ES2346640T3 - Acido l-nucleico modificado. - Google Patents
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Abstract
Un ácido L-nucleico modificado, que comprende un resto de ácido L-nucleico y un resto diferente de ácido L-nucleico, en el que el resto de ácido L-nucleico está conjugado con el resto diferente de ácido L-nucleico, y la conjugación del resto de ácido L-nucleico con el resto diferente de ácido L-nucleico da lugar a una excreción retardada de un organismo comparada con un ácido L-nucleico que comprende sólo el resto de ácido L-nucleico, en el que dicho resto de ácido L-nucleico es un spiegelmer y el resto diferente de ácido L-nucleico se selecciona del grupo que consiste en poli(etilen)glicol lineal, poli(etilen)glicol ramificado, hidroxietil almidón, péptidos, proteínas, polisacáridos, esteroles, polioxipropileno, polioxiamidato, poli(2-hidroxietil)-L-glutamina y polietilen glicol preciso.
Description
Ácido L-nucléico modificado.
La presente invención se refiere a ácidos
L-nucleicos modificados, a su uso, así como a
métodos para su preparación.
Además del uso de moléculas orgánicas
comparativamente pequeñas, el desarrollo de nuevos conceptos
terapéuticos se basa de manera creciente en anticuerpos
monoclonales, péptidos y ácidos nucleicos funcionales, es decir,
tal como ácidos nucleicos, que se unen específicamente a una
estructura diana. Los exponentes típicos de estos ácidos nucleicos
funcionales son los denominados aptámeros, que ya se han
desarrollado frente a una multitud de biomoléculas diferentes. Por
lo tanto, partiendo de una biblioteca de ácidos
D-nucleicos, se aíslan una o más moléculas de ácido
nucleico, los denominados aptámeros, que se distinguen por una
afinidad particularmente alta frente a su estructura diana, en
varias etapas por selección in vitro. Los métodos para la
preparación de dichos aptámeros se describen, por ejemplo, en la
solicitud de patente Europea EP 0 533 838.
En farmacología, el problema de estabilidad y
disponibilidad biológica, expresado como el tiempo medio biológico
de los agentes farmacéuticamente activos administrados se conoce
suficientemente. Las estrategias para lograr un tiempo medio
biológico que permita el efecto óptimo de las sustancias
farmacéuticamente activas administradas se concentran por una parte
en una modificación apropiada de los agentes farmacéuticamente
activos y por otra parte en el desarrollo de formas apropiadas de
administración. En el primer caso, existen limitaciones
considerables, de manera que debe asegurarse que el compuesto que
tiene un tiempo medio biológico incrementado, es decir, tiempo de
retención en el organismo que se va a tratar, no pierda sus
propiedades farmacológicas, en otras palabras su eficacia así como
causar los menores efectos secundarios posibles.
Además de los aptámeros mencionados
anteriormente, existe una forma adicional de ácidos nucleicos
funcionales en los denominados spiegelmer. Los spiegelmer se unen
también específicamente a una secuencia diana, por la que se
selecciona frente a la forma enantiomérica de la diana usando una
biblioteca de ácidos D-nucleicos, y después los
ácidos D-nucleicos que se unen a él se preparan como
ácidos L-nucleicos, y como resultado de la
reciprocidad quiral éstos son capaces de unirse a la diana verdadera
y no a la forma enantiomérica de ésta usada para el proceso de
selección. Los métodos para la preparación de dichos spiegelmer se
describen, por ejemplo, en la solicitud de patente internacional WO
98/08856.
Desde un punto de vista puramente químico, los
spiegelmer son ácidos L-nucleicos, típicamente
L-oligonucleótidos, que virtualmente no pueden ser
degradados por las enzimas naturales como resultado de su ensamblaje
a partir de L-nucleótidos. Además de la
especificidad de diana, esta característica los cualifica para
usarlos en áreas muy diferentes, tales como p. ej. análisis de
muestras biológicas, diagnóstico y terapia.
De manera similar a otros compuestos químicos,
que tienen aplicaciones en diagnóstico así como en terapia,
particularmente aquellos que se aplican en un organismo, existe por
lo tanto una necesidad de spiegelmer que conviertan estos en una
forma que permita que los spiegelmer estén presentes y sean eficaces
en un organismo durante un periodo de tiempo largo. Por esto, es un
objeto adicional subyacente a la presente invención que la
característica de especificidad de la molécula diana para los
spiegelmer no se vea influida por la modificación.
Según la invención, el objeto se resuelve en un
primer aspecto por un ácido L-nucleico que comprende
un resto de ácido L-nucleico y un resto diferente
de ácido L-nucleico, y la conjugación del resto de
ácido L-nucleico con el resto diferente de ácido
L-nucleico da lugar a una excreción del organismo y
aclaramiento renal retardados, respectivamente, comparado con un
ácido L-nucleico que comprende sólo el resto de
ácido L-nucleico, en el que dicho resto de ácido
L-nucleico es un spiegelmer y el resto diferente de
ácido nucleico se selecciona del grupo que comprende
poli(etilen)glicol lineal,
poli(etilen)glicol ramificado, hidroxietil almidón,
péptidos, proteínas, polisacáridos, esteroles, polioxipropileno,
polioxiamidato,
poli(2-hidroxietil)-L-glutamina
y polietilen glicol preciso.
En un segundo aspecto, el objeto que subyace a
la invención se resuelve por un ácido L-nucleico
modificado, que comprende un resto de ácido
L-nucleico y un resto diferente de ácido
L-nucleico, en el que la conjugación con el resto
diferente de ácido L-nucleico da lugar a un tiempo
de retención incrementado en un organismo comparado con un ácido
L-nucleico que comprende sólo el resto de ácido
L-nucleico, en el que dicho resto de ácido
L-nucleico es un spiegelmer y el resto diferente de
ácido L-nucleico se selecciona del grupo que
comprende poli(etilen)glicol lineal,
poli(etilen)glicol ramificado, hidroxietil almidón,
péptidos, proteínas, polisacáridos, esteroles, polioxipropileno,
polioxiamidato,
poli(2-hidroxietil)-L-glutamina
y polietilen glicol preciso.
En una realización del primer y segundo aspecto
se pretende que el resto de ácido L-nucleico se
conjugue con el resto diferente de ácido
L-nucleico, en el que el resto distinto de ácido
L-nucleico tiene un peso molecular de más de
aproximadamente 300 Da, preferiblemente más de aproximadamente
20.000 Da, y más preferiblemente más de aproximadamente 40.000
Da.
En una realización adicional de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que el ácido L-nucleico modificado tenga
un peso molecular de aproximadamente 600 a 500.000 Da,
preferiblemente de aproximadamente 10.000 a 400.000 Da, más
preferiblemente de aproximadamente 50.000 a 300.000 Da.
En una realización adicional más de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que el resto de ácido L-nucleico tenga un
peso molecular de 300 a 50.000 Da, preferiblemente de 5.000 a 25.000
Da, más preferiblemente de 7.000 a 15.000 Da.
Finalmente, en una realización de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que el resto diferente de ácido L-nucleico
esté unido directamente o indirectamente al resto de ácido
L-nucleico mediante un grupo funcional del resto de
ácido L-nucleico, que está presente en o unido a uno
de los componentes siguientes del ácido L-nucleico,
en el que el grupo funcional se selecciona del grupo que comprende
fosfatos terminales y no terminales, porciones de azúcar terminales
y no terminales, y bases de purina naturales y no naturales y bases
de pirimidina naturales y no naturales.
En una realización de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que la unión del resto diferente de ácido
L-nucleico con el resto de ácido
L-nucleico ocurra a través del grupo
2'-OH, 3'-OH y/o
5'-OH o un derivado de estos de una o más de las
porciones de azúcar del resto de ácido
L-nucleico.
En una realización más de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que la unión ocurra a través de al menos una de las
posiciones 5 ó 6 de la base de pirimidina.
En una realización adicional más de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que la unión ocurra a través de al menos una de la
posición 8 de las bases de purina.
Finalmente, en una realización de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que la unión ocurra en uno o más de los grupos amino
exocíclicos y/o endocíclicos y/o grupos ceto de las bases de purina
y/o pirimidina y/o posición o posiciones abásicas.
En una realización de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que se disponga un conector entre el resto de ácido
L-nucleico y el resto diferente de ácido
L-nucleico.
En una realización más de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que el resto de ácido L-nucleico comprenda
un ácido nucleico según la SEQ ID NO. 1.
En una realización preferida de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención, se
pretende que el resto de ácido L-nucleico tenga un
6-aminohexilfosfato en el extremo
5'-OH como conector.
En una realización particularmente preferida de
los ácidos L-nucleicos modificados según la
invención, se pretende que se acople polietilenglicol al amino
libre del conector aminohexilfosfato.
En un tercer aspecto el objeto se resuelve
usando los ácidos L-nucleicos según la invención
para la fabricación de un diagnóstico o medio de diagnóstico.
En un cuarto aspecto el objeto subyacente a la
invención se resuelve mediante el uso de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención para la
preparación de un medicamento.
En un quinto aspecto el objeto se resuelve por
un método para la provisión de un ácido L-nucleico
modificado según la invención, que comprende un resto de ácido
L-nucleico y un resto diferente de ácido
L-nucleico, en el que se pretenden las etapas
siguientes:
a) proporcionar un ácido
L-nucleico, que forma el resto de ácido
L-nucleico o una parte de éste, del ácido
L-nucleico modificado;
b) proporcionar uno diferente de ácido
L-nucleico, que forma el resto diferente de ácido
L-nucleico o una parte de éste, del diferente de
ácido L-nucleico modificado;
c) hacer reaccionar el ácido
L-nucleico de a) y el diferente de ácido
L-nucleico de b); y
d) opcionalmente aislar el ácido
L-nucleico modificado obtenido en la etapa c).
En una realización del método según la
invención, se pretende que el ácido L-nucleico de la
etapa a) comprenda un conector.
En una realización adicional del método según la
invención, se pretende que después de proporcionar el ácido
L-nucleico en la etapa a), éste se proporcione con
un conector.
Además está en el alcance de la presente
invención, que el resto diferente de ácido
L-nucleico comprenda un conector y que después de
proporcionar el diferente de ácido L-nucleico en la
etapa b), éste se proporcione con un conector, respectivamente.
\newpage
La presente invención se basa en el
descubrimiento sorprendente de que después del uso de los ácidos
L-nucleicos en un organismo como por ejemplo un
organismo mamífero y en particular en un mamífero que se selecciona
preferiblemente del grupo que comprende seres humanos, monos,
perros, gatos, ovejas, cabras, conejos, cobayas, ratones y ratas,
aunque los ácidos L-nucleicos no se metabolizan, lo
que vuelve a que las nucleasas que se encuentran en dichos
organismos como norma, no reconocen los ácidos
L-nucleicos como sustrato debido a su
estereoespecificidad, el tiempo medio biológico de los ácidos
L-nucleicos en dichos organismos es sin embargo
comparativamente bajo. Por lo tanto se observó, que después de la
administración in vivo de los ácidos
L-nucleicos no modificados de secuencia aleatoria a
ratas y monos el tiempo medio era de entre 30 minutos y 6 horas.
También, usando un ácido L-nucleico, es decir un
spiegelmer, que está dirigido frente a una molécula diana presente
en el organismo ensayado, se confirmó la observación anterior de un
tiempo medio biológico comparativamente bajo, lo que confirma que
esto no es debido a un artefacto como resultado de la no
especificidad del ácido L-nucleico. Además, los
presentes inventores observaron que el tiempo medio de los ácidos
L-nucleicos no modificados es aproximadamente tan
alto como el tiempo medio de los ácidos D-nucleicos
no modificados. Al mismo tiempo, la estabilidad de los ácidos
L-nucleicos no modificados es claramente superior
comparada con la estabilidad de los ácidos
D-nucleicos no modificados. Sorprendentemente, pudo
mostrarse, que debido a la modificación, el tiempo medio de los
ácidos L-nucleicos se incrementaba más que después
de la modificación de los ácidos D-nucleicos. Así,
va a haber un cambio, de manera completamente inesperada, en el
tiempo medio de los ácidos L-nucleicos modificados
como resultado de la modificación comparado con el tiempo medio de
los ácidos D-nucleicos modificados, cuyos tiempos
medios son de otra manera similares entre sí en la forma no
modificada. En otras palabras, sólo como resultado de la
modificación puede conseguirse el efecto deseado de un tiempo medio
prolongado de los ácidos nucleicos funcionales, lo que es sólo
posible usando ácidos L-nucleicos modificados, y no
usando ácidos D-nucleicos modificados. En el caso
específico descrito anteriormente, es un spiegelmer para el agonista
de la hormona liberadora de gonadotropina (GnRH), el que se
administró a ratas macho orquidectomizadas. GnRH estimula la
síntesis y liberación de la gonadotropina hormona estimuladora del
folículo (FSH) y de la hormona luteinizante (LH). Existen niveles
incrementados de FSH y LH en ratas macho orquidectomizadas debido a
la ausencia de señal de retroalimentación de la testosterona. El
spiegelmer específico causó una disminución clara del nivel de LH
en un primer estudio (100 mg/kg, aplicación s.c.), sin embargo
después de unas pocas horas, pudo observarse una reducción de la
eficacia del spiegelmer. En un resultado del mismo estudio con el
conjugado GnRH spiegelmer correspondiente y PEG (150 mg/kg,
aplicación i.v.) pudo observarse una disminución completa del nivel
de LH, sin embargo, que permaneció completamente disminuido durante
un periodo de tiempo de 24 horas. El conjugado GnRH spiegelmer y
PEG representa un ejemplo de un ácido L-nucleico
modificado según la invención. El GnRH spiegelmer corresponde aquí
a la parte del ácido L-nucleico, y el PEG a la parte
diferente de ácido L-nucleico.
Estos resultados muestran que el tiempo de
retención de los ácidos L-nucleicos como spiegelmers
en un organismo puede extenderse por una modificación,
particularmente por una modificación de alto peso molecular del
ácido L-nucleico. La modificación del ácido
L-nucleico tiene lugar mediante la unión del mismo
con uno diferente de ácido L-nucleico. Sin
pretender ajustarse a ninguna teoría, esta sorprendente observación
parece volver a que la eliminación del ácido
L-nucleico modificado de un organismo,
particularmente de un organismo mamífero, se ralentiza como
resultado del peso molecular incrementado de un ácido
L-nucleico modificado de dicha manera. Como la
eliminación se realiza típicamente a través de los riñones, se asume
que ahora la velocidad de filtración glomerular de los riñones
respecto a los ácidos L-nucleicos modificados está
significativamente reducida comparada con la de los ácidos
L-nucleicos no modificados, lo que da lugar a un
tiempo de retención incrementado, es decir, tiempo medio biológico
del ácido L-nucleico modificado comparado con el
tiempo de retención del ácido L-nucleico
correspondiente pero no modificado.
Es particularmente interesante en este contexto
el hecho de que a pesar de la modificación realizada, el ácido
L-nucleico modificado, es decir, en particular la
parte de ácido L-nucleico de éste, que es
responsable de la especificidad para la molécula diana, obviamente
no pierde nada de su especificidad. Así, los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención tienen
de manera completamente sorprendente las características que de otra
forma no pueden conseguirse normalmente en otros compuestos
farmacéuticamente activos, concretamente los que pueden hacerse sin
formulaciones galénicas importantes, por ejemplo en la forma de
preparaciones de liberación sostenida, que liberan el agente
sucesivamente, y en su lugar puede realizarse una modificación
directa del agente en cuestión sin que su actividad biológica se
vea influida negativamente, en el caso de los spiegelmer expresados
particularmente como especificidad de la reacción o la formación de
un complejo con su molécula diana respectiva. En otras palabras,
los ácidos L-nucleicos modificados según la
invención superan la incompatibilidad del agente farmacéuticamente
activo con un incremento de su tiempo de retención en un organismo,
en particular con una reducción de la eliminación como por ejemplo
en la velocidad de filtración glomerular que existe de otra manera
en los agentes farmacéuticamente activos y particularmente en
moléculas de agente pequeñas de actividad específica. Aquí, es
importante que la afinidad del resto de ácido
L-nucleico permanezca esencialmente invariable por
la conjugación con la parte diferente de ácido
L-nucleico.
Lo dicho anteriormente se aplica por supuesto no
sólo en el caso del uso de los ácidos L-nucleicos
modificados como spiegelmer como agentes terapéuticamente activos,
sino también para su uso como medios de diagnóstico,
particularmente en su uso como diagnósticos in vivo. Un
ejemplo típico del uso de spiegelmer como diagnósticos in
vivo es la formación de imágenes in vivo, y en la
presente memoria el uso de radionucleótidos que portan spiegelmer
para la tomografía de emisión de positrones, en particular. En esta
aplicación, está dirigido frente al radionucleótido que sobrevive
durante un periodo de tiempo definido exactamente. Si el
radionucleótido y así la radiactividad permanecen en el organismo
durante un periodo de tiempo más largo, en el que más largo debe
tomarse como necesario para realizar el examen respectivo, esto se
vería acompañado de una exposición a la radiación radiactiva
innecesaria para el paciente y en algunos casos posiblemente incluso
que presenta un riesgo para la salud. Por otra parte, en el caso en
el que la eliminación del marcador del medio de diagnóstico y así
el marcaje radiactivo del cuerpo ocurra demasiado deprisa, esto
daría lugar a que no sea posible un diagnóstico o una declaración
de diagnóstico apropiado. Con la disponibilidad de los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención los
medios de diagnóstico pueden ajustarse de una manera optimizada
dependiendo de sus requerimientos respectivos respecto a su tiempo
de retención, es decir, su tiempo medio biológico. Esto también se
basa en gran medida en la observación de que la velocidad de
filtración glomerular se ve limitada de manera importante por un
peso molecular de más de aproximadamente 45.000 Da en adelante. De
otra manera la eliminación, en particular la velocidad de
filtración glomerular, se correlaciona claramente con el tamaño de
la molécula. Usando una parte diferente de ácido
L-nucleico adecuada, como por ejemplo las descritas
en la presente memoria, el tiempo de retención del ácido
L-nucleico modificado puede ajustarse exactamente a
los requerimientos.
La naturaleza química del resto diferente de
ácido L-nucleico del ácido
L-nucleico modificado puede diseñarse virtualmente
de manera libre en el alcance de determinados límites. Un
requerimiento para el ácido nucleico modificado administrado a un
organismo, que debería cumplirse en la multitud de casos de
aplicación del ácido L-nucleico modificado, es que
el resto diferente de ácido L-nucleico consista en
uno o más compuestos no inmunogénicos. Alternativamente, pero si
aplicable también adicionalmente a esto, estos pueden ser compuestos
lipófilos así como compuestos hidrófilos. Para el experto en la
técnica es obvio que dependiendo de las condiciones generales del
caso aislado, también pueden reclutarse compuestos ligeramente
inmunogénicos, en particular si no se pretende que la
administración del ácido L-nucleico modificado según
la invención ocurra durante un periodo de tiempo más largo o de
manera repetida, sino simplemente una vez. A su vez, este aspecto es
particularmente importante si los ácidos
L-nucleicos modificados según la invención tienen
que administrarse durante un periodo de tiempo más largo o de
manera repetida. Como norma, tiene que asegurarse que no se genere
ninguna respuesta inmune por el resto diferente de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado según la invención después de la aplicación del ácido
L-nucleico modificado, que después de una nueva
administración del mismo, daría lugar a una reacción inmunológica o
alérgica.
El resto diferente de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado puede diseñarse de manera que más de un resto diferente
de ácido L-nucleico se una a o se conjugue con un
resto de ácido L-nucleico. Por ejemplo, es posible
que dos o más restos diferentes de ácido L-nucleico
se unan al resto de ácido L-nucleico. El resto
diferente de ácido L-nucleico individual es
preferiblemente un polímero, en el que las subunidades del polímero
pueden tener un peso molecular comparativamente bajo. También está
en el alcance de la presente invención que más de un resto de ácido
L-nucleico se una a un resto diferente de ácido
L-nucleico.
Un aspecto adicional, que tiene que tenerse en
cuenta cuando se selecciona la parte diferente de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado, es el direccionamiento de los spiegelmer hacia
determinados compuestos, particularmente hacia determinados órganos
o células. Aquí, dependiendo de las circunstancias específicas, el
resto diferente de ácido L-nucleico puede ajustarse
de manera que el ácido L-nucleico modificado se
acumule preferiblemente en determinadas células, tejidos u órganos,
independientemente de la especificidad de unión del spiegelmer o el
ácido L-nucleico modificado, causada por el resto de
ácido L-nucleico.
Típicamente, el peso molecular del resto
diferente de ácido L-nucleico es entre 300 y 500.000
Da. El resto de ácido L-nucleico puede acoplarse
bien individualmente, de manera múltiple o en cualquier combinación
con otros restos diferentes de ácido L-nucleico en
la misma o diferente localización del resto de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado.
Está en el alcance de la presente invención que
el peso molecular del ácido L-nucleico modificado
esté determinado firmemente por la parte diferente de ácido
L-nucleico. Básicamente, el ácido
L-nucleico modificado puede tener un peso molecular
de aproximadamente 600 a 500.000 Da, preferiblemente de
aproximadamente 10.000 a 400.000 Da y más preferiblemente de
aproximadamente 50.000 a 300.000 Da. Los pesos moleculares más bajos
se consiguen por ejemplo con ácidos L-nucleicos
modificados de una clase, que son conjugados con colesterol y
típicamente tienen un peso molecular de aproximadamente 10 kDa a 25
kDa. Los intervalos de pesos moleculares mayores se consiguen por
ejemplo con ácidos L-nucleicos modificados de una
clase, que son conjugados con HES y a menudo tienen un peso
molecular de aproximadamente 100 kDa a 500 kDa. En el caso de que
los ácidos L-nucleicos modificados sean conjugados
con PEG, el peso molecular preferido es aproximadamente 40 a 70
kDa.
Como resto de la parte diferente de ácido
L-nucleico se puede usar por ejemplo:
- poliéter, alcoxipoliéter, como por ejemplo
poli(etilen) glicoles (PEG) lineales o ramificados,
metoxipoli(etilen) glicoles, etoxipoli(etilen)
glicoles, PEG precisos (en el que el PEG preciso es una poliamida de
la forma
(-NH-Y-NH-CO-X-CO-),
en el que Y y Z pueden variarse en cada localización como
(-CH_{2}CH_{2}O-)_{p} con p diferente en el intervalo de
4-6),
poli(2-hidroxietil)-L-glutaminas,
polioxipropilenos, que se distinguen en particular por no ser
metabolizables in vivo y por esto el efecto de la eliminación
controlada causado por el tamaño, es decir, el peso molecular del
ácido L-nucleico modificado se refleja de manera
particularmente duradera y no se ve afectada por los procesos de
degradación de la parte diferente de ácido
L-nucleico.
- péptidos, polipéptidos y proteínas, tales como
p. ej. albúmina, en el que estos compuestos pueden existir de
manera natural así como ser sustancias añadidas desde el
exterior.
- polisacáridos, como p. ej. hidroxietil
almidón, dextranos, son hasta que son metabolizables y son capaces
de afectar el tiempo de retención muy específicamente, como
resultado de la velocidad de degradación controlable de manera
exacta. El peso molecular del hidroxietil almidón, usado en una
realización es entre 10 kDa, preferiblemente entre 40 kDa y 400
kDa, preferiblemente entre 100 kDa y 300 kDa. El hidroxietil almidón
tiene un grado molar de sustitución de 0,1 a 0,8 y una proporción
de C_{2}: C_{6} en el intervalo de 2 a 20. Respecto al
acoplamiento de los polisacáridos al resto de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado se aplica lo que se ha dicho en la presente memoria en
el contexto de la parte de azúcar de los ácidos
L-nucleicos respecto al uso de los grupos OH y su
derivatización.
- esteroles, como p. ej. colesterol. Aunque los
esteroles se distinguen por un peso molecular relativamente bajo,
sin embargo, esto puede dar lugar ya a un incremento del tiempo de
retención del ácido L-nucleico modificado de esta
manera. Tiene aún mayor importancia a este respecto el
comportamiento de los esteroles que se van a juzgar, en particular
del colesterol, que forma un complejo no covalente con lipoproteínas
in vivo, tal como por ejemplo HDL, por lo cual se consigue
un alargamiento de la molécula y así un tiempo medio más largo.
Básicamente, está en el alcance de la presente
invención que el resto diferente de ácido L-nucleico
se forme también a partir de uno o más
D-nucleósidos y D-nucleótidos,
respectivamente, en el que estos pueden tener modificaciones
adicionales, individualmente o como un todo, como por ejemplo
modificaciones para una estabilidad incrementada en sistemas
biológicos. Dichas modificaciones son por ejemplo la fluoridación en
la posición 2' de la parte de azúcar de los nucleótidos y
nucleósidos, respectivamente. Además, estos
D-nucleósidos y D-nucleótidos
pueden ser un componente de las diferentes partes diferentes de
ácidos L-nucleicos, particularmente de los
mencionados anteriormente, pero también una parte de uno de los
conectores descritos en la presente memoria. Aquí, está en el
alcance de la presente invención que uno o varios de los
D-nucleósidos o D-nucleótidos
pueden comprender también una o más posiciones abásicas.
La unión del resto de ácido
L-nucleico con uno o más de los restos diferentes de
ácidos L-nucleicos puede ocurrir en principio en
todos los componentes o grupos de las dos partes que constituyen el
ácido L-nucleico modificado, en el que puede
pretenderse que las derivatizaciones ocurran en una o más
localizaciones de una o ambas partes, es decir, en el ácido
L-nucleico así como en la parte o partes
diferente(s) de ácido L-nucleico. La unión
puede ocurrir en particular en el grupo 5'-OH,
3'-OH ó 2'-OH del ácido
L-nucleico, en particular en la parte ribosa o
desoxirribosa de éste.
