具体实施方式
本发明提供一种纳米金微球复合物,所述纳米金微球复合物为表面直接或间接附着有亲和素、生物素、多肽和寡核苷酸的纳米金。
在一些具体实施方式中,所述亲和素选自卵白亲和素、链霉亲和素、卵黄亲和素及类亲和素。更具体地,所述亲和素为链霉亲和素。
在一些具体实施方式中,所述生物素为包含咪唑酮环的化学分子。所述咪唑酮环为与亲和素结合的部位。
在一些具体实施方式中,所述多肽为氨基酸以肽键连接在一起而形成的化合物。更具体地,所述多肽为抗体或抗原。优选地,所述多肽为抗体。更优选地,所述抗体为降钙素原抗体。
在一些具体实施方式中,所述寡核苷酸可以理解为核酸分子,通常为人工核酸分子,例如天然不存在的DNA或RNA。换句话说,人工核酸分子可以理解为非天然核酸分子。此类核酸分子由于其单独的序列(其不是天然存在的)和/或由于不是天然存在的其他修饰例如核苷酸的结构修饰而可能是非天然的。人工核酸分子可以是DNA分子、RNA分子或包含DNA和RNA部分的杂合分子。通常,可以通过基因工程方法设计和/或产生人工核酸分子以对应于所需的人工核苷酸序列(异源序列)。在这种情况下,人工序列通常是可能天然不存在的序列,即,其与野生型序列相差至少一个核苷酸。术语“野生型”可以理解为天然存在的序列。此外,术语“人工核酸分子”不限于表示“一个单一分子”,而是通常被理解为包括相同分子的整体。因此,它可以涉及包含在试样中的多个相同分子。
在一些具体实施方式中,所述多肽和所述亲和素附着于所述纳米金表面,所述亲和素连接所述生物素,所述生物素连接所述寡核苷酸即生物素修饰的寡核苷酸。
在一些具体实施方式中,所述纳米金的粒径为5-50nm。更具体地,所述纳米金的粒径为5-10、10-15、15-20、20-30、30-40或40-50nm。优选地,所述纳米金的粒径为10-40nm。
在一些具体实施方式中,所述寡核苷酸的长度为50-70bp。更具体地,所述寡核苷酸的长度为50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69或70bp。优选地,所述寡核苷酸的长度为55-65bp。
在一些具体实施方式中,所述寡核苷酸的核苷酸序列如SEQ ID NO.1:CATCTTACGACGCAACTCTTCCACTTCATCTGCATGCGCTTGTAATTCCGCTTCATC所示。
本发明还提供前述纳米金微球复合物的制备方法,所述制备方法包含如下步骤:
1)将交联剂和纳米金混合,活化纳米金,清洗去除多余的交联剂;
2)将亲和素和步骤1)中活化后的纳米金混合,获得负载亲和素的纳米金,清洗未负载的多余亲和素;
3)将多肽和步骤2)中清洗后负载亲和素的纳米金混合,获得负载亲和素和多肽的纳米金,清洗未负载的多余多肽;
4)将生物素修饰的寡核苷酸和步骤3)中负载亲和素和多肽的纳米金混合,加入封闭液封闭,获得前述纳米金微球复合物。
在一些具体实施方式中,所述制备方法还包含如下步骤:
5)将储存液和步骤4)中所述的纳米金微球复合物混合。
在一些具体实施方式中,步骤1)中所述交联剂选自EDC(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺)、DMTMM(4-(4,6-二甲氧基-1,3,5,-三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐水合物)、MMTM(4-(4,6-二甲氧基-1,3,5,-三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐水合物)或CDI(N,N'-羰基二咪唑)。
在一些具体实施方式中,以步骤1)中反应液的总体积为基准,所述交联剂的浓度为5-15mg/ml。更具体地,所述交联剂的浓度为5-7mg/ml、7-9mg/ml、9-10mg/ml、10-11mg/ml、11-13mg/ml或13-15mg/ml。优选地,所述交联剂的浓度9-11mg/ml。
在一些具体实施方式中,以步骤1)中反应液的总体积为基准,所述纳米金的浓度为40-60μg/ml。更具体地,所述纳米金的浓度为40-45μg/ml、45-50μg/ml、50-55μg/ml或55-60μg/ml。优选地,所述纳米金的浓度为45-55μg/ml。
在一些具体实施方式中,以步骤2)中反应液的总体积为基准,所述亲和素的浓度为25-45μg/ml。更具体地,所述亲和素的浓度为25-30μg/ml、30-35μg/ml、35-40μg/ml或40-45μg/ml。优选地,所述亲和素的浓度为30-40μg/ml。
在一些具体实施方式中,以步骤3)中反应液的总体积为基准,所述多肽的浓度为60-80μg/ml。更具体地,所述多肽的浓度为60-65μg/ml、65-70μg/ml、70-75μg/ml或75-80μg/ml。优选地,所述多肽的浓度为65-75μg/ml。
在一些具体实施方式中,以步骤4)中反应液的总体积为基准,所述生物素修饰的寡核苷酸的浓度为0.0001-0.01pmol/ml。更具体地,所述生物素修饰的寡核苷酸的浓度为0.0001-0.0005pmol/ml、0.0005-0.001pmol/ml、0.001-0.005pmol/ml、0.005-0.01pmol/ml。优选地,所述生物素修饰的寡核苷酸的浓度为0.0005-0.005pmol/ml。
在一些具体实施方式中,步骤1)、步骤2)、步骤3)中所述清洗采用清洗缓冲液。更具体地,所述清洗缓冲液选自磷酸缓冲液(PBS)、Tris-HCl(三(羟甲基)氨基甲烷盐酸盐)缓冲液、柠檬酸缓冲液、MES(吗啉乙磺酸)缓冲液、HEPES(N-2-羟乙基哌嗪-N'-2-乙磺酸)缓冲液、硼酸缓冲液或碳酸缓冲液。优选地,所述清洗缓冲液为MES缓冲液。
在一些具体实施方式中,步骤4)中所述封闭液或步骤5)中所述储存液包含BSA、牛血清、山羊血清、酪蛋白、明胶、鱼胶蛋白、鲑鱼精中的一种或多种。
在一些具体实施方式中,前述储存液还包含表面活性剂、蛋白保护剂和/或防腐剂。更具体地,所述表面活性剂选自Tw-20(吐温-20)、Tw-80(吐温-80)、Triton X-100(曲拉通X-100)、SDS(十二烷基硫酸钠)、PVP K30(聚乙烯吡咯烷酮K30)中的一种或多种;所述防腐剂选自叠氮钠、ProClin300、硫化汞、山梨酸钾中的一种或多种;所述蛋白保护剂选自海藻糖、葡萄糖或甘露醇中的一种或多种。
本发明还提供前述纳米金微球复合物在制备免疫PCR产品中的用途。
本发明还提供一种检测试剂盒,所述检测试剂盒包含前述纳米金微球复合物。
本发明还提供一种免疫PCR检测方法,所述免疫PCR检测方法包含如下步骤:
I)将样品与偶联有和样品特异性结合的抗体的磁珠混合,清洗后分离磁珠;
II)将前述纳米金微球复合物与步骤I)中清洗后分离的磁珠混合,清洗后分离磁珠;
III)对步骤II)中分离的磁珠,进行荧光定量PCR扩增,通过荧光信号检测样品的含量。
在一些具体实施方式中,步骤I)中所述偶联有和样品特异性结合的抗体的磁珠通过如下方式制备:
1)将交联剂和磁珠混合,活化磁珠,清洗去除多余的交联剂;
2)将和样品特异性结合的抗体和步骤1)中活化的磁珠混合,获得负载抗体的磁珠,清洗未负载的多余抗体;
3)步骤2)中负载抗体的磁珠,加入封闭液封闭,获得所述偶联有和样品特异性结合的抗体的磁珠。
在一些具体实施方式中,步骤1)中所述交联剂选自EDC(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺)、DMTMM(4-(4,6-二甲氧基-1,3,5,-三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐水合物)、MMTM(4-(4,6-二甲氧基-1,3,5,-三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐水合物)或CDI(N,N'-羰基二咪唑)。
在一些具体实施方式中,步骤1)、步骤2)中所述清洗采用清洗缓冲液。更具体地,所述清洗缓冲液选自磷酸缓冲液、Tris-HCl(三(羟甲基)氨基甲烷盐酸盐)缓冲液、柠檬酸缓冲液,MES(吗啉乙磺酸)缓冲液、HEPES(N-2-羟乙基哌嗪-N'-2-乙磺酸)缓冲液、硼酸缓冲液或碳酸缓冲液。优选地,所述清洗缓冲液为MES缓冲液。
在一些具体实施方式中,以步骤II)中反应液的总体积为基准,步骤II)中所述纳米金微球复合物与所述步骤I)中清洗后分离的磁珠的质量比1:60-1:100。更具体地,所述质量比为1:60-1:70、1:70-1:80、1:80-1:90、或1:90-1:100。优选地,所述质量为1:70-1:90。
在一些具体实施方式中,步骤III)中荧光定量PCR中引物对的核苷酸序列如SEQID No.2:CGATGAAGCGGAATTACAAGC或SEQ ID No.3:CATCTTACGACGCAACTCTTCC所示。
在一些具体实施方式中,步骤III)中所述荧光定量PCR反应包含如下特征中的一种或多种:
a)预变性的温度为90-105℃;更具体地,所述预变性的温度为90-95℃、95-100℃或100-105℃;和/或,预变性的时间为1-5min;更具体地,所述预变性的时间为1-2min、2-3min、3-4min或4-5min;
