FI125136B - Eukaryottiset solut ja menetelmä glykolihapon valmistamiseksi - Google Patents

Eukaryottiset solut ja menetelmä glykolihapon valmistamiseksi Download PDF

Info

Publication number
FI125136B
FI125136B FI20116334A FI20116334A FI125136B FI 125136 B FI125136 B FI 125136B FI 20116334 A FI20116334 A FI 20116334A FI 20116334 A FI20116334 A FI 20116334A FI 125136 B FI125136 B FI 125136B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
gene
host
glycolic acid
glyoxylate
seq
Prior art date
Application number
FI20116334A
Other languages
English (en)
Swedish (sv)
Other versions
FI20116334A (fi
Inventor
Outi Koivistoinen
Joosu Kuivanen
Peter Richard
Merja Penttilä
Original Assignee
Teknologian Tutkimuskeskus Vtt Oy
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Teknologian Tutkimuskeskus Vtt Oy filed Critical Teknologian Tutkimuskeskus Vtt Oy
Priority to PCT/FI2012/050956 priority Critical patent/WO2013050659A1/en
Priority to DK12777936.1T priority patent/DK2764085T3/da
Priority to EP12777936.1A priority patent/EP2764085B1/en
Priority to US14/348,902 priority patent/US9783809B2/en
Publication of FI20116334A publication Critical patent/FI20116334A/fi
Application granted granted Critical
Publication of FI125136B publication Critical patent/FI125136B/fi

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
    • C12N1/16—Yeasts; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/40—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a carboxyl group including Peroxycarboxylic acids
    • C12P7/42—Hydroxy-carboxylic acids

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (15)

1. Eukaryoottinen tuotantoisäntä, joka on valittu mikro-organismeista, jossa isäntä on sienisolu tai rihmasienisolu, jota on geneettisesti muunneltu muuttamalla proteiinia koodaavaa polynukleotidiä tai modifioimalla isäntäsolun promoottorialuetta glyoksylaattireduktaasiaktiivisuutta koodaavan geenin ilmentämiseksi ja glykolihapon tuottamiseksi.
2. Patenttivaatimuksen 1 mukainen isäntä, jossa isäntä on hiivasolu.
3. Patenttivaatimuksen 1 tai 2 mukainen isäntä, jossa isäntä pystyy tuottamaan glykolihappoa pH-välillä 1,5-6,0, edullisesti pH-välillä 1,5-5.
4. Jonkin edellä olevan patenttivaatimuksen mukainen isäntä, jossa isäntä pystyy tuottamaan glykolihappoa puskuroimattomissa viljelyolosuhteissa.
5. Jonkin edellä olevan patenttivaatimuksen mukainen isäntä, jossa glyoksylaattireduktaasigeeni on heterologinen geeni.
6. Patenttivaatimuksen 5 mukainen isäntä, jossa glyoksylaattireduktaasigeeni koodaa proteiinia, jonka EC-numero on 1.1.1.79 tai 1.1.1.26.
7. Patenttivaatimuksen 5 tai 6 mukainen isäntä, jossa isäntäsolu käsittää geenit, jotka koodaavat proteiineja, joiden tunnusmerkkinä on sekvenssi SEQ ID NO: 3 tai sekvenssi, joka on vähintään 50-prosenttisesti identtinen, edullisesti vähintään 60-prosenttisesti, edullisemmin vähintään 70-prosenttisesti identtinen ja edullisimmin vähintään 80-prosenttisesti identtinen geenin kanssa, joka koodaa polypeptidiä, jolla on sekvenssi SEQ ID NO: 3, tai sen aktiivista fragmenttia.
8. Jonkin edellä olevan patenttivaatimuksen mukainen isäntä, jossa solua on geneettisesti muunneltu a) yli-ilmentämällä geeniä, joka koodaa glyoksylaattireduktaasia; tai b) lisäämällä vuota kohti glyoksylaattisykliä; tai c) muuntelemalla geenejä, jotka säätelevät glyoksylaattisykliä; tai d) parantamalla NADPHm saatavuutta; tai e) heikentämällä alkoholin tuotantoon osallistuvia geenejä; tai f) millä tahansa kohtien a)-e) yhdistelmällä.
9. Patenttivaatimuksen 8 mukainen isäntä, jossa glyoksylaattireitin vuota lisätään - yli-ilmentämällä yhtä tai useampia geenejä, jotka on valittu ryhmästä, jonka muodostavat isositraattilyaasi-, fumaraattireduktaasi-, akonitaasi-, sitraattisyntaasi-ja asetyylikoentsyymisyntetaasigeenit; tai - vähentämällä syklin välituotteita kuluttavien entsyymien aktiivisuutta, esim. vähentämällä malaattisyntaasin, NAD:stä ja/tai NADP:stä riippuvaisen mitokondriaalisen ja/tai sytosolin isositraattidehydrogenaasin ilmentymistä; tai - millä tahansa kohtien a) ja b) yhdistelmällä.
10. Patenttivaatimuksen 8 mukainen isäntä, jossa glyoksylaattisykliä säätelevää geeniä REG1 heikennetään tai geeniä CAT8 aktivoidaan.
11. Patenttivaatimuksen 8 mukainen isäntä, jossa alkoholin tuotantoa vähennetään - yli-ilmentämällä pyruvaattikarboksylaaseja; tai - vähentämällä alkoholidehydrogenaasia koodaavan geenin, kuten alkoholidehydrogenaasigeenin, ilmentymistä.
12. Patenttivaatimuksen 8 mukainen isäntä, jossa NADPHm saatavuutta parannetaan yli-ilmentämällä sytosolin aldehydidehydrogenaasigeeniä tai poistamalla fosfoglukoosi-isomeraasigeeni.
13. Menetelmä glykolihapon valmistamiseksi, joka menetelmä käsittää jonkin patenttivaatimuksen 1-12 mukaisista mikro-organismisoluista valitun glyoksylaattireduktaasiaktiivisuutta koodaavan eukaryoottisolun viljelyn kasvu- ja tuotantoelatusaineessa ja mahdollisesti glykolihapon talteenoton mainitusta elatusaineesta.
14. Patenttivaatimuksen 13 mukainen menetelmä, jolloin elatusaineiden pH on 1,5-6, edullisesti 1,5-5, edullisemmin 2-4 ja edullisimmin 2-3.
15. Patenttivaatimuksen 13 tai 14 mukainen menetelmä Jolloin viljely elatusainetta ei ole puskuroitu.
FI20116334A 2011-10-04 2011-12-29 Eukaryottiset solut ja menetelmä glykolihapon valmistamiseksi FI125136B (fi)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/FI2012/050956 WO2013050659A1 (en) 2011-10-04 2012-10-04 Eukaryotic cell and method for producing glycolic acid
DK12777936.1T DK2764085T3 (da) 2011-10-04 2012-10-04 Eukaryot-celle og fremgangsmåde til at fremstille glykolsyre
EP12777936.1A EP2764085B1 (en) 2011-10-04 2012-10-04 Eukaryotic cell and method for producing glycolic acid
US14/348,902 US9783809B2 (en) 2011-10-04 2012-10-04 Eukaryotic cell and method for producing glycolic acid

