FI120261B - PNA-syntes under användning av gentemot svaga syror labila aminoskyddsgrupper - Google Patents

PNA-syntes under användning av gentemot svaga syror labila aminoskyddsgrupper Download PDF

Info

Publication number
FI120261B
FI120261B FI951130A FI951130A FI120261B FI 120261 B FI120261 B FI 120261B FI 951130 A FI951130 A FI 951130A FI 951130 A FI951130 A FI 951130A FI 120261 B FI120261 B FI 120261B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
formula
amino
acid
polymer
amino acid
Prior art date
Application number
FI951130A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI951130A (sv
FI951130A0 (sv
Inventor
Eugen Uhlmann
Gerhard Breipohl
Original Assignee
Hoechst Ag
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hoechst Ag filed Critical Hoechst Ag
Publication of FI951130A0 publication Critical patent/FI951130A0/sv
Publication of FI951130A publication Critical patent/FI951130A/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI120261B publication Critical patent/FI120261B/sv

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D473/00Heterocyclic compounds containing purine ring systems
    • C07D473/02Heterocyclic compounds containing purine ring systems with oxygen, sulphur, or nitrogen atoms directly attached in positions 2 and 6
    • C07D473/18Heterocyclic compounds containing purine ring systems with oxygen, sulphur, or nitrogen atoms directly attached in positions 2 and 6 one oxygen and one nitrogen atom, e.g. guanine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D473/00Heterocyclic compounds containing purine ring systems
    • C07D473/26Heterocyclic compounds containing purine ring systems with an oxygen, sulphur, or nitrogen atom directly attached in position 2 or 6, but not in both
    • C07D473/32Nitrogen atom
    • C07D473/34Nitrogen atom attached in position 6, e.g. adenine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/001Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof by chemical synthesis
    • C07K14/003Peptide-nucleic acids (PNAs)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08GMACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED OTHERWISE THAN BY REACTIONS ONLY INVOLVING UNSATURATED CARBON-TO-CARBON BONDS
    • C08G69/00Macromolecular compounds obtained by reactions forming a carboxylic amide link in the main chain of the macromolecule
    • C08G69/02Polyamides derived from amino-carboxylic acids or from polyamines and polycarboxylic acids
    • C08G69/08Polyamides derived from amino-carboxylic acids or from polyamines and polycarboxylic acids derived from amino-carboxylic acids
    • C08G69/10Alpha-amino-carboxylic acids
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Claims (2)

