EP1177313A2 - Methoden zur auffindung von proteasen, die spezifisch membrangebundene substrate spalten - Google Patents

Methoden zur auffindung von proteasen, die spezifisch membrangebundene substrate spalten

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EP1177313A2
EP1177313A2 EP00934985A EP00934985A EP1177313A2 EP 1177313 A2 EP1177313 A2 EP 1177313A2 EP 00934985 A EP00934985 A EP 00934985A EP 00934985 A EP00934985 A EP 00934985A EP 1177313 A2 EP1177313 A2 EP 1177313A2
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
fusion protein
membrane
protease cleavage
cleavage sequence
recombinant fusion
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP00934985A
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Christian Haass
Harald Steiner
Brigitte Pesold
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Boehringer Ingelheim Pharma GmbH and Co KG
Original Assignee
Boehringer Ingelheim Pharma GmbH and Co KG
Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals Inc
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Filing date
Publication date
Application filed by Boehringer Ingelheim Pharma GmbH and Co KG, Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals Inc filed Critical Boehringer Ingelheim Pharma GmbH and Co KG
Publication of EP1177313A2 publication Critical patent/EP1177313A2/de
Withdrawn legal-status Critical Current

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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/37Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
    • C07K14/39Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
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    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4711Alzheimer's disease; Amyloid plaque core protein
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • C12Q1/37Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Definitions

  • the invention relates to a method for the detection of proteases which cleave membrane-associated substrates and the recombinant fusion proteins necessary for this
  • Proteases play an important role in many physiological processes such as transcription, apoptosis, development and signal transduction (Whiteside, ST et al J Biol Chem, 269, 1994 27059). Proteases are also known to play a key role in a whole range of diseases, as for example in the case of neurodegenerative diseases, which for example also include Alzheimer 's disease in humans. The known and as yet unknown proteases involved in such clinical pictures represent an important starting point for the development of new therapeutic methods.
  • proteases and the detection of their proteolytic activity and Specificity is based on the detection and characterization of a fission product.Look here at the methods of Smith and Kohorn (Smith, TA and Kohorn, BD Proc Natl Acad Sei USA 88, 1991 5159) and Dasmahapatra et al (Dasmahapatra, B et al PNAS 89 (9), 1992 4159-4162)
  • Smith and Kohorn describe a method for finding the cDNA s of eukaryotic proteases that cleave a predetermined amino acid sequence.
  • a fusion protein from a known protease cleavage sequence and the transcription factor GAL4 and the protease specific therefor were recombinantly expressed in yeast.
  • the cleavage of the protease cleavage sequence the specific protease separates the transcription-activating domain from the DNA-binding domain contained in this fusion protein were linked functionally by the cleavage sequence.
  • the specific protease reaction is detected by inactivating the Gal4 actinate.
  • Dasmahapatra et al also use the GAL4 reporter system in an identical manner by inserting an autolytically cleaving protease between the functional parts of the GAL4 reporter system.
  • the loss of the Gal4 Akt ⁇ v ⁇ tat is also used for iD detection of the autoproteolytic activity of the insertion sequence
  • neurotoxic amyloid ß-peptide
  • the object of the present invention was therefore to provide a method for finding proteases which cleave membrane-associated substrates
  • a recombinant fusion protein consisting of at least one reporter portion and a protease cleavage sequence in a suitable cell system, is associated with a membrane and
  • a protease in the sense of the invention is any protein or macromolecule with a peptide portion which is able to cleave peptide bonds
  • a fusion protein to be a protein which is recombinantly expressed in a suitable cell system and has at least two functional parts, a reporter part and a protease cleavage sequence.
  • Membrane-associated fusion proteins in the sense of the present invention are proteins which are spatially close to any one Stand membrane within the cell or the cell membrane The membranes of the cell and cell organelles or cell compartments are well known to the person skilled in the field of cell biology and are not listed in detail here
  • protease cleavage sequence is a peptide sequence which is known or is suspected to be a cleavable sequence by proteases.
  • the membrane-associated cleavage sequence can be completely or partially inside the membrane To be localized
  • the invention therefore comprises methods which are characterized in that the protease cleavage sequence is localized entirely or partially within the cell membrane
  • the invention therefore comprises methods which are characterized in that the protease cleavage sequence is located wholly or partly within the cytosol
  • the fusion protein can be provided with an additional functional anchor portion. Therefore, in a further preferred embodiment, the invention also includes methods which are characterized in that the fusion protein is characterized by a additional anchor portion is anchored in the membrane
  • the fusion protein in the membrane by means of an appropriate suitable cleavage sequence.
  • an appropriate suitable cleavage sequence is to be expected in the case of membrane-bound natural protease substrates.
  • the cleavage sequence that is cleaved by the ⁇ -secretase is mentioned here.
  • the invention therefore encompasses a particularly preferred one Embodiment also methods, which are characterized in that the fusion protein is anchored in the membrane itself by the protease cleavage sequence.
  • the recombinant fusion protein in the sense of the invention can contain not only the functional parts such as the cleavage sequence, the reporter sequence and optionally an additional anchor sequence, but also spacers in the sense of the patent, these are peptides that separate or connect functional parts from one another.
  • Their use consists in the spatial separation of the functional parts, which in some cases is only the uninhibited end Practicing their function enables the registration in a further particularly preferred embodiment to include methods which are characterized in that the protease cleavage sequence and / or the reporter portion and / or the anchor portion of the fusion protein are connected by a spacer.
  • a signal sequence or signal component in the sense of the present invention directs the transport of the fusion protein to the membrane in the corresponding expression systems
  • the present invention therefore includes in a particularly preferred Embodiment processes which are characterized in that the recombinant fusion protein according to the invention contains a signal component which directs the fusion protein according to the invention to the desired membrane of a suitable cell system
  • Cell systems which do not express endogenous proteases, which cleave the protease cleavage sequence of the fusion protein according to the invention, and which allow expression of the fusion protein and a further protein or fragment thereof and the association of the fusion protein with membranes are particularly suitable for carrying out the method according to the invention
  • the present invention makes it possible to find proteases of any origin which cleave membrane-associated substrates.
  • the proteases can be of prokaryotic, eukaryotic, animal or vegetable origin.
  • Eukaryotic expression systems are particularly suitable for the discovery of therapy-relevant proteases in nipples.
  • the present invention therefore comprises in a particularly preferred form Embodiment Methods which are characterized in that the suitable expression system is a eukaryotic expression system
  • Yeast expression systems are very particularly preferred since they are easy to handle and are often free of endogenous mammalian proteases.
  • a large number of recombinant tools are available for yeast.
  • the invention therefore comprises processes which are characterized in that the suitable expression system is a yeast - expression system is
  • the invention therefore also includes processes which are characterized in that the suitable expression system is a Sucker expression system is
  • the reporter portion of a fusion protein according to the invention can be any recombinantly expandable protein or peptide, the release of which from Fusion protein triggers a detectable signal by proteolytic cleavage.On the one hand, the reporter portion can then be detected as a protein or peptide in the cytosol, for example, by reporter portion-specific antibody binding in the cytosol after separation of the membrane fraction.All types of soluble transcription factors can also be considered. The release of soluble transcription factors can then
  • Suitable transcription regulating elements are known to the person skilled in the art from the prior art and include signal molecules such as Gal4 (Laughan, A and Gesteland, R Molec Cell Biol, 4, 1984 260-267), VP16 (Goff, Stephen P et al Current Opmion in Biotechnology, 6, 1995 59-64) and LexA (see Goff et al)
  • Gal4 Laughan, A and Gesteland, R Molec Cell Biol, 4, 1984 260-267
  • VP16 Goff, Stephen P et al Current Opmion in Biotechnology, 6, 1995 59-6
  • LexA see Goff et al
  • the transcription activator Gal4 is particularly suitable for
  • the invention also encompasses processes which are characterized in that the reporter portion of the fusion protein is the yeast absorption activator Gal4
  • Typical reporter genes downstream of transcription activators are CAT (Alton and Vapnek, Nature 282, 1979 864-869), luciferase (deWet et al Mol Cell Biol, 7, 1987 725-737, Engebrecht and Silverman, PNAS 1, 1984 4154-4158), ⁇ -galctosidase (see above, Goff et al) and alkaline phosphatase (Toh et al Eur J Biochem 182, 1989, 231-238)
  • the present invention comprises a fusion protein which in addition to the cleavage sequence to be examined as
  • _J Anchor share has the TM1 domain of Presini n 1, the reporter share of which - • Yeast transcription factor is Gal4 and is connected to a suitable membrane signal component
  • Methods which are characterized in that the suitable expression system does not contain any native proteases which cleave membrane-associated substrates are particularly preferred.
