ES2345167T3 - Utilizacion de nnmt como marcador de cancer de pulmon. - Google Patents

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Abstract

Método para la evaluación del cáncer de pulmón in vitro, que comprende medir en una muestra la concentración de proteínas de: a) nicotinamida N-metiltransferasa (NNMT), b) opcionalmente otro u otros marcadores de cáncer de pulmón, y c) utilizar la concentración determinada en la etapa (a), y opcionalmente en la etapa (b), en la evaluación de cáncer de pulmón, en la que un incremento de NNMT es indicativo de cáncer de pulmón.

Description

Utilización de NNMT como marcador de cáncer de pulmón.
La presente invención se refiere a un método que ayuda en la evaluación del cáncer pulmonar o de pulmón (=LC) y en particular en la evaluación del carcinoma pulmonar de células no pequeñas (NSCLC). Da a conocer la utilización de la proteína nicotinamida N-metiltransferasa (=NNMT) como marcador del LC, particularmente del NSCLC. Además, se refiere especialmente a un método para evaluar el cáncer de pulmón en una muestra líquida derivada de un individuo, mediante la medición de NNMT en dicha muestra. La medición de NNMT puede utilizarse, por ejemplo, para la detección precoz del cáncer de pulmón o para la vigilancia de pacientes sometidos a cirugía.
El cáncer sigue siendo un reto importante de salud pública a pesar de los avances en la detección y terapia. Entre los diversos tipos de cáncer, LC es un cáncer frecuente en el mundo occidental y entre las causas más frecuentes de mortalidad relacionada con cáncer. Ello se debe en gran parte al vacío diagnóstico en la detección precoz de la enfermedad. LC es en gran parte asintomática en sus primeros estadios. La mayoría de todos los cánceres de pulmón se detecta en un estadio tardío, cuando la enfermedad ya se ha convertido en inoperable.
La mayoría de tumores de LC puede dividirse en carcinoma de pulmón de células pequeñas (SCLC) y en carcinoma de pulmón de células no pequeñas (NSCLC). SCLC explica aproximadamente 20% a 25% de todos los casos de cáncer de pulmón. SLCL es un tipo neuroendocrino agresivo de LC y presenta un muy mal pronóstico, incluso en el caso de que se detecte en estadios tempranos. El SCLC raramente puede tratarse de manera curativa mediante resección. Debido a la velocidad a la que progresa la enfermedad, el SCLC generalmente se clasifica utilizando únicamente dos estadios: enfermedad limitada y enfermedad extensiva, y no el sistema de estadificación más complejo llamado TNM (ver posteriormente). Aproximadamente 75% a 80% de los casos de LC se agrupan en la clase de NSCLC, incluyendo el carcinoma de células escamosas (carcinoma=CA), el adeno-CA (que comprende las subclases de CA acinar, CA papilar, tumor broncoalveolar, tumor sólido y subtipos mixtos) y el carcinoma de células grandes (que comprende las subclases de tumores de células gigantes, el CA de células claras, el CA adenoescamoso y el CA no diferenciado).
El NSCLC, en caso de detectarse en estadios tardíos, también presenta un muy mal pronóstico. La estadificación del cáncer es la clasificación de la enfermedad en términos de extensión, progresión y severidad. Agrupa a los pacientes de cáncer de manera que puedan realizarse generalizaciones sobre el pronóstico y la elección de terapia.
En la actualidad, el sistema TNM es el sistema de clasificación más ampliamente utilizado, basado en la extensión anatómica del cáncer. Representa un sistema de estadificación uniforme internacionalmente aceptado. Existen tres variables básicas: T (la extensión del tumor primario), N (el estado del os nódulos linfáticos regionales) y M (la presencia o ausencia de metástasis distantes). Los criterios del TNM han sido publicados por el UICC (International Union Against Cancer), en: TNM Classification of Malignant Tumours, quinta edición, Sobin L.H. y Witteking, Ch. (editores), Wiley-Liss, 1997, páginas 1803-1804).
La resección quirúrgica del tumor primario se acepta ampliamente como el tratamiento de elección para el NSCLC de estadio temprano. Con la progresión del NSCLC y, más específicamente, la transición del estadio IIIa (T3N1M0, T1N2M0, T2N2M0, T3N2M0) a IIIb (T4N0M0, T4N1M0, T4N2M0), se precipita un cambio significativo en el enfoque médico. Sin embargo, en el caso de que el cáncer se detecte durante los estadios más tempranos (Ia-IIIa, preferentemente hasta el estadio T3N1M0), la tasa de supervivencia a los cinco años varía entre 35% y 80%. La detección en el estadio Ia ((T1N0M0), pequeño tamaño del tumor, sin metástasis) evidentemente presenta un mejor pronóstico, con una supervivencia a los cinco años de hasta 80%.
La cirugía se utiliza raramente o nunca en el control del NSCLC de estadio IIIb-IV. El estadio IV corresponde a metástasis distantes, es decir, la extensión de la enfermedad más allá de los pulmones y de los nódulos linfáticos regionales. La tasa de supervivencia a cinco años en los últimos estadios (III-IV) cae a entre menos de 1% y 15%.
Lo que resulta especialmente importante es que el diagnóstico precoz del NSCLC se traduce en un pronóstico mucho mejor. Los pacientes diagnosticados como de estadio temprano, tal como en estadio Ia (T1N0M0), Ib (T2N0M0), IIa (T1N1M0), IIb (T3N0M0) e IIIa (T3N1M0), en caso de ser tratados correctamente presentan una probabilidad de supervivencia a 5 años tras el diagnóstico de hasta 80%. Esto debe compararse con una tasa de supervivencia a 5 años inferior a 1% para los pacientes diagnosticados una vez se encuentran ya presentes metástasis distantes.
En el sentido de la presente invención, la evaluación precoz del LC se refiere a una evaluación en un estadio tumoral T1N0M0 o T1-3N0-1M0.
Resulta preferente que el LC se evalúe en el estadio T1-3N0-1M0 (=T1-30-1M0).
La mayoría de cánceres de pulmón se detecta al convertirse en sintomáticos. Entre los métodos actuales de detección se incluyen los rayos X torácicos, la tomografía computerizada espiral, la citología de esputo y la bronquioscopia. Sin embargo, existe una controversia sobre la conveniencia de estos medios para los cribados en masa.
Existen varios marcadores tumorales séricos para los cánceres de pulmón que se utilizan clínicamente. El fragmento soluble de 30 kDa de la citoqueratina 19 (CYFRA 21-1), el antígeno carcinoembriogénico (CEA), la enolasa específica de neuronas (NSE) y el antígeno de carcinoma de células escamosas (SCC) son los marcadores de LC más prominentes. Sin embargo, ninguno de ellos cumple los criterios de sensibilidad y especificidad requeridos para una herra-
mienta de cribado (Thomas L., Labor und Diagnose, TH Books Verlagsgesellschaft, Frankfurt/Main, Alemania, 2000).
