ES2353014T3 - Predicción de la evolución del cáncer. - Google Patents

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ES2353014T3 ES04733219T ES04733219T ES2353014T3 ES 2353014 T3 ES2353014 T3 ES 2353014T3 ES 04733219 T ES04733219 T ES 04733219T ES 04733219 T ES04733219 T ES 04733219T ES 2353014 T3 ES2353014 T3 ES 2353014T3
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Abstract

Método para predecir la recidiva de cáncer en un sujeto tratado para una enfermedad cancerosa que comprende las etapas de: - poner en contacto un ligando de afinidad por la proteína timidina cinasa 1 (TK1) con una muestra de fluido corporal de dicho sujeto, dicho ligando se une específicamente a dicha proteína TK1; - determinar una cantidad de ligando que se une a dicha proteína TK1 y/o a un complejo que comprende la proteína TK1 en dicha muestra; y - estimar una probabilidad de futura recidiva de cáncer después de al menos un año tras el tratamiento contra el cáncer basándose en dicha cantidad determinada de unión de ligando y sin determinación de un nivel de actividad enzimática de TK1.

Description

Predicción de la evolución del cáncer.
Campo técnico
La presente invención se refiere en general a la monitorización y predicción de enfermedades cancerosas y en particular a la predicción temprana de la evolución y reaparición de enfermedades cancerosas.
Antecedentes
El cáncer es una causa principal de muerte en los seres humanos y el número de individuos afectados aumenta cada año. Aunque los diferentes métodos de tratamiento para el cáncer, por ejemplo quimioterapia, terapia endocrina, radioterapia y cirugía, han mejorado tremendamente en las últimas décadas, están lejos de ser perfectos, en particular para pacientes con estadios tardíos de cáncer. Por tanto, se ha invertido mucha investigación en la detección temprana de tumores en pacientes.
Un método usado para la detección del estadio tumoral y de tumor es la determinación de la proliferación celular en pacientes. Se ha usado la proporción de células que sintetizan ADN (células en fase S) en tumores como una medida de su tasa de proliferación. Las células que sintetizan ADN se han determinado anteriormente por medio de timidina marcada con radioactividad (autorradiografía). La incorporación de análogos de halógeno de timidina (BrdU) y anticuerpos frente a los mismos se han usado junto con mediciones de ADN citométricas de flujo cuantitativas. La desventaja del uso de timidina marcada de manera isotópica y BrdU es que sólo pueden medirse células vivas. Por tanto, estos métodos sólo se han usado en pacientes seleccionados y en un número limitado de estudios [Wilson, Acta Oncol., 30:903, 1991]. Además, la técnica de citometría de flujo no puede distinguir entre las células en proliferación y las que no están en proliferación. La determinación de células en fase S es incluso más complicada en tumores, puesto que las células tumorales cancerosas no se apartan, en su contenido en ADN, de las células benignas [Tribukait, World J. Urol., 5:108, 1987].
En lugar de medir la propia síntesis de ADN, se han usado marcadores relacionados con células en proliferación, por ejemplo, Ki-67 y PCNA (antígeno nuclear de células en proliferación). Ki-67 se expresa en todos los estadios del ciclo celular excepto en G0 [Scholzen, J. Cellular Physiol., 182:311, 2000]. Pueden usarse anticuerpos frente a Ki-67 en tejidos frescos así como en tejidos incrustados en parafina y fijados en formalina. Dependiendo de la tasa de proliferación celular, el PCNA se expresa en todas las etapas del ciclo celular. El PCNA no es tan sensible para diversas técnicas de fijación como Ki-67 [Hall, Cell Tissue Kinet., 25:502, 1990]. Se han sometido a prueba anticuerpos frente a otros tipos de proteínas y enzimas implicadas en la síntesis de ADN (ADN polimerasa, ribonucleótido reductasa), pero con resultados satisfactorios limitados [Wilson, Acta Oncol., 30:903, 1991].
La timidina cinasa (TK), una enzima de la ruta de recuperación de pirimidina, cataliza la fosforilación de timidina para dar timidina monofosfato. La TK en células humanas aparece en dos formas, una proteína citoplásmica (TK1) y una mitocondrial (TK2), codificada por diferentes genes. Las TK1 y TK2 humanas se ubican en el cromosoma 17q23.2-q25.3 y 16q22-q23.1, respectivamente. Los transcritos de TK1 codifican para una proteína de 25,5 kDa con regiones altamente conservadas típicas de nucleósido cinasas. Sin embargo, aún no se han determinado las estructuras cristalinas de esta familia de enzimas. La expresión de TK1 se regula por el ciclo celular y la regulación de TK1 es compleja con niveles de ARNm que alcanzan su nivel máximo en células en proliferación. El corte y empalme y la traducción del ARNm de TK1 también varían en las células en diferentes fases de crecimiento. Principalmente, los niveles de TK1 se regulan mediante mecanismos postraduccionales, en particular mediante degradación diferencial debido a la expresión de proteasa altamente activa en células mitóticas. La región C-terminal de TK1 contiene una secuencia específica, KEN, que se ha mostrado recientemente que es la señal de la degradación mitótica de TK1 en la ruta mediada por complejo promotor de la anafase/ciclosoma Cdhl [Ke, Mol. Cell. Biol., 24: 514, 2004]. La TK2 no se regula por el ciclo celular y es la única enzima TK encontrada en células en reposo [Wintersberger, Biochem. Soc. Trans., 25:303, 1997; Sherley, J. Biol. Chem., 263:8350, 1988; He, Cell. Prolif., 24:3, 1991; Kauffman, Mol. Cell. Biol., 11:2538, 1991; Hengstschläger, J. Biol. Chem., 269:13836, 1994; Munch-Petersen, J. Biol. Chem., 266:9032, 1991].
La mayoría de los marcadores mencionados anteriormente se han usado para identificar células en proliferación en tejidos. Sin embargo, se ha determinado la actividad de la timidina cinasa en fracciones de citosol de tejidos como marcador de proliferación en cáncer de mama humano. En un estudio de 1.692 pacientes con cáncer de mama [Broet, J. Clin. Oncol., 19:2778, 2000], la alta actividad de TK1 en el citosol se correlacionaba con una supervivencia más corta así como un mal resultado del tratamiento endocrino (tamoxifeno) [Foekens, Cancer Res., 61:1421, 2001]. Además, también se ha usado la timidina cinasa como un marcador de proliferación celular en suero midiendo su actividad enzimática.
Debido al acoplamiento estrecho entre la actividad enzimática de TK sérica (STK) y la alta proliferación, se considera un marcador sensible y útil para la proliferación celular y por tanto para la detección de tumores malignos [He, Internal. J. Biol. Marker, 15: 139, 2000; Zou, Internal. J. Biol. Marker, 17:135, 2002; He, Biochimica Biophysica Acta, 1289:25, 1996; He, Europ. J. Cell Biol., 70:117, 1996; Wu, Anticancer Res., 6:4867, 2000; Mao, Cancer Inves. 20:922, 2002; Wang, Analysis Cell. Pathology, 23:11, 2001; Kuroiwa, J. Immuno. Methods, 253: 1, 2001]. Por tanto, se ha usado la actividad enzimática de STK como marcador tumoral en pacientes con diferentes tumores sanguíneos. Sin embargo, se ha encontrado que la actividad de STK no es un buen marcador en pacientes con tumores
sólidos.
Más del 95% de la actividad enzimática de STK corresponde a TK1 mientras menos del 5% corresponde a TK2. La composición y las propiedades de STK aún no se entienden bien. Los resultados indican que STK es una forma polimérica de TK1, probablemente también en complejo con otras proteínas séricas y tiene un peso molecular total de aproximadamente 700 kDa [Karlström, Mol. Cell. Biochem, 92:23, 1990].
