EP2142662A2 - Milieu reactionnel pour l'identification/detection de microorganismes - Google Patents
Milieu reactionnel pour l'identification/detection de microorganismesInfo
- Publication number
- EP2142662A2 EP2142662A2 EP08805715A EP08805715A EP2142662A2 EP 2142662 A2 EP2142662 A2 EP 2142662A2 EP 08805715 A EP08805715 A EP 08805715A EP 08805715 A EP08805715 A EP 08805715A EP 2142662 A2 EP2142662 A2 EP 2142662A2
- Authority
- EP
- European Patent Office
- Prior art keywords
- cyclodextrin
- beta
- reaction medium
- bcd
- microorganisms
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Withdrawn
Links
- 239000012429 reaction media Substances 0.000 title claims abstract description 38
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 33
- 229920000858 Cyclodextrin Polymers 0.000 claims abstract description 121
- HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N schardinger α-dextrin Chemical compound O1C(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC(C(O)C2O)C(CO)OC2OC(C(C2O)O)C(CO)OC2OC2C(O)C(O)C1OC2CO HFHDHCJBZVLPGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 39
- 229960004853 betadex Drugs 0.000 claims description 59
- 239000001116 FEMA 4028 Substances 0.000 claims description 49
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 49
- WHGYBXFWUBPSRW-FOUAGVGXSA-N beta-cyclodextrin Chemical compound OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)CO)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO WHGYBXFWUBPSRW-FOUAGVGXSA-N 0.000 claims description 44
- 235000011175 beta-cyclodextrine Nutrition 0.000 claims description 43
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 26
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims description 25
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 claims description 21
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 claims description 21
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims description 21
- HFHDHCJBZVLPGP-RWMJIURBSA-N alpha-cyclodextrin Chemical compound OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)CO)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO HFHDHCJBZVLPGP-RWMJIURBSA-N 0.000 claims description 19
- GDSRMADSINPKSL-HSEONFRVSA-N gamma-cyclodextrin Chemical compound OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)CO)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO GDSRMADSINPKSL-HSEONFRVSA-N 0.000 claims description 19
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 15
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 15
- 229920001450 Alpha-Cyclodextrin Polymers 0.000 claims description 14
- 229940043377 alpha-cyclodextrin Drugs 0.000 claims description 14
- 229940080345 gamma-cyclodextrin Drugs 0.000 claims description 14
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 13
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 claims description 9
- ODLHGICHYURWBS-LKONHMLTSA-N trappsol cyclo Chemical compound CC(O)COC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](COCC(C)O)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](COCC(C)O)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](COCC(C)O)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](COCC(C)O)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)COCC(O)C)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1COCC(C)O ODLHGICHYURWBS-LKONHMLTSA-N 0.000 claims description 8
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 4
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 4
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 claims description 3
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 claims description 3
- 150000002959 penams Chemical class 0.000 claims description 3
- 150000001781 cephams Chemical class 0.000 claims description 2
- 238000002144 chemical decomposition reaction Methods 0.000 claims description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 39
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 23
- 229960003326 cloxacillin Drugs 0.000 description 18
- LQOLIRLGBULYKD-JKIFEVAISA-N cloxacillin Chemical compound N([C@@H]1C(N2[C@H](C(C)(C)S[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)C1=C(C)ON=C1C1=CC=CC=C1Cl LQOLIRLGBULYKD-JKIFEVAISA-N 0.000 description 18
- GNWUOVJNSFPWDD-XMZRARIVSA-M Cefoxitin sodium Chemical compound [Na+].N([C@]1(OC)C(N2C(=C(COC(N)=O)CS[C@@H]21)C([O-])=O)=O)C(=O)CC1=CC=CS1 GNWUOVJNSFPWDD-XMZRARIVSA-M 0.000 description 16
- 229960002682 cefoxitin Drugs 0.000 description 16
- -1 Penicillin Chemical class 0.000 description 14
- 229940097362 cyclodextrins Drugs 0.000 description 14
- 108090000371 Esterases Proteins 0.000 description 13
- 229960003022 amoxicillin Drugs 0.000 description 13
- LSQZJLSUYDQPKJ-NJBDSQKTSA-N amoxicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=C(O)C=C1 LSQZJLSUYDQPKJ-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 13
- LSQZJLSUYDQPKJ-UHFFFAOYSA-N p-Hydroxyampicillin Natural products O=C1N2C(C(O)=O)C(C)(C)SC2C1NC(=O)C(N)C1=CC=C(O)C=C1 LSQZJLSUYDQPKJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 9
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 9
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 9
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 9
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 7
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 6
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 6
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 5
- OQSNLLFOSPUBIA-RZBHUTHNSA-N 6-o-hopr-cmhdextrin Chemical compound O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.O.OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)COC[C@H](O)C)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO.OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)COC[C@H](O)C)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO.OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)COC[C@H](O)C)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO OQSNLLFOSPUBIA-RZBHUTHNSA-N 0.000 description 4
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 4
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 4
- 206010041925 Staphylococcal infections Diseases 0.000 description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 4
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 4
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 4
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 4
- 102000006995 beta-Glucosidase Human genes 0.000 description 4
- 108010047754 beta-Glucosidase Proteins 0.000 description 4
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 4
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 4
- PCKPVGOLPKLUHR-UHFFFAOYSA-N indoxyl Chemical group C1=CC=C2C(O)=CNC2=C1 PCKPVGOLPKLUHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 4
- 208000015688 methicillin-resistant staphylococcus aureus infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 4
- IQUPABOKLQSFBK-UHFFFAOYSA-N 2-nitrophenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O IQUPABOKLQSFBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000053187 Glucuronidase Human genes 0.000 description 3
- 108010060309 Glucuronidase Proteins 0.000 description 3
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 3
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 3
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 229960004261 cefotaxime Drugs 0.000 description 3
- AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M cefotaxime sodium Chemical compound [Na+].N([C@@H]1C(N2C(=C(COC(C)=O)CS[C@@H]21)C([O-])=O)=O)C(=O)\C(=N/OC)C1=CSC(N)=N1 AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M 0.000 description 3
- WZOZEZRFJCJXNZ-ZBFHGGJFSA-N cefoxitin Chemical compound N([C@]1(OC)C(N2C(=C(COC(N)=O)CS[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)CC1=CC=CS1 WZOZEZRFJCJXNZ-ZBFHGGJFSA-N 0.000 description 3
- 229960005090 cefpodoxime Drugs 0.000 description 3
- WYUSVOMTXWRGEK-HBWVYFAYSA-N cefpodoxime Chemical compound N([C@H]1[C@@H]2N(C1=O)C(=C(CS2)COC)C(O)=O)C(=O)C(=N/OC)\C1=CSC(N)=N1 WYUSVOMTXWRGEK-HBWVYFAYSA-N 0.000 description 3
- 229960000484 ceftazidime Drugs 0.000 description 3
- ORFOPKXBNMVMKC-DWVKKRMSSA-N ceftazidime Chemical compound S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C([O-])=O)=O)NC(=O)\C(=N/OC(C)(C)C(O)=O)C=2N=C(N)SC=2)CC=1C[N+]1=CC=CC=C1 ORFOPKXBNMVMKC-DWVKKRMSSA-N 0.000 description 3
- 229960004755 ceftriaxone Drugs 0.000 description 3
- VAAUVRVFOQPIGI-SPQHTLEESA-N ceftriaxone Chemical compound S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C(O)=O)=O)NC(=O)\C(=N/OC)C=2N=C(N)SC=2)CC=1CSC1=NC(=O)C(=O)NN1C VAAUVRVFOQPIGI-SPQHTLEESA-N 0.000 description 3
- 238000010668 complexation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 3
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 3
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- VBEGHXKAFSLLGE-UHFFFAOYSA-N n-phenylnitramide Chemical compound [O-][N+](=O)NC1=CC=CC=C1 VBEGHXKAFSLLGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 3
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 3
- YZOUYRAONFXZSI-SBHWVFSVSA-N (1S,3R,5R,6R,8R,10R,11R,13R,15R,16R,18R,20R,21R,23R,25R,26R,28R,30R,31S,33R,35R,36R,37S,38R,39S,40R,41S,42R,43S,44R,45S,46R,47S,48R,49S)-5,10,15,20,25,30,35-heptakis(hydroxymethyl)-37,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49-dodecamethoxy-2,4,7,9,12,14,17,19,22,24,27,29,32,34-tetradecaoxaoctacyclo[31.2.2.23,6.28,11.213,16.218,21.223,26.228,31]nonatetracontane-36,38-diol Chemical compound O([C@@H]([C@H]([C@@H]1OC)OC)O[C@H]2[C@@H](O)[C@@H]([C@@H](O[C@@H]3[C@@H](CO)O[C@@H]([C@H]([C@@H]3O)OC)O[C@@H]3[C@@H](CO)O[C@@H]([C@H]([C@@H]3OC)OC)O[C@@H]3[C@@H](CO)O[C@@H]([C@H]([C@@H]3OC)OC)O[C@@H]3[C@@H](CO)O[C@@H]([C@H]([C@@H]3OC)OC)O3)O[C@@H]2CO)OC)[C@H](CO)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](OC)[C@H](OC)[C@H]3[C@@H](CO)O1 YZOUYRAONFXZSI-SBHWVFSVSA-N 0.000 description 2
- KJCVRFUGPWSIIH-UHFFFAOYSA-N 1-naphthol Chemical compound C1=CC=C2C(O)=CC=CC2=C1 KJCVRFUGPWSIIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RUFPHBVGCFYCNW-UHFFFAOYSA-N 1-naphthylamine Chemical compound C1=CC=C2C(N)=CC=CC2=C1 RUFPHBVGCFYCNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZIIUUSVHCHPIQD-UHFFFAOYSA-N 2,4,6-trimethyl-N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzenesulfonamide Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1S(=O)(=O)NC1=CC=CC(C(F)(F)F)=C1 ZIIUUSVHCHPIQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JWAZRIHNYRIHIV-UHFFFAOYSA-N 2-naphthol Chemical compound C1=CC=CC2=CC(O)=CC=C21 JWAZRIHNYRIHIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JFGQHAHJWJBOPD-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-n-phenylnaphthalene-2-carboxamide Chemical compound OC1=CC2=CC=CC=C2C=C1C(=O)NC1=CC=CC=C1 JFGQHAHJWJBOPD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HSHNITRMYYLLCV-UHFFFAOYSA-N 4-methylumbelliferone Chemical compound C1=C(O)C=CC2=C1OC(=O)C=C2C HSHNITRMYYLLCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OPIFSICVWOWJMJ-LNNRFACYSA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-glucoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-LNNRFACYSA-N 0.000 description 2
- RGCKGOZRHPZPFP-UHFFFAOYSA-N Alizarin Natural products C1=CC=C2C(=O)C3=C(O)C(O)=CC=C3C(=O)C2=C1 RGCKGOZRHPZPFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229930186147 Cephalosporin Natural products 0.000 description 2
- ULGZDMOVFRHVEP-RWJQBGPGSA-N Erythromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)C[C@@](C)(O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 ULGZDMOVFRHVEP-RWJQBGPGSA-N 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 102000004366 Glucosidases Human genes 0.000 description 2
- 108010056771 Glucosidases Proteins 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N Methicillin Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N 0.000 description 2
- MVTQIFVKRXBCHS-SMMNFGSLSA-N N-[(3S,6S,12R,15S,16R,19S,22S)-3-benzyl-12-ethyl-4,16-dimethyl-2,5,11,14,18,21,24-heptaoxo-19-phenyl-17-oxa-1,4,10,13,20-pentazatricyclo[20.4.0.06,10]hexacosan-15-yl]-3-hydroxypyridine-2-carboxamide (10R,11R,12E,17E,19E,21S)-21-hydroxy-11,19-dimethyl-10-propan-2-yl-9,26-dioxa-3,15,28-triazatricyclo[23.2.1.03,7]octacosa-1(27),6,12,17,19,25(28)-hexaene-2,8,14,23-tetrone Chemical compound CC(C)[C@H]1OC(=O)C2=CCCN2C(=O)c2coc(CC(=O)C[C@H](O)\C=C(/C)\C=C\CNC(=O)\C=C\[C@H]1C)n2.CC[C@H]1NC(=O)[C@@H](NC(=O)c2ncccc2O)[C@@H](C)OC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H]2CC(=O)CCN2C(=O)[C@H](Cc2ccccc2)N(C)C(=O)[C@@H]2CCCN2C1=O)c1ccccc1 MVTQIFVKRXBCHS-SMMNFGSLSA-N 0.000 description 2
- 108010064785 Phospholipases Proteins 0.000 description 2
- 102000015439 Phospholipases Human genes 0.000 description 2
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 2
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 2
- 102000004879 Racemases and epimerases Human genes 0.000 description 2
- 108090001066 Racemases and epimerases Proteins 0.000 description 2
- 229930189077 Rifamycin Natural products 0.000 description 2
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 2
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 2
- 102000005262 Sulfatase Human genes 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HFVAFDPGUJEFBQ-UHFFFAOYSA-M alizarin red S Chemical compound [Na+].O=C1C2=CC=CC=C2C(=O)C2=C1C=C(S([O-])(=O)=O)C(O)=C2O HFVAFDPGUJEFBQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102000019199 alpha-Mannosidase Human genes 0.000 description 2
- 108010012864 alpha-Mannosidase Proteins 0.000 description 2
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 229940124587 cephalosporin Drugs 0.000 description 2
- 150000001780 cephalosporins Chemical class 0.000 description 2
- 238000011208 chromatographic data Methods 0.000 description 2
- MYSWGUAQZAJSOK-UHFFFAOYSA-N ciprofloxacin Chemical compound C12=CC(N3CCNCC3)=C(F)C=C2C(=O)C(C(=O)O)=CN1C1CC1 MYSWGUAQZAJSOK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001066 destructive effect Effects 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 238000011066 ex-situ storage Methods 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 229960003085 meticillin Drugs 0.000 description 2
- 239000006225 natural substrate Substances 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 108060007951 sulfatase Proteins 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- IEDVJHCEMCRBQM-UHFFFAOYSA-N trimethoprim Chemical compound COC1=C(OC)C(OC)=CC(CC=2C(=NC(N)=NC=2)N)=C1 IEDVJHCEMCRBQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960001082 trimethoprim Drugs 0.000 description 2
- GSXRBRIWJGAPDU-BBVRJQLQSA-N tyrocidine A Chemical compound C([C@H]1C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCN)C(=O)N[C@H](C(N[C@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N2CCC[C@H]2C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1)=O)CC(C)C)C(C)C)C1=CC=C(O)C=C1 GSXRBRIWJGAPDU-BBVRJQLQSA-N 0.000 description 2
- SGKRLCUYIXIAHR-AKNGSSGZSA-N (4s,4ar,5s,5ar,6r,12ar)-4-(dimethylamino)-1,5,10,11,12a-pentahydroxy-6-methyl-3,12-dioxo-4a,5,5a,6-tetrahydro-4h-tetracene-2-carboxamide Chemical compound C1=CC=C2[C@H](C)[C@@H]([C@H](O)[C@@H]3[C@](C(O)=C(C(N)=O)C(=O)[C@H]3N(C)C)(O)C3=O)C3=C(O)C2=C1O SGKRLCUYIXIAHR-AKNGSSGZSA-N 0.000 description 1
- FFTVPQUHLQBXQZ-KVUCHLLUSA-N (4s,4as,5ar,12ar)-4,7-bis(dimethylamino)-1,10,11,12a-tetrahydroxy-3,12-dioxo-4a,5,5a,6-tetrahydro-4h-tetracene-2-carboxamide Chemical compound C1C2=C(N(C)C)C=CC(O)=C2C(O)=C2[C@@H]1C[C@H]1[C@H](N(C)C)C(=O)C(C(N)=O)=C(O)[C@@]1(O)C2=O FFTVPQUHLQBXQZ-KVUCHLLUSA-N 0.000 description 1
- CJNPEPJBIHGEMU-UHFFFAOYSA-N (5-bromo-6-chloro-1h-indol-3-yl) dihydrogen phosphate Chemical compound ClC1=C(Br)C=C2C(OP(O)(=O)O)=CNC2=C1 CJNPEPJBIHGEMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FICBLGOBWCGQKR-SCSAIBSYSA-N (5R)-3-oxa-4-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptan-7-one Chemical compound S1OCN2C(=O)C[C@H]21 FICBLGOBWCGQKR-SCSAIBSYSA-N 0.000 description 1
- RXZBMPWDPOLZGW-XMRMVWPWSA-N (E)-roxithromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)C(=N/OCOCCOC)/[C@H](C)C[C@@](C)(O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 RXZBMPWDPOLZGW-XMRMVWPWSA-N 0.000 description 1
- IZXIZTKNFFYFOF-UHFFFAOYSA-N 2-Oxazolidone Chemical class O=C1NCCO1 IZXIZTKNFFYFOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ACTOXUHEUCPTEW-BWHGAVFKSA-N 2-[(4r,5s,6s,7r,9r,10r,11e,13e,16r)-6-[(2s,3r,4r,5s,6r)-5-[(2s,4r,5s,6s)-4,5-dihydroxy-4,6-dimethyloxan-2-yl]oxy-4-(dimethylamino)-3-hydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-10-[(2s,5s,6r)-5-(dimethylamino)-6-methyloxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-5-methoxy-9,16-dimethyl-2-o Chemical compound O([C@H]1/C=C/C=C/C[C@@H](C)OC(=O)C[C@@H](O)[C@@H]([C@H]([C@@H](CC=O)C[C@H]1C)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H](O[C@@H]2O[C@@H](C)[C@H](O)[C@](C)(O)C2)[C@@H](C)O1)N(C)C)O)OC)[C@@H]1CC[C@H](N(C)C)[C@@H](C)O1 ACTOXUHEUCPTEW-BWHGAVFKSA-N 0.000 description 1
- DZMQPTZCBQTBKV-UHFFFAOYSA-N 2-[6-(carboxymethyl)-1,6-dihydroxy-4-(4-oxochromen-2-yl)cyclohexa-2,4-dien-1-yl]acetic acid Chemical compound OC(=O)CC1(O)C(CC(=O)O)(O)C=CC(C=2OC3=CC=CC=C3C(=O)C=2)=C1 DZMQPTZCBQTBKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CDAWCLOXVUBKRW-UHFFFAOYSA-N 2-aminophenol Chemical compound NC1=CC=CC=C1O CDAWCLOXVUBKRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FUBFWTUFPGFHOJ-UHFFFAOYSA-N 2-nitrofuran Chemical class [O-][N+](=O)C1=CC=CO1 FUBFWTUFPGFHOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QWZHDKGQKYEBKK-UHFFFAOYSA-N 3-aminochromen-2-one Chemical class C1=CC=C2OC(=O)C(N)=CC2=C1 QWZHDKGQKYEBKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MJKVTPMWOKAVMS-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-1-benzopyran-2-one Chemical class C1=CC=C2OC(=O)C(O)=CC2=C1 MJKVTPMWOKAVMS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ARQXEQLMMNGFDU-JHZZJYKESA-N 4-methylumbelliferone beta-D-glucuronide Chemical compound C1=CC=2C(C)=CC(=O)OC=2C=C1O[C@@H]1O[C@H](C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O ARQXEQLMMNGFDU-JHZZJYKESA-N 0.000 description 1
- YUDPTGPSBJVHCN-DZQJYWQESA-N 4-methylumbelliferyl beta-D-galactoside Chemical compound C1=CC=2C(C)=CC(=O)OC=2C=C1O[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O YUDPTGPSBJVHCN-DZQJYWQESA-N 0.000 description 1
- YUDPTGPSBJVHCN-YMILTQATSA-N 4-methylumbelliferyl beta-D-glucoside Chemical compound C1=CC=2C(C)=CC(=O)OC=2C=C1O[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O YUDPTGPSBJVHCN-YMILTQATSA-N 0.000 description 1
- BTJIUGUIPKRLHP-UHFFFAOYSA-N 4-nitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 BTJIUGUIPKRLHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SUWPNTKTZYIFQT-XZINFULNSA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl N-acetyl-beta-D-glucosaminide Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 SUWPNTKTZYIFQT-XZINFULNSA-N 0.000 description 1
- OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-galactoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 0.000 description 1
- YLDFTMJPQJXGSS-UHFFFAOYSA-N 6-bromo-2-naphthol Chemical compound C1=C(Br)C=CC2=CC(O)=CC=C21 YLDFTMJPQJXGSS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GSDSWSVVBLHKDQ-UHFFFAOYSA-N 9-fluoro-3-methyl-10-(4-methylpiperazin-1-yl)-7-oxo-2,3-dihydro-7H-[1,4]oxazino[2,3,4-ij]quinoline-6-carboxylic acid Chemical compound FC1=CC(C(C(C(O)=O)=C2)=O)=C3N2C(C)COC3=C1N1CCN(C)CC1 GSDSWSVVBLHKDQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DPSPPJIUMHPXMA-UHFFFAOYSA-N 9-fluoro-5-methyl-1-oxo-6,7-dihydro-1H,5H-pyrido[3,2,1-ij]quinoline-2-carboxylic acid Chemical compound C1CC(C)N2C=C(C(O)=O)C(=O)C3=C2C1=CC(F)=C3 DPSPPJIUMHPXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000589291 Acinetobacter Species 0.000 description 1
- 241000606750 Actinobacillus Species 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 241000607534 Aeromonas Species 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 241000588986 Alcaligenes Species 0.000 description 1
- 102000003677 Aldehyde-Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090000072 Aldehyde-Lyases Proteins 0.000 description 1
- 108090000915 Aminopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000004400 Aminopeptidases Human genes 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- WZPBZJONDBGPKJ-UHFFFAOYSA-N Antibiotic SQ 26917 Natural products O=C1N(S(O)(=O)=O)C(C)C1NC(=O)C(=NOC(C)(C)C(O)=O)C1=CSC(N)=N1 WZPBZJONDBGPKJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 108010001478 Bacitracin Proteins 0.000 description 1
- 241000588807 Bordetella Species 0.000 description 1
- 241001453380 Burkholderia Species 0.000 description 1
- COXVTLYNGOIATD-HVMBLDELSA-N CC1=C(C=CC(=C1)C1=CC(C)=C(C=C1)\N=N\C1=C(O)C2=C(N)C(=CC(=C2C=C1)S(O)(=O)=O)S(O)(=O)=O)\N=N\C1=CC=C2C(=CC(=C(N)C2=C1O)S(O)(=O)=O)S(O)(=O)=O Chemical compound CC1=C(C=CC(=C1)C1=CC(C)=C(C=C1)\N=N\C1=C(O)C2=C(N)C(=CC(=C2C=C1)S(O)(=O)=O)S(O)(=O)=O)\N=N\C1=CC=C2C(=CC(=C(N)C2=C1O)S(O)(=O)=O)S(O)(=O)=O COXVTLYNGOIATD-HVMBLDELSA-N 0.000 description 1
- 108010049990 CD13 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 241000589876 Campylobacter Species 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004031 Carboxy-Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090000489 Carboxy-Lyases Proteins 0.000 description 1
- 241000046135 Cedecea Species 0.000 description 1
- QYQDKDWGWDOFFU-IUODEOHRSA-N Cefotiam Chemical compound CN(C)CCN1N=NN=C1SCC1=C(C(O)=O)N2C(=O)[C@@H](NC(=O)CC=3N=C(N)SC=3)[C@H]2SC1 QYQDKDWGWDOFFU-IUODEOHRSA-N 0.000 description 1
- 241000588923 Citrobacter Species 0.000 description 1
- HZZVJAQRINQKSD-UHFFFAOYSA-N Clavulanic acid Natural products OC(=O)C1C(=CCO)OC2CC(=O)N21 HZZVJAQRINQKSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000193403 Clostridium Species 0.000 description 1
- 108010078777 Colistin Proteins 0.000 description 1
- 241001527609 Cryptococcus Species 0.000 description 1
- 108020005199 Dehydrogenases Proteins 0.000 description 1
- JWCSIUVGFCSJCK-CAVRMKNVSA-N Disodium Moxalactam Chemical compound N([C@]1(OC)C(N2C(=C(CSC=3N(N=NN=3)C)CO[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)C(C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 JWCSIUVGFCSJCK-CAVRMKNVSA-N 0.000 description 1
- 241000607473 Edwardsiella <enterobacteria> Species 0.000 description 1
- 241000588914 Enterobacter Species 0.000 description 1
- 241000194033 Enterococcus Species 0.000 description 1
- 244000024675 Eruca sativa Species 0.000 description 1
- 235000014755 Eruca sativa Nutrition 0.000 description 1
- 241000588698 Erwinia Species 0.000 description 1
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 1
- IECPWNUMDGFDKC-UHFFFAOYSA-N Fusicsaeure Natural products C12C(O)CC3C(=C(CCC=C(C)C)C(O)=O)C(OC(C)=O)CC3(C)C1(C)CCC1C2(C)CCC(O)C1C IECPWNUMDGFDKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000207202 Gardnerella Species 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 108010015899 Glycopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000002068 Glycopeptides Human genes 0.000 description 1
- 241000606790 Haemophilus Species 0.000 description 1
- 241000588731 Hafnia Species 0.000 description 1
- 102000002268 Hexosaminidases Human genes 0.000 description 1
- 108010000540 Hexosaminidases Proteins 0.000 description 1
- 102000004867 Hydro-Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090001042 Hydro-Lyases Proteins 0.000 description 1
- 108010020056 Hydrogenase Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 102000005385 Intramolecular Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108010031311 Intramolecular Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 1
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 description 1
- 241000588915 Klebsiella aerogenes Species 0.000 description 1
- 241000579722 Kocuria Species 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 241000194036 Lactococcus Species 0.000 description 1
- 241000589248 Legionella Species 0.000 description 1
- 208000007764 Legionnaires' Disease Diseases 0.000 description 1
- 241000192132 Leuconostoc Species 0.000 description 1
- GSDSWSVVBLHKDQ-JTQLQIEISA-N Levofloxacin Chemical compound C([C@@H](N1C2=C(C(C(C(O)=O)=C1)=O)C=C1F)C)OC2=C1N1CCN(C)CC1 GSDSWSVVBLHKDQ-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- OJMMVQQUTAEWLP-UHFFFAOYSA-N Lincomycin Natural products CN1CC(CCC)CC1C(=O)NC(C(C)O)C1C(O)C(O)C(O)C(SC)O1 OJMMVQQUTAEWLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004317 Lyases Human genes 0.000 description 1
- 108090000856 Lyases Proteins 0.000 description 1
- 239000006154 MacConkey agar Substances 0.000 description 1
- IPWKIXLWTCNBKN-UHFFFAOYSA-N Madelen Chemical compound CC1=NC=C([N+]([O-])=O)N1CC(O)CCl IPWKIXLWTCNBKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100024295 Maltase-glucoamylase Human genes 0.000 description 1
- 241000192041 Micrococcus Species 0.000 description 1
- 241000588621 Moraxella Species 0.000 description 1
- 241000588771 Morganella <proteobacterium> Species 0.000 description 1
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 description 1
- KYGZCKSPAKDVKC-UHFFFAOYSA-N Oxolinic acid Chemical compound C1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CC2=C1OCO2 KYGZCKSPAKDVKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000417 Oxygenases Proteins 0.000 description 1
- 102000004020 Oxygenases Human genes 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000520272 Pantoea Species 0.000 description 1
- 241000606860 Pasteurella Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 108700020962 Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108010079780 Pristinamycin Proteins 0.000 description 1
- RLNUPSVMIYRZSM-UHFFFAOYSA-N Pristinamycin Natural products CC1OC(=O)C(C=2C=CC=CC=2)NC(=O)C2CC(=O)CCN2C(=O)C(CC=2C=CC(=CC=2)N(C)C)CCN(C)C(=O)C2CCCN2C(=O)C(CC)NC(=O)C1NC(=O)C1=NC=CC=C1O RLNUPSVMIYRZSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 1
- 241000588769 Proteus <enterobacteria> Species 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 241000232299 Ralstonia Species 0.000 description 1
- 108091007187 Reductases Proteins 0.000 description 1
- URWAJWIAIPFPJE-UHFFFAOYSA-N Rickamicin Natural products O1CC(O)(C)C(NC)C(O)C1OC1C(O)C(OC2C(CC=C(CN)O2)N)C(N)CC1N URWAJWIAIPFPJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006159 Sabouraud's agar Substances 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- 241000607720 Serratia Species 0.000 description 1
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 1
- 229930192786 Sisomicin Natural products 0.000 description 1
- 239000004187 Spiramycin Substances 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 241000122971 Stenotrophomonas Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 108010053950 Teicoplanin Proteins 0.000 description 1
- WKDDRNSBRWANNC-UHFFFAOYSA-N Thienamycin Natural products C1C(SCCN)=C(C(O)=O)N2C(=O)C(C(O)C)C21 WKDDRNSBRWANNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GWEVSGVZZGPLCZ-UHFFFAOYSA-N Titan oxide Chemical compound O=[Ti]=O GWEVSGVZZGPLCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 1
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 241000223230 Trichosporon Species 0.000 description 1
- 102100040653 Tryptophan 2,3-dioxygenase Human genes 0.000 description 1
- 101710136122 Tryptophan 2,3-dioxygenase Proteins 0.000 description 1
- 108010076164 Tyrocidine Proteins 0.000 description 1
- 108010021006 Tyrothricin Proteins 0.000 description 1
- 108010059993 Vancomycin Proteins 0.000 description 1
- 241000607598 Vibrio Species 0.000 description 1
- 239000004188 Virginiamycin Substances 0.000 description 1
- 108010080702 Virginiamycin Proteins 0.000 description 1
- 229920004482 WACKER® Polymers 0.000 description 1
- 206010052428 Wound Diseases 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 241000589634 Xanthomonas Species 0.000 description 1
- 241000607734 Yersinia <bacteria> Species 0.000 description 1
- QNHQEUFMIKRNTB-UHFFFAOYSA-N aesculetin Natural products C1CC(=O)OC2=C1C=C(O)C(O)=C2 QNHQEUFMIKRNTB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUAFOGOEJLSQBT-UHFFFAOYSA-N aesculetin dimethyl ether Natural products C1=CC(=O)OC2=C1C=C(OC)C(OC)=C2 GUAFOGOEJLSQBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000005840 alpha-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010030291 alpha-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 108010028144 alpha-Glucosidases Proteins 0.000 description 1
- 229960004821 amikacin Drugs 0.000 description 1
- LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N amikacin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)[C@@H](O)CCN)[C@H]1O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 229940126575 aminoglycoside Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 1
- 229960004099 azithromycin Drugs 0.000 description 1
- MQTOSJVFKKJCRP-BICOPXKESA-N azithromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)N(C)C[C@H](C)C[C@@](C)(O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 MQTOSJVFKKJCRP-BICOPXKESA-N 0.000 description 1
- 229960003623 azlocillin Drugs 0.000 description 1
- JTWOMNBEOCYFNV-NFFDBFGFSA-N azlocillin Chemical compound N([C@@H](C(=O)N[C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C=1C=CC=CC=1)C(=O)N1CCNC1=O JTWOMNBEOCYFNV-NFFDBFGFSA-N 0.000 description 1
- WZPBZJONDBGPKJ-VEHQQRBSSA-N aztreonam Chemical compound O=C1N(S([O-])(=O)=O)[C@@H](C)[C@@H]1NC(=O)C(=N/OC(C)(C)C(O)=O)\C1=CSC([NH3+])=N1 WZPBZJONDBGPKJ-VEHQQRBSSA-N 0.000 description 1
- 229960003644 aztreonam Drugs 0.000 description 1
- PFOLLRNADZZWEX-FFGRCDKISA-N bacampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@@H]3N(C2=O)[C@H](C(S3)(C)C)C(=O)OC(C)OC(=O)OCC)=CC=CC=C1 PFOLLRNADZZWEX-FFGRCDKISA-N 0.000 description 1
- 229960002699 bacampicillin Drugs 0.000 description 1
- 229960003071 bacitracin Drugs 0.000 description 1
- 229930184125 bacitracin Natural products 0.000 description 1
