CN116368228A - 用于治疗眼部疾病的组合物和方法 - Google Patents
用于治疗眼部疾病的组合物和方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN116368228A CN116368228A CN202180064406.4A CN202180064406A CN116368228A CN 116368228 A CN116368228 A CN 116368228A CN 202180064406 A CN202180064406 A CN 202180064406A CN 116368228 A CN116368228 A CN 116368228A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- sequence
- seq
- rpe65
- promoter
- aav
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 64
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 49
- 208000022873 Ocular disease Diseases 0.000 title description 6
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 48
- 201000003533 Leber congenital amaurosis Diseases 0.000 claims abstract description 39
- 101000729271 Homo sapiens Retinoid isomerohydrolase Proteins 0.000 claims description 393
- 102100031176 Retinoid isomerohydrolase Human genes 0.000 claims description 393
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 274
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 220
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 215
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 149
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 149
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 149
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 141
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 136
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 124
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 118
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 105
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 104
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 102
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 52
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 claims description 44
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 38
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 claims description 31
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims description 27
- 108010035291 retinol dehydrogenase Proteins 0.000 claims description 22
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 21
- 102100038247 Retinol-binding protein 3 Human genes 0.000 claims description 20
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 19
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 claims description 18
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 claims description 18
- 102100038794 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 6 Human genes 0.000 claims description 16
- 101100118093 Drosophila melanogaster eEF1alpha2 gene Proteins 0.000 claims description 16
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 16
- 108010048996 interstitial retinol-binding protein Proteins 0.000 claims description 14
- 239000007924 injection Substances 0.000 claims description 13
- 238000002347 injection Methods 0.000 claims description 13
- 101150116978 RPE65 gene Proteins 0.000 claims description 11
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 11
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 claims description 10
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 claims description 10
- 102100033356 Lecithin retinol acyltransferase Human genes 0.000 claims description 9
- 101710097927 Retinal-binding protein Proteins 0.000 claims description 8
- 108010084957 lecithin-retinol acyltransferase Proteins 0.000 claims description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 8
- 108091008695 photoreceptors Proteins 0.000 claims description 8
- 102000024458 retinal binding proteins Human genes 0.000 claims description 8
- 241001529936 Murinae Species 0.000 claims description 7
- 208000017442 Retinal disease Diseases 0.000 claims description 7
- 102100038054 Retinol dehydrogenase 12 Human genes 0.000 claims description 7
- 108091093126 WHP Posttrascriptional Response Element Proteins 0.000 claims description 7
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 7
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims description 7
- 108091004242 G-Protein-Coupled Receptor Kinase 1 Proteins 0.000 claims description 6
- 102000004437 G-Protein-Coupled Receptor Kinase 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 101000801643 Homo sapiens Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4 Proteins 0.000 claims description 6
- 208000035719 Maculopathy Diseases 0.000 claims description 6
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 claims description 6
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 claims description 6
- 102100033617 Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100023918 Retinol dehydrogenase 10 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100038053 Retinol dehydrogenase 5 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100024844 Retinol dehydrogenase 8 Human genes 0.000 claims description 6
- 102100022941 Retinol-binding protein 1 Human genes 0.000 claims description 6
- 108090000799 Rhodopsin kinases Proteins 0.000 claims description 6
- 102000005406 Tissue Inhibitor of Metalloproteinase-3 Human genes 0.000 claims description 6
- 108010031429 Tissue Inhibitor of Metalloproteinase-3 Proteins 0.000 claims description 6
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 claims description 6
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 6
- 208000002780 macular degeneration Diseases 0.000 claims description 6
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 6
- 102000029752 retinol binding Human genes 0.000 claims description 6
- 108091000053 retinol binding Proteins 0.000 claims description 6
- 108010042033 retinol dehydrogenase 5 Proteins 0.000 claims description 6
- 101150021183 65 gene Proteins 0.000 claims description 5
- 101001078886 Homo sapiens Retinaldehyde-binding protein 1 Proteins 0.000 claims description 5
- 101000742938 Homo sapiens Retinol dehydrogenase 12 Proteins 0.000 claims description 5
- 102100028001 Retinaldehyde-binding protein 1 Human genes 0.000 claims description 5
- 101000792933 Homo sapiens AT-rich interactive domain-containing protein 4A Proteins 0.000 claims description 4
- 101001111656 Homo sapiens Retinol dehydrogenase 10 Proteins 0.000 claims description 4
- 101001111655 Homo sapiens Retinol dehydrogenase 11 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000687592 Homo sapiens Retinol dehydrogenase 8 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000756373 Homo sapiens Retinol-binding protein 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000665873 Homo sapiens Retinol-binding protein 3 Proteins 0.000 claims description 4
- 101000904152 Homo sapiens Transcription factor E2F1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100023916 Retinol dehydrogenase 11 Human genes 0.000 claims description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 4
- 108010000521 Human Growth Hormone Proteins 0.000 claims description 2
- 102000002265 Human Growth Hormone Human genes 0.000 claims description 2
- 239000000854 Human Growth Hormone Substances 0.000 claims description 2
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 claims description 2
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 154
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 88
- 241000702423 Adeno-associated virus - 2 Species 0.000 description 71
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 54
- 241001634120 Adeno-associated virus - 5 Species 0.000 description 40
- 241001164825 Adeno-associated virus - 8 Species 0.000 description 39
- 241001655883 Adeno-associated virus - 1 Species 0.000 description 35
- 241000580270 Adeno-associated virus - 4 Species 0.000 description 35
- 241000972680 Adeno-associated virus - 6 Species 0.000 description 35
- 241001164823 Adeno-associated virus - 7 Species 0.000 description 35
- 241000649045 Adeno-associated virus 10 Species 0.000 description 35
- 241000649046 Adeno-associated virus 11 Species 0.000 description 35
- 241000649047 Adeno-associated virus 12 Species 0.000 description 35
- 241000300529 Adeno-associated virus 13 Species 0.000 description 35
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 35
- 241000425548 Adeno-associated virus 3A Species 0.000 description 32
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 30
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 26
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 25
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 22
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 19
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 19
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 19
- 101710197658 Capsid protein VP1 Proteins 0.000 description 18
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 17
- 101710081079 Minor spike protein H Proteins 0.000 description 17
- 101710118046 RNA-directed RNA polymerase Proteins 0.000 description 17
- 101710108545 Viral protein 1 Proteins 0.000 description 17
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 16
- 238000002571 electroretinography Methods 0.000 description 16
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 15
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 15
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 15
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 14
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 13
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 12
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 11
- 101000670189 Homo sapiens Ribulose-phosphate 3-epimerase Proteins 0.000 description 10
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 10
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 10
- 210000003583 retinal pigment epithelium Anatomy 0.000 description 10
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 9
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 9
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 9
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 8
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 7
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 7
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 7
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 7
- 241000710198 Foot-and-mouth disease virus Species 0.000 description 6
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 6
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 6
- 230000006870 function Effects 0.000 description 6
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 6
- 239000013608 rAAV vector Substances 0.000 description 6
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 6
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 6
- 101000805768 Banna virus (strain Indonesia/JKT-6423/1980) mRNA (guanine-N(7))-methyltransferase Proteins 0.000 description 5
- 101150044789 Cap gene Proteins 0.000 description 5
- 101000686790 Chaetoceros protobacilladnavirus 2 Replication-associated protein Proteins 0.000 description 5
- 101000864475 Chlamydia phage 1 Internal scaffolding protein VP3 Proteins 0.000 description 5
- 101000803553 Eumenes pomiformis Venom peptide 3 Proteins 0.000 description 5
- 101000583961 Halorubrum pleomorphic virus 1 Matrix protein Proteins 0.000 description 5
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 5
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 5
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 5
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 5
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 5
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 5
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 5
- 229940124624 oral corticosteroid Drugs 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 101150066583 rep gene Proteins 0.000 description 5
- 230000004243 retinal function Effects 0.000 description 5
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 5
- 239000013607 AAV vector Substances 0.000 description 4
- GSCLWXDNIMNIJE-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O GSCLWXDNIMNIJE-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- WUQXMTITJLFXAU-JIOCBJNQSA-N Asn-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O WUQXMTITJLFXAU-JIOCBJNQSA-N 0.000 description 4
- GHODABZPVZMWCE-FXQIFTODSA-N Asp-Glu-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GHODABZPVZMWCE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- 241000214054 Equine rhinitis A virus Species 0.000 description 4
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 4
- 102000053171 Glial Fibrillary Acidic Human genes 0.000 description 4
- 101710193519 Glial fibrillary acidic protein Proteins 0.000 description 4
- BAYQNCWLXIDLHX-ONGXEEELSA-N Gly-Val-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CN BAYQNCWLXIDLHX-ONGXEEELSA-N 0.000 description 4
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 4
- 102400001132 Melanin-concentrating hormone Human genes 0.000 description 4
- 101800002739 Melanin-concentrating hormone Proteins 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- 102000010780 Platelet-Derived Growth Factor Human genes 0.000 description 4
- 108010038512 Platelet-Derived Growth Factor Proteins 0.000 description 4
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 4
- SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N Ser-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO SFTZWNJFZYOLBD-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 241000249107 Teschovirus A Species 0.000 description 4
- ABWNZPOIUJMNKT-IXOXFDKPSA-N Thr-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ABWNZPOIUJMNKT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 4
- 210000005046 glial fibrillary acidic protein Anatomy 0.000 description 4
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 4
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- ORRDHOMWDPJSNL-UHFFFAOYSA-N melanin concentrating hormone Chemical compound N1C(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CCCNC(N)=N)NC(=O)CNC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CCSC)NC(=O)C(NC(=O)C(CCCNC(N)=N)NC(=O)C(NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC(O)=O)C(C)O)CCSC)CSSCC(C(=O)NC(CC=2C3=CC=CC=C3NC=2)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(C(C)C)C(O)=O)NC(=O)C2CCCN2C(=O)C(CCCNC(N)=N)NC(=O)C1CC1=CC=C(O)C=C1 ORRDHOMWDPJSNL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 4
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 4
- 210000000844 retinal pigment epithelial cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 13-cis retinol Natural products OCC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000202702 Adeno-associated virus - 3 Species 0.000 description 3
- 241000649044 Adeno-associated virus 9 Species 0.000 description 3
- IGFJVXOATGZTHD-UHFFFAOYSA-N Arg-Phe-His Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccccc1)C(=O)NC(Cc2c[nH]cn2)C(=O)O IGFJVXOATGZTHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JRVABKHPWDRUJF-UBHSHLNASA-N Asn-Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JRVABKHPWDRUJF-UBHSHLNASA-N 0.000 description 3
- UFAQGGZUXVLONR-AVGNSLFASA-N Asp-Gln-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O UFAQGGZUXVLONR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N Asp-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N 0.000 description 3
- 108091029430 CpG site Proteins 0.000 description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- FXLVSYVJDPCIHH-STQMWFEESA-N Gly-Phe-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FXLVSYVJDPCIHH-STQMWFEESA-N 0.000 description 3
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MDVZJYGNAGLPGJ-KKUMJFAQSA-N Leu-Asn-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MDVZJYGNAGLPGJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- USLNHQZCDQJBOV-ZPFDUUQYSA-N Leu-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O USLNHQZCDQJBOV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- ARRIJPQRBWRNLT-DCAQKATOSA-N Leu-Met-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N ARRIJPQRBWRNLT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- XZNJZXJZBMBGGS-NHCYSSNCSA-N Leu-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XZNJZXJZBMBGGS-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BYAIIACBWBOJCU-URLPEUOOSA-N Phe-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BYAIIACBWBOJCU-URLPEUOOSA-N 0.000 description 3
- BRJGUPWVFXKBQI-XUXIUFHCSA-N Pro-Leu-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O BRJGUPWVFXKBQI-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 3
- JUJCUYWRJMFJJF-AVGNSLFASA-N Pro-Lys-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 JUJCUYWRJMFJJF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- UFKPDBLKLOBMRH-XHNCKOQMSA-N Ser-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O UFKPDBLKLOBMRH-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 3
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 3
- RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N Thr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 3
- LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N Tyr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 3
- -1 antibodies Substances 0.000 description 3
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 description 3
- 230000004300 dark adaptation Effects 0.000 description 3
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 3
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- HPAIKDPJURGQLN-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-histidyl-L-phenylalanine Natural products C=1C=CC=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(NC(=O)CN)CC1=CN=CN1 HPAIKDPJURGQLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 3
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 3
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 3
- 108010016686 methionyl-alanyl-serine Proteins 0.000 description 3
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 108010024654 phenylalanyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 3
- 229920001983 poloxamer Polymers 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 3
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 3
- 108010054126 retinoid isomerohydrolase Proteins 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 3
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 3
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 3
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 description 3
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 3
- 239000000277 virosome Substances 0.000 description 3
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N (2s)-1-[2-[[(2s)-pyrrolidine-2-carbonyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H]1NCCC1 BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-HPNHMNAASA-N 11-cis-retinol Natural products OCC=C(C)C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-HPNHMNAASA-N 0.000 description 2
- KISWVXRQTGLFGD-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[6-amino-2-[[2-[[2-[[5-amino-2-[[2-[[1-[2-[[6-amino-2-[(2,5-diamino-5-oxopentanoyl)amino]hexanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)p Chemical compound C1CCN(C(=O)C(CCCN=C(N)N)NC(=O)C(CCCCN)NC(=O)C(N)CCC(N)=O)C1C(=O)NC(CO)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(=O)NC(CO)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C(=O)NC(CC(C)C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 KISWVXRQTGLFGD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710122462 65 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- FJVAQLJNTSUQPY-CIUDSAMLSA-N Ala-Ala-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN FJVAQLJNTSUQPY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- LBJYAILUMSUTAM-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asn-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O LBJYAILUMSUTAM-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N Ala-Asp-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- IKKVASZHTMKJIR-ZKWXMUAHSA-N Ala-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IKKVASZHTMKJIR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVFVBBGVOILKPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- XUCHENWTTBFODJ-FXQIFTODSA-N Ala-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XUCHENWTTBFODJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- BHTBAVZSZCQZPT-GUBZILKMSA-N Ala-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C)N BHTBAVZSZCQZPT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- KLALXKYLOMZDQT-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Asn Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KLALXKYLOMZDQT-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N Ala-Thr-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 2
- 241000134916 Amanita Species 0.000 description 2
- BVBKBQRPOJFCQM-DCAQKATOSA-N Arg-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BVBKBQRPOJFCQM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- OCOZPTHLDVSFCZ-BPUTZDHNSA-N Arg-Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N OCOZPTHLDVSFCZ-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 2
- ALOVURZCXKYKJC-NAKRPEOUSA-N Arg-Asp-Gln-Ser Chemical compound N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ALOVURZCXKYKJC-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- HKRXJBBCQBAGIM-FXQIFTODSA-N Arg-Asp-Ser Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)CN=C(N)N HKRXJBBCQBAGIM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- KBBKCNHWCDJPGN-GUBZILKMSA-N Arg-Gln-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O KBBKCNHWCDJPGN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- UHFUZWSZQKMDSX-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UHFUZWSZQKMDSX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- UULLJGQFCDXVTQ-CYDGBPFRSA-N Arg-Pro-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O UULLJGQFCDXVTQ-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 2
- UZSQXCMNUPKLCC-FJXKBIBVSA-N Arg-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O UZSQXCMNUPKLCC-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 2
- CPTXATAOUQJQRO-GUBZILKMSA-N Arg-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CPTXATAOUQJQRO-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- HUZGPXBILPMCHM-IHRRRGAJSA-N Asn-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O HUZGPXBILPMCHM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- PCKRJVZAQZWNKM-WHFBIAKZSA-N Asn-Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O PCKRJVZAQZWNKM-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- AYZAWXAPBAYCHO-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N AYZAWXAPBAYCHO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- NVGWESORMHFISY-SRVKXCTJSA-N Asn-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NVGWESORMHFISY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- GNKVBRYFXYWXAB-WDSKDSINSA-N Asn-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O GNKVBRYFXYWXAB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- OOWSBIOUKIUWLO-RCOVLWMOSA-N Asn-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OOWSBIOUKIUWLO-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 2
- PHJPKNUWWHRAOC-PEFMBERDSA-N Asn-Ile-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N PHJPKNUWWHRAOC-PEFMBERDSA-N 0.000 description 2
- COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- YUOXLJYVSZYPBJ-CIUDSAMLSA-N Asn-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YUOXLJYVSZYPBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- GZXOUBTUAUAVHD-ACZMJKKPSA-N Asn-Ser-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GZXOUBTUAUAVHD-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- QUMKPKWYDVMGNT-NUMRIWBASA-N Asn-Thr-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O QUMKPKWYDVMGNT-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- JZLFYAAGGYMRIK-BYULHYEWSA-N Asn-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O JZLFYAAGGYMRIK-BYULHYEWSA-N 0.000 description 2
- XYBJLTKSGFBLCS-QXEWZRGKSA-N Asp-Arg-Val Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O XYBJLTKSGFBLCS-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 2
- VBVKSAFJPVXMFJ-CIUDSAMLSA-N Asp-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N VBVKSAFJPVXMFJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ZSVJVIOVABDTTL-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)O)N ZSVJVIOVABDTTL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- AITKTFCQOBRJTG-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N AITKTFCQOBRJTG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- USNJAPJZSGTTPX-XVSYOHENSA-N Asp-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O USNJAPJZSGTTPX-XVSYOHENSA-N 0.000 description 2
- MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N Asp-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- LLRJPYJQNBMOOO-QEJZJMRPSA-N Asp-Trp-Gln Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N LLRJPYJQNBMOOO-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 2
- QPDUWAUSSWGJSB-NGZCFLSTSA-N Asp-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N QPDUWAUSSWGJSB-NGZCFLSTSA-N 0.000 description 2
- 201000004569 Blindness Diseases 0.000 description 2
- 101100091490 Caenorhabditis elegans hrp-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 108010021988 Cellular Retinol-Binding Proteins Proteins 0.000 description 2
- XIZWKXATMJODQW-KKUMJFAQSA-N Cys-His-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CS)N XIZWKXATMJODQW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N Cys-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 101000834253 Gallus gallus Actin, cytoplasmic 1 Proteins 0.000 description 2
- YJIUYQKQBBQYHZ-ACZMJKKPSA-N Gln-Ala-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YJIUYQKQBBQYHZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- JSYULGSPLTZDHM-NRPADANISA-N Gln-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JSYULGSPLTZDHM-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- HVQCEQTUSWWFOS-WDSKDSINSA-N Gln-Gly-Cys Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N HVQCEQTUSWWFOS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- SMLDOQHTOAAFJQ-WDSKDSINSA-N Gln-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SMLDOQHTOAAFJQ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- ZBKUIQNCRIYVGH-SDDRHHMPSA-N Gln-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N ZBKUIQNCRIYVGH-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 2
- FALJZCPMTGJOHX-SRVKXCTJSA-N Gln-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FALJZCPMTGJOHX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- UESYBOXFJWJVSB-AVGNSLFASA-N Gln-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UESYBOXFJWJVSB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- XQDGOJPVMSWZSO-SRVKXCTJSA-N Gln-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCC(=O)N)N XQDGOJPVMSWZSO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- OSCLNNWLKKIQJM-WDSKDSINSA-N Gln-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O OSCLNNWLKKIQJM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- RDDSZZJOKDVPAE-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RDDSZZJOKDVPAE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- QIQABBIDHGQXGA-ZPFDUUQYSA-N Glu-Ile-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QIQABBIDHGQXGA-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- DNPCBMNFQVTHMA-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O DNPCBMNFQVTHMA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- QDMVXRNLOPTPIE-WDCWCFNPSA-N Glu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QDMVXRNLOPTPIE-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- GWCRIHNSVMOBEQ-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GWCRIHNSVMOBEQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- DWUKOTKSTDWGAE-BQBZGAKWSA-N Gly-Asn-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DWUKOTKSTDWGAE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- PABFFPWEJMEVEC-JGVFFNPUSA-N Gly-Gln-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)CN)C(=O)O PABFFPWEJMEVEC-JGVFFNPUSA-N 0.000 description 2
- QPDUVFSVVAOUHE-XVKPBYJWSA-N Gly-Gln-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)CN)C(O)=O QPDUVFSVVAOUHE-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 2
- VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- ZLCLYFGMKFCDCN-XPUUQOCRSA-N Gly-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN)C(O)=O ZLCLYFGMKFCDCN-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- YXTFLTJYLIAZQG-FJXKBIBVSA-N Gly-Thr-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YXTFLTJYLIAZQG-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JENKOCSDMSVWPY-SRVKXCTJSA-N His-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JENKOCSDMSVWPY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- PLCAEMGSYOYIPP-GUBZILKMSA-N His-Ser-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 PLCAEMGSYOYIPP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 101000899806 Homo sapiens Retinal guanylyl cyclase 1 Proteins 0.000 description 2
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 2
- 108010020056 Hydrogenase Proteins 0.000 description 2
- HTDRTKMNJRRYOJ-SIUGBPQLSA-N Ile-Gln-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HTDRTKMNJRRYOJ-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 2
- DFJJAVZIHDFOGQ-MNXVOIDGSA-N Ile-Glu-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N DFJJAVZIHDFOGQ-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- LEHPJMKVGFPSSP-ZQINRCPSSA-N Ile-Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 LEHPJMKVGFPSSP-ZQINRCPSSA-N 0.000 description 2
- UAELWXJFLZBKQS-WHOFXGATSA-N Ile-Phe-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)NCC(O)=O UAELWXJFLZBKQS-WHOFXGATSA-N 0.000 description 2
- BJECXJHLUJXPJQ-PYJNHQTQSA-N Ile-Pro-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N BJECXJHLUJXPJQ-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 2
- PXKACEXYLPBMAD-JBDRJPRFSA-N Ile-Ser-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PXKACEXYLPBMAD-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 2
- 241000701460 JC polyomavirus Species 0.000 description 2
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VPKIQULSKFVCSM-SRVKXCTJSA-N Leu-Gln-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O VPKIQULSKFVCSM-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N Leu-Pro-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- IDGZVZJLYFTXSL-DCAQKATOSA-N Leu-Ser-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IDGZVZJLYFTXSL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- QWWPYKKLXWOITQ-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C QWWPYKKLXWOITQ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- YIRIDPUGZKHMHT-ACRUOGEOSA-N Leu-Tyr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O YIRIDPUGZKHMHT-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 2
- NLOZZWJNIKKYSC-WDSOQIARSA-N Lys-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 NLOZZWJNIKKYSC-WDSOQIARSA-N 0.000 description 2
- ULUQBUKAPDUKOC-GVXVVHGQSA-N Lys-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ULUQBUKAPDUKOC-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N Lys-Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- IPTUBUUIFRZMJK-ACRUOGEOSA-N Lys-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 IPTUBUUIFRZMJK-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 2
- RMOKGALPSPOYKE-KATARQTJSA-N Lys-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RMOKGALPSPOYKE-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N Met-Gly-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- 108010063312 Metalloproteins Proteins 0.000 description 2
- 102000010750 Metalloproteins Human genes 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N N-L-cysteinyl-L-phenylalanine Natural products SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010047562 NGR peptide Proteins 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- UHRNIXJAGGLKHP-DLOVCJGASA-N Phe-Ala-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UHRNIXJAGGLKHP-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- DJPXNKUDJKGQEE-BZSNNMDCSA-N Phe-Asp-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O DJPXNKUDJKGQEE-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- YYKZDTVQHTUKDW-RYUDHWBXSA-N Phe-Gly-Gln Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N YYKZDTVQHTUKDW-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- HBGFEEQFVBWYJQ-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HBGFEEQFVBWYJQ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- WFHRXJOZEXUKLV-IRXDYDNUSA-N Phe-Gly-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 WFHRXJOZEXUKLV-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- BEEVXUYVEHXWRQ-YESZJQIVSA-N Phe-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CC3=CC=CC=C3)N)C(=O)O BEEVXUYVEHXWRQ-YESZJQIVSA-N 0.000 description 2
- MYQCCQSMKNCNKY-KKUMJFAQSA-N Phe-His-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N MYQCCQSMKNCNKY-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- JLLJTMHNXQTMCK-UBHSHLNASA-N Phe-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JLLJTMHNXQTMCK-UBHSHLNASA-N 0.000 description 2
- RAGOJJCBGXARPO-XVSYOHENSA-N Phe-Thr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RAGOJJCBGXARPO-XVSYOHENSA-N 0.000 description 2
- RVGRUAULSDPKGF-UHFFFAOYSA-N Poloxamer Chemical compound C1CO1.CC1CO1 RVGRUAULSDPKGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 2
- YFNOUBWUIIJQHF-LPEHRKFASA-N Pro-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O YFNOUBWUIIJQHF-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- YKQNVTOIYFQMLW-IHRRRGAJSA-N Pro-Cys-Tyr Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=C(O)C=C1 YKQNVTOIYFQMLW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- DIFXZGPHVCIVSQ-CIUDSAMLSA-N Pro-Gln-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIFXZGPHVCIVSQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- VGVCNKSUVSZEIE-IHRRRGAJSA-N Pro-Phe-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O VGVCNKSUVSZEIE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- SBVPYBFMIGDIDX-SRVKXCTJSA-N Pro-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1N(C(=O)[C@H]2NCCC2)CCC1 SBVPYBFMIGDIDX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- BGWKULMLUIUPKY-BQBZGAKWSA-N Pro-Ser-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 BGWKULMLUIUPKY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N Pro-Ser-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- VVAWNPIOYXAMAL-KJEVXHAQSA-N Pro-Thr-Tyr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VVAWNPIOYXAMAL-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 2
- XDKKMRPRRCOELJ-GUBZILKMSA-N Pro-Val-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 XDKKMRPRRCOELJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- IMNVAOPEMFDAQD-NHCYSSNCSA-N Pro-Val-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IMNVAOPEMFDAQD-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- 101150061360 RBP1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- 102100022663 Retinal guanylyl cyclase 1 Human genes 0.000 description 2
- 108050002017 Retinol dehydrogenase 10 Proteins 0.000 description 2
- 101710178616 Retinol dehydrogenase 12 Proteins 0.000 description 2
- 101710189258 Retinol dehydrogenase 8 Proteins 0.000 description 2
- 101710137010 Retinol-binding protein 3 Proteins 0.000 description 2
- DWUIECHTAMYEFL-XVYDVKMFSA-N Ser-Ala-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 DWUIECHTAMYEFL-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 2
- WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N Ser-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CCCN=C(N)N WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 2
- FMDHKPRACUXATF-ACZMJKKPSA-N Ser-Gln-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FMDHKPRACUXATF-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- WBINSDOPZHQPPM-AVGNSLFASA-N Ser-Glu-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O WBINSDOPZHQPPM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- CLKKNZQUQMZDGD-SRVKXCTJSA-N Ser-His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CC1=CN=CN1 CLKKNZQUQMZDGD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ZKBKUWQVDWWSRI-BZSNNMDCSA-N Ser-Phe-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZKBKUWQVDWWSRI-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- NUEHQDHDLDXCRU-GUBZILKMSA-N Ser-Pro-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NUEHQDHDLDXCRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- FKYWFUYPVKLJLP-DCAQKATOSA-N Ser-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FKYWFUYPVKLJLP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N Ser-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- ZSDXEKUKQAKZFE-XAVMHZPKSA-N Ser-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O ZSDXEKUKQAKZFE-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 2
- PIQRHJQWEPWFJG-UWJYBYFXSA-N Ser-Tyr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PIQRHJQWEPWFJG-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 2
- PCMZJFMUYWIERL-ZKWXMUAHSA-N Ser-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O PCMZJFMUYWIERL-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N Ser-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- LVHHEVGYAZGXDE-KDXUFGMBSA-N Thr-Ala-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O LVHHEVGYAZGXDE-KDXUFGMBSA-N 0.000 description 2
- GCXFWAZRHBRYEM-NUMRIWBASA-N Thr-Gln-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O GCXFWAZRHBRYEM-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- GKWNLDNXMMLRMC-GLLZPBPUSA-N Thr-Glu-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N)O GKWNLDNXMMLRMC-GLLZPBPUSA-N 0.000 description 2
- SLUWOCTZVGMURC-BFHQHQDPSA-N Thr-Gly-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SLUWOCTZVGMURC-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 2
- KKPOGALELPLJTL-MEYUZBJRSA-N Thr-Lys-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 KKPOGALELPLJTL-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 2
- UJQVSMNQMQHVRY-KZVJFYERSA-N Thr-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O UJQVSMNQMQHVRY-KZVJFYERSA-N 0.000 description 2
- STUAPCLEDMKXKL-LKXGYXEUSA-N Thr-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O STUAPCLEDMKXKL-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- AAZOYLQUEQRUMZ-GSSVUCPTSA-N Thr-Thr-Asn Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O AAZOYLQUEQRUMZ-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 2
- MFMGPEKYBXFIRF-SUSMZKCASA-N Thr-Thr-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O MFMGPEKYBXFIRF-SUSMZKCASA-N 0.000 description 2
- NHQVWACSJZJCGJ-FLBSBUHZSA-N Thr-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NHQVWACSJZJCGJ-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 2
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 2
- HYVLNORXQGKONN-NUTKFTJISA-N Trp-Ala-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 HYVLNORXQGKONN-NUTKFTJISA-N 0.000 description 2
- WVHUFSCKCBQKJW-HKUYNNGSSA-N Trp-Gly-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 WVHUFSCKCBQKJW-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 2
- YRSOERSDNRSCBC-XIRDDKMYSA-N Trp-His-Cys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N YRSOERSDNRSCBC-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- RERRMBXDSFMBQE-ZFWWWQNUSA-N Trp-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N RERRMBXDSFMBQE-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 2
- NMKJPMCEKQHRPD-IRXDYDNUSA-N Tyr-Gly-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 NMKJPMCEKQHRPD-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 2
- DMWNPLOERDAHSY-MEYUZBJRSA-N Tyr-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DMWNPLOERDAHSY-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 2
- BYAKMYBZADCNMN-JYJNAYRXSA-N Tyr-Lys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O BYAKMYBZADCNMN-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- WURLIFOWSMBUAR-SLFFLAALSA-N Tyr-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N)C(=O)O WURLIFOWSMBUAR-SLFFLAALSA-N 0.000 description 2
- PLVVHGFEMSDRET-IHPCNDPISA-N Tyr-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N PLVVHGFEMSDRET-IHPCNDPISA-N 0.000 description 2
- LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N Tyr-Thr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 2
- DBOXBUDEAJVKRE-LSJOCFKGSA-N Val-Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N DBOXBUDEAJVKRE-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 2
- OVLIFGQSBSNGHY-KKHAAJSZSA-N Val-Asp-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O OVLIFGQSBSNGHY-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 2
- UZDHNIJRRTUKKC-DLOVCJGASA-N Val-Gln-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N UZDHNIJRRTUKKC-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- NXRAUQGGHPCJIB-RCOVLWMOSA-N Val-Gly-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NXRAUQGGHPCJIB-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 2
- UMPVMAYCLYMYGA-ONGXEEELSA-N Val-Leu-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O UMPVMAYCLYMYGA-ONGXEEELSA-N 0.000 description 2
- ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N Val-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ZHQWPWQNVRCXAX-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 2
- MGVYZTPLGXPVQB-CYDGBPFRSA-N Val-Met-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](C(C)C)N MGVYZTPLGXPVQB-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 2
- ZEBRMWPTJNHXAJ-JYJNAYRXSA-N Val-Phe-Met Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N ZEBRMWPTJNHXAJ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- XBJKAZATRJBDCU-GUBZILKMSA-N Val-Pro-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XBJKAZATRJBDCU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- GQMNEJMFMCJJTD-NHCYSSNCSA-N Val-Pro-Gln Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GQMNEJMFMCJJTD-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 2
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N all-trans-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N 0.000 description 2
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 2
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 2
- 210000004436 artificial bacterial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 2
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000003889 eye drop Substances 0.000 description 2
- 229940012356 eye drops Drugs 0.000 description 2
- 230000004438 eyesight Effects 0.000 description 2
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 2
- 230000007849 functional defect Effects 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010077435 glycyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 2
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 2
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 2
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 2
- 238000012014 optical coherence tomography Methods 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 2
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 2
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 229960000502 poloxamer Drugs 0.000 description 2
- 108010014614 prolyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108700042769 prolyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 2
- 108010015796 prolylisoleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 210000001525 retina Anatomy 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 2
- 108010015666 tryptophyl-leucyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- 208000029257 vision disease Diseases 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- NCYCYZXNIZJOKI-IOUUIBBYSA-N 11-cis-retinal Chemical compound O=C/C=C(\C)/C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C NCYCYZXNIZJOKI-IOUUIBBYSA-N 0.000 description 1
- NCYCYZXNIZJOKI-HPNHMNAASA-N 11Z-retinal Natural products CC(=C/C=O)C=C/C=C(C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C NCYCYZXNIZJOKI-HPNHMNAASA-N 0.000 description 1
- HXUVTXPOZRFMOY-NSHDSACASA-N 2-[[(2s)-2-[[2-[(2-aminoacetyl)amino]acetyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]acetic acid Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HXUVTXPOZRFMOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- KDZIGQIDPXKMBA-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-amino-3-methylbutanoyl)amino]acetyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(=O)NC(CO)C(=O)NC(C(O)=O)CCC(O)=O KDZIGQIDPXKMBA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010067484 Adverse reaction Diseases 0.000 description 1
- CXRCVCURMBFFOL-FXQIFTODSA-N Ala-Ala-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O CXRCVCURMBFFOL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N Ala-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)N JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- LWUWMHIOBPTZBA-DCAQKATOSA-N Ala-Arg-Lys Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LWUWMHIOBPTZBA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XQJAFSDFQZPYCU-UWJYBYFXSA-N Ala-Asn-Tyr Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N XQJAFSDFQZPYCU-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- LSLIRHLIUDVNBN-CIUDSAMLSA-N Ala-Asp-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN LSLIRHLIUDVNBN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- UQJUGHFKNKGHFQ-VZFHVOOUSA-N Ala-Cys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UQJUGHFKNKGHFQ-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- OMMDTNGURYRDAC-NRPADANISA-N Ala-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OMMDTNGURYRDAC-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- CCDFBRZVTDDJNM-GUBZILKMSA-N Ala-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CCDFBRZVTDDJNM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- RGDKRCPIFODMHK-HJWJTTGWSA-N Ala-Leu-Leu-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 RGDKRCPIFODMHK-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N Ala-Leu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- XHNLCGXYBXNRIS-BJDJZHNGSA-N Ala-Lys-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O XHNLCGXYBXNRIS-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- RMAWDDRDTRSZIR-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RMAWDDRDTRSZIR-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N Ala-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- YCTIYBUTCKNOTI-UWJYBYFXSA-N Ala-Tyr-Asp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N YCTIYBUTCKNOTI-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- ZJLORAAXDAJLDC-CQDKDKBSSA-N Ala-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ZJLORAAXDAJLDC-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 1
- ASQYTJJWAMDISW-BPUTZDHNSA-N Arg-Asp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N ASQYTJJWAMDISW-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- VXXHDZKEQNGXNU-QXEWZRGKSA-N Arg-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VXXHDZKEQNGXNU-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- VNFWDYWTSHFRRG-SRVKXCTJSA-N Arg-Gln-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VNFWDYWTSHFRRG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BQBPFMNVOWDLHO-XIRDDKMYSA-N Arg-Gln-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N BQBPFMNVOWDLHO-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- GNYUVVJYGJFKHN-RVMXOQNASA-N Arg-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N GNYUVVJYGJFKHN-RVMXOQNASA-N 0.000 description 1
- LLUGJARLJCGLAR-CYDGBPFRSA-N Arg-Ile-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N LLUGJARLJCGLAR-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- GMFAGHNRXPSSJS-SRVKXCTJSA-N Arg-Leu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GMFAGHNRXPSSJS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UZGFHWIJWPUPOH-IHRRRGAJSA-N Arg-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UZGFHWIJWPUPOH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FIQKRDXFTANIEJ-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N FIQKRDXFTANIEJ-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- KZXPVYVSHUJCEO-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Lys Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KZXPVYVSHUJCEO-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- VUGWHBXPMAHEGZ-SRVKXCTJSA-N Arg-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VUGWHBXPMAHEGZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- INOIAEUXVVNJKA-XGEHTFHBSA-N Arg-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O INOIAEUXVVNJKA-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- ZPWMEWYQBWSGAO-ZJDVBMNYSA-N Arg-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZPWMEWYQBWSGAO-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- WTFIFQWLQXZLIZ-UMPQAUOISA-N Arg-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O WTFIFQWLQXZLIZ-UMPQAUOISA-N 0.000 description 1
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000238421 Arthropoda Species 0.000 description 1
- 102100024081 Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1 Human genes 0.000 description 1
- PFOYSEIHFVKHNF-FXQIFTODSA-N Asn-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O PFOYSEIHFVKHNF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SLKLLQWZQHXYSV-CIUDSAMLSA-N Asn-Ala-Lys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O SLKLLQWZQHXYSV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CIBWFJFMOBIFTE-CIUDSAMLSA-N Asn-Arg-Gln Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)CN=C(N)N CIBWFJFMOBIFTE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LJUOLNXOWSWGKF-ACZMJKKPSA-N Asn-Asn-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LJUOLNXOWSWGKF-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- DAPLJWATMAXPPZ-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DAPLJWATMAXPPZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KXFCBAHYSLJCCY-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O KXFCBAHYSLJCCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XSGBIBGAMKTHMY-WHFBIAKZSA-N Asn-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O XSGBIBGAMKTHMY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- GFFRWIJAFFMQGM-NUMRIWBASA-N Asn-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GFFRWIJAFFMQGM-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N Asn-Gly-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JQSWHKKUZMTOIH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- IKLAUGBIDCDFOY-SRVKXCTJSA-N Asn-His-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IKLAUGBIDCDFOY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- WQLJRNRLHWJIRW-KKUMJFAQSA-N Asn-His-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O WQLJRNRLHWJIRW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- SPCONPVIDFMDJI-QSFUFRPTSA-N Asn-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SPCONPVIDFMDJI-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- HFPXZWPUVFVNLL-GUBZILKMSA-N Asn-Leu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O HFPXZWPUVFVNLL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JEEFEQCRXKPQHC-KKUMJFAQSA-N Asn-Leu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JEEFEQCRXKPQHC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YXVAESUIQFDBHN-SRVKXCTJSA-N Asn-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXVAESUIQFDBHN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- GKKUBLFXKRDMFC-BQBZGAKWSA-N Asn-Pro-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O GKKUBLFXKRDMFC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- GMUOCGCDOYYWPD-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GMUOCGCDOYYWPD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- JPSODRNUDXONAS-XIRDDKMYSA-N Asn-Trp-His Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JPSODRNUDXONAS-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- DPSUVAPLRQDWAO-YDHLFZDLSA-N Asn-Tyr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N DPSUVAPLRQDWAO-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- XEDQMTWEYFBOIK-ACZMJKKPSA-N Asp-Ala-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XEDQMTWEYFBOIK-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N Asp-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IXIWEFWRKIUMQX-DCAQKATOSA-N Asp-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O IXIWEFWRKIUMQX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- UQBGYPFHWFZMCD-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UQBGYPFHWFZMCD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- WCFCYFDBMNFSPA-ACZMJKKPSA-N Asp-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O WCFCYFDBMNFSPA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HAFCJCDJGIOYPW-WDSKDSINSA-N Asp-Gly-Gln Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HAFCJCDJGIOYPW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- PGUYEUCYVNZGGV-QWRGUYRKSA-N Asp-Gly-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PGUYEUCYVNZGGV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N Asp-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LIVXPXUVXFRWNY-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O LIVXPXUVXFRWNY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N Asp-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VSMYBNPOHYAXSD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IDDMGSKZQDEDGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- MVRGBQGZSDJBSM-GMOBBJLQSA-N Asp-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC(=O)O)N MVRGBQGZSDJBSM-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- KGHLGJAXYSVNJP-WHFBIAKZSA-N Asp-Ser-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O KGHLGJAXYSVNJP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- JSHWXQIZOCVWIA-ZKWXMUAHSA-N Asp-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JSHWXQIZOCVWIA-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- UTLCRGFJFSZWAW-OLHMAJIHSA-N Asp-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O UTLCRGFJFSZWAW-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- JJQGZGOEDSSHTE-FOHZUACHSA-N Asp-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JJQGZGOEDSSHTE-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N Asp-Thr-Leu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- ALMIMUZAWTUNIO-BZSNNMDCSA-N Asp-Tyr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ALMIMUZAWTUNIO-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- SFJUYBCDQBAYAJ-YDHLFZDLSA-N Asp-Val-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SFJUYBCDQBAYAJ-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 241000201370 Autographa californica nucleopolyhedrovirus Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 206010005176 Blindness congenital Diseases 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 101710197665 Capsid protein VP2 Proteins 0.000 description 1
- 101800001319 Capsid protein VP3 Proteins 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 102100035673 Centrosomal protein of 290 kDa Human genes 0.000 description 1
- 208000024304 Choroidal Effusions Diseases 0.000 description 1
- 108020004638 Circular DNA Proteins 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100029362 Cone-rod homeobox protein Human genes 0.000 description 1
- 108091029523 CpG island Proteins 0.000 description 1
- ZOLXQKZHYOHHMD-DLOVCJGASA-N Cys-Ala-Phe Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N ZOLXQKZHYOHHMD-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- YZFCGHIBLBDZDA-ZLUOBGJFSA-N Cys-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YZFCGHIBLBDZDA-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SKSJPIBFNFPTJB-NKWVEPMBSA-N Cys-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CS)N)C(=O)O SKSJPIBFNFPTJB-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- RJPKQCFHEPPTGL-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RJPKQCFHEPPTGL-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- PXEGEYISOXISDV-XIRDDKMYSA-N Cys-Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CS)=CNC2=C1 PXEGEYISOXISDV-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- 206010011968 Decreased immune responsiveness Diseases 0.000 description 1
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 241001524679 Escherichia virus M13 Species 0.000 description 1
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 108010046649 GDNP peptide Proteins 0.000 description 1
- HHWQMFIGMMOVFK-WDSKDSINSA-N Gln-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O HHWQMFIGMMOVFK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- NUMFTVCBONFQIQ-DRZSPHRISA-N Gln-Ala-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NUMFTVCBONFQIQ-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- LJEPDHWNQXPXMM-NHCYSSNCSA-N Gln-Arg-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LJEPDHWNQXPXMM-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- IVCOYUURLWQDJQ-LPEHRKFASA-N Gln-Gln-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O IVCOYUURLWQDJQ-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- VOLVNCMGXWDDQY-LPEHRKFASA-N Gln-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O VOLVNCMGXWDDQY-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- ORYMMTRPKVTGSJ-XVKPBYJWSA-N Gln-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ORYMMTRPKVTGSJ-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- KHGGWBRVRPHFMH-PEFMBERDSA-N Gln-Ile-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N KHGGWBRVRPHFMH-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- FTIJVMLAGRAYMJ-MNXVOIDGSA-N Gln-Ile-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FTIJVMLAGRAYMJ-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- ITZWDGBYBPUZRG-KBIXCLLPSA-N Gln-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ITZWDGBYBPUZRG-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- XZLLTYBONVKGLO-SDDRHHMPSA-N Gln-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O XZLLTYBONVKGLO-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- OZEQPCDLCDRCGY-SOUVJXGZSA-N Gln-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O OZEQPCDLCDRCGY-SOUVJXGZSA-N 0.000 description 1
- HMIXCETWRYDVMO-GUBZILKMSA-N Gln-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HMIXCETWRYDVMO-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SGVGIVDZLSHSEN-RYUDHWBXSA-N Gln-Tyr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(O)=O SGVGIVDZLSHSEN-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- UBRQJXFDVZNYJP-AVGNSLFASA-N Gln-Tyr-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O UBRQJXFDVZNYJP-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UQKVUFGUSVYJMQ-IRIUXVKKSA-N Gln-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O UQKVUFGUSVYJMQ-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- BBFCMGBMYIAGRS-AUTRQRHGSA-N Gln-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BBFCMGBMYIAGRS-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- PBEQPAZRHDVJQI-SRVKXCTJSA-N Glu-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N PBEQPAZRHDVJQI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JPHYJQHPILOKHC-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O JPHYJQHPILOKHC-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- SBCYJMOOHUDWDA-NUMRIWBASA-N Glu-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SBCYJMOOHUDWDA-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- WATXSTJXNBOHKD-LAEOZQHASA-N Glu-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WATXSTJXNBOHKD-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- HUFCEIHAFNVSNR-IHRRRGAJSA-N Glu-Gln-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HUFCEIHAFNVSNR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N Glu-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N 0.000 description 1
- MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- CUXJIASLBRJOFV-LAEOZQHASA-N Glu-Gly-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CUXJIASLBRJOFV-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- WVTIBGWZUMJBFY-GUBZILKMSA-N Glu-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WVTIBGWZUMJBFY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- CXRWMMRLEMVSEH-PEFMBERDSA-N Glu-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CXRWMMRLEMVSEH-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N Glu-Lys-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SUIAHERNFYRBDZ-GVXVVHGQSA-N Glu-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SUIAHERNFYRBDZ-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- CBWKURKPYSLMJV-SOUVJXGZSA-N Glu-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O CBWKURKPYSLMJV-SOUVJXGZSA-N 0.000 description 1
- DXVOKNVIKORTHQ-GUBZILKMSA-N Glu-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DXVOKNVIKORTHQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JVYNYWXHZWVJEF-NUMRIWBASA-N Glu-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O JVYNYWXHZWVJEF-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- RGJKYNUINKGPJN-RWRJDSDZSA-N Glu-Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RGJKYNUINKGPJN-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- DLISPGXMKZTWQG-IFFSRLJSSA-N Glu-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DLISPGXMKZTWQG-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N Glu-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 BPCLDCNZBUYGOD-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- QGAJQIGFFIQJJK-IHRRRGAJSA-N Glu-Tyr-Gln Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O QGAJQIGFFIQJJK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N Glu-Tyr-Ser Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O VXEFAWJTFAUDJK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- QXPRJQPCFXMCIY-NKWVEPMBSA-N Gly-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN QXPRJQPCFXMCIY-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- CLODWIOAKCSBAN-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CLODWIOAKCSBAN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CIMULJZTTOBOPN-WHFBIAKZSA-N Gly-Asn-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CIMULJZTTOBOPN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- DJTXYXZNNDDEOU-WHFBIAKZSA-N Gly-Asn-Cys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN)C(=O)N DJTXYXZNNDDEOU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- XCLCVBYNGXEVDU-WHFBIAKZSA-N Gly-Asn-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XCLCVBYNGXEVDU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- KQDMENMTYNBWMR-WHFBIAKZSA-N Gly-Asp-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KQDMENMTYNBWMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- XLFHCWHXKSFVIB-BQBZGAKWSA-N Gly-Gln-Gln Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O XLFHCWHXKSFVIB-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- INLIXXRWNUKVCF-JTQLQIEISA-N Gly-Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 INLIXXRWNUKVCF-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- ALOBJFDJTMQQPW-ONGXEEELSA-N Gly-His-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)CN ALOBJFDJTMQQPW-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WZSHYFGOLPXPLL-RYUDHWBXSA-N Gly-Phe-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WZSHYFGOLPXPLL-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- JYPCXBJRLBHWME-IUCAKERBSA-N Gly-Pro-Arg Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JYPCXBJRLBHWME-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- QSQXZZCGPXQBPP-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Cys Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O QSQXZZCGPXQBPP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SSFWXSNOKDZNHY-QXEWZRGKSA-N Gly-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN SSFWXSNOKDZNHY-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- IRJWAYCXIYUHQE-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN IRJWAYCXIYUHQE-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- FKESCSGWBPUTPN-FOHZUACHSA-N Gly-Thr-Asn Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FKESCSGWBPUTPN-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- PNUFMLXHOLFRLD-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 PNUFMLXHOLFRLD-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- SYOJVRNQCXYEOV-XVKPBYJWSA-N Gly-Val-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SYOJVRNQCXYEOV-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- IZVICCORZOSGPT-JSGCOSHPSA-N Gly-Val-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IZVICCORZOSGPT-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- KSOBNUBCYHGUKH-UWVGGRQHSA-N Gly-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CN KSOBNUBCYHGUKH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 102100035368 Growth/differentiation factor 6 Human genes 0.000 description 1
- 208000016605 Hereditary Eye disease Diseases 0.000 description 1
- BDHUXUFYNUOUIT-SRVKXCTJSA-N His-Asp-Lys Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N BDHUXUFYNUOUIT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AASLOGQZZKZWKH-SRVKXCTJSA-N His-Cys-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N AASLOGQZZKZWKH-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HVCRQRQPIIRNLY-IUCAKERBSA-N His-Gln-Gly Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)NCC(=O)O)N HVCRQRQPIIRNLY-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- VJJSDSNFXCWCEJ-DJFWLOJKSA-N His-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O VJJSDSNFXCWCEJ-DJFWLOJKSA-N 0.000 description 1
- ZSKJIISDJXJQPV-BZSNNMDCSA-N His-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 ZSKJIISDJXJQPV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- QEYUCKCWTMIERU-SRVKXCTJSA-N His-Lys-Asp Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N QEYUCKCWTMIERU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VUUFXXGKMPLKNH-BZSNNMDCSA-N His-Phe-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CN=CN3)N VUUFXXGKMPLKNH-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- ZVKDCQVQTGYBQT-LSJOCFKGSA-N His-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZVKDCQVQTGYBQT-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- XIGFLVCAVQQGNS-IHRRRGAJSA-N His-Pro-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XIGFLVCAVQQGNS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- LNDVNHOSZQPJGI-AVGNSLFASA-N His-Pro-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CN=CN1 LNDVNHOSZQPJGI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IAYPZSHNZQHQNO-KKUMJFAQSA-N His-Ser-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N IAYPZSHNZQHQNO-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- GIRSNERMXCMDBO-GARJFASQSA-N His-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)C(=O)O GIRSNERMXCMDBO-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- GBMSSORHVHAYLU-QTKMDUPCSA-N His-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O GBMSSORHVHAYLU-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- 241001272567 Hominoidea Species 0.000 description 1
- 101000833576 Homo sapiens Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000919370 Homo sapiens Cone-rod homeobox protein Proteins 0.000 description 1
- 101001023964 Homo sapiens Growth/differentiation factor 6 Proteins 0.000 description 1
- 101001044118 Homo sapiens Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001054334 Homo sapiens Interferon beta Proteins 0.000 description 1
- 101001047038 Homo sapiens Inward rectifier potassium channel 13 Proteins 0.000 description 1
- 101001017786 Homo sapiens Lecithin retinol acyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000996052 Homo sapiens Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000610652 Homo sapiens Peripherin-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000726148 Homo sapiens Protein crumbs homolog 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000652369 Homo sapiens Spermatogenesis-associated protein 7 Proteins 0.000 description 1
- 101000772173 Homo sapiens Tubby-related protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001104110 Homo sapiens X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1 Proteins 0.000 description 1
- HERITAGIPLEJMT-GVARAGBVSA-N Ile-Ala-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HERITAGIPLEJMT-GVARAGBVSA-N 0.000 description 1
- SACHLUOUHCVIKI-GMOBBJLQSA-N Ile-Arg-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N SACHLUOUHCVIKI-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- DVRDRICMWUSCBN-UKJIMTQDSA-N Ile-Gln-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N DVRDRICMWUSCBN-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 1
- BEWFWZRGBDVXRP-PEFMBERDSA-N Ile-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BEWFWZRGBDVXRP-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- DFFTXLCCDFYRKD-MBLNEYKQSA-N Ile-Gly-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N DFFTXLCCDFYRKD-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- NUKXXNFEUZGPRO-BJDJZHNGSA-N Ile-Leu-Cys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N NUKXXNFEUZGPRO-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N Ile-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- OVDKXUDMKXAZIV-ZPFDUUQYSA-N Ile-Lys-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N OVDKXUDMKXAZIV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- XQLGNKLSPYCRMZ-HJWJTTGWSA-N Ile-Phe-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N XQLGNKLSPYCRMZ-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- FQYQMFCIJNWDQZ-CYDGBPFRSA-N Ile-Pro-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 FQYQMFCIJNWDQZ-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- MLSUZXHSNRBDCI-CYDGBPFRSA-N Ile-Pro-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N MLSUZXHSNRBDCI-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- NAFIFZNBSPWYOO-RWRJDSDZSA-N Ile-Thr-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N NAFIFZNBSPWYOO-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- COWHUQXTSYTKQC-RWRJDSDZSA-N Ile-Thr-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N COWHUQXTSYTKQC-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- NURNJECQNNCRBK-FLBSBUHZSA-N Ile-Thr-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NURNJECQNNCRBK-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 1
- RTSQPLLOYSGMKM-DSYPUSFNSA-N Ile-Trp-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N RTSQPLLOYSGMKM-DSYPUSFNSA-N 0.000 description 1
- WIYDLTIBHZSPKY-HJWJTTGWSA-N Ile-Val-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 WIYDLTIBHZSPKY-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- YHFPHRUWZMEOIX-CYDGBPFRSA-N Ile-Val-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N YHFPHRUWZMEOIX-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 102100021602 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- 102100022843 Inward rectifier potassium channel 13 Human genes 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N L-isoleucyl-L-alanine Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N L-valyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000009708 Leber congenital amaurosis 17 Diseases 0.000 description 1
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 1
- STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N Leu-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O STAVRDQLZOTNKJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- OIARJGNVARWKFP-YUMQZZPRSA-N Leu-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O OIARJGNVARWKFP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VIWUBXKCYJGNCL-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 VIWUBXKCYJGNCL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OXKYZSRZKBTVEY-ZPFDUUQYSA-N Leu-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OXKYZSRZKBTVEY-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- YKNBJXOJTURHCU-DCAQKATOSA-N Leu-Asp-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YKNBJXOJTURHCU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VQPPIMUZCZCOIL-GUBZILKMSA-N Leu-Gln-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VQPPIMUZCZCOIL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FQZPTCNSNPWHLJ-AVGNSLFASA-N Leu-Gln-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O FQZPTCNSNPWHLJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N Leu-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LLBQJYDYOLIQAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- HYMLKESRWLZDBR-WEDXCCLWSA-N Leu-Gly-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HYMLKESRWLZDBR-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- XQXGNBFMAXWIGI-MXAVVETBSA-N Leu-His-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CN=CN1 XQXGNBFMAXWIGI-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- KUIDCYNIEJBZBU-AJNGGQMLSA-N Leu-Ile-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KUIDCYNIEJBZBU-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- HNDWYLYAYNBWMP-AJNGGQMLSA-N Leu-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N HNDWYLYAYNBWMP-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- JKSIBWITFMQTOA-XUXIUFHCSA-N Leu-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JKSIBWITFMQTOA-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- REPBGZHJKYWFMJ-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N REPBGZHJKYWFMJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BIZNDKMFQHDOIE-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 BIZNDKMFQHDOIE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- AIRUUHAOKGVJAD-JYJNAYRXSA-N Leu-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AIRUUHAOKGVJAD-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- KTOIECMYZZGVSI-BZSNNMDCSA-N Leu-Phe-His Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 KTOIECMYZZGVSI-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- PJWOOBTYQNNRBF-BZSNNMDCSA-N Leu-Phe-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N PJWOOBTYQNNRBF-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BMVFXOQHDQZAQU-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N BMVFXOQHDQZAQU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- UCXQIIIFOOGYEM-ULQDDVLXSA-N Leu-Pro-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 UCXQIIIFOOGYEM-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N Leu-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SVBJIZVVYJYGLA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N Leu-Thr-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- FPFOYSCDUWTZBF-IHPCNDPISA-N Leu-Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 FPFOYSCDUWTZBF-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- BTEMNFBEAAOGBR-BZSNNMDCSA-N Leu-Tyr-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N BTEMNFBEAAOGBR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 description 1
- XFIHDSBIPWEYJJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XFIHDSBIPWEYJJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IXHKPDJKKCUKHS-GARJFASQSA-N Lys-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N IXHKPDJKKCUKHS-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- SJNZALDHDUYDBU-IHRRRGAJSA-N Lys-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O SJNZALDHDUYDBU-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DEFGUIIUYAUEDU-ZPFDUUQYSA-N Lys-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O DEFGUIIUYAUEDU-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N Lys-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FACUGMGEFUEBTI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QUYCUALODHJQLK-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QUYCUALODHJQLK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VSRXPEHZMHSFKU-IUCAKERBSA-N Lys-Gln-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VSRXPEHZMHSFKU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- NDORZBUHCOJQDO-GVXVVHGQSA-N Lys-Gln-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NDORZBUHCOJQDO-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- ZXEUFAVXODIPHC-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ZXEUFAVXODIPHC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N Lys-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- LCMWVZLBCUVDAZ-IUCAKERBSA-N Lys-Gly-Glu Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC([O-])=O LCMWVZLBCUVDAZ-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- GNLJXWBNLAIPEP-MELADBBJSA-N Lys-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O GNLJXWBNLAIPEP-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- KYNNSEJZFVCDIV-ZPFDUUQYSA-N Lys-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KYNNSEJZFVCDIV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HVAUKHLDSDDROB-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HVAUKHLDSDDROB-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- TWPCWKVOZDUYAA-KKUMJFAQSA-N Lys-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O TWPCWKVOZDUYAA-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- LNMKRJJLEFASGA-BZSNNMDCSA-N Lys-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LNMKRJJLEFASGA-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- BOJYMMBYBNOOGG-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BOJYMMBYBNOOGG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PDIDTSZKKFEDMB-UWVGGRQHSA-N Lys-Pro-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O PDIDTSZKKFEDMB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- MIROMRNASYKZNL-ULQDDVLXSA-N Lys-Pro-Tyr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MIROMRNASYKZNL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- PSVAVKGDUAKZKU-BZSNNMDCSA-N Lys-Tyr-His Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O PSVAVKGDUAKZKU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- MIMXMVDLMDMOJD-BZSNNMDCSA-N Lys-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MIMXMVDLMDMOJD-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 description 1
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 description 1
- YRAWWKUTNBILNT-FXQIFTODSA-N Met-Ala-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YRAWWKUTNBILNT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VHGIWFGJIHTASW-FXQIFTODSA-N Met-Ala-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VHGIWFGJIHTASW-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- WXHHTBVYQOSYSL-FXQIFTODSA-N Met-Ala-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WXHHTBVYQOSYSL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- HUKLXYYPZWPXCC-KZVJFYERSA-N Met-Ala-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HUKLXYYPZWPXCC-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- DZTDEZSHBVRUCQ-FXQIFTODSA-N Met-Asp-Cys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N DZTDEZSHBVRUCQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DGNZGCQSVGGYJS-BQBZGAKWSA-N Met-Gly-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O DGNZGCQSVGGYJS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BMHIFARYXOJDLD-WPRPVWTQSA-N Met-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BMHIFARYXOJDLD-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- HWROAFGWPQUPTE-OSUNSFLBSA-N Met-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N HWROAFGWPQUPTE-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- SMVTWPOATVIXTN-NAKRPEOUSA-N Met-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O SMVTWPOATVIXTN-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- VYDLZDRMOFYOGV-TUAOUCFPSA-N Met-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N VYDLZDRMOFYOGV-TUAOUCFPSA-N 0.000 description 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 102100034451 Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 1 Human genes 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 238000013324 OneBac system Methods 0.000 description 1
- 102000010175 Opsin Human genes 0.000 description 1
- 108050001704 Opsin Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 description 1
- 241000701945 Parvoviridae Species 0.000 description 1
- 102100040375 Peripherin-2 Human genes 0.000 description 1
- UNLYPPYNDXHGDG-IHRRRGAJSA-N Phe-Gln-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 UNLYPPYNDXHGDG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JWQWPTLEOFNCGX-AVGNSLFASA-N Phe-Glu-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JWQWPTLEOFNCGX-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N Phe-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- WLYPRKLMRIYGPP-JYJNAYRXSA-N Phe-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 WLYPRKLMRIYGPP-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- GPLWGAYGROGDEN-BZSNNMDCSA-N Phe-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GPLWGAYGROGDEN-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- CZQZSMJXFGGBHM-KKUMJFAQSA-N Phe-Pro-Gln Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O CZQZSMJXFGGBHM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NJJBATPLUQHRBM-IHRRRGAJSA-N Phe-Pro-Ser Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O NJJBATPLUQHRBM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WEDZFLRYSIDIRX-IHRRRGAJSA-N Phe-Ser-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 WEDZFLRYSIDIRX-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- HBXAOEBRGLCLIW-AVGNSLFASA-N Phe-Ser-Gln Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N HBXAOEBRGLCLIW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N Phe-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O QSWKNJAPHQDAAS-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- XNMYNGDKJNOKHH-BZSNNMDCSA-N Phe-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O XNMYNGDKJNOKHH-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- VIIRRNQMMIHYHQ-XHSDSOJGSA-N Phe-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N VIIRRNQMMIHYHQ-XHSDSOJGSA-N 0.000 description 1
- 101710182846 Polyhedrin Proteins 0.000 description 1
- DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 DZZCICYRSZASNF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VXCHGLYSIOOZIS-GUBZILKMSA-N Pro-Ala-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 VXCHGLYSIOOZIS-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DBALDZKOTNSBFM-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O DBALDZKOTNSBFM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- APKRGYLBSCWJJP-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O APKRGYLBSCWJJP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ICTZKEXYDDZZFP-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Pro Chemical compound N([C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 ICTZKEXYDDZZFP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- MLQVJYMFASXBGZ-IHRRRGAJSA-N Pro-Asn-Tyr Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O MLQVJYMFASXBGZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WGAQWMRJUFQXMF-ZPFDUUQYSA-N Pro-Gln-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WGAQWMRJUFQXMF-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- UEHYFUCOGHWASA-HJGDQZAQSA-N Pro-Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 UEHYFUCOGHWASA-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- CLNJSLSHKJECME-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 CLNJSLSHKJECME-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N Pro-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- BODDREDDDRZUCF-QTKMDUPCSA-N Pro-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O BODDREDDDRZUCF-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- GNADVDLLGVSXLS-ULQDDVLXSA-N Pro-Phe-His Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(O)=O GNADVDLLGVSXLS-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- HOTVCUAVDQHUDB-UFYCRDLUSA-N Pro-Phe-Tyr Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=C(O)C=C1 HOTVCUAVDQHUDB-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- FYKUEXMZYFIZKA-DCAQKATOSA-N Pro-Pro-Gln Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O FYKUEXMZYFIZKA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NAIPAPCKKRCMBL-JYJNAYRXSA-N Pro-Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 NAIPAPCKKRCMBL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SNGZLPOXVRTNMB-LPEHRKFASA-N Pro-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O SNGZLPOXVRTNMB-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- UGDMQJSXSSZUKL-IHRRRGAJSA-N Pro-Ser-Tyr Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O UGDMQJSXSSZUKL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DMNANGOFEUVBRV-GJZGRUSLSA-N Pro-Trp-Gly Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)NCC(=O)O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 DMNANGOFEUVBRV-GJZGRUSLSA-N 0.000 description 1
- IIRBTQHFVNGPMQ-AVGNSLFASA-N Pro-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 IIRBTQHFVNGPMQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HCBIBCJNVBAKAB-UHFFFAOYSA-N Procaine hydrochloride Chemical compound Cl.CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 HCBIBCJNVBAKAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100027331 Protein crumbs homolog 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710150114 Protein rep Proteins 0.000 description 1
- 108010079005 RDV peptide Proteins 0.000 description 1
- 208000037418 Rare genetic eye disease Diseases 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 101710152114 Replication protein Proteins 0.000 description 1
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 1
- 201000007737 Retinal degeneration Diseases 0.000 description 1
- 206010038923 Retinopathy Diseases 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- ZUGXSSFMTXKHJS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZUGXSSFMTXKHJS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- FCRMLGJMPXCAHD-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FCRMLGJMPXCAHD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- HQTKVSCNCDLXSX-BQBZGAKWSA-N Ser-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O HQTKVSCNCDLXSX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N Ser-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OYEDZGNMSBZCIM-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- UBRXAVQWXOWRSJ-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asn-Asp Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N UBRXAVQWXOWRSJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ICHZYBVODUVUKN-SRVKXCTJSA-N Ser-Asn-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ICHZYBVODUVUKN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N Ser-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- CRZRTKAVUUGKEQ-ACZMJKKPSA-N Ser-Gln-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CRZRTKAVUUGKEQ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YMAWDPHQVABADW-CIUDSAMLSA-N Ser-Gln-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O YMAWDPHQVABADW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QKQDTEYDEIJPNK-GUBZILKMSA-N Ser-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QKQDTEYDEIJPNK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- GZFAWAQTEYDKII-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CO GZFAWAQTEYDKII-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- MLSQXWSRHURDMF-GARJFASQSA-N Ser-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O MLSQXWSRHURDMF-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- GVIGVIOEYBOTCB-XIRDDKMYSA-N Ser-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 GVIGVIOEYBOTCB-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- IXZHZUGGKLRHJD-DCAQKATOSA-N Ser-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IXZHZUGGKLRHJD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NNFMANHDYSVNIO-DCAQKATOSA-N Ser-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NNFMANHDYSVNIO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N Ser-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ILZAUMFXKSIUEF-SRVKXCTJSA-N Ser-Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ILZAUMFXKSIUEF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CUXJENOFJXOSOZ-BIIVOSGPSA-N Ser-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O CUXJENOFJXOSOZ-BIIVOSGPSA-N 0.000 description 1
- DKGRNFUXVTYRAS-UBHSHLNASA-N Ser-Ser-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O DKGRNFUXVTYRAS-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N Ser-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RXUOAOOZIWABBW-XGEHTFHBSA-N Ser-Thr-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N RXUOAOOZIWABBW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- KIEIJCFVGZCUAS-MELADBBJSA-N Ser-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O KIEIJCFVGZCUAS-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- 102100030257 Spermatogenesis-associated protein 7 Human genes 0.000 description 1
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 1
- 241000701424 Spodoptera frugiperda multiple nucleopolyhedrovirus Species 0.000 description 1
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- NJEMRSFGDNECGF-GCJQMDKQSA-N Thr-Ala-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O NJEMRSFGDNECGF-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- WFUAUEQXPVNAEF-ZJDVBMNYSA-N Thr-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CCCN=C(N)N WFUAUEQXPVNAEF-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- PQLXHSACXPGWPD-GSSVUCPTSA-N Thr-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PQLXHSACXPGWPD-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 1
- PZVGOVRNGKEFCB-KKHAAJSZSA-N Thr-Asn-Val Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N)O PZVGOVRNGKEFCB-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- MFEBUIFJVPNZLO-OLHMAJIHSA-N Thr-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O MFEBUIFJVPNZLO-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- YBXMGKCLOPDEKA-NUMRIWBASA-N Thr-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YBXMGKCLOPDEKA-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- JEDIEMIJYSRUBB-FOHZUACHSA-N Thr-Asp-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O JEDIEMIJYSRUBB-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- NIEWSKWFURSECR-FOHZUACHSA-N Thr-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NIEWSKWFURSECR-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- VYEHBMMAJFVTOI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O VYEHBMMAJFVTOI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- XOWKUMFHEZLKLT-CIQUZCHMSA-N Thr-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XOWKUMFHEZLKLT-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- NCXVJIQMWSGRHY-KXNHARMFSA-N Thr-Leu-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O NCXVJIQMWSGRHY-KXNHARMFSA-N 0.000 description 1
- NZRUWPIYECBYRK-HTUGSXCWSA-N Thr-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O NZRUWPIYECBYRK-HTUGSXCWSA-N 0.000 description 1
- GYUUYCIXELGTJS-MEYUZBJRSA-N Thr-Phe-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O GYUUYCIXELGTJS-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- YGCDFAJJCRVQKU-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O YGCDFAJJCRVQKU-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- FWTFAZKJORVTIR-VZFHVOOUSA-N Thr-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FWTFAZKJORVTIR-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- QJIODPFLAASXJC-JHYOHUSXSA-N Thr-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N)O QJIODPFLAASXJC-JHYOHUSXSA-N 0.000 description 1
- ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N Thr-Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N Thr-Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N 0.000 description 1
- FBQHKSPOIAFUEI-OWLDWWDNSA-N Thr-Trp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FBQHKSPOIAFUEI-OWLDWWDNSA-N 0.000 description 1
- NJGMALCNYAMYCB-JRQIVUDYSA-N Thr-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJGMALCNYAMYCB-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 1
- REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N Thr-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- ABCLYRRGTZNIFU-BWAGICSOSA-N Thr-Tyr-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O ABCLYRRGTZNIFU-BWAGICSOSA-N 0.000 description 1
- QGVBFDIREUUSHX-IFFSRLJSSA-N Thr-Val-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O QGVBFDIREUUSHX-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- NMCBVGFGWSIGSB-NUTKFTJISA-N Trp-Ala-Leu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N NMCBVGFGWSIGSB-NUTKFTJISA-N 0.000 description 1
- QNTBGBCOEYNAPV-CWRNSKLLSA-N Trp-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)C(=O)O QNTBGBCOEYNAPV-CWRNSKLLSA-N 0.000 description 1
- VPRHDRKAPYZMHL-SZMVWBNQSA-N Trp-Leu-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 VPRHDRKAPYZMHL-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- GWBWCGITOYODER-YTQUADARSA-N Trp-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N GWBWCGITOYODER-YTQUADARSA-N 0.000 description 1
- NWQCKAPDGQMZQN-IHPCNDPISA-N Trp-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NWQCKAPDGQMZQN-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- SEXRBCGSZRCIPE-LYSGOOTNSA-N Trp-Thr-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N)O SEXRBCGSZRCIPE-LYSGOOTNSA-N 0.000 description 1
- FFWCYWZIVFIUDM-OYDLWJJNSA-N Trp-Val-Trp Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O FFWCYWZIVFIUDM-OYDLWJJNSA-N 0.000 description 1
- 102100029293 Tubby-related protein 1 Human genes 0.000 description 1
- KSVMDJJCYKIXTK-IGNZVWTISA-N Tyr-Ala-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 KSVMDJJCYKIXTK-IGNZVWTISA-N 0.000 description 1
- HKIUVWMZYFBIHG-KKUMJFAQSA-N Tyr-Arg-Gln Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N)O HKIUVWMZYFBIHG-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- CYDVHRFXDMDMGX-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-His Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O CYDVHRFXDMDMGX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- AYPAIRCDLARHLM-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O AYPAIRCDLARHLM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FQNUWOHNGJWNLM-QWRGUYRKSA-N Tyr-Cys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O FQNUWOHNGJWNLM-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- WZQZUVWEPMGIMM-JYJNAYRXSA-N Tyr-Gln-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O WZQZUVWEPMGIMM-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- AZGZDDNKFFUDEH-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gly-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AZGZDDNKFFUDEH-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- NKUGCYDFQKFVOJ-JYJNAYRXSA-N Tyr-Leu-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NKUGCYDFQKFVOJ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- DWAMXBFJNZIHMC-KBPBESRZSA-N Tyr-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O DWAMXBFJNZIHMC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- PRONOHBTMLNXCZ-BZSNNMDCSA-N Tyr-Leu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PRONOHBTMLNXCZ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- IGXLNVIYDYONFB-UFYCRDLUSA-N Tyr-Phe-Arg Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 IGXLNVIYDYONFB-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- OKDNSNWJEXAMSU-IRXDYDNUSA-N Tyr-Phe-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OKDNSNWJEXAMSU-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- QFXVAFIHVWXXBJ-AVGNSLFASA-N Tyr-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QFXVAFIHVWXXBJ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HZDQUVQEVVYDDA-ACRUOGEOSA-N Tyr-Tyr-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HZDQUVQEVVYDDA-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- HZWPGKAKGYJWCI-ULQDDVLXSA-N Tyr-Val-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(C)C)C(O)=O HZWPGKAKGYJWCI-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- DDRBQONWVBDQOY-GUBZILKMSA-N Val-Ala-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O DDRBQONWVBDQOY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N Val-Ala-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- ZMDCGGKHRKNWKD-LAEOZQHASA-N Val-Asn-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N ZMDCGGKHRKNWKD-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- PVPAOIGJYHVWBT-KKHAAJSZSA-N Val-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O PVPAOIGJYHVWBT-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N Val-Asp-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- SZTTYWIUCGSURQ-AUTRQRHGSA-N Val-Glu-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SZTTYWIUCGSURQ-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N Val-Glu-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 1
- XWYUBUYQMOUFRQ-IFFSRLJSSA-N Val-Glu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O XWYUBUYQMOUFRQ-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- JTWIMNMUYLQNPI-WPRPVWTQSA-N Val-Gly-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N JTWIMNMUYLQNPI-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- WFENBJPLZMPVAX-XVKPBYJWSA-N Val-Gly-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O WFENBJPLZMPVAX-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- APQIVBCUIUDSMB-OSUNSFLBSA-N Val-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N APQIVBCUIUDSMB-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- DAVNYIUELQBTAP-XUXIUFHCSA-N Val-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N DAVNYIUELQBTAP-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- IJGPOONOTBNTFS-GVXVVHGQSA-N Val-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IJGPOONOTBNTFS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- QRVPEKJBBRYISE-XUXIUFHCSA-N Val-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C(C)C)N QRVPEKJBBRYISE-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- YMTOEGGOCHVGEH-IHRRRGAJSA-N Val-Lys-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O YMTOEGGOCHVGEH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- XPKCFQZDQGVJCX-RHYQMDGZSA-N Val-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O XPKCFQZDQGVJCX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- YKNOJPJWNVHORX-UNQGMJICSA-N Val-Phe-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YKNOJPJWNVHORX-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- ZXYPHBKIZLAQTL-QXEWZRGKSA-N Val-Pro-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ZXYPHBKIZLAQTL-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N Val-Ser-Pro Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UJMCYJKPDFQLHX-XGEHTFHBSA-N Val-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O UJMCYJKPDFQLHX-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N Val-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- UQMPYVLTQCGRSK-IFFSRLJSSA-N Val-Thr-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O UQMPYVLTQCGRSK-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- NGXQOQNXSGOYOI-BQFCYCMXSA-N Val-Trp-Gln Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 NGXQOQNXSGOYOI-BQFCYCMXSA-N 0.000 description 1
- MIAZWUMFUURQNP-YDHLFZDLSA-N Val-Tyr-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N MIAZWUMFUURQNP-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- PMKQKNBISAOSRI-XHSDSOJGSA-N Val-Tyr-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N PMKQKNBISAOSRI-XHSDSOJGSA-N 0.000 description 1
- LLJLBRRXKZTTRD-GUBZILKMSA-N Val-Val-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N LLJLBRRXKZTTRD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 102100040089 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1 Human genes 0.000 description 1
- HOBWAPHTEJGALG-JKCMADFCSA-N [(1r,5s)-8-methyl-8-azoniabicyclo[3.2.1]octan-3-yl] 3-hydroxy-2-phenylpropanoate;sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O.C([C@H]1CC[C@@H](C2)[NH+]1C)C2OC(=O)C(CO)C1=CC=CC=C1.C([C@H]1CC[C@@H](C2)[NH+]1C)C2OC(=O)C(CO)C1=CC=CC=C1 HOBWAPHTEJGALG-JKCMADFCSA-N 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 230000006838 adverse reaction Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 239000011717 all-trans-retinol Substances 0.000 description 1
- 229940100609 all-trans-retinol Drugs 0.000 description 1
- 235000019169 all-trans-retinol Nutrition 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 230000010516 arginylation Effects 0.000 description 1
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 1
- 229960002028 atropine sulfate Drugs 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 239000008366 buffered solution Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 102000003631 carotenoid oxygenase Human genes 0.000 description 1
- 108010086245 carotenoid oxygenase Proteins 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 108010004073 cysteinylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 125000005594 diketone group Chemical group 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 230000004424 eye movement Effects 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 108010013768 glutamyl-aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- JYPCXBJRLBHWME-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-prolyl-L-arginine Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(O)=O JYPCXBJRLBHWME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010025801 glycyl-prolyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010059898 glycyl-tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 238000003125 immunofluorescent labeling Methods 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 230000026045 iodination Effects 0.000 description 1
- 238000006192 iodination reaction Methods 0.000 description 1
- 108010031424 isoleucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010047926 leucyl-lysyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 208000018769 loss of vision Diseases 0.000 description 1
- 231100000864 loss of vision Toxicity 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 206010029864 nystagmus Diseases 0.000 description 1
- 239000002674 ointment Substances 0.000 description 1
- 238000002577 ophthalmoscopy Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 208000003154 papilloma Diseases 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 1
- 229960003733 phenylephrine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- OCYSGIYOVXAGKQ-FVGYRXGTSA-N phenylephrine hydrochloride Chemical compound [H+].[Cl-].CNC[C@H](O)C1=CC=CC(O)=C1 OCYSGIYOVXAGKQ-FVGYRXGTSA-N 0.000 description 1
- 210000000608 photoreceptor cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 230000013823 prenylation Effects 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 229960001309 procaine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010093296 prolyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001747 pupil Anatomy 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000006340 racemization Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004258 retinal degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000004283 retinal dysfunction Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 108020004418 ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 210000003786 sclera Anatomy 0.000 description 1
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000019635 sulfation Effects 0.000 description 1
- 238000005670 sulfation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009469 supplementation Effects 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 108010031491 threonyl-lysyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 108010045269 tryptophyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 238000013351 twoBac system Methods 0.000 description 1
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 230000034512 ubiquitination Effects 0.000 description 1
- 238000010798 ubiquitination Methods 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 230000007442 viral DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 230000004393 visual impairment Effects 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
- A61K48/0058—Nucleic acids adapted for tissue specific expression, e.g. having tissue specific promoters as part of a contruct
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/52—Isomerases (5)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
- A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
- A61P27/02—Ophthalmic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
- A61P9/10—Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/18—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/01—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
- C12Y301/01064—Retinoid isomerohydrolase (3.1.1.64)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2217/00—Genetically modified animals
- A01K2217/07—Animals genetically altered by homologous recombination
- A01K2217/072—Animals genetically altered by homologous recombination maintaining or altering function, i.e. knock in
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2227/00—Animals characterised by species
- A01K2227/10—Mammal
- A01K2227/105—Murine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01K—ANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
- A01K2267/00—Animals characterised by purpose
- A01K2267/03—Animal model, e.g. for test or diseases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14151—Methods of production or purification of viral material
- C12N2750/14152—Methods of production or purification of viral material relating to complementing cells and packaging systems for producing virus or viral particles
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14171—Demonstrated in vivo effect
Abstract
提供了一种用于治疗Leber先天性黑朦的药物组合物和用于使用所述药物组合物治疗Leber先天性黑朦的方法。
Description
相关申请
本申请要求2020年7月21日提交的中国专利申请202010704946.1和2021年4月8日提交的中国专利申请202110378979.6的优先权权益,其中的每一个申请均通过引用以其全文并入本文。
序列表
本申请含有按ASCII格式以电子方式递交并特此通过引用以其全文并入的序列表。所述ASCII副本创建于2021年7月14日,名称为57837-706_601_SL.txt并且大小为47,087字节。
背景技术
Leber先天性黑朦(LCA)是一种罕见的遗传性眼部疾病,其表现为出生时或生命早期的严重视力障碍并且通常在前20年内完全丧失视力。LCA的表现形式因受影响的部位和相关联的基因突变而异。
视网膜色素上皮细胞特异性65kDa蛋白(RPE65),也被称为类视黄醇异构水解酶,大小为65kDa,并且在人类中由RPE65基因编码。RPE65是脊椎动物视觉周期中的一种酶,在视网膜色素上皮细胞(RPE)中表达,并且也存在于视杆细胞和视锥细胞中。RPE65的缺陷可能导致LCA,占LCA病例的约6%至16%。
发明内容
目前,本领域需要开发可以有效治疗LCA的药物和方法。本公开提供了可以有效治疗遗传性眼病诸如LCA的组合物、药物组合物和方法。
在一方面,本公开提供了一种重组腺相关病毒(rAAV)颗粒,其包含含有RPE65多肽的编码序列的表达盒多核苷酸序列,其中所述编码序列是密码子优化的,并且与野生型RPE65核苷酸序列(SEQ ID NO:1)相比含有改变数量的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含减少数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约50%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列不包含CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含增加数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约600%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含约100至200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列选自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10中的一个或多个具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10中的一个或多个具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID NO:2、SEQID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:9或SEQ ID NO:10中的一个或多个具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10中的一个或多个具有至少98%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10中的一个或多个具有至少99%同一性。
在一些实施方案中,所述rAAV颗粒还包含AAV衣壳蛋白。在一些实施方案中,所述AAV蛋白来自血清型AAV2或其变体、血清型AAV5或其变体、或血清型AAV8或其变体。
在一些实施方案中,所述表达盒多核苷酸序列还包含启动子,并且所述启动子可操作地连接至所述编码序列。在一些实施方案中,所述启动子是CMV、CAG、MNDU3、PGK、EF1a、Ubc启动子或眼部组织特异性启动子。在一些实施方案中,所述眼部组织特异性启动子选自RPE 65基因启动子、人视网膜结合蛋白(CRALBP)基因启动子、鼠11-顺式视黄醇脱氢酶(RDH)基因启动子、视紫红质启动子、视紫红质激酶启动子、金属蛋白酶组织抑制因子3(Timp3)启动子、光感受器视黄醇结合蛋白启动子和卵黄状黄斑营养不良2启动子或光感受器间类视黄醇结合蛋白(IRBP)启动子。
在一些实施方案中,所述表达盒序列还包含在3'末端处的WPRE序列。在一些实施方案中,所述编码序列还包含在3'末端处的poly(A)序列。在一些实施方案中,所述poly(A)序列是SV40晚期poly(A)(SV40pA)、人生长激素poly(A)(hGHpA)和牛生长激素poly(A)(bGHpA)中的一种。在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含填充序列。在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述反向末端重复(ITR)序列是变体反向末端重复(ITR)序列。
在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约200至500个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含编码其它治疗性蛋白的序列。在一些实施方案中,所述其它治疗性蛋白选自ABCA4、RDH12、RDH8、RBP3、RBP1、LRAT、RLBP1、RDH10或RDH11。在一些实施方案中,所述编码序列通过编码接头的序列与编码其它治疗性蛋白的序列连接。在一些实施方案中,所述接头是可切割接头。在一些实施方案中,所述接头包含2A肽的序列。
在另一方面,本公开提供了一种组合物,其包含:(i)编码腺相关病毒(AAV)蛋白的第一多核苷酸,和(ii)包含编码RPE65多肽的序列的第二多核苷酸,其中所述序列是密码子优化的,并且与野生型RPE65核苷酸序列相比含有改变数量的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述RPE65编码序列包含减少数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约50%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列不包含CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述AAV衣壳蛋白来自血清型AAV2或其变体、血清型AAV5或其变体、或血清型AAV8或其变体。
在一些实施方案中,所述第一多核苷酸是密码子优化的。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含启动子,并且所述启动子可操作地连接至所述序列。在一些实施方案中,所述启动子是CMV、CAG、MNDU3、PGK、EF1a、Ubc启动子或眼部组织特异性启动子。在一些实施方案中,所述眼部组织特异性启动子选自RPE 65基因启动子、人视网膜结合蛋白(CRALBP)基因启动子、鼠11-顺式视黄醇脱氢酶(RDH)基因启动子、视紫红质启动子、视紫红质激酶启动子、金属蛋白酶组织抑制因子3(Timp3)启动子、光感受器视黄醇结合蛋白启动子和卵黄状黄斑营养不良2启动子或光感受器间类视黄醇结合蛋白(IRBP)启动子。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约200至500个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述序列还包含在3'末端处的WPRE序列。在一些实施方案中,所述序列还包含在3'末端处的poly(A)序列。在一些实施方案中,所述poly(A)序列是SV40pA、hGHpA和bGHpA中的一种。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含填充序列。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述反向末端重复(ITR)序列是变体反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含编码其它治疗性蛋白的序列。在一些实施方案中,所述其它治疗性蛋白选自ABCA4、RDH12、RDH8、RBP3、RBP1、LRAT、RLBP1、RDH10或RDH11。在一些实施方案中,所述序列通过编码接头的序列与编码其它治疗性蛋白的序列连接。所述接头是可切割接头。在一些实施方案中,所述接头包含2A肽的序列。
在另一方面,本公开提供了一种用于制备重组腺相关病毒(rAAV)颗粒的方法,所述方法包括在宿主细胞中引入本文所述的表达盒多核苷酸序列。在另一方面,本公开提供了一种重组腺相关病毒(rAAV)颗粒,其通过包括在宿主细胞中引入本文所述的表达盒多核苷酸序列的方法制备。在一些实施方案中,所述方法包括在所述宿主细胞中表达本文所述的表达盒多核苷酸序列。在一些实施方案中,所述宿主细胞是人细胞、动物细胞或昆虫细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是Sf9细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是HEK293细胞或其衍生物。在一些实施方案中,所述宿主细胞是HEK293T细胞。在一些实施方案中,所述方法包括生成杆状病毒质粒(bacmid)DNA和/或杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法包括生成RPE65表达序列杆状病毒质粒DNA。在一些实施方案中,所述方法包括生成rAAV cap表达序列杆状病毒质粒DNA。在一些实施方案中,所述方法包括用所述杆状病毒质粒DNA转染宿主细胞以产生杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法包括用所述RPE65表达序列杆状病毒质粒DNA转染宿主细胞以产生杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法包括用所述rAAV cap表达序列杆状病毒质粒DNA转染宿主细胞以产生杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法还包括将所述两种杆状病毒混合来感染宿主细胞(诸如Sf9细胞),以获得本公开的包装的rAAV/RPE65优化病毒颗粒。
在另一方面,本公开提供了一种用于治疗有需要的对象的Leber先天性黑朦(LCA)的药物组合物,所述药物组合物包含本公开的rAAV颗粒和药学上可接受的载剂。
在另一方面,本公开提供了一种试剂盒,其包括用于治疗LCA的本公开的药物组合物和说明书。
在另一方面,本公开提供了一种用于治疗有需要的对象的Leber先天性黑朦(LCA)的药物组合物,其包括向所述对象施用治疗有效量的本公开的rAAV颗粒或药物组合物。在一些实施方案中,所述治疗有效量的rAAV颗粒或药物组合物通过玻璃体内注射、视网膜下注射或脉络膜上腔注射来施用。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×109-1×1013个rAAV颗粒。在一些实施方案中,对于每只眼睛,所述治疗有效量是1×109-1×1013个载体基因组(vg)。在另一方面,本公开提供了如本文所述的rAAV颗粒在制备用于治疗与RPE65突变相关联的眼病的药物中的用途。在另一方面,本公开提供了如本文所述的rAAV颗粒在制备用于治疗对象的遗传性视网膜疾病(IRD)的药物中的用途。在一些实施方案中,所述IRD与RPE65突变相关联。在一些实施方案中,所述IRD是由于对象的RPE65基因的两个拷贝的突变引起。在一些实施方案中,所述IRD是由于对象的RPE65基因的一个拷贝的一个或多个突变引起。在一些实施方案中,所述IRD是LCA。
附图说明
图1是含有优化的RPE65编码序列的多核苷酸表达盒结构的一部分的示意图。
具体实施方式
尽管本文已经示出和描述了本公开的各种实施方案,但对于本领域技术人员显而易见的是,这些实施方案仅以示例的方式提供。在不脱离本公开内容的情况下,本领域技术人员将会想到许多变化、改变和替代。应理解,可以采用针对本文所述的本公开实施方案的各种可替代方案。
除非另外指示,否则本文所公开的一些实施方案的实施采用免疫学、生物化学、化学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、基因组学和重组DNA的常规技术。参见例如,Sambrook和Green,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第4版(2012);the seriesCurrent Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel等人编);the series MethodsIn Enzymology(Academic Press,Inc.),PC 2:A Practical Approach(M.J.MacPherson,B.D.Hames和G.R.Taylor编(1995)),Harlow和Lane编(1988)Antibodies,A LaboratoryManual,以及Culture of Animal Cells:A Manual of Basic Technique andSpecialized Applications,第6版(R.I.Freshney编(2010))。
定义
除非上下文另外明确指示,否则如说明书和权利要求中所用,单数形式“一个/种(a/an)”以及“所述(the)”包括复数个指示物。例如,术语“rAAV颗粒”包括一个或多个rAAV颗粒。
术语“约”或“大约”意指如由本领域普通技术人员确定的具体值处于可接受的误差范围内,这将部分取决于所述值的测量或确定方式,即,测量系统的限制性。例如,根据本领域中的实践,“约”可以意指在1个或超过1个标准偏差内。可替代地,“约”可以意指给定值的至多20%、至多10%、至多5%或至多1%的范围。可替代地,特别是关于生物系统或过程,所述术语可以意指在值的一个数量级以内、优选在值的5倍以内及更优选在值的2倍以内。在本申请和权利要求中描述特定值的情况下,除非另外说明,否则应假设术语“约”意指所述特定值在可接受的误差范围内。
如本文所用,术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”在本文中可互换使用,是指任何长度的氨基酸聚合物。所述聚合物可以是直链、环状或支链的,它可以含有经修饰的氨基酸,并且可以被非氨基酸中断。所述术语还包括进行修饰的氨基酸聚合物,诸如通过硫酸化、糖基化、乙酰化、乙酰化、磷酸化、碘化、甲基化、氧化、蛋白水解、磷酸化、异戊二烯化、外消旋化、硒化、转移RNA介导的向蛋白质添加氨基酸(例如,精氨酰化)、泛素化或任何其它操作,诸如与标记组分缀合。如本文所用,术语“氨基酸”是指天然和/或非天然或合成的氨基酸,包括甘氨酸和D或L光学异构体,以及氨基酸类似物和肽模拟物。“衍生”自给定蛋白质的多肽或氨基酸序列是指多肽的来源。优选地,多肽具有与序列中编码的多肽的氨基酸序列或其一部分基本上相同的氨基酸序列,其中所述部分由至少10-20个氨基酸或至少20-30个氨基酸或至少30-50个氨基酸组成,或者可以用序列中编码的多肽进行免疫鉴定。所述术语还包括从给定核酸序列表达的多肽。如本文所用,术语“结构域”是指在物理上或功能上与蛋白质或肽的其它部分区分开来的蛋白质的一部分。物理上定义的结构域包括极其疏水或亲水的氨基酸序列,诸如膜结合或细胞质结合的那些氨基酸序列。结构域也可以例如通过由基因复制引起的内部同源性来定义。功能上定义的结构域具有不同的生物学功能。例如,抗原结合结构域是指抗原结合单元或与抗原结合的抗体的一部分。功能上定义的结构域不需要由连续氨基酸序列编码,并且功能上定义的结构域可以含有一个或多个物理上定义的结构域。
如本文所用,术语“氨基酸”是指天然和/或非天然或合成的氨基酸,包括但不限于D或L光学异构体,以及氨基酸类似物和肽模拟物。标准的单字母或三字母代码用于指定氨基酸。氨基酸在本文中通常用本领域熟知的单字母和三字母缩写来代表。例如,丙氨酸可以用A或Ala表示。
如本文所用,在多肽的情况下,“序列”是多肽中氨基酸在从氨基末端至羧基末端的方向上的序列,其中序列中彼此相邻的残基在多肽的一级结构中是连续的。所述序列也可以是已知在一个或两个方向上含有额外残基的多肽的一部分的直链序列。
如本文所用,“同一性”、“同源性”或“序列同一性”是指两个或更多个多核苷酸序列之间或者两个或更多个多肽序列之间的序列相似性或可互换性。当使用程序诸如EmbossNeedle或BestFit确定两个不同氨基酸序列之间的序列同一性、相似性或同源性时,可以使用默认设置,或者可以选择适当的评分矩阵,诸如blosum45或blosum80,以优化同一性、相似性或同源性的得分。优选地,同源多核苷酸是在如本文定义的严格条件下杂交,并且与这些序列相比具有至少70%、优选至少80%、更优选至少90%、更优选95%、更优选97%、更优选98%并且甚至更优选99%的序列同一性的那些多核苷酸。当具有相当长度的序列最佳比对时,同源多肽优选具有至少80%、或至少90%、或至少95%、或至少97%、或至少98%的序列同一性,或者具有至少99%的序列同一性。
如本文所用,“序列同一性百分比(%)”被定义为:在比对序列并引入空位(如果需要以获得最大序列同一性百分比)之后,并且不将任何保守取代视为序列同一性的一部分,查询序列中与第二参考多肽序列或其一部分的氨基酸残基相同的氨基酸残基的百分比。旨在确定氨基酸序列同一性百分比的比对可以以本领域技术范围内的各种方式来实现,例如,通过使用公众可获得的计算机软件,诸如BLAST、BLAST-2、ALIGN、NEEDLE或Megalign(DNASTAR)软件。本领域技术人员可以确定用于测量比对的适当参数,包括为了在被比较的序列的全长上获得最大比对所需要的任何算法。同一性百分比可以在整个定义的多肽序列的长度上测量,或者可以在较短的长度上测量,例如,从较大的定义的多肽序列中获取的片段的长度,诸如至少5个、至少10个、至少15个、至少20个、至少50个、至少100个或至少200个连续残基的片段。这些长度只是示例性的,并且应理解,本文中的表、附图或序列表中所示的序列支持的任何片段长度都可以用于描述可以测量同一性百分比的长度。
本文所述的蛋白质相对于参考序列可以具有一个或多个修饰。修饰可以是氨基酸残基的缺失、插入或添加,或取代或替换。“缺失”是指由于缺少一个或多个氨基酸残基而导致的氨基酸序列变化。“插入”或“添加”是指与参考序列相比,由于添加一个或多个氨基酸残基而导致的氨基酸序列变化。“取代”或“替换”是指用不同的氨基酸取代一个或多个氨基酸。在本文中,抗原结合单元相对于参考序列的突变可以通过将抗原结合单元与参考序列进行比较来确定。用于比较的序列的最佳比对可以根据本领域的任何已知方法来进行。
如本文所用,术语“分离的”是指从在自然界中在正常情况下与多核苷酸、肽、多肽、蛋白质、抗体或其片段缔合的细胞和其它组分中分离。本领域技术人员知道,非天然存在的多核苷酸、肽、多肽、蛋白质、抗体或其片段不需要被“分离”以与其天然存在的对应物区分开来。另外,“浓缩”、“分离”或“稀释”的多核苷酸、肽、多肽、蛋白质、抗体或其片段可与其天然存在的对应物区分开来,因为每单位体积的分子浓度或数量大于(“浓缩”)或小于(“分离”)其天然存在的对应物。富集可以基于绝对量,诸如每单位体积的溶液重量来测量,或者可以相对于源混合物中存在的第二种潜在干扰物种进行测量。
术语“多核苷酸”、“核酸”、“核苷酸”和“寡核苷酸”可互换使用。它们是指核苷酸(无论是脱氧核糖核苷酸还是核糖核苷酸)或其任何长度的类似物的聚合物形式。多核苷酸可以具有任何三维结构,并且可以执行任何已知或未知的功能。以下是多核苷酸的非限制性实例:基因或基因片段的编码区或非编码区、通过连锁分析确定的基因座、外显子、内含子、信使RNA(mRNA)、转移RNA、核糖体RNA、核酶、cDNA、重组多核苷酸、支链多核苷酸、质粒、载体、任何序列的分离DNA、任何序列的分离RNA、核酸探针、引物、寡核苷酸或合成DNA。多核苷酸可以含有经修饰的核苷酸,诸如甲基化的核苷酸和核苷酸类似物。对核苷酸结构的修饰(如果存在)可以在聚合物组装之前或之后进行。核苷酸的序列可以被非核苷酸组分中断。多核苷酸可以在聚合之后进一步被修饰,例如通过与标记组分缀合。
当应用于多核苷酸时,“重组”意指多核苷酸是克隆、限制性消化和/或连接步骤的各种组合以及产生与自然界中发现的多核苷酸不同的构建体的其它程序的产物。
术语“基因”或“基因片段”在本文中可互换使用。它们是指包含至少一个开放阅读框的多核苷酸,所述开放阅读框可以在转录和翻译之后编码特定蛋白质。所述基因或基因片段可以是基因组的、cDNA的或合成的,只要所述多核苷酸包含至少一个开放阅读框即可,所述开放阅读框可以覆盖整个编码区或其区段。
术语“可操作地连接”或“有效地连接”是指并列,其中如此描述的组分处于允许它们以预期方式发挥功能的关系中。例如,如果启动子序列促进编码序列的转录,则所述启动子序列可操作地连接至编码序列。
如本文所用,“表达”是指将多核苷酸转录为mRNA的过程,和/或转录的mRNA(也被称为“转录物”)随后被翻译为肽、多肽或蛋白质的过程。转录物和编码的多肽统称为基因产物。如果多核苷酸衍生自基因组DNA,则表达可以包括在真核细胞中剪接mRNA。
如本文所用,术语“载体”是指用于核酸递送的工具,其中可以插入多核苷酸。当载体可以表达由插入的多核苷酸编码的蛋白质时,所述载体被称为表达载体。载体可以通过转化、转导或转染来引入宿主细胞中,使得其携带的遗传物质元件可以在宿主细胞中表达。载体是本领域技术人员熟知的,包括但不限于:质粒;噬菌粒;人工染色体,诸如酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)或P1衍生的人工染色体(PAC);噬菌体,诸如λ噬菌体或M13噬菌体和动物病毒等。可以用作载体的动物病毒包括但不限于逆转录酶病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相关病毒、疱疹病毒(例如,单纯疱疹病毒)、痘病毒、杆状病毒、乳头瘤病毒和乳头多瘤空泡病毒(例如,SV40)。载体可以含有控制表达的各种元件,包括但不限于启动子序列、转录起始序列、增强子序列、选择元件和报告基因。另外,载体还可以含有复制起点位点。
如本文所用,术语“宿主细胞”是指可以用于引入载体的细胞,其包括但不限于原核细胞,诸如大肠杆菌或枯草芽孢杆菌;真菌细胞,诸如酵母细胞或曲霉属;昆虫细胞,诸如S2果蝇细胞或Sf9;或动物和人细胞,诸如成纤维细胞、CHO细胞、COS细胞、NSO细胞、HeLa细胞、BHK细胞、HEK293细胞或其衍生物。
如本文所用,“治疗有效量”是指实现特定病状的可测量改善或预防所需的至少最小浓度。本文中的有效量可以随患者的疾病状态、年龄、性别、体重和其它因素而变化。有效量也是治疗益处超过治疗中的任何毒性或不良作用的量。在癌症或肿瘤的治疗中,药物的有效量可以具有以下作用:减少癌细胞的数量,降低肿瘤大小,抑制癌细胞浸润到外周器官中,抑制肿瘤转移,在一定程度上抑制肿瘤生长,和/或在一定程度上缓解与疾病相关的一种或多种症状。有效量可以在一个或多个剂量中施用。
如本文所用,术语“接受者”、“个体”、“对象”、“宿主”和“患者”在本文中可互换使用,并且是指需要对其进行诊断、治疗或疗法的任何哺乳动物对象,特别是人类。
如本文所用,术语“疗法”和“治疗”是指获得所需的药理学和/或生理学作用。作用就完全或部分预防疾病或其症状而言可以是预防性的,并且/或者就部分或完全稳定或治愈疾病和/或归因于疾病的不良反应而言可以是治疗性的。如本文所用,“治疗”涵盖对哺乳动物的疾病的任何治疗,所述哺乳动物诸如小鼠、大鼠、兔、猪、灵长类动物,包括人类和其它类人猿,尤其是人类,并且所述术语包括:(a)防止疾病或症状在可能易患疾病或症状但尚未被诊断的对象中发生;(b)抑制疾病症状;(c)预防疾病发展;(d)缓解疾病症状;(e)导致疾病或症状消退;或其任何组合。如本文所用,术语“试剂盒”是指包装在一起使用或可商购获得的组合。例如,本公开的试剂盒可以包括本公开的组合物,以及使用所述组合物或试剂盒的说明书。术语“说明书”是指通常包含在治疗产品的商业包装中的解释性插页,其含有关于此类治疗性产品的适应症、用途、剂量、施用、组合疗法、禁忌症和/或使用警告的信息。
“密码子优化”是指改变构成核酸序列的密码子,使得密码子最适合在特定系统(例如,特定物种或一组物种)中表达。例如,优化核酸序列以在哺乳动物细胞中更有效地表达。由于存在同义密码子,密码子优化不会改变编码蛋白质的氨基酸序列。各种密码子优化方法是本领域已知的,诸如美国专利号5,786,464和6,114,148中公开的那些。“同义密码子”是指编码相同氨基酸的密码子。
Leber先天性黑朦和其它疾病
在一方面,本文提供了用于治疗对象的疾病或病状的组合物和方法。所述疾病或病状可以是遗传性视网膜疾病(IRD)。在一些实施方案中,所述IRD由RPE65基因的突变导致。在一些实施方案中,所述IRD由对象的RPE65基因的两个拷贝的突变导致。在一些实施方案中,足够的活细胞保留在对象的视网膜中。在一些实施方案中,所述疾病或病状是Leber先天性黑朦(LCA)。
Leber先天性黑朦(LCA)是一种罕见的遗传性眼部疾病,占所有遗传性视网膜疾病的约6%,并且是遗传性视网膜病变的最严重的形式。LCA是儿童先天性失明的最常见病因,其通常表现为出生时或生命早期的严重视力障碍并且在前20年内完全丧失视力。在LCA的发展过程中,患者疾病的症状包括视网膜功能障碍、眼球运动(眼球震颤)、视力障碍、瞳孔无反应以及最终失明。
LCA通常是一种常染色体隐性遗传病。迄今为止,已经鉴定出18种与LCA相关的基因,并且这些基因的突变通常是LCA的病因。根据这18种基因,在线人类孟德尔遗传(OMIM)进一步将LCA分为18种不同的类型。不同类型的LCA及其相关联的遗传信息在以下表1中示出。
表1.LCA和相关基因的分类
类型 | 基因 | 基因座 |
LCA1 | GUCY2D | 17p13.1 |
LCA2 | RPE65 | 1p31.3-p31.2 |
LCA3 | SPATA7 | 14q31.3 |
LCA4 | AIPL1 | 17p13.2 |
LCA5 | LCA5 | 6q14.1 |
LCA6 | RPGRIP1 | 14q11.2 |
LCA7 | CRX | 19q13.3 |
LCA8 | CRB1 | 1q31-q32.1 |
LCA9 | NMNAT1 | 1p36.22 |
LCA10 | CEP290 | 12q21.32 |
LCA11 | IMPDH1 | 7q32.1 |
LCA12 | RD3 | 7q32.1 |
LCA13 | RDH12 | 1q32.3 |
LCA14 | LRAT | 14q24.1 |
LCA15 | TULP1 | 4q31 |
LCA16 | KCNJ13 | 2q37 |
LCA17 | GDF6 | 8q22 |
LCA18 | PRPH2 | 6p21 |
视网膜色素上皮细胞特异性65kDa蛋白(RPE65),也被称为类视黄醇异构水解酶,属于类胡萝卜素加氧酶家族,是脊椎动物视觉周期中的一种酶,并且在人类中由RPE65基因编码。
RPE65主要在视网膜色素上皮(RPE)中表达,并且也存在于视杆细胞和视锥细胞中。它负责在光转导过程中将全反式视黄酯转化为11-顺式视黄醇。然后在其它酶的作用下,11-顺式视黄醇被氧化成11-顺式视黄醛,其进而与视蛋白配混形成活性视觉色素,从而激活大脑检测光的光转导途径。
RPE65的功能性缺陷可能导致LCA2,占所有LCA病例的约6%至16%。研究显示,用具有正常功能的RPE65补充具有RPE65功能性缺陷的眼细胞可以改善LCA。
重组AAV载体
腺相关病毒(AAV)属于细小病毒科,并且是一种单链DNA(ssDNA)病毒。AAV基因组的长度为大约4.7千碱基,并且可以包含在DNA链两个末端处的反向末端重复序列(ITR)和被称为rep和cap的两个开放阅读框(ORF)。
“AAV反向末端重复(ITR)”序列可以是存在于天然单链AAV基因组的两个末端处的约145个核苷酸的序列。ITR是用于在腺相关病毒基因组中高效复制的对称核酸序列,其可以用作病毒DNA合成的复制起点,并且可以是重组AAV载体的必需结构组分。
“rep”可以包含编码AAV生命周期所需的四种rep蛋白rep78、rep68、rep52和rep40的多核苷酸序列。“cap”可以包含编码AAV衣壳蛋白VP1、VP2和VP3的多核苷酸序列,其中AAV衣壳蛋白VP1、VP2和VP3可以相互作用以形成三八面体对称的AAV衣壳。
AAV可以有效地感染分裂和/或未分裂的人细胞,并且其基因组可以整合到宿主细胞基因组中的单个染色体位点中。最重要的是,虽然AAV存在于许多人的体内,但当前的研究认为AAV与任何疾病无关。基于其高安全性、低免疫原性、宽宿主范围以及介导外源基因在动物中的长期稳定表达的能力,AAV已成为基因疗法中最有前景的载体系统。
迄今为止,根据AAV血清型或感染组织或细胞的差异,已经鉴定出13种不同的AAV,即AAV1-AAV13。而且,如以下表2所示,已经开发了不同的AAV作为转染特定细胞类型的有利载体系统。在许多AAV血清型中,血清型2(AAV2)是研究和应用最广泛的一种,它可以感染视网膜上皮细胞、光感受器细胞、骨骼肌、中枢神经系统和肝细胞等,并且已被用作许多正在进行的临床研究的载体。
表2.AAV血清型及其在基因疗法中用作递送载体的组织
如本文所用,术语“重组AAV载体(rAAV载体)”是指含有一个或多个侧接两个AAV反向末端重复序列(ITR)的异源序列(即,非AAV衍生的核酸序列)的多核苷酸载体。当存在于表达AAV rep和cap蛋白的宿主细胞中时,rAAV载体可以被复制并包装到AAV病毒颗粒中。
“重组AAV(rAAV)病毒”或“rAAV病毒颗粒”是指由被至少一种AAV衣壳蛋白包封的rAAV载体构成的AAV病毒颗粒。当前用于产生rAAV病毒颗粒的宿主细胞可以是衍生自哺乳动物的细胞类型,诸如293细胞、COS细胞、HeLa细胞、KB细胞和其它哺乳动物细胞系,以及昆虫细胞。rAAV病毒颗粒可以通过提供rAAV质粒在哺乳动物细胞培养系统中产生。然而,大多数以上哺乳动物细胞培养系统的输出难以满足临床试验和商业规模生产的要求。最近还开发了使用昆虫细胞(诸如Sf9细胞)的rAAV病毒颗粒产生系统。然而,为了在昆虫细胞中产生AAV,必须进行一些修改以获得AAV衣壳蛋白的正确化学计量比。
杆状病毒属于杆状病毒科,并且是一种双链环状DNA病毒,基因组大小在90kb与230kb之间。杆状病毒仅寄生在节肢动物中,并且已知感染超过600种昆虫。在1983年,Smith等人使用苜蓿丫纹夜蛾核多角体病毒(AcMNPV)在草地贪夜蛾细胞系Sf9中成功表达了人β-干扰素,并首次创建了杆状病毒表达系统(Mol Cell Biol,1983,3:2156-2165)。此后,杆状病毒表达系统不断完善和发展,并且已经成为应用非常广泛的真核表达系统。在2002年,Urabe等人确认了感染杆状病毒的Sf9昆虫细胞可以支持AAV复制。他们使用分别携带AAV的rep基因、Cap基因和ITR核心表达元件的3种重组杆状病毒共感染Sf9细胞,并成功制备了rAAV病毒颗粒。在此基础上,研究人员相继开发了更适合大规模制备rAAV病毒颗粒的系统。
目前,使用杆状病毒表达系统大规模制备rAAV病毒颗粒的方法主要有两种:两杆状病毒系统(Two Bac system)和依赖包装细胞系的一杆状病毒系统(One Bac system)。使用两杆状病毒系统制备rAAV病毒颗粒的主要过程是将AAV rep基因和cap基因整合到一个杆状病毒基因组中,将ITR核心表达元件和目的靶基因整合到另一个杆状病毒基因组中,并且然后使用以上所述的两个重组杆状病毒共感染宿主细胞,以产生携带靶基因的rAAV病毒颗粒。使用依赖包装细胞系的一杆状病毒系统来制备rAAV病毒颗粒的主要过程是首先建立诱导rep基因和cap基因表达的包装细胞系。此包装细胞系整合了rep基因和cap基因的表达元件,其中rep基因和cap基因分别置于杆状病毒晚期基因表达强启动子多角体蛋白(polh)和/或p10的调控下,并且除rep和cap之外,还添加了hr2增强子序列和/或AAV的rep蛋白结合序列。在感染含有AAV ITR和靶基因的重组杆状病毒之后,诱导包装细胞系中的rep基因和cap基因表达,从而产生与靶基因整合的rAAV病毒颗粒。
在一些实施方案中,rAAV病毒颗粒中用于携带靶基因的rAAV载体还可以包含一种或多种“表达调控元件”。如本文所用,术语“表达调控元件”是指影响可操作连接的多核苷酸表达的核酸序列,包括促进异源多核苷酸的转录和翻译的多核苷酸序列。可以用于本公开的表达调控元件包括但不限于启动子、增强子、内含子剪接信号、poly(A)、反向末端重复序列(ITR)等。
“启动子”是与编码靶产物的异源多核苷酸序列相邻定位的DNA序列,并且通常可操作地连接至相邻序列,诸如异源多核苷酸。与没有启动子的异源多核苷酸相比,启动子通常增加表达的异源多核苷酸的量。
“增强子”是增强启动子的活性的序列。与启动子不同,增强子不具有启动子活性,并且通常可以独立于其相对于启动子的位置(即,启动子的上游或下游)来发挥作用。可以用于本公开的增强子元件(或其部分)的非限制性实例包括在昆虫细胞中发现的杆状病毒增强子和增强子元件。
“填充序列”是指包含在较大核酸分子(诸如载体)中的核苷酸序列,并且通常用于在两个核酸特征之间(诸如在启动子与编码序列之间)产生所需的间距,或将核酸分子延伸至所需长度。填充序列不含蛋白质编码信息,并且可能具有未知/合成来源和/或与较大核酸分子内的其它核酸序列无关。
密码子优化
构成蛋白质的氨基酸有20种,并且编码氨基酸的密码子有64种。每个氨基酸对应于至少一个密码子,并且一个氨基酸可以对应于最多达6个密码子(简并密码子)。不同的生物体,甚至同一生物体的不同蛋白质编码基因,对简并密码子的使用频率不同,并且有一定的偏好。其中,高频率密码子被称为偏爱密码子,并且很少使用的密码子被称为稀有或低频率密码子。基因密码子的优化可以通过利用偏爱密码子、避免使用利用率低的稀有或低频率密码子、简化基因转录之后mRNA的二级结构、并入有益于高效表达的基序和减少不利于表达的基序、以及调整GC含量等来增加蛋白表达水平。虽然通用密码子优化原理有很多,但这些通用优化原理不能统一地应用于单个基因疗法载体。不同的通用优化原理可能相互矛盾。例如,改变CpG岛的组成或编码区的GC含量可能影响密码子使用偏好的选择。另外,不同的密码子优化可能导致不同的翻译后修饰和不同的生物活性。
本公开提供了一种编码RPE65多肽的核苷酸序列。在一些实施方案中,所述核苷酸序列是密码子优化的。在密码子优化之后,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述核苷酸序列含有改变数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约95%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约90%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约80%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约70%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约60%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约50%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约40%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约30%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约20%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约10%或更少的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含至多约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含至多约60%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含至多约50%的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过19个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过18个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过17个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过16个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过15个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过14个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过13个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过12个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过11个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过9个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过8个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过7个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过6个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过5个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过4个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过3个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过2个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不超过1个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列不包含CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含5至20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含5至15个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含12至20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含2至10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含0至5个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含增加数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约200%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约300%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约400%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约500%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约600%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码本文所述的RPE65的序列包含约700%的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不少于50个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不少于100个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不少于150个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不少于200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不少于250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含不少于300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含约50至300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含约100至250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含约150至200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含约150个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含约100个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,编码本文所述的RPE65的序列包含选自SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10的序列。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:2。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少98%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:4。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:5。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:6。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少98%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:7。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:8。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:9。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少95%同一性。
在一些实施方案中,编码腺相关病毒(AAV)衣壳蛋白的核苷酸序列是密码子优化的。在密码子优化之后,与野生型AAV衣壳蛋白核苷酸序列相比,所述核苷酸序列含有改变数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,编码腺相关病毒(AAV)rep蛋白的核苷酸序列是密码子优化的。在密码子优化之后,与野生型AAV rep蛋白核苷酸序列相比,所述核苷酸序列含有改变数量的CpG二核苷酸。
组合物
在一方面,本公开提供了一种组合物,其包含:(i)编码腺相关病毒(AAV)蛋白的第一多核苷酸,和(ii)包含编码RPE65多肽的序列的第二多核苷酸。在一方面,本公开提供了一种组合物,其包含:(i)编码腺相关病毒(AAV)蛋白的第一多核苷酸,和(ii)包含编码RPE65多肽的序列的第二多核苷酸,其中所述序列是密码子优化的,并且与野生型RPE65核苷酸序列相比含有改变数量的CpG二核苷酸。
本文所述的RPE65多肽可以是衍生自任何哺乳动物的RPE65及其变体。在一些实施方案中,哺乳动物包括但不限于灵长类动物(例如,人类)、牛、犬科动物、猫科动物和啮齿类动物(例如,豚鼠、大鼠或小鼠)。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽是人衍生的RPE65或其变体。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少75%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少80%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少85%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少90%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少95%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少96%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少97%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少98%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65具有至少99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与人RPE65相比具有一个或多个氨基酸突变、取代、缺失或添加的序列。
本文所述的组合物可以包含多核苷酸,所述多核苷酸包含编码RPE65多肽的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含SEQ ID No:1的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少75%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少80%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ IDNo:1具有至少85%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少90%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少95%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少96%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少97%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少98%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1具有至少99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文所述的RPE65多肽包含与SEQ ID No:1相比具有一个或多个氨基酸突变、取代、缺失或添加的序列。
在一些实施方案中,本文提供了一种多核苷酸,其包含编码RPE65多肽的序列,其中与对应野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含减少数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,编码RPE65多肽的序列包含约90%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约80%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约70%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约60%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约50%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约40%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约30%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约20%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约10%的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述序列包含不超过20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过19个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过18个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过17个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过16个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过15个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过14个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过13个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过12个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过11个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过9个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过8个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过7个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过6个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过5个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过4个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过3个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过2个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不超过1个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列不包含CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含增加数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约200%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约300%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约400%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约500%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约600%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约700%的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述序列包含不少于50个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不少于100个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不少于150个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不少于200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不少于250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含不少于300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含约50至300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含约100至250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含约150至200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含约150个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述序列包含约100个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述序列选自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:2。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQID No:2具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:4。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:5。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:6。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ IDNo:6具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:7。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ IDNo:7具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:8。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ IDNo:8具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:9。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ IDNo:9具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列包含或是SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQID No:10具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少95%同一性。
在一些实施方案中,所述腺相关病毒(AAV)蛋白可以来自任何AAV血清型。在一些实施方案中,所述AAV蛋白可以来自AAV血清型1(AAV1)、AAV血清型2(AAV2)、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV血清型3(AAV3,包括血清型3A和3B)、AAV血清型4(AAV4)、AAV血清型5(AAV5)、AAV血清型6(AAV6)、AAV血清型7(AAV7)、AAV血清型8(AAV8)、AAV血清型9(AAV9)、AAV血清型10(AAV10)、AAV血清型11(AAV11)、AAV血清型12(AAV12)、AAV血清型13(AAV13)、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述AAV蛋白与衍生自以下的野生型AAV蛋白具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型AAV蛋白相比,所述AAV蛋白具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,所述AAV蛋白来自血清型AAV2或其变体、血清型AAV5或其变体、或血清型AAV8或其变体。
在一些实施方案中,所述AAV蛋白包含cap蛋白。在一些实施方案中,所述第一多核苷酸包含编码cap蛋白的序列。在一些实施方案中,所述cap蛋白可以是本领域已知的任何结构蛋白,其能够形成功能性AAV衣壳(即,能够包装DNA并感染靶细胞)。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP1、VP2和VP3。在一些实施方案中,所述cap蛋白不需要包含VP1、VP2和VP3的全部,只要它可以产生功能性AAV衣壳即可。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP1和VP2。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP1和VP3。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP2和VP3。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP1。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP2。在一些实施方案中,所述cap蛋白包含VP3。
VP1、VP2和VP3可以衍生自任何AAV血清型。在一些实施方案中,VP1可以衍生自AAV血清型1(AAV1)、AAV血清型2(AAV2)、AAV血清型2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV血清型3(AAV3,包括血清型3A和3B)、AAV血清型4(AAV4)、AAV血清型5(AAV5)、AAV血清型6(AAV6)、AAV血清型7(AAV7)、AAV血清型8(AAV8)、AAV血清型9(AAV9)、AAV血清型10(AAV10)、AAV血清型11(AAV11)、AAV血清型12(AAV12)、AAV血清型13(AAV13)、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述VP1与衍生自以下的野生型VP1具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型VP1相比,VP1具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,VP2可以衍生自AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,VP2与衍生自以下的野生型VP2具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型VP2相比,所述VP2具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,VP3可以衍生自AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述VP3与衍生自以下的野生型VP3具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型VP3相比,所述VP3具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,所述cap包含衍生自相同AAV血清型的VP1、VP2和/或VP3,例如,所述cap可以包含衍生自AAV2的VP1、VP2和/或VP3。在一些实施方案中,所述cap包含衍生自不同AAV血清型的VP1、VP2和/或VP3,例如,所述cap可以包含衍生自以下中的任一种或多种的VP1、VP2和/或VP3:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74和AAV-2i8。
在一些实施方案中,编码cap蛋白的序列可操作地连接至启动子。所述启动子可以是本领域已知的任何合适的启动子,其可以驱动cap的表达。在一些实施方案中,所述启动子可以是组织特异性启动子、组成型启动子或调控型启动子。在一些实施方案中,所述启动子可以选自不同的来源,例如,所述启动子可以是病毒启动子、植物启动子和哺乳动物启动子。
所述启动子的实例包括但不限于人巨细胞病毒(CMV)即时早期增强子/启动子、SV40早期增强子/启动子、JC多瘤病毒启动子、髓磷脂碱性蛋白(MBP)或胶质细胞原纤维酸性蛋白(GFAP)启动子、单纯疱疹病毒(HSV-1)潜伏期相关启动子(LAP)、劳氏肉瘤病毒(RSV)长末端重复序列(LTR)启动子、神经元特异性启动子(NSE)、血小板源性生长因子(PDGF)启动子、hSYN、黑色素聚集激素(MCH)启动子、CBA、基质金属蛋白启动子(MPP)、鸡β-肌动蛋白启动子、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子。
在一些实施方案中,所述启动子是适于在昆虫细胞中表达的启动子。在一些实施方案中,适于在昆虫细胞中表达的启动子包括但不限于polh启动子、p10启动子、基本启动子、诱导型启动子、E1启动子或ΔE1启动子。在一些实施方案中,所述启动子是polh启动子。在一些实施方案中,所述启动子是p10启动子。
在一些实施方案中,编码cap蛋白的核苷酸序列的3'末端还包含多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度范围可以是约1-500bp。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度可以是但不限于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、50、100、200或500个核苷酸。
在一些实施方案中,本公开的组合物中所含的AAV蛋白还包含腺相关病毒(AAV)rep蛋白。在一些实施方案中,第一多核苷酸包含编码AAV rep蛋白的序列,其中所述rep蛋白可以是任何rAAV载体复制和包装到rAAV病毒颗粒中所必需的复制蛋白。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep78、rep68、rep52和rep40。在一些实施方案中,所述rep蛋白不需要包含rep78、rep68、rep52和rep40的全部,只要它可以允许rAAV载体复制并包装到rAAV病毒颗粒中即可。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep78、rep68、rep52和rep40中的任意三种。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep78、rep68、rep52和rep40中的任意两种。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep78、rep68、rep52和rep40中的任一种。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep78和rep52。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep78和rep40。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep68和rep52。在一些实施方案中,所述rep蛋白包含rep68和rep40。
所述rep78、rep68、rep52和rep40可以衍生自任何AAV血清型。在一些实施方案中,所述rep78可以衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述rep78与衍生自以下的野生型rep78具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型rep78相比,所述rep78具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,所述rep68可以衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述rep68与衍生自以下的野生型rep68具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型rep68相比,所述rep68具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,所述rep52可以衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述rep52与衍生自以下的野生型rep52具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型rep52相比,所述rep52具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,所述rep40可以衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述rep40与衍生自以下的野生型rep40具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型rep40相比,所述rep40具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。
在一些实施方案中,所述rep包含衍生自相同AAV血清型的rep78、rep68、rep52和/或rep40,例如,所述rep可以包含衍生自AAV2的rep78、rep68、rep52和/或rep40。在一些实施方案中,所述rep包含衍生自不同AAV血清型的rep78、rep68、rep52和/或rep40,例如,所述rep可以包含衍生自以下中的任一种或多种的rep78、rep68、rep52和/或rep40:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。
在一些实施方案中,编码rep蛋白的序列可操作地连接至启动子。所述启动子可以是本领域已知的任何合适的启动子,其可以驱动rep的表达。在一些实施方案中,所述启动子可以是组织特异性启动子、组成型启动子或调控型启动子。在一些实施方案中,所述启动子可以选自不同的来源,例如,所述启动子可以是病毒启动子、植物启动子和哺乳动物启动子。
所述启动子的实例包括但不限于人巨细胞病毒(CMV)即时早期增强子/启动子、SV40早期增强子/启动子、JC多瘤病毒启动子、髓磷脂碱性蛋白(MBP)或胶质细胞原纤维酸性蛋白(GFAP)启动子、单纯疱疹病毒(HSV-1)潜伏期相关启动子(LAP)、劳氏肉瘤病毒(RSV)长末端重复序列(LTR)启动子、神经元特异性启动子(NSE)、血小板源性生长因子(PDGF)启动子、hSYN、黑色素聚集激素(MCH)启动子、CBA、基质金属蛋白启动子(MPP)、鸡β-肌动蛋白启动子、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子。
在一些实施方案中,所述启动子是适于在昆虫细胞中表达的启动子。在一些实施方案中,适于在昆虫细胞中表达的启动子包括但不限于polh启动子、p10启动子、基本启动子、诱导型启动子、E1启动子或ΔE1启动子。在一些实施方案中,所述启动子是polh启动子。在一些实施方案中,所述启动子是p10启动子。
在一些实施方案中,编码rep蛋白的核苷酸序列的3'末端还包含多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度范围可以是约1-500bp。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度可以是但不限于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、50、100、200或500个核苷酸。
在一些实施方案中,所述cap和rep可以衍生自相同的AAV血清型。在一些实施方案中,所述cap和rep可以衍生自相同的AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8或任何其它已知的AAV和变体。
在一些实施方案中,所述cap和rep可以衍生自不同的AAV血清型,例如,所述cap和rep可以分别衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8或任何其它已知的AAV。例如,在一些实施方案中,所述cap可以衍生自AAV2,并且所述rep衍生自AAV5。
在一些实施方案中,所述第一多核苷酸是密码子优化的。在一些实施方案中,AAV蛋白的编码序列是密码子优化的。在一些实施方案中,AAV cap蛋白的编码序列是密码子优化的。在一些实施方案中,AAV rep蛋白的编码序列是密码子优化的。在一些实施方案中,启动子的编码序列是密码子优化的。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含启动子,并且所述启动子可操作地连接至所述序列。在一些实施方案中,所述启动子是CMV、CAG、MNDU3、PGK、EF1a、Ubc启动子或眼部组织特异性启动子。在一些实施方案中,所述眼部组织特异性启动子选自RPE 65基因启动子、人视网膜结合蛋白(CRALBP)基因启动子、鼠11-顺式视黄醇脱氢酶(RDH)基因启动子、视紫红质启动子、视紫红质激酶启动子、金属蛋白酶组织抑制因子3(Timp3)启动子、光感受器视黄醇结合蛋白启动子和卵黄状黄斑营养不良2启动子或光感受器间类视黄醇结合蛋白(IRBP)启动子。
在一些实施方案中,所述序列还包含在3'末端处的WPRE序列。
在一些实施方案中,所述序列还包含在3'末端处的多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度范围可以是约1-500bp。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度可以是但不限于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、50、100、200或500个核苷酸。在一些实施方案中,poly(A)序列的长度是5至100、5至50、10至50、10至25、25至50或25-75个核苷酸。在一些实施方案中,所述poly(A)序列是SV40pA、hGHpA和bGHpA中的一种。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含一个或多个其它调控序列。所述调控序列包括但不限于反向末端重复序列(ITR)、增强子、剪接信号、多腺苷酸化信号、填充序列、终止子、蛋白质降解信号、内部核糖体进入元件(IRES)、2A序列等。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含增强子区。在一些实施方案中,所述增强子区包含SV40增强子、即时早期巨细胞病毒增强子、IRBP增强子和衍生自免疫球蛋白基因的增强子。在一些实施方案中,所述增强子区位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子的上游。在一些实施方案中,所述增强子位于眼部组织特异性启动子的上游。在一些实施方案中,所述增强子区位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子的下游。在一些实施方案中,所述增强子位于眼部组织特异性启动子的下游。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含至少一个反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含两个反向末端重复序列(ITR)。在一些实施方案中,所述两个ITR是相同的。在一些实施方案中,所述两个ITR彼此是不同的。在一些实施方案中,所述反向末端重复序列(ITR)是衍生自AAV的ITR。在一些实施方案中,所述ITR可以衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV的ITR。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型ITR相比,所述ITR具有一个或多个碱基突变、插入或缺失:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV的ITR,只要它保留作为末端重复序列的所需功能,诸如靶基因的复制、病毒颗粒的包装和/或整合等即可。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含一个或多个填充序列。在一些实施方案中,所述填充序列位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子序列的上游。在一些实施方案中,所述填充序列位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子序列的下游。在一些实施方案中,所述填充序列位于眼部组织特异性启动子的上游。在一些实施方案中,所述填充序列位于眼部组织特异性启动子的下游。在一些实施方案中,所述填充序列位于5'ITR序列的5'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于5'ITR序列的3'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于5'ITR序列的5'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于3'ITR序列的5'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于3'ITR序列的3'末端处。
在一些实施方案中,所述填充序列的长度可以是约0.1kb-5kb,诸如但不限于0.1kb、0.2kb、0.3kb、0.4kb、0.5kb、0.6kb、0.7kb、0.8kb、0.9kb、1kb、1.1kb、1.2kb、1.3kb、1.4kb、1.5kb、1.6kb、1.7kb、1.8kb、1.9kb、2kb、2.1kb、2.2kb、2.3kb、2.4kb、2.5kb、2.6kb、2.7kb、2.8kb、2.9kb、3kb、3.1kb、3.2kb、3.3kb、3.4kb、3.5kb、3.6kb、3.7kb、3.8kb、3.9kb、4.0kb、4.1kb、4.2kb、4.3kb、4.4kb、4.5kb、4.6kb、4.7kb、4.8kb、4.9kb或5.0kb。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸还包含编码一个或多个其它治疗性蛋白的序列。在一些实施方案中,所述治疗性蛋白选自:ATP结合盒亚家族A成员4(ABCA4)、视黄醇脱氢酶12(RDH12)、视黄醇脱氢酶8(RDH8)、视黄醇结合蛋白3(RBP 3)、视黄醇结合蛋白1(RBP 1)、卵磷脂视黄醇酰基转移酶(LRAT)、视黄醛结合蛋白1(Rlbp1)、视黄醇脱氢酶10(RDH10)和视黄醇脱氢酶氢化酶11(RDH11)。
在一些实施方案中,编码其它治疗性蛋白的序列通过编码接头的序列连接至所述序列。在一些实施方案中,所述接头是可切割接头。在一些实施方案中,所述可切割接头包含2A肽的序列。在一些实施方案中,所述2A肽可以选自衍生自口蹄疫病毒或心脏病毒的2A肽,诸如衍生自口蹄疫病毒(FMDV)、马鼻炎A病毒(ERAV)、明脉扁刺蛾病毒(TaV)或猪捷申病毒(PTV-1)的2A肽。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸是密码子优化的。在一些实施方案中,所述启动子是密码子优化的。在一些实施方案中,所述填充序列是密码子优化的。在一些实施方案中,所述其它治疗性蛋白是密码子优化的。在一些实施方案中,所述接头序列是密码子优化的。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过500个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过450个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过400个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过350个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含不超过200个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约200至500个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约250至450个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约300至400个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约200至400个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约200至300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约210至290个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约220至280个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约230至270个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约240至260个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述第二多核苷酸包含约250个CpG二核苷酸。
重组AAV病毒颗粒
在一方面,本公开提供了一种重组腺相关病毒(rAAV)颗粒,其包含含有RPE65多肽的编码序列的表达盒多核苷酸序列。在一些实施方案中,所述编码序列是密码子优化的,并且与野生型RPE65核苷酸序列相比含有改变数量的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含减少数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约90%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约80%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约70%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约60%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约50%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约40%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约30%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约20%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约10%的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过25个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过20个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过19个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过18个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过17个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过16个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过15个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过14个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过13个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过12个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过11个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过9个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过8个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过7个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过6个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过5个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过4个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过3个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过2个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不超过1个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列不包含CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含至少1、2、3、4、5或10个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含5至15个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含7至12个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含0至10个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含增加数量的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约200%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约300%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约400%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约500%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约600%的CpG二核苷酸。在一些实施方案中,与野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约700%的CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述编码序列包含不少于50个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不少于100个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不少于150个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不少于200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不少于250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含不少于300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含约50至300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含约100至250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含约150至200个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含约150个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述编码序列包含约100个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述编码序列选自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:2。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQID No:2具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:2具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ IDNo:3具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:3具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:4。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:4具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:5。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:5具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:6。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:6具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:7。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:7具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:8。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:8具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:9。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:9具有至少95%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列是SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少80%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少90%同一性。在一些实施方案中,所述编码序列与SEQ ID No:10具有至少95%同一性。
在一些实施方案中,所述RPE65多肽在rAAV颗粒感染宿主细胞之后在宿主细胞中表达。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平高于含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约1.1倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约1.2倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约1.3倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约1.4倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约1.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约2倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约2.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约3倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约3.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约4倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约4.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约5.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约6倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约6.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约7倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约7.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约8倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约8.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约9倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约9.5倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约10倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约11倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约12倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约13倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约14倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约15倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约20倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约25倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约30倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约35倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约40倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约45倍。在一些实施方案中,rAAV颗粒的RPE65多肽在宿主细胞中的表达水平是含有野生型RPE65编码序列的rAAV颗粒在宿主细胞中的表达水平的大约50倍。
在一些实施方案中,由rAAV颗粒表达的RPE65信使核糖核酸(mRNA)在宿主细胞中的稳定性高于由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA的稳定性。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA在宿主细胞中具有更长的半衰期。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约10%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约20%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约30%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约40%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约50%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约60%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约70%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约80%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约90%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA相比,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA的半衰期增加约100%。
在一些实施方案中,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽在宿主细胞中的稳定性高于由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽的稳定性。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽在宿主细胞中具有更长的半衰期。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约10%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约20%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约30%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约40%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约50%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约60%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约70%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约80%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约90%。在一些实施方案中,与由野生型RPE65编码序列表达的RPE65多肽相比,由rAAV颗粒表达的RPE65多肽的半衰期增加约100%。
在一些实施方案中,rAAV颗粒中所含的RPE65 DNA在对象中具有比野生型RPE65DNA更低的免疫原性。在一些实施方案中,由rAAV颗粒表达的RPE65 mRNA在对象中具有比由野生型RPE65编码序列表达的RPE65 mRNA更低的免疫原性。
在一些实施方案中,所述rAAV颗粒还包含AAV蛋白。在一些实施方案中,所述AAV蛋白可以来自任何AAV血清型。在一些实施方案中,所述AAV蛋白可以来自AAV血清型1(AAV1)、AAV血清型2(AAV2)、AAV血清型2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV血清型3(AAV3,包括血清型3A和3B)、AAV血清型4(AAV4)、AAV血清型5(AAV5)、AAV血清型6(AAV6)、AAV血清型7(AAV7)、AAV血清型8(AAV8)、AAV血清型9(AAV9)、AAV血清型10(AAV10)、AAV血清型11(AAV11)、AAV血清型12(AAV12)、AAV血清型13(AAV13)、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV。在一些实施方案中,所述AAV蛋白与衍生自以下的野生型AAV蛋白具有至少75%、80%、85%、90%、95%或更大的同一性:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型AAV蛋白相比,所述AAV蛋白具有一个或多个氨基酸取代、缺失和/或添加:AAV1、AAV2、AAV2变体(诸如AAV2.7m8、AAV2(quad Y-F)和AAV2tYF)、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74或AAV-2i8。在一些实施方案中,所述AAV蛋白来自血清型AAV2或其变体、血清型AAV5或其变体、或血清型AAV8或其变体。
在一些实施方案中,所述核苷酸序列还包含启动子,并且所述启动子可操作地连接至所述编码序列。在一些实施方案中,所述启动子是CMV、CAG、MNDU3、PGK、EF1a、Ubc启动子或眼部组织特异性启动子。在一些实施方案中,所述眼部组织特异性启动子选自RPE 65基因启动子、人视网膜结合蛋白(CRALBP)基因启动子、鼠11-顺式视黄醇脱氢酶(RDH)基因启动子、视紫红质启动子、视紫红质激酶启动子、金属蛋白酶组织抑制因子3(Timp3)启动子、光感受器视黄醇结合蛋白启动子和卵黄状黄斑营养不良2启动子或光感受器间类视黄醇结合蛋白(IRBP)启动子。
在一些实施方案中,所述表达盒多核苷酸序列还包含在3'末端处的WPRE序列。
在一些实施方案中,所述表达盒多核苷酸序列还包含在3'末端处的多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度范围可以是约1-500bp。在一些实施方案中,多腺苷酸化序列或“poly(A)序列”的长度可以是但不限于1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、50、100、200或500个核苷酸。在一些实施方案中,所述poly(A)序列是SV40pA、hGHpA和bGHpA中的一种。
在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含其它调控序列。所述调控序列包括但不限于反向末端重复序列(ITR)、增强子、剪接信号、多腺苷酸化信号、填充序列、终止子、蛋白质降解信号、内部核糖体进入元件(IRES)、2A序列等。
在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含增强子区。在一些实施方案中,所述增强子区包含SV40增强子、即时早期巨细胞病毒增强子、IRBP增强子和衍生自免疫球蛋白基因的增强子。在一些实施方案中,所述增强子区位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子的上游。在一些实施方案中,所述增强子位于眼部组织特异性启动子的上游。在一些实施方案中,所述增强子区位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子的下游。在一些实施方案中,所述增强子位于眼部组织特异性启动子的下游。
在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含至少一个反向末端重复(ITR)序列。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含两个反向末端重复序列(ITR)。在一些实施方案中,所述两个ITR是相同的。在一些实施方案中,所述两个ITR彼此是不同的。在一些实施方案中,所述反向末端重复序列(ITR)是衍生自AAV的ITR。在一些实施方案中,所述ITR可以衍生自AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV的ITR。在一些实施方案中,与衍生自以下的野生型ITR相比,所述ITR具有一个或多个碱基突变、插入或缺失:AAV1、AAV2、AAV3(包括AAV3A和3B)、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV13、AAV-Rh10、AAV-Rh74、AAV-2i8和任何其它已知的AAV的ITR,只要它保留作为末端重复序列的所需功能,诸如靶基因的复制、病毒颗粒的包装和/或整合等即可。
在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含一个或多个填充序列。在一些实施方案中,所述填充序列位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子序列的上游。在一些实施方案中,所述填充序列位于CMV、CAG、MNDU3、PGK和EF1a启动子序列的下游。在一些实施方案中,所述填充序列位于眼部组织特异性启动子的上游。在一些实施方案中,所述填充序列位于眼部组织特异性启动子的下游。在一些实施方案中,所述填充序列位于5'ITR序列的5'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于5'ITR序列的3'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于3'ITR序列的5'末端处。在一些实施方案中,所述填充序列位于3'ITR序列的3'末端处。
在一些实施方案中,所述填充序列的长度可以是约0.1kb-5kb,诸如但不限于0.1kb、0.2kb、0.3kb、0.4kb、0.5kb、0.6kb、0.7kb、0.8kb、0.9kb、1kb、1.1kb、1.2kb、1.3kb、1.4kb、1.5kb、1.6kb、1.7kb、1.8kb、1.9kb、2kb、2.1kb、2.2kb、2.3kb、2.4kb、2.5kb、2.6kb、2.7kb、2.8kb、2.9kb、3kb、3.1kb、3.2kb、3.3kb、3.4kb、3.5kb、3.6kb、3.7kb、3.8kb、3.9kb、4.0kb、4.1kb、4.2kb、4.3kb、4.4kb、4.5kb、4.6kb、4.7kb、4.8kb、4.9kb或5.0kb。
在一些实施方案中,所述多核苷酸还包含编码一种其它治疗性蛋白的序列。在一些实施方案中,所述治疗性蛋白选自:ATP结合盒亚家族A成员4(ABCA4)、视黄醇脱氢酶12(RDH12)、视黄醇脱氢酶8(RDH8)、视黄醇结合蛋白3(RBP 3)、视黄醇结合蛋白1(RBP 1)、卵磷脂视黄醇酰基转移酶(LRAT)、视黄醛结合蛋白1(Rlbp1)、视黄醇脱氢酶10(RDH10)和视黄醇脱氢酶氢化酶11(RDH11)。
在一些实施方案中,编码其它治疗性蛋白的序列通过编码接头的序列连接至所述编码序列。在一些实施方案中,所述接头是可切割接头。在一些实施方案中,所述可切割接头包含2A肽的序列。在一些实施方案中,所述2A肽可以选自衍生自口蹄疫病毒或心脏病毒的2A肽,诸如衍生自口蹄疫病毒(FMDV)、马鼻炎A病毒(ERAV)、明脉扁刺蛾病毒(TaV)或猪捷申病毒(PTV-1)的2A肽。
在一些实施方案中,所述多核苷酸是密码子优化的。在一些实施方案中,所述启动子是优化的。在一些实施方案中,所述填充序列是优化的。在一些实施方案中,所述其它治疗性蛋白是优化的。在一些实施方案中,所述接头序列是优化的。
在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过500个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过450个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过400个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过350个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过250个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含不超过200个CpG二核苷酸。
在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约200至500个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约250至450个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约300至400个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约200至400个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约200至300个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约210至290个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约220至280个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约230至270个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约240至260个CpG二核苷酸。在一些实施方案中,所述多核苷酸包含约250个CpG二核苷酸。在另一方面,本公开提供了一种用于制备重组腺相关病毒(rAAV)颗粒的方法,所述方法包括在宿主细胞中引入本文所述的表达盒多核苷酸序列。在另一方面,本公开提供了一种重组腺相关病毒(rAAV)颗粒,其通过包括在宿主细胞中引入本文所述的表达盒多核苷酸序列的方法制备。在一些实施方案中,所述方法包括在所述宿主细胞中表达本文所述的表达盒多核苷酸序列。在一些实施方案中,所述宿主细胞是人细胞、动物细胞或昆虫细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是人细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是Sf9细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是HEK293细胞或其衍生物。在一些实施方案中,所述宿主细胞是HEK293T细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是HEK293FT细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞是昆虫细胞。在一些实施方案中,所述方法包括生成杆状病毒质粒DNA和/或杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法包括生成RPE65表达序列杆状病毒质粒DNA。在一些实施方案中,所述方法包括生成rAAV cap表达序列杆状病毒质粒DNA。在一些实施方案中,所述方法包括用所述杆状病毒质粒DNA转染宿主细胞以产生杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法包括用所述RPE65表达序列杆状病毒质粒DNA转染宿主细胞以产生杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法包括用所述rAAV cap表达序列杆状病毒质粒DNA转染宿主细胞以产生杆状病毒。在一些实施方案中,所述方法还包括将所述两种杆状病毒混合来感染宿主细胞(诸如Sf9细胞),以获得本公开的包装的rAAV/RPE65优化病毒颗粒。
在一些实施方案中,本公开的组合物可以通过本领域已知的任何方法递送到宿主细胞中。在一些实施方案中,所述方法包括但不限于电穿孔、磷酸钙沉淀、脂质体介导等。在一些实施方案中,所述组合物稳定地转染到宿主细胞中。在一些实施方案中,所述组合物瞬时转染到宿主细胞中。在一些实施方案中,所述宿主细胞用于产生rAAV病毒颗粒。
如果需要,可以根据本领域技术人员已知的常规方法从宿主细胞中分离和纯化rAAV病毒颗粒。例如,rAAV病毒颗粒可以使用离心、HPLC、疏水相互作用色谱法(HIC)、阴离子交换色谱法、阳离子交换色谱法、尺寸排阻色谱法、超滤、凝胶电泳、亲和色谱法和/或其它纯化技术进行纯化。
药物组合物
在一方面,本文提供了一种药物组合物,其包含所述的rAAV颗粒或所述的组合物。在一些实施方案中,所述药物组合物包含本公开的rAAV颗粒和药学上可接受的载剂或赋形剂。
如本文所用,“药学上或治疗上可接受的载剂或赋形剂”是指不干扰活性成分的生物活性的有效性并且对宿主或患者无毒的载剂介质。药物配制品中使用的载剂类型将取决于治疗化合物的施用方法。制备用于多种施用途径的药物组合物的许多方法是本领域熟知的。“药学上可接受的眼用载剂”是指可以用于直接或间接地将本公开的rAAV病毒颗粒递送到眼睛、眼睛上或眼睛附近的药学上可接受的载剂或赋形剂。
在本公开的一些实施方案中,所述药物组合物通过将本公开的rAAV病毒颗粒溶解在合适的溶剂中来制备。合适的溶剂包括但不限于水、盐溶液(例如,NaCl)、缓冲溶液(例如,磷酸盐缓冲盐水(PBS))或其它溶剂。在某些实施方案中,所述病毒颗粒药物组合物可以包含表面活性剂(例如,泊洛沙姆、普朗尼克酸F68(pluronic acid F68))。在某些实施方案中,所述溶剂是无菌的。在某些实施方案中,所述病毒颗粒药物组合物包含氯化钠、磷酸钠和泊洛沙姆。在一些实施方案中,所述药物组合物不包含任何防腐剂。
在一些实施方案中,所述药物组合物是悬浮液。在一些实施方案中,所述药物组合物是溶液。
本文所述的药物组合物可以包含任何合适量的rAAV颗粒。在一些实施方案中,所述药物组合物包含1x109至1x1014个载体基因组(vg)/mL。在一些实施方案中,所述药物组合物包含1x1010至1x1013个vg/mL。在一些实施方案中,所述药物组合物包含5x1010至5x1012个vg/mL。在一些实施方案中,所述药物组合物包含1x1011至1x1012个vg/mL。在一些实施方案中,所述药物组合物具有0.1至5mL的体积。在一些实施方案中,所述药物组合物具有0.2至0.5mL的体积。在一些实施方案中,所述药物组合物具有0.1至1mL的体积。
治疗方法
在一方面,本申请提供了一种用于治疗遗传性视网膜疾病,诸如由RPE65基因的一个或两个拷贝的突变引起的疾病的方法。在一方面,本申请提供了一种用于治疗Leber先天性黑朦(LCA)的方法。在一些实施方案中,所述方法包括向有需要的对象施用治疗有效量的本文所述的rAAV病毒颗粒和/或本公开的药物组合物。在一些实施方案中,所述对象患有由RPE65基因的两个拷贝的突变引起的遗传性视网膜疾病。在一些实施方案中,所述对象患有LCA。
在一些实施方案中,所述rAAV病毒颗粒和/或药物组合物可以通过本领域已知的任何合适的方法施用于对象。在一些实施方案中,所述rAAV病毒颗粒和/或药物组合物可以诸如通过结膜下、眼球后、眼周、玻璃体内、视网膜下、脉络膜上腔或眼内施用局部施用于眼睛。在一些实施方案中,所述rAAV病毒颗粒和/或药物组合物经由视网膜下注射施用。
在一些实施方案中,包含rAAV病毒颗粒的药物组合物以在医学上可接受的毒性水平下实现所需生物学作用的治疗有效量提供。剂量可以根据施用途径和疾病的严重程度而变化。剂量也可以根据每个待治疗患者的体重、年龄、性别和/或症状程度进行调整。准确剂量和施用途径最终将由主治医生或兽医决定。可以理解的是,根据患者的年龄和体重以及待治疗的病状的严重程度,可能需要常规剂量变化。
在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×105至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×106至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×107至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×108至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×109至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×1010至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×1011至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×1012至1×1013个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×106至1×1012个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×107至1×1012个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×108至1×1012个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×109至1×1012个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×1010至1×1012个rAAV病毒颗粒。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×109至1×1010个rAAV病毒颗粒。
在一些实施方案中,所述治疗有效量是约1×105至1×1020个载体基因组(vg)/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×106至1×1016个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×107至1×1014个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×108至1×1013个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×109至1×1013个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×1010至1×1013个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×1011至1×1013个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×1012至1×1013个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×106至1×1012个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×107至1×1012个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×108至1×1012个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×109至1×1012个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量通常是约1×1010至1×1012个vg/剂量。在一些实施方案中,所述治疗有效量是1×109至1×1010个vg/剂量。
在一些实施方案中,递送体积是约0.01mL-1mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.05mL-1mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.1mL-1mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.5mL-1mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.1mL-0.5mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.01mL-0.5mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.05mL-0.5mL。在一些实施方案中,递送体积是约0.05mL-1mL。
在一些实施方案中,施用频率可以是每天至少一次,包括每天2、3、4或5次。在一些实施方案中,治疗可以持续1天、2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天、10天、11天、12天、13天、14天、15天、16天、17天、18天、19天、20天、21天、22天、23天、24天、25天、26天、27天、28天、29天、30天、31天、32天、33天、34天、35天、36天、37天、38天、39天、40天、41天、42天、43天、44天、45天、46天、47天、48天、49天、50天、60天、70天、80天、90天、100天、150天、200天、250天、300天、400天、500天、750天、1000天或超过1000天。
在一些实施方案中,所述施用包括稀释药物组合物。例如,药物组合物可以在施用之前以1:1至1:100比例稀释。在一些实施方案中,药物组合物在施用之前以1:10稀释。
在一些实施方案中,所述施用包括每只眼睛单个剂量。对于对象的每只眼睛的施用可以是相同或不同的一天。在一些实施方案中,对于对象的每只眼睛的施用在单独的一天进行,例如,间隔至少1天、2天、3天、4天、5天、6天、7天或10天。在一些实施方案中,对于对象的每只眼睛的施用间隔至多45天、30天、20天、15天、10天、7天或3天进行。在一些实施方案中,对于对象的每只眼睛的施用间隔不少于6天进行。
在一些实施方案中,第二治疗剂可以与所述药物组合物同时或顺序施用。在一些实施方案中,第二治疗剂是全身口服皮质类固醇。例如,口服皮质类固醇可以0.1至40mg/kg/天施用,持续总计1至30天。在一些实施方案中,口服皮质类固醇以1mg/kg/天施用,持续总计7天。在一些实施方案中,口服皮质类固醇在施用药物组合物之前1、2、3、4、5、6或7天开始施用。在一些实施方案中,口服皮质类固醇在施用药物组合物之后接下来的5、6、7、8、9、10、11、12、15或更多天期间以递减剂量施用。
在一些实施方案中,所述对象是至少12个月的年龄。在一些实施方案中,所述对象是成年人。在一些实施方案中,所述对象是二酮。在一些实施方案中,所述对象是老年人。在一些实施方案中,所述对象是1至18岁。在一些实施方案中,所述对象是4至12岁。在一些实施方案中,所述对象是至少18岁。
试剂盒
在另一方面,本公开提供了一种用于治疗LCA的试剂盒,所述试剂盒包括本公开的药物组合物和说明书。在一些实施方案中,所述说明书用于指示施用药物组合物以治疗LCA的方法。
在一些实施方案中,所述试剂盒还包括容器。在一些实施方案中,所述容器被配置来递送本文所述的药物组合物。在一些实施方案中,所述容器包括小瓶、滴管、瓶子、管和注射器。在一些实施方案中,所述容器是用于施用药物组合物的滴管。在一些实施方案中,所述容器是用于施用药物组合物的注射器。
本公开的一些实施方案通过以下实施例进一步说明,其不应被解释为限制性的。本领域技术人员将理解,以下实施例中公开的技术代表了实施本文所述的本公开实施方案的操作良好的技术,并且因此可以被认为构成用于实现这些实施方案的优选手段。然而,本领域技术人员将理解,根据本公开,在不脱离本公开的精神和范围的情况下,可以对本文公开的具体实施方案做出许多改变,并且仍然实现相同或类似的结果。
实施例
以下实施例进一步说明了本公开。这些实施例仅用于说明本公开,并且不应被解释为限制本公开。
实施例1重组AAV载体的设计和克隆
将衍生自rAAV的cap和rep编码序列及其对应的启动子一起分别克隆到pFastBac1载体中,以获得编码AAV蛋白的多核苷酸。rAAV的衣壳蛋白VP1的编码序列是SEQ ID NO:17;衣壳蛋白VP2的编码序列是SEQ ID NO:18;并且衣壳蛋白VP3的编码序列是SEQ ID NO:19。优化了SEQ ID No:1中所示的编码RPE65多肽的野生型核苷酸序列的密码子。具体地,同义替换RPE65基因中较少使用的密码子,同时确保RPE65的优化核苷酸序列含有改变数量的CpG二核苷酸。密码子优化的RPE65核苷酸序列编码的氨基酸序列与SEQ ID No:1中所示的RPE65多肽的氨基酸序列一致。换言之,由密码子优化的RPE65核苷酸序列编码的氨基酸序列是SEQ ID NO:11。优化的RPE65核苷酸序列是SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10。
将本申请的优化的RPE65核苷酸序列与CAG启动子(例如,SEQ ID NO:12)和两个末端处的ITR序列一起克隆到pFastBac1载体中,以获得含有优化的RPE65序列的多核苷酸。其中,如图1所示,优化的RPE65核苷酸序列的3'末端后面还可以是poly(A)序列hGHpA(例如,SEQ ID NO:13)、SV40pA(例如,SEQ ID NO:15)或bGHpA(例如,SEQ ID NO:14)。优化的RPE65核苷酸序列的3'末端后面还可以是WPRE序列(例如,SEQ ID NO:16)。两个末端处的ITR序列在启动子前面并且在poly(A)后面。
实施例2重组AAV病毒颗粒的制备
将编码AAV蛋白的多核苷酸和含有实施例1获得的优化的RPE65序列的多核苷酸转化到DH10Bac中,以分别产生Rep-Cap和RPE65表达序列杆状病毒质粒DNA,并且然后单独转染Sf9昆虫细胞产生杆状病毒,接着将两种杆状病毒混合以感染Sf9细胞,获得本申请的包装的rAAV/RPE65优化病毒颗粒。另外,编码AAV蛋白的多核苷酸和含有优化的RPE65序列的多核苷酸也可以与辅助质粒载体一起共转染到HEK293细胞中,以获得本申请的包装的rAAV/RPE65优化病毒颗粒。最后,通过梯度超速离心纯化rAAV/RPE65优化病毒颗粒。
实施例3RPE65在宿主细胞中的体外表达
用RPE65优化表达质粒转染的宿主细胞可以高效地表达RPE65多肽。与野生型RPE65表达质粒相比,本申请的RPE65优化质粒的RPE65多肽表达效率显著更高。在分别用本公开的RPE65优化多核苷酸或对照质粒的野生型RPE65多核苷酸转染HEK293细胞之后,收集HEK293细胞并使用蛋白质印迹法测量RPE65的表达水平。结果显示,以对照中野生型RPE65的表达水平作为参考,其它组的归一化表达水平如下(在3个独立实验中测量):RPE001的表达水平为0.36、0.58和0.20;RPE002的表达水平为0.76、0.93和0.61;RPE003的表达水平为2.43、2.42和1.05;RPE004的表达水平为8.00、2.60和3.70;RPE005的表达水平为5.48、1.19和3.52;并且RPE006的表达水平为2.60、1.31和3.02。
在MOI=1E5的剂量下,用含有本公开的优化RPE65和对照的野生型RPE65的rAAV颗粒感染HEK293细胞之后,使用流式细胞术测量表达RPE65蛋白的阳性细胞。结果如下(在2-3个独立实验中测量):野生型AAV颗粒的RPE65阳性细胞率为9.84%和4.5%,RPE001的RPE65阳性细胞率为4.71%、3.5%和5.02%;RPE002的RPE65阳性细胞率为3.95%、6.08%和4.74%;RPE003的RPE65阳性细胞率为3.04%、5.22%和4.36%;RPE004的RPE65阳性细胞率为28.8%、31%和27.4%;RPE005的RPE65阳性细胞率为6.66%、9.65%和11%;RPE006的RPE65阳性细胞率为9.25%、13.6%和14.1%;并且RPE007的RPE65阳性细胞率为18.9%、27%和22.6%。
在MOI=5E5的剂量下,用含有本公开的优化RPE65和对照的野生型RPE65的rAAV颗粒感染HEK293细胞之后,使用流式细胞术测量表达RPE65蛋白的阳性细胞。结果如下(在2-3个独立实验中测量):野生型AAV颗粒的RPE65阳性细胞率为13.3%和9.27%,RPE001的RPE65阳性细胞率为7.88%、9.11%和2.94%;RPE002的RPE65阳性细胞率为9.61%、9.13%和6.84%;RPE003的RPE65阳性细胞率为7.73%、11.5%和7.39%;RPE004的RPE65阳性细胞率为34.7%、41%和34.3%;RPE005的RPE65阳性细胞率为22.9%、20.9%和12.4%;RPE006的RPE65阳性细胞率为19.4%、24.2%和15.5%;并且RPE007的RPE65阳性细胞率为38.8%、32.7%和25.5%。
在MOI=1E5的剂量下,用含有本公开的优化RPE65和对照的野生型RPE65的AAV颗粒感染HEK293细胞之后,使用蛋白质印迹法测量表达水平。结果显示,以用RPE001 AAV颗粒感染的HEK293T细胞中RPE65蛋白的表达水平作为参考,其它组的归一化表达水平如下(在2-3个独立实验中测量):野生型的表达水平为1.46和2.20;RPE002的表达水平为1.17、0.63和0.91;RPE003的表达水平为1.61、1.34和1.34;RPE004的表达水平为11.63、5.13和7.47;RPE005的表达水平为2.60、2.03和2.09;RPE006的表达水平为2.70、2.94和3.10;并且RPE007的表达水平为4.70、8.24和7.20。
在MOI=5E5的剂量下,用含有本公开的优化RPE65和对照的野生型RPE65的AAV颗粒感染HEK293细胞之后,使用蛋白质印迹法测量RPE65的表达水平。结果显示,以用RPE001AAV颗粒感染的HEK293T细胞中RPE65蛋白的表达水平作为参考,其它组的归一化表达水平如下(在2-3个独立实验中测量):野生型的表达水平为2.93和3.18;RPE002的表达水平为0.91、0.68和1.45;RPE003的表达水平为2.10、1.75和2.19;RPE004的表达水平为17.44、3.94和11.56;RPE005的表达水平为3.95、1.65和0.64;RPE006的表达水平为3.73、2.94和0.71;并且RPE007的表达水平为8.35、4.51和10.15。以上结果显示,本公开的RPE65优化rAAV颗粒中RPE65的感染率和表达水平均显著高于对照的野生型RPE65 AAV颗粒的感染率和表达水平。
实施例4rAAV/优化RPE65在B6(A)-Rpe65rd12小鼠中的治疗作用
使用B6(A)-Rpe65rd12小鼠来确定rAAV/优化RPE65的体内治疗作用。其中,对照使用不含rAAV的空白媒介物缓冲液,并且实验组使用由实施例2生成的纯化的rAAV/RPE65优化病毒颗粒RPE003、RPE004、RPE006、RPE007和WT进行视网膜下注射。具体地,在出生之后14天对Rpe65rd12小鼠进行视网膜下注射。在整个程序中使用手术显微镜,并且将针头切向插入巩膜,从而产生具有自密封巩膜通道的伤口。将约1μl的病毒悬浮液注射到视网膜下间隙中,并且两者都导致检眼镜检查可见的大疱性视网膜脱离。向小鼠的一只或两只眼睛注射不含rAAV的空白媒介物缓冲液或rAAV/RPE65优化病毒颗粒。用于注射的病毒颗粒剂量是每只眼睛5×109个vg。
在注射之后,使用本领域技术人员熟知的视网膜电图(ERG)观察小鼠的眼睛。ERG是一种非侵入性工具,通过测量视网膜细胞对光刺激的电应答来测试视网膜功能。ERG测试经常用于评估眼部疾病和视网膜变性,并且其可以用于人类或小鼠的眼睛。有两种类型的ERG测试:暗视ERG和明视ERG。其中,暗视ERG包括暗视A波和暗视B波。暗视ERG使用低强度闪光在过夜的黑暗适应之后诱导视杆细胞的激活,以实现最大的视杆细胞激活和灵敏性。A波测量视杆细胞光感受器的功能,并且B波测量视网膜细胞对于光感受器刺激的下游应答。任一波的振幅读数的降低和增加分别可以指示疾病进展和视网膜功能的恢复。明视ERG使用高强度闪光来诱导视锥细胞的激活,并在一段时间的光刺激之后抑制视杆细胞的应答。
使用ERG来评估视网膜功能的恢复是本领域技术人员熟知的一种技术手段。参见例如,ERG协议,包括实验设置、研究材料、小鼠准备、ERG设置和数据处理的详细信息,其在Assessment of Murine Retinal Function by Electroretinography(G.Benchorin等人,Bio Protoc.2017)中描述。
所有小鼠在实验日之前进行至少12小时的过夜黑暗适应,并且在准备期间通过仅使用红色过滤光源保持黑暗适应。将小鼠置于加热至37℃的平台上,并且用含有硫酸阿托品、盐酸去氧肾上腺素和盐酸丙美卡因的滴眼液处理。然后去除滴眼液,并且然后用药膏将它们的眼睛保持润湿。对于A波和B波两者,脉冲强度为1cd sec/m2。使用Microsoft Excel和GraphPad Prism来分析数据。
在注射治疗之后一个月,通过暗视ERG A波和B波评价视网膜功能的恢复。此后每个月进行暗视ERG,直至注射之后3个月(进行评价的最后时间点)。结果在表3和表4中总结。
表3.暗视ERG A波结果
*10uV≤A<50uV;并且0<B<10uV。
表4.暗视ERG B波结果
*30uV≤A<100uV;15uV<B<30uV;并且0<C≤15uV。
另外,此研究还使用视网膜眼底成像和光学相干断层扫描(OCT)技术来评价对照组和实验组中视网膜结构的变化。在研究结束时,收集小鼠眼睛组织样品进行免疫荧光染色和免疫组织化学,以评价视网膜的结构和人RPE65蛋白的表达水平。
序列表
SEQ ID NO:1
ATGTCTATCCAGGTTGAGCATCCTGCTGGTGGTTACAAGAAACT
GTTTGAAACTGTGGAGGAACTGTCCTCGCCGCTCACAGCTCATG
TAACAGGCAGGATCCCCCTCTGGCTCACCGGCAGTCTCCTTCGA
TGTGGGCCAGGACTCTTTGAAGTTGGATCTGAGCCATTTTACCA
CCTGTTTGATGGGCAAGCCCTCCTGCACAAGTTTGACTTTAAAG
AAGGACATGTCACATACCACAGAAGGTTCATCCGCACTGATGCT
TACGTACGGGCAATGACTGAGAAAAGGATCGTCATAACAGAAT
TTGGCACCTGTGCTTTCCCAGATCCCTGCAAGAATATATTTTCC
AGGTTTTTTTCTTACTTTCGAGGAGTAGAGGTTACTGACAATGC
CCTTGTTAATGTCTACCCAGTGGGGGAAGATTACTACGCTTGCA
CAGAGACCAACTTTATTACAAAGATTAATCCAGAGACCTTGGA
GACAATTAAGCAGGTTGATCTTTGCAACTATGTCTCTGTCAATG
GGGCCACTGCTCACCCCCACATTGAAAATGATGGAACCGTTTAC
AATATTGGTAATTGCTTTGGAAAAAATTTTTCAATTGCCTACAA
CATTGTAAAGATCCCACCACTGCAAGCAGACAAGGAAGATCCA
ATAAGCAAGTCAGAGATCGTTGTACAATTCCCCTGCAGTGACCG
ATTCAAGCCATCTTACGTTCATAGTTTTGGTCTGACTCCCAACTA
TATCGTTTTTGTGGAGACACCAGTCAAAATTAACCTGTTCAAGT
TCCTTTCTTCATGGAGTCTTTGGGGAGCCAACTACATGGATTGT
TTTGAGTCCAATGAAACCATGGGGGTTTGGCTTCATATTGCTGA
CAAAAAAAGGAAAAAGTACCTCAATAATAAATACAGAACTTCT
CCTTTCAACCTCTTCCATCACATCAACACCTATGAAGACAATGG
GTTTCTGATTGTGGATCTCTGCTGCTGGAAAGGATTTGAGTTTG
TTTATAATTACTTATATTTAGCCAATTTACGTGAGAACTGGGAA
GAGGTGAAAAAAAATGCCAGAAAGGCTCCCCAACCTGAAGTTA
GGAGATATGTACTTCCTTTGAATATTGACAAGGCTGACACAGGC
AAGAATTTAGTCACGCTCCCCAATACAACTGCCACTGCAATTCT
GTGCAGTGACGAGACTATCTGGCTGGAGCCTGAAGTTCTCTTTT
CAGGGCCTCGTCAAGCATTTGAGTTTCCTCAAATCAATTACCAG
AAGTATTGTGGGAAACCTTACACATATGCGTATGGACTTGGCTT
GAATCACTTTGTTCCAGATAGGCTCTGTAAGCTGAATGTCAAAA
CTAAAGAAACTTGGGTTTGGCAAGAGCCTGATTCATACCCATCA
GAACCCATCTTTGTTTCTCACCCAGATGCCTTGGAAGAAGATGA
TGGTGTAGTTCTGAGTGTGGTGGTGAGCCCAGGAGCAGGACAA
AAGCCTGCTTATCTCCTGATTCTGAATGCCAAGGACTTAAGTGA
AGTTGCCCGGGCTGAAGTGGAGATTAACATCCCTGTCACCTTTC
ATGGACTGTTCAAAAAATCTTGA
SEQ ID NO:2
ATGTCTATCCAGGTTGAGCATCCTGCTGGTGGTTACAAGAAACT
GTTTGAAACTGTGGAGGAACTGTCCTCGCCGCTCACAGCTCATG
TAACAGGCAGGATCCCCCTCTGGCTCACCGGCAGTCTCCTTCGA
TGTGGGCCAGGACTCTTTGAAGTTGGATCTGAGCCATTTTACCA
CCTGTTTGATGGGCAAGCCCTCCTGCACAAGTTTGACTTTAAAG
AAGGACACGTCACATACCACAGAAGGTTCATCCGCACTGATGC
TTACGTACGGGCAATGACTGAGAAAAGGATCGTCATAACAGAA
TTTGGCACCTGTGCTTTCCCAGATCCCTGCAAGAATATATTTTCC
AGGTTTTTTTCTTACTTTCGAGGAGTAGAGGTTACTGACAACGC
CCTTGTTAATGTCTACCCAGTGGGGGAAGATTACTACGCTTGCA
CAGAGACCAACTTTATTACAAAGATTAATCCAGAGACCTTGGA
GACAATTAAGCAGGTTGATCTTTGCAACTATGTCTCTGTCAATG
GGGCCACTGCTCACCCCCACATTGAAAATGATGGAACCGTTTAC
AATATTGGTAATTGCTTTGGAAAAAATTTTTCAATTGCCTACAA
CATTGTAAAGATCCCACCACTGCAAGCAGACAAGGAAGATCCA
ATAAGCAAGTCAGAGATCGTTGTACAATTCCCCTGCAGTGACCG
ATTCAAGCCATCTTACGTTCATAGTTTTGGTCTGACTCCCAACTA
TATCGTTTTTGTGGAGACACCAGTCAAAATTAACCTGTTCAAGT
TCCTTTCTTCATGGAGTCTTTGGGGAGCCAACTACATGGATTGT
TTTGAGTCCAATGAAACCATGGGGGTTTGGCTTCATATTGCTGA
CAAAAAAAGGAAAAAGTACCTCAATAATAAATACAGAACTTCT
CCTTTCAACCTCTTCCATCACATCAACACCTATGAAGACAATGG
GTTTCTGATTGTGGATCTCTGCTGCTGGAAAGGATTTGAGTTTG
TTTATAATTACTTATATTTAGCCAATTTACGTGAGAACTGGGAA
GAGGTGAAAAAAAATGCCAGAAAGGCTCCCCAACCTGAAGTTA
GGAGATATGTACTTCCTTTGAATATTGACAAGGCTGACACAGGC
AAGAATTTAGTCACGCTCCCCAATACAACTGCCACTGCAATTCT
GTGCAGTGACGAGACTATCTGGCTGGAGCCTGAAGTTCTCTTTT
CAGGGCCTCGTCAAGCATTTGAGTTTCCTCAAATCAATTACCAG
AAGTATTGTGGGAAACCTTACACATATGCGTATGGACTTGGCTT
GAATCACTTTGTTCCAGATAGGCTCTGTAAGCTGAATGTCAAAA
CTAAAGAAACTTGGGTTTGGCAAGAGCCTGATTCATACCCATCA
GAACCCATCTTTGTTTCTCACCCAGATGCCTTGGAAGAAGATGA
TGGTGTAGTTCTGAGTGTGGTGGTGAGCCCAGGAGCAGGACAA
AAGCCTGCTTATCTCCTGATTCTGAATGCCAAGGACTTAAGTGA
AGTTGCCCGGGCTGAAGTGGAGATTAACATCCCTGTCACCTTTC
ACGGACTGTTCAAAAAATCTTGA
SEQ ID NO:3
ATGTCCATCCAGGTGGAGCACCCAGCTGGAGGCTACAAGAAGC
TGTTTGAAACTGTGGAAGAACTGAGCAGCCCCCTGACAGCCCAT
GTGACAGGCAGAATCCCTCTGTGGCTGACAGGCAGCCTGCTGA
GATGTGGCCCAGGCCTGTTTGAGGTGGGCTCTGAGCCTTTCTAC
CACCTGTTTGATGGCCAAGCCCTGCTCCACAAGTTTGATTTCAA
GGAGGGCCATGTGACCTACCACAGAAGATTCATCAGAACAGAT
GCCTATGTGAGGGCCATGACAGAGAAGAGGATAGTTATCACAG
AGTTTGGCACCTGTGCCTTCCCTGACCCCTGCAAGAACATCTTC
AGCAGATTCTTCAGCTACTTCAGAGGAGTGGAAGTGACAGACA
ATGCCCTGGTCAATGTGTACCCTGTGGGAGAGGACTACTATGCC
TGTACTGAGACCAACTTCATCACCAAGATCAACCCTGAAACCCT
GGAAACCATCAAGCAGGTGGACCTGTGCAACTATGTGTCAGTC
AATGGAGCCACAGCCCACCCTCACATTGAGAATGATGGCACAG
TTTACAACATAGGCAACTGCTTTGGCAAAAACTTCAGCATTGCC
TACAACATTGTGAAGATCCCCCCTCTGCAGGCTGACAAGGAGG
ACCCCATCAGCAAGTCTGAGATAGTGGTGCAGTTCCCATGCTCT
GACAGATTCAAGCCCAGCTATGTGCACAGCTTTGGCCTGACCCC
AAACTACATTGTGTTTGTGGAAACCCCTGTGAAGATCAACCTGT
TCAAGTTCCTGAGCTCCTGGAGCCTGTGGGGAGCCAACTACATG
GACTGCTTTGAAAGCAATGAGACCATGGGAGTGTGGCTGCACA
TTGCTGACAAGAAAAGAAAGAAGTACCTGAACAACAAATACAG
AACCAGCCCTTTCAACCTGTTCCACCACATCAACACCTATGAGG
ACAATGGCTTCCTGATTGTGGACCTGTGCTGCTGGAAGGGCTTT
GAGTTTGTGTACAACTACCTGTACCTGGCCAACCTGAGAGAAAA
CTGGGAGGAAGTGAAAAAAAATGCCAGAAAGGCCCCCCAGCCT
GAGGTGAGGAGATATGTGCTGCCTCTGAACATAGACAAGGCTG
ACACAGGCAAGAACCTGGTGACCCTCCCCAACACCACAGCCAC
AGCCATCCTGTGCTCTGATGAGACCATCTGGCTGGAGCCTGAAG
TGCTGTTCTCTGGCCCCAGACAGGCCTTTGAGTTCCCTCAAATC
AACTACCAGAAATACTGTGGCAAACCCTACACCTATGCCTATGG
CCTGGGCCTGAACCACTTTGTCCCTGACAGACTGTGCAAGCTGA
ATGTGAAAACCAAGGAGACCTGGGTCTGGCAGGAGCCTGACTC
CTACCCTTCTGAACCCATCTTTGTGAGCCACCCTGATGCCCTGG
AGGAGGATGATGGAGTGGTGCTGAGTGTGGTGGTCAGCCCTGG
TGCTGGCCAGAAGCCTGCATACCTGCTAATCCTGAATGCCAAGG
ACCTGTCTGAAGTTGCCAGGGCTGAGGTGGAAATCAACATCCCT
GTGACCTTCCATGGCCTTTTCAAGAAGAGCTGA
SEQ ID NO:4
ATGAGCATCCAGGTGGAACATCCTGCTGGTGGCTACAAGAAAC
TGTTTGAGACAGTGGAAGAACTGAGCAGCCCTCTGACAGCCCA
TGTGACAGGCAGAATCCCTCTGTGGCTGACAGGCTCCCTGCTGA
GATGTGGCCCTGGCCTGTTTGAAGTGGGCTCTGAGCCTTTCTAC
CACCTGTTTGATGGACAGGCCCTGCTGCACAAGTTTGACTTCAA
AGAGGGCCATGTGACCTACCACAGAAGATTCATCAGGACAGAT
GCCTATGTCAGAGCCATGACAGAGAAGAGGATTGTGATCACTG
AGTTTGGCACCTGTGCCTTTCCAGATCCTTGCAAGAACATCTTC
AGCAGATTCTTCAGCTACTTCAGAGGGGTTGAAGTGACAGACA
ATGCCCTGGTCAATGTGTACCCTGTGGGAGAAGATTACTATGCC
TGCACAGAGACAAACTTCATCACCAAGATCAACCCTGAGACAC
TGGAAACCATCAAGCAGGTTGACCTGTGCAACTATGTGTCTGTG
AATGGGGCCACAGCTCACCCTCACATTGAGAATGATGGCACAG
TGTACAACATTGGCAACTGCTTTGGCAAGAACTTCAGCATTGCC
TACAACATAGTGAAGATCCCACCTCTGCAGGCTGACAAAGAGG
ACCCCATCAGCAAGTCTGAGATTGTGGTGCAGTTCCCCTGCTCT
GACAGATTCAAGCCCAGCTATGTGCACAGCTTTGGCCTGACACC
TAACTACATTGTGTTTGTGGAAACCCCTGTGAAGATCAATCTGT
TCAAGTTCCTGAGCAGCTGGTCCCTGTGGGGAGCCAACTACATG
GACTGCTTTGAGAGCAATGAGACAATGGGAGTGTGGCTGCACA
TTGCAGACAAGAAGAGAAAGAAGTACCTGAACAACAAGTACAG
GACAAGCCCCTTCAACCTGTTCCACCACATCAACACCTATGAGG
ACAATGGCTTCCTGATTGTGGACCTGTGCTGCTGGAAGGGCTTT
GAGTTTGTGTACAACTACCTGTACCTGGCCAACCTGAGGGAAAA
CTGGGAAGAAGTGAAGAAGAATGCCAGAAAGGCCCCTCAGCCT
GAAGTTAGAAGATATGTGCTGCCCCTGAACATTGACAAGGCTG
ACACAGGCAAGAACCTGGTCACCCTGCCTAACACCACAGCCAC
AGCCATCCTGTGCTCTGATGAGACTATCTGGCTGGAACCTGAGG
TGCTGTTCTCTGGCCCCAGACAGGCCTTTGAGTTCCCTCAGATC
AACTACCAGAAATACTGTGGCAAGCCCTACACCTATGCCTATGG
CCTGGGCCTGAACCACTTTGTGCCAGACAGACTGTGCAAGCTGA
ATGTCAAGACCAAAGAGACATGGGTCTGGCAAGAGCCTGACAG
CTACCCTTCTGAGCCCATCTTTGTGTCTCACCCTGATGCTCTGGA
AGAGGATGATGGGGTTGTGCTGTCTGTGGTGGTGTCCCCTGGTG
CTGGACAGAAGCCTGCCTATCTGCTGATCCTGAATGCCAAGGAC
CTGTCTGAGGTGGCCAGAGCTGAGGTGGAAATCAACATCCCTGT
GACCTTCCATGGCCTGTTCAAGAAGTCCTGA
SEQ ID NO:5
ATGAGCATCCAGGTGGAACATCCTGCTGGTGGCTACAAGAAAC
TGTTTGAGACAGTGGAAGAACTGAGCAGCCCTCTGACAGCCCA
TGTGACAGGCAGAATCCCTCTGTGGCTGACAGGCTCCCTGCTGA
GATGTGGCCCTGGCCTGTTTGAAGTGGGCTCTGAGCCTTTCTAC
CACCTGTTTGATGGACAGGCCCTGCTGCACAAGTTTGACTTCAA
AGAGGGCCATGTGACCTACCACAGAAGATTCATCAGGACAGAT
GCCTATGTCAGAGCCATGACAGAGAAGAGGATTGTGATCACTG
AGTTTGGCACCTGTGCCTTTCCAGATCCTTGCAAGAACATCTTC
AGCAGATTCTTCAGCTACTTCAGAGGGGTTGAAGTGACAGACA
ATGCCCTGGTCAATGTGTACCCTGTGGGAGAAGATTACTATGCC
TGCACAGAGACAAACTTCATCACCAAGATCAACCCTGAGACAC
TGGAAACCATCAAGCAGGTTGACCTGTGCAACTATGTGTCTGTG
AATGGGGCCACAGCTCACCCTCACATTGAGAATGATGGCACAG
TGTACAACATTGGCAACTGCTTTGGCAAGAACTTCAGCATTGCC
TACAACATAGTGAAGATCCCACCTCTGCAGGCTGACAAAGAGG
ACCCCATCAGCAAGTCTGAGATTGTGGTGCAGTTCCCCTGCTCT
GACAGATTCAAGCCCAGCTATGTGCACAGCTTTGGCCTGACACC
TAACTACATTGTGTTTGTGGAAACCCCTGTGAAGATCAATCTGT
TCAAGTTCCTGAGCAGCTGGTCCCTGTGGGGAGCCAACTACATG
GACTGCTTTGAGAGCAATGAGACAATGGGAGTGTGGCTGCACA
TTGCAGACAAGAAGAGAAAGAAGTACCTGAACAACAAGTACCG
GACAAGCCCCTTCAACCTGTTCCACCACATCAACACCTATGAGG
ACAATGGCTTCCTGATTGTGGACCTGTGCTGCTGGAAGGGCTTT
GAGTTCGTGTACAACTACCTGTACCTGGCCAACCTGAGGGAAA
ACTGGGAAGAAGTGAAGAAGAATGCCAGAAAGGCCCCTCAGCC
TGAAGTTAGAAGATATGTGCTGCCCCTGAACATTGACAAGGCTG
ACACAGGCAAGAACCTGGTCACCCTGCCTAACACCACAGCCAC
AGCCATCCTGTGCTCTGATGAGACTATCTGGCTGGAACCTGAGG
TGCTGTTCTCTGGCCCCAGACAGGCCTTCGAGTTCCCTCAGATC
AACTACCAGAAATACTGCGGCAAGCCCTACACCTATGCCTATGG
CCTGGGCCTGAACCACTTCGTGCCAGACAGACTGTGCAAGCTGA
ATGTCAAGACCAAAGAGACATGGGTCTGGCAAGAGCCTGACAG
CTACCCTTCTGAGCCCATCTTTGTGTCTCACCCTGATGCTCTGGA
AGAGGATGATGGGGTTGTGCTGTCTGTGGTGGTGTCCCCTGGTG
CTGGACAGAAGCCTGCCTATCTGCTGATCCTGAATGCCAAGGAC
CTGTCTGAGGTGGCCAGAGCTGAGGTGGAAATCAACATCCCTGT
GACCTTCCATGGCCTGTTCAAGAAGTCCTGA
SEQ ID NO:6
ATGTCCATCCAGGTGGAGCACCCAGCTGGAGGCTACAAGAAGC
TGTTTGAGACTGTGGAAGAACTGAGCAGCCCCCTGACAGCCCAT
GTGACAGGCAGGATCCCCCTGTGGCTGACAGGCAGCCTGCTGA
GATGTGGCCCAGGCCTGTTTGAGGTGGGCTCTGAGCCTTTCTAC
CACCTGTTTGATGGCCAAGCCCTGCTCCACAAGTTCGATTTCAA
AGAGGGCCATGTGACCTACCACAGACGGTTCATCAGAACAGAT
GCCTATGTGAGAGCCATGACAGAGAAGAGAATTGTGATCACAG
AATTTGGCACCTGTGCCTTCCCTGACCCCTGCAAGAACATCTTC
AGCAGATTCTTCAGCTACTTCAGAGGAGTGGAAGTGACAGACA
ATGCCCTGGTGAATGTGTACCCTGTGGGAGAAGACTACTATGCC
TGTACTGAGACCAACTTCATCACCAAGATCAACCCTGAAACCCT
GGAAACCATCAAGCAGGTGGACCTGTGCAACTATGTGTCAGTC
AATGGAGCCACAGCCCACCCTCACATCGAGAATGATGGCACAG
TTTACAACATTGGCAACTGCTTTGGCAAAAACTTCAGCATCGCC
TACAACATTGTGAAGATCCCCCCTCTGCAGGCTGACAAAGAGG
ACCCCATCAGCAAGTCTGAGATAGTGGTGCAGTTCCCATGCTCT
GACCGGTTCAAGCCCAGCTATGTGCACAGCTTTGGCCTGACCCC
AAACTACATTGTGTTTGTGGAAACCCCTGTCAAAATCAACCTGT
TCAAATTCCTGAGCTCCTGGAGCCTGTGGGGAGCCAACTACATG
GACTGCTTTGAAAGCAATGAGACCATGGGAGTGTGGCTGCACA
TTGCTGACAAGAAACGGAAGAAGTACCTGAACAACAAGTACCG
GACCAGCCCTTTCAACCTGTTCCACCACATCAACACCTATGAGG
ACAATGGCTTCCTGATCGTGGACCTGTGCTGCTGGAAGGGCTTT
GAGTTCGTGTACAACTACCTGTACCTGGCCAACCTGAGAGAAA
ACTGGGAGGAGGTGAAGAAGAATGCCAGAAAGGCCCCCCAGCC
TGAAGTGAGGAGATATGTGCTGCCTCTGAACATAGACAAGGCT
GACACAGGCAAGAACCTGGTGACCCTCCCTAACACCACAGCCA
CAGCCATCCTCTGCTCTGATGAGACCATCTGGCTGGAACCTGAA
GTGCTGTTCTCTGGCCCCAGACAGGCCTTTGAGTTCCCACAAAT
CAACTACCAGAAATACTGTGGCAAGCCCTACACCTACGCCTATG
GCCTGGGCCTGAACCACTTTGTGCCTGACAGACTGTGCAAGCTG
AATGTGAAGACCAAGGAGACCTGGGTCTGGCAGGAGCCTGACT
CCTACCCTTCTGAACCCATCTTTGTCAGCCACCCTGATGCCCTG
GAGGAGGATGATGGAGTGGTGCTGAGTGTGGTGGTGAGCCCTG
GTGCTGGCCAGAAGCCTGCATACCTGCTGATCCTGAATGCCAAG
GACCTGTCTGAGGTTGCCAGAGCTGAGGTGGAAATCAACATCC
CTGTCACCTTCCATGGCTTATTCAAGAAAAGCTGA
SEQ ID NO:7
ATGAGCATCCAGGTTGAGCATCCTGCTGGTGGTTACAAGAAACT
GTTTGAAACTGTGGAGGAACTGTCCTCGCCGCTCACAGCTCATG
TAACAGGCAGGATCCCCCTCTGGCTCACCGGCAGTCTCCTTCGA
TGTGGGCCAGGACTCTTTGAAGTTGGATCTGAGCCATTTTACCA
CCTGTTTGATGGGCAAGCCCTCCTGCACAAGTTTGACTTTAAAG
AAGGACATGTCACATACCACAGAAGGTTCATCCGCACTGATGCT
TACGTACGGGCAATGACTGAGAAAAGGATCGTCATAACAGAAT
TTGGCACCTGTGCTTTCCCAGATCCCTGCAAGAATATATTTTCC
AGGTTTTTTTCTTACTTTCGAGGAGTAGAGGTTACTGACAACGC
CCTTGTTAATGTCTACCCAGTGGGGGAAGATTACTACGCTTGCA
CAGAGACCAACTTTATTACAAAGATTAATCCAGAGACCTTGGA
GACAATTAAGCAGGTTGATCTTTGCAACTATGTCTCTGTCAATG
GGGCCACTGCTCACCCCCACATTGAAAATGATGGAACCGTTTAC
AATATTGGTAATTGCTTTGGAAAAAATTTTTCAATTGCCTACAA
CATTGTAAAGATCCCACCACTGCAAGCAGACAAGGAAGATCCA
ATAAGCAAGTCAGAGATCGTTGTACAATTCCCCTGCAGTGACCG
ATTCAAGCCATCTTACGTTCATAGTTTTGGTCTGACTCCCAACTA
TATCGTTTTTGTGGAGACACCAGTCAAAATTAACCTGTTCAAGT
TCCTTTCTTCATGGAGTCTTTGGGGAGCCAACTACATGGATTGT
TTTGAGTCCAATGAAACCATGGGGGTTTGGCTTCATATTGCTGA
CAAAAAAAGGAAAAAGTACCTCAATAATAAATACAGAACTTCT
CCTTTCAACCTCTTCCATCACATCAACACCTATGAAGACAATGG
GTTTCTGATTGTGGATCTCTGCTGCTGGAAAGGATTTGAGTTTG
TTTATAATTACTTATATTTAGCCAATTTACGTGAGAACTGGGAA
GAGGTGAAAAAAAATGCCAGAAAGGCTCCCCAACCTGAAGTTA
GGAGATATGTACTTCCTTTGAATATTGACAAGGCTGACACAGGC
AAGAATTTAGTCACGCTCCCCAATACAACTGCCACTGCAATTCT
GTGCAGTGACGAGACTATCTGGCTGGAGCCTGAAGTTCTCTTTT
CAGGGCCTCGTCAAGCATTTGAGTTTCCTCAAATCAATTACCAG
AAGTATTGTGGGAAACCTTACACATATGCGTATGGACTTGGCTT
GAATCACTTTGTTCCAGATAGGCTCTGTAAGCTGAATGTCAAAA
CTAAAGAAACTTGGGTTTGGCAAGAGCCTGATTCATACCCATCA
GAACCCATCTTTGTTTCTCACCCAGATGCCTTGGAAGAAGATGA
TGGTGTAGTTCTGAGTGTGGTGGTGAGCCCAGGAGCAGGACAA
AAGCCTGCTTATCTCCTGATTCTGAATGCCAAGGACTTAAGTGA
AGTTGCCCGGGCTGAAGTGGAGATTAACATCCCTGTCACCTTTC
ATGGACTGTTCAAAAAATCTTAATAA
SEQ ID NO:8
ATGTCTATTCAAGTCGAGCACCCAGCGGGGGGATATAAAAAGC
TTTTCGAAACGGTGGAGGAGCTGAGCTCCCCCCTTACGGCGCAT
GTTACGGGGCGCATACCTCTGTGGCTCACGGGATCATTGCTTCG
CTGCGGACCCGGATTGTTCGAGGTTGGCAGTGAACCATTCTACC
ATCTCTTCGATGGTCAGGCATTGCTTCATAAATTTGATTTCAAA
GAAGGACACGTCACATATCATCGCAGGTTCATCCGGACAGATG
CGTACGTTCGCGCCATGACAGAAAAGCGCATTGTAATAACTGA
GTTTGGGACATGTGCATTTCCTGACCCTTGTAAGAATATATTCA
GCCGCTTTTTCAGCTATTTTAGAGGCGTTGAGGTTACTGACAAT
GCGCTCGTGAACGTCTATCCAGTAGGTGAAGATTATTACGCCTG
TACTGAGACTAATTTCATCACTAAAATTAATCCAGAAACTTTGG
AGACCATAAAGCAGGTTGATCTCTGTAACTATGTCTCAGTGAAT
GGCGCTACAGCGCACCCGCACATAGAAAACGATGGAACGGTTT
ACAATATAGGCAACTGTTTTGGTAAGAATTTTAGCATTGCTTAC
AACATAGTCAAGATACCTCCTCTCCAAGCCGATAAAGAGGACC
CGATATCCAAATCAGAGATTGTTGTCCAATTCCCGTGCAGTGAT
AGATTCAAACCGTCTTACGTCCACAGTTTTGGCCTGACACCCAA
TTACATTGTTTTTGTTGAAACACCTGTTAAGATAAATCTCTTTAA
ATTTCTGTCTTCTTGGAGTCTGTGGGGGGCAAATTACATGGATT
GTTTCGAGTCTAACGAGACGATGGGAGTCTGGCTTCATATAGCA
GATAAAAAGCGCAAAAAGTATTTGAATAACAAGTACCGGACGA
GCCCGTTCAATTTGTTCCACCATATCAACACTTACGAGGATAAC
GGGTTTCTGATCGTCGACCTTTGCTGTTGGAAAGGGTTCGAGTT
CGTGTATAACTACCTCTACTTGGCGAACCTTCGGGAAAATTGGG
AGGAAGTTAAGAAGAACGCAAGAAAGGCCCCGCAGCCAGAAG
TCCGAAGGTATGTTCTGCCGTTGAATATCGACAAAGCCGACACT
GGAAAGAACCTCGTTACGCTTCCCAATACCACGGCTACCGCGAT
CTTGTGCAGTGACGAAACAATTTGGCTGGAGCCCGAGGTGTTGT
TTTCTGGCCCAAGGCAAGCCTTTGAATTCCCACAGATAAATTAT
CAAAAATATTGTGGAAAGCCCTACACCTACGCTTATGGACTCGG
TCTCAACCATTTTGTTCCAGATCGACTTTGCAAGCTGAATGTAA
AGACCAAAGAAACCTGGGTTTGGCAAGAACCCGATTCCTACCC
CAGTGAACCGATCTTTGTTTCCCATCCCGACGCCCTCGAAGAAG
ACGACGGAGTTGTCTTGTCCGTTGTGGTGAGCCCCGGTGCAGGA
CAGAAGCCCGCTTATCTTTTGATTCTTAATGCCAAAGATTTGTC
AGAAGTAGCGCGGGCCGAGGTAGAGATCAACATACCTGTTACT
TTCCATGGGTTGTTCAAAAAGAGTTGA
SEQ ID NO:9
ATGAGCATCCAGGTGGAACATCCTGCCGGCGGATACAAGAAAC
TGTTCGAGACAGTGGAAGAACTGAGCAGCCCTCTGACAGCCCA
CGTGACAGGCAGAATCCCTCTGTGGCTGACCGGCAGCCTGCTGA
GATGTGGACCTGGCCTGTTTGAAGTGGGCAGCGAGCCTTTCTAC
CACCTGTTCGATGGACAGGCCCTGCTGCACAAGTTCGACTTCAA
AGAGGGCCACGTCACCTACCACCGGCGGTTCATTAGAACCGAT
GCCTACGTGCGGGCCATGACCGAGAAGAGAATCGTGATCACCG
AGTTCGGCACCTGTGCCTTTCCAGATCCTTGCAAGAACATCTTC
AGCCGGTTCTTCAGCTACTTCAGAGGCGTGGAAGTGACCGACA
ACGCCCTGGTCAATGTGTACCCCGTGGGCGAAGATTACTACGCC
TGCACCGAGACAAACTTCATCACCAAGATCAACCCCGAGACAC
TGGAAACCATCAAGCAGGTTGACCTGTGCAACTACGTGTCCGTG
AACGGCGCCACAGCTCACCCTCACATCGAGAATGATGGCACCG
TGTACAACATCGGCAACTGCTTCGGCAAGAACTTCTCTATCGCC
TACAATATCGTGAAGATCCCACCTCTGCAGGCCGACAAAGAGG
ACCCCATCAGCAAGAGCGAGATCGTGGTGCAGTTCCCCTGCAG
CGACAGATTCAAGCCCAGCTACGTGCACAGCTTCGGCCTGACAC
CTAACTACATCGTGTTCGTGGAAACCCCTGTGAAGATCAATCTG
TTCAAGTTCCTGAGCAGCTGGTCCCTGTGGGGCGCCAACTACAT
GGATTGCTTCGAGAGCAACGAGACAATGGGCGTGTGGCTGCAC
ATTGCCGACAAGAAGCGGAAGAAGTACCTGAACAACAAGTACC
GGACAAGCCCCTTCAACCTGTTCCACCACATCAACACCTACGAG
GACAACGGCTTCCTGATCGTGGACCTGTGTTGCTGGAAGGGCTT
CGAGTTCGTGTACAATTACCTGTACCTGGCCAACCTGCGCGAGA
ACTGGGAAGAAGTGAAGAAGAACGCCCGGAAGGCCCCTCAGCC
TGAAGTGCGAAGATATGTGCTGCCCCTGAACATCGACAAGGCC
GACACCGGCAAGAATCTGGTCACCCTGCCTAATACCACCGCCAC
CGCCATCCTGTGTAGCGACGAAACCATCTGGCTGGAACCCGAG
GTGCTGTTCTCTGGACCTAGACAGGCCTTCGAGTTTCCCCAGAT
CAACTACCAGAAGTACTGCGGCAAGCCCTACACCTACGCCTATG
GCCTGGGCCTGAATCACTTCGTGCCCGACAGACTGTGCAAGCTG
AACGTCAAGACCAAAGAGACATGGGTCTGGCAAGAGCCCGACA
GCTACCCTAGCGAGCCCATCTTTGTGTCTCACCCCGACGCTCTG
GAAGAGGACGATGGCGTTGTGCTGAGCGTGGTGGTTTCTCCTGG
CGCCGGACAGAAACCTGCCTACCTGCTGATCCTGAACGCCAAG
GACCTGAGCGAAGTGGCCAGAGCCGAGGTGGAAATCAACATCC
CCGTGACCTTCCACGGCCTGTTCAAGAAGTCCTAATAA
SEQ ID NO:10
ATGAGCATCCAGGTGGAGCACCCCGCCGGCGGCTACAAGAAGC
TGTTCGAGACCGTGGAGGAGCTGAGCAGCCCCCTGACCGCCCA
CGTGACCGGCCGCATCCCCCTGTGGCTGACCGGCAGCCTGCTGC
GCTGCGGCCCCGGCCTGTTCGAGGTGGGCAGCGAGCCCTTCTAC
CACCTGTTCGACGGCCAGGCCCTGCTGCACAAGTTCGACTTCAA
GGAGGGCCACGTGACCTACCACCGCCGCTTCATCCGCACCGAC
GCCTACGTGCGCGCCATGACCGAGAAGCGCATCGTGATCACCG
AGTTCGGCACCTGCGCCTTCCCCGACCCCTGCAAGAACATCTTC
AGCCGCTTCTTCAGCTACTTCCGCGGCGTGGAGGTGACCGACAA
CGCCCTGGTGAACGTGTACCCCGTGGGCGAGGACTACTACGCCT
GCACCGAGACCAACTTCATCACCAAGATCAACCCCGAGACCCT
GGAGACCATCAAGCAGGTGGACCTGTGCAACTACGTGAGCGTG
AACGGCGCCACCGCCCACCCCCACATCGAGAACGACGGCACCG
TGTACAACATCGGCAACTGCTTCGGCAAGAACTTCAGCATCGCC
TACAACATCGTGAAGATCCCCCCCCTGCAGGCCGACAAGGAGG
ACCCCATCAGCAAGAGCGAGATCGTGGTGCAGTTCCCCTGCAG
CGACCGCTTCAAGCCCAGCTACGTGCACAGCTTCGGCCTGACCC
CCAACTACATCGTGTTCGTGGAGACCCCCGTGAAGATCAACCTG
TTCAAGTTCCTGAGCAGCTGGAGCCTGTGGGGCGCCAACTACAT
GGACTGCTTCGAGAGCAACGAGACCATGGGCGTGTGGCTGCAC
ATCGCCGACAAGAAGCGCAAGAAGTACCTGAACAACAAGTACC
GCACCAGCCCCTTCAACCTGTTCCACCACATCAACACCTACGAG
GACAACGGCTTCCTGATCGTGGACCTGTGCTGCTGGAAGGGCTT
CGAGTTCGTGTACAACTACCTGTACCTGGCCAACCTGCGCGAGA
ACTGGGAGGAGGTGAAGAAGAACGCCCGCAAGGCCCCCCAGCC
CGAGGTGCGCCGCTACGTGCTGCCCCTGAACATCGACAAGGCC
GACACCGGCAAGAACCTGGTGACCCTGCCCAACACCACCGCCA
CCGCCATCCTGTGCAGCGACGAGACCATCTGGCTGGAGCCCGA
GGTGCTGTTCAGCGGCCCCCGCCAGGCCTTCGAGTTCCCCCAGA
TCAACTACCAGAAGTACTGCGGCAAGCCCTACACCTACGCCTAC
GGCCTGGGCCTGAACCACTTCGTGCCCGACCGCCTGTGCAAGCT
GAACGTGAAGACCAAGGAGACCTGGGTGTGGCAGGAGCCCGAC
AGCTACCCCAGCGAGCCCATCTTCGTGAGCCACCCCGACGCCCT
GGAGGAGGACGACGGCGTGGTGCTGAGCGTGGTGGTGAGCCCC
GGCGCCGGCCAGAAGCCCGCCTACCTGCTGATCCTGAACGCCA
AGGACCTGAGCGAGGTGGCCCGCGCCGAGGTGGAGATCAACAT
CCCCGTGACCTTCCACGGCCTGTTCAAGAAGAGCTAA
SEQ ID NO:11
MSIQVEHPAGGYKKLFETVEELSSPLTAHVTGRIPLWLTGSLLRCG
PGLFEVGSEPFYHLFDGQALLHKFDFKEGHVTYHRRFIRTDAYVR
AMTEKRIVITEFGTCAFPDPCKNIFSRFFSYFRGVEVTDNALVNVYP
VGEDYYACTETNFITKINPETLETIKQVDLCNYVSVNGATAHPHIE
NDGTVYNIGNCFGKNFSIAYNIVKIPPLQADKEDPISKSEIVVQFPCS
DRFKPSYVHSFGLTPNYIVFVETPVKINLFKFLSSWSLWGANYMDC
FESNETMGVWLHIADKKRKKYLNNKYRTSPFNLFHHINTYEDNGF
LIVDLCCWKGFEFVYNYLYLANLRENWEEVKKNARKAPQPEVRR
YVLPLNIDKADTGKNLVTLPNTTATAILCSDETIWLEPEVLFSGPRQ
AFEFPQINYQKYCGKPYTYAYGLGLNHFVPDRLCKLNVKTKETW
VWQEPDSYPSEPIFVSHPDALEEDDGVVLSVVVSPGAGQKPAYLLI
LNAKDLSEVARAEVEINIPVTFHGLFKKS
SEQ ID NO:12
CGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCA
ACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATA
GTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTA
TTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATA
TGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCC
GCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTAC
TTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGTCGA
GGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTC
CCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCA
GCGATTGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGG
GGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGG
TGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTT
TTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAG
CGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGACGCTGCCTTCGCCCCGT
GCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGAC
TGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCT
CCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCT
TTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGGGCCC
TTTGTGCGGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGT
GTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCCCGCGCTGCCCGGCGGCT
GTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCAG
TGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGC
GGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGT
GCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGGCGGTCGGGCT
GTAACCCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGC
CCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTACGGGGCGTGGCGCGGGGC
TCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGG
CGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGG
GCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCG
AGCCGCAGCCAATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGC
AGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGG
AGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGT
GCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATCGGGCGGGGAGGGCCTTCGTG
CGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGC
TGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGG
CGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCT
GCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAG
SEQ ID NO:13
GGGTGGCATCCCTGTGACCCCTCCCCAGTGCCTCTCCTGGCCCT
GGAAGTTGCCACTCCAGTGCCCACCAGCCTTGTCCTAATAAAAT
TAAGTTGCAATCCATTTTGTCTGACTAGGTGTCCTTCTATAATAT
TATGGGGTGGAGGGGGGTGGTATGGAGCAAGGGGCAAGTTGGG
AAGACAACCTGTAGGGCCTGCGGGGTCTATTGGGAACCAAGCT
GGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGCAATCTCCGCCTCC
TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTTGTTGGG
ATTCCAGGCATGCATGACCAGGCTCAGCTAATTTTTGTTTTTTTG
GTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGGTCTCCAACT
CCTAATCTCAGGTGATCTACCCACCTTGGCCTCCCAAATTGCTG
GGATTACAGGCGTGAACCACTGCTCCCTTCCCTGTCCTT
SEQ ID NO:14
CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCG
TGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCT
AATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCAT
TCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGG
ATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTC
TATGG
SEQ ID NO:15
AACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAG
CATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTA
GTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTATCATGTCTGGA
TC
SEQ ID NO:16
AATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTAT
TCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTT
AATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTT
CTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTT
GTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTG
CTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAG
CTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCG
GAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCG
GCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGA
CGTCCTTTCCATGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGC
GCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCG
GACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCC
GCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGG
CCGCCTCCCCGC
SEQ ID NO:17
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRG
LVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDN
PYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVE
EPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGD
ADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVG
NSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGAS
NDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRL
NFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSA
HQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQM
LRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRT
NTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSA
DNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQS
GVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNL
QRGNRQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDG
HFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYS
TGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGV
YSEPRPIGTRYLTRNL
SEQ ID NO:18
TAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSV
PDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSG
NWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDN
HYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKL
FNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGC
LPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTG
NNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPS
GTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNN
SEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIF
GKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNR
QAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSP
LMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVS
VEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPR
PIGTRYLTRNL
SEQ ID NO:19
MATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTR
TWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCH
FSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANN
LTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTL
NNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAH
SQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRD
QSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSL
VNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDE
EEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNRQAATADVNTQGVLPGMVW
QDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTP
VPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQ
YTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL。
序列表
<110> 英斯培瑞有限公司
<120> 用于治疗眼部疾病的组合物和方法
<130> 57837-706.601
<140>
<141>
<150> CN 202110378979.6
<151> 2021-04-08
<150> CN 202010704946.1
<151> 2020-07-21
<160> 19
<170> PatentIn 版本 3.5
<210> 1
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 1
atgtctatcc aggttgagca tcctgctggt ggttacaaga aactgtttga aactgtggag 60
gaactgtcct cgccgctcac agctcatgta acaggcagga tccccctctg gctcaccggc 120
agtctccttc gatgtgggcc aggactcttt gaagttggat ctgagccatt ttaccacctg 180
tttgatgggc aagccctcct gcacaagttt gactttaaag aaggacatgt cacataccac 240
agaaggttca tccgcactga tgcttacgta cgggcaatga ctgagaaaag gatcgtcata 300
acagaatttg gcacctgtgc tttcccagat ccctgcaaga atatattttc caggtttttt 360
tcttactttc gaggagtaga ggttactgac aatgcccttg ttaatgtcta cccagtgggg 420
gaagattact acgcttgcac agagaccaac tttattacaa agattaatcc agagaccttg 480
gagacaatta agcaggttga tctttgcaac tatgtctctg tcaatggggc cactgctcac 540
ccccacattg aaaatgatgg aaccgtttac aatattggta attgctttgg aaaaaatttt 600
tcaattgcct acaacattgt aaagatccca ccactgcaag cagacaagga agatccaata 660
agcaagtcag agatcgttgt acaattcccc tgcagtgacc gattcaagcc atcttacgtt 720
catagttttg gtctgactcc caactatatc gtttttgtgg agacaccagt caaaattaac 780
ctgttcaagt tcctttcttc atggagtctt tggggagcca actacatgga ttgttttgag 840
tccaatgaaa ccatgggggt ttggcttcat attgctgaca aaaaaaggaa aaagtacctc 900
aataataaat acagaacttc tcctttcaac ctcttccatc acatcaacac ctatgaagac 960
aatgggtttc tgattgtgga tctctgctgc tggaaaggat ttgagtttgt ttataattac 1020
ttatatttag ccaatttacg tgagaactgg gaagaggtga aaaaaaatgc cagaaaggct 1080
ccccaacctg aagttaggag atatgtactt cctttgaata ttgacaaggc tgacacaggc 1140
aagaatttag tcacgctccc caatacaact gccactgcaa ttctgtgcag tgacgagact 1200
atctggctgg agcctgaagt tctcttttca gggcctcgtc aagcatttga gtttcctcaa 1260
atcaattacc agaagtattg tgggaaacct tacacatatg cgtatggact tggcttgaat 1320
cactttgttc cagataggct ctgtaagctg aatgtcaaaa ctaaagaaac ttgggtttgg 1380
caagagcctg attcataccc atcagaaccc atctttgttt ctcacccaga tgccttggaa 1440
gaagatgatg gtgtagttct gagtgtggtg gtgagcccag gagcaggaca aaagcctgct 1500
tatctcctga ttctgaatgc caaggactta agtgaagttg cccgggctga agtggagatt 1560
aacatccctg tcacctttca tggactgttc aaaaaatctt ga 1602
<210> 2
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 2
atgtctatcc aggttgagca tcctgctggt ggttacaaga aactgtttga aactgtggag 60
gaactgtcct cgccgctcac agctcatgta acaggcagga tccccctctg gctcaccggc 120
agtctccttc gatgtgggcc aggactcttt gaagttggat ctgagccatt ttaccacctg 180
tttgatgggc aagccctcct gcacaagttt gactttaaag aaggacacgt cacataccac 240
agaaggttca tccgcactga tgcttacgta cgggcaatga ctgagaaaag gatcgtcata 300
acagaatttg gcacctgtgc tttcccagat ccctgcaaga atatattttc caggtttttt 360
tcttactttc gaggagtaga ggttactgac aacgcccttg ttaatgtcta cccagtgggg 420
gaagattact acgcttgcac agagaccaac tttattacaa agattaatcc agagaccttg 480
gagacaatta agcaggttga tctttgcaac tatgtctctg tcaatggggc cactgctcac 540
ccccacattg aaaatgatgg aaccgtttac aatattggta attgctttgg aaaaaatttt 600
tcaattgcct acaacattgt aaagatccca ccactgcaag cagacaagga agatccaata 660
agcaagtcag agatcgttgt acaattcccc tgcagtgacc gattcaagcc atcttacgtt 720
catagttttg gtctgactcc caactatatc gtttttgtgg agacaccagt caaaattaac 780
ctgttcaagt tcctttcttc atggagtctt tggggagcca actacatgga ttgttttgag 840
tccaatgaaa ccatgggggt ttggcttcat attgctgaca aaaaaaggaa aaagtacctc 900
aataataaat acagaacttc tcctttcaac ctcttccatc acatcaacac ctatgaagac 960
aatgggtttc tgattgtgga tctctgctgc tggaaaggat ttgagtttgt ttataattac 1020
ttatatttag ccaatttacg tgagaactgg gaagaggtga aaaaaaatgc cagaaaggct 1080
ccccaacctg aagttaggag atatgtactt cctttgaata ttgacaaggc tgacacaggc 1140
aagaatttag tcacgctccc caatacaact gccactgcaa ttctgtgcag tgacgagact 1200
atctggctgg agcctgaagt tctcttttca gggcctcgtc aagcatttga gtttcctcaa 1260
atcaattacc agaagtattg tgggaaacct tacacatatg cgtatggact tggcttgaat 1320
cactttgttc cagataggct ctgtaagctg aatgtcaaaa ctaaagaaac ttgggtttgg 1380
caagagcctg attcataccc atcagaaccc atctttgttt ctcacccaga tgccttggaa 1440
gaagatgatg gtgtagttct gagtgtggtg gtgagcccag gagcaggaca aaagcctgct 1500
tatctcctga ttctgaatgc caaggactta agtgaagttg cccgggctga agtggagatt 1560
aacatccctg tcacctttca cggactgttc aaaaaatctt ga 1602
<210> 3
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 3
atgtccatcc aggtggagca cccagctgga ggctacaaga agctgtttga aactgtggaa 60
gaactgagca gccccctgac agcccatgtg acaggcagaa tccctctgtg gctgacaggc 120
agcctgctga gatgtggccc aggcctgttt gaggtgggct ctgagccttt ctaccacctg 180
tttgatggcc aagccctgct ccacaagttt gatttcaagg agggccatgt gacctaccac 240
agaagattca tcagaacaga tgcctatgtg agggccatga cagagaagag gatagttatc 300
acagagtttg gcacctgtgc cttccctgac ccctgcaaga acatcttcag cagattcttc 360
agctacttca gaggagtgga agtgacagac aatgccctgg tcaatgtgta ccctgtggga 420
gaggactact atgcctgtac tgagaccaac ttcatcacca agatcaaccc tgaaaccctg 480
gaaaccatca agcaggtgga cctgtgcaac tatgtgtcag tcaatggagc cacagcccac 540
cctcacattg agaatgatgg cacagtttac aacataggca actgctttgg caaaaacttc 600
agcattgcct acaacattgt gaagatcccc cctctgcagg ctgacaagga ggaccccatc 660
agcaagtctg agatagtggt gcagttccca tgctctgaca gattcaagcc cagctatgtg 720
cacagctttg gcctgacccc aaactacatt gtgtttgtgg aaacccctgt gaagatcaac 780
ctgttcaagt tcctgagctc ctggagcctg tggggagcca actacatgga ctgctttgaa 840
agcaatgaga ccatgggagt gtggctgcac attgctgaca agaaaagaaa gaagtacctg 900
aacaacaaat acagaaccag ccctttcaac ctgttccacc acatcaacac ctatgaggac 960
aatggcttcc tgattgtgga cctgtgctgc tggaagggct ttgagtttgt gtacaactac 1020
ctgtacctgg ccaacctgag agaaaactgg gaggaagtga aaaaaaatgc cagaaaggcc 1080
ccccagcctg aggtgaggag atatgtgctg cctctgaaca tagacaaggc tgacacaggc 1140
aagaacctgg tgaccctccc caacaccaca gccacagcca tcctgtgctc tgatgagacc 1200
atctggctgg agcctgaagt gctgttctct ggccccagac aggcctttga gttccctcaa 1260
atcaactacc agaaatactg tggcaaaccc tacacctatg cctatggcct gggcctgaac 1320
cactttgtcc ctgacagact gtgcaagctg aatgtgaaaa ccaaggagac ctgggtctgg 1380
caggagcctg actcctaccc ttctgaaccc atctttgtga gccaccctga tgccctggag 1440
gaggatgatg gagtggtgct gagtgtggtg gtcagccctg gtgctggcca gaagcctgca 1500
tacctgctaa tcctgaatgc caaggacctg tctgaagttg ccagggctga ggtggaaatc 1560
aacatccctg tgaccttcca tggccttttc aagaagagct ga 1602
<210> 4
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 4
atgagcatcc aggtggaaca tcctgctggt ggctacaaga aactgtttga gacagtggaa 60
gaactgagca gccctctgac agcccatgtg acaggcagaa tccctctgtg gctgacaggc 120
tccctgctga gatgtggccc tggcctgttt gaagtgggct ctgagccttt ctaccacctg 180
tttgatggac aggccctgct gcacaagttt gacttcaaag agggccatgt gacctaccac 240
agaagattca tcaggacaga tgcctatgtc agagccatga cagagaagag gattgtgatc 300
actgagtttg gcacctgtgc ctttccagat ccttgcaaga acatcttcag cagattcttc 360
agctacttca gaggggttga agtgacagac aatgccctgg tcaatgtgta ccctgtggga 420
gaagattact atgcctgcac agagacaaac ttcatcacca agatcaaccc tgagacactg 480
gaaaccatca agcaggttga cctgtgcaac tatgtgtctg tgaatggggc cacagctcac 540
cctcacattg agaatgatgg cacagtgtac aacattggca actgctttgg caagaacttc 600
agcattgcct acaacatagt gaagatccca cctctgcagg ctgacaaaga ggaccccatc 660
agcaagtctg agattgtggt gcagttcccc tgctctgaca gattcaagcc cagctatgtg 720
cacagctttg gcctgacacc taactacatt gtgtttgtgg aaacccctgt gaagatcaat 780
ctgttcaagt tcctgagcag ctggtccctg tggggagcca actacatgga ctgctttgag 840
agcaatgaga caatgggagt gtggctgcac attgcagaca agaagagaaa gaagtacctg 900
aacaacaagt acaggacaag ccccttcaac ctgttccacc acatcaacac ctatgaggac 960
aatggcttcc tgattgtgga cctgtgctgc tggaagggct ttgagtttgt gtacaactac 1020
ctgtacctgg ccaacctgag ggaaaactgg gaagaagtga agaagaatgc cagaaaggcc 1080
cctcagcctg aagttagaag atatgtgctg cccctgaaca ttgacaaggc tgacacaggc 1140
aagaacctgg tcaccctgcc taacaccaca gccacagcca tcctgtgctc tgatgagact 1200
atctggctgg aacctgaggt gctgttctct ggccccagac aggcctttga gttccctcag 1260
atcaactacc agaaatactg tggcaagccc tacacctatg cctatggcct gggcctgaac 1320
cactttgtgc cagacagact gtgcaagctg aatgtcaaga ccaaagagac atgggtctgg 1380
caagagcctg acagctaccc ttctgagccc atctttgtgt ctcaccctga tgctctggaa 1440
gaggatgatg gggttgtgct gtctgtggtg gtgtcccctg gtgctggaca gaagcctgcc 1500
tatctgctga tcctgaatgc caaggacctg tctgaggtgg ccagagctga ggtggaaatc 1560
aacatccctg tgaccttcca tggcctgttc aagaagtcct ga 1602
<210> 5
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 5
atgagcatcc aggtggaaca tcctgctggt ggctacaaga aactgtttga gacagtggaa 60
gaactgagca gccctctgac agcccatgtg acaggcagaa tccctctgtg gctgacaggc 120
tccctgctga gatgtggccc tggcctgttt gaagtgggct ctgagccttt ctaccacctg 180
tttgatggac aggccctgct gcacaagttt gacttcaaag agggccatgt gacctaccac 240
agaagattca tcaggacaga tgcctatgtc agagccatga cagagaagag gattgtgatc 300
actgagtttg gcacctgtgc ctttccagat ccttgcaaga acatcttcag cagattcttc 360
agctacttca gaggggttga agtgacagac aatgccctgg tcaatgtgta ccctgtggga 420
gaagattact atgcctgcac agagacaaac ttcatcacca agatcaaccc tgagacactg 480
gaaaccatca agcaggttga cctgtgcaac tatgtgtctg tgaatggggc cacagctcac 540
cctcacattg agaatgatgg cacagtgtac aacattggca actgctttgg caagaacttc 600
agcattgcct acaacatagt gaagatccca cctctgcagg ctgacaaaga ggaccccatc 660
agcaagtctg agattgtggt gcagttcccc tgctctgaca gattcaagcc cagctatgtg 720
cacagctttg gcctgacacc taactacatt gtgtttgtgg aaacccctgt gaagatcaat 780
ctgttcaagt tcctgagcag ctggtccctg tggggagcca actacatgga ctgctttgag 840
agcaatgaga caatgggagt gtggctgcac attgcagaca agaagagaaa gaagtacctg 900
aacaacaagt accggacaag ccccttcaac ctgttccacc acatcaacac ctatgaggac 960
aatggcttcc tgattgtgga cctgtgctgc tggaagggct ttgagttcgt gtacaactac 1020
ctgtacctgg ccaacctgag ggaaaactgg gaagaagtga agaagaatgc cagaaaggcc 1080
cctcagcctg aagttagaag atatgtgctg cccctgaaca ttgacaaggc tgacacaggc 1140
aagaacctgg tcaccctgcc taacaccaca gccacagcca tcctgtgctc tgatgagact 1200
atctggctgg aacctgaggt gctgttctct ggccccagac aggccttcga gttccctcag 1260
atcaactacc agaaatactg cggcaagccc tacacctatg cctatggcct gggcctgaac 1320
cacttcgtgc cagacagact gtgcaagctg aatgtcaaga ccaaagagac atgggtctgg 1380
caagagcctg acagctaccc ttctgagccc atctttgtgt ctcaccctga tgctctggaa 1440
gaggatgatg gggttgtgct gtctgtggtg gtgtcccctg gtgctggaca gaagcctgcc 1500
tatctgctga tcctgaatgc caaggacctg tctgaggtgg ccagagctga ggtggaaatc 1560
aacatccctg tgaccttcca tggcctgttc aagaagtcct ga 1602
<210> 6
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 6
atgtccatcc aggtggagca cccagctgga ggctacaaga agctgtttga gactgtggaa 60
gaactgagca gccccctgac agcccatgtg acaggcagga tccccctgtg gctgacaggc 120
agcctgctga gatgtggccc aggcctgttt gaggtgggct ctgagccttt ctaccacctg 180
tttgatggcc aagccctgct ccacaagttc gatttcaaag agggccatgt gacctaccac 240
agacggttca tcagaacaga tgcctatgtg agagccatga cagagaagag aattgtgatc 300
acagaatttg gcacctgtgc cttccctgac ccctgcaaga acatcttcag cagattcttc 360
agctacttca gaggagtgga agtgacagac aatgccctgg tgaatgtgta ccctgtggga 420
gaagactact atgcctgtac tgagaccaac ttcatcacca agatcaaccc tgaaaccctg 480
gaaaccatca agcaggtgga cctgtgcaac tatgtgtcag tcaatggagc cacagcccac 540
cctcacatcg agaatgatgg cacagtttac aacattggca actgctttgg caaaaacttc 600
agcatcgcct acaacattgt gaagatcccc cctctgcagg ctgacaaaga ggaccccatc 660
agcaagtctg agatagtggt gcagttccca tgctctgacc ggttcaagcc cagctatgtg 720
cacagctttg gcctgacccc aaactacatt gtgtttgtgg aaacccctgt caaaatcaac 780
ctgttcaaat tcctgagctc ctggagcctg tggggagcca actacatgga ctgctttgaa 840
agcaatgaga ccatgggagt gtggctgcac attgctgaca agaaacggaa gaagtacctg 900
aacaacaagt accggaccag ccctttcaac ctgttccacc acatcaacac ctatgaggac 960
aatggcttcc tgatcgtgga cctgtgctgc tggaagggct ttgagttcgt gtacaactac 1020
ctgtacctgg ccaacctgag agaaaactgg gaggaggtga agaagaatgc cagaaaggcc 1080
ccccagcctg aagtgaggag atatgtgctg cctctgaaca tagacaaggc tgacacaggc 1140
aagaacctgg tgaccctccc taacaccaca gccacagcca tcctctgctc tgatgagacc 1200
atctggctgg aacctgaagt gctgttctct ggccccagac aggcctttga gttcccacaa 1260
atcaactacc agaaatactg tggcaagccc tacacctacg cctatggcct gggcctgaac 1320
cactttgtgc ctgacagact gtgcaagctg aatgtgaaga ccaaggagac ctgggtctgg 1380
caggagcctg actcctaccc ttctgaaccc atctttgtca gccaccctga tgccctggag 1440
gaggatgatg gagtggtgct gagtgtggtg gtgagccctg gtgctggcca gaagcctgca 1500
tacctgctga tcctgaatgc caaggacctg tctgaggttg ccagagctga ggtggaaatc 1560
aacatccctg tcaccttcca tggcttattc aagaaaagct ga 1602
<210> 7
<211> 1605
<212> DNA
<213> 智人
<400> 7
atgagcatcc aggttgagca tcctgctggt ggttacaaga aactgtttga aactgtggag 60
gaactgtcct cgccgctcac agctcatgta acaggcagga tccccctctg gctcaccggc 120
agtctccttc gatgtgggcc aggactcttt gaagttggat ctgagccatt ttaccacctg 180
tttgatgggc aagccctcct gcacaagttt gactttaaag aaggacatgt cacataccac 240
agaaggttca tccgcactga tgcttacgta cgggcaatga ctgagaaaag gatcgtcata 300
acagaatttg gcacctgtgc tttcccagat ccctgcaaga atatattttc caggtttttt 360
tcttactttc gaggagtaga ggttactgac aacgcccttg ttaatgtcta cccagtgggg 420
gaagattact acgcttgcac agagaccaac tttattacaa agattaatcc agagaccttg 480
gagacaatta agcaggttga tctttgcaac tatgtctctg tcaatggggc cactgctcac 540
ccccacattg aaaatgatgg aaccgtttac aatattggta attgctttgg aaaaaatttt 600
tcaattgcct acaacattgt aaagatccca ccactgcaag cagacaagga agatccaata 660
agcaagtcag agatcgttgt acaattcccc tgcagtgacc gattcaagcc atcttacgtt 720
catagttttg gtctgactcc caactatatc gtttttgtgg agacaccagt caaaattaac 780
ctgttcaagt tcctttcttc atggagtctt tggggagcca actacatgga ttgttttgag 840
tccaatgaaa ccatgggggt ttggcttcat attgctgaca aaaaaaggaa aaagtacctc 900
aataataaat acagaacttc tcctttcaac ctcttccatc acatcaacac ctatgaagac 960
aatgggtttc tgattgtgga tctctgctgc tggaaaggat ttgagtttgt ttataattac 1020
ttatatttag ccaatttacg tgagaactgg gaagaggtga aaaaaaatgc cagaaaggct 1080
ccccaacctg aagttaggag atatgtactt cctttgaata ttgacaaggc tgacacaggc 1140
aagaatttag tcacgctccc caatacaact gccactgcaa ttctgtgcag tgacgagact 1200
atctggctgg agcctgaagt tctcttttca gggcctcgtc aagcatttga gtttcctcaa 1260
atcaattacc agaagtattg tgggaaacct tacacatatg cgtatggact tggcttgaat 1320
cactttgttc cagataggct ctgtaagctg aatgtcaaaa ctaaagaaac ttgggtttgg 1380
caagagcctg attcataccc atcagaaccc atctttgttt ctcacccaga tgccttggaa 1440
gaagatgatg gtgtagttct gagtgtggtg gtgagcccag gagcaggaca aaagcctgct 1500
tatctcctga ttctgaatgc caaggactta agtgaagttg cccgggctga agtggagatt 1560
aacatccctg tcacctttca tggactgttc aaaaaatctt aataa 1605
<210> 8
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 8
atgtctattc aagtcgagca cccagcgggg ggatataaaa agcttttcga aacggtggag 60
gagctgagct ccccccttac ggcgcatgtt acggggcgca tacctctgtg gctcacggga 120
tcattgcttc gctgcggacc cggattgttc gaggttggca gtgaaccatt ctaccatctc 180
ttcgatggtc aggcattgct tcataaattt gatttcaaag aaggacacgt cacatatcat 240
cgcaggttca tccggacaga tgcgtacgtt cgcgccatga cagaaaagcg cattgtaata 300
actgagtttg ggacatgtgc atttcctgac ccttgtaaga atatattcag ccgctttttc 360
agctatttta gaggcgttga ggttactgac aatgcgctcg tgaacgtcta tccagtaggt 420
gaagattatt acgcctgtac tgagactaat ttcatcacta aaattaatcc agaaactttg 480
gagaccataa agcaggttga tctctgtaac tatgtctcag tgaatggcgc tacagcgcac 540
ccgcacatag aaaacgatgg aacggtttac aatataggca actgttttgg taagaatttt 600
agcattgctt acaacatagt caagatacct cctctccaag ccgataaaga ggacccgata 660
tccaaatcag agattgttgt ccaattcccg tgcagtgata gattcaaacc gtcttacgtc 720
cacagttttg gcctgacacc caattacatt gtttttgttg aaacacctgt taagataaat 780
ctctttaaat ttctgtcttc ttggagtctg tggggggcaa attacatgga ttgtttcgag 840
tctaacgaga cgatgggagt ctggcttcat atagcagata aaaagcgcaa aaagtatttg 900
aataacaagt accggacgag cccgttcaat ttgttccacc atatcaacac ttacgaggat 960
aacgggtttc tgatcgtcga cctttgctgt tggaaagggt tcgagttcgt gtataactac 1020
ctctacttgg cgaaccttcg ggaaaattgg gaggaagtta agaagaacgc aagaaaggcc 1080
ccgcagccag aagtccgaag gtatgttctg ccgttgaata tcgacaaagc cgacactgga 1140
aagaacctcg ttacgcttcc caataccacg gctaccgcga tcttgtgcag tgacgaaaca 1200
atttggctgg agcccgaggt gttgttttct ggcccaaggc aagcctttga attcccacag 1260
ataaattatc aaaaatattg tggaaagccc tacacctacg cttatggact cggtctcaac 1320
cattttgttc cagatcgact ttgcaagctg aatgtaaaga ccaaagaaac ctgggtttgg 1380
caagaacccg attcctaccc cagtgaaccg atctttgttt cccatcccga cgccctcgaa 1440
gaagacgacg gagttgtctt gtccgttgtg gtgagccccg gtgcaggaca gaagcccgct 1500
tatcttttga ttcttaatgc caaagatttg tcagaagtag cgcgggccga ggtagagatc 1560
aacatacctg ttactttcca tgggttgttc aaaaagagtt ga 1602
<210> 9
<211> 1605
<212> DNA
<213> 智人
<400> 9
atgagcatcc aggtggaaca tcctgccggc ggatacaaga aactgttcga gacagtggaa 60
gaactgagca gccctctgac agcccacgtg acaggcagaa tccctctgtg gctgaccggc 120
agcctgctga gatgtggacc tggcctgttt gaagtgggca gcgagccttt ctaccacctg 180
ttcgatggac aggccctgct gcacaagttc gacttcaaag agggccacgt cacctaccac 240
cggcggttca ttagaaccga tgcctacgtg cgggccatga ccgagaagag aatcgtgatc 300
accgagttcg gcacctgtgc ctttccagat ccttgcaaga acatcttcag ccggttcttc 360
agctacttca gaggcgtgga agtgaccgac aacgccctgg tcaatgtgta ccccgtgggc 420
gaagattact acgcctgcac cgagacaaac ttcatcacca agatcaaccc cgagacactg 480
gaaaccatca agcaggttga cctgtgcaac tacgtgtccg tgaacggcgc cacagctcac 540
cctcacatcg agaatgatgg caccgtgtac aacatcggca actgcttcgg caagaacttc 600
tctatcgcct acaatatcgt gaagatccca cctctgcagg ccgacaaaga ggaccccatc 660
agcaagagcg agatcgtggt gcagttcccc tgcagcgaca gattcaagcc cagctacgtg 720
cacagcttcg gcctgacacc taactacatc gtgttcgtgg aaacccctgt gaagatcaat 780
ctgttcaagt tcctgagcag ctggtccctg tggggcgcca actacatgga ttgcttcgag 840
agcaacgaga caatgggcgt gtggctgcac attgccgaca agaagcggaa gaagtacctg 900
aacaacaagt accggacaag ccccttcaac ctgttccacc acatcaacac ctacgaggac 960
aacggcttcc tgatcgtgga cctgtgttgc tggaagggct tcgagttcgt gtacaattac 1020
ctgtacctgg ccaacctgcg cgagaactgg gaagaagtga agaagaacgc ccggaaggcc 1080
cctcagcctg aagtgcgaag atatgtgctg cccctgaaca tcgacaaggc cgacaccggc 1140
aagaatctgg tcaccctgcc taataccacc gccaccgcca tcctgtgtag cgacgaaacc 1200
atctggctgg aacccgaggt gctgttctct ggacctagac aggccttcga gtttccccag 1260
atcaactacc agaagtactg cggcaagccc tacacctacg cctatggcct gggcctgaat 1320
cacttcgtgc ccgacagact gtgcaagctg aacgtcaaga ccaaagagac atgggtctgg 1380
caagagcccg acagctaccc tagcgagccc atctttgtgt ctcaccccga cgctctggaa 1440
gaggacgatg gcgttgtgct gagcgtggtg gtttctcctg gcgccggaca gaaacctgcc 1500
tacctgctga tcctgaacgc caaggacctg agcgaagtgg ccagagccga ggtggaaatc 1560
aacatccccg tgaccttcca cggcctgttc aagaagtcct aataa 1605
<210> 10
<211> 1602
<212> DNA
<213> 智人
<400> 10
atgagcatcc aggtggagca ccccgccggc ggctacaaga agctgttcga gaccgtggag 60
gagctgagca gccccctgac cgcccacgtg accggccgca tccccctgtg gctgaccggc 120
agcctgctgc gctgcggccc cggcctgttc gaggtgggca gcgagccctt ctaccacctg 180
ttcgacggcc aggccctgct gcacaagttc gacttcaagg agggccacgt gacctaccac 240
cgccgcttca tccgcaccga cgcctacgtg cgcgccatga ccgagaagcg catcgtgatc 300
accgagttcg gcacctgcgc cttccccgac ccctgcaaga acatcttcag ccgcttcttc 360
agctacttcc gcggcgtgga ggtgaccgac aacgccctgg tgaacgtgta ccccgtgggc 420
gaggactact acgcctgcac cgagaccaac ttcatcacca agatcaaccc cgagaccctg 480
gagaccatca agcaggtgga cctgtgcaac tacgtgagcg tgaacggcgc caccgcccac 540
ccccacatcg agaacgacgg caccgtgtac aacatcggca actgcttcgg caagaacttc 600
agcatcgcct acaacatcgt gaagatcccc cccctgcagg ccgacaagga ggaccccatc 660
agcaagagcg agatcgtggt gcagttcccc tgcagcgacc gcttcaagcc cagctacgtg 720
cacagcttcg gcctgacccc caactacatc gtgttcgtgg agacccccgt gaagatcaac 780
ctgttcaagt tcctgagcag ctggagcctg tggggcgcca actacatgga ctgcttcgag 840
agcaacgaga ccatgggcgt gtggctgcac atcgccgaca agaagcgcaa gaagtacctg 900
aacaacaagt accgcaccag ccccttcaac ctgttccacc acatcaacac ctacgaggac 960
aacggcttcc tgatcgtgga cctgtgctgc tggaagggct tcgagttcgt gtacaactac 1020
ctgtacctgg ccaacctgcg cgagaactgg gaggaggtga agaagaacgc ccgcaaggcc 1080
ccccagcccg aggtgcgccg ctacgtgctg cccctgaaca tcgacaaggc cgacaccggc 1140
aagaacctgg tgaccctgcc caacaccacc gccaccgcca tcctgtgcag cgacgagacc 1200
atctggctgg agcccgaggt gctgttcagc ggcccccgcc aggccttcga gttcccccag 1260
atcaactacc agaagtactg cggcaagccc tacacctacg cctacggcct gggcctgaac 1320
cacttcgtgc ccgaccgcct gtgcaagctg aacgtgaaga ccaaggagac ctgggtgtgg 1380
caggagcccg acagctaccc cagcgagccc atcttcgtga gccaccccga cgccctggag 1440
gaggacgacg gcgtggtgct gagcgtggtg gtgagccccg gcgccggcca gaagcccgcc 1500
tacctgctga tcctgaacgc caaggacctg agcgaggtgg cccgcgccga ggtggagatc 1560
aacatccccg tgaccttcca cggcctgttc aagaagagct aa 1602
<210> 11
<211> 533
<212> PRT
<213> 智人
<400> 11
Met Ser Ile Gln Val Glu His Pro Ala Gly Gly Tyr Lys Lys Leu Phe
1 5 10 15
Glu Thr Val Glu Glu Leu Ser Ser Pro Leu Thr Ala His Val Thr Gly
20 25 30
Arg Ile Pro Leu Trp Leu Thr Gly Ser Leu Leu Arg Cys Gly Pro Gly
35 40 45
Leu Phe Glu Val Gly Ser Glu Pro Phe Tyr His Leu Phe Asp Gly Gln
50 55 60
Ala Leu Leu His Lys Phe Asp Phe Lys Glu Gly His Val Thr Tyr His
65 70 75 80
Arg Arg Phe Ile Arg Thr Asp Ala Tyr Val Arg Ala Met Thr Glu Lys
85 90 95
Arg Ile Val Ile Thr Glu Phe Gly Thr Cys Ala Phe Pro Asp Pro Cys
100 105 110
Lys Asn Ile Phe Ser Arg Phe Phe Ser Tyr Phe Arg Gly Val Glu Val
115 120 125
Thr Asp Asn Ala Leu Val Asn Val Tyr Pro Val Gly Glu Asp Tyr Tyr
130 135 140
Ala Cys Thr Glu Thr Asn Phe Ile Thr Lys Ile Asn Pro Glu Thr Leu
145 150 155 160
Glu Thr Ile Lys Gln Val Asp Leu Cys Asn Tyr Val Ser Val Asn Gly
165 170 175
Ala Thr Ala His Pro His Ile Glu Asn Asp Gly Thr Val Tyr Asn Ile
180 185 190
Gly Asn Cys Phe Gly Lys Asn Phe Ser Ile Ala Tyr Asn Ile Val Lys
195 200 205
Ile Pro Pro Leu Gln Ala Asp Lys Glu Asp Pro Ile Ser Lys Ser Glu
210 215 220
Ile Val Val Gln Phe Pro Cys Ser Asp Arg Phe Lys Pro Ser Tyr Val
225 230 235 240
His Ser Phe Gly Leu Thr Pro Asn Tyr Ile Val Phe Val Glu Thr Pro
245 250 255
Val Lys Ile Asn Leu Phe Lys Phe Leu Ser Ser Trp Ser Leu Trp Gly
260 265 270
Ala Asn Tyr Met Asp Cys Phe Glu Ser Asn Glu Thr Met Gly Val Trp
275 280 285
Leu His Ile Ala Asp Lys Lys Arg Lys Lys Tyr Leu Asn Asn Lys Tyr
290 295 300
Arg Thr Ser Pro Phe Asn Leu Phe His His Ile Asn Thr Tyr Glu Asp
305 310 315 320
Asn Gly Phe Leu Ile Val Asp Leu Cys Cys Trp Lys Gly Phe Glu Phe
325 330 335
Val Tyr Asn Tyr Leu Tyr Leu Ala Asn Leu Arg Glu Asn Trp Glu Glu
340 345 350
Val Lys Lys Asn Ala Arg Lys Ala Pro Gln Pro Glu Val Arg Arg Tyr
355 360 365
Val Leu Pro Leu Asn Ile Asp Lys Ala Asp Thr Gly Lys Asn Leu Val
370 375 380
Thr Leu Pro Asn Thr Thr Ala Thr Ala Ile Leu Cys Ser Asp Glu Thr
385 390 395 400
Ile Trp Leu Glu Pro Glu Val Leu Phe Ser Gly Pro Arg Gln Ala Phe
405 410 415
Glu Phe Pro Gln Ile Asn Tyr Gln Lys Tyr Cys Gly Lys Pro Tyr Thr
420 425 430
Tyr Ala Tyr Gly Leu Gly Leu Asn His Phe Val Pro Asp Arg Leu Cys
435 440 445
Lys Leu Asn Val Lys Thr Lys Glu Thr Trp Val Trp Gln Glu Pro Asp
450 455 460
Ser Tyr Pro Ser Glu Pro Ile Phe Val Ser His Pro Asp Ala Leu Glu
465 470 475 480
Glu Asp Asp Gly Val Val Leu Ser Val Val Val Ser Pro Gly Ala Gly
485 490 495
Gln Lys Pro Ala Tyr Leu Leu Ile Leu Asn Ala Lys Asp Leu Ser Glu
500 505 510
Val Ala Arg Ala Glu Val Glu Ile Asn Ile Pro Val Thr Phe His Gly
515 520 525
Leu Phe Lys Lys Ser
530
<210> 12
<211> 1604
<212> DNA
<213> 智人
<400> 12
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt 60
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca 120
atgggtggac tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc 180
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta 240
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac 300
catgtcgagg tgagccccac gttctgcttc actctcccca tctccccccc ctccccaccc 360
ccaattttgt atttatttat tttttaatta ttttgtgcag cgattggggg cggggggggg 420
gggggggcgc gcgccaggcg gggcggggcg gggcgagggg cggggcgggg cgaggcggag 480
aggtgcggcg gcagccaatc agagcggcgc gctccgaaag tttcctttta tggcgaggcg 540
gcggcggcgg cggccctata aaaagcgaag cgcgcggcgg gcgggagtcg ctgcgacgct 600
gccttcgccc cgtgccccgc tccgccgccg cctcgcgccg cccgccccgg ctctgactga 660
ccgcgttact cccacaggtg agcgggcggg acggcccttc tcctccgggc tgtaattagc 720
gcttggttta atgacggctt gtttcttttc tgtggctgcg tgaaagcctt gaggggctcc 780
gggagggccc tttgtgcggg ggggagcggc tcggggggtg cgtgcgtgtg tgtgtgcgtg 840
gggagcgccg cgtgcggccc gcgctgcccg gcggctgtga gcgctgcggg cgcggcgcgg 900
ggctttgtgc gctccgcagt gtgcgcgagg ggagcgcggc cgggggcggt gccccgcggt 960
gcgggggggg ctgcgagggg aacaaaggct gcgtgcgggg tgtgtgcgtg ggggggtgag 1020
cagggggtgt gggcgcggcg gtcgggctgt aacccccccc tgcacccccc tccccgagtt 1080
gctgagcacg gcccggcttc gggtgcgggg ctccgtacgg ggcgtggcgc ggggctcgcc 1140
gtgccgggcg gggggtggcg gcaggtgggg gtgccgggcg gggcggggcc gcctcgggcc 1200
ggggagggct cgggggaggg gcgcggcggc ccccggagcg ccggcggctg tcgaggcgcg 1260
gcgagccgca gccaattgcc ttttatggta atcgtgcgag agggcgcagg gacttccttt 1320
gtcccaaatc tgtgcggagc cgaaatctgg gaggcgccgc cgcaccccct ctagcgggcg 1380
cggggcgaag cggtgcggcg ccggcaggaa ggaaatcggg cggggagggc cttcgtgcgt 1440
cgccgcgccg ccgtcccctt ctccctctcc agcctcgggg ctgtccgcgg ggggacggct 1500
gccttcgggg gggacggggc agggcggggt tcggcttctg gcgtgtgacc ggcggctcta 1560
gagcctctgc taaccatgtt catgccttct tctttttcct acag 1604
<210> 13
<211> 479
<212> DNA
<213> 智人
<400> 13
gggtggcatc cctgtgaccc ctccccagtg cctctcctgg ccctggaagt tgccactcca 60
gtgcccacca gccttgtcct aataaaatta agttgcaatc cattttgtct gactaggtgt 120
ccttctataa tattatgggg tggagggggg tggtatggag caaggggcaa gttgggaaga 180
caacctgtag ggcctgcggg gtctattggg aaccaagctg gagtgcagtg gcacaatctt 240
ggctcactgc aatctccgcc tcctgggttc aagcgattct cctgcctcag cctcccgagt 300
tgttgggatt ccaggcatgc atgaccaggc tcagctaatt tttgtttttt tggtagagac 360
ggggtttcac catattggcc aggctggtct ccaactccta atctcaggtg atctacccac 420
cttggcctcc caaattgctg ggattacagg cgtgaaccac tgctcccttc cctgtcctt 479
<210> 14
<211> 225
<212> DNA
<213> 智人
<400> 14
ctgtgccttc tagttgccag ccatctgttg tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc 60
tggaaggtgc cactcccact gtcctttcct aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc 120
tgagtaggtg tcattctatt ctggggggtg gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt 180
gggaagacaa tagcaggcat gctggggatg cggtgggctc tatgg 225
<210> 15
<211> 135
<212> DNA
<213> 智人
<400> 15
aacttgttta ttgcagctta taatggttac aaataaagca atagcatcac aaatttcaca 60
aataaagcat ttttttcact gcattctagt tgtggtttgt ccaaactcat caatgtatct 120
tatcatgtct ggatc 135
<210> 16
<211> 589
<212> DNA
<213> 智人
<400> 16
aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct 60
ccttttacgc tatgtggata cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt 120
atggctttca ttttctcctc cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg 180
tggcccgttg tcaggcaacg tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact 240
ggttggggca ttgccaccac ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct 300
attgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg 360
ttgggcactg acaattccgt ggtgttgtcg gggaagctga cgtcctttcc atggctgctc 420
gcctgtgttg ccacctggat tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc 480
aatccagcgg accttccttc ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt 540
cgccttcgcc ctcagacgag tcggatctcc ctttgggccg cctccccgc 589
<210> 17
<211> 735
<212> PRT
<213> 智人
<400> 17
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Thr Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Gln Trp Trp Lys Leu Lys Pro Gly Pro Pro Pro Pro
20 25 30
Lys Pro Ala Glu Arg His Lys Asp Asp Ser Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Glu Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Arg Gln Leu Asp Ser Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Lys Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Lys Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Pro Val Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu His Ser Pro Val Glu Pro Asp Ser Ser Ser Gly Thr Gly
145 150 155 160
Lys Ala Gly Gln Gln Pro Ala Arg Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
165 170 175
Gly Asp Ala Asp Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Leu Gly Gln Pro Pro
180 185 190
Ala Ala Pro Ser Gly Leu Gly Thr Asn Thr Met Ala Thr Gly Ser Gly
195 200 205
Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Asn Ser
210 215 220
Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp Met Gly Asp Arg Val Ile
225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
245 250 255
Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Gln Ser Gly Ala Ser Asn Asp Asn His Tyr
260 265 270
Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg Phe His
275 280 285
Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn Asn Trp
290 295 300
Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile Gln Val
305 310 315 320
Lys Glu Val Thr Gln Asn Asp Gly Thr Thr Thr Ile Ala Asn Asn Leu
325 330 335
Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr
340 345 350
Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro Ala Asp
355 360 365
Val Phe Met Val Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asn Gly Ser
370 375 380
Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe Pro Ser
385 390 395 400
Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr Phe Ser Tyr Thr Phe Glu
405 410 415
Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu Asp Arg
420 425 430
Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr
435 440 445
Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln Ser Arg Leu Gln Phe Ser Gln
450 455 460
Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln Ser Arg Asn Trp Leu Pro Gly
465 470 475 480
Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys Thr Ser Ala Asp Asn Asn
485 490 495
Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly
500 505 510
Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro Ala Met Ala Ser His Lys Asp
515 520 525
Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser Gly Val Leu Ile Phe Gly Lys
530 535 540
Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp Ile Glu Lys Val Met Ile Thr
545 550 555 560
Asp Glu Glu Glu Ile Arg Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Gln Tyr
565 570 575
Gly Ser Val Ser Thr Asn Leu Gln Arg Gly Asn Arg Gln Ala Ala Thr
580 585 590
Ala Asp Val Asn Thr Gln Gly Val Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asp
595 600 605
Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr
610 615 620
Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys
625 630 635 640
His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala Asn
645 650 655
Pro Ser Thr Thr Phe Ser Ala Ala Lys Phe Ala Ser Phe Ile Thr Gln
660 665 670
Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys
675 680 685
Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr
690 695 700
Asn Lys Ser Val Asn Val Asp Phe Thr Val Asp Thr Asn Gly Val Tyr
705 710 715 720
Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
725 730 735
<210> 18
<211> 598
<212> PRT
<213> 智人
<400> 18
Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg Pro Val Glu His Ser Pro Val Glu Pro
1 5 10 15
Asp Ser Ser Ser Gly Thr Gly Lys Ala Gly Gln Gln Pro Ala Arg Lys
20 25 30
Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr Gly Asp Ala Asp Ser Val Pro Asp Pro
35 40 45
Gln Pro Leu Gly Gln Pro Pro Ala Ala Pro Ser Gly Leu Gly Thr Asn
50 55 60
Thr Met Ala Thr Gly Ser Gly Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly
65 70 75 80
Ala Asp Gly Val Gly Asn Ser Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr
85 90 95
Trp Met Gly Asp Arg Val Ile Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu
100 105 110
Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Gln Ser Gly
115 120 125
Ala Ser Asn Asp Asn His Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr
130 135 140
Phe Asp Phe Asn Arg Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln
145 150 155 160
Arg Leu Ile Asn Asn Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe
165 170 175
Lys Leu Phe Asn Ile Gln Val Lys Glu Val Thr Gln Asn Asp Gly Thr
180 185 190
Thr Thr Ile Ala Asn Asn Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp
195 200 205
Ser Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys
210 215 220
Leu Pro Pro Phe Pro Ala Asp Val Phe Met Val Pro Gln Tyr Gly Tyr
225 230 235 240
Leu Thr Leu Asn Asn Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr
245 250 255
Cys Leu Glu Tyr Phe Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe
260 265 270
Thr Phe Ser Tyr Thr Phe Glu Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala
275 280 285
His Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr
290 295 300
Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln
305 310 315 320
Ser Arg Leu Gln Phe Ser Gln Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln
325 330 335
Ser Arg Asn Trp Leu Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser
340 345 350
Lys Thr Ser Ala Asp Asn Asn Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala
355 360 365
Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro
370 375 380
Ala Met Ala Ser His Lys Asp Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser
385 390 395 400
Gly Val Leu Ile Phe Gly Lys Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp
405 410 415
Ile Glu Lys Val Met Ile Thr Asp Glu Glu Glu Ile Arg Thr Thr Asn
420 425 430
Pro Val Ala Thr Glu Gln Tyr Gly Ser Val Ser Thr Asn Leu Gln Arg
435 440 445
Gly Asn Arg Gln Ala Ala Thr Ala Asp Val Asn Thr Gln Gly Val Leu
450 455 460
Pro Gly Met Val Trp Gln Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile
465 470 475 480
Trp Ala Lys Ile Pro His Thr Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu
485 490 495
Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys
500 505 510
Asn Thr Pro Val Pro Ala Asn Pro Ser Thr Thr Phe Ser Ala Ala Lys
515 520 525
Phe Ala Ser Phe Ile Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu
530 535 540
Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu
545 550 555 560
Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Asn Lys Ser Val Asn Val Asp Phe Thr
565 570 575
Val Asp Thr Asn Gly Val Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg
580 585 590
Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
595
<210> 19
<211> 533
<212> PRT
<213> 智人
<400> 19
Met Ala Thr Gly Ser Gly Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala
1 5 10 15
Asp Gly Val Gly Asn Ser Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp
20 25 30
Met Gly Asp Arg Val Ile Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro
35 40 45
Thr Tyr Asn Asn His Leu Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Gln Ser Gly Ala
50 55 60
Ser Asn Asp Asn His Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe
65 70 75 80
Asp Phe Asn Arg Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg
85 90 95
Leu Ile Asn Asn Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys
100 105 110
Leu Phe Asn Ile Gln Val Lys Glu Val Thr Gln Asn Asp Gly Thr Thr
115 120 125
Thr Ile Ala Asn Asn Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser
130 135 140
Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu
145 150 155 160
Pro Pro Phe Pro Ala Asp Val Phe Met Val Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu
165 170 175
Thr Leu Asn Asn Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys
180 185 190
Leu Glu Tyr Phe Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr
195 200 205
Phe Ser Tyr Thr Phe Glu Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His
210 215 220
Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu
225 230 235 240
Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln Ser
245 250 255
Arg Leu Gln Phe Ser Gln Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln Ser
260 265 270
Arg Asn Trp Leu Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys
275 280 285
Thr Ser Ala Asp Asn Asn Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala Thr
290 295 300
Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro Ala
305 310 315 320
Met Ala Ser His Lys Asp Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser Gly
325 330 335
Val Leu Ile Phe Gly Lys Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp Ile
340 345 350
Glu Lys Val Met Ile Thr Asp Glu Glu Glu Ile Arg Thr Thr Asn Pro
355 360 365
Val Ala Thr Glu Gln Tyr Gly Ser Val Ser Thr Asn Leu Gln Arg Gly
370 375 380
Asn Arg Gln Ala Ala Thr Ala Asp Val Asn Thr Gln Gly Val Leu Pro
385 390 395 400
Gly Met Val Trp Gln Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp
405 410 415
Ala Lys Ile Pro His Thr Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met
420 425 430
Gly Gly Phe Gly Leu Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn
435 440 445
Thr Pro Val Pro Ala Asn Pro Ser Thr Thr Phe Ser Ala Ala Lys Phe
450 455 460
Ala Ser Phe Ile Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile
465 470 475 480
Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile
485 490 495
Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Asn Lys Ser Val Asn Val Asp Phe Thr Val
500 505 510
Asp Thr Asn Gly Val Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr
515 520 525
Leu Thr Arg Asn Leu
530
Claims (72)
1.一种重组腺相关病毒(rAAV)颗粒,其包含含有RPE65多肽的编码序列的多核苷酸序列,其中所述编码序列是密码子优化的,并且与野生型RPE65核苷酸序列相比含有改变数量的CpG二核苷酸。
2.根据权利要求1所述的rAAV颗粒,其中与所述野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含减少数量的CpG二核苷酸。
3.根据权利要求2所述的rAAV颗粒,其中与所述野生型RPE65核苷酸序列相比,所述编码序列包含约50%的CpG二核苷酸。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述编码序列包含少于20个CpG二核苷酸。
5.根据权利要求4所述的rAAV颗粒,其中所述编码序列包含少于10个CpG二核苷酸。
6.根据权利要求5所述的rAAV颗粒,其中所述编码序列不包含CpG二核苷酸。
7.根据权利要求1所述的rAAV颗粒,其中所述编码序列选自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和SEQID NO:10。
8.根据权利要求1所述的rAAV颗粒,其中所述编码序列与选自SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10的序列具有至少95%序列同一性。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的rAAV颗粒,其还包含AAV衣壳蛋白。
10.根据权利要求9所述的rAAV颗粒,其中所述AAV衣壳蛋白是血清型2AAV蛋白、血清型5AAV蛋白、血清型8AAV蛋白或其片段或变体。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸序列还包含启动子,并且所述启动子可操作地连接至所述编码序列。
12.根据权利要求11所述的rAAV颗粒,其中所述启动子是CMV、CAG、MNDU3、PGK、EF1a、Ubc启动子或眼部组织特异性启动子。
13.根据权利要求12所述的rAAV颗粒,其中所述眼部组织特异性启动子选自RPE 65基因启动子、人视网膜结合蛋白(CRALBP)基因启动子、鼠11-顺式视黄醇脱氢酶(RDH)基因启动子、视紫红质启动子、视紫红质激酶启动子、金属蛋白酶组织抑制因子3(Timp3)启动子、光感受器视黄醇结合蛋白启动子、卵黄状黄斑营养不良2启动子或光感受器间类视黄醇结合蛋白(IRBP)启动子。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸序列还包含在3'末端处的WPRE序列。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸序列还包含在3'末端处的poly(A)序列。
16.根据权利要求15所述的rAAV颗粒,其中所述poly(A)序列是SV40pA、hGHpA或bGHpA。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸还包含填充序列。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸序列还包含反向末端重复(ITR)序列。
19.根据权利要求18所述的rAAV颗粒,其中所述反向末端重复(ITR)序列是变体反向末端重复(ITR)序列。
20.根据权利要求1至19中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸包含不超过300个CpG二核苷酸。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸包含不超过250个CpG二核苷酸。
22.根据权利要求1至21中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸包含约200至500个CpG二核苷酸。
23.根据权利要求1至22中任一项所述的rAAV颗粒,其中所述多核苷酸还包含编码一种其它治疗性蛋白的序列。
24.根据权利要求23所述的rAAV颗粒,其中所述其它治疗性蛋白选自ABCA4、RDH12、RDH8、RBP3、RBP1、LRAT、RLBP1、RDH10和RDH11。
25.根据权利要求23或24所述的rAAV颗粒,其中所述编码序列通过接头序列与所述其它治疗性蛋白的序列连接。
26.根据权利要求25所述的rAAV颗粒,其中所述接头是可切割接头。
27.根据权利要求25或26所述的rAAV颗粒,其中所述接头包含2A肽。
28.一种组合物,其包含:
(i)编码腺相关病毒(AAV)蛋白的第一多核苷酸,和
(ii)包含编码RPE65多肽的序列的第二多核苷酸,其中所述序列是密码子优化的,并且与野生型RPE65核苷酸序列相比含有改变数量的CpG二核苷酸。
29.根据权利要求28所述的组合物,其中与所述野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含减少数量的CpG二核苷酸。
30.根据权利要求29所述的组合物,其中与所述野生型RPE65核苷酸序列相比,所述序列包含约50%的CpG二核苷酸。
31.根据权利要求28至30所述的组合物,其中所述序列包含少于20个CpG二核苷酸。
32.根据权利要求31所述的组合物,其中所述序列包含少于10个CpG二核苷酸。
33.根据权利要求32所述的组合物,其中所述序列不包含CpG二核苷酸。
34.根据权利要求28所述的组合物,其中所述序列选自SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:3、SEQID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和SEQ IDNO:10。
35.根据权利要求28所述的组合物,其中所述序列与选自SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和SEQID NO:10的序列具有至少95%序列同一性。
36.根据权利要求28至35所述的组合物,其中所述AAV蛋白是血清型2AAV蛋白、血清型5AAV蛋白、血清型8AAV蛋白或其片段或变体。
37.根据权利要求28至36所述的组合物,其中所述第一多核苷酸是密码子优化的。
38.根据权利要求28至37所述的组合物,其中所述第二多核苷酸包含启动子,所述启动子可操作地连接至所述序列。
39.根据权利要求38所述的组合物,所述启动子是CMV、CAG、MNDU3、PGK、EF1a、Ubc启动子或眼部组织特异性启动子。
40.根据权利要求39所述的组合物,其中所述眼部组织特异性启动子选自RPE 65基因启动子、人视网膜结合蛋白(CRALBP)基因启动子、鼠11-顺式视黄醇脱氢酶(RDH)基因启动子、视紫红质启动子、视紫红质激酶启动子、金属蛋白酶组织抑制因子3(Timp3)启动子、光感受器视黄醇结合蛋白启动子、卵黄状黄斑营养不良2启动子或光感受器间类视黄醇结合蛋白(IRBP)启动子。
41.根据权利要求28至40所述的组合物,其中所述第二多核苷酸包含少于300个CpG二核苷酸。
42.根据权利要求41所述的组合物,其中所述第二多核苷酸包含少于250个CpG二核苷酸。
43.根据权利要求28至42所述的组合物,其中所述第二多核苷酸包含约200-500个CpG二核苷酸。
44.根据权利要求28至43所述的组合物,其中所述第二多核苷酸序列还包含在3'末端处的WPRE序列。
45.根据权利要求28至44所述的组合物,其中所述第二多核苷酸序列还包含在3'末端处的poly A序列。
46.根据权利要求45所述的组合物,其中所述poly(A)序列是SV40晚期poly(A)(SV40pA)、人生长激素poly(A)(hGHpA)或牛生长激素poly(A)(bGHpA)。
47.根据权利要求28至46所述的组合物,其中所述第二多核苷酸还包含填充序列。
48.根据权利要求47所述的组合物,其中所述第二多核苷酸还包含反向末端重复(ITR)序列。
49.根据权利要求48所述的组合物,其中所述反向末端重复(ITR)序列是变体反向末端重复(ITR)序列。
50.根据权利要求28至49所述的组合物,其中所述第二多核苷酸还包含编码一种其它治疗性蛋白的序列。
51.根据权利要求50所述的组合物,其中所述其它治疗性蛋白是ABCA4、RDH12、RDH8、RBP3、RBP1、LRAT、RLBP1、RDH10或RDH11。
52.根据权利要求49所述的组合物,其中所述序列和所述其它治疗性蛋白的序列通过接头连接。
53.根据权利要求52所述的组合物,其中所述接头是可切割接头。
54.根据权利要求52或53所述的组合物,其中所述接头包含2A肽。
55.一种重组腺相关病毒(rAAV)颗粒,其通过将根据权利要求28至54中任一项所述的组合物引入宿主细胞中来制备。
56.根据权利要求55所述的rAAV颗粒,其中所述宿主细胞是人细胞、动物细胞或昆虫细胞。
57.根据权利要求56所述的rAAV颗粒,其中所述昆虫细胞是Sf9细胞。
58.一种宿主细胞,其包含根据权利要求1至27中任一项所述的rAAV颗粒或根据权利要求28至54中任一项所述的组合物。
59.一种用于制备rAAV颗粒的方法,所述方法包括在宿主细胞中引入根据权利要求27-52中任一项所述的组合物。
60.根据权利要求59所述的方法,其中所述宿主细胞是人细胞、动物细胞或昆虫细胞。
61.根据权利要求60所述的方法,其中所述宿主细胞是Sf9细胞。
62.根据权利要求60所述的方法,其中所述宿主细胞是HEK293细胞或其衍生物。
63.根据权利要求62所述的方法,其中所述宿主细胞是HEK293T细胞。
64.根据权利要求58至63中任一项所述的方法,其还包括生成杆状病毒质粒DNA和/或杆状病毒。
65.一种用于治疗Leber先天性黑朦(LCA)的药物组合物,所述药物组合物包含根据权利要求1至27或55至57中任一项所述的rAAV颗粒和药学上可接受的载剂。
66.一种试剂盒,其包括根据权利要求65所述的药物组合物和说明书。
67.根据权利要求1至27或55至57中任一项所述的rAAV颗粒在制备用于治疗对象的遗传性视网膜疾病(IRD)的药物中的用途。
68.根据权利要求67所述的rAAV颗粒的用途,其中所述IRD是由于所述对象的RPE65基因的两个拷贝的突变引起。
69.一种用于治疗有需要的对象的Leber先天性黑朦(LCA)的方法,所述方法包括向所述对象施用治疗有效量的根据权利要求1至27或55至57中任一项所述的rAAV颗粒或根据权利要求65所述的药物组合物。
70.根据权利要求69所述的方法,其中根据权利要求1至27中任一项所述的rAAV颗粒或根据权利要求65所述的药物组合物通过玻璃体内注射、视网膜下注射或脉络膜上腔注射来施用。
71.根据权利要求69或70所述的方法,其中所述治疗有效量是1×109-1×1013个rAAV颗粒。
72.根据权利要求69或70所述的方法,其中对于每只眼睛,所述治疗有效量是1×109-1×1013个载体基因组(vg)。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202010704946.1A CN113952471A (zh) | 2020-07-21 | 2020-07-21 | 用于治疗眼部疾病的组合物和方法 |
CN2020107049461 | 2020-07-21 | ||
CN202110378979 | 2021-04-08 | ||
CN2021103789796 | 2021-04-08 | ||
PCT/CN2021/107284 WO2022017363A1 (en) | 2020-07-21 | 2021-07-20 | Compositions and methods for the treatment of ocular diseases |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN116368228A true CN116368228A (zh) | 2023-06-30 |
Family
ID=79728991
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202180064406.4A Pending CN116368228A (zh) | 2020-07-21 | 2021-07-20 | 用于治疗眼部疾病的组合物和方法 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20230321280A1 (zh) |
EP (1) | EP4185335A1 (zh) |
JP (1) | JP2023535232A (zh) |
CN (1) | CN116368228A (zh) |
AU (1) | AU2021314400A1 (zh) |
CA (1) | CA3186818A1 (zh) |
WO (1) | WO2022017363A1 (zh) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2023187822A1 (en) * | 2022-03-28 | 2023-10-05 | Indian Institute Of Technology Kanpur | A system for an ocular gene therapy and a process for preparing thereof |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB201502137D0 (en) * | 2015-02-09 | 2015-03-25 | Ucl Business Plc | Treatment |
JP2018522834A (ja) * | 2015-06-04 | 2018-08-16 | インセルム(インスティチュート ナショナル デ ラ サンテ エ デ ラ リシェルシェ メディカル) | 遺伝子治療による眼疾患治療のための改良された方法 |
KR20200036912A (ko) * | 2017-07-31 | 2020-04-07 | 리플렉션 바이오테크놀러지스 리미티드 | 안과 질환을 위한 세포 모델 및 치료요법 |
CN111118017B (zh) * | 2018-11-01 | 2023-10-03 | 上海朗昇生物科技有限公司 | 治疗Leber先天性黑蒙症的载体及其应用 |
-
2021
- 2021-07-20 EP EP21846029.3A patent/EP4185335A1/en active Pending
- 2021-07-20 WO PCT/CN2021/107284 patent/WO2022017363A1/en unknown
- 2021-07-20 CN CN202180064406.4A patent/CN116368228A/zh active Pending
- 2021-07-20 JP JP2023512465A patent/JP2023535232A/ja active Pending
- 2021-07-20 AU AU2021314400A patent/AU2021314400A1/en active Pending
- 2021-07-20 CA CA3186818A patent/CA3186818A1/en active Pending
-
2023
- 2023-01-20 US US18/157,577 patent/US20230321280A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP4185335A1 (en) | 2023-05-31 |
CA3186818A1 (en) | 2022-01-27 |
AU2021314400A1 (en) | 2023-03-23 |
JP2023535232A (ja) | 2023-08-16 |
US20230321280A1 (en) | 2023-10-12 |
WO2022017363A1 (en) | 2022-01-27 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP3717636B1 (en) | Adeno-associated virus variant capsids and use for inhibiting angiogenesis | |
CN105408352B (zh) | 通过双重aav载体有效递送大基因 | |
RU2759335C2 (ru) | Генное редактирование глубоких интронных мутаций | |
US10214785B2 (en) | Adeno-associated virus virions with variant capsid and methods of use thereof | |
US20230321280A1 (en) | Compositions and methods for the treatment of ocular diseases | |
CN116685329A (zh) | 核酸构建体及其用于治疗脊髓性肌肉萎缩症的用途 | |
CN116113700A (zh) | 用于glut1表达的腺相关病毒载体及其用途 | |
KR20230039669A (ko) | eEF1A2용 유전자 요법 벡터 및 이의 용도 | |
EP2968612B1 (en) | Modified soluble vegf receptor-1 genes and vectors for gene therapy | |
KR20210057720A (ko) | Clrn1 관련된 청력 손실 및/또는 시력 손실의 치료 방법 | |
KR20230019062A (ko) | 연령-관련 황반 변성 및 다른 안구 질환 및 장애의 치료를 위한 아데노-연관 바이러스 (aav) 벡터 | |
AU2022310166A1 (en) | Retgc gene therapy | |
JPWO2022017363A5 (zh) | ||
JPWO2022018518A5 (zh) | ||
NZ713958A (en) | Promoters, expression cassettes, vectors, kits, and methods for the treatment of achromatopsia and other diseases |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
REG | Reference to a national code |
Ref country code: HK Ref legal event code: DE Ref document number: 40092769 Country of ref document: HK |