CN117264028A - 一种重组vsv载体、重组vsv病毒及其制备方法和应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种重组VSV载体、重组VSV病毒及其制备方法和应用。本发明将编码缺失53个氨基酸的CCHFV GPC序列的核酸片段和报告基因同时插入到VSV载体质粒中,拯救了获得同时表达CCHFV GPC和EGFP的重组病毒。该重组VSV病毒可复制到较高滴度,感染细胞后发生多轮的复制,灵敏度高,可高效快速地评价针对CCHFV包膜糖蛋白GPC的中和抗体效价、疫苗免疫效果、CCHFV入侵机制研究以及应用于CCHFV单轮感染假病毒颗粒的高效包装。由于包含报告基因,可以更灵敏、便捷、直观、高效的检测假病毒的感染情况,有利于开展高通量研究工作,大大降低了成本。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种重组VSV载体、重组VSV病毒及其制备方法和应用。
背景技术
克里米亚-刚果出血热病毒(Crimean-Congo hemorrhagic fever virus,CCHFV),又称新疆出血热病毒,属于布尼亚病毒目(Bunyavirales)、内罗病毒科(Nairoviridae)、正内罗病毒属(Orthonairovirus),是一种分节段有囊膜的负链RNA病毒。基因组分为3个节段分别为S、M和L,分别编码病毒核衣壳蛋白、包膜糖蛋白和RNA依赖的RNA聚合酶。CCHFV感染所引发的克里米亚-刚果出血热(Crimean-Congo hemorrhagic fever,CCHF)是流行于中国、俄罗斯、欧洲、中东以及非洲的一种烈性、高致病性和高传播性的传染病,其临床症状为发热、多器官出血、坏死和功能衰竭,病死率极高,一般在30%-50%,最高可达80%。目前针对CCHFV尚没有特效药物和预防疫苗。
CCHFV属于生物安全三级的病毒,CCHFV所有活病毒的操作需要在三级的生物安全实验室完成,严重限制了对CCHFV的研究。因此,建立一种能够在生物安全二级实验室进出操作的病毒模型,用于高效快速的评价针对CCHFV的中和抗体、疫苗免疫效果以及入侵抑制剂和入侵相关机制的研究,具有重大意义。
假病毒系统在一定程度可以模拟真病毒的入侵过程。现有研究已经建立了能够在生物安全二级实验室进行操作的CCHFV假病毒模型系统,例如包装CCHFV包膜糖蛋白GPC的水疱性口炎病毒(Vesicular stomatitis virus,VSV)单轮感染假病毒系统和可复制型假病毒系统。然而,目前还没有同时将CCHFV包膜糖蛋白GPC的序列和含有EGFP或者其他报告基因的序列同时插入到VSV病毒载体中成功拯救病毒的报道。
发明内容
有鉴于此,本发明提供了一种重组VSV载体、重组VSV病毒及其制备方法和应用。本发明制备得到的表达CCHFV GPC和报告基因的重组病毒可用于针对CCHFV的中和抗体效价、疫苗免疫效果的评价、CCHFV入侵机制的研究、作为预防CCHFV感染的候选疫苗,也可应用于包装高效的单轮感染CCHFV假病毒颗粒。
为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体,其在野生型CCHFV包膜糖蛋白GPC的序列中缺失C端末尾53个氨基酸,且包含R516K或L518V单点突变;
所述野生型CCHFV包膜糖蛋白GPC的氨基酸序列如SEQ ID NO.23所示。
本发明还提供了编码CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的核酸片段,包括:
i)、编码权利要求1所述的CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的核酸片段;和/或
ii)、编码SEQ ID NO.2所示氨基酸序列的核酸片段。
本发明中编码CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的核酸片段经过密码子优化,其序列为:
I)、如SEQ ID NO:1所示的序列;或
II)、SEQ ID NO:1所示的序列中第1547位碱基由G突变为A获得的序列;
III)、SEQ ID NO:1所示的序列中第1552位碱基由C突变为G获得的序列;
IV)、在I)、II)或III)所示的核苷酸序列中取代、缺失或添加一个或多个碱基获得的核苷酸序列,且编码的蛋白功能相同或相似的核苷酸序列;或
V)、与I)~IV)任一项所述序列至少有90%同源性的序列。
其中,缺失C端末尾53个氨基酸的CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的氨基酸序列如SEQID NO.2所示,其编码基因经密码子优化,优化后的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
缺失C端末尾53个氨基酸,且包含R516K单点突变氨基酸序列的突变体,其编码基因的核酸序列经密码子优化,优化后的序列为SEQ ID NO:1(缺失C端末尾53个氨基酸的突变体)所示的序列中第1552位碱基由C突变为G获得的序列。
缺失C端末尾53个氨基酸,且包含L518V单点突变氨基酸序列的突变体,其编码基因的核酸序列优化后的序列为:在SEQ ID NO:1所示的序列中第1547位碱基由G突变为A获得的序列。
本发明还提供了重组VSV载体,包括:VSV载体质粒、本发明所述的编码CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的核酸片段和目的基因;
所述VSV载体质粒为包含VSV基因组序列且编码VSV包膜糖蛋白的G基因缺失的质粒。
一些实施方案中,所述目的基因为报告基因;所述报告基因为GFP、EGFP、mCherry、RFP、YFP、mNeonGreen、TurboGFP、mGreenLantern、ZsGreen、mKate2、NanoLuc luciferase、Firefly luciferase、Gaussia luciferase、Renilla luciferase等。
一些具体实施例中,所述目的基因为报道基因EGFP。本发明将编码缺失53个氨基酸的CCHFV GPC突变体的核酸片段和报告基因同时插入到VSV载体质粒中,拯救了获得同时表达CCHFV GPC和EGFP的重组病毒。该重组VSV病毒可复制到较高滴度,感染细胞后发生多轮的复制,灵敏度高,在BHK-21细胞和Vero E6细上的滴度最高分别达到107PFU/mL、106PFU/mL,可高效快速地评价针对CCHFV包膜糖蛋白GPC的中和抗体效果、疫苗免疫效果以及CCHFV入侵机制的研究。由于包含报告基因,有利于开展高通量研究工作,如筛选CCHFV感染相关的宿主因子、筛选入侵的抑制剂。
所述目的基因为抗原蛋白基因;所述抗原蛋白基因包括编码病毒抗原、肿瘤抗原或表达宿主与病原微生物抗原的基因。
本发明中,所述编码CCHFV包膜糖蛋白GPC的核酸片段为:
核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的核酸片段,或在SEQ ID NO.1所示序列中取代、缺失或添加一个或多个核苷酸,且编码的蛋白功能相同或相似的核酸片段,或与SEQ IDNO.1所示序列具有至少90%同源性且编码SEQ ID NO.2所示氨基酸序列的GPC蛋白的核酸片段。
本发明中,编码C末端缺失53个氨基酸GPC的核酸片段的扩增引物包括:上游引物pC-CCHFV-GPC-F(序列如SEQ ID NO.3)下游引物pC-CCHFV-GPC-R(序列如SEQ ID NO.4)。
本发明中,所述VSV载体质粒为包含VSV基因组序列且编码VSV包膜糖蛋白的G基因缺失的质粒的载体质粒。一些实施方案中,所述VSV载体质粒的骨架为pBlueScript系列载体、pSMART系列载体或细菌人工染色体BAC系列载体等。
本发明中,所述报告基因为GFP、EGFP、mCherry、RFP、YFP、mNeonGreen、TurboGFP、mGreenLantern、ZsGreen、mKate2、NanoLuc luciferase、Firefly luciferase、Gaussialuciferase、Renilla luciferase等。一些具体实施例中,所述报告基因为EGFP。
本发明还提供一种水疱性口炎病毒VSV的可复制型假病毒系统,包括本发明所述的重组病毒质粒、包含VSV病毒N、P、L、G基因的辅助质粒以及包装细胞。
本发明中,所述包含VSV病毒N、P、L、G基因的辅助质粒包括辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4,分别表达N、P、L、G蛋白。一些实施方案中,所述重组病毒质粒和辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4的质量比为10:(2-8):(3-6.5):(1-3):(1-8)。一些具体实施例中,所述比例具体为10:3:3:3:3,10:5:4:2:1、10:5:3:1:2、10:2:6.5:1.25:2、10:2.5:6.5:1.25:2、10:8:4:1:8,优选为10:3:3:3:3。
本发明中,所述包装细胞为表达T7 RNA聚合酶的293T细胞。
本发明还提供一种重组VSV病毒,由本发明所述的重组病毒质粒经包装细胞包装而成。
一些实施方案中,所述包装细胞为表达T7 RNA聚合酶的293T细胞。
本发明还提供了所述的重组VSV病毒的制备方法,包括:
将本发明所述的重组VSV载体(命名为pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53)、分别包含VSV病毒N基因、P基因、L基因、G基因的辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4共转染表达T7 RNA聚合酶的宿主细胞,收集上清,传代,获得重组VSV病毒。
所述重组病毒质粒和辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4的质量比为10:3:3:3:3。
一些实施方案中,辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4分别包含VSV病毒N、P、L、G基因的开放阅读框全长序列,引物序列如SEQ ID NO.5到SEQ ID NO.12所示。
所述宿主细胞为表达T7 RNA聚合酶的293T细胞;待宿主细胞培养至80%-90%汇合度进行所述共转染。
所述传代用的细胞系为BHK-21,传代次数为2~3次。
本发明中,在所述传代的同时还包括加入抗VSV G蛋白的中和抗体步骤,用于中和含G蛋白的VSV病毒。
进一步的,一些实施方案中,本发明提供的重组VSV重组病毒的构建过程具体包括如下步骤:
(1)pC-CCHFV-GPCΔ53质粒的构建
以密码子优化合成的GPC核苷酸序列为模版,设计引物pC-CCHFV-GPC-F和pC-CCHFV-GPC-R通过PCR扩增有C末端缺失53个氨基酸的GPC,然后与经限制性内切VSV基因组载体酶EcoR I和Xho I双酶切后的pCAGGS载体连接,构建获得C末端缺失53个氨基酸的GPC表达质粒pC-CCHFV-GPCΔ53;所述质粒的包膜糖蛋白GPC的核苷酸序列和氨基酸序列如SEQID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
(2)重组质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G质粒的构建
以pBlue-VSV-GFP质粒为模版,设计引物pC-VSV-N-F、pC-VSV-N-R、pC-VSV-P-F、pC-VSV-P-R、pC-VSV-L-F、pC-VSV-L-R、pC-VSV-G-F、pC-VSV-G-R分别扩增VSV的N、P、L和G基因的开放阅读框,然后与经限制性内切酶EcoR I和Xho I双酶切后的pCAGGS载体连接,构建获得VSV的N、P、L和G表达质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G。
(3)重组质粒pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53质粒的构建
以pC-CCHFV-GPCΔ53质粒为模版,设计引物pBlue-VSV-GPC-F和pBlue-VSV-GPC-R,扩增目的片段CCHFV-GPCΔ53片段,然后与经限制性内切酶Mlu I和Xho I双酶切后的pBlue-VSV-GFP质粒相连接,构建获得了缺失VSV G基因表达CCHFV-GPCΔ53片段的重组质粒pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53;
(4)VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒的拯救
表达T7 RNA聚合酶的293T-T7细胞培养至80%-90%汇合度时,通过磷酸钙转染的方法,将重组质粒pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53和辅助质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G共同转染293T-T7细胞,转染48小时后收集上清,在BHK-21连续传代3次,传代同时加入抗VSV G蛋白的中和抗体,最终获得重组VSV病毒同时表达CCHFV GPC和报告基因EGFP的报告病毒,命名为VSV-CCHFV-GFP。
进一步的,步骤(1)中所述引物pC-CCHFV-GPC-F和pC-CCHFV-GPC-R基因序列如SEQID NO.3和SEQ ID NO.4所示。
进一步的,步骤(2)中所述引物pC-VSV-N-F、pC-VSV-N-R、pC-VSV-P-F、pC-VSV-P-R、pC-VSV-L-F、pC-VSV-L-R、pC-VSV-G-F、pC-VSV-G-R的序列分别如SEQ ID NO.5~SEQ IDNO.12所示。
进一步的,步骤(3)中所述引物pBlue-rVSV-GPC-F和pBlue-rVSV-GPC-R序列如SEQID NO.13和SEQ ID NO.14所示。
本发明还提供了所述的重组VSV载体、所述的可复制型假病毒系统、所述的重组VSV病毒或本发明制备方法制得的重组VSV病毒在如下至少一方面中的应用:
I)、在CCHFV中和抗体效价评估中的应用;
II)、在CCHFV入侵机制的研究中的应用;
III)、在制备CCHFV疫苗中的应用,或CCHFV疫苗免疫效果评价中的应用;
IV)、在CCHFV单轮感染假病毒颗粒包装中的应用。
本发明还提供一种CCHFV疫苗,包括本发明所述的重组VSV病毒、本发明制备方法制得的重组VSV病毒或本发明所述的重组VSV载体。
本发明还提供了由上述方法制备得到的基于VSV载体同时表达CCHFV GPC蛋白和EGFP蛋白的报告病毒VSV-CCHFV-GFP。
本发明还提供了上述制备的重组VSV病毒(简称VSV-CCHFV-GFP)在CCHFV的中和抗体效价评估、入侵机制研究以及在CCHFV单轮感染假病毒颗粒包装中的应用。
本发明将编码CCHFV包膜糖蛋白GPC截短序列的核酸片段和报告基因同时插入到VSV载体质粒中,拯救了获得同时表达CCHFV包膜糖蛋白GPC和报告基因(EGFP)的重组病毒。与现有技术相比,本发明具有如下优势:
1、相比单轮感染假病毒系统,本发明可复制型假病毒,可以复制到较高滴度,感染细胞后发生多轮的复制,灵敏度高,毒种准备容易,成本低;
2、相比现有的可复制型假病毒,除了表达包膜糖蛋白基因GPC,本发明重组VSV载体、重组VSV病毒还插入了表达EGFP的报告基因。报告基因的插入,可以更灵敏、便捷、直观、高效的检测假病毒的感染情况,降低成本。构建同时表达较大片段的包膜糖蛋白GPC和报告基因,难度加大,这是本专利的优势和与之前专利的不同之处。因为含有EGFP报告基因,可以通过荧光显微镜、流式细胞仪,高内涵扫描等仪器直观、迅速得判断病毒的感染情况。
3、相比现有的可复制型假病毒,表达包膜糖蛋白GPC的序列长度和编码基因的序列均不同。现有GPC蛋白的胞内段缺失14个氨基酸。本发明在胞内段缺失了GPC蛋白C末端53个氨基酸,并且对核苷酸序列进行了优化,最终明显提高了病毒滴定和拯救效率。
4、相比现有的可复制型假病毒,拯救方式不同。现有技术已公开的是依赖表达T7聚合酶的痘病毒的辅助完成拯救,而本发明是直接转染真核表达质粒,拯救方式更便利,不用后期纯化病毒,减少了痘病毒的污染发生。
5、拯救获得的VSV-CCHFV-GPC重组病毒的GPC蛋白,除含有初始设计的C端末尾53个氨基酸缺失和R516K突变,关键的点突变R516K可显著地提高包装单轮感染CCHFV假病毒颗粒效率,显著高于现有GPC蛋白的胞内段缺失14个氨基酸或含有L518V点突变。
附图说明
图1为pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53质粒的图谱;
图2为VSV-CCHFV-GFP重组病毒的鉴定:图2A为显示VSV-CCHFV-GFP测序突变位点R516K;图2B为VSV-CCHFV-GFP病毒和VSV-GFP病毒的噬斑形态;
图3为斑点形成实验(FFA)检测VSV-CCHFV-GFP病毒在BHK-21细胞和Vero E6细胞上的生长曲线;
图4为流式检测VSV-CCHFV-GFP病毒感染A549细胞后细胞表面Gc表达;
图5为用VSV-CCHFV-GFP感染测试不同来源细胞的敏感性:图5A为流式检测VSV-CCHFV-GFP感染不同来源细胞后的感染效率;图5B为荧光显微镜检测VSV-CCHFV-GFP感染不同来源细胞后的荧光图;
图6为不同抗体对VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP的中和效果评价:图6A为抗CCHFV-Gc和抗VSV-G中和抗体对VSV-CCHFV-GFP的中和曲线;图6B为抗CCHFV-Gc和抗VSV-G中和抗体对VSV-GFP的中和曲线;图6C为抗体对VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP的中和效价IC50值;图6D为VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP在有和无抗CCHFV-Gc和抗VSV-G中和抗体下的荧光图;
图7为VSV-CCHFV-GFP用于研究硫酸乙酰肝素对入胞的影响:图7A为流式检测敲除B3GAT3和B4GALT7后细胞表面的硫酸乙酰肝素的表达;图7B流式检测VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP感染野生型或敲除B3GAT3或B4GALT7的A549细胞上的感染效率。
图8为VSV-CCHFV-GFP重组病毒的GPC蛋白用于单轮感染假病毒颗粒的包装:图8A为荧光显微镜下观察不同缺失或突变的CCHFV GPC蛋白包装的假病毒感染BHK-21效率;图8B为流式细胞术检测不同缺失或突变的CCHFV GPC蛋白包装的假病毒感染BHK-21效率。
具体实施方式
本发明提供了一种重组VSV载体、重组VSV病毒及其制备方法和应用。本领域技术人员可以借鉴本文内容,适当改进工艺参数实现。特别需要指出的是,所有类似的替换和改动对本领域技术人员来说是显而易见的,它们都被视为包括在本发明。本发明的方法及应用已经通过较佳实施例进行了描述,相关人员明显能在不脱离本发明内容、精神和范围内对本文的方法和应用进行改动或适当变更与组合,来实现和应用本发明技术。
本发明采用的试材皆为普通市售品,皆可于市场购得。
本发明中,经人源密码子优化后的CCHFV包膜糖蛋白GPC的基因全长为5055bp,将该序列克隆至质粒载体pUC57。然后以pUC57-GPC质粒为模版,构建包含C末端缺失53个氨基酸的GPC编码序列的表达质粒pC-CCHFV-GPCΔ53,在此基础上将CCHFV GPC(Δ53)片段克隆至pBlue-VSV-GFP质粒中,构建成pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53重组质粒。将该质粒与VSV辅助质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G共同转染至稳定表达T7 RNA聚合酶的293T-T7细胞,拯救出同时表达CCHFV包膜糖蛋白GPC和报告基因EGFP的重组VSV病毒。该报告病毒可用于针对CCHFV包膜糖蛋白GPC的中和抗体效价和疫苗免疫效果的评价、CCHFV入侵机制的研究、作为预防CCHFV感染的候选疫苗,也可应用于包装高效的单轮感染CCHFV假病毒颗粒。
本发明采用的产品和材料来源如下:
大肠杆菌Stbl3感受态和磷酸钙转染试剂购自赛默飞世尔科技有限公司;pUC57-CCHFV-GPC质粒由南京金斯瑞公司合成;pCAGGS载体购自Addgene;pBlue-VSV-GFP质粒是以pBlueScript为骨架按照本领域常规技术手段插入VSV基因组全长序列和GFP序列获得;稳定表达T7 RNA聚合酶的293T-T7细胞由本课题组之前构建并保存;VSV-GFP病毒和VSV(ΔG)/G单轮感染病毒颗粒病毒由本课题组制备并保存,抗CCHFV-Gc和抗VSV-G中和抗体由本课题组制备并保存;抗体mouse-anti-HS monoclonal antibody购自USBio公司;抗体goat-anti-mouse IgM conjugated with Alexa Fluor 647和goat-anti-human IgGconjugated withAlexa Fluor 647购自赛默飞世尔科技有限公司;本发明使用的限制性内切酶和Next Ultra IIQ5高保真DNA聚合酶购自NEB生物技术有限公司;MUL组装克隆试剂盒购自上海朗晶生物技术公司。
下面结合实施例,进一步阐述本发明:
实施例1基于水疱性口炎病毒(VSV)载体的克里米亚-刚果出血热病毒(CCHFV)荧光报告病毒的制备
(1)pC-CCHFV-GPCΔ53质粒的构建
本实验所使用的CCHFV包膜糖蛋白GPC为CCHFV IbAr10200毒株的包膜糖蛋白GPC(NP_950235)。经人源密码子优化后由南京金斯瑞公司进行合成,克隆进质粒pUC57,得到质粒pUC57-CCHFV-GPC。然后以质粒pUC57-CCHFV-GPC为模版,设计相应引物扩增有C末端缺失53个氨基酸的GPC,具体包括如下引物:
上游引物pC-CCHFV-GPC-F(序列如SEQ ID NO.3)下游引物pC-CCHFV-GPC-R(序列如SEQ ID NO.4)
SEQ ID NO.3:
GTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCGCCACCATGCACATCTCCCT GATGTACGCCATC
SEQ ID NO.4:
AGGGAAAAAGATCTGCTAGCTCGAGTCAGCCTCTGGTCCGTCTGCA GCACTTGAAAC
利用Next Ultra IIQ5 DNA聚合酶扩增有C末端缺失53个氨基酸的GPC片段,PCR反应体系如下:模版(pUC57-CCHFV-GPC)10ng,上游引物pC-CCHFV-GPC-F和下游引物各2μL,酶25μL,加水至50μL,反应条件为:98℃ 30s,(98℃ 10s、58℃ 30s、72℃ 3min 30s)32个循环,72℃ 10min,4℃一直保存。
PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后,通过胶回收试剂盒回收目的条带。
质粒pCAGGS用限制性内切酶EcoR I和Xho I进行双酶切,酶切体系如下:pCAGGS 3μg,EcoR I 2μL和Xho I 2μL,10xBuffer 5μL,加水补至50μL,37℃酶切3h,酶切产物经经琼脂糖凝胶电泳后,通过胶回收试剂盒回收目的条带。
上述扩增回收的PCR片段和双酶切的载体通过同源重组的方式进行连接,连接体系为pCAGGS 50ng,PCR产物50ng,MUL enzyme 5μL,总体积为10μL;连接条件为50℃ 1h。
取5μL连接产物加入大肠杆菌Stbl3感受态,混匀后冰浴25min,42℃热应激60s,冰浴90s,加入无抗生素的LB培养基800μL,置于摇床上震荡培养45min,离心后取少量LB重悬菌体,均匀涂布在氨苄抗性的LB平板上,将平板倒置培养。待菌落形成后,挑取单克隆菌落,接种于含有氨苄抗性的LB培养基中进行过夜摇菌,小提质粒后进行Sanger测序验证,获得质粒pC-CCHFV-GPCΔ53。
(2)重组质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G质粒的构建
以pBlue-VSV-GFP质粒为模版,设计引物pC-VSV-N-F、pC-VSV-N-R、pC-VSV-P-F、pC-VSV-P-R、pC-VSV-L-F、pC-VSV-L-R、pC-VSV-G-F、pC-VSV-G-R分别扩增VSV的N、P、L和G基因的开放阅读框,引物序列如SEQ ID NO.5到SEQ ID NO.12所示,具体的PCR反应体系及反应条件参考上述方法。
SEQ ID NO.5:
AGGGAAAAAGATCTGCTAGCTCGAGTCAGCCTCTGGTCCGTCT
GCAGCACTTGAAAC
SEQ ID NO.6:
AGGGAAAAAGATCTGCTAGCTCGAGTCATTTGTCAAATTCTG
ACTTAGCAT
SEQ ID NO.7:
GTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCGCCACCATGGATAATCTCA
CAAAAGTTCGTG
SEQ ID NO.8:
GAGGGAAAAAGATCTGCTAGCTCGAGCTACAGAGAATATTT
GACTCTCGCC
SEQ ID NO.9:
GTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCGCCACCATGGAAGTCCAC
GATTTTGAGACC
SEQ ID NO.10:
AGAGGGAAAAAGATCTGCTAGCTCGAGTTAATCTCTCCAAG
AGTTTTCCTCGTGTAGG
SEQ ID NO.11:
TTTTGGCAAAGAATTCGCCACCATGAAGTGCCTTTTGTACTTAG
SEQ ID NO.12:
GATCTGCTAGCTCGAGTTACTTTCCAAGTCGGTTCATCTC。
PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后,切胶回收目的片段,回收后的目的片段与经限制性内切酶EcoR I和Xho I双酶切后的pCAGGS载体连接,连接反应及后续的转化如前所述,经Sanger测序后获得VSV的N、P、L和G的表达质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G。
(3)pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53重组质粒的构建
以上述构建的pC-CCHFV-GPCΔ53质粒为模版,设计上游引物pBlue-VSV-GPC-F和下游引物pBlue-VSV-GPC-R,引物序列如SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14所示,扩增目的片段CCHFV-GPCΔ53片段,经胶回收后与经限制性内切酶Mlu I和Xho I双酶切后的pBlue-VSV-GFP质粒相连接,连接反应及后续的转化如前所述,经Sanger测序后获得重组质粒pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53(图1);
SEQ ID NO.13:
TAACAGAGATCGATCTGTTTACGCGTCACTATGCACATCTCCCTGAT GTACGCCATCCTGTG
SEQ ID NO.14:
GCTAGCGCGCAATTGCCTCGAGCGTGATATCTGTTAGTTTTTTTCAT ACCTAGCAGGATTTGAGTCAGCCTCTGGTCCGTCTGCAGCAC
2.VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒的拯救
将293T-T7细胞接种于10cm Dish中,待细胞汇合度达到80%-90%时,通过磷酸钙转染的方式将pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53质粒和辅助质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G,按最优化的质量比为10:3:3:3:3。转染16h后换液为10%FBS的DMEM,48h后收集上清。将上清在BHK-21细胞上连续传代三次,同时加入抗VSV-G的中和抗体,最终获得VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒,收获的上清保存于-80℃。
3.VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒的鉴定与特征
(1)Sanger测序鉴定VSV-CCHFV-GFP病毒。病毒提取RNA基因组后,通过RT-PCR扩增VSV-CCHFV-GFP病毒全基因组并送Sanger测序全长。测序结果显示,在CCHFV的GPC蛋白第1547位碱基由“G”突变为“A”,氨基酸序列则由第516位的“R”变为“K”,如图2A所示。在其余位置并没有发现核苷酸改变。
(2)结晶紫染色检测VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP病毒(表达绿色荧光蛋白EGFP的VSV病毒,由本课题组制备并保存,后续应用中作对照使用)的噬斑形态。
VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP病毒分别以10倍的梯度稀释感染Vero E6细胞,感染2h后加入1%的甲基纤维素,感染48h后用4%PFA固定细胞,PBS洗3次后用1%的结晶紫染色15min,再次洗掉结晶紫,观察病毒的噬斑形态,结果如图2B所示,VSV-CCHFV-GFP形成较小的针状噬斑形态,VSV-GFP形成大而圆的噬斑形态。
(3)测定VSV-CCHFV-GFP在BHK-21和Vero E6细胞上的生长曲线
VSV-CCHFV-GFP以MOI为0.01感染BHK-21和Vero E6细胞,分别在2h、6h、12h、24h、48h、60h和72h收集细胞上清,保存于-80℃。将Vero E6细胞接种于96孔板中,待细胞汇合度接近100%时,将上述收集的上清分别以10倍梯度稀释并感染Vero E6细胞,每个稀释度3个复孔,在37℃中感染2h,感染2h后加入1%的甲基纤维素,继续培养,48h后加入4%PFA固定细胞,PBS洗3次后用1%的结晶紫染色15min,再次洗掉结晶紫,记录96孔中的斑点数,计算病毒的每毫升中病毒的噬斑形成单位(Plaque-forming unitper milliliter,PFU/mL)。结果如图3所示,VSV-CCHFV-GFP在BHK-21细胞上的滴度最高可以达到107PFU/mL,在Vero E6细胞上的滴度最高可以达到106PFU/mL。
(4)检测VSV-CCHFV-GFP感染后细胞表面Gc的表达
VSV-CCHFV-GFP以MOI为0.01感染A549细胞,感染24h后用TrypLE消化细胞,用冰预冷的PBS洗细胞两次,用anti-CCHFV-Gc抗体作为一抗,用human IgG1 isotype Control抗体作为同型对照抗体,冰上孵育30min,孵育结束后预冷的PBS洗涤1次,加入goat-anti-human IgG conjugated withAlexa Fluor 647二抗,冰上继续孵育30min。孵育结束后预冷的PBS洗涤1次,加入2%PFA固定细胞10min,固定结束后用PBS继续洗涤细胞2次,使用1%FBS的PBS重悬细胞,通过流式检测Gc蛋白的表达。结果如图4所示,VSV-CCHFV-GFP感染的A549细胞表面可以表达正确构象的Gc蛋白。
4.VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒在筛查CCHFV易感细胞系中的应用
VSV-CCHFV-GFP以MOI为0.01分别感染A549细胞、Hela细胞、Huh7细胞、SW13细胞、293T细胞、Vero E6细胞、BHK-21细胞和MDCK细胞。感染20h后,荧光显微镜下观察GFP荧光,随后消化细胞,用2%PFA固定细胞10min,PBS洗涤细胞1次后,使用1%FBS的PBS重悬细胞,通过流式检测病毒感染效率。结果如图5所示,BHK-21细胞、Huh7细胞为CCHFV的高度易感细胞系;A549细胞、293T细胞和Vero E6细胞为CCHFV的中度易感细胞系,Hela细胞和MDCK细胞为CCHFV的低易感细胞系。
5.VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒在评估CCHFV中和抗体效价中的应用
将anti-CCHFV-Gc抗体和anti-VSV-G抗体以5倍的倍比稀释,然后分别和VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP病毒在37℃孵育1h,孵育结束后将孵育混合物加入到长满的A549细胞的96孔板中,在37℃中继续培养16h,16h后用荧光显微镜下观察GFP荧光,同时收集细胞,用2%PFA固定细胞10min,PBS洗涤细胞1次后,使用1%FBS的PBS重悬细胞,通过流式检测病毒感染效率,通过GraphPad Prism软件中的非线性回归计算抗体的IC50值。结果如图6所示,anti-CCHFV-Gc可以很好的中和VSV-CCHFV-GFP病毒而不能中和VSV-GFP病毒,而anti-VSV-G可以很好的中和VSV-GFP病毒而不能中和VSV-CCHFV-GFP病毒。
6.VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒在研究CCHFV入侵机制中的应用
用于研究基因BAGAT3或B4GALT7在硫酸乙酰肝素(heparan sulfate,HS)生成通路中发挥重要的调控作用。
利用CRISPR/Cas9技术,设计靶向BAGAT3和B4GALT7的sgRNA,构建敲除BAGAT3和B4GALT7的A549细胞。sgRNA序列如SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16所示。
SEQ ID NO.15:CCAGAGCCCATACCTGGCAT;
SEQ ID NO.16:CACTACAAGACCTATGTCGG。
sgRNA分别克隆到慢病毒载体lentiCRISPRv2(Addgene#52961),同慢病毒包装质粒psPAX2和pMD2G共转293T细胞,用包装好的慢病毒转导A549细胞,使用puromycin筛选7天获得敲除BAGAT3和B4GALT7的A549细胞。
将野生型、敲除BAGAT3或B4GALT7的A549细胞用TrypLE消化,随后用冰预冷的PBS洗细胞两次,用mouse-anti-HS monoclonal antibody抗体作为一抗,用mouse IgMisotype Control抗体作为同型对照抗体,冰上孵育30min,孵育结束后预冷的PBS洗涤1次,加入goat-anti-mouse IgM conjugated withAlexa Fluor 647二抗,冰上继续孵育30min。孵育结束后预冷的PBS洗涤2次,用1%FBS的PBS重悬细胞,通过流式检测细胞表面的HS表达。结果如图7A所示,敲除BAGAT3和B4GALT7的A549细胞表面的HS表达明显减少。
将VSV-CCHFV-GFP和VSV-GFP病毒分别以MOI为1感染野生型和敲除BAGAT3和B4GALT7的A549细胞,感染12h后收集细胞,用2%PFA固定细胞10min,PBS洗涤细胞1次后,使用1%FBS的PBS重悬细胞,通过流式检测病毒感染效率。结果如图7B所示,敲除BAGAT3和B4GALT7的A549细胞的VSV-CCHFV-GFP报告病毒的感染效率明显下降,而VSV-GFP病毒的感染效率没有变化,表明HS在CCHFV病毒入侵细胞过程中发挥重要作用,而VSV-CCHFV-GFP报告病毒可以方便快捷的应用于病毒入侵机制研究。
7.VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒的GPC蛋白在包装单轮感染病毒颗粒中的应用
获得的VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒GPC蛋白除了含有设计的C端末尾53个氨基酸缺失外,还存在第516位的“R”变为“K”突变。利用该特点,将GPC蛋白应用于包装出更高效的CCHFV单轮感染假病毒颗粒。
(1)CCHFV单轮感染假病毒颗粒质粒的构建(pC-CCHFV-GPCΔ14、pC-CCHFV-GPCΔ53-L518V、pC-CCHFV-GPCΔ53-R516K)
以质粒pUC57-CCHFV-GPC为模版,设计相应引物扩增有C末端缺失14个氨基酸的GPC,用以构建质粒pC-CCHFV-GPCΔ14。具体包括如下引物:
上游引物pC-CCHFV-GPCΔ14-F(序列如SEQ ID NO.17)下游引物pC-CCHFV-GPCΔ14-R(序列如SEQ ID NO.18)
SEQ ID NO.17:
GTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTCGCCACCATGCACATCTCCCTGA TGTACGCCATC。
SEQ ID NO.18:
AGGGAAAAAGATCTGCTAGCTCGAGTCAGTCGGCCAGTCTCTCCCC GTCCAGC。
以质粒pUC57-CCHFV-GPCΔ53为模版,设计相应突变引物构建含有L518V突变位点的质粒pC-CCHFV-GPCΔ53-L518V。具体包括如下引物:
上游引物pC-CCHFV-GPC-F(序列如SEQ ID NO.3)和下游引物pC-CCHFV-GPCΔ53-L518V-R(序列如SEQ ID NO.19)
SEQ ID NO.19:CAGACAGCACCCTTCTAGAGCCGGTGGAGGCCTTG。
上游引物pC-CCHFV-GPCΔ53-L518V-F(序列如SEQ ID NO.20)和下游引物pC-CCHFV-GPC-R(序列如SEQ ID NO.4)。
SEQ ID NO.20:CTCTAGAAGGGTGCTGTCTGAGGAACCCAGCGACG。
以质粒pUC57-CCHFV-GPCΔ53为模版,设计相应引物构建含有R516K突变位点的质粒pC-CCHFV-GPCΔ53-R516K。具体包括如下引物:
上游引物pC-CCHFV-GPC-F(序列如SEQ ID NO.3)和下游引物pC-CCHFV-GPCΔ53-R516K-R(序列如SEQ ID NO.21)。
SEQ ID NO.21:
CAGCAGCCTTTTAGAGCCGGTGGAGGCCTTGCCGAT。
上游引物pC-CCHFV-GPCΔ53-R516K-F(序列如SEQ ID NO.22)和下游引物pC-CCHFV-GPC-R(序列如SEQ ID NO.4)。
SEQ ID NO.22:
CACCGGCTCTAAAAGGCTGCTGTCTGAGGAACCCAG。
利用Next Ultra IIQ5 DNA聚合酶扩增GPC片段,PCR反应体系如下:模版10ng,上游引物和下游引物各2μL,酶25μL,加水至50μL,反应条件为:98℃ 30s,(98℃ 10s、58℃30s、72℃ 3min 30s)32个循环,72℃ 10min,4℃一直保存。
PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后,通过胶回收试剂盒回收目的条带。
质粒pCAGGS用限制性内切酶EcoR I和Xho I进行双酶切,酶切体系如下:pCAGGS 3μg,EcoR I 2μL和Xho I 2μL,10xBuffer 5μL,加水补至50μL,37℃酶切3h,酶切产物经经琼脂糖凝胶电泳后,通过胶回收试剂盒回收目的条带。
上述扩增回收的PCR片段和双酶切的载体通过同源重组的方式进行连接,连接体系为pCAGGS 50ng,PCR产物50ng,MUL enzyme 5μL,总体积为10μL;连接条件为50℃ 1h。
取5μL连接产物加入大肠杆菌Stbl3感受态,混匀后冰浴25min,42℃热应激60s,冰浴90s,加入无抗生素的LB培养基800μL,置于摇床上震荡培养45min,离心后取少量LB重悬菌体,均匀涂布在氨苄抗性的LB平板上,将平板倒置培养。待菌落形成后,挑取单克隆菌落,接种于含有氨苄抗性的LB培养基中进行过夜摇菌,小提质粒后进行Sanger测序验证,获得质粒pC-CCHFV-GPCΔ14、pC-CCHFV-GPCΔ53-L518V及pC-CCHFV-GPCΔ53-R516K。
(2)CCHFV单轮感染假病毒颗粒的包装
将293T细胞接种于12孔细胞培养板中,待细胞汇合度达到80%-90%时,使用3μLFugene HD转染试剂对应1μg质粒分别转染pC-CCHFV-GPCΔ14、pC-CCHFV-GPCΔ53、pC-CCHFV-GPCΔ53-L518V及pC-CCHFV-GPCΔ53-R516K。转染24h后换液为10%FBS的DMEM。以MOI=3剂量感染G蛋白反式包装的VSV(ΔG)/G单轮感染病毒颗粒。感染2h后更换为含抗VSV-G的中和抗体的10%FBS的DMEM。24h后收取的上清保存于-80℃。
(3)CCHFV单轮感染假病毒颗粒的感染
将BHK-21细胞接种于96孔细胞培养板中,待细胞汇合度达到80%-90%时,弃掉培养基,加入75μL 2%FBS的DMEM和25μL包装的单轮感染假病毒混合液。感染12h后,荧光显微镜下拍照。随后消化细胞,用2%PFA固定细胞10min,PBS洗涤细胞1次后,使用1%FBS的PBS重悬细胞,通过流式检测病毒感染效率。结果如图8所示,GPC蛋白缺失C端末尾14个氨基酸或53个氨基酸的包装效率较低;在缺失53个氨基酸的基础上突变L518V,感染效率提升约15倍;若在缺失53个氨基酸的基础上突变R516K,感染效率提升约76倍。
实施例2VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒的拯救
按照实施例1的方法进行VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒的拯救,与实施例1的区别在于,将pBlue-VSV(ΔG)-CCHFV-GPCΔ53质粒和辅助质粒pC-VSV-N、pC-VSV-P、pC-VSV-L和pC-VSV-G分别按照10:5:4:2:1、10:5:3:1:2、10:2:6.5:1.25:2、10:2.5:6.5:1.25:2、10:8:4:1:8的比例进行转染,结果只有少量GFP荧光产生。结果表明,这些转染比例虽然能成功拯救VSV-CCHFV-GFP重组报告病毒,但拯救效率低。
以上仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
Claims (20)
1.CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体,其特征在于,其在野生型CCHFV包膜糖蛋白GPC的序列中缺失C端末尾53个氨基酸,且包含R516K或L518V单点突变;
所述野生型CCHFV包膜糖蛋白GPC的氨基酸序列如SEQ ID NO.23所示。
2.编码CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的核酸片段,其特征在于,包括:
i)、编码权利要求1所述的CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体的核酸片段;和/或
ii)、编码SEQ ID NO.2所示氨基酸序列的核酸片段。
