EA005163B1 - СПОСОБЫ КРУПНОМАСШТАБНОГО ПРОИЗВОДСТВА ВЫВЕДЕННЫХ ИЗ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК МОЛЕКУЛ tPA ИЛИ K2S - Google Patents

СПОСОБЫ КРУПНОМАСШТАБНОГО ПРОИЗВОДСТВА ВЫВЕДЕННЫХ ИЗ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК МОЛЕКУЛ tPA ИЛИ K2S Download PDF

Info

Publication number
EA005163B1
EA005163B1 EA200300502A EA200300502A EA005163B1 EA 005163 B1 EA005163 B1 EA 005163B1 EA 200300502 A EA200300502 A EA 200300502A EA 200300502 A EA200300502 A EA 200300502A EA 005163 B1 EA005163 B1 EA 005163B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
dna
variant
molecule
bei
sequence
Prior art date
Application number
EA200300502A
Other languages
English (en)
Other versions
EA200300502A1 (ru
Inventor
Рольф-Гюнтер Вернер
Фридрих Гётц
Чатчай Таяпиватана
Йирадей Маносрои
Араня Маносрои
Original Assignee
Бёрингер Ингельхайм Интернациональ Гмбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Бёрингер Ингельхайм Интернациональ Гмбх filed Critical Бёрингер Ингельхайм Интернациональ Гмбх
Publication of EA200300502A1 publication Critical patent/EA200300502A1/ru
Publication of EA005163B1 publication Critical patent/EA005163B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424Serine endopeptidases (3.4.21)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12N9/6456Plasminogen activators
    • C12N9/6459Plasminogen activators t-plasminogen activator (3.4.21.68), i.e. tPA
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00Preparation of peptides or proteins
    • C12P21/02Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21069Protein C activated (3.4.21.69)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Inorganic Compounds Of Heavy Metals (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области тромбоза и получению производных тканевого активатора плазминогена (tPA) в прокариотических клетках. В патенте описаны также способы получения выведенного из рекомбинантной ДНК tPA, его варианта или молекулы, несущей «кренделеобразный» домен 2 и домен сериновой протеазы (K2S), или ее варианта в прокариотических клетках, где tPA или K2S или вариант секретируются внеклеточно в виде активного протеина с правильной складчатостью, и прокариотическая клетка содержит и экспрессирует вектор, который содержит ДНК, кодирующую tPA или K2S или вариант, фукционально связанную с ДНК, которая кодирует сигнальный пептид OmpA. Изобретение относится также к некоторым производным K2S, получаемым с помощью указанного способа. Изобретение относится также у указанным молекулам ДНК и к применению молекул ДНК согласно указанным способам.

