ES2304398T3 - Antigeno de tumores. - Google Patents
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Abstract
Un péptido constituido por una secuencia de aminoácidos seleccionada entre el grupo constituido de SEQ ID Nº: 1 a SEQ ID Nº: 44.
Description
Antígeno de tumores.
La presente invención se refiere a un antígeno
de tumores, y más particularmente a se refiere a un péptido
reconocido por linfocitos T citotóxicos específicos de tumores, un
polinucleótido que codifica el péptido de y un polinucleótido de
hebra complementario a él, un vector recombinante que comprende el
polinucleótido, un transformante que comprende el vector
recombinante, un anticuerpo contra el péptido, un compuesto que
tiene cualquier interacción con el péptido o el polinucleótido, un
inductor de linfocito T citotóxico que consta del péptido, y una
composición farmacéutica que comprende el mismo, y procedimiento
para producir el polipéptido, un procedimiento para seleccionar un
compuesto que tiene cualquier interacción con el péptido o el
polinucleótido, un procedimiento para inducir linfocitos T
citotóxicos usando el péptido, un procedimiento para medir el
péptido o el polinucleótido que codifica el péptido, y un kit de
reactivo usado para el procedimiento de medición.
El sistema inmune, particularmente linfocitos T
citotóxicos (que de aquí en adelante se pueden abreviar como CTL)
juegan un papel importante en la exclusión de cáncer in vivo.
La infiltración de linfocitos T citotóxicos que muestran una
actividad citotóxica contra las células tumorales se han detectado
en el sitio del tumor de un paciente de cáncer (Arch. Surg., 126:
200 - 205, 1990). Una molécula Diana (antígeno de tumores) de los
linfocitos T citotóxicos específicos de tumores se descubrió primero
en un melanoma. Un antígeno de tumores generado en una célula
tumoral se degrada en la célula en un péptido (péptido de antígeno
de tumores) constituido por 8 a 11 aminoácidos, que se une a una
molécula de antígeno de leucocitos humanos (HLA) que es el antígeno
de complejo de histocompatibilidad principal que se va a mostrar
sobre la superficie de la célula tumoral. Los linfocitos T
citotóxicos reconocen un complejo constituido por HLA y el péptido
de antígeno de tumores, y un daño de la célula tumoral. En otras
palabras, los linfocitos T citotóxicos reconocen el péptido de
antígenos de tumores de una manera restringida de HLA.
HLA es un antígeno de membrana de la célula, y
se expresa sobre casi todas las células eucarióticas. HLA se
clasifica principalmente en el antígeno de clase I y antígeno de
clase II. El HLA reconocidos por los linfocitos T citotóxicos
conjuntamente con un péptido de antígeno pertenece a los antígenos
de clase I. Los antígenos de clase I de HLA se clasifican
adicionalmente en HLA-A, HLA-B,
HLA-C, y así sucesivamente. Se reseñó que HLA tiene
polimorfismo genético. El alelo HLA-A2, que es uno
de los polimorfismos de la sub-región
HLA-A, se encuentra en aproximadamente 23% de los
negros africanos, aproximadamente 53% de los chinos, aproximadamente
40% de los japoneses, aproximadamente 49% de los caucasianos del
norte, y aproximadamente 38% de los caucasianos del sur.
Como se usa en el presente documento, un
antígeno de tumores significa una proteína, un polipéptido, o un
péptido, que constituye parte de la célula tumoral y es capaz de
inducir linfocitos T citotóxicos específicos de tumores. Un péptido
de antígeno de tumores significa un péptido que se genera como
resultado de la degradación del antígeno de tumores en una célula
tumoral y puede inducir o activar linfocitos T citotóxicos
específicos de tumores tras expresarse sobre la superficie celular
mediante la unión de una molécula de HLA. Además el sitio de la
secuencia de aminoácidos que es capaz de inducir linfocitos T
citotóxicos específicos de tumores que está presente en un antígeno
de tumores se llama un epítope de antígeno de tumores (determinante
de antígeno de tumores).
En los años recientes, muchos genes que
codifican antígenos de tumores que se pueden reconocer por
linfocitos T citotóxicos se han identificado a partir de ADNc de
células tumorales humanas (Science 254: 1643 - 1647, 1991; J. Exp.
Med. 183: 1185 - 1192, 1996; J. Immunol. 163: 4994 - 5004, 1999).
Algunos de estos genes están implicados en la proliferación celular
y transformación maligna que incluye HER/neu (Proc. Natl Acad. Sci.
USA, 92: 432 - 436, 1995) cdk mutante (Science, 269: 1281 - 1284,
1995) CASP-8 mutante (J. Exp. Med., 186: 785 - 793,
1997) y así sucesivamente.
Por otra parte, una molécula tal como un gen de
antígeno de rechazo de tumores y un receptor de antígeno de células
T (TCR), que están implicados en la inmunidad específica, se han
identificado en melanoma, cáncer de esófago, y otros cánceres en
los 10 años pasados, y una inmunoterapia específica de cáncer
avanzado se ha estudiado usando el péptido.
Ahora, en Europa y en los Estados Unidos, se ha
desarrollado terapia de vacuna de cáncer en el que los linfocitos T
citotóxicos se activan mediante una administración de un antígeno de
tumores en un paciente de cáncer. Se han reseñado los resultados de
un ensayo clínico de un antígeno de tumores específico de melanoma.
Por ejemplo, la administración de un péptido gp-100
de antígeno de melanoma por vía subcutánea a pacientes de melanoma
junto con la administración de interleuquina-2
(IL-2) por vía intravenosa proporcionó una regresión
de tumores en el 42% de los pacientes (Nature Medicine, 4: 321,
1998). De esta forma, utilizando un antígeno de tumores como una
vacuna, se puede lograr un tratamiento eficaz contra cáncer.
Sin embargo, casi todos los antígenos de tumores
identificados se derivan de melanoma. Los antígenos de tumores
derivados de cánceres de epitelio y adenocarcinomas, tal como cáncer
de páncreas, que se produce a altas velocidades de incidencia, se
han reseñado para tal inmunoterapia específica solamente en unas
pocas publicaciones. El cáncer de páncreas es una de las causas
mayores de muerte por cáncer en el mundo y provoca aproximadamente
27.000 muertes al año en los Estados Unidos y aproximadamente 50.000
muertes en Europa. Los muchos factores que provocan estos grandes
números de muertes son la carencia de un procedimiento terapéutico
eficaz, y dificultar de diagnosis, y la actividad de este cáncer.
Solamente entre 1 y 4% de pacientes de cáncer de páncreas superan
la enfermedad, y la incidencia sustancialmente iguala la tasa de
muerte. Por lo tanto, es necesario un nuevo planteamiento de
terapia, por ejemplo, desarrollo de inmunoterapia específica.
Además, en vista de la diversidad de cáncer, un
antígeno de tumores idéntico no se debería expresar en el mismo
grado en todas las células cancerosas. Naturalmente, la terapia de
vacuna de cáncer mediante la activación de de los linfocitos T
citotóxicos que usan un tipo de antígeno de tumores tiene un efecto
terapéutico sobre el cáncer que tiene el antígeno de tumores. Sin
embargo, con el fin de inducir y activar los linfocitos T
citotóxicos específicos de antígeno tumoral y obtener un alto efecto
terapéutico que corresponde a la diversidad de cáncer, es
importante descubrir y usar muchos antígenos de tumores novedosos de
acuerdo con la diversidad de cáncer.
Una realización de la presente invención es un
péptido constituido por una secuencia de aminoácidos de acuerdo con
una cualquiera de las de SEQ ID Nº: 1 a SEQ ID Nº: 44 en el listado
de secuencias.
La presente invención describe un polipéptido
constituido por una secuencia de aminoácidos s de acuerdo con una
cualquiera de las de SEQ ID Nº: 45 a SEQ ID Nº: 53.
Una realización de la presente invención es un
medicamento que comprende uno o más de los péptidos seleccionados
entre los péptidos, que constan de la secuencia de aminoácidos de
acuerdo con una cualquiera de las de SEQ ID Nº:1 a SEQ ID Nº:44 en
el listado de secuencias.
Una realización de la presente invención es una
vacuna contra el cáncer que comprende uno o más de los péptidos
seleccionados entre los péptidos, que consta de la secuencia de
aminoácidos de acuerdo con una cualquiera de las de SEQ ID Nº:1 a
SEQ ID Nº: 44 en el listado de secuencias.
Una realización de la presente invención es una
vacuna contra el cáncer que comprende uno o más de los péptidos
seleccionados entre los péptidos, que constan de la secuencia de
aminoácidos de acuerdo con una cualquiera de las de SEQ ID Nº: 1 a
SEQ ID Nº: 4 4 en el listado de secuencias, centrada en el
tratamiento de cáncer de páncreas, cáncer de colon, o cáncer de
estómago.
Una realización de la presente invención es un
inductor de linfocitos T citotóxicos que comprende uno o más de los
péptidos seleccionados entre los péptidos, que consta de la
secuencia de aminoácidos de acuerdo con una cualquiera de las de
SEQ ID Nº:1 a SEQ ID Nº:44 en el listado de secuencias.
Una realización de la presente invención es un
procedimiento para inducir linfocitos T citotóxicos que usan uno o
más de los péptidos seleccionados entre los péptidos, que constan de
la secuencia de aminoácidos de acuerdo con una cualquiera de las de
SEQ ID Nº:1 a SEQ ID Nº:44 en el listado de secuencias.
Una realización de la presente invención es un
polipéptido que codifica un péptido que consta de la secuencia de
aminoácidos de acuerdo con una cualquiera de las de SEQ ID Nº:1 a
SEQ ID Nº:44 en el listado de secuencias, o su hebra
complementaria.
La presente invención describe un polinucleótido
de acuerdo con una cualquiera de las de SEQ ID Nº:54 a SEQ ID Nº:
62 en el listado de secuencias, o su hebra complementaria.
La presente invención describes un
polinucleótido de acuerdo con una cualquiera de las de SEQ ID Nº:54
a SEQ ID Nº:62 en el listado de secuencias, o su hebra
complementaria, en la que un polipéptido codificado por el
polinucleótido induce linfocitos T citotóxicos y/o se reconoce por
los linfocitos T citotóxicos.
Una realización de la presente invención es un
polinucleótido que se hibrida al polinucleótido o su hebra
complementaria en condiciones rigurosas. Una realización de la
presente invención es un vector recombinante que comprende el
polinucleótido o su hebra complementaria o el polinucleótido que se
hibrida al polinucleótido o su hebra complementaria en condiciones
rigurosas.
Una realización de la presente invención es un
vector de expresión recombinante que comprende el polinucleótido o
su hebra complementaria o el polinucleótido que se hibrida al
polinucleótido o su hebra complementaria en condiciones
rigurosas.
Una realización de la presente invención es un
transformante transformado con el vector recombinante o el vector
de expresión recombinante, que comprende el polinucleótido o su
hebra complementaria o el polinucleótido que se hibrida al
polinucleótido o su hebra complementaria en condiciones
rigurosas.
Una realización de la presente invención es un
procedimiento que produce el polipéptido, que comprende el cultivo
del transformante transformado con el vector de expresión
recombinante que comprende el polinucleótido o su hebra
complementaria o el polinucleótido que se hibrida al polinucleótido
o su hebra complementaria en condiciones rigurosas.
Una realización de la presente invención es un
anticuerpo que inmunológicamente reconoce el péptido.
Una realización de la presente invención es un
procedimiento para la selección de un compuesto que potencia al
menos el reconocimiento del péptido por linfocitos T citotóxicos
restringidos de HLA-A2, interactuando con el
péptido y/o HLA-A2 para potenciar, y/o el compuesto
que potencia la expresión del polinucleótido o su hebra
complementaria interactuando, con el mismo, en el que el
procedimiento usa al menos uno seleccionado entre un grupo
constituido por el péptido, el polinucleótido o su hebra
complementaria, el vector recombinante o el vector de expresión
recombinante, el transformante, y el anticuerpo.
Una realización de la presente invención es un
compuesto obtenido por el procedimiento para seleccionar un
compuesto que potencia al menos el reconocimiento del péptido por
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2,
interactuando con el péptido y/o HLA-A2 para
potenciar, y/o el compuesto que potencia la expresión del
polinucleótido o su hebra complementaria que interactúa con el
mismo, en la que el procedimiento usa al menos uno seleccionado
entre un grupo constituido por el péptido, el polinucleótido o su
hebra complementaria, el vector recombinante, el vector de
expresión recombinante, el transformante, y el anticuerpo.
Una realización de la presente invención es un
compuesto que potencia el reconocimiento de al menos uno de los
péptidos por los linfocitos T citotóxicos restringidos de
HLA-A, o el compuesto que potencia la expresión del
polinucleótido o su hebra complementaria mediante la interactuación
con el mismo.
Una realización de la presente invención es una
composición farmacéutica usada para tratamiento de cáncer, que
comprende al menos una seleccionada entre el grupo constituido por
el péptido, el polinucleótido o su hebra complementaria, el vector
recombinante o el vector de expresión recombinante, el
transformante, el anticuerpo, y el compuesto.
Una realización de la presente invención es el
uso de medicamento, la vacuna contra el cáncer, el inductor de los
linfocitos T citotóxicos, o la composición farmacéutica para la
enfermedad de cáncer.
Una realización de la presente invención es un
procedimiento para medir de manera cuantitativa o de manera
cualitativa el péptido, o el polinucleótido.
Una realización de la presente invención es un
kit de reactivos usado en el procedimiento para medir de manera
cuantitativa o de manera cualitativa el péptido, o el
polinucleótido, en el que el kit comprende al menos uno
seleccionado entre el grupo constituido por el péptido, el
polinucleótido o su hebra, y el anticuerpo.