1. Förfarande för framställning av PNA-oligomerer med formel I: B I (!) K’-(A)k-(Xln-(Q),-Q'’ 5 väri B/X är B c.g c - o MH-(CM,),~CH,-N-(CU, ) ,-CO 8 ( C H j ) , HH-CH-CO-NH-CHj-CO 8 (CH,)f HH-CH-CHj-CHj-CHj-CO B ( C H , ) , NH-CH,-CO~N~CH,-CO 8 i CU , C ' 0 I nh-ch,-ch2-ch-ch2-co o ? —CH NH-CMj-CH,-Nn/X-.C0 8 (ch,), . eller NH-CHj-CO-Nv^^do 31 γ» „ (CR,) -CO Γ '''Y _ (eH2>f NH-(CH2)g varvid f = 1 - 4; och g = 0 - 3; R° är väte, Ci-ig-alkanoyl, Ci-is-alkoxikarbonyl, C3-8-cykloalkanoyl, C7_i5-aroyl, C3-i3~heteroaroyl eller en grupp, 5 som gynnar intracellular upptagning av oligomeren; eller som i samband med hybridisationen samverkar med en mälnuklein-syra; A är en aminosyrarest; k är ett heltal 0 - 10;
10 Q är en aminosyrarest; 1 är ett heltal 0 - 10; B är en inom nukleotidkemin vanlig naturlig nukleo-bas eller icke-naturlig nukleobas eller en förläkemedels-form av dessa, eller ocksä en basersättningsförening;
15 Q° är hydroxi, NH2 eller NHR", väri R" är Ci-i8- alkyl, C2-i8-aminoalkyl eller C2_i8-hydroxialkyl; och n är ett heltal 1 - 50; vilket förfarande är kännetecknat av att a) tili en polymerbärare med formel II: 20 L-[polymer] (II) som är försedd med en ankargrupp L, som innehäller latent resten Q°, antingen kopplas först med ett för fast- 25 fassyntes vanligt förfarande aminosyror (Q'), vilkas sido-kedjor eventuellt är skyddade b) eventuellt avspjälks en i förhällande tili svaga syror labil skyddsgrupp PG med en lämplig reagens, c) upprepas stegen a och b (1-1) ganger, och 32 d) till den härvid som mellanprodukt uppkomna fore-ningen med formel III: (Q ' ) l-L-[polymer] (III) 5 väri L definieras sasom ovan, Q' är en aminosyra Q, vars eventuellt närvarande sidokedjefunktioner är skyddade, och 1 är ett heltal 0 - 10, eller direkt till polymerbäraren enligt formel II kopplas en förening med formel IV:
10 PG-X -OH (IV) ff B' väri PG är en i förhallande till svaga syror labil aminoskyddsgrupp och B'/X är en strukturdel enligt vad som definierats i formel I med en nukleobas, vars exocykliska 15 amino- eller hydroxifunktion är skyddad, varvid B' är en inom nukleotidkemin vanlig naturlig nukleobas eller icke-naturlig nukleobas, eller en förläkemedels-form av dessa, eller ocksä en basersättningsförening, vilkas exocykliska amino- eller hydroxigrupper eventuellt är 20 skyddade med lämpliga kända skyddsgrupper, genom att använda inom peptidkemin vanliga kopp-lingsreagenser, e) en tillfällig, i förhallande till svaga syror labil skyddsgrupp PG avspjälks genom användning av en lämp- 25 lig reagens, f) stegen d och e upprepas (n-1) ganger, g) med ett för fastfassyntes vanligt förfarande kopplas ytterligare aminosyror (A’) , vilkas sidokedjor eventuellt är skyddade, 30 h) en i förhallande tili svaga syror labil skydds grupp PG avspjälks genom användning av en lämplig reagens, i) stegen g och h upprepas (k—1) ganger, j) i det fallet att R° inte är väte, tillsätts res-ten R° med ett vanligt förfarande, 33 k) frän den som mellanprodukt erhallna föreningen enligt formel Ia: B I <!a) R ° " ( A ' )i(“( X I n — ( 0 ' ) | - L - (polymeeri 1 väri R°, k, B'/X, n, Q' och 1 definieras säsom 5 ovan, A' betecknar en aminosyra A, vars sidokedja eventu-ellt är skyddad, och L är en ankargrupp, föreningen enligt formel I avspjälks genom använd-ning av avspjälkningsreagensen frän polymerbäraren, varvid samtidigt eller även härnäst bortspjälks skyddsgrupper som 10 eventuellt förekommer i nukleobasernas exocykliska amino- eller hydroxifunktion och i aminosyrornas sidokedjor.
2. Förfarande enligt patentkrav 1 för framställning av PNA-oligomerer med formel I, kännetecknat av att A är en aminosyrarest frän gruppen glycin, leucin, 15 histidin, fenylalanin, cystein, lycin, arginin, asparaginsy- ra, glutaminsyra, prolin, tetrahydroisokinolin-3-karboxylsy-ra, oktahydroindol-2-karboxylsyra och N-(2-aminoetyl)glycin; k är ett heltal 0 - 6; Q är en aminosyrarest frän gruppen glycin, leucin, 20 histidin, fenylalanin, cystein, lycin, arginin, asparaginsy- ra, glutaminsyra, prolin, tetrahydroisokinolin-3-karboxylsy-ra, oktahydroindol-2-karboxylsyra och N-(2-aminoetyl)glycin; 1 är ett heltal 0 - 6; B är en naturlig nukleobas frän gruppen adenin, cy-25 tosin, guanin, tyrnin och uracil eller en icke-naturlig nukleobas frän gruppen purin, 2,β-diaminopyrin, 7-deaza-ade-nin, 7-deazaguanin, N4N4-etanocytosin, N6N6-etano-2,6-diami-nopurin, 5-metylcytosin, 5-C3-6-alkinyluracil, 5-C3_6-alki-nylcytosin, 5-fluoruracil eller pseudoisocytosin, 2-hydro-30 xi-5-metyl-4-triazolopyrimidin eller en förläkemedelsform av dessa, eller imidazol, nitroimidazol och triazol; och n är ett heltal 4-35.
FI951130A 1994-03-14 1995-03-10 PNA-syntes under användning av gentemot svaga syror labila aminoskyddsgrupper FI120261B (sv)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE4408531A DE4408531A1 (de) 1994-03-14 1994-03-14 PNA-Synthese unter Verwendung einer gegen schwache Säuren labilen Amino-Schutzgruppe
DE4408531 1994-03-14

