DE10030149A1 - Verwendung von Polypeptiden oder diese kodierende Nukleinsäuren zur Diagnose oder Behandlung von Hauterkrankungen oder Wundheilung sowie ihre Verwendung zur Identifizierung von pharmakologisch aktiven Substanzen - Google Patents
Verwendung von Polypeptiden oder diese kodierende Nukleinsäuren zur Diagnose oder Behandlung von Hauterkrankungen oder Wundheilung sowie ihre Verwendung zur Identifizierung von pharmakologisch aktiven SubstanzenInfo
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Abstract
Verwendung von Polypeptiden oder diese kodierende Nukleinsäuren zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven Substanzen.
Description
Die Erfindung betrifft die Verwendung von Polypeptiden oder diese kodierende
Nukleinsäuren zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbe
sondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung
von pharmakologisch aktiven Substanzen.
Wunden heilen im allgemeinen ohne therapeutischen Eingriff ab. Es gibt jedoch
zahlreiche Erkrankungen, bei denen die Wundheilung eine Rolle spielt, wie z. B.
Diabetes mellitus, arterielle Verschlußkrankheiten, Schuppenflechte (Psoriasis),
Morbus Crohn, Epidermolysis bullosa, altersbedingte Hautveränderungen oder
Innervationsstörungen. Wundheilungsstörungen führen zu einer verzögerten
Wundheilung oder zu chronischen Wunden. Diese Störungen können durch die
Art der Verwundung (z. B. großflächige Wunden, tiefgehende und mechanisch
gedehnte Operationswunden, Verbrennungen, Trauma, Dekubitus), medikamentö
se Behandlung der Patienten (z. B. mit Corticoiden) aber auch durch die Art der
Erkrankung selber verursacht werden. So leiden z. B. 25% der Patienten mit Typ-
II-Diabetes häufig an chronischen Ulzera ("diabetischer Fuß"), von denen etwa
die Hälfte aufwendige stationäre Behandlungen erfordern und letztlich doch
schlecht heilen. Der diabetische Fuß verursacht mehr Klinikaufenthalte als jede
andere mit Diabetes assoziierte Komplikation. Die Zahl dieser Fälle bei Diabetes
Typ I und II ist im Steigen begriffen und repräsentiert 2,5% aller Klinikeinweisungen.
Zudem heilen Wunden mit zunehmendem Alter der Patienten schlechter.
Oft ist auch eine Beschleunigung des natürlichen Wundheilungsprozesses wün
schenswert, um z. B. die Gefahr von bakteriellen Infektionen oder die Liegezeiten
der Patienten zu verringern.
Auch nach erfolgtem Wundverschluß kann es zu weiteren Störungen kommen.
Während Wunden fötaler Haut ohne Narbenbildung heilen, kommt es nach Ver
letzungen in der Postnatalperiode stets zu Narbenbildungen, die oft ein großes
kosmetisches Problem darstellen. Bei Patienten mit großflächigen Brandwunden
kann zudem die Lebensqualität dramatisch beeinträchtigt werden, zumal vernarb
ter Haut auch die Anhangsgebilde, wie Haarfollikel, Schweiß- und Talgdrüsen
fehlen. Bei entsprechender genetischer Disposition kann es auch zu Keloiden
kommen, hypertrophischen Narben, die in die umgebende Haut einwuchern.
Der Vorgang der Wundheilung erfordert komplexe koordiniert ablaufende Wir
kungen und Interaktionen verschiedener Zelltypen. Im Wundheilungsprozeß un
terscheidet man folgende Schritte: die Blutgerinnung im Bereich der Wunde, die
Rekrutierung von Entzündungszellen, die Reepithelialisierung, die Bildung von
Granulationsgewebe sowie die Restrukturierung von Matrix. Die exakten Reakti
onsmuster der beteiligten Zelltypen während der Phasen der Proliferation, der
Migration, der Matrixsynthese und der Kontraktion sind, ebenso wie die Regulati
on von Genen wie z. B. Wachstumsfaktoren, Rezeptoren und Matrixproteinen,
bislang wenig bekannt.
So sind bisher nur wenig zufriedenstellende Therapien entwickelt worden, um bei
Wundheilungstörungen eingreifen zu können. Etablierte Therapieformen be
schränken sich auf physikalische Unterstützung der Wundheilung (z. B. Verbände,
Kompressen, Gele) oder der Transplantation von Hautgeweben, gezüchteten
Hautzellen und/oder Matrixproteinen. In den letzten Jahren sind Wachstumsfakto
ren zur Verbesserung der Wundheilung erprobt worden, ohne jedoch die konven
tionelle Therapie entscheidend zu verbessern. Auch die Diagnose von Wundheilungsstörungen
beruht auf wenig aussagekräftigen optischen Analysen der Haut,
da ein tieferes Verständnis der Genregulation während der Wundheilung bisher
fehlt.
Auch für andere Störungen von regenerativen Prozessen sind bisher wenig zufrie
denstellende Therapien entwickelt worden. Auch hier ist die Kenntnis der Genre
gulation vorteilhaft für die Entwicklung von Diagnostika und Therapien. Es ist
gezeigt worden (Finch et al., 1997, Am. J. Pathol. 151: 1619-28; Werner, 1998,
Cytokine Growth Factor Rev. 9: 153-165), daß wundheilungsrelevante Gene auch
bei dermatologischen Erkrankungen, die auf Störungen der Regeneration der Haut
beruhen, und allgemein bei regenerativen Prozessen eine entscheidende Rolle
spielen. So spielt der Wachstumsfaktor KGF nicht nur eine entscheidende Rolle
bei der Regulation der Proliferation und Differenzierung von Keratinozyten wäh
rend der Wundheilung, sondern ist auch ein wichtiger Faktor bei der Hyperpro
liferation der Keratinozyten bei der Schuppenflechte (Psoriasis) und Regenerati
onsprozessen im Darm (bei Morbus Crohn und ulcerativer Colitis)
Es ist daher Aufgabe der vorliegenden Erfindung, Polypeptide und diese kodie
rende Nukleinsäuren zur Verfügung zu stellen, die an Prozessen bei (i) Erkran
kungen von Säugetierzellen, insbesondere bei Erkrankungen von Hautzellen,
und/oder (ii) der Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, beteiligt
sind, und deren Verwendung die Diagnose und/oder Behandlung sowie die Identi
fizierung und Entwicklung von in Zusammenhang mit diesen Erkrankungen wirk
samen Pharmazeutika entscheidend verbessert.
Bei der Analyse der Genexpression während des Wundheilungsprozesses konnten
überraschenderweise Gene identifiziert werden, die bisher nicht mit Diagnose
und/oder Behandlung von Erkrankungen oder mit der Diagnose und/oder Be
handlung bei der Wundheilung oder zur Identifizierung von pharmakologisch ak
tiven Substanzen in Verbindung gebracht wurden, deren Regulation aber für den
Heilungsprozeß essentiell ist und die damit im kausalen Zusammenhang mit Diagnose
und/oder Behandlung von Erkrankungen und/oder Diagnose und/oder Be
handlung bei der Wundheilung oder zur Identifizierung von pharmakologisch ak
tiven Substanzen stehen. Die Polypeptide dieser Gene gehören nicht zu den bisher
bekannten Zielen für die Diagnose - wie beispielsweise der Indikation - und/oder
der Behandlung - wie beispielsweise der Modulation - von Erkrankungen oder
Wundheilung oder für die Identifizierung von pharmakologisch aktiven Substan
zen, so daß sich aus dieser Erfindung völlig neue Therapieansätze ergeben.
Die Aufgabe wird daher erfindungsgemäß durch die Verwendung eines oder meh
rerer Polypeptide oder Varianten davon gemäß einer der SEQ ID Nr. 55 bis SEQ
ID Nr. 58 und/oder diese kodierende Nukleinsäuren oder Varianten davon zur (i)
Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankun
gen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbe
sondere Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch
aktiven Substanzen gelöst.
Der Begriff "Varianten" eines Polypeptids im Sinne der vorliegenden Erfindung
umfaßt auch funktionell aktive Varianten. Unter funktionell aktiven Varianten
sind Polypeptide zu verstehen, die beispielsweise wie die erfindungsgemäß ver
wendeten Polypeptide während Erkrankung, insbesondere Hauterkrankungen,
oder bei regenerativen Prozessen der Haut, insbesondere jedoch bei Wundhei
lungsstörungen, reguliert werden. Unter "Regulation" wird beispielsweise die
Erhöhung oder Erniedrigung der Menge der Polypeptide oder diese kodierende
Nukleinsäuren verstanden, wobei diese Änderung beispielsweise auf trankriptio
neller oder translationeller Ebene stattfinden kann.
Zu funktionell aktiven Varianten zählen beispielsweise auch Polypeptide, die von
einer Nukleinsäure kodiert werden, die aus nicht-wundheilungsspezifischen Ge
webe, z. B. Embryonalgewebe, isoliert werden, jedoch nach Expression in einer an
der Wundheilung beteiligten Zelle die bezeichneten Funktionen besitzen.
Varianten im Sinne der vorliegenden Erfindung sind auch Polypeptide, die eine
Sequenzhomologie, insbesondere eine Sequenzidentität, von ca. 70%, vorzugs
weise ca. 80%, insbesondere ca. 90%, vor allem ca. 95% zu dem Polypeptid mit
der Aminosäuresequenz gemäß einer der SEQ ID Nr. 1 bis SEQ ID Nr. 48 und
SEQ ID Nr. 55 bis SEQ ID Nr. 58 und SEQ. ID Nr. 63 bis SEQ ID Nr. 73 auf
weisen. Beispiele solcher Varianten, die auch funktionell aktive Varianten seien
können, sind demnach die entsprechenden Polypeptide, die aus anderen Organis
men als dem Menschen bzw. der Maus, vorzugsweise aus nicht-menschlichen
Säugetieren wie z. B. Affen, Schweinen und Ratten stammen. Andere Beispiele
von Varianten sind Polypeptide, die durch unterschiedliche Allele des Gens, in
verschiedenen Individuen oder in verschiedenen Organen eines Organismus ko
diert werden.
Varianten des Polypeptids können auch Teile des erfindungsgemäß verwendeten
Polypeptids mit mindestens 6 Aminosäuren Länge, vorzugsweise mit mindestens
8 Aminosäuren Länge, insbesondere mit mindestens 12 Aminosäuren Länge sein.
Umfaßt sind auch Deletionen des erfindungsgemäß verwendeten Polypeptids im
Bereich von ca. 1-60, vorzugsweise von ca. 1-30, insbesondere von ca. 1-15, vor
allem von ca. 1-5 Aminosäuren. Beispielsweise kann die erste Aminosäure Me
thionin fehlen, ohne daß die Funktion des Polypeptids wesentlich verändert wird.
Der Begriff "kodierende Nukleinsäure" bezieht sich auf eine DNA-Sequenz, die
für ein isolierbares bioaktives erfindungsgemäßes Polypeptid oder einen Precursor
kodiert. Das Polypeptid kann durch eine Sequenz in voller Länge oder jeden Teil
der kodierenden Sequenz kodiert werden, solange die spezifische, beispielsweise
enzymatische Aktivität erhalten bleibt.
Es ist bekannt, daß kleine Veränderungen in der Sequenz der vorangehend be
schriebenen Nukleinsäuren vorhanden sein können, zum Beispiel durch die Dege
nerierung des genetischen Codes, oder daß nicht translatierte Sequenzen am 5'
und/oder 3'-Ende der Nukleinsäure angehängt sein können, ohne daß dessen Aktivität
wesentlich verändert wird. Diese Erfindung umfaßt deshalb auch soge
nannte "Varianten" der vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren.
Unter Varianten der Nukleinsäuren sind alle DNA-Sequenzen zu verstehen, die
komplementär zu einer DNA-Sequenz sind, die unter stringenten Bedingungen
mit der Referenzsequenz hybridisieren und eine ähnliche Aktivität aufweisen wie
das von der Referenzsequenz kodierte Polypeptid.
Unter "stringenten Hybridisierungsbedingungen" sind solche Bedingungen zu
verstehen, bei denen eine Hybridisierung bei 60°C in 2,5 × SSC-Puffer, gefolgt
von mehreren Waschschritten bei 37°C in einer geringeren Pufferkonzentration
erfolgt und stabil bleibt.
Varianten der Nukleinsäure können auch Teile der erfindungsgemäß verwendeten
Nukleinsäure mit mindestens 8 Nukleotiden Länge, vorzugsweise mit mindestens
18 Nukleotiden Länge, insbesondere mit mindestens 24 Nukleotiden Länge sein.
Die genauen biologischen Funktionen der erfindungsgemäß verwendeten Poly
peptide der SEQ ID Nr. 55 bis SEQ ID Nr. 58 sind unbekannt. Bei den Untersu
chungen im Rahmen dieser Erfindung konnte zum ersten Mal ein Zusammenhang
der erfindungsgemäßen Polypeptide mit Erkrankungen, beispielsweise Hauter
krankungen, festgestellt werden. Die Accession Numbers der erfindungsgemäßen
Polypeptidsequenzen und ihrer cDNAs soweit bekannt sind in Fig. 4 aufgelistet.
Die noch nicht in öffentlichen Datenbanken zugänglichen cDNA Sequenzen der
Polypeptide von Seq ID Nr. 55 bis 57 sind unter SEQ ID Nr. 50 bis 52 angeführt.
Fig. 7 und Fig. 8 zeigen den Vergleich der menschlichen und murinen Poly
peptidsequenzen.
Bei der Analyse der Genexpression während des Wundheilungsprozesses konnten
weitere Gene identifiziert werden, deren bereits bekannte und beschriebene Funk
tionen bisher nicht mit Hauterkrankungen, beispielsweise bei einer gestörten
Wundheilung, in Verbindung gebracht wurden, deren Regulation aber für den
Wundheilungsprozeß essentiell ist und die damit erstmals in kausalen Zusammen
hang mit Hauterkrankungen, beispielsweise bei einer gestörten Wundheilung,
gebracht wurden. Die Polypeptide dieser Gene gehören nicht zu den bisher be
kannten Zielen von Therapien von Hauterkrankungen und/oder der Wundheilung,
so daß sich aus dieser Erfindung völlig neue Therapieansätze ergeben.
Die Aufgabe der Erfindung wird weiterhin durch die Verwendung mindestens
eines Polypeptids oder Varianten davon gemäß einer der SEQ ID Nr. 1 bis SEQ
ID Nr. 20 und SEQ ID Nr. 31 bis SEQ ID Nr. 48 und SEQ ID Nr. 63 bis SEQ ID
Nr. 70 und/oder diese kodierende Nukleinsäuren oder Varianten zur (i) Diagnose
und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen,
und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere
Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven
Substanzen gelöst.
Erfindungsgemäß können folgende Polypeptide verwendet werden:
- - Das tumor susceptibility gene TSG101 aus Maus (SEQ ID Nr. 1) oder Mensch (SEQ ID Nr. 2), das aus WO 97/18333 und US 5,892,016 bekannt ist (Li und Co hen, 1996, Cell 85: 319-329; Li et al., 1997, Cell 88: 143-154). Die funktionelle Inaktivierung von TSG101 in Fibroblasten führt zur zellulären Transformation und zur Fähigkeit metastasierende Tumore zu bilden. TSG101-defiziente neopla stische Zellen zeigen Abnormitäten in Mitose-assoziierten Prozessen (Xie et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 1595-1600). Zudem wird eine Rolle als transkriptioneller Modulator vermutet (Sun et al., 1999, Cancer 86: 689-696).
- - Das aus US 5,905,023, US 5,801,001, US 5,470,970 und WO 94/05804 be kannte Tumorsuppressor-Protein Maspin aus Maus (SEQ ID Nr. 3) oder Mensch (SEQ ID Nr. 4) (Zou et al., 1994, Science 263, 526-529). MASPIN ist ein Serin- Protease-Inhibitor (Zhang et al., 1997, Mol. Med. 3: 49-59), der in normalen Brust- und Prostataepithelzellen exprimiert wird (Zhang et al., 1997, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 5673-5678) und eine wesentliche Rolle bei der Entwicklung der Brustdrüsen spielt (Zhang et al., 1999, Dev. Biol. 215: 278-287).
- - Der RNA-Polymerase I Terminationsfaktor TTF-I aus Maus (SEQ ID Nr. 5) oder Mensch (SEQ ID Nr. 6) (Evers und Grummt, 1995, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 5827-5831). Das Protein vermittelt die Termination der Transkription ribosomaler Gene (Kuhn et al., 1990, Nature 344: 559-62) sowie die transkriptio nelle Aktivierung der ribosomalen Gene im Chromatin (Langst et al., 1998, EMBO J. 17: 3135-45).
- - Das aus WO 91/02077 und US 7,745,381 bekannte B-raf Protoonkogen aus Maus (SEQ ID Nr. 7) oder Mensch (SEQ ID Nr. 8) (Miki et al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 5167-5171; Stephens et al., 1992, Mol. Cell. Biol. 12: 3733- 3742). Das B-raf Protoonkogen gehört zur Raf-Familie, die Serin-/Threonin- Proteinkinasen umfaßt, die die Stimulation von Wachstumsfaktorrezeptoren und die Aktivierung von mitogen-aktivierten Proteinkinase koppeln (Mason et al., 1999, EMBO J. 18: 2137-48). U. a. kann B-Raf Apoptose inhibieren (Erhardt et al., 1999, Mol. Cell. Biol. 19: 5308-15).
- - Das aus US 4,716,148 und US 4,659,694 bekannte Prothymosin alpha aus Maus (SEQ ID Nr. 9) oder Mensch (SEQ ID Nr. 10) (Schmidt und Werner D.; 1991, Biochim. Biophys. Acta 1088: 442-444, Eschenfeldt und Berger, 1986, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9403-9407). Es kodiert ein kleines acidisches Kernprotein, das eine Rolle bei der Proliferation von Zellen spielt (Tao et al., 1999, J. Cell. Physiol. 178: 154-63).
- - Der GOLGI 4-TRANSMEMBRANE SPANNING TRANSPORTER oder MTP (mouse transporter protein) aus Maus (SEQ ID Nr. 11) oder Mensch (SEQ ID Nr. 12) (Hogue et al., 1996, J. Biol. Chem. 271: 9801-9808; Nagase et al., 1995, DNA Res. 2: 37-43). Es ist ein stark konserviertes Membranprotein, das in Säugerzellen in Lysosomen und Endosomen lokalisiert ist. Das Protein ist für die subzelluläre Verteilung verschiedener kleiner hydrophober Moleküle verantwortlich und trägt zur Sensitivität bzw. Resistenz von Säugerzellen gegenüber bestimmten Wirkstof fen bei (Hogue et al., 1999, J. Biol. Chem. 274: 12877-82).
- - CCR-1 aus Maus (SEQ ID Nr. 13) oder Mensch (SEQ ID Nr. 14) (Post et al., 1995, J. Immunol. 155: 5299-5305), das ein Eosinophil-Rezeptor für das CC Che mokin Eotaxin ist (Gao et al., 1996, Biochem. Biophys. Res. Comm. 223: 679-84). CCR-1 wird in Herz, Milz und Lunge exprimiert (Gao und Murphy, 1995, Geno mics 29: 294-96).
- - das Nukleosomen-Bindeprotein HMG-14 aus Maus (SEQ ID Nr. 15) oder Mensch (SEQ ID Nr. 16) (Landsman und Bustin, 1990, Nucleic Acids Res. 18: 5311-5311; Landsman et al., 1986, J. Biol. Chem. 261: 16082-16086), das hö her geordnete Chromatinstrukturen öffnet und somit das Transkriptions- und Re plikationspotential von Chromatin erhöht (Herrera et al., 1999, Mol. Cell. Biol. 19: 3466-73).
- - Split hand/foot deleted 1 aus Maus (SEQ ID Nr. 17) oder Mensch (SEQ ID Nr. 18), das ein Kandidaten-Gen für die autosomal dominante Form der "split hand/split foot malformation disorder" ist. Es wird in den Knospen der Gliedma ßen, in der "cranofacial primordia" und in der Haut exprimiert (Crackower et al., 1996, Hum. Mol. Genet. 5: 571-9).
- - Der Orphan Receptor TAK1 oder TR4 aus Maus (SEQ ID Nr. 19) oder Mensch (SEQ ID Nr. 20) (Hirose et al., 1995, Gene 163: 239-242, Hirose et al., 1994, Mol. Endocrinol. 8: 1667-1680), der zur Superfamilie der nukleären Hormonrezeptoren gehört (Hirose et al., 1994, Mol. Endocrinol. 8: 1667-80). Als Homodimer beein flußt TR4 eine Vielzahl von Signaltransduktionswegen, darunter die von Retinol säure, Thyreoidhormon, Vitamin D3 und "ciliary neutrophic factor". Außerdem bildet TR4 Heterodimere mit dem Androgenrezeptor (Lee et al., 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 14724-9).
- - Das aus WO 95/14772 bekannte BAF57 aus Maus (SEQ ID Nr. 31) oder Mensch (SEQ ID Nr. 32), das Bestandteil der Chromatin-remodellierenden SWI/SNF-Komplexe höherer Eukaryonten ist (Wang et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 492-498). Die SWI/SNF-Komplexe regulieren die Tran skription spezifischer Gene indem sie die Chromatin-vermittelte Repression der Transkription aufheben (Wolffe und Guschin, 2000, J. Struct. Biol. 129: 102-122). Außerdem wurde eine Rolle bei der Umstellung der Expression von fötalem zu adultem Globin in Mäusen gezeigt (Armstrong et al., 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 349-54).
- - Das aus US 7,935,311 bekannte Epidermal Growth Factor Receptor Kinase Sub strat EPS8 aus Maus (SEQ ID Nr. 33) oder Mensch (SEQ ID Nr. 34), das EGF- abhängige mitogene Signale verstärkt (Wong et al., 1994, Oncogene 9: 3057-3061; Fazioli et al., 1993, EMBO J. 12: 3799-3808). Sowohl Überexpression als auch konstitutive Phosphorylierung von EPS8 wurden im Zusammenhang mit Tu morentwicklung beschrieben (Matoskova et al., 1995, Mol. Cell Biol. 15: 3805- 3812).
- - KIAA1247 aus Mensch (SEQ. ID Nr. 36), das laut WO 99/34004 als Marker- Protein bei Krebsmetastasen eingesetzt werden kann. Außerdem ist ein KIAA1247 Homolog aus der Ratte aus WO 98/53071 als Protein bekannt, dessen Expression in verletzten oder regenerierenden Geweben, vor allem in Nierenge webe der Ratte, induziert wird. Zusätzlich zu dem bekannten Polypeptid aus Mensch kann auch das in dieser Arbeit erstmals erwähnte Polypeptid aus der Maus (SEQ. ID Nr. 35) verwendet werden.
- - Der aus US 5,948,626, US 5,663,059 und US 5,811,520 bekannte Phospholipase Inhibitor GIPL aus Mensch (SEQ ID Nr. 38). Zusätzlich zu dem bekannten Poly peptid aus Mensch können auch das in dieser Arbeit erstmals erwähnte Polypeptid aus der Maus (SEQ ID Nr. 37) und das in dieser Arbeit erstmals erwähnte eng verwandte Polypeptid mit signifikant abweichender Sequenz (SEQ ID Nr. 45) verwendet werden.
- - Das aus WO 95/28497 bekannte EAT/MCL-1 aus Maus (SEQ ID Nr. 39) oder Mensch (SEQ ID Nr. 40), das in zahlreichen Geweben exprimiert wird (Krajewski et al., 1995, Am. J. Pathol. 146: 1309-19) und eine Rolle bei cutanen malignen Melanomen spielt (Tang et al., 1998, Clin. Cancer Res. 4: 1865-71).
- - Das aus US 5,958,690 bekannte TSC-22 (TGF beta-stimulated clone 22 gene) aus Mensch (SEQ ID Nr. 42) und Maus (SEQ ID Nr. 41) (Jay et al., 1996, Bio chem. Biophys. Res. Commun. 222: 821-826; Shibanuma et al., 1992, J. Biol. Chem. 267: 10219-10224), das zu der Familie der "Leucin-Zipper" Transkripti onsfaktoren gehört (Kester et al., 1999, J. Biol. Chem. 274: 27439-47). Die Transkription von TSC-22 wird durch verschiedene Stimuli wie Wachstumsinhibitoren induziert (Kester et al., 1999, J. Biol. Chem. 274: 27439-47). Außerdem wurde während der Entwicklung des Maus-Embryos eine verstärkte Expression von TSC-22 an Orten beobachtet, an denen Mesenchym-Epithel-Interaktionen statt finden (Dohrmann et al., 1999, Mech. Dev. 84: 147-51).
- - Das aus JP 100 57 065 und US 5,837,537 bekannte gamma-Sarcoglycan aus Mensch (SEQ ID Nr. 44) oder Maus (SEQ ID Nr. 43) (Noguchi et al., 1995, Sci ence 270: 819-822; Noguchi et al., 1999, Biochem. Biophys. Res. Commun. 262: 88-93). Gamma-Sarcoglycan ist eine Komponente des Sarcoglycan- Komplexes, der wiederum ein Subkomplex des Dystrophin-Gycoprotein- Komplexes ist. Dieser stellt eine Verbindung zwischen der extrazellulären Matrix und dem Aktin-Cytoskelett her (Hack et al., 2000, Microsc. Res. Tech. 48: 167- 80). Mutationen des gamma-Sarcoglycan wurden als primärer genetischer Defekt einer muskulären Dystrophie (SCARMD) beschrieben (Noguchi et al., 1995, Sci ence 270: 819-822).
- - Der aus WO 99/38882, WO 88/09384, DE 37 24 581, JP 012 02 287, JP 010 74 988 und US 5,212,297 bekannte Cystein Proteinase Inhibitor Cystatin C aus Mensch (SEQ ID Nr. 47) oder Maus (SEQ ID Nr. 46) (Abrahamson et al., 1987, FEBS Lett. 216: 229-233; Solem et al., 1990, Biochem. Biophys. Res. Commun. 172: 945-951). Cystein Protease Inhibitoren spielen eine Rolle bei Entzündungs krankheiten, wie z. B. Rheuma (Lenarcic et al., 1988, Biol. Chem. Hoppe Seyler 369 (Suppl.): 257-261 und bei vaskulären Krankheiten (Shi et al., 1999, J. Clin. Invest. 104: 1191-1197). Zusätzlich zu der bekannten Polypeptidvariante aus der Maus (SEQ ID Nr. 46) (Solem et al., 1990, Biochem. Biophys. Res. Commun. 172: 945-951) kann auch das in dieser Arbeit erstmals erwähnte eng verwandte Polypeptid mit abweichender Sequenz verwendet werden (SEQ ID Nr. 48).
- - Die Tyrosinkinase Fer aus Maus (SEQ ID Nr. 63) oder Mensch (SEQ ID Nr. 64) (SwissProt: P70451; Hao et al., 1989, Mol. Cell. Biol. 9: 1587-1593), die sowohl im Kern als auch im Zytoplasma lokalisiert ist (Hao et al., 1991, Mol. Cell. Biol. 11: 1180-1183). Für Fer wurde sowohl eine Rolle bei der Zell-Zell-Adhäsion (Rosato et al., 1998, Mol. Cell. Biol. 18: 5762-5770) als auch eine Rolle als Proto- Onkogen (Morris et al., 1990, Cytogenet. Cell. Genet. 53: 196-200) postuliert.
- - Das aus WO 99/28473, WO 96/34891 und WO 98/14582 bekannte C-C Cytokin MRP-3 (Macrophage Inflammatory Protein 3) aus Maus (SEQ ID Nr. 65) oder Mensch (SEQ ID Nr. 66), das auch C10, MPIF-1 (Myeloid Progenitor Inhibitory Factor-1), CK-beta-8 oder Small Inducible Cytokine A23 genannt wird (Orlofsky et al., 1991, Cell Regul. 2: 403-412; Li und Ruben, 1996, US 5,504,003). Bei chronischer Bauchfellentzündung wurde eine hohe MRP-3-Expression in Makro phagen beobachtet (Wu et al., 1999, Cytokine 11: 523-30). Als typisches C-C Cytokin ist MRP-3 ein Chemoattraktant für Leukozyten (Haelens et al., 1996, Immunobiology 195: 499-521), es wirkt aber auch auf Osteoclasten (Votta et al., 2000, J. Cell Physiol. 183: 196-207). Außerdem wurde beobachtet, daß MRP-3 mRNA nicht signifikant durch Stimuli, die mit Wundheilung im Zusammenhang stehen, hochreguliert wird (Orlofsky et al., Cell Regul., 1991, 2: 403-412).
- - Die Nikotinamid N-Methyltransferase NNMT aus Maus (SEQ ID Nr. 67) oder Mensch (SEQ ID Nr. 68) (Aksoy et al., 1994, J. Biol. Chem. 269: 14835-14840; Yan et al., 1997, Biochem. Pharmacol. 54: 1139-1149), die den Methyltransfer von S-Adenosylmethionin auf Nikotinamid katalysiert. Es existieren Hinweise, daß NNMT das Wachstum von Leberzellen regulieren kann (Seifert et al., 1984, Bio chim. Biophys. Acta 801: 259-64). Zudem wurde eine Rolle des Enzyms bei Le berkrebs vorgeschlagen (Hoshino et al., 1982, Biochim. Biophys. Acta 719: 518- 526).
- - Die Ubiquitin-Protein Ligase UBC9 aus Maus (SEQ ID Nr. 69) oder Mensch (SEQ ID Nr. 70) (Yasugi und Howley; 1996, Nucleic Acids Res. 24: 2005-2010; SwissProt: P50550), die eine wichtige Komponente des Proteosom-vermittelten Proteinabbaus darstellt (Hershko und Ciechanover, 1998, Annu. Rev. Biochem. 67: 425-479). Der Ubiqitin-abhängige Proteinabbau spielt eine Rolle in verschie densten Prozessen wie Zellzykluskontrolle, Signaltransduktion oder der Im munantwort. Es existieren Hinweise, daß UBC9 eine Rolle bei beschleunigter Alterung spielt (Kawabe et al., 2000, J. Biol. Chem.). Zudem katalysiert UBC9 die Sumoylierung von p53 und aktiviert somit seine Funktion als Transkriptions faktor (Rodriguez et al., 1999, EMBO J. 18: 6455-61):
Für keines dieser Polypeptide, deren kodierende Nukleinsäure oder der beschrie
benen cDNA wurde bisher ein Zusammenhang mit Hauterkrankungen, beispiels
weise bei einer gestörten Wundheilung, beschrieben oder nahegelegt. Es war da
her unerwartet, daß diese Verbindungen erfindungsgemäß verwendet werden
können. Die Accession Numbers der erfindungsgemäßen Polypeptide und ihrer
cDNAs sind in Fig. 5 aufgeführt. Die noch nicht in öffentlichen Datenbanken
zugänglichen cDNA Sequenzen der Polypeptide der SEQ ID Nr. 35 und der SEQ
ID Nr. 37 sind unter SEQ ID Nr. 53 und SEQ ID Nr. 54 angeführt.
Bei der Analyse der Genexpression während des Wundheilungsprozesses konnten
zusätzlich Gene identifiziert werden, deren bereits bekannte und beschriebene
Funktionen bisher nicht mit der Wundheilung in Verbindung gebracht wurden,
deren Regulation aber für den Wundheilungsprozeß essentiell ist und die damit
erstmals in kausalen Zusammenhang mit der Wundheilung gebracht wurden. Die
Polypeptide dieser Gene gehören nicht zu den bisher bekannten Zielen von The
rapien in Zusammenhang mit der krankhaften Veränderung der Wundheilung, so
daß sich aus dieser Erfindung völlig neue Therapieansätze ergeben.
Die Aufgabe der Erfindung wird daher zusätzlich durch die Verwendung minde
stens eines Polypeptids oder Varianten davon gemäß einer der SEQ ID Nr. 21 bis
SEQ ID Nr. 30 und SEQ ID Nr. 71 bis SEQ ID Nr. 73 und/oder diese kodierende
Nukleinsäuren oder Varianten davon zur (i) Diagnose und/oder Behandlung bei
der Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (ii) Identifizierung
von pharmakologisch aktiven Substanzen gelöst.
Erfindungsgemäß können folgende Polypeptide verwendet werden:
- - Das aus WO 95/04158, WO 99/12968 und EP 0 488 900 bekannte Monocyte Chemotactic Protein-3, MCP-3 aus Maus (SEQ ID Nr. 21) oder Mensch (SEQ ID Nr. 22) (Kulmburg et al., 1992, J. Exp. Med. 176: 1773-1778; Minty et al., 1993, Eur. Cytokine Netw. 4: 99-110). MCP-3 ist ein CC-Chemokin, das der Chemoat traktion und Aktivierung von Monocyten, T-Lymphocyten, Eosinophilen und Basophilen Granulocyten, Killerzellen und dendritischen Zellen dient. Die Akti vierung der Zielzellen erfolgt über die Chemokinrezeptoren CCR2 und CCR3 (Wang et al., 2000, Biochim. Biophys. Acta 1500: 41-8). MCP-3 spielt eine Rolle bei allergischen Reaktionen in der Haut (Ying et al., 1999, J. Immunol. 163: 3976- 84).
- - Die aus EP 0 475 746 und WO 98/47923 bekannte alpha-Kette des heterodime
ren Interleukin-5-Rezeptors aus Maus (SEQ ID Nr. 23) oder Mensch (SEQ ID Nr.
24) (Takaki 1990, EMBO J. 9: 4367-4374, Tavernier et al., 1992, Proc. Natl.
Acad. Sci. U.S.A. 89: 7041-7045). Sie vermittelt die spezifische Bindung des Li
ganden Interleukin-5 (Van Ostade et al., 1999, Eur. J. Biochem. 259: 954-60) und
wird auf der Zellmembran von Eosinophilen exprimiert (Weltman und Karim,
1998, Allergy Asthma Proc. 19: 257-61). Eine Rolle des Interleukin-5 Rezeptors
bei der Atopischen Dermatitis wurde beschrieben (Taha et al., 1998, J. Allergy
Clin. Immunol. 102: 245-50).
Interleukin-5 spielt eine wesentliche Rolle in der Differenzierung, Proliferation und funktionellen Aktivierung von Eosinophilen (Iwama et al., 1999, Mol. Cell. Biol. 19: 3940-50) und, im Gegensatz zum hier beschriebenen Rezeptor, wurde eine Funktion von Interleukin-5 in der Wundheilung beschrieben (Yang et al., 1997, Am J Pathol 151: 813-9). - - Das aus WO 99/04265 bekannte integrale Membranprotein Dad1 aus Maus (SEQ ID Nr. 25) oder Mensch (SEQ a Nr. 26) (Nakashima et al., 1993, Mol. Cell. Biol. 13: 6367-6374; Apte et al., 1995; FEBS Lett. 363: 304-306). Es ist Be standteil des Oligosaccharyltransferase-Enzymkomplexes, der die N- Glukosylierung einleitet (Sanjay et al., 1998, J. Biol. Chem., 273: 26094-9). Dad1 spielt eine Rolle bei der Verhinderung von Apoptose in bestimmten Zelltypen (Hong et al., 1999, J. Immunol. 163: 1888-93) und in Keloiden (Sayah et al., 1999, J. Surg. Res. 87: 209-16).
- - Das aus DE 198 13 839, US 5,776,348 und US 5,614,397 bekannte Calcium bindende Protein MRP-14 aus Maus (SEQ ID Nr. 27) oder Mensch (SEQ ID Nr. 28) (Odink et al., 1987, Nature 330: 80-82; Lagasse und Weissman, 1992, Blood 79: 1907-1915). Das Protein bildet Heterodimere mit MRP-8 und ist in Makropha gen in akut entzündeten Geweben hochreguliert (Sorg, 1992, Behring Inst. Mitt. 91: 126-37). Außerdem wurden erhöhte Mengen an MRP-14 in der Epidermis von Patienten mit Liehen planus, Lupus erythematosus und Psoriasis vulgaris beob achtet (Kunz et al., 1992, Arch. Dermatol. Res. 284: 386-90).
- - Das aus EP 0 905 240, EP 0 905 241, WO 98/02459, EP 0 906 954, WO 95/04158, WO 99/12968, WO 97/25427 bekannte MCP-2 (C-C chemokine mo nocyte chemotactic protein 2) aus Mensch (SEQ ID Nr. 30) oder Maus (SEQ ID Nr. 29) (von Coillie et al., 1997, Genomics 40: 323-331; EMBL: AB023418). MCP-2 gehört zu den C-C Chemokinen und wirkt die als Chemoattraktant für verschiedene Zellen wie Macrophagen, Basophile und Eosinophile (Taub et al., 1995, J. Clin. Invest. 95: 1370-6; Proost et al., 1996, J. Leukoc. Biol. 59: 67-74). MCP-2 ist ein Signalmolekül, das bei Entzündungsprozessen die gerichtete Mi gration von T-Zellen und Monocyten stimuliert und diese rekrutiert (Taub et al., 1995, J. Clin. Invest. 95: 1370-6). Zusätzlich zu der bekannten Polypeptidvariante aus dem Mensch (SEQ ID Nr. 31)(von Coillie et al., 1997, Genomics 40: 323-331) kann auch das in dieser Arbeit erstmals erwähnte eng verwandte Polypeptid mit abweichender Sequenz verwendet werden (SEQ ID Nr. 71).
- - Die aus WO 96/33278 bekannte Cystein-Protease Cathepsin C aus Maus (SEQ ID Nr. 72) oder Mensch (SEQ ID Nr. 73) (Paris et al., 1995, FEBS Lett. 369: 326- 330; McGuire et al., 1997, Biochim. Biophys. Acta 1351: 267-273), die in Lyso somen verschiedener Zellen vorkommt (Turk et al., 1997, Biol. Chem. 378: 141- 150). Cathepsin C spielt eine wichtige Rolle bei der Aktivierung von Granzym A und B und somit bei der Induktion von Apoptose durch cytotoxische Lympho zyten (Pham und Ley, 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 8627-8632). Außer dem wurde beobachtet, daß "loss-of-function" Mutationen im Cathepsin C Gen zu palmoplanarer Keratose und Periodonditis führen (Hart et al., 1999, J. Med. Ge net. 36: 881-887; Toomes et al., 1999, Nat. Genet. 23: 421-424).
Für keines dieser Polypeptide oder diese kodierende Nukleinsäuren wurde bisher
ein Zusammenhang mit der Wundheilung beschrieben oder nahegelegt. Es war
daher unerwartet, daß diese Polypeptide erfindungsgemäß verwendet werden
können. Die Accession Numbers der erfindungsgemäßen Polypeptide und ihrer
cDNAs sind in Fig. 6 aufgeführt.
Die erfindungsgemäßen Polypeptide können weiterhin dadurch gekennzeichnet
sein, daß diese synthetisch hergestellt werden. So kann das gesamte Polypeptid
oder Teile davon zum Beispiel mit Hilfe der klassischen Synthese (Merrifield-
Technik) synthetisiert werden. Teile der erfindungsgemäßen Polypeptide eignen
sich insbesondere zur Gewinnung von Antiseren, mit deren Hilfe geeignete
Genexpressionsbanken durchsucht werden können, um so zu weiteren Varianten
des erfindungsgemäßen Polypeptids zu gelangen.
Bevorzugterweise handelt es sich bei den erfindungsgemäß verwendeten Nuklein
säuren um DNA oder RNA, vorzugsweise eine DNA, insbesondere eine doppel
strängige DNA. Weiterhin kann die Sequenz der Nukleinsäuren dadurch gekenn
zeichnet sein, daß sie mindestens ein Intron und/oder eine polyA-Sequenz auf
weist. Die erfindungsgemäß verwendeten Nukleinsäuren können auch in Form
ihrer antisense-Sequenz verwendet werden.
Für die Expression des betreffenden Gens ist im allgemeinen eine doppelsträngige
DNA bevorzugt, wobei der für das Polypeptid kodierende DNA-Bereich beson
ders bevorzugt ist. Dieser Bereich beginnt mit dem ersten in einer Kozak Sequenz
(Kozak, 1987, Nucleic. Acids Res. 15: 8125-48) liegenden Start-Codon (ATG) bis
zum nächsten Stop-Codon (TAG, TGA bzw. TAA), das im gleichen Leseraster
zum ATG liegt.
Eine weitere erfindungsgemäße Verwendung der Nukleinsäuresequenzen ist die
Konstruktion von anti-sense Oligonukleotiden (Zheng und Kemeny, 1995, Clin.
Exp. Immunol. 100: 380-2; Nellen und Lichtenstein, 1993, Trends Biochem. Sci.
18: 419-23; Stein, 1992, Leukemia 6: 967-74) und/oder Ribozymen (Amarzguioui,
et al. 1998, Cell. Mol. Life Sci. 54: 1175-202; Vaish, et al., 1998, Nucleic Acids
Res. 26: 5237-42; Persidis, 1997, Nat. Biotechnol. 15: 921-2; Couture und
Stinchcomb, 1996, Trends Genet. 12: 510-5). Mit anti-sense Oligonukleotiden
kann man die Stabilität von Nukleinsäuren verringert werden und/oder die
Translation von Nukleinsäuren inhibiert werden. So kann durch die erfindungs
gemäße Verwendung der Nukleinsäuresequenzen beispielsweise die Expression
der entsprechenden Gene in Zellen sowohl in vivo als auch in vitro vernngert
werden. Oligonukleotide können sich daher als Therapeutikum eignen. Diese
Strategie eignet sich beispielsweise auch für Haut, epidermale und dermale Zel
len, insbesondere, wenn die antisense Oligonukleotide mit Liposomen komple
xiert werden (Smyth et al., 1997, J. Invest. Dermatol. 108: 523-6; White et al.,
1999, J. Invest. Dermatol. 112: 699-705; White et al., 1999, J. Invest. Dermatol.
112: 887-92). Für die Verwendung als Sonde oder als "antisense" Oligonukleotid
ist eine einzelsträngige DNA oder RNA bevorzugt.
Weiterhin kann zur Durchführung der Erfindung eine Nukleinsäure verwendet
werden, die synthetisch hergestellt worden ist. So kann die erfindungsgemäß ver
wendete Nukleinsäure beispielsweise chemisch anhand der in den Fig. 4 bis 6
beschriebenen DNA Sequenzen und/oder anhand der in diesen Figuren ebenfalls
beschriebenen Proteinsequenzen unter Heranziehen des genetischen Codes z. B.
nach der Phosphotriester-Methode synthetisiert werden (siehe z. B. Uhlmann, E.
& Peyman, A. (1990) Chemical Revievs, 90, 543-584, No. 4).
Oligonukleotide werden in der Regel schnell durch Endo- oder Exonukleasen,
insbesondere durch in der Zelle vorkommende DNasen und RNasen, abgebaut.
Deshalb ist es vorteilhaft, die Nukleinsäure zu modifizieren, um sie gegen den
Abbau zu stabilisieren, so daß über einen langen Zeitraum eine hohe Konzentrati
on der Nukleinsäure in der Zelle beibehalten wird (Beigelman et al., 1995,
Nucleic Acids Res. 23: 3989-94; Dudycz, 1995, WO 95/11910; Macadam et al.,
1998, WO 98/37240; Reese et al., 1997, WO 97/29116). Typischerweise kann
eine solche Stabilisierung durch die Einführung von einer oder mehrerer Internu
kleotid-Phosphorgruppen oder durch die Einführung einer oder mehrerer Nicht-
Phosphor-Internukleotide, erhalten werden.
Geeignete modifizierte Internukleotide sind in Uhlmann und Peymann (1990
Chem. Rev. 90, 544) zusammengefaßt (siehe auch Beigelman et al., 1995 Nucleic
Acids Res. 23: 3989-94; Dudycz, 1995, WO 95/11910; Macadam et al., 1998,
WO 98/37240; Reese et al., 1997, WO 97/29116). Modifizierte Internukleotid-
Phosphatreste und/oder Nicht-Phosphorbrücken in einer Nukleinsäure, die bei
einer der erfindungsgemäßen Verwendungen eingesetzt werden können, enthalten
zum Beispiel Methylphosphonat, Phosphorothioat, Phosphoramidat, Phosphoro
dithioat, Phophatester, während Nicht-Phosphor-Internukleotid-Analoge, bei
spielsweise Siloxanbrücken, Carbonatbrücken, Carboxymethylester, Acetamidat
brücken und/oder Thioetherbrücken enthalten. Es ist auch beabsichtigt, daß diese
Modifizierung die Haltbarkeit einer pharmazeutischen Zusammensetzung, die bei
einer der erfindungsgemäßen Verwendungen eingesetzt werden kann, verbessert.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungsgemäßen Verwendung sind die
vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren in einem Vektor, vorzugsweise in ei
nem "shuttle" Vektor, Phagemid, Cosmid, Expressionsvektor oder gentherapeu
tisch wirksamen Vektor enthalten. Weiterhin können die vorangehend beschrie
benen Nukleinsäuren in "knock-out" Genkonstrukten oder Expressionskassetten
enthalten sein.
Vorzugsweise enthält ein gentherapeutisch wirksamer Vektor wund- bzw. haut
spezifische regulatorische Sequenzen, die funktionell mit der vorangehend be
schriebenen Nukleinsäure verbunden sind.
Die Expressionsvektoren können prokaryotische oder eukaryotische Expressions
vektoren sein. Beispiele für prokaryotische Expressionsvektoren sind für die Ex
pression in E. coli z. B. die Vektoren pGEM oder pUC-Derivate und für eukaryotische
Expressionsvektoren für die Expression in Saccharomyces cerevisiae z. B.
die Vektoren p426Met25 oder p426GAL1 (Mumberg et al. (1994) Nucl. Acids
Res., 22, 5767-5768), für die Expression in Insektenzellen z. B. Baculovirus-
Vektoren wie in EP-B 1-0 127 839 oder EP-B 1-0 549 721 offenbart, und für die
Expression in Säugerzellen z. B. die Vektoren Rc/CMV und Rc/RSV oder SV40-
Vektoren, welche alle allgemein erhältlich sind.
Im allgemeinen enthalten die Expressionsvektoren auch für die jeweilige Wirts
zelle geeignete Promotoren, wie z. B. den trp-Promotor für die Expression in E.
coli (siehe z. B. EP-B1-0 154 133), den Met 25, GAL1 oder ADH2-Promotor für
die Expression in Hefen (Russel et al. (1983), J. Biol. Chem. 258, 2674-2682;
Mumberg, supra), den Baculovirus-Polyhedrin-Promotor, für die Expression in
Insektenzellen (siehe z. 13. EP-B1-0 127 839). Für die Expression in Säugetier
zellen sind beispielsweise Promotoren geeignet, die eine konstitutive, regulierba
re, gewebsspezifische, zellzyklusspezifische oder metabolischspezifische Expres
sion in eukaryotischen Zellen erlauben. Regulierbare Elemente gemäß der vorlie
genden Erfindung sind Promotoren, Aktivatorsequenzen, Enhancer, Silencer
und/oder Repressorsequenzen.
Beispiel für geeignete regulierbare Elemente, die konstitutive Expression in Euka
ryonten ermöglichen, sind Promotoren, die von der RNA Polymerase III erkannt
werden oder virale Promotoren, CMV-Enhancer, CMV-Promotor, SV40 Promotor
oder LTR-Promotoren z. B. von MMTV (mouse mammary tumour virus; Lee et
al. (1981) Nature 214, 228-232) und weitere virale Promotor- und Aktivatorse
quenzen, abgeleitet aus beispielsweise HBV, HCV, HSV, HPV, EBV, HTLV oder
HIV.
Beispiele für regulierbare Elemente, die regulierbare Expression in Eukaryonten
ermöglichen, sind der Tetracyclinoperator in Kombination mit einem entspre
chenden Repressor (Gossen M. et al. (1994) Curr. Opin. Biotechnol. 5, 516-20).
Vorzugsweise erfolgt die Expression von wundheilungsrelevanten Genen unter
der Kontrolle von gewebespezifischen Promotoren, wobei hautspezifische Pro
motoren wie beispielsweise der humane K10 Promotor (Bailleul et al., 1990. Cell
62: 697-708), der humane K14 Promotor (Vassar et al., 1989, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 86: 1563-67) oder der bovine Cytokeratin IV Promotor (Fuchs et al.,
1988; The biology of wool and hair (Hrsg.: G. E. Rogers, et al.), S. 287-309.
Chapman und Hall, London/New York) besonders zu bevorzugen sind.
Weitere Beispiele für regulierbare Elemente, die gewebsspezifische Expression in
Eukaryonten ermöglichen, sind Promotoren oder Aktivatorsequenzen aus Promo
toren oder Enhancern von solchen Genen, die für Proteine kodieren, die nur in
bestimmten Zelltypen exprimiert werden.
Beispiele für regulierbare Elemente, die zellzyklusspezifische Expression in Euka
ryonten ermöglichen, sind Promotoren folgender Gene: cdc25A, cdc25B, cdc25C,
Cyclin A, Cyclin E, cdc2, E2F-1 bis E2F-5, B-myb oder DHFR (Zwicker J. und
Müller R. (1997) Trends Genet. 13, 3-6). Die Verwendung von zellzyklusregu
lierten Promotoren ist besonders bevorzugt in Fällen, in denen die Expression der
erfindungsgemäß verwendeten Polypeptide oder Nukleinsäuren auf proliferieren
de Zellen beschränkt werden soll.
Beispiele für regulierbare Elemente, die metabolischspezifische Expression in
Eukaryonten ermöglichen, sind Promotoren, die durch Hypoxie, durch Glukose
mangel, durch Phosphatkonzentration oder durch Hitzeschock reguliert werden.
Um die Einführung von den vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren und damit
die Expression des Polypeptids in einer eu- oder prokaryotischen Zelle durch
Transfektion, Transformation oder Infektion zu ermöglichen, kann die Nuklein
säure als Plasmid, als Teil eines viralen oder nicht-viralen Vektors vorliegen. Als
virale Vektoren eignen sich hierbei besonders: Baculoviren, Vakziniaviren, Ade
noviren, adenoassoziierte Viren und Herpesviren. Als nicht-virale Vektoren eignen
sich hierbei besonders: Virosomen, Liposomen, kationische Lipide, oder po
ly-Lysin konjugierte DNA.
Beispiele von gentherapeutisch wirksamen Vektoren sind Virusvektoren, bei
spielsweise Adenovirusvektoren oder retroviralen Vektoren (Lindemann et al.,
1997, Mol. Med. 3: 466-76; Springer et al., 1998, Mol. Cell. 2: 549-58). Eukaryo
tische Expressionsvektoren eignen sich in isolierter Form für die gentherapeuti
sche Anwendung, da nackte DNA bei topischer Applikation in Hautzellen ein
dringen kann (Hengge et al., 1996, J. Clin. Invest. 97: 2911-6; Yu et al., 1999, J.
Invest. Dermatol. 112: 370-5).
Gentherapeutisch wirksame Vektoren lassen sich auch dadurch erhalten, daß man
die vorangehend beschriebenen Nukleinsäure mit Liposomen komplexiert, da da
mit eine sehr hohe Transfektionseffizienz, insbesondere von Hautzellen, erreicht
werden kann (Alexander und Akhurst, 1995, Hum. Mol. Genet. 4: 2279-85). Bei
der Lipofektion werden kleine unilamellare Vesikel aus kationischen Lipiden
durch Ultraschallbehandlung der Liposomensuspension herstellt. Die DNA wird
ionisch auf der Oberfläche der Liposomen gebunden, und zwar in einem solchen
Verhältnis, daß eine positive Nettoladung verbleibt und die Plasmid-DNA zu
100% von den Liposomen komplexiert wird. Neben den von Felgner et al. (1987,
supra) eingesetzten Lipidmischungen DOTMA (1,2-Dioleyloxpropyl-3-
trimethylammoniumbromid) und DPOE (Dioleoylphosphatidylethanolamin) wur
den inzwischen zahlreiche neue Lipidformulierungen synthetisiert und auf ihre
Effizienz der Transfektion verschiedener Zellinien getestet (Behr et al. (1989),
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 6982-6986; Gao und Huang (1991), Biochim.
Biophys. Acta 1189, 195-203; Felgner et al. (1994) J. Biol. Chem. 269, 2550-
2561). Beispiele der neuen Lipidformulierungen sind DOTAP N-[1-(2,3-
Dioleoyloxy)propyl]-N,N,N-trimethylammoniumethylsulfat oder DOGS
(TRANSFECTAM; Dioctadecylamidoglycylspermin). Hilfsstoffe, die den Trans
fer von Nukleinsäuren in die Zelle erhöhen, können beispielsweise Proteine oder
Peptide, die an DNA gebunden sind oder synthetische Peptid-DNA-Moleküle, die
den Transport der Nukleinsäure in den Kern der Zelle ermöglichen, sein
(Schwartz et al. (1999) Gene Therapy 6, 282; Brandén et al. (1999) Nature Bio
tech. 17, 784). Hilfsstoffe umfassen auch Moleküle, die die Freisetzung von Nu
kleinsäuren in das Cytoplasma der Zelle ermöglichen (Planck et al. (1994) J. Biol.
Chem. 269, 12918; Kichler et al. (1997) Bioconj. Chem. 8, 213) oder beispiels
weise Liposomen (Uhlmann und Peymann (1990) supra). Eine andere besonders
geeignete Form von gentherapeutischen Vektoren läßt sich dadurch erhalten, daß
man die vorangehend beschriebene Nukleinsäure auf Goldpartikeln aufbringt und
diese mit Hilfe der sogenannten "Gene Gun" in Gewebe, bevorzugt in die Haut,
oder Zellen schießt (Wang et al., 1999, J. Invest. Dermatol., 112: 775-81, Tuting et
al., 1998, J. Invest. Dermatol. 111: 183-8).
Eine weitere Form eines gentherapeutisch wirksamen Vektors läßt sich durch das
Einbringen von "nackten" Expressionsvektoren in eine biokompatible Matrix,
beispielsweise eine Kollagenmatrix, herstellen. Diese Matrix kann in Wunden
eingebracht werden, um die einwandernden Zellen mit dem Expressionsvektor zu
transfizieren und die erfindungsgemäßen Polypeptide in den Zellen zu exprimie
ren (Goldstein und Banadio, US 5,962,427).
Für die gentherapeutische Anwendung der vorangehend beschriebenen Nuklein
säure ist es auch von Vorteil, wenn der Teil der Nukleinsäure, der für das Poly
peptid kodiert, ein oder mehrere nicht kodierende Sequenzen einschließlich
Intronsequenzen, vorzugsweise zwischen Promotor und dem Startcodon des Poly
peptids, und/oder eine polyA-Sequenz, insbesondere die natürlich vorkommende
polyA-Sequenz oder eine SV40 Virus polyA-Sequenz, vor allem am 3'-Ende des
Gens enthält, da hierdurch eine Stabilisierung der mRNA erreicht werden kann
(Palmiter et al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 478-482; Jackson, 1993,
Cell 74: 9-14).
Knock-out Genkonstrukte sind dem Fachmann zum Beispiel aus den US-Patenten
5,625,122; US 5,698,765; US 5,583,278 und US 5,750,825 bekannt.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine Wirtszelle, insbe
sondere eine Hautzelle, die mit einem der vorangehend beschriebenen Vektoren
oder knock-out Genkonstrukt transformiert ist. Wirtszellen können sowohl proka
ryotische als auch eukaryotische Zellen sein, Beispiele für prokaryotische Wirts
zellen sind E. coli und für eukaryotische Zellen Saccharomyces cerevisiae oder
Insektenzellen.
Ein besonders bevorzugte transformierte Wirtszelle ist eine transgene embryonale
nichtmenschliche Stammzelle, die dadurch gekennzeichnet ist, daß sie mindestens
ein knock-out Genkonstrukt und/oder mindestens eine Expressionskassette, wie
vorangehend beschrieben, enthält. Verfahren zur Transformation von Wirtszellen
und/oder Stammzellen sind dem Fachmann gut bekannt und umfassen zum Bei
spiel Elektroporation oder Mikroinjektion.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist ein transgenes nichtmenschliches Säu
getier, dessen Genom mindestens ein knock-out Genkonstrukt und/oder minde
stens eine Expressionskassette, wie vorangehend beschrieben, enthält. Transgene
Tiere zeigen im allgemeinen eine gewebespezifisch erhöhte Expression der Nu
kleinsäuren und/oder Polypeptide und lassen sich zur Analyse von Wundheilungs
störungen verwenden. So weist beispielsweise eine Activin A transgene Maus
eine verbesserte Wundheilung auf (Munz et al., 1999, EMBO J. 18: 5205-15) wäh
rend eine transgene Maus mit dominant negativem KGF Rezeptor eine verzögerte
Wundheilung aufweist (Werner et al., 1994, Science 266: 819-22).
Verfahren zur Herstellung von transgenen Tieren, insbesondere von transgenen
Mäusen, sind dem Fachmann ebenfalls aus der DE 196 25 049 und den US 4,736,866;
US 5,625,122; US 5,698,765; US 5,583,278 und US 5,750,825 be
kannt und umfassen transgene Tiere, die beispielsweise über direkte Injektion von
Expressionsvektoren (s. o.) in Embryonen oder Spermatozyten oder über die
Transfektion von Expressionsvektoren in embryonale Stammzellen erzeugt werden
können (Polites und Pinkert: DNA Microinjection and Transgenic Animal
Produktion, Seite 15 bis 68 in Pinkert, 1994: Transgenic animal technology: a
laboratory handbook, Academic Press, London, UK; Houdebine, 1997, Harwood
Academic Publishers, Amsterdam, The Netherlands; Doetschman: Gene Transfer
in Embryonic Stern Cells, Seite 115 bis 146 in Pinkert, 1994, supra; Wood: Retro
virus-Mediated Gene Transfer, Seite 147 bis 176 in Pinkert, 1994, supra; Mona
stersky: Gene Transfere Technology: Alternative Techniques and Applications,
Seite 177 bis 220 in Pinkert, 1994, supra).
Werden die vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren in sogenannte "Targeting"
Vektoren oder "knock-out" Genkonstrukte integriert (Pinkert, 1994, supra) kön
nen nach Transfektion von embryonalen Stammzellen und homologer Rekombi
nation beispielsweise knock-out Mäuse generiert werden, die im allgemeinen als
heterozygote Mäuse verringerte Expression der Nukleinsäure zeigen, während
homozygote Mäuse keine Expression der Nukleinsäure mehr aufweisen. Auch die
so erzeugten Tiere lassen sich zur Analyse von Wundheilungsstörungen verwen
den. So weisen beispielsweise die eNOS- (Lee et al., 1999, Am. J. Physiol.
277:H1600-H1608), Nf-1 (Atit et al., 1999, J. Invest. Dermatol. 112: 835-42) und
Osteopontin (Liaw et al., 1998, J. Clin. Invest. 101: 967-71) knock-out Mäuse eine
verschlechterte Wundheilung auf. Auch hier ist eine gewebespezifische Reduktion
der Expression wundheilungsrelevanter Gene, beispielsweise in hautspezifischen
Zellen unter Verwendung des Cre-loxP Systems (stat3 knock-out, Sano et al.,
EMBO J. 1999 18: 4657-68), besonders zu bevorzugen. So erzeugte transgene und
knock-out Zellen oder Tiere lassen sich auch zum Screening und zur Identifizie
rung von pharmakologisch aktiven Substanzen bzw. gentherapeutisch aktiven
Vektoren verwenden.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung ei
nes Polypeptids zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbe
sondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung
von pharmakologisch aktiven Substanzen in einer geeigneten Wirtszelle, das da
durch gekennzeichnet ist, daß mindestens eine der vorangehend beschriebenen
Nukleinsäuren verwendet wird.
Das Polypeptid wird beispielsweise durch Expression der vorangehend beschrie
benen Nukleinsäuren in einem geeigneten Expressionssystem, wie oben bereits
erwähnt, nach dem Fachmann allgemein bekannten Methoden hergestellt. Als
Wirtszellen eignen sich beispielsweise die E, coli Stämme DHS, HB101 oder
BL21, der Hefestamm Saccharomyces cerevisiae, die Insektenzellinie Lepidopte
ran, z. B. von Spodoptera frugiperda, oder die tierischen Zellen COS, Vero, 293,
HaCaT, und HeLa, die alle allgemein erhältlich sind.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur Herstellung eines
Fusionsproteins zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbe
sondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung
von pharmakologisch aktiven Substanzen in einer geeigneten Wirtszelle, bei dem
mindestens eine der vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren verwendet wird.
Hergestellt werden hierbei Fusionsproteine, die die oben beschriebenen Polypep
tide enthalten, wobei die Fusionsproteine selbst bereits die Funktion eines Poly
peptids der Erfindung aufweisen oder erst nach Abspaltung des Fusionsanteils die
spezifische Funktion aufweisen. Vor allem zählen hierzu Fusionsproteine mit ei
nem Anteil von ca. 1-300, vorzugsweise ca. 1-200, insbesondere ca. 1-100, vor
allem ca. 1-50 fremden Aminosäuren. Beispiele solcher Peptidsequenzen sind
prokaryotische Peptidsequenzen, die z. B. aus der Galactosidase von E. coli ab
geleitet sein können. Weiterhin können auch virale Peptidsequenzen, wie zum
Beispiel vom Bakteriophagen M13 verwendet werden, um so Fusionsproteine für
das dem Fachmann bekannte "phage display"-Verfahren zu erzeugen.
Weitere bevorzugte Beispiele für Peptidsequenzen für Fusionsproteine sind Pepti
de, die die Detektion der Fusionsproteine erleichtern, hierzu zählen beispielsweise
"Green-fluorescent-protein" oder Varianten davon.
Zur Aufreinigung der vorangehend beschriebenen Proteine kann ein weite
res/weiterer Polypeptid ("tag") angefügt sein. Erfindungsgemäße Protein-tags
erlauben beispielsweise die hochaffine Absorption an eine Matrix, stringentes
Waschen mit geeigneten Puffern, ohne den Komplex in nennenswertem Maße zu
eluieren und anschließend gezielte Elution des absorbierten Komplexes. Beispiele
der dem Fachmann bekannten Protein-tags sind ein (His)6-tag, ein Myc-tag, ein
FLAG-tag, ein Hämagglutinin-tag, Glutathion-Transferase (GST)-tag, Intein mit
einem Affinitäts-Chitin-binding-tag oder Maltose-binding protein (MBP)-tag.
Diese Protein-tags können sich N-, C-terminal und/oder intern befinden.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung ei
nes Antikörpers oder Antikörperfragments, vorzugsweise eines polyklonalen oder
monoklonalen Antikörpers zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkran
kungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Be
handlung bei der Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (iii)
Identifizierung von pharmakologisch aktiven Substanzen, bei dem ein Polypeptid
oder eine Varianten davon, wie vorangehend beschrieben, verwendet wird.
Das Verfahren erfolgt nach dem Fachmann allgemein bekannten Methoden durch
Immunisieren eines Säugetiers, beispielsweise eines Kaninchens, mit dem ge
nannten Polypeptid oder Varianten davon, vorzugsweise mit Teilen davon, mit
mindestens 6 Aminosäuren Länge, vorzugsweise mit mindestens 8 Aminosäuren
Länge, insbesondere mit mindestens 12 Aminosäuren Länge, gegebenenfalls in
Anwesenheit von z. B. Freunds Adjuvant und/oder Aluminiumhydroxidgelen
(siehe z. B. Diamond, B. A. et al. (1981) The New England Journal of Medicine,
1344-1349). Die im Tier aufgrund einer immunologischen Reaktion entstandenen
polyklonalen Antikörper lassen sich anschließend nach allgemein bekannten Methoden
leicht aus dem Blut isolieren und z. B. über Säulenchromatographie reini
gen. Monoklonale Antikörper können beispielsweise nach der bekannten Methode
von Winter & Milstein (Winter, G. & Milstein, C. (1991) Nature, 349, 293-299)
hergestellt werden.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Antikörper oder Anti
körperfragment zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbe
sondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung
von pharmakologisch aktiven Substanzen, der gegen ein erfindungsgemäßes Po
lypeptid gerichtet ist und mit den erfindungsgemäßen Polypeptiden spezifisch
reagiert, wobei die oben genannten Teile des Polypeptids entweder selbst immu
nogen sind oder durch Kopplung an geeignete Träger, wie z. B. bovines Serumal
bumin, immunogen gemacht bzw. in ihrer Immunogenität gesteigert werden kön
nen. Dieser Antikörper ist entweder polyklonal oder monoklonal, bevorzugt ist ein
monoklonaler Antikörper. Unter dem Begriff Antikörper oder Antikörperfragment
versteht man gemäß der vorliegenden Erfindung auch gentechnisch hergestellte
und gegebenenfalls modifizierte Antikörper bzw. antigenbindende Teile davon,
wie z. B. chimäre Antikörper, humanisierte Antikörper, multifunktionelle Antikör
per, bi- oder oligospezifische Antikörper, einzelsträngige Antikörper, F(ab)- oder
F(ab)2-Fragmente (siehe z. B. EP-B1-0 368 684, US 4,816,567, US 4,816,397,
WO 88/01649, WO 93/06213, WO 98/24884).
Die erfindungsgemäßen Antikörper oder Antikörperfragmente können zur (i) Dia
gnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen,
und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere
Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven
Substanzen verwendet werden.
So kann beispielsweise die lokale Injektion von monoklonalen Antikörpern gegen
TGF beta 1 im Tiermodell die Wundheilung verbessern (Ernst et al., 1996, Gut
39: 172-5).
Die vorliegende Erfindung betrifft auch ein Verfahren zur Herstellung eines Arz
neimittels zur (i) Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankun
gen, und/oder (ii) Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere Wundheilungs
störungen, bei dem mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein Polypeptid oder
mindestens ein Antikörper, wie vorangehend beschrieben, zusammen mit geeig
neten Zusatz- und Hilfsstoffen kombiniert wird.
Die vorliegende Erfindung betrifft weiterhin ein nach diesem Verfahren herge
stelltes Arzneimittel zur (i) Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauter
krankungen, und/oder (ii) Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere Wund
heilungsstörungen, das mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein Polypeptid
oder mindestens einen Antikörper, wie vorangehend beschrieben, gegebenenfalls
zusammen mit geeigneten Zusatz- und Hilfsstoffen, enthält. Die Erfindung betrifft
weiterhin die Verwendung dieses Arzneimittels zur (i) Behandlung von Erkran
kungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Behandlung bei der
Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen.
Die Therapie (i) von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii)
bei der Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörungen, kann auf her
kömmliche Weise, z. B. durch Verbände, Pflaster, Kompressen oder Gele erfol
gen, die die erfindungsgemäßen Arzneimittel enthalten. So ist es möglich, die
geeignete Zusatz- oder Hilfsstoffe, wie z. B. physiologische Kochsalzlösung,
entmineralisiertes Wasser, Stabilisatoren, Proteinaseinhibitoren, Gelformulierun
gen, wie z. B. weiße Vaseline, dünnflüssiges Paraffin und/oder gelbes Wachs, etc.,
enthaltenden Arzneimittel topisch und lokal zu verabreichen, um die Wundhei
lung sofort und unmittelbar zu beeinflussen. Die Verabreichung der erfindungs
gemäßen Arzneimittel kann weiterhin gegebenenfalls in Form von Liposomenkomplexen
bzw. Goldpartikelkomplexen ebenfalls topisch und lokal im Bereich
der Wunde erfolgen. Weiterhin kann die Behandlung mittels eines transdermalen
therapeutischen Systems (TTS) erfolgen, das eine zeitlich gesteuerte Abgabe der
erfindungsgemäßen Arzneimittel ermöglicht. Die Behandlung mittels der erfin
dungsgemäßen Arzneimittel kann aber auch über orale Dosierungsformen, wie
z. B. Tabletten oder Kapseln, über die Schleimhäute, zum Beispiel der Nase oder
der Mundhöhle, oder in Form von unter die Haut implantierten Dispositorien er
folgen. TTS sind zum Beispiel aus den EP 0 944 398, EP 0 916 336, EP 0 889 723
oder EP 0 852 493 bekannt.
Die vorliegende Erfindung betrifft weiterhin ein Verfahren zur Herstellung eines
Diagnostikums zur Diagnose von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen
und/oder zur Diagnose bei der Wundheilung, das dadurch gekennzeichnet ist, daß
mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein Polypeptid oder mindestens ein
Antikörper, wie vorangehend beschrieben, gegebenenfalls zusammen mit geeig
neten Zusatz- und Hilfsstoffen, verwendet wird.
Beispielsweise kann gemäß der vorliegenden Erfindung anhand einer der be
schriebenen Nukleinsäure ein Diagnostikum auf der Basis der Polymeraseketten
reaktion (Beispiel 2, PCR-Diagnostik, z. B. gemäß EP 0 200 362) oder eines
RNase-Protection-Assays (siehe z. B. Sambrook et al., supra Kapitel 7, Seite 7.71-
7.78; Werner et al., 1992, Growth Factors and Receptors: A Practical Approach
175-197; Werner, 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 6896-6900) hergestellt
werden. Diese Tests beruhen auf der spezifischen Hybridisierung einer Nuklein
säure mit ihrem komplementären Gegenstrang, üblicherweise der entsprechenden
mRNA oder ihrer cDNA. Die vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren können
hierbei auch modifiziert sein, wie z. B. in EP 0 063 879 offenbart. Vorzugsweise
wird ein solches DNA-Fragment mittels geeigneter Reagenzien, z. B. radioaktiv
mit α-P32-dCTP oder nicht-radioaktiv mit Biotin oder Digoxigenin, nach allge
mein bekannten Methoden markiert und mit isolierter RNA, die vorzugsweise
vorher an geeignete Membranen aus z. B. Cellulose oder Nylon gebunden wurde,
inkubiert. Bei gleicher Menge an untersuchter RNA aus jeder Gewebeprobe kann
somit die Menge an mRNA bestimmt werden, die spezifisch durch die Sonde
markiert wurde. Alternativ kann die Bestimmung der mRNA Menge auch direkt
in Gewebeschnitten mit Hilfe der in situ Hybridisierung (siehe z. B. Werner et al.,
1992, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 6896-900) erfolgen.
Mit Hilfe des erfindungsgemäßen Diagnostikums kann somit auch in vitro die
Expressionsstärke des jeweiligen Gens in einer Gewebeprobe spezifisch gemessen
werden, um beispielsweise eine Wundheilungsstörung oder dermatologische Er
krankungen sicher diagnostizieren zu können (Beispiele 1 bis 3). Insbesondere
eignet sich ein solches Verfahren zur frühzeitigen Prognose von Störungen.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung betrifft ein Diagnostikum
zur Diagnose von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen oder Diagnosti
kum bei der Wundheilung, das mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein
Polypeptid oder mindestens einen Antikörper, wie vorangehend beschrieben, ge
gebenenfalls zusammen mit geeigneten Zusatz- und Hilfsstoffen, umfaßt.
Ein bevorzugtes erfindungsgemäßes Diagnostikum enthält das beschriebene Poly
peptid bzw. die oben näher beschriebenen immunogenen Teile davon. Das Poly
peptid bzw. die Teile davon, die vorzugsweise an eine Festphase, z. B. aus Ni
trocellulose oder Nylon, gebunden sind, können beispielsweise mit der zu unter
suchenden Körperflüssigkeit, z. B. Wundsekret, in vitro in Berührung gebracht
werden, um so beispielsweise mit Autoimmunantikörper reagieren zu können. Der
Antikörper-Peptid-Komplex kann anschließend beispielsweise anhand markierter
Antihuman-IgG- oder Antihuman-IgM-Antikörper nachgewiesen werden. Bei der
Markierung handelt es sich beispielsweise um ein Enzym, wie Peroxidase, das
eine Farbreaktion katalysiert. Die Anwesenheit und die Menge an anwesenden
Autoimmunantikörper kann somit über die Farbreaktion leicht und schnell nach
gewiesen werden.
Ein weiteres Diagnostikum, das Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist, ent
hält die erfindungsgemäßen Antikörper selbst. Mit Hilfe dieser Antikörper kann
beispielsweise eine Gewebeprobe leicht und schnell dahingehend untersucht wer
den, ob das betreffende Polypeptid in einer erhöhten Menge vorhanden ist, um
dadurch einen Hinweis auf eine mögliche Erkrankung, insbesondere Hauterkran
kungen und Wundheilungsstörung zu erhalten. In diesem Fall sind die erfin
dungsgemäßen Antikörper beispielsweise mit einem Enzym, wie oben bereits
beschrieben, markiert. Der spezifische Antikörper-Peptid-Komplex kann dadurch
leicht und ebenso schnell über eine enzymatische Farbreaktion nachgewiesen
werden.
Ein weiteres erfindungsgemäßes Diagnostikum umfaßt eine Sonde, vorzugsweise
eine DNA-Sonde, und/oder Primer. Dies eröffnet eine weitere Möglichkeit, die
beschriebenen Nukleinsäuren, zum Beispiel durch die Isolierung aus einer geeig
neten Genbank, beispielsweise aus einer wundspezifischen Genbank, anhand einer
geeigneten Sonde zu erhalten (siehe z. B. J. Sambrook et al., 1989, Molecular
Cloning. A Laboratory Manual 2nd edn., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold
Spring Harbor, NY Kapitel 8 Seite 8.1 bis 8.81, Kapitel 9 Seite 9.47 bis 9.58 und
Kapitel 10 Seite 10.1 bis 10.67).
Als Sonde eignen sich beispielsweise DNA- oder RNA-Fragmente mit einer Län
ge von ca. 100-1000 Nukleotiden, vorzugsweise mit einer Länge von ca. 200-500
Nukleotiden, insbesondere mit einer Länge von ca. 300-400 Nukleotiden deren
Sequenz aus den Polypeptiden gemäß den SEQ ID Nr. 1 bis SEQ ID Nr. 48, SEQ
ID Nr. 55 bis SEQ a Nr. 58 und SEQ ID Nr. 63 bis SEQ ID Nr. 73 des Sequenz
protokolls und/oder anhand der cDNA Sequenzen der in den Fig. 4 bis 6 an
gegebenen Datenbankeinträge oder anhand des Sequenzprotokolls gemäß einer
SEQ ID Nr. 50 bis SEQ ID Nr. 54 abgeleitet werden kann.
Alternativ können anhand der abgeleiteten Nukleinsäuresequenzen Oligonukleoti
de synthetisiert werden, die sich als Primer für eine Polymerase Kettenreaktion
eignen. Mit diesen kann die vorangehend beschriebene Nukleinsäure oder Teile
dieser aus cDNA, beispielsweise wundspezifischer cDNA, amplifiziert und iso
liert werden (Beispiel 2). Als Primer eignen sich beispielsweise DNA-Fragmente
mit einer Länge von ca. 10 bis 100 Nukleotiden, vorzugsweise mit einer Länge
von ca. 15 bis 50 Nukleotiden, insbesondere mit einer Länge von 20 bis 30 Nu
kleotiden deren Sequenz aus den Polypeptiden gemäß den SEQ ID Nr. 1 bis SEQ
ID Nr. 48 und SEQ ID Nr. 55 bis SEQ ID Nr. 58 und SEQ ID Nr. 63 bis SEQ ID
Nr. 73 des Sequenzprotokolls und/oder anhand der cDNA Sequenzen der in den
Fig. 4 bis 6 angegebenen Datenbankeinträge oder anhand des Sequenzproto
kolls gemäß einer SEQ ID Nr. 50 bis SEQ ID Nr. 54 abgeleitet werden kann.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung betrifft die Verwendung des erfindungs
gemäßen Diagnostikums zur (i) Diagnose von Erkrankungen, insbesondere Hau
terkrankungen, und/oder (ii) Diagnose bei der Wundheilung, insbesondere Dia
gnose bei Wundheilungsstörungen.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung ei
nes Tests zur Auffindung von Interaktoren in Zusammenhang mit Erkrankungen,
insbesondere Hauterkrankungen und/oder in Zusammenhang mit Wundheilung,
dadurch gekennzeichnet, daß mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein Poly
peptids oder mindestens ein Antikörper oder Antikörperfragment, wie vorange
hend beschrieben, gegebenenfalls zusammen mit geeigneten Zusatz- und Hilfs
stoffen, zur Herstellung des Tests verwendet wird.
Unter dem Begriff "Interaktoren" im Sinne der vorliegenden Erfindung sind alle
diejenigen Moleküle, Verbindungen und/oder Zusammensetzungen und Stoffge
mische zu verstehen, die mit den vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren, Po
lypeptiden, Antikörpern oder Antikörperfragment, gegebenenfalls zusammen mit
geeigneten Zusatz- und Hilfsstoffen, unter geeigneten Bedingungen in Wechsel
wirkung treten können. Mögliche Interaktoren sind einfache chemische organi
sche oder anorganische Moleküle oder Verbindungen, können aber auch Peptide,
Proteine oder Komplexe davon umfassen. Die Interaktoren können aufgrund ihrer
Wechselwirkung die Funktion(en) der Nukleinsäuren, Polypeptide oder Antikör
per in vivo oder in vitro beeinflussen oder auch nur an die vorangehend beschrie
benen Nukleinsäuren, Polypeptiden, Antikörpern oder Antikörperfragmenten bin
den oder mit ihnen andere Wechselwirkungen kovalenter oder nicht-kovalenter
Weise eingehen.
Die Erfindung umfaßt weiterhin einen erfindungsgemäß hergestellten Test zur
Identifizierung von Interaktoren in Zusammenhang mit (i) Erkrankungen, insbe
sondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Wundheilung, insbesondere Wundhei
lungstörungen, der mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein Polypeptid oder
mindestens einen Antikörper oder Antikörperfragment gemäß der vorliegenden
Erfindung, gegebenenfalls zusammen mit geeigneten Zusatz- und Hilfsstoffen,
umfaßt.
Ein geeignetes System läßt sich beispielsweise durch die stabile Transformation
von epidermalen bzw. dermalen Zellen mit Expressionsvektoren, die selektierbare
Markergene und die beschriebenen Nukleinsäuren enthalten, herstellen. Bei die
sem Verfahren wird die Expression der beschriebenen Nukleinsäuren in den Zel
len so verändert, daß sie der pathologisch gestörten Expression in vivo entspricht.
Auch anti-sense Oligonukleotide, die die beschriebenen Nukleinsäure enthalten,
können zu diesem Zweck eingesetzt werden. Von besonderem Vorteil für diese
Systeme ist es daher, das Expressionsverhalten der Gene bei gestörten regenerati
ven Prozessen, wie in dieser Anmeldung offengelegt, zu kennen. Oft kann so das
pathologische Verhalten der Zellen in vitro nachgeahmt werden und es können
Substanzen gesucht werden, die das normale Verhalten der Zellen wieder herstel
len und die ein therapeutisches Potential besitzen.
Für diese Testsysteme eignen sich z. B. HaCaT-Zellen, die allgemein erhältlich
sind, und der Expressionsvektor pCMV4 (Anderson et al., 1989, J. Biol. Chem.
264: 8222-9). Die vorangehend beschriebene Nukleinsäure kann dabei sowohl in
sense als auch in anti-sense Orientierung in die Expressionsvektoren integriert
werden, so daß die funktionelle Konzentration an mRNA der entsprechenden Ge
ne in den Zellen entweder erhöht, oder durch Hybridisierung mit der antisense-
RNA erniedrigt wird. Nach der Transformation und Selektion stabiler Transfor
manden zeigen die Zellen in Kultur im allgemeinen ein verändertes Proliferations-
Migrations, und/oder Differenzierungsverhalten im Vergleich zu Kontrollzellen.
Dieses Verhalten in vitro ist häufig mit der Funktion der entsprechenden Gene bei
regenerativen Prozessen im Organismus korreliert (Yu et al., 1997, Arch. Derma
tol. Res. 289: 352-9; Mils er al., 1997, Oncogene 14: 15555-61; Charvat et al.,
1998, Exp Dermatol 7: 184-90; Werner, 1998, Cytokine Growth Factor Rev.
9: 153-65; Mythily et al., 1999, J. Gen. Virol. 80: 1707-13) und läßt sich mit einfa
chen und schnell durchzuführenden Tests nachweisen, so daß man darauf basie
rend Testsysteme für pharmakologisch aktive Substanzen aufbauen kann. So läßt
sich das Proliferationsverhalten von Zellen sehr schnell durch z. B. den Einbau
von markierten Nukleotiden in die DNA der Zellen (siehe z. B. Savino und Dar
denne, 1985, J. Immunol. Methods 85: 221-6; Perros und Weightman, 1991, Cell
Prolif. 24: 517-23; de Fries und Mitsuhashi, 1995, J. Clin. Lab. Anal. 9: 89-95),
durch Anfärbung der Zellen mit spezifischen Farbstoffen (Schulz et al., 1994, J.
Immunol. Methods 167: 1-13) oder über immunologische Verfahren (Frahm et al.,
1998, J. Immunol. Methods 211: 43-50) nachweisen. Die Migration läßt sich ein
fach durch den "Migration Index" Test (Charvat et al., supra) und vergleichbare
Testsysteme (Benestad et al., 1987, Cell Tissue Kinet. 20: 109-19, Junger et al.,
1993, J. Immunol. Methods 160: 73-9) nachweisen. Als Differenzierungsmarker
eignen sich z. B. Keratin 6, 10 und 14 sowie Loricrin und Involucrin (Rosenthal et
al., 1992, J. Invest. Dermatol. 98: 343-50), deren Expression z. B. über allgemein
erhältliche Antikörper leicht nachzuweisen ist.
Ein anderes geeignetes Testsystem basiert auf der Identifikation von Interaktionen
mit dem sogenannten "Two-Hybrid System" (Fields und Sternglanz, 1994, Trends
in Genetics, 10, 286-292; Colas und Brent, 1998 TIBTECH, 16, 355-363). Bei
diesem Test werden Zellen mit Expressionsvektoren transformiert, die Fusionsproteine
aus dem erfindungsgemäßen Polypeptid und einer DNA-
Bindungsdomäne eines Transkriptionsfaktors wie beispielsweise Gal4 oder LexA
exprimieren. Die transformierten Zellen enthalten außerdem ein Reportergen, des
sen Promotor Bindungsstellen für die entsprechende DNA Bindungsdomäne ent
halten. Durch Transformation eines weiteren Expressionsvektors, der ein zweites
Fusionsprotein aus einem bekannten bzw. unbekannten Polypeptid mit einer Akti
vierungsdomäne, beispielsweise von Gal4 oder Herpes simplex Virus VP16, ex
primiert, kann die Expression des Reportergens stark gesteigert werden, wenn das
zweite Fusionsprotein mit dem erfindungsgemäßen Polypeptid interagiert. Diese
Expressionssteigerung kann man ausnutzen, um neue Interaktoren zu identifizie
ren, beispielsweise indem man zur Konstruktion des zweiten Fusionsproteins eine
cDNA-Bibliothek aus sich regenerierenden Gewebe herstellt. Zudem läßt sich
dieses Testsystem zum Screening von Substanzen ausnutzen, die eine Interaktion
zwischen dem erfindungsgemäßen Polypeptid und einem Interaktor inhibieren.
Solche Substanzen verringern die Expression des Reportergens in Zellen, die Fu
sionsproteine des erfindungsgemäßen Polypeptids und des Intreraktors exprimie
ren (Vidal und Endoh, 1999, Trends in Biotechnology, 17: 374-81). So lassen sich
schnell neue Wirkstoffe identifizieren, die zur Therapie von Störungen regenerati
ver Prozesse eingesetzt werden können.
Interaktoren der erfindungsgemäßen Polypeptide können auch Nukleinsäuren
sein, die über Selektionsverfahren, wie beispielsweise SELEX (siehe Jayasena,
1999, Clin. Chem. 45: 1628-50; Klug und Famulok, 1994, M. Mol. Biol. Rep.
20: 97-107; Toole et al., 1996, US 5,582,981) isoliert wereden. Im SELEX-
Verfahren werden typischerweise aus einem großen Pool unterschiedlicher, ein
zelsträngige RNA Moleküle durch wiederholte Amplifikation und Selektion die
jenigen Moleküle isoliert, die an ein Polypeptid mit hoher Affinität binden
(Aptamere). Aptamere können auch in ihrer spiegelbildlichen Form, beispielswei
se als L-Ribonukleotid, synthetisiert und selektioniert werden (Nolte et al., 1996,
Nat. Biotechnol. 14: 1116-9; Klussmann et al., 1996, Nat. Biotechnol. 14: 1112-5).
So isolierte Formen haben den Vorteil, das sie nicht von natürlich vorkommenden
Ribonukleasen abgebaut werden und daher größere Stabilität besitzen.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur Herstellung eines auf
einem Trägermaterial fixierten Arrays zur Analyse in Zusammenhang mit (i) Er
krankungen, insbesondere Hauterkrankungen und/oder (ii) Wundheilung, insbe
sondere Wundheilungsstörungen, bei dem mindestens eine Nukleinsäure, minde
stens ein Polypeptid oder mindestens ein Antikörper oder Antikörperfragment,
wie vorangehend beschrieben, zur Herstellung verwendet wird.
Verfahren zur Herstellung von solchen Arrays sind zum Beispiel aus der US 5,744,305
mittels Festphasenchemie und photolabilen Schutzgruppen bekannt.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist ein auf einem Trägermaterial fixiertes
Array zur Analyse in Zusammenhang mit (i) Erkrankungen, insbesondere Hauter
krankungen und/oder (ii) Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen,
das dadurch gekennzeichnet ist, daß es mindestens eine Nukleinsäure und/oder
mindestens ein Polypeptid und/oder oder mindestens einen Antikörper oder Anti
körperfragment, wie vorangehend beschrieben, umfaßt.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung umfaßt einen DNA-Chip und/oder Prote
in-Chip zur Analyse in Zusammenhang mit (i) Erkrankungen, insbesondere Hau
terkrankungen und/oder (ii) Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen,
der mindestens eine Nukleinsäure, mindestens ein Polypeptid, und/oder minde
stens einen Antikörper oder Antikörperfragment, wie vorangehend beschrieben,
umfaßt. DNA-Chips sind zum Beispiel aus der US 5,837,832 bekannt.
Ein Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist auch ein Arzneimittel zur Indika
tion und Therapie, das eine Nukleinsäure oder ein Polypeptid, wie vorangehend
beschrieben, und gegebenenfalls geeignete Zusatz- oder Hilfsstoffe enthält und
ein Verfahren zur Herstellung eines solchen Arzneimittels zur Behandlung von
dermatologischen Erkrankungen, insbesondere von Wundheilungsstörungen, bei
dem eine Nukleinsäure oder ein Polypeptid, wie vorangehend beschrieben, mit
einem pharmazeutisch annehmbaren Träger formuliert wird.
Für die gentherapeutische Anwendung beim Menschen ist vor allem ein Arznei
mittel geeignet, das die beschriebenen Nukleinsäure in nackter Form oder in Form
eines der oben beschriebenen gentherapeutisch wirksamen Vektoren oder in mit
Liposomen bzw. Goldpartikeln komplexierter Form enthält. Der pharmazeutische
Träger ist beispielsweise eine physiologische Pufferlösung, vorzugsweise mit ei
nem pH von ca. 6,0-8,0, vorzugsweise von ca. 6,8-7,8. Insbesondere von ca. 7,4
und/oder einer Osmolarität von ca. 200-400 milliosmol/Liter, vorzugsweise von
ca. 290-310 milliosmol/Liter. Zusätzlich kann der pharmazeutische Träger geeig
nete Stabilisatoren, wie z. B. Nukleaseinhibitoren, vorzugsweise Komplexbildner
wie EDTA und/oder andere dem Fachmann bekannte Hilfsstoffe enthalten.
Die Verabreichung der beschriebenen Nukleinsäure gegebenenfalls in Form der
oben näher beschriebenen Virusvektoren oder als Liposomenkomplexe bzw.
Goldpartikelkomplex erfolgt üblicherweise topisch und lokal im Bereich der
Wunde. Es ist auch möglich, das Polypeptid selbst mit geeigneten Zusatz- oder
Hilfsstoffen, wie z. B. physiologische Kochsalzlösung, entmineralisiertes Wasser,
Stabilisatoren, Proteinaseinhibitoren, Gelformulierungen, wie z. B. weiße Vaseli
ne, dünnflüssiges Paraffin und/oder gelbes Wachs, etc., zu verabreichen, um die
Wundheilung sofort und unmittelbar zu beeinflussen.
Die Nukleinsäuren der beschriebenen Polypeptide wurden aus cDNA Bibliothe
ken isoliert, die aus intakter und verwundeter Haut hergestellt wurden. Dabei
wurden die cDNAs ausgewählt, die unterschiedliche Häufigkeiten in gut heilen
den im Vergleich zu schlecht heilenden Wunden aufwiesen (Beispiele 1 und 3)
und/oder unterschiedliche Häufigkeiten in Wunden von jungen im Vergleich zu
alten Mäusen aufwiesen. Dies geschah beispielsweise mit Hilfe von subtraktiver
Hybridisierung (Diatchenko et al., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 6025-30)
und/oder mit dem vergleichenden Auszählen von Klonen in cDNA Bibliotheken
mittels Analyse von Restriktionsfragmentmustern (Halle et al., 1999, EP 0965642 A1)
und/oder mit Hilfe von "Differential Display RT-PCR" (Liang et al.,
1992, Cancer Res. 52: 6996-6998; Liang und Pardee, 1992, Science 257: 967-971;
Prashar und Weissman, 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 659-663). Die so
ausgewählten cDNAs entstammen Genen, die bei Wundheilungsstörungen entwe
der stärker oder schwächer exprimiert werden als bei normal verlaufender Wund
heilung.
Allgemein ist die Analyse von differentiell exprimierten Genen in Geweben mit
deutlich mehr Fehlern in Form von falsch positiven Klone behaftet, als bei der
Analyse von Zellkultursystemen. Da bei der Wundheilung eine Vielzahl von ver
schiedenen Zelltypen beteiligt sind, deren Zusammensetzung und deren Genex
pressionsmuster sich während des gesamten Wundheilungsprozesses ständig än
dert, ergibt sich hier bei der Analyse von differentiell exprimierten Genen eine
besonders niedrige Trefferquote. Diese kann nicht durch die Verwendung eines
definierten Zellkultursystems umgangen werden, da ein solches auf Grund der
Komplexität der Wundheilung nicht zur Verfügung steht. Zudem gibt es enorme
Variabilitäten des Wundzustands zum Zeitpunkt einer möglichen Biopsie des Pa
tienten beim Erstkontakt mit dem Arzt.
Daher wurde zur Identifikation der vorangehend beschriebenen Nukleinsäuren ein
Tiermodell verwendet. Es wurden BALB/c Mäuse verwundet und zu verschiede
nen Zeitpunkten Wundbiopsien entnommen. Dieses Verfahren hat den Vorteil,
das sich die Randbedingungen wie genetischer Hintergrund, Art der Wunde, Zeit
punkt der Biopsie etc. exakt kontrollieren lassen und so erst eine reproduzierbare
Analyse der Genexpression erlauben. Selbst unter den definierten Maus-
Bedingungen ergeben sich weitere methodische Probleme wie Redundanz der
analysierten Klone und Unterrepräsentation von schwach exprimierten Genen, die
die Identifikation von relevanten Genen erschweren.
Bei der vorliegenden Analyse der Genexpression wurden während des Wundhei
lungsprozesses neben Genen, deren Funktion bisher gänzlich unbekannt war, auch
Gene identifiziert, die bisher nicht mit Wundheilungsstörungen in Verbindung
gebracht wurden. Von zwei der bekannten Gene wurden weiterhin neuartige Vari
anten mit Sequenzen identifiziert, die signifikant von den bisher veröffentlichten
und/oder patentierten Sequenzen abweicht.
Von dem bisher nicht mit Wundheilungsstörungen in Zusammenhang gebrachten
Teil der identifizierten Gene war bisher bekannt, daß sie eine Funktion bei der
Proliferation (Tsg101: Xie et al., 1998, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 1595-
1600; MASPIN: Sager et al., 1997, Adv. Exp. Med. Biol. 425: 77-88; B-Raf: Ma
son et al., 1999, EMBO J. 18: 2137-48; Ikawa et al., 1988, Mol. Cell Biol. 8: 2651-
2654; Prothymosin alpha: Tao et al., 1999, J. Cell. Physiol. 178: 154-163; Eps8:
Wong et al., 1994, Oncogene 9: 3057-3061; KIAA1247: WO 9934004; EAT/MCL-
1: Tang et al., 1998, Clin. Cancer Res. 4: 1865-1871; TSC-22: Kester et al., 1999,
J. Biol. Chem. 274: 27439-47; Fer: Morns et al., 1990, Cytogenet. Cell. Genet.
53: 196-200), Differenzierung (MASPIN: Zhang et al., 1999, Dev. Biol. 215: 278-
87; Split hand/foot deleted 1: Crackower et al., 1996, Hum. Mol. Genet. 5: 571-9),
Zell-Migration (MRP-3: Haelens et al., 1996, Immunobiology 195: 499-521;
MCP-3: Taub et al., 1995, J. Clin. Invest. 95: 1370-6; MCP-2: Taub et al., 1995, J.
Clin. Invest. 95: 1370-6) und/oder Apoptose (B-Raf: Erhardt et al., 1999, Mol.
Cell. Biol. 19: 5308-15) haben. Diese Gene wurden bisher jedoch nicht mit Wund
heilung in Verbindung gebracht.
Zusätzlich zu den bekannten Polypeptiden von Mensch Phospholipase Inhibitor
GIPL (US 5,948,626), MCP-2 (von Coillie et al., 1997, Genomics 40: 323-331)
und Maus Cystatin C (Solem et al., 1990, Biochem. Biophys. Res. Commun.
172: 945-951) wurden eng verwandte Polypeptide mit signifikant abweichender
Sequenz identifiziert. Von den bekannten Polypeptiden von Mensch Phospholipa
se GIPL (US 5,948,626) und Mensch KIAA1247 (WO 99/34004) wurden erst
mals die Sequenzen des entsprechenden Polypeptids der Maus identifiziert.
Die Polypeptide dieser Gene gehören nicht zu den bisher bekannten Zielen von
Therapien von Wundheilungsstörungen, so daß sich aus dieser Erfindung völlig
neue Therapieansätze ergeben. Von den restlichen identifizierten Genen existiert
noch keine Funktionsbeschreibung (Fig. 4).
Nach der primären Identifikation der Gene ist es notwendig, die wundheilungs
spezifische Expression durch eine weitere Methode zu bestätigen. Dies erfolgte
mit Hilfe von sogenannten "Reverse Northern Blots" oder "TaqMan Assays". Mit
diesen Methoden wurde die Menge an mRNA in Gewebeextrakten aus verschie
denen Wundheilungszuständen von 10 Wochen alten Mäusen und/oder von alten
und jungen Mäusen und/oder von Mäusen mit Diabetes bestimmt. So wurde bei
spielsweise die wundspezifische Expression der Klone in einer subtraktiven
cDNA Bibliothek mit Hilfe eines "Reverse Northern Blots" ermittelt (Beispiel 1).
Es zeigte sich, das ca. 20% aller Klone in den Bibliotheken unterschiedliche Si
gnale mit Hybridisierungssonden aus Wund-cDNA im Vergleich zu Sonden aus
intakter Haut zeigten (Fig. 1). Nach der Identifikation der Klone wurden diese
teilweise sequenziert, redundante Klone aussortiert, und die Sequenz mit Se
quenz-Datenbanken mit dem Ziel abgeglichen, Vollängen Sequenzen der Maus-
Gene und der menschlichen Gene zu identifizieren. Die Sequenzierung und Red-
undanzanalyse der positiven Klonen ergab, daß mehr als 75% der Klone mehrfach
vorhanden waren und somit nur ca. 5% aller Ausgangsklone weiter verwendet
werden konnten. Eine Minderheit von diesen wundspezifischen Genen zeigte
wiederum eine verminderte Expression in schlecht heilenden Wunden. Von diesen
konnte bei ca. 50% die differentielle Expression im "TaqMan Assay" bestätigt
werden (Beispiel 2).
Zur Überprüfung bzw. Generierung von Vollängen cDNA Sequenzen der voran
gehend beschriebenen Nukleinsäuren wurden Vollängen-Klone mit Hilfe von
Kolonie-Hybridisierung (Sambrook et al., 1989, Molecular cloning: A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York,
Kapitel 8-10) und/oder PCR basierten Methoden ("RACE", Frohman et al., 1988,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 8998-9002, Chenchik et al., 1996, in A Laboratory
Guide to RNA: Isolation, Analysis, and Synthesis, Ed. Krieg, Wiley-Liss, Seiten
272-321; "LDPCR", Barnes, 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91: 2216-20) so
wohl für die Maus-Gene als auch für die menschlichen Gene generiert und die
Sequenz diese Klone bestimmt.
Die Erfindung soll nun im folgenden anhand der Figuren und Beispiele weiter
verdeutlicht werden, ohne daß die Erfindung hierauf eingeschränkt wird.
Fig. 1: Autoradiogramme der Hybridisierungen von Membranen (Maus
ATLAS Array, Clontech Laboratories GmbH, Heidelberg) mit glei
chem Muster von aufgebrachten cDNA-Fragmenten mit vier ver
schiedenen Sonden. Alle Sonden wurden aus cDNAs hergestellt, die
aus subtraktiven Hybridisierungen stammten. A: wundspezifische
Sonde (Subtraktion Wunde versus intakte Haut), B: hautspezifische
Sonde (Subtraktion intakte Haut versus Wunde), C: Sonde spezifisch
für schlecht heilende Wunden (Subtraktion Wunde Dexamethason be
handelte Tiere versus Wunde Kontrolltiere), D: Sonde spezifisch für
gut heilende Wunden (Subtraktion Wunde Kontrolltiere versus Wunde
Dexamethason behandelte Tiere). Die Positionen der TTF-1 cDNAs
(jeweils doppelt aufgetragen) sind mit Pfeilen gekennzeichnet.
Fig. 2: Tabellarische Aufstellung der veränderten Expression verschiedener
wundheilungsrelevanter Gene in Wunden von 10 Wochen alten
BALB/c Mäusen und in Wunden von jungen (4 Wochen alt) und alten
(12 Monate) Mäusen.
Fig. 3: Tabellarische Aufstellung der veränderten Expression verschiedener
wundheilungsrelevanter Gene in Mäusen mit Diabetes.
Fig. 4: Tabellarische Übersicht über die bei der Analyse der Genexpression
während des Wundheilungsprozesses identifizierten Polypeptidse
quenzen mit unbekannter biologischer Funktion und ihre cDNAs und
Accession Numbers oder SEQ ID Nummern.
Fig. 5: Tabellarische Übersicht über die bei der Analyse der Genexpression
während des Wundheilungsprozesses identifizierten Polypeptidse
quenzen mit bereits bekannten und beschriebenen Funktionen und ihre
cDNAs und Accession Numbers.
Fig. 6: Tabellarische Übersicht über die bei der Analyse der Genexpression
während des Wundheilungsprozesses zusätzlich identifizierten Poly
peptidsequenzen mit bereits bekannten und beschriebenen Funktionen
und ihre cDNAs und Accession Numbers oder SEQ ID Nummern.
Fig. 7: Vergleich der Polypeptidsequenz der identifizierten Proteine von
SW1136 aus Maus und Mensch. Abweichungen zur humanen Se
quenz von SW1136 sind markiert.
Fig. 8: Vergleich der Polypeptidsequenz der identifizierten Proteine von
SW1295 aus Maus und Mensch. Abweichungen zur humanen Se
quenz von SW1295 sind markiert.
SEQ ID Nr. 1 bis SEQ ID Nr. 58 und SEQ ID Nr. 63 bis SEQ ID Nr. 73 zeigen
die erfindungsgemäßen Polypeptid- oder cDNA-Sequenzen aus Mensch oder
Maus.
SEQ ID Nr. 59 bis SEQ ID Nr. 62 und SEQ ID Nr. 75 bis SEQ ID Nr. 76 zeigen
DNA-Sequenzen von Oligo 13820 00070 552 001000280000000200012000285911370900040 0002010030149 00004 13701nukleotiden, die für die Versuche der vorliegenden
Erfindung verwendet wurden.
SEQ ID Nr. 74 zeigt den Teil der cDNA Sequenz von humanem MRP-14, aus
dem die Sonde für die in situ Hybridisierung hergestellt wurde.
Aus intakter Haut und aus Wundgewebe (Verwundung am Rücken 1 Tag vor Ge
webeentnahme durch Scherenschnitt) von BALB/c Mäusen wurde durch Stan
dardmethoden (Chomczynski und Sacchi, 1987, Anal. Biochem. 162: 156-159,
Chomczynski und Mackey, 1995, Anal. Biochem. 225: 163-164) Gesamt-RNA
isoliert. Um Gewebe von Mäusen mit schlecht heilenden Wunden zu gewinnen,
wurden BALB/c Mäuse vor der Verwundung mit Dexamethason (Injektion von
0,5 mg Dexamethason in isotonischer Salzlösung pro kg Körpergewicht zwei mal
pro Tag für 5 Tage) behandelt. Die RNAs wurden dann mit Hilfe einer reversen
Transkriptase in cDNA umgeschrieben. Die cDNA Synthese erfolgte mit dem
"SMART PCR cDNA Synthesis Kit" der Firma Clontech Laboratories GmbH,
Heidelberg, nach Anweisungen des entsprechenden Manuals.
Um diejenigen cDNAs zu identifizieren, die mit unterschiedlicher Häufigkeit in
den cDNA Pools vorkamen, wurde eine subtraktive Hybridisierung (Diatchenko
et al., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 6025-30) durchgeführt. Dies er
folgte mit dem "PCR-Select cDNA Subtraction Kit" der Firma Clontech Labora
tories GmbH, Heidelberg, nach Anweisungen des entsprechenden Manuals, wobei
die Abtrennung überschüssiger Oligonukleotide nach der cDNA Synthese über
Agarose-Gelelekrophorese erfolgte. Es wurden vier für wundrelevante Gene ange
reicherte cDNA Pools angelegt, wobei ein Pool für cDNA Fragmente angereichert
war, die im Wundgewebe im Vergleich zu intakter Haut stärker exprimiert sind
("wundspezifischer cDNA Pool"), ein Pool war angereichert an cDNA Fragmen
ten, die in intakter Haut im Vergleich zu Wundgewebe stärker exprimiert sind
("hautspezifischer cDNA Pool"), ein Pool war angereichert an cDNA Fragmen
ten, die in gut heilenden Wunde im Vergleich zu schlecht heilenden Wunden stär
ker exprimiert sind ("gut heilender cDNA Pool") und ein Pool war angereichert an
cDNA Fragmenten, die in schlecht heilenden Wunden im Vergleich zu gut hei
lenden Wunden stärker exprimiert sind ("schlecht heilender cDNA Pool").
Um diejenigen Gene zu identifizieren, die in den wundheilungsrelevanten cDNA-
Pools enthalten waren, wurde das Vorhandensein der entsprechenden cDNAs in
den Pools im "Reverse Northern Blot" analysiert. Hier werden cDNA-Fragmente
auf Membranen in Form von Arrays von vielen verschiedenen cDNAs fixiert, und
mit einem komplexen Gemisch radioaktiv markierter cDNA hybridisiert (Sam
brook et al., 1989, Molecular cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor,
Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, kapitel 9 Seite 9.47 bis 9.58 und
kapitel 10 Seite 10.38 bis 10.50; Anderson and Young: Quantitative filter hybridi
sation; in: Nucleic Acids Hybridisation, A Practical Approach, 1985, Eds. Hames
and Higgins, IRL Press Ltd.; Oxford, Kapitel 4, Seite 73 bis 112). Beispielsweise
wurden kommerziell erhältliche Membranen verwendet (Maus ATLAS Array,
Clontech).
Zur Herstellung geeigneter Hybridisierungssonden wurden die subtrahierten
cDNA Pools mit der Restriktionsendonuklease RsaI behandelt und über Agarose
gelelektrophorese gereinigt (Sambrook et al., supra, Kapitel 6, Seite 6.1 bis 6.35),
um die cDNA- Synthese- und Amplifikationsprimer (siehe Manual "PCR-Select
cDNA Subtraction Kit", Clonetech) abzutrennen. Die cDNAs wurde dann mit der
"random-hexamer priming" Methode (Feinberg und Vogelstein, 1983, Anal. Bio
chem. 132: 6-13) radioaktiv markiert, um Hybridisierungssonden herzustellen.
Die Membran wurde für 30 min bei 65°C in 25 ml Hybridisierungslösung vorin
kubiert (25 mM Natriumphosphat, pH = 7,5, 125 mM NaCl, 7% SDS). Die Hy
bridisierungssonde wurde 10 min bei 100°C denaturiert, anschließend auf Eis ab
gekühlt, ca. 100 CPM ("counts per minute") pro ml zur Hybridisierungslösung
gegeben und die Hybridisierung für 16 Stunden bei 65°C im Hybridisierungsofen
durchgeführt. Danach wurde die Membran zweimal für 10 min mit der Hybridi
sierungslösung ohne Sonde bei 65°C gewaschen. Anschließend wurde die Mem
bran mehrfach für jeweils 10 min in Waschlösung (2,5 mM Natriumphosphat, pH
= 7,5, 12,5 mM NaCl, 0,7% SDS) bei 65°C gewaschen, bis in der abgegossenen
Lösung keine Aktivität mehr nachgewiesen werden konnte. Die radioaktiven Si
gnale wurden mit einem Phosphoimager (BioRad, Quantitiy One®) ausgewertet
(Fig. 1). Danach wurden diejenigen cDNAs ausgewählt, die mit den verschiede
nen Sonden unterschiedliche Signalintensitäten ergaben. Dabei ergab sich an der
Position von TTF-1 auf der Membran eine deutlich stärkere Signalintensität mit
der Hybridisierungssonde des hautspezifischen cDNA Pools im Vergleich zum
wundspezifischen cDNA Pool (Fig. 1A, B). Die Analyse des Experiments, bei
dem parallel Hybridisierungen mit dem "schlecht heilenden cDNA Pool" (s. o.)
und dem "gut heilenden cDNA Pool" (s. o.) durchgeführt wurden, ergab, daß die
Hybridisierungssonde des "schlecht heilenden cDNA Pools" an der Position von
TTF-1 signifikant stärker hybridisierte (Fig. 1C, D). Somit wurde in zwei unter
schiedlichen Wundheilungszuständen eine differentielle Expression von TTF-1
beobachtet.
Eine Verifikation der differentiellen Expression der vorangehend beschriebenen
Nukleinsäuren als auch die Untersuchung weiterer Wundheilungszustände er
folgte über eine real-time RTPCR im ABI Prism 7700 Sequence Detection Sy
stem (PE Applied Biosystems). Das Gerät war mit der ABI Prism 7200/7700
SDS-Software Version 1.6.3 (1998) ausgestattet. Der Nachweis von PCR Pro
dukten erfolgte während der Amplifikation der cDNA mit Hilfe des Farbstoffs
SYBR Green 1, dessen Fluoreszenz durch Bindung an doppelsträngige DNA stark
erhöht wird (Karlsen et al. 1995, J. Virol. Methods. 55: 153-6; Wittwer et al.,
1997, BioTechniques 22: 130-8, Morrison et al., 1998, BioTechniques 24: 954-
62). Basis für die Quantifizierung ist der PCR Zyklus ("threshold cycle", CT-
Wert), der erreicht ist, wenn das Fluoreszenzsignal einen definierten Schwellen
wert übersteigt. Die Auswertung erfolgt über die Δ-CT-Methode (User Bulletin
#2, Relative Quantitation of Gene Expression, PE Applied Biosystems, 1997). Die
Abundanzen der cDNAs wurden relativ zu einer endogenen Referenz (GAPDH)
bestimmt. Die Ergebnisse sind in Fig. 2 und 3 dargestellt.
Um Gewebe von Mäusen mit schlecht heilenden Wunden zu gewinnen, wurden
BALB/c Mäuse vor der Verwundung mit Dexamethason (Injektion von 0,5 mg
Dexamethason in isotonischer Salzlösung pro kg Körpergewicht zwei mal pro Tag
für 5 Tage) behandelt. Um Gewebe von jungen und alten Mäusen zu gewinnen,
wurden 1-Tageswunden von 4 Wochen alten und 12 Monate alten BALB/c Mäu
sen verwendet. Um Wundgewebe von Mäusen mit Diabetes zu erhalten, wurden 1
Tageswunden von 10 Wochen alten C57BL/Ks-db/db/Ola Mäuse verwendet. Ge
samt-RNA wurde wie oben beschrieben aus Haut und Wundgewebe gewonnen
und 1 µg Gesamt-RNA wurde mit dem TaqMan Reverse Transcription Reagents
Kit (Perkin Elmer) nach den Empfehlungen des Herstellers (SYBR Green PCR
and RT-PCR Reagents-Protokol, Perkin Elmer Applied Biosystems, 1998) in ei
nem Thermocycler (GeneAmp PCR-System 9700, PE) revers transkribiert. Die
Primer für die Amplifikation der TTF-1 cDNA (TTF-1-Primer 1:
CGAGCGCTACATTGTCGCT (SEQ ID Nr. 59), TTF-1-Primer 2:
GTCTTAAATTTGCTTGTGCCCC (SEQ ID Nr. 60) und der Referenz (GAPDH-
Primer1: ATCAACGGGAAGCCCATCA (SEQ a Nr. 61), GAPDH-Primer2:
GACATACTCAGCACCGGCCT (SEQ ID Nr. 62)) wurden anhand der vorange
hend beschriebenen Nukleinsäure und der bekannten Sequenz von GAPDH mit
der Primer-Express-Software für Macintosh PPC Version 1.0 (PE Applied Biosy
stems, P/N 402089, 1998) ausgewählt. Für die PCR wurde das SYBR Green PCR
Core Reagents Kit (4304886, PE Applied Biosystems) verwendet. Die Konzentration
der Primer in der PCR wurde zunächst im Bereich von 50 nM bis 600 nM
optimiert und die Spezifität der PCR durch Analyse der Länge der amplifizierten
Produkte in einer Agarose-Gel Elekrophorese geprüft. Anschließend wurde mit
tels einer Verdünnungsreihe die Effizienz der PCR-Systeme ermittelt (User
Bulletin #2, Relative Quantitation of Gene Expression, PE Applied Biosystems,
1997). Dabei ergab sich, daß für beide cDNAs die Effizienz der Amplifikation bei
100% lag, d. h. bei jeder 1 : 2 Verdünnung der cDNA wurde ein Zyklus mehr be
nötigt, um den Fluoreszensschwellenwert zu überschreiten.
Für die Quantifizierung wurden je Ansatz cDNA aus 10 ng revers transkribierter
Gesamt-RNA in einem Gesamtvolumen von 25 µl amplifiziert. Die Laufbedin
gungen für die PCR entsprachen den Angaben des Herstellers (PE Applied Biosy
stems, SYBR Green PCR and RT-PCR Reagents Protocol, 1998). Die CT-Werte
wurden analysiert und die Abundanz von TTF-1 relativ zu GAPDH wurde be
rechnet. Dabei bestätigte sich zum Einen die Abnahme von TTF-1 in Wunden im
Vergleich zu intakter Haut von Kontrolltieren als auch von jungen Mäusen (Fig.
2, vergleiche Fig. 1A, B). Zum Anderen wurde wiederum eine verstärkte Ex
pression von TTF-1 in schlecht heilenden Wunden von mit Dexamethason behan
delten Mäusen im Vergleich zu gut heilenden Wunden von Kontrolltieren beob
achtet (Fig. 2, vergleiche Fig. 1B, C). Außerdem konnte eine Abnahme von
TTF-1 in_Wunden von Mäusen mit Diabetes gemessen werden Fig. 3). Somit
konnte die Regulation der Expression von TTF-1 in unterschiedlichen Wundhei
lungszuständen verifiziert werden.
BALB/c Mäuse wurden mit Dexamethason (Injektion von 0,5 mg Dexamethason
pro kg Körpergewicht zwei mal pro Tag für 5 Tage) behandelt und anschließend
verwundet um Gewebe von Mäuse mit schlecht heilenden 1-Tageswunden zu gewinnen.
Die Herstellung der cDNA aus der aus dem Gewebe isolierten Gesamt-
RNA, sowie alle weiteren Schritte wurden wie in EP 0 965 642 beschrieben
durchgeführt: die cDNA wurde gerichtet in einen geeigneten Vektor kloniert und
die erhaltenen Plasmide in einen geeigneten E. coli Stamm transformiert. Je 100
E. coli Klone wurden gemischt und die Plasmid-DNA isoliert. Die DNA wurde in
3 Portionen aufgeteilt und anschließend mit der Restriktionsendonuklease BglI
hydrolysiert und mit je einem Fluoreszenz-Farbstoff markiert. Jede Portion wurde
anschließend auf 2 Portionen aufgeteilt und dann mit je einer der Restriktionsen
donukleasen BfaI, DpnI, RsaI, DdeI, AluI und HinfI hydrolysiert. Die portionier
ten Nukleinsäuren wurden elektrophoretisch aufgetrennt und das Muster der auf
getrennten Nukleinsäuren analysiert. Die Restriktionsfragmentmuster der Klon
gemische wurde mit dem Muster von cDNA Einzelklonanalysen verglichen und
die cDNAs somit identifiziert. Es wurden diejenigen Nukleinsäuren ausgewählt,
deren Restriktionsfragmentmuster unterschiedlich häufig in cDNA-Pools schlecht
heilender und gut heilender Wunden identifiziert wurde. Bei der Analyse von
37000 cDNAs konnte beispielsweise 3 mal das Muster von MCP-2 (DdeI:
196,23 ± 0,3 Basenpaare; AluI: 67,51 ± 0,5 Basenpaare; Hinif: 349,88 ± 0,7 Basen
paare; BfaI: 531,02 ± 2,0 Basenpaare; DpnI: 245,02 ± 0,3 Basenpaare; RsaI:
254,23 ± 0,3 Basenpaare) im cDNA-Pool schlecht heilender Wunden identifiziert
werden, während das Muster im cDNA-Pool gut heilender Wunden nicht beob
achtet wurde.
Die Expression von MRP-14 in Wunden wurde durch in situ Hybridisierung ana
lysiert. Die Herstellung der Sonde mittels des DIG RNA Labelling Mix (Boehrin
ger) als auch die weiteren Hybridisierungsschritte wurden im Wesentlichen nach
den Angaben des Herstellers durchgeführt. Ein 364 bp langes Fragment der hu
manen MRP-14 cDNA (SEQ ID Nr. 74) wurde über PCR aus humaner cDNA
mittels PCR amplifiziert. An die spezifischen Primersequenzen waren die Pro
motorsequenzen von SP6-Polymerase (MRP-14 Primer 1:
AATTAACCCTCACTAAAGGGGGTGGCTCCTCGGCTTTGACA (SEQ ID
NR. 75)) und von T3-Polymerase (MRP-14 Primer 2:
ATTTAGGTGACACTATAGAATACCCCGAGGCCTGGCTTATGGT(SEQ ID
Nr. 76)) angefügt. Das Amplifikat wurde durch Sequenzierung verifiziert und als
Vorlage für eine Synthese von Digoxigenin-markierten RNA-
Hybridisierungssonden (cRNA als auch Kontroll-RNA) verwendet. Mit diesen
Sonden wurden Paraffinschnitte von humanen 5-Tages-Wunden von gesunden
Probanden und Patienten mit diabetischem und venösem Ulcus hybridisiert. Es
zeigte sich, daß das MRP-14 Gen in den suprabasalen Zellschichten des hyper
proliferativen Epithels am Wundrand gesunder Probanden exprimiert wird, wäh
rend sich keine Expression in intakter Haut dieser Probanden und eine veränderte
Expression in Wunden der Patienten nachweisen ließ. Dies ist in sehr guter Über
einstimmung mit der verstärkten Expression von MRP-14 in Wunden von Mäusen
im Vergleich zu intakter Haut (Fig. 2 und Fig. 3).
Claims (33)
1. Verwendung mindestens eines Polypeptids oder einer Variante davon ge
mäß einer der SEQ ID Nr. 55 bis SEQ ID Nr. 58 und/oder diese kodierende
Nukleinsäure oder Variante davon zur (i) Diagnose und/oder Behandlung
von Erkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven Sub
stanzen.
2. Verwendung mindestens eines Polypeptids oder einer Variante davon ge
mäß einer der SEQ ID Nr. 1 bis SEQ ID Nr. 20 und SEQ ID Nr. 31 bis SEQ
ID Nr. 48 und SEQ ID Nr. 63 bis SEQ ID Nr. 70 und/oder diese kodierende
Nukleinsäure oder Variante davon zur (i) Diagnose und/oder Behandlung
von Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven Sub
stanzen.
3. Verwendung eines Polypeptids oder einer Variante davon gemäß einer der
SEQ ID Nr. 21 bis SEQ ID Nr. 30 und SEQ ID Nr. 70 bis SEQ ID Nr. 73
und/oder diese kodierende Nukleinsäure oder Variante davon zur (i) Dia
gnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, oder (ii) Identifizierung
von pharmakologisch aktiven Substanzen.
4. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet,
daß die Nukleinsäure eine DNA oder RNA, vorzugsweise eine DNA, insbe
sondere eine doppelsträngige DNA ist.
5. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet,
daß die Sequenz der Nukleinsäure mindestens ein Intron und/oder eine po
lyA-Sequenz aufweist.
6. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 5, dadurch gekennzeichnet,
daß die Nukleinsäure ihre antisense-Sequenz aufweist.
7. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 6, dadurch gekennzeichnet,
daß die Nukleinsäure synthetisch hergestellt worden ist.
8. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid synthetisch hergestellt worden ist.
9. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid ein Fusionsprotein ist.
10. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 7, dadurch gekennzeichnet,
daß die Nukleinsäure in einem Vektor, vorzugsweise in einem Plasmid,
shuttle Vektor, Phagemid, Cosmid, Expressionsvektors oder gentherapeu
tisch wirksamen Vektor enthalten ist.
11. Verwendung nach einem der Ansprüche 1 bis 7, dadurch gekennzeichnet,
daß die Nukleinsäure in einem knock-out Genkonstrukt oder einer Expressi
onskassette enthalten ist.
12. Wirtszelle, transformiert mit einem Vektor oder einem knock-out Genkon
strukts gemäß einem der Ansprüche 10 oder 11.
13. Wirtszelle nach Anspruch 12, dadurch gekennzeichnet, daß es sich um eine
Hautzelle handelt.
14. Transgene embryonale nichtmenschliche Stammzelle, dadurch gekenn
zeichnet, daß sie ein knock-out Genkonstrukt oder eine Expressionskassette
gemäß Anspruch 11 enthält.
15. Verfahren zur Herstellung eines transgenen nicht-menschlichen Säugetiers,
dadurch gekennzeichnet, daß eine embryonale nichtmenschliche Stamm
zelle gemäß Anspruch 14 zu einem transgenen nicht-menschlichen Säugetier
regeneriert wird.
16. Transgenes nichtmenschliches Säugetier, dadurch gekennzeichnet, daß sein
Genom ein knock-out Genkonstrukt oder eine Expressionskassette gemäß
Anspruch 11 enthält.
17. Verfahren zur Herstellung eines Polypeptids zur (i) Diagnose und/oder Be
handlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii)
Diagnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere von
Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch ak
tiven Substanzen in einer geeigneten Wirtszelle, dadurch gekennzeichnet,
daß eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10 oder 11
exprimiert wird.
18. Verfahren zur Herstellung eines Fusionsproteins zur (i) Diagnose und/oder
Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder
(ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere von
Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch ak
tiven Substanzen in einer geeigneten Wirtszelle, dadurch gekennzeichnet,
daß eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10 oder 11
exprimiert wird.
19. Verfahren zur Herstellung eines Antikörpers oder Antikörperfragments,
vorzugsweise eines polyklonalen oder monoklonalen Antikörpers oder An
tikörperfragments zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankun
gen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Be
handlung bei der Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörungen,
oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven Substanzen, dadurch
gekennzeichnet, daß ein Antikörper produzierender Organismus mit einem
Polypeptid oder einer Variante davon gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3
und 8 oder 9 immunisiert wird.
20. Antikörper oder Antikörperfragment zur (i) Diagnose und/oder Behandlung
von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose
und/oder Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere von Wundhei
lungsstörungen, oder (iii) Identifizierung von pharmakologisch aktiven Sub
stanzen, dadurch gekennzeichnet, daß der Antikörper oder das Antikörper
fragment gegen ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3 und 8
oder 9 gerichtet ist.
21. Verwendung eines Antikörpers oder Antikörperfragments gemäß Anspruch
20 zur (i) Diagnose und/oder Behandlung von Erkrankungen, insbesondere
Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose und/oder Behandlung bei der
Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörungen, oder (iii) Identifi
zierung von pharmakologisch aktiven Substanzen.
22. Verfahren zur Herstellung eines Diagnostikums zur (i) Diagnose von Er
krankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Diagnose bei der
Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörungen, dadurch gekenn
zeichnet, daß mindestens eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1
bis 7 und 10 oder 11, mindestens ein Polypeptid gemäß einem der Ansprü
che 1 bis 3 und 8 oder 9 oder mindestens ein Antikörper oder Antikörper
fragment gemäß einem der Ansprüche 19 oder 20, gegebenenfalls zusam
men mit geeigneten Zusatz- und Hilfsstoffen kombiniert wird.
23. Diagnostikum zur (i) Diagnose von Erkrankungen, insbesondere Hauter
krankungen, und/oder (ii) Diagnose bei der Wundheilung, insbesondere von
Wundheilungsstörungen, dadurch gekennzeichnet, daß es mindestens eine
Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10 oder 11, minde
stens ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3 und 8 oder 9 oder
mindestens einen Antikörper oder ein Antikörperfragment gemäß einem der
Ansprüche 19 oder 20, gegebenenfalls zusammen mit geeigneten Zusatz-
und Hilfsstoffen, enthält.
24. Diagnostikum nach Anspruch 23, dadurch gekennzeichnet, daß es eine Son
de, vorzugsweise eine DNA-Sonde, enthält.
25. Verwendung eines Diagnostikums nach einem der Ansprüche 22 bis 24 zur
(i) Diagnose von Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder
(ii) Diagnose bei der Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörun
gen.
26. Verfahren zur Herstellung eines Arzneimittels zur (i) Behandlung von Er
krankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Behandlung bei
der Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörungen, dadurch ge
kennzeichnet, daß mindestens eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprü
che 1 bis 7 und 10 oder 11, mindestens ein Polypeptid gemäß einem der An
sprüche 1 bis 3 und 8 oder 9 oder mindestens ein Antikörper oder Antikör
perfragment gemäß einem der Ansprüche 19 oder 20 zusammen mit geeig
neten Zusatz- und Hilfsstoffen kombiniert wird.
27. Arzneimittel zur (i) Behandlung von Erkrankungen, insbesondere Hauter
krankungen, und/oder (ii) Behandlung bei der Wundheilung, insbesondere
von Wundheilungsstörungen, dadurch gekennzeichnet, daß es mindestens
eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10 oder 11,
mindestens ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3 und 8 oder 9
oder mindestens einen Antikörper oder ein Antikörperfragment gemäß ei
nem der Ansprüche 19 oder 20, gegebenenfalls zusammen mit geeigneten
Zusatz- und Hilfsstoffen, enthält.
28. Verwendung eines Arzneimittels nach Anspruch 27 zur (i) Behandlung von
Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Behandlung
bei der Wundheilung, insbesondere von Wundheilungsstörungen.
29. Verfahren zur Herstellung eines Tests zur Auffindung von Interaktoren in
Zusammenhang mit (i) Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen,
und/oder (ii) Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, dadurch
gekennzeichnet, daß mindestens eine Nukleinsäure gemäß einem der An
sprüche 1 bis 7 und 10 oder 11, mindestens ein Polypeptid gemäß einem der
Ansprüche 1 bis 3 und 8 oder 9 oder mindestens ein Antikörper oder Anti
körperfragment gemäß einem der Ansprüche 19 oder 20 zusammen mit ge
eigneten Zusatz- und Hilfsstoffen kombiniert wird.
30. Test zur Identifizierung von Interaktoren in Zusammenhang mit (i) Erkran
kungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Wundheilung, insbe
sondere Wundheilungsstörungen, dadurch gekennzeichnet, daß er minde
stens eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10 oder 11,
mindestens ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3 und 8 oder 9
oder mindestens einen Antikörper oder ein Antikörperfragment gemäß ei
nem der Ansprüche 19 oder 20, gegebenenfalls zusammen mit geeigneten
Zusatz- und Hilfsstoffen, enthält.
31. Verfahren zur Herstellung eines auf einem Trägermaterial fixierten Arrays
zur Analyse in Zusammenhang mit (i) Erkrankungen, insbesondere Hauter
krankungen, und/oder (ii) Wundheilung, insbesondere Wundheilungsstö
rungen, dadurch gekennzeichnet, daß mindestens eine Nukleinsäure gemäß
einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10 oder 11, mindestens ein Polypeptid
gemäß einem der Ansprüche 1 bis 3 und 8 oder 9 oder mindestens ein Anti
körper oder Antikörperfragment gemäß einem der Ansprüche 19 oder 20 auf
einem Trägermaterial fixiert wird.
32. Auf einem Trägermaterial fixiertes Array zur Analyse in Zusammenhang
mit (i) Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Wund
heilung, insbesondere Wundheilungsstörungen, dadurch gekennzeichnet,
daß es mindestens eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7
und 10 oder 11 und/oder mindestens ein Polypeptid gemäß einem der An
sprüche 1 bis 3 und 8 oder 9 und/oder mindestens einen Antikörper oder ein
Antikörperfragment gemäß einem der Ansprüche 19 oder 20 enthält.
33. DNA-Chip und/oder Protein-Chip zur Analyse in Zusammenhang mit (i)
Erkrankungen, insbesondere Hauterkrankungen, und/oder (ii) Wundheilung,
insbesondere Wundheilungsstörungen, dadurch gekennzeichnet, daß er
mindestens eine Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 1 bis 7 und 10
oder 11 und/oder mindestens ein Polypeptid gemäß einem der Ansprüche 1
bis 3 und 8 oder 9 und/oder mindestens einen Antikörper oder ein Antikör
perfragment gemäß einem der Ansprüche 19 oder 20 enthält.
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