ES2329768T3 - Poxvirus recombinantes para las proteinas quimericas del virus de inmunodeficiencia humana. - Google Patents

Poxvirus recombinantes para las proteinas quimericas del virus de inmunodeficiencia humana. Download PDF

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Abstract

Se describen genes quiméricos del VIH formados por la unión de fragmentos de diferentes genes de este virus, donde estos fragmentos contienen epitopos para células T citotóxicas (CTL) o T auxiliadoras del VIH-1, los cuales son presentados por una amplia gama de antígenos del Sistema Principal de Histocompatibilidad Humano tipo 1 (HLA-1). A partir de estos genes se obtienen poxvirus recombinantes útiles en la vacunación profiláctica y terapéutica contra la infección por VIH/SIDA capaces de generar una respuesta inmune celular protectora en animales de laboratorio inmunizados y siendo reconocidos por los linfocitos CTL de pacientes de VIH/SIDA.

Description

Poxvirus recombinantes para las proteínas quiméricas del virus de inmunodeficiencia humana.
Campo de la invención
La presente invención se refiere al campo de la inmunología y, en particular, al desarrollo de vacunas para la prevención o tratamiento de Síndrome de Inmunodeficiencia adquirida (SIDA). Se describen los genes quiméricios y Virus de la viruela aviar que los expresan, útiles para el tratamiento y prevención de SIDA.
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Técnica anterior
VIH es el agente etiológico del SIDA (Popovic M, Sarngadharan M, Read G, and Gallo RC. Science 1984, 224: 497-500). Este virus infecta no solamente las células T CD4+ (Klatzman D, Barre Sinoussi F, Nugeyre MT, Dauguet C, Vilmer E, Griscelli C, Brun-Vezinet F, Rouzioux C, Gluckman, JD, Chermannn JC y Montagnier L. Science 1984, 225: 59-63) sino también otros tipos de células tales como macrófagos, células dendríticas, microglia y células
epiteliales.
VIH puede escapar de la respuesta inmune humana a pesar de los altos niveles de anticuerpos que persisten a lo largo de toda la infección. A largo plazo, VIH provoca una profunda inmunodeficiencia en el huésped, que llega a ser altamente susceptible al ataque de infecciones oportunistas.
Más de 36 millones de personas están viviendo con VIH/SIDA y 94% de las 16.000 infecciones diarias se producen en los países desarrollados. (UNAIDS Report on the global VIH/AIDS epidemic, junio 2000) debido a estos números alarmantes y la ausencia de un tratamiento eficaz y económico para esta enfermedad, existe una urgente necesidad del desarrollo de una vacuna de VIH.
Entre varias características de VIH que hacen esta tarea difícil lo más importante es quizás el alto grado de variabilidad genética de sus antígenos, especialmente la glicoproteína de envuelta (gp 120) donde se localizan los principales dominios implicados en el proceso infeccioso y dirigidos por los anticuerpos neutralizantes.
Los candidatos de vacuna basados en anticuerpos neutralizantes han sido capaces de proteger contra el VIH en chimpancés (Berman PW, Gregory TJ, Lavon R, Nakamura GR, Champe MA, Porter JP, Wurm FM, Hershberg RD, Cobb GK Y Eichberg JW. Nature 1990, 345: 622-625; Girard M, Kieny MP, Pinter A; Barre-Sinoussi F, Nara P, Kolbe H, Kusumi K, Chaput A, Rainhart T, Muchmore E, Ronco J, Kaczorek M, Gomard E, Gluckman JC y Fultz PN, PNAS 1991, 88: 542-546). Sin embargo esos experimentos se realizaron en condiciones casi ideales donde la dosis, vía y programación de la exposición viral eran muy diferentes de la infección natural. Además, esos inmunógenos no pueden proteger contra aislamientos de VIH divergentes y los anticuerpos inducidos no neutralizan los aislamientos de VIH primarios.
Se han evaluado diferentes candidatos de vacuna en ensayos clínicos en fase I y II (Johnston MI. AIDS vaccine development: status and future directions. 1999. XII Colloque des Cent Gardes. Ed. Girard M y Dodet B.161-163). La mayoría de éstos se basan en las proteínas de envuelta. gp 160 y gp 120. Solamente una vacuna, basada en la gp 120 recombinante está actualmente experimentando en ensayos de Fase III de evaluación de eficacia en Tailandia y Estados Unidos. Los resultados de los ensayos previos sugieren que solamente se puede esperar una protección muy limitada si la hay de esta vacuna.
Debido a estas serias limitaciones para generar una respuesta humoral capaz de conferir protección contra diferentes aislamientos y subtipos de VIH, los esfuerzos de los investigadores se han desviado mayormente en los últimos años hacia el desarrollo de candidatos de vacuna capaces de estimular principalmente la rama celular del sistema inmune y particularmente células T citotóxicas dirigidas contra los antígenos de VIH.
Entre los hallazgos experimentales que sugieren fuertemente la relevancia clínica de los anti VIH CTL son: la administración de anticuerpo monoclonal anti CD8 a los macacos previamente inoculados con Virus de Inmunodeficiencia Simia-Humana (VISH) marcadamente potenciaba los niveles de viremia (Matano T, Shibata R, Simeón C, Connors M, Lane C, Martín M, Administration of an Anti-C08 monoclonal antibody interferes with the clearance of chimeric Simian/Human Immunodeficiencyvirus during primary infections of rhesus macaques, J Virol, 1998, 72, 1: 164-169); las variantes virales capaces de escapar al reconocimiento de las células T CD8+ se seleccionan en tanto los individuos infectados por VIH (Borrow, P., H. Lewicki, X. Wei, M. S. Horwitz, N. Peffer, H. Meyers, J. A. Nelson, J. E. Gairin, B. H. Hahn, M. B. A. Oldstone, y G. M. Shaw. 1997. Antiviral pressure exerted by HIV-1-specific cytotoxic T Iymphocytes (CTLs) during primary infection demonstrated by rapid selection of CTL escape virus. Nature Med. 3:205-211.) y los macacos infectados por VIS (Allen, 1. M., O. C. DH, P. Jing, J. L. Dzuris, B. R. Mothe, 1. U. Vogel, E. Dunphy, M. E. Liebl, C. Emerson, N. Wilson, K. J. Kunstman, X. Wang, D. B. Allison, A. L. Hughes, R. C. Desrosiers, J. D. Altman, S. M. Wolinsky, A. Sette, y D. 1. Watkins. 2000. Tat-specific cytotoxic T Iymphocytes select for SIV escape variants during resolution of primary viraemia. Nature. 407: 386-90); los ratones SCID poblados con PBMC de voluntarios inyectados con Virus de Vaccinia (VV) recombinante de VIH-1 se protegieron contra la exposición en la ausencia de anticuerpos neutralizantes (Van Kuyk R, Torbett B, Gulizia R et al, Human CTL specific for the nef protein of HIV protect hu-PBL-SCID mice from HIV infection. AIDS Res Hum Retroviruses, 1993; 9 (supl 1:S77); una proporción significativa de personas no infectadas expuestas muestran respuesta inmune celular específica para las proteínas de VIH, esto es verdad para las personas profesionales del sexo Africanas (Rowland-Jones SL, J Sotton, K Ariyoshi, T Dong, F Gotch, s McAdams, D Whitby, S Sabally, A Gallimore, T Corrah, M Takiguchi, T Schltz, A McMichael, H Whittle. 