EA201692118A1 - Зонд на основе нуклеиновой кислоты, способ конструирования зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени - Google Patents

Зонд на основе нуклеиновой кислоты, способ конструирования зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени

Info

Publication number
EA201692118A1
EA201692118A1 EA201692118A EA201692118A EA201692118A1 EA 201692118 A1 EA201692118 A1 EA 201692118A1 EA 201692118 A EA201692118 A EA 201692118A EA 201692118 A EA201692118 A EA 201692118A EA 201692118 A1 EA201692118 A1 EA 201692118A1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
nucleic acid
atoms
probe based
acid molecule
detecting
Prior art date
Application number
EA201692118A
Other languages
English (en)
Inventor
Йосихиде Хайясизаки
Такеси Ханами
Такахиро Сома
Ясумаса Кимура
Хадзиме Канамори
Ясумаса Митани
Original Assignee
КАБУСИКИ КАЙСЯ ДиЭнЭйФОРМ
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by КАБУСИКИ КАЙСЯ ДиЭнЭйФОРМ filed Critical КАБУСИКИ КАЙСЯ ДиЭнЭйФОРМ
Publication of EA201692118A1 publication Critical patent/EA201692118A1/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
    • C09B23/00—Methine or polymethine dyes, e.g. cyanine dyes
    • C09B23/02—Methine or polymethine dyes, e.g. cyanine dyes the polymethine chain containing an odd number of >CH- or >C[alkyl]- groups
    • C09B23/04—Methine or polymethine dyes, e.g. cyanine dyes the polymethine chain containing an odd number of >CH- or >C[alkyl]- groups one >CH- group, e.g. cyanines, isocyanines, pseudocyanines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
    • C09B23/00—Methine or polymethine dyes, e.g. cyanine dyes
    • C09B23/02—Methine or polymethine dyes, e.g. cyanine dyes the polymethine chain containing an odd number of >CH- or >C[alkyl]- groups
    • C09B23/06—Methine or polymethine dyes, e.g. cyanine dyes the polymethine chain containing an odd number of >CH- or >C[alkyl]- groups three >CH- groups, e.g. carbocyanines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/6818—Hybridisation assays characterised by the detection means involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2330/00—Production
    • C12N2330/30—Production chemically synthesised

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

В настоящем изобретении предлагается зонд на основе нуклеиновой кислоты, с помощью которого можно добиться высокой чувствительности обнаружения и высокой специфичности в обнаружении мутации, обнаружения участка ошибочного спаривания оснований и т.д. с помощью метода ПЦР, способ конструирования подобного зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени. Зонд на основе нуклеиновой кислоты включает молекулу нуклеиновой кислоты, при этом молекула нуклеиновой кислоты содержит множество флуоресцентных групп атомов, которые проявляют экситонный эффект. По меньшей мере две из флуоресцентных групп атомов, проявляющих экситонный эффект, связываются с тем же самым основанием или двумя смежными основаниями в молекуле нуклеиновой кислоты, при этом каждая флуоресцентная группа атомов связана с помощью линкера (связывающего атома или связывающей группы атомов). Конец молекулы указанной нуклеиновой кислоты со стороны удлинения химически модифицирован, чем предотвращается реакция удлинения молекулы нуклеиновой кислоты.
EA201692118A 2012-07-16 2013-07-12 Зонд на основе нуклеиновой кислоты, способ конструирования зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени EA201692118A1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2012158229 2012-07-16

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA201692118A1 true EA201692118A1 (ru) 2017-05-31

Family

ID=49948783

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201692118A EA201692118A1 (ru) 2012-07-16 2013-07-12 Зонд на основе нуклеиновой кислоты, способ конструирования зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени
EA201491064A EA032769B1 (ru) 2012-07-16 2013-07-12 Способ конструирования экситонного зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201491064A EA032769B1 (ru) 2012-07-16 2013-07-12 Способ конструирования экситонного зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени

Country Status (6)

Country Link
US (1) US9862989B2 (ru)
EP (2) EP2873731B1 (ru)
JP (2) JP5618436B2 (ru)
CA (1) CA2873370C (ru)
EA (2) EA201692118A1 (ru)
WO (1) WO2014013954A1 (ru)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP5618436B2 (ja) * 2012-07-16 2014-11-05 株式会社ダナフォーム 核酸プローブ、核酸プローブの設計方法、およびターゲット配列の検出方法
EA032482B1 (ru) * 2012-08-30 2019-06-28 КАБУСИКИ КАЙСЯ ДиЭнЭйФОРМ Способ анализа нуклеиновой кислоты-мишени
US10760116B2 (en) * 2015-08-28 2020-09-01 Kabushiki Kaisha Dnaform Analysis kit, analyzer, and methods for analyzing template nucleic acid or target substance
CN106008486B (zh) * 2016-05-31 2018-05-18 安徽大学 一种靶向细胞核仁的噻吩基六氟磷酸吡啶盐生物荧光探针及其合成方法
WO2018008435A1 (ja) * 2016-07-04 2018-01-11 株式会社ダナフォーム 核酸分析方法
CN116024320A (zh) * 2022-07-13 2023-04-28 上海翔琼生物技术有限公司 一种用于检测核酸的荧光定量pcr方法
WO2024069938A1 (ja) * 2022-09-30 2024-04-04 株式会社Mirai Genomics 核酸増幅用反応槽、カートリッジ及び核酸検出方法

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0723800A (ja) * 1993-07-08 1995-01-27 Tanabe Seiyaku Co Ltd 核酸の検出方法
JPH093800A (ja) * 1995-06-19 1997-01-07 Dainippon Printing Co Ltd 抗菌用紙及びその製造方法
IT1303767B1 (it) * 1998-11-17 2001-02-23 San Raffaele Centro Fond Metodo di quantificazione di acidi nucleici.
AUPR050700A0 (en) * 2000-10-03 2000-10-26 Id+Plus Ltd Detection method
CA2622649C (en) 2007-03-09 2018-04-24 Riken Nucleic acid amplification method using primer exhibiting exciton effect
KR101551985B1 (ko) * 2007-03-09 2015-09-09 리가가쿠 겐큐쇼 모노뉴클레오시드 또는 모노뉴클레오티드로부터 유도되는 구조를 갖는 화합물, 핵산, 표지 물질, 핵산 검출 방법 및 키트
JP4370385B2 (ja) * 2007-03-09 2009-11-25 独立行政法人理化学研究所 プライマー、プライマーセット、それを用いた核酸増幅方法および変異検出方法
EP2336358A1 (en) * 2008-05-06 2011-06-22 QIAGEN GmbH Simultaneous detection of multiple nucleic acid sequences in a reaction
JP5975524B2 (ja) * 2010-12-28 2016-08-23 国立研究開発法人理化学研究所 化合物、核酸、核酸の製造方法および核酸を製造するためのキット
JP5618436B2 (ja) * 2012-07-16 2014-11-05 株式会社ダナフォーム 核酸プローブ、核酸プローブの設計方法、およびターゲット配列の検出方法
EA032482B1 (ru) * 2012-08-30 2019-06-28 КАБУСИКИ КАЙСЯ ДиЭнЭйФОРМ Способ анализа нуклеиновой кислоты-мишени

Also Published As

Publication number Publication date
EA201491064A1 (ru) 2014-11-28
EP3401407A1 (en) 2018-11-14
EP3401407B1 (en) 2020-04-22
EA032769B1 (ru) 2019-07-31
EP2873731A4 (en) 2016-04-27
EP2873731B1 (en) 2018-08-29
US9862989B2 (en) 2018-01-09
US20150203902A1 (en) 2015-07-23
CA2873370A1 (en) 2014-01-23
JPWO2014013954A1 (ja) 2016-06-30
JP2015012868A (ja) 2015-01-22
CA2873370C (en) 2021-06-08
WO2014013954A1 (ja) 2014-01-23
JP5618436B2 (ja) 2014-11-05
EP2873731A1 (en) 2015-05-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EA201692118A1 (ru) Зонд на основе нуклеиновой кислоты, способ конструирования зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени
CY1125261T1 (el) Συνθεσεις για αλληλουχιση νουκλεϊκων οξεων
AU2017257624A1 (en) Hybridization chain reaction methods for in situ molecular detection
CY1123973T1 (el) Συνθεσεις και μεθοδοι για ακριβη ταυτοποιηση μεταλλαξεων
CY1125029T1 (el) Τροποποιημενοι νουκλεοζιτες, νουκλεοτιδια, και νουκλεϊκα οξεα και χρησεις αυτων
CY1117858T1 (el) Ολιγονουκλεοτιδια για την προκληση αλλαγης στην αλληλουχια rna μοριου-στοχου παροντος σε ζωντανο κυτταρο
WO2014182528A3 (en) Multiplex labeling of molecules by sequential hybridization barcoding
CY1122788T1 (el) Ανιχνευση πυρηνικου οξεος στοχου και παραλλαγματων
MX353840B (es) Deteccion de acidos nucleicos.
DK2572004T3 (da) Detection of target nucleic acid sequences by pto cleavage and extension assay
WO2013016694A3 (en) Methods for rna detection and quantification
GB201317477D0 (en) Methods, compositions and kits for determing the presence/absnece of a variant nucleic acid sequence
CY1124064T1 (el) Ιχνηθετης νουκλεϊκου οξεος με επισημανση με μεμονωμενο φθοριζον μοριο δεσμευμενο σε μια εσωτερικη κυτοσινη για χρηση σε ισοθερμικη ενισχυση μεσω βροχου
EA201391723A1 (ru) Продукты и способы для идентификации мультиплексных нуклеиновых кислот
EP3274471A4 (en) Polymer tagged nucleotides for single molecule electronic snp assay
MX338296B (es) Composiciones y metodos para cuantificar una secuencia de acido nucleico en una muestra.
WO2015058008A3 (en) Enhanced nucleic acid identification and detection
EP2576839A4 (en) DETECTION AND QUANTIFICATION OF NUCLEIC ACID BY POST-HYBRIDIZED MARKING AND UNIVERSAL CODING
WO2012178046A3 (en) Multivariate diagnostic assays and methods for using same
EA201692157A1 (ru) Синтез двухцепочечных нуклеиновых кислот
EA201171325A1 (ru) Нуклеиновые кислоты, связывающиеся с гепсидином
BR112015017354A2 (pt) método para detectar pelo menos uma base modificada
BR112012030813A2 (pt) "métodos e kits para detecção in situ de sequências de nucleotídeo"
BR112018073378A2 (pt) composições de nucleotídeos marcados e métodos para sequenciamento de ácidos nucleicos
ZA201405894B (en) Detection of nucleotide variation on target nucleic acid sequence by pto cleavage and extension assay