Usando el análogo de timidina 5-yodo-2'-desoxiuridina como sustrato, se estableció la actividad de STK como un marcador de proliferación serológica en 1984 [Gronowich, Br. J. Cancer, 47:487, 1983] y ahora está disponible como kit de RIA comercial para radioensayo con [^{125}I] (Sangtec Medical AB, Estocolmo, Suecia, recientemente adquirido por DiaSorin Inc.). El ensayo de actividad de STK ha sido útil para la estimación de la propagación y el pronóstico tumorales en pacientes con leucemia aguda y leucemia crónica (CLL), linfoma de Hodgkin y de no Hodgkin, pero no en el caso de tumores sólidos [Gronowich, Int. J. Cancer, 15:5, 1984]. La actividad enzimática de STK en un paciente con CLL proporciona información de pronóstico útil con respecto a ambas respuestas a la terapia y duración de supervivencia. Aunque el método es relativamente eficaz, especialmente para enfermedades de leucemia y linfoma, el 5-yodo-2'-desoxiuridina no es un sustrato específico para la actividad de STK (TK1). Además, la [^{125}I]-radio-yodo-desoxiuridina tiene una semivida corta (cuatro semanas), la actividad enzimática de STK es altamente sensible a cambios de temperatura y pH, y el radioensayo requiere equipo especializado (contador de centelleo \gamma), laboratorio de isótopos y personal altamente cualificado. Las desventajas de una técnica de radioensayo de este tipo han limitado probablemente el uso clínico de este ensayo.
Por tanto, se ha desarrollado recientemente un nuevo kit de actividad de STK basándose en anticuerpos frente al producto de la reacción de STK. También se han generado anticuerpos anti-TK1 durante las últimas décadas, principalmente anticuerpos policlonales para investigación básica y no para uso comercial. Recientemente, se han desarrollado anticuerpos mono y policlonales de ratón anti-TK1 para fines clínicos potenciales, es decir para cáncer de mama [Zhang, Cancer Detección Prev., 25:8, 2001] y cáncer de pulmón [Voeller, Anti-Cancer Drugs, 12:555, 2001]. Ahora está disponible comercialmente un anticuerpo monoclonal anti-TK1 para investigación básica, pero no para uso clínico (QED Bioscience Inc, San Diego, EE.UU., 2003).
En la patente estadounidense n.º 5.698.409 O'Neil da a conocer anticuerpos monoclonales (AcM) generados frente a la forma tetramérica de 100 kDa enzimáticamente activa de TK1 de células Raji. Los AcM se usan para determinar sólo esta forma enzimáticamente activa de TK1 en muestras biológicas de pacientes. Además, O'Neil tiene que determinar la actividad de TK usando timidina radiomarcada, además de usar el AcM. Entonces se usan las actividades de TK1 determinadas para diagnosticar y monitorizar diversas formas de cáncer. Las propiedades de sus anticuerpos monoclonales anti-TK1 plantean preguntas sobre la especificidad de estos anticuerpos, es decir, reaccionan con una proteína de peso molecular mayor del esperado en inmunotransferencia de tipo Western de electroforesis en gel de SDS (45 kDa frente a 25 kDa en extractos de células HeLa humanas). Además, los anticuerpos detectan una proteína en el suero que se produce en otro intervalo de concentración (más alto) que el encontrado por otros investigadores en el campo, es decir, se necesita diluir el suero 16.000 veces mientras otros usan suero no diluido. Estos hechos sugieren que sus anticuerpos reaccionan con otras proteínas además de TK1 y/o TK2 enzimáticamente activas. Además, el método de O'Neil se ve afectado por los problemas similares a los del uso del análogo de timidina radiomarcada comentado anteriormente.
Kuroiwa, et al, [Kuriowa, J. Immuno. Methods, 253:1, 2001] han desarrollado y sometido a prueba 26 anticuerpos monoclonales anti-TK1. Las propiedades de estos anticuerpos son más de lo esperado, es decir reaccionan con una proteína con un peso molecular de 25 kDa en extractos de HeLa humanas en inmunotransferencia de tipo Western sin reactividad cruzada notificada con otras proteínas. Cuando se usan estos anticuerpos en suero de pacientes con tumores sólidos usando ELISA, no se encontraron diferencias significativas de los niveles de TK1 sérica en comparación con los niveles de TK1 sérica de individuos sanos.
Sumario
Es un objetivo general de la presente invención proporcionar una prueba para la predicción temprana de recidiva de una enfermedad cancerosa en un sujeto tratado para una enfermedad cancerosa que comprende las etapas de:
-
poner un contacto un ligando de afinidad por la proteína timidina cinasa 1 (TK1) con una muestra de fluido corporal de dicho sujeto, dicho ligando se une específicamente a dicha proteína TK1;
-
determinar una cantidad de ligando que se une a dicha proteína TK1 y/o complejo que comprende proteína TK1 en dicha muestra; y
-
estimar una probabilidad de futura recidiva de cáncer después de al menos un año tras el tratamiento contra el cáncer basándose en dicha cantidad determinada de unión de ligando y sin la determinación de un nivel de actividad enzimática de TK1.
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Es un objetivo particular de la presente invención proporcionar la predicción temprana de aparición o reaparición local y/o metastásica de tumores en un sujeto después de al menos un año tras el tratamiento contra el cáncer.
Estos y otros objetivos se cumplen mediante la invención tal como se define mediante las reivindicaciones de patente adjuntas.
En resumen, la presente invención implica la predicción temprana de, o la estimación de la probabilidad de recidiva de una enfermedad cancerosa en un sujeto diagnosticado de cáncer y tratado contra el cáncer. La invención se basa en determinar un nivel de respuesta de unión de un material inmunorreactivo (MI) que comprende proteína timidina cinasa 1 (TK1) en una muestra, preferiblemente una muestra de fluido corporal, por ejemplo muestra de suero sanguíneo, de un sujeto, preferiblemente un sujeto mamífero y más preferiblemente un sujeto humano, en el diagnóstico del cáncer y/o tras el tratamiento contra el cáncer (por ejemplo tras un tratamiento mediante operación, quimioterapia, terapia endocrina, radioterapia y/o terapia inmunológica). Entonces se estima la probabilidad de reaparición tumoral basándose directamente en este nivel de respuesta de unión del MI determinado.
El nivel de respuesta de unión del MI determinado puede determinarse en una realización para el sujeto en múltiples ocasiones en el tiempo. Preferiblemente, una primera toma de muestra y determinación de respuesta de unión se lleva a cabo no más tarde de un mes tras el inicio del tratamiento contra el cáncer, más preferiblemente antes de la finalización del tratamiento, tal como antes de comenzar el tratamiento contra el cáncer en el sujeto. Preferiblemente, se toma una segunda muestra del sujeto y se analiza para determinar el nivel de respuesta de unión del MI tras comenzar el tratamiento, tal como en el plazo del primer año después del tratamiento contra el cáncer. Más preferiblemente, se determina el segundo nivel de respuesta de unión del MI en el sujeto entre un mes hasta un año, tal como entre un mes y seis meses, o aproximadamente 3 meses, después de que haya comenzado o ha finalizado el tratamiento. En cualquier caso, preferiblemente no se determina el segundo nivel de respuesta de unión del MI hasta que al menos ha transcurrido una semana, por ejemplo algunas semanas, un mes, o múltiples meses, desde la determinación del primer nivel de respuesta de unión del MI en el mismo sujeto.
El sujeto tiene una alta probabilidad de recidiva tumoral si el segundo nivel de respuesta de unión del MI es igual a o supera el primer nivel de respuesta de unión del MI, o expresado de otra manera, la probabilidad de recidiva tumoral es alta si la razón del segundo (posterior) nivel de respuesta de unión del MI y el primer nivel de respuesta de unión del MI supera, o es igual a, uno.
Alternativamente, el nivel de respuesta de unión del MI determinado en el sujeto podría compararse con un nivel de respuesta de unión del MI normal, tal como se determina a partir de muestras de fluidos corporales de sujetos sanos, mediante lo cual se predice la aparición de tumor local y/o metastásico basándose en esta comparación.
Preferiblemente, el nivel de respuesta de unión del MI se determina poniendo en contacto la muestra de fluido corporal (por ejemplo, suero) con un ligando que tiene afinidad por la proteína TK1. En una realización preferida de la invención el ligando es un anticuerpo que se une específicamente a un epítopo expuesto en la superficie de la proteína TK1, preferiblemente a una secuencia inmunogénica definida de la parte C-terminal de la proteína TK1. Preferiblemente, este ligando debe poder detectar formas tanto enzimáticamente activas como inactivas de la proteína TK1 y posiblemente también la proteína TK1 complejada con otras macromoléculas. Entonces la cantidad de unión de anticuerpo se mide mediante un método de ensayo sensible y adecuado, preferiblemente el sistema de ensayo de transferencia puntual con quimioluminiscencia mejorada (ECL) y más preferiblemente un sistema de ensayo de transferencia puntual con ECL de este tipo usando membranas de nitrocelulosa.
A partir de este nivel de respuesta de unión del MI medido puede determinarse una concentración del MI usando un patrón, por ejemplo TK1 humana recombinante (rhTK1). En tal caso, se mide la respuesta de unión usando un anticuerpo anti-TK1 en muestras con diferentes concentraciones conocidas de rhTK1 y puede generarse una curva patrón de respuesta de unión frente a concentración. Entonces una medición del nivel de respuesta de unión del MI posterior de un sujeto tratado para el cáncer puede relacionarse con una concentración del MI correspondiente usando la curva patrón. Entonces la estimación de la probabilidad de reaparición se basa directamente en esta concentración del MI.
Esto significa que en la presente invención, la recidiva de una enfermedad cancerosa en un sujeto tratado contra la enfermedad se determina basándose en el nivel de respuesta o nivel de concentración de unión de la proteína TK1 que comprende material inmunorreactivo. Esto contrasta claramente con las técnicas de la técnica anterior que usan la actividad de la timidina cinasa para la predicción de la reaparición tumoral.
Determinando el nivel de respuesta de unión del MI en un paciente en el plazo de los primeros pocos meses tras el diagnostico y tratamiento del cáncer, es posible detectar e identificar aquellos pacientes que corren un alto riesgo de una recidiva de enfermedad cancerosa posterior (en el plazo de 1 a 3 años, posiblemente hasta 10 años, tras el tratamiento). Por tanto, la invención permite la detección temprana de aquellos pacientes que tienen un alto y bajo riesgo de recidiva tumoral, lo que permite tratamientos diferenciales y aumenta las posibilidades de éxito del tratamiento y puede prolongar la supervivencia del paciente, pero también evita tratamientos ineficaces y por tanto innecesarios.
\newpage
La proteína TK1 que comprende material inmunorreactivo incluye la proteína TK1, por ejemplo proteína TK1 sérica, una forma monomérica y/o polimérica (por ejemplo dimérica, tetramérica) enzimáticamente activa y/o inactiva de la proteína TK1 y/o la proteína TK1 complejada con otras moléculas, por ejemplo proteínas, tales como inhibidores.
La invención puede ser aplicable a la mayoría de tipos de cánceres y está especialmente adaptada para cánceres con tumores sólidos, tales como cáncer de mama, cáncer gástrico y cáncer de pulmón.
La invención ofrece las siguientes ventajas:
-
Detección temprana de pacientes con cáncer tratados que corren riesgo de recidivas tumorales;
-
Permite aumentar las posibilidades de supervivencia aumentadas y la calidad de vida de los pacientes con cáncer.
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Otras ventajas ofrecidas por la presente invención se apreciarán con la lectura de la descripción más adelante de las realizaciones de la invención.
Breve descripción de los dibujos
La invención junto con los objetivos y ventajas adicionales de la misma, puede entenderse de la mejor manera haciendo referencia a la siguiente descripción tomada junto con los dibujos adjuntos, en los que:
la figura 1 ilustra la correlación entre la actividad enzimática de timidina cinasa sérica (STK) y la concentración de la proteína TK1 que comprende material inmunorreactivo (MI) (STK1) en individuos sanos;
la figura 2 ilustra la concentración del MI (STK1) en suero de individuos sanos y pacientes humanos con diferentes tipos de tumores, en la que A representa leucemias, B representa tumores gástricos, C representa tumores de colon, D representa tumores de recto, E representa tumores de mama, F representa tumores de pulmón, G representa linfomas, H representa hepatomas, I representa tumores cerebrales, J representa otros tipos de tumores malignos, K representa lesiones benignas morfológicas y L representa personas sanas;
la figura 3 ilustra la concentración del MI (STK1) medida mediante inmunotransferencia de tipo Western y transferencia puntual de un paciente con un cáncer gástrico (P3), una transferencia puntual de un individuo sano y de TK1 recombinante humana;
la figura 4 ilustra la correlación entre la concentración del MI (STK1) y la actividad enzimática de STK en pacientes con lesiones benignas y tumores malignos antes del tratamiento contra el cáncer, en la que A representa leucemias, B representa tumores gástricos, C representa tumores de colon, D representa tumores de recto, E representa tumores de pulmón, F representa linfomas, G representa hepatomas, H representa cerebro, I representa tumores de lesiones benignas morfológicas y J representa tumores de mama;
la figura 5 ilustra la incidencia acumulativa de cualquier reaparición en 67 pacientes con cáncer de mama, divididos en tres grupos iguales que representan concentraciones de STK1 relativas de <0,78, 0,78-1,08 y >1,08, tal como se define mediante la concentración de STK1 determinada tres meses tras la cirugía dividida entre la concentración de STK1 correspondiente 21 días tras la cirugía;
la figura 6 es una comparación de la concentración del MI (STK1), la actividad enzimática de STK y la concentración de CA 15-3 en suero 3 meses tras la operación en 37 pacientes con cáncer de mama con (A) y sin (B) recidiva tumoral de cáncer posterior expresada en porcentaje de valores medidos 21 días tras la operación; y
la figura 7 es una ilustración de un diagrama de flujo del método de predicción de recidiva tumoral de la presente invención.
Descripción detallada
A menos que se defina lo contrario, todos los términos técnicos y científicos usados en el presente documento tienen el significado comúnmente entendido por un experto en la técnica a la que pertenece la presente invención. Para claridad de la invención, en el presente documento se usa la siguiente definición.
La "timidina cinasa" (ATP: timidina-5'-fosfotransferasa, EC.2.7.1.21 en el sistema de clasificación de la unión internacional de bioquímica) es una enzima de la ruta de recuperación de pirimidina y cataliza la fosforilación de timidina para dar timidina monofosfato. En células humanas, la TK aparece en dos formas, una forma timidina cinasa 1 (TK1) citoplásmica y una timidina cinasa 2 (TK2) mitocondrial, codificadas por diferentes genes. La "actividad enzimática de TK" se refiere al papel de la TK en catalizar la fosforilación de timidina para dar timidina monofos-
fato.
\newpage
"Material inmunorreactivo (MI) que comprende proteína TK1" se refiere a un material o composición que comprende la proteína TK1. El material MI podría comprender formas tanto enzimáticamente activas como inactivas de la proteína TK1, incluyendo por ejemplo formas de proteína TK1 monoméricas, poliméricas (por ejemplo diméricas, tetraméricas) y/o todas las formas de la proteína TK1. El material también puede incluir también o en su lugar la proteína TK1 (enzimáticamente activa o inactiva) complejada con otras moléculas, incluyendo proteínas y polipéptidos, tales como inhibidores y/o activadores.
Según un aspecto de la presente invención se proporciona un método de predicción temprana de recidiva o reaparición de una enfermedad cancerosa en un sujeto, preferiblemente un sujeto mamífero y más preferiblemente un sujeto humano, tratado contra el cáncer. El método comprende la determinación de un nivel de respuesta de unión de un material inmunorreactivo (MI) que comprende la proteína timidina cinasa 1 (TK1) en una muestra del sujeto. Entonces la probabilidad de aparición o reaparición de un tumor canceroso al menos un año tras el tratamiento contra el cáncer se estima basándose directamente en el nivel de respuesta de unión del MI determinado.