1995. HIV-specific cytotoxic T cells in HIV-exposed but uninfected Gambian women. Nature Medicine, 1: 59-64) y niños nacidos de madres seropositivas (Rowland-Jones SL, DF Nixon, MC Aldhous, F Gotch, K Aroyoshi, N Hallam, JS Kroll, K Froebel, A McMichael. HIV specific cytotoxic T- cell activity in an HIV- exposed but uninfected infant. Lancet, 1993, 341: 860-861). De manera adicional a largo plazo ningunos de los que progresan muestran una fuerte respuesta de CTL (Cao, Y, Qin L, Zhang 1, Safrit J y Ho DD, New Engl J Med, 1995, 332: 201-208; Riviere Y, McChesney MB, Porrot E, et al. AIDS Res Hum Retroviruses, 11: 903-990); y el tipo de clase I de HLA ha estado asociado a la velocidad de progresión de enfermedad en los individuos infectados con VIH-1 (Carrington, M., G. W. Nelson, M. P. Martin, 1. Kissner, D. Vlahov, J. J. Goedert, R. Kaslow, S. Buchbinder, K. Hoots, y O. B. SJ. 1999. HLA and HIV-1: heterozygote advantage and B*35-Cw*04 disadvantage. Science. 283: 1748-52). Las respuestas de CTL precede a los anticuerpos neutralizantes en la infección natural y ha estado asociada al control de viremia en infección aguda (Koup RA, Safrit JT, Cao Y, et al, Temporal association of cellular immune responses with the initial control of viremia in primary human immunodeficiency syndrome, J Virol, 1994; 68: 4650-4655) y la progresión a SIDA se correlaciona en gran medida con la alteración de CTL (Harrer T, Harrer E, Kalams S, Elbeik T, Staprans S, Feinberg MB, Cao Y, Ho DD, Yilma T, Caliendo A, Jonson RP, Buchbinder S, y Walker B. HIV-specific CTL-response in healthy long-term asymptomatic HIV infection. AIDS Res Hum Retroviruses, 1996, 12, 7: 585-592). Finalmente las vacunas que inducen las respuestas de células T CD8+ pueden afectar de manera favorable los resultados de la infección en modelos de VIS de infección de VIH (Barouch, D. H., S. Santra, J. E. Schmitz, M. J. Kuroda, 1. M. Fu, W. Wagner, M. Bilska, A. Craiu, X. X. Zheng, G. R. Krivulka, K. Beaudry, M. A. Lifton, C. E. Nickerson, W. L. Trigona, K. Punt, D. C. Freed, L. Guan, S. Dubey, D. Casimiro, A. Simon, M. E. Davies, M. Chastain, 1. B. Strom, R. S. Gelman, D. C. Montefiori, M. G. Lewis, E. A. Emini, J. W. Shiver, y N. L. Letvin. 2000. Control of viremia and prevention of clinical AIDS in rhesus monkeys by cytokine-augmented DNA vaccination. Science. 290: 486-92; Gallimore, A., M. Cranage, N. Cook, N. Almond, J. Bootman, E. Rud, P. Silvera, M. Dennis, T. Corcoran, J. Stott, A. McMichael, y F. Gotch. 1995. Early suppression of SIV replication by CD8+ nefspecific cytotoxic T cells in vaccinated macaques. Nature Med. 1: 1167-1173.).
Todo este conjunto de hallazgos experimentales sugieren en gran medida que las estrategias y profilácticas deben incluir la inducción/conservación/restauración de este brazo de la respuesta inmune como al menos uno de sus objetivos.
Se han desarrollado diferentes metodologías para general los CTL en animales o seres humanos. La más eficaz hasta ahora ha sido los vectores vivos recombinantes. Este procedimiento usa virus o bacterias inofensivos para transportar genes seleccionados del patógeno en las células del receptor para producir ahí los antígenos seleccionados. Este procedimiento de administración de gen en las células maximiza el procesamiento de los epítopes de CTL y su presentación por moléculas de MHC-I y posteriormente la estimulación eficaz de los clones de CTL en el
huésped.
Los virus que se han usado con más éxito como vectores han sido los poxvirus (Familia Poxviridae). El miembro mejor conocido de esta familia es el Virus Vaccinia (VV), que se usa en gran medida en seres humanos durante una campaña de erradicación de la viruela.
Se han llevado a cabo varios ensayos clínicos con recombinante W para las proteínas de VIH (Corey L, McElrath J, Weihold K, Matthewa T, Stablein D, Grahm B, Keefer M, Schwartz D, Gorse G. Cytotoxic T Cell and Neutralizing Antibody Responses to Human Immunodeficiency Virus Type 1 Envelope with a combination vaccine regimen. J Infectious Dis, 35 1998, 177: 301-9; Graham BS, Matthews TJ, Belshe R, Clements ML, Dolin R, Wright PF, Gorse GJ, Schwartz DH, Keefer MC, Bolognesi DP, Corey L, Stablein D, Esterlitz JR, Hu SL, Smith GE, Fast P, Koff W, J Infectious Dis, 1993, 167: 533-7). Sin embargo VV tiene dos limitaciones principales para uso humano: (1) un pequeño porcentaje de personas vacunadas mostraron fuertes reacciones adversas que pueden ser letales en el caso de individuos comprometidos inmunes (2) personas con historia previa de vacunación de VV responden de manera pobre contra los antígenos heterólogos.
Una solución a estos inconvenientes es ha sido el uso de Avipoxvirus en lugar de W. Estos son miembros de la familia poxvirus pero su replicación se restringe a células aviares y su ciclo de replicación es abortivo en células humanas. Se han usado dos Avipoxvirus con estos propósitos: Virus de la viruela de canarios (CPV) y virus de la viruela aviar (FPV).
Los Avipoxvirus recombinantes para diversos patógenos humanos de antígenos asociados a tumores inducen respuesta de los CTL en animales (Limbach KJ, y E Paoletti. 1996. Non-replicating expression vectors: applications in vaccines development 45 and gene therapy. Epidemiol. Infect. 116: 241-256). y terapia génica Epidemiol. Infect 116: 241-256). El uso de Avipoxvirus recombinante para el desarrollo de vacuna se ha patentado en los Estados Unidos (Paoletti E y cols. 1992 US5174993, Paoletti E et al.. 1993 documento US5505941) y específicamente una solicitud de patente en el uso de apoxivirus recombinantes para los antígenos lentivirales se han presentado en Europa (Paoletti E et al., Documento EP0956360).
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Un CPV recombinante para gag.pol y env de VIH-1 se han evaluado en los ensayos de la Fase I y II en voluntarios sanos (Clements-Mann ML, KWeinhold, TJ Matthews, BS Graham, GL Gorse, MC Keefer, MJ McElrath, R-H Hsieh, J Mestecky, S Zolla-Pazner, J Mascola, D Schwartz, R Siliciano, L Corey, PF Wright, R Belshe, R Dolin, S Jackson, S Xu, P Fast, MC Walker, D Stablein, J-L Excler, J Tartaglia, A-M Duliege, F Sinangil, E Paoletti. 1998. Immune responses to Human Immunodeficiency Virus (HIV) Type 1 induced by Canarypox expressing HIV-1 MN gp120, HIV-1 SF2 recombinant gp120, or both vaccines in seronegative adults. J Infect Dis 177: 1230-1246; Egan MA, WA Pavlat, J Tartaglia, E Paoletti, KJ Weinhold, ML Clements, RF Siliciano. 1995. Induction of Human Immunodeficiency Virus Type 1 (H IV-1) - specific cytolytic T Iymphocyte responses in seronegative adults by a nonreplicating, host-range-restricted canarypox vector (ALVAC) carrying the HIV-1MN env gene. J Infect Dis 171: 1623-1627). Los CTL contra al menos un antígeno de VIH se reseñaron en el 50% de personas vacunadas en un ensayo de Fase I, 30% en un ensayo de Fase II y menos de 10% en el último ensayo de Fase I en Uganda. Este CPVr (vCP205) se creó mediante la inserción de los genes de VIH en tres regiones diferentes no esenciales en el genoma para lograr una respuesta de CTL contra más de una diana de VIH.