Description

Изобретение относится к тромболизу и получению производного тканевого активатора плазминогена (ΐΡΑ) в прокариотических клетках.
Изобретение относится к способам получения выведенных из рекомбинантной ДНК тканевого активатора плазминогена (ΐΡΑ), его варианта, молекулы К28 (несущей «кренделеобразный» домен 2 и сериновый домен) (К28) или ее варианта в прокариотических клетках, где ΐΡΑ или К28 или вариант секретируются внеклеточно в виде активного протеина с правильной складчатостью, и прокариотическая клетка содержит и экспрессирует вектор, который несет ДНК, кодирующую ΐΡΑ или К28 или вариант, которая функционально связана с ДНК, кодирующей сигнальный пептид ОтрА.
Изобретение относится также к специфическим производным К28. которые можно получать указанным способом. Кроме того, изобретение относится к молекулам ДНК и к применению этих молекул ДНК согласно указанным способам.
Предпосылки создания изобретения
Тканевый активатор плазминогена (ΐΡΑ) представляет собой полипептид, содержащий 527 аминокислотных остатков (27), молекулярная масса которого составляет 72 кДа. Молекула содержит 5 структурных доменов. Вблизи Νконцевой области расположен образующий петлю «пальцеобразный» («йидег») домен, за которым расположен домен фактора роста. За ними находятся два аналогичных домена «кренделеобразный» домен 1(«кгшд1е 1») и «кренделеобразный» домен 2 («кгшд1е 2»). Как «пальцеобразный» домен, так и «кренделеобразный» домен 2, специфично связываются с фибриновыми сгустками, усиливая тем самым активацию связанного плазминогена протеином ΐΡΑ. Далее по ходу транскрипции относительно «кренделеобразного» домена 2 расположена сериновая протеаза, каталитический сайт которой локализован на С-конце. Сериновая протеаза ответственна за превращение плазминогена в плазмин, т. е. за реакцию, играющую важную роль в гомеостазе образования фибрина и рассасывания сгустка. Для правильной складчатости ΐΡΑ необходимо правильное спаривание 17 дисульфидных мостиков в молекуле (1).
В клинических условиях ΐΡΑ используют в качестве тромболитического агента для лечения острого инфаркта миокарда, легочной эмболии, «удара», периферических артериальных окклюзии и других тромбоэмболических заболеваний. Его преимуществом является отсутствие побочных воздействий, связанных с системным кровотечением и истощением фибриногена (7).
Первоначально для получения ΐΡΑ в терапевтических целях использовали клетки бычьей меланомы (12). Поскольку для клинических целей необходимо иметь стабильный процесс, обеспечивающий эффективное получение высо коочищенного протеина с достаточным выходом, была создана полноразмерная рекомбинантная молекула ΐΡΑ (г-ΐΡΑ), экспрессирующаяся в клетках млекопитающих. Клетки яичника китайского хомячка трансфектировали геном ΐΡΑ для 8синтеза г-ΐΡΑ (8, 22). Выведенный из рекомбинантной ДНК продукт, полученный с помощью ферментационной системы с использованием культур клеток млекопитающих, собирали и очищали от культуральной среды. Принимая во внимание простоту и экономичность производства, были предприняты многочисленные попытки получения г-ΐΡΑ из микроорганизмов, прежде всего из бактерий, и более предпочтительно из ЕксйепсЫа со11 (10, 13, 30). Для решения проблем, связанных с низким выходом и образованием внутриклеточных телец, что приводило к неправильной складчатости и инактивации фермента, был предложен целый ряд стратегий.
Было предложено несколько вариантов делеционных мутантов, содержащих «кренделеобразный» домен 2 и сериновую протеазу (К28). Однако проявление ферментативной активности рекомбинантной молекулы К28 (г-К28) достигалось только после процессов повторного образования складчатости выделенных из цитоплазматического компартмента внутриклеточных телец (16, 29). Для того, чтобы избежать сложности процессов повторного образования складчатости, загрязненности протеинами с неправильной складчатостью и переноса протеинов в периплазму, применяли специальные бактериальные системы экспрессии (6, 31). Несмотря на периплазматическую экспрессию ΐΡΑ, сверхэкспрессия приводила к получению неактивных агрегатов даже в условиях относительно высокого окисления в периплазме.
Из прототипов известно несколько описаний методов получения рекомбинантной молекулы К28 в Е. сой. Однако отсутствует описание метода, обеспечивающего эффективное с точки зрения стоимости крупномасштабное производство биологически активной молекулы К28.
У ОЬико\\'1сх с соавторами (25) предложен метод экспрессии и очистки г-К28 из периплазматического пространства. Очевидным недостатком этого метода является дополнительная стадия экстракции из периплазмы, непригодная для крупномасштабного производства.
У 8айо с соавторами (29) описана экспрессия г-К28 в цитоплазме. Для экспрессии молекулы г-К28, которую выделяли из цитоплазматического пространства Е. со11 в виде внутриклеточного тельца, авторы использовали процессы ренатурации ίη угьо. Исследователи фирмы Воейпидег Маппйеип применяли аналогичный сложный процесс денатурации/повторного образования складчатости, включающий стадии расщепления клеток, солюбилизации в денатурирующих и восстанавливающих условиях и реактивации в окислительных условиях в присутствии С8Н/О88О (восстановленный глутатион/окисленный глутатион), который является не эффективным с точки зрения стоимости (24) и для которого необходима мутация аминокислотной последовательности, что может сопровождаться появлением антигенных свойств.
В 1991 г. \Уа1бсп51гот с соавторами (34) сконструировали вектор (ρΕΖΖΚ2Ρ) для секреции конструкции «кренделеобразный» домен 2 плюс домен сериновой протеазы в супернатант культуры Е.со11. Для удаления слитого протеина ΖΖ из очищенной с помощью ЦС-Сефарозы фракции использовали гидроксиламин. Для расщепляющего агента гидрокисламина необходима модификация сайтов расщепления конструкции «кренделеобразный» домен 2 плюс сериновая протеаза (Лкп177-> 8ет и Лкп184-> Οίη). обеспечивающая защиту ее от расщепления гидроксиламином. Однако полученную в результате этого не встречающуюся в естественных условиях молекулу Κ28 с неправильной складчатостью нельзя применять для терапевтических целей. Она не обладает ферментативной активностью в отношении связывания фибрина/протеазной активностью. Не встречающаяся в естественных условиях последовательность может даже активировать человеческую иммунную систему.
Таким образом, в основу настоящего изобретения была положена задача разработать приемлемый с коммерческой точки зрения способ крупномасштабного производства молекул ΐΡΑ и их производных, например, Κ28, который предусматривает секрецию молекулы Κ28 в биологически активной форме в супернатант культуры.
Подробное описание изобретения
Пути решения поставленной задачи представлены в формуле и описании настоящего изобретения.
Изобретение не ограничено применением одного или нескольких пунктов формулы изобретения или описания, а включает также их модификации. Изобретение относится к способу получения выведенных из рекомбинантной ДНК тканевого активатора плазминогена (ΐΡΑ), варианта ΐΡΑ, молекулы, содержащей «кренделеобразный» домен 2 и домен сериновой протеазы (Κ28), или варианта Κ28 в прокариотических клетках, где ΐΡΑ, вариант ΐΡΑ, молекула Κ28 или вариант Κ28 секретируются внеклеточно в виде активного протеина с правильной складчатостью, и прокариотическая клетка содержит и экспрессирует вектор, который несет ДНК, кодирующую ΐΡΑ вариант ΐΡΑ, молекулу Κ28 или вариант Κ28, функционально связанную с ДНК, которая кодирует сигнальный пептид ОтрА или его функционально активное производное.
При создании изобретения неожиданно было установлено, что сигнальный пептид ОтрА индивидуально и/или в сочетании с Ν’ концевыми аминокислотами 8ΕΟΝ (8ΕΟ ΙΌ N0:9)/ 8ΕΟΝ8Ό (8 НО ΙΌ N0: 10) переносит выведенные из рекомбинантной ДНК ΐΡΑ, вариант ΐΡΑ, молекулу Κ28 или вариант Κ28 к внешней поверхности и облегчает высвобождение функциональной и активной молекулы в культуральную среду в большей степени, чем это достигается при использовании любого другого известного из существующего уровня техники метода. Согласно способу по изобретению перед пересечением наружной мембраны выведенный из рекомбинантной ДНК протеин приобретает правильную складчатость. Сигнальный пептид отщепляется, образуя зрелую молекулу. Неожиданно было установлено, что эффективность удаления сигнального пептида является очень высокой и приводит к правильной складчатости выведенного из рекомбинантной ДНК протеина.
Сигнальный пептид ОтрА взаимодействует с 8есΕ и его перенос через внутреннюю мембрану осуществляется с помощью энергии, которая генерируется 8есΑ при связывании с компонентами 8ес (8есΕ-8есΥ).8есΥ образует поры для секреции, предназначенные для переноса выведенного из рекомбинантной ДНК протеина по изобретению. Пространство между наружной мембраной и внутренней мембраной грамотрицательных бактерий, т.е. периплазма, обладает более высокими окислительными условиями по сравнению с цитоплазматическим пространством. Это способствует образованию дисульфидных мостиков и правильной складчатости выведенного из рекомбинантной ДНК протеина (например, Κ28) в периплазме, что приводит к получению активной молекулы. Согласно настоящему изобретению сигнальный пептид должен отщепляться с образованием зрелой молекулы. Комплекс, включающий секретин ΟκρΌ и липопротеин Οκρδ на наружной мембране служит в качестве воротного механизма ионного канала для секреции выведенного из рекомбинантной ДНК протеина по изобретению во внеклеточную среду. Для этого процесса секреции требуется энергия которая образуется в цитоплазме с помощью связывающего нуклеотид ΟκρΕ протеина, и затем переносится на протеин внутренней мембраны (Οκρ 0-1, Е и Κ-Ν). ΟκρΟ переносит энергию на ΟκρΌ путем образования поперечной связи между рядом протеинов внутренней мембраны (Οκρ 0-1, Е и Κ-Ν) и ΟκρΌ. Перед успешным пересечением наружной мембраны выведенный из рекомбинантной ДНК протеин приобретает правильную складчатость.
Согласно изобретению понятие «функционально связанный» обозначает, что ДНК, кодирующую ΐΡΑ, вариант ΐΡΑ, молекулу Κ28 или вариант Κ28 (предпочтительно содержащую нуклеиновую кислоту, которая кодирует 8ΕΟΝ или 8ΕΟΝ8Ό на Ν-конце), клонируют в векторе в непосредственной близости с ДНК ОтρА для достижения экспрессии слитого протеина ОтρА и ίΡΆ, варианта ΐΡΆ, молекулы К28 или варианта К28п и для направления секреции наружу из прокариотической клетки-хозяина. Как правило, секретируется большая часть ίΡΆ, вариантов ΐΡΆ, молекул К28 или вариантов К28, и их можно затем очищать с помощью приемлемых методов, таких как осаждение сульфатом аммония и/или аффинная хроматография, и с помощью дополнительных стадий очистки. Под объем изобретения подпадает также применение индукторов, таких как ИПТГ (изопропилтиогалактозид) или ИПТГ в сочетании с глицерином, улучшение условий инкубации и периода сбора с целью максимального повышения количества активного протеина.
Согласно предпочтительному варианту осуществления изобретения ДНК, кодирующую сигнальный пептид ОтрА, можно сливать с коротким пептидом, который отличается наличием аминокислотной последовательности 8ΕΟΝ или 8ΕΟΝ8Ό кодирующей нуклеотидной последовательности ТСТСАСССАААС(8Ер ГО N0:20) или ТСТСАСССАААСАСТСАС (8ΕΟ ГО N0:1), и локализован в Ν-концевой области или вблизи Ν-концевой области ίΡА, варианта ίΡА, молекулы К28 или варианта К28. Так, предпочтительно этот слитый протеин содержит 0ιηρΛ-8Ε0Ν80-ΐΡΛ. -ΐΡΛ-вариант. -К28МопеКупа или -К28-ВариаНТ.
Еще более предпочтительно эти аминокислотные последовательности, характеризующиеся наличием 8ΕΟΝ или 8ΕΟΝ8Ό, могут иметь точковую мутацию или могут быть заменены на не встречающиеся в естественных условиях аминокислоты. И еще более предпочтительно между ОтрА и 8ΕΟΝ или 8ΕΟΝ8Ό и ίΡА, вариантом ίΡА, молекулой К28 или вариантом К28 может находиться аминокислотный или неаминокислотный спейсер.
Таким образом, согласно предпочтительному способу по изобретению прокариотическая клетка содержит и экспрессирует вектор, содержащий ДНК, которая кодирует ίΡА, вариант ίΡА, молекулу К28 или вариант К28, функционально связанный с ДНК, которая кодирует сигнальный пептид 0трА, функционально связанный с молекулой нуклеиновой кислоты, которая имеет последовательность
ТСТСАСССАААСАСТСАС, или с ее функционально активным производным.
Способ по изобретение предусматривает применение прокариотических клеток-хозяев, таких как (но не ограничиваясь ими) Εδε^ήεΗία соб (Ε. сой). ВасШиз зиЫбйз, 8!гер!отусез, Ρзеиботопаз, например, Ρзеиботоηаз рибба, Ρ^оίеиз тиаЫШз, 8ассйаготусез, ΡΚΙιίη или 8ίарйу1ососсиз, например, 8!арйу1ососсиз сагиозиз. Предпочтительно клетка-хозяин по изобретению представляет собой грамотрицательную бактерию.
Предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что прокариотическая клетка представляет собой Ε. сой. Пригодные штаммы включают (но не ограничиваясь ими) штаммы Ε. сой ХЬ-1 Ыие, ΒΕ21(ΌΕ3), 1М109, ΌΗ-серии, ТОРЮ и НВ101.
Предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что осуществляют следующие стадии:
а) амплифицируют с помощью ПЦР ДНК, кодирующую ίΡА, вариант ίΡА, молекулу К28 или вариант К28;
б) очищают ПЦР-продукт;
в) встраивают указанный ПЦР-продукт в вектор, содержащий ДНК, которая кодирует сигнальный пептид 0трА, и ДНК, которая кодирует дрШ, таким образом, чтобы ПЦРпродукт в этом векторе был функционально связан против хода транскрипции с ДНК, кодирующей сигнальную последовательность 0трА, и связан по ходу транскриции с ДНК, кодирующей дрШ;
г) встраивают стоп-кодон между ίΡА, вариантом ίΡА, молекулой К28 или вариантом К28 и дрШ;
д) экспрессируют вектор с помощью прокариотической клетки;
е) очищают ίΡА, вариант ίΡА, молекулу К28 или вариант К28. При осуществлении стадии а) способа по изобретению выбор/создание праймеров является важным для клонирования в экспрессионном векторе ДНК в правильной локализации и направлении (см. пример 1). Так, праймеры, которые приведены в качестве примера в примере 1 и на фиг. 4, являются важным объектом настоящего изобретения. Указанный на стадии в) др III, т.е. ген протеина III, представляет собой ген, который присутствует главным образом в фагмидных векторах. Стопкодон встраивают для того, чтобы избежать транскрипции др III, что в конце концов приводит к секреции представляющего интерес ίΡА, варианта ίΡА, молекулы К28 или варианта К28. Для встраивания стоп-кодона можно применять любой пригодный метод, такой как сайтнаправленный мутагенез (см., например, у Аешег ΜΡ, Соз!а СЬ (1994) ЕСЕ Ме!йобз Арр1 4(3):8131136; Аешег ΜΡ, Созίа СЬ, 8сйоеб1ш А, С1ше I, МаШиг Ε, ВаиеНС (1994) Сепе 151(1-2): 119123; см. также пример 1).
Согласно изобретению можно применять любой вектор, предпочтительно вектор представляет собой фагмидный вектор (см. ниже).
Предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что ίΡА, вариант ίΡА, молекулу К28 или вариант К28 выбирают из ряда, включающего человеческий тканевый активатор плазминогена ^А, фиг. 16) или его фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединицу, химическое производное, слитый протеин или их гликозилированные варианты. Такие фрагменты, аллельные варианты, функционально активные варианты, варианты, полученные благодаря вы005163 рожденности нуклеотидного кода, слитые протеины с протеином ίΡΆ по изобретению, химические производные или гликозилированный вариант протеинов ίΡΆ по изобретению могут содержать один, несколько или все перечисленные ниже домены или субъединицы или варианты:
1. «Пальцеобразный» домен (4-50).
2. Домен фактора роста (50-87).
3. «Кренделеобразный» домен 1 (87-176).
4. «Кренделеобразный» домен 2 (176-262).
5. Протеазный домен (276-527).
Нумерация/название доменов соответствует нумерации/названию, приведенным для протеина, имеющего регистрационный номер СепЬаик С1 137119, или они описаны в №1Шге 301 (5897), 214-221 (1983).
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что 5 ίΡΑ, вариант ίΡΑ, молекулу К28 или вариант К28 выбирают из ряда, включающего «Кренделеобразный» домен 2 (4.) плюс домен сериновой протеазы (5.), вариант К28 человеческого тканевого активатора плазминогена или его фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединицу, химическое производное, слитый протеин или их гликозилированные варианты.
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что вектор представляет собой фагмидный вектор, содержащий ДНК, которая кодирует сигнальный пептид ОтрА, и ДНК, которая кодирует др111.
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что вектор представляет собой фагмидный вектор рСотЬ3Н88 (см. также пример 1).
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что последовательность ДНК содержит или представляет собой приведенную ниже последовательность ДНК, которая кодирует ОтрА и К28 или ее функционально активный вариант или вариант, полученный благодаря вырожденности нуклеотидного кода:
АТОАААААОАСАССТАТСОСОАТТОСАОТООСАСТООСТСОТТТСССТАССО ТООСССАООСОаССТСТОАОООАААСАОТОАСТССТАСТТТОООААТООбТС АСССТАССОТООСАСССАСАОССТСАССОАОТС6СОТОССТССТОССТСССО ТООААТТССАТОАТССТОАТАООСААООТТТАСАСАОСАСАОААССССАСТО СССАООСАСТОООССТОООСАААСАТААТТАСТОССООААТССТОАТ6ССО АТОССААССССТООТбССАСОТбСТСААОААССОСАООСТСАССТаООАОТ АСТ6Т0АТ0Т0СССТССТ0СТССАССТ0С00ССТСА0АСА0ТАСА0ССА6СС ТСАОТТТСССАТСАААООАаООСТСТТССССОАСАТСОССТСССАССССТОО СА6ССТСССАТСТТТОССААОСАСАООАОСТСОСССООАОАОСООТТССТОТ ОСОаОООСАТАСТСАТСАССТССТОСТССАТТСТСТСТСССОСССАСТОСТТС САООАОАООТТТССОССССАССАССТОАССОТОАТСТТСОССАОААСАТАСС ОСОТООТСССТООССАООАОСАОСАОАААТТТОААОТССАААААТАСАТТО ТССАТААООААТТСОАТОАТОАСАСТТАСОАСААТОАСАТТОСССТОСТОСА ОСТОАААТСООАТТСОТСССОСТОТОСССАООАОАОСАССОТбОТССОСАСТ СТОТСССТТССССССОСООАССТССАОСТОССООАСТСОАССОАаТСТОАОС ТСТСССССТАССОСААОСАТСАСбССТТаТСТССТТТСТАТТСаОАбССбСТ СААССАСССТСАТ0ТСА0АСТ6ТАСССАТССА0СС0СТ0САСАТСАСААСАТ ТТАСТТААСАОААСАОТСАССОАСААСАТОСТОТСТОСТССАОАСАСТСООА СССССОООССССАООСАААСТТОСАСОАСОССТОССАОООСОАТТСОООА6 ССССССТ00ТСТ0ТСТ0ААС0АТ00СС0САТ0АСТТТС0Т060САТСАТСАС СТООСОССТССОСТОТО6АСАОААССАТ0ТССС6ОСТ0ТОТАСАСАААС6Т ТАССААСТАССТА6АСТ0САТТС0Т0АСААСАТ0ССАСС0 (8Е0 ГО N0:2)
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что последова тельность ДНК ОтрА содержит или представляет собой приведенную ниже последовательность или ее функционально активный вариант или вариант, полученный благодаря вырожденности нуклеотидного кода: АТСАААААСАСАССТАТССССАТТССАСТ СССАСТСССТССТТТСССТАСССТСССССА ССССССС (8ЕО ГО N0:3).
Указанная ДНК кодирует приведенную ниже аминокислотную последовательность ОтрА. Таким образом, ОтрА содержит или представляет собой протеин, который отличается тем, что приведенная ниже аминокислотная последовательность МККТА1А1АУАЬАСЕАТУАЦАА (8ЕЦ ГО NО:21) или ее фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединица, химическое производное или гликозилированный вариант подпадают под объем изобретения.
