DE10049902A1 - Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihre Detektion - Google Patents
Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihre DetektionInfo
- Publication number
- DE10049902A1 DE10049902A1 DE2000149902 DE10049902A DE10049902A1 DE 10049902 A1 DE10049902 A1 DE 10049902A1 DE 2000149902 DE2000149902 DE 2000149902 DE 10049902 A DE10049902 A DE 10049902A DE 10049902 A1 DE10049902 A1 DE 10049902A1
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- electrodes
- sensor
- macromolecules
- electrical
- conductive polymer
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Withdrawn
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54366—Apparatus specially adapted for solid-phase testing
- G01N33/54373—Apparatus specially adapted for solid-phase testing involving physiochemical end-point determination, e.g. wave-guides, FETS, gratings
- G01N33/5438—Electrodes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00653—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being bound to electrodes embedded in or on the solid supports
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07B—GENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
- C07B2200/00—Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
- C07B2200/11—Compounds covalently bound to a solid support
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/60—Detection means characterised by use of a special device
- C12Q2565/607—Detection means characterised by use of a special device being a sensor, e.g. electrode
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Investigating Or Analyzing Materials By The Use Of Electric Means (AREA)
Abstract
Es wird eine elektrisch adressierbare Vorrichtung und ein Verfahren zur beschleunigten Immobilisierung von elektrisch geladenen Makromolekülen wie Nukleinsäuren und Proteinen beschrieben. Die Vorrichtung besteht dabei aus DOLLAR A - mindestens einem Träger mit einer oder mehreren darauf befindlichen Sensorpositionen, die jeweils wenigstens eine Elektrodenoberfläche umfassen sowie mit Flächen versehen sind, an denen Makromoleküle immobilisiert werden können; DOLLAR A - einer Steuereinheit, welche über elektrische Zuleitungen an die Elektroden unabhängig voneinander elektrische Signale applizieren kann; DOLLAR A - einem elektrisch leitfähigen Polymeren auf wenigstens einer Elektrodenoberfläche wenigstens eines Teiles der Sensorpositionen; DOLLAR A - einem Elektrolyten, der in Kontakt mit wenigstens einem Teil der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Sensorflächen ist und der die zu immobilisierenden Makromoleküle enthält oder enthalten könnte.
Description
Die Erfindung betrifft ein neues Verfahren und eine neue Vorrichtung zur elektrisch
beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihrer Detektion.
Die Detektion einer oder mehrerer unterschiedlicher Molekülstrukturen aus einer
Lösung heraus ist ein essentieller Bestandteil vieler biochemischer Untersuchungen.
Eine weit verbreitete Methode besteht darin, die zu detektierenden Moleküle selektiv zu
immobilisieren und anschließend zu detektieren. Typischerweise werden die zu
erkennenden Molekülstrukturen (Zielmoleküle) aus Liganden gebildet, die durch
spezifische Rezeptoren (Fängermoleküle) erkannt und gebunden werden. Zu solchen
Systemen gehören z. B. Antigen-Antikörper- oder Ligand-Rezeptor-Reaktionen oder
Hybridisierungen von Nukleinsäuren. Als Fängermoleküle können Verbindungen
eingesetzt werden, die stabile und spezifische Bindungen mit den zu erkennenden
Molekülen eingehen. Beispiele von Fängermolekülen sind mono- oder polyklonale
Antikörper, Antigene, Enzyme, Coenzyme, Enzyminhibitoren und -aktivatoren, Proteine,
Hormone, Hormonrezeptoren, Agonisten und Antagonisten für Zellmembranrezeptoren,
Oligosaccharide, Lectine, Toxine, Pathogene, Bakterien, Oligonukleotide,
Nukleinsäuren, Nukleinsäure bindende Proteine wie z. B. Transkriptionsfaktoren,
Peptide oder auch synthetische Paarungssysteme, wie PNA, p-RNA, p-DNA oder
CNA. Aber auch unspezifisch wirkende Fängermoleküle, wie z. B. Lectine sind
verwendbar. Auch die Inhibierung der Erkennung durch kleine Moleküle oder die
Bindung kleiner Moleküle an Biomoleküle selbst ist in diesem Zusammenhang zu
nennen. Die Erkennung der Präsens solcher Molekülstrukturen und in vielen Fällen
auch ihre Quantifizierung ist insbesondere in der Wirkstoffentwicklung der
pharmazeutischen Industrie, der Therapieverfolgung bei medizinischer Behandlung, der
medizinischen Diagnostik aber auch in den Agrarwissenschaften und der Forensik von
Bedeutung.
In der Regel will man eine Probe auf mehrere verschiedenartige Zielmoleküle hin
gleichzeitig analysieren. Dazu bietet sich das Format eines Chips an, bei dem auf einem
ebenen Substrat verschiedene Sensorpositionen definiert sind. Die selektive Beladung
der verschiedenen Sensorpositionen mit spezifischen Erkennungsmolekülen
(Fängermoleküle) kann z. B. mit Hilfe eines Dispensers geschehen. Es können jedoch
auch elektrische oder andere Verfahren genutzt werden.
In US 4787963 und WO 96/01836 wird ein Verfahren vorgestellt, wie die
Immobilisierung der zu detektierenden Moleküle in wässriger Lösung elektrisch
gesteuert und beschleunigt werden kann. Dabei nutzt man die Tatsache aus, daß die
meisten der interessierenden Moleküle in der Lösung in ionischer Form, also elektrisch
geladen, vorliegen. Zur Steuerung und Beschleunigung der Immobilisierung werden die
Moleküle mittels Elektrophorese nahe der Elektrode angereichert und so die
Immobilisierungsrate erhöht. Dies verkürzt die zur Immobilisierung der Zielmoleküle
notwendige Inkubationszeit der Elektrode bzw. des gesamten Chips deutlich. Dabei wird
insbesondere darauf hingewiesen, daß eine elektrolytische Zersetzung des wässrigen
Lösungsmittels notwendig ist, um den erforderlichen Gleichstrom aufrecht erhalten zu
können. Dies erfordert seinerseits einen Schutz der Zielmoleküle vor den daraus
resultierenden chemischen Folgeprodukten, was durch eine für diese Moleküle
undurchlässige Schicht über der Elektrode erreicht wird. Auf der anderen Seite muß
diese Schicht durchlässig für Wasser und kleine Ionen sein.
In WO 96/01836 wird weiterhin offenbart, daß mit diesem Verfahren neben der
selektiven und beschleunigten Immobilisierung der zu detektierenden Moleküle
(Zielmoleküle) auch eine selektive Beladung mit biologischen Erkennungssystemen
(Fängermoleküle) vorgenommen werden kann. Darüberhinaus kann die elektrische
Feldapplikation auch in umgekehrter Richtung zum Wegtreiben geladener Biomoleküle
aus der unmittelbaren Umgebung der Elektrode genutzt werden. Auf diese Weise
können z. B. unspezifisch gebundene Zielmoleküle oder zum Fängermolekül nicht ganz
komplementäre Zielmoleküle (sog. Mismatches) wieder mobilisiert werden, so daß nur
die gewünschten genau passenden Zielmoleküle immobilisiert übrigbleiben.
Bekanntestes Beispiel hierfür ist bei der Hybridisierung von Nukleinsäuremolekülen die
Diskriminierung zwischen genau passenden komplementären Nukleotidsträngen und
solchen, bei denen eine Base nicht das entsprechende passende Pendant vorfindet,
also die Detektion von sog. Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). Diese
Diskriminierungsmöglichkeit wird gemeinhin als Stringenzkontrolle bezeichnet und ist
z. B. beschrieben in WO 96/01836 und in Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 1119-1123,
Feb. 1997.
In US 5653939 wird zwar auch auf die Möglichkeit einer Beschleunigung der
Immobilisierung von Oligonukleotiden und deren Hybridisierung hingewiesen, jedoch
wird nicht offenbart, wie dies effizient geschehen kann. In WO 96/01836 und z. B. in
Electrophoresis 2000, 21, 157-164 wird dargelegt, daß dazu die Aufrechterhaltung eines
Stromes notwendig ist, was seinerseits durch das Aufrechterhalten einer laufenden
Elektrolyse erreicht wird. Diese Möglichkeit wird, wie in WO 96/01836 offenbart wird,
durch eine besondere, sogenannte Permeation Layer oder Permeationsschicht eröffnet,
die bestimmte funktionelle Eigenschaften besitzt. Dabei sind unabdingbar die
Undurchlässigkeit für die zu detektierenden Biomoleküle und die Durchlässigkeit für
Wasser und kleine Ionen. Des weiteren dient diese Schicht zum Schutz der
Biomoleküle vor den adversen Bedingungen, die durch die Elektrolyseprodukte wie H+,
OH-, H2, O2 und freie Radikale hervorgerufen werden, indem sie die Biomoleküle
typischerweise einige µm von der Elektrode entfernt hält. Integraler Bestandteil der in
WO 96/01836 offenbarten Vorrichtung ist deshalb eine sogenannte Attachment Layer
zum Anbinden der Biomoleküle, die entweder in die Permeationsschicht integriert oder
als separate Schicht auf sie aufgebracht wird.
Die oben geschilderten Verfahren und Vorrichtungen haben eine Reihe von Nachteilen.
Die Elektrolyse erfordert relativ hohe Spannungen und muß sehr genau geführt werden,
damit die dabei gebildeten Gase nicht zur Blasenbildung führen und die Elektrode
isolieren oder die Permeationsschicht schädigen. Des weiteren erfordern die agressiven
Elektrolyseprodukte eine hohe Stabilität der Permeationsschicht und bilden trotz aller
Vorsichtsmaßnahmen eine Gefahr für die Biomoleküle.
Bei der Detektion mittels elektrischer Verfahren ist es vorteilhaft, die Biomoleküle
möglichst nahe an der Elektrode zu immobilisieren, was wegen der oben geschilderten
Maßnahmen zum Schutz der Biomoleküle stark limitiert ist.
In dem vorliegenden erfindungsgemäßen Verfahren wird die Elektrode mit einem
leitfähigen Polymer beschichtet. Mit dieser Beschichtung kann ein elektrischer
Gleichstrom ohne elektrolytische Zersetzung der Lösung überraschend lange aufrecht
erhalten werden, was die elektrophoretische Anreicherung der nur eine relativ geringe
Beweglichkeit aufweisenden Biomoleküle an der Elektrode ermöglicht.
Zur Immobilisierung der aufkonzentrierten Biomoleküle (Fängermoleküle) kann das
elektrisch leitfähige Polymer modifiziert werden, z. B. durch Einlagerung von
Bindungsgruppen wie Avidin oder Streptavidin oder durch kovalente Funktionalisierung
mit chemisch reaktiven Gruppen wie Carbonsäureestern oder Aminogruppen.
Eine andere Möglichkeit besteht darin, das elektrisch leitfähige Polymer mit einer
weiteren Schicht zu belegen, welche solche Bindungsstellen enthält. Beispiele für
solche Schichten sind Agarose mit eingelagertem Avidin oder Streptavidin oder
Polyacrylamid.
Eine wiederum andere Möglichkeit besteht darin, daß in unmittelbarer räumlicher Nähe
der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Elektrode Flächen
implementiert werden, auf denen unmittelbar oder über eine darauf befindliche
Anbindungsschicht die Biomoleküle angebunden werden können. Diese Flächen
können ihrerseits selbst Elektroden darstellen oder mit Elektroden unterlegt sein.
Zur Detektion der auf den zugehörigen Fängermolekülen immobilisierten Zielmolekülen
kann eine ganze Reihe von Verfahren verwendet werden, wie Autoradiographie,
optische Auslesung mittels Fluoreszenzspektroskopie, elektromechanische Verfahren
(Quarzwaage) oder elektrische Detektionsverfahren.
Besonders vorteilhaft sind elektrische Ausleseverfahren, da sie apparativ weniger
aufwendig und leichter zu miniaturisieren sind. Zudem bedürfen sie nicht
notwendigerweise einer radioaktiven oder fluoreszierenden Markierung der Moleküle.
Außerdem ist die elektrische Auslesung universell bzgl. des Chipformates - unabhängig
vom Chipformat ist eine direkte digitale Positionszuordnung möglich.
Beispiele für elektrische Verfahren und Vorrichtungen dieser Art sind z. B. offenbart in
WO 88/09499, EP 0543550, US 5653939, WO 97/21094 und WO 97/34140.
Bei allen diesen Verfahren werden die zu detektierenden Moleküle entweder direkt auf
oder zwischen den mit Elektroden bestückten Meßchip oder auf einer dafür
vorgesehenen Schicht auf dem Chip immobilisiert. In US 5653939, WO 97/21094 und
WO 97/34140 werden sehr feine, im sub-µm-Bereich strukturierte Elektroden
beschrieben, die große Vorteile durch höhere Sensitivität bei der
Impedanzspektroskopie und dem Redox-Recycling besitzen. Die Methode des Redox-Recycling
wird auch beschrieben in Sensors and Actuators B 26-27 (1995) 394-397.
Insbesondere bietet sich eine elektrische Detektion an, wenn man zum Zwecke der
elektrisch beschleunigten Immobilisierung ohnehin mit Chipformaten arbeitet, die mit
Elektroden versehen sind und an elektrische Steuereinheiten gekoppelt sind. Hier
ergeben sich sowohl strukturelle (elektrische Kontakte, Leiterbahnen, Elektroden) als
auch funktionelle (elektrische Signalgeneratoren und Meßinstrumente) Synergien.
Nachteil der oben geschilderten bekannten Verfahren und Vorrichtungen ist, daß mit
den vorgeschlagenen Vorrichtungen eine Kopplung von elektrisch beschleunigter
Immobilisierung und Hybridisierung auf der einen Seite und elektrischer Detektion auf
der anderen Seite nicht oder nur in ungenügender Weise möglich ist. Dies liegt u. a.
darin begründet, daß die beschleunigte Immobilisierung und Hybridisierung ein
Fernhalten der zu detektierenden Moleküle von den Elektroden erfordert
(Electrophoresis 2000, 21, 157-164), eine hohe Sensitivität beim Auslesen mittels
Impedanzspektroskopie oder Redox-Recycling jedoch möglichst kleiner
Elektrodenstrukturen im µm oder sub-µm-Bereich bedarf, wobei die zu detektierenden
Moleküle möglichst nahe an der Elektrode immobilisiert werden müssen (Sensors and
Actuators B49, (1998) 73-80), um hohe Sensitivität zu erhalten.
In der vorliegenden Erfindung wird dieser Konflikt dadurch gelöst, daß zur elektrisch
beschleunigten Immobilisierung keine Elektrolyse betrieben werden muß und die
Biomoleküle in unmittelbarer Nähe der stromführenden Elektrode immobilisiert werden
können. Es kann jedoch auch eine Arbeitsteilung vorgenommen werden zwischen einer
Elektrode oder einem Satz von Elektroden (Mobilisierungselektroden), die mit einem
elektrisch leitfähigen Polymer beschichtet sind und mit deren Hilfe die zu detektierenden
Moleküle elektrophoretisch über der betreffenden Sensorposition anreichert werden mit
der Folge einer beschleunigten Immobilisierung auf einem zweiten Satz von Elektroden
(Sensorelektroden) auf derselben Sensorposition, der für eine hochsensitive Detektion
genutzt wird.
Gegenstand der Erfindung ist eine elektrisch adressierbare Vorrichtung, bestehend aus
- - einem Träger mit einer oder mehreren darauf befindlichen Sensorpositionen, die jeweils wenigstens eine Elektrodenoberfläche umfassen sowie mit Flächen versehen sind, an denen Makromoleküle immobilisiert werden können;
- - einer Steuereinheit, welche über elektrische Zuleitungen an die Elektroden unabhängig voneinander elektrische Signale versenden kann;
- - einem elektrisch leitfähigen Polymeren auf wenigstens einer Elektrodenfläche wenigstens eines Teiles der Sensorpositionen;
- - einem Elektrolyten, der in Kontakt mit wenigstens einem Teil der mit dem elektrisch leitfähigen Polymeren beschichteten Sensorfläche ist und der die zu immobilisierenden Makromoleküle enthält.
Das Trägermaterial der erfindungsgemäßen Vorrichtung besteht vorzugsweise aus
Silizium, Siliziumdioxid, Glas, Keramik oder Kunststoff, oder aus einem Verbund dieser
Stoffe. In das Trägermaterial ist ein aktiver Halbleiterchip mit elektrischen Schaltkreisen
oder mit CMOS-Bausteinen integriert.
Die Elektroden der erfindungsgemäßen Vorrichtung bestehen unabhängig voneinander
aus metallischen Materialien wie Gold, Platin, Palladium, Silber, Kupfer, Aluminium oder
aus Kohlenstoff.
Das auf wenigstens eine Elektrodenfläche aufgeschichtete elektrisch leitfähige
Polymere wird aus der Gruppe Polyethylen, Polythiophen, Polypyrrol,
Polyparaphenylen, Polyanilin oder Polyparaphenylenvinylen oder Modifikationen dieser
Polymere ausgewählt. Das leitfähige Polymere kann auch funktionelle Gruppen zur
Bindung von Makromolekülen enthalten, die auch physikalisch im leitfähigen Polymer
eingeschlossen sein können. Bevorzugte funktionelle Gruppen sind Avidin oder
Streptavidin. Es können aber auch als kovalent gebundene Gruppen
Carbonsäuregruppen oder deren Derivate wie Aktivester oder Aminogruppen eingesetzt
werden.
Eine Variante der erfindungsgemäßen Vorrichtung besteht darin, dass auf das
elektrisch leitfähige Polymere eine Bindungsschicht aufgetragen wird, die elektrisch
nicht leitfähig zu sein braucht, aber durchlässig für Wasser und kleine Ionen ist und die
funktionelle Gruppen zur Anbindung von Makromolekülen enthält. Diese
Bindungsschicht kann vorzugsweise aus der Gruppe Agarose, Polyacrylamid oder
Polyurethan ausgewählt werden.
Eine weitere Variante der erfindungsgemäßen Vorrichtung besteht darin, dass die
Sensorpositionen wenigstens eine weitere Elektrodenfläche, sog. Sensorelektroden,
aufweisen, die nicht mit einem elektrisch leitfähigen Polymeren beschichtet sind. Die
Sensorelektroden sind vielmehr vorteilhafterweise mit Makromolekülen bestückt, diese
werden bei aus Gold bestehenden Sensorelektroden mit einer SH-Gruppe an die
Elektrode gebunden. Die Sensorelektroden können aber auch mit einer
Bindungsschicht belegt sein, die funktionelle Gruppen zur Anbindung von
Makromolekülen enthält. Beispiele solcher Bindungsschichten sind Agarose,
Polyacrylamid oder Polyurethan.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung kann so ausgestaltet sein, dass die mit dem
elektrischen Polymeren belegten Elektroden und die Sensorelektroden zueinander
höhenversetzt sind.
Eine bevorzugte Ausführungsform besteht darin, dass die Sensorpositionen mit drei
unabhängigen Elektroden, einer mit dem elektrischen Polymer beschichteten und zwei
Sensorelektroden bestückt sind. Dabei bilden die beiden Sensorelektroden schmale,
lange, fingerähnliche Strukturen mit einer Fingerbreite unter 2 µm. Wenn die
Sensorelektroden Interdigitalelektroden darstellen, können zumindest einige
Zwischenräume durch eine mit einem elektrisch leitfähigen Polymer beschichtete
Elektrode ausgefüllt werden. Die Sensorpositionen sind in einem zweidimensionalen
Array angeordnet und weisen im Allgemeinen ein Rastermaß von 10 bis 1000 µm auf.
Die Elektroden der Sensorpositionen sind an eine elektrische Steuerungs- und
Ausleseeinheit angekoppelt und können zusätzlich noch durch eine auf dem Träger
flächig aufgebrachte Referenzelektrode ergänzt werden. Als Referenzelektroden
kommen Silber, Platin, Silber/Silberchlorid oder andere literaturbekannte
Standardsysteme in Betracht.
Die Erfindungsgemäße Vorrichtung muss Sensorpositionen aufweisen, die mit einem
flüssigen Elektrolyten benetzt werden können, der die zu detektierenden Moleküle
enthält. Das kann zweckmäßigerweise in einer Durchflusskammer stattfinden.
Schließlich kann die erfindungsgemäße Vorrichtung auch so ausgestaltet sein, dass die
Sensorelektroden der verschiedenen Sensorpositionen selektiv mit Makromolekülen als
spezifischen Erkennungssystemen bestückt sind.
Abb. 1 zeigt eine erfindungsgemäße Vorrichtung. Auf einem festen Träger (1) und einer
darüberliegenden Isolationsschicht (2) befinden sich sogenannte
Mobilisierungselektroden (3) und Detektions- oder Sensorelektroden (4). Über den
Mobilisierungselektroden befindet sich eine elektrisch leitfähige Polymerschicht (5).
Abb. 1 zeigt auch einen vergrößerten Ausschnitt eines Satzes der Mobilisierungs- und
Sensorelektroden.
Abb. 2 illustriert, wie bei Beaufschlagung des mittleren Satzes von
Mobilisierungselektroden mit einem geeigneten elektrischen Potential der
darüberliegende Bereich des Elektrolyten (6) mit den zu detektierenden Molekülen
angereichert (7) wird.
Zur Detektion der vorzugsweise auf den Sensorelektroden immobilisierten Molekülen
können neben elektrochemischen bzw. elektrischen auch optische, elektromechanische
oder radiometrische Verfahren eingesetzt werden. Ggf. können die zu detektierenden
Moleküle auch mit elektrisch aktiven Labeln oder elektrisch aktiven Reportergruppen,
wie Ferrocen, PQQ oder Porphyrine markiert werden, um die Sensitivität der
elektrochemischen oder elektrischen Analyse zu erhöhen.
Bevorzugt erfolgt die Detektion elektrisch bzw. elektrochemisch, z. B. mittels
Cyclovoltametrie, ganz besonders bevorzugt sind dabei die Impedanzanalyse und das
Redox-Recycling. Dabei können neben den Sensorelektroden weitere Hilfselektroden
z. B. als Referenzelektroden oder stromabführende Gegenelektroden zum Einsatz
kommen. Diese Hilfselektroden können z. B. auf dem Chip vorhandene
Mobilisierungselektroden oder andere auf dem Chip integrierte Elektroden oder externe
mit dem Elektrolyt in elektrischem Kontakt befindliche Elektroden sein.
Bei der Impedanzanalyse wird bevorzugt die Impedanzspektroskopie verwendet. Dabei
wird an die Sensorelektroden eine Wechselspannung unterschiedlicher Frequenz
angelegt. Die Frequenz der Wechselspannung sowie die Stärke der angelegten
Wechselspannung sind frei wählbar. Ein typischer Frequenzbereich geht dabei von
0,1 Hz bis 20 MHz, bevorzugt ist ein Bereich von 1 Hz bis 5 MHz. Ein typischer
Spannungsbereich reicht von 0,1 mV bis zu 10 V, bevorzugt ist hier 1 bis 100 mV.
Ebenso frei wählbar ist die geometrische Anordnung und Größe der Elektroden, durch
die auch die Wahl der vorteilhaftesten Frequenz und Spannung gesteuert werden kann.
Ggf. können die zu detektierenden Moleküle auch mit elektrisch aktiven Labeln
markiert werden, um die Sensitivität der Impedanzanalyse zu erhöhen.
In einer bevorzugten Ausführungsform stellen die Sensorelektroden sog.
Interdigitalelektroden da, die sich durch besonders hohe Sensitivität auszeichnen
(Sensors & Actuators B49 (1998) 73-80).
Abb. 3 zeigt eine solche Ausführungsform für das in Abb. 1 gezeigte Beispiel in
Seitenansicht und in Aufsicht. Die Sensorelektroden (1) ragen fingerförmig ineinander,
wobei benachbarte Finger elektrisch gegeneinander geschaltet werden können. Sie
sind getrennt durch isolierende Bereiche und eine oder mehrere
Mobilisierungselektroden. Die Mobilisierungselektroden sind mit einer elektrisch
leitfähigen Polymerschicht (2) belegt, die zur Sichtbarmachung der
Mobilisierungselektrode (3) teilweise freigelegt wurde.
In Abb. 4(a) bis (c) sind verschiedene Ausführungsformen des Höhenversatzes von
Mobilisierungs- und interdigitierenden Sensorelektroden illustriert. In (a) wird eine
Isolationsschicht, z. B. (photostrukturierbares) Polyimid (2) auf die durchgehende
Mobilisierungselektrode (1) aufgebracht, photostrukturiert und die erhabenen Bereiche
metallisiert (3). Die laterale Strukturierung kann auch auf andere in der Photolitographie
übliche Weisen geschehen. So kann z. B. auch die zunächst noch unstrukturiert auf der
Mobilisierungselektrode aufgebrachte Isolationsschicht metallisiert werden und
anschließend Metallschicht und Isolationsschicht durch photolithographische Verfahren
strukturiert werden.
Abb. 4(b) zeigt eine Ausführungsform bei der die Mobilisierungselektrode (1) strukturiert
ist und nicht mit Mobilisierungselektrode belegte Bereiche (2) mit einem von der
Mobilisierungselektrode isolierten leitfähigen Steg (3) versehen sind, auf dem eine aus
geeignetem Material bestehende leitfähige Beschichtung (4) aufgebracht ist.
Abb. 4(c) zeigt die Möglichkeit der Erzielung eines Höhenversatzes durch Vertiefungen
(1) in der SiO2-Schicht, die die Oberseite des Chips vom Si-Substrat isoliert. Solche
Vertiefungen können z. B. in die SiO2-Schicht geätzt werden. In den Vertiefungen liegen
die Mobilisierungselektroden (2) während sich die Sensorelektroden (3) auf den
erhabenen Stellen befinden.
Abb. 4(d) stellt eine Ausführungsform dar, bei der mehrere interdigitierende Finger (1)
auf einer erhabenen Stelle (2) ohne zwischenliegende Mobilisierungselektrode (3) eng
benachbart nebeneinander angeordnet sind. Diese Variante ist besonders bevorzugt bei
Anwendungen, bei denen es auf hohe Sensitivität ankommt und auch besonders
bevorzugt beim Redox-Recycling. Die Anzahl der unmittelbar benachbarten Finger kann
dabei beliebig gewählt werden, besonders bevorzugt ist eine Anzahl von 1 bis 10
Finger.
Typische Schichtdicken der elektrisch leitenden Polymerschicht liegen im Bereich
einiger µm- oder sub-µm-Bereich. Die notwendige laterale Strukturierung erfolgt
bevorzugt durch Elektropolymerisation. Bestehen Mobilisierungs- und Sensorelektroden
aus verschiedenen metallischen Materialien, kann deren selektives Bindungsverhalten
zu einer selektiven Aufbringung einer elektrisch leitfähigen Polymerschicht genutzt
werden. Eine photolitographische Strukturierung kann z. B. durch ein lift-off-Verfahren
oder durch eine direkte Strukturierung einer photoempfindlichen elektrisch leitfähigen
Polymerschicht vorgenommen werden. Es kann auch eine photoinduzierte
Polymerisation von geeigneten Mono- und Oligomeren zur strukturierten Belegung des
Chips mit einer elektrisch leitfähigen Polymerschicht verwendet werden. Dabei wird der
ganze Chip z. B. mittels Spin Coating mit einer Lösung beschichtet, die neben einem
polymerisierbaren Baustein eine photosensitive Initiatorkomponente zur Polymerisation
enthält. Eine Belichtung mittels entsprechender Masken führt dann zu einer lateral
strukturierten Polymerisation. Die nicht polymerisierten Bereiche werden dann mit
einem geeigneten Lösungsmittel von den nicht polymerisierten Monomer- oder
Oligomerbausteinen befreit.
Die Anbindung von Fängermolekülen kann direkt auf den Sensorelektroden erfolgen
über funktionelle Gruppen, die kovalent an die Fängermoleküle gebunden sind, wie
Thiollinkern bei Elektroden aus Gold oder über eine vorausgeschaltete
Funktionalisierung der Metalloberfläche z. B. in Form von Aminopropyltriethoxysilan an
das mit Aktivester funktionalisierte Fängermoleküle gebunden werden.
Eine gegebenenfalls verbleibende Aufnahmekapazität der Elektrodenoberfläche nach
Anbindung der Fängermoleküle kann vollständig mit Molekülen abgesättigt werden, die
in den folgenden Schritten keine Bindung mit Molekülen eingehen, die mit der
Sensorposition in Kontakt kommen, so daß keine weiteren unspezifischen Bindungen
an die Elektrode möglich sind. Diese Moleküle sind vorzugsweise sehr reaktiv, was die
Anbindung an die Elektrode betrifft, damit möglichst alle verbleibenden freien
Reaktionsstellen besetzt werden und sie sind vorzugsweise kleiner als die eigentlichen
Fängermoleküle, um den nachfolgenden Erkennungsprozeß nicht zu stören.
Für die Immobilisierung von Nukleinsäuren aufgrund von Hybridisierung mit passenden
Fängeroligonukleotiden auf der Sensorposition wird vorzugsweise ein hochohmiger
Elektrolyt gewählt, der zu höherer strominduzierter Verdichtung der Nukleinsäuren in
der Nähe der Sensorposition führt. Andererseits muß der Elektrolyt natürlich den
Hybridisierungsprozeß stützen. Beispiele solcher Puffer sind niedrigkonzentrierte
Standardpuffer, wie Phosphatpuffer oder Zwitterionenpuffer, wie Histidin.
Im Falle der elektrisch beschleunigten Hybridisierung von (anionischen) Nukleinsäuren
kann man zur Verminderung des Anteils der anderen Anionen im Elektrolyt am
elektrischen Strom im Vergleich zu den Nukleinsäuren Elektrolyten verwenden mit
Anionen, die besonders geringe Beweglichkeiten aufweisen. Dazu können z. B.
Elektrolyte eingesetzt werden mit besonders großem Molekulargewicht der Anionen, wie
Borate, Tartrate, Citrate oder mit an mikroskopische Kügelchen gebundene Anionen,
wie mit Carboxylatgruppen versehene Polystyrolbeads.
Das erfindungsgemäße Verfahren zur beschleunigten Immobilisierung von Makromolekülen
besteht in einer Ausführungsform aus den folgenden Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition mit wenigstens einer mit einem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Elektrode, wobei das Polymer so ausgebildet ist, dass es die zu detektierenden Makromoleküle spezifisch oder unspezifisch binden kann;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten, der die zu immobilisierenden Makromoleküle in gelöster Form enthält oder enthalten könnte;
- c) Beaufschlagung der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Elektrode mit einem genügend hohen Potential geeigneter Polarität zur Verdichtung der geladenen Makromoleküle in der unmittelbaren Umgebung der Sensorposition;
- d) Immobilisierung der zu detektierenden Makromoleküle am elektrisch leitfähigen Polymer.
In einer modifizierten Ausführungsform befinden sich die Bindungsstellen für die zu
immobilisierenden Makromoleküle nicht direkt im elektrisch leitfähigen Polymer, sondern
in einer weiteren Schicht, mit der das elektrisch leitfähige Polymer beschichtet ist. Diese
Schicht muß durchlässig sein für Wasser und kleine Ionen.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform geschieht die Detektion der
Makromoleküle ebenfalls durch eine elektrische Methode, entweder mittels
benachbarter Sensorelektroden, was beim Redox Recycling ganz besonders bevorzugt
ist oder mittels derselben Elektrode, was bei Cyclovoltammetrie Impedanzanalyse ganz
besonders bevorzugt ist, im letzteren Fall insbesondere bei der Impedanzspektroskopie.
Eine weiteres erfindungsgemäßes Verfahren zur Immobilisierung von Makromolekülen
besteht in folgenden Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition mit wenigstens einer mit einem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Mobilisierungselektrode und einer Sensorelektrode an die die Makromoleküle unspezifisch oder spezifisch anbinden können;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten, der die zu immobilisierenden Makromoleküle in gelöster Form enthält oder enthalten könnte;
- c) Beaufschlagung der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Elektrode mit einem genügend hohen Potential geeigneter Polarität zur Verdichtung der geladenen Makromoleküle in der unmittelbaren Umgebung der Sensorposition;
- d) Immobilisierung der zu detektierenden Makromoleküle auf der/den Sensorelektroden, entweder direkt oder auf einer auf den Sensorelektroden befindlichen Bindungsschicht. Insbesondere kann eine solche Schicht auch aus einer ersten Lage von immobilisierten Makromolekülen bestehen, die eine zweite Lage von Makromolekülen spezifisch binden kann.
Die Detektion der immobilisierten Makromomoleküle geschieht mit Hilfe der mit den
Makromolekülen belegten Sensorelektroden elektrisch, ganz besonders bevorzugt sind
dabei die Methoden des Redox-Recyclings, der Cyclovoltametrie und der
Impedanzanalyse, im letzteren Fall insbesondere der Impedanzspektroskopie.
Gegenstand der Erfindung ist auch ein Verfahren zur elektrischen Spezifitätsselektion von
Makromolekülen, bestehend aus den Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition mit wenigstens einer mit einem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Elektrode, wobei das Polymer so ausgebildet ist, dass es die zu detektierenden Makromoleküle spezifisch an Fängermoleküle binden kann;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten, der gegebenenfalls die zu immobilisierenden Zielmoleküle in gelöster Form enthält oder enthalten könnte;
- c) Immobilisierung der Zielmoleküle an den spezifischen Bindungsstellen im elektrisch leitfähigen Polymer;
- d) Beaufschlagung der Elektroden mit einem genügend hohen elektrischen Potential geeigneter Polarität und genügend langer Dauer, gegebenenfalls auch pulsierend, zur Lösung aller Bindungen von Zielmolekülen auf der Sensorposition bis auf die Bindungen mit der höchsten Bindungsstärke.
Die spezifischen Bindungsstellen auf dem elektrisch leitfähigen Polymer werden in der
Regel durch eine immobilisierte erste Sorte von Makromolekülen (Fängermoleküle)
gebildet, die z. B. mittels eines Dispensers oder mittels der weiter oben beschriebenen
elektrisch beschleunigten Immobilisierung an das elektrische Polymer gebunden
werden können.
Bevorzugt werden die Zielmoleküle mittels elektrisch beschleunigter Immobilisierung an
die Fängermoleküle gebunden bevor die oben beschriebene Spezifitätsselektion
vorgenommen wird.
In einer modifizierten Ausführungsform befinden sich die Bindungsstellen für die zu
immobilisierende erste Sorte von Makromolekülen nicht direkt im elektrisch leitfähigen
Polymer, sondern in einer weiteren Schicht, mit der das elektrisch leitfähige Polymer
beschichtet ist. Diese Schicht muß durchlässig sein für Wasser und kleine Ionen.
Eine weiteres erfindungsgemäßes Verfahren zur elektrischen Spezifitätsselektion von
Makromolekülen besteht in folgenden Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition mit wenigstens einer mit einem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Mobilisierungselektrode und einer Sensorelektrode an die die Makromoleküle spezifisch anbinden können;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten, der die zu immobilisierenden Makromoleküle in gelöster Form enthält;
- c) Immobilisierung der zu detektierenden Makromoleküle (Zielmoleküle) auf der/den Sensorelektroden, entweder direkt oder auf einer auf den Sensorelektroden befindlichen Bindungsschicht. Insbesondere kann eine solche Schicht auch aus einer ersten Lage von immobilisierten Makromolekülen bestehen, die eine zweite Lage von Makromolekülen spezifisch binden kann;
- d) Beaufschlagung der Sensorelektroden mit einem genügend hohen elektrischen Potential geeigneter Polarität und genügend langer Dauer, gegebenenfalls auch pulsierend, zur Lösung aller Bindungen von Zielmolekülen auf der Sensorposition bis auf die Bindungen mit der höchsten Bindungsstärke.
Die spezifischen Bindungsstellen auf den Sensorelektroden werden in der Regel durch
eine immobilisierte erste Sorte von Makromolekülen (Fängermoleküle) gebildet, die z. B.
mittels eines Dispensers oder mittels der weiter oben beschriebenen elektrisch
beschleunigten Immobilisierung an die Sensorelektroden gebunden werden können.
Bevorzugt werden die Zielmoleküle mittels elektrisch beschleunigter Immobilisierung an
die Fängermoleküle gebunden bevor die oben beschriebene Spezifitätsselektion
vorgenommen wird.
Die Lösung der unerwünschten Bindungen (alle bis auf die mit der höchsten
Bindungsenergie) kann auch durch Beaufschlagung der Mobilisierungselektrode mit
einem geeigneten elektrischen Potential geschehen oder dadurch unterstützt werden.
Als Arbeitselektroden wurde eine Goldelektrode (CH Instruments, Inc., TX, USA, ∅ 2 mm)
verwendet. Als Referenzelektrode diente ein Silberdraht. Die Gegenelektrode
bestand aus einem Platindraht. Vor Benutzung wurde die Oberfläche der Arbeitselek
trode mit einer 0.3 µm-Tonerde-Suspension poliert und mit Millipore-Wasser gespült.
Anschließend wurde die Elektrodenoberfäche elektrochemisch in 0.2 M NaOH-Lösung
gereinigt. Dazu wurde die Elektrode cyclovoltammetrisch mit 5 Potentialzyklen zwischen
-0.5 V und +1.8 V (gegen die Silber-Referenzelektrode) und anschließend mit 3
Potentialzyklen zwischen -0.3 V und +1.1 V jeweils bei einer Vorschubgeschwindigkeit
von 50 mV/s behandelt.
Das elektrisch leitfähige Polymer wurde potentiodynamisch auf der Oberfläche der
Arbeitselektrode abgeschieden. Dazu wurde eine herkömmliche elektrochemische Zelle
mit einer Dreielektrodenanordnung verwendet. Als Potentiostat diente eine
IM6-Workstation (Zahner-Meßtechnik, Kronach, Deutschland). Der Elektrolyt bestand aus
einer 0.1 M Lösung von Natriumperchlorat in Acetonitril. Das Zellvolumen betrug 2 ml.
Als Monomer wurden 8 mg 3,4-Ethylendioxythiophen (Baytron M, Bayer AG,
Leverkusen, CAS: 126213-50-1) zum Elektrolyten hinzugegeben (entsprechend einer
0.028 molaren Lösung).
Mittels 30 Potentialzyklen zwischen -0.4 und +1.1 V wurde bei einer Vorschubge
schwindigkeit von 100 mV/s ein dunkelblauer Poly(3,4-ethylendioxythiophen)-Film
(Leitfähigkeit: -200 mS/cm [Q. Pei, G. Zuccarello, M. Ahlskog, O. Inganäs, Polymer
1994, 35, 1347-1351]) auf der Arbeitselektrode abgeschieden (Film 1). Im
Cyclovoltammogramm kann die Bildung des Polymerfilms anhand des Stromanstiegs
nach jedem Zyklus verfolgt werden (Abb. 5).
Mit demselben Verfahren wurde mittels 10 Zyklen ein dünnerer Polymerfilm auf der
Elektrode abgeschieden (Film 2).
Die modifizierte Arbeitselektrode (mit Film 1) wurde mit Acetonitril gespült. Die
Charakterisierung erfolgte in monomerfreier Elektrolytlösung (Acetonitril, 0.1 M Natrium
perchlorat). Die Lösung wurde vor der Messung 5 Minuten mit Argon entgast. Es
wurden Cyclovoltammogramme bei verschiedenen Vorschubgeschwindigkeiten (50 bis
250 mV/s) in einem Potentialbereich von -0.6 V bis +0.7 V aufgenommen. Der Strom
variiert dabei linear mit der Vorschubgeschwindigkeit, und zeigt damit das Vorliegen
eines Oberflächenfilms auf der Elektrode. Bei einer Vorschubgeschwindigkeit von
100 mV/s erhielt man einen Peakstrom des Polymerfilms von etwa 40 µA (Abb. 6).
Auf gleiche Weise wurde die mit Film 2 modifizierte Goldelektrode behandelt. (n diesem
Fall beträgt der Peakstrom etwa 20 µA (Abb. 7).
Einer kommerziell erhältlichen Kartusche der Firma Nanogen, Inc., San Diego, USA
(NanoChip™ cartridge) wurde der Biochip entnommen und die Beschichtung über den
Platinelektroden entfernt. Dazu wurde der Chip in 1 M H2SO4 getaucht und bei 80°C für
30 Minuten mit Ultraschall behandelt. Der Chip wurde danach mit Wasser gespült. Zum
Abschluß wurde noch mehrere Male mit abs. Ethanol gespült und der Chip im
Argonstrom getrocknet. Die Chipoberfläche wurde mit einem Mikroskop überprüft; bei
Rückständen der Beschichtung wurde die Reinigungsprozedur wiederholt.
Die Präparation des Polymerfilms auf den Platinelektroden des Biochips erfolgte in
wässriger Lösung mit 0.1 M Natriumperchlorat als Elektrolyt. Durch Zugabe von
Natriumdodecylsulfat (0,07 M) unter Rühren wurde das 3,4-Ethylendioxythiophen
(0.015 M) in eine Dispersion überführt und einer Polymerisation zugänglich gemacht.
Die Dispersion wurde in eine Durchflußzelle zur Benetzung des Biochips eingespeist.
Die Durchflußzelle ist so ausgelegt, daß sie eine elektrische Kontaktierung des Chips
zuläßt. Eine kleine Platinelektrode wurde als Arbeits- und ein größeres im Außenbereich
des Chips liegendes Segment als Gegenelektrode geschaltet. Über eine Zuleitung für
den Elektrolyten wurde ein Silberdraht als Referenzelektrode eingebracht. Die
potentiodynamische Polymerbildung erfolgte mit 15 Potentialzyklen in einem
Potentialbereich von -0.4 V bis +0.9 V bei einer Vorschubgeschwindigkeit von
100 mV/s (Abb. 8).
Unter dem Mikroskop war die Arbeitselektrode infolge des aufgebrachten dunkelblauen
Polymerfilms eindeutig von den freien Platinelektroden unterscheidbar (Abb. 9). Die
elektrochemische Charakterisierung dieser derart beschichteten Elektrode erfolgte in
monomerfreiem Elektrolyt (wässrige 0.1 M Natriumperchloratlösung). Dazu wurden 5
Potentialzyklen zwischen -0.5 V und +0.8 V bei unterschiedlichen
Vorschubgeschwindigkeiten (50, 100, 150, 200, 250 mV/s) aufgenommen. Der
Peakstrom variiert linear mit der Vorschubgeschwindigkeit und bestätigt das Vorliegen
eines Oberflächenfilms (Abb. 10).
Die in Abb. 9 gezeigte mit Polymer belegte Elektrode wurde zusammen mit dem Feld
der umgebenden unbelegten Elektroden mittels einer transparenten Durchflußzelle mit
einer 1 µM Lösung des mit dem am 5'-Ende mit dem Fluoreszenzfarbstoff Texas Red
markierten Oligonukleotids: 5'-CCA TTT TCA GAA TTG GGT GT-3' in Wasser
benetzt. Über eine Zuleitung für die Lösung wurde ein Silberdraht als Referenzelektrode
eingebracht. Die Elektroden wurden an die IM6-Workstation angeschlossen und in
Auflicht im Fluoreszenzmikroskop (Zeiss Axioplan) mit den für Texas Red passenden
Anregungs- und Emissionsfarbfiltern untersucht. Über einen Photomultiplyer wurde die
Intensität des Fluoreszenzsignals aus einem mittels Meßfeldblende ausschließlich auf
die betrachtete Elektrode fokussierten Meßfeld gemessen.
Bei Applikation eines symmetrischen Rechteckpotentials der Amplitude 0,5 V und nach
Dunkelstromabzug wurde für die mit Polymerschicht belegte Elektrode bei Vorliegen
des negativen Potentialwertes eine Intensität von 20 SKT (Skalenteile) und bei
Vorliegen des positiven Potentialwertes eine Intensität von 640 SKT gemessen. Für
eine benachbarte identische, jedoch ohne Polymer beschichtete Elektrode wurden als
entsprechende Werte 35 bzw. 150 gemessen. Der Intensitätsquotient für positives und
negatives Potential war mithin bei der polymerbeschichteten Elektrode um den Faktor
7,5 größer und damit entsprechend auch die Verdichtung bzw. Verarmung der
Oligonukleotide an der Elektrode.
In den nachfolgenden Abbildungen ist Folgendes dargestellt:
Abb. 1: Prinzipaufbau des erfindungsgemäßen Biochips
Abb. 2: Sensorfelder bei angelegtem elektrischem Feld an die Mobilisierungselektroden des mittleren Sensorfeldes
Abb. 3: Ausschnitt aus einer Sensorposition mit Interdigital- und Mobilisierungs elektroden
Abb. 4: Verschiedene Ausführungsformen des Höhenversatzes von Mobilisierungs- und interdigitierenden Sensorelektroden
Abb. 5: Potentiodynamische Polymerisation von 3,4-Ethylendioxythiophen auf Gold in Acetonitril (0,1 M NaClO4)-Film 1
Abb. 6: Gyclovoltamogramm von Poly(3,4-ethylendioxythiophen)-Film 1 auf Gold in Acetonitril (0,1 M NaClO4)
Abb. 7: Cyclovoltamogramm von Poly(3,4-ethylendioxythiophen) - Film 2 auf Gold in Acetonitril (0,1 M NaClO4)
Abb. 8: Potentiodynamische Polymerisation von 3,4-Ethylendioxythiophen auf Platin in wässriger Lösung (0,1 M NaClO4)
Abb. 9: Mikroskopische Aufnahme einer poly(3,4-ethylendioxythiophen)-beschichteten Platinelektrode (dunkles Feld) Abb. 10: Gyclovoltamogramm von Poly(3,4-ethylendioxythiophen) - auf Platin in wässriger Lösung (0,1 M NaClO4) bei verschiedenen Vorschubgeschwindig keiten.
Abb. 1: Prinzipaufbau des erfindungsgemäßen Biochips
Abb. 2: Sensorfelder bei angelegtem elektrischem Feld an die Mobilisierungselektroden des mittleren Sensorfeldes
Abb. 3: Ausschnitt aus einer Sensorposition mit Interdigital- und Mobilisierungs elektroden
Abb. 4: Verschiedene Ausführungsformen des Höhenversatzes von Mobilisierungs- und interdigitierenden Sensorelektroden
Abb. 5: Potentiodynamische Polymerisation von 3,4-Ethylendioxythiophen auf Gold in Acetonitril (0,1 M NaClO4)-Film 1
Abb. 6: Gyclovoltamogramm von Poly(3,4-ethylendioxythiophen)-Film 1 auf Gold in Acetonitril (0,1 M NaClO4)
Abb. 7: Cyclovoltamogramm von Poly(3,4-ethylendioxythiophen) - Film 2 auf Gold in Acetonitril (0,1 M NaClO4)
Abb. 8: Potentiodynamische Polymerisation von 3,4-Ethylendioxythiophen auf Platin in wässriger Lösung (0,1 M NaClO4)
Abb. 9: Mikroskopische Aufnahme einer poly(3,4-ethylendioxythiophen)-beschichteten Platinelektrode (dunkles Feld) Abb. 10: Gyclovoltamogramm von Poly(3,4-ethylendioxythiophen) - auf Platin in wässriger Lösung (0,1 M NaClO4) bei verschiedenen Vorschubgeschwindig keiten.
Claims (47)
1. Eine elektrisch adressierbare Vorrichtung bestehend aus folgenden Bestandteilen:
mindestens einem Substrat mit einer oder mehrerer darauf befindlichen Sensorpositionen, die jeweils wenigstens eine Elektrodenfläche umfassen sowie mit Flächen versehen sind, an der Makromoleküle immobilisiert werden können
eine Steuereinheit, welche über elektrische Zuleitungen an die Elektroden unabhängig voneinander elektrische Signale applizieren kann
einem elektrisch leitfähigen Polymer auf wengistens einer Elektrodenfläche wenigstens eines Teils der Sensorpositionen
einem Elektrolyten, der in Kontakt mit wenigstens einem Teil der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichtete Sensorflächen ist und der die zu immobilisierenden Makromoleküle enthält.
mindestens einem Substrat mit einer oder mehrerer darauf befindlichen Sensorpositionen, die jeweils wenigstens eine Elektrodenfläche umfassen sowie mit Flächen versehen sind, an der Makromoleküle immobilisiert werden können
eine Steuereinheit, welche über elektrische Zuleitungen an die Elektroden unabhängig voneinander elektrische Signale applizieren kann
einem elektrisch leitfähigen Polymer auf wengistens einer Elektrodenfläche wenigstens eines Teils der Sensorpositionen
einem Elektrolyten, der in Kontakt mit wenigstens einem Teil der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichtete Sensorflächen ist und der die zu immobilisierenden Makromoleküle enthält.
2. Vorrichtung nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass das Trägermaterial
aus Silizium, Siliziumoxid, Glas, Keramik oder Kunststoff besteht oder einen
Verbund dieser Stoffe darstellt.
3. Vorrichtung nach Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, dass der Träger einen
aktiven Halbleiterchip mit elektrischen Schaltkreisen oder mit CMOS-Bausteinen
beinhaltet.
4. Vorrichtung nach den Ansprüchen 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet, dass die
Elektroden unabhängig voneinander aus metallischen Materialien bestehen.
5. Vorrichtung nach Anspruch 4, dadurch gekennzeichnet, dass die Elektroden
unabhängig voneinander aus den Materialien Gold, Platin, Palladium, Silber,
Kupfer, Aluminium oder aus Kohlenstoff gewählt sind.
6. Vorrichtung nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass das elektrisch
leitfähige Polymer aus der Gruppe Polyethylen, Polythiophen, Polypyrrol,
Polyparaphenylen, Polyanilin oder Polyparaphenylenvinylen oder Modifikationen
dieser Polymere ausgewählt ist.
7. Vorrichtung nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass das leitfähige
Polymer funktionelle Gruppen zur Bindung von Makromolekülen enthält.
8. Vorrichtung nach Anspruch 7, dadurch gekennzeichnet, dass die funktionellen
Gruppen kovalent an das elektrisch leitfähige Polymer gebunden sind.
9. Vorrichtung nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, dass die funktionellen
Gruppen Carbonsäure, deren Derivate wie Aktivester oder Aminogruppen
darstellen.
10. Vorrichtung nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass auf das elektrisch
leitfähige Polymer eine Bindungsschicht aufgetragen wird, die durchlässig ist für
Wasser und kleine Ionen und die funktionelle Gruppen zur Anbindung von
Makromolekülen enthält.
11. Vorrichtung nach Anspruch 10, dadurch gekennzeichnet, dass die Bindungsschicht
aus der Gruppe Agarose Polyacrylamid oder Polyurethan ausgewählt ist.
12. Vorrichtung nach den Ansprüchen 1 bis 11, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorpositionen wenigstens eine weitere Elektrodenfläche (Sensorelektrode)
aufweist, die nicht mit einem elektrisch leitfähigen Polymer belegt ist.
13. Vorrichtung nach Anspruch 12, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorelektroden mit Makromolekülen bestückt sind.
14. Vorrichtung nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorelektroden aus Gold bestehen und Makromoleküle mittels einer SH-Gruppe
daran gebunden sind.
15. Vorrichtung nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorelektroden mit einer Bindungsschicht belegt sind, die funktionelle Gruppen
zur Anbindung von Makromolekülen enthält.
16. Vorrichtung nach Anspruch 15, dadurch gekennzeichnet, dass die Bindungsschicht
aus der Gruppe Agarose, Polyacrylamid oder Polyurethan ausgewählt ist.
17. Vorrichtung nach den Ansprüchen 12 bis 16, dadurch gekennzeichnet, dass die mit
dem elektrisch leitfähigen Polymer belegten Elektroden und die Sensorelektroden
zueinander höhenversetzt sind.
18. Vorrichtung nach den Ansprüchen 12 bis 17, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorpositionen mit drei unabhängigen Elektroden, einer mit dem elektrischen
Polymer beschichteten und zwei Sensorelektroden bestückt sind.
19. Vorrichtung nach Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet, dass die beiden
Sensorelektroden schmale, lange, fingerähnliche Strukturen bilden mit einer
Fingerbreite unter 2 µm.
20. Vorrichtung nach Anspruch 19, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorelektroden Interdigitalelektroden darstellen, bei denen zumindest einige
Zwischenräume durch eine mit einem elektrisch leitfähigen Polymer beschichtete
Elektrode ausgefüllt werden.
21. Vorrichtung nach den Ansprüchen 1 bis 20, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorpositionen in einem zweidimensionalen Array angeordnet sind.
22. Vorrichtung nach Ansprüchen 1 bis 21, dadurch gekennzeichnet, dass die
Elektroden der Sensorpositionen an eine elektrische Steuerungs- und
Ausleseeinheit angekoppelt sind.
23. Vorrichtung nach den Ansprüchen 1 bis 22, dadurch gekennzeichnet, dass auf dem
Substrat noch eine oder mehrere Referenzelektroden flächig aufgebracht sind.
24. Vorrichtung nach den Ansprüchen 1 bis 23, dadurch gekennzeichnet, dass die
Sensorpositionen mit einem flüssigen Elektrolyten benetzt sind, der die zu
detektierenden Moleküle enthält.
25. Vorrichtung nach Anspruch 24, dadurch gekennzeichnet, dass die Benetzung in
einer Durchflusskammer stattfindet.
26. Vorrichtung nach den Ansprüchen 7, 10 oder 13, dadurch gekennzeichnet, dass
die verschiedenen Sensorpositionen selektiv mit Makromolekülen als spezifischen
Erkennungssystemen bestückt sind.
27. Verfahren zur beschleunigten Immobilisierung von elektrisch geladenen
Makromolekülen, wie Nukleinsäuren und Proteinen, bestehend aus den Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition gemäß den Ansprüchen 1 bis 26;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten, der das zu bindende Makromolekül enthält oder enthalten könnte;
- c) Beaufschlagung der mit dem elektrisch leitfähigen Polymer beschichteten Elektroden mit einem elektrischen Potential zur Verdichtung der geladenen Makromoleküle in der unmittelbaren Umgebung der Sensorposition und
- d) Immobilisierung der Makromoleküle an den dafür vorgesehenen Bindungsstellen.
28. Verfahren nach Anspruch 27, dadurch gekennzeichnet, dass als Elektrolyt eine
wässrige Lösung verwendet wird und das zur Verdichtung der Makromoleküle
applizierte Potential niedriger als das zur Elektrolyse von Wasser notwendige
Potential gewählt wird.
29. Verfahren nach den Ansprüchen 27 bis 28, dadurch gekennzeichnet, dass
unspezifische Bindungspositionen zuvor mit spezifischen Erkennungsstrukturen als
Fängermoleküle belegt wurden.
30. Verfahren nach Anspruch 29, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei den
spezifischen Fängermolekülen um Proteine oder Polypeptide handelt.
31. Verfahren nach Anspruch 29, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei den
spezifischen Fängermolekülen um Nukleinsäuren bzw. Oligonukleotide handelt.
32. Verfahren nach Anspruch 31, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei den
Fängermolekülen um Oligonukleotide mit 10 bis 25 Basen handelt.
33. Verfahren nach den Ansprüchen 27 bis 32, dadurch gekennzeichnet, dass die
immobilisierten Moleküle mittels optischer, radiographischer, elektrischer oder
elektrochemischer Verfahren qualitativ oder quantitativ analysiert werden.
34. Verfahren nach Anspruch 33, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei dem
elektrischen Detektionsverfahren um Impedanzspektroskopie handelt.
35. Verfahren nach Anspruch 33, dadurch gekennzeichnet, dass es sich bei dem
elektrischen Detektionsverfahren um Cyclovoltametrie handelt.
36. Verfahren nach Anspruch 33, dadurch gekennzeichnet, dass die zu detektierenden
Makromoleküle enzymatisch markiert sind und es sich bei dem elektrischen
Detektionsverfahren um Redox-Recycling handelt.
37. Verfahren nach den Ansprüchen 34 oder 35, dadurch gekennzeichnet, dass die
Detektion mittels elektrochemisch aktiver Reportergruppen, wie Ferrocen, PQQ
oder Porphyrinen erfolgt oder verstärkt wird.
38. Verfahren zur elektrischen Spezifitätsselektion von Zielmolekülen, wie
Nukleinsäuren und Proteinen, bestehend aus den Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition nach Anspruch 1 bis 26, die mit wenigstens einer Elektrode mit darüberliegendem elektrisch leitfähigen Polymer versehen ist und das fest mit einer ersten Sorte von Erkennungsmolekülen versehen ist, welche eine zweite Sorte von Makromolekülen reversibel gebunden haben;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten;
- c) Beaufschlagung der Elektrode mit einem genügend hohen elektrischen Potential geeigneter Polarität zur Lösung aller Bindungen von Makromolekülen auf den Sensorelektroden bis auf die Bindungen mit der höchsten Bindungsstärke.
39. Verfahren nach Anspruch 38 zur elektrischen Spezifitätsselektion von
Zielmolekülen, wie Nukleinsäuren und Proteinen, bestehend aus den Schritten:
- a) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition mit wenigstens einer Elektrode, die mit einem elektrisch leitfähigen Polymer überzogen ist, das seinerseits mit einem strukturell nicht leitfähigen Polymer beschichtet ist, welches durchlässig ist wenigstens für Wasser und kleine Ionen und welches fest mit einer ersten Sorte von Erkennungsmolekülen versehen ist welche eine zweite Sorte von Makromolekülen reversibel gebunden haben;
- b) Benetzung der Sensorposition mit einem Elektrolyten;
- c) Beaufschlagung der Elektrode mit einem genügend hohen elektrischen Potential geeigneter Polarität zur Lösung aller Bindungen von Makromolekülen auf den Sensorelektroden bis auf die Bindungen mit der höchsten Bindungsstärke.
40. Verfahren nach den Ansprüchen 38 und 39 zur elektrischen Spezifitätsselektion von
Zielmolekülen, wie Nukleinsäuren und Proteinen, bestehend aus den Schritten:
- A) Bereitstellung einer elektrisch adressierbaren Sensorposition mit Mobilisierungs-
und Sensorelektroden, wobei
- a) die Mobilisierungselektroden mit einem leitfähigen Polymer überzogen ist;
- b) die Sensorposition mit einem Elektrolyt benetzt ist;
- c) die Sensorelektroden fest mit einer ersten Sorte von Erkennungsmolekülen versehen sind welche eine zweite Sorte von Makromolekülen reversibel gebunden haben;
- B) Beaufschlagung der Mobilisierungselektroden mit einem genügend hohen elektrischen Potential geeigneter Polarität zur Lösung aller Bindungen von Makromolekülen auf den Sensorelektroden bis auf die Bindungen mit der höchsten Bindungsstärke.
41. Verfahren nach den Ansprüchen 38 bis 40, dadurch gekennzeichnet, dass es sich
bei den Erkennungs- und Makromolekülen um Antigen-Antikörper oder um
Nukleinsäuresequenzen handelt.
42. Verfahren nach den Ansprüchen 38 bis 40, dadurch gekennzeichnet, dass die
verbleibenden zweite Sorte von Makromolekülen mittels optischer, radiographischer
oder elektrischer Verfahren detektiert wird.
43. Verfahren nach Anspruch 42, dadurch gekennzeichnet, dass das elektrische
Verfahren ein Redox-Recycling nutzt.
44. Verfahren nach Anspruch 42, dadurch gekennzeichnet, dass das elektrische
Verfahren eine Impedanzanalyse darstellt.
45. Verfahren nach den Ansprüchen 33 bis 37, dadurch gekennzeichnet, dass vor der
elektrischen Detektion eine elektrische Spezifitätsselektion vorgenommen wird,
indem die Sensorelektroden mit einem Potential beaufschlagt werden, das von
Polarität und Höhe her so gewählt ist, daß alle Bindungen von Makromolekülen auf
den Sensorelektroden bis auf die Bindungen mit der höchsten Bindungsstärke
gelöst werden.
46. Verfahren zur Herstellung einer Vorrichtung nach Anspruch 10, dadurch
gekennzeichnet, dass die laterale Strukturierung von elektrisch leitfähigem Polymer
und der Bindungsschicht durch Elektropolymerisation bzw. photolithographisches
lift-off Verfahren vorgenommen wird.
47. Verfahren nach Anspruch 10, dadurch gekennzeichnet, dass die Bindungsschicht
ein Polymer ist, das zunächst als Monomer oder Oligomer aufgebracht wird und
anschließend lichtinduziert strukturiert polymerisiert wird.
Priority Applications (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE2000149902 DE10049902A1 (de) | 2000-10-10 | 2000-10-10 | Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihre Detektion |
PCT/EP2001/011413 WO2002031482A2 (de) | 2000-10-10 | 2001-10-02 | Vorrichtung und verfahren zur elektrisch beschleunigten immobilisierung von molekülen |
AU2002220583A AU2002220583A1 (en) | 2000-10-10 | 2001-10-02 | Device and method for electrically accelerated immobilisation of molecules |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE2000149902 DE10049902A1 (de) | 2000-10-10 | 2000-10-10 | Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihre Detektion |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE10049902A1 true DE10049902A1 (de) | 2002-04-18 |
Family
ID=7659114
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE2000149902 Withdrawn DE10049902A1 (de) | 2000-10-10 | 2000-10-10 | Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihre Detektion |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
DE (1) | DE10049902A1 (de) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8007744B2 (en) | 2003-01-17 | 2011-08-30 | Greiner Bio-One Gmbh | Sample container for analyses |
US9005549B2 (en) | 2003-01-17 | 2015-04-14 | Greiner Bio-One Gmbh | High throughput polymer-based microarray slide |
-
2000
- 2000-10-10 DE DE2000149902 patent/DE10049902A1/de not_active Withdrawn
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8007744B2 (en) | 2003-01-17 | 2011-08-30 | Greiner Bio-One Gmbh | Sample container for analyses |
US9005549B2 (en) | 2003-01-17 | 2015-04-14 | Greiner Bio-One Gmbh | High throughput polymer-based microarray slide |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP1786927B1 (de) | Vorrichtung und verfahren zum nachweis von geladenen makromolekülen | |
DE112005003134B4 (de) | Elektrisch aktiver kombinatorisch-chemischer (electrically-active combinatorial-chemical; eacc) Chip zur biochemischen Analytbestimmung | |
DE19610115C2 (de) | Detektion von Molekülen und Molekülkomplexen | |
DE10049901C2 (de) | Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung und zur Detektion von Molekülen | |
DE3787555T2 (de) | Potential-verursachende Membran für Immunosensoren. | |
EP2286227B1 (de) | Verfahren zum detektieren von chemischen oder biologischen species sowie vorrichtung zum durchführen des verfahrens | |
WO2000062047A1 (de) | Elektrisches sensorarray | |
EP1518109A2 (de) | Vorrichtung zur detektion eines analyten | |
WO1996012176A1 (de) | Analytselektiver sensor | |
WO1999027367A1 (de) | Vorrichtung und verfahren zum nachweis von analyten | |
DE69623006T2 (de) | Sensor | |
WO1999027355A1 (de) | Verfahren zur bildung lateral organisierter strukturen auf trägeroberflächen | |
WO2002031482A2 (de) | Vorrichtung und verfahren zur elektrisch beschleunigten immobilisierung von molekülen | |
DE10049902A1 (de) | Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen und ihre Detektion | |
DE10065278A1 (de) | Vorrichtung und Verfahren zur elektrisch beschleunigten Immobilisierung von Molekülen | |
DE10319155B4 (de) | Elektrisch auslesbare Bindungen von Analytmolekülen an immobilisierten Sondenmolekülen | |
EP2414821B1 (de) | Vorrichtung nach art einer elektrochemischen kamera sowie verfahren zur herstellung und verwendung der vorrichtung | |
DE10256415B3 (de) | Verfahren und Vorrichtung zum Transport bzw. zur bindungspezifischen Trennung elektrisch geladener Moleküle | |
WO1999042827A2 (de) | Vorrichtung zur detektion von oligo- und/oder polynukleotid-hybridisierungen | |
DE10327683A1 (de) | Verfahren und Vorrichtung zum quantitativen elektrischen Nachweis von Analyten | |
EP1604198A2 (de) | Leiterplatte zur elektrochemischen detektion von biomolekülen | |
DE10320312A1 (de) | Substrat als Träger von Ligaten | |
EP1200817B1 (de) | Sensoranordnung mit elektrisch ansteuerbaren arrays | |
DE10156433A1 (de) | Verfahren und Vorrichtungen zur elektronischen Bestimmung von Analyten | |
WO2001075445A1 (de) | Verfahren und vorrichtung zur detektion von molekülen mittels impedanzspektroskopie |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
OP8 | Request for examination as to paragraph 44 patent law | ||
8127 | New person/name/address of the applicant |
Owner name: NANOGEN, INC., SAN DIEGO, CALIF., US |
|
8128 | New person/name/address of the agent |
Representative=s name: ACKERMANN, J., DIPL.-CHEM. DR.RER.NAT., PAT.-ANW., |
|
8130 | Withdrawal |