CN118109601A - 用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的pcr鉴别的引物及方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的PCR鉴别的引物,所述引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2所示。本发明还公开了上述引物的应用,基于该引物的试剂盒以及基于该引物的鉴别方法。实施本发明可有效鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的真伪。
Description
技术领域
本发明涉及中药鉴别技术领域,尤其涉及一种用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的PCR鉴别的引物及方法。
背景技术
中国药典2020年版规定龟甲来源为龟科动物乌龟Chinemys reevesii(Gray)的背甲及腹甲。龟甲始载于汉代《神农本草经》,列为上品,是传统名贵药材,有滋阴潜阳、益肾强骨、养血补心、固精止汗的作用,用于阴虚潮热、骨蒸盗汗、头晕目弦、虚风内动、筋骨萎软、心虚健忘、崩漏经多等症。近代药理学研究表明龟甲有抗肿瘤,抑制肿瘤细胞的活性,在临床上应用了多年。
龟甲作为传统的滋阴药,在临床上应用广泛,且为细贵中药材,市场上出现大量的混淆品,如巴西龟、花龟、鳄龟、黄喉拟水龟等亲缘关系较近的龟类,它们形态学特征相似,依靠传统方法对破碎的、不完整的龟甲也无法进行客观准确地鉴别,使得准确性下降,尤其是经过水提取制成标准汤剂,进一步加工成配方颗粒后,在失去药材性状后,传统方法更难以进行有效鉴别,极大影响了龟甲的用药安全,为保证龟甲的质量和疗效,一种能准确、快速地鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的手段刻不容缓。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于,提供一种用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的PCR鉴别的引物,其可有效鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的真伪。
本发明还要解决的技术问题在于,提供所述龟甲及其配方颗粒的PCR鉴别的引物的应用。
本发明还要解决的技术问题在于,提供一种试剂盒,其能够快速鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的真伪。
本发明还要解决的技术问题在于,提供一种鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其准确度好、专属性高。
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的PCR鉴别的引物,所述引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2所示。
表1为所述上游引物和下游引物的具体序列
为了解决上述技术问题,本发明提供了所述龟甲及其配方颗粒的PCR鉴别的引物在(1)、(2)或(3)中的应用:
(1)鉴定龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的应用;
(2)制备用于鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的试剂盒;
(3)构建鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法中的应用。
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种试剂盒,所述试剂盒包括上述引物。
在一种实施方式中,所述试剂盒中还包括DNA阳性对照、PCR反应体系、电泳鉴定体系。
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,包括以下步骤:
S1、提取待测样品的基因组DNA;
S2、以所述基因组DNA为模板,采用如表1所述的引物进行PCR扩增,得到扩增产物;
S3、将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,以判断待测样品的真伪。
在一种实施方式中,步骤S2中,所述PCR扩增的程序为:将扩增体系在94℃-96℃的温度下预变性4min-6min,然后在94℃-96℃的温度下变性25s-35s,再在61℃-62℃的温度下退火25s-35s,最后在71-75℃延伸下延伸25s-35s,至此完成一个循环周期,重复完成30-33个所述循环周期后在71-75℃延伸下延伸4min-6min。
在一种实施方式中,所述PCR扩增的反应体系包括:10×PCR缓冲液2μL-3μL,dNTP1μL-3μL,Ex Taq聚合酶0.1μL-0.3μL,所述上游引物0.2μL-0.4μL,所述下游引物0.2μL-0.4μL,DNA模板0.5μL-1.5μL,灭菌双蒸水补足至25μL。
在一种实施方式中,所述dNTP的浓度为2mmol/L-3mmol/L;
所述Ex Taq聚合酶的浓度为4U/μL-6U/μL;
所述上游引物的浓度为9μmol/L-11μmol/L,所述下游引物的浓度为9μmol/L-11μmol/L;
所述DNA模板为龟甲配方颗粒DNA模板、龟甲药材DNA模板或龟甲标准汤剂DNA模板,所述龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂DNA模板的浓度为100ng/μl-300ng/μl,所述龟甲药材DNA模板的浓度为10ng/μl-40ng/μl。
在一种实施方式中,步骤S3中包括:将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,若所述扩增产物在270bp处产生条带,则待测样品中含有龟甲;否则待测样品为伪劣品。
在一种实施方式中,步骤S1中,采用如下方法提取龟甲药材的基因组DNA:
取龟甲药材研磨成粉末后置于离心管中,加入SDS裂解液、蛋白酶K,涡旋震荡混匀,水浴加热过夜,取出离心,吸取上清液置于离心管中;
加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积预冷异丙醇,在零下18℃-22℃静置60-90分钟,离心弃上清液,得到沉淀;
向所述沉淀中加入70%-80%乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,再加入无水乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液后挥干溶剂,加高压灭菌超纯水溶解,得到龟甲药材的基因组DNA溶液。
在一种实施方式中,步骤S1中,采用如下方法提取龟甲配方颗粒和龟甲标准汤剂的基因组DNA:
取龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂研磨成细粉后置于离心管中,加入CTAB沉淀液,涡旋震荡,水浴加热,离心弃去上清液,再加入CTAB沉淀液,涡旋震荡,水浴加热,离心弃去上清液,再加入CTAB提取液、蛋白酶K和β-巯基乙醇,涡旋震荡混匀,水浴加热过夜,取出,离心吸取上清液置于离心管中;
加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心取上清液,再加入等体积预冷异丙醇,在零下18℃-22℃静置60-90分钟,离心弃上清液,得到沉淀;
向所述沉淀中加入70%-80%乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,再加入无水乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,挥干溶剂,加高压灭菌超纯水溶解,得到龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂的基因组DNA溶液。
实施本发明,具有如下有益效果:
本发明提供的引物能够特异性检测龟甲药材及龟甲配方颗粒、龟甲标准汤剂,可作为快速鉴别龟甲药材及龟甲配方颗粒、龟甲标准汤剂的特异性引物,为中药配方颗粒用药安全与临床疗效,提供了快速准确的鉴别方法。而且,本发明提供的鉴别方法,其准确度好、专属性高,能够快速准确地辨别龟甲及其配方颗粒的真伪,可解决龟甲配方颗粒在失去形态后难以鉴别的难题。
附图说明
图1为本发明实施例1中的引物筛选电泳图;其中,M.DNA maker DL 1000,1.龟甲对照药材,2.龟甲饮片,3-4.龟甲标准汤剂,5-6.龟甲配方颗粒,7.鳄龟药材,8.巴西龟药材,9.花龟药材,10.黄喉拟水龟药材,11.空白(ddH2O);
图2为本发明实施例2中不同退火温度的考察结果;其中,M.DNA maker DL 1000,1.龟甲对照药材,2.龟甲饮片,3-4.龟甲标准汤剂,5-6.龟甲配方颗粒,7.鳄龟药材,8.巴西龟药材,9.花龟药材,10.黄喉拟水龟药材,11.空白(ddH2O);
图3为本发明实施例2中不同酶的考察结果:其中,M.DNA maker DL 1000,1.龟甲对照药材,2.龟甲饮片,3-4.龟甲标准汤剂,5-6.龟甲配方颗粒,7.鳄龟药材,8.巴西龟药材,9.花龟药材,10.黄喉拟水龟药材,N.空白(ddH2O);
图4为本发明实施例2中不同循环周数的考察结果:其中,M.DNA maker DL 1000,1.龟甲对照药材,2.龟甲饮片,3-4.龟甲标准汤剂,5-6.龟甲配方颗粒,7.鳄龟药材,8.巴西龟药材,9.花龟药材,10.黄喉拟水龟药材,N.空白(ddH2O);
图5为本发明实施例2中方法适用性的考察结果:其中,M.DNA maker DL 1000,1.龟甲对照药材,2-17.龟甲饮片,18-33.龟甲标准汤剂,34-36.龟甲配方颗粒,37-39.鳄龟药材,40-44.巴西龟药材,45-48.花龟药材,49-51.黄喉拟水龟药材,N.空白(ddH2O)。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面对本发明作进一步地详细描述。
除非另外说明或存在矛盾之处,本文中使用的术语或短语具有以下含义:
本发明中,“优选”仅为描述效果更好的实施方式或实施例,应当理解,并不构成对本发明保护范围的限制。
本发明中,以开放式描述的技术特征中,包括所列举特征组成的封闭式技术方案,也包括包含所列举特征的开放式技术方案。
本发明中,涉及到数值区间,如无特别说明,则包括数值区间的两个端点。
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将结合附图及具体实施方式对本发明作进一步地详细描述。
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的PCR鉴别的引物,所述引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2所示。
表1为所述上游引物和下游引物的具体序列
相应地,本发明提供了所述龟甲及其配方颗粒的PCR鉴别的引物在(1)、(2)或(3)中的应用:
(1)鉴定龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的应用;
(2)制备用于鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的试剂盒;
(3)构建鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法中的应用。
进一步地,本发明提供了一种试剂盒,所述试剂盒包括上述引物。在一种实施方式中,所述试剂盒中还包括DNA阳性对照、PCR反应体系、电泳鉴定体系。
再者,本发明还提供了一种鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,包括以下步骤:
S1、提取待测样品的基因组DNA;
在一种实施方式中,步骤S1中,采用如下方法提取龟甲药材的基因组DNA:
取龟甲药材研磨成粉末后置于离心管中,加入SDS裂解液、蛋白酶K,涡旋震荡混匀,水浴加热过夜,取出离心,吸取上清液置于离心管中;
加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积预冷异丙醇,在零下18℃-22℃静置60-90分钟,离心弃上清液,得到沉淀;
向所述沉淀中加入70%-80%乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,再加入无水乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液后挥干溶剂,加高压灭菌超纯水溶解,得到龟甲药材的基因组DNA溶液。
在一种实施方式中,步骤S1中,采用如下方法提取龟甲配方颗粒和龟甲标准汤剂的基因组DNA:
取龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂研磨成细粉后置于离心管中,加入CTAB沉淀液,涡旋震荡,水浴加热,离心弃去上清液,再加入CTAB沉淀液,涡旋震荡,水浴加热,离心弃去上清液,再加入CTAB提取液、蛋白酶K和β-巯基乙醇,涡旋震荡混匀,水浴加热过夜,取出,离心吸取上清液置于离心管中;
加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心取上清液,再加入等体积预冷异丙醇,在零下18℃-22℃静置60-90分钟,离心弃上清液,得到沉淀;
向所述沉淀中加入70%-80%乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,再加入无水乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,挥干溶剂,加高压灭菌超纯水溶解,得到龟甲配方颗粒的基因组DNA溶液。
进一步地,对提取出的基因组DNA的浓度进行测定。在一种实施方式中,取基因组DNA样品,采用BioSpec-nano微量紫外分光光度计测定DNA浓度,同时记录OD260/OD230,OD260/OD280,并调整药材/饮片、配方颗粒/标准汤剂DNA浓度分别到10ng/μl-40ng/μl和100-300ng/μL。
S2、以所述基因组DNA为模板,采用如表1所述的引物进行PCR扩增,得到扩增产物;
在一种实施方式中,所述PCR扩增的程序为:将扩增体系在94℃-96℃的温度下预变性4min-6min,然后在94℃-96℃的温度下变性25s-35s,再在61℃-62℃的温度下退火25s-35s,最后在71-75℃延伸下延伸25s-35s,至此完成一个循环周期,重复完成30-33个所述循环周期后在71-75℃延伸下延伸4min-6min。
优选地,所述PCR扩增的程序为:将扩增体系在95℃的温度下预变性5min,然后在95℃的温度下变性30s,再在61℃的温度下退火30s,最后在72℃延伸下延伸30s,至此完成一个循环周期,重复完成32个所述循环周期后在72℃延伸下延伸5min。
在一种实施方式中,所述PCR扩增的反应体系包括:10×PCR缓冲液2μL-3μL,dNTP1μL-3μL,Ex Taq聚合酶0.1μL-0.3μL,所述上游引物0.2μL-0.4μL,所述下游引物0.2μL-0.4μL,DNA模板0.5μL-1.5μL,灭菌双蒸水补足至25μL。
优选地,所述PCR扩增的反应体系包括:10×PCR缓冲液2.5μL,dNTP2μL,Ex Taq聚合酶0.2μL,所述上游引物0.3μL,所述下游引物0.3μL,DNA模板1μL,灭菌双蒸水补足至25μL。
在一种实施方式中,所述dNTP的浓度为2mmol/L-3mmol/L;所述ExTaq DNA聚合酶的浓度为4U/μL-6U/μL;所述上游引物的浓度为9μmol/L-11μmol/L,所述下游引物的浓度为9μmol/L-11μmol/L;
所述DNA模板为龟甲配方颗粒DNA模板或龟甲药材DNA模板或龟甲标准汤剂DNA模板,所述龟甲配方颗粒和龟甲标准汤剂DNA模板的浓度为100ng/μl-300ng/μl,所述龟甲药材DNA模板的浓度为10ng/μl-40ng/μl。
优选地,所述dNTP的浓度为2.5mmol/L;所述Ex Taq聚合酶的浓度为5U/μL;所述上游引物的浓度为10μmol/L,所述下游引物的浓度为10μmol/L;
S3、将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,以判断待测样品的真伪。
在一种实施方式中,向扩增产物反应体系中加入5μL 6×loading buffer,混匀,取混合产物6-8μL点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于150-170V电压的条件下电泳25min,经GelRed显色,最后于凝胶成像仪观察记录结果。
在一种实施方式中,将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,若所述扩增产物在270bp处产生条带,则待测样品中含有龟甲;否则待测样品为伪劣品。
下面以具体实施例对本发明进行说明。
实施例1
鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,具体包括以下步骤:
S1、提取待测样品的基因组DNA;
按照表2准备样品,按照下述方法进行样品基因组DNA的提取。
表2为样品列表
取龟甲药材适量,充分研磨使成粉末,取100mg,置2.0ml离心管中,加入SDS裂解液[50mmol/L Tris-盐酸pH=8.0,200mmol/L氯化钠,250mmol/L乙二胺四乙酸二钠pH=8.0,1%十二烷基硫酸钠]1.0ml、蛋白酶K(20mg/ml)10μl,涡旋震荡混匀,56℃水浴加热过夜(中间翻转混匀3~5次),取出,离心(转速为每分钟12000转)10分钟,吸取上清液置另一2.0ml离心管中;加入等体积的三氯甲烷-异戊醇(体积比24:1)溶液(约1.0ml),充分混匀,4℃离心(转速为每分钟12000转)10分钟;吸取上清液置另一2.0ml离心管中,加入等体积的三氯甲烷-异戊醇(体积比24:1)溶液(约900μl),充分混匀,4℃离心(转速为每分钟12000转)10分钟;吸取上清液,加入等体积的三氯甲烷-异戊醇(体积比24:1)溶液(约800μl),充分混匀,4℃离心(转速为每分钟12000转)10分钟;吸取上清液置另一1.5ml离心管中,加入等体积预冷异丙醇(约700μl),在零下20℃静置60~90分钟;离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃上清液;沉淀加入75%乙醇700μl,用移液器吹打5次,离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃上清液,再同法操作两次;沉淀加入无水乙醇700μl,用移液器吹打5次,离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃上清液;置37℃下挥干溶剂,加高压灭菌超纯水50μl,置37℃使溶解,作为模板DNA溶液,置4℃保存或置零下20℃长期保存。另取龟甲对照药材适量,同法制成对照药材模板DNA溶液。
取龟甲配方颗粒/标准汤剂适量,充分研磨使成细粉,取100mg,置2.0ml离心管中,加入CTAB沉淀液[2.0%十六烷基三甲基溴化铵,100mmol/L Tris-盐酸pH=8.0,20mmol/L乙二胺四乙酸二钠pH=8.0]1.2ml,涡旋震荡,65℃水浴加热1小时(中间震荡混匀2~3次),离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃去上清液;再加入CTAB沉淀液1.2ml,涡旋震荡,65℃水浴加热30分钟(中间震荡混匀2~3次),离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃去上清液,加入CTAB提取液[2%十六烷基三甲基溴化铵,100mmol/L Tris-盐酸pH=8.0,20mmol/L乙二胺四乙酸二钠pH=8.0,2.5mmol/L氯化钠,2%PVP40]1.0ml、蛋白酶K(20mg/ml)10μl和β-巯基乙醇10μl,涡旋震荡混匀,56℃水浴加热过夜(中间翻转混匀3~5次),取出,离心(转速为每分钟12000转)10分钟,吸取上清液置另一2.0ml离心管中;加入等体积的三氯甲烷-异戊醇(体积比24:1)溶液(约1.0ml),充分混匀,4℃离心(转速为每分钟12000转)10分钟;吸取上清液置另一2.0ml离心管中,加入等体积的三氯甲烷-异戊醇(体积比24:1)溶液(约900μl),充分混匀,4℃离心(转速为每分钟12000转)10分钟;吸取上清液,加入等体积的三氯甲烷-异戊醇(体积比24:1)溶液(约800μl),充分混匀,4℃离心(转速为每分钟12000转)10分钟;吸取上清液置另一1.5ml离心管中,加入等体积预冷异丙醇(约700μl),在零下20℃静置60~90分钟;离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃上清液;沉淀加入75%乙醇700μl,用移液器吹打5次,离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃上清液,再同法操作两次;沉淀加入无水乙醇700μl,用移液器吹打5次,离心(转速为每分钟12000转)5分钟,弃上清液;置37℃下挥干溶剂,加高压灭菌超纯水20μl,置37℃下使溶解,作为模板DNA溶液,置4℃保存或置零下20℃长期保存。
取上述DNA样品,采用BioSpec-nano微量紫外分光光度计测定DNA浓度,同时记录OD260/OD230,OD260/OD280,并调整浓度到相应浓度。
S2、以所述基因组DNA为模板,采用表1所述的引物进行PCR扩增,得到扩增产物;
(1)引物设计
在GeneBank数据库中搜索下载乌龟、鳄龟、巴西红耳龟、中华花龟和黄喉拟水龟的Cytochrome Oxidase I(CO I)序列,利用BioEdit软件对乌龟及其他龟类的序列进行同源比对,校对后分析乌龟的特异性SNP位点,将包含SNP位点的碱基序列导入到PrimerPremier 5软件中,进行引物设计,经初步筛选确定了表3所示的4对引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
表3为引物信息表
(2)引物筛选
建立PCR扩增体系和程序,如表4所示:
表4为PCR反应体系(25μL)
PCR扩增程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,61℃退火30s,72℃延伸30s,共32个循环;最后72℃延伸5min。
以步骤S1所得的基因组DNA和表1所示的引物进行PCR扩增,得到扩增产物。
S3、将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,以判断待测样品的真伪。
待PCR扩增反应结束后,向反应体系加5μL 6×loading buffer,混匀,取混合产物6-8μL点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于150V电压的条件下电泳25min,经GelRed显色,于凝胶成像仪观察结果,结果见图1。结果显示,所有引物对的空白对照均未出现反应条带,说明PCR反应过程无污染,结果可靠。其中,参考文献中的引物并未能实现本研究的龟甲特异性鉴别,而本专利设计的引物组GJ-2F/GJ-2R对能够对龟甲正品进行扩增,PCR扩增得到的目的条带长度为270bp,而目标条带处伪品没有扩增条带,但部分伪品有非特异性扩增,可通过后期PCR反应条件进行优化,说明了该引物组能够特异性检测龟甲,则可作为快速鉴别龟甲的特异性引物。
实施例2
PCR反应条件优化
(1)退火温度考察
通过单因素分别考察退火温度分别为58℃、59℃、60℃、61℃时,对PCR扩增的影响。以图2所示,当退火温度分别为58℃、59℃、60℃、61℃时,龟甲DNA样品均获得PCR扩增条带,且空白对照均无假阳性出现;在58℃~60℃,龟甲伪品均获得亮度较弱的PCR扩增条带,而61℃时伪品未出现PCR扩增条带,为保证结果准确性,故选用退火温度为61℃。
(2)不同酶考察
通过单因素分别考察DNA聚合酶分别为2×M5 Supper FastTaq、Ex Taq、MightyAMP、SpeedSTAR时,对PCR扩增的影响。以图3所示,当使用中保真的2×M5 SupperFastTaq聚合酶和Ex Taq聚合酶、高度保真的SpeedSTAR聚合酶以及MightyAMP聚合酶进行试验时,只有2×M5 Supper FastTaq聚合酶和Ex Taq聚合酶获得龟甲DNA样品的PCR扩增条带,且Ex Taq聚合酶得到的条带质量较好,为保证结果准确性,故选用Ex Taq聚合酶作为DNA聚合酶。
(3)不同循环数考察
通过单因素分别考察循环数为30、32、34、36个时,对PCR扩增的影响。以图4所示,随着循环数的增加,PCR扩增条带亮度逐渐增加,且均空白对照无假阳性出现;当循环数为36和34个时,龟甲伪品均获得PCR扩增条带;当循环数为32个时,条带亮度适中,且龟甲伪品无条带出现,为保证结果准确性,故选循环数为32个。
(4)龟甲特异性PCR方法适用性检测
以龟甲对照药材1批、龟甲饮片16批、龟甲标准汤剂16批、龟甲配方颗粒3批、鳄龟药材3批、巴西红耳龟药材5批、中华花龟药材4批和黄喉拟水龟3批DNA为模板,利用引物组GJ2-F/GJ2-R进行PCR扩增,验证龟甲特异性PCR法的适用性。
根据图5所示,引物组GJ2-F/GJ2-R对龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的鉴定率均为100%,真阳性率均为100%,真阴性率均为100%,假阳性率均为0%,假阴性率均为0%。由此表明该方法能用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的特异性鉴别。
以上所述是发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也视为本发明的保护范围。
Claims (10)
1.一种用于龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的PCR鉴别的引物,其特征在于,所述引物包括上游引物和下游引物,所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2所示。
2.如权利要求1所述的引物在(1)、(2)或(3)中的应用:
(1)鉴定龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的应用;
(2)制备用于鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂的试剂盒;
(3)构建鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法中的应用。
3.一种试剂盒,其特征在于,其包括如权利要求1所述的引物。
4.一种鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、提取待测样品的基因组DNA;
S2、以所述基因组DNA为模板,采用如权利要求1所述的引物进行PCR扩增,得到扩增产物;
S3、将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,以判断待测样品的真伪。
5.如权利要求4所述的鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,步骤S2中,所述PCR扩增的程序为:将扩增体系在94℃-96℃的温度下预变性4min-6min,然后在94℃-96℃的温度下变性25s-35s,再在61℃-62℃的温度下退火25s-35s,最后在71-75℃延伸下延伸25s-35s,至此完成一个循环周期,重复完成30-33个所述循环周期后在71-75℃延伸下延伸4min-6min。
6.如权利要求4所述的鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系包括:10×PCR缓冲液2μL-3μL,dNTP1μL-3μL,Ex Taq聚合酶0.1μL-0.3μL,所述上游引物0.2μL-0.4μL,所述下游引物0.2μL-0.4μL,DNA模板0.5μL-1.5μL,灭菌双蒸水补足至25μL。
7.如权利要求6所述的鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,所述dNTP的浓度为2mmol/L-3mmol/L;
所述Ex Taq聚合酶的浓度为4U/μL-6U/μL;
所述上游引物的浓度为9μmol/L-11μmol/L,所述下游引物的浓度为9μmol/L-11μmol/L;
所述DNA模板为龟甲配方颗粒DNA模板、龟甲药材DNA模板或龟甲标准汤剂DNA模板,所述龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂DNA模板的浓度为100ng/μl-300ng/μl,所述龟甲药材DNA模板的浓度为10ng/μl-40ng/μl。
8.如权利要求4所述的鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,步骤S3中包括:
将所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,若所述扩增产物在270bp处产生条带,则待测样品中含有龟甲;否则待测样品为伪劣品。
9.如权利要求4所述的鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,步骤S1中,采用如下方法提取龟甲药材的基因组DNA:
取龟甲药材研磨成粉末后置于离心管中,加入SDS裂解液、蛋白酶K,涡旋震荡混匀,水浴加热过夜,取出离心,吸取上清液置于离心管中;
加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积预冷异丙醇,在零下18℃-22℃静置60-90分钟,离心弃上清液,得到沉淀;
向所述沉淀中加入70%-80%乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,再加入无水乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液后挥干溶剂,加高压灭菌超纯水溶解,得到龟甲药材的基因组DNA溶液。
10.如权利要求4所述的鉴别龟甲及其配方颗粒、标准汤剂真伪的方法,其特征在于,步骤S1中,采用如下方法提取龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂的基因组DNA:
取龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂研磨成细粉后置于离心管中,加入CTAB沉淀液,涡旋震荡,水浴加热,离心弃去上清液,再加入CTAB沉淀液,涡旋震荡,水浴加热,离心弃去上清液,再加入CTAB提取液、蛋白酶K和β-巯基乙醇,涡旋震荡混匀,水浴加热过夜,取出,离心吸取上清液置于离心管中;
加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心吸取上清液,再加入等体积的三氯甲烷-异戊醇溶液,充分混匀,离心取上清液,再加入等体积预冷异丙醇,在零下18℃-22℃静置60-90分钟,离心弃上清液,得到沉淀;
向所述沉淀中加入70%-80%乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,再加入无水乙醇,用移液器吹打,离心弃上清液,挥干溶剂,加高压灭菌超纯水溶解,得到龟甲配方颗粒或龟甲标准汤剂的基因组DNA溶液。
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