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI951130A0 FI951130A0 (sv) 1995-03-10
FI951130A FI951130A (sv) 1995-09-15
FI120261B true FI120261B (sv) 2009-08-31

Family

ID=6512696

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI951130A FI120261B (sv) 1994-03-14 1995-03-10 PNA-syntes under användning av gentemot svaga syror labila aminoskyddsgrupper

Country Status (12)

Country Link
US (1) US6046306A (sv)
EP (1) EP0672700B1 (sv)
JP (1) JP4098837B2 (sv)
AT (1) ATE180805T1 (sv)
AU (1) AU695931B2 (sv)
CA (1) CA2144477C (sv)
DE (2) DE4408531A1 (sv)
DK (1) DK0672700T3 (sv)
ES (1) ES2132450T3 (sv)
FI (1) FI120261B (sv)
GR (1) GR3030883T3 (sv)
NO (1) NO321034B1 (sv)

Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7825215B1 (en) * 1993-04-26 2010-11-02 Peter E. Nielsen Substituted nucleic acid mimics
US6133444A (en) * 1993-12-22 2000-10-17 Perseptive Biosystems, Inc. Synthons for the synthesis and deprotection of peptide nucleic acids under mild conditions
US6150510A (en) 1995-11-06 2000-11-21 Aventis Pharma Deutschland Gmbh Modified oligonucleotides, their preparation and their use
DE4438918A1 (de) * 1994-11-04 1996-05-09 Hoechst Ag Modifizierte Oligonukleotide, deren Herstellung sowie deren Verwendung
JP2001518054A (ja) * 1995-06-07 2001-10-09 パーセプティブ バイオシステムズ,インコーポレーテッド Pna−dnaキメラと、このキメラ合成用のpnaシントン
US20050042647A1 (en) * 1996-06-06 2005-02-24 Baker Brenda F. Phosphorous-linked oligomeric compounds and their use in gene modulation
US20050032068A1 (en) * 2002-11-05 2005-02-10 Prakash Thazha P. Sugar and backbone-surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
US7812149B2 (en) 1996-06-06 2010-10-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2′-Fluoro substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations
US9096636B2 (en) * 1996-06-06 2015-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation
US20040171030A1 (en) * 1996-06-06 2004-09-02 Baker Brenda F. Oligomeric compounds having modified bases for binding to cytosine and uracil or thymine and their use in gene modulation
US5898031A (en) 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
US20050118605A9 (en) * 1996-06-06 2005-06-02 Baker Brenda F. Oligomeric compounds having modified bases for binding to adenine and guanine and their use in gene modulation
US20040266706A1 (en) * 2002-11-05 2004-12-30 Muthiah Manoharan Cross-linked oligomeric compounds and their use in gene modulation
US6331618B1 (en) * 1999-05-13 2001-12-18 Pe Corporation (Ny) Compositions of solvents and high concentrations of nucleic acid analogs
DE10019136A1 (de) * 2000-04-18 2001-10-31 Aventis Pharma Gmbh Polyamidnukleinsäure-Derivate, Mittel und Verfahren zu ihrer Herstellung
DE10019135A1 (de) * 2000-04-18 2001-10-31 Aventis Pharma Gmbh Polyamidnukleinsäure-Derivate, Mittel und Verfahren zu ihrer Herstellung
US9150606B2 (en) * 2002-11-05 2015-10-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2'-modified nucleosides for use in gene modulation
US9150605B2 (en) * 2002-11-05 2015-10-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2′-modified nucleosides for use in gene modulation
WO2004044132A2 (en) * 2002-11-05 2004-05-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modified oligonucleotides for use in rna interference
CA2504694C (en) * 2002-11-05 2013-10-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
US8569474B2 (en) 2004-03-09 2013-10-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double stranded constructs comprising one or more short strands hybridized to a longer strand
US8394947B2 (en) 2004-06-03 2013-03-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Positionally modified siRNA constructs
JP2008501693A (ja) * 2004-06-03 2008-01-24 アイシス ファーマシューティカルズ、インク. 遺伝子調節で使用するための個別に調節された鎖を有する二本鎖組成物
US7884086B2 (en) 2004-09-08 2011-02-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugates for use in hepatocyte free uptake assays
PT1966130E (pt) 2005-12-23 2014-01-30 Zealand Pharma As Compostos miméticos de lisina modificados
DK2468724T3 (en) 2006-12-21 2016-02-22 Zealand Pharma As Synthesis of pyrrolidine compounds
DK3618847T3 (da) 2017-05-05 2021-05-25 Boston Medical Ct Corp GAP-junction-modulatorer af intercellulær kommunikation og deres anvendelse til behandling af diabetisk øjensygdom