Por otra parte FPV también se ha usado para inducir una respuesta de CTL en macacos contra los antígenos de VIH en combinación con la inmunización de ADN (Robinson HL, DC Montefiori, RP Johnson, KH Manson, ML Kalish, JD Lifson, TA 5 Rizvi, S Lu, S-L Hu, GP Mazzara, DL Panicali, JG Herndon, R Glickmanm, MA Candido, SL Lydy, MS Wyand y HM McClure. 1999. Nature Medicine, 5: 526-534). Esta combinación de inmunógenos proporciona algún nivel de protección en el modelo de infección de nemestrina de macacos con VIH-1 (Kent SJ, AZhao, SJ Best, JD Chandler, DB Boyle, IA Ramshaw. Enhanced T-Cell immunogenicity and protective efficacy of a human immunodeficiency virus type 1 vaccine regime consisting of a consecutive priming with DNA and boosting with recombinant fowlpox virus. 1998. J Virol, 72: 10180-10188). Sin embargo el modelo animal presenta importantes limitaciones ya que la infección de VIH en M nemestrina es ineficaz y dificulta que se reproduzca.
Se ha reseñado también la generación de una respuesta de CTL a través de la inmunización con minigenes compuestos de una serie de epítopes de CTL exactos de varios patógenos (Whitton, L, Sheng N, Oldstone MB, y McKee T.A "string of beads" vaccine, comprising linked minigenes, confers protection from lethal-dose virus challenge, J Virol, 1993, 67, 1: 348-352; Ling-Ling An y J. Lindsay Whitton, A multivalent minigene vaccine, containing B-cell, cytotoxic T-Lymphocyte and Th epitopes from several microbes, induces appropriate responses in vivo and confers protection against more than one pathogen. J Virol, 1997, 71, 3: 2292-2302).
El recombinante de Vaccinia Ankara modificado (MVA) para un minigen derivado de gag conjuntamente con el gen gag completo se ha usado para inducir una respuesta de CTL en ratones (Hanke T, RV Samuel, TJ Blanchard, VC Neumann, TM Allen, JE Boyson, SA Sharpe, N Cook, GL Smith, DI Watkins, MP Cranage, AJ McMichael. 1999. Effective induction of simian immunodeficiency virus-specific cytotoxic T Iymphocytes in macaques by using a multiepitope gene and DNA primeModified Vaccinia Virus Ankara boost vaccination regimen. J Virol, 73, 9: 7524-7532). Esos minigenes constan de una hebra de epítopes de CTL discretos de gag.
La principal limitación del planteamiento del minigen es que la combinación de los epítopes de CTL individuales solamente cubren un intervalo limitado de antígenos de HLA y por lo tanto la respuesta de CTL inducida está por definición demasiado restringida.
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Descripción de la invención
La esencia de la presente invención es la construcción de los genes quiméricos compuesta por las regiones ricas en epítopes de las proteínas de VIH, donde las regiones se seleccionan entre tanto las proteínas conservadas internas como las proteínas reguladoras expresadas muy tempranamente en del ciclo de vida viral.
La solución tiene ventajas sobre los minigenes de VIH descritos debido a que permite el procesamiento simultáneo de los epítopes de superposición de CTL presentados por muchos alelos de HLA. Otra ventaja de esta solución en comparación con otro apoxivirus recombinante para varias proteínas de VIH-1 es que la concentración de regiones inmunológicamente relevantes de varias proteínas en un solo gen facilita la generación de virus recombinantes, y evitan la necesidad de usar varios sistemas de resistencia a antibióticos en el mismo virus recombinante. De manera adicional facilita la combinación de epítopes de varios subtipos de VIH en un único virus recombinante. Las regiones elegidas pertenecen a la mayoría de las proteínas virales conservadas y a productos reguladores expresados de manera temprana. Esas regiones ricas en epítopes de CTL se combinan con epítopes de células T auxiliares conservadas flanqueadas por dos lisinas para facilitar su procesamiento mediante proteasas celulares. Finalmente se añade un epítope de células B, reconocido por un anticuerpo monoclonal, para facilitar la detección del polipéptido mediante técnicas inmunoquímicas.
El gen quimérico se ensambla mediante la unión conjuntamente con fragmentos de ADN diferentes, algunos de ellos generados mediante la síntesis química y otros amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) usando los genes de VIH como moldes. Los fragmentos de ADN se clonan conjuntamente en un vector plásmido apropiado, secuenciado y traducido a un vector de recombinación de poxvirus.
Más particularmente esta invención se refiere ala gen cr3, que contiene epítopes de células Th de proteínas VIH-1 gp 120, gp41 y Vpr, el epítope sobre el bucle V3 de gp 120 reconocido por Mab 2C4 (Duarte CA, Pérez L, Vázquez J, Duenas M, Vilarubia OL, Navea L, Valdés R, Reyes O, Montero M, Ayala M, y Gavilondo J. Epitope mapping, V region DNA sequence, and neutralizing Fab fragments of two monoclonal antibodies against the HIV-1 V3 loop. Immunotechnology 1996, 2: 11-20) y las regiones ricas en epítopes en las proteínas RT, Gag y Nef.
Los genes quiméricos se insertan en el genoma de un vector vivo bacterial o viral (por ejemplo, poxvirus, herpesvirus, alfavirus, poliovirus, adenovirus, BCG, Salmonella), siendo este vector preferiblemente un poxvirus, y todavía más específicamente un avipoxvirus e incluso más específicamente FPV. Los virus vivos recombinantes se usan para inducir una respuesta inmune de TH1 y células T citotóxicas contra VIH en animales o seres humanos.
Incluso más específicamente esta invenciones refiere a FPv recombinante para las proteínas quiméricas y particularmente a las cepas de FPV recombinantes denominadas FPCR3 y FPSCR3gpt, que contiene el gen quimérico cr3. una vez ensamblado como se ha descrito anteriormente cr3 se clona en un vector de recombinación de poxvirus, en particular un vector de recombinación de FPV. En este caso particular se usaron los plásmidos pEFL29 y pFP67xgpt como vectores de recombinación. pEFL29 presenta regiones homólogas al fragmento terminal de 6 kb BamHI del genoma de FPB, que flanquea la unidad de transcripción, en la que el gen heterólogo se inserta en el control del promotor VV 7,5 K, y contiene también el gen indicador lacZ en el control del promotor 4b de FPV. pFP67xgpt emplea 6 y 7 marcos abiertos de lectura de la región BamHi de 11,2 kb como señales de recombinación homólogas. Esas regiones flanquean la unidad de transcripción en la que el gen heterólogo se coloca en el promotor E/L poxviral sintético y también contiene el gen gpt que confiere resistencia a ácido micofenólico que permite la selección de virus recombinantes.
Los plásmidos resultantes se denominaron pFPCR3 y pFPSCR3gpt respectivamente. Los plásmidos se transfectan en un primer cultivo de Fibroblastos de Embriones de pollo (CEF) usando una de las varias técnicas de transfección disponibles en la técnica. En este caso particular la transfección se lleva a cabo usando lipofectina (Sigma, Estados Unidos) en CEF infectados previamente con la cepa FP29 de FPV pero se pueden usar otros procedimientos tales como electroporación y DEAE dextrano, entre otros. Como resultado de la recombinación homológa entre entre plásmido y las regiones no esenciales correspondientes del genoma de FPV, se pueden recuperar virus recombinantes que expresaban la galactosidasa B en el caso de pFPCR3 o resistente al ácido micofenólico en el caso de pFPSCR3gpt. La presencia del marcador de selección permite la identificación de placas virales recombinantes y su purificación mediante varios pases sobre CEF. La presencia del gen heterólogo sobre los virus seleccionados se puede verificar mediante PCR y la expresión de la proteína se puede verificar mediante transferencia de Western.
La invención se refiere también al uso del FPV recombinante, obtenido como se ha descrito, para inducir una respuesta de TH1 inmune con actividad de CTL en ratones Balb/c solos o en combinación con una formulación farmacéuticamente aceptada seleccionada entre los que se conocen en la técnica.
Esta invención se refiere también a una combinación terapéutica o preventiva de FPV recombinante para los genes quiméricos descritos, y particularmente FPCR3 y FPSCR3gpt, con inmunomoduladores o adyuvantes en particular con titoquinas tales como IL-2, IL-12, IFN\gamma, GMSCF, GSCF, entre otros, que estimulan preferentemente la respuesta inmune de TH1.
En particular se refiere a una combinación de los virus de FPCR3 y FPSCR3gpt con dosis diarias de IL2 en un intervalo entre 10^{2} y 10^{7} IU en animales o seres humanos. La administración diaria de IL2 a ratones Balb/c comenzando el día de la administración del FPV o más tarde potencia la respuesta inmune celular contra CR3.
Aunque se refiere en particular a CR3, está en la esencia de esta invención que también se pueden usar los fragmentos ricos en CTL diferentes de aquellos en CR3 o los fragmentos equivalentes a aquellos en CR3 pero de otros aislamientos de VIH-1.
De manera similar, aunque se refiere en particular a la cepa FP9 de FPV, está en la esencia de esta invención que otras cepas parentales de FPV se pueden usar para construir los virus recombinantes, así comootros apoxivirus tal como CPV, otros poxvirus tales como VV o MVA o incluso otros virus tales como herpesvirus, alfavirus, adenovirus, poliovirus o incluso bacterias tales como BCG o Salmonella.
En otra realización de la presente invención el gen se puede clonar en un vector de plásmido apropiado para la expresión en células de mamífero y se inyectan en un mamífero para inducir una respuesta inmune de TH1 y actividad de CTL en combinación con un vehículo farmacéuticamente aceptable.
En todavía otra realización de la invención también se incluye una combinación terapéutica o preventiva de los plásmidos recombinantes descritos anteriormente con inmunomoduladores o adyuvantes como se ha descrito o incluso otros tales como liposomas, polisacáridos, lipopéptidos, lípidos, proteoliposomas o sus combinaciones.
En todavía otra realización de la invención esos genes se pueden clonar en otros plásmidos para la expresión de las proteínas recombinantes en bacterias, levaduras, hongos, células de insecto o de mamífero, plantas o en la leche de animales no transgénicas no humanas. Las proteínas recuperadas de estos sistemas también se pueden usar para inducir una respuesta inmune de TH1 y actividad de CTL en animales o seres humanos cuando se administran en un vehículo farmacéuticamente aceptable.
Todavía otra realización de la invención incluye combinaciones terapéuticos o preventivas de la proteína CR3 con inmunomoduladores o adyuvantes tal como se ha descrito anteriormente o incluso otros tales como liposomas, polisacáridos, lipopéptidos, lípidos, proteoliposomas u otros adyuvantes disponibles de acuerdo con la técnica capaces de potenciar la respuesta inmune de tipo TH1 y actividad de CTL en animales o seres humanos.
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Descripción de las figuras
Figura 1. Plásmido pEL-cr3, para la recombinación homóloga en la viruela aviar usando el ORF-1 de la región terminal de 6 Kb de BamHI como sitio de inserción. El gen cr3 está bajo el control del promotor VV p7,5 K y el gen indicador LacZ bajo el promotor de FPV 4b.
Figura 2. Plásmido FP67xgpt, para la recombinación homóloga en FPV usando la región de ADN entre ORF-6 y ORF-7 del fragmento de 11,2 Kb de BamHI como sitio de inserción. El gen cr3 se coloca bajo el control del promotor sintético E/L y el gen Ecogpt bajo el promotor de W 7,5 K.
Figura 3. (A) PCR y (B) transferencia de Western de tres FPV recombinantes de cr3 independientes: (1) FPCR3.1; (2) FPCR3.2; (3) FPCR3.3; (4) FLP29.4; (5) marcador del peso molecular de ADN.
Figura 4. (A) PCR con oligonucleótidos internos de cr3 (B) transferencia de Western de tres FPV recombinantes de cr3 independientes (1) FPSCR3GPT.1; (2) FPSCR3GPT.2; (3) FPSCR3GPT.3; (4) virus parental; (5) Marcador de peso molecular.
Figura 5. Estabilidad de la expersión de CR3 determinada mediante transferencia de Western. Las calles representan tres muestras independientes de FPV infectadas con FPSCR3GPT de la reserva viral (1,2,3) o purificadas mediante lecho de sacarosa (4,5,6). La calle 7 representa los CEF infectado con el virus parental.
Figura 6. Se produce a partir dos experimentos independientes ELlSPOT usando esplenocitos de ratones inmunizados con células FPSCR3gpt y P815 cargadas con el péptido 32 o infectados con VV recombinante para CR3, Gag o Nef. Los resultados se expresan como número de células que segregan IFN gamma por 10^{6} esplenocitos. Los valores de los controles negativos correspondientes (P815 solo o infectado con VV WR) se han restado.
Figura 7. Experimentos ELlSPOT de IFN gamma usando esplenocitos de ratones inmunizados con FPCR3 o FPSCR3gpt y P815 transfectados de manera estable con el gen cr3 gene. Los resultados se expresan como número de células que secretan IFN gamma por 10^{6} esplenocitos. Los valores de los controles negativos (P815 parental) se han restado.
Figura 8. Reconocimiento de células B autólogas infectadas con VVCR3 por linfocitos T de pacientes con SIDA. Los resultados de un IFNy ELlSPOT se expresan como el número de células que secretan IFN gamma por 10^{6} de células mononucleares de sangre periférica.
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Ejemplos Ejemplo 1 Obtención de cr3
cr3 es un gen quimérico ensamblado por fragmentos de diferentes genes de VIH. Se ensambló sobre plásmido pTAB11, que es esencialmente igual a pTAB9 (Gómez CE, Navea L, Lobaina L, Dubed M, Expósito N, Soto A y Duarte CA. El Polipéptido TAB9 Multi-Epítope basado en el bucle he V3 adyuvantado con Montanide ISA720 es altamente inmunogénico en primates no humanos e Induce anticuerpos neutralizantes contra cinco aislamientos de VIH-1. Vaccine 17: 2311-2319, 1999), pero tiene los epítopes de células auxiliares T T1 y T2 T de gp120 en el extreme del terminal 5' del gen en lugar del fragmento que codifica la parte N-terminal de la proteína P64K. Un fragmento de ADN sintético de 186 pares de bases blunt-BamHI que codifica el epítope T2 de gp120, el V3 epítope de la cepa MN, y epítopes de células auxiliares T de gp41 y vpr, se clonó en pTAB11 previamente digerido por EcoRV-BamHI. Las secuencias de ADN que codifican dos lisinas consecutivas se insertaron entre epítopes individuales para facilitar el procesamiento intracelular. El plásmido resultante se denominó pCR1. Un fragmento de 603 pares de bases que codifica la proteína p66/p51 (RT) (pos. 2663-3109 de VIH-1 SF2 provirus) se amplificó mediante PCR usando los cebadores O.2660 y O.2661 (tabla 1). El fragmento de PCR se extrajo de agarosa de bajo punto de fusión digerido por BglII-EcoRI y subclonado en el vector pCR1 cortado por BglII-EcoRI para obtenerle plásmido pCR2 que codifica la proteína CR2. A continuación, un fragmento de 324 pares de bases, que comprende una secuencia de del gen nef (pos. 8516-8818 de aislamiento LAI de VIH-1), se amplificó mediante PCR con los cebadores O.2660 y O.2663. Finalmente, otro segmento de 267 pares de bases en el gen gag (pos. 1451-1696 de VIH-1 SF2) se amplificó usando los cebadores O.2664 y O.2665 (tabla 1). Después, se llevó a cabo una PCR de superposición usando 20 pmol de los cebadores O.2660 y O.2666 (tabla 1). Se mezcló una cantidad igual de cada banda (0,47 pmol) en tampón de PCR [KCl 50 mM; Tris-HCl 10 mM, (pH 8,3), a 25ºC; gelatina 0,001%], MgCl_{2} 2,5 mM, dNTP 0,2 mM de cada uno y 4 U de Taq Polimerasa, en un volumen de 50 \mul. Para promover la hibridación de las bandas mediante los extremos de 9 pares de bases complementarios de los oligonucleótidos O.2663 y O.2664, la mezcla se calentó primero a 92ºC durante 2 min y después se enfrió a 50ºC. Finalmente, la temperatura se incremento hasta 72ºC durante 5 min para extender los segmentos de hibridación. Después, se añadieron 10 \mul de la anterior reacción a la mezcla de tampón de PCR que contenía 2,5 mM de MgCl_{2}, 0,2 mM de dNTPs, 20 pmol de O.2662 y 20 pmol de O.2666 y 4 U Vent poI. en 50 \mul como volumen total. Las condiciones de amplificación convencionales eran 92ºC durante 2 min, seguido de 30 ciclos de 92ºC durante 40 seg, 50ºC durante 1 min y 72ºC durante 1 min, y una extensión final a 72ºC durante 5 mino A continuación, la banda amplificada de nef-p24 de superposición se purificaron en electroforesis en agarosa de bajo punto de fisión y digerido con XbaI. Finalmente, la banda anterior blunt-XbaI se clonó en un vector pCR2 cortado previamente por NruI-XbaI para obtener el plásmido pCR3. cr3 codifica por lo tanto una proteína quimérica que incluye células auxiliares T y epítopes de CTL de gp120, gp41, vpr, RT, nef y gag presentados mediante un amplio intervalo de antígenos de HLA (tabla 2).
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TABLA 1 Secuencia de ADN de oligonucleótidos usados en las reacciones de PCR
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1
TABLA 2 T epítopes de células T en cr3
2
3
4
Ejemplo 2 Clonación de cr3 en pFPL29
En pCR3, el gen cr3 se clonó bajo el control de pTryp, con un sitio a Cial sobre el 5' y el terminador del gen del fago T4 y un sitio HindIII en 3'. Este plásmido se digirió con ClaI e HindIII, y se trató con Klenow I obteniendo un gen r3 con ATG en el extremo 5' y los codones de parada de traducción en 3'. Este fragmento de ADN se clonó en el vector de recombinación de poxvirus pEFL29.
pEFL29 tiene el fragmento terminal BamHI de 6Kb de FPV como regiones no esenciales para la recombinación homóloga en el genoma de FPV. Este fragmento contiene tres ORF y el ORF1 está interrumpido. Franqueadas por estas regiones de homología están VV p7.5K, promotor, seguido de un sitio SmaI y el gen indicador lacZ bajo el control de del último promotor 4b de FPV. Este plásmido incluye también el gen de resistencia a kanamicina y un origen bacteriano de replicación.
PEFL29 se digirió por SmaI, se trató con fosfatasa alcalina y se ligó con una banda digerida por ClaII HindIII que contenía el gen cr3. Se seleccionaron varios clones con cr3 en la orientación derecha con bajo el p7.5K. La cepa DH5\alpha de E. coli (\Phi80dlacZ\DeltaM15, recA1, endA1, gyrA96, thi-1, hsdR17 (rK- mK+), supE44, relA1, deoR, \Delta (lacZYA-argF)U169) se usó para la propagación y selección de plásmidos recombinantes en medio LB que contenía kanamicina (25 \mug/ml). Todas las manipulaciones genéticas se realizaron de acuerdo con Sambrook y col (Sambrook J, Fritsh EF, Maniatis T. 1989. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. Seg. Ed. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.)
El ADN secuenciado del clon pEFL-cr3 (Figura 1), se verificó usando procesador de secuencia automático (Pharmacia). Este clon se purificó usando gradiente de CsCI y se usó para transfectar fibroblastos de embriones de pollo (CEF).
Ejemplo 3 Clonación de cr3 en pFP67xgpt
El gen cr3 se amplificó mediante PCR y se clonó en el vector pMosblue (Amersham, Reino Unido). El plásmido resultante se denominó pTCR3. pTCR3 se digirió por HpaI/BamHI y la banda más corta que contenía cr3 se clonó en el vector poxvirus pFP67xgpt.
pFP67xgpt tiene un fragmento del 11,2 Kb BamHI de genoma de FPV como una región no esencial de recombinación homóloga en el genoma de FPV (Tomley F, Binns M, Campwell J, Boursnell M. Sequence Analysis of an 11.2 Kilobase, near-terminal, BamHI fragment of fowlpox virus, J Gen Virol, 1988, 69, 1025-1040). Este fragmento contiene el marco abierto de lectura 6 y 7 de esta región y la inserción se produce en la región intergénica. Flanqueadas por estas regiones homólogas son están un promotor sintético de E/L (Carroll MW, Moss B. E. coli B-glucoronidase (GUS) as a marker for recombinant vaccinia viruses, Biotechniques, 1995, 19,3: 352-354), y el gen indicador Ecogpt bajo el control del promotor 7,5K de VV. Este plásmido incluye también el gen de resistencia a kanamicina y un origen bacteriano de replicación.
El plásmido pFP67xgp se cortó por StuI/BamHI y se ligó con un fragmento de ADN que contenía cr3 derivado de la digestión por HpaI/BamHI de pTCR3. Se seleccionaron varios clones con cr3 en la propia orientación bajo el promotor sintético de E/L (Figura 1). La cepa DH5a de E. coli (\Phi80dlacZ\DeltaM15, recA1, endA1, gyrA96, thi-1, hsdR17 (rK- mK+), supE44, relA1, deoR, \Delta(lacZYA-argF)U169) se usó para la propagación y selección de plásmidos recombinantes en medio LB que contenía ampicilina (50 \mug/ml). Todas las manipulaciones genéticas se realizaron de acuerdo con Sambrook et al. El ADN secuenciado del clon pFP67xgptct se verificó usando un procesador de secuencia automático (Pharmacia). Este clon se purificó usando un gradiente de CsCI y se usó para transfectar
CEF).
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Ejemplo 4 Generación de FPV recombinantes
El FPV parental usado para la generación de recombinantes era la cepa atenuada de HP-438, que se derivó de la cepa HP-1 patógena mediante seis pases consecutivos sobre CEF, dos pases adicionales sobre las membranas corioalantoicas, y finalmente 438 pases a través de los CEF (Mayr A y K Malicki. 1966. Attenuierung von virulentem Huhnerpockenvirus in Zellkulturen und Eigenschaften des attenuierten Virus. Zentralbl. Veterinaermed. Reihe B 13: 1-13). Un aislamiento purificado dos veces en placa de HP438 (FP9) se pasó después seis veces para constituir una reserva de FPV. Las reservas de FPV se desarrollaron sobre los CEF en medio 199 que contenía 2% de suero de ternera recién nacida (NBCS).
Los FPV recombinante se generaron mediante recombinación homóloga entre FP9 y el plásmido pEFL29 o sus derivados como se ha descrito previamente. Los CEF desarrollados en matraces de 25 cm^{2} se infectaron con FP9 a una multiplicidad de infección (m.o.i) de 2 unidades formadoras de placa (pfu)/célula, 2 horas más tarde las células se transfectaron con 10 \mug de CsCI purificado de ADN de plásmido (pEFL-cr3 o pFP67xgptctl) usando 20 \mug de Lipofectina (Gibco BRL, Estados Unidos). Se añadió medio reciente (3 ml de medio 199 que contenía 10% de caldo de triptosa fosfato más 2% de NBCS) y se incubaron las células a 37ºC en un incubador de CO_{2}. Se añadió medio reciente de Nuevo después de 24 h, y después las células se incubaron durante 3 a 4 días adicionales. Después de ese tiempo, las células se congelaron descongelaron tres veces. Después el lisado celular se valoró en CEF para determinar los virus recombinantes selectivos. Después de 2 hrs de adsorción el inóculo viral se retiró y se añadió una capa de agarosa que contenía EMEN. Se preparó esta fase mezclando volúmenes iguales de 2% de agarosa de bajo punto de fusión y EMEN 2X. (Gibco, Grand Island, NY) con 4% de suero de ternera fetal (Gibco, Grand Island, NY). El día cuatro eran evidentes placas virales. Se transfectaron los CEF con pEFL-cr3 se tiñeron mediante la adición de otra capa de agarosa con 0,33% de Xgal (Melford Laboratories, Reino Unido) a los cultivos. Las placas de color azul se seleccionaron y se purificaron tres veces hasta que el 100% de las placas virales eran positivas para la expresión de galactosidasa B. Las reservas de virus lacZ+ se amplificaron después en CEF desarrollados en matraces de 25 cm^{2} en medio 199 que contenía 10% de caldo de triptosa fosfato más 2% de NBCS. El FPV seleccionado recombinante se denominó FPCR3.
El medio selectivo para la transfección con el plásmido pFP67xgptctl contenía ácido micofenólico (25 \mug/ml), xantina (250 \mug/ml) e hipoxantina (1 \mug/ml). El día cuatro eran evidentes placas virales. Ya que los genes gpt y cr3 estaban flanqueados por las mismas regiones de homología el aislamiento de las placas virales en medio selectivo indican que se produjo recombinación y ambos genes se insertan en el genoma de FPV. Se purificaron las placas tres veces consecutivas en CEF. El virus recombinante seleccionado se denominó FPSCR3G PT.
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Ejemplo 5 Análisis de PCR de FPCR3
Se usó análisis de PCR para comprobar que los recombinantes de FPCR3 contenían el gen cr3. Los FPV recombinantes se prepararon en CEF durante 6 días y después las células se recogieron y se sedimentaron. Se suspendió el gránulo y se incubó durante 2 h a 55ºC en 200 \mul de tampón de extracción (10 mM de Tris HCl, 100 mM de NaCl, 10 mM de EDTA, 0,5% de SDS, 2% de \beta-mercaptoetanol) que contenía 1,25 mg/ml de proteinasa K. El ADN se extrajo después con fenol-cloroformo y se precipitó en etanol. El ADN de cada virus se ensayó mediante PCR con los cebadores descritos más adelante, complementarios con las secuencias en el 5' y 3' del gen cr3, respectivamente. Las condiciones de PCR usadas eran 5 min a 94ºC, seguido de 25 ciclos de 1 min a 94ºC, 1 min 30 seg a 45ºC y 1 min 30 seg a 72ºC, y una extensión final a 72ºC durante 10 min. Las secuencias de los cebadores eran como sigue:
cebador 775, 5' TATIAACATIGCCTAGTAG 3'
cebador 776, 5' GAAGTAGAATCATAAAGAAC 3'
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Tres virus recombinantes de CR3 independientes (FPCR3.1; FPCR3.2; FPCR3.3), mostraron la banda de 1,3kb esperada después de la reacción de PCR. Esta banda no estaba en el virus parental FPL29 (Figura 3A).
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Ejemplo 6 FPSCR3GPT de análisis de PCR
Se usó análisis de PCR para comprobar que los recombinantes de FPSCR3GPT contenían el gen cr3. Los FPV recombinantes se propagaron en los CEF durante 6 días, y después las células se recogieron y se sedimentaron. El sedimento se suspendió y se incubó durante 2 h a 55ºC en 200 \muI de tampón de extracción (10 mM de Tris HCl, 100 mM de NaCl, 10 mM de EDTA, 0,5% de SDS, 2% de \beta-mercaptoetanol) que contenía 1,25 mg/ml de proteinasa K. El ADN se extrajo después con fenol-cloroformo y se precipitó en etanol. El ADN de cada virus se ensayó mediante PCR con los cebadores descritos más adelante, complementarios con las secuencias en el 5' y 3' del gen cr3, respectivamente. Las condiciones de PCR usadas eran 5 min a 94ºC, seguido de 25 ciclos de 1 min a 94ºC, 1 min 30 seg a 45ºC y 1 min 30 seg a 72ºC, y una extensión final a 72ºC durante 10 min. Las secuencias de los cebadores eran como sigue:
cebador 2660, (257-279) 5' GAAGATCTGTACAGAAATGGAAAAG 3'
cebador 2663, (1029-1059) 5' CCCTGCATGTGGCTCAACTGGTACTAGCTIG 3'
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Tres virus recombinantes independientes (FPSCR3gpt.1; FPSCR3gpt.2; FPSCR3gpt.3), mostraron la banda de de 800 pares de bases esperada después de la reacción de PCR. Esta banda no estaba en el virus parental FPL29 (Figura 4A).
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Ejemplo 7 Evaluación de la expresión de CR3 por CEF infectado por FPCR3
La expresión de CR3 por el FPCR3 se confirmó mediante transferencia de Western. Se infectaron los CEF confluentes en placas Petri de 60 mm a 0,5 pfu/célula con FPV recombinantes. Después de 24 horas se recogieron las células, se sedimentaron y se suspendieron en tampón de carga de del 1 X SDS (50 mM de Tris HCl pH 6.8, 100 mM de DTT, 2% de SDS, 0,1% de azul de bromofenol, 10% de glicerol). Se fraccionaron las proteínas mediante electroforesis de gel de dodecil sulfato sódico-poliacrilamida (SDS-PAGE) sobre un gel al 15%. Después se electrotransfirieron en una membrana de nitrocelulosa (Hybond-C, Amersham, Reino Unido) siguiendo protocolos convencionales. Después de la transferencia, la membrana se bloqueó durante toda una noche en 5% de leche en polvo no grasa en solución salina tamponada con fosfato (PBS: 2,68 mM de KCl, 1,47 mM de KH_{2}P0_{4}, 0,137 M NaCl, 8,06 mM Na_{2}HP0_{4}). Después se incubó durante 2 h a temperatura ambiente con 10 ug/ml de anticuerpo monoclonal 6.2, diluido en PBS que contenía 1% de leche en polvo. Este anticuerpo monoclonal se produjo en ratones inmunizados CR3 (Iglesias E, Ruiz M, Carrazana Y, Cruz LJ, Aguilar A, Jiménez V, Carpio E, Martínez M, Perez M. Martinez C, Cruz O, Martín A, Duarte C. Chimeric proteins containing VIH-1 epítopes. Journal Biochemistry, Molecular Biology and Biophysics, 2001, 5: 109-20.). La membrana después se lavó y se incubó con anticuerpo anti-ratón de oveja (1 : 2000) conjugado a peroxidasa de rábano picante (HRPO) (Amersham, Reino Unido). Después de varios lavados, las inmunotransferencias se desarrollaron usando el sistema de detección de transferencia de Western ECL (Amersham, Reino Unido) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Una banda específica con un peso molecular entre 50 y 64 kDa se detectó en cultivos infectados con FPCR3. No se detectó proteína en CEF infectado con virus FP9 parental (figura 3 B).
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Ejemplo 8 Evaluación de la expresión de CR3 por CEF infectado por FPSCR3gpt
La expresión de CR3 por el FPSCR3gpt se confirmó por transferencia de Western siguiendo un procedimiento similar al descrito en el ejemplo previo. También se detectó una banda específica con un peso molecular entre 50 y 64 kDa en cultivos infectados con FPSCR3gpt mientras no se detectó proteína en CEF infectado con el virus parental FP9 (figura 4 B).
Ejemplo 9 Purificación de FPCR3 y FPSCR3gpt e immunización de ratones
Se desarrollaron reservas grandes de FPV recombinante sobre los CEF obtenidos de huevos de una multitud específica sin patógenos. Se purificó FPV mediante centrifugación de extractos citoplásmicos a través de un lecho de sacarosa al 25% (p/v) en un agitador Beckman SW28 a 29000 rpm durante 2 horas. Después se determinaron las valoraciones de virus mediante ensayo en placa sobre monocapas de CEF. La Figura 5 muestra que la expresión de CR3 no variaba después del aumento a escala del cultivo.
Ratones adultos jóvenes hembras Balb/c (cinco a ocho semanas de edad) (obtenidos de la colonia de crianza SPF en el Instituto para la salud animal, Compton, Reino Unido, o el Centro Nacional de Producción de Animales de Laboratorio (CENPALAB), Cuba) se cebaron mediante las vías intravenosa (i. v), intraperitoneal (i. p), o subcutánea (s.c) con 2,5 - 5 x 10^{7} pfu de FPCR3, FPSCR3gpt o el virus de control negativo en 200 \muI de PBS estéril. Dos a cuatro semanas más tarde, los ratones se volvieron a inmunizar por la misma vía con una segunda dosis de 2,5 - 9 x 10^{7} pfu de los mismos virus en 200 \muI de PBS estéril.
Ejemplo 10 Detección de la respuesta de CTL contra CR3 en ratones Balb/c
Se realizaron ensayos de in inmunotransferencia ligada a Enzima (ELlSPOT) para la detección de células de liberación de IFN-\gamma específicas de antígeno usando un procedimiento basado en la descrita previamente (Tanguay S y JJ Killion. Direct comparison of ELISPOT and ELISA-based assays for detection of individual cytokine-secreting cells. 1994. Lymphokine Cytokine Res, 13: 259-263). En resumen, placas de 96 pocillos de membrana immobilon-P (Millipore, Molsheim, Francia) se recubrieron con 100 \muI/pocillo de 5 \mug/ml de anticuerpo monoclonal R4 específico de IFN-\gamma murino (Pharmingen, San Diego, California) durante toda una noche a 4ºC, se lavó 3 X con PBS y se bloqueó usando medio RPMI 1640 suplementado con 10% de FBS a 37ºC durante 1h. Después se añadieron células de ensayo: éstas eran o bien suspensiones de esplenocitos ex vivo (preparadas como se ha descrito anteriormente) de ratones cebados y vueltos a inmunizar con FPCR3 o FPSCR3gpt. Se añadieron por pocillo diferentes números de células de ensayo: 10^{6}, 2 x 10^{5} y 4 x 10^{4}. Las células se estimularon mediante la adición de células P815 incubadas con péptidos sintéticos a 1 \muM o infectadas con recombinante W para CR3, 15 Gag, o Nef a una m.o.i de 5 pfu/célula. Las células P815 sin péptido o infectadas con virus vaccinia control (vSC8 o la cepa de vaccinia de tipo salvaje WR) se incluyeron para revelar los números antecedentes de células que producían IFN-\gamma. Cada pocillo tenía una concentración final de 200 \mul de medio R10 más hIL-2. Todas las variables de ensayo se ensayaron por duplicado. Después de la incubación durante toda una noche (al menos 17 horas), las placas se lavaron 3 X con PBS y 5 X con PBS más 0,05% de Tween 20, después un anticuerpo secundario XMG1.2 conjugado a biotina (Pharmingen, San Diego, California) se añadió a 0,5 \mug/ml y se hizo reaccionar a temperatura ambiente durante 2h. Los pocillos se lavaron 5X con PBS más 0,05% de Tween 20, y se añadió estreptavidina marcada con fosfatasa alcalina (AP) (Vector Labs, CA, Estados Unidos) a una dilución 1/1000 en PBS más 0,05% de Tween 20 durante 1 h a temperatura ambiente. Los pocillos se lavaron de nuevo 3X con PBS más 0,05% de Tween 20 y 3X con PBS, y se desarrollaron las manchas usando un kit de actividad de AP (Biorad, CA, Estados Unidos). Después de 15 min, los pocillos se lavaron con agua potable, se secaron y las manchas se contaron en un microscopio estereoscópico (Leica Microscopy System, Heerbrugg, Suiza). Como alternativa, en algunos ensayos los inventores estreptavidina marcada con HRPO (Amersham, Reino Unido), diluida 1/800; después las manchas se desarrollaron con 0,1% de 3,3'diaminobencidina (Sigma, Saint Louis, Estados Unidos) en Tris-HCl 50 mM, pH 7,4 y 0,1% de peróxido de hidrógeno. Los resultados se expresaron como el número de células formadoras de mancha (SFC) por 10^{6} esplenocitos o células fraccionadas. Los valores de más de dos veces el control negativo para cada grupo (P815 sin péptido o infectado con control W) se consideraron positivos.
Los resultados de dos ensayos independientes de ELlSPOT se muestran en la Figura 6. Una fracción significativa de esplenocitos de ratones Balb/c inmunizados con FPCR3 pero no con virus negativo era positivo en ELlSPOT de IFN gamma contra P815 infectados con o bien WCR3 o Wgag y Wnef o cebados con los péptidos V3 MN (LKKKRIHIGPGRAFYERY).
En otro experimento los ratones Balb/c se inmunizaron con FPCR3 o FPSCR3gpt como se ha descrito y la inducción de los CTL se midió usando un P815 transfectado establemente con cr3 (P815cr3). Los resultados de este experimento se muestran en la figura 7. Ambos FPV recombinantes inducían una fracción significativa de células que secretan IFB gamma específicas para CR3.
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Ejemplo 11 Procesamiento y reconocimiento de epítopes de CR3 mediante linfocitos de pacientes de SIDA
Células B autólogas de pacientes infectados con VIH se transformaron por EBV y se infectaron con un recombinante de VV para CR3 (VVCR3). Las células diana se incubaron con linfocitos de sangre periférica de pacientes con VIH y se calculó el número de esplenocitos que secretan IFN-\gamma mediante ELlSPOT. Este experimento demostró que el gen cr3 expresado por poxvirus es capaz de presentar de manera eficaz sus epítopes para los linfocitos de CTL de pacientes infectados con VIH.
<110> CENTRO DE INGENIERÍA GENÉTICA y BIOTECNOLOGÍA
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<120> POXVIRUS RECOMBINANTES PARA PROTEINAS QUIMERICAS DEL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA
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<130> poxvirus
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<150> CU 2001-0057
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<151> 28-02-2001
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<160> 1
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<170> PatentIn version 3.1
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<210> 1
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<211> 1333
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<212> ADN
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<213> Virus de inmunodeficiencia humana
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<400> 1
5

Claims (27)

1. Un gen quimérico que contiene fragmentos de diferentes genes de VIH-1, en el que dichos fragmentos codifican los epítopes de células T citotóxicas (CTL) de superposición, que se presentan mediante un amplio intervalo de antígenos de Complejo de Histocompatiblidad Principal (HLA-1), codificando dichos fragmentos opcionalmente además epítopes de células T auxiliares (Th) de VIH y al menos un epítope de células B que es la diana de un anticuerpo monoclonal (Mab).
2. Un gen de acuerdo con la reivindicación 1 que codifica una poliproteína quimérica que contiene fragmentos de al menos una proteína estructural de VIH y una proteína no estructural de VIH.
3. Un gen de acuerdo con la reivindicación 2 que codifica una poliproteína quimérica que contiene fragmentos de las Proteínas de VIH-1 Transcriptasa Inversa, P24 y Nef, los epítopes de gp120, gp41 y vpr y un epítope de células B de gp120.
4. Un gen de acuerdo con la reivindicación 3 que codifica una poliproteína quimérica que contiene los fragmentos 203-259 de la Transcriptasa Inversa, 219-307 de P24, y 45-147 de Nef, epítopes de células Th T1 y T2 de gp120, 580-594 de gp41 y 566-580 de vpr y un epítope de células B de de la región V3 de la cepa MN reconocida por Mab 2C4.
5. Un gen de acuerdo con la reivindicación 4, que tiene una secuencia de ADN que se corresponde esencialmente con la del gen cr3, SEQ ID NO.1.
6. Una proteína quimérica que tiene una secuencia de aminoácidos que se corresponde esencialmente con la secuencia de la proteína CR3 codificada por el gen cr3, SEQ ID NO 1.
7. Un virus recombinante para un gen heterólogo, que contiene fragmentos de diferentes genes de VIH-1, en el que dichos fragmentos codifican los epítopes de CTL de superposición, que se presentan mediante un amplio intervalo de antígenos de HLA-1, codificando dichos fragmentos opcionalmente además epítopes de células T auxiliares de VIH-1 y al menos un epítope de células B reconocido por un Mab.
8. Un virus recombinante de acuerdo con la reivindicación 7 en el que el gen heterólogo codifica una proteína quimérica que contiene fragmentos de al menos una proteína estructural de VIH y una proteína no estructural de VIH.
9. Un virus recombinante de acuerdo con la reivindicación 8 en el que el gen heterólogo codifica una proteína quimérica que contiene fragmentos de proteínas de VIH-1 RT, P24 y Nef, epítopes Th de gp120, gp41 y vpr y un epítope de células B de gp120.
10. Un virus recombinante de acuerdo con la reivindicación 9 en el que el gen heterólogo codifica una proteína quimérica que contiene los fragmentos 203-259 de RT, 219-307 de P24, y 45-147 de NEF y los epítopes de células Th T1 y T2 de gp120, 580-594 de gp41 y 566-580 de vpr y epítope de células B de la región V3 de la cepa MN reconocida por Mab 2C4.
11. Un virus recombinante de acuerdo con la reivindicación 10 en el que la secuencia de ADN del gen heterólogo corresponde esencialmente a cr3, SEQ ID NO.1.
12. Un virus de acuerdo con las reivindicaciones 7-11 en el que el virus es un poxvirus.
13. Un virus de acuerdo con las reivindicaciones 7-12 en el que el virus es un Avipoxvirus.
14. Un virus de acuerdo con las reivindicaciones 7-13 en el que el virus es un Virus de la viruela aviar.
15. Un virus de acuerdo con las reivindicaciones 7-14 en el que el virus es FPCR3, un Virus de la viruela aviar que comprende el gen cr3.
16. Un virus de acuerdo con las reivindicaciones 7-14 en el que el virus es FPSCR3gpt, un Virus de la viruela aviar que comprende el gen cr3 y el gen gpt.
17. Una formulación de vacuna que contiene un virus recombinante de acuerdo con las reivindicaciones 7-16 y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
18. Uso del virus recombinante de acuerdo con las reivindicaciones 7-16 para la fabricación de una vacuna para inducir una respuesta inmune contra VIH en pacientes de SIDA o personas no infectadas.
19. Una combinación preventiva o terapéutica compuesta de la formulación de vacuna de acuerdo con la reivindicación 17 y una sustancia inmunopotenciadora.
\newpage
20. Una combinación preventiva o terapéutica de acuerdo con la reivindicación 19 en la que la sustancia inmunopotenciadora es una citoquina.
21. Una combinación preventiva o terapéutica de acuerdo con la reivindicación 20 en la que dicha citoquina es IL2.
22. Un vector de plásmido que contiene un gen quimérico de acuerdo con las reivindicaciones 1-5 bajo el control de un promotor de células de mamífero.
23. Una formulación de vacuna que contiene un vector de plásmido recombinante de acuerdo con la reivindicación 22 y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
24. Uso de un vector de plásmido recombinante de acuerdo con la reivindicación 22 para la fabricación de una formulación de vacuna para inducir una respuesta inmune contra diferentes proteínas de VIH en pacientes de SIDA o personas no infectadas.
25. Una combinación preventiva o terapéutica compuesta de la formulación de vacuna de acuerdo con la reivindicación 23 y una sustancia inmunoprotectora.
26. Una combinación preventiva o terapéutica de acuerdo con la reivindicación 25 en la que la sustancia inmunoprotectora es una citoquina.
27. Una combinación preventiva o terapéutica de acuerdo con la reivindicación 26 en la que dicha citoquina es IL2.
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