Con el fin de que resulten de utilidad clínica, un marcador diagnóstico nuevo como marcador único debería ser comparable a otros marcadores conocidos de la técnica, o mejor. Alternativamente, un marcador nuevo debería conducir a un avance en la sensibilidad y/o especificidad diagnóstico en el caso de que se utilice solo o en combinación con uno o más otros marcadores, respectivamente. La sensibilidad y/o especificidad diagnósticas de un ensayo se evalúan mejor a partir de sus características de operación por parte del receptor, que se describen en detalle posteriormente.
Las fuentes más ampliamente utilizadas de muestra en la rutina clínica son la sangre completa, el suero o el plasma. La identificación de un marcador precoz de tumor de LC que ayudaría en la detección fiable del cáncer o proporcionaría información pronóstica precoz podría conducir a un método que ayudaría mucho en el diagnóstico y en el control de esta enfermedad. Por lo tanto, existe una necesidad clínica urgente de mejorar la evaluación in vitro de LC. Resulta especialmente importante mejorar el diagnóstico precoz del LC, debido a que los pacientes diagnosticados precozmente, la probabilidad de supervivencia es mucho más alta en comparación con aquellos diagnosticados en un estadio avanzado de la enfermedad.
La utilidad clínica de los marcadores bioquímicos en el cáncer de pulmón se ha revisado recientemente (Duffy M.J., Crit. Rev. Clin. Lab. Sci. 38:225-262, 2001).
En la actualidad CYFRA 21-1 se considera el mejor de los marcadores tumorales conocidos actualmente para el cáncer de pulmón. Aunque no es específico de un órgano, se encuentra predominantemente en tejido pulmonar. La sensibilidad de CYFRA 1-1 para el cáncer de pulmón se describe que se encuentra comprendida entre 46% y 61% a una especificidad de 95% hacia otras enfermedades pulmonares benignas. Los niveles séricos incrementados de CYFRA 21-1 también se asocian a enfermedades hepáticas benignas pronunciadas, insuficiencia renal y cáncer de vejiga invasivo. Se recomienda el análisis de CYFRA 21-1 para la vigilancia de la terapia postoperatoria.
CEA pertenece al grupo de antígenos carcinofetales, habitualmente producidos durante la embriogénesis. CEA no es específico de un órgano y se utiliza predominantemente para el seguimiento del cáncer colorrectal. Aparte de las malignidades, también varias enfermedades benignas, tales como la cirrosis, la bronquitis, la pancreatitis y las enfermedades autoinmunológicas, se asocian a niveles séricos incrementados de CEA. La especificidad para las enfermedades pulmonares benignas es de 95%, mientras que su sensibilidad para el cáncer de pulmón se informa que es de entre 29% y 44%. Un uso preferente de CEA es la vigilancia de la terapia del cáncer de pulmón.
NSE es un marcador tumoral de SCLC. Generalmente se encuentran niveles séricos incrementados de NSE en asociación con tumores neuroectodérmicos y neuroendocrinos. También se observan niveles séricos incrementados en pacientes con enfermedades pulmonares benignas y enfermedades cerebrales, tales como meningitis u otras enfermedades inflamatorias del cerebro, y lesiones traumáticas de la cabeza. Aunque la sensibilidad para el SCLC a una especificidad de 95% se informa que es de entre 60% y 87%, el rendimiento del ensayo de NSE para el NSCLC es pobre (7% a 25%). Se recomienda NSE para la vigilancia de la terapia del SCLC.
SCC fue identificado originalmente en el CA de células escamosas del cérvix. La sensibilidad de SCC para el LC en general es baja (18% a 27%). Por lo tanto, el ensayo de SCC no se considera adecuado para el cribado. Sin embargo, debido a la mayor sensibilidad del CA de células escamosas, un uso preferente de SCC es la vigilancia de la terapia, aunque CYFRA 21-1 generalmente funciona mejor.
Con respecto a los perfiles de marcadores y con el objetivo de alcanzar un diagnóstico mejorado del cáncer de pulmón, ha sido publicado un método (Schneider J. et al., Int. J. Clin. Oncol. 7:145-151, 2002) utilizando algoritmos de clasificación basados en lógica difusa para combinar niveles séricos de CYFRA 21-1, NSE y proteína C reactiva (CRP), que es un marcador general de inflamación. Los autores informan de una sensibilidad de 92% a una especificidad de 95%.
La tarea de la presente invención fue investigar si puede identificarse un marcador bioquímico que pueda utilizarse para evaluar el LC.
Inesperadamente se ha encontrado que la utilización del marcador NNMT puede superar, por lo menos parcialmente, algunos de los problemas de los marcadores actualmente conocidos del estado de la técnica.
La presente invención se refiere a un método para evaluar el cáncer de pulmón in vitro, que comprende medir en una muestra la concentración de NNMT, y utilizar la concentración determinada en la evaluación del cáncer de pulmón. Inesperadamente pudo establecerse que un nivel incrementado de NNMT en una muestra es indicativo, por ejemplo, para la presencia de cáncer de pulmón en un individuo.
La presente invención también se refiere a un método para evaluar el LC in vitro mediante marcadores bioquímicos, que comprende medir en una muestra la concentración de NNMT y uno o más otros marcadores de LC y utilizar las concentraciones determinadas en la evaluación del LC. Resulta preferente la selección de otro u otros marcadores de LC de entre el grupo que consiste de CYFRA 21-1, CEA, NSE y SCC.
La presente invención, en una realización preferente, también se refiere a la utilización de un panel de marcadores que comprende por lo menos NNMT y CYFRA-21 en la evaluación del LC.
La presente invención también se refiere a la utilización de un panel de marcadores que comprende por lo menos NNMT y CEA en la evaluación del LC.
La presente invención también se refiere a la utilización de un panel de marcadores que comprende por lo menos NNMT y SCC en la evaluación del LC.
En una realización preferente, la presente invención se refiere a un método para evaluar el cáncer de pulmón in vitro, que comprende medir en una muestra la concentración de: a) NNMT, b) opcionalmente uno o más otros marcadores del cáncer de pulmón, y c) utilizar las concentraciones determinadas en la etapa (a), y opcionalmente en la etapa (b), en la evaluación del cáncer de pulmón.
La NNMT (nicotinamida N-metiltransferasa, EC 2.1.1.1) cataliza la N-metilación de la nicotinamida y otras piridinas. La proteína NNMT (Swiss-PROT:P40261) se caracteriza por la secuencia proporcionada en SEC ID nº 1. NNMT presenta un peso molecular aparente de 29,6 kDa y un punto isoeléctrico de 5,56.
