ES2201124T3 - Medio para detectar enterococos en una muestra. - Google Patents

Medio para detectar enterococos en una muestra.

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Abstract

UN MEDIO PARA EL CULTIVO DE ENTEROCOCCI DE FORMA QUE SU DETECCION SE PUEDA REALIZAR DENTRO DE LAS 24 HORAS.

Description

Medio para detectar enterococos en una muestra.
Campo de la invención
Esta invención pertenece al campo de la química, la biología y la microbiología y se refiere a nuevos medios para detectar la presencia de los microbios objetivos en una muestra de un material posiblemente contaminado.
Antecedentes
Los microorganismos están presentes de manera omnipresente en las muestras biológicas y en los medios ambientales adecuados para su crecimiento. Sin embargo, algunos han demostrado ser perjudiciales para los organismos superiores y los medios para detectar su presencia son importantes para preservar la salud pública. Están disponibles muchos medios para detectar diferentes tipos de microorganismos, y ofrecen diferentes ventajas con respecto a la velocidad y la especificidad.
Todos los microorganismos tienen ciertos requerimientos para su crecimiento y reproducción. En general, los microorganismos requieren la presencia de lo siguiente para crecer: una fuente de energía que incluya la luz y compuestos de carbono; y una fuente de materias primas que incluya carbono, nitrógeno, azufre, y fósforo así como trazas de otros minerales. Además, los microorganismos deben estar presentes en un medioambiente adecuado en el que se mantengan una temperatura, pH, salinidad y concentración de oxígeno apropiados.
Un procedimiento común usado para detectar la presencia de los microorganismos implica añadir una muestra a un medio de cultivo que contiene todos los elementos necesarios para permitir el crecimiento. La muestra puede ser natural o pretratada, como por filtración con membrana, antes de ser añadida al medio de cultivo, y el medio puede contener o no compuestos químicos tales como antimetabolitos o antibióticos que son activos selectivamente frente a microorganismos distintos de los microorganismos objetivos. Usualmente, estos medios de cultivo se han esterilizado para asegurar que no hay interferencias procedentes de microbios contaminantes, y usualmente se requiere una etapa de incubación bastante larga de 48 a 72 horas para proporcionar la detección apropiada de los Enterococci. Adicionalmente, una vez que se detecta el crecimiento en estos procedimientos, el microorganismo objetivo debe ser confirmado usando uno o más de una serie de ensayos específicos para una variedad de características físicas y bioquímicas. Estos procedimientos son, por tanto, laboriosos y muy largos.
Se han hecho muchos esfuerzos para simplificar y acelerar los procedimientos de detección. Entre estos esfuerzos se han hecho intentos de medir productos secundarios específicos de bacterias individuales, ensayos de impedancia eléctrica, ensayos de ATP, y ensayos de sustrato marcado con carbono-14. La mayoría no han demostrado ser muy eficaces. También, se han usado indicadores de crecimiento microbiano que cambian el color sólo después del crecimiento microbiano. Normalmente, dichos indicadores reaccionan químicamente con un producto secundario metabólico producido por los microbios objetivos. Se han usado también productos químicos que cambian el color en presencia de los cambios de pH asociados con el crecimiento incluyendo rojo fenol, azul de bromocresol, y rojo neutro. Por ejemplo, Golber, patente de Estados Unidos Nº 3.206.317 usa rojo fenol en presencia de un medio ácido producido por los productos de desecho bacterianos. Berger et al., patente de Estados Unidos Nº 3.496.066 describen el uso de compuestos que las bacterias convierten en productos colorantes. Bochner, patente de Estados Unidos Nº 4.129.483 describe el uso de una sustancia no biodegradable que es reducida para producir un cambio de color. En todas estas situaciones, el indicador es una sustancia adicional y no una sustancia que sirva también como una fuente de un nutriente requerido.
Edberg, patente de Estados Unidos Nº 4.925.789 describe el uso de un indicador nutriente que no sólo sirve como una fuente de nutrientes, sino que también cambia de color después de ser metabolizado. La patente, incorporada aquí como referencia, proporciona un medio que contiene un indicador nutriente, el cual cuando es metabolizado por una bacteria objetivo, libera un resto que da un color u otro cambio detectable al medio. El procedimiento tiene la ventaja de una especificidad enzimática única para especies o grupos particulares de bacterias. Esto sugiere el uso de antibióticos para seleccionar para cultivo de los microorganismos objetivos y proporciona ejemplos específicos de ensayos basados en medio líquido. Otros métodos usados previamente tales como los de Kilian et al., Acta. Path. Microbiol. Scand. Sect. B \NAK7 271-276 (1979) y Damare et al., J. Food Science 50:1736 (1985) describen el uso de medios basados en agar sin antibióticos.
La densidad de Enterococcus es un medio para predecir los riesgos para la salud pública asociados con las aguas de recreo contaminadas. Hay dos métodos aceptados para el análisis de la densidad de Enterococcus en las muestras de agua, la técnica de los tubos múltiples para el número más probable (MPN) y la técnica del filtro de membrana (MF) (Greenberg et al., Standard methods for the evaluation of water and wastewater Eaton, A.D. (ed.) 18th ed. Asociación de la salud pública americana (1992); y Mooney, K. et al., Testing the waters: a national perspective on beach closings Natural Resources Defense Council. (1992)). Los resultados basados en la técnica de los tubos múltiples pueden no estar disponible hasta las 72 horas, y los resultados de la técnica del filtro de membrana pueden no estar disponibles hasta las 48 horas. El "procedimiento MPN" implica un ensayo presuntivo de 24 a 48 horas en una serie de caldos de cultivo de azida-dextrosa seguido por un ensayo de confirmación a las 48 horas usando Enterococcus agar selectivo y caldo de cultivo de infusión de cerebro-corazón y NaCl al 6,5%. La técnica del filtro de membrana implica la filtración por membrana de las muestras de agua seguida por la incubación de una membrana estéril prefiltrada en medios selectivos de Enterococcus. Los medios de elección son o mE agar seguido de un ensayo de sustrato EIA, o Enterococcus agar. Tales métodos pueden ser tediosos, laboriosos y muy largos. Esto puede llevar a retrasos en la notificación pública y, por tanto, a aumentar los riesgos para la salud pública.
Panosian & Edberg, Journal of Clinical Microbiology 27:1719-1722 (1989) describen un método para la detección de S. Bovis y bacterias relacionadas que comprende el cultivo de colonias de organismos sobre placas durante periodos de 24 a 48 horas y de 18 a 24 horas seguido por la transferencia de las colonias cultivadas a un medio de detección que comprende p-nitrofenil-\alpha-D-galactopiranosido y 4-metilumbiliferil-\beta-D-glucósido. Trepeta & Edberg, Antonie van Leeuwenhoek 53:273-277 (1987) describen un método para detectar bacterias que poseen esculinasa y utilizan un medio de detección que comprende p-nitrofenil-\beta-D-glucopiranosido.
Sumario de la invención
La presente invención aporta un medio que permite la detección de microbios Enterococci en un ambiente licuado o en una muestra biológica, dentro de un periodo de tiempo tan corto como 24 horas. El presente medio es distinto de los medios anteriores en los que se requieren aproximadamente de 48 a 72 horas para obtener un resultado del ensayo para los Enterococci. El medio permite también cuantificar la cantidad de Enterococci presentes en una muestra y se puede usar en métodos de cribado rápido.
El medio contiene una cantidad efectiva de vitaminas, aminoácidos, elementos trazas e ingredientes salinos necesarios para permitir la viabilidad y la reproducción de los Enterococci en presencia de un indicador nutriente. El indicador nutriente se proporciona en una cantidad suficiente para permitir una señal característica detectable a ser producida en el medio por el cultivo de los Enterococci. El medio contiene adicionalmente cantidades efectivas de agentes selectivos que son activos para evitar o inhibir el crecimiento de los microorganismos que no son objetivo (es decir, los no enterococcos).