  • the method according to the invention is suitable for all protease cleavage sequences. Methods which are characterized in that it at
  • the protease cleavage sequence is an ammosaurase sequence which is cleaved by at least one of the following proteases ⁇ -secretase (Selkoe, J Biol Chem 271, 1996 18259), NOTCH protease (Schroeter et al Nature 393, 1998 382), Presenihn protease (Thinakaran et al Neuron 17, 1998 181), caspases (Nicholson, DW and Thornberry, NA Trends Biochem Sei, 22,
  • the present invention discloses methods which are characterized in that the protease cleavage sequence is the human ⁇ amyloid precursor protein ( ⁇ APP) or a part thereof
  • the present invention provides methods, which are characterized in that the protease cleavage sequence one of the partial sequences shown in Figures 5 or 6 of the human beta amyloid precursor protem 's (ßAPP) corresponds
  • the inventive method is particularly suitable To identify proteases and their genes from gene libraries as soon as a suitable cell system with a suitable recombinant fusion protein with a defined protease cleavage sequence is available, only the further gene from a gene library to be examined has to be exposed in the same expression system as soon as the person skilled in the art has a suitable cell system with an inventive one
  • ⁇ recombinant fusion protein has established a cleavage sequence of interest contains, he only has to express another protein or fragment thereof from a gene library to be examined in the same expression system in order to find proteins or parts thereof with corresponding specific proteolytic activity in the gene library to be examined
  • Methods according to the invention for locating the ⁇ -ir secretase, or the presmi nase, or the NOTCH protease, or the presini-cleaving caspases from gene libraries are very particularly preferred
  • a further aspect of the present invention relates to the recombinant fusion proteins which are necessary to carry out the methods described above.
  • Such fusion proteins can associate with a cellular membrane and consist of at least one reporter portion and a protease cleavage sequence. Should such a recombinant fusion protein consist of a reporter portion and a protease cleavage sequence cannot automatically associate with the membranes of the expression system, such a fusion protein must
  • Fusion protein an additional signal portion for the purpose of targeting
  • fusion protein according to the invention contains the TM1 domain from Presenihn as an anchor component.
  • a special embodiment of the invention contains fusion proteins whose signal component is taken from the yeast invertase (see above)
  • the fusion proteins according to the invention contain, as protease cleavage sequences, at least one of the amino acid sequences which are cleaved specifically by the ⁇ -secretase, or the presennenase, or the NOTCH protease, or the preseni-cleaving caspases. In a very particularly preferred embodiment, they contain the inventive
  • the fusion protein according to the invention contains, as a reporter part, the yeast transcription activator Gal4, the TM1 domains of Presinihn 1 as the anchor part, the signal part Yeast invertase as i signal component and a suspected protease cleavage sequence
  • Recombinant fusion proteins according to the invention are preferred, which are characterized in that the protease cleavage sequence is the human ⁇ amyloid precursor protein ( ⁇ APP) or a part thereof. Recombinant fusion proteins according to the invention are particularly preferred
  • ßAPP human beta amyloid precursor protein 's
  • Recombinant fusion proteins according to the invention are very particularly preferred, which are characterized in that they contain a signal sequence according to FIG. 3, a protease cleavage sequence with spacers according to FIG. 5 and a reporter portion according to FIG.
  • Recombinant fusion proteins according to the invention are very particularly preferred, which are characterized in that they contain a signal sequence according to FIG. 3, a protease cleavage sequence with spacers according to FIG. 6 and a reporter portion O according to FIG.
  • the present invention relates to the use of one of the fusion proteins according to the invention described above in one of the methods described above according to the invention
  • the invention was exemplified by a recombinant fusion protein (ssTM1 Gal4, ss stands for signal sequence according to FIG. 3, but without a methionm at the end, TM1 stands for the amino acid sequence according to FIG. 4, Gal4 stands for the amino acid sequence according to FIG. 8, between TM1 and Gal4 the spacer or the cloning site according to FIG.
  • Gal4 constructs used here were derived from pCI1 (Fields S and Song O Nature, 340, 1989 245) and contain an expression cassette of the Gal4 gene which is under the control of the ADH1 promoter and terminator sequences.
  • This cassette was emcloned in YCplac22 (Gietz, RD and Sugmo, A Gene, 74 1988 527) to represent the parent plasmid for ssTM1 Gal4 and its derivatives
  • the fusion protein ssTMIGal4 consists of the signal sequence of yeast invertase (aa1-aa19, Moir, DT and Dumais, DR G ene, 56, 1987 209), which was fused to the N-terminus of the human PS1, which extends to the first transmembrane domain (aa3-aa101) and to which there is a 3aa (RPH) spacer region which extends over the Stul and 0 Ndel restoration sites are available and yeast Gal4 (aa1 -aa881) is connected.
  • SsTM1 Gal4 was prepared by PCR amphication of the corresponding cDNA coding regions using standard cloning techniques (Ausubel, FM et al Current Protocols in Molec Biol (Greene, New York, 1992)
  • the fusion proteins ssTM1 -DEVDG-Gal4 and ssTM1-DEVNG-Gal4 were produced by inserting hybridized oonucleotides, which code for DEVDG or DEVNG, into Stul and Ndel cut ssTM1 Gal4 constructs).
  • Target sequence namely the signal sequence of the yeast invertase (Dumais and Noir see above) linked to the N-terminus of the TM1 domain
  • SFY526 standard methods (Ausubel et al, see above en) used to introduce the plasmids into the yeast strain SFY526 (MATa, ura3-52, h ⁇ s3-200, ade2-101, Iys2-801, trp1-901, Ieu2-3, 112, can ⁇ , gal4-542, gal80- 538, URA3 Gall-lacZ) (Bartel, PL et al BioTechniques, 14, 1993 920) and for the production of protein extracts and ß-gal assays), no ß-galactosidase activity was detectable.
  • a component of ssTM1 -Gal4 was ssTM1 -DEVDG-Gal4, a fusion protein whose components ssTM1 and Gal4 are connected by the protease cleavage sequence DEVDG (Nicholson, DW and Thornberry, NA, Trends Biochem Sei, 22, 1997 299).
  • DEVDG provides a recognition site for Caspase-3 (Lazebnik YA et al, Nature 371, 1994 346), Femandes-Alnemri, T et al, J Biol Chem 269, 1994 i ⁇ 30761, Tewari, M et al, Cell, 81, 1995 801, Nicholson , DW et al Nature 376, 1995 37, Nicholson, DW and Thornberry, NA, Trends Biochem Sei, 22, 1997 299)
  • the expression of ssTM1 -DEVDG-Gal4 in SFY526 yeast cells caused no ⁇ -galactosidase activity.
  • the co-expression of human caspase-3 together with ssTM1 -DEVDG-Gal4 in SFY526 yeast cells caused a strong ß-galactosidase-
  • the activity of the caspase-3 expression was confirmed by cleavage of in vitro-translated 35 S methionm-radiolabeled PARPC (a C-termmally truncated PARP derivative) using a cytoscopic extract from Caspase-3 transformed yeast cells Immunoblotting with anti-Gal4 antibodies showed that ssTM1-DEVDG-Gal4 is present as membrane protein 0 without coexpression. Coexpression with Caspase-3 led to soluble split-off Gal4 components. The 12 kDa subunit of Caspase-3 was also detectable To prove d In terms of specificity, the membrane-associated fusion protein ssTM1 - DEVNG-Gal4 was co-expanded in yeast cells with caspase-3.
  • fusion proteins according to the invention without an anchor portion were produced in suitable expression systems.
  • ssMC1 -99-Gal4 contains a signal sequence (ss) according to Figure 3, a methionm (M), the amino acid sequence according to FIG. 5 (C1 -99) and the reporter portion (Gal4) according to FIG. 8
  • fusion proteins associate without an additional anchor portion and are suitable
  • FIG. 1 schematically describes the mode of operation of the method according to the invention for the identification of proteases, which recognize membrane-associated protease cleavage sequences using the example of a recombinant fusion protein (I + II
  • ⁇ + III which contains a signaling molecule (III) and a membrane anchor part (I) and a protease cleavage sequence (II) connecting these functional parts.
  • a suspected protease (V) in a suitable cell system, there are two possible consequences a) or b) for the cell system a)
  • the suspected protease (V) does not cleave the predetermined protease cleavage sequence (II) i
  • the signal portion of the fusion protein remains connected to the membrane and can neither directly detected by cytoscopy nor indirectly by a reporter gene (VIA / B) present in the cell nucleus, which is influenced in its transcription by the signal component (III)
  • the reporter gene remains unaffected (VIIA)
  • the suspected protease (V) cleaves the specified protease cleavage sequence (II) and can now be detected directly in the cytosol (VI) or indirectly by influencing the transcription of a reporter gene (VIB) in the
  • the reporter gene now mediates a detectable change in the cell
  • Fig. 2 Schematic representation of the mode of action of ssTM1 -DEVDG- Gal4
  • FIG. 2 schematically describes the functioning of the method according to the invention for identifying proteases.