3.根据权利要求2所述的核酸片段,其特征在于,所述核酸片段的序列为:
I)、如SEQ ID NO:1所示的序列;或
II)、SEQ ID NO:1所示的序列中第1547位碱基由G突变为A获得的序列;
III)、SEQ ID NO:1所示的序列中第1552位碱基由C突变为G获得的序列;
IV)、在I)、II)或III)所示的核苷酸序列中取代、缺失或添加一个或多个碱基获得的核苷酸序列,且编码的蛋白功能相同或相似的核苷酸序列;或
V)、与I)~IV)任一项所述序列至少有90%同源性的序列。
4.重组VSV载体,其特征在于,包括:VSV载体质粒、权利要求2或3所述的核酸片段和目的基因;
所述VSV载体质粒为包含VSV基因组序列且编码VSV包膜糖蛋白的G基因缺失的质粒。
5.根据权利要求1所述的重组VSV载体,其特征在于,所述目的基因为报告基因;所述报告基因为GFP、EGFP、mCherry、RFP、YFP、mNeonGreen、TurboGFP、mGreenLantern、ZsGreen、mKate2、NanoLuc luciferase、Firefly luciferase、Gaussia luciferase或Renillaluciferase。
6.根据权利要求1所述的重组VSV载体,其特征在于,所述目的基因为抗原蛋白基因;所述抗原蛋白基因包括编码病毒抗原、肿瘤抗原或表达宿主与病原微生物抗原的基因。
7.根据权利要求1所述的重组VSV载体,其特征在于,VSV载体质粒的骨架包括pBlueScript系列载体、pSMART系列载体或细菌人工染色体BAC系列载体。
8.一种水疱性口炎病毒VSV的可复制型假病毒系统,其特征在于,包括权利要求4~7任一项所述的重组VSV载体、含VSV病毒N基因、P基因、L基因和/或G基因的辅助质粒以及包装细胞。
9.根据权利要求8所述的水疱性口炎病毒VSV的可复制型假病毒系统,其特征在于,包含VSV病毒N、P、L、G基因的辅助质粒包括辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4,分别表达N、P、L、G蛋白。
10.根据权利要求9所述的可复制型假病毒系统,其特征在于,所述重组病毒质和辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4的质量比为10:(2-8):(3-6.5):(1-3):(1-8),优选为10:3:3:3:3。
11.根据权利要求8所述的可复制型假病毒系统,其特征在于,所述包装细胞为表达T7RNA聚合酶的293T细胞。
12.一种重组VSV病毒,其特征在于,由权利要求4~7任一项所述的重组VSV载体经包装细胞包装而成。
13.根据权利要求12所述的重组VSV病毒,其特征在于,所述包装细胞为表达T7 RNA聚合酶的293T细胞。
14.权利要求12或13所述的重组VSV病毒的制备方法,其特征在于,包括:
将权利要求1~5任一项所述的重组VSV载体和辅助质粒共转染表达T7RNA聚合酶的宿主细胞,收集上清,传代,获得重组VSV病毒;
所述辅助质粒包括:分别含VSV病毒的N基因、P基因、L基因、G基因的辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3、辅助质粒4。
15.根据权利要求14所述的制备方法,其特征在于,所述重组VSV载体、辅助质粒1、辅助质粒2、辅助质粒3和辅助质粒4的质量比为10:3:3:3:3。
16.根据权利要求14所述的制备方法,其特征在于,所述宿主细胞为表达T7 RNA聚合酶的293T细胞;待宿主细胞培养至80%-90%汇合度进行所述共转染。
17.根据权利要求14所述的制备方法,其特征在于,所述传代用的细胞系为BHK-21,传代次数为2~3次。
18.根据权利要求14~17任一项所述的制备方法,其特征在于,所述传代的同时还包括加入抗VSV G蛋白的中和抗体步骤。
19.权利要求1所述的CCHFV包膜糖蛋白GPC突变体、权利要求2或3所述的核酸片段、权利要求4~7任一项所述的重组VSV载体、权利要求8~11任一项所述的可复制型假病毒系统、权利要求12或13所述的重组VSV病毒或权利要求14~18任一项制备方法制得的重组VSV病毒在如下至少一方面中的应用:
1)、在CCHFV中和抗体效价评估中的应用;
2)、在CCHFV入侵机制的研究中的应用;
3)、在制备CCHFV疫苗中的应用,或CCHFV疫苗免疫效果评价中的应用;
4)、在CCHFV单轮感染假病毒颗粒包装中的应用。
20.一种CCHFV疫苗,包括权利要求12或13所述的重组VSV病毒或权利要求14~18任一项制备方法制得的重组VSV病毒。
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20200362316A1 (en) * | 2019-05-15 | 2020-11-19 | Sergio E. Rodriguez | Vesicular stomatitis vectors encoding crimean-congo hemorrhagic fever antigen |
US20220023410A1 (en) * | 2018-12-14 | 2022-01-27 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Crimean-congo hemorrhagic fever virus replicon particles and use thereof |
WO2023114912A2 (en) * | 2021-12-16 | 2023-06-22 | Thomas Jefferson University | A therapeutic against crimean-congo hemorrhagic fever virus |
-
2023
- 2023-09-27 CN CN202311258654.XA patent/CN117264028A/zh active Pending
Patent Citations (3)
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Non-Patent Citations (2)
Title |
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