CN1170929C - 编码具有抑制癌细胞生长功能的人蛋白的多核苷酸 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一类新的具有抑癌功能的人蛋白,编码此多肽的多核苷酸和经重组技术产生该多肽的方法。本发明还公开了此多肽用于治疗多种疾病如癌症等的方法。本发明还公开了抗此多肽的拮抗剂及其治疗作用。本发明还公开了编码这类新的具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸的用途。
Description
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明涉及新的编码具有抑癌功能(即抑制癌细胞生长)的人蛋白的多核苷酸,以及此多核苷酸编码的多肽。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的用途和制备。
人基因组学研究目前是国际上的热点,除人染色体DNA大规模测序,表达序列测序(EST)的方法外,还缺少从功能开始的筛选具有功能基因的高通量的方法。
癌症是危害人类健康的主要疾病之一。为了有效地治疗和预防肿瘤,目前人们已越来越关注肿瘤的基因治疗。因此,本领域迫切需要开发研究具有抑癌功能的人蛋白及其激动剂/抑制剂。
本发明的目的是提供一类新的具有抑癌功能的人蛋白多肽以及其片段、类似物和衍生物。
本发明的另一目的是提供编码这些多肽的多核苷酸。
本发明的另一目的是提供生产这些多肽的方法以及该多肽和编码序列的用途。
在本发明的第一方面,提供新颖的分离出的具有抑癌功能的蛋白多肽,它包含具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ IDNO:44、SEQ ID NO:47;或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
较佳地,该多肽是具有选自下组的氨基酸序列的多肽:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:23、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:47。
在本发明的第二方面,提供了一种分离的多核苷酸,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列与选自下组的一种核苷酸序列有至少85%相同性:(a)编码上述的具有抑癌功能的蛋白多肽的多核苷酸;(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。较佳地,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ IDNO:44、SEQ ID NO:47。更佳地,该多核苷酸的序列选自下组:SEQ ID NO:3、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:36、SEQ IDNO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:48的编码区序列或全长序列。
在本发明的第三方面,提供了含有上述多核苷酸的载体,以及被该载体转化或转导的宿主细胞或者被上述多核苷酸直接转化或转导的宿主细胞。
在本发明的第四方面,提供了制备具有具有抑癌功能的蛋白活性的多肽的制备方法,该方法包含:(a)在适合表达具有抑癌功能的蛋白的条件下,培养上述被转化或转导的宿主细胞;(b)从培养物中分离出具有具有抑癌功能的蛋白活性的多肽。
在本发明的第五方面,提供了与上述的具有抑癌功能的蛋白多肽特异性结合的抗体。还提供了可用于检测的核酸分子,它含有上述的多核苷酸中连续的10-800个核苷酸。
在本发明的第六方面,提供了一种药物组合物,它含有安全有效量的本发明的具有抑癌功能的蛋白多肽以及药学上可接受的载体。这些药物组合物可治疗癌症以及细胞异常增殖等病症。
本发明的其它方面由于本文的技术的公开,对本领域的技术人员而言是显而易见的。
本发明采用大规模cDNA克隆转染癌细胞,在获得具有抑癌作用的基础上,经测序证明为新的基因,进一步得到全长cDNA克隆。DNA转染试验证明,本发明的具有抑癌功能的蛋白对癌细胞(肝癌细胞)具有抑制克隆形成的作用,其抑制率在50%或50%以上。
如本文所用,“分离的”是指物质从其原始环境中分离出来(如果是天然的物质,原始环境即是天然环境)。如活体细胞内的天然状态下的多聚核苷酸和多肽是没有分离纯化的,但同样的多聚核苷酸或多肽如从天然状态中同存在的其他物质中分开,则为分离纯化的。
如本文所用,“分离的具有抑癌功能的蛋白或多肽”是指具有抑癌功能的蛋白多肽基本上不含天然与其相关的其它蛋白、脂类、糖类或其它物质。本领域的技术人员能用标准的蛋白质纯化技术纯化具有抑癌功能的蛋白。基本上纯的多肽在非还原聚丙烯酰胺凝胶上能产生单一的主带。具有抑癌功能的蛋白多肽的纯度能用氨基酸序列分析。
本发明的多肽可以是重组多肽、天然多肽、合成多肽,优选重组多肽。本发明的多肽可以是天然纯化的产物,或是化学合成的产物,或使用重组技术从原核或真核宿主(例如,细菌、酵母、高等植物、昆虫和哺乳动物细胞)中产生。根据重组生产方案所用的宿主,本发明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本发明的多肽还可包括或不包括起始的甲硫氨酸残基。
本发明还包括具有抑癌功能的人蛋白的片段、衍生物和类似物。如本文所用,术语“片段”、“衍生物”和“类似物”是指基本上保持本发明的天然具有抑癌功能的人蛋白相同的生物学功能或活性的多肽。本发明的多肽片段、衍生物或类似物可以是(i)有一个或多个保守或非保守性氨基酸残基(优选保守性氨基酸残基)被取代的多肽,而这样的取代的氨基酸残基可以是也可以不是由遗传密码编码的,或(ii)在一个或多个氨基酸残基中具有取代基团的多肽,或(iii)成熟多肽与另一个化合物(比如延长多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(iv)附加的氨基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前导序列或分泌序列或用来纯化此多肽的序列或蛋白原序列)。根据本文的教导,这些片段、衍生物和类似物属于本领域熟练技术人员公知的范围。
本发明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因组DNA或人工合成的DNA。DNA可以是单链的或是双链的。DNA可以是编码链或非编码链。以PP1224蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:3所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”在本发明中是指编码具有SEQ ID NO:2的蛋白质,但与SEQ ID NO:3所示的编码区序列有差别的核酸序列。以PP265蛋白(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)(在本申请中,蛋白质的命名采用其克隆编号)为例,编码成熟多肽的编码区序列可以与SEQ ID NO:6所示的编码区序列相同或者是简并的变异体。如本文所用,“简并的变异体”在本发明中是指编码具有SEQ ID NO:5的蛋白质,但与SEQ ID NO:6所示的编码区序列有差别的核酸序列。对于其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。对于其他具有抑癌功能的蛋白,可依此类推。
编码成熟多肽的多核苷酸包括:只编码成熟多肽的编码序列:成熟多肽的编码序列和各种附加编码序列;成熟多肽的编码序列(和任选的附加编码序列)以及非编码序列。
术语“编码多肽的多核苷酸”可以是包括编码此多肽的多核苷酸,也可以是还包括附加编码和/或非编码序列的多核苷酸。
本发明还涉及上述多核苷酸的变异体,其编码与本发明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、类似物和衍生物。此多核苷酸的变异体可以是天然发生的等位变异体或非天然发生的变异体。这些核苷酸变异体包括取代变异体、缺失变异体和插入变异体。如本领域所知的,等位变异体是一个多核苷酸的替换形式,它可能是一个或多个核苷酸的取代、缺失或插入,但不会从实质上改变其编码的多肽的功能。
本发明还涉及与上述的序列杂交且两个序列之间具有至少50%,较佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本发明特别涉及在严格条件下与本发明所述多核苷酸可杂交的多核苷酸。在本发明中,“严格条件”是指:(1)在较低离子强度和较高温度下的杂交和洗脱,如0.2×SSC,0.1%SDS,60℃;或(2)杂交时加有变性剂,如50%(v/v)甲酰胺,0.1%小牛血清/0.1%Ficoll,42℃等;或(3)仅在两条序列之间的相同性至少在95%以上,更好是97%以上时才发生杂交。并且,可杂交的多核苷酸编码的多肽与SEQ IDNO:2所示的成熟多肽有相同的生物学功能和活性。
本发明还涉及与上述的序列杂交的核酸片段。如本文所用,“核酸片段”的长度至少含15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸以上。核酸片段可用于核酸的扩增技术(如PCR)以确定和/或分离编码具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸。
本发明中的多肽和多核苷酸优选以分离的形式提供,更佳地被纯化至均质。
本发明的DNA序列能用几种方法获得。例如,用本领域熟知的杂交技术分离DNA。这些技术包括但不局限于:1)用探针与基因组或cDNA文库杂交以检出同源性核苷酸序列,和2)表达文库的抗体筛选以检出具有共同结构特征的克隆的DNA片段。
编码具有抑癌功能的蛋白的特异DNA片段序列产生也能用下列方法获得:1)从基因组DNA分离双链DNA序列;2)化学合成DNA序列以获得所需多肽的双链DNA。
上述提到的方法中,分离基因组DNA最不常用。当需要的多肽产物的整个氨基酸序列已知时,DNA序列的直接化学合成是经常选用的方法。如果所需的氨基酸的整个序列不清楚时,DNA序列的直接化学合成是不可能的,选用的方法是cDNA序列的分离。分离感兴趣的cDNA的标准方法是从高表达该基因的供体细胞分离mRNA并进行逆转录,形成质粒或噬菌体cDNA文库。提取mRNA的方法已有多种成熟的技术,试剂盒也可从商业途径获得(Qiagene)。而构建cDNA文库也是通常的方法(Sambrook,et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory.New York,1989)。还可得到商业供应的cDNA文库,如Clontech公司的不同cDNA文库。当结合使用聚合酶反应技术时,即使极少的表达产物也能克隆。
可用常规方法从这些cDNA文库中筛选本发明的基因。这些方法包括(但不限于):(1)DNA-DNA或DNA-RNA杂交;(2)标志基因的功能出现或丧失;(3)测定具有抑癌功能的蛋白的转录本的水平;(4)通过免疫学技术或测定生物学活性,来检测基因表达的蛋白产物。上述方法可单用,也可多种方法联合应用。
在第(1)种方法中,杂交所用的探针是与本发明的多核苷酸的任何一部分同源,其长度至少15个核苷酸,较好是至少30个核苷酸,更好是至少50个核苷酸,最好是至少100个核苷酸。此外,探针的长度通常在2kb之内,较佳地为1kb之内。此处所用的探针通常是在本发明的基因DNA序列信息的基础上化学合成的DNA序列。本发明的基因本身或者片段当然可以用作探针。DNA探针的标记可用放射性同位素,荧光素或酶(如碱性磷酸酶)等。
在第(4)种方法中,检测具有抑癌功能的蛋白基因表达的蛋白产物可用免疫学技术如Western印迹法,放射免疫沉淀法,酶联免疫吸附法(ELISA)等。
应用PCR技术扩增DNA/RNA的方法(Saiki,et al.Science 1985;230:1350-1354)被优选用于获得本发明的基因。特别是很难从文库中得到全长的cDNA时,可优选使用RACE法(RACE-cDNA末端快速扩增法),用于PCR的引物可根据本文所公开的本发明的序列信息适当地选择,并可用常规方法合成。可用常规方法如通过凝胶电泳分离和纯化扩增的DNA/RNA片段。
如上所述得到的本发明的基因,或者各种DNA片段等的核苷酸序列的测定可用常规方法如双脱氧链终止法(Sanger et al.PNAS,1977,74:5463-5467)。这类核苷酸序列测定也可用商业测序试剂盒等。为了获得全长的cDNA序列,测序需反复进行。有时需要测定多个克隆的cDNA序列,才能拼接成全长的cDNA序列。
本发明也涉及包含本发明的多核苷酸的载体,以及用本发明的载体或具有抑癌功能的蛋白编码序列经基因工程产生的宿主细胞,以及经重组技术产生本发明所述多肽的方法。
通过常规的重组DNA技术,可利用本发明的多聚核苷酸序列可用来表达或生产重组的具有抑癌功能的蛋白多肽(Science,1984;224:1431)。一般来说有以下步骤:
(1).用本发明的编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸(或变异体),或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;
(2).在合适的培养基中培养的宿主细胞;
(3).从培养基或细胞中分离、纯化蛋白质。
本发明中,具有抑癌功能的人蛋白多核苷酸序列可插入到重组表达载体中。术语“重组表达载体”指本领域熟知的细菌质粒、噬菌体、酵母质粒、植物细胞病毒、哺乳动物细胞病毒如腺病毒、逆转录病毒或其他载体。在本发明中适用的载体包括但不限于:在细菌中表达的基于T7的表达载体(Rosenberg,et al.Gene,1987,56:125);在哺乳动物细胞中表达的pMSXND表达载体(Lee and Nathans,J Bio Chem.263:3521,1988)和在昆虫细胞中表达的来源于杆状病毒的载体。总之,只要能在宿主体内复制和稳定,任何质粒和载体都可以用。表达载体的一个重要特征是通常含有复制起点、启动子、标记基因和翻译控制元件。
本领域的技术人员熟知的方法能用于构建含具有抑癌功能的人蛋白编码DNA序列和合适的转录/翻译控制信号的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、DNA合成技术、体内重组技术等(Sambroook,et al.Molecular Cloning,a Laboratory Manual,coldSpring Harbor Laboratory.New York,1989)。所述的DNA序列可有效连接到表达载体中的适当启动子上,以指导mRNA合成。这些启动子的代表性例子有:大肠杆菌的lac或trp启动子;λ噬菌体PL启动子;真核启动子包括CMV立即早期启动子、HSV胸苷激酶启动子、早期和晚期SV40启动子、反转录病毒的LTRs和其他一些已知的可控制基因在原核或真核细胞或其病毒中表达的启动子。表达载体还包括翻译起始用的核糖体结合位点和转录终止子。
此外,表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因,以提供用于选择转化的宿主细胞的表型性状,如真核细胞培养用的二氢叶酸还原酶、新霉素抗性以及绿色荧光蛋白(GFP),或用于大肠杆菌的四环素或氨苄青霉素抗性。
包含上述的适当DNA序列以及适当启动子或者控制序列的载体,可以用于转化适当的宿主细胞,以使其能够表达蛋白质。
宿主细胞可以是原核细胞,如细菌细胞;或是低等真核细胞,如酵母细胞;或是高等真核细胞,如哺乳动物细胞。代表性例子有:大肠杆菌,链霉菌属;鼠伤寒沙门氏菌的细菌细胞;真菌细胞如酵母;植物细胞;果蝇S2或Sf9的昆虫细胞;CHO、COS或Bowes黑素瘤细胞的动物细胞等。
本发明的多核苷酸在高等真核细胞中表达时,如果在载体中插入增强子序列时将会使转录得到增强。增强子是DNA的顺式作用因子,通常大约有10到300个碱基对,作用于启动子以增强基因的转录。可举的例子包括在复制起始点晚期一侧的100到270个碱基对的SV40增强子、在复制起始点晚期一侧的多瘤增强子以及腺病毒增强子等。
本领域一般技术人员都清楚如何选择适当的载体、启动子、增强子和宿主细胞。
用重组DNA转化宿主细胞可用本领域技术人员熟知的常规技术进行。当宿主为原核生物如大肠杆菌时,能吸收DNA的感受态细胞可在指数生长期后收获,用CaCl2法处理,所用的步骤在本领域众所周知。可供选择的是用MgCl2。如果需要,转化也可用电穿孔的方法进行。当宿主是真核生物,可选用如下的DNA转染方法:磷酸钙共沉淀法,常规机械方法如显微注射、电穿孔、脂质体包装等。
获得的转化子可以用常规方法培养,表达本发明的基因所编码的多肽。根据所用的宿主细胞,培养中所用的培养基可选自各种常规培养基。在适于宿主细胞生长的条件下进行培养。当宿主细胞生长到适当的细胞密度后,用合适的方法(如温度转换或化学诱导)诱导选择的启动子,将细胞再培养一段时间。
在上面的方法中的重组多肽可包被于细胞内、细胞外或在细胞膜上表达或分泌到细胞外。如果需要,可利用其物理的、化学的和其它特性通过各种分离方法分离和纯化重组的蛋白。这些方法是本领域技术人员所熟知的。这些方法的例子包括但并不限于:常规的复性处理、用蛋白沉淀剂处理(盐析方法)、离心、渗透破菌、超处理、超离心、分子筛层析(凝胶过滤)、吸附层析、离子交换层析、高效液相层析(HPLC)和其它各种液相层析技术及这些方法的结合。
重组的具有抑癌功能的人蛋白或多肽有多方面的用途。这些用途包括(但不限于):直接做为药物治疗具有抑癌功能的蛋白功能低下或丧失所致的疾病,和用于筛选促进或对抗具有抑癌功能的蛋白功能的抗体、多肽或其它配体。例如,抗体可用于激活或抑制具有抑癌功能的人蛋白的功能。用表达的重组具有抑癌功能的人蛋白筛选多肽库可用于寻找有治疗价值的能抑制或刺激具有抑癌功能的人蛋白功能的多肽分子。
本发明也提供了筛选药物以鉴定提高(激动剂)或阻遏(拮抗剂)具有抑癌功能的人蛋白的药剂的方法。激动剂提高具有抑癌功能的人蛋白刺激细胞增殖等生物功能,而拮抗剂阻止和治疗与细胞过度增殖有关的紊乱如各种癌症。例如,能在药物的存在下,将哺乳动物细胞或表达具有抑癌功能的人蛋白的膜制剂与标记的具有抑癌功能的人蛋白一起培养。然后测定药物提高或阻遏此相互作用的能力。
具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂包括筛选出的抗体、化合物、受体缺失物和类似物等。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可以与具有抑癌功能的人蛋白结合并消除其功能,或是抑制具有抑癌功能的人蛋白的产生,或是与多肽的活性位点结合使多肽不能发挥生物学功能。具有抑癌功能的人蛋白的拮抗剂可用于治疗用途。
在筛选作为拮抗剂的化合物时,可以将具有抑癌功能的蛋白加入生物分析测定中,通过测定化合物影响具有抑癌功能的蛋白和其受体之间的相互作用来确定化合物是否是拮抗剂。用上述筛选化合物的同样方法,可以筛选出起拮抗剂作用的受体缺失物和类似物。
本发明的多肽可直接用于疾病治疗,例如,各种恶性肿瘤、和细胞异常增殖等。
本发明的多肽,及其片段、衍生物、类似物或它们的细胞可以用来作为抗原以生产抗体。这些抗体可以是多克隆或单克隆抗体。多克隆抗体可以通过将此多肽直接注射动物的方法得到。制备单克隆抗体的技术包括杂交瘤技术,三瘤技术,人B-细胞杂交瘤技术,EBV-杂交瘤技术等。
可以将本发明的多肽和拮抗剂与合适的药物载体组合后使用。这些载体可以是水、葡萄糖、乙醇、盐类、缓冲液、甘油以及它们的组合。组合物包含安全有效量的多肽或拮抗剂以及不影响药物效果的载体和赋形剂。这些组合物可以作为药物用于疾病治疗。
本发明还提供含有一种或多种容器的药盒或试剂盒,容器中装有一种或多种本发明的药用组合物成分。与这些容器一起,可以有由制造、使用或销售药品或生物制品的政府管理机构所给出的指示性提示,该提示反映出生产、使用或销售的政府管理机构许可其在人体上施用。此外,本发明的多肽可以与其它的治疗化合物结合使用。
药物组合物可以以方便的方式给药,如通过局部、静脉内、腹膜内、肌内、皮下、鼻内或皮内的给药途径。具有抑癌功能的蛋白以有效地治疗和/或预防具体的适应症的量来给药。施用于患者的具有抑癌功能的蛋白的量和剂量范围将取决于许多因素,如给药方式、待治疗者的健康条件和诊断医生的判断。
具有抑癌功能的人蛋白的多聚核苷酸也可用于多种治疗目的。基因治疗技术可用于治疗由于具有抑癌功能的蛋白的无表达或异常/无活性的具有抑癌功能的蛋白的表达所致的细胞增殖、发育或代谢异常。重组的基因治疗载体(如病毒载体)可设计成表达变异的具有抑癌功能的蛋白,以抑制内源性的具有抑癌功能的蛋白活性。例如,一种变异的具有抑癌功能的蛋白可以是缩短的、缺失了信号传导功能域的具有抑癌功能的蛋白,虽可与下游的底物结合,但缺乏信号传导活性。因此重组的基因治疗载体可用于治疗具有抑癌功能的蛋白表达或活性异常所致的疾病。来源于病毒的表达载体如逆转录病毒、腺病毒、腺病毒相关病毒、单纯疱疹病毒、细小病毒等可用于将具有抑癌功能的蛋白基因转移至细胞内。构建携带具有抑癌功能的蛋白基因的重组病毒载体的方法可见于已有文献(Sambrook,et al.)。另外重组具有抑癌功能的人蛋白基因可包装到脂质体中转移至细胞内。
抑制具有抑癌功能的人蛋白mRNA的寡聚核苷酸(包括反义RNA和DNA)以及核酶也在本发明的范围之内。核酶是一种能特异性分解特定RNA的酶样RNA分子,其作用机制是核酶分子与互补的靶RNA特异性杂交后进行核酸内切作用。反义的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技术获得,如固相磷酸酰胺化学合成法合成寡核苷酸的技术已广泛应用。反义RNA分子可通过编码该RNA的DNA序列在体外或体内转录获得。这种DNA序列已整合到载体的RNA聚合酶启动子的下游。为了增加核酸分子的稳定性,可用多种方法对其进行修饰,如增加两侧的序列长度,核糖核苷之间的连接应用磷酸硫酯键或肽键而非磷酸二酯键。
多聚核苷酸导入组织或细胞内的方法包括:将多聚核苷酸直接注入到体内组织中;或在体外通过载体(如病毒、噬菌体或质粒等)先将多聚核苷酸导入细胞中,再将细胞移植到体内等。
本发明的多肽还可用作肽谱分析,例如,多肽可用物理的、化学或酶进行特异性切割,并进行一维或二维或三维的凝胶电泳分析。
本发明还提供了针对具有抑癌功能的人蛋白抗原决定簇的抗体。这些抗体包括(但不限于):多克隆抗体、单克隆抗体、嵌合抗体、单链抗体、Fab片段和Fab表达文库产生的片段。
抗具有抑癌功能的人蛋白的抗体可用于免疫组织化学技术中,检测活检标本中的具有抑癌功能的人蛋白。
与具有抑癌功能的人蛋白结合的单克隆抗体也可用放射性同位素标记,注入体内可跟踪其位置和分布。这种放射性标记的抗体可作为一种非创伤性诊断方法用于肿瘤细胞的定位和判断是否有转移。
本发明中的抗体可用于治疗或预防与具有抑癌功能的人蛋白相关的疾病。给予适当剂量的抗体可以刺激或阻断具有抑癌功能的人蛋白的产生或活性。
抗体也可用于设计针对体内某一特殊部位的免疫毒素。如具有抑癌功能的人蛋白高亲和性的单克隆抗体可与细菌或植物毒素(如白喉毒素,蓖麻蛋白,红豆碱等)共价结合。一种通常的方法是用巯基交联剂如SPDP,攻击抗体的氨基,通过二硫键的交换,将毒素结合于抗体上,这种杂交抗体可用于杀灭具有抑癌功能的人蛋白阳性的细胞。
多克隆抗体的生产可用具有抑癌功能的人蛋白或多肽免疫动物,如家兔,小鼠,大鼠等。多种佐剂可用于增强免疫反应,包括但不限于弗氏佐剂等。
具有抑癌功能的人蛋白单克隆抗体可用杂交瘤技术生产(Kohler and Milstein.Nature,1975,256:495-497)。将人恒定区和非人源的可变区结合的嵌合抗体可用已有的技术生产(Morrison et al,PNAS,1985,81:6851)。而已有的生产单链抗体的技术(U.S.PatNo.4946778)也可用于生产抗具有抑癌功能的人蛋白的单链抗体。
能与具有抑癌功能的人蛋白结合的多肽分子可通过筛选由各种可能组合的氨基酸结合于固相物组成的随机多肽库而获得。筛选时,必须对具有抑癌功能的人蛋白分子进行标记。
本发明还涉及定量和定位检测具有抑癌功能的人蛋白水平的诊断试验方法。这些试验是本领域所熟知的,且包括FISH测定和放射免疫测定。试验中所检测的具有抑癌功能的人蛋白水平,可以用作解释具有抑癌功能的人蛋白在各种疾病中的重要性和用于诊断具有抑癌功能的蛋白起作用的疾病。
具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于具有抑癌功能的蛋白相关疾病的诊断和治疗。在诊断方面,具有抑癌功能的蛋白的多聚核苷酸可用于检测具有抑癌功能的蛋白的表达与否或在疾病状态下具有抑癌功能的蛋白的异常表达。如具有抑癌功能的蛋白DNA序列可用于对活检标本的杂交以判断具有抑癌功能的蛋白的表达异常。杂交技术包括Southern印迹法,Northern印迹法、原位杂交等。这些技术方法都是公开的成熟技术,相关的试剂盒都可从商业途径得到。本发明的多核苷酸的一部分或全部可作为探针固定在微阵列(Microarray)或DNA芯片(又称为“基因芯片”)上,用于分析组织中基因的差异表达分析和基因诊断。用具有抑癌功能的蛋白特异的引物进行RNA-聚合酶链反应(RT-PCR)体外扩增也可检测具有抑癌功能的蛋白的转录产物。
检测具有抑癌功能的蛋白基因的突变也可用于诊断具有抑癌功能的蛋白相关的疾病。具有抑癌功能的蛋白突变的形式包括与正常野生型具有抑癌功能的蛋白DNA序列相比的点突变、易位、缺失、重组和其它任何异常等。可用已有的技术如Southern印迹法、DNA序列分析、PCR和原位杂交检测突变。另外,突变有可能影响蛋白的表达,因此用Northern印迹法、Western印迹法可间接判断基因有无突变。
本发明的序列对染色体鉴定也是有价值的。该序列会特异性地针对某条人染色体具体位置且并可以与其杂交。目前,需要鉴定染色体上的各基因的具体位点。现在,只有很少的基于实际序列数据(重复多态性)的染色体标记物可用于标记染色体位置。根据本发明,为了将这些序列与疾病相关基因相关联,其重要的第一步就是将这些DNA序列定位于染色体上。
简而言之,根据cDNA制备PCR引物(优选15-35bp),可以将序列定位于染色体上。然后,将这些引物用于PCR筛选含各条人染色体的体细胞杂合细胞。只有那些含有相应于引物的人基因的杂合细胞会产生扩增的片段。
体细胞杂合细胞的PCR定位法,是将DNA定位到具体染色体的快捷方法。使用本发明的的寡核苷酸引物,通过类似方法,可利用一组来自特定染色体的片段或大量基因组克隆而实现亚定位。可用于染色体定位的其它类似策略包括原位杂交、用标记的流式分选的染色体预筛选和杂交预选,从而构建染色体特异的cDNA库。
将cDNA克隆与中期染色体进行荧光原位杂交(FISH),可以在一个步骤中精确地进行染色体定位。此技术的综述,参见Verma等,Human Chromosomes:a Manual of BasicTechniques,Pergamon Press,New York(1988)。
一旦序列被定位到准确的染色体位置,此序列在染色体上的物理位置就可以与基因图数据相关联。这些数据可见于例如,V.Mckusick,Mendelian Inheritance in Man(可通过与Johns Hopkins University Welch Medical Library联机获得)。然后可通过连锁分析,确定基因与业已定位到染色体区域上的疾病之间的关系。
接着,需要测定患病和未患病个体间的cDNA或基因组序列差异。如果在一些或所有的患病个体中观察到某突变,而该突变在任何正常个体中未观察到,则该突变可能是疾病的病因。比较患病和未患病个体,通常涉及首先寻找染色体中结构的变化,如从染色体水平可见的或用基于cDNA序列的PCR可检测的缺失或易位。根据目前的物理作图和基因定位技术的分辨能力,被精确定位至与疾病有关的染色体区域的cDNA,可以是50至500个潜在致病基因间之一种(假定1兆碱基作图分辨能力和每20kb对应于一个基因)。
本发明的具有抑癌功能的蛋白核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
目前,已经可以完全通过化学合成来编码本发明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中的各种DNA分子(如载体)和细胞中。此外,还可通过化学合成将突变引入本发明蛋白序列中。
此外,由于本发明的具有抑癌功能的蛋白具有源自人的天然氨基酸序列,因此,与来源于其他物种的同族蛋白相比,预计在施用于人时将具有更高的活性和/或更低的副作用(例如在人体内的免疫原性更低或没有)。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1:cDNA基因的获得及对癌细胞克隆形成的抑制作用
SP1224来自于从GIBCO BRL公司购得的肝cDNA文库(cat,No.10422-012),PP265,PP384,PP432,PP552,PP591,PP603,PP632,PP844,PP928,PP1200,PP1226,PP1292,PP1396,PP1563和PP1746是通过用常规方法构建人胎盘cDNA文库获得的。取3、6、10月龄的胎盘组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(pharmacia公司)提取mRNA。用pCMV-script TMXR cDNA文库构建试剂盒(Stratagene公司)构建上述mRNA的cDNA文库。其中反转录酶改用MMLV-RT-Superscript II(GIBCO BRL),反转录反应在42℃进行。转化XL 10-Gold感受细胞,获得了1×106cfu/μg cDNA滴度的cDNA文库。第一轮随机挑取cDNA克隆,其后以高丰度cDNA克隆和已证明有抑癌细胞生长功能的cDNA克隆为探针,杂交筛选cDNA文库,挑取弱阳性及阴性克隆。用Qiagen 96孔板质粒抽提试剂盒,按厂家说明书进行质粒DNA的提取。质粒DNA和空载体同时转染肝癌细胞系7721。100ng DNA酒精沉淀干燥后,加6μl H2O溶解,待转染。每份DNA样品中加0.74μl脂质体及9.3μl无血清培液,混匀后,室温放置10分钟。每管中加150μl无血清培液,均分加入3孔生长于96孔板的7721细胞中,37℃放置2小时,每孔再加50μl无血清培液,37℃ 24小时。每孔换100μl全培液,37℃ 24小时,换含G418的全培液100μl,37℃ 24~48小时,边观察,边换G418浓度不等的培液。约2~3次后,直到镜检细胞有克隆形成,计数。发现上述克隆有抑制细胞克隆形成作用,结果如下表所示。
cDNA克隆转染细胞(7721)克隆形成情况
cDNA克隆名称 | cDNA克隆数 | 对照克隆数 |
SP1224 | 1 2 1 | 15 10 8 |
PP265 | 13 9 8 | 20 17 16 |
PP384 | 12 7 8 | 45 52 31 |
PP432 | 25 29 21 | 31 33 30 |
PP552 | 4 1 3 | 20 17 16 |
PP591 | 8 1 2 | 21 30 42 |
PP603 | 2 1 0 | 21 30 42 |
PP632 | 0 3 2 | 22 19 13 |
PP844 | 0 0 0 | 31 38 32 |
PP928 | 32 34 21 | 57 54 40 |
PP1200 | 0 0 0 | 30 37 41 |
PP1226 | 0 4 3 | 30 20 22 |
PP1292 | 2 2 4 | 16 14 17 |
PP1396 | 7 8 2 | 26 23 32 |
PP1563 | 11 6 3 | 27 25 26 |
PP1746 | 1 0 0 | 10 18 9 |
对cDNA克隆采用双脱氧终止法,在ABI377 DNA自动测序仪上测定其一端近500bp的核苷酸序列。分析后,确定为新基因克隆,进行另一端测序,仍未获得全长cDNA序列,设计引物,再次进行测序,直到获得全长序列(SEQ ID NO:1、4、7、10、13、16、19、22、25、28、31、34、37、40、43、46)。
实施例2:从胎盘cDNA中PCR获得基因克隆:
取3、6、10月龄的胎盘组织,用Trizol试剂(GIBCO BRL公司)按厂方说明书提取总RNA,用mRNA提纯试剂盒(pharmacia公司)提取mRNA。用MMLV-RT-SuperscriptII(GIBCO BRL)反转录酶在42℃进行反转录反应,获得胎盘cDNA。利用各个基因的转异引物(如下表所示),按90℃ 3分钟1个循环;94℃ 30秒,60℃ 30秒,72℃ 1分钟,共35个循环;72℃ 10分钟,1个循环进行PCR扩增,获得含有完整开放阅读框序列的各蛋白基因的扩增产物。扩增产物经测序验证,与实施例1测得的序列相符,随后用常规技术将扩增产物转入宿主细胞,以获得重组蛋白。
基因特异引物
克隆名称 | 特异引物1(5′→3′) | 特异引物2(5′→3′) |
SP1224 | CACGCGTCCGGGAATCCAGTC | GCATCAACAGATCAAGCAAAGCCATGA |
PP265 | GCGAGGTGGCCATGAAGATCCAG | GCTCAGCACCTCTCCCAGCTCCA |
PP384 | TCAGAATGGGAAGGCCTGGAAGA | CGAGCCTCAGCTCAGGGGAAACA |
PP432 | TCGGGTCTCCCCATTCTCCAGGT | GTCCCACAACCGGGGAAGGAGAG |
PP552 | AACTCCCTCCCGCCAGCCCTTTA | TTTACAGGCAGTGCGTGGCTGCT |
PP591 | GAACAGGCAGGTTCCCTCGACCC | TGCCCTCTCAGGGATTTGCAGGA |
PP603 | CTTAGTTGCCGGAGCTGAACGGC | AAGACCCAATTTCCACAGCGCCC |
PP632 | CCCCCAGGCCACTAACAGCAACA | TAGGGTGAGGCCCATGTCAACGG |
PP844 | AGTGGTCGGCTTGGTGTGGTGTG | CAAACTTGCAGCCAAAGGGCGAG |
PP928 | CGAGAACAGCAAAGGCCAAAGCC | GGAAAGCTGTGTCCCTCCCCAGA |
PP1200 | TGCTAACCCTGAGACAGCAAGAC | GCAAGCATTTATCACTTCGACGCC |
PP1226 | CTAGCTTCGCGAGGGTGCCTGTC | ACCCCTGTAAAACCTCGTGCCCA |
PP1292 | CCGACCTCCACAAGCTCCCTCAT | TGGAATGCAGTTACACGCAGGGG |
PP1396 | AAGGTGTCTGGCGCCCCATTTTC | ATCACACCACCACATGGGCCTGA |
PP1563 | AGGAAGGCCAGCGATCACCTTGA | GCTGCTTTTGGAGACCAGCAGGC |
PP1746 | ACCCTGGCGACGTGCTACTGAGC | TTATTGCGGGATCCTCACACGGC |
实施例3:cDNA克隆序列分析
1.SP1224
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:1) 长度:2492bp
1 CCCACGCGTC CGGGAATCCA GTCCGGGGGC CGAGCTGGCT GCGCCCTCCG
51 CCAAGCGCCG GCAGCGCGGG GCGAGCTCCG GACGGCGCGC GGCCCAGGCA
101 GCGGCTCCCG CTCGGCCCGC CCTCCGAGCC GCAGGGGCCG CCACCGCCGC
151 GGCGCCTCCC CTGGCGACCG CGCCCCCGGG CCCCGGCTCC GGCCCGGGAC
201 GGAGGAGCCG GCGCTCGACA CAGAGAGCTC TTCAGAAACC AGGCTGCTTT
251 CAGGAACATT GCTGTGGATT CCCAGGGCCT ATTCCACTAG AAGCAAGATG
301 GCTGAACTCA ATACTCATGT GAATGTCAAG GAAAAGATCT ATGCAGTTAG
351 ATCAGTTGTT CCCAACAAAA GCAATAATGA AATAGTCCTG GTGCTCCAAC
401 AGTTTGATTT TAATGTGGAT AAAGCCGTGC AAGCCTTTGT GGATGGCAGT
451 GCAATTCAAG TTCTAAAAGA ATGGAATATG ACAGGAAAAA AGAAGAACAA
501 TAAAAGAAAA AGAAGCAAGT CCAAGCAGCA TCAAGGCAAC AAAGATGCTA
551 AAGACAAGGT GGAGAGGCCT TGAGGCAGGG CCCCTGCAGC CGCAGCCACC
601 ACAGATTCAA AACGGCCCCA TGAATGGCTG CGAGAAGGAC AGCTCGTCCA
651 CAGATTCTGC TAACGAAAAA CCAGCCCTTA TCCCTCGTGA GAAAAAGATC
701 TCGATACTTG AGGAACCTTC AAAGGCACTT CGTGGGGTCA CAGAAGGCAA
751 CAGACTACTG CAACAGAAAC TATCCTTAGA TGGGAACCCC AAACCTATAC
801 ATGGAACAAC AGAGAGGTCA GATGGCCTAC AGTGGTCAGC TGAGCAGCCT
851 TGTAACCCAA GCAAGCCTAA GGCAAAAACA TCTCCTGTTA AGTCCAATAC
901 CCCTGCAGCT CATCTTGAAA TAAAGCCAGA TGAGTTGGCA AAGAAAAGAG
951 GCCCAAATAT TGAGAAATCA GTGAAGGATT TGCAACGCTG CACCGTTTCT
1001 CTAACTAGAT ATCGCGTCAT GATTAAGGAA GAAGTGGATA GTTCCGTGAA
1051 GAAGATCAAA GCTGCCTTTG CTGAATTACA CAACTGCATC ATTGACAAAG
1101 AAGTTTCATT AATGGCAGAA ATGGATAAAG TTAAAGAAGA AGCCATGGAA
1151 ATCCTGACTG CTCGTCAGAA GAAAGCAGAA GAACTAAAGA GACTCACTGA
1201 CCTTGCCAGT CAGATGGCAG AGATGCAGCT GGCCGAACTC AGGGCAGAAA
1251 TTAAGCACTT TGTCAGCGAG CGTAAATATG ACGAGGAGCT CGGGAAAGCT
1301 GCCCGGTTTT CCTGTGACAT CGAACAGCTG AAGGCCCAAA TCATGCTCTG
1351 CGGAGAAATT ACACATCCAA AGAACAACTA TTCCTCAAGA ACTCCCTGCA
1401 GCTCCCTGCT GCCTCTGCTG AATGCGCACG CAGCAACCTC TGGGAAACAG
1451 AGTAACTTTT CCCGAAAATC ATCCACTCAC AATAAGCCCT CTGAAGGCAA
1501 AGCGGCAAAC CCCAAAATGG TGAGCAGTCT CCCCAGCACC GCCGACCCCT
1551 CTCACCAGAC CATGCCGGCC AACAAGCAGA ATGGATCTTC TAACCAAAGA
1601 CGGAGATTTA ATCCACAGTA TCATAACAAC AGGCTAAATG GGCCTGCCAA
1651 GTCGCAGGGC AGTGGGAATG AAGCCGAGCC ACTGGGAAAG GGCAACAGCC
