CN1169956C - 编码具有抑制癌细胞生长功能的人蛋白的多核苷酸 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一类新的具有抑癌功能的人蛋白,编码此多肽的多核苷酸和经重组技术产生该多肽的方法。本发明还公开了此多肽用于治疗多种疾病如癌症等的方法。本发明还公开了抗此多肽的拮抗剂及其治疗作用。本发明还公开了编码这类新的具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸的用途。
Description
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明涉及新的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸,以及此多核苷酸编码的多肽。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的用途和制备。
人基因组学研究目前是国际上的热点,除人染色体DNA大规模测序,表达序列测序(EST)的方法外,还缺少从功能开始的筛选具有功能基因的高通量的方法。
癌症是危害人类健康的主要疾病之一。为了有效地治疗和预防肿瘤,目前人们已越来越关注肿瘤的基因治疗。因此,本领域迫切需要开发研究具有抑癌功能的人蛋白及其激动剂/抑制剂。
本发明的目的是提供一类新的具有抑癌功能的人蛋白多肽以及其片段、类似物和衍生物。
本发明的另一目的是提供编码这些多肽的多核苷酸。
本发明的另一目的是提供生产这些多肽的方法以及该多肽和编码序列的用途。
在本发明的第一方面,提供新颖的分离出的具有抑癌功能的蛋白多肽,它包含具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26:或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
较佳地,该多肽是具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:26。
在本发明的第二方面,提供了一种分离的多核苷酸,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列与选自下组的一种核苷酸序列有至少85%相同性:(a)编码上述的具有抑癌功能的蛋白多肽的多核苷酸;(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。较佳地,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26。更佳地,该多核苷酸的序列选自下组:SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27的编码区序列或全长序列。
在本发明的第三方面,提供了含有上述多核苷酸的载体,以及被该载体转化或转导的宿主细胞或者被上述多核苷酸直接转化或转导的宿主细胞。
在本发明的第四方面,提供了制备具有具有抑癌功能的蛋白活性的多肽的制备方法,该方法包含:(a)在适合表达具有抑癌功能的蛋白的条件下,培养上述被转化或转导的宿主细胞;(b)从培养物中分离出具有具有抑癌功能的蛋白活性的多肽。
在本发明的第五方面,提供了与上述的具有抑癌功能的蛋白多肽特异性结合的抗体。还提供了可用于检测的核酸分子,它含有上述的多核苷酸中连续的10-800个核苷酸。
在本发明的第六方面,提供了一种药物组合物,它含有安全有效量的本发明的具有抑癌功能的蛋白多肽以及药学上可接受的载体。这些药物组合物可治疗癌症以及细胞异常增殖等病症。
本发明的其它方面由于本文的技术的公开,对本领域的技术人员而言是显而易见的。
本发明采用大规模cDNA克隆转染癌细胞,在获得具有抑癌作用的基础上,经测序证明为新的基因,进一步得到全长cDNA克隆。DNA转染试验证明,本发明的具有抑癌功能的蛋白对癌细胞(肝癌细胞)具有抑制克隆形成的作用,其抑制率在50%或50%以上。
如本文所用,“分离的”是指物质从其原始环境中分离出来(如果是天然的物质,原始环境即是天然环境)。如活体细胞内的天然状态下的多聚核苷酸和多肽是没有分离纯化的,但同样的多聚核苷酸或多肽如从天然状态中同存在的其他物质中分开,则为分离纯化的。
如本文所用,“分离的具有抑癌功能的蛋白或多肽”是指具有抑癌功能的蛋白多肽基本上不含天然与其相关的其它蛋白、脂类、糖类或其它物质。本领域的技术人员能用标准的蛋白质纯化技术纯化具有抑癌功能的蛋白。基本上纯的多肽在非还原聚丙烯酰胺凝胶上能产生单一的主带。具有抑癌功能的蛋白多肽的纯度能用氨基酸序列分析。
本发明的多肽可以是重组多肽、天然多肽、合成多肽,优选重组多肽。本发明的多肽可以是天然纯化的产物,或是化学合成的产物,或使用重组技术从原核或真核宿主(例如,细菌、酵母、高等植物、昆虫和哺乳动物细胞)中产生。根据重组生产方案所用的宿主,本发明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本发明的多肽还可包括或不包括起始的甲硫氨酸残基。
本发明还包括具有抑癌功能的人蛋白的片段、衍生物和类似物。如本文所用,术语“片段”、“衍生物”和“类似物”是指基本上保持本发明的天然具有抑癌功能的人蛋白相同的生物学功能或活性的多肽。本发明的多肽片段、衍生物或类似物可以是(i)有一个或多个保守或非保守性氨基酸残基(优选保守性氨基酸残基)被取代的多肽,而这样的取代的氨基酸残基可以是也可以不是由遗传密码编码的,或(ii)在一个或多个氨基酸残基中具有取代基团的多肽,或(iii)成熟多肽与另一个化合物(比如延长多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(iv)附加的氨基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前导序列或分泌序列或用来纯化此多肽的序列或蛋白原序列)。根据本文的教导,这些片段、衍生物和类似物属于本领域熟练技术人员公知的范围。
本发明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因组DNA或人工合成的DNA。DNA可以是单链的或是双链的。DNA可以是编码链或非编码链。以SP82蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:3所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”在本发明中是指编码具有SEQ ID NO:2的蛋白质,但与SEQ ID NO:3所示的编码区序列有差别的核酸序列。以SP192蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:6所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”在本发明中是指编码具有SEQ IDNO:5的蛋白质,但与SEQ ID NO:6所示的编码区序列有差别的核酸序列。对于其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。对于其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。
编码成熟多肽的多核苷酸包括:只编码成熟多肽的编码序列;成熟多肽的编码序列和各种附加编码序列;成熟多肽的编码序列(和任选的附加编码序列)以及非编码序列。
术语“编码多肽的多核苷酸”可以是包括编码此多肽的多核苷酸,也可以是还包括附加编码和/或非编码序列的多核苷酸。
本发明还涉及上述多核苷酸的变异体,其编码与本发明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、类似物和衍生物。此多核苷酸的变异体可以是天然发生的等位变异体或非天然发生的变异体。这些核苷酸变异体包括取代变异体、缺失变异体和插入变异体。如本领域所知的,等位变异体是一个多核苷酸的替换形式,它可能是一个或多个核苷酸的取代、缺失或插入,但不会从实质上改变其编码的多肽的功能。
本发明还涉及与上述的序列杂交且两个序列之间具有至少50%,较佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本发明特别涉及在严格条件下与本发明所述多核苷酸可杂交的多核苷酸。在本发明中,“严格条件”是指:(1)在较低离子强度和较高温度下的杂交和洗脱,如0.2×SSC,0.1%SDS,60℃;或(2)杂交时加有变性剂,如50%(v/v)甲酰胺,0.1%小牛血清/0.1%Ficoll,42℃等;或(3)仅在两条序列之间的相同性至少在95%以上,更好是97%以上时才发生杂交。并且,可杂交的多核苷酸编码的多肽与SEQ IDNO:2所示的成熟多肽有相同的生物学功能和活性。
本发明还涉及与上述的序列杂交的核酸片段。如本文所用,“核酸片段”的长度至少含15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸以上。核酸片段可用于核酸的扩增技术(如PCR)以确定和/或分离编码具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸。
本发明中的多肽和多核苷酸优选以分离的形式提供,更佳地被纯化至均质。
本发明的DNA序列能用几种方法获得。例如,用本领域熟知的杂交技术分离DNA。这些技术包括但不局限于:1)用探针与基因组或cDNA文库杂交以检出同源性核苷酸序列,和2)表达文库的抗体筛选以检出具有共同结构特征的克隆的DNA片段。
编码具有抑癌功能的蛋白的特异DNA片段序列产生也能用下列方法获得:1)从基因组DNA分离双链DNA序列;2)化学合成DNA序列以获得所需多肽的双链DNA。
上述提到的方法中,分离基因组DNA最不常用。当需要的多肽产物的整个氨基酸序列已知时,DNA序列的直接化学合成是经常选用的方法。如果所需的氨基酸的整个序列不清楚时,DNA序列的直接化学合成是不可能的,选用的方法是cDNA序列的分离。分离感兴趣的cDNA的标准方法是从高表达该基因的供体细胞分离mRNA并进行逆转录,形成质粒或噬菌体cDNA文库。提取mRNA的方法已有多种成熟的技术,试剂盒也可从商业途径获得(Qiagene)。而构建cDNA文库也是通常的方法(Sambrook,et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory.New York,1989)。还可得到商业供应的cDNA文库,如Clontech公司的不同cDNA文库。当结合使用聚合酶反应技术时,即使极少的表达产物也能克隆。
可用常规方法从这些cDNA文库中筛选本发明的基因。这些方法包括(但不限于):(1)DNA-DNA或DNA-RNA杂交;(2)标志基因的功能出现或丧失;(3)测定具有抑癌功能的蛋白的转录本的水平;(4)通过免疫学技术或测定生物学活性,来检测基因表达的蛋白产物。上述方法可单用,也可多种方法联合应用。
在第(1)种方法中,杂交所用的探针是与本发明的多核苷酸的任何一部分同源,其长度至少15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸。此外,探针的长度通常在2kb之内,较佳地为1kb之内。此处所用的探针通常是在本发明的基因DNA序列信息的基础上化学合成的DNA序列。本发明的基因本身或者片段当然可以用作探针。DNA探针的标记可用放射性同位素,荧光素或酶(如碱性磷酸酶)等。
在第(4)种方法中,检测具有抑癌功能的蛋白基因表达的蛋白产物可用免疫学技术如Western印迹法,放射免疫沉淀法,酶联免疫吸附法(ELISA)等。
应用PCR技术扩增DNA/RNA的方法(Saiki,et al.Science 1985;230:1350-1354)被优选用于获得本发明的基因。特别是很难从文库中得到全长的cDNA时,可优选使用RACE法(RACE-cDNA末端快速扩增法),用于PCR的引物可根据本文所公开的本发明的序列信息适当地选择,并可用常规方法合成。可用常规方法如通过凝胶电泳分离和纯化扩增的DNA/RNA片段。
如上所述得到的本发明的基因,或者各种DNA片段等的核苷酸序列的测定可用常规方法如双脱氧链终止法(Sanger et al.PNAS,1977,74:5463-5467)。这类核苷酸序列测定也可用商业测序试剂盒等。为了获得全长的cDNA序列,测序需反复进行。有时需要测定多个克隆的cDNA序列,才能拼接成全长的cDNA序列。
本发明也涉及包含本发明的多核苷酸的载体,以及用本发明的载体或具有抑癌功能的蛋白编码序列经基因工程产生的宿主细胞,以及经重组技术产生本发明所述多肽的方法。
通过常规的重组DNA技术,可利用本发明的多聚核苷酸序列可用来表达或生产重组的具有抑癌功能的蛋白多肽(Science,1984;224:1431)。一般来说有以下步骤:
(1).用本发明的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸(或变异体),或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;
(2).在合适的培养基中培养的宿主细胞;
(3).从培养基或细胞中分离、纯化蛋白质。
本发明中,具有抑癌功能的人蛋白多核苷酸序列可插入到重组表达载体中。术语“重组表达载体”指本领域熟知的细菌质粒、噬菌体、酵母质粒、植物细胞病毒、哺乳动物细胞病毒如腺病毒、逆转录病毒或其他载体。在本发明中适用的载体包括但不限于:在细菌中表达的基于T7的表达载体(Rosenberg,et al.Gene,1987,56:125);在哺乳动物细胞中表达的pMSXND表达载体(Lee and Nathans,J Bio Chem.263:3521,1988)和在昆虫细胞中表达的来源于杆状病毒的载体。总之,只要能在宿主体内复制和稳定,任何质粒和载体都可以用。表达载体的一个重要特征是通常含有复制起点、启动子、标记基因和翻译控制元件。
本领域的技术人员熟知的方法能用于构建含具有抑癌功能的人蛋白编码DNA序列和合适的转录/翻译控制信号的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、DNA合成技术、体内重组技术等(Sambroook,et al.Molecular Cloning,a Laboratory Manual,coldSpring Harbor Laboratory.New York,1989)。所述的DNA序列可有效连接到表达载体中的适当启动子上,以指导mRNA合成。这些启动子的代表性例子有:大肠杆菌的lac或trp启动子;λ噬菌体PL启动子;真核启动子包括CMV立即早期启动子、HSV胸苷激酶启动子、早期和晚期SV40启动子、反转录病毒的LTRs和其他一些已知的可控制基因在原核或真核细胞或其病毒中表达的启动子。表达载体还包括翻译起始用的核糖体结合位点和转录终止子。
此外,表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因,以提供用于选择转化的宿主细胞的表型性状,如真核细胞培养用的二氢叶酸还原酶、新霉素抗性以及绿色荧光蛋白(GFP),或用于大肠杆菌的四环素或氨苄青霉素抗性。
包含上述的适当DNA序列以及适当启动子或者控制序列的载体,可以用于转化适当的宿主细胞,以使其能够表达蛋白质。
宿主细胞可以是原核细胞,如细菌细胞;或是低等真核细胞,如酵母细胞;或是高等真核细胞,如哺乳动物细胞。代表性例子有:大肠杆菌,链霉菌属;鼠伤寒沙门氏菌的细菌细胞;真菌细胞如酵母;植物细胞;果蝇S2或Sf9的昆虫细胞;CHO、COS或Bowes黑素瘤细胞的动物细胞等。
本发明的多核苷酸在高等真核细胞中表达时,如果在载体中插入增强子序列时将会使转录得到增强。增强子是DNA的顺式作用因子,通常大约有10到300个碱基对,作用于启动子以增强基因的转录。可举的例子包括在复制起始点晚期一侧的100到270个碱基对的SV40增强子、在复制起始点晚期一侧的多瘤增强子以及腺病毒增强子等。
本领域一般技术人员都清楚如何选择适当的载体、启动子、增强子和宿主细胞。
用重组DNA转化宿主细胞可用本领域技术人员熟知的常规技术进行。当宿主为原核生物如大肠杆菌时,能吸收DNA的感受态细胞可在指数生长期后收获,用CaCl2法处理,所用的步骤在本领域众所周知。可供选择的是用MgCl2。如果需要,转化也可用电穿孔的方法进行。当宿主是真核生物,可选用如下的DNA转染方法:磷酸钙共沉淀法,常规机械方法如显微注射、电穿孔、脂质体包装等。
获得的转化子可以用常规方法培养,表达本发明的基因所编码的多肽。根据所用的宿主细胞,培养中所用的培养基可选自各种常规培养基。在适于宿主细胞生长的条件下进行培养。当宿主细胞生长到适当的细胞密度后,用合适的方法(如温度转换或化学诱导)诱导选择的启动子,将细胞再培养一段时间。
在上面的方法中的重组多肽可包被于细胞内、细胞外或在细胞膜上表达或分泌到细胞外。如果需要,可利用其物理的、化学的和其它特性通过各种分离方法分离和纯化重组的蛋白。这些方法是本领域技术人员所熟知的。这些方法的例子包括但并不限于:常规的复性处理、用蛋白沉淀剂处理(盐析方法)、离心、渗透破菌、超处理、超离心、分子筛层析(凝胶过滤)、吸附层析、离子交换层析、高效液相层析(HPLC)和其它各种液相层析技术及这些方法的结合。
重组的具有抑癌功能的人蛋白或多肽有多方面的用途。这些用途包括(但不限于):直接做为药物治疗具有抑癌功能的蛋白功能低下或丧失所致的疾病,和用于筛选促进或对抗具有抑癌功能的蛋白功能的抗体、多肽或其它配体。例如,抗体可用于激活或抑制具有抑癌功能的人蛋白的功能。用表达的重组具有抑癌功能的人蛋白筛选多肽库可用于寻找有治疗价值的能抑制或刺激具有抑癌功能的人蛋白功能的多肽分子。
本发明也提供了筛选药物以鉴定提高(激动剂)或阻遏(拮抗剂)具有抑癌功能的人蛋白的药剂的方法。激动剂提高具有抑癌功能的人蛋白刺激细胞增殖等生物功能,而拮抗剂阻止和治疗与细胞过度增殖有关的紊乱如各种癌症。例如,能在药物的存在下,将哺乳动物细胞或表达具有抑癌功能的人蛋白的膜制剂与标记的具有抑癌功能的人蛋白一起培养。然后测定药物提高或阻遏此相互作用的能力。
具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂包括筛选出的抗体、化合物、受体缺失物和类似物等。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可以与具有抑癌功能的人蛋白结合并消除其功能,或是抑制具有抑癌功能的人蛋白的产生,或是与多肽的活性位点结合使多肽不能发挥生物学功能。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可用于治疗用途。
在筛选作为拮抗剂的化合物时,可以将具有抑癌功能的蛋白加入生物分析测定中,通过测定化合物影响具有抑癌功能的蛋白和其受体之间的相互作用来确定化合物是否是拮抗剂。用上述筛选化合物的同样方法,可以筛选出起拮抗剂作用的受体缺失物和类似物。
本发明的多肽可直接用于疾病治疗,例如,各种恶性肿瘤、和细胞异常增殖等。
本发明的多肽,及其片段、衍生物、类似物或它们的细胞可以用来作为抗原以生产抗体。这些抗体可以是多克隆或单克隆抗体。多克隆抗体可以通过将此多肽直接注射动物的方法得到。制备单克隆抗体的技术包括杂交瘤技术,三瘤技术,人B-细胞杂交瘤技术,EBV-杂交瘤技术等。
可以将本发明的多肽和拮抗剂与合适的药物载体组合后使用。这些载体可以是水、葡萄糖、乙醇、盐类、缓冲液、甘油以及它们的组合。组合物包含安全有效量的多肽或拮抗剂以及不影响药物效果的载体和赋形剂。这些组合物可以作为药物用于疾病治疗。
本发明还提供含有一种或多种容器的药盒或试剂盒,容器中装有一种或多种本发明的药用组合物成分。与这些容器一起,可以有由制造、使用或销售药品或生物制品的政府管理机构所给出的指示性提示,该提示反映出生产、使用或销售的政府管理机构许可其在人体上施用。此外,本发明的多肽可以与其它的治疗化合物结合使用。
药物组合物可以以方便的方式给药,如通过局部、静脉内、腹膜内、肌内、皮下、鼻内或皮内的给药途径。具有抑癌功能的蛋白以有效地治疗和/或预防具体的适应症的量来给药。施用于患者的具有抑癌功能的蛋白的量和剂量范围将取决于许多因素,如给药方式、待治疗者的健康条件和诊断医生的判断。
具有抑癌功能的人蛋白的多聚核苷酸也可用于多种治疗目的。基因治疗技术可用于治疗由于具有抑癌功能的蛋白的无表达或异常/无活性的具有抑癌功能的蛋白的表达所致的细胞增殖、发育或代谢异常。重组的基因治疗载体(如病毒载体)可设计成表达变异的具有抑癌功能的蛋白,以抑制内源性的具有抑癌功能的蛋白活性。例如,一种变异的具有抑癌功能的蛋白可以是缩短的、缺失了信号传导功能域的具有抑癌功能的蛋白,虽可与下游的底物结合,但缺乏信号传导活性。因此重组的基因治疗载体可用于治疗具有抑癌功能的蛋白表达或活性异常所致的疾病。来源于病毒的表达载体如逆转录病毒、腺病毒、腺病毒相关病毒、单纯疱疹病毒、细小病毒等可用于将具有抑癌功能的蛋白基因转移至细胞内。构建携带具有抑癌功能的蛋白基因的重组病毒载体的方法可见于已有文献(Sambrook,et al.)。另外重组具有抑癌功能的人蛋白基因可包装到脂质体中转移至细胞内。
抑制具有抑癌功能的人蛋白mRNA的寡聚核苷酸(包括反义RNA和DNA)以及核酶也在本发明的范围之内。核酶是一种能特异性分解特定RNA的酶样RNA分子,其作用机制是核酶分子与互补的靶RNA特异性杂交后进行核酸内切作用。反义的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技术获得,如固相磷酸酰胺化学合成法合成寡核苷酸的技术已广泛应用。反义RNA分子可通过编码该RNA的DNA序列在体外或体内转录获得。这种DNA序列已整合到载体的RNA聚合酶启动子的下游。为了增加核酸分子的稳定性,可用多种方法对其进行修饰,如增加两侧的序列长度,核糖核苷之间的连接应用磷酸硫酯键或肽键而非磷酸二酯键。
多聚核苷酸导入组织或细胞内的方法包括:将多聚核苷酸直接注入到体内组织中;或在体外通过载体(如病毒、噬菌体或质粒等)先将多聚核苷酸导入细胞中,再将细胞移植到体内等。
本发明的多肽还可用作肽谱分析,例如,多肽可用物理的、化学或酶进行特异性切割,并进行一维或二维或三维的凝胶电泳分析。
本发明还提供了针对具有抑癌功能的人蛋白抗原决定簇的抗体。这些抗体包括(但不限于):多克隆抗体、单克隆抗体、嵌合抗体、单链抗体、Fab片段和Fab表达文库产生的片段。
抗具有抑癌功能的人蛋白的抗体可用于免疫组织化学技术中,检测活检标本中的具有抑癌功能的人蛋白。
与具有抑癌功能的人蛋白结合的单克隆抗体也可用放射性同位素标记,注入体内可跟踪其位置和分布。这种放射性标记的抗体可作为一种非创伤性诊断方法用于肿瘤细胞的定位和判断是否有转移。
本发明中的抗体可用于治疗或预防与具有抑癌功能的人蛋白相关的疾病。给予适当剂量的抗体可以刺激或阻断具有抑癌功能的人蛋白的产生或活性。
抗体也可用于设计针对体内某一特殊部位的免疫毒素。如具有抑癌功能的人蛋白高亲和性的单克隆抗体可与细菌或植物毒素(如白喉毒素,蓖麻蛋白,红豆碱等)共价结合。一种通常的方法是用巯基交联剂如SPDP,攻击抗体的氨基,通过二硫键的交换,将毒素结合于抗体上,这种杂交抗体可用于杀灭具有抑癌功能的人蛋白阳性的细胞。
多克隆抗体的生产可用具有抑癌功能的人蛋白或多肽免疫动物,如家兔,小鼠,大鼠等。多种佐剂可用于增强免疫反应,包括但不限于弗氏佐剂等。
具有抑癌功能的人蛋白单克隆抗体可用杂交瘤技术生产(Kohler and Milstein.Nature,1975,256:495-497)。将人恒定区和非人源的可变区结合的嵌合抗体可用已有的技术生产(Morrison et al,PNAS,1985,81:6851)。而已有的生产单链抗体的技术(U.S.PatNo.4946778)也可用于生产抗具有抑癌功能的人蛋白的单链抗体。
能与具有抑癌功能的人蛋白结合的多肽分子可通过筛选由各种可能组合的氨基酸结合于固相物组成的随机多肽库而获得。筛选时,必须对具有抑癌功能的人蛋白分子进行标记。
本发明还涉及定量和定位检测具有抑癌功能的人蛋白水平的诊断试验方法。这些试验是本领域所熟知的,且包括FISH测定和放射免疫测定。试验中所检测的具有抑癌功能的人蛋白水平,可以用作解释具有抑癌功能的人蛋白在各种疾病中的重要性和用于诊断具有抑癌功能的蛋白起作用的疾病。
具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于具有抑癌功能的蛋白相关疾病的诊断和治疗。在诊断方面,具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于检测具有抑癌功能的蛋白的表达与否或在疾病状态下具有抑癌功能的蛋白的异常表达。如具有抑癌功能的蛋白DNA序列可用于对活检标本的杂交以判断具有抑癌功能的蛋白的表达异常。杂交技术包括Southern印迹法,Northern印迹法、原位杂交等。这些技术方法都是公开的成熟技术,相关的试剂盒都可从商业途径得到。本发明的多核苷酸的一部分或全部可作为探针固定在微阵列(Microarray)或DNA芯片(又称为“基因芯片”)上,用于分析组织中基因的差异表达分析和基因诊断。用具有抑癌功能的蛋白特异的引物进行RNA-聚合酶链反应(RT-PCR)体外扩增也可检测具有抑癌功能的蛋白的转录产物。
检测具有抑癌功能的蛋白基因的突变也可用于诊断具有抑癌功能的蛋白相关的疾病。具有抑癌功能的蛋白突变的形式包括与正常野生型具有抑癌功能的蛋白DNA序列相比的点突变、易位、缺失、重组和其它任何异常等。可用已有的技术如Southern印迹法、DNA序列分析、PCR和原位杂交检测突变。另外,突变有可能影响蛋白的表达,因此用Northern印迹法、Western印迹法可间接判断基因有无突变。
