CN115679012A - 一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用 - Google Patents
一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN115679012A CN115679012A CN202211269383.3A CN202211269383A CN115679012A CN 115679012 A CN115679012 A CN 115679012A CN 202211269383 A CN202211269383 A CN 202211269383A CN 115679012 A CN115679012 A CN 115679012A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- pepper
- snp
- breeding
- panel
- variety
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提供了一种辣椒全基因组SNP‑Panel及其应用,涉及辣椒分子育种技术领域。本发明提供了一种辣椒全基因组SNP‑Panel,包括550个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物,所述SNP位点均匀分布于辣椒12条染色体上,覆盖面广,密度高。利用所述SNP‑Panel通过一次扩增反应,可实现550个SNP位点的同时检测,能够实现辣椒分子设计育种的流程化、信息化,大幅度提高我国辣椒育种效率,缩短育种周期。本发明所述辣椒全基因组SNP‑Panel体系稳定性好,操作简单,成本低,很好的解决了之前全基因组分子标记成本过高的问题,能够显著促进农业发展,具有很好的应用前景。
Description
技术领域
本发明涉及辣椒分子育种技术领域,具体涉及一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用。
背景技术
辣椒是一种重要的蔬菜作物,全国各地均有种植,2019年栽培面积约3400万亩。目前辣椒品种选育仍然以传统的表型选择为主要的技术手段,通过田间个体的表型观察来进行目标单株的选择,工作量大,育种周期长,精准度也不足。分子设计育种技术将实现对农艺性状的精确改良,显示出比其他育种手段更为突出的优越性,是今后作物育种技术发展的方向。
近年来随着高通量测序技术的飞速发展,辣椒基因组信息越来越丰富,为开展辣椒分子设计育种打下了良好的基础。目前分子标记辅助育种的技术有SSR/InDel、KASP和基因芯片,SSR/InDel和KASP可用的标记少,单价高,不适合全基因组范围的分子标记辅助育种;基因芯片价格高且核心技术为国外所有,不能大规模应用且不能满足个性化的需求,同时存在技术壁垒,鉴于当前的国际形势,不利于国内育种的安全。因此,开发一种覆盖全基因组的通量高、成本低的分子标记检测体系对于开展辣椒分子育种具有重要的意义。
发明内容
有鉴于此,本发明的目的在于提供一种辣椒全基因组SNP-Panel,通过一次扩增反应,可实现550个SNP位点的同时检测,检测覆盖度广,分析速度快,检测成本低。
为解决上述技术问题,本发明提供了以下技术方案:
本发明提供了一种辣椒全基因组SNP-Panel,包括550个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物,所述550个SNP位点信息及扩增引物序列如表1所示。
本发明还提供了上述辣椒全基因组SNP-Panel在辣椒育种中的应用,所述应用包括以下一种或多种:
(1)建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析;
(2)辣椒品种真实性及种子纯度鉴定;
(3)辣椒表型关联分析;
(4)辣椒分子设计育种、回交育种及其背景选择、全基因组育种。
优选的,所述建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析包括如下步骤:
利用上述550个SNP位点的引物对辣椒的基因组DNA进行混合PCR扩增,扩增产物经测序、分型获得辣椒在所述550个SNP位点上的的基因组数据,即构成辣椒的DNA指纹数据库;
根据所述辣椒的DNA指纹数据库信息建立聚类树状图,即可进行辣椒的遗传多样性分析。
优选的,所述辣椒品种真实性鉴定的方法包括如下步骤:
分别提取待测辣椒品种样本和对照样本的基因组DNA;
利用上述的550个SNP位点的引物对待测辣椒样本和对照样本的基因组DNA进行扩增和测序,从而获取上述待测辣椒样本和对照样本各自在550个SNP位点的基因型数据进行品种真实性鉴定。
优选的,所述种子纯度鉴定的方法包括如下步骤:
根据上述方法获得待检测品种杂交种子双亲本在550个SNP位点基因型数据,分析并选择在双亲本中呈现多态性的SNP位点引物;
利用筛选出的多态性SNP引物对F1杂交种子进行PCR扩增测序分析检测,分析F1种子与双亲本的关系,从而鉴定辣椒品种种子纯度。