Нетранслируемая область может содержать регуляторный элемент, такой, например, как инициатор транскрипции (промотор) или энхансер. Промотор может, например, представлять собой конститутивный, индуцибельный или контролируемый стадией развития промотор. Предпочтительно (но не исключая другие известные промоторы) используют конститутивные промоторы человеческого цитомегаловируса (ЦМВ) и вируса саркомы Рауса (РСВ), а также обезьянего вируса 40 (ОВ-40) и промотор вируса герпеса простого. Согласно изобретению индуцибельные промоторы представляют собой промоторы, обеспечивающие устойчивость к антибиотикам, промоторы, индуцируемые тепловым шоком, индуцируемый гормонами «промотор вируса рака молочной железы» и промотор металлотионеина. Предпочтительные промоторы включают промотор фага Т3, промотор фагаТ7, Ьае/ага1 и ИеЮ-1.
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что ДНК, кодирующую ίΡΑ, вариант ίΡΑ, молекулу К28 или вариант К28, помещают под контроль промотора 1ас и/или сайта связывания рибосомы, такого как последовательность Шайна-Дальгарно (см. также пример).
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что ДНК, кодирующую ίΡΑ, вариант ίΡΑ, молекулу К28 или вариант К28, выбирают из группы молекул ДНК, кодирующих по меньшей мере 90% аминокислот 87-527, 174 - 527, 180 - 527 или 220 527 протеина человеческого тканевого активатора плазминогена.
Более предпочтительно способ по изобретению отличается также тем, что последовательность ДНК К28 содержит или представляет собой следующую последовательность:
ТСТбАОООАААСАОТОАСТОСТАСТТТОаОААТбОСТСАСССТАСССТОССА СОСАСАОССТСАССОА6ТСОООТОССТССТОССТСССОТООААТТССАТОАТ ССТОАТАООСААООТТТАСАСАОСАСАСААССССАОТССССАОбСАСТООО ССТ6С0СААЛСА ААТТАСТ6ССООААТССТСАТООООАТОССААОСССТСО ТСССАСОТОСТОААОААССОСАООСТОАСОТСОСАСТАСТОТОАТОТССССТ ССТССТССАССТОСОСССТОАОАСАОТАСАОССАОССТСАСТТТС6САТСАА АООАОООСТСТТСОССОАСАТСОССТСССАССССТООСАООСТОССАТСТТТ ОССААОСАСАООАОСТСОСССООАОАОСООТТССТОТОСОООООСАТАСТС АТСАССТССТОСТООАТТСТСТСТОССОСССАСТОСТТССАОСАОАООТТТСС СССССАССАССТОАСООТОАТСТТООССАОААСАТАССОООТООТСССТООС ОАООАООАОСАаАААТТТОААОТСОАААААТАСАТТОТССАТААОСААТТС 6АТОАТОАСАСТТАССАСААТОАСАТТОСОСТОСТОСАССТСАААТСООАТТ СОТСССОСТОТОСССАООАОАОСАОСОТООТССОСАСТОТОТСССТТССССС ОССООАССТССАОСТОССООАСТООАС6<ЗАСТСТОАОСТСТСССОСТАСОО СААОСАТОАбОССТТОТСТССТТТСТАТТСООАОСООСТОААОСАООСТСАТ ОТСА6АСТСТАСССАТССАОСС6СТОСАСАТСАСААСАТТТАСТТААСАОАА САОТСАСС6АСААСАТОСТОТОТОСТООАОАСАСТСООАОСООССОССССС АООСАААСТТОСАСОАС6ССТОССАОООС6АТТСОООАС6СССССТООТОТ СТСТбААСОАТОаССОСАТСАСТТТООТОООСАТСАТСАССТССООССТбОО СТОТОСАСАСААОСАТОТССССОСТОТСТАСАСАААООТТАССААСТАССТА САСТ6ОАТТСОТСАСААСАТОСОАССОТОА (8ЕЦ Ю N0:4).
Настоящее изобретение относится также к вариантам описанных выше молекул нуклеиновых кислот, полученным благодаря вырожденности нуклеотидного кода, или их фрагментам, к нуклеиновым кислотам, которые гибридизуются с указанными нуклеиновыми кислотами в строгих условиях, к их аллельным и функционально активным вариантам. Изобретение относится также к нуклеиновым кислотам, которые содержат нуклеиновую кислоту К28, слитую с нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу другого протеина.
Строгие условия, как должно быть очевидно специалистам в данной области, представляют собой условия, которые позволяют отбирать нуклеиновые кислоты, гомологичные более чем на 85%, предпочтительно более чем на 90% (8атЬтоок и др., 1989; Мо1еси1аг С1ошид: А ЬаЬота1оту Мапиа1, 2-ое изд., Со1б 8рпид НагЬог ЬаЬогаЮгу Ргекк, Со1б 8рпид НагЬог, Иете Уогк).
Гибридизацию следует осуществлять, например, в смеси: 6х 88С/5х раствор Денхардта/0,1% ДСН (ДСН обозначает додецилсульфат натрия) при 65°С. Степень строгости определяется на стадии отмывки. Так, например, для отбора последовательностей ДНК, гомология которых составляет примерно 85% или более, пригодны следующие условия: 0,2 х 88С/0,01% ДСН/65°С, а для отбора последовательностей ДНК, гомология которых составляет примерно 90% или более, пригодны следующие условия: 0,1х 88С/ 0,01% ДСН/ 65°С. Состав указанных реагентов описан у 8атЬтоок и др. (1989, выше).
Другим важным объектом настоящего изобретения является вариант человеческого тканевого активатора плазминогена, содержащий или представляющий собой протеин: «кренделеобразный» домен 2 (4.) плюс сериновая протеаза (5.) (сокращенно К28) или его вариант или фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединица, химическое производное или их гликозилированные варианты.
Нумерация/название доменов соответствует нумерации/названию, приведенным для протеина, имеющего регистрационный номер Сеи
Ьаик С1 137119, или они описаны в №11иге 301 (5897), 214-221 (1983), причем «кренделеобразный» домен 2 простирается от аминокислоты 176 до 262, а протеазный домен от аминокислоты 276 до 527. Таким образом, согласно изобретению предпочтительная молекула К28 может содержать аминокислоты 176-527, включая аминокислоты между «кренделеобразным» доменом 2 и доменом протеазы (аминокислоты 263 - 275; см. пример, приведенный на чертеже (структура А)). Молекула К28 по изобретению содержит минимальный фрагмент «кренделеобразного» домена 2 и домен протеазы, еще сохраняющий протеазную активность и активность в отношении связывания с фибрином (указанные активности оценивали, например, согласно методам, приведенным в описании/примерах). Молекула К28 по изобретению содержит аминокислоты 8ЕСИ или 8ЕСИ8О на Ν-конце (см. выше).Предпочтительная молекула А не содержит аминокислоты 1-3 или 1-5 молекулы 1РА. Предпочтительно молекула К28 по изобретению содержит аминокислоту Аки в положениях 177 и 184, т.е. для не требуются описанные у \Уа1бепк1гот модификации для улучшения продуктивности согласно способу по изобретению. Таким образом, предпочтительная молекула К28 по изобретению имеет нативную аминокислотную последовательность (без мутации) в отличие от известных из прототипов молекул. Наиболее предпочтительная молекула К28 по изобретению представляет собой молекулу, которая отличается наличием нативной аминокислотной последовательности или ее фрагмента, не содержит ни аминокислот 1-3, ни 1-5 1РА и содержит Ν-концевые аминокислоты 8ЕСN или 8ЕС№И для улучшения продуктивности и/или правильной складчатости молекулы.
Важно, что протеин К28 по изобретению содержит на Ν-конце пептид, имеющий аминокислотную последовательность 8ЕСН что позволяет осуществлять промышленное производство с помощью описанного выше способа секретируемого протеина К28 с правильной складчатостью. Указанные 4 аминокислоты, обозначенные как 8ЕСН могут содержать на Ν-конце еще одну или несколько аминокислот, однако указанные аминокислоты должны быть локализованы в Ν-концевой области, а не в С-концевой области. Более предпочтительно указанные аминокислоты локализованы в Ν-концевой области. Предпочтительно аминокислоты, обозначенные как 8ЕСН могут нести точковую мутацию или могут иметь замены на не встречающуюся в естественных условиях аминокислоты.
Таким образом, еще одним важным объектом изобретения является протеин К28, отличающийся тем, что он содержит аминокислоты, последовательность которых обозначена как 8ЕСН или его вариант или фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединица, химическое производное, слитый протеин или их гликозилированные варианты.
Примеры таких фрагментов, простирающихся от аминокислоты 193 до аминокислоты 527 приведены, например, на фиг. 10 (структура Б-1) и на фиг. 11 (структура Б-2). В структуре Б1 присутствует нативная аминокислота Сук в положении 261, а в структуре Б-2 эта аминокислота заменена 8ег. Другие фрагменты по изобретению, включающие аминокислоты 220-527 (фиг. 14, структура В) или аминокислоты 260527 (фиг. 15, структура Г), можно модифицировать согласно изобретению путем добавления аминокислот 8ΕΟΝ и/или замены Сук-261 на 8ег. Специалист в данной области может определить минимальную длину молекулы К28 по изобретению, необходимую для сохранения ее биологической функции, и получить молекулу К28, обладающую повышенной продуктивностью и/или правильной складчатостью, путем добавления аминокислот 8ΕΟΝ в Ν-концевую область. Таким образом, еще одним предпочтительным вариантом осуществления изобретения является указанная минимальная по размеру молекула К28, несущая 8ΕΟΝ в Ν-концевой области.
Следующим важным объектом изобретения является протеин К28, отличающийся тем, что он содержит аминокислоты, последовательность которых обозначена как 8ΕΟΝ8Ό, или его вариант или фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединицу, химическое производное, слитый протеин или их гликозилированные варианты. Примеры таких фрагментов, простирающихся от аминокислоты 191 до аминокислоты 527 приведены, например, на фиг. 12 (структура Б-3) и на фиг. 13 (структура Б-4). В структуре Б-3 присутствует нативная аминокислота Сук в положении 261, а в структуре Б-4 эта аминокислота заменена 8ег. Другие фрагменты по изобретению, включающие аминокислоты 220-527 (фиг. 14, структура В) или аминокислоты 260-527 (фиг. 15, структура Г), можно модифицировать согласно изобретению путем добавления аминокислот 8ΕΟΝ8Ό и/или замены Сук-261 на 8ег. Специалист в данной области может определить минимальную длину молекулы К28 по изобретению, необходимую для сохранения ее биологической функции, и получить молекулу К28, обладающую повышенной продуктивностью и/или правильной складчатостью, путем добавления аминокислот 8ΕΟΝ8Ό в Ν-концевую область. Таким образом, еще одним предпочтительным вариантом осуществления изобретения является указанная минимальная по размеру молекула К28, несущая 8ΕΟΝ8Ό в Ν-концевой области.
Еще одним предпочтительным вариантом осуществления настоящего изобретения является протеин К28, который содержит протеин, отличающийся наличием следующей аминокислотной последовательности или ее варианта или фрагмента, функционально активного варианта, аллельного варианта, субъединицы, химического производного или гликозилированного варианта:
δΕαΝδϋεΥΡΟΝΟδΑΥΚΟΤΗδΕΤΕδΟΑδΟίΡνΝδΜΙΕΙΟΚνΥΤΑΟΝΡδΑΟΑΕΟΕΟ ΚΗΝΥΟΚΝΡΟΟΟΑΚΡίνΕΗνΕΚΝΚΚΕΤΧνΕΥΟΟνΡδΰδΤΟΟΕΚΟΥδΡΡΟΕΚΙΚΟΟΕ ΡΑΟΙΑδΗΡίνΟΑΑΙΡΑΚΗΚΚδΡΟΕΚΡΕΟΟΟΙΕΙδδείνίΕδΑΑΗΟΡΟΕΚΡΡΡΗΗΕΤνΐ ΕσΚΤΥΚννΡΟΕΕΕ(}ΚΓΕνΕΚΥΐνΗΚ.ΕΓΟΟΟΤΥ0ΝΟΙΑΕΕ(2ΕΚ.8ΟδδΚ.εΑ9Ε88ν νΚΤνΟΕΡΡΑΟΕΟΕΡΟίνΤΕΰΕΕδΟΥΟΚΗΕΑΕδΡΡΥδΕΚΕΚΕΑΗνΚΕΥΡδδΚΟΤδς ΗΕΕΝΚΤνΤΟΝΜΕΟΑΟΟΤΚδΟΟΡρΑΝΕΗΟΑΟρΟΟδσΟΡΕνΟΕΝΟΟΚΜΤΕνΟΙΙδ ΨΟΕΟΟΟρΚΟνΡΟνΥΤΚνΤΝΥΕΟννίΚΟΝΜΚΡ* (8Ε0 ΙϋΝΟ: 11).
В настоящем описании звездочкой (*) обозначен 8ΤΘΡ (т.е. кодируемая стоп-кодоном аминокислота). Пример этой молекулы К28 приведен на фиг. 8.
Одним из вариантов молекулы К28 по изобретению является слитый протеин К28, который слит с молекулой другого протеина.
Следующим предпочтительным вариантом осуществления настоящего изобретения является протеин К28, представляющий собой протеин, который имеет следующую аминокислотную последовательность: δΕσΝ8ϋΟΥΡΟΝ68ΑΥΚΟΤΗ8ΕΤΕ8ΟΑ8ΟΕΡνΝδΜΙΕΙΟΚνΥΤΑ0ΝΡ8Α0ΑΕΟΕΟ ΚΗΝΥΟΚΝΡΟΟΟΑΚΡΧνθΗνΕΚΝΚ.Κ.ΕΤλνΕΥ€θνΡ8€8Τ€ΟΕΚ9Υ8ρΡρΡΚ.ΙΚΟΟΕ РАО1А8НРХ¥0АА1РАКНК.К8РОЕЕРЕСаО1Е188С^1Е8ААНСГ0ЕК.РРРННЕТУ1 ΕΟΚΤΥΚννΡΟΕΕΕρΚΡΕνΕΚΥΐνΗΚΕΡΟΟΡΤΥΟΝΟΙΑΕΕρΕΚδϋδδΚΟΑΟΕδδν УКТУСЕРРАОЕСЕРО^ТЕСЕЕ80УОКНЕАЕ8РРУ8ЕКЕКЕАНУКЕУР88КСТ80 ΗΕΕΝΚΤνΤΟΝΜΕεΑΟΌΤΚ.8ΟΟΡ0ΑΝΕΗΒΑθρθΠ8ΟΟΡΕν0ΕΝΟΟΚ.ΜΤΕνθΙΙ8 ν/ΟΕΟΟΟΟΚΟνΡΟνΥΤΚνΤΝΥΕϋνίΚΟΝΜΚΡ· (8Ε<> Ю ΝΟ: 11).
Указанные молекулы К28 могут кодироваться описанной выше молекулой ДНК.
Еще одним важным объектом изобретения является молекула ДНК, отличающаяся тем, что она кодирует:
а) протеин ОтрА или его функционально активное производное, функционально связанные с
б) молекулой ДНК, которая кодирует полипептид, содержащий «кренделеобразный» домен 2 и домен сериновой протеазы протеина тканевого активатора плазминогена.
Более предпочтительно молекула ДНК по изобретению отличается также тем, что последовательность ДНК содержит или представляет собой приведенную ниже последовательность ДНК, кодирующую ОтрА и К28, или ее функционально активный вариант или вариант, полученный вследствие вырожденности нуклеотидного кода:
АТОЛА АААОАСАОСТАТСОССАТТ6САОТООСАСТ6ССТ06ТТТСОСТАСС6
ТООСССАбОСОСССТСТОАСООАААСАОТОАСТОСТАСТТТОООААТОООТС АОССТАССОТСОСАСССАСАОССТСАССОАОТСОООТОССТССТСССТСССО ТСОААТТССАТОАТССТОАТАОССААООТТТАСАСАССАСАОААССССАОТО СССАООСАСТОООССТОООСАААСАТААТТАСТССССаААТССТОАТаООа АТОССААОСССТООТСССАСОТОСТСААОААССССАООСТ6АСОТОООАОТ АСТОТОАТОТОСССТССТОСТССАССТОСООССТОАОАСАОТАСАОССАОСС ТСАОТТТСССАТСАААООАОООСТСТТСОСССАСАТСаССТСССАССССТСО САООСТОССАТСТТТОССААОСАСАООАООТСОСССОСАОАССС6ТТССТОТ ОСОООООСАТАСТСАТСАОСТССТОСТ6САТТСТСТСТОСС6СССАСТОСТТС САСОАСАООТТТСССССССАССАССТОАСООТОАТСТТОООСАОААСАТАСС ОООТООТСССТООСаАООАОСАОСАОАААТТТСААОТСОАААААТАСАТТО ТССАТААООААТТСОАТОАТОАСАСТТАСОАСААТОАСАТТОСОСТаСТОСА ОСТСАААТСООАТТСОТСССССТОТОСССАСОАОАбСАОСбТОаТССОСАСТ ОТОТОССТТСССССООСООАССТОСАОСТССССОАСТОСАСОСАОТОТОАОС ТСТССООСТАСООСААОСАТОАСОССТТОТСТССТТТСТАТТСООАОССОС ТОААОаАОаСТСАТОТСАОАСТСТАСССАТССАОССОСТОСАСАТСАСААС АТТТАСТТААСАОААСАОТСАССОАСААСАТОСТОТОТОСТООАОАСАСТС ООАОС60ССОСССССАООСАААСТТОСАСОАСОССТОССАООССОАТТСО СбАООСССССТООТОТСТСТСААСбАТбСССССАТОАСТТТООТОООСАТС АТСАССТ0000ССТ000СТ0Т00АСАСАА00АТ0ТССС60СТ0Т0ТАСАС АААОСТТАССААСТАССТАОАСТСОАТТСОТОАСААСАТОССАССО (8Е<2 ГО Νο:2).
Указанная молекула ДНК кодирует следующий слитый протеин ОтрА и К28. Этот слитый протеин ОтрА и К28, отличающийся тем, что он содержит или представляет собой протеин, который имеет приведенную ниже аминокислотную последовательность или его фрагмент, функционально активный вариант, аллельный вариант, субъединицу, химическое производное или их гликозилированные варианты, является важным объектом настоящего изобретения:
ΜΚΚΤΑΙΑΙΑνΑΕΑΟΡΑΤνΑ9ΑΑ8ΕΟΝ8θεΥΕΟΝ68ΑΥΚΟΤΗ8ΕΤΕ8ΟΑ80ΕΡ\ν Ν8ΜΙΕ16Κ V ΥΤΛ(3ΝΡ8Λ9ΛΕ6ΕΓίΚΗΝΥ<_ΊίΝΡΕ6Γ.)ΑΚΡν.ΌΙ νΕΚΝΕΡΕΤν/ΕΥΕ О\’Р8С8ТС<И.Р9У'89Р9ЕК1К(ЗОЕЕАЕ>1А8НР\У9АА1ЕАКНЕИ8РСЕКЕ1.ССт<НЕ1 ΕΕΕ'ΛΊΕΕΛΛΕίΕΡρΕ.ΚΕΡΡΙΙΕίΙ.ΤνΠ,ΰΚΤΥΚννρΟΕΕΕΟΚΕΕνΕ,Κ ΥΐνΗΚΕΡΓ)Γ>Γ)Τ ΥΕ)Ε-'[) ЕЛ Е Ι.Ο1.Κ М)88 (<СЛ<,1Е88 V V ЕТ ΥΕΕΡΡΛ Ш/,1 !.Р1> У/ТЕСЕЕ8< т ΥΟΚ ί I ЕЛ 1.8 ΡΡΥ8ΕΚΕΚΕΑΗνΚΕΥΡ88Κ(:Τ8<2ΗΕΕΝΚΤνΤΟΝΜΕΕΑ60ΤΚ86αΡ<2ΑΝΕΗΒΑΟ (ΑΠ>8Γ,<,ΡΕνΕΕΝΐκ,ΚΜΤΓΛ4ΗΙ8ν/<ΗΧ;Ε<Χ.>ΚΓ™<τνΥΤΚνΤΝΥΕΓ>\νίΚΟΝΜΚ ΡΟ(8ΕΟΙΟΝΟ:8)
Следующим предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе б) последовательность ДНК кодирует по меньшей мере 90% аминокислот 87-527 протеина человеческого тканевого активатора плазминогена (в настоящем описании использована нумерация, предложенная для С1 137119 или описанная в ХаИие 301 (5897), 214-221 (1983)).
Еще одним предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе б) последовательность ДНК кодирует по меньшей мере 90% аминокислот 174-527 протеина человеческого тканевого активатора плазминогена.
Следующим предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе б) последовательность ДНК кодирует по меньшей мере 90% аминокислот 180 - 527 протеина человеческого тканевого активатора плазминогена.
Еще одним предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе б) последовательность ДНК кодирует по меньшей мере 90% аминокислот 220 - 527 протеина человеческого тканевого активатора плазминогена.
Следующим предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе а) последовательность ДНК гибридизуется в строгих условиях со следующей последовательностью:
АТОАААААОАСАОСТАТСОСОАТТОСАОТОаСАСТООСТООТТТСОСТАССО ТООСССАООСООСС (8Е<2 Ю N0:3).
Еще одним предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе а) последовательность ДНК имеет следующую последовательность:
АТОАААААбАСАОСТАТСОСОАТТОСАСТОССАСТОССТСОТТТСОСТАССО ТСОСССАООСООСС (5Е(2 Ю N0:3).
Следующим предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе б) последовательность ДНК гибридизуется в строгих условиях со следующей последовательностью:
ТСТОАОООАААСАОТОАСТОСТАСТТТОООААТОООТСАОССТАССОТООСА СССАСАОССТСАССОАОТСС6СТОССТССТОССТСССОТООААТТССАТ6АТ ССТСАТАООСААООТТТАСАСАОСАСАОААССССАОТОСССАСССАСТССО ССТСОССАААСАТААТТАСТОССОСААТССТОАТС666АТСССААССССТОО ТОССАСОТОСТОАА6ААСС6САООСТОАСОТОООАОТАСТОТОАТОТОСССТ ССТОСТССАССТССООССТОАОАСАОТАСАОССАОССТСА6ТТТСОСАТСАА АССА66ССТСТТС6СССАСАТС0ССТСССАССССТСССА00СТСССАТСТТТ СССААОСАСАООАООТСОСССООАОАОСООТТССТбТССООССОСАТАСТС АТСАССТССТбСТССАТТСТСТСТСССбСССАСТбСТТССАСгСАСАСбТТТСС 0ССССАССАССТ6АС00Т0АТСТТ000СА0ААСАТАСС000Т00ТСССТ00С ОАООАООАОСАОАААТТТОААОТСОАААААТАСАТТОТССАТААООААТТС ОАТОАТОАСАСТТАСОАСААТОАСАТТССОСТОСТОСАОСТОАААТСООАТТ ССТСССССТОТ6СССА6САОА6СА6СОТООТССОСАСТСТОТСССТТССССС ОбСООАССТОСАССТОССООАСТООАСбОАаТОТОАОСТСТССОССТАСОО СААОСАТОАООССТТОТСТССТТТСТАТТСбСгАССОССТОААООАООСТСАТ СТСА6АСТСТАСССАТССА6ССССТОСАСАТСАСААСАТТТАСТТААСАОАА СА6ТСАССОАСААСАТОСТСТОТОСТООАОАСАСТСООАСССССС60СССС АООСАААСТТОСАСОАСОССТОССАОООСОАТТСОООАООСССССТООТСТ аТСТОААСОАТСОССОСАТОАСТТТООТОООСАТСАТСАОСТСОООССТООО СТ6ТС0АСАСААС0АТ0ТССС0С0Т6Т0ТАСАСААА00ТТАССААСТАССТА ОАСТООАТТСОТОАСААСАТОСОАССОТОА (8Е() 10 N0:4).
Следующим предпочтительным объектом изобретения является молекула ДНК по изобретению, отличающаяся тем, что указанная в разделе б) последовательность ДНК имеет следующую последовательность:
ТСТ0А600АААСА0Т0АСТ0СТАСТТТ0С0ААТСС6ТСА0ССТАСС6Т00СА СбСАСАОССТСАСССАОТСббОТСССТССТСССТСССОТООААТТССАТСАТ ССТОАТАСССААСОТТТАСАСАССАСАОААССССАОТОСССАООСАСТООО ССТ000САААСАТААТТАСТ0СС00ААТССТ0АТ0660АТСССАА0СССТ00 ТОССАСОТОСТОААОААССОСАООСТаАСбТОООАОТАСТОТОАТОТОСССТ ССТОСТССАССТОСООССТОАОАСАбТАСАОССАбССТСАОТТТСОСАТСАА АООАОООСТСТТСОССОАСАТСОССТСССАССССТСССАОбСТбССАТСТТТ ОССААОСАСАООАСОТСОСССООАОАОСООТТССТОТОСОООСОСАТАСТС АТСАССТССТОСТООАТТСТСТСТСССОСССАСТбСТТССАСгОАОАСОТТТСС ОССССАССАССТОАСбОТОАТСТТООССАОААСАТАССОООТООТСССТСОС 6А6САООАОСАСАААТТТОААСТС6АААААТАСАТТОТССАТААОСААТТС ОАТОАТОАСАСТТАСОАСААТОАСАТТОСбСТОСТОСАОСТСАААТСббАТТ СОТСССОСТОТОСССАООАОАССАСССТОСТССССАСТОТОТСССТТССССС ООСО6АССТ6СА6СТ6ССООАСТООАСО6А6ТОТОАОСТСТСС6ССТАСОО СААОСАТОАОСССТТОТСТССТТТСТАТТСООАОСООСТОААОбАбОСТСАТ СТСАОАСТОТАСССАТССАОССОСТОСАСАТСАСААСАТТТАСТТААСАСАА 1СА6ТСАССОАСААСАТОСТОТОТССТООА6АСАСТСССАОСООСОООСССС АОССАААСТТОСАСОАСОССТОССАОООСОАТТССООАОбСССССТОаТОТ 6ТСТОААС6АТС6ССССАТ6АСТТТ06ТОООСАТСАТСАОСТООООССТОСО СТСТООАСАОААООАТОТСССОООТОТОТАСАСАААООТТАССААСТАССТА 6АСТСОАТТСОТСАСААСАТОСОАСССТОА (8Ер Ю N0:4).
Еще одним предпочтительным вариантом осуществления изобретения является вектор, содержащий последовательность ДНК по изобретению.
Следующим предпочтительным вариантом осуществления изобретения является вектор по изобретению, где указанная последовательность ДНК находится под контролем промотора 1ас и сайта связывания рибосомы. Приемлемые векторы по изобретению включают (но не ограничиваясь ими) вирусные векторы, такие, например, как вирус коровьей оспы, вирус СемликиФореста (§етйк1-Гоге81) и аденовируса, фагмидные векторы и т.п. Предпочтительными являются векторы, которые целесообразно использовать в Е. сой, а также в другом прокарио тическом хозяине, такие как ρΡΚΌΊεΐ.Ε, ρΡΚΌЬаг.А, представители семейства ρΒΛΌ, семейства ρ8Ε, семейства ρΟΕ и рСАЬ.
Еще одним предпочтительным вариантом осуществления изобретения является вектор ρСοтЬ3Η88, который содержит ДНК по изобретению, где экспрессию протеина §ρ III подавляют или ингибируют путем делении молекулы ДНК, кодирующей протеин §ρ III, или с помощью стоп-кодона, расположенного между геном, который кодирует полипептид, содержащий «кренделеобразный» домен 2 и домен сериновой протеазы протеина тканевого активатора плазминогена, и геном протеина III.
Следующим важным объектом настоящего изобретения является прокариотическая клеткахозяин, содержащая молекулу ДНК по изобретению.
Еще одним важным объектом настоящего изобретения является прокариотическая клеткахозяин, содержащая вектор по изобретению.
Следующим важным объектом настоящего изобретения является клетка-хозяин Е. сой, содержащая молекулу ДНК по изобретению.
Еще одним важным объектом настоящего изобретения является клетка-хозяин Е. сой, содержащая вектор по изобретению.
И еще одним важным объектом настоящего изобретения является применение молекулы ДНК по изобретению или вектора по изобретению или клетки-хозяина по изобретению согласно методу получения полипептида, обладающего активностью тканевого активатора плазминогена.
И еще одним важным объектом настоящего изобретения является применение по изобретению, как описано выше, где указанный способ представляет собой способ по изобретению.
Еще одним очень важным объектом является фармацевтическая композиция, содержащая субстанцию, получаемую с помощью способа по изобретению, и фармацевтически приемлемые эксципиенты и носители. Примером такой субстанции является описанная выше молекула К28. Понятие «фармацевтически приемлемый носитель» в контексте настоящего описания относится к общепринятым фармацевтическим эксципиентам или добавкам, применяемым в области приготовления фармацевтических препаратов. Такие физиологически приемлемые соединения включают, например, углеводы, такие как глюкоза, сахароза или декстраны, антиоксиданты, такие как аскорбиновая кислота или глутатион, хелатирующие агенты, низкомолекулярные протеины или другие стабилизаторы или эксципиенты (см., например, также Кештдои'к РйагтасеиИса1 8сюпсск (1990, 18-ое изд., изд-во Маск РиЫ., Еак1оп.)). Указанную фармацевтическую композицию по изобретению целесообразно вводить внутривенно в виде болюса, например, в виде однократного быстрого внутривенного введения больших объемов жидкости в течение 5-10 с.
Изобретение относится также к применению субстанций, получаемых способом по изобретению, для приготовления лекарственного средства, предназначенного для лечения «удара», инфаркта сердца, острого инфаркта миокарда, легочной эмболии, любой артериальной окклюзии, такой как окклюзия коронарной артерии, окклюзия внутричерепной артерии (например, артерий головного мозга), окклюзия периферических артерий, глубокий тромбоз вен, или родственных заболеваний, связанных с нежелательным коагулированием крови.
Ниже изобретение проиллюстрировано на примерах, не ограничивающих его объем.
Пример 1. Материалы и методы.
Конструирование праймеров. Для амплификации определенного фрагмента гена ίΡΛ синтезировали пару праймеров 8К2/174 [5
ОАОСАООАООТОаСССАОаССОССТСТОАООСАААСАСТОАС 3' ] (ЯЕО ЮИО:22) и А88Р [5'САСОАООАОСТСОСС06ССТООСССООТСОСАТСТТОТСАСО 3'1 (8Е<2 Ю ΝΟ: 23) (фирма ЫГе Тес11по1ощек. Гранд Айленд, штат Нью-Йорк). Эти праймеры конструировали на основе гена человеческого ίΡΛ, полученного из базы данных 30 NСΒI (§137119). Их синтезировали с помощью концевых сайтов клонирования 8Г11 (подчеркнуты) таким образом, чтобы рамка считывания, начинающаяся с кодона АТС гена ^Ш, сохранялась в последовательности, встроенной в фагмидный вектор ρСотЬ3Η88.
Конструировали другой набор праймеров для сайтнаправленного мутагеназа, предназначенный для «отжига» последовательности, расположенной между геном К28 и геном III в ρСотЬ3Η-К28. Последовательности праймеров с замененными в результате мутации основаниями (подчеркнуты) с целью получения нового стоп-кодона представляют собой Μ8ΤΡΑ [5' АСАТОСОАССОТОАСАООССООССАО 3’] <8Е<) ГО ΝΟ: 24) и МА8ТРА [5’ СТООССССССТОТСАСОСТСССАТСТ 3'] <8Е() ГО N0:25),
Амплификация гена К28 с помощью ПЦР. 1 мкг праймеров 8К2/174 и Α88Ρ вместе с 50 нг матрицы р51-3 (полученной от Др. НпокЫ 8акак1, фирма Еицката Ρйа^тасеиί^са1, Япония) суспендировали в 100 мкл смеси для ПЦР. Затем к раствору добавляли 2,5 ед. полимеразы Тас.| (фирма Косйе Мо1еси1аг Вюсйеткак, Индианаполис, штат Индиана). Осуществление амплификации в заданных условиях инициировали резким началом при 85°С в течение 4 мин, с последующей денатурацией при 95°С в течение 50 с, отжигом при 42°С в течение 50 с, удлинением при 72°С в течение 1,5 мин. Реакцию осуществляли с использованием 35 повторяющихся циклов. Смесь дополнительно инкубировали при 72°С в течение 10 мин. Амлифицированный продукт длиной 1110 пар оснований затем очищали с помощью набора р^цшск ΡίΤ Ρи^^Гϊсаί^оη (фирма 0!ΑΟΕΝ, Гильден,
Германия). Правильность очищенного продукта подтверждали с помощью рестриктаз.
Конструкция для экспрессии К2З в фагмидном векторе. Очищенный ПЦР-продукт К2З и фагмидный вектор рСотЬ3НЗЗ (любезно предоставленный Др. Сат1о8 Р. ВагЬак, Зспррк 1п5Йи(е, США) расщепляли с помощью ЗР11 (фирма Воске Мо1еси1аг Вюскеткак,
Индианаполис, штат Индиана), получая специфические «липкие» сайты клонирования. 4 мкг очищенного ПЦР-продукта расщепляли с помощью 60 ед. Зй1 при 50°С в течение 18 ч. Для расщепления рСотЬ3НЗЗ 20 мкг фагмидных векторов обрабатывали 100 ед. ЗР11. Затем расщепленные продукты очищенного ПЦРпродукта К2З и рСотЬ3НЗЗ (-3300 пар оснований), очищали на геле с помощью набора ΟΙΑс.|шск Се1 Ех1гас1юп (фирма 0ΙΑΟΕΝ, Гильден, Германия). В смесь, содержащую 0,7 мкг очищенного расщепленного с помощью Зй1 рСотЬЗНЗЗ и 0,9 мкг очищенного, расщепленного с помощью ЗШ ПЦР-продукта, интродуцировали 5 ед. лигазы фага Т4 (фирма Воске Мо1еси1аг Вюскеткак, Индианаполис, штат Индиана). Реакционную смесь для лигирования инкубировали при 30°С в течение 18 ч. Вновь сконструированный фагмидный вектор обозначили как рСотЬЗН-К2З.
Трансформация штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие. 200 мкл СаСЧз-компетентного штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие (фирма З1та1адепе, Ла Джолла, штат Калифорния) трансформировали с использованием 70 нг лигированного или мутантного продукта. Трансформированные клетки размножали, распределяя на ЬВ-агаре, содержащем 100 мкг/мл ампициллина и 10 мкг/мл тетрациклина (фирма Зщта. Сент Луис, штат Миссури). После культивирования при 37°С в течение 18 ч отбирали с использованием метода щелочного лизиса несколько устойчивых к антибиотикам колоний для получения минипрепаратов плазмид. Каждую очищенную плазмиду подвергали анализу в отношении сайтов рестрикции Зй1. Затем несущую трансформант плазмиду с правильным(ими) сайтом(ами) рестрикции Зй1 размножали в течение 18 ч при 37°С в 100 мл ЬВбульона, дополненного ампициллином (100 мкг/мл) и тетрациклином (10 мкг/мл).
Максипрепараты плазмид получали с помощью набора ^IΑСΕN Р1а§т1б Мах1 (фирма О1АСЕП Гильден, Германия). Очищенную плазмиду повторно оценивали в отношении специфичных сайтов рестрикции с помощью Зй1 и секвенировали с использованием набора Атр1|Тас.| ΌΝΑ Ро1утета§е Тетт1па1от Сус1е Зесщепстд (фирма Тке Реткт-Е1тет Сотротайоп, Форстер Сити, штат Калифорния).
Сайтнаправленный мутагенез рСотЬ3НК2З. 10 нг матрицы рСотЬ3Н-К2З смешивали с 125 нг праймеров МЗТРА и МАЗТРА. К смеси добавляли 2,5 ед. ДНК-полимеразы РкиТитЬо (фирма З1та1адепе, Ла Джолла, штат Калифорния) для осуществления циклической амплификации. Реакцию начинали с одного цикла при 95°С в течение 30 с. Затем осуществляли 16 циклов, включающих: 95°С в течение 30 с, 55°С в течение 1 мин и 68°С в течение 9 мин. Затем реакционную пробирку помещали на лед на 2 мин. Для расщепления цепей матрицы в реакционную смесь для амплификации добавляли 10 ед. рестриктазы Ирп1 (фирма З1та1адепе, Ла Джолла, штат Калифорния) и инкубировали в течение 1 ч при 37°С. Этот синтезированный продукт (МрСотЬ3Н-К2З) затем применяли для трансформации штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие.
Получение выявляемой с помощью фага рекомбинантной молекулы К2З. После трансформации штамма ХЬ-1 В1ие с помощью рСотЬ3Н-К2З использовали методику выявления с помощью фага. Клон рСотЬ3Н-К2З, которым трансформировали штамм Е. сой ХЬ-1 В1ие, размножали в 10 мл супер-бульона, содержащего ампициллин (100 мкг/мл) и тетрациклин (10 мкг/мл), при 37 С до достижения оптической плотности (ОП) [при 600 нм], равной 1,5. Затем бактериальную культуру размножали в 100 мл такой же среды и культивировали в течение 2 ч. Для заражения трансформированного штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие использовали 10 БОЕ (бляшкообразующих единиц) фага- хелпера УСЗМ13 (фирма З1та1адепе, Ла Джолла, штат Калифорния). После инкубации в течение 3 ч в культуру добавляли канамицин в конечной концентрации 70 мкг/мл. Культуру выдерживали при встряхивании (200 об/мин) в течение 18ч при 37°С. Затем собирали бактериофаги, несущие К2З на др3 (К2З-(|)), добавляя 4% (мас./об.) ПЭГ с молекулярной массой 8000 (фирма Зщша, Сент Луис, штат Миссури) и 3% (мас./об.) №С1. И, наконец, собранный фаг ресуспендировали в 2 мл ЗФР, рН 7,4. Количество фага определяли, заражая штамм Е. сой ХЬ-1 В1ие. Количество колониеобразующих единиц на один миллилитр (КОЕ/мл) расчитывали согласно описанному ранее методу (21).
Экспрессия полученной рекомбинантным путем молекулы К2З во встряхиваемых колбах. Трансформированный МрСотЬ3Н-К2З штамм Е. сок ХЬ-1 В1ие культивировали в 100 мл «супер»-бульона (3% (мас./об.) триптон, 2% (мас./об.) дрожжевой экстракт, 1% (мас./об.) МОРЗ [3 -(№морфолино)пропансульфоновая кислота]) при рН 7,0 в присутствии ампициллина (100 мкг/мл) при 37 С до достижения ОП [600 нм], равной 0,8.
Затем синтез протеина индуцировали с помощью 1мМ ИПТГ (фирма Рго те да, Мэдисон, штат Висконсин). Затем бактерии культивировали при встряхивании (200 об/мин) в течение 6 ч при 30°С. Супернатант культуры собирали и осаждали 55%-ным насыщенным раствором сульфата аммония (32). Осадок восстанав ливали с помощью ЗФР, рН 7,2 и подвергали диализу в противотоке такого же буферного раствора при 4°С в течение 18 ч. Периплазматические протеины из бактериальных клеток экстрагировали, используя хлороформный шок согласно описанному ранее методу (А тек и др.) (2).
Количественный иммуноанализ полученной рекомбинантным путем молекулы К28.
Для обнаружения г-К28 твердую фазу сенсибилизировали моноклональным антителом к «кренделеобразному» домену 2 (16/В) (любезно предоставленным Др. И1е Ζ;·ιο1ι;·ιπ;·ΐ5. Сеи1га1 1пкШШе о£ Мо1еси1аг Вю1оду, Берлин-Бух, Германия). Осуществляли отмывку и блокирование согласно стандартному методу ЕБ18А. В каждую лунку, сенсибилизированную антителом к «кренделеобразному» домену 2, добавляли по 50 мкл 10 КОЕ/мл К28-ф или секреторного гК28. Оценку комплекса антиген-антитело осуществляли согласно описанному ниже процессу. В каждую реакционную лунку после стадии отмывки добавляли либо овечье антитело к М13, конъюгированное с пероксидазой из хрена (НКР) (фирма Рйагшас1а Вю1ес11. Уппсала.Швеция), или овечье антитело к (РА, конъюгированное с НКР (фирма Себаг1апе, Онтарио, Канада). В каждую лунку вносили субстрат ТМБ (тетраметилбензидин) и, наконец, после инкубации в течение 30 мин реакцию прекращали, добавляя раствор Н24. В качестве позитивного контроля использовали стандартный полученный из меланомы 1РА 86/670 (Ыайопа1 1п5111и(е £ог Вю1ощса1 81аибагбк и Соп1го1, Хертфордшин, Великобритания).
Анализ амидолитической активности.
Для оценки амидолитической активности (РА использовали набор, поставляемый фирмой Сйготодешх (Молндал, Швеция). Для определения ферментативной активности сериновой протеазы в качестве субстрата использовали смесь, содержащую плазминоген и 8-2251. Активность каждого осажденного аммонием и разбавленного в 100 раз образца оценивали с добавлением в качестве стимулятора фрагментов человеческого фибриногена или без стимулятора. Анализ выполняли согласно руководству СОА8ЕТ 1-РА.
ДСН-ПААГ и иммуноблоттинг. Подвергнутый диализу осажденный из супернатанта культуры продукт дополнительно концентрировали в 10 раз с помощью центрикона 10 (фирма АМ1СОИ, Беверли, штат Миннесота). Протеины сконцентрированного образца разделяли с помощью ДСН-ПААГ, используя 15%-ный фильтрующий гель в восстанавливающем буфере, с последующим электроблоттингом на нитроцеллюлозу. Затем нитроцелюлозу блокировали с помощью 4%-ного снятого молока в течение 2 ч. Для обнаружения г-К28 нитроцеллюлозу обрабатывали соответствующим образом разведенным овечьим антителом к (РА, конъюгиро ванным с НКР. Иммунореактивную полосу визуализировали с помощью чувствительной системы обнаружения, набора АшрйПеб Орй-4СК (фирма ВЮКАЭ, Геркулес, штат Калифорния).
Электрофорез в сополимеризированном с плазминогеном полиакриламидном геле. 11%ный фильтрующий полиакриламидный гель подвергали сополимеризации с плазминогеном и желатином согласно описанному ранее методу (Неиккеп и др.) (14). 4%-ный концентрирующий гель готовили без плазминогена и желатина. Электрофорез осуществляли при 4 С при постоянной силе тока 8 мА. Оставшийся в полосе геля ДСН удаляли послеосторожного встряхивания при комнатной температуре в течение 1 ч в 2,5%-ном Тгйоп Х-100. Затем полосу геля инкубировали в 0,1М глицине-ЫаОН, рН 8,3 в течение 5 ч при 37°С. И, наконец, полосу геля окрашивали и обесцвечивали с помощью стандартной системы для окраски гелей на основе кумасси бриллиантового голубого (К-250). Область, в которой была локализована присущая пептиду ферментативная активность, не окрашивалась красителем в противоположность окрашенному в голубой цвет фону.
Результаты
Конструирование вектора, несущего ген К28. Из вектора р51-3 амплифицировали «кренделеобразный» домен 2 плюс домен сериновой протеазы (РА (от 8ег174 в «кренделеобразном» домене 2 до Рго527 в сериновой протеазе) с помощью праймеров 8К.2/174 и А88Р. Полученный в результате амплификации продукт длиной 1110 пар оснований выявляли с помощью электрофореза в агарозном геле (фиг. 1, полоса 2) и встраивали в фагмидный вектор рСошЬ3Н88 с использованием двух сайтов расщепления 8ίΐ1 на 5'- и 3'-концах в правильной рамке считывания. Таким образом получали новый вектор рСотЬ3Н-К28, несущий К28. В этом векторе ген К28 фланкирован против хода транскрипции сигнальной последовательностью ОтрА и по ходу транскрипции - геном др3. Правильность вставки К28 подтверждали рестрикционным анализом с использованием 8ίΐ1 (фиг. 2, полоса 3), ПЦР-анализом (продемонстрировано наличие одной полосы, соответствующей 1110 парам оснований) и секвенированием ДНК. Схематичная диаграмма карты рСотЬ3Н-К28 приведена на фиг. 3.
Выявляемая с помощью фага молекула г-К28. Для заражения трансформированного рСотЬ3Н-К28 штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие, Х[К28] использовали нитчатый фаг УС8М13. УС8М13 размножали и встраивали в него слитый протеин К28-др3 во время процесса упаковки вируса. Собранный рекомбинантный фаг (К28-ф) имел концентрацию 5,4 х 10 КОЕ/мл, которую определяли путем повторного заражения штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие осажденным с помощью ПЭГ фагами. В этих рекомбинантных фаговых частицах с помощью сэндвич- ЕЫ8А подтверждали наличие экспрессии г-К28. Связанный с фагом гетерологичный протеин К28 выявляли с помощью моноклонального антитела к «кренделеобразному» домену 2 (16/В), используя в качестве системы для обнаружения овечье антитело к 1РЛ, конъюгированное с НИР. В этом анализе коэффициент абсорбции составил 1,12 ± 0,03 (табл. 1). Количество К28, обнаруженного на 10 в 12 степени фаговых частицах, соответствовало 336 нг протеина в пересчете на стандартный полученный из меланомы 1РЛ. Для подтверждения того, что слитый протеин К28-др3 связан с фаговыми частицами, овечье антитело к 1РЛ. конъюгированное с НИР, заменяли овечьим антителом к М13, конъюгированным с НИР. Для этой иммуннологической реакции коэффициент абсорбции составлял 1,89 ± 0,07 (табл. 1). В отличие от этого, если иммобилизованное антитело представляло собой овечье антитело к М13, то был выявлен очень низкий уровень К28 при использовании овечьего антитела к 1РЛ, коъюгированного с НИР; коэффициент абсорбции составлял только 0,17 ± 0,01 (таблица 1). Этот позволяет предположить наличие лишь небольшого количества очищенных фаговых частиц, несущих слитый протеин К28др3. В качестве негативного контроля использовали УС8М13, полученный из нетрансформированного штамма ХЬ-1 В1ие.
Конструкция МрСошЬ3Н-К28. Стоп-кодон помещали между К28 и др3 в рСошЬ3Н-К28 с помощью мутагенных праймеров (М8ТРЛ и МЛ8ТРЛ) (фиг. 4). Для повышения количества вновь синтезированного и мутантного МрСошЬ3Н-К28, смесь для циклической амплификации преднамеренно расщепляли с помощью Эрп1 с целью расщепления старой батметилированной матрицы рСошЬ3Н-К28 (Эрп1 обладает специфичностью в отношении батметилированной ДНК). После трансформации штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие с помощью МрСотЬ3Н-К28 для дальнейших исследований был выбран трансформант ХМ[К28]. В результате замены пар оснований один из сайтов расщепления 8ίϊ1, прилегающий к 3'-концу гена К28, был удален после сайтнаправленного мутагенеза. Была выявлена линейная версия длиной 4319 пар оснований расщепленного с помощью 81Ϊ1 МрСотЬ3Н-К28, в которой не обнаружен встроенный фрагмент гена К28 (фиг. 5, полоса 3). Таким образом, ген К28, кодируемый МрСотЬ3Н-К28, экспрессировался в ХМ[К28] в не слитой с др3 форме.
Экспрессия и очистка К28. Экспрессию К28 в ХМ[К28]индуцировали с помощью ИПТГ. С помощью ЕЫ8Л г-К28 был выявлен как в периплазматическом пространстве, так и в супернатанте культуры. Количество гетерологичного протеина определяли в каждом препарате с помощью сэндвич-ЕЫ8Л и сопоставляли со стандартным 1РЛ. Из 100 мл бактериальной культуры во встряхиваемых колбах при ОП [600 нм], равном 50, в периплазматической фракции обнаружено 1,38 мкг г-К28 (примерно 32%), в то время как в осажденном аммонием супернатанте культуры обнаружено 2,96 мкг г-К28 (примерно 68%). Метод сэндвич-ЕЫ8Л применяли для оценки осажденного ПЭГ фага из зараженного УС8М13 ХМ[К28]. Никакого г-К28, иммобилизованного с помощью моноклонального антитела к «кренделеобразному» домену 2, не было обнаружено при выявлении с помощью антитела к М13, конъюгированного с НИР, эти результаты свидетельствуют о том, что К28 не присутствовал на фаговых частицах, в том случае, если отсутствовал др3.
Оценка амидолитической активности. Если в образце присутствует домен сериновой протеазы, то плазминоген превращается в плазмин. Полученный плазмин далее расщепляет субстрат 8-2251 с образованием окрашенного продукта, пара-нитроанилина, который имеет максимум абсорбции при 405 нм. Удельная активность рекомбинантного продукта кореллирует с коэффициентом абсорбции. Оценивали и сравнивали зависящую от фибриногена ферментативную активность каждого образца, т.е. К28-ф, периплазматического г-К28 или выделенного из супернатанта культуры г-К28. Для обоих таких образцов, как К28-ф и перипоазматический гК28, выявлен очень низкий уровень ферментативной активности, который оказался ниже уровня чувствительности метода (0,25 ед./мл). Выделенный из супернатанта культуры г-К28 обладал зависящей от фибриногена ферментативной активностью, составляющей 7 ед./мл. Таким образом, из 100 мл культуры получали всего 700 ед. ферментативной активности. Без фибриногена никакой ферментативной активности г-К28, очищенного из супернатанта культуры, не было обнаружено, в то время как стандартный полученный из меланомы 1РЛ обладал некоторой активностью.