La actividad de NNMT resulta importante para la biotransformación de muchos fármacos y compuestos xenobióticos. Se ha informado que la proteína se expresa predominantemente en el hígado y que se localiza en el citoplasma. NNMT ha sido clonada a partir de ADNc de hígado humano y contiene un marco de lectura abierto de 792 nucleótidos codificante de una proteína de 264 aminoácidos con una masa molecular calculada de 29,6 kDa (Aksoy S. et al., J. Biol. Chem. 269:14835-14840, 1994). Se conoce poco en la literatura sobre un papel potencial del enzima en el cáncer humano. En un artículo, se ha informado de actividad enzimática hepática incrementada de NNMT como marcador de la caquexia del cáncer en ratones (Okamura A. et al., Jpn. J. Cancer Res. 89:649-656, 1998). En un informe reciente, se demostró la regulación negativa del gen NNMT en respuesta a radiación en líneas celulares sensibles a la radiación. En la patente US nº 2006/0024692, se encontró que el nivel de ARNm de NNMR era más bajo en células de carcinoma pulmonar de células no pequeñas en comparación con tejido no canceroso. La patente WO nº 02/0827076 describe una proteína NNMR como marcador de subtipos de carcinoma renal.
Tal como se utiliza en la presente memoria, cada una de las expresiones siguientes presenta el significado asociado a las mismas en la presente sección.
Los artículos "uno" y "una" se utilizan en la presente memoria para referirse a uno o a más de uno (es decir, a por lo menos uno) del objeto gramatical del artículo. A título de ejemplo, "un marcador" se refiere a un marcador o a más de un marcador.
La expresión "marcador" o "marcador bioquímico" tal como se utiliza en la presente memoria se refiere a una molécula que se utilizará como diana en el análisis de la muestra de un paciente. Son ejemplos de dichas dianas moleculares las proteínas o polipéptidos mismos, así como anticuerpos de dichas dianas tal como se encuentran presentes en una muestra. La expresión "uno o más" se refiere a 1 a 20, preferentemente 1 a 10, preferentemente 1 a 5, más preferentemente 3 ó 4.
Las proteínas o polipéptidos utilizados como marcador en la presente invención se contempla que incluyan variantes naturales de dicha proteína, así como fragmentos o complejos naturales de dicha proteína o de dicha variante, en particular fragmentos o complejos inmunológicamente detectables, respectivamente.
Tal como resultará evidente para el experto en la materia, la presente invención no debe interpretarse como limitada a la medición de la proteína NNMT de longitud completa de secuencia SEC ID nº 1. También pueden medirse fragmentos fisiológicos de NNMT y utilizarse como marcador para el cáncer de pulmón durante la práctica de la presente invención. Los fragmentos inmunológicamente detectables preferentemente comprenden por lo menos 6, 7, 8, 10, 12, 15 ó 20 aminoácidos contiguos de dicho polipéptido marcador. El experto en la materia reconocerá que las proteínas que son liberadas por las células o que se encuentran presentes en la matriz extracelular pueden resultar dañadas, por ejemplo durante la inflamación, y podrían ser degradadas o cortadas en dichos fragmentos. Tal como apreciará el experto en la materia, NNMT o fragmentos de la misma también pueden encontrarse presentes como parte de un complejo. Dicho complejo también puede utilizarse como marcador en el sentido de la presente invención. Además, o alternativamente, el polipéptido NNMT puede incluir una modificación post-traduccional, preferentemente una glucosilación, acilación y/o fosforilación, y dicha NNMT modificada también puede servir como marcador del LC.
La expresión "evaluación del cáncer de pulmón" se utiliza para indicar que el método según la presente invención ayudará (solo o conjuntamente con otros marcadores o variables, por ejemplo los criterios proporcionados por la UICC (ver anteriormente)), por ejemplo, al médico para establecer o confirmar la ausencia o presencia del LC, o ayudará al médico en el pronóstico, detección de la recurrencia (en el seguimiento de los pacientes tras la cirugía) y/o en el seguimiento del tratamiento, especialmente de la quimioterapia.
El término "muestra" tal como se utiliza en la presente memoria se refiere a una muestra biológica obtenida con el propósito de la evaluación in vitro. En los métodos de la presente invención, la muestra o muestra del paciente preferentemente puede comprender cualquier líquido corporal. Son muestras preferentes, sangre completa, suero, plasma, lavado bronquial o esputo, respectivamente, siendo los más preferentes plasma o suero.
Los inventores de la presente invención inesperadamente han podido detectar el marcador NNMT en un porcentaje significativo de muestras derivadas de pacientes con LC. Todavía más inesperadamente, han podido demostrado que la presencia de NNMT en dicha muestra líquida obtenida de un individuo puede utilizarse en la evaluación del cáncer de pulmón.
En una realización preferente, la presente invención se refiere a un método para evaluar el LC mediante la medición en una muestra, de la concentración de NNMT y la utilización de la concentración determinada en la evaluación del LC.
Tal como apreciará el experto en la materia, cualquiera de dichas mediciones se realiza in vitro. La muestra del paciente se descarta posteriormente. La muestra del paciente se utiliza únicamente para el método diagnóstico in vitro de la invención y el material de la muestra del paciente no se transfiere nuevamente al cuerpo del paciente. Típicamente la muestra es una muestra líquida, por ejemplo sangre completa, suero o plasma.
Tal como apreciará el experto en la materia a partir de los ejemplos descritos, NNMT ha sido identificada mediante la medición en un inmunoensayo como marcador que resulta útil en el diagnóstico del LC; pueden utilizarse maneras alternativas para alcanzar un resultado comparable a los resultados de la presente invención. La proteína marcadora NNMT puede detectarse mediante cualquier medio apropiado y utilizarse como marcador del LC. Dichos medios apropiados preferentes comprenden la detección de la NNMT mediante un procedimiento de inmunoensayo, mediante cualquier otra forma de ensayo de unión, mediante la medición de su actividad enzimática, mediante cromatografía líquida, especialmente cromatografía líquida de alto rendimiento, mediante electroforesis, especialmente SDS-PAGE en combinación con transferencia western y mediante espectroscopía de masas.
El escenario ideal para el diagnóstico sería una situación en la que un único suceso o proceso causaría la enfermedad respectiva, tal como, por ejemplo, en enfermedades infecciosas. En los demás casos, el diagnóstico correcto puede resultar muy difícil, especialmente en el caso de que la etiología de la enfermedad no se entiende por completo, tal como ocurre con el LC. Tal como apreciará el experto en la materia, ningún marcador bioquímico, por ejemplo en el campo del LC, es diagnóstico con una especificidad del 100% y simultáneamente con una sensibilidad de 100% para una enfermedad dada. Por el contrario, pueden utilizarse marcadores bioquímicos, por ejemplo CYFRA 21-1, CEA, NSE, SCC, o tal como se muestra en la presente memoria, NNMT, par evaluar con una determinada probabilidad o valor predictivo, la presencia o ausencia de una enfermedad. Por lo tanto, en el diagnóstico clínico rutinario, generalmente se consideran conjuntamente diversos síntomas clínicos y marcadores biológicos en el diagnóstico, tratamiento y control de la enfermedad subyacente.
Los marcadores bioquímicos pueden determinarse individualmente o, en una realización preferente de la invención, pueden medirse simultáneamente utilizando un chip o una tecnología de matrices basada en perlas. Las concentraciones de los marcadores biológicos seguidamente se interpretan individualmente utilizando un valor de corte individual para cada marcador o se combinan para la interpretación.
