EA036509B1 - Пегилированный свиной интерферон и способы его применения - Google Patents

Пегилированный свиной интерферон и способы его применения Download PDF

Info

Publication number
EA036509B1
EA036509B1 EA201892671A EA201892671A EA036509B1 EA 036509 B1 EA036509 B1 EA 036509B1 EA 201892671 A EA201892671 A EA 201892671A EA 201892671 A EA201892671 A EA 201892671A EA 036509 B1 EA036509 B1 EA 036509B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
variant
pifn
seq
pig
pegylated
Prior art date
Application number
EA201892671A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201892671A1 (ru
Inventor
Питер Коннор Кэннинг
Николас Кнудсен
Лиллиан Скидмор
Original Assignee
Эланко Юэс Инк.
Амбркс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Эланко Юэс Инк., Амбркс, Инк. filed Critical Эланко Юэс Инк.
Publication of EA201892671A1 publication Critical patent/EA201892671A1/ru
Publication of EA036509B1 publication Critical patent/EA036509B1/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/56Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule
    • A61K47/59Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyureas or polyurethanes
    • A61K47/60Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyureas or polyurethanes the organic macromolecular compound being a polyoxyalkylene oligomer, polymer or dendrimer, e.g. PEG, PPG, PEO or polyglycerol
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C07K14/555Interferons [IFN]
    • C07K14/56IFN-alpha
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/19Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • A61K38/21Interferons [IFN]
    • A61K38/212IFN-alpha
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/02Inorganic compounds
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/06Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
    • A61K47/08Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite containing oxygen, e.g. ethers, acetals, ketones, quinones, aldehydes, peroxides
    • A61K47/10Alcohols; Phenols; Salts thereof, e.g. glycerol; Polyethylene glycols [PEG]; Poloxamers; PEG/POE alkyl ethers
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/06Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
    • A61K47/08Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite containing oxygen, e.g. ethers, acetals, ketones, quinones, aldehydes, peroxides
    • A61K47/12Carboxylic acids; Salts or anhydrides thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0019Injectable compositions; Intramuscular, intravenous, arterial, subcutaneous administration; Compositions to be administered through the skin in an invasive manner
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/08Solutions
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)

Abstract

В документе раскрыты варианты свиного интерферона альфа (pIFN-), содержащие синтетическую аминокислоту в выбранных местоположениях в pIFN- и вставку одной или двух аминокислот на N-конце после удаления сигнального пептида. Варианты pIFN- могут быть дополнительно пегилированными. Также предполагаются способы получения и введения этих соединений для лечения вирусных инфекций у свиней и составы, содержащие данные варианты.