Демонстрация наличия рекомбинантного протеина с помощью иммуноблоттинга. С использованием овечьих антител к 1РЛ установлено, что молекулярная масса частично очищенного К28, полученного из супернатанта ХМ[К28], составляет 39 кДа (фиг. 6). Негативный контроль, т. е. частично очищенный супернатант культуры не трансформированного штамма ХЬ 1-В1ие, не имел никакой реактивной полосы, соответствующей указанному размеру.
Локализация активного фермента с помощью ПААГ. Плазминоген подвергали сополимеризации и иммобилизовали с помощью желатина в полиакриламидном геле до осуществления электрофореза. Анализировали осажденные аммонием супернатанты культур штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие, штамма Е. сой ХЬ-1 В1ие, трансформированного рСотЬ3Н88 и ХМ[К28] (фиг. 7). Все образцы разгоняли в невосстанавливающих условиях для сохранения правильной конформации и активности домена сериновой протеа зы. Прозрачные области, полученные в результате расщепления плазминогена сериновой протеазой, были обнаружены только в осажденных аммонием супернатантах культуры ХМ[К28] в положениях, соответствующих 34 и 37 кДа. При использовании других образцов не выявлено очищенных зон. На соответствующей позитивному контролю полосе стандартного полученного из меланомы !РА также продемонстрирована ферментативная активность в положениях, соответствующих 66 и 72 кДа.
Ссылки
1. Айей 8., Н. Υ. Νιίηι и N. 1. Ви11е1б. 1995. 1и1гасе11и1аг Го1бтд οί йккие-1уре р1акттодеп ас!1уа!ог. ЕГГес!к οί б1ки1йбе Ьопб Гогтайоп οη Ν1ткеб д1усоку1айоп и кесгейоп. 1. Βίο1. Сйет. 270:4797-4804.
2. Атек С. Р., С. Ргобу и 8. Кик!и. 1984. 81тр1е, гарИ, и диапЫайуе ге1еаке οί репр1акт1с ргсЛетк Ьу сЫогоГогт. 1. Вас!епо1. 160:11811183.
3. 8.ВагЬак С. Р. 111, А. 8. Капд, В. А. Ьетег и 8. 1. Вепкоую. 1991. АккетЬ1у οί сотЬта!опа1 апйЬобу йЬгапек оп рйаде кигГасек: !йе депе III кйе. Ргос. №11. Асаб. 8ск и. 8. А. 88:7978-7982.
4. ВагЬак С. Р. 111 и I. Щ ад пег. 1995. 8уп!йейс йитап апйЬоб1ек: ке1есйпд апб еуоМпд Гипсйопа1 рго!етк. А Сотрапюп 1о Ме!йобк ш Епхуто1оду 8: 94-103.
5. Веппей Щ. Р., Ν. Р. Раош, В. А. Кеу!, Ό. Во!к!ет, А. I. 1опек, Ь. Ргек!а, Р. М. Щигт и М. I. Ζο1Βγ. 1991. Н1дй геко1ийоп апа1ук1к οί Гипсйопа1 бе!егттап!к оп йитап йккие-1уре р1акттодеп асйуа!ог. I. Вю1. СЬет. 266:5191-5201.
6. Вейоп I. М., Ν. 8аккооп, М. НоГпипд, и М. Ьаигеп!. 1998. Оедгабайоп уегкик аддгедайоп οί т1кГо1беб таИоке-Ьтбшд рго!ет ш !йе репр1акт οί ЕксйепсЫа сой. I. Вю1. СЬет. 273:8897-8902.
7. Сатю1о 8. М., 8. Тйогкеп и Т. Акйир. 1971. Р1Ьгтодепо1ук1к апб йЬппо1ук1к тейй йккие р1акттодеп асйуа!ог, игоктаке, к!гер!октакеасйуа!еб йитап д1оЬийп апб р1актт. Ргос. 8ос. Ехр. Вю1. Меб. 38:277-280.
8. СагтйдЫ Т., 1992. Ргобисйоп οί !-РА йот атта1 се11 сийиге, с. 217-245. В В. Е. 8р1ег и I. В. СпГГййк (ред.). Ашта1 Се11 Вю!есйпо1оду, том 5. Асабетю Ргекк, Ν.Υ.
9. Сипу, К. А., А. Щ. Υет, М. В. Эекек 1г., Ν. Т. НаЫепЬиЫег, I. С. Ноодегйе1бе и С. 8. Тотюй 1990. ЕксйепсЫа сой ехргеккюп апб ргосеккшд οί йитап т!ег1еикт-1 Ье!а Гикеб 1о к1дпа1 рерйбек. ПХ'А Се11 Вю1. 9:167-175.
10. Эа1аг В. V., Т. СагйгпдЫ и С.-С. Вокеп. 1993. Ргосекк есопописк οί ашта1 се11 апб Ьас!епа1 Гегтеп!айопк: а саке к!ибу апа1ук1к οί йккие р1акттодеп асйуа!ог. Вю!есйпо1оду 11:349-357.
11. ОепеПе Р., 8. Коуапк, Т. Сюга, Ν. Соккек!, I. С. ВеЫсйои, М. Ьайа, Р. СтпеЕ А. Ву!ег и I. Р. Мауаих. 1989. Не!его1одоик рго!ет ехрой т ЕксйепсЫа сой: тГЫепсе οί Ьас1епа1 кгдпа1 рерйбек оп !йе ехрой οί йитап т!ег1еикт 1 Ье!а. Сепе 85:499-510.
12. СпГГййк I. В., А. Е1ес1пс\\Ыа. 1987. Ргобисйоп οί йккие р1акттодеп асйуа!огк йот ашта1 се11к. Абу. Вюсйет. Епд. Вю1есйпо1. 34:147166.
13. Натк Т. I., Т. Ра!е1, Р. А. Магк!оп, 8. Ьййе, I. 8. Ет!аде, С. Орбепаккег, С. ^1скаей, Щ. ВотЬаЫк, А. Вййаи и Р. Эе 8отег. 1986. С1ошпд οί с^NА собтд Гог йитап Иккиейуре р1акттодеп асйуа!ог апб йк экспрессия т ЕксйепсЫа сой. Мо1. Вю1. Меб. 3:279-292.
14. Неиккеп С., и Е. В. Оо\\б1е. 1980. Е1ес!горйогейс апа1ук1к οί р1акттодеп асйуа!огк т ро1уасгу1ат1бе де1к соп!аштд кобшт бобесу1 ки1Га!е апб соро1утепхеб киЬк1га!ек. Апа1. Вюсйет. 102:196-202.
15. Неиккеп С., Р. 1оиЬей и Е. В. Оо\\б1е. 1984. Ршзйсайоп οί йитап йккие р1акттодеп асйуа!ог тейй Егу!йппа йуркт шЫЬйог. I. Вю1. Сйет. 259:11635-11638.
16. Ни С. К., и. Койпей, О. Щ11йе1т, 8. Р1ксйег и М. Ьйпак. 1994. Т1ккие-1уре р1акттодеп асйуа!ог ботат-бе1е!юп ти!ап! ВМ 06.022: тоби1аг к!аЫ1йу, тЫЬйог Ьтбтд, апб асйуайоп с1еауаде. Вюсйет1к!гу 33:11760-11766.
17. К1рпуапоу 8. М., С. Мо1бепйаиег и М. Ьййе. 1997. Н1дй 1еуе1 ргобисйоп οί ко1иЬ1е ктд1е сйат апйЬобгек т кта11-кса1е ЕксйепсЫа сой сийигек. I. 1ттипо1. Ме!йобк 200:69-77.
18. Ко I. Н., Ό. К. Рагк, I. С. Кип, 8. Н. Ьее и 8. М. Вуип. 1995. Н1дй-1еуе1 ехргеккюп апб кесгейоп οί к!гер!октаке т ЕхсйепсЫа сой. Вю!есйпо1. Ьей. 17:1019-1024.
19. Копхпта Υ., Ν. Υатакак^ и М. К1тига. 1997. Тйе йккие-1уре р1акттодеп асйуа!ог тЫЬйог ЕТЕ1 Ггот Егу!йппа уапеда!а: к1гис!ига1 Ьак1к Гог !йе 1пЫЬйогу асйуйу Ьу с1оЫпд, ехргеккюп апб тЫадепещк оГ !йе с^NА епсобтд ЕТЫ. I. Вюсйет. (Токуо) 121:456-463.
20. Ьак!егк I., Ν . Vаη Негхее1е, Н. В. Ьупеп, Ό. Со11еп и Ь. 1екрегк. 1997. Епхутабс ргорегйек оГ рйаде-б1кр1ауеб ГгадтеШк оГ йитап р1акттодеп. Еиг. ЕВюсйет. 244:946-952.
21. ЬоЬе1 Ь. I., Р. Ваиксй, I. Тгакй!, 8. Ро11ак и I. Щ. Ьик!Ьабег. 1997. РПатеШоик рйаде бгкр1аутд !йе ех!гасе11и1аг ботат оГ !йе йЬН/СС гесер!ог Ыпб йСС кресйгсайу. Епбосппо1оду. 138:1232-1239.
22. ЬцЫпкскг А., В. Ага!йооп, С. Ро1ак1гг I. Тйотак, М. ЩгеЬе, В. СагЫск, А. 1опек, В. уап Ве1к и 8. Вийбег. 8е1ес!еб к1га1ед1ек Гог тапиГас!ше апб соп!го1 оГ гесотЫпап! йккие р1акттодеп асйуа!ог ргерагеб Ггот се11 сийиге, с. 442-451. В В. Е. 8ркг, I. В. СпГГййк, I. 8!ерйеппе и Р. I. Сгооу (ред.). Абуапсек т аЫта1 се11 Ью1оду апб !есйпо1оду Гог Ьюргосеккек. Вийегооййк, Ьопбоп.
23. Ьисю М. В., В. Е. РогЬек, 8. Е. Сгокуепог, I. М. Сагг, I. С. Ща11асе и С. РогкЬегд. 1998. 8есгейоп т ЕксйепсЫа сой апб рйаде-б1кр1ау оГ гесотЫпап! ткийп-йке дгоМй Гас!ог Ьтбтд ргокт-2. I. Вю!есйпо1. 61:95-108.
24. Матбп и., 8. Рйсйет, и. Койпей, Н. Ы11, В. Вибо1рй, 6. 8ропег, А. 8!егп и К. 8беш. 1990. Рторетбек оГ а поуе1 рИктшодеп асбуа!от (ВМ 06.022) ргобисеб ш ЕксйейсЫа сой. Ζ. Катбю1. 79:167-170.
25. ОЬико\\'1сх М. 6., М. Е. 6ик!аГкоп, К. Ό. Ыпдет, В. М. йеппдгиЬег. А. 1. ЭДЫ^ет, Т. С. ЭДип, Т. 6. ЭДаггеп, В. Р. Вййор, К. 1. МаГй1к, Ό. Т. МсРйегкоп, N. В., 81еде1, М. 6. 1епЫпд, В. В. ВпдЫге11, 1. А. ЭГах-СШет, Ь. Ό. Ве11, С. 8. Сга1к и ЭД. С. Тасоп. 1990. 8естебоп оГ асбуе кппд1е-2кеппе рго!еаке ш ЕксйейсЫа сой. Вюсйешййу 29:9737-9745.
26. Рагт1еу,8. Р. и 6. Р. 8шйй. 1988. АпбЬобу-ке1ес!аЬ1е Гйатеп!оик Гб рйаде уесЮгк: аГйпйу ритТбсабоп оГ 1агце1 депек. 6епе 73:305318.
27. РепЫса Ό., ЭД. Е. Но1тек, ЭД. 1. Койг, В. N. Наткшк, 6. А. Уейаг, С. А. ЭДагб, ЭД. Р. Веппей, Е. Уе1уейоп, Р. Н. 8ееЬигд, Н. I. Неупекег, Ό. V. 6оеббе1 и Ό. Со11еп. 1983. С1ошпд апб ехртеккюп оГ йишап бккие-1уре р1акш1подеп асбуа!от сЭЙЛ ίπ Е. сой. №1иге 301:214-221.
28. В1рршапп 1. Р., М. К1ет, С. Нойсйеп, В. Вгоскк, ЭД. 1. Ве!бд, 1. 6итрей, К. РГ17епша1ег, В. Ма!!ек и Ό. Мооктауег. 1998. Ртосатуобс экспрессия оГ ктд1е-сйат уапаЫе-Ггадтеп! (ксРу) апбЬоб1ек: кесгебоп т Ь-Гогт се11к оГ Рго!еик т1гаЬШк 1еабк Ю асбуе ргобис! и оуегсотек !йе бтйабопк оГ репрЫктю ехртеккюп ш ЕксйейсЫа сой. Арр1. Епуйоп. М1сгоЫо1. 64:4862-4869.
29. 8айо Υ., Υ. 1кйб, Н. 8акак1, М. НауакЫ, Т. Риртига, Υ. 1та1, 8. Nакаши^а, 8. 8и/икГ 1. №1апк Т. Акаба, Н. Нопак К. Макакахи и N. Мтео. 1994. Ргобисбоп апб сйатас!епхабоп оГ а поуе1 Пккие-1уре р1акттодеп асбуа!ог бепуабуе т ЕксйейсЫа сой. Вю1есйпо1. Ргод. 10:472-479.
30. 8апЫеп1ок Р., М. Эисйекпе, Р. ЭепеДе, 1. Во171аи, N. Рготаде, N. Эе1ройе, Р. Рагкег, Υ. Ьепеуге, Е-Р. Мауаих и Т. Саг1\тпдЫ. 1989. 8уп!йек1к апб ритТДсабоп оГ асбуе йитап бккие р1акттодеп асбуа!ог Ггот ЕксйейсЫа сой. Вю!есйпо1оду 7:495-501.
31. 8сйеггег 8., N. ВоЬак, Н. Ζоийе^^у, 6. Вгап1ап! и С. Вгап1ап!. 1994. Репр1акт1с аддгедабоп йтйк !йе рго!ео1убс таЫгабоп оГ !йе ЕксйепсЫа сой решсШш 6 ат1баке ргесигког ро1урерйбе. Арр1. М1сгоЫо1. Вю!есйпо1. 42:85-89.
32. 8оеба 8., М. Как1к1, Н. 8й1тепо и А. №дата1ки. 1986. Вар1б апб Ыдй-у1е1б ригГДсабоп оГ рогсше йеай Иккие-1уре р1актйюдеп асбуа!ог Ьу йерапп-керйатоке сйгота!одгарйу. ЬГГе 8сГ 39:1317-1324.
33. 8хагка 8. 1., Е. 6. 81йо!а, Н. В. НаЫЬк и 8.-Ь. ЭДопд. 1999. 8!арйу1окшаке ак а р1акттодеп асбуа!ог сотропеп! т гесотЬтап! Гикюп рго!етк. Арр1. Епуйоп. М1сгоЪю1. 65:506-513.
34. ЭДа1бепк!гот М., Е. Но1тдгеп, А. Айегкапб, С. Ка1бегеп, В. Ьотепаб1ег, В. Вабеп, Ь. Напккоп и 6. Рой1. 1991. 8упГйек1к апб кесгебоп оГ а ДЬппо1убса11у асбуе бккие-Гуре рИктшодеп асбуа!ог уапап! т ЕксйейсЫа соб. 6епе 99:243248.
35. ЭДап Е. ЭД.-М. и Р. Вапеух. 1998. То1А111 Со-оуегэкспрессия Расбйа1ек !йе Весоуегу оГ Рег1р1акт1с ВесотЫпап! Рго!ешк т!о !йе Сго\\Й1 Мебшт оГ ЕксйейсЫа сой. Рго!ет Ехрг. РипГ 14:13-22.
36. Ζасйа^^ак и., В. Рйсйег, Р. №11 и Н. ЭД111. 1992. С11агас1епхабоп оГ йитап 11ккие-1уре р1актйюдеп асбуа!ог тейй топос1опа1 апбЬоб1ек: тарршд оГерйорек апб Ьтбшд кйек Гог ПЬпп апб 1укше. ТйготЬ. Наеток!. 67:88-94.
Описание чертежей
На чертежах показано:
на фиг. 1 - подтверждение характеристик продукта ПЦР-амплификации гена К28 из вектора р51-3 с помощью праймеров 8К2/174 и А88Р. Ряд 1 соответствует маркеру размером 1 т.п.н. (фирма Восйе Мо1еси1аг ВЫсИеп-исаК Индианаполис, штат Иллинойс). Ряд 2 соответствует продукту амплификации, внесенному в количестве 1 мкл. Обозначена индивидуальная полоса, соответствующая 1110 парам оснований. Электрофорез осуществляли в 1%-ном агарозном геле;
на фиг. 2 - ряд 1 соответствует встроенному гену К28 на полосе, соответствующей 1110 пар оснований (*), после расщепления с помощью 8Г11 вектора рСотЬ3Н-К28. Ряд 1 соответствует маркеру размером 1 т.п.н. Ряд 2 соответствует нерасщепленному вектору рСотЬ3НК28. Электрофорез осуществляли в 1%-ном агарозном геле;
на фиг 3. - схематичное изображение рСотЬ3Н-К28 с указанием двух сайтов клонирования 8Гб, в которые встраивали ген К28. Также обозначены сигнальная последовательность (ОтрА), сайт связывания рибосомы (В1В8), промотор 1ас и ген др111;
на фиг. 4. - схематичная диаграмма сайта мутации в стыке между генами К28 и дрШ в векторе рСотЬ3Н-К28. Сайтренатурации рСотЬ3Н-К28 связывали с набором праймеров для мутации (М8ТРА и МА8ТРА), которые содержали модифицированные олигонуклеозиды (подчеркнуто). После осуществления цикла амплификации сайт 1 8Г11 (выделен жирным шрифтом) модифицировали и удаляли из вновь синтезированной цепи;
на фиг. 5. - характеризация вновь синтезированного вектора МрСотЬ3Н-К28 с помощью рестриктазы 8Г1 I. Ряд 3 соответствует полосе размером 4319 пар оснований, которая соответствует одному сайту расщепления МрСотЬ3НК28. В области, соответствующей 1110 парам оснований, не удалось визуализировать встроенный ген К28. Ряд 1 соответствует маркеру размером 1 т. п. н. Ряд 2 соответствует нерасщепленному вектору МрСотЬ3Н-К28. Электрофорез осуществляли в 1%-ном агарозном геле;
на фиг. 6 - идентификация иммунологически реактивной полосы, соответствующей вы веденному из рекомбинантной ДНК протеину, полученному из супернатанта культуры ХМ[К28], с помощью овечьего антитела к ίΡΆ, конъюгированного с НКР. В ряд 1 вносили 40 нг стандартного полученного из меланомы ίΡΑ (86/670), для которого обнаружена реактивная полоса, соответствующая 70 кДа. В ряд 2 и 3 соответственно вносили очищенные и сконцентрированные супернатанты культур нетрансформированных штаммов Е. сой ХЬ1- В1ие и ХМ[К28]. Индивидуальная реактивная полоса, соответствующая 39 кДа, особенно хорошо видна в ряду 3;
на фиг. 7 - определение молекулярной массы внеклеточного Г-К28, несущего активный домен сериновой протеазы, путем электрофореза в полиакриламидном геле сополимеризованного плазминогена. В ряд 1 внесены стандарты молекулярной масс (510'), ДСН-6Н (фирма 81дша, Сент Луис, штат Миссури). В ряды 2, 3 и 4 соответственно вносили по 50 мкг осажденного насыщенным 55%-ным раствором сульфата аммония супернатанта культуры ХЬ-1 В1ие, XI1 В1ие, трансформированного рСошЬ3Н88, и ХМ[К28]. В полосу 5 вносили 5 мед. стандартного полученного из миеломы ίΡΑ (86/670). Прозрачные зоны расщепленного плазминогена в полиакриламидном геле обнаружены только в ряду 4 в областях, соответствующих молекулярным массам 34 и 37 кДа (Б) и в ряду 5 в области, соответствующей молекулярным массам 66 и 72 кДа (А);
на фиг. 8 - структура Α (8ЕО ГО N0: 11)
Нативная молекула К28 от аминокислоты 174 до 527 без модификации;
на фиг. 9 - структура В-0 (8ЕЭ ГО N0: 12)
Нативная молекула К28 от аминокислоты 197 до 527 без модификации;
на фиг. 10 - структура Б-1 (8ЕЭ ГО N0: 13)
Молекула К28 от аминокислоты 193 до 527, где к структуре В-0, приведенной на фиг. 9, к Ν-концевой области добавлены аминокислоты 8Ε6Ν;
на фиг. 11 -структура Б-2 (8Е0 ГО N0: 14)
Молекула К28 от аминокислоты 193 до 527, соответствующая молекуле, приведенной на фиг. 10, где Сук-261 заменен на 8ег;
на фиг. 12 - структура Б-3 (8Е0 ГО N0: 15)
Молекула К28 от аминокислоты 191 до 527, где к структуре В-0, приведенной на фиг. 9, к ^концевой области добавлены аминокислоты 8ЕС.Х81);
на фиг. 13 - структура Б-4 (8ЕЭ ГО N0: 16)
Молекула К28 от аминокислоты 191 до 527, соответствующая молекуле, приведенной на фиг. 12, где Сук-261 заменен на 8ег;
на фиг. 14 - структура В (8Е0 ГО N0: 17)
Нативная молекула К28 от аминокислоты 220 до 527 без модификации. Эту молекулу можно дополнительно модифицировать аналогично тому, как описано для структуры Б на фиг. 10-13;
на фиг. 15 - структура Ό (8Е0 ГО N0: 18)
Нативная молекула К28 от аминокислоты 260 до 527 без модификации. Эту молекулу можно дополнительно модифицировать аналогично тому, как описано для структуры Б на фиг. 10-13;
на фиг. 16 - молекула ίΡΑ (8ЕЭ ГО N0: 19).
Таблица 1. Обнаружение молекулы Г-К28 в препарате фага с помощью сэнвич- ЕЬ18А
Иммобилизованное антитело - Антитело-метка (конъюгированное с НКР)
Антитело к (РА Антитело к М13
К28-ф УС8М18* * К28-ф УС8М13
Антитело к «кренделеобразно -I6 му» домену 2 Антитело к М13 1,12± 0,04в 0,17 ±0,01 0,12 ±0,03 0,14 ±0,05 1,89 ±0,02 1,91 ±0,02 0,16 ±0,02 1,88 ±0,03
а УС8М13 получали из штамма ХЬ-1 В1ие, трансформированного рСошЬ3Н88.
б Применяли мышиное моноклональное антитело к «кренделеобразному» домену 2 (16/В). Другие антитела получали из овечьего иммуноглобулина.
в Данные являются средними величинами абсорбции каждого образца, полученными по трем повторностям.
Перечень последовательностей <110> Бёрингер Ингельхайм Интернациональ ГмбХ, ИЕ <120> Способы крупномасштабного производства выведенных из рекомбинантной ДНК молекул б₽А или К23 <130> Сазе 1-11*70 <1 4 0>
<150> СВ 0027779.8 <151> 14 ноября 2000г.
<160> 25 <170> ВаеепЧп Уег . 2 . 1 <210> 1 <211> 18 <212> ΌΝΑ <220>
<223> Описание искусственной последовательности: кодирующая последовательность Ν-концевой области протеина К25 <400> 1 бсбдадддаа асадбдас <220>
<223> Описание искусственной последовательности: последовательность слитого протеина ОтрА-К25 <400> 2 абдааааада дсддссбсбд сасадссбса бдссддаабс асдбдддадб ссбсадбббс дссабсбббд абсадсбссб сассбдасдд бббдаадбсд аббдсдсбдс сдсасбдбдб дссббсссс бссддсбасд дсаадсабда ддссббдбс: сабдссад.
ассдасаа: дасдссбд. ббддбддд< асаааддб!
|са< бдб; бдсбдбдбдс адддсдаббс бсабса:
сдбддсссад 60 ссдбддсасд 120 ссбдабаддс 180 асабааббас 240 ссдсаддс-бд 300 дбасадссад 360 сбддсаддсб 420 :басбс 480 садсбабсдс даббдсадбд д< адддааасад бдасбдсбас Ы ... ссдадбсддд бдссбссбдс сбсссдбдд; садсасадаа ссссадбдс< сбдабдддда бдссаадсс< асбдбдабдб дсссбссбдс дсабсааадд адддсбсбб: ссаадсасад даддбсдсс: дсбддаббсб сбсбдссдс< бдабсббддд садаас;
бдсадсбдаа абсддаббсд ддсддассбд :бддсбд дбббсдсбас :ббдддаабд ддбсадссба • ' 1ббссабдаб саддсасбдд дссбдддсаа бддбдссасд бдсбдаадаа Ьссассбдсд дссбдадаса ддададсддб бссбдбдсдд дддс. сасбдсббсс аддададдбб бссд< сдддбддбсс сбддсдадда ддад< 1ад дааббсдабд абдасасбба сдасаабдас бсссдсбдбд сссаддадад садсдбддб< садсбдссдд асбддасдда дбдбдадсб» ссбббсбабб сддадсддсб дааддаддс’ сддадсддсд ддссс< сбддбдбдбс бдаасс бдбддасада аддабдбс< сдбдасааса бдсдассд
540
600
660
720
780 .сббаа садаасадбс 900 :саддс ааасббдсас 960 :дабдд ссдсабдасб 1020 дддбдбдбас 1080 1128 садссдсбдс бддадасасб дддаддсссс :дсбд дддссбдддс :аосб адасбддабб <210> 3 <211> бб <212> БЫА <213> ЕзсЬеххсЫа соИ <400> 3 айдааааада садсЕайсдс даЕйдсадЕд дсасйддсЕд дЕЕЕсдсЕас сдЕддсссад 60 дсддсс 66 <210> 4 <211> 1065 <212> ΟΝΑ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: кодирующая последовательность протеина К23 <400> 4
ЕсЕдадддаа асадЕдасЕд сЕасЕЕЕддд ааЕдддЕсад ссЕассдЕдд сасдсасадс 60
сЕсассдадЕ сдддЕдссЕс сЕдссЕсссд ЕддааЕЕсса ЕдаЕссЕдаЕ аддсааддЕЕ 120
Еасасадсас адаассссад Едсссаддса сЕдддссЕдд дсааасаЕаа ЕЕасЕдссдд 180
ааЕссЕдаЕд дддаЕдссаа дсссЕддЕдс сасдЕдсЕда адаассдсад дсЕдасдЕдд 240
дадЕасЕдЕд аЕдЕдсссЕс сЕдсЕссасс ЕдсддссЕда дасадЕасад ссадссЕсад 300
ЕЕЕсдсаЕса ааддадддсе сЕЕсдссдас аСсдссСссс ассссЕддса ддсЕдссаЕс 360
ЕЕЕдссаадс асаддаддЕс дсссддадад сддЕЕссЕдЕ дсдддддсаЕ асЕсаЕсадс 420
ЕссЕдсЕдда ЕЕсЕсЕсЕдс сдсссасЕдс ЕЕссаддада ддЕЕЕссдсс ссассассйд 480
асддЕдаЕсЕ Едддсадаас аЕассдддЕд дЕсссЕддсд аддаддадса даааЕЕЕдаа 540
дЕсдаааааЕ асаЕЕдЕсса ЕааддааЕЕс даЕдаЕдаса сЕЕасдасаа ЕдасаЕЕдсд 600
сЕдсЕдсадс ЕдаааЕсдда ЕЕсдЕсссдс ЕдЕдсссадд ададсадсдй ддЕссдсасЕ 660
дЕдЕдссЕЕс ссссддсдда ссЕдсадсЕд ссддасЕдда сддадЕдЕда дсЕсЕссддс 720
Еасддсаадс аЕдаддссЕЕ дЕсЕссЕЕЕс ЕаЕЕсддадс ддсЕдаадда ддсЕсайдЕс 780
адасЕдЕасс саЕссадссд сЕдсасаЕса саасаЕЕЕас ЕЕаасадаас адйсассдас 840
аасайдсЕдЕ дЕдсЕддада сасЕсддадс ддсдддсссс аддсааасЕЕ дсасдасдсс 900
Едссадддсд аЕЕсдддадд сссссЕддЕд ЕдЕсЕдаасд аЕддссдсай дасЕЕЕддйд 960
ддсаЕсаЕса дсЕддддссЕ дддсЕдЕдда садааддаЕд ЕсссдддЕдЕ дЕасасааад 1020
дЕЕассаасЕ ассЕадасЕд даЕЕсдЕдас аасайдсдас сдЕда 1065
<210> 5 <211> 1128 <212> ϋΝΑ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: кодирующая последовательность слитого протеина ОтрА-К23 · <400> 5 .
аЕдааааада садсЕаЕсдс даЕЕдсадйд дсасйддсЕд дЕЕЕсдсЕас сдЕддсссад 60 дсддссЕсЕд адддааасад ЕдасйдсЕас ЕЕЕдддааЕд ддйсадссЕа ссдЕддсасд 120 сасадссЕса ссдадЕсддд ЕдссСссЕдс сЕсссдЕдда аЕЕссаЕдаЕ ссЕдаЕаддс 180 ааддЕЕЕаса садсасадаа ссссадЕдсс саддсасЕдд дссЕдддсаа асаЕааЕЕас 240
ЕдссддааЕс сЕдаЕдддда Едссаадссс ЕддЕдссасд ЕдсЕдаадаа ссдсаддсЕд 300 асдйдддадЕ асЕдЕдаЕдЕ дсссЕссЕдс ЕссассЕдсд дссйдадаса дЕасадссад 360 ссЕсадЕЕЕс дсаЕсааадд адддсЕсЕЕс дссдасаЕсд ссЕсссассс сЕддсаддсЕ 420 дссаЕсЕЕЕд ссаадсасад даддЕсдссс ддададсддЕ ЕссЕдйдсдд дддсаЕасЕс 480 аЕсадсЕссЕ дсЕддаЕЕсй сЕсЕдссдсс сасЕдсЕЕсс аддададдЕЕ Ессдссссас 540 сассЕдасдд ЕдаЕсЕЕддд садаасаЕас сдддЕддЕсс сЕддсдадда ддадсадааа 600
ЕЕЕдаадЕсд аааааЕасаЕ ЕдЕссаЕаад дааЕЕсдаЕд аЕдасасЕЕа сдасааЕдас 660 аЕЕдсдсЕдс ЕдсадсЕдаа аЕсддаЕЕсд ЕсссдсЕдЕд сссаддадад садсдЕддЕс 720 сдсасЕдЕдЕ дссЕЕссссс ддсддассЕд садсЕдссдд асЕддасдда дЕдЕдадсЕс 780