  • the transformation of CPP32 cDNA leads to two possible reaction sequences a) or b) within the cell system a)
  • the suspected protease (V) CPP 32 cleaves the predetermined protease cleavage sequence ( lla) DEVN not (IV)
  • the recombinant fusion protein consists of the
  • Transcription activator Gal4 (III), which is connected via two spacers (la, purple) and the protease cleavage sequence (lla) to a membrane anchor portion (I) from the TM1 domain from Presmihnl, where I additionally contains a signal portion of the yeast invertase Construct remains attached to the membrane and can neither be detected directly by cytoscopy nor indirectly by a reporter gene (Gal1 -lacZ) present in the cell nucleus. The reporter gene remains unaffected. Colony staining due to ß-galactosidase activity is not possible.
  • V CPP 32 cleaves (VI) the specified protease cleavage sequence (DEVD Mb) and now passes through the cytosol into the cell nucleus (VIB), where, as a transcription activator, it enables the expression of the ⁇ -galactosidase and thus the blue color of the colonies (VIIB) Fig. 3 signal sequence (yeast Suc2p 1-19) plus methionine
  • Fig. 8 signal molecule (yeast Gal4p 1-881)
  • Example 1 Representation of the membrane-associated fusion proteins ssTM1-Gal4, ssTM1-DEVDG-Gal4, ssTM1-DEVNG-Gal4
  • Gal4-Fus ⁇ onsprote ⁇ ne are derived from plasmid pCL1 (S Fields and 0 song,
  • Ycplac22 Gal4 is the starting vector for ssTM1-Gal4 and its derivatives.
  • the fusion protein ssTM1-0 Gal4 consists of the signal sequence of the invertase from yeast (As1 -As19 (DT Moir and DR Dumais, Gene, 56, 209 (1987)) followed by the N-terminus of human PS1 (up to the first transmembrane domain (As3-As101)) followed by a three amino acid (RPH) spacing region which contains restriction sections for Stul and Ndell, followed by yeast Gal4 (As1 -As881) SsTM1 Gal4 was amplified by PCR 5 using the corresponding cDNA regions
  • Example 2 Detection of membrane binding of the membrane-associated fusion protein ssTM1-Gal4 and ssTM1-DEVDG-Gal4
  • Example 3 Representation of human caspase-3
  • the cDNA of human caspase-3 (T. Fernandes-Alnemri et al., J. Biol. Chem. 269, 30761 (1994); M. Tewari et al., Ce // 81 , 801 (1995); DW Nicholson et al., Nature 376, 37 (1995).) was cloned into a derivative of the yeast expression vector pVT100-U (2626. T. Vernet et al., Gene 52, 225 (1997).) , in which the URA3 gene was replaced by the LEU2 gene. In this construct, the expression of caspase-3 takes place under the control of the ADH1 promoter and terminator sequences.
  • Caspase-3 is broken down into the characteristic subunits of the proteolytically active enzyme in yeast cells.
  • the mechanism of caspase-3 activation in yeast cells that show neither apoptosis nor contain caspase homologues (The Yeast Genome Directory, A Supplement to Nature 387, No. 6632) is not known, but could be due to auto-activation due to overexpression.
  • Example 4 Detection of the cleavage of ssTM1 -DEVDG-Gal4 in SFY526 yeast cells expressing caspase-3.

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Abstract

Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur Auffindung von Proteasen, die membranassoziierte Substrate spalten sowie die dafür notwendigen rekombinanten Fusionsproteine.

Description

Methoden zur Auffindung von Proteasen, die spezifisch membrangebundene Substrate spalten
Technisches Gebiet
Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur Auffindung von Proteasen, die membranassoziierte Substrate spalten sowie die dafür notwendigen rekombinanten Fusionsproteine
Stand der Technik
Proteasen spielen eine wichtige Rolle für viele physiologische Prozesse wie beispielsweise die Transkription, Apoptose, Entwicklung und Signaltransduktion (Whiteside, S T et al J Biol Chem , 269, 1994 27059) Auch ist bekannt, daß Proteasen eine Schlusselrolle in einer ganzen Reihe von Erkrankungen einnehmen, wie beispielsweise bei den neurodegenerativen Krankheiten, die zum Beispiel auch die Alzheimer'sche Krankheit beim Menschen umfassen Die in solchen Krankheitsbildern involvierten bekannten und noch unbekannten Proteasen stellen einen wichtigen Ansatzpunkt zur Entwicklung neuer therapeutischer Verfahren dar Das Auffinden von Proteasen und der Nachweis ihrer proteolytischen Aktivität und Spezifitat basiert auf dem Nachweis und der Charakterisierung eines Spaltprodukts Es sei hier auf die Verfahren von Smith und Kohorn (Smith, T A und Kohorn, B D Proc Natl Acad Sei USA 88, 1991 5159) und Dasmahapatra et al (Dasmahapatra, B et al PNAS 89(9), 1992 4159-4162) verwiesen
Smith und Kohorn beschreiben ein Verfahren zur Auffindung der cDNA s eukaryontischer Proteasen die eine vorgegebene Aminosauresequenz spalten Zum Nachweis einer spezifischen proteolytischen Aktivität wurde hier ein Fusionsprotein aus einer bekannten Proteasespaltsequenz und dem Transkriptionsfaktor GAL4 sowie die dafür spezifische Protease selbst rekombinant in Hefe expπmiert Die Spaltung der Proteasespaltsequenz durch die spezifische Protease trennt die transkπptions- aktivierende Domäne von der DNA-bindenden Domäne, die in diesem Fusionsprotein durch die Spaltsequenz funktional verbunden waren Der Nachweis der spezifischen Proteasereaktion erfolgt durch die Inaktivieruπg der Gal4-Aktιvιtat Auch Dasmahapatra et al verwenden das GAL4-Reportersystem in identischer Weise durch Insertion einer autolytisch spaltendenden Protease zwischen den funktionellen Anteilen des GAL4-Reportersystems Der Verlust der Gal4-Aktιvιtat dient auch hier zum iD Nachweis der autoproteolytischen Aktivität der Insertionssequenz
Beide Verfahren sind beschrankt auf das Auffinden cytoso sch lokalisierter bzw cytosohsch spaltender Proteasen, da die beschriebenen rekombinanten Substrate bzw Fusionsproteine cytosohsch lokalisiert sind
Manche physiologischen Vorgange, aber auch einige pathologische Prozesse wie die oben bereits erwähnten neurologischen Erkrankungen basieren auf der proteolytischen Spaltung membrangebundener Substrate Die Pathologie der Alzheimerschen Erkrankung, der am häufigsten vorkommenden neurodegenerativen Erkrankung am Menschen, ist mit der proteolytischen Aktivierung des neurotoxischen Amyloid ß- peptids (Aß) assoziiert und involviert mindestens zwei proteolytische Aktivitäten, die
20 beide ein membrangebundenes Substrat voraussetzen (Haass, C and Selkoe, D J Cell, 75, 1993 1039, Selkoe, D J J Biol Chem , 271 , 18295, Citron M et al Neuron 14, 1995 661 , Tischer, E and Cordeil, B J Biol Chem , 271 , 1996 21914) Wahrend die ß-Sekretase im Lumen von Membrankompartimenten den N-Terminus generiert spaltet die γ-Sekretase den C-Terminus der Amyioiddomane (Haass, C et al Nature
- 359, 1992 325, M Shoji et al Science, 258, 1992 126, Buscigho, J et al Proc Natl Acad Sei USA, 90, 1993 2092) Auch die zwei in die Alzheimersche Pathologie involvierten homologen Presenilinproteine (PS), die wahrscheinlich die γ-Sekretase aktivieren (DeStrooper, B et al Nature, 391 , 1998 391 ), sind membrangebunden und werden durch noch unbekannte Preseni nasen und Caspasen proteolytisch prozessiert ι (Thinakaran, G et al Neuron, 17, 1996 181 , Pod sny, M et al Neurobiology of Disease, 3, 1997 325, Mercken, M et al FEBS Letters, 389, 1996 297, Tomita, T et al Proc Natl Acad Sei USA, 94, 1997 2025, Capell, A et al J Biol Chem , 273 1998 32050, Thinakaran, G et al Neurobiol Disease, 4, 1998 438, Yu, G et al J Biol Chem 273 1998 16740, Kim, T -W et al Science, 277, 1997 373, Loetscher, H et al ^ J Biol Chem 272, 1997 20655, Vito P et al J Biol Chem 272, 1997 28315 Grunberg, J et al Biochemistry, 37, 1998 2263)
Derzeit ist es mit den Methoden des Standes der Technik nicht möglich, Proteine selbst bekannter proteolytischer Aktivität von membrangebundenen Substraten zu identifizieren und isolieren Die Identifizierung solcher Proteasen, wie beispielsweise w der oben genannten γ-Sekretase, der Presenilinasen und Caspasen wurde erheblich zum molekularen Verständnis pathologischer Erkrankungen beitragen und die Entwicklung hochspezifischer Proteaseinhibitoren zur Therapie entscheidend voranbringen Die Reinigung dieser bekannten proteolytischen Aktivitäten durch konventionelle Methoden unter Verwendung loslicher Substrate ist sehr schwierig
. ι wenn nicht sogar unmöglich, da diese Proteasen membrangebundene Substrate zur Erkennung ihrer Zielsequenz (Citron M et al Neuron, 14, 1995 661 , Tischer, E and Cordeil, B J Biol Chem , 271 , 1996 219145)
Aufgabe der vorliegenden Erfindung war daher das Bereitstellen eines Verfahrens zum Auffinden von Proteasen, die membranassoziierte Substrate spalten 0
Darstellung der Erfindung und bevorzugter Aus führungsformen
Die der Anmeldung zugrundeliegende Aufgabe konnte mit der vorliegenden Erfindung im Rahmen der Beschreibung und der Patentansprüche gelost werden, indem ein Verfahren zum Auffinden von Proteasen die membranassoziierte Substrate spalten, zur Verfugung gestellt wird, das dadurch gekennzeichnet ist, daß
I ein rekombinantes Fusionsprotein, bestehend aus mindestens einem Reporteranteil und einer Proteasespaltsequenz in einem geeigneten Zellsystem expπmiert wird das mit einer Membran assoziiert und
II ein weiteres Protein in dem gleichen Zellsystem expπmiert wird, und
III das Vorhandensein des abgespaltenen Reporteraπteils nachgewiesen wird
Eine Protease im Sinne der Erfindung ist jedes Protein oder Makromolekül mit einem Peptidanteil, das in der Lage ist, Peptidbindungen zu spalten Unter einem Fusionsprotein soll der Fachmann ein Protein verstehen, das rekombinant in einem geeigneten Zellsystem expπmiert wird und mindestens zwei funktionelle Anteile aufweist, einen Reporteranteil und eine Proteasespaltsequenz Unter membranassoziierten Fusionsproteinen im Sinne der vorliegenden Erfindung sind Proteine zu verstehen, die in räumlicher Nahe mit einer beliebigen Membran innerhalb der Zelle oder der Zellmembran stehen Die Membranen der Zelle und Zellorganellen bzw Zellkompartimente sind dem Fachmann auf dem Gebiet der Zellbiologie bestens bekannt und werden hier nicht im einzelnen aufgezahlt
Unter einem weiteren Protein, das neben dem erfindungsgemaßen rekombinanten Fusionsprotein im gleichen Zellsystem exprimiert wird, ist im Sinne der Erfindung sowohl ein endogen vorhandenenes Protein als auch ein rekombinantes Protein oder das Fragment eines solchen endogenen oder rekombinanten Proteins zu verstehen, von dem vermutet wird, das dieses eine proteolytische Aktivität aufweist Bei der Proteasespaltsequenz handelt es sich um eine Peptidsequenz, die als durch Proteasen spaltbare Sequenz bekannt ist oder als solche vermutet wird Für die Lokalisation des rekombinanten Fusionsproteins ergeben sich drei Möglichkeiten Zum einen kann die membranassoziierte Spaltsequenz vollständig oder teilweise innnerhalb der Membran lokalisiert sein In einer bevorzugten Ausfuhrungsform umfasst die Erfindung daher Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß die Proteasespaltsequenz ganz oder teilweise innerhalb der Zellmembran lokalisiert ist
Neben der seltenen jedoch nicht auszuschließenden Möglichkeit, daß die membranassoziierte Spaltsequenz außerhalb der Zellmembran in das extrazellulare Medium ragt, besteht auch die Möglichkeit, daß die membranassoziierte Proteasespaltsequenz teilweise oder ganz im Zytosol lokalisiert ist Selbst ein solches membranassoziiertes Proteasesubstrat, das vollständig im Zytosol lokalisiert ist, kann bedingt durch die unmittelbare räumliche Nahe von Membranen nicht als zytosohsch, sondern muß als membranassoziiert angesehen werden, da die Zugang chkeit dieses Substrats für eine rein zytosohsch spaltende Protease räumlich in erheblichem Maße eingeschränkt ist In einer weiteren bevorzugten Ausfuhrungsform umfasst die Erfindung daher Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß die Proteasespaltsequenz ganz oder teilweise innerhalb des Zytosols lokalisiert ist
Wenn weder die Proteasespaltsequenz noch der Reporteranteil, noch ein anderer Teil des Fusionproteins eine Membranassoziation ermöglichen, so kann das Fusionsprotein mit einem zusätzlichen funktionellen Ankeranteil versehen werden Daher umfasst die Erfindung in einer weiteren bevorzugten Ausfuhrungsform auch Verfahren die dadurch gekennzeichnet sind, daß das Fusionsprotein durch einen zusatzlichen Ankeranteil in der Membran verankert ist
Es ist auch möglich, das Fusionsprotein durch eine entsprechende geeignete Spaltsequenz in der Membran zu verankern Bei membranstandigen naturlichen Proteasesubstraten ist eine solche Eigenschaft zu erwarten Beispielsweise sei hier die Spaltsequenz genannt, die durch die γ-Sekretase gespalten wird Daher umfasst die Erfindung in einer besonders bevorzugten Ausfuhrungsform auch Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß das Fusionsprotein durch die Proteasespaltsequenz selbst in der Membran verankert ist Das rekombinante Fusionsprotein im Sinne der Erfindung kann neben den funktionellen Anteilen wie der Spaltsequenz, der Reportersequenz und optional einer zusätzlichen Ankersequenz auch reine Abstandshalter beinhalten Bei Abstandshaltern im Sinne des Patents handelt es sich um Peptide, die funktionelle Anteile voneinander trennen beziehungsweise verbinden Ihr Nutzen besteht in der räumlichen Trennung der funktionellen Anteile, die in manchen Fallen erst das unbeeintrachtigte Ausüben deren Funktion ermöglicht Daher umfasst die Anmeldung in einer weiteren besonders bevorzugten Ausfuhrungsform Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind daß die Proteasespaltsequenz und/oder der Reporteranteil und/oder der Ankeranteil des Fusionsproteins durch einen Abstandshalter verbunden sind Auch ist es möglich, Signalsequenzen direkt bzw über einen Abstandshalter mit dem Fusionsprotein zu verbinden Ein Beispiel für eine Signalsequenz ist für Hefezellen die Hefe Invertase Signalsequenz (Moir and Dumais, Gene 56, 1987 209) Eine Signalsequenz bzw Signalanteil im Sinne der vorliegenden Erfindung dirigiert in den entsprechenden Expressionssystemen den Transport des Fusionproteins zur Membran Die vorliegende Erfindung umfasst daher in einer besonders bevorzugten Ausfuhrungsform Verfahren die dadurch gekennzeichnet sind daß das erfindungsgemaße rekombinante Fusionsprotein einen Signalanteil enthalt, der das erfindungsgemaße Fusionsprotein zur gewünschten Membran eines dafür geeigneten Zellsystems dirigiert
Für die Durchfuhrung des erfmdungsgemaßen Verfahrens sind Zellsysteme besonders geeignet, die keine endogenen Proteasen exprimieren, die die Proteasespaltsequenz des erfmdungsgemaßen Fusionsprotein spalten, und die ein Exprimieren des Fusionproteins und eines weiteren Proteins oder Fragments desselben sowie die Assoziation des Fusionproteins mit Membranen ermöglichen
Die vorliegende Erfindung ermöglicht die Auffindung von Proteasen jeglichen Ursprungs, die membranassoziierte Substrate spalten Die Proteasen können prokaryontischen, eukaryontischen, tierischen oder pflanzlichen Ursprungs sein Für die Auffindung von therapierelevanten Proteasen in Saugern eignen sich eukaryontischen Expressionssysteme besonders gut Daher umfasst die vorliegende Erfindung in einer besonders bevorzugten Ausfuhrungsform Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß das geeignete Expressionsystem ein eukaryontisches Expressionssystem ist
Ganz besonders bevorzugt sind Hefeexpressionssysteme da diese einfach handhabbar und oftmals frei von endogenen Saugetierproteasen sind Zudem stehen eine Vielzahl rekombinanter Werkzeuge für Hefe zur Verfugung In einer weiteren ganz besonders bevorzugten Ausfuhrungsform umfasst die Erfindung daher Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß das geeignete Expressionsystem ein Hefe- expressionssystem ist
Zur Realisierung der Erfindung sind auch Expressionsysteme aus Saugetierzellen oder transgenen Tieren möglich Hierbei ist jedoch besonders auf das Vorhandensein und nach Möglichkeit Inaktivieren endogener Proteasen zu achten die das Verfahren beeinflussen können Die Erfindung umfasst daher auch Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß das geeignete Expressionsystem ein Sauger- expressionssystem ist
Der Reporteranteil eines erfmdungsgemaßen Fusionsproteins kann jedes beliebige rekombinant expπmierbare Protein oder Peptid sein, dessen Freisetzung vom Fusionsprotein durch proteolytische Spaltung ein nachweisbares Signal auslost Zum einen kann der Reporteranteil dann als Protein bzw Peptid im Zytosol nachgewiesen werden, beispielsweise durch reporteranteilspezifische Antikorperbindung im Zytosol nach Abtrennung der Membranfraktion In Frage kommen aber auch alle Arten loslicher Transkriptionsfaktoren Die Freisetzung löslicher Transkriptionsfaktoren kann dann
10 nachgeschaltete Signale auslosen Geeignete transkπptionsreguherende Elemente sind dem Fachmann aus dem Stand der Technik geläufig und beinhalten Signalmolekule wie Gal4 (Laughan, A and Gesteland, R Molec Cell Biol , 4, 1984 260-267), VP16 (Goff, Stephen P et al Current Opmion in Biotechnology, 6, 1995 59-64) und LexA (siehe Goff et al ) Der Transkriptionsaktivator Gal4 eignet sich besonders gut für
'< Hefeexpressionssysteme Auch verkürzte aktive Formen von Gal4, wie beispielsweise Gal4-1 -147/768-881 und Gal4-1 -238/768-881 (Jun Ma und Mark Ptashne, Cell 48, 1998 847-853) sind geeignet Daher umfasst die Erfindung in einer besonders bevorzugten Ausfuhrungsform auch Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß der Reporteranteil des Fusionsproteins der Hefetranskπptionsaktivator Gal4 ist
-Ό Typische Reportergene, die Transkriptionsaktivatoren nachgeschaltet sind, sind CAT (Alton and Vapnek, Nature 282, 1979 864-869), Luziferase (deWet et al Mol Cell Biol , 7, 1987 725-737, Engebrecht and Silverman, PNAS 1 , 1984 4154-4158), ß- Galctosidase (siehe oben, Goff et al ) und alkalische Phosphatase (Toh et al Eur J Biochem 182, 1989, 231 -238)
Als Ankeranteil im Sinne der Erfindung kommen alle Peptidsequenzen in Frage, die mit Membranen assoziieren Hier sei besonders auf die Transmembranregionen membran- standiger Proteine verwiesen Insbesondere eignen sich Transmembraπregionen von Typ1 Transmembranregionen. Preseni n (Sherπngton et al , Nature 325 754), z B die TM1 -Domäne von Presenihn 1 , und ßAPP (Kang et al , Nature 325 733) enthalten o bevorzugte Transmembranregionen Die Erfindung umfasst daher auch Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß der Ankeranteil des Fusionsproteins die TM1 - Domane von Presenihn 1 ist
In einer ganz besonders bevorzugten Ausfuhrungsform umfasst die vorliegende Erfindung ein Fusionsprotein, das neben der zu untersuchenden Spaltsequenz als
_J Ankeranteil über die TM1 -Domäne von Presini n 1 verfugt, dessen Reporteranteil der -• Hefetranskriptionsfaktor Gal4 ist und das mit einem geeigneten Membransignalanteil verbunden ist
Dem Fachmann sind eine ganze Reihe von Techniken gelaufig, die Expression endogener Proteine in Zellsystemen zu inhibieren Bei Bedarf ist der Fachmann somit in der Lage, systemeigene unerwünschte Proteasen aus geeigneten
10 Expressionssytemen zu entfernen oder zu inaktivieren Besonders bevorzugt sind Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß das geeignete Expressionsystem keine systemeigenen Proteasen enthalt, die membranassoziierte Substrate spalten Das erfindungsgemaße Verfahren eignet sich für alle Proteasespaltsequenzen Ganz besonders bevorzugt sind Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß es sich bei
7- der Proteasespaltsequenz um eine Ammosauresequenzen handelt, die von mindestens einer der folgenden Proteasen gespalten wird γ-Sekretase (Selkoe, J Biol Chem 271 , 1996 18259), NOTCH Protease (Schroeter et al Nature 393, 1998 382), Presenihn Protease (Thinakaran et al Neuron 17, 1998 181 ), Caspasen (Nicholson, D W and Thornberry, N A Trends Biochem Sei , 22,
20 1997 299)
In einer weiteren ganz besonders bevorzugten Ausfuhrungsform offenbart die vorliegende Erfindung Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß die Proteasespaltsequenz das humane ß amyloid precursor protein (ßAPP) oder ein Teil davon ist
2i In einer weiteren ganz besonders bevorzugten Ausfuhrungsform offenbart die vorliegende Erfindung Verfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, daß die Proteasespaltsequenz einer der in den Figuren 5 oder 6 dargestellten Teilsequenzen des humanen ß amyloid precursor protem's (ßAPP) entspricht Das erfindungsgemaße Verfahren ist besonders geeignet, Proteasen und deren Gene so aus Genbibhotheken zu identifizieren Sobald ein geeignetes Zellsystem mit einem geeigneten rekombinanten Fusionsprotein mit einer festgelegten Proteasespaltsequenz vorliegt, muß nur noch das weitere Gen aus einer zu untersuchenden Genbibliothek im gleichen Expressionssystem expπmiert werden Sobald der Fachmann ein geeignetes Zellsystem mit einem erfmdungsgemaßen
^ rekombinanten Fusionsprotein etabliert hat, das eine Spaltsequenz von Interesse enthalt, muß er nur noch ein weiteres Protein oder Fragment davon aus einer zu untersuchenden Genbibliothek im gleichen Expressionssystem exprimieren, um Proteine oder Teile davon mit entspechender spezifischer proteolytischer Aktivität in der zu untersuchenden Genbibliothek aufzufinden
Ganz besonders bevorzugt sind erfindungsgemaße Verfahren zur Auffindung der γ- ir Sekretase, oder der Presmi nase, oder der NOTCH-Protease, oder der Presinihn- spaltenden Caspasen aus Genbibhotheken
Ein weiterer Aspekt der vorliegenden Erfindung betrifft die rekombinanten Fusionsproteine, die zur Ausübung der oben beschriebenen Verfahren notwendig sind i s Solche Fusionsproteine können mit einer zellularen Membran assoziieren und bestehen mindestens aus einem Reporteranteil und einer Proteasespaltsequenz Sollte ein solches rekombmantes Fusionsprotein bestehend aus einem Reporteranteil und einer Proteasespaltsequenz nicht von selbst mit den Membranen des Expressionssystems assoziieren können, so muß ein solches Fusionsprotein einen
20 zusätzlichen Membranankeranteil enthalten
Auch kann es vorteilhaft sein, die oben genannten funktionellen Anteile des erfmdungsgemaßen Fusionsproteins durch zusätzliche Abstandshalter zu trennen und so den steπschen Freiraum einzelner funktioneller Anteile zu erhohen oder deren
Loka sation in oder an der Membran zu verandern
Desweiteren kann es vorteilhaft sein, dem rekombinanten erfmdungsgemaßen
Fusionsprotein einen zusatzlichen Signalanteil zum Zweck des zielgerichteten
Transports zur Membran eines Expressionssystems hinzuzufügen
Als besonders vorteilhafte Ausfuhrungsform hat sich für Hefeexpressionssysteme das
Reportermolekul Hefetranskπptionsaktivator Gal4 bewahrt 0 Eine weitere besonders vorteilhafte Ausfuhrungsform des erfmdungsgemaßen Fusionsproteins enthalt als Ankeranteil die TM1 -Domäne von Presenihn 1 Als Signalanteil in Hefeexpressionssystemen enthalt eine besondere Ausfuhrungsform der Erfindung Fusionsproteine deren Signalanteil der Hefe Invertase (siehe oben) entnommen ist Als Proteasespaltsequenzen enthalten die erfmdungsgemaßen Fusionsproteine in einer ganz besonderen Ausfuhrungsform mindestens eine der Aminosauresequenzen, die spezifisch von der γ-Sekretase, oder der Presenihnase, oder der NOTCH-Protease, oder den Preseni n-spaltenden Caspasen gespalten werden In einer ganz besonders bevorzugten Ausfuhrungsform enthalt das erfindungsgemaße
10 Fusionsprotein als Reporteranteil den Hefetranskπptionsaktivator Gal4, als Ankeranteil die TM1 -Domäne von Presinihn 1 und eine vermutete Proteasespaltsequenz In einer ganz besonders bevorzugten Ausfuhrungsform enthalt das erfindungsgemaße Fusionsprotein als Reporteranteil den Hefetranskriptionsaktivator Gal4, die TM1 - Domane von Presinihn 1 als Ankeranteil, die Signalsequenz der Hefe Invertase als i Signalanteil und eine vermutete Proteasespaltsequenz
Bevorzugt sind rekombinante erfindungsgemaße Fusionsproteine, die dadurch gekennzeichnet sind, daß die Proteasespaltsequenz das humane ß amyloid precursor protein (ßAPP) oder ein Teil davon ist Besonders bevorzugt sind rekombinante erfindungsgemaße Fusionsproteine, die
20 dadurch gekennzeichnet sind, daß die Proteasespaltsequenz einer der in den Figuren 5 oder 6 dargestellten Teilsequenzen des humanen ß amyloid precursor protein 's (ßAPP) entspricht
Ganz besonders bevorzugt sind rekombinante erfindungsgemaße Fusionsproteine, die dadurch gekennzeichnet sind, daß es eine Signalsequenz gemäß Figur 3, eine Proteasespaltsequenz mit Abstandshalter gemäß Figure 5 und einen Reporteranteil gemäß Figur 8 enthalt
Ganz besonders bevorzugt sind rekombinante erfindungsgemaße Fusionsproteine, die dadurch gekennzeichnet sind, daß es eine Signalsequenz gemäß Figur 3 eine Proteasespaltsequenz mit Abstandshalter gemäß Figure 6 und einen Reporteranteil O gemäß Figur 8 enthalt
In einem weiteren Aspekt betrifft die vorliegende Erfindung die Verwendung eines der oben beschriebenen erfmdungsgemaßen Fusionsproteine in einem der oben beschriebenen erfmdungsgemaßen Verfahren < Die Erfindung wurde beispielhaft an einem rekombinanten Fusionsprotein (ssTM1 Gal4, ss steht für Signalsequenz gemäß Figur 3, jedoch ohne Methionm am Ende, TM1 steht für die Aminosauresequenz gemäß Figur 4, Gal4 steht für die Aminosauresequenz gemäß Figur 8, zwischen TM1 und Gal4 befindet sich der Abstandshalter bzw die Klonierungsstelle gemäß Figur 7) gezeigt, bei dem der Transkriptionsaktivator Gal4 C- o terminal mit der TM1 Domäne des PS1 Gens verbunden wurde (alle hier verwendeten Gal4-Konstrukte wurden aus pCI1 (Fields S and Song O Nature, 340, 1989 245) abgeleitet und beinhalten eine Expressionskassette des Gal4-Gens, die unter der Kontrolle der ADH1 Promoter- und Terminatorsequenzen steht Diese Kassette wurde in YCplac22 (Gietz, R D und Sugmo, A Gene, 74 1988 527) emkloniert zur s Darstellung des parentalen Plasmids für ssTM1 Gal4 und dessen Derivativen Das Fusionsprotein ssTMIGal4 besteht aus der Signalsequenz der Hefe-Invertase (aa1- aa19, Moir, D T und Dumais, D R Gene, 56, 1987 209), die an den N-Terminus des humanen PS1 fusioniert wurde, der bis hm zur ersten Transmembrandomane (aa3- aa101 ) reicht und an den sich eine 3aa (RPH) Spacerregion, die über die Stul-und 0 Ndel-Restπctionstellen verfugt, sowie Hefe-Gal4 (aa1 -aa881 ) anschließt SsTM1 Gal4 wurde durch PCR-Amphfikation der korrespondierenden cDNA-kodierenden Regionen unter Verwendung von Standardklonierungstechniken hergestellt (Ausubel, F M et al Current Protokols in Molec Biol (Greene, New York, 1992) Die Fusionsproteine ssTM1 -DEVDG-Gal4 und ssTM1-DEVNG-Gal4 wurden durch Insertion hybridisierter O gonukleotide, die für DEVDG oder DEVNG kodieren, in Stul und Ndel geschnittene ssTM1 Gal4-Konstrukte hergestellt ) Zum Zweck des Diπgierens an Membranen in Hefezellen wurde eine Zielsequenz, namhch die Signalsequenz der Hefe-Invertase (Dumais und Noir siehe oben) mit dem N-Terminus der TM1 -Domäne verbunden Nach Expression in SFY526 (Es wurden Standardmethoden (Ausubel et al , siehe oben) zur o Einfuhrung der Plasmide in den Hefestamm SFY526 verwendet (MATa, ura3-52, hιs3- 200, ade2-101, Iys2-801, trp1-901, Ieu2-3, 112, canφ, gal4-542, gal80-538, URA3 Gall- lacZ) (Bartel, P L et al BioTechniques, 14, 1993 920) sowie zur Herstellung von Proteinextrakten und ß-gal Assays ) war keine ß-Galaktosidaseaktivitat detektierbar Die Expression des gleichen, jedoch loslichen Gal4-Anteιls für sich allein führte zu
> einer starken ß-Galaktosidaseaktivitat Nach Fraktionierung der Hefezellen war ssTM1- Gal4 in der Membranfraktion nachweisbar Die Membranassoziation von ssTM1 -Gal4 wurde ferner durch Karbonatextraktion erbracht Die Karbonatextraktion der Membranfraktion führte nicht zur Freisetzung des Fusionsproteins SsTM1-Gal4 verhalt sich somit wie ein integrales Membranprotein Zum Nachweis der Spaltbarkeit von membranassoziierten Proteasespaltsequenzen als
10 Bestandteil von ssTM1 -Gal4 wurde ssTM1 -DEVDG-Gal4 hergestellt, ein Fusionsprotein, dessen Bestandteile ssTM1 und Gal4 durch die Proteasespaltsequenz DEVDG (Nicholson, D W and Thornberry, N A , Trends Biochem Sei , 22, 1997 299) verbunden sind DEVDG stellt eine Erkennungsstelle für Caspase-3 dar (Lazebnik Y A et al , Nature 371 , 1994 346), Femandes-Alnemri, T et al , J Biol Chem 269, 1994 i^ 30761 , Tewari, M et al , Cell, 81 , 1995 801 , Nicholson, D W et al Nature 376, 1995 37, Nicholson, D W and Thornberry, N A , Trends Biochem Sei , 22, 1997 299) Die Expression von ssTM1 -DEVDG-Gal4 in SFY526 Hefezellen bewirkte keine ß- Galaktosidaseaktivitat Die Koexpression von humaner Caspase-3 zusammen mit ssTM1 -DEVDG-Gal4 in SFY526 Hefezellen bewirkte eine starke ß-Galaktosidase-
20 aktivitat Die Gesamt cDNA der humanen Caspase-3 (Femandes-Alnemri, T et al , J Biol Chem , 269, 1994 30761 , Tewari, M et al , Cell, 81, 1995 801 , Nicholson, D W et al , Nature, 376, 1995 37) wurde in ein pVT100-U-Deπvat (Vernet, T et al , Gene, 52, 1997 225) emkloniert, in welchem das URA3-Gen durch das LEU2-Gen ersetzt worden war In diesem Konstrukt steht die Caspase-3-Expressιon unter der Kontrolle der ADH1 i Promoter- und Terminatorsequenzen Die Aktivität der Caspase-3-Expressιon wurde durch Spaltung von in vitro-translatiertem 35S Methionm-radiomarkiertem PARPC (ein C-termmal trunkiertes PARP-Deπvat) bestätigt mittels eines cytoso schen Extrakts aus Caspase-3 transformierten Hefezellen Immunoblotting mit antι-Gal4-Antιkorpern zeigte daß ssTM1-DEVDG-Gal4 ohne Koexpression als Gesamtprotein membrangebunden 0 vorliegt Die Koexpression mit Caspase-3 führte zu löslichen abgespaltenen Gal4- Anteilen Auch die 12 kDa Untereinheit der Caspase-3 war nachweisbar Zum Nachweis der Spezifitat wurde das membranassoziierte Fusionsprotein ssTM1 - DEVNG-Gal4 in Hefezellen mit Caspase-3 koexpπmiert Der Austausch der Aminosäure Aspartat in der ursprünglichen Spaltsequenz gegen Asparagin resultierte in keiner i Spaltung des Fusionsproteins und somit in keiner ß-Galaktosidaseaktivitat Die oben genannten Versuche demonstrieren deutlich, daß die Expression einer Protease, in diesem Fall humane Caspase-3, effizient die Spaltung erfmdungsgemaßer membranassoziierter Fusionsproteine und die Freisetzung der membrangebunden Signalanteile, in diesem Fall des Transkriptionsaktivators Gal4, bewirken kann Ein solches erfmdungsgemaßes Verfahren unter Verwendung der erfmdungsgemaßen ιr Konstrukte erweist sich somit als hochspezifisch und sensibel unter in-vivo Bedingungen
In zwei weiteren spezifischen Ausfuhrungsbeispielen wurden erfindungsgemaße Fusionsproteine ohne Ankeranteil in geeigneten Expresssionssystemen hergestellt Das eine Fusionsprotein, ssMC1 -55-Gal4 enthalt eine Signalsequenz (ss) gemäß Figur
'- 3, ein Methionm (M), eine Aminosauresequenz gemäß Figur 4 (C1 -55) und den Reporteranteil (Gal4) gemäß Figur 8 Das andere Fusionsprotein, ssMC1 -99-Gal4 enthält eine Signalsequenz (ss) gemäß Figur 3, ein Methionm (M), die Aminosauresequenz gemäß Figur 5 (C1 -99) und den Reporteranteil (Gal4) gemäß Figur 8 Beide Fusionsproteine assoziieren ohne zusätzlichen Ankeranteil und eignen
20 sich speziell zum Auffinden der γ-Sekretase aus Genbibhotheken, die die Proteasespaltsequenzen in Figur 5 und 6 spezifisch spaltet
Legenden zu den Figuren
Fig. 1. Schematische Darstellung des Verfahrens
Figur 1 beschreibt schematisch die Funktionsweise des erfmdungsgemaßen Verfahrens zur Identifikation von Proteasen, die membranassoziierte Proteasespaltsequenzen erkennen am Beispiel eines erfmdungsgemaßen rekombinanten Fusionsproteins (I + II
Ό + III), das ein Signalmolekül (III) und einen Membranankeranteil (I) enthalt sowie eine diese funktionellen Anteile verbindende Proteasespaltsequenz (II) Im Falle der Expression einer vermuteten Protease (V) in einem geeigneten Zellsystem ergeben sich die beiden möglichen Folgen a) oder b) für das Zellsystem a) Die vermutete Protease (V) spaltet die vorgegebene Proteasespaltsequenz (II) nicht i Der Signalanteil des Fusionsproteins bleibt mit der Membran verbunden und kann weder direkt cytosohsch nachgewiesen werden noch indirekt durch ein im Zellkern vorhandenes Reportergen (VIA/B), das durch den Signalanteil (III) in seiner Transkription beemflusst wird Das Reportergen bleibt unbeemflusst (VIIA) b) Die vermutete Protease (V) spaltet die vorgegebene Proteasespaltsequenz (II) und kann nun direkt im Cytosol (VI) nachgewiesen werden beziehungsweise indirekt durch die Beeinflussung der Transkription eines Reportergens (VIB) im Zellkern
Das Reportergen vermittelt nun eine detektierbare Veränderung der Zelle
Fig. 2. Schematische Darstellung des Wirkungsweise von ssTM1 -DEVDG- Gal4
Figur 2 beschreibt schematisch die Funktionsweise des erfmdungsgemaßen Verfahrens zur Identifikation von Proteasen In dieser speziellen Ausfuhrungsform fuhrt die Transformation von CPP32 cDNA zu zwei möglichen Reaktionsfolgen a) oder b) innerhalb des Zellsystems a) Die vermutete Protease (V) CPP 32 spaltet die vorgegebene Proteasespaltsequenz (lla) DEVN nicht (IV) Das rekombinante Fusionsprotein besteht aus dem
Transknptionsaktivator Gal4 (III), der über zwei Abstandshalter (la, lila) und der Proteasespaltsequenz (lla) mit einem Membranankeranteil (I) aus der TM1 -Domäne von Presmihnl verbunden ist, wobei I zusätzlich einen Signalanteil der Hefe-Invertase enthalt Der Signalanteil des Konstrukts bleibt mit der Membran verbunden und kann weder direkt cytosohsch nachgewiesen werden noch indirekt durch ein im Zellkern vorhandenes Reportergen (Gal1 -lacZ) Das Reportergen bleibt unbeemflusst Eine Färbung der Kolonien durch ß-Galaktosidaseaktivitat ist nicht möglich b) Die vermutete Protease (V) CPP 32 spaltet (VI) die vorgegebene Proteasespaltsequenz (DEVD Mb) und gelangt nun durch das Cytosol in den Zellkern (VIB), wo es als Transknptionsaktivator die Expression der ß-Galaktosidase und somit die Blaufärbung der Kolonien ermöglicht (VIIB) Fig. 3 Signalsequenz (Hefe Suc2p 1-19) plus Methionin
MLLQAFLFLLAGFAAKISA + M
Fig. 4 Abstandshalter und Transmembrandomäne (humanes APP695597-651, C1 -55)
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGWIATVIVITLVMLKKK
Fig. 5 Abstandshaiter, Transmembrandomäne und cytosolische Domäne
(humanes APP695597-695, C1-99)
DAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGWIATVIVITLVMLKKKQ YTSIHHGWEVDAAVTPEERHLSKMQQNGYENPTYKFFEQMQN
Fig. 6 Abstandshaiter und Transmembrandomäne (humanes Presenilin 1,
Aminosäuren 3-101 ) ELPAPLSWQNAQMSEDNHLSNTV SQ DNRERQEHNDRRSLGHPEPLSNGRP
QGNSRQVNEQDEEEDEELTLKYGAKHVTMLF VTLCMNVVVATIK
Fig. 7 Abstandshaiter mit Klonierungsstelle
RPH
Fig. 8 Signal Molekül (Hefe Gal4p 1-881)
MKLLSSIEQACDICRLKKLKCSKEKPKCAKCLKΝΝWECRYSPKTKRSPLTRAHLTEVES RLERLEQLFLLIFPREDLDMILKMDSLQDIKALLTGLFVQDΝVΝKDAVTDRLASVETDMP LTLRQHRISATSSSEESSΝKGQRQLTVSIDSAAHHDΝSTIPLDFMPRDALHGFDWSEED DMSDGLPFLKTDPΝΝΝGFFGDGSLLCILRSIGFKPEΝYTΝSΝVΝRLPTMITDRYTLASR STTSRLLQSYLΝΝFHPYCPIVHSPTLMMLYΝΝQIEIASKDQWQILFΝCILAIGAWCIEGES TDIDVFYYQΝAKSHLTSKVFESGSIILVTALHLLSRYTQWRQKTΝTSYΝFHSFSIRMAISL GLΝRDLPSSFSDSSILEQRRRIWWSVYSWEIQLSLLYGRSIQLSQΝTISFPSSVDDVQR TTTGPTIYHGIIETARLLQVFTKIYELDKTVTAEKSPICAKKCLMICΝEIEEVSRQAPKFLQ MDISTTALTΝLLKEHPWLSFTRFELKWKQLSLIIYVLRDFFTΝFTQKKSQLEQDQΝDHQ SYEVKRCSIMLSDAAQRTVMSVSSYMDΝHΝVTPYFAWΝCSYYLFΝAVLVPIKTLLSΝSK SΝAEΝΝETAQLLQQIΝTVLMLLKKLATFKIQTCEKYIQVLEEVCAPFLLSQCAIPLPHISY ^ NNSNGSAIKNIVGSATIAQYPTLPEENVNNISVKYVSPGSVGPSPVPLKSGASFSDLVKL LSNRPPSRNSPVTIPRSTPSHRSVTPFLGQQQQLQSLVPLTPSALFGGANFNQSGNIAD SSLSFTFTNSSNGPNLITTQTNSQALSQPIASSNVHDNFMNNEITASKIDDGNNSKPLSP GWTDQTAYNAFGITTGMFNTTTMDDVYNYLFDDEDTPPNPKKE
w Beispiele
Beispiel 1: Darstellung der membranassoziierten Fusionsproteine ssTM1-Gal4, ssTM1-DEVDG-Gal4, ssTM1-DEVNG-Gal4
Alle Gal4-Fusιonsproteιne leiten sich von Plasmid pCL1 (S Fields and 0 Song,
;•< Nature, 340, 245 (1989)) ab, welches das GAL4 Gen in einer Expressionskassette enthalt, die aus dem ADH1 Promoter und dem ADH1 Terminator besteht Diese Expressionskassette wurde in den Hefeexpressionsvektor Ycplac22 (R D Gietz and A Sugino, Gene, 74, 527 (1988) kloniert Das resultierende Konstrukt (Ycplac22 Gal4) ist der Ausgangsvektor für ssTM1-Gal4 und seine Derivate Das Fusionsprotein ssTM1 - 0 Gal4 besteht aus der Signalsequenz der Invertase aus Hefe (As1 -As19 (D T Moir and D R Dumais, Gene, 56, 209 (1987)) gefolgt vom N-Terminus von humanem PS1 (bis zur ersten Transmembrandomane (As3-As101 )) gefolgt von einer drei Aminosäure (RPH) langen Abstandsregion welche Restriktionschnittsteilen für Stul und Ndell enthalt, gefolgt von Hefe Gal4 (As1-As881 ) SsTM1 Gal4 wurde durch PCR 5 Amphfikation der entsprechenden cDNA Regionen mittels
Standardklonierungstechniken (F M Ausubel et al , Current Protocols in Molecular Biology (Greene, New York, 1992)) hergestellt Die Fusioπsproteme ssTM1-DEVDG- Gal4 und ssTM1-DEVNG-Gal4 wurden durch Insertion von doppelstangigen Ohgonukleotiden, die für die Aminosauresequenz DEVDG oder DEVNG kodieren, in 0 das mit Stul und Ndell geschnittenes ssTM1 -Gal4 Konstrukt hergestellt
Beispiel 2: Nachweis der Membranbindung des membranassoziierten Fusionsproteins ssTM1- Gal4 und ssTM1-DEVDG-Gal4
Standardmethoden wurden zur Fraktionierung von Hefezellen verwendet (Guthπe C & i Fmk, G R (1991 ) Guide to Yeast Gentics and Molecular Biology, Academic Press San Diego). SsTM1 -Gal4 war in der Membranfraktion nachweisbar. Die Membranassoziation von ssTM1 -Gal4 wurde ferner durch Resistenz gegen alkalische Extraktion nachgewiesen (Y. Fujiki et al., J. Cell Biol., 93, 97 (1982)).
Beispiel 3: Darstellung der humanen Caspase-3 Die cDNA der humanen Caspase-3 (T. Fernandes-Alnemri et al., J. Biol. Chem. 269, 30761 (1994); M. Tewari et al., Ce// 81 , 801 (1995); D.W. Nicholson et al., Nature 376, 37 (1995).) wurde in eine Derivat des Hefeexpressionsvektors pVT100-U (2626. T. Vernet et al., Gene 52, 225 (1997).) kloniert, in dem das URA3 Gen durch das LEU2 Gen ersetzt wurde. In diesem Konstrukt erfolgt die Expression der Caspase-3 unter der Kontrolle der ADH1 Promoter- und Terminatorsequenzen. Die Caspase-3 wird in Hefezellen in die charakteristischen Untereinheiten des proteolytisch aktiven Enzyms gespalten. Der Mechanismus der Caspase-3-Aktivierung in Hefezellen, die weder Apoptose zeigen noch Caspase-Homologe (The Yeast Genome Directory, A Supplement to Nature 387, No. 6632) enthalten, ist nicht bekannt, aber könnte durch Autoaktivierung aufgrund der Überexpression erfolgen.
Beispiel 4: Nachweis der Spaltbarkeit von ssTM1 -DEVDG-Gal4 in Caspase-3 exprimierenden SFY526 Hefezellen.
Standardmethoden (Guthrie, C. & Finkk, G.R. (1991 ) Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Academic Press, San Diego; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology ((Greene, New York, 1992) wurden angewandt um die Expressionsvektoren für Gal4, ssTM1 -Gal4, ssTM1 -DEVDG-Gal4, ssTM1 -DEVNG-Gal4 und Caspase-3 in den Hefestamm SFY526 (MATa, ura3-52, his3-200, ande2-101, Iys2- 801, trp1-901, Ieu2-3, 112, canΘ, gal4-542 gal80-538, URA3::Gal1-lacZ) (P.L. Bartel et al.. BioTechniques 14, 920 (1993)) einzubringen. Die Preparation von Proteinextrakten und ß-gal assays folgte Standardmethoden (Gurthrie, C. & Fink, G.R. (1991 ) Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Academic Press, San Diego; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (Greene, New York, 1992).

Claims

Ansprüche
Ein Verfahren zur Identifikation von Proteasen, die membranassoziierte Substrate spalten, dadurch gekennzeichnet, daß
I ein rekombinantes Fusionsprotein, bestehend aus mindestens einem Reporteranteil und einer Proteasespaltsequenz in einem geeigneten
Zellsystem expπmiert wird, das mit einer Membran assoziiert und
II ein weiteres Protein in dem gleichen Zellsystem expπmiert wird, und
III das Vorhandensein des abgespaltenen Reporteranteils nachgwiesen wird
Verfahren gemäß Anspruch 1 , dadurch gekennzeichnet, daß die Proteasespaltsequenz ganz oder teilweise innerhalb der Zellmembran lokalisiert ist
Verfahren gemäß Anspruch 1 , dadurch gekennzeichnet, daß die Proteasespaltsequenz ganz oder teilweise innerhalb des Zytosols lokalisiert ist
Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet, daß das Fusionsprotein durch einen zusätzlichen Ankeranteil in der Membran verankert ist
Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet, daß das Fusionsprotein durch die membranassoziierte Proteasespaltsequenz in der Membran verankert ist
Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5, dadurch gekennzeichnet, daß die membranassoziierte Protease-Spaltsequenz und/oder der Reporteranteil und/oder der Ankeranteil des Fusionsproteins durch einen Abstandshaiter verbunden sind
Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 6, dadurch gekennzeichnet, daß das erfindungsgemaße Fusionsprotein einen Signalanteil enthalt, der das Fusionsprotein zur Membran eines dafür geeigneten Zellsystems dirigiert 8 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7, dadurch gekennzeichnet, daß das geeignete Expressionsystem ein eukaryontisches Expressionssystem ist
9 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 8, dadurch gekennzeichnet, daß das geeignete Expressionsystem ein Hefeexpressionssystem ist 0
10 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 8, dadurch gekennzeichnet, daß das geeignete Expressionsystem ein Saugerexpressionssystem ist
1 1 Verfahren gemäß Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet daß der Reporteranteil des •> Fusionsproteins der Hefetranskπptionsaktivator Gal4 ist
12 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 4 und 6 bis 1 1 , dadurch gekennzeichnet daß der Ankeranteil des Fusionsproteins die TM1 -Domäne von Presenihn 1 ist
0 13 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 12, dadurch gekennzeichnet, daß die zu untersuchende Spaltsequenz mit einem Ankeranteil gemäß Anspruch 12 und einem Reporteranteil gemäß Anspruch 1 1 und einem geeigneten Signalanteil verbunden ist
ι 14 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 13, dadurch gekennzeichnet, daß das geeignete Expressionsystem keine systemeigenen Proteasen enthalt, die membran¬ assoziierte Substrate spalten
15 Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 14, dadurch gekennzeichnet daß es 0 sich bei der Proteasespaltsequenz um eine Aminosauresequenz handelt die von der γ-Sekretase, oder von der NOTCH Protease, oder von der Presinihn Protease oder von den Presenihn-spaltenden Caspasen gespalten wird Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 15 dadurch gekennzeichnet, daß die Proteasespaltsequenz das humane ß amyloid precursor protein (ßAPP) oder ein Teil davon ist
Verfahren gemäß Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet, daß die Proteasespaltsequenz einer der in den Figuren 5 oder 6 dargestellten
Teilsequenzen des humanen ß amyloid precursor protein 's (ßAPP) ist
Verfahren gemäß einem der vorangegangen Ansprüche zur Auffindung von Proteasen, die membranassoziierte Substrate spalten und deren Gene aus Genbibhotheken
Verfahren gemäß einem der vorangegangenen Ansprüche zur Auffindung der γ- Sektretase, oder der Presmihnase, oder der NOTCH-Protease oder der Preseni n- spaltenden Caspasen aus Genbibhotheken
Ein rekombmantes Fusionsprotein, das mit einer zellularen Membran assoziieren kann und mindestens einen Reporteranteil und eine Proteasespaltsequenz enthalt
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß Anspruch 20, dadurch gekennzeichnet, daß es einen zusätzlichen Membranankeranteil enthalt
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß Anspruch 20 oder 21 , dadurch gekennzeichnet, daß es zusätzlich mindestens einen Abstandshaiter zwischen den funktionellen Anteilen des Fusionsproteins enthalt
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 22 dadurch gekennzeichnet, daß es zusätzlich einen Signalanteil zum Zweck des zielgerichteten Transports zur Membran eines Expressionssystems enthalt Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 23, dadurch gekennzeichnet, daß der Reporteranteil der Hefetranskπptionsaktivator Gal4 ist
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 21 bis 24, dadurch gekennzeichnet, daß der Ankeranteil die TM1 -Domäne von Presinihn 1 ist
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 25, dadurch gekennzeichnet, daß der Signalanteil die Signalsequenz der Hefe Invertase ist
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 26, dadurch gekennzeichnet, daß es als Proteasespaltsequenz mindestens eine der Aminosauresequenzen enthalt, die spezifisch von der γ-Sekretase, oder der NOTCH Protease, oder der Presenihn Protease oder von den Presenihn-spaltenden Caspasen gespalten werden
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 27, dadurch gekennzeichnet, daß das Fusionsprotein als Reporteranteil den Hefetranskriptions- aktivator Gal4, die TM1 -Domäne von Presinihn 1 als Ankeranteil, und eine vermutete Proteasespaltsequenz enthalt
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß Anspruch 28, dadurch gekennzeichnet, daß ein zusätzlicher Signalanteil der Signalanteil der Hefe Invertase ist
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 29, dadurch gekennzeichnet, daß die Proteasespaltsequenz das humane ß amyloid precursor protein (ßAPP) oder ein Teil davon ist
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 30, dadurch gekennzeichnet, daß die Proteasespaltsequenz einer der in den Figuren 5 oder 6 dargestellten Teilsequenzen des humanen ß amyloid precursor protem's (ßAPP) entspricht Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 31 , dadurch gekennzeichnet, daß es eine Signalsequenz gemäß Figur 3, eine Proteasespaltsequenz mit Abstandshaiter gemäß Figure 5 und einen Reporteranteil gemäß Figur 8 enthalt
Ein rekombmantes Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 20 bis 32, dadurch gekennzeichnet, daß es eine Signalsequenz gemäß Figur 3, eine Proteasespaltsequenz mit Abstandshaiter gemäß Figure 6 und einen Reporteranteil gemäß Figur 8 enthalt Verwendung eines Fusionsprotein gemäß einem der Ansprüche 18 bis 27 in einem Verfahren gemäß einem der Ansprüche 1 bis 17
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