Los medios que han demostrado ser óptimos en esta invención para la detección de los Enterococci en una muestra incluyen (por litro) un tampón biológico (por ejemplo, aproximadamente de 5,0 a 7,0 gramos de ácido N-tris[hidroxi-metil]metil-3-amino-propanosulfónico, ácido libre (ácido TAPS libre), y aproximadamente de 5,0 a 7,0 gramos de ácido N-tris[hidroxi-metil]metil-3-amino-propanosulfónico, sal de sodio (TAPS-sodio) o aproximadamente de 4,0 a 5,0 gramos de ácido HEPES libre y aproximadamente de 7,0 a 9,0 gramos de sal de sodio de HEPES)); y bicarbonato de sodio (por ejemplo, aproximadamente de 1,5 a 2,5 gramos).
Adicionalmente, se proporcionan los siguientes componentes en los medios en aproximadamente las cantidades indicadas. Los expertos en la técnica entenderán que no se requieren todos los componentes. También se pueden sustituir los componentes por otros componentes de similares propiedades. Las cantidades de los componentes pueden variar también. Específicamente, el medio contiene (por litro) un contenido total nitrogenada aproximadamente de 1,0 a 1,7 gramos (principalmente procedente de sulfato de amonio). También se proporcionan los aminoácidos requeridos para el cultivo de los microorganismos a ser detectados. No todos los aminoácidos deben ser proporcionados, y la cantidad relativa de cada uno puede variar. Los aminoácidos de pueden proporcionar a partir de una variedad de fuentes. Se pueden proporcionar de fuentes naturales (por ejemplo, extractos de organismos completos), como mezclas o en forma purificada. Las mezclas naturales pueden contener cantidades variables de tales aminoácidos y vitaminas. Las cantidades específicas de tales aminoácidos y vitaminas se indican más adelante. Los expertos en la técnica reconocerán que se pueden usar muchas combinaciones diferentes de aminoácidos y vitaminas en los medios de esta invención. Normalmente, sólo se deben proporcionar los aminoácidos que no se pueden sintetizar endógenamente por los microorganismos a ser detectados. Sin embargo, se pueden proporcionar otros aminoácidos sin apartarse del medio de la invención. Los contenidos de aminoácidos son al menos los siguientes en aproximadamente las siguientes cantidades (por litro): alanina (de 0,015 a 0,055 gramos); arginina (de 0,01 a 0,04 gramos); ácido aspártico (de 0,04 a 0,10 gramos), cistina (de 0,001 a 0,005 gramos), ácido glutámico (de 0,05 a 0,15 gramos), glicina (de 0,01 a 0,03 gramos), histidina (de 0,010 a 0,06 gramos), isoleucina (de 0,01 a 0,10 gramos), leucina (de 0,03 a 0,08 gramos), lisina (de 0,03 a 0,07 gramos), metionina (de 0,01 a 0,04 gramos), fenilalanina (de 0,01 a 0,04 gramos), prolina (de 0,02 a 0,08 gramos), serina (de 0,01 a 0,05 gramos), treonina (de 0,01 a 0,04 gramos), triptófano (de 0,002 a 0,006 gramos), tirosina (de 0,01 a 0,02 gramos), y valina (de 0,02 a 0,05 gramos).
Se pueden proporcionar sales como una fuente de iones después de la disociación. Tales sales pueden incluir fosfato de potasio (por ejemplo, aproximadamente de 0,5 a 1,5 gramos); sulfato de cobre (por ejemplo, aproximadamente de 40 a 50 \mug); sulfato de amonio (por ejemplo, aproximadamente de 4,0 a 6,0 gramos); yoduro de potasio (por ejemplo, aproximadamente de 50,0 a 150,0 \mug); cloruro férrico (por ejemplo, aproximadamente de 150,0 a 250,0 \mug); sulfato de manganeso (por ejemplo, aproximadamente de 300,0 a 500,0 \mug); molibdato de sodio (por ejemplo, aproximadamente de 150,0 a 250,0 \mug); sulfato de zinc (por ejemplo, aproximadamente de 300,0 a 500,0 \mug); y cloruro de sodio (por ejemplo, aproximadamente de 0,05 a 0,15 g). Se pueden incluir otros restos inorgánicos para ayudar al cultivo microbiano. Estos incluyen los siguientes (hasta un límite que no se ha proporcionado todavía en las fuentes anteriores de los diferentes productos químicos y se describen en cantidades por litro): fósforo (aproximadamente 0,0005 g/l), potasio (aproximadamente 0,0004 g/l), sodio (aproximadamente de 0,03 a 0,06 g/l) y trazas de calcio, magnesio, aluminio, bario, cloruro, cobalto, cobre, hierro, plomo, manganeso, sulfato, azufre, estaño y cinc.
\newpage
También deben proporcionarse las vitaminas requeridas para el crecimiento y la reproducción de los microorganismos que se quieren detectar. Éstas se pueden proporcionar en una forma pura o como parte de medios más complejos. Tales vitaminas pueden estar presentes en aproximadamente las siguientes cantidades (por gramo de medio): biotina (aproximadamente de 0,15 a 0,40 \mug/l), ácido pantoténico (aproximadamente de 45,0 a 65,0 \mug/l), piridoxina (aproximadamente de 6,0 a 9,0 \mug/l), riboflavina (aproximadamente de 10,0 a 20,0 \mug/l), ácido fólico (aproximadamente de 5,00 a 10,00 \mug/l), tiamina (aproximadamente de 10,0 a 20,0 \mug/l), vitamina B_{12} (aproximadamente de 0,20 a 0,30 \mug/l), y niacina (aproximadamente de 15,0 a 25,0 \mug/l).
También se pueden proporcionar agentes selectivos, y en particular antibióticos, que inhiben o evitan el crecimiento de los organismos no objetivo. Se pueden proporcionar muchos agentes selectivos, y los agentes selectivos usados dependerán del microorganismo objetivo. Preferiblemente, los agentes selectivos incluyen uno o más de los siguientes en concentraciones que están dentro de los siguientes intervalos: sulfato de amikacina (aproximadamente de 0,0045 a 0,0055 gramos/litro), anfotericina B (aproximadamente de 0,00198 a 0,00242 gramos/litro), y bacitracina (aproximadamente de 0,000476 a 0,00794 gramos/litro). Alternativamente, pueden ser sustitutos el acetato de talio, sulfato de neomicina, cicloheximida, tetraciclina, colistina, ansiomicina o clindamicina.
Los expertos en la técnica reconocerán que el carbono, nitrógeno, elementos trazas, vitaminas, aminoácidos y agentes selectivos se pueden proporcionar de muchas formas. Algunos ingredientes se pueden proporcionar en cantidades reducidas o se pueden suprimir si pueden ser sintetizados endógenamente por los microorganismos cuya presencia se va a determinar.
El indicador nutriente está presente en el medio en una cantidad que es suficiente para mantener el crecimiento del microbio objetivo hasta que se produzca una señal característica detectable en el medio durante el crecimiento. Las vitaminas, los aminoácidos, los elementos trazas, las sales y los indicadores nutrientes, juntos, permiten un crecimiento suficiente del organismo, de modo que se puede observar un cambio detectable en la muestra. El indicador nutriente altera una característica detectable de la muestra sólo cuando es metabolizado por un organismo. Preferiblemente, altera una característica detectable sólo cuando es metabolizado por el microbio objetivo. Por tanto, se puede usar para confirmar la presencia o ausencia del microbio objetivo en la muestra. Es preferible que el indicador nutriente se elija de modo que sea partido para liberar la porción indicadora al medio sólo por el microbio objetivo. Esto es, si están presentes en la muestra otros microbios que puedan partir el indicador nutriente, entonces el medio se forma de modo que estos otros microbios no puedan crecer sustancialmente en el medio. Adicionalmente, aunque se prefiere que el indicador nutriente sea la única fuente del tipo específico de nutrientes para el microbio objetivo, el medio puede contener otras de dichas fuentes, pero en cantidades que no reducirán la especificidad del medio. Por ejemplo, el indicador nutriente puede ser la única fuente de carbono para este microorganismo. Alternativamente, pueden estar presentes otras fuentes de carbono (por ejemplo, aminoácidos) que no son usadas de forma preferencial por el microbio objetivo. Si se desea, pueden estar presentes algunas pequeñas cantidades de otras fuentes de carbono que podrían ser usadas de forma preferencial por el microbio objetivo, pero la cantidad proporcionada es tal que no reduce la especificidad del medio sin dicha fuente de carbono. Lo más preferiblemente, el indicador nutriente es 4-metillumberiferil-\beta-D-glucopiranosido. Otros indicadores nutrientes que se pueden usar en la invención incluyen los siguientes: 5-bromo-4-cloro-3-indoxil-\beta-D-glucopiranosido, o-nitrofenil-\beta-D-glucopiranosido, p-nitrofenil-\beta-D- glucopiranosido, resofuran-\beta-D-glucopiranosido, 6-bromo-2-naftil-D-glucopiranosido, rose-\beta-D-glucopiranosido, yoduro de VQM-Glc(2-{2-[4-(D-glucopiranosiloxi)-3-metoxifenil]vinil)-1-metil-quinolinio, y yoduro de VBzTM-Gluc(2-{2-[4-(D-glucopiranosiloxi)-3-metoxifenil]vinil)-1- metilbenzotiazolio.