Al mismo tiempo, también está en el alcance de
la presente invención que al menos una parte de los componentes de
azúcar de los nucleótidos que constituyen el ácido
L-nucleico pueda tener un azúcar distinto de ribosa
o desoxirribosa. Dichos azúcares pueden ser por ejemplo pentosas
adicionales, tales como por ejemplo arabinosa, pero también hexosas
o tetrosas o pueden contener también un átomo de nitrógeno, como por
ejemplo en un anillo morfolino o aza o tio azúcar, o modificaciones
de azúcar adicionales tales como en ácidos nucleicos bloqueados
(LNA) o ácidos nucleicos peptídicos (PNA). Estos grupos OH pueden
estar presentes por una modificación química apropiada como grupos
NH_{2}, SH, aldehído, ácido carboxílico, fosfato, yodo, bromo, o
cloro. Los grupos funcionales adicionales que permiten una unión en
la parte de ácido L-nucleico son conocidos para el
experto en la técnica. Hasta donde la unión del resto diferente de
ácido L-nucleico con un resto de ácido
L-nucleico se describe en la presente memoria, los
comentarios se aplican básicamente también para el caso de que más
de un resto diferente de ácido L-nucleico se una a
la parte de ácido L-nucleico o se conecte a éste,
siempre que no se proporcionen declaraciones contrarias.
Adicionalmente, está en el alcance de la
presente invención que al menos una parte de los grupos fosfato de
los nucleótidos que constituyen el ácido L-nucleico
modificado tenga modificación. Dichas modificaciones son por
ejemplo fosfotioatos, fosfoditioatos, fosfoamidatos, fosfonatos y
modificaciones adicionales conocidas para los expertos en la
técnica.
Aparte de la unión del resto de ácido
L-nucleico al resto diferente de ácido
L-nucleico a través de la porción de azúcar del
resto de ácido L-nucleico, la unión también puede
ocurrir en el núcleo fosfato, en el que aquí también, como se ha
indicado en el contexto de la unión a través de la parte ribosa o
desoxirribosa del ácido L-nucleico, puede ocurrir
una modificación correspondiente. Eventualmente, son posibles las
uniones a través de la posición 5 y/o 6 de la o las bases de
pirimidina, posición 8 de la o las bases de purina, así como los
grupos amino y ceto exo y endocíclicos de las nucleobases
respectivas, si es aplicable también después de la modificación
funcional de los mismos, como se ha discutido anteriormente. Aparte
de las bases naturales el ácido L-nucleico puede
contener una o más bases no naturales, como p. ej. isoguanidina,
isocitidina, xantosina, inosina,
2,4-diaminopirimidina. Aquí está en el alcance de la
presente invención que cualquiera de las uniones descritas en la
presente memoria entre el resto de ácido L-nucleico
y el resto diferente de ácido L-nucleico puede
ocurrir directamente o indirectamente. Una unión indirecta está
presente en particular si un conector se dispone entre el resto de
ácido L-nucleico y el resto diferente de ácido
L-nucleico, por ejemplo un conector descrito en la
presente memoria, y proporciona uno o ambos de los grupos
funcionales.
También está en el alcance de la presente
invención que entre el resto de ácido L-nucleico y
el resto diferente de ácido L-nucleico pueden
incluirse uno o más de los denominados conectores. Dicho conector
consiste típicamente en al menos un grupo funcional así como un
medio para mantener la distancia o un espaciador. Por una parte, la
función de este conector puede consistir en facilitar la reacción de
acoplamiento. Además o alternativamente puede impartir una función
tal como el establecimiento de una distancia espacial entre el resto
de ácido L-nucleico y el resto diferente de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado. Dicha distancia es ventajosa en determinadas
circunstancias, por ejemplo si se quieren evitar las interacciones
entre las partes que constituyen el ácido
L-nucleico modificado, en particular entre el resto
de ácido L-nucleico y el resto diferente de ácido
L-nucleico o entre dos o más de los restos
diferentes de ácido L-nucleico del ácido
L-nucleico modificado.
A su vez, el conector en sí mismo puede
comprender uno o más grupos funcionales y puede estar unido a uno
de los sitios del resto de ácido L-nucleico
mencionado anteriormente al último. Típicamente, el espaciador
consiste en cadenas alquilo de diferente longitud, en el que se
prefiere una longitud de cadena de 1 a 20, en particular de 4 a 15
y más en particular 6 a 12 átomos de carbono. La cadena alquilo en
sí misma puede ser ramificada o portar grupos funcionales
adicionales. Una realización típica del espaciador comprende uniones
éter entre monómeros individuales, tales como están presentes en p.
ej. poli(etilen)glicol o poliproxileno, en el que
aquí los monómeros están presentes habitualmente 1 a 20 veces en los
polímeros. También, en la formación del espaciador a partir de
cadenas poliaminoalquilo o poliamidoalquilo es común una frecuencia
de un valor de 1 a 20 para los monómeros que constituyen estos
polímeros.
El conector puede estar acoplado a uno de los
L-nucleótidos, que forman el resto de ácido
L-nucleico del ácido L-nucleico
modificado. Alternativamente, el conector puede estar incluido en el
oligómero emergente durante la síntesis enzimática o química del
ácido L-nucleico. Además, está en el alcance de la
presente invención que el ácido L-nucleico se
modifique después de la síntesis y se proporcione de ese modo con un
conector para el acoplamiento de una parte diferente de ácido
L-nucleico.
También está en el alcance de la presente
invención que se incluya un conector, por ejemplo, en una posición
abásica en un bucle en horquilla o en el extremo 3'- ó 5'- o en otra
posición. Si el ácido L-nucleico es un spiegelmer
la posición abásica puede estar incluida en una posición del
spiegelmer que no es esencial para la unión de la molécula diana, y
para la estructura del spiegelmer, respectivamente. Posición abásica
se refiere aquí a un sitio de la parte de ácido
L-nucleico, que posee de manera análoga a un
nucleótido normal el mismo núcleo de fosfato y azúcar, pero en el
que la nucleobase está sustituida con un átomo de hidrógeno o un
conector, como también se muestra en la Fig. 24.
Los ácidos L-nucleicos
modificados, referidos en la presente memoria también como
conjugados de ácido L-nucleico, como es ya evidente
a partir del detalle anterior respecto a los sitios de unión entre
el resto de ácido L-nucleico y el resto diferente
de ácido L-nucleico pueden prepararse por varias
reacciones, como se explica con más detalle en los siguiente.
- Las amidas ácidas pueden prepararse por
reacción de N-hidroxisuccinimida (NHS) o
activaciones similares de ácidos carbónicos, tales como anhídrido,
cloruro de ácido, éster, succinimida y maleimida a partir de una
amina primaria o secundaria ^{1,2}.
- El tioéter puede prepararse empezando a partir
de un haluro o tiol ^{3,4} y puede someterse posteriormente a una
oxidación en sulfóxido o sulfona ^{5,6}. Los haluros, en
particular haloacetilo (ácido yodoacético, ácido bromoacético)
pueden acoplarse a cualquier grupo funcional de una de ambas partes
del ácido L-nucleico por enlace éster o amida
ácida, y posteriormente el grupo yodo o bromo altamente reactivo
puede acoplarse con un tiol libre. El haloacetilo es por lo tanto
un caso especial de acoplamiento halogenuro tiol ^{7}. El tioéter
también puede prepararse empezando a partir de maleimida y tiol
^{7-9}, isotiourea a partir de isotiocianato y
amina ^{10}, isourea empezando a partir de isocianato y amina
^{11}, carbamato empezando a partir de isocianato y alcohol
^{12}, uniones C-C por medio de una reacción de
Diels-Alder ^{13}, heterociclos por cicloadición
1,3 dipolar ^{13}, aminas por aminación reductora, seguido de la
reacción de, por ejemplo, aldehído o cetona con una amina después
de reducción posterior ^{14}, amida ácida empezando a partir de
un ácido y una amina ^{15,16}, éster empezando a partir de ácido
carbónico o los ácidos carbónicos activados mencionados
anteriormente y alcohol, sulfonamida empezando a partir de amina y
sulfonilcloruro ^{17}, aminas secundarias empezando a partir de
un epóxido y una amina ^{18,19}, tioéter empezando a partir de un
epóxido y un tiol ^{20}, un disulfuro empezando a partir de un
tiol y un tiol adicional o un disulfuro ^{21,22}, hidrazonas
empezando a partir de una hidracina y un aldehído o una cetona, en
el que la hidrazona puede reducirse adicionalmente a una hidracina
modificada estable ^{23}, fosfotioatos empezando a partir de un
fosfato o un ácido fosfórico activado, tal como por ejemplo
fosforoimidazoluro y un tiol ^{24}, fosforamidato empezando a
partir de un fosfato o un ácido fosfórico activado, tal como por
ejemplo fosforoimidazoluro o
fos-N-hidroxi benzotriazol y una
amina ^{24,27}. Así, está en el alcance de la presente invención
acoplar en primer lugar un conector a través de una unión
fosfoamidato o fosfotioato al resto de ácido
L-nucleico y posteriormente al resto diferente de
ácido L-nucleico. Dichos conectores pueden ser
etilendiamina o cisteamina, en particular.
En principio, las explicaciones anteriores se
aplican también al caso de que el grupo reactivo de partida
mencionado en primer lugar esté dispuesto en el resto diferente de
ácido L-nucleico así como al caso en el que esté
dispuesto en el resto de ácido L-nucleico. La
modificación correspondiente del ácido L-nucleico en
el sentido de que se proporciona un grupo reactivo correspondiente,
es conocida para los expertos en esta técnica. Lo mismo se aplica
al resto diferente de ácido L-nucleico.
El término ácido L-nucleico se
usa en la presente memoria como sinónimo del término
L-oligonucleótido o L-polinucleótido
y se refiere, entre otros, a ácido
L-desoxirribonucleico así como a ácido
L-ribonucleico y combinaciones de estos, es decir,
que un nucleótido individual o un grupo de nucleótidos está presente
como ARN y los nucleótidos adicionales que constituyen el ácido
nucleico están presentes como ADN o viceversa. Aquí, también se
pretende que en lugar de desoxirribosa o ribosa otros azúcares
pueden formar el componente de azúcar del nucleótido. Además, está
comprendido el uso de nucleótidos con modificaciones adicionales en
la posición 2', tales como NH_{2}, OMe, OEt, OAlquilo, NHAlquilo
y el uso de nucleobases naturales y no naturales, como por ejemplo
isocitidina, isoguanosina. Está así también en el alcance de la
presente invención que el ácido L-nucleico tenga
las denominadas posiciones abásicas, es decir, nucleótidos, cuya
nucleobase está ausente. Dichas posiciones abásicas pueden estar
dispuestas en la secuencia nucleotídica del ácido
L-nucleico así como en uno o ambos extremos, es
decir, el extremo 5' y/o 3'.
Además está en el alcance de la presente
invención que el ácido L-nucleico contenga uno o más
D-nucleósidos o D-nucleótidos.
Aquí, el o los varios D-nucleósidos o nucleótidos
pueden estar dispuestos en el ácido L-nucleico así
como en uno o ambos extremos del ácido L-nucleico.
El único D-nucleósido o D-nucleótido
puede portar una o más modificaciones, por ejemplo para incrementar
la estabilidad del nucleósido o el nucleótido, respectivamente, y
su unión al ácido L-nucleico, respectivamente.
En principio, el ácido
L-nucleico puede estar presente en forma bicatenaria
o monocatenaria. Típicamente, es un ácido
L-nucleico monocatenario, que puede formar, sin
embargo, estructuras secundarias definidas y así también
estructuras terciarias, debido a su secuencia primaria. En la
estructura secundaria una multitud de ácidos
L-nucleicos tiene secciones bicatenarias.
Aparte de las modificaciones de alto peso
molecular descritas en la presente memoria en particular, los ácidos
L-nucleicos también pueden referirse a
modificaciones respecto a nucleótidos individuales del ácido
nucleico, en el que aquí p. ej. el grupo 2'-OH de
la porción de azúcar de los nucleótidos puede estar presente como
un metiléter, como ya se ha descrito anteriormente.
Los ácidos L-nucleicos y las
partes de ácido L-nucleico, respectivamente,
descritas en la presente memoria son preferiblemente ácidos
nucleicos funcionales. A los ácidos nucleicos funcionales
pertenecen, entre otros, aptámeros, spiegelmer, ribozimas y
aptazimas. Preferiblemente, los ácidos L-nucleicos y
las partes de ácido L-nucleico, respectivamente,
son spiegelmer. Como ya se ha mencionado en el comienzo, los
spiegelmer son ácidos nucleicos que se unen a una molécula diana o
una parte de ésta y están constituidos por
L-nucleótidos, al menos en la parte del acido
nucleico que se une a la molécula diana. Preferiblemente, son el
resultado de poner en contacto una biblioteca de ácido nucleico, en
particular una biblioteca de ácido nucleico estadística, con la
molécula diana.
Para un método de selección para el desarrollo
de ácidos nucleicos funcionales se preparan en primer lugar
bibliotecas de ADN combinatorias. Como norma, es una síntesis de
oligonucleótidos de ADN, que contienen una región de
10-100 nucleótidos aleatorizados en el centro, que
está flanqueada 5' y 3' terminalmente por dos sitios de unión de
cebador. La preparación de dichas bibliotecas combinatorias se
describe, por ejemplo, en Conrad, R.C., Giver, L., Tian, Y. y
Ellington, A.D., 1996, Methods Enzymol., Vol 267,
336-367. Dicha biblioteca de ADN monocatenario
sintetizado químicamente puede convertirse en una biblioteca
bicatenaria por la reacción en cadena de la polimerasa, que puede
usarse para una selección en sí misma. Como norma, tiene lugar una
separación de las cadenas individuales con métodos adecuados, de
manera que se recupera una biblioteca monocatenaria, que se usa
para el método de selección, si es una selección de ADN (Bock, L.C.,
Griffin, L.C., Latham, J.A., Vermaas, E.H. y Toole, J.J., 1992,
Nature, Vol. 355, 564-566). Es incluso posible usar
la biblioteca de ADN sintetizado químicamente directamente para la
selección in vitro. Además, en principio puede generarse una
biblioteca de ARN a partir de ADN bicatenario, si un promotor T7 se
ha incluido previamente, también por una polimerasa dependiente de
ADN adecuada, p. ej. T7 ARN polimerasa. Con la ayuda de los métodos
descritos, es posible generar bibliotecas de 10^{15} y más
moléculas de ADN o ARN. Cada molécula de esta biblioteca tiene una
secuencia diferente y así una estructura tridimensional diferente.
Por los métodos de selección in vitro es ahora posible
aislar una o más moléculas de ADN a partir de la biblioteca
mencionada, que tienen una propiedad de unión significativa frente
a una diana dada, por uno o más ciclos de selección y amplificación
así como mutación, si es aplicable. Las dianas pueden ser virus,
proteínas, péptidos, ácidos nucleicos, moléculas pequeñas tales
como metabolitos del metabolismo, agentes farmacéuticos y
metabolitos de éstos, u otros compuestos químicos, bioquímicos o
biológicos, tales como se describen, por ejemplo, en Gold, L.,
Polisky, B., Uhlenbeck, O. y Yarus, 1995, Annu. Rev. Biochem. Vol.
6, 763-797 y Lorsch, J.R. y Szostak, J.W., 1996,
Combinatorial Libraries, Synthesis, Screening and application
potential, ed. Riccardo Cortese, Walter de Gruyter, Berlín. El
procedimiento se realiza de tal manera que las moléculas de ADN o
ARN que se unen se aíslan a partir de la biblioteca usada
inicialmente y se amplifican después de la etapa de selección por
medio de la reacción en cadena de la polimerasa. En la selección
del ARN se pone una transcripción inversa delante de la etapa de
amplificación por la reacción en cadena de la polimerasa. Una
biblioteca enriquecida después de un primer ciclo de selección puede
usarse para un nuevo ciclo de selección, de manera que las
moléculas enriquecidas en el primer ciclo de selección tienen la
oportunidad de prevalecer de nuevo por selección y amplificación y
entrar en un ciclo nuevo de selección con aún más moléculas hijas.
Al mismo tiempo, la etapa de la reacción en cadena de la polimerasa
presenta la posibilidad de introducir nuevas mutaciones durante la
amplificación, p. ej. variando la concentración de sal. Después de
suficientes ciclos de amplificación y selección las moléculas que se
unen prevalecen. De esta manera surge un conjunto enriquecido,
cuyos miembros pueden separarse por clonación, y posteriormente
determinarse respecto a su estructura primaria por métodos comunes
para determinar una secuencia. Las secuencias obtenidas se ensayan
para estudiar sus propiedades de unión respecto a la diana. El
método para la generación de dichos aptámeros también se refiere
como método SELEX y se describe, por ejemplo, en EP 0 533 838, cuya
descripción se incluye en la presente memoria por referencia.
Las mejores moléculas de unión pueden acortarse
a su dominio de unión esencial por acortamiento de las secuencias
primarias, y prepararse por síntesis química o enzimática.
Una forma especial de aptámeros que se puede
fabricar de dicha manera son los denominados spiegelmer, que se
caracterizan esencialmente por estar constituidos al menos
parcialmente, preferiblemente completamente, por los
L-nucleótidos no naturales. Los métodos para la
preparación de dichos spiegelmer se describen en PCT/EP 97/04726,
cuya descripción se incluye en la presente memoria por referencia.
La característica específica del método descrito en la presente
memoria, es la generación de moléculas de ácido nucleico
enantioméricas, es decir, de moléculas de ácido
L-nucleico, que se unen a una diana nativa, es
decir, estando en su forma o configuración natural, o dicha
estructura diana. El método de selección in vitro descrito
anteriormente se usa para seleccionar ácidos nucleicos o secuencias
de unión inicialmente frente a los enantiómeros, es decir, la
estructura no natural de una diana natural, como por ejemplo en el
caso de que la molécula diana sea una proteína, frente a una
D-proteína. Las moléculas de unión resultantes
obtenidas de esta manera (D-ADN,
D-ARN, y D-derivados
correspondientes, respectivamente) se determinan en lo que se
refiere a sus secuencias y la secuencia idéntica se sintetiza con
módulos de ácido nucleico que son imágenes especulares
(L-nucleótidos y derivados de
L-nucleótidos, respectivamente). Los ácidos
nucleicos enantioméricos que son imágenes especulares resultantes
(L-ADN, L-ARN y
L-derivados correspondientes, respectivamente),
denominados spiegelmer, tienen por razones de simetría una
estructura terciaria que es imagen especular y así una propiedad de
unión para la diana presente en su forma o configuración
natural.
Las moléculas diana descritas anteriormente,
también referidas como diana, pueden ser moléculas o estructuras,
tales como p. ej. virus, viroides, bacterias, superficies celulares,
orgánulos celulares, proteínas, péptidos, ácidos nucleicos,
pequeñas moléculas tales como metabolitos del metabolismo, agentes
farmacéuticos y metabolitos de estos, u otros compuestos químicos,
bioquímicos o biológicos.
En lo siguiente, la invención se ilustra
adicionalmente por las figuras y ejemplos de los que resultan
ventajas, realizaciones y características adicionales de la
invención.
La Fig. 1 muestra un conector hexilamina, que
tiene un espaciador lineal ("medio para mantener la distancia")
que consiste en seis átomos de carbono así como un grupo amino
terminal y un resto fosfato terminal. La sustitución indicada con R
puede presentar aquí también un ácido nucleico y el resto de ácido
L-nucleico de un ácido L-nucleico
modificado, respectivamente. A través del grupo amino el resto
diferente de ácido L-nucleico puede acoplarse al
resto de ácido L-nucleico y así se forma el ácido
L-nucleico modificado según la invención.
La Fig. 2 muestra conectores adicionales, en los
que las estructuras referidas como (2), (4) y (6) corresponden a un
conector según (1), (3) y (5), en el que en el último la parte
fosfato proporcionada con el resto R representa preferiblemente el
resto de ácido L-nucleico, y el resto diferente de
ácido L-nucleico del ácido
L-nucleico modificado se acopla a través del grupo
funcional denominado X en el ácido L-nucleico. El
término "oligo" significa ejemplarmente un oligonucleótido, en
el que está en el alcance de la presente invención, que éste y el
ácido L-nucleico o las partes de ácido
L-nucleico, respectivamente, en la presente memoria
pueden ser generalmente L-polinucleótidos. Los
distintos sustituyentes se refieren en la presente memoria a los
grupos reactivos siguientes, que son individuales y cada uno
independiente de los demás:
X = OH, NH_{2}, HS, Hal, CHO, COOH
Y = O, NH, NMe, S, CH_{2}
Z_{1}, Z_{2}, Z_{3}, Z_{4}, Z_{5} y
Z_{6} = H, Me, Alquilo, OH(CH_{2})_{n}, HO,
H_{2}N(CH_{2})_{n}, H_{2}N, F, en el que n es
un número entero entre 1 y 20 y en el que Alquilo se refiere a
cadenas hidrocarbonadas lineales y ramificadas con preferiblemente
1-20 átomos de carbono, más preferiblemente 1 a 4
átomos de carbono y/o -(CH_{2})_{n}H,
-CH[(CH_{2})_{n}H] [(CH_{2})_{m}H],
-C[(CH_{2})_{n}H] [(CH_{2})_{m}H] [(CH_{2})_{l}H], -(CH_{2})_{n}(CH_{2})_{m}[(CH_{2})_{l}H] [(CH_{2})_{k}H], -(CH_{2})_{n}(C)_{m}[(CH_{2})_{l}H] [(CH_{2})_{k}H][(CH_{2})_{j}H], en el que n, m, l, k y j son números enteros independientes entre sí entre 1 y 8, preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono.
-C[(CH_{2})_{n}H] [(CH_{2})_{m}H] [(CH_{2})_{l}H], -(CH_{2})_{n}(CH_{2})_{m}[(CH_{2})_{l}H] [(CH_{2})_{k}H], -(CH_{2})_{n}(C)_{m}[(CH_{2})_{l}H] [(CH_{2})_{k}H][(CH_{2})_{j}H], en el que n, m, l, k y j son números enteros independientes entre sí entre 1 y 8, preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono.
La Fig. 3 muestra una visión general de
diferentes conectores, que están acoplados a diferentes posiciones
de las nucleobases. Así, es notable que la parte de azúcar del
nucleósido mostrada en cada caso puede ser una ribosa, una
desoxirribosa o una ribosa modificada y desoxirribosa modificada,
respectivamente, y el resto X puede ser = H, OH, H_{2}N, MeO,
EtOH o alcoxi. Así, alcoxi, en particular, se refiere a cadenas
oxihidrocarbonadas lineales y ramificadas con 1-20
átomos de carbono, preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono y/o
-O(CH_{2})_{n}H,
-CH[(CH_{2})_{n}H]
[(CH_{2})_{m}H], -OC[(CH_{2})_{n}H] [(CH_{2})_{m}H] [(CH_{2})_{l}H], -O(CH_{2})_{n}(CH_{2})_{m}[(CH_{2})_{l}H] [(CH_{2})_{k}H], -(CH_{2})_{n}(C)_{m}[(CH_{2})_{l}H]
[(CH_{2})_{k}H] [(CH_{2})_{j}H], en el que n, m, l, k y j son números enteros independientes entre sí entre 1 y 8, preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono. La estructura real del conector es X_{l}-[X]_{n} en los cuatro nucleósidos (1), (2), (3) y (4) mostrados, en el que n es un número entero entre 0 y 20. X_{l} representa un grupo funcional que se selecciona del grupo que comprende HO, H_{2}N, HRN, HS, SSR, Hal, CHO, COOH, COOR y COHal. En los conectores indicados como fórmulas estructurales (5-12) n es también un número entero entre 0 y 20, y Z significa independientemente de otros sustituyentes O, NH, NR o S, en el que R significa alquilo como se define en la presente memoria.
[(CH_{2})_{m}H], -OC[(CH_{2})_{n}H] [(CH_{2})_{m}H] [(CH_{2})_{l}H], -O(CH_{2})_{n}(CH_{2})_{m}[(CH_{2})_{l}H] [(CH_{2})_{k}H], -(CH_{2})_{n}(C)_{m}[(CH_{2})_{l}H]
[(CH_{2})_{k}H] [(CH_{2})_{j}H], en el que n, m, l, k y j son números enteros independientes entre sí entre 1 y 8, preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono. La estructura real del conector es X_{l}-[X]_{n} en los cuatro nucleósidos (1), (2), (3) y (4) mostrados, en el que n es un número entero entre 0 y 20. X_{l} representa un grupo funcional que se selecciona del grupo que comprende HO, H_{2}N, HRN, HS, SSR, Hal, CHO, COOH, COOR y COHal. En los conectores indicados como fórmulas estructurales (5-12) n es también un número entero entre 0 y 20, y Z significa independientemente de otros sustituyentes O, NH, NR o S, en el que R significa alquilo como se define en la presente memoria.
La Fig. 4 muestra conectores posibles en la
posición 5 de los nucleósidos y nucleótidos de pirimidina,
respectivamente. Respecto a los restos R', R'' y R''' básicamente
se aplica lo que se ha dicho en la presente memoria en el contexto
de la Fig. 5. El conector R tiene la estructura
-[Y]_{n}-X_{l} y puede adquirir
preferiblemente las formas mostradas en las estructuras (2) a (9),
en el que Z puede significar O, NH, NHR o S aquí también,
independientemente de la elección de los demás sustituyentes, y n
puede ser un número entero entre 1 y 20. El grupo funcional X_{l}
se selecciona preferiblemente del grupo que tiene OH, H_{2}N, HRN,
HS, SSR, Hal, CHO, COOH, COOR, COHal.
La Fig. 5 muestra en 1 la estructura básica de
la citosina, que puede tener diferentes estructuras de conector en
su amina exocíclica. Así, R' se refiere a un ácido
L-nucleico o a un L-polinucleótido,
OH, o fosfato, R'' a un ácido L-nucleico o a un
L-polinucleótido, OH o fosfato y R''' a H, OH, OMe,
OEt, NH_{2}. El resto R se refiere así al conector, que tiene la
estructura básica -[Y]_{n}-X_{l} y puede
tener las fórmulas estructurales mostradas en (2) a (9), en el que
Z = O, NH, NR, S y n puede ser un número entero entre 1 y 20. El
grupo funcional X_{l} se selecciona preferiblemente del grupo que
tiene OH, H_{2}N, HRN, HS, SSR, Hal, CHO, COOH, COOR, COHal.
La Fig. 6 muestra la formación de un ácido
L-nucleico modificado según la invención por
reacción de PEG-NHS con un ácido
L-nucleico proporcionado con un conector. Después
del acoplamiento exitoso está presente el ácido
L-nucleico modificado, que comprende en el caso
presente PEG como el resto diferente de ácido
L-nucleico y en este caso real un oligonucleótido
como ácido L-nucleico, en el que un conector o un
espaciador, respectivamente, que porta un grupo amino se inserta
entre ambos, y se vuelve una unión amida ácida entre el conector y
el PEG. Además del ácido L-nucleico modificado la
N-hidroxisuccinimida separada del PEG se obtiene
como un producto adicional de la reacción. Como restos posibles se
prefieren R, H, CH_{3} y en general cadenas alquilo con una
longitud de 1-20. El grupo funcional puede ser en
principio el producto de una cualquiera de las reacciones
explicadas en la presente memoria anteriormente. Hasta el momento,
las realizaciones del conector descritas en asociación con las
figuras adicionales, en particular Fig. 2 y 3, también se aplican a
este contexto. Lo mismo se aplica a los sustituyentes y variables
de control como n representadas en la fórmula.
La Fig. 7 muestra la conversión de diferentes
derivados de PEG con diferentes conectores. Aquí, las dos reacciones
(1) y (2) se diferencian sólo en que en la reacción (1) el grupo
carboxilo está presente en el PEG y en la reacción (2) el grupo
carboxilo está presente en un L-oligonucleótido
proporcionado con un conector. El grupo funcional del compañero de
reacción correspondiente respectivo, es decir, en el caso de la
reacción (1) el ácido L-nucleico proporcionado con
un conector, y en el caso de la reacción (2) el PEG proporcionado
con un grupo amino. Así, se confirma la declaración que se hizo en
el contexto de las diferentes reacciones como anteriormente, que
son posibles entre un resto de ácido L-nucleico y un
resto diferente de ácido L-nucleico, si es
aplicable con la participación de uno o más conectores insertados,
de que en principio los grupos reactivos mencionados pueden estar
presentes en todos los compañeros de reacción que están implicados.
Las estructuras finalmente obtenidas se diferenciarán entre sí
correspondientemente, de manera que en el caso de la reacción (1),
en la que está presente un grupo amida ácido en el PEG y en el caso
de la reacción (2), en la que la amida ácida de unión está presente
en la construcción de conector y oligonucleótido, es decir, el ácido
L-nucleico. Respecto a los sustituyentes R se
aplica lo que se ha dicho en el contexto de la figura 6,
correspondientemente.
La Fig. 8 muestra la reacción de un halogenuro
con un tioéster, que están unidos bien al resto diferente de ácido
L-nucleico o al resto de ácido
L-nucleico, respectivamente. En las reacciones (1) a
(3) se pretende que el ácido L-nucleico, aquí como
en todas las figuras abreviado como oligo, se proporcione con un
conector, y que el conector porte un halogenuro, como por ejemplo
I, Br, Cl. Este ácido L-nucleico derivatizado se
hace reaccionar acto seguido con un PEG proporcionado con un grupo
tiol, preferiblemente un grupo tiol terminal. En el caso de la
reacción (1) ocurrirá un enlace tioéter entre el conector y PEG. Por
oxidación puede resultar, como se muestra en la reacción (2), la
formación de un sulfóxido o una sulfona, respectivamente. En las
reacciones según (4) a (6) también ocurre una reacción entre un
tiol y un halogenuro, en la que en estos casos el ácido
L-nucleico se proporciona con el grupo tiol, y el
conector porta el halogenuro. Correspondientemente, ocurre una
formación de compuestos, en la que el azufre se dispone entre el
ácido L-nucleico y el conector, y puede oxidarse,
como se muestra en las reacciones (5) y (6), de nuevo a los
derivados correspondientes.
La Fig. 9 muestra la reacción del PEG
proporcionado con un grupo maleimida con un ácido
L-nucleico, referido como oligo, que tiene un
conector que porta un grupo tiol. El producto de la reacción es un
tioéter.
La Fig. 10 muestra la reacción de un ácido
L-nucleico que porta un grupo fosfato con un PEG,
que se proporciona con un conector que porta un grupo tiol. El
producto de la reacción es un fosfotioato.
La Fig. 11 muestra la reacción de un ácido
L-nucleico proporcionado con un resto fosfato,
terminal si es aplicable, con un PEG, que se proporciona con un
conector que tiene una amina. El producto de la reacción es un
fosfoamidato. Respecto al resto R se aplica lo que se detalló en el
contexto de la Fig. 6.
La Fig. 12 muestra la inserción de un grupo
amino o tiol reactivo, respectivamente, en un ácido
L-nucleico usando un grupo fosfato activado,
preferiblemente un grupo fosfato terminal del ácido
L-nucleico. Aquí, se hace un fosforimidazoluro (I)
en una primera etapa, que da lugar a la formación de un
2-aminoetilen-1-fosforamidato
(II) en el caso de la reacción (2) usando una etilendiamina, o en
el caso de la reacción (3) usando cisteamina a
2-tioetilen-1-fosfoamidato
(III), respectivamente. Los compuestos según (II) y (III) pueden
reaccionar acto seguido con los diferentes de ácido
L-nucleico, particularmente con los descritos en la
presente memoria.
La Fig. 13 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo cloruro de sulfonilo con un ácido
L-nucleico que tiene un conector que porta un grupo
amino. El producto de la reacción es una sulfonamida. Respecto al
resto R se aplica lo que se detalló en el contexto de la Fig. 6.
La Fig. 14 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo epóxido con un ácido
L-nucleico que tiene un conector que porta un grupo
amino que forma una amina. Respecto al resto R se aplica lo que se
detalló en el contexto de la Fig. 6.
La Fig. 15 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo epóxido con un ácido
L-nucleico que tiene un conector proporcionado con
un grupo tiol. El producto de la reacción es un tioéter.
La Fig. 16 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo isotiocianato con un ácido
L-nucleico que tiene un conector que porta un grupo
amino. El producto de la reacción es una isotiourea. Respecto al
resto R se aplica lo que se detalló en el contexto de la Fig. 6.
La Fig. 17 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo isocianato con un ácido
L-nucleico que tiene un conector que porta un grupo
amino que forma una isourea. Respecto al resto R se aplica lo que se
detalló en el contexto de la Fig. 6.
La Fig. 18 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo isocianato con un ácido
L-nucleico que porta un grupo OH libre, que puede
venir directamente del ácido L-nucleico, como por
ejemplo de un grupo fosfato o el resto de azúcar del nucleósido, es
decir, las posiciones 2'-OH, 3'-OH ó
5'-OH. Alternativamente, el grupo OH puede unirse
al ácido L-nucleico a través de un conector
adecuado. El producto de la reacción es un carbamato.
La Fig. 19 muestra la reacción de un grupo
aldehído o ceto con un grupo amino, que está presente en cada caso
bien en el resto diferente de ácido L-nucleico
(reacción (1)), en el caso mostrado en PEG; o en el resto de ácido
L-nucleico (reacción (2)). Preferiblemente aquí, el
resto de ácido L-nucleico tiene un conector que
porta el grupo reactivo respectivo, es decir, el grupo amino o el
grupo carbonilo. En el caso de la reacción (1), el PEG porta un
grupo amino, mientras que el ácido L-nucleico tiene
un conector que porta el grupo carbonilo. El producto de la
reacción obtenido directamente, imina, se convierte acto seguido en
una amina por reducción. En el caso de la reacción (2) el PEG que
porta un grupo carbonilo se hace reaccionar con el ácido
L-nucleico, que porta un conector que tiene un
grupo amino. El producto de la reacción imina se reduce y da lugar a
una amina. Respecto al resto R se aplica lo que se detalló en el
contexto de la Fig. 6.
La Fig. 20 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo tiol con un ácido
L-nucleico que porta un conector proporcionado
también con un grupo tiol. El producto de la reacción es un ácido
L-nucleico modificado que tiene un grupo disulfuro
entre el PEG y el ácido L-nucleico, hablando
estrictamente con el conector unido a él.
La Fig. 21 muestra la reacción de un PEG
proporcionado con un grupo hidracina con un ácido
L-nucleico que porta un conector que comprende un
grupo carbonilo. En una primera etapa de la reacción, se obtiene una
hidrazona que se convierte acto seguido de manera reductora en una
hidracina sustituida. Respecto al resto R se aplica lo que se
detalló en el contexto de la Fig. 6.
La Fig. 22 muestra en la reacción (1) la
conversión de un PEG proporcionado con un dieno conjugado con un
ácido L-nucleico que porta un conector con un
denominado grupo dienofílico. El dienófilo consiste en un enlace
doble C-C, que a su vez tiene un sustituyente Z que
comprende un grupo que obtiene electrones. Éste puede ser
preferiblemente NO_{2}, CH_{2}Cl, COOR, CN o maleimida. Respecto
al resto R se aplica lo que se detalló en el contexto de la Fig. 6.
Debido a esta reacción se produce la formación de un ácido
L-nucleico modificado que tiene un grupo hexeneilo
entre el PEG y el ácido L-nucleico proporcionado con
un conector. La reacción de Diels-Alder mostrada en
la reacción (2) empieza con un PEG que tiene un dienófilo con un
sustituyente Z que reacciona con un ácido
L-nucleico que comprende un conector que porta un
dieno conjugado. Respecto al sustituyente Z se aplica lo que se
detalló en el contexto de la reacción (1). El producto de la
reacción en esta reacción (2) también es un conjugado de ácido
L-nucleico unido a través de un grupo hexeneilo.
La Fig. 23 muestra la estructura del mPEG-éster
de NHS ramificado y lineal que se usó.
La Fig. 24 muestra en (1) el ensamblaje básico
de un L-nucleósido abásico, que en lugar de la
nucleobase puede tener bien un átomo de hidrógeno o una o más
estructuras de conector opcionalmente diferentes. Aquí R' indica un
ácido L-nucleico o un
L-polinucleótido, OH o fosfato, R'' un ácido
L-nucleico o un L-polinucleótido, OH
o fosfato y X = H, OH, OMe, OEt, NH_{2}. El resto R indica bien
el átomo de hidrógeno en lugar de la nucleobase o el conector, que
puede tener las fórmulas estructurales mostradas en (2) a (8), en
las que Z = CH_{2}, O, NH, NR, S y n puede ser un número entero
entre 1 y 20. El grupo funcional X_{l} se selecciona
preferiblemente del grupo que tiene HO, H_{2}N, HRN, HS, SSR,
Hal, CHO, COOH, COOR, COHal.
La Fig. 25 muestra un ensayo de actividad de un
spiegelmer de ADN PEGilado que se une a GnRH en ratas macho
orquidectomizadas.
La Fig. 26a muestra un ensayo de actividad de un
spiegelmer de ADN PEGilado que se une a GnRH in vitro.
La Fig. 26b muestra un ensayo de actividad de un
spiegelmer de ADN no PEGilado y PEGilado que se une a GnRH in
vitro.
La Fig. 27 muestra la farmacocinética de un
spiegelmer de ADN PEGilado que se une a GnRH en ratas.
La Fig. 28a muestra un perfil farmacocinético de
L-ARN PEGilado después de dosis intravenosa en
ratas.
La Fig. 28b muestra un perfil farmacocinético de
L-ARN no PEGilado después de dosis intravenosa en
ratas.
La Fig. 28c muestra un perfil farmacocinético de
L-ARN PEGilado después de dosis subcutánea en
ratas.
La Fig. 28d muestra un perfil farmacocinético de
L-ARN no PEGilado después de dosis subcutánea en
ratas.
La Fig. 29 muestra un ensayo de actividad de un
spiegelmer de ADN que se une a GnRH en ratas macho orquidectomizadas
in vivo.
\vskip1.000000\baselineskip
Las condiciones para la síntesis de conjugados
de PEG de ácidos L-nucleicos se examinaron empezando
a partir del ácido L-nucleico representado en la
SEQ ID NO: 2 y PEG, en el que el PEG se modificó de manera que
estaba presente bien como un éster de NHS o como una amina primaria
para el acoplamiento en una amina y un fosfato, respectivamente. Se
procedió de manera que el ácido nucleico se disolvió en un sistema
acuoso. El pH se ajustó a pH 6,5-9,0 con diferentes
tampones o bases como, por ejemplo, NaHCO_{3},
NaH_{2}PO_{4}/Na_{2}HPO_{4}, HEPES, MOPS, NH_{4}OAc,
trietilamina. Se ensayó la influencia de la adición de diferentes
disolventes orgánicos, como por ejemplo DMF, DMSO, acetonitrilo y
otros, en el que la porción del disolvente orgánico se varió entre
0-100%. Posteriormente, se produjo la adición de
diferentes derivados de PEG, como por ejemplo mPEG_{2}-éster de
NHS ramificado, mPEG-éster de NHS lineal o
mPEG-NH_{2} (Shearwater Corporations) de
diferentes pesos moleculares entre 10.000 Da y 40.000 Da. La
adición de PEG-éster de NHS puede hacerse de diferentes maneras.
Así, el PEG-éster de NHS puede disolverse por ejemplo en un ácido de
baja concentración tal como, por ejemplo, 0,01 N HCl, o puede
añadirse en gotas disolviéndose en un disolvente orgánico tal como
DMF o añadirse como un sólido. La manera preferida de añadir
PEG-NHS es como un sólido por partes. Además, se
ensayó la influencia de la temperatura de la reacción entre
4ºC-65ºC. Como ácidos nucleicos se usaron ácidos
nucleicos con la secuencia siguiente
5'-NH_{2}-TAT TAG AGA
C-3' (SEQ ID NO: 2), y
5'-PO_{4}-TAT TAG AGA
C-3' (SEQ ID NO:3) así como el acido nucleico según
la SEQ ID NO: 1. Los rendimientos de las reacciones resumidas
anteriormente fueron entre 5-78%.
La variante preferida de la reacción fue la
adición de dos equivalentes de PEG-éster de NHS sólido en intervalos
de aproximadamente 30 minutos, seis veces en total, a un ácido
nucleico disuelto en un disolvente que consiste en 60 partes
H_{2}O y 40 partes de DMF con NaHCO_{3} (0,2 M), un pH de 8,0 y
37º. Las condiciones de la reacción dan lugar a un rendimiento de
78%.
\vskip1.000000\baselineskip
Empezando a partir de un ácido
L-nucleico con la secuencia
5'-PO_{4}-TAT TAG AGA
C-3' (SEQ ID NO: 3) se hizo un conjugado
correspondiente fosfoamidato PEG. El ácido
L-nucleico (10 OD) se hizo reaccionar con
PEG-NH_{2} (20.000 Da, lineal,
1-10 equivalentes) en disolución acuosa con EDCI a
50ºC a un conjugado de PEG de un fosfoamidato de ácido
L-nucleico. El análisis y purificación se hicieron
de manera análoga a la de la PEGilación de los ácidos
L-nucleicos con PEG-NHS, como se ha
descrito en el ejemplo 1. Las condiciones de la reacción no se
optimizaron y dieron lugar a un rendimiento de < 8%.
\vskip1.000000\baselineskip
La hormona peptídica GnRH I (hormona liberadora
de gonadotropina, gonadoliberina), que se refiere generalmente como
GnRH, es un decapéptido hecho en el hipotálamo que estimula la
secreción de las hormonas gonadotrópicas hormona luteinizante y
hormona estimuladora del folículo (FSH) por la glándula pituitaria.
GnRH es secretada por las neuronas del hipotálamo en pulsos y se
une a un receptor en la superficie celular de la glándula
pituitaria. El complejo ligando receptor se internaliza, por lo que
ocurre una liberación de FSH y LH, que a su vez estimula la
producción de hormonas sexuales tales como estrógeno, progesterona o
testosterona. Pudo producirse un spiegelmer, es decir, un ácido
L-nucleico que se une específicamente a GnRH y tiene
la secuencia siguiente:
5'-CCA AGC TTG CGT AAG CAG TCT CCT CTC AGG GGA GGT TGG GCG GTG | |
CGT AAG CAC CGG TTT GCA GGG G-3' | (SEQ ID NO:1) |
La síntesis del spiegelmer de la secuencia
mostrada anteriormente se realizó en un sintetizador de ADN Biotech
Oligopilot II de Amersham Pharmacia en escala de 780 \muMol en una
fase sólida 1.000 \ring{A} CPG (Controlled Pored Glass) según la
química de 2-cianoetil-fosforamidita
(Sinha et al. NAR, 12, 1984, p. 4539ff). Posteriormente, se
unió una
6-(monometoxitritilamino)-hexil-(2-cianoetil)-(N,N-diiospropil)-fosforamidita
al extremo 5' del spiegelmer
(5'-MMT-aminohexil spiegelmer), para
permitir la conjugación posterior a la síntesis con PEG.
Después de terminar la síntesis el
5'-MMT aminohexil spiegelmer se escindió de la fase
sólida por una incubación de 8 horas en disolución de amoniaco al
33% a 65ºC y se desprotegió completamente, después se concentró a
sequedad, se recogió en 10 mM NaOH y se purificó mediante
RP-HPLC. La escisión del grupo protector
monometoxitritilo ocurrió con ácido trifluoroacético (TFA) al 0,4%
en 30 min a RT. TFA se eliminó por coevaporación dos veces con
etanol y el 5'-aminohexil spiegelmer según la SEQ ID
NO: 1 se purificó por precipitación en etanol (rendimiento: 5.000
OD, 7,5 \mumoles). El pico del producto se recogió y se desaló
mediante cromatografía de exclusión por tamaño en una columna
Sephadex G10 o por ultrafiltración (Labscale TFF System,
Millipore).
El GnRH spiegelmer modificado 5'amino de dicha
manera (5.000 OD, 7,5 \mumoles) se preparó en 0,2 M NaHCO_{3},
pH 8,5/DMF 60:40 (v/v) (125 mL), se calentó a 37º C y se añadió en
partes éster activado en polvo de
N-hidroxisuccinimidilo (NHS) de poli (etilen) glicol
ramificado de 40.000 Da (2 eq (equivalentes) cada 30 min, en
conjunto 12 eq, (6 x 600 mg, 180 \mumoles). El progreso de la
reacción se monitorizó por electroforesis analítica en gel (8%
poliacrilamida, 8,3 M urea). El producto bruto se purificó
inicialmente por HPLC de intercambio iónico del PEG en exceso
(Fuente Q 30; disolvente A: H_{2}O, disolvente B: 2 M NaCl;
velocidad de caudal 20 mL/min; carga de la columna y elución de PEG
libre con 10% B; elución del conjugado PEG-GnRH
spiegelmer con 50% B), posteriormente el GnRH spiegelmer PEGilado
por RP-HPLC se separó del GnRH spiegelmer no
PEGilado (Fuente RPC 15: disolvente A: 100 mM acetato de
trietilamonio (TEAA), disolvente B: 100 mM TEAA en
H_{2}O/acetonitrilo 5:95; velocidad de caudal 40 mL/min; carga de
la columna con 10% B; gradiente de 10% a 70% B en 10 volúmenes de
columna, elución de PEG-GnRH spiegelmer a
45-50% B), se intercambió la sal (Fuente Q 30;
disolvente A: H_{2}O, disolvente B: 2 M NaCl; velocidad de caudal
20 mL/min; carga de la columna y elución de PEG libre con 10% B;
elución de PEG-GnRH spiegelmer con 50% B) y
posteriormente se desaló por filtración en gel (Sephadex G10;
disolvente H_{2}O; velocidad de caudal 5 mL/min) o ultrafiltración
(Labscale TFF System, Millipore). Por liofilización se obtuvo el
producto deseado como un polvo blanco (3.900 OD, 375 mg, 78%).
De manera análoga, ácidos nucleicos adicionales
incluyendo la secuencia según la SEQ ID NO: 1 se unieron a
diferentes PEG (10.000 Dalton lineal, 20.000 Dalton lineal, 20.000
Dalton ramificado, 35.000 Dalton lineal) y se purificaron.
\vskip1.000000\baselineskip
El GnRH spiegelmer 5'amino modificado obtenido
según el ejemplo 3 se preparó en 0,5 M NaHCO_{3} pH 8,5, se
calentó a 65ºC y se añadió un exceso de isotiocianato de
fluoresceína (FITC, 10 eq) a la mezcla de reacción. La reacción se
monitorizó mediante RP-HPLC analítica. Se agitó
durante 48 h a 65ºC, se separó el exceso de FITC por
Centri-Spin10 (Princeton Separations) y el ácido
L-nucleico marcado con fluoresceína se purificó por
RP-HPLC. La liofilización dio lugar al producto
deseado como un polvo amarillento en rendimiento cuantitativo.
\vskip1.000000\baselineskip
Ratas macho se orquidectomizaron, por lo que el
nivel de LH de las ratas se incrementó de manera constante durante
los ocho días siguientes debido a la ausencia de señal de
retroalimentación de la testosterona. En el día 8 el
PEG-GnRH spiegelmer de ADN, es decir, el conjugado
de PEG y GnRH spiegelmer, se administró intravenosamente a siete
ratas (150 mg/kg). Se tomaron muestras de sangre en el día 0 (antes
de la orquidectomía), en el día 8 (0 horas antes de la aplicación
i.v. del PEG-GnRH spiegelmer), 0,5 h, 1,5 h, 3 h, 6
h así como 24 h después de la aplicación i.v. y se determinó el
nivel respectivo de LH usando radioinmunoensayo (RIA). En paralelo,
se administró sólo el vehículo (tampón PBS, pH 7,4) i.v. como
control negativo a siete ratas macho orquidectomizadas y el
antagonista estándar Cetrorelix (100 \mug/kg) s.c. como control
positivo a siete ratas macho orquidectomizadas. El resultado se
muestra en la Fig. 25.
Con la excepción del control negativo (en la
Fig. 25 representado como triángulos) existe un nivel de LH incluso
después de 24 h bajo la influencia de los PEG-GnRH
spiegelmer, que es comparable al de las ratas no orquidectomizadas
y las ratas, respectivamente, que habían recibido el antagonista
estándar Cetrorelix. Esto prueba la idoneidad del
PEG-GnRH spiegelmer de ADN para influir de manera
duradera en el efecto de GnRH durante un periodo de tiempo largo.
El hecho de que el efecto del PEG-GnRH spiegelmer de
ADN descrito anteriormente es debido a la PEGilación del GnRH
spiegelmer resulta del hecho de que después de la aplicación del
GnRH spiegelmer sin la modificación correspondiente con aplicación
subcutánea de 100 mg/kg pudo observarse una reducción de la
actividad del GnRH spiegelmer después de unas pocas horas. El
resultado se muestra también en la Fig. 29.
\vskip1.000000\baselineskip
El estudio de cultivo celular descrito en la
presente memoria se realizó en células de Ovario de Hámster Chino
(CHO) que expresan el receptor humano de GnRH. Aquí, se midió la
liberación intracelular de iones Ca^{2+}, ya que esta liberación,
importante para la transducción de la señal, ocurre después de la
formación del complejo agonista receptor. El nivel de Ca^{2+} se
determinó por un marcador fluorescente sensible a Ca^{2+}. El
PEG-GnRH spiegelmer de ADN y el GnRH spiegelmer,
respectivamente, fue para capturar el agonista GnRH e inhibir así
su unión al receptor en la membrana celular. Se hizo
experimentalmente de manera que el agonista GnRH (2 nM) se
preincubó durante 20 min con el GnRH spiegelmer y el
PEG-GnRH spiegelmer de ADN, respectivamente, en un
intervalo de concentración de 100 pM hasta 1 \muM. Cada una de
estas disoluciones se administró a células CHO cargadas con
marcador fluorescente y la concentración de Ca^{2+} respectiva se
determinó con un Lector de Placas de Imagen Fluorescente (FLIPR).
El resultado del PEG-GnRH spiegelmer de ADN
(triángulos llenos) y de un antagonista estándar (cuadrados
llenos), usado aquí como control positivo, se muestra en la Fig.
26a.
La determinación dependiente de la concentración
resultó en una curva de actividad sigmoidal, que indica que el
spiegelmer nativo, es decir, el GnRH spiegelmer no modificado
(cuadrados llenos), así como el GnRH-spiegelmer de
ADN modificado con PEG (triángulos llenos) fueron capaces de inhibir
la formación del complejo GnRH receptor un 100%. La CI_{50} fue
20 nM para el GnRH spiegelmer y 30 nM para el
PEG-GnRH spiegelmer de ADN (Fig. 26b).
\vskip1.000000\baselineskip
Siete ratas macho Wistar (Tierzucht Schönwalde
GmbH, Alemania, peso: 250-300 g) se usaron para la
determinación de las características farmacocinéticas de la unión a
GnRH del spiegelmer de ADN PEGilado. El grupo se trató en paralelo
con los grupos para los ensayos de actividad (véase el ejemplo 6),
es decir, castrados después de una fase de adaptación y después de
otra semana los animales recibieron una única dosis de 800 nmoles/kg
de PEG-GnRH spiegelmer de ADN administrado
intravenosamente. La sustancia se disolvió en 1xPBS, pH 7,4
(disolución
madre: 1 mM).
madre: 1 mM).
Para el análisis se tomaron muestras de sangre
antes de la dosis de la sustancia (0 h) así como 1 h, 6 h y 8 h
después de la dosis de la sustancia y se analizaron como plasma
EDTA.
A partir del plasma, se extrajo el spiegelmer de
ADN PEGilado que se une a GnRH por extracción en fase sólida
mediante intercambiadores débiles de aniones. Para esto, se
disolvieron 50 \mul de plasma EDTA de cada uno en tampón A (50 mM
NaH_{2}PO_{4}, pH 5,5; 0,2 M NaClO_{4}; formamida al 20% (v/v)
y acetonitrilo al 5% (v/v) en un volumen total de 1 ml y se
almacenó a 4ºC durante la noche o a -20ºC durante 4 días como
máximo, respectivamente, hasta la extracción. Las muestras
congeladas se descongelaron durante al menos 2 h a temperatura
ambiente, se mezclaron y posteriormente se centrifugaron.
Para la extracción en fase sólida, se usaron
columnas de intercambio de aniones dimetilaminopropilo (DMA 3
ml/200 mg de material de columna, Macherey y Nagel, Düren) en un
aparato de vacío Baker spe-12G (Mallinckrodt Baker,
Griesheim). Los tampones usados consistieron en: tampón A (50 mM
NaH_{2}PO_{4}, pH 5,5; 0,2 M NaClO_{4}; formamida al 20%
(v/v) y acetonitrilo al 5% (v/v) y tampón B (80 mM
NaH_{2}PO_{4}, pH 6,0; 50 mM Na_{2}HPO_{4}, 2 M
NaClO_{4}; formamida al 20% (v/v) y acetonitrilo al 5% (v/v), en
el que los dos tampones A y B se mezclaron en una proporción
específica para la preparación del tampón de lavado y de elución, de
manera que se consiguieron las concentraciones de sal deseadas. Los
intercambiadores aniónicos se lavaron con 2 ml de tampón A. Las
muestras se añadieron aplicando -100 mbares y se lavaron con 2 ml de
tampón A así como 2 ml de tampón de lavado (0,4 M NaClO_{4}).
Después de secar el material de la columna durante 5 min aplicando
-200 mbares, el spiegelmer de ADN PEGilado que se une a GnRH se
eluyó con 3 x 0,5 ml de tampón de elución (0,9 M NaClO_{4}), en
el que el tampón se calentó a 70ºC antes de la elución. Los eluatos
se almacenaron a 4ºC hasta la filtración en gel.
Como estándar interno se había añadido un
spiegelmer de ADN 30 mer a las muestras antes de la extracción, que
se unió a una molécula de polietilenglicol (PEG) de 40 kDa en el
extremo 5'. El estándar interno se llevó con tampón hasta un
volumen de 360 \mul a una concentración de 1 \mug/\mul y se
añadieron 10 \mul de cada uno a cada muestra.
Para desalar las muestras antes del análisis por
HPLC, se usaron columnas NAP-25 (Amersham Pharmacia
Biotech). Los eluatos obtenidos se secaron en vacío y se
disolvieron en 100 ml de 10 mM Tris-HCl, pH 8,0.
La identificación y cuantificación del
spiegelmer PEGilado se hizo mediante cromatografía de intercambio
aniónico usando un sistema de HPLC Waters Alliance 2695 y detección
a 254 nm. Las condiciones fueron como sigue:
precolumna: DNAPac PA-100 (504
mm, Dionex)
columna principal: DNAPac PA-100
(2504 mm, Dionex)
eluyente A: 10 mM NaOH, 1 mM EDTA, acetonitrilo
al 10% (v/v) en agua
eluyente B: 375 mM NaCl_{4} en eluyente A
temperatura: 25ºC
volumen de inyección: 20 \mul
gradiente y velocidades de caudal:
0-1 min 10% eluyente B con 0,5 ml/min;
1-2 min 10% eluyente B con 2 ml/min;
2-3 min 30% eluyente B con 2 ml/min;
3-13 min 60% eluyente B con 2 ml/min;
13-19 min 10% eluyente B
con 2 ml/min.
con 2 ml/min.
La concentración de spiegelmer de ADN PEGilado
que se une a GnRH en los diferentes puntos de tiempo de muestreo se
muestra en la Fig. 27. El tiempo medio del spiegelmer de ADN
PEGilado que se une a GnRH después de inyección intravenosa es
aproximadamente 4 horas en ratas.
\vskip1.000000\baselineskip
secuencias nucleotídicas:
L-ARN, 40 mer (NOX_M039)
5' uaa gga aac ucg guc uga ugc ggu agc gcu gug
cag agc u 3' (SEQ ID NO: 4)
40 kDalton
PEG-L-ARN, 40 mer (NOX_M041)
PEG 5' uaa gga aac ucg guc uga ugc ggu agc gcu
gug cag agc u 3' (SEQ ID NO: 5)
El perfil farmacocinético del
L-ARN no PEGilado (NOX_M039) y el
L-ARN PEGilado (NOX_M041) se examinó en ratas macho
(CD®, Charles River Alemania GmbH; peso 280-318 g).
Después de un periodo de acondicionamiento de 7 días, 3 animales
por sustancia recibieron una dosis única de 150 mmoles/kg aplicada
intravenosamente. 4 ratas cada una por sustancia recibieron cada
una 150 mmoles/kg como dosis subcutánea única. Las sustancias se
disolvieron en 1 x PBS pH 7,4 (disolución madre: 383 \muM).
Después de la dosis intravenosa, se tomaron muestras de sangre para
el L-ARN no modificado antes de la aplicación de la
sustancia (0 min) y 5 min, 15 min, 30 min, 1 h, 2 h, 4 h, 6 h
después de la aplicación de la sustancia y se transfirieron a tubos
Eppendorf con EDTA para el análisis. Después de la dosis
intravenosa, se tomaron muestras de sangre para el
L-ARN PEGilado antes de la aplicación de la
sustancia (0 min) y 5 min, 30 min, 1 h, 3 h, 8 h, 16 h, 24 h, 36 h
así como 48 h después de la aplicación de la sustancia y se
transfirieron a tubos Eppendorf con EDTA para el análisis. En los
animales tratados subcutáneamente, se tomaron muestras de sangre
para el L-ARN no modificado antes de la aplicación
de la sustancia (0 min) y 5 min, 15 min, 30 min, 1 h, 2 h, 4 h, 6 h
después de la aplicación de la sustancia y se transfirieron a tubos
Eppendorf con EDTA para el análisis. En los animales tratados
subcutáneamente, se tomaron muestras de sangre para el
L-ARN PEGilado antes de la aplicación de la
sustancia (0 min) y 5 min, 30 min, 1 h, 3 h, 8 h, 16 h, 24 h, 36 h
y 48 h después de la aplicación de la sustancia y se transfirieron
a tubos Eppendorf con EDTA para el análisis.
La cantidad de L-ARN y
L-ARN PEGilado en las muestras de sangre se examinó
mediante un ensayo de hibridación (véase Drolet, D.W. et al.
(2000) Pharmacokinetics and safety of an
anti-vascular endothelial growth factor aptamer
(NX1838) following injection into the vitreous humor of rhesus
monkeys. Pharmaceutical Res 17 (12): 1503-1510). El
ensayo de hibridación se basa en el principio siguiente: la molécula
de L-ARN que se quiere detectar se hibrida con una
sonda oligonucleotídica de L-ADN inmovilizada (=
sonda de captura; aquí: 5'-CCG CAT CAG ACC GAG TTT
CCT TA T TTT TTT TT-(C7) NH_{2}-3' (SEQ ID NO: 6))
y se detecta con una sonda de L-ADN de detección
biotinilada (= sonda detectora; aquí: 5'- (BB) TTT TTT TT A GCT CTG
CAC AGC GCT-3' (SEQ ID NO: 7)). Para esto, se une
un conjugado de estreptavidina fosfatasa alcalina al complejo en una
etapa adicional. Después de la adición de un sustrato
quimioluminiscente, se genera luz y se mide en un luminómetro.
Inmovilización de la sonda oligonucleotídica:
100 g de la sonda de captura (0,75 pmoles/\mul en tampón de
acoplamiento: 50 mM Na_{2}HPO_{4} pH 8,5, 0,5 mM EDTA) por
pocillo se transfirieron a placas DNA BIND (COSTAR) y se incubaron
toda la noche a 4ºC. Posteriormente, se lavó con 3 x 200 \mul de
tampón de acoplamiento cada una y se incubaron durante 1 h a 37ºC
con 200 \mul de tampón de bloqueo (BSA al 0,5% (p/v) en tampón de
acoplamiento) cada una. Después de un nuevo lavado con 200 \mul de
tampón de acoplamiento y 3 x 200 \mul de tampón de hibridación 1
(0,5 x SSC pH 7,0, SDS al 0,5% (p/v)) las placas pueden usarse para
la detección.
Hibridación y detección: se preparó una
disolución de 20 pmoles/\mul de la sonda L-ADN de
detección (= sonda detectora) en 10 mM Tris-HCl pH
8,0. Se mezclaron 10 \mul de plasma con EDTA (o ddH_{2}O) con 90
\mul de tampón de hibridación 1 (0,5 x SSC pH 7,0, SDS al 0,5%
(p/v). Posteriormente, se añadieron 2 \mul de la disolución de la
sonda detectora (20 pmoles/\mul), se mezclaron y se centrifugaron.
Después se realizó una etapa de desnaturalización a 95ºC durante 10
min en el Termociclador (MJ Research). Los lotes se transfirieron a
pocillos DNA-BIND preparados adecuadamente (véase
anteriormente) y se incubaron durante 2 h a 50ºC. Después de eso,
se realizaron etapas de lavado: 2 x 200 \mul tampón de hibridación
1 (0,5 x SSC pH 7,0, SDS al 0,5% (p/v) y 3 x 200 \mul 1 x
TBS/Tween 20 (20 mM Tris-Cl pH 7,6, 137 mM NaCl,
Tween 20 al 0,1% (v/v). Se diluyó 1 \mul de conjugado
estreptavidina fosfatasa alcalina (Promega) con 5 ml 1 x TBS/Tween
20. Se añadieron 100 \mul del conjugado diluido por pocillo y se
incubó a temperatura ambiente durante 30 min. Se realizaron las
etapas de lavado siguientes: 1 x 200 \mul 1 x TBS/Tween 20 y 3 x
200 \mul 1 x tampón de ensayo (20 mM Tris-Cl pH
9,8, 1 mM MgCl_{2}). Finalmente, se añadieron 100 \mul CSPD
"Sustrato Listo Para Usarse" (Applied Biosystems), se incubó
30 min a temperatura ambiente y se midió la quimioluminiscencia en
un lector de placas multidetección POLARstar Galaxy (BMG
Labtechnologies).
Las curvas de
concentración-tiempo del L-ARN
PEGilado después de la dosis intravenosa y subcutánea se muestran
en la Fig. 28a y Fig. 28c. Los perfiles de concentración del
L-ARN no modificado después de la dosis intravenosa
y subcutánea se muestran en la Fig. 28b y Fig. 28d. Después de la
dosis intravenosa, el tiempo medio terminal es 50 minutos para el
L-ARN no modificado. Para la sustancia PEGilada, por
el contrario, resulta un tiempo medio de aproximadamente 18 horas.
Después de la dosis subcutánea, el tiempo medio terminal es 84
minutos para el L-ARN no modificado, para la
sustancia PEGilada, por el contrario, resulta una fase de
eliminación muy larga.
Así, se muestra, que el ácido
L-nucleico modificado según la invención es
ventajoso en comparación con el ácido L-nucleico no
modificado. Esta ventaja surge también con vista al estado de la
técnica, descrito por ejemplo por Watson S.R. et al.,
Antisense nucleic acid drug dev. 10. 63-75 (2000).
En esta publicación, se examina un aptámero
2'-F-modificado, que se une a
L-selectina. El tiempo medio farmacocinético del
aptámero 2'-F PEGilado (40 kDa PEG) administrado
intravenosamente in vivo a ratas
Sprague-Dawley es 228 min y es así claramente
inferior al de los ácidos L-nucleicos modificados
según la invención.
\vskip1.000000\baselineskip
Se generó un ácido
L-ribonucleico para el examen del perfil
farmacológico de L-ARN no modificado y PEGilado en
ratas. El L-ARN tiene la secuencia siguiente:
5'-UAA GGA AAC UCG GUC UGA UGC GGU AGC GCU GUG CAG AGC U-3' | (SEQ ID NO: 4) |
La síntesis del L-ARN con la
secuencia mostrada anteriormente se realizó en un Sintetizador ÄKTA
Pilot 10 (Amersham Pharmacia Biotech, Uppsala, Suecia) en una
escala de 20 \muM en una fase sólida CPG 1.000 \ring{A} según
la química de 2-cianoetil fosforamidita.
Posteriormente, se acopló
6-(monometoxitritilamino)-hexil-(2-cianoetil)-(N,N-diisopropil)-fosforamidita
al extremo 5' del L-ARN
(5'-MMT-aminohexil-L-ARN)
para permitir la conjugación después de la síntesis con PEG.
Después de terminar la síntesis, El
5'-MMT-aminohexil-L-ARN
se escindió de la fase sólida por una incubación de 30 min en
disolución de metilamina al 41% a 65ºC y las nucleobases se
desprotegieron completamente. La desprotección de la posición 2' se
hizo por incubación en 1,5 ml DMSO, 0,75 ml trietilamina (TEA) y 1
ml TEA 3HF durante 2 h a 60ºC. Se hizo una primera purificación
mediante RP-HPLC. La escisión del grupo protector
monometoxitritilo se realizó con ácido acético al 80% en 70 min a
RT. El ácido acético se eliminó por coevaporación dos veces con
etanol y el
5'-aminohexil-L-ARN
según la SEQ ID NO: 4 se purificó por precipitación en etanol
(rendimiento: 220 OD, 60% puro). El producto se recogió en 1 M
acetato de sodio, pH 8,0 y se desaló mediante cromatografía de
exclusión por tamaño con una columna Sephadex G10 o con Vivaspin
3000 (Vivascience, Hannover, Alemania).
El L-ARN
5'-amino modificado de dicha manera (530 OD, 60%
puro) se preparó en tampón acuoso universal según Theorell y
Stenhagen (33 mM citrato de sodio, 33 mM fosfato de sodio, 57 mM
borato de sodio, pH 7,5) (7,5 ml), se calentó a 37º C, se añadió
DMF (5 ml) y se añadió en partes polvo de éster activado de
N-hidroxisuccinimidilo (NHS) de poli (etilen)
glicol ramificado de 40.000 Da (2 eq cada 45 min, en total 18 eq).
El progreso de la reacción se monitorizó por electroforesis en gel
analítica (8% poliacrilamida, 8,3 M urea) o HPLC analítica de
intercambio iónico. El producto bruto se purificó inicialmente por
HPLC analítica de intercambio iónico del PEG en exceso (Fuente Q;
disolvente A: 10 mM hidrógenocarbonato de sodio, pH 7,5, disolvente
B: 10 mM hidrógenocarbonato de sodio, pH 7,5, 2 M cloruro de sodio,
carga de la columna y elución de PEG libre con 5% B; velocidad de
caudal 20 ml/min; separación y elución del conjugado
PEG-L-ARN del L-ARN
que no ha reaccionado con un gradiente hasta 35% B durante 20
volúmenes de columna; velocidad de caudal 50 ml/min), posteriormente
se desala por ultrafiltración (Labscale TFF System, Millipore). Por
liofilización, se obtuvo el producto deseado como un polvo blanco
(254 OD, 48% (80% respecto a la pureza del producto de
partida)).
De manera análoga, ácidos
L-nucleicos adicionales incluyendo la secuencia
según la SEQ ID NO: 1 se unieron con diferentes PEG (10.000 Dalton
lineal, 20.000 Dalton lineal, 20.000 Dalton ramificado, 35.000
Dalton lineal) y se purificaron.
\vskip1.000000\baselineskip
Se orquidectomizaron ratas macho, por lo que el
nivel de LH de las ratas se incrementó de manera constante durante
los ocho días siguientes debido a la ausencia de señal de
retroalimentación de la testosterona. En el día 8 el
PEG-GnRH spiegelmer de ADN (NOX 1255) se administró
subcutáneamente a cinco ratas (100 mg/kg). Se tomaron muestras de
sangre en el día 0 (antes de la orquidectomía), en el día 8 (0 horas
antes de la aplicación s.c. del GnRH spiegelmer), así como 0,5 h,
1,5 h, 3 h, 6 h 24 h después de la aplicación s.c. y se determinó
el nivel respectivo de LH usando radioinmunoenmsayo (RIA). En
paralelo, se administró sólo el vehículo (tampón PBS, pH 7,4) s.c.
como control negativo a cinco ratas macho orquidectomizadas y el
antagonista estándar Cetrorelix (100 \mug/kg) s.c. como control
positivo a cinco ratas macho orquidectomizadas. El resultado se
muestra en la Fig. 29.
Los niveles de LH disminuyeron en el grupo GnRH
spiegelmer de ADN (en la Fig. 29 representado como círculos) y
alcanzaron su punto más bajo después de 1,5 h, y se mantuvieron
durante aproximadamente 3 h. Esta reducción es comparable con ratas
no orquidectomizadas y las ratas, respectivamente, tratadas con
Cetrorelix (antagonista estándar). Seis horas después de la dosis
de GnRH spiegelmer de ADN los niveles de LH se incrementaron
lentamente y alcanzaron el nivel del grupo control no tratado en 24
h.
Así, el efecto biológico del GnRH spiegelmer de
ADN es observable durante un periodo de 3 horas, mientras que el
GnRH spiegelmer de ADN PEGilado es activo durante un periodo de 24
horas (véase el ejemplo 5).
Las referencias proporcionadas en lo que sigue
corresponden a las citas, proporcionadas con números en superíndice,
proporcionadas en la presente memoria.
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Las características de la invención descritas en
la descripción anterior, las reivindicaciones así como las figuras
pueden ser esenciales individualmente así como en cualquier
combinación para la comprensión de la invención en sus diferentes
realizaciones.
<110> Noxxon Pharma AG
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Ácido L-Nucleico
Modificado
\vskip0.400000\baselineskip
<130> N 10032 PCT
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn versión 3.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 67
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: ácido L-nucleico, que se une
específicamente a GnRH
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: ácido L-nucleico modificado
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> grupo NH_{2} en el extremo 5'
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base_modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: ácido L-nucleico modificado
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<223> grupo PO_{4} en el extremo 5'
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ARN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> L-ARN
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(40)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ARN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> L-ARN
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(40)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
PEG-L-ARN 40 kDalton
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> L-ARN
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Modificación con PEG en el extremo
5'
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> L-ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> sonda de captura de
L-ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> L-ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (32)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> NH_{2} en el extremo 3'
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> ácido nucleico artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> sonda detectora de
L-ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> ácido nucleico artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> biotinilado en el extremo 5'
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\hskip1cm
Claims (19)
1. Un ácido L-nucleico
modificado, que comprende un resto de ácido
L-nucleico y un resto diferente de ácido
L-nucleico, en el que el resto de ácido
L-nucleico está conjugado con el resto diferente de
ácido L-nucleico, y la conjugación del resto de
ácido L-nucleico con el resto diferente de ácido
L-nucleico da lugar a una excreción retardada de un
organismo comparada con un ácido L-nucleico que
comprende sólo el resto de ácido L-nucleico, en el
que dicho resto de ácido L-nucleico es un spiegelmer
y el resto diferente de ácido L-nucleico se
selecciona del grupo que consiste en
poli(etilen)glicol lineal,
poli(etilen)glicol ramificado, hidroxietil almidón,
péptidos, proteínas, polisacáridos, esteroles, polioxipropileno,
polioxiamidato,
poli(2-hidroxietil)-L-glutamina
y polietilen glicol preciso.
2. Un ácido L-nucleico
modificado, que comprende un resto de ácido
L-nucleico y un resto diferente de ácido
L-nucleico, en el que el resto de ácido
L-nucleico está conjugado con el resto diferente de
ácido L-nucleico, y la conjugación del resto de
ácido L-nucleico con el resto diferente de ácido
L-nucleico da lugar a un tiempo de retención
incrementado en un organismo comparado con un ácido
L-nucleico que comprende sólo el resto de ácido
L-nucleico, y en el que dicho resto de ácido
L-nucleico es un spiegelmer y el resto diferente de
ácido L-nucleico se selecciona del grupo que
consiste en poli(etilen)glicol lineal,
poli(etilen)glicol ramificado, hidroxietil almidón,
péptidos, proteínas, polisacáridos, esteroles, polioxipropileno,
polioxiamidato,
poli(2-hidroxietil)-L-glutamina
y polietilen glicol preciso.
3. Un ácido L-nucleico
modificado, particularmente de la reivindicación 1 y/o la
reivindicación 2, que comprende un resto de ácido
L-nucleico y un resto diferente de ácido
L-nucleico, en el que el resto de ácido
L-nucleico está conjugado con el resto diferente de
ácido L-nucleico, y el resto diferente de ácido
L-nucleico tiene un peso molecular de más de 300
Da, preferiblemente más de 20.000 Da, y más preferiblemente más de
40.000 Da.
4. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3,
caracterizado porque el ácido L-nucleico
modificado tiene un peso molecular de 600 a 500.000 Da,
preferiblemente de 10.000 a 400.000 Da, más preferiblemente de
50.000 a 300.000 Da.
5. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4,
caracterizado porque el resto de ácido
L-nucleico tiene un peso molecular de 300 a 50.000
Da, preferiblemente de 5.000 a 25.000 Da, más preferiblemente de
7.000 a 15.000 Da.
6. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5,
caracterizado porque el resto diferente de ácido
L-nucleico está unido directamente o indirectamente
al resto de ácido L-nucleico a través de un grupo
funcional del resto de ácido L-nucleico, que está
presente en o unido a uno de los componentes siguientes del ácido
L-nucleico, en el que el grupo funcional se
selecciona del grupo que comprende fosfatos terminales y no
terminales, porciones de azúcar terminales y no terminales, y bases
de purina naturales y no naturales y bases de pirimidina naturales
y no naturales.
7. El ácido L-nucleico
modificado de la reivindicación 6, caracterizado porque la
unión del resto diferente de ácido L-nucleico con
el resto de ácido L-nucleico ocurre a través del
grupo 2'-OH, 3'-OH y/o
5'-OH o un derivado de estos, o uno o más de los
restos de azúcar del resto de ácido L-nucleico.
8. El ácido L-nucleico
modificado de la reivindicación 6 ó 7, caracterizado porque
la unión ocurre a través de al menos una de las posiciones 5 ó 6 de
la base de pirimidina.
9. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8,
caracterizado porque la unión ocurre a través de al menos
una de las bases de purina, en el que la unión ocurre
preferiblemente en la posición 8.
10. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9,
caracterizado porque la unión ocurre en uno o más de los
grupos amino exocíclicos y/o endocíclicos y/o grupos ceto de las
bases de purina y/o pirimidina y/o posición o posiciones
abásicas.
11. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10,
caracterizado porque se dispone un conector entre el resto
de ácido L-nucleico y el resto diferente de ácido
L-nucleico.
12. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11,
caracterizado porque el resto de ácido
L-nucleico comprende un ácido nucleico según la SEQ
ID NO: 1.
13. El ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12,
caracterizado porque el resto de ácido
L-nucleico tiene un
6-aminohexilfosfato en el extremo
5'-OH como un conector.
14. El ácido L-nucleico
modificado de la reivindicación 13, caracterizado porque se
acopla polietilen glicol al amino libre del conector
aminohexilfosfato.
15. Uso del ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14 para la
fabricación de un medio de diagnóstico.
16. Uso del ácido L-nucleico
modificado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14 para la
preparación de un medicamento.
17. Un método para la preparación de un ácido
L-nucleico modificado que comprende un resto de
ácido L-nucleico y un resto diferente de ácido
L-nucleico de una cualquiera de las reivindicaciones
1 a 14, caracterizado por las etapas siguientes:
a) proporcionar un ácido
L-nucleico, que forma el resto de ácido
L-nucleico o una parte de éste, del ácido
L-nucleico modificado;
b) proporcionar uno diferente de ácido
L-nucleico, que forma el resto diferente de ácido
L-nucleico o una parte de éste, del ácido
L-nucleico modificado;
c) hacer reaccionar el ácido
L-nucleico de a) y el diferente de ácido
L-nucleico de b); y
d) opcionalmente aislar el ácido
L-nucleico modificado obtenido en la etapa c), en el
que el resto de ácido L-nucleico es un
Spiegelmer.
18. El método de la reivindicación 17,
caracterizado porque el ácido L-nucleico de
la etapa a) comprende un conector.
19. El método de la reivindicación 17,
caracterizado porque después de proporcionar el ácido
L-nucleico en la etapa a) se proporciona con un
conector.
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