ЕссддсЕасд дсаадсаЕда ддссЕЕдЕсЕ ссЕЕЕсСаЕЕ сддадсддсЕ дааддадд'сЕ 840 саЕдЕсадас ЕдЕасссаЕс садссдсйдс асаЕсасаас аЕЕЕасЕЕаа садаасадЕс 900 ассдасааса ЕдсЕдЕдЕдс ЕддадасасЕ сддадсддсд ддссссаддс ааасЕЕдсас 960 дасдссЕдсс адддсдаЕЕс дддаддсссс сЕддЕдЕдЕс ЕдаасдаЕдд ссдсаЕдасЕ 1020
ЕЕддЕдддса ЕсаЕсадсЕд дддссЕдддс ЕдЕддасада аддаЕдЕссс дддЕдЕдЕас 1080 асаааддЕЕа ссаасЕассЕ адасЕддаЕЕ сдЕдасааса Едсдассд 1128 <210> 6 <211> бб <212> ΏΝΑ <213> ЕзсЬеххсМа соИ <400> 6 аЕдааааада садсЕаЕсдс даЕЕдсадЕд дсасЕддсЕд дЕЕЕсдсЕас сдЕддсссад 60 дсддсс 66 <210> 7 <211> 1065 <212> ϋΝΑ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: кодирующая последовательность протеина К25 <400> 7
ЕсЕдадддаа асадЕдасЕд сЕасЕЕЕддд ааЕдддйсад ссЕассдЕдд сасдсасадс 60
сЕсассдадЕ сдддЕдссЕс сЕдссЕсссд ЕддааЕЕсса ЕдаЕссЕдаЕ аддсааддЕЕ 120
Еасасадсас адаассссад Едсссаддса сЕдддссЕдд дсааасаЕаа ЕЕасЕдссдд 180
ааЕссЕдаЕд дддаЕдссаа дсссЕддЕдс сасдЕдсЕда адаассдсад дсЕдасдЕдд 240
дадЕасЕдЕд аЕдЕдсссЕс сЕдсЕссасс Едсддссйда дасадЕасад ссадссЕсад 300
ЕЕЕсдсаЕса ааддадддсй сЕЕсдссдас аЕсдссйссс ассссЕддса ддсЕдссаЕс 360
ЕЕЕдссаадс асаддаддЕс дсссддадад сддЕЕссЕдй дсдддддсаЕ асЕсаЕсадс 420
ЕссЕдсЕдда ЕЕсЕсЕсЕдс сдсссасЕдс ЕЕссаддада ддЕЕЕссдсс ссассассЕд 480
асддЕдаЕсЕ Едддсадаас аЕассдддЕд дЕсссЕддсд аддаддадса даааЕЕЕдаа 540
дЕсдаааааЕ асаЕЕдЕсса ЕааддааЕЕс даЕдаЕдаса сЕЕасдасаа ЕдасаЕЕдсд 600
сЕдсЕдсадс ЕдаааЕсдда ЕЕсдЕсссдс Едйдсссадд ададсадсдй ддЕссдсасЕ 660
дЕдЕдссЕЕс ссссддсдда ссЕдсадсЕд ссддасйдда сддадЕдЕда дсЕсЕссддс 720
Еасддсаадс аЕдаддссЕЕ дЕсЕссЕЕЕс ЕаЕЕсддадс ддсЕдаадда ддсЕсаЕдЕс 780
адасЕдЕасс саЕссадссд сйдсасаЕса саасаЕЕЕас ЕЕаасадаас адЕсассдас 840
аасаЕдсЕдЕ дЕдсЕддада сасЕсддадс ддсдддсссс аддсааасЕЕ дсасдасдсс 900
Едссадддсд аЕЕсдддадд сссссЕддЕд ЕдЕсЕдаасд аЕддссдсаЕ дасЕЕЕддЕд 960
ддсаЕсаЕса дсЕддддссЕ дддсЕдЕдда садааддаЕд ЕсссдддЕдЕ дЕасасааад 1020
дЕЕассаасЕ ассЕадасЕд даЕЕсдЕдас аасаЕдсдас сдЕда 1065
<400> 8 МеЕ Ьуз 1 Ьуз ТЬг А1а Не 5 А1а Не А1а Уа1 10 А1а Ьеи А1а О1у РЬе 15 А1а
ТЬг Уа1 А1а С1п 20 А1а А1а Зег С1и С1у 25 Азп Зег Азр Суз Туг 30 РЬе С1у
Азп С1у Зег А1а 35 Туг Агд С1у ТЬг 40 Нхз 5ег Ьеи ТЬг С1и 45 Зех С1у А1а
Зег Суз 50 Ьеи Рго Тгр Азп Зег 55 Мей Не Ьеи Не С1у 60 Ьуз Уа1 Туг ТЬг
А1а С1п 65 Азп Рхо Зег А1а 70 б1п А1а Ьеи С1у Ьеи 75 С1у Ьуз Нхз Азп Тух 80
Суз Агд Азп Рго Азр С1у 85 Азр А1а Ьуз Рго 90 Тгр Суз ΗΪ5 Уа1 Ьеи 95 Ьуз
Азп Агд Агд Ьеи 100 ТЬг Тгр О1и Туг Суз 105 Азр Уа1 Рго Зег Суз 110 Зех ТЬг
Суз С1у Ьеи Агд 115 С1п Туг Зег 61п 120 Рго Й1п РЬе Агд Не 125 Ьуз С1у С1у
Ьеи РЬе 130 А1а Азр Не А1а Зег 135 Нхз Рго Тгр <31п А1а 140 А1а Не РЬе А1а
Ьуз ΗΪ5 145 Агд Агд Зег Рго 150 С1у С1и Агд РЬе Ьеи 155 Суз С1у С1у Не Ьеи 160.
Не Зег Зег Суз Тгр 11е 165 Ьеи Зег А1а А1а 170 ΗΪ3 Суз РЬе С1п С1и 175 Агд
РЬе Рго Рго Нхз 180 Нхз Ьеи ТЫ Уа1 Не 195 Ьеи 61у Агд ТЬг Тух 190 Ахд Уа1
Уа1 Рго С1у С1и 195 С1и С1и С1п Ьуз 200 РЬе С1и Уа1 С1и Ьуз 205 Туг Не Уа1
Н1з Ьуз 210 б!и РЬе Агр Азр Азр 215 ТЬг Туг Азр Азп Азр 220 Не А1а Ьеи Ьеи
С1п Ьеи 225 , =ег Азр Зег 230 Зег Агд Суз А1а С1п 235 С1и Зег Зех Уа1 Уа1 240
Агд ТЬг Уа1 Суз Ьеи Рго 245 Рго А1а Азр Ьеи 250 <31п Ьеи Рго Азр Тгр 255 ТЬх
С1и Суз С1и Ьеи 260 Зег С1у Туг 61у Ьуз 265 ΗΪ3 б1и А1а Ьеи Зег 270 Рго РЬе
Туг Зег С1и Агд 275 Ьеи Ьуз С1и А1а 280 Нхз Уа1 Агд Ьеи Туг 285 Рго Зех Зег
Агд Суз 290 ТЬг Зег 61п Нхз Ьеи 295 Ьеи Азп Агд ТЬг Уа1 300 ТЬг Азр Азп МеЕ
Ьеи Суз 305 А1а С1у Азр ТЬг 310 Агд Зег С1у С1у Рго 315 С1п А1а Азп Ьеи ΗΪ3 320
Азр А1а Суз С1п С1у 325 Азр Зех <31у С1у Рго 330 Ьеи Уа1 Суз Ьеи Азп 335 Азр
С1у Агд МеЕ ТЬг Ьеи Уа1 <31у Не Не Зег Тгр С1у Ьеи С1у Суз С1у
340 345 350
<31п Ьуз Азр Уа1 Рго С1у Уа1 Туг ТЬх Ьуз Уа1 ТЬх Азп Туг Ьеи Азр
355 360 365
Тхр Не Ахд Азр Азп МеЕ Ахд Рхо С1 у
370 375
<210> 9 <211> 4 <212> РНТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: пептидная последовательность <400> 9
Зег С1и С1у Азп <210> 10 <211> 6 <212> РРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: пептидная последовательность <400> 10
Зег О1ц С1у Азп Зег Азр
5 <210> 8 <211> 377 <212> РРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: слитый протеин ОшрАК2 3 <210> 11 <211> 354 <212> РРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К23 174-527 <400> 11
Зег О1и С1у Азп 1
С1у ТЬг Н1з Зег
Зег МеЕ Не Ьеи
О1п А1а Ьеи О1у
Зег Азр Суз Туг
Ьеи ТЬг О1и Зег
Не 61у Ьуз Уа1
Ьеи О1у Ьуз Нхз
РЬе 61у Азп С1у
С1у А1а Зег Суз 25
Туг ТЬг А1а С1п
Азп Туг Суз Агд
Зег А1а Туг Агд
Ьеи Рго Тгр Азп
Азп Рго Зег А1а.
Азп Рго Азр С1у
Азр 65 А1а Рго Тгр Суз Ηίε 70 Уа1 Ьеи Ьуз Азп 75 Агд Агд Ьеи ТЬг Тгр 80
61и Туг Суз Азр Уа1 Рхо Зех Суз Зег ТЬг Суз 61 у Ьеи Агд 61п Тух
85 90 95
Зег С1п Рго 61п РЬе Агд 11е Ьу5 61у С1у Ьеи РЬе А1а Азр Не А1а
100 105 НО
Зег Ηίε Рго Тгр 61п А1а А1а Не РЬе А1а Ьуз Нхз Агд Агд Зех Рхо
115 120 125
61у С1и Агд РЬе Ьеи Суз С1у С1у Не Ьеи Не Зег Зег Суз Тгр Не
130 135 140
Ьеи Зег А1а А1а ΗΪ3 Суз РЬе 61п 61и Агд РЬе Рго Рго Ηίε Нхз Ьеи
145 150 155 160
ТЬг Уа1 Не Ьеи 61у Агд ТЬг Туг Агд Уа1 Уа1 Рго 61у 61и С1и 61и
165 170 175
61п Ьуз РЬе 61и Уа1 б1и Ьуз Туг 11е Уа1 Нхз Ьуз 61и РЬе Азр Азр
180 185 190
Αερ ТЬх Туг Азр Азп Азр Не А1а Ьеи Ьеи σΐη Ьеи Ьуз Зег Азр Зег
195 200 205
Зег Агд Суз А1а С1п 61и Зег Зег Уа1 Уа1 Агд ТЬг Уа1 Суз Ьеи Рго
210 215 220
Рго А1а Αερ Ьеи С1п Ьеи Рго Азр Тгр ТЬг С1и Суз 61и Ьеи Зег 61у
225 230 235 240
Туг 61у Ьуз Ηίε 61и А1а Ьеи Зег Рго РЬе Туг Зег 61и Агд Ьеи Ьуз
245 250 255
61и А1а Ηίε Уа1 Агд Ьеи Туг Рго Зег Зег Агд Суз ТЬх Зег 61п Нхз
260 265 270
Ьеи Ьеи Азп Агд ТЬг Уа1 ТЬг Азр Азп МеЕ Ьеи Суз А1а 61у Азр ТЬг
275 280 285
Агд Зег С1у 61у Рхо 61п А1а Азп Ьеи Нхз Азр А1а Суз 61п 61у Азр
290 295 300
Зег 61у С1у Рго Ьеи Уа1 Суз Ьеи Азп Азр 61 у Ахд МеЕ ТЬг Ьеи Уа1
305 310 315 320
С1у Не Не Зег Тгр 61у Ьеи С1у Суз С1у 61п Ьуз Азр Уа1 Рхо 61у
325 330 335
Уа1 Туг ТЬг Ьуз Уа1 ТЬх Азп Тух Ьеи Азр Тгр Не Агд Азр Азп МеЕ
340 345 350
Агд Рго <210> 12 <211> 331 <212> РКТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К23 197-527 <400> 12
Зех 1 61у А1а Зег Суз 5 Ьеи Рго Тгр Азп Зег 10 Мей Не Ьеи 11е 61у 15 Ьуз
Уа1 Туг ТЬг А1а 61п Азп Рго Зег А1а 61п А1а Ьеи 61у Ьеи 61у Ьуз
20 25 30
Ηίε Азп Туг Суз Агд Азп Рго Азр 61у Азр А1а Ьуз Рго Тгр Суз Ηίε
35 40 45
Уа1 Ьеи Ьуз Азп Агд Агд Ьеи ТЬг Тгр 61и Туг Суз Азр Уа1 Рхо Зег
50 55 60
Суз Зег ТЬг Суз 61у Ьеи Агд 61п Туг Зег С1п Рго 61П РЬе Агд Не
65 70 75 80
Ьуз 61у 61у Ьеи РЬе А1а Азр 11е А1а Зех ΗΪ3 Рхо Тхр 61п А1а А1а
85 90 95
11е РЬе А1а Ьуз Нхз Агд Агд Зег Рго 61у О1и Агд РЬе Ьеи Суз 61у
100 105 110
61у Не Ьеи Не Зех Зех Суз Тгр Не Ьеи Зех А1а А1а Нхз Суз РЬе
115 120 125
С1п 61и Ахд РЬе Рго Рго Ηίε Ηίε Ьеи ТЬг Уа1 Не Ьеи 61у Агд ТЬг
130 135 140
Туг Агд Уа1 Уа1 Рго 61 у 61и 61и 61и 61п Ьуз РЬе 61и Уа1 61и Ьуз
145 150 155 160
Туг 11е Уа1 Ηίε Ьуз 61и РЬе Азр Αερ Азр ТЬг Туг Азр Азп Азр Не
165 170 175
А1а Ьеи Ьеи 61п Ьеи Ьуз Зег Азр Зег Зег Агд Суз А1а 61п 61и Зег
180 185 190
Зех Уа1 Уа1 Ах д ТЬг Уа1 Суз Ьеи Рго Рго А1а Азр Ьеи 61п Ьеи Рго
195 200 205
Азр Тгр ТЬх 61и Суз 61 и Ьеи Зег 61у Туг 61у Ьуз Нхз 61и А1а Ьеи
210 215 220
Зег Рхо РЬе Туг Зег С1и Агд Ьеи Ьуз 61и А1а Ηίε Уа1 Агд Ьеи Туг
225 230 235 240
Рхо Зег Зег Агд Суз ТЬг Зег 61п Н15 Ьеи Ьеи Азп Агд ТЬг Уа1 ТЬг
245 250 255
Азр Азп МеЕ Ьеи Суз А1а С1у Азр ТЬг Агд Зег 61у 61у Рхо 61п А1а
260 265 270
Азп Ьеи ΗΪ3 Αερ А1а Суз 61п 61у Азр Зег 61 у 61у Рго Ьеи Уа1 Суз
275 280 285
Ьеи Азп Азр 61у Агд МеЕ ТЬг Ьеи Уа1 61у Не Не Зег Тгр 61у Ьеи
290 295 300
61у Суз 61у 61л Ьуз Азр Уа1 Рго 61у Уа1 Туг ТЬх Ьуз Уа1 ТЬг Азп
305 310 315 320
Туг Ьеи Азр Тгр Не Агд Азр Азп МеЕ Агд Рго
325 330 <210> 13 <211> 339 <212> РКТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К25 193-527 модифицированный
<400> 13
Зег 1 61и 61у Азп Зег Ьеи 5 ТЬг 61и Зег 61у А1а 10 Зег Суз Ьеи Рго 15 Тгр
Азп Зег МеЕ Не Ьеи Не 61у Ьуз Уа1 Туг ТЬг А1а 61п Азп Рго Зег
20 25 30
А1а 61п А1а Ьеи 61у Ьеи 61у Ьуз Нхз Азп Тух Суз Агд Азп Рго Азр
35 40 45
61у Азр А1а Ьуз Рго Тгр Суз Нхз Уа1 Ьеи Ьуз Азп Агд Агд Ьеи ТЬг
50 55 60
Тхр 61и Туг Суз Азр Уа1 Рго Зег Суз Зег ТЬг Суз 61у Ьеи Агд 61п
65 70 75 80
Туг Зег 61п Рго 61п РЬе Агд Не Ьуз 61у 61у Ьеи РЬе А1а Азр Не
85 90 95
А1а Зег Ηίε Рхо Тгр 61п А1а А1а Не РЬе А1а Ьуз Ηίε Агд Агд Зех
100 105 НО
Рхо 61у 61и Ахд РЬе Ьеи Суз 61у 61у Не Ьеи Не Зех Зег Суз Тхр
115 120 125
Не Ьеи Зех А1а А1а Н15 Суз РЬе О1п 61и Агд РЬе Рхо Рхо Нхз Нхз
130 135 140
Ьеи ТЬг Уа1 Не Ьеи 61у Агд ТЬг Тух Ахд Уа1 Уа1 Рго С1у С1и 61и
14 5 150 155 160
61и 61п Ьуз РЬе 61и Уа1 61и Ьуз Туг Не Уа1 Нхз Ьуз 61и РЬе Азр
165 170 175
Азр Αερ ТНг Туг Азр Азп Азр Не А1а Ьеи Ьеи 61п Ьеи Ьуз Зег Азр
180 185 190
5ег Зех Агд Суз А1а 61п 61и Зег Зег Уа1 Уа1 Агд ТЬг Уа1 Суз Ьеи
195 200 205
Рго Рго А1а Αερ Ьеи 61п Ьеи Рго Азр Тгр ТЬг 61и Суз 61и Ьеи Зех
210 215 220
61у Туг С1у Ьуз Ηχε С1и А1а Ьеи Зег Рго РЬе Туг Зег 61и Агд Ьеи
225 230 235240
Ьуз б1и А1а Ηίε Уа1 Агд Ьеи Туг Рго Зег Зег Агд Суз ТНг Зег61п
245 250255
Ηίε Ьеи Ьеи Азп Агд ТЬг Уа1 ТНг Азр Азп МеЕ Ьеи Суз А1а 61у Азр
260 265270
ТНг Агд Зег 61у 61у Рго 61п А1а Азп Ьеи Ηίε Αερ А1а Суз 61п С1у
275 280285
Азр Зег 290 61у 61у Рго Ьеи Уа1 295 Суз Ьеи Азп Азр 61у 300 Агд МеЕ ТЬг Ьеи
Уа1 61у Не 11е Зег Тхр 61у Ьеи 61у Суз 61у 61п Ьуз Азр Уа1 Рго
305 310 315 320
61у Уа1 Туг ТЬг Ьуз Уа1 ТНг Азп Туг Ьеи Азр Тгр Не Ахд Азр Азп
325 330 335
МеЕ Агд Рго <210> 14 <211> 335 <212> РКТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К25 193-527 модифицированный
<400> 14 61и Зег 5 61у А1а Зег Суз Ьеи Рго Тгр 10 Азп Зег МеЕ 15 Не
Зех 1 Ьеи ТЬг
Ьеи Не 61у Ьуз Уа1 Туг ТЬг А1а 61п А5П Рго Зег А1а 61п А1а Ьеи
20 25 30
61у Ьеи 61у Ьуз Нхз Азп Туг Суз Агд Азп Рго Азр 61у Аар А1а Ьуз'
35 40 45
Рго Тхр Суз Нхз Уа1 Ьеи Ьуз Азп Ахд Агд Ьеи ТЬг Тгр 61и Туг Суз
50 55 60
Азр Уа1 Рхо Зег Зег 5ег ТЬг Суз 61у Ьеи Агд 61п Тух Зег 61п Рго
65 70 75 80
61п РЬе Агд 11е Ьуз 61 у 61у Ьеи РЬе А1а Азр 11е А1а Зег ΗΪ5 Рго
85 90 95
Тгр 61п А1а А1а Не РЬе А1а Ьуз Нхз Агд Агд Зег Рго 61у 61и Агд
100 105 110
РЬе Ьеи Суз 61у 61у Не Ьеи Не Зег Зег Суз Тхр Не Ьеи Зег А1а
115 120 125
А1а Нхз 130 Суз РЬе СЬп СЬи Агд 135 РЬе Рго Рго Нхз Нхз Ьеи 140 ТЬг УаЬ 1Ье
Беи СЬу Агд ТЬг Туг Агд УаЬ УаЬ Рго СЬу СЬи СЬи СЬи С1п Ьуз РЬе
145 150 155 160
СЬи УаЬ СЬи Ьуз Туг 11е УаЬ Нхз Ьуз СЬи РЬе Азр Аэр Азр ТЬг Туг
165 170 175
Азр Азп Азр Не А1а Ьеи Ьеи СЬп Ьеи Ьуз Зег Азр Зег Зег Агд Суз
180 185 190
АЬа СЬп СЬи Зег Зег УаЬ УаЬ Агд ТЬг УаЬ Суз Ьеи Рго Рго А1а Азр
195 200 205
Ьеи СЬп Ьеи Рго Азр Тгр ТЬг СЬи Суз С1и Ьеи Зег СЬу Туг СЬу Ьуз
210 215 220
Нхз СЬи А1а Ьеи Зех Рго РЬе Туг Зег С1и Агд Ьеи Ьуз СЬи АЬа Нхз
225 230 235 240
УаЬ Агд Ьеи Туг Рго Зег Зег Агд Суз ТЬг Зег СЬп Нхз Ьеи Ьеи Азп.
245 250 255
Агд ТЬг УаЬ ТЬг Азр Азп МеС Ьеи Суз А1а СЬу Азр ТЬг Агд Зег СЬу
260 265 270
СЬу Рго СЬп АЬа Азп Ьеи НХЗ Азр А1а Суз СЬп СЬу Азр Зег СЬу СЬу
275 280 285
Рго Ьеи УаЬ Суз Ьеи Азп Азр СЬу Агд Мей ТЬг Ьеи УаЬ СЬу Не 11е
290 295 300
Зег Тгр СЬу Ьеи СЬу Суз СЬу СЬп Ьуз Азр УаЬ Рго СЬу νβΐ Туг ТЫ
305 310 315 320
Ьуз УаЬ ТЬг Азп Туг Ьеи Азр Тгр 1Ье Агд Азр Азп МеЕ Агд Рго
325 330 335 <2Ь0> 15 <211> 343 <212> РАТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К25 191-527, модифицированный <400> 15
Зег СЬи 1 СЬу Азп Зег Азр ТЬг Нхз 5 Зег Ьеи ЬО ТЬг СЬи Зег СЬу АЬа 15 Зег
Суз Ьеи Рго Тгр Азп Зег МеЪ 1Ье Ьеи Не СЬу Ьуз УаЬ Туг ТЬг АЬа
20 25 30
СЬп Азп Рго Зег АЬа СЬп АЬа Ьеи С1у Ьеи СЬу Ьуз Нхз Азп Туг Суз
35 40 45
Агд Азп Рго Азр СЬу Азр АЬа Ьуз Рго Тгр Суз Нхз УаЬ Ьеи Ьуз Азп
50 55 60
Агд Агд Ьеи ТЬг Тгр СЬи Туг Суз Азр УаЬ Рго Зег Суз Зег ТЬг Суз
65 70 75 80
51 у Ьеи Агд СЬп Туг Зег СЬп Рго СЬп РЬе Агд Не Ьуз СЬу СЬу Ьеи
85 90 95
РЬе АЬа Азр Не АЬа Зег Нхз Рго Тгр СЬп АЬа АЬа Не РЬе АЬа Ьуз
100 105 НО
Нхз Агд Агд Зег Рго СЬу СЬи Агд РЬе Ьеи Суз СЬу СЬу Не Ьеи Не
115 Ь20 125
Зег Зех Суз Тгр 1Ье Ьеи Зег АЬа АЬа Нхз Суз РЬе СЬп СЬи Агд РЬе
130 135 140
Рго Рго Нхз Нхз Ьеи ТЬг УаЬ Пе Ьеи СЬу Агд ТЬг Тух Агд УаЬ УаЬ
145 150 155 160
Рго С1у СЬи СЬи СЬи СЬп Ьуз РЬе СЬи УаЬ С1и Ьуз Туг Не УаЬ Нхз
165 170 175
Ьуз СЬи РЬе Азр Азр Азр ТЬг Туг Азр Азп Азр Не АЬа Ьеи Ьеи СЬп
180 185 190
Ьеи Ьуз Зег Азр Зег Зег Агд Суз АЬа СЬп СЬи Зег Зег УаЬ УаЬ Агд
195 200 205
ТЬг УаЬ Суз Ьеи Рго Рго АЬа Азр Ьеи СЬп Ьеи Рго Азр Тгр ТЬг СЬи
210 215 220
Суз СЬи Ьеи Зег СЬу Туг СЬу Ьуз Нхз СЬи АЬа Ьеи Зег Рго РЬе Тух
225 230 235 240
Зег СЬи Агд Ьеи Ьуз СЬи АЬа Нхз УаЬ Агд Ьеи Туг Рго Зег Зег Агд
245 250 255
Суз ТЬг Зег СЬп Нхз Ьеи Ьеи Азп Агд ТЫ УаЬ ТЬг Азр Азп МеЪ Ьеи
260 265 270
Суз А1а СЬу Азр ТЬг Агд Зег СЬу СЬу Рго С1п АЬа Азп Ьеи Нхз Азр
275 280 295
АЬа Суз СЬп СЬу Азр Зег СЬу СЬу Рго Ьеи УаЬ Суз Ьеи Азп Азр СЬу
290 295 300
Агд Мей ТЬг Ьеи УаЬ СЬу 1Ье 1Ье Зег Тгр СЬу Ьеи СЬу Суз СЬу СЬп
305 ЗЬО 315 320
Ьуз Азр УаЬ Рго СЬу УаЬ Туг ТЬг Ьуз УаЬ ТЬг Азп Туг Ьеи Азр Тгр
325 330 335
Не Агд Азр Азп МеС Агд Рго
340 <210> 16 <211> 343 <212> РКТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К23 191-527, модифицированный <400> 16
Зег СЬи 1 СЬу Азп Зег Азр 5 ТЬх Нхз Зег Ьеи ТЬг СЬи 10 Зег СЬу АЬа 15 Зег
Суз Ьеи Рго Тгр Азп Зег МеС 11е Ьеи Не СЬу Ьуз УаЬ Туг ТЬг АЬа
20 25 30
СЬп Азп Рго Зег АЬа С1п АЬа Ьеи СЬу Ьеи СЬу Ьуз Нхз Азп Туг Суз
35 40 45
Агд Азп Рго Азр СЬу Азр АЬа Ьуз Рхо Тгр Суз Нхз УаЬ Ьеи Ьуз Азп
50 55 60
Ахд Агд Ьеи ТЬг Тгр СЬи Тух Суз Азр УаЬ Рхо Зег Зег Зех ТЬг Суз
65 70 75 80
О1у Ьеи Агд СЬп туг Зег СЬп Рго СЬп РЬе Агд Не Ьуз СЬу СЬу Ьеи
85 90 95
РЬе АЬа Азр Не АЬа Зег Нхз Рго Тхр СЬп АЬа АЬа Не РЬе А1а Ьуз
100 105 110
Нхз Агд Агд Зех Рго СЬу СЬи Агд РЬе Ьеи Суз СЬу СЬу Не Ьеи Не
115 120 125
Зег Зег Суз Тгр Не Ьеи Зег АЬа АЬа Нхз Суз РЬе СЬп СЬи Агд РЬе
130 135 140
Рго Рго Нхз Нхз Ьеи ТЬг УаЬ Не Ьеи СЬу Ахд ТЬх Туг Агд УаЬ УаЬ
145 150 155 160
Рго СЬу С1и СЬи СЬи СЬп Ьуз РЬе СЬи УаЬ СЬи Ьуз Туг Не УаЬ Нхз
165 170 175
Ьуз СЬи РЬе Азр Азр Азр ТЬг Тух Азр Азп Азр Не АЬа Ьеи Ьеи СЬп
180 185 190
Ьеи Ьуз Зег Азр Зег Зег Ахд Суз АЬа СЬп С1и Зех Зег УаЬ УаЬ Агд
195 200 205
ТЬг УаЬ Суз Ьеи Рго Рхо АЬа Азр Ьеи СЬп Ьеи Рго Азр Тгр ТЬг СЬи
210 215 220
Суз СЬи Ьеи Зег С1у Туг СЬу Ьуз Нхз СЬи АЬа Ьеи Зег Рго РЬе Туг
225 230 235 240
Зег СЬи Ахд Ьеи Ьуз СЬи АЬа Нхз УаЬ Ахд Ьеи Туг Рхо Зег Зех Ахд
245 250 255
Суз ТЬг Зех СЬп Нхз Ьеи Ьеи Азп Агд ТЬг УаЬ ТЬг Азр Азп МеС Ьеи
260 265 270
Суз АЬа СЬу Азр ТЬх Ахд Зех СЬу СЬу Рго СЬп АЬа Азп Ьеи Нхз Азр
275 280 285
АЬа Суз СЬп СЬу Азр Зег СЬу СЬу Рго Ьеи УаЬ Суз Ьеи Азп Азр С1у
290 295 300
Агд МеЬ ТЬг Ьеи УаЬ СЬу Не Не Зег Тгр СЬу Ьеи С1у Суз СЬу С1п
305 310 315 320
Ьуз Азр УаЬ Рхо СЬу УаЬ Туг ТЬг Ьуз УаЬ ТЬг Азп Туг Ьеи Азр Тгр
325 330 335
11е Агд Азр Азп МеЬ Агд Рго
340 <210> 17 <211> 308 <212> РАТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К23 220-527
<400> 17 Суз Агд Азп 15 Рго
Зег 1 АЬа СЬп А1а Ьеи 5 СЬу Ьеи СЬу Ьуз Нхз 10 Азп Туг
Азр СЬу Азр АЬа Ьуз Рхо Тгр Суз Нхз УаЬ Ьеи Ьуз Азп Агд Ахд Ьеи
20 25 30
ТЬг Тгр СЬи Туг Суз Азр УаЬ Рго Зег Суз Зег ТЬг Суз СЬу Ьеи Агд
35 40 45
СЬп Туг Зег СЬп Рго СЬп РЬе Агд Не Ьуз СЬу СЬу Ьеи РЬе АЬа Азр
50 55 60
1Ье АЬа Зег Нхз Рго Тгр СЬп АЬа АЬа 1Ье РЬе АЬа Ьуз Нхз Агд Агд
65 70 75 80
Зег Рго СЬу СЬи Агд РЬе Ьеи Суз СЬу СЬу Не Ьеи Не Зег Зег Суз
85 90 95
Тгр 1Ье Ьеи Зех АЬа АЬа Нхз Суз РЬе СЬп СЬи Агд РЬе Рго Рго Нхз
100 105 110
Нхз Ьеи ТЬг УаЬ Не Ьеи СЬу Агд ТЬг Туг Агд УаЬ УаЬ Рго СЬу СЬи
115 120 125
СЬи СЬи СЬп Ьуз РЬе СЬи УаЬ СЬи Ьуз Туг Не УаЬ Нхз Ьуз СЬи РЬе
130 Ь35 14 0
Азр Азр Азр ТЬг Туг Азр Азп Азр Не АЬа Ьеи Ьеи СЬп Ьеи Ьуз Зег
145 150 155 160
Азр Зег Зег Агд Суз АЬа СЬп СЬи Зег Зег УаЬ УаЬ Агд ТЬг УаЬ Суз
165 170 175
Ьеи Рго Рго АЬа Азр Ьеи СЬп Ьеи Рго Азр Тгр ТЬг СЬи Суз СЬи Ьеи
180 185 190
Зег СЬу Туг СЬу Ьуз Нхз СЬи АЬа Ьеи Зег Рго РЬе Туг Зег СЬи Агд
195 200 205
Ьеи Ьуз СЬи АЬа НЬз УаЬ Агд Ьеи Туг Рго Зег Зег Агд Суз ТЬх Зег
210 215 220
С1п 225 НЬз Ьеи Ьеи Азп Агд ТЬг Уа1 ТЬг 230 Азр Азп 235 МеЕ Ьеи Суз А1а С1у 240
Азр ТЬг Агд Зег 51 у С1у Рго С1п А1а Азп Ьеи НЬз Азр А1а Суз С1п
245 250 255
С1у Азр Зег С1у С1у Рго Ьеи Уа1 Суз Ьеи Азп Азр 51у Агд МеЕ ТЬг·
260 265 270
Ьеи Уа1 С1у Не Не Зег Тгр С1у Ьеи С1у Суз 61у С1п Ьуз Азр Уа1
275 280 285
Рго С1у Уа1 Туг ТЬг Ьуз Уа1 ТЬг Азп Туг Ьеи Азр Тгр Не Агд Азр
290 295 300
Азп МеЕ Агд Рго
305 <210> 18 <211> 268 <212> РКТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: К23 260-527 <400> 18
Зег Суз Зег ТЬг Суз С1у Ьеи Агд С1п Туг Зег С1п Рго С1п РЬе Агд 15 1015
Не Ьуз С1у С1у Ьеи РЬе А1а Азр Не А1а Зег НЬз Рго Тгр 61п А1а . 20 2530
А1а Не РЬе А1а Ьуз НЬз Агд Агд Зег Рго С1у С1и Агд РЬе Ьеи Суз 35 4045
С1у С1у Не Ьеи Не Зег Зег Суз Тгр Не Ьеи Зег А1а А1а НЬз Суз 50 5560
РЬе С1п С1и Агд РЬе Рго Рго НЬз НЬз Ьеи ТЬг Уа1 Не Ьеи С1у Агд 65 70 7580
ТЬг Туг Агд Уа1 Уа1 Рго С1у С1и С1и С1и С1п Ьуз РЬе С1и Уа1 С1и 85 9095
Ьуз Туг Не Уа1 НЬз Ьуз 61и РЬе Азр Азр Азр ТЬг Туг Азр Азп Азр 100 105110
Не А1а Ьеи Ьеи С1п Ьеи Ьуз Зег Азр Зег Зег Агд Суз А1а С1п С1и 115 120125
Зег Зег Уа1 Уа1 Агд ТЬг Уа1 Суз Ьеи Рго Рго А1а Авр Ьеи С1п Ьеи 130 135140
Рго Азр Тгр ТЬг С1и Суз С1и Ьеи Зег С1у Туг С1у Ьуз НЬз С1иА1а
145 150 155160
Ьеи Зег Рго РЬе Туг Зег С1и Агд Ьеи Ьуз С1и А1а НЬз Уа1 АгдЬеи
165 170175
Туг Рго Зег Зег 180 Агд Суз ТЬг Зег
ТЬг Азр Азп 195 МеЕ Ьеи Суз А1а С1у 200
А1а Азп 210 Ьеи НЬз Азр А1а Суз 215 С1п
Суз 225 Ьеи Азп Азр С1у Агд 230 МеЕ ТЬг
Ьеи С1у Суз С1у С1п 245 Ьуз Азр νβΐ
51п 185 ΗΪ3 Ьеи Ьеи Азп 190 ТЬг Уа1
Азр ТЬг Агд Зег С1у 205 С1у Рго С1п
51у Азр Зег С1у 220 С1у Рго Ьеи Уа1
Ьеи Уа1 С1у 235 11е 11е Зег Тгр С1у 240
Рго С1у 250 Уа1 Туг ТЬг Ьуз Уа1 255 ТЬг
Азп Туг Ьеи Азр Тгр 11е Агд Азр
260
Азп МеЕ Агд Рго
265 <210> 19 <211> 527 <212> РКТ <213> Ното зарЬепз
<40С Зег 1 |> 18 Туг С1п Уа1 Не 5 Суз Агд Азр 51и Ьуз 10 ТЬг С1п МеЕ Не Туг 15 С1п
51п НЬз С1п Зег 20 Тгр Ьеи Агд Рго Уа1 25 Ьеи Агд Зег Азп Агд 30 Уа1 С1и
Туг Суз Тгр 35 Суз Азп Зег С1у Агд 40 А1а Б1п Суз НЬз Зег 45 Уа1 Рго Уа1
Ьуз Зег 50 Суз Зег С1и Рго Агд 55 Суз РЬе Азп С1у С1у 60 ТЬг Суз С1п С1п
А1а 65 Ьеи Туг РЬе Зег 70 РЬе Уа1 Суз С1п Суз 75 Рго С1и С1у РЬе А1а 80
О1у Ьуз Суз Суз 01и 85 Не Азр ТЬг Агд А1а 90 ТЫ Суз Туг С1и Азр 95 С1п
С1у Не Зег Туг 100 Агд С1у ТЬг Тгр Зег 105 ТЬг А1а С1и Зег С1у 110 А1а <31и
Суз ТЬг Азп Тгр Азп Зег Зег А1а Ьеи А1а С1п Ьуз Рго Туг Зег С1у
115 120 125
Агд Агд Рго Азр А1а Не Агд Ьеи С1у Ьеи <51у Азп НЬз Азп Туг Суз 130 135 140
Агд Азп 145 Рго Азр Агд Азр 150 Зег Ьуз Рго Тгр Суз 155 Туг Уа1 РЬе Ьуз А1а 160
61у Ьуз Туг Зег Зег <31и РЬе Суз Зег ТЬг Рго А1а Суз Зег С1и С1у'
165 170 175
Азп Зег Азр Суз Туг РЬе С1у Азп С1у Зег А1а Туг Агд С1у ТЬг НЬз
С1у Ьеи С1у Ьуз НЬз Азп Туг Суз Агд Азп Рго Азр С1у Азр А1а Ьуз
225 230 235 240
Рго Тгр Суз НЬз Уа1 Ьеи Ьуз Азп Агд Агд Ьеи ТЬг Тгр С1и Туг Суз
245 250 255
Азр Уа1 Рго Зег Суз Зег ТЬг Суз С1у Ьеи Агд 61п Туг Зег С1п Рго
260 265 270
С1п РЬе Агд Не Ьуз С1у С1у Ьеи РЬе А1а Азр Не А1а 5ег Н15 Рго
<220>
<223> Описание искусственной последовательности: праймер <400> 24 асаСдсдасс д+дасаддсс ддссад 26 <210> 25 <211> 26 <212> ΟΝΑ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Описание искусственной последовательности: праймер <400> 25 сСддссддсс Ьд+сасддЬс дсаЕдС 26