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201161542833P 2011-10-04 2011-10-04
US201161542833 2011-10-04

Publications (2)

Publication Number Publication Date
FI20116334A FI20116334A (fi) 2013-04-05
FI125136B true FI125136B (fi) 2015-06-15

Family

ID=47073470

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI20116334A FI125136B (fi) 2011-10-04 2011-12-29 Eukaryottiset solut ja menetelmä glykolihapon valmistamiseksi

Country Status (5)

Country Link
US (1) US9783809B2 (fi)
EP (1) EP2764085B1 (fi)
DK (1) DK2764085T3 (fi)
FI (1) FI125136B (fi)
WO (1) WO2013050659A1 (fi)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FI20155412A (fi) * 2015-05-29 2016-11-30 Teknologian Tutkimuskeskus Vtt Oy Sokerien suora konversio glykolihapoksi
WO2018007560A1 (en) 2016-07-08 2018-01-11 Metabolic Explorer Method for the fermentative production of molecules of interest by microorganisms comprising genes coding sugar phosphotransferase system (pts)
EP3354742A1 (en) 2017-01-26 2018-08-01 Metabolic Explorer Methods and microorganisms for the production of glycolic acid and/or glyoxylic acid
US11124810B2 (en) 2017-07-28 2021-09-21 Teknologian Tutkimuskeskus Vtt Oy Production of oxalyl-CoA, glyoxylate and/or glycolic acid
WO2019046946A1 (en) 2017-09-07 2019-03-14 The Governing Council Of The University Of Toronto PRODUCTION OF GLYCOLATE FROM ETHYLENE GLYCOL AND ASSOCIATED MICROBIAL ENGINEERING
BR112020017374A2 (pt) * 2018-03-01 2020-12-29 Total Raffinage Chimie Vias metabólicas com rendimento de carbono aumentado
WO2020180411A2 (en) * 2019-01-23 2020-09-10 Integrated Lipid Biofuels Llc Genetically engineered yeast yarrowia lipolytica and methods for producing bio-based glycolic acid
US20220098627A1 (en) 2019-01-24 2022-03-31 Photanol B.V. A process for the bioproduction of glycolate
CN113710813A (zh) 2019-02-15 2021-11-26 布拉斯科公司 通过逆向乙醛酸支路生产乙醇酸和甘氨酸的微生物和方法
CN110734865B (zh) * 2019-12-02 2022-11-01 南京昊禾生物科技有限公司 一种低pH条件下高产苹果酸的黑曲霉基因工程菌株及应用