Una realización de la presente invención es el
uso de un kit de reactivos para un ensayo de de la enfermedad de
cáncer, en el que el kit se usa para medir de manera cuantitativa o
de manera cualitativa el péptido, o el polinucleótido, comprende al
menos uno seleccionado entre un grupo constituido por el péptido, el
polinucleótido o su hebra complementaria, y el anticuerpo.
La Fig. 1 ilustra que OK-CTLp
(HLA-A0207/A3101) lisa las células tumorales de una
manera restringida de HLA-A2.
La Fig. 2 ilustra que el reconocimiento de la
línea celular de adenocarcinoma de páncreas Panc-1
por OK-CTLp y la producción de interferón como
resultado del mismo es un episodio restringido de
HLA-A2.
La Fig. 3 ilustra que OK-CTLp
reconoce las células COS7, en la que cada uno de los clones de ADNc
1 a 6 ((A) en la figura) y el clon 7 de ADNc 7 ((B) en la figura),
obtenida de la línea celular de adenocarcinoma de páncreas humano
Panc-1, se coexpresó con HLA-A2, de
una manera restringida de HLA-A2.
La Fig. 4 ilustra que los clones de ADNc 1 a 6,
obtenida de la línea celular de adenocarcinoma de páncreas humano
Panc-1, se reconocen por OK-CTLp de
una manera dependiente de la dosis. En la figura, (A), (B), (C),
(D), (E), y (F) cada una muestra que OK-CTLp
reconoce las células COS7, en la que cada uno de los clones de ADNc
1 a 6, que tiene una alta homología con UBE2V, HNRPL, WHSC2,
EIF4EBP1, ppMAPkkk, y 2-5 OAS3, respectivamente, se
coexpresó con HLA-A2, de una manera restringida de
HLAA2. El símbolo -\blacksquare- muestra la cantidad de
interferón \gamma producida por OK-CTLp, cuando
el gen HLAA0207 se coexpresa con cada uno de los antígenos de
tumores en las células diana, -\lozenge- muestra la cantidad de
interferón \gamma producida por OK-CTLp, cuando el
gen HLA-A2402 se coexpresa con cada uno de los
genes de antígenos de tumores en las células diana
La Fig. 5 ilustra que el clon
OK-CTLp u OK-CTL reconoce cinco
péptidos derivados de un producto génico del gen 1 de antígenos de
tumores que se obtiene a partir de la línea celular
Panc-1 de adenocarcinoma de páncreas humano, que
tiene alta homología con UBE2V.
La Fig. 6 ilustra que el clon
OK-CTLp o OK-CTL reconoce cuatro
péptidos derivados de un producto génico del gen 2 de antígeno de
tumores que se obtiene a partir de la línea celular
Panc-1 de adenocarcinoma de páncreas humano, que
tiene alta homología con HNRPL.
La Fig. 7 ilustra que el clon
OK-CTLp o OK-CTL reconoce cuatro
péptidos derivados de un producto génico del gen 3 de antígeno de
tumores que se obtiene a partir de la línea celular
Panc-1 de adenocarcinoma de páncreas humano, que
tiene alta homología con WHSC2.
La Fig. 8 ilustra que el clon
OK-CTLp o OK-CTL reconoce dos
péptidos derivados de un producto génico del gen 4 de antígeno de
tumores que se obtiene a partir de la línea celular
Panc-1 de adenocarcinoma de páncreas humano, que
tiene alta homología con EIF4EBP1.
La Fig. 9 ilustra que OK-CTLp o
OK-CTL reconoce tres péptidos derivados de un
producto génico del gen 5 de antígeno de tumores que se obtiene a
partir de la línea celular Panc-1 de adenocarcinoma
de páncreas humano, que tiene alta homología con ppMAPkkk.
La Fig. 10 ilustra que el clon
OK-CTLp o OK-CTL reconoce un péptido
derivado de un producto génico del gen 3 de antígeno de tumores que
se obtiene a partir de la línea celular Panc-1 de
adenocarcinoma de páncreas humano, que tiene alta homología con
2-5 OAS3.
La Fig. 11 ilustra péptidos representativos que
muestran que los péptidos del antígeno de tumores péptidos, que se
derivan de productos génicos del antígeno de tumores obtenidos a
partir de la línea celular Panc-1 de adenocarcinoma
de páncreas humano, se reconocen por el clon OK-CTL
de una manera dependiente de la dosis. Cada uno de (A), (B), (C),
(D), (E), y (F) en esta figura muestra que OKCTLp reconoce los
péptidos que se derivan de productos génicos de los genes de
antígeno de tumores 1 a 6, que tiene alta homología con UBE2V,
HNRPL, WHSC2, EIF4EBP1, ppMAPkkk, y 2-5 OAS3,
respectivamente.
La Fig. 12 ilustra que los tres péptidos
derivados de un producto génico del gen 1 de antígeno de tumores
que tiene alta homología con UBE2V puede inducir CTL que muestran
citotoxicidad contra la célula tumoral HLA-A2+ de
células de mononucleares de sangre periférica de un paciente de
cáncer. El símbolo -\blacksquare- muestra línea celular
Panc-1
de adenocarcinoma de páncreas humano (HLAA0201/1101), -\blacklozenge- muestra la línea celular de adenocarcinoma de colon humano SW620 (HLA-A0201/2402), -\medcirc- muestra la línea celular adenocarcinoma de pulmón RERF-LC-MS de HLAA2 (HLA-A1101/1101), -\Delta- muestra una célula B autóloga transformada de EBV (HLA-A0207/3101), -\square- y muestra un blasto PHA de célula T autóloga (HLA-A0207/3101). Estos símbolos también se usan de la misma manera en las Figs. 13 a 17 descritas a continuación.
de adenocarcinoma de páncreas humano (HLAA0201/1101), -\blacklozenge- muestra la línea celular de adenocarcinoma de colon humano SW620 (HLA-A0201/2402), -\medcirc- muestra la línea celular adenocarcinoma de pulmón RERF-LC-MS de HLAA2 (HLA-A1101/1101), -\Delta- muestra una célula B autóloga transformada de EBV (HLA-A0207/3101), -\square- y muestra un blasto PHA de célula T autóloga (HLA-A0207/3101). Estos símbolos también se usan de la misma manera en las Figs. 13 a 17 descritas a continuación.
La Fig. 13 ilustra que dos péptidos derivados de
un producto génico del gen 2 del antígeno de tumores que tienen
alta homología con HNRPL pueden inducir CTL que muestran
citotoxicidad contra la célula tumoral de HLA-A2+,
a partir de células mononucleares de sangre periférica de un
paciente de cáncer.
La Fig. 14 ilustra que dos péptidos derivados de
un producto génico del gen 3 de antígeno de tumores que tiene alta
homología con WHSC2 puede inducir CTL que muestran citotoxicidad
contra célula tumoral de HLA-A2+, a partir de
células mononucleares de sangre periférica de un paciente de
cáncer.
La Fig. 15 ilustra que dos péptidos derivados de
un producto génico del gen 4 de antígeno de tumores que tiene alta
homología con EIF4EBP1 puede inducir CTL que muestran citotoxicidad
contra célula tumoral e HLA-A2+, a partir de
células mononucleares de sangre periférica de un paciente de
cáncer.
La Fig. 16 ilustra que un péptido derivado de un
producto génico del gen 5 del antígeno de tumores que tiene alta
homología con ppMAPkkk puede inducir CTL que muestran citotoxicidad
contra célula tumoral de HLA-A2+, a partir de
células mononucleares de sangre periférica de un paciente de
cáncer.
La Fig. 17 ilustra un péptido derivado de un
producto génico del gen 6 de antígeno de tumores que tiene alta
homología con 2-5 OAS3 puede inducir CTL que
muestran citotoxicidad contra célula tumoral de
HLA-A2+, a partir de células mononucleares de
sangre periférica de un paciente de cáncer.
La Fig. 18 ilustra que los péptidos de antígeno
de tumores pueden inducir CTL, que muestra actividad citotóxica de
una manera restringida de HLA-A2 y de una manera
dependiente de la dosis, a partir de células mononucleares de
sangre periférica de un paciente de cáncer. (A), (B), (C), (D), y
(E) en esta figura cada una muestra que los péptidos derivados de
los productos génicos de los genes 1 a 5 de antígeno de tumores, que
tienen alta homología con UBE2V, HNRPL, WHSC2, EIF4EBP1, y
ppMAPkkk, respectivamente, induce CTL que reconocen el péptido de
una manera restringida de HLA-A2, a partir de
células mononucleares de sangre periférica de un paciente de
cáncer. El símbolo -\blacksquare- muestra células T2 en la que el
péptido de antígeno de tumores se realiza para expresar y
-\lozenge- muestra células T de blastos de PHA.
La Fig. 19 ilustra que los productos génicos de
de los genes del antígeno de tumores
KM-PA-2 ((A) en la figura) y
KM-PA-4 ((B) en la figura), que se
obtuvieron a partir de la línea celular CFPAC-1 de
adenocarcinoma de páncreas humano, se reconocen por
OK-CTLp de una manera restringida de
HLA-A2.
La Fig. 20 muestra que los péptidos derivados de
los genes del antígeno de tumores
KM-PA-2 y
KM-PA-4, respectivamente, que se
obtuvieron a partir de la línea celular humano
CFPAC-1 de adenocarcinoma de páncreas (A y B en la
figura, respectivamente), puede inducir CTL a partir de células
mononucleares de sangre periférica (PBMC) de un paciente de cáncer,
que muestra citotoxicidad contra las células T2 que se han pulsado
con el péptido que corresponde al péptido usado para estimular las
PBMC (lado izquierdo de las figuras de A y B en la figura), y una
Panc-1 de la célula tumoral HLA-A2+
(lado derecho de A y B en la figura).
La Fig. 21 muestra que CTL, que se indujo a
partir de células mononucleares de sangre periférica de un paciente
de cáncer por el péptido derivado del gen
KM-PA-2 del antígeno de tumores
obtenido a partir de la línea celular
CFPAC-1
de adenocarcinoma de páncreas humano, lisa las células tumorales de una manera restringida de HLA-A2.
de adenocarcinoma de páncreas humano, lisa las células tumorales de una manera restringida de HLA-A2.
Con el fin de identificar un gen de antígeno de
rechazo de tumores y un antígeno de tumores codificado por el gen,
que se puede usar para para< la inmunoterapia específica de un
cáncer de páncreas, se han establecido linfocitos T citotóxicos
específicos de tumores restringidos de HLA-A2 en la
presente invención qu7e se activan mediante reconocimiento de
HLA-A2 y un péptido de antígeno de tumores (de aquí
en adelante, esta célula se puede llamar OK-CTLp)
de un paciente de cáncer de colon, y genes que codifican antígenos
de tumores, que se pueden reconocer por estos linfocitos T
citotóxicos específicos de tumores (CTL), se han
aislado/identificado a partir de una genoteca de ADNc de la célula
Panc-1 que como la línea celular de adenocarcinoma
de páncreas humano que usa el procedimiento de clonación de la
expresión de los genes. En la presente invención, también se han
identificado los genes, que se pueden reconocer por CTL de la misma
forma que se ha descrito anteriormente, de los genes identificados
como los que codifican el antígeno de tumores mediante el
procedimiento SEREX (análisis sexológico de genotecas de expresión
de ADNc) (Proc. Natl Acad. Sci. USA, 92: 11910 - 11813, 1995).
Además, basándose en el antígeno de tumores codificado por el gen
obtenido, se ha encontrado un péptido que tiene el epítope de
antígeno de tumores en la presente invención.
Como se usa en el presente documento, a
polipéptido significa un péptido de cadena larga de péptidos
arbitrarios que comprende dos o más aminoácidos unidos entre sí por
un enlace peptídico o por un enlace peptídico modificado. Por
ejemplo, se incluye una proteína en la definición de polipéptido en
el presente documento. Además, un péptido de cadena corta a veces
llamado un oligopéptido o un oligómero se llama simplemente un
péptido en el presente documento.
"Reconocer" en el presente documento
significa que un sujeto distingue un objeto de otros y lo reconoce,
por ejemplo, se une al objeto conocido Particularmente, en la
presente invención, CTL que reconocen las células tumoraleso los
péptidos de antígeno de tumores significa que CTL se une mediante un
receptor de células T a los péptidos de antígeno de tumores que se
presentan por HLA.
"Activar" en el presente documento
significa que potencia o lo hace que funcione además una cosa o un
estado, que tiene una actividad o una acción. Particularmente, en
la presente invención, la activación de CTL significa que CTL
reconocen un antígeno que se está presentando por HLA para producir
IFN-\gamma o CTL muestran citotoxicidad contra
las células diana reconocidas por CTL.
"Inducir" en el presente documento
significa que genera una actividad o una acción de de una cosa o un
estado que están en una fase que solamente tiene la actividad o
acción. Particularmente, en la presente invención, la inducción de
CTL específicos de antígeno significa que hace CTL, que
específicamente reconoce un cierto antígeno diferencia y/o
prolifera in vitro o in vivo. Además, el inductor de
linfocitos T citotóxicos en la presente invención significa un
medicamento que cambia el estado, donde los linfocitos T positivos
de CD8 -que específicamente reconocen un cierto antígeno está
ausente o presente en un grado muy bajo, al estado, donde los
linfocitos T citotóxicos que reconocen el antígeno está presente en
un grado alto.