1701 GCCACGAACA CAGAAGACAG CCGCACAACG GCTTCCGGCC CAAAAACAAA
1751 GGCGGTGCCA AAAATCAAGA GGCTTCCTTG GGGATGAAGA CCCCCGAGGC
1801 CCCGGCCCAT TCTGAAAAGC CCCGGCGAAG GCAGCACGCT GCAGACACCT
1851 CGGAGGCCAG GCCCTTCCGG GGTAGTGTCG GTAGGGTTTC ACAGTGCAAT
1901 CTCTGCCCCA CGAGAATAGA AGTTTCCACA GATGCAGCAG TTCTCTCAGT
1951 CCCGGCTGTG ACGTTGGTGG CCTGAGCTAG GAGGAAAAAG AGCAGTTTTC
2001 ACTCAGTTTT GGTTCCCTGC CCGAGGTGCT GACCCAATTC GCTGCCAAAA
2051 GAGTGTCAAT CAGAATATAC AAATCCCGTA TGGTTGTGTC ATCCTCTCTT
2101 AATCATTTTT ACTAATTCTA ATAATCAGCT CTAGCTTGCT TCATAATTTT
2151 CATGGCTTTG CTTGATCTGT TGATGCTTTC TCTCATCAAG ACTTTGCAGC
2201 ATTTTAGCCA GGCAGTATTT ACTCATTATT AGGAAAATCA AGATGTGGCT
2251 GAAGATCAGA GGCTCAGTTA GCAACCTGTG TTGTAGCAGT GATGTCAGTC
2301 CATTGATTGT CTTTAGAGAG TTAATGTTAC AAAAAAGAAT TCTTAATAAT
2351 CAGACAAACA TGATCTGCTG AGGACACATG CGCTTTTGTA GAATTTAACA
2401 TCTGGTGTTT TTCTGAAAAA ATATATATAC ATATATTGCT TTATTTGAAA
2451 CAAATTAAAA TATGCTGCAT TTGAAAAAAA AAAAAAAAAA AA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:2)长度:476个氨基酸
1 MLKTRWRGLE AGPLQPQPPQ IQNGPMNGCE KDSSSTDSAN EKPALIPREK
51 KISILEEPSK ALRGVTEGNR LLQQKLSLDG NPKPIHGTTE RSDGLQWSAE
101 QPCNPSKPKA KTSPVKSNTP AAHLEIKPDE LAKKRGPNIE KSVKDLQRCT
151 VSLTRYRVMI KEEVDSSVKK IKAAFAELHN CIIDKEVSLM AEMDKVKEEA
201 MEILTARQKK AEELKRLTDL ASQMAEMQLA ELRAEIKHFV SERKYDEELG
251 KAARFSCDIE QLKAQIMLCG EITHPKNNYS SRTPCSSLLP LLNAHAATSG
301 KQSNFSRKSS THNKPSEGKA ANPKMVSSLP STADPSHQTM PANKQNGSSN
351 QRRRFNPQYH NNRLNGPAKS QGSGNEAEPL GKGNSRHEHR RQPHNGFRPK
401 NKGGAKNQEA SLGMKTPEAP AHSEKPRRRQ HAADTSEARP FRGSVGRVSQ
451 CNLCPTRIEV STDAAVLSVP AVTLVA
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:3)
克隆号和蛋白名称:SP1224
起始编码子:545 ATG 终止编码子:1975 TGA
蛋白质分子量:52451.74
1 C CCA CGC GTC CGG GAA TCC AGT CCG GGG GCC GAG CTG GCT GCG CCC 46
47 TCC GCC AAG CGC CGG CAG CGC GGG GCG AGC TCC GGA CGG CGC GCG GCC 94
95 CAG GCA GCG GCT CCC GCT CGG CCC GCC CTC CGA GCC GCA GGG GCC GCC 142
143 ACC GCC GCG GCG CCT CCC CTG GCG ACC GCG CCC CCG GGC CCC GGC TCC 190
191 GGC CCG GGA CGG AGG AGC CGG CGC TCG ACA CAG AGA GCT CTT CAG AAA 238
239 CCA GGC TGC TTT CAG GAA CAT TGC TGT GGA TTC CCA GGG CCT ATT CCA 286
287 CTA GAA GCA AGA TGG CTG AAC TCA ATA CTC ATG TGA ATG TCA AGG AAA 334
335 AGA TCT ATG CAG TTA GAT CAG TTG TTC CCA ACA AAA GCA ATA ATG AAA 382
383 TAG TCC TGG TGC TCC AAC AGT TTG ATT TTA ATG TGG ATA AAG CCG TGC 430
431 AAG CCT TTG TGG ATG GCA GTG CAA TTC AAG TTC TAA AAG AAT GGA ATA 478
479 TGA CAG GAA AAA AGA AGA ACA ATA AAA GAA AAA GAA GCA AGT CCA AGC 526
527 AGC ATC AAG GCA ACA AAG ATG CTA AAG ACA AGG TGG AGA GGC CTT GAG 574
1 Met Leu Lys Thr Arg Trp Arg Gly Leu Glu 10
575 GCA GGG CCC CTG CAG CCG CAG CCA CCA CAG ATT CAA AAC GGC CCC ATG 622
11 Ala Gly Pro Leu Gln Pro Gln Pro Pro Gln Ile Gln Asn Gly Pro Met 26
623 AAT GGC TGC GAG AAG GAC AGC TCG TCC ACA GAT TCT GCT AAC GAA AAA 670
27 Asn Gly Cys Glu Lys Asp Ser Ser Ser Thr Asp Ser Ala Asn Glu Lys 42
671 CCA GCC CTT ATC CCT CGT GAG AAA AAG ATC TCG ATA CTT GAG GAA CCT 718
43 Pro Ala Leu Ile Pro Arg Glu Lys Lys Ile Ser Ile Leu Glu Glu Pro 58
719 TCA AAG GCA CTT CGT GGG GTC ACA GAA GGC AAC AGA CTA CTG CAA CAG 766
59 Ser Lys Ala Leu Arg Gly Val Thr Glu Gly Asn Arg Leu Leu Gln Gln 74
767 AAA CTA TCC TTA GAT GGG AAC CCC AAA CCT ATA CAT GGA ACA ACA GAG 814
75 Lys Leu Ser Leu Asp Gly Asn Pro Lys Pro Ile His Gly Thr Thr Glu 90
815 AGG TCA GAT GGC CTA CAG TGG TCA GCT GAG CAG CCT TGT AAC CCA AGC 862
91 Arg Ser Asp Gly Leu Gln Trp Ser Ala Glu Gln Pro Cys Asn Pro Ser 106
863 AAG CCT AAG GCA AAA ACA TCT CCT GTT AAG TCC AAT ACC CCT GCA GCT 910
107 Lys Pro Lys Ala Lys Thr Ser Pro Val Lys Ser Asn Thr Pro Ala Ala 122
911 CAT CTT GAA ATA AAG CCA GAT GAG TTG GCA AAG AAA AGA GGC CCA AAT 958
123 His Leu Glu Ile Lys Pro Asp Glu Leu Ala Lys Lys Arg Gly Pro Asn 138
959 ATT GAG AAA TCA GTG AAG GAT TTG CAA CGC TGC ACC GTT TCT CTA ACT 1006
139 Ile Glu Lys Ser Val Lys Asp Leu Gln Arg Cys Thr Val Ser Leu Thr 154
1007 AGA TAT CGC GTC ATG ATT AAG GAA GAA GTG GAT AGT TCC GTG AAG AAG 1054
155 Arg Tyr Arg Val Met Ile Lys Glu Glu Val Asp Ser Ser Val Lys Lys 170
1055 ATC AAA GCT GCC TTT GCT GAA TTA CAC AAC TGC ATC ATT GAC AAA GAA 1102
171 Ile Lys Ala Ala Phe Ala Glu Leu His Asn Cys Ile Ile Asp Lys Glu 186
1103 GTT TCA TTA ATG GCA GAA ATG GAT AAA GTT AAA GAA GAA GCC ATG GAA 1150
187 Val Ser Leu Met Ala Glu Met Asp Lys Val Lys Glu Glu Ala Met Glu 202
1151 ATC CTG ACT GCT CGT CAG AAG AAA GCA GAA GAA CTA AAG AGA CTC ACT 1198
203 Ile Leu Thr Ala Arg Gln Lys Lys Ala Glu Glu Leu Lys Arg Leu Thr 218
1199 GAC CTT GCC AGT CAG ATG GCA GAG ATG CAG CTG GCC GAA CTC AGG GCA 1246
219 Asp Leu Ala Ser Gln Met Ala Glu Met Gln Leu Ala Glu Leu Arg Ala 234
1247 GAA ATT AAG CAC TTT GTC AGC GAG CGT AAA TAT GAC GAG GAG CTC GGG 1294
235 Glu Ile Lys His Phe Val Ser Glu Arg Lys Tyr Asp Glu Glu Leu Gly 250
1295 AAA GCT GCC CGG TTT TCC TGT GAC ATC GAA CAG CTG AAG GCC CAA ATC 1342
251 Lys Ala Ala Arg Phe Ser Cys Asp Ile Glu Gln Leu Lys Ala Gln Ile 266
1343 ATG CTC TGC GGA GAA ATT ACA CAT CCA AAG AAC AAC TAT TCC TCA AGA 1390
267 Met Leu Cys Gly Glu Ile Thr His Pro Lys Asn Asn Tyr Ser Ser Arg 282
1391 ACT CCC TGC AGC TCC CTG CTG CCT CTG CTG AAT GCG CAC GCA GCA ACC 1438
283 Thr Pro Cys Ser Ser Leu Leu Pro Leu Leu Asn Ala His Ala Ala Thr 298
1439 TCT GGG AAA CAG AGT AAC TTT TCC CGA AAA TCA TCC ACT CAC AAT AAG 1486
299 Ser Gly Lys Gln Ser Asn Phe Ser Arg Lys Ser Ser Thr His Asn Lys 314
1487 CCC TCT GAA GGC AAA GCG GCA AAC CCC AAA ATG GTG AGC AGT CTC CCC 1534
315 Pro Ser Glu Gly Lys Ala Ala Asn Pro Lys Met Val Ser Ser Leu Pro 330
1535 AGC ACC GCC GAC CCC TCT CAC CAG ACC ATG CCG GCC AAC AAG CAG AAT 1582
331 Ser Thr Ala Asp Pro Ser His Gln Thr Met Pro Ala Asn Lys Gln Asn 346
1583 GGA TCT TCT AAC CAA AGA CGG AGA TTT AAT CCA CAG TAT CAT AAC AAC 1630
347 Gly Ser Ser Asn Gln Arg Arg Arg Phe Asn Pro Gln Tyr His Asn Asn 362
1631 AGG CTA AAT GGG CCT GCC AAG TCG CAG GGC AGT GGG AAT GAA GCC GAG 1678
363 Arg Leu Asn Gly Pro Ala Lys Ser Gln Gly Ser Gly Asn Glu Ala Glu 378
1679 CCA CTG GGA AAG GGC AAC AGC CGC CAC GAA CAC AGA AGA CAG CCG CAC 1726
379 Pro Leu Gly Lys Gly Asn Ser Arg His Glu His Arg Arg Gln Pro His 394
1727 AAC GGC TTC CGG CCC AAA AAC AAA GGC GGT GCC AAA AAT CAA GAG GCT 1774
395 Asn Gly Phe Arg Pro Lys Asn Lys Gly Gly Ala Lys Asn Gln Glu Ala 410
1775 TCC TTG GGG ATG AAG ACC CCC GAG GCC CCG GCC CAT TCT GAA AAG CCC 1822
411 Ser Leu Gly Met Lys Thr Pro Glu Ala Pro Ala His Ser Glu Lys Pro 426
1823 CGG CGA AGG CAG CAC GCT GCA GAC ACC TCG GAG GCC AGG CCC TTC CGG 1870
427 Arg Arg Arg Gln His Ala Ala Asp Thr Ser Glu Ala Arg Pro Phe Arg 442
1871 GGT AGT GTC GGT AGG GTT TCA GAG TGC AAT CTC TGC CCC ACG AGA ATA 1918
443 Gly Ser Val Gly Arg Val Ser Gln Cys Asn Leu Cys Pro Thr Arg Ile 458
1919 GAA GTT TCC ACA GAT GCA GCA GTT CTC TCA GTC CCG GCT GTG ACG TTG 1966
459 Glu Val Ser Thr Asp Ala Ala Val Leu Ser Val Pro Ala Val Thr Leu 474
1967 GTG GCC TGA GCT AGG AGG AAA AAG AGC AGT TTT CAC TCA GTT TTG GTT 2014
475 Val Ala *** 477
2015 CCC TGC CCG AGG TGC TGA CCC AAT TCG CTG CCA AAA GAG TGT CAA TCA 2062
2063 GAA TAT ACA AAT CCC GTA TGG TTG TGT CAT CCT CTC TTA ATC ATT TTT 2110
2111 ACT AAT TCT AAT AAT CAG CTC TAG CTT GCT TCA TAA TTT TCA TGG CTT 2158
2159 TGC TTG ATC TGT TGA TGC TTT CTC TCA TCA AGA CTT TGC AGC ATT TTA 2206
2207 GCC AGG CAG TAT TTA CTC ATT ATT AGG AAA ATC AAG ATG TGG CTG AAG 2254
2255 ATC AGA GGC TCA GTT AGC AAC CTG TGT TGT AGC AGT GAT GTC AGT CCA 2302
2303 TTG ATT GTC TTT AGA GAG TTA ATG TTA CAA AAA AGA ATT CTT AAT AAT 2350
2351 CAG ACA AAC ATG ATC TGC TGA GGA CAC ATG CGC TTT TGT AGA ATT TAA 2398
2399 CAT CTG GTG TTT TTC TGA AAA AAT ATA TAT ACA TAT ATT GCT TTA TTT 2446
2447 GAA ACA AAT TAA AAT ATG CTG CAT TTG AAA AAA AAA AAA AAA AAA A 2492
D:Blastp结果
Query=SP1224[基因=SP1224](476个氨基酸)
>SP_IN:046309 046309 drosophila melanogaster(fruit fly).eg:8d8.6
protein.5/1999
长度=402
分值=45.7 bits(106),预计值=8e-04
相同性=42/186(22%),相似性=80/186(42%),缺口=16/186(8%)
Query:291 LLNAHAATSGKQSNFSRKSSTHNKPSEGKAANPKMVSSLPSTADPSHQTMPANKQNGSSN 350
++ A AA +GK+ ++K+S P+ ++ ++ + PS HQ A + +
Sbjct:1 MADAQAAAAGKKKYKNKKNSAEKNPNHNPNSSGQVEAQTPSNGHVQHQEEEATEDQEPAQ 60
Query:351 QRRRFNPQYHNNRLNGPAKSQGSGNEAEPLGKGNSRHEHRRQPHNGFRPKNKGGAKNQEA 410
+R + H NG + EA PLG+ + H H +N R G + N +
Sbjct:61 ELRGLLKKMH--LCNGHGHKE---QEARPLGEVVNGHAHGHSNNNHIR-CTSGSSNNNNS 114
Query:411 SLGMKTPEAPAHSEKPRRR---QHAADTSEARPFRGSVGRVSQ--CNLCPT-----RIEV 460
+ + ++ ++ K RR +D++ +P + S+ N+ PT + +V
Sbjct:115 THNNNSVDSSNNNRKQRREGGDGGGSDSNSLKPEEKPITATSKTTANIHPTTTTDPKPKV 174
Query:461 STDAAV 466
S D AV
Sbjct:175 SEDVAV 180
>SW:YG6P_CAEEL P90970 caenorhabditis elegans.hypothetical 60.7 kd
protein t23g11.8 in chromosome i.11/1997
长度=530
分值=44.9 bits(104),预计值=0.001
相同性=51/201(25%),相似性=98/201(48%),缺口=18/201(8%)
Query:115 VKSNTPAAHLEIKPDELAKKRGPNIEKSVKDLQRCTVSLTRYRVMIKEEVDSSVKKIKAA 174
V++ ++H EL R ++ K ++ C + R V ++EE+ + V++++ A
Sbjct:180 VENQKVSSHEMDSLQELKLARQKAQDQKEKAVEECNMH-KRKIVGLEEEIRAMVEQLRLA 238
Query:175 FAELHNCIIDKEVSLMAEMDKVKEEAMEILTARQKKAEELKRLTDLASQMAEMQLAELRA 234
L+ +K+ E D+ K +A +ILTA++K E LK + S + L L+A
Sbjct:239 KFNLNE---NKK-----EFDEYKNKAQKILTAKEKLVESLKSEQGIGSSDRPVHL--LQA 288
Query:235 EIKHFVSER---KYDEELGKAARFS--CDIEQLKAQIM-LCGEITHPKNNY-SSRTPCSS 287
E++ ER K D E + ++ D+E+L+AQI L +++ K + + S
Sbjct:289 EVEEIRVERDLTKADLESAQLQVYTLRSDMEELEAQIRDLQSQLSDQKRTHLEEKQTWDS 348
Query:288 LLPLLNAHAATSGKQSNFSRK 308
+LLN S ++F+++
Sbjct:349 TIGLLNEKVECSRIENEFTKQ 369
2. PP265
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:4)长度:1969bp
1 CGGCCGCGAG GTGGCCATGA AGATCCAGTA CCCTGGCGTG GCCCAGAGCA
51 TCAACAGTGA TGTCAACAAC CTCATGGCCG TGTTGAACAT GAGCAACATG
101 CTTCCAGAAG GCCTGTTCCC CGAGCACCTG ATCGACGTGC TGAGGCGGGA
151 GCTGGCCCTG GAGTGTGACT ACCAGCGAGA GGCCGCCTGT GCCCGCAAGT
201 TCAGGTGTGG CCCCCGGCCG GGCCCCTTGC GTGTTTGCAC CAGGGAGGCA
251 GAAGGGACCA TGTTCAGCAG CTGGTGAAGG CCCCTCCAGC TCTGAGGGGC
301 AGAGGGCTGG GGTTGCAGCC TGGGCCGAGG CCATATCCTG CCTGGGGTGA
351 AGGAGGGCCC TCTGCCTGGT TGGGGGGTGT GTGTGGGGGG GGGGACGGTG
401 TGGAGGGCCT GTGGCTAGGG CGTGACCTCC CTCCCCTACC CAGGGACCTG
451 CTGAAGGGCC ACCCCTTCTT CTATGTGCCT GAGATTGTGG ATGAGCTCTG
501 CAGCCCACAT GTGCTGACCA CAGAGCTGGT GTCTGGCTTC CCCCTGGACC
551 AGGCCGAAGG GCTCAGCCAG GAGATTCGGA ACGAGATCTG CTACAACATC
601 CTGGTTCTGT GCCTGAGGGA GCTGTTCGAG TTCCACTTCA TGCAAACAGA
651 CCCCAACTGG TCCAACTTCT TCTATGACCC CCAGCAGCAC AAGGTGGCTC
701 TTTTGGATTT TGGGGCAACG CGGGAATATG ACAGATCCTT CACCGACCTC
751 TACATTCAGA TCATCAGGGC TGCTGCCGAC AGGGACAGGG AGACTGTGCG
801 GGCGAAATCC ATAGAGATGA AGTTCCTCAC CGGCTACGAG GTCAAGGTCA
851 TGGAAGACGC CCACTTGGAT GCCATCCTCA TCCTGGGGGA GGCCTTCGCC
901 TCTGATGAGC CTTTTGATTT TGGCACTCAG AGCACCACCG AGAAGATCCA
951 CAACCTGATT CCCGTCATGC TGAGGCACCG TCTCGTCCCC CCACCCGAGG
1001 AAACCTACTC CCTGCACAGG AAGATGGGGG GCTCCTTCCT CATCTGCTCC
1051 AAGCTGAAGG CCCGCTTCCC CTGCAAGGCC ATGTTCGAGG AGGCCTACAG
1101 CAACTACTGC AAGAGGCAGG CCCAGCAGTA GGGCTGCGGG CCACGCCCAG
1151 GCCGGCTCCG CGGGAACTCT CTCCCTCAGA CAGGCCAAAA ACCAGTAGCG
1201 AGGTCGTGGT GATGCTCTTT TTAACTCCTT TGCCCAATAA GGGGGGTGGC
1251 TGCCTGGAGC CCCGTAGCCA GCGCTTTCCA CGGTTTCTGT TGCTAAATGG
1301 TTGTAGGGTG AGAAGTGCAA GAATGAAGAT GAAGCCCCAC TGCTCGGTCA
1351 GTCTGCCTCC GTGTGTCCTC TGAAATAAGC AGATGAAGAT GAAAGGGCAA
1401 CTTTGTTTTC TTCTTTTTCC TGATGTGAAT GTTAAGCAGA AGGGAGAGAG
1451 TCCTTACTCC CTTCCAATCT CTGTTCAGTG CAAAACCCAG AAACATGACA
1501 GATACGATTG TGGGATTTTA TCATCTGTGT AGTAGGTGTG TGTATGTGTT
1551 TCTAGAGTGA GATTTGTGTT TTCTGCCCTT TTCCTCTCCA GCCAATGGGC
1601 TGGAGCTGGG AGAGGTGCTG AGCTAACAGT GCCAACAAGT GCTCCTTAAG
1651 CCTGCGAGGC CCAGGCCTGT GGGGCTGGTT CTCACCTTTG ACAGCTGAAT
1701 GTTCCTAAAG AACTGCTGCC CCACAGTGAG GGTGGGAGCA GCGGAACAGG
1751 GAATGCCAGA CACAGGCTCG CTGCTGCTGG AAGGCGGGGT GGGACTTCCT
1801 TCCTCTGTCC AGAGAGGCAC AGGTGTCACC AGTTCCAGCC AAAGGCTCCT
1851 CACAGGCGCT GTGAATTTTT GTACAAGTCT TGTAATTATC GAATCAACAA
1901 CTTGTTTCAA TTTAATAAAA ATGCTCATGG GAAGTGCAAA AAAAAAAAAA
1951 AAAAAAAAAA AAAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:5)长度:163个氨基酸
1 MQTDPNWSNF FYDPQQHKVA LLDFGATREY DRSFTDLYIQ IIRAAADRDR
51 ETVRAKSIEM KFLTGYEVKV MEDAHLDAIL ILGEAFASDE PFDFGTQSTT
101 EKIHNLIPVM LRHRLVPPPE ETYSLHRKMG GSFLICSKLK ARFPCKAMFE
151 EAYSNYCKRQ AQQ
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:6)
克隆号和蛋白名称:PP265
起始编码子:640 ATG终止编码子:1131 TAG
蛋白质分子量:18935.63
1 CGG CCG CGA GGT GGC CAT GAA GAT CCA GTA CCC TGG CGT GGC CCA GAG 48
49 CAT CAA CAG TGA TGT CAA CAA CCT CAT GGC CGT GTT GAA CAT GAG CAA 96
97 CAT GCT TCC AGA AGG CCT GTT CCC CGA GCA CCT GAT CGA CGT GCT GAG 144
145 GCG GGA GCT GGC CCT GGA GTG TGA CTA CCA GCG AGA GGC CGC CTG TGC 192
193 CCG CAA GTT CAG GTG TGG CCC CCG GCC GGG CCC CTT GCG TGT TTG CAC 240
241 CAG GGA GGC AGA AGG GAC CAT GTT CAG CAG CTG GTG AAG GCC CCT CCA 288
289 GCT CTG AGG GGC AGA GGG CTG GGG TTG CAG CCT GGG CCG AGG CCA TAT 336
337 CCT GCC TGG GGT GAA GGA GGG CCC TCT GCC TGG TTG GGG GGT GTG TGT 384
385 GGG GGG GGG GAC GGT GTG GAG GGC CTG TGG CTA GGG CGT GAC CTC CCT 432
433 CCC CTA CCC AGG GAC CTG CTG AAG GGC CAC CCC TTC TTC TAT GTG CCT 480
481 GAG ATT GTG GAT GAG CTC TGC AGC CCA CAT GTG CTG ACC ACA GAG CTG 528
529 GTG TCT GGC TTC CCC CTG GAC CAG GCC GAA GGG CTC AGC CAG GAG ATT 576
577 CGG AAC GAG ATC TGC TAC AAC ATC CTG GTT CTG TGC CTG AGG GAG CTG 624
625 TTC GAG TTC CAC TTC ATG CAA ACA GAC CCC AAC TGG TCC AAC TTC TTC 672
1 Met Gln Thr Asp Pro Asn Trp Ser Asn Phe Phe 11
673 TAT GAC CCC CAG CAG CAC AAG GTG GCT CTT TTG GAT TTT GGG GCA ACG 720
12 Tyr Asp Pro Gln Gln His Lys Val Ala Leu Leu Asp Phe Gly Ala Thr 27
721 CGG GAA TAT GAC AGA TCC TTC ACC GAC CTC TAC ATT CAG ATC ATC AGG 768
28 Arg Glu Tyr Asp Arg Ser Phe Thr Asp Leu Tyr Ile Gln Ile Ile Arg 43
769 GCT GCT GCC GAC AGG GAC AGG GAG ACT GTG CGG GCG AAA TCC ATA GAG 816
44 Ala Ala Ala Asp Arg Asp Arg Glu Thr Val Arg Ala Lys Ser Ile Glu 59
817 ATG AAG TTC CTC ACC GGC TAC GAG GTC AAG GTC ATG GAA GAC GCC CAC 864
60 Met Lys Phe Leu Thr Gly Tyr Glu Val Lys Val Met Glu Asp Ala His 75
865 TTG GAT GCC ATC CTC ATC CTG GGG GAG GCC TTC GCC TCT GAT GAG CCT 912
76 Leu Asp Ala Ile Leu Ile Leu Gly Glu Ala Phe Ala Ser Asp Glu Pro 91
913 TTT GAT TTT GGC ACT CAG AGC ACC ACC GAG AAG ATC CAC AAC CTG ATT 960
92 Phe Asp Phe Gly Thr Gln Ser Thr Thr Glu Lys Ile His Asn Leu Ile 107
961 CCC GTC ATG CTG AGG CAC CGT CTC GTC CCC CCA CCC GAG GAA ACC TAC 1008
108 Pro Val Met Leu Arg His Arg Leu Val Pro Pro Pro Glu Glu Thr Tyr 123
1009 TCC CTG CAC AGG AAG ATG GGG GGC TCC TTC CTC ATC TGC TCC AAG CTG 1056
124 Ser Leu His Arg Lys Met Gly Gly Ser Phe Leu Ile Cys Ser Lys Leu 139
1057 AAG GCC CGC TTC CCC TGC AAG GCC ATG TTC GAG GAG GCC TAC AGC AAC 1104
140 Lys Ala Arg Phe Pro Cys Lys Ala Met Phe Glu Glu Ala Tyr Ser Asn 155
1105 TAC TGC AAG AGG CAG GCC CAG CAG TAG GGC TGC GGG CCA CGC CCA GGC 1152
156 Tyr Cys Lys Arg Gln Ala Gln Gln *** 164
1153 CGG CTC CGC GGG AAC TCT CTC CCT CAG ACA GGC CAA AAA CCA GTA GCG 1200
1201 AGG TCG TGG TGA TGC TCT TTT TAA CTC CTT TGC CCA ATA AGG GGG GTG 1248
1249 GCT GCC TGG AGC CCC GTA GCC AGC GCT TTC CAC GGT TTC TGT TGC TAA 1296
1297 ATG GTT GTA GGG TGA GAA GTG CAA GAA TGA AGA TGA AGC CCC ACT GCT 1344
1345 CGG TCA GTC TGC CTC CGT GTG TCC TCT GAA ATA AGC AGA TGA AGA TGA 1392
1393 AAG GGC AAC TTT GTT TTC TTC TTT TTC CTG ATG TGA ATG TTA AGC AGA 1440
1441 AGG GAG AGA GTC CTT ACT CCC TTC CAA TCT CTG TTC AGT GCA AAA CCC 1488
1489 AGA AAC ATG ACA GAT ACG ATT GTG GGA TTT TAT CAT CTG TGT AGT AGG 1536
1537 TGT GTG TAT GTG TTT CTA GAG TGA GAT TTG TGT TTT CTG CCC TTT TCC 1584
1585 TCT CCA GCC AAT GGG CTG GAG CTG GGA GAG GTG CTG AGC TAA CAG TGC 1632
1633 CAA CAA GTG CTC CTT AAG CCT GCG AGG CCC AGG CCT GTG GGG CTG GTT 1680
1681 CTC ACC TTT GAC AGC TGA ATG TTC CTA AAG AAC TGC TGC CCC ACA GTG 1728
1729 AGG GTG GGA GCA GCG GAA CAG GGA ATG CCA GAC ACA GGC TCG CTG CTG 1776
1777 CTG GAA GGC GGG GTG GGA CTT CCT TCC TCT GTC CAG AGA GGC ACA GGT 1824
1825 GTC ACC AGT TCC AGC CAA AGG CTC CTC ACA GGC GCT GTG AAT TTT TGT 1872
1873 ACA AGT CTT GTA ATT ATC GAA TCA ACA ACT TGT TTC AAT TTA ATA AAA 1920
1921 ATG CTC ATG GGA AGT GCA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1968
1969 A 1969
D:Blastp结果
Query=PP265[基因=PP265](163个氨基酸)
>SW:YLC4_CAEEL Q18486 caenorhabditis elegans.hypothetical 81.0 kd
protein c35d10.4 in chromosomeiii.7/1998
长度=733
分值=176 bits(441),预计值=1e-43
相同性=81/160(50%),相似性=110/160(68%),缺口=4/160(2%)
Query:1 MQTDPNWSNFFYDPQ----QHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAK 56
MQTDPNWSNFF + ++ LLDFGA+R Y + F D+Y+ II++A D D++ +
Sbjct:562 MQTDPNWSNFFLGKHPKTGEPRLVLLDFGASRAYGKKFVDIYMNIIKSAYDGDKKKIIEY 621
Query:57 SIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLV 116
S E+ FLTGYE VMEDAH+++++I+GE AS+ P++F Q T +I LIPVML HRL
Sbjct:622 SREIGFLTGYETSVMEDAHVESVMIMGETLASNHPYNFANQDVTMRIQKLIPVMLEHRLT 681
Query:117 PPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY 156
PPEE YSLHRK+ G +L+ +KLKA C +F E + NY
Sbjct:682 SPPEEIYSLHRKLSGCYLLAAKLKATVSCGGLFHEIHENY 721
>PIR2:S71110 abc1 protein-fission yeast(Schizosaccharomyces
pombe)
长度=610
分值=161 bits(404),预计值=3e-39
相同性=78/158(49%),相似性=105/158(66%),缺口=2/158(1%)
Query:1 MQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAKSIEM 60
MQTDPNWSNF Y+ + K+ LLDFGA+ EYD F Y +++ AAA R+RE + S+E+
Sbjct:451 MQTDPNWSNFLYNGKTKKIELLDFGASIEYDEKFIKKYCRLLLAAAHRNREKCKKLSVEL 510
Query:61 KFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEP--FDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLVPP 118
+L +E M DAH+++I L E FA D P +DFG Q+ T ++ IPVML RL PP
Sbjct:511 GYLNNHESAQMIDAHINSIFTLAEPFAFDAPDVYDFGDQTITARVKQQIPVMLDLRLQPP 570
Query:119 PEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY 156
PEETYSLHR++ G FL+C+KL A+ CK +F +Y
Sbjct:571 PEETYSLHRRLSGHFLLCAKLGAKVRCKELFSGMLKHY 608
>SW:ABCI_SCHPO Q92338 schizosaccharomyces pombe(fission yeast).
abc1 protein homolog precursor.12/1998
长度=610
分值=161bits(404),预计值=3e-39
相同性=78/158(49%),相似性=105/158(66%),缺口=2/158(1%)
Query:1 MQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAKSIEM 60
MQTDPNWSNF Y+ + K+ LLDFGA+ EYD F Y +++ AAA R+RE + S+E+
Sbjct:451 MQTDPNWSNFLYNGKTKKIELLDFGASIEYDEKFIKKYCRLLLAAAHRNREKCKKLSVEL 510
Query:61 KFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEP--FDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLVPP 118
+L +E M DAH+++I L E FA D P +DFG Q+ T ++ IPVML RL PP
Sbjct:511 GYLNNHESAQMIDAHINSIFTLAEPFAFDAPDVYDFGDQTITARVKQQIPVMLDLRLQPP 570
Query:119 PEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNY 156
PEETYSLHR++ G FL+C+KL A+ CK+F +Y
Sbjct:571 PEETYSLHRRLSGHFLLCAKLGAKVRCKELFSGMLKHY 608
3.PP384
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:7) 长度:2357bp
1 CAAAGGGCTG TTGCTGACAG TTAATACCAG TAGTCAGAAT GGGAAGGCCT
51 GGAAGAACAC TTATTAAAGA AATCCAGAGT CCTCTGTCTA GTATCTGTGA
101 TGGCTCCATA GCTCTAGATG CTGAGCCTGT TACCCAGCCA GCATCGCTGC
151 CCAGACACAG CAGCACACCA GACCACACCA GCACACTGGA GCCTCCTCGT
201 TTGCCTCAAA GAAAGAACTT ACAAAGTGAA AAGGAAACTT ATCAGCTGTC
251 TAAGGAAGTG GAAATTTTAT CTAGGAACCT GGTTGAAATG CAACGGTGTC
301 TTTCTGAACT TACAAACCGT CTGCATAATG GGAAGAAATC CTCTTCAGTG
351 TATCCACTCT CTCAAGATCT TCCTTATGTT CACATCATTT ACCAGAAACC
401 TTATTATCTA GGTCCTGTTG TTGAAAAAAG AGCGGTGCTT CTCTGTGATG
451 GTAAACTAAG GCTCAGTACA GTTCAGCAGA CTTTTGGCCT TTCTCTCATT
501 GAAATGCTAC ATGATTCCCA CTGGATTCTT CTCTCTGCTG ACAGTGAGGG
551 CTTTATCCCG TTAACCTTCA CAGCCACACA GGAAATAATC ATAAGAGATG
601 GCAGCCTGTC CAGGTCAGAT GTCTTCAGAG ACTCTTTTTC TCACAGTCCA
651 GGTGCTGTTT CTTCTCTTAA AGTCTTTACA GGCCTTGCTG CCCCCAGTTT
701 AGATACCACT GGCTGTTGTA ACCATGTAGA TGGCATGGCT TGATATCTGC
751 AGTGTCCTTG CTGTGTAGCT CTTCAGATGA GACCATTACA AACAAGGCCT
801 GCTTGACACT GGACACTCGC CAATGAGACT CCCACTGCAC TCAGGCGAAG
851 CGCTTGCCAT GGTCGGCTCT CCTGGTTTCC CCCTGTTTCC CCTGAGCTGA
901 GGCTCGCTGC TGTGTAGCAG AGCTCAGTCT TTATTAGATG GCTCCGAAAG
951 TGGTGTTTAT GTATTCATGA CTGTGTGGTT TTGACTAAGG GCAGAATTCT
1001 CAGAACAAAA CAATATTATG GTGCCATATG GATGGTGTTT TATGGTTTCT
1051 CTGAGGCTTT GTGTCCCTTG TCCAAAGCTG CATTGAAGCT GTCTTAGGAG
1101 CACTTAAAAG ATACCTTGGC ATTGTTATAG GTCTTTTTCT TGGCTTCAAG
1151 AGGAGGTTGA GGAGTCTGCT GGGGGGCATG TGCTCTAGCA TATTAACCTC
1201 AAACCAGCAA AGAATTAGCA GAGCTCCAAG GAGGACCAAG AGACCCACTG
1251 GCTTCTGCTC TCAGGAACAG GAAGTGGCTC TGATGTTGCC TGGACCTCCC
1301 AGAATTTAAA CCAAACCCTC TTGCTTCCTT AACAAATTCT GGCTGACGAA
1351 GGTCCAGGTA CTCTTAAAAA CTGGCCCTGG GAAAATTTTG AATGAAATTT
1401 CAAGGGAATT TGTCCCCTCT GGGTTCCACT TGAGGTTGTG CCGATGCTGC
1451 TACCACACTG TCGAGCCCAG GTAAGTCCTA CTGCAGGATT TTGTGCTGTG
1501 GCCACTCATG AGTGTCCCTG AAATAACTTT TTTTTTTTTT AAATCCAGTT
1551 TTGGGATCAC GCAACTTTCC TATTTTTCTC CCAGTAGTCA GCTCCCTTAG
1601 TTAACTTGTC ACTTTAATTT GATATTTTTA TTTTCTCTCC TTTTAAGTCT
1651 TAGAGACCAG CAGAGAATCT GTGAGAGAAA GTATTTCAGG AAGTTAGAAA
1701 TTCAACCGAA TCTGAGGTAG TCCTAAAAAG TGCCATTTTG TTTCACTTAT
1751 GGGCTAAAGT ACCAGCTTAG TCAGGTAAGA GCCCTGACCC ACTTCAGATG
1801 GTAACACCAC TTCTCACTGC CTTCAGATGG AATCACAGAT TTCAGTCACG
1851 GCGCATAACA AATTGATCAG TGAGTGGCTA GGCATCTGCA GATAAATTGT
1901 TTCAGCCATA GAAGCTCCAT TAGCACATAT GCTTCCTTTT CCCCCCTTCC
1951 TTTAAAATCA TCTGGAAAGA AACTATTTTG TGCCCTTGGG GACTCCTGTC
2001 TGTCTGTTAC AGTTTACCAA GATGGAGCTG GGTTAGGAAA GAAGTGAGGG
2051 CCCATTTTGT GGTTCAAGTG CACTAGACAG CTGCTGGGGT AGGAAGCACA
2101 GGCAATGTCT GCAATCAGCT GTGGGAGAGC GGTGACTGAG AACAGTCTGA
2151 GGCCTGGCTC CACTTGGAAG TATCTGGGGT GCGATGAAAT CACAATTATC
2201 TTGAAGCCTA AAGAGGGAAC TACAAGACTG TTAACTAAGA TCAATGTGGG
2251 CACCTAAAAG GGTATGTTAA AATCACCATT TCTCAGGTCA AAATACTGTG
2301 AATAAGTCTT CAATAAAATC ACTAATGGTT AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
2351 AAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:8)长度:234个氨基酸
1 MGRPGRTLIK EIQSPLSSIC DGSIALDAEP VTQPASLPRH SSTPDHTSTL
51 EPPRLPQRKN LQSEKETYQL SKEVEILSRN LVEMQRCLSE LTNRLHNGKK
101 SSSVYPLSQD LPYVHIIYQK PYYLGPVVEK RAVLLCDGKL RLSTVQQTFG
151 LSLIEMLHDS HWILLSADSE GFIPLTFTAT QEIIIRDGSL SRSDVFRDSF
201 SHSPGAVSSL KVFTGLAAPS LDTTGCCNHV DGMA
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:9)
克隆号和蛋白名称:PP384
起始编码子:39 ATG 终止编码子:743 TGA
蛋白质分子量:25844.05
1 CA AAG GGC TGT TGC TGA CAG TTA ATA CCA GTA GTC AGA ATG GGA AGG 47
1 Met Gly Arg 3
48 CCT GGA AGA ACA CTT ATT AAA GAA ATC CAG AGT CCT CTG TCT AGT ATC 95
4 Pro Gly Arg Thr Leu Ile Lys Glu Ile Gln Ser Pro Leu Ser Ser Ile 19
96 TGT GAT GGC TCC ATA GCT CTA GAT GCT GAG CCT GTT ACC CAG CCA GCA 143
20 Cys Asp Gly Ser Ile Ala Leu Asp Ala Glu Pro Val Thr Gln Pro Ala 35
144 TCG CTG CCC AGA CAC AGC AGC ACA CCA GAC CAC ACC AGC ACA CTG GAG 191
36 Ser Leu Pro Arg His Ser Ser Thr Pro Asp His Thr Ser Thr Leu Glu 51
192 CCT CCT CGT TTG CCT CAA AGA AAG AAC TTA CAA AGT GAA AAG GAA ACT 239
52 Pro Pro Arg Leu Pro Gln Arg Lys Asn Leu Gln Ser Glu Lys Glu Thr 67
240 TAT CAG CTG TCT AAG GAA GTG GAA ATT TTA TCT AGG AAC CTG GTT GAA 287
68 Tyr Gln Leu Ser Lys Glu Val Glu Ile Leu Ser Arg Asn Leu Val Glu 83
288 ATG CAA CGG TGT CTT TCT GAA CTT ACA AAC CGT CTG CAT AAT GGG AAG 335
84 Met Gln Arg Cys Leu Ser Glu Leu Thr Asn Arg Leu His Asn Gly Lys 99
336 AAA TCC TCT TCA GTG TAT CCA CTC TCT CAA GAT CTT CCT TAT GTT CAC 383
100 Lys Ser Ser Ser Val Tyr Pro Leu Ser Gln Asp Leu Pro Tyr Val His 115
384 ATC ATT TAC CAG AAA CCT TAT TAT CTA GGT CCT GTT GTT GAA AAA AGA 431
116 Ile Ile Tyr Gln Lys Pro Tyr Tyr Leu Gly Pro Val Val Glu Lys Arg 131
432 GCG GTG CTT CTC TGT GAT GGT AAA CTA AGG CTC AGT ACA GTT CAG CAG 479
132 Ala Val Leu Leu Cys Asp Gly Lys Leu Arg Leu Ser Thr Val Gln Gln 147
480 ACT TTT GGC CTT TCT CTC ATT GAA ATG CTA CAT GAT TCC CAC TGG ATT 527
148 Thr Phe Gly Leu Ser Leu Ile Glu Met Leu His Asp Ser His Trp Ile 163
528 CTT CTC TCT GCT GAC AGT GAG GGC TTT ATC CCG TTA ACC TTC ACA GCC 575
164 Leu Leu Ser Ala Asp Ser Glu Gly Phe Ile Pro Leu Thr Phe Thr Ala 179
576 ACA CAG GAA ATA ATC ATA AGA GAT GGC AGC CTG TCC AGG TCA GAT GTC 623
180 Thr Gln Glu Ile Ile Ile Arg Asp Gly Ser Leu Ser Arg Ser Asp Val 195
624 TTC AGA GAC TCT TTT TCT CAC AGT CCA GGT GCT GTT TCT TCT CTT AAA 671
196 Phe Arg Asp Ser Phe Ser His Ser Pro Gly Ala Val Ser Ser Leu Lys 211
672 GTC TTT ACA GGC CTT GCT GCC CCC AGT TTA GAT ACC ACT GGC TGT TGT 719
212 Val Phe Thr Gly Leu Ala Ala Pro Ser Leu Asp Thr Thr Gly Cys Cys 227
720 AAC CAT GTA GAT GGC ATG GCT TGA TAT CTG CAG TGT CCT TGC TGT GTA 767
228 Asn His Val Asp Gly Met Ala *** 235
768 GCT CTT CAG ATG AGA CCA TTA CAA ACA AGG CCT GCT TGA CAC TGG ACA 815
816 CTC GCC AAT GAG ACT CCC ACT GCA CTC AGG CGA AGC GCT TGC CAT GGT 863
864 CGG CTC TCC TGG TTT CCC CCT GTT TCC CCT GAG CTG AGG CTC GCT GCT 911
912 GTG TAG CAG AGC TCA GTC TTT ATT AGA TGG CTC CGA AAG TGG TGT TTA 959
960 TGT ATT CAT GAC TGT GTG GTT TTG ACT AAG GGC AGA ATT CTC AGA ACA 1007
1008 AAA CAA TAT TAT GGT GCC ATA TGG ATG GTG TTT TAT GGT TTC TCT GAG 1055
1056 GCT TTG TGT CCC TTG TCC AAA GCT GCA TTG AAG CTG TCT TAG GAG CAC 1103
1104 TTA AAA GAT ACC TTG GCA TTG TTA TAG GTC TTT TTC TTG GCT TCA AGA 1151
1152 GGA GGT TGA GGA GTC TGC TGG GGG GCA TGT GCT CTA GCA TAT TAA CCT 1199
1200 CAA ACC AGC AAA GAA TTA GCA GAG CTC CAA GGA GGA CCA AGA GAC CCA 1247
1248 CTG GCT TCT GCT CTC AGG AAC AGG AAG TGG CTC TGA TGT TGC CTG GAC 1295
1296 CTC CCA GAA TTT AAA CCA AAC CCT CTT GCT TCC TTA ACA AAT TCT GGC 1343
1344 TGA CGA AGG TCC AGG TAC TCT TAA AAA CTG GCC CTG GGA AAA TTT TGA 1391
1392 ATG AAA TTT CAA GGG AAT TTG TCC CCT CTG GGT TCC ACT TGA GGT TGT 1439
1440 GCC GAT GCT GCT ACC ACA CTG TCG AGC CCA GGT AAG TCC TAC TGC AGG 1487
1488 ATT TTG TGC TGT GGC CAC TCA TGA GTG TCC CTG AAA TAA CTT TTT TTT 1535
1536 TTT TTA AAT CCA GTT TTG GGA TCA CGC AAC TTT CCT ATT TTT CTC CCA 1583
1584 GTA GTC AGC TCC CTT AGT TAA CTT GTC ACT TTA ATT TGA TAT TTT TAT 1631
1632 TTT CTC TCC TTT TAA GTC TTA GAG ACC AGC AGA GAA TCT GTG AGA GAA 1679
1680 AGT ATT TCA GGA AGT TAG AAA TTC AAC CGA ATC TGA GGT AGT CCT AAA 1727
1728 AAG TGC CAT TTT GTT TCA CTT ATG GGC TAA AGT ACC AGC TTA GTC AGG 1775
1776 TAA GAG CCC TGA CCC ACT TCA GAT GGT AAC ACC ACT TCT CAC TGC CTT 1823
1824 CAG ATG GAA TCA CAG ATT TCA GTC ACG GCG CAT AAC AAA TTG ATC AGT 1871
1872 GAG TGG CTA GGC ATC TGC AGA TAA ATT GTT TCA GCC ATA GAA GCT CCA 1919
1920 TTA GCA CAT ATG CTT CCT TTT CCC CCC TTC CTT TAA AAT CAT CTG GAA 1967
1968 AGA AAC TAT TTT GTG CCC TTG GGG ACT CCT GTC TGT CTG TTA CAG TTT 2015
2016 ACC AAG ATG GAG CTG GGT TAG GAA AGA AGT GAG GGC CCA TTT TGT GGT 2063
2064 TCA AGT GCA CTA GAC AGC TGC TGG GGT AGG AAG CAC AGG CAA TGT CTG 2111
2112 CAA TCA GCT GTG GGA GAG CGG TGA CTG AGA ACA GTC TGA GGC CTG GCT 2159
2160 CCA CTT GGA AGT ATC TGG GGT GCG ATG AAA TCA CAA TTA TCT TGA AGC 2207
2208 CTA AAG AGG GAA CTA CAA GAC TGT TAA CTA AGA TCA ATG TGG GCA CCT 2255
2256 AAA AGG GTA TGT TAA AAT CAC CAT TTC TCA GGT CAA AAT ACT GTG AAT 2303
2304 AAG TCT TCA ATA AAA TCA CTA ATG GTT AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 2351
2352 AAA AAA 2357
D:Blastp结果
Query=PP384[基因=PP384](234个氨基酸)
>PIR2:S06286 major merozoite surface antigen precursor-Plasmodium
falciparum(strain RO-33Ghana)(fragment)
长度=1060
分值=34.8 bits(78),预计值=0.68
相同性=20/70(28%),相似性=36/70(50%),缺口=3/70(4%)
Query:55 LPQRKNLQSE---KETYQLSKEVEILSRNLVEMQRCLSELTNRLHNGKKSSSVYPLSQDL 111
+ Q KN +E K+ YQ ++ I ++ L E +S L R+ KK+ ++ L +D+
Sbjct:251 IDQNKNADNEEGKKKLYQAQYDLFIYNKQLQEAHNLISVLEKRIDTLKKNENIKKLLEDI 310
Query:112 PYVHIIYQKP 121
+I +KP
Sbjct:311 DKIKIDAEKP 320
>SP_IN:P90922 P90922 caenorhabditis elegans.k07a12.4 protein.
5/1999
长度=936
分值=32.8bits(73),预计值=2.6
相同性=22/56(39%),相似性=31/56(55%),缺口=4/56(7%)
Query:34 PASLPRHSSTPDHTSTLEPP-RLPQRKNLQSEKETYQLSK---EVEILSRNLVEMQ 85
P +L STP +S L P R PQ KNLQ+E T +S+ EV++ S ++Q
Sbjct:421 PKNLNSRPSTPQTSSNLNTPKRTPQVKNLQAESTTPTVSRPSSEVDLTSFRRNQLQ 476
>SW:YQU3_CAEEL Q09550 caenorhabditis elegans.hypothetical 133.5kd
protein f26c11.3 in chromosome ii.11/1995
长度=1251
分值=32.5bits(72),预计值=3.4
相同性=27/108(25%),相似性=47/108(43%),缺口=18/108(16%)
Query:8 LIKEIQSPLSSICDGSIALDAEPVTQPASLPRHSSTPDHTSTLEPP--------------- 53
L++ I +P + I DAE + +S P SST H++T P
Sbjct:462 LMQLIYNPRTKETRTEITSDAEGCKKTSSTPTPSSTSVHSTTATPSTTPGTTTYNWPTGG 521
Query:54 ---RLPQRKNLQSEKETY-QLSKEVEILSRNLVEMQRCLSELTNRLHN 97
LP + + + Y Q+ K+++ILS +L+ C + L ++N
Sbjct:522 TTRMLPSGEIVGFDLHLYAQVRKKLQILSESLIAYPNCTTVLMQLIYN 569
4.PP432
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:10) 长度:1615bp
1 GGCGCGCCCG CTCCCAAGTC GGCTTCCTCC CCGCCGGGGC CGCTTTGCCT
51 CGGGTCTCCC CATTCTCCAG GTCCCCTGAA CTGCACAGTC GGAGGCCGTG
101 GGCGGCGGGC TCTGCCTCCG CCGAGGGACA GCCGGATCGC CCCTCTGCTT
151 CCCGCAACTG CCCTGATCAC CCCCCGTCCC AGCCCTTGAG TGAACGTCCT
201 TCTGAGCGGC TTCCTGGGGT CCTCCCCACG TCCCAAAGGC CGGCAAGATG
251 GTGTCCTGGA TGATCTGTCG CCTGGTGGTG CTGGTGTTTG GGATGCTGTG
301 TCCAGCTTAT GCTTCCTATA AGGCTGTGAA GACCAAGAAC ATTCGTGAAT
351 ATGTGCGGTG GATGATGTAC TGGATTGTTT TTGCACTCTT CATGGCAGCA
401 GAGATCGTTA CAGACATTTT TATCTCCTGG TTCCCTTTCT ACTATGAGAT
451 CAAGATGGCC TTCGTGCTGT GGCTGCTCTC ACCCTACACC AAGGGCGCCA
501 GCCTGCTTTA CCGCAAGTTT GTCCACCCGT CCCTGTCCCG CCATGAGAAG
551 GAGATCGACG CGTACATCGT GCAGGCCAAG GAGCGCAGCT ACGAGACCGT
601 GCTCAGCTTC GGGAAGCGGG GCCTCAACAT TGCCGCCTCC GCTGCTGTGC
651 AGGCTGCCAC CAAGAGTCAG GGGGCGCTGG CCGGCAGGCT GCAGAGCTTC
701 TCCATGCAGG ACCTGCGCTC CATCTCTGAC GCACCTGCCC CTGCCTACCA
751 TGACCCCCTC TACCTGGAGG ACCAGGTGTC CCACCGGAGG CCACCCATTG
801 GGTACCGGGC CGGGGGCCTG CAGGACAGCG ACACCGAGGA TGAGTGTTGG
851 TCAGATACTG AGGCAGTCCC CCGGGCGCCA GCCCGGCCCC GAGAGAAGCC
901 CCTAATCCGC AGCCAGAGCC TGCGTGTGGT CAAGAGGAAG CCACCGGTGC
951 GGGAGGGCAC CTCGCGCTCC CTGAAGGTTC GGACGAGGAA AAAGACTGTG
1001 CCCTCAGACG TGGACAGCTA GGGTCTGCTG CATCTGCCCC CTTCTTACCT
1051 CGTGCCCTGC AGGGCTCCAG GGCTATTTGG AGGGACCTTG GGCTGCACAT
1101 CTGGCCTGCC TGCACCAGCT GCCTGGGCCC CACCCTCCTG ACTCCTGCTG
1151 ATGGTTAAGG CCCGGAAGCA GAATGCTGCC AAGGCCACAA TGCAGGAATG
1201 CACCCACATT GACCAAAGCA GCTGGGCCCA GGGTTCTATT TATTGCCTTG
1251 CTCTGCCTCT CCTTCCCCGG TTGTGGGACA AGAACCCTCC CTTAACCCCT
1301 GCAACCCTTC CTGAACCCCT GCAAATGAAA CCAAACGTCC ACCTGGGTGT
1351 GTTCATTCCT TCCTGTCCTT CAAAAGTACT TGATAGCCTT TCATAAGGCC
1401 TGGCACATGT GTCCTGGTTG TGTGTGTGTG TGTTGGTGAG TGAGGTCAGG
1451 TTTGCGAGTG TTTTGATAAA TAAATACATA AAGGGGCAAA AAAAAAAAAA
1501 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1551 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1601 AAAAAAAAAA AAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:11) 长度:257个氨基酸
1 MVSWMICRLV VLVFGMLCPA YASYKAVKTK NIREYVRWMM YWIVFALFMA
51 AEIVTDIFIS WFPFYYEIKM AFVLWLLSPY TKGASLLYRK FVHPSLSRHE
101 KEIDAYIVQA KERSYETVLS FGKRGLNIAA SAAVQAATKS QGALAGRLQS
151 FSMQDLRSIS DAPAPAYHDP LYLEDQVSHR RPPIGYRAGG LQDSDTEDEC
201 WSDTEAVPRA PARPREKPLI RSQSLRVVKR KPPVREGTSR SLKVRTRKKT
251 VPSDVDS
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:12)
克隆号和蛋白名称:PP432
起始编码子:248ATG终止编码子:1021TAG
蛋白质分子量:29365.46
1 G GCG CGC CCG CTC CCA AGT CGG CTT CCT CCC CGC CGG GGC CGC TTT 46
47 GCC TCG GGT CTC CCC ATT CTC CAG GTC CCC TGA ACT GCA CAG TCG GAG 94
95 GCC GTG GGC GGC GGG CTC TGC CTC CGC CGA GGG ACA GCC GGA TCG CCC 142
143 CTC TGC TTC CCG CAA CTG CCC TGA TCA CCC CCC GTC CCA GCC CTT GAG 190
191 TGA ACG TCC TTC TGA GCG GCT TCC TGG GGT CCT CCC CAC GTC CCA AAG 238
239 GCC GGC AAG ATG GTG TCC TGG ATG ATC TGT CGC CTG GTG GTG CTG GTG 286
1 Met Val Ser Trp Met Ile Cys Arg Leu Val Val Leu Val 13
287 TTT GGG ATG CTG TGT CCA GCT TAT GCT TCC TAT AAG GCT GTG AAG ACC 334
14 Phe Gly Met Leu Cys Pro Ala Tyr Ala Ser Tyr Lys Ala Val Lys Thr 29
335 AAG AAC ATT CGT GAA TAT GTG CGG TGG ATG ATG TAC TGG ATT GTT TTT 382
30 Lys Asn Ile Arg Glu Tyr Val Arg Trp Met Met Tyr Trp Ile Val Phe 45
383 GCA CTC TTC ATG GCA GCA GAG ATC GTT ACA GAC ATT TTT ATC TCC TGG 430
46 Ala Leu Phe Met Ala Ala Glu Ile Val Thr Asp Ile Phe Ile Ser Trp 61
431 TTC CCT TTC TAC TAT GAG ATC AAG ATG GCC TTC GTG CTG TGG CTG CTC 478
62 Phe Pro Phe Tyr Tyr Glu Ile Lys Met Ala Phe Val Leu Trp Leu Leu 77
479 TCA CCC TAC ACC AAG GGC GCC AGC CTG CTT TAC CGC AAG TTT GTC CAC 526
78 Ser Pro Tyr Thr Lys Gly Ala Ser Leu Leu Tyr Arg Lys Phe Val His 93
527 CCG TCC CTG TCC CGC CAT GAG AAG GAG ATC GAC GCG TAC ATC GTG CAG 574
94 Pro Ser Leu Ser Arg His Glu Lys Glu Ile Asp Ala Tyr Ile Val Gln 109
575 GCC AAG GAG CGC AGC TAC GAG ACC GTG CTC AGC TTC GGG AAG CGG GGC 622
110 Ala Lys Glu Arg Ser Tyr Glu Thr Val Leu Ser Phe Gly Lys Arg Gly 125
623 CTC AAC ATT GCC GCC TCC GCT GCT GTG CAG GCT GCC ACC AAG AGT CAG 670
126 Leu Asn Ile Ala Ala Ser Ala Ala Val Gln Ala Ala Thr Lys Ser Gln 141
671 GGG GCG CTG GCC GGC AGG CTG CAG AGC TTC TCC ATG CAG GAC CTG CGC 718
142 Gly Ala Leu Ala Gly Arg Leu Gln Ser Phe Ser Met Gln Asp Leu Arg 157
719 TCC ATC TCT GAC GCA CCT GCC CCT GCC TAC CAT GAC CCC CTC TAC CTG 766
158 Ser Ile Ser Asp Ala Pro Ala Pro Ala Tyr His Asp Pro Leu Tyr Leu 173
767 GAG GAC CAG GTG TCC CAC CGG AGG CCA CCC ATT GGG TAC CGG GCC GGG 814
174 Glu Asp Gln Val Ser His Arg Arg Pro Pro Ile Gly Tyr Arg Ala Gly 189
815 GGC CTG CAG GAC AGC GAC ACC GAG GAT GAG TGT TGG TCA GAT ACT GAG 862
190 Gly Leu Gln Asp Ser Asp Thr Glu Asp Glu Cys Trp Ser Asp Thr Glu 205
863 GCA GTC CCC CGG GCG CCA GCC CGG CCC CGA GAG AAG CCC CTA ATC CGC 910
206 Ala Val Pro Arg Ala Pro Ala Arg Pro Arg Glu Lys Pro Leu Ile Arg 221
911 AGC CAG AGC CTG CGT GTG GTC AAG AGG AAG CCA CCG GTG CGG GAG GGC 958
222 Ser Gln Ser Leu Arg Val Val Lys Arg Lys Pro Pro Val Arg Glu Gly 237
959 ACC TCG CGC TCC CTG AAG GTT CGG ACG AGG AAA AAG ACT GTG CCC TCA 1006
238 Thr Ser Arg Ser Leu Lys Val Arg Thr Arg Lys Lys Thr Val Pro Ser 253
1007 GAC GTG GAC AGC TAG GGT CTG CTG CAT CTG CCC CCT TCT TAC CTC GTG 1054
254 Asp Val Asp Ser *** 258
1055 CCC TGC AGG GCT CCA GGG CTA TTT GGA GGG ACC TTG GGC TGC ACA TCT 1102
1103 GGC CTG CCT GCA CCA GCT GCC TGG GCC CCA CCC TCC TGA CTC CTG CTG 1150
1151 ATG GTT AAG GCC CGG AAG CAG AAT GCT GCC AAG GCC ACA ATG CAG GAA 1198
1199 TGC ACC CAC ATT GAC CAA AGC AGC TGG GCC CAG GGT TCT ATT TAT TGC 1246
1247 CTT GCT CTG CCT CTC CTT CCC CGG TTG TGG GAC AAG AAC CCT CCC TTA 1294
1295 ACC CCT GCA ACC CTT CCT GAA CCC CTG CAA ATG AAA CCA AAC GTC CAC 1342
1343 CTG GGT GTG TTC ATT CCT TCC TGT CCT TCA AAA GTA CTT GAT AGC CTT 1390
1391 TCA TAA GGC CTG GCA CAT GTG TCC TGG TTG TGT GTG TGT GTG TTG GTG 1438
1439 AGT GAG GTC AGG TTT GCG AGT GTT TTG ATA AAT AAA TAC ATA AAG GGG 1486
1487 CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1534
1535 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1582
1583 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1615
D:Blastp结果
Query=PP432[基因=PP432](257个氨基酸)
>SW:YSV4_CAEEL Q10010 caenorhabditis elegans.hypothetical 26.6kd
protein t19c3.4 in chromosome iii.11/1997
长度=229
分值=163bits(409),预计值=1e-39
相同性=77/163(47%),相似性=111/163(67%),缺口=2/163(1%)
Query:2 VSWMICRLVVLVFGMLCPAYASYKAVKTKNIREYVRWMMYWIVFALFMAAEIVTDIFIS- 60
+S + RL+++ G L PAY SYKAV+TK+ REYV+WMMYWIVFA++ E + D+ ++
Sbjct:1 MSETLSRLLIITAGTLYPAYRSYKAVRTKDTREYVKWMMYWIVFAIYSFLENLLDLVLAF 60
Query:61 WFPFYYEIKMAFVLWLLSPYTKGASLLYRKFVHPSLSRHEKEIDAYIVQAKERSYETVLS 120
WFPFY+++K+ F+ WLLSP+TKGAS+LYRK+VHP+L+RHEK+IDA + AK SY ++
Sbjct:61 WFPFYFQLKIVFIFWLLSPWTKGASILYRKWVHPTLNRHEKDIDALLESAKSESYNQLMR 120
Query:121 FGKRGLNIXXXXXXXXXTKSQGALAGRLQ-SFSMQDLRSISDA 162
G + L + Q L +LQ S+S D+ S +A
Sbjct:121 IGSKSLVYAKDVVAEAAVRGQQQLVNQLQRSYSANDVGSEREA 163
>PIR2:T16888 hypothetical protein T19C3.4-Caenorhabditis elegans
长度=229
分值=163bits(409),预计值=1e-39
相同性=77/163(47%),相似性=111/163(67%),缺口=2/163(1%)
Query:2 VSWMICRLVVLVFGMLCPAYASYKAVKTKNIREYVRWMMYWIVFALFMAAEIVTDIFIS- 60
+S + RL+++ G L PAY SYKAV+TK+ REYV+WMMYWIVFA++ E + D+ ++
Sbjct:1 MSETLSRLLIITAGTLYPAYRSYKAVRTKDTREYVKWMMYWIVFAIYSFLENLLDLVLAF 60
Query:61 WFPFYYEIKMAFVLWLLSPYTKGASLLYRKFVHPSLSRHEKEIDAYIVQAKERSYETVLS 120
WFPFY+++K+ F+ WLLSP+TKGAS+LYRK+VHP+L+RHEK+IDA + AK SY ++
Sbjct:61 WFPFYFQLKIVFIFWLLSPWTKGASILYRKWVHPTLNRHEKDIDALLESAKSESYNQLMR 120
Query:121 FGKRGLNIXXXXXXXXXTKSQGALAGRLQ-SFSMQDLRSISDA 162
G + L + Q L +LQ S+S D+ S +A
Sbjct:121 IGSKSLVYAKDVVAEAAVRGQQQLVNQLQRSYSANDVGSEREA 163
5.PP552
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:13) 长度:1786bp
1 TGGTGGCGCA TGTCTGTAAT CCCAGCTACT CGGGAAGCTG AGGCAGGAGA
51 ATCGCTTGAA CCCAGGAAGC GGAGGTTGCA GTGAGCCGAG ATCGCGCCAC
101 TGCACTCCAA CCTGGGCAAC AATACAAGAC TCCATCTGAA AAAAAAAAGA
151 TCACACAGGA AAACAGAAGT TCGATTTTAC GTCGTACACT GCTGTAATTT
201 CAGCACATGT GGACTCGTGT AACCAACACC ATAACCTTCC ATCACCCCTG
251 AAACTCCCTC CCGCCAGCCC TTTAGGGTTG CCCCTCCCCC CGAACCCCAC
301 CAGCCCCTGG TGACCACTGA TCTGTCCTCC AACCCATAGT GTTTTTCCGG
351 GAATGTCACA AAAACAGAAG CCGACCATGG GTCACCTTTC TGGCGCCTTT
401 CTCCCCGCAC AAAGTCTTTG TCCTTGTGAA GTTGTCACGT GCCAAACGCT
451 TGTCCCTTTT TCCTGCTGGG TAATACTCCC GGTGCCGCCC TTGCTGTTCG
501 TCGATGCACA TCTGGCTGCT TTTCGCTGGC TGCGAGCGGA GCTGCTAGGG
551 ACATGGCCAC GGGGCTGTGA GAGCGGAGTT TCCTCTCTCC GGTGACCCTG
601 AGCTGCGCCT TTCTCAGCCG CCTCCCGAGG CCCCAGGCGC TCTGCGGGGG
651 CTCTGGCGGG GTTGGTGGGG GTGGGCGTTC TCGTTGTTTC AGCGGCGCTG
701 CCCCAGGCCC TGCGGGAGGG ACCGTGGGAC CCGAGACATC CCCGCCTGGC
751 CTCCGCTCCC CACCCGGGAG TGGGGCTCGC ACCCCCCCAA CCTCGGGTAA
801 AGACGCTTCT GGAAGGAAGG GCGCCCCGCG GACCCCGCCC AACCCTGCCC
851 AGCCCAGCCC AGCCCAGCCC AGCCCTTCCC GGGGCGGCGG CGCGGGAAGC
901 AGGCGGCGGC GCACGGGCGT CGTCATGGCA ACCCCACCGG CTCCGGGGGC
951 CGGGACCGCT GCCCCCTCCG CCCCTCGACC CCCGCCCCCC CGCCCTTCCT
1001 GGCTGCGGCT GGACCCGGCT GCGCGGGGCG CGAGGCTGCC TTTCCCGGGA
1051 TCACCAGGGA CCACCCGGCG CGCTCCCCGG GAATCCGCAC CCCTGGCCCC
1101 AGCGCTCCGG AGCGACCCGG GTCAGCCCCT GGCTGCCTGC AATGGGCCCC
1151 CGGGCGAACC CCGGGCGGAC CCAGGAGTGA GCACCCGGTG CGCGGCAACG
1201 ATGATCCCGC AAGGGAAGCT CACGGGAGGC AGGAGCTGTG GCAGCCGCCC
1251 CAGGATGGGG CGCGGGGAGC GCGCTGAGCT GTCCTTTCCC GCAGCGGCCC
1301 CGCGGTTGAA GCGTGGGCTT GGGTTTTGGT TTTTCTTCTG TGGCAACAGT
1351 TCTGTTGAGA TATTACTCGC CTGCCATACA ACTCACCCAT TTTAAAAGTA
1401 CACCTCAGGG GTCCTGCGTG TATTGACAAA CCCGCCGCCG TCACCACAGC
1451 CAATTTCAGA ACATTTTCAT CTCTTCAAAA GAAACCCTGT ACCCTTCAGC
1501 TGTCACCCTC CTGGTCCCCA TCCGGTCCTC GTCCCGCCCT CAGCAGCCAC
1551 GCACTGCCTG TAAAGTCCCC TGTCCTGCCC TGTAGGTGGA ATCTATACCT
1601 TGGGGTCTGT TCTGACGTTC ACCTAACAGC CTTTCCAGGC TCAGCTGTGC
1651 TATTGTATGG ACCAGGGGGT TGTTTTGTTT TTGTTGTTTG TTGATTGTGT
1701 GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGAGCCTGG CGTGGTTGCG GGCGCCTATA
1751 ATCCCAGCTG CTCAGGAGGC TGAGGCAGGA GGATCA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:14) 长度:156个氨基酸
1 MATPPAPGAG TAAPSAPRPP PPRPSWLRLD PAARGARLPF PGSPGTTRRA
51 PRESAPLAPA LRSDPGQPLA ACNGPPGEPR ADPGVSTRCA ATMI PQGKLT
101 GGRSCGSRPR MGRGERAELS FPAAAPRLKR GLGFWFFFCG NSSVEILLAC
151 HTTHPF
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:15)
克隆号和蛋白名称:PP552
起始编码子:925 ATG 终止编码子:1395 TAA
蛋白质分子量:16177.61
1 TGG TGG CGC ATG TCT GTA ATC CCA GCT ACT CGG GAA GCT GAG GCA GGA 48
49 GAA TCG CTT GAA CCC AGG AAG CGG AGG TTG CAG TGA GCC GAG ATC GCG 96
97 CCA CTG CAC TCC AAC CTG GGC AAC AAT ACA AGA CTC CAT CTG AAA AAA 144
145 AAA AGA TCA CAC AGG AAA ACA GAA GTT CGA TTT TAC GTC GTA CAC TGC 192
193 TGT AAT TTC AGC ACA TGT GGA CTC GTG TAA CCA ACA CCA TAA CCT TCC 240
241 ATC ACC CCT GAA ACT CCC TCC CGC CAG CCC TTT AGG GTT GCC CCT CCC 288
289 CCC GAA CCC CAC CAG CCC CTG GTG ACC ACT GAT CTG TCC TCC AAC CCA 336
337 TAG TGT TTT TCC GGG AAT GTC ACA AAA ACA GAA GCC GAC CAT GGG TCA 384
385 CCT TTC TGG CGC CTT TCT CCC CGC ACA AAG TCT TTG TCC TTG TGA AGT 432
433 TGT CAC GTG CCA AAC GCT TGT CCC TTT TTC CTG CTG GGT AAT ACT CCC 480
481 GGT GCC GCC CTT GCT GTT CGT CGA TGC ACA TCT GGC TGC TTT TCG CTG 528
529 GCT GCG AGC GGA GCT GCT AGG GAC ATG GCC ACG GGG CTG TGA GAG CGG 576
577 AGT TTC CTC TCT CCG GTG ACC CTG AGC TGC GCC TTT CTC AGC CGC CTC 624
625 CCG AGG CCC CAG GCG CTC TGC GGG GGC TCT GGC GGG GTT GGT GGG GGT 672
673 GGG CGT TCT CGT TGT TTC AGC GGC GCT GCC CCA GGC CCT GCG GGA GGG 720
721 ACC GTG GGA CCC GAG ACA TCC CCG CCT GGC CTC CGC TCC CCA CCC GGG 768
769 AGT GGG GCT CGC ACC CCC CCA ACC TCG GGT AAA GAC GCT TCT GGA AGG 816
817 AAG GGC GCC CCG CGG ACC CCG CCC AAC CCT GCC CAG CCC AGC CCA GCC 864
865 CAG CCC AGC CCT TCC CGG GGC GGC GGC GCG GGA AGC AGG CGG CGG CGC 912
913 ACG GGC GTC GTC ATG GCA ACC CCA CCG GCT CCG GGG GCC GGG ACC GCT 960
1 Met Ala Thr Pro Pro Ala Pro Gly Ala Gly Thr Ala 12
961 GCC CCC TCC GCC CCT CGA CCC CCG CCC CCC CGC CCT TCC TGG CTG CGG 1008
13 Ala Pro Ser Ala Pro Arg Pro Pro Pro Pro Arg Pro Ser Trp Leu Arg 28
1009 CTG GAC CCG GCT GCG CGG GGC GCG AGG CTG CCT TTC CCG GGA TCA CCA 1056
29 Leu Asp Pro Ala Ala Arg Gly Ala Arg Leu Pro Phe Pro Gly Ser Pro 44
1057 GGG ACC ACC CGG CGC GCT CCC CGG GAA TCC GCA CCC CTG GCC CCA GCG 1104
45 Gly Thr Thr Arg Arg Ala Pro Arg Glu Ser Ala Pro Leu Ala Pro Ala 60
1105 CTC CGG AGC GAC CCG GGT CAG CCC CTG GCT GCC TGC AAT GGG CCC CCG 1152
61 Leu Arg Ser Asp Pro Gly Gln Pro Leu Ala Ala Cys Asn Gly Pro Pro 76
1153 GGC GAA CCC CGG GCG GAC CCA GGA GTG AGC ACC CGG TGC GCG GCA ACG 1200
77 Gly Glu Pro Arg Ala Asp Pro Gly Val Ser Thr Arg Cys Ala Ala Thr 92
1201 ATG ATC CCG CAA GGG AAG CTC ACG GGA GGC AGG AGC TGT GGC AGC CGC 1248
93 Met Ile Pro Gln Gly Lys Leu Thr Gly Gly Arg Ser Cys Gly Ser Arg 108
1249 CCC AGG ATG GGG CGC GGG GAG CGC GCT GAG CTG TCC TTT CCC GCA GCG 1296
109 Pro Arg Met Gly Arg Gly Glu Arg Ala Glu Leu Ser Phe Pro Ala Ala 124
1297 GCC CCG CGG TTG AAG CGT GGG CTT GGG TTT TGG TTT TTC TTC TGT GGC 1344
125 Ala Pro Arg Leu Lys Arg Gly Leu Gly Phe Trp Phe Phe Phe Cys Gly 140
1345 AAC AGT TCT GTT GAG ATA TTA CTC GCC TGC CAT ACA ACT CAC CCA TTT 1392
141 Asn Ser Ser Val Glu Ile Leu Leu Ala Cys His Thr Thr His Pro Phe 156
1393 TAA AAG TAC ACC TCA GGG GTC CTG CGT GTA TTG ACA AAC CCG CCG CCG 1440
157 *** 157
1441 TCA CCA CAG CCA ATT TCA GAA CAT TTT CAT CTC TTC AAA AGA AAC CCT 1488
1489 GTA CCC TTC AGC TGT CAC CCT CCT GGT CCC CAT CCG GTC CTC GTC CCG 1536
1537 CCC TCA GCA GCC ACG CAC TGC CTG TAA AGT CCC CTG TCC TGC CCT GTA 1584
1585 GGT GGA ATC TAT ACC TTG GGG TCT GTT CTG ACG TTC ACC TAA CAG CCT 1632
1633 TTC CAG GCT CAG CTG TGC TAT TGT ATG GAC CAG GGG GTT GTT TTG TTT 1680
1681 TTG TTG TTT GTT GAT TGT GTG TGT GTG TGT GTG TGT GTG TGT GAG CCT 1728
1729 GGC GTG GTT GCG GGC GCC TAT AAT CCC AGC TGC TCA GGA GGC TGA GGC 1776
1777 AGG AGG ATC A 1786
6.PP591
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:16) 长度:1838bp
1 GAAAGAGCCG GTGAAGGGGC AGAACAGGCA GGTTCCCTCG ACCCAGGACC
51 CCCTGTTCCC AGGCTATGGC CCCCAGTGCC CTGTAGACCT GGCAGGCCCC
101 CCGTGCTTGC GACCCCTATT TGGGGGTCTG GGTGGCTACT GGAGGGCCTT
151 GCAGAGGGGC AGAGAAGGCA GGACCATGAC ATCTAGGGCC TCTGAACTTT
201 CTCCGGGGCG CAGCGTGACG GCTGGCATCA TCATTGTTGG AGATGAGATC
251 CTTAAGTTGG AAACAACAAA TGGCTTTTGA GTCCAAGAGT GATGCAATCA
301 CAGTGACGCA TTAAAACGGT TACTCCGGAG ACATCAGAGC ACTGTGGCTG
351 GAGGCTGGGA GCCTGGCCAG GAAGCTGTCG CCATTGTCCA GGTGAAAGGT
401 GCTAAGGACC TGCTTGGTGG CAGTGGGGAC AGAAAGAAGA AAGCAGGCCA
451 GGCGTGGTGG CTCACACCTA TAATTCCAGC ACTTTGGGAG GCTGAGGCAG
501 GAGGATCACT TGAGACCAGG AATTCAACAC CAGCCTGGGC AACATGGCAA
551 GACCCCATTT CTACAAAAAA AATTTAAAAT GAGCTGAATG TGGTGGCACG
601 CGCCTGTAGT CCCAGCTACT CGGAAGGCTG GGGTGGCCCT TGAAGCCAGG
651 AGGTTGAGGC TGCAGTGAAC TGTGACTGAG CCACTATACT CCAGCCTGGG
701 TGACAGAGAC CCAGCTTTAA AACCAAACAA ATGGATTTTC CCACTCTTGT
751 GTCCAGTCCA GGCCCCTCAG CAGCCTGAGG TGGTGTCCTT CAAAGAGCAG
801 AGCACTGCAT CATCAGGTGG ATGCAGCCAT CATCTTCAAC CCCTCCCCTT
851 CATCCCTACA GTACTGATGG CCTCATCTTC CCCTTCAACC CCCAGGGACA
901 CACTCAGGAC ACCAACACCT TCTTTCTGTG CCGGACACTG CGCTCCCTAG
951 GGGTCCAGGT TTGCCGAGTC TCAGTTGTAC CTGATGAGGT AGCCACCATT
1001 GCAGCTGAGG TCACTTCTTT CTCCAACCGC TTCACCCATG TCCTCACAGC
1051 AGGGGGCATC GGCCCCACTC ATGATGATGT GACCTTTGAG GCAGTGGCAC
1101 AGGCCTTTGG AGATGAGCTG AAGCCACACC CCAAGTTGGA AGCAGCCACC
1151 AAAGCCCTAG GAGGGGAAGG CTGGGAGAAG CTATCATTGG TGCCCTCCTC
1201 TGCCCGCCTG CATTATGGCA CAGATCCTTG CACTGGTCAA CCTTTCAGAT
1251 TCCCTCTGGT CTCCGTCCGA AACGTCTACC TCTTCCCAGG CATTCCAGAG
1301 CTGCTGCGGC GGGTGCTGGA GGGGATGAAG GGACTATTCC AAAACCCAGC
1351 TGTTCAGTTC CACTCAAAGG AGCTATATGT GGCTGCTGAT GAAGCCTCCA
1401 TCGCCCCCAT TCTGGCTGAG GCCCAGGCCC ACTTTGGACG TAGGCTTGGC
1451 CTGGGTTCCT ACCCTGACTG GGGCAGCAAC TACTATCAGG TGAAGCTGAC
1501 TCTAGACTCA GAGGAAGAAG GACCCCTGGA GGAATGCTTG GCCTACCTGA
1551 CTGCCCGTTT GCCCCAGGGA TCGCTGGTCC CCTACATGCC CAACGCTGTG
1601 GAGCAGGCCA GTGAGGCTGT ATACAAACTC GCTGAATCAG GTAGGGACCT
1651 TATGGAGGAG GGGCATTATG CCCAAAGCCA TTGGTGGCAC CCCAGATCTC
1701 AGTAATGCAG GGGCTGTTGG GTGCTTCCTG CAAATCCCTG AGAGGGCAGA
1751 AGATAGCTTC TGTTAATTCA TTATTCTTCC AATAAATGTT GATTGAGTAC
1801 CTAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:17) 长度:294个氨基酸
1 MQPSSSTPPL HPYSTDGLIF PFNPQGHTQD TNTFFLCRTL RSLGVQVCRV
51 SVVPDEVATI AAEVTSFSNR FTHVLTAGGI GPTHDDVTFE AVAQAFGDEL
101 KPHPKLEAAT KALGGEGWEK LSLVPSSARL HYGTDPCTGQ PFRFPLVSVR
151 NVYLFPGIPE LLRRVLEGMK GLFQNPAVQF HSKELYVAAD EASIAPILAE
201 AQAHFGRRLG LGSYPDWGSN YYQVKLTLDS EEEGPLEECL AYLTARLPQG
251 SLVPYMPNAV EQASEAVYKL AESGRDLMEE GHYAQSHWWH PRSQ
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:18)
克隆号和蛋白名称:PP591
起始编码子:821 ATG 终止编码子:1705 TAA
蛋白质分子量:32367.76
1 G AAA GAG CCG GTG AAG GGG CAG AAC AGG CAG GTT CCC TCG ACC CAG 46
47 GAC CCC CTG TTC CCA GGC TAT GGC CCC CAG TGC CCT GTA GAC CTG GCA 94
95 GGC CCC CCG TGC TTG CGA CCC CTA TTT GGG GGT CTG GGT GGC TAC TGG 142
143 AGG GCC TTG CAG AGG GGC AGA GAA GGC AGG ACC ATG ACA TCT AGG GCC 190
191 TCT GAA CTT TCT CCG GGG CGC AGC GTG ACG GCT GGC ATC ATC ATT GTT 238
239 GGA GAT GAG ATC CTT AAG TTG GAA ACA ACA AAT GGC TTT TGA GTC CAA 286
287 GAG TGA TGC AAT CAC AGT GAC GCA TTA AAA CGG TTA CTC CGG AGA CAT 334
335 CAG AGC ACT GTG GCT GGA GGC TGG GAG CCT GGC CAG GAA GCT GTC GCC 382
383 ATT GTC CAG GTG AAA GGT GCT AAG GAC CTG CTT GGT GGC AGT GGG GAC 430
431 AGA AAG AAG AAA GCA GGC CAG GCG TGG TGG CTC ACA CCT ATA ATT CCA 478
479 GCA CTT TGG GAG GCT GAG GCA GGA GGA TCA CTT GAG ACC AGG AAT TCA 526
527 ACA CCA GCC TGG GCA ACA TGG CAA GAC CCC ATT TCT ACA AAA AAA ATT 574
575 TAA AAT GAG CTG AAT GTG GTG GCA CGC GCC TGT AGT CCC AGC TAC TCG 622
623 GAA GGC TGG GGT GGC CCT TGA AGC CAG GAG GTT GAG GCT GCA GTG AAC 670
671 TGT GAC TGA GCC ACT ATA CTC CAG CCT GGG TGA CAG AGA CCC AGC TTT 718
719 AAA ACC AAA CAA ATG GAT TTT CCC ACT CTT GTG TCC AGT CCA GGC CCC 766
767 TCA GCA GCC TGA GGT GGT GTC CTT CAA AGA GCA GAG CAC TGC ATC ATC 814
815 AGG TGG ATG CAG CCA TCA TCT TCA ACC CCT CCC CTT CAT CCC TAC AGT 862
1 Met Gln Pro Ser Ser Ser Thr Pro Pro Leu His Pro Tyr Ser 14
863 ACT GAT GGC CTC ATC TTC CCC TTC AAC CCC CAG GGA CAC ACT CAG GAC 910
15 Thr Asp Gly Leu Ile Phe Pro Phe Asn Pro Gln Gly His Thr Gln Asp 30
911 ACC AAC ACC TTC TTT CTG TGC CGG ACA CTG CGC TCC CTA GGG GTC CAG 958
31 Thr Asn Thr Phe Phe Leu Cys Arg Thr Leu Arg Ser Leu Gly Val Gln 46
959 GTT TGC CGA GTC TCA GTT GTA CCT GAT GAG GTA GCC ACC ATT GCA GCT 1006
47 Val Cys Arg Val Ser Val Val Pro Asp Glu Val Ala Thr Ile Ala Ala 62
1007 GAG GTC ACT TCT TTC TCC AAC CGC TTC ACC CAT GTC CTC ACA GCA GGG 1054
63 Glu Val Thr Ser Phe Ser Asn Arg Phe Thr His Val Leu Thr Ala Gly 78
1055 GGC ATC GGC CCC ACT CAT GAT GAT GTG ACC TTT GAG GCA GTG GCA CAG 1102
79 Gly Ile Gly Pro Thr His Asp Asp Val Thr Phe Glu Ala Val Ala Gln 94
1103 GCC TTT GGA GAT GAG CTG AAG CCA CAC CCC AAG TTG GAA GCA GCC ACC 1150
95 Ala Phe Gly Asp Glu Leu Lys Pro His Pro Lys Leu Glu Ala Ala Thr 110
1151 AAA GCC CTA GGA GGG GAA GGC TGG GAG AAG CTA TCA TTG GTG CCC TCC 1198
111 Lys Ala Leu Gly Gly Glu Gly Trp Glu Lys Leu Ser Leu Val Pro Ser 126
1199 TCT GCC CGC CTG CAT TAT GGC ACA GAT CCT TGC ACT GGT CAA CCT TTC 1246
127 Ser Ala Arg Leu His Tyr Gly Thr Asp Pro Cys Thr Gly Gln Pro Phe 142
1247 AGA TTC CCT CTG GTC TCC GTC CGA AAC GTC TAC CTC TTC CCA GGC ATT 1294
143 Arg Phe Pro Leu Val Ser Val Arg Asn Val Tyr Leu Phe Pro Gly Ile 158
1295 CCA GAG CTG CTG CGG CGG GTG CTG GAG GGG ATG AAG GGA CTA TTC CAA 1342
159 Pro Glu Leu Leu Arg Arg Val Leu Glu Gly Met Lys Gly Leu Phe Gln 174
1343 AAC CCA GCT GTT CAG TTC CAC TCA AAG GAG CTA TAT GTG GCT GCT GAT 1390
175 Asn Pro Ala Val Gln Phe His Ser Lys Glu Leu Tyr Val Ala Ala Asp 190
1391 GAA GCC TCC ATC GCC CCC ATT CTG GCT GAG GCC CAG GCC CAC TTT GGA 1438
191 Glu Ala Ser Ile Ala Pro Ile Leu Ala Glu Ala Gln Ala Hi s Phe Gly 206
1439 CGT AGG CTT GGC CTG GGT TCC TAC CCT GAC TGG GGC AGC AAC TAC TAT 1486
207 Arg Arg Leu Gly Leu Gly Ser Tyr Pro Asp Trp Gly Ser Asn Tyr Tyr 222
1487 CAG GTG AAG CTG ACT CTA GAC TCA GAG GAA GAA GGA CCC CTG GAG GAA 1534
223 Gln Val Lys Leu Thr Leu Asp Ser Glu Glu Glu Gly Pro Leu Glu Glu 238
1535 TGC TTG GCC TAC CTG ACT GCC CGT TTG CCC CAG GGA TCG CTG GTC CCC 1582
239 Cys Leu Ala Tyr Leu Thr Ala Arg Leu Pro Gln Gly Ser Leu Val Pro 254
1583 TAC ATG CCC AAC GCT GTG GAG CAG GCC AGT GAG GCT GTA TAC AAA CTC 1630
255 Tyr Met Pro Asn Ala Val Glu Gln Ala Ser Glu Ala Val Tyr Lys Leu 270
1631 GCT GAA TCA GGT AGG GAC CTT ATG GAG GAG GGG CAT TAT GCC CAA AGC 1678
271 Ala Glu Ser Gly Arg Asp Leu Met Glu Glu Gly His Tyr Ala Gln Ser 286
1679 CAT TGG TGG CAC CCC AGA TCT CAG TAA TGC AGG GGC TGT TGG GTG CTT 1726
287 His Trp Trp His Pro Arg Ser Gln *** 295
1727 CCT GCA AAT CCC TGA GAG GGC AGA AGA TAG CTT CTG TTA ATT CAT TAT 1774
1775 TCT TCC AAT AAA TGT TGA TTG AGT ACC TAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1822
1823 AAA AAA AAA AAA AAA A 1838
D:Blastp结果
Query=PP591[基因=PP591](294个氨基酸)
>SP_IN:Q22017 Q22017 caenorhabditis elegans.r53.1 protein.1/1999
长度=519
分值=132 bits(329),预计值=3e-30
相同性=86/260(33%),相似性=138/260(53%),缺口=28/260(10%)
Query:25 QGHTQDTNTFFLCRTLRSLGVQVCRVSVVPDEVATIAAEVTSFSNRFTHVLTAGGIGPTH 84
+G T+DTN+ FLC+ L LGV + ++SV+ D+++ I+ EV S S + +V+T+GG+GPTH
Sbjct:27 KGTTRDTNSHFLCKRLHKLGVNIRKISVIGDDISEISREVQSASGAYDYVITSGGVGPTH 86
Query:85 DDVTFEAVAQAFGDELKPH-----------PKLEAATKALG-GEG--------WEKLSLV 124
DD T+ +A AF D+++ P A +A G GEG EKL +
Sbjct:87 DDKTYLGLAHAFTDQMQFSDEIRQAVNRFLPTYTAKKRAEGVGEGLEEAVRLATEKLCTI 146
Query:125 PSSARLHYGTDPCTGQPFRFPLVSVRNVYLFPGIPELLRRVLEGMKG-LFQNPAVQFHS- 182
P ++L +GT G FP+V + NV PG+P+ R + ++ LF P + S
Sbjct:147 PKMSQLLWGTQKINGSLSTFPVVRISNVVALPGVPKFCERAFDELQDQLF--PIEERQSL 204
Query:183 --KELYVAADEASIAPILAEAQAHF-GRRLGLGSYPDWGSNYYQVKLTLDSEEEGPLEEC 239
+LY DE + L + A F R + +GSYP+ + +++ KLT+++E +E
Sbjct:205 CFETLYTDLDEFDFSKKLTDLAAQFEDRNVQIGSYPELKNKFFKTKLTIETESSETMEAV 264
Query:240 LAYLTARLPQGSLVPYMPNA 259
+ L L G +V Y +A
Sbjct:265 VTSL-RELLAGHIVYYDSHA 283
>SW:YM44_YEAST Q03219 saccharomyces cerevisiae(baker′s yeast).
hypothetical 31.1 kd protein in sip18-spt21 intergenic
region.11/1997
长度=274
分值=67.9bits(163),预计值=1e-10
相同性=49/234(20%),相似性=106/234(44%),缺口=27/234(11%)
Query:26 GHTQDTNTFFLCRTLRSLGVQVCRVSVVPDEVATIAAEVTSFSNRFTHVLTAGGIGPTHD 85
G DTN+ F + G+Q+ ++ + D+ I V + +++ GGIGPTHD
Sbjct:18 GKVVDTNSTFFAKYCFDHGIQLKEIATIGDDETQIVDTVRRLVKNYDFIISTGGIGPTHD 77
Query:86 DVTFEAVAQAFG----------DELKPHPKLEAATKALGGEGWEKLSLVP--SSARLHYG 133
D+T+E +A++F + ++ EA A + +++ +P ++ + +Y
Sbjct:78 DITYECMAKSFNLPCELDEECKERMRHKSDPEARLDADALKAHYQMATMPKGTNVKNYYV 137
Query:134 TDPCTGQPFRFPLVSV-RNVYLFPGIPELLRRVLEG-------MKGLFQNPA--VQFHSK 183
D P+ S+ +Y+ PGIP+L R+L+ + L ++P V++ +
Sbjct:138 CD-----DLWVPICSISHKMYILPGIPQLFARMLKAFTPTLKKIYNLDKDPREYVRYFVR 192
Query:184 ELYVAADEASIAPILAEAQAHFGRRLGLGSYPDWGSNYYQVKLTLDSEEEGPLE 237
+ + ++ + + +GSYP +G + V + + +++ L+
Sbjct:193 THLTESQISKELKLIQDESTKVSEAIKIGSYPHFGMGFNTVSILGEKKDDSYLK 246
7.PP603
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:19) 长度:1619bp
1 GCGCGGCGCG CTTAGTTGCC GGAGCTGAAC GGCGCGGAGC TGGTCTGAGG
51 CGAGCCGAGC CGAGCGAGCG CGGCGGTGGG GCCGAGAGGA CGCGCAGGTG
101 GCGGCGTTGC CATGTCGCAC GGTCACAGCC ACGGCGGGGG TGGCTGCCGC
151 TGCGCCGCCG AACGGGAGGA GCCGCCCGAG CAGCGCGGCC TGGCCTACGG
201 CCTGTACCTG CGCATCGACC TGGAGCGGCT GCAATGCCTT AACGAGAGCC
251 GCGAGGGCAG CGGCCGCGGC GTCTTCAAGC CGTGGGAGGA GCGGACCGAC
301 CGCTCCAAGT TTGTTGAAAG TGATGCAGAT GAAGAGCTTC TGTTTAATAT
351 TCCATTTACG GGCAATGTCA AGCTCAAAGG CATCATTATA ATGGGAGAGG
401 ATGATGACTC ACACCCCTCT GAGATGAGAC TGTACAAGAA TATTCCACAG
451 ATGTCCTTTG ATGATACAGA AAGGGAGCCA GATCAGACCT TTAGTCTGAA
501 CCGGGATCTT ACAGGAGAAT TAGAGTATGC TACAAAAATT TCTCGTTTTT
551 CAAATGTCTA TCATCTCTCA ATTCATATTT CAAAAAACTT CGGAGCAGAT
601 ACGACAAAGG TCTTTTATAT TGGCCTGAGA GGAGAGTGGA CTGAGCTTCG
651 CCGACACGAG GTGACCATCT GCAATTACGA AGCATCTGCC AACCCAGCAG
701 ACCATAGGGT CCATCAGGTT ACCCCACAGA CACACTTTAT TTCCTAAGGG
751 CTGGCCAAGG CTCCCATAGA GGCGCTGTGT CAGTGAAGAT GTACGACTAC
801 CTGTTGGGAA GGACAAAGGG ATGAGGCTCC AGAGAGAGTT GGCTGCCACA
851 GCCTCTGCCA AGCTTTGTCT TTGGGGCTTG CTGCAGAAAC CTGGCCTACG
901 GAAGATACGA CACCACTGGG AGGGTTGTGT AGGTGCCAGG GGACCATCGT
951 GGTTCTCTAG GGCGCTGTGG AAATTGGGTC TTGGGCTGGG TGGCATCTGG
1001 CAGTCATGGA TAACACTTGC TTTTCCAGTT AATGTGGCCA TGTGATTCCA
1051 AGTGTCATGT TGCTTTGTGG CAAGATTGTT GTGTGACTTG TTTTTTTGTT
1101 TTTGTTTTTG TTTTTTTAAA GGAAACTATT TGTGGGCTAT AGGAAACTTT
1151 CTGATGCCTC CGGATTGTGT TAGTAGTAGC CATCAGGAGG GTCTCCAACT
1201 AAAACACTTG TTCCTGCTTG CTCCTTTCCC CTCTCATTGT TCAGCATTCT
1251 TGTCAAGTTG CCCAGCTTGG AGTTGTCTGT CACGCACATG TGTCCTGTGG
1301 TTATAGCTAG AAGGACAGGA GTCTCCTGCT GATGCGTGAT AGCTTAAGCT
1351 TGGGGAGAAG GTCTTTTCCA CTGCCTAGCT AAGCAGTCTG GGGAGAGCAT
1401 GGGGATCATT TCTATGTGTG TGGGTAATCT GGTCAGTAAG ATTGAGACTT
1451 AGTTAAGATT CCCCTTGGAA ATTCCTTAAT GTTTATTAGC TTCTAACTAG
1501 TGTTGTAAGT CCGATGCCAG AATTTGGAGA TTTGAGTTCT TCTTTTCATG
1551 GCTTTTATTC ACTGTGACTA ATAAGCTTCC TAATAAATCC TTGCCAGACT
1601 TAAAAAAAAA AAAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:20)长度:211个氨基酸
1 MSHGHSHGGG GCRCAAEREE PPEQRGLAYG LYLRIDLERL QCLNESREGS
51 GRGVFKPWEE RTDRSKFVES DADEELLFNI PFTGNVKLKG IIIMGEDDDS
101 HPSEMRLYKN IPQMSFDDTE REPDQTFSLN RDLTGELEYA TKISRFSNVY
151 HLSIHISKNF GADTTKVFYI GLRGEWTELR RHEVTICNYE ASANPADHRV
201 HQVTPQTHFI S
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:21)
克隆号和蛋白名称:PP603
起始编码子:112 ATG 终止编码子:747 TAA
蛋白质分子量:24176.62
1 GCG CGG CGC GCT TAG TTG CCG GAG CTG AAC GGC GCG GAG CTG GTC TGA 48
49 GGC GAG CCG AGC CGA GCG AGC GCG GCG GTG GGG CCG AGA GGA CGC GCA 96
97 GGT GGC GGC GTT GCC ATG TCG CAC GGT CAC AGC CAC GGC GGG GGT GGC 144
1 Met Ser His Gly His Ser His Gly Gly Gly Gly 11
145 TGC CGC TGC GCC GCC GAA CGG GAG GAG CCG CCC GAG CAG CGC GGC CTG 192
12 Cys Arg Cys Ala Ala Glu Arg Glu Glu Pro Pro Glu Gln Arg Gly Leu 27
193 GCC TAC GGC CTG TAC CTG CGC ATC GAC CTG GAG CGG CTG CAA TGC CTT 240
28 Ala Tyr Gly Leu Tyr Leu Arg Ile Asp Leu Glu Arg Leu Gln Cys Leu 43
241 AAC GAG AGC CGC GAG GGC AGC GGC CGC GGC GTC TTC AAG CCG TGG GAG 288
44 Asn Glu Ser Arg Glu Gly Ser Gly Arg Gly Val Phe Lys Pro Trp Glu 59
289 GAG CGG ACC GAC CGC TCC AAG TTT GTT GAA AGT GAT GCA GAT GAA GAG 336
60 Glu Arg Thr Asp Arg Ser Lys Phe Val Glu Ser Asp Ala Asp Glu Glu 75
337 CTT CTG TTT AAT ATT CCA TTT ACG GGC AAT GTC AAG CTC AAA GGC ATC 384
76 Leu Leu Phe Asn Ile Pro Phe Thr Gly Asn Val Lys Leu Lys Gly Ile 91
385 ATT ATA ATG GGA GAG GAT GAT GAC TCA CAC CCC TCT GAG ATG AGA CTG 432
92 Ile Ile Met Gly Glu Asp Asp Asp Ser His Pro Ser Glu Met Arg Leu 107
433 TAC AAG AAT ATT CCA CAG ATG TCC TTT GAT GAT ACA GAA AGG GAG CCA 480
108 Tyr Lys Asn Ile Pro Gln Met Ser Phe Asp Asp Thr Glu Arg Glu Pro 123
481 GAT CAG ACC TTT AGT CTG AAC CGG GAT CTT ACA GGA GAA TTA GAG TAT 528
124 Asp Gln Thr Phe Ser Leu Asn Arg Asp Leu Thr Gly Glu Leu Glu Tyr 139
529 GCT ACA AAA ATT TCT CGT TTT TCA AAT GTC TAT CAT CTC TCA ATT CAT 576
140 Ala Thr Lys Ile Ser Arg Phe Ser Asn Val Tyr His Leu Ser Ile His 155
577 ATT TCA AAA AAC TTC GGA GCA GAT ACG ACA AAG GTC TTT TAT ATT GGC 624
156 Ile Ser Lys Asn Phe Gly Ala Asp Thr Thr Lys Val Phe Tyr Ile Gly 171
625 CTG AGA GGA GAG TGG ACT GAG CTT CGC CGA CAC GAG GTG ACC ATC TGC 672
172 Leu Arg Gly Glu Trp Thr Glu Leu Arg Arg His Glu Val Thr Ile Cys 187
673 AAT TAC GAA GCA TCT GCC AAC CCA GCA GAC CAT AGG GTC CAT CAG GTT 720
188 Asn Tyr Glu Ala Ser Ala Asn Pro Ala Asp His Arg Val His Gln Val 203
721 ACC CCA CAG ACA CAC TTT ATT TCC TAA GGG CTG GCC AAG GCT CCC ATA 768
204 Thr Pro Gln Thr His Phe Ile Ser *** 212
769 GAG GCG CTG TGT CAG TGA AGA TGT ACG ACT ACC TGT TGG GAA GGA CAA 816
817 AGG GAT GAG GCT CCA GAG AGA GTT GGC TGC CAC AGC CTC TGC CAA GCT 864
865 TTG TCT TTG GGG CTT GCT GCA GAA ACC TGG CCT ACG GAA GAT ACG ACA 912
913 CCA CTG GGA GGG TTG TGT AGG TGC CAG GGG ACC ATC GTG GTT CTC TAG 960
961 GGC GCT GTG GAA ATT GGG TCT TGG GCT GGG TGG CAT CTG GCA GTC ATG 1008
1009 GAT AAC ACT TGC TTT TCC AGT TAA TGT GGC CAT GTG ATT CCA AGT GTC 1056
1057 ATG TTG CTT TGT GGC AAG ATT GTT GTG TGA CTT GTT TTT TTG TTT TTG 1104
1105 TTT TTG TTT TTT TAA AGG AAA CTA TTT GTG GGC TAT AGG AAA CTT TCT 1152
1153 GAT GCC TCC GGA TTG TGT TAG TAG TAG CCA TCA GGA GGG TCT CCA ACT 1200
1201 AAA ACA CTT GTT CCT GCT TGC TCC TTT CCC CTC TCA TTG TTC AGC ATT 1248
1249 CTT GTC AAG TTG CCC AGC TTG GAG TTG TCT GTC ACG CAC ATG TGT CCT 1296
1297 GTG GTT ATA GCT AGA AGG ACA GGA GTC TCC TGC TGA TGC GTG ATA GCT 1344
1345 TAA GCT TGG GGA GAA GGT CTT TTC CAC TGC CTA GCT AAG CAG TCT GGG 1392
1393 GAG AGC ATG GGG ATC ATT TCT ATG TGT GTG GGT AAT CTG GTC AGT AAG 1440
1441 ATT GAG ACT TAG TTA AGA TTC CCC TTG GAA ATT CCT TAA TGT TTA TTA 1488
1489 GCT TCT AAC TAG TGT TGT AAG TCC GAT GCC AGA ATT TGG AGA TTT GAG 1536
1537 TTC TTC TTT TCA TGG CTT TTA TTC ACT GTG ACT AAT AAG CTT CCT AAT 1584
1585 AAA TCC TTG CCA GAC TTA AAA AAA AAA AAA AAA AA 1619
D:Blastp结果
Query=PP603[基因=PP603](211个氨基酸)
>SW:YOJ1_CAEEL P34624 caenorhabditis elegans.hypothetical 63.5kd
protein zk353.1 in chromosome iii.6/1994
长度=548
分值=179 bits(449),预计值=2e-44
相同性=89/187(47%),相似性=124/187(65%),缺口=1/187(0%)
Query:14 CAAER-EEPPEQRGLAYGLYLRIDLERLQCLNESREGSGRGVFKPWEERTDRSKFVESDA 72
CAAE E P Y + ID+E++ LNES +G+G+ VFK E+R DR ++VESD
Sbjct:350 CAAEHIPEVPGDDVYRYDMVSYIDMEKVTTLNESVDGAGKKVFKVMEKRDDRLEYVESDC 409
Query:73 DEELLFNIPFTGNVKLKGIIIMGEDDDSHPSEMRLYKNIPQMSFDDTEREPDQTFSLNRD 132
D ELLFNIPFTG+V+L G+ I+G++D SHP+++RL+K+ MSFDD E DQ L +D
Sbjct:410 DHELLFNIPFTGHVRLTGLSIIGDEDGSHPAKIRLFKDREAMSFDDCSIEADQEIDLKQD 469
Query:133 LTGELEYATKISRFSNVYHLSIHISKNFGADTTKVFYIGLRGEWTELRRHEVTICNYEAS 192
G ++Y K S+F N+++LSI+ NFG D TK++YIGLRGE+ R + I YE+
Sbjct:470 PQGLVDYPLKASKFGNIHNLSILVDANFGEDETKIYYIGLRGEFQHEFRQRIAIATYESR 529
Query:193 ANPADHR 199
A DH+
Sbjct:530 AQLKDHK 536
8.PP632
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:22) 长度:1854bp
1 GGAGAGCCCG GCCCGCGGGC CGTCCGTCCC CCACAGGAAA CCGCCGGGGA
51 GGCCGCGGCA GGGACCCGCC CCCAGGCCAC TAACAGCAAC AACAGAGAGG
101 CTGGAGCTCT GCCTGCGTGC GGGCCAAGGG CTAAACCTTG GACAGGTTCT
151 TTCACTTACT CCGCCTGACA ACCCTGCGAC GTGATACCAT TATCCCCACT
201 TCGCAGATCA AATAAACGGA GTCTTGGAGA GATTGAATTG ACTTTACCAA
251 AACCGTCAGG ATTTGAATCT GCTGCTCTCT GATCCTAAAG CCTGAGCTAG
301 AAACCACCGC TCCCCCTCCT AGGAGGCCCC TTCCAGGGGC TTGCCGTGGC
351 CAAGCCAGGC CAGGTGGGAG AAGCGGCAGC CTTGCCCTGG AGGGTTTTGA
401 GAAGCACTGC TCCTGGAGGC CCTGGGGAAG GTCCCTGAAA CCTTTGGCCA
451 ATGTGGCTGT CCCCATGGTC CACATGCCCT CCCCACCCCC TGCCTAGCTG
501 CTTGACTGCC TGCTGCTCCC CAGCCCACCA GCCTGTCCGT GGGTCAGCCC
551 AGCCACCCGC TTCGGATCTC TGCACGTGTG TCACCTGCTG TTCTGGCCCT
601 CATCCCAACT ATCCACCTGC CCATCTCCTC CCTACCTCCT CGCTGCCTAT
651 CTGCCCAGGA CTTATCTGCT GTCTGCTCAC CTGCCTGCTT GTTGACTGCT
701 TCTCTGCCCT CCTATCTGCC TGTGAGACTA GAGATTTGTC ACCTTGGAAA
751 GCACGGAGAG TACTGCTAAG ATGAAACACA GGAAGGACAG GCCTTGATGG
801 AAGGTTGGGG GGCCGAGAGA TCCAGAGCCT ATGGGAGGGG ACTTGTGAGT
851 GCTGGCATAT TCAGGACCCA GTGCAAACCC AAGCACAGCT CTGCTCCCGG
901 CCCCAGTGGC CAAACTGAAG GCTTGCCCTG GCTATTCTGC CGTTGACATG
951 GGCCTCACCC TACCACGGGG ATAGGTCTTG GATGGAGGGA AGAGGGAGAC
1001 TCACCGGGGG CCTCCTGAGT CCTTTGAGTG TCCCCATGAC CCCAGCACCT
1051 GGGACAGCTG CTGGAAAGAG GGTACTGGCA AAAATTTGCT AAATGGACAA
1101 TCATAGGCCC AGTGTGGTGG CTCACGTCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG
1151 GCCGAGGTGT GCAGATCACT GAAGTCCAGG AGTTTGAGAC CAGCCTGGGC
1201 AACATGGTGA AACCCCATTT CTACAGAAAA CTACAAAAAT TAGCTGGACA
1251 CGGTAGCACA CACCTATAGT TCCTGCTACT CAGGAGGCTA AGGTGGGAGG
1301 ATCGCTTGAG CCCAGGAGAT CAAGGCTATG GTGAGCCGTG ATCGTGCCAC
1351 TGTACTCCAG CCTGGATGAC AGAGGAAGAC CCTGTCTCAA AACAAACAAA
1401 ACAACAGCAA CAACAAGAAA ACAATAATAG GGACATTGAG TACCCTTTCT
1451 GGCACCTGGC ACTCTGCCAA ATGCTATGCA CACTCCGCCC TTCAGTCTTC
1501 CCAGGAACCC TGTGCAGTTT GTAGCGTGGC TCACATTTGC CAAGAAGGAA
1551 GTGAGGCTCA GCGAGGTTAA GCAGTGCCTG TGGAGTCACA TGGCTGCAAG
1601 TAGTGGCCTG GACTGGACTG CAGAGCCCAT GCTCCCCACC GCTTTCCATG
1651 GGGCAACTCT AGGCCATCAT TCTCCACCCC TCAGACCCAA AGCTGCCTTT
1701 TCATAATGCT TGCTGTTGCT CCCTTTATGC TCCTGAAATG AAATTTATGG
1751 CTAATATGCC AGCCTTTACA TCTAATTAAA AATCATCCAA TGGTTTTTTT
1801 GTCCTTATTA ATATATAAGA AATAAAAGGT AATGATAAAA AAAAAAAAAA
1851 AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:23)长度:107个氨基酸
1 MWLSPWSTCP PHPLPSCLTA CCSPAHQPVR GSAQPPASDL CTCVTCCSGP
51 HPNYPPAHLL PTSSLPICPG LICCLLTCLL VDCFSALLSA CETRDLSPWK
101 ARRVLLR
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:24)
克隆号和蛋白名称:PP632
起始编码子:451 ATG 终止编码子:774 TGA
蛋白质分子量:11453.94
1 GGA GAG CCC GGC CCG CGG GCC GTC CGT CCC CCA CAG GAA ACC GCC GGG 48
49 GAG GCC GCG GCA GGG ACC CGC CCC CAG GCC ACT AAC AGC AAC AAC AGA 96
97 GAG GCT GGA GCT CTG CCT GCG TGC GGG CCA AGG GCT AAA CCT TGG ACA 144
145 GGT TCT TTC ACT TAC TCC GCC TGA CAA CCC TGC GAC GTG ATA CCA TTA 192
193 TCC CCA CTT CGC AGA TCA AAT AAA CGG AGT CTT GGA GAG ATT GAA TTG 240
241 ACT TTA CCA AAA CCG TCA GGA TTT GAA TCT GCT GCT CTC TGA TCC TAA 288
289 AGC CTG AGC TAG AAA CCA CCG CTC CCC CTC CTA GGA GGC CCC TTC CAG 336
337 GGG CTT GCC GTG GCC AAG CCA GGC CAG GTG GGA GAA GCG GCA GCC TTG 384
385 CCC TGG AGG GTT TTG AGA AGC ACT GCT CCT GGA GGC CCT GGG GAA GGT 432
433 CCC TGA AAC CTT TGG CCA ATG TGG CTG TCC CCA TGG TCC ACA TGC CCT 480
1 Met Trp Leu Ser Pro Trp Ser Thr Cys Pro 10
481 CCC CAC CCC CTG CCT AGC TGC TTG ACT GCC TGC TGC TCC CCA GCC CAC 528
11 Pro His Pro Leu Pro Ser Cys Leu Thr Ala Cys Cys Ser Pro Ala His 26
529 CAG CCT GTC CGT GGG TCA GCC CAG CCA CCC GCT TCG GAT CTC TGC ACG 576
27 Gln Pro Val Arg Gly Ser Ala Gln Pro Pro Ala Ser Asp Leu Cys Thr 42
577 TGT GTC ACC TGC TGT TCT GGC CCT CAT CCC AAC TAT CCA CCT GCC CAT 624
43 Cys Val Thr Cys Cys Ser Gly Pro His Pro Asn Tyr Pro Pro Ala His 58
625 CTC CTC CCT ACC TCC TCG CTG CCT ATC TGC CCA GGA CTT ATC TGC TGT 672
59 Leu Leu Pro Thr Ser Ser Leu Pro Ile Cys Pro Gly Leu Ile Cys Cys 74
673 CTG CTC ACC TGC CTG CTT GTT GAC TGC TTC TCT GCC CTC CTA TCT GCC 720
75 Leu Leu Thr Cys Leu Leu Val Asp Cys Phe Ser Ala Leu Leu Ser Ala 90
721 TGT GAG ACT AGA GAT TTG TCA CCT TGG AAA GCA CGG AGA GTA CTG CTA 768
91 Cys Glu Thr Arg Asp Leu Ser Pro Trp Lys Ala Arg Arg Val Leu Leu 106
769 AGA TGA AAC ACA GGA AGG ACA GGC CTT GAT GGA AGG TTG GGG GGC CGA 816
107 Arg *** 108
817 GAG ATC CAG AGC CTA TGG GAG GGG ACT TGT GAG TGC TGG CAT ATT CAG 864
865 GAC CCA GTG CAA ACC CAA GCA CAG CTC TGC TCC CGG CCC CAG TGG CCA 912
913 AAC TGA AGG CTT GCC CTG GCT ATT CTG CCG TTG ACA TGG GCC TCA CCC 960
961 TAC CAC GGG GAT AGG TCT TGG ATG GAG GGA AGA GGG AGA CTC ACC GGG 1008
1009 GGC CTC CTG AGT CCT TTG AGT GTC CCC ATG ACC CCA GCA CCT GGG ACA 1056
1057 GCT GCT GGA AAG AGG GTA CTG GCA AAA ATT TGC TAA ATG GAC AAT CAT 1104
1105 AGG CCC AGT GTG GTG GCT CAC GTC TGT AAT CCC AGC ACT TTG GGA GGC 1152
1153 CGA GGT GTG CAG ATC ACT GAA GTC CAG GAG TTT GAG ACC AGC CTG GGC 1200
1201 AAC ATG GTG AAA CCC CAT TTC TAC AGA AAA CTA CAA AAA TTA GCT GGA 1248
1249 CAC GGT AGC ACA CAC CTA TAG TTC CTG CTA CTC AGG AGG CTA AGG TGG 1296
1297 GAG GAT CGC TTG AGC CCA GGA GAT CAA GGC TAT GGT GAG CCG TGA TCG 1344
1345 TGC CAC TGT ACT CCA GCC TGG ATG ACA GAG GAA GAC CCT GTC TCA AAA 1392
1393 CAA ACA AAA CAA CAG CAA CAA CAA GAA AAC AAT AAT AGG GAC ATT GAG 1440
1441 TAC CCT TTC TGG CAC CTG GCA CTC TGC CAA ATG CTA TGC ACA CTC CGC 1488
1489 CCT TCA GTC TTC CCA GGA ACC CTG TGC AGT TTG TAG CGT GGC TCA CAT 1536
1537 TTG CCA AGA AGG AAG TGA GGC TCA GCG AGG TTA AGC AGT GCC TGT GGA 1584
1585 GTC ACA TGG CTG CAA GTA GTG GCC TGG ACT GGA CTG CAG AGC CCA TGC 1632
1633 TCC CCA CCG CTT TCC ATG GGG CAA CTC TAG GCC ATC ATT CTC CAC CCC 1680
1681 TCA GAC CCA AAG CTG CCT TTT CAT AAT GCT TGC TGT TGC TCC CTT TAT 1728
1729 GCT CCT GAA ATG AAA TTT ATG GCT AAT ATG CCA GCC TTT ACA TCT AAT 1776
1777 TAA AAA TCA TCC AAT GGT TTT TTT GTC CTT ATT AAT ATA TAA GAA ATA 1824
1825 AAA GGT AAT GAT AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1854
D:Blastp结果
Query=PP632AA(107个氨基酸)
>SP_IN:045021 045021 caenorhabditis elegans.zc123.1 protein.
11/1998
长度=768
分值=35.6 bits(80),预计值=0.16
相同性=19/50(38%),相似性=21/50(42%),缺口=8/50(16%)
Query:5 PWSTCPPHPLPSCLTACCSPAHQPVRGSAQPPASDLCTCVTCCSGPHPNY 54
P + CPP P P CC PA P PA+ C CC G P Y
Sbjct:106 PLACCPPPPPPK---PCCQPAFGPCC-----PATPNCCPKPCCRGRRPEY 147
>SP_IN:Q17982 Q17982 caenorhabditis elegans.similarity to erbb-3
receptor protein-tyrosine kinase.11/1998
长度=654
分值=31.7bits(70),预计值=2.3
相同性=24/99(24%),相似性=32/99(32%),缺口=15/99(15%)
Query:7 STCPPHPLPSCLTACCSPAHQPVRGS------------AQPPASDLCTCVTCCSGPHPNY 54
S+C P SC+ C+PA QP S QPP S C + C P
Sbjct:352 SSCMPACQSSCVQQACAPACQPKCSSQCVEQQQAQIVVVQPPTSSSNNCASSCM---PQC 408
Query:55 PPAHLLPTSSXXXXXXXXXXXXXXXXVDCFSALLSACET 93
P + + C A L+CE+
Sbjct:409 TPQCVQQQTICAAACQPSCQSSCSSNAQCVQACLPSCES 447
>PIR2:A60533 tumor-associated antigen DF3-human
长度=256
分值=30.5bits(67),预计值=5.2
相同性=19/56(33%),相似性=25/56(43%),缺口=7/56(12%)
Query:4 SPWSTCPP-HPLPSCLTACCSPAHQPVRGSAQPPASDLCTCVTCCSGPHPNYPPAH 58
+P ST PP H + S +P +P GS PPA + + P PPAH
Sbjct:130 APGSTAPPAHRVTS------APESRPAPGSTAPPAHRVTSAPESRPAPGSTAPPAH 179
9.PP844
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:25) 长度:1843bp
1 TGAAGGCCGA TGCTGTGGGG GTGGGCGTGG AGAGAATTCT TCTGTGGGTC
51 CTCTGGTGTT GAGTGGTCGG CTTGGTGTGG TGTGCGGAGG AGCTCCAGGC
101 CCGTCGGCGC GGAGGGTCTT GCTGTGTTGC CCAGCCTGGT CTTGAATTCC
151 TGGACTCAAG TGATGCTCCT GCCTTGGCTT CCCAAACTCC TGGAATTACA
201 ACTTGGTCTC ACGTGTGAAA CATGGCTACA GATTGGCTGG GAAGTATTGT
251 GTCCATCAAT TGTGGAGATA GCTTGGGTGT CTATCAGGGA AGAGTGTCAG
301 CTGTGGATCA GGTCAGCCAG ACCATTTCTC TCACCCGGCC TTTCCATAAT
351 GGAGTGAAGT GTCTTGTTCC AGAAGTCACC TTCAGGGCAG GTGACATTAC
401 GGAGTTAAAA ATTCTGGAGA TACCAGGACC TGGAGACAAC CAACATTTTG
451 GAGACCTTCA TCAAACAGAA TTAGGCCCCT CTGGTGCTGG CTGCCAAGTG
501 GGCATCAATC AGAATGGCAC AGGCAAGTTT GTCAAGAAGC CAGCCTCTTC
551 CAGCAGTGCC CCTCAGAATA TCCCTAAGAG GACAGATGTG AAGAGCCAGG
601 ATGTTGCCGT TTCCCCGCAG CAGCAACAGT GCTCAAAGAG CTATGTCGAC
651 AGGCACATGG AATCCTTGAG TCAGTCCAAA AGTTTCCGTC GTCGGCACAA
701 CTCCTGGTCA TCTAGTAGCA GGCACCCAAA TCAGGCAACT CCCAAGAAAA
751 GTGGTTTAAA GAATGGCCAG ATGAAGAATA AAGATGACGA GTGCTTCGGG
801 GATGATATTG AGGAGATCCC AGACACAGAT TTTGATTTTG AAGGGAACCT
851 GGCTCTTTTT GACAAGGCAG CTGTGTTTGA GGAGATTGAT ACCTATGAAA
901 GGAGAAGTGG TACCCGTTCC CGGGGCATCC CAAATGAAAG GCCCACTCGG
951 TACCGCCATG ATGAGAACAT CTTGGAGTCC GAGCCCATTG TCTATCGACG
1001 GATCATAGTG CCCCACAACG TGAGCAAGGA GTTCTGCACG GACTCTGGCC
1051 TGGTTGTCCC AAGTATTTCC TATGAGCTGC ATAAAAAGCT GTTGTCCGTG
1101 GCTGAGAAGC ATGGGCTGAC CCTTGAGCGG AGACTGGAGA TGACAGGTGT
1151 GTGTGCCAGT CAGATGGCAC TGACCCTCCT CGGAGGACCT AACAGGTTGA
1201 ATCCCAAAAA TGTTCACCAG AGGCCTACAG TGGCTCTACT GTGTGGACCT
1251 CATGTGAAGG GGGCTCAGGG TATCAGCTGT GGAAGGCACC TAGCCAACCA
1301 TGATGTCCAG GTCATCCTTT TCCTGCCCAA TTTTGTCAAG ATGTTGGAAT
1351 CTATCACCAA TGAGCTGTCG CTCTTCAGCA AGACCCAAGG CCAACAAGTG
1401 TCTAGCCTCA AAGATCTGCC CACTAGCCCT GTGGACCTGG TCATCAACTG
1451 CCTGGATTGC CCTGAGAACG TCTTCCTGCG CGATCAACCC TGGTACAAGG
1501 CAGCTGTGGC CTGGGCCAAC CAGAACCGGG CACCAGTACT CAGCATAGAC
1551 CCTCCTGTGC ATGAAGTCGA ACAGGGCATT GATGCCAAAT GGTCACTGGC
1601 ACTGGGCCTG CCTCTGCCAC TGGGGGAGCA CGCAGGCCGT ATCTATTTGT
1651 GCGACATTGG CATTCCCCAG CAGGTCTTCC AGGAGGTGGG CATCAACTAC
1701 CACTCGCCCT TTGGCTGCAA GTTTGTTATC CCACTGCACT CTGCTTAAAG
1751 GGTTCCTGCG CAGGCAGGAC TCTGCTGTCC CCTGCTGCTC CTGATAACAA
1801 ACGCCTTAAG GTTTTGTAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:26)长度:508个氨基酸
1 MATDWLGSIV SINCGDSLGV YQGRVSAVDQ VSQTISLTRP FHNGVKCLVP
51 EVTFRAGDIT ELKILEIPGP GDNQHFGDLH QTELGPSGAG CQVGINQNGT
101 GKFVKKPASS SSAPQNIPKR TDVKSQDVAV SPQQQQCSKS YVDRHMESLS
151 QSKSFRRRHN SWSSSSRHPN QATPKKSGLK NGQMKNKDDE CFGDDIEEIP
201 DTDFDFEGNL ALFDKAAVFE EIDTYERRSG TRSRGIPNER PTRYRHDENI
251 LESEPIVYRR IIVPHNVSKE FCTDSGLVVP SISYELHKKL LSVAEKHGLT
301 LERRLEMTGV CASQMALTLL GGPNRLNPKN VHQRPTVALL CGPHVKGAQG
351 ISCGRHLANH DVQVILFLPN FVKMLESITN ELSLFSKTQG QQVSSLKDLP
401 TSPVDLVINC LDCPENVFLR DQPWYKAAVA WANQNRAPVL SIDPPVHEVE
451 QGIDAKWSLA LGLPLPLGEH AGRIYLCDIG IPQQVFQEVG INYHSPFGCK
501 FVIPLHSA
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:27)
克隆号和蛋白名称:PP844
起始编码子:222 ATG 终止编码子:1748 TAA
蛋白质分子量:56074.68
1 TG AAG GCC GAT GCT GTG GGG GTG GGC GTG GAG AGA ATT CTT CTG TGG 47
48 GTC CTC TGG TGT TGA GTG GTC GGC TTG GTG TGG TGT GCG GAG GAG CTC 95
96 CAG GCC CGT CGG CGC GGA GGG TCT TGC TGT GTT GCC CAG CCT GGT CTT 143
144 GAA TTC CTG GAC TCA AGT GAT GCT CCT GCC TTG GCT TCC CAA ACT CCT 191
192 GGA ATT ACA ACT TGG TCT CAC GTG TGA AAC ATG GCT ACA GAT TGG CTG 239
1 Met Ala Thr Asp Trp Leu 6
240 GGA AGT ATT GTG TCC ATC AAT TGT GGA GAT AGC TTG GGT GTC TAT CAG 287
7 Gly Ser Ile Val Ser Ile Asn Cys Gly Asp Ser Leu Gly Val Tyr Gln 22
288 GGA AGA GTG TCA GCT GTG GAT CAG GTC AGC CAG ACC ATT TCT CTC ACC 335
23 Gly Arg Val Ser Ala Val Asp Gln Val Ser Gln Thr Ile Ser Leu Thr 38
336 CGG CCT TTC CAT AAT GGA GTG AAG TGT CTT GTT CCA GAA GTC ACC TTC 383
39 Arg Pro Phe His Asn Gly Val Lys Cys Leu Val Pro Glu Val Thr Phe 54
384 AGG GCA GGT GAC ATT ACG GAG TTA AAA ATT CTG GAG ATA CCA GGA CCT 431
55 Arg Ala Gly Asp Ile Thr Glu Leu Lys Ile Leu Glu Ile Pro Gly Pro 70
432 GGA GAC AAC CAA CAT TTT GGA GAC CTT CAT CAA ACA GAA TTA GGC CCC 479
71 Gly Asp Asn Gln His Phe Gly Asp Leu His Gln Thr Glu Leu Gly Pro 86
480 TCT GGT GCT GGC TGC CAA GTG GGC ATC AAT CAG AAT GGC ACA GGC AAG 527
87 Ser Gly Ala Gly Cys Gln Val Gly Ile Asn Gln Asn Gly Thr Gly Lys 102
528 TTT GTC AAG AAG CCA GCC TCT TCC AGC AGT GCC CCT CAG AAT ATC CCT 575
103 Phe Val Lys Lys Pro Ala Ser Ser Ser Ser Ala Pro Gln Asn Ile Pro 118
576 AAG AGG ACA GAT GTG AAG AGC CAG GAT GTT GCC GTT TCC CCG CAG CAG 623
119 Lys Arg Thr Asp Val Lys Ser Gln Asp Val Ala Val Ser Pro Gln Gln 134
624 CAA CAG TGC TCA AAG AGC TAT GTC GAC AGG CAC ATG GAA TCC TTG AGT 671
135 Gln Gln Cys Ser Lys Ser Tyr Val Asp Arg His Met Glu Ser Leu Ser 150
672 CAG TCC AAA AGT TTC CGT CGT CGG CAC AAC TCC TGG TCA TCT AGT AGC 719
151 Gln Ser Lys Ser Phe Arg Arg Arg His Asn Ser Trp Ser Ser Ser Ser 166
720 AGG CAC CCA AAT CAG GCA ACT CCC AAG AAA AGT GGT TTA AAG AAT GGC 767
167 Arg His Pro Asn Gln Ala Thr Pro Lys Lys Ser Gly Leu Lys Asn Gly 182
768 CAG ATG AAG AAT AAA GAT GAC GAG TGC TTC GGG GAT GAT ATT GAG GAG 815
183 Gln Met Lys Asn Lys Asp Asp Glu Cys Phe Gly Asp Asp Ile Glu Glu 198
816 ATC CCA GAC ACA GAT TTT GAT TTT GAA GGG AAC CTG GCT CTT TTT GAC 863
199 Ile Pro Asp Thr Asp Phe Asp Phe Glu Gly Asn Leu Ala Leu Phe Asp 214
864 AAG GCA GCT GTG TTT GAG GAG ATT GAT ACC TAT GAA AGG AGA AGT GGT 911
215 Lys Ala Ala Val Phe Glu Glu Ile Asp Thr Tyr Glu Arg Arg Ser Gly 230
912 ACC CGT TCC CGG GGC ATC CCA AAT GAA AGG CCC ACT CGG TAC CGC CAT 959
231 Thr Arg Ser Arg Gly Ile Pro Asn Glu Arg Pro Thr Arg Tyr Arg His 246
960 GAT GAG AAC ATC TTG GAG TCC GAG CCC ATT GTC TAT CGA CGG ATC ATA 1007
247 Asp Glu Asn Ile Leu Glu Ser Glu Pro Ile Val Tyr Arg Arg Ile Ile 262
1008 GTG CCC CAC AAC GTG AGC AAG GAG TTC TGC ACG GAC TCT GGC CTG GTT 1055
263 Val Pro His Asn Val Ser Lys Glu Phe Cys Thr Asp Ser Gly Leu Val 278
1056 GTC CCA AGT ATT TCC TAT GAG CTG CAT AAA AAG CTG TTG TCC GTG GCT 1103
279 Val Pro Ser Ile Ser Tyr Glu Leu His Lys Lys Leu Leu Ser Val Ala 294
1104 GAG AAG CAT GGG CTG ACC CTT GAG CGG AGA CTG GAG ATG ACA GGT GTG 1151
295 Glu Lys His Gly Leu Thr Leu Glu Arg Arg Leu Glu Met Thr Gly Val 310
1152 TGT GCC AGT CAG ATG GCA CTG ACC CTC CTC GGA GGA CCT AAC AGG TTG 1199
311 Cys Ala Ser Gln Met Ala Leu Thr Leu Leu Gly Gly Pro Asn Arg Leu 326
1200 AAT CCC AAA AAT GTT CAC CAG AGG CCT ACA GTG GCT CTA CTG TGT GGA 1247
327 Asn Pro Lys Asn Val His Gln Arg Pro Thr Val Ala Leu Leu Cys Gly 342
1248 CCT CAT GTG AAG GGG GCT CAG GGT ATC AGC TGT GGA AGG CAC CTA GCC 1295
343 Pro His Val Lys Gly Ala Gln Gly Ile Ser Cys Gly Arg His Leu Ala 358
1296 AAC CAT GAT GTC CAG GTC ATC CTT TTC CTG CCC AAT TTT GTC AAG ATG 1343
359 Asn His Asp Val Gln Val Ile Leu Phe Leu Pro Asn Phe Val Lys Met 374
1344 TTG GAA TCT ATC ACC AAT GAG CTG TCG CTC TTC AGC AAG ACC CAA GGC 1391
375 Leu Glu Ser Ile Thr Asn Glu Leu Ser Leu Phe Ser Lys Thr Gln Gly 390
1392 CAA CAA GTG TCT AGC CTC AAA GAT CTG CCC ACT AGC CCT GTG GAC CTG 1439
391 Gln Gln Val Ser Ser Leu Lys Asp Leu Pro Thr Ser Pro Val Asp Leu 406
1440 GTC ATC AAC TGC CTG GAT TGC CCT GAG AAC GTC TTC CTG CGC GAT CAA 1487
407 Val Ile Asn Cys Leu Asp Cys Pro Glu Asn Val Phe Leu Arg Asp Gln 422
1488 CCC TGG TAC AAG GCA GCT GTG GCC TGG GCC AAC CAG AAC CGG GCA CCA 1535
423 Pro Trp Tyr Lys Ala Ala Val Ala Trp Ala Asn Gln Asn Arg Ala Pro 438
1536 GTA CTC AGC ATA GAC CCT CCT GTG CAT GAA GTC GAA CAG GGC ATT GAT 1583
439 Val Leu Ser Ile Asp Pro Pro Val His Glu Val Glu Gln Gly Ile Asp 454
1584 GCC AAA TGG TCA CTG GCA CTG GGC CTG CCT CTG CCA CTG GGG GAG CAC 1631
455 Ala Lys Trp Ser Leu Ala Leu Gly Leu Pro Leu Pro Leu Gly Glu His 470
1632 GCA GGC CGT ATC TAT TTG TGC GAC ATT GGC ATT CCC CAG CAG GTC TTC 1679
471 Ala Gly Arg Ile Tyr Leu Cys Asp Ile Gly Ile Pro Gln Gln Val Phe 486
1680 CAG GAG GTG GGC ATC AAC TAC CAC TCG CCC TTT GGC TGC AAG TTT GTT 1727
487 Gln Glu Val Gly Ile Asn Tyr His Ser Pro Phe Gly Cys Lys Phe Val 502
1728 ATC CCA CTG CAC TCT GCT TAA AGG GTT CCT GCG CAG GCA GGA CTC TGC 1775
503 Ile Pro Leu His Ser Ala *** 509
1776 TGT CCC CTG CTG CTC CTG ATA ACA AAC GCC TTA AGG TTT TGT AAA AAA 1823
1824 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AA 1843
D:Blastp结果
Query=PP844[基因=PP844](508个氨基酸)
>SP_FUN:094752 094752 schizosaccharomyces pombe(fission yeast).
hypothet ical 49.2kd protein.5/1999
长度=454
分值=77.6 bits(188),预计值=2e-13
相同性=80/347(23%),相似性=138/347(39%),缺口=63/347(18%)
Query:201 DTDFDFEGNLALFDKAAVFEEIDTYERRSGTRSRGIPNERPTR-YRHDENILE------- 252
D +FDF NL FDK VF E +++ + N+ P R Y H +N+L
Sbjct:96 DEEFDFAANLEKFDKKQVFAEFREKDKKDPAKLLVSHNKSPNRNYHHKQNVLGPSVKDEF 155
Query:253 --------------------------------SEPIVYRRIIVPHNVSKEFCTDSGLVVP 280
S + ++ V N+ E T +G ++
Sbjct:156 VDLPSAGSQINGIDAVLSSSSNGHVTPGSKKGSRETLKKKPFVDENIPAELHTTTGDILK 215
Query:281 SISYELHKKLLSVAEKHGLTLERRLEMTGVCASQMALTLLGGPNRLNPKNVHQRPTVALL 340
I+ E + +++A T + +E SQ ++LGG RL+ +N + +P V +L
Sbjct:216 PITPEQLSQGIALAIAKTST-DIVVENAAQLLSQFVFSVLGGHKRLSSRNHNSQPLVCIL 274
Query:341 CGPHVKGAQGISCGRHLANHDVQVILFLPNFVKMLESITNELSLFSKTQG----QQVSSL 396
G H + ++ GR L ++V+L L + +L +F G +
Sbjct:275 VGSHDHASAAVAAGRRLCAIGIKVVLRL---LTPFNVDNRQLLMFQAAGGYIPTENFDQF 331
Query:397 KDLPTSPVDLVINCLDCPENVFLRDQPWYKAAVAWANQNRAPVLSIDPP----VHEVEQG 452
+ TSP++LV++ L ++ A + WAN +LS+D P V +
Sbjct:332 LNKLTSPIELVVDVLTGFHPSIDKNS---HALIQWANDLNVLILSVDIPSGYTVQKKNTA 388
Query:453 IDAKWSLALGLPLPLGEHAG--------RIYLCDIGIPQQVFQEVGI 491
I KW+LALG A +++ ++G Q + E+GI
Sbjct:389 ILPKWTLALGAVTTTLAQAALVKQAAGVSVFVGNLGTGSQTWAELGI 435
>SW:YNUO_YEAST P40165 saccharomyces cerevisiae(baker′s yeast).
hypothetical 27.5kd protein in spx19-gcr2 intergenic
region.7/1998
长度=246
分值=35.6 bits(80),预计值=1.0
相同性=51/212(24%),相似性=89/212(41%),缺口=28/212(13%)
Query:277 LVVPSISYELHKKLLSVAEKHGLTLERRLEMTGVCASQMALTLLGGPNRLNPKNVHQRPT 336
+V ++ E+ K+L+ + G TL++ +E+ G +Q P R +
Sbjct:6 VVSSKLAAEIDKELMG--PQIGFTLQQLMELAGFSVAQAVCRQF--PLR-GKTETEKGKH 60
Query:337 VALLCGPHVKGAQGISCGRHLANHDVQVILFLP------NFVKMLESITN--ELSLFSKT 388
V ++ GP G G+ C RHL ++F P F K L N ++ + S+
Sbjct:61 VFVIAGPGNNGGDGLVCARHLKLFGYNPVVFYPKRSERTEFYKQLVHQLNFFKVPVLSQD 120
Query:389 QGQQVSSLKDLPT-SPVDLVINCLDCPENVFLRDQPWYKAAV--AWANQNRAPVLSIDPP 445
+G + LK T VD + P +R+ +K V QN P++S+D P
Sbjct:121 EGNWLEYLKPEKTLCIVDAIFGFSFKPP---MREP--FKGIVEELCKVQNIIPIVSVDVP 175
Query:446 V-HEVEQG------IDAKWSLALGLPLPLGEH 470
+V++G I+ ++L +P P H
Sbjct:176 TGWDVDKGPISQPSINPAVLVSLTVPKPCSSH 207
>SP_IN:P91255 P91255 caenorhabditis elegans.f12f3.2 protein.5/1999
长度=2783
分值=35.2bits(79),预计值=1.3
相同性=25/92(27%),相似性=39/92(42%),缺口=8/92(8%)
Query:48 LVPEVTFRAGDITELKILEIPGPGDNQHFGDLHQTELGPSGAGCQVGINQNGTGKFVKKP 107
+VP+ + IL + +N F L + ELG + A CQV I KP
Sbjct:1536 IVPDEKIDVATTSTSSILNLKSQEENGTFNCLIENELGQASASCQVTI--------FNKP 1587
Query:108 ASSSSAPQNIPKRTDVKSQDVAVSPQQQQCSK 139
AS S P + +R V + A++ + Q +
Sbjct:1588 ASLQSTPDHSLERNLVPTLQKALNNESAQAGQ 1619
>SP_IN:Q21740 Q21740 caenorhabditis elegans.r05d11.8 protein.
1/1999
长度=566
分值=34.4bits(77),预计值=2.3
相同性=31/138(22%),相似性=64/138(45%),缺口=13/138(9%)
Query:6 LGSIVSINCGDSLGVYQGRVSAVDQVSQTISLTRPFHNGV---KCLVPEVTFRAGDITEL 62
+GS++S D VYQG+++ D + +++ NG+ +C T + DI+ L
Sbjct:6 IGSVISTETKDG-NVYQGKLTTYDTNNGNLTMANVIKNGLPLHRCF----TLSSSDISRL 60
Query:63 KILEIPGPGDNQHFGDLHQTELGPSGAGCQVGINQNGTGKFVKKPASSSSAPQNIPKRTD 122
K+ I G + + + Q + ++ V +++SS+ ++P +
Sbjct:61 KV--IRGATQSTQKSQPLPVQNSSNSVNKQRPLKKSAEST-VSSTSTASSSASSVPDSS- 116
Query:123 VKSQDVAVSPQQQQCSKS 140
+++ VAVSPQ+ +S
Sbjct:117 -RNRSVAVSPQKSAKGRS 133
10.PP928
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:28) 长度:1964bp
1 GTCCAGCCCA GCCACTCACC CACCGAGAAC AGCAAAGGCC AAAGCCCACC
51 CTCGAAGGAT GGGAGTGGTG ACTACCAGTC TCGTGGGCTG GTAAAGGCCC
101 CTGGCAAGAG CTCGTTCACG ATGTTTGTGG ATCTAGGGAT CTACCAGCCT
151 GGAGGCAGTG GGGACAGCAT CCCCATCACA GCCCTAGTGG GTGGAGAGGG
201 CACTCGGCTC GACCAGCTGC AGTACGACGT GAGGAAGGGT TCTGTGGTCA
251 ACGTGAATCC CACCAACACC CGGCCCACAG TGAGACCCCT GAGATCCGGA
301 AGTACAAGAA GCGATTCAAC TCCGAGATCC TCTGTGCAGC CCTTTGGGGG
351 GTCAACCTGC TGGTGGGCAC GGAGAACGGC TGATGTTGCT GGACCGAAGT
401 GGGCAAGGCA AGGTGTATGG ACTCATTGGG CGGCGACGCT TCCAGCAGAT
451 GGATGTGCTG GAGGGGCTCA ACCTGCTCAT CACCATCTCA GGGAAAAGGA
501 ACAAACTGCG GGTGTATTAC CTGTCCTGGC TCCGGAACAA GATTCTGCAC
551 AATGACCCAG AAGTGGAGAA GAAGCAGGGC TGGACCACCG TGGGGGACAT
601 GGAGGGCTGC GGGCACTACC GTGTTGTGAA ATACGAGCGG ATTAAGTTCC
651 TGGTCATCGC CCTCAAGAGC TCCGTGGAGG TGTATGCCTG GGCCCCCAAA
701 CCCTACCACA AATTCATGGC CTTCAAGTCC TTTGCCGACC TCCCCCACCG
751 CCCTCTGCTG GTCGACCTGA CAGTAGAGGA GGGGCAGCGG CTCAAGGTCA
801 TCTATGGCTC CAGTGCTGGC TTCCATGCTG TGGATGTCGA CTCGGGGAAC
851 AGCTATGACA TCTACATCCC TGTGCACATC CAGAGCCAGA TCACGCCCCA
901 TGCCATCATC TTCCTCCCCA ACACCGACGG CATGGAGATG CTGCTGTGCT
951 ACGAGGACGA GGGTGTCTAC GTCAACACGT ACGGGCGCAT CATTAAGGAT
1001 GTGGTGCTGC AGTGGGGGGA GATGCCTACT TCTGTGGCCT ACATCTGCTC
1051 CAACCAGATA ATGGGCTGGG GTGAGAAAGC CATTGAGATC CGCTCTGTGG
1101 AGACGGGCCA CCTCGACGGG GTCTTCATGC ACAAACGAGC TCAGAGGCTC
1151 AAGTTCCTGT GTGAGCGGAA TGACAAGGTG TTTTTTGCCT CAGTCCGCTC
1201 TGGGGGCAGC AGCCAAGTTT ACTTCATGAC TCTGAACCGT AACTGCATCA
1251 TGAACTGGTG ACGGGGCCCT GGGCTGGGGC TGTCCCACAC TGGACCCAGC
1301 TCTCCCCCTG CAGCCAGGCT TCCCGGGCCG CCCCTCTTTC CCCTCCCTGG
1351 GCTTTTGCTT TTACTGGTTT GATTTCACTG GAGCCTGCTG GGAACGTGAC
1401 CTCTGACCCC TGATGCTTTC GTGATCACGT GACCATCCTC TTCCCCAACA
1451 TGTCCTCTTC CCAAAACTGT GCCTGTCCCC AGCTTCTGGG GAGGGACACA
1501 GCTTTCCCTT CCCAGGAATT GAGTGGGCCT AGCCCCTCCC CCCTTTTCTC
1551 CATTTGAGAG GAGAGTGCTT GGGGCTTGAA CCCCTTACCC CACTCCAGGG
1601 GCAGGGACCA TTTCTTCATT TTCTGAAAGC ACTTTAATGA TTCCCCTTCC
1651 CCCAAACTCC AGGGAATGGA GGGGGGACCC CGCCAGCCAA AACATTCCCC
1701 CCATTCCCGA CCCCCATCTC CTCTTCTAGC CCATGCCCTT CCCCGGCGGA
1751 GGGAGGGAGC AGGGAGCCCT CACTCTCCAC GCCCCTTGCT TGCATCTGTA
1801 TATAGTGTGA GCAGCAAGTA ACCCTTCTTC TCCCTTCCCC CTCACCCCTT
1851 CTCAATGTAG TGGCCTTGGA TATCCCTGTT TGTTAATAAA GACAATTTAA
1901 CCAGCTCCCA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1951 AAAAAAAAAA AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:29) 长度:292个氨基酸
1 MLLDRSGQGK VYGLIGRRRF QQMDVLEGLN LLITISGKRN KLRVYYLSWL
51 RNKILHNDPE VEKKQGWTTV GDMEGCGHYR VVKYERIKFL VIALKSSVEV
101 YAWAPKPYHK FMAFKSFADL PHRPLLVDLT VEEGQRLKVI YGSSAGFHAV
151 DVDSGNSYDI YIPVHIQSQI TPHAIIFLPN TDGMEMLLCY EDEGVYVNTY
201 GRIIKDVVLQ WGEMPTSVAY ICSNQIMGWG EKAIEIRSVE TGHLDGVFMH
251 KRAQRLKFLC ERNDKVFFAS VRSGGSSQVY FMTLNRNCIM NW
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:30)
克隆号和蛋白名称:PP928
起始编码子:383 ATG 终止编码子:1261 TGA
蛋白质分子量:33572.24
1 G TCC AGC CCA GCC ACT CAC CCA CCG AGA ACA GCA AAG GCC AAA GCC 46
47 CAC CCT CGA AGG ATG GGA GTG GTG ACT ACC AGT CTC GTG GGC TGG TAA 94
95 AGG CCC CTG GCA AGA GCT CGT TCA CGA TGT TTG TGG ATC TAG GGA TCT 142
143 ACC AGC CTG GAG GCA GTG GGG ACA GCA TCC CCA TCA CAG CCC TAG TGG 190
191 GTG GAG AGG GCA CTC GGC TCG ACC AGC TGC AGT ACG ACG TGA GGA AGG 238
239 GTT CTG TGG TCA ACG TGA ATC CCA CCA ACA CCC GGC CCA CAG TGA GAC 286
287 CCC TGA GAT CCG GAA GTA CAA GAA GCG ATT CAA CTC CGA GAT CCT CTG 334
335 TGC AGC CCT TTG GGG GGT CAA CCT GCT GGT GGG CAC GGA GAA CGG CTG 382
383 ATG TTG CTG GAC CGA AGT GGG CAA GGC AAG GTG TAT GGA CTC ATT GGG 430
1 Met Leu Leu Asp Arg Ser Gly Gln Gly Lys Val Tyr Gly Leu Ile Gly 16
431 CGG CGA CGC TTC CAG CAG ATG GAT GTG CTG GAG GGG CTC AAC CTG CTC 478
17 Arg Arg Arg Phe Gln Gln Met Asp Val Leu Glu Gly Leu Asn Leu Leu 32
479 ATC ACC ATC TCA GGG AAA AGG AAC AAA CTG CGG GTG TAT TAC CTG TCC 526
33 Ile Thr Ile Ser Gly Lys Arg Asn Lys Leu Arg Val Tyr Tyr Leu Ser 48
527 TGG CTC CGG AAC AAG ATT CTG CAC AAT GAC CCA GAA GTG GAG AAG AAG 574
49 Trp Leu Arg Asn Lys Ile Leu His Asn Asp Pro Glu Val Glu Lys Lys 64
575 CAG GGC TGG ACC ACC GTG GGG GAC ATG GAG GGC TGC GGG CAC TAC CGT 622
65 Gln Gly Trp Thr Thr Val Gly Asp Met Glu Gly Cys Gly His Tyr Arg 80
623 GTT GTG AAA TAC GAG CGG ATT AAG TTC CTG GTC ATC GCC CTC AAG AGC 670
81 Val Val Lys Tyr Glu Arg Ile Lys Phe Leu Val Ile Ala Leu Lys Ser 96
671 TCC GTG GAG GTG TAT GCC TGG GCC CCC AAA CCC TAC CAC AAA TTC ATG 718
97 Ser Val Glu Val Tyr Ala Trp Ala Pro Lys Pro Tyr His Lys Phe Met 112
719 GCC TTC AAG TCC TTT GCC GAC CTC CCC CAC CGC CCT CTG CTG GTC GAC 766
113 Ala Phe Lys Ser Phe Ala Asp Leu Pro His Arg Pro Leu Leu Val Asp 128
767 CTG ACA GTA GAG GAG GGG CAG CGG CTC AAG GTC ATC TAT GGC TCC AGT 814
129 Leu Thr Val Glu Glu Gly Gln Arg Leu Lys Val Ile Tyr Gly Ser Ser 144
815 GCT GGC TTC CAT GCT GTG GAT GTC GAC TCG GGG AAC AGC TAT GAC ATC 862
145 Ala Gly Phe His Ala Val Asp Val Asp Ser Gly Asn Ser Tyr Asp Ile 160
863 TAC ATC CCT GTG CAC ATC CAG AGC CAG ATC ACG CCC CAT GCC ATC ATC 910
161 Tyr Ile Pro Val His Ile Gln Ser Gln Ile Thr Pro His Ala Ile Ile 176
911 TTC CTC CCC AAC ACC GAC GGC ATG GAG ATG CTG CTG TGC TAC GAG GAC 958
177 Phe Leu Pro Asn Thr Asp Gly Met Glu Met Leu Leu Cys Tyr Glu Asp 192
959 GAG GGT GTC TAC GTC AAC ACG TAC GGG CGC ATC ATT AAG GAT GTG GTG 1006
193 Glu Gly Val Tyr Val Asn Thr Tyr Gly Arg Ile Ile Lys Asp Val Val 208
1007 CTG CAG TGG GGG GAG ATG CCT ACT TCT GTG GCC TAC ATC TGC TCC AAC 1054
209 Leu Gln Trp Gly Glu Met Pro Thr Ser Val Ala Tyr Ile Cys Ser Asn 224
1055 CAG ATA ATG GGC TGG GGT GAG AAA GCC ATT GAG ATC CGC TCT GTG GAG 1102
225 Gln Ile Met Gly Trp Gly Glu Lys Ala Ile Glu Ile Arg Ser Val Glu 240
1103 ACG GGC CAC CTC GAC GGG GTC TTC ATG CAC AAA CGA GCT CAG AGG CTC 1150
241 Thr Gly His Leu Asp Gly Val Phe Met His Lys Arg Ala Gln Arg Leu 256
1151 AAG TTC CTG TGT GAG CGG AAT GAC AAG GTG TTT TTT GCC TCA GTC CGC 1198
257 Lys Phe Leu Cys Glu Arg Asn Asp Lys Val Phe Phe Ala Ser Val Arg 272
1199 TCT GGG GGC AGC AGC CAA GTT TAC TTC ATG ACT CTG AAC CGT AAC TGC 1246
273 Ser Gly Gly Ser Ser Gln Val Tyr Phe Met Thr Leu Asn Arg Asn Cys 288
1247 ATC ATG AAC TGG TGA CGG GGC CCT GGG CTG GGG CTG TCC CAC ACT GGA 1294
289 Ile Met Asn Trp *** 293
1295 CCC AGC TCT CCC CCT GCA GCC AGG CTT CCC GGG CCG CCC CTC TTT CCC 1342
1343 CTC CCT GGG CTT TTG CTT TTA CTG GTT TGA TTT CAC TGG AGC CTG CTG 1390
1391 GGA ACG TGA CCT CTG ACC CCT GAT GCT TTC GTG ATC ACG TGA CCA TCC 1438
1439 TCT TCC CCA ACA TGT CCT CTT CCC AAA ACT GTG CCT GTC CCC AGC TTC 1486
1487 TGG GGA GGG ACA CAG CTT TCC CTT CCC AGG AAT TGA GTG GGC CTA GCC 1534
1535 CCT CCC CCC TTT TCT CCA TTT GAG AGG AGA GTG CTT GGG GCT TGA ACC 1582
1583 CCT TAC CCC ACT CCA GGG GCA GGG ACC ATT TCT TCA TTT TCT GAA AGC 1630
1631 ACT TTA ATG ATT CCC CTT CCC CCA AAC TCC AGG GAA TGG AGG GGG GAC 1678
1679 CCC GCC AGC CAA AAC ATT CCC CCC ATT CCC GAC CCC CAT CTC CTC TTC 1726
1727 TAG CCC ATG CCC TTC CCC GGC GGA GGG AGG GAG CAG GGA GCC CTC ACT 1774
1775 CTC CAC GCC CCT TGC TTG CAT CTG TAT ATA GTG TGA GCA GCA AGT AAC 1822
1823 CCT TCT TCT CCC TTC CCC CTC ACC CCT TCT CAA TGT AGT GGC CTT GGA 1870
1871 TAT CCC TGT TTG TTA ATA AAG ACA ATT TAA CCA GCT CCC AAA AAA AAA 1918
1919 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA A 1964
11.PP1200
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:31) 长度:2146bp
1 AAAAAGGCAT ACTATGATTC AAGAAAAAGT GAAGTCATTA TATCACAGCT
51 TTTAGATTCT AAAGCTGGAG ACTTTAATGC CAGCAAAGGA TGGTGTTTTT
101 TTTTGTTTGT TTGTTTTTTG TTTTTTTTTT TGAAATGGAG TCTTGCTCTG
151 TCATCCAGAC TGGAGTACAG TGGCACTATC TCGGCTCACT GTAACCTCCG
201 CCTCCTGGGT TCAAGCAATT CTCCTGCCCC AGCCTCCCAA GTAGTTGTGA
251 TTACAGGTGT GTGCCACCAT GCCCGGCTAA TTTTTGTATT TCTTTAGTAG
301 AGATGGGGTT TCACCACGTT GGCCAGGCTG CTCTCAAACT CCTGACCTCA
351 GGTGATCCAC CCACCTCAGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA TAGAGTGGAA
401 CCGCCACACC TGGCCGGTTT GGTAATTTTA GAAAAAGGTT TGGCTTTGAA
451 AAAGTCAAGA TAACAGGAGA AACAGCTTCT GCCAGAAAAG AGGCAGTAGG
501 TTCCCAAACT ACATTAAGAA AGTTCCCAAA CTATATTAAG TTGTTGGAGA
551 AAGAGTATCT GCCTGAACAA GTTTTTAATG CAGACAAAAG TGCCCTATTC
601 TGGAAGAAAA AGGTCACAAA GATCTAAGGA AGAAAAGTGA ATACTAGGAC
651 TTAAGGCAGG AGGAGATCGT CTAACTTTAC TGTTTTGCGC AAATGCAGTT
701 GGGTTTATGA TCAGAACTGC CATTACCTAT AAAGCTGCTA ACCCGAGTCT
751 TGAAGGGAAA AAGATAAACA CCAGCTGCCA GTCTTTTGGT TGTACAACAG
801 GAACGCTTAA ACAATATGAA CCCTTTTTCG TGATCGGTTA CATTAATGCT
851 TTGTCCCTGA AATCAGAAAG TATCTTGCTA GTAAGGGACT GCCTTTTAAA
901 GTTGTTGGGT TTTTTTTTTT TTTTTTTTGA GATGGAGTTT CACTCTTTTC
951 GCCTAGGCTG GAGTGCAGTG GCGCACTCTC CACTCACTGC AACCTCCTCC
1001 TCCTGGGTTC TAGCGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCTAGT AGCTGGGATT
1051 ACAGGCGTAC TCCACCATGC CCAACTTAAT TTCTTTGTAT CTTTAGTAGA
1101 GACGGGGTTT CGCCCTGTTG GCCAAGCTGG TCCCAAACTC CTGATCGCAG
1151 GTGATCCGTC CACCTCAGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCACGAGC
1201 CACAGCTCCT GGCCTAAAGT TGTTTTGATA TTGGACAATG CCCCTGGCCA
1251 CCCAGAACCT CATGAGTTCA GCACTGAAGG CGTCGAAGTG ATAAATGCTT
1301 GCTCCCAGAG AAGCATCTCT AATTCAGCCT CTAGGTCAGG GGTCGTAAAG
1351 ACCTTTCAGG CTCATTACAC ATGGTACTCT TTGGAAAAGA TTGTCAGTGC
1401 TATGGAAGAG AACCCCAATA GAGGGAACAT CATATCATTG AAGATACCAT
1451 TATTGTTTAG AAAAAGATGT GAAAGCTCTC AAGCCTGAAA CAACAAATTT
1501 TTGCAGGAGA AAACTCCAGA TGTTGTGTGA CTTCACAGGA TGGAAATCAT
1551 GATAGAGATT GTGGATATGG CAAGAAAGGT TGGGGGTTAA GGATTTCAAG
1601 ATAGGGATCT TGGAGATATT CAGGAGCTAA TAGACACCAA ACCAGAAGAA
1651 TTAACAGAAG ATGACTTGAT GGAGATGACT GCTTCCAAAC CACTGCCAGA
1701 CAGTGAGGAA GAAGACATAG AAAAAGAGAA AAAGCGTGCA AGAAAACAGA
1751 TTGACACTAG ACAGTCTGAC AGAAGGGGTC TGATTATTCA AGACTGCTTT
1801 TCACTTCGTT TGCAACGTGG ACCGTTTGGT GATATGAGAA CTGAAACTAA
1851 AGCAAATGGT GGAAGAAGGA TTGGTACCAT ATGGAAACAA TTTAGAGAAC
1901 AAAAAAGCAG AAAAGTCAGA AATTACATTG TATTTCCATA AAGTTACACC
1951 AAGTATGCCT GCCTCTCCAG CCTCCCCTTT TACCTTCTCC ACCTCTGCTA
2001 ACCCTGAGAC AGCAAGACCA ACCCCTCTTC TACCTATTCA ATGTAAAGAC
2051 AAGGATGAAG ACTTTTATGA TGATCGACTT TCACTTAATG AATAGTAAAT
2101 ATATTTTCTC TTCCTTGTGA TTTTCTGAAA AAAAAAAAAA AAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:32) 长度:110个氨基酸
1 MIRTAITYKA ANPSLEGKKI NTSCQSFGCT TGTLKQYEPF FVIGYINALS
51 LKSESILLVR DCLLKLLGFF FFFFEMEFHS FRLGWSAVAH SPLTATSSSW
101 VLAILLPQPP
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:33)
克隆号和蛋白名称:PP1200
起始编码子:707 ATG 终止编码子:1039 TAG
蛋白质分子量:12302.74
1 A AAA AGG CAT ACT ATG ATT CAA GAA AAA GTG AAG TCA TTA TAT CAC 46
47 AGC TTT TAG ATT CTA AAG CTG GAG ACT TTA ATG CCA GCA AAG GAT GGT 94
95 GTT TTT TTT TGT TTG TTT GTT TTT TGT TTT TTT TTT TGA AAT GGA GTC 142
143 TTG CTC TGT CAT CCA GAC TGG AGT ACA GTG GCA CTA TCT CGG CTC ACT 190
191 GTA ACC TCC GCC TCC TGG GTT CAA GCA ATT CTC CTG CCC CAG CCT CCC 238
239 AAG TAG TTG TGA TTA CAG GTG TGT GCC ACC ATG CCC GGC TAA TTT TTG 286
287 TAT TTC TTT AGT AGA GAT GGG GTT TCA CCA CGT TGG CCA GGC TGC TCT 334
335 CAA ACT CCT GAC CTC AGG TGA TCC ACC CAC CTC AGC CTC CCA AAG TGC 382
383 TGG GAT TAT AGA GTG GAA CCG CCA CAC CTG GCC GGT TTG GTA ATT TTA 430
431 GAA AAA GGT TTG GCT TTG AAA AAG TCA AGA TAA CAG GAG AAA CAG CTT 478
479 CTG CCA GAA AAG AGG CAG TAG GTT CCC AAA CTA CAT TAA GAA AGT TCC 526
527 CAA ACT ATA TTA AGT TGT TGG AGA AAG AGT ATC TGC CTG AAC AAG TTT 574
575 TTA ATG CAG ACA AAA GTG CCC TAT TCT GGA AGA AAA AGG TCA CAA AGA 622
623 TCT AAG GAA GAA AAG TGA ATA CTA GGA CTT AAG GCA GGA GGA GAT CGT 670
671 CTA ACT TTA CTG TTT TGC GCA AAT GCA GTT GGG TTT ATG ATC AGA ACT 718
1 Met Ile Arg Thr 4
719 GCC ATT ACC TAT AAA GCT GCT AAC CCG AGT CTT GAA GGG AAA AAG ATA 766
5 Ala Ile Thr Tyr Lys Ala Ala Asn Pro Ser Leu Glu Gly Lys Lys Ile 20
767 AAC ACC AGC TGC CAG TCT TTT GGT TGT ACA ACA GGA ACG CTT AAA CAA 814
21 Asn Thr Ser Cys Gln Ser Phe Gly Cys Thr Thr Gly Thr Leu Lys Gln 36
815 TAT GAA CCC TTT TTC GTG ATC GGT TAC ATT AAT GCT TTG TCC CTG AAA 862
37 Tyr Glu Pro Phe Phe Val Ile Gly Tyr Ile Asn Ala Leu Ser Leu Lys 52
863 TCA GAA AGT ATC TTG CTA GTA AGG GAC TGC CTT TTA AAG TTG TTG GGT 910
53 Ser Glu Ser Ile Leu Leu Val Arg Asp Cys Leu Leu Lys Leu Leu Gly 68
911 TTT TTT TTT TTT TTT TTT GAG ATG GAG TTT CAC TCT TTT CGC CTA GGC 958
69 Phe Phe Phe Phe Phe Phe Glu Met Glu Phe His Ser Phe Arg Leu Gly 84
959 TGG AGT GCA GTG GCG CAC TCT CCA CTC ACT GCA ACC TCC TCC TCC TGG 1006
85 Trp Ser Ala Val Ala His Ser Pro Leu Thr Ala Thr Ser Ser Ser Trp 1001007 GTT CTA GCG ATT CTC CTG CCT CAG CCT CCC TAG TAG CTG GGA TTA CAG 1054
101 Val Leu Ala Ile Leu Leu Pro Gln Pro Pro *** 111
1055 GCG TAC TCC ACC ATG CCC AAC TTA ATT TCT TTG TAT CTT TAG TAG AGA 1102
1103 CGG GGT TTC GCC CTG TTG GCC AAG CTG GTC CCA AAC TCC TGA TCG CAG 1150
1151 GTG ATC CGT CCA CCT CAG CCT CCC AAA GTG CTG GGA TTA CAG GCA CGA 1198
1199 GCC ACA GCT CCT GGC CTA AAG TTG TTT TGA TAT TGG ACA ATG CCC CTG 1246
1247 GCC ACC CAG AAC CTC ATG AGT TCA GCA CTG AAG GCG TCG AAG TGA TAA 1294
1295 ATG CTT GCT CCC AGA GAA GCA TCT CTA ATT CAG CCT CTA GGT CAG GGG 1342
1343 TCG TAA AGA CCT TTC AGG CTC ATT ACA CAT GGT ACT CTT TGG AAA AGA 1390
1391 TTG TCA GTG CTA TGG AAG AGA ACC CCA ATA GAG GGA ACA TCA TAT CAT 1438
1439 TGA AGA TAC CAT TAT TGT TTA GAA AAA GAT GTG AAA GCT CTC AAG CCT 1486
1487 GAA ACA ACA AAT TTT TGC AGG AGA AAA CTC CAG ATG TTG TGT GAC TTC 1534
1535 ACA GGA TGG AAA TCA TGA TAG AGA TTG TGG ATA TGG CAA GAA AGG TTG 1582
1583 GGG GTT AAG GAT TTC AAG ATA GGG ATC TTG GAG ATA TTC AGG AGC TAA 1630
1631 TAG ACA CCA AAC CAG AAG AAT TAA CAG AAG ATG ACT TGA TGG AGA TGA 1678
1679 CTG CTT CCA AAC CAC TGC CAG ACA GTG AGG AAG AAG ACA TAG AAA AAG 1726
1727 AGA AAA AGC GTG CAA GAA AAC AGA TTG ACA CTA GAC AGT CTG ACA GAA 1774
1775 GGG GTC TGA TTA TTC AAG ACT GCT TTT CAC TTC GTT TGC AAC GTG GAC 1822
1823 CGT TTG GTG ATA TGA GAA CTG AAA CTA AAG CAA ATG GTG GAA GAA GGA 1870
1871 TTG GTA CCA TAT GGA AAC AAT TTA GAG AAC AAA AAA GCA GAA AAG TCA 1918
1919 GAA ATT ACA TTG TAT TTC CAT AAA GTT ACA CCA AGT ATG CCT GCC TCT 1966
1967 CCA GCC TCC CCT TTT ACC TTC TCC ACC TCT GCT AAC CCT GAG ACA GCA 2014
2015 AGA CCA ACC CCT CTT CTA CCT ATT CAA TGT AAA GAC AAG GAT GAA GAC 2062
2063 TTT TAT GAT GAT CGA CTT TCA CTT AAT GAA TAG TAA ATA TAT TTT CTC 2110
2111 TTC CTT GTG ATT TTC TGA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 2146
12.PP1226
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:34) 长度:1588bp
1 AGCTTGCAAG CATGCTCCGC TGGACCCGAG CCTGGAGGCT CCCGCGTGAG
51 GGACTCGGCC CCCACGGCCC TAGCTTCGCG AGGGTGCCTG TCGCACCCAG
101 CAGCAGCAGC GGCGGCCGAG GGGGCGCCGA GCCGAGGCCG CTTCCGCTTT
151 CCTACAGGCT TCTGGACGGG GAGGCAGCCC TCCCGGCCGT CGTCTTTTTG
201 CACGGGCTCT TCGGCAGCAA AACTAACTTC AACTCCATCG CCAAGATCTT
251 GGCCCAGCAG ACAGGCCGTG CTGACGGTGG ATGCTCGTAA CCACGGTGAC
301 AGCCCCCACA GCCCAGACAT GAGCTACGAG ATCATGAGCC AGGACCTGCA
351 GGACCTTCTG CCCCAGCTGG GCCTGGTGCC CTGCGTCGTC GTTGGCCACA
401 GCATGGGAGG AAAGACAGCC ATGCTGCTGG CACTACAGAG GGTGAGCCGC
451 CCATGTCTGG GGCCTCCTCC CATTCAGTAT ATACCCTGAG GGCCCTGCAG
501 GCAACCTGGG ACTCACATGA TCGTTGGATG ACCAAGTTCA GGCTCCAGGA
551 GCCATGCCTG AGACTCCCTA TGTCTGCCTA AGACTGGTCC CAGTTCGGTT
601 CTCTCCCACA GCCAGAGCTG GTGGAACGTC TCATTGCTGT AGATATCAGC
651 CCAGTGGAAA GCACAGGTGT CTCCCACTTT GCAACCTATG TGGCAGCCAT
701 GAGGGCCATC AACATCGCAG ATGAGCTGCC CCGCTCCCGT GCCCGAAAAC
751 TGGCGGATGA ACAGCTCAGT TCTGTCATCC AGGACATGGC CGTGCGGCAG
801 CACCTGCTCA CTAACCTGGT AGAGGTAGAC GGGCGCTTCG TGTGGAGGGT
851 GAACTTGGAT GCCCTGACCC AGCACCTAGA CAAGATCTTG GCTTTCCCAC
901 AGAGGCAGGA GTCCTACCTC GGGCCAACAC TCTTTCTCCT TGGTGGAAAC
951 TCCCAGTTCG TGCATCCCAG CCACCACCCT GAGATTATGC GGCTCTTCCC
1001 TCGGGCCCAG ATGCAGACGG TGCCGAACGC TGGCCACTGG ATCCACGCTG
1051 ACCGCCCACA GGACTTCATA GCTGCCATCC GAGGCTTCCT GGTCTAAGAG
1101 TTGCTGGCAA GAAGATGGCC GGGCGTGGTG GCTCATGCCT GTAATTCCAG
1151 CACTTTGGGA GGCTAAGGCG GGAGGATGAC TTGAGGCCAG GAGTTGGAGA
1201 CCAGCCTGGC CAACATGGTG AAACCCTGTC TCTACTAAAA ATACAAAAAT
1251 TAGCCTGGCG TGGTGGTGCA CACCTGTAAT CCCAGCTACT CTGGAGGCTG
1301 AGGCAGGAGA ATCACTTGAA CCCTGGAGGC AGAGGTTGCA ATGAGCCGAG
1351 ATCACACCAC TACACTCCAG CCTAGGCAAC AGAGCAAGAC TCTGTCTCAA
1401 AAAAAACAAA ACAAAAAGGA GGCACAAAAC CCCAGGCTTC AAGTCTCTGC
1451 AGCCTGCTCC ACATTTGGGC ACAGAAGGAC TCAGACAGGC ACTGTGTGGG
1501 CACGAGGTTT TACAGGGGTG GTCAGACCTC AGGCTTTAAT GAATAAAGAC
1551 ACTACTCCCC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:35)长度:132个氨基酸
1 MRAINIADEL PRSRARKLAD EQLSSVIQDM AVRQHLLTNL VEVDGRFVWR
51 VNLDALTQHL DKILAFPQRQ ESYLGPTLFL LGGNSQFVHP SHHPEIMRLF
101 PRAQMQTVPN AGHWIHADRP QDFIAAIRGF LV
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:36)
克隆号和蛋白名称:PP1226
起始编码子:699 ATG 终止编码子:1097 TAA
蛋白质分子量:15123.62
1 AG CTT GCA AGC ATG CTC CGC TGG ACC CGA GCC TGG AGG CTC CCG CGT 47
48 GAG GGA CTC GGC CCC CAC GGC CCT AGC TTC GCG AGG GTG CCT GTC GCA 95
96 CCC AGC AGC AGC AGC GGC GGC CGA GGG GGC GCC GAG CCG AGG CCG CTT 143
144 CCG CTT TCC TAC AGG CTT CTG GAC GGG GAG GCA GCC CTC CCG GCC GTC 191
192 GTC TTT TTG CAC GGG CTC TTC GGC AGC AAA ACT AAC TTC AAC TCC ATC 239
240 GCC AAG ATC TTG GCC CAG CAG ACA GGC CGT GCT GAC GGT GGA TGC TCG 287
288 TAA CCA CGG TGA CAG CCC CCA CAG CCC AGA CAT GAG CTA CGA GAT CAT 335
336 GAG CCA GGA CCT GCA GGA CCT TCT GCC CCA GCT GGG CCT GGT GCC CTG 383
384 CGT CGT CGT TGG CCA CAG CAT GGG AGG AAA GAC AGC CAT GCT GCT GGC 431
432 ACT ACA GAG GGT GAG CCG CCC ATG TCT GGG GCC TCC TCC CAT TCA GTA 479
480 TAT ACC CTG AGG GCC CTG CAG GCA ACC TGG GAC TCA CAT GAT CGT TGG 527
528 ATG ACC AAG TTC AGG CTC CAG GAG CCA TGC CTG AGA CTC CCT ATG TCT 575
576 GCC TAA GAC TGG TCC CAG TTC GGT TCT CTC CCA CAG CCA GAG CTG GTG 623
624 GAA CGT CTC ATT GCT GTA GAT ATC AGC CCA GTG GAA AGC ACA GGT GTC 671
672 TCC CAC TTT GCA ACC TAT GTG GCA GCC ATG AGG GCC ATC AAC ATC GCA 719
1 Met Arg Ala Ile Asn Ile Ala 7
720 GAT GAG CTG CCC CGC TCC CGT GCC CGA AAA CTG GCG GAT GAA CAG CTC 767
8 Asp Glu Leu Pro Arg Ser Arg Ala Arg Lys Leu Ala Asp Glu Gln Leu 23
768 AGT TCT GTC ATC CAG GAC ATG GCC GTG CGG CAG CAC CTG CTC ACT AAC 815
24 Ser Ser Val Ile Gln Asp Met Ala Val Arg Gln His Leu Leu Thr Asn 39
816 CTG GTA GAG GTA GAC GGG CGC TTC GTG TGG AGG GTG AAC TTG GAT GCC 863
40 Leu Val Glu Val Asp Gly Arg Phe Val Trp Arg Val Asn Leu Asp Ala 55
864 CTG ACC CAG CAC CTA GAC AAG ATC TTG GCT TTC CCA CAG AGG CAG GAG 911
56 Leu Thr Gln His Leu Asp Lys Ile Leu Ala Phe Pro Gln Arg Gln Glu 71
912 TCC TAC CTC GGG CCA ACA CTC TTT CTC CTT GGT GGA AAC TCC CAG TTC 959
72 Ser Tyr Leu Gly Pro Thr Leu Phe Leu Leu Gly Gly Asn Ser Gln Phe 87
960 GTG CAT CCC AGC CAC CAC CCT GAG ATT ATG CGG CTC TTC CCT CGG GCC 1007
88 Val His Pro Ser His His Pro Glu Ile Met Arg Leu Phe Pro Arg Ala 103
1008 CAG ATG CAG ACG GTG CCG AAC GCT GGC CAC TGG ATC CAC GCT GAC CGC 1055
104 Gln Met Gln Thr Val Pro Asn Ala Gly His Trp Ile His Ala Asp Arg 119
1056 CCA CAG GAC TTC ATA GCT GCC ATC CGA GGC TTC CTG GTC TAA GAG TTG 1103
120 Pro Gln Asp Phe Ile Ala Ala Ile Arg Gly Phe Leu Val *** 133
1104 CTG GCA AGA AGA TGG CCG GGC GTG GTG GCT CAT GCC TGT AAT TCC AGC 1151
1152 ACT TTG GGA GGC TAA GGC GGG AGG ATG ACT TGA GGC CAG GAG TTG GAG 1199
1200 ACC AGC CTG GCC AAC ATG GTG AAA CCC TGT CTC TAC TAA AAA TAC AAA 1247
1248 AAT TAG CCT GGC GTG GTG GTG CAC ACC TGT AAT CCC AGC TAC TCT GGA 1295
1296 GGC TGA GGC AGG AGA ATC ACT TGA ACC CTG GAG GCA GAG GTT GCA ATG 1343
1344 AGC CGA GAT CAC ACC ACT ACA CTC CAG CCT AGG CAA CAG AGC AAG ACT 1391
1392 CTG TCT CAA AAA AAA CAA AAC AAA AAG GAG GCA CAA AAC CCC AGG CTT 1439
1440 CAA GTC TCT GCA GCC TGC TCC ACA TTT GGG CAC AGA AGG ACT CAG ACA 1487
1488 GGC ACT GTG TGG GCA CGA GGT TTT ACA GGG GTG GTC AGA CCT CAG GCT 1535
1536 TTA ATG AAT AAA GAC ACT ACT CCC CAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1583
1584 AAA AA 1588
D:Blastp结果
Query=PP1226[基因=PP1226](132个氨基酸)
>SP_IN:O45707 O45707 caenorhabditis elegans.r05d7.4 protein.5/1999
长度=299
分值=110 bits(272),预计值=6e-24
相同性=52/121(42%),相似性=78/121(63%),缺口=3/121(2%)
Query:14 RARKLADEQLSSVIQDMAVRQHLLTNLV---EVDGRFVWRVNLDALTQHLDKILAFPQRQ 70
R RK + L S I D+A+RQ +LTNL E +G+ W++N++ + H+D+IL +
Sbjct:177 RTRKEILKDLESAIPDLAMRQFILTNLQPSSENEGQMEWKININTIDSHVDEILGYTLPV 236
Query:71 ESYLGPTLFLLGGNSQFVHPSHHPEIMRLFPRAQMQTVPNAGHWIHADRPQDFIAAIRGF 130
S+ GPTLFL G NS +V H P+I LFP+ Q +P++GHW+HA++PQ FI ++ F
Sbjct:237 GSFRGPTLFLHGANSGYVPDDHKPDIKCLFPQVQFDAIPDSGHWVHAEKPQLFINSVYKF 296
Query:131 L 131
L
Sbjct:297 L 297
>SP_FUN:O94437 O94437 schizosaccharomyces pombe(fission yeast).
putative abhydrolase.5/1999
长度=270
分值=61.3 bits(146),预计值=3e-09
相同性=36/118(30%),相似性=65/118(54%),缺口=6/118(5%)
Query:19 ADEQLSSVIQDMAVRQHLLTNLVEVDGR---FVWRVNLDALTQHLDKILAFPQRQES--Y 73
AD+ +S+V +D+ VR LL+NL + F +RV ++ +++ L I FP Y
Sbjct:152 ADKMMSTVEKDILVRSFLLSNLKKDSNNSNTFKFRVPIELISKSLKTIEGFPASLNDLVY 211
Query:74 LGPTLFLLGGNSQFVHPSHHPEIMRLFPRAQMQTVPNAGHWIHADRPQDFIAAIRGFL 131
PTL + + F+ S P + FP+ ++ ++ + GHW+H ++P++F +I FL
Sbjct:212 DSPTLVIRALKAPFIPDSALPVFKKFFPKYELVSL-DCGHWVHFEKPKEFSESIINFL 268
>SW:YG1L_YEAST P53219 saccharomyces cerevisiae(baker′s yeast).
hypothetical 38.5 kd protein in erv1-gls2 intergenic
region.11/1997
长度=342
分值=45.7 bits(106),预计值=2e-04
相同性=42/132(31%),相似性=66/132(49%),缺口=15/132(11%)
Query:14 RARKLADEQLSSVIQ-DMAVRQHLLTNL--VEVDGR-------FVWRVNLDALTQHLDK- 62
R K ADE L+ I + VR+ LLT L V++D F R+ L L + K
Sbjct:207 RTLKQADEHLAERIGGNELVRRFLLTALKKVKMDNSSSVSSYTFEERIPLATLKDAIVKG 266
Query:63 -ILAFP--QRQESYLGPTLFLLGGNSQFVHPSHHPEIMRLFPRAQMQTVPNAGHWIHADR 119
I A+P +E + P LF+ S +V + P I FPR + + + +AGHW++A++
Sbjct:267 EIAAWPLDPARERWTRPALFIRATQSHYVVDEYLPIIGAFFPRFETRDI-DAGHWVNAEK 325
Query:120 PQDFIAAIRGFL 131
P + +I F+
Sbjct:326 PGECAESIVDFV 337
13.PP1292
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:37) 长度:966bp
1 GATGTCTGGG ATGGCACGTG GCCCGACCTC CACAAGCTCC CTCATGCTTC
51 CTGTCCCCCG CTTACACGAC AACGGGCCAG ACCACGGGAA GGACGGTGTT
101 TGTGTCTGAG GGAGCTGCTG GCCACAGTGA ACACCCACGT TTATTCCTGC
151 CTGCTCCGGC CAGGACTGAA CCCCTTCTCC ACACCTGAAC AGTTGGCTCA
201 AGGGCCACCA GAAGCATTTC TTTATTATTA TTATTTTTTA ACCTGGACAT
251 GCATTAAAGG GTCTATTAGC TTTCTTTCCG TCTGTCTCAA CAGCTGAGAT
301 GGGGCCGCCA AGGAGTGCCT TCCTTTTGCT CCCTCCTAGC TGGGAGTGAC
351 GGGTGGGAGT GTGTGTGCCC AGGTGGGGGT GTCTCCTGGC TGGGAAGGAG
401 GGAAAGGGAG GGAGAGTTTT GCGGGGGTTG GCAGTGAAGA GCAGGCTGGA
451 AAGGAGATGG CTAATAGCTG TTTAATGGAA ACCTGCTGGG CTGGAGGGAG
501 TTAGGCTGAA TTTCCCGACT TCCTCTGCCA GTTATTGACA CAGCTCTCTT
551 TGTAAGAGAG GAAAGAAACT AAACCCACCC AAGGGATGAT TTCAGGGGGA
601 GAGGTGGAGG GCAGATGTCC TGGGCAAACC GGGCCCCTTT GCCCACACAC
651 CTCACTTGAT CCTTTTGCCA AACTTGTCAA ACTCAGGGGA ACTGGCTTCC
701 CAGTTGCCCC TTTGCCATAT TCCAAGTCCC CCTCAGACTT CATGTCTCTG
751 CTCATCAGCA CTGTCCCAGG ATCCTGGAGA GGGAGAACCC CTGGCCCCAG
801 GGGAAAGAGG GGGGGGTCTC CCGTTTCCTG TGCCTGCACC AGCCCTGCCC
851 CCATTGCGTC TGCACACCCC TGCGTGTAAC TGCATTCCAA CCACTAATAA
901 AGTGCCTATT GTACAGGTCC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
951 AAAAAAAAAA AAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:38) 长度:97个氨基酸
1 MISGGEVEGR CPGQTGPLCP HTSLDPFAKL VKLRGTGFPV APLPYSKSPS
51 DFMSLLISTV PGSWRGRTPG PRGKRGGSPV SCACTSPAPI ASAHPCV
C.核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:39)
克隆号和蛋白名称:PP1292
起始编码子:586 ATG终止编码子:879 TAA
蛋白质分子量:9929.97
1 GAT GTC TGG GAT GGC ACG TGG CCC GAC CTC CAC AAG CTC CCT CAT GCT 48
49 TCC TGT CCC CCG CTT ACA CGA CAA CGG GCC AGA CCA CGG GAA GGA CGG 96
97 TGT TTG TGT CTG AGG GAG CTG CTG GCC ACA GTG AAC ACC CAC GTT TAT 144
145 TCC TGC CTG CTC CGG CCA GGA CTG AAC CCC TTC TCC ACA CCT GAA CAG 192
193 TTG GCT CAA GGG CCA CCA GAA GCA TTT CTT TAT TAT TAT TAT TTT TTA 240
241 ACC TGG ACA TGC ATT AAA GGG TCT ATT AGC TTT CTT TCC GTC TGT CTC 288
289 AAC AGC TGA GAT GGG GCC GCC AAG GAG TGC CTT CCT TTT GCT CCC TCC 336
337 TAG CTG GGA GTG ACG GGT GGG AGT GTG TGT GCC CAG GTG GGG GTG TCT 384
385 CCT GGC TGG GAA GGA GGG AAA GGG AGG GAG AGT TTT GCG GGG GTT GGC 432
433 AGT GAA GAG CAG GCT GGA AAG GAG ATG GCT AAT AGC TGT TTA ATG GAA 480
481 ACC TGC TGG GCT GGA GGG AGT TAG GCT GAA TTT CCC GAC TTC CTC TGC 528
529 CAG TTA TTG ACA CAG CTC TCT TTG TAA GAG AGG AAA GAA ACT AAA CCC 576
577 ACC CAA GGG ATG ATT TCA GGG GGA GAG GTG GAG GGC AGA TGT CCT GGG 624
1 Met Ile Ser Gly Gly Glu Val Glu Gly Arg Cys Pro Gly 13
625 CAA ACC GGG CCC CTT TGC CCA CAC ACC TCA CTT GAT CCT TTT GCC AAA 672
14 Gln Thr Gly Pro Leu Cys Pro His Thr Ser Leu Asp Pro Phe Ala Lys 29
673 CTT GTC AAA CTC AGG GGA ACT GGC TTC CCA GTT GCC CCT TTG CCA TAT 720
30 Leu Val Lys Leu Arg Gly Thr Gly Phe Pro Val Ala Pro Leu Pro Tyr 45
721 TCC AAG TCC CCC TCA GAC TTC ATG TCT CTG CTC ATC AGC ACT GTC CCA 768
46 Ser Lys Ser Pro Ser Asp Phe Met Ser Leu Leu Ile Ser Thr Val Pro 61
769 GGA TCC TGG AGA GGG AGA ACC CCT GGC CCC AGG GGA AAG AGG GGG GGG 816
62 Gly Ser Trp Arg Gly Arg Thr Pro Gly Pro Arg Gly Lys Arg Gly Gly 77
817 TCT CCC GTT TCC TGT GCC TGC ACC AGC CCT GCC CCC ATT GCG TCT GCA 864
78 Ser Pro Val Ser Cys Ala Cys Thr Ser Pro Ala Pro Ile Ala Ser Ala 93
865 CAC CCC TGC GTG TAA CTG CAT TCC AAC CAC TAA TAA AGT GCC TAT TGT 912
94 His Pro Cys Val *** 98
913 ACA GGT CCA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 960
961 AAA AAA 966
14.PP1396
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:40)长度:2070bp
1 GGACCCCAGG CACCCTCCAG CGTCAGGTGC GGATCCCCCA GATGCCCGCC
51 CCGCCCCATC CCAGGACACC CCTGGGGTCT CCAGCTGCGT ACTGGAAACG
101 AGTGGGACAC TCTGCATGCT CAGCGTCCTG CGGGAAAGGT GTCTGGCGCC
151 CCATTTTCCT CTGCATCTCC CGTGAGTCGG GAGAGGAACT GGATGAACGC
201 AGCTGTGCCG CGGGTGCCAG GCCCCCAGCC TCCCCTGAAC CCTGCACGGC
251 ACCCCATGCC CCCCATACTG GGAGGCTGGC GAGTGGACAT CCTGCAGCCG
301 CTCCTGTGGC CCCGGCACCC AGCACCGCCA GCTGCAGTGC CGGCAGGAAT
351 TTGGGGGGGG TGGCTCCTCG GTGCCCCCGG AGCGCTGTGG ACATCTCCCC
401 CGGCCCAACA TCACCCAGTC TTGCCAGCTG CGCCTCTGTG GCCATTGGGA
451 AGTTGGCTCT CCTTGGAGCC AGTGCTCCGT GCGGTGCGGC CGGGGCCAGA
501 GAAGCCGGCA GGTTCGCTGT GTTGGGAACA ACGGTGATGA AGTGAGCGAG
551 CAGGAGTGTG CGTCAGGCCC CCCACAGCCC CCCAGCAGAG AGGCCTGTGA
601 CATGGGGCCC TGTACTACTG CCTGGTTCCA CAGCGACTGG AGCTCCAAGT
651 GCTCAGCCGA GTGTGGGACG GGAATCCAGC GGCGCTCTGT GGTCTGCCTT
701 GGGAGTGGGG CAGCCCTCGG GCCAGGCCAG GGGGAAGCAG GAGCAGGAAC
751 TGGGCAGAGC TGTCCAACAG GAAGCCGGCC CCCTGACATG CGCGCCTGCA
801 GCCTGGGGCC CTGTGAGAGA ACTTGGCGCT GGTACACAGG GCCCTGGGGT
851 GAGTGCTCCT CCGAATGTGG CTCTGGCACA CAGCGTAGAG ACATCATCTG
901 TGTATCCAAA CTGGGGACGG AGTTCAACGT GACTTCTCCG AGCAACTGTT
951 CTCACCTCCC CAGGCCCCCT GCCCTGCAGC CCTGTCAAGG GCAGGCCTGC
1001 CAGGACCGAT GGTTTTCCAC GCCCTGGAGC CCATGTTCTC GCTCCTGCCA
1051 AGGGGGAACG CAGACACGGG AGGTCCAGTG CCTGAGCACC AACCAGACCC
1101 TCAGCACCCG ATGCCCTCCT CAACTGCGGC CCTCCAGGAA GCGCCCCTGT
1151 AACAGCCAAC CCTGCAGCCA GCGCCCTGAT GATCAATGCA AGGACAGCTC
1201 TCCACATTGC CCCCTGGTGG TACAGGCCCG GCTCTGCGTC TACCCCTACT
1251 ACACAGCCAC CTGTTGCCGC TCTTGCGCAC ATGTCCTGGA GCGGTCTCCC
1301 CAGGATCCCT CCTGAAAGGG GTCCGGGGCA CCTTCACGGT TTTCTGTGCC
1351 ACCATCGGTC ACCCATTGAT CGGCCCACTC TGAACCCCCT GGCTCTCCAG
1401 CCTGTCCCAG TCTCAGCAGG GATGTCCTCC AGGTGACAGA GGGTGGCAAG
1451 GTGACTGACA CAAAGTGACT TTCAGGGCTG TGGTCAGGCC CATGTGGTGG
1501 TGTGATGGGT GTGTGCACAT ATGCCTCAGG TGTGCTTTTG GGACTGCATG
1551 GATATGTGTG TGCTCAAACG TGTATCACTT TTCAAAAAGA GGTTACACAG
1601 ACTGAGAAGG ACAAGACCTG TTTCCTTGAG ACTTTCCTAG GTGGAAAGGA
1651 AAGCAAGTCT GCAGTTCCTT GCTAATCTGA GCTACTTAGA GTGTGGTCTC
1701 CCCACCAACT CCAGTTTTGT GCCCTAAGCC TCATTTCTCA TGTTCAGACC
1751 TCACATCTTT TAAGCCGCCC TGTGTCTCTG ACCCCTTCTC ATTTGCCTAG
1801 TATCTCTGCC CCTGCCTCCC TAATTAGCTA GGGCTGGGGT CAGCCACTGC
1851 CAATCCTGCC TTACTCAGGA AGGCAGGAGG AAAGAGACTG CCTCTCCAGA
1901 GCAAGGCCCA GCTGGGCAGA GGGTGAAAAA GAGAAATGTG AGCATCCGCT
1951 CCCCCACCAC CCCGCCCAGC CCCTAGCCCC ACTCCCTGCC TCCTGAAATG
2001 GTTCCCACCC AGAACTAATT TATTTTTTAT TAAAGATGGT CATGACAAAT
2051 GAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:41) 长度:237个氨基酸
1 MGPCTTAWFH SDWSSKCSAE CGTGIQRRSV VCLGSGAALG PGQGEAGAGT
51 GQSCPTGSRP PDMRACSLGP CERTWRWYTG PWGECSSECG SGTQRRDIIC
101 VSKLGTEFNV TSPSNCSHLP RPPALQPCQG QACQDRWFST PWSPCSRSCQ
151 GGTQTREVQC LSTNQTLSTR CPPQLRPSRK RPCNSQPCSQ RPDDQCKDSS
201 PHCPLVVQAR LCVYPYYTAT CCRSCAHVLE RSPQDPS
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:42)
克隆号和蛋白名称:PP1396
起始编码子:602 ATG 终止编码子:1315 TGA
蛋白质分子量:25657.55
1 G GAC CCC AGG CAC CCT CCA GCG TCA GGT GCG GAT CCC CCA GAT GCC 46
47 CGC CCC GCC CCA TCC CAG GAC ACC CCT GGG GTC TCC AGC TGC GTA CTG 94
95 GAA ACG AGT GGG ACA CTC TGC ATG CTC AGC GTC CTG CGG GAA AGG TGT 142
143 CTG GCG CCC CAT TTT CCT CTG CAT CTC CCG TGA GTC GGG AGA GGA ACT 190
191 GGA TGA ACG CAG CTG TGC CGC GGG TGC CAG GCC CCC AGC CTC CCC TGA 238
239 ACC CTG CAC GGC ACC CCA TGC CCC CCA TAC TGG GAG GCT GGC GAG TGG 286
287 ACA TCC TGC AGC CGC TCC TGT GGC CCC GGC ACC CAG CAC CGC CAG CTG 334
335 CAG TGC CGG CAG GAA TTT GGG GGG GGT GGC TCC TCG GTG CCC CCG GAG 382
383 CGC TGT GGA CAT CTC CCC CGG CCC AAC ATC ACC CAG TCT TGC CAG CTG 430
431 CGC CTC TGT GGC CAT TGG GAA GTT GGC TCT CCT TGG AGC CAG TGC TCC 478
479 GTG CGG TGC GGC CGG GGC CAG AGA AGC CGG CAG GTT CGC TGT GTT GGG 526
527 AAC AAC GGT GAT GAA GTG AGC GAG CAG GAG TGT GCG TCA GGC CCC CCA 574
575 CAG CCC CCC AGC AGA GAG GCC TGT GAC ATG GGG CCC TGT ACT ACT GCC 622
1 Met Gly Pro Cys Thr Thr Ala 7
623 TGG TTC CAC AGC GAC TGG AGC TCC AAG TGC TCA GCC GAG TGT GGG ACG 670
8 Trp Phe His Ser Asp Trp Ser Ser Lys Cys Ser Ala Glu Cys Gly Thr 23
671 GGA ATC CAG CGG CGC TCT GTG GTC TGC CTT GGG AGT GGG GCA GCC CTC 718
24 Gly Ile Gln Arg Arg Ser Val Val Cys Leu Gly Ser Gly Ala Ala Leu 39
719 GGG CCA GGC CAG GGG GAA GCA GGA GCA GGA ACT GGG CAG AGC TGT CCA 766
40 Gly Pro Gly Gln Gly Glu Ala Gly Ala Gly Thr Gly Gln Ser Cys Pro 55
767 ACA GGA AGC CGG CCC CCT GAC ATG CGC GCC TGC AGC CTG GGG CCC TGT 814
56 Thr Gly Ser Arg Pro Pro Asp Met Arg Ala Cys Ser Leu Gly Pro Cys 71
815 GAG AGA ACT TGG CGC TGG TAC ACA GGG CCC TGG GGT GAG TGC TCC TCC 862
72 Glu Arg Thr Trp Arg Trp Tyr Thr Gly Pro Trp Gly Glu Cys Ser Ser 87
863 GAA TGT GGC TCT GGC ACA CAG CGT AGA GAC ATC ATC TGT GTA TCC AAA 910
88 Glu Cys Gly Ser Gly Thr Gln Arg Arg Asp Ile Ile Cys Val Ser Lys 103
911 CTG GGG ACG GAG TTC AAC GTG ACT TCT CCG AGC AAC TGT TCT CAC CTC 958
104 Leu Gly Thr Glu Phe Asn Val Thr Ser Pro Ser Asn Cys Ser His Leu 119
959 CCC AGG CCC CCT GCC CTG CAG CCC TGT CAA GGG CAG GCC TGC CAG GAC 1006
120 Pro Arg Pro Pro Ala Leu Gln Pro Cys Gln Gly Gln Ala Cys Gln Asp 135
1007 CGA TGG TTT TCC ACG CCC TGG AGC CCA TGT TCT CGC TCC TGC CAA GGG 1054
136 Arg Trp Phe Ser Thr Pro Trp Ser Pro Cys Ser Arg Ser Cys Gln Gly 151
1055 GGA ACG CAG ACA CGG GAG GTC CAG TGC CTG AGC ACC AAC CAG ACC CTC 1102
152 Gly Thr Gln Thr Arg Glu Val Gln Cys Leu Ser Thr Asn Gln Thr Leu 167
1103 AGC ACC CGA TGC CCT CCT CAA CTG CGG CCC TCC AGG AAG CGC CCC TGT 1150
168 Ser Thr Arg Cys Pro Pro Gln Leu Arg Pro Ser Arg Lys Arg Pro Cys 183
1151 AAC AGC CAA CCC TGC AGC CAG CGC CCT GAT GAT CAA TGC AAG GAC AGC 1198
184 Asn Ser Gln Pro Cys Ser Gln Arg Pro Asp Asp Gln Cys Lys Asp Ser 199
1199 TCT CCA CAT TGC CCC CTG GTG GTA CAG GCC CGG CTC TGC GTC TAC CCC 1246
200 Ser Pro His Cys Pro Leu Val Val Gln Ala Arg Leu Cys Val Tyr Pro 215
1247 TAC TAC ACA GCC ACC TGT TGC CGC TCT TGC GCA CAT GTC CTG GAG CGG 1294
216 Tyr Tyr Thr Ala Thr Cys Cys Arg Ser Cys Ala His Val Leu Glu Arg 231
1295 TCT CCC CAG GAT CCC TCC TGA AAG GGG TCC GGG GCA CCT TCA CGG TTT 1342
232 Ser Pro Gln Asp Pro Ser *** 238
1343 TCT GTG CCA CCA TCG GTC ACC CAT TGA TCG GCC CAC TCT GAACCC CCT 1390
1391 GGC TCT CCA GCC TGT CCC AGT CTC AGC AGG GAT GTC CTC CAG GTG ACA 1438
1439 GAG GGT GGC AAG GTG ACT GAC ACA AAG TGA CTT TCA GGG CTG TGG TCA 1486
1487 GGC CCA TGT GGT GGT GTG ATG GGT GTG TGC ACA TAT GCC TCA GGT GTG 1534
1535 CTT TTG GGA CTG CAT GGA TAT GTG TGT GCT CAA ACG TGT ATC ACT TTT 1582
1583 CAA AAA GAG GTT ACA CAG ACT GAG AAG GAC AAG ACC TGT TTC CTT GAG 1630
1631 ACT TTC CTA GGT GGA AAG GAA AGC AAG TCT GCA GTT CCT TGC TAA TCT 1678
1679 GAG CTA CTT AGA GTG TGG TCT CCC CAC CAA CTC CAG TTT TGT GCC CTA 1726
1727 AGC CTC ATT TCT CAT GTT CAG ACC TCA CAT CTT TTA AGC CGC CCT GTG 1774
1775 TCT CTG ACC CCT TCT CAT TTG CCT AGT ATC TCT GCC CCT GCC TCC CTA 1822
1823 ATT AGC TAG GGC TGG GGT CAG CCA CTG CCA ATC CTG CCT TAC TCA GGA 1870
1871 AGG CAG GAG GAA AGA GAC TGC CTC TCC AGA GCA AGG CCC AGC TGG GCA 1918
1919 GAG GGT GAA AAA GAG AAA TGT GAG CAT CCG CTC CCC CAC CAC CCC GCC 1966
1967 CAG CCC CTA GCC CCA CTC CCT GCC TCC TGA AAT GGT TCC CAC CCA GAA 2014
2015 CTA ATT TAT TTT TTA TTA AAG ATG GTC ATG ACA AAT GAA AAA AAA AAA 2062
2063 AAA AAA AA 2070
D:Blastp结果
Query=PP1396[基因=PP1396](237个氨基酸)