- CLKOFPXJLQSYAH-ABRJDSQDSA-N bacitracin A Chemical compound C1SC([C@@H](N)[C@@H](C)CC)=N[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2N=CNC=2)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCCCC1 CLKOFPXJLQSYAH-ABRJDSQDSA-N 0.000 description 1
- 239000003782 beta lactam antibiotic agent Substances 0.000 description 1
- 102000007478 beta-N-Acetylhexosaminidases Human genes 0.000 description 1
- 108010085377 beta-N-Acetylhexosaminidases Proteins 0.000 description 1
- 235000013361 beverage Nutrition 0.000 description 1
- 238000005842 biochemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229960001506 brilliant green Drugs 0.000 description 1
- HXCILVUBKWANLN-UHFFFAOYSA-N brilliant green cation Chemical compound C1=CC(N(CC)CC)=CC=C1C(C=1C=CC=CC=1)=C1C=CC(=[N+](CC)CC)C=C1 HXCILVUBKWANLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 1
- QYIYFLOTGYLRGG-GPCCPHFNSA-N cefaclor Chemical compound C1([C@H](C(=O)N[C@@H]2C(N3C(=C(Cl)CS[C@@H]32)C(O)=O)=O)N)=CC=CC=C1 QYIYFLOTGYLRGG-GPCCPHFNSA-N 0.000 description 1
- 229960005361 cefaclor Drugs 0.000 description 1
- 229960004841 cefadroxil Drugs 0.000 description 1
- NBFNMSULHIODTC-CYJZLJNKSA-N cefadroxil monohydrate Chemical compound O.C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@@H]3N(C2=O)C(=C(CS3)C)C(O)=O)=CC=C(O)C=C1 NBFNMSULHIODTC-CYJZLJNKSA-N 0.000 description 1
- XIURVHNZVLADCM-IUODEOHRSA-N cefalotin Chemical compound N([C@H]1[C@@H]2N(C1=O)C(=C(CS2)COC(=O)C)C(O)=O)C(=O)CC1=CC=CS1 XIURVHNZVLADCM-IUODEOHRSA-N 0.000 description 1
- 229960003012 cefamandole Drugs 0.000 description 1
- OLVCFLKTBJRLHI-AXAPSJFSSA-N cefamandole Chemical compound CN1N=NN=C1SCC1=C(C(O)=O)N2C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](O)C=3C=CC=CC=3)[C@H]2SC1 OLVCFLKTBJRLHI-AXAPSJFSSA-N 0.000 description 1
- UOCJDOLVGGIYIQ-PBFPGSCMSA-N cefatrizine Chemical compound S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C(O)=O)=O)NC(=O)[C@H](N)C=2C=CC(O)=CC=2)CC=1CSC=1C=NNN=1 UOCJDOLVGGIYIQ-PBFPGSCMSA-N 0.000 description 1
- 229960002420 cefatrizine Drugs 0.000 description 1
- 229960001139 cefazolin Drugs 0.000 description 1
- MLYYVTUWGNIJIB-BXKDBHETSA-N cefazolin Chemical compound S1C(C)=NN=C1SCC1=C(C(O)=O)N2C(=O)[C@@H](NC(=O)CN3N=NN=C3)[C@H]2SC1 MLYYVTUWGNIJIB-BXKDBHETSA-N 0.000 description 1
- 229960002129 cefixime Drugs 0.000 description 1
- OKBVVJOGVLARMR-QSWIMTSFSA-N cefixime Chemical compound S1C(N)=NC(C(=N\OCC(O)=O)\C(=O)N[C@@H]2C(N3C(=C(C=C)CS[C@@H]32)C(O)=O)=O)=C1 OKBVVJOGVLARMR-QSWIMTSFSA-N 0.000 description 1
- 229960004682 cefoperazone Drugs 0.000 description 1
- GCFBRXLSHGKWDP-XCGNWRKASA-N cefoperazone Chemical compound O=C1C(=O)N(CC)CCN1C(=O)N[C@H](C=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2C(C(O)=O)=C(CSC=3N(N=NN=3)C)CS[C@@H]21 GCFBRXLSHGKWDP-XCGNWRKASA-N 0.000 description 1
- 229960005495 cefotetan Drugs 0.000 description 1
- SRZNHPXWXCNNDU-RHBCBLIFSA-N cefotetan Chemical compound N([C@]1(OC)C(N2C(=C(CSC=3N(N=NN=3)C)CS[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)C1SC(=C(C(N)=O)C(O)=O)S1 SRZNHPXWXCNNDU-RHBCBLIFSA-N 0.000 description 1
- 229960001242 cefotiam Drugs 0.000 description 1
- SYLKGLMBLAAGSC-QLVMHMETSA-N cefsulodin Chemical compound C1=CC(C(=O)N)=CC=[N+]1CC1=C(C([O-])=O)N2C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](C=3C=CC=CC=3)S(O)(=O)=O)[C@H]2SC1 SYLKGLMBLAAGSC-QLVMHMETSA-N 0.000 description 1
- 229960003202 cefsulodin Drugs 0.000 description 1
- 229960001668 cefuroxime Drugs 0.000 description 1
- JFPVXVDWJQMJEE-IZRZKJBUSA-N cefuroxime Chemical compound N([C@@H]1C(N2C(=C(COC(N)=O)CS[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)\C(=N/OC)C1=CC=CO1 JFPVXVDWJQMJEE-IZRZKJBUSA-N 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 229940106164 cephalexin Drugs 0.000 description 1
- ZAIPMKNFIOOWCQ-UEKVPHQBSA-N cephalexin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@@H]3N(C2=O)C(=C(CS3)C)C(O)=O)=CC=CC=C1 ZAIPMKNFIOOWCQ-UEKVPHQBSA-N 0.000 description 1
- 150000001782 cephems Chemical class 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 1
- NPGNOVNWUSPMDP-UTEPHESZSA-N chembl1650818 Chemical compound N(/[C@H]1[C@@H]2N(C1=O)[C@H](C(S2)(C)C)C(=O)OCOC(=O)C(C)(C)C)=C\N1CCCCCC1 NPGNOVNWUSPMDP-UTEPHESZSA-N 0.000 description 1
- DDTDNCYHLGRFBM-YZEKDTGTSA-N chembl2367892 Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]([C@H]1C(N[C@@H](C2=CC(O)=CC(O[C@@H]3[C@H]([C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)O)=C2C=2C(O)=CC=C(C=2)[C@@H](NC(=O)[C@@H]2NC(=O)[C@@H]3C=4C=C(O)C=C(C=4)OC=4C(O)=CC=C(C=4)[C@@H](N)C(=O)N[C@H](CC=4C=C(Cl)C(O5)=CC=4)C(=O)N3)C(=O)N1)C(O)=O)=O)C(C=C1Cl)=CC=C1OC1=C(O[C@H]3[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O3)NC(C)=O)C5=CC2=C1 DDTDNCYHLGRFBM-YZEKDTGTSA-N 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 229960003405 ciprofloxacin Drugs 0.000 description 1
- 229960002626 clarithromycin Drugs 0.000 description 1
- AGOYDEPGAOXOCK-KCBOHYOISA-N clarithromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)C[C@](C)([C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)OC)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 AGOYDEPGAOXOCK-KCBOHYOISA-N 0.000 description 1
- HZZVJAQRINQKSD-PBFISZAISA-N clavulanic acid Chemical compound OC(=O)[C@H]1C(=C/CO)/O[C@@H]2CC(=O)N21 HZZVJAQRINQKSD-PBFISZAISA-N 0.000 description 1
- 229960003324 clavulanic acid Drugs 0.000 description 1
- 229960002227 clindamycin Drugs 0.000 description 1
- KDLRVYVGXIQJDK-AWPVFWJPSA-N clindamycin Chemical compound CN1C[C@H](CCC)C[C@H]1C(=O)N[C@H]([C@H](C)Cl)[C@@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](SC)O1 KDLRVYVGXIQJDK-AWPVFWJPSA-N 0.000 description 1
- 229960003346 colistin Drugs 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- 239000007382 columbia agar Substances 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 description 1
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 1
- GLNDAGDHSLMOKX-UHFFFAOYSA-N coumarin 120 Chemical compound C1=C(N)C=CC2=C1OC(=O)C=C2C GLNDAGDHSLMOKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000593 degrading effect Effects 0.000 description 1
- 229960003807 dibekacin Drugs 0.000 description 1
- JJCQSGDBDPYCEO-XVZSLQNASA-N dibekacin Chemical compound O1[C@H](CN)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N JJCQSGDBDPYCEO-XVZSLQNASA-N 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- AIUDWMLXCFRVDR-UHFFFAOYSA-N dimethyl 2-(3-ethyl-3-methylpentyl)propanedioate Chemical class CCC(C)(CC)CCC(C(=O)OC)C(=O)OC AIUDWMLXCFRVDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003722 doxycycline Drugs 0.000 description 1
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229960002549 enoxacin Drugs 0.000 description 1
- IDYZIJYBMGIQMJ-UHFFFAOYSA-N enoxacin Chemical compound N1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CC(F)=C1N1CCNCC1 IDYZIJYBMGIQMJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940092559 enterobacter aerogenes Drugs 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 229960003276 erythromycin Drugs 0.000 description 1
- ILEDWLMCKZNDJK-UHFFFAOYSA-N esculetin Chemical compound C1=CC(=O)OC2=C1C=C(O)C(O)=C2 ILEDWLMCKZNDJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003699 evans blue Drugs 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 229960000702 flumequine Drugs 0.000 description 1
- 229940124307 fluoroquinolone Drugs 0.000 description 1
- 235000015203 fruit juice Nutrition 0.000 description 1
- 229960004675 fusidic acid Drugs 0.000 description 1
- IECPWNUMDGFDKC-MZJAQBGESA-N fusidic acid Chemical compound O[C@@H]([C@@H]12)C[C@H]3\C(=C(/CCC=C(C)C)C(O)=O)[C@@H](OC(C)=O)C[C@]3(C)[C@@]2(C)CC[C@@H]2[C@]1(C)CC[C@@H](O)[C@H]2C IECPWNUMDGFDKC-MZJAQBGESA-N 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 239000003349 gelling agent Substances 0.000 description 1
- 229930182480 glucuronide Natural products 0.000 description 1
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 1
- CJNBYAVZURUTKZ-UHFFFAOYSA-N hafnium(IV) oxide Inorganic materials O=[Hf]=O CJNBYAVZURUTKZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003505 heat denaturation Methods 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 229960002182 imipenem Drugs 0.000 description 1
- ZSKVGTPCRGIANV-ZXFLCMHBSA-N imipenem Chemical compound C1C(SCC\N=C\N)=C(C(O)=O)N2C(=O)[C@H]([C@H](O)C)[C@H]21 ZSKVGTPCRGIANV-ZXFLCMHBSA-N 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960004144 josamycin Drugs 0.000 description 1
- XJSFLOJWULLJQS-NGVXBBESSA-N josamycin Chemical compound CO[C@H]1[C@H](OC(C)=O)CC(=O)O[C@H](C)C\C=C\C=C\[C@H](O)[C@H](C)C[C@H](CC=O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](N(C)C)[C@H](O[C@@H]2O[C@@H](C)[C@H](OC(=O)CC(C)C)[C@](C)(O)C2)[C@@H](C)O1 XJSFLOJWULLJQS-NGVXBBESSA-N 0.000 description 1
- 229960000433 latamoxef Drugs 0.000 description 1
- 229960003376 levofloxacin Drugs 0.000 description 1
- 229960005287 lincomycin Drugs 0.000 description 1
- OJMMVQQUTAEWLP-KIDUDLJLSA-N lincomycin Chemical compound CN1C[C@H](CCC)C[C@H]1C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)[C@@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](SC)O1 OJMMVQQUTAEWLP-KIDUDLJLSA-N 0.000 description 1
- 229940041028 lincosamides Drugs 0.000 description 1
- 229960003907 linezolid Drugs 0.000 description 1
- TYZROVQLWOKYKF-ZDUSSCGKSA-N linezolid Chemical compound O=C1O[C@@H](CNC(=O)C)CN1C(C=C1F)=CC=C1N1CCOCC1 TYZROVQLWOKYKF-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- 239000003120 macrolide antibiotic agent Substances 0.000 description 1
- 229940041033 macrolides Drugs 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- FDZZZRQASAIRJF-UHFFFAOYSA-M malachite green Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC=C1C(C=1C=CC=CC=1)=C1C=CC(=[N+](C)C)C=C1 FDZZZRQASAIRJF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229940107698 malachite green Drugs 0.000 description 1
- 239000008268 mayonnaise Substances 0.000 description 1
- 235000010746 mayonnaise Nutrition 0.000 description 1
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- FZECHKJQHUVANE-MCYUEQNJSA-N metampicillin Chemical compound C1([C@@H](N=C)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 FZECHKJQHUVANE-MCYUEQNJSA-N 0.000 description 1
- 229960003806 metampicillin Drugs 0.000 description 1
- 229960000282 metronidazole Drugs 0.000 description 1
- VAOCPAMSLUNLGC-UHFFFAOYSA-N metronidazole Chemical compound CC1=NC=C([N+]([O-])=O)N1CCO VAOCPAMSLUNLGC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YPBATNHYBCGSSN-VWPFQQQWSA-N mezlocillin Chemical compound N([C@@H](C(=O)N[C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C=1C=CC=CC=1)C(=O)N1CCN(S(C)(=O)=O)C1=O YPBATNHYBCGSSN-VWPFQQQWSA-N 0.000 description 1
- 229960000198 mezlocillin Drugs 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 229960004023 minocycline Drugs 0.000 description 1
- 229940041009 monobactams Drugs 0.000 description 1
- 229960003702 moxifloxacin Drugs 0.000 description 1
- FABPRXSRWADJSP-MEDUHNTESA-N moxifloxacin Chemical compound COC1=C(N2C[C@H]3NCCC[C@H]3C2)C(F)=CC(C(C(C(O)=O)=C2)=O)=C1N2C1CC1 FABPRXSRWADJSP-MEDUHNTESA-N 0.000 description 1
- JORAUNFTUVJTNG-BSTBCYLQSA-N n-[(2s)-4-amino-1-[[(2s,3r)-1-[[(2s)-4-amino-1-oxo-1-[[(3s,6s,9s,12s,15r,18s,21s)-6,9,18-tris(2-aminoethyl)-3-[(1r)-1-hydroxyethyl]-12,15-bis(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20-heptaoxo-1,4,7,10,13,16,19-heptazacyclotricos-21-yl]amino]butan-2-yl]amino]-3-h Chemical compound CC(C)CCCCC(=O)N[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)CN[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]1CCNC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCN)NC1=O.CCC(C)CCCCC(=O)N[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)CN[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]1CCNC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCN)NC1=O JORAUNFTUVJTNG-BSTBCYLQSA-N 0.000 description 1
- 229960000210 nalidixic acid Drugs 0.000 description 1
- MHWLWQUZZRMNGJ-UHFFFAOYSA-N nalidixic acid Chemical compound C1=C(C)N=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=C1 MHWLWQUZZRMNGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000808 netilmicin Drugs 0.000 description 1
- ZBGPYVZLYBDXKO-HILBYHGXSA-N netilmycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@]([C@H](NC)[C@@H](O)CO1)(C)O)NCC)[C@H]1OC(CN)=CC[C@H]1N ZBGPYVZLYBDXKO-HILBYHGXSA-N 0.000 description 1
- PGSADBUBUOPOJS-UHFFFAOYSA-N neutral red Chemical compound Cl.C1=C(C)C(N)=CC2=NC3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 PGSADBUBUOPOJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YCWSUKQGVSGXJO-NTUHNPAUSA-N nifuroxazide Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C(=O)N\N=C\C1=CC=C([N+]([O-])=O)O1 YCWSUKQGVSGXJO-NTUHNPAUSA-N 0.000 description 1
- 229960003888 nifuroxazide Drugs 0.000 description 1
- 229960000564 nitrofurantoin Drugs 0.000 description 1
- NXFQHRVNIOXGAQ-YCRREMRBSA-N nitrofurantoin Chemical compound O1C([N+](=O)[O-])=CC=C1\C=N\N1C(=O)NC(=O)C1 NXFQHRVNIOXGAQ-YCRREMRBSA-N 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000004957 nitroimidazoles Chemical class 0.000 description 1
- 229960005131 nitroxoline Drugs 0.000 description 1
- RJIWZDNTCBHXAL-UHFFFAOYSA-N nitroxoline Chemical compound C1=CN=C2C(O)=CC=C([N+]([O-])=O)C2=C1 RJIWZDNTCBHXAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001180 norfloxacin Drugs 0.000 description 1
- OGJPXUAPXNRGGI-UHFFFAOYSA-N norfloxacin Chemical compound C1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CC(F)=C1N1CCNCC1 OGJPXUAPXNRGGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001331 nose Anatomy 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 229960001699 ofloxacin Drugs 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000003605 opacifier Substances 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 229960002313 ornidazole Drugs 0.000 description 1
- UWYHMGVUTGAWSP-JKIFEVAISA-N oxacillin Chemical compound N([C@@H]1C(N2[C@H](C(C)(C)S[C@@H]21)C(O)=O)=O)C(=O)C1=C(C)ON=C1C1=CC=CC=C1 UWYHMGVUTGAWSP-JKIFEVAISA-N 0.000 description 1
- 229960001019 oxacillin Drugs 0.000 description 1
- 229960000321 oxolinic acid Drugs 0.000 description 1
- VDDWRTZCUJCDJM-PNHLSOANSA-N p-Naphtholbenzein Chemical compound C12=CC=CC=C2C(O)=CC=C1\C(=C\1C2=CC=CC=C2C(=O)C=C/1)C1=CC=CC=C1 VDDWRTZCUJCDJM-PNHLSOANSA-N 0.000 description 1
- 229960004236 pefloxacin Drugs 0.000 description 1
- FHFYDNQZQSQIAI-UHFFFAOYSA-N pefloxacin Chemical compound C1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CC(F)=C1N1CCN(C)CC1 FHFYDNQZQSQIAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002961 penems Chemical class 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 229940066779 peptones Drugs 0.000 description 1
- BPLBGHOLXOTWMN-MBNYWOFBSA-N phenoxymethylpenicillin Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)COC1=CC=CC=C1 BPLBGHOLXOTWMN-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 1
- 229960001732 pipemidic acid Drugs 0.000 description 1
- JOHZPMXAZQZXHR-UHFFFAOYSA-N pipemidic acid Chemical compound N1=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=CN=C1N1CCNCC1 JOHZPMXAZQZXHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002292 piperacillin Drugs 0.000 description 1
- WCMIIGXFCMNQDS-IDYPWDAWSA-M piperacillin sodium Chemical compound [Na+].O=C1C(=O)N(CC)CCN1C(=O)N[C@H](C=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C([O-])=O)C(C)(C)S[C@@H]21 WCMIIGXFCMNQDS-IDYPWDAWSA-M 0.000 description 1
- ZEMIJUDPLILVNQ-ZXFNITATSA-N pivampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@@H]3N(C2=O)[C@H](C(S3)(C)C)C(=O)OCOC(=O)C(C)(C)C)=CC=CC=C1 ZEMIJUDPLILVNQ-ZXFNITATSA-N 0.000 description 1
- 229960003342 pivampicillin Drugs 0.000 description 1
- 229960004212 pivmecillinam Drugs 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- XDJYMJULXQKGMM-UHFFFAOYSA-N polymyxin E1 Natural products CCC(C)CCCCC(=O)NC(CCN)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)NC(CCN)C(=O)NC1CCNC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CCN)NC1=O XDJYMJULXQKGMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KNIWPHSUTGNZST-UHFFFAOYSA-N polymyxin E2 Natural products CC(C)CCCCC(=O)NC(CCN)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)NC(CCN)C(=O)NC1CCNC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CCN)NC1=O KNIWPHSUTGNZST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 229960003961 pristinamycin Drugs 0.000 description 1
- DAIKHDNSXMZDCU-OUDXUNEISA-N pristinamycin-IIA Natural products CC(C)[C@H]1OC(=O)C2=CCCN2C(=O)c3coc(CC(=O)C[C@H](O)C=C(C)C=CCNC(=O)C=C[C@@H]1C)n3 DAIKHDNSXMZDCU-OUDXUNEISA-N 0.000 description 1
- JOOMGSFOCRDAHL-XKCHLWDXSA-N pristinamycin-IIB Natural products CC(C)[C@@H]1OC(=O)[C@H]2CCCN2C(=O)c3coc(CC(=O)C[C@@H](O)C=C(C)C=CCNC(=O)C=C[C@H]1C)n3 JOOMGSFOCRDAHL-XKCHLWDXSA-N 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 1
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 1
- MCJGNVYPOGVAJF-UHFFFAOYSA-N quinolin-8-ol Chemical compound C1=CN=C2C(O)=CC=CC2=C1 MCJGNVYPOGVAJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000007660 quinolones Chemical class 0.000 description 1
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 description 1
- JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N rifampicin Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)\C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C([O-])=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CC[NH+](C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N 0.000 description 1
- 229960003292 rifamycin Drugs 0.000 description 1
- BTVYFIMKUHNOBZ-QXMMDKDBSA-N rifamycin s Chemical class O=C1C(C(O)=C2C)=C3C(=O)C=C1NC(=O)\C(C)=C/C=C\C(C)C(O)C(C)C(O)C(C)C(OC(C)=O)C(C)C(OC)\C=C/OC1(C)OC2=C3C1=O BTVYFIMKUHNOBZ-QXMMDKDBSA-N 0.000 description 1
- 229940081192 rifamycins Drugs 0.000 description 1
- 229960005224 roxithromycin Drugs 0.000 description 1
- 239000012449 sabouraud dextrose agar Substances 0.000 description 1
- 229940041008 second-generation cephalosporins Drugs 0.000 description 1
- 229960005456 sisomicin Drugs 0.000 description 1
- URWAJWIAIPFPJE-YFMIWBNJSA-N sisomycin Chemical compound O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H](CC=C(CN)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N URWAJWIAIPFPJE-YFMIWBNJSA-N 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- YVOFSHPIJOYKSH-NLYBMVFSSA-M sodium rifomycin sv Chemical compound [Na+].OC1=C(C(O)=C2C)C3=C([O-])C=C1NC(=O)\C(C)=C/C=C/[C@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@@H](OC)\C=C\O[C@@]1(C)OC2=C3C1=O YVOFSHPIJOYKSH-NLYBMVFSSA-M 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 1
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 1
- 230000003381 solubilizing effect Effects 0.000 description 1
- 229960001294 spiramycin Drugs 0.000 description 1
- 235000019372 spiramycin Nutrition 0.000 description 1
- 229930191512 spiramycin Natural products 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- FKENQMMABCRJMK-RITPCOANSA-N sulbactam Chemical compound O=S1(=O)C(C)(C)[C@H](C(O)=O)N2C(=O)C[C@H]21 FKENQMMABCRJMK-RITPCOANSA-N 0.000 description 1
- 229960005256 sulbactam Drugs 0.000 description 1
- SEEPANYCNGTZFQ-UHFFFAOYSA-N sulfadiazine Chemical compound C1=CC(N)=CC=C1S(=O)(=O)NC1=NC=CC=N1 SEEPANYCNGTZFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004306 sulfadiazine Drugs 0.000 description 1
- 229940124530 sulfonamide Drugs 0.000 description 1
- 150000003456 sulfonamides Chemical class 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- LPQZKKCYTLCDGQ-WEDXCCLWSA-N tazobactam Chemical compound C([C@]1(C)S([C@H]2N(C(C2)=O)[C@H]1C(O)=O)(=O)=O)N1C=CN=N1 LPQZKKCYTLCDGQ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- 229960003865 tazobactam Drugs 0.000 description 1
- 229960001608 teicoplanin Drugs 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 229940040944 tetracyclines Drugs 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 229960003053 thiamphenicol Drugs 0.000 description 1
- OTVAEFIXJLOWRX-NXEZZACHSA-N thiamphenicol Chemical compound CS(=O)(=O)C1=CC=C([C@@H](O)[C@@H](CO)NC(=O)C(Cl)Cl)C=C1 OTVAEFIXJLOWRX-NXEZZACHSA-N 0.000 description 1
- OHKOGUYZJXTSFX-KZFFXBSXSA-N ticarcillin Chemical compound C=1([C@@H](C(O)=O)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)C=CSC=1 OHKOGUYZJXTSFX-KZFFXBSXSA-N 0.000 description 1
- 229960004659 ticarcillin Drugs 0.000 description 1
- OGIDPMRJRNCKJF-UHFFFAOYSA-N titanium oxide Inorganic materials [Ti]=O OGIDPMRJRNCKJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000707 tobramycin Drugs 0.000 description 1
- NLVFBUXFDBBNBW-PBSUHMDJSA-N tobramycin Chemical compound N[C@@H]1C[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N NLVFBUXFDBBNBW-PBSUHMDJSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003281 tyrothricin Drugs 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 229960003165 vancomycin Drugs 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N vancomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N vancomycin Natural products O1C(C(=C2)Cl)=CC=C2C(O)C(C(NC(C2=CC(O)=CC(O)=C2C=2C(O)=CC=C3C=2)C(O)=O)=O)NC(=O)C3NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC3=CC2=CC1=C3OC1OC(CO)C(O)C(O)C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 229960003842 virginiamycin Drugs 0.000 description 1
- 235000019373 virginiamycin Nutrition 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- 235000013618 yogurt Nutrition 0.000 description 1
- 239000002132 β-lactam antibiotic Substances 0.000 description 1
- 229940124586 β-lactam antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 150000003952 β-lactams Chemical class 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
Definitions
- the field of the invention is that of the detection and identification of microorganisms, such as in particular bacteria or yeasts by seeding reaction media.
- reaction media for the detection of microorganisms. This detection can be based in particular on the use of particular substrates, specific for an enzyme of the microorganism that one wishes to detect.
- the Escherichia coli strains are often evidenced by the revelation of an enzymatic activity of the osidase type such as beta-glucuronidase or beta-galactosidase activity.
- the genus Listeria can be detected by demonstrating beta-glucosidase activity.
- Aminopeptidase activity can also be used to reveal a group, a genus or a species of bacteria.
- alanine aminopeptidase activity makes it possible to differentiate gram-negative bacteria from gram-positive bacteria.
- the identification of a microorganism or a group of microorganisms through the reaction media may be based on the resistance of a microorganism to a therapeutic treatment.
- the medium then generally comprises one or more so-called active molecules, such as in particular antibiotics against which the microorganism is likely to be resistant.
- there are environments dedicated to environmental control such as surface control, for detecting the presence of microorganisms on a laboratory bench for example.
- a medium comprising an active molecule such as beta lactamase to inhibit the action of residual antibiotics that may be present on the bench, and thus allow the growth and identification of possible microorganisms.
- active molecules such as beta lactamase
- the maintenance of active molecules in solution is conditioned by their stability in complex media or at very high dilutions. They can be quickly denatured depending on the physico-chemical or degraded conditions under the action of enzymes.
- ⁇ -Lactamase for example is sensitive to thermal denaturation (60 ⁇ 70 ° C).
- Antibiotics are also sensitive to heat. To overcome this degradation over time, the initial concentration of active molecule must be very important, which poses a problem of manufacturing cost.
- the preservation of media comprising such active molecules remains a major problem in this field of activity: they can not generally be kept at room temperature, because prolonged exposure to heat can induce denaturation of the active molecules of the medium such as the antibiotics, enzymes ... Moreover, even if the cold chain is respected, the reaction media must be generally used within 2 to 4 months of their manufacture. It is therefore very important to increase the stability of the active molecules present in a reaction medium.
- the present invention therefore proposes to improve the reaction media allowing the detection of microorganisms currently marketed by reducing their manufacturing cost and improving their stability, so as to extend their shelf life.
- the inventors have shown that the encapsulation of active molecules in cyclodextrins makes it possible to protect these active molecules in reaction media, conferring a resistance of the active molecules to various factors such as heat, agitation, etc.
- Cyclodextrins or cycloamyloses are well known molecules. They are composed of a hydrophobic cavity in which hydrophobic molecules can be housed, and a hydrophilic outer surface allowing the cyclodextrin-hydrophobic molecule complex to dissolve in the aqueous solvents. Thanks to this apolar cavity, cyclodextrins are capable of forming inclusion complexes in aqueous medium with a large variety of hydrophobic host molecules. The resultant of this complexation is the solubilization of hydrophobic molecules that are very insoluble in the aqueous phase.
- reaction medium a medium comprising all the elements necessary for the expression of a metabolism and / or the growth of microorganisms.
- the reaction medium may be solid, semi-solid or liquid.
- solid medium is meant for example a gelled medium.
- Agar is the traditional gelling agent in microbiology for the cultivation of microorganisms, but it is possible to use gelatin or agarose.
- a number of preparations are commercially available, such as, for example, Columbia agar, Trypcase-soy agar, Mac Conkey agar, Sabouraud agar or more generally those described in the Handbook of Microbiological Media (CRC Press).
- the reaction medium may comprise one or more elements in combination, such as amino acids, peptones, carbohydrates, nucleotides, minerals, vitamins, active molecules such as antibiotics, enzymes, surfactants, buffers, phosphate, ammonium, sodium, metal salts, one or more substrates for the detection of enzymatic or metabolic activity ...
- the medium may also include a dye.
- a dye of Evans blue, neutral red, sheep blood, horse blood, an opacifier such as titanium oxide, nitroaniline, malachite green, brilliant green ...
- the reaction medium may be a revelation medium, or a culture and revelation medium.
- the culture of the microorganisms is carried out before seeding, and in the second case, the detection and / or identification medium also constitutes the culture medium.
- the term microorganism covers bacteria, in particular gram-negative and gram-positive, yeast, and more generally, generally unicellular organisms, invisible to the naked eye, which can be multiplied and manipulated in the laboratory .
- gram-negative bacteria As gram-negative bacteria, mention may be made of the following genera: Pseudomonas, Escherichia, Salmonella, Shigella, Enterobacter, Klebsiella, Serratia, Proteus, Campylobacter, Haemophilus, Morganella, Vibrio, Yersinia, Acinetobacter, Branhamella, Neisseria, Burkholderia , Citrobacter, Hafnia, Edwardsiella, Aeromonas, Moraxella, Pasteurella, Providentiel, Actinobacillus, Alcaligenes, Bordetella, Cedecea, Erwinia, Pantoea, Ralstonia, Stenotrophomonas, Xanthomonas and Legionella.
- Gram-positive bacteria mention may be made of the following genera: Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Bacillus, Listeria, Clostridium, Gardnerella, Kocuria, Lactococcus, Leuconostoc, Micrococcus, Mycobacteria and Corynebacteria.
- yeasts that may be mentioned include yeasts of the following genera: Candida, Cryptococcus, Saccharomyces and Trichosporon.
- active molecule a molecule that produces an effect, such as a destructive effect on microorganisms or a catalyst effect on chemical reactions, and which degrades over time, particularly under the effect of heat.
- active molecule we preferentially mean an antibiotic or an enzyme.
- antibiotic is meant a chemical substance having a destructive effect on microorganisms.
- betalactamines including penams (such as Penicillin, Bipenicillin, Extencillin, Oracillin, Oxacillin, Cloxaciline, Ampicillin, Amoxicillin, Bacampicillin, Metampicillin, Pivampicillin, Azlocillin, Mezlocillin, Piperacillin, Ticarcillin, Pivmecillinam and Oxapenam; Clavulanic acid, Sulbactam, Tazobactam); penems (such as imipenem); cephems (such as cephalosporins of the 1st generation (cefalexin, cefadroxil, cefaclor, cefatrizine, cefalotine, cefapyrin, cefazolin), second-generation cephalosporins (cefoxitin, cefamandole, cefotetan, cefuroxime), cephalosporins of third generation ( Cefotaxime, Cefsulo
- Teicoplanin Teicoplanin
- polymycins colistin
- gramicidines and tyrocidine Bacillus subtilis
- Bacillus subtilis Bacillus subtilis
- sisomicin dibekacin; Netilmicin; macrolides (Spiramycin, Erythromycin;
- Pristinamycin phenycoles (chloramphenicol, thiamphenicol); tetracyclines (Tetracycline, Doxycycline, Minocycline); fusidic acid; oxazolidinones
- pefloxacin pefloxacin; norfloxacin; ofloxacin; Ciprofloxacin; enoxacin; levofloxacin;
- Moxifloxacin Moxifloxacin
- oxyquinolines Niroxoline; Tilboquinol
- nitrofurans Non-furantoin; Nifuroxazide
- nitroimidazoles metalronidazole, ornidazole
- sulfonamides Sulfadiazine, Sulfamethisol
- trimethoprim Trimethoprim
- enzyme By enzyme is meant a molecule of a protein nature catalyzing the biochemical reactions of the metabolism taking place in the cellular or extracellular medium.
- oxidoreductases such as oxidases, reductases, peroxidases, oxygenases, hydrogenases, or dehydrogenases
- transferases such as kinases, transaminases, mutases
- hydrolases such as esterases, peptidases, osidases: glucosidases
- lyases such as decarboxylases, aldolases, dehydratases
- isomerases such as racemases, epimerases
- ligases such as racemases, epimerases.
- the enzyme is a hydrolase, and even more preferentially a beta lactamase.
- cyclodextrin is meant a molecule of the family of cyclic oligosaccharides composed of ⁇ - (1,4) -linked glucopyranose subunits and corresponding to the empirical formula
- BCD beta-cyclodextrin
- HPCD hydroxypropyl-beta-cyclodextrin
- MCD methyl-beta-cyclodextrin
- ACD alpha-cyclodextrin
- GCD gamma-cyclodextrin
- the cyclodextrin is chosen from an alpha-cyclodextrin, which is preferably Cyclomaltohexaose (reference BioCydex ACD NO; CAS No. 51211-54-9); a gamma-cyclodextrin, which is preferentially Cyclomaltooctaose (reference BioCydex GCD NO, CAS No.
- beta-cyclodextrin which is preferably 2-O-methyl-beta-cyclodextrin or randomly 2-O-methyl-cyclomaltoheptaose
- reference bioCydex BCD C 15 or preferentially a 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrin also called randomly 2,3,6-O- (2-hydroxypropyl) -cyclomaltoheptaose
- reference bioCydex BCD R59 CAS No.
- cyclodextrins of the present invention were provided by BioCydex (Poitiers, France).
- cyclomaltohexaose and cyclomaltooctaose are on sale at Wacker Chemie; cyclomaltoheptaose, 2, O-methyl-cyclomaltoheptaose and hydroxypropyl-beta-cyclodextrin are available from Roquette Fromme and monopropane-diamino-beta-cyclodextrin is available from BioCydex.
- substrate allowing the detection of an enzymatic or metabolic activity is meant any molecule capable of generating, directly or indirectly, a detectable signal due to an enzymatic or metabolic activity of the microorganism. When this activity is an enzymatic activity, it is called enzymatic substrate.
- enzymatic substrate any substrate that can be hydrolyzed by an enzyme into a product for the direct or indirect detection of a microorganism.
- This substrate comprises in particular a first specific part of the enzymatic activity to be revealed and a second part serving as a marker, hereinafter referred to as a marker part.
- This marker part can be chromogenic, fluorogenic, luminescent, etc.
- a chromogenic substrate well suited to solid supports (filter, agar, electrophoresis gel), mention may be made in particular of substrates based on indoxyl and its derivatives, and substrates based on hydroxyquinoline or esculetin and their derivatives, which allow the detection of osidase and esterase activities.
- Indoxyl As substrates based on Indoxyl, there may be mentioned in particular 3-Indoxyl, 5-Bromo-3-indoxyl, 5-Iodo-3-indoxyl, 4-chloro-3-indoxyl, 5-Bromo-4-chloro 3-indoxyl, 5-bromo-6-chloro-3-indoxyl, 6-bromo-3-indoxyl, 6-chloro-3-indoxyl, 6-fluoro-3-indoxyl, 5-bromo-4-chloro-N- 3-methyl-3-indoxyl, N-methyl-3-indoxyl, etc.).
- substrates derived from flavoids such as in particular 3 ', 4'-dihydroxyflavone-4'- ⁇ -D-riboside. , 3 ', 4'-Dihydroxyflavone-4'- ⁇ -D-galactoside, 3', 4'-Dihydroxyflavone-4'- ⁇ -D-glucoside, 3-Hydroxyflavone- ⁇ -D-galactoside, 3- Hydroxyflavone- ⁇ -D-glucoside, 3 ', 4'-dihydroxyflavone-3', 4'-diacetate.
- substrates based on nitrophenol ortho-nitrophenol, para-nitrophenol, etc.
- nitroaniline and derivatives for detecting osidase and esterase activities in the case of substrates based on nitrophenol, and peptidase activities. in the case of substrates based on nitroaniline.
- substrates based on naphthol and naphthylamine and their derivatives which make it possible to detect the osidase and esterase activities via naphthol, and the peptidase activities via naphthylamine.
- This substrate may make it possible in particular, but in a non-limiting manner, to detect an enzymatic activity such as the activity of an osidase, peptidase, esterase, etc.
- Coumarin-based substrates and derivatives may also be mentioned.
- Naphtol and Naphtylamine substrates and their derivatives which make it possible to detect the osidase and esterase activities via Naphtol, and the peptidase activities via Naphtylamine.
- Naphtol-based substrate is understood to mean in particular substrates based on ⁇ -Naphtol, ⁇ -Naphtol, 6-Bromo-2-naphthol, Naphtol AS BI, Naphtol AS, p-Naphtholbenzein as defined. in the patent application EP 1224196 of the Applicant.
- the osidase substrates are in particular substrates of N-acetyl- ⁇ -hexosaminidase, ⁇ -galactosidase, ⁇ -galacotosidase, ⁇ -glucosidase, ⁇ -glucosidase, ⁇ -glucuronidase, ⁇ -cellobiosidase, of ⁇ -mannosidase.
- substrate based on Alizarin is meant in particular the substrates described in the patent EP1235928 of the applicant.
- the enzymatic substrate can also be a natural substrate whose hydrolysis product is detected directly or indirectly.
- a natural substrate mention may in particular be made of Tryptophan for detecting tryptophanase or desaminase activity, a cyclic amino acid (Tryptophan, Phenylalanine, Histidine, Tyrosine) for detecting a desaminase activity, Phosphatidyl Inositol for detecting phospholipase activity, etc.
- the substrate is then a metabolic substrate, such as a source of carbon or nitrogen, coupled to an indicator producing a staining in the presence of one of the products of metabolism.
- a metabolic substrate such as a source of carbon or nitrogen
- the substrates used for the detection of a beta- glucuronidase activity may especially be 4-methylumbelliferyl-beta-glucuronide, 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-glucuronide, 5-Bromo 6-chloro-3-indolyl-beta- glucuronide, 6-chloro-3-indolyl-beta-glucuronide, Alizarin-beta-glucuronide, Cyclohexeno-esculetin-beta-glucuronide or their salts.
- the substrates used for the detection of a beta-galactosidase activity may especially be 4-methylumbelliferyl-beta-galactoside, 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-galactoside, 5-Bromo 6-chloro-3-indolyl-beta-galactoside, 6-chloro-3-indolyl-beta-galactoside, Alizarin-beta-galactoside, Cyclohexeno-esculetin-beta-galactoside or their salts.
- the substrates used for the detection of a beta-glucosidase activity may especially be 4-methylumbelliferyl-beta-Glucoside, 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-glucoside, 5-Bromo-6-chloro 3-indolyl-beta-glucoside, 6-chloro-3-indolyl-beta-glucoside, Alizarin-beta-Glucoside, Cyclohexeno-esculetin-beta-glucoside, Nitrophenyl-beta-glucoside, Dichloroaminophenyl -glucoside or their salts.
- biological sample we mean a clinical sample, from a sample of biological fluid, or a food sample, from any type of food.
- This sample may thus be liquid or solid and may be mentioned in a nonlimiting manner, a clinical sample of blood, plasma, urine, faeces, nose samples, throats, skin, wounds, cerebrospinal fluid, a food sample of water, beverages such as milk, fruit juice; yogurt, meat, eggs, vegetables, mayonnaise, cheese; fish ..., a food sample from a feed intended for animals, such as in particular a sample from animal meal.
- the invention relates to a reaction medium for the identification / detection of microorganisms comprising at least one active molecule encapsulated in a cyclodextrin.
- the cyclodextrin is chosen from: an alpha-cyclodextrin, which is preferably Cyclomaltohexaose (reference BioCydex ACD NO, CAS No. 51211-54-9); a gamma-cyclodextrin, which is preferentially Cyclomaltooctaose (reference BioCydex GCD NO, CAS No.
- beta-cyclodextrin which is preferably 2-O-methyl-beta- cyclodextrin or randomly 2-O-methyl-cyclomaltoheptaose
- reference bioCydex BCD C 15 or preferentially a 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrin also called randomly 2,3,6-O- (2-hydroxypropyl) -cyclomaltoheptaose
- the active molecule is an antibiotic.
- the antibiotic is chosen from the family of penams or cephams.
- the antibiotic is cefoxitin or cloxacillin.
- the reaction medium according to the present invention may comprise an antibiotic or several antibiotics. Those skilled in the art will easily adapt the antibiotic concentration according to the desired effect.
- the antibiotic concentration is between 0.01 and 80 mg / l, preferentially between 0.05 and 32 mg / l, more preferably between 0.1 and 8 mg / l and even more preferably between 0.25 and 6 mg / l.
- the concentration of cefotaxime in the medium is preferably between 0.25 and 8 mg / l, preferably between 1 and 2 mg / l; when the antibiotic is cefoxitine, the concentration of cefoxitine in the medium is preferably between 0.1 and 8 mg / l and even more preferably between 0.25 and 6 mg / l; when the antibiotic is cloxacillin, the concentration of cloxacillin in the medium is preferably between 0.1 and 8 mg / l and even more preferably between 0.25 and 6 mg / l; when the antibiotic is ceftazidime, the concentration of ceftazidime in the medium is preferably between 0.25 and 8 mg / l, preferably between 2 and 2.5 mg / l; when the antibiotic is ceftriaxone, the concentration of ceftriaxone in the medium is preferably between 0.25 and 8 mg / l, preferably between 1 and 2.5 mg / l; when the antibiotic is ceftriaxone, the concentration of ceftri
- the active molecule is an enzyme, preferably beta lactamase.
- the beta lactamase concentration in the medium is preferably between 50 and 500 IU / l, preferably between 100 and 150 IU / l.
- the reaction medium comprises at least one substrate for detecting an enzymatic or metabolic activity.
- the medium may also comprise a combination of substrates, depending on the microorganisms that one wishes to identify. Those skilled in the art will adapt the substrate concentration (s) according to the microorganism that one wishes to identify. Preferably, the concentration of substrate is between 25 and 750 mg / l, preferably between 40 and 200 mg / l.
- the concentration is preferably at a concentration of between 25 and 500 mg / l, preferably between 40 and 150 mg / l.
- the concentration is preferably at a concentration of between 25 and 500 mg / l, preferably between 40 and 150 mg / l.
- the concentration is preferably at a concentration of between 25 and 750 mg / l, preferably between 40 and 750 mg / l. and 200 mg / l.
- biboite which makes it easy to compare two media, comprising different substrates, on which a same biological sample has been deposited.
- said substrate allowing the detection of an enzymatic or metabolic activity is an enzymatic substrate, preferentially fluorescent or chromogenic.
- the enzymatic activity is chosen from the following enzymatic activities: osidase, esterase, peptidase, and even more preferentially, said same enzymatic activity is chosen from the following enzymatic activities: BD-glucosidase, ⁇ -D-galactosidase, alpha-D glucosidase, alpha-D-galactosidase, alpha-mannosidase, ⁇ -D-glucuronidase, N-acetyl- ⁇ -D-hexosaminidase, ⁇ -D-cellobiosidase, esterase, phosphatase, phospholipase, sulfatase, peptidase.
- BD-glucosidase ⁇ -D-galactosidase
- alpha-D glucosidase alpha-D-galactosidase
- alpha-mannosidase alpha-D-glucu
- the invention also relates to a method for detecting and / or identifying microorganisms, characterized in that it comprises the following steps: a) having a reaction medium as defined above, b) seeding the medium with a biological sample to be tested, c) allow to incubate, and d) detect and / or identify microorganisms
- the seeding of the microorganisms can be carried out by all the seeding techniques known to those skilled in the art.
- An incubation step can be carried out at a temperature for which the enzymatic activity that one wishes to detect is optimal, that the person skilled in the art can easily choose according to the enzymatic activity to be detected.
- Step d) can be carried out by visual examination, colorimetry or fluorimetry.
- the invention also relates to the use of the reaction medium as described above for the detection and / or identification of microorganisms.
- the invention also relates to the use of cyclodextrin (s) to increase the stability of a reaction medium. Thanks to such use, it is possible to set back the expiry date of the reaction medium, and to preserve the medium more easily.
- the cyclodextrin used is chosen from an alpha-cyclodextrin, which is preferably Cyclomaltohexaose (BioCydex reference ACD NO: CAS No. 51211-54-9); a gamma-cyclodextrin, which is preferentially Cyclomaltooctaose (reference BioCydex GCD NO, CAS No.
- beta-cyclodextrin which is preferably 2-O-methyl-beta-cyclodextrin or randomly 2-O-methyl-cyclomaltoheptaose
- reference bioCydex BCD C 15 or preferentially a 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrin also called the randomly 2,3,6-O- (2-hydroxypropyl) -cyclomaltoheptaose
- reference bioCydex BCD R59 CAS No.
- the invention also relates to the use of cyclodextrin (s) for protecting active molecules against physico-chemical degradation in a reaction medium, such as in particular heat or agitation.
- the cyclodextrin used is chosen from an alpha-cyclodextrin, which is preferably Cyclomaltohexaose (BioCydex reference ACD NO: CAS No. 51211-54-9); a gamma-cyclodextrin, which is preferentially Cyclomaltooctaose (reference BioCydex GCD NO, CAS No.
- beta-cyclodextrin which is preferably a 2-O-methyl-beta-cyclodextrin or the randomly 2-O-methyl-cyclomaltoheptaose (Reference bioCydex BCD C 15); or preferably a 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrin also called the randomly 2,3,6-O- (2-hydroxypropyl) -cyclomaltoheptaose (Reference bioCydex BCD R59, CAS No.
- PROTECTION AND STABILIZATION OF CLOXACILLIN Cloxacillin (Molecular Weight 475.88) is a ⁇ -lactam antibiotic, used to inhibit the growth of certain bacterial species such as Enterobacter aerogenes or Escherichia coli.
- the sodium salt of cloxacillin (Sigma, Ref C 9393) has a high intrinsic solubility in aqueous medium ( ⁇ 100 gL -1 ).
- the complexes were prepared at room temperature with cloxacillin: cyclodextrin molar ratios of 1:16 and 1:79.
- the analysis of the samples and their quantification to evaluate the stability of the antibiotic were carried out on a Thermo chain.
- Table I Stability of cloxacillin in the presence of cyclodextrins at 75 ° C.
- FIG. 1 shows the protective effect of cyclodextrins against the degradation of cloxacillin by heat (- CD: absence of cyclodextrin, 1: 1 to
- Cyclodextrin BCD C 15 exhibited the best protection at a low ratio. For molar ratios greater than 1:50, similar performance was observed for both cyclodextrins.
- Cefoxitin is an antibiotic of the ⁇ -lactam family, an inhibitor of mucopeptide synthesis in the bacterial wall.
- Thermo Finnigan SpectraSYSTEM HPLC System equipped with a P1000XR pump, an AS3000 automatic injector, a UV1000 UV / Visible detector, a Merck Chromolith ® Performance RP-18 endcapped column (100- 4.6 mm) preceded by a Merck Chromolith ® RP-18e guard column (5-4.6 mm).
- the mobile phases were prepared from acetonitrile grade-HPLC and water acidified with trifluoroacetic acid (100 ⁇ L / L). A methanol / water gradient of 0/100 to 100/0 was applied in 12 min. After stabilization for 2 min the column is rebalanced under the initial conditions.
- the elution rate is 1 mL / min, the temperature is 22 ° C. and the detection is carried out at 254 nm.
- the injection volume of the samples is 20 ⁇ L.
- Chromatographic data were processed by Atlas software, version 2003.1 (Thermo Electron Corporation, UK). The results are shown in Table II:
- the ⁇ -lactamase (Genzyme Biochemicals Ref BELA-70-1431) in an amount equivalent to 0.375 U.mL "1 was mixed with the cyclodextrin BCD A56 of the Protéosol ® range (1 or 10 mM), at room temperature and at room temperature. the mixture was then heated at 70 ° C. for 45 minutes, the amoxicillin (Glaxo, 5003), 500 mg.L -1 , revealing the activity of the ⁇ -lactamase, was then added at room temperature. After a 5 min incubation at 25 ° C, the residual amoxicillin was analyzed by HPLC. The profiles obtained are presented in FIG.
- reaction media were made from ChromlD TM MRSA medium, one with cefoxitin and the other containing a BCD Cl 5 + cefoxitin cyclodextrin complex.
- the latter being obtained by solubilizing cefoxitin and cyclodextrin in osmosis water and then stirring the solution at room temperature and protected from light. The mixture is then filtered before being incorporated in the agar.