本发明的序列对染色体鉴定也是有价值的。该序列会特异性地针对某条人染色体具体位置且并可以与其杂交。目前,需要鉴定染色体上的各基因的具体位点。现在,只有很少的基于实际序列数据(重复多态性)的染色体标记物可用于标记染色体位置。根据本发明,为了将这些序列与疾病相关基因相关联,其重要的第一步就是将这些DNA序列定位于染色体上。
简而言之,根据cDNA制备PCR引物(优选15-35bp),可以将序列定位于染色体上。然后,将这些引物用于PCR筛选含各条人染色体的体细胞杂合细胞。只有那些含有相应于引物的人基因的杂合细胞会产生扩增的片段。
体细胞杂合细胞的PCR定位法,是将DNA定位到具体染色体的快捷方法。使用本发明的的寡核苷酸引物,通过类似方法,可利用一组来自特定染色体的片段或大量基因组克隆而实现亚定位。可用于染色体定位的其它类似策略包括原位杂交、用标记的流式分选的染色体预筛选和杂交预选,从而构建染色体特异的cDNA库。
将cDNA克隆与中期染色体进行荧光原位杂交(FISH),可以在一个步骤中精确地进行染色体定位。此技术的综述,参见Verma等,Human Chromosomes:a Manual of BasicTechniques,Pergamon Press,New York(1988)。
一旦序列被定位到准确的染色体位置,此序列在染色体上的物理位置就可以与基因图数据相关联。这些数据可见于例如,V.Mckusick,Mendelian Inheritance in Man(可通过与Johns Hopkins University Welch Medical Library联机获得)。然后可通过连锁分析,确定基因与业已定位到染色体区域上的疾病之间的关系。
接着,需要测定患病和未患病个体间的cDNA或基因组序列差异。如果在一些或所有的患病个体中观察到某突变,而该突变在任何正常个体中未观察到,则该突变可能是疾病的病因。比较患病和未患病个体,通常涉及首先寻找染色体中结构的变化,如从染色体水平可见的或用基于cDNA序列的PCR可检测的缺失或易位。根据目前的物理作图和基因定位技术的分辨能力,被精确定位至与疾病有关的染色体区域的cDNA,可以是50至500个潜在致病基因间之一种(假定1兆碱基作图分辨能力和每20kb对应于一个基因)。
本发明的具有抑癌功能的蛋白核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
目前,已经可以完全通过化学合成来编码本发明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中的各种DNA分子(如载体)和细胞中。此外,还可通过化学合成将突变引入本发明蛋白序列中。
此外,由于本发明的具有抑癌功能的蛋白具有源自人的天然氨基酸序列,因此,与来源于其他物种的同族蛋白相比,预计在施用于人时将具有更高的活性和/或更低的副作用(例如在人体内的免疫原性更低或没有)。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1:cDNA基因的获得及对癌细胞克隆形成的抑制作用
SP82,SP192,来自于GIBCO BRL公司购得肝cDNA文库(cat,NO.10422-012)PP79,PP1009,PP1045,PP1195,PP1345,PP1744和PP1757是通过用常规方法构建人胎盘cDNA文库获得的。取3、6、10月龄的胎盘组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(pharmacia公司)提取mRNA。用pCMV-script TMXR cDNA文库构建试剂盒(Stratagene公司)构建上述mRNA的cDNA文库。其中反转录酶改用MMLV-RT-Superscript II(GIBCO BRL),反转录反应在42℃进行。转化XL 10-Gold感受细胞,获得了1×106cfu/μg cDNA滴度的cDNA文库。第一轮随机挑取cDNA克隆,其后以高丰度cDNA克隆和已证明有抑癌细胞生长功能的cDNA克隆为探针,杂交筛选cDNA文库,挑取弱阳性及阴性克隆。用Qiagen96孔板质粒抽提试剂盒,按厂家说明书进行质粒DNA的提取。质粒DNA和空载体同时转染肝癌细胞系7721。100ng DNA酒精沉淀干燥后,加6μl H2O溶解,待转染。每份DNA样品中加0.74μl脂质体及9.3μl无血清培液,混匀后,室温放置10分钟。每管中加150μl无血清培液,均分加入3孔生长于96孔板的7721细胞中,37℃放置2小时,每孔再加50μl无血清培液,37℃ 24小时。每孔换100μl全培液,37℃ 24小时,换含G418的全培液100μl,37℃ 24~48小时,边观察,边换G418浓度不等的培液。约2~3次后,直到镜检细胞有克隆形成,计数。发现上述克隆有抑制细胞克隆形成作用,结果如下表所示。
cDNA克隆转染细胞(7721)克隆形成情况
cDNA克隆名称 CDNA克隆数(三个重复) 空载体克隆数(三个重复)
SP82 17 32 31 16 15 23
SP192 4 3 4 17 12 7
PP79 18 31 15 38 12 40
PP1009 1 1 1 54 45 40
PP1045 2 1 0 32 39 37
PP1195 22 26 4 30 37 41
PP1345 15 13 12 34 31 30
PP1744 4 2 6 10 18 9
PP1757 6 6 2 10 18 9
对cDNA克隆采用双脱氧终止法,在ABI377 DNA自动测序仪上测定其一端近500bp的核苷酸序列。分析后,确定为新基因克隆,进行另一端测序,仍未获得全长cDNA序列,设计引物,再次进行测序,直到获得全长序列(SEQ ID NO:1、4、7、10、13、16、19、22、25)。
实施例2:从胎盘cDNA中PCR获得全长基因:
取3、6、10月龄的胎盘组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(pharmacia公司)提取mRNA。用MMLV-RT-SuperscriptII(GIBCO BRL)反转录酶在42℃进行反转录反应,获得胎盘cDNA。利用各个基因的转异引物(如下表所示),按90℃3分钟1个循环;94℃ 30秒,60℃ 30秒,72℃ 1分钟,共35个循环;72℃ 10分钟,1个循环,进行PCR扩增,获得含有完整开放阅读框序列的各蛋白基因的扩增产物。扩增产物经测序验证,与实施例1测得的序列相符,随后用常规技术将扩增产物转入宿主细胞,以获得重组蛋白。
基因特异引物
克隆名称 特异引物1(5′→3′) 特异引物2(5′→3′)
SP82 TCAAAAAGGCACCCCAACCTTGC GAGGGTTGGGGACTTAGGGCAGG
SP192 TCTGGGATCCTGGCCATGAGGTT GTGAGTGCCCCAAGGGCTGGTAG
PP79 AGCCACCATGCCAGGCCCTCTTA GGGTGAGTGTCCAAGGTCAGCGA
PP1009 TGAGATTACCGACGAGCCGCCTT GACGCCCATCTGGTTTACCGCTC
PP1045 TCAGCCCAGCTCCTCTGCTGACA GGATTCAGGGGGTGTCTGGGGTC
PP1195 CATCCTGCTCCATGAAGGCCGAC TGGGCAGCACGCACTCTCTGTTC
PP1345 CCCGGGCACTTGAGCTCCTCATA GGCAGCACAGGATGGTGTCCACT
PP1744 AGGTGGAGGTGCATCAAGAGCCC GAGGCCGTTTCTCCTCACAGGCT
PP1757 CTGGGATCATGCTGATGTGGCCC GCCTGGGTGCTCCTGGAGGTTCT
实施例3:cDNA克隆序列分析
1.SP82
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:1)长度:1918bp
1 CCCAGAGCAA GCCGATTCTC TACACACTGC CTTCCCTTCC TGTAAGACTC
51 ATCAAAAAGG CACCCCAACC TTGCATGGAT CTGCTGTTGG TATTCCTTGG
101 GGTGAAGCCA GAAGTCAGGC TTTCCACAGA GAGACGGGAC TACATGGCCA
151 CCTGGGAAGG CTAGGGAGTC AAAGGGCCTG AGGAATGACT ACTTCCCTCC
201 ACAAGGGCAT TCCCTGCCCT GCTCTGCTTC CTGGGGGCTT CAGCAAGCCT
251 TCCTTCTAGA GCTCCTAGAA CCCTCCCATG GTCAACACAA CAGCAGCCCA
301 GACAATGAGA TGCAAGAGGC CTGAGCTCAC AGGCCATTCA GGTCTTCTAG
351 ATGCCTTCTT GAGGCTGCTT GTGGCCACCC ACAGACACTT GTAAGGAGGA
401 GAGAAGTCAG CCTGGCAGAG AGACTCTGAA ATGAGGGATT AGAGGTGTTC
451 AAGGAGCAAG AGCTTCAGCC TGAAGACAAG GGAGCAGTCC CTGAAGACGC
501 TTCTACTGAG AGGTCTGCCA TGGCCTCTCT TGGCCTCCAA CTTGTGGGCT
551 ACATCCTAGG CCTTCTGGGG CTTTTGGGCA CACTGGTTGC CATGCTGCTC
601 CCCAGCTGGA AAACAAGTTC TTATGTCGGT GCCAGCATTG TGACAGCAGT
651 TGGCTTCTCC AAGGGCCTCT GGATGGAATG TGCCACACAC AGCACAGGCA
701 TCACCCAGTG TGACATCTAT AGCACCCTTC TGGGCCTGCC CGCTGACATC
751 CAGGCTGCCC AGGCCATGAT GGTGACATCC AGTGCAATCT CCTCCCTGGC
801 CTGCATTATC TCTGTGGTGG GCATGAGATG CACAGTCTTC TGCCAGGAAT
851 CCCGAGCCAA AGACAGAGTG GCGGTAGCAG GTGGAGTCTT TTTCATCCTT
901 GGAGGCCTCC TGGGATTCAT TCCTGTTGCC TGGAATCTTC ATGGGATCCT
951 ACGGGACTTC TACTCACCAC TGGTGCCTGA CAGCATGAAA TTTGAGATTG
1001 GAGAGGCTCT TTACTTGGGC ATTATTTCTT CCCTGTTCTC CCTGATAGCT
1051 GGAATCATCC TCTGCTTTTC CTGCTCATCC CAGAGAAATC GCTCCAACTA
1101 CTACGATGCC TACCAAGCCC AACCTCTTGC CACAAGGAGC TCTCCAAGGC
1151 CTGGTCAACC TCCCAAAGTC AAGAGTGAGT TCAATTCCTA CAGCCTGACA
1201 GGGTATGTGT GAAGAACCAG GGGCCAGAGC TGGGGGGTGG CTGGGTCTGT
1251 GAAAAACAGT GGACAGCACC CCGAGGGCCA CAGGTGAGGG ACACTACCAC
1301 TGGATCGTGT CAGAAGGTGC TGCTGAGGAT AGACTGACTT TGGCCATTGG
1351 ATTGAGCAAA GGCAGAAATG GGGGCTAGTG TAACAGCATG CAGGTTGAAT
1401 TGCCAAGGAT GCTCGCCATG CCAGCCTTTC TGTTTTCCTC ACCTTGCTGC
1451 TCCCCTGCCC TAAGTCCCCA ACCCTCAACT TGAAACCCCA TTCCCTTAAG
1501 CCAGGACTCA GAGGATCCCT TTGCCCTCTG GTTTACCTGG GACTCCATCC
1551 CCAAACCCAC TAATCACATC CCACTGACTG ACCCTCTGTG ATCAAAGACC
1601 CTCTCTCTGG CTGAGGTTGG CTCTTAGCTC ATTGCTGGGG ATGGGAAGGA
1651 GAAGCAGTGG CTTTTGTGGG CATTGCTCTA ACCTACTTCT CAAGCTTCCC
1701 TCCAAAGAAA CTGATTGGCC CTGGAACCTC CATCCCACTC TTGTTATGAC
1751 TCCACAGTGT CCAGACTAAT TTGTGCATGA ACTGAAATAA AACCATCCTA
1801 CGGTATCCAG GGAACAGAAA GCAGGATGCA GGATGGGAGG ACAGGAAGGC
1851 AGCCTGGGAC ATTTAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1901 AAAAAAAAAA AAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:2)长度:230个氨基酸
1 MASLGLQLVG YILGLLGLLG TLVAMLLPSW KTSSYVGASI VTAVGFSKGL
51 WMECATHSTG ITQCDIYSTL LGLPADIQAA QAMMVTSSAI SSLACIISVV
101 GMRCTVFCQE SRAKDRVAVA GGVFFILGGL LGFIPVAWNL HGILRDFYSP
151 LVPDSMKFEI GEALYLGIIS SLFSLIAGII LCFSCSSQRN RSNYYDAYQA
201 QPLATRSSPR PGQPPKVKSE FNSYSLTGYV
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:3)
克隆号和蛋白名称:SP82
起始编码子: 520 ATG 终止编码子:1212 TGA
蛋白质分子量:24574.31
1 CCC AGA GCA AGC CGA TTC TCT ACA CAC TGC CTT CCC TTC CTG TAA GAC 48
49 TCA TCA AAA AGG CAC CCC AAC CTT GCA TGG ATC TGC TGT TGG TAT TCC 96
97 TTG GGG TGA AGC CAG AAG TCA GGC TTT CCA CAG AGA GAC GGG ACT ACA 144
145 TGG CCA CCT GGG AAG GCT AGG GAG TCA AAG GGC CTG AGG AAT GAC TAC 192
193 TTC CCT CCA CAA GGG CAT TCC CTG CCC TGC TCT GCT TCC TGG GGG CTT 240
241 CAG CAA GCC TTC CTT CTA GAG CTC CTA GAA CCC TCC CAT GGT CAA CAC 288
289 AAC AGC AGC CCA GAC AAT GAG ATG CAA GAG GCC TGA GCT CAC AGG CCA 336
337 TTC AGG TCT TCT AGA TGC CTT CTT GAG GCT GCT TGT GGC CAC CCA CAG 384
385 ACA CTT GTA AGG AGG AGA GAA GTC AGC CTG GCA GAG AGA CTC TGA AAT 432
433 GAG GGA TTA GAG GTG TTC AAG GAG CAA GAG CTT CAG CCT GAA GAC AAG 480
481 GGA GCA GTC CCT GAA GAC GCT TCT ACT GAG AGG TCT GCC ATG GCC TCT 528
1 Met Ala Ser 3
529 CTT GGC CTC CAA CTT GTG GGC TAC ATC CTA GGC CTT CTG GGG CTT TTG 576
4 Leu Gly Leu Gln Leu Val Gly Tyr Ile Leu Gly Leu Leu Gly Leu Leu 19
577 GGC ACA CTG GTT GCC ATG CTG CTC CCC AGC TGG AAA ACA AGT TCT TAT 624
20 Gly Thr Leu Val Ala Met Leu Leu Pro Ser Trp Lys Thr Ser Ser Tyr 35
625 GTC GGT GCC AGC ATT GTG ACA GCA GTT GGC TTC TCC AAG GGC CTC TGG 672
36 Val Gly Ala Ser Ile Val Thr Ala Val Gly Phe Ser Lys Gly Leu Trp 51
673 ATG GAA TGT GCC ACA CAC AGC ACA GGC ATC ACC CAG TGT GAC ATC TAT 720
52 Met Glu Cys Ala Thr His Ser Thr Gly Ile Thr Gln Cys Asp Ile Tyr 67
721 AGC ACC CTT CTG GGC CTG CCC GCT GAC ATC CAG GCT GCC CAG GCC ATG 768
68 Ser Thr Leu Leu Gly Leu Pro Ala Asp Ile Gln Ala Ala Gln Ala Met 83
769 ATG GTG ACA TCC AGT GCA ATC TCC TCC CTG GCC TGC ATT ATC TCT GTG 816
84 Met Val Thr Ser Ser Ala Ile Ser Ser Leu Ala Cys Ile Ile Ser Val 99
817 GTG GGC ATG AGA TGC ACA GTC TTC TGC CAG GAA TCC CGA GCC AAA GAC 864
100 Val Gly Met Arg Cys Thr Val Phe Cys Gln Glu Ser Arg Ala Lys Asp 115
865 AGA GTG GCG GTA GCA GGT GGA GTC TTT TTC ATC CTT GGA GGC CTC CTG 912
116 Arg Val Ala Val Ala Gly Gly Val Phe Phe Ile Leu Gly Gly Leu Leu 131
913 GGA TTC ATT CCT GTT GCC TGG AAT CTT CAT GGG ATC CTA CGG GAC TTC 960
132 Gly Phe Ile Pro Val Ala Trp Asn Leu His Gly Ile Leu Arg Asp Phe 147
961 TAC TCA CCA CTG GTG CCT GAC AGC ATG AAA TTT GAG ATT GGA GAG GCT 1008
148 Tyr Ser Pro Leu Val Pro Asp Ser Met Lys Phe Glu Ile Gly Glu Ala 163
1009 CTT TAC TTG GGC ATT ATT TCT TCC CTG TTC TCC CTG ATA GCT GGA ATC 1056
164 Leu Tyr Leu Gly Ile Ile Ser Ser Leu Phe Ser Leu Ile Ala Gly Ile 179
1057 ATC CTC TGC TTT TCC TGC TCA TCC CAG AGA AAT CGC TCC AAC TAC TAC 1104
180 Ile Leu Cys Phe Ser Cys Ser Ser Gln Arg Asn Arg Ser Asn Tyr Tyr 195
1105 GAT GCC TAC CAA GCC CAA CCT CTT GCC ACA AGG AGC TCT CCA AGG CCT 1152
196 Asp Ala Tyr Gln Ala Gln Pro Leu Ala Thr Arg Ser Ser Pro Arg Pro 211
1153 GGT CAA CCT CCC AAA GTC AAG AGT GAG TTC AAT TCC TAC AGC CTG ACA 1200
212 Gly Gln Pro Pro Lys Val Lys Ser Glu Phe Asn Ser Tyr Ser Leu Thr 227
1201 GGG TAT GTG TGA AGA ACC AGG GGC CAG AGC TGG GGG GTG GCT GGG TCT 1248
228 Gly Tyr Val *** 231
1249 GTG AAA AAC AGT GGA CAG CAC CCC GAG GGC CAC AGG TGA GGG ACA CTA 1296
1297 CCA CTG GAT CGT GTC AGA AGG TGC TGC TGA GGA TAG ACT GAC TTT GGC 1344
1345 CAT TGG ATT GAG CAA AGG CAG AAA TGG GGG CTA GTG TAA CAG CAT GCA 1392
1393 GGT TGA ATT GCC AAG GAT GCT CGC CAT GCC AGC CTT TCT GTT TTC CTC 1440
1441 ACC TTG CTG CTC CCC TGC CCT AAG TCC CCA ACC CTC AAC TTG AAA CCC 1488
1489 CAT TCC CTT AAG CCA GGA CTC AGA GGA TCC CTT TGC CCT CTG GTT TAC 1536
1537 CTG GGA CTC CAT CCC CAA ACC CAC TAA TCA CAT CCC ACT GAC TGA CCC 1584
1585 TCT GTG ATC AAA GAC CCT CTC TCT GGC TGA GGT TGG CTC TTA GCT CAT 1632
1633 TGC TGG GGA TGG GAA GGA GAA GCA GTG GCT TTT GTG GGC ATT GCT CTA 1680
1681 ACC TAC TTC TCA AGC TTC CCT CCA AAG AAA CTG ATT GGC CCT GGA ACC 1728
1729 TCC ATC CCA CTC TTG TTA TGA CTC CAC AGT GTC CAG ACT AAT TTG TGC 1776
1777 ATG AAC TGA AAT AAA ACC ATC CTA CGG TAT CCA GGG AAC AGA AAG CAG 1824
1825 GAT GCA GGA TGG GAG GAC AGG AAG GCA GCC TGG GAC ATT TAA AAA AAA 1872
1873 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA A 1918
D:Blastp结果
Query=SP82[基因=SP82](230个氨基酸)
>SP_R0:O88552 O88552 mus musculus(mouse).claudin-2.11/1998
长度=230
分值=326bits(826),预计值=1e-88
相同性=159/203(78%),相似性=166/203(81%)
Query:28 PSWKTSSYVGASIVTAVGFSKGLWMECATHSTGITQCDIYSTLLGLPADIQAAQAMMVTX 87
P+W+TSSYVGASIVTAVGFSKGLWMECATHSTGITQCDIYSTLLGLPADIQAAQAMMVT
Sbjct:28 PNWRTSSYVGASIVTAVGFSKGLWMECATHSTGITQCDIYSTLLGLPADIQAAQAMMVTS 87
Query:88 XXXXXXXXXXXVVGMRCTVFCQESRAKDRXXXXXXXXXXXXXXXXXXPVAWNLHGILRDF 147
VVGMRCTVFCQ+SRAKDR PVAWNLHGILRDF
Sbjct:88 SAMSSLACIISVVGMRCTVFCQDSRAKDRVAVVGGVFFILGGILGFIPVAWNLHGILRDF 147
Query:148 YSPLVPDSMKFEIGEALYLGIISSLFSLIAGIILCFSCSSQRNRSNYYDAYQAQPLATRS 207
YSPLVPDSMKFEIGEALYLGIIS+LFSL+AG+ILCFSCS Q NR+NYYD YQAQPLATRS
Sbjct:148 YSPLVPDSMKFEIGEALYLGIISALFSLVAGVILCFSCSPQGNRTNyYDGYQAQPLATRS 207
Query:208 SPRPGQPPKVKSEFNSYSLTGYV 230
SPR Q PK KSEFNSYSLTGYV
Sbjct:208 SPRSAQQPKAKSEFNSYSLTGYV 230
E:Blastn结果
Query=SP82[org=Homo sapiens](1918个核苷酸)
>GB_RO:AF072128 AF072128 Mus musculus claudin-2 mRNA,complete cds.
7/1998
长度=791
分值=747bits(377),预计值=0.0
相同性=647/737(87%),相似性=647/737(87%)
Query:500 cttctactgagaggtctgccatggcctctcttggcctccaacttgtgggctacatcctag 559
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Sbjct:28 cttctactgagaggtctgccatggcctcccttggcgttcaactggtgggctacatcctag 87
Query:560 gccttctggggcttttgggcacactggttgccatgctgctccccagctggaaaacaagtt 619
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Sbjct:88 gccttttggggctgttaggcacatccattgccatgctgcttcccaactggcgaacgagtt 147
Query:620 cttatgtcggtgccagcattgtgacagcagttggcttctccaagggcctctggatggaat 679
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Sbjct:148 cctatgttggtgccagcattgtgacggcggttggcttttccaagggcctctggatggagt 207
Query:680 gtgccacacacagcacaggcatcacccagtgtgacatctatagcacccttctgggcctgc 739
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Sbjct:208 gtgcgacacacagcacaggcatcacccagtgcgatatctacagtacccttttaggacttc 267
Query:740 ccgctgacatccaggctgcccaggccatgatggtgacatccagtgcaatctcctccctgg 799
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Sbjct:268 ctgctgacatccaggctgcccaggccatgatggtgacgtccagtgcaatgtcctcgctgg 327
Query:800 cctgcattatctctgtggtgggcatgagatgcacagtcttctgccaggaatcccgagcca 859
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Sbjct:328 cttgtattatctctgtggtgggcatgagatgcaccgtgttctgccaggattctcgagcta 387
Query:860 aagacagagtggcggtagcaggtggagtctttttcatccttggaggcctcctgggattca 919
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Query:920 ttcctgttgcctggaatcttcatgggatcctacgggacttctactcaccactggtgcctg 979
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Sbjct:448 tcccagttgcttggaatcttcatggcatccttcgggacttctactcgccgctggttcctg 507
Query:980 acagcatgaaatttgagattggagaggctctttacttgggcattatttcttccctgttct 1039
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Sbjct:508 acagcatgaaatttgagattggagaggctctgtacttgggcatcatctcagccctgtttt 567
Query:1040 ccctgatagctggaatcatcctctgcttttcctgctcatcccagagaaatcgctccaact 1099
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Query:1100 actacgatgcctaccaagcccaacctcttgccacaaggagctctccaaggcctggtcaac 1159
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Query:1220 ggggccagagctggggg 1236
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Sbjct:748 ggggccagagctggggg 764
2.SP192
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:4)长度:2390bp
1 TGCTTCATCA TAAGTCGTGC TGCCGGCCAG GTTACTTAAG CACCCTTTTA
51 ACAAGGAAAC CTTGTGGGAG ATCCAGCTGG CCGACTCGAG TTCAGAAACG
101 GGACCACAGA GGTTACACTC TGGGATCCTG GCCATGAGGT TGGATGCCTC
151 ACCTTACTGA AAGGAGACAC TGGACCTAAA TGGCGCAGCA TGATTTTGTT
201 CCTGCTTGGC TAAATTTCTC AACACCACAG TCAGCTAAGT CACCTACTGC
251 CACCTTCGAA AAACACGGAG AGCACCTACC CAGAGGAGAA GGTAGATTTG
301 GAGTAAGCCG CCGTCGACAT AATTCCTCTG ATGGTTTTTT TAACAATGGT
351 CCCCTACGAA CTGCAGGAGA TTCTTGGCAC CAGCCCTCCC TGTTCCGCCA
401 TGATTCTGTG GACTCTGGTG TCTCTAAGGG AGCATATGCT GGAATCACAG
451 GGAACCCATC TGGTTGGCAT AGCTCTTCCC GAGGTCATGA TGGCATGAGC
501 CAACGTAGTG GAGGTGGCAC AGGGAACCAT CGCCATTGGA ATGGCAGCTT
551 CCACTCCCGG AAAGGGTGTG CTTTTCAGGA AAAGCCACCT ATGGAGATTA
601 GGGAAGAAAA GAAAGAAGAC AAGGTGGAAA AGTTGCAGTT TGAAGAGGAG
651 GACTTTCCTT CCTTGAATCC AGAAGCTGGC AAACAGCATC AGCCATGCAG
701 ACCTATTGGG ACACCTTCTG GAGTATGGGA AAACCCGCCT AGTGCCAAGC
751 AACCCTCCAA GATGCTAGTT ATCAAAAAAG TTTCCAAAGA GGATCCTGCT
801 GCTGCCTTCT CTGCTGCATT CACCTCACCA GGATCTCACC ATGCAAATGG
851 GAACAAATTG TCATCCGTGG TTCCAAGTGT CTATAAGAAC CTGGTTCCTA
901 AGCCTGTACC ACCTCCTTCC AAGCCTAATG CATGGAAAGC TAACAGGATG
951 GAGCACAAGT CAGGATCCCT TTCCTCTAGC CGGGAGTCTG CTTTTACCAG
1001 TCCAATCTCT GTTACCAAAC CAGTGGTACT GGCTAGTGGT GCAGCTCTGA
1051 GTTCTCCCAA AGAGAGTCCC TCCAGCACCA CCCCTCCAAT TGAGATCAGC
1101 TCCTCTCGTC TGACCAAGTT GACCCGCCGA ACCACCGACA GGAAGAGTGA
1151 GTTCCTGAAA ACTCTGAAGG ATGACCGGAA TGGAGACTTC TCAGAGAATA
1201 GAGACTGTGA CAAGCTGGAA GATTTGGAGG ACAACAGCAC ACCTGAACCA
1251 AAGGAAAATG GGGAGGAAGG CTGTCATCAA AATGGTCTTG CCCTCCCTGT
1301 AGTGGAAGAA GGGGAGGTTC TCTCACACTC TCTAGAAGCA GAGCACAGGT
1351 TATTGAAAGC TATGGGTTGG CAGGAATATC CTGAAAATGA TGAGAATTGC
1401 CTTCCCCTCA CAGAGGATGA GCTCAAGGAG TTCCACATGA AGACAGAGCA
1451 GCTGAGAAGA AATGGCTTTG GAAAGAATGG CTTCTTGCAG AGCCGCAGTT
1501 CCAGCCTGTT CTCCCCTTGG AGAAGCACTT GCAAAGCAGA GTTTGAGGAC
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1601 GTAGGCATAT AAATGCTCAC AGTTAAATCT GACCCAGTAA ACTCTGTGTG
1651 TTTAGGGAGT ATACAAAAGA AATCGTTCTT TTCCTTTTCT TATGTTGTTG
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1751 GCTTGTTTTG CTTTTGTTAT TGTTCTTCCC TGTTATCTGC TTTATAGAGA
1801 GAAGTTTGTG TGGTGGGACA GATTTTTTAA ACACACTCAT ACACACACAC
1851 ACATACACAC CCAGTATATA TGGGGCGATG CACAGGTAGG AGCTGGCAGT
1901 GCAGGGAAGA GGAGACACTG GTCTGCAGCA ACAGCTTCTA CTACCAGCCC
1951 TTGGGGCACT CACCCCTGTG ATCAAGCAAT CATTGTCAAT GACAAAGTGA
2001 CTATTGAAGT TATAATTGTA TTAAATTAAT GCTAATAATT TGGATATTTT
2051 ATTTTATTTT TGGCTGCTCG GGTAACTTTA GCCCTTAACC AAGCATATGT
2101 GGGTTTTTTT GGTTGTTTTT TTGTTTTTGT TTTTTTTTTC TTTTTCCTTT
2151 TTGGGTACAG CTGTAAAATA TTTGGATATA GGAAATGTTG TGTTATTCTT
2201 GCAGCCTTGA TATTCAGGGT GGATTGTAAA ATATAAATTT TTGTGAGATT
2251 TCAAAGATTA AGATTATTTT GATAACATTA TTTACAGATT TAAAAGATGT
2301 GGTTATCACA AGTCTCGAGG GGGAAACTAC TGCATAAAAT AACTAACTTG
2351 GAATAAATAT TTTGCATCAG TTAAAAAAAA AAAAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:5)长度:474个氨基酸
1 MAQHDFVPAW LNFSTPQSAK SPTATFEKHG EHLPRGEGRF GVSRRRHNSS
51 DGFFNNGPLR TAGDSWHQPS LFRHDSVDSG VSKGAYAGIT GNPSGWHSSS
101 RGHDGMSQRS GGGTGNHRHW NGSFHSRKGC AFQEKPPMEI REEKKEDKVE
151 KLQFEEEDFP SLNPEAGKQH QPCRPIGTPS GVWENPPSAK QPSKMLVIKK
201 VSKEDPAAAF SAAFTSPGSH HANGNKLSSV VPSVYKNLVP KPVPPPSKPN
251 AWKANRMEHK SGSLSSSRES AFTSPISVTK PVVLASGAAL SSPKESPSST
301 TPPIEISSSR LTKLTRRTTD RKSEFLKTLK DDRNGDFSEN RDCDKLEDLE
351 DNSTPEPKEN GEEGCHQNGL ALPVVEEGEV LSHSLEAEHR LLKAMGWQEY
401 PENDENCLPL TEDELKEFHM KTEQLRRNGF GKNGFLQSRS SSLFSPWRST
451 CKAEFEDSDT ETSSSETSDD DAWK
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:6)
克隆号和蛋白名称:PP192
起始编码子: 180 ATG 终止编码子:1604 TAG
蛋白质分子量:52298.77
1 TG CTT CAT CAT AAG TCG TGC TGC CGG CCA GGT TAC TTA AGC ACC CTT 47
48 TTA ACA AGG AAA CCT TGT GGG AGA TCC AGC TGG CCG ACT CGA GTT CAG 95
96 AAA CGG GAC CAC AGA GGT TAC ACT CTG GGA TCC TGG CCA TGA GGT TGG 143
144 ATG CCT CAC CTT ACT GAA AGG AGA CAC TGG ACC TAA ATG GCG CAG CAT 191
1 Met Ala Gln His 4
192 GAT TTT GTT CCT GCT TGG CTA AAT TTC TCA ACA CCA CAG TCA GCT AAG 239
5 Asp Phe Val Pro Ala Trp Leu Asn Phe Ser Thr Pro Gln Ser Ala Lys 20
240 TCA CCT ACT GCC ACC TTC GAA AAA CAC GGA GAG CAC CTA CCC AGA GGA 287
21 Ser Pro Thr Ala Thr Phe Glu Lys His Gly Glu His Leu Pro Arg Gly 36
288 GAA GGT AGA TTT GGA GTA AGC CGC CGT CGA CAT AAT TCC TCT GAT GGT 335
37 Glu Gly Arg Phe Gly Val Ser Arg Arg Arg His Asn Ser Ser Asp Gly 52
336 TTT TTT AAC AAT GGT CCC CTA CGA ACT GCA GGA GAT TCT TGG CAC CAG 383
53 Phe Phe Asn Asn Gly Pro Leu Arg Thr Ala Gly Asp Ser Trp His Gln 68
384 CCC TCC CTG TTC CGC CAT GAT TCT GTG GAC TCT GGT GTC TCT AAG GGA 431
69 Pro Ser Leu Phe Arg His Asp Ser Val Asp Ser Gly Val Ser Lys Gly 84
432 GCA TAT GCT GGA ATC ACA GGG AAC CCA TCT GGT TGG CAT AGC TCT TCC 479
85 Ala Tyr Ala Gly Ile Thr Gly Asn Pro Ser Gly Trp His Ser Ser Ser 100
480 CGA GGT CAT GAT GGC ATG AGC CAA CGT AGT GGA GGT GGC ACA GGG AAC 527
101 Arg Gly His Asp Gly Met Ser Gln Arg Ser Gly Gly Gly Thr Gly Asn 116
528 CAT CGC CAT TGG AAT GGC AGC TTC CAC TCC CGG AAA GGG TGT GCT TTT 575
117 His Arg His Trp Asn Gly Ser Phe His Ser Arg Lys Gly Cys Ala Phe 132
576 CAG GAA AAG CCA CCT ATG GAG ATT AGG GAA GAA AAG AAA GAA GAC AAG 623
133 Gln Glu Lys Pro Pro Met Glu Ile Arg Glu Glu Lys Lys Glu Asp Lys 148
624 GTG GAA AAG TTG CAG TTT GAA GAG GAG GAC TTT CCT TCC TTG AAT CCA 671
149 Val Glu Lys Leu Gln Phe Glu Glu Glu Asp Phe Pro Ser Leu Asn Pro 164
672 GAA GCT GGC AAA CAG CAT CAG CCA TGC AGA CCT ATT GGG ACA CCT TCT 719
165 Glu Ala Gly Lys Gln His Gln Pro Cys Arg Pro Ile Gly Thr Pro Ser 180
720 GGA GTA TGG GAA AAC CCG CCT AGT GCC AAG CAA CCC TCC AAG ATG CTA 767
181 Gly Val Trp Glu Asn Pro Pro Ser Ala Lys Gln Pro Ser Lys Met Leu 196
768 GTT ATC AAA AAA GTT TCC AAA GAG GAT CCT GCT GCT GCC TTC TCT GCT 815
197 Val Ile Lys Lys Val Ser Lys Glu Asp Pro Ala Ala Ala Phe Ser Ala 212
816 GCA TTC ACC TCA CCA GGA TCT CAC CAT GCA AAT GGG AAC AAA TTG TCA 863
213 Ala Phe Thr Ser Pro Gly Ser His His Ala Asn Gly Asn Lys Leu Ser 228
864 TCC GTG GTT CCA AGT GTC TAT AAG AAC CTG GTT CCT AAG CCT GTA CCA 911
229 Ser Val Val Pro Ser Val Tyr Lys Asn Leu Val Pro Lys Pro Val Pro 244
912 CCT CCT TCC AAG CCT AAT GCA TGG AAA GCT AAC AGG ATG GAG CAC AAG 959
245 Pro Pro Ser Lys Pro Asn Ala Trp Lys Ala Asn Arg Met Glu His Lys 260
960 TCA GGA TCC CTT TCC TCT AGC CGG GAG TCT GCT TTT ACC AGT CCA ATC 1007
261 Ser Gly Ser Leu Ser Ser Ser Arg Glu Ser Ala Phe Thr Ser Pro Ile 276
1008 TCT GTT ACC AAA CCA GTG GTA CTG GCT AGT GGT GCA GCT CTG AGT TCT 1055
277 Ser Val Thr Lys Pro Val Val Leu Ala Ser Gly Ala Ala Leu Ser Ser 292
1056 CCC AAA GAG AGT CCC TCC AGC ACC ACC CCT CCA ATT GAG ATC AGC TCC 1103
293 Pro Lys Glu Ser Pro Ser Ser Thr Thr Pro Pro Ile Glu Ile Ser Ser 308
1104 TCT CGT CTG ACC AAG TTG ACC CGC CGA ACC ACC GAC AGG AAG AGT GAG 1151
309 Ser Arg Leu Thr Lys Leu Thr Arg Arg Thr Thr Asp Arg Lys Ser Glu 324
1152 TTC CTG AAA ACT CTG AAG GAT GAC CGG AAT GGA GAC TTC TCA GAG AAT 1199
325 Phe Leu Lys Thr Leu Lys Asp Asp Arg Asn Gly Asp Phe Ser Glu Asn 340
1200 AGA GAC TGT GAC AAG CTG GAA GAT TTG GAG GAC AAC AGC ACA CCT GAA 1247
341 Arg Asp Cys Asp Lys Leu Glu Asp Leu Glu Asp Asn Ser Thr Pro Glu 356
1248 CCA AAG GAA AAT GGG GAG GAA GGC TGT CAT CAA AAT GGT CTT GCC CTC 1295
357 Pro Lys Glu Asn Gly Glu Glu Gly Cys His Gln Asn Gly Leu Ala Leu 372
1296 CCT GTA GTG GAA GAA GGG GAG GTT CTC TCA CAC TCT CTA GAA GCA GAG 1343
373 Pro Val Val Glu Glu Gly Glu Val Leu Ser His Ser Leu Glu Ala Glu 388
1344 CAC AGG TTA TTG AAA GCT ATG GGT TGG CAG GAA TAT CCT GAA AAT GAT 1391
389 His Arg Leu Leu Lys Ala Met Gly Trp Gln Glu Tyr Pro Glu Asn Asp 404
1392 GAG AAT TGC CTT CCC CTC ACA GAG GAT GAG CTC AAG GAG TTC CAC ATG 1439
405 Glu Asn Cys Leu Pro Leu Thr Glu Asp Glu Leu Lys Glu Phe His Met 420
1440 AAG ACA GAG CAG CTG AGA AGA AAT GGC TTT GGA AAG AAT GGC TTC TTG 1487
421 Lys Thr Glu Gln Leu Arg Arg Asn Gly Phe Gly Lys Asn Gly Phe Leu 436
1488 CAG AGC CGC AGT TCC AGC CTG TTC TCC CCT TGG AGA AGC ACT TGC AAA 1535
437 Gln Ser Arg Ser Ser Ser Leu Phe Ser Pro Trp Arg Ser Thr Cys Lys 452
1536 GCA GAG TTT GAG GAC TCA GAC ACC GAA ACC AGT AGC AGT GAA ACA TCA 1583
453 Ala Glu Phe Glu Asp Ser Asp Thr Glu Thr Ser Ser Ser Glu Thr Ser 468
1584 GAT GAC GAT GCC TGG AAG TAG GCA TAT AAA TGC TCA CAG TTA AAT CTG 1631
469 Asp Asp Asp Ala Trp Lys *** 475
1632 ACC CAG TAA ACT CTG TGT GTT TAG GGA GTA TAC AAA AGA AAT CGT TCT 1679
1680 TTT CCT TTT CTT ATG TTG TTG AAT ACT TCA TTC ACA AGG GAA ATA ATC 1727
1728 ATA TCC CAA AGA GAG AGC AAT TGG CTT GTT TTG CTT TTG TTA TTG TTC 1775
1776 TTC CCT GTT ATC TGC TTT ATA GAG AGA AGT TTG TGT GGT GGG ACA GAT 1823
1824 TTT TTA AAC ACA CTC ATA CAC ACA CAC ACA TAC ACA CCC AGT ATA TAT 1871
1872 GGG GCG ATG CAC AGG TAG GAG CTG GCA GTG CAG GGA AGA GGA GAC ACT 1919
1920 GGT CTG CAG CAA CAG CTT CTA CTA CCA GCC CTT GGG GCA CTC ACC CCT 1967
1968 GTG ATC AAG CAA TCA TTG TCA ATG ACA AAG TGA CTA TTG AAG TTA TAA 2015
2016 TTG TAT TAA ATT AAT GCT AAT AAT TTG GAT ATT TTA TTT TAT TTT TGG 2063
2064 CTG CTC GGG TAA CTT TAG CCC TTA ACC AAG CAT ATG TGG GTT TTT TTG 2111
2112 GTT GTT TTT TTG TTT TTG TTT TTT TTT TCT TTT TCC TTT TTG GGT ACA 2159
2160 GCT GTA AAA TAT TTG GAT ATA GGA AAT GTT GTG TTA TTC TTG CAG CCT 2207
2208 TGA TAT TCA GGG TGG ATT GTA AAA TAT AAA TTT TTG TGA GAT TTC AAA 2255
2256 GAT TAA GAT TAT TTT GAT AAC ATT ATT TAC AGA TTT AAA AGA TGT GGT 2303
2304 TAT CAC AAG TCT CGA GGG GGA AAC TAC TGC ATA AAA TAA CTA ACT TGG 2351
2352 AAT AAA TAT TTT GCA TCA GTT AAA AAA AAA AAA AAA AAA 2390
3.PP79
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:7)长度:1626bp
1 CTGACCTCAA GTGATCCACC CACCTCTACC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC
51 AGGTGTGAGC CACCATGCCA GGCCCTCTTA ACCTCTTCAA GTCTGTTTTC
101 TCATCTGCAA AACAGAGGTA ATAAGATCAG TATCTTCTTA ATGGAAGCAC
151 CTGGACTACA TTTTTTTCAT TCATTGTTAT CATAAATGAG GACTAACCTG
201 TCTCCCGTTG GGAGTTTTGA ACCTAGACCT CATGTCTTCA TGACGTCATC
251 ACTGCCCCAG GCCCAGCTGT GTCCCTACAC CAGCCCCAGC TGACGCATCT
301 TCTTTTTCTG CCTGTAGAGA TGGTTACAAT GCCTGGCGTG ATGCATTCTG
351 GCCTTCGCAG ATCCTGGCGG GGCTGTGCCA ACGCTGTGGC CTCCCTGCCC
401 CTGAATACCG AGCCGGTGCT GTCAAGGTGG GCAGCAAAGT CTTCCTGACA
451 CCACCGGAGA CCCTGCCCCC AGGGATCTCT TCACATGTGG ATTGACATCT
501 TTCCTCAAGA TGTGCCTGCT CCACCCCCAG TTGACATCAA GCCTCGGCAG
551 CCAATCAGCT ATGAGCTCAG AGTTGTCATC TGGAACACGG AGGATGTGGT
601 TCTGGATGAC GAGAATCCAC TCACCGGAGA GATGTCGAGT GACATCTATG
651 TGAAGAGCTG GGTGAAGGGG TTGGAGCATG ACAAGCAGGA GACAGACGTT
701 CACTTCAACT CCCTGACTGG GGAGGGGAAC TTCAATTGGC GCTTTGTGTT
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801 CTGGACCCTT TGCCCTGGAG GAGGCGGAGT TCCGGCAGCC TGCAGTGCTG
851 GTCCTGCAGG TCTGGGACTA TGACCGCATC TCTGCCAATG ACTTCCTTGG
901 ATCCCTGGAG TTGCAGCTAC CAGACATGGT GCGTGGGGCC CGGGGCCCCG
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1001 CTGTTTCGCT GCCGCCGCCT GAGGGGCTGG TGGCCGGTAG TGAAGCTGAA
1051 GGAGGCAGAG GACGTGGAGC GGGAGGCGCA GGAGGCTCAG GCTGGCAAGA
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1251 GGCGGAAGCA GCCAGAGCCT CTGGAGAAAC CCAGCCGCCC CAAAACTTCC
1301 TTCAACTGGT TTGTGAACCC GCTGAAGACC TTTGTCTTCT TCATCTGGCG
1351 CCGGTACTGG CGCACCCTGG TGCTGCTGCT ACTGGTGCTG CTCACCGTCT
1401 TCCTCCTCCT GGTCTTCTAC ACCATCCCTG GCCAGATCAG CCAGGTCATC
1451 TTCCGTCCCC TCCACAAGTG ACTCTCGCTG ACCTTGGACA CTCACCCAGG
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1551 CTACCCCAGA GTCTAGTGCT TCCTCTGAAT AAACCTATCA CAGCCCCTGA
1601 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:8)长度:328个氨基酸
1 MWIDIFPQDV PAPPPVDIKP RQPISYELRV VIWNTEDVVL DDENPLTGEM
51 SSDIYVKSWV KGLEHDKQET DVHFNSLTGE GNFNWRFVFR FDYLPTEREV
101 SVWRRSGPFA LEEAEFRQPA VLVLQVWDYD RISANDFLGS LELQLPDMVR
151 GARGPELCSV QLARNGAGPR CNLFRCRRLR GWWPVVKLKE AEDVEREAQE
201 AQAGKKKRKQ RRRKGRPEDL EFTDMGGNVY ILTGKVEAEF ELLTVEEAEK
251 RPVGKGRKQP EPLEKPSRPK TSFNWFVNPL KTFVFFIWRR YWRTLVLLLL
301 VLLTVFLLLV FYTIPGQISQ VIFRPLHK
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:9)
克隆号和蛋白名称:PP79
起始编码子: 485 ATG 终止编码子:1471 TAG
蛋白质分子量:38386.24
1 C TGA CCT CAA GTG ATC CAC CCA CCT CTA CCT CCC AAA GTG CTG GGA 46
47 TTA CAG GTG TGA GCC ACC ATG CCA GGC CCT CTT AAC CTC TTC AAG TCT 94
95 GTT TTC TCA TCT GCA AAA CAG AGG TAA TAA GAT CAG TAT CTT CTT AAT 142
143 GGA AGC ACC TGG ACT ACA TTT TTT TCA TTC ATT GTT ATC ATA AAT GAG 190
191 GAC TAA CCT GTC TCC CGT TGG GAG TTT TGA ACC TAG ACC TCA TGT CTT 238
239 CAT GAC GTC ATC ACT GCC CCA GGC CCA GCT GTG TCC CTA CAC CAG CCC 286
287 CAG CTG ACG CAT CTT CTT TTT CTG CCT GTA GAG ATG GTT ACA ATG CCT 334
335 GGC GTG ATG CAT TCT GGC CTT CGC AGA TCC TGG CGG GGC TGT GCC AAC 382
383 GCT GTG GCC TCC CTG CCC CTG AAT ACC GAG CCG GTG CTG TCA AGG TGG 430
431 GCA GCA AAG TCT TCC TGA CAC CAC CGG AGA CCC TGC CCC CAG GGA TCT 478
479 CTT CAC ATG TGG ATT GAC ATC TTT CCT CAA GAT GTG CCT GCT CCA CCC 526
1 Met Trp Ile Asp Ile Phe Pro Gln Asp Val Pro Ala Pro Pro 14
527 CCA GTT GAC ATC AAG CCT CGG CAG CCA ATC AGC TAT GAG CTC AGA GTT 574
15 Pro Val Asp Ile Lys Pro Arg Gln Pro Ile Ser Tyr Glu Leu Arg Val 30
575 GTC ATC TGG AAC ACG GAG GAT GTG GTT CTG GAT GAC GAG AAT CCA CTC 622
31 Val Ile Trp Asn Thr Glu Asp Val Val Leu Asp Asp Glu Asn Pro Leu 46
623 ACC GGA GAG ATG TCG AGT GAC ATC TAT GTG AAG AGC TGG GTG AAG GGG 670
47 Thr Gly Glu Met Ser Ser Asp Ile Tyr Val Lys Ser Trp Val Lys Gly 62
671 TTG GAG CAT GAC AAG CAG GAG ACA GAC GTT CAC TTC AAC TCC CTG ACT 718
63 Leu Glu His Asp Lys Gln Glu Thr Asp Val His Phe Asn Ser Leu Thr 78
719 GGG GAG GGG AAC TTC AAT TGG CGC TTT GTG TTC CGC TTT GAC TAC CTG 766
79 Gly Glu Gly Asn Phe Asn Trp Arg Phe Val Phe Arg Phe Asp Tyr Leu 94
767 CCC ACG GAG CGG GAG GTG AGC GTC TGG CGC AGG TCT GGA CCC TTT GCC 814
95 Pro Thr Glu Arg Glu Val Ser Val Trp Arg Arg Ser Gly Pro Phe Ala 110
815 CTG GAG GAG GCG GAG TTC CGG CAG CCT GCA GTG CTG GTC CTG CAG GTC 862
111 Leu Glu Glu Ala Glu Phe Arg Gln Pro Ala Val Leu Val Leu Gln Val 126
863 TGG GAC TAT GAC CGC ATC TCT GCC AAT GAC TTC CTT GGA TCC CTG GAG 910
127 Trp Asp Tyr Asp Arg Ile Ser Ala Asn Asp Phe Leu Gly Ser Leu Glu 142
911 TTG CAG CTA CCA GAC ATG GTG CGT GGG GCC CGG GGC CCC GAG CTC TGC 958
143 Leu Gln Leu Pro Asp Met Val Arg Gly Ala Arg Gly Pro Glu Leu Cys 158
959 TCT GTG CAG CTG GCC CGC AAT GGG GCC GGG CCG AGG TGC AAT CTG TTT 1006
159 Ser Val Gln Leu Ala Arg Asn Gly Ala Gly Pro Arg Cys Asn Leu Phe 174
1007 CGC TGC CGC CGC CTG AGG GGC TGG TGG CCG GTA GTG AAG CTG AAG GAG 1054
175 Arg Cys Arg Arg Leu Arg Gly Trp Trp Pro Val Val Lys Leu Lys Glu 190
1055 GCA GAG GAC GTG GAG CGG GAG GCG CAG GAG GCT CAG GCT GGC AAG AAG 1102
191 Ala Glu Asp Val Glu Arg Glu Ala Gln Glu Ala Gln Ala Gly Lys Lys 206
1103 AAG CGA AAG CAG AGG AGG AGG AAG GGC CGG CCA GAA GAC CTG GAG TTC 1150
207 Lys Arg Lys Gln Arg Arg Arg Lys Gly Arg Pro Glu Asp Leu Glu Phe 222
1151 ACA GAC ATG GGT GGC AAT GTG TAC ATC CTC ACG GGC AAG GTG GAG GCA 1198
223 Thr Asp Met Gly Gly Asn Val Tyr Ile Leu Thr Gly Lys Val Glu Ala 238
1199 GAG TTT GAG CTG CTG ACT GTG GAG GAG GCC GAG AAA CGG CCA GTG GGG 1246
239 Glu Phe Glu Leu Leu Thr Val Glu Glu Ala Glu Lys Arg Pro Val Gly 254
1247 AAG GGG CGG AAG CAG CCA GAG CCT CTG GAG AAA CCC AGC CGC CCC AAA 1294
255 Lys Gly Arg Lys Gln Pro Glu Pro Leu Glu Lys Pro Ser Arg Pro Lys 270
1295 ACT TCC TTC AAC TGG TTT GTG AAC CCG CTG AAG ACC TTT GTC TTC TTC 1342
271 Thr Ser Phe Asn Trp Phe Val Asn Pro Leu Lys Thr Phe Val Phe Phe 286
1343 ATC TGG CGC CGG TAC TGG CGC ACC CTG GTG CTG CTG CTA CTG GTG CTG 1390
287 Ile Trp Arg Arg Tyr Trp Arg Thr Leu Val Leu Leu Leu Leu Val Leu 302
1391 CTC ACC GTC TTC CTC CTC CTG GTC TTC TAC ACC ATC CCT GGC CAG ATC 1438
303 Leu Thr Val Phe Leu Leu Leu Val Phe Tyr Thr Ile Pro Gly Gln Ile 318
1439 AGC CAG GTC ATC TTC CGT CCC CTC CAC AAG TGA CTC TCG CTG ACC TTG 1486
319 Ser Gln Val Ile Phe Arg Pro Leu His Lys *** 329
1487 GAC ACT CAC CCA GGG TGC CAA CCC TTC AAT GCC TGC TCC TGG AAG TCT 1534
1535 TTC TTA CCC ATG TGA GCT ACC CCA GAG TCT AGT GCT TCC TCT GAA TAA 1582
1583 ACC TAT CAC AGC CCC TGA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AA 1626
D:Blastp结果
Query=PP79[基因=PP79](328个氨基酸)
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4.PP1009
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:10)长度:1605bp
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901 GGTGGTGTCC CCCTTTGTCC TCCGCCCAGG GCAGGGAAAG TGCTTAGTAT
951 TAGCGTGATG CTTGGGGTTA TTGGAGCCTG AGCTTGACCT CAAACGGGTG
1001 GCGATTTGAT GGGTACCCCC AGGCTGGGGA AAATGACAGC GCTTCTCCTA
1051 ATCAGCTCAC TGGATTCCAT CACCCTGAGC GGTAAACCAG ATGGGCGTCA
1101 CCCCAGTTCT GCAGACACAT ACACAACCCG TTTGCTGCAG AGCCGGACCC
1151 AGTGGCTACA CCCACAGCGG TCTGTGGTAG AGAACTCTCT TCCTTCTTTC
1201 CACCGACAGG GGCGAGGGGT GTTTCCTCGC GGCAGCCCCC GCGAAGAAAT
1251 CTCGAGAGAA CTGGCATGAG GAGTTAGGTT CATCACAAAT ACACACACAC
1301 TGCCCCCAAC CCTCTGCCGT TGCCTCTCTC AGAAAAACAA GACGTACTGA
1351 ATGAAATATT TTACTAAGCG TTCAGTCTGT GCCTCCTGCA TGGGTGGGAG
1401 TGAGGGGAAC GAGACCCCCA GCCTCTGCAA ATGCTACCCC CAGGCTCCTG
1451 GGAGACCTGG CGATGCACTC CTGGGCTCAG GGTCCATCAG GCAGCCTCTT
1501 ACCCTAGAGC TCTCTCCACT CTGAGGTTCA GAAGGACCCC AACCCACACC
1551 GTAGGCGTTC CCCCCAAGTA AAGTTAGGTA GCAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1601 AAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:11)长度:172个氨基酸
1 MAIRPGRRTR AHFAEGRLCA PQAPRAPGHE AQHPGRAPAL RPPPQPVGQR
51 RPLVAAHPGD AAGRDQGPPR AGAGPGAAHH GSGEHAVRAG GRHGLAPRAR
101 QAERGGAHKL GPAPAFSPEL RTPPSWAGPG GGTGEGTPPL AGDQNSWSLG
151 ETHVAPAEAG LRASSGTRLE LA
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:12)
克隆号和蛋白名称:PP1009
起始编码子: 334 ATG 终止编码子:852 TAG
蛋白质分子量:17387.35
1 CAA CGG GGT CCT ATT GCC CTT TTA CGA TCC CGA CTC CAG CAT CGT CTA 48
49 CCT GTG TGG CAA GGG CGA CAG CAG CAT TCG GTA CTT TGA GAT TAC CGA 96
97 CGA GCC GCC TTT CGT GCA CTA CCT GAA CAC GTT CAG CAG CAA AGA GCC 144
145 GCA GCG GGG CAT GGG TTT CAT GCC CAA AAG GGG ACT GGA TGT CAG CAA 192
193 GTG TGA GAT CGC CCG GTT CTA CAA GCT ACA CGA AAG AAA GTG TGA ACC 240
241 TAT CAT CAT GAC TGT GCC CCG CAA GTC AGA CCT CTT CCA GGA CGA TCT 288
289 GTA CCC GGA TAC GCC AGG CCC GGA GCC GGC CCT AGA AGC GGA CGA ATG 336
1 Met 1
337 GCT ATC CGG CCA GGA CGC CGA ACC CGT GCT CAT TTC GCT GAG GGA CGG 384
2 Ala Ile Arg Pro Gly Arg Arg Thr Arg Ala His Phe Ala Glu Gly Arg 17
385 CTA TGT GCC CCC CAA GCA CCG CGA GCT CCG GGT CAC GAA GCG CAA CAT 432
18 Leu Cys Ala Pro Gln Ala Pro Arg Ala Pro Gly His Glu Ala Gln His 33
433 CCT GGA CGT GCG CCC GCC CTC CGG CCC CCG CCG CAG CCA GTC GGC CAG 480
34 Pro Gly Arg Ala Pro Ala Leu Arg Pro Pro Pro Gln Pro Val Gly Gln 49
481 CGA CGC CCC CTT GTC GCA GCA CAC CCT GGA GAC GCT GCT GGA AGA GAT 528
50 Arg Arg Pro Leu Val Ala Ala His Pro Gly Asp Ala Ala Gly Arg Asp 65
529 CAA GGC CCT CCG CGA GCG GGT GCA GGC CCA GGA GCA GCG CAT CAC GGC 576
66 Gln Gly Pro Pro Arg Ala Gly Ala Gly Pro Gly Ala Ala His His Gly 81
577 TCT GGA GAA CAT GCT GTG CGA GCT GGT GGA CGG CAC GGA CTA GCC CCG 624
82 Ser Gly Glu His Ala Val Arg Ala Gly Gly Arg His Gly Leu Ala Pro 97
625 CGC GCC AGG CAG GCG GAG CGG GGC GGG GCG CAC AAG CTC GGC CCC GCC 672
98 Arg Ala Arg Gln Ala Glu Arg Gly Gly Ala His Lys Leu Gly Pro Ala 113
673 CCG GCT TTT AGT CCC GAA CTC CGG ACC CCG CCT TCT TGG GCT GGG CCC 720
114 Pro Ala Phe Ser Pro Glu Leu Arg Thr Pro Pro Ser Trp Ala Gly Pro 129
721 GGG GGC GGG ACT GGG GAG GGA ACT CCG CCC CTC GCG GGA GAC CAG AAC 768
130 Gly Gly Gly Thr Gly Glu Gly Thr Pro Pro Leu Ala Gly Asp Gln Asn 145
769 TCT TGG AGC TTA GGG GAG ACC CAC GTC GCT CCA GCG GAG GCT GGA CTG 816
146 Ser Trp Ser Leu Gly Glu Thr His Val Ala Pro Ala Glu Ala Gly Leu 161
817 CGA GCC TCG TCT GGG ACT CGG CTG GAG CTG GCC TAG GGA GGC CTG GGG 864
162 Arg Ala Ser Ser Gly Thr Arg Leu Glu Leu Ala *** 173
865 TAA CCT GGG GGG CTC AGC AAT GGT GCT GCA CGG CGA GGT GGT GTC CCC 912
913 CTT TGT CCT CCG CCC AGG GCA GGG AAA GTG CTT AGT ATT AGC GTG ATG 960
961 CTT GGG GTT ATT GGA GCC TGA GCT TGA CCT CAA ACG GGT GGC GAT TTG 1008
1009 ATG GGT ACC CCC AGG CTG GGG AAA ATG ACA GCG CTT CTC CTA ATC AGC 1056
1057 TCA CTG GAT TCC ATC ACC CTG AGC GGT AAA CCA GAT GGG CGT CAC CCC 1104
1105 AGT TCT GCA GAC ACA TAC ACA ACC CGT TTG CTG CAG AGC CGG ACC CAG 1152
1153 TGG CTA CAC CCA CAG CGG TCT GTG GTA GAG AAC TCT CTT CCT TCT TTC 1200
1201 CAC CGA CAG GGG CGA GGG GTG TTT CCT CGC GGC AGC CCC CGC GAA GAA 1248
1249 ATC TCG AGA GAA CTG GCA TGA GGA GTT AGG TTC ATC ACA AAT ACA CAC 1296
1297 ACA CTG CCC CCA ACC CTC TGC CGT TGC CTC TCT CAG AAA AAC AAG ACG 1344
1345 TAC TGA ATG AAA TAT TTT ACT AAG CGT TCA GTC TGT GCC TCC TGC ATG 1392
1393 GGT GGG AGT GAG GGG AAC GAG ACC CCC AGC CTC TGC AAA TGC TAC CCC 1440
1441 CAG GCT CCT GGG AGA CCT GGC GAT GCA CTC CTG GGC TCA GGG TCC ATC 1488
1489 AGG CAG CCT CTT ACC CTA GAG CTC TCT CCA CTC TGA GGT TCA GAA GGA 1536
1537 CCC CAA CCC ACA CCG TAG GCG TTC CCC CCA AGT AAA GTT AGG TAG CAA 1584
1585 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1605
5.PP1045
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:13)长度:3108bp
1 TCTGTGGCCA TTGCCACTCA CCTGGGAGCT CAGGTGTTGG GGGCTGAGCA
51 GCAGTGCCCC AGCGCGGAGC CTCCACGTGC TGTCCTCGTA CTTCCTTCGT
101 GGGCGCCGCT GCTCCCCTGG GCGCCTCAGC CCAGCTCCTC TGCTGACAGC
151 CAGCTGCTGT CTCTGCCTGG CTTTTTTGTT GTTGGTCGTC CTGGAGATCC
201 AAGTGTCAAA TTACCGTCGC GAGGGGGAGC CCGAGGAAGC CCTGCTTGGG
251 AACTTGTCCT CCAACTTCAT GTCCCGGTGC CTCACCTCTG CCCTGAGAGC
301 GCTGCTCAGG GACAAGACAA GCTCTCTCTC TCCTCCTCCT TCCTCCTCCT
351 CTCCCTCTCC CCGACTCCCA CGCCGTGGGC TGGGCCTGGG TTGGGAGCTG
401 AAGAAAGAAG TCGGCTCTCT GCCTTCCTGG CCAGGAGGAC CCTGGGGAGG
451 CTCCACCTGA GCCTGTGGAG GGGAGTCCTG CAGCGCTCTC AGGTCTGGGG
501 CACCCACCCT GCCCTCAGGA AGGCCACCCC TTCTGTCCCT CTGGCCACTC
551 CCTGGCTGGT CCCTCCCTCT GGCCTCTCTC AGGAACAACA GTAAACAGTG
601 GGGAGCTGGT GGCCCTCTCA AGCTGAGCAG GAGGCTTTGC AACCAGTCCC
651 TGGGGAGGCC CTTGTGCCGC TCAGCATCTG AAGGCGTCTT GGGGGAGAAC
701 TTGGAATCCT GAGTGACCTG GGAGTGGCCT GCGCGCCCGG CAAGGCGCCT
751 CATGTTCCTT GTGAGGTGCC GCCATGCCGC CATTGCCAAG TACTTCGGGG
801 ATGCGCTGCC TGCCTGCGCC AAAGGCTGCG ACCACTGCCA GAACCCCACG
851 GCCGTGCGGA GGCGGCTGGA GGCCTTGGAG CGCAGCAGCA GCTGGAGCAA
901 GACCTGCATC GGGCCCTCCC AGGGGAACGG CTTTGACCCC GAGCTGTACG
951 AGGGAGGCCG CAAGGGCTAC GGGGACTTCA GCAGGTATGA CGAAGGTTCT
1001 GGAGGCAGCG GGGATGAAGG CAGAGATGAG GCCCACAAGC GGGAGTGGAA
1051 CCTCTTCTAT CAGAAGCAGA TGCAGCTGCG CAAGGGCAAA GACCCCAAGA
1101 TAGAAGAATT TGTACCCCCA GATGAGAACT GTCCCCTGAA AGAGGCTTCT
1151 AGCAGGAGGA TCCCCAGGCT GACTGTGAAG GCACGGGAGC ACTGCCTGCG
1201 GCTTCTGGAG GAGGCGCTGA GCAGCAACCG CCAGTCAACA CGTACCGCTG
1251 ATGAAGCTGA CCTCCGGGCC AAGGCCGTGG AGCTGGAACA TGAGACATTC
1301 CGGAACGCCA AGGTGGCCAA CCTCTACAAG GCCAGCGTGC TGAAGAAGGT
1351 GGCCGATATC CACAGAGCCT CCAAGGATGG GCAGCCCTAT GACATGGGAG
1401 GCAGTGCCAA GAGCTGCAGT GCCCAAGCTG AGCCCCCGGA GCCCAATGAG
1451 TATGACATTC CACCAGCCTC CCATGTGTAC TCGCTCAAAC CCAAGCGGGT
1501 GGGAGCTGGT TTCCCCAAAG GCTCCTGCCC GTTCCAGACG GCCACGGAAC
1551 TGATGGAGAC GACTCGGATC AGGGAGCAAG CCCCCCAGCC CGAGCGGGGA
1601 GGCGAGCATG AGCCCCCGAG CCGGCCCTGT GGCCTCCTGG ATGAGGATGG
1651 GAGTGAGCCC CTCCCTGGGC CCAGAGGGGA GGTCCCTGGA GGCAGCGCTC
1701 ACTATGGGGG GCCCTCCCCT GAGAAGAAGG CAAAAAGTTC CTCTGGGGGC
1751 AGCTCCCTTG CCAAGGGCCG GGCTAGCAAG AAACAGCAGC TCCTAGCCAC
1801 AGCGGCCCAC AAGGATTCTC AGAGCATCGC CCGCTTCTTC TGCCGAAGGG
1851 TGGAAAGCCC AGCTCTGCTG GCATCAGCCC CAGAGGCAGA AGGTGCCTGC
1901 CCCTCCTGTG AGGGGGTTCA GGGACCCCCG ATGGCCCCAG AGAAGTACAC
1951 AGGGGAGGAA GATGGAGCCG GGGGACATTC GCCTGCCCCT CCCCAGACTG
2001 AGGAGTGCCT CAGGGAGAGG CCAAGCACCT GCCCGCCCAG AGACCAGGGC
2051 ACCCCTGAAG TCCAGCCCAC CCCTGCAAAG GACACATGGA AGGGCAAGCG
2101 GCCTCGATCC CAGCAGGAGA ACCCAGAGAG CCAGCCTCAG AAGAGGCCAC
2151 GCCCCTCAGC CAAGCCCTCC GTCGTAGCTG AGGTCAAGGG CAGCGTCTCG
2201 GCCAGCGAAC AGGGCACCTT GAATCCCACG GCTCAAGACC CCTTCCAGCT
2251 CTCCGCTCCT GGCGTCTCCT TGAAGGAGGC TGCAAATGTT GTGGTCAAGT
2301 GCCTCACCCC TTTCTACAAG GAGGGCAAGT TTGCTTCCAA GGAGTTGTTT
2351 AAAGGCTTTG CCCGCCACCT CTCACACTTG CTGACTCAGA AGACCTCTCC
2401 TGGAAGGAGC GTGAAAGAAG AGGCCCAGAA CCTCATCAGG CACTTCTTCC
2451 ATGGCCGGGC CCGGTGCGAG AGCGAAGCTG ACTGGCATGG CCTGTGTGGC
2501 CCCCAGAGAT GACCAACTGC TGGCTGGGCA GGGCCCGCGT CCTCCCCCAG
2551 ATTCTAGCAT GGGTCATCCT GGGCCTCACC TGCTGATGCC AGGGCCATCG
2601 TCTTTTCTCA GTCCTTCTCC TTTCCAACCA TACTTGGCTT TGGGGATGAC
2651 CCCAGACACC CCCTGAATCC AGGTCAGAGG TCAGCCCACC TTTCTTTCTG
2701 CTTGCAAAGC CTATAGACCC TTCTCAGAGC GGTCCTCATG GCTGGGTTTT
2751 CTGGGACACA TGTCGAGGAC AGAAGGTGGA GGGTGGTGGA GCTGCTGCTG
2801 GAAGAAGGGG AAGGAAGAGT GGCCCCTCCC CGAGTTCTAA GTCAGGATGA
2851 GGCCCACCTG TCCAAGGTAT CGGAACCTAC CCAGGGGACC CTCAGATCCT
2901 CCACCCACTC CCCCATCCAT TACGATGCCA GCTTCCAGCC TTGCCCAGGT
2951 CAGAGCTGTG GCAGAGGAGA GGCAGCCAGG CCCTGTTCCT GCTCAGCTCC
3001 TGCTCAGGAA GGCCAGGCCT GACAGATGTT TGGGAGAGGA ATAAAGTTGT
3051 GTTGTTGTGG GGCATGCAGG CGTGCACACA GCCCTTTTCA AAAAAAAAAA
3101 AAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:14)长度:586个氨基酸
1 MFLVRCRHAA IAKYFGDALP ACAKGCDHCQ NPTAVRRRLE ALERSSSWSK
51 TCIGPSQGNG FDPELYEGGR KGYGDFSRYD EGSGGSGDEG RDEAHKREWN
101 LFYQKQMQLR KGKDPKIEEF VPPDENCPLK EASSRRIPRL TVKAREHCLR
151 LLEEALSSNR QSTRTADEAD LRAKAVELEH ETFRNAKVAN LYKASVLKKV
201 ADIHRASKDG QPYDMGGSAK SCSAQAEPPE PNEYDIPPAS HVYSLKPKRV
251 GAGFPKGSCP FQTATELMET TRIREQAPQP ERGGEHEPPS RPCGLLDEDG
301 SEPLPGPRGE VPGGSAHYGG PSPEKKAKSS SGGSSLAKGR ASKKQQLLAT
351 AAHKDSQSIA RFFCRRVESP ALLASAPEAE GACPSCEGVQ GPPMAPEKYT
401 GEEDGAGGHS PAPPQTEECL RERPSTCPPR DQGTPEVQPT PAKDTWKGKR
451 PRSQQENPES QPQKRPRPSA KPSVVAEVKG SVSASEQGTL NPTAQDPFQL
501 SAPGVSLKEA ANVVVKCLTP FYKEGKFASK ELFKGFARHL SHLLTQKTSP
551 GRSVKEEAQN LIRHFFHGRA RCESEADWHG LCGPQR
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:15)
克隆号和蛋白名称:PP1045
起始编码子: 752 ATG 终止编码子:2512 TGA
蛋白质分子量:63841.11
1 T CTG TGG CCA TTG CCA CTC ACC TGG GAG CTC AGG TGT TGG GGG CTG 46
47 AGC AGC AGT GCC CCA GCG CGG AGC CTC CAC GTG CTG TCC TCG TAC TTC 94
95 CTT CGT GGG CGC CGC TGC TCC CCT GGG CGC CTC AGC CCA GCT CCT CTG 142
143 CTG ACA GCC AGC TGC TGT CTC TGC CTG GCT TTT TTG TTG TTG GTC GTC 190
191 CTG GAG ATC CAA GTG TCA AAT TAC CGT CGC GAG GGG GAG CCC GAG GAA 238
239 GCC CTG CTT GGG AAC TTG TCC TCC AAC TTC ATG TCC CGG TGC CTC ACC 286
287 TCT GCC CTG AGA GCG CTG CTC AGG GAC AAG ACA AGC TCT CTC TCT CCT 334
335 CCT CCT TCC TCC TCC TCT CCC TCT CCC CGA CTC CCA CGC CGT GGG CTG 382
383 GGC CTG GGT TGG GAG CTG AAG AAA GAA GTC GGC TCT CTG CCT TCC TGG 430
431 CCA GGA GGA CCC TGG GGA GGC TCC ACC TGA GCC TGT GGA GGG GAG TCC 478
479 TGC AGC GCT CTC AGG TCT GGG GCA CCC ACC CTG CCC TCA GGA AGG CCA 526
527 CCC CTT CTG TCC CTC TGG CCA CTC CCT GGC TGG TCC CTC CCT CTG GCC 574
575 TCT CTC AGG AAC AAC AGT AAA CAG TGG GGA GCT GGT GGC CCT CTC AAG 622
623 CTG AGC AGG AGG CTT TGC AAC CAG TCC CTG GGG AGG CCC TTG TGC CGC 670
671 TCA GCA TCT GAA GGC GTC TTG GGG GAG AAC TTG GAA TCC TGA GTG ACC 718
719 TGG GAG TGG CCT GCG CGC CCG GCA AGG CGC CTC ATG TTC CTT GTG AGG 766
1 Met Phe Leu Val Arg 5
767 TGC CGC CAT GCC GCC ATT GCC AAG TAC TTC GGG GAT GCG CTG CCT GCC 814
6 Cys Arg His Ala Ala Ile Ala Lys Tyr Phe Gly Asp Ala Leu Pro Ala 21
815 TGC GCC AAA GGC TGC GAC CAC TGC CAG AAC CCC ACG GCC GTG CGG AGG 862
22 Cys Ala Lys Gly Cys Asp His Cys Gln Asn Pro Thr Ala Val Arg Arg 37
863 CGG CTG GAG GCC TTG GAG CGC AGC AGC AGC TGG AGC AAG ACC TGC ATC 910
38 Arg Leu Glu Ala Leu Glu Arg Ser Ser Ser Trp Ser Lys Thr Cys Ile 53
911 GGG CCC TCC CAG GGG AAC GGC TTT GAC CCC GAG CTG TAC GAG GGA GGC 958
54 Gly Pro Ser Gln Gly Asn Gly Phe Asp Pro Glu Leu Tyr Glu Gly Gly 69
959 CGC AAG GGC TAC GGG GAC TTC AGC AGG TAT GAC GAA GGT TCT GGA GGC 1006
70 Arg Lys Gly Tyr Gly Asp Phe Ser Arg Tyr Asp Glu Gly Ser Gly Gly 85
1007 AGC GGG GAT GAA GGC AGA GAT GAG GCC CAC AAG CGG GAG TGG AAC CTC 1054
86 Ser Gly Asp Glu Gly Arg Asp Glu Ala His Lys Arg Glu Trp Asn Leu 101
1055 TTC TAT CAG AAG CAG ATG CAG CTG CGC AAG GGC AAA GAC CCC AAG ATA 1102
102 Phe Tyr Gln Lys Gln Met Gln Leu Arg Lys Gly Lys Asp Pro Lys Ile 117
1103 GAA GAA TTT GTA CCC CCA GAT GAG AAC TGT CCC CTG AAA GAG GCT TCT 1150
118 Glu Glu Phe Val Pro Pro Asp Glu Asn Cys Pro Leu Lys Glu Ala Ser 133
1151 AGC AGG AGG ATC CCC AGG CTG ACT GTG AAG GCA CGG GAG CAC TGC CTG 1198
134 Ser Arg Arg Ile Pro Arg Leu Thr Val Lys Ala Arg Glu His Cys Leu 149
1199 CGG CTT CTG GAG GAG GCG CTG AGC AGC AAC CGC CAG TCA ACA CGT ACC 1246
150 Arg Leu Leu Glu Glu Ala Leu Ser Ser Asn Arg Gln Ser Thr Arg Thr 165
1247 GCT GAT GAA GCT GAC CTC CGG GCC AAG GCC GTG GAG CTG GAA CAT GAG 1294
166 Ala Asp Glu Ala Asp Leu Arg Ala Lys Ala Val Glu Leu Glu His Glu 181
1295 ACA TTC CGG AAC GCC AAG GTG GCC AAC CTC TAC AAG GCC AGC GTG CTG 1342
182 Thr Phe Arg Asn Ala Lys Val Ala Asn Leu Tyr Lys Ala Ser Val Leu 197
1343 AAG AAG GTG GCC GAT ATC CAC AGA GCC TCC AAG GAT GGG CAG CCC TAT 1390
198 Lys Lys Val Ala Asp Ile His Arg Ala Ser Lys Asp Gly Gln Pro Tyr 213
1391 GAC ATG GGA GGC AGT GCC AAG AGC TGC AGT GCC CAA GCT GAG CCC CCG 1438
214 Asp Met Gly Gly Ser Ala Lys Ser Cys Ser Ala Gln Ala Glu Pro Pro 229
1439 GAG CCC AAT GAG TAT GAC ATT CCA CCA GCC TCC CAT GTG TAC TCG CTC 1486
230 Glu Pro Asn Glu Tyr Asp Ile Pro Pro Ala Ser His Val Tyr Ser Leu 245
1487 AAA CCC AAG CGG GTG GGA GCT GGT TTC CCC AAA GGC TCC TGC CCG TTC 1534
246 Lys Pro Lys Arg Val Gly Ala Gly Phe Pro Lys Gly Ser Cys Pro Phe 261
1535 CAG ACG GCC ACG GAA CTG ATG GAG ACG ACT CGG ATC AGG GAG CAA GCC 1582
262 Gln Thr Ala Thr Glu Leu Met Glu Thr Thr Arg Ile Arg Glu Gln Ala 277
1583 CCC CAG CCC GAG CGG GGA GGC GAG CAT GAG CCC CCG AGC CGG CCC TGT 1630
278 Pro Gln Pro Glu Arg Gly Gly Glu His Glu Pro Pro Ser Arg Pro Cys 293
1631 GGC CTC CTG GAT GAG GAT GGG AGT GAG CCC CTC CCT GGG CCC AGA GGG 1678
294 Gly Leu Leu Asp Glu Asp Gly Ser Glu Pro Leu Pro Gly Pro Arg Gly 309
1679 GAG GTC CCT GGA GGC AGC GCT CAC TAT GGG GGG CCC TCC CCT GAG AAG 1726
310 Glu Val Pro Gly Gly Ser Ala His Tyr Gly Gly Pro Ser Pro Glu Lys 325
1727 AAG GCA AAA AGT TCC TCT GGG GGC AGC TCC CTT GCC AAG GGC CGG GCT 1774
326 Lys Ala Lys Ser Ser Ser Gly Gly Ser Ser Leu Ala Lys Gly Arg Ala 341
1775 AGC AAG AAA CAG CAG CTC CTA GCC ACA GCG GCC CAC AAG GAT TCT CAG 1822
342 Ser Lys Lys Gln Gln Leu Leu Ala Thr Ala Ala His Lys Asp Ser Gln 357
1823 AGC ATC GCC CGC TTC TTC TGC CGA AGG GTG GAA AGC CCA GCT CTG CTG 1870
358 Ser Ile Ala Arg Phe Phe Cys Arg Arg Val Glu Ser Pro Ala Leu Leu 373
1871 GCA TCA GCC CCA GAG GCA GAA GGT GCC TGC CCC TCC TGT GAG GGG GTT 1918
374 Ala Ser Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Cys Pro Ser Cys Glu Gly Val 389
1919 CAG GGA CCC CCG ATG GCC CCA GAG AAG TAC ACA GGG GAG GAA GAT GGA 1966
390 Gln Gly Pro Pro Met Ala Pro Glu Lys Tyr Thr Gly Glu Glu Asp Gly 405
1967 GCC GGG GGA CAT TCG CCT GCC CCT CCC CAG ACT GAG GAG TGC CTC AGG 2014
406 Ala Gly Gly His Ser Pro Ala Pro Pro Gln Thr Glu Glu Cys Leu Arg 421
2015 GAG AGG CCA AGC ACC TGC CCG CCC AGA GAC CAG GGC ACC CCT GAA GTC 2062
422 Glu Arg Pro Ser Thr Cys Pro Pro Arg Asp Gln Gly Thr Pro Glu Val 437
2063 CAG CCC ACC CCT GCA AAG GAC ACA TGG AAG GGC AAG CGG CCT CGA TCC 2110
438 Gln Pro Thr Pro Ala Lys Asp Thr Trp Lys Gly Lys Arg Pro Arg Ser 453
2111 CAG CAG GAG AAC CCA GAG AGC CAG CCT CAG AAG AGG CCA CGC CCC TCA 2158
454 Gln Gln Glu Asn Pro Glu Ser Gln Pro Gln Lys Arg Pro Arg Pro Ser 469
2159 GCC AAG CCC TCC GTC GTA GCT GAG GTC AAG GGC AGC GTC TCG GCC AGC 2206
470 Ala Lys Pro Ser Val Val Ala Glu Val Lys Gly Ser Val Ser Ala Ser 485
2207 GAA CAG GGC ACC TTG AAT CCC ACG GCT CAA GAC CCC TTC CAG CTC TCC 2254
486 Glu Gln Gly Thr Leu Asn Pro Thr Ala Gln Asp Pro Phe Gln Leu Ser 501
2255 GCT CCT GGC GTC TCC TTG AAG GAG GCT GCA AAT GTT GTG GTC AAG TGC 2302
502 Ala Pro Gly Val Ser Leu Lys Glu Ala Ala Asn Val Val Val Lys Cys 517
2303 CTC ACC CCT TTC TAC AAG GAG GGC AAG TTT GCT TCC AAG GAG TTG TTT 2350
518 Leu Thr Pro Phe Tyr Lys Glu Gly Lys Phe Ala Ser Lys Glu Leu Phe 533
2351 AAA GGC TTT GCC CGC CAC CTC TCA CAC TTG CTG ACT CAG AAG ACC TCT 2398
534 Lys Gly Phe Ala Arg His Leu Ser His Leu Leu Thr Gln Lys Thr Ser 549
2399 CCT GGA AGG AGC GTG AAA GAA GAG GCC CAG AAC CTC ATC AGG CAC TTC 2446
550 Pro Gly Arg Ser Val Lys Glu Glu Ala Gln Asn Leu Ile Arg His Phe 565
2447 TTC CAT GGC CGG GCC CGG TGC GAG AGC GAA GCT GAC TGG CAT GGC CTG 2494
566 Phe His Gly Arg Ala Arg Cys Glu Ser Glu Ala Asp Trp His Gly Leu 581
2495 TGT GGC CCC CAG AGA TGA CCA ACT GCT GGC TGG GCA GGG CCC GCG TCC 2542
582 Cys Gly Pro Gln Arg *** 587
2543 TCC CCC AGA TTC TAG CAT GGG TCA TCC TGG GCC TCA CCT GCT GAT GCC 2590
2591 AGG GCC ATC GTC TTT TCT CAG TCC TTC TCC TTT CCA ACC ATA CTT GGC 2638
2639 TTT GGG GAT GAC CCC AGA CAC CCC CTG AAT CCA GGT CAG AGG TCA GCC 2686
2687 CAC CTT TCT TTC TGC TTG CAA AGC CTA TAG ACC CTT CTC AGA GCG GTC 2734
2735 CTC ATG GCT GGG TTT TCT GGG ACA CAT GTC GAG GAC AGA AGG TGG AGG 2782
2783 GTG GTG GAG CTG CTG CTG GAA GAA GGG GAA GGA AGA GTG GCC CCT CCC 2830
2831 CGA GTT CTA AGT CAG GAT GAG GCC CAC CTG TCC AAG GTA TCG GAA CCT 2878
2879 ACC CAG GGG ACC CTC AGA TCC TCC ACC CAC TCC CCC ATC CAT TAC GAT 2926
2927 GCC AGC TTC CAG CCT TGC CCA GGT CAG AGC TGT GGC AGA GGA GAG GCA 2974
2975 GCC AGG CCC TGT TCC TGC TCA GCT CCT GCT CAG GAA GGC CAG GCC TGA 3022
3023 CAG ATG TTT GGG AGA GGA ATA AAG TTG TGT TGT TGT GGG GCA TGC AGG 3070
3071 CGT GCA CAC AGC CCT TTT CAA AAA AAA AAA AAA AAA AA 3108
D:Blastp结果
Query=PP1045[基因=PP1045](586个氨基酸)
>SP_IN:Q19046 Q19046 caenorhabditis elegans.e03a3.2 protein.5/1999
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Query:5 RCRHAAIAKYFGDA-LPACAKGCDHCQNPTAVXXXXXXXXXXXXXXKTCI----GPSQGN 59
RCRH +IA+F D C CD+C++PT + S +
Sbjct:573 RCRHVSIASFFDDTECRPCKTNCDYCRDPTKTIRNVEAFINSEASTGRSMFRKSASSGES 632
Query:60 GFDPELYEGGRKG---YGDFXXXXXXXXXXXXXXXXXAHKREWNLFYQKQMQLRKGKDP- 115
GFD +Y GG++G + KR ++ Q+ + R+ P
Sbjct:633 GFD-SVYGGGKRGGETEDELLSAASTSKDAMDRMEQEEAKRVRSVISQEFAKRRQAAPPP 691
Query:116 -KIEEFVPPDENCPLKEASSRRIPRLTVKAREHCLRLLEEALSSNRQSTRTADEADLRAK 174
V P + + + I +T++ RE+ +R L AL SN + +
Sbjct:692 RATARRVEPATDVNVIKPEQNVIKNVTLETRENWVRFLHRALDSNWIVSGPPAGVTTKQC 751
Query:175 AVELEHETFRNAKVANLYKASVLKKVADIHRASKDGQPY 213
A +LE+ + +K YK K+A+I + + P+
Sbjct:752 AEQLEYGLYSISKNETTYKNKCGHKLAEIKKLTLKNAPF 790
6.PP1195
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:16)长度:2854bp
1 GGCACCACAG GTTGGCCAGG TGCCCGTCAC ACCAGCCCCA AGTGCCCCAG
51 GGGTCGTGCA GACCTGTCCA GGTGTGCTGC TGACCAGCAG GGCTGGCCGC
101 TCATGGAGAC GCATCACCAG CCCGCTCCCA GCATCCTGCT CCATGAAGGC
151 CGACCGCTCC ATGGCTGGGT CCTCAGGTTC TGAGCTGAAG GGGGAGAAAA
201 AAACCCTGTG AGAGGCCACA GAGCAGGCCC AGGACCCAGA ACGGGCATCT
251 CCTGCCATGG CAAGGCCTGC AGGCTCCCAA CGGTTGGGGT GCCCAGCCGC
301 ATCAGCAGCA CCAGGCCACC CCTGCCAATC GAGGCATGGG CTTGCTTTCT
351 CTAATATTGT TTCTGGGTGC TAAGGTTACA ACAGCAAACA AGACTGACTC
401 ATTCCTTTTC TCCACGGGAC TTACTGTCTT ATCATCCCCT GGACTCAAGA
451 TGAGGGTGCT AGGATGCCCT CCCACACCAC CCCAGCTTAC CCAGGGGCAC
501 ACCTCAGGGT ATGTGGACCT GCACAAAGGT CCCTTCCTTA GCCCCATGAG
551 ACACCCCAGG GGACACACAG GTCCACAGAT CCTGCCACAG GCCTGGGAAC
601 CCATTGGCAG GAGAGTAAGA CAGTGCAGGG GTCCACAAAC ATTTCTTAAG
651 GGGCCAGAGA GTAAATACTT CAGGCTTTGC AGGCCAGACA TTCTCTGTTG
701 CAAAACGCAA TTCTGCTATT GTAGCTCAAA GGCGGCTATA GACAACTCAG
751 AAGTTAATGA GTGTGTTGTG TCCCAATGAA ACTTGATTTA CAAAAGCAGG
801 AGACTGGCCT GTAGCCTTAG TTTGCCAACC CCTGGATGAG TGGGTTCCCA
851 GGTCTGCAGT GAGAAGGGGA GAGGCCAGGG CAGTGGCGAG CAGGAGAGAA
901 GGCAGCTGAG GATGGGAGGC CTACCAGGCC CTGAACAGAG AGTGCGTGCT
951 GCCCACCTTC ATGAGGAGCC GGTGCTGCAG GTCCAGAGGT GCCTCTTTAA
1001 AGAAAGATGC CAGCTTGTCG TAGACGGTCA CAGCCCTGCA ATGAAATCAT
1051 GGCAGGACTA TTGCATTAGT CCAGCGTGGA GGCTACTTTC TGCTCAAACC
1101 ACTCATTTGG GTCCCGTGCC CAACGTCACC CATCCTCAGC AAAACCACCA
1151 TTATTTCCTT CTGCCTGGTT TCCAGAAAGT TCCCCTAAAG CCCTGAGGAA
1201 TCACCGAATG AAAGGGGCTT TTTACAAACA GGAAACTTAA GTGGAGTGCC
1251 AATACACAAC ATGGATTGCA GCAGGCTCGG TCTAAGATAA AACCAGACGG
1301 TGGACAACAG GCCAGGTAAG ACCCACATGG TCTGCACTCC CTGGTTCTGT
1351 TATTGTGTGG AGGAATGTCT TAGTCTGTTG CTCCTGTGGG TGTAGCTAAA
1401 GCACAAACCA GGAGTCCTCA TCCTTAGAAA GCAGTTAGAC AGACATCTGA
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1501 AATGCAACTT ATTACTGCCA GAGGGTCTTT GATGAGAGTC TACTCTCCAC
1551 CATTTGTCTT CAGAGAGAAT ACCCACCTAT TCTCTTTCCG TGGAAAGGTA
1601 AGTTATTGGA GTTTATGCAG TCTGGTATAT TAATTGAGAG CTTTACTTCA
1651 AAGAATGTCA CGTTTATGGT TCAGTCTCAC AGACTGGGTT AAAAAGGCAG
1701 TGTTGACTAT TAAGTTGTAA ATTACTATGA TGATCATTAT TATTGAAGCA
1751 AGCTGTGAGA AATGAGCATT ATCTTACAAT ATCTGCATTT TAGTGAACCT
1801 GAAGGAAGAG TGTATTGCTG GAATTACAGA AGCCTGAGAA CCACAGGGGA
1851 ATTCTCACTG CAGGGTATTC AGGGTCAAAA GCTGATTCTA TTTTGCATGC
1901 TCAATCCTTC GTCAATTTAT TTTTATTTCT TTCTTTATTT TTTGAGACAG
1951 GGTCTTACTC TGTCGCCCAG GCTGGAAGGC CTTGGTGCAA TCTCAGCTCA
2001 CTGCAACCTC GCCTCCCGGG TTCAAGTGAT TCTCCTGCCT CAGCCTCCCA
2051 CGTGACTGGG ATTACAGGTT TTTGCTTGTC TGATGACTGA TGGCTCCACC
2101 CAGACCTGCC AACCACTCCC GCGGCCCCAT CCAGAAGTGG CTCAGCGTGC
2151 ATGAGGACCA TCTCCAACAT CCCTGTGATT GTACCCCCAA CCAACCAGCA
2201 GCAAGAACCT ATTGCCTAGT CACCTCCCCT CTCTTTCCCC AACTATCATT
2251 GAAAAAGTCT GGCTTCCAAA TTTTCCGGGA GACTGATTTG GGTAATAATA
2301 AAACTCCAGT CTTCTGTTCA GCCAGCTCTG CATGAATTAA GCTCTTTCTC
2351 TATTGCAATT TTCCTGTCTT GATAAATTGT CTCTACCTGG GCAGGGGGCA
2401 AAATGAACCC ATAGGGTGGT TACAGTACCT TGCTGGGTCA CTTGATATTC
2451 CTGGAGGGTC ACGGGAAGCG CTATGTGAAT CCCACTTCTG ATATTGTAAG
2501 ATTCTCTCCA GGGCCTGAAA GCTTAAGGGG TTGAGCAACT CCTCCCTTCT
2551 CAGGCCCAGC CCCAGGGCGC AAGGCCGCTT GCATCAGCAG CGTGCGTGAG
2601 CAGATGCGCC AGCAAGATAG CAAAAGCAGG AAGAGAGCCA GCCGGAAGAC
2651 AAGTACCTCT GAAGATGGAG AAAGAGGCCA TCTGGGTACA ACGTTGCAGT
2701 TACGTCAGAC CAGGACACTT CCTGTTTACA GGAGACTATA AAACCTTTGC
2751 CCCATCCTCA CTTGGGGCTG ACGCCGTTTT AGGCCTCAGC CCACCAGCAC
2801 CCAGGCTCTC ATTAAAACAG CATGTTGCTC CAAATAAAAA AAAAAAAAAA
2851 AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:17)长度:147个氨基酸
1 MGLLSLILFL GAKVTTANKT DSFLFSTGLT VLSSPGLKMR VLGCPPTPPQ
51 LTQGHTSGYV DLHKGPFLSP MRHPRGHTGP QILPQAWEPI GRRVRQCRGP
101 QTFLKGPESK YFRLCRPDIL CCKTQFCYCS SKAAIDNSEV NECVVSQ
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:18)
克隆号和蛋白名称:PP1195
起始编码子: 336 ATG 终止编码子:779 TGA
蛋白质分子量:16162.07
1 GG CAC CAC AGG TTG GCC AGG TGC CCG TCA CAC CAG CCC CAA GTG CCC 47
48 CAG GGG TCG TGC AGA CCT GTC CAG GTG TGC TGC TGA CCA GCA GGG CTG 95
96 GCC GCT CAT GGA GAC GCA TCA CCA GCC CGC TCC CAG CAT CCT GCT CCA 143
144 TGA AGG CCG ACC GCT CCA TGG CTG GGT CCT CAG GTT CTG AGC TGA AGG 191
192 GGG AGA AAA AAA CCC TGT GAG AGG CCA CAG AGC AGG CCC AGG ACC CAG 239
240 AAC GGG CAT CTC CTG CCA TGG CAA GGC CTG CAG GCT CCC AAC GGT TGG 287
288 GGT GCC CAG CCG CAT CAG CAG CAC CAG GCC ACC CCT GCC AAT CGA GGC 335
336 ATG GGC TTG CTT TCT CTA ATA TTG TTT CTG GGT GCT AAG GTT ACA ACA 383
1 Met Gly Leu Leu Ser Leu Ile Leu Phe Leu Gly Ala Lys Val Thr Thr 16
384 GCA AAC AAG ACT GAC TCA TTC CTT TTC TCC ACG GGA CTT ACT GTC TTA 431
17 Ala Asn Lys Thr Asp Ser Phe Leu Phe Ser Thr Gly Leu Thr Val Leu 32
432 TCA TCC CCT GGA CTC AAG ATG AGG GTG CTA GGA TGC CCT CCC ACA CCA 479
33 Ser Ser Pro Gly Leu Lys Met Arg Val Leu Gly Cys Pro Pro Thr Pro 48
480 CCC CAG CTT ACC CAG GGG CAC ACC TCA GGG TAT GTG GAC CTG CAC AAA 527
49 Pro Gln Leu Thr Gln Gly His Thr Ser Gly Tyr Val Asp Leu His Lys 64
528 GGT CCC TTC CTT AGC CCC ATG AGA CAC CCC AGG GGA CAC ACA GGT CCA 575
65 Gly Pro Phe Leu Ser Pro Met Arg His Pro Arg Gly His Thr Gly Pro 80
576 CAG ATC CTG CCA CAG GCC TGG GAA CCC ATT GGC AGG AGA GTA AGA CAG 623
81 Gln Ile Leu Pro Gln Ala Trp Glu Pro Ile Gly Arg Arg Val Arg Gln 96
624 TGC AGG GGT CCA CAA ACA TTT CTT AAG GGG CCA GAG AGT AAA TAC TTC 671
97 Cys Arg Gly Pro Gln Thr Phe Leu Lys Gly Pro Glu Ser Lys Tyr Phe 112
672 AGG CTT TGC AGG CCA GAC ATT CTC TGT TGC AAA ACG CAA TTC TGC TAT 719
113 Arg Leu Cys Arg Pro Asp Ile Leu Cys Cys Lys Thr Gln Phe Cys Tyr 128
720 TGT AGC TCA AAG GCG GCT ATA GAC AAC TCA GAA GTT AAT GAG TGT GTT 767
129 Cys Ser Ser Lys Ala Ala Ile Asp Asn Ser Glu Val Asn Glu Cys Val 144
768 GTG TCC CAA TGA AAC TTG ATT TAC AAA AGC AGG AGA CTG GCC TGT AGC 815
145 Val Ser Gln *** 148
816 CTT AGT TTG CCA ACC CCT GGA TGA GTG GGT TCC CAG GTC TGC AGT GAG 863
864 AAG GGG AGA GGC CAG GGC AGT GGC GAG CAG GAG AGA AGG CAG CTG AGG 911
912 ATG GGA GGC CTA CCA GGC CCT GAA CAG AGA GTG CGT GCT GCC CAC CTT 959
960 CAT GAG GAG CCG GTG CTG CAG GTC CAG AGG TGC CTC TTT AAA GAA AGA 1007
1008 TGC CAG CTT GTC GTA GAC GGT CAC AGC CCT GCA ATG AAA TCA TGG CAG 1055
1056 GAC TAT TGC ATT AGT CCA GCG TGG AGG CTA CTT TCT GCT CAA ACC ACT 1103
1104 CAT TTG GGT CCC GTG CCC AAC GTC ACC CAT CCT CAG CAA AAC CAC CAT 1151
1152 TAT TTC CTT CTG CCT GGT TTC CAG AAA GTT CCC CTA AAG CCC TGA GGA 1199
1200 ATC ACC GAA TGA AAG GGG CTT TTT ACA AAC AGG AAA CTT AAG TGG AGT 1247
1248 GCC AAT ACA CAA CAT GGA TTG CAG CAG GCT CGG TCT AAG ATA AAA CCA 1295
1296 GAC GGT GGA CAA CAG GCC AGG TAA GAC CCA CAT GGT CTG CAC TCC CTG 1343
1344 GTT CTG TTA TTG TGT GGA GGA ATG TCT TAG TCT GTT GCT CCT GTG GGT 1391
1392 GTA GCT AAA GCA CAA ACC AGG AGT CCT CAT CCT TAG AAA GCA GTT AGA 1439
1440 CAG ACA TCT GAG AAC CAA TCC CAA ACT GCA GCC TTC CAC AGA ACC TTC 1487
1488 TGG AAC CTT CTG GAA TGC AAC TTA TTA CTG CCA GAG GGT CTT TGA TGA 1535
1536 GAG TCT ACT CTC CAC CAT TTG TCT TCA GAG AGA ATA CCC ACC TAT TCT 1583
1584 CTT TCC GTG GAA AGG TAA GTT ATT GGA GTT TAT GCA GTC TGG TAT ATT 1631
1632 AAT TGA GAG CTT TAG TTC AAA GAA TGT CAC GTT TAT GGT TCA GTC TCA 1679
1680 CAG ACT GGG TTA AAA AGG CAG TGT TGA CTA TTA AGT TGT AAA TTA CTA 1727
1728 TGA TGA TCA TTA TTA TTG AAG CAA GCT GTG AGA AAT GAG CAT TAT CTT 1775
1776 ACA ATA TCT GCA TTT TAG TGA ACC TGA AGG AAG AGT GTA TTG CTG GAA 1823
1824 TTA CAG AAG CCT GAG AAC CAC AGG GGA ATT CTC ACT GCA GGG TAT TCA 1871
1872 GGG TCA AAA GCT GAT TCT ATT TTG CAT GCT CAA TCC TTC GTC AAT TTA 1919
1920 TTT TTA TTT CTT TCT TTA TTT TTT GAG ACA GGG TCT TAC TCT GTC GCC 1967
1968 CAG GCT GGA AGG CCT TGG TGC AAT CTC AGC TCA CTG CAA CCT CGC CTC 2015
2016 CCG GGT TCA AGT GAT TCT CCT GCC TCA GCC TCC CAC GTG ACT GGG ATT 2063
2064 ACA GGT TTT TGC TTG TCT GAT GAC TGA TGG CTC CAC CCA GAC CTG CCA 2111
2112 ACC ACT CCC GCG GCC CCA TCC AGA AGT GGC TCA GCG TGC ATG AGG ACC 2159
2160 ATC TCC AAC ATC CCT GTG ATT GTA CCC CCA ACC AAC CAG CAG CAA GAA 2207
2208 CCT ATT GCC TAG TCA CCT CCC CTC TCT TTC CCC AAC TAT CAT TGA AAA 2255
2256 AGT CTG GCT TCC AAA TTT TCC GGG AGA CTG ATT TGG GTA ATA ATA AAA 2303
2304 CTC CAG TCT TCT GTT CAG CCA GCT CTG CAT GAA TTA AGC TCT TTC TCT 2351
2352 ATT GCA ATT TTC CTG TCT TGA TAA ATT GTC TCT ACC TGG GCA GGG GGC 2399
2400 AAA ATG AAC CCA TAG GGT GGT TAC AGT ACC TTG CTG GGT CAC TTG ATA 2447
2448 TTC CTG GAG GGT CAC GGG AAG CGC TAT GTG AAT CCC ACT TCT GAT ATT 2495
2496 GTA AGA TTC TCT CCA GGG CCT GAA AGC TTA AGG GGT TGA GCA ACT CCT 2543
2544 CCC TTC TCA GGC CCA GCC CCA GGG CGC AAG GCC GCT TGC ATC AGC AGC 2591
2592 GTG CGT GAG CAG ATG CGC CAG CAA GAT AGC AAA AGC AGG AAG AGA GCC 2639
2640 AGC CGG AAG ACA AGT ACC TCT GAA GAT GGA GAA AGA GGC CAT CTG GGT 2687
2688 ACA ACG TTG CAG TTA CGT CAG ACC AGG ACA CTT CCT GTT TAC AGG AGA 2735
2736 CTA TAA AAC CTT TGC CCC ATC CTC ACT TGG GGC TGA CGC CGT TTT AGG 2783
2784 CCT CAG CCC ACC AGC ACC CAG GCT CTC ATT AAA ACA GCA TGT TGC TCC 2831
2832 AAA TAA AAA AAA AAA AAA AAA AA 2854
D:Blastp结果
Query=PP1195[基因=PP1195](147个氨基酸)
>SP_IN:O61603 O61603 drosophila melanogaster(fruit fly).eyelid.
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Query:43 GCPPTPPQLTQGHTSGYVDLHKGPFLSPMRHPRGHTGP 80
G PTPPQ QG+ +G +H G + P H GP
Sbjct:781 GGSPTPPQGPQGYGNGPTGMHPGMPMGPPHHMGPPHGP 818
7.PP1345
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:19)长度:1837bp
1 AGGAGGAACA CTTCCACTAA AAGAAACATC AAGATTACTA TGAACTATTA
51 GCTGTGACTG CACCCGGGCA CTTGAGCTCC TCATATCAGG AGACTACTAG
101 GCAAGAACAG TCACCATTCT TTGAGGGATA ATTAATCCTG ATCATCAGGA
151 GGAGGTACAG CTGCTGTTAA GCAATGGAGG GAAGGGAGGT ATATCTTTGG
201 TACTCAGTTG ATTCACGTGG AGACTTCTTG GTATTCCTTT GCCCAATTTT
251 TTTTTCTTTT TCTTTTTCAG AGGTGGAGTC TCTGTCACCC AGGCTGGAGT
301 GCAGTGGCAC CATCTCGGCT CACTGCAACC TCTGCCTCCT GGGTTCAAGC
351 TATTCTCCTG CCTCAGCCTC CCGAGTAACT GGGATTACAG GCATGTGCCA
401 CCATGCCCAG CTGATTTTTG TATTTTTAGT AAAGATGGAG TTTCGCCATG
451 TTGGCCAGAC TAGTTTTGAA CTTCTGGCCT CAAGCAGTCC ACCTGCCTCA
501 GCTTCCCAAA GTGCTGGGAT TACAGGCGTG AGCCACTGCG CCTGGCCCCT
551 TGCCCAATAT TTATAAAATA ATTATACAAG TGCCCAGACC GTGACCTGAG
601 CAGGATATGC TGACTTCAGG CTCAGCCCCC TCAGGGCTGA GGGTCTAAAT
651 CATGCCTCCG TGGAAGTGAC GGAGACCGGA ACACGTGCTG GCTGAGGGTA
701 AGGAGGATCT AGAATGGATA GTAGAAGAGG GAGATGATGA GTATCAGTTG
751 TGGCCTCAAG ACCAGTCAGT GATGGAGGTT GTAGTTTGTC CAACTTACTT
801 TCCTAAGTTT CCCCCAGGAA AGGAGGTCCA CCAGAACTTA AACCAAAAAG
851 TAGAGCTGAG CAGCACAAAT GTGGGCTGTA GTGGACACCA TCCTGTGCTG
901 CCCAGACCCC CCAGCCACCA TGCTTCCTGG GCCTCTTCCC ACAGCTACTG
951 GGAGTGCTCT CAGCCAGCAG CCTTCAGCTG TCAGCCCCCT GGGAATTTTC
1001 CTCAATGGAA GAGTTACCTC ACTGACATAC CCCTTTCCCA GGCAGGTCAG
1051 TTCAAGGTTA TGAAGGCCTG GCCCCACTGC CTCAACTTGA CAACTTGGAA
1101 GGGCCATCTC AGCTTCAAGA CCCTCCCATG AGACTGGCTG AGGTCTTCAT
1151 ACAGCATCGG AGCCCAATTT ATCTCTCTGA GCAATCCTGC TTCCTTTCCT
1201 GCCCCCTTCC CAAGAGCAAT CCCTGATAAA CTTCCCGCAT GCTAATCTCC
1251 ATCTCAGAGT CTACTTTCCA AGGAAGTGGG CCTATAACAT AGCTCTTCCA
1301 GTTTTTGTTA ACAATTCTAG AACAGGGGTC AGCAAACTTT TTTTTTTTTT
1351 CTTTTGAGAC GGAGTCTCAC TCCGTCACCA GGCTGGAGTG CAGTGGCGCG
1401 ATCTTGGCTC ACTGCAACCT CTGCCTCCCG GGTTCAAGCG ATTCTCCTGC
1451 CTCAGCCTCC CGAGTAGCTG GGACTACCAT GCCACCACAC CCAGCTAATT
1501 TTTTTATTTT TAGAGAGATT GGGTTTCACC ATGTTGGCCA GGATGGTCTT
1551 GATCTCTTGA CCTCGTGATC CGCGCTCCTC GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA
1601 TTATAGACAT GAATCCCCAC ACCCGGCCAG CAAACTTTTT TAAAGGAACA
1651 GATAGTAAAT ATTTTAAGCT TTGTGAGCCA CATGGTCTCT GTCACAACTA
1701 TTCAGCTCTG CTATTGTAAT ACAAAAGCAG CTGTGGACAG TATGTAAATG
1751 AATGAATGTG GCTGTGTTCC AATAAAACTT TATTTCCCAA AAAAAAAAAA
1801 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:20)长度:130个氨基酸
1 MEGREVYLWY SVDSRGDFLV FLCPIFFSFS FSEVESLSPR LECSGTISAH
51 CNLCLLGSSY SPASASRVTG ITGMCHHAQL IFVFLVKMEF RHVGQTSFEL
101 LASSSPPASA SQSAGITGVS HCAWPLAQYL
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:21)
克隆号和蛋白名称:PP1345
起始编码子:174 ATG 终止编码子:566 TAA
蛋白质分子量:14152.40
1 AG GAG GAA CAC TTC CAC TAA AAG AAA CAT CAA GAT TAC TAT GAA CTA 47
48 TTA GCT GTG ACT GCA CCC GGG CAC TTG AGC TCC TCA TAT CAG GAG ACT 95
96 ACT AGG CAA GAA CAG TCA CCA TTC TTT GAG GGA TAA TTA ATC CTG ATC 143
144 ATC AGG AGG AGG TAC AGC TGC TGT TAA GCA ATG GAG GGA AGG GAG GTA 191
1 Met Glu Gly Arg Glu Val 6
192 TAT CTT TGG TAC TCA GTT GAT TCA CGT GGA GAC TTC TTG GTA TTC CTT 239
7 Tyr Leu Trp Tyr Ser Val Asp Ser Arg Gly Asp Phe Leu Val Phe Leu 22
240 TGC CCA ATT TTT TTT TCT TTT TCT TTT TCA GAG GTG GAG TCT CTG TCA 287
23 Cys Pro Ile Phe Phe Ser Phe Ser Phe Ser Glu Val Glu Ser Leu Ser 38
288 CCC AGG CTG GAG TGC AGT GGC ACC ATC TCG GCT CAC TGC AAC CTC TGC 335
39 Pro Arg Leu Glu Cys Ser Gly Thr Ile Ser Ala His Cys Asn Leu Cys 54
336 CTC CTG GGT TCA AGC TAT TCT CCT GCC TCA GCC TCC CGA GTA ACT GGG 383
55 Leu Leu Gly Ser Ser Tyr Ser Pro Ala Ser Ala Ser Arg Val Thr Gly 70
384 ATT ACA GGC ATG TGC CAC CAT GCC CAG CTG ATT TTT GTA TTT TTA GTA 431
71 Ile Thr Gly Met Cys His His Ala Gln Leu Ile Phe Val Phe Leu Val 86
432 AAG ATG GAG TTT CGC CAT GTT GGC CAG ACT AGT TTT GAA CTT CTG GCC 479
87 Lys Met Glu Phe Arg His Val Gly Gln Thr Ser Phe Glu Leu Leu Ala 102
480 TCA AGC AGT CCA CCT GCC TCA GCT TCC CAA AGT GCT GGG ATT ACA GGC 527
103 Ser Ser Ser Pro Pro Ala Ser Ala Ser Gln Ser Ala Gly Ile Thr Gly 118
528 GTG AGC CAC TGC GCC TGG CCC CTT GCC CAA TAT TTA TAA AAT AAT TAT 575
119 Val Ser His Cys Ala Trp Pro Leu Ala Gln Tyr Leu *** 131
576 ACA AGT GCC CAG ACC GTG ACC TGA GCA GGA TAT GCT GAC TTC AGG CTC 623
624 AGC CCC CTC AGG GCT GAG GGT CTA AAT CAT GCC TCC GTG GAA GTG ACG 671
672 GAG ACC GGA ACAC GT GCT GGC TGA GGG TAA GGA GGA TCT AGA ATG GAT 719
720 AGT AGA AGA GGG AGA TGA TGA GTA TCA GTT GTG GCC TCA AGA CCA GTC 767
768 AGT GAT GGA GGT TGT AGT TTG TCC AAC TTA CTT TCC TAA GTT TCC CCC 815
816 AGG AAA GGA GGT CCA CCA GAA CTT AAA CCA AAA AGT AGA GCT GAG CAG 863
864 CAC AAA TGT GGG CTG TAG TGG ACA CCA TCC TGT GCT GCC CAG ACC CCC 911
912 CAG CCA CCA TGC TTC CTG GGC CTC TTC CCA CAG CTA CTG GGA GTG CTC 959
960 TCA GCC AGC AGC CTT CAG CTG TCA GCC CCC TGG GAA TTT TCC TCA ATG 1007
1008 GAA GAG TTA CCT CAC TGA CAT ACC CCT TTC CCA GGC AGG TCA GTT CAA 1055
1056 GGT TAT GAA GGC CTG GCC CCA CTG CCT CAA CTT GAC AAC TTG GAA GGG 1103
1104 CCA TCT CAG CTT CAA GAC CCT CCC ATG AGA CTG GCT GAG GTC TTC ATA 1151
1152 CAG CAT CGG AGC CCA ATT TAT CTC TCT GAG CAA TCC TGC TTC CTT TCC 1199
1200 TGC CCC CTT CCC AAG AGC AAT CCC TGA TAA ACT TCC CGC ATG CTA ATC 1247
1248 TCC ATC TCA GAG TCT ACT TTC CAA GGA AGT GGG CCT ATA ACA TAG CTC 1295
1296 TTC CAG TTT TTG TTA ACA ATT CTA GAA CAG GGG TCA GCA AAC TTT TTT 1343
1344 TTT TTT TCT TTT GAG ACG GAG TCT CAC TCC GTC ACC AGG CTG GAG TGC 1391
1392 AGT GGC GCG ATC TTG GCT CAC TGC AAC CTC TGC CTC CCG GGT TCA AGC 1439
1440 GAT TCT CCT GCC TCA GCC TCC CGA GTA GCT GGG ACT ACC ATG CCA CCA 1487
1488 CAC CCA GCT AAT TTT TTT ATT TTT AGA GAG ATT GGG TTT CAC CAT GTT 1535
1536 GGC CAG GAT GGT CTT GAT CTC TTG ACC TCG TGA TCC GCG CTC CTC GGC 1583
1584 CTC CCA AAG TGC TGG GAT TAT AGA CAT GAA TCC CCA CAC CCG GCC AGC 1631
1632 AAA CTT TTT TAA AGG AAC AGA TAG TAA ATA TTT TAA GCT TTG TGA GCC 1679
1680 ACA TGG TCT CTG TCA CAA CTA TTC AGC TCT GCT ATT GTA ATA CAA AAG 1727
1728 CAG CTG TGG ACA GTA TGT AAA TGA ATG AAT GTG GCT GTG TTC CAA TAA 1775
1776 AAC TTT ATT TCC CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1823
1824 AAA AAA AAA AAA AA 1837
8.PP1744
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:22)长度:1996bp
1 GGACGAGAGC ACAAGGAGAT CCACCAGCAG AGGCAGGAGG ACGAGGAGGA
51 TAAACCCAGG CAGGTGGAGG TGCATCAAGA GCCCGGGGCA GCGGTGCCCA
101 GAGGCCAGGA GGCCCCTGAA GGCAAGGCCA GGGAGACGGT GGAGAATCTG
151 CCTCCCCTGC CTTTGGACCC TGTCCTCAGA GCTCCTGGGG GCCGCCCTGC
201 TCCATCCCAG GACCTTAACC AGCGCTCCCT GGAGCACTCT GAGGGGCCTG
251 TGGGCAGAGA CCCTGCTGGC CCTCCTGACG GCGGCCCTGA CACAGAGCCT
301 CGGGCAGCCC AGGGCAAGCT GAGAGATGGC CAGAAGGATG CCGCCCCCAG
351 GGCAGCTGGC ACTGTGAAGG AGCTCTGAGG ACAGGGTCCT CAGAGCTCCT
401 GGGGGCCGCC CTGCTCCATC CCAGGACCTT AACCAGCGCT CCCTGGAGCA
451 CTCTGAGGGG CCTGTGGGCA GAGACCCTGC TGGCCCTCCT GACGGCGGCC
501 CTGACACAGA GCCTCGGGCA GCCCAGGGCA AGCTGAGAGA TGGCCAGAAG
551 GATGCCGCCC CCAGGGCAGC TGGCACTGTG AAGGAGCTCC CCAAGGGCCC
601 GGAGCAGGTG CCCGTGCCAG ACCCCGCCAG GGAAGCCGGG GGCCCAGAGG
651 AGCGCCTCGC AGAGGAATTC CCTGGGCAAA GTCAGGACGT TACTGGCGGT
701 TCCCAAGACA GGAAAAAACC TGGGAAGGAG GTGGCAGCCA CTGGCACCAG
751 CATTCTGAAG GAAGCCAACT GGCTCGTGGC AGGGCCAGGA GCAGAGACGG
801 GGGACCCTCG CATGAAGCCC AAGCAAGTGA GCCGAGACCT GGGCCTTGCA
851 GCGGACCTGC CCGGTGGGGC GGAAGGAGCA GCTGCACAGC CCCAGGCTGT
901 GTTACGCCAG CCGGAACTGC GGGTCATCTC TGATGGCGAG CAGGGTGGAC
951 AGCAGGGCCA CCGGCTGGAC CATGGCGGTC ACCTGGAGAT GAGAAAGGCC
1001 CGCGGGGGGG ACCATGTGCC TGTGTCCCAC GAGCAGCCGA GAGGCGGGGA
1051 GGACGCTGCT GTCCAGGAGC CCAGGCAGAG GCCAGAGCCA GAGCTGGGGC
1101 TCAAACGAGC TGTCCCGGGG GGCCAGAGGC CGGACAATGC CAAGCCCAAC
1151 CGGGACCTGA AACTGCAGGC TGGCTCCGAC CTCCGGAGGC GACGGCGGGA
1201 CCTTGGCCCT CATGCAGAGG GTCAGCTGGC CCCGAGGGAT GGGGTCATTG
1251 GCCTTAACCC CCTGCCTGAT GTCCAGGTGA ACGACCTCCG TGGCGCCCTG
1301 GATGCCCAGC TCCGCCAGGC TGCGGGGGGA GCTCTGCAGG TGGTCCACAG
1351 CCGGCAGCTT AGACAGGCGC CTGGGCCTCC AGAGGAGTCC TAGCACCTGC
1401 TGGCCATGAG GGCCACGCCA GCCACTGCCC TCCTCGGCCA GCAGCAGGTC
1451 TGTCTCAGCC GCATCCCAGC CAAACTCTGG AGGTCACACT CGCCTCTCCC
1501 CAGGGTTTCA TGTCTGAGGC CCTCACCAAG TGTGAGTGAC AGTATAAAAG
1551 ATTCACTGTG GCATCGTTTC CAGAATGTTC TTGCTGTCGT TCTGTTGCAG
1601 CTCTTAGTCT GAGGTCCTCT GACCTCTAGA CTCTGAGCTC ACTCCAGCCT
1651 GTGAGGAGAA ACGGCCTCCG CTGCGAGCTG GCTGGTGCAC TCCCAGGCTC
1701 AGGCTGGGGA GCTGCTGCGT CTGTGGTCAG GCCTCCTGCT CCTGCCAGGG
1751 AGCACGCGTG GTCTTCGGGT TGAGCTCGCC CGTGCGTGGA GGTGCGCATG
1801 GCTGCTCATG GTCCCAACAC AGGCTACTGT GAGAGCCAGC ATCCAACCCC
1851 ACGCTTGCAG TGACTCAGAA TGATAATTAT TATGACTGTT TATCGATGCT
1901 TCCCCCAGTG TGGTAGAAAG TCTTGAATAA ACACTTTTGC CTTCACCCAA
1951 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:23)长度:193个氨基酸
1 MKPKQVSRDL GLAADLPGGA EGAAAQPQAV LRQPELRVIS DGEQGGQQGH
51 RLDHGGHLEM RKARGGDHVP VSHEQPRGGE DAAYQEPRQR PEPELGLKRA
101 VPGGQRPDNA KPNRDLKLQA GSDLRRRRRD LGPHAEGQLA PRDGV IGLNP
151 LPDVQVNDLR GALDAQLRQA AGGALQVVHS RQLRQAPGPP EES
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:24)
克隆号和蛋白名称:PP1744
起始编码子: 812 ATG 终止编码子:1393 TAG
蛋白质分子量:20631.96
1 G GAC GAG AGC ACA AGG AGA TCC ACC AGC AGA GGC AGG AGG ACG AGG 46
47 AGG ATA AAC CCA GGC AGG TGG AGG TGC ATC AAG AGC CCG GGG CAG CGG 94
95 TGC CCA GAG GCC AGG AGG CCC CTG AAG GCA AGG CCA GGG AGA CGG TGG 142
143 AGA ATC TGC CTC CCC TGC CTT TGG ACC CTG TCC TCA GAG CTC CTG GGG 190
191 GCC GCC CTG CTC CAT CCC AGG ACC TTA ACC AGC GCT CCC TGG AGC ACT 238
239 CTG AGG GGC CTG TGG GCA GAG ACC CTG CTG GCC CTC CTG ACG GCG GCC 286
287 CTG ACA CAG AGC CTC GGG CAG CCC AGG GCA AGC TGA GAG ATG GCC AGA 334
335 AGG ATG CCG CCC CCA GGG CAG CTG GCA CTG TGA AGG AGC TCT GAG GAC 382
383 AGG GTC CTC AGA GCT CCT GGG GGC CGC CCT GCT CCA TCC CAG GAC CTT 430
431 AAC CAG CGC TCC CTG GAG CAC TCT GAG GGG CCT GTG GGC AGA GAC CCT 478
479 GCT GGC CCT CCT GAC GGC GGC CCT GAC ACA GAG CCT CGG GCA GCC CAG 526
527 GGC AAG CTG AGA GAT GGC CAG AAG GAT GCC GCC CCC AGG GCA GCT GGC 574
575 ACT GTG AAG GAG CTC CCC AAG GGC CCG GAG CAG GTG CCC GTG CCA GAC 622
623 CCC GCC AGG GAA GCC GGG GGC CCA GAG GAG CGC CTC GCA GAG GAA TTC 670
671 CCT GGG CAA AGT CAG GAC GTT ACT GGC GGT TCC CAA GAC AGG AAA AAA 718
719 CCT GGG AAG GAG GTG GCA GCC ACT GGC ACC AGC ATT CTG AAG GAA GCC 766
767 AAC TGG CTC GTG GCA GGG CCA GGA GCA GAG ACG GGG GAC CCT CGC ATG 814
1 Met 1
815 AAG CCC AAG CAA GTG AGC CGA GAC CTG GGC CTT GCA GCG GAC CTG CCC 862
2 Lys Pro Lys Gln Val Ser Arg Asp Leu Gly Leu Ala Ala Asp Leu Pro 17
863 GGT GGG GCG GAA GGA GCA GCT GCA CAG CCC CAG GCT GTG TTA CGC CAG 910
18 Gly Gly Ala Glu Gly Ala Ala Ala Gln Pro Gln Ala Val Leu Arg Gln 33
911 CCG GAA CTG CGG GTC ATC TCT GAT GGC GAG CAG GGT GGA CAG CAG GGC 958
34 Pro Glu Leu Arg Val Ile Ser Asp Gly Glu Gln Gly Gly Gln Gln Gly 49
959 CAC CGG CTG GAC CAT GGC GGT CAC CTG GAG ATG AGA AAG GCC CGC GGG 1006
50 His Arg Leu Asp His Gly Gly His Leu Glu Met Arg Lys Ala Arg Gly 65
1007 GGG GAC CAT GTG CCT GTG TCC CAC GAG CAG CCG AGA GGC GGG GAG GAC 1054
66 Gly Asp His Val Pro Val Ser His Glu Gln Pro Arg Gly Gly Glu Asp 81
1055 GCT GCT GTC CAG GAG CCC AGG CAG AGG CCA GAG CCA GAG CTG GGG CTC 1102
82 Ala Ala Val Gln Glu Pro Arg Gln Arg Pro Glu Pro Glu Leu Gly Leu 97
1103 AAA CGA GCT GTC CCG GGG GGC CAG AGG CCG GAC AAT GCC AAG CCC AAC 1150
98 Lys Arg Ala Val Pro Gly Gly Gln Arg Pro Asp Asn Ala Lys Pro Asn 113
1151 CGG GAC CTG AAA CTG CAG GCT GGC TCC GAC CTC CGG AGG CGA CGG CGG 1198
114 Arg Asp Leu Lys Leu Gln Ala Gly Ser Asp Leu Arg Arg Arg Arg Arg 129
1199 GAC CTT GGC CCT CAT GCA GAG GGT CAG CTG GCC CCG AGG GAT GGG GTC 1246
130 Asp Leu Gly Pro His Ala Glu Gly Gln Leu Ala Pro Arg Asp Gly Val 145
1247 ATT GGC CTT AAC CCC CTG CCT GAT GTC CAG GTG AAC GAC CTC CGT GGC 1294
146 Ile Gly Leu Asn Pro Leu Pro Asp Val Gln Val Asn Asp Leu Arg Gly 161
1295 GCC CTG GAT GCC CAG CTC CGC CAG GCT GCG GGG GGA GCT CTG CAG GTG 1342
162 Ala Leu Asp Ala Gln Leu Arg Gln Ala Ala Gly Gly Ala Leu Gln Val 177
1343 GTC CAC AGC CGG CAG CTT AGA CAG GCG CCT GGG CCT CCA GAG GAG TCC 1390
178 Val His Ser Arg Gln Leu Arg Gln Ala Pro Gly Pro Pro Glu Glu Ser 193
1391 TAG CAC CTG CTG GCC ATG AGG GCC ACG CCA GCC ACT GCC CTC CTC GGC 1438
194 *** 194
1439 CAG CAG CAG GTC TGT CTC AGC CGC ATC CCA GCC AAA CTC TGG AGG TCA 1486
1487 CAC TCG CCT CTC CCC AGG GTT TCA TGT CTG AGG CCC TCA CCA AGT GTG 1534
1535 AGT GAC AGT ATA AAA GAT TCA CTG TGG CAT CGT TTC CAG AAT GTT CTT 1582
1583 GCT GTC GTT CTG TTG CAG CTC TTA GTC TGA GGT CCT CTG ACC TCT AGA 1630
1631 CTC TGA GCT CAC TCC AGC CTG TGA GGA GAA ACG GCC TCC GCT GCG AGC 1678
1679 TGG CTG GTG CAC TCC CAG GCT CAG GCT GGG GAG CTG CTG CGT CTG TGG 1726
1727 TCA GGC CTC CTG CTC CTG CCA GGG AGC ACG CGT GGT CTT CGG GTT GAG 1774
1775 CTC GCC CGT GCG TGG AGG TGC GCA TGG CTG CTC ATG GTC CCA ACA CAG 1822
1823 GCT ACT GTG AGA GCC AGC ATC CAA CCC CAC GCT TGC AGT GAC TCA GAA 1870
1871 TGA TAA TTA TTA TGA CTG TTT ATC GAT GCT TCC CCC AGT GTG GTA GAA 1918
1919 AGT CTT GAA TAA ACA CTT TTG CCT TCA CCC AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1966
1967 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1996
9.PP1757
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:25)长度:2279bp
1 GCATTCTAGT GCGACCTTGT TTACACCTCC CCTGGCTCAG TCACACAGCT
51 GTGTGGTAGG CTACTAGAAG TGTTTAGTAG TTGTCACTGG GATCATGCTG
101 ATGTGGCCCC ATCCCCGCCT CTCCCTGCCC TGTGATATCG GAGGAAACCT
151 GACAGAGCAA ATTGGCCATG GCCAAGAAAA AGGAAAAGAA AGAGTGCCAC
201 CAAAAGCAGG GAGCCCTAAG GGAGCAGTTA CAGGTCCTCT TTGGATTCCA
251 GCACGACGCA TCAAACCATA CCATGACGTG ACTAGGACCC AACCTAGAAA
301 TGAAGGAACT GACCCTACAG GACTCACAAC CCTGGATAAT GCAGTGTCCT
351 CGGACGGCAA CAAGCTCTGG ACATTACCTG GGGGATGCTG AAGGCGGCAA
401 CTGAGGAGGC TGAATGAATC CTGCTCCAGA CACAGACACC ATTCACTCCA
451 GATAATTTGT TGCTTGCTAT GCTCTCTGTT GTACATTGCA ACTCGCATAG
501 GGATGCAAAG CCGGAATAAG AGCAATGACC ACCATGCCTG ACAGACCTGT
551 TGCTGCGCAC ACCTGTACTC TCCAATGAAC AAGACTGAAT GCAAAAAAAA
601 CAGAAAATGG GGAGATTTAG GGGATCAGTC AGTGTGGTTG GAAAATTGTA
651 AGATGAAGTT ACAGGATATA GACACAAACC TTCTTGGAAG GCCAGAAGGT
701 TTGCATAGCT TCAGTAAAGG ATTTGGCTGA AATCCTTTTT ACCTCTAATC
751 CCCTTTACCT TGAGTTGATA GCAATAGAGC AAATAACATG GGAATGTGGG
801 GGAGTTTATC TGAATAGCTT GTTTACTCAT GTGGTCCTAA GACCAACCTT
851 TGATTATCCG CAGGTGCATG ATTGCTCTCT ACCTGGGGGC AGGGGGAGTT
901 AATTACCCAC AGGTGGAGCT GAAGAGCCAG GAGGCTCAGA GTCTGCAGCA
951 GCAGCAGGAC CAGTACCTGG GTCATCTGCA GCAGTATGTG GCCACCTATC
1001 AGCAGCAGGT GGTCACCTAT CAGCAGCTGA CCTCTGAGGA GGAGGAGCTG
1051 CACAACCAGT TACTGCTGCA GACCCAGCTC GTGGACCGGC TGCAGCAGCA
1101 GAAAGCTCAA AGCAAAGCTG TGGCCAAGAT GGGCTGCCAA GAGTTGCGGG
1151 AGACCCAGGA GCACCTGGAA GCTATCAGCC AGCAGAACCA GCAGCCTCAG
1201 GCCCAGTTGA GCCTCATGGC TCTCCCTGGG GAAGGAGATG GACAGTGAGG
1251 AGGAGGAGGA GGTGCCTCAG CCCATGCCAA GCATCCCGGA GGATCTAGAG
1301 AGCCAGAAGG CCATGGTGGC ATTTTTCAAC TCAGCTGTAG CTAGTGCCGA
1351 GGAGGAGCAG GCACGGCTAT GTGGGCAGCT GAAGGAGTGC ACTGCCAGCG
1401 CCTGGCTCAT CTGTTGGCCT CGGCCCAGAA GGAACCTGAG GCAGCAGCCC
1451 CAGCCCCAAG AACTGGGGGT GATCCCATGT GTGGGGAGAC CCACCAGGCC
1501 CTGCAGGGGG CCATGGAGAA GCTGTGGGAG AGTACATCGC ACTGTACCAG
1551 AGCCAGAGGG CAGTGCGGAA GGAGGAGGAG TGCATCAGCA GGCTGGCCCA
1601 GGACAAGGGA GAGGTGAAGG TGAAGCTGCT GGAGCTGGCG TGGCTTGTGG
1651 ACGACTGCAA CAAGTGGCAT AGCAGATTCC TGGCAGCTGC CCAGAACCCT
1701 GCTGATGAGC CCACTCCAGG GGCCCCCGCC CCCCAGTAGC TTGGGGCTAC
1751 TGACAAGCCA GGGTAGTGAG TAGAGTCCTC AGGCACAGTG GGCACGCAGG
1801 AGCAGGGGAG GGCTCCCACA GCACCCTGCC TCCCTCTCTC CAAAGATCTT
1851 TGTGAGGTGA GCCTTGCCAG CAGTGGGGAG TCTGCACAAG GAGAGGCGGG
1901 GAAGCATTCT CCCTGTGACA ACCCCACTGA GCAGCAGATC ATGCAACTGC
1951 TTCATGAGAT GCAGAACCTC CAGGAGCACC CAGGCTTGGG CAGCAGCCCT
2001 TGCATTCCTT TTTTGTACCA GACTGATGAG AACAATGAGG TGAAGATCAC
2051 CATCATCTAA AAGCCGGCCA CTGTCAGCAA AACCTGGGGA AGTGGGGCTG
2101 GAGGCTCTGC CCCTACCATG TCCCTACCAC CCCTTCCCAG TCAACCCTTT
2151 ACCCTCACAG TAGCAAGCAT AAGACCCCTG TCTAATGTGG GGAGACAGGT
2201 GGAGATGAGG TGAAGATCAC CATAATCTAA AAGGCCACTA AATAAAAAAA
2251 TAAAAAATTT TAAAAAAAAA AAAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:26)长度:144个氨基酸
1 MDSEEEEEVP QPMPSIPEDL ESQKAMVAFF NSAVASAEEE QARLCGQLKE
51 CTASAWLICW PRPRRNLRQQ PQPQELGVIP CVGRPTRPCR GPWRSCGRVH
101 RTVPEPEGSA EGGGVHQQAG PGQGRGEGEA AGAGVACGRL QQVA
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:27)
克隆号和蛋白名称:PP1757
起始编码子: 1238 ATG 终止编码子:1672 TAG
蛋白质分子量:15481.60
1 G CAT TCT AGT GCG ACC TTG TTT ACA CCT CCC CTG GCT CAG TCA CAC 46
47 AGC TGT GTG GTA GGC TAC TAG AAG TGT TTA GTA GTT GTC ACT GGG ATC 94
95 ATG CTG ATG TGG CCC CAT CCC CGC CTC TCC CTG CCC TGT GAT ATC GGA 142
143 GGA AAC CTG ACA GAG CAA ATT GGC CAT GGC CAA GAA AAA GGA AAA GAA 190
191 AGA GTG CCA CCA AAA GCA GGG AGC CCT AAG GGA GCA GTT ACA GGT CCT 238
239 CTT TGG ATT CCA GCA CGA CGC ATC AAA CCA TAC CAT GAC GTG ACT AGG 286
287 ACC CAA CCT AGA AAT GAA GGA ACT GAC CCT ACA GGA CTC ACA ACC CTG 334
335 GAT AAT GCA GTG TCC TCG GAC GGC AAC AAG CTC TGG ACA TTA CCT GGG 382
383 GGA TGC TGA AGG CGG CAA CTG AGG AGG CTG AAT GAA TCC TGC TCC AGA 430
431 CAC AGA CAC CAT TCA CTC CAG ATA ATT TGT TGC TTG CTA TGC TCT CTG 478
479 TTG TAC ATT GCA ACT CGC ATA GGG ATG CAA AGC CGG AAT AAG AGC AAT 526
527 GAC CAC CAT GCC TGA CAG ACC TGT TGC TGC GCA CAC CTG TAC TCT CCA 574
575 ATG AAC AAG ACT GAA TGC AAA AAA AAC AGA AAA TGG GGA GAT TTA GGG 622
623 GAT CAG TCA GTG TGG TTG GAA AAT TGT AAG ATG AAG TTA CAG GAT ATA 670
671 GAC ACA AAC CTT CTT GGA AGG CCA GAA GGT TTG CAT AGC TTC AGT AAA 718
719 GGA TTT GGC TGA AAT CCT TTT TAC CTC TAA TCC CCT TTA CCT TGA GTT 766
767 GAT AGC AAT AGA GCA AAT AAC ATG GGA ATG TGG GGG AGT TTA TCT GAA 814
815 TAG CTT GTT TAC TCA TGT GGT CCT AAG ACC AAC CTT TGA TTA TCC GCA 862
863 GGT GCA TGA TTG CTC TCT ACC TGG GGG CAG GGG GAG TTA ATT ACC CAC 910
911 AGG TGG AGC TGA AGA GCC AGG AGG CTC AGA GTC TGC AGC AGC AGC AGG 958
959 ACC AGT ACC TGG GTC ATC TGC AGC AGT ATG TGG CCA CCT ATC AGC AGC 1006
1007 AGG TGG TCA CCT ATC AGC AGC TGA CCT CTG AGG AGG AGG AGC TGC ACA 1054
1055 ACC AGT TAC TGC TGC AGA CCC AGC TCG TGG ACC GGC TGC AGC AGC AGA 1102
1103 AAG CTC AAA GCA AAG CTG TGG CCA AGA TGG GCT GCC AAG AGT TGC GGG 1150
1151 AGA CCC AGG AGC ACC TGG AAG CTA TCA GCC AGC AGA ACC AGC AGC CTC 1198
1199 AGG CCC AGT TGA GCC TCA TGG CTC TCC CTG GGG AAG GAG ATG GAC AGT 1246
1 Met Asp Ser 3
1247 GAG GAG GAG GAG GAG GTG CCT CAG CCC ATG CCA AGC ATC CCG GAG GAT 1294
4 Glu Glu Glu Glu Glu Val Pro Gln Pro Met Pro Ser Ile Pro Glu Asp 19
1295 CTA GAG AGC CAG AAG GCC ATG GTG GCA TTT TTC AAC TCA GCT GTA GCT 1342
20 Leu Glu Ser Gln Lys Ala Met Val Ala Phe Phe Asn Ser Ala Val Ala 35
1343 AGT GCC GAG GAG GAG CAG GCA CGG CTA TGT GGG CAG CTG AAG GAG TGC 1390
36 Ser Ala Glu Glu Glu Gln Ala Arg Leu Cys Gly Gln Leu Lys Glu Cys 51
1391 ACT GCC AGC GCC TGG CTC ATC TGT TGG CCT CGG CCC AGA AGG AAC CTG 1438
52 Thr Ala Ser Ala Trp Leu Ile Cys Trp Pro Arg Pro Arg Arg Asn Leu 67
1439 AGG CAG CAG CCC CAG CCC CAA GAA CTG GGG GTG ATC CCA TGT GTG GGG 1486
68 Arg Gln Gln Pro Gln Pro Gln Glu Leu Gly Val Ile Pro Cys Val Gly 83
1487 AGA CCC ACC AGG CCC TGC AGG GGG CCA TGG AGA AGC TGT GGG AGA GTA 1534
84 Arg Pro Thr Arg Pro Cys Arg Gly Pro Trp Arg Ser Cys Gly Arg Val 99
1535 CAT CGC ACT GTA CCA GAG CCA GAG GGC AGT GCG GAA GGA GGA GGA GTG 1582
100 His Arg Thr Val Pro Glu Pro Glu Gly Ser Ala Glu Gly Gly Gly Val 115
1583 CAT CAG CAG GCT GGC CCA GGA CAA GGG AGA GGT GAA GGT GAA GCT GCT 1630
116 His Gln Gln Ala Gly Pro Gly Gln Gly Arg Gly Glu Gly Glu Ala Ala 131
1631 GGA GCT GGC GTG GCT TGT GGA CGA CTG CAA CAA GTG GCA TAG CAG ATT 1678
132 Gly Ala Gly Val Ala Cys Gly Arg Leu Gln Gln Val Ala *** 145
1679 CCT GGC AGC TGC CCA GAA CCC TGC TGA TGA GCC CAC TCC AGG GGC CCC 1726
1727 CGC CCC CCA GTA GCT TGG GGC TAC TGA CAA GCC AGG GTA GTG AGT AGA 1774
1775 GTC CTC AGG CAC AGT GGG CAC GCA GGA GCA GGG GAG GGC TCC CAC AGC 1822
1823 ACC CTG CCT CCC TCT CTC CAA AGA TCT TTG TGA GGT GAG CCT TGC CAG 1870
1871 CAG TGG GGA GTC TGC ACA AGG AGA GGC GGG GAA GCA TTC TCC CTG TGA 1918
1919 CAA CCC CAC TGA GCA GCA GAT CAT GCA ACT GCT TCA TGA GAT GCA GAA 1966
1967 CCT CCA GGA GCA CCC AGG CTT GGG CAG CAG CCC TTG CAT TCC TTT TTT 2014
2015 GTA CCA GAC TGA TGA GAA CAA TGA GGT GAA GAT CAC CAT CAT CTA AAA 2062
2063 GCC GGC CAC TGT CAG CAA AAC CTG GGG AAG TGG GGC TGG AGG CTC TGC 2110
2111 CCC TAC CAT GTC CCT ACC ACC CCT TCC CAG TCA ACC CTT TAC CCT CAC 2158
2159 AGT AGC AAG CAT AAG ACC CCT GTC TAA TGT GGG GAG ACA GGT GGA GAT 2206
2207 GAG GTG AAG ATC ACC ATA ATC TAA AAG GCC ACT AAA TAA AAA AAT AAA 2254
2255 AAA TTT TAA AAA AAA AAA AAA AAA A 2279
Claims (5)
1.一种分离的多核苷酸,其特征在于,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列选自下组:
(a)编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸,所述蛋白具有选自下组的氨基酸序列:
SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26;
(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。
2.如权利要求1所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26。
3.如权利要求1所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸的序列选自下组:
SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27的编码区序列或全长序列。
4.一种载体,其特征在于,它含有权利要求1所述的多核苷酸。
5.一种遗传工程化的宿主细胞,其特征在于,它是选自下组的一种宿主细胞:
(a)用权利要求4所述的载体转化或转导的宿主细胞;
(b)用权利要求1所述的多核苷酸转化或转导的宿主细胞。
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Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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CNB001119893A Expired - Fee Related CN1169956C (zh) | 2000-03-13 | 2000-03-13 | 编码具有抑制癌细胞生长功能的人蛋白的多核苷酸 |
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C14 | Grant of patent or utility model | ||
GR01 | Patent grant | ||
C19 | Lapse of patent right due to non-payment of the annual fee | ||
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