b)变性的温度为90-100℃;更具体地,所述变性的温度为90-92℃、92-94℃、94-96℃、96-98℃或98-100℃;和/或,变性的时间为5-15s;更具体地,所述变性的时间为5-7s、7-9s、9-10s、10-11s、11-13s或13-15s;
c)退火、延伸的温度为50-70℃;更具体地,所述退火、延伸的温度为50-55℃、55-60℃、60-65℃或65-70℃;和/或,退火、延伸的时间为10-30s;更具体地,所述退火、延伸的时间为10-15s、15-20s、20-25s或25-30s;
4)扩增的循环数为30-50;更具体地,所述扩增的循环数为30-35、35-40、40-45或45-50。
本申请中,术语“DNA”是脱氧核糖核酸的常用缩写。它是核酸分子,即由核苷酸组成的聚合物。这些核苷酸通常是脱氧腺苷单磷酸、脱氧胸苷单磷酸、脱氧鸟苷单磷酸和脱氧胞苷单磷酸单体,它们本身由糖部分(脱氧核糖)、碱基部分和磷酸部分组成,并通过特征性的骨架结构聚合。通常,骨架结构由第一核苷酸的糖部分即脱氧核糖和第二相邻单体的磷酸部分之间的磷酸二酯键形成。单体的特定顺序,即与糖/磷酸骨架相连的碱基的顺序,被称为DNA序列。DNA可以是单链或双链的。在双链形式中,第一链的核苷酸通常与第二链的核苷酸杂交,例如通过A/T碱基配对和G/C碱基配对杂交。
以下通过特定的具体实例说明本发明的实施方式,本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本发明的其他优点与功效。本发明还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用,本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用,在没有背离本发明的精神下进行各种修饰或改变。
在进一步描述本发明具体实施方式之前,应理解,本发明的保护范围不局限于下述特定的具体实施方案;还应当理解,本发明实施例中使用的术语是为了描述特定的具体实施方案,而不是为了限制本发明的保护范围;在本发明说明书和权利要求书中,除非文中另外明确指出,单数形式“一个”、“一”和“这个”包括复数形式。
当实施例给出数值范围时,应理解,除非本发明另有说明,每个数值范围的两个端点以及两个端点之间任何一个数值均可选用。除非另外定义,本发明中使用的所有技术和科学术语与本技术领域技术人员通常理解的意义相同。除实施例中使用的具体方法、设备、材料外,根据本技术领域的技术人员对现有技术的掌握及本发明的记载,还可以使用与本发明实施例中所述的方法、设备、材料相似或等同的现有技术的任何方法、设备和材料来实现本发明。
实施例1 纳米金微球复合物在免疫PCR中的应用
一种使用纳米金微球复合物试剂盒的制备:
偶联有抗体的磁珠(FB-PCT Ab A)制备:
洗涤FB(即磁珠):于2ml无菌离心管中,加入10ul 100mg/ml的FB,再加入100ulpH5.0MES缓冲液,振荡混匀,并磁分离(磁力架上静置2min,移除全部液体),如此重复洗涤2次;
活化FB:于上述离心管中,加入100ul 1mg/ml EDC(MES溶解),37度孵育30min后,用MES洗涤2次,并磁分离;
包被Ab:于上述离心管中,加入100ul 600ug/ml PCT Ab A(MES稀释),37度孵育5h后,用MES洗涤2次,并磁分离;
封闭FB:于上述离心管中,加入200ul封闭液(pH7.0 PBS+1%BSA),37度孵育1h后,用清洗液(即PBST,pH7.0 PBS+0.05%Tw20)洗涤2次,并磁分离;
储存FB:于上述离心管中,加入1ml储存液(PBST+1%BSA+0.02%NaN3),FB-PCT AbA的终浓度为1mg/ml,于2-8度存放。
纳米金微球复合物(PCT Ab B-Au-SA-Bio-ssDNA)的制备:
制备Au-SA(纳米金偶联链霉亲和素):于2ml无菌离心管中,加入100ul 50ug/mlAu(20nm),加入10ul 10mg/ml DMTMM(MES溶解),加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Ab-Au-SA(纳米金偶联链霉亲和素和抗体):于上述离心管中,加入100ul70ug/ml PCT Ab B(MES稀释),37度孵育1h后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Ab-Au-SA-Bio-ssDNA(纳米金微球复合物):于上述离心管中,加入100ul0.01pmol/ml Bio-ssDNA(生物素修饰的寡核苷酸)(PBS稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul清洗液洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;
封闭:于上述离心管中,加入100ul封闭液,37度孵育1h后,加100ul清洗液洗涤Au,离心去上清,重复洗涤2次;
储存:于上述离心管中,加入100ul储存液,PCT Ab B-Au-SA-Bio-ssDNA(纳米金微球复合物)的终浓度为50ug/ml,于2-8度存放。
应用本免疫PCR技术检测PCT Ag(降钙素原抗原):
偶联抗体的磁珠与纳米金微球复合物的结合方式如图1所示。使用偶联抗体的磁珠与纳米金微球复合物的免疫PCR技术检测具体方法如下:
步骤1:于5个1.5ml离心管中,分别加入2ul FB-PCT Ab A(1mg/ml),加入100ul不同浓度的PCT Ag(0pg/ml,0.024pg/ml,2.4pg/ml,240pg/ml,2400pg/ml),37度孵育30min后,磁分离,加入200ul清洗液,振荡混匀5s,磁分离,如此重复洗涤磁珠2次;
步骤2:于上述离心管中,分别加入100ul PCT Ab B-Au-SA-Bio-ssDNA(1:200,PBST稀释),37度孵育30min后,用清洗液洗涤磁珠3次,磁分离,加入10ul无酶水重悬;
步骤3:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共15ul,再加入上述重悬液10ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环;
结果如图3所示,图3数据整理如表1:上述结果表明使用偶联抗体的磁珠与纳米金微球复合物的免疫PCR技术检测的检测灵敏度可至0.024pg/ml,即24fg/ml。
表1
PCT浓度 |
Ct |
24000pg/ml |
18.66 |
240pg/ml |
23.64 |
2.4pg/ml |
29.31 |
0.024pg/ml |
35.5 |
0 |
N/A |
实施例2 不同DNA连接方式的纳米金微球复合物的检测对比
采用两种方法制备DNA-Au,并检测比较其DNA的标记量和其与磁珠的非特异性反应情况:
制备Au-SA-Bio-ssDNA步骤:
制备Au-SA:于2ml无菌离心管中,加入100ul 50ug/ml Au(20nm),加入10ul 10mg/ml DMTMM(MES溶解),加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,加入100ul 0.01pmol/ml Bio-ssDNA(PBS稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS(Tris-HCl盐溶液)重悬后于4度保存;
制备Au-S-ssDNA(纳米金偶联巯基单链DNA,结构如图2所示)步骤:
活化SH-ssDNA:于2ml无菌离心管中,取10ul 10uM DNA,加入90ul无酶水,加入1ul20mM TCEP(三(2-羧乙基)膦盐酸盐),室温反应2h;
制备Au-S-ssDNA:于2ml无菌离心管中,加入100ul 50ug/ml Au(20nm),用3ul10mM NaOH调节pH至pH9.0,加入加入1ul 1pmol/ml活化的SH-ssDNA,37度孵育1h后,加入无酶水300ul,加入20ul 0.2M pH7.1的PB,放置于4度,24h内分6次加入2M NaCl,每次4ul;12000g离心10min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS重悬后于4度保存;
用PCR法检测DNA-Au的DNA标记量:
步骤:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共18ul,再加入重悬液2ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,结果如表2所示;
用PCR法检测DNA-Au与磁珠的非特异性反应:
步骤1:于1.5ml离心管中,分别加入5ul磁珠(1mg/ml),加入100ul DNA-Au(1:100,无酶水稀释),37度孵育30min后,用无酶水洗涤磁珠3次,磁分离;加入10ul无酶水重悬磁珠;
步骤2:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共15ul,再加入上述重重悬液10ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,结果如表3所示;
表2
表3
反应浓度(1:100) |
Au-S-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
检测样本量(5ug) |
磁珠 |
磁珠 |
编号 |
Ct |
Ct |
1 |
24.58 |
29.62 |
2 |
25.01 |
29.15 |
AVE CT |
24.795 |
29.385 |
从表2的结果可以看出,Au-SA-Bio-ssDNA的DNA标记量比直连法制备的Au-S-ssDNA的要高即Au-SA-Bio-ssDNA组的ct值比Au-S-ssDNA的ct值小,而表3的结果表明,就磁珠-Ab的非特异性反应,Au-SA-Bio-ssDNA也比Au-S-ssDNA的低,说明前者的DNA标记效果明显优于后者,所以选择Au-SA-Bio-ssDNA的制备方法。
实施例3 纳米金微球复合物中金微球粒径的筛选
别选择10nm,20nm,40nm三种规格的纳米金制备Au-SA-Bio-DNA,并检测比较DNA标记量:
制备10nm Au-SA-Bio-ssDNA步骤:
制备Au-SA:于2ml无菌离心管中,分别加入100ul 50ug/ml Au(10nm),加入10ul10mg/ml DMTMM(MES溶解),再分别加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,10000g离心8min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,加入100ul 0.01pmol/ml Bio-DNA(PBS稀释),37度孵育30min后,10000g离心8min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS重悬后于4度保存;
制备20nm Au-SA-Bio-ssDNA步骤:
制备Au-SA:于2ml无菌离心管中,分别加入100ul 50ug/ml Au(20nm),加入10ul10mg/ml DMTMM(MES溶解),再分别加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,加入100ul 0.01pmol/ml Bio-DNA(PBS稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS重悬后于4度保存;
制备40nm Au-SA-Bio-ssDNA步骤:
制备Au-SA:于2ml无菌离心管中,分别加入100ul 50ug/ml Au(40nm),加入10ul10mg/ml DMTMM(MES溶解),再分别加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,15000g离心20min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,加入100ul 0.01pmol/ml Bio-DNA(PBS稀释),37度孵育30min后,15000g离心20min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS重悬后于4度保存;
不同大小的纳米金离心时间需不同,离心时间不够其沉淀易分散,离心时间过长易出现死金;
用PCR法检测DNA-Au的DNA标记量:
步骤:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共18ul,再加入重悬液2ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,结果如表4所示;
表4
Au大小 |
10nm |
20nm |
40nm |
检测样本量(2ul) |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
编号 |
Ct |
Ct |
Ct |
1 |
11.78 |
12.24 |
13.52 |
2 |
11.53 |
12.06 |
13.27 |
AVE CT |
11.655 |
12.15 |
13.395 |
从表4的结果可见,纳米金越小,DNA的标记量越高一些,考虑是纳米金越小,其比表面积越大,结合的DNA量会相对越多,但纳米金越小,离心沉淀需要的离心力越高,离心时间越长,增加了制备时间和难度,综合考虑选择20nm的Au会比较适用