更优选的,所述选择的多态性SNP数量不少于2个。
优选的,所述辣椒表型关联分析的方法包括如下步骤:
选定极端表型个体,根据权利要求3所述方法获得极端表型个体在550个SNP位点基因型数据,分析并筛选在差异表型个体中呈现多态性的SNP位点信息;
利用筛选的SNP在分离群体中进行关联分析,确定与目标性状紧密连锁的SNP。
优选的,所述辣椒分子设计育种、回交育种及其背景选择的方法包括如下步骤:
根据上述方法获得待转育辣椒品种在550个SNP位点基因型数据,获得背景基因型;
根据育种目标选择目标基因供体亲本,与待转育品种进行杂交建立杂交分离群体或回交分离群体;
在分离群体中,通过目标性状进行前景筛选;
在选择的分离群里中,按照上述方法获得群体个体在550个SNP位点基因型数据;
比较个体基因型与所述获得的背景基因型,选择变异位点数最少的个体进行进一步转育,直至获得含有目标性状基因、背景基因型完全恢复的稳定个体。
本发明具有以下有益效果:
本发明提供了一种辣椒全基因组SNP-Panel,包括550个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物,所述SNP位点均匀分布于辣椒12条染色体上,覆盖面广,密度高。利用所述SNP-Panel通过一次扩增反应,可实现550个SNP位点的同时检测,能够实现辣椒分子设计育种的流程化、信息化,大幅度提高我国辣椒育种效率,缩短育种周期。本发明所述辣椒全基因组SNP-Panel体系稳定性好,操作简单,成本低,很好的解决了之前全基因组分子标记成本过高的问题,能够显著促进农业发展,具有很好的应用前景。
附图说明
图1为挑选的SNPs在基因组上的分布情况。
图2为14份高代自交系辣椒的系统发生树。
具体实施方式
本发明提供了一种辣椒全基因组SNP-Panel,包括550个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物,所述550个SNP位点信息及扩增引物序列如表1所示:
表1 550个SNP位点信息及扩增引物序列
本发明中,所述550个SNP标记的分布如下:Chr01染色体62个SNPs;Chr02染色体26个SNPs;Chr03染色体61个SNPs;Chr04染色体44个SNPs;Chr05染色体44个SNPs;Chr06染色体48个SNPs;Chr07染色体43个SNPs;Chr08染色体35个SNPs;Chr09染色体46个SNPs;Chr10染色体42个SNPs;Chr11染色体47个SNPs;Chr12染色体52个SNPs。
本发明还提供了上述辣椒全基因组SNP-Panel在辣椒育种中的应用,所述应用包括以下一种或多种:
(1)建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析;
(2)辣椒品种真实性及种子纯度鉴定;
(3)辣椒表型关联分析;
(4)辣椒分子设计育种、回交育种及其背景选择、全基因组育种。
本发明中,所述建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析包括如下步骤:利用上述550个SNP位点的引物对辣椒的基因组DNA进行混合PCR扩增,扩增产物经测序、分型获得辣椒在所述550个SNP位点上的的基因组数据,即构成辣椒的DNA指纹数据库;根据所述辣椒的DNA指纹数据库信息建立聚类树状图,即可进行辣椒的遗传多样性分析。本发明中,所述辣椒基因组DNA的提取对象优选为辣椒的幼嫩组织,更优选为辣椒干种子、新鲜叶片、幼穗老叶、幼苗或幼嫩茎段。
本发明中,所述辣椒品种真实性鉴定的方法包括如下步骤:分别提取待测辣椒品种样本和对照样本的基因组DNA;利用上述的550个SNP位点的引物对待测辣椒样本和对照样本的基因组DNA进行扩增和测序,从而获取上述待测辣椒样本和对照样本各自在550个SNP位点的基因型数据进行品种真实性鉴定。
本发明中,所述种子纯度鉴定的方法包括如下步骤:根据上述方法获得待检测品种杂交种子双亲本在550个SNP位点基因型数据,分析并选择在双亲本中呈现多态性的SNP位点引物;利用筛选出的多态性SNP引物对F1杂交种子进行PCR扩增测序分析检测,分析F1种子与双亲本的关系,从而鉴定辣椒品种种子纯度。本发明中,所述选择的多态性SNP数量优选的不少于2个。
本发明中,所述辣椒表型关联分析的方法包括如下步骤:选定极端表型个体,根据权利要求3所述方法获得极端表型个体在550个SNP位点基因型数据,分析并筛选在差异表型个体中呈现多态性的SNP位点信息;利用筛选的SNP在分离群体中进行关联分析,确定与目标性状紧密连锁的SNP。
本发明中,所述辣椒分子设计育种、回交育种及其背景选择的方法包括如下步骤:根据上述方法获得待转育辣椒品种在550个SNP位点基因型数据,获得背景基因型;根据育种目标选择目标基因供体亲本,与待转育品种进行杂交建立杂交分离群体或回交分离群体;在分离群体中,通过目标性状进行前景筛选;在选择的分离群里中,按照上述方法获得群体个体在550个SNP位点基因型数据;比较个体基因型与所述获得的背景基因型,选择变异位点数最少的个体进行进一步转育,直至获得含有目标性状基因、背景基因型完全恢复的稳定个体。