Description

Данное изобретение содержит перечень последовательностей, который был предоставлен в формате
ASCII с использованием EFS-Web и который таким образом включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Указанная копия ASCII, созданная 15 июня 2017 г., имеет название
204257_0028_561478_SL_ST25.txt и размер 45280 байтов.
Введение интерферона альфа (IFN-α) имеет медицинские последствия, которые необходимо оценить и контролировать. Например, аутоиммунные реакции также могут индуцироваться у людей терапией хронического вирусного гепатита с использованием IFN-α. Таким образом, лечение людей, в целом, было ограничено пациентами, которые нуждались в терапии, поскольку терапия может усугублять ранее существующие аутоиммунные реакции, демаскировать скрытые аутоиммунные процессы или даже индуцировать аутоиммунные заболевания de novo. F.L. Dumoulin et al., Autoimmunity induced by interferonα therapy for chronic viral hepatitis, Biomed. & Pharmacother., 53: 242-54 (1999). Также наблюдали, что интерферон-α оказался неспособен к лечению инфекций вирусом гепатита С у людей.
Также наблюдали, что интерферон оказался эффективным для лечения некоторых людей с вирусом гепатита С (HCV) в такой степени, что на данный момент клиническое применение у людей имеют две пегилированные формы интерферона альфа (IFN-α), т.е. пегинтерферон-а-2а и пегинтерферон-α-2b, также известные как PEGASYS® и PEGINTRON® соответственно. Пока остается неясным то, как IFN-α ингибирует репликацию HCV. Что более интересно, пегинтерферон-α-2а и пегинтерферон-α-2b характеризуются только 7% и 28% активностью, соответственно, по сравнению с их нативными формами (диким типом).
В процессе получения интерферона были созданы различные варианты для лечения человека с целью повышения биологической доступности и содействия продуцированию белка. Один пример приведен в патенте США № 8106160, в котором обсуждается добавление одного или нескольких аминокислотных остатков к N-концевому цистеину зрелого человеческого интерферона </.-2b для снижения образования дисульфидных связей, не характерных для естественных условий, и, вследствие этого, снижения уровня структурных изоформ. Он включает добавление пролинового остатка на N-конце.
Способы введения не встречающихся в естественных условиях аминокислот, вставленных в сайты в белке, описаны, например, в международной заявке WO 2010/011735 и в международной заявке WO 2005/074650.
Свиной интерферон α-1 дикого типа имеет длину 189 аминокислот и находится под кодом доступа Х57191 в GenBank.
Требуются формы интерферона-α для применения у животных и в животноводстве, в особенности в лечении популяций свиней, чувствительных к вирусным инфекциям, и еще более конкретно в лечении популяций свиней с активными и протекающими вирусными инфекциями для защиты стад свиней от патологии, ассоциированной с вирусной инфекцией. Будет благоприятно обнаружить вариант IFN-α для применения у животных-свиней, который имеет продолжительное действие и является полезным для ингибирования или снижения репликации вируса, патологии в стаде и гибели животных, связанной с вирусной инфекцией. Вариант свиного IFN-α будет сохранять биологическую активность, будет иметь более длительный период биологической доступности и будет иметь малое число изоформ, что обеспечивает возможность более простой очистки.
На фиг. 1 изображена плазмида pKG0083 c pIFN-α-PS-E107amber, который включает в себя Nконцевую вставку пролин-серина. Эта плазмида управляет продукцией варианта белка с SEQ ID NO: 14 клеточной линией AXID2820.
На фиг. 2 изображены результаты выравнивания последовательностей и идентификаторы последовательностей для вариантов pIFN-α, имеющих синтетическую аминокислоту pAF, заменяющую остатки Q102, Е103, Е107, L112 и Y136. У всех последовательностей отсутствует сигнальная последовательность для pIFN-α. У последовательностей либо отсутствует (SEQ ID NO: 6, 9, 12, 15 и 18) дополнительная аминокислота на N-конце, либо они имеют пролин (SEQ ID NO: 7, 10, 13, 16 и 19) или пролин-серин, добавленные на N-конце (SEQ ID NO: 8, 11, 14, 17 и 20).
На фиг. 3 изображена последовательность мотива SEQ ID NO: 1. SEQ ID NO: 2 является такой же, как SEQ ID NO: 1, но включает в себя N-концевой метионин, который обычно отщепляется при созревании зрелого варианта pIFN-α. SEQ ID NO: 3 включает в себя сигнальную последовательность, но у нее отсутствует вставка пролина, пролина-серина и/или метионина. SEQ ID NO: 4 представляет собой зрелый pIFN-α дикого типа. SEQ ID NO: 5 представляет собой последовательность дикого типа с метионином на N-конце.
На фиг. 4 в таблице изображены различные варианты pIFN-α с Q102, Е103, Е107, L112 и 136, либо не имеющие дополнительного остатка, либо имеющие пролин или пролин-серин, присоединенные на Nконце, как указано в положениях Xa и Xb. Под abs подразумевается отсутствие. SEQ ID NO: 1 приведена для сравнения.
На фиг. 5 изображены результаты выравнивания последовательностей для трех дополнительных вариантов pIFN-α, в которых pAF заменяет Н7, R34 и Н40. Эти последовательности либо не имеют про- 1 036509 лина или пролин-серина на N-конце, либо они не имеют N-концевого метионина. Сайты мутации изображены в рамке в последовательности pIFN-α WT над таблицей, и в таблице они изображены в виде
X в рамке. Xa и Xb являются такими, как определено в таблице. Под abs подразумевается отсутствие.
На фиг. 6 изображены дополнительные синтезированные мутации в Е107, в которых серии (SEQ ID NO: 24), серин-глицин (SEQ ID NO: 25) и гистидин (SEQ ID NO: 26) добавлены на аминоконце варианта pIFN-α, имеющего pAF, заменяющую Е107 (представленный как X в рамке). Xa и Xb являются такими, как определено в таблице. Под abs подразумевается отсутствие.
В данном документе представлены варианты свиного интерферона-α (pIFN-α) и способы их применения, которые можно применять у животных, которые не являются вакцинированными, таких как невакцинированные новорожденные поросята, а также животные с угнетенным иммунитетом, т.е. беременные свиньи (беременные свиноматки или молодые свиньи); у животных, которым вакцинация предоставляет недостаточную защиту; у животных, чувствительных к инфекции вирусом, для которого нет доступной эффективной вакцины; и у животных, инфицированных в настоящее время. Эти композиции и способы применения будут предупреждать инфекцию в случае вспышки вирусной инфекции. Композиции также можно применять для снижения тяжести заболевания у инфицированной свиньи. В целом, введение осуществляют по схеме дозирования с введением одной дозы. В качестве альтернативы и если это необходимо, дозы могут быть обеспечены с интервалом примерно 1 -3 или 2 недели, причем, необяза тельно, вводят только одну-две дозы.
Свиной интерферон-α (pIFN-α) дикого типа, который включает в себя сигнальную последователь ность из 23 остатков, представляет собой:
maptsaflta Ivllscnaic slqcdlpqth slahtralrl laqmrrispf scldhrrdfg spheafggnq vqkaqamalv hemlqqtfql fstegsaaaw nesllhqfct gldqqlrdle acvmqeagle gtplleedsi lavrkyfhrl tlylqeksys pcaweivrae vmrsfsssrn
Iqdrlrkke (SEQ ID NO: 3).
Выделенная двойным подчеркиванием часть представляет собой сигнальную последовательность, которая не присутствует в зрелой форме pIFN-α дикого типа.
В данном документе представлен вариант (pIFN-α). В варианте пропущена сигнальная последовательность из 23 аминокислот. Вариант может иметь метиониновый остаток на аминоконце, который может быть отщеплен в зрелой форме белка. Этот метионин не присутствует в форме pIFN-α дикого типа. Вариант pIFN-α дополнительно имеет вставку одной или двух аминокислот между метионином сигнальной последовательности и N-концевым цистеином. Вставка представляет собой либо пролин, либо пролин-серин. Последовательность представлена ниже
MXaXbCDLPQTHSLAHTRALRLLAQMRRISPFSCLDHRRDFGSPHEAFGGNQVQKAQAM
ALVHEMLQQTFQLFSTEGSAAAWNESLLHQFYTGLDQQLRDLEACVMQEAGLEGTPLL
EEDSIRAVRKYFHRLTLYLQEKSYSPCAWEIVRAEVMRSFSSSRNLQDRLRKKE (SEQ ID
NO: 2).
Xb (положение 3 в SEQ ID NO: 2) либо представляет собой любой из пролина, серина, либо отсутствует. Xa (положение 2 в SEQ ID NO: 2) либо отсутствует, либо представляет собой пролин. Если Xb отсутствует, Xa отсутствует, если Xb представляет собой пролин, Xa отсутствует, и если Xb представляет собой серин, Xa представляет собой пролин. Выделенный жирным шрифтом остаток глутаминовой кислоты Е располагается ниже Xa по направлению транскрипции, и Xb представляет собой сайт замены синтетической аминокислотой, т.е. pAF.
Вариант pIFN-α дополнительно имеет синтетическую аминокислоту, параацетилфенилаланин (pAF), заменяющую одно из 5 местоположений в SEQ ID NO: 1: остаток Е103 (SEQ ID NO: 9-11 соответственно), Е107 (SEQ ID NO: 12-14 соответственно), L112 (SEQ ID NO: 15-17 соответственно), Y136 (SEQ ID NO: 18-20) или Q102 (SEQ ID NO: 6-8 соответственно) (нумерация в соответствии с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 4, без N-концевого Met).
Вариант pIFN-α может быть дополнительно пегилирован на pAF. Вариант pIFN-α может быть пегилирован с использованием PEG с молекулярной массой от приблизительно 5 до приблизительно 40 кДа или PEG с молекулярной массой 30 кДа. Вариант pIFN-α может быть пегилирован с использованием линейного оксиамино-PEG с молекулярной массой 30 кДа. Активированная оксиаминогруппа хемоселективно реагирует с ацетильной боковой цепью, присутствующей на синтетической аминокислоте, такой как параацетилфенилаланин. Вариант pIFN-α имеет линейный PEG с молекулярной массой 30 кДа, ковалентно связанный с pAF, заменяющей Е107 (SEQ ID NO: 12-14) (нумерация в соответствии со зрелой последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 4). Вариант pIFN-α с E107 может дополнитель- 2 036509 но иметь пролин или пролин и серии на N-конце, что отражено в SEQ ID NO: 13 и 14 соответственно.
Варианты pIFN-α могут быть включены в составы. Состав, содержащий варианты pIFN-α, может содержать 20 мМ ацетат натрия, 100 мМ хлорид натрия, 5% глицерин при рН 5,0 с титром свиного IFNα, составляющим от 2,0 до 6,0 г/л.
Составы могут быть получены с помощью способа, предусматривающего стадии:
(a) очистка pIFN-α;
(b) растворение указанного очищенного варианта pIFN-α в 50 мМ Tris, 6М гуанидине при рН 8;
(c) инкубирование растворенного варианта pIFN-aA при комнатной температуре в течение 16-24 ч в 20 мМ Tris, 1M аргинине, 10 мМ метионине (met), 1 мМ EDTA (этилендиаминтетрауксусная кислота) при рН 8,0 для обеспечения возможности рефолдинга белка;
(d) удаление оставшихся ацетилированных вариантов с помощью хроматографического разделения на сильной анионообменной смоле;
(e) конъюгирование варианта pIFN-a с PEG при соотношении PEG к белку, составляющем от 1:1 до 1:8 или от 1:1 до 1:2; и (f) очистка пегилированного варианта pIFN-a.
Варианты pIFN-a и составы с ними можно применять для лечения вирусной инфекции. Способ лечения вирусной инфекции у свиньи предусматривает подкожное введение варианта pIFN-a свинье в количестве любого из вариантов свиного интерферона-a (pIFN-a), составляющем от 25 до 150 мкг/кг массы животного. Способ может дополнительно предусматривать второе введение варианта pIFN-aA в количестве от приблизительно 25 до приблизительно 150 мкг/кг массы животного. Если способ включает второе введение, второе введение может происходить приблизительно через 7, 14 или 21 сутки после первого введения.
Способ лечения вирусной инфекции можно применять для лечения вирусной инфекции, выбранной из группы, состоящей из вируса свиного репродуктивного и респираторного заболевания, вируса ящура, вируса свиного гриппа, свиного цирковируса, свиного вируса эпизоотической диареи и вируса трансмиссивного гастроэнтерита. Способ можно применять для лечения новорожденного поросенка или беременной свиньи.
Также предполагается применение любого из вариантов pIFN-a (или состава, содержащего вариант) в терапии у свиньи для лечения вирусной инфекции, причем инфекция может быть вызвана любым из вирусов, обсуждаемых в данном документе.
Также описывается применение варианта pIFN-a для применения в производстве лекарственного средства для лечения вирусной инфекции у свиньи. Свинья может представлять собой новорожденного поросенка или беременную свинью.
Под введением подразумевается инъекция терапевтически эффективного количества соединений и композиций, содержащих указанные раскрытые соединения.
Введение может быть внутримышечным (i.m.) или подкожным (s.c). Количество вводимого варианта pIFN-a будут устанавливать на основании массы животного, например, при этом беременные свиньи получают большее количество, чем новорожденные поросята.
Составы, раскрытые в данном документе, также могут быть помещены во флакон с одной дозой или многодозовый флакон.
Свинья, подвергающаяся лечению с помощью способов, описанных в данном документе, будет представлять собой новорожденного поросенка или беременную свинью (беременную молодую свинью или свиноматку).
Под терминами лечить, осуществлять лечение или лечение подразумевается снижение или ослабление одного или нескольких симптомов, ассоциированных с инфекцией одним из вирусов, упомянутых в данном документе. Композицию можно дополнительно применять в производстве лекарственного средства для лечения вирусной инфекции у свиньи. Композицию или лекарственное средство можно применять для лечения свиньи. Свинья может представлять собой новорожденного поросенка или беременную свинью.
Будут подробно обсуждаться соединения, составы с указанными соединениями, способы получения составов и способы применения соединений и составов для лечения свиней (подсвинков или хряков), имеющих вирусную инфекцию.
В контексте данного документа и пунктов приложенной формулы изобретения формы единственного числа включают в себя соответствующие формы множественного числа, если контекст явно не указывает иное, и использование форм множественного числа, в свою очередь, также может охватывать использование в единственном числе.
Синтетическая аминокислота относится к аминокислоте, которая не является одной из 20 распространенных аминокислот, или пирролизином, или селеноцистеином. Примеры таких синтетических аминокислот включают в себя, без ограничения, параацетилфенилаланин (pAF), ацетилглюкозаминил-Lсерин и №ацетилглюкозаминил-Ь-треонин. Для дополнительных подробностей относительно таких синтетических аминокислот и их включения и модификации, см. международные заявки WO 2010/011735 и
- 3 036509
WO 2005/074650.
Термин субъект в контексте данного документа относится к свинье, в особенности к домашней свинье (Sus scrofa domesticus или Sus domesticus), и может включать в себя карликовых свиней, а также их породы, которые разводят для получения мяса. Предполагается, что термины свинья, хряк или подсвинок включают в себя все породы свиней.
Используемый термин эффективное количество относится к такому количеству варианта pIFN-α, которое при введении будет обеспечивать предупреждение, лечение или снижение переноса свиного вируса от инфицированного животного к неинфицированному животному или будет обеспечивать предупреждение, лечение или снижение симптома заболевания, вызванного инфекцией свиным вирусом. В данном документе раскрыты варианты свиного интерферона альфа (pIFN-α). Эти варианты имеют синтетические аминокислоты, заменяющие различные положения в последовательности свиного IFN-α. Ген pIFN-α Sus scrofa domestica (GenBank X57191), в котором подчеркнутая лидерная последовательность (остатки 1-23 в SEQ ID NO: 3) удалена, как представлено ниже (в ориентации от амино- к карбоксиконцу)
MAPTSAFLTALVLLSCNAICSLGCDLPOTHSLAHTRALRLLAQMRRISPFSCLDHRRDFG
SPHEAFGGNQVQKAQAMALVHEMLQQTFQLFSTEGSAAAWNESLLHQFYTGLDQQLR
DLEACVMQEAGLEGTPLLEEDSIRAVRKYFHRLTLYLOEKSYSPCAWEIVRAEVMRSFS
SSRNLQDRLRKKE. (SEQ ID NO:3).
Зрелая последовательность представляет собой
CDLPQTHSLAHTRALRLLAQMRRISPFSCLDHRRDFGSPHEAFGGNQVQKAQAMALVH
EMLOOTFOLFSTEGSAAAWNESLLHOFYTGLDOOLRDLEACVMQEAGLEGTPLLEEDS
IRAVRKYFHRLTLYLQEKSYSPCAWEIVRAEVMRSFSSSRNLQDRLRKKE (SEQ ID NO:
4). Подчеркнутая сигнальная последовательность на N-конце SEQ ID NO: 3 может быть заменена на другую сигнальную последовательность или даже на один метиониновый остаток, например, для транскрипции in vitro, что приводит в результате к следующей последовательности:
MCDLPQTHSLAHTRALRLLAQMRR1SPFSCLDHRRDFGSPHEAFGGNQVQKAQA
MALVHEMLQQTFQLFSTEGSAAAWNESLLHQFYTGLDQQLRDLEACVMQEAGLEGTP
LLEEDSIRAVRKYFHRLTLYLQEKSYSPCAWEIVRAEVMRSFSSSRNLQDRLRKKE (SEQ
Ш NO: 5) или она может включать в себя остатки пролина или пролин-серина между N-концевым метионином и цистеином (см. SEQ ID NO: 2). Можно применять другие родственные свиные последовательности.
Варианты pIFN-α имеют синтетические аминокислоты, введенные в одно из следующих местоположений на Sus scrofa domestica (при использовании нумерации, соответствующей зрелой последовательности, представленной в SEQ ID NO: 4): Q102 (SEQ ID NO: 6), Е103 (SEQ ID NO:9), E107 (SEQ ID NO: 12), L112 (SEQ ID NO: 15) и Y136 (SEQ ID NO: 18) (которые выделены жирным шрифтом и подчеркиванием в последовательности выше), а также изображены на фиг. 2-4. У зрелого pIFN-α N-концевой метиониновый остаток (например, остаток 1 в SEQ ID NO: 5) может отщепляться при созревании.
Синтетические аминокислоты и их включение являются такими, как обсуждается, например, в международной заявке WO 2010/011735. Синтетические аминокислоты можно применять у Escherichia coli (Е. coif) (например, L. Wang, et al., (2001), Science 292: 498-500) и у эукариота Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae) (например, J. Chin et al., Science 301: 964-7 (2003)), которые обеспечивают возможность включения синтетических аминокислот в белки in vivo.
Из пяти (5) перечисленных вариантов с заменой на синтетическую аминокислоту, характеризующихся биологической активностью (замены на pAF в одном из пяти остатков Е103, Е107, L112, Y136 или Q102, которые выделены подчеркиванием в последовательности ниже), эти варианты могут быть дополнительно модифицированы посредством вставки аминокислот на N-конце молекулы. Например, пролин (Pro) или пролин-серин (Pro-Ser) могут быть вставлены между N-концевым Met и Cys.
В зрелой форме вариантов будет исключен N-концевой метионин.
В данном документе описываются способы получения полипептида pIFN-α, связанного с водорастворимым полимером. Подразумевается, что термины пегилирование и пегилированный относятся к ковалентному связыванию определенной синтетической аминокислоты с молекулой полиэтиленгликоля (PEG). Способ может предусматривать приведение в контакт выделенного полипептида pIFN-α, содержащего синтетическую аминокислоту, с водорастворимым полимером, содержащим фрагмент, который реагирует с синтетической аминокислотой.
Молекула поли(этиленгликоля) может характеризоваться молекулярной массой, составляющей от приблизительно 0,1 до приблизительно 100 кДа. Молекула поли(этиленгликоля) может характеризоваться молекулярной массой, составляющей от 0,1 до 50 кДа, от 20 до 40 кДа и любое значение в виде целого числа от 25 до 35 кДа. Молекула поли(этиленгликоля) может характеризоваться молекулярной массой,
- 4 036509 составляющей приблизительно 30 кДа. Молекула поли(этиленгликоля) может представлять собой линейную молекулу, характеризующуюся молекулярной массой, составляющей от 0,1 до 50 кДа, от 20 до 40 кДа и любое значение в виде целого числа от 25 до 35 кДа. Молекула поли(этиленгликоля) может представлять собой линейную молекулу, характеризующуюся молекулярной массой, составляющей 30 кДа. Молекула поли(этиленгликоля) может иметь аминооксигруппу, способную к реакции с ацетильной группой на синтетической аминокислоте. Молекула поли(этиленгликоля) может представлять собой линейный PEG молекулярной массой 30 кДа с активированной аминооксигруппой, способный к образованию оксимной связи с ацетильной боковой цепью параацетилфенилаланина.
Один pIFN-α имеет линейный PEG, который характеризуется молекулярной массой приблизительно 30 кДа, прикрепленный к остатку pAF.
Варианты, которые обсуждались выше и которые обсуждаются далее по тексту, могут быть дополнительно смешаны в составе с различными вспомогательными веществами, стабилизаторами, буферами и другими компонентами для введения животным. Идентификация подходящих составов в отношении стабильности, введения животным и активности не является простой задачей. Наоборот, состав должен быть адаптирован для каждого соединения, исходя из требований к очистке этого соединения, стабилизатора, необходимого для сохранения соединения, и различных других компонентов состава.
Подходящие соли для включения в состав включают в себя хлорид натрия, хлорид калия или хлорид кальция.
Ацетат натрия можно применять в качестве буферного средства и/или стабилизирующего средства.
Подходящие буферы могут включать в себя фосфатно-цитратный буфер, фосфатный буфер, цитратный буфер, L-гистидин, L-аргинина гидрохлорид, бикарбонатный буфер, сукцинатный буфер, цитратный буфер и TRIS буфер либо отдельно, либо в комбинации.
Состав также может включать в себя криопротектор. Криопротекторы могут включать в себя криопротектор, выбранный из группы, состоящей из гидроксипропил-в-циклодекстрина (HPBCD), сукралозы и поливинилпирролидона 4000 (PVP 4000).
Состав, необязательно, может включать в себя поверхностно-активное вещество. Подходящие поверхностно-активные вещества включают в себя полисорбаты (например, полисорбат 80), додецилсульфат (SDS), лецитин либо отдельно, либо в комбинации.
Состав может представлять собой водную композицию, или он может иметь форму восстановленной жидкой композиции или присутствовать в виде порошка. Кроме того, состав можно хранить во флаконе или картридже или в предварительно заполненном стерильном шприце, готовом для введения субъекту.
рН состава может находиться в диапазоне от 4,0 до 7,0 или от 4,5 до 6,5, когда состав имеет форму жидкости.
Подходящие вирусные инфекции, лечение которых можно осуществлять, включают в себя, без ограничения, коронавирус, пестивирус (вирус чумы свиней или классической чумы свиней, CSF), коронавирус, вызывающий трансмиссивный гастроэнтерит (TGEV), свиной артеривирус (PoAV), вирус свиного репродуктивного и респираторного синдрома (PRRSV), свиной цирковирус (PCV), вирус свиной эпизоотической диареи (PEDV), вирус ящура (FMDV), свиной коронавирус, такой как свиной дельтакоронавирус (PDCoV), и вирус свиного гриппа (SIV).
Введение варианта или состава, содержащего вариант, может представлять собой введение единственной дозы или за введением одной дозы следует введение второй дозы через 7-21 сутки после первой дозы, например приблизительно через 14 суток после первой дозы. Животному вводят вариант в количестве, составляющем от приблизительно 25 до приблизительно 150 мкг/кг варианта на 1 кг массы животного. Другой диапазон эффективных количеств варианта pIFN-α составляет от приблизительно 50 мкг/кг до приблизительно 100 мкг/кг массы животного. Вариант можно вводить в составе или сам по себе. Вариант можно вводить однократно, например, перед вспышкой заболевания. Вариант также можно вводить после вспышки вирусной инфекции стаду с целью предотвращения дальнейших потерь в стаде. Вариант или состав с ним можно вводить во второй раз. Второе введение можно назначать после периода от приблизительно 7 до приблизительно 21 суток после первого введения, например через 14 суток после первого введения. Дополнительные введения могут предполагаться, если они необходимы для снижения или предупреждения заболевания, ассоциированного с вирусными инфекциями.
Специалисту в данной области техники будет очевидно, что различные модификации и изменения могут быть выполнены без отступления от идеи или объема композиций, соединений и способов, раскрытых в данном документе. Таким образом, предполагается, что настоящим изобретением покрываются модификации и варианты настоящего изобретения при условии, что они попадают в объем пунктов прилагаемой формулы изобретения и их эквивалентов.
Примеры
Пример 1. Варианты с pAF.
Одиннадцать (11) вариантов с pAF создают и сравнивают относительно pIFN-α дикого типа (wt). Из них три варианта pIFN-α исключают из продолжающегося исследования вследствие плохой экспрессии
- 5 036509 белка/проблем с продуцированием в случае синтетических аминокислот, замещенных в различных точках в pIFN-a.
AXID2820 имеет плазмиду pKG0083 с pIFN-a-E107amber и N-концевой вставкой пролин-серина (фиг. 1). Нумерация остатков была стандартизирована для обеспечения соответствия последовательности pIFN-α дикого типа (SEQ ID NO: 4). Аминокислотную последовательность свиного интерферона-а-1 дикого типа получают из GenBank (номер доступа Х57191). Соответствующую последовательность нуклеиновой кислоты синтезируют и клонируют в вектор экспрессии. Стоп-кодон янтарь (TAG) вставляют в кодон глутаминовой кислоты, соответствующий положению аминокислоты 107 (или другим положениям, которые указаны) в кодирующем участке зрелой последовательности дикого типа. Нуклеиновые кислоты, кодирующие Pro-Ser, вставляют на аминоконец после инициирующего метионинового кодона (AUG). Для подтверждения того, что клонирование и последующий мутагенез протекали, как ожидается, без включения нежелательной(нежелательных) мутации(мутаций), полную последовательность плазмидной ДНК pKG0083 подвергают секвенированию.
Восемь (8) вариантов pIFN-α в табл. 1 были способны экспрессироваться в виде белка. Эти восемь вариантов также пегилируют с использованием линейного PEG молекулярной массой 30 кДа с активированной аминооксигруппой. Пегилирование вариантов осуществляют посредством доведения раствора белка (при концентрации белка, составляющей примерно 20 мг/мл или более) до рН 4,0 с использованием 10% ледяной уксусной кислоты. Гидразид уксусной кислоты добавляют до конечной концентрации 100 мМ и оксиамино-PEG добавляют в молярном отношении от 1:1 до 2:1 или вплоть до приблизительно 8:1 относительно варианта pIFNa. Реакции позволяют протекать в течение 1-3 суток при 28-30°С в темноте. Реакцию гасят посредством 5-кратного разведения реакционной смеси 30 мМ ацетатом натрия, рН 5,0. Эти 8 пегилированных вариантов анализируют с использованием гель-хроматографии (SEC), как показано в табл. 1. Варианты pIFN-α являются такими же, как pIFN-α дикого типа, за исключением замены на pAF в указанном остатке, например His7 заменяли на pAF, Arg34 заменяли на pAF и так далее. Концентрация белка указана в мг/мл. RP обозначает обращенную фазу (т.е. обращенно-фазовую хроматографию или RP-HPLC).
Таблица 1
Получение пегилированных вариантов pIFNa
Образец Конц, белка (мг/мл) % от главного пика согласно RP % мономера согласно SEC
pIFN-a wt SEQ Ш NO: 4 1,5 69,4 99,5
pIFNa-H7-PEG30 SEQ ГО NO: 21 2,6 67,0 94,7
pIFNa-R34-PEG30 SEQ ГО NO: 22 2,2 73,8 99,6
pIFNa-Q102-PEG30 SEQ ID NO: 6 1,9 68,1 97,7
pIFNa-E103-PEG30 SEQ ID NO: 9 2,1 58,2 96,3
pIFNa-E107-PEG30 SEQ ID NO: 12 1,9 60,2 98,2
pIFNa-L112-PEG30 SEQ ID NO: 15 3,4 60,1 98,3
pIFNa-Y136-PEG30 SEQ ID NO: 18 2,1 51,9 99,1
pIFNa-H40-PEG30 SEQ ID NO: 23 1,9 52,1 98,7
SEC выполняют с использованием системы для HPLC, способной к детекции при нескольких длинах волны (Agilent 1100 или 1200 или эквивалент). Подвижная фаза представляет собой 200 мМ фосфат калия, 250 мМ хлорид калия, рН 6,0, 10% изопропанол (IPA).
Эти 8 вариантов исследуют в in vitro анализе биологической активности. Коммерчески доступный набор для анализа интерферона iLite™ huIFNa от Pestka Biomedical Laboratories, Inc. (Пискатауэй, НьюДжерси, США) используют для исследования биологической активности pIFN-α. Кратность потери активности у вариантов PEG рассчитывают относительно белка Ambrx WT следующим образом:
- 6 036509
Кратность потери _ ЕС50 PEG-варианта активности PEG-варианта Е”С5О АтЬгх WT
Как показано в табл. 2, из восьми исследуемых вариантов три варианта pIFN-α характеризовались значительно меньшей активностью, чем непегилированный pIFN-α дикого типа.
Таблица 2
Порядок по рангу Исследуемый образец Кратность потери активности по сравнению с pIFNa WT ЕС50 [нг/мл] Исследуемый образец ЕС50 [нг/мл] Ambrx pIFNa WT
1 pIFNoc El 03PEG30K 184 22
2 pIFNoc L112PEG30K 15х 475 32
3 pIFNaoc El 07PEG30K 23х 731 32
4 pIFNaoc Y136PEG30K 26х 874 33
5 pIFNaa QI 02PEG30K 32х 693 22
6 pIFNaoc H40PEG30K 171х 5662 33
7 pIFNaoc H7PEG30K 387х 8761 23
нет активности pIFNaoc R34PEG30K нет активности нет активности 23
У контрольного pIFN-α дикого типа отсутствует сигнальный пептид, нет вставленных N-концевых аминокислот (метионин, пролин или серин), нет замены любой аминокислоты на pAF, и он не является пегилированным (SEQ ID NO: 4).
В результате этих экспериментов пегилированные варианты pIFN-α, имеющие замену на pAF в Н40 (SEQ ID NO: 23), Н7 (SEQ ID NO: 21) и R34 (SEQ ID NO: 22), считаются бесполезными вариантами pIFN-α для лечения вирусной инфекции у свиней вследствие низких уровней их активности по сравнению с диким типом в анализе iLite™ huIFNa.
В анализе методом RP-HPLC и пегилированных, и непегилированных вариантов для результатов в табл. 2 используется подвижная фаза А (0,05% TFA/вода) и подвижная фаза В (0,05% TFA/ACN).
Пример 2. Исследование in vivo.
Восемнадцать крыс линии Спраг-Доули (n=3 в группе) получают дозу 0,2 мг/кг каждого из 6 исследуемых образцов (ресуспендированных в 20 мМ ацетате натрия, рН 5,0, 100 мМ NaCl и 5% глицерине) подкожно в заднюю часть шеи, отдаленную от катетера: (1) pIFNa-E103-PEG30K (пегилированная SEQ ID NO: 9), (2) pIFNa-L112-PEG30K (пегилированная SEQ ID NO: 15), (3) pIFNa-E107-PEG30K (пегилированная SEQ ID NO: 12), (4) pIFNa-Y136-PEG30K (пегилированная SEQ ID NO: 18) и (5) pIFNa-a-Q102PEG30K (пегилированная SEQ ID NO: 6).
Варианты pIFN-α растворяют в 20 мМ ацетате натрия с рН 5,0, 100 мМ NaCl и 5% глицерине. Каждому животному вводят инъекцией подкожно (т.е. в заднюю часть шеи) один из 5 вариантов или pIFN-a дикого типа (такого же, как используется в примере 1) с образованием, таким образом, 6 тестовых групп, по 3 крысы в каждой.
Забор образцов осуществляют в следующие моменты времени: перед введением дозы и после введения дозы через 1 ч, 6 ч, 24 ч, 48 ч, 72 ч, 144 ч, 192 ч и 240 ч после введения дозы. Образцы крови получают через катетер в яремной вене, или через боковую хвостовую вену, или в момент завершения эксперимента посредством прокола сердца и их подвергают обработке, позволяя крови свернуться и удаляя образующуюся в результате сыворотку. Концентрации каждого пегилированного варианта pIFN-α определяют с помощью анализа связывания лиганда при использовании моноклонального антитела к PEG для захвата и козьего поликлонального антитела к свиному IFN-α для выявления. AUClast, Cmax, Tmax рассчитывают посредством анализа необработанных данных с использованием программного обеспечения WINNONLIN® для моделирования PK (фармакокинетических) свойств (Pharsight Corporation, сейчас Certara USA, Inc.). Воздействие (AUClast) для пегилированных вариантов делили на воздействие для pIFN дикого типа (pIFN WT) с получением кратности различий. Результаты для пегилированных вариантов представлены ниже в табл. 3.
- 7 036509
Таблица 3
Биологическая доступность пегилированных вариантов IFN-a
Соединение Животное № AUClast Кратность различия в сравнении с pIFN WT С max т max Оцен. Т 1/2
(нг*час/мл) (нг/мл) час час
PEG Q102 pIFNa Среднее значение 12500 133 339 24 16,3
SD 686 14,4 0 2,10
PEG El07 pIFNa Среднее значение 9420 100 246 24 17,6
SD 2590 77,6 0 3,93
PEG LI 12 pIFNa Среднее значение 6000 64 165 24 12,7
SD 510 15,6 0 1,11
PEG El03 pIFNa Среднее значение 5210 55 147 18 11,7
SD 365 12,5 10,4 0,479
PEGY136 pIFNa Среднее значение 5140 55 141 24 12,4
SD 788 23,2 0 0,987
WT pIFNa SEQ ID NO: 4 Среднее значение 94,2 1 81 1 NC
SD 49,3 49,9 0 NC
DN обозначает нормализованный к дозе; единицы для DN AUClast представляют собой (нг-ч/мл)/(мг/кг), а ДЛЯ DN Cmax представляют собой (нг/мл)/(мг/кг). Cmax используют для расчета периода полужизни. Тем не менее, пегилированный по Е107 вариант pIFN-α характеризовался наибольшим периодом полужизни из пяти (5) вариантов. NC означает не поддающийся расчету, поскольку концентрации поддавались измерению только в два момента времени.
Подтверждено, что воздействие (по показателю AUClast) является наивысшим для PEG30K-Q102 и PEG30K-E107, и они представлены в таблице в порядке убывания воздействия. Все из пяти исследуемых вариантов pIFN-α характеризуются большим воздействием для pIFN-α, чем форма pIFN-α дикого типа (SEQ ID NO: 4). Tmax обычно наблюдают через 24 ч после введения дозы для пегилированных вариантов pIFN-α по сравнению с 1 ч после введения дозы для pIFN-α дикого типа. В случае этого эксперимента Cmax включают в расчет периода полужизни вследствие несоответствующих точек данных в окончательной фазе. Поскольку время в момент Cmax не представляет истинную фазу выведения, оценки периода полужизни следует рассматривать как приближенную величину.
Следует заметить, что гетерологичность молекулы не оказывает влияния в этом типе исследования.
Пример 3. Характеристика связанных с продуктом загрязняющих примесей для pIFNa-E107pAF.
Исходя из результатов масс-спектроскопии (MS) pIFN-aA-E107 (SEQ ID NO: 12), присутствуют ацетилированные формы, 58 Да форма и образующиеся в результате окисления загрязняющие примеси. Вариант становится ацетилированным в ходе биосинтеза внутри продуцирующего штамма Е. coli. Таким образом, один вариант для продуцирования pIFN-aA-E107 заключается в добавлении ацетилтрансфераз в соответствующий момент в ходе продуцирования или в использовании нокаутной ацетилтрансферазы аланина рибосомального белка (ribosomal-protein-alanine acetyltransferase) (RimJ) (N-концевая ацетилтрансфераза). Кроме того, для очистки можно использовать мелко- и крупномасштабную хроматографию. В качестве альтернативы и как показано в данном документе, последовательность N-конца может быть дополнительно модифицирована для предотвращения ацетилирования на варианте в целом.
В случае хроматографических методов один способ заключается в применении САРТО Adhere Impres (GE Healthcare Lifesciences), которая представляет собой сильную анионообменную среду (смолу) для мультимодальной хроматографии с использованием технологии BIOPROCESS. В этом способе используется подвижная фаза из 25 мМ ацетата аммония (при рН 6,5), загрузка немодифицированного (т.е. непегилированного) варианта pIFN-α до концентрации 1-5 мг/мл смолы. Колонку промывают 5 объемами колонки (CV) 25 мМ ацетата аммония при рН 6,5. Элюирование варианта pIFN-aA осуществляется с использованием линейного градиента к 100% буферу для элюирования (5 мМ уксусная кислота) и 0100% В за 40 CV (объем колонки), при помощи чего удаляют пики, соответствующие окисленному pIFN-a. Пик один имеет N-конец pIFN-α без ацетилирования цистеина, в то время как пик 2 содержал ацетилированную форму (+42 Да), +58 Да форму, +58+1 Ох форму (вероятно, ацетилированные и однократно окисленные молекулы) и +58 Да+2 Ох форму (вероятно, ацетилированная форма по меньшей мере с двумя окисленными остатками).
Исходя из результатов пролин вставляли на аминоконце pIFN-a для предотвращения образования ацетилированных форм. Таким образом, создали Pro-pIFNa-E107pAF (SEQ ID NO: 13). Для наглядности,
- 8 036509 нумерация положений аминокислот всегда начинается с N-концевого цистеина (С1). Добавленный пролин становится остатком -1, и N-концевой метионин (если он присутствует) становится остатком -2. Также можно выполнить вставку Pro-Ser, при этом пептид содержит серин в положении -1, пролин в положении -2 и, возможно, метионин в положении -3 относительно N-концевого цистеина. Добавление пролина удаляло другие пики, наблюдаемые для предыдущего варианта при анализе посредством массспектроскопии.
В табл. 4 ниже Pro-pIFNa-E107pAF имеет пролин на N-конце и замену на pAF в Е107. Активность варианта Pro-pIFNa-E107pAF сравнивают с активностью варианта, лишенного добавления пролина на Nконце, pIFNa-E107pAF. Вариант, имеющий добавленный пролин, имеет меньшее число ацетилированных и окисленных вариантов. Стоит заметить, что эти варианты не являются пегилированными и они не включают в себя метионин сигнальной последовательности.
Таблица 4
Pro-pIFNa-E107pAF ЕС50, нг/мл pIFNa-E107pAF ЕС50, нг/мл
Прогон 1 6,46 8,08
Прогон 2 4,55 7,01
Пример 4. Другие варианты N-концов.
С учетом успеха с добавлением пролина на N-конец pIFNa-E107pAF также оценивали другие варианты N-концов, включающие добавление серина (Ser, S), добавление Pro-Ser (PS), добавление His (H) и добавление Ser-Gly (SG) к pIFNa-E107pAR Эти варианты N-концов не являются пегилированными. Активность этих вариантов N-концов (все они являются вариантами с E107-pAF) затем оценивали в биологическом in vitro анализе с использованием набора iLite™ huIFNa kit от Pestka Biomedical Laboratories, описанного выше, и результаты представлены в табл. 5.
Таблица 5
Мутация EC 50 (нг/мл)
Pro-pIFNa SEQ Ю NO: 13 18,3
S (-1) pIFNa SEQ Ш NO: 24 34,2
SG (-2/-1) pIFNa SEQ ID NO: 25 69,1
PS (-2/-1) pIFNa SEQ ID NO: 14 28,7
H (-1) pIFNa SEQ ID NO: 26 25,4
Pro-pIFNa представляет собой вариант, имеющий пролин, добавленный на аминоконце между метионином (в незрелом пептиде) и цистеином.
Пример 5. Конъюгирование варианта pIFN-α с PEG.
Вариант pIFNa-PS-E107 (SEQ ID NO: 14) получают из пула, собранных с помощью хроматографии по методу Capto после применения хроматографии по методу Capto в соответствии с инструкциями производителя, и 0,2М глицин добавляют к очищенной форме. рН смеси доводят до 4,0 с использованием уксусной кислоты. Вариант pIFN-α затем концентрируют до 8,2 мг/мл с использованием фильтрующей центрифуги Amicon Ultra в соответствии с инструкциями производителя. После концентрирования линейный PEG с молекулярной массой 30 кДа (PEG может быть коммерчески приобретен, например, у NOF America Corporation или EMD Merck) добавляют при молярном отношении pEG^p^^ pIFNa, составляющем 8:1. Смесь PEG/вариант pIFN-α затем инкубируют при 28°С в течение приблизительно 18 ч. Этот способ приводит в результате к тому, что >95% варианта pIFN-a конъюгируются с PEG после 18 ч инкубирования.
Пегилированный вариант (pIFNa-PS-E107-PEG30K) затем может быть очищен следующим образом. Колонку Tosoh SP650S объемом 143 мл можно применять для очистки пегилированного варианта при использовании следующей подвижной фазы:
А: 30 мМ ацетат натрия, рН 5,0,
- 9 036509
В: 30 мМ ацетат натрия, 5% этиленгликоль, рН 5,0 от 0 до 100% В за 20 объемов колонки.
Пример 6. Сравнительное исследование вариантов с различными N-концами.
Анализы активности проводят для нескольких вариантов как в их пегилированных (линейным PEG с молекулярной массой 30 кДа), так и непегилированных формах для оценки воздействия пегилирования на варианты, имеющие замену на pAF в Е107 и имеющие пролин-серин на аминоконце (SEQ ID NO: 14). Результаты представлены ниже в таблице 6. Концентрация белка, значения SEC, RP и ЕС50 определены, как обсуждалось выше. pIFNa-P-E107-pAF используют в качестве сравнительного образца, чтобы отразить результаты для белка без аминоконцевого удлинения.
Таблица 6
Образец Конц, белка (мг/мл) SEC, % мономера RP, % от главного пика ЕС50 (нг/мл)
pIFNa-PS-E107-pAF 8,2 99,8 84,8 5,96
pIFNa-P S -Е107-3 0KPEG 7,3 99,0 98,2 409,7
pIFNa-P-E107-pAF 4,27
pIFNa-P-Е 107-3 0KPEG з,з 99,3 99,7 641,2
При исследовании для характеристики вариантов наблюдали ошибочное включение норлейцина. Известно, что норлейцин ошибочно включается в положении аминокислоты метионина при ферментации с использованием Е. coli при высокой плотности. Это наблюдалось при проведении экспериментов по ферментации. Включение норлейцина снижалось при использовании одной или нескольких из следующих стадий: подача растворов с метионином, ферментация с использованием комплексных сред вместо определенной среды (комплексные среды имеют один или несколько неопределенных компонентов в своем составе, в том числе, без ограничения, глицерин, соли, аминокислоты, витамины, дрожжевые экстракты, растительные и животные гидролизаты, пептоны и триптоны) и/или снижение температуры реакционной смеси после продуцирования. L-метионин добавляют в партию среды в концентрации 1,2 мМ, а также непрерывно подают через питательный раствор, который содержит 20 мМ L-метионин.
Варианты pIFN-α находятся под контролем промотора Т7. Добавление арабинозы (индуктор) к среде ферментации приводит в результате к каскаду, который обеспечивает возможность продуцирования вариантов. Таким образом, после индукции означает после добавления индуктора, в данном случае арабинозы.
Пример 7. Влияние замораживания-оттаивания на пегилированные и непегилированные варианты.
Образцы подвергали замораживанию и оттаиванию в течение пяти циклов посредством замораживания до 0°С в пробирках объемом 1,5 мл и оттаивания на водяной бане комнатной температуры. Не наблюдали какого-либо значительного воздействия в случае профиля белка с высокой молекулярной массой (HMW) в течение пяти циклов замораживания-оттаивания, что подтверждается ниже в табл. 7.
Таблица 7
pIFNa-PS-E107pAF pIFNa-PS-E107-30KPEG
Цикл замораживания/оттаивания % от главного пика % IIMW % от главного пика %HMW
0 99,8 0,2 99,0 0,7
1 99,8 0,2 99,0 0,8
3 99,8 0,2 99,0 0,9
5 99,8 0,2 99,0 0,9
В табл. 7 отражены различия между пегилированными и непегилированными вариантами, имеющими пролин-серин на N-конце, а также замену на pAF в Е107, причем вариант имеет вставку пролинсерина на аминоконце (pIFNa-PS-E107-30), т.е. в виде остатков -2 и -1.

Claims (30)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Вариант свиного интерферона-α (pIFN-α), содержащий
    XAXBCDLPQTHSLAHTRALRLLAQMRRISPFSCLDHRRDFGSPHEAFGGNQVQKAQAMALV HEMLQQTFQLFSTEGSAAAWNESLLHQFYTGLDQQLRDLEACVMQEAGLEGTPLLEEDSIR AVRKYFHRLTLYLQEKSYSPCAWEIVRAEVMRSFSSSRNLQDRLRKKE (SEQ ID NO: 1), причем остаток Е103, Е107, L112, Y136 или Q102 (нумерация относительно SEQ ID NO: 4) заменен на синтетическую аминокислоту.
  2. 2. Вариант pIFN-α по п.1, причем синтетическая аминокислота представляет собой параацетилфе
    - 10 036509 нилаланин (pAF).
  3. 3. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 7.
  4. 4. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 10.
  5. 5. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 13.
  6. 6. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 16.
  7. 7. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 19.
  8. 8. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 8.
  9. 9. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 11.
  10. 10. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 14.
  11. 11. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 17.
  12. 12. Вариант pIFN-α по п.1, причем вариант представляет собой SEQ ID NO: 20.
  13. 13. Вариант pIFN-α по любому из пп.1-12, причем синтетическая аминокислота является пегилированной.
  14. 14. Вариант pIFN-α по п.13, причем пегилированный вариант pIFN-α пегилирован с использованием PEG с молекулярной массой приблизительно от 5 до 40 кДа.
  15. 15. Вариант pIFN-α по п. 14, причем PEG представляет собой PEG с молекулярной массой 30 кДа.
  16. 16. Вариант свиного интерферона-α (pIFN-α), состоящий из
    PSCDLPQTHSLAHTRALRLLAQMRRISPFSCLDHRRDFGSPHEAFGGNQVQKAQAMALVHE MLQQTFQLFSTEGSAAAWNESLLHQFYTGLDQQLRDLEACVMQEAGL-pAF-GTPLLEEDSIRAVR KYFHRLTLYLQEKSYSPCAWEIVRAEVMRSFSSSRNLQDRLRKKE (SEQ ID NO: 14), причем остаток, соответствующий E107 (нумерация относительно SEQ ID NO: 4), заменен на параацетилфенилаланин (pAF), и указанный остаток pAF пегилирован с использованием линейного PEG с молекулярной массой 30 кДа.
  17. 17. Состав для предупреждения или лечения вирусной инфекции, содержащий вариант pIFN-α по любому из пп.1-16, содержащий 20 мМ ацетат натрия, 100 мМ хлорид натрия, 5% глицерин при рН 5,0 с титром варианта pIFN-α от приблизительно 2,0 до приблизительно 6,0 г/л.
  18. 18. Способ получения состава варианта pIFN-α по п.1, предусматривающий стадии:
    (a) очистка pIFN-α;
    (b) растворение указанного очищенного варианта pIFN-α в 50 мМ Tris, 6М гуанидине при рН 8;
    (c) инкубирование растворенного варианта pIFN-α при комнатной температуре в течение 16-24 ч в 20 мМ Tris, 1М аргинине, 10 мМ метионине (met), 1 мМ EDTA при рН 8,0;
    (d) удаление оставшихся ацетилированных вариантов;
    (e) конъюгирование варианта pIFN-α с PEG при отношении PEG к белку, составляющем от 1:1 до 1:2; и (f) очистка пегилированного варианта pIFN-α.
  19. 19. Способ предупреждения или лечения вирусной инфекции у свиньи, предусматривающий подкожное введение указанной свинье, нуждающейся в этом, варианта pIFN-α по любому из пп.1-16.
  20. 20. Способ по п. 19, причем вариант pIFN-α вводят в количестве от 25 до 150 мкг/кг массы животного.
  21. 21. Способ по п.20, предусматривающий второе введение указанного варианта pIFN-α в количестве от 25 до 150 мкг/кг массы животного.
  22. 22. Способ по п.21, причем второе введение осуществляют через 7-14 суток после первого введения.
  23. 23. Способ по п.19, причем вирусная инфекция выбрана из группы, состоящей из вируса свиного репродуктивного и респираторного заболевания, вируса ящура, вируса свиного гриппа, свиного цирковируса, вируса свиной эпизоотической диареи и вируса трансмиссивного гастроэнтерита.
  24. 24. Способ по любому из пп.19-23, причем свинья представляет собой новорожденного поросенка, или свинья представляет собой беременную свинью.
  25. 25. Многодозовый флакон, содержащий состав по п.17.
  26. 26. Применение варианта pIFN-α по любому из пп.1-16 в терапии у свиньи для лечения вирусной инфекции.
  27. 27. Применение варианта pIFN-α по любому из пп.1-16 для предупреждения или лечения вирусной инфекции.
  28. 28. Применение состава по п.17 или варианта pIFN-α по любому из пп.1-16 для лечения вирусной инфекции у свиньи.
  29. 29. Применение состава по п.17 или варианта pIFN-α по любому из пп.1-16 в производстве лекарственного средства для лечения вирусной инфекции у свиньи.
  30. 30. Применение по одному из пп.28 или 29, причем свинья представляет собой новорожденного поросенка или беременную свинью.
EA201892671A 2016-06-20 2017-06-16 Пегилированный свиной интерферон и способы его применения EA036509B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662352163P 2016-06-20 2016-06-20
PCT/US2017/037964 WO2017222940A1 (en) 2016-06-20 2017-06-16 Pegylated porcine interferon and methods of use thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201892671A1 EA201892671A1 (ru) 2019-05-31
EA036509B1 true EA036509B1 (ru) 2020-11-18

Family

ID=59258379

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201892671A EA036509B1 (ru) 2016-06-20 2017-06-16 Пегилированный свиной интерферон и способы его применения

Country Status (18)

Country Link
US (2) US10960080B2 (ru)
EP (1) EP3471755B1 (ru)
JP (2) JP7093311B2 (ru)
KR (2) KR102409470B1 (ru)
CN (2) CN117024562A (ru)
AU (2) AU2017280958A1 (ru)
BR (1) BR112018076437A2 (ru)
CA (1) CA3028683A1 (ru)
CL (1) CL2018003697A1 (ru)
DK (1) DK3471755T3 (ru)
EA (1) EA036509B1 (ru)
ES (1) ES2793773T3 (ru)
MX (1) MX2018016295A (ru)
NZ (1) NZ749962A (ru)
PL (1) PL3471755T3 (ru)
PT (1) PT3471755T (ru)
WO (1) WO2017222940A1 (ru)
ZA (1) ZA201808352B (ru)

Families Citing this family (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3365340B1 (en) 2015-10-19 2022-08-10 Incyte Corporation Heterocyclic compounds as immunomodulators
MD3377488T2 (ro) 2015-11-19 2023-02-28 Incyte Corp Compuși heterociclici ca imunomodulatori
SG11201805300QA (en) 2015-12-22 2018-07-30 Incyte Corp Heterocyclic compounds as immunomodulators
ES2906460T3 (es) 2016-05-06 2022-04-18 Incyte Corp Compuestos heterocíclicos como inmunomoduladores
US20170342060A1 (en) 2016-05-26 2017-11-30 Incyte Corporation Heterocyclic compounds as immunomodulators
CA3028685A1 (en) 2016-06-20 2017-12-28 Incyte Corporation Heterocyclic compounds as immunomodulators
US20180016260A1 (en) 2016-07-14 2018-01-18 Incyte Corporation Heterocyclic compounds as immunomodulators
ES2941716T3 (es) 2016-08-29 2023-05-25 Incyte Corp Compuestos heterocíclicos como inmunomoduladores
US20180179179A1 (en) 2016-12-22 2018-06-28 Incyte Corporation Heterocyclic compounds as immunomodulators
HRP20221216T1 (hr) 2016-12-22 2022-12-23 Incyte Corporation Derivati tetrahidro imidazo[4,5-c]piridina kao induktori internalizacije pd-l1
US20180179201A1 (en) 2016-12-22 2018-06-28 Incyte Corporation Heterocyclic compounds as immunomodulators
ES2934230T3 (es) 2016-12-22 2023-02-20 Incyte Corp Derivados de benzooxazol como inmunomoduladores
FI3774791T3 (fi) 2018-03-30 2023-03-21 Incyte Corp Heterosyklisiä yhdisteitä immunomodulaattoreina
CN112752756A (zh) 2018-05-11 2021-05-04 因赛特公司 作为PD-L1免疫调节剂的四氢-咪唑并[4,5-c]吡啶衍生物
TW202115059A (zh) 2019-08-09 2021-04-16 美商英塞特公司 Pd—1/pd—l1抑制劑之鹽
CN110343164A (zh) * 2019-08-22 2019-10-18 安阳工学院 一种高活性7位点突变的猪干扰素α突变体及其制备方法和应用
AU2020357514A1 (en) 2019-09-30 2022-04-07 Incyte Corporation Pyrido[3,2-d]pyrimidine compounds as immunomodulators
WO2021096849A1 (en) 2019-11-11 2021-05-20 Incyte Corporation Salts and crystalline forms of a pd-1/pd-l1 inhibitor
US11760756B2 (en) 2020-11-06 2023-09-19 Incyte Corporation Crystalline form of a PD-1/PD-L1 inhibitor
IL302590A (en) 2020-11-06 2023-07-01 Incyte Corp Process for preparing PD-1/PD-L1 inhibitor and salts and crystalline forms thereof
US11780836B2 (en) 2020-11-06 2023-10-10 Incyte Corporation Process of preparing a PD-1/PD-L1 inhibitor
CN113845599B (zh) * 2021-11-01 2023-09-19 长春萤火虫生物科技有限公司 一种重组猪干扰素融合蛋白及其应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20070237743A1 (en) * 2005-06-20 2007-10-11 Villarete Lorelie H Combination therapies using low-toxicity, long-circulating human interferon-alpha analogs
US20080132681A1 (en) * 2005-06-03 2008-06-05 Ambrx, Inc. Human Interferon Molecules and Their Uses
CN104262480A (zh) * 2014-09-28 2015-01-07 重庆理工大学 重组猪长效-α干扰素的构建和修饰方法及其冻干注射剂的制备方法

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6858409B1 (en) * 1988-05-27 2005-02-22 Amgen Inc. Nucleic acids encoding interleukin-1 inhibitors and processes for preparing interleukin-1 inhibitors
DK0730470T3 (da) * 1993-11-10 2002-06-03 Enzon Inc Forbedrede interferonpolymerkonjugater
US5908621A (en) * 1995-11-02 1999-06-01 Schering Corporation Polyethylene glycol modified interferon therapy
JP2006213597A (ja) * 2000-07-19 2006-08-17 Pepgen Corp インターフェロン−タウを用いるc型肝炎ウイルスの処置のための組成物およびモニタリングの方法
US20050226845A1 (en) * 2004-03-10 2005-10-13 Chih-Ping Liu Method of treatment using interferon-tau
AU2005211385B2 (en) 2004-02-02 2008-12-11 Ambrx, Inc. Modified human growth hormone polypeptides and their uses
WO2009046080A1 (en) 2007-10-01 2009-04-09 Pharmaessentia Corp. N-terminal modified interferon-alpha
JP5680534B2 (ja) 2008-07-23 2015-03-04 イーライ リリー アンド カンパニー 修飾されているウシg−csfポリペプチドおよびそれらの使用

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20080132681A1 (en) * 2005-06-03 2008-06-05 Ambrx, Inc. Human Interferon Molecules and Their Uses
US20070237743A1 (en) * 2005-06-20 2007-10-11 Villarete Lorelie H Combination therapies using low-toxicity, long-circulating human interferon-alpha analogs
CN104262480A (zh) * 2014-09-28 2015-01-07 重庆理工大学 重组猪长效-α干扰素的构建和修饰方法及其冻干注射剂的制备方法

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
F LEFEVRE, LA BONNADIERE C: "Molecular cloning and sequencing of a gene encoding biologically active porcine alpha-interferon", JOURNAL OF INTERFERON RESEARCH, MARY ANN LIEBERT, INC., NEW YORK, NY, US, vol. 6, no. 4, 1 August 1986 (1986-08-01), US, pages 349 - 360, XP055396551, ISSN: 0197-8357, DOI: 10.1089/jir.1986.6.349 *

Also Published As

Publication number Publication date
KR20190039889A (ko) 2019-04-16
MX2018016295A (es) 2019-09-16
BR112018076437A2 (pt) 2019-10-01
KR102518451B1 (ko) 2023-04-04
EP3471755B1 (en) 2020-04-22
AU2017280958A1 (en) 2018-12-20
US10960080B2 (en) 2021-03-30
KR102409470B1 (ko) 2022-06-16
JP7093311B2 (ja) 2022-06-29
NZ749962A (en) 2020-06-26
EA201892671A1 (ru) 2019-05-31
US20190192673A1 (en) 2019-06-27
CN109641034A (zh) 2019-04-16
CN109641034B (zh) 2023-08-15
AU2021229132B2 (en) 2023-04-06
JP7441892B2 (ja) 2024-03-01
CL2018003697A1 (es) 2019-05-10
ES2793773T3 (es) 2020-11-16
JP2019519553A (ja) 2019-07-11
PL3471755T3 (pl) 2020-10-19
PT3471755T (pt) 2020-05-22
WO2017222940A1 (en) 2017-12-28
DK3471755T3 (da) 2020-05-18
KR20220086700A (ko) 2022-06-23
JP2022137063A (ja) 2022-09-21
ZA201808352B (en) 2020-08-26
US20210177980A1 (en) 2021-06-17
EP3471755A1 (en) 2019-04-24
CA3028683A1 (en) 2017-12-28
CN117024562A (zh) 2023-11-10
AU2021229132A1 (en) 2021-09-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2021229132B2 (en) Pegylated Porcine Interferon and Methods of Use Thereof
EP2853536B1 (en) Long-acting erythropoietin polypeptides and uses thereof
KR20090089316A (ko) Peg 변형된 엑센딘 또는 엑센딘 유사체 및 조성물 및 이의 용도
EA019968B1 (ru) Модифицированные бычьи полипептиды g-csf и их применение
EA033788B1 (ru) Способ увеличения гидродинамического объема полипептида путем присоединения карбоксиконцевого пептида гонадотропина
US10406235B2 (en) Use of multi-arm polyethylene glycol modifier and application of multi-arm polyethylene glycol modifier in L-asparaginasum modification
CN107056929A (zh) 经过修饰的猪促生长素多肽和其用途
CN107674121A (zh) 经过修饰的牛促生长素多肽和其用途
CA2710841A1 (en) Y-shaped polyethylene glycol modified g-csf, the preparation and use thereof
WO2005105151A1 (fr) Derives pegyles de thymosine 1
CN101671390B (zh) 人干扰素α衍生物及其聚乙二醇化修饰物的制备和用途
US20240052330A1 (en) Blockade of sars-cov-2 infection using hydrocarbon stapled peptides
US9895420B2 (en) IL-1beta propeptide and IL-1Ra chimera and methods of using the same
CN112029000A (zh) 鸭干扰素α融合蛋白在制备抗鸭1型肝炎病毒的药物中的用途