En la presente invención,
OK-CTLp que era el linfocito T citotóxico
restringido de HLA-A2 -descrito anteriormente se
usó como una célula efectora y antígenos de tumores capaces de
activar esta célula se aislaron e identificaron mediante el uso del
procedimiento de clonación de expresión de genes. En otras palabras,
el ADNc de la línea celular Panc-1 de
adenocarcinoma de páncreas humano y ADNc de
HLA-A0207 se cotransfectaron en células
COS-7, y entre las células en las que los genes
transfectados se expresaron, las células que potencian la producción
de IFN-\gamma a partir de OK-CTLp
se seleccionaron, y por lo tanto, se identificó el gen que codifica
el antígeno de tumores capaz de activación de CTL. El procedimiento
se presentará en más detalle en los ejemplos descritos en el
presente documento. Como resultado, se obtuvieron siete clones de
ADNc que se reconocieron por OK-CTLp de una manera
restringida de HLA-A2.
Además, dos genes,
KM-PA-2 y
KM-PA-4, que codifican los antígenos
de tumores capaces de activar CTL de una manera restringida de
HLAA2 se encontraron de la misma manera que se ha descrito
anteriormente a partir de los genes que codifican el antígenos de
tumores, se detectaron a partir de una genoteca de ADNc de la línea
celular de adenocarcinoma de páncreas humano CFPAC-1
que usa el procedimiento SEREX y ya se reseñaron (Biochim. Biophys.
Res. Commun., 281: 936 - 944, 2001). El procedimiento SEREX es un
procedimiento que se puede aplicar a la detección de de un antígeno
de tumores. Sin embargo, entre 1500 o más tipos de antígenos de
tumores detectados mediante este procedimiento, los que se
identifican como antígenos de tumores capaces de inducir tanto
inmunidad mediada por células como inmunidad humoral son solamente
MAGE-1, tirosinasa, y
NY-ESO-1. De este modo, el antígeno
de tumores identificado por el procedimiento SEREX no puede siempre
activar CTL. La presente invención reveló primero que los genes de
antígeno de tumores descritos anteriormente,
KM-PA-2 y
KM-PA-4, puede activar CTL de una
manera restringida de HLA-A2.
Los siete clones de ADNc descritos
anteriormente, que se obtuvieron a partir de la célula
Panc-1, contenía un marco abierto de lectura
completo (ORF). La secuencia de bases de nucleótidos de estos genes
se determinó mediante el procedimiento de Sanger (procedimiento de
terminador de cadena) para estimar la secuencia de aminoácidos en
base a la secuencia de bases de nucleótidos. Cuando se lleva a cabo
una investigación de homología para estas secuencias de bases de
nucleótidos y se dedujeron las secuencias de aminoácidos en una base
de datos existente tal como GenBank, se encontró que estos genes
eran los ADNc cuyas secuencias de bases de nucleótidos son
novedosas, que funcionan como un antígeno de tumores. Con relación
al clon 3 entre los 7 clones entre los clones de ADNc (clones 1 a
7) obtenidos, la secuencia de un clon inicial, que se obtuvo
mediante el procedimiento de clonación de la expresión del gen
descrito anteriormente, y tiene alta homología con la de un gen de
la proteína del candidato 2 del síndrome de Wolf - Hirschhorn
(WHSC2), era de 25 pares de bases más corto en la región 5'-
terminal que la de WHSC2, de manera que se obtuvo ADNc de longitud
completa a partir de la genoteca de ADNc de la célula de
Panc-1 mediante un procedimiento de hibridación de
una colonia estándar usando el clon marcado con ^{32}P como una
sonda. En el presente documento de aquí en adelante, los genes de la
célula de Panc-1, a partir de la cual se derivaron
los clones descritos anteriormente 1 a 7, se llamarán gen 1 a 7,
respectivamente. También, los polipéptidos que constan de una
secuencia de aminoácidos codificada por cada gen se llaman
ocasionalmente en el presente documento producto génico 1 a 7. La
secuencia de aminoácidos deducida codificada por cada uno de estos
genes se muestran como la SEQ ID Nº: 45 a SEQ ID Nº: 51 en el
listado de secuencias, respectivamente, y las secuencias de bases
de nucleótidos de los mismos se muestran como las SEQ ID Nº:54 a
SEQ ID Nº:60 en el listado de secuencias, respectivamente. Los genes
1 a 6 descritos anteriormente y el gen 7 se registraron en el Banco
de Datos de ADN de Japón (DDBJ) del Instituto de Investigación
Nacional de Genética el 12 de junio de 2000 y 2 de agosto de
2000, respectivamente
(Tabla 1).
(Tabla 1).
Para KM-PA-2 y
KM- PA-4, los genes homólogos se han reseñado como
se muestra en la Tabla 1 (Biochem. Biophys. Res. Commun., 281: 936
- 944, 2001). Las secuencias de bases de nucleótidos de
KM-PA-2 y
KM-PA-4 se muestran como las SEQ ID
Nº: 52 y SEQ ID Nº: 53 en el listado de secuencias, respectivamente,
y la secuencia deducida de aminoácidos se muestran como las SEQ ID
Nº:61 y SEQ ID Nº:62 en el listado de secuencias,
respectivamente.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 1
tiene una alta homología con la de la variante con el gen Kua de la
enzima conjugada a ubiquitina (UBE 2V) registrada en el GenBank (nº
de acceso AF155120). La longitud del aminoácido (aa) codificado
por el gen 1 era ligeramente más larga que la codificada por el gen
UBE2V (3 aa en las posiciones 109 a 111). La función de UBE2V no se
ha reseñado hasta ahora.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 2
tiene una alta homología con la del gen de la ribonucleoproteína
nuclear heterogénea L (HNRPL) (nº de acceso NM_001533). Sin embargo,
la longitud de los aminoácidos deducida era< ligeramente más
larga que la del gen de HNRPL en las posiciones N- terminal 1 a 31.
El producto génico de HNRPL es un complejo de ribonucleoproteína
nuclear heterogéneo y proporciona un sustrato para los episodios de
procesamiento que el ARNm experimenta en el citoplasma.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 3
tiene alta homología con la del gen de las proteínas del candidato
2 del síndrome de Wolf- Hirschhorn (WHSC2) registrada en GenBank (nº
de acceso AK001304). El gen WHSC2 parece que tiene algunas
funciones en el fenotipo de WHS, un síndrome de malformación
múltiple caracterizado por defectos mentales y de desarrollo que se
producen por una supresión parcial del brazo corto del cromosoma
4.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 4
tiene una alta homología con la del gen de la proteína 1 de unión a
eIF-4E (EIF4EBP1, nº de acceso NM_004095). El
producto del gen EIF4EBP1 se conoce como un factor de inicio de la
traducción que inicia la fosforilación dependiente de insulina de
4E-BP1, haciéndolo disponible para formar un
complejo de unión a cap activo.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 5
tiene homología con la del gen gen de la proteína quinasa quinasa
quinasa (ppMAPkkk, nº de acceso .AJ242724) registrado en el GenBank.
La secuencia de aminoácidos deducida codificada por el gen 5 es 230
aa más larga el N-terminal y 258 aa más en el
C-terminal cuando se compara la del gen ppMAPkkk
registrado (su función no se ha reseñado todavía).
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 6
consta de 6707 pares de bases y tiene homología con la del gen de
la 3 de 2', 5'-oligoadenilato sintasa (gen
2-5 OAS3, nº de acceso NM_006187) con un total de
diferencias de 13-aa en las posiciones 18, 159,
249, 287, 288, 316, 393 a 398, y 984. 2-5 OAS3 se
conoce como la proteína inducida de IFN que juega un papel
importante en la protección inmune contra la infección por
microorganismos.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen 7
tiene homología con las posiciones 3701 a 4463 del gen del factor
de especificidad escisión humano y poli Adenilation (CPSF, nº de
acceso U37012) y la secuencia de aminoácidos es aproximadamente 1226
aa más corta.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen
KM-PA-2 tiene una alta homología con
la de KIAA0124 y los homólogos humanos de bloque de ratón de la
proliferación 1 (Bop1). La base de nucleótidos en la posición 1466
del gen KIAA0124 es guanina (G) y de este modo, el resto de
aminoácidos de la posición 465 es histidina (H). Por el contrario,
en el gen KM-PA-2, son adenina (A) y
arginina (R), respectivamente.
La secuencia de bases de nucleótidos del gen
KM-PA-4 y la secuencia de
aminoácidos codificada por el gen son idénticas a las de la
proteína de tipo coactosina (CLP).
Con el fin de obtener péptidos de antígeno de
tumores a partir de los 9 genes descritos anteriormente que
codifican un antígeno de tumores, se diseñaron y se sintetizaron los
péptidos basándose en la secuencia de aminoácidos codificada por
los genes descritos anteriormente. Para el gen 7, el gen se
consideró como parte de de un gen que consistía de una secuencia de
bases más larga, de manera que los péptidos, que se derivaron de la
secuencia de aminoácidos codificada por el gen (CPSF) homólogo al
gen 7, donde también se diseñaron y se sintetizaron. Se ha
conocido que un péptido de antígeno de tumores capaz de unirse a
HLA-A2 tiene un motivo (una secuencia específica)
en su secuencia. Después, al principio, el péptido que tiene un
motivo de unión a HLA-A2 (una secuencia específica)
se investigó en la bibliografía (J. Immunol., 152:163, 1994;
Immunogenetics, 41: 178, 1994), y el péptidos de
9-meros a 11-meros, que eran
diferentes entre sí y adecuado al motivo obtenido, se diseñaron y
se sintetizaron basándose en la secuencia de aminoácidos codificada
por los genes descritos anteriormente. El reconocimiento de cada
péptido por CTL, se midió usando OK-CTLp o varios
tipos de clones de OK- CTL obtenidos mediante la clonación de
OK-CTLp mediante el procedimiento de dilución
limitante usando la producción de IFN-\gamma a
partir de estos CTL como un indicador. Los clones de
OK-CTL son las células que reconocen uno cualquiera
de los genes 1 a 7 descritos anteriormente. Por otra parte, OK- CTLp
reconoce cualquiera de los genes 1 a 7. Los resultados revelan que
OK- CTLp es una población de células que reconoce diversos tipos de
antígenos de tumores. Por lo tanto, cuando los clones de
OK-CTL se usaron para ensayar el péptido por su
capacidad de activar CTL, se usó un clon que reconoce el producto
del gen que codifica el mismo péptido como el que se va a ensayar.
Cuarenta y cuatro péptidos (SEQ ID Nº:1 a SEQ ID Nº:44 en el
listado de secuencias; Tabla 2 y Tabla 3) entre los sintetizados se
reconocieron por los clones OK-CTLp o
OK-CTL y potenciaron la producción de
IFN-\gamma a partir de CTL. Entre estos péptidos,
P1 a P5, P6 a P9, P10 a P13, P14 y P15, P16 a P18, y P19 son los
péptidos constituidos por una secuencia parcial de la secuencia de
aminoácidos codificada por el gen 1, gen 2, gen 3, gen 4, gen 5, y
el gen 6, respectivamente, y codificada también por los genes
UBE2V, HNRPL, WHSC2, EIF4-EBP1, ppMAPkkk, y
2-5 OAS3 que tienen alta homología con cada uno de
los genes. Por otra parte, P25, P26, P27, P28, P30, y P31 son los
péptidos constituidos por una secuencia parcial de las secuencias
de aminoácidos codificada por el gen 7 y el gen CPSF que tiene alta
homología con el gen 7. P20, P21, P22, P23, P24, P29, y P32 consta
de una secuencia parcial de de la secuencia de aminoácidos
específica para CPSF.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
Estos péptidos de antígeno de tumores péptidos
se presentan sobre una superficie celular por HLA-A2
y se reconocen por el receptor de las células T (TCR) expresado
sobre el clon OK-CTL específico de péptido. Los
péptidos derivados del gen 1 y UBE2V, gen 2 y HNRPL, o gen 6 y
2-5 OAS3 se reconocen por el clon
OK-CTL que expresa TCR-V\beta
8.1, TCR-V\beta 3.2, o
TCR-V\beta14. Además, los Péptidos derivados del
gen 3 y WHSC2, gen 4 y EIF4EBP1, o gen 5 y ppMAPkkk se reconocen
por el clon OK-CTL que expresa
TCR-V\beta13, TCR-V\beta8.1, o
TCR-V\beta18, respectivamente.
Dos de cada uno de los clones de
OK-CTL que reconocen los péptidos derivados del gen1
y UBE2V, gene2 y HNRPL, y gen 6 y 2-5 OAS3 eran TCR
expresadas que poseen diferentes regiones 3 determinantes de
complementariedad regiones (CDR 3; un elemento responsable de la
unión a epítopes antigénicos sobre un encaje de las moléculas de
clase I HLA), respectivamente. El clon OK-CTL que
reconoce los péptidos derivados del gen 3 y WHSC2, gen 4 y
EIF4EBP1, y gen 5 y ppMAPkkk también expresaban TCR que posee los
las diferentes CDR3, respectivamente.
Además, los 44 péptidos descritos anteriormente
reconocidos por OK-CTLp cada uno inducían CTL
específicos de tumor restringido de HLA-A2 in
vitro a partir de células mononucleares de sangre periférica
(que, en el presente documento a continuación, se puede abreviar a
PBMC) con las células autólogas derivadas de un paciente de cáncer
de colon a partir del que se obtuvo OK-CTLp, y/o a
partir de pacientes de cáncer PBMC de HLA- A0201+ (cáncer de
páncreas, cáncer de colon, y cáncer de estómago). Los CTL descritos
anteriormente inducidos a partir de las células mononucleares de
sangre periférica de los pacientes de cáncer de células tumorales
HLA-A2+ lisadas de una manera dependiente de la
dosis. Sin embargo, no se observó ninguna lisis en la célula
tumoral RERF-LC-MS de
HLA-A2-, y células EBV-B antólogas
de HLA-A+ células T de HLA-A+
estimuladas por PHA, ambas de las cuales se derivan de las células
normales. Además, los CTL descritos anteriormente mostraron
citotoxicidad de una manera dependiente de la dosis contra las
células T2 que se pulsaron con el mismo péptido como el que se usa
para estimulación.
