CN115667537A - 用于由二氧化碳生产乙烯的方法 - Google Patents

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Abstract

一种方法,所述方法包括:(i)提供包含大于1体积%的二氧化碳的气态流;(ii)提供水;(iii)在光的存在下将二氧化碳和水转化为有机中间体和氧气;(iv)将氧气与有机中间体分离;以及(v)在将氧气与有机中间体分离的所述步骤之后,将有机中间体转化为乙烯和二氧化碳。

Description

用于由二氧化碳生产乙烯的方法
本申请要求于2020年3月20日递交的美国临时申请序列号62/992,689和于2020年7月16日递交的美国临时申请序列号63/052,664的权益。
发明领域
本发明的实施方案提供了用于将二氧化碳转化为乙烯的方法和系统。
发明背景
对化石燃料的长期可用性的关注连同对大气二氧化碳水平的关注已增强了用于经由二氧化碳固定来生产基于石油的产品的生物合成方法的开发。即,利用光合过程来将二氧化碳转化为有用的有机化合物,这些有机化合物可以用作燃料或用于较大有机分子的有机结构单元。
例如,美国专利号7,807,427教导了使用光合生物诸如基因修饰的蓝细菌(cyanobacteria)来将二氧化碳转化成中间产物诸如葡萄糖和乙酸。在随后的步骤中,使用产甲烷细菌来将中间产物转化为甲烷。甲烷可以被收集和储存以用作燃料。
乙烯被广泛认为是用于许多工业的最重要的化学原料,并且已经提出了多种方法以通过二氧化碳固定来生物合成乙烯。
已知丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)在由乙烯形成酶(其被称为“efe”)催化的一步反应中使用TCA循环中间体α-酮戊二酸(alpha-ketoglutarate)来合成乙烯。在目的为由二氧化碳直接生产乙烯的情况下,美国专利号9,309,541公开了用于在宿主诸如集胞藻(Synechocystis)中表达和过表达efe基因以生成能够光养性地生产乙烯的菌株的方法。换言之,通过生物工程,光自养生物被修饰以在一步反应中将碳固定的产物转化为乙烯。虽然目前的研究集中在修饰光自养生物以生产乙烯,但是收获乙烯可能存在挑战。如在Eckert等人,Ethylene-forming enzyme and bioethylene production(乙烯形成酶和生物乙烯生产),BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS 2014,7:33中所概述的,当O2在光合系统中与乙烯联产时,存在关于乙烯在O2存在下的可燃性的重要安全问题,这需要工程设计来降低风险。
发明内容
本发明的一个或多个实施方案提供了一种方法,所述方法包括(i)提供包含大于1体积%的二氧化碳的气态流;(ii)提供水;(iii)在光的存在下将二氧化碳和水转化为有机中间体和氧气;(iv)将氧气与有机中间体分离;(v)在将氧气与有机中间体分离的所述步骤之后,将有机中间体转化为乙烯和二氧化碳。
本发明的其他实施方案提供了一种用于生产乙烯的系统,所述系统包括(i)第一生物反应器,其包括将二氧化碳转化为有机中间体的光合微生物,所述第一生物反应器具有二氧化碳入口和用于有机中间体的出口;以及(ii)第二生物反应器,其与第一生物反应器流体连通并且包括将第一生物反应器中产生的有机中间体转化为乙烯的微生物,所述第二生物反应器具有用于包括乙烯在内的气态材料的出口,并且所述第二生物反应器具有用于包括未反应的有机中间体在内的流体材料的出口。
附图说明
图1是一种用于实施本发明的实施方案的系统的示意图。
图2是本发明的实施方案内的一种用于输送二氧化碳的子系统的示意图。
图3是一种用于实施本发明的实施方案的包括第二光合生物反应器的备选系统的示意图。
图4是一种用于实施本发明的实施方案的包括氧气-燃料燃烧系统的系统的示意图。
图5是一种用于实施本发明的实施方案的包括上游二氧化碳纯化的系统的示意图。
图6是一种适用于本发明的一个或多个实施方案的乙烯纯化和压缩方案的示意图。
图7是一种用于实施本发明的一个或多个实施方案的包括二氧化碳膜分离的备选系统的示意图。
图8是一种用于实施本发明的实施方案的包括单个生物反应器的备选系统的示意图。
具体实施方式
本发明的实施方案至少部分地基于发现一种用于以工业上显著水平由二氧化碳生物合成乙烯的方法。根据本发明的实施方案,首先将二氧化碳光合转化为有机中间体,同时作为副产物产生氧气。然后将副产物氧气与有机中间体分离,然后在明显不存在副产物氧气的情况下将有机中间体生物转化为乙烯。虽然与生物合成乙烯相关的当前技术集中于一步合成,但是本发明的两步方法解决了与以工业上显著水平联产乙烯和氧气相关的安全问题。此外,有机中间体向乙烯的生物转化会产生副产物二氧化碳,这会影响整体碳效率。此外,相对于大多数二氧化碳输入流(例如烟道气),乙烯产物流中的二氧化碳的量是显著的,并且因此如果恰当地管理,则乙烯产物流内的二氧化碳可以成为有价值的资源。因此,本发明的实施方案提供了对于副产物二氧化碳的管理解决方案,这包括但不限于将二氧化碳光合转化为有机中间体,所述有机中间体可以再循环回到将有机中间体生物转化为乙烯的步骤。更进一步地,将有机中间体生物转化为乙烯的步骤可以通过使用工业反应器诸如连续搅拌釜式反应器在商业规模上有效地实现,所述反应器在稳态或接近稳态下运作,这导致有机中间体的不完全消耗、碳效率的损失以及有价值原料的损失。因此,本发明的实施方案通过恰当地管理来自其中将有机中间体转化为乙烯的反应器的流出物流而提供了对于这些问题的解决方案。
方法和系统概述
本发明的实施方案可以参考图1进行描述,图1示出了一种用于将二氧化碳转化为乙烯的系统20。所述系统包括第一生物反应器21,接着是串联的第二生物反应器41。第一生物反应器21经由中间产物导管31直接或间接地与第二生物反应器41流体连通。第二生物反应器41还经由中间体再循环导管33与第一生物反应器21流体连通。二氧化碳分离器61在第二生物反应器41的下游并且经由导管51直接或间接地与第二生物反应器41流体连通。二氧化碳分离器61还可以经由二氧化碳再循环导管53直接或间接地与第一生物反应器21流体连通。
根据本发明的实施方案,第一生物反应器21包括将进料到生物反应器21的二氧化碳和水转化为有机中间体的光合生物培养物(即光合微生物)。这种转化在供应至第一生物反应器21的光能的存在下进行。有机中间体的合成在充当反应介质的过量水的存在下进行,并且过量水充当用于中间产物流的载体。在一个或多个实施方案中,有机中间体可溶于水。如技术人员将理解的,可以将光合生物培养物从接种反应器23供应至生物反应器21。
氧气在生物反应器21内在形成有机中间体期间作为副产物产生。根据本发明的方面,在将中间产物流引入到第二生物反应器41之前将氧气与有机中间体分离。例如,氧气可以与反应器内的其他挥发物(诸如氮气)一起从第一生物反应器21排出。
经由中间产物导管31,将有机中间体在中间产物流内直接或间接地从第一反应器21转移至第二生物反应器41。在一个或多个实施方案中,中间产物流可以在该流离开生物反应器21时进行过滤。在运作期间,在中间产物流离开生物反应器21时过滤该流可以防止用于固定光合微生物的任何介质的转移,并且由此有助于防止微生物从第一生物反应器21转移至第二生物反应器41。
除了在中间产物流离开生物反应器21时过滤该流之外或代替在中间产物流离开生物反应器21时过滤该流,中间产物流可以在位于生物反应器21和生物反应器41之间的一个或多个中间单元处进行过滤和/或灭菌。例如,并且参考图2,任选的灭菌单元35可以定位在第一生物反应器21和第二生物反应器41之间。单元35可以包括过滤单元。除了过滤单元之外或代替过滤单元,单元35可以包括离心单元。或者,在其他实施方案中,除了过滤或离心之外或者代替过滤或离心,单元35可以包括澄清单元(例如沉降罐)。代替过滤、离心和/或澄清或者除了过滤、离心和/或澄清之外,单元35可以包括灭菌单元。例如,灭菌单元可以利用UV灭菌、热或γ辐射来处理中间产物流,可以这样做以防止任何活微生物从第一生物反应器21引入到第二生物反应器41中。
在一个或多个实施方案中,第二生物反应器41包括将有机中间体转化为乙烯的产乙烯生物培养物(即,产乙烯生物)。
如技术人员所理解的,可以设计若干子系统以用于将微生物培养物引入到相应的生物反应器中。本领域技术人员可以容易地设计适当的系统来实现这些目标。例如,并且参考附图,可以将适当的微生物从接种单元23(其也可以被称为接种反应器23)供应至生物反应器21和/或生物反应器41。接种单元23可以包括用于相应微生物的单独的室或容器,或者可以为相应微生物提供单独的单元。同样,可能期望从这些生物反应器中的一个或多个中移除生物质。在一个或多个实施方案中,本发明的系统可以包括生物质消化单元25,其中从这些生物反应器中的任一者或二者获得的生物质可以从任何固定化支撑介质中移除并且从系统中移除。在运作期间,生物质消化单元25可以与生物反应器21、41中的任一者或二者流体连通,或者生物质(任选地与固定化材料一起)可以手动地从相应的反应器中移除。在一个或多个实施方案中,生物质可以转化为营养物(诸如氨基酸),并且返回至生物反应器作为用于微生物的营养物来源。备选地,生物质可以从系统中移除并且用于其他用途诸如肥料等。
二氧化碳作为在生物反应器41内的乙烯合成的副产物产生,并且乙烯和二氧化碳作为气态产物流从第二生物反应器41中移除。液体流出物流也离开第二生物反应器41。这种液体流出物流可以包括水和未反应的有机中间体,并且该流可以经由有机中间体再循环导管33被输送回到第一生物反应器21。如图2中最佳显示的,包括水和未反应的有机中间体的液体流出物流可以在过滤/灭菌单元37处经历过滤和/或灭菌。这种过滤和/或灭菌可以利用与单元35相同类型的技术,并且因此将以上关于单元35的讨论结合于此。如技术人员所理解的,这可以用于确保产乙烯微生物不会迁移到第一生物反应器21中。
离开第二生物反应器41的气态产物流在第二生物反应器41的下游直接或间接地经由导管51被输送至二氧化碳分离器61(其也可以被称为二氧化碳分离单元61)。在分离器61(其也可以被称为分离器系统61)内,二氧化碳从气态产物流中分离以提供浓缩的乙烯流,其也可以被称为富含乙烯的流,其通过导管53运送。这种富含乙烯的流可以输送到下游纯化和加压单元100,其将在本文中更详细地讨论。分离器61还产生浓缩的二氧化碳流,其也可以被称为纯化的二氧化碳流,并且这种浓缩的二氧化碳流可以经由导管55输送回到第一生物反应器21中。
在备选的实施方案中(其可以参考图3进行描述),由二氧化碳分离器61产生的纯化的二氧化碳流可以经由导管57输送至包括光合生物培养物的中间生物反应器71(其可以被称为第二光合生物反应器71),所述光合生物培养物将二氧化碳光合转化为有机中间体和氧气。有利地,由于进入生物反应器71的二氧化碳进料流是纯化的二氧化碳流(经由二氧化碳分离器61),所以离开第二光合生物反应器71的气态副产物流包括相对纯的氧气流,其可以经由导管75输送。技术人员将理解,在本发明的上下文中,相对纯的氧气流包括基本上没有氮气和氩气的那些流,否则其将需要复杂且昂贵的过程以将氮气和氩气与氧气分离(例如空气分离技术)。然而,除非另有说明,否则在本文所定义的相对纯的氧气流中二氧化碳的存在是无害的,并且因此可以存在于相对纯的氧气流内,因为二氧化碳可以更容易地从氧气流中分离。与第一生物反应器21一致,中间生物反应器71产生可以包含有机中间体和水的流出物流,所述流出物流可以经由导管79输送回到第一生物反应器21和/或第二生物反应器41中。如通常所示的,这种流出物流可以经历如参考图2所述的在单元37处的过滤和/或灭菌。
如贯穿附图所示的,离开第二生物反应器41的气态流(其经由导管51输送)在单元61处的二氧化碳分离之前可以任选地经历一种或多种处理或操纵。例如,可以在压缩单元43处对流进行加压。除了加压之外或代替加压,气态流可以任选地经历处理以在除氧单元45处移除氧气。由于可以在除氧单元45处产生二氧化碳,所以将除氧单元45定位在二氧化碳分离单元61(其中可以移除在单元45处产生的二氧化碳)的上游可能是有益的。
可以参考图8来描述本发明的又一个实施方案。如所示的,代替关于上述的其他系统所示的两个生物反应器21、41,方法120包括单个容器121,其也可以被称为集成生物反应器121。在运作期间,供应至生物反应器121的光能以产生亮循环和暗循环的方式进行控制。在运作期间,集成生物反应器121内的光合微生物在亮循环期间将二氧化碳转化为有机中间体,然后在暗循环期间,集成生物反应器121内的乙烯形成微生物在暗循环期间将有机中间体转化为乙烯。在亮循环期间可以将氧气在其产生期间从生物反应器121中移除,并且在暗循环期间可以将乙烯在其产生期间从生物反应器121中移除。与其他实施方案一致,乙烯可以与二氧化碳联产,并且乙烯和二氧化碳可以在如上所述的下游过程中分离(例如在二氧化碳洗涤器61处)。
返回到图2,本发明的方法可以包括调节二氧化碳输入流(即,在将该流提供到生物反应器21中之前对该流进行调节)。在一个或多个实施方案中,通过导管11运送的二氧化碳输入流可以在压缩机13处加压。在一个或多个实施方案中,二氧化碳输入流的加压(例如在压缩机13内)实现足以克服第一生物反应器21内的反作用力的压力,使得输入流内的惰性气体(例如氮气)可以最终进入反应器的顶部空间。在一个或多个实施方案中,将二氧化碳输入流加压至约2至约20psig的压力,在其他实施方案中加压至约3至约18psig的压力,并且在其他实施方案中加压至约5至约15psig的压力。
此外,如图2中最佳显示的,二氧化碳输入流可以在经由导管17输送至生物反应器21之前在骤冷器15处被冷却。如技术人员将理解的,骤冷器15可以包括水冷单元(包括骤冷水回路15'),其可以包括一个或多个用于使水冷却的热交换器。在一个或多个实施方案中,将二氧化碳输入流冷却至这样的温度,低于所述温度则将对生物反应器21内的微生物培养物具有有害影响。在一个或多个实施方案中,在输送至生物反应器21之前,将二氧化碳输入流冷却至约10至约80℃的温度,在其他实施方案中冷却至约20至约60℃的温度,并且在其他实施方案中冷却至约30至约50℃的温度。
因为一个或多个实施方案的二氧化碳输入流可以包括可观量的水,并且至少一部分的水将经由在骤冷器15处的冷却循环被冷凝,所以可以将来自骤冷器15的水进料到第一生物反应器21,其消耗大量的水。在一个或多个实施方案中,在骤冷器15处采用的水和/或输送至第一生物反应器21的水流可以用苛性碱处理以调节水的pH。在一个或多个实施方案中,将在骤冷器15处采用的水和/或从骤冷器15输送至第一生物反应器21的水的pH调节至大于5.5,在其他实施方案中调节至大于6.0,并且在其他实施方案中调节至大于6.5(例如在5.5-8.0或6.0-7.5的范围内)。预计水的苛性碱处理将形成碳酸盐(诸如碳酸钠),这不仅关于pH控制有益于第一生物反应器21,而且还以碳酸钠和/或碳酸氢钠的形式提供额外的二氧化碳来源。本领域技术人员可以容易地调整条件和/或提供额外的成分(例如盐酸)以在碳酸钠和碳酸氢钠之间产生期望的平衡。在特定的实施方案中,提供至骤冷器15内的骤冷水的苛性钠来源于可以与本发明的实践整合的其他过程。例如,乙烯纯化可以使用苛性钠和/或产生可以与骤冷器15整合的碳酸钠。
在其他实施方案中,离开第二生物反应器41的液体流出物流(其如关于其他实施方案所描述的可以被输送回到第一生物反应器21)可以任选地被输送到骤冷器15。在一个或多个实施方案中,离开第二生物反应器41的液体流出物流在输送到骤冷器15之前首先在灭菌站37处进行处理。
进入第一生物反应器的二氧化碳进料流
本发明的方法可以有利地将来自各种各样的气态来源的二氧化碳(其可以被称为二氧化碳输入流)转化为有用的中间体(其可以被转化为乙烯)。在一个或多个实施方案中,通过二氧化碳输入流将二氧化碳提供给系统,所述二氧化碳输入流包括大于1体积%、在其他实施方案中大于3体积%、在其他实施方案中大于5体积%并且在其他实施方案中大于10体积%的二氧化碳。在一个或多个实施方案中,二氧化碳输入流是或来源于燃烧过程的排气流(即烟道气流)。如技术人员所理解的,排气流的组成可以基于包括燃烧过程的设计和在燃烧过程中被燃烧的燃料在内的若干因素而变化。例如,烟道气流可以来源于燃煤炉、燃气炉、涡轮发电机和氧燃料燃烧过程。
在一个或多个实施方案中,二氧化碳输入流可以来源于氧燃料燃烧过程的排气流,所述过程也可以被称为氧燃烧(oxycombustion)。本领域技术人员理解,这些过程包括燃料(例如烃)在基本上不存在氮气和氩气的情况下的燃烧。例如,这些过程可以包括燃烧过程,其中将基本上纯的氧气(即基本上不含氮气和氩气)或者纯氧气和再循环烟道气的混合物进料至燃烧过程。作为结果,燃烧产物主要是二氧化碳和水,而氮气副产物或氩气非常低。有利地,因为来自氧燃烧过程的二氧化碳输入流包括显著水平的二氧化碳,并且基本上没有氮气和氧气,所以来自光合生物反应器的气态副产物流将包括基本上高浓度的氧气以及任何未反应的二氧化碳。来自光合生物反应器的气态副产物流然后可以再循环回到氧燃烧单元作为氧燃烧过程内的燃料,其中任何未反应的二氧化碳为氧燃烧过程提供冷却。
例如,并且参考图4,本发明的一个实施方案包括来自氧燃烧单元18的二氧化碳输入流。与之前的实施方案一样,利用第一生物反应器21将二氧化碳光合转化为有机中间体与副产物氧气。包括氧气和未反应的二氧化碳的副产物氧气流经由导管22被输送至氧燃烧单元18。此外,尽管未示出,但是来自氧燃烧单元18的二氧化碳输入流可以如上文关于其他实施方案(参见例如图2)所描述的进行冷却和加压。在第一生物反应器21中产生的中间产物以与其他实施方案一致的方式在下游被输送到第二生物反应器41。
在其他实施方案中,可以将相对纯的二氧化碳流进料到第一生物反应器21中。相对纯的二氧化碳流可以从多个来源获得并且通常包括含有大于90体积%、在其他实施方案中大于95体积%并且在其他实施方案中大于99体积%的二氧化碳的那些流。如上所解释的,在使用相对纯的二氧化碳流的情况下,本发明的方法产生相对纯的氧气流(即基本上不含氮气或氩气),作为从第一生物反应器21输出的副产物。这些相对纯的氧气流可以例如用于工业应用诸如乙烯的氧氯化。
在一个或多个实施方案中,作为本发明的一个步骤产生相对纯的二氧化碳流并且其用作输入流。例如,含有二氧化碳的输入流可以在将该流引入到第一生物反应器21中之前进行纯化和/或浓缩。在一个或多个实施方案中,可以通过使用例如胺洗涤和汽提技术来纯化二氧化碳输入流。与之前的实施方案中的一个或多个一样,通过向第一生物反应器中提供纯化的二氧化碳流,可以产生相对高等级的氧气流,作为离开第一生物反应器的副产物流。技术人员将理解,除了胺洗涤和汽提技术之外或代替胺洗涤和汽提技术,可以使用各种各样的二氧化碳移除和分离技术来纯化和/或浓缩二氧化碳流。这些技术包括但不限于膜分离、固体吸附剂以及使用其他溶剂化学诸如碳酸钾。
一个示例性实施方案可以参考图5进行描述,图5示出了系统50,其包括第一生物反应器21,所述第一生物反应器21从二氧化碳纯化单元16接收二氧化碳输入流。纯化单元16产生纯化的二氧化碳流,其经由导管11'被引入到第一生物反应器21中。尽管未示出,但是来自燃烧单元的二氧化碳输入流可以如上文关于其他实施方案(参见例如图2)所描述的进行冷却和加压。二氧化碳在生物反应器21中被光合转化为有机中间体与副产物氧气。副产物氧气经由导管24直接或间接地输送到例如需要相对高纯度氧气的工业过程26。在一个或多个实施方案中,在生物反应器41处产生的乙烯也可以被输送到工业过程26。尽管在图5中未示出,但是应当理解,来自第二生物反应器41的乙烯流经历如关于其他实施方案所描述的下游处理,包括但不限于氧气转化、二氧化碳移除(以及再循环回到光合生物反应器)和乙烯纯化。
同样,在其中光合生物反应器生成相对纯的氧气副产物流(其可以来源于使用相对纯的二氧化碳流)的那些实施方案中,相对纯的氧气流可以用于工业应用。在一个或多个实施方案中,离开光合生物反应器的气态流可以经历二氧化碳移除以移除氧气流中的任何未反应的二氧化碳。然后,可以将氧气流输送至所需的工业应用。例如,可以将来自这些实施方案的氧气流输送至氧氯化单元,其中乙烯在氧气的存在下与盐酸反应。在这个实例中,乙烯可以来源于产乙烯的生物反应器。应当理解,来自产乙烯的生物反应器的乙烯流将经历如关于其他实施方案所描述的二氧化碳移除和乙烯纯化。
二氧化碳分离
在一个或多个实施方案中,下游二氧化碳分离(例如在二氧化碳分离单元61处)可以通过使用常规的胺洗涤/汽提来进行。可以使用各种各样的其他二氧化碳分离技术,包括但不限于使用碳酸钾的溶剂分离、膜分离和固体吸附剂分离。
如技术人员所理解的,胺洗涤和汽提技术或方法通常包括水载体内的有机胺对二氧化碳的吸收(即洗涤),以及随后的二氧化碳从有机胺的再生或释放(即汽提)。这些系统和使用它们的技术在本领域中是众所周知的,如在美国公开号2009/0038314、2009/0156696和2013/0244312(它们通过引用结合于此)中描述的。也可以参考EngineeringData Book(工程数据手册),第II卷,第17-26节;Gas Processors Suppliers Assoc.(1994)。
代替胺洗涤/汽提或除了胺洗涤/汽提之外,可以采用膜分离技术。如技术人员所理解的,这些膜可以包括允许二氧化碳通过渗透物的聚合物或无机微孔膜。这些膜和使用它们的技术是众所周知的,如在美国公开号2008/0173179和2013/0312604(它们通过引用结合于此)中描述的。在实施本发明时,在使用膜分离代替胺洗涤/汽提技术的情况下,可能期望移除残余乙烯,所述残余乙烯可能会迁移到渗透物流中并且因此则将被输送回到固定反应器(即第一生物反应器),然后最终迁移到氧气流中。在这方面,参考图7,图7示出了包括膜分离单元61'的备选系统20',其中二氧化碳的渗透物流经由导管73在下游输送到乙烯处理单元75,所述乙烯处理单元75可以适用于催化处理该流,以在渗透物流经由导管51'被输送回到生物反应器21之前移除(例如经由催化燃烧)渗透物流中的任何残余乙烯。
乙烯纯化
如上所述,第二生物反应器41的含有乙烯的产物流的二氧化碳分离(例如在分离器61内)产生通过导管53运送的富含乙烯的流。这种富含乙烯的流可以在子过程100内经历纯化和任选的压缩以供后续使用以及任选的运输,这参照图6最佳地进行描述。在一个或多个实施方案中,子过程100利用一种或多种技术来处理经由导管53提供的富含乙烯的流。例如,富含乙烯的流可以在任选的氧气移除单元101处经历氧气移除。在该单元内,富含乙烯的流内的残余氧气被例如一部分的乙烯的催化燃烧所消耗。在一个或多个实施方案中,子过程100可以包括乙烯流在苛性碱洗涤单元103处的精制,这移除了任何残余的二氧化碳(例如将二氧化碳的水平降低至小于10ppm、或小于5ppm、或小于3ppm)。在苛性碱洗涤单元103的下游,富含乙烯的流可以在脱水单元105处经历脱水,所述脱水单元105可以包括使用分子筛的脱水单元。在脱水后,富含乙烯的流可以在冷凝器107处冷凝,所述冷凝器107可以通过丙烯制冷单元108进行冷却。技术人员将理解,根据多种因素,可以改变多个纯化步骤的顺序。此外,技术人员将理解,可以进行纯化过程的多个步骤以实现所需的压力,其可能是使用或运输(例如经由管线)所需的。为此,可以在纯化步骤之前、之后或两个以上纯化步骤之间对富含乙烯的流进行加压。例如,如图6所示,可以在压缩单元99处对流进行加压。同样,进一步的加压可以在乙烯产物泵109处进行。
光合微生物
如上所述,第一生物反应器含有光合生物培养物,其含有一种或多种类型的光合微生物,所述光合微生物在光能的存在下将二氧化碳和水转化为有机中间体。在多个实施方案中,光合微生物可以是天然存在的。在其他实施方案中,可以对光合微生物进行基因修饰以改善所需有机中间体的生产。在一个或多个实施方案中,与第一生物反应器一起利用的光合微生物可以包括光合细菌诸如蓝细菌。如本领域技术人员所理解的,光合细菌在光的存在下消耗二氧化碳和水而固定碳。有利地,在有氧条件期间蓝细菌的代谢途径的主要产物是氧气和有机中间体(诸如糖)。本领域普通技术人员将能够在无需过度实验的情况下选择合适的光合微生物,以产生所需的有机中间体。
在一个或多个实施方案中,所需的有机中间体包括蔗糖、右旋糖、木糖、葡萄糖、果糖、α-酮戊二酸或它们的混合物。
示例性的光合微生物包括但不限于蓝细菌、藻类和紫细菌。可用的蓝细菌类型包括进行生氧光合作用(oxygenic photosynthesis)的光合原核生物。可用于本文所述目的的蓝细菌在本领域中通常是熟知的(参见例如Donald Bryant,The Molecular Biology ofCyanobacteria(蓝细菌分子生物学),由Kluwer Academic Publishers(1994)出版,其公开内容通过引用整体结合于此)。代表性的实例包括聚球藻(Synechococcus)属中的蓝细菌,诸如灰蓝聚球藻(Synechococcus lividus)和细长聚球藻(Synechococcus elongatus);和集胞藻(Synechocystis)属中的蓝细菌,诸如米纳瓦集胞藻(Synechocystis minervae)和集胞藻Sp PCC 6803(Synchocystis Sp PCC6803)。在这方面,将美国专利号7,807,427通过引用整体结合于此。可以使用的合成微生物的实例包括在美国专利号10,196,627中公开的那些,所述专利通过引用整体结合于此。其他实例包括在美国专利号9,914,947和9,309,541中公开的那些微生物,所述专利通过引用整体结合于此。
在一个或多个实施方案中,将蓝细菌进行基因修饰以表达一个或多个外源基因,所述外源基因编码提供目标有机中间体的增强产生的一种或多种酶。在一个或多个实施方案中,目标有机中间体包括蔗糖、右旋糖、木糖、葡萄糖、果糖和α-酮戊二酸。如对本领域技术人员而言显而易见的,添加到蓝细菌的基因组中的特定基因(以及产生的酶)将取决于特定的目标有机中间体。
在一个或多个实施方案中,修饰的光合微生物包括修饰的核苷酸序列,其产生由二氧化碳形成α-酮戊二酸的酶。在某些实施方案中,这种修饰的光合微生物通过表达形成非天然AKGP的核苷酸序列来表达α-酮戊二酸通透酶蛋白(AKGP)。在一个或多个实施方案中,与缺乏修饰的核苷酸序列的对照微生物所产生的量相比,修饰的微生物产生更多量的酶。这个量可以为缺乏修饰的核苷酸序列的对照微生物所产生的量的大于1%、在其他实施方案中大于50%并且在其他实施方案中大于75%。
在一个或多个实施方案中,α-酮戊二酸(aKG)可以通过异柠檬酸脱氢酶(ICD)对异柠檬酸的氧化脱羧而产生或者通过谷氨酸脱氢酶(GDH)对谷氨酸的氧化脱氨而产生。用于在蓝细菌中克隆和aKG生产的目标酶可以包括ICD酶:1.1.1.42,荧光假单胞菌(P.Fluorescens)ICD的编码序列(SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:2),ICD酶:1.1.1.42,细长聚球藻(Synechococcus elongatus)PCC794的编码序列(SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:4),以及GDH酶:1.4.1.2,荧光假单胞菌(P.Fluorescens)的编码序列(SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:6)。
在一个或多个实施方案中,用于形成α-酮戊二酸的酶选自异柠檬酸脱氢酶(ICD)蛋白、谷氨酸脱氢酶(GDH)蛋白或它们的组合。
在某些实施方案中,修饰的光合微生物通过表达修饰的ICD蛋白核苷酸序列(其具有与SEQ ID NO:2至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的核苷酸序列)而表达具有与SEQ ID NO:1至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的氨基酸序列的ICD蛋白。在某些实施方案中,修饰的微生物通过表达修饰的ICD蛋白核苷酸序列(其具有与SEQ ID NO:4至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的核苷酸序列)而表达具有与SEQ ID NO:3至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的氨基酸序列的ICD蛋白。在某些实施方案中,修饰的微生物通过表达修饰的GDH蛋白核苷酸序列(其具有与SEQ ID NO:6至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的核苷酸序列)而表达具有与SEQ ID NO:5至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的氨基酸序列的GDH蛋白。
在一个或多个实施方案中,有机中间体是蔗糖。在这些实施方案中的一些中,例如,蓝细菌(细长聚球藻(Synechococcus elongatus)、集胞藻(Synechocystis))可以被改造以产生蔗糖,从而用作用于产乙烯微生物的生长的底物。用于改造细长聚球藻PCC 7942以产生蔗糖的各种方法可以包括激活一个基因(cscB)和缺失一个基因(GlgC)。
在这些实施方案的一个或多个中,修饰的光合微生物表达蔗糖合酶蛋白。在一个或多个实施方案中,通过表达修饰的蔗糖合酶蛋白核苷酸序列(其具有与SEQ ID NO:10至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的核苷酸序列),蔗糖合酶蛋白具有与SEQ ID NO:9至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的氨基酸序列。在这些实施方案的一个或多个中,修饰的微生物表达蔗糖磷酸合酶蛋白。在一个或多个实施方案中,通过表达修饰的蔗糖磷酸合酶蛋白核苷酸序列(其具有与SEQ ID NO:12至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的核苷酸序列),蔗糖磷酸合酶蛋白具有与SEQ IDNO:11至少98%、或至少95%、或至少90%、或至少85%同一性的氨基酸序列。
如本文所使用的,序列同一性是如通过比较序列确定的两个以上氨基酸(多肽或蛋白质)序列或两个以上核酸(多核苷酸)序列之间的关系。序列同一性或相似性典型地在相应序列的整个长度上进行比较。技术人员理解,“同一性”是指氨基酸或核酸序列之间的序列相关性程度,根据具体情况,如由这样的序列的串之间的匹配所确定的。两个氨基酸序列之间的“相似性”是通过比较一个多肽的氨基酸序列及其保守氨基酸置换体与第二个多肽的序列来确定的。技术人员可以通过各种已知方法容易地计算“同一性”和“相似性”。例如,确定同一性和相似性的方法编码在可公开获得的计算机程序中,诸如BestFit、BLASTP(蛋白质基本局部比对搜索工具,Protein Basic Local Alignment Search Tool)、BLASTN(核苷酸基本局部比对搜索工具,Nucleotide Basic Local Alignment Search Tool)、FASTA(Altschul,S.F.等人,J.Mol.Biol.215:403-410(1990),可从NCBI和其他来源(BLAST.RTM.Manual,Altschul,S.等人,NCBI NLM NIH Bethesda,Md.20894)公开获得,以及EMBOSS(欧洲分子生物学开放软件套件,European Molecular Biology Open SoftwareSuite)。使用EMBOSS进行氨基酸序列比较的示例性参数是缺口打开(gap open)10.0、缺口扩展(gap extend)0.5、Blosum矩阵。使用EMBOSS进行核酸序列比较的示例性参数是缺口打开10.0、缺口扩展0.5、DNA全矩阵(DNA同一性矩阵)。如技术人员所理解的,可以使用在线数据诸如Gene bank、KEG、BLAST和Ensemble来比较不同物种之间的DNA/蛋白质序列以确定序列的同源性。技术人员还可以考虑到所谓的“保守”氨基酸置换,其是指具有相似侧链的残基的互换性。例如,一组具有脂族侧链的氨基酸是甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸;一组具有脂族羟基侧链的氨基酸是丝氨酸和苏氨酸;一组具有含酰胺侧链的氨基酸是天冬酰胺和谷氨酰胺;一组具有芳族侧链的氨基酸是苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸;一组具有碱性侧链的氨基酸是赖氨酸、精氨酸和组氨酸;并且一组具有含硫侧链的氨基酸是半胱氨酸和蛋氨酸。本文公开的氨基酸序列的置换变体是其中所公开序列中的至少一个残基已被移除并且在其位置插入了不同残基的那些。优选地,氨基酸变化是保守的。每种天然存在的氨基酸的优选保守置换如下:Ala到ser;Arg到lys;Asn到gln或his;Asp到glu;Cys到ser或ala;Gln到asn;Glu到asp;Gly到pro;His到asn或gln;Ile到leu或val;Leu到ile或val;Lys到arg;gln或glu;Met到leu或ile;Phe到met、leu或tyr;Ser到thr;Thr到ser;Trp到tyr;Tyr到trp或phe;以及Val到ile或leu。
除非另有说明,否则术语“适应的”或“密码子适应的”是指如本文所公开的多核苷酸的“密码子优化”,其序列可以是天然的或非天然的,或者可以适应于在其他微生物中进行表达。密码子优化使得用于编码多肽的密码子使用适应在其中表达多肽的生物的密码子偏好。密码子优化通常有助于提高宿主细胞中的编码多肽的产生水平。
在某些实施方案中,修饰的光合微生物包括缺乏葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶蛋白表达的δ-glgc(Δglgc)突变微生物。类似地,缺乏功能性ADP-葡萄糖焦磷酸化酶的蓝细菌细胞是已知的,如在美国专利号9,309,541和9,309,541(它们通过引用整体结合于此)中描述的。
产乙烯微生物
如上所述,产乙烯生物包括通过消耗光合生物反应器中产生的有机中间体而天然产生乙烯或被基因修饰为通过消耗光合生物反应器中产生的有机中间体而产生乙烯的那些生物。在一个或多个实施方案中,与第二生物反应器一起使用的微生物包括表达或已被基因修饰为表达乙烯形成酶(efe)基因的那些微生物。这些微生物在本文中可以被称为efe形成微生物。产生乙烯或已被修饰为产生乙烯的微生物在本领域是熟知的,并且可以使用能够在所述反应条件下由目标有机中间体产生乙烯的任何微生物。在一个或多个实施方案中,所需微生物不产生任何将会干扰本文所述方法的其他物质。