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5015733A (en) * 1983-12-20 1991-05-14 California Institute Of Technology Nucleosides possessing blocked aliphatic amino groups
US5367066A (en) * 1984-10-16 1994-11-22 Chiron Corporation Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites
DE4016596A1 (de) * 1990-05-23 1991-11-28 Hoechst Ag Ein neues kupplungsreagenz fuer die peptidsynthese
DK51092D0 (da) * 1991-05-24 1992-04-15 Ole Buchardt Oligonucleotid-analoge betegnet pna, monomere synthoner og fremgangsmaade til fremstilling deraf samt anvendelser deraf
MX9207334A (es) * 1991-12-18 1993-08-01 Glaxo Inc Acidos nucleicos peptidicos y formulacion farma- ceutica que los contiene

Also Published As

Publication number Publication date
EP0672700B1 (de) 1999-06-02
AU1480195A (en) 1995-09-21
FI951130A (sv) 1995-09-15
NO950957L (no) 1995-09-15
NO950957D0 (no) 1995-03-13
JP4098837B2 (ja) 2008-06-11
US6046306A (en) 2000-04-04
DE4408531A1 (de) 1995-09-28
DK0672700T3 (da) 1999-11-29
AU695931B2 (en) 1998-08-27
ATE180805T1 (de) 1999-06-15
JPH07285989A (ja) 1995-10-31
EP0672700A1 (de) 1995-09-20
GR3030883T3 (en) 1999-11-30
FI951130A0 (sv) 1995-03-10
NO321034B1 (no) 2006-03-06
ES2132450T3 (es) 1999-08-16
CA2144477C (en) 2007-09-18
CA2144477A1 (en) 1995-09-15
DE59506063D1 (de) 1999-07-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI120261B (sv) PNA-syntes under användning av gentemot svaga syror labila aminoskyddsgrupper
US6710163B1 (en) Peptide nucleic acid synthons
US5539082A (en) Peptide nucleic acids
US6451968B1 (en) Peptide nucleic acids
US6403763B1 (en) Chiral peptide nucleic acids
US6441130B1 (en) Linked peptide nucleic acids
JP4620810B2 (ja) ポリアミド−オリゴヌクレオチド誘導体、その製造及び使用
CA2184681C (en) Process for preparing substituted n-ethylglycine derivatives
US5849893A (en) Nucleic acid-binding oligomers possessing C-branching for therapy and diagnostics
US6713602B1 (en) Synthetic procedures for peptide nucleic acids
US6355726B1 (en) Method for producing polymers having nucleo-bases as side-groups
FI120262B (sv) PNA-syntes under användning av baslabila aminoskyddsgrupper
US7485421B2 (en) Polyamide-oligonucleotide derivatives, their preparation and use
US6716961B2 (en) Chiral peptide nucleic acids with a N-aminoethyl-d-proline backbone
Aviñó et al. Synthesis of Oligonucleotide–Peptide Conjugates for Biomedical and Technological Applications
Hudson et al. The detrimental effect of orotic acid substitution in the peptide nucleic acid strand on the stability of PNA2: NA triple helices
US20030105286A1 (en) Linked peptide nucleic acids
Ferrer et al. Synthesis of peptide nucleic acid oligomers carrying 5-methylcytosine derivatives by postsynthetic substitution

Legal Events

Date Code Title Description
FG Patent granted

Ref document number: 120261

Country of ref document: FI

MM Patent lapsed