Claims (7)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Способ получения тканевого активатора плазминогена (1РА), варианта 1РА, молекулы несущей домен кппДе 2 и серинпротеазу (К28) или варианта К28 в прокариотических клетках, где 1РА, вариант 1РА, молекула К28 или вариант К28 секретируется внеклеточно в виде активного протеина с правильной складчатостью, отличающийся тем, что прокариотическая клетка содержит и экспрессирует вектор, включающий ДНК, которая кодирует 1РА, вариант 1РА, молекулу К28 или вариант К28, функционально связанную с ДНК, которая кодирует сигнальный пептид ОтрА.
  2. 2. Способ по п.1, отличающийся тем, что прокариотическая клетка содержит и экспрессирует вектор, который включает ДНК, кодирующую 1РА, вариант 1РА, молекулу К28 или вариант К28, функционально связанную с ДНК, которая кодирует сигнальный пептид ОтрА, функционально связанный с молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей последовательность ТСТСАСССАААСАСТСАС (8 ЕС) ГО N0:1), или ее функционально активным производным.
  3. 3. Способ по п.1 или 2, отличающийся тем, что прокариотическая клетка представляет собой Е. сой.
  4. 4. Способ по любому из пп.1-3, отличающийся тем, что осуществляют следующие стадии:
    а) амплифицируют с помощью ПЦР ДНК, кодирующую 1РА, вариант 1РА, молекулу К28 или вариант К28;
    б) очищают ПЦР-продукт;
    в) встраивают указанный ПЦР-продукт в вектор, включающий ДНК, которая кодирует сигнальный пептид ОтрА, и ДНК, которая кодирует дрШ, таким образом, чтобы ПЦРпродукт в этом векторе был функционально связан против хода транскрипции с ДНК, кодирующей сигнальную последовательность ОтрА, и связан по ходу транскриции с ДНК, кодирующей дрШ;
    г) встраивают стоп-кодон между 1РА, вариантом 1РА, молекулой К28 или вариантом К28 и дрШ;
    д) экспрессируют вектор с помощью прокариотической клетки;
    е) очищают 1РА, вариант 1РА, молекулу К28 или вариант К28.
  5. 5. Способ по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что вектор представляет собой фаг мидный вектор, включающий ДНК, которая кодирует сигнальный пептид ОтрА, и ДНК, которая кодирует дрШ.
  6. 6. Способ по любому из пп.1-5, отличающийся тем, что вектор представляет собой фагмидный вектор рСотЬ83Н88.
  7. 7. Способ по любому из пп.1-6, отличающийся тем, что последовательность ДНК ОтрА, связанная против хода транскрипции с К28, включает следующую последовательность или ее вариант, полученный вследствие вырожденности нуклеотидного кода:
EA200300502A 2000-11-14 2001-11-07 СПОСОБЫ КРУПНОМАСШТАБНОГО ПРОИЗВОДСТВА ВЫВЕДЕННЫХ ИЗ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК МОЛЕКУЛ tPA ИЛИ K2S EA005163B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GBGB0027779.8A GB0027779D0 (en) 2000-11-14 2000-11-14 Methods for large scale production of recombinant dna-derived tpa or k2s molecules
PCT/EP2001/012857 WO2002040650A2 (en) 2000-11-14 2001-11-07 Methods for large scale production of recombinant dna-derived tpa or k2s molecules

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA200300502A1 EA200300502A1 (ru) 2003-12-25
EA005163B1 true EA005163B1 (ru) 2004-12-30

Family

ID=9903153

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA200300502A EA005163B1 (ru) 2000-11-14 2001-11-07 СПОСОБЫ КРУПНОМАСШТАБНОГО ПРОИЗВОДСТВА ВЫВЕДЕННЫХ ИЗ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК МОЛЕКУЛ tPA ИЛИ K2S

Country Status (32)

Country Link
EP (1) EP1407030B1 (ru)
JP (1) JP2004520018A (ru)
KR (1) KR100856346B1 (ru)
CN (1) CN100567495C (ru)
AR (1) AR031334A1 (ru)
AT (1) ATE504652T1 (ru)
AU (2) AU2181502A (ru)
BG (1) BG66121B1 (ru)
BR (1) BR0115344A (ru)
CA (1) CA2428642C (ru)
CZ (1) CZ20031657A3 (ru)
DE (1) DE60144395D1 (ru)
EA (1) EA005163B1 (ru)
EC (1) ECSP034573A (ru)
EE (1) EE200300232A (ru)
GB (1) GB0027779D0 (ru)
HK (1) HK1070097A1 (ru)
HR (1) HRP20030377A2 (ru)
HU (1) HUP0301619A3 (ru)
IL (2) IL155568A0 (ru)
MX (1) MXPA03004161A (ru)
MY (1) MY129838A (ru)
NO (1) NO20032143L (ru)
NZ (1) NZ526280A (ru)
PL (1) PL206783B1 (ru)
SK (1) SK5792003A3 (ru)
TW (1) TWI292782B (ru)
UA (1) UA75102C2 (ru)
UY (1) UY27020A1 (ru)
WO (1) WO2002040650A2 (ru)
YU (1) YU36103A (ru)
ZA (1) ZA200303547B (ru)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7087412B2 (en) 2000-11-14 2006-08-08 Boehringer Ingelheim International Gmbh Methods for large scale protein production in prokaryotes
US6955910B2 (en) 2000-11-14 2005-10-18 Boehringer Ingelheim International Gmbh Method for large scale production of recombinant DNA-derived TPA or K2S molecules
IL190184A0 (en) * 2008-03-16 2009-02-11 Hadasit Med Res Service tPA MUTANT IN THE TREATMENT OF ACUTE BRAIN INJURY AND NEURODEGENERATIVE DISORDERS

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
IL87276A (en) * 1987-08-03 1995-07-31 Fujisawa Pharmaceutical Co Analog of a tissue plasminogen activator containing the Pringle 2 and protease regions only, DNA encoding it, processes for its preparation, and pharmaceutical preparations containing it
WO1997038123A1 (en) * 1996-04-05 1997-10-16 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods for producing soluble, biologically-active disulfide bond-containing eukaryotic proteins in bacterial cells
CA2291482A1 (en) * 1997-05-28 1998-12-03 Human Genome Sciences, Inc. Tissue plasminogen activator-like protease
US6083715A (en) * 1997-06-09 2000-07-04 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods for producing heterologous disulfide bond-containing polypeptides in bacterial cells
EP1048732A1 (de) * 1999-04-26 2000-11-02 F. Hoffmann-La Roche Ag Verfahren zur Herstellung von natürlich gefalteten und sekretierten Proteinen
EP1077263A1 (de) * 1999-07-29 2001-02-21 F.Hoffmann-La Roche Ag Verfahren zur Herstellung von natürlich gefalteten und sekretierten Proteinen durch Co-Sekretion von Chaperonen
GB0027782D0 (en) * 2000-11-14 2000-12-27 Boehringer Ingelheim Int Methods fro large scale protein productio in prokaryotes

Also Published As

Publication number Publication date
PL206783B1 (pl) 2010-09-30
EA200300502A1 (ru) 2003-12-25
KR100856346B1 (ko) 2008-09-04
BR0115344A (pt) 2003-08-26
EP1407030B1 (en) 2011-04-06
NO20032143L (no) 2003-07-07
HUP0301619A3 (en) 2006-11-28
HRP20030377A2 (en) 2005-04-30
WO2002040650A2 (en) 2002-05-23
CN100567495C (zh) 2009-12-09
AR031334A1 (es) 2003-09-17
HK1070097A1 (en) 2005-06-10
MXPA03004161A (es) 2004-04-20
KR20030059252A (ko) 2003-07-07
TWI292782B (en) 2008-01-21
IL155568A0 (en) 2003-11-23
EE200300232A (et) 2003-10-15
ATE504652T1 (de) 2011-04-15
UY27020A1 (es) 2002-07-31
BG66121B1 (bg) 2011-05-31
DE60144395D1 (de) 2011-05-19
SK5792003A3 (en) 2004-01-08
CN1541271A (zh) 2004-10-27
PL361881A1 (en) 2004-10-04
JP2004520018A (ja) 2004-07-08
CZ20031657A3 (cs) 2003-10-15
ZA200303547B (en) 2004-05-10
IL155568A (en) 2010-02-17
WO2002040650A3 (en) 2003-12-31
UA75102C2 (en) 2006-03-15
EP1407030A2 (en) 2004-04-14
ECSP034573A (es) 2003-05-26
MY129838A (en) 2007-05-31
AU2002221815B2 (en) 2007-08-23
HUP0301619A2 (hu) 2003-09-29
YU36103A (sh) 2006-05-25
AU2181502A (en) 2002-05-27
GB0027779D0 (en) 2000-12-27
CA2428642C (en) 2010-03-30
NO20032143D0 (no) 2003-05-13
NZ526280A (en) 2006-02-24
CA2428642A1 (en) 2002-05-23
BG107780A (bg) 2004-02-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US8313928B2 (en) Expression system
JP2561708B2 (ja) 新規な組織プラスミノーゲン活性化因子
AU2006336468A1 (en) Method of expressing proteins with disulfide bridges
US7462476B2 (en) Methods for large scale production of recombinant DNA-derived tPA or K2S molecules
JP2002165593A (ja) シュードモナス・アエルギノザの外部膜タンパク質f
US7087412B2 (en) Methods for large scale protein production in prokaryotes
KR100857402B1 (ko) 원핵세포에서의 단백질 대량 생산 방법
JPS5869897A (ja) Dna遺伝子
EA005163B1 (ru) СПОСОБЫ КРУПНОМАСШТАБНОГО ПРОИЗВОДСТВА ВЫВЕДЕННЫХ ИЗ РЕКОМБИНАНТНОЙ ДНК МОЛЕКУЛ tPA ИЛИ K2S
DK175020B1 (da) Fremgangsåde til udtrykkelse og ekstracellulær udskillelse af proteiner i G(-)bakterie, rekombinant DNA-konstruktion og plasmidvektor kodende herfor, samt G(-)bakterie indeholdende disse
JPH0478276B2 (ru)
WO2003008594A1 (en) Construction of the plasmid for expressing the thrombus-targeting thrombolytic fusion protein
AU2002221815A1 (en) Methods for large scale production of recombinant DNA-derived tPA or K2S molecules
JPH05508771A (ja) Ancrod類似蛋白質、その製造及び使用
Gouveia Recombinant Antimicrobial Polypeptides as Alternative Antibacterial Agents
KR100212979B1 (ko) 스타필로키나제 발현 재조합 미생물 및 그를 이용한 스타필로키나제의 제조방법
JP2007053999A (ja) 抗gtf抗体及びその製造方法
JPH04112791A (ja) トリプスタチン構造遺伝子及びその用途

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ KG MD TJ TM

MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): BY KZ RU