En un aspecto particular de la invención el nivel de respuesta de unión se determina en un material inmunorreactivo que incluye formas tanto enzimáticamente activas como inactivas de la proteína TK1. En una realización de la invención, este nivel de respuesta de unión se expresa como un nivel de concentración del MI en una muestra de un sujeto usando un ligando que tiene afinidad por TK1. Entonces la probabilidad de recidiva del cáncer se estima basándose directamente en el nivel de concentración del MI determinado.
En una realización de la invención se determina el nivel de respuesta de unión del MI para el sujeto en múltiples, es decir al menos dos, ocasiones en el tiempo. Entonces la probabilidad de recidiva de la enfermedad se basa en una comparación de estos al menos dos niveles de respuesta de unión. En una realización preferida de la invención, la primera toma de muestra y la determinación de respuesta de unión se llevan a cabo no más tarde de un mes tras el inicio del tratamiento contra el cáncer, más preferiblemente antes de la finalización del tratamiento, tal como antes de comenzar el tratamiento contra el cáncer en el sujeto o en conexión con el diagnóstico de la enfermedad cancerosa. La al menos segunda muestra se toma preferiblemente del sujeto y se analiza para determinar el nivel de respuesta de unión del MI tras comenzar el tratamiento, tal como en el plazo del primer año después del tratamiento contra el cáncer. Más preferiblemente, se determina el segundo nivel de respuesta de unión del MI en el sujeto entre un mes hasta un año, tal como entre un mes y seis meses, o aproximadamente 3 meses, después de que se haya comenzado o ha finalizado el tratamiento. Preferiblemente, en cada caso, el segundo nivel de respuesta de unión del MI no se determina hasta que ha transcurrido al menos una semana, por ejemplo algunas semanas, un mes, o múltiples meses, desde la determinación del primer nivel de respuesta de unión del MI en el mismo sujeto.
Entonces la predicción de reaparición tumoral se basa en una comparación de los dos niveles de respuesta de unión del MI o mediante la investigación de una cantidad derivada de los mismos. Por ejemplo, el sujeto tiene una alta probabilidad de recidiva de cáncer si el segundo nivel de respuesta de unión del MI es igual a o supera el primer nivel de respuesta de unión del MI, o expresado de otra manera, la probabilidad de recidiva tumoral es alta si la razón del segundo (posterior) nivel de respuesta de unión del MI y el primer nivel de respuesta de unión del MI supera, o es igual a, uno.
Preferiblemente, el nivel de respuesta de unión del MI en el sujeto se determina periódica o intermitentemente en varias ocasiones en el tiempo durante y tras el tratamiento contra el cáncer, por ejemplo tras la operación, tras el inicio del tratamiento con quimioterapia, tras el inicio del tratamiento con terapia endocrina, tras el inicio del tratamiento con radioterapia y/o tras el inicio del tratamiento con terapia inmunológica, en el paciente. Por tanto, el nivel del MI se determina preferiblemente durante los primeros años siguientes, por ejemplo hasta los 5 a 10 años siguientes, después del tratamiento para, tan pronto como sea posible, detectar la evolución de la enfermedad cancerosa en el sujeto. Sin embargo, para la mayoría de tipos de cáncer, y especialmente tipos de cáncer con tumor sólido, probablemente el método de la invención puede detectar cualquier recidiva de cáncer posterior en el plazo de los primeros 6 meses, tal como en el plazo de los primeros 3 meses, después del tratamiento contra el cáncer. Preferiblemente, estos niveles de respuesta de unión posteriores se comparan con los niveles de respuesta de unión correspondientes determinados anteriormente para el mismo sujeto, por ejemplo el primer nivel de respuesta de unión del MI comentado anteriormente.
En otras palabras, la presente invención puede predecir en el plazo de los primeros pocos meses (normalmente 0-6 meses, para algunos cánceres 0-3 meses) después del tratamiento contra el cáncer si un sujeto volverá a tener tumores de nuevo (locales y/o metastásicos). Por tanto, aunque una enfermedad cancerosa reaparecerá primero en el plazo de un par de años tras el tratamiento, la invención puede predecir su recidiva en el plazo de unos pocos meses tras el tratamiento. Por medio de una predicción temprana de este tipo, puede aplicarse tratamiento adicional y/o cambio de la estrategia de tratamiento con el fin de prevenir la aparición de tumor local y/o metastásico predicho. Además, los sujetos que se predice que puedan tener posiblemente una recidiva pueden estar bajo estrecha vigilancia para, tan pronto como sea posible, detectar cualquier tumor nuevo, y así aumentar las posibilidades de supervivencia del sujeto. La identificación de pacientes de bajo riesgo con el mismo ensayo también mejoraría la calidad de vida de los pacientes reduciendo el riesgo de tratamiento excesivo o tratamientos innecesarios.
En otra realización de la invención, se compara el nivel de respuesta de unión del MI determinado con un nivel de respuesta de unión normal, tal como se determina a partir de sujetos sanos libres de tumores. Entonces la estimación de la probabilidad de recidiva de cáncer se basa en esta comparación. Por ejemplo, es posible que la enfermedad experimente recidiva si el nivel del MI determinado es significativamente mayor que el nivel del MI normal. Tal como se observó anteriormente, el nivel de respuesta de unión del MI se determina preferiblemente en múltiples ocasiones diferentes en el tiempo, comenzando por ejemplo desde antes del tratamiento contra el cáncer y continuando durante y tras el tratamiento.
Puede determinarse el nivel de respuesta de unión del MI del sujeto sano o normal (concentración o cantidad) que va a compararse con el nivel del MI medido midiendo el nivel de respuesta de unión del MI en una serie de muestras, preferiblemente muestras de fluidos corporales, por ejemplo muestras de suero sanguíneo, de sujetos sanos. Preferiblemente, estos sujetos sanos no tienen o no han tenido ningún tumor demostrable, es decir no presentan signo clínico alguno de tumor o enfermedad cancerosa. Puede determinarse el nivel de respuesta de unión del MI de estos sujetos control sanos usando los mismos métodos que para la determinación del nivel de respuesta de unión en el sujeto bajo investigación, tal como se comenta con más detalle a continuación. En una realización, el nivel de respuesta de unión del MI normal es el promedio de los niveles de respuesta de unión del MI medidos a partir de las series de muestras de sujetos sanos.
El nivel de concentración del MI en sujetos humanos sanos es de aproximadamente 1 pM o inferior, mientras para pacientes humanos con tumor el nivel aumenta hasta varios cientos de pM. Un nivel de concentración del MI determinado de 2 ó 3 pM o por encima podría determinarse como un nivel anómalo, y por tanto puede corresponder a la estimación de una probabilidad de evolución de enfermedad tumoral. Sin embargo, el nivel de concentración que corresponde a una probabilidad de recidiva de enfermedad cancerosa puede ser diferente para diferentes tipos de tumores y diferentes clases de sujetos.