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚明白,下面结合实施例对本发明进行详细的说明,但是不能把它们理解为对本发明保护范围的限定。
下述实施例中,如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1
辣椒特定SNP筛选及SNP-Panel开发
1.核心资源重测序:
挑选不同类型、表型差异大、遗传距离较远的核心辣椒资源进行重测序,以公布的辣椒品种zunla基因组为参考基因组(版本:Zunla-1v2.0,网址:https://ftp.cngb.org/pub/CNSA/data2/CNPhis0000547/pepper/),形成核心辣椒种质数据库。
2.变异检测:
利用高通量测序数据变异数据分析软件GATK(version 3.7)进行变异分析,按照如下条件进行了筛选:1)各样品测序深度不小于5;2)所有样品基因型缺失比例不超过50%;3)较小等位基因频率不低于5%。共获得了26084029个为SNP,其中17440583个是转换类型(A/G和C/T),8643446个是颠换类型(A/C、A/T、C/G和G/T),转换颠换比(Ts/Tv)为2.02。
3.特异SNP筛选及SNP-Panel开发:
根据如下标准筛选可用SNPs:1)SNP间隔大于100Kb;2)SNP对应的MAF不小于0.1;3)没有基因型缺失,共得到20376个SNPs。使用Primer3软件(version 2.5.0)来设计各目标SNP位点的扩增引物,设置的参数包括:1)引物序列的长度在17-32bp之间;2)Tm值在60-64℃之间;3)产物大小不超过500bp;4)测序reads必须能够覆盖目标位点。
对每个目标位点,设计3对引物,然后使用e-PCR软件(version 2.3.12)检测每对引物的扩增特异性,去掉非特异引物后共剩余34881对引物。检测引物之间形成二聚体的可能性,最终获得了550个SNP位点的扩增引物,这550个SNP位点即组成了本发明所述最终的SNP-Panel。这550个SNP位点在基因组上分布情况如附图1所示。
实施例2
辣椒资源DNA指纹图谱
1.辣椒资源DNA提取:
采用CTAB法提取辣椒组织的DNA:
1)选取辣椒幼嫩组织提取基因组DNA。
2)试剂配制:
CTAB缓冲液:2%CTAB,1.4M NaCl,l00mM Tris-HCl,l0mM EDTA,pH=8.0;
洗涤缓冲液:76%乙醇,l0mM乙酸铵;
TE缓冲液:20mM Tris-HCl,lmM EDTA,pH8.0;
冰无水乙醇:将无水乙醇预先存放于-20℃,存放时间大于1小时。
3)提取辣椒组织中的DNA:
将取自辣椒的幼嫩组织剪碎,并在液氮环境中研磨;加入与组织的量相当的预热CTAB,并迅速置于65℃水浴,水浴30min至lh,每隔5min摇动一次;4℃、12000rpm/min离心l0min后,移出上清并加入等体积氯仿和异戊醇(氯仿和异戊醇体积比为24︰1)混合液,混匀;4℃、12000rpm/min离心15min后,移出上清并加入两倍体积冰无水乙醇,于-20℃放置lh;4℃、12000rpm/min离心l0min后,弃上清,沉淀经洗涤缓冲液洗涤后风干;加入5μL至l00μL的TE缓冲液,充分溶解;用琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量,并用紫外分光光度计检测浓度和纯度;将检测后的DNA保存于-20℃。
2.文库构建与测序:
使用实施例1中表1所述550个SNP引物捕获各目标位点的DNA序列,然后回收产物并质检合格后依据Illumina文库构建流程完成Paired-end(PE)测序文库构建,取各个样本等量DNA构建一个PE文库并在Illumina Hiseq测序仪上进行PE150测序。
3.目标位点基因型分析:
对测序获得的原始数据进行数据质控,得到高质量的clean data,然后使用BWA软件将clean data分解到各目标位点,得到SAM格式的比对结果,然后使用软件samtools将SAM格式的文件转换成BAM格式,接着使用Picard工具中的SortSam对BAM文件中的reads进行排序,得到最终的BAM文件。使用GATK确定各目标位点的基因型,即构成辣椒种质资源DNA指纹图谱,如表2显示部分辣椒资源图谱信息。
表2显示部分辣椒资源图谱信息
统计发现,25份辣椒资源群体中需要检测的基因型共有13750个,最终获得了有效数据(Depth≥30)的基因型比例为96.41%,平均测序深度为1990.26倍。
实施例3
辣椒资源遗传多样性分析
为了验证SNP-Panel的可靠性和应用价值,挑选14份不同类型的辣椒自交系,对其550个SNP标记进行了检测。参照实施例2的实验方法,得到了14份辣椒自交系的SNP基因型,然后基于SNP基因型构建系统发生树。使用MEGA7(version 7.0)软件中的邻接法(neighbor-joining methods)构建系统发生树,并使用ggtree(version 1.7.10)进行可视化。结果如图2所示。