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS54119089A (en) 1978-03-09 1979-09-14 Agency Of Ind Science & Technol Microbial preparation of glycolic acid
JPH10174593A (ja) 1996-12-17 1998-06-30 Ngk Insulators Ltd 酵母によるグリコール酸の生産方法
JP2006067823A (ja) 2004-08-31 2006-03-16 Asahi Kasei Corp バッファーを使用しない条件下での微生物を用いたグリコール酸の製造方法
EP1885842A4 (en) 2005-06-02 2009-06-10 Cargill Inc GENETICALLY MODIFIED YEAST OF ISSATCHENKIAORIENTALIS SPECIES AND CLOSELY BINDED SPECIES AND PROCESSES OF FERMENTATION USING THE SAME
WO2007140816A1 (en) 2006-06-09 2007-12-13 Metabolic Explorer Glycolic acid production by fermentation from renewable resources
KR20160025043A (ko) * 2008-12-12 2016-03-07 메타볼릭스 인코포레이티드 폴리（5ｈｖ）및 5 탄소 화학물질의 생산을 위한 녹색 공정 및 조성물
EP2233562A1 (en) 2009-03-24 2010-09-29 Metabolic Explorer Method for producing high amount of glycolic acid by fermentation
EP2480679A2 (en) 2009-09-25 2012-08-01 Roquette Frères Fermentation process for producing glycolic acid
CA2788811A1 (en) * 2010-02-11 2011-08-18 Metabolix, Inc. Process for gamma-butyrolactone production

Also Published As

Publication number Publication date
EP2764085B1 (en) 2017-08-30
WO2013050659A1 (en) 2013-04-11
DK2764085T3 (da) 2017-11-27
EP2764085A1 (en) 2014-08-13
US9783809B2 (en) 2017-10-10
FI20116334A (fi) 2013-04-05
US20140295510A1 (en) 2014-10-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI125136B (fi) Eukaryottiset solut ja menetelmä glykolihapon valmistamiseksi
US9689005B2 (en) Succinic acid production in a eukaryotic cell
JP6061862B2 (ja) ３‐ヒドロキシプロピオン酸生産用の組成物及び方法
US9315834B2 (en) Manufacture of xylonic acid
US9994877B2 (en) Yeast cell having acid tolerance, method of preparing yeast cell and use thereof
US20150291986A1 (en) Itaconic acid and itaconate methylester production
US20210222136A1 (en) Ectoine-producing yeast
WO2016193540A1 (en) Direct conversion of sugars to glycolic acid
US20140045230A1 (en) Dicarboxylic acid production in a filamentous fungus
US20160024536A1 (en) Genetically engineered and acid-resistant yeast cell with enhanced erg5 activity and method of producing lactate by using the yeast cell
US10072276B2 (en) Genetically engineered yeast cell having increased NADPH production, method of increasing NADPH level in yeast cell, method of preparing yeast cell, and method of producing lactate using yeast cell
US20170191089A1 (en) Itaconic acid and itaconate methylester and dimethylester production
US9783776B2 (en) Yeast having improved product productivity and method of producing product
US9598709B2 (en) Genetically engineered and stress resistant yeast cell with enhanced MSN2 activity and method of producing lactate using the same
US9885067B2 (en) Yeast cell having decreased RGT1 activity, method of producing the same, and method of producing product using the same
KR20190008806A (ko) 젖산 생산이 향상된 형질전환된 미생물
WO2021193666A1 (ja) 改良型鉄代謝工学による新規キシロース代謝系を介した有用物質の製造方法
US20230272440A1 (en) Enzymes and methods for production of malonic acid and derivatives thereof
US11535830B2 (en) Threonine-producing yeast
US20180245106A1 (en) Process for producing itaconic acid and itaconic acid esters under anaerobic conditions
WO2024033303A1 (en) Synthetic formolase pathway

Legal Events

Date Code Title Description
PC Transfer of assignment of patent

Owner name: TEKNOLOGIAN TUTKIMUSKESKUS VTT OY

FG Patent granted

Ref document number: 125136

Country of ref document: FI

Kind code of ref document: B

Effective date: 20150615