>SP_IN:Q19791 Q19791 caenorhabditis elegans.f25h8.3 protein.5/1999
长度=2165
分值=98.7 bits(242),预计值=4e-20
相同性=58/205(28%),相似性=86/205(41%),缺口=31/205(15%)
Query:8 WFHSDWSSKCSAECGTGIQR-RSVVCLGSXXXXXXXXXXXXXXXXQSCPTGSRPPDMRAC 66
W ++W +C A CGT +Q+ R+V C+ + C RP R C
Sbjct:1426 WKMAEWE-ECPATCGTHVQQSRNVTCVSAEDGGRTILKDV------DCDVQKRPTSARNC 1478
Query:67 SLGPC----ERTWRWYTGPWGECSSECGSGTQRRDIICVSKLGTEFNVTSPSNCSHLPRP 122
L PC E W G W +CS+ CG G +RR + C S S+C +P
Sbjct:1479 RLEPCPKGEEHIGSWIIGDWSKCSASCGGGWRRRSVSCTS-----------SSCDETRKP 1527
Query:123 PALQPCQGQAC----QDRWFSTPWSPCSRSCQGGTQTREVQC---LSTNQTLSTRCPPQL 175
C + C + W +PW+ CS SC GG Q R++ C LS + C ++
Sbjct:1528 KMFDKCNEELCPPLTNNSWQISPWTHCSVSCGGGVQRRKIWCEDVLSGRKQDDIEC-SEI 1586
Query:176 RPSRKRPCNSQPCSQRPDDQCKDSS 200
+P +R C PC ++ +S
Sbjct:1587 KPREQRDCEMPPCRSHYHNKTSSAS 1611
分值=93.6 bits(229),预计值=2e-18
相同性=67/219(30%),相似性=88/219(39%),缺口=37/219(16%)
Query:4 CTTAWFHSDWSSKCSAECGTGIQRRSVVCLGSXXXXXXXXXXXXXXXXQSCPTGSRPPDM 63
C+T W D SS CSA+CG+G +R+ V C+ C S+P D+
Sbjct:958 CSTRWITEDVSS-CSAKCGSGQKRQRVSCV------KMEGDRQTPASEHLCDRNSKPSDI 1010
Query:64 RACSLGPCERTWRWYTGPWGECSSECGS-GTQRRDIICV---------SKLGTEFNVTSP 113
+C + R W + G W CS CGS G R CV S G E +
Sbjct:1011 ASCYIDCSGRKWNY--GEWTSCSETCGSNGKMHRKSYCVDDSNRRVDESLCGREQKEATE 1068
Query:114 SNCSHLPRPPALQPCQGQACQDRWFSTPWSPCSRSCQGGTQTREVQCL--STNQTLSTRC 171
C+ +P P RW WS CSRSC GG + R QCL + +T ++RC
Sbjct:1069 RECNRIPCP-------------RWVYGHWSECSRSCDGGVKMRHAQCLDAADRETHTSRC 1115
Query:172 PPQLRPSRKRPCNSQPCSQRPDDQCKDSSPHCPLVVQAR 210
P + CN C+ D S C VQ R
Sbjct:1116 GP---AQTQEHCNEHACTWWQFGVWSDCSAKCGDGVQYR 1151
15.PP1563
A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:43)长度:1664bp
1 TCGAGTTTTT TTTTTTTTTT TTTAATTAGA GCAGGTATGC TTTTGATGGT
51 AGGGAAGGGA TGGAAAAAAG GAAAAGCAAT AGAAACTGTC CAATTCACAT
101 CAGTTATCCG TCTGCTTTTT CTTGAGAGCT TGTGGAAGGT GTTAACGTGG
151 CTGGGAACAT CAACACCTTG GCATGCATGA ATGTTAAGTC AGGAAGGCCA
201 GCGATCACCT TGATAGCTTC TTCACTTAGG TGCTCTTCTC TTTTCGGTTT
251 CCTACTGGTA GATGTGCTTG TCTTCTCTAC TGTAGACATG AGTCTTGCAA
301 ATGCATCAGT CACTTTGAGG CTTGAGGTGG AGATTTCCAG CTTAGAAGTT
351 GTTAACTCAT ACAACTCCGG ATCCACACCT GGGATTGTGG TGCTGCTGCT
401 AGAGCTACTG TCATCCACGG GCCCAAAGAA ATCAAGGTTC AGAAGAGTGG
451 AACCTCCACT AGCATCTAAA GGGTTAGTAA GGCCACTGCT ACTCCAGTCA
501 AACTGGACGG GTGGTAGAGA CTCCTGGAAC TGATCAGATG TACATGTGTT
551 CATATCTGGT GACATGGTGG CTGTCTGACC GATGGAAGCT ATTTTTTCTG
601 CAGCAGAAAG TGGTTTCAGT GGTTCCTTGG TGGGCTCTAA CATACCCAAT
651 CCTGCTGCAT ACATGGGCAC TATAACAGGC TGCTTCTTAT TGCCCGTGAA
701 GAGAATGTTT CGGGTGTCTA TTCCCAAGGA GGACAAAAGC TTCTTGTTGC
751 TATGGGAGCC GCCCCACTGG TATCTCAAGC CATGTGCATC ATGGATATCC
801 TGTAGCTCAG TCCACACATC TAGCAATTCC CCACTTTCAG GTAAGGCCTC
851 TCTCGTTTTT ATTGGCAAAG TGCTTGTTTC CAGCAAGTGC TTCAGGGAAG
901 TAACTTCCTC TTCAGCATCA GGGACAAGTA TGGAAGGAAA ACATGCTTCG
951 AAAATTCGCT CCAGGCGGTT TAATAAAGCT GTCTGAACTG AAGTGGCTGA
1001 TTCCTGTAAA TGGCCACTAG CAACTGCTCC TTTGGAAGTT GCTGAAGGTA
1051 CACTGTGCGT TTTGGGGGTT CCTGGAGTAT CAATATTTTC ATCTGTCCTA
1101 TGTGACTGCC AGGCTTCCTT TCGATGATGA GATTCAGTAG CCTGCTGGTC
1151 TCCAAAAGCA GCCCAAGAAC AACTATCTTT TTGTTCATCC TCAAAAGCAT
1201 TCCAATCTAC AACTTGGCTA GGACCAGCTG AACTGAAGTC TGCAAAATCA
1251 TCAGAGTCTT GAAAACCATT GCAGTCATCC TGAATATTTG GCACAGAATC
1301 AAAATGTCCA ATCTCACCTT CTTGCCCATT TTTAAGTTTT GCAACAGGTT
1351 CAGTGCCTGT TCCACTAGAT TTTCTTGCCA ATTGACATTC TTCTGATAAA
1401 TTATCAGAAG TCTGTTTTAG GTCTGACTTT GTTAATATTG TCTCCTCTTG
1451 GCAAGAAACA GCATTTATAT CCCCAAATTC TCCAAAGTCA TCACCTGGTT
1501 CACTAAAATG TGGAAAGTGC TCTGAAGACT CTTCAAAAGT GGCATCACTC
1551 ATTGAATCTT GAGTACCAGT AACAAAAGGT GGAGTTGAGC CACTGGCAGA
1601 GCCAAAGTCA CCAAAATCCC CCAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
1651 AAAAAAAAAA AAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:44) 长度:134个氨基酸
1 MEAIFSAAES GFSGSLVGSN IPNPAAYMGT ITGCFLLPVK RMFRVSIPKE
51 DKSFLLLWEP PHWYLKPCAS WISCSSVHTS SNSPLSGKAS LVFIGKVLVS
101 SKCFREVTSS SASGTSMEGK HASKIRSRRF NKAV
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:45)
克隆号和蛋白名称:PP1563
起始编码子:582 ATG 终止编码子:986 TGA
蛋白质分子量:14492.98
1 TC GAG TTT TTT TTT TTT TTT TTT AAT TAG AGC AGG TAT GCT TTT GAT 47
48 GGT AGG GAA GGG ATG GAA AAA AGG AAA AGC AAT AGA AAC TGT CCA ATT 95
96 CAC ATC AGT TAT CCG TCT GCT TTT TCT TGA GAG CTT GTG GAA GGT GTT 143
144 AAC GTG GCT GGG AAC ATC AAC ACC TTG GCA TGC ATG AAT GTT AAG TCA 191
192 GGA AGG CCA GCG ATC ACC TTG ATA GCT TCT TCA CTT AGG TGC TCT TCT 239
240 CTT TTC GGT TTC CTA CTG GTA GAT GTG CTT GTC TTC TCT ACT GTA GAC 287
288 ATG AGT CTT GCA AAT GCA TCA GTC ACT TTG AGG CTT GAG GTG GAG ATT 335
336 TCC AGC TTA GAA GTT GTT AAC TCA TAC AAC TCC GGA TCC ACA CCT GGG 383
384 ATT GTG GTG CTG CTG CTA GAG CTA CTG TCA TCC ACG GGC CCA AAG AAA 431
432 TCA AGG TTC AGA AGA GTG GAA CCT CCA CTA GCA TCT AAA GGG TTA GTA 479
480 AGG CCA CTG CTA CTC CAG TCA AAC TGG ACG GGT GGT AGA GAC TCC TGG 527
528 AAC TGA TCA GAT GTA CAT GTG TTC ATA TCT GGT GAC ATG GTG GCT GTC 575
576 TGA CCG ATG GAA GCT ATT TTT TCT GCA GCA GAA AGT GGT TTC AGT GGT 623
1 Met Glu Ala Ile Phe Ser Ala Ala Glu Ser Gly Phe Ser Gly 14
624 TCC TTG GTG GGC TCT AAC ATA CCC AAT CCT GCT GCA TAC ATG GGC ACT 671
15 Ser Leu Val Gly Ser Asn Ile Pro Asn Pro Ala Ala Tyr Met Gly Thr 30
672 ATA ACA GGC TGC TTC TTA TTG CCC GTG AAG AGA ATG TTT CGG GTG TCT 719
31 Ile Thr Gly Cys Phe Leu Leu Pro Val Lys Arg Met Phe Arg Val Ser 46
720 ATT CCC AAG GAG GAC AAA AGC TTC TTG TTG CTA TGG GAG CCG CCC CAC 767
47 Ile Pro Lys Glu Asp Lys Ser Phe Leu Leu Leu Trp Glu Pro Pro His 62
768 TGG TAT CTC AAG CCA TGT GCA TCA TGG ATA TCC TGT AGC TCA GTC CAC 815
63 Trp Tyr Leu Lys Pro Cys Ala Ser Trp Ile Ser Cys Ser Ser Val His 78
816 ACA TCT AGC AAT TCC CCA CTT TCA GGT AAG GCC TCT CTC GTTITT ATT 863
79 Thr Ser Ser Asn Ser Pro Leu Ser Gly Lys Ala Ser Leu Val Phe Ile 94
864 GGC AAA GTG CTT GTT TCC AGC AAG TGC TTC AGG GAA GTA ACT TCC TCT 911
95 Gly Lys Val Leu Val Ser Ser Lys Cys Phe Arg Glu Val Thr Ser Ser 110
912 TCA GCA TCA GGG ACA AGT ATG GAA GGA AAA CATGCT TCG AAA ATT CGC 959
111 Ser Ala Ser Gly Thr Ser Met Glu Gly Lys His Ala Ser Lys Ile Arg 126
960 TCC AGG CGG TTT AAT AAA GCT GTC TGA ACT GAA GTG GCT GAT TCC TGT 1007
127 Ser Arg Arg Phe Asn Lys Ala Val *** 1351008 AAA TGG CCA CTA GCA ACT GCT CCT TTG GAA GTT GCT GAA GGT ACA CTG 10551056 TGC GTT TTG GGG GTT CCT GGA GTA TCA ATA TTT TCA TCT GTC CTA TGT 1103 1104 GAC TGC CAG GCT TCC TTT CGA TGA TGA GAT TCA GTA GCC TGC TGG TCT 11511152 CCA AAA GCA GCC CAA GAA CAA CTA TCT TTT TGT TCA TCC TCA AAA GCA 11991200 TTC CAA TCT ACA ACT TGG CTA GGA CCA GCT GAA CTG AAG TCT GCA AAA 12471248 TCA TCA GAG TCT TGA AAA CCA TTG CAG TCA TCC TGA ATA TTT GGC ACA 12951296 GAA TCA AAA TGT CCA ATC TCA CCT TCT TGC CCA TTT TTA AGT TTT GCA 13431344 ACA GGT TCA GTG CCT GTT CCA CTA GAT TTT CTT GCC AAT TGA CAT TCT 13911392 TCT GAT AAA TTA TCA GAA GTC TGT TTT AGG TCT GAC TTT GTT AAT ATT 14391440 GTC TCC TCT TGG CAA GAA ACA GCA TTT ATA TCC CCA AAT TCT CCA AAG 14871488 TCA TCA CCT GGT TCA CTA AAA TGT GGA AAG TGC TCT GAA GAC TCT TCA 15351536 AAA GTG GCA TCA CTC ATT GAA TCT TGA GTA CCA GTA ACA AAA GGT GGA 15831584 GTT GAG CCA CTG GCA GAG CCA AAG TCA CCA AAA TCC CCC AAA AAA AAA 16311632 AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1664
D:Blastp结果Query=PP1563[基因=PP1563](134个氨基酸)>SP_FUN:Q05164 Q05164 saccharomyces cerevisiae(baker′s yeast).
aob567,aof1001,aoe110,aoe264 and aoe130 genes.8/1998长度=1001分值=31.3 bits(69),预计值=3.6相同性=22/61(36%),相似性=31/61(50%),缺口=1/61(1%)Query:65 LKPCASWISCSSVHTSSNSPLSGKASLVFIGKVLVSSKCFREVTSSSASGTSMEGKHASK 124
+ P S SS TSS S+ SG +S+ G + SS E + SSASG+S + SSbjct:81 IAPSTSSSEVSSSITSSGSSVSGSSSITSSGSSVSSSSSATE-SGSSASGSSSATESGSS 139Query:125 I 125
+Sbjct:140 V 140>SP_FUN:Q08294 Q08294 saccharomyces cerevisiae(baker′s yeast).
chromosome xv reading frame orf yol155c.11/1996长度=967分值=31.3 bits(69),预计值=3.6相同性=22/61(36%),相似性=31/61(50%),缺口=1/61(1%)Query:65 LKPCASWISCSSVHTSSNSPLSGKASLVFIGKVLVSSKCFREVTSSSASGTSMEGKHASK 124
+ P S SS TSS S +SG +S+ G + SS E + SSASG+S + SSbjct:81 IAPSTSSSEVSSSITSSGSSVSGSSSITSSGSSVSSSSSATE-SGSSASGSSSATESGSS 139Query:125 I 125
+Sbjct:140 V 140>SW:YAO6_CAEEL Q20762 caenorhabditis elegans.hypothetical 167.7kd
protein f54d1.6 in chromosome iv.7/1998长度=1462分值=30.1 bits(66),预计值=8.0相同性=14/56(25%),相似性=29/56(51%),缺口=3/56(5%)Query:63 WYLKPCASWISCSSVHTSSNSPLSGKASLVFIGKVLVSSKC---FREVTSSSASGT 115
WY + A W T+S+ P +++ IG+ + +C FR++T +++ G+ Sbjct:673 WYDEDGAQWNFIRDTETNSSCPCIERQAIADIGRFMPHPRCSQAFRDITCTTSIGS 72816. PP1746A:核苷酸序列:(SEQ ID NO:46) 长度:1977bp
1 GTCCAATGCC CCCCACATCC CTGTGCACCT GGGTGCCATG CAGGAGACGG
51 TGCAGTTCCA GATTCAGCAC CTGGGGGCCG ATCTCCACCC TGGCGACGTG
101 CTACTGAGCA ACCATCCCAG TGCCGGGGGC AGCCACCTGC CAGACCTGAC
151 TGTTATCACA CCGGTGAGGG GTGCTGCCCG CCTGCCTCTG CTGGGGCAGT
201 GGTGGCCGAT GCAGCTGACC GTGGCTCTCC ACCCGCTAGG TGTTTTGGCC
251 GGGTCAGACG CGGCCTGTGT TCTATGTGGC CAGCCGAGGG CACCACGCAG
301 ACATCGGGGG CATCACACCA GGCTCCATGC CCCCCCACTC CACCATGCTG
351 CAACAGGAGG GTGCCGTCTT TCTGTCCTTC AAACTTGTCC AGGGGGGCGT
401 CTTCCAGGAG GAGGCGGTGA CGGAGGCCCT GCGGGCGCCA GGCAAGGTCC
451 CCAACTGCAG CGGAACCAGA AACCTGCACG ACACCTGGAA GATAAACTGA
501 AATGCACCAA AGAGGAGCAC CTCTGTACAC AAAGGATGCT GGACCAGACC
551 CTGCTTGACC TGAATGAGAT GTAGAACGCC CCAGTCCCAC CCTGCTGCTG
601 CTCCTCCCTC TGACCCAGAC TCCGCCTGAG GCCAGCCTGC GGGAAGCTGA
651 CCTTTAATTG AGGGCTGATC TTTAACTGGA AGGCTGCTTT CTCCTTTCAC
701 CACCCCCTCC TTCCCTGTGT CTTTTTCGCC AAACTGTCTC TGCCTCTTCC
751 CGGAGAATCC AGCTGGGCTA GAGGCTGAGC ACCTTTGGAA ACAACATTTA
801 AGGGAATGTG AGCACAATGC ATAATGTCTT TAAAAAGCAT GTTGTGATGT
851 ACACATTTTG TAATTACCTT TTTTGTTGTT TTGTAGCAAC CATTTGTAAA
901 ACATTCCAAA TGGTTGCTCC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA
951 AAAAAAAAAA AAAAAAAACT CGAGGGGGGG CCCGGTACCA GGTAATCTAC
1001 TGCCTGCGCT GTCTGGTGGG CCGCGACATC CCACTCAACC AGGGCTGCCT
1051 GGCGCCAGTG CGCGTGGTCA TTCCCCGAGG CTCCATCCTG GACCCGTCGC
1101 CCGAGGCGGC GGTGGTGGGC GGCAACGTGC TCACGTCGCA GCGCGTGGTG
1151 GATGTCATCC TGGGGGCCTT TGGGGCCTGC GCCGCCTCCC AGGTGCGGGG
1201 GCGGGGTGGG CGCAGCTCGG GGGCGGACTG GGTGGGCAGG CTGGAGTAGG
1251 AGCGGGAGGG CGAGGTGGGG ACGCCCTGCC CCAGCCCAGC GCAGCGACCA
1301 GGTGCCCTCA CCAGGGCTGC ATGAACAACG TGACCCTGGG CAACGCCCAC
1351 ATGGGCTACT ACGAGACGGT GGCGGGCGGC GCGGGCGCGG GTCCCAGCTG
1401 GCACGGGCGC AGCGGTGTGC ACAGCCACAT GACCAACACA CGCATCACCG
1451 ACCCTGAGAT CCTGGAGAGC CGGTACCCGG TCATCCTGCG CCGCTTCGAG
1501 CTGCGGCGGG GCTCGGGGGG CAGAGGCCGC TTCCGAGGCG GCGACGGCGT
1551 CACCCGCGAG CTGCTCTTTC GTGAGGAGGC GCTGCTGTCA GTGCTGACCG
1601 AGCGCCGCGC CTTCCGGCCA TACGGGCTCC ACGGGGGCGA GCCTGGCGCC
1651 CGCGGCCTAA ACCTGCTGAT CCGCAAAAAC GGCCGGACGG TGAATCTGGG
1701 CGGCAAGACG TCGGTGACCG TGTACCCCGG GGATGTGTTC TGTCTCCACA
1751 CGCCCGGCGG CGGTGGCTAT GGGGACCCGG AGGACCCCGC CCCACCGCCG
1801 GGGTCGCCCC CGCAAGCACT GGCCTTTCCC GAGCACGGCA GCGTCTATGA
1851 GTATCGCCGG GCCCAGAAGG CCGTGTGAGG ATCCCGCAAT AAAAATGCCT
1901 TAAGTCTCCC GGTTCTGGGG ACGCAGCTAC GGCGCCTTAA AAAAAAAAAA
1951 AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAA
B:氨基酸序列:(SEQ ID NO:47) 长度:353个氨基酸
1 MHNVFKKHVV MYTFCNYLFC CFVATICKTF QMVAPKKKKK KKKKKKKKKK
51 NSRGGPVPGN LLPALSGGPR HPTQPGLPGA SARGHSPRLH PGPVARGGGG
101 GRQRAHVAAR GGCHPGGLWG LRRLPGAGAG WAQLGGGLGG QAGVGAGGRG
151 GDALPQPSAA TRCPHQGCMN NVTLGNAHMG YYETVAGGAG AGPSWHGRSG
201 VHSHMTNTRI TDPEILESRY PVILRRFELR RGSGGRGRFR GGDGVTRELL
251 FREEALLSVL TERRAFRPYG LHGGEPGARG LNLLIRKNGR TVNLGGKTSV
301 TVYPGDVFCL HTPGGGGYGD PEDPAPPPGS PPQALAFPEH GSVYEYRRAQ
351 KAV
C:核苷酸及氨基酸组合序列(SEQ ID NO:48)
克隆号和蛋白名称:PP1746
起始编码子:817 ATG 终止编码子:1878 TGA
蛋白质分子量:37265.90
1 GTC CAA TGC CCC CCA CAT CCC TGT GCA CCT GGG TGC CAT GCA GGA GAC 48
49 GGT GCA GTT CCA GAT TCA GCA CCT GGG GGC CGA TCT CCA CCC TGG CGA 96
97 CGT GCT ACT GAG CAA CCA TCC CAG TGC CGG GGG CAG CCA CCT GCC AGA 144
145 CCT GAC TGT TAT CAC ACC GGT GAG GGG TGC TGC CCG CCT GCC TCT GCT 192
193 GGG GCA GTG GTG GCC GAT GCA GCT GAC CGT GGC TCT CCA CCC GCT AGG 240
241 TGT TTT GGC CGG GTC AGA CGC GGC CTG TGT TCT ATG TGG CCA GCC GAG 288
289 GGC ACC ACG CAG ACA TCG GGG GCA TCA CAC CAG GCT CCA TGC CCC CCC 336
337 ACT CCA CCA TGC TGC AAC AGG AGG GTG CCG TCT TTC TGT CCT TCA AAC 384
385 TTG TCC AGG GGG GCG TCT TCC AGG AGG AGG CGG TGA CGG AGG CCC TGC 432
433 GGG CGC CAG GCA AGG TCC CCA ACT GCA GCG GAA CCA GAA ACC TGC ACG 480
481 ACA CCT GGA AGA TAA ACT GAA ATG CAC CAA AGA GGA GCA CCT CTG TAC 528
529 ACA AAG GAT GCT GGA CCA GAC CCT GCT TGA CCT GAA TGA GAT GTA GAA 576
577 CGC CCC AGT CCC ACC CTG CTG CTG CTC CTC CCT CTG ACC CAG ACT CCG 624
625 CCT GAG GCC AGC CTG CGG GAA GCT GAC CTT TAA TTG AGG GCT GAT CTT 672
673 TAA CTG GAA GGC TGC TTT CTC CTT TCA CCA CCC CCT CCT TCC CTG TGT 720
721 CTT TTT CGC CAA ACT GTC TCT GCC TCT TCC CGG AGA ATC CAG CTG GGC 768
769 TAG AGG CTG AGC ACC TTT GGA AAC AAC ATT TAA GGG AAT GTG AGC ACA 816
817 ATG CAT AAT GTC TTT AAA AAG CAT GTT GTG ATG TAC ACA TTT TGT AAT 864
1 Met His Asn Val Phe Lys Lys His Val Val Met Tyr Thr Phe Cys Asn 16
865 TAC CTT TTT TGT TGT TTT GTA GCA ACC ATT TGT AAA ACA TTC CAA ATG 912
17 Tyr Leu Phe Cys Cys Phe Val Ala Thr Ile Cys Lys Thr Phe Gln Met 32
913 GTT GCT CCA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 960
33 Val Ala Pro Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys Lys 48
961 AAA AAA AAC TCG AGG GGG GGC CCG GTA CCA GGT AAT CTA CTG CCT GCG 1008
49 Lys Lys Asn Ser Arg Gly Gly Pro Val Pro Gly Asn Leu Leu Pro Ala 64
1009 CTG TCT GGT GGG CCG CGA CAT CCC ACT CAA CCA GGG CTG CCT GGC GCC 1056
65 Leu Ser Gly Gly Pro Arg His Pro Thr Gln Pro Gly Leu Pro Gly Ala 80
1057 AGT GCG CGT GGT CAT TCC CCG AGG CTC CAT CCT GGA CCC GTC GCC CGA 1104
81 Ser Ala Arg Gly His Ser Pro Arg Leu His Pro Gly Pro Val Ala Arg 96
1105 GGC GGC GGT GGT GGG CGG CAA CGT GCT CAC GTC GCA GCG CGT GGT GGA 1152
97 Gly Gly Gly Gly Gly Arg Gln Arg Ala His Val Ala Ala Arg Gly Gly 112
1153 TGT CAT CCT GGG GGC CTT TGG GGC CTG CGC CGC CTC CCA GGT GCG GGG 1200
113 Cys His Pro Gly Gly Leu Trp Gly Leu Arg Arg Leu Pro Gly Ala Gly 128
1201 GCG GGG TGG GCG CAG CTC GGG GGC GGA CTG GGT GGG CAG GCT GGA GTA 1248
129 Ala Gly Trp Ala Gln Leu Gly Gly Gly Leu Gly Gly Gln Ala Gly Val 144
1249 GGA GCG GGA GGG CGA GGT GGG GAC GCC CTG CCC CAG CCC AGC GCA GCG 1296
145 Gly Ala Gly Gly Arg Gly Gly Asp Ala Leu Pro Gln Pro Ser Ala Ala 160
1297 ACC AGG TGC CCT CAC CAG GGC TGC ATG AAC AAC GTG ACC CTG GGC AAC 1344
161 Thr Arg Cys Pro His Gln Gly Cys Met Asn Asn Val Thr Leu Gly Asn 176
1345 GCC CAC ATG GGC TAC TAC GAG ACG GTG GCG GGC GGC GCG GGC GCG GGT 1392
177 Ala His Met Gly Tyr Tyr Glu Thr Val Ala Gly Gly Ala Gly Ala Gly 192
1393 CCC AGC TGG CAC GGG CGC AGC GGT GTG CAC AGC CAC ATG ACC AAC ACA 1440
193 Pro Ser Trp His Gly Arg Ser Gly Val His Ser His Met Thr Asn Thr 208
1441 CGC ATC ACC GAC CCT GAG ATC CTG GAG AGC CGG TAC CCG GTC ATC CTG 1488
209 Arg Ile Thr Asp Pro Glu Ile Leu Glu Ser Arg Tyr Pro Val Ile Leu 224
1489 CGC CGC TTC GAG CTG CGG CGG GGC TCG GGG GGC AGA GGC CGC TTC CGA 1536
225 Arg Arg Phe Glu Leu Arg Arg Gly Ser Gly Gly Arg Gly Arg Phe Arg 240
1537 GGC GGC GAC GGC GTC ACC CGC GAG CTG CTC TTT CGT GAG GAG GCG CTG 1584
241 Gly Gly Asp Gly Val Thr Arg Glu Leu Leu Phe Arg Glu Glu Ala Leu 256
1585 CTG TCA GTG CTG ACC GAG CGC CGC GCC TTC CGG CCA TAC GGG CTC CAC 1632
257 Leu Ser Val Leu Thr Glu Arg Arg Ala Phe Arg Pro Tyr Gly Leu His 272
1633 GGG GGC GAG CCT GGC GCC CGC GGC CTA AAC CTG CTG ATC CGC AAA AAC 1680
273 Gly Gly Glu Pro Gly Ala Arg Gly Leu Asn Leu Leu Ile Arg Lys Asn 288
1681 GGC CGG ACG GTG AAT CTG GGC GGC AAG ACG TCG GTG ACC GTG TAC CCC 1728
289 Gly Arg Thr Val Asn Leu Gly Gly Lys Thr Ser Val Thr Val Tyr Pro 304
1729 GGG GAT GTG TTC TGT CTC CAC ACG CCC GGC GGC GGT GGC TAT GGG GAC 1776
305 Gly Asp Val Phe Cys Leu His Thr Pro Gly Gly Gly Gly Tyr Gly Asp 320
1777 CCG GAG GAC CCC GCC CCA CCG CCG GGG TCG CCC CCG CAA GCA CTG GCC 1824
321 Pro Glu Asp Pro Ala Pro Pro Pro Gly Ser Pro Pro Gln Ala Leu Ala 336
1825 TTT CCC GAG CAC GGC AGC GTC TAT GAG TAT CGC CGG GCC CAG AAG GCC 1872
337 Phe Pro Glu His Gly Ser Val Tyr Glu Tyr Arg Arg Ala Gln Lys Ala 352
1873 GTG TGA GGA TCC CGC AAT AAA AAT GCC TTA AGT CTC CCG GTT CTG GGG 1920
353 Val *** 354
1921 ACG CAG CTA CGG CGC CTT AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA AAA 1968
1969 AAA AAA AAA 1977
D:Blastp结果
Query=PP1746[基因=PP1746](353个氨基酸)
>SW:YAOE_SCHPO Q10093 schizosaccharomyces pombe(fission yeast).
hypothetical 138.8 kd protein clld3.14c in chromosome i.
12/1998
长度=1260
分值=134 bits(335),预计值=9e-31
相同性=75/157(47%),相似性=92/157(57%),缺口=10/157(6%)
Query:166 QGCMNNVTLG----NAHMGY--YETVAGGAGAGPSWHGRSGVHSHMTNTRITDPEILESR 219
QGCMNN+T G N G+ YET+AGGAGAGP+W+G SGVH+HMTNTRITDPE++E R
Sbjct:1093 QGCMNNLTFGYDGENGEEGFAMYETIAGGAGAGPTWNGTSGVHTHMTNTRITDPEVVERR 1152
Query:220 YPVILXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXVTRELLFREEALLSVLTERRAFRPYGLHGGEPGAR 279
PVIL V R FR S+L+ERR+ PYG++GGE GA
Sbjct:1153 APVILRRFCLRENSGGKGEYHGGDGVIRHFEFRRSMHCSILSERRSRAPYGMNGGEDGAM 1212
Query:280 GLNLLIRKNG----RTVNLGGKTSVTVYPGDVFCLHT 312
G+N I + R VNLGGK V + GD + T
Sbjct:1213 GVNTWIDCSNPDFPRYVNLGGKNHVLMGKGDHIVIET 1249
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
Claims (5)
1.一种分离的多核苷酸,其特征在于,它包含一核苷酸序列,该核苷酸序列选自下组:
(a)编码具有抑癌功能的人蛋白的多核苷酸,所述蛋白具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:47;
(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸。
2.如权利要求1所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸编码的多肽具有选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:47。
3.如权利要求1所述的多核苷酸,其特征在于,该多核苷酸的序列选自下组:
SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:48的编码区序列或全长序列。
4.一种载体,其特征在于,它含有权利要求1所述的多核苷酸。
5.一种遗传工程化的宿主细胞,其特征在于,它是选自下组的一种宿主细胞:
(a)用权利要求4所述的载体转化或转导的宿主细胞;
(b)用权利要求1所述的多核苷酸转化或转导的宿主细胞。
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CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |