CN115873880A - 重组核酸序列、重组表达载体以及基因工程菌 - Google Patents

重组核酸序列、重组表达载体以及基因工程菌 Download PDF

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Abstract

本发明公开了重组核酸序列、重组表达载体以及基因工程菌。其中,所述重组核酸序列包括串联启动子、赖氨酸脱羧酶基因以及增强细胞耐受压力的基因,所述串联启动子包括piclR启动子和稳定期特异性启动子。本发明通过使用piclR‑稳定期特异性启动子串联后控制L‑赖氨酸脱羧酶的表达时间和表达量,降低1,5‑戊二胺耐受过程中的能耗,促进菌株的生产能力,进而提高1,5‑戊二胺的产量。并且通过增加促进1,5‑戊二胺排出细胞外的基因表达量,降低胞内1,5‑戊二胺浓度及其对胞内赖氨酸脱羧酶活性的抑制,增加菌株的耐受能力,进一步提高1,5‑戊二胺的产量。

Description

重组核酸序列、重组表达载体以及基因工程菌
技术领域
本发明属于微生物工程技术领域,具体地说,涉及用于发酵生产1,5-戊二胺的重组核酸序列、重组表达载体、基因工程菌及其用途。
背景技术
1,5-戊二胺的用途相当广泛且在工业生产中具有很高的经济价值,例如可以与二元酸进行聚合反应合成新型尼龙。目前,1,5-戊二胺的生物合成主要利用两种策略进行:发酵生产或体外酶催化。对于发酵生产,1,5-戊二胺通过赖氨酸脱羧酶(L-lysinedecarboxylase,简称LDC,EC 4.1.1.18)将L-赖氨酸脱去一个羧基而生成。具体的,可以将赖氨酸脱羧酶基因添加至产赖氨酸的微生物例如谷氨酸棒杆菌和大肠杆菌中,从而将赖氨酸生物合成途径延长至1,5-戊二胺生物合成途径。
目前已有通过DNA重组技术改造的具有L-赖氨酸生产能力的棒杆菌属和埃希杆菌属的细菌,其效率的提高是通过过表达L-赖氨酸合成途径的相关基因和反馈抑制脱敏的相关基因,或者强化从葡萄糖代谢开始的能量供应途径而实现的。反馈抑制脱敏的相关基因,例如天冬氨酸激酶Ⅲ(LysC)是赖氨酸合成途径中的特异关键酶。然而,由于菌体本身耐受的1,5-戊二胺浓度有限,如果在发酵体系中前期表达了赖氨酸脱羧酶转化生成的1,5-戊二胺过多,就会对菌体造成毒害,从而抑制菌体生长及利用葡萄糖生产L-赖氨酸的过程(Qian,et al.,Biotechnol.Bioeng.2011;108:93–103)。
例如:公开号为WO2019006723A1,公开日为2019年1月19日,名称为“HETEROLOGOUSEXPRESSION OF THERMOPHILIC LYSINE DEC-ARBOXYLASE AND USES THEREOF”的专利文献公开了一种嗜热赖氨酸脱羧酶的异源表达及其用途。在该专利文献所公开的技术方案中,先使用嗜热赖氨酸脱羧酶,通过高温控制酶活性。
又例如:公开号为CN105368766A,公开日为2016年3月2日,名称为“一株生产戊二胺的基因工程菌及其制备戊二胺的方法”的中国专利文献公开了一种戊二胺生产菌株及其高效生产戊二胺的工艺。在该专利文献所公开的技术方案中,通过使用温控型启动子表达赖氨酸脱羧酶,一定程度上解决了稳定性问题,但使用高温进行催化又额外增加了能耗和生产成本。
因此,需要开发更经济、稳定、高效的1,5-戊二胺生产工艺。
发明内容
为了克服现有技术的不足,本发明的目的在于一种重组核酸序列、重组表达载体以及基因工程菌,以实现1,5-戊二胺的稳定、高效、低成本生产。
为了实现上述目的,本发明通过以下几个方面实现:
第一方面,本发明提出了一种重组核酸序列,所述重组核酸序列包括串联启动子、赖氨酸脱羧酶基因以及增强细胞耐受压力的基因,其中,所述串联启动子包括piclR启动子和稳定期特异性启动子,所述稳定期特异性启动子选自下述的一种或多种:pcsiE、pbolA、posmY、pkatE、p21、p22、p23和p24。
耐渗透胁迫是细胞生理性能的重要方面。对于分泌到胞外的大宗化学品,产量越高,渗透胁迫越大,细胞需具备耐渗透胁迫能力才能获得高产量。
串联启动子一方面具有强启动子的启动能力,另一方面IclR是一个局部调控转录抑制因子,IclR蛋白能够抑制自身和乙醛酸途径中的arcABC操纵子的转录。IclR启动子的启动还受到FadR的激活。
本发明通过将包括piclR启动子和稳定期特异性启动子的串联启动子,及其控制之下的赖氨酸脱羧酶基因重组插入到细菌染色体中,增强启动子强度,保证L-赖氨酸脱羧酶的足量、稳定表达,大大降低宿主细胞耐受1,5-戊二胺毒害而导致的能耗,从而促进1,5-戊二胺的生产,而整个过程无需使用抗性基因、诱导元件等等。
本领域技术人员理解,为了提高目的基因在宿主细胞中的表达,可以根据该宿主细胞的密码子偏好对目的基因的编码序列进行优化。例如,可以将目的基因的稀有密码子进行同义替换,使之更接近于宿主细胞的密码子使用方式。通过这种方法,提高外源基因在宿主细胞中表达量的报道已有很多。
优选地,所述piclR启动子来源于大肠杆菌(Escherichia coli)、谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)以及蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)中的任意一种或几种。
更优选地,所述piclR启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:83-85任意一项所示;所述稳定期特异性启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-8任意一项所示;和/或,所述赖氨酸脱羧酶基因选自来自大肠杆菌、谷氨酸棒状杆菌、蜂房哈夫尼菌中的任意一种的cadA基因或ldcC基因。
进一步更优选地,所述cadA基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示。
在一些实施方案中,所述赖氨酸脱羧酶(简称LDC,EC 4.1.1.18)的基因可以来自微生物、动物或植物的细胞,包括但不局限于大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、嗜碱芽孢杆菌(Bacillus halodurans)、天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)、蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)、谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)或奥克西托克雷白杆菌(Klebsiella oxytoca)等。
在一些实施方案中,赖氨酸脱羧酶基因是来自于大肠杆菌的cadA基因或ldcC基因,例如cadA基因的序列可以是SEQ ID NO:9,CadA蛋白的序列可以是SEQ ID NO:10。另外,赖氨酸脱羧酶也可以来自于上述菌株经过诱变或随机突变之后的菌株或基因工程菌。赖氨酸脱羧酶还可以是上述来源的赖氨酸脱羧酶的突变体(包括天然突变体和人工重组突变体)或者活性片段(保留了赖氨酸脱羧酶活性的截短形式的蛋白片段)。
在一些实施方案中,所述串联启动子中的稳定期特异性启动子选自pcsiE、pbolA、posmY、pkatE、p21、p22、p23和p24中的任意一种或几种。
所述稳定期特异性启动子可以来自微生物、动物或植物的细胞,包括但不局限于大肠杆菌(Escherichia coli)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、嗜碱芽孢杆菌(Bacillus halodurans)、天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)、蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)、谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)或奥克西托克雷白杆菌(Klebsiella oxytoca)等。
所述pcsiE的序列可以是SEQ ID NO:1;pbolA的序列可以是SEQ ID NO:2;posmY的序列可以是SEQ ID NO:3;pkatE的序列可以是SEQ ID NO:4;p21的序列可以是SEQ ID NO:5;p22的序列可以是SEQ ID NO:6;p23的序列可以是SEQ ID NO:7;p24的序列可以是SEQ IDNO:8。
在本文中,促进1,5-戊二胺从细胞排出的基因是指,其表达产物促进微生物细胞将1,5-戊二胺排出到细胞外,从而降低胞内1,5-戊二胺浓度及其对胞内赖氨酸脱羧酶活性的抑制,促进1,5-戊二胺的生产。在一些实施方案中,所述促进戊二胺排出的基因包括外膜孔蛋白的基因或增加细胞耐压能力的基因。更具体地,所述促进戊二胺排出的外膜孔蛋白或增加细胞耐压能力的蛋白还可以是上述蛋白的突变体(包括天然突变体和人工重组突变体)或者活性片段。可选地,结合增加细胞耐受压力的基因(如rpoS、crp、puuR、pepA以及soxS)和/或外膜孔蛋白基因(如ompA、ompC、ompF、ompW和ompX),以进一步降低胞内1,5-戊二胺浓度,提高1,5-戊二胺的产量。
优选地,所述重组核酸序列还包括组成型启动子。
更优选地,所述组成型启动子选自plac、trp、tac、trc和PL中的任意一种或几种。
进一步更优选地,所述组成型启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:60所示。
在本文中所使用的组成型启动子是本领域技术人员所熟知的,其可以使促进1,5-戊二胺从细胞排出的基因或增加细胞耐压能力的基因在宿主细胞中表达,例如可以使用plac、trp、tac、trc或PL启动子。例如,plac的序列可以是SEQ ID NO:60。
优选地,所述增强细胞耐受压力的基因与组成型启动子可操作地连接,所述增强细胞耐受压力的基因选自:rpoS、crp、puuR、pepA以及soxS中的任意一种或几种。
更优选地,所述增强细胞耐受压力的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:11-15任意一项所示。其中,rpoS基因的序列可以是SEQ ID NO:11,其蛋白序列如SEQ ID NO:16所示,crp基因的序列可以是SEQ ID NO:12,其蛋白序列如SEQ ID NO:17所示,puuR基因的序列可以是SEQ ID NO:13的编码序列,其蛋白序列如SEQ ID NO:18所示,pepA基因的序列可以是SEQ ID NO:14,其蛋白序列如SEQ ID NO:19所示,soxS基因的序列可以是SEQ ID NO:15,其蛋白序列如SEQ ID NO:20所示。
优选地,所述重组核酸序列还包括编码外膜孔蛋白的基因。
更优选地,所述编码外膜孔蛋白的基因与组成型启动子可操作性地连接,和/或,所述编码外膜孔蛋白的基因选自:ompA、ompC、ompF、ompW和ompX中的任意一种或几种;更优选地,所述编码外膜孔蛋白的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:62-66任意一项所示。其中,ompA基因的序列可以是SEQ ID NO:62,其蛋白序列如SEQ ID NO:67所示,ompC基因的序列可以是SEQ ID NO:63,其蛋白序列如SEQ ID NO:68所示,ompF基因的序列可以是SEQ IDNO:64的编码序列,其蛋白序列如SEQ ID NO:69所示,ompW基因的序列可以是SEQ ID NO:65,其蛋白序列如SEQ ID NO:70所示,ompX基因的序列可以是SEQ ID NO:66,其蛋白序列如SEQ ID NO:71所示。
在本文所述的重组DNA中,所述串联启动子(元件a)和赖氨酸脱羧酶基因(元件b)可操作地连接(表示为a-b),使得赖氨酸脱羧酶的转录和表达在戊二胺诱导型启动子的控制之下。优选地,所连接的a-b可以实现在宿主细胞中表达受戊二胺浓度的调控,通过所述串联启动子控制L-赖氨酸脱羧酶的生产,提高1,5-戊二胺的产量。
在本文所述的重组DNA中,组成型启动子(元件c)和促进戊二胺排出的基因(元件d)可操作的连接(表示为c-d),使得促进戊二胺排出的基因的转录和表达在组成型启动子的控制之下;组成型启动子(元件e)和增加细胞耐压能力的基因(元件f)可操作的连接(表示为e-f)。可选地,前述所连接的a-b、c-d和e-f可以进行可操作的连接或者独立存在。
优选地,所述重组核酸序列选自以下组:
(1)piclR-p24-cadA-plac-rpoS、piclR-p24-cadA-plac-crp、piclR-p24-cadA-plac-puuR、piclR-p24-cadA-plac-pepA或piclR-p24-cadA-plac-soxS;和,
(2)piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompA、piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompC、piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompF、piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompW或piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompX。
第二方面,本发明提出了一种重组表达载体,所述重组表达载体包括上述的重组核酸序列。
优选地,所述重组表达载体的骨架质粒包括pUC18、pUC19、pBR322、pACYC、pET、pSC101以及它们的衍生质粒。
或,优选地,在本发明所述的技术方案中,采用pKD46进行大肠杆菌染色体重组。
在本文中,赖氨酸脱羧酶基因可以包含在一个质粒中。
在本文中,促进1,5-戊二胺从细胞排出的基因或增加细胞耐压能力的基因可以包含在与赖氨酸脱羧酶基因相同的质粒中。或者,其也可以包含在不同的质粒中,独立于宿主染色体而在宿主细胞内表达。
第三方面,本发明提出了一种生产1,5-戊二胺的基因工程菌,所述基因工程菌包含上述的重组核酸序列。
在本文中,所述基因工程菌的染色体中包含在所述串联启动子控制之下的赖氨酸脱羧酶基因。由此,通过使用piclR-稳定期特异性启动子串联启动子调控L-赖氨酸脱羧酶的表达,降低1,5-戊二胺耐受过程中的能耗,促进L-赖氨酸的生产,进而提高1,5-戊二胺的产量。进一步地,所述基因工程菌还可以通过重组在染色体中包含所述促进1,5-戊二胺从细胞排出的基因或在所转化的表达质粒中包含所述促进1,5-戊二胺从细胞排出的基因,由此通过表达促进1,5-戊二胺从细胞排出的蛋白而降低胞内1,5-戊二胺浓度及其对胞内赖氨酸脱羧酶活性的抑制,进而提高1,5-戊二胺的产量。
作为出发菌株,可以使用可生产L-赖氨酸的大肠杆菌(Escherichia coli)M11A3菌株,该菌株现已保藏于中国典型培养物保藏中心,地址:中国武汉,武汉大学,邮编430072,保藏编号CCTCC No:M2018456,保藏日期2018年7月6日。
优选地,所述重组核酸序列位于游离的重组表达载体或整合到染色体中。
更优选地,所述基因工程菌的宿主菌来源于埃希氏菌属(Escherichia)、棒杆菌属(Corynebacterium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、栖热菌属(Thermus)、短杆菌属(Brevibacterium)或哈夫尼菌属(Hafnia)的菌种。
进一步更优选地,所述基因工程菌的宿主菌来源于大肠杆菌(Escherichiacoli)、嗜热菌(Thermus.thermophilus)、蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)或谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)。
第四方面,本发明提出了一种生产1,5-戊二胺的方法,所述方法包括步骤:在发酵培养基中对含有上述的基因工程菌进行培养以生产1,5-戊二胺。
在一些实施方案中,基因工程菌培养温度为20-50℃。
在本文中,将所述重组DNA构建到具有生产L-赖氨酸能力的工程菌中,发酵培养重组菌并进行赖氨酸积累,发酵培养温度控制在20-50℃,进行菌体的快速生长以及赖氨酸积累,进入发酵稳定期后,使赖氨酸脱羧酶大量表达,转化生产1,5-戊二胺。
如本文所用,术语“约”在用于修改温度范围内的数值时表示该数值与该值的合理偏差,例如,在该范围内所述的值之下或之上1℃或2℃以内,是在所述值或范围的预期含义内。
在一些实施方案中,培养在约25℃至约45℃的温度下进行。在其他实施方案中,培养在约30℃至约40℃的温度下进行。在进一步的实施方案中,培养在约35℃至约39℃的温度下进行。
第五方面,本发明提出了生产1,5-戊二胺的方法,所述方法包括步骤:在发酵培养基中对含有上述的基因工程菌进行培养以生产1,5-戊二胺。
第六方面,本发明提出了上述的重组核酸序列、重组表达载体或基因工程菌在生产1,5-戊二胺中的应用。
借由上述技术方案,本发明至少具有下列优点及有益效果:
本发明使用了包括piclR启动子和稳定期特异性启动子的串联启动子,当菌体生长到稳定期后才会启动赖氨酸脱羧酶基因的足量表达。与表达嗜热赖氨酸脱羧酶或温控启动子表达赖氨酸脱羧酶相比,本发明可以通过在染色体上插入所述串联启动子-赖氨酸脱羧酶基因序列,实现赖氨酸脱羧酶稳定和足量的表达,另外,该菌株去除了抗生素、特殊环境条件或其他诱导剂的使用,整个发酵培养过程自调控。
将其应用于1,5-戊二胺生产,可以显著降低细胞生长及L-赖氨酸生产阶段产生的1,5-戊二胺的细胞毒性,提高L-赖氨酸产量;发酵结束后,可以将L-赖氨酸几乎全部转化为1,5-戊二胺,从而实现了1,5-戊二胺产量的增加。同时使用了增加细胞耐受能力的蛋白和或促进戊二胺排出的蛋白,转化的同时将1,5-戊二胺输出胞外,综合显著地提高重组菌株发酵生产1,5-戊二胺的产量,实现了1,5-戊二胺的稳定、高效、低成本生产。
具体实施方式
下面通过实施例的方式进一步说明本发明,但并不因此将本发明限制在所述的实施例范围之中。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,按照常规方法和条件,或按照商品说明书选择。
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。应当理解,尽管本文示例了实施本发明的一些实施方案,根据本公开,本领域技术人员会认识到,可以进行众多修改而不脱离本发明的精神和预期范围。还应当理解,本文所用的术语用于仅描述具体实施方案并且不意在是限制性的,因为本发明的范围将仅由所附的权利要求及其等同物限定。
若未特别指明,实施例均按照常规实验条件,如Sambrook等分子克隆实验手册(Sambrook J&Russell DW,Molecular Cloning:a Laboratory Manual,2001),或按照制造厂商说明书建议的条件。
以下实施例中涉及到的PCR扩增、纯化、质粒提取、酶切、酶切产物连接、转化等的具体步骤、条件参数等均按所购相关酶和试剂的说明书进行。其中PCR扩增所用的DNA聚合酶、酶切所用的限制性内切酶、酶切产物连接所用的连接酶均购自宝生物工程(大连)有限公司。质粒提取试剂盒、DNA胶回收试剂盒、PCR纯化试剂盒均购自康宁生命科学(吴江)有限公司
Figure BDA0003288489240000091
引物均购自赛默飞世尔科技(中国)有限公司(INVITROGEN)。
以下实施例中涉及到的质粒转化方法如下:将连接产物加至100μl的大肠杆菌E.coli BL21(DE3)感受态细胞中,冰浴30min后,42℃热激90s。冰上孵育5min后加入1ml的LB。涂布至相对应的抗性平板上。
本发明中,培养基中L-赖氨酸和1,5-戊二胺的量可以通过核磁共振方法检测。
本发明中涉及到的百分号“%”,若未特别说明,是指质量百分比;但溶液的百分比,除另有规定外,是指100mL溶液中含有溶质的克数。
实施例中使用的宿主、过表达的蛋白质及质粒汇总如下表1所示。
表1.
Figure BDA0003288489240000092
/>
Figure BDA0003288489240000101
实施例1pBU质粒骨架的构建
以市售大肠杆菌K12 MG1655的基因组为模板,引物对upp-UF(SEQ ID NO:21)和upp-UR(SEQ ID NO:22)扩增出Upp-U片段(SEQ ID NO:23),引物对upp-DF(SEQ ID NO:24)和upp-DR(SEQ ID NO:25)扩增出Upp-500bp-D(SEQ ID NO:26)片段,引物对upp-F(SEQ IDNO:27)和upp-R(SEQ ID NO:28)扩增出Pupp-Upp-D片段(SEQ ID NO:29)。
以市售质粒pBR322为模板,引物对P1P2-tetA-F(SEQ ID NO:30)和P1P2-tetA-R(SEQ ID NO:31)扩增出质粒上包含P1P2启动子和tetA序列(即带抗性标记)的片段P1P2-tetA(SEQ ID NO:32)。将upp-U、upp-500bp-D、P1P2-tetA和Pupp-Upp-D片段PCR产物切胶回收后,与EcoRI和NaeI双酶切后的pBR322载体进行连接,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接。重组连接后的混合物转化至E.coli JM109(购自宝生物工程(大连)有限公司)感受态细胞中,在含有氨苄青霉素的LB平板上进行筛选,获得多个单菌落。通过菌落PCR和测序验证正确后,抽提质粒即得到包含Upp-U、Upp-500bp-D、P1P2-tetA和Pupp-Upp-D四个片段的质粒,该质粒命名为pBU载体。
实施例2赖氨酸脱羧酶CadA基因的克隆
以市售大肠杆菌K12 MG1655的基因组为模板,引物对cadA-F(序列如SEQ ID NO:33所示)和cadA-R(序列如SEQ ID NO:34所示)扩增出cadA基因片段(序列如SEQ ID NO:9所示),将cadA基因片段和EcoRI单酶切后的实施例1获得的pBU载体进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组,产生的质粒名为pBU-cadA。
以市售大肠杆菌K12 MG1655的基因组为模板,引物对piclR-F(序列如SEQ ID NO:35所示)和piclR-R(序列如SEQ ID NO:36所示)扩增出piclR启动子,序列如SEQ ID NO:83所示,当然在一些其他的实施方式中,根据来源的不同,pirclR序列还可以来源自谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)的如SEQ ID NO:84所示的piclR-Cg,或来自蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)的如SEQ ID NO:85所示的piclR-Ha。将piclR启动子片段和sacI单酶切后的pBU-cadA载体进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接。重组连接后的混合物转化至E.coli JM109(购自宝生物工程(大连)有限公司)感受态细胞中,在含有氨苄青霉素的LB平板上进行筛选,获得多个单菌落。通过菌落PCR和测序验证正确后,抽提质粒即得到pBU-piclR-cadA质粒,该质粒包含了piclR启动子控制下的cadA基因。
实施例3构建pBU-piclR-稳定期特异性启动子-cadA和pBU-稳定期特异性启动子-cadA质粒
以市售大肠杆菌K12 MG1655的基因组为模板,分别利用引物pcsiE-F(序列如SEQID No:37所示)/pcsiE-R(序列如SEQ ID No:38所示),pbolA-F(序列如SEQ ID No:39所示)/pbolA-R(序列如SEQ ID No:40所示),posmY-F(序列如SEQ ID No:41所示)/posmY-R(序列如SEQ ID No:42所示),pkatE-F(序列如SEQ ID No:43所示)/pkatE-R(序列如SEQ IDNo:44所示),pcsiE-F2(序列如SEQ ID No:45所示)/pcsiE-R(序列如SEQ ID No:38所示),pbolA-F2(序列如SEQ ID No:46所示)/pbolA-R(序列如SEQ ID No:40所示),posmY-F2(序列如SEQ ID No:47所示)/posmY-R(序列如SEQ ID No:42所示),pkatE-F2(序列如SEQ IDNo:48所示)/pkatE-R(序列如SEQ ID No:44所示);扩增稳定期特异性启动子pcsiE(序列如SEQ ID No:1所示),pbolA(序列如SEQ ID NO:2所示),posmY(序列如SEQ ID No:3所示),pkatE(序列如SEQ ID No:4所示),将PCR产物进行切胶回收后,分别与SacI酶切的实施例2获得的pBU-piclR-cadA和pBU-cadA质粒连接,得到含有4个串联启动子的质粒:pBU-piclR-pcsiE-cadA,pBU-piclR-pbolA-cadA,pBU-piclR-posmY-cadA,pBU-piclR-pkatE-cadA;和只含有4个稳定期特异性启动子的质粒:pBU-pcsiE-cadA,pBU-pbolA-cadA,pBU-posmY-cadA,和pBU-pkatE-cadA。
使用本领域常用基因序列合成方法分别合成p21、p22、p23、p24条启动子的双链DNA序列(5’-3’),然后分别连接至SacI酶切的实施例2获得的pBU-piclR-cadA和pBU-cadA质粒中。得到含有4个串联启动子的质粒pBU-piclR-p21-cadA,pBU-piclR-p22-cadA,pBU-piclR-p23-cadA,pBU-piclR-p24-cadA;和只含有4个稳定期特异性启动子的质粒:pBU-p21-cadA,pBU-p22-cadA,pBU-p23-cadA,pBU-p24-cadA。
实施例4构建1,5-戊二胺生产菌株并检测1,5-戊二胺产量
本发明中出发菌株采用可生产L-赖氨酸的大肠杆菌(Escherichia coli)M11-A3菌株,该菌株现已保藏于中国典型培养物保藏中心(CCTCC),地址:中国武汉,武汉大学,邮编430072,保藏编号CCTCC No:M2018456,保藏日期2018年7月6日。
首先,制备电转感受态,通过热激法转化市售pKD46质粒至M11-A3菌株感受态,含有100μg/ml氨苄青霉素的LB抗性平板中筛选培养后,挑取单菌落于5mL的LB液体培养基中,30℃,200rpm,培养8h;以1%的接种量转接到50mL含的LB液体培养基中培养至OD600约为0.15,加入1mL 2mM的L-阿拉伯糖溶液,继续培养至OD600为0.4~0.5;随即转入50mL离心管中冰浴20min,使其停止生长;4℃,4000rpm,离心10min,收集菌体;再用40mL预冷的无菌水洗涤菌体,离心收集细胞;重复上述步骤;用20mL预冷的10%甘油洗涤菌体,离心收集细胞;最后用500μL预冷的10%甘油重悬菌体,将得到的M11-A3/pKD46感受态进行分装备用。
以实施例3构建得到的16个质粒(如下表2所示)作为模板,使用引物对upp-UF/upp-R分别扩增获得可用于染色体上同源重组的片段,并进行切胶回收。每个片段分别转入受体菌M11A3/pKD46菌株中。涂布在含有10μg/ml四环素的LB抗性平板中进行筛选。针对每个质粒转化挑取3个单菌落至添加有氨苄青霉素的600μl LB培养基中,37℃培养8h后,取1μl菌体作为模板进行PCR验证筛选出正确的重组菌株,并甘油保种。
将甘油保种的16株菌株接种至含有0.1ug/mL 5-FU(5-氟尿嘧啶)的LB液体培养基中,37℃,200rpm,培养8h;取菌液分别划线至含有和不含有5-氟尿嘧啶的LB培养基平板,过夜培养。平板分析显示在含有5-氟尿嘧啶的平板上不能生长的菌株,从对应的不含5-氟尿嘧啶的平板上随机选取6个单克隆,取1μl菌体作为模板再次进行PCR验证,如果P1P2-tetA和Pupp-Upp片段已同时被移除,表明获得正确的重组株,将正确的重组株进行甘油保种。
上述重组株各选取3个转化子,与和出发株M11A3一同分别涂布不含抗生素的种子培养基(含有4wt%葡萄糖,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2%酵母提取物),于37℃培养过夜。然后,分别各挑取3个单克隆,利用5ml种子培养基(含有4wt%葡萄糖,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2wt%酵母提取物)进行培养,37℃、225rpm过夜。然后将每个菌株再分别转接至50ml新鲜的发酵培养基(30g/L葡萄糖,0.7wt%Ca(HCO3)2,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2%酵母提取物的培养基)于37℃、170rpm继续培养48h,利用核磁检测并计算各培养基中的1,5-戊二胺的含量(表2)。
表2核磁检测重组株与出发菌株相比的1,5-戊二胺产量及OD600
Figure BDA0003288489240000141
从表2可以看出,使用稳定期特异性启动子直接表达CadA的重组菌株pcsiE-cadA/M11A3,pbolA-cadA/M11A3,posmY-cadA/M11A3,pkatE-cadA/M11A3,p21-cadA/M11A3,p22-cadA/M11A3,p23-cadA/M11A3,p24-cadA/M11A3,发酵48h后,检测到0.88~2.23g/kg的L-赖氨酸和1.14~2.12g/kg的1,5-戊二胺,说明赖氨酸脱羧酶表达量偏少,仅将部分L-赖氨酸转化为1,5-戊二胺。
相比之下,使用串联启动子表达cadA的重组菌株piclR-pcsiE-cadA/M11A3,piclR-pbolA-cadA/M11A3,piclR-posmY-cadA/M11A3,piclR-pkatE-cadA/M11A3,piclR-p21-cadA/M11A3,piclR-p22-cadA/M11A3,piclR-p23-cadA/M11A3,piclR-p24-cadA/M11A3,通过测试发现在发酵48h的时候,使用了串联启动子表达cadA的各重组菌株与使用稳定期特异性启动子直接表达cadA的8个重组菌株相比,生成的1,5-戊二胺的产量有进一步的提高,同时L-赖氨酸近乎全部转化为1,5-戊二胺,其中piclR-p24-cadA/M11A3菌株的1,5戊二胺产量最高,最后积累了2.93g/kg以上的1,5-戊二胺,且几乎没有L-赖氨酸残留。
实施例5构建pBU-piclR-p24-plac-rpoS、pBU-piclR-p24-cadA-plac-crp、pBU-piclR-p24-cadA-plac-puuR、pBU-piclR-p24-plac-pepA、pBU-piclR-p24-cadA-plac-soxS质粒
以市售大肠杆菌K12 MG1655的基因组为模板,引物对rpoS-F(序列如SEQ ID NO:49所示)和rpoS-R(序列如SEQ ID NO:50所示)扩增出rpoS基因(序列如SEQ ID NO:11所示),引物对crp-F(序列如SEQ ID NO:51所示)和crp-R(序列如SEQ ID NO:52所示)扩增出crp基因(序列如SEQ ID NO:12所示)。引物对puuR-F(序列如SEQ ID NO:53所示)和puuR-R(序列如SEQ ID NO:54所示)扩增出puuR基因(序列如SEQ ID NO:13所示)。引物对pepA-F(序列如SEQ ID NO:55所示)和pepA-R(序列如SEQ ID NO:56所示)扩增出pepA基因(序列如SEQ ID NO:14所示)。引物对soxS-F(序列如SEQ ID NO:57所示)和soxS-R(序列如SEQ IDNO:58所示)扩增出soxS基因(序列如SEQ ID NO:15所示)。以市售pUC18质粒DNA为模板,引物对plac-F(序列如SEQ ID NO:59示)和plac-R(序列如SEQ ID NO:60所示)扩增出plac启动子(SEQ ID NO:61);
将plac启动子片段、rpos基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA和pBU-p24-cadA质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpos和pBU-p24-cadA-plac-rpos。
将plac启动子片段、crp基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA和pBU-p24-cadA质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-crp和pBU-p24-cadA-plac-crp。
将plac启动子片段、puuR基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA和pBU-p24-cadA质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-puuR和pBU-p24-cadA-plac-puuR。
将plac启动子片段、pepA基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA和pBU-p24-cadA质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为Pbu-piclR-p24-cadA-plac-pepA和pBU-p24-cadA-plac-pepA。
将plac启动子片段、soxS基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA和pBU-p24-cadA质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-soxS和pBU-p24-cadA-plac-soxS。
实施例6构建1,5-戊二胺生产菌株
以实施例5构建得到的5对质粒作为模板,使用引物对upp-UF/upp-R分别扩增获得可用于染色体上同源重组的片段,并进行切胶回收。每个片段分别转入受体菌M11-A3/pKD46菌株中。涂布在含有10μg/ml四环素的LB抗性平板中进行筛选。挑取12个单菌落至添加有氨苄青霉素的600μl LB培养基中,37℃培养8h后,取1μl菌体作为模板进行PCR验证筛选正确的重组株,并甘油保种。
将甘油保种的菌株接种至含有0.1ug/mL 5-FU(5-氟尿嘧啶)的LB液体培养基中,37℃,200rpm,培养8h;取菌液分别划线至含有和不含有5-氟尿嘧啶的LB培养基平板,过夜培养。平板分析显示在含有5-氟尿嘧啶的平板上不能生长的菌株,从对应的不含5-氟尿嘧啶的平板上选取6个单克隆,取1μl菌体作为模板再次进行PCR验证,如果P1P2-tetA和Pupp-Upp片段已同时被移除,表明获得正确的重组株,将正确的重组株进行甘油保种。
实施例7检测菌株1,5-戊二胺产量
自实施例6中获得的重组株各选取3个转化子,出发株M11A3、piclR-p24--cadA/M11A3和p24-cadA/M11A3作为对照菌株,分别涂布不含抗生素的种子培养基(含有4wt%葡萄糖,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2%酵母提取物),于37℃培养过夜。然后分别各挑取3个单克隆,利用5ml种子培养基(含有4wt%葡萄糖,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2wt%酵母提取物)进行培养,37℃、225rpm过夜。然后将每个菌株再分别转接至50ml新鲜的发酵培养基(30g/L葡萄糖,0.7%Ca(HCO3)2,0.1%KH2PO4,0.1%MgSO4,1.6%(NH4)2SO4,0.001%FeSO4,0.001%MnSO4,0.2%酵母提取物的培养基,此外一组摇瓶添加30g/kg的戊二胺)中于37℃、170rpm继续培养48h,取样测定添加或不添加戊二胺条件下每个菌株的OD600。未添加戊二胺的一组样品,利用核磁检测并计算各培养基中的戊二胺的含量(结果参见表3)。
如表3所示,添加戊二胺的摇瓶,稀释20倍后测定菌株的OD600,与M11-A3,pcilR-p24-cadA/M11A3,p24-cadA/M11A3重组菌株相比,表达增加细胞压力耐受能力的基因rpoS,crp,puuR,pepA以及soxS的10个新菌株,OD600受影响显著减少(即菌株OD600下降少),其中picR-p24-cadA-plac-rpoS/M11A3菌株OD600最高,说明其耐受戊二胺的能力最强。
如表4所示,表达促进1,5-戊二胺排出蛋白的菌株piclR-p24-cadA-plac-rpoS/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-crp/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-puuR/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-pepA/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-soxS/M11A3与piclR-p24-cadA/M11A3重组菌株相比,生成的1,5-戊二胺的产量有进一步的提高,同时L-赖氨酸近乎全部转化为1,5-戊二胺,其中piclR-p24-cadA-plac-rpoS/M11A3菌株1,5戊二胺产量最高,最后积累了3.68g/kg以上的1,5-戊二胺,且几乎没有L-赖氨酸残留。
表3添加及未添加戊二胺条件下测定菌株的OD600
菌株 OD600-未添加戊二胺 OD600-添加戊二胺
M11A3 0.826±0.007 0.521±0.008
piclR-cadA/M11A3 0.842±0.005 0.507±0.003
piclR-p24-cadA/M11A3 0.863±0.003 0.516±0.004
p24-cadA/M11A3 0.856±0.014 0.497±0.001
piclR-p24-cadA-plac-rpoS/M11A3 0.889±0.004 0.794±0.007
p24-cadA-plac-rpoS/M11A3 0.878±0.002 0.743±0.006
piclR-p24-cadA-plac-crp/M11A3 0.841±0.004 0.693±0.003
p24-cadA-plac-crp/M11A3 0.854±0.009 0.634±0.005
piclR-p24-cadA-plac-puuR/M11A3 0.839±0.005 0.675±0.005
p24-cadA-plac-puuR11A3 0.849±0.006 0.615±0.006
piclR-p24-cadA-plac-pepA/M11A3 0.875±0.009 0.733±0.008
p24-cadA-plac-pepA/M11A3 0.859±0.003 0.671±0.003
piclR-p24-cadA-plac-soxS/M11A3 0.847±0.002 0.690±0.007
p24-cadA-plac-soxS/M11A3 0.818±0.004 0.686±0.006
表4核磁检测重组株与出发菌株相比的戊二胺产量
Figure BDA0003288489240000181
Figure BDA0003288489240000191
实施例8构建pBU-piclR-p24-plac-rpoS-plac-ompA、pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompC、pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompF、pBU-piclR-p24-plac-rpoS-plac-ompW、pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompX质粒
以市售大肠杆菌K12 MG1655的基因组为模板,引物对ompA-F(序列如SEQ ID NO:73所示)和ompA-R(序列如SEQ ID NO:74所示)扩增出ompA基因(序列如SEQ ID NO:62所示),引物对ompC-F(序列如SEQ ID NO:75所示)和ompC-R(序列如SEQ ID NO:76所示)扩增出ompC基因(序列如SEQ ID NO:63所示)。引物对ompF-F(序列如SEQ ID NO:77所示)和ompF-R(序列如SEQ ID NO:78所示)扩增出ompF基因(序列如SEQ ID NO:64所示)。引物对ompW-F(序列如SEQ ID NO:79所示)和ompW-R(序列如SEQ ID NO:80所示)扩增出ompW基因(序列如SEQ ID NO:65所示)。引物对ompX-F(序列如SEQ ID NO:81所示)和ompX-R(序列如SEQ ID NO:82所示)扩增出ompX基因(序列如SEQ ID NO:66)所示。以市售pUC18质粒DNA为模板,引物对plac-F2(序列如SEQ ID NO:72)和plac-R(序列如SEQ ID NO:59所示)扩增出plac启动子(序列如SEQ ID NO:61所示);将plac启动子片段、ompA基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompA。
将plac启动子片段、ompC基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompC。
将plac启动子片段、ompF基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompF。
将plac启动子片段、ompW基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompW。
将plac启动子片段、ompX基因片段和XbaI单酶切后的pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS质粒进行切胶回收纯化,使用多片段一步法克隆试剂盒将基因片段和载体进行重组连接,产生的质粒名为pBU-piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompX。
实施例9构建1,5-戊二胺生产菌株
以实施例8构建得到的5个质粒作为模板,使用引物对upp-UF/upp-R分别扩增获得可用于染色体上同源重组的片段,并进行切胶回收。每个片段分别转入受体菌M11-A3/pKD46菌株中。涂布在含有10μg/ml四环素的LB抗性平板中进行筛选。挑取12个单菌落至添加有氨苄青霉素的600μl LB培养基中,37℃培养8h后,取1μl菌体作为模板进行PCR验证筛选正确的重组株,并甘油保种。
将甘油保种的菌株接种至含有0.1ug/mL 5-FU(5-氟尿嘧啶)的LB液体培养基中,37℃,200rpm,培养8h;取菌液分别划线至含有和不含有5-氟尿嘧啶的LB培养基平板,过夜培养。平板分析显示在含有5-氟尿嘧啶的平板上不能生长的菌株,从对应的不含5-氟尿嘧啶的平板上选取6个单克隆,取1μl菌体作为模板再次进行PCR验证,如果P1P2-tetA和Pupp-Upp片段已同时被移除,表明获得正确的重组株,将正确的重组株进行甘油保种。
实施例10检测菌株1,5-戊二胺产量
自实施例9中获得的重组株各选取3个转化子,出发株M11A3、piclR-p24--cadA/M11A3和piclR-p24-cadA-plac-rpoS/M11A3作为对照菌株,分别涂布不含抗生素的种子培养基(含有4wt%葡萄糖,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2wt%酵母提取物),于37℃培养过夜。然后分别各挑取3个单克隆,利用5ml种子培养基(含有4wt%葡萄糖,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2%酵母提取物)进行培养,37℃、225rpm过夜。然后将每个菌株再分别转接至50ml新鲜的发酵培养基(30g/L葡萄糖,0.7wt%Ca(HCO3)2,0.1wt%KH2PO4,0.1wt%MgSO4,1.6wt%(NH4)2SO4,0.001wt%FeSO4,0.001wt%MnSO4,0.2wt%酵母提取物的培养基)中于37℃、170rpm继续培养48h,利用核磁检测并计算各培养基中的戊二胺的含量。
如表5所示,表达促进1,5-戊二胺排出蛋白的菌株piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompA/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompC/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompF/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompW/M11A3,piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompX/M11A3与piclR-p24-cadA-plac-rpoS/M11A3重组菌株相比,生成的1,5-戊二胺的产量有进一步的提高,同时L-赖氨酸近乎全部转化为1,5-戊二胺,其中piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompA/M11A3菌株1,5戊二胺产量最高,最后积累了4.18g/kg以上的1,5-戊二胺,且几乎没有L-赖氨酸残留。
表5核磁检测重组株与出发菌株相比的戊二胺产量
Figure BDA0003288489240000221
虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之做一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 上海凯赛生物技术股份有限公司
CIBT美国公司(CIBT America Inc.)
凯赛(乌苏)生物材料有限公司
<120> 重组核酸序列、重组表达载体以及基因工程菌
<130> P21015902C
<160> 85
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 235
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 1
tgctttttcc gatcgtcacg gcgatgttta tcgcgaacag atggtggact ttatccttag 60
cgcgttgaat ccgcagaact aacccatgat cgctagcacg ataatcattc acaaaaccac 120
cttaagacat gctaatccac tggtcagaac agtttaagat gagaaaaatt ctgtgacgct 180
tgccaacatt tctgatgatt agcattccct tcgccatttc cttgagcaaa cttta 235
<210> 2
<211> 238
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 2
tgtttggtaa aaattcccgc catcataaca ttgccaacgg cgaggggaag tgggtaaggc 60
atgtaaattc atcatgttga cgaaataatc gcccctggta aaagaaacac tgatgcgagg 120
cctgtgtttc aatctttaaa tcagtaaact tcatacgctt gacggaaaaa ccaggacgaa 180
acctaaatat ttgttgttaa gctgcaatgg aaacggtaaa agcggctagt atttaaag 238
<210> 3
<211> 233
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 3
ctcgcttaca tcgctaccag catggtcaac ctgcgcctgg cacaggaacg ttatccggac 60
gttcagttcc accagacccg cgagcattaa ttcttgcctc cagggcgcgg tagccgctgc 120
gccctgtcaa tttcccttcc ttattagccg cttacggaat gttcttaaaa cattcacttt 180
tgcttatgtt ttcgctgata tcccgagcgg tttcaaaatt gtgatctata ttt 233
<210> 4
<211> 237
<212> DNA
<213> Escherichia coli
<400> 4
gcagaaatga ctctcccatc agtacaaacg caacatattt gccacgcagc atccagacat 60
cacgaaacga atccatcttt atcgcatgtt ctggcggcgc gggttccgtg cgtgggacat 120
agctaataat ctggcggttt tgctggcgga gcggtttctt cattactggc ttcactaaac 180
gcatattaaa aatcagaaaa actgtagttt agccgattta gcccctgtac gtcccgc 237
<210> 5
<211> 42
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p21
<400> 5
cactcccgcc tttaggggtc aaaattgttc tatactgtat tg 42
<210> 6
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p22
<400> 6
tcccgccaaa ttcccaattt tgttctatac tgtattg 37
<210> 7
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p23
<400> 7
tcccgccttt aggggtgaat tgttctatac tgaattg 37
<210> 8
<211> 37
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p24
<400> 8
tcccgccttt aggggctaat tgttctatac tgaaatg 37
<210> 9
<211> 2148
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cadA基因序列
<400> 9
atgaacgtta ttgcaatatt gaatcacatg ggggtttatt ttaaagaaga acccatccgt 60
gaacttcatc gcgcgcttga acgtctgaac ttccagattg tttacccgaa cgaccgtgac 120
gacttattaa aactgatcga aaacaatgcg cgtctgtgcg gcgttatttt tgactgggat 180
aaatataatc tcgagctgtg cgaagaaatt agcaaaatga acgagaacct gccgttgtac 240
gcgttcgcta atacgtattc cactctcgat gtaagcctga atgacctgcg tttacagatt 300
agcttctttg aatatgcgct gggtgctgct gaagatattg ctaataagat caagcagacc 360
actgacgaat atatcaacac tattctgcct ccgctgacta aagcactgtt taaatatgtt 420
cgtgaaggta aatatacttt ctgtactcct ggtcacatgg gcggtactgc attccagaaa 480
agcccggtag gtagcctgtt ctatgatttc tttggtccga ataccatgaa atctgatatt 540
tccatttcag tatctgaact gggttctctg ctggatcaca gtggtccaca caaagaagca 600
gaacagtata tcgctcgcgt ctttaacgca gaccgcagct acatggtgac caacggtact 660
tccactgcga acaaaattgt tggtatgtac tctgctccag caggcagcac cattctgatt 720
gaccgtaact gccacaaatc gctgacccac ctgatgatga tgagcgatgt tacgccaatc 780
tatttccgcc cgacccgtaa cgcttacggt attcttggtg gtatcccaca gagtgaattc 840
cagcacgcta ccattgctaa gcgcgtgaaa gaaacaccaa acgcaacctg gccggtacat 900
gctgtaatta ccaactctac ctatgatggt ctgctgtaca acaccgactt catcaagaaa 960
acactggatg tgaaatccat ccactttgac tccgcgtggg tgccttacac caacttctca 1020
ccgatttacg aaggtaaatg cggtatgagc ggtggccgtg tagaagggaa agtgatttac 1080
gaaacccagt ccactcacaa actgctggcg gcgttctctc aggcttccat gatccacgtt 1140
aaaggtgacg taaacgaaga aacctttaac gaagcctaca tgatgcacac caccacttct 1200
ccgcactacg gtatcgtggc gtccactgaa accgctgcgg cgatgatgaa aggcaatgca 1260
ggtaagcgtc tgatcaacgg ttctattgaa cgtgcgatca aattccgtaa agagatcaaa 1320
cgtctgagaa cggaatctga tggctggttc tttgatgtat ggcagccgga tcatatcgat 1380
acgactgaat gctggccgct gcgttctgac agcacctggc acggcttcaa aaacatcgat 1440
aacgagcaca tgtatcttga cccgatcaaa gtcaccctgc tgactccggg gatggaaaaa 1500
gacggcacca tgagcgactt tggtattccg gccagcatcg tggcgaaata cctcgacgaa 1560
catggcatcg ttgttgagaa aaccggtccg tataacctgc tgttcctgtt cagcatcggt 1620
atcgataaga ccaaagcact gagcctgctg cgtgctctga ctgactttaa acgtgcgttc 1680
gacctgaacc tgcgtgtgaa aaacatgctg ccgtctctgt atcgtgaaga tcctgaattc 1740
tatgaaaaca tgcgtattca ggaactggct cagaatatcc acaaactgat tgttcaccac 1800
aatctgccgg atctgatgta tcgcgcattt gaagtgctgc cgacgatggt aatgactccg 1860
tatgctgcat tccagaaaga gctgcacggt atgaccgaag aagtttacct cgacgaaatg 1920
gtaggtcgta ttaacgccaa tatgatcctt ccgtacccgc cgggagttcc tctggtaatg 1980
ccgggtgaaa tgatcaccga agaaagccgt ccggttctgg agttcctgca gatgctgtgt 2040
gaaatcggcg ctcactatcc gggctttgaa accgatattc acggtgcata ccgtcaggct 2100
gatggccgct ataccgttaa ggtattgaaa gaagaaagca aaaaataa 2148
<210> 10
<211> 715
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cadA蛋白序列
<400> 10
Met Asn Val Ile Ala Ile Leu Asn His Met Gly Val Tyr Phe Lys Glu
1 5 10 15
Glu Pro Ile Arg Glu Leu His Arg Ala Leu Glu Arg Leu Asn Phe Gln
20 25 30
Ile Val Tyr Pro Asn Asp Arg Asp Asp Leu Leu Lys Leu Ile Glu Asn
35 40 45
Asn Ala Arg Leu Cys Gly Val Ile Phe Asp Trp Asp Lys Tyr Asn Leu
50 55 60
Glu Leu Cys Glu Glu Ile Ser Lys Met Asn Glu Asn Leu Pro Leu Tyr
65 70 75 80
Ala Phe Ala Asn Thr Tyr Ser Thr Leu Asp Val Ser Leu Asn Asp Leu
85 90 95
Arg Leu Gln Ile Ser Phe Phe Glu Tyr Ala Leu Gly Ala Ala Glu Asp
100 105 110
Ile Ala Asn Lys Ile Lys Gln Thr Thr Asp Glu Tyr Ile Asn Thr Ile
115 120 125
Leu Pro Pro Leu Thr Lys Ala Leu Phe Lys Tyr Val Arg Glu Gly Lys
130 135 140
Tyr Thr Phe Cys Thr Pro Gly His Met Gly Gly Thr Ala Phe Gln Lys
145 150 155 160
Ser Pro Val Gly Ser Leu Phe Tyr Asp Phe Phe Gly Pro Asn Thr Met
165 170 175
Lys Ser Asp Ile Ser Ile Ser Val Ser Glu Leu Gly Ser Leu Leu Asp
180 185 190
His Ser Gly Pro His Lys Glu Ala Glu Gln Tyr Ile Ala Arg Val Phe
195 200 205
Asn Ala Asp Arg Ser Tyr Met Val Thr Asn Gly Thr Ser Thr Ala Asn
210 215 220
Lys Ile Val Gly Met Tyr Ser Ala Pro Ala Gly Ser Thr Ile Leu Ile
225 230 235 240
Asp Arg Asn Cys His Lys Ser Leu Thr His Leu Met Met Met Ser Asp
245 250 255
Val Thr Pro Ile Tyr Phe Arg Pro Thr Arg Asn Ala Tyr Gly Ile Leu
260 265 270
Gly Gly Ile Pro Gln Ser Glu Phe Gln His Ala Thr Ile Ala Lys Arg
275 280 285
Val Lys Glu Thr Pro Asn Ala Thr Trp Pro Val His Ala Val Ile Thr
290 295 300
Asn Ser Thr Tyr Asp Gly Leu Leu Tyr Asn Thr Asp Phe Ile Lys Lys
305 310 315 320
Thr Leu Asp Val Lys Ser Ile His Phe Asp Ser Ala Trp Val Pro Tyr
325 330 335
Thr Asn Phe Ser Pro Ile Tyr Glu Gly Lys Cys Gly Met Ser Gly Gly
340 345 350
Arg Val Glu Gly Lys Val Ile Tyr Glu Thr Gln Ser Thr His Lys Leu
355 360 365
Leu Ala Ala Phe Ser Gln Ala Ser Met Ile His Val Lys Gly Asp Val
370 375 380
Asn Glu Glu Thr Phe Asn Glu Ala Tyr Met Met His Thr Thr Thr Ser
385 390 395 400
Pro His Tyr Gly Ile Val Ala Ser Thr Glu Thr Ala Ala Ala Met Met
405 410 415
Lys Gly Asn Ala Gly Lys Arg Leu Ile Asn Gly Ser Ile Glu Arg Ala
420 425 430
Ile Lys Phe Arg Lys Glu Ile Lys Arg Leu Arg Thr Glu Ser Asp Gly
435 440 445
Trp Phe Phe Asp Val Trp Gln Pro Asp His Ile Asp Thr Thr Glu Cys
450 455 460
Trp Pro Leu Arg Ser Asp Ser Thr Trp His Gly Phe Lys Asn Ile Asp
465 470 475 480
Asn Glu His Met Tyr Leu Asp Pro Ile Lys Val Thr Leu Leu Thr Pro
485 490 495
Gly Met Glu Lys Asp Gly Thr Met Ser Asp Phe Gly Ile Pro Ala Ser
500 505 510
Ile Val Ala Lys Tyr Leu Asp Glu His Gly Ile Val Val Glu Lys Thr
515 520 525
Gly Pro Tyr Asn Leu Leu Phe Leu Phe Ser Ile Gly Ile Asp Lys Thr
530 535 540
Lys Ala Leu Ser Leu Leu Arg Ala Leu Thr Asp Phe Lys Arg Ala Phe
545 550 555 560
Asp Leu Asn Leu Arg Val Lys Asn Met Leu Pro Ser Leu Tyr Arg Glu
565 570 575
Asp Pro Glu Phe Tyr Glu Asn Met Arg Ile Gln Glu Leu Ala Gln Asn
580 585 590
Ile His Lys Leu Ile Val His His Asn Leu Pro Asp Leu Met Tyr Arg
595 600 605
Ala Phe Glu Val Leu Pro Thr Met Val Met Thr Pro Tyr Ala Ala Phe
610 615 620
Gln Lys Glu Leu His Gly Met Thr Glu Glu Val Tyr Leu Asp Glu Met
625 630 635 640
Val Gly Arg Ile Asn Ala Asn Met Ile Leu Pro Tyr Pro Pro Gly Val
645 650 655
Pro Leu Val Met Pro Gly Glu Met Ile Thr Glu Glu Ser Arg Pro Val
660 665 670
Leu Glu Phe Leu Gln Met Leu Cys Glu Ile Gly Ala His Tyr Pro Gly
675 680 685
Phe Glu Thr Asp Ile His Gly Ala Tyr Arg Gln Ala Asp Gly Arg Tyr
690 695 700
Thr Val Lys Val Leu Lys Glu Glu Ser Lys Lys
705 710 715
<210> 11
<211> 993
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rpoS的基因序列
<400> 11
atgagtcaga atacgctgaa agttcatgat ttaaatgaag atgcggaatt tgatgagaac 60
ggagttgagg tttttgacga aaaggcctta gtagaacagg aacccagtga taacgatttg 120
gccgaagagg aactgttatc gcagggagcc acacagcgtg tgttggacgc gactcagctt 180
taccttggtg agattggtta ttcaccactg ttaacggccg aagaagaagt ttattttgcg 240
cgtcgcgcac tgcgtggaga tgtcgcctct cgccgccgga tgatcgagag taacttgcgt 300
ctggtggtaa aaattgcccg ccgttatggc aatcgtggtc tggcgttgct ggaccttatc 360
gaagagggca acctggggct gatccgcgcg gtagagaagt ttgacccgga acgtggtttc 420
cgcttctcaa catacgcaac ctggtggatt cgccagacga ttgaacgggc gattatgaac 480
caaacccgta ctattcgttt gccgattcac atcgtaaagg agctgaacgt ttacctgcga 540
accgcacgtg agttgtccca taagctggac catgaaccaa gtgcggaaga gatcgcagag 600
caactggata agccagttga tgacgtcagc cgtatgcttc gtcttaacga gcgcattacc 660
tcggtagaca ccccgctggg tggtgattcc gaaaaagcgt tgctggacat cctggccgat 720
gaaaaagaga acggtccgga agataccacg caagatgacg atatgaagca gagcatcgtc 780
aaatggctgt tcgagctgaa cgccaaacag cgtgaagtgc tggcacgtcg attcggtttg 840
ctggggtacg aagcggcaac actggaagat gtaggtcgtg aaattggcct cacccgtgaa 900
cgtgttcgcc agattcaggt tgaaggcctg cgccgtttgc gcgaaatcct gcaaacgcag 960
gggctgaata tcgaagcgct gttccgcgag taa 993
<210> 12
<211> 633
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> crp的基因序列
<400> 12
atggtgcttg gcaaaccgca aacagacccg actctcgaat ggttcttgtc tcattgccac 60
attcataagt acccatccaa gagcacgctt attcaccagg gtgaaaaagc ggaaacgctg 120
tactacatcg ttaaaggctc tgtggcagtg ctgatcaaag acgaagaggg taaagaaatg 180
atcctctcct atctgaatca gggtgatttt attggcgaac tgggcctgtt tgaagagggc 240
caggaacgta gcgcatgggt acgtgcgaaa accgcctgtg aagtggctga aatttcgtac 300
aaaaaatttc gccaattgat tcaggtaaac ccggacattc tgatgcgttt gtctgcacag 360
atggcgcgtc gtctgcaagt cacttcagag aaagtgggca acctggcgtt cctcgacgtg 420
acgggccgca ttgcacagac tctgctgaat ctggcaaaac aaccagacgc tatgactcac 480
ccggacggta tgcaaatcaa aattacccgt caggaaattg gtcagattgt cggctgttct 540
cgtgaaaccg tgggacgcat tctgaagatg ctggaagatc agaacctgat ctccgcacac 600
ggtaaaacca tcgtcgttta cggcactcgt taa 633
<210> 13
<211> 558
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> puuR的基因序列
<400> 13
atgagtgatg agggactggc gccaggaaaa cgcttgtcgg aaatccgcca gcagcagggg 60
ctttcacaac gtcgtgccgc cgaactctcc gggctgactc acagtgctat cagtacgata 120
gaacaagata aagtcagccc tgccatcagt acgctgcaaa agctgctgaa ggtgtatggt 180
ctgtcactct cggaattctt ttccgagccg gaaaaacctg atgagccgca ggtcgtcatt 240
aatcaggacg acttaattga gatgggtagt cagggtgtgt caatgaagct ggttcataac 300
ggtaacccga atcgcacgct ggcgatgatc tttgaaacgt accagccggg cacaaccact 360
ggggaaagaa ttaagcatca gggtgaggaa ataggcactg tactggaagg tgaaattgtt 420
ctgacgatta atggtcagga ttaccacctc gtcgcggggc aaagttatgc cattaatacc 480
ggcatcccgc acagtttcag taatacgtcg gcaggtattt gccgaattat cagcgcccat 540
acgcccacca cgttttaa 558
<210> 14
<211> 1512
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pepA的基因序列
<400> 14
atggagttta gtgtaaaaag cggtagcccg gagaaacagc ggagtgcctg catcgtcgtg 60
ggcgtcttcg aaccacgtcg cctttctccg attgcagaac agctcgataa aatcagcgat 120
gggtacatca gcgccctgct acgtcggggc gaactggaag gaaaaccggg gcagacattg 180
ttgctgcacc atgttccgaa tgtactttcc gagcgaattc tccttattgg ttgcggcaaa 240
gaacgtgagc tggatgagcg tcagtacaag caggttattc agaaaaccat taatacgctg 300
aatgatactg gctcaatgga agcggtctgc tttctgactg agctgcacgt taaaggccgt 360
aacaactact ggaaagtgcg tcaggctgtc gagacggcaa aagagacgct ctacagtttc 420
gatcagctga aaacgaacaa gagcgaaccg cgtcgtccgc tgcgtaagat ggtgttcaac 480
gtgccgaccc gccgtgaact gaccagcggt gagcgcgcga tccagcacgg tctggcgatt 540
gccgccggga ttaaagcagc aaaagatctc ggcaatatgc cgccgaatat ctgtaacgcc 600
gcttacctcg cttcacaagc gcgccagctg gctgacagct acagcaagaa tgtcatcacc 660
cgcgttatcg gcgaacagca gatgaaagag ctggggatgc attcctatct ggcggtcggt 720
cagggttcgc aaaacgaatc gctgatgtcg gtgattgagt acaaaggcaa cgcgtcggaa 780
gatgcacgcc caatcgtgct ggtgggtaaa ggtttaacct tcgactccgg cggtatctcg 840
atcaagcctt cagaaggcat ggatgagatg aagtacgata tgtgcggtgc ggcagcggtt 900
tacggcgtga tgcggatggt cgcggagcta caactgccga ttaacgttat cggcgtgttg 960
gcaggctgcg aaaacatgcc tggcggacga gcctatcgtc cgggcgatgt gttaaccacc 1020
atgtccggtc aaaccgttga agtgctgaac accgacgctg aaggccgcct ggtactgtgc 1080
gacgtgttaa cttacgttga gcgttttgag ccggaagcgg tgattgacgt ggcgacgctg 1140
accggtgcct gcgtgatcgc gctgggtcat catattactg gtctgatggc gaaccataat 1200
ccgctggccc atgaactgat tgccgcgtct gaacaatccg gtgaccgcgc atggcgctta 1260
ccgctgggtg acgagtatca ggaacaactg gagtccaatt ttgccgatat ggcgaacatt 1320
ggcggtcgtc ctggtggggc gattaccgca ggttgcttcc tgtcacgctt tacccgtaag 1380
tacaactggg cgcacctgga tatcgccggt accgcctggc gttctggtaa agcaaaaggc 1440
gccaccggtc gtccggtagc gttgctggca cagttcctgt taaaccgcgc tgggtttaac 1500
ggcgaagagt aa 1512
<210> 15
<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> soxS的基因序列
<400> 15
atgtcccatc agaaaattat tcaggatctt atcgcatgga ttgacgagca tattgaccag 60
ccgcttaaca ttgatgtagt cgcaaaaaaa tcaggctatt caaagtggta cttgcaacga 120
atgttccgca cggtgacgca tcagacgctt ggcgattaca ttcgccaacg ccgcctgtta 180
ctggccgccg ttgagttgcg caccaccgag cgtccgattt ttgatatcgc aatggacctg 240
ggttatgtct cgcagcagac cttctcccgc gttttccgtc ggcagtttga tcgcactccc 300
agcgattatc gccaccgcct gtaa 324
<210> 16
<211> 330
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> RpoS
<400> 16
Met Ser Gln Asn Thr Leu Lys Val His Asp Leu Asn Glu Asp Ala Glu
1 5 10 15
Phe Asp Glu Asn Gly Val Glu Val Phe Asp Glu Lys Ala Leu Val Glu
20 25 30
Gln Glu Pro Ser Asp Asn Asp Leu Ala Glu Glu Glu Leu Leu Ser Gln
35 40 45
Gly Ala Thr Gln Arg Val Leu Asp Ala Thr Gln Leu Tyr Leu Gly Glu
50 55 60
Ile Gly Tyr Ser Pro Leu Leu Thr Ala Glu Glu Glu Val Tyr Phe Ala
65 70 75 80
Arg Arg Ala Leu Arg Gly Asp Val Ala Ser Arg Arg Arg Met Ile Glu
85 90 95
Ser Asn Leu Arg Leu Val Val Lys Ile Ala Arg Arg Tyr Gly Asn Arg
100 105 110
Gly Leu Ala Leu Leu Asp Leu Ile Glu Glu Gly Asn Leu Gly Leu Ile
115 120 125
Arg Ala Val Glu Lys Phe Asp Pro Glu Arg Gly Phe Arg Phe Ser Thr
130 135 140
Tyr Ala Thr Trp Trp Ile Arg Gln Thr Ile Glu Arg Ala Ile Met Asn
145 150 155 160
Gln Thr Arg Thr Ile Arg Leu Pro Ile His Ile Val Lys Glu Leu Asn
165 170 175
Val Tyr Leu Arg Thr Ala Arg Glu Leu Ser His Lys Leu Asp His Glu
180 185 190
Pro Ser Ala Glu Glu Ile Ala Glu Gln Leu Asp Lys Pro Val Asp Asp
195 200 205
Val Ser Arg Met Leu Arg Leu Asn Glu Arg Ile Thr Ser Val Asp Thr
210 215 220
Pro Leu Gly Gly Asp Ser Glu Lys Ala Leu Leu Asp Ile Leu Ala Asp
225 230 235 240
Glu Lys Glu Asn Gly Pro Glu Asp Thr Thr Gln Asp Asp Asp Met Lys
245 250 255
Gln Ser Ile Val Lys Trp Leu Phe Glu Leu Asn Ala Lys Gln Arg Glu
260 265 270
Val Leu Ala Arg Arg Phe Gly Leu Leu Gly Tyr Glu Ala Ala Thr Leu
275 280 285
Glu Asp Val Gly Arg Glu Ile Gly Leu Thr Arg Glu Arg Val Arg Gln
290 295 300
Ile Gln Val Glu Gly Leu Arg Arg Leu Arg Glu Ile Leu Gln Thr Gln
305 310 315 320
Gly Leu Asn Ile Glu Ala Leu Phe Arg Glu
325 330
<210> 17
<211> 210
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CRP
<400> 17
Met Val Leu Gly Lys Pro Gln Thr Asp Pro Thr Leu Glu Trp Phe Leu
1 5 10 15
Ser His Cys His Ile His Lys Tyr Pro Ser Lys Ser Thr Leu Ile His
20 25 30
Gln Gly Glu Lys Ala Glu Thr Leu Tyr Tyr Ile Val Lys Gly Ser Val
35 40 45
Ala Val Leu Ile Lys Asp Glu Glu Gly Lys Glu Met Ile Leu Ser Tyr
50 55 60
Leu Asn Gln Gly Asp Phe Ile Gly Glu Leu Gly Leu Phe Glu Glu Gly
65 70 75 80
Gln Glu Arg Ser Ala Trp Val Arg Ala Lys Thr Ala Cys Glu Val Ala
85 90 95
Glu Ile Ser Tyr Lys Lys Phe Arg Gln Leu Ile Gln Val Asn Pro Asp
100 105 110
Ile Leu Met Arg Leu Ser Ala Gln Met Ala Arg Arg Leu Gln Val Thr
115 120 125
Ser Glu Lys Val Gly Asn Leu Ala Phe Leu Asp Val Thr Gly Arg Ile
130 135 140
Ala Gln Thr Leu Leu Asn Leu Ala Lys Gln Pro Asp Ala Met Thr His
145 150 155 160
Pro Asp Gly Met Gln Ile Lys Ile Thr Arg Gln Glu Ile Gly Gln Ile
165 170 175
Val Gly Cys Ser Arg Glu Thr Val Gly Arg Ile Leu Lys Met Leu Glu
180 185 190
Asp Gln Asn Leu Ile Ser Ala His Gly Lys Thr Ile Val Val Tyr Gly
195 200 205
Thr Arg
210
<210> 18
<211> 185
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PuuR
<400> 18
Met Ser Asp Glu Gly Leu Ala Pro Gly Lys Arg Leu Ser Glu Ile Arg
1 5 10 15
Gln Gln Gln Gly Leu Ser Gln Arg Arg Ala Ala Glu Leu Ser Gly Leu
20 25 30
Thr His Ser Ala Ile Ser Thr Ile Glu Gln Asp Lys Val Ser Pro Ala
35 40 45
Ile Ser Thr Leu Gln Lys Leu Leu Lys Val Tyr Gly Leu Ser Leu Ser
50 55 60
Glu Phe Phe Ser Glu Pro Glu Lys Pro Asp Glu Pro Gln Val Val Ile
65 70 75 80
Asn Gln Asp Asp Leu Ile Glu Met Gly Ser Gln Gly Val Ser Met Lys
85 90 95
Leu Val His Asn Gly Asn Pro Asn Arg Thr Leu Ala Met Ile Phe Glu
100 105 110
Thr Tyr Gln Pro Gly Thr Thr Thr Gly Glu Arg Ile Lys His Gln Gly
115 120 125
Glu Glu Ile Gly Thr Val Leu Glu Gly Glu Ile Val Leu Thr Ile Asn
130 135 140
Gly Gln Asp Tyr His Leu Val Ala Gly Gln Ser Tyr Ala Ile Asn Thr
145 150 155 160
Gly Ile Pro His Ser Phe Ser Asn Thr Ser Ala Gly Ile Cys Arg Ile
165 170 175
Ile Ser Ala His Thr Pro Thr Thr Phe
180 185
<210> 19
<211> 503
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PepA
<400> 19
Met Glu Phe Ser Val Lys Ser Gly Ser Pro Glu Lys Gln Arg Ser Ala
1 5 10 15
Cys Ile Val Val Gly Val Phe Glu Pro Arg Arg Leu Ser Pro Ile Ala
20 25 30
Glu Gln Leu Asp Lys Ile Ser Asp Gly Tyr Ile Ser Ala Leu Leu Arg
35 40 45
Arg Gly Glu Leu Glu Gly Lys Pro Gly Gln Thr Leu Leu Leu His His
50 55 60
Val Pro Asn Val Leu Ser Glu Arg Ile Leu Leu Ile Gly Cys Gly Lys
65 70 75 80
Glu Arg Glu Leu Asp Glu Arg Gln Tyr Lys Gln Val Ile Gln Lys Thr
85 90 95
Ile Asn Thr Leu Asn Asp Thr Gly Ser Met Glu Ala Val Cys Phe Leu
100 105 110
Thr Glu Leu His Val Lys Gly Arg Asn Asn Tyr Trp Lys Val Arg Gln
115 120 125
Ala Val Glu Thr Ala Lys Glu Thr Leu Tyr Ser Phe Asp Gln Leu Lys
130 135 140
Thr Asn Lys Ser Glu Pro Arg Arg Pro Leu Arg Lys Met Val Phe Asn
145 150 155 160
Val Pro Thr Arg Arg Glu Leu Thr Ser Gly Glu Arg Ala Ile Gln His
165 170 175
Gly Leu Ala Ile Ala Ala Gly Ile Lys Ala Ala Lys Asp Leu Gly Asn
180 185 190
Met Pro Pro Asn Ile Cys Asn Ala Ala Tyr Leu Ala Ser Gln Ala Arg
195 200 205
Gln Leu Ala Asp Ser Tyr Ser Lys Asn Val Ile Thr Arg Val Ile Gly
210 215 220
Glu Gln Gln Met Lys Glu Leu Gly Met His Ser Tyr Leu Ala Val Gly
225 230 235 240
Gln Gly Ser Gln Asn Glu Ser Leu Met Ser Val Ile Glu Tyr Lys Gly
245 250 255
Asn Ala Ser Glu Asp Ala Arg Pro Ile Val Leu Val Gly Lys Gly Leu
260 265 270
Thr Phe Asp Ser Gly Gly Ile Ser Ile Lys Pro Ser Glu Gly Met Asp
275 280 285
Glu Met Lys Tyr Asp Met Cys Gly Ala Ala Ala Val Tyr Gly Val Met
290 295 300
Arg Met Val Ala Glu Leu Gln Leu Pro Ile Asn Val Ile Gly Val Leu
305 310 315 320
Ala Gly Cys Glu Asn Met Pro Gly Gly Arg Ala Tyr Arg Pro Gly Asp
325 330 335
Val Leu Thr Thr Met Ser Gly Gln Thr Val Glu Val Leu Asn Thr Asp
340 345 350
Ala Glu Gly Arg Leu Val Leu Cys Asp Val Leu Thr Tyr Val Glu Arg
355 360 365
Phe Glu Pro Glu Ala Val Ile Asp Val Ala Thr Leu Thr Gly Ala Cys
370 375 380
Val Ile Ala Leu Gly His His Ile Thr Gly Leu Met Ala Asn His Asn
385 390 395 400
Pro Leu Ala His Glu Leu Ile Ala Ala Ser Glu Gln Ser Gly Asp Arg
405 410 415
Ala Trp Arg Leu Pro Leu Gly Asp Glu Tyr Gln Glu Gln Leu Glu Ser
420 425 430
Asn Phe Ala Asp Met Ala Asn Ile Gly Gly Arg Pro Gly Gly Ala Ile
435 440 445
Thr Ala Gly Cys Phe Leu Ser Arg Phe Thr Arg Lys Tyr Asn Trp Ala
450 455 460
His Leu Asp Ile Ala Gly Thr Ala Trp Arg Ser Gly Lys Ala Lys Gly
465 470 475 480
Ala Thr Gly Arg Pro Val Ala Leu Leu Ala Gln Phe Leu Leu Asn Arg
485 490 495
Ala Gly Phe Asn Gly Glu Glu
500
<210> 20
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SoxS
<400> 20
Met Ser His Gln Lys Ile Ile Gln Asp Leu Ile Ala Trp Ile Asp Glu
1 5 10 15
His Ile Asp Gln Pro Leu Asn Ile Asp Val Val Ala Lys Lys Ser Gly
20 25 30
Tyr Ser Lys Trp Tyr Leu Gln Arg Met Phe Arg Thr Val Thr His Gln
35 40 45
Thr Leu Gly Asp Tyr Ile Arg Gln Arg Arg Leu Leu Leu Ala Ala Val
50 55 60
Glu Leu Arg Thr Thr Glu Arg Pro Ile Phe Asp Ile Ala Met Asp Leu
65 70 75 80
Gly Tyr Val Ser Gln Gln Thr Phe Ser Arg Val Phe Arg Arg Gln Phe
85 90 95
Asp Arg Thr Pro Ser Asp Tyr Arg His Arg Leu
100 105
<210> 21
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> upp-UF
<400> 21
aggcgtatca cgaggccctt tcgtcttcaa aaacccgcga catcgtaatc 50
<210> 22
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> upp-UR
<400> 22
ggattatacc tcctttcttc aaggcg 26
<210> 23
<211> 790
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Upp-U
<400> 23
aggcgtatca cgaggccctt tcgtcttcaa aaacccgcga catcgtaatc ctcaccgtga 60
tacatccccg gcatttctgc cgtttcgcca cccaccagtg aacagcctga ttgcagacaa 120
ccttccgcaa tgccgctgat caccgctgaa gcggtatcaa catccagttt tccggttgcg 180
taatagtcga ggaaaaacag cggctctgca ccttgcacca ccaggtcatt aacgcacatg 240
gcgaccagat caataccaat ggtgtcgtga cgttttaagt ccattgccag acgcagcttg 300
gtacctacgc cgtcagtgcc agaaaccagc acgggttcac gatatttttg cggcaatgca 360
cacagcgcac cgaagccgcc cagaccgccc atcacttccg gacgacgcgt tttcttcact 420
acgcctttga ttcttccaac cagagcatta cccgcgtcaa tatcaacacc ggcatctttg 480
tagctaagag aggttttatc ggtcactgct tgggtcccca cgcgttactt gcggtagaaa 540
aataaaattc ggcgcaattc taacagggaa agcaaacgtt tgcgagactg ctttacacaa 600
cctttttgca cgtcttttcc ccaggcgcgc ggcgaaagaa gacttgtgcc agggtaaagg 660
ttagttttcg gatggaataa tcttctttca taaccatctg aatataaaat aactttatct 720
caaaccgtta tcattttgac taaagtcaac gaaaagaata ttgccgcctt gaagaaagga 780
ggtataatcc 790
<210> 24
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> upp-DF
<400> 24
tgccgccttg aagaaaggag gtataatccg aattcagtcg gctttttttt gagtaaagcg 60
<210> 25
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> upp-DR
<400> 25
ccgcattaaa gcttatcgat gataagctgt caaacatgac cgggagtaaa cccgccata 59
<210> 26
<211> 574
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Upp-500bp-D
<400> 26
tgccgccttg aagaaaggag gtataatccg aattcagtcg gctttttttt gagtaaagcg 60
cctataacac ataatacaga ggataatact atgacgcgcc gtgctatcgg ggtgagtgaa 120
agaccgccac ttttacagac aatcccgctt agtttgcaac atttgttcgc catgtttggt 180
gcaaccgtcc tggtgcccgt cttatttcat attaacccgg cgactgtact gttatttaac 240
ggtattggaa cgctgctgta tctcttcatc tgtaaaggga aaattccggc ttatcttggt 300
tccagctttg cctttatttc accggtattg ttactgttgc cgttagggta tgaagtcgcg 360
ctgggcggct ttattatgtg cggcgtgctg ttctgcctgg tttcttttat cgtgaagaaa 420
gcggggaccg gctggctgga cgtgctgttt ccacctgcgg caatgggcgc aatcgttgcc 480
gtcatcggtc tggagctggc gggcgtagct gccggtatgg cgggtttact cccggtcatg 540
tttgacagct tatcatcgat aagctttaat gcgg 574
<210> 27
<211> 59
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> upp-F
<400> 27
tggagccggg ccacctcgac ctgaatggaa gccggcgtcg attttttttg tggctgccc 59
<210> 28
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> upp-R
<400> 28
tggagtggtg aatccgttag cgaggtgccg ctttgttgta atccactttc g 51
<210> 29
<211> 1905
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pupp-UPP-D
<400> 29
tggagccggg ccacctcgac ctgaatggaa gccggcgtcg attttttttg tggctgcccc 60
tcaaaggaga aagagtatga agatcgtgga agtcaaacac ccactcgtca aacacaagct 120
gggactgatg cgtgagcaag atatcagcac caagcgcttt cgcgaactcg cttccgaagt 180
gggtagcctg ctgacttacg aagcgaccgc cgacctcgaa acggaaaaag taactatcga 240
aggctggaac ggcccggtag aaatcgacca gatcaaaggt aagaaaatta ccgttgtgcc 300
aattctgcgt gcgggtcttg gtatgatgga cggtgtgctg gaaaacgttc cgagcgcgcg 360
catcagcgtt gtcggtatgt accgtaatga agaaacgctg gagccggtac cgtacttcca 420
gaaactggtt tctaacatcg atgagcgtat ggcgctgatc gttgacccaa tgctggcaac 480
cggtggttcc gttatcgcga ccatcgacct gctgaaaaaa gcgggctgca gcagcatcaa 540
agttctggtg ctggtagctg cgccagaagg tatcgctgcg ctggaaaaag cgcacccgga 600
cgtcgaactg tataccgcat cgattgatca gggactgaac gagcacggat acattattcc 660
gggcctcggc gatgccggtg acaaaatctt tggtacgaaa taaagaataa aaataattaa 720
agccgacttt aagagtcggc ttttttttga gtaaagcgcc tataacacat aatacagagg 780
ataatactat gacgcgccgt gctatcgggg tgagtgaaag accgccactt ttacagacaa 840
tcccgcttag tttgcaacat ttgttcgcca tgtttggtgc aaccgtcctg gtgcccgtct 900
tatttcatat taacccggcg actgtactgt tatttaacgg tattggaacg ctgctgtatc 960
tcttcatctg taaagggaaa attccggctt atcttggttc cagctttgcc tttatttcac 1020
cggtattgtt actgttgccg ttagggtatg aagtcgcgct gggcggcttt attatgtgcg 1080
gcgtgctgtt ctgcctggtt tcttttatcg tgaagaaagc ggggaccggc tggctggacg 1140
tgctgtttcc acctgcggca atgggcgcaa tcgttgccgt catcggtctg gagctggcgg 1200
gcgtagctgc cggtatggcg ggtttactcc cggctgaagg gcaaacgcca gactccaaaa 1260
ccatcatcat ctctattacc accctggcgg tcacggtttt aggttccgtg ctgtttcgtg 1320
gtttcctggc aattatcccg attttaattg gcgtgctggt ggggtacgcg ctctctttcg 1380
caatgggaat tgtcgatacc acgccgatta ttaatgctca ctggtttgcg ctgccaaccc 1440
tctatacgcc gcgcttcgag tggtttgcca ttctgactat tctgccagcg gcgttagtgg 1500
ttattgccga acacgtaggg cacctggtag taacggctaa tatcgtcaaa aaagatctgc 1560
tgcgcgatcc aggtctgcac cgttcgatgt ttgctaatgg cttgtcgacc gtgatttccg 1620
gcttctttgg ctctacgcca aatactactt acggagaaaa cattggcgtg atggcgatca 1680
cccgtgttta cagtacctgg gttatcggcg gggcggcgat tttcgctatc ctgctttcct 1740
gcgtcggtaa actggctgcc gctatccaga tgatcccatt gccggtgatg ggcggcgttt 1800
cgctgctgct ttatggtgtc atcggtgctt ccggtattcg tgttttgatc gaatcgaaag 1860
tggattacaa caaagcggca cctcgctaac ggattcacca ctcca 1905
<210> 30
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1P2-tetA-F
<400> 30
tcatgtttga cagcttatca tcgataagc 29
<210> 31
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1P2-tetA-R
<400> 31
gccggcttcc attcaggtcg 20
<210> 32
<211> 1285
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> P1P2-tetA
<400> 32
tcatgtttga cagcttatca tcgataagct ttaatgcggt agtttatcac agttaaattg 60
ctaacgcagt caggcaccgt gtatgaaatc taacaatgcg ctcatcgtca tcctcggcac 120
cgtcaccctg gatgctgtag gcataggctt ggttatgccg gtactgccgg gcctcttgcg 180
ggatatcgtc cattccgaca gcatcgccag tcactatggc gtgctgctag cgctatatgc 240
gttgatgcaa tttctatgcg cacccgttct cggagcactg tccgaccgct ttggccgccg 300
cccagtcctg ctcgcttcgc tacttggagc cactatcgac tacgcgatca tggcgaccac 360
acccgtcctg tggatcctct acgccggacg catcgtggcc ggcatcaccg gcgccacagg 420
tgcggttgct ggcgcctata tcgccgacat caccgatggg gaagatcggg ctcgccactt 480
cgggctcatg agcgcttgtt tcggcgtggg tatggtggca ggccccgtgg ccgggggact 540
gttgggcgcc atctccttgc atgcaccatt ccttgcggcg gcggtgctca acggcctcaa 600
cctactactg ggctgcttcc taatgcagga gtcgcataag ggagagcgtc gaccgatgcc 660
cttgagagcc ttcaacccag tcagctcctt ccggtgggcg cggggcatga ctatcgtcgc 720
cgcacttatg actgtcttct ttatcatgca actcgtagga caggtgccgg cagcgctctg 780
ggtcattttc ggcgaggacc gctttcgctg gagcgcgacg atgatcggcc tgtcgcttgc 840
ggtattcgga atcttgcacg ccctcgctca agccttcgtc actggtcccg ccaccaaacg 900
tttcggcgag aagcaggcca ttatcgccgg catggcggcc gacgcgctgg gctacgtctt 960
gctggcgttc gcgacgcgag gctggatggc cttccccatt atgattcttc tcgcttccgg 1020
cggcatcggg atgcccgcgt tgcaggccat gctgtccagg caggtagatg acgaccatca 1080
gggacagctt caaggatcgc tcgcggctct taccagccta acttcgatca ctggaccgct 1140
gatcgtcacg gcgatttatg ccgcctcggc gagcacatgg aacgggttgg catggattgt 1200
aggcgccgcc ctataccttg tctgcctccc cgcgttgcgt cgcggtgcat ggagccgggc 1260
cacctcgacc tgaatggaag ccggc 1285
<210> 33
<211> 62
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cadA-F
<400> 33
cgccttgaag aaaggaggta taatccgagc tcatgaacgt tattgcaata ttgaatcaca 60
tg 62
<210> 34
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cadA-R
<400> 34
ggcgctttac tcaaaaaaaa gccgacttct agaccacttc ccttgtacga gctaa 55
<210> 35
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> piclR-F
<400> 35
ccttgaagaa aggaggtata atccatttgt tcaacattaa ctcatcggat 50
<210> 36
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> piclR-R
<400> 36
attcaatatt gcaataacgt tcatgagctc ctgaacctgt ccagtcgctg 50
<210> 37
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pcsiE-F
<400> 37
cgccttgaag aaaggaggta taatccgagc tctgcttttt ccgatcgtca cg 52
<210> 38
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pcsiE-R
<400> 38
aatattgcaa taacgttcat gagctctaaa gtttgctcaa ggaaatggc 49
<210> 39
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pbolA-F
<400> 39
cgccttgaag aaaggaggta taatccgagc tctgtttggt aaaaattccc g 51
<210> 40
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pbolA-R
<400> 40
aatattgcaa taacgttcat gagctccttt aaatactagc cgcttttac 49
<210> 41
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> posmY-F
<400> 41
cgccttgaag aaaggaggta taatccgagc tcctcgctta catcgctacc agc 53
<210> 42
<211> 48
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> posmY-R
<400> 42
aatattgcaa taacgttcat gagctcaaat atagatcaca attttgaa 48
<210> 43
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pkatE-F
<400> 43
cgccttgaag aaaggaggta taatccgagc tcgcagaaat gactctccca tc 52
<210> 44
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pkatE-R
<400> 44
aatattgcaa taacgttcat gagctcgcgg gacgtacagg ggc 43
<210> 45
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pcsiE-F2
<400> 45
cgcaccagcg actggacagg ttcagtgctt tttccgatcg tcacg 45
<210> 46
<211> 44
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pbolA-F2
<400> 46
cgcaccagcg actggacagg ttcagtgttt ggtaaaaatt cccg 44
<210> 47
<211> 46
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> posmY-F2
<400> 47
cgcaccagcg actggacagg ttcagctcgc ttacatcgct accagc 46
<210> 48
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pkatE-F2
<400> 48
cgcaccagcg actggacagg ttcaggcaga aatgactctc ccatc 45
<210> 49
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rpoS-F
<400> 49
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgagtcagaa tacgctgaaa gtt 53
<210> 50
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rpoS-R
<400> 50
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttactcgcgg aacagcgctt 50
<210> 51
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> crp-F
<400> 51
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tggtgcttgg caaaccgca 49
<210> 52
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> crp-R
<400> 52
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttaacgagtg ccgtaaacga 50
<210> 53
<211> 49
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> puuR-F
<400> 53
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgagtgatga gggactggc 49
<210> 54
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> puuR-R
<400> 54
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttaaaacgtg gtgggcgtat 50
<210> 55
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pepA-F
<400> 55
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tggagtttag tgtaaaaagc gg 52
<210> 56
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pepA-R
<400> 56
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttactcttcg ccgttaaacc ca 52
<210> 57
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> soxS-F
<400> 57
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgtcccatca gaaaattatt cagg 54
<210> 58
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> soxS-R
<400> 58
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttacaggcgg tggcgataat c 51
<210> 59
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> plac-F
<400> 59
gagctcctcc tgtgtgaaat tgttatc 27
<210> 60
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> plac-R
<400> 60
aaaaataatt agctcgtaca agggaagtgg ggataaccgt attaccgcct ttgag 55
<210> 61
<211> 308
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 包含有plac启动子的序列
<400> 61
ggataaccgt attaccgcct ttgagtgagc tgataccgct cgccgcagcc gaacgaccga 60
gcgcagcgag tcagtgagcg aggaagcgga agagcgccca atacgcaaac cgcctctccc 120
cgcgcgttgg ccgattcatt aatgcagctg gcacgacagg tttcccgact ggaaagcggg 180
cagtgagcgc aacgcaatta atgtgagtta gctcactcat taggcacccc aggctttaca 240
ctttatgctt ccggctcgta tgttgtgtgg aattgtgagc ggataacaat ttcacacagg 300
aggagctc 308
<210> 62
<211> 1041
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompA的基因序列
<400> 62
atgaaaaaga cagctatcgc gattgcagtg gcactggctg gtttcgctac cgtagcgcag 60
gccgctccga aagataacac ctggtacact ggtgctaaac tgggctggtc ccagtaccat 120
gacactggtt tcatcaacaa caatggcccg acccatgaaa accaactggg cgctggtgct 180
tttggtggtt accaggttaa cccgtatgtt ggctttgaaa tgggttacga ctggttaggt 240
cgtatgccgt acaaaggcag cgttgaaaac ggtgcataca aagctcaggg cgttcaactg 300
accgctaaac tgggttaccc aatcactgac gacctggaca tctacactcg tctgggtggc 360
atggtatggc gtgcagacac taaatccaac gtttatggta aaaaccacga caccggcgtt 420
tctccggtct tcgctggcgg tgttgagtac gcgatcactc ctgaaatcgc tacccgtctg 480
gaataccagt ggaccaacaa catcggtgac gcacacacca tcggcactcg tccggacaac 540
ggcatgctga gcctgggtgt ttcctaccgt ttcggtcagg gcgaagcagc tccagtagtt 600
gctccggctc cagctccggc accggaagta cagaccaagc acttcactct gaagtctgac 660
gttctgttca acttcaacaa agcaaccctg aaaccggaag gtcaggctgc tctggatcag 720
ctgtacagcc agctgagcaa cctggatccg aaagacggtt ccgtagttgt tctgggttac 780
accgaccgca tcggttctga cgcttacaac cagggtctgt ccgagcgccg tgctcagtct 840
gttgttgatt acctgatctc caaaggtatc ccggcagaca agatctccgc acgtggtatg 900
ggcgaatcca acccggttac tggcaacacc tgtgacaacg tgaaacagcg tgctgcactg 960
atcgactgcc tggctccgga tcgtcgcgta gagatcgaag ttaaaggtat caaagacgtt 1020
gtaactcagc cgcaggctta a 1041
<210> 63
<211> 1104
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompC的基因序列
<400> 63
atgaaagtta aagtactgtc cctcctggtc ccagctctgc tggtagcagg cgcagcaaac 60
gctgctgaag tttacaacaa agacggcaac aaattagatc tgtacggtaa agtagacggc 120
ctgcactatt tctctgacaa caaagatgta gatggcgacc agacctacat gcgtcttggc 180
ttcaaaggtg aaactcaggt tactgaccag ctgaccggtt acggccagtg ggaatatcag 240
atccagggca acagcgctga aaacgaaaac aactcctgga cccgtgtggc attcgcaggt 300
ctgaaattcc aggatgtggg ttctttcgac tacggtcgta actacggcgt tgtttatgac 360
gtaacttcct ggaccgacgt actgccagaa ttcggtggtg acacctacgg ttctgacaac 420
ttcatgcagc agcgtggtaa cggcttcgcg acctaccgta acactgactt cttcggtctg 480
gttgacggcc tgaactttgc tgttcagtac cagggtaaaa acggcaaccc atctggtgaa 540
ggctttacta gtggcgtaac taacaacggt cgtgacgcac tgcgtcaaaa cggcgacggc 600
gtcggcggtt ctatcactta tgattacgaa ggtttcggta tcggtggtgc gatctccagc 660
tccaaacgta ctgatgctca gaacaccgct gcttacatcg gtaacggcga ccgtgctgaa 720
acctacactg gtggtctgaa atacgacgct aacaacatct acctggctgc tcagtacacc 780
cagacctaca acgcaactcg cgtaggttcc ctgggttggg cgaacaaagc acagaacttc 840
gaagctgttg ctcagtacca gttcgacttc ggtctgcgtc cgtccctggc ttacctgcag 900
tctaaaggta aaaacctggg tcgtggctac gacgacgaag atatcctgaa atatgttgat 960
gttggtgcta cctactactt caacaaaaac atgtccacct acgttgacta caaaatcaac 1020
ctgctggacg acaaccagtt cactcgtgac gctggcatca acactgataa catcgtagct 1080
ctgggtctgg tttaccagtt ctaa 1104
<210> 64
<211> 1089
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompF的基因序列
<400> 64
atgatgaagc gcaatattct ggcagtgatc gtccctgctc tgttagtagc aggtactgca 60
aacgctgcag aaatctataa caaagatggc aacaaagtag atctgtacgg taaagctgtt 120
ggtctgcatt atttttccaa gggtaacggt gaaaacagtt acggtggcaa tggcgacatg 180
acctatgccc gtcttggttt taaaggggaa actcaaatca attccgatct gaccggttat 240
ggtcagtggg aatataactt ccagggtaac aactctgaag gcgctgacgc tcaaactggt 300
aacaaaacgc gtctggcatt cgcgggtctt aaatacgctg acgttggttc tttcgattac 360
ggccgtaact acggtgtggt ttatgatgca ctgggttaca ccgatatgct gccagaattt 420
ggtggtgata ctgcatacag cgatgacttc ttcgttggtc gtgttggcgg cgttgctacc 480
tatcgtaact ccaacttctt tggtctggtt gatggcctga acttcgctgt tcagtacctg 540
ggtaaaaacg agcgtgacac tgcacgccgt tctaacggcg acggtgttgg cggttctatc 600
agctacgaat acgaaggctt tggtatcgtt ggtgcttatg gtgcagctga ccgtaccaac 660
ctgcaagaag ctcaacctct tggcaacggt aaaaaagctg aacagtgggc tactggtctg 720
aagtacgacg cgaacaacat ctacctggca gcgaactacg gtgaaacccg taacgctacg 780
ccgatcacta ataaatttac aaacaccagc ggcttcgcca acaaaacgca agacgttctg 840
ttagttgcgc aataccagtt cgatttcggt ctgcgtccgt ccatcgctta caccaaatct 900
aaagcgaaag acgtagaagg tatcggtgat gttgatctgg tgaactactt tgaagtgggc 960
gcaacctact acttcaacaa aaacatgtcc acctatgttg actacatcat caaccagatc 1020
gattctgaca acaaactggg cgtaggttca gacgacaccg ttgctgtggg tatcgtttac 1080
cagttctaa 1089
<210> 65
<211> 639
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompW的基因序列
<400> 65
atgaaaaagt taacagtggc ggctttggca gtaacaactc ttctctctgg cagtgccttt 60
gcgcatgaag caggcgaatt ttttatgcgt gcaggttctg caaccgtacg tccaacagaa 120
ggtgctggtg gtacgttagg aagtctgggt ggattcagcg tgaccaataa cacgcaactg 180
ggccttacgt ttacttatat ggcgaccgac aacattggtg tggaattact ggcagcgacg 240
ccgttccgcc ataaaatcgg cacccgggcg accggcgata ttgcaaccgt tcatcatctg 300
ccaccaacac tgatggcgca gtggtatttt ggtgatgcca gcagcaaatt ccgtccttac 360
gttggggcag gtattaacta caccaccttc tttgataatg gatttaacga tcatggcaaa 420
gaggcagggc tttccgatct cagtctgaaa gattcctggg gagctgccgg gcaggtgggg 480
gttgattatc tgattaaccg tgactggttg gttaacatgt cagtgtggta catggatatc 540
gataccaccg ccaattataa gctgggcggt gcacagcaac acgatagcgt acgcctcgat 600
ccgtgggtgt ttatgttctc agcaggatat cgtttttaa 639
<210> 66
<211> 516
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompX的基因序列
<400> 66
atgaaaaaaa ttgcatgtct ttcagcactg gccgcagttc tggctttcac cgcaggtact 60
tccgtagctg cgacttctac tgtaactggc ggttacgcac agagcgacgc tcagggccaa 120
atgaacaaaa tgggcggttt caacctgaaa taccgctatg aagaagacaa cagcccgctg 180
ggtgtgatcg gttctttcac ttacaccgag aaaagccgta ctgcaagctc tggtgactac 240
aacaaaaacc agtactacgg catcactgct ggtccggctt accgcattaa cgactgggca 300
agcatctacg gtgtagtggg tgtgggttat ggtaaattcc agaccactga atacccgacc 360
tacaaacacg acaccagcga ctacggtttc tcctacggtg cgggtctgca gttcaacccg 420
atggaaaacg ttgctctgga cttctcttac gagcagagcc gtattcgtag cgttgacgta 480
ggcacctgga ttgccggtgt tggttaccgc ttctaa 516
<210> 67
<211> 346
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OmpA
<400> 67
Met Lys Lys Thr Ala Ile Ala Ile Ala Val Ala Leu Ala Gly Phe Ala
1 5 10 15
Thr Val Ala Gln Ala Ala Pro Lys Asp Asn Thr Trp Tyr Thr Gly Ala
20 25 30
Lys Leu Gly Trp Ser Gln Tyr His Asp Thr Gly Phe Ile Asn Asn Asn
35 40 45
Gly Pro Thr His Glu Asn Gln Leu Gly Ala Gly Ala Phe Gly Gly Tyr
50 55 60
Gln Val Asn Pro Tyr Val Gly Phe Glu Met Gly Tyr Asp Trp Leu Gly
65 70 75 80
Arg Met Pro Tyr Lys Gly Ser Val Glu Asn Gly Ala Tyr Lys Ala Gln
85 90 95
Gly Val Gln Leu Thr Ala Lys Leu Gly Tyr Pro Ile Thr Asp Asp Leu
100 105 110
Asp Ile Tyr Thr Arg Leu Gly Gly Met Val Trp Arg Ala Asp Thr Lys
115 120 125
Ser Asn Val Tyr Gly Lys Asn His Asp Thr Gly Val Ser Pro Val Phe
130 135 140
Ala Gly Gly Val Glu Tyr Ala Ile Thr Pro Glu Ile Ala Thr Arg Leu
145 150 155 160
Glu Tyr Gln Trp Thr Asn Asn Ile Gly Asp Ala His Thr Ile Gly Thr
165 170 175
Arg Pro Asp Asn Gly Met Leu Ser Leu Gly Val Ser Tyr Arg Phe Gly
180 185 190
Gln Gly Glu Ala Ala Pro Val Val Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ala Pro
195 200 205
Glu Val Gln Thr Lys His Phe Thr Leu Lys Ser Asp Val Leu Phe Asn
210 215 220
Phe Asn Lys Ala Thr Leu Lys Pro Glu Gly Gln Ala Ala Leu Asp Gln
225 230 235 240
Leu Tyr Ser Gln Leu Ser Asn Leu Asp Pro Lys Asp Gly Ser Val Val
245 250 255
Val Leu Gly Tyr Thr Asp Arg Ile Gly Ser Asp Ala Tyr Asn Gln Gly
260 265 270
Leu Ser Glu Arg Arg Ala Gln Ser Val Val Asp Tyr Leu Ile Ser Lys
275 280 285
Gly Ile Pro Ala Asp Lys Ile Ser Ala Arg Gly Met Gly Glu Ser Asn
290 295 300
Pro Val Thr Gly Asn Thr Cys Asp Asn Val Lys Gln Arg Ala Ala Leu
305 310 315 320
Ile Asp Cys Leu Ala Pro Asp Arg Arg Val Glu Ile Glu Val Lys Gly
325 330 335
Ile Lys Asp Val Val Thr Gln Pro Gln Ala
340 345
<210> 68
<211> 367
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OmpC
<400> 68
Met Lys Val Lys Val Leu Ser Leu Leu Val Pro Ala Leu Leu Val Ala
1 5 10 15
Gly Ala Ala Asn Ala Ala Glu Val Tyr Asn Lys Asp Gly Asn Lys Leu
20 25 30
Asp Leu Tyr Gly Lys Val Asp Gly Leu His Tyr Phe Ser Asp Asn Lys
35 40 45
Asp Val Asp Gly Asp Gln Thr Tyr Met Arg Leu Gly Phe Lys Gly Glu
50 55 60
Thr Gln Val Thr Asp Gln Leu Thr Gly Tyr Gly Gln Trp Glu Tyr Gln
65 70 75 80
Ile Gln Gly Asn Ser Ala Glu Asn Glu Asn Asn Ser Trp Thr Arg Val
85 90 95
Ala Phe Ala Gly Leu Lys Phe Gln Asp Val Gly Ser Phe Asp Tyr Gly
100 105 110
Arg Asn Tyr Gly Val Val Tyr Asp Val Thr Ser Trp Thr Asp Val Leu
115 120 125
Pro Glu Phe Gly Gly Asp Thr Tyr Gly Ser Asp Asn Phe Met Gln Gln
130 135 140
Arg Gly Asn Gly Phe Ala Thr Tyr Arg Asn Thr Asp Phe Phe Gly Leu
145 150 155 160
Val Asp Gly Leu Asn Phe Ala Val Gln Tyr Gln Gly Lys Asn Gly Asn
165 170 175
Pro Ser Gly Glu Gly Phe Thr Ser Gly Val Thr Asn Asn Gly Arg Asp
180 185 190
Ala Leu Arg Gln Asn Gly Asp Gly Val Gly Gly Ser Ile Thr Tyr Asp
195 200 205
Tyr Glu Gly Phe Gly Ile Gly Gly Ala Ile Ser Ser Ser Lys Arg Thr
210 215 220
Asp Ala Gln Asn Thr Ala Ala Tyr Ile Gly Asn Gly Asp Arg Ala Glu
225 230 235 240
Thr Tyr Thr Gly Gly Leu Lys Tyr Asp Ala Asn Asn Ile Tyr Leu Ala
245 250 255
Ala Gln Tyr Thr Gln Thr Tyr Asn Ala Thr Arg Val Gly Ser Leu Gly
260 265 270
Trp Ala Asn Lys Ala Gln Asn Phe Glu Ala Val Ala Gln Tyr Gln Phe
275 280 285
Asp Phe Gly Leu Arg Pro Ser Leu Ala Tyr Leu Gln Ser Lys Gly Lys
290 295 300
Asn Leu Gly Arg Gly Tyr Asp Asp Glu Asp Ile Leu Lys Tyr Val Asp
305 310 315 320
Val Gly Ala Thr Tyr Tyr Phe Asn Lys Asn Met Ser Thr Tyr Val Asp
325 330 335
Tyr Lys Ile Asn Leu Leu Asp Asp Asn Gln Phe Thr Arg Asp Ala Gly
340 345 350
Ile Asn Thr Asp Asn Ile Val Ala Leu Gly Leu Val Tyr Gln Phe
355 360 365
<210> 69
<211> 362
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OmpF
<400> 69
Met Met Lys Arg Asn Ile Leu Ala Val Ile Val Pro Ala Leu Leu Val
1 5 10 15
Ala Gly Thr Ala Asn Ala Ala Glu Ile Tyr Asn Lys Asp Gly Asn Lys
20 25 30
Val Asp Leu Tyr Gly Lys Ala Val Gly Leu His Tyr Phe Ser Lys Gly
35 40 45
Asn Gly Glu Asn Ser Tyr Gly Gly Asn Gly Asp Met Thr Tyr Ala Arg
50 55 60
Leu Gly Phe Lys Gly Glu Thr Gln Ile Asn Ser Asp Leu Thr Gly Tyr
65 70 75 80
Gly Gln Trp Glu Tyr Asn Phe Gln Gly Asn Asn Ser Glu Gly Ala Asp
85 90 95
Ala Gln Thr Gly Asn Lys Thr Arg Leu Ala Phe Ala Gly Leu Lys Tyr
100 105 110
Ala Asp Val Gly Ser Phe Asp Tyr Gly Arg Asn Tyr Gly Val Val Tyr
115 120 125
Asp Ala Leu Gly Tyr Thr Asp Met Leu Pro Glu Phe Gly Gly Asp Thr
130 135 140
Ala Tyr Ser Asp Asp Phe Phe Val Gly Arg Val Gly Gly Val Ala Thr
145 150 155 160
Tyr Arg Asn Ser Asn Phe Phe Gly Leu Val Asp Gly Leu Asn Phe Ala
165 170 175
Val Gln Tyr Leu Gly Lys Asn Glu Arg Asp Thr Ala Arg Arg Ser Asn
180 185 190
Gly Asp Gly Val Gly Gly Ser Ile Ser Tyr Glu Tyr Glu Gly Phe Gly
195 200 205
Ile Val Gly Ala Tyr Gly Ala Ala Asp Arg Thr Asn Leu Gln Glu Ala
210 215 220
Gln Pro Leu Gly Asn Gly Lys Lys Ala Glu Gln Trp Ala Thr Gly Leu
225 230 235 240
Lys Tyr Asp Ala Asn Asn Ile Tyr Leu Ala Ala Asn Tyr Gly Glu Thr
245 250 255
Arg Asn Ala Thr Pro Ile Thr Asn Lys Phe Thr Asn Thr Ser Gly Phe
260 265 270
Ala Asn Lys Thr Gln Asp Val Leu Leu Val Ala Gln Tyr Gln Phe Asp
275 280 285
Phe Gly Leu Arg Pro Ser Ile Ala Tyr Thr Lys Ser Lys Ala Lys Asp
290 295 300
Val Glu Gly Ile Gly Asp Val Asp Leu Val Asn Tyr Phe Glu Val Gly
305 310 315 320
Ala Thr Tyr Tyr Phe Asn Lys Asn Met Ser Thr Tyr Val Asp Tyr Ile
325 330 335
Ile Asn Gln Ile Asp Ser Asp Asn Lys Leu Gly Val Gly Ser Asp Asp
340 345 350
Thr Val Ala Val Gly Ile Val Tyr Gln Phe
355 360
<210> 70
<211> 212
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OmpW
<400> 70
Met Lys Lys Leu Thr Val Ala Ala Leu Ala Val Thr Thr Leu Leu Ser
1 5 10 15
Gly Ser Ala Phe Ala His Glu Ala Gly Glu Phe Phe Met Arg Ala Gly
20 25 30
Ser Ala Thr Val Arg Pro Thr Glu Gly Ala Gly Gly Thr Leu Gly Ser
35 40 45
Leu Gly Gly Phe Ser Val Thr Asn Asn Thr Gln Leu Gly Leu Thr Phe
50 55 60
Thr Tyr Met Ala Thr Asp Asn Ile Gly Val Glu Leu Leu Ala Ala Thr
65 70 75 80
Pro Phe Arg His Lys Ile Gly Thr Arg Ala Thr Gly Asp Ile Ala Thr
85 90 95
Val His His Leu Pro Pro Thr Leu Met Ala Gln Trp Tyr Phe Gly Asp
100 105 110
Ala Ser Ser Lys Phe Arg Pro Tyr Val Gly Ala Gly Ile Asn Tyr Thr
115 120 125
Thr Phe Phe Asp Asn Gly Phe Asn Asp His Gly Lys Glu Ala Gly Leu
130 135 140
Ser Asp Leu Ser Leu Lys Asp Ser Trp Gly Ala Ala Gly Gln Val Gly
145 150 155 160
Val Asp Tyr Leu Ile Asn Arg Asp Trp Leu Val Asn Met Ser Val Trp
165 170 175
Tyr Met Asp Ile Asp Thr Thr Ala Asn Tyr Lys Leu Gly Gly Ala Gln
180 185 190
Gln His Asp Ser Val Arg Leu Asp Pro Trp Val Phe Met Phe Ser Ala
195 200 205
Gly Tyr Arg Phe
210
<210> 71
<211> 171
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OmpX
<400> 71
Met Lys Lys Ile Ala Cys Leu Ser Ala Leu Ala Ala Val Leu Ala Phe
1 5 10 15
Thr Ala Gly Thr Ser Val Ala Ala Thr Ser Thr Val Thr Gly Gly Tyr
20 25 30
Ala Gln Ser Asp Ala Gln Gly Gln Met Asn Lys Met Gly Gly Phe Asn
35 40 45
Leu Lys Tyr Arg Tyr Glu Glu Asp Asn Ser Pro Leu Gly Val Ile Gly
50 55 60
Ser Phe Thr Tyr Thr Glu Lys Ser Arg Thr Ala Ser Ser Gly Asp Tyr
65 70 75 80
Asn Lys Asn Gln Tyr Tyr Gly Ile Thr Ala Gly Pro Ala Tyr Arg Ile
85 90 95
Asn Asp Trp Ala Ser Ile Tyr Gly Val Val Gly Val Gly Tyr Gly Lys
100 105 110
Phe Gln Thr Thr Glu Tyr Pro Thr Tyr Lys His Asp Thr Ser Asp Tyr
115 120 125
Gly Phe Ser Tyr Gly Ala Gly Leu Gln Phe Asn Pro Met Glu Asn Val
130 135 140
Ala Leu Asp Phe Ser Tyr Glu Gln Ser Arg Ile Arg Ser Val Asp Val
145 150 155 160
Gly Thr Trp Ile Ala Gly Val Gly Tyr Arg Phe
165 170
<210> 72
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> plac-F2
<400> 72
ctgaatatcg aagcgctgtt ccgcgagtaa ggataaccgt attaccgcct ttgag 55
<210> 73
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompA-F
<400> 73
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgaaaaagac agctatcgcg 50
<210> 74
<211> 50
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompA-R
<400> 74
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttaagcctgc ggctgagtta 50
<210> 75
<211> 54
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompC-F
<400> 75
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgaaagttaa agtactgtcc ctcc 54
<210> 76
<211> 52
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompC-R
<400> 76
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttagaactgg taaaccagac cc 52
<210> 77
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompF-F
<400> 77
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgatgaagcg caatattctg g 51
<210> 78
<211> 53
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompF-R
<400> 78
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttagaactgg taaacgatac cca 53
<210> 79
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompW-F
<400> 79
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgaaaaagtt aacagtggcg g 51
<210> 80
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompW-R
<400> 80
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttaaaaacga tatcctgctg agaac 55
<210> 81
<211> 55
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompX-F
<400> 81
cggataacaa tttcacacag gaggagctca tgaaaaaaat tgcatgtctt tcagc 55
<210> 82
<211> 51
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ompX-R
<400> 82
gctttactca aaaaaaagcc gacttctaga ttagaagcgg taaccaacac c 51
<210> 83
<211> 175
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> piclR启动子序列
<400> 83
atttgttcaa cattaactca tcggatcagt tcagtaacta ttgcattagc taacaataaa 60
aatgaaaatg atttccacga tacagaaaaa agagactgtc atggtcgcac ccattcccgc 120
gaaacgcggc agaaaacccg ccgttgccac cgcaccagcg actggacagg ttcag 175
<210> 84
<211> 113
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 来源谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium
glutamicum)piclR启动子piclR-Cg
<400> 84
acagtatagc tattaagagg cgtaaatgtc acctcccgcc caaaatcttc ttataccccc 60
acacagtgaa tcccttcacc acgtctcatt gggtgaaatg ctaaattcaa ggt 113
<210> 85
<211> 71
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 来源蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)的piclR启动子piclR-Ha
<400> 85
gagcagttaa aaaccacgat cgcatccata atgtcgaaaa cgaaaataga ttccattttt 60
ataacatttt t 71

Claims (10)

1.一种重组核酸序列,其特征在于,所述重组核酸序列包括串联启动子、赖氨酸脱羧酶基因以及增强细胞耐受压力的基因,其中,所述串联启动子包括piclR启动子和稳定期特异性启动子,所述稳定期特异性启动子选自下述的一种或多种:pcsiE、pbolA、posmY、pkatE、p21、p22、p23和p24。
2.根据权利要求1所述的重组核酸序列,其特征在于,所述piclR启动子来源于大肠杆菌(Escherichia coli)、谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)以及蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)中的任意一种或几种;
优选地,所述piclR启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:83-85任意一项所示;所述稳定期特异性启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-8任意一项所示;和/或,所述赖氨酸脱羧酶基因选自来自大肠杆菌、谷氨酸棒状杆菌、蜂房哈夫尼菌中的任意一种的cadA基因或ldcC基因;
更优选地,所述cadA基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示。
3.根据权利要求1所述的重组核酸序列,其特征在于,所述重组核酸序列还包括组成型启动子;
优选地,所述组成型启动子选自plac、trp、tac、trc和PL中的任意一种或几种;
更优选地,所述组成型启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:60所示。
4.根据权利要求1所述的重组核酸序列,其特征在于,所述增强细胞耐受压力的基因与组成型启动子可操作地连接,所述增强细胞耐受压力的基因选自:rpoS、crp、puuR、pepA以及soxS中的任意一种或几种;
优选地,所述增强细胞耐受压力的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:11-15任意一项所示。
5.根据权利要求1所述的重组核酸序列,其特征在于,所述重组核酸序列还包括编码外膜孔蛋白的基因;
优选地,所述编码外膜孔蛋白的基因与组成型启动子可操作性地连接,和/或,所述编码外膜孔蛋白的基因选自:ompA、ompC、ompF、ompW和ompX中的任意一种或几种;更优选地,所述编码外膜孔蛋白的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:62-66任意一项所示。
6.根据权利要求1~5任一项所述的重组核酸序列,其特征在于,所述重组核酸序列选自以下组:
(1)piclR-p24-cadA-plac-rpoS、piclR-p24-cadA-plac-crp、piclR-p24-cadA-plac-puuR、piclR-p24-cadA-plac-pepA或piclR-p24-cadA-plac-soxS;和,
(2)piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompA、piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompC、piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompF、piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompW或piclR-p24-cadA-plac-rpoS-plac-ompX。
7.一种重组表达载体,其特征在于,所述重组表达载体包括如权利要求1-6中任意一项所述的重组核酸序列;
优选地,所述重组表达载体的骨架质粒包括pUC18、pUC19、pBR322、pACYC、pET、pSC101以及它们的衍生质粒。
8.一种生产1,5-戊二胺的基因工程菌,其特征在于,所述基因工程菌包含权利要求1-6中任意一项所述的重组核酸序列;
优选地,所述重组核酸序列位于游离的重组表达载体或整合到染色体中;
更优选地,所述基因工程菌的宿主菌来源于埃希氏菌属(Escherichia)、棒杆菌属(Corynebacterium)、芽孢杆菌属(Bacillus)、栖热菌属(Thermus)、短杆菌属(Brevibacterium)或哈夫尼菌属(Hafnia)的菌种;
进一步更优选地,所述基因工程菌的宿主菌来源于大肠杆菌(Escherichia coli)、嗜热菌(Thermus thermophilus)、蜂房哈夫尼菌(Hafnia alvei)、枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)或谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)。
9.一种生产1,5-戊二胺的方法,其特征在于,所述方法包括步骤:在发酵培养基中对含有如权利要求8所述的基因工程菌进行培养以生产1,5-戊二胺。
10.如权利要求1-6中任意一项所述的重组核酸序列、权利要求7所述的重组表达载体或如权利要求8所述的基因工程菌在生产1,5-戊二胺中的应用。
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