El término "Enterococci" incluye los siguentes microorganismos: Enterococcus avium, E. casseliflavus, E. cecorum, E. columbae, E. dispar, E. durans, E. faecalis, E. faecium, E. gallinarum, E. hirae, E. malodoratus, E. mundtii, E. psudoavium, E. raffinosus, E. saccharolyticus, E. seriolicida, E. solitarius, y E. sulfureus. Entre ellos, Los E. avium, E. durans, E. faecalis, E. faecium, E. gallinarum y E. hirae son las cepas de origen fecal. El término no está limitado para indicar cualquier número dado de estas especies y no significa que excluya especies que todavía están por descubrir pero que más tarde pueden ser identificadas e incluidas en este género por los expertos en la técnica.
El término "Streptococci fecales" incluye especies de las bacterias Streptococci presentes en el tracto gastrointestinal de los organismos superiores. Incluye organismos tales como S. Faecalis, S. Faecuim, S. Avium, y S. Gallinarum. Los S. Faecalis, S. faecium, S. avium, y S. Gallinarum son más comúnmente conocidos como Enterococci y se incluyen aquí dentro de ese término.
El término "24 horas" indica el tiempo requerido por aproximadamente 95% de las muestras líquidas que contienen sólo aproximadamente de uno a diez Enterococci por 100 ml para mostrar un cambio característico detectable. La temperatura, cantidad y el tipo de inductor enzimático presente, la cantidad de nutrientes proporcionada en el medio, y la salud relativa de las bacterias, afectan todos al tiempo de detección. La cantidad de nutrientes tales como aminoácidos, vitaminas, y elementos trazas proporcionada puede afectar a la velocidad de crecimiento del microbio objetivo y por tanto al tiempo de detección. El equilibrar térmicamente la muestra a una temperatura de incubación de aproximadamente 35ºC después de añadir el medio puede disminuir el tiempo requerido para la detección. La cantidad de inductor enzimático también puede disminuir el tiempo para la detección. Los inductores enzimáticos encontrados en el medio son agentes que actúan como un inductor de la enzima que parte al indicador nutriente. El inductor enzimático, por ejemplo, puede ser un homólogo del indicador nutriente. Ejemplos de tales inductores son conocidos en la técnica. La salud relativa de los microbios afecta también al tiempo requerido para la detección. La adición de agentes tales como piruvato que pueden ayudar a la recuperación de organismos dañados puede, por tanto, acelerar la detección. Si grandes cantidades de bacterias están presentes en la muestra, es posible también una detección más rápida. En esta invención, los medios proporcionados permiten la detección de pequeñas cantidades de microbios objetivos (es decir, menos de 10/100 ml) en el periodo de 24 horas, al menos el 95% de las veces. Se pueden usar métodos estándar para determinar esta capacidad.
El término "medio" indica una mezcla sólida, en polvo o líquida que contiene todos o sustancialmente todos los nutrientes necesarios para permitir que un microbio crezca y se reproduzca. Esta invención incluye tanto los medios que se esterilizan como los medios que no son estériles.
El término "licuado" indica sustancialmente en forma líquida, aunque también indica muestras pulverizadas u homogeneizadas de sustancias sólidas que tienen al menos un contenido líquido de 10%. La frase excluye un medio gelificado, tal como ocurre en el agar.
Los términos "medioambiental" y "biológico" indican tomado o procedente de una sustancia capaz de mantener una o más formas de vida incluyendo algas, levaduras y bacterias. Ejemplos incluyen, pero sin limitarse a ellos, aguas de recreo, aguas marinas, aguas potables, efluyentes residuales, y sustancias alimenticias.
El término "inoculación" indica en el momento o cerca del momento en que la muestra medioambiental o biológica licuada se mezcla con el medio de esta invención. Quiere decir el momento en el que las dos sustancias se mezclan de forma sustancial.
El término "cantidad efectiva" es una cantidad dentro del intervalo que permite o favorece el crecimiento y la reproducción de un microorganismo objetivo. Esto es, una cantidad que permite que los microbios u otros organismos se adapten al medio, sinteticen los constituyentes necesarios para la reproducción y subsiguientemente se reproduzcan. No quiere decir que sea específica y puede variar dependiendo de factores tales como el tamaño de la muestra y la concentración de microorganismos. Generalmente, el término indica la cantidad requerida para detectar menos de 100 microbios objetivos por 1 ml de muestra, lo más preferiblemente menos de 100 microbios por 100 ml de muestra, o incluso 1 microbio por 100 ml de muestra.
Los términos "vitaminas", "aminoácidos", "elementos trazas", y "sales" se definen para que incluyan todas las moléculas, compuestos y sustancias clasificadas en cada categoría por los expertos en la técnica, tanto orgánicos como inorgánicos, y las categorías no pretenden excluir ninguna sustancia que pueda ser necesaria o propicia para mantener la vida.
El término "indicador nutriente" indica una molécula o sustancia que contiene un resto que es una fuente para un nutriente esencial y un resto que causa o produce un cambio característico observable en el medio o en la muestra. Un indicador nutriente incluye fuentes de nutrientes unidas o conjugadas con cromógenos o fluorógenos. Las fuentes de nutrientes pueden proporcionar vitaminas, minerales, elementos o ingredientes de aminoácidos esenciales o carbono. Normalmente, como un microorganismo progresa desde la fase en la que los nutrientes se acumulan para la reproducción (fase lag) hasta la fase durante la que realmente ocurre la reproducción a una velocidad relativamente rápida (fase log), los requerimientos de nutrición aumentan. Consecuentemente, se metabolizan cantidades mayores del indicador nutriente y se produce un cambio característico y detectable. Preferiblemente, el indicador nutriente incluye un resto nutriente y un cromógeno o un fluorógeno. Los cromógenos incluyen cualquier resto que produzca un cambio de color observable en el espectro visible. Los fluorógenos incluyen cualquier resto que tenga fluorescencia después de la exposición a una fuente de luz de excitación. Ejemplos, incluyen, pero sin limitarse a ellos, restos ortonitrofenilo, fenolftaleína, y 4- metilumbeliferona. Aunque el indicador nutriente puede proporcionar la única fuente de un nutriente esencial, se pueden proporcionar otras fuentes de tales nutrientes, siempre que se mantenga la adecuada selectividad y sensibilidad del medio.
El término "señal característica detectable" incluye cualquier cambio en una muestra que se pueda detectar mediante uno o más de los sentidos humanos. El término incluye ejemplos tales como cambio de color en los intervalos de longitudes de onda del espectro visible y no visible, un cambio de estado tal como entre sólido, líquido y gas, una emisión de gas, o un cambio de olor.
El término "microbio objetivo" indica el microorganismo cuya presencia o ausencia se quiere detectar. Preferiblemente, incluye especies de Enterococci y Streptococci fecales que pueden vivir en el tracto gastrointestinal de los organismos superiores.