- the media are stored at 2-8 0 C for 19 weeks and the performances (growth of MRSA: Meticillin-resistant Staphylococcus aureus, inhibition of MSSA: Meticillin-sensitive Staphylococcus aureus) are evaluated weekly compared to a marketed ready medium. to work.
- the protection of cefoxitin by cyclodextrin is measured by comparing growth inhibition of MSSA (active cefoxitin) over time on media with and without BCD C 15 cyclodextrin.
- strains of MRSA and MSSA are seeded on the media according to the three-dial method and then the dishes are incubated for 48 hours at 37 ° C.
- MRSA strains grow to form green colonies whereas MSSA strains are correctly inhibited.
- the presence of cyclodextrins is compatible with use in culture medium.
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
La présente invention concerne un milieu réactionnel pour l' identification/détection de microorganismes comprenant au moins une molécule active encapsulée dans une cyclodextrine.
Description
Milieu réactionnel pour l'identification/détection de microorganismes
Le domaine de l'invention est celui de la détection et de l'identification de microorganismes, tels que notamment de bactéries ou de levures par ensemencement de milieux réactionnels.
Il existe actuellement de très nombreux milieux réactionnels permettant la détection de microorganismes. Cette détection peut être basée notamment sur l'utilisation de substrats particuliers, spécifiques d'une enzyme du microorganisme que l'on souhaite détecter. Ainsi, dans le cas de bactéries, les souches d'Escherichia coli sont souvent mises en évidence par la révélation d'une activité enzymatique du type osidase telle que l'activité beta-glucuronidase ou beta-galactosidase. De la même façon, le genre Listeria peut être détecté par la mise en évidence d'une activité beta- glucosidase. Une activité aminopeptidase peut également être utilisée pour révéler un groupe, un genre ou une espèce de bactéries. Ainsi, l'activité alanine-aminopeptidase, par exemple, permet de différencier les bactéries à Gram négatif des bactéries à Gram positif. Enfin, on peut citer également la détection d'une activité estérase pour notamment la mise en évidence du genre Salmonella. Outre l'utilisation de substrats particuliers, l'identification d'un microorganisme ou d'un groupe de microorganismes grâce aux milieux réactionnels, peut reposer sur la résistance d'un microorganisme à un traitement thérapeutique. Le milieu comprend alors généralement une ou plusieurs molécules dites actives, tel que notamment des antibiotiques contre lequel le microorganisme est susceptible d'être résistant. Il existe enfin des milieux dédiés au contrôle d'environnement tel que le contrôle de surface, permettant de détecter la présence de microorganismes sur une paillasse de laboratoire par exemple. Pour détecter la présence de microorganismes dans un laboratoire de fabrication d'antibiotiques, il est possible d'utiliser un milieu comprenant une molécule active telle que la beta lactamase afin d'inhiber l'action des antibiotiques résiduels qui pourraient être présents sur la paillasse, et ainsi permettre la croissance et l'identification des éventuels microorganismes.
Toutefois, le maintien de molécules actives en solution est conditionné par leur stabilité dans des milieux complexes ou à de très fortes dilutions. Elles peuvent être rapidement dénaturées en fonction des conditions physico-chimiques ou dégradées sous l'action d'enzymes. La β-lactamase par exemple est sensible à la dénaturation thermique (60~70°C). Les antibiotiques sont également sensibles a la chaleur. Pour pallier cette dégradation au cours du temps, la concentration initiale en molécule active doit être très importante, ce qui pose un problème de coût de fabrication. La conservation de milieux comprenant de telles molécules actives reste un problème majeur dans ce domaine d'activité : ils ne peuvent généralement pas être conservés à température ambiante, car une exposition prolongée à la chaleur peut induire une dénaturation des molécules actives du milieu tels que les antibiotiques, les enzymes... De plus, même si la chaîne du froid est respectée, les milieux réactionnels doivent être généralement utilisés dans un délai de 2 à 4 mois suivant leur fabrication. Il est donc très important d'augmenter la stabilité des molécules actives présentes dans un milieu réactionnel. La présente invention se propose donc d'améliorer les milieux réactionnels permettant la détection de microorganismes actuellement commercialisés en diminuant leur coût de fabrication et en améliorant leur stabilité, de façon à allonger leur durée de conservation. De façon surprenante, les inventeurs ont montré que l'encapsulation de molécules active dans des cyclodextrines permettait de protéger ces molécules actives dans des milieux réactionnels, conférant une résistance des molécules actives à différents facteurs tels que la chaleur, l'agitation etc...
Les cyclodextrines ou cycloamyloses sont des molécules bien connues. Elles sont composées d'une cavité hydrophobe dans laquelle peuvent venir se loger des molécules hydrophobes, et d'une face externe hydrophile permettant au complexe cyclodextrine- molécule hydrophobe de se dissoudre dans les solvants aqueux. Grâce à cette cavité apolaire, les cyclodextrines sont capables de former des complexes d'inclusion en milieu aqueux avec une grande variété de molécules-hôtes hydrophobes. La résultante de cette complexation est la solubilisation de molécules hydrophobes très insolubles dans la phase aqueuse. Toutefois, ces molécules n'ont, à la connaissance des Demanderesses, jamais été décrite comme étant capable de protéger des molécules actives dans des
milieux réactionnels à différents facteurs tels que la chaleur, l'agitation etc .. L'utilisation de complexes d'encapsulation molécule(s) active(s) / cyclodextrine(s) dans des milieux réactionnels permet ainsi d'accroître la stabilité de ces molécules actives et d'allonger la durée de vie de ces milieux réactionnels.
Avant d'aller plus avant dans la description de l'invention, les définitions ci dessous sont données afin de faciliter l'exposé de l'invention.
Par milieu réactionnel, on entend un milieu comprenant tous les éléments nécessaires à l'expression d'un métabolisme et/ou à la croissance de microorganismes. Le milieu réactionnel peut être solide, semi-solide ou liquide. Par milieu solide, on entend par exemple un milieu gélifié. L'agar est l'agent gélifiant traditionnel en microbiologie pour la culture des microorganismes, mais il est possible d'utiliser de la gélatine ou de l'agarose. Un certain nombre de préparation sont disponibles dans le commerce, comme par exemple l'agar Columbia, la gélose Trypcase-soja, la gélose Mac Conkey, la gélose Sabouraud ou plus généralement celles décrites dans le Handbook of Microbiological Media (CRC Press).
Le milieu réactionnel peut comprendre un ou plusieurs éléments en combinaison, tels que des acides aminés, des peptones, des hydrates de carbone, des nucléotides, des minéraux, des vitamines, des molécules actives telles que des antibiotiques, des enzymes, des tensioactifs, des tampons, des sels de phosphate, d'ammonium, de sodium, de métaux, un ou plusieurs substrats permettant la détection d'une activité enzymatique ou métabolique...
Le milieu peut comprendre également un colorant. A titre indicatif, on peut citer comme colorant le bleu d'Evans, du rouge neutre, du sang de mouton, du sang de cheval, un opacifiant tel que l'oxyde de Titane, de la nitroaniline, du vert malachite, du vert brillant...
Le milieu réactionnel peut être un milieu de révélation, ou un milieu de culture et de révélation. Dans le premier cas, la culture des microorganismes est effectuée avant ensemencement et, dans le deuxième cas, le milieu de détection et/ou d'identification constitue également le milieu de culture.
Au sens de la présente invention, le terme microorganisme recouvre les bactéries, notamment à gram négatif et à gram positif, les levures, et plus généralement, les organismes généralement unicellulaires, invisibles à l'œil nu, qui peuvent être multipliés et manipulés en laboratoire. A titre de bactéries à Gram négatif, on peut citer les bactéries des genres suivants : Pseudomonas, Escherichia, Salmonella, Shigella, Enterobacter, Klebsiella, Serratia, Proteus, Campylobacter, Haemophilus, Morganella, Vibrio, Yersinia, Acinetobacter, Branhamella, Neisseria, Burkholderia, Citrobacter, Hafnia, Edwardsiella, Aeromonas, Moraxella, Pasteurella, Providentiel, Actinobacillus, Alcaligenes, Bordetella, Cedecea, Erwinia, Pantoea, Ralstonia, Stenotrophomonas, Xanthomonas et Legionella.
A titre de bactéries à Gram positif, on peut citer les bactéries des genres suivants : Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Bacillus, Listeria, Clostridium, Gardnerella, Kocuria, Lactococcus, Leuconostoc, Micrococcus, Mycobacteria et Corynebacteria. A titre de levures, on peut citer les levures des genres suivants: Candida, Cryptococcus, Saccharomyces et Trichosporon.
Par molécule active, on entend une molécule qui produit un effet, tel qu'un pouvoir destructeur sur les microorganismes ou un effet catalyseur sur des réactions chimiques, et qui se dégrade au cours du temps, sous l'effet de la chaleur notamment. Par molécule active, on entend préférentiellement un antibiotique ou une enzyme.
Par antibiotique, on entend une substance chimique ayant un pouvoir destructeur sur les micro-organismes.
On peut citer notamment la famille des betalactamines, comprenant notamment les penams (tels que Pénicilline; Bipénicilline; Extencilline; Oracilline, Oxacilline; Cloxaciline; Ampicilline; Amoxicilline; Bacampicilline; Métampicilline; Pivampicilline; Azlocilline; Mezlocilline; Pipéracilline; Ticarcilline; Pivmécillinam; Oxapénam; Acide clavulanique; Sulbactam; Tazobactam); les penems (tel que l'imipénème) ; les cephems (tels que les céphalosporines de 1° génération (Céfalexine; Céfadroxil; céfaclor; Céfatrizine; Céfalotine; Céfapyrine; Céfazoline), les céphalosporines de 2° génération (Céfoxitine; Céfamandole; Céfotétan; Céfuroxime), les céphalosporines de 3° génération (Céfotaxime; Cefsulodine; Céfopérazone;
Céfotiam; Ceftazidime; Ceftriaxone; Céfixime; Cefpodoxime; Latamoxef)); les monobactams tel que l'aztréonam).
On peut citer également la famille des fosfomycines; des glycopeptides (Vancomycine;
Teicoplanine) ; des polymycines (colistine); des gramicidines et tyrocidine (Bacitracine; Tyrothricine; des aminosides (Streptomycine; Tobramycine; Amikacine;
Sisomicine; Dibékacine; Nétilmicine); des macrolides (Spiramycine; Erythromycine;
Erythrocine; Josamycine; Roxithromycine; Clarithromycine; Azithromycine); des lincosamides (Lincomycine; Clindamycine); des synergistines (Virginiamycine;
Pristinamycine); des phenycoles (Chloramphénicol; Thiamphénicol); des tetracyclines (Tétracycline; Doxycycline; Minocycline); acide fusidique; des oxazolidinones
(Linézolide); des rifamycines (Rifamycine; Rifampicine); des quinolones (Acide nalidixique; Acide oxolinique; Acide pipémidique); des fluoroquinolones (Fluméquine;
Péfloxacine; Norfloxacine; Ofloxacine; Ciprofloxacine; Enoxacine; Levofloxacine;
Moxifloxacine); des oxyquinoleines (Nitroxoline; Tilboquinol); des nitrofuranes (Nitrofurantoïne; Nifuroxazide); des nitro-imidazoles (Métronidazole; Ornidazole); des sulfamides (Sulfadiazine; Sulfaméthisol), des trimethoprime (Triméthoprime).
Par enzyme, on entend une molécule de nature protéique catalysant les réactions biochimiques du métabolisme se déroulant dans le milieu cellulaire ou extracellulaire.
On peut citer notamment les oxydoréductases (telles que les oxydases, réductases, peroxydases, oxygénases, hydrogénases, ou déshydrogénases.); transférases (telles que les kinases ; transaminases; mutases) ; hydrolases (telles que les estérases; peptidases ; osidases: glucosidases) ; lyases (telles que les décarboxylases, aldolases; déshydratases); isomérases (telles que les racémases; épimérases) ; ligases.
Préférentiellement, l'enzyme est une hydrolase, et encore plus préférentiellement une beta lactamase.
Par cyclodextrine, on entend une molécule de la famille d'oligosaccharides cycliques composés de sous unités glucopyranose liées en α-(l,4) et répondant à la formule brute
C42H70O35 ou à un dérivé de cette molécule, dans laquelle les groupements hydroxyles des unités glucopyranose peuvent être aminés, estérifiés ou éthérifiés. On peut citer notamment la beta-cyclodextrine (BCD), l'hydroxypropyl-beta-cyclodextrine
(HPCD),la méthyl-beta-cyclodextrine (MCD), l'alpha-cyclodextrine (ACD), la gamma- cyclodextrine (GCD).
Préférentiellement, la cyclodextrine est choisie parmi une alpha-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltohexaose (Référence bioCydex ACD NO ; No CAS 51211-54-9) ; une gamma-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltooctaose (Référence bioCydex GCD NO ; No CAS 91464-90-3) ; une beta- cyclodextrine qui est préférentiellement une 2-O-méthyl-beta-cyclodextrine ou la randomly 2-O-méthyl-cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD C 15) ; ou préférentiellement une 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrine encore appelée la randomly 2,3,6-O-(2-hydroxypropyl)-cyclomaltoheptaose ( Référence bioCydex BCD R59, No CAS 128449-35-5) ; ou préférentiellement une monopropanediamino-beta- cyclodextrine encore appelée la 6I-(3-amino-propylamino)-6I-desoxy- cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD A56). D'une manière générale, les cyclodextrines de la présente invention ont été fournies par la société BioCydex (Poitiers, France). A titre indicatif, la cyclomaltohexaose et la cyclomaltooctaose sont en vente chez Wacker Chemie; la cyclomaltoheptaose, la 2, O methyl- cyclomaltoheptaose et l'hydroxypropyl-beta-cyclodextrine sont en vente chez Roquette Frères et la monopropane-diamino-beta-cyclodextrine est en vente chez BioCydex. Par substrat permettant la détection d'une activité enzymatique ou métabolique, on entend toute molécule susceptible d'engendrer directement ou indirectement un signal détectable dû à une activité enzymatique ou métabolique du microorganisme. Lorsque cette activité est une activité enzymatique, on parle alors de substrat enzymatique. Par substrat enzymatique, on entend tout substrat pouvant être hydrolyse par une enzyme en un produit permettant la détection, directe ou indirecte d'un microorganisme. Ce substrat comprend notamment une première partie spécifique de l'activité enzymatique à révéler et une seconde partie faisant office de marqueur, ci- après appelée partie marqueur. Cette partie marqueur peut être chromogène, fluorogène, luminescente... Comme substrat chromogène, bien adapté aux supports solides (filtre, gélose, gel d'électrophorèse), on peut citer notamment les substrats à base d'indoxyl et ses dérivés, et les substrats à base d'hydroxyquinoline ou d'esculétine et leurs dérivés, qui permettent la détection d'activités osidase et estérase.
A titre de substrats à base d'Indoxyl, on peut citer notamment 3-Indoxyl, 5-Bromo-3- indoxyl, 5-Iodo-3-indoxyl, 4-Chloro-3-indoxyl, 5-Bromo-4-chloro-3-indoxyl, 5- Bromo-6-chloro-3-indoxyl, 6-Bromo-3-indoxyl, 6-Chloro-3-indoxyl, 6-Fluoro-3- indoxyl, 5-Bromo-4-chloro-N-méthyl-3-indoxyl, N-Méthyl-3-indoxyl, ...).. On peut également citer les substrats dérivés de flavoides, tels que notamment le 3 ',4'- Dihydroxyflavone-4'-β-D-riboside, le 3',4'-Dihydroxyflavone-4'-β-D-galactoside, le 3',4'-Dihydroxyflavone-4'-β-D-glucoside, 3-Hydroxyflavone-β-D-galactoside, le 3- Hydroxyflavone-β-D-glucoside, 3 ' ,4 ' -Dihydroxyflavone-3 ' ,4' -diacétate. On peut citer également les substrats à base de nitrophénol (ortho-Nitrophénol, para- Nitrophénol, ...) et nitroaniline et dérivés, permettant de détecter les activités osidases et estérases dans le cas de substrats à base de nitrophénol, et des activités peptidases dans le cas de substrats à base de la nitroaniline.