可以看出,14份辣椒自交系能被本发明所述的辣椒全基因组SNP-Panel清晰区分,相同类型的辣椒能被聚到一起,表明亲缘关系更近。系统发生树的结果揭示了14份辣椒资源的亲缘关系,将有效指导下一步的辣椒育种研究。
以上所述仅为本发明的实施例,并非因此限制本发明的专利范围,凡是利用本发明说明书内容所作的等效结构或等效流程变换,或直接或间接运用在其他相关的技术领域,均同理包括在本发明的专利保护范围内。
Claims (8)
2.权利要求1所述辣椒全基因组SNP-Panel在辣椒育种中的应用,其特征在于,所述应用包括以下一种或多种:
(1)建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析;
(2)辣椒品种真实性及种子纯度鉴定;
(3)辣椒表型关联分析;
(4)辣椒分子设计育种、回交育种及其背景选择、全基因组育种。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析包括如下步骤:
利用权利要求1所述550个SNP位点的引物对辣椒的基因组DNA进行混合PCR扩增,扩增产物经测序、分型获得辣椒在所述550个SNP位点上的的基因组数据,即构成辣椒的DNA指纹数据库;
根据所述辣椒的DNA指纹数据库信息建立聚类树状图,即可进行辣椒的遗传多样性分析。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述辣椒品种真实性鉴定的方法包括如下步骤:
分别提取待测辣椒品种样本和对照样本的基因组DNA;
利用权利要求1所述的550个SNP位点的引物对待测辣椒样本和对照样本的基因组DNA进行扩增和测序,从而获取上述待测辣椒样本和对照样本各自在550个SNP位点的基因型数据进行品种真实性鉴定。
5.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述种子纯度鉴定的方法包括如下步骤:
根据权利要求3中所述方法获得待检测品种杂交种子双亲本在550个SNP位点基因型数据,分析并选择在双亲本中呈现多态性的SNP位点引物;
利用筛选出的多态性SNP引物对F1杂交种子进行PCR扩增测序分析检测,分析F1种子与双亲本的关系,从而鉴定辣椒品种种子纯度。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述选择的多态性SNP数量不少于2个。
7.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述辣椒表型关联分析的方法包括如下步骤:
选定极端表型个体,根据权利要求3所述方法获得极端表型个体在550个SNP位点基因型数据,分析并筛选在差异表型个体中呈现多态性的SNP位点信息;
利用筛选的SNP在分离群体中进行关联分析,确定与目标性状紧密连锁的SNP。
8.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述辣椒分子设计育种、回交育种及其背景选择的方法包括如下步骤:
根据权利要求3所述方法获得待转育辣椒品种在550个SNP位点基因型数据,获得背景基因型;
根据育种目标选择目标基因供体亲本,与待转育品种进行杂交建立杂交分离群体或回交分离群体;
在分离群体中,通过目标性状进行前景筛选;
在选择的分离群里中,按照权利要求3所述方法获得群体个体在550个SNP位点基因型数据;
比较个体基因型与所述获得的背景基因型,选择变异位点数最少的个体进行进一步转育,直至获得含有目标性状基因、背景基因型完全恢复的稳定个体。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211269383.3A CN115679012B (zh) | 2022-10-18 | 2022-10-18 | 一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211269383.3A CN115679012B (zh) | 2022-10-18 | 2022-10-18 | 一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN115679012A true CN115679012A (zh) | 2023-02-03 |
CN115679012B CN115679012B (zh) | 2023-07-04 |
Family
ID=85067079
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202211269383.3A Active CN115679012B (zh) | 2022-10-18 | 2022-10-18 | 一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN115679012B (zh) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN117587159A (zh) * | 2023-12-06 | 2024-02-23 | 华智生物技术有限公司 | 一种辣椒snp分子标记组合、snp芯片及其应用 |