En una realización preferida, el indicador nutriente altera el color del medio específico para un microbio. El cambio de color puede ser evidente en el intervalo de las longitudes de onda del espectro visible o puede ser fluorescente lo que es evidente en un intervalo de las longitudes de onda del espectro visible después de exposición a una fuente de luz de excitación. Esto se logra por la separación de un resto cromogénico o de un resto fluorescente. Un resto cromogénico es un resto que cambia el color de la muestra en el intervalo visible cuando está en una forma no conjugada, esto no sin estar ya conjugada o unida al resto nutriente. Un resto fluorescente es un resto que cambia el color de la muestra en el intervalo no visible cuando está en una forma no conjugada, esto es sin estar ya conjugada o unida al resto nutriente. Ejemplos de restos cromogénicos que pueden estar conjugados a un resto nutriente incluyen, pero sin limitarse a ellos, restos de ortonitrofenilo que producen un color amarillo cuando se liberan del indicador nutriente, y restos de fenolftaleína que producen un color rojo cuando se liberan del indicador nutriente. Ejemplos de restos fluorescentes incluyen, restos de metillumbeliferilo que se vuelven fluorescentes a aproximadamente 366 nm cuando se liberan del indicador nutriente, y restos de bromo-cloro-indol que se vuelven azules cuando se liberan del indicador nutriente. Lo más preferiblemente, el medio usa el resto fluorescente, 4-metillumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido.
Preferiblemente, el medio contiene también uno o más agentes selectivos tales como antibióticos que evitan o inhiben que microbios distintos del microbio objetivo metabolizen el indicador nutriente. Esto es, preferiblemente el medio contiene agentes que son específicos para microbios distintos de Enterococci o Streptococci fecales y evitan o inhiben eficazmente el crecimiento de al menos algunos de estos microbios. El término se define para incluir agentes tales como azida de sodio, acetato de talio, ácido nalidíxico, sulfato de neomicina, sulfato de gentamicina, sales biliares, cloruro de sodio, licloheximida, tetraciclina, colistina, ansiomicina, clindamicina y polimicina B. Preferiblemente, incluye sulfato de amikacina (por ejemplo, aproximadamente de 0,0045 a 0,0055 g/litro), anfotericina B (por ejemplo aproximadamente de 0,00198 a 0,00242 g/litro) y bacitracina (por ejemplo aproximadamente de 0,000476 a 0,000794 g/litro).
El término "medio específico para un microbio" indica un medio que permite un crecimiento sustancial sólo del microbio objetivo. Esto incluye medios que contienen uno o más antibióticos específicos para inhibir el crecimiento de microorganismos distintos del microbio objetivo, e incluye medios que alternativa o adicionalmente contienen uno o más indicadores nutrientes que no son metabolizados preferiblemente por microorganismos distintos del microbio objetivo en un grado sustancial. El término "sustancial" como se usa en este contexto, indica que el medio siempre permite la detección específica (es decir, con una exactitud de al menos 95% o incluso 98%) y sensible (es decir, con unos niveles de detección de al menos 95% o incluso 98%) del microbio objetivo, como se mide por procedimientos estándar.
En otra realización preferida, el medio contiene un agente que actúa como un inductor de la enzima que divide al indicador nutriente. Este agente, por ejemplo, puede ser un homólogo del indicador nutriente. Tales inductores incluyen isopropil-\beta-D-tiogalactosido (IPTG) que induce la actividad de la \beta-galactosidasa y etil-\beta-D-tioglucosido que induce la actividad de la \beta-glucosidasa.
Preferiblemente, el medio permite la detección de los Enterococci (incluyendo Streptococci fecales) en 24 horas. El medio está también preferiblemente en la forma de un polvo no estéril, soluble en agua que permite la fácil adición a las muestras líquidas.
En otro aspecto, la invención aporta un método para detectar la presencia o ausencia de los Enterococci y Streptococci fecales en una muestra licuada poniendo en contacto la muestra con el medio descrito antes, incubando, y monitorizando la mezcla de la muestra y el medio para determinar la presencia o ausencia de la señal característica detectable. La incubación se puede realizar a una serie de temperaturas, pero preferiblemente se lleva a cabo entre 35ºC y 45ºC. Preferiblemente, la señal característica detectable se puede observar en 24 horas. La invención aporta la provisión de muestras preferiblemente de una fuente de agua incluyendo agua fresca, agua marina, suministros de agua potable o aguas residuales.
Otra característica de la invención es un método para detectar la presencia o ausencia de un microbio objetivo en una muestra medioambiental o biológica licuada preferiblemente incluyendo la etapa de calentar la muestra a la temperatura de incubación en un incubador líquido, y después añadir el medio específico para el microbio. Lo más preferiblemente, la temperatura de incubación es aproximadamente 35ºC. El término "incubador líquido" indica un líquido calentado a una temperatura o intervalo de temperaturas especificados. Este puede incluir cualquier forma de baños de agua por ejemplo. Tal incubador es ventajoso con respecto a los incubadores de aire usados previamente, ya que el medio alcanza más rápidamente una temperatura de incubación adecuada.
En otro aspecto adicional, la invención aporta un método para cuantificar la cantidad o número de Enterococci presentes en una muestra líquida poniendo en contacto una muestra líquida con el medio descrito antes, situando la muestra líquida que incluye el medio en recipientes, incubando la mezcla de la muestra líquida y el medio, observando la cantidad y calidad de una señal característica detectable, y comparando la cantidad y calidad de una señal característica detectable con los valores más probables. Este procedimiento de cuantificación compara la cantidad y calidad de la característica que ha sido alterada, preferiblemente un cambio de color, con los valores numéricos más probables obtenidos de muestras en las que la concentración y el cambio característico habían sido correlacionados con muestras de las cuales se conoce la concentración de Enterococci o bacterias. Véase, por ejemplo, Compendium of Methods for the Microbiological Examination of foods 3rd ed., editado por Vanderzant y Splittstoesser, 1992. La técnica de los números más probables permite la estimación de las concentraciones de las bacterias que están por debajo de los límites detectables por otros métodos.
En las realizaciones preferidas, la invención usa el aparato descrito por Naqui et al. en la patente de Estados Unidos Nº 5.518.892. La etapa de cuantificación incluye proporcionar una muestra medioambiental o una muestra biológica en una forma líquida, situar o distribuir la muestra dentro de la bolsa porta-muestras descrita por Naqui, mezclar la muestra con un medio para permitir y favorecer el crecimiento de las bacterias viables, incubar la muestra, detectar la cantidad y calidad del cambio de color, y comparar esa cantidad y calidad con los resultados obtenidos para una serie de muestras de las cuales se conoce la concentración de bacterias. Más preferiblemente, la etapa de incubación se lleva a cabo a 41ºC durante un periodo de 24 horas usando el medio descrito antes.
La invención proporciona el medio óptimo para determinar la presencia de microorganismos Enterococci (incluyendo Streptococci fecales). Los Enterococci se pueden detectar mucho antes en este medio que en los disponibles actualmente. Por tanto, los resultados del ensayo están más rápidamente disponibles. Los rápidos resultados ahorran tanto dinero como tiempo en el laboratorio. La velocidad disminuye también el peligro para la salud pública, permitiendo alertas y medidas curativas precoces para tratar con la presencia de algunos microorganismos en sitios tales como suministros de agua potable y aguas de recreo. Además, el método de esta invención no requiere generalmente ensayos confirmativos ya que se pueden usar indicadores nutrientes específicos para un microorganismo. Adicionalmente, la invención no requiere el uso de un medio estéril como requieren muchos otros métodos.
Otras características y ventajas de la invención serán evidentes con la siguiente descripción de sus realizaciones preferidas, y con las reivindicaciones.
Breve descripción de las realizaciones preferidas
En la siguiente descripción, se hará referencia a diferentes metodologías conocidas por los expertos en las técnicas química, biológica y microbiológica. Las composiciones, métodos y productos de esta invención son aplicables a muestras biológicas y medioambientales, y son útiles en las técnicas química, biológica y microbiológica para la detección de microorganismos.
Detección de microorganismos basada en la especificidad enzimática
Los microorganismos específicos obtienen sus nutrientes a partir de un conjunto de fuentes, sin embargo, algunas fuentes pueden ser únicas para un microorganismo particular o grupo de microorganismos. Familias, grupos o especies de microorganismos pueden compartir las especificidad enzimática para ciertos nutrientes que está ausente en otros microorganismos. Aprovechando las características metabólicas de microorganismos específicos, es posible demostrar su presencia. Se han identificado muchas enzimas que son específicas para grupos o especies particulares y probablemente en el futuro serán identificadas otras similares.
El grupo de bacterias enterococcus contiene una única enzima constitutiva, \beta-glucosidasa (Littel et al., Appl Environ. Microbiol. 45:622-627 (1983). Dicha enzima cataliza la hidrólisis de sustratos cromogénicos o fluorogénicos apropiados en los entornos selectivos apropiados dando como resultado una señal coloreada o fluorescente que se puede detectar o visual o espectrofotométricamente. Un sustrato específico para \beta-glucosidasa puede servir como el indicador nutriente en los medios diseñados para detectar los Enterococci y proporcionar un fuente principal de carbono en la formulación del medio. Están disponibles una serie de sustratos de indicadores nutrientes. Sin embargo, el sustrato preferiblemente usado para detectar Enterococci es el sustrato fluorogénico de 4-metillumbeliferil-\beta-D-glucopiranosida. Cuando están presentes en una muestra bacterias enterococcus viables, el indicador nutriente es metabolizado, con lo que se separa la porción indicadora, la cual, cuando se separa, se hace fluorescente. El resto de glucosa liberado se utiliza entonces por las bacterias Enterococci para favorecer su crecimiento.
Enterococci
El grupo de bacterias enterococcus y streptococcus fecal es un valioso indicador bacteriano para determinar la extensión de la contaminación fecal en la superficie de las aguas de recreo (Greenberg et al, Stándard Methods for the Examination of water and Wastewater. 18th ed Eaton, A.D. (ed.) American Public Health Association (1992). El genero Enterococcus contiene actualmente 18 especies: Enterococcus avium, Enterococcus casseliflavus, Enterococcus cecorum, Enterococcus columbae, Enterococcus dispar, Enterococcus durans, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Enterococcus gallinarum, Enterococcus hirae, Enterococcus malodoratus, Enterococcus mundtii, Enterococcus pseudoavium, Enterococcus raffinosus, Enterococcus saccharolyticus, Enterococcus seriolicida, Enterococcus solitarius, y Enterococcus sulfureus. Entre estas, Enterococcus avium, Enterococcus durans, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, Enterococcus gallinarum, y Enterococcus hirae son las cepas de origen fecal (Hernandez et al, Wat. Res. 27:597-606 (1993)). Estas bacterias sobreviven durante mucho más tiempo que otros indicadores en el entorno marino. Los Enterococci son también resistentes al tratamiento de las aguas residuales, incluyendo la cloración, y por tanto, son indicadores sensibles de la supervivencia de patógenos y virus intestinales en las muestras de agua. Se ha demostrado una correlación directa entre la concentración de Enterococci en aguas marinas y los riesgos de gastroenteritis asociada con el baño (Cabelli, Wat. Sci. Tech. 21:13-21 (1989); y Cabelli et al., Journal WPCF (1983)). Ha sido recomendado por la agencia de protección medioambiental de Estados Unidos (U.S. EPA) que el grupo de bacterias Enterococci sea usado como el indicador bacteriano para las aguas frescas y marinas. Las guías actuales de seguridad para las aguas de recreo basadas en la densidad de Enterococci son de 33 Enterococci por 100 ml de agua fresca y 35 Enterococci por 100 ml de agua marina, respectivamente.
Las técnicas estándar actuales para medir las densidades de enterococcus en las aguas marinas y de recreo frescas son laboriosas y muy largas. Los resultados basados en MPN requieren un mínimo de 72 horas y en MF requieren 48 horas. Aunque los Enterococci son indicadores bacterianos más sensibles para los riesgos sanitarios asociados con el baño, el tiempo requerido para la interpretación de los resultados ha dificultado su aceptación como una adecuada monitorización. El sistema de diagnóstico basado en la \beta-glucosidasa permite la detección precoz de las especies de enterococcus en muestras de agua en 24 horas. Los rápidos resultados permiten respuestas veloces por parte del gobierno para realizar medidas tales como cierre de playas para proteger la salud pública.
Selectividad
En general, la actividad de la \beta-glucosidasa es una característica específica para detectar los Enterococci y los Streptococci fecales. Otras bacterias, sin embargo, poseen también tal actividad enzimática. Estas incluyen los géneros de la familia Enterobacteriaceae (enterobacter aerogenes, E colacae) Klebsiella pneumoniae, Serratia marcescens, Listeria monocytogenes, y Bacterioides fragilis. Se puede usar cierto factor o factores selectivos para inhibir el crecimiento de dichas bacterias positivas a la \beta-glucosidasa (es decir, otras especies distintas de enterococcus).
Se puede producir un medio selectivo para microorganismos específicos utilizando una combinación de especificidad enzimática y medioambientes selectivos. Por ejemplo, en un medio de esta invención, se suprimen los microbios no objetivo que no poseen actividad de \beta-glucosidasa y que no pueden digerir el indicador nutriente. Las bacterias heterotróficas u otros microbios no objetivos que poseen \beta-glucosidasa son suprimidos selectivamente durante el periodo de prueba por la combinación de reactivos químicos antibióticos específicamente formulados y otros parámetros físicos (pH y temperatura). Los agentes selectivos típicos que se pueden usar en el medio de esta invención incluyen azida de sodio, acetato de talio, ácido nalixílico, sulfato de neomicina, sulfato de gentamicina, sales biliares, cloruro de sodio, y polimicina B (Hernandez et al., Wat. Res. 27:597-606 (1993); Knuntson, et al., Appl. Environ. Microbiol. 59:936-938 ((1993), y Littel et al., Appl. Environ. Microbiol. 45:622-627 (1983)).
La combinación de la especificidad enzimática y la selectividad antibiótica proporciona múltiples barreras que evitan la competencia de los microbios no enterococcus a ser detectados dentro del periodo de prueba de 24 horas. Esto impide el uso de un único elemento altamente tóxico que no sólo puede inhibir los microorganismos no objetivos sino también suprimir los microbios objetivos.
Indicador nutriente
En los Enterococci, la \beta-glucosidasa cataliza la conversión del sustrato fluorescente, 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido (MUD), a 4-metilumbeliferona y glucosa. El fluoróforo, 4-metilumbeliferona, emite fluorescencia azul cuando se excita a 365 nm (que puede ser vista bajo una lámpara UV a 365 nm). El resto de azúcar liberado, glucosa, sirve como una fuente principal de carbono para apoyar el crecimiento de los Enterococci. Un aumento del nivel de indicador nutriente puede proporcionar un mejor crecimiento microbiano y una fluorescencia más fuerte, sin embargo, los altos niveles de indicador nutriente pueden causar también citotoxicidad celular y un nivel más alto de fluorescencia de fondo. El 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido (MUD), a un nivel de 25 mg/l no inhibe el crecimiento de las especies de enterococus.
Inductores enzimáticos
La mayoría de las hidrolasas glucolíticas (\beta-glucosidasa, \beta-galactosidasa, y \beta-glucuronidasa) son inducibles. La inducción de la actividad de la \beta-galactosidasa por el isopropil-\beta-D-tiogalactosido (IPTG) es un ejemplo clásico. El etil-\beta-D-tioglucósido que funciona de un modo similar es un inductor de \beta-glucosidasa.
Estimuladores del crecimiento
NaHCO_{3} (2 g/litro), Tween-80® (0,75 ml/litro), y KH_{2}PO_{4} (5 g/litro) estimulan el crecimiento de las especies de Streptococcus fecales aisladas de aguas (véase, por ejemplo Lachica et al., J. Appl. Bacteriol. 31:151-156 (1968)). Otros elementos trazas tales como aminoácido(s) específicos (ácido glutámico), vitamina(s) (ácido lipoico), y nucleótido(s) (quinetina-ribosido) pueden tener todos actividades para favorecer el crecimiento de las especies de enterococcus.