En base al examen descrito anteriormente, se
obtuvieron 44 péptidos de antígeno de tumor capaces de de activación
de OK-CTLp Posteriormente, se encontró que estos
péptidos podrían inducir CTLs específica de tumor restringida de
HLA-A2 de PBMC derivadas de pacientes de cáncer de
páncreas, cáncer de colon, y/o cáncer de estómago. Además, se
reveló que tanto la línea celular Panc-1 de
adenocarcinoma de páncreas y la línea celular SW620 de
adenocarcinoma de colon se reconocieron por CTLp y por CTLs
inducidas a partir de PBMC mediante el péptido descrito
anteriormente. Este resultado sugiere que el cáncer de páncreas y
cáncer de colon tienen un epítope de antígeno de tumores
reconocidos por CTLs.
Un polipéptido descrito en la presente invención
es un polipéptido que consta de la secuencia de aminoácidos cada
una de las cuales está codificada por los genes 1 a 7 descritos
anteriormente anteriores obtenidos a partir de la línea celular
Panc-1 de adenocarcinoma de páncreas o gen
KM-PA-2 o
KM-PA-4 obtenido a partir de la
línea celular CFPAC-1 de adenocarcinoma de páncreas,
y preferiblemente, a polipéptido que consta de la secuencia de
aminoácidos descrita en cualquiera de de las de las SEQ ID Nº:45 a
SEQ ID Nº:53 en el listado de secuencias. Estos polipéptidos se
pueden usar para inducir y/o activar CTL como un antígeno de tumor.
Además estos polipéptidos se pueden usar como un material para
especificar un epítope de antígeno de tumores para obtener un
péptido de antígeno de tumores.
Un péptido de acuerdo con la presente invención
se puede obtener mediante el diseño de péptidos, por ejemplo, que
son adecuados para el motivo restringido de HLA-A2,
basándose en la secuencia de aminoácidos del polipéptido descrito
anteriormente, para seleccionar los reconocidos por CTL, por
ejemplo, que activan y/o inducen CTL, a partir de los péptidos
diseñados. Un péptido de acuerdo con la presente invención puede ser
el péptido que tiene una propiedad de un epítope de antígeno de
tumores presentado en la superficie de la célula que presenta
antígeno que se une a HLA-A2 y reconocido por CTL.
El péptido consta de restos de aminoácidos de al menos
aproximadamente 5 o más, preferiblemente aproximadamente 7 o más, y
más preferiblemente 9 a 10. Particularmente preferiblemente, el
péptido es uno que consta de una secuencia de aminoácidos descrita
por una cualquiera de de las de SEQ ID Nº:1 a SEQ ID Nº:44 en el
listado de secuencias. Estos péptidos se pueden usar como un
péptido de antígeno de tumores para activar y/o inducir los
linfocitos T citotóxicos específicos de tumores restringidos de
HLA-A2.
Para activar y/o inducir CTL, uno de los
polipéptido o péptido descrito anteriormente se puede usar o se
pueden usar en combinación de dos o más. Como se ha descrito
anteriormente, CTL es una población que consta de células plurales
que reconocen diversos antígenos, de manera que se recomiende usar
estos péptidos preferiblemente en combinación con dos o más.
Un péptido, que tiene uno o varios aminoácido
(s) con una mutación tal como supresión, sustitución, adición, o
inserción introducido (s) en un péptido especificado como antes y se
reconoce por al menos los CTL restringidos de
HLA-A2, también se incluye dentro del alcance de la
presente invención. Un medio para introducir mutaciones tales como
una supresión, sustitución, adición, o inserción se conoce bien y,
por ejemplo, la técnica de Ulmer (Science, 219: 666, 1983) se puede
introducir. Cuando se introduce tal mutación, en vista o prevención
de un cambio de las propiedades fundamentales (tales como las
propiedades físicas, actividad, o actividad inmunológica) del
péptido, se puede llevar cabo la substitución mutua entre, por
ejemplo, aminoácidos que tienen propiedades similares (aminoácidos
polares, aminoácidos no polares, aminoácidos hidrófobos, aminoácidos
hidrófilos, aminoácidos cargados positivamente, aminoácidos
aromáticos, y así sucesivamente). Además, se puede realizar alguna
modificación sobre estos péptidos hasta tal grado que no exista
ningún cambio notable en su función, tal como la modificación del
grupo amino o grupo carboxilo constitutivo.
Un polinucleótido descrito en la presente
invención es un polinucleótido constituido por la secuencia de base
de nucleótidos en cualquiera de las de SEQ ID Nº: 54 a SEQ ID Nº: 62
en el listado de secuencias, que son las secuencias de base de
nucleótidos de los genes 1 a 7 o gen
KM-PA-2 o
KM-PA-4 obtenido a partir de línea
celular Panc-1 de adenocarcinoma de páncreas humano
o línea celular CFPAC-1 de adenocarcinoma de
páncreas humano como se ha descrito anteriormente, o su hebra
complementaria. El polinucleótido también puede ser un
polinucleótido que codifica cada uno de los péptidos constituidos
por la secuencia de aminoácidos descrita en cualquiera de las de la
SEQ ID Nº: 1 a SEQ ID Nº: 44 En el listado de secuencias, o su hebra
complementaria. Un polinucleótido descrito en la presente invención
es además un polinucleótido que codifica un polipéptido constituido
por la secuencia de aminoácidos descrita en cualquiera de las de SEQ
ID Nº: 45 a SEQ ID Nº: 53 en el listado de secuencias, o su hebra
complementaria. Además, el polinucleótido descrito anteriormente
puede constar de una secuencia de bases de nucleótidos de al menos
15 o más, preferiblemente 21 a 30 o más nucleótidos, en la que la
secuencia de bases de nucleótidos corresponde a una región que
codifica un epítope de antígeno de tumores en la secuencia de
aminoácidos de los polipéptidos descritos en la presente invención,
o su hebra complementaria. La selección de un polinucleótido útil y
determinación de su secuencia de bases de nucleótidos son posibles,
por ejemplo, empleando los sistemas de expresión de proteínas bien
conocidos para confirmar la capacidad de la proteína expresada para
inducir y/o activar CTL.
Además, un polinucleótido que se hibrida al
polinucleótido descrito anteriormente en condiciones rigurosas se
incluye en el alcance de la presente invención. En el caso donde la
molécula de polinucleótidos es una molécula de ADN, "una molécula
de ADN que se hibrida a una molécula de ADN en condiciones
rigurosas" se puede obtener, por ejemplo, mediante el
procedimiento descrito en "Molecular Cloning: A Laboratory Manual
(Cold Spring Harbor Laboratory, 1989)". "Hibridar en
condiciones rigurosas" en el presente documento significa que
una señal de de hibridación positiva se observa todavía incluso en
la condición en la que, por ejemplo, la incubación se lleva a cabo
en usa solución que contiene 6 X SSC, 0,5% de SDS, y 50% de
formamida a 42ºC y después, se lleva a cabo el lavado en una
solución que contiene 0,1 X SSC y 0,5% de SDS a 68ºC.
El polinucleótido descrito anteriormente puede
inducir y/o activar los CTL restringidos de HLA-A2,
cuando se expresa en las células que tienen HLA- A2. En este caso,
el polinucleótido descrito anteriormente tiene una estructura poli
(A) en su terminal 3'. El número de poli (A) no tienen una
influencia en el sitio que codifica el aminoácido que actúa como un
antígeno de tumores, de manera que el número de poli (A), del
polinucleótido no esté limitado.
Todos los polinucleótidos descritos
anteriormente proporcionan información genética útil para producir
un péptido de acuerdo con la presente invención o también se puede
utilizar como un reactivo y un patrón de ácido nucleico.
Un vector recombinante se puede obtener mediante
la inserción del polinucleótido descrito anteriormente en un
vector de ADN adecuado. El vector de ADN usado se selecciona
apropiadamente de acuerdo con el tipo de huésped y el propósito de
uso. El vector de ADN puede ser uno de origen natural que existe y
también puede ser uno que carece una parte de una parte de su ADN
diferente del necesario para replicación. Por ejemplo, los vectores
se pueden ejemplificar como los derivados de un cromosoma, un
episoma, y un virus, por ejemplo, los vectores derivados de un
plásmido bacteriano, derivados de un bacteriófago, derivado de un
transposón, derivado de un epitoma enzimático, derivado de un
elemento de inserción, y derivado de un elemento cromosómico de
enzima, por ejemplo, los vectores derivados de un virus tal como
baculovirus, papovavirus, SV40, virus vaccinia, adenovirus, virus
de la sífilis de aves, virus de la pseudorrabia, y retrovirus, y los
vectores preparados mediante combinación de ellos, por ejemplo, los
vectores derivados del elemento genético del plásmido y el
bacteriófago, por ejemplo, un cósmido y un fagémido. Además, un
vector de expresión y un vector de clonación etc., se puede usar de
acuerdo con el propósito deseado.
El vector recombinante, que comprende los
elementos constitucionales de la secuencia de ADN deseada y una
secuencia de ADN que posee información relativa a la replicación y
regulación, tal como un promotor, un sitio de unión a ribosoma, un
terminador, una secuencia de señal, un potenciador, y así
sucesivamente, se pueden preparar mediante su combinación usando
procedimientos bien conocidos. Como un procedimiento para la
inserción del polinucleótido de acuerdo con la presente invención
en el vector de ADN descrito anteriormente, se pueden emplear
procedimientos bien conocidos. Por ejemplo, se puede usar un
procedimiento, en el que se elige una enzima de restricción
apropiada para tratar un ADN que los escinda a un sitio especifico,
y después, el ADN se mezcla con el ADN usado como un vector tratado
de la misma manera, seguido de la ligación con una ligasa. Un
vector recombinante deseado también se puede obtener mediante
ligación de un engarce adecuado al polinucleótido deseado seguido
de la inserción de la molécula resultante en un sitio de
multiclonación de un vector adecuado para un propósito.
El vector de ADN en el que el polinucleótido
descrito anteriormente también se insertado se puede usar para
obtener un transformante mediante la transformación de un huésped
bien conocido tal como Escherichia coli, levadura,
Bacillus subtillis, una célula de insecto, o una célula de
mamífero inmediatamente mediante procedimientos bien conocidos. En
el caso de llevar a cabo la transformación, un sistema más
preferible se ejemplifica mediante el procedimiento para integrar
el gen en un cromosoma, en vista de lograr la estabilidad del gen.
Sin embargo, un sistema de replicación autónoma que usa un plásmido
se puede usar de manera conveniente. La introducción del vector de
ADN en la célula huésped se puede llevar a cabo mediante
procedimientos convencionales tales como los descritos en
"Molecular Cloning: A Laboratory Manual" (ed. by Sambrook et
al., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring
Harbor,NewYork, 1989). Concretamente se puede usar transfección con
fosfato de calcio, transfección mediada por
DEAE-dextrano, microinyección, transfección mediada
por lípido catiónico, electroporación, transducción, carga por
legrado, introducción balística o infección.
Usando un vector de expresión tal como un vector
de ADN para la transducción del transformante descrito
anteriormente, se puede proporcionar un péptido de acuerdo con la
presente invención. Un transformante, transformado con un vector de
expresión de ADN que comprende el polinucleótido descrito
anteriormente, se cultiva en condiciones de cultivo bien conocidas
adecuadas para cada huésped. El cultivo se puede llevar a cabo
usando indicadores, tales como una función de un péptido de acuerdo
con la presente invención se expresa en mediante el transformante,
particularmente al menos la actividad para inducir y/o activar CTL,
o el péptido o la cantidad del péptido producido en el huésped o
fuera del huésped. El subcultivo o el cultivo del lote también se
puede llevar a cabo usando una cantidad del transformante en el
cultivo como un indicador.
Un péptido de acuerdo con la presente invención
se puede producir mediante un procedimiento general conocido en la
química de péptidos. Por ejemplo, se ejemplifican "Péptido
Synthesis (Maruzen) 1975" y "Péptido Synthesis, Interscience,
New York, 1996". Sin embargo, se puede usar cualquier
procedimiento ampliamente conocido.
Un péptido de acuerdo con la presente invención
se puede purificar y recoger mediante un procedimiento, tal como
cromatografía por filtración en gel, una cromatografía de columna de
iones, una cromatografía de afinidad, y similares, en combinación,
o mediante medios de fraccionamiento en la base de una diferencia de
solubilidad usando sulfato de amonio, alcohol, y similares, usando
una capacidad de activación de CTL del péptido como un indicador.
Más preferiblemente se usa un procedimiento, en el que los péptidos
se adsorben de manera específica mediante el uso de anticuerpos
policlonales o anticuerpos monoclonales, que se preparan contra el
polipéptido o los péptidos basándose en la información de las
secuencias de aminoácidos.
Un anticuerpo de acuerdo con la presente
invención se prepara mediante el uso del péptido descrito
anteriormente como antígeno. Un antígeno puede ser el propio
péptido descrito anteriormente, o su fragmento que se compone de al
menos 5, más preferiblemente al menos 8 a 10 aminoácidos. Con el fin
de preparar el anticuerpo específico para el péptido descrito
anteriormente. La secuencia de aminoácidos no es necesariamente
homóloga con la secuencia de aminoácidos del péptido, pero es
preferiblemente un sitio expuesto al exterior de una estructura
estéreo del péptido. En tal caso, es suficiente que la secuencia de
aminoácidos del sitio expuesto esté consecutiva al sitio expuesto,
incluso puede ser discreta en su estructura primaria. El anticuerpo
no se limita mientras que se una o reconozca el péptido de manera
inmunológica. La presencia o ausencia de la unión o el
reconocimiento se puede determinar mediante procedimientos bien
conocidos de reacción de unión antígeno - anticuerpo.
Con el fin de producir un anticuerpo, se puede
emplear un procedimiento bien conocido para la producción de
anticuerpo. Por ejemplo, el anticuerpo se obtiene mediante la
administración del péptido de acuerdo con la presente invención a
un animal en presencia o ausencia de de un adyuvante con o sin unión
tal como a un vehículo de manera que induzca la inmunidad humoral
y/o inmunidad mediada por célula. Se puede usar cualquier vehículo
mientras que no sea dañino para el huésped. Por ejemplo, celulosa,
un aminoácido polimerizado, albúmina, y similares se ejemplifican,
pero no se limitan a ellos. Como animal usado para la inmunización,
un ratón, rata, conejo, cabra, caballo, y así sucesivamente, se usa
preferiblemente.
Se puede obtener un anticuerpo policlonal a
partir de suero de un animal sometido a los medios inmunológicos
descritos anteriormente mediante un procedimiento bien conocido para
la recogida de anticuerpos. Un medio preferible se ejemplifica en
mediante cromatografía inmunológica.
Se puede producir un anticuerpo monoclonal
mediante la recogida de de las células que producen anticuerpos
(por ejemplo, un linfocito derivado de un nódulo de bazo o
linfático) de un animal sometido a los medios inmunológicos
descritos anteriormente, seguido de la introducción de un medio de
transformación bien conocido con una célula de proliferación
permanentemente (por ejemplo, cepa de mieloma tal como células
P3/X63 - Ag8). Por ejemplo, las células que producen anticuerpo -se
condensan con las células proliferadoras permanentes mediante un
procedimiento bien conocido para hibridomas. Después, los
hibridomas se someten a clonación, después de seleccionar los que
producen el anticuerpo específicamente el polipéptido o péptido
descrito anteriormente para recoger el anticuerpo a partir de una
solución de cultivo del hibridoma.
El anticuerpo policlonal o el anticuerpo
monoclonal así obtenido, que reconoce y se une al péptido descrito
anteriormente, se puede utilizar como un anticuerpo para
purificación, un reactivo, un marcador de etiquetado y así
sucesivamente.
El péptido descrito anteriormente, el
polinucleótido que codifica el mismo y su hebra complementaria, la
célula transformada basada en la información concerniente a la
secuencia de aminoácidos y secuencia de base de nucleótidos, o el
anticuerpo que reconoce de manera inmunológica el mismo proporcionan
medios eficaces para seleccionar una sustancia capaz de inducir
y/o activar CTL, cuando se usan de manera sola o en combinación
entre sí. El procedimiento de selección se puede construir
utilizando un sistema de selección bien conocido. Por ejemplo, como
se muestran en los ejemplos en el presente documento, usando un
sistema en el que la activación de CTL por las células que
presentan antígeno que se pulsan con el péptido de antígeno de
rumores, se mide en base a la cantidad de la producción de
IFN-\gamma a partir de CTL. La adición de una
sustancia de ensayo al sistema permite que se seleccione la
sustancia que induce y/o activa CTL y la sustancia que potencia la
inducción y/o la activación. Este sistema describe un procedimiento
de selección, pero el procedimiento de selección de acuerdo con la
presente invención no se limita a ello.
Un compuesto obtenido mediante el procedimiento
de selección descrito anteriormente es también parte de la presente
invención. El compuesto puede ser un compuesto que potencia el
reconocimiento del péptido por los CTL mediante una interacción con
el péptido de acuerdo con la presente invención, y/o
HLA-A2. Además, puede ser un compuesto que potencie
la expresión del polipéptido de acuerdo con la presente invención
mediante una interacción con el polinucleótido. El compuesto así
seleccionado se puede usar en una composición farmacéutica mediante
la selección de las que tienen tanto utilidad biológica como baja
toxicidad.
El péptido de acuerdo con la presente invención
se puede usar para activar y/o inducir los linfocitos T citotóxicos
específicos de tumor restringidos de HLA- A2, como un antígeno de
tumores o un péptido de antígeno de tumores. En otras palabras, el
procedimiento para inducir CTL, que se caracteriza porque se usa el
polipéptido o péptido, y un inductor de CTL que comprende el
polipéptido o péptido se incluyen en el alcance de la presente
invención.
El péptido de acuerdo con la presente invención,
el polinucleótido que codifica el péptido y su hebra complementaria,
el vector recombinante preparado basándose en al información de sus
secuencias de aminoácidos y secuencias de bases de nucleótidos, la
célula transformada con el vector recombinantes, o el anticuerpo que
reconoce de manera inmunológica el péptido, el compuesto que
potencia el reconocimiento del péptido por CTL mediante la
interacción con el péptido, y/o HLA-A2, o el
compuesto que potencia la expresión del polinucleótido mediante
interacción con el mismo s puede usar una composición farmacéutica
que comprende al menos una de sus especies, cuando se usan solos o
en combinación entre sí.
Concretamente, por ejemplo, el medicamento
constituido por el péptido de acuerdo con la presente invención, y
la composición farmacéutica que comprende el péptido de acuerdo con
la presente invención se puede usar como una vacuna llamada
anticáncer. En tal caso, con el fin de activar la inmunidad mediada
por células, el péptido de acuerdo con la presente invención se
puede usar en la presencia de o ausencia de un adyuvante con o sin
unión tal como un vehículo. Se puede usar cualquier vehículo
mientras no sea dañina para el cuerpo humano. Por ejemplo,
celulosa, un aminoácido polimerizado, o albúmina se ejemplifica,
pero el vehículo no se limita a ellos. Una forma de dosificación se
elige apropiadamente entre aquellas para las que se aplican los
medios bien conocidos para preparar un polipéptido o un péptido.
Su cantidad a administrar depende de un grado de reconocimiento del
péptido por CTL, y es generalmente 0,01 mg a 100 mg/día/cuerpo
humano de adulto, preferiblemente 0,1 mg a 10 mg/día/cuerpo humano
de adulto como una cantidad de sustancia activa. Tal cantidad se
administra una vez cada varios días o cada varios meses.
Como alternativa, una acción eficaz de una
vacuna anticáncer también se puede obtener mediante la recogida de
una fracción de células mononucleares a partir de la sangre
periférica de un paciente, y cultivar la fracción con un péptido de
acuerdo con la presente invención, seguido de la devolución de la
fracción de células mononucleares, donde los CTL se inducen y/o
activan, de nuevo en la sangre del paciente. Las condiciones de
cultivo, tal como la concentración de células mononucleares y la
concentración del polipéptido o el péptido de acuerdo con la
presente invención cuando se cultivan, se pueden determinar
fácilmente. Además, una sustancia, tal como interleuquina 2
(IL-2) que tiene una capacidad de inducir el crecimiento de linfocitos se puede añadir al cultivo.
(IL-2) que tiene una capacidad de inducir el crecimiento de linfocitos se puede añadir al cultivo.
En el caso de usar el péptido de acuerdo con la
presente invención como una vacuna anticáncer, que usa incluso
solamente un péptido es eficaz como una vacuna anticáncer. Sin
embargo, tipos plurales del péptido descrito anteriormente se puede
usar en combinación. Los CTL del paciente de cáncer en la población
de células que reconocen diversos antígenos de tumores, de manera
que el uso de tipos plurales de péptidos como una vacuna anticáncer
puede dar lugar a a un efecto mayor que usa solamente un tipo.
El medicamento descrito anteriormente, inductor
de los linfocitos T citotóxicos, vacuna anticáncer y composición
farmacéutica son útiles para el tratamiento de una enfermedad de
cáncer tal como un cáncer de páncreas, cáncer de colon, o cáncer de
estómago.
Además, el polinucleótido que codifica el
péptido de acuerdo con la presente invención y su hebra
complementaria son también útiles para la terapia génica de una
enfermedad de cáncer tal como cáncer de páncreas, cáncer de colon,
o cáncer de estómago.
Un procedimiento en el que estos polinucleótidos
están presentes en un vector e introducidos directamente in
vivo, y un procedimiento en el que las células recogidas de un
donante seguido de la introducción de los polinucleótidos presentes
en un vector in vitro, se pueden utilizar ambos. Retrovirus,
adenovirus, y virus de vaccinia ejemplifican los vectores, y se
prefieren los relacionados con retrovirus. Es innecesario decir,
que estos virus muestran deficiencia para la replicación. La
cantidad de su administración puede depender del grado de
reconocimiento por CTL del péptido codificado por el
polinucleótido. En general, ya que un contenido de de ADN que
codifica el péptido de antígeno de tumores de acuerdo con la
presente invención, la cantidad varía entre los intervalos de 0,1
mg a 100 mg/día/cuerpo humano de adulto, preferiblemente 1 mg a 50
mg/día/cuerpo humano de adulto. Esta cantidad se administra una vez
cada varios días o cada varios meses.
El péptido de acuerdo con la presente invención,
el polinucleótido que codifica el péptido y su hebra complementaria,
y el anticuerpo que reconoce de manera inmunológica el péptido se
puede usar de manera independientemente para un marcador de
diagnóstico y un reactivo, etc. La presente invención también
proporciona un kit de reactivos que comprende uno o más recipientes
en los que una o más de sus especies están presentes. Para su
preparación, es suficiente usar un medio bien conocido para su
preparación de acuerdo con cada péptido, polinucleótido, o
anticuerpo.
Medios de diagnóstico para una enfermedad
relacionada con con la expresión o actividad del péptido de acuerdo
con la presente invención se puede llevar a cabo, por ejemplo,
utilizando la interacción o reactividad con el polinucleótido que
codifica el péptido, mediante la determinación de la cantidad
existente de la correspondiente molécula de ácido nucleico, y/o
determinación de una distribución del péptido en el cuerpo vivo de
un individuo, y/o determinar una presencia del péptido, y la
cantidad existente en una muestra derivada del cuerpo del
individuo; la medición se lleva a cabo de manera cuantitativa o
cualitativa para el péptido de acuerdo con la presente invención o
el polinucleótido que codifica el mismo como el marcador de
diagnóstico. Como un procedimiento para la medición de manera
cuantitativa o cualitativa del péptido o el ácido nucleico que
codifica el mismo, que están presentes en la muestra, se puede
utilizar un procedimiento bien conocido. El radioinmunoensayo,
ensayo de unión competitivo, análisis de transferencia de Western,
ELISA, y similares ejemplifican tal procedimiento. Además, la
molécula de ácido nucleico se puede detectar y cuantificar a nivel
de ARN mediante el uso, por ejemplo, de amplificación, reacción en
cadena de la polimerasa (PCR), RT-PCR, protección de
ARNasa, procedimiento de transferencia de Northern, y otros
procedimientos de hibridación.
La muestra sometida a medición se ejemplifica
mediante las células derivadas de un cuerpo humano del individuo
presente en por ejemplo, sangre, orina, saliva, fluido raquídeo,
biopsia de tejidos, o material de autopsia, y similares. La
molécula de ácido nucleico sometida a medición se obtiene a partir
de cada muestra descrita anteriormente mediante un procedimiento
bien conocido para la preparación de ácido nucleico. Para la
molécula de ácido nucleico, se puede usar directamente ADN genómico
para detección, o se puede amplificar de manera enzimática mediante
el uso de otro cualquier procedimiento de amplificación antes del
análisis. Se puede usar de manera similar ARN o ADNc. En
comparación con un genotipo normal, una supresión o inserción se
puede detectar de acuerdo con un cambio de tamaño de un producto de
amplificación. La hibridación del ADN amplificado con el ADN
marcado que codifica el polipéptido descrito anteriormente puede
identificar mutaciones puntuales.
La detección de de, reducción de, e incremento
en el polipéptido de acuerdo con la presente invención y el ADN que
codifica el polipéptido mediante el procedimiento de medición
descrito anteriormente, le hace posible para diagnosticar
enfermedades, a las que está asociado el polipéptido, tales como
cáncer de páncreas, cáncer de colon, o cáncer de estómago.
La presente invención se ilustrará más
concretamente con los siguientes ejemplos, pero no se limitan a
ellos.
La línea de linfocitos T citotóxicos específicos
de tumores restringidos de HLA-A2 se estableció a
partir de linfocitos infiltrantes de tumores (TIL) de un paciente
de tumor de colon (HLA-A0207/3101,
HLA-B46/51, HLA-Cw1) (Int. J.
CANCER, 81: 459 - 466, 1999; J. Immunol., 163: 4994 - 5004, 1999).
Específicamente, TIL obtenidos a partir de paciente de tumor de
colon se cultivaron durante un largo período de hasta 50 días o más
mediante la adición de 100 U/ml de interleuquina 2
(IL-2). humana recombinante. Cada 7 días, una
porción de TIL activados por
IL-2 se recogió y se cultivó conjuntamente con diversos tipos de células tumorales o células normales para ensayar su actividad de CTL mediante la medición de IFN-\gamma producida por y mediante la medición de ^{51}Cr liberado a partir de células cancerosas (J. Immunol., 163: 4994 - 5004, 1999). IFN-\gamma se midió mediante un ensayo inmunoabsorbente unido a enzima (ELISA). El día 58 después del comienzo del cultivo, se obtuvo OK-CTLp, que es una de las sublíneas que muestran actividad de CTL específicos de tumor restringidos de HLA-A2. OK-CTLp obtenida es una población de células en la que el 80% de las células tienen un fenotipo de CD3^{+}CD4^{-}CD8^{+} y el 20% de las células tiene un fenotipo de CD34CD4^{+}CDB^{-}. El uso OK-CTLp como una célula efectora y su cultivo conjuntamente con diversos tipos de células que se usan como una célula diana, tal como una célula tumoral, la citotoxicidad para la célula diana y activación de OKCTLp se midieron usando el ensayo de liberación de ^{51}Cr mediante el uso de la producción de IFN-\gamma como indicador, respectivamente. Los resultados se presentan cada uno en las Fig. 1 y Fig. 2.
IL-2 se recogió y se cultivó conjuntamente con diversos tipos de células tumorales o células normales para ensayar su actividad de CTL mediante la medición de IFN-\gamma producida por y mediante la medición de ^{51}Cr liberado a partir de células cancerosas (J. Immunol., 163: 4994 - 5004, 1999). IFN-\gamma se midió mediante un ensayo inmunoabsorbente unido a enzima (ELISA). El día 58 después del comienzo del cultivo, se obtuvo OK-CTLp, que es una de las sublíneas que muestran actividad de CTL específicos de tumor restringidos de HLA-A2. OK-CTLp obtenida es una población de células en la que el 80% de las células tienen un fenotipo de CD3^{+}CD4^{-}CD8^{+} y el 20% de las células tiene un fenotipo de CD34CD4^{+}CDB^{-}. El uso OK-CTLp como una célula efectora y su cultivo conjuntamente con diversos tipos de células que se usan como una célula diana, tal como una célula tumoral, la citotoxicidad para la célula diana y activación de OKCTLp se midieron usando el ensayo de liberación de ^{51}Cr mediante el uso de la producción de IFN-\gamma como indicador, respectivamente. Los resultados se presentan cada uno en las Fig. 1 y Fig. 2.
OK-CTLp obtenida, como se
muestra en las Figs. 1 y 2, reconocían célula de adenocarcinoma de
páncreas HLA-A0201^{+}Panc-1,
célula de adenocarcinoma de colon SW620, célula de carcinoma de
células escamosas de esófago HLA-A0206^{+}KE3
(SCC) y célula SCC oral de HLAA0207^{+} CA9-22
para producir IFN-\gamma y representar suficiente
citotoxicidad. Sin embargo, no se mostró citotoxicidad contra
células tumorales de HLA-A2, tales como célula de
adenocarcinoma de pulmón QG56, célula de adenocarcinoma de pulmón
RERF-LC-MC, y célula de
adenocarcinoma de colon COLO320, y célula B transformada de virus de
Epstein-Barr autóloga (EBV-B) y
células T de blastoides (PHA) de fitohemaglutinina autólogas ambas
derivadas de las células normales. Además, OK-CTLp
lisaban todas las células tumorales HLAA2^{+} ensayadas (célula
de cáncer de mama R27, célula de carcinoma hepatocelular primario
HAK-2, célula de melanoma
SK-MEL-5, y célula de astrocitoma
SF126, que son HLA-A0201^{+}, y célula de
adenocarcinoma de pulmón HLA-A0206^{+} PC9, y
célula de adenocarcinoma de pulmón 1-87 y célula SCC
cervical OMC-4, que son
HLA-A0207^{+}). la actividad de se inhibió
mediante un anticuerpo monoclonal (mAb) de clase I anti - HLA, un
mAb anti- CD8 o un mAb anti-HLA-A2,
pero no se inhibe por otros mAbs (Fig. 2). Este resultado reveló que
OK-CTLp reconoce las células tumorales descritas
anteriormente de una manera restringida de HLA-A2 y
muestra citotoxicidad.
Mientras tanto, se ha descrito el genotipo de
los alelos de clase I de HLA de las células tumorales descritas
anteriormente (J. Immunol., 163: 4994 - 5004, 1999). El serotipo de
la clase I de HLA de los pacientes descritos anteriormente se
determinó mediante la aplicación de un procedimiento convencional
que usa las células mononucleares de sangre periférica (PBMC).
Además, el subtipo HLA-A2 se determinó mediante un
procedimiento de sonda de oligonucleótidos específico de secuencia
y secuenciación directa de ADN. El fenotipo de
OK-CTLp se analizó mediante análisis de
inmunofluorescencia directa, usando mAb anti-CD3,
mAb anti-CD4, o mAb anti-CD8
(preparados por Nichirei) o mAb
anti-TCR\alpha\beta (WT31, Becton Dickinson),
que se marcaron con isotiocianato de fluoresceína (FITC). Además,
los anticuerpos usados para analizar la restricción de
HLA-A2 y especificidad de OK-CTLp
eran mAb anti- HLA de clase I (W6/32, IgG2a), mAb
anti-HLA-A2 (BB7.2, IgG 2b), mAb
anti- CD8 (Nu-Ts/c, IgG2a), mAb
anti-HLA de clase II
(H-DR-1, IgG2A), y mAb anti- CD4
(Nu-Th/i, IgGl). Anti-CD13 mAb
(MCS-2, IgG2a) y Anti-CD14 mAb
(JML- H14, IgGl) se usaron como un mAb de control de emparejamiento
de isotipo.
Un gen que codifica el antígeno de tumores de la
célula tumoral Panc-1 reconocida por
OK-CTLp se aisló e identificó de acuerdo con el
procedimiento de de clonación de expresión de genes bien conocido
(J. Immunol., 163: 4994 - 5004, 1999). Específicamente, poli (A)+
ARN de las células tumorales Panc-1 se convirtieron
en ADNc, y se ligaron con un adaptador SalI de manera que se
insertaba en en el vector de expresión
pCMV-SPORT-2 (Invitrogen Corp.) los
ADNc de HLA-A0207, HLA-A2402, o
HLA-A2601 se obtuvieron mediante reacción en cadena
de la polimerasa de transcriptasa inversa (RT-PCR)
y se clonaron en el vector de expresión de eucariotas pCR3
(Invitrogen Corp.).
200 ng de la combinación de ADN de plásmido
descrito anteriormente o clones de la genoteca de ADNc de células
Panc-1 se mezcló con 200 ng del ADNc de
HLA-A0207 en 100 \mul de Opti-MEM
(Invitrogen Corp.) durante 30 min. 50 \mul de esta mezcla se
añadieron a células COS-7 (5 X 10^{3}) y se
incubaron durante 6 h en una placa de microcultivo de tipo de fondo
en U de 96 pocillos (Nunc Corp.) para la transducción conjunta.
Después el medio de cultivo RPMI-1640 que contenía
10% de FCS se añadió y se llevó a cabo el cultivo durante 2 días,
seguido de la adición de OK-CTLp (5 X10^{4}) a
cada pocillo. Después de un período adicional de 18 h, 100 ml del
sobrenadante se recogieron y se midió la producción de
IFN-\gamma después mediante ELISA. En este caso,
el uso de células COS-7 a las que el gen no se había
transfectado como una diana, la producción de
IFN-\gamma por OK-CTLp se examinó
y el valor de IFN-\gamma producido se sustrajo
como un fondo a partir del de cada medida. Como resultado, se
obtuvieron siete clones, que potenciaron la producción de IFN-
\gamma mediante OK-CTLp mediante el
reconocimiento de OK-CTLp.
La secuencia de nucleótidos de los siete clones
de ADNc obtenidos se determinaron mediante el procedimiento de
secuenciación de didesoxinucleótidos usando un kit de secuenciación
de ADN (Perkin Elmer Corp.) y usando un secuenciador ABI
PRISM^{TM}377DNA (Perkin Elmer Corp). Además, la secuencia de
aminoácidos codificada por cada clon se dedujo de la secuencia de
bases de nucleótidos. También, se llevó a cabo una investigación de
homología de la secuencia de bases de nucleótidos de estos clones
mediante el acceso del GenBank. Los resultados se presentan en la
Tabla 1 descrita anteriormente. Con relación al clon 3 entre los
siete clones de ADNc (clones 1 a 7) obtenidos, la secuencia del
clon inicial, que se obtuvo mediante el procedimiento de clonación
de la expresión del gen descrito anteriormente, era de 25 pares de
bases más corto en la región 5'-terminal que la de
WHSC2 que muestra alta homología, de manera que el ADNc de longitud
completa se obtuvo a partir de la genoteca de ADNc de la célula
Panc-1 mediante un procedimiento de hibridación de
colonia estándar que usa el clon marcado con ^{32}P como
una
sonda.
sonda.
Como se muestra en las Figs. 3 (A) y 3 (B), los
clones 1 a 7 se reconocieron cada uno por OK-CTLp
para potenciar la producción de IFN-\gamma de
OK-CTLp. Sin embargo, OK-CTLp no
reconoció las células COS-7 para las que el ADNc de
HLA-A0207 y el clon de ADNc usado como control
negativo se cotransfectaron, o las células COS-7
para las que uno cualquiera de los clones de ADNc 1 a 7 y el ADNc
de HLAA2402 o HLA-A2601 se cotransfectaron, y no
mostraron la producción de IFN-\gamma. Cuando se
cotransfectaron diversas concentraciones de clones de ADNc 1 a 6 en
las células COS-7 conjuntamente con 100 ng de ADNc
de HLA-A0207 o ADNc de HLA-A2402, la
producción de IFN-\gamma por
OK-CTL se observó de una manera dependiente de la
dosis ((A) a (F) de Fig. 4).
La expresión del ARNm de estos genes se examinó
mediante análisis de transferencia de Northern. Se observó el mismo
patrón de expresión excepto para el gen 5. Estos genes se expresan
de manera común en las células tumorales y las células normales.
Sin embargo, los niveles de expresión en las células tumorales tales
como célula Panc-1, célula SW620, y célula
CA9-22 eran significativamente mayores que los de en
células normales, tales como la célula t estimulada por PHA y una
célula B transformada por el virus de Epstein-Barr
(EBV-B). La expresión de ARNm del gen 5 se detectó
de manera escueta en estas condiciones experimentales. La razón
puede ser que la expresión del gen 5 es raro como se prueba por el
hecho que la hibridación de la colonia que usa el clon 5 marcado
con ^{32}P proporciona solamente 3 clones de una genoteca de ADNc
de aproximadamente 1 X 10^{6}.
Ya que los CTL activados mediante reconocimiento
del antígeno de tumores es una población de células que reconocen
tipos plurales de antígenos tumorales, la OK-CTLp
descrita anteriormente se sometió a clonación mediante cultivo de
dilución limitante (0,3, 0,5, 1, 2, y 4 células/pocillo) para
obtener un clon de OK-CTL (J. Immunol., 163: 4994 -
5004, 1999). Estos clones son los que tienen actividad de CTL
seleccionados mediante su cultivo conjuntamente con las células
COS-7 en las que 100 ng/pocillo de uno cualquiera de
los siete clones de ADNc descritos anteriormente y 100 ng/pocillo
de ADNc de HLA- A0207 se cotransfectaron, o con las células
tumorales, en una relación de células de 1:1, y midiendo la
producción de la producción de IFN-\gamma.
Específicamente, trescientos clones de CTL se obtuvieron a partir
de la línea precursora de OK-CTLp mediante un
cultivo de dilución limitante. Ochenta clones de CTL entre ellos
tenían actividad de CTL específicos de tumores restringidos de
HLA-A2 y expresaron el fenotipo de CD3^{+} CD4-
CD8^{+} y TCR \alpha\beta^{+}. Entre ellos, los clones 2,
3, 1, 3, 2, y 4 CTL mostraron reactividad para las células
COS-7 que expresan el clon 1, el clon 2, el clon 3,
el clon 4, el clon 5, y el clon 6, respectivamente. En otras
palabras, se reveló que el antígeno de tumores reconocido por CTL
se diferencia de acuerdo con los clones de CTL. La Tabla 4 muestra
los datos de quince clones típicos de CTL. Esto sugiere que
OK-CTLp, es decir, CTL derivado del paciente de
cáncer, es una población de células que reconocen los tipos
plurales de antígenos de tumores.
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Con el fin de obtener el antígeno de tumores
péptido derivado de los siete genes de antígeno de tumores, que se
obtuvieron en el Ejemplo 2 y pueden inducir CTL de una manera
restringida de HLA-A2, un péptido que tiene un
motivo de unión de HLA-A2 (una secuencia específica)
se investigó en la bibliografía (J. Immunol., 152: 163, 1994;
Immunogenetics, 41: 178, 1994), y péptidos de 9 mer a 11 mer, que se
diferencian entre sí y se adecuan al motivo obtenido, se diseñó y
se sintetizó basándose en la secuencia de aminoácidos codificada por
los descritos anteriormente 1 a 7 y la secuencia de aminoácidos de
UBE2V, HNRPL, WHSC2, EIF4EBP1, ppMAPkkk, 2-5 OAS3,
y CPSF que tienen alta homología con estos genes. La pureza de los
péptidos obtenidos era cada una 70% o más.
La actividad de unión del péptido a la molécula
de HLA-A0201 se ensayó usando una cepa mutante de
células T2 (Cancer Res., 54: 1071 - 1076, 1994). La célula T2
expresa la molécula HLA-A2 sobre una superficie
celular sin unión a un péptido, debido a la deficiencia de de TAP.
Específicamente, el péptido sintetizado (10 pM) y las células T2 se
incubaron a 26ºC durante 3 h y, posteriormente, se incubaron en 5%
de CO_{2} y 95% de aire a 37ºC durante 3 h. De este modo, se
obtuvieron las células T2, sobre cuya superficie el péptido se
presentó por HLA-A2. Se incubaron las células
conjuntamente con mAb anti- HLA-A2 (BB7.2) seguido
de la tinción con immunoglobulina (Ig) anti-ratón
F(ab')_{2} unida a ficoeritrina R (DAKO Corp.). Después, el
patrón de expresión se analizó mediante el empleo de FACScan
(Beckman Dickinson Corp.), que dio como resultado la confirmación
de que las moléculas HLA-A0201 con el péptido se
expresaron en la superficie celular.
Con el fin de ensayar para determinar el
reconocimiento de un péptido por CTL, las células T2 pulsadas
previamente con cada péptido (10 \muM) como una célula diana (T),
y el clon OK-CTLp o OK-CTL clone se
usó como una célula efectora (E). La célula diana y la célula
efectora se incubaron durante 18 horas, se recogió el sobrenadante,
seguido de la medición de IFN-\gamma contenida en
el sobrenadante mediante un ELISA. En el caso en el que se usó
OK-CTLp como el efector, se estableció una relación
de E/T a 10:1. En el caso en que se usó el clon
OK-CTL, se estableció a 2:1 para llevar a cabo el
ensayo. Por otra parte, en el caso en el que se usó el clon
OK-CTL para ensayar la capacidad de activación de
CTL del péptido, el clon se usó para que reconociera el producto
génico que codifica el péptido que se está examinando. Usando la
producción de IFN-\gamma del clon
OK-CTLp o OK-CTL contra las células
T2, que no se habían pulsado con el péptido, como un fondo, se
realizó la sustracción de cada valor de medición. Los resultados se
muestran en las Figs. 5 a 10. Las Fig. 5, Fig. 6, Fig. 7, Fig. 8,
Fig. 9, y Fig. 10 cada una muestra el resultado de del péptido
derivado del gen 1 y UBE2V, gen 2 y HNRPL, gene3 y WHSC2, gen 4 y
EIF4EBP1, y gen 5 y ppMAPkkk, y gen 6 y 2-5
OAS3.
Además, las diversas concentraciones de cada
péptido se usaron para la incubación conjunta con las células T2
para examinar la capacidad de activación del clon de CTL, dando como
resultado el hallazgo de que el clon CTL puede estar activado por
cada péptido de una manera dependiente de la dosis. Los ejemplos
representativos de los péptidos derivados del gen 1 y UBE2V, gen 2
y HNRPL, gen 3 y WHSC2, gen 4 y EIF4EBP1, gen 5 y ppMAPkkk, y gen 6
y 2-5 OAS3 se presentaron en (A), (B), (C), (D), (E)
y (F) de la Fig. 11, respectivamente. Por otra parte, la Tabla 5
muestra los péptidos derivados del gen 7 y CPSF. En la Tabla 5, el
péptido derivado de EBV y el péptido derivado del virus de la gripe
son controles positivos, que pueden activar CTL.
Como resultado de estos experimentos, se reveló
que los péptidos mostrados en la tabla 2 descritos anteriormente
activan el clon OK-CTLp y/o OK-CTL
para producir IFN-\gamma.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
Entre los péptidos que eran capaces de potenciar
la producción de IFN- \gamma a partir del clon de
OK-CTLp o OK-CTL en el Ejemplo 4,
los de P1 a P19 se examinaron por su capacidad de inducir CTL a
partir de células mononucleares de sangre periférica derivadas de
un paciente de cáncer. El procedimiento para inducir CTL por un
péptido era de acuerdo con el procedimiento bien conocido (J. Exp.
Med., 187: 277 - 288, 1998; Cancer Res., 59: 4056 - 4063, 1999).
Específicamente, células mononucleares de sangre periférica
autólogas (PBMC) derivadas de un paciente de cáncer, a partir de
las que se obtuvo OK- CTLp, se incubaron conjuntamente con el
péptido (10 \muM). Se volvieron a estimular las células el día 10
y 14 después del comienzo del cultivo, usando PBMC antólogas como
una célula que presenta antígeno (APC) que se pulsaron con 10 \muM
del mismo péptido durante 2 h y se expuso a irradiación (30 gray).
El día 21 después del comienzo del cultivo, las células se
recogieron para ensayar el fenotipo de superficie. Además, se
examinaron las células para el reconocimiento de diversas células
diana, usando la producción de IFN-\gamma medida
por ELISA cuando se cultivaron conjuntamente con las células diana
como un indicador. Como células diana se usaron, célula SW620,
célula CA9- 22, y célula Panc-1, que son las
células tumorales HLA-A2+. El resultado se mostró en
la Tabla 6.
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\vskip1.000000\baselineskip
Las PBMC estimuladas in vitro usando P1,
P3, P5, P6, P8, P9, P10, P11, P13, P14, P15, P17, o P18 entre los
19 péptidos reconocían las células SW620, células
CA9-22 y células Panc-1, que son las
células tumorales HLA- A2^{+}, producían
IFN-\gamma en una cantidad significativa. Sin
embargo, las PBMC apenas reconocían la célula tumoral
HLA-A2^{-}. Por otra parte, P2, P4, P7, P12, y P16
también inducían CTL que reconocían una cualquiera de las células
tumorales HLA-A2^{+}. PBMC estimuladas por P19
reconocían no solamente las células tumorales que expresan
HLA-A2,
pero también las células tumorales que expresan otros tipos de HLA. La producción de IFN-\gamma a partir de estos CTL se inhibió mediante mAb de clase I anti-HLA, mAb anti-CD8, o mAb anti-HLA-A2, y no se inhibían por otros mAbs. Además, cuando las células mononucleares de sangre periférica (PBMC) se prepararon a partir de sangre de dos pacientes HLA-A0201^{+} (un paciente de cáncer de colon y un paciente de cáncer de páncreas) para examinar la inducción de CTL por los péptidos, se obtuvo el mismo resultado que antes. En otras palabras, se encontró que los péptidos descritos anteriormente pueden inducir CTL restringidos de HLA-A2 a partir de las células mononucleares de sangre periférica del paciente.
pero también las células tumorales que expresan otros tipos de HLA. La producción de IFN-\gamma a partir de estos CTL se inhibió mediante mAb de clase I anti-HLA, mAb anti-CD8, o mAb anti-HLA-A2, y no se inhibían por otros mAbs. Además, cuando las células mononucleares de sangre periférica (PBMC) se prepararon a partir de sangre de dos pacientes HLA-A0201^{+} (un paciente de cáncer de colon y un paciente de cáncer de páncreas) para examinar la inducción de CTL por los péptidos, se obtuvo el mismo resultado que antes. En otras palabras, se encontró que los péptidos descritos anteriormente pueden inducir CTL restringidos de HLA-A2 a partir de las células mononucleares de sangre periférica del paciente.
La afinidad de unión de los péptidos a la
molécula de HLA-A0201 se expresó como yna intensidad
de fluorescencia media relativa (MFI) de la molécula de
HLA-A2. El MFI de controles positivos y negativos
eran 898 y 490, respectivamente. Se puede suponer que la afinidad
de unión de un péptido a la molécula HLA-A0201 no
tiene correlación con la inducción de CTL por el péptido.
Además, la capacidad de activar CTL de estos 19
péptidos se examinó directamente en un ensayo de liberación de
^{51}Cr que usa toxicidad a las células diana como un indicador.
Específicamente, las PBMC descritas anteriormente, en las que se
indujo CTL, se volvió a cultivar adicionalmente para proliferar en
la presencia de APC antólogas, IL-2, y un péptido
correspondiente. Aproximadamente el día 21 a 28 después del comienzo
del cultivo de nuevo, PBMC se recogió y se ensayó su toxicidad de
nuevo midiendo IFN-\gamma y mediante un ensayo
de liberación de ^{51}Cr 6-h. Los resultados se
mostraron en las figuras Figs. 12 a 17. PBMC del paciente de
cáncer, que se estimuló mediante estos péptidos, lisaban las células
tumorales HLA-A2^{+}. Sin embargo, las células
EBV-B autólogas y las células T estimuladas por PHA,
ambas se derivaban de células normales que expresaban
HLA-A2, y la célula tumoral
RERF-LC-MS de
HLA-A2, no se lisaron. Sin embargo, PBMC estimuladas
por péptidos P14, P15, y P17 también mostraron citotoxicidad por
las células EBV-B autólogas. Además, PBMC
estimuladas por P19 mostraron alta toxicidad para las células
EBV-B autólogas. Además, PBMC estimuladas por
estos péptidos mostraron citotoxicidad par alas células T2, que se
pulsaron con el mismo péptido que el usado para estimulación de
PBMC, de una manera dependiente de la dosis. Los ejemplos típicos se
muestran en (A) a (E) de la Fig. 18. A partir de esto descrito
anteriormente, se encontró que los péptidos descritos anteriormente
pueden inducir CTL, que muestra citotoxicidad de
HLA-A2, a partir de las células mononucleares de
sangre periférica del paciente de cáncer.
Para los seis péptidos (P21, P22, P24, P26, P30,
y P32) con una pureza de 95% o mayor entre los péptidos de P20 a
P32 derivados del gen 7 y CPSF entre el péptido de antígeno de
tumores obtenido en el Ejemplo 4, la actividad de inducir CTL in
vitro a partir de las células mononucleares de sangre periférica
humana (PBMC) se examinó usando la producción de
IFN-\gamma como un indicador. PBMC usadas
preparadas a partir de cada sangre periférica de dieciséis
pacientes de cáncer HLA-A2 positivo (4 pacientes con
cáncer de páncreas, siete pacientes con cáncer de estómago, y 5
pacientes con cáncer de colon) y seis individuos sanos.
Específicamente, 1X10^{5} de PBMC se añadió a cada pocillo de de
placa de microcultivo de tipo de fondo en U de 96 pocillos (Nunc
Corp.) y se incubaron conjuntamente con 10 \muM de cada uno de
los péptidos descritos anteriormente en 200 \mul de medio de
cultivo. El medio de cultivo constaba de 45% de
RPMI-1640, 45% de AIM-V (Invitrogen
Corp.), 10% de suero de ternera fetal (FCS), 100U/ml de
interleuquina-2 humana, y 0,1 \muM MEM de solución
de aminoácidos no esenciales (Invitrogen Corp.). El día 4 y día 7
después del comienzo del cultivo, se retiró la mitad del medio de
cultivo y se reemplazó con la composición descrita anteriormente que
comprende cada péptido correspondiente. El día 10 después del
comienzo del cultivo, se recogieron las células y se lavaron,
seguido de la reacción con las células T2, que se pulsaron con cada
péptido correspondiente, para medir la cantidad de
IFN-\gamma producida.
Mientras tanto, las células cultivadas
anteriormente durante 10 días después de la estimulación por el
péptido se cultivaron durante 10 días adicionales. La citotoxicidad
de las células obtenidas contra la célula de adenocarcinoma de
páncreas Panc-1 (HLA-A2) se midió
mediante el ensayo de liberación de ^{51}Cr- de 6 h en una
relación E/T de 10:1. Los resultados obtenidos se presentan como %
de lisis específica (tabla 7). Conjuntamente con esta etapa, la
citotoxicidad contra la célula tumoral SSTW-9 como
la célula tumoral HLA-A2 - se midió para usar como
un fondo que se sustrajo del resultado descrito anteriormente.
Como resultado, la inducción de CTL restringidos
de HLA-A2 a partir de PBMC por P21, P22, P23, P26,
P30, y P32, que era específico para cada péptido, se observó en
pacientes de 31% (5/16), 38% (6/16), 25% (4/6), 31% (5/16), 44%
(7/16), y 7% (1/16) de los dieciséis pacientes descritos
anteriormente, respectivamente. Por otra parte, la inducción de CTL
by P21 y P22 a partir de las PBMC de individuos sanos se encontró en
50% (3/6) y 33% (2/6), respectivamente. Sin embargo, los otros
péptidos no inducían CTL a partir de las PBMC de individuos sanos
(Tabla 7). Los CTL descritos anteriormente inducidos a partir de
PBMC de los pacientes de cáncer mediante el uso del péptido
mostraron citotoxicidad contra la célula de adenocarcinoma de
páncreas Panc-1, y también la célula de
adenocarcinoma de colon SW620 (HLA-A2/A24) y célula
de adenocarcinoma de estómago KWS (HLA-A2), ambas
son las células tumorales HLA-A2^{+}. Sin embargo,
la lisis no se observó en al célula de adenocarcinoma de estómago
SSTW9 (HLA-A24), que es la célula tumoral de
HLA-A2, o las células T blastoides de PHA - o las
células B transformadas de EBV-B, ambas expresan
HLA-A2 y no son las células tumorales. El
reconocimiento de la célula tumoral por los CTL descritos
anteriormente se inhibían por mAb de clase I
anti-HLA, mAb anti-CD8, o mAb
anti-HLA -A2, y no de inhibían por otros mAb.
A partir de los genes que codifican los
antígenos de tumores (Biochim. Biophys. Res. Commun., 281: 936 -
944, 2001), que se detectaron por el procedimiento SEREX (análisis
sexológico de Genotecas de Expresión de ADNc Recombinante) (Proc.
Natl Acad. Sci. USA, 92: 11910 - 11813, 1995) y ya reseñado, dos
genes de antígeno de tumores,
KM-PA-2 y
KM-PA-4, que pueden activar CTL
restringidos de HLA-A2, se encontraron mediante el
uso del mismo procedimiento que el del Ejemplo 2. Específicamente,
los clones de ADNc que codifica cada uno
KM-PA-2,
KM-PA-4,
KM-PA-5,
KM-PA-14, KM-PA- 15,
o KM-PA-18 se empaquetaron en el
vector pBluescript, y se digirieron mediante EcoRI y XhoI para
insertar en pCMV-SPORT2. Estos ADNcs en diversas
concentraciones se expresaron cada uno en las células
COS-7 conjuntamente con HLA-A0207 o
HLA-A2402. El uso de las células de
COS-7 como una célula diana, se realizó la
incubación conjuntamente con OK-CTLp. Como
resultado, las células de COS-7, a las que se
cotransfectaron KM-PA-2 o
KM-PA-4 con
HLA-A0207, inducía la producción de
IFN-y a partir de OK-CTLp, de una
manera dependiente de la dosis del gen ((A) y (B) de Fig. 19). El
procedimiento SEREX es un procedimiento para la detección del
antígeno de tumores. Sin embargo, entre 1500 o más tipos de
antígenos de tumores detectados mediante este procedimiento, los
identificados como antígenos de tumores capaces inducir tanto la
inmunidad mediada por células como inmunidad humoral son solamente
MAGE-1, tirosinasa, y
NY-ESO-1. Por lo tanto, incluso un
gen identificado mediante el procedimiento SEREX por codificar el
antígeno de tumores no puede siempre activar CTL. Se encontró
primero que los genes de antígeno de tumores destritos
anteriormente, KM-PA- 2 y
KM-PA-4, pueden activar CTL de una
manera restringida de HLA-A2.
\vskip1.000000\baselineskip
Con el fin de obtener el péptido de antígeno de
tumores derivado de los genes de antígeno de tumores,
KM-PA-2 y
KM-PA-4, que se obtiene a partir del
Ejemplo 7, diferentes péptidos de 9 mer o 10 mer se diseñaron
basándose en la secuencia de aminoácidos codificada por
KM-PA-2 y
KM-PA-4 y se sintetizaron mediante
un procedimiento bien conocido de la misma manera que en el Ejemplo
4.
La capacidad del péptido sintetizado de inducir
para inducir CTL a partir de las células mononucleares de sangre
periférica del paciente de cáncer de colon, a partir del cual se
obtuvo OK-CTLp, se examinó de la misma manera que
en el Ejemplo 6. Como resultado, como se muestra en (A) y (B) de la
Fig. 20, PBMC que se estimularon in vitro usando uno
cualquiera de los péptidos P33 a P41 (SEQ ID Nº:33 a SEQ ID Nº:41)
derivados de KM-PA-2 y péptidos P42
a P44 (SEQ ID Nº:42 to SEQ ID Nº:44) derivados de
KM-PA-4, producían
IFN-\gamma mediante el reconocimiento de las
células T2 (la parte izquierda de la figura (A) y (B) de Fig. 20),
que se pulsaron con el péptido que corresponde al usado para la
estimulación de las PBMC, y la célula Panc-1 (parte
derecha de la figura de (A) y (B) de la Fig. 20), que es la célula
tumoral HLA-A2^{+}. Sin embargo, las PBMC apenas
reaccionaron a la célula tumoral de HLA-A2. Como
resultado, it se reveló que uno cualquiera de los doce péptidos
descritos anteriormente puede inducir los CTL específicos de
antígeno de PBMC del paciente de cáncer de una manera restringida
de HLA-A2 y que los CTL inducidos pueden reconocer
los péptidos descritos anteriormente para producir
IFN-\gamma de una manera restringida de
HLA-A2. Además, la citotoxicidad de estos CTL
inducidos por los péptidos se confirmó directamente mediante el
ensayo de liberación de ^{51}Cr de la misma manera que en el
Ejemplo 6. La Fig. 21 muestra un ejemplo representativo del
resultado. Como se muestra en la Fig. 21, los CTL inducidos a
partir de PBMC del paciente de cáncer mediante P35, P39, o P40
lisaron las células de Panc-1 y las células
YPK-3, que son células tumorales
HLA-A2^{+}. Sin embargo, la célula tumoral
PaCa-2 de HLA-A2^{-}, la línea
celular OKAB2 de EBV-B, y las células T estimuladas
por PHA, no se lisaron. En otras palabras, se reveló que los
péptidos descritos anteriormente pueden inducir CTL que muestra
citotoxicidad a partir de las células mononucleares de sangre
periférica del paciente de cáncer de una manera restringida de
HLA-A2. Además, CTL también se indujo mediante los
péptidos descritos anteriormente a partir de PBMC obtenidas a
partir del paciente de cáncer, tal como un paciente de cáncer de
páncreas, además al paciente de cáncer de colon a partir del cual
se obtuvo OK-CTLp.
\vskip1.000000\baselineskip
Con el fin de determinar el fenotipo de TCR
expresado en la superficie celular del clon de CTL que reconoce el
péptido descrito anteriormente, se obtuvo ARN total a partir de cada
uno de los clones 5 X 10^{6} de CTL, que se obtuvieron en el
ejemplo 3, usando RNAzol^{TM}B (TEL-TEST Corp). Se
preparó ADNc usando el sistema. SuperScript^{TM} Preamplification
(Invitrogen Corp.) para la síntesis de la primera hebra de ADNc. El
ADNc de una sola cadena se amplificó mediante reacción en cadena de
la polimerasa (PCR) usando uno de uno de los 22 cebadores
diferentes V\beta (V\beta1 a 20) y cebadores 3'C \beta. La PCR
se realizó durante 35 ciclos, en la que 1 ciclo comprendía la
desnaturalización a 94ºC durante 1 min, hibridación a 58ºC durante 2
min, y extensión a 72ºC durante 3 min. El producto de la PCR se
insertó en el plásmido pCR2 seguido de la transformación en
Escherichia coli usando el sistema de clonación de TA
(Invitrogen Corp.), selección de colonias, y preparación de
plásmido para la determinación de la secuencia
de ADNc.
de ADNc.
Como resultado, cada dos clones de CTL que
reaccionan con el péptido derivado de UBE2V y gen 1, el péptido
derivado de HNRPL y el gen 2, y el péptido derivado de
2-5 OAS3 y el gen 6, expresaban
TCR-V\beta 8.1, TCRV\beta 3.2, y
TCR-V\beta 14, respectivamente. Además, los clones
de CTL que reconocen el péptido derivado de WHSC2 y el gen 3, el
péptido derivado de EIF4EBP1 y el gen 4, el péptido derivado de
ppMAPkkk y el gen 5, expresaban TCRV\beta 13.1,
TCR-V\beta 8.1, y TCR-V\beta 18,
respectivamente (Tabla 8-1 y tabla
8-2).
Cada dos clones de CTL que reconocían el péptido
derivado de UBE2V y el gen 1, el péptido derivado de HNRPL y el gen
2, y el péptido derivado de 2-5 OAS3 y gen 6,
expresaban TCR que poseen diferentes regiones 3 determinantes de
complementariedad (CDR3) (un elemento responsable de la unión a los
epítopes antigénicos en el surco de las moléculas de clase I de
HLA), respectivamente. Los clones de CTL que reconocían el péptido
derivado de WHSC2 y el gen 3, el péptido derivado de EIF4EBP1 y el
gen 4, el péptido derivado de ppMAPkkk y el gen 5, expresaban TCR
que poseen diferentes CDR3, respectivamente. La secuencia de
aminoácidos de cada CDR3 es la que se muestra con un subrayado en
la Tabla 8-2.
\vskip1.000000\baselineskip
De acuerdo con la presente invención, se pueden
inducir los linfocitos T citotóxicos restringidos de
HLA-A2, que hacen posible lograr una inmunoterapia
específica para cáncer de páncreas, cáncer de colon, y cáncer de
estómago. Los alelos de HLA-A2 se encuentran en el
23% de negros africanos, 53% de chinos, 40% de japoneses, 49% de
caucasianos del norte, y 38% de los caucasianos del sur. Por
consiguiente, la presente invención puede prometer su gran
contribución a la terapia de cáncer. Además la presente invención
contribuye en gran medida a la investigación fundamental sobre la
molécula relacionada para el reconocimiento por las células T de una
célula de cáncer de páncreas, una célula de cáncer de colon, cáncer
de estómago, y así sucesivamente.
<110> ITOH, Kyogo
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Antígeno de tumores
\vskip0.400000\baselineskip
<130> GP01-1024
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip0.400000\baselineskip
<150> JP P2000-231814
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
2000-07-31
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 62
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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<210> 2
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<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 2
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<210> 3
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 3
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<210> 4
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 4
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<210> 5
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 5
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<210> 6
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<211> 9
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 6
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<210> 7
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 7
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<210> 8
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<211> 9
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 9
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<210> 10
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 10
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<210> 11
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<400> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<140>
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<150> JP P2000-231814
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<151>
2000-07-31
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<223> Descripción de la Secuencia
artificial: Péptido diseñado que tiene una capacidad de activar
linfocitos T citotóxicos restringidos de HLA-A2
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<212> PRT
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<211> 779
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<213> Homo sapiens
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<211> 216
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<213> Homo sapiens
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<400> 51
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<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 634
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 52
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<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 142
\vskip0.400000\baselineskip
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<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
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<210> 54
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<211> 1775
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<212> ADN
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<220>
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<221> sitio de poli A
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<222> (1775)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
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<210> 55
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<211> 2097
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<212> ADN
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<222> (2097)
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<400> 55
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<210> 56
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<211> 2243
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> sitio de poli A
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<222> (2243)
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<400> 56
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<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 831
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> sitio de poli A
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<222> (831)
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<400> 57
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<210> 58
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<211> 2404
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 58
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<210> 59
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<211> 6707
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> sitio de poli A
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (6707)
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<400> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
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<211> 769
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> sitio de poli A
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (769)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2039
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> sitio de poli A
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (2039)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 61
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 62
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1822
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> sitio de poli A
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1822)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 62
Claims (23)
1. Un péptido constituido por una secuencia de
aminoácidos seleccionada entre el grupo constituido de SEQ ID Nº: 1
a SEQ ID Nº: 44.
2. Una composición farmacéutica, que comprende
el péptido de acuerdo con la reivindicación 1.
3. La composición farmacéutica de acuerdo con la
reivindicación 2, que se selecciona entre un medicamento, una
vacuna anticáncer, y un agente para inducir la proliferación,
diferenciación y/o activación de linfocitos T citotóxicos.
4. La vacuna anticáncer de acuerdo con la
reivindicación 3, en la que dicha vacuna anticáncer es una vacuna
anticáncer para el tratamiento de cáncer de páncreas, cáncer de
colon, o cáncer de estómago.
5. Un procedimiento
in-vitro para inducir la proliferación,
diferenciación y/o activación de linfocitos T citotóxicos, que
comprende el uso del péptido de acuerdo con la reivindicación 1.
6. El procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 5, en el que dicha activación está de una manera
restringida de HLA-A2.
7. A polinucleótido que codifica el péptido de
acuerdo con la reivindicación 1 o su hebra complementaria.
8. Un vector recombinante que comprende el
polinucleótido o su hebra complementaria de acuerdo con la
reivindicación 7.
9. El vector recombinante de acuerdo con la
reivindicación 8, en el que el vector recombinante es un vector de
expresión recombinante.
10. Una célula huésped, transformada con el
vector recombinante de acuerdo con la reivindicación 8 o
reivindicación 9, en la que la célula huésped expresa el
polinucleótido comprendido en dicho vector, con la condición de que
las células de las líneas germinales humanas y células de tronco
embrionario germinal humanas están excluidas.
11. Un procedimiento para producir el péptido de
acuerdo con la reivindicación 1, que comprende la etapa de cultivar
una célula huésped de acuerdo con la reivindicación 10.
12. un anticuerpo obtenible a partir de un suero
de un animal inmunizado con el péptido de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicho anticuerpo específicamente
reconoce un péptido de acuerdo con la reivindicación 1.
13. Un procedimiento para seleccionar un
compuesto que potencia el reconocimiento de un péptido de acuerdo
con la reivindicación 1 mediante linfocitos T citotóxicos
restringidos de HLA-A2, mediante interacción con
dicho péptido y/o HLA-A2, en el que dicho
procedimiento comprende
- poner en contacto dicho compuesto con al menos
uno seleccionado entre el grupo constituido por el péptido de
acuerdo con la reivindicación 1, el polinucleótido o su hebra
complementaria de acuerdo con la reivindicación 7, el vector
recombinante de acuerdo con la reivindicación 8 o reivindicación 9,
la célula huésped de acuerdo con la reivindicación 10 o el
anticuerpo de acuerdo con la reivindicación 12, y
- medir un cambio en el reconocimiento de un
péptido de acuerdo con la reivindicación 1 mediante linfocitos T
citotóxicos restringidos de HLA-A2.
14. El péptido de acuerdo con la reivindicación
1 para uso en medicina.
15. El polinucleótido o su hebra complementaria
de acuerdo con la reivindicación 7 para uso en medicina.
16. El vector recombinante de acuerdo con la
reivindicación 8 o reivindicación 9 para uso en medicina.
17. la célula huésped de acuerdo con la
reivindicación 10 para uso en medicina.
18. El anticuerpo de acuerdo con la
reivindicación 12 para uso en medicina.
19. Uso del péptido de acuerdo con la
reivindicación 1 o la composición farmacéutica de acuerdo con la
reivindicación 2 para la fabricación de un medicamento para tratar
cáncer, en el que dicho cáncer se selecciona entre cáncer de
páncreas, cáncer de colon, o cáncer de estómago.
20. Uso del polinucleótido o su hebra
complementaria de acuerdo con la reivindicación 7 para la
fabricación de un medicamento para tratar cáncer, en el que dicho
cáncer se selecciona entre cáncer de páncreas, cáncer de colon, o
cáncer de estómago.
21. Uso del anticuerpo de acuerdo con la
reivindicación 12 para la fabricación de un medicamento para tratar
cáncer, en el que dicho cáncer se selecciona entre cáncer de
páncreas, cáncer de colon, o cáncer de estómago.
22. Un procedimiento
in-vitro de diagnosis, que comprende la
medición de manera cuantitativa o cualitativa del péptido de
acuerdo con la reivindicación 1, o el polinucleótido o su hebra
complementaria de acuerdo con la reivindicación 7 en un espécimen
obtenido a partir de un sujeto que se va a diagnosticar.
23. Un kit de reactivos, que comprende al menos
un compuesto seleccionado entre el grupo constituido por el péptido
de acuerdo con la reivindicación 1, el polinucleótido o su hebra
complementaria de acuerdo con la reivindicación 7, y el anticuerpo
de acuerdo con la reivindicación 12.
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