En una realización preferente adicional, la evaluación del LC según la presente invención se lleva a cabo en un método que comprende medir en una muestra la concentración de: a) NNMT, b) uno o más otros marcadores de cáncer de pulmón, y c) utilizando la concentración determinada en las etapas (a) y (b) en la evaluación del cáncer de pulmón. Tal como resultará evidente para el experto en la materia, la medición de la NNMT y la medición del marcador o marcadores de cáncer de pulmón pueden realizarse alternativamente a partir de la misma alícuota de una muestra, o a partir de diferentes alícuotas.
Según los datos mostrados en la sección de Ejemplos, el marcador NNMT, tanto en el análisis univariante como en el análisis multivariante realizados, presenta (a una especificidad de aproximadamente 95%), una sensibilidad notable para el LC, de prácticamente 50%, y a este respecto se encontró que era comparable o incluso superior a otros marcadores del LC investigados. En la evaluación del LC, el marcador NNMT resultará ventajoso en uno o más de los aspectos siguientes: cribado, ayuda al diagnóstico, pronóstico, seguimiento de la terapia, tal como la quimioterapia, la radioterapia y la inmunoterapia.
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Cribado
El cribado se define como la aplicación sistemática de un ensayo para identificar los individuos bajo suficiente riesgo de sufrir LC para beneficiarse de la investigación adicional o la acción preventiva directa, de entre personas que no han buscado atención médica respecto a síntomas de LC.
Tal como demuestran los datos proporcionados en la sección de Ejemplos, NNMT por sí solo no resulta suficiente para permitir un cribado general, por ejemplo de la población de riesgo de LC. Con toda probabilidad ningún marcador bioquímico en circulación cumplirá jamás los criterios de sensibilidad y especificidad requeridos para los fines de cribado. Por el contrario, debe esperarse que resulte necesario utilizar un panel de marcadores en el cribado del LC. Los datos establecidos en la presente invención indican que el marcador NNMT formará una parte integral de un panel de marcadores apropiados para fines de cribado del LC. Un nivel incrementado de NNMT es indicativo de la presencia de LC. Los presentes datos indican además que determinadas combinaciones de marcadores resultarán ventajosas en el cribado del LC. Por lo tanto, la presente invención también se refiere a la utilización de un panel de marcadores que comprende NNMT y CYFRA 21-1, o de un panel de marcadores que comprende NNMT y CEA, o de un panel de marcadores que comprende NNMT y NSE, o de un panel de marcadores que comprende NNMT y SCC, o de un panel de marcadores que comprende NNMT y dos marcadores seleccionados de entre el grupo que consiste de CYFRA 21-1, CEA, NSE y SCC, con el fin de cribado del LC.
Ayuda al diagnóstico
Los marcadores pueden ayudar al diagnóstico diferencial de enfermedades benignas y malignas en un órgano particular, o ayudar a distinguir entre diferentes tipos histológicos de un tumor. Tal como informan Molina R. et al., Tumor Biol. 24:209-218, 2003, CEA, CA 125, CYFRA 21-1, SSC y NSE fueron utilizados como marcadores séricos para ayudar al diagnóstico histológico del LC. Los resultados de este estudio también indican que, de entre los marcadores analizados, CYFRA 21-1 es el marcador más sensible en el cáncer de pulmón, aunque sin relación con los resultados histológicos.
Debido a que NNMT como marcador único según los datos de la presente invención podría resultar superior a otros marcadores del LC tales como CEA o NSE, debe esperarse que NNMT se utilizará como ayuda al diagnóstico, especialmente mediante el establecimiento de un valor de línea base antes de la cirugía. De esta manera, la presente invención también se refiere a la utilización de NNMT para establecer un valor de línea base antes de la cirugía de LC.
Pronóstico
Los indicadores pronósticos pueden definirse como características clínicas, patológicas o bioquímicas de los pacientes de cáncer y sus tumores que predicen el resultado de la enfermedad. Su utilización principal es ayudar a planificar racionalmente el control del paciente, es decir, a evitar el infratratamiento de una enfermedad agresiva, o el sobretratamiento de una enfermedad indolente. Molina R. et al., Tumor Biol. 24:209-218, 2003, evaluaron el valor pronóstico de CEA, CA 125, CYFRA 21-1, SSC y NSE en el NSCLC, por ejemplo se evaluó la supervivencia global de los pacientes, en los que los niveles séricos anormales de los marcadores NSE, CEA y LDH (lactato deshidrogenasa) aparentemente indican una supervivencia más corta.
Debido a que NNMT por sí solo contribuye significativamente a la diferenciación de los pacientes de LC de los controles sanos, debe esperarse que ayude a evaluar el pronóstico de los pacientes que sufren LC. El nivel preoperatorio de NNMT muy probablemente se combinará con uno o más otros marcadores de LC y/o el sistema de estadificación TNM. En una realización preferente, NNMT se utiliza en el pronóstico de pacientes que presentan LC.
Seguimiento de la quimioterapia
Merle P. et al., Int. J. of Biological Markers 19:310-315, 2004, han evaluado las variaciones del nivel sérico de CYFRA 21-1 en pacientes con NSCLC localmente avanzado tratado mediante quimioterapia de inducción. Concluyeron que el seguimiento precoz de los niveles séricos de CYFRA 21-1 podría resultar una herramienta pronóstica útil para la respuesta tumoral y la supervivencia en pacientes de NSCLC de estadio III. Además, algunos informes han descrito la utilización de CEA en el seguimiento del tratamiento de pacientes que presentan LC (Fukasawa T. et al., Gan to Kagaku Ryoho. Cancer & Chemotherapy 13:1862-1867, 1986 (en japonés); Zhang H. et al., Shandong Yike Daxue Xuebao 39:537-538, 2001, 541 (en chino)). La mayoría de estos estudios eran retrospectivos, no aleatorizados y contenían un número reducido de pacientes. Tal como en el caso de los estudios con CYFRA 21-1, los estudios con CEA sugieren que: a) los pacientes con una reducción de los niveles de CEA mientras reciben quimioterapia generalmente presentan un mejor resultado clínico que aquellos pacientes cuyos niveles de CEA no se redujeron, y (b) para la práctica totalidad de los pacientes, el incremento de los niveles de CEA se asoció a progresión de la enfermedad.
Basándose en los datos mostrados en la sección de Ejemplos, debe esperarse que NNMT sea un marcador por lo menos tan bueno para el seguimiento de la quimioterapia como CYFRA 21-1 o CEA. Por lo tanto, la presente invención también se refiere a la utilización de NNMT en el seguimiento de los pacientes de LC bajo quimioterapia.
Seguimiento
Una gran parte de los pacientes que presentan LC sometidos a resección quirúrgica con objeto de eliminar por completo el tejido canceroso, posteriormente desarrollan enfermedad recurrente o metastásica (Wagner H., Chest 117:110-116, 2000; Buccheri G. et al., Ann. Thorac. Surg. 75:973-980, 2003). La mayoría de estas recaídas se produce dentro de los primeros 2 a 3 años de la cirugía. Debido a que la enfermedad recurrente/metastásica invariablemente es falta, mucha investigación se ha centrado en la identificación del LC en un estadio precoz y de esta manera, potencialmente tratable.
En consecuencia, muchos pacientes de LC se someten a un programa de vigilancia postoperatoria que frecuentemente incluye el seguimiento regular con CEA. El seguimiento en serie con CEA un años después de la resección quirúrgica se ha demostrado que detecta una enfermedad recurrente/metastásica postoperatoria temprana con una sensibilidad de aproximadamente 29%, especificidad de aproximadamente 97%, incluso en ausencia de síntomas o indicios sospechosos (Buccheri G. et al., Ann. Thorac. Surg. 75:973-980, 2003). De esta manera, el seguimiento de los pacientes que presentan LC tras la cirugía es uno de los campos más importantes de utilización de un marcador bioquímico apropiado. Debido a la elevada sensibilidad de NNMT en los pacientes investigados que presentaban LC, se esperaba que NNMT solo o en combinación con uno o más otros marcadores, resultase de gran ayuda en el seguimiento de los pacientes de LC, especialmente en los pacientes de LC tras la cirugía. La utilización de un panel de marcadores que comprenda NNMT y uno o más otros marcadores de LC en el seguimiento de los pacientes de LC representa una realización preferente adicional de la presente invención.
La presente invención se refiere, en una realización preferente, a la utilización de NNMT en el campo diagnóstico del LC, o en la evaluación del LC, respectivamente.
En todavía una realización preferente adicional, la presente invención se refiere a la utilización de NNMT como molécula marcadora del cáncer de pulmón en combinación con una o más moléculas marcadores del cáncer de pulmón, en la evaluación del cáncer de pulmón a partir de una muestra líquida obtenida de un individuo.
De esta manera, una realización preferente de la presente invención es la utilización de NNMT como molécula marcadora del cáncer de pulmón en combinación con una o más moléculas marcadoras del cáncer de pulmón, en la evaluación del cáncer de pulmón a partir de una muestra líquida obtenida de un paciente. Son otros marcadores de LC preferentes seleccionados con los que puede combinarse la medición de NNMT, CYFRA 21-1, CEA, NSE y SCC. Todavía más preferentemente, el panel de marcadores utilizado en la evaluación del LC comprende NNMT y por lo menos otra molécula marcadora seleccionada de entre el grupo que consiste de CYFRA 21-1 y CEA.
Tal como apreciará el experto en la materia, existen muchas maneras de utilizar las mediciones de dos o más marcadores con el fin de mejorar la cuestión diagnóstica bajo investigación. En un enfoque bastante simple, aunque con frecuencia eficaz, se supone un resultado positivo en el caso de que una muestra sea positiva para por lo menos uno de los marcadores investigados. Éste puede ser el caso, por ejemplo, del diagnóstico de una enfermedad infecciosa, tal como el SIDA.
Sin embargo, con frecuencia se evalúa una combinación de marcadores. Preferentemente, los valores medidos de marcadores de un panel, por ejemplo de CYFRA y de CEA, se combinan matemáticamente y el valor combinado se correlación con la cuestión diagnóstica subyacente. Los valores de los marcadores pueden combinarse mediante cualquier método matemático apropiado del estado de la técnica. Son métodos matemáticos bien conocidos para correlacionar una combinación de marcadores con una enfermedad, el análisis discriminante (AD) (es decir, el AD lineal, cuadrático o regularizado), los métodos núcleo ("kernel"; es decir SVM), los métodos no paramétricos (es decir, clasificadores del vecino k más próximo), PLS (mínimos cuadrados parciales), los métodos basados en árboles de decisión (es decir, regresión logística, CART, métodos de bosque aleatorio, métodos de boosting/bagging), los modelos lineales generalizados (es decir, la regresión logística), los métodos de tipo componentes principales (es decir, SIMCA), los modelos aditivos generalizados, los métodos de tipo lógica difusa, y los métodos basados en redes neuronales y algoritmos genéticos. El experto en la materia no tendrá dificultad en evaluar una combinación de marcadores de la presente invención. Preferentemente, el método utilizado para correlacionar la combinación de marcadores de la invención a, por ejemplo, la ausencia o presencia de LC, se selecciona de entre AD (análisis discriminante lineal, cuadrático o regularizado), los métodos núcleo (es decir, SVM), los métodos no paramétricos (es decir clasificadores del vecino k más próximo), PLS (mínimos cuadrados parciales), los métodos basados en árboles de decisión (es decir, regresión logística, CART, métodos de bosque aleatorio, métodos de boosting), los modelos lineales generalizados (es decir, la regresión logística). Pueden encontrarse datos referentes a dichos métodos estadísticos en las referencias siguientes: Ruczinski I. et al., J. of Computational and Graphical Statistics 12:475-511, 2003; Friedman J.H., J. of the American Statistical Association 84:165-175, 1989; Hastie T. et al., The Elements of Statistical Learning, Springer Series in Statistics, 2001; Breiman L. et al., Classification and Regression Trees, Wadsworth International Group, Belmont, California, 1984; Breiman L., Random Forests, Machine Learning 45:5-32, 2001; Pepe M.S., The Statistical Evaluation of Medical Tests for Classification and Prediction, Oxford Statistical Science Series 28, 2003; y Duda R.O. et al., Pattern Classification, Wiley Interscience, 2a edición, 2001.
Es una realización preferente de la invención utilizar un valor de corte multivariante optimizado para la combinación subyacente de marcadores biológicos y para discriminar el estado A del estado B, por ejemplo enfermo de sano. En este tipo de análisis, los marcadores ya no son independientes, sino que forman un panel de marcadores. Podría establecerse que la combinación de las mediciones de NNMT con las de CYFRA 21-1 o de CEA, respectivamente, mejore significativamente la exactitud diagnóstica del LC en comparación con controles sanos.
La exactitud de un método diagnóstico se describe mejor a partir de las características operativas del receptor (ROC) (ver especialmente Zweig M.H. y Campbell G., Clin. Chem. 39:561-577, 1993). El gráfico ROC es un gráfico de todas las parejas de sensibilidad/especificidad resultante de modificar continuamente el umbral de decisión a lo largo del intervalo completo de datos observados.
El rendimiento clínico de un ensayo de laboratorio depende de su exactitud diagnóstico, o de la capacidad de clasificar correctamente los sujetos en subgrupos clínicamente relevantes. La exactitud diagnóstica mide la capacidad del ensayo de distinguir correctamente dos condiciones diferentes de los sujetos investigados. Dichas condiciones son, por ejemplo, salud y enfermedad, o enfermedad benigna frente a maligna.
En cada caso, el gráfico ROC ilustra el solapamiento entre las dos distribuciones dibujando la sensibilidad frente a (1 - especificidad para el intervalo completo de umbrales de decisión). En el eje y está la sensibilidad, o la fracción positiva verdadera [definida como (número de resultados de ensayo positivos verdaderos)/(número de resultados de ensayo positivos verdaderos + número de resultados de ensayo falsos negativos)]. A esto también se le ha denominado positividad en presencia de una enfermedad o condición. Se calcula únicamente a partir del subgrupo afectado. En el eje x está la fracción falsa positiva, o (1 - especificidad [definida como (número de resultados falsos positivos)/(número de resultados negativos verdaderos + número de resultados falsos positivos)]. Es un índice de especificidad y se calcula completamente a partir del subgrupo no afectado. Debido a que las fracciones positivas verdaderas y falsas positivas se calculan de manera completamente separada, mediante la utilización de los resultados de ensayo de los dos subgrupos diferentes, el gráfico ROC es independiente de la prevalencia de la enfermedad en la muestra. Cada punto en el gráfico ROC representa una pareja de sensibilidad/1-especificidad correspondiente a un umbral de decisión particular. Un ensayo con discriminación perfecta (sin solapamiento entre las dos distribuciones de resultados) presenta un gráfico ROC que pasa a través de la esquina izquierda superior, en la que la fracción positiva verdadera es 1,0, o 100% (sensibilidad perfecta), y la fracción falsa positiva es 0 (especificidad perfecta). El gráfico teórico para un ensayo sin discriminación (distribuciones idénticas de resultados para los dos grupos) es una línea diagonal en 45º entre la esquina izquierda inferior y la esquina derecha superior. La mayoría de gráficos se encuentra entre estos dos extremos (en el caso de que el gráfico ROC se encuentre completamente debajo de la diagonal en 45º, esto se soluciona fácilmente invirtiendo el criterio de "positividad" de "superior a" a "inferior a", o viceversa). Cualitativamente, cuanto más próximo se encuentre el gráfico a la esquina izquierda superior, más alta será la exactitud global del ensayo.
Un objetivo conveniente para cuantificar la exactitud diagnóstica de un ensayo de laboratorio es expresar su comportamiento mediante un único número. Este parámetro global, por ejemplo el denominado "error total", o alternativamente el "área bajo la curva=AUC". La medida global más común es el área bajo el gráfico ROC. Convencionalmente este área es siempre \geq0,5 (si no lo es, puede invertirse la regla de decisión para que sí lo sea). Los valores se encuentran comprendidos entre 1,0 (separación perfecta de los valores de ensayo de los dos grupos) y 0,5 (sin diferencia aparente entre distribuciones de los dos grupos de valores de ensayo). El área no depende únicamente de una parte particular del gráfico, tal como el punto más próximo a la diagonal o la sensibilidad con especificidad de 90%, sino del gráfico completo. Ésta es una expresión descriptiva cuantitativa de la proximidad del gráfico ROC al gráfico perfecto (área=1,0).
La combinación de mediciones de NNMT con otros marcadores, tales como CYFRA 21-1 o CEA, o con otros marcadores del LC todavía no descubiertos, NNMT conduce, y conducirá, respectivamente, a mejoras adicionales en la evaluación del LC.
La combinación de los dos marcadores, NNMT y CYFRA 21-1, mejora significativamente la exactitud diagnóstica del LC. La combinación de los dos marcadores, NNMT y CEA, también mejora significativamente la exactitud diagnóstica del LC.
En una realización preferente, la presente invención se refiere a un método para mejorar la exactitud diagnóstica de LC frente a controles sanos, mediante la medición en una muestra de la concentración de por lo menos NNMT y CYFRA 21-1, CEA, NSE o SCC, respectivamente, y la correlación de las concentraciones determinadas con la presencia o ausencia de LC, resultando la mejora en que se clasifican correctamente más pacientes como que sufren LC frente a controles sanos en comparación con una clasificación basada en un único marcador investigado por sí solo.
En un método preferente según la presente invención, se determina por lo menos la concentración de los marcadores biológicos NNMT y CYFRA 21-1, respectivamente, y se utiliza la combinación de marcadores en la evaluación del LC.
En un método preferente adicional según la presente invención, se determina por lo menos la concentración de los marcadores biológicos NNMT y CEA, respectivamente, y se utiliza la combinación de marcadores en la evaluación del LC.
En todavía un método preferente adicional según la presente invención, se determina por lo menos la concentración de los marcadores biológicos NNMT, CYFRA 21-1 y CEA, respectivamente, y se utiliza la combinación de marcadores en la evaluación del LC.
En todavía un método preferente adicional según la presente invención, se determina por lo menos la concentración de los marcadores biológicos NNMT, CYFRA 21-1 y SCC, respectivamente, y se utiliza la combinación de marcadores en la evaluación del LC.
Los ejemplos siguientes se proporcionan para ayudar a la comprensión de la presente invención, el alcance real de la cual se proporciona en las reivindicaciones adjuntas. Se entiende que pueden realizarse modificaciones en los procedimientos proporcionados sin apartarse del espíritu de la invención.
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Ejemplo 1 Generación de anticuerpos contra la proteína marcadora NNMT de cáncer de pulmón
Se generó anticuerpo policlonal contra la proteína marcadora NNMT de cáncer de pulmón para la utilización adicional del anticuerpo en la medición de niveles séricos, plasmáticos y sanguíneos de NNMT mediante ensayos de inmunodetección, por ejemplo transferencia western y ELISA.
Expresión de proteínas recombinantes en E. coli
Con el fin de generar anticuerpos contra NNMT, se llevó a cabo la expresión recombinante de la proteína para la obtención de inmunógenos. La expresión se realizó mediante la aplicación de una combinación del sistema de expresión RTS 100 y la expresión en E. coli. En una primera etapa, se analizó la secuencia del ADN y se obtuvieron recomendaciones para variantes mutacionales silenciosas de ADNc de alto rendimiento y secuencias de cebador de PCR respectivas, utilizando el sistema "ProteoExpert RTS E. coli HY". Éste es un servicio comercial en internet (www.proteoexpert.com). Mediante la utilización de las parejas de cebadores recomendadas, se utilizó el sistema "RTS 100 E. coli Lineal Template Generation Set, His-tag" (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Alemania, nº de cat. 3186237) para generar moldes lineales de PCR a partir del ADNc y para la transcripción y expresión in vitro de la secuencia de nucleótidos codificante de la proteína NNMT. Para la detección mediante transferencia western y la purificación posterior, la proteína expresada contenía una etiqueta de His. Se identificó la variante de mejor expresión. Todas las etapas entre la PCR y la expresión y detección se llevaron a cabo siguiendo las instrucciones del fabricante. El producto de PCR respectivo, que contenía todas las regiones reguladoras de T7 necesarias (promotor, sitio de unión ribosómica y terminador de T7) se clonaron en el vector pBAD TOPO® (Invitrogen, Karlsruhe, Alemania, nº de cat. K4300/01) siguiendo las instrucciones del fabricante. Para la expresión de las secuencias reguladoras de T7, el constructo se transformó en E. coli BL 21 (DE 3) (Studier F.W. et al., Methods Enzymol. 185:60-89, 1990) y las bacterias transformadas se cultivaron en un lote de 1 litro para la expresión de proteínas.
La purificación de la proteína de fusión His-NNMT se realizó siguiendo los procedimientos estándares en una columna de quelato de Ni. Brevemente, se peletizó mediante centrifugación un cultivo bacteriano de 1 litros que contenía el vector de expresión para la proteína de fusión His-NNMT. El pellet celular se resuspendió en tampón de lisis, que contenía fosfato, pH 8,0, cloruro de guanidinio 7 M, imidazol y tioglicerol, seguido de homogeneización utilizando un Ultra-Turrax®. El material insoluble se peletizó mediante centrifugación de alta velocidad y el sobrenadante se aplicó a una columna cromatográfica de quelato de Ni. La columna se lavó con varios volúmenes de lecho de tampón de lisis, seguido de lavados con tampón, que contenía fosfato, pH 8,0, y urea. Finalmente, el antígeno unido se eluyó utilizando un tampón fosfato que contenía SDS bajo condiciones ácidas.
Generación de anticuerpos policlonales a) Inmunización
Para la inmunización, se preparó una emulsión fresca de la solución de proteína (100 \mug/ml de proteína NNMT) y adyuvante completo de Freund en una proporción de 1:1. Se inmunizó cada conejo con 1 ml de la emulsión los días 1, 7, 14 y 30, 60 y 90. Se extrajo sangre y el suero anti-NNMT resultante se utilizó para experimentos adicionales, tal como se describe en los Ejemplos 3 y 4.
b) Purificación de IgG (inmunoglobulina G) a partir de suero de conejo mediante precipitación secuencial con ácido caprílico y sulfato amónico
Se diluyó un volumen de suero de conejo con 4 volúmenes de tampón acetato (60 mM, pH 4,0). Se ajustó el pH a 4,5 con base Tris 2 M. Se añadió gota a gota ácido caprílico (25 \mul/ml de muestra diluida) bajo agitación vigorosa. Tras 30 minutos, la muestra se centrifugó (13.000xg, 30 minutos, 4ºC), se descartó el pellet y se recogió el sobrenadante. Se ajustó el pH del sobrenadante a 7,5 mediante la adición de base Tris 2 M y se filtró (0,2 \mum).
La inmunoglobulina en el sobrenadante se precipitó bajo agitación vigorosa mediante la adición gota a gota de una solución de sulfato amónico 4 M hasta una concentración final de 2 M. Las inmunoglobulinas precipitadas se recogieron mediante centrifugación (8.000xg, 15 minutos, 4ºC).
Se descartó el sobrenadante. El pellet se disolvió en NaH2PO4/NaOH 10 mM, pH 7,5, NaCl 30 mM y se dializó exhaustivamente. El dializado se centrifugó (13.000xg, 15 minutos, 4ºC) y se filtró (0,2 \mum).
Biotinilación de IgG policlonal de conejo
Se llevó IgG policlonal de conejo a 10 mg/ml en NaH2PO4/NaOH 10 mM, pH 7,5, NaCl 30 mM. Por cada ml de solución de IgG, se añadieron 50 \mul de biotín-N-hidroxisuccinimida (3,6 mg/ml en DMSO). Tras 30 minutos a temperatura ambiente, se cromatografió la muestra en Superdex 200 (NaH2PO4/NaOH 10 mM, pH 7,5, NaCl 30 mM). Se recogió la fracción que contenía IgG biotinilado. Se han biotinilado anticuerpos monoclonales siguiendo el mismo procedimiento.
Digoxigenilación de IgG policlonal de conejo
Se llevó IgG policlonal de conejo a 10 mg/ml en NaH_{2}PO_{4}/NaOH 10 mM, NaCl 30 mM, pH 7,5. Por cada ml de solución de IgG, se añadieron 50 \mul de N-hidroxisuccinimida éster de ácido dioxigenín-3-O-metilcarbonil-\varepsilon-aminocaproico (Roche Diagnostics, Mannheim, Alemania, nº de cat. 1 333 054) (3,8 mg/ml en DMSO). Tras 30 minutos a temperatura ambiente, la muestra se cromatografió en Superdex® 200 (NaH_{2}PO_{4}/NaOH 10 mM, pH 7,5, NaCl 30 mM). Se recogieron las fracciones que contenían IgG digoxigenilado. Se han marcado anticuerpos monoclonales con digoxigenina siguiendo el mismo procedimiento.
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Ejemplo 2 ELISA para la medición de NNMT en muestras de suero y plasma humanos
Para la detección de NNMT en suero o plasma humano, se desarrolló una ELISA sándwich. Para la captura y detección del antígeno, se conjugaron alícuotas del anticuerpo policlonal anti-NNMT (ver el Ejemplo 2) con biotina y con digoxigenina, respectivamente.
Se incubaron placas de microtitulación de 96 pocillos recubiertas con estreptavidina, con 100 \mul de anticuerpo policlonal anti-NNMT biotinilado durante 60 minutos a una concentración de 10 \mug/ml en fosfato 10 mM, pH 7,4, BSA al 1%, NaCl al 0,9% y Tween 20 al 0,1%. Tras la incubación, las placas se lavaron tres veces con NaCl 0,9%, Tween 20 al 0,1%. A continuación, los pocillos se incubaron durante 2 horas con una dilución en serie de la proteína recombinante (ver el Ejemplo 2) como antígeno estándar, o con muestras diluidas de plasma procedentes de pacientes. Tras la unión de NNMT, las placas se lavaron tres veces con NaCl al 0,9%, Tween 20 al 0,1%. Para la detección específica de NNMT unido, los pocillos se incubaron con 100 \mul de anticuerpo policlonal anti-NNMT digoxigenilado durante 60 minutos a una concentración de 10 \mug/ml en fosfato 10 mM, pH 7,4, BSA al 1%, NaCl al 0,9% y Tween 20 al 0,1%. A continuación, las placas se lavaron tres veces para eliminar el anticuerpo no unido. En una etapa posterior, los pocillos se incubaron con 20 mU/ml de conjugados de anti-digoxigenina-POD (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Alemania, nº de catálogo 1633716) durante 60 minutos en fosfato 10 mM, pH 7,4, BSA al 1%, NaCl al 0,9% y Tween 20 al 0,1%. Las placas seguidamente se lavaron tres veces con el mismo tampón. Para la detección de los complejos de antígeno-anticuerpo, los pocillos se incubaron con 100 \mul de solución de ABTS (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Alemania, nº de catálogo 11685767) y se midió la DO tras 30 a 60 minutos a 405 nm con un lector ELISA.
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Ejemplo 3 Estudio I: población de estudio
En un primer estudio, se utilizaron muestras derivadas de 56 pacientes bien caracterizados de LC con la clasificación según UICC proporcionada en la Tabla 1. El estudio de esta cohorte se centraba en NSCLC (50 muestras), debido a que esta forma de LC presenta un mejor pronóstico que el tipo SC, y de esta manera su detección precoz resulta especialmente importante.
TABLA 1 Estudio I: muestras de LC y clasificación UICC correspondiente
1
Las muestras de LC de la Tabla 1 se evaluaron en comparación con muestras de control obtenidas de 121 individuos evidentemente sano sin ninguna enfermedad pulmonar maligna conocida (=cohorte de control).
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Ejemplo 4 Estudio I: sensibilidad de marcadores únicos
Se calculó la sensibilidad de cada marcador a un nivel de especificidad común de 95% para cada marcador individual sometido a ensayo. La Tabla 2 proporciona la sensibilidad en porcentaje para cada uno de los marcadores de LC más prometedores.
TABLA 2 Estudio I: sensibilidad de marcadores únicos
2
Tal como resulta fácilmente evidente a partir de la Tabla 2, se encontró que el marcador NNMT presentaba la segunda sensibilidad más alta para LC de entre todos los marcadores investigados, tras CYFRA 21-1. El marcador CEA aparentemente presentaba una sensibilidad significativamente más baja, mientras que NSE aparentemente presentaba un comportamiento pobre.
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Ejemplo 5 Estudio I: combinaciones de marcadores
Se clasificó un individuo como presentando LC en el caso de que por lo menos uno de los marcadores de la combinación respectiva excediese un determinado umbral. Estos valores de corte se definieron de manera que proporcionasen una especificidad de 95% respecto a la cohorte de control.
La Tabla 3 presenta los resultados de clasificación de pacientes diagnosticados con LC frente a controles sanos.
3
La combinación de los marcadores NNMT y Cyfra 21-1 en este análisis proporcionó la sensibilidad más alta a un nivel de especificidad de 95%. Se han evaluado diversos otros marcadores en combinación con NNMT. Tal como se muestra en la Tabla 3, CEA en combinación con NNMT también conduce a una mejora significativa de la sensibilidad.
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Ejemplo 6 Estudio II: población de estudio
Un segundo estudio totalmente independiente del primero se centró en los tipos principales de NSCLC, adenocarcinoma y carcinoma de células escamosas. La Tabla 4a describe la distribución de tipos y estadios de la cohorte de cánceres.
TABLA 4a Estudio II: tipo y estadificación de muestras de LC
4
Se definió más específicamente la cohorte de control en el presente estudio para que contuviese muestras de fumadores y no fumadores, tal como se describe en la Tabla 4b. Se llevó a cabo un ensayo de función pulmonar (espirometría, Miller M.R. et al., Eur. Respir. J. 26:319-338, 2005) con cada individuo. Las muestras se incluyeron en la cohorte de control únicamente en el caso de que el resultado del donante en el ensayo de función pulmonar se encontrase dentro del intervalo normal.
TABLA 4b Estudio II: composición de la cohorte de control
5
Ejemplo 7 Estudio II: sensibilidad de los marcadores únicos
Se calculó la sensibilidad de cada marcador tal como anteriormente, basándose en las muestras indicadas en la Tabla 4b. Se proporciona la sensibilidad (en porcentaje) a un nivel de especificidad común de 95% para cada marcador individual sometido a ensayo. La Tabla 5 ilustra la sensibilidad para el adenocarcinoma y el carcinoma de células escamosas, respectivamente, así como la sensibilidad global de cada uno de los marcadores.
TABLA 5 Estudio II: sensibilidad (%) de marcadores únicos con una especificidad de 95%
6
Resulta evidente en este caso que NNMT es superior a Cyfra 21-1 por dos motivos: en primer lugar, la sensibilidad global de NNMT es significativamente mejor. En segundo lugar, y que también resulta muy importante, Cyfra 21-1 indica los adenocarcinoma con menor eficiencia que los carcinomas de células escamosas, mientras que NNMT funciona de manera similar con ambos tipos de cáncer.
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Ejemplo 8 Estudio II: combinaciones de marcadores
Los resultados con las combinaciones de marcadores en el estudio II se muestran en la Tabla 6. El tipo de combinación era el mismo que el indicado anteriormente para el estudio I.
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TABLA 6 Estudio II: comportamiento de las combinaciones de marcadores con dos subtipos principales de cáncer de pulmón. Se proporciona la sensibilidad con una especificidad de 95%
7
8
La combinación de dos cualesquiera de los marcadores investigados conduce a una mejora significativa de la sensibilidad de la combinación de marcadores en comparación con la sensibilidad obtenida al utilizar los marcadores individualmente (comparar el conjunto de marcadores nº 7 con los conjuntos nº 1 y nº 2, a título ilustrativo). Se obtiene cierto beneficio mediante la adición de un tercer marcador (comparar los conjuntos nº 8 y nº 10). La combinación de los cuatro marcadores (conjunto nº 14), sin embargo, no proporciona un mejor comportamiento que el mejor conjunto de tres (conjunto nº 10).
Las combinaciones dobles y triples que comprenden NNMT en todos los casos son mejores que las correspondientes que presentan NNMT en lugar de cualquier otro marcador.
En resumen, NNMT solo demuestra una buena sensibilidad en la detección de los dos tipos principales de cáncer de pulmón NSC. Se obtuvieron resultados muy impresionantes utilizando una combinación de NNMT con Cyfra 21-1 y/o CEA, respectivamente. La utilización de una combinación que comprendía los tres marcadores, se clasificaron correctamente 93% de las muestras de cáncer y 95% de los controles.

Claims (9)

1. Método para la evaluación del cáncer de pulmón in vitro, que comprende medir en una muestra la concentración de proteínas de:
a) nicotinamida N-metiltransferasa (NNMT),
b) opcionalmente otro u otros marcadores de cáncer de pulmón, y
c) utilizar la concentración determinada en la etapa (a), y opcionalmente en la etapa (b), en la evaluación de cáncer de pulmón, en la que un incremento de NNMT es indicativo de cáncer de pulmón.
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2. Método según la reivindicación 1, en el que dicho otro u otros marcadores se selecciona de entre el grupo que consiste de CYFRA 21-1, CEA, NSE y SCC.
3. Método según la reivindicación 2, en el que dicho otro u otros marcadores es CYFRA 21-1.
4. Método según la reivindicación 2, en el que dicho otro u otros marcadores es CEA.
5. Método según la reivindicación 2, en el que dicho otro u otros marcadores es SCC.
6. Utilización in vitro de la concentración de proteína NNMT en la evaluación del cáncer de pulmón.
7. Utilización in vitro de un panel de marcadores que comprende la concentración de proteína NNMT y otro u otros marcadores del cáncer de pulmón en la evaluación del cáncer de pulmón.
8. Utilización del panel de marcadores según la reivindicción7, en la que el otro u otros marcadores se seleccionan de entre el grupo que consiste de CYFRA 21-1, CEA, NSE y SCC.
9. Utilización de un panel de marcadores según la reivindicación 8, que comprende por lo menos NNMT y CYFRA 21-1.
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