El medio de la invención para detectar los Enterococci se describe en la tabla 1.
TABLA 1 Componente I
Ingrediente Fuente Cantidad
Nitrógeno Nitrógeno de amino de 0,02 a 0,05 g/l
Aminoácidos Alanina de 0,015 a 0,055 g/l
Arginina de 0,01 a 0,04 g/l
Ácido aspártico de 0,04 a 0,1 g/l
Cistina de 0,001 a 0,005 g/l
Ácido glutámico de 0,05 a 0,15 g/l
Glicina de 0,01 a 0,03 g/l
Histidina de 0,01 a 0,06 g/l
TABLA 1 (continuación)
Ingrediente Fuente Cantidad
Isoleucina de 0,01 a 0,10 g/l
Leucina de 0,03 a 0,08 g/l
Lisina de 0,03 a 0,07 g/l
Metionina de 0,01 a 0,04 g/l
Fenilalanina de 0,01 a 0,04 g/l
Prolina de 0,02 a 0,08 g/l
Serina de 0,01 a 0,05 g/l
Treonina de 0,01 a 0,04 g/l
Triptófano de 0,002 a 0,006 g/l
Tirosina de 0,01 a 0,02 g/l
Valina de 0,02 a 0,05 g/l
Elementos Calcio Trazas
Cloruro Trazas
Cobalto Trazas
Cobre Trazas
Hierro Trazas
Plomo Trazas
Manganeso Trazas
Fosfato de 0,0005 a 0,005 g/l
Potasio de 0,0004 a 0,004 g/l
Sodio de 0,03 a 0,06 g/l
Sulfato Trazas
Azufre Trazas
Estaño Trazas
Cinc Trazas
Vitaminas Biotina de 0,15 a 0,4 \mug/l
Colina de 5,0 a 10,0 \mug/l
Piridoxina de 6,0 a 7,5 \mug/l
Riboflavina de 10,0 a 20,0 \mug/l
Tiamina de 20,0 a 20,0 \mug/l
Vitamina B_{12} de 0,2 a 0,3 \mug/l
Niacina de 15,0 a 25,0 \mug/l
Ácido pantoténico de 45,0 a 65,0 \mug/l
Componente II
Ácido libre HEPES De 4,032-4,928 g/l
Sal de sodio HEPES de 7,301-8,933 g/l
Base nitrogenada de levaduras modificada de 4,635-5,665 g/l
Bicarbonato de sodio de 1,8-2,2 g/l
Fosfato de potasio de 0,1-1,0 g/l
\beta-ETG (etil-\beta-D-tioglucósido) de 0,009-0,011 g/l
MUD (4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido) de 0,02-0,03 g/l
Sulfato de amiKacina de 0,0045-0,0055 g/l
Anfotericina B de 0,00198-0,00242 g/l
Bacitracina de 0,000476-0,000794 g/l
Trazas = menos de 0,001 g/litro.
\newpage
Métodos de uso
El medio de esta invención se puede usar de tres formas diferentes. En primer lugar, se puede usar para detectar la presencia o ausencia de Enterococci. En segundo lugar, se puede usar para cuantificar la cantidad de Enterococci presentes en una muestra. En tercer lugar, se puede usar en un formato de cribado para relacionar el tiempo de un resultado positivo del ensayo con la concentración de Enterococci en una muestra.
Presencia/ausencia
Se describe a continuación el procedimiento para detectar la presencia o ausencia de las especies de enterococcus en muestras de agua.
1. En primer lugar, se recogen una o más muestras de agua usando recipientes estériles precalibrados. El volumen de la muestra puede ser de diferentes cantidades, incluyendo 100 ml, 10 ml, o 1 ml dependiendo de la aplicación. El medio de esta invención se puede añadir en forma de polvo a la muestra de agua recogida. Alternativamente, el medio puede estar presente en forma de polvo en los recipientes antes de la recogida de la muestra.
2. Los recipientes para las muestras se equilibran después térmicamente (esto es se llevan a la temperatura de incubación en un baño de agua) preferiblemente a 35ºC o a 41ºC \pm 1ºC, preferiblemente durante 20 minutos.
3. Una fluorescencia azul es indicativa de la presencia de especies de Enterococcus en la muestra de agua ensayada cuando el 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido es el indicador nutriente. La fluorescencia se puede leer visualmente usando una lámpara UV a 365 nm. Alternativamente, la señal se puede monitorizar con un espectrofotómetro fluorescente usando una longitud de onda de excitación de 365 nm y una longitud de onda de emisión de 440-450 nm.
Puede tener lugar una reacción positiva en cualquier momento antes de 24 horas si hay bacterias viables presentes en la muestra. Esto es, aproximadamente 95% de las muestras que contienen 10 cfu/100 ml presentarán un cambio característico detectable antes de 24 horas. El tiempo para la detección, que está dentro del intervalo de aproximadamente 12 a 24 horas, varía con la concentración y la presencia de especies de cepas de Enterococci.
Cuantificación
Se puede usar el mismo medio para cuantificar las moléculas objetivos. El ensayo se puede realizar con el formato regular de MPN con 5 o 10 tubos o con el formato MPN "Quanti-tray" de 50 a 100 pocillos (véase, Naqui, solicitud de patente de Estados Unidos 08/201.110). El procedimiento para cuantificar los Enterococci usando el medio de la tabla I se describe a continuación:
1. Se recoge una muestra de agua usando uno o más recipientes estériles precalibrados. El volumen de la muestra puede ser de diferentes cantidades, incluyendo 100 ml, 10 ml, o 1 ml dependiendo de la aplicación. El medio de esta invención se puede añadir en forma de polvo a la muestra de agua recogida. Alternativamente, el medio de esta invención puede estar presente en forma de polvo en el recipiente antes de la recogida de la muestra.
2. La muestra se vierte después en un "Quanti-tray" y a continuación se sella con calor para crear los 50 o 100 pocillos MPN. Alternativamente, se pueden distribuir alícuotas de la muestra en 5 o 10 tubos MPN.
3. Los recipientes con la muestra se incuban preferiblemente a 35ºC o 41ºC \pm 1ºC.
4. La fluorescencia se puede leer visualmente usando una lámpara UV a 365 nm. Una fluorescencia azul es indicativa de una reacción positiva cuando se usa el 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido como indicador nutriente. La densidad de enterococcus en las muestras de agua se puede correlacionar directamente con el número de pocillos positivos del "Quanti-tray" o con el número de tubos positivos usando la fórmula de cálculo de MPN, MPN = Nln (N/N-X) en la que N representa el número total de tubos o pocillos ensayados y X representa el número total de tubos o pocillos positivos. El tiempo máximo para la detección es de 24 horas.
Cribado rápido
El medio descrito antes se puede usar también para la aplicación de cribado rápido pasa/no pasa. Este formato implica el uso de una relación lineal directa entre la densidad de enterococcus en una muestra de agua ensayada con el tiempo de detección de los resultados positivos. El procedimiento para el ensayo de cribado rápido pasa/no pasa usando la misma fórmula es el siguiente:
1. Se recoge una muestra de agua usando uno o más recipientes estériles precalibrados. El volumen de la muestra puede ser de diferentes cantidades, incluyendo 100 ml, 10 ml, o 1 ml dependiendo de la aplicación. El medio de esta invención se puede añadir en forma de polvo a la muestra de agua recogida. Alternativamente, el medio de esta invención puede estar presente en forma de polvo en el recipiente antes de la recogida de la muestra.
2. Los recipientes con la muestra se incuban preferiblemente a 35ºC o 41ºC \pm 1ºC.
3. La fluorescencia se puede leer visual o fluoroespectrofotométricamente. Una fluorescencia azul es indicativa de una reacción positiva. El tiempo para un resultado positivo se usa como un indicador para determinar si la muestra de agua ensayada está en un nivel de "riesgo", "precaución", o "pasa".
Experimento 1
Este experimento se realizó para determinar el indicador nutriente que proporciona la detección más rápida.
Métodos y materiales
Las cepas de enterococcus usadas se hicieron crecer en placas con agar y sangre TSAI. Se hicieron crecer los siguientes microorganismos: E. faecalis ATCC 19433, ATCC 33012, ATCC 33186, ATCC 35550, ATCC 29212; E. faecium ATCC 19434, ATCC 35667; E. durans ATCC 6056, ATCC 11576, ATCC 19432; E. avium ATCC 14025, ATCC 35665; E. gallinarium ATCC 49573; Streptococcus bovis ATCC 9809, ATCC 35034; y S. Equinus ATCC 9812. Se prepararon las suspensiones celulares tomando las células de las placas usando una torunda de algodón estéril (prehumedecida) y se resuspendieron en tampón HEPES 50 mM pH 7,5 hasta una turbidez equivalente al estándar de MacFarland. Los siguientes sustratos enzimáticos se ensayaron en cuanto a su sensibilidad por la \beta-glucosidasa: o-nitrofenil-\beta-D-glucopiranosido (ONPD) y 4-metilumbeliferona-\beta-D-glucopiranosido (MUD).
Los datos mostraron que el 4-metilumbeliferona-\beta-D-glucopiranosido era el sustrato más sensible a la actividad de la \beta-glucosidasa del enterococcus. Este sustrato cuando se excita a 315 \mum (monitorizado con una lámpara UV), da una fluorescencia azul después de la hidrólisis con \beta-glucosidasa.
Experimento 2
Se realizó un estudio usando la fórmula nutriente proporcionada en la tabla 1. Esto permitió la detección de los Enterococci a 1-2 cfu/100 ml en 16 a 22 horas (véase la tabla más adelante). Las muestras de agua se recogieron y se añadieron al medio descrito antes. Los recipientes de las muestras se incubaron después a 41ºC \pm 1ºC. Los recipientes de las muestras se monitorizaron para la aparición de la fluorescencia azul. Los resultados se muestran a continuación e indican la detección sensible de los Enterococci en un medio de esta invención.
Detección de enterococcus con un ensayo de enterococcus prototipo
Tiempo
Cepas Inóculo 16 h 18 h 20h 22 h
E. faecalis ATCC 33186 26 cfu; 100 ml + + + +
2,6 cfu/100 ml + + + +
E. faecium ATCC 35667 15 cfu/100 ml + + + +
1,5 cfu/100 ml + + + +
E. avium ATCC 35665 20 cfu/100 ml D + + +
2 cfu/100 ml - + + +
E. durans ATCC 6056 11 cfu/100 ml D + + +
1,1 cfu/100 ml - - D +
"+"-positivo; "-"- negativo; "D"- débil fluorescencia
Otras realizaciones están dentro del alcance de las siguientes reivindicaciones.

Claims (16)

1. Un medio para detectar la presencia o ausencia de Enterococci en una muestra licuada y no gelificada, que comprende:
a) alanina (de 0,015 a 0,055 g/l); arginina (de 0,01 a 0,04 g/l); ácido aspártico (de 0,04 a 0,10 g/l), cistina (de 0,001 a 0,005 g/l), ácido glutámico (de 0,05 a 0,15 g/l), glicina (de 0,01 a 0,03 g/l), histidina (de 0,010 a 0,06 g/l), isoleucina (de 0,01 a 0,10 g/l), leucina (aproximadamente de 0,03 a 0,08 g/l), lisina (aproximadamente de 0,03 a 0,07 g/l), metionina (aproximadamente de 0,01 a 0,04 g/l), fenilalanina (aproximadamente de 0,01 a 0,04 g/l), prolina (aproximadamente de 0,02 a 0,08 g/l), serina (aproximadamente de 0,01 a 0,05 g/l), treonina (aproximadamente de 0,01 a 0,04 g/l), triptófano (aproximadamente de 0,002 a 0,006 g/l), tirosina (aproximadamente de 0,01 a 0,02 g/l), y valina (aproximadamente de 0,02 a 0,05 g/l);
biotina (aproximadamente de 0,15 a 0,40 \mug/l), ácido pantoténico (aproximadamente de 45,0 a 65,0 \mug/l), piridoxina (aproximadamente de 6,0 a 9,0 \mug/l), riboflavina (aproximadamente de 10,0 a 20,0 \mug/l), ácido fólico (aproximadamente de 5,00 a 10,00 \mug/l), tiamina (aproximadamente de 10,0 a 20,0 \mug/l), vitamina B_{12} (aproximadamente de 0,20 a 0,30 \mug/l), y niacina (aproximadamente de 15,0 a 25,0 \mug/l).
fosfato (aproximadamente de 0,0005 a 0,005 g/l), potasio (aproximadamente de 0,0004 a 0,004 g/l), sodio (aproximadamente de 0,03 a 0,06 g/l), y trazas de calcio, magnesio, aluminio, bario, cloruro, cobalto, cobre, hierro, plomo, manganeso, sulfato, azufre, estaño y zinc;
b) una cantidad efectiva de uno o más indicadores nutrientes proporcionados en una cantidad suficiente para proporcionar una señal característica detectable en el medio durante el crecimiento de dichos Enterococci; liberando dicho indicador nutriente un resto nutriente en la presencia de \beta-glucosidasa; y
c) una cantidad efectiva de uno o más agentes selectivos, activos para evitar o inhibir el crecimiento de otros microorganismos distintos de los Enterococci
presentando dicho medio un cambio característico detectable antes de 24 horas en una muestra que contiene de 1 a 10 Enterococci por 100 ml.
2. El medio de la reivindicación 1, que comprende además: un tampón, de 4,0 a 6,0 g/litro de sulfato de amonio, una fuente de dióxido de carbono y de iones fósforo, una cantidad efectiva de un inductor de \beta-glucosidasa, una cantidad efectiva de antibióticos para inhibir el crecimiento de hongos y de bacterias gram positivas y gram negativas distintas de los Enterococci.
3. El medio de la reivindicación 1 o de la reivindicación 2, en el que dicho indicador nutriente se metaboliza hasta un resto que sirve como una fuente de nutrición y un resto que altera una característica observable de dicho medio.
4. El medio de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en el que dicho indicador nutriente altera el color de dicho medio en un intervalo de longitudes de onda del espectro visible por medio de la acción de la actividad de la \beta-glucosidasa.
5. El medio de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en el que dicho indicador nutriente altera el color de dicho medio en un intervalo de longitudes de onda del espectro no visible por medio de la acción de la actividad de la \beta-glucosidasa.
6. El medio de la reivindicación 5, en el que dicho indicador nutriente es 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido.
7. El medio de la reivindicación 1, que comprende además: un tampón, de 4,000 a 6,000 g/l de base nitrogenada de levaduras modificada, de 1,0 a 2,5 g/l de bicarbonato de sodio, de 0,1 a 1,0 g/l de fosfato de potasio, de 0,009 a 0,011 g/l de etil-\beta-D-tioglucósido, de 0,02 a 0,03 g/l de 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranosido, de 0,0045 a 0,0055 g/l de sulfato de amikacina, de 0,00198 a 0,00242 g/l de anfotericina B, y de 0,00476 a 0,00794 g/l de bacitracina.
8. Un método para detectar la presencia o ausencia de Enterococci en una muestra licuada y no gelificada, que comprende las etapas de:
a) poner en contacto una muestra líquida con el medio de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7;
b) incubar dicha muestra líquida y dicho medio; y
c) monitorizar dicha muestra líquida para determinar la presencia de un cambio detectable en una característica física
presentando dicho medio un cambio característico detectable antes de 24 horas en una muestra que contiene de 1 a 10 Enterococci por 100 ml.
9. El método de la reivindicación 8, en el que dicha etapa de monitorización dura un máximo de 24 horas.
10. El método de la reivindicación 8 o de la reivindicación 9, en el que dicha muestra líquida se toma de una fuente de agua fresca o marina.
11. El método de la reivindicación 8 o de la reivindicación 9, en el que dicha muestra líquida se toma de una fuente de aguas residuales.
12. El método de la reivindicación 8 o de la reivindicación 9, en el que dicha muestra líquida se toma de una fuente de agua potable.
