ES2698899T3 - Composiciones de anticuerpos contra el virus de la gripe - Google Patents

Composiciones de anticuerpos contra el virus de la gripe Download PDF

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Abstract

Anticuerpo de un único dominio que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 124, y que se une al virus de la gripe H1N1.

Description

DESCRIPCIÓN
Composiciones de anticuerpos contra el virus de la gripe
La presente divulgación se refiere a composiciones de anticuerpos y al uso de los mismos para prevenir o tratar una infección por gripe. La presente divulgación también se refiere al uso de dichas composiciones de anticuerpos para evaluar la reactividad cruzada y el contenido de antígeno de hemaglutinina de vacunas contra la gripe en ensayos de potencia de la vacuna.
La aparición de cepas virales de gripe altamente patógenas supone una seria amenaza para la salud pública a escala mundial. Aunque las vacunas son el pilar de la infección, el control del espacio entre la aparición de nuevas cepas virales y una vacuna clínicamente aprobada presenta, está aumentando una seria preocupación en particular como la resistencia a fármacos antivirales existentes, tales como oseltamavir™ y zanamivir™.
Una estrategia actual es la inmunoterapia pasiva con suero de pacientes convalecientes. Esta estrategia, sin embargo, tiene limitaciones importantes para la aplicación en toda la población, tal como el coste prohibitivo, alto riesgo de toxicidad, dosificación incierta y dificultad en la administración.
Otra estrategia es almacenar anticuerpos monoclonales recombinantes para su despliegue inmediato tras la aparición de una nueva amenaza de pandemia. A modo de ejemplo, informes recientes han descrito el aislamiento de anticuerpos humanos funcionales de los supervivientes de la pandemia de gripe de 1918 (Kashyap et al., 2008), de individuos vacunados estacionales (Ekiert et al., 2009) y de bibliotecas de anticuerpos humanos sin tratamiento previo (Sui et al., 2009). Sin embargo, aunque los anticuerpos monoclonales convencionales son generalmente considerados como una clase exitosa de fármaco, su alto coste y complejidad son una limitación importante. Además, en vista de la epidemiología rápidamente cambiante del virus de la gripe, dicha estrategia con anticuerpos monoclonales requeriría la provisión de un anticuerpo monoclonal que demuestre la reactividad a través de diferentes subtipos virales. Este problema presenta actualmente un gran desafío para la tecnología de anticuerpos monoclonales.
La gripe pandémica se produce cuando aparece un nuevo virus e infecta una población humana global que tiene poca o ninguna inmunidad preexistente. El más reciente H1N1 2009 pandémico, a pesar de una considerable carga económica, no dio lugar a las mismas tasas de mortalidad que las pandemias anteriores como la “gripe española” pandémica de 1918, lo que dio lugar a una estimación de 50 millones de muertes en todo el mundo. El virus de la gripe aviar H5N1 altamente patógeno ha mostrado tasas de mortalidad del 60% en seres humanos infectados y pone de relieve claramente el riesgo que presenta la gripe pandémica.
Las opciones de tratamiento actuales se dividen en dos categorías; fármacos antivirales o vacunas. Los fármacos antivirales actuales reconocen la neuraminidasa viral (por ejemplo Oseltamavir™) o el canal iónico M2 (por ejemplo Amantadina™); los cuales pueden llegar a ser ineficaces con el tiempo debido a la creciente resistencia. Las vacunas son la piedra angular del control de la infección, pero tienen limitaciones en que se necesita un tiempo significativo para desarrollar una vacuna ras la aparición de una nueva cepa viral, no actúan rápidamente, no son eficaces en todos los grupos de población (por ejemplo, pacientes inmunocomprometidos), la protección es ampliamente específica de la cepa y hay una capacidad de producción limitada en todo el mundo. Por lo tanto, existe una clara necesidad de nuevas opciones de tratamiento.
Otro problema en la técnica es la necesidad de estandarización y control de vacunas de la gripe estacional y pandémica. Actualmente, el ensayo de inmunodifusión radial simple (SRD) se considera un ensayo “estándar de oro” para determinar el contenido de antígeno de HA en vacunas contra la gripe. Este ensayo requiere el desarrollo de antisuero de referencia para cada nueva cepa viral, que habitualmente puede agregar 2-3 meses a la línea de desarrollo de vacunas. Naturalmente, la eliminación de este retardo sería muy valiosa en el montaje de una respuesta rápida a una emergencia pandémica. Con este fin, hay una necesidad de un reactivo de “anticuerpo universal”, que comprenda anticuerpos de reacción cruzada que puedan usarse en un ensayo de SRD o en otros formatos de ensayo relacionado basados en, por ejemplo, ELISA, resonancia de plasmón superficial (SPR) o espectrometría de masas.
Por tanto, existe una necesidad urgente de opciones de tratamiento alternativo del virus de la gripe para un ensayo de detección robusto del virus de la gripe y/o para un ensayo de potencia de la vacuna basado en el antígeno del virus de la gripe.
La presente divulgación se dirige a uno o más de los problemas anteriores proporcionando un anticuerpo tal como se describe en el presente documento. La presente invención se define por las reivindicaciones. Estos aspectos/casos de la presente divulgación que constituyen la presente invención se definen por las reivindicaciones.
Una característica principal de los anticuerpos de la presente divulgación es que poseen una región determinante de complementariedad (CDR), por ejemplo una secuencia de aminoácidos de CDR3, de un anticuerpo de un único dominio Vhh de alpaca.
En un caso, la presente divulgación comprende o consiste en un anticuerpo de un único dominio de camélido (por ejemplo un anticuerpo de un único dominio de alpaca); dichos anticuerpos tienen una estructura proteica muy simple y robusta y muestran varias ventajas sobre los anticuerpos monoclonales convencionales, tales como: (i) tamaño: los anticuerpos de un único dominio son aproximadamente 1/10° el tamaño de los anticuerpos monoclonales. Como resultado, dichos anticuerpos tienen la capacidad de acceder a epítopos enterrados u ocultos que normalmente estarían en silencio para el sistema inmunitario humano (por ejemplo, acceso a epítopos más conservados enterrados en la región del tallo de hemaglutinina); (ii) producción a coste significativamente menor que los anticuerpos monoclonales convencionales; (iii) procedimientos más simples para diseñar anticuerpos biespecíficos o multiespecíficos; (iv) bucles de CDR3 más largos que los anticuerpos convencionales, lo que facilita acceder más fácilmente a hendiduras y ranuras en las superficies antigénicos; y/o (v) alta estabilidad estructural.
En un caso, un anticuerpo de la divulgación se une a un virus de la gripe H1 (por ejemplo, un virus de la gripe H1N1), por ejemplo un virus de la gripe H1 (por ejemplo, H1N1) pandémica. En un caso, el anticuerpo se une a la cepa A/California/06/09 y/o A/California/07/2009 y/o A/Brisbane/59/2007.
En un caso un anticuerpo de la divulgación tiene una CDR3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 1-19; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en el que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 1-19. En este sentido, las SEQ ID NOs 1-19 se definen de acuerdo con la nomenclatura de Kabat convencional.
En otro caso, un anticuerpo de la divulgación tiene una CDR3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 20-38; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en el que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 20-38. En este sentido, las SEQ ID NOs 20-38 se definen de acuerdo con la sistema de información internacional ImMunoGeneTics convencional para la nomenclatura de inmunoglobulinas o anticuerpos (IMGT).
Un anticuerpo de la divulgación puede incluir además una CDR2, en el que dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 39-57; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en el que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 39-57. En este sentido, las SEQ ID NOs 39-57 se definen según la nomenclatura de Kabat convencional. Alternativamente, dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 58-76; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 58-76. En este sentido, las SEQ ID NOs 58-78 se definen de acuerdo con la nomenclatura IMGT convencional.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo de la divulgación puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR2, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
1 más 39 o 58 20 más 39 o 58
2 más 40 o 59 21 más 40 o 59
3 más 41 o 60 22 más 41 o 60
4 más 42 o 61 23 más 42 o 61
5 más 43 o 62 24 más 43 o 62
6 más 44 o 63 25 más 44 o 63
7 más 45 o 64 26 más 45 o 64
8 más 46 o 65 27 más 46 o 65
9 más 47 o 66 28 más 47 o 66
10 más 48 o 67 29 más 48 o 67
11 más 49 o 68 30 más 49 o 68
12 más 50 o 69 31 más 50 o 69
13 más 51 o 70 32 más 51 o 70
14 más 52 o 71 33 más 52 o 71
15 más 53 o 72 34 más 53 o 72
16 más 54 o 73 35 más 54 o 73
17 más 55 o 74 36 más 55 o 74
18 más 56 o 75 37 más 56 o 75
19 más 57 o 76 38 más 57 o 76.
Además de la característica de CDR3 mencionada anteriormente (y, opcionalmente, además de la característica de CDR2 mencionada anteriormente), un anticuerpo de la divulgación puede incluir además un CDR1, en el que dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 77-95; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 77-95. En este sentido, las SEQ ID NOs 77-95 se definen según la nomenclatura de Kabat convencional. Alternativamente, dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 96-114; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 96-114. En este sentido, las SEQ ID NOs 96-114 se definen de acuerdo con la nomenclatura IMGT convencional.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo de la divulgación puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR1, tal como se ha definido anteriormente, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
1 más 77 o 96; 20 más 77 o 96;
2 más 78 o 97; 21 más 78 o 97;
3 más 79 o 98; 22 más 79 o 98;
4 más 80 o 99; 23 más 80 o 99;
5 más 81 o 100; 24 más 81 o 100;
6 más 82 o 101; 25 más 82 o 101;
7 más 83 o 102; 26 más 83 o 102;
8, más 84 o 103; 27 más 84 o 103;
9 más 85 o 104; 28 más 85 o 104;
10 más 86 o 105 29 más 86 o 105
11 más 87 o 106 30 más 87 o 106
12 más 88 o 107 31 más 88 o 107
13 más 89 o 108 32 más 89 o 108
14 más 90 o 109 33 más 90 o 109
15 más 91 o 110 34 más 91 o 110
16 más 92 o 111 35 más 92 o 111
17 más 93 o 112 36 más 93 o 112
18 más 94 o 113 37 más 94 o 113
19 más 95 o 114 38 más 95 o 114.
Una vez más, simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo de la divulgación puede comprender combinaciones de CDR3 más c DR2 y CDR1, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
1 más 39 más 77 20 más 58, más 96;
2 más 40 más 78 21 más 59 más 97;
3 más 41 más 79 22 más 60 más 98;
4 más 42 más 80 23 más 61, más 99;
5 más 43 más 81 24 más 62 más 100;
6 más 44 más 82 25 más 63 más 101;
7 más 45 más 83 26 más 64 más 102;
8 más 46 más 84 27 más 65 más 103;
9 más 47 más 85 28 más 66 más 104;
10 más 48, más 86; 29 más 67 más 105;
11 más 49 más 87; 30 más 68 más 106;
12 más 50, más 88; 31 más 69 más 107;
13 más 51, más 89; 32 más 70 más 108;
14 más 52 más 90; 33 más 71 más 109;
15 más 53, más 91; 34 más 72 más 110;
16 más de 54 más 92; 35 más 73, más 111;
17 más 55 más 93; 36 más 74 más 112;
18 más 56, más 94; 37 más 75 más 113;
19 más 57, más 95; 38 más 76 más 114.
En un caso, un anticuerpo de la divulgación comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 115-133. En un caso relacionado, dicho anticuerpo conserva la secuencia de aminoácidos de CDR3 precisa, tal como se ha definido anteriormente, y opcionalmente la secuencia de aminoácidos de CDR1 precisa y/o la secuencia de aminoácidos de CDR2 precisa, tal como se define anteriormente en el presente documento.
En un segundo aspecto relacionado, un anticuerpo de la divulgación se une no sólo al virus de la gripe H1 (tal como se describe anteriormente en el presente documento), sino también a un virus de la gripe H5 (por ejemplo, H5N1 o H5N3), por ejemplo un virus de la gripe H5 pandémico. En un caso, el anticuerpo se une a la cepa A/Vietnam/1203/2004 y/o A/Vietnam/1194/2004 y/o A/Vietnam/119/2004 y/o A/Hong Kong/213/2003 y/o A/pavo/Turquía/1/2005 y/o A/Indonesia/05/2005 y/o A/Pato/Singapur-Q/119-3/97. En un caso, de este aspecto, un anticuerpo de la divulgación tiene una CDR3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 3-4, 6-7, 10, 13 o 15; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 3-4, 6-7, 10, 13 o 15. Alternativamente, dicha CDR3 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 22-23, 25-26, 29, 32 o 34; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22-23, 25-26, 29, 32 o 34.
Un anticuerpo del segundo aspecto puede incluir además una CDR2, en la que dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 41-42, 44-45, 48, 51 o 53; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 41-42, 44-45, 48,51 o 53. Alternativamente, dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 60-61, 63-64, 67, 70 o 72; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 60-61, 63-64, 67, 70 o 72.
Simplemente, a modo de ilustración, un anticuerpo del segundo aspecto puede comprender combinaciones de CDR 3 y CDR2, tal como se han definido anteriormente en el presente documento, para el segundo aspecto basado en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
3 más 41 o 60 22 más 41 o 60;
4 más 42 o 61 23 más 42 o 61;
6 más 44 o 63 25 más 44 o 63;
7 más 45 o 64 26 más 45 o 64;
10 más 48 o 67 29 más 48 o 67;
13 más 51 o 70 32 más 51 o 70;
15 más 53 o 72 34 más 53 o 72.
Un anticuerpo del segundo aspecto, además de la característica de CDR3 mencionada anteriormente (y, opcionalmente, además de la característica de CDR2 mencionada anteriormente), puede incluir además una CDR1, en la que dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 79-80, 82-83, 86, 89 o 91; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 79-80, 82-83, 86, 89 o 91. Alternativamente, dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 98-99, 101­ 102, 105, 108 o 110; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 98-99, 101-102, 105, 108 o 110.
Simplemente, a modo de ilustración, un anticuerpo del segundo aspecto puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR1, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el segundo aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
3 más 79 o 98; 22 más 79 o 98;
4 más 80 o 99; 23 más 80 o 99;
6 más 82 o 101; 25 más 82 o 101;
7 más 83 o 102; 26 más 83 o 102;
10 más 86 o 105 29 más 86 o 105;
13 más 89 o 108 32 más 89 o 108;
15 más 91 o 110 34 más 91 o 110.
Una vez más, simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del segundo aspecto puede comprender las combinaciones CDR3 más CDR2 y CDR1, tal como se han definido anteriormente para el segundo aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
3 más 41 más 79; 22 más 60 más 98;
4 más 42 más 80; 23 más 61, más 99;
6 más 44 más 82; 25 más 63 más 101;
7 más 45 más 83; 26 más 64 más 102;
10 más 48, más 86; 29 más 67 más 105;
13 más 51, más 89; 32 más 70 más 108
15 más 53, más 91; 34 más 72 más 110.
Un anticuerpo del segundo aspecto puede comprender una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las SEQ ID NOs: 117-118, 120-121, 124, 127 o 129. En un caso relacionado, dicho anticuerpo conserva la secuencia de aminoácidos de CDR3 exacta, tal como se ha definido antes en el presente documento, y opcionalmente la secuencia de aminoácidos de CDR1 exacta y/o la secuencia de aminoácidos de CDR2 exacta, tal como se ha definido antes en el presente documento.
En un tercer aspecto relacionado, un anticuerpo de la divulgación se une no sólo a un virus de la gripe H1 y a un virus de la gripe H5 (tal como se han descrito anteriormente en el presente documento), sino también a 1) un virus de la gripe H2 (por ejemplo, H2N2 o H2N3), tales como a un virus de la gripe H2 pandémico (por ejemplo, H2N2 o H2N3), y a 2) un virus de la gripe H9 (por ejemplo, H9N2), tales como un virus de la gripe H9 pandémico (por ejemplo, H9N2). Por ejemplo, el anticuerpo se une a una cepa del virus de la gripe H2 A/Japón/305/1957 y/o al A/Mallard/Eng/727/06. Por ejemplo, el anticuerpo se une a una cepa del virus de la gripe H9 A/Hong Kong/1073/99. En un caso de este aspecto, un anticuerpo de la divulgación tiene una CDR3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 3, 4, 7 o 10; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3, 4, 7 o 10. Alternativamente, dicha CDR3 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 22, 23, 26 o 29; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 22, 23, 26 o 29.
Un anticuerpo del tercer aspecto puede incluir además una CDR2, en la que dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 41, 42, 45 o 48; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 41, 42, 45 o 48. Alternativamente, dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 60, 61, 64 o 67; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 60, 61, 64 o 67.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del tercer aspecto puede comprender combinaciones de CDR 3 y CDR2, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el tercer aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
3 más 41 o 60 22 más 41 o 60
4 más 42 o 61 23 más 42 o 61
7 más 45 o 64 26 más 45 o 64
10 más 48 o 67; 29 más 48 o 67.
Un anticuerpo del tercer aspecto, además de la característica de CDR3 mencionada anteriormente (y, opcionalmente, además de la característica de CDR2 mencionada anteriormente), puede incluir además una CDR1, en la que dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 79, 80, 83 o 86; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la correspondiente secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 79, 80, 83 o 86. Alternativamente, dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 98, 99, 102 o 105; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 98, 99, 102 o 105.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del tercer aspecto puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR1, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el tercer aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
3 más 79 o 98; 22 más 79 o 98;
4 más 80 o 99; 23 más 80 o 99;
7 más 83 o 102; 26 más 83 o 102;
10 más 86 o 105; 29 más 86 o 105.
Una vez más, simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del tercer aspecto puede comprender combinaciones de c DR3 más CDR2 y CDR1, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el tercer aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
3 más 41 más 79; 22 más 60 más 98;
4 más 42 más 80; 23 más 61 más 99;
7 más 45 más 83; 26 más 64 más 102;
10 más 48, más 86; 29 más 67 más 105;
15 más 53, más 91; 34 más 72 más 110.
Un anticuerpo del tercer aspecto puede comprender una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 80% de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 117, 118, 121 o 124. En un ejemplo relacionado, dicho anticuerpo conserva la secuencia de aminoácidos de CDR3 exacta, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento, y opcionalmente la secuencia de aminoácidos de CDR1 exacta y/o la secuencia de aminoácidos de CDR2 exacta, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento.
En un cuarto aspecto relacionado, un anticuerpo de la divulgación se une no sólo a un virus de la gripe H1 y a un virus de la gripe H5 (tal como se describe anteriormente en el presente documento), sino también a un virus de la gripe H2 (por ejemplo, H2N2 o H2N3), por ejemplo a un virus de la gripe H2 pandémico (por ejemplo, H2N2 o H2N3). A modo de un ejemplo específico de virus de la gripe H2, el anticuerpo se une a la cepa A/Japón/305/1957 y/o a A/Mallard/Eng/727/06. En un caso de este aspecto, un anticuerpo de la divulgación tiene una CDR3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 6 o 15; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 6 o 15. Alternativamente, dicha CDR3 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 25 o 34; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 25 o 34.
Un anticuerpo del cuarto aspecto puede incluir además una CDR2, en la que dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 44 o 53; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 44 o 53. Alternativamente, dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 63 o 72; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 63 o 72.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del cuarto aspecto puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR2, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el cuarto aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
6 más 44 o 63; 25 más 44 o 63;
15 más 53 o 61; 34 más 53 o 61.
Un anticuerpo del cuarto aspecto, además de la característica de CDR3 mencionada anteriormente (y, opcionalmente, además de la característica de CDR2 mencionada anteriormente), puede incluir además una CDR1, en la que dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 82 o 91; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 62 o 91. Alternativamente, dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 101 o 110; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 101 o 110.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del cuarto aspecto puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR1, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el cuarto aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
6 más 82 o 101; 25 más 82 o 101;
15 más 91 o 110; 34 más 91 o 110.
Una vez más, simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del cuarto aspecto puede comprender combinaciones de CDR3 más CDR2 y CDR1, tal como se han definido anteriormente en el presente documento, para el cuarto aspecto basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs:
6 más 44 más 82; 25 más 63 más 101;
15 más 53 más 91; 34 más 72 más 110.
Un anticuerpo del cuarto aspecto puede comprender una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 120 o 129. En un ejemplo relacionado, dicho anticuerpo retiene la secuencia de aminoácidos de CDR3 exacta, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento, y opcionalmente la secuencia de aminoácidos de CDR1 exacta y/o la secuencia de aminoácidos de CDR2 exacta, tal como se define anteriormente en el presente documento.
En un quinto aspecto relacionado, un anticuerpo de la divulgación se une no sólo a un virus de la gripe H1 y a un virus de la gripe H5 (tal como se describe anteriormente en el presente documento), sino también a un virus de la gripe H9 (por ejemplo, H9N2), por ejemplo a un virus de la gripe H9 pandémica (por ejemplo, H9N2). A modo de ejemplo específico de virus de la gripe H9, el anticuerpo se une a la cepa A/Hong Kong/1073/99. En un caso de este aspecto, un anticuerpo de la divulgación tiene una CDR3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 13; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 13. Alternativamente, dicha CDR3 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 32; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 32.
Un anticuerpo del quinto aspecto puede incluir además una CDR2, en la que dicha CDR2 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 51 o 70; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 51 o 70.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del quinto aspecto puede comprender combinaciones de CDR3 y CDR2, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el quinto aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs: 13 más 51 o 70; 32 más 51 o 70.
Un anticuerpo del quinto aspecto, además de la característica de CDR3 mencionada anteriormente (y, opcionalmente, además de la característica de CDR2 mencionada anteriormente), puede incluir además una CDR1, en la que dicha CDR1 comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEQ ID NO: 89 o 108; o una secuencia de aminoácidos variante de la misma, en la que dicha secuencia de aminoácidos variante posee un máximo de sustitución, deleción o inserción de 1 o 2 aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos correspondiente de SEQ ID NO: 89 o 108.
Simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del quinto aspecto puede comprender las combinaciones de CDR3 y CDR1, tal como se han definido anteriormente en el presente documento para el quinto aspecto, basadas en las siguientes combinaciones de SEQ ID NOs: 13 más 89 o 108; 32 más 89 o 108.
Una vez más, simplemente a modo de ilustración, un anticuerpo del quinto aspecto puede comprender CDR3 más CDR2 y CDR1 combinaciones como se han definido para el quinto aspecto basado en las siguientes combinaciones de SeQ ID NOs: 13 más 51, más 89; 32 más 70 más 108.
Un anticuerpo del quinto aspecto puede comprender una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NOs: 127. En un ejemplo relacionado, dicho anticuerpo conserva la secuencia de aminoácidos de CDR3 exacta, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento, y opcionalmente la secuencia de aminoácidos de CDR1 exacta y/o la secuencia de aminoácidos de CDR2 exacta, tal como se ha definido anteriormente en el presente documento.
En un caso, los anticuerpos de la divulgación se unen y preferiblemente neutralizan todos los virus de la gripe de hemaglutinina del Grupo I (por ejemplo, virus de la grioe H1, H2, H5, H6, H11, H13, H16, H9, H8 y/o H12). En un caso relacionado, los anticuerpos de la divulgación se unen y neutralizan preferiblemente A/California/07/09 (H1N1) y/o A/Vietnam/1194/04 (H5N1).
En un caso, el anticuerpo puede ser humanizado. Ejemplos de técnicas de humanización convencionales se describen en Jones P.T. et al. (1986) Replacing the complementarity-determining regions in a human antibody with those from a mouse; Nature, 321 (6069): pág. 522-525. En un caso, la secuencia de aminoácidos de Vhh de CDR3 de la presente divulgación puede insertarse (por ejemplo, sustituir) una secuencia de aminoácidos de Vhh de CDR3 presente en un anticuerpo humano. Alternativamente, toda la secuencia de aminoácidos de Vhh de un anticuerpo de la presente divulgación puede alinearse en la secuencia con un anticuerpo humano correspondiente y mapear las diferencias de aminoácidos. Después de dicho mapeo, las diferencias de aminoácidos identificadas en la secuencia de anticuerpos de la presente divulgación presentes pueden entonces modificarse para imitar la secuencia humana correspondiente. En este sentido, las regiones CDR están preferiblemente no se modifican. Por ejemplo, las diferencias identificadas en las regiones FR de un anticuerpo de la presente divulgación, opcionalmente sujetas a los residuos 'Hallmark' (Vincke et al, 2008, J. Biol. Chem., 284 (5), pág. 3.273-3.284) pueden modificarse para imitar la secuencia humana correspondiente. Simplemente con fines ilustrativos, se describe un protocolo de humanización a modo de ejemplo 10.
Puramente a efectos ilustrativos, un anticuerpo humanizado de la divulgación puede comprender una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 80% de identidad de secuencia a un anticuerpo VH humano, por ejemplo un anticuerpo VH3 humano tal como es codificada por los genes de la línea germinal v H3 DP51 o DP53.
En un caso, un anticuerpo (opcionalmente humanizado) de la presente divulgación consiste en o comprende un anticuerpo de un único dominio.
En otro caso, un anticuerpo (opcionalmente humanizado) de la presente divulgación puede comprender dos o más dominios únicos, tal como se han definido anteriormente en el presente documento. Dichos dominios únicos pueden ser los mismos o diferentes. Cuando se emplean el primero y segundo (o más) dominios únicos diferentes, el primer dominio único tiene habitualmente una afinidad de unión, avidez y/o especificidad que es diferente del segundo de un único dominio.
En un caso, un anticuerpo (opcionalmente humanizado) de la presente divulgación consiste o comprende un anticuerpo biespecífico o multiespecífico.
De acuerdo con un aspecto adicional de la presente divulgación, se proporciona un anticuerpo tal como se define en el presente documento anteriormente, para usar en la prevención o el tratamiento de infección por el virus de la gripe. En un aspecto relacionado, la presente divulgación proporciona un procedimiento que comprende la administración de una cantidad profilácticamente eficaz o terapéuticamente eficaz de un anticuerpo, tal como se ha definido anteriormente a un paciente. Estos aspectos incluyen el uso de dos o más de dichos anticuerpos definidos anteriormente en el presente documento.
Los pacientes típicos que se benefician del aspecto anterior de “inmunoterapia pasiva” incluyen individuos “en riesgo” en la aparición de una nueva cepa de virus de la gripe (por ejemplo, una nueva cepa pandémica, tal como una nueva cepa de la gripe del Grupo 1). Ejemplos de dichos pacientes “en riesgo” incluyen: no respondedores de la vacuna; pacientes inmunocomprometidos; y profesionales de la salud. Una ventaja particular de la estrategia de la inmunoterapia pasiva de la presente divulgación es que no se añade a los crecientes problemas asociados con la resistencia a fármacos antivirales.
En un caso, el anticuerpo o combinaciones de anticuerpos de la presente divulgación proporcionan reactividad cruzada heterosubhabitual y/o la neutralización contra la gripe subtipos H1, H1 y H5, y/o subtipos H1 y H2 y H5 y H9, y/o todos los subtipos de hemaglutinina del grupo I (por ejemplo, virus de la gripe H1, H2, H5, H6, H11, H13, H16, H9, H8 y/o H12).
Un aspecto adicional de la presente divulgación proporciona un procedimiento para el diseño de una "vacuna universal" para provocar la respuesta inmunitaria heterosubhabitual. Simplemente con fines ilustrativos, se describen protocolos adecuados en el Ejemplo 14.
Un aspecto adicional de la presente divulgación proporciona ensayos y reactivos de diagnóstico de “campo” robustos. Simplemente con fines ilustrativos, se describen protocolos adecuados en el ejemplo 13.
Un aspecto adicional de la presente divulgación proporciona anticuerpos de reacción cruzada para la determinación de potencia de la vacuna. Simplemente para fines ilustrativos se describen protocolos adecuados en el Ejemplo 13.
Suministro de anticuerpos
En el uso, la presente divulgación emplea una composición farmacéutica, que comprende la composición de anticuerpos de la presente divulgación en una forma adecuada para la administración parenteral, generalmente intravenosa. Los anticuerpos intactos purificados, o sus fragmentos, se formulan para dicho suministro. Por ejemplo, un anticuerpo, o su fragmento, a una concentración entre 5-50 o 15-50 o 25-50 g/litro se puede formular en un tampón. Ejemplos de componentes de tampón adecuados incluyen sales fisiológicas, tales como citrato de sodio y/o ácido cítrico. Los tampones preferidos contienen 100-200 o 125-175 o aproximadamente 150 mM (por ejemplo, 153 mM) de sales fisiológicas, tales como cloruro de sodio. Los tampones preferidos mantienen la composición farmacéutica a un pH que está cerca del pH fisiológico del paciente - por ejemplo, a un pH de 5,5 a 6,4, o a un pH de 5,6 a 6,3, o a un pH de 5,7 a 6,2, o a un pH de 5,8 a 6,2. Las composiciones que contienen anticuerpos de la presente divulgación excluyen preferiblemente un adyuvante o adyuvantes, ya que no es deseable para estimular una respuesta inmunitaria contra dichos anticuerpos en el paciente.
Los anticuerpos de la divulgación se pueden formular para, pero no limitado a, administración intramuscular, subcutánea, intranasal o intravenosa. Las composiciones adecuadas para inyección intramuscular, subcutánea o intravenosa incluyen soluciones acuosas estériles. Tales soluciones acuosas deben tamponarse adecuadamente si es necesario y el diluyente líquido de hace primero isotónico con solución salina o glucosa suficiente. Las composiciones de anticuerpos de la presente divulgación pueden formularse por separado como formulaciones orales.
Las composiciones adecuadas para inyección pueden estar en forma de soluciones, suspensiones o polvos secos que se disuelven o suspenden en un vehículo adecuado antes de su uso.
En la preparación de soluciones de los anticuerpos o sus fragmentos, se pueden disolver en el vehículo, la solución se hace isotónica si es necesario mediante la adición de cloruro de sodio y se esteriliza por filtración a través de un filtro estéril utilizando técnicas asépticas antes del llenado en viales o ampollas estériles adecuadas y sellado. Ventajosamente, aditivos tales como tampón, solubilizantes, estabilizantes, agentes conservantes o bactericidas o de suspensión y/o anestésicos locales se pueden disolver en el vehículo.
Los polvos secos, que se disuelven o suspenden en un vehículo adecuado antes de su uso, se pueden preparar por llenado de ingredientes preesterilizados en un recipiente estéril utilizando una técnica aséptica en un área estéril. Alternativamente, los ingredientes se pueden disolver en contenedores adecuados utilizando técnicas asépticas en un área estéril. El producto se liofiliza a continuación y los recipientes se sellan asépticamente.
Los intervalos de dosificación para la administración de los anticuerpos de la presente divulgación son aquellos para producir el efecto terapéutico deseado. Se entenderá que el intervalo de dosificación requerido depende de la naturaleza precisa del anticuerpo o composición, la ruta de administración, la naturaleza de la formulación, la edad del paciente, la naturaleza, extensión o gravedad de la afección del paciente, contraindicaciones, si las hay, y el juicio del médico que lo atiende. Las variaciones en estos niveles de dosificación pueden ajustarse usando rutinas empíricas estándar para la optimización.
Las dosis diarias adecuadas están en el intervalo de 5-20 mg por kg de peso corporal. La dosificación unitaria puede variar desde menos de 100 mg, pero habitualmente estará en la región de 250-2000 mg por dosis, que se puede administrar diariamente o con menos frecuencia (por ejemplo, en días alternativos durante un máximo de 1 semana). También está dentro del alcance de la divulgación utilizar los anticuerpos de la divulgación en procedimientos terapéuticos para la prevención o tratamiento de la infección por virus de la gripe en combinación entre sí, o como un adjunto a, o en conjunción con, otras terapias establecidas normalmente utilizadas en la prevención del tratamiento de la infección por el virus de la gripe. Por ejemplo, los anticuerpos de la presente divulgación se pueden administrar en combinación con un antiviral adecuado (por ejemplo Oseltamavir™, Rimantadine™, Zanamavir™ y/o Amantadine™).
El tratamiento de combinación puede llevarse a cabo de cualquier manera que se considere necesaria o conveniente por la persona experta en la técnica y para el propósito de esta memoria, no se contemplan limitaciones con respecto al orden, la cantidad, la repetición o cantidad relativa de los compuestos a utilizar en combinación.
Sección de definiciones
Un anticuerpo que se une a un virus de la gripe de interés es uno capaz de unirse a dicho virus con una afinidad suficiente de manera que el anticuerpo es útil como agente terapéutico y/o reactivo de potencia de la vacuna. A modo de ejemplo, un anticuerpo que se une a un virus de la gripe de interés es uno que puede unirse a un virus de la gripe con una afinidad (Ka) de al menos 104 M.
Una cantidad terapéuticamente eficaz se refiere a la cantidad del anticuerpo, que cuando se administra solo o en combinación a un paciente para tratar o prevenir la infección de la gripe, o al menos uno de los síntomas clínicos de la infección de la gripe, es suficiente para afectar a dicho tratamiento o prevención de la enfermedad, o síntoma. La cantidad terapéuticamente eficaz puede variar dependiendo, por ejemplo, del anticuerpo, la infección y/o síntomas de la infección, gravedad de la infección, y/o síntomas de la infección, la edad, peso y/o la salud del paciente a tratar, y el juicio del médico que prescribe. Una cantidad terapéuticamente eficaz apropiada en cualquier caso determinado puede determinarse por los expertos en la técnica o capaz de la determinación mediante experimentación rutinaria. Una cantidad terapéuticamente eficaz también es una en la que cualquier efecto tóxico o perjudicial del anticuerpo es superado por los efectos beneficiosos.
Una cantidad profilácticamente eficaz es cualquier cantidad del anticuerpo que, cuando se administra solo o en combinación a un paciente, inhibe o retrasa la aparición o reaparición de la infección por el virus de la gripe, o al menos uno de los síntomas clínicos de la infección por el virus gripe. En algunos casos, la cantidad profilácticamente eficaz evita la aparición o reaparición de la infección por el virus de la gripe por completo. La inhibición de la aparición significa reducir la probabilidad de aparición de la infección o prevenir la aparición por completo.
Para la comparación de secuencias, habitualmente una secuencia actúa como secuencia de referencia, a la que las secuencias de prueba se pueden comparar. Cuando se usa un algoritmo de comparación de secuencias, las secuencias de prueba y de referencia se introducen en un ordenador, se designan las coordenadas posteriores, si es necesario, y se designan los parámetros del programa de algoritmo de secuencia. El algoritmo de comparación de secuencias calcula entonces el porcentaje de identidad de secuencia para la secuencia o secuencias de prueba con respecto a la secuencia de referencia, basándose en los parámetros del programa designados.
A lo largo de esta memoria, la referencia a al menos el 80% de identidad de secuencia se utiliza indistintamente con uno o más de al menos 81, al menos 82, al menos 83, al menos 84, al menos 85, al menos 86, al menos 87, al menos 88, al menos 89, al menos 90, al menos 91, al menos 92, al menos 93, al menos 94, al menos 95, al menos 96, al menos 97, al menos 98, al menos 99 y/o 100% de identidad de secuencia.
El alineamiento óptimo de secuencias para comparación puede realizarse, por ejemplo, mediante el algoritmo de alineación de homología local de Smith y Waterman [Adv. Appl. Math. 2: 484 (1981)], mediante el algoritmo de Needleman y Wunsch [J. Mol. Biol. 48: 443 (1970)], mediante la búsqueda del proceso de similitud de Pearson y Lipman [Proc. Nacional. Acad. Sci. USA. 85: 2444 (1988)], mediante implementaciones informáticas de estos algoritmos (GAP, BESTFIT, FASTA y TFASTA - Sequence Analysis Software Package of the Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center, 1710 University Avenue, Madison, Wis 53705), o mediante inspección visual [ver Current Protocols in Molecular Biology, F.M. Ausbel et al, eds, Current Protocols, una empresa conjunta entre Greene Publishing Associates, en y John Wiley & Sons, Inc. (1995 Suplemento) Ausbubel].
Ejemplos de algoritmos adecuados para determinar el porcentaje de similitud de secuencia son los algoritmos BLAST y BLAST 2.0 [véase Altschul (1990) J. Mol. Biol. 215: pág. 403-410; y "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/" del National Center for Biotechnology Information].
En una comparación de homología preferida, la identidad existe sobre una región de las secuencias que tiene al menos 5 residuos de aminoácidos contiguos, o al menos 10 residuos de aminoácidos contiguos, o al menos 15 residuos de aminoácidos contiguos, o al menos 20 residuos de aminoácidos contiguos, o al menos 25 residuos de aminoácidos contiguos, o al menos 30 residuos de aminoácidos contiguos de longitud.
Un "anticuerpo" se utiliza en el sentido más amplio y específicamente cubre anticuerpos y fragmentos de anticuerpos siempre que presenten la actividad biológica deseada. Por ejemplo, un anticuerpo es una proteína que incluye al menos una o dos regiones variables de cadena pesada (H) (abreviada en el presente documento como VHC), y al menos una o dos regiones variables de cadena ligera (l) (abreviada en el presente documento como VLC). Las regiones VHC y VLC pueden subdividirse adicionalmente en regiones de hipervariabilidad, denominadas "regiones determinantes de complementariedad" ("CDR"), intercaladas con regiones que están más conservadas, denominadas "regiones marco" (FR). La extensión de la región marco y CDR se ha definido con precisión (véase, Kabat, E.A., et al. Sequences of Proteins of Immunological Interest. Quinta Edición, Departamento de Salud y Servicios Humanos de Estados Unidos NIH Publicación No. 91-3242, 1991 y Chothia, C. et al, J. Mol Biol. 196: 901­ 917, 1987). Preferiblemente, cada VHC y VLC se compone de tres CDR y cuatro FR, dispuestas desde el extremo amino terminal a carboxi terminal en el siguiente orden: FRI, CDRI, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.
La cadena VHC o VLC del anticuerpo puede incluir además toda o parte de una región constante de cadena pesada o ligera. En un caso, el anticuerpo es un tetrámero de dos cadenas de inmunoglobulina pesadas y dos cadenas de inmunoglobulina ligeras, en el que las cadenas de inmunoglobulina pesadas y ligeras están interconectadas por, por ejemplo, enlaces disulfuro. La región constante de cadena pesada comprende tres dominios, CH2 y CH3, y opcionalmente CH1. La región constante de la cadena ligera está compuesta de un dominio, CL. La región variable de las cadenas pesadas y ligeras contiene un dominio de unión que interacciona con un antígeno. Las regiones constantes de los anticuerpos habitualmente median en la unión del anticuerpo a los tejidos o factores del huésped, incluyendo varias células del sistema inmunitario (por ejemplo, células efectoras) y el primer componente (Clq) del sistema de complemento clásico. El término "anticuerpo" incluye inmunoglobulinas intactas de tipos IgA, IgG, IgE, IgD, IgM (así como subtipos de las mismas), en el que las cadenas ligeras de la inmunoglobulina pueden ser de tipos kappa o lambda.
El término anticuerpo, como se usa en el presente documento, también se refiere a una porción de un anticuerpo que se une a un virus de la gripe, por ejemplo una molécula en la que una o más cadenas de inmunoglobulina no es de longitud completa, pero que se une a un virus de la gripe. Ejemplos de porciones de unión incluidos dentro del término anticuerpo incluyen (i) un fragmento Fab, un fragmento monovalente que consiste en los dominios VLC, VHC, CL y CHI; (ii) un fragmento F(ab')2, un fragmento bivalente que comprende dos fragmentos Fab unidos por un puente disulfuro en la región bisagra; (iii) un fragmento Fc que consiste en los dominios VHC y CHI; (iv) un fragmento Fv que consiste en los dominios VLC y VHC de un único brazo de un anticuerpo, (v) un fragmento dAb (Ward et al, Nature 341: 544-546, 1989), que consiste en un dominio VHC; y (vi) una región determinante de complementariedad (CDR) aislada que tiene un marco suficiente para unirse, por ejemplo, a una porción de unión a antígeno de una región variable. Una porción de unión a antígeno de una región variable de cadena ligera y una parte de unión a antígeno de una región variable de cadena pesada, por ejemplo, los dos dominios del fragmento Fv, VLC y VHC, pueden unirse, usando procedimientos recombinantes, mediante un enlazador sintético que permite que pueden producirse como una única cadena de proteína en la que las regiones VLC y VHC se emparejan para formar moléculas monovalentes (conocidas como Fv de cadena sencilla (scFv); véase, por ejemplo, Bird et al (1988) Science IAl-ATi-Alp; y Huston et al (1988) Proc Natl Acad Sci USA. 85: 5879-5883). Tales anticuerpos de cadena sencilla también se incluyen dentro del término anticuerpo. Éstos se obtienen usando técnicas convencionales conocidas por los expertos en la materia y las porciones se criban para la utilidad de la misma manera que los anticuerpos intactos.
Del mismo modo, el término anticuerpo abarca armazones proteicos.
Los armazones proteicos proporcionan marcos de unión universales para complementar el repertorio en expansión de anticuerpos monoclonales terapéuticos y derivados, tales como scFv, moléculas Fab, dAb (anticuerpos de un único dominio), diacuerpos y minicuerpos. Los sistemas de armazones crean o modifican dominios de reconocimiento de proteínas conocidas, ya sea mediante la creación de nuevos armazones o modificación de dominios de unión a proteínas conocidas. Tales armazones incluyen, pero no se limitan a:
(i) armazones a base de proteína A - aficuerpos (Nord, K. et al. 1997 "Binding proteins selected from combinatorial libraries of an alpha-helical bacterial receptor domain”. Nat Biotechnol 15, 772-777);
(ii) armazones basados en lipocalina - anticalinas (Skerra 2008 "Alternative binding proteins: anticalins - harnessing the structural plasticity of the lipocalin ligand pocket to engineer novel binding activities”. FEBS J. 275: 2677-83); (iii) armazones basados en fibronectina - adnectina (Dineen et al 2008 "The Adnectin CT-322 is a novel VEGF receptor 2 inhibitor that decreases tumor burden in an orthotopic mouse model of pancreatic cáncer”. BMC Cancer 8: 352.);
(iv) avímeros (Silverman et al 2005 "Multivalent avimer proteins evolved by exon shuffling of a family of human receptor domains”. Nat Biotechnol 23: 1556-1561.);
(v) armazones basados en anquirina - darpins (Zahnd et al 2006 "Selection and characterization of Her2 bindingdesigned ankyrin repeat proteins”. J Biol Chem 281: 35167-75); y
(vi) armazones de centirina, basados en un pliegue de proteína que tiene homología estructural significativa con los dominios de Ig con bucles que son análogos a CDR. Los dominios de Ig son un módulo común en proteínas humanas y han sido ampliamente aplicados como proteínas de armazones alternativos.
La referencia al término prevenir o tratar puede usarse como sinónimo del término de supresión.
Las secuencias de aminoácidos descritas en este documento pueden incluir sustituciones, deleciones o adiciones de uno o más aminoácidos. Estos cambios son preferiblemente de una naturaleza menor, por ejemplo sustituciones de aminoácidos conservativas (véase más adelante) y otras sustituciones que no afectan significativamente al plegamiento o a la actividad del anticuerpo.
Sustituciones conservativas de aminoácidos
Básicos arginina
lisina
histidina
Ácidos ácido glutámico
ácido aspártico
Polares glutamina
asparagina
Hidrófobos leucina
isoleucina
valina
Aromáticos fenilalanina
triptófano
tirosina
Pequeños glicina
alanina
serina
treonina
metionina
Además de los 20 aminoácidos estándar, los aminoácidos no estándar (tales como 4-hidroxiprolina, 6-N-metil lisina, ácido 2-aminoisobutírico, isovalina y a-metil serina) pueden sustituirse por residuos de aminoácidos de los polipéptidos de la presente divulgación. Un número limitado de aminoácidos no conservativos, aminoácidos que no son codificados por el código genético y aminoácidos no naturales pueden ser sustituidos por residuos de aminoácidos de polipéptidos naturales. Los polipéptidos de la presente divulgación también pueden comprender residuos de aminoácidos de origen no natural.
Los aminoácidos de origen no natural incluyen, sin limitación, trans-3-metilprolina, 2,4-metano-prolina, cis-4-hidroxiprolina, trans-4-hidroxiprolina, N-metilglicina, alo-treonina, metil-treonina, hidroxi-etilcisteína, hidroxietilhomocisteína, nitro-glutamina, homoglutamina, ácido pipecólico, terc-leucina, norvalina, 2-azafenilalanina, 3-azafenilalanina, 4-azafenilalanina, p-naftilalanina, p-piridilalanina, N-guanidino-(butil) homoarginina, N, N-guanidino-(dimetil)homoarginina, N,N'-guanidino-bis-(2,2,2-trifluoroetil)homoarginina, N,N'-guanidino-(metil, hexil homoarginina), Ne -metilisina, Ne-isopropil lisina, aminometilfenilalanina, aminociclohexilalanina, ácido aaminobutírico, 4-tioprolina, N-metil leucina, ornitina, norleucina, 5-bromo-triptófano, 5-fluoro-triptófano, 5-nitrotriptófano, ácido g-aminobutírico, J-mercaptopropionilo, acetilo, penicilamina y 4-fluorofenilalanina.
Se conocen varios procedimientos en la técnica para la incorporación de residuos de aminoácidos de origen no natural en proteínas. Por ejemplo, se puede emplear un sistema in vitro en el que las mutaciones sin sentido se suprimen utilizando tARN supresores químicamente aminoacilados. Los procedimientos para sintetizar aminoácidos y aminoacilar tARN son conocidos en la técnica. La transcripción y traducción de plásmidos que contienen mutaciones sin sentido se lleva a cabo en un sistema libre de células que comprende un extracto de E. coli S30 y enzimas disponibles comercialmente y otros reactivos. Las proteínas se purifican por cromatografía. Véase, por ejemplo, Robertson et al., J. Am. Chem. Soc. 113: 2722, 1991; Ellman et al., Methods Enzymol. 202: 301, 1991; Chung et al, Science 259: 806-9, 1993; y Chung et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90: 10145-9, 1993). En un segundo procedimiento, la traducción se realiza en ovocitos de Xenopus por microinyección de ARNm mutado y ARNt supresores químicamente aminoacilados (Turcatti et al, J. Biol Chem 271: 19991-8, 1996). En un tercer procedimiento, las células de E. coli se cultivan en ausencia de un aminoácido natural que va a ser reemplazado (por ejemplo, fenilalanina) y en presencia del aminoácido o aminoácidos no naturales deseados (por ejemplo, 2-azafenilalanina, 3-azafenilalanina, 4-azafenilalanina o 4-fluorofenilalanina). El aminoácido de origen no natural se incorpora en el polipéptido en lugar de su homólogo natural. Véase, Koide et al., Biochem. 33: 7470-6, 1994. Los residuos de aminoácidos naturales se pueden convertir en especies no naturales por modificación química in vitro. La modificación química puede combinarse con mutagénesis dirigida al sitio para ampliar aún más la gama de sustituciones (Wynn y Richards, Protein Sci. 2: 395-403, 1993).
Un número de aminoácidos no conservativos, aminoácidos que no son codificados por el código genético, aminoácidos de origen no natural y aminoácidos no naturales pueden ser sustituidos por residuos de aminoácidos de polipéptidos de la presente divulgación.
Los aminoácidos esenciales en los polipéptidos de la presente divulgación pueden ser identificados según procedimientos conocidos en la técnica, tales como mutagénesis dirigida al sitio o mutagénesis de barrido de alanina (Cunningham y Wells, Science 244: 1081-5, 1989). Los sitios de interacción biológica también pueden determinarse mediante análisis físico de la estructura, tal como se determina por técnicas, tales como resonancia magnética nuclear, cristalografía, difracción de electrones o marcaje por fotoafinidad, junto con mutación de los posibles aminoácidos del sitio de contacto. Véase, por ejemplo, de Vos et al, Science 255: 306-12, 1992; Smith et al., J. Mol. Biol. 224: 899-904, 1992; Wlodaver et al., FeBS Lett. 309: 59-64, 1992. Las identidades de los aminoácidos esenciales también pueden deducirse del análisis de homologías con secuencias de anticuerpos relacionadas.
Se pueden realizar múltiples sustituciones de aminoácidos y analizarse usando procedimientos conocidos de mutagénesis y cribado, tales como los descritos por Reidhaar-Olson y Sauer (Science 241: 53-7, 1988) o Bowie y Sauer (Proc Natl Acad Sci. USA. 86: 2152-6, 1989). Brevemente, estos autores describen procedimientos para aleatorizar simultáneamente dos o más posiciones en un polipéptido, seleccionar el polipéptido funcional y, a continuación, secuenciar los polipéptidos mutagenizados para determinar el espectro de sustituciones permisibles en cada posición. Otros procedimientos que pueden usarse incluyen la expresión en fagos (por ejemplo, Lowman et al, Biochem. 30: 10832-7, 1991; Ladner et al, patente de Estados Unidos. No. 5.223.409; Huse, Publicación WIPO WO 92/06204) y mutagénesis dirigida de región (Derbyshire et al, Gene 46: 145, 1986; Ner et al, DNA 7: 127, 1988).
Se pueden realizar múltiples sustituciones de aminoácidos y analizarse usando procedimientos conocidos de mutagénesis y cribado, tales como los descritos por Reidhaar-Olson y Sauer (Science 241: 53-7, 1988) o Bowie y Sauer (Proc Natl Acad Sci. USA. 86: 2152-6, 1989). Brevemente, estos autores describen procedimientos para aleatorizar simultáneamente dos o más posiciones en un polipéptido, seleccionar el polipéptido funcional y, a continuación, secuenciar los polipéptidos mutagenizados para determinar el espectro de sustituciones permisibles en cada posición. Otros procedimientos que pueden usarse incluyen la expresión en fagos (por ejemplo, Lowman et al, Biochem. 30: 10832-7, 1991; Ladner et al, patente de Estados Unidos. No. 5.223.409; Huse, Publicación WIPO WO 92/06204) y mutagénesis dirigida de región (Derbyshire et al, Gene 46: 145, 1986; Ner et al, DNA 7: 127, 1988).
SEQ ID NOs
CDR3 (Kabat)
SEQ ID NO: 1 = STTTPPYEY
SEQ ID NO: 2 = RRDWRDY
SEQ ID NO: 3 = NPPGNLY
SEQ ID NO: 4 = DPLSTGWGQYSY
SEQ ID NO: 5 = STTTPPHEF
SEQ ID NO: 6 = RDGFFNRYDY
SEQ ID NO: 7 = SGPGGLNV
SEC ID NO: 8 = TRWVPTMKADEYNY
SEQ ID NO: 9 = ASWVASLWSPSEYDY
SEQ ID NO: 10 = DPPGILY
SEQ ID NO: 11 = DPVCTAGWYRPSRFDL
SEQ ID NO: 12 = STLTPPHEY
SEQ ID NO: 13 = GNTGSSDRSSSYVH
SEQ ID NO: 14 = KSPLVDNEY
SEQ ID NO: 15 = KGFAPFLIGCPWGKAEYDY
SEQ ID NO: 16 = TKAFGIATITADYEL
SEQ ID NO: 17 = SSTVAPHEY
SEQ ID NO: 18 = SGPGGVEV
SEQ ID NO: 19 = SGPGGVIL
CDR3 (IMGT)
SEQ ID NO: 20 = KTSTTTPPYEY
SEQ ID NO: 21 = NTRRDWRDY
SEQ ID NO: 22 = NLNPPGNLY
SEQ ID NO: 23 = NADPLSTGWGQYSY
SEQ ID NO: 24 = KCSTTTPPHEF
SEQ ID NO: 25 = NARDGFFNRYDY
SEQ ID NO: 26 = MASGPGGLNV
SEC ID NO: 27 = AGTRWVPTMKADEYNY SEQ ID NO: 28 = AAASWVASLWSPSEYDY SEQ ID NO: 29 = NLDPPGILY
SEQ ID NO: 30 = AADPVCTAGWYRPSRFDL SEQ ID NO: 31 = KISTLTPPHEY
SEQ ID NO: 32 = GAGNTGSSDRSSSYVH SEQ ID NO: 33 = HAKSPLVDNEY
SEQ ID NO: 34 = AVKGFAPFLIGCPWGKAEYDY SEQ ID NO: 35 = AATKAF GIATITADYEL SEQ ID NO: 36 = KFSSTVAPHEY
SEQ ID NO: 37 = KASGPGGVEV
SEQ ID NO: 38 = KASGPGGVIL
CDR2 (Kabat)
SEQ ID NO: 39 = VIGNYGNTNYADSVKR SEQ ID NO: 40 = DIASTRGTTNYADSVKG SEQ ID NO: 41 = GITYDDSTNYAGSVKG SEQ ID NO: 42 = AITSGESTNYADSVKG
SEQ ID NO: 43 = VIGNYGNTNYADSVKG SEQ ID NO: 44 = AVTTDGSTSYADYAKG SEQ ID NO: 45 = VIGNGGNTNYAESVKG SEC ID NO: 46 = FITSTSAVTKYADSVKG SEQ ID NO: 47 = CRASDGNTYYAESLKG SEQ ID NO: 48 = SIAYDGSTSYADPVKG
SEQ ID NO: 49 = CISPSDSFTEYGDSVKG SEQ ID NO: 50 = VIGNNDNTVYGDSVQG SEQ ID NO: 51 = AIDWGDGPTTYADSVKG SEQ ID NO: 52 = SIDGRGTPMYADSVKG SEQ ID NO: 53 = CMNSRDGTTNYADSVKG SEQ ID NO: 54 = AITAGGNTYYADSAKA SEQ ID NO: 55 = VIGNYGNTNYADSVKG SEQ ID NO: 56 = VIGNGGNTNYADSVKG SEQ ID NO: 57 = VIGNGGTNYADSVKG
CDR2 (IMGT)
SEQ ID NO: 58 = IGNYGNT
SEQ ID NO: 59 = IASTRGTT
SEQ ID NO: 60 = ITYDDST
SEQ ID NO: 61 = ITSGEST
SEQ ID NO: 62 = IGNYGNT
SEQ ID NO: 63 = VTTDGST
SEQ ID NO: 64 = IGNGGNT
SEC ID NO: 65 = ITSTSAVT
SEQ ID NO: 66 = RASDGNT
SEQ ID NO: 67 = IAYDGST
SEQ ID NO: 68 = ISPSDSFT
SEQ ID NO: 69 = IGNNDNT
SEQ ID NO: 70 = IDWGDGPT
SEQ ID NO: 71 = IDGRGTP
SEQ ID NO: 72 = MNSRDGTT
SEQ ID NO: 73 = ITAGGNT
SEQ ID NO: 74 = IGNYGNT
SEQ ID NO: 75 = IGNGGNT
SEQ ID NO: 76 = IGNGGNT
CDR1 (Kabat)
SEQ ID NO: 77 = IVTMG
SEQ ID NO: 78 = WYDVG
SEQ ID NO: 79 = RYRMG
SEQ ID NO: 80 = LYTMG
SEQ ID NO: 81 = IVTMG
SEQ ID NO: 82 = TYPMS
SEQ ID NO: 83 = FYTMG
SEC ID NO: 84 = NYAIG
SEQ ID NO: 85 = GYAIA
SEQ ID NO: 86 = RYRMG
SEQ ID NO: 87 = AYAIA
SEQ ID NO: 88 = IITMG
SEQ ID NO: 89 = LYRVG
SEQ ID NO: 90 = MYMID
SEQ ID NO: 91 = NNAIG
SEQ ID NO: 92 = INAMG
SEQ ID NO: 93 = IVTMG
SEQ ID NO: 94 = FYTMG
SEQ ID NO: 95 = FYTMG
CDR1 (IMGT)
SEQ ID NO: 96 = GSISRIVT
SEQ ID NO: 97 = GFTFSWYD
SEQ ID NO: 98 = GSFFSRYR
SEQ ID NO: 99 = GSAFSLYT
SEQ ID NO: 100 = GSISRIVT
SEQ ID NO: 101 = GSAVLFSTYP
SEQ ID NO: 102 = NDIFSFYT
SEC ID NO: 103 = GFSLDNYA
SEQ ID NO: 104 = GFPFDGYA
SEQ ID NO: 105 = GSFFSRYR
SEQ ID NO: 106 = GFTLGAYA
SEQ ID NO: 107 = GSMSRIIT
SEQ ID NO: 108 = VLTFSLYR
SEQ ID NO: 109 = GDIFVMYM
SEQ ID NO: 110 = GSTLNNNA
SEQ ID NO: 111 = GSAFSINA
SEQ ID NO: 112 = GSISSIVT
SEQ ID NO: 113 = DNIFSFYT
SEQ ID NO: 114 = TNIASFYT
VHH de longitud completa
SEQ ID NO: 115 =
QLQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSISRIVTMGWYRQASGKERELVAVIGNYGNTNYADSVKGR
FTVSRDNAKDTAYLQMNGLNVEDTAIYYCKTSTTTPPYEYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 116 =
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSWYDVGWYRRAPGKERELVADIASTRGTTNYADSVK GRFTISRDNAKNSVYLQMNSLKPEDTAVYYCNTRRDWRDYWGQGIQVTVSS
SEQ ID NO: 117 =
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSFFSRYRMGWYRQAPGEQRELVAGITYDDSTNYAGSVKG RFTISRDNAKNTVHLQMNSLKPEDTAVYYCNLNPPGNLYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 118 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCLASGSAFSLYTMGWYRQAPGNQRELVAAITSGESTNYADSVKG RFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNADPLSTGWGQYSYWGQGTGVTVSS
SEQ ID NO: 119 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSISRIVTMGWYRQGPGKERELVAVIGNYGNTNYADSVKGR FTVSRDNAKDTAYLQMNNLNVEDTAMYYCKCSTTTPPHEFWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 120 -QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSAVLFSTYPMSWYRQAPGKQRELVAAVTTDGSTSYADYA KGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNARDGFFNRYDYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 121 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASNDIFSFYTMGWYLQAIGKQREPVAVIGNGGNTNYAESVKGR FTISRDGAKNTAYLQMNSLKPEDTAVYYCMASGPGGLNVWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 122 = QLQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLDNYAIGWFRRAPGEEREGVSFITSTSAVTKYADSVKGR FTISRDNAKNTVYLQMTSLKPEDTAVYYCAGTRWVPTMKADEYNYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 123 -QLQLVESGGGLVQVGGSLRLSCAASGFPFDGYAIAWFRQAPGKEREGVSCRASDGNTYYAESLKG RLTMSTDNAKNTVYLGMNSLKPEDTAVYYCAAASWVASLWSPSEYDYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 124 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSFFSRYRMGWYRQAPGEGRELVASIAYDGSTSYADPVKG RFTISRDNANTVHLQMYSLKPDDTAVYYCNLDPPGILYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 125 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLGAYAIAWFRQAPGKEREGVSCISPSDSFTEYGDSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLQPEDTAVYYCAADPVCTAGWYRPSRFDLWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 126 = QVQLVESGGGLVQSGGSLRLSCAASGSMSRIITMGWYRQAPGMERELVAVIGNNDNTVYGDSVQG RFTVSRDNAKNTAYLQMNSLNAEDTAMYYCKISTLTPPHEYWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 127 = QVQLVESGGGLVQAGDSLRLSCTASVLTFSLYRVGWFRQAPGKEREFVAAIDWGDGPTTYADSVKG RFTISRDNAERTAYLQINSLKPEDTAVYYCGAGNTGSSDRSSSYVHWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 128 = QLQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTASGDIFVMYMIDWYRQAPGKQRELVASIDGRGTPMYADSVKGR FTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY3CHAKSPLVDNEYWGQGTQVTV5S
SEQ ID NO: 129 = QLQLAESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSTLNNNAIGWFRQAPGKEREGVSCMNSRDGTTNYADSVK GRFTISRDVAKNTVYLGMNSLKPEOTAVYFCAVKGFAPFLIGCPWGKAEYDYWGGGTGVTVSS
SEQ ID NO: 130 = GVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSAFSINAMGWYRQAPGEEREFVAAITAGGNTYYADSAKAR FTISRDNAKNMLYLQMNSLKPEDTAMYYCAATKAFGIATITADYELWGGGTGVTVSS
SEQ ID NO: 131 = GVGLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSISSIVTMGWYRQAPGKERELVAVIGNYGNTNYADSVKGR FTVSRDNAKNTVYLGMNSLNVEDTAMYVCKFSSTVAPHEYWGQGTGVTVSS
SEQ ID NO: 132 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASDNIFSFYTMGWYRQSPGKERELVAVIGNGGNTNYADSVKG RFTISRDNGKNKAHLGMNSLKPEDTAVYYCKASGPGGVEVWGQGTQVTVSS
SEQ ID NO: 133 = QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASTNIASFYTMGWYRQTPGQQRDVVAVIGNGGNTNYADSVKG RFTISRDGAKNTAHLQMNSLKPEDTDVYYCKASGPGGVILWGGGTQVTVSS
Ejemplos
Los siguientes ejemplos no limitantes sirven para ilustrar realizaciones seleccionadas de la presente invención. Se entenderá que las variaciones en las proporciones y alternativas en elementos de los componentes mostrados serán evidentes para los expertos en la técnica y están dentro del alcance de las realizaciones de la presente invención. La invención se refiere a un anticuerpo de un único dominio que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 124. Los ejemplos relacionados con otros anticuerpos se proporcionan para referencia y/o con fines comparativos.