On peut citer enfin les substrats à base de naphtol et naphtylamine et leurs dérivés, qui permettent de détecter les activités osidases et estérases par l'intermédiaire du naphtol, et les activités peptidases par l'intermédiaire de la naphtylamine. Ce substrat peut permettre notamment, mais d'une façon non limitative, la détection d'une activité enzymatique telle que l'activité d'une osidase, peptidase, estérase... On peut aussi citer les substrats à base de Coumarine et dérivés permettant aussi de détecter les activités osidases et estérases dans le cas de substrats à base d'hydroxycoumarines et notamment de la 4-Méthyl-umbelliférone ou de la Cyclohexenoesculétine, et des activités peptidases dans le cas de substrats à base d'aminocoumarines et notamment de la 7-Amino-4-méthyl-coumarine. On peut encore citer les substrats à base d'Aminophénol et dérivés permettant de détecter les activités osidases, estérases et peptidases. On peut citer également les substrats à base d'Alizarine et dérivés permettant de détecter les activités osidases et estérases. On peut citer enfin les substrats à base de Naphtol et Naphtylamine et leurs dérivés, qui permettent de détecter les activités osidases et estérases par l'intermédiaire du Naphtol, et les activités peptidases par l'intermédiaire de la Naphtylamine. Par substrat à base de Naphtol, on entend notamment les substrats à bases d'α-Naphtol, de β-Naphtol, de 6-Bromo-2-naphtol, de Naphtol AS BI, de Naphtol AS, de p- Naphtolbenzeine tel que définis dans la demande de brevet EP 1224196 de la
demanderesse. Cela peut être des substrats d'osidase, d'estérase, de phosphatase, de sulfatase. Les substrats d'osidase sont notamment des substrats de N-Acétyl-β- hexosaminidase, de β-galactosidase, d'α-galacotosidase, de β-glucosidase, d'α- glucosidase, de β-glucuronidase, de β-cellobiosidase, d'α-mannosidase. Par substrat à base d'Alizarine, on entend notamment les substrats décrits dans le brevet EP1235928 de la demanderesse.
Le substrat enzymatique peut également être un substrat naturel dont le produit d'hydrolyse est détecté directement ou indirectement. Comme substrat naturel, on peut notamment citer le Tryptophane pour détecter une activité tryptophanase ou desaminase, un acide aminé cyclique (Tryptophane, Phénylalanine, Histidine, Tyrosine) pour détecter une activité desaminase, le Phosphatidyl Inositol pour détecter une activité phospholipase, ...
Lorsque cette activité est une activité métabolique, le substrat est alors un substrat métabolique, telle qu'une source de carbone ou d'azote, couplée à un indicateur produisant une coloration en présence de l'un des produits du métabolisme.
A titre indicatif, les substrats utilisés pour la détection d'une activité beta- glucuronidase peuvent notamment être le 4-Méthylumbelliféryl-beta-glucuronide, le 5- Bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-glucuronide, le 5-Bromo-6-chloro-3-indolyl-beta- glucuronide, le 6-Chloro-3-indolyl-beta-glucuronide, l'Alizarine-beta-glucuronide, le Cyclo-hexeno-esculetine-beta-glucuronide ou leurs sels. A titre indicatif, les substrats utilisés pour la détection d'une activité beta-galactosidase peuvent notamment être le 4- Méthylumbelliféryl-beta-galactoside, le 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-galactoside, le 5-Bromo-6-chloro-3-indolyl-beta-galactoside, le 6-Chloro-3-indolyl-beta- galactoside, l'Alizarine-beta-galactoside, le Cyclo-hexeno-esculetine-beta-galactoside ou leurs sels. Les substrats utilisés pour la détection d'une activité beta-glucosidase peuvent notamment être le 4-Méthylumbelliféryl-beta-Glucoside, le 5-Bromo-4-chloro- 3-indolyl-beta-Glucoside, le 5-Bromo-6-chloro-3-indolyl-beta-Glucoside, le 6-Chloro- 3-indolyl-beta-Glucoside, l'Alizarine-beta-Glucoside, le Cyclo-hexeno-esculetine-beta- Glucoside, le Nitrophényl-beta-glucoside, le Dichloroaminophényl-glucoside ou leurs sels.
Par échantillon biologique, on entend un échantillon clinique, issu d'un prélèvement de liquide biologique, ou un échantillon alimentaire, issu de tout type d'aliment. Cet échantillon peut être ainsi liquide ou solide et on peut citer d'une manière non limitative, un échantillon clinique de sang, de plasma, d'urines, de fécès, de prélèvements de nez, de gorges, de peaux, de plaies, de liquide céphalo-rachidien, un échantillon alimentaire d'eau, de boissons tels que le lait, un jus de fruits; de yaourt, de viande, d'œufs, de légumes, de mayonnaise, de fromage ; de poisson..., un échantillon alimentaire issu d'une alimentation destinée aux animaux, tel que notamment un échantillon issu de farines animales.
A ce titre, l'invention concerne un milieu réactionnel pour l' identification/détection de microorganismes comprenant au moins une molécule active encapsulée dans une cyclodextrine.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, la cyclodextrine est choisie parmi : une alpha-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltohexaose (Référence bioCydex ACD NO; No CAS 51211-54-9) ; une gamma-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltooctaose (Référence bioCydex GCD NO ; No CAS 91464-90-3) ; une beta-cyclodextrine qui est préférentiellement une 2-O-méthyl-beta- cyclodextrine ou la randomly 2-O-méthyl-cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD C 15) ; ou préférentiellement une 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrine encore appelée la randomly 2,3,6-O-(2-hydroxypropyl)-cyclomaltoheptaose ( Référence bioCydex BCD R59 No CAS 128449-35-5) ; ou préférentiellement une monopropanediamino-beta-cyclodextrine encore appelée la 6I-(3-amino-propylamino)- ό^desoxy-cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD A56). Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, la molécule active est un antibiotique. Préférentiellement, l'antibiotique est choisi parmi la famille des penams ou des cephams. Préférentiellement, l'antibiotique est la cefoxitine ou la cloxacilline. Bien évidement, le milieu réactionnel selon la présente invention peut comprendre un antibiotique ou plusieurs antibiotiques. L'homme du métier adaptera aisément la concentration en antibiotique selon l'effet recherché. Préférentiellement, la concentration en antibiotique est comprise 0,01 et 80 mg/1, préférentiellement entre
0,05 et 32 mg/1, encore plus préférentiellement entre 0,1 et 8 mg/1 et encore plus préférentiellement entre 0,25 et 6mg/l.
A titre indicatif, lorsque l'antibiotique est la cefotaxime, la concentration en cefotaxime dans le milieu est préférentiellement comprise entre 0,25 et 8 mg/1, préférentiellement entre 1 et 2 mg/1 ; lorsque l'antibiotique est la cefoxitine, la concentration en cefoxitine dans le milieu est préférentiellement comprise entre 0,1 et 8 mg/1 et encore plus préférentiellement entre 0,25 et 6mg/l ; lorsque l'antibiotique est la cloxacilline, la concentration en cloxacilline dans le milieu est préférentiellement comprise entre 0, 1 et 8 mg/1 et encore plus préférentiellement entre 0,25 et 6mg/l ; lorsque l'antibiotique est la ceftazidime, la concentration en ceftazidime dans le milieu est préférentiellement comprise entre 0,25 et 8 mg/1, préférentiellement entre 2 et 2,5 mg/1 ; lorsque l'antibiotique est la ceftriaxone, la concentration en ceftriaxone dans le milieu est préférentiellement comprise entre 0,25 et 8 mg/1, préférentiellement entre 1 et 2,5 mg/1 ; lorsque l'antibiotique est la cefpodoxime, la concentration en cefpodoxime dans le milieu est préférentiellement comprise entre 0,1 et 32 mg/1, préférentiellement entre 0,75 et 10 mg/1 et encore plus préférentiellement entre 1 et 6 mg/1. Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, la molécule active est une enzyme, préférentiellement la beta lactamase. L'homme du métier adaptera la concentration en enzyme selon l'effet recherché. Préférentiellement, la concentration en beta lactamase dans le milieu est préférentiellement comprise entre 50 et 500 UI/1, préférentiellement entre 100 et 150 UI/1.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, le milieu réactionnel comprend au moins un substrat permettant la détection d'une activité enzymatique ou métabolique. Le milieu peut comprendre également une combinaison de substrats, selon les microorganismes que l'on souhaite identifier. L'homme du métier adaptera la concentration en substrat(s) selon le microorganisme que l'on souhaite identifier. Préférentiellement, la concentration en substrat est comprise entre 25 et 750 mg/1, préférentiellement entre 40 et 200 mg/1. A titre indicatif, lorsqu'on utilise le substrat 5- Bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-glucoside permettant la détection d'une activité enzymatique beta-glucosidase, la concentration est préférentiellement à une concentration comprise entre 25 et 500mg/l, préférentiellement entre 40 et 150mg/l. A
titre indicatif, lorsqu'on utilise le substrat, le 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-N-acétyl-β- D-glucosaminide permettant la détection d'une activité enzymatique hexosaminidase, la concentration est préférentiellement à une concentration comprise entre 25 et 500 mg/1, préférentiellement entre 40 et 150 mg/1. A titre indicatif, lorsqu'on utilise le 5- Bromo-6-chloro-3-indolyl-phosphate permettant la détection d'une activité phosphatase, la concentration est préférentiellement à une concentration comprise entre 25 et 750 mg/1, préférentiellement entre 40 et 200 mg/1.
L'homme du métier peut également utiliser une biboite, permettant de comparer aisément deux milieux, comprenant différents substrats, sur lequel on aura déposé un même échantillon biologique.
Préférentiellement, ledit substrat permettant la détection d'une activité enzymatique ou métabolique est un substrat enzymatique, préférentiellement fluorescent ou chromogène.
Préférentiellement, l'activité enzymatique est choisie parmi les activités enzymatiques suivantes: osidase, estérase, peptidase, et encore plus préférentiellement, ladite même activité enzymatique est choisie parmi les activités enzymatiques suivantes : B-D- glucosidase, β-D-galactosidase, alpha-D-glucosidase, alpha-D-galactosidase, alpha- mannosidase, β-D-glucuronidase, N-Acetyl-β-D-hexosaminidase, β-D-cellobiosidase, estérase, phosphatase, phospholipase, sulfatase, peptidase. L'invention concerne également un procédé de détection et/ou d'identification de micro-organismes, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes à : a) disposer d'un milieu réactionnel tel que défini ci avant, b) ensemencer le milieu avec un échantillon biologique à tester, c) laisser incuber, et d) détecter et/ou identifier les microorganismes
L'ensemencement des microorganismes peut être réalisé par toutes les techniques d'ensemencement connues de l'homme du métier. Une étape d'incubation peut être réalisée à une température pour laquelle l'activité enzymatique que l'on souhaite détecter est optimale, que l'homme du métier peut choisir aisément selon l'activité enzymatique à détecter. L'étape d) peut s'effectuer par un examen visuel, par colorimétrie ou fluorimétrie.
L'invention concerne également l'utilisation du milieu réactionnel tel que décrit ci avant pour la détection et/ou l'identification de micro-organismes. L'invention concerne également l'utilisation de cyclodextrine(s) pour accroître la stabilité d'un milieu réactionnel. Grâce à une telle utilisation, il est possible de reculer la date de péremption du milieu réactionnel, et de conserver le milieu plus aisément.
Préférentiellement, la cyclodextrine utilisée est choisie parmi une alpha-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltohexaose (Référence bioCydex ACD NO ; No CAS 51211-54-9) ; une gamma-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltooctaose (Référence bioCydex GCD NO ; No CAS 91464-90-3) ; une beta- cyclodextrine qui est préférentiellement une 2-O-méthyl-beta-cyclodextrine ou la randomly 2-O-méthyl-cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD C 15) ; ou préférentiellement une 2-hydroxypropyl-beta-cyclodextrine encore appelée la randomly 2,3,6-O-(2-hydroxypropyl)-cyclomaltoheptaose ( Référence bioCydex BCD R59 ; No CAS 128449-35-5) ; ou préférentiellement une monopropanediamino-beta- cyclodextrine encore appelée la 6I-(3-amino-propylamino)-6I-desoxy- cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD A56).
L'invention concerne également l'utilisation de cyclodextrine(s) pour protéger des molécules actives contre une dégradation physico-chimique en milieu réactionnel, telle que notamment la chaleur ou une agitation. Préférentiellement, la cyclodextrine utilisée est choisie parmi une alpha-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltohexaose (Référence bioCydex ACD NO ; No CAS 51211-54-9) ; une gamma-cyclodextrine, qui est préférentiellement la Cyclomaltooctaose (Référence bioCydex GCD NO ; No CAS 91464-90-3) ; une beta-cyclodextrine qui est préférentiellement une 2-O-méthyl-beta-cyclodextrine ou la randomly 2-O-méthyl- cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD C 15) ; ou préférentiellement une 2- hydroxypropyl-beta-cyclodextrine encore appelée la randomly 2,3,6-O-(2- hydroxypropyl)-cyclomaltoheptaose ( Référence bioCydex BCD R59 ; No CAS 128449-35-5) ; ou préférentiellement une monopropanediamino-beta-cyclodextrine encore appelée la 6I-(3-amino-propylamino)-6I-desoxy-cyclomaltoheptaose (Référence bioCydex BCD A56).
Les exemples ci dessous sont donnés à titre explicatif et n'ont aucun caractère limitatif. Ils permettront de mieux comprendre l'invention.
Les exemples ci dessous sont relatifs à la protection contre la dégradation de 3 molécules actives (deux antibiotiques, la cloxacilline et la céfoxitine, et une enzyme, la β-lactamase) grâce à leur encapsulation dans une cyclodextrine. Plusieurs cyclodextrines (ACD NO, GCD NO, BCD C 15, BCD R59, BCD A56) de la gamme SolvamaχR ont été testées pour leur capacité à ralentir la dégradation thermique de molécules actives. La stabilité a été évaluée par CLHP.
1. PROTECTION ET STABILISATION DE LA CLOXACILLINE La cloxacilline (Masse Moléculaire 475,88) est un antibiotique de type β-lactamine, utilisé pour inhiber la croissance de certaines espèces bactériennes telles que Enterobacter aerogenes ou Escherichia coli. Les cyclodextrines de la librairie de BioCydex ont été incubées avec la cloxacilline dans un rapport molaire 1 : 1 (concentration = 210,12 mM), à 200C pendant 72 h (agitation à l'abri de la lumière). La quantité de cloxacilline résiduelle a été ensuite analysée par HPLC.
Les essais suivants ont été réalisés en milieu aqueux et à température élevée (75°C) pour accélérer la vitesse de dégradation.
1.1 Criblage ex-situ
Le sel de sodium de la cloxacilline (Sigma, Réf. C 9393) présente une solubilité intrinsèque élevée en milieu aqueux (~100 g.L"1).
Les complexes ont été préparés à température ambiante avec des rapports molaires cloxacilline : cyclodextrine de 1: 16 et de 1 :79. Les solutions contenant 0,63 mM soit 300 mg.L"1 de cloxacilline ont été incubées à 75 0C pendant 31 h. L'analyse des échantillons et leur quantification pour évaluer la stabilité de l'antibiotique ont été réalisés sur une chaîne Thermo Finnigan SpectraSYSTEM HPLC System équipée avec une pompe P1000XR, un injecteur automatique AS3000, un détecteur UV1000 UV/Visible, une colonne Merck ChromolithR Performance RP-18 endcapped (100-4,6 mm) précédée par une colonne de garde Merck Chromolith® RP- 18e (5-4,6 mm). Les phases mobiles ont été préparées à partir d'acétonitrile grade-HPLC et d'eau acidifiée par de l'acide trifluoroacétique (lOOμL/L). Un gradient méthanol/eau de 0/100 à 100/0 a été appliqué en 12 min. Après stabilisation pendant 2 min la colonne est
rééquilibrée dans les conditions initiales. La vitesse d'élution est de 1 mL/min, la température de 22°C et la détection réalisée à 220 nm. Le volume d'injection des échantillons est de 20 μL. Les données chromatographiques ont été traitées par le logiciel Atlas, version 2003.1 (Thermo Electron Corporation, U.K.). Les résultats sont présentés dans le tableau I :
Tableau I : Stabilité de la cloxacilline en présence de cyclodextrines à 75°C
Ces résultats démontrent l'effet protecteur des cyclodextrines BCD R59 et BCD C15 sur la cloxacilline. Ces résultats ont été confirmés dans les mêmes conditions expérimentales lorsque le rapport molaire cloxacilline : cyclodextrine était au minimum de 1 : 15. A ce titre, la figure 1 présente l'effet protecteur des cyclodextrines contre la dégradation de la cloxacilline par la chaleur (-CD : absence de cyclodextrine ; 1 : 1 à
1 : 125 : rapports molaires cloxacilline:CD). La cyclodextrine BCD C 15 présentait la meilleure protection a de faible rapport. Pour des rapports molaires supérieurs à 1:50, des performances similaires étaient observées pour les deux cyclodextrines.
Ces résultats montrent que la complexation de la cloxacilline à une cyclodextrine comme la BCD R59 ou BCD C15 confère à la molécule antibiotique une protection contre l'inactivation par un traitement thermique (3 Ih à 75°C) puisque 40% de la molécule native sont retrouvés après chauffage contre 0% lorsque la cloxacilline n'est pas associée à la cyclodextrine.
2. COMPLEXATION DE LA CEFOXITINE La cefoxitine est un antibiotique de la famille des β-lactamines, inhibiteur de la synthèse des mucopeptides de la paroi bactérienne. 2.1 Criblage ex-situ
0,444 mM de céfoxitine (Sigma, Réf. C4786-5G) et 8,88 mM de cyclodextrine (ACD NO ou GCD NO ou BCD R59 ou BCD C15), soit dans un rapport molaire de 1 :20, ont été dissous sous agitation pendant une heure à température ambiante. Le mélange était ensuite porté à 65°C pendant 90 min. L'intégrité de la céfoxitine était ensuite analysée par HPLC. L'analyse des échantillons et leur quantification ont été réalisés sur une chaîne Thermo Finnigan SpectraSYSTEM HPLC System équipée avec une pompe P1000XR, un injecteur automatique AS3000, un détecteur UV1000 UV/Visible, une colonne Merck Chromolith® Performance RP- 18 endcapped (100-4,6 mm) précédée par une colonne de garde Merck Chromolith® RP- 18e (5-4,6 mm). Les phases mobiles ont été préparées à partir d'acétonitrile grade-HPLC et d'eau acidifiée par de l'acide trifluoroacétique (lOOμL/L). Un gradient méthanol/eau de 0/100 à 100/0 a été appliqué en 12 min. Après stabilisation pendant 2 min la colonne est rééquilibrée dans les conditions initiales. La vitesse d'élution est de 1 mL/min, la température de 22°C et la détection réalisée à 254 nm. Le volume d'injection des échantillons est de 20 μL. Les données chromatographiques ont été traitées par le logiciel Atlas, version 2003.1 (Thermo Electron Corporation, U.K.). Les résultats sont présentés dans le tableau II :
Tableau II : Effet de différentes cyclodextrines sur la stabilité de la céfoxitine à
65°C
L'optimisation de la protection a été recherchée en faisant varier le rapport molaire céfoxitine:cyclodextrine (BCD R59 et BCD C15) de 1 : 1 à 1 :216, les autres conditions demeurant inchangées. A ce titre, la figure 2 présente l'effet protecteur de BCD R59 et de BCD C15 sur la céfoxitine en milieu aqueux. L'amélioration de la stabilité a été calculée par rapport au témoin sans cyclodextrine.
Pour des rapports molaires variant entre 1 :6 et 1 :30, la cyclodextrine BCD C15 était la plus efficace. Au-delà, les deux cyclodextrines étaient équivalentes. Un rapport molaire
de 1 :50 était suffisant pour atteindre un degré de protection important à basse température. Dans ce cas, la stabilité de la céfoxitine après 90 min à 65°C est de 47,5% au lieu de 38,5% avec le témoin sans cyclodextrine.
Ces résultats démontrent que les cyclodextrines ACD NO, GCD NO, BCD R59 et BCD C15 protègent la céfoxitine d'une dénaturation par la chaleur puisque qu'en présence de BCD C 15, l'antibiotique complexé est environ 10% moins dégradé que la molécule seule.
3. PROTECTION DE LA BETA-LACTAMASE 3.1 Stabilité de la β-lactamase
La β-lactamase (Genzyme Biochemicals Réf. BELA-70-1431) en quantité équivalente à 0,375 U.mL"1 a été mélangée à la cyclodextrine BCD A56 de la gamme Protéosol® (1 ou 10 mM), à température ambiante et à l'abri de la lumière, pendant 30 min. Le mélange a été ensuite chauffé à 700C pendant 45 min. L'amoxicilline (Glaxo, Réf. 5003), 500 mg.L"1, révélatrice de l'activité de la β-lactamase, a été ensuite ajoutée à température ambiante. Après une incubation de 5 min à 25°C, l'amoxicilline résiduelle a été analysée par HPLC. Les profils obtenus sont présentés dans la figure 3, qui présente l'analyse HPLC de l'amoxicilline (A : témoin amoxicilline non traitée ; B : amoxicilline + β-lactamase non chauffée ; C : amoxicilline + β-lactamase chauffée ; D : amoxicilline + complexe β-lactamase : BCD A56 (1 mM) chauffé. TR amoxicilline = 5,5 min). Le pic de l'amoxicilline sortait à 5,5 min.
L'activité de la β-lactamase a été attestée par la diminution du pic de l' amoxicilline (Fig. 3B) par rapport au témoin amoxicilline seule (Fig. 3A) et par l'apparition de produits d'hydrolyse caractérisés par un massif à des temps de rétention plus faibles. Lorsque la β-lactamase était dégradée par chauffage, elle perdait une partie de son activité, ce qui se traduisait par une meilleure stabilité de l'arnoxicilline (Fig. 3C). Le même traitement thermique en présence de cyclodextrine (Fig. 3D) permettait de conserver une activité de la β-lactamase identique à celle du témoin amoxicilline-β- lactamase non chauffée (Fig. 3B).
A partir des profils ci-dessus, il a été possible de quantifier la concentration de l'arnoxicilline et lier cette valeur à l'activité de la β-lactamase. Les résultats sont présentés dans le tableau III.
Tableau III: Influence de BCD A56 sur la résistance de la β-lactamase à la dégradation thermique
En prenant comme référence la situation en absence de cyclodextrine, on concluait à une excellente protection de la β-lactamase en présence de BCD A56 à 10 mM et que, de plus, cette cyclodextrine n'interagissait pas avec le site actif de l'enzyme.
Ces résultats démontrent que la beta-lactamase associée à la cyclodextrine conserve toute son activité enzymatique même après chauffage à 700C pendant 45 minutes puisqu'elle reste capable de dégrader complètement l' amoxicilline, substrat de l'enzyme, contrairement à la protéine non complexée. La cyclodextrine protège donc l'enzyme et son site actif d'une dénaturation par un traitement thermique.
5. Milieu réactionnel :
Deux milieux réactionnels ont été fabriqués à partir d'un milieu ChromlD™ MRSA, l'un avec de la céfoxitine et l'autre contenant un complexe cyclodextrine BCD Cl 5 + céfoxitine. Ce dernier étant obtenu en solubilisant la céfoxitine et la cyclodextrine dans de l'eau osmosée puis en agitant la solution à température ambiante et à l'abri de la lumière. Le mélange est ensuite filtré avant d'être incorporé dans la gélose. Les milieux sont stockés à 2-8 0C pendant 19 semaines et les performances (croissance des MRSA : Staphylococcus aureus Résistants à la Méticilline, inhibition des MSSA : Staphylococcus aureus Sensibles à la Méticilline) sont évaluées toutes les semaines comparativement à un milieu commercialisé prêt à l'emploi.
La protection de la céfoxitine par la cyclodextrine est mesurée en comparant l'inhibition de croissance des MSSA (céfoxitine active) au cours du temps sur les milieux avec et sans cyclodextrine BCD C 15.
Les souches de MRSA et MSSA sont ensemencées sur les milieux selon la méthode en trois cadrans puis les boîtes sont incubées 48 h à 37°C.
La croissance des souches (présence de colonies sur la boîte) ainsi que la couleur des colonies après 24 et 48 h d'incubation sont observées. Les résultats sont présentés dans le tableau ci-dessous :
Légende :
+ : croissance
- : absence de croissance
(N) : nombre de souches qui poussent/nombre de souches testées
V : vert
Comme attendu à T=O, les souches MRSA se développent en formant des colonies vertes alors que les souches de MSSA sont correctement inhibées. La présence de cyclodextrines est compatible avec une utilisation en milieu de culture.
Claims
1. Milieu réactionnel pour l' identification/détection de microorganismes comprenant au moins une molécule active encapsulée dans une cyclodextrine.
2. Milieu réactionnel selon la revendication 1 caractérisé en ce que la cyclodextrine est choisie parmi : une alpha-cyclodextrine ; une gamma-cyclodextrine ; une beta- cyclodextrine : une 2-0-méthyl-beta-cyclodextrine ; une 2-hydroxypropyl-beta- cyclodextrine ; une monopropanediamino-beta-cyclodextrine.
3. Milieu réactionnel selon la revendication 1 ou 2 caractérisé en ce que la molécule active est un antibiotique.
4. Milieu réactionnel selon la revendication 3 caractérisé en ce que l'antibiotique est choisi parmi la famille des penams ou des cephams.
5. Milieu réactionnel selon la revendication 1 ou 2 caractérisé en ce que la molécule active est une enzyme, préférentiellement une hydrolase et encore plus préférentiellement une beta lactamase.
6. Milieu réactionnel selon la revendication 1 a 5 caractérisé en ce qu'il comprend au moins un substrat permettant la détection d'une activité enzymatique ou métabolique.
7. Milieu réactionnel selon la revendication 6 caractérisé en ce que ledit substrat permettant la détection d'une activité enzymatique ou métabolique est un substrat enzymatique, préférentiellement fluorescent ou chromogène.
8. Procédé de détection et/ou d'identification de micro-organismes, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes à : a) disposer d'un milieu réactionnel selon l'une quelconque des revendications
1 à 7, b) ensemencer le milieu avec un échantillon biologique à tester, c) laisser incuber, et d) détecter et/ou identifier les microorganismes.
9. Utilisation du milieu réactionnel selon l'une quelconque des revendications 1 à 7 pour la détection et/ou l'identification de micro-organismes.
10. Utilisation de cyclodextrine(s) pour accroître la stabilité d'un milieu réactionnel.
11. Utilisation de cyclodextrine(s) pour protéger des molécules actives contre une dégradation physico-chimique en milieu réactionnel.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| FR0754806A FR2915492B1 (fr) | 2007-04-30 | 2007-04-30 | Milieu reactionnel pour l'identification / detection de microorganismes |
| PCT/FR2008/050761 WO2008148972A2 (fr) | 2007-04-30 | 2008-04-28 | Milieu reactionnel pour l'identification/detection de microorganismes |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EP2142662A2 true EP2142662A2 (fr) | 2010-01-13 |
Family
ID=38857924
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| EP08805715A Withdrawn EP2142662A2 (fr) | 2007-04-30 | 2008-04-28 | Milieu reactionnel pour l'identification/detection de microorganismes |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20100120084A1 (fr) |
| EP (1) | EP2142662A2 (fr) |
| JP (1) | JP2010525803A (fr) |
| CN (1) | CN101743318A (fr) |
| FR (1) | FR2915492B1 (fr) |
| WO (1) | WO2008148972A2 (fr) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN102671210B (zh) * | 2012-05-09 | 2013-06-26 | 张奎昌 | 硝呋酚酰肼β-环糊精或其衍生物的包合物及制剂的制备方法 |
| CN103436589A (zh) * | 2013-09-11 | 2013-12-11 | 中国检验检疫科学研究院 | 鉴别革兰氏阴性和阳性菌的培养基及使用方法 |
| CN103937663A (zh) * | 2014-05-08 | 2014-07-23 | 杭州北望生物技术有限公司 | 一种抗生素生产车间环境监测用无菌培养基平皿及其制备方法 |
| JP7176833B2 (ja) * | 2015-11-19 | 2022-11-22 | 栄研化学株式会社 | インフルエンザ菌のスクリーニング方法およびスクリーニング用培地 |
| JP7503384B2 (ja) * | 2020-01-09 | 2024-06-20 | 栄研化学株式会社 | レジオネラ属菌鑑別用発色培地 |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP3636849B2 (ja) * | 1996-11-14 | 2005-04-06 | キッコーマン株式会社 | 微生物の薬剤感受性試験法、同試験用キット、微生物の最少発育阻止濃度測定法並びに同測定用キット |
| FR2875240B1 (fr) * | 2004-09-16 | 2006-11-17 | Biomerieux Sa | Procede de detection de streptococcus agalactiae en utilisant l'activite alpha-glucosidase |
| FR2881755B1 (fr) * | 2005-02-10 | 2012-11-30 | Biomerieux Sa | Milieux pour la detection specifique de micro-organismes resistants |
| MX2007015862A (es) * | 2005-06-13 | 2008-02-22 | Cargill Inc | Complejos de inclusion de ciclodextrina y metodos para preparar los mismos. |
-
2007
- 2007-04-30 FR FR0754806A patent/FR2915492B1/fr not_active Expired - Fee Related
-
2008
- 2008-04-28 CN CN200880014269A patent/CN101743318A/zh active Pending
- 2008-04-28 JP JP2010504809A patent/JP2010525803A/ja active Pending
- 2008-04-28 US US12/450,603 patent/US20100120084A1/en not_active Abandoned
- 2008-04-28 WO PCT/FR2008/050761 patent/WO2008148972A2/fr not_active Ceased
- 2008-04-28 EP EP08805715A patent/EP2142662A2/fr not_active Withdrawn
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| See references of WO2008148972A2 * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| FR2915492A1 (fr) | 2008-10-31 |
| JP2010525803A (ja) | 2010-07-29 |
| CN101743318A (zh) | 2010-06-16 |
| US20100120084A1 (en) | 2010-05-13 |
| FR2915492B1 (fr) | 2011-04-15 |
| WO2008148972A2 (fr) | 2008-12-11 |
| WO2008148972A3 (fr) | 2009-03-19 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| FR2973042A1 (fr) | Detection de bacteries presentant une resistance aux carbapenemes | |
| EP1543147A1 (fr) | Procede de detection de microorganismes resistants a la meticilline | |
| EP2142662A2 (fr) | Milieu reactionnel pour l'identification/detection de microorganismes | |
| EP2235202B1 (fr) | Procédé de détection et/ou d'identification de clostridium difficile | |
| EP2877591B1 (fr) | Procede de detection de bacteries productrices de carbapenemases de type oxa-048 | |
| FR2973041A1 (fr) | Detection de bacteries presentant une resistance enzymatique aux carbapenemes | |
| EP1789573B1 (fr) | Procede de detection de streptococcus agalactiae en utilisant l'activite alpha-glucosidase | |
| EP3094738B1 (fr) | Utilisation d'au moins un substrat de carboxylestérase et/ou de triacylglycérol-lipase pour la détection des bactéries du groupe bacillus cereus | |
| EP2981619B1 (fr) | Utilisation d'au moins un substrat de phosphatase chromogène et/ou fluorogène pour la détection et/ou le dénombrement d'entérobactéries dans un échantillon | |
| EP2041298B1 (fr) | Milieu de culture solide pour la detection et/ou la discrimination au niveau de l'espece des enterocoques resistants aux glycopeptides | |
| EP2459736B1 (fr) | Nouveaux substrats enzymatiques de nitroreductase | |
| EP2611903B1 (fr) | Utilisation d'un activateur de beta-glucosidase pour la détection et/ou l'identification de c.difficile | |
| EP1605059A2 (fr) | Milieu de culture et procédé d'identification de Listeria monocytogènes | |
| EP2459738B1 (fr) | Nouveaux substrats enzymatiques de nitroreductase | |
| EP2459737B1 (fr) | Nouveaux substrats enzymatiques de nitroreductase | |
| EP2459735A2 (fr) | Nouveaux substrats de peptidase | |
| EP2459733B1 (fr) | Nouveaux substrats de peptidase |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PUAI | Public reference made under article 153(3) epc to a published international application that has entered the european phase |
Free format text: ORIGINAL CODE: 0009012 |
|
| 17P | Request for examination filed |
Effective date: 20091002 |
|
| AK | Designated contracting states |
Kind code of ref document: A2 Designated state(s): AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HR HU IE IS IT LI LT LU LV MC MT NL NO PL PT RO SE SI SK TR |
|
| DAX | Request for extension of the european patent (deleted) | ||
| 17Q | First examination report despatched |
Effective date: 20121129 |
|
| STAA | Information on the status of an ep patent application or granted ep patent |
Free format text: STATUS: THE APPLICATION IS DEEMED TO BE WITHDRAWN |
|
| 18D | Application deemed to be withdrawn |
Effective date: 20130410 |