13. El método de cualquiera de las reivindicaciones 8 a 12, en el que dicho cambio físico característico detectable es un cambio de color.
14. El método de cualquiera de las reivindicaciones 8 a 13, en el que dicho cambio físico característico detectable es un cambio de color visible en presencia de una fuente de luz de excitación.
15. El método de cualquiera de las reivindicaciones 8 a 14, en el que dicha etapa de incubación se realiza de 35ºC a 45ºC.
16. Un método para cuantificar la cantidad o el número de Enterococci presentes en una muestra líquida, no gelificada que comprende las etapas de:
a) poner en contacto una muestra líquida con el medio de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7;
b) poner dicha muestra líquida y dicho medio en recipientes;
c) incubar dicha mezcla de la muestra líquida y el medio;
d) observar la cantidad y calidad de un cambio detectable en una característica física; y
e) comparar la calidad y cantidad de un cambio detectable en dicha característica física con los valores numéricos más probables
presentando dicho medio un cambio característico detectable antes de 24 horas en una muestra que contiene de 1 a 10 Enterococci por 100 ml.
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Families Citing this family (32)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5429933A (en) 1986-06-30 1995-07-04 Edberg; Stephen C. Detection of first generation environmental sourced microbes in an environmentally-derived sample
WO1998004674A1 (en) * 1996-07-26 1998-02-05 Idexx Laboratories, Inc. METHOD AND MEDIUM FOR DETECTING VANCOMYCIN-RESISTANT $i(ENTEROCOCCUS)
US5837482A (en) * 1997-01-23 1998-11-17 Minnesota Mining And Manufacturing Company Culture medium and methods for detecting staphylococci
US6696286B1 (en) 1997-04-09 2004-02-24 3M Innovative Properties Company Method and devices for detecting and enumerating microorganisms
US6391578B2 (en) 1997-04-09 2002-05-21 3M Innovative Properties Company Method and devices for partitioning biological sample liquids into microvolumes
US6984499B2 (en) 1997-10-02 2006-01-10 Idexx Laboratories, Inc. Method and apparatus for concurrently detecting pathogenic organisms and antimicrobial susceptibility
GB2334100B (en) * 1998-02-10 2000-03-22 Praill Price Richardson Ltd Chromogenic substrates, media, and methods for the detection of salmonella spp
US5968762A (en) * 1998-03-19 1999-10-19 The University Of Connecticut Method for detecting bacteria in a sample
US5972641A (en) * 1998-08-28 1999-10-26 Colifast Systems Asa Rapid coliform detection system
US6511819B2 (en) 1998-08-28 2003-01-28 Nye Colifast As Rapid coliform detection system
US6174699B1 (en) 1999-03-09 2001-01-16 3M Innovative Properties Company Disc assay device with inoculation pad and methods of use
US8716558B2 (en) 1999-06-30 2014-05-06 Marker Gene Technologies, Inc. Method of altering glycosylation of proteins in response to nojirimycin glucuronide in a plant cell expressing glucuronidase
US6656917B1 (en) * 1999-06-30 2003-12-02 Marker Gene Technologies, Inc. Compositions and methods for targeted enzymatic release of cell regulatory compounds
US6402941B1 (en) * 2000-02-07 2002-06-11 Wastewater Biological Solutions, Corp Apparatus for biological treatment of environmental contaminants and waste
FR2826019B1 (fr) * 2001-06-13 2003-09-26 Alain Rambach Milieu de culture pour la detection et/ou la discrimination des enterocoques et procede de mise en oeuvre
US20030138906A1 (en) * 2001-11-05 2003-07-24 Ingun Tryland Fluorescence test for measuring heterotrophic bacteria in water
US7811783B2 (en) 2001-12-14 2010-10-12 Colifast As Rapid method of detection and enumeration of sulfide-producing bacteria in food products
US6632632B1 (en) * 2001-12-14 2003-10-14 Colifast As Rapid method of detection and enumeration of sulfide-producing bacteria in food products
EP1469872A4 (en) * 2002-01-10 2007-07-18 Idexx Lab Inc METHOD AND DEVICES FOR DETECTING PATHOGENIC MICROORGANISMS AND THEIR ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY
FR2845097B1 (fr) * 2002-10-01 2006-06-16 Metis Biotechnologies Procede de detection et de comptage de microorganismes dans un echantillon
CU23302A1 (es) 2003-01-10 2008-07-24 Ct Nac Biopreparados Medio de cultivo selectivo para el aislamiento y detecciã"n de especies del gã0/00nero streptococcus
JP2005130768A (ja) * 2003-10-30 2005-05-26 Kanto Chem Co Inc 腸球菌検出用培地
WO2006001716A1 (en) 2004-06-23 2006-01-05 Sharpin Rosemary Katherine Cam Improvements in and relating to micro-organism test apparatus and methods of using the same
JP4925590B2 (ja) * 2004-08-20 2012-04-25 デンカ生研株式会社 乳酸菌用培地
FR2881755B1 (fr) 2005-02-10 2012-11-30 Biomerieux Sa Milieux pour la detection specifique de micro-organismes resistants
FR2903421B1 (fr) * 2006-07-10 2008-10-03 Alain Rambach Milieu de culture solide pour la detection et/ou la discrimination au niveau de l'espece des enterocoques resistants aux glycopeptides
JP5118336B2 (ja) * 2006-11-28 2013-01-16 日水製薬株式会社 腸球菌検出用培地
WO2008076452A1 (en) 2006-12-19 2008-06-26 Becton, Dickinson And Company Chromogenic medium for the detection and identification of vancomycin resistant enterococci and method therfor
EP2062978A1 (en) 2007-11-23 2009-05-27 Nederlandse Organisatie voor toegepast- natuurwetenschappelijk onderzoek TNO System for detecting microbial contamination
GB0820398D0 (en) 2008-11-07 2008-12-17 Oxoid Ltd Semi-opaque medium for culture of microorganisms
US11306345B2 (en) 2015-07-21 2022-04-19 Xcellence in Bio Innovations and TechnologieS Pvt. Ltd. Invention relating to a microbiological testing apparatus
CN113832212A (zh) * 2021-09-10 2021-12-24 奎泰斯特(上海)科技有限公司 水中肠球菌酶底物法测定剂及其制备方法

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3206317A (en) * 1961-06-15 1965-09-14 Golber Leonard Mark Food spoilage indicator
US3496066A (en) * 1966-03-29 1970-02-17 Boehringer & Soehne Gmbh Diagnostic aids for use in the detection of bacteria in biological and other fluids
US4288543A (en) * 1977-01-28 1981-09-08 Pfizer Inc. Method and apparatus for identifying microorganisms
FR2405301A1 (fr) * 1977-10-04 1979-05-04 Api Labor Substrats et procede permettant l'identification rapide de bacteries du genre streptococcus
US4235964A (en) * 1978-09-28 1980-11-25 Bochner Barry R Method for testing and identifying microorganisms
JPS5817598B2 (ja) * 1979-10-31 1983-04-08 味の素株式会社 微生物の迅速検出方法
US4925789A (en) * 1986-06-30 1990-05-15 Edberg Stephen C Method and medium for use in detecting target microbes in situ in a specimen sample of a possibly contaminated material
US4912036A (en) * 1986-09-24 1990-03-27 Eastman Kodak Company Rapid differentiation of bacteria using cyclic polypeptide antibiotics
US5164301A (en) * 1990-06-22 1992-11-17 Difco Laboratories Process and kit for detecting microbial metabolism
FR2696476B1 (fr) * 1992-10-07 1994-12-16 Alain Rambach Nouveau milieu de culture pour la mise en évidence de E. coli et procédé pour son utilisation.
US5464755A (en) * 1994-04-29 1995-11-07 Biolog, Inc. Microbiological medium and method of assay

Also Published As

Publication number Publication date
WO1996015435A2 (en) 1996-05-23
ATE242476T1 (de) 2003-06-15
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DE69531007T2 (de) 2004-04-01
CA2204120A1 (en) 1996-05-23
BR9505075A (pt) 1997-10-21
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AR000061A1 (es) 1997-05-21
EP0871854A2 (en) 1998-10-21
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