Los métodos de predicción de la técnica anterior, tal como se muestra a modo de ejemplo por la patente estadounidense n.º 5.698.409, se basan, tal como se mencionó brevemente en la sección de antecedentes, en la medición de la actividad enzimática de TK (y TK1) en muestras de suero. En la patente identificada anteriormente, O'Neil usa anticuerpos monoclonales que se unen a la forma tetramérica de 100 kDa enzimáticamente activa de TK1, probablemente al sitio activo de la forma tetramérica de 100 kDa de TK1, e inhiben la actividad enzimática de TK1. Con el fin de predecir la reaparición de un tumor basándose en la actividad enzimática de TK, O'Neil supone que hay una correlación directa entre la actividad enzimática de TK (suero) y el nivel (concentración) de TK1 que comprende material inmunorreactivo. Tal como se muestra por la presente invención, existe una correlación de este tipo para individuos humanos sanos, para pacientes con determinadas enfermedades no cancerosas, por ejemplo insuficiencia renal, hemorragia e infección pulmonar. También puede encontrarse una correlación entre la actividad sérica de TK y la concentración para algunos tipos de cánceres antes del tratamiento contra el cáncer. Sin embargo, no se ha encontrado una correlación de este tipo durante o, en particular, tras el tratamiento contra el cáncer. Una posible explicación para esta falta de correlación entre la concentración de TK1 sérica (STK1) y la actividad enzimática de TK sérica (STK) en pacientes con cáncer podría ser que la concentración de STK1 y la actividad de STK reflejan diferentes subpoblaciones de timidina cinasa. Además, puede haber factor(es) de regulación en suero que controla(n) la concentración del MI/STK1 y/o la actividad enzimática de STK. Además, también se conoce que la actividad enzimática de TK es muy sensible a cambios en el pH y la temperatura.
Por tanto, los métodos de la técnica anterior que determinan la probabilidad de reaparición tumoral basándose en la medición de la actividad enzimática de STK (es decir basándose en una medida en un dominio de actividad enzimática) tras el tratamiento contra el cáncer, por ejemplo usando los anticuerpos monoclonales dados a conocer en la patente estadounidense n.º 5.698.409, y la suposición de una correlación entre el nivel (concentración) de respuesta de unión de STK1 y la actividad enzimática de STK dan predicciones incorrectas, en particular en casos de tumores sólidos.
Sin embargo, determinando el nivel o la concentración de respuesta de unión del MI (STK1) usando los anticuerpos comentados en esta invención y estimando la evolución de la enfermedad cancerosa basándose directamente en el nivel o la concentración de respuesta de unión medidos (es decir una medida en el dominio de concentración o respuesta de unión), se obtiene una predicción de enfermedad tumoral mucho más precisa.
La predicción de recidiva de cáncer según la presente invención se basa en el nivel (concentración o cantidad) de respuesta de unión del IM, tal como la concentración de la proteína TK1, en una muestra biológica, preferiblemente una muestra de fluido corporal, por ejemplo muestra de suero sanguíneo, de un sujeto. Puede determinarse el nivel de respuesta de unión del MI en la muestra (suero) de varias maneras diferentes conocidas por el experto en la técnica usando diferentes ligandos. En una realización actualmente preferida de la invención, se determina el nivel de respuesta de unión del MI poniendo en contacto la muestra con anticuerpos frente a TK especiales y después midiendo la unión del anticuerpo. Puede medirse esta unión del anticuerpo mediante varios métodos conocidos en la técnica. Entonces el nivel de respuesta de unión del MI se relaciona preferiblemente con un patrón químicamente definido. En una realización actualmente preferida el patrón es TK1 humana, por ejemplo TK1 humana recombinante d(rhTK1) aislada y sustancialmente purificada, que puede preparase tal como se describe por Wang et al. [Wang, Biochemistry, 38:16993, 1999]. Por tanto, el mismo anticuerpo (ligando) anti-TK que se usa en la muestra de un sujeto que va a tratarse para o ya tratado para el cáncer se usa en muestras de prueba que comprenden diferentes concentraciones conocidas de rhTK1. Determinando la unión del anticuerpo en la muestra de prueba respectiva se obtiene una curva patrón de la correlación entre la unión del anticuerpo y el nivel de concentración. Entonces puede determinarse la concentración del MI a partir de la unión del anticuerpo medida y la curva patrón. Una relación alternativa entre el nivel de concentración y nivel de respuesta de unión podría ser una función de mapeo que usa una medida de respuesta de unión del IM determinada como entrada y salidas de un valor de concentración correspondiente. Puede determinarse una función de este tipo usando la curva patrón y/o las muestras de prueba que incluyen rhTK1.
El método de ensayo usado para la unión del anticuerpo tiene que ser lo suficientemente sensible para detectar la baja cantidad de MI en los sujetos, especialmente en sujetos sanos. Preferiblemente, el método de ensayo es lo suficientemente sensible para detectar niveles de concentración del MI de al menos 1 pM, preferiblemente al menos 0,7 pM, más preferiblemente al menos 0,5 pM, tal como al menos 0,3 pM. Un ejemplo de un método de ensayo sensible de este tipo es el ensayo de transferencia puntual con quimioluminiscencia mejorada (ECL). Tal como se conoce en la técnica, el procedimiento del ensayo de transferencia puntual con ECL es sustancialmente igual que para la inmunotransferencia de tipo Western. Básicamente, se aplica suero sanguíneo (u otro fluido corporal) sobre una membrana por ejemplo, una membrana de nitrocelulosa. Tras un bloqueo (opcional), se añaden anticuerpos (anti-TK1) primarios, seguidos por anticuerpos secundarios biotinilados. Después se sumerge la membrana en una disolución tampón con H_{2}O_{2} seguido por la incubación con una disolución tampón con avidina-HRP-estreptavidina (avidina-peroxidasa del rábano-estreptavidina) y/o estreptavidina-HRP. Entonces se detecta la luz mediante por ejemplo, una cámara CCD (dispositivo acoplado cargado) digital o se expone a película de rayos X. El ensayo de transferencia puntual con ECL puede detectar los niveles de concentración de menos de 0,3 pM [He, Internal. J. Biol. Marker, 15:139, 2000].
Otro posible método de ensayo es RIA (radioinmunoanálisis), en el que se marcan anticuerpos (anti-TK1) con un isótopo, por ejemplo ^{125}I. Aunque este método es tan sensible como la transferencia puntual con ECL, el ^{125}I usado es un isótopo inestable con una semivida de algunas semanas. Además, habitualmente se requiere un equipo de detección caro (contador de centelleo \gamma) para la determinación de unión del anticuerpo.
Los anticuerpos usados en el método de ensayo del MI tratado anteriormente podrían ser anticuerpos monoclonales y/o policlonales que se unen específicamente a un epítopo de la proteína TK1, preferiblemente proteína TK1 de sujetos humanos y más preferiblemente formas tanto enzimáticamente activas como inactivas de la proteína TK1 humana. Preferiblemente, se separa el epítopo (físicamente) del sitio activo de la TK1, es decir, los anticuerpos no deben afectar o inhibir sustancialmente la actividad enzimática de TK1 mediante la unión directa al sitio activo. Según la invención, preferiblemente los anticuerpos se unen específicamente a la parte C-terminal de la proteína TK1 y más preferiblemente a la secuencia de la proteína TK1 desde el aminoácido 179 hasta el aminoácido 234, o una parte de la misma, por ejemplo una secuencia desde el aminoácido 195 hasta el aminoácido 225, tal como una secuencia desde el aminoácido 210 hasta el aminoácido 224, o una secuencia polipeptídica que comprende la secuencia de aminoácidos de la proteína TK1 desde el aminoácido 179 hasta el aminoácido 234. Ejemplos de tales anticuerpos se describen en la patente estadounidense n.º 6.083.707, cuya enseñanza se incorpora en el presente documento como referencia en la presente invención. En esta patente estadounidense, se producen anticuerpos policlonales frente a una secuencia larga de 15 aminoácidos (KPGEAVAARKLFAPQ, SEQ ID NO: 1 o acetil-KPGEAVAARKLFAPQ, SEQ ID NO: 2) del extremo C-terminal de TK1. Los anticuerpos de la invención se generan, por tanto, frente a partes expuestas de la superficie (epítopos) de la proteína TK1. Usando un anticuerpo frente a una de las secuencias comentadas anteriormente, podría determinarse el nivel de respuesta de unión y nivel de concentración de la proteína TK1 y posiblemente de la TK1 complejada con otras moléculas. Esto significa que los anticuerpos de la invención determinan preferiblemente una cantidad total de la proteína TK1, incluyendo formas enzimáticamente activas e inactivas de la proteína TK1 y la proteína TK1 complejada con otras moléculas, que incluyen los epítopos por los que los anticuerpos tienen afinidad.
Agentes de bloqueo en determinados sueros pueden prevenir la unión de los anticuerpos a la proteína TK1, por ejemplo, bloqueando el epítopo al que se une el anticuerpo y/o cambiando, tras la unión a la proteína TK1 de modo que el epítopo que se une al anticuerpo se mueve desde una ubicación accesible (superficie) hasta una ubicación en la que es inaccesible para el anticuerpo.
La presente invención es aplicable en varios tipos diferentes de cánceres, incluyendo, pero sin limitarse a, sarcomas y carcinomas humanos, por ejemplo fibrosarcoma, mixosarcoma, liposarcoma, condrosarcoma, sarcoma osteogénico, cordoma, angiosarcoma, endoteliosarcoma, linfangiosarcoma, linfangioedoteliosarcoma, sinovioma, mesotelioma, tumor de Ewing, leiomiosarcoma, rabdomiosarcoma, carcinoma de colon, cáncer pancreático, cáncer de mama, cáncer de ovario, cáncer de próstata, carcinoma de células escamosas, carcinoma de células basales, adenocarcinoma, carcinoma de glándulas sudoríparas, carcinoma de glándulas sebáceas, carcinoma papilar, adenocarcinomas papilares, cistadenocarcinoma, carcinoma medular, carcinoma broncogénico, carcinoma de células renales, hepatoma, carcinoma del conducto biliar, coriocarcinoma, seminoma, carcinoma embrionario, tumor de Wilms, cáncer cervicouterino, tumor testicular, carcinoma pulmonar, carcinoma pulmonar de células pequeñas, carcinoma de vejiga, carcinoma epitelial, glioma, astrocitoma, meduloblastoma, craneofaringioma, ependimoma, hemangioblastoma, oligodendroglioma, melanoma, neuroblastoma y retinoblastoma, leucemias, por ejemplo leucemia linfocítica aguda (ALL), y leucemia mielógena aguda (mieloblástica, promielocítica, mielomonocítica, monocítica y eritroleucemia), leucemias crónicas (leucemia mielógena crónica, leucemia granulocítica crónica y leucemia linfocítica crónica), policitemia verdadera, linfoma (enfermedad de Hodgkin y enfermedad de no Hodgkin), mieloma múltiple, macroglobulinemia de Waldenström y enfermedad de cadenas pesadas. La presente invención es aplicable en particular en la predicción de la evolución de cánceres con tumor sólido, por ejemplo cáncer de mama y gástrico.
El método de predicción y monitorización tumoral de la invención se resume en la figura 7. Comenzando con la etapa S1, se determina un nivel de respuesta de unión de un material inmunorreactivo (MI) que comprende la proteína TK1 (enzimáticamente activa e inactiva) en una muestra, preferiblemente muestra de fluido corporal, por ejemplo muestra de suero sanguíneo, de un sujeto, preferiblemente un sujeto mamífero y más preferiblemente un sujeto humano, tratado para el cáncer. Obsérvese que el tratamiento contra el cáncer no tiene que finalizarse cuando se realiza la toma de muestra del sujeto. Se determina el nivel de respuesta de unión del MI usando un ligando, preferiblemente un anticuerpo que se une específicamente a la proteína TK1, más preferiblemente un anticuerpo que se une específicamente a la parte C-terminal de la proteína TK1. En la etapa S2, la estimación de la probabilidad de recidiva de la enfermedad cancerosa, por ejemplo tal como se manifiesta mediante la aparición o reaparición del tumor local y/o metastásico, se realiza basándose directamente en el nivel de respuesta de unión del MI determinado. Esta probabilidad puede estimarse basándose en una comparación del nivel de respuesta de unión del MI determinado con un nivel de respuesta de unión del MI tal como se determinó anteriormente para el sujeto o de sujetos sanos.
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Ejemplos Ensayo de transferencia puntual con ECL
El procedimiento del ensayo de transferencia puntual con ECL es el mismo que para la inmunotransferencia de tipo Western, con una ligera modificación [He, Internal. J. Biol. Marker, 15:139, 2000]. Se aplicaron directamente tres \mul de suero de sangre venosa de tubos sanguíneos no heparinizados sobre una membrana de nitrocelulosa (HybandTM-C, Amersham). Se tomaron las muestras de sangre por la mañana entre las 7-9 a.m. de personas que no habían tomado el desayuno. Puede almacenarse la sangre venosa extraída en los tubos no heparinizados durante al menos 24 horas a +4ºC, o centrifugarse a 1.500 g durante 5 min. y después almacenarse a -20ºC durante 5 años y a -80ºC durante más de 10 años. Se usó TK1 humana recombinante (rhTK1) como un patrón, tal como se describió inicialmente por He, et al. [He, Europ. J. Cell Biol., 70:117, 1996] y se modificó tal como se describió por Wang, et al. [Wang, Biochemistry, 38:16993, 1999]. Se bloqueó la membrana empleada en tampón TBS (solución salina tamponada con tris) con leche desnatada con un 10% de grasa durante 4 horas y después se añadió anticuerpo (anti-TK1) primario y se incubó a +4ºC durante la noche o a temperatura ambiente durante dos horas. Tras la incubación con un anticuerpo secundario biotinilado durante una hora a temperatura ambiente, se sumergió la membrana en tampón TBS con H_{2}O_{2} al 3% durante 5 min. Entonces se incubó la membrana en tampón TBS con avidina-HRP-estreptavidina y se expuso a una película de rayos X. Se determinó la intensidad de un único punto sobre la película mediante un densitómetro láser. A partir de la intensidad de la rhTK1 de concentraciones conocidas, se volvió a calcular la intensidad del MI y se expresó como pM.
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Caracterización de anticuerpos anti-TK1
Se caracterizaron anticuerpos anti-TK1 mediante inmunotransferencia de tipo Western, isoelectroenfoque, inmunoprecipitación e inmunohistoquímica. Los resultados se resumen en la tabla 1 a continuación. Según las inmunotransferencias de tipo Western, los anticuerpos monoclonales frente a la secuencia peptídica de 15 aminoácidos de longitud (SEQ ID NO: 2) (mAb1D11 y mAb1E3) o rhTK1 (mAb26-3 y mAb26-5) reconocen la forma nativa de la proteína TK1 en células tumorales humanas, así como la proteína TK1 en suero de pacientes con tumores malignos, pero no la subunidad 25 desnaturalizada de la proteína TK1. No se encontró ninguna banda en el gel de electroforesis en las células TK1-negativas, en suero de personas sanas o en presencia de antígeno de competición. Las pruebas de inmunoprecipitación indicaron que mAb1E3, aunque no se dirige al sitio activo de la proteína TK1, afecta a la actividad enzimática de TK1. mAb26-3+5 y mAb1D11 inhiben la actividad de TK1 en el sobrenadante constituyendo un inmunocomplejo con la proteína TK1, que se recoge en el sedimento. El isoelectroenfoque mostró que la proteína TK1 tiene un valor pI de \approx7,0, cuando se somete a transferencia con mAb26-3+5. Sin embargo, no se detectó ninguna banda cuando se sometió a transferencia con mAb1D11 y mAb1E3. El anticuerpo policlonal de conejo anti-TK1 (AcP) reconoce la subunidad de 25 kDa en electroforesis en gel de SDS y proporciona un valor pI de TK1 de \approx8,3. El anticuerpo IgY de pollo anti-TK1 (SSTK Biotech Inc., China), dirigido frente a una secuencia de 31 aminoácidos o de los aminoácidos 194 a 225 de la proteína TK1, reconoce tanto la forma nativa de TK1 y la subunidad de 25 kDa y proporciona un valor pI de \approx8,3. Finalmente, los anticuerpos monoclonales (AcM, EE.UU.) frente a la proteína TK1 completa (QED Bioscience Inc, San Diego, EE.UU.) reconocen la subunidad de 25 kDa de TK1.
1
Pueden usarse todos los anticuerpos comentados anteriormente y presentados en la tabla 1 para tinción inmunocitoquímica, tanto en líneas celulares como en material incrustado en parafina. Se ubicó la reacción del anticuerpo anti-TK1 en el citoplasma de células tumorales. Se encontró nada o muy poco de tinción en células mutantes que carecen de la actividad enzimática de TK1, así como en linfocitos en reposo. Por tanto, pueden usarse los anticuerpos anti-TK1 sometidos a prueba para determinar el nivel y la concentración de respuesta de unión del MI. Estos anticuerpos también reconocen diferentes epítopos en la proteína TK1, que identifican probablemente diversas subpoblaciones de TK1.
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Concentración del MI y actividad enzimática de STK en sujetos sanos
La concentración del MI (STK1) tal como se midió mediante el inmunoensayo de transferencia puntual con ECL comentado anteriormente se comparó con la actividad enzimática de STK tal como se determinó mediante el ensayo RIA en personas sanas y los resultados se presentan en la figura 1 y la tabla 2. Tanto la concentración del MI como la actividad enzimática de STK fueron bajas (inferior a 2 pM y 2 U/l, respectivamente). Hubo una correlación significativa entre la concentración del MI y la actividad enzimática de STK (r = 0,67, p<0,01) para estas personas sanas.
También se determinaron la concentración del MI y la actividad de STK en pacientes con enfermedades no cancerosas. En seis de 19 de estos pacientes con insuficiencia renal, hemorragia, cirrosis de hígado e infección pulmonar y enfermedades no infecciosas, se elevaron la concentración del MI y la actividad de STK 1,6 y 1,8 veces, respectivamente, en comparación con los controles sanos. En un caso de hemorragia y un caso de cirrosis hepática, la concentración del MI era 5 veces mayor y la actividad de STK 2-4 veces por encima de los valores de corte de 2 pM y 2,4 U/l, respectivamente. Hubo una correlación significativa entre la concentración del MI (STK1) y la actividad de STK en pacientes con estos tipos de enfermedades no cancerosas (tabla 2).
En la tabla 2, la correlación y sus valores de significación se basan en coeficientes de correlación de Pearson.
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TABLA 2
2
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Concentración del MI y actividad de STK en pacientes con tumor antes del tratamiento
Se determinaron las concentraciones del MI (STK1) de 752 pacientes con tumor con 9 tipos diferentes de tumores malignos mediante el inmunoensayo de transferencia puntual con ECL y se encontró que aumentaron hasta 200 veces, en comparación con las personas sanas. También se midieron las concentraciones del MI en suero de pacientes con lesiones benignas morfológicas. Los resultados de las concentraciones medidas se presentan en la figura 2, en la que A representa leucemias, B representa tumores gástricos, C representa tumores de colon, D representa tumores de recto, E representa tumores de mama, F representa tumores de pulmón, G representa linfomas, H representa hepatomas, I representa tumores de cerebro, J representa otros tipos de tumores malignos, K representa lesiones benignas morfológicas y L representa personas sanas. En los pacientes con tumores malignos la concentración del MI se encontró desde valores casi normales (punto de corte 2 pM) (29/752) hasta 100 pM (711/752), y en algunos casos hasta 200 pM (13/752). Por tanto, aproximadamente el 95 por ciento de los pacientes con tumor maligno muestran concentraciones del MI por encima de un valor de corte del MI de 2 pM.
También se determinó la actividad enzimática de STK en paralelo en 264 pacientes con tumor, lesiones benignas, enfermedades no cancerosas y personas sanas. Mientras que la concentración del MI variaba extensamente entre los diversos pacientes, la actividad de STK sólo mostró una variación limitada. En lesiones benignas, leucemia, cáncer de mama y cáncer gástrico, se encontró correlación significativa entre la concentración del MI y la actividad de STK para los pacientes antes de cualquier tratamiento contra el cáncer (véase la tabla 2). Sin embargo, no se encontró ninguna correlación para la mayoría de los tipos de tumores investigados en los individuos no tratados, véase la figura 4.
También se investigó la concentración del MI (STK1) en 68 pacientes preoperatorios con cáncer del tubo gastrointestinal con respecto a la presencia o ausencia de metástasis (sin metástasis (M0) n=46, y metástasis (M1) n=22) y el grado de diferenciación (diferenciación alta o moderada alta n=56, y diferenciación baja n= 12) según directrices expuestas en el TNM clínico (UICC, quinta edición, 1997). Los resultados se resumen en la tabla 3. Las concentraciones del MI fueron 4,5 veces superiores en los pacientes con metástasis (M1), en comparación con pacientes sin metástasis (M0) (p<0,01). La concentración en los pacientes con tumores diferenciados de manera baja, también era superior, en comparación con pacientes con tumores diferenciados altamente/de manera moderadamente alta, aunque no significativamente diferente (p>0,05).
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TABLA 3
3
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Cáncer gástrico
Se determinaron las concentraciones del MI (STK1) y actividades enzimáticas de STK en 43 pacientes con cáncer gástrico (CG) por medio del inmunoensayo de transferencia puntual con ECL y mediante el ensayo de actividad RIA, respectivamente. La figura 3 ilustra una inmunotransferencia de tipo Western y transferencia puntual de un ejemplo de un paciente con tumor (P3), una transferencia puntual de un individuo sano (sano) y de diferentes concentraciones de TK1 recombinante humana (rhTK1). En la tabla 4 se presentan la concentración de STK1 y los valores de actividad de STK determinados de pacientes preoperatorios. La concentración del MI y la actividad de STK se elevaron significativamente en los pacientes con tumor antes de la operación.
TABLA 4
4
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Treinta y cinco días tras la operación las concentraciones del MI disminuyeron significativamente en aproximadamente la mitad en casos libres de tumor, (p = 0,0106), mientras que las actividades enzimáticas de STK no lo hicieron. En los pacientes con metástasis (M1), la concentración del MI aumentó hasta el 173%, 35 tras la operación. No se observó tal aumento en la actividad enzimática de STK, véase la tabla 5. La concentración del MI no modificada en pacientes M0 en el día 7 tras la operación se debe en parte a un aumento en la concentración del MI en conexión con el traumatismo de la operación (datos no mostrados).
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TABLA 5
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Como es evidente a partir de las tablas 4 y 5, las concentraciones del MI pueden usarse para monitorizar los resultados del tratamiento en cáncer gástrico, en contraposición a la actividad enzimática de STK. Además, el nivel de concentración del MI, pero no la actividad de STK, puede detectar recidiva de la enfermedad cancerosa.
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Leucemias
Se determinaron la concentración del MI (STK1) tal como se midió mediante el inmunoensayo de transferencia puntual con ECL y las actividades enzimáticas de STK medidas mediante un ensayo RIA en 24 pacientes con leucemia. Hubo una correlación significativa entre estos dos parámetros en los pacientes antes de comenzar el tratamiento (r = 0,44), véase el diagrama A en la figura 4.
De estos 24 pacientes se siguió a 6 durante y tras el tratamiento. Hubo una reducción en la concentración del MI en los pacientes que recibieron quimioterapia. Cuando se terminó la quimioterapia, aumentó la concentración del MI. La actividad enzimática de STK aún era alta tras comenzar de la terapia, lo que indica que la concentración del MI es un ensayo más fiable para predecir el resultado del tratamiento en comparación con la actividad de STK.
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Cáncer de mama
Las concentraciones del MI (STK1) en suero en una cohorte de 120 pacientes con cáncer de mama, incluidos en un ensayo clínico controlado de terapia endocrina adyuvante, se determinaron en 67 de estos pacientes tres meses tras la operación, usando el anticuerpo IgY de pollo anti-TK1 (véase la tabla 1). La concentración del MI a los tres meses se relacionó con la obtenida a los 21 días tras la operación. Doce pacientes desarrollaron enfermedad cancerosa metastásica distante y 7 tumores locorregionales como el primer acontecimiento durante un período de seguimiento medio de 11,6 años.
Se subdividieron los 67 pacientes en tres grupos de pacientes de igual tamaño con unas concentraciones del MI relativas de <0,78, 0,78-1,08 o > 1,08, tal como se determinó dividiendo la concentración del MI a los tres meses tras la cirugía entre la concentración del MI correspondiente 21 días tras la operación. Un análisis multivariado de pacientes con cualquier reaparición tumoral (distante o locorregional), considerando el estado nodular y ER, tamaño del tumor, tratamiento endocrino y edad, mostró que los pacientes con una concentración del MI relativa > 1,08 eran significativamente diferentes estadísticamente a los pacientes que tienen una concentración del MI relativa de <0,78 (p=0,004). La razón de tasa de riesgo de desarrollar cualquier reaparición en los pacientes con una concentración del MI relativa > 1,08 era aproximadamente 6-7 veces superior que en pacientes con las concentraciones relativas < 0,78.
TABLA 6
7
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Las tasas de incidencia acumulativa estimada de cualquier reaparición a los 5 años fueron 0,09 (IC del 95%: 0,02-0,34), 0,23 (IC del 95%: 0,11-0,49) y 0,48 (IC del 95%: 0,31-0,73) para las concentraciones de STK1 relativas <0,78, 0,78-1,08 y >1,08, respectivamente, véase la figura 5. Por tanto, una alta concentración del MI a los 3 meses tras el tratamiento contra el cáncer, tal como se representa por el grupo > 1,08, es una clara indicación de una alta probabilidad de reaparición tumoral (locorregional o distante).
Se determinaron la concentración del MI (STK1) y la actividad enzimática de STK en 37 de los pacientes. Estos resultados también se compararon con determinaciones de CA 15-3, que se consideran "el marcador de oro" dentro del campo de los marcadores tumorales. La figura 6 ilustra la concentración del MI determinada, la actividad de STK y la concentración de CA 15-3 a los 3 meses tras la operación expresadas como porcentaje de valores correspondientes 21 días tras la operación. En 15 pacientes (A) hubo una recidiva de tumor en el plazo de 1 a 5 años tras la operación, mientras que no hubo ninguna recidiva tumoral en 22 pacientes (B). Tal como se muestra en la figura, ya a los 3 meses tras la operación la concentración del MI era marcadamente superior en un 50-60% de los pacientes (A) que los tumores desarrollados de nuevo después de 1 a 5 años. Sin embargo, no hubo ninguna diferencia en las actividades de STK o los valores de CA 15-3 en los pacientes con (A) o sin (B) cualquier tumor recurrente. La concentración del MI también predijo un 25-30% de los pacientes (B) que posteriormente no tuvieron enfermedad tumoral recurrente.
Por tanto, se concluye que existe una tendencia significativa hacia concentraciones del MI relativas superiores en pacientes que desarrollan enfermedad cancerosa recurrente locorregional y/o distante, durante el período de seguimiento de 11,6 años. Puede usarse tal información para evitar, prolongar o cambiar la terapia adyuvante debido a una evaluación de riesgo mejorada.
Se entenderá por un experto en la técnica que pueden realizarse diversas modificaciones y cambios a la presente invención sin apartarse del alcance de la misma, que se define mediante las reivindicaciones adjuntas.
<110> xi Bao Research AB
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<120> Predicción de la evolución del cáncer
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<130> P377PC00
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<150> US 60/471.245
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<151> 16-05-2003
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<160> 2
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<170> PatentIn version 3.1
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<210> 1
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<211> 15
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<300>
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<302> Timidina cinasa TK1, péptido, anticuerpos correspondientes y uso de de los mismos en la determinación de la proliferación tumoral
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<309>
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<310> US 6.083.707
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<311> 21-04-1995
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<312> 02-11-1995
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<313> (1)..(15)
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<400> 1
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100
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<210> 2
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<211> 15
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> 15 aminoácidos del extremo C-terminal de TK1 de humana con un grupo acetilo unido al aminoácido 1.
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<220>
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<221> MISC-FEATURE
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<222> (1)..(1)
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<223> Acetil-Lisina
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<300>
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<302> Timidina cinasa TK1, péptido, anticuerpos correspondientes y uso de los mismos en la determinación de la proliferación tumoral
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<309>
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<310> US 6.083.707
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<311> 21-04-1995
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<313> (1)..(15)
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<400> 2
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9

Claims (13)

1. Método para predecir la recidiva de cáncer en un sujeto tratado para una enfermedad cancerosa que comprende las etapas de:
-
poner en contacto un ligando de afinidad por la proteína timidina cinasa 1 (TK1) con una muestra de fluido corporal de dicho sujeto, dicho ligando se une específicamente a dicha proteína TK1;
-
determinar una cantidad de ligando que se une a dicha proteína TK1 y/o a un complejo que comprende la proteína TK1 en dicha muestra; y
-
estimar una probabilidad de futura recidiva de cáncer después de al menos un año tras el tratamiento contra el cáncer basándose en dicha cantidad determinada de unión de ligando y sin determinación de un nivel de actividad enzimática de TK1.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Método según la reivindicación 1, que comprende además las etapas de:
-
determinar una primera cantidad de unión de ligando en dicho sujeto no más tarde de un mes tras el inicio de dicho tratamiento contra el cáncer; y
-
determinar una segunda cantidad de unión de ligando en dicho sujeto tras el inicio de dicho tratamiento contra el cáncer, en el que dicha etapa de estimación comprende estimar dicha probabilidad de futura recidiva de cáncer basándose en dichas primera y segunda cantidades de unión de ligando.
\vskip1.000000\baselineskip
3. Método según la reivindicación 2, que comprende además predecir una futura recidiva de cáncer si una razón de dicha segunda cantidad de unión de ligando y dicha primera cantidad de unión de ligando supera uno.
4. Método según la reivindicación 2 ó 3, en el que dicha primera cantidad de unión de ligando se determina en dicho sujeto 21 días tras dicho tratamiento contra el cáncer.
5. Método según cualquiera de las reivindicaciones 2 a 4, en el que dicha segunda cantidad de unión de ligando se determina en dicho sujeto en el plazo de uno a seis meses después de dicho tratamiento contra el cáncer.
6. Método según la reivindicación 5, en el que dicha segunda cantidad de unión de ligando se determina en dicho sujeto aproximadamente 3 meses después de dicho tratamiento contra el cáncer.
7. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, que comprende además las etapas de:
-
generar una relación entre una cantidad de unión de ligando y un nivel de concentración de dicha proteína TK1 y/o dicho complejo que comprende la proteína TK1 usando TK1 recombinante; y
-
determinar un nivel de concentración a partir de dicha cantidad de unión de ligando y dicha relación generada, en el que dicha etapa de estimación comprende estimar dicha probabilidad de futura recidiva de cáncer basándose en dicho nivel de concentración determinado.
\vskip1.000000\baselineskip
8. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en el que dicho ligando es un anticuerpo que se une específicamente a la parte C-terminal de TK1.
9. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, en el que dicho ligando es un anticuerpo que se produce frente a una secuencia peptídica seleccionada de:
-
secuencia de aminoácidos según la SEQ ID NO: 1; y
-
secuencia de aminoácidos según la SEQ ID NO: 2.
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10. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en el que dicha etapa de determinación de la unión de ligando comprende la etapa de medir dicha unión de ligando mediante un inmunoensayo de transferencia puntual con quimioluminiscencia mejorada (ECL).
11. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10, en el que dicha enfermedad cancerosa es una enfermedad cancerosa de tumor sólido.
\newpage
12. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, en el que dicha probabilidad de futura recidiva de cáncer se estima basándose directamente en dicha cantidad determinada de unión de ligando.
13. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12, en el que dicho complejo que comprende la proteína TK1 es un complejo de dicha proteína TK1 y una proteína o polipéptido, tal como un inhibidor o activador de dicha proteína TK1.
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