Ejemplo 1: Procedimiento de inmunización y el análisis de la respuesta inmunitaria a la gripe
Se mantuvieron alpacas machos jóvenes en el Royal Veterinary College, Hertfordshire, Reino Unido. Todos los experimentos con animales se realizaron de conformidad con la licencia del Ministerio del 80/2117. Se obtuvo una muestra de sangre antes de la inmunización de la vena yugular y esto fue seguido por 4 inyecciones por vía intramuscular en los intervalos de 0 días, 21 días, 43 días y 71 días dividido entre 4 patas. La inmunización primaria consisitó en 50 pg de H1 recombinante (A/California/07/09 (H1 N1 pdm) (Protein Sciences™) en 400 pl de PBS estéril y se emulsionó con 800 pl de adyuvante completo de Freund (Sigma) justo antes de la inmunización. De manera similar, se administraron tres inyecciones de refuerzo por separado de 50 pg de H1 recombinante (A/California/07/09 (H1N1pdm) (Protein Sciences™) en adyuvante incompleto de Freund (Sigma). Aproximadamente 3 días después de cada inyección se recogió una muestra de 10 ml de sangre de la que se preparó el suero después de permitir que la sangre coagule durante la noche a 4°C. La respuesta serológica a A/California/07/09 en cada etapa del programa de inmunización se evaluó mediante ELISA, ensayo de inhibición de la hemaglutinación (ensayo HI) en un panel de cepas virales inactivadas y ensayos de microneutralización (ensayos MN) utilizando la cepa viral de H1 N1 pandémica A/California/07/09 (Tabla 1). Se observó una respuesta clara para el inmunógeno (H 1N1 pdm) que aumentaba con cada inmunización subsecuente.
Figure imgf000018_0001
Ejemplo 2: Construcción de bibliotecas de anticuerpos VHH de un único dominio expresadas en fagos
Para la construcción de bibliotecas de anticuerpos se recogieron muestras de aproximadamente 10 ml de sangre de una alpaca inmunizada (Ejemplo 1) en tubos de heparina. Se purificaron linfocitos de sangre periférica usando un procedimiento de centrifugación con Ficol Hypaque (Sigma). El ARN se extrajo usando el kit de extracción de ARN RiboPure™ (Novagen) según las instrucciones del fabricante y se almacenó a -70°C antes de la síntesis de ADNc. La síntesis de la primera hebra de ADNc se realizó según las instrucciones del fabricante (Invitrogen). En resumen, se utilizaron hasta 200 ng de ARN total por reacción de síntesis de ADNc cebado con oligo dT que se dejó proceder durante 50 minutos a 50°C, después de lo cual la reacción se terminó por incubación a 85°C durante 5 minutos, seguido de la colocación de la mezcla de reacción en hielo. Las mezclas de reacción se recogieron por centrifugación breve y se añadió 1 ml de ARNasa H a cada tubo y se incubaron durante 20 minutos a 37°C. El ADNc resultante se almacenó a -20°C o se usó inmediatamente en la reacción de PCR primaria para amplificar las secuencias de genes de anticuerpos.
Se realizó una PCR primaria utilizando dos cebadores de oligonucleótidos diseñados para primar universalmente genes de inmunoglobulina de mamífero en el dominio CH2 y también en el extremo 5' de los genes de VHH de alpaca (Harmsen et al., 2000) dentro de la secuencia señal. Se utilizó Taq polimerasa de alta fidelidad (Roche) para toda la amplificación de ADN.
Al p-CH2_Rev
5' CGC CAT CAA GGT ACC AGT TGA
Alpl-Fw_VHH
5' GGT GGT CCT GGC TGC
Esto dio lugar a la amplificación de productos génicos de anticuerpos de 600 pb y 900 pb. El producto de 600 pb corresponde a la población de anticuerpos de solo cadena pesada y no contiene un dominio CH1. El producto génico de 900 pb corresponde a la población de anticuerpos con cadena pesada convencional y no es necesario. El producto génico con solo cadena pesada de 600 pb se purificó en gel (QIAGEN) y a continuación se sometió a una etapa secundaria de PCR para amplificar sólo la población de genes de anticuerpos VHH (~ 450 pb) y para añadir sitios de restricción apropiados para la clonación en el vector de expresión en fagos pNIBS-1 (Ejemplo 3). Los cebadores para PCR secundaria fueron diseñados para amplificar todos los genes de VHH mediante hibridación a las regiones de anticuerpo FR1 y FR4. Los sitios de restricción Sfi1 y Not1 fueron elegidos para la clonación ya que no cortan con frecuencia dentro de los genes de anticuerpos.
Al p_FR1_Sfi 1
5’ CTG CAG GGA TCC GTT AGC AAG GCC CAG CCG GCC ATG GCA CAG KTG CAG
CTC GTG GAG TCN
Alp_FR4back_Not1
GCT AGT GCA TGG 5' AGC TCA TGC GGC C
Se digirieron aproximadamente 5 mg de ADN de anticuerpo VHH con la enzima de restricción SfiI (New England Biolabs) en una mezcla de reacción de 200 ml durante la noche a 50°C. Después de purificación adicional (QIAGEN), los genes de VHH se digirieron con Not1 en una mezcla de reacción de 100 ml a 37°C durante 6 horas. Los genes de VHH digeridos se ligaron a continuación en el vector de expresión en fagos pNIBS-1 (Ejemplo 3), que se digirió de manera similar con las enzimas de restricción Sfi1 y Not1. Las ligaciones se establecieron en una proporción de 4:1 de inserción con respecto a vector en una mezcla de reacción de 20 ml, conteniendo cada mezcla reacción aproximadamente 100 ng de vector. Después de la adición de ADN ligasa de T4 (New England Biolabs), las mezclas de reacción se incubaron durante la noche a 16°C. Las ligaciones individuales se reunieron y se purificaron (QIAGEN) según las instrucciones del fabricante. A continuación, la mezcla de ligación purificada se transformó en células electrocompetentes TG1 (Agilent) usando electroporación (BIO-RAD). Las células se recuperaron de las cubetas de electroporación usando 1 ml de medio SOC (Sigma) precalentado a 37°C y después se incubaron a 37°C durante 1 hora con agitación para permitir la expresión de resistencia a antibióticos. Las bibliotecas se extendieron en placas de 22 cm que contenían 2 TY agar con ampicilina (100 mg/ml) y glucosa al 20% v/v. El tamaño de la biblioteca se determinó mediante la preparación de una serie de diluciones contando las colonias viables y fue de 5 x 107 clones independientes. Después de la incubación durante la noche de los placas de 22 cm a 37°C, las bibliotecas se recogieron inundando las placas con 2 TY agar con carbenicilina (100 mg/ml), glucosa al 20% v/v y el raspado de las colonias. Las colonias resuspendidas que representaban la biblioteca de anticuerpos se almacenaron a -70°C en glicerol al 20% v/v.
Ejemplo 3: Construcción del vector de expresión en fagos pNIBS-1
Una secuencia de polienlazador de 1782 pb fue diseñada comprendiendo las características clave siguientes:
(i) Una secuencia señal pelB que acciona la secreción de anticuerpo expresado en el periplasma y cuyo aminoácido C terminal y la secuencia de ADN es compatible con la codificación de un sitio de restricción Sfi1.
(ii) Una etiqueta de hexa-histidina que se fusiona al extremo C-terminal de un anticuerpo VHH clonado y facilita tanto la purificación como la detección de anticuerpos expresados.
(iii) Una etiqueta de epítopo c-Myc unido al extremo C-terminal del anticuerpo clonado después de la etiqueta de hexa-histidina y facilita la detección del anticuerpo expresado
(iv) La secuencia de gen III que codifica la proteína de cubierta 3 del bacteriófago M13 y está en el marco con el cassette de anticuerpo para facilitar la producción de los productos de fusión de anticuerpo-gen III que se pueden expresar en la superficie del fago.
(v) Un codón de terminación de ADN ámbar entre la etiqueta de epítopo c-Myc y la proteína de cubierta del fago del gen III. Este codón se lee como un codón de terminación en Escherichia coli pero en cepas que llevan un gen de tARN supresor mutante se lee con frecuencia como un aminoácido de codificación y se lee para producir un producto de fusión de anticuerpo-gen 3. Esto permite la expresión de la fusión anticuerpo-gen 3 en fagos. La supresión del codón ámbar es generalmente de baja eficiencia y esto tiene la ventaja de que el anticuerpo soluble no fusionado al gen 3 puede producirse a partir de la misma célula clon de E. coli sin subclonación para eliminar la secuencia del gen 3.
(vi) Se incluyeron sitios de restricción Sfi’1 y Not1 para la clonación de genes de anticuerpos, ya que cortan con poca frecuencia en genes de anticuerpos y se pueden colocar dentro de la secuencia de ADN, mientras que mantienen un casete de expresión funcional. Otro sitio de restricción como Mfe1 y SstEII también se incorporaron, ya que éstos son altamente conservados en los genes de la línea germinal de anticuerpos y pueden ser útiles para la clonación de anticuerpos seleccionados en otros formatos.
La secuencia de polienlazador se sintetizó a partir de oligonucleótidos (Geneart™) como un fragmento Hind111/EcoR1 y se clonó en el vector fagémido pUC119 estándar para generar pNIBS-1 (Figura 1a y Figura 1b).
Ejemplo 4: Estrategia de selección de la biblioteca de anticuerpos en fagos
La biblioteca de anticuerpos expresados en fagos (Ejemplo 2) se inoculó en 50 ml de medio 2 x TY suplementado con carbenicilina a 100 mg/ml (p/v) y glucosa al 2% v/v (2xTY AG). Se utilizó una inoculación mayor que 10 x tamaño de la biblioteca para asegurar que se mantiene la diversidad de la biblioteca durante el procedimiento de rescate de los fagos [tamaño de la biblioteca 5 x 107 de tamaño, por lo tanto se utilizaron 5 x 108 células como inoculación de partida a partir de un mezcla madre de glicerol]. El cultivo se desarrolló a 37°C hasta una DO600 de 0,5 y se transfirieron 5 ml de cultivo (que corresponde a aproximadamente 7,5 x 108 bacterias) a un tubo estéril de 50 ml que contenía el fago auxiliar M13KO7 (New England Biolabs). La multiplicidad de infección (MOI) fue de aproximadamente 20:1 fagos con respecto a bacterias, de manera que se utilizaron aproximadamente 1,5 x 1010 fagos para infectar el cultivo bacteriano. Después de añadir el cultivo bacteriano a la cantidad apropiada de fago auxiliar M13KO7, se incubó en un baño de agua a 37°C durante 30 minutos. Las células infectadas se centrifugaron a continuación durante 10 minutos a 4000 x g, el sobrenadante se extrajo y el sedimento bacteriano se resuspendió en 25 ml de 2 x TY precalentado suplementado con 25 mg/ml de kanamicina y 100 mg/ml de ampicilina (2 x TY AK) y se incubó durante la noche a 30°C con agitación. Al día siguiente, las células se sedimentaron por centrifugación durante 15 minutos a 4000 x g y se recogió el sobrenadante que contenía la biblioteca de anticuerpos expresados en fagos. Para purificar los fagos, un 1/5 de volumen polietilenglicol 6000 al 20%, 2,5 M de NaCl (PEG) y se incubaron en hielo durante 1 hora. A continuación, los fagos se sedimentaron en una microcentrífuga y se resuspendieron en 1 ml de PBS estéril. Las bacterias restantes se eliminaron entonces mediante una breve centrifugación y el sobrenadante de fago se transfirió a un nuevo tubo. Se realizó una segunda purificación mediante la adición de 200 ml de PEG e la incubación en hielo durante 20 minutos. Los fagos se recogieron por centrifugación durante 5 minutos a 4°C. Los fagos sedimentados se resuspendieron a continuación en 1 ml de PBS estéril y se eliminó cualquier bacteria contaminante mediante una breve centrifugación adicional. Los fagos purificados se usaron entonces para la selección.
Las selecciones de bibliotecas de anticuerpos en fagos se realizaron en inmunotubos (Nunc) recubiertos con 1 ml de hemaglutinina recombinante 10 mg/ml en PBS durante la noche a 4°C [H1 recombinante [A/California/07/2009 (H1N1 pandémico), H5 recombinante (A/Vietnam/1203/2004) protein sciences™] (Figura 2). La estrategia de selección se diseñó para recuperar ambos anticuerpos específicos de H1 y también anticuerpos de reacción cruzada H1/H5 mediante la alternancia en la selección entre inmunotubos recubiertos con H1 y H5 (Figura 2). También se utilizó una selección paralela con un inmunotubo vacío para monitorear el enriquecimiento específico en antígeno de la biblioteca de anticuerpos de fagos. Al día siguiente, el tubo de los inmunotubos y el tubo de control se bloquearon rellenando completamente con 2% p/v de leche en polvo en PBS estéril (M-PBS), seguido de una incubación de 2 horas a temperatura ambiente. Se añadieron 500 ml de fago concentrado purificado (1012 - 1013 fagos) a 0,5 ml de MPBS al 4% y los fagos se bloquearon durante 1 hora a temperatura ambiente. A continuación, el inmunotubo se lavó con PBS Tween 20 (0,1% v/v) y 2 x PBS y la mezcla de fagos se transfirió a los inmunotubos cubiertos con parafilm y se incubaron durante 30 minutos en rotadores y a continuación 1,5 horas de reposo a temperatura ambiente. A continuación, el inmunotubo se lavó 20 veces con PBS Tween (0,1% v/v) y a continuación 20 veces con PBS [se utilizaron 10 lavados para la primera ronda de selección para maximizar el porcentaje de recuperación de anticuerpos de fagos específicos de antígeno]. Los anticuerpos de fagos específicos se eluyeron mediante la adición de 1 ml de trietilamina 100 mM al tubo y el cubrimiento con parafilm fresco, seguido de incubación durante 10 minutos en un rotador a temperatura ambiente. El fago eluido se neutralizó a continuación mediante la transferencia a un microtubo fresco que contenía 0,5 ml de Tris HCl 1 M pH 7,5. Los fagos eluidos se infectaron a continuación en E. coli para preparar fagos para una segunda ronda de selección y también para titular la cantidad de fagos recuperados entre las rondas secuenciales de selección.
Se desarrolló un cultivo de células ER2378 de E. coli hasta una DO 600 de aproximadamente 0,5. Para amplificar los fagos seleccionados para una siguiente ronda de selección, se mezcló 1 ml de fago eluido con 5 ml de cultivo ER2738 y 4 ml de medio 2 x TY. A continuación, se incubó en un baño de agua a 37°C durante 30 minutos. A continuación, se extendió sobre placas de bioensayo de 22 cm de 2 x TY AG más tetraciclina (20 mg/ml) y se cultivaron durante la noche a 30°C. A continuación, se rascaron las placas de bioensayo y las células recuperadas se utilizaron para una segunda ronda de selección como antes. Con el fin de controlar el progreso de las selecciones entre la ronda secuencial de selección, se determinaron el título de fagos de entrada y fagos de salida. Se realizó una dilución en serie de fagos en 500 ml de 2TY a los que se añadieron 500 ml de cultivo ER2738 de fagos log y se incubaron en un baño de agua durante 30 minutos a 37°C. Las células infectadas se extendieron sobre placas de agar con 2 x TY AG tetraciclina (20 mg/ml) y se contaron las colonias después de la incubación durante la noche a 30°C. El título de fagos antes y después de la selección por tres rondas se calculó como ufp/ml y mostró un aumento en la recuperación de fagos indicativo de enriquecimiento selectivo en antígenos de anticuerpos de fagos específicos (Tabla 2).
Tabla 2. Selección y cribado de una biblioteca de anticuerpos de un único dominio expresados en fagos
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Ejemplo 5: Cribado de biblioteca seleccionada para los clones de anticuerpo que se unen a H1 recombinante (A/California/07/09) y H5 recombinante (A/Vietnam/1203/2004)
El cribado primario de anticuerpos seleccionados se realizó utilizando anticuerpos VHH solubles no purificados inducidos en un formato de 96 pocillos. Las colonias individuales de cada ronda de selección se inocularon en 100 ml de 2 x TY AG (2%) en placas de fondo plano de 96 pocillos (Costar) usando palillos de dientes estériles. Las placas se incubaron durante la noche a 30°C girando a 255 rpm. Al día siguiente, se añadieron 35 ml de glicerol al 60% v/v a cada pocillo y la placa maestra se almacenó a -70°C. A partir de esta placa maestra, se inoculó una nueva placa de fondo redondo de 96 pocillos (Costar) que contenía 120 ml de 2 x TY ampicilina y glucosa al 0,1% p/v, se inoculó y se cultivó durante 6 horas a 37°C hasta que la DO 600 fue de aproximadamente 0,9. Después de esto, se añadieron 30 ml de 2 x TY ampicilina 100 mg/ml, más 5 mM de IPTG (concentración final 1 mM) y se continuó agitando a 37°C durante la noche. Las placas se centrifugaron a continuación a 600 x g durante 10 minutos y el sobrenadante que contenía anticuerpos VHH solubles fue utilizado para analizar la reactividad específica del antígeno en ELISA.
Se recubrió una placa de 96 pocillos (Nunc) con hemaglutinina recombinante a 1 mg/ml durante la noche en PBS a 4°C. Las placas se lavaron tres veces con PBS y después se bloquearon con 120 ml/pocillo de leche en polvo al 2% p/v en PBS (M-PBS) durante 1 hora a temperatura ambiente. A continuación, las placas se lavaron dos veces con PBS al 0,1% en Tween (v/v) y PBS. A cada pocillo, se añadieron 50 ml de leche en polvo al 4% (p/v) en PBS y a continuación 50 ml de sobrenadante de cultivo que contenia VHH soluble. La placa ELISA se incubó a continuación durante 1,5 horas en una plataforma de agitación a temperatura ambiente. Después de esta incubación, las placas se lavaron tres veces cada una con PBS al 0,1% (v/v) en Tween 20 y tres veces con PBS. Para detectar la unión del anticuerpo, se añadieron 100 ml de anti myc 9E10-HRP (dilución 1/1000) (Roche) en MPBS al 2% a cada pocillo y se incubaron durante 1 hora a temperatura ambiente sobre una plataforma de agitación. A continuación, las placas se lavaron tres veces cada una con PBS al 0,1% (v/v) en Tween 20 y tres veces con PBS y la unión del anticuerpo se reveló utilizando tinción TMB estándar. Después de detener la reacción con 50 ml de ácido sulfúrico 1M, las placas se leyeron a 450 nm. Un ejemplo de un cribado de ELISA primario utilizando anticuerpos VHH solubles no purificados en un formato de ELISA de 96 pocillos se muestra en la Figura 3. Los clones positivos se puntuaron por tener al menos dos veces la señal de fondo y se caracterizaron adicionalmente para analizar la diversidad de secuencias, en particular, el número de veces que un clon particular se recuperó en los clones cribados (Tabla 3). Usando un análisis de la secuencia y la evaluación por ELISA, se aislaron diecinueve anticuerpos con una secuencia CDR3 de VHH única con especificidad para H1 recombinante y/o H5 recombinante y progresaron para el cribado secundario más detallado (Ejemplo 6).
Tabla 3. Secuencias de CDR de anticuerpos únicos específicos a H1N1 pandémico
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Ejemplo 6: Análisis de anticuerpos VHH de un único dominio purificados en diferentes subtipos de gripe
Para un cribado más detallado de la especificidad del anticuerpo, se purificaron anticuerpos VHH solubles purificados a partir del periplasma de E. coli. Los diecinueve anticuerpos diferentes identificados en el Ejemplo 4 se inocularon cada uno en 2 ml de medio 2YT suplementado con 100 mg/ml (p/v) de ampicilina, glucosa al 2% (p/v), Tet (5 mg/ml) en un tubo de 10 ml y se cultivaron durante la noche a 37°C con agitación. De este cultivo, se tomó una inoculación de 50 ml en 50 ml de medio 2x TY suplementado con 100 mg/ml de ampicilina, glucosa al 0,1% (v/v) y se cultivaron hasta una DO de -0,6 a 37°C. La expresión de anticuerpos solubles se indujo con la adición de IPTG 1 mM, seguido de una incubación adicional durante la noche a 30°C. El cultivo de 50 ml se centrifugó durante 20 minutos y el sedimento bacteriano se resuspendió en 2,5 ml de tampón periplásmico (Tris HCl200 mM, pH 7,5, sacarosa al 20% (v/v), EDTA 1 mM), seguido de incubación en un rotador durante 1 hora a 4°C. Los residuos celulares se eliminaron por centrifugación dos veces y el sobrenadante correspondiente a los anticuerpos VHH solubles recuperado del periplasma bacteriano se dializó (Pierce) en PBS con dos cambios de tampón. Después de la eliminación de EDTA por diálisis, el anticuerpo se purificó por cromatografía de quelatos metálicos (Clontech) según las instrucciones del fabricante. Se utilizó aproximadamente 1 ml de resina por anticuerpo. Después de la incubación de la resina con las preparaciones periplásmicas, se transfirió a una columna de gravedad (BioRad) y se lavó de acuerdo con las instrucciones del fabricante. El anticuerpo purificado se eluyó en dos volúmenes de lecho de tampón de elución que contenía imidazol 100 mM. El anticuerpo se dializó adicionalmente frente a PBS con dos cambios de tampón y la concentración de anticuerpo se determinó usando DO 280.
Se reconstituyeron preparaciones virales inactivadas en 1 ml de PBS y se incubó una placa de 96 pocillos de ELISA durante la noche a 4°C con 50 ml de antígeno resuspendidos en 10 ml de tampón de bicarbonato 0,5 M pH 9,6. Las placas se lavaron y se procesaron como en el Ejemplo 4, excepto que se utilizó una dilución en serie de anticuerpo purificado de 30, 10, 3, 1, 0,3, 0,1, 0,03, 0,01, 0,003, 0,001, 0,0003, 0,0001 mg/ml y se realizaron ensayos por duplicado. Se representaron curvas de dosis-respuesta y se calcularon los valores de EC50 utilizando GraphPad Prism (Tabla 4). A partir de este análisis, los anticuerpos de reacción cruzada se observaron como R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5, R1a-C5, R1a-B6, R1a-H6, y R2a-G8.
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Ejemplo 7: Afinidad de los anticuerpos de un único dominio en hemaglutinina recombinante de diferentes subtipos virales de gripe
Se determinó la afinidad de los anticuerpos VHH purificados (Ejemplo 5) utilizando el procedimiento de cinética de un ciclo en una máquina BIAcore T100 (Karlsson et al., 2006). El procedimiento consiste en inyectar secuencialmente una serie de concentraciones de anticuerpos sobre una superficie hemaglutinina sin regeneración entre inyecciones. La hemaglutinina recombinante purificada de subtipo variante (Protein Sciences, E enzymes) se inmovilizó sobre un chip CM5 a aproximadamente 3000 unidades de resonancia (RU). Se hicieron correr una serie de diluciones de anticuerpo de 100 nM, 50 nM, 25 nM, 10 nM 5 nM secuencialmente sobre las diferentes superficies de antígeno sin regeneración. Se restó una superficie de referencia antes de la evaluación de los sensogramas. La afinidad del anticuerpo se determinó usando el procedimiento de cinética de un ciclo del software de evaluación BIA (GE Healthcare) usando un modelo de ajuste 1:1 (Tabla 5). El análisis sobre hemaglutinina recombinante y preparaciones virales (ejemplo 6) mostró que los anticuerpos R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5, R1a-C5, R1a-B6, R1a-H6, y R2a-G8 eran anticuerpos de reacción cruzada.
Tabla 5 Análisis de unión en diferentes hemaglutininas recombinantes utilizando resonancia de plasmón superficial
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Ejemplo 8: Mapeo de epítopos
Evaluación de si los anticuerpos se unían a la cabeza globular de la hemaglutinina se evaluó en BIAcore. Se inmovilizaron el dominio HA1 recombinante de hemaglutinina (18-344) (A/California /06/09) H1N1 y la hemaglutinina total (18-530) (E enzymes) sobre un chip CM5 de BIAcore (GE Healthcare). Se determinó la afinidad usando un procedimiento cinética de un ciclo (Ejemplo 7) y se observó que los anticuerpos de reacción cruzada no se unían al dominio de cabeza globular HA1 y por inferencia probablemente se unían a la región tallo HA2. La región tallo HA2 está más conservada a lo largo de los subtipos virales y como tal, es coherente con la reactividad cruzada de estos anticuerpos.
Se obtuvo una prueba adicional de la localización de anticuerpos de reacción cruzada en la región tallo de hemaglutinina conservada mediante un tratamiento ácido que desencadena un cambio conformacional irreversible en la molécula de HA. Se resuspendió una preparación viral de H1N1 (A/California/06/09) en 1 ml de PBS y se diluyeron 200 ml en 20 ml en PBS y el pH bajó a 2,83 con 1,5 ml de HCl 1M. Después de la incubación durante 2,5 horas a temperatura ambiente el antígeno se neutralizó con 20 ml de tampón bicarbonato 0,5 M para dar un pH final de ~9.0. A continuación, este antígeno tratado con ácido se utilizó para recubrir placas de ELISA durante la noche a 4°C. Las placas de ELISA al día siguiente se bloquearon y se determinó la unión a antígeno como en el Ejemplo 6.
También se realizó un ensayo paralelo con antígeno que no había sido tratado con ácido. Se observó que todos los anticuerpos se unieron a H1N1 que no había sido tratado con ácido, mientras que se observó que varios anticuerpos perdieron la unión después de incluir los anticuerpos de reacción cruzada R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5, R1a-C5, R1a-B6, R1a -H6. Los anticuerpos que se unieron a la cabeza globular generalmente retuvieron la unión después del tratamiento con ácido. Esto proporcionó más pruebas de que los anticuerpos de reacción cruzada se unían a la región tallo más conservada de hemaglutinina.
Otra prueba de la unión de anticuerpos de reacción cruzada a la región del tallo conservada se proporcionó mediante el ensayo de la inhibición de la hemaglutinación de eritrocitos de pavo. La hemaglutinina (HA) es la principal proteína de la cubierta viral que media en la unión al ácido siálico de la superficie celular a través del dominio cabeza globular (HA1). Los ensayos de inhibición de la hemaglutinación se realizaron como en Harmon et al., (1988) y se utilizaron para determinar que los anticuerpos podrían bloquear la unión del virus de la gripe a los eritrocitos de pavo, y para indicar la localización del epítopo de anticuerpo al dominio de cabeza globular (HA1). Brevemente, se prepararon diluciones en serie de suero de alpacas inmunizadas o anticuerpos VHH purificados partiendo de 250 mg/ml. Las diluciones en serie se incubaron con 8 unidades de HA de virus por pocillo y se añadieron eritrocitos de pavo a una concentración del 0,5% y la placa se incubó a temperatura ambiente durante 30 minutos. Todos los anticuerpos que mostraron unión al dominio de cabeza globular (HA1) también fueron positivos para la inhibición de la hemaglutinación, excepto R2a-G8. De todos los anticuerpos neutralizantes cruzados H1/H5, sólo se identificó que R1a-C5 mostraba alguna inhibición de la hemaglutinación (Tabla 6).
Tabla 6. Mapeo de epítopos de anticuerpos a la cabeza globular o región tallo de haemaglutinina
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Ejemplo 9 - humanización de un anticuerpo Vhh (ejemplificado por referencia a la secuencia VHH R2a-F9 de camélido)
Las regiones marco (FR) de R2a-F9 se alinearon con la base de datos de secuencia de línea germinal humana utilizando ClustalW y usando secuencias tomados de la base V (http://www.mrc-cpe.cam.ac.uk/vbase-ok), véase la tabla 7. La secuencia de la línea germinal humana más cercana era DP53. La FR4 de R2a-F9 se alineó con las secuencias JH y se escogió JH1. Las regiones FR y CDR se definieron de acuerdo con Kabat et al., (1991). El sistema de numeración IMGT (http://cines.fr) define los límites de manera diferente, por ejemplo la cisteína 92 define el inicio de CDR3 de acuerdo con esta nomenclatura.
Los residuos del marco en R2a-F9 diferentes de la secuencia de VH-DP53 de la línea germinal están resaltados en azul (subrayado). La identidad de secuencia en las regiones de marco es del 79%. Hay un total de 17 residuos en los marcos que son diferentes en el gen variable DP53 entre la línea germinal de alpaca y humano.
La estrategia de humanización implica la sustitución de los residuos en FR que no son esenciales para la unión al antígeno y la estabilidad. Esto incluye elegir residuos de camélidos habituales conocidos para ser retenidos en la secuencia final, por ejemplo, “residuos Hallmark” (Vincke et al., 2008, Journal of Biological Chemistry, 284 (5), 3.273­ 3.284). En R2a-F9, se han identificado cinco residuos “hallmarck”, 4 de los cuales están en la FR2. Se realizan una serie de variantes y se evalúa la importancia de cada residuo de lama para la unión del antígeno y la estabilidad. Las 12 construcciones se ensayan en BIAcore para la unión a H1, rendimiento de expresión y estabilidad térmica, véase la Tabla 8. Las mutaciones en la línea germinal humana que no afectan a la unión al antígeno se combinan en una segunda ronda de construcciones y la prueba se repite hasta que se obtiene una construcción humanizada final con la cantidad mínima de secuencia de anticuerpo de alpaca en las regiones marco.
Combinar todas las mutaciones que no afectan a la función y la estabilidad en construcciones finales para crear un gen de anticuerpo con el máxima contenido de la secuencia humana en las regiones marco. En la tabla 9 se muestran un total de 13 residuos de alpaca se convierten a la línea germinal humana.
Tabla 7
1 30 C D R 1- 3637 49 -----------C D R 2------------- 65
R 2 a -F 9 a OV ;;L V i:.K X P ... P -p P -'L S p a ip I P ; TVTPG '■■■ÍÍGa........V IG M Y .P -P K P .P ' P P P P Y P P P P P 'íj
DP53 E v P 'P T P P P : /G C 3 í* ilS e ^ g G F T K w S ¥ W 3 H BVRQ!:PCKCLVW>;S R ÍN S d £S S "S Z ¡-D p ;RP RFYIS RDRAi'Nal Y r/P /iv-P áY P iP P v"'-.
94 -CDR3—
R2a-F9-h :GKF SSTVAPHEY
DP53 <96) éhR
Tabla 8
Construcciones de mutantes en primera ronda
R 2a-F 9_ Q1F QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSA3G5IS5 IVTMG WYRQAPGKE L LVA V ' NYGNTNYADSVPG RF T VSRDN AKNTVYLQMNSLNVED TAMYVCKF SSTVAPHRY WGQGTQVTVS; R 2 a -F 9 _ S 23 A EVQLVESGGGLVQ1 GGSLRLSC.AASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG PPTVSRDNAKNTVYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS; R2a-F9_S27F EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGFIÜc; LVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNYEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS; R 2 a -F 9 _ I28 T EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSTSS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVSI R2a-F9_S29F EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSIFS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVSI R 2 a -F 9 _ E 4 S V EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSGSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERVLVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS, R 2 cl-j 9_A49S EVQLVESGGGLVgr GSLRLSCSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVS VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS, R 2 a -F 9 _ V 69 l EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RPTISRDNAXNTVYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS R 2 a -L 9_H93R EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTLYLQMNSLNVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS R2a-F9_V94A EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLRVEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS R2a-F9 M99V EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG KFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNAEDTAMYVCKF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS R2a-F3_M99V EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCSASGSISS IVTMG WYRQAPGKERELVA VIGNYGNTNYADSVKG RFTVSRDNAKNTVYLQMNSLNVEDTAVYVCEF SSTVAPHEY WGQGTQVTVS
Tabla 9
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Ejemplo 10: Introducción de una secuencia de CDR3 de VHH en un anticuerpo humano
Dado que la CDR3 de VHH es el determinante clave de la especificidad de unión, este bucle se puede incorporar fácilmente en un gen de VH enteramente humano al tiempo que preserva la funcionalidad. El anticuerpo resultante es totalmente humano con una CDR1 y CDR2 humanas, excepto para el bucle CDR3 de VHH que deriva de alpaca. Dicho anticuerpo tiene un menor riesgo de provocar una respuesta inmunitaria adversa cuando se administra como un anticuerpo monoclonal terapéutico debido al mayor contenido de secuencia humana en comparación con el anticuerpo derivado en el Ejemplo 9.
A modo de ejemplo, el bucle CDR3 de VHH se injerta en un gen V humano apropiado mediante el diseño de un oligonucleótido correspondiente a la secuencia de CDR3 de VHH entre paréntesis por la secuencia de línea germinal de anticuerpo humano correspondiente a FR3 y FR4 de cualquiera de una VH humana individual o una colección de secuencias de VH humanas. A continuación se muestra un ejemplo que incluye un oligonucleótido 3' correspondiente a la VHH-CDR3 de R2a-F9 (SEQ ID 36) adjunto con una secuencia degenerada diseñada para cebar a todos los miembros de la familia de genes de VH3 humanos. El gen de VH3 fue seleccionado simplemente porque los anticuerpos VHH de camélidos muestran mayor homología a la familia VH3 humana. El cebador 5' correspondiente es un oligonucleótido degenerado diseñado para hibridarse con FR1 de todos los miembros de genes de VH3 humanos. Estos dos oligonucleótidos se utilizan en una reacción de PCR con genes de VH humanos derivados de ADNc preparado por ejemplo a partir de linfocitos de sangre periférica de los donantes sin tratar utilizando procedimientos establecidos. El diseño mostrado a continuación añade los sitios de restricción Sfi 1 y BstEII para facilitar la clonación en el vector de expresión en fagos pNIBS-1 (Ejemplo 3).
Figure imgf000027_0001
Después de la construcción de una biblioteca de expresión en fagos de genes de VH humanos injertados con VHH-CDR3 de R2a-F9, la biblioteca se selecciona a continuación en base a H1 recombinante como en el Ejemplo 4 y los anticuerpos humanizados se criban como en el Ejemplo 5.
Ejemplo 11: Evaluación de la eficacia in vivo
La eficacia de los anticuerpos de reacción cruzada para la inmunoterapia pasiva se evalúa en un modelo de estimulación con ratón. Los siete anticuerpos neutralizantes cruzados H1/H5 (R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5, R1a-C5, R1a-B6, R1a-H6, R2a-G8) se ensayan por su capacidad de proteger a los ratones BALB/c de la estimulación con virus H1N1 (A/California/07/09) y H5N1 (A/Vietnam/1203/2004) en un entorno profiláctico. Los anticuerpos VHH se expresan, purifican (Ejemplo 6) y se administran por vía intranasal como agentes monovalentes a 5 mg/kg, 24 horas antes de la estimulación con una dosis letal de virus. Un anticuerpo VHH no relevante y un único brazo de PBS del estudio se incluyen como controles. Se controlan la supervivencia, el peso corporal y los títulos virales en los pulmones y otros tejidos para evaluar la capacidad de los anticuerpos de proteger contra la estimulación letal con los virus H1N1 y H5N1. Dichos anticuerpos demuestran protección contra dicha exposición letal. Los anticuerpos también se evalúan en un entorno terapéutico, donde el anticuerpo se administra 24 horas después de la infección con H1N1 y H5N1. De nuevo, se controlan la supervivencia, el peso corporal y los títulos virales después de la estimulación en los pulmones y otros tejidos. Dichos anticuerpos demuestran protección contra dicha estimulación letal.
Ejemplo 12: Actividad de neutralización de anticuerpos VHH recombinantes sobre H1N1 y H5N1
El ensayo de microneutralización de la gripe se realizó esencialmente como en Harmon et al., (1988). En resumen, el suero de una alpaca inmunizada o anticuerpos VHH purificados (a una concentración de partida de 5 mg/ml) se diluyeron en serie, dos veces, en un volumen de 50 ml de diluyente de ensayo (DMEM con la adición de: 2 mM de glutamina, Pen/Strep 1/100, anfotericina 1 /100, aminoácidos no esenciales y FCS 1/200) en una placa de fondo plano de 96 pocilios (Costar) en columnas duplicadas 1-10. Los reagrupamientos de genética inversa NIBRG-14 (A/Vietnam/1194/04; H5N1) y el virus atenuado reagrupado X-181 (A/California/07/09; H1N1) fueron utilizados en ensayos de neutralización viral. El virus X-181 y los virus NIBRG-14 se utilizaron a una dosis de virus de 102 TCID50 por 50 ml de diluyentes de ensayo. En todos los ensayos, se incluyó un control de “virus solo” (VC) y un control de “células solas” (CC). Las placas se incubaron a temperatura ambiente durante 1 hora y se añadieron 100 ml de 1,5x105/ml de células MDCK (células de riñón canino Madin-Darby) a todos los pocillos. Las placas se incubaron durante 18 horas a 30°C en 5% de CO2. Las células se fijaron con 100 ml de 0,6% p/v de metanol/peróxido de hidrógeno por pocillo y se dejaron durante 20 minutos a temperatura ambiente. A continuación, las placas se lavaron 3 veces en PBS Tween-20 (0,05% p/v). El crecimiento de virus de la gripe y la liberación de nucleoproteína fue con un anticuerpo monoclonal primario anti- nucleoproteína de gripe A de ratón (Serotec). Se añadieron 100 ml de este anticuerpo a cada pocillo a una dilución 1: 3000 en 6 sal PBS/Tween-20 (0,1%) 5% p/v de leche Marvel. Se añadieron 100 ml de esto a todos los pocillos y las placas y se incubaron durante 1 hora a 37°C. Se utilizó conjugado con HRP de policlonal de conejo anti-IgG de ratón (DAKO) a una dilución de 1:5000 en 6 sal PBS/Tween-20 (0,1% v/v), 5% (p/v) de leche Marvel en polvo, 1% (v/v) de albúmina de suero bovino y se incubó durante 1 hora a 37°C. Las placas se lavaron 4 veces y se revelaron utilizando tinción TMB. Las reacciones se detuvieron mediante la adición de 100 ml de HCl 0,5 M a cada pocillo y se leyeron a 450 nm y 620 nm. Los valores de 620 nm se restaron de los valores de 450 nm para corregir para la absorción de la placa. La concentración de anticuerpo a la que se observó un 50% de neutralización viral se determinó utilizando la ecuación;
(promedio de la DO del VC) -(promedio de la DO de CC) (promedia de la DO de CC) = x
2
Donde x es la DO a la que estaban infectadas el 50% de las células MDCK.
Todos los clones de anticuerpos, excepto R2b-D8, R1a-F4, R1a-E5, R1a-F5 y R1a-E6, fueron capaces de neutralizar X-181 que es una capa adaptada para laboratorio de H1N1 (Tabla 10). De los anticuerpos neutralizantes de H1N1, R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5, R1a-C5, R1a-B6, R1a-H6 y R2a-G8 también fueron capaces de neutralizar NIBRG-14 (H5N1) y fueron considerados como anticuerpos de neutralización cruzados (Tabla 10). Esto fue consistente con los datos de reactividad cruzada que se muestran en los ejemplos 5, 6 y 7. Para los anticuerpos R2b-E8, R2b-D9, R1a-A5, R1a-B6 y R1a-H6 esto fue consistente con la ausencia de actividad de inhibición de la hemaglutinación y la especificidad para epítopos sensibles a ácidos en la región tallo conservada de hemaglutinina (Tabla 6).
Tabla 10. Neutralización por anticuerpos de la infección viral por H1N1 y H5N1 de células MDCK
Figure imgf000028_0001
Ejemplo 13: Evaluación como “anticuerpo universal” para potencia de la vacuna
Los anticuerpos de reacción cruzada de la divulgación se utilizan en ensayos de potencia para las vacunas de la gripe atenuadas. Los anticuerpos de reactividad cruzada de esta solicitud reaccionan de forma cruzada con (1) muchas/todas las hemaglutininas de un subtipo/tipo de virus de la gripe, o con (2) hemaglutininas de más de un subtipo de virus de gripe A, perteneciendo todos estos subtipos a uno de los dos grupos filogenéticos reconocidos de la gripe HA, o con (3) HA de ambos grupos filogenéticos, el grupo 1 y grupo 2.
Un anticuerpo que tiene reactividad cruzada como en (1) es útil para la prueba de potencia de vacunas de la gripe multivalentes, preferiblemente trivalentes y tetravalentes. Un anticuerpo que tiene reactividad cruzada como en (2) es útil para la prueba de potencia de vacunas de la gripe multivalentes, preferiblemente trivalentes y tetravalentes; para la prueba de potencia de vacunas de gripe pandémica o prepandémicas que contienen un único subtipo de virus A de la gripe; y para la prueba de potencia de las vacunas que contienen más de un subtipo/tipo, perteneciendo cada componente del virus a un grupo filogenético diferente. Un anticuerpo que tiene reactividad cruzada como en (3) es útil para la prueba de potencia de las vacunas de la gripe monovalentes, preferiblemente vacunas de la gripe pandémicas y prepandémicas.
El uso de dichos anticuerpos de reacción cruzada en las pruebas de potencia elimina la necesidad de cambiar con frecuencia el reactivo anticuerpo como es el caso en los procedimientos utilizados en la actualidad, para los que los antisueros de oveja específicos tienen que ser generados cada vez que se anuncia y aplica un cambio cepa; la producción de un nuevo antisuero para cada virus antigénicamente derivado que se utiliza en las vacunas de la gripe ha sido identificado como un posible cuello de botella en el camino del cambio de cepa del virus a la vacunación con una vacuna contra la gripe actualizada. Para resolver este problema, los anticuerpos de reacción cruzada de esta divulgación se producen por adelantado y están por lo tanto disponibles en todo momento; después de un cambio de cepa en la producción de vacunas de la gripe, (a) anticuerpo/anticuerpos de reacción cruzada se pueden usar inmediatamente, sin tiempo de espera a la disponibilidad de anticuerpos específicos de la cepa.
A modo de ejemplo, se utiliza un anticuerpo de reacción cruzada en un ensayo de inmunodifusión radial simple (SRID o SRD). Siguiendo los protocolos estándar para SRD, el anticuerpo de reacción cruzada se incorpora en una matriz de gel y a continuación se usa en el ensayo. Se forma un anillo de precipitina cuando se deja difundir la hemaglutinina de la gripe en el gel y se puede medir siguiendo protocolos estándar para la visualización del anillo/zona de SRD.
En otro ejemplo, se utilizan anticuerpos de reacción cruzada en ensayos de ELISA para medir cuantitativamente la potencia de las vacunas y las muestras prevacunas, tales como grupos monovalentes. Se pueden utilizar ensayos de ELISA de varios formatos. Por ejemplo, se puede utilizar un ELISA sándwich utilizando un anticuerpo recubierto sobre una superficie sólida para capturar hemaglutinina y un anticuerpo para detectar HA capturada. El anticuerpo de captura y de detección puede ser el mismo anticuerpo, o pueden ser diferentes anticuerpos. Cualquiera de los dos anticuerpos, o ambos, pueden ser anticuerpos de reacción cruzada de la presente divulgación. En otro formato, se utiliza un ELISA de competición. HA se recubre sobre una superficie sólida y reacciona con anticuerpo/anticuerpos de reacción cruzada de la presente divulgación. Un antígeno de referencia, o la muestra a medir, se utiliza como reactivo competitivo. La reducción de la unión del anticuerpo de reacción cruzada a la HA recubierta se puede utilizar para cuantificar la HA en solución usando una curva estándar generada a partir del reactivo antígeno de referencia. Pueden emplearse otros formatos de ensayos ELISA para un efecto similar; en todos los casos, un anticuerpo de reacción cruzada, o una multitud de anticuerpos de reacción cruzada, se utilizan como reactivos específicos para capturar y/o detectar HA.
En otro ejemplo, la tecnología de resonancia de plasmón superficial (SPR) se utiliza para establecer un ensayo de potencia para vacunas de la gripe atenuadas. Se utilizan anticuerpos de reacción cruzada para detectar y cuantificar proteína/antígeno HA. Se pueden utilizar varios formatos de ensayos basados en SPR. En un ejemplo preferido, se emplea un ensayo competitivo, con antígeno de referencia y anticuerpo de reacción cruzada que compite por la unión a HA que recubre un chip, según sea apropiado para el dispositivo específico utilizado.
En otro ejemplo, se utilizan el anticuerpo/anticuerpos de reacción cruzada en un procedimiento que utiliza proteínas (en particular, HA) inmovilizadas sobre una membrana. La membrana puede ser una membrana de nitrocelulosa, una membrana de PVDF u otra membrana adecuada. La inmovilización de proteínas y HA en la membrana se puede producir a través de diversos procesos, tales como transferencia Western utilizando diversos dispositivos, slot blotting, manchas sobre una membrana, y otros.
En otro ejemplo, se utilizan anticuerpos de reacción cruzada para enriquecer HA a partir de muestras, tales como vacunas o grupos monovalentes. El enriquecimiento puede ser a través del uso de anticuerpos de reacción cruzada en inmunoprecipitación, cromatografía de afinidad, separación magnética (con el anticuerpo que está acoplado por algún medio a sustancias magnéticas, tales como perlas paramagnéticas), o cualquier otro procedimiento inmunológico capaz de unirse y enriquecer HA de una muestra que va a ser, en su mayor parte, un líquido que contiene HA en solución. La hA adsorbida a las sustancias, tales como adyuvantes, también puede someterse a dicho enriquecimiento, ya sea en muestras no tratadas o después del tratamiento para desadsorber la HA. A continuación, puede cuantificarse la HA enriquecida usando cualquier procedimiento adecuado. Los procedimientos adecuados incluyen, pero no se limitan a, espectrometría de masas, en particular espectrometría de masas con dilución de isótopos, tal como se utiliza en “espectrometría de masas por inmunocaptura con dilución de isótopos” (Pierce et al., Analytical Chemistry, 2011 dx.doi.org/10.1021/ac2006526) y HPLC.
Ejemplo 14: Diseño de una vacuna de la gripe que provoca una respuesta inmunitaria de protección cruzada contra

Claims (8)

REIVINDICACIONES
1. Anticuerpo de un único dominio que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 124, y que se une al virus de la gripe H1N1.
2. Anticuerpo, según la reivindicación 1, en el que dicho anticuerpo demuestra reactividad cruzada antigénica a: (a) subtipos del virus de la gripe H1 y H5;
(b) subtipos del virus de la gripe H2 y H9; y/o
(c) uno o todos de subtipos del virus de la gripe H2, H5, H6, H9, H11, H13, H16, H8 y H12.
3. Anticuerpo que comprende o consiste en dos o tres o cuatro o más anticuerpos de un único dominio, tal como se define en una cualquiera de las reivindicaciones 1-2.
4. Anticuerpo, según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dicho anticuerpo demuestra actividad neutralizante contra:
(a) un virus de la gripe H1 (por ejemplo, H1N1), por ejemplo contra la cepa A/California/06/09 y/o A/California/7/2009 y/o A/Brisbane/59/2007;
(b) un virus de la gripe H5 (por ejemplo, H5N1 o H5N3), por ejemplo contra la cepa A/Vietnam/1203/2004 y/o A/Vietnam/1194/04 y/o A/Vietnam/119/2004 y/o Hong Kong/213/2003 y/o A/pavo/Turquía/1/2005 y/o A/Indonesia/05/2005 y/o A/Pato/Singapur-Q/119-3/97;
(c) un virus de la gripe H2 (por ejemplo, H2N2 o H2N3), por ejemplo contra la cepa A/Japón/305/1957 y/o A/ánade/Eng/727/06; y/o
(d) un virus de la gripe H9 (por ejemplo, H9N2), por ejemplo contra la cepa A/Hong Kong/1073/99.
5. Anticuerpo, según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dicho anticuerpo demuestra actividad neutralizante contra uno, o más, o todos los virus de la gripe de grupo I con hemaglutinina seleccionados del grupo que consiste en los virus de la gripe H1, H2, H5, H6, H11, H13, H16, H9, H8 y/o H12.
6. Anticuerpo, según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, para usar en la prevención o el tratamiento de la infección por el virus gripe.
7. Utilización de un anticuerpo, según cualquiera de las reivindicaciones 1-5, como reactivo para detectar la presencia de un subtipo del virus de la gripe seleccionado entre:
(a) subtipos H1 y H5; o
(b) subtipos H1 y H5 y H2 y H9; o
(c) subtipos H1 y H5 y H6 y H11 y H13 y H16 y H8 y H12; o
(d) un subtipo del virus de gripe del grupo I con hemaglutinina; o
para confirmar la ausencia de un subtipo del virus de la gripe seleccionado entre:
(a) subtipos H3 y H7;
(b) un subtipo del virus de la gripe del grupo II con hemaglutinina.
8. Utilización de un anticuerpo, según cualquiera de las reivindicaciones 1-5, como reactivo:
(a) en un ensayo in vitro para evaluar la potencia de una vacuna contra el virus de la gripe;
(b) en un ensayo para evaluar la reactividad cruzada de una vacuna contra el virus de la gripe contra diferentes tipos y/o subtipos del virus de la gripe;
(c) para concentrar y/o cuantificar la cantidad de hemaglutinina presente en una muestra;
(d) para aislar anticuerpos anti-idiotípicos contra hemaglutinina; o
(e) in vitro para diseñar una vacuna contra la gripe universal.
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Families Citing this family (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9969794B2 (en) 2012-05-10 2018-05-15 Visterra, Inc. HA binding agents
US9650434B2 (en) 2013-04-02 2017-05-16 Xiamen University Broad-spectrum monoclonal antibody recognizing HA1 domain of hemagglutinin of influenza virus
EP2994163B1 (en) 2013-05-09 2019-08-28 The United States of America, as represented by The Secretary, Department of Health and Human Services Single-domain vhh antibodies directed to norovirus gi.1 and gii.4 and their use
WO2015025900A1 (ja) * 2013-08-23 2015-02-26 学校法人藤田学園 抗インフルエンザウイルス中和抗体
CN103804493B (zh) * 2014-01-27 2015-12-30 南通伊仕生物技术股份有限公司 针对甲型流感病毒h1n1的重链抗体vhh及其应用
CN103936852B (zh) * 2014-05-14 2016-08-17 南通伊仕生物技术股份有限公司 特异性针对甲型h3n2流感病毒的纳米抗体及其在诊断中的应用
US10732180B2 (en) 2014-06-04 2020-08-04 Indevr, Inc. Universal capture array for multiplexed subtype-specific quantification and stability determination of influenza proteins
CA2975655C (en) 2015-02-05 2023-09-19 Janssen Vaccines & Prevention B.V. Binding molecules directed against influenza hemagglutinin and uses thereof
JP2017036258A (ja) 2015-08-07 2017-02-16 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウィルスに結合する抗体
US10513553B2 (en) 2015-11-13 2019-12-24 Visterra, Inc. Compositions and methods for treating and preventing influenza
JP6868763B2 (ja) 2016-04-01 2021-05-12 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウィルスに結合する抗体
US9988435B2 (en) 2016-06-01 2018-06-05 Panasonic Intellectual Property Management Co., Ltd. Composite comprising antibody capable of binding to intranuclear protein of influenza virus
JP6931765B2 (ja) * 2016-06-01 2021-09-08 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウィルス核内蛋白質に結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
US9988436B2 (en) 2016-06-01 2018-06-05 Panasonic Intellectual Property Management Co., Ltd. Composite comprising antibody capable of binding to intranuclear protein of influenza virus
JP2018058812A (ja) * 2016-06-01 2018-04-12 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウィルス核内蛋白質に結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
JP2020137414A (ja) * 2017-06-26 2020-09-03 国立研究開発法人理化学研究所 変異vhh抗体及びその製造方法
JP2019011297A (ja) 2017-06-30 2019-01-24 パナソニックIpマネジメント株式会社 ノロウイルスに結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
JP2021004177A (ja) 2017-09-12 2021-01-14 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウイルス核内蛋白質に結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
WO2019054198A1 (ja) * 2017-09-12 2019-03-21 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウイルス核内蛋白質に結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
JP7065338B2 (ja) 2017-09-12 2022-05-12 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウイルス核内蛋白質に結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
JP7162190B2 (ja) 2018-07-17 2022-10-28 パナソニックIpマネジメント株式会社 インフルエンザウィルス核内蛋白質に結合する抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
JP7178623B2 (ja) * 2018-07-17 2022-11-28 パナソニックIpマネジメント株式会社 検出装置
JP7308477B2 (ja) 2019-03-11 2023-07-14 パナソニックIpマネジメント株式会社 抗体、複合体、それを用いた検出装置及び検出方法
CA3132521A1 (en) 2019-03-25 2020-10-01 Visterra, Inc. Compositions and methods for treating and preventing influenza
WO2021201677A1 (en) 2020-04-01 2021-10-07 Kiadis Pharma Intellectual Property B.V. Compositions and methods targeting influenza
WO2023112965A1 (ja) * 2021-12-15 2023-06-22 学校法人帝京平成大学 Vhh抗体
CN115043933B (zh) * 2022-03-31 2023-08-08 深圳市人民医院 靶向新冠病毒的纳米抗体及其制备方法和应用
CN114805608B (zh) * 2022-05-20 2023-05-19 青岛农业大学 一种基于自组装铁蛋白抗甲型h1n1亚型流感病毒的纳米颗粒及其制备方法和应用

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS5973698A (ja) 1982-10-20 1984-04-25 Nichiwa Sangyo Kk 単管脱圧型分配弁による高所配管のシステム
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
IL99552A0 (en) 1990-09-28 1992-08-18 Ixsys Inc Compositions containing procaryotic cells,a kit for the preparation of vectors useful for the coexpression of two or more dna sequences and methods for the use thereof
GB0522460D0 (en) * 2005-11-03 2005-12-14 Prendergast Patrick T Composition and method for the treatment of avian influenza
AU2007293662B2 (en) 2006-09-07 2012-10-04 Crucell Holland B.V. Human binding molecules capable of neutralizing influenza virus H5N1 and uses thereof
CA2682047A1 (en) * 2007-03-26 2008-10-02 University Of Massachusetts Medical School Compositions and methods for increasing immunogenicity of glycoprotein vaccines
FR2921928B1 (fr) * 2007-10-08 2011-03-04 Sanofi Pasteur Anticorps monoclonaux specifiques de l'hemagglutinine du virus grippal
EP2254909A4 (en) 2007-12-21 2012-05-02 Ca Nat Research Council HUMAN NON-AGGREGATING DOMAINS
CA2736799A1 (en) * 2008-08-25 2010-03-11 Burnham Institute For Medical Research Conserved hemagglutinin epitope, antibodies to the epitope, and methods of use
PT2387583T (pt) * 2009-01-14 2018-12-24 Ablynx Nv Administração pulmonar de domínios de variável única de imunoglobulina e construtos dos mesmos
AU2010249046A1 (en) * 2009-05-13 2011-12-01 Sea Lane Biotechnologies, Llc Neutralizing molecules to influenza viruses
AU2010254136B2 (en) * 2009-05-26 2016-09-29 Mount Sinai School Of Medicine Monoclonal antibodies against influenza virus generated by cyclical administration and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
DK2750708T3 (en) 2018-12-10
ES2864711T3 (es) 2021-10-14
JP2014527065A (ja) 2014-10-09
CN104053453B (zh) 2019-03-29
WO2013030604A1 (en) 2013-03-07
AU2012300592A1 (en) 2014-03-20
CN104053453A (zh) 2014-09-17
BR112014004860A2 (pt) 2019-07-02
CA2847263C (en) 2021-04-20
EP3424532B1 (en) 2021-01-06
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