示例性的efe形成微生物包括丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)、丁香假单胞菌大豆致病变种(Pseudomonas syringae pv.Glycinia)和指状青霉(Penicilliumdigitatum),它们全部都天然表达efe。在其他实施方案中,第二反应器内的微生物包括修饰的微生物,其表达或过表达efe基因,诸如天然存在于丁香假单胞菌或指状青霉中的efe基因。在这些实施方案中,为了这样做,使用本领域已知的众多方法中的任一种来将一种或多种efe基因的一个或多个拷贝转染到宿主微生物中。可用的宿主微生物可以包括但不限于大肠杆菌(Escherichia coli)(E.Coli)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)、绿色木霉(Trichoderma viride)和里氏木霉(Trichoderma reesei)。
在一个或多个实施方案中,可以如在Wang,J.P.等人,“Metabolic engineeringfor ethylene production by inserting the ethylene-forming enzyme gene(efe)atthe 16S rDNA sites of Pseudomonas putida KT2440(通过在恶臭假单胞菌KT2440的16SrDNA位点处插入乙烯形成酶基因(efe)进行乙烯生产的代谢改造)”BiosourceTechnology,(2010)101:6404-6409(其公开内容通过引用整体结合于此)中所述来产生用于产生efe的修饰的微生物。在这些实施方案中,efe基因从丁香假单胞菌大豆致病变种(P.syringae pv.glycinea)ICMP2189克隆并且使用双交叉重组插入到恶臭假单胞菌KT2440宿主的一个或多个16S rDNA位点中。
如上所述,在一个或多个实施方案中,产生efe酶的微生物将包括基因改造的微生物。在一个或多个实施方案中,efe形成微生物是在其DNA内包括一个或多个在表达时产生efe的外源核苷酸序列的修饰的微生物。在一个或多个实施方案中,与缺乏修饰的核苷酸序列的对照微生物所产生的量相比,修饰的微生物产生更多量的efe酶。这个量可以为缺乏修饰的核苷酸序列的对照微生物所产生的量的大于5%、在其他实施方案中大于50%并且在其他实施方案中大于75%。在多个实施方案中,基因修饰的微生物将被修饰以含有在表达时产生efe的外源核苷酸序列的两个以上拷贝,从而进一步改善乙烯生产。
在一个或多个实施方案中,可以将编码萨氏假单胞菌菜豆致病变种(Pseudomonassavastanoi pv.Phaseolicola)efe蛋白的多核苷酸(GenBank:KPB44727.1,SEQ ID NO:8)克隆到pET-30a(+)载体质粒中。相应的核苷酸序列也可以是适应于在大肠杆菌中表达的密码子(SEQ ID NO:7),并且在C-末端处含有任选的His标签,随后是终止密码子和HindIII位点。NdeI位点也可以用于在5-引物端(5-prime end)进行克隆,其中NdeI位点含有ATG起始密码子。在多个实施方案中,可以使用重组质粒来转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞。
在一些实施方案中,在LacI基因的存在下,可以通过IPTG诱导型启动子(pTrc)来激活ann氨苄青霉素盒;LacI基因可以由LacIq启动子(SEQ ID NO:13)调控。
在某些实施方案中,通过表达具有与SEQ ID NO:8至少95%、或至少90%、或至少80%同一性的核苷酸序列的非天然efe蛋白核苷酸序列,乙烯形成重组微生物表达具有与SEQ ID NO:7至少95%、或至少90%、或至少80%同一性的氨基酸序列的efe蛋白。
技术人员理解,可能有益的是固定微生物以增加产率并且帮助管理过程内的微生物(例如,帮助从产物流或反应介质中分离微生物)。在一个或多个实施方案中,微生物被固定至支撑介质诸如但不限于高表面积支撑介质。可用的高表面积支撑材料可以包括海绵、纤维材料、生物球、陶瓷过滤器等。
第一生物反应器(光合生物反应器)
再次参考附图,第一生物反应器21可以包括单个反应容器,或者它可以包括多个(即两个以上)反应容器,其可以以互补方式运作。例如,两个以上的反应器容器可以并联或串联运作以有利于所需的光合反应。
技术人员通常理解应由第一生物反应器21保持以维持微生物并促进所需光合反应的适当条件。在一个或多个实施方案中,水既是反应物又用作第一生物反应器21内的反应介质。
在一个或多个实施方案中,光合生物反应器内的反应器介质的温度保持在约25至约70℃、在其他实施方案中约35至约60℃并且在其他实施方案中约40至约50℃。在这些或其他实施方案中,光合生物反应器内的反应介质的pH保持在约5.0至约8.5、在其他实施方案中约5.5至约8.0并且在其他实施方案中约6.0至约7.0。
在一个或多个实施方案中,光合生物反应器基本上没有产生或适于产生efe基因的微生物。
在一个或多个实施方案中,第一生物反应器包括至少一个用于将至少反应物(例如二氧化碳)引入到生物反应器中的入口。在这些或其他实施方案中,第一生物反应器包括至少一个用于从生物反应器中移除至少一种产物或至少一种副产物的出口。在一个或多个实施方案中,第一生物反应器21包括用于气态产物/副产物的出口和用于液体流出物的出口。在一个或多个实施方案中,要不是存在入口和出口,生物反应器21会是封闭系统。在其他实施方案中,生物反应器21是开放系统。在一个或多个实施方案中,第一生物反应器选自连续搅拌釜式反应器、气升反应器、环管反应器和流化床反应器。在一个或多个实施方案中,第一生物反应器的容量大于10,000加仑、在其他实施方案中大于100,000加仑、在其他实施方案中大于1,000,000加仑。
第二生物反应器(产乙烯的生物反应器)
再次参考附图,第二生物反应器41可以包括单个反应容器,或者它可以包括多个(即两个以上)反应容器,其可以以互补方式运作。例如,两个以上的反应器容器可以并联或串联运作以有利于将中间体转化为乙烯的所需反应。
技术人员通常理解应由第二生物反应器保持以维持微生物并促进所需的乙烯形成反应的适当条件。在一个或多个实施方案中,水用作第二反应器中的反应介质。
在一个或多个实施方案中,乙烯形成生物反应器内的反应器介质的温度保持在约25至约70℃、在其他实施方案中约35至约60℃并且在其他实施方案中约40至约50℃。在这些或其他实施方案中,乙烯形成生物反应器内的反应介质的pH保持在约6.0至约9.5、在其他实施方案中约6.5至约9.0并且在其他实施方案中约7.0至约8.0。
在一个或多个实施方案中,乙烯形成生物反应器基本上没有产生或适于产生氧气的微生物。例如,第二生物反应器没有或基本上没有光合微生物(例如通过卡尔文循环(Calvin Cycle)运作的微生物)。
在一个或多个实施方案中,乙烯形成生物反应器保持在缺氧条件下。在一个或多个实施方案中,乙烯形成生物反应器保持在基本上不存在光能的情况下。
在一个或多个实施方案中,第二生物反应器包括至少一个用于将有机中间体产物流引入到生物反应器中的入口。在这些或其他实施方案中,第二生物反应器包括至少一个用于从第二生物反应器移除产物(例如用于乙烯气体的气态物出口)和至少一种副产物(例如二氧化碳)的出口。在一个或多个实施方案中,第二生物反应器还包括用于移除液体流出物(例如水和未反应的有机中间体)的流出物出口。在一个或多个实施方案中,第二生物反应器选自连续搅拌釜式反应器、环管反应器和流化床反应器。在一个或多个实施方案中,第二生物反应器的容量大于10,000加仑、在其他实施方案中大于100,000加仑、在其他实施方案中大于1,000,000加仑。在一个或多个实施方案中,要不是存在反应物入口以及产物或副产物出口,第二生物反应器会适于提供封闭系统。
在一个或多个实施方案中,第二反应器内的微生物的浓度可以基于每单位体积的反应器的干细胞重量来量化。例如,在一个或多个实施方案中,第二反应器中的微生物浓度大于10克干细胞重量/升、在其他实施方案中大于50克干细胞重量/升并且在其他实施方案中大于100克干细胞重量/升。
用于形成重组微生物的技术
在某些实施方案中,将用于表达中间体形成酶或用于efe的核苷酸序列插入到微生物表达载体中。在多个实施方案中,微生物表达载体可以包括细菌载体质粒、同源重组系统的核苷酸向导(nucleotide guide)、抗生素抗性系统、用于蛋白质纯化和检测的辅助系统、CRISPR CAS系统、噬菌体展示系统或它们的组合。
如上所述,在一个或多个实施方案中,可以将表达efe的核苷酸序列的多个拷贝插入到乙烯形成微生物中。类似地,可以将表达中间体酶的核苷酸序列的多个拷贝插入到光合微生物中。插入到载体和/或宿主基因组中的基因的拷贝数量在本文中称为“拷贝数”。在某些实施方案中,表达efe的核苷酸序列在微生物表达载体中的拷贝数大于1、在其他实施方案中大于10、在其他实施方案中大于100并且在其他实施方案中大于250。将显而易见的是,对表达efe的核苷酸序列的多个拷贝进行表达可以增加乙烯产率,从而降低商业规模的乙烯生产的体积和成本。
在某些实施方案中,微生物表达载体包括至少一种微生物表达启动子。如本领域技术人员将理解的,微生物表达启动子是启动随后的、通常相邻的DNA序列的转录的核苷酸序列,并且可以是组成型的或诱导型的。在某些实施方案中,至少一种微生物表达启动子可以包括但不限于光敏启动子、化学敏感启动子、温度敏感启动子、Lac启动子、T7启动子、CspA启动子、λPL启动子、λCL启动子、连续生产启动子、psbA启动子或它们的组合。在某些实施方案中,可以将至少一种启动子诱导剂添加到生物反应器或生物反应器内的反应介质中以控制有机中间体的量和/或产生的乙烯的量。在某些实施方案中,启动子诱导剂包括乳糖、木糖、IPTG、冷激、热激或它们的组合。
在一个或多个实施方案中,ICD和GDH基因可以使用克隆到pSyn6质粒构建体(pSyn6_ICD和pSyn6_GDH)中的gBlocksTM基因片段来合成。为了克隆到pSyn6质粒中,细长聚球藻(S.elongatus)ICD编码序列的两侧是N-末端HindIII和C-末端BamHI识别位点(SEQ IDNO:4)。使用质粒构建体,可以将ICD和GDH基因克隆到未修饰的细长聚球藻或细长聚球藻Δglgc突变菌株中(参见实施例2)。可以转化目标基因的1-3个拷贝。ICD和GCH基因的克隆可以通过PCR和测序来确认。aKG合成和定量可以通过SDS-PAGE、蛋白质印迹(Western Blot)和乙烯生产测定进行评估。
在一个或多个实施方案中,形成蓝细菌的糖原突变菌株将改变细菌产生以及分泌更高浓度的酮酸(诸如aKG)的途径。糖原突变蓝细菌可以经由glgc基因的突变(Δglgc)通过形成糖原缺乏菌株来产生。例如,可以使用gBlocksTM来合成氨苄青霉素抗性(AmpR)基因并且将其整合到质粒构建体中。质粒构建体可以转化到野生型蓝细菌(例如,集胞藻、细长聚球藻2973、细长聚球藻2434)中。然后可以将一部分的野生型glgc基因替换为AmpR基因以形成突变菌株。可以通过在含有AmpR的培养基中生长、接着进行PCR和测序来确认Δglgc突变菌株。
保持挥发性气体的水平
在一个或多个实施方案中,第二反应器包括安全水平的氧气。特别地,第二反应器中的顶部空间和第二反应器的气态物出口流包括相对于乙烯的安全水平的氧气。如技术人员所理解的,乙烯流内的商业上可接受的氧气水平可以由考虑了存在的乙烯水平的爆炸下限(LEL)来定义。在一个或多个实施方案中,第二反应器内(即在反应器的顶部空间内或在气态物出口流中)的氧气的量小于可接受的LEL、在其他实施方案中小于可接受的LEL的80%并且在其他实施方案中小于可接受的LEL的50%。
过程特性
如本文所述,通过使用生物合成方法,本发明的方法有效地以高碳效率将二氧化碳转化为乙烯,同时解决了与乙烯和氧气的联产相关的安全问题。
在一个或多个实施方案中,本发明的方法以大于100μmol/gCDW/小时、在其他实施方案中大于500μmol/gCDW/小时、在其他实施方案中大于1000μmol/gCDW/小时、在其他实施方案中大于1500μmol/gCDW/小时、在其他实施方案中大于2000μmol/gCDW/小时并且在其他实施方案中大于2500μmol/gCDW/小时的生产率生产乙烯,其中CDW是指细胞干重。
对于本领域技术人员而言,没有背离本发明的范围和精神的各种修改和改变将是显而易见的。本发明当然不限于本文所阐述的示例性实施方案。
附录
SEQ ID NO:1-
Figure BDA0003946239380000231
SEQ ID NO:2-
Figure BDA0003946239380000232
SEQ ID NO:3-
Figure BDA0003946239380000233
SEQ ID NO:4-
Figure BDA0003946239380000241
SEQ ID NO.5-
Figure BDA0003946239380000242
SEQ ID NO.6-
Figure BDA0003946239380000251
Figure BDA0003946239380000261
SEQ ID NO.7-
Figure BDA0003946239380000262
SEQ ID.NO8-
Figure BDA0003946239380000271
SEQ ID NO.9-
Figure BDA0003946239380000272
SEQ ID NO.10:-
Figure BDA0003946239380000281
SEQ ID NO.11:-
Figure BDA0003946239380000282
SEQ ID NO.12:-
Figure BDA0003946239380000291
SEQ ID NO.13:-
Figure BDA0003946239380000292
Figure BDA0003946239380000301
Figure BDA0003946239380000311
序列表
<110> Oxy Low Carbon Ventures, LLC
<120> 用于由二氧化碳生产乙烯的方法
<130> PA223641C
<150> 62/992689
<151> 2020-03-20
<160> 13
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 418
<212> PRT
<213> 荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)
<220>
<221> MISC_FEATURE
<223> 异柠檬酸脱氢酶
<400> 1
Met Gly Tyr Lys Lys Ile Gln Val Pro Ala Val Gly Asp Lys Ile Thr
1 5 10 15
Val Asn Ala Asp His Ser Leu Asn Val Pro Asp Asn Pro Ile Ile Pro
20 25 30
Phe Ile Glu Gly Asp Gly Ile Gly Val Asp Val Ser Pro Val Met Ile
35 40 45
Lys Val Val Asp Ala Ala Val Glu Lys Ala Tyr Gly Gly Lys Arg Lys
50 55 60
Ile Ser Trp Met Glu Val Tyr Ala Gly Glu Lys Ala Thr Gln Val Tyr
65 70 75 80
Asp Gln Asp Thr Trp Leu Pro Gln Glu Thr Leu Asp Ala Val Lys Asp
85 90 95
Tyr Val Val Ser Ile Lys Gly Pro Leu Thr Thr Pro Val Gly Gly Gly
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Ile Arg Ser Leu Asn Val Ala Leu Arg Gln Gln Leu Asp Leu Tyr Val
115 120 125
Cys Leu Arg Pro Val Val Trp Phe Glu Gly Val Pro Ser Pro Val Lys
130 135 140
Lys Pro Gly Asp Val Asp Met Val Ile Phe Arg Glu Asn Ser Glu Asp
145 150 155 160
Ile Tyr Ala Gly Ile Glu Trp Lys Ala Gly Ser Pro Glu Ala Thr Lys
165 170 175
Val Ile Lys Phe Leu Lys Glu Glu Met Gly Val Thr Lys Ile Arg Phe
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Asp Gln Asp Cys Gly Ile Gly Ile Lys Pro Val Ser Lys Glu Gly Thr
195 200 205
Lys Arg Leu Val Arg Lys Ala Leu Gln Tyr Val Val Asp Asn Asp Arg
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Lys Ser Leu Thr Ile Val His Lys Gly Asn Ile Met Lys Phe Thr Glu
225 230 235 240
Gly Ala Phe Lys Asp Trp Gly Tyr Glu Val Ala Lys Glu Glu Phe Gly
245 250 255
Ala Glu Leu Leu Asp Gly Gly Pro Trp Met Lys Phe Lys Asn Pro Lys
260 265 270
Thr Gly Arg Glu Val Val Val Lys Asp Ala Ile Ala Asp Ala Met Leu
275 280 285
Gln Gln Ile Leu Leu Arg Pro Ala Glu Tyr Asp Val Ile Ala Thr Leu
290 295 300
Asn Leu Asn Gly Asp Tyr Leu Ser Asp Ala Leu Ala Ala Glu Val Gly
305 310 315 320
Gly Ile Gly Ile Ala Pro Gly Ala Asn Leu Ser Asp Thr Val Ala Met
325 330 335
Phe Glu Ala Thr His Gly Thr Ala Pro Lys Tyr Ala Gly Lys Asp Gln
340 345 350
Val Asn Pro Gly Ser Val Ile Leu Ser Ala Glu Met Met Leu Arg His
355 360 365
Leu Gly Trp Thr Glu Ala Ala Asp Leu Ile Ile Lys Gly Thr Asn Gly
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Ala Ile Lys Ala Lys Thr Val Thr Tyr Asp Phe Glu Arg Leu Met Glu
385 390 395 400
Gly Ala Thr Leu Val Ser Ser Ser Gly Phe Gly Glu Ala Leu Ile Lys
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His Met
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<212> DNA
<213> 荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)
<220>
<221> misc_feature
<223> 异柠檬酸脱氢酶编码序列1.1.1.42
<400> 2
atgggttaca agaagattca ggttccagcc gtcggcgaca aaatcaccgt caacgcagac 60
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gtcgacgtca gccctgtgat gatcaaagtg gttgatgctg ccgtagagaa agcctacggg 180
ggtaagcgca agatttcctg gatggaggtt tatgctggcg aaaaagcaac tcaggtctat 240
gaccaggaca cctggctgcc ccaggaaacc ctggacgcgg tcaaggatta cgtggtctcc 300
atcaaaggcc cgctgaccac tccggtcggt ggcggcatcc gttccctcaa cgtcgccctg 360
cgccaacagc tcgatctcta tgtctgcctt cgccctgtgg tgtggttcga aggtgtgccg 420
agcccggtga aaaagcctgg cgacgtcgac atggtgatct tccgcgagaa ctccgaagac 480
atttatgccg gtatcgaatg gaaagccggc tcccctgagg ccaccaaggt catcaaattc 540
ctgaaagaag aaatgggcgt caccaagatc cgtttcgacc aggattgcgg catcggcatc 600
aagccggttt ccaaagaagg caccaagcgt ctggtgcgca aggcgctgca atacgtggtg 660
gacaacgacc gcaagtcgct gaccatcgtg cacaagggca acatcatgaa attcaccgaa 720
ggtgccttca aggactgggg ctacgaggtg gcgaaggaag aattcggcgc cgagctgctc 780
gatggcggcc catggatgaa attcaagaac ccgaaaaccg gccgcgaagt cgtcgtcaag 840
gacgccatcg ccgacgccat gctccagcag atcctgctgc gtccggccga atacgatgtg 900
atcgccaccc tcaacctcaa cggtgactac ctgtccgacg ccctggcggc ggaagtgggc 960
ggtatcggta tcgcgccggg tgccaacctg tccgacaccg tagccatgtt cgaggcgacc 1020
cacggtactg cgccgaaata tgccggcaag gaccaggtca acccgggttc ggtgattttg 1080
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ggcaccaatg gcgccatcaa ggccaagacc gtgacctacg acttcgaacg tctgatggaa 1200
ggcgccacac tggtgtcttc ttcgggcttc ggtgaagcgc tgatcaagca catgtaa 1257
<210> 3
<211> 475
<212> PRT
<213> 细长聚球藻PPC794(Synechococcus elongatus PPC794)
<220>
<221> MISC_FEATURE
<223> 异柠檬酸脱氢酶
<400> 3
Met Tyr Glu Lys Ile Gln Pro Pro Ser Glu Gly Ser Lys Ile Arg Phe
1 5 10 15
Glu Ala Gly Lys Pro Ile Val Pro Asp Asn Pro Ile Ile Pro Phe Ile
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Arg Gly Asp Gly Thr Gly Val Asp Ile Trp Pro Ala Thr Glu Arg Val
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Leu Asp Ala Ala Val Ala Lys Ala Tyr Gly Gly Gln Arg Lys Ile Thr
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115 120 125
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Leu Glu Gly Arg Lys Arg His Val Thr Leu Val His Lys Gly Asn Ile
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Ala Ala Val Val Gly Gly Leu Gly Met Ala Pro Gly Ala Asn Ile Gly
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<212> DNA
<213> 细长聚球藻PCC794(Synechococcus elongatus PCC794)
<220>
<221> misc_feature
<223> 异柠檬酸脱氢酶编码序列1.1.1.42
<400> 4
agggcaagct tatgtacgag aagattcaac cccctagcga aggcagcaaa attcgctttg 60
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<211> 1628
<212> PRT
<213> 荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)
<220>
<221> MISC_FEATURE
<223> 谷氨酸脱氢酶
<400> 5
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Glu Ile Asp Arg Cys Ala Asn Ala Ala Glu Leu Asn Val Leu Ser Lys
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Glu Leu Ala Gln Val Leu Glu Val Leu Pro Arg Asp Asp Leu Phe Gln
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Thr Pro Val Asp Glu Leu Phe Ser Thr Val Met Ser Ile Val Gln Ile
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Gln Glu Arg Asn Lys Ile Arg Val Phe Leu Arg Lys Asp Pro Tyr Gly
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Ala Phe Asn His Leu His Ile Phe Ile Asp Pro Asn Pro Asn Pro
1010 1015 1020
Ala Thr Ser Phe Ala Glu Arg Gln Arg Met Phe Asp Leu Pro Arg
1025 1030 1035
Ser Ala Trp Ser Asp Tyr Asp Thr Ser Ile Met Ser Glu Gly Gly
1040 1045 1050
Gly Ile Phe Ser Arg Ser Ala Lys Ser Ile Ala Ile Ser Pro Gln
1055 1060 1065
Met Lys Glu Arg Phe Asp Ile Gln Ala Asp Lys Leu Thr Pro Thr
1070 1075 1080
Glu Leu Leu Asn Ala Leu Leu Lys Ala Pro Val Asp Leu Leu Trp
1085 1090 1095
Asn Gly Gly Ile Gly Thr Tyr Val Lys Ala Ser Thr Glu Ser His
1100 1105 1110
Ala Asp Val Gly Asp Lys Ala Asn Asp Ala Leu Arg Val Asn Gly
1115 1120 1125
Asn Glu Leu Arg Cys Lys Val Val Gly Glu Gly Gly Asn Leu Gly
1130 1135 1140
Met Thr Gln Leu Gly Arg Val Glu Phe Gly Leu Asn Gly Gly Gly
1145 1150 1155
Ser Asn Thr Asp Phe Ile Asp Asn Ala Gly Gly Val Asp Cys Ser
1160 1165 1170
Asp His Glu Val Asn Ile Lys Ile Leu Leu Asn Glu Val Val Gln
1175 1180 1185
Ala Gly Asp Met Thr Asp Lys Gln Arg Asn Gln Leu Leu Ala Ser
1190 1195 1200
Met Thr Asp Glu Val Gly Gly Leu Val Leu Gly Asn Asn Tyr Lys
1205 1210 1215
Gln Thr Gln Ala Leu Ser Leu Ala Ala Arg Arg Ala Tyr Ala Arg
1220 1225 1230
Ile Ala Glu Tyr Lys Arg Leu Met Ser Asp Leu Glu Gly Arg Gly
1235 1240 1245
Lys Leu Asp Arg Ala Ile Glu Phe Leu Pro Thr Glu Glu Gln Leu
1250 1255 1260
Ala Glu Arg Val Ala Glu Gly His Gly Leu Thr Arg Pro Glu Leu
1265 1270 1275
Ser Val Leu Ile Ser Tyr Ser Lys Ile Asp Leu Lys Glu Gln Leu
1280 1285 1290
Leu Gly Ser Leu Val Pro Asp Asp Asp Tyr Leu Thr Arg Asp Met
1295 1300 1305
Glu Thr Ala Phe Pro Pro Thr Leu Val Ser Lys Phe Ser Glu Ala
1310 1315 1320
Met Arg Arg His Arg Leu Lys Arg Glu Ile Val Ser Thr Gln Ile
1325 1330 1335
Ala Asn Asp Leu Val Asn His Met Gly Ile Thr Phe Val Gln Arg
1340 1345 1350
Leu Lys Glu Ser Thr Gly Met Thr Pro Ala Asn Val Ala Gly Ala
1355 1360 1365
Tyr Val Ile Val Arg Asp Ile Phe His Leu Pro His Trp Phe Arg
1370 1375 1380
Gln Ile Glu Ala Leu Asp Tyr Gln Val Ser Ala Asp Val Gln Leu
1385 1390 1395
Glu Leu Met Asp Glu Leu Met Arg Leu Gly Arg Arg Ala Thr Arg
1400 1405 1410
Trp Phe Leu Arg Ala Arg Arg Asn Glu Gln Asn Ala Ala Arg Asp
1415 1420 1425
Val Ala His Phe Gly Pro His Leu Lys Glu Leu Gly Leu Lys Leu
1430 1435 1440
Asp Glu Leu Leu Ser Gly Glu Ile Arg Glu Asn Trp Gln Glu Arg
1445 1450 1455
Tyr Gln Ala Tyr Val Ala Ala Gly Val Pro Glu Leu Leu Ala Arg
1460 1465 1470
Met Val Ala Gly Thr Thr His Leu Tyr Thr Leu Leu Pro Ile Ile
1475 1480 1485
Glu Ala Ala Asp Val Thr Gly Gln Asp Pro Ala Glu Val Ala Lys
1490 1495 1500
Ala Tyr Phe Ala Val Gly Ser Ala Leu Asp Ile Thr Trp Tyr Ile
1505 1510 1515
Ser Gln Ile Ser Ala Leu Pro Val Glu Asn Asn Trp Gln Ala Leu
1520 1525 1530
Ala Arg Glu Ala Phe Arg Asp Asp Val Asp Trp Gln Gln Arg Ala
1535 1540 1545
Ile Thr Ile Ala Val Leu Gln Ala Gly Gly Gly Asp Ser Asp Val
1550 1555 1560
Glu Thr Arg Leu Ala Leu Trp Met Lys Gln Asn Asp Ala Met Ile
1565 1570 1575
Glu Arg Trp Arg Ala Met Leu Val Glu Ile Arg Ala Ala Ser Gly
1580 1585 1590
Thr Asp Tyr Ala Met Tyr Ala Val Ala Asn Arg Glu Leu Asn Asp
1595 1600 1605
Val Ala Leu Ser Gly Gln Ala Val Val Pro Ala Ala Ala Thr Ala
1610 1615 1620
Glu Leu Glu Leu Ala
1625
<210> 6
<211> 4887
<212> DNA
<213> 荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)
<220>
<221> misc_feature
<223> 谷氨酸脱氢酶1.4.1.2编码序列
<400> 6
atggcgttct tcaccgcagc cagcaaagcc gacttccagc accaactgca agcggcactg 60
gcgcagcaca tcagtgaaca ggcactgcca caagtggcgc tgttcgctga acaattcttc 120
ggcatcattt ccctggacga gctgacccaa cgtcgcctct ccgacctcgc tggctgtact 180
ctctctgcgt ggcgcctgct tgagcgcttc gatcacgcgc aaccgcaagt gcgcgtctac 240
aaccccgatt acgaacgtca cggctggcag tcgacccaca ccgcggtcga agtgctgcac 300
cacgacttgc cgttcctggt ggactcggtg cgtaccgagc tgaaccgtcg cggctacagc 360
atccacaccc tgcagaccac cgtgctgagc gtgcgtcgtg gcagcaaggg cgaattgctg 420
gaaatcctgc caaaaggcac caccggcgaa ggcgttctgc acgagtcgct gatgtacctg 480
gaaatcgacc gctgcgccaa tgcggccgaa ttgaatgtgc tgtccaagga actggagcag 540
gtcctgggtg aagtccgcgt cgcggtctcc gatttcgagc cgatgaaggc caaggtgcag 600
gaaatcctca ccaagctcga taacagcgca ttcgccgtcg atgccgacga aaagaatgaa 660
atcaagagct tcctggaatg gctggtgggc aaccacttca ccttcctcgg ctacgaagag 720
ttcaccgttg tcgatcaggc cgatggcggc cacatcgaat acgaccagaa ctccttcctc 780
ggcctgacca agatgctgcg caccggtctg accaacgaag accgccacat cgaagactat 840
gccgtgaagt acctgcgcga accgacactg ctgtcgttcg ccaaggcggc gcatccgagc 900
cgcgtgcacc gtccggccta cccggactac gtgtcgatcc gcgaaatcga tgccgacggc 960
aaagtgatca aggaacaccg cttcatgggc ctgtacacct cgtcggtgta tggcgaaagc 1020
gtgcgtgtca tcccgttcat ccgccgcaag gtcgaggaaa tcgagcgtcg ctccggcttc 1080
caggccaagg ctcacctggg caaggaactg gctcaggttc tggaagtgct gccgcgtgac 1140
gatctgttcc agaccccggt cgacgaactg ttcagcaccg tgatgtcgat cgtgcagatc 1200
caggaacgca acaagatccg cgtgttcctg cgtaaagacc cgtacggtcg tttctgctac 1260
tgcctggcct acgtgccgcg tgacatctac tccaccgaag ttcgccagaa gatccagcaa 1320
gtgctgatgg agcgcctgaa agcctccgac tgcgaattct ggacgttctt ctccgagtcc 1380
gtgctggccc gcgtgcaact gatcttgcgc gtcgacccga aaaaccgcat cgacatcgac 1440
ccgctgcaac tggaaaacga agtgatccag gcctgccgca gctggcagga cgactacgct 1500
gccctgaccg ttgaaacctt cggcgaagcc aacggcacca acgtgttggc cgacttcccg 1560
aaaggcttcc cggccggcta ccgcgagcgt ttcgcagcgc attcggccgt ggtcgacatg 1620
cagcacttgc tcaatctgag cgagaaaaag ccgctggcca tgagctttta ccagccgctg 1680
gcctccggcc cacgcgagct gcactgcaag ctgtatcacg ccgatacccc gctggccctg 1740
tccgacgtgc tgccgatcct ggaaaacctc ggcctgcgcg tgctgggtga gttcccgtac 1800
cgcctgcgtc ataccaacgg ccgcgagttc tggatccacg acttcgcgtt caccgctgcc 1860
gaaggcctgg acctggacat ccagcaactc aacgacaccc tgcaggacgc gttcgtccac 1920
atcgtccgtg gcgatgccga aaacgatgcg ttcaaccgtc tggtgctgac cgccggcctg 1980
ccatggcgcg acgtggcgct gctgcgtgcc tacgcccgct acctgaagca gatccgcctg 2040
ggcttcgacc tcggctacat cgccagcacc ctgaacaacc acaccgacat cgctcgcgaa 2100
ctgacccggt tgttcaagac ccgtttctac ctggcccgca agctgggcag cgaggatctg 2160
gacgacaagc aacagcgtct ggaacaggcc atcctgaccg cgctggacga cgttcaagtc 2220
ctcaacgaag accgcatcct gcgtcgttac ctggacctga tcaaagcaac cctgcgcacc 2280
aacttctacc agaccgacgc caacggccag aacaagtcgt acttcagctt caagttcaac 2340
ccgcacttga ttcctgaact gccgaaaccg gtgccgaagt tcgaaatctt cgtttactcg 2400
ccacgcgtcg aaggcgtgca cctgcgcttc ggcaacgttg ctcgtggtgg tctgcgctgg 2460
tcggaccgtg aagaagactt ccgtaccgaa gtcctcggcc tggtaaaagc ccagcaagtg 2520
aagaactcgg tcatcgtgcc ggtgggggcg aagggcggct tcctgccgcg tcgcctgcca 2580
ctgggcggca gccgtgacga gatcgcggcc gagggcatcg cctgctaccg catcttcatt 2640
tcgggcctgt tggacatcac cgacaacctg aaagacggca aactggtacc gccggccaac 2700
gtcgtgcggc atgacgacga tgacccgtac ctggtggtcg cggcggacaa gggcactgca 2760
accttctccg acatcgccaa cggcatcgcc atcgactacg gcttctggct gggtgacgcg 2820
ttcgcgtccg gtggttcggc cggttacgac cacaagaaaa tgggcatcac cgccaagggc 2880
gcgtgggtcg gcgtacagcg ccacttccgc gagcgcggca tcaatgtcca ggaagacagc 2940
atcacggtgg tcggcgtggg cgacatggcc ggtgacgtgt tcggtaacgg cctgttgatg 3000
tctgacaagc tgcaactggt tgctgcgttc aaccacctgc acatcttcat cgacccgaac 3060
ccgaacccgg ccaccagctt cgccgagcgt cagcgcatgt tcgatctgcc gcgctcggcc 3120
tggtccgact acgacaccag catcatgtcc gaaggcggcg gcatcttctc gcgcagcgcg 3180
aagagcatcg ccatctcgcc acagatgaaa gagcgcttcg acatccaggc cgacaagctg 3240
accccgaccg aactgctgaa cgccttgctc aaggcgccgg tggatctgct gtggaacggc 3300
ggtatcggta cctacgtcaa agccagcacc gaaagtcacg ccgatgtcgg cgacaaggcc 3360
aacgatgcgc tgcgcgtgaa cggcaacgaa ctgcgctgca aagtggtggg cgagggcggt 3420
aacctcggca tgacccaatt gggtcgtgtg gagttcggtc tcaatggcgg cggttccaac 3480
accgacttca tcgacaacgc cggtggcgtg gactgctccg accacgaagt gaacatcaag 3540
atcctgctga acgaagtggt tcaggccggc gacatgaccg acaagcaacg caaccagttg 3600
ctggcgagca tgaccgacga agtcggtggt ctggtgctgg gcaacaacta caagcagact 3660
caggccctgt ccctggcggc ccgccgtgct tatgcgcgga tcgccgagta caagcgtctg 3720
atgagcgacc tggagggccg tggcaagctg gatcgcgcca tcgagttcct gccgaccgaa 3780
gagcaactgg ccgaacgcgt tgccgaaggc catggcctga cccgtcctga gctgtcggtg 3840
ctgatctcgt acagcaagat cgacctcaag gagcagctgc tgggctccct ggtgccggac 3900
gacgactacc tgacccgcga catggaaacg gcgttcccgc cgaccctggt cagcaagttc 3960
tccgaagcta tgcgtcgtca ccgcctcaag cgcgagatcg tcagcaccca gatcgccaac 4020
gatctggtca accacatggg catcaccttc gttcagcgac tcaaagagtc cacgggcatg 4080
accccggcga atgttgccgg tgcgtatgtg attgttcggg atatcttcca cctcccgcac 4140
tggttccgtc agatcgaagc gctggactac caggtttccg ctgacgtgca gctggagctg 4200
atggacgagc tgatgcgtct gggccgtcgc gctacgcgct ggttcctgcg tgcccgtcgc 4260
aacgagcaga acgctgcccg tgacgtcgcg catttcggtc cgcacctcaa agagctgggc 4320
ctgaagctgg acgagctgct gagcggcgaa atccgcgaaa actggcaaga gcgttatcag 4380
gcgtacgtcg ccgccggtgt tccggaactg ctggcgcgta tggtggcggg gacgacccac 4440
ctctacacgc tgctgccgat catcgaagcg gccgacgtga ccggccagga tccagccgaa 4500
gtggccaagg cgtacttcgc cgtgggcagc gcgctggaca tcacctggta catctcgcag 4560
atcagcgcct tgccggttga aaacaactgg caggccctgg cccgtgaagc gttccgcgac 4620
gacgtcgact ggcagcaacg cgcgattacc atcgccgttc tgcaagcggg tggcggtgat 4680
tcggacgtgg aaacccgtct ggcactgtgg atgaagcaga acgacgccat gatcgaacgc 4740
tggcgcgcca tgctggtgga aatccgtgcc gccagcggca ccgactacgc catgtacgcg 4800
gtggccaacc gcgagctgaa cgacgtggcg ctgagcggtc aggcagttgt gcctgctgcg 4860
gcgactgcgg agcttgagct tgcttga 4887
<210> 7
<211> 387
<212> PRT
<213> 萨氏假单胞菌菜豆致病变种(Pseudomonas savastanoi pv. Phaseolicola)
<220>
<221> MISC_FEATURE
<223> 乙烯形成酶(GenBank: KPB44727.1)
<400> 7
Met Ile His Ala Pro Ser Arg Trp Gly Val Phe Pro Ser Leu Gly Leu
1 5 10 15
Cys Ser Pro Asp Val Val Trp Asn Glu His Pro Ser Leu Tyr Met Asp
20 25 30
Lys Glu Glu Thr Ser Met Thr Asn Leu Gln Thr Phe Glu Leu Pro Thr
35 40 45
Glu Val Thr Gly Cys Ala Ala Asp Ile Ser Leu Gly Arg Ala Leu Ile
50 55 60
Gln Ala Trp Gln Lys Asp Gly Ile Phe Gln Ile Lys Thr Asp Ser Glu
65 70 75 80
Gln Asp Arg Lys Thr Gln Glu Ala Met Ala Ala Ser Lys Gln Phe Cys
85 90 95
Lys Glu Pro Leu Thr Phe Lys Ser Ser Cys Val Ser Asp Leu Thr Tyr
100 105 110
Ser Gly Tyr Val Ala Ser Gly Glu Glu Val Thr Ala Gly Lys Pro Asp
115 120 125
Phe Pro Glu Ile Phe Thr Val Cys Lys Asp Leu Ser Val Gly Asp Gln
130 135 140
Arg Val Lys Ala Gly Trp Pro Cys His Gly Pro Val Pro Trp Pro Asn
145 150 155 160
Asn Thr Tyr Gln Lys Ser Met Lys Thr Phe Met Glu Glu Leu Gly Leu
165 170 175
Ala Gly Glu Arg Leu Leu Lys Leu Thr Ala Leu Gly Phe Glu Leu Pro
180 185 190
Ile Asn Thr Phe Thr Asp Leu Thr Arg Asp Gly Trp His His Met Arg
195 200 205
Val Leu Arg Phe Pro Pro Gln Thr Ser Thr Leu Ser Arg Gly Ile Gly
210 215 220
Ala His Thr Asp Tyr Gly Leu Leu Val Ile Ala Ala Gln Asp Asp Val
225 230 235 240
Gly Gly Leu Tyr Ile Arg Pro Pro Val Glu Gly Glu Lys Arg Asn Arg
245 250 255
Asn Trp Leu Pro Gly Glu Ser Ser Ala Gly Met Phe Glu His Asp Glu
260 265 270
Pro Trp Thr Phe Val Thr Pro Thr Pro Gly Val Trp Thr Val Phe Pro
275 280 285
Gly Asp Ile Leu Gln Phe Met Thr Gly Gly Gln Leu Leu Ser Thr Pro
290 295 300
His Lys Val Lys Leu Asn Thr Arg Glu Arg Phe Ala Cys Ala Tyr Phe
305 310 315 320
His Glu Pro Asn Phe Glu Ala Ser Ala Tyr Pro Leu Phe Glu Pro Ser
325 330 335
Ala Asn Glu Arg Ile His Tyr Gly Glu His Phe Thr Asn Met Phe Met
340 345 350
Arg Cys Tyr Pro Asp Arg Ile Thr Thr Gln Arg Ile Asn Lys Glu Asn
355 360 365
Arg Leu Ala His Leu Glu Asp Leu Lys Lys Tyr Ser Asp Thr Arg Ala
370 375 380
Thr Gly Ser
385
<210> 8
<211> 1161
<212> DNA
<213> 萨氏假单胞菌菜豆致病变种(Pseudomonas savastanoi pv. Phaseolicola)
<220>
<221> misc_feature
<223> 编码乙烯形成酶的序列(GenBank: KPB44727.1)
<400> 8
atgatacacg ctccaagtag atggggagta tttccctcac tagggttatg cagcccggac 60
gttgtgtgga atgagcatcc gagcctgtac atggacaaag aggaaaccag catgaccaac 120
ctgcagacct ttgaactgcc gaccgaagtg accggttgcg cggcggacat cagcctgggt 180
cgtgcgctga ttcaggcgtg gcaaaaggat ggtatcttcc agattaaaac cgacagcgag 240
caggatcgta agacccaaga agcgatggcg gcgagcaagc aattttgcaa agagccgctg 300
accttcaaaa gcagctgcgt tagcgacctg acctacagcg gttatgtggc gagcggcgag 360
gaagttaccg cgggcaagcc ggatttcccg gaaattttta ccgtgtgcaa ggacctgagc 420
gtgggcgatc agcgtgttaa agcgggttgg ccgtgccatg gtccggttcc gtggccgaac 480
aacacctatc aaaagagcat gaaaaccttt atggaggaac tgggtctggc gggcgagcgt 540
ctgctgaaac tgaccgcgct gggttttgaa ctgccgatca acaccttcac cgacctgacc 600
cgtgatggct ggcaccacat gcgtgtgctg cgtttcccgc cgcagaccag caccctgagc 660
cgtggtattg gtgcgcacac cgactacggt ctgctggtga ttgcggcgca agacgatgtt 720
ggtggcctgt atatccgtcc gccggtggag ggcgaaaagc gtaaccgtaa ctggctgccg 780
ggcgagagca gcgcgggcat gtttgagcac gacgaaccgt ggaccttcgt taccccgacc 840
ccgggtgtgt ggaccgtttt tccgggcgat attctgcagt tcatgaccgg tggccaactg 900
ctgagcaccc cgcacaaggt taaactgaac acccgtgaac gtttcgcgtg cgcgtacttt 960
cacgagccga acttcgaagc gagcgcgtat ccgctgttcg agccgagcgc gaacgaacgt 1020
atccactacg gcgagcactt caccaacatg tttatgcgtt gctatccgga tcgtatcacc 1080
acccaacgta ttaacaaaga aaaccgtctg gcgcacctgg aagacctgaa gaaatacagc 1140
gacacccgtg cgaccggcag c 1161
<210> 9
<211> 808
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> 合成的氨基酸序列
<400> 9
Met Tyr Lys Leu Val Gln Thr Ile Val Asn Ser Asp Glu Lys Asn Val
1 5 10 15
Leu Gly Asp Phe Ile Leu Glu Leu Gly Lys Asp His Lys Arg Tyr Phe
20 25 30
Leu Arg Asn Glu Ile Leu Gln Ala Phe Ala Asp Tyr Cys His Gln Phe
35 40 45
Pro Lys Pro Ala Tyr Phe Tyr His Ser Ser Ser Leu Gly Thr Phe Ile
50 55 60
Gln Tyr Thr His Glu Ile Ile Leu Asp Gly Glu Asn Thr Trp Phe Val
65 70 75 80
Val Arg Pro Lys Ile Ala Ser Gln Glu Val Trp Leu Leu Ser Ala Asp
85 90 95
Leu Thr Lys Phe Glu Leu Met Thr Pro Lys Ala Leu Leu Asp Val Ser
100 105 110
Asp Arg Leu Val Lys Arg Tyr Gln Pro His Ile Leu Glu Ile Asp Leu
115 120 125
His Pro Phe Tyr Ser Ala Ala Pro Arg Ile Asp Asp Ser Arg Asn Ile
130 135 140
Gly Gln Gly Leu Thr Val Leu Asn His Tyr Phe Cys Asn Gln Ala Leu
145 150 155 160
Thr Asp Pro Glu Tyr Trp Ile Asp Ala Leu Phe Gln Ser Leu Lys Arg
165 170 175
Leu Glu Tyr Asn Gly Ile Lys Leu Leu Ile Ser Asn His Ile His Ser
180 185 190
Gly Leu Gln Leu Thr Lys Gln Ile Lys Leu Ala Leu Glu Phe Val Ser
195 200 205
His Leu Ser Pro Gln Thr Pro Tyr Ile Lys Phe Lys Phe His Leu Gln
210 215 220
Glu Leu Gly Leu Glu Pro Gly Trp Gly Asn Asn Ala Ala Arg Val Arg
225 230 235 240
Glu Thr Leu Glu Leu Leu Glu Arg Leu Met Asp Asn Pro Glu Pro Ala
245 250 255
Ile Leu Glu Thr Phe Val Ser Arg Ile Cys Ala Val Phe Arg Val Val
260 265 270
Leu Ile Ser Ile His Gly Trp Val Ala Gln Glu Asp Val Leu Gly Arg
275 280 285
Asp Glu Thr Leu Gly Gln Val Ile Tyr Val Leu Glu Gln Ala Arg Ser
290 295 300
Leu Glu Asn Lys Met Arg Ala Glu Ile Lys Leu Ala Gly Leu Asp Thr
305 310 315 320
Leu Gly Ile Lys Pro His Ile Ile Ile Leu Thr Arg Leu Ile Pro Asn
325 330 335
Cys Glu Gly Thr Phe Cys Asn Leu Pro Leu Glu Lys Val Asp Gly Thr
340 345 350
Glu Asn Ala Trp Ile Leu Arg Val Pro Phe Ala Glu Ser Arg Pro Glu
355 360 365
Ile Thr Asn Asn Trp Ile Ser Lys Phe Glu Ile Trp Pro Tyr Leu Glu
370 375 380
Lys Phe Ala Leu Asp Ala Glu Ala Glu Leu Leu Lys Gln Phe Gln Gly
385 390 395 400
Lys Pro Asn Leu Ile Ile Gly Asn Tyr Ser Asp Gly Asn Leu Val Ala
405 410 415
Phe Ile Leu Ser Arg Lys Met Lys Val Thr Gln Cys Asn Ile Ala His
420 425 430
Ser Leu Glu Lys Pro Lys Tyr Leu Phe Ser Asn Leu Tyr Trp Gln Asp
435 440 445
Leu Glu Ala Gln Tyr His Phe Ser Ala Gln Phe Thr Ala Asp Leu Ile
450 455 460
Ser Met Asn Ala Ala Asp Phe Ile Ile Thr Ser Ser Tyr Gln Glu Ile
465 470 475 480
Val Gly Thr Pro Asp Thr Met Gly Gln Tyr Glu Ser Tyr Lys Cys Phe
485 490 495
Thr Met Pro Asn Leu Tyr His Val Ile Asp Gly Ile Asp Leu Phe Ser
500 505 510
Pro Lys Phe Asn Val Val Leu Pro Gly Val Ser Glu Asn Ile Phe Phe
515 520 525
Pro Tyr Asn Gln Thr Thr Asn Arg Glu Ser His Arg Arg Gln His Ile
530 535 540
Gln Asp Leu Ile Phe His Gln Glu His Pro Glu Ile Leu Gly Lys Leu
545 550 555 560
Asp His Pro His Lys Lys Pro Ile Phe Ser Val Ser Pro Ile Thr Ser
565 570 575
Ile Lys Asn Leu Thr Gly Leu Val Glu Cys Phe Gly Lys Ser Glu Glu
580 585 590
Leu Gln Lys His Ser Asn Leu Ile Leu Leu Thr Ser Lys Leu His Pro
595 600 605
Asp Leu Gly Thr Asn Ser Glu Glu Ile Gln Glu Ile Ala Lys Ile His
610 615 620
Ala Ile Ile Asp Gln Tyr His Leu His His Lys Ile Arg Trp Leu Gly
625 630 635 640
Met Arg Leu Pro Leu Arg Asp Ile Ala Glu Thr Tyr Arg Val Ile Ala
645 650 655
Asp Phe Gln Gly Ile Tyr Ile His Phe Ala Leu Tyr Glu Ser Phe Ser
660 665 670
Arg Ser Ile Leu Glu Ala Met Ile Ser Gly Leu Pro Thr Phe Thr Thr
675 680 685
Gln Phe Gly Gly Ser Leu Glu Ile Ile Glu Asn His Asp Gln Gly Phe
690 695 700
Asn Leu Asn Pro Thr Asp Leu Ala Gly Thr Ala Lys Thr Ile Ile Asn
705 710 715 720
Phe Leu Glu Lys Cys Glu Asn Tyr Pro Glu His Trp Leu Glu Asn Ser
725 730 735
Gln Trp Met Ile Glu Arg Ile Arg His Lys Tyr Asn Trp Asn Ser His
740 745 750
Thr Asn Gln Leu Leu Leu Leu Thr Lys Met Phe Ser Phe Trp Asn Phe
755 760 765
Ile Tyr Pro Glu Asp Asn Glu Ala Arg Asp Arg Tyr Met Glu Ser Leu
770 775 780
Phe His Leu Leu Tyr Lys Pro Ile Ala Asp His Ile Leu Ser Glu His
785 790 795 800
Leu Ser Lys Ile Arg Asn His Asn
805
<210> 10
<211> 2427
<212> DNA
<213> 人工
<220>
<223> 合成的DNA序列
<400> 10
atgtataaat tagtgcaaac tattgttaac agtgatgaaa aaaatgtttt aggtgacttt 60
atcttagaat taggcaagga tcataaacgt tactttttaa gaaatgagat tttacaagct 120
tttgcagatt attgtcacca attcccaaaa cccgcttatt tttatcactc ttcctcttta 180
gggacattca ttcaatacac ccatgaaata attttagatg gtgaaaatac ttggtttgta 240
gttagaccaa agattgcgag tcaagaagta tggttattaa gcgcggactt gactaagttt 300
gagttaatga caccgaaagc attattagat gtgagcgatc gcttagtaaa gcgttatcaa 360
ccgcacattt tagaaattga tctccatccc ttttattcag cagcaccaag aattgatgat 420
tccagaaata ttggccaagg tttaaccgtt cttaatcatt atttttgtaa tcaagcattg 480
acagatcctg aatattggat tgacgcatta tttcaatcat taaaaagatt agaatataac 540
ggcatcaaat tattaattag taatcatatt cattcaggtt tgcaactaac aaagcaaatc 600
aaactagcgt tagaatttgt gagtcattta tccccccaga caccatatat aaaatttaaa 660
tttcatcttc aagaactcgg tttagaacca ggttggggta ataatgcagc cagagtcaga 720
gaaaccttag aactgctgga aagactcatg gataatcccg aacctgcaat tttagaaacc 780
tttgtttctc gcatttgtgc agttttccgc gtcgtcctta tttccatcca tggttgggtt 840
gcacaagaag atgttttagg cagagatgaa acattaggac aagttattta tgttttagaa 900
caagcccgca gtttagaaaa taaaatgcgg gcagaaatta aacttgcagg tttagataca 960
ttaggaatta aaccccatat cattatatta actcgactga ttcccaattg tgaaggcaca 1020
ttttgtaact taccattaga aaaagttgat ggtacagaaa atgcttggat tttgcgcgtt 1080
ccttttgcag aatctcgacc ggaaattacc aacaactgga tttctaaatt tgaaatttgg 1140
ccttatttag aaaaatttgc tcttgatgcc gaagcagaac ttttaaaaca attccaagga 1200
aagcccaatc taattattgg taactacagt gacgggaact tagttgcttt tattctctcc 1260
cgaaaaatga aagttaccca atgtaatatt gcccattccc tcgaaaaacc taaatatcta 1320
tttagtaact tatattggca agatttagaa gcacaatatc acttttctgc ccaatttacc 1380
gctgatttaa tcagtatgaa tgccgcagat tttattatca catcatccta tcaagaaatt 1440
gtaggtacac cagatacaat gggacaatat gaatcttata aatgtttcac catgcccaac 1500
ttatatcatg taattgatgg cattgattta tttagcccta aattcaatgt ggtattacca 1560
ggagtcagtg aaaatatatt ttttccctac aaccaaacaa caaatagaga atcccaccgt 1620
cgtcaacata tccaagacct aattttccat caagaacacc cagaaattct cggtaaatta 1680
gatcatcctc ataaaaaacc gatcttttcc gttagtccca ttacctcaat taaaaacctc 1740
acaggtttag ttgaatgttt cggtaaaagt gaagaattac aaaaacatag taacctaatt 1800
ttattaacca gtaaacttca tccagactta ggaacaaact ccgaagaaat tcaagaaata 1860
gcaaaaattc atgcgattat tgatcaatat catcttcacc ataaaatccg ctggttggga 1920
atgcgtcttc ctctccgcga tattgctgaa acctatcgtg taattgccga ttttcaaggg 1980
atttatattc actttgccct ttatgaatcc tttagcagaa gtattttaga agcaatgatt 2040
tctggattac caacttttac aactcaattt ggtggttcat tagaaattat tgaaaaccat 2100
gatcaaggat ttaacctcaa ccccacagac ttagcaggaa cagccaaaac aattatcaac 2160
ttcttagaaa aatgtgaaaa ttatccagaa cattggctag aaaattctca atggatgatt 2220
gaacgcattc gccataaata taactggaat tcccacacaa atcaactcct gttattaacg 2280
aaaatgttta gcttttggaa cttcatctat cccgaagata acgaagccag agatcgttac 2340
atggaaagtt tatttcatct tctttataaa cctatagctg accatatttt atcagaacat 2400
ctaagcaaaa tcagaaatca taattaa 2427
<210> 11
<211> 709
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> 合成的氨基酸序列
<400> 11
Met Ala Ala Gln Asn Leu Tyr Ile Leu His Ile Gln Thr His Gly Leu
1 5 10 15
Leu Arg Gly Gln Asn Leu Glu Leu Gly Arg Asp Ala Asp Thr Gly Gly
20 25 30
Gln Thr Lys Tyr Val Leu Glu Leu Ala Gln Ala Gln Ala Lys Ser Pro
35 40 45
Gln Val Gln Gln Val Asp Ile Ile Thr Arg Gln Ile Thr Asp Pro Arg
50 55 60
Val Ser Val Gly Tyr Ser Gln Ala Ile Glu Pro Phe Ala Pro Lys Gly
65 70 75 80
Arg Ile Val Arg Leu Pro Phe Gly Pro Lys Arg Tyr Leu Arg Lys Glu
85 90 95
Leu Leu Trp Pro His Leu Tyr Thr Phe Ala Asp Ala Ile Leu Gln Tyr
100 105 110
Leu Ala Gln Gln Lys Arg Thr Pro Thr Trp Ile Gln Ala His Tyr Ala
115 120 125
Asp Ala Gly Gln Val Gly Ser Leu Leu Ser Arg Trp Leu Asn Val Pro
130 135 140
Leu Ile Phe Thr Gly His Ser Leu Gly Arg Ile Lys Leu Lys Lys Leu
145 150 155 160
Leu Glu Gln Asp Trp Pro Leu Glu Glu Ile Glu Ala Gln Phe Asn Ile
165 170 175
Gln Gln Arg Ile Asp Ala Glu Glu Met Thr Leu Thr His Ala Asp Trp
180 185 190
Ile Val Ala Ser Thr Gln Gln Glu Val Glu Glu Gln Tyr Arg Val Tyr
195 200 205
Asp Arg Tyr Asn Pro Glu Arg Lys Leu Val Ile Pro Pro Gly Val Asp
210 215 220
Thr Asp Arg Phe Arg Phe Gln Pro Leu Gly Asp Arg Gly Val Val Leu
225 230 235 240
Gln Gln Glu Leu Ser Arg Phe Leu Arg Asp Pro Glu Lys Pro Gln Ile
245 250 255
Leu Cys Leu Cys Arg Pro Ala Pro Arg Lys Asn Val Pro Ala Leu Val
260 265 270
Arg Ala Phe Gly Glu His Pro Trp Leu Arg Lys Lys Ala Asn Leu Val
275 280 285
Leu Val Leu Gly Ser Arg Gln Asp Ile Asn Gln Met Asp Arg Gly Ser
290 295 300
Arg Gln Val Phe Gln Glu Ile Phe His Leu Val Asp Arg Tyr Asp Leu
305 310 315 320
Tyr Gly Ser Val Ala Tyr Pro Lys Gln His Gln Ala Asp Asp Val Pro
325 330 335
Glu Phe Tyr Arg Leu Ala Ala His Ser Gly Gly Val Phe Val Asn Pro
340 345 350
Ala Leu Thr Glu Pro Phe Gly Leu Thr Ile Leu Glu Ala Gly Ser Cys
355 360 365
Gly Val Pro Val Val Ala Thr His Asp Gly Gly Pro Gln Glu Ile Leu
370 375 380
Lys His Cys Asp Phe Gly Thr Leu Val Asp Val Ser Arg Pro Ala Asn
385 390 395 400
Ile Ala Thr Ala Leu Ala Thr Leu Leu Ser Asp Arg Asp Leu Trp Gln
405 410 415
Cys Tyr His Arg Asn Gly Ile Glu Lys Val Pro Ala His Tyr Ser Trp
420 425 430
Asp Gln His Val Asn Thr Leu Phe Glu Arg Met Glu Thr Val Ala Leu
435 440 445
Pro Arg Arg Arg Ala Val Ser Phe Val Arg Ser Arg Lys Arg Leu Ile
450 455 460
Asp Ala Lys Arg Leu Val Val Ser Asp Ile Asp Asn Thr Leu Leu Gly
465 470 475 480
Asp Arg Gln Gly Leu Glu Asn Leu Met Thr Tyr Leu Asp Gln Tyr Arg
485 490 495
Asp His Phe Ala Phe Gly Ile Ala Thr Gly Arg Arg Leu Asp Ser Ala
500 505 510
Gln Glu Val Leu Lys Glu Trp Gly Val Pro Ser Pro Asn Phe Trp Val
515 520 525
Thr Ser Val Gly Ser Glu Ile His Tyr Gly Thr Asp Ala Glu Pro Asp
530 535 540
Ile Ser Trp Glu Lys His Ile Asn Arg Asn Trp Asn Pro Gln Arg Ile
545 550 555 560
Arg Ala Val Met Ala Gln Leu Pro Phe Leu Glu Leu Gln Pro Glu Glu
565 570 575
Asp Gln Thr Pro Phe Lys Val Ser Phe Phe Val Arg Asp Arg His Glu
580 585 590
Thr Val Leu Arg Glu Val Arg Gln His Leu Arg Arg His Arg Leu Arg
595 600 605
Leu Lys Ser Ile Tyr Ser His Gln Glu Phe Leu Asp Ile Leu Pro Leu
610 615 620
Ala Ala Ser Lys Gly Asp Ala Ile Arg His Leu Ser Leu Arg Trp Arg
625 630 635 640
Ile Pro Leu Glu Asn Ile Leu Val Ala Gly Asp Ser Gly Asn Asp Glu
645 650 655
Glu Met Leu Lys Gly His Asn Leu Gly Val Val Val Gly Asn Tyr Ser
660 665 670
Pro Glu Leu Glu Pro Leu Arg Ser Tyr Glu Arg Val Tyr Phe Ala Glu
675 680 685
Gly His Tyr Ala Asn Gly Ile Leu Glu Ala Leu Lys His Tyr Arg Phe
690 695 700
Phe Glu Ala Ile Ala
705
<210> 12
<211> 2130
<212> DNA
<213> 人工
<220>
<223> 合成的DNA序列
<400> 12
gtggcagctc aaaatctcta cattctgcac attcagaccc atggtctgct gcgagggcag 60
aacttggaac tggggcgaga tgccgacacc ggcgggcaga ccaagtacgt cttagaactg 120
gctcaagccc aagctaaatc cccacaagtc caacaagtcg acatcatcac ccgccaaatc 180
accgaccccc gcgtcagtgt tggttacagt caggcgatcg aaccctttgc gcccaaaggt 240
cggattgtcc gtttgccttt tggccccaaa cgctacctcc gtaaagagct gctttggccc 300
catctctaca cctttgcgga tgcaattctc caatatctgg ctcagcaaaa gcgcaccccg 360
acttggattc aggcccacta tgctgatgct ggccaagtgg gatcactgct gagtcgctgg 420
ttgaatgtac cgctaatttt cacagggcat tctctggggc ggatcaagct aaaaaagctg 480
ttggagcaag actggccgct tgaggaaatt gaagcgcaat tcaatattca acagcgaatt 540
gatgcggagg agatgacgct cactcatgct gactggattg tcgccagcac tcagcaggaa 600
gtggaggagc aataccgcgt ttacgatcgc tacaacccag agcgcaagct tgtcattcca 660
ccgggtgtcg ataccgatcg cttcaggttt cagcccttgg gcgatcgcgg tgttgttctc 720
caacaggaac tgagccgctt tctgcgcgac ccagaaaaac ctcaaattct ctgcctctgt 780
cgccccgcac ctcgcaaaaa tgtaccggcg ctggtgcgag cctttggcga acatccttgg 840
ctgcgcaaaa aagccaacct tgtcttagta ctgggcagcc gccaagacat caaccagatg 900
gatcgcggca gtcggcaggt gttccaagag attttccatc tggtcgatcg ctacgacctc 960
tacggcagcg tcgcctatcc caaacagcat caggctgatg atgtgccgga gttctatcgc 1020
ctagcggctc attccggcgg ggtattcgtc aatccggcgc tgaccgaacc ttttggtttg 1080
acaattttgg aggcaggaag ctgcggcgtg ccggtggtgg caacccatga tggcggcccc 1140
caggaaattc tcaaacactg tgatttcggc actttagttg atgtcagccg acccgctaat 1200
atcgcgactg cactcgccac cctgctgagc gatcgcgatc tttggcagtg ctatcaccgc 1260
aatggcattg aaaaagttcc cgcccattac agctgggatc aacatgtcaa taccctgttt 1320
gagcgcatgg aaacggtggc tttgcctcgt cgtcgtgctg tcagtttcgt acggagtcgc 1380
aaacgcttga ttgatgccaa acgccttgtc gttagtgaca tcgacaacac actgttgggc 1440
gatcgtcaag gactcgagaa tttaatgacc tatctcgatc agtatcgcga tcattttgcc 1500
tttggaattg ccacggggcg tcgcctagac tctgcccaag aagtcttgaa agagtggggc 1560
gttccttcgc caaacttctg ggtgacttcc gtcggcagcg agattcacta tggcaccgat 1620
gctgaaccgg atatcagctg ggaaaagcat atcaatcgca actggaatcc tcagcgaatt 1680
cgggcagtaa tggcacaact accctttctt gaactgcagc cggaagagga tcaaacaccc 1740
ttcaaagtca gcttctttgt ccgcgatcgc cacgagactg tgctgcgaga agtacggcaa 1800
catcttcgcc gccatcgcct gcggctgaag tcaatctatt cccatcagga gtttcttgac 1860
attctgccgc tagctgcctc gaaaggggat gcgattcgcc acctctcact ccgctggcgg 1920
attcctcttg agaacatttt ggtggcaggc gattctggta acgatgagga aatgctcaag 1980
ggccataatc tcggcgttgt agttggcaat tactcaccgg aattggagcc actgcgcagc 2040
tacgagcgcg tctattttgc tgagggccac tatgctaatg gcattctgga agccttaaaa 2100
cactatcgct tttttgaggc gatcgcttaa 2130
<210> 13
<211> 4186
<212> DNA
<213> 人工
<220>
<223> 合成的启动子DNA序列
<220>
<221> 启动子
<222> (1)..(4186)
<223> LacIq启动子
<400> 13
caattgccct aagacagttg tcgtctttcg aagtctagtt aacattaggg gcgattcttt 60
gtttccactg agtggaagca aacggtatca aggttgcagg cagactcaag gtctagattg 120
cttcacagct tgtgtggcta tatttattat cttcattatt gatggtagtt gtgggtggat 180
ttaagatgga aaagtaacag ataaatgtcg tctttaaggg cgatctagat cgtatcgttt 240
ttaattccta ggtcggcatt tattaatcaa cctcgataca atattttttt gtaaaaactt 300
ctagataaat gactcaagtc tcattgaaag tctggggtgt tgcctcccca gtcaattcaa 360
gattaccaag gcctcgcatc gcctcttcta ttttgtttga aggggaccta acgtgttgcg 420
ccaagctagt tctcgacaga gcatctcaag agcgcgttgc tcgcgggggg caaacagttg 480
gagatcagcc agctcttgca agacttgttg ggtgaggtgg ctggcaaagc taccggcata 540
gcgcagtaag agactgtagt agcgaaattg cggttggccg ttgcaatcgc ggtgaaaggc 600
agcaatttct gcttcgctga ggcagtagac aggggtattg accggcacga tcgcgcgagg 660
aatgccctgt tcgccgtagc gatcgccgcc ctctgtttcc gctaagctgc cgatcaaaac 720
cgtggagagc agcgtgcggg tttcattgat taaatcaggc gtgaatagtg ggtcgggccc 780
acttgaaaga cgcggcccgt tgttcagaaa gaggggatta aacaactgcg agttgtagac 840
cactccgatc gcccaatggc gatcgccttc caaacgaaca aagctgccaa atccatagct 900
ctcggcggct ggtggattgg agacatccat gtcgtcatcc acttggacaa cgtagtcaca 960
gtgcgagttg gatttgacaa ctttgccgag gcgcatggtg ctgccagtgt tacaaccaat 1020
taaccaattc tgacatatgg acaccatcga atggtgcaaa acctttcgcg gtatggcatg 1080
atagcgcccg gaagagagtc aattcagggt ggtgaatgtg aaaccagtaa cgttatacga 1140
tgtcgcagag tatgccggtg tctcttatca gaccgtttcc cgcgtggtga accaggccag 1200
ccacgtttct gcgaaaacgc gggaaaaagt ggaagcggcg atggcggagc tgaattacat 1260
tcccaaccgc gtggcacaac aactggcggg caaacagtcg ttgctgattg gcgttgccac 1320
ctccagtctg gccctgcacg cgccgtcgca aattgtcgcg gcgattaaat ctcgcgccga 1380
tcaactgggt gccagcgtgg tggtgtcgat ggtagaacga agcggcgtcg aagcctgtaa 1440
agcggcggtg cacaatcttc tcgcgcaacg cgtcagtggg ctgatcatta actatccgct 1500
ggatgaccag gatgccattg ctgtggaagc tgcctgcact aatgttccgg cgttatttct 1560
tgatgtctct gaccagacac ccatcaacag tattattttc tcccatgaag acggtacgcg 1620
actgggcgtg gagcatctgg tcgcattggg tcaccagcaa atcgcgctgt tagcgggccc 1680
attaagttct gtctcggcgc gtctgcgtct ggctggctgg cataaatatc tcactcgcaa 1740
tcaaattcag ccgatagcgg aacgggaagg cgactggagt gccatgtccg gttttcaaca 1800
aaccatgcaa atgctgaatg agggcatcgt tcccactgcg atgctggttg ccaacgatca 1860
gatggcgctg ggcgcaatgc gcgccattac cgagtccggg ctgcgcgttg gtgcggatat 1920
ctcggtagtg ggatacgacg ataccgaaga cagctcatgt tatatcccgc cgttaaccac 1980
catcaaacag gattttcgcc tgctggggca aaccagcgtg gaccgcttgc tgcaactctc 2040
tcagggccag gcggtgaagg gcaatcagct gttgcccgtt tcactggtga aaagaaaaac 2100
caccctggcg cccaatacgc aaaccgcctc tccccgcgcg ttggccgatt cattaatgca 2160
gctggcacga caggtttccc gactggaaag cgggcagtga gctttgttga caattaatca 2220
tccggctcgt ataatgtgtg gaattgtgag cggataacaa gaaggagatg agtattcaac 2280
atttccgtgt cgcccttatt cccttttttg cggcattttg ccttcctgtt tttgctcacc 2340
cagaaacgct ggtgaaagta aaagatgctg aagatcagtt gggtgcacga gtgggttaca 2400
tcgaactgga tctcaacagc ggtaagatcc ttgagagttt tcgccccgaa gaacgttttc 2460
caatgatgag cacttttaaa gttctgctat gtggcgcggt attatcccgt attgacgccg 2520
ggcaagagca actcggtcgc cgcatacact attctcagaa tgacttggtt gagtactcac 2580
cagtcacaga aaagcatctt acggatggca tgacagtaag agaattatgc agtgctgcca 2640
taaccatgag tgataacact gcggccaact tacttctgac aacgatcgga ggaccgaagg 2700
agctaaccgc ttttttgcac aacatggggg atcatgtaac tcgccttgat cgttgggaac 2760
cggagctgaa tgaagccata ccaaacgacg agcgtgacac cacgatgcct gtagcaatgg 2820
caacaacgtt gcgcaaacta ttaactggcg aactacttac tctagcttcc cggcaacaat 2880
taatagactg gatggaggcg gataaagttg caggaccact tctgcgctcg gcccttccgg 2940
ctggctggtt tattgctgat aaatctggag ccggtgagcg tgggtctcgc ggtatcattg 3000
cagcactggg gccagatggt aagccctccc gtatcgtagt tatctacacg acggggagtc 3060
aggcaactat ggatgaacga aatagacaga tcgctgagat aggtgcctca ctgattaagc 3120
attggtaatt gttcagaacg ctcggtcttg cacaccgggc gttttttctt tgtgagtcca 3180
ggtaccaatc aatctccccc aagtcaagcg gcgctgagac ccagtgtctg ccggtgagtc 3240
agtcttggca agcaaactgt gcctttgcga tttcttaccc tacgcagctc cgggatcgat 3300
cggaggtaac caaggctacg gacaatggcg cgggcaccag ctgttggtaa actgaggagc 3360
gatcgccgct tcagtccaaa ggctatgacg caaaaatccg ttgttattgc tccgtccatt 3420
ctgtcagcgg atttcagccg cttgggcgac gatgtccgcg ctgttgacca ggctggcgct 3480
gactggattc acgtcgatgt gatggatggt cgcttcgtcc ctaacatcac cattggaccg 3540
ctgatcgttg aagcgctgcg cccggtgacc caaaagccgt tggacgtcca cttgatgatc 3600
gtcgagccgg aaaaatatgt gccggatttc gcgaaagcag gggctgacat catctcggtc 3660
caagcagaag cttgccccca cctgcaccgc aacttggctc agatcaaaga cctcggcaag 3720
caagcaggcg tcgtcctcaa cccctctacc ccagtcgaaa ccctggaata cgtgctggag 3780
ttgtgcgacc tgattttgat catgagcgtc aaccctggct tcggtggtca gagtttcatc 3840
ccagctgtcc tgccgaaaat ccgtaagctg cgcgccatgt gcgatgagcg tggccttgat 3900
ccttggattg aagtcgatgg cggcttgaaa gccaataaca cttggcaggt gctggaagcc 3960
ggtgctaacg caattgtggc gggctcggca gtcttcaacg cgccggacta tgctgaagcg 4020
atcgcggcga ttcgcaacag caagcgtcct gaacttgtca ctgcttaggc ttctcgctca 4080
acgctcagtg gagcaatctg aatcttgcag cccttcagtg gatcagtctg ctgaggggtt 4140
ttgctttagg atgggcgatc gcgagtaggg acacggatcg ctggta 4186

Claims (23)

1.一种方法,所述方法包括:
(i)提供包含大于1体积%的二氧化碳的气态流;
(ii)提供水;
(iii)在光的存在下将所述二氧化碳和所述水转化为有机中间体和氧气;
(iv)将所述氧气与所述有机中间体分离;以及
(v)在将所述氧气与所述有机中间体分离的所述步骤之后,将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳。
2.根据权利要求1所述的方法,其中将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤(iii)在来自将二氧化碳和水转化为有机中间体的所述步骤(i)的过量水的存在下进行,并且其中(iii)将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤仅消耗在将二氧化碳和水转化为有机中间体和氧气的所述步骤(i)中形成的所述有机中间体的一部分,并且还包括以下步骤:将来自将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤(iii)的过量水和有机中间体输送回到将所述二氧化碳和水转化为有机中间体的所述步骤(i)。
3.根据权利要求1所述的方法,其中将二氧化碳和水转化为有机中间体和氧气的所述步骤(i)在第一生物反应器内进行,所述第一生物反应器含有在光能的存在下由所述二氧化碳产生有机中间体和氧气的微生物。
4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述气态流包含大于3体积%的二氧化碳。
5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法还包括以下步骤:将来自燃烧步骤的烟道气流进行压缩以形成含有二氧化碳的流。
6.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中将氧气与所述有机中间体分离的所述步骤(ii)产生富含有机中间体的流,所述富含有机中间体的流被引入到(iii)将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤中。
7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述富含有机中间体的流包含小于30ppm的氧气。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中将氧气分离的所述步骤包括从所述第一生物反应器中排出氧气。
9.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中(iii)将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤在第二生物反应器内进行,所述第二生物反应器含有产生用于将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的酶的微生物。
10.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤(iii)在基本上不存在光能的情况下进行。
11.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述乙烯和所述二氧化碳形成产物流。
12.根据前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法还包括以下步骤:将所述产物流内的氧气转化为二氧化碳。
13.根据前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法还包括以下步骤:从所述产物流中移除水。
14.根据前述权利要求中任一项所述的方法,所述方法还包括从所述产物流中分离二氧化碳。
15.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中将二氧化碳与所述乙烯分离的所述步骤产生富含乙烯的流。
16.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中将所述二氧化碳与所述乙烯分离的所述步骤产生二氧化碳流,并且其中将所述二氧化碳流引入到将二氧化碳转化为有机中间体和水的步骤(i)中。
17.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中将二氧化碳和水转化为有机中间体和氧气的所述步骤在第一生物反应器内进行。
18.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述将所述氧气与所述有机中间体分离包括从其中含有所述有机中间体的水性介质中排出所述氧气。
19.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中在将所述氧气与所述有机中间体分离的所述步骤之后将所述有机中间体转化为乙烯和二氧化碳的所述步骤在第二生物反应器内进行。
20.一种用于生产乙烯的系统,所述系统包括:
(i)第一生物反应器,其包括将二氧化碳转化为有机中间体的光合微生物,所述第一生物反应器具有二氧化碳入口和用于所述有机中间体的出口;和
(ii)第二生物反应器,其与所述第一生物反应器流体连通并且包括将所述第一生物反应器中产生的所述有机中间体转化为乙烯的微生物,所述第二生物反应器具有用于包括乙烯在内的气态材料的出口,并且所述第二生物反应器具有用于包括未反应的有机中间体在内的流体材料的出口。
21.根据权利要求20所述的系统,其中所述第二生物反应器的用于流体材料的所述出口与所述第一生物反应器流体连通。
22.根据权利要求20或21所述的系统,其中所述第二生物反应器的用于气态材料的所述出口与二氧化碳分离器流体连通。
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述二氧化碳分离器包括用于纯化的二氧化碳的出口,并且其中用于纯化的二氧化碳的所述出口与所述第一生物反应器流体连通。
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