实施例4 纳米金微球复合物中亲和素条件的筛选
分别选择用3.5ug,7ug,10.5ug三种量的SA制备Au-SA-Bio-DNA,并检测比较DNA标记量:
制备Au-SA:于3个2ml无菌离心管中,分别加入100ul 50ug/ml Au(20nm),加入10ul 10mg/ml DMTMM(MES溶解),再分别加入70ug/ml SA(MES稀释)50ul、100ul、150ul,37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,加入100ul 0.01pmol/ml Bio-DNA(PBS稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS重悬后于4度保存;
用PCR法检测DNA-Au的DNA标记量:
步骤:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共18ul,再加入重悬液2ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,其结果表5所示;
表5
SA标记量 |
3.5ug |
7ug |
10.5ug |
检测样本量(2ul) |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
编号 |
Ct |
Ct |
Ct |
1 |
14.43 |
12.24 |
11.82 |
2 |
14.96 |
12.18 |
12.12 |
AVE CT |
14.695 |
12.15 |
11.97 |
从表5的结果可见,7ug SA的DNA标记量比3.5ug的有明显提高,但是再提高SA的标记量至10.5ug时,Ct值提高就不明显了,所以综合考虑选择SA的标记量为7ug。
实施例5 纳米金微球复合物中多肽条件的筛选
分别选择用3.5ug,7ug,10.5ug三种量的PCT Ab B制备Ab-Au-SA-Bio-DNA,并检测比较DNA标记量和Ab标记量:
制备Ab-Au-SA-Bio-ssDNA步骤:
制备Au-SA:于3个2ml无菌离心管中,加入100ul 50ug/ml Au(20nm),加入10ul10mg/ml DMTMM(MES溶解),加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Ab-Au-SA:于上述离心管中,分别加入70ug/ml PCT Ab B(MES稀释)50ul、100ul、150ul,37度孵育1h后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Ab-Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,加入100ul 0.01pmol/ml Bio-ssDNA(PBS稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次,加100ul PBS重悬;
用PCR法检测DNA-Au的DNA标记量:
步骤:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共18ul,再加入重悬液2ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,结果如表6所示;
表6
将制备好的Ab-Au-SA-Bio-ssDNA与羊抗鼠-吖啶酯反应,用化学发光法检测Ab标记量:
步骤:于1.5ml离心管中,分别加入2ul Ab-Au-SA-Bio-ssDNA(50ug/ml),加入100ul羊抗鼠-吖啶酯(1:1000,0.5mg/ml,PBST稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,用PBST洗涤3次,离心去上清;加入100ul PBST重悬,上化学发光仪检测信号,结果如表7所示;
表7
Ab标记量 |
3.5ug |
7ug |
10.5ug |
检测样本量(2ul) |
Ab-Au-SA-Bio-ssDNA |
Ab-Au-SA-Bio-ssDNA |
Ab-Au-SA-Bio-ssDNA |
编号 |
发光信号 |
发光信号 |
发光信号 |
1 |
612543 |
1028664 |
1112573 |
2 |
633259 |
1035463 |
1145218 |
AVE CT |
622901 |
1032063 |
1128895 |
从表6结果可见,抗体的标记量多少并不影响SA与Bio-ssDNA的反应,因此DNA的CT值基本一致。
从表7结果可见,7ug Ab的发光信号比3.5ug的有明显提高,但是再提高Ab的标记量至10.5ug时,发光信号提高就不明显了,所以综合考虑选择Ab的标记量为7ug。
实施例6 纳米金微球复合物中生物素修饰的寡核苷酸条件的筛选
分别选择用0.01pmol,0.001pmol,0.0001pmol三种量的Bio-ssDNA制备Au-SA-Bio-DNA,并检测比较DNA标记量和与磁珠的非特异性反应情况:
制备Au-SA-Bio-ssDNA步骤:
制备Au-SA:于3个2ml无菌离心管中,加入100ul 50ug/ml Au(20nm),加入10ul10mg/ml DMTMM(MES溶解),加入100ul 70ug/ml SA(MES稀释),37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul MES洗涤Au,离心去上清;
制备Au-SA-Bio-ssDNA:于上述离心管中,分别加入0.1pmol/ml、0.01pmol/ml、0.001pmol/ml Bio-ssDNA(PBS稀释)各100ul,37度孵育30min后,12000g离心10min,去上清,加100ul PBS洗涤Au,离心去上清,重复洗涤3次;加100ul TBS重悬后于4度保存;
用PCR法检测DNA-Au的DNA标记量:
步骤:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共18ul,再加入重悬液2ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,结果如表8所示。
用PCR法检测DNA-Au与磁珠的非特异性反应:
步骤1:于1.5ml离心管中,分别加入5ul磁珠(1mg/ml),加入100ul DNA-Au(1:100,无酶水稀释),37度孵育30min后,用无酶水洗涤磁珠3次,磁分离;加入10ul无酶水重悬磁珠;
步骤2:于PCR管中,加入PCR反应预混液和引物对共15ul,再加入上述重重悬液10ul,放入实时荧光定量PCR分析仪中,进行扩增检测,扩增条件是:95度3分钟;95度10秒,60度15秒,共40个循环,结果如表9所示。
表8
Bio-ssDNA反应量 |
0.01pmol |
0.001pmol |
0.0001pmol |
检测样本量(2ul) |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
编号 |
Ct |
Ct |
Ct |
1 |
10.90 |
11.84 |
15.65 |
2 |
10.93 |
11.99 |
15.15 |
AVE CT |
10.915 |
11.915 |
15.4 |
表9
Bio-ssDNA反应量 |
0.01pmol |
0.001pmol |
0.0001pmol |
反应浓度(1:100) |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
Au-SA-Bio-ssDNA |
检测样本量(5ug) |
磁珠 |
磁珠 |
磁珠 |
编号 |
Ct |
Ct |
Ct |
1 |
25.66 |
29.39 |
30.11 |
2 |
25.89 |
29.15 |
30.00 |
AVE |
25.775 |
29.27 |
30.055 |
从表8、表9可见,表9显示的是Au-SA-Bio-ssDNA与磁珠的非特异性反应结果,从结果看Bio-ssDNA的反应量过高会导致非特异性结果的升高即高反应量Bio-ssDNA的ct值相较真实值(可理解为相较于0.01pmol、0.001pmol、0.0001pmol Bio-ssDNA反应量的平均值)偏小;表8是Au-SA-Bio-ssDNA上DNA量的测试结果,从结果看Bio-ssDNA的反应量过低会导致DNA的标记量显著下降即低反应量Bio-ssDNA的ct值相较真实值偏大,所以综合考虑两者的情况,Bio-ssDNA的反应量选择0.001pmol。
以上的实施例是为了说明本发明公开的实施方案,并不能理解为对本发明的限制。此外,本文所列出的各种修改以及发明中方法的变化,在不脱离本发明的范围和精神的前提下对本领域内的技术人员来说是显而易见的。虽然已结合本发明的多种具体优选实施例对本发明进行了具体的描述,但应当理解,本发明不应仅限于这些具体实施例。事实上,各种如上所述的对本领域内的技术人员来说显而易见的修改来获取发明都应包括在本发明的范围内。