CN1274837C - 化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4及其制备方法 - Google Patents
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Abstract
化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4及其制备方法,涉及一种真菌代谢产物,尤其是一种利用新分离获得的阜孢霉A4-Z-1代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4(Mycodiketopiperazine)。其步骤为菌种接种于培养基中至发酵,发酵液经过滤去菌,收集上清分装后萃取,收集有机相浓缩;取硅胶用石油醚拌匀装柱洗脱平衡至硅胶的沉降不再变动,用洗脱溶剂系统洗脱,浓缩,洗涤,离心,收集固体;固体用甲醇加热溶解,重结晶,得化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4。可作为抗肿瘤药物或其他生物活性的先导物。
Description
技术领域
本发明涉及一种真菌代谢产物,尤其是一种利用新分离获得的阜孢霉A4-Z-1代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4(Mycodiketopiperazine)。
背景技术
阜孢霉(Papularia sp.)分离于土壤,腐生,为一般土壤真菌。文献([美]H.L.巴尼特,B.B.亨特著(沈崇尧译):《半知菌属图解》,北京:科学出版社,1977)上报道该属真菌为植物兼性寄生菌。该菌株在PDA(马铃薯琼脂培养基)培养基上生长良好,菌丝灰褐色絮状,分生孢子梗明显,但较短,无色或成熟时淡褐色,直立少分支。分生孢子暗色,单孢,卵圆形,少数近球形,在分生孢子梗顶端单生或簇生。
发明内容
本发明的目的在于提供一种结构新颖,前未发现的利用新分离获得的阜孢霉A4-Z-1代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4及其制备方法。
本发明的另一目的在于将化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4作为抗肿瘤药物或其他生物活性的先导物。
本发明所采用的真菌为本申请发明人从福建沙溪河附近的黄磷口(地名)的土壤中分离得到的菌株A4-Z-1,经鉴定为阜孢霉(Papularia sp.)。该菌株已保藏于中国典型培养物保藏中心,登记入册的保藏编号为CCTCC NO:M 204036,保藏的培养物名称及注明的鉴别特征为阜孢霉Papularia sp.,保藏日为2004年5月25日。
本发明所说的真菌代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的结构式为
本发明所说的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的制备方法为
1)液体培养及发酵液处理:取斜面上菌种接种于液体培养基中培养至发酵,发酵液经过滤,除去菌体,收集发酵液,分装后加入乙酸乙酯萃取,收集萃取所得的有机相浓缩;
2)化合物的分离:取质量为上样量30~50倍的硅胶,用石油醚拌匀后装柱洗脱平衡至硅胶的沉降不再变动,用洗脱溶剂系统,按极性从小到大的顺序进行洗脱,收集浓缩。发现有固体析出的收集管中,用乙酸乙酯洗涤,离心,收集固体;
3)固体用甲醇加热至溶解,重结晶,得到方形薄片无色透明晶体,制得的真菌代谢产物即为化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4。
在步骤2)中所说的洗脱溶剂系统可选择石油醚/7酸乙酯。
化合物的分析可进行晶体X-Ray测试,其余部分进行NMR,IR,MS,生物活性等测试。
根据NMR数据、晶体数据、ESI和HREI质谱数据及IR数据,对化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4进行结构鉴定,可确定化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的结构。根据对化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的生物活性测定,利用细胞毒MTT法2测定化合物的抗肿瘤活性,发现其对人口腔皮样癌KB细胞IC50=120微克/毫升,研发为抗肿瘤药物或其他生物活性的先导物,由此证明,化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4具有抗肿瘤活性。
附图说明
图1为本发明的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的分子结构图。
具体实施方式
实施例1
取斜面上菌种接种子PDA液体培养基中28℃,160rpm培养7d至发酵,发酵液经8层纱布过滤,除去菌体,收集上清,将收集到的上清分装于5L三角瓶中(2L/瓶),加入等体积乙酸乙酯萃取12h;收集有机相,合并两次萃取所得的有机相,用旋转蒸发仪40℃减压浓缩。取质量为上样量的40倍的硅胶,用石油醚拌匀后装柱,柱内径选为5cm,柱长为50~70cm,用石油醚洗脱平衡至硅胶的沉降不再变动;用硅胶拌样后上柱,用石油醚/乙酸乙酯洗脱溶剂系统,按极性从小到大的顺序,选择不同的梯度进行洗脱,每个梯度为2~3倍柱床体积,洗脱液每150mL收集1管。浓缩第17管,发现有固体产生(约50mg),用乙酸乙酯洗涤,离心,收集固体。固体用甲醇加热至溶解,重结晶,得到方形薄片无色透明晶体(都是小晶体)。小晶体进行X-Ray测试,其余部分进行NMR,IR,MS,生物活性等测试,保存。
化合物的结构鉴定可采用以下办法:基于各种NMR谱图分析可知,13C NMR谱图中的10个信号分别为1个甲基,1个次甲基,5个含单质子的C,一个羰基C,一个二取代的烯碳;1H NMR和1H-13C COSY谱显示9个信号,包括1个甲基,1个亚甲基(裂分成两个信号),1个烯烃H,一个OH,2个环氧碳H,一个季碳H,1个连OH的季碳H;进一步由1H-13H COSY谱确证,甲基单峰,由化学位移推测为硫甲基。亚甲基(3A,3B)裂分的信号自己相互偶合,旁边相连碳无质子(C2,C4)。连OH的季碳(C6)和单取代烯烃碳(C5),环氧碳相连(C7)。由ESI质谱(473.0[M+Na]+)和HREI高分辨质谱推测该分子为对称结构。另外红外光谱也同时确证了环氧(1257cm-1,837cm-1),OH(3409cm-1),烯烃(814cm-1),酰胺键(1663cm-1,3268cm-1),硫甲基(1311cm-1)的存在。
化合物1H和13C NMR数据见表1。
表1化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A41H和13C NMR数据
Assignment | δC | δH(multiplicity,JH/H HZ) | 1H-1H COSY |
1 | 165.82(q) | ||
2 | 71.20(q) | ||
3 | 39.50(s) | 2.81(HA d)14 | 3B |
3.01(HB d)14 | 3A | ||
4 | 133.61(q) | ||
5 | 124.17(t) | 5.80(1H d)5 | 6 |
6 | 61.79(t) | 4.45(1H dd)5,4,8 | 5,7(OH) |
7 | 53.12(t) | 3.38(1H m)4,4 | 6,8 |
8 | 57.50(t) | 3.62(1H d)4 | 7 |
9 | 55.52(t) | 4.23(1H s) | |
10 | 13.87(p) | 2.08(3H s) | |
OH | 5.0(1H d)8 | 6 |
a.化合物溶于DMSO氘代试剂中,氢谱由TMS做内标;
b.字母p,s,t,q分别代表伯,仲,叔,季碳,由DEPT图确定。
化合物的绝对构型:化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的绝对构型通过1H-1H偶合常数和单晶衍射2,3确定。在1H-1H COSY谱中,H-8与H-9没有偶合,表明他们分别在环的两侧;H-8与H-7有偶合(JH-8/H-7=4Hz),而H-9和H-7不存在偶合,则可确定H-8与H-7在同侧,而H-9与环氧键同侧;H-6和H-7(JH-6/H-7=4Hz),H-5(JH-6/H-5=5Hz),OH(JH-6/OH=8Hz)都存在偶合,推测H-6与H-7同侧。该化合物的立体构型进一步由单晶衍射确证,如图1所示。晶体数据参见表2。
表2化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的晶体学参数
CCDC number | 240904 |
Empirical formula | C20H22N2O6S2·C2H5OH |
Formula weight | 450.53 |
Temperature(K) | 273(2)K |
Crystal size | 0.32×0.30×0.05mm |
Crvstal system | Tetragonal |
space group | P212121 |
Unit cell dimensions | |
a/ | 9.469(3) |
b/ | 9.469(3) |
c/ | 23.915(6) |
α/° | 90 |
β/° | 90 |
γ/° | 90 |
Volume,3 | 2144.1(8) |
Z | 4 |
d,Mg/m3 | 1.538 |
F(000) | 1048 |
Diffractometor | Bruker APEX area-detector |
θrange,deg | 1.70to28.27 |
Limiting indices | -12<=h<=10, |
Reflections collections | 12979/4957[R(int)=0.0405] |
Independent reflections | 4957 |
Data/restraints/parameters | 4957/2/298 |
Goodness-of-fit on F2 | 1.190 |
R indices[I>2σ(I)] | R1=0.0612,wR2=0.1523 |
R indices(all data) | R1=0.0650,wR2=0.1545 |
Refinement methods | Full-matrix least-squares on F^2 |
Largest diff.Peak/hole(e -3) | 0.474and-0.647 |
根据NMR数据、晶体数据、ESI和HREI质谱数据及IR数据,可确定上述化合物的结构。
利用细胞毒MTT法4测定上述化合物的生物活性,发现其对人口腔皮样癌KB细胞IC50=120微克/毫升,可研发为抗肿瘤药物或其他生物活性的先导物。
实施例2
与实施例1类似,其不同在于取斜面上菌种接种于PDA液体培养基中26℃,180rpm培养8d至发酵,加入的乙酸乙酯萃取液为发酵液的1.2倍,萃取3次。在分离化合物时,硅胶的质量为上样量30倍。
实施例3
与实施例1类似,其不同在于取斜面上菌种接种于PDA液体培养基中30℃,150rpm培养6d至发酵,加入的乙酸乙酯萃取液为发酵液的0.8倍。在分离化合物时,硅胶的质量为上样量50倍。
Claims (3)
1、一种用真菌代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4,所说的真菌为阜孢霉(Papulariasp.)A4-Z-1,登记入册的保藏编号为CCTCC NO:M 204036,株号为A4-Z-1,其特征在于所说的真菌代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的结构式为
2、如权利要求1所述的一种用真菌代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的制备方法,其特征在于其步骤为
1)液体培养及发酵液处理:取斜面上菌种阜孢霉A4-Z-1接种于液体培养基中培养至发酵,发酵液经过滤,除去菌体,收集上清,分装后加入乙酸乙酯萃取,收集萃取所得的有机相浓缩;
2)化合物的分离:取质量为上样量30~50倍的硅胶,用石油醚拌匀后装柱洗脱平衡至硅胶的沉降不再变动,用洗脱溶剂系统,按极性从小到大的顺序进行洗脱,浓缩,发现有固体产生时,用乙酸乙酯洗涤,离心,收集固体;
3)固体用甲醇加热至溶解,重结晶,得到方形薄片无色透明晶体,制得的真菌代谢产物即为化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4。
3、如权利要求2所述的一种用真菌代谢产生的化合物α-硫甲基-二酮哌嗪A4的制备方法,其特征在于在步骤2)中所说的洗脱溶剂系统为石油醚/乙酸乙酯。
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