CN1410549A - 快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒 - Google Patents
快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒 Download PDFInfo
- Publication number
- CN1410549A CN1410549A CN 01127872 CN01127872A CN1410549A CN 1410549 A CN1410549 A CN 1410549A CN 01127872 CN01127872 CN 01127872 CN 01127872 A CN01127872 A CN 01127872A CN 1410549 A CN1410549 A CN 1410549A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- reagent
- ihhnv
- tissue necrosis
- subcutaneous
- necrosis virus
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 241000238557 Decapoda Species 0.000 title claims abstract description 42
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 title claims abstract description 19
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 title claims abstract description 19
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 title claims abstract description 19
- 241000700605 Viruses Species 0.000 title claims abstract description 14
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims abstract description 8
- 230000011132 hemopoiesis Effects 0.000 title claims description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 title abstract 3
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 title abstract 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 claims abstract description 4
- 238000013016 damping Methods 0.000 claims description 3
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 3
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 claims description 2
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 abstract description 16
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 abstract 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 abstract 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 abstract 1
- 238000000034 method Methods 0.000 description 9
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 9
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 9
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 5
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000439574 Decapod penstyldensovirus 1 Species 0.000 description 2
- 241000238553 Litopenaeus vannamei Species 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 2
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000000366 juvenile effect Effects 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- BZSXEZOLBIJVQK-UHFFFAOYSA-N 2-methylsulfonylbenzoic acid Chemical compound CS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1C(O)=O BZSXEZOLBIJVQK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 206010061199 Head deformity Diseases 0.000 description 1
- 241001157775 Litopenaeus stylirostris Species 0.000 description 1
- 208000033787 Rare developmental defect during embryogenesis Diseases 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000005336 cracking Methods 0.000 description 1
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 1
- 208000022734 developmental defect during embryogenesis Diseases 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 238000001493 electron microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000009313 farming Methods 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000012625 in-situ measurement Methods 0.000 description 1
- 238000009413 insulation Methods 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 208000035853 malformation syndrome Diseases 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 101150024183 tigar gene Proteins 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提供一种对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒检测试剂盒,该试剂盒主要由以下几种试剂配方组成:试剂A:组织裂解液;试剂B:DNA提取液;试剂C:PCR反应液,其中含有特定引物IHHNV-5’5’-TCATCCCGACGACGAAGAA和IHHNV-3’5’-GGTTGTCTCCTCCGCTTGTC。使用本发明的试剂盒,经实际试验,证明可以快速、灵敏、准确地判断各种对虾苗种、幼虾、成虾及亲虾是否携带传染性皮下及造血组织坏死病毒。
Description
本发明涉及对虾养殖中传染性皮下及造血组织坏死病毒的检测装置。
对虾养殖业是我国海水养殖的支柱性产业,也是亚洲和美洲许多发展中国家的支柱性海洋产业。近几年来,我国加强了对虾病害防治和养殖高新技术的研究与应用,同时也积极引进原产于南美洲的凡纳对虾(Litopenaeus vannamei,俗称南美白对虾)和细角对虾(Litopenaeus stylirostris,俗称蓝对虾)等新的虾种进行养殖,特别是我国华南地区采用高位池和过滤海水防病养虾系统等高新技术进行凡纳对虾和斑节对虾养殖取得了显著的成功,促进了我国对虾养殖产量的迅速回升。但由于在凡纳对虾和细角对虾亲虾和幼体的引进过程中,危害严重的各种对虾病毒也随之带入我国对虾养殖地区。传染性皮下及造血组织坏死病毒(Infectious hypodermal and haematopoietic necrosis virus,简写IHHNV),又称畸形综合症病毒(Runt-deformity syndrome virus),可造成对虾幼体和仔虾高达80%的累积死亡率,存活的个体头部畸形,体小,对对虾养殖产量造成很大影响。由于该病毒粒子微小(直径17-26nm),即使用透射电镜也很难发现。因此,找出传染性皮下及造血组织坏死病毒的快速检测方法能有效控制该病毒的流行。
目前,世界上主要有三种方法检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒:1.电镜法,该法检测仪器昂贵,样品预处理复杂,灵敏度低,不适合现场测定;2.基因探针法,价格高,操作复杂;3.聚合酶链式反应法,国外产品价格很高,不适合我国对虾养殖业户。
本发明的目的是提供一种对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒检测试剂盒,以便可以快速、灵敏、准确地判断各种对虾苗种、幼虾、成虾及亲虾是否携带传染性皮下及造血组织坏死病毒。
本发明的试剂盒主要由以下几种试剂配方组成:
试剂A:组织裂解液;
试剂B:DNA提取液;
试剂C:PCR反应液,其中含有特定引物IHHNV-5’和IHHNV-3’,其序列分别为:5’-TCATCCCGACGACGAAGAA和5’-GGTTGTCTCCTCCGCTTGTC。
试剂C中所含的特定引物IHHNV-5’和IHHNV-3’,应有足够的含量,一般每种的含量应不少于8pm。
本发明所提供的对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒检测试剂盒的使用方法如下:
一、传染性皮下及造血组织坏死病毒DNA的提取
1.取待检样品组织25-30mg,于1.5ml离心管中,加200ul TE缓冲液,捣烂。
2.200ul样品中加入400ul溶液A,混匀后,加入3ul蛋白酶K,置于55℃水浴5-10分钟,裂解过程中上下混匀几次。降解完全的样品应为半透明粘稠液体,否则应继续保温处理。
3.加入600ul氯仿,轻轻混匀,以保证DNA的完整性。
4.用台式离心机10000转/分离心5分钟,取500ul上清液,置于1.5ml离心管中。
5.加入500ul溶液B,混匀,室温放置2分钟。10000转/分离心5分钟。
6.吸去上清液,加入100ul 1.2M NaCl,轻轻摇动混匀直至DNA样品完全溶解。加入3ul核糖核酸A,混匀,置于55℃水浴5-10分钟。
7.加入300ul冷乙醇,-20℃放置10分钟。10000转/分离心3-4分钟。倒掉乙醇,用70%乙醇洗一次。倒置于干净的滤纸上,室温干燥。
8.待检样品DNA用50ul水溶解。
二、PCR反应
在取1-2ul待检样品DNA加入反应管C中,混匀后在PCR仪中进行以下反应:
72℃ 5分钟
15℃ 停止
反应结束后取5-10ul加4ul溴酚蓝混匀后进行2%琼脂糖凝胶电泳,确定扩增产物。如出现约540bp的反应产物,说明待检样品携带传染性皮下及造血组织坏死病毒。
使用本发明的试剂盒,经实际试验,证明可以快速、灵敏、准确地判断各种对虾苗种、幼虾、成虾及亲虾是否携带传染性皮下及造血组织坏死病毒。
实施例
凡纳对虾和细角对虾幼苗用对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒检测试剂盒检测。试剂盒组成为:
试剂A:组织裂解液。其组成为0.5%SDS,0.25M EDTA;
试剂B:DNA提取液。其组成为氯仿∶1.2M氯酸钠=6∶1;
试剂C:PCR反应液,每管组成为2mM MgCl2,2.5ul 10X PCR缓冲液,17.2ul ddH2O,4ul 10mMdNTP,1u Taq,10pm IHHNV-5’,10pm IHHNV-3’。
按本发明所提供的对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒检测试剂盒的使用方法,提取传染性皮下及造血组织坏死病毒DNA,进行PCR反应,反应结束后取5-10ul加4ul溴酚蓝混匀后进行2%琼脂糖凝胶电泳,即可发现幼苗是否携带有传染性皮下及造血组织坏死病毒。
Claims (2)
1.一种快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒,其特征在于该试剂盒由以下试剂组成:
试剂A:组织裂解液;
试剂B:DNA提取液;
试剂C:PCR反应液,其中含有特定引物IHHNV-5’和IHHNV-3’,其序列分别为:5’-TCATCCCGACGACGAAGAA和5’-GGTTGTCTCCTCCGCTTGTC。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所说的试剂C:PCR反应液,每管组成为2mM MgCl2,2.5ul 10X PCR缓冲液,17.2ul ddH2O,4ul 10mMdNTP,1u Taq,1 0pm IHHNV-5’,10pm IHHNV-3’。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN 01127872 CN1410549A (zh) | 2001-09-21 | 2001-09-21 | 快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN 01127872 CN1410549A (zh) | 2001-09-21 | 2001-09-21 | 快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN1410549A true CN1410549A (zh) | 2003-04-16 |
Family
ID=4667782
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN 01127872 Pending CN1410549A (zh) | 2001-09-21 | 2001-09-21 | 快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN1410549A (zh) |
Cited By (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN100351630C (zh) * | 2005-10-23 | 2007-11-28 | 王学海 | 对虾ihhnv的fq-pcr诊断试剂盒及检测方法 |
WO2008024293A1 (en) * | 2006-08-24 | 2008-02-28 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Sequences diagnostic for shrimp pathogens |
CN100460519C (zh) * | 2006-08-29 | 2009-02-11 | 中国科学院南海海洋研究所 | 检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒的试剂盒及方法 |
CN101845444A (zh) * | 2010-04-16 | 2010-09-29 | 国家海洋局第三海洋研究所 | 对虾传染性皮下及造血组织坏死病的衣壳蛋白基因及病毒样颗粒 |
CN104204231A (zh) * | 2012-02-27 | 2014-12-10 | 马来亚大学 | 用于传染性皮下及造血器官坏死病毒的实时病毒检测方法和试剂盒 |
CN109022622A (zh) * | 2018-09-14 | 2018-12-18 | 上海海洋大学 | 对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒的pcr检测引物及检测方法 |
-
2001
- 2001-09-21 CN CN 01127872 patent/CN1410549A/zh active Pending
Cited By (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN100351630C (zh) * | 2005-10-23 | 2007-11-28 | 王学海 | 对虾ihhnv的fq-pcr诊断试剂盒及检测方法 |
WO2008024293A1 (en) * | 2006-08-24 | 2008-02-28 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Sequences diagnostic for shrimp pathogens |
JP2010501178A (ja) * | 2006-08-24 | 2010-01-21 | イー・アイ・デュポン・ドウ・ヌムール・アンド・カンパニー | エビ病原体の診断用配列 |
US7732142B2 (en) | 2006-08-24 | 2010-06-08 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Sequences diagnostic for shrimp pathogens |
CN101506387B (zh) * | 2006-08-24 | 2014-04-09 | 纳幕尔杜邦公司 | 用于诊断虾病原体的序列 |
CN100460519C (zh) * | 2006-08-29 | 2009-02-11 | 中国科学院南海海洋研究所 | 检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒的试剂盒及方法 |
CN101845444A (zh) * | 2010-04-16 | 2010-09-29 | 国家海洋局第三海洋研究所 | 对虾传染性皮下及造血组织坏死病的衣壳蛋白基因及病毒样颗粒 |
CN104204231A (zh) * | 2012-02-27 | 2014-12-10 | 马来亚大学 | 用于传染性皮下及造血器官坏死病毒的实时病毒检测方法和试剂盒 |
CN109022622A (zh) * | 2018-09-14 | 2018-12-18 | 上海海洋大学 | 对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒的pcr检测引物及检测方法 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN112094948B (zh) | 一种靶标基因组合在非洲猪瘟病毒检测中的应用及试剂盒 | |
CN107299054A (zh) | Dna测序装置的控制系统及控制方法 | |
CN108624586B (zh) | 一种核酸提取试剂盒及其应用方法 | |
CN100460519C (zh) | 检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒的试剂盒及方法 | |
CN106167833B (zh) | 一种同时检测8种虫媒脑炎病毒的rt-pcr引物和探针组合及试剂盒 | |
CN103397105B (zh) | 一种检测gii型诺如病毒的试剂盒及其用途 | |
CN112359137A (zh) | 一种可视化病毒核酸rna检测所用的rt-lamp扩增体系及应用 | |
CN101691615B (zh) | 一种用于检测对虾白斑综合症病毒的试剂盒及其检测方法 | |
CN109517927A (zh) | 一种甲型、乙型流感病毒快速分型检测试剂盒及其应用 | |
CN1410549A (zh) | 快速检测对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒试剂盒 | |
CN103233082B (zh) | 一种利用实时荧光定量pcr检测h7n9禽流感病毒的试剂盒 | |
CN107574261B (zh) | 用于检测汉坦病毒的检测引物、检测试剂盒及检测方法 | |
CN109182600A (zh) | 一种同步检测乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、人免疫缺陷病毒1型的荧光定量pcr试剂盒 | |
CN103146846A (zh) | 一种基于单一标准品的四色荧光定量pcr方法和试剂盒 | |
Sun et al. | Rapid and sensitive detection of hepatitis C virus in clinical blood samples using reverse transcriptase polymerase spiral reaction | |
CN112111597B (zh) | 一种免核酸提取快速检测新型冠状病毒2019-nCoV核酸的荧光PCR试剂盒 | |
CN111719018B (zh) | 新型冠状病毒环介导等温扩增检测芯片及制备和使用方法 | |
CN105296676A (zh) | 一种戊型肝炎病毒荧光定量pcr检测试剂盒及其使用方法 | |
CN101386893A (zh) | 一种检测口蹄疫病毒基因组rna的单细胞实时荧光定量rt-pcr的方法 | |
CN100460518C (zh) | 用等温分支扩增检测对虾白斑综合症病毒的试剂盒及方法 | |
He et al. | A reverse transcription-polymerase spiral reaction (RT-PSR)-based rapid coxsackievirus A16 detection method and its application in the clinical diagnosis of hand, foot, and mouth disease | |
CN103525945B (zh) | 甲型h1n1流感病毒(2009)实时荧光核酸恒温扩增检测试剂盒 | |
CN102392077B (zh) | 一种检测水体中产毒铜绿微囊藻浓度的引物序列及方法 | |
CN111118221B (zh) | 斯里兰卡木薯花叶病毒检测用rpa引物、探针及试剂盒 | |
CN102925584B (zh) | 火鸡组织滴虫lamp检测试剂盒 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C12 | Rejection of a patent application after its publication | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |