CN117551100A - (s)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-n2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及腺嘌呤技术领域,公开一种(S)‑9‑[3‑(4,4'‑双甲氧基三苯甲基)‑2‑羟基丙基]‑N2‑乙酰基鸟嘌呤的制备方法,该方法包括:将预先配置的吡啶、N2‑乙酰基‑(S)‑9‑(2,3‑二羟基丙基)‑鸟嘌呤以及4,4'‑双甲氧基三苯甲基氯放入反应瓶中进行第一次搅拌;在第一搅拌完成后,进行HPLC中控反应,并在确认完全反应后,进行淬灭浓缩稀释搅拌处理,得到反应化合物溶液;将反应化合物溶液和预先配置的晶种进行第二次搅拌,并在第二次搅拌完成后,进行过滤干燥处理,得到产品。本发明操作简单,且成本低,利于大规模生产。

Description

(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰 基鸟嘌呤的制备方法
技术领域
本发明涉及腺嘌呤技术领域,特别涉及一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法。
背景技术
寡核苷酸是一类只有20个以下碱基的短链核苷酸的总称(包括脱氧核糖核酸DNA或核糖核酸RNA内的核苷酸),因其易与它们的互补链对接,常用来作为探针确定DNA或RNA的结构。寡核苷酸合成的DNA可以用于链聚合反应,能放大确定几乎所有DNA的片段,在这个过程中寡核苷酸是作为引子和DNA中标的的互补片段结合,作成DNA的复制品。
而腺嘌呤是用于寡核苷酸合成的重要试剂, 用于制备腺嘌呤的许多技术具有低产率和/或纯度,这显著地增加了寡核苷酸合成的成本。如:传统(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤(CAS:182625-67-8))主要是通过N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤与4,4'-双甲氧基三苯甲基氯为原料,以吡啶为溶剂进行柱层析纯化反应,工艺复杂,成本较高,且反应温度较高和反应时间较长,造成反应结束时杂质较多,导致收率较低。
因此,如何提供一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的新型制备方法,是目前亟待解决的问题。
发明内容
本发明实施例提供了一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,以解决现有技术中的上述技术问题。
本发明的技术方案是这样实现的:
一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,包括以下步骤:
预先配置原料,所述原料吡啶、N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及4,4'-双甲氧基三苯甲基氯;
将预先配置的吡啶、N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及4,4'-双甲氧基三苯甲基氯放入反应瓶中进行第一次搅拌;
在第一搅拌完成后,进行HPLC中控反应,并在确认完全反应后,进行淬灭浓缩稀释搅拌处理,得到反应化合物溶液;
将反应化合物溶液和预先配置的晶种进行第二次搅拌,并在第二次搅拌完成后,进行过滤干燥处理,得到(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤。
进一步的,所述(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的结构式为:
进一步的,所述吡啶的结构式为:
进一步的,所述N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤的结构式为:
进一步的,所述4,4'-双甲氧基三苯甲基氯的结构式为:
进一步的,所述(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的合成路线为:
其中,N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤到(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的主要反应机理式为:
具体的,4,4'-双甲氧基三苯甲基氯在吡啶作用下分解出4,4'-双甲氧基三苯甲基叔碳正离子和氯负离子;N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤的3'位置的羟基氧由于空间位阻效应去进攻4,4'-双甲氧基三苯甲基叔碳正离子,发生SN1取代反应得到产物(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤;同时3'位置的羟基氧氢键断裂,离去的质子与从4,4'-双甲氧基三苯甲基氯离去的氯负离子结合并被吡啶中和,获得副产物吡啶盐酸盐。
进一步的,所述原料的重量包括:吡啶3400g-3500g、N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤180-181g以及4,4'-双甲氧基三苯甲基氯410-411g。
进一步的,所述第一次搅拌的温度为20-30℃,所述第一次搅拌的时间为2-4小时。
进一步的,在进行淬灭浓缩稀释搅拌处理时,通过预先配置的甲醇进行淬灭,且所述甲醇的用量为180-190ml。
进一步的,在进行浓缩处理后,通过预先配置的乙酸乙酯进行萃取,且所述乙酸乙酯的用量为3550-3650ml。
进一步的,在进行浓缩稀释搅拌处理时,搅拌温度为20-30,且搅拌时间为0.25-0.5小时。
进一步的,所述晶种的用量为4.5-5.5g,且所述第二次搅拌的温度为20-30℃,所述第二次搅拌的时间为5-8小时。
进一步的,在进行干燥处理时,通过真空干燥方式进行干燥处理。
本发明提供的技术方案可以包括以下有益效果:
本发明提供的技术方案可以包括以下有益效果:本发明工艺操作简单,且原料成本低,同时,通过本发明的工艺得到的产品纯度较高,有利于大规模生产,为后续寡核苷酸合成提供了高纯度且价格低廉的原料保障,从而利于整个领域的技术进步。
应当理解的是,以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的,并不能限制本发明。
附图说明
此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分,示出了符合本发明的实施例,并与说明书一起用于解释本发明的原理。
图1是根据一示例性实施例示出的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的1H NMR谱图;
图2是根据一示例性实施例示出的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的HPLC纯度谱图。
具体实施方式
下面对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
在以下实施例中,吡啶采用国药集团化学试剂有限公司批号为20230421生产的吡啶,N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤采用苏州诺维康生物科技有限公司批号为NVC0038-08的N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤,4,4'-双甲氧基三苯甲基氯采用芜湖华仁科技有限公司批号为22042805的4,4'-双甲氧基三苯甲基氯,甲醇采用江苏强盛功能化学股份有限公司白茆分公司批号为20230513的甲醇,乙酸乙酯采用国药集团化学试剂有限公司批号为20230621的乙酸乙酯,晶种采用苏州诺维康生物科技有限公司批号为NVC0038-04的晶种。
实施例1
根据本发明实施例所述的一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,包括以下步骤:
将预先配置的3400g吡啶、180g N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及411g 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯放入反应瓶中,在20℃下搅拌2小时;
在搅拌反应完成后,进行HPLC中控反应,并在确认完全反应后,加入180ml甲醇淬灭,反应液浓缩至130ml;
加入3600ml乙酸乙酯,并在20℃下搅拌0.25小时,然后加入5g晶种,在20℃下搅拌5小时;
在搅拌反应后,进行过滤并真空干燥,得到260g (S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤,纯度:94.4%,收率67.8%。
实施例2
根据本发明实施例所述的一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,包括以下步骤:
将预先配置的3500g吡啶、180g N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及410.8g4,4'-双甲氧基三苯甲基氯放入反应瓶中,在25℃下搅拌3小时;
在搅拌反应完成后,进行HPLC中控反应,并在确认完全反应后,加入180ml甲醇淬灭,反应液浓缩至160ml;
加入3600ml乙酸乙酯,并在25℃下搅拌0.4小时,然后加入5g晶种,在24℃下搅拌6小时;
在搅拌反应后,进行过滤并真空干燥,得到253g (S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤,纯度:94.2%,收率66.0%。
实施例3
根据本发明实施例所述的一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,包括以下步骤:
将预先配置的3450g吡啶、180g N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及410g4,4'-双甲氧基三苯甲基氯放入反应瓶中,在30℃下搅拌4小时;
在搅拌反应完成后,进行HPLC中控反应,并在确认完全反应后,加入180ml甲醇淬灭,反应液浓缩至180ml;
加入3600ml乙酸乙酯,并在30℃下搅拌0.5小时,然后加入5g晶种,在30℃下搅拌8小时;
在搅拌反应后,进行过滤并真空干燥,得到246g (S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤, 纯度:93.5%,收率64.1%。
在具体应用时,对本发明制备出的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤进行1H NMR分析,结果如图1所示:
1H NMR (400 MHz, CDCl3): d =7.88 (s, 1 H), 7.37-7.39 (d, 1 H), 7.27-7.31 (t, 2 H), 7.21-7.24 (m, 5 H), 6.85-6.88 (m,4 H), 5.45-5.46 (d, 1 H),4.05-4.12 (m, 2H), 3.74 (s, 6 H), 3.73-3.74 (m, 1 H) , 3.35-3.41 (m, 1 H),3.16-3.21 (m, 1 H), 2.82-2.88 (m, 2 H) , 2.17 (s, 3 H)。
对本发明制备出的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤进行HPLC纯度分析,结果如图2所示:HPLC纯度大于94.35%。
由此可见,通过本发明的制备方法制备出的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤无需纯化即可直接用于下一步反应,相比于柱层析纯化工艺,提高了纯度和收率。
本发明并不局限于上面已经描述并在附图中示出的结构,并且可以在不脱离其范围进行各种修改和改变。本发明的范围仅由所附的权利要求来限制。

Claims (8)

1.一种(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,包括:
预先配置原料,所述原料吡啶、N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及4,4'-双甲氧基三苯甲基氯;
将预先配置的吡啶、N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤以及4,4'-双甲氧基三苯甲基氯放入反应瓶中进行第一次搅拌;
在第一搅拌完成后,进行HPLC中控反应,并在确认完全反应后,进行淬灭浓缩稀释搅拌处理,得到反应化合物溶液;
将反应化合物溶液和预先配置的晶种进行第二次搅拌,并在第二次搅拌完成后,进行过滤干燥处理,得到(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤。
2.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,所述原料的重量包括:
吡啶3400g-3500g、N2-乙酰基-(S)-9-(2,3-二羟基丙基)-鸟嘌呤180-181g以及4,4'-双甲氧基三苯甲基氯410-411g。
3.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,所述第一次搅拌的温度为20-30℃,所述第一次搅拌的时间为2-4小时。
4.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,在进行淬灭浓缩稀释搅拌处理时,通过预先配置的甲醇进行淬灭,且所述甲醇的用量为180-190ml。
5.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,在进行浓缩处理后,通过预先配置的乙酸乙酯进行萃取,且所述乙酸乙酯的用量为3550-3650ml。
6.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,在进行浓缩稀释搅拌处理时,搅拌温度为20-30,且搅拌时间为0.25-0.5小时。
7.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,所述晶种的用量为4.5-5.5g,且所述第二次搅拌的温度为20-30℃,所述第二次搅拌的时间为5-8小时。
8.根据权利要求1所述的(S)-9-[3-(4,4'-双甲氧基三苯甲基)-2-羟基丙基]-N2-乙酰基鸟嘌呤的制备方法,其特征在于,在进行干燥处理时,通过真空干燥方式进行干燥处理。
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