Citations (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2014077464A1 (ko) * | 2012-11-19 | 2014-05-22 | (주)고추와 육종 | 종간교잡을 통해 육성된 탄저병 저항성 고추 품종 및 이를 선별하기 위한 프라이머 세트 |
CN105238859A (zh) * | 2015-10-13 | 2016-01-13 | 中国农业大学 | 一种获取鸡全基因组高密度snp标记位点的方法 |
WO2018085971A1 (zh) * | 2016-11-08 | 2018-05-17 | 南京农业大学 | 棉花全基因组snp芯片及其应用 |
CN108411027A (zh) * | 2018-05-24 | 2018-08-17 | 武汉市农业科学院 | 一种检测辣椒cms雄性不育恢复基因的caps分子标记引物及应用 |
CN108486276A (zh) * | 2018-06-01 | 2018-09-04 | 江西省农业科学院蔬菜花卉研究所 | 辣椒熟性snp分子标记及其应用 |
CN110305978A (zh) * | 2018-03-27 | 2019-10-08 | 华中农业大学 | 一种与辣椒果实朝向紧密关联的snp位点及其通用性分子标记、获取方法和应用 |
US20210139962A1 (en) * | 2017-10-10 | 2021-05-13 | Institute Of Animal Science, Chinese Academy Of Agricultural Sciences | Chicken whole-genome snp chip and use thereof |
CN113736911A (zh) * | 2021-10-19 | 2021-12-03 | 武汉市农业科学院 | 萝卜基因组SNP-Panel及其应用 |
US20220071165A1 (en) * | 2020-09-10 | 2022-03-10 | Sakata Seed America, Inc. | Serrano Pepper Hybrid XHP16823 |
CN114717355A (zh) * | 2022-05-07 | 2022-07-08 | 分子标记(武汉)生物育种有限公司 | 一种西瓜全基因组SNP-Panel |
-
2022
- 2022-10-18 CN CN202211269383.3A patent/CN115679012B/zh active Active
Patent Citations (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2014077464A1 (ko) * | 2012-11-19 | 2014-05-22 | (주)고추와 육종 | 종간교잡을 통해 육성된 탄저병 저항성 고추 품종 및 이를 선별하기 위한 프라이머 세트 |
CN105238859A (zh) * | 2015-10-13 | 2016-01-13 | 中国农业大学 | 一种获取鸡全基因组高密度snp标记位点的方法 |
WO2018085971A1 (zh) * | 2016-11-08 | 2018-05-17 | 南京农业大学 | 棉花全基因组snp芯片及其应用 |
US20210139962A1 (en) * | 2017-10-10 | 2021-05-13 | Institute Of Animal Science, Chinese Academy Of Agricultural Sciences | Chicken whole-genome snp chip and use thereof |
CN110305978A (zh) * | 2018-03-27 | 2019-10-08 | 华中农业大学 | 一种与辣椒果实朝向紧密关联的snp位点及其通用性分子标记、获取方法和应用 |
CN108411027A (zh) * | 2018-05-24 | 2018-08-17 | 武汉市农业科学院 | 一种检测辣椒cms雄性不育恢复基因的caps分子标记引物及应用 |
CN108486276A (zh) * | 2018-06-01 | 2018-09-04 | 江西省农业科学院蔬菜花卉研究所 | 辣椒熟性snp分子标记及其应用 |
US20220071165A1 (en) * | 2020-09-10 | 2022-03-10 | Sakata Seed America, Inc. | Serrano Pepper Hybrid XHP16823 |
CN113736911A (zh) * | 2021-10-19 | 2021-12-03 | 武汉市农业科学院 | 萝卜基因组SNP-Panel及其应用 |
CN114717355A (zh) * | 2022-05-07 | 2022-07-08 | 分子标记(武汉)生物育种有限公司 | 一种西瓜全基因组SNP-Panel |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
HESHAN DU 等: "Target sequencing reveals genetic diversity, population structure, core-SNP markers, and fruit shape-associated loci in pepper varieties", 《BMC PLANT BIOLOGY》, vol. 19, pages 1 - 16 * |
JIAOWEN CHENG 等: "Development of a SNP array and its application to genetic mapping and diversity assessment in pepper (Capsicum spp.)", 《SCIENTIFIC REPORTS》, vol. 6, pages 1 - 11 * |
王昆 等: "基于全基因组SNP分析辣椒亲本间遗传距离与产量性状杂种优势的关系", 《中国蔬菜》, vol. 4, pages 30 - 35 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN117587159A (zh) * | 2023-12-06 | 2024-02-23 | 华智生物技术有限公司 | 一种辣椒snp分子标记组合、snp芯片及其应用 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN115679012B (zh) | 2023-07-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN106636393B (zh) | 与南瓜皮色基因连锁的snp分子标记及其应用 | |
CN108060261B (zh) | 一种对玉米snp标记组合进行捕获测序的方法及其应用 | |
CN107345256A (zh) | 一种基于转录组测序开发山黧豆est‑ssr引物组及方法和应用 | |
CN103555717A (zh) | 一种甜瓜甜味酸味性状相关基因功能性分子标记及应用 | |
CN107090494A (zh) | 与谷子码粒数性状相关的分子标记及其检测引物和应用 | |
CN107090495A (zh) | 与谷子脖长性状相关的分子标记及其检测引物和应用 | |
CN105925721A (zh) | 用于鉴定桃果实表皮着色性状的单核苷酸多态性标记位点、引物、试剂盒及应用 | |
CN106755561A (zh) | 一种与大豆根干重相关的qtl、snp分子标记及应用 | |
CN114717355A (zh) | 一种西瓜全基因组SNP-Panel | |
CN115679012B (zh) | 一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用 | |
CN108642201B (zh) | 与谷子株高性状相关的snp标记及其检测引物和应用 | |
CN114574613A (zh) | 一种小麦-拟鹅观草全基因组液相芯片及应用 | |
CN117965781A (zh) | 一种花生40K液相SNP芯片“PeanutGBTS40K”及其应用 | |
CN106498048A (zh) | 一种与大豆结瘤数相关的qtl、snp分子标记及应用 | |
CN112852989A (zh) | 一种与大豆农艺性状相关的snp位点组合、液相基因芯片及应用 | |
CN117051151A (zh) | 一种辣椒5k液相芯片及其应用 | |
CN107365873B (zh) | 与谷子叶鞘色性状连锁的分子标记及其应用 | |
CN113789407B (zh) | 一种用于油莎豆基因分型的snp分子标记组合及其应用 | |
CN115011717A (zh) | 一种西瓜全基因组SNP-Panel的开发、检测方法及育种应用 | |
CN106755562A (zh) | 一种与大豆根表面积相关的qtl、snp分子标记及应用 | |
CN117821650B (zh) | 一种芋全基因组SNP-Panel及其应用 | |
CN111733278A (zh) | 水稻钠钾离子吸收qtl连锁的snp分子标记及其应用 | |
CN118109639B (zh) | 一种鉴定华中五味子性别的snp分子标记及其应用 | |
CN113549616B (zh) | 鉴定文心兰品种的caps分子标记、筛选方法与应用 | |
CN103725760A (zh) | 水稻的分子标记方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |