ES2299268T3 - Hibridos proteicos de anticuerpos y sueros. - Google Patents

Hibridos proteicos de anticuerpos y sueros. Download PDF

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Abstract

Una proteína híbrida que comprende un fragmento de anticuerpo de unión a antígeno unido covalentemente a una molécula de albúmina o un fragmento de la misma, en la que el fragmento de anticuerpo y la albúmina están unidos indirectamente mediante una molécula puente entre los grupos tiol de un residuo de cisteína presente en el anticuerpo y otro presente en la albúmina en la posición 34, en la que la molécula puente tiene de 10 Aº a 20 Aº de longitud.

Description

Híbridos proteicos de anticuerpos y sueros.
Esta invención se refiere a fragmentos de anticuerpo modificados, a procedimientos para su preparación y a su uso en medicina.
Dado que los anticuerpos muestran una gran especificidad en su unión a otras moléculas, son beneficiosos como agentes terapéuticos o de diagnóstico, o como reactivos (por ejemplo, como reactivos de purificación por afinidad o como enzimas catalíticas). La aparición de la tecnología de hibridomas y la generación de animales transgénicos ha permitido la producción de grandes volúmenes de anticuerpos monoclonales, suficientes para su uso terapéutico. La mayoría de tales anticuerpos se han generado para el tratamiento de enfermedades agudas, tales como tipos particulares de cáncer. Para el tratamiento de enfermedades crónicas y/o más comunes, es probable que se requieran todavía grandes cantidades de anticuerpo. Un aumento del uso también conlleva un aumento de la necesidad de un agente terapéutico más barato.
Los anticuerpos monoclonales pueden producirse en células de insecto o de mamífero cultivadas o en animales transgénicos, pero la capacidad de estas tecnologías para suministrar a un gran mercado a un coste razonable aún no está demostrada hasta este punto. De nuevo, se ha mostrado que los hongos pueden producir proteínas heterólogas [por ejemplo, Sleep, D., et al (1991) Bio/Technology, 9, 183-187], pero se ha notificado que la expresión de inmunoglobulina G completa (IgG1) en un hongo se produce sólo a un nivel bajo (en Saccharomyces cerevisiae) o en cultivo de matraz de agitación (en Pichia pastoris), de modo que aún no está demostrada la producción de anticuerpos a partir de hongos a escala industrial. [Horwitz, A. H., et al (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85, 8678-8682; Ogunjimi, A.A. et al (1999) Biotechnology Lett. 21, 561-567]. Además, se esperaría que la glicosilación del anticuerpo fuese diferente a la de sistemas de mamífero y en mamíferos esto puede generar problemas de inmunogenicidad y función anómala (activación del complemento, unión a receptores Fc, transcitosis y prolongación de la semivida a través de la interacción con el receptor FcRn) [Nose, M. y Wigzell, H. (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80, 6632-6636; Tao, M.-H. y Morrison, S. L. (1989) J. Immunol. 143, 2595-2601; Wawrzynczak, E. J. et al (1992) Molec. Immunol. 29, 213-220; Kim, J.-K., et al (1994) Eur. J. Immunol. 24, 2429-2434].
No se conoce que los sistemas bacterianos puedan producir un anticuerpo funcional completo en un rendimiento suficiente para proporcionar un procedimiento rentable para la fabricación a gran escala, pero son una fuente de fragmentos de inmunoglobulina de bajo coste, tales como Fab' [Better, M., et al (1988) Science, 240, 1041-1043]. Sin embargo, los fragmentos de anticuerpo pueden carecer de diversas de las funciones de un anticuerpo completo. Por ejemplo, Fab', F(ab')_{2} o scFv carecen del dominio Fc que confiere una larga vida in vivo: [Medesan. C. et al (1997) J. Immunol. 158, 2211-2217]. Se ha notificado que la semivida en la circulación en mamíferos de Fab' o F(ab')_{2} es aproximadamente el 1% de la de la IgG completa [Waldmann, T. A. y Strober, W. (1969) Progr. Allergy, 13, 1-110.] y se ha notificado que la semivida de la fase \beta (el tiempo que tarda en eliminarse la mitad de las moléculas en la circulación) de Fab' es aproximadamente el 5% de la de la IgG completa [Chapman, A. P., et al (1999) Nature Biotechnology, 17, 780-783]. Por tanto, aunque pueden ser baratos de producir, estos fragmentos se eliminan rápidamente de la circulación y pueden ser de uso terapéutico limitado. Esto ha conducido a intentos para prolongar la semivida de los fragmentos de anticuerpo, por ejemplo mediante la modificación de Fab' o F(ab')_{2} in vitro mediante la adición de una o más moléculas de polietilenglicol a cada molécula de fragmento. Memoria descriptiva de la patente internacional número WO98/925971.
En la presente invención, se ha tratado la necesidad identificable de un medio para producir de manera rentable un fragmento de IgG que pueda unirse a antígeno y que tenga una semivida larga in vivo. Se ha logrado esto empleando una proteína vehículo para prolongar la inmunoglobulina en la circulación.
Por tanto, según un aspecto de la invención, se proporciona una proteína híbrida de múltiples componentes que comprende un fragmento de anticuerpo de unión a antígeno unido covalentemente a una proteína vehículo sérica o fragmento de la misma, en la que la proteína vehículo sérica es una molécula de albúmina y en la que el fragmento de anticuerpo y la albúmina están unidos indirectamente según lo mencionado en la reivindicación 1.
Existe una variedad de proteínas en el plasma, que circulan en el organismo con semividas medidas en días, por ejemplo 5 días para la proteína de unión a tiroxina y 2 días para la transtirretina [Bartalena, L y Robbins, J. (1993) Clinics in Lab. Med. 13, 583-598] o 65 h en la segunda fase de la renovación de la \alpha1-glicoproteína ácida yodada [Bree, F. et al (1986) Clin, Pharmacokin. 11, 336-342]. De nuevo, los datos de Gitlin et al. [Gitlin, D., et al (1964) J. Clin. Invest. 10, 1938-1951] sugieren que en mujeres embarazadas la semivida de la \alpha1-glicoproteína ácida es de 3,8 días, de 12 días para la transferrina y de 2,5 días para el fibrinógeno.
La albúmina sérica es una proteína abundante tanto en el compatimento vascular como extravascular [Peters, Jr., T. (1985) Adv. Prot. Chem. 37, 161-245]. La semivida de la albúmina en el hombre, aproximadamente 19 días [Peters, 1985 igual que la referencia anterior], es similar a la de la IgG1 (aproximadamente 21 días [Waldeman+Strober ibídem]), aunque es menor en otras especies (aproximadamente 2 días en ratas, por ejemplo [Peters, 1985 ibídem]). La albúmina no presenta la capacidad observada de los anticuerpos de unirse específicamente a ligandos, particularmente aquéllos de elevado peso molecular.
El documento WO9200763 da a conocer el acoplamiento químico de moléculas de albúmina a fragmentos de IgM o IgA para restaurar la afinidad de unión a antígeno.
El documento WO9533492 da a conocer el acoplamiento químico de un agente de transporte dirigido (molécula de unión específica a la matriz extracelular del tejido) a un agente antiproliferativo o citotóxico. El conjugado resultante se usa en la inhibición de la cicatrización de heridas en el ojo. Opcionalmente, el agente de transporte dirigido puede acoplarse químicamente a una molécula vehículo tal como albúmina para permitir la unión de múltiples moléculas del agente antiproliferativo o citotóxico a cada molécula de agente de transporte dirigido.
Yukawa N. et al. (1997) J. Immunol. 18, 215-233 dan a conocer un conjugado de albumina sérica unida a Fab' de conejo biespecífico policlonal para su uso en un inmunoensayo de hemaglutinación para determinar la beta-microseminoproteína. La molécula de albúmina se usa como una molécula conectora a la que se unen múltiples fragmentos Fab'.
En la presente invención se ha producido una serie de proteínas híbridas que tienen ventajosamente las capacidades de unión a antígeno de un fragmento de anticuerpo y la longevidad de la albúmina sérica in vivo. Adicionalmente, los híbridos pueden ser especialmente adecuados para su uso en futuras madres o madres lactantes dado que como con otras diversas proteínas séricas, la albúmina se transporta mal a través de la placenta: la albúmina marcada inyectada en una madre aparece con un 5% o menos de actividad específica en el feto tras 25 días [Gitlin, D. Kumate, J. Urrusti, J. y Morales. C. (1964) J. Clin. Invest 10, 1938-1951]. Esto contrasta con la IgG, que se transporta eficazmente a través de la placenta hasta el feto. De manera similar, la albúmina no se transporta a través de la pared intestinal de los neonatos, mientras que la IgG sí, mediante interacción con el receptor FcRn. Por tanto, de manera ventajosa, un feto o neonato se expondría a: cantidades mínimas de los híbridos según la invención de la circulación materna o de la leche.
Con respecto a la producción comercial, se ha notificado que la albúmina recombinante se produce a varios gramos por litro de cultivo de levaduras (Pichia pastoris o Kluyveromyces lactis [Barr, K. A., et al (1992) Pharm. Eng. 12, 48-51; Fleer, R., et al (1991) Bio/Technology 9, 968-975; Cregg, J. M., et al (1993) Bio/Technology 11, 905-910]). Este nivel de expresión hace factible de manera rentable la producción industrial de la proteína de calidad farmacéutica, según lo comentado por Fleer et al [Fleer, R., et al (1991) Bio/Technology 9, 968-975]. De manera similar, se ha encontrado que los ratones transgénicos expresan como máximo 10 g por litro de albúmina en su leche [Hurwitz, D. R, et al (1994) Transgenic Res. 3,365-375].
El componente de fragmento de anticuerpo de unión a antígeno en las proteínas según la invención comprenderá en general un dominio de región variable de anticuerpo que contiene uno o más sitios de unión a antígeno.
El dominio de región variable puede ser de cualquier tamaño o composición de aminoácidos y comprenderá generalmente al menos una secuencia de aminoácidos hipervariable responsable de la unión a antígeno incluida en una secuencia de entramado. En términos generales, el dominio de región variable (V) puede ser cualquier disposición adecuada de dominios variables de cadena pesada (V_{H}) y/o ligera (V_{L}). Por tanto, por ejemplo, el dominio de región V puede ser monomérico y ser un dominio V_{H} o V_{L} en el que estos pueden unirse independientemente al antígeno con afinidad aceptable. Como alternativa, el dominio de región V puede ser dimérico y contener dímeros V_{H}-V_{H}, V_{H}-V_{L} o V_{L}-V_{L}, en los que las cadenas V_{H} y V_{L} no están asociadas covalentemente. Sin embargo, si se desea, las cadenas pueden acoplarse covalentemente o bien directamente, por ejemplo a través de un puente disulfuro entre los dos dominios variables, o a través de un conector, por ejemplo un conector peptídico, para formar un dominio de cadena sencilla, por ejemplo scFv.
El dominio de región variable puede ser cualquier domino variable que se produce en la naturaleza o una versión modificada mediante ingeniería genética del mismo. Por versión modificada por ingeniería genética se quiere decir un domino de región variable que se ha creado usando técnicas de modificación por ingeniería genética de ADN recombinante. Tales versiones modificadas por ingeniería genética incluyen las creadas, por ejemplo, a partir de regiones variables de anticuerpos naturales mediante inserciones, deleciones o cambios en o a las secuencias de aminoácidos de los anticuerpos naturales. Los ejemplos particulares de este tipo incluyen los dominios de región variable modificados por ingeniería genética que contienen al menos una CDR y opcionalmente uno o más aminoácidos de entramado de un anticuerpo y el resto del domino de región variable de un segundo anticuerpo.
El dominio de región variable podrá unirse selectivamente en general a un antígeno. El antígeno puede ser cualquier antígeno asociado a células, por ejemplo un antígeno de la superficie celular tal como un marcador de células tumorales, de células endoteliales o de células T, o puede ser un antígeno de la matriz extracelular, un antígeno intracelular o un antígeno soluble. Los ejemplos particulares de antígenos de la superficie celular incluyen moléculas de adhesión, por ejemplo integrinas tales como integrinas \beta1, por ejemplo VLA-4, selectina E, seledina P o selectina L, CD2, CD3, CD4, CD5, CD7, CD8, CD11a, CD11b, CD18, CD19, CD20, CD23, CD25, CD33, CD38, CD40, CD45, CDW52, CD69, antígeno carcinoembrionario (CEA), globulina de la grasa de leche humana (HMFG1 y 2), antígenos del MHC clase I y MHC clase II, y VEGF, y cuando sea apropiado, receptores de los mismos. Los antígenos solubles incluyen interleucinas tales como IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-8 o IL-12, antígenos virales, por ejemplo antígenos del virus sincitial respiratorio o del citomegalovirus, inmunoglobulinas, tales como IgE, interferones tales como interferón \alpha, interferón \beta o interferón \gamma, factor \alpha de necrosis tumoral, factor \beta de necrosis tumoral, factores estimuladores de colonias tales como G-CSF o GM-CSF, y factores de crecimiento derivados de las plaquetas tales como PDGF-\alpha y PDGF-\beta, y cuando sea apropiado, receptores de los mismos.
En la práctica, se prefiere generalmente que el dominio de región variable esté unido covalentemente en un aminoácido C-terminal a al menos otro dominio de anticuerpo o un fragmento del mismo. Por tanto, por ejemplo, cuando está presente un dominio V_{H} en el dominio de región variable, éste puede estar unido a un dominio C_{H}1 de inmunoglobulina o un fragmento del mismo. De manera similar, un dominio V_{L} puede estar unido a un dominio C_{K} o un fragmento del mismo. De esta forma, por ejemplo, el fragmento según la invención puede ser un fragmento Fab en el que el dominio de unión a antígeno contiene dominios V_{H} y V_{L} asociados unidos covalentemente en sus extremos C-terminales a un dominio CH1 y C_{K} respectivamente. El dominio CH1 puede extenderse con otros aminoácidos, por ejemplo para proporcionar un dominio de región bisagra tal como se encuentra en un fragmento Fab', o para proporcionar otros dominios, tales como dominios CH2 y CH3 de anticuerpo.
El componente de proteína vehículo sérica en las proteínas híbridas según la invención es albúmina o un fragmento de la misma que será en particular de origen humano y que puede tener uno o más aminoácidos adicionales o diferentes con respecto a la secuencia que se produce en la naturaleza siempre con tal que la secuencia resultante sea funcionalmente equivalente con respecto a la semivida. Los fragmentos incluyen cualquier parte más pequeña de la proteína original que conserve la función de vehículo de la secuencia madura.
Los componentes de anticuerpo y de proteína vehículo en las proteínas híbridas según la invención están unidos covalentemente de manera indirecta. El enlace covalente indirecto pretende significar que un aminoácido en un fragmento de anticuerpo está unido a un aminoácido en una proteína vehículo a través de una secuencia química intermedia, por ejemplo un grupo puente. Los grupos puente particulares incluyen por ejemplo cadenas alifáticas, incluyendo peptídicas, según lo descrito más particularmente a continuación en el presente documento.
Los grupos puente particulares útiles para unir indirectamente un anticuerpo a una proteína vehículo incluyen grupos alifáticos, cicloalifáticos, heteroalifáticos, heterocicloalifáticos, aromáticos y heteroaromáticos opcionalmente sustituidos. Los grupos particulares incluyen cadenas de alquileno C_{1-20}, alquenileno C_{2-20} o alquinileno C_{2-20} lineales o ramificadas opcionalmente sustituidas, opcionalmente interrumpidas y/o sustituidas en los extremos terminales con uno o más átomos de -O- o -S-, o grupos -N(R^{1})- [en la que R^{1} es un átomo de hidrógeno o un grupo alquilo C_{1-6}], -N(R^{1})CO-, -CON(R^{1})-, -N(R^{1})SO_{2}-, -SO_{2}N(R^{1})-, -C(O)-, -C(O)O-, -OC(O)-, -S(O)-, -S(O)_{2}-, compuesto aromático, por ejemplo fenilo, compuesto heteroaromático, por ejemplo piridilo o cicloalquilo, por ejemplo ciclohexilo. Tales cadenas incluyen, por ejemplo, cadenas de alquileno C_{1-10} lineales o ramificadas opcionalmente sustituidas tales como cadenas de butileno, pentileno, hexileno o heptileno opcionalmente sustituidas, residuos de aminoácidos individuales y cadenas peptídicas, que contienen por ejemplo de dos a veinte aminoácidos, que pueden ser iguales o diferentes, por ejemplo cadenas de poliglicina tales como (Gly)_{n} en la que n es un número entero desde dos hasta diez. Los sustituyentes opcionales que pueden estar presentes en cualquiera de las cadenas anteriores incluyen uno o más átomos de halógeno, por ejemplo átomos de flúor, cloro, bromo o yodo, o grupos alquilo C_{1-6}, alcoxilo C_{1-6}, haloalquilo C_{1-6}, haloalcoxilo C_{1-6}, -OH o -N(R^{1})(R^{2}) [en el que R^{2} es según lo definido para R^{1}].
El grupo puente que une indirectamente un anticuerpo a una proteína vehículo lo hace en la cadena lateral de residuos de cisteína ubicados en el anticuerpo o proteína vehículo. En cada punto de unión puede estar presente el residuo de un grupo reactivo. Por ejemplo, cuando el grupo puente está unido a un residuo de cisteína en el anticuerpo o proteína vehículo, puede incorporarse el residuo de un grupo reactivo selectivo para tiol tal como un grupo maleimida o similar como parte de la unión.
Si se desea, la proteína híbrida según la invención puede tener una o más moléculas efectoras o indicadoras unidas a ella y la invención se extiende a tales proteínas modificadas. Las moléculas efectoras o indicadoras pueden unirse al fragmento de anticuerpo y/o a la proteína vehículo a través de cualquier cadena lateral de aminoácidos disponible o grupo funcional del aminoácido terminal ubicados en cualquier componente, por ejemplo cualquier grupo amino, imino, hidroxilo o carboxilo libres. El enlace puede ser directo o indirecto, a través de grupos puente o espaciadores, según lo descrito justo anteriormente, para unir los componentes de anticuerpo y de proteína vehículo. Como alternativa, el indicador/efector puede unirse al resto de enlace.
Las moléculas efectoras incluyen, por ejemplo, agentes antineoplásicos, toxinas (tales como toxinas enzimáticamente activas de origen vegetal o bacteriano y fragmentos de las mismas, por ejemplo ricina y fragmentos de la misma), proteínas biológicamente activas, por ejemplo enzimas, ácidos nucleicos y fragmentos de los mismos, por ejemplo ADN, ARN y fragmentos de los mismos, polímeros naturales o sintéticos tales como polisacáridos o polímeros de polialquileno tales como polietilenglicol, radionúclidos, particularmente yodo radiactivo, y metales quelados. Los grupos indicadores adecuados incluyen metales quelados, compuestos fluorescentes o compuestos que pueden detectarse mediante espectroscopía de RMN o ESR.
Los agentes antineoplásicos particulares incluyen agentes citotóxicos y citostáticos, por ejemplo agentes alquilantes, tales como mostazas de nitrógeno (por ejemplo clorambucil, melfalán, mecloretamina, ciclofosfamida o mostaza de uracilo) y derivados de las mismas, trietilenfosforamida, trietilentiofosforamida, busulfán, o cisplatino; antimetabolitos, tales como metotrexato, fluorouracilo, floxuridina, citarabina, mercaptopurina, tioguanina, ácido fluoroacético o ácido fluorocítrico, antibióticos, tales como bleomicinas (por ejemplo, sulfato de bleomicina), doxorubicina, daunorubicina, mitomicinas (por ejemplo mitomicina C), actinomicinas (e.g. dactinomicina), plicamicina, calicheamicina y derivados de las mismas, o esperamicina y derivados de la misma; inhibidores mitóticos, tales como etopósido, vincristina o vinblastina y derivados de los mismos; alcaloides, tales como elipticina; polioles tales como taxicina-I o taxicina-II; hormonas, tales como andrógenos (por ejemplo dromostanolona o testolactona), progestinas (por ejemplo acetato de megestrol o acetato de medroxiprogesterona), estrógenos (por ejemplo difosfato de dimetilestilbestrol, fosfato de poliestradiol o fosfato de estramustina) o antiestrógenos (por ejemplo tamoxifeno); antraquinonas, tales como mitoxantrona, ureas, tales como hidroxiurea; hidrazinas, tales como procarbazina; o imidazoles, tales como dacarbazina.
Los grupos efectores particularmente útiles son la calicheamicina y derivados de la misma (véase por ejemplo las memorias descriptivas de las patentes surafricanas números 85/8794, 88/8127 y 90/2839).
Los metales quelados incluyen quelatos de metales di- o tripositivos que tienen un número de coordinacion desde 2 hasta 8 incluidos. Los ejemplos particulares de tales metales incluyen tecnecio (Tc), renio (Re), cobalto (Co), cobre (Cu), oro (Au), plata (Ag), plomo (Pb), bismuto (Bi), indio (In), galio (Ga), itrio (Y), terbio (Tb), gadolinio (Gd) y escandio (Sc). En general, el metal es preferiblemente un radionúclido. Los radionúclidos particulares incluyen ^{99m}Tc, ^{186}Re, ^{188}Re, ^{58}Co, ^{60}Co, ^{67}Cu, ^{195}Au, ^{199}Au, ^{110}Ag, ^{203}Pb, ^{206}Bi, ^{207}Bi, ^{111}In, ^{67}Ga, ^{68}Ga, ^{88}Y, ^{90}Y, ^{160}Tb, ^{153}Gd y ^{47}Sc.
El metal quelado puede ser, por ejemplo, uno de los tipos anteriores de metal quelado con cualquier agente quelante polidentado adecuado, por ejemplo poliaminas cíclicas o acíclicas, poliéteres (por ejemplo, éteres corona y derivados de los mismos); poliamidas; porfirinas; y derivados carbocíclicos.
En general, el tipo de agente quelante dependerá del metal en uso. Sin embargo, un grupo particularmente útil de agentes quelantes en conjugados según la invención son poliaminas cíclicas y acíclicas, especialmente ácidos poliaminocarboxílicos, por ejemplo ácido dietilentriaminapentaacético y derivados del mismo, y aminas macrocíclicas, por ejemplo derivados de triaza y tetraaza cíclicos (por ejemplo, según lo descrito en la memoria descriptiva de la patente internacional número WO 92/22583); y poliamidas, especialmente desferrioxiamina y derivados de la misma.
En las proteínas según la invención, cada fragmento de anticuerpo de unión a antígeno es preferiblemente un fragmento Fab' monovalente, que contiene opcionalmente uno o más aminoácidos adicionales unidos al extremo C-terminal del dominio CH1 y es especialmente un fragmento Fab'. Los fragmentos Fab' particularmente útiles incluyen aquéllos en los que el dominio bisagra contiene un único residuo de cisteína. Los fragmentos de albúmina incluyen uno o más dominios I, II y/o III o subdominios de los mismos [véase, por ejemplo, Peters, T. en "All about Albumin", Academic press, London (1996)].
En los híbridos de anticuerpo-albúmina según la invención, cada componente de proteína está unido indirectamente entre los grupos tiol de un residuo de cisteína presente en el anticuerpo y otro en la albúmina. El enlace indirecto puede lograrse mediante una molécula puente según se describió anteriormente. Los grupos particularmente útiles incluyen grupos conectores no rompibles, especialmente cadenas de alquileno C_{1-10} lineales o ramificadas opcionalmente sustituidas.
El anticuerpo es preferiblemente un fragmento Fab' que contiene opcionalmente uno o más aminoácidos adicionales unidos al extremo C-terminal del dominio CH1. Los fragmentos especialmente útiles incluyen fragmentos Fab'. El residuo de cisteína al que está unida la molécula puente o espaciadora se ubica preferiblemente en el dominio CH1 del Fab o, especialmente, se ubica en cualquier extensión del extremo G-terminal del dominio CH1 del Fab, por ejemplo en el dominio bisagra de un Fab'.
La albúmina puede ser en particular albúmina sérica humana madura o un fragmento de la misma. La molécula puente está unida al residuo de cisteína en la posición 34 de la albúmina. De manera ventajosa, para evitar la formación no deseable de homodímeros [véanse los ejemplos más adelante], la molécula puente tiene aproximadamente desde 10 \ring{A} hasta aproximadamente 20 \ring{A} de longitud, por ejemplo aproximadamente 16 \ring{A}. Las moléculas puente adecuadas en este intervalo de longitud pueden determinarse fácilmente a partir de fuentes publicadas, por ejemplo catálogos de fabricantes [véase más adelante]. Las moléculas puente particularmente útiles incluyen cadenas de hexileno opcionalmente sustituidas. Cuando cada extremo de la molécula puente está unido al residuo de cisteína, esto puede ser a través de un puente disulfuro o, en particular, una unión azufre-carbono. Cuando el enlace es una unión azufre-carbono, el residuo de un grupo reactivo selectivo para tiol, tal como una maleimida, puede estar presente como parte de cada extremo del grupo puente o espaciador.
Las proteínas híbridas según la invención pueden ser útiles en la detección o tratamiento de varias enfermedades o trastornos. Tales enfermedades o trastornos pueden incluir los descritos con los títulos generales de enfermedad infecciosa, por ejemplo infección viral; autoinmunidad/enfermedad inflamatoria, por ejemplo artritis reumatoide, osteoartritis, enfermedad inflamatoria intestinal; cáncer, enfermedad alérgica/atópica, por ejemplo asma, eczema; enfermedad congénita, por ejemplo fibrosis quística, anemia drepanocítica; enfermedad dermatológica, por ejemplo psoriasis; enfermedad neurológica, por ejemplo esclerosis múltiple; trasplantes, por ejemplo rechazo al trasplante de órganos, enfermedad de injerto contra huésped; y enfermedad metabólica/idiopática, por ejemplo diabetes.
La proteína híbrida según la invención puede formularse para su uso en terapia y/o diagnosis y según otro aspecto de la invención, se proporciona una composición farmacéutica que comprende una proteína híbrida de múltiples componentes que comprende un fragmento de anticuerpo de unión a antígeno unido covalentemente a una molécula de albúmina o fragmento de la misma, junto con uno o más excipientes, diluyentes o vehículos farmacéuticamente aceptables.
Según se explicó anteriormente, la proteína híbrida en este aspecto de la invención puede estar unida opcionalmente a uno o más grupos efectores o indicadores.
La composición farmacéutica puede tomar cualquier forma para la administración, por ejemplo para la administración oral, bucal, parenteral, nasal, tópica o rectal, o una forma adecuada para la administración mediante inhalación o insuflación, y preferiblemente está en una forma adecuada para la administración parenteral, por ejemplo mediante inyección o infusión, por ejemplo mediante inyección en bolo o infusión continua. Si la composición es para inyección o infusión, puede tomar la forma de una suspensión, disolución o emulsión en un vehículo acuoso o aceitoso y puede contener agentes de formulación tal como agentes de suspensión, conservantes, estabilizantes, antioxidantes y/o de dispersión.
Como alternativa, la composición puede estar en forma seca, para la reconstitución antes de su uso con un líquido estéril apropiado.
Si la composición es adecuada para la administración oral, la formulación puede contener, además del principio activo, aditivos tales como: almidón, por ejemplo almidón de patata, maíz o trigo o derivados de celulosa o almidón tales como celulosa microcristalina; sílice; diversos azúcares tales como lactosa; carbonato de magnesio y/o fosfato de calcio. Es deseable que, si la formulación es para administración oral, sea bien tolerada por el sistema digestivo del paciente. Para este fin, puede ser deseable incluir en la formulación formadores de mucosidad y resinas. También puede ser deseable mejorar la tolerancia formulando el anticuerpo en una cápsula que sea insoluble en los jugos gástricos. También puede ser preferible incluir el anticuerpo o composición en una formulación de liberación controlada.
Si la composición es adecuada para la administración rectal, la formulación puede contener un agente de unión y/o lubricante; por ejemplo glicoles poliméricos, gelatinas, manteca de cacao u otras ceras o grasas vegetales.
Los usos terapéuticos y de diagnóstico de las proteínas híbridas según la invención comprenden normalmente administrar una cantidad eficaz de la proteína a un sujeto humano. La cantidad exacta que va a administrarse variará según el uso pretendido de la proteína y la edad, sexo y estado del paciente, pero puede variarse normalmente desde aproximadamente 0,1 mg hasta 1000 mg, por ejemplo desde aproximadamente 1 mg hasta 500 mg. La proteína puede administrarse como una dosis única o de una manera continua a lo largo de un periodo de tiempo. Las dosis pueden repetirse según sea apropiado. Las dosis típicas pueden ser por ejemplo de entre 0,1-50 mg/kg de peso corporal por dosis terapéutica única, particularmente de entre 0,1-20 mg/kg de peso corporal para una dosis terapéutica única.
Las proteínas híbridas según la invención pueden prepararse mediante procedimientos químicos, enzimáticos y/o de ADN recombinante convencionales.
Por tanto, por ejemplo, la proteína híbrida puede prepararse mediante el uso de técnicas de ADN recombinante que implican la manipulación y reexpresión de ADN que codifica regiones variables y/o constantes del anticuerpo y una proteína vehículo deseada o un fragmento de la misma. Tal ADN se conoce y/o está fácilmente disponible a partir de bibliotecas de ADN que incluyen por ejemplo bibliotecas de fago-anticuerpo [véase Chiswell, D J y McCafferty, J. Tibtech. 10, 80-84 (1992)] o puede sintetizarse si se desea. Pueden usarse procedimientos de química y/o biología molecular convencionales para secuenciar y manipular el ADN, por ejemplo, para introducir codones para crear residuos de cisteína, para modificar, añadir o delecionar otros aminoácidos o dominios en el anticuerpo y/o vehículo según se desee.
A partir de aquí, pueden prepararse uno o más vectores de expresión replicables que contienen el ADN y usarse para transformar una línea celular apropiada, por ejemplo una línea celular de mieloma no productora, tal como una línea NSO de ratón o una línea bacteriana, por ejemplo una línea de E. coli, o, especialmente, una línea fúngica, tal como una línea de levaduras, por ejemplo miembros del género Pichia, Saccharomyces, o Kluyveromyces, en las que se producirá la producción del anticuerpo. Con el fin de obtener una transcripción y traducción eficaces, la secuencia de ADN en cada vector debe incluir secuencias reguladoras apropiadas, particularmente una secuencia promotora y líder operativamente unida a la secuencia del dominio variable. Los procedimientos particulares para producir proteínas recombinantes de esta forma se conocen bien en general y se usan rutinariamente. Por ejemplo, se describen procedimientos de biología molecular básica por Maniatis et al [Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, Nueva York, 1989]; la secuenciación del ADN puede realizarse según lo descrito por Sanger et al [PNAS 74, 5463, (1977)] y el manual de secuenciación plc de Amersham International; y la mutagénesis dirigida al sitio puede llevarse a cabo según el procedimiento de Kramer et al [Nucl. Acids Res. 12, 9441, (1984)] y el manual de Anglian Biotechnology Ltd. Adicionalmente, existen numerosas publicaciones, incluyendo memorias descriptivas de patentes, que detallan técnicas adecuadas para la preparación de proteínas mediante manipulación de ADN, creación de vectores de expresión y transformación de células apropiadas, por ejemplo según lo descrito en la memoria descriptiva de la patente internacional número WO86/01533 y la memoria descriptiva de la patente europea número 392745.
La síntesis química de las proteínas híbridas según la invención puede lograrse acoplando apropiadamente un anticuerpo funcionalizado, una proteína vehículo y, cuando sea apropiado, grupos puente en un orden predeterminado. Pueden emplearse técnicas de acoplamiento químico convencionales que utilizan materiales de partida que contienen uno o más grupos funcionales reactivos tales como tioles, ácidos, tioácidos, anhídridos, haluros de ácido, ésteres, imidas, aldehídos, cetonas, iminas y aminas. El anticuerpo y proteína vehículo de partida pueden obtenerse fácilmente a partir de fuentes naturales y/o mediante técnicas de ADN recombinante según se describió anteriormente. Los grupos puente adecuados, por ejemplo en el intervalo de longitud de 10 \ring{A}-20 \ring{A} según se describió anteriormente, están disponibles comercialmente [véase, por ejemplo Pierce & Warriner (UK) Ltd., Chester, RU] o bien pueden obtenerse mediante funcionalización simple de productos químicos fácilmente disponibles conocidos usando química convencional.
Por tanto, en un enfoque general, un grupo puente homo- o heteropolifuncional, por ejemplo bi- o trifuncional, puede acoplarse en primer lugar al anticuerpo o bien a la proteína vehículo y el producto resultante puede acoplarse según sea necesario al/a los componente(s) restante(s) para proporcionar la proteína híbrida de la invención. Las reacciones de acoplamiento pueden realizarse usando condiciones convencionales para las reacciones de este tipo. Por tanto, por ejemplo, la reacción puede realizarse en un disolvente, por ejemplo un disolvente orgánico, un disolvente acuoso-orgánico o, especialmente, un disolvente acuoso a o aproximadamente a temperatura ambiente hasta aproximadamente 70ºC. Preferiblemente, para evitar la polimerización no deseada en la primera reacción de acoplamiento, se emplea el grupo puente homo- o heteropolifuncional en una concentración en exceso con respecto al anticuerpo o proteína vehículo. De manera similar, en la segunda reacción de acoplamiento, se emplea preferiblemente el anticuerpo o proteína vehículo en una concentración en exceso con respecto al producto de la primera reacción de acoplamiento. Se describen reacciones ilustrativas en detalle en los ejemplos a continuación en el presente documento para la preparación de proteínas según la invención y estos pueden adaptarse fácilmente usando diferentes materiales de partida para proporcionar otros compuestos de la invención.
Los siguientes ejemplos ilustran la invención. En estos se hace referencia a diversas figuras que son:
Figura 1
SDS PAGE del conjugado RSA-Fab'
Se hizo correr el conjugado RSA-Fab' tanto en condiciones reductoras como no reductoras. Se estimaron los pesos moleculares aparentes aproximados mediante comparación con proteínas convencionales que se hacen correr en el mismo gel en condiciones reductoras. Se determinaron las proporciones molares mediante secuenciación en el extremo N-terminal de bandas inmunotransferidas de geles sobre membrana de PVDF.
Figura 2
Farmacocinética del conjugado RSA-Fab' o controles en la rata
Se marcaron las proteínas con ^{125}I antes de la inyección en 6 ratas. Se cuantificó la radiactividad presente en la muestra de sangre tomada a intervalos mediante recuento de rayos gamma. Se muestran los resultados del análisis mediante Winnonlin. Las unidades para la semivida plasmática en las fases \alpha y \beta (t_{1/2}\alpha y t_{1/2}\beta, respectivamente) son horas (h). Las áreas bajo las curvas de concentración plasmática-tiempo (AUC, 0-\infty) están en las unidades de h*% de dosis. Los datos representados como conjugado RSA-Fab' (factor de corrección) se han corregido a partir de los datos para el conjugado RSA-Fab' para tener en cuenta la inestabilidad de la proteína marcada, según se describe en el texto.
Figura 3
Farmacocinética de RSA-Fab' o Fab'-Cys en la rata (sometida a ensayo mediante ELISA o neutralización de citocinas)
Se inyectaron proteínas no marcadas en 2 ratas y se cuantificaron posteriormente en muestras de plasma mediante ELISA. En el caso del conjugado, el ELISA empleó la unión del ligando (TNF) y del anticuerpo anti-albúmina, y en el caso del control Fab'-Cys empleó la unión del TNF y de la cadena L anti-kappa, según se describe en el texto. Las unidades para la semivida plasmática en las fases \alpha y \beta (t_{1/2}\alpha y t_{1/2}\beta, respectivamente) son horas (h). Como alternativa, se sometieron a ensayo las muestras mediante neutralización de la actividad de TNF en el ensayo L929. Las áreas bajo las curvas de concentración plasmática-tiempo (AUC, 0-\infty) están en las unidades de h*%\mug/ml. Las curvas para RSA-Fab' se superponen entre sí y asimismo las curvas para Fab'-Cys. Barras de error = e.e.m.
Figura 4
Construcción de pPIC(scFv-HSA)
Diagrama de flujo del procedimiento de construcción.
Figura 5
SDS PAGE en condiciones reductoras de proteínas de fusión HSA-scFv
Se hizo correr una muestra de cada proteína de fusión antes y después de la cromatografía en Blue Sepharose en condiciones reductoras, junto con marcadores de peso molecular convencionales y RSA convencional en el mismo gel.
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Figura 6
Farmacocinética de las proteínas de fusión HSA-Fab' o HSA en la rata
Se marcaron las proteínas con ^{125}I antes de la inyección en 6 ratas. Se cuantificó la radiactividad presente en la muestra de sangre tomada a intervalos mediante recuento de rayos gamma. Se muestran los resultados de los análisis mediante Winnonlin. Las unidades para la semivida plasmática en las fases \alpha y \beta (t_{1/2}\alpha y t_{1/2}\beta, respectivamente) son horas (h). Las áreas bajo las curvas de concentración plasmática-tiempo (AUC, 0-\infty) están en las unidades de h*% de dosis.
Figura 7
Estructura del agente de reticulación de trimaleimida.
Se usó este reactivo en la generación del conjugado RSA-F(ab')_{2}.
Figura 8
SDS PAGE en condiciones reductoras del conjugado de HSA-F(ab')_{2}
Se hicieron correr las proteínas convencionales y de muestra purificada en el mismo gel en condiciones reductoras. Se determinaron las proporciones molares mediante secuenciación en el extremo N-terminal de bandas inmunotransferidas de geles sobre membrana de PVDF.
Figura 9
Gráficos de Scatchard de la unión de RSA-F(ab')_{2} o control F(ab')_{2} a membranas celulares
Se calcularon 2 valores para K_{D} para cada una de las curvas (bifásicas), tal como se muestra. Cada fase de cada curva se muestra como una línea recta.
Ejemplo 1 Conjugado Fab'-albúmina Procedimientos Preparación de Fab' anti-TNF
Se produjo Fab' anti-TNF recombinante en E. coli, y se preparó a partir del periplasma mediante los procedimientos descritos en la memoria descriptiva de la patente internacional número WO98/25971.
Conjugación del Fab' anti-TNF con albúmina sérica de rata
Se disolvió albúmina sérica de rata (RSA, fracción V, Sigma, número de código A-6272) hasta 6,7 mg/ml (0,1 mM) en acetato de sodio, 0,1 M, pH 5,9. Se añadió disolución de ditiotreitol (100 mM en el mismo tampón acetato) para dar una concentración final de ditiotreitol de 0,3 M, proporcionando así un exceso molar de 3 veces sobre la RSA. Se incubó la mezcla a 37ºC durante 40 min. Se sometió entonces la mezcla a cromatografía sobre Sephadex G25M usando una columna PD10 (Pharmacia, número de código 17-0851-01, usada según las instrucciones del fabricante), eliminando así el ditiotreitol e intercambiando el tampón por fosfato de sodio, 0,1 M, pH 6, etilendiaminatetraacetato (EDTA) 2 mM. La concentración de RSA en esa fase fue de 70 \muM.
Se disolvió 1,6-bismaleimidohexano (BMH, Pierce, número de código 22330) hasta 7,736 mg/ml (28 mM) en dimetilformamida. Se añadió la disolución de BMH a la disolución de RSA reducida para dar un exceso molar de 21 veces de BMH sobre RSA. Se incubó la mezcla a 21ºC durante 100 min., se sometió entonces a cromatografía sobre G25M en un tampón de fosfato de sodio, 0,1 M, pH 6, EDTA 2 mM. La concentración de RSA derivatizada fue de 46 \muM en esa fase.
Se mezclaron las disoluciones de RSA derivatizada y el Fab' anti-TNF (187 \muM) en fosfato de sodio, 0,1 M, pH 6, EDTA 2 mM para dar una proporción molar, RSA:Fab':1:1,3 (que, corregida para la derivatización de RSA y la reducción del tiol de Fab' dio una proporción, RSA derivatizada:Fab' reducido:1:1,4). Se incubó la mezcla a 21ºC durante 2 h, aunque la reacción se completó esencialmente en el plazo de 1 h. Se almacenó entonces la mezcla a 4ºC hasta que se sometió a los procedimientos de purificación.
Conjugación de Fab' con cisteína
El procedimiento para la preparación de la molécula control, Fab' anti-TNF unido covalentemente mediante BMH a través de tioles a cisteína (en lugar de RSA) fue esencialmente el mismo que para la preparación del conjugado (véase anteriormente). Se hizo reaccionar Fab' 20 \muM a 21ºC durante 95 min. con un exceso molar de 40 veces de BMH (añadido como una disolución en dimetilformamida). Tras la cromatografía sobre G25M (para eliminar BMH), se hizo reaccionar el Fab' derivatizado con cisteína (Sigma, número de código C-4820) a una proporción molar de Fab':tiol libre de cisteína:1:4,5. Tras la reacción a 21ºC durante 160 min., se almacenó la muestra a 4ºC antes de la purificación del producto de Fab'-Cys.
Purificación del conjugado
Se sometió la mezcla de reacción en primer lugar a cromatografía sobre Gammabind plus (Pharmacia), una matriz que tiene afinidad por Fab'. Se equilibró una columna de 5,3 ml en un tampón de fosfato de sodio, 0,1 M, pH 6, EDTA 2 mM a un caudal de 2 ml/min. Toda la cromatografía fue a una temperatura de 21ºC. Se aplicó la muestra a la columna a un caudal de 1 ml/min., y se lavó entonces la columna en el mismo tampón (fosfato de sodio, 0,1 M, pH 6, EDTA 2 mM) hasta que se restauró el nivel inicial. Se eluyó la proteína adsorbida mediante la aplicación de un tampón de ácido acético, 0,5 M, preparado a pH 3 mediante la adición de hidróxido de sodio. Se recogió el eluyente completo en fracciones y se analizó cada fracción mediante SDS PAGE (usando tanto condiciones reductoras como no reductoras). Tal como se esperaba de esta matriz de afinidad, el Fab' no conjugado eluyó en el tampón a pH 3, mientras que la RSA no conjugada no se unió nada a la matriz y salió en la fracción no retenida durante la carga de la muestra. La conjugación de un único Fab' a una molécula de RSA afectó claramente a su unión a la proteína G sobre la matriz, para el conjugado que salió en la fracción no retenida, justo ligeramente más tarde que (y solapándose con) la RSA no conjugada. Se sometió la fracción que contenía el conjugado una vez más a cromatografía sobre Gammabind plus (tal como anteriormente), con el fin de separar más RSA de la misma. Se concentraron las fracciones que contenían el conjugado (y algunas trazas de RSA) en una célula agitada (Amicon, membrana de punto de corte de peso molecular nominal de 10 kDa).
Se eliminó la RSA contaminante de la preparación mediante cromatografía de permeación en gel sobre una columna de HPLC GF250 de tamaño 2x23 cm (usando un aparato de HPLC Hewlett Packard 1090). Se equilibró la columna y se eluyó en un tampón de fosfato de sodio, 0,2 M, pH 7, a un caudal de 3 ml/min., a 21ºC. Se sometió a cromatografía la muestra de conjugado concentrado (y RSA) y se controló la elución a 280 y 220 nm. Se recogieron las fracciones correspondientes a los picos observados y se analizaron mediante SDS PAGE. Se combinaron las fracciones que contenían el conjugado (que se resolvió completamente a partir de la RSA que eluye más tarde) y se concentraron en una célula agitada (Amicon, membrana de punto de corte de peso molecular nominal de 10 kDa). Se almacenó la disolución a 4ºC, con azida de sodio añadida al 0,05% (p/v), para actuar como conservante.
Purificación del Fab'-Cys
Se diluyó la mezcla de reacción que contenía el producto de Fab'-Cys 5 veces en un tampón de acetato de sodio, 50 mM, pH 4,5, luego se cargó en una columna Mono S (de volumen de 1 ml), usando un aparato FPLC (Pharmacia). Se eluyeron entonces las proteínas adsorbidas en un gradiente de cloruro de sodio de 0 a 250 mM en acetato de sodio, 50 mM, pH 4,5. Se controló la elución (1 ml/min. a 21ºC) mediante la absorción a 280 nm. Se analizaron los picos recogidos mediante SDS PAGE.
Radiomarcaje de proteínas
Se marcaron las proteínas en los grupos \varepsilon-amino de residuos de lisilo, usando reactivo de Bolton y Hunter marcado con ^{125}I (Amersham International, número de código IM5861). Se disolvieron las proteínas o se diluyeron en un tampón de borato, para dar una concentración final de borato de 0,1 M, pH 8. Se mezcló entonces una disolución (de entre 300 \mul y 370 \mul) que contenía 300 \mug de proteína con 20 \mul de disolución de reactivo de Bolton y Hunter en propan-2-ol (que contenía 9 MBq de ^{125}I). Se incubó la mezcla a 21ºC durante 15 min., luego se extinguió la reacción mediante la adición de 60 \mul de disolución de glicina, 1 M, en borato, 0,1 M, pH 8,5. Tras aproximadamente 5 min. de reacción a 21ºC, se sometió la mezcla de reacción a cromatografía sobre Sephadex G25M usando una columna PD10 (Pharmacia, número de código 17-0851-01, usada según las instrucciones del fabricante). Al hacer esto, se intercambió el tampón por solución salina tamponada con fosfato. Se calculó la actividad específica de cada preparación a partir de los cálculos de la concentración de proteína (véanse los procedimientos analíticos) y de radiactividad, y estaban normalmente en el intervalo de 0,45 \muCi/\mug a 0,54 \muCi/\mug. Se usaron directamente las muestras radiomarcadas tras el marcaje.
Procedimientos analíticos
La electroforesis en gel de poliacrilamida con dodesilsulfato de sodio (SDS PAGE) utilizó geles de SDS prefabricados (Novex), de 1 mm de espesor y de una concentración de acrilamida del 4% al 20%, que se hicieron correr según las instrucciones del fabricante. Se tiñeron los geles empapándolos durante 1 h en Coomassie BBG en ácido perclórico (Sigma, número de código B-8772), seguido por lavado en agua. Se usaron diversos patrones de peso molecular con el fin de derivar pesos (aparentes) moleculares aproximados para las proteínas de la muestra. Estos patrones eran los marcadores Mark 12 y Seeblue, no teñidos y teñidos previamente, respectivamente (Novex). Para las inmunotransferencias de tipo Western, a la SDS PAGE le siguió la inmunotransferencia a una membrana de difluoruro de polivinilideno (Millipore), con detección del fragmento Fd de Fab' mediante la fracción de IgG de oveja anti-IgG(Fd) humana (The Binding Site, número de código PC075) seguido por fragmento F(ab')_{2}-affinipure-peroxidasa de IgG de conejo anti-oveja, fragmento Fc (Immunoresearch, número de código 313036046) y visualización mediante el uso de quimioluminiscencia (ECL; Amersham International). Para la autorradiografía, a la SDS PAGE le siguió la exposición del gel a película fotográfica (Hyperfilm MP; Amersham International). Para la obtención de imágenes de muestras radiomarcadas en geles (y posterior cuantificación), se expusieron los geles a selecciones de alta resolución o de uso general y se procesaron en el sistema Canberra Packard Cyclone, usando el programa Optiquant.
La cuantificación de las disoluciones de proteína fue mediante absorción a una longitud de onda de 280 nm en una célula de 1 cm, usando coeficientes de absorción (para una disolución de 1 mg/ml en una célula de 1 cm) de 1,43 para Fab' o F(ab')_{2} y de 0,58 para RSA. Se calculó un coeficiente de 1,0 para el conjugado RSA-Fab' a partir de los de RSA y Fab', pesado según las masas constituyentes de los dos componentes.
Se midió la concentración de tiol libre en una disolución de proteína añadiendo un volumen de 1/9 de 4,4'-ditiodipiridina (5 mM, por tanto la concentración final fue de 0,5 mM) en solución salina tamponada con fosfato. Tras 10 min. a 21ºC, se midió la absorbancia a 324 nm en una célula de 1 cm. Se restó la absorbancia de una muestra de blanco sólo con el tampón de este valor, y se multiplicó este número por 56,1167 para dar el resultado en \muM de tiol (corrigiéndose éste además para cualquier dilución de la muestra original).
Se realizó la secuenciación en el extremo N-terminal de la proteína según las instrucciones del fabricante en un secuenciador de proteínas modelo 470A con un instrumento de HPLC 120A y un sistema de análisis de datos 900A en línea (Applied Biosystems). Se adsorbió la proteína en disolución en una membrana de difluoruro de polivinilideno en un dispositivo Prosorb (Applied Biosystems). Se inmunotransfirieron las proteínas a partir de la SDS PAGE a una membrana de difluoruro de polivinilideno (Immobilon PSQ, Millipore), y se detectaron las bandas de proteína mediante tinción por Ponceau S al 0,1% (p/v) (Sigma, número de código P-3504) en ácido acético al 1% (v/v) durante 1 min., destiñendo después el fondo en agua. Se cortaron las bandas y se secuenciaron directamente.
Se realizó el estudio de resonancia de plasmón superficial de las interacciones con el ligando en un aparato BIACORE 2000 (Biacore AB), según las recomendaciones del fabricante. Se usó una superficie de chip detector revestido por anticuerpo de cabra anti-F(ab')_{2} humano (Jackson ImmunoResearch Lab. Inc.), que se une a la cadena ligera, para unir el conjugado, Fab' o IgG, cuya unión al ligando (TNF) de la disolución pudo medirse después.
Se realizaron los ELISA tal como sigue a continuación, con etapas intercaladas lavando en Tween 20 al 0,1% en solución salina tamponada con fosfato. Se revistieron los pocillos de la placa de microtitulación con el antígeno citocina. Se bloquearon entonces los sitios de unión no específica mediante incubación de los pocillos con una disolución al 5% (p/v) de leche desnatada secada ("Marvel", Premier Beverages, RU) en solución salina tamponada con fosfato, durante 1 h. Se diluyeron las muestras o patrones en albúmina sérica bovina, al 1% (p/v) en solución salina tamponada con fosfato y después se incubaron en los pocillos durante 1 h a 21ºC. La cuantificación fue mediante absorción a 630 nm, generada a partir de 3,2'5,5' tetrametilbencidina (120 \muM en acetato 10 mM, pH6) como resultado de la actividad de peroxidasa, siguiendo cualquiera de:
(i) Para la detección del conjugado albúmina-Fab', se incuba cada pocillo con anticuerpo de conejo anti-albúmina de rata (Cappel, número de producto 55711, diluido 1 en 4000 en albúmina sérica bovina al 1% en solución salina tamponada con fosfato), seguido por conjugado de cabra anti-inmunoglobulina Fc de conejo-peroxidasa (Jackson, número de producto 111-036-046, diluido 1 en 5000 en albúmina sérica bovina al 1% (p/v) en solución salina tamponada con fosfato).
(ii) Para la detección de Fab', se incuba en anticuerpo de cabra anti-cadena ligera kappa humana (Southern Biotechnology Associates, Inc., número de producto 2060-01, diluido 1 en 5000 en albúmina sérica bovina al 1% en solución salina tamponada con fosfato), seguido por conjugado de asno anti-inmunoglobulina (H+L) de cabra-peroxidasa (Jackson, número de producto 705-035-147, diluido 1 en 5000 en albúmina sérica bovina al 1% (p/v) en solución salina tamponada con fosfato).
El formato (i) de ensayo dio una respuesta lineal en el intervalo de 40-500 ng/ml de conjugado, y el formato (ii) de ensayo dio una respuesta lineal en el intervalo de 5-100 ng/ml de Fab'.
Para someter a ensayo la neutralización de la actividad de TNF, se hizo crecer una monocapa de células L929 de ratón en RPMI 1640 normal más glutamina y suero de ternero fetal al 10% (v/v). Se añadió TNF en presencia de actinomicina D (al 1%, p/v) con o sin muestra/anti-TNF. Se controló la muerte celular provocada por TNF mediante el ensayo de MTT: se añadió bromuro de 3-[4,5-dimetiltiazol-2-il]-2,5-difeniltetrazolio (MTT; Sigma, número de código M-2128) hasta una concentración final de 50 \mug/ml en el medio de las células tratadas y se incubó a 37ºC durante 4 h. Se paró la reacción y se solubilizó el color marrón producido por las células vivas mediante una disolución de SDS, al 20% (p/v) en dimetilformamida el 50% en agua, a pH 4,7 (mediante adición de ácido acético al 50%, 1 M, en ácido clorhídrico, 1 M) y después se cuantificó midiendo la absorbancia a 570 nm. Habiendo restado la absorbancia a 630 nm, pudo evaluarse el grado de supervivencia celular (y así la concentración de TNF activo presente) mediante la comparación con muestras de células tratadas mediante cantidades patrón de TNF en ausencia de actividad neutralizante de TNF.
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Incubación de proteína en plasma o sangre in vitro
Se prepararon de manera reciente plasma y sangre (heparinizados) de rata. A 100 \mul se añadieron 12 \mul de disolución de proteína marcada con ^{125}I. La incubación fue a 37ºC en un tubo de 0,5 ml tapado, retirándose muestras de 0,5 \mul y 2 \mul a intervalos para la SDS PAGE y la autorradiografía.
Se mezcló el conjugado no marcado o Fab'-Cys (2 \mul de disolución 0,9 mg/ml) con 100 \mul de plasma de rata recién preparado y se incubó a 37ºC en un tubo de 0,5 ml tapado. Se retiraron muestras de 2 \mul a intervalos para el análisis mediante inmunotransferencia de tipo Western.
Análisis farmacocinético del conjugado
Recibieron cada una de las ratas Wistar macho (de aproximadamente 250 g cada una) 20 \mug de proteína marcada con ^{125}I, o 180 \mug de proteína no marcada en disolución en solución salina tamponada con fosfato, que se inyectaron en una vena de la cola. Después de eso, se tomaron muestras de sangre de la arteria de la cola a intervalos, preparándose el plasma mediante heparinización y centrifugación. Se analizaron las muestras según se describió anteriormente (véanse los procedimientos analíticos) y se calculó la radiactividad en la sangre completa como cpm/g de sangre. Se calculó el porcentaje de dosis inyectada (% de DI) para cada rata individual, basándose en patrones y se expresó como % de DI/ml de volumen de sangre total. Se usaron grupos de 6 ó 2 ratas para el estudio de la proteína marcada con ^{125}I o no marcada, respectivamente.
Se analizaron los datos mediante el programa WinNonlin con el fin de determinar los valores farmacocinéticos citados. Se usó un modelo bicompartimental para este análisis a menos que se indique lo contrario.
Resultados Caracterización del conjugado
Se sabe que aunque la albúmina sérica tiene un residuo de cisteinilo que no está implicado en un puente disulfuro (residuo 34 en la secuencia de la albúmina humana madura), muchas de las moléculas en una preparación de albúmina no presentan un tiol de cisteinilo libre debido a la formación de disulfuros mixtos con moléculas tales como glutatión o cisteína libre [Peters, ibídem 1985]. Según esto, el análisis de la disolución de albúmina de rata antes de la reducción mostró que había 0,15 moles de tiol por mol de albúmina, es decir, sólo un 15% de las moléculas de albúmina presentaban un tiol libre. Tras la reducción, esto aumentó hasta 0,95 moles de tiol por mol de albúmina, consecuente con la presencia de un grupo tiol libre en el 95% de las moléculas de albúmina, lo más probablemente en la posición 34 en la secuencia de albúmina madura, ya que la reducción en condiciones tales como las usadas en el presente documento no perturban ninguno de los disulfuros presentes en cualquier lugar en la molécula [Peters, ibídem 1985]. La posterior reacción en este residuo de cisteinilo permitió la unión de otra molécula en un sitio específico, y en una proporción molar de 1:1, sin producción concomitante de otros productos de proporción superior de albúmina:otra molécula que sería necesario eliminar posteriormente. Las coordenadas para la estructura cristalina de la albúmina sérica humana se han depositado en la base de datos Brookhaven (como entrada 1AO6, por S. Sugio, S. Mochizuki y A. Kashima). La inspección de este modelo muestra que el residuo de cisteinilo libre en la posición 34 se encuentra en una hendidura entre dos hélices, pero no está claro a partir de esto qué longitud debe tener un brazo espaciador en un agente de reticulación con el fin de funcionar eficazmente. La ausencia de homodímero de albúmina sería ventajosa en un procedimiento de producción ya que el rendimiento de heterodímero sería entonces mayor, y tampoco habría necesidad de una etapa adicional para eliminar el homodímero. Se encontró que el agente de reticulación usado en el presente ejemplo produjo este resultado ventajoso. La reacción de la albúmina reducida con un exceso molar de 20 veces de BMH provocó una derivatización del 80% de estas moléculas de albúmina. No se formaron homodímeros de albúmina durante la derivatización de la albúmina (o reacción posterior con otras moléculas proteicas). El brazo espaciador del agente de reticulación, de 16,1 \ring{A} de longitud, era lo suficientemente largo para alcanzar desde el tiol de cisteinilo en la posición 34 hasta la superficie de la molécula de albúmina, en la que pudo reaccionar con el tiol libre en una molécula de Fab'. No era lo suficientemente largo para penetrar en la hendidura equivalente en una segunda albúmina para alcanzar el tiol libre allí, y así se evitó la producción de homodímeros.
Se mezclaron la albúmina derivatizada y Fab' en la proporción molar de 1:1,4:albúmina:Fab'. El análisis mediante SDS PAGE de los productos al final de la reacción indicó un rendimiento de conjugado de albúmina-Fab' del orden del 20% al 30%, aunque se esperaría que esto mejorase mediante la optimización de las condiciones de reacción. Se purificó el conjugado de la mezcla de reacción mediante cromatografía de afinidad, no uniéndose el conjugado sorprendentemente a la matriz tal como lo hizo Fab', pero eluyéndose ligeramente más tarde que la albúmina, que no se unió en absoluto. Habiéndose eliminado el Fab' no reaccionado, se separó la albúmina del conjugado mediante exclusión molecular. Se analizó la preparación final de conjugado mediante SDS PAGE (figura 1), que indicó (mediante los pesos moleculares aparentes) el enlace de un Fab' por molécula de albúmina. En la SDS PAGE no reducida la banda principal fue un conjugado de 1 RSA con 1 molécula de Fab', según se determinó mediante la secuenciación N-terminal de la proteína de la banda. Aproximadamente un 37% del conjugado estaba presente como una banda de peso molecular superior que tenía también una proporción de RSA:Fab' de 1:1. Se asumió que éste era un material de dímero, análogo a la aparición observada de polímeros de albúmina en preparaciones no tratadas de albúmina. También estaban presentes cantidades menores (aproximadamente el 2% del material total) de conjugado que carecía de la cadena L, y un derivado pequeño supuesto del conjugado (aproximadamente el 4% del total). El análisis de la secuencia N-terminal de la proteína de la banda principal en SDS PAGE en condiciones reductoras mostró que era FSA-Fd (es decir, la cadena H de Fab'), de modo que el enlace era específicamente a través de Fd de Fab' y no a través de la cadena L. Por tanto, se confirmó la estequiometría 1:1 de la conjugación.
La conjugación de Fab' con cisteína (para producir la molécula control, Fab'-Cys) dio un buen rendimiento (prácticamente todo el derivado de Fab' reaccionó con la cisteína con sólo trazas de material de tipo F(ab')_{2} mayor de aproximadamente 55 kDa (aparente) en la SDS PAGE en condiciones no reductoras. Esta traza de material eluyó junto después del producto Fab'-Cys, que eluyó en una concentración de cloruro de sodio de aproximadamente 75 mM en la cromatografía Mono S, y se excluyó de la misma.
La capacidad de someter a ensayo el conjugado en un ELISA que dependía de la unión del conjugado a TNF indicó que el conjugado conservaba la capacidad de unirse a TNF. Esto se confirmó mediante el análisis de la unión del conjugado a TNF mediante resonancia de plasmón superficial usando el aparato BIACORE 200 (tasas de asociación y disociación, y constante de equilibrio, véase la tabla 1). Esto mostró que el Fab' anti-TNF no estaba afectado por la conjugación a la albúmina. Se confirmó también esto mediante su igual capacidad para la neutralización de TNF: en un ensayo de muerte de células L929 provocada por TNF, la concentración de proteína para inhibir el 90% de la actividad de TNF (la CI90) para el conjugado albúmina-Fab' anti-TNF fue de 14,7 pM, en comparación con 18,0 pM para el conjugado de Fab' anti-TNF-cisteína, 10,9 pM para F(ab')_{2} anti-TNF y 11,3 pM para IgG4 anti-TNF. El mantenimiento de la actividad de unión de Fab' se atribuyó a la orientación deseada del dominio de unión de Fab' lejos del punto de conjugación con la molécula de albúmina, lograda seleccionando como diana la región de bisagra de Fab' como el punto de unión al otro resto.
El control, Fab'-Cys, conservó también su capacidad de unirse a, y de neutralizar, TNF, según se observa mediante su detección por ELISA y su actividad en el ensayo de L929.
Análisis farmacocinético del conjugado en plasma de rata
Se controló la RSA marcada con ^{125}I, Fab', F(ab')_{2} y el conjugado RSA-Fab' en plasma tomado como muestra a diversos tiempos a lo largo de 144 h (figura 2). La semivida en la fase \beta observada de la albúmina estaba de acuerdo con el valor de la bibliografía de aproximadamente 2 días [Peters, ibídem 1985]. La semivida en la fase \beta del F(ab')_{2} y el Fab', era similar a la de F(ab')_{2} descrita anteriormente [por ejemplo, Kitamura et al, ibídem; Chapman et al, ibídem], y estaba precedida por una eliminación rápida en la fase \alpha, típica de tales moléculas. Sin embargo, cuando Fab' estaba conjugado a RSA, persistió en la circulación de la rata hasta un grado comparable a la albúmina de rata. Debido a una reducción de la eliminación durante tanto la fase \alpha como \beta, el conjugado mostró un área bajo la curva de concentración plasmática (AUC, 0-\infty) 35 veces mayor que el control Fab'-Cys, similar a la de la albúmina sola. Con el fin garantizar que la radiactividad detectada en las muestras de plasma reflejaba el conjugado restante, se corrieron las muestras de una rata a la que se había administrado conjugado marcado en SDS PAGE y se exploraron mediante un sistema de detección y cuantificación de la radiactividad (Phosphorimager) (datos no mostrados). Esto mostró la persistencia in vivo del conjugado marcado intacto durante al menos 120 h, y se calculó que la semivida en la fase \beta del conjugado intacto era de 32,70 h, en buena concordancia con el resultado equivalente de la detección mediante ^{125}I total.
Se inspeccionó la estabilidad del conjugado en el plasma. La incubación del conjugado no marcado en plasma de rata (in vitro) a 37ºC durante 68 h en presencia o ausencia de una variedad de inhibidores de proteasas, controlada mediante SDS PAGE e inmunotransferencia de tipo Western, indicó que el conjugado era estable en el plasma de rata. El conjugado que se había marcado con ^{125}I se incubó in vitro en solución salina tamponada con fosfato (pH 7) durante hasta 10 días y también se encontró que era estable.
Sin embargo, la incubación del conjugado marcado con ^{125}I a 37ºC en el plasma o sangre de rata in vitro indicó que la molécula no era completamente estable, experimentando algunas moléculas escisión en o cerca del punto de enlace entre la albúmina y la molécula de Fab'. Dado que el conjugado no marcado era estable, se atribuyó la inestabilidad observada a la modificación de la proteína mediante la presencia de ^{125}I o mediante el procedimiento de marcaje. A pesar de una aparente inestabilidad en estas condiciones, se mantuvo el material intacto incluso tras 168 h de incubación in vitro. Se evaluó la integridad del conjugado in vivo mediante SDS PAGE de muestras de plasma, seguido por cuantificación del conjugado intacto mediante exploración por sistema de detección y cuantificación de la radiactividad, y como en los experimentos in vitro, se observó una pequeña inestabilidad del conjugado marcado con ^{125}I. Los resultados observados a partir de los experimentos in vivo pudieron ajustarse en consecuencia para reflejar solamente la cantidad de conjugado intacto, marcado. Los datos ajustados dieron el resultado mostrado en la figura 2 (véase el conjugado (corrección)), que fue tal que incluso la versión marcada ligeramente inestable del conjugado tenía un AUC que era 17 veces mayor que la del control Fab'-Cys.
La conclusión de que los datos derivados del uso del conjugado marcado con ^{125}I representan una subestimación de la longevidad del conjugado no marcado in vivo estaba apoyada por un experimento en el que el conjugado no estaba marcado. Se controló la proteína no marcada mediante dos formas de ELISA y mediante la actividad biológica (neutralización de TNF en el ensayo L929). Los resultados del uso de los tres ensayos en muestras de dos ratas fueron similares entre sí (figura 3), mostrando que RSA-Fab' era estable in vivo durante periodos prolongados. Sin embargo, Fab'-Cys se eliminó rápidamente, de modo que se obtuvieron pocos datos mediante ELISA como para permitir el uso de un modelo bicompartimental, y el AUC estimado facilitado en la figura 3 es mediante el uso de un modelo monocompartimental. Se obtuvieron muy pocos datos mediante el uso del ensayo de actividad como para permitir cualquier modelado en absoluto. El AUC del conjugado RSA-Fab' fue aproximadamente 200 veces mayor que el del control Fab'-Cys.
Se ha mostrado que es posible preparar un fragmento Fab' de anticuerpo IgG, reticularlo químicamente con albúmina in vitro conservando la capacidad de unión total (teniendo la misma afinidad observada en el anticuerpo completo), y se demuestra que tiene una semivida significativamente más larga in vivo que la del Fab' no conjugado. El conjugado contenía un Fab' por molécula de albúmina. La semivida en la fase \beta del conjugado en la rata era aproximadamente dos veces la del Fab no conjugado, estando próxima a la de la albúmina no conjugada, y el área bajo la curva era aproximadamente 200 veces mayor para el conjugado que para el Fab' no conjugado. Por tanto, la consecuencia de la conjugación de Fab' con albúmina fue una prolongación significativa de su actividad biológica in vivo, permitiendo (en el presente caso) un tratamiento anti-citocina prolongado.
Ejemplo 2 Fusión genética de scFv a albúmina. (Este ejemplo se incluye para información solamente) Procedimiento Construcción de plásmidos que codifican para las proteínas de fusión scFv-albúmina sérica humana
El plásmido pPIC(scFv) contenía el gen para un scFv anti-TNF, que comprendía los dominios variables en el orden V_{L}-V_{H}. Este plásmido se escindió con enzimas de restricción KpnI y NotI para generar un fragmento de ADN "vector" que se purificó tras la electroforesis en agarosa. Dentro de éste se ligó un fragmento PvuII - NotI de ADN que contenía el gen de HSA madura, junto con un conector de 200 pb que codificaba una fusión en marco directa entre el extremo C-terminal de scFv y el extremo N-terminal de HSA. Este procedimiento se resume en la figura 4. El conector o fragmento de unión introdujo también un sitio de restricción ClaI único para facilitar la construcción de otra serie de genes que codifican proteínas de fusión que contienen espaciadores diferentes para separar físicamente los motivos scFv y HSA. Se usaron casetes oligonucleotídicos hibridados para introducir los siguientes espaciadores entre los sitios KpnI y ClaI:
1. Una secuencia que codifica 3 repeticiones de la secuencia Gly_{4}Ser.
2. Una secuencia derivada del extremo N-terminal flexible de la región bisagra de IgG1 humana.
Además, se generó un gen que codifica otra proteína de fusión en la que se usó el dominio C de la cadena ligera kappa de Ig humana como un espaciador para separar el scFv (esta vez en la orientación V_{H}-V_{L}) de la HSA. La nomenclatura del constructo fue: scFv-HSA; scFv-G4S-HSA; scFv-UHL-HSA; scFv-C_{K}-HSA, respectivamente.
Expresión de proteínas de fusión en levaduras
Se linealizaron estos plásmidos y se transfectaron en células de Pichia pastoris competentes. Esto se realizó usando un kit de expresión en Pichia "EasySelect" (Invitrogen) siguiendo las instrucciones del fabricante. Se seleccionaron transformantes mediante resistencia a zeomicina (500 g/ml) incorporada en el agar YPDS usado para hacerlos crecer. Se confirmaron los transformantes como Mut^{++}, es decir, que podían utilizar metanol como única fuente de carbono, aunque sensibles a la presencia de metanol en exceso. Se recogieron dos colonias de cada uno de los 4 tipos de transformante y se hicieron crecer en cultivo de matraz de agitación en medio BMGY, según las instrucciones del kit de expresión en Pichia "EasySelect". Cada cultivo era de 25 ml en un matraz de 25 ml, se incubó a 30ºC, agitando a 225 rpm. Tras 16-18 h, cuando los cultivos habían crecido hasta dar una densidad óptica a 600 nm (DO600) de entre 2 y 6, se recogieron las células mediante centrifugación y se resuspendieron en 30 ml-40 ml de medio BMMY (que contiene metanol como fuente de carbono), hasta dar una DO600 de 1. Se continuó entonces la incubación con agitación y adición ocasional de metanol con el fin de mantener una concentración de metanol de aproximadamente el 0,5% (v/v). Tras 84 h de incubación, se centrifugaron los cultivos y se conservaron los sobrenadantes para su uso en la preparación de proteínas de fusión expresadas y secretadas.
Purificación de proteínas de fusión
Se purificaron las proteínas expresadas del medio de cultivo de levaduras tras la clarificación mediante centrifugación. Se sometió el medio a cromatografía en una matriz de Blue sepharose (Pharmacia), que actuó como una matriz de afinidad para las proteínas que contenían albúmina, tal como sigue a continuación. Se mezcló cada sobrenadante clarificado con un volumen de solución salina tamponada con fosfato, pH 7, y se aumentó el pH de la mezcla desde aproximadamente 6,5 hasta aproximadamente 7 mediante la adición de un pequeño volumen de disolución de hidróxido de sodio (2 M). Se aplicó entonces la muestra a una columna de 1,5 ml de Blue sepharose, equilibrada previamente en solución salina tamponada con fosfato, pH 7. El caudal en todas las fases fue de 0,5 ml/min, y la temperatura fue de 21ºC. Tras la aplicación, se lavó la columna con solución salina tamponada con fosfato hasta que se logró un nivel inicial estable, y entonces se eluyó la proteína unida mediante el eluyente tiocianato de sodio, 0,2 M en solución salina tamponada con fosfato. Se controló la elución mediante absorción a una longitud de onda de 280 nm. Se recogió la proteína eluida, se concentró y se intercambió su tampón por solución salina tamponada con fosfato mediante el uso de un concentrador de célula agitada (Amicon, usando una membrana de filtro con un punto de corte de peso molecular nominal de 10 kDa). Se cuantificó la proteína mediante absorbancia a una longitud de onda de 280 nm y el uso de un coeficiente de absorción teórico que se calculó para cada proteína de fusión mediante el uso del programa ProtParam (encontrado en el sitio de Internet ExPasy).
Radiomarcaje de proteínas
Se marcaron proteínas de fusión sin conector, con conector de G4S o con conector de bisagra superior, y albúmina sérica humana no modificada con ^{125}I, según se describió en el ejemplo 1, anterior.
Procedimientos analíticos
Se caracterizaron las proteínas y se analizó su farmacocinética en ratas según se describió en el ejemplo 1.
Resultados Caracterización de las proteínas de fusión
Se expresaron las cuatro proteínas de fusión scFv-albúmina sérica humana (HSA) en Pichia pastoris, que se secretaron en el medio a las siguientes tasas, según se determinó mediante absorbancia a 280 nm de disoluciones de proteína preparadas mediante cromatografía (media de 2 experimentos): scFv-HSA (sin conector), 9,0 \mug/ml; scFv-G4S-HSA, 8,5 \mug/ml; scFv-UHL-HSA, 7,5 \mug/ml; scFv-C_{K} conector, 7,8 \mug/ml. Las bandas correspondientes a las proteínas expresadas pudieron observarse tras la SDS PAGE del medio de cultivo de levaduras no fraccionado (por ejemplo, figura 5). No se emprendió desarrollo con el objetivo de mejorar los niveles de expresión. Estos datos sugirieron que el orden de los dominios variables en la porción de scFv no afectó de manera significativa a los niveles de expresión de la proteína de fusión.
La SDS PAGE en condiciones reductoras (figura 5) de proteínas de fusión preparadas tras sólo cromatografía en Blue sepharose mostró que cada una contenía una banda principal y una minoritaria, en la que las especies principales representaban el 91% de toda la proteína en la preparación de scFv-HSA, el 75% en la preparación de scFv-G4S-HSA, el 80% en scFv-UHL-HSA, y el 83% en la preparación de scFv-CK-HSA, según se estimó mediante exploración de geles teñidos con azul brillante G. La banda principal en cada preparación tenía un peso molecular aparente igual al peso molecular teórico calculado a partir de la secuencia de ADN traducida. La banda minoritaria en cada una migró con la albúmina sérica humana patrón en el mismo gel, indicando acontecimiento(s) de escisión minoritario(s) en la secuencia entre la albúmina y scFv o scFv-bisagra/secuencia espaciadora. La secuenciación del extremo N-terminal de este producto minoritario en la preparación de scFv-G4S-HSA mostró que de hecho tiene el extremo N-terminal de HSA madura. El análisis de la secuencia del extremo N-terminal de las proteínas de fusión mostró que tienen el extremo N-terminal de scFv esperado, precedido en cada caso por la secuencia de EAEA, que se había incluido en la proteína de fusión con el fin de aliviar posible(s) problema(s) de impedimento estérico que volviese(n) ineficaz la escisión de la pro-secuencia (según lo tratado por Sreekrishna, K. et al (1997) Gene, 190, 55-62). Sin embargo, esta secuencia espaciadora EAEA no se eliminó posteriormente mediante la actividad diaminopeptidasa de levaduras. No obstante, esta extensión de EAEA del extremo N-terminal no inhibió de manera obvia la expresión y secreción de las proteínas heterólogas. Es probable que la secuencia de EAEA pudiese delecionarse de la proteína de fusión con el fin de generar una proteína de extremo N-terminal de scFv (u otro) auténtico.
Se mostró que la cromatografía en Blue sepharose era eficaz en la purificación de proteínas que contienen albúmina en una única etapa. Estas proteínas incluían productos minoritarios de proteolisis en los presentes casos, pero no se emprendió la optimización en el presente documento. Por tanto, podría esperarse que se redujese la proteolisis mediante tales medios de optimización de las condiciones de cultivo, inclusión de inhibidores de proteasas y/o expresión en cepas de levaduras deficientes en proteasas (por ejemplo, según lo descrito por Gleeson, M. A. G. et al en "Pichia Protocols" [eds. Higgins, D. R. y Cregg, J. M.), pub. Humana Press, Totowa, New Jersey (1998), págs. 81-94]. En cuanto a los procesos industriales, el coste de Blue sepharose en muy bajo, desde luego considerablemente inferior que cualquier otra matriz de afinidad disponible comercialmente. Por tanto, el uso de albúmina como parte de una proteína de fusión es doblemente beneficioso, dado que no sólo puede añadir a la proteína propiedades tales como larga semivida en suero (véase el ejemplo 1 o a continuación), si no que también permite una purificación rápida, de bajo coste. La capacidad de las proteínas de fusión de unirse al ligando se confirmó mediante análisis de Biacore. Esto mostró que las tasas de asociación y disociación y K_{D} de los 4 tipos de proteína de fusión eran similares entre sí y a otras formas del anticuerpo anti-TNF, incluyendo IgG completa (tabla 1).
Análisis farmacocinético de las proteínas de fusión en plasma de rata
Se marcaron las proteínas de fusión scFv-HSA, scFv-G4S-HSA y scFv-UHL-HSA con ^{125}I, al igual que la HSA sola. El componente minoritario de la albúmina que estaba presente en cada una de las preparaciones de proteína de fusión se marcó también.
Los análisis de la distribución del marcador en los componentes de proteína de fusión y albúmina de las preparaciones mediante los dos procedimientos de autorradiografía y mediante sistema de detección y cuantificación de la radiactividad dieron resultados similares. La media de los dos procedimientos fue: para scFv-HSA, un 76% del marcador estaba en la proteína de fusión; para scFv-G4S-HSA, un 80% del marcador estaba en la proteína de fusión; para scFv-UHL-HSA, un 40% del marcador estaba en la proteína de fusión. El componente de albúmina de cada preparación captó el marcador restante.
Se inyectaron estas proteínas en ratas (n=6). Se tomaron muestras de plasma a intervalos para su análisis mediante recuento de rayos gamma y mediante SDS PAGE seguido por el sistema de detección y cuantificación de la radiactividad. La distribución del marcador en las diferentes muestras se determinó durante las primeras 48 h mediante el sistema de detección y cuantificación de la radiactividad de muestras de una rata por grupo (número de réplicas, n=2 ó 4). En cada caso, se encontró que no había un cambio claro en la distribución del marcador durante el periodo de 48 h (datos no mostrados). Por tanto, las proteínas de fusión no eran propensas a degradación significativa in vivo. Se asumió que esta estabilidad se mantuvo durante la duración total del experimento, que fue de 144 h, y el análisis farmacocinético de las proteínas se basó en los resultados del recuento de rayos gamma. La farmacocinética era similar para todas las proteínas (véase la figura 6), mostrando de ese modo que las proteínas de fusión se comportaban de manera similar a la albúmina humana no modificada en el plasma in vivo. Obsérvese que en ratas la HSA es sólo la mitad (o menos) de persistente que la albúmina homóloga, de rata, y no se esperaría necesariamente que una fusión de scFv con HSA estuviese dotada de una semivida más larga que la propia HSA. No obstante, las AUC para las proteínas de fusión marcadas con ^{125}I son aproximadamente 13 veces mayores que las de el control Fab'-Cys marcado con ^{125}I (mostrado en la figura 2).
Este ejemplo muestra que la albúmina sérica puede fusionarse a otra(s) proteína(s) para generar una fusión que presenta función(es) de otra(s) proteína(s) junto con la semivida larga de la albúmina. Además, dado que la fusión no implicaba tioles de cisteinilo de la albúmina, se mantiene la posibilidad de usar una proteína de fusión como un aceptor de una o más moléculas de Fab', unidas por medios químicos, según se ejemplifica mediante los ejemplos 1 y 3. De estas formas, podrían generarse moléculas poliespecíficas así como polivalentes.
Ejemplo 3 Conjugado dímero de Fab'-albúmina Procedimientos Preparación del dímero de Fab' marcador anti-superficie celular
Se diseñó mediante ingeniería genética el marcador anti-superficie celular como un Fab'. Se expresó en E. coli y se extrajo del periplasma, según se describe en la memoria descriptiva de la patente internacional número WO98/25971.
El puente disulfuro intercatenario de Fab' se redujo tal como sigue: se mezclaron 12 ml de Fab' a 20,93 mg/ml en fosfato de sodio 0,1 M, pH 6,0, EDTA 2 mM con 240 \muL de 2-mercaptoetilamina 250 mM en el mismo tampón, y se incubaron durante 50 min a 38ºC. La diafiltración de la muestra frente al mismo tampón eliminó el agente reductor. El rendimiento de Fab' en esta fase fue del 85,1%. El ensayo de tiol mostró que había un promedio de 0,83 tioles libres por molécula de Fab', y el análisis mediante cromatografía de exclusión molecular GF250 indicó que la proteína comprendía un 93,1% de monómeros de Fab' y un 6,9% de F(ab')_{2} unidos por puentes disulfuro.
El agente de reticulación fue un compuesto de trimaleimida, ilustrado en la figura 7. Esta molécula contenía también una función quelante de metales. Se preparó una disolución de 1 mg/ml de este compuesto en fosfato de sodio 0,1 M, pH 6,0, EDTA 2 mM, y se añadieron 5 alícuotas de 434,8 \mul cada una con mezclado a intervalos de 5 min a la preparación de Fab' reducida anterior. Esto proporcionó una proporción molar de reticulante:Fab':1:2,56. Se incubó la mezcla a 21ºC durante 3 h, momento en el que se añadieron 25 \mul de ácido acético glacial para disminuir el pH hasta 4,5. Se añadieron 47 ml de agua para disminuir la conductividad y se resolvió la mezcla mediante cromatografía de intercambio iónico. Se aplicaron las proteínas a una columna de d.i. de 2,6 cm x 15,5 cm (Pharmacia) que contenía intercambiador catiónico de sulfonato de metilo (SP-Sepharose HP) a un caudal de 10,5 ml/min, y se eluyó mediante un gradiente de cloruro de sodio de 0 a 250 mM en acetato 50 mM, pH 4,5. Se controló la elución mediante absorbancia a 280 nm. Se identificaron los diversos productos de reacción (monómero, dímero y trímero) mediante SDS PAGE y mediante cromatografía de exclusión molecular GF250. Sólo se usó la fracción que contenía el dímero de Fab' para la conjugación posterior con la albúmina.
Enlace del dímero de Fab' con albúmina sérica de rata
Se disolvieron 33,71 mg de RSA en 2,5 ml de fosfato de sodio 0,1 M, pH 6,0, EDTA 2 mM y se mezclaron con 25 \mul de 2-mercaptoetilamina 200 mM en el mismo tampón, dando una concentración final de agente reductor de 2 mM. Se incubó la mezcla a 37ºC durante 1 h. Se eliminó entonces el agente reductor mediante cromatografía de exclusión molecular sobre Sephadex G25M, usando una columna PD10 (Pharmacia, número de código 17-0851-01, usada según las instrucciones del fabricante). El tampón fue entonces fosfato de sodio, 0,1 M, pH 6, 2 mM (EDTA). La concentración de albúmina fue de 143 \muM.
Se incubó la albúmina reducida con dímero de Fab' conjugado en una proporción molar de 1:1, y se incubó a 21ºC durante 24 h. Se resolvió la mezcla de reacción mediante cromatografía sobre Gammabind plus, según se describió en el ejemplo 1 (anterior), usando una columna de 3 ml de volumen. La albúmina no reaccionada no se unió a esta matriz. Se eluyó el material unido mediante un tampón de ácido acético 0,5 M, pH 3. Se neutralizaron inmediatamente las fracciones eluidas mediante la adición de Trizma, 2 M, pH 8,8. Se purificó además este material mediante cromatografía en Blue sepharose, según se describió en el ejemplo 2. El dímero de Fab' no reaccionado no se unió a la matriz, y se eluyó el material unido mediante tiocianato de sodio, 0,2 M en solución salina tamponada con fosfato. Se concentraron las fracciones eluidas y se intercambió el tampón por solución salina tamponada con fosfato en una célula agitada (Amicon) con un filtro de punto de corte de peso molecular nominal de 10 kDa. Se repitió cada tipo de cromatografía con el fin de purificar completamente el conjugado albúmina-dímero de Fab'.
Procedimientos analíticos
Los procedimientos fueron según se describieron en los ejemplos 1 y 2, excepto que para la determinación de la secuencia N-terminal de la proteína, el secuenciador automatizado usado fue un Procise 492 de PE Biosystems. Adicionalmente, se determinaron las características de unión a ligando del conjugado mediante análisis de Scatchard de su unión a células completas, tal como sigue a continuación.
Se marcaron el conjugado y una proteína control (un dímero de Fab' reticulado a través de tioles mediante bis-maleimidohexano) mediante unión de fluoresceína. Se realizó esto mediante incubación de un mg de proteína en 1 ml de NaHCO_{3} 0,1 M con 100 \mug de isotiocianato de fluoresceína (Sigma F7250) añadidos como una disolución de 10 \mul en dimetilsulfóxido. La reacción se llevó a cabo durante 2 h a 21ºC. Se paró la reacción mediante la adición de un exceso molar de lisina. Se separó la proteína marcada de la fluoresceína libre mediante cromatografía de exclusión molecular. Se recogió el anticuerpo marcado con fluoresceína en solución salina tamponada con fosfato y se cuantificó el componente proteico mediante absorción a 280 nm, mientras que se estimó el grado de sustitución a partir de la absorción a 495 nm. El coeficiente de extinción \muM usado para DFM fue de 0,14, para RSA-(Fab')_{2} fue de 0,2 y para la fluoresceína fue de 0,077. La proteína control marcada con fluoresceína tenía una proporción molar de fluoresceína:proteína de 1,59, y el RSA-(Fab')_{2} marcado con fluoresceína tenía 3,08 moléculas de fluoresceína por molécula proteica.
Entonces, se diluyeron en serie los conjugados de proteína fluorescentes (1:1,4) a partir de una concentración superior de 2 \mug/ml en solución salina tamponada con fosfato que contenía suero de ternero fetal al 5% (v/v). El volumen final por tubo fue de 250 \mul. Se añadieron cuarenta mil células diana en 100 \mul por tubo para dar un volumen final de 350 \mul y una concentración final de anticuerpo más alta de 1,43 \mug/ml. Se incubaron las células con anticuerpo a 4ºC durante 3 h. Se realizó entonces a las células el análisis de separación celular activada por fluorescencia (FACS). Se convirtió la señal de fluorescencia en moléculas de fluoresceína soluble equivalente a partir de una curva patrón de perlas fluorescentes según el procedimiento de Krause et al., (1990) Determination of Affinities of Murine and Chimeric Anti-\alpha/\beta-T Cell Receptor Antibodies by Flow Cytometry. Behring Inst. Mitt. 87,56-67). El número de moléculas de fluoresceína unidas por célula se convirtió en el número de moléculas de anticuerpo unidas por células mediante la proporción de fluoresceína:proteína. La resta del número total de moléculas de anticuerpo por tubo dio el número de moléculas libres por tubo. Se realizó el análisis de Scatchard a estos datos.
Resultados
En las condiciones no optimizadas usadas, los rendimientos de productos a partir de la reacción de reticulación química fueron: trímero de Fab', 30,6%; dímero de Fab', 30,7%; monómero de Fab', 38,7%.
Se usó este dímero en reacciones posteriores con la albúmina. Al producirse mediante reticulación con un agente trifuncional, el dímero presentaba un grupo funcional restante en el resto de enlace. Éste era una maleimida que podía reaccionar con un tiol libre. Se generó un tiol libre en albúmina de rata mediante reducción, mediante un procedimiento que era diferente al usado en el ejemplo 1. El ensayo de tioles en la preparación de albúmina reducida de esta forma mostró que había entonces un promedio de 0,97 tioles libres por molécula. Por tanto, puede generarse un único tiol en la albúmina mediante más de un procedimiento.
La incubación del dímero de Fab' preparado con la RSA reducida dio un rendimiento de 1 mg de conjugado albúmina-dímero de Fab', según se estimó mediante absorbancia a 280 nm, usando un coeficiente de absorción teórico calculado mediante el programa ProtParam (ExPasy), tras la purificación completa.
La SDS PAGE (reducida) del producto mostró la presencia de dos bandas, de peso molecular aparente de aproximadamente 150 kDa y aproximadamente 31 kDa (figura 8). La secuenciación N-terminal mostró que éstas eran el dímero albúmina-cadena pesada de Fab' y la cadena ligera de Fab', respectivamente. La SDS PAGE en condiciones no reductoras mostró una banda principal de peso molecular aparente de aproximadamente 200 kDa. La secuenciación N-terminal de la proteína mostró que esta banda era el dímero albúmina-Fab' (es decir, cadenas pesadas más ligeras). Se confirmó que el producto de la combinación de RSA y el dímero de Fab' consistía en una molécula de albúmina y dos moléculas de Fab' mediante la secuenciación N-terminal también del producto final no fraccionado. Esto mostró también que no se había disociado la cadena ligera de Fab' durante la producción y que el enlace covalente entre Fab' y la albúmina era solamente mediante la cadena pesada de Fab'.
El conjugado conservó la actividad de unión a ligando, según se mostró mediante el análisis de FACS de su unión a células que portan ligando en su superficie. El análisis de Scatchard de la unión dio una curva de 2 fases, con una K_{D} de 8 nM para la unión de uno de los dos Fab', y de 3 nM para la unión de ambos Fab' en el constructo (figura 9). Esto valores fueron similares a los de un control (Fab' dimerizado mediante reticulación por bis-maleimidohexano, es decir, que carece del resto de albúmina), siendo de 12 nM y de 3 nM, respectivamente. Como en los otros dos ejemplos, el mantenimiento de la actividad de unión total de Fab' a pesar de la unión de un resto de gran peso molecular se debía probablemente a la selección como diana de la bisagra de Fab' como el punto de unión, estando en el extremo opuesto de la molécula respecto a la función de unión a antígeno. En el presente ejemplo, la albúmina no interfirió con ningún Fab' al que estaba unida.
Por tanto, este procedimiento produce un producto muy específico, bivalente. A diferencia del ejemplo 1, esto fue mediante modificación del resto de inmunoglobulina, en lugar de la albúmina, antes de la fase final de conjugación. De nuevo a diferencia de los otros ejemplos, se usó una inmunoglobulina diferente, lo que ejemplifica la utilidad general del enfoque. Usando tales enfoques, el enlace de la albúmina a otras inmunoglobulinas poliespecíficas generaría claramente moléculas poliespecíficas con una semivida prolongada in vivo.
Los presentes resultados también ejemplifican la inclusión de una función extra en el conjugado. El presente ejemplo es la inclusión de una función quelante de metales, tal como podría ser útil para ensayos, diagnóstico y tratamiento. La función quelante en este ejemplo está en el resto de enlace, y es un macrociclo que se había encontrado anteriormente que se unía fuertemente a metales, en particular indio, pero posiblemente como alternativa cobre, gadolinio, hierro III, cobalto III, cromo III, níquel o aluminio.
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Tabla 1
Análisis mediante resonancia de plasmón superficial de la unión del ligando al conjugado, fusiones y otras inmunoglobulinas
Todas las inmunoglobulinas y derivados derivaban del mismo anticuerpo anti-TNF, y se usó TNF como ligando. Véase la figura 10 para el análisis de la unión de RSA-F(ab')_{2}.
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TABLA 1 Análisis mediante resonancia de plasmón superficial de la unión del ligando al conjugado, fusiones y otras inmunoglobulinas
1

Claims (6)

1. Una proteína híbrida que comprende un fragmento de anticuerpo de unión a antígeno unido covalentemente a una molécula de albúmina o un fragmento de la misma, en la que el fragmento de anticuerpo y la albúmina están unidos indirectamente mediante una molécula puente entre los grupos tiol de un residuo de cisteína presente en el anticuerpo y otro presente en la albúmina en la posición 34, en la que la molécula puente tiene de 10 \ring{A} a 20 \ring{A} de longitud.
2. Una proteína híbrida según la reivindicación 1, en la que la molécula puente es una cadena de hexileno con el residuo de una maleimida en cada extremo.
3. Una proteína híbrida según las reivindicaciones 1 y 2, en la que el fragmento de anticuerpo es un fragmento Fab monovalente que contiene opcionalmente uno o más aminoácidos adicionales unidos al extremo C-terminal del dominio CH1.
4. Una proteína híbrida según la reivindicación 3, en la que el fragmento de anticuerpo es un fragmento Fab o Fab' monovalente.
5. Una proteína híbrida según las reivindicaciones 1-4 unida a uno o más grupos efectores o indicadores.
6. Una composición farmacéutica que comprende una proteína híbrida según las reivindicaciones 1-5 junto con uno o más excipientes, diluyentes o vehículos farmacéuticamente aceptables.
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