séquence nucléotidique représentée à la SEQ ID NO : 1 ; (b) une séquence nucléotidique qui code pour la séquence d'acides aminés SEQ ID NO : 2; (c) une séquence nucléotidique qui diffère de la séquence selon (a) ou (b) par dégénérescence du code; (d) une séquence nucléotidique s'hybridant a une séquence selon (a), (b) ou (c), et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3 ; (e) une séquence nucléotidique ayant un pourcentage d'identité égal ou supérieur à 45 %, de préférence à 80 %, de manière plus préférée à 85 %, de manière encore plus préférée à 90 %, et mieux encore à 95,96, 97,98 ou 99 % avec la
SEQ ID NO: 1, et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3; (f) un fragment d'une séquence nucléotidique selon (a), (b), (c), (d) ou (e), comprenant au moins 30, de préférence au moins 60, de manière plus préférée
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au moins 150 ou 300 nucléotides consécutifs, et codant pour une protéine ayant une activité EH sur les époxydes à CF3.
4- Procédé selon l'une des revendications 1 à 3, dans lequel la protéine est l'époxyde hydrolase d'Aspergillus niger LCP521, naturelle ou recombinante.
5- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 4, caractérisée en ce que l'époxyde répond à la formule (I) :
dans laquelle : - le groupe R représente un groupe alkyle, alcényle, cycloalkyle, aryle ou aralkyle, éventuellement substitué par alkyle, alcoxy, alkylthio ou halogène; les substituants alkyle, alcoxy, alkylthio comportant une chaîne hydrocarbonée en Ci-Ce, de préférence en C1-C3, linéaire, ramifié ou cyclique et comportant éventuellement un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - le groupe R' représente H ou un alkyle linéaire, ramifié ou cyclique en C1-C10, de préférence en Ci, C2 ou C3 et comportant éventuellement un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - étant entendu que l'un au moins des radicaux R et R' est, ou comporte, un ou plusieurs, de préférence de 1 à 3, groupements trifluorométhyle (CF3).
6- Procédé selon la revendication 5, dans lequel l'époxyde de formule (1) est tel que R' est H ou un alkyle linéaire en C1, C2 ou C3, de préférence R' est H ou alkyle en Ci éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogènes, de préférence par 3 atomes de F.
7- Procédé selon la revendication 5 ou 6 , dans lequel, à la formule (1), les groupes R sont choisis parmi les groupes suivants : - alkyles linéaires ou ramifiés, comportant de 1 à 10 C, de préférence de 1 à 6 C, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - cycloalkyle comportant de 3 à 10 C, de préférence de 3 à 8 C, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F ; - phényle ou naphtyle, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que Ci, F, Br, de préférence F ;
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- aralkyle comportant de 7 à 18 C, éventuellement substitué par un ou plusieurs atomes d'halogène, tels que CI, F, Br, de préférence F.
8- Procédé selon l'une des revendications 5 à 7, dans lequel R comporte de 1 à 3 groupements CF3.
9- Procédé selon l'une des revendications 5 à 8, dans lequel R est un phényle substitué par de 1 à 3 groupes choisis parmi trifluorométhyle, trifluorométhoxy et trifluorométhylthio.
10- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 9, dans lequel l'époxyde est un mélange d'énantiomères (R) et (S).
11- Procédé selon la revendication 10, dans lequel le mélange est racémique.
12- Procédé selon l'une des revendications 1 à 12, dans lequel on effectue une hydrolyse d'époxyde avec un coefficient d'énantiosélectivité supérieur ou égal à 10, de préférence supérieur ou égal à 30.
13- Procédé selon la revendication 10 ou 11, dans lequel on effectue une hydrolyse énantiosélective et l'on produit un mélange enrichi en l'un des isomères et en diol correspondant à l'autre isomère.
14- Procédé selon l'une des revendications 1 à 13, dans lequel on produit une préparation enrichie en époxyde (S) et en diol (R).
15- Procédé selon la revendication 14, dans lequel, à l'issue de la réaction d'hydrolyse, on sépare le diol (R) de l'époxyde (S), et l'on récupère ce dernier.
16- Procédé selon l'une des revendications 1 à 13, dans lequel on produit une préparation enrichie en époxyde (R) et en diol (S).
17- Procédé selon la revendication 16, dans lequel, à l'issue de la réaction d'hydrolyse, on sépare le diol (S) de l'époxyde (R), et l'on récupère ce dernier.
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18- Procédé selon l'une des revendications 1 à 13, dans lequel on produit une préparation enrichie en diol (R), et, à l'issue de la réaction d'hydrolyse, on sépare l'époxyde (S) du diol (R), et l'on récupère ce dernier.
19- Procédé selon l'une des revendications 1 à 13, dans lequel on produit une préparation enrichie en diol (S), et, à l'issue de la réaction d'hydrolyse, on sépare l'époxyde (R) du diol (S), et l'on récupère ce dernier.
20- Procédé selon l'une des revendications 1 à 11 et 13, dans lequel on effectue une hydrolyse d'époxyde avec un coefficient d'énantiosélectivité inférieur à 10.
21- Procédé selon la revendication 20, dans lequel on effectue l'hydrolyse des isomères (R) et (S) et l'on produit un diol racémique ou non racémique.
22- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 21, dans lequel l'époxyde est en solution dans un solvant organique miscible à l'eau.
23- Procédé selon la revendication 22, dans lequel ce solvant est choisi parmi le diméthylsulfoxyde, le diméthylformamide, l'acétone, le tetrahydrofurane, le dioxane, le propanol, et leurs mélanges.
24- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 21, dans lequel l'époxyde est en solution dans un solvant organique non miscible à l'eau.
25- Procédé selon la revendication 24, dans lequel ce solvant est choisi parmi l'isooctane, l'hexane, les cycloalcanes, les aromatiques et leurs mélanges.
26- Procédé selon la revendication 24 ou 25, dans lequel une émulsion est formée entre la solution organique d'époxyde et une solution aqueuse de la protéine à activité EH.
27- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 26, dans lequel la protéine à activité EH est en solution aqueuse.
28- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 12 et 14 à 20, pour produire un excès énantiomérique en époxyde (R) ou (S) supérieur ou égal à 97 %.
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29- Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 19, dans lequel on produit une préparation énantiopure ou énantiomériquement enrichie en époxyde ou diol (R) ou (S), l'époxyde ou le diol étant unproduit pharmaceutique, phytosanitaire ou agrochimique ou un intermédiaire de produit pharmaceutique, phytosanitaire ou agrochimique.
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