CN115667255A - 卤代杂芳基和其他杂环激酶抑制剂及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及激酶抑制剂,特别是蛋白激酶的抑制剂,该蛋白激酶包括SIK家族CSF1R、ABL/BCR‑ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或其突变体。尽管在结构上与达沙替尼相似,但是本发明的激酶抑制剂是与众不同的,具有特定类别的卤代杂芳基。这种激酶抑制剂可以表现出一种或多种与达沙替尼和其他结构相似的激酶抑制剂不同的某些特性。本发明的激酶抑制剂或包含它们的药物组合物可被用于治疗疾病或病症,例如增殖性疾病,例如白血病或实体瘤。特别是,这些和其他结构相似的激酶抑制剂可被用于治疗增殖性疾病——例如混合表型急性白血病(MPAL)——其特征(尤其)在于MEF2C蛋白、在11q23处人染色体易位和/或KMT2A融合癌蛋白的存在。本文公开的激酶抑制剂或药物组合物可被局部使用以调节对象的皮肤色素沉积,例如赋予紫外线防护和降低皮肤癌风险。

Description

卤代杂芳基和其他杂环激酶抑制剂及其用途
说明书
本发明涉及激酶抑制剂,特别是包括SIK家族、CSF1R、ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或它们的突变体的蛋白激酶抑制剂。尽管在结构上类似于达沙替尼(dasatinib),但本发明的激酶抑制剂是独特的;具有特定类别的卤代杂芳基。这种激酶抑制剂可以显示一种或多种与达沙替尼和其他结构相似的激酶抑制剂不同的某些特性。本发明的激酶抑制剂或包含它们的药物组合物可被用于治疗疾病或病症,例如增殖性疾病,比如白血病或实体瘤。特别是,这些和其他结构相似的激酶抑制剂可被用于治疗增殖性疾病——例如混合表型急性白血病(MPAL)——其特征(尤其)在于存在MEF2C蛋白、11q23处的人类染色体易位和/或KMT2A融合癌蛋白。本发明所公开的激酶抑制剂或药物组合物可被局部施用调节受试者的皮肤色素沉着,例如给予紫外线防护并降低皮肤癌风险。
激酶抑制剂是一种阻断激酶的作用的酶抑制剂。此类激酶的部分非限制性列举包括ABL、AKT、BCR-ABL、BLK、BRK、c-KIT、c-MET、CDK1、CDK2、CDK3、CDK4、CDK5、CDK6、CDK7、CDK8、CDK9、CDK10、cRAF1、CSF1R、CSK、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERK、PAK、FES、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FGFR5、FGR、FIT-1、FPS、FRK、FYN、HCK、IGF-1R、INS-R、JAK、KDR、LCK、LYN、MEK、p38、PDGFR、PIK、PKC、PYK2,ROS、SIK1、SIK2、SIK3、SRC、TIE、TIE2、TRK和ZAP70。激酶是向蛋白质或其他有机分子中添加磷酸基团的酶,已被证实是大多数细胞功能的关键调节剂,包括细胞信号传导、增殖、分化、代谢、存活、凋亡、运动、DNA损伤修复等。磷酸化,特别是由于蛋白质磷酸化控制缺陷而导致的信号传导失调,与多种疾病密切相关;例如与激酶的异常活动(如活性增加)有关的疾病。此类疾病包括但不限于增殖性疾病(例如癌症、良性肿瘤、病理性血管生成、炎症性疾病和自身免疫性疾病)以及过敏和CNS疾病。
蛋白酪氨酸激酶(PTK)是与ATP结合作为底物的磷酸化肽链和蛋白质中的酪氨酸残基的酶。PTK尤其包含受体蛋白酪氨酸激酶(RPTK),包括表皮生长因子激酶家族的成员(例如,HER1和HER2)、血小板衍生生长因子(PDGF)和在血管生成中起作用的激酶(例如,TIE2和KDR);此外,还包括非受体蛋白酪氨酸激酶,包括SYK、JAK和SRC激酶家族的成员(例如SRC、HCK、FYN、LYN、LCK和BLK激酶)。蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶(STK)是在肽链和蛋白质中磷酸化丝氨酸或苏氨酸侧链的氧原子的酶。STK尤其包括AKT1、极光激酶、BRAF、MAP激酶、PLK1、SIK1、SIK2和SIK3。
抑制蛋白激酶,并且因此抑制底物的肽或蛋白质磷酸化,已被证明在治疗许多疾病中是有效的。例如,阿法替尼(afatinib)是一种ERBB抑制剂,在治疗非小细胞肺癌中是有效的;阿西替尼(axitinib)是一种VEGFR、PDGFR和c-KIT抑制剂,在治疗肾细胞癌中是有效的;博舒替尼(bosutinib)是一种ABL/BCR-ABL抑制剂,在治疗慢性粒细胞白血病中是有效的;卡博替尼(cabozantinib)是一种c-MET和VEGFR2抑制剂,在治疗甲状腺癌中是有效的;克唑替尼(crizotinib)是一种ALK、HGFR和c-MET抑制剂,在治疗非小细胞肺癌中是有效的;达沙替尼(dasatinib)是一种ABL/BCR-ABL、SRC和c-KIT抑制剂,在治疗慢性粒细胞白血病中是有效的;厄洛替尼(erlotinib)是一种EGFR抑制剂,在治疗非小细胞肺癌和胰腺癌中是有效的;吉非替尼(gefitinib)是一种EGFR抑制剂,在治疗非小细胞肺癌中是有效的;伊马替尼(imatinib)是一种ABL/BCR-ABL抑制剂,在治疗慢性粒细胞白血病中是有效的;拉帕替尼(lapatinib)是一种HER2抑制剂,在治疗乳腺癌中是有效的;尼洛替尼(nilotinib)是一种ABL/BCR-ABL抑制剂,在治疗慢性粒细胞白血病中是有效的;帕唑帕尼(pazopanib)是一种VEGFR、PDGFR和c-KIT抑制剂,在治疗肾细胞癌和软组织肉瘤中是有效的;帕博西尼(palbociclib)是一种CDK4和CDK6的抑制剂,在治疗ER阳性和HER2阴性乳腺癌中是有效的;普纳替尼(ponatinib)是一种ABL/BCR-ABL、BEGFR、PDGFR、FGFR、EPH、SRC、c-KIT、RET、TIE2和FLT3抑制剂,在治疗慢性粒细胞白血病和急性淋巴细胞白血病中是有效的;瑞戈菲尼(regorafenib)是一种RET、VEGFR和PDGFR抑制剂,在治疗结直肠癌和胃肠道间质瘤中是有效的;瑞博西尼(ribociclib)是一种细胞周期蛋白D1/CDK4和CDK6的抑制剂,在治疗HR阳性、HER2阴性的晚期或转移性乳腺癌中是有效的;鲁索替尼(ruxolitinib)是一种JAK抑制剂,在治疗骨髓纤维化中是有效的;索拉非尼(sorafenib)是一种VEGFR、PDGFR、BRAF和c-KIT抑制剂,在治疗肾细胞癌和肝细胞癌中是有效的;舒尼替尼(sunitinib)是一种VEGFR和PDGFR抑制剂,在治疗肾细胞癌、胃肠道间质瘤和胰腺神经内分泌肿瘤中是有效的;托法替尼(tofacitinib)是一种JAK抑制剂,在治疗类风湿性关节炎中是有效的;凡德他尼(vandetanib)是一种VEGFR、EGFR、RET和BRK抑制剂,在治疗甲状腺癌中是有效的;和维莫非尼(vemurafenib)是一种BRAF抑制剂,在治疗恶性黑色素瘤中是有效的。
鉴于激酶和相关疾病的数量众多,对具有多种激酶选择性、可能对相关疾病的治疗有用的新抑制剂的需求一直存在;特别是仍然需要新的激酶抑制剂、药物组合物/制剂及其用途(包括在治疗方案中)来治疗与一种或多种激酶活性异常相关的疾病;特别是,仍需要新的激酶抑制剂:(a)用于治疗增殖性疾病,例如混合表型急性白血病(MPAL),其特征(尤其)在于存在肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白、11q23处的人类染色体易位和/或赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)融合癌蛋白;或(b)现有激酶抑制剂(例如达沙替尼)的替代品。
一种特定的激酶抑制剂是达沙替尼(N-(2-氯-6-甲基苯基)-2-[[6-[4-(2-羟乙基)-1-哌嗪基]-2-甲基-4-嘧啶基]氨基]-5-噻唑甲酰胺,一种水合物;图1A),被Bristol-Myers Squibb以“SPRYCEL”为名销售,并且适用于患有以下疾病成年患者的治疗:(i)新诊断为慢性期的费城染色体阳性(Ph+)慢性粒细胞白血病(CML);(ii)对包括伊马替尼(imatinib)在内的先前的治疗有耐药性或不耐受的慢性期、加速期或(髓细胞或淋巴性)急变期(Ph+)CML;和(iii)对先前的治疗有耐药性或不耐受的费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病(Ph+ALL)。在欧洲,达沙替尼也适用于对包括伊马替尼在内的先前的治疗有耐药性或不耐受的新诊断为慢性期Ph+CML(Ph+CML-CP)或Ph+CML-CP的儿科患者的治疗;在美国,该药适用于慢性期Ph+CML的儿科患者。
值得注意的是,尽管用达沙替尼进行了大量试验,但在美国或欧洲,该药并未被用于除CML或Ph+ALL外的任何癌症;特别是,截至2018年9月,达沙替尼未被用于任何实体瘤。事实上,许多使用达沙替尼研究其可能用于治疗实体瘤的临床试验都提前终止(例如,由于毒性问题),或未能报告强有力或者至少给人希望的结果。例如,根据2018年9月9日clincialtrials.gov上的信息,达沙替尼只进行过一次实体瘤的3期检测:在一项针对去势抵抗性前列腺癌联合多西紫杉醇的单一研究(“READY”试验(NCT00744497))中,尽管在早期试验中有一些它的活动迹象表明可以抵抗未接受过化疗的去势抵抗性前列腺癌(例如Araujo et al.2012,Cancer 118:63),但在该试验中,达沙替尼无法比单用多西紫杉醇提高总生存率(Araujo et al.2013,Lancet Oncol.14:13017)。尽管对其他癌症如乳腺癌、皮肤癌、胰腺癌、脑癌或肺癌进行了几项试验,但达沙替尼并未显示出令人满意的疗效或耐受性,也没有进展到针对这些癌症的3期试验。特别是,最近在针对局部晚期不可切除胰腺癌患者的双盲2期试验中,达沙替尼联合吉西他滨未能显示出比单独使用吉西他滨更高的总生存率(Evens et al.2017,Annal.Onc.28:354)。然而,最近,一些专门的研究旨在为表达特定药物靶点的特定癌症(包括实体瘤)的患者选择“靶向”治疗,可能根据患者的靶向情况来潜在地检测达沙替尼。例如(i)“TAPUR”测试(“The Targeted Agent and ProfilingUtilization Registry”,https://www.tapur.org,NCT02693535)基于以下一个或多个靶点,将达沙替尼纳入一个可能的治疗组中:BCR-ABL,SRC,KIT,PDGFRB,EPHA2,FYN,LCK,YES1;和(ii)澳大利亚黑色素瘤研究所的一项试验(NCT02645149),涉及患有不可切除的转移性III期或IV期BRAF和NRAS野生型黑色素瘤患者,患者已经恶化或无法接受标准治疗(一般为免疫治疗),包括达沙替尼作为一种可能的治疗方法,这取决于在患者癌症中发现的KIT突变。达沙替尼也是BMS“FRACTION-Lung”2期试验(NCT02750514)的一个可能分支,其可能被测试与肿瘤免疫药物纳武单抗(nivolumab)联合用于晚期非小细胞肺癌患者。本试验的其他分支将纳武单抗与其他肿瘤免疫药物联合使用。
因此,特别需要新的激酶抑制剂用于治疗未指明用达沙替尼治疗的癌症(特别是实体瘤)、和/或达沙替尼没有显示出良好效果的癌症。特别是,需要新的激酶抑制剂用于治疗一种或多种癌症,例如乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌)、胰腺癌或前列腺癌(例如,去势性或激素抵抗前列腺癌)以及黑色素瘤。
此外,还有对用于治疗增殖性疾病(如混合表型急性白血病(MPAL,又称混合谱系白血病“MLL”))的新型激酶抑制剂的特殊需求,其特征(尤其)在于存在MEF2C蛋白(如磷酸化的MEF2C蛋白和/或作为活性转录因子的MEF2C蛋白)、11q23的人类染色体易位和/或KMT2A融合癌蛋白。
混合表型急性白血病(MPAL),也被称为“混合谱系白血病”(MLL),是一种主要发生在儿科患者中的非常具有侵袭性的血癌,与其他类型的儿童急性白血病不同,预后很差(综述自Slany 2009,Haematologica 94:984)。MPAL的一种形式是BCR/ABL重排。带有t(9;22)(q34;q11.2)(或BCR/ABL1重排)的MPAL被视为一个单独的实体(Arber et al 2016,Blood127:2391)。t(9;22)(q34;q11.2)易位导致位于费城染色体(Ph)上的BCR/ABL1融合基因,导致组成性激活的BCR/ABL1酪氨酸激酶。MPAL的另一种形式的特征是存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)融合蛋白(也称为MLL1融合蛋白),这是影响11q23处KMT2A基因(也称为MLL1基因)的染色体易位的结果。这种KMT2A/MLL重排是MPAL(MPAL-MLL+)第二常见的遗传性病变。这些11q23翻译活动将组蛋白甲基转移酶KMT2A的氨基末端与多种不同的(易位)融合伴侣并列,这些融合伴侣破坏了KMT2A的正常组蛋白甲基转移酶功能,并将其取代为(易位)融合伴侣贡献的异源功能取代。由此产生的蛋白质嵌合体是转录调节因子,控制通常由KMT2A控制的其他基因。特别是,转录因子MEF2C可由KMT2A控制,并被认为是儿童急性白血病的癌基因。MEF2C表达与AML中的KMT2A融合基因重排相关(Schwieger et al 2009,Blood 114:2476),MEF2C的表达定义了具有低存活率的AML患者的一个亚群(Lazlo et al 2015,JHematol&Oncol 8:115)。
Tarumoto及其同事(2018,Mol Cell 69:1017)表明AML中的MEF2C活性是由HDAC4的SIK3磷酸化驱动的,并且SIK3基因敲除或小分子工具化合物HG-9-91-01的化学抑制大大降低了几个MPAL相关AML细胞系(包括MOLM-13和MV4-11)的存活性;因为SIK3磷酸化HDAC4的细胞质滞留通过阻止作为MEF2C的辅抑制因子的核定位(非磷酸化)HDAC4来调节与AML增殖相关的肿瘤生存/维持基因的转录因子MEF2C的活性(图19)。事实上,最近的研究表明,腹膜内施用的小分子工具化合物YKL-05-099的SIK3抑制,抑制了AML在体内的进展(Tarumotoet al 2020,Blood 135:56)。然而,仍然需要更多的SIK3抑制剂,尤其是那些具有药物样特性的和特别是那些可以口服施用的,用于增殖性疾病(例如MPAL)的治疗,特别是那些与SIK3驱动的MEF2C控制的癌症生存基因的表达有关的抑制剂。
还需要用于治疗例如白血病的髓样或淋巴母细胞癌的新激酶抑制剂,优选地,用于治疗例如CML和/或ALL的一种或多种Ph+白血病。
达沙替尼被描述为以下激酶的在纳摩尔浓度下的抑制剂:BCR-ABL、SRC家族(SRC,LCK,YES,FYN)、c-KIT、EPHA2和PDGFR-β;与Ph+白血病的达沙替尼适应症特别相关的是它对杂合蛋白激酶BCR-ABL的抑制作用。
BCR-ABL激酶直接与白血病癌细胞(特别是CML细胞)的22号染色体上存在特定的遗传异常有关;被称为“费城染色体”(或费城易位)。这种遗传物质在9号染色体和22号染色体之间的相互易位,将9号染色体的ABL1基因并置到22号染色体的BCR基因上,形成了称为“BCR-ABL”的杂合蛋白的编码序列:一种“永远在线”、使细胞无法控制地分裂的蛋白质酪氨酸激酶。绝大多数CML病例和20-30%的ALL病例都是Ph+。第一种选择性BRC-ABL抑制剂,伊马替尼(STI571),被诺华公司称为“GLEEVEC/GLIVEC”销售,被认为是治疗Ph+白血病的突破。然而,尽管总生存率有所增加,但伊马替尼治疗期间产生的耐药性使科学家发现,大多数此类耐药性是由于BCR-ABL突变的出现而产生的,特别是ABL衍生激酶结构域内的氨基酸置换(对于综述,请参见Rossari&Orciuolo.2018,J.Hemat.Oncol.11:84,在此通过引用整体并入本文)。
对伊马替尼治疗患者的BCR-ABL突变状态和生存概率的分析表明,BCR-ABL激酶ABL位的磷酸酶环(P环)内的突变最为频繁,但P环外(尤其是激酶结构域内)的(更罕见)突变与伊马替尼治疗的CML患者的总生存率降低有关(Jabbour et al.2006,Leukemia 20:1767)。许多新的BCR-ABL突变已经被确认和描述(见Manley et al.2005,Biochem.Biophys.Acta 1754:3的表1和Rossari&Orciuolo 2018的表1,其还描述了达沙替尼其他激酶靶点的突变;在此通过引用将这两个表具体并入本文)。特别是在BCR-ABL的ATP结合区(指示野生型ABL蛋白的位置)发现以下突变:V299L、F311L、T315I、T315A、F317L和F317V。事实上,达沙替尼最初是作为“第二代”BCR-ABL抑制剂研发的,用于已对伊马替尼产生耐药性的CML的二线治疗,推测是由于这些突变中的一个或其他突变的出现而产生的。基于模型研究,达沙替尼被预测与ABL激酶的多种构象结合,这被认为可以解释为什么达沙替尼抑制ABL的几种构象改变突变,而伊马替尼却不能。事实上,一项比较达沙替尼或伊马替尼一线治疗期间突变发展的回顾性分析显示,与伊马替尼治疗(12个不同位点)相比,使用达沙替尼治疗(4个不同位点)出现更少的不同突变位点(Hughes et al.2015,Leukemia29:1832,特别是其图1)。然而,重要的是:(i)发生任何类型突变的患者的总体比例大致相同(达沙替尼患者17/259,伊马替尼患者18/260);(ii)达沙替尼治疗后出现的大多数突变位点位于ATP结合区(3/4突变位点);以及(iii)达沙替尼治疗期间(11/17)出现的最常见的突变是在被称为“门卫”的残基处的T315I突变,它仍然使BCR-ABL激酶对达沙替尼抑制产生抗性。可针对激酶抑制剂进行测试的一组特定BCR-ABL突变体由ProQinase ABL1激酶“野生型和突变体组”提供,包括ABL1野生型蛋白质(氨基酸P118-S525)和代表BCR-ABL最普遍的伊马替尼抗性突变体形式的突变体形式:G250E、Q252H、Y253F、E255K、T315I,F317I、M351T和H396P(www.proqinase.com)。
T315I突变是最常见的BCR-ABL突变之一:出现在2%到20%的CML病例中(Nicolini et al.2009,Blood 114:5271)。这种突变对达沙替尼抑制具有抗性,这是达沙替尼作为激酶抑制剂的一个潜在缺点,它刺激了被称为普纳替尼(被Incyte&Takeda称为ICLUSIG销售)的“第三代”BCR-ABL抑制剂的发展。然而,尽管普纳替尼确实能强烈抑制BCR-ABL激酶的T315I突变(体外IC50为2.0nM),但它已知是一种比达沙替尼更混杂的激酶抑制剂,并且还在体外以在0.1和20nM之间的IC50浓度抑制许多其他激酶,至少包括VEGFR、PDGFR、FGFR、EPH受体和激酶的SRC家族的成员,以及KIT、RET、TIE2和FLT3。此外,由于“存在危及生命的血栓和血管重度狭窄的风险”,普纳替尼在美国的销售在2013年10月被暂停。随着普纳替尼被发布了经修订的处方信息、新的“黑框警告”和“风险评估和缓解策略”以更好地评估使用该药物的风险和益处,该暂停在2013年12月部分解除。此外,普纳替尼在美国的价格(每年可能要花费138,000美元)也受到了批评。因此,普纳替尼显示出实质性的缺点,因此仍然需要新的激酶抑制剂,特别是那些更有潜力有效、安全、容易和/或廉价治疗Ph+白血病(或其他癌症)的激酶抑制剂;和/或对SRC、ABL/BCR-ABL和/或LCK比其他激酶抑制剂(如达沙替尼或普纳替尼)更具选择性的抑制剂。
然而,与伊马替尼相比,达沙替尼并不是对BCR-ABL特别特异的,而是结合和/或抑制大量其他激酶(见Bantscheff et al.2007,Nat.Biotech.25:1035图3;Anastassiadiset al.2012,Nat.Biotech.29:1039补充图2)。特别是,与伊马替尼相比,达沙替尼被描述为更显著地结合和/或抑制许多其他激酶,包括:BTK、CSK、EPHB2、EPHB4、FYN、GAK、KIT、LYN、QIK、QSK、RIPK2、SRC、TEC、TESK2、YES和ZAK。更具体地说,达沙替尼是盐诱导激酶的重要抑制剂,三个家族的成员SIK1、SIK2和SIK3的IC50值分别为<3nM、<3nM和18nM(Ozanne etal.2015,Biochem.J.465:271;也如同时待审的PCT/EP2018/060172所述)。事实上,考虑到达沙替尼是一种选择性较低的激酶抑制剂(这是另一个潜在的缺点),这种选择性降低可能与达沙替尼治疗患者时所面临的不显著的毒性挑战有关,特别是血小板减少症发生的增加(Wei et al.2010,J.Hemat.Oncol.3:47)。
如上所述,达沙替尼是一种有效的KIT抑制剂,这种受体酪氨酸激酶正成为治疗某些癌症的越来越感兴趣的靶点(Babei et al.2016,Drug Des.Dev.Thera.,10:2443),尤其是因为已经在白血病、卵巢癌和黑色素瘤等癌症中检测到KIT基因的突变。众所周知,达沙替尼至少还可以抑制黑色素瘤中最常见的KIT突变(Woodman et al.2009,J.Clin.Onc.27:9019)。然而,KIT的抑制,特别是某些酪氨酸激酶抑制剂的针对FLT3和KIT的相对活性,与骨髓抑制和其他副作用(如头发褪色)有关(Galanis and Levis 2015:Haematologica 100:e89)。事实上,达沙替尼治疗与严重的骨髓抑制有关(见下文)。
盐诱导激酶(SIK)构成丝氨酸酪氨酸激酶亚家族,属于腺苷单磷酸激活的激酶(AMPK)家族。到目前为止已经确定了三个成员(SIK1、-2和-3)。SIK1与SIK2和SIK3在激酶结构域的氨基酸同源性分别为78%和68%。在高盐饮食喂养大鼠的肾上腺中大量表达的SIK1(也称为SIK和SNF1LK)的克隆导致了随后的主要表达于脂肪组织的SIK2(也称为QIK、KIAA0781和SNF1LK2)的克隆,以及相当普遍的SIK3(也称为QSK、KIAA0999或L19)(Katoh etal.2004,Mol.Cell.Endocrinol.217:109)。这三种SIK具有相似的结构,具有一个N-末端激酶结构域(催化结构域)、一个中间泛素相关结构域(被认为对通过LKB1磷酸化很重要)和一个长的C-末端序列(被认为是通过PKA进一步磷酸化的位点)。然而,不同的SIK涉及的角色非常不同。例如,各种SIK参与不同的生物学过程,如骨细胞对甲状旁腺激素的反应(Weinet al.2016,Nature Commun.7:13176)来通过胃泌素诱导SIK1和抑制胃腺癌细胞的迁移(elvik et al.2014,PLoS ONE 9:e112485)。盐诱导激酶(尤其是SIK3)的其他潜在作用在WO2018/193084A1中描述(本申请人,并于2018年10月25日公布),此外,SIK3是一种参与肿瘤细胞对细胞介导免疫应答的抵抗,特别是肿瘤细胞对TNF的抵抗的基因。最近,SIK(尤其是SIK3)被证明也调节TGFβ介导的转录活性和凋亡,Hutchinson等人(2010,Cell Deathand Disease 11:49)表明SIK3的表达或活性导致对TGFβ介导的凋亡的抵抗。
尤其是,除了在各种炎症反应(Clark et al 2014;Sundberg et al 2016)和肿瘤学中发挥作用——特别是肿瘤细胞对免疫反应的敏感性(WO2018/193084A1)——自2011年以来,人们已经知道抑制SIK2促进B16F10黑色素瘤细胞的黑色素生成(Kumagai et al2011,PLoS ONE 6(10):e26148)。随后描述了通过(局部)使用SIK抑制剂,包括与YKL-05-099结构相关的抑制剂,可有效诱导包括人类皮肤外植体中的色素沉着途径(Mujahid etal 2017,Cell Reports 19:2177)。事实上,利用这些结果,随后寻求通过向受试者皮肤局部施用有效量的SIK抑制剂,包括使用先前已知为SIK抑制剂的激酶抑制剂(WO2016/023014),来增加(出现)受试者皮肤色素沉着的方法(WO2018/160774)。
被称为集落刺激因子1受体(CSF1R)的激酶与其配体CSF1结合,由此产生的下游信号导致表达CSF1R受体的髓样细胞的分化和存活。特别是,CSF1-CSF1R信号对于巨噬细胞向更具抑制性的M2表型分化非常重要(Lenzo et al 2012,Immunol Cell Bio 90:429)。事实上,肿瘤中CSF1R+巨噬细胞的存在与包括胃癌、乳腺癌、卵巢癌、膀胱癌等各种适应症的低存活率相关(Zhang et al 2012,PLoS One 7:e50946t)。因此,通过消除或重新培养抑制性M2巨噬细胞,以抗体或小分子抑制剂靶向CSF1R已成为治疗癌症的重要手段。PLX3397是这样一种靶向CSF1R的抑制剂,正处于针对黑色素瘤、胶质母细胞瘤、AML等的临床研发(Cannarile et al 2017,J Immunotherapy Cancer 5:53)。
被称为造血细胞激酶(HCK)的激酶是细胞质酪氨酸激酶(SFK)SRC家族的成员,在髓样和B-淋巴细胞系的细胞中表达。过度的HCK激活与多种类型的白血病相关,并通过与致癌融合蛋白的物理联系以及与受体酪氨酸激酶的功能性相互作用促进细胞增殖和存活。HCK活性升高也见于许多实体恶性肿瘤,包括乳腺癌和结肠癌,并与患者生存率降低相关。HCK可促进髓样细胞生长因子和促炎性细胞因子的分泌,并且促进巨噬细胞向伤口愈合和促瘤交替激活表型分化。在肿瘤相关巨噬细胞中,HCK刺激促进细胞外基质降解的伪足小体的形成,从而增强免疫和上皮细胞的侵袭。由于HCK与真正的致癌酪氨酸激酶之间的功能合作,过多的HCK激活也会降低药物疗效并导致化疗耐药,而HCK的基因消融在健康小鼠中导致最小的生理后果。鉴于其已知的晶体结构,HCK因此为两者提供了有吸引力的治疗靶点,直接抑制癌细胞的生长,并间接抑制肿瘤微环境中促瘤变化的来源(Poh et al 2015,Oncotarget 6:15742)。
因此,仍然需要新的激酶抑制剂,特别是那些表现出药物样性质(特别是那些适合口服给药的)和抑制一种或多种激酶(包括从SIK3、ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或CSF1R中选择的任何一种),和/或特别是表现出与达沙替尼抑制的激酶不同的激酶谱的抑制剂。例如,新的激酶抑制剂,其:(i)与达沙替尼对一种或多种其他激酶的特异性相比,对关键疾病相关激酶(例如,ABL/BCR-ABL、SRC、LCK、HCK、PDGFR CSFR1和/或EPHA2、EPHA4、ACK1和/或KIT)的特异性更强;(ii)以不同于达沙替尼的方式抑制关键疾病或副作用相关激酶(例如对KIT和/或FLT3);和/或(iii)抑制疾病相关激酶的一个或多个突变体,特别是对一个或其他激酶抑制剂具有抗性的突变体,例如ABL/BCR-ABL或KIT的突变体。
此外,尽管达沙替尼在人体内主要由细胞色素P450酶3A4(CYP3A4)代谢,但它也是CYP3A4的时间依赖性抑制剂。事实上,如果患者同时服用强效CYP3A4抑制剂(如酮康唑(ketoconazole)、伊曲康唑(itraconazole)、克拉霉素(clarithromycin)、阿扎那韦(atazanavir)、茚地那韦(indinavir)、奈法唑酮(nefazodone)、奈非那韦(nelfinavir)、利托那韦(ritonavir)、沙奎那韦(saquinavir)、泰利霉素(telithromycin)和伏立康唑(voriconazole)),则达沙替尼的剂量必须显著减少(例如,从每天100mg减少到每天20mg),因为这可能会使达沙替尼的血浆浓度增加到潜在不安全的水平。葡萄柚汁也可能增加达沙替尼的血浆浓度,也应该避免使用。因此,仍然需要显示不同于达沙替尼的细胞色素P450抑制模式(例如,对CYP3A4)的新激酶抑制剂。
重要的是,一旦出现骨髓抑制,达沙替尼的剂量和给药应停止(或减少)。事实上,在达沙替尼的美国处方信息中,骨髓抑制仅仅被描述为一种“预警与防范”,因为达沙替尼治疗与严重(NCI CTC 3级或4级)血小板减少、中性粒细胞减少和贫血相关。除了导致人类受试者血小板减少外,在所有达沙替尼临床研究中:(i)1%的患者发生严重中枢神经系统出血(包括死亡);(ii)4%的患者发生严重胃肠道出血,包括死亡,通常需要中断治疗和输血;和(iii)2%的患者发生其他严重出血。
达沙替尼的进一步“预警与防范”包括:(x)它与液体滞留有关,临床试验中有高达10%的患者出现严重的液体滞留;(y)它有可能延长心室复极(QT间期),临床试验中高达1%的CML患者出现QT延长;和(z)在258例服用达沙替尼的患者中,有5.8%的患者出现心脏不良反应,包括1.6%心肌病、充血性心力衰竭、舒张功能不全、致死性心肌梗死和左心室功能不全的患者。事实上,达沙替尼已知是hERG的抑制剂(Pharmacological/ToxicityReview and Evaluation of NDA 21-986,page 31)。hERG(人类Ether-a-go-go相关基因)是一种离子通道,它有助于心脏的电活动,并协调心脏的跳动。当该通道跨细胞膜传导电流的能力受到抑制或损害时(例如,通过给药),可能会导致可能致命的“长QT综合征”。因此,仍然需要不同于达沙替尼的展现出对hERG的抑制作用的新激酶抑制剂。例如,提供对hERG的IC50大于达沙替尼的新激酶抑制剂是有利的。
实际上,达沙替尼的主要代谢途径包括达沙替尼的氯/甲基苯基或哌嗪基修饰后的代谢途径(例如,Christopher et al2008,Drug Metab&Disp 36:1357,特别是其中的图4)。特别是,CYP3A4介导的反应性环氧化合物和醌亚胺中间体的形成可形成达沙替尼的活性代谢物,它可以共价结合生物分子,如CYP蛋白(Duckett&Cameron 2010,Expert OpinDrug Metab Toxicol 6):1175),可促进达沙替尼在人体中观察到的毒性,和/或导致与其他CYP底物(如辛伐他汀)的药物相互作用。
因此,仍然需要表现出与达沙替尼不同代谢物谱的其他激酶抑制剂(例如在人类中),尤其是具有与达沙替尼不同的一个或多个主要代谢途径的其他激酶抑制剂(尤其是氯/甲基苯基和/或哌嗪基修饰后的达沙替尼)。
与其他BCR-ABL抑制剂相比,达沙替尼有非常短的半衰期:总的平均终末半衰期只有3-5小时(完整处方信息的第12.3节“药代动力学”)。与此形成鲜明对比的是:伊马替尼的消除半衰期约为18小时;博舒替尼的平均终末期消除半衰期为22.5小时;尼洛替尼的表观消除半衰期约为17小时;普纳替尼的几何平均终末消除半衰期约为24小时。在不受理论约束的情况下,达沙替尼的半衰期较短——适用于每天一次的剂量——可能解释了与当天晚些时候体内药物浓度较低相关的有限的活性和/或与给药后不久体内药物浓度峰值/较高相关的副作用。因此,仍然需要具有更长半衰期特性的新激酶抑制剂(例如,比达沙替尼所显示半衰期更长)。例如,有利的激酶抑制剂可以是一种比达沙替尼更稳定的抑制剂,例如通过在血浆和/或肝微粒体稳定性测定中表现出更长的半衰期。
达沙替尼的进一步预防措施、不良事件和其他处方信息可从EMA和FDA各自网站的完整处方信息的产品特征摘要(SmPC)中找到(分别如下所示,2018年8月20日访问,并且通过引用将其全部内容并入本文):(i)http://www.ema.europa.eu/docs/en_GB/document_library/EPAR_Product_Information/human/000709/WC500056998.pdf和(ii)https://www.accessdata.fda.gov/drugsatfda_docs/label/2010/021986s7s8lbl.pdf。
达沙替尼的多种变体已被合成并被证明对一种或多种激酶具有体外生化抑制活性和/或对细胞具有抗增殖作用。特别是,合成了这些变体:(i)在达沙替尼的发现阶段以了解和描述其构效关系(SAR)(Lombardo et al 2004,J Med Chem 47:6658;Das et al2006,J Med Chem 49:6819);和(ii)提供替代激酶抑制剂和/或候选药物(例如WO 2006/081172和WO 2008/033746)。其中所述的达沙替尼变体在甲酰胺处携带苯基部分。这些公开内容证明了其它位置和可在其上被取代的大量取代基,提供了是激酶抑制剂和/或具有细胞抗增殖活性的化合物(图8)。
WO 2018/193084(本申请人,并于2018年10月25日公开)公开了携带吡啶基部分的达沙替尼变体及其用途。同时待审的申请PCT/EP2019/078751(本申请人)进一步公开了携带其他杂环部分的达沙替尼变体,尤其是携带噻唑基部分的变体。Beutner等人(2018,OrgLett 20:4218)描述了一种形成具有挑战性的酰胺键的方法,包括连接至某些吡啶、吡嗪和嘧啶的酰胺键。Pennington等人(2017,J Med Chem 60:3552)描述了在芳香环和杂芳香环系统中用N原子取代CH基团会对分子和生理特性产生影响。然而,根据经验证明,进行这样的替代在统计学上并不会比单纯的偶然性更好地提升效力:Abbott内部数据的匹配分子对分析(MMPA)(Hajduk&Sauer 2008,J Med Chem 51:553)发现,与大多数取代基一样,通过交换CH基团和N原子来增加或减少效力的概率大致相等。事实上,该分析进一步表明,用这种替代物实现效力增加10倍的概率小于十分之一,实现100倍的概率小于百分之一;类似于在研究这类替代物对提高结合亲和力的影响时观察到的概率(Hu et al 2014,F1000Research 3:36;de la Vega de Leon et al 2014,MedChemComm 5:64)。
因此,本发明的一个目的是提供一种或多种激酶抑制剂(例如SIK3、ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或CSF1R激酶的抑制剂),其具有一个或更多特性(例如体外和/或体内试验显示的特性),可以解决这些或其他问题中的一个或多个。在其他目的中,本发明提供了达沙替尼(或一种或其他激酶抑制剂,例如本文所述的那些)的替代和/或改进激酶抑制剂。例如,具有一种或多种功能性(例如,激酶选择性)、ADMET、PK和/或药理学性质的与达沙替尼(或一种或其他激酶抑制剂,例如这里描述的那些)不同和/或相比达沙替尼改进的激酶抑制剂将是有利的。特别是,提供一种或多种具有类似药物特性的SIK家族激酶抑制剂将是有利的,尤其是那些可以口服给药的,用于治疗增殖性疾病(例如MPAL),其特征(尤其)在于MEF2C蛋白(例如磷酸化MEF2C蛋白和/或作为活性转录因子的MEF2C蛋白)、11q23处的人类染色体易位和/或KMT2A融合癌蛋白的存在。本发明所基于的目的由本文任何地方所公开或定义的主题来解决,例如由所附权利要求的主题来解决。
发明概述
一般来说,通过简要描述,本发明的主要方面可以概括如下:
在第一方面,本发明提供一种化合物,选自下式的激酶抑制剂:
Figure BDA0003884477230000071
以及其溶剂化物、盐、N氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;其中Hy、R2、R3、R4、R5、A和E如本文所定义。
在第二方面,本申请提供一种药物组合物,其包含第一方面的化合物和任选的药学上可接受的赋形剂。
在第三方面,本申请提供用于治疗的第一方面的化合物或第二方面的药物组合物。
在相关方面,本发明提供了一种用于治疗对象的疾病、病症或病状的方法,包括向所述对象施用第一方面的化合物或第二方面的药物组合物,任选地其中所述疾病、病症或病状与激酶相关。
在第四方面,本申请提供用于治疗对象(尤其是人类患者)的增殖性疾病的第一方面的化合物或第二方面的药物组合物。
在相关方面,本发明提供一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,包括向所述对象施用第一方面的化合物或第二方面的药物组合物。
在第五方面,本申请提供用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,该治疗包括向对象施用该化合物或药物组合物,其中所述化合物选自以下化合物:(a)至(c),或所述药物组合物包含所述化合物和任选的药学上可接受的赋形剂:
(a)第一方面的化合物;
(b)具有下式的化合物:
Figure BDA0003884477230000072
以及溶剂化物、盐、N氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;其中Hy、R2、R3、R4、R5'、A和E如本文所定义;和
(c)具有下式(Ic)的化合物:
Figure BDA0003884477230000081
以及溶剂化物、盐、N氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;其中R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如本文所定义;
并且其中所述增殖性病症选自(α)至(γ)中的一种或多种:
(α)增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病有关的细胞的特征在于)存在肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白,例如磷酸化MEF2C蛋白和/或作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地,其中增殖性疾病的特征还在于存在磷酸化组蛋白脱乙酰酶4(HDAC4)蛋白,例如SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(β)增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病有关的细胞,其特征在于):(i)在11q23处存在人类染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或在RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变;和/或
(γ)混合表型急性白血病(MPAL)。
在相关方面,本发明提供了一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,包括向所述对象施用如第五方面所定义的化合物或药物组合物,其中增殖性疾病如第五方面所定义。
在另一方面,本申请提供了一种用于确定患有增殖性疾病的对象适用于第五方面中定义的化合物或药物组合物进行治疗的方法,该方法包括,在从所述对象获得的生物样品中确定:
(X)存在MEF2C蛋白,例如磷酸化MEF2C蛋白和/或作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地,其中增殖性疾病的特征还在于存在磷酸化的HDAC4蛋白,例如由SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(Y)(i)在11q23处存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在KRAS基因和/或RUNX1基因中存在突变,其中,生物样品中所述蛋白质、易位、重排、癌蛋白和/或突变的存在表明所述对象适用于所述化合物或药物组合物的治疗。
在另一方面,本发明涉及增加对象中的皮肤色素沉着(或增加皮肤色素沉着的出现)的方法,该方法包括向所述对象施用(例如有效量的)在第五方面中使用的激酶抑制剂(或包含该化合物的药物组合物)。
在另一方面,本申请提供一种中间体,选自具有式(Id)的化合物:
Figure BDA0003884477230000082
以及溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,其中R40和R41如本文所定义。
在另一方面,本申请提供了一种制备包含酰胺部分的化合物的方法,该方法包括使本发明的中间体与相应的羧酸反应的步骤,以及任选地去除氨基保护基团。
本文还公开了本发明的其他方面。
附图简要说明
附图显示:
图1:描述以下化合物的化学结构:(A)达沙替尼(化合物A8),N-(2-氯-6-甲基苯基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)-1-哌嗪基)-2-甲基-4-嘧啶基)氨基)-5-噻唑甲酰胺;(B)激酶抑制剂B3,N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)-1-哌嗪基)-2-甲基-4-嘧啶基)氨基)-5-噻唑甲酰胺;(C)式(Ib)/(Ic)C1至C13的某些其他激酶抑制剂;(D)某些进一步的式(Ib)/(Ic)D1至D10的激酶抑制剂;和(E)式(Ia)E1至E16的某些激酶抑制剂。
图2:描述(在A至E中)与达沙替尼(A8,右栏)相比,式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(B3,左栏)对激酶(A)ABL1;(B)SRC;(C)SIK1;(D)SIK2和(E)SIK3的抑制活性;并描述(在F至J中)式(Ib)/(Ic)的其它激酶抑制剂(C3,左栏;C12,右栏)对激酶(F)ABL1;(G)SRC;(H)SIK1;(I)SIK2和(J)SIK3的抑制活性。X轴化合物浓度(M)和Y轴激酶活性(%)。
图3:描述用B3(式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂)、达沙替尼(A8)和C7(式(Ib)/(Ic)的另一种激酶抑制剂)的按残留活性百分比计(在1uM化合物处)对激酶抑制的选择性:****<25%残留活性;***25%至<50%残留活性;**50%至<75%残留活性;*>75%残留活性。蛋白激酶家族的分类(Manning et al.Science 6December 2002:Vol.298no.5600pp.1912-1934):AGC:包含PKA、PKG和PKC家族;CAMK:钙/钙调素依赖性蛋白激酶;CK1:酪蛋白激酶样;CMGC:包含CDK、MAPK、GSK3和CLK家族;TK:酪氨酸激酶;TKL:酪氨酸激酶样;STE:酵母菌7号、11号、20号激酶的同系物。##组成性活性激酶。
图4:描述与达沙替尼(A8;Y轴)相比,式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂B3(X轴)对激酶抑制的选择性(按1uM化合物的残留活性百分比计):(A)轴显示全部范围的残留活性;(B)轴显示0到50%范围的残留活性。
图5:描述与达沙替尼(A8,右栏)相比,式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(B3,左栏)对激酶(A)FLT3;(B)SYK;(C)KIT和(D)LCK的抑制活性。X轴化合物浓度(M)和Y轴激酶活性(%)。
图6:描述了肿瘤细胞对(A)激酶抑制剂B3和(B)A8(达沙替尼)体外TNF攻击的敏感性;圆圈:化合物(浓度如图所示)加rHuTNF(10ng/mL);正方形:单独的化合物(浓度如图所示),不含rHuTNF。
图7:描述PCT/EP2018/060172中所述的某些激酶抑制剂在使用实施例9中所述的M579-A2-luc在不同浓度下单独使用(正方形)或与10ng/mL TNF(圆形)组合使用的测定中的相对肿瘤细胞存活率(通过细胞毒性/存活性使RLU标准化)。还显示了该化合物对SIK家族成员和相关激酶ABL1和SRC的指示性抑制活性,与表3中使用的指示剂一起显示。(A)pan-SIK和ABL1&SRC抑制剂,化合物B1;(B)ABL1&SRC抑制剂,化合物B8;(C)SIK1、SIK2和ABL1&SRC抑制剂,化合物B4。
图8:描述:(A)取自Lombardo et al 2004(J Med Chem 47:6658)表一的达沙替尼变体的细胞抗增殖活性,显示达沙替尼的各种衍生物对所示细胞系的效力。a根据化合物暴露72h后的四氮唑类染料转化率测定抗增殖活性。IC50值报告为至少三次单独测定的平均值,或在少于三次测量的情况下报告为单独的IC50值。平均值周围的可变性<50%,除非括号中的SE值另有说明;(B)Das et al 2006(J Med Chem 49:6819)表4中的达沙替尼变体的生物化学和细胞抗增殖活性。a.n=3,个体值的变化,<20%。b n=3,个体值,<30%。
图9:描述与(A)达沙替尼(A8;X轴)和(B)式(Ib)/(Ic)的另一种激酶抑制剂B3(X轴)相比,式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂C7(Y轴)对激酶抑制的选择性(按1uM化合物的残留活性百分比计)。虚线区域突出显示了在适用化合物之间被显著地区别抑制的激酶组。
图10:描述与对照动物(灰色正方形)相比,通过管饲法给予雌性C57Bl/6小鼠每日一次(QD=A)和每日两次(BID=B)不同浓度33mg/kg(黑色正方形)和100mg/kg(灰色正方形)的C7后的体重。X轴:给药后天数;Y轴:体重变化(%)。(C)通过LC-MS/MS测定C7的血浆水平。A=33mg/kg QD;B=100mg/kg QD;C=33mg/kg BID;D=100mg/kg BID。Y轴:C7的血浆浓度(nM)。
图11:描述(A)用赋形剂(黑色正方形)、C7 100mg/kg QD(灰色六边形)、C7 100mg/kg BID(灰色三角形)和A8(达沙替尼)30mg/kg QD A8(灰色圆圈)治疗植入MC38细胞的小鼠的肿瘤生长动力学;Y轴=平均肿瘤体积(mm3)。误差线SEM。X轴:天数。采用双因素方差分析计算统计显著性,包括Tukey多重比较分析。***p<0.001;(B):(A)中小鼠体重动力学。Y轴:平均体重变化(%)。
图12:描述式(Ib)/(Ic)的化合物C7对肿瘤微环境中存在的免疫细胞的免疫肿瘤学效应。肿瘤内免疫浸润以肿瘤内CD45+细胞的百分比计算。采用单因素方差计算统计显著性,包括Tukey多重比较分析。(A)Y轴:CTL与Treg细胞的比值。(B)活化CTL(CD25+CD69+);Y轴:CD45+细胞的百分比。(C)活化CTL(颗粒酶B+);Y轴:CD45+细胞的百分比。(D)免疫抑制性M2样肿瘤相关巨噬细胞(TAM)(CD206+MHC-II+);Y轴:CD45+细胞的百分比;*p<0.05;**p<0.01;***p<0.00。
图13:描述TNF对由化合物C7引起敏感的细胞的杀伤作用。(A)TNF诱导的PANC-1细胞凋亡。PANC-1细胞用370nM(“菱形”)、3333nM(“正方形”)的C7和仅DMSO(“星形”)处理120小时,然后加入100ng/ml rHuTNF(+rHuTNF=空心形状;-rHuTNF=实心形状;空心圆圈10ng/mL rHuTNF对照组)。采用实时活细胞显微镜进行评估细胞死亡,测量YOYO-1染料的核掺入(YOYO-1+细胞的面积/孔)。Y轴=肿瘤细胞死亡(um2/孔)。X轴=时间(h);(B)C7对TNF诱导(100ng/ml rMuTNF)小鼠MC38细胞凋亡的影响(+rMuTNF=“菱形”;-rMuTNF=“圆圈”)。72小时后用CellTiter-Glo测定细胞存活性。荧光素酶值被标准化为用不含抑制剂的rHuTNF(仅DMSO)处理的细胞。Y轴=存活性(%)。X轴=化合物浓度(nM)。
图14:描述:(A)化合物C7对NFKB活性的影响。在NFKB启动子的控制下表达荧光素酶的报告PANC-1细胞分别用不同浓度的C7处理8小时,然后添加10ng/ml rHuTNF(+rMuTNF=“菱形”;-rMuTNF=“圆圈”)。荧光素酶活性被标准化为用不含抑制剂的rHuTNF(仅DMSO)处理的PANC-1细胞。Y轴=NFKB活性(%)。X轴=化合物浓度(nM);(B)化合物C7对HDAC4磷酸化的影响。用不同浓度的C7(存在10ng/mL rHuTNF)处理PANC-1细胞3小时。使用抗HDAC4捕获抗体和抗pHDAC4检测抗体在Meso Scale Discovery(MSD)测定中分析全细胞裂解物。HDAC4磷酸化被标准化为未经处理的PANC-1细胞(仅DMSO)。Y轴=HDAC4磷酸化(%)。X轴=化合物浓度(nM)。
图15:描述:化合物C7对WSU-NHL(A)和DOHH-2(B)细胞系的生长抑制作用,分别显示约8nM和9nM的GI50。X轴:化合物浓度(M);Y轴:96小时的生长抑制百分比(GI)。
图16:描述激酶抑制选择性(按0.1uM化合物的%残留活性计):(A)式(Ia)的激酶抑制剂E9(X轴)与E10(Y轴)相比;和(B)C7(X轴)与式(Ia)的激酶抑制剂E4(Y轴)相比。
图17:描述化合物C7(X轴)和式(Ia)的激酶抑制剂E10(Y轴:%残余活性)在:(A)1uM化合物浓度;和(B)0.1uM化合物浓度下对MAP3K11和NEK11激酶的区别抑制。
图18:描述本文公开的SIK3抑制剂对表达MEF2C的AML细胞系的活性:(A)化合物C7针对一组AML细胞系,显示具有磷酸化MEF2C蛋白的此类细胞系的强裂解;(B)化合物C7对pMEF2C阳性KASUMI-1细胞系的高效细胞杀伤;和(C)化合物C7对pMEF2C阴性HEL细胞系的低细胞杀伤作用。
图19:描述SIK3介导的通过磷酸化心肌细胞增强因子2C(MEF2C)转录因子控制存活/维持基因(a)表达的示意图。MEF2C的过度表达与存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)蛋白(以前称为“MLL”;(b))融合有关,通常由11q23处的人类染色体易位引起。MEF2C的活性受HDAC4在细胞核中的存在控制,HDAC4作为一种抑制性辅因子,其在细胞质中的滞留是由SIK3磷酸化引起的。未磷酸化HDAC4的核进入和存在(c)(因此通过抑制MEF2C的转录因子活性来降低肿瘤生存/维持基因(a)的表达)可通过本文所公开的化合物(d)抑制SIK3来实现。
图20:描述(A)植入MC38细胞的小鼠的肿瘤生长动力学,并用以下方法治疗:(1)对照:ratIgG2a 10mg/kg(黑色实心正方形)、aPD-1 10mg/kg 3q7d(浅灰色空心交叉圆圈)和赋形剂(浅灰色实心倒三角形);化合物E1030mg/kg BID(灰色空心倒三角形)、E4 40mg/kgBID(深灰色实心圆圈)、E9 25mg/kg BID(浅灰色实心正方形)、E9 50mg/kg BID(深灰色实心三角形)和C7 100mg/kg BID(浅灰色实心菱形)。Y轴=平均肿瘤体积(mm3)。采用单因素方差分析,包括Tukey多重比较分析,计算误差条SEM的统计显著性。X轴=天数。(B)(A)中小鼠肿瘤体积<1000mm3的概率。Y轴:治疗后肿瘤体积<=1000mm3的发生概率。X轴:天数。对于(A)和(B),对照:ratIgG2a(a),aPD-1 10mg/kg(b)和赋形剂(c);和化合物:C7 100mg/kg(d)BID、E4 40mg/kg BID(e)、E925mg/kg BID(f)、E9 50mg/kg BID(g)和E10 30mg/kg BID(h)。(C)至(H)小鼠肿瘤生长曲线;Y轴:肿瘤体积(mm3),X轴:天数。(C)E9 25mg/kg BID;(D)E950mg/kg BID;(E)C7 100mg/kg BID;(F)aPD-110mg/kg;(G)ratIgG2a 10mg/kg和(H)赋形剂。
图21:描述式(Ia)激酶抑制剂对存在于肿瘤微环境中的免疫细胞的免疫肿瘤学作用。肿瘤内免疫浸润以肿瘤内CD45+细胞百分比计算。统计显著性采用单因素方差分析,包括Tukey多重比较分析。采用单因素方差分析计算统计显著性,包括Tukey多重比较分析。(A)CD3+T细胞;(B)CD8+T细胞;(C)活化CTL(CD8+CD25+);(D)活化CTL(CD8+颗粒酶B+);(E)调节性T细胞(CD25+、FoxP3+)。Y轴:CD45+细胞的百分比。(F)CD11b+髓细胞;(G)抗肿瘤M1肿瘤相关巨噬细胞(TAM)(CD206-MHC-II+);(H)免疫抑制性M2肿瘤相关巨噬细胞(TAM)(CD206+MHC-II-);(I)mMDSC(Ly6C+);(J)gMDSC(Ly6G+)。Y轴:CD45+细胞百分比,*p<0.05;**p<0.01;***p<0.001。X轴:A=ratIgG2a(10mg/kg,3q7d);B=aPD-1(10mg/kg,3q7d);C=赋形剂(BID);1=C7(100mg/kg,BID);2=E4(40mg/kg,BID);3=E9(25mg/kg,BID);4=E9(50mg/kg,BID);5=E10(30mg/kg,BID)。
图22:描述在5ng/ml TNF存在下,(A)化合物E9或(B)化合物C7诱导的在SIK3敲除MC38克隆(三角形)或SIK3野生型MC38克隆(正方形)中的TNF介导的细胞杀伤。Y轴=活性,标准化为无TNF。X轴=抑制剂浓度,单位:nM。
图23:描述所有已知的KMT2A融合易位伴侣基因(TPG)的疾病分类(改编自Meyeret al 2018图3)。所有TPG均按其诊断的疾病类型分组。这些基因已经被诊断为ALL、t-ALL、t-AML、AML、t-ALL、MLL、急性双表型白血病(BAL)、MDS、t-MDS、慢性粒细胞白血病(CML)、t-CML、幼年型粒单核细胞白血病(JMML)和淋巴瘤。交叉点的基因属于两个不同的组。粗体标记的TPG是最常见的。
图24:描述给药30mg/kg po后,与密切相关的化合物C7(正方形)相比,式(Ia)的化合物E4(圆形)、E9(倒三角形)和E10(菱形)的药代动力学曲线。Y轴=总血浆化合物浓度(ng/ml);X轴=时间(h)。
图25:描述式(Ia)和C7化合物对抗MC38肿瘤细胞和TNF的实验的再现性。Y轴=EC50肿瘤细胞裂解(nM)。
图26:描述与不同(小鼠)TNF浓度下(rMuTNF浓度:x=0ng/ml、y=10ng/ml、y=100ng/ml)针对各种小鼠肿瘤细胞系测试的密切相关化合物C7相比,化合物E9的示例性TNF依赖性剂量反应曲线。垂直条:在所示的rMuTNF浓度下无化合物的标准化存活性。左侧栏化合物E9,右侧栏化合物C7,针对:MC38(A);CT26(B)和EMT6(C)。Y轴=存活性(标准化为无化合物);X轴=化合物浓度(nM)。
图27:描述与达沙替尼(30mg/kg QD)(B)相比,化合物E9(24mg/kg BID)(A)在MC38同基因肿瘤模型中的更好和更均匀的肿瘤生长抑制作用。左栏=化合物治疗组;右栏=赋形剂治疗组。Y轴=肿瘤体积(mm3);X轴=接种后天数。
图28:描述:(A)和(B)化合物E9对NFKB活性的影响。用不同浓度的E9处理在NFKB启动子控制下表达荧光素酶的报告PANC-1细胞(A)或MC38细胞(B)8小时,然后加入10ng/mlrHuTNF,(+rHuTNF=“菱形”,EC50s=405nM的PANC-1和389nM的MC38;-rHuTNF=“圆圈”)。将荧光素酶活性标准化为用不含抑制剂(仅DMSO)的rHuTNF处理的细胞。Y轴=NFKB活性(%)。X轴=化合物浓度(nM);条“A”:不含化合物且不含TNF的存活性;条“B”:不含化合物且含10ng/ml TNF的存活性;和(C)化合物E9对HDAC4磷酸化的影响。用不同浓度的E9(在10ng/mLrHuTNF的存在下)处理PANC-1细胞3小时。用抗HDAC4捕获抗体和抗pHDAC4检测抗体在特定蛋白分析仪(MSD)中分析全细胞裂解物。HDAC4磷酸化针对未经处理的PANC-1细胞进行标准化(仅DMSO)。Y轴=HDAC4磷酸化(%)。X轴=化合物浓度(nM)。
图29:描述在MC38同基因肿瘤模型中,化合物E9和抗PD-1mAB(单独或联合)对体内肿瘤生长(平均+/-SEM)的影响。(A)Y轴=肿瘤体积(mm3);X轴=开始治疗后的天数。赋形剂+抗PD-1mAB(正方形)、赋形剂+mIgG1e ctr(圆形)、E9+抗PD-1mAB(倒三角形)和E9+mIgG1ectr(三角形)。(B)总生存率中位数。Y轴=存活概率(%);X轴=开始治疗后的天数。赋形剂+抗PD-1mAB(灰色/虚线)、赋形剂+mIgG1e ctr(黑色/实心)、E9+抗PD-1mAB(灰色/实心)和E9+mIgG1e ctr(黑色/虚线)。(C)至(D)小鼠肿瘤生长曲线;Y轴:肿瘤体积(mm3),X轴:开始治疗后的天数。(C)E9 25mg/kg BID;(D)aPD-1 2,5mg/kg;(E)E9 50mg/kg BID+aPD-1 2,5mg/kg和(F)赋形剂。
图30:描述(A)和(B)化合物E9对免疫豁免肿瘤模型(EMT6)中对体内肿瘤生长的影响(平均+/-SEM)。Y轴=肿瘤体积(mm3);X轴=治疗开始后的天数。(A)赋形剂BID(正方形)、E9 25mg/kg BID(三角形)、E9 12.5mg/kg BID(菱形)和E9 5mg/kg BID(圆形)。(B)赋形剂BID(正方形)、E9 25mg/kg BID(三角形)、E9 25mg/kg QD(倒三角形)。
本发明的详述
本发明及其特定的非限制性方面和/或实施例可以更详细地描述如下。
尽管可以更详细地进一步描述本发明,但是应当理解,本发明不限于本文中描述的特定方法、方案和试剂,因为它们可以变化。还应理解,本文中使用的术语仅用于描述特定实施例的目的,并不旨在限制本发明的范围,本发明的范围将仅限于本文中所描述、定义或以其他方式公开的内容的限制,特别是在任何详细的实施例或所附权利要求中。
在此,更详细地描述本发明的某些要素。这些要素与特定实施例一起列出,然而,应当理解,它们可以以任何方式和任何数量组合以创建附加实施例。各种描述的实施例和优选实施例不应被解释为将本发明仅限于明确描述的实施例。本申请的描述应理解为支持并包含将明确描述的实施例与任何数量的公开和/或优选要素结合的实施例。此外,除非上下文另有指示,否则本申请中所有描述的元素的任何排列和组合应被认为是本申请的说明书所公开的。例如,如果在本发明化合物的一个实施例中,L是键,而在本发明化合物的另一实施例中,R3是H,则在本发明化合物的优选实施例中,L是键且R3是H,或者如果在使用本发明化合物的一个实施例中,受试者是成年人,而在使用本发明化合物的另一实施例中,增殖性疾病是前列腺癌,则在本发明化合物用途的优选实施例中,受试者为成人且增生性疾病为前列腺癌。
一般定义
除非另有定义,本文中使用的所有技术和科学术语与本领域普通技术人员通常理解的含义相同。
优选地,本文中使用的术语如“生物技术术语的多语种词汇表:(IUPAC建议)”中所定义,H.G.W.Leuenberger,B.Nagel,and H.
Figure BDA0003884477230000121
Eds.,Helvetica Chimica Acta,CH-4010Basel,Switzerland,(1995)。
除非另有说明,否则本发明的实践将采用化学、生物化学和重组DNA技术的常规方法,这些方法在本领域的文献中进行了解释(参见,例如Molecular Cloning:A LaboratoryManual,2nd Edition,J.Sambrook et al.eds.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor 1989)。
在本说明书和随后的权利要求书中,除非上下文另有要求,否则“包括”一词以及诸如“包括”和“包含”等变体将被理解为暗示包括所述成员、整数或步骤或成员、整数或步骤组,但不排除任何其他成员,整数或步骤或成员、整数或步骤组。术语“基本上由……组成”是指排除其他具有任何基本意义的成员、整数或步骤或具有任何基本意义的成员、整数或步骤组。例如,基本上由本文所定义的成员/部分组成的药物组合物(例如本发明任一方面中定义的化合物和任选一种附加治疗剂),将排除其他治疗药物(除了本发明任一方面中定义的化合物和任选的一种附加治疗剂之外),但不排除微量(例如,污染物的量(优选化合物中存在的所有污染物的量)相比于总成分,小于按重量计5%,例如小于按重量计4%,按重量计3%,按重量计2%,按重量计1%,按重量计0.5%,按重量计0.4%,按重量计0.3%,按重量计0.2%,按重量计0.1%,按重量计0.1%,按重量计0.05%)污染物(例如那些来自分离纯化法的)和/或药学上可接受的赋形剂(例如载体,例如磷酸盐缓冲溶液、防腐剂等)。术语“由……组成”是指排除所有其他成员、整数或重要步骤或成员、整数或重要步骤组。例如,由如本文所定义的成员/部分(如本发明任一方面中定义的化合物、赋形剂及任选的一种附加治疗剂)组成的药物组合物不包括任何其他相对于总成分重量超过2%(如任何其他化合物,其按重量计大于1%、按重量计大于0.5%、按重量计大于0.4%、按重量计大于0.3%、按重量计大于0.2%、按重量计大于0.1%、按重量计大于0.09%、按重量计大于0.08%、按重量计大于0.07%、按重量计大于0.06%、按重量计大于0.05%、按重量计大于0.04%、按重量计大于0.03%、按重量计大于0.02%、按重量计大于0.01%)的化合物(包括第二种或更多赋形剂)。术语“包括”包含术语“基本上由……组成”,而后者又包括术语“由……组成”。因此,在本申请中每次出现时,术语“包括”可替换为术语“基本上由……组成”或“由……组成”。同样,在本申请中每次出现时,术语“基本上由……组成”可替换为术语“由……组成”。
在本文中使用时,“和/或”将被视为对两个特定特征或要素中的每一个的具体公开,包括或不包括另一个。例如,“X和/或Y”将被视为(i)X、(ii)Y和(iii)X和Y中的每一个的具体公开,就如同每一个在本文中被单独列出一样。
在本发明的上下文中,术语“大约”和“约”可互换使用,表示普通技术人员将理解的准确区间,以仍然确保所述特征的技术效果。该术语通常表示与所示数值的偏差±5%、±4%、±3%、±2%、±1%、±0.9%、±0.8%、±0.7%、±0.6%、±0.5%、±0.4%、±0.3%、±0.2%、±0.1%、±0.05%,例如±0.01%。如普通技术人员所理解的,对于给定技术效果的数值,这种具体的偏差将取决于技术效果的性质。例如,自然或生物技术效果通常可能比人为或工程技术效果的偏差更大。
术语“一”、“一个”和“该/所述”以及在描述本发明的上下文中(特别是在权利要求书的上下文中)使用的类似引用应被解释为同时包括单数和复数,除非本文中另有说明或与上下文明显矛盾。
本文中的值的范围的引用仅旨在用作单独提及落在该范围内的每个单独值的速记方法。除非本文另有说明,否则每一个单独的值都被并入说明书中,如同它在本文中被单独叙述一样。
本文描述的所有方法都可以以任何适当的顺序执行,除非本文另有说明或与上下文明显矛盾。
本文提供的任何和所有示例或示例性语言(如,“例如”)的使用仅旨在更好地说明本发明,而不对另外要求保护的本发明的范围构成限制。说明书中的任何语言都不应被解释为表示对本发明实施至关重要的任何未要求保护的要素。
本说明书的全文引用了若干文件。本文引用的每个文件(包括所有专利、专利申请、科学出版物、制造商说明书、说明书等),无论上文还是下文,均以引用方式全部并入本文。本文中的任何内容都不应被解释为承认本发明无权凭借在先发明提前披露。
本文中使用的术语“(本)发明的”、“依照(本)发明”、“根据(本)发明”等意指本文中描述和/或要求保护的本发明的所有方面和实施例。
应当理解,将本发明的教导应用于特定问题或环境,以及包括本发明的变体或其附加特征(例如进一步的方面和实施例),根据本文所包含的教导,将在本领域普通技术人员的能力范围内。
除非上下文另有指示,否则上文或下问列出的特征的描述和定义不限于本发明的任何特定方面或实施例,并且同样适用于所描述的所有方面和实施例。
术语“烷基”指饱和直链或支链烃的单自由基。优选地,烷基包含1到12个(例如1到10个)碳原子,即1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),更优选1到8个碳原子,例如1到6个或1到4个碳原子。示例性的烷基包括甲基(Me)、乙基(Et)、丙基、异丙基(也称为2-丙基或1-甲基乙基)、丁基、异丁基、叔丁基、正戊基、异戊基、仲戊基、新戊基、1,2-二甲基丙基、异戊基、正己基、异己基、仲己基、正庚基、异庚基、正辛基、2-乙基己基、正壬基、正癸基、正十一烷基、正十二烷基,诸如此类。“取代的烷基”是指烷基的一个多个(如1至与烷基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或至多10,例如1至5、1至4或1至3或1或2)氢原子被氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如-OH、NH2、NHCH3、N(CH3)2、CN、OCH3、OCF3,或任选地取代的芳基。取代的烷基的实例包括三氟甲基、二氟甲基、氟甲基、2,2,2-三氯乙基、2-羟乙基、2-氨基乙基、2-(二甲氨基)乙基、芳烷基(也称为“芳烷基”,例如,苄基、氯(苯基)甲基、4-甲基苯基甲基、(2,4-二甲基苯基)甲基、邻氟苯基甲基、2-苯基丙基、2-、3-或4-羧基苯基烷基)或杂芳烷基(也称为“杂芳烷基”)。
术语“亚烷基”指饱和直链或支链烃的双自由基。优选地,亚烷基包括1至12(例如1至10)个碳原子,即1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),更优选地包括1至8个碳原子,例如1至6或1至4个碳原子。示例性亚烷基包括亚甲基、亚乙基(即1,1-亚乙基、1,2-亚乙基)、亚丙基(即1,1-亚丙基、1,2-亚丙基(-CH(CH3)CH2-)、2,2-亚丙基(-C(CH3)2-)和1,3-亚丙基)、亚丁基异构体(例如1,1-亚丁基、1,2-亚丁基、2,2-亚丁基、1,3-亚丁基、2,3-亚丁基(顺式或反式或它们的混合物)、1,4-亚丁基、1,1-异亚丁基、1,2-异亚丁基和1,3-异亚丁基)、亚戊基异构体(例如1,1-亚戊基、1,2-亚戊基、1,3-亚戊基、1,4-亚戊基、1,5-亚戊基、1,1-异亚戊基、1,1-仲戊基、1,1-新戊基)、亚己基异构体(例如1,1-亚己基、1,2-亚己基、1,3-亚己基、1,4-亚己基、1,5-亚己基、1,6-亚己基和1,1-异亚己基)、亚庚基异构体(例如1,1-亚庚基、1,2-亚庚基、1,3-亚庚基、1,4-亚庚基、1,5-亚庚基、1,6-亚庚基、1,7-亚庚基和1,1-异亚庚基)、亚辛基异构体(例如1,1-亚辛基、1,2-亚辛基、1,3-亚辛基、1,4-亚辛基、1,5-亚辛基、1,6-亚辛基、1,7-亚辛基、1,8-亚辛基和1,1-异亚辛基)等。在每端具有至少3个碳原子和自由价的直链亚烷基部分也可被指定为多个亚甲基(例如,1,4-丁烯也可被称为四亚甲基)。一般来说,代替如上文所述在亚烷基部分前缀“亚基”,还可以使用后缀“二基”(例如,1,2-亚丁基也可以称为丁烷-1,2-二基)。“取代的亚烷基”是指亚烷基的一个或多个(例如与亚烷基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素或任选地取代芳基。取代的亚烷基的实例包括氯亚甲基、二氯亚甲基、氟亚甲基和二氟亚甲基。
术语“烯基”指具有至少一个碳-碳双键的不饱和直链或支链烃的单自由基。通常,烯基中碳-碳双键的最大数目可以等于整数,该整数由烯基中的碳原子数除以2计算得出,如果烯基中的碳原子数不均匀,则将除法结果四舍五入到下一个整数。例如,对于具有9个碳原子的烯基,碳-碳双键的最大数目是4。优选地,烯基具有1到6(例如1到4),即1、2、3、4、5或6个碳-碳双键。优选地,烯基包含2到12个(例如2到10个)碳原子,即2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子(例如2、3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),更优选2到8个碳原子,例如2到6个碳原子或2到4个碳原子。因此,在优选实施例中,烯基包含2至12(例如,2至10)个碳原子和1、2、3、4、5或6(例如,1、2、3、4或5)个碳-碳双键,更优选地,它包含2至8个碳原子和1、2、3或4个碳-碳双键,例如2至6个碳原子和1、2或3个碳-碳双键或2至4个碳原子和1或2个碳-碳双键。碳-碳双键可以是顺式(Z)或反式(E)构型。示例性烯基包括乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基(即烯丙基)、1-丁烯基、2-丁烯基、3-丁烯基、1-戊烯基、2-戊烯基、3-戊烯基、4-戊烯基、1-己烯基、2-己烯基、3-己烯基、4-己烯基、5-己烯基、1-庚烯基、2-庚烯基、3-庚烯基、4-庚烯基、5-庚烯基、6-庚基、1-辛烯基、2-辛烯基、3-辛烯基、4-辛烯基、5-辛烯基、6-辛烯基、7-辛烯基、1-壬烯基、2-壬烯基、3-壬烯基、4-壬烯基、5-壬烯基、6-壬烯基、7-壬烯基、8-壬烯基、1-癸烯基、2-癸烯基、3-癸烯基、4-癸烯基、5-癸烯基、6-癸烯基、7-癸烯基、8-癸烯基、9-癸烯基、1-十一烯基、2-十一烯基、3-十一烯基、4-十一烯基、5-十一烯基、6-十一烯基、7-十一烯基、8-十一烯基、9-十一烯基、10-十一烯基,1-十二烯基、2-十二烯基、3-十二烯基、4-十二烯基、5-十二烯基、6-十二烯基、7-十二烯基、8-十二烯基、9-十二烯基、10-十二烯基、11-十二烯基等。如果烯基与氮原子相连,则双键不能是氮原子的α键。“取代的烯基”是指烯基的一个或多个(例如与烯基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素或任选地取代的芳基。取代的烯基的实例为苯乙烯基(即,2-苯基乙烯基)。
术语“亚烯基”是指具有至少一个碳-碳双键的不饱和直链或支链烃的双自由基。通常,亚烯基中碳-碳双键的最大数目可以等于整数,该整数通过将亚烯基中碳原子的数目除以2计算得出,如果亚烯基中碳原子的数目不均匀,则将除法结果四舍五入到下一个整数。例如,对于具有9个碳原子的亚烯基,碳-碳双键的最大数目是4。优选地,亚烯基具有1到6(例如1到4),即1、2、3、4、5或6个碳-碳双键。优选地,亚烯基包含2到12个(例如2到10个)碳原子,即2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子(例如2、3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),更优选2到8个碳原子,例如2到6个碳原子或2到4个碳原子。因此,在优选实施例中,亚烯基包含2至12个(例如2至10个碳)原子和1、2、3、4、5或6个(例如1、2、3、4或5个)碳-碳双键,更优选地,它包含2至8个碳原子和1、2、3或4个碳-碳双键,例如2至6个碳原子和1、2、3或4个碳-碳双键,或3个碳-碳双键或2到4个碳原子和1或2个碳-碳双键。碳-碳双键可以是顺式(Z)或反式(E)构型。示例性亚烯基包括乙烯-1,2-二基、亚乙烯基(也称为亚乙烯基),1-丙烯-1,2-二基、1-丙烯-1,3-二基、1-丙烯-2,3-二基、亚烯丙基、1-丁烯-1,2-二基、1-丁烯-1,3-二基、1-丁烯-1,4-二基、1-丁烯-2,3-二基、1-丁烯-2,4-二基、1-丁烯-3,4-二基、2-丁烯-1,2-二基、2-丁烯-1,3-二基、2-丁烯-1,4-二基、2-丁烯-2,3-二基、2-丁烯-2,4-二基、2-丁烯-3,4-二基等。如果亚烯基与氮原子相连,则双键不能是氮原子的α键。“取代的亚烯基”是指亚烯基的一个或多个(例如与亚烯基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素或任选地取代的芳基。取代的亚烯基的实例为1-苯基-乙烯-1,2-二基和2-苯基-乙烯-1,2-二基。
术语“炔基”是指具有至少一个碳-碳三键的不饱和直链或支链烃的单自由基。通常,炔基中碳-碳三键的最大数目可以等于整数,该整数是通过将炔基中碳原子的数目除以2计算得出,如果炔基中碳原子的数目不均匀,则将除法的结果四舍五入到下一个整数。例如,对于具有9个碳原子的炔基,碳-碳三键的最大数目为4。优选地,炔基具有1到6(例如1到4),即1、2、3、4、5或6,更优选1或2个碳-碳三键。优选地,炔基包含2到12个(例如2到10个)碳原子(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),即2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子,更优选2到8个碳原子,例如2到6个碳原子或2到4个碳原子。因此,在优选实施例中,炔基包含2至12(例如2至10)个碳原子及1、2、3、4、5或6(例如1、2、3、4或5(优选1、2或3))个碳-碳三键,更优选其包含2至8个碳原子及1、2、3或4(优选1或2)个碳-碳三键,例如2到6个碳原子和1,2或3个碳-碳三键或2到4个碳原子和1或2个碳-碳三键。示例性炔基包括炔基、1-炔基、2-炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、3-丁炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、3-戊炔基、4-戊炔基、1-己炔基、2-己炔基、3-己炔基、4-己炔基、5-己炔基、1-庚炔基、2-庚炔基、3-庚炔基、4-庚炔基、5-庚炔基、6-庚炔基、1-辛炔基、2-辛炔基、3-辛炔基、4-辛炔基、5-辛炔基、6-辛炔基、7-辛炔基,1-壬炔基、2-壬炔基、3-壬炔基、4-壬炔基、5-壬炔基、6-壬炔基、7-壬炔基、8-壬炔基、1-癸炔基、2-癸炔基、3-癸炔基、4-癸炔基、5-癸炔基、6-癸炔基、7-癸炔基、8-癸炔基、9-癸炔基等。如果炔基与氮原子相连,则三键不能是氮原子的α键。“取代的炔基”是指炔基的一个或多个(例如与炔基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素或任选地取代的芳基。
术语“亚炔基”是指具有至少一个碳-碳三键的不饱和直链或支链烃的双自由基。通常,亚炔基中碳-碳三键的最大数目可以等于整数,该整数是通过将亚炔基中碳原子的数目除以2计算得出,如果亚炔基中碳原子的数目不均匀,则将除法的结果四舍五入到下一个整数。例如,对于具有9个碳原子的亚炔基,碳-碳三键的最大数目为4。优选地,亚炔基具有1到6(例如1到4),即1、2、3、4、5或6,更优选1或2个碳-碳三键。优选地,亚炔基包含2到12个(例如2到10个)碳原子(例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),即2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个碳原子,更优选2到8个碳原子,例如2到6个碳原子或2到4个碳原子。因此,在优选实施例中,亚炔基包含2至12(例如2至10)个碳原子及1、2、3、4、5或6(例如1、2、3、4或5(优选1、2或3))个碳-碳三键,更优选其包含2至8个碳原子及1、2、3或4(优选1或2)个碳-碳三键,例如2到6个碳原子和1,2或3个碳-碳三键或2到4个碳原子和1或2个碳-碳三键。示例性亚炔基包括乙炔-1,2-二基、1-丙炔-1,3-二基、1-丙炔-3,3-二基、1-丁炔-1,3-二基、1-丁炔-1,4-二基、1-丁炔-3,4-二基、2-丁炔-1,4-二基等。如果亚炔基与氮原子相连,则双键不能是氮原子的α键。“取代的亚炔基”是指亚炔基的一个或多个(例如与亚炔基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素或任选地取代的芳基。
术语“芳基”或“芳香环”指芳香环状烃的单自由基。优选地,芳基包含3到14个(例如,5、6、7、8、9或10个,例如5、6或10个)碳原子,这些碳原子可以排列在一个环(例如,苯基)或两个或更多个稠环(例如,萘基)中。示例性芳基包括环丙烯基、环戊二烯基、苯基、茚基、萘基、天青基、芴基、蒽基和菲基。优选地,“芳基”是指含有6个碳原子的单环或含有10个碳原子的芳香双环体系。优选的例子是苯基和萘基。芳基不包含富勒烯。“取代的芳基”是指芳基的一个或多个(例如与芳基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素、-CN、硝基、-OR11(例如,-OH)、-SR11(例如,-SH)、-N(R12)(R13)(例如,-NH2)、烷基(例如C1-6烷基)、烯基(例如C2-6烯基)和炔基(例如C2-6炔基)。取代的芳基的实例包括联苯、2-氟苯基、2-氯-6-甲基苯基、苯胺基、3-硝基苯基、4-羟基苯基、甲氧基苯基(即,2-、3-或4-甲氧基苯基)和4-乙氧基苯基。
术语“杂芳基”或“杂芳环”是指上文定义的芳基,其中芳基中的一个或多个碳原子被杂原子(例如O、S或N)取代。优选地,杂芳基指5或6元芳香单环,其中1、2或3个碳原子被相同或不同的O、N或S杂原子取代。或者,它是指芳香双环或三环系统,其中1、2、3、4或5个碳原子被相同或不同的O、N或S杂原子取代。优选地,在杂芳基的每个环中,O原子的最大数目为1,S原子的最大数目为1,O和S原子的最大总数为2。例如,3至14元杂芳基包含单环杂芳基(例如,5或6元)、双环杂芳基(例如,9或10元)和三环杂芳基(例如,13或14元)。示例性杂芳基包括呋喃基、噻吩基、恶唑基、异恶唑基、恶二唑基(1,2,5-和1,2,3-)、吡咯基、咪唑基、吡唑基、三唑基(1,2,3-和1,2,4-)、四唑基、噻唑基、异噻唑基、噻二唑基(1,2,3-和1,2,5-)、吡啶基(也称为吡啶基)、嘧啶基、吡嗪基、三嗪基(1,2,3-、1,2,4-和1,3,5-)、苯并呋喃基(1-和2)、吲哚基、异吲哚基、苯并噻吩基(1-和2-)、1H-吲哚基、苯并咪唑基、苯并恶唑基、吲哚恶嗪基、苯并异恶唑基、苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并三唑基、喹啉基、异喹啉基、苯并二嗪基、喹啉基、喹唑啉基、苯并三嗪基(1,2,3-和1,2,4-苯并三嗪基)、哒嗪基、吩恶嗪基、噻唑并吡啶基、吡咯噻唑基、吩噻嗪基、异苯并呋喃基、色烯基、黄烯基、吩噻嗪基、吡咯里嗪基、吲哚嗪基、吲哚唑基、嘌呤基、喹嗪基、邻苯二甲嗪基、萘啶基(1,5-、1,6-、1,7-、1,8-和2,6-)、辛诺林基(cinnolinyl)、蝶啶基、咔唑基,菲啶基、吖啶基、哌啶基、菲咯啉基(phenanthrolinyl)(1,7-、1,8-、1,10-、3,8-和4,7-)、菲嗪基、恶唑并吡啶基、异恶唑并吡啶基、吡咯并恶唑基和吡咯并吡咯基。示例性5或6元杂芳基包括呋喃基、噻吩基、恶唑基、异恶唑基、恶二唑基(1,2,5-和1,2,3-)、吡咯基、咪唑基、吡唑基、三唑基(1,2,3-和1,2,4-)、噻唑基、异噻唑基、噻二唑基(1,2,3-和1,2,5-)、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、三嗪基(1,2,3-、1,2,4-和1,3,5-)和哒嗪基。“取代的杂芳基”是指杂芳基的一个或多个(例如与杂芳基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素、-CN、硝基、-OR11(例如,-OH)、-SR11(例如,-SH)、-N(R12)(R13)(例如,-NH2)、烷基(例如C1-6烷基)、烯基(例如C2-6烯基)和炔基(例如C2-6炔基)。取代的杂芳基的实例包括2,4-二甲基吡啶-3-基、2-甲基-4-溴吡啶-3-基、3-甲基-2-吡啶-2-基、3-氯-5-甲基吡啶-4-基、4-氯-2-甲基吡啶-3-基、3,5-二甲基吡啶-4-基、2-甲基吡啶-3-基、2-氯-4-甲基噻吩-3-基、1,3,5-三甲基吡唑-4-基、3,5-二甲基-1,2-二恶唑-4-基、1,2,4-三甲基吡咯-3-基、3-苯基吡咯基、2,3'-双硫醇、4-甲基吡啶基、2-或3-乙基吲哚基。
术语“环烷基”或“环脂族”表示具有优选3到14个碳原子的“烷基”和“烯基”的环状非芳香族版本,例如3到12个或3到10个碳原子,即3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14个碳原子(例如3、4、5、6、7、8、9或10个碳原子),更优选3到7个碳原子。示例性环烷基包括环丙基、环丙烯基、环丁基、环丁烯基、环戊基、环戊烯基、环己基、环己烯基、环庚基、环庚烯基、环辛基、环辛烯基、环壬基、环壬烯基、环十二烷基和金刚烷基。术语“环烷基”还意指包括其双环和三环形式。如果形成双环,则优选各环在两个相邻的碳原子处彼此连接,然而,或者两个环通过相同的碳原子连接,即它们形成螺环系统或它们形成“桥联”环系统。环烷基的优选实例包括C3-8-环烷基,尤其是环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基、螺环[3,3]庚基、螺环[3,4]辛基、螺环[4,3]辛基、双环[4.1.0]庚基、双环[3.2.0]庚基、双环[2.2.1]庚基、双环[2.2.2]辛基、双环[5.1.0]辛基和双环[4.2.0]辛基。环烷基不包含富勒烯。“取代的环烷基”是指环烷基的一个或多个(例如与环烷基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素、-CN、硝基、-OR11(例如,-OH)、-SR11(例如,-SH)、-N(R12)(R13)(例如,-NH2)、=X(例如=O、=S或=NH)、烷基(例如C1-6烷基)、烯基(例如C2-6烯基)和炔基(例如C2-6炔基)。取代的环烷基的实例包括氧代环己基、氧代环戊基、氟代环己基和氧代环己基。
术语“杂环基”或“杂环”意指如上文所定义的环烷基,其中环烷基中的1、2、3或4个环碳原子被杂原子取代(例如选自O、S、S(O)、S(O)2、N、B、Si和P,优选地选自O、S、S(O)2和N,更优选地选自O、S和N)。如果杂环基的环仅包含一种类型的杂原子,则所述杂环基的环中所述杂原子的最大数目可为:2个O原子(优选1个O原子);2个S原子(优选1个S原子);4个N原子(例如1、2或3N原子);2个B原子(优选1个B原子);1个Si原子和/或1个P原子。如果杂环基的一个环包含两种或两种以上的杂原子,则杂环基的环中所述杂原子的最大数目可为如下:1个O原子;1个S原子;2个N原子(优选1个N原子);1个B原子;1个Si原子和/或1个P原子,其中所述杂环基环中杂原子的最大总数为4个,所述杂环基环中每个杂原子的最大总数为如下:1个O原子;1个S原子;1或2个N原子;1个B原子(优选0个B原子);1个Si原子(优选0个Si原子)和/或1个P原子(优选0个P原子)。在一个实施例中,杂环基的杂原子选自O、S和N。在本实施例中,优选地,在杂环基的每个环中,O原子的最大数目为1,S原子的最大数目为1,O和S原子的最大总数为2。例如,3至14元杂环基包含单环杂环基(例如,3、4、5、6或7元,优选4至7元)、双环杂环基(例如,8、9或10元)和三环杂环基(例如,12、13或14元)。如果杂环基包含两个或更多个环,则这些环要么是稠合的(例如在喹啉基或嘌呤基中),要么是螺环部分,要么是桥联结构,要么通过双键连接,或者是它们的组合。换句话说,未取代的杂环基不包含通过单键连接的两个杂环基。术语“杂环基”还意指包含上述杂芳基的部分或完全氢化形式(例如二氢、四氢、六氢、八氢、十氢、十二氢等或全氢形式)。示例性杂环基包括氮杂环丁烷基、吗啉基、异色氨基、色氨基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、哌啶基、哌嗪基、吲哚基、异吲哚基、三嗪基(1,2,3-、1,2,4-和1,3,5-)、二和四氢呋喃基,二和四氢噻吩基、二和四氢恶唑基、二和四氢异恶唑基、二和四氢恶唑基(1,2,5-和1,2,3-)、二氢吡咯基、二氢咪唑基、二氢吡唑基、二和四氢三唑基(1,2,3-和1,2,4-)、二和四氢噻唑基、二和四氢噻唑基、二和四氢噻唑基(1,2,3-和1,2,5-)、二和四氢吡啶基、二、四和六氢嘧啶基、二和四氢吡嗪基、二和四氢三嗪基(1,2,3-、1,2,4-和1,3,5-)、二、四、六和八氢苯并呋喃基(1-和2-)、二、四、六和八氢吲哚基、二、四、六和八氢异吲哚基、二、四、六和八氢异吲哚基,二、四、六、八羟基吲哚恶嗪基、二、四、六、八羟基苯并异恶唑基、二、四、六、八羟基苯并噻唑基、二、四、六、八羟基苯并异噻唑基、二、四、六、八羟基苯并三唑基、二、四、六、八羟基苯并三唑基、二、四、六、八、十羟基喹啉基、二、四、六、八、十羟基异喹啉基、二、四、六、八、十氢苯并二嗪基、二、四、六、八、十氢喹恶啉基、二、四、六、八、十氢喹唑啉基、二、四、六、八、十氢苯并三嗪基(1,2,3-和1,2,4-)、二、四、六氢吡啶基、二、四、六、八、十二氢苯并恶嗪基,二、四、六、八氢噻唑并吡啶基(例如4,5,6-7-四氢[1,3]噻唑基[5,4-c]吡啶基或4,5,6-7-四氢[1,3]噻唑基[4,5-c]吡啶基,例如4,5,6-7-四氢[1,3]-噻唑基[5,4-c]吡啶-2-基或4,5,6-7-四氢[1,3]噻唑基[4,5-c]吡啶-2-基)、二、四、六氢吡咯噻唑基、二、四、六、八和十氢吩噻嗪基、二、四、六和八氢异苯并呋喃基、二、四、六和八氢色烯基、二、四、六、八、十和十二氢杂蒽基、二、四、六、八、十和十二氢杂蒽基、二、四、六氢吡咯烷基、二、四、六、八氢吲哚嗪基、二、四、六、八氢吲哚唑基、二、四、六、八氢嘌呤基、二、四、六、八氢喹啉基、二、四、六、八和十氢吩嗪基,二、四、六、八、十氢萘啶基(1,5-、1,6-、1,7-、1,8-、2,6-)、二、四、六、八、十氢茚基、二、四、六、八、十氢蝶二烯基、二、四、六、八、十和十二氢咔唑基、二、四、六、八、十、十二和十四氢蒽基,二、四、六、八、十、十二和十四氢吖啶基、二、四、六、八、十、十二氢嘧啶基、二、四、六、八、十、十二、十四氢邻菲罗啉基(1,7-、1,8-、1,10-、3,8-、4,7-)、二、四、六、八、十、十二和十四氢吩嗪基、二、四、六和八氢恶唑并吡啶基、二、四、六和八氢异恶唑并吡啶基、二、四、六和八氢环戊吡咯基、二、四、六和八氢环戊吡唑基、二、四、六和八氢环戊咪唑基、二、四、六和八氢环戊噻唑基、二、四、六和八氢环戊恶唑基、二、四、六和八氢吡咯基、二、四、六和八氢吡咯基、二、四、六和八氢吡咯咪唑基、二、四、六和八氢吡咯噻唑基(例如5,6-二氢-4H-吡咯并[3,4-d][1,3]噻唑基)、二、四、六和八氢吡咯恶唑基、二、四、六和八氢吡咯偶氮基、二、四、六、八氢吡唑咪唑基、二、四、六、八氢吡唑噻唑基、二、四、六、八氢吡唑恶唑基、二、四、六和八氢咪唑基、二、四、六和八氢咪唑基、二、四、六和八氢咪唑并恶唑基、二、四、六和八氢噻唑并噻唑基、二、四、六和八氢噻唑恶唑基,以及二、四、六和八氢恶唑恶唑基。示例性5或6元杂环基包括吗啉基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、哌啶基、哌嗪基、二和四氢呋喃基、二和四氢噻吩基、二和四氢恶唑基、二和四氢异恶唑基、二和四氢恶唑基(1,2,5-和1,2,3-)、二氢咪唑基、二氢吡唑基、二和四氢三唑基(1,2,3-和1,2,4-)、二和四氢噻唑基、二和四氢异噻唑基、二和四氢噻二唑基(1,2,3-和1,2,5)、二和四氢吡啶基、二、四和六氢嘧啶基、二和四氢吡嗪基、二和四氢三嗪基(1,2,3-、1,2,4-和1,3,5)和三嗪基(1,2,3-、1,2,4-和1,3,5)。“取代的杂环基”是指杂环基的一个或多个(例如与杂环基结合的氢原子的1到最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3或1或2)氢原子被除氢以外的取代基取代(当一个以上的氢原子被取代时,取代基可能相同或不同)。优选地,除氢以外的取代基是如本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如卤素、-CN、硝基、-OR11(例如,-OH)、-SR11(例如,-SH)、-N(R12)(R13)(例如,-NH2)、=X(例如=O、=S或=NH)、烷基(例如C1-6烷基)、烯基(例如C2-6烯基)和炔基(例如C2-6炔基)。
如本文所用的不饱和化合物或基团的“部分氢化形式”的表达意味着通过在不移除所有不饱和部分的情况下向最初的不饱和化合物或基团正式添加氢来移除部分不饱和。不饱和化合物或基团的短语“完全氢化形式”在本文中与术语“全氢”互换使用,并且意味着通过向最初的不饱和化合物或基团正式添加氢来去除所有不饱和。例如,5元杂芳基的部分氢化形式(环中含有2个双键,例如呋喃)包括所述5元杂芳基的二氢形式(例如2,3-二氢呋喃或2,5-二氢呋喃),而所述五元杂芳基的四氢形式(例如四氢呋喃,即THF)是所述五元杂芳基的完全氢化(或全氢)形式。同样,对于环中具有3个双键的6元杂芳基(例如吡啶基),部分氢化形式包括二氢和四氢形式(例如二氢和四氢吡啶基),而六氢形式(例如在杂芳基吡啶基的情况下为哌啶基)是所述6元杂芳基的完全氢化(或全氢)衍生物。因此,如果芳基或杂芳基包含由环原子之间的双键和三键组成的至少4个不饱和部分,则芳基或杂芳基的六氢形式只能被认为是根据本发明的部分氢化形式。
在上下文的碳氢化合物中,“芳香族”一词意味着整个分子必须是芳香族的。例如,如果单环芳基被氢化(部分或全部),则出于本发明的目的,所得氢化环结构被分类为环烷基。同样,如果双环或多环芳基(例如萘基)被氢化,则所得到的氢化双环或多环结构(例如1,2-二氢萘基)就本发明而言被分类为环烷基(即使只有一个环,如1,2-二氢萘基中的环,仍然是芳香族的)。在本申请中对杂芳基和杂环基进行了类似的区分。例如,吲哚基,即吲哚基的二氢变体,出于本发明的目的被分类为杂环基,因为双环结构中只有一个环是芳香的,而其中一个环原子是杂原子。
本文中使用的术语“多环”是指该结构具有两个或更多个(例如2、3、4、5、6、7、8、9或10)环、优选2、3、4或5个环、更优选2、3或4个环。因此,根据本发明,术语“多环”不包括单环结构,其中所述结构仅包含一个环。多环基团的实例为稠合结构(例如萘基或蒽基)、螺环化合物、通过单键或双键连接的环(例如联苯)和桥联结构(例如龙脑基)。示例性多环结构是上文特指的具有至少两个环的芳基、杂芳基、环烷基和杂环基。
术语“卤素”或“卤族元素”是指氟、氯、溴或碘。
术语“叠氮基”指-N3
术语“N-氧化物”是指氧化胺或胺-N-氧化物,其是含有官能团(Rn)3N+-O-(即N-O配位共价键)的化合物,,其中Rn独立地选自氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基,其中所述烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个(例如1到与烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基或杂环基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4或1到3或1或2)独立选择的R30取代,所述R30优选为本文所规定的一级取代基、二级取代基或三级取代基。
本文中使用的术语“羧酸”是指含有至少一个羧基(COOH)或硫代羧基(-CSOH)的化合物(优选地,含有至少一个羧基(COOH)的化合物,并且在实施例1.1和1.2的上下文中,仅含有至少一个羧基(COOH)的化合物)。本文所用术语“相应的羧酸”是指当与另一化合物(例如中间体,如本发明中间体)反应时产生所需化合物(例如,具有酰胺或硫酰胺键的化合物)的(硫代)羧酸。例如,如果希望使用式(Id)的中间体制备式(Ia)化合物,则相应的酸可具有以下式(Ie):
Figure BDA0003884477230000191
其中Hy、R2、R3、A和E如本文所定义(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))例如,如果希望制备式(Ia)化合物,其中E是S,则优选使用式(Id)的中间体,并且相应的酸可具有上述式(Ie),其中E是S。如果在另一实施例中,希望制备式(Ia)化合物,其中E为O,则优选使用式(Id)的中间体,并且相应的酸可以具有上述式(Ie),其中E为O。
本文中使用的术语“杂质”是指可能存在于包含所需化合物的组合物(例如,包含本文所述化合物的组合物,例如式(Ia)化合物)中的任何杂质(尤其是化学物质)。杂质可自然产生,可在所需化合物的合成和/或纯化期间添加,或可在所需化合物的合成和/或纯化期间生成。示例性杂质包括一种或多种起始材料、一种或多种溶剂、一种或多种中间体或反应物、上述任一种或所需化合物的一种或多种降解产物、脱保护后保护基团的一种或多种残余物以及其组合。
如本文所使用的表达“R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个被一个或多个F原子取代”(和类似表达)意味着R6被(i)至少一个F原子和/或(ii)含有一个或多个(例如,1到与该部分结合的氢原子的最大数目,如1、2、3、4、5、6、7、8、9,或者最多10个,比如1到5个,1到4个,或者1到3个,或者1个或2个)F原子的部分取代。带有一个或多个F原子的示例性部分包括带有一个或多个(例如,1到与烷基结合的氢原子的最大数目,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1到5、1到4或1到3,或1或2或3)F原子的烷基,例如含有一个或多个(例如,1到与烷基结合的氢原子的最大数目,例如,1、2、3、4、5、6或7,或最多6个,例如1到5、1到4、或1到3、或1或2或3)F原子的C1-3烷基,如-CH2F、-CHF2或-CF3。含有一个或多个F原子的进一步示例性部分包括F取代的烷氧基(即-O(烷基),例如-O(C1-3烷基))或F取代的烷基氨基(即-NH(烷基)或-N(烷基)2,例如-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2),其中烷氧基和单烷基氨基的烷基(例如,C1-3烷基)部分和二烷基氨基的至少一个烷基(例如,C1-3烷基)部分被一个或多个(例如,1到与烷基部分结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10或最多7,例如1到5、1到4或1到3,或1或2或3)F原子取代。
如本文别处所述,对于式(Ic),R5”为-L-R6”,且R6”为杂芳基或杂环基,其各自任选地被一个或多个独立选择的R7’取代。对此,如本文所使用的表达“任何两个与R6”的同一个原子结合的R7'可以结合在一起形成=O”意味着两个单自由基(即,R7’)在总共取代2个氢原子时,仅与R6”的一个环原子结合,可以形成双自由基=O。例如,根据本发明,
Figure BDA0003884477230000192
(其中
Figure BDA0003884477230000193
表示R6”与化合物其余部分结合的键)不仅包括(1)R7'基团中的每一个是独立地选自本文规定的特定部分(例如甲基或Cl)的单自由基的可能性,还包括(2)任何两个R7'基团与R6”的同一个原子结合在一起形成双自由基=O的可能性,结果是R6”基团具有以下分子式
Figure BDA0003884477230000194
Figure BDA0003884477230000201
其中剩余的R7'基团是单自由基。同样,如果R6”是被四个R7’取代的3-四氢噻吩,则这种取代的R6”包含以下分子式:
Figure BDA0003884477230000202
等。如本文所用的类似术语,例如“与环烷基或杂环基的相同碳原子结合的任何两个R30可以结合在一起形成=X1”,将以类似方式解释。在这方面,应理解,在那些实施例中,其中结合到R6”的相同原子的任何两个R7’可结合在一起形成=O,R6”最初(即,未经修饰=O)必须是杂环(因为在杂环中没有两个自由价的碳环原子)。类似地,如果与一部分的同一原子结合的任何两个R30可以结合在一起形成=X1,则该部分最初(即,未经修饰=X1)必须是脂环或杂环(因为在(杂)芳香环中没有具有两个自由价的碳环原子)。
如本文所使用的表达“一个R7’基团在相对于R6’与化合物的其余部分结合的环原子的位置2处与R6’的环原子结合”(和类似表达)意味着直接与R6’连接到化合物的其余部分的环原子相邻的两个环原子中的至少一个具有一个R7’基团。换言之,R6’的至少一个邻位,相对于R6’与化合物其余部分结合的环原子(即R6’的“基位置”),带有R7’基团。例如,将上述表达式应用于R6'被一个R7'取代的3-吡啶基(因此,基位置是相对于环氮原子的位置3处的环碳)的情况,可以得出该R7'基位于3-吡啶基的位置2或4,如以下式所示:
Figure BDA0003884477230000203
其中
Figure BDA0003884477230000204
表示R6’与化合物其余部分结合的键。此外,如果R6’被一个以上(例如两个或三个)R7’基团取代,如本文所使用的表达“一个R7’基团在相对于R6’与化合物的其余部分结合的环原子的位置2处与R6’的环原子结合”(和类似表达)包括与R6’连接到化合物的其余部分的环原子直接相邻的两个环原子中的每一个都带有一个R7’基团的情况(即,作为k元环的R6’在位置2和k中的每一个具有一个R7’基团,相对于R6’与化合物的其余部分结合的环原子,即R6’在其两个邻位处被取代)。例如,如果R6’是3-吡咯基(因此,基位置是相对于环氮原子的位置3处的环碳),则被两个R7’基团取代,表达“一个R7’基团在相对于R6’与化合物的其余部分结合的环原子的位置2处与R6’的环原子结合”包括以下结构:
Figure BDA0003884477230000205
但不包括以下结构:
Figure BDA0003884477230000206
本文所使用的术语“k元环”意味着环具有k个环原子。例如,对于吡唑基k是5;因此,相对于吡唑基与化合物其余部分结合的环原子(基位置),邻位是位置2和5,位置k-1是位置4。此外,吡啶基是6元杂芳基,相对于吡啶基与化合物的其余部分结合的环原子(基位置),邻位是位置2和6,位置k-1为位置5。
关于R6为含有至少一个S环原子的5元单环杂芳基,如本文所使用的表达“一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2处连接到C环原子”(和类似表达)优选地意味着一个R7基团与R6的C环原子结合,该C环原子(i)直接与R6通过其连接到化合物的剩余部分的环原子相邻且(ii)在对R6的环原子编号时接收较低的数字(例如,从S环原子的数字“1”开始,并以使R6与化合物的剩余部分结合的环原子的数字(即R6的“基”位置)尽可能低的方式继续)。换句话说,相对于R6的基位置,当考虑S环原子和yl位置之间的最短路径时,R6的两个“邻”位的C环原子优选地具有位于R6的S环原子和基位置之间的R7基团。例如,将上述表达式应用于R6是被一个R7取代的3-噻吩基(因此,基位置是相对于S环原子的第3位环碳)的情况,得出该R7基团位于2的3-噻吩基,如下式所示:
Figure BDA0003884477230000211
其中
Figure BDA0003884477230000212
表示R6与化合物的剩余部分结合的键。同样地,关于R6是包含至少一个S环原子的5元单环杂芳基,如本文所使用的表达“一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置5处连接到C环原子”(和类似表达)优选地意味着一个R7基团与R6的C环原子结合该C环原子(i)直接与R6通过其连接到化合物的剩余部分的环原子相邻且(ii)在对R6的环原子进行编号时接收较高的数字(例如,从S环原子的数字“1”开始,以使R6的基位置的数字尽可能低的方式继续)。换句话说,相对于R6的基位置,当考虑S环原子和基位置之间的最短路径时,该C环原子优选具有不位于S环原子和R6的基位置之间的R7基团。例如,将上述表达(“一个R7基团在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置5处连接到C环原子”)适用于R6是是用一个R7取代的3-噻吩基的情况(因此,基位置是相对于S环原子的位置3处的环碳),由此可知,该R7基团位于3-噻吩基的位置4处,如下式所示:
Figure BDA0003884477230000213
其中
Figure BDA0003884477230000214
表示R6与化合物剩余部分绑定的键。此外,关于R6是包含至少一个S环原子的5元单环杂环杂环,如本文所使用的表达“一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2连接到C环原子,一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置5连接到C环原子”(和类似表达)优选地意味着,对于直接与环原子相邻的R6的两个C环原子中的每一个都与R6与R7相连的化合物的其余部分相连的环原子相连。例如,将上述表达(“一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2连接到C环原子,一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置5连接到C环原子”)应用于R6是被至少两个R7基团取代的3-噻吩基(因此,基位置是相对于S环原子的位置3处的环碳)的情况,可以得出这些R7基团位于3-噻吩基的位置2和4处,如下式所示:
Figure BDA0003884477230000215
其中
Figure BDA0003884477230000216
表示R6与化合物其余部分结合的键。
本文所用的表达“
Figure BDA0003884477230000217
表示R6与化合物的剩余部分结合的键”是指R6通过其附着到化合物剩余部分的键(即,如果L不是键,则连接到(i)L;如果L是键,则连接到(ii)式(Ia)、(Ib)或(Ic)的羧基(硫代)酰胺基-C(=e)N(R4)的氮原子)。例如,在R6
Figure BDA0003884477230000221
且L是(i)亚甲基或(ii)键的情况下,式(Ia)化合物分别具有以下结构(A1)和(A2):
Figure BDA0003884477230000222
类似术语,如“
Figure BDA0003884477230000223
表示Hy与化合物其余部分结合的键”或“
Figure BDA0003884477230000224
表示R1a与化合物剩余部分结合的键”,如本文所用,将以类似方式解释。
本文中使用的术语“非对称”(例如,结合R1a)优选地意味着相关部分(特别是非对称的环烷基或杂环基),相对于其与化合物的剩余部分的附着点而言,本身是非对称的(例如,1,4-恶氮杂环-4-基)和/或具有非对称的取代模式(例如,3-恶哌嗪-1-基或3-甲基哌嗪-1-基)。例如,相对于其与化合物其余部分的附着点,对称基团具有对称平面(如4-甲基哌嗪基),而非对称基团没有对称面。非对称基团可具有不对称原子(例如,手性C原子),例如在2-甲基吗啉-4-基中,但不一定具有不对称原子(例如在3-恶哌嗪-1-基)。非对称的示例性基团包括以下基团:
Figure BDA0003884477230000225
其中R30和X如本文所定义;并且
Figure BDA0003884477230000226
表示非对称基团与化合物其余部分结合的键。
非对称的特定基团包括以下基团:
Figure BDA0003884477230000227
Figure BDA0003884477230000231
其中R30和X如本文所定义;
Figure BDA0003884477230000232
表示非对称基团与化合物其余部分结合的键。
本文所使用的表达“相邻的环原子”,如在“C环原子和S环原子是相邻的环原子”中,优选地,意味着这两个环原子共享一个共同的键,因此,它们直接相互结合。例如,在如下所示的结构中(即,在位置4处被R7取代的3-噻吩基),位置2的C环原子和S环原子是相邻的环原子,而位置4处的C环原子和S环原子被C环原子隔开:
Figure BDA0003884477230000233
其中
Figure BDA0003884477230000234
表示R6与化合物的剩余部分结合的键。
同样,本文所使用的表达“与邻近S环原子的C环原子结合的R40”优选地意味着R40附着的C环原子和S环原子是相邻原子。例如,如下图所示的结构中,与S环原子相邻的C环原子结合的R40是在位置2处与C环原子结合的R40(因为该C环原子与S环原子相邻),而在位置4处与C环原子结合的R40是与S环原子分离(或不相邻)的C环原子结合的R40(即位置4处的C环原子和S环原子由C环原子(在位置5处)分离):
Figure BDA0003884477230000235
本文所使用的表达“R6的S环原子与R6与化合物其余部分结合的环原子不相邻”优选地意味着R6的S环原子与通过至少一个环原子将R6结合到化合物的剩余部分(即,从R6的基位置)的环原子隔开。例如,如果R6是任选地被一个R7取代的噻吩基,则表达“R6的S环原子与R6与化合物的其余部分结合的环原子不相邻”包含以下结构:
Figure BDA0003884477230000236
但尤其是,不包括下列结构:
Figure BDA0003884477230000237
其中
Figure BDA0003884477230000238
表示R6与化合物其余部分结合的键。
根据IUPAC命名法,优选地,被取代的杂环基的编号从环杂原子开始并且以取代基的数目尽可能低的方式继续。例如,下面所示的化合物具有以下环原子编号和名称:
Figure BDA0003884477230000241
N-(2-氟-4-甲基噻吩-3-基)-2,5-二氢-1H-咪唑-2-胺
术语“任选地取代”表示一个或多个(例如1到与一个基团结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4、1到3或1或2)氢原子可被不同于氢的基团(即,一级取代基)取代,例如烷基(优选地,C1-6烷基),烯基(优选地,C2-6烯基)、炔基(优选地,C2-6炔基)、芳基(优选地,6至14元芳基),杂芳基(优选地,3至14元杂芳基)、环烷基(优选地,3至14元环烷基)、杂环基(优选,3至14元杂环基)、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR71、-N(R72)(R73)、-S(O)0-2R71、-S(O)1-2OR71、-OS(O)1-2R71、-OS(O)1-2OR71、-S(O)1-2N(R72)(R73)、-OS(O)1-2N(R72)(R73)、-N(R71)S(O)1-2R71、-NR71S(O)1-2OR71、-NR71S(O)1-2N(R72)(R73)、-OP(O)(OR71)2、-C(=X1)R71、-C(=X1)X1R71、-X1C(=X1)R71和-X1C(=X1)X1R71,和/或与环烷基或杂环基的同一碳原子结合的任何两个1级取代基可结合在一起形成=X1,其中,一级取代基的烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基中的每一个本身可以被一个或多个(例如,一个、两个或三个)取代基(即,二级取代基)取代,该取代基独立地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、6至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OR81、-N(R82)(R83)、-S(O)0-2R81、-S(O)1-2OR81、-OS(O)1-2R81、-OS(O)1-2OR81、-S(O)1-2N(R82)(R83)、-OS(O)1-2N(R82)(R83)、-N(R81)S(O)1-2R81、-NR81S(O)1-2OR81、-NR81S(O)1-2N(R82)(R83)、-OP(O)(OR81)2、-C(=X2)R81、-C(=X2)X2R81、-X2C(=X2)R81和-X2C(=X2)X2R81,和/或与作为一级取代基的环烷基或杂环基的相同碳原子结合的任何两个二级取代基可结合在一起形成=X2,其中,二级取代基的C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、6至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基中的每一个任选地被一个或多个(例如,一个、两个或三个)取代基(即,三级取代基)取代,该取代基独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基,和/或结合到作为二级取代基的3至14元环烷基或杂环基的相同碳原子的任何两个三级取代基可以结合在一起形成=O、=S、=NH或=N(C1-3烷基);
其中
R71、R72和R73中的每一个都独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂环基和3至7元杂环基,其中,所述C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至7元杂环基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的取代基取代:C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;
R81、R82和R83中的每一个独立地选自H、C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至6元杂环基,其中C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至6元杂环基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的取代基取代:C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3,=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;且
X1和X2中的每个都独立地选自O、S和N(R84),其中R84为H或C1-3烷基。
典型的一级取代基优选地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、6至14元(例如6至10元)芳基、3至14元(例如5至6元)杂芳基、3至14元(例如3至7元)环烷基、3至14元(例如3至7元)杂环基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR71、-N(R72)(R73)、-S(O)0-2R71、-S(O)1-2OR71、-OS(O)1- 2R71、-OS(O)1-2OR71、-S(O)1-2N(R72)(R73)、-OS(O)1-2N(R72)(R73)、-N(R71)S(O)1-2R71、-NR71S(O)1-2OR71、-C(=X1)R71、-C(=X1)X1R71、-X1C(=X1)R71和-X1C(=X1)X1R71,例如C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、6元芳基、5或6元杂芳基、3至7元环烷基、3至7元(例如5或6元)杂环基,卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH2,-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;其中X1独立地选自O、S、NH和N(CH3);并且R71、R72和R73中的每一个如上文所定义,或者优选地,独立地选自H、C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、5或6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和5或6元杂环基,其中,所述烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的取代基取代:C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH,-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基。一级取代基的特定实例独立地选自C1-3烷基、苯基、咪唑基、噻唑基、环戊基、环己基、二氢噻唑基、噻唑烷基、卤素、-CF3、-CN、-OH、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基。特别优选的一级取代基独立地选自C1-3烷基、苯基、噻唑烷基、卤素(如F、Cl或Br)、-NH2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)和-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z,其中z为0、1或2,并且每个C1-3烷基分别为甲基、乙基、丙基或异丙基。
典型的二级取代基优选地选自C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、6或10元芳基、5或6元杂芳基、5或6元环烷基、5或6元杂环基、卤素、=O、=S、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基。二级取代基的特定实例独立地选自C1-3烷基、苯基、5或6元杂芳基、5或6元环烷基、5或6元杂环基、卤素、=O、=S、-CF3、-CN、-OH、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基。特别优选的二级取代基独立地选自甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基、=O和=S。
典型的三级取代基优选地选自C1-3烷基、苯基、卤素、-CF3、-OH、-OCH3、-SCH3、-NH2-z(CH3)z、-C(=O)OH和-C(=O)OCH3,其中z为0、1或2且C1-3烷基为甲基、乙基、丙基或异丙基。特别优选的三级取代基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、卤素(例如F、Cl或Br)和-CF3,例如卤素(如F、Cl或Br)和-CF3
本文使用的术语“任选”或“任选的”意指随后描述的事件、情况或条件可能发生或可能不发生,并且该描述包括所述事件、情况或条件发生的情况和不发生的情况。
“异构体”是具有相同分子式但在结构(“结构异构体”)或官能团和/或原子的几何(空间)位置(“立体异构体”)上不同的化合物。“对映体”是一对立体异构体,是彼此不可叠加的镜像。“外消旋混合物”或“外消旋体”包含一对等量对映体,并用前缀表示(±)。“非对映异构体”是立体异构体,不可叠加,也不是彼此的镜像。“互变异构体”是同一种化学物质的结构异构体,由于单个原子或原子群的迁移,即使是纯的,也能自发地、可逆地相互转化;即,互变异构体彼此处于动态化学平衡状态。互变异构体的一个例子是酮-烯醇互变异构的异构体。“构象”是立体异构体,只需围绕形式上的单键旋转就可以相互转化,并且(尤其)包括那些导致(杂环)环的三维形态不同的异构体,如环己烷的椅式、半椅式、船式和扭转船式。
如果本申请中所示的结构式可以被解释为包括一种以上的异构体,除非另外明确说明,否则所述结构式包括所有可能的异构体,因此包括每个单独的异构体。例如,式(Ia)化合物,其中Hy是:
Figure BDA0003884477230000261
其中
Figure BDA0003884477230000262
表示Hy与化合物剩余部分结合的键;R1a为3-甲基哌嗪基,包含两种异构体,例如,具有下式(B1)的异构体和具有下式(B2)的异构体:
Figure BDA0003884477230000263
此外,式(Ic)化合物,其中R6”为1-氮杂双环[2.2.2]辛-3-基(任选被一个或多个R7'基团取代)包含两种异构体,例如,具有下式(B3)的异构体和具有下式(B4)的异构体(其中n1为0、1、2、3或更大):
Figure BDA0003884477230000264
本文所指的“多晶型”是指固体材料(例如化合物)能够以一种以上的形式或晶体结构存在,即“多晶型变体”或“多晶型形式”。术语“多晶型变体”或“多晶型形式”和“多晶型”在本发明中可互换使用。根据本发明,这些“多晶型变体”包括晶型、非晶型、溶剂化物和水合物。不同晶型存在的原因主要在于结晶过程中使用了不同的条件,如:
·溶剂效应(极性和非极性溶剂中晶体的堆积可能不同);
·某些杂质抑制生长模式,有利于亚稳态多晶型物的生长;
·材料结晶的过饱和度水平(通常高于溶解度的浓度越高,形成亚稳态的可能性越大);
·进行结晶的温度;
·共价键的几何结构(导致构象多态性的差异);
·搅拌条件的变化。
多晶型物可能具有不同的化学、物理和/或药理学性质,包括但不限于:熔点、X射线晶体和衍射图、化学反应性、溶解度、溶解速率、蒸气压、密度、吸湿性、流动性、稳定性、紧实性和生物利用度。在特定温度下,多晶型可自发地从亚稳型(不稳定型)转化为稳定型。根据Ostwald定律,一般来说,首先结晶的不是最稳定的多晶型,而是最不稳定的多晶型。因此,诸如本发明化合物的质量、功效、安全性、可加工性和/或制造会受到多晶型现象的影响。通常,选择化合物(例如本发明的化合物)的最稳定多晶型,因为其转化为另一种多晶型的可能性最小。然而,由于稳定性以外的原因,例如溶解度、溶出速率和/或生物利用度,可以选择不是最稳定的多晶型形式。
本文所用材料的术语“结晶形式”意指所述材料的最小组分(即原子、分子或离子)形成晶体结构。本文所指的“晶体结构”是指晶体液体或固体中原子或分子的独特三维排列,其特征在于以特定方式排列的图案、一组原子和显示长程有序和对称性的晶格。晶格是在三维空间中周期性重复的点阵列,并且图案位于格的点上。晶格的亚单位是晶胞。点阵参数是一个单元的边的长度和它们之间的角度。晶体的对称性体现在它的空间群中。为了描述晶体结构,需要以下参数:化学式、晶格参数、空间群、原子坐标和点位的占位数。
本文所用材料的术语“非晶形形式”意指所述材料的最小组分(即原子、分子或离子)不排列在晶格中而是随机排列。因此,与存在短程有序(与下一个相邻原子的距离恒定)和长程有序(基本晶格的周期性重复)的晶体不同,只有短程有序以无定形形式存在。
本文所使用的术语“化合物的络合物”是指通过化合物与一个或多个其它分子缔合而产生的更高阶化合物。化合物的示例性络合物包括但不限于所述化合物的溶剂化物、团簇和螯合物。
本文所用术语“溶剂化物”是指溶解材料在溶剂(例如有机溶剂(例如,脂肪醇(例如甲醇、乙醇、正丙醇、异丙醇)、丙酮、乙腈、乙醚等)、水或这些液体中的两种或两种以上的混合物)中的加成络合物,其中所述加成络合物以晶体或混合晶体的形式存在。加成络合物中所含溶剂的量可以是化学计量的或非化学计量的。“水合物”是溶剂化物,其中溶剂是水。
在同位素标记的化合物中,一个或多个原子被具有相同质子数但中子数不同的相应原子所取代。例如,氢原子可以被氘原子取代。可用于本发明化合物中的示例性同位素包括氘、11C、13C、14C、15N、18F、32P、32S、35S、36Cl和125I。
如本文所使用的表达“氨基保护基团”优选地指化合物中所含氨基可通过其转移成反应性较低(即,受保护的)氨基的任何基团。优选地,氨基保护基团可在温和条件下以化学选择性和/或区域选择性方式和/或以良好产率并入相应化合物中。此外,氨基保护基团应在受保护化合物所经受的条件下(例如,所需反应的条件和/或纯化条件)保持稳定。优选地,当存在于化合物中时,氨基保护基团应最小化立体基因中心外消旋化的风险。在一个实施例中,氨基保护基团应在温和条件下以选择性方式从受保护化合物中移除,以便以高产率获得脱保护化合物。示例性的氨基保护基团包括叔丁氧基羰基(BOC)、9-芴甲氧基羰基(FMOC)、苄氧基羰基(Cbz)、对甲氧基苄基羰基(MOZ)、乙酰基(Ac)、三氟乙酰基、苯甲酰基(Bz)、苄基(Bn)、对甲氧基苄基(PMB)、3,4-二甲氧基苯基(DMPM)、对甲氧基苯基(PMP)、2,2-三氯甲氧基羰基(Troc)、三苯基甲基(trityl;Tr)、甲苯磺酰基(tosyl;Ts)、对溴苯磺酰基(brosyl)、4-硝基苯磺酰基(nosyl)和2-硝基苯磺酰基(Nps)。
术语“半衰期”一词涉及消除一半活性、量或分子数量所需的时间段。在本发明的上下文中,本文公开的化合物(例如式(Ia)、(Ib)或(Ic)的化合物)的半衰期指示所述化合物的稳定性。
术语“受试者/对象”、“患者”、“个体”或“动物”涉及多细胞动物,如脊椎动物。例如,在本发明的上下文中脊椎动物是哺乳动物、鸟类(例如家禽)、爬行动物、两栖动物、硬骨鱼类和软骨鱼类,尤其是上述任何一种家养动物以及圈养动物(特别是脊椎动物),例如动物园的动物(特别是脊椎动物)。本发明所涉哺乳动物包括但不限于人类、非人类灵长类、驯化哺乳动物(如狗、猫、绵羊、牛、山羊、猪、马等)、实验室的哺乳动物(如小鼠、大鼠、兔子、豚鼠等)、以及圈养哺乳动物(如动物园的哺乳动物)。本文中使用的术语“动物”也包括人类。鸟类的特定非限制性示例包括家养家禽,并且包括诸如鸡、火鸡、鸭、鹅、珍珠鸡、鸽子、雉鸡等的鸟类;而硬骨或软骨鱼类的特定非限制性示例包括适于通过水产养殖养殖的鱼类,并且包括硬骨鱼类,例如鲑鱼、鳟鱼、鲈鱼、鲤鱼、鲶鱼等。
化合物达沙替尼(本文也称为化合物A8)具有以下结构:
Figure BDA0003884477230000281
化合物
在第一方面,如本文中可能进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明提供了一种选自下式激酶抑制剂的化合物:
Figure BDA0003884477230000282
以及溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;
其中:
Hy是任选地被一个或多个独立选择的R1e取代的杂芳基或杂环基;
每个R1e独立地选自R1a、R1b、R1c和R1d
R1a和R1d中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
R1b和R1c中的每一个独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-7环烷基、C6-10芳基、3至7元杂芳基、3至7元杂环基、-O(CH2)0-2(C3-7环烷基)、-O(CH2)0-2(C6-10芳基)、-O(CH2)0-2(3至7元杂芳基)、-O(CH2)0-2(3至7元杂环基)、-NH(CH2)0-2(C3-7环烷基)、-NH(CH2)0-2(C6-10芳基)、-NH(CH2)0-2(3至7元杂环基)、-NH(CH2)0-2(3至7元杂环基)、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-6烷基)、-OCF3,-S(C1-6烷基)、-NH2,-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为0、1或2,并且C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-7环烷基、C6-10芳基、3至7元杂芳基和3至7元杂环基基团中的每一个任选地被1、2或3个独立地选自-OH、甲基、乙基、-OCH3、-SCH3和-NH2-z(CH3)z的部分取代;
R2是H;
R3选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
R4是H;
R5是-L-R6
L选自键、C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基和-(CH2)m-[Y-(CH2)n]o-,其中m是介于1和6之间的整数,n是介于0和3之间的整数,o是介于1和3之间的整数,其中,如果n为0,则o为1;Y独立地选自O、S和-N(R13)-;所述C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基、-(CH2)m-和-(CH2)n-基团中的每一个任选地被一个或两个独立选择的R30取代;
R6是含有至少一个S环原子并被一个或多个独立选择的R7取代的5元单环杂芳基;
R7独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个被一个或多个F原子取代;
A选自S、O、NR8和C(R9)2
R8选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
R9独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R1、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
X独立地选自O、S和N(R14);
E是O或S;
R11独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
R12和R13中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,或者R12和R13可以与它们所连接的氮原子结合形成基团-N=CR15R16,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
R14独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基和-OR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
R15和R16中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂环化基和-NHyR20 2-y,或者R15和R16可以与它们连接到的原子连接在一起形成一个环,该环可被一个或多个独立选择的R30取代,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
y是0到2的整数;
R20独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;并且
R30是一级取代基,并且在每种情况下,独立地选自烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR71、-N(R72)(R73)、-S(O)0-2R71、-S(O)1-2OR71、-OS(O)1-2R71、-OS(O)1-2OR71、-S(O)1-2N(R72)(R73)、-OS(O)1-2N(R72)(R73)、-N(R71)S(O)1-2R71、-NR71S(O)1-2OR71、-NR71S(O)1-2N(R72)(R73)、-OP(O)(OR71)2、-C(=X1)R71、-C(=X1)X1R71、-X1C(=X1)R71和-X1C(=X1)X1R71,和/或与环烷基或杂环基的同一碳原子结合的任何两个R30可以结合在一起形成=X1,其中,作为一级取代基的烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个二级取代基取代,其中,在每种情况下,所述二级取代基独立地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OR81、-N(R82)(R83)、-S(O)0-2R81、-S(O)1- 2OR81、-OS(O)1-2R81、-OS(O)1-2OR81、-S(O)1-2N(R82)(R83)、-OS(O)1-2N(R82)(R83)、-N(R81)S(O)1- 2R81、-NR81S(O)1-2OR81、-NR81S(O)1-2N(R82)(R83)、-OP(O)(OR81)2、-C(=X2)R81、-C(=X2)X2R81、-X2C(=X2)R81和-X2C(=X2)X2R81,和/或与作为一级取代基的环烷基或杂环基的相同碳原子结合的任何两个二级取代基可结合在一起形成=X2,其中,作为二级取代基的C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基中的每一个任选地被一个或多个三级取代基取代,其中,在各种情况下,所述三级取代基独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基,和/或与作为二级取代基的3至14元环烷基或杂环基的相同碳原子结合的任何两个三级取代基可结合在一起形成=O、=S、=NH或=N(C1-3烷基);
其中
R71、R72和R73中的每一个独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂环烷基和3至7元杂环基,其中,所述C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂环烷基和3至7元杂环基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的取代基取代:C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;
R81、R82和R83中的每一个独立地选自H、C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂环烷基和3至6元杂环基,其中,所述C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂环烷基和3至6元杂环基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的取代基取代:C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;且
X1和X2中的每一个独立地选自O、S和N(R84),其中R84是H或C1-3烷基。
在一个实施例中,激酶抑制剂具有式(IIa):
Figure BDA0003884477230000301
其中Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R5是-L-R6,其中L如上文(特别是关于式(Ia))或下文所定义且R6是含有至少一个S环原子的5元单环杂芳基,被一个或多个(例如1到结合到5元单环杂芳基的氢原子的最大数目,例如1、2或3,优选2)独立选择的R7取代,其中R7独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个(例如,1至最大数量的氢原子与烷基、烯基、炔烃、环烷基、芳基、杂环基或杂环基结合,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1至5、1至4、或1至3或1或2)独立选择的R30取代,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个被一个或多个F原子取代。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R7独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,R6选自噻吩基、噻唑基和噻二唑基,其中每一个被一个或多个(例如1到与5元单环杂芳基结合的氢原子的最大数目,例如1、2或3)独立选择的R7取代。例如,R6可以选自噻吩和噻唑基,其中每一个都被一个或多个(例如1到与5元单环杂芳基结合的氢原子的最大数目,例如1、2或3)独立选择的R7取代。优选地,R6是被一个或多个(例如1到结合到5元单环杂芳基的氢原子的最大数目,例如1、2或3,优选2)独立选择的R7取代的噻吩基。
在式(IIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,优选R6的R6通过其与化合物的其余部分结合的环原子是C原子。
在式(IIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,优选地R6选自:
Figure BDA0003884477230000311
Figure BDA0003884477230000312
其中
Figure BDA0003884477230000313
表示R6与化合物其余部分结合的键。
在式(IIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,优选R6的S环原子不与R6通过其与化合物的剩余部分结合的环原子相邻。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R7独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,R6为噻吩基或噻唑基,优选噻吩基,其每一个均被至少两个R7取代;在本实施例中,更优选用彼此不同的两个R7取代R6
在式(IIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,优选一个R7(特别是,R7为F和/或R7被一个或多个F原子取代)在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2或5处连接到C环原子。在这些情况下,其中R6被至少两个R7基团取代,优选地,其中一个R7基团(尤其是R7为F和/或R7被一个或多个F原子取代)在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2和5处连接到其中一个C环原子,并且其中一个R7基团在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2和5处连接到另一个C环原子。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R6独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自:烷基、-OR11和-N(R12)(R13),其中所述烷基和R11基团中的每一个以及所述R12和R13基团中的至少一个被一个或多个(例如,1至与烷基、R11、R12或R13基团结合的氢原子的最大数目,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1至5、1至4或1至3或1或2)F原子取代。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R6独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自:烷基、-O(烷基)、-NH(烷基)和-N(烷基)2,其中,烷基、-O(烷基)、-NH(烷基)的烷基和-N(烷基)2的至少一个烷基被一个或多个(例如,1到与烷基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4或1到3,或1或2)F原子取代。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R6独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中,C1-3烷基、-O(C1-3烷基)和-NH(C1-3烷基)的烷基以及-N(C1-3烷基)2的至少一个烷基被一个或多个(例如,1到与C1-3烷基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7或最多6,例如1到5、1到4或1到3或1或2)F原子取代。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R6独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个是C1-3烷基,其中C1-3烷基的烷基被一个或多个(例如,1到与C1-3烷基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7或最多6,例如1到5、1到4或1到3或1或2)F原子取代。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R6独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选地选自-CH2F和-CHF2
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、E、L和R6独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R6被至少两个R7取代,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,一个R7选自卤素、-CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选地选自Cl、Br、F、CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3。例如,在一个实施例中,一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选地选自-CH2F和-CHF2,且一个R7是Cl。在替代实施例中,一个R7是F,一个R7选自卤素、-CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选地选自Cl、Br、F、CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3;更优选地,一个R7是F,一个R7是Cl。在这些实施例中,优选地,这两个R7基团中的一个基团在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2和5处连接到C环原子中的一个,并且这两个R7基团中的另一个在相对于R6与化合物其余部分结合的环原子的位置2和5处连接到另一个C环原子。
在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A、L和E独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R6选自:
Figure BDA0003884477230000321
更优选地选自:
Figure BDA0003884477230000322
或选自:
Figure BDA0003884477230000323
其中
Figure BDA0003884477230000324
在每种情况下表示R6与化合物的剩余部分结合的键。
在式(IIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,L可选自键、C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基和-(CH2)m-[Y-(CH2)n]o-,其中m为1、2或3,n为0、1或2,o为1、2或3,其中,如果n为0,则o为1;Y独立地选自O、S和NH,其中,C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基、-(CH2)m-和-(CH2)n-基团中的每一个都任选地被一个或两个独立选择的R30取代。例如,在式(IIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,L可选自:键;C1亚烷基,任选地被一个R30取代;C2亚烷基(特别是1,2-亚乙基或1,1-亚乙基),任选地被一个R30取代;C3亚烷基(特别是三亚甲基)任选地被一个R30取代;C4亚烷基(尤其是四亚甲基或2,4-丁二基),任选地被一个R30、-(CH2)mO-和-(CH2)mNH-取代,其中m是1、2或3。尤其是,在式(IIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,L可选自:键、C1亚烷基,任选地被一个R30取代;C2亚烷基(特别是1,2-亚乙基或1,1-亚乙基),任选地被一个R30、-(CH2)mO-和-(CH2)mNH-取代;优选地,L可选自:键、-(CH2)-、-(CH2)2-。
最优选地,在式(IIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,L是键(即,R5是R6)。
在一个实施例中,激酶抑制剂具有式(IIIa):
Figure BDA0003884477230000331
其中在式(IIa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、和R5独立地如上文(特别是关于式(Ia)和/或(IIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,E为O或S(优选O);且A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2。在式(IIIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)和式(IIa)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,E是O或S(优选O);A可以是S、O或N(CH3)2。在式(IIIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)和式(IIa)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,优选E是O或S(优选O);且A是S。在式(IIIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)和式(IIa)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,优选E是O;且A是S。
在一个实施例中,激酶抑制剂具有式(IVa):
Figure BDA0003884477230000332
其中Hy、R2、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)和/或(IIIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z是0、1或2,并且其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基中的每一个任选地被一个或多个(例如,1到与C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4或1到3或1或2)独立选择的R30取代。
在式(IVa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)和/或(IIIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中,所述C1-4烷基、C3-6环烷基和苯基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;其中z为0、1或2。
在式(IVa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)和/或(IIIa))或(下文特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中所述苯基任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的基团取代:卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和CH2)1-3O(C1-3烷基);其中z为0、1或2。
在式(IVa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)和/或(IIIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R3选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基和卤素。
在式(IVa)激酶抑制剂的一个实施例中,Hy、R2、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)和/或(IIIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R3是H。
在一个实施例中,激酶抑制剂具有式(Va):
Figure BDA0003884477230000341
其中R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,Hy是3至10元杂芳基或3至10元杂环基,其中每一个任选地被一个或多个(例如,1至与3至10元杂芳基或3至10元杂环基结合的氢原子的最大数目,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1至5、1至4、1至3或1或2)独立选择的R1e取代,其中每个R1e独立地选自R1a、R1b、R1c和R1d;且R1a、R1b、R1c和R1d中的每一个独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义。例如,Hy可选自:5至6元单环杂环基、5至6元单环杂环基、9至10元双环杂环基和8至10元双环杂环基,其中每一个任选地被一个或多个(例如,1至与5至6元单环杂环基、5至6元单环杂环基、9至10元双环杂环基或8至10元双环杂环基结合的氢原子的最大数量,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,如1至5、1至4、1至3或1或2)独立选择的R1e取代,其中每个R1e独立地选自R1a、R1b、R1c和R1d;且R1a、R1b、R1c和R1d中的每一个独立地如上文(特别是关于式(Ia))或下文特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义。优选地,Hy是杂芳基或杂环基,其包含至少一个N环原子并且任选地被一个或多个(例如,1到与杂芳基或杂环基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4或1到3或1或2)独立选择的R1e取代。
在式(Va)激酶抑制剂的一个实施例中,R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且Hy是:
Figure BDA0003884477230000342
其中
Figure BDA0003884477230000343
表示Hy与化合物剩余部分结合的键,从而使式(Va)的激酶抑制剂具有式(VIa):
Figure BDA0003884477230000351
其中R1a、R1b和R1c独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa))或下文特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义;且B是N或CR1d,其中R1d如上文(特别是关于式(Ia))或下文特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义。
在式(VIa)激酶抑制剂的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)和/或(Va))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,其中烷基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个(例如,1到与烷基或杂环基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4或1到3或1或2)独立选择的R30取代。优选地,任选地取代R1a的一个或多个独立选择的R30独立地选自本文规定的一级取代基、二级取代基和三级取代基;更优选地,任选地取代R1a的一个或多个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;所述C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。
在式(VIa)激酶抑制剂的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)和/或(Va))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至11元杂环基,其中所述3至11元杂环基任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个个独立选择的R30独立地选自本文规定的一级取代基、二级取代基和三级取代基;更优选地,任选地取代R1a的一个或多个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1- 3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;所述C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。
在式(VIa)激酶抑制剂的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)和/或(Va))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、六氢嘧啶基、六氢嘧啶基、吗啉基、1,2-恶嗪烷基(oxazinanyl)、1,3-恶嗪烷基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、二氮杂环庚烷基(diazepanyl)、氧杂氮杂环庚烷基(oxazepanyl)、氮杂螺酮基(azaspirononyl)、二氮杂螺酮基、氮杂螺癸烷基(azaspirodecyl)、二氮杂螺癸烷基、氮杂螺十一烷基(azaspiroundecyl)和二氮杂螺十一烷基,其中哌嗪基、哌啶基、六氢嘧啶基、六氢嘧啶基、吗啉基、1,2-恶嗪烷基、1,3-恶嗪烷基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基、氮杂螺酮基、二氮杂螺酮基、氮杂螺癸烷基、二氮杂螺癸烷基、氮杂螺十一烷基和二氮杂螺十一烷基任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自本文规定的一级取代基、二级取代基和三级取代基;更优选地,任选地取代R1a的一个或多个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;所述C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。
在式(VIa)激酶抑制剂的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)和/或(Va))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R1a选自-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基,其中哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基中的每一个任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、-OH、=O、-OCH3、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙氧基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。
在式(VIa)激酶抑制剂的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)和/或(Va))或下文(特别是关于式(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R1a选自4-(2-羟乙基)哌嗪基、4-甲基哌嗪基、3,4-二甲基哌嗪基、4-甲基-1,4-二氮杂-1-基、3-氧代哌嗪-1-基、2-甲基吗啉-4-基、3-甲基哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基、3-(二甲氨基)哌嗪-1-基、3-(甲氧基)哌啶-1-基、3-(羟基)哌啶-1-基、3-(二甲氨基)吡咯烷-1-基、3-(羟基)吡咯烷-1-基、3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基、3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基、3-(甲基磺酰氨基))吡咯烷-1-基、7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基、4-[2-(二甲基氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
在式(VIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,R1a可以是非对称的。例如,R1a可以选自:
Figure BDA0003884477230000361
其中R30和X如本文所定义;且
Figure BDA0003884477230000362
表示R1a基团与化合物其余部分结合的键。在一个实施例中,R1a是非对称的,并且选自3,4-二甲基哌嗪基、4-甲基-1,4-二氮杂-1-基、3-氧代哌嗪-1-基、2-甲基吗啉-4-基、3-甲基哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基、3-(二甲氨基)哌啶-1-基、3-(甲氧基)哌啶-1-基、3-(羟基)哌啶-1-基、3-(二甲氨基)吡咯烷-1-基、3-(羟基)吡咯烷-1-基、3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基、3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基、3-(甲磺酰氨基)吡咯烷-1-基、7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基、4-[2-(二甲氨基)乙基]-1、4-氮杂环庚烷-1-基、4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
在式(VIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,R1a与化合物的其余部分结合的R1a原子可以是C以外的原子;优选地,R1a与该化合物的其余部分结合的R1a原子是N原子。在本实施例中,R1a优选地选自杂环基、杂环芳基、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中杂环基和杂芳基中的每一个通过除C之外的原子与化合物的其余部分结合,并且任选地被一个或多个(例如1至与杂环基或杂芳基结合的氢原子的最大数目,如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10个,例如1至5、1至4、或1至3、或1或2)独立选择的R30取代。例如,R1a可为杂环基,其包含至少一个N环原子且经由N环原子与化合物的剩余部分结合。
在式(VIa)激酶抑制剂的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)和/或(Va))或下文所定义,且R1a选自:
Figure BDA0003884477230000371
其中
Figure BDA0003884477230000372
表示R1a与化合物其余部分结合的键。优选地R1a选自:
Figure BDA0003884477230000373
其中
Figure BDA0003884477230000374
表示R1a与化合物其余部分结合的键。
在式(VIa)激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)激酶抑制剂)的上述任一实施例中,R1b和R1c可以独立地选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃甲氧基,其中z为0、1或2;并且苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃甲氧基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的部分取代:甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。优选地,R1b和R1c中的至少一个选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2;在一个实施例中,R1b为H;R1c是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,优选甲基。在另一个实施方案中,R1b是甲基、乙基、丙基或异丙基,优选甲基;R1c为H。
在式(VIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,其中R1C与化合物的其余部分结合的R1C原子可以是C原子。在本实施例中,优选R1c独立地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、-CF3、-CN、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)和-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为0、1或2且C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的部分取代:-OH、甲基、乙基、-OCH3、-SCH3和-NH2-z(CH3)z
在式(VIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,B为N或CR1d,其中R1d可选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:卤素、-OH、-OCH3、-SCH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。在式(VIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,B为N或CR1d,其中R1d可选自:C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2
在式(VIa)的激酶抑制剂(包括式(Ia)、(IIa)、(IIa)、(IVa)和/或(Va)的激酶抑制剂)的上述任一实施例中,最优选B是N。
在一个实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa):
Figure BDA0003884477230000381
其中Hy、R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、R5、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa))或下文所定义,并且L是键。在具有通式(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂的优选实施例中:
(A)R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,优选通过C以外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中烷基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个(例如,1到与烷基或杂环基结合的氢原子的最大数目,如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4、1到3或1或2)独立选择的R30取代,其中,优选地,R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;所述C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;和/或
(B)R1b和R1c中的每一个独立地选自:H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃甲氧基,其中z为0、1或2;所述苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃甲氧基中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的部分取代:甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;优选地,其中R1b和R1c中的一个为H;且R1b和R1c中的另一个是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选地,R1b和R1c中的另一个为甲基;和/或
(C)R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为0、1或2;且其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代,优选地,其中R3是H;和/或
(D)R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自烷基、OR11和-N(R12)(R13),其中所述烷基和R11基团中的每一个以及所述R12和R12基团中的至少一个被一个或多个F原子取代;和/或
(E)A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2,其中优选地A是S;和/或
(F)B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:卤素、-OH、-OCH3、-SCH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2,优选地B是N;和/或
(G)E是O或S,优选O。
在具有通式(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂的优选实施例中,R1a如上文(A)中所述;R1b和R1c如上文(B)中所定义;R3如上文(C)所述;R7如上文(D)所定义,其中R6如上文所规定(特别是关于式(IIa));A如上文(E)所述;B如上文(F)所述;E如上文(G)所述。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa):
(A’)R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至11元杂环基,优选通过C以外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中,3至11元杂环基任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;所述C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;和/或
(B’)R1b和R1c中的至少一个选自:H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2,R1b和R1c中的另一个如上文(B)中所定义,优选地其中R1b和R1c中的一个为H;且R1b和R1c中的另一个是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选地,R1b和R1c中的另一个为甲基;和/或
(C’)R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中所述苯基任选地被一个、两个或三个独立地选自以下的基团取代:卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基);其中z为0、1或2,其中优选地R3为H;和/或
(D’)R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个是选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基以及-N(C1-3烷基)2的至少一个烷基被一个或多个F原子取代;
(E’)A为S、O或N(CH3)2,其中优选地A为S;和/或
(F’)B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,优选地B是N;和/或
(G’)E是O或S,优选O。
在具有通式(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂的优选实施例中,R1a如上文(A’)中所述;R1b和R1c如上文(B’)中所定义;R3如上文(C’)所述;R7如上文(D’)所定义,其中R6如上文所规定(特别是关于式(IIa));A如上文(E’)所述;B如上文(F’)所述;E如上文(G’)所述。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa):
(A”)R1a是通过C以外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中所述3至11元杂环基任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲胺基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;且C1-3烷基中的每一个任选地被一个或两个独立地选自以下的部分取代:-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;和/或
(B”)R1b和R1c中的一个是H;R1b和R1c中的另一个为甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选R1b和R1c中的另一个为甲基;和/或
(C”)R3为H;和/或
(D”)R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基以及-N(C1-3烷基)2的至少一个烷基被一个或多个F原子取代;
(E”)A是S;和/或
(F”)B是N;和/或
(G”)E是O。
在具有通式(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂的优选实施例中,R1a如上文(A”)中所述;R1b和R1c如上文(B”)中所定义;R3如上文(C”)所述;R7如上文(D”)所定义,其中R6如上文所规定(特别是关于式(IIa));A如上文(E”)所述;B如上文(F”)所述;E如上文(G”)所述。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),一个R7(优选为F的R7和/或被一个或多个F原子取代的R7)在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2或5处连接到C环原子。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),R6被至少两个R7取代。例如,R6可以被彼此不同的两个R7取代。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),R6被至少两个R7取代,其中一个R7(优选为F的R7和/或被一个或多个F原子取代的R7)在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2和5处连接到一个C环原子,一个R7在相对于R6结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2和5处连接到另一个C环原子。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),R6被至少两个R7取代,其中一个R7选自-CH2F,-CHF2和-CF3,且一个R7选自卤素、-CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选地选自Cl、Br、F、-CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3。在一个实施例中,一个R7选自-CH2F,-CHF2和-CF3,优选地选自-CH2F和-CHF2,且一个R7是Cl。在替代实施例中,一个R7是F,且一个R7选自卤素、-CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选地选自Cl、Br、F、-CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3。在该替代实施例中,优选地一个R7是F且一个R7是Cl。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),R6选自噻吩基、噻唑基和噻二唑基,优选选自噻吩基和噻唑基,更优选地R6是噻吩基,其中噻吩基、噻唑基和噻二唑基中的每一个被一个或多个(例如,1到与噻吩基、噻唑基或噻二唑基结合的氢原子的最大数目,例如1、2或3,例如1或2)独立选择的R7取代。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),R6与化合物的其余部分结合的R6环原子是C原子。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),R6的S环原子与R6与化合物其余部分结合的环原子不相邻。
在进一步优选实施例中,激酶抑制剂具有通式(VIIa)或(VIIIa)(特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时),其中R6选自:
Figure BDA0003884477230000411
优选地选自:
Figure BDA0003884477230000412
其中
Figure BDA0003884477230000413
表示R6与化合物其余部分结合的键。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些)激酶抑制剂的任一实施例中,R1a可以选自-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基,其中哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基中的每一个任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、-OH、=O、-OCH3、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙氧基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。例如,R1a可以选自4-(2-羟乙基)哌嗪基、4-甲基哌嗪基、3,4-二甲基哌嗪基、4-甲基-1,4-二氮杂氮-1-基、3-氧哌嗪-1-基、2-甲基吗啉-4-基、3-甲基哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基、3-(二甲氨基)哌啶-1-基、3-(甲氧基)哌啶-1-基、3-(羟基)哌啶-1-基、3-(二甲氨基)吡咯烷-1-基、3-(羟基)吡咯烷-1-基、3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基、3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基、3-(甲基磺酰氨基)吡咯烷-1-基、7-甲基-2,7-二氮杂螺环[4.4]酮-2-基、4-[2-(二甲氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些,特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时)激酶抑制剂的任一实施例中,R1a可以是非对称的。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些,特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时)激酶抑制剂的任一实施例中,使R1a与化合物的剩余部分结合的R1a原子可以是C以外的原子;优选地,使R1a与化合物的剩余部分结合的R1a原子是N原子。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些,特别是当R1a、R1b、R1c、R3、A、B和E如上文(A)、(B)、(C)、(E)、(F)和/或(G)所述,或(A’)、(B’)、(C’)、(E’)、(F’)和/或(G’)所述,或(A”)、(B”)、(C”)、(E”)、(F”)和/或(G”)所述时)激酶抑制剂的任一实施例中,R1c与化合物其余部分结合的R1c原子可以是C原子。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些),优选地R1b是H;且R1c是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,优选甲基。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些),优选地A是S;B是N;和/或E是O。
更优选地,上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些),A是S;B是N;且E是O。
在上述式(VIIa)或(VIIIa)(包括式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)和/或(VIa)的那些),R3优选地选自以下:H、甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基和卤素;更优选地,R3是H。
在一个实施例中,本发明化合物选自图1E所示化合物。
在第五方面的上下文中,本申请提供用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向对象施用所述化合物或所述药物组合物,其中所述化合物选自(a)第一方面的化合物;(b)下式(Ib)的化合物;和(c)下式(Ic)的化合物,或者,所述药物组合物包含所述化合物和可选的药学上可接受的赋形剂:
Figure BDA0003884477230000421
以及溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合,其中Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文所定义;R5’是-L-R6’;L是键;R6’是任选地被一个或多个独立选择的R7’取代的5或6元杂芳基;R7’独立地选自R7、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1- 2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;并且R11、R12、R13、X和R30独立地如上文所定义(特别是关于式(Ia));
Figure BDA0003884477230000431
以及溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合,其中R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文所定义;R5’是-L-R6’;L如上所述(特别是关于式(Ia)和/或(IIa));R6’是任选地被一个或多个独立选择的R7’取代的杂芳基或杂环基;R7’独立地选自R7、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,和/或与作为杂环基的R6”的同一个原子结合的任何两个R7’可以结合在一起形成=O,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;并且R11、R12、R13、X和R30独立地如上文所定义(特别是关于式(Ia))。
在一个实施例中,根据第五方面的特定用途的式(Ib)化合物具有通式(IIb)
Figure BDA0003884477230000432
其中Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义;R6’是任选地被一个或多个(例如1到与5或6元杂芳基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5,例如1到4,或1到3,或1或2)独立选择的R7'(特别是如本文所定义,如关于下面的式(Vc))取代的5或6元杂芳基。
在根据第五方面使用的式(IIb)化合物的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义;且R6’是如下文(特别是关于式(Vc))对R6”所定义的5或6元杂芳基。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义;且R6’是5或6元杂芳基(尤其是5至6元单环杂芳基),其包含选自N、O和S的至少一个环杂原子,其中5或6元杂芳基任选地被一个或多个(例如1到与5或6元杂芳基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5,例如1到4,或1到3,或1或2)独立选择的R7’(特别是如本文所定义,如关于下面的式(Vc))取代。例如,R6'可以是5或6元杂芳基,其包含选自N和O的至少一个环杂原子(即杂芳基不含S作为环杂原子;并且在一些实施例中不包含O作为环杂原子,即R6'可由N-杂芳基构成),其中5或6元杂芳基任选地被一个、两个或三个独立选择的R7'取代(特别是如本文所定义,例如关于下面的式(Vc))。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义;且R6’选自吡啶基、噻吩、吡嗪基、嘧啶基、吡嗪基、呋喃基、吡咯、吡唑基、恶唑基、异恶唑基和恶二唑基,其中每一个任选地被一个、两个或三个独立选择的R7’(特别如本文所定义,例如关于下面的式(Vc))取代,优选地R6’选自吡啶基、噻吩基、吡唑基、异恶唑基和吡咯基,其中每一个任选地被一个、两个或三个独立选择的R7’(特别如本文所定义,例如关于下面的式(Vc))取代。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,R7’可独立地选自R7、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、卤素、-CN、-O(C1-6烷基)、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)1-2(C1-6烷基)、-NHS(O)1-2O、(C1-6烷基)、-C(=O)(C1-6烷基)和-OC(=O)(C1-6烷基),其中C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基中的每一个任选地被一个或多个(例如,1到与C1-6烷基、C2-6烯基或C2-6炔基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1到5、1到4或1到3或1或2)独立选择的R30(其中每个R30优选地选自如本文所规定的一级取代基、二级取代基和三级取代基)取代。例如,R7'可独立地选自C1-3烷基、卤素、-CN,-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中,所述C1-3烷基中的每一个任选地被一个或多个(例如,1到与C1-3烷基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7或最多6,例如1到5、1到4、或1到3、或1或2)独立选择的R30(其中每个R30优选地选自如本文所规定的一级取代基、二级取代基和三级取代基)取代。在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,R7'可独立地选自Cl、Br、甲基和乙基,例如选自Cl、Br和甲基。在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的上述任一实施例中的另一实施例中,R7'可独立地为R7,例如式(Ia)定义的任何R7
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,当R6'被取代时,优选一个R7'基团在相对于R6'结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2处结合到R6'环原子(即优选地R6’具有一个邻位R7’基团)。在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,其中R6'被两个或更多(例如两个、三个或四个)R7'基团取代,优选地,两个或更多个R7'基团中的一个在相对于R6'与化合物的剩余部分结合的环原子的位置2处与R6'的环原子结合(即R6'具有邻位R7'基团),并且剩余的R7'基团在位置2以外的位置连接到R6'的环原子。例如,在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,其中R6'是被两个或更多R7'基团取代的k元环,优选地,两个或更多R7'基团中的一个在相对于R6'结合到化合物的剩余部分的环原子的位置2处结合到R6'的环原子(即,相对于基位置),并且剩余的R7'基团在位置2以外的位置(例如,位置3、4、5、…k)与R6'的环原子结合。例如,在R6'是5元环的情况下,优选两个或更多个R7'基团中的一个在位置2处连接到R6'的环原子(相对于yl位置),并且剩余的R7'基团与R6'的环原子在位置3、4或5(相对于基位置)结合。此外,在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,其中R6'被两个或更多(例如两个、三个或四个)R7'基团取代,优选地,直接与R6'连接到化合物的其余部分的环原子相邻的两个环原子中的每一个都带有一个R7'基团(例如,相对于与化合物的其余部分结合的R6'环原子,作为k元环的R6'在位置2和k的每一处具有一个R7'基团,例如R6'在其两个邻位处被取代)。另外,在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的任何上述实施例中,其中R6'被三个或更多(例如三个或四个)R7'基团取代,优选地,直接与R6连接到化合物的其余部分的环原子相邻的两个环原子中的每一个都带有一个R7'基团(例如,相对于与化合物的其余部分结合的R6'环原子,作为k元环的R6'在位置2和k的每一处具有一个R7'基团,例如R6'在其两个邻位处被取代),且第三个R7'基团与R6'的一个环原子结合,该环原子与一个邻位环原子直接相邻,但不是R6'与化合物其余部分结合的环原子(例如,R6'是一个k元环,相对于R6'与化合物其余部分结合的环原子,在3至k-1中的一个位置上带有第三个R7'基团)。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义,R6'选自以下式:
Figure BDA0003884477230000451
其中
Figure BDA0003884477230000452
表示R6'与化合物其余部分结合的键。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义,R6'选自以下式:
Figure BDA0003884477230000453
其中
Figure BDA0003884477230000454
表示R6'与化合物其余部分结合的键。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物的一个实施例中,Hy、R2、R3、R4、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIIb))所定义,R6'选自以下式:
Figure BDA0003884477230000455
其中
Figure BDA0003884477230000456
表示R6'与化合物其余部分结合的键。
在根据第五方面的特定用途的式(IIb)化合物(包括式(Ib)化合物)的上述任一实施例中,其中R6'是5或6元杂芳基,其中含有作为环杂原子的N原子,R6'可经由5或6元杂芳基的N环原子连接到化合物的其余部分。
在一个实施例中,根据第五方面的特定用途的式(Ib)化合物具有通式(IIIb)
Figure BDA0003884477230000461
其中R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IVc)、(VIc)和/或(VIIc))所定义,且Hy是任选地被一个或多个(例如1至与杂芳基或杂环基结合的氢原子的最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如1至5、1至4或1至3或1或2)独立选择的R1e取代的杂芳基或杂环基;每个R1e独立地选自R1a、R1b、R1c和R1d;并且R1a、R1b、R1c和R1d中的每一个独立地如上文(特别是关于式(Ia)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IIc)、(IIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义。
在式(IIIb)化合物的一个实施例中,R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IVc)、(VIc)和/或(VIIc))所定义,Hy如上文所定义(特别是关于式(Va)、(VIIa)和/或(VIIIa))。
在式(IIIb)化合物的一个实施例中,R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IVc)、(VIc)和/或(VIIc))所定义,且Hy是3-10元杂环基或3-10元杂环基,其中每一个任选地由一个、两个、三个、四个、五个或六个独立选择的如本文所定义的R1e取代(特别是关于式(Ib)、(IIIb)、(Ia)和/或(Va))。
在式(IIIb)化合物的一个实施例中,R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IVc)、(VIc)和/或(VIIc))所定义,且Hy是单或双环杂芳基或单或双环杂环基,其中每一个任选地由一个、两个、三个、四个、五个或六个独立选择的R1e取代(特别是关于式(Ib)、(IIIb)、(Ia)和/或(Va))。
在式(IIIb)化合物的一个实施例中,R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IVc)、(VIc)和/或(VIIc))所定义,且Hy是选自含5-6元单环杂环基、5-6元单环杂环基、9-10元双环杂环基和8-10元双环杂环基的基团,其中每一个任选地由一个、两个、三个、四个、五个或六个独立选择的R1e取代(特别是关于式(Ib)、(IIIb)、(Ia)和/或(Va))。
在式(IIIb)化合物的一个实施例中,R2、R3、R4、R5、A和E独立地如上文(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或下文(特别是关于式(IVc)、(VIc)和/或(VIIc))所定义,且Hy选自吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、三嗪基(例如,1,2,3-三嗪基、1,2,4-三嗪基、1,3,5-三嗪基)、吡唑基、恶二唑基、噻唑基、三唑基、噻二唑基、环五嘧啶基、二氢环五嘧啶基、吡咯嘧啶基、吲哚嗪基、二氢吲哚嗪基、四氢吲哚嗪基、喹唑啉基、二氢喹唑啉基、四氢喹唑啉基、吡啶嘧啶基、吡喃嘧啶基、二氢吡喃嘧啶基、四氢吡喃嘧啶基、哌啶基、四氢吡喃基和1,1-二氧基四氢硫代吡喃基,其中每一个任选地由一个、两个、三个、四个、五个或六个独立选择的R1e取代(特别是关于式(Ib)、(IIIb)、(Ia)和/或(Va))。
在式(IIIb)的化合物的一个实施例中,R2、R3、R4、R5’、A和E是独立的如上(特别是关于式(Ib)、(IIb)、(IIIa)、(IVa)和/或(VIIIa))或如下((IVc)(VIc)和/或(VIIc))所定义,并且Hy选自:
a)
Figure BDA0003884477230000462
b)
Figure BDA0003884477230000463
c)
Figure BDA0003884477230000471
d)
Figure BDA0003884477230000472
e)
Figure BDA0003884477230000473
f)
Figure BDA0003884477230000474
和/或
g)
Figure BDA0003884477230000475
其中每个在a)、b)、c)、d)、e)、f)、和g)之下指定的基团任选地被一个、二个、三个、四个、五个或六个独立选择的R1e(特别是关于式(Ib)、(IIIb)、(Ia)、和/或(Va))取代,并且其中
Figure BDA0003884477230000476
代表Hy与式(IIIb)中NR2部分的氮原子相连的键。如果Hy包含NH部分作为环的一员,则优选地将氢原子取代为烷基,例如C1-6或C1-3烷基,进一步优选甲基(导致烷基取代N环原子),并且Hy任选地进一步被一个、两个、三个、四个或五个独立选择的R1e取代。这种N烷基取代的Hy基团的例子包括
Figure BDA0003884477230000477
Figure BDA0003884477230000478
其中
Figure BDA0003884477230000479
代表Hy与式(Ib)中NR2部分的氮原子相连的键。
在以上任意实施例中的式(IIIb)的化合物中,Hy可以被一个R1b、一个R1c、和1至4个(例如1、2或3个)R1a或R1d取代;例如,Hy可以被一个(或两个)R1a(如上所定义,特别是关于式(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa),或如下,特别是关于式(IIc)和/或(VIIIc))取代,并且被一个(或两个)R1b或R1c(如上所定义,特别是关于式(VIa)(VIIa)和/或(VIIIa),或如下,特别是关于式(IIIc)和/或(VIIIc))取代,并且所有其他R1e为H。
在以上任意实施例的式(Ib)、(IIb)和(IIIb)中的化合物中,优选A是S和/或E是O。
在以上任意实施例的式(Ib)、(IIb)和(IIIb)中的化合物中,优选R3是H。
在以上任意实施例的式(Ib)、(IIb)和(IIIb)中的化合物中,优选A是S和/或E是O和/或R3是H。例如,在式(Ib)、(IIb)和(IIIb)的一个实施例中,A是S;E是O;并且R3是H。
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物有通式(IIc)
Figure BDA0003884477230000481
其中R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,其中每个烷基和杂环基基团任选地被一个或者多个(例如,一个、两个或三个)独立选择的R30取代。优选地,每个R30独立地是如本文所述的一级取代基、二级取代基、或三级取代基,例如烷基(例如,C1-6烷基)、-(CH2)1-3OH、烯基(例如,C2-6烯基)、炔基(例如,C2-6炔基)、卤素、-CN、硝基、-OR11(例如,-OH)、-SR11(例如,-SH)、-N(R12)(R13)(例如,-NH2)和C(=O)R11(例如,-C(=O)(C1-3烷基))。
在式(IIc)的化合物的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至7元杂环基,其中3至7元杂环基基团任选地被独立选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;且每一个C1-3烷基基团任选地被独立选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2。
在式(IIc)的化合物的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、吗啉基、哌啶基和吡咯烷基,其中每个哌嗪基、吗啉基、哌啶基和吡咯烷基基团任选地被独立选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH、和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;且每一个C1-3烷基基团任选地被独立选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2。
在式(IIc)的化合物的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1a选自-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基和吡咯烷基,其中哌嗪基基团任选地被独立选自2-羟乙基、甲基、-CH2COOH和-C(=O)CH3的一个或两个部分取代;哌啶基基团任选地被独立选自-NH2和4-甲基哌嗪基的一个或两个部分取代;吡咯烷基基团任选地被一个或两个-OH取代;且C1-3烷基中的每一个基团都任选地被独立选自-OH、-OCH3、和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2。
在式(IIc)的化合物的一个实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1a选自4-(2-羟乙基)哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-乙酰基哌嗪基、(2-羟乙基)氨基、4-氨基哌啶基、4-(4-甲基哌嗪基)哌啶基、(4-羧甲基哌嗪基)和3-羟基吡咯烷基,例如选自4-(2-羟乙基)哌嗪基、4-甲基哌嗪基、4-乙酰基哌嗪基和(2-羟乙基)氨基。
在式(IIc)的化合物的一个替代实施例中,R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(Ic)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))所定义,且R1a是离去基团(例如,卤素(例如Cl、Br或F)、硝基、苯并三唑-1-基氧基、C1-C10烷基磺酸盐、C1-C10卤代烷基磺酸盐、全氟丁基磺酸盐(CF3CF2CF2CF2SO3-)、CF3C(=O)O-、苯磺酸盐(其中苯基任选地被一个、两个或三个各自独立地选自卤素和C1-C4烷基的基团取代),或式-[N(Rx)(Ry)(Rz)]+[G]-的铵盐,其中Rx、Ry和Rz都独立地为氢或烷基,且G是强酸的共轭碱(例如,G-是Cl-))。
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物具有通式(IIIc)
Figure BDA0003884477230000491
其中R1a、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且每个R1b和R1c独立地选自H、甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z为0、1或2;且每个苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基任选地被独立选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z的一个、两个或三个部分取代,其中z为0、1或2。
在式(IIIc)的化合物的一个实施例中,R1a、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1b和R1c中的至少一个选自H、甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2。在此项实施例中,R1b和R1c中的另一个可以如上所定义(特别是关于式(Ia)、(IIa)和/或(IIIa)),例如,R1b和R1c中的另一个可以选自H、甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z是0、1或2;且其中苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基基团中的每一个都任选地被独立选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z中的一个、两个或三个部分取代,其中z为0、1或2。或者,R1b和R1c中的每一个都独立地选自H、甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2。
在式(IIIc)的化合物的一个实施例中,R1a、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R1b为甲基、乙基、丙基、或异丙基,优选甲基;且R1c是H。在一个替代实施例中,R1c是H;且R1c是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,优选甲基。
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物具有通式(IVc)
Figure BDA0003884477230000501
其中R1a、R1b、R1c、R2、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IIIa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为、1或2且其中每个C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基都任选地被一个或多个独立选择的R30取代。
在式(IVc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IIIa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中苯基任选地被一个、两个或独立选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;且其中z为0、1或2。
在式(IVc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IIIa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R3选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基和卤素。
在式(IVc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IIIa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R3为H。
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物具有通式(Vc)
Figure BDA0003884477230000502
其中R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R5”为-L-R6”,其中R6”是包含至少一个选自N、O和S的环杂原子的杂芳基,或者是包含至少一个选自N、O和S的环杂原子的杂环基,其中每个杂芳基和杂环基基团任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7'取代。例如,R6”可以是包含至少一个选自N和O的环杂原子的杂芳基(例如,杂芳基不含S作为环杂原子;并且在一些实施例中不包含O作为环杂原子,即,R6”可以为N-杂芳基),或者可以是包含至少一个选自N和O的环杂原子的杂环基(例如,杂环基不含S作为环杂原子;并且在一些实施例中不包含O作为环杂原子,即,R6”可以为N-杂环基),其中每个杂芳基和杂环基基团任选地被一个或多个(例如,一个、两个或三个)独立选择的R7'取代。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”是3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中每个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7'取代。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”是单环或双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或是单环或双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中每个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7'取代。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”选自5至6元单环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)、4至6元单环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)、7至9元双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)和7至9元双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中每个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7'取代。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”是5至6元单环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),其任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”是7至9元双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),其被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”选自吡啶基、噻吩基、哒嗪基、呋喃基、吡咯基、吡唑基、恶唑基、异恶唑基、恶二唑基、咪唑咪唑基、吲哚基、萘啶基、噻吩并吡啶、四氢吡喃基、哌啶基、吡咯烷基、氮杂环丁烷基、氮杂双环庚基、氮杂双环辛基、氮杂五环辛基、哌嗪基、吗啉基和四氢噻吩基,以上中每个任选地被一个、两个或三个独立选择的R7'取代,优选地R6”选自吡啶基、噻吩基、吡唑基、异恶唑基、吡咯基、哌啶基、吡咯烷基、氮杂环丁烷基和氮杂双环辛基,以上中每个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代。
在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),R7'可以独立选自R7、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、卤素、-CN、-O(C1-6烷基)、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)1-2(C1-6烷基)、-NHS(O)1-2O(C1-6烷基)、-C(=O)(C1-6烷基)和-OC(=O)(C1-6烷基),和/或任意两个与作为杂环基的R6”的相同原子结合的R7'可以连接在一起形成=O,其中每个C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基基团任选地被一个或多个独立选择的R30取代。例如R7'可以独立地选自R7、C1-3烷基、卤素、-CN、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,和/或任意两个与作为杂环基的R6”的相同原子结合的R7'可以连接在一起形成=O,其中C1-3烷基基团任选地被一个或多个独立选择的R30取代。在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),R7'可以独立选自Cl、Br、甲基和乙基,例如选自Cl、Br和甲基。在式(Vc)的化合物的任何上述实施例的另一个中(包括(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),R7'可以独立地是R7,例如可以结合式(Ia)中定义的任意R7
在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),在R6”被取代的情况中,优选一个R7'基团在相对于R6”与化合物其余部分结合的环原子的位置2与R6”的环原子相连(即,优选R6”带有邻位R7'基团)。在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),在R6”被两个或更多个(例如,两个、三个或四个)R7'基团取代的情况中,优选两个或更多个R7'基团之一在相对于R6”与化合物其余部分相连的环原子的位置2处与R6”的环原子相连(即,R6”带有邻位R7'基团),且剩余的R7'基团在除位置2之外的位置与R6”的环原子相连。例如,在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),在R6”是被两个或更多个(例如,两个、三个或四个)R7'基团取代的k元环的情况中,优选两个或更多个R7'基团之一在相对于R6”与化合物其余部分相连的环原子的位置2处与R6”的环原子相连(即,相对于基位置),且剩余的R7'基团在除位置2之外的位置与(与)R6”的环原子相连,例如,在位置3、4、5……k。例如,在R6”是5元环的情况中,优选两个或更多个R7'基团之一在位置2处(相对于基位置)与R6”的环原子相连,且剩余的R7'基团在位置3、4或5处(相对于基位置)与R6”的环原子相连。而且,在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),在R6”被两个或更多个(例如,两个、三个或四个)R7'基团取代的情况中,优选与R6”与化合物的其余部分相连的环原子直接相邻的两个环原子中的每一个都带有一个R7'基团(例如,R6”是k元环,在相对于R6”与化合物的其余部分结合的环原子的位置2和k的每一个上带有一个R7'基团,例如,R6”的两个邻位都被取代)。此外,在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),在R6”被三个或更多个(例如,三个或四个)R7'基团取代的情况中,优选与R6”与化合物的其余部分相连的环原子直接相邻的两个环原子中的每一个都带有一个R7'基团(例如,R6”是k元环,在相对于R6”与化合物的其余部分相连的环原子的位置2和k的每一个上带有一个R7'基团,例如,R6”的两个邻位都被取代)且第三个R7'基团与R6”的环原子相连,该环原子与邻位环原子之一直接相邻,但不是R6”与化合物其余部分相连的环原子(例如,R6”是k元环,在相对于R6”与化合物其余部分结合的环原子的位置3和k-1之一带有第三个R7'基团)。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa)或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”选自以下分子式:
Figure BDA0003884477230000521
其中
Figure BDA0003884477230000522
代表R6”与化合物其余部分相连的键。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”选自以下分子式:
Figure BDA0003884477230000531
其中
Figure BDA0003884477230000532
代表R6”与化合物其余部分相连的键。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”选自以下分子式:
Figure BDA0003884477230000533
其中
Figure BDA0003884477230000534
代表R6”与化合物其余部分相连的键。
在式(Vc)的化合物的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且R6”选自以下分子式:
Figure BDA0003884477230000535
其中
Figure BDA0003884477230000536
代表R6”与化合物其余部分相连的键。
在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),L可以选自键、C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基和-(CH2)m-[Y-(CH2)n]o-,其中m为1、2或3,n为0、1或2,o为1、2或3,其中如果n为0则o为1;y独立选自O、S和NH,其中每个C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基、-(CH2)m-和-(CH2)n-基团任选地被一个或多个独立选择的R30取代。例如,在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),L可以选自:键;C1亚烷基,任选地被一个R30取代;C2亚烷基(特别是1,2-亚乙基或1,1-亚乙基),任选地被一个R30取代;C3亚烷基(特别是三亚甲基),任选地被一个R30取代;C4亚烷基(特别是四亚甲基或2,4-丁二基),任选地被一个R30取代;-(CH2)mO-和-(CH2)mNH-,其中m为1、2或3。特别地,在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),L可以是键。
在式(Vc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)和(IVc)的那些),在R6”是含有N原子作为环杂原子的杂环基或杂芳基(例如5元杂芳基)的情况中,L可以通过杂环基或杂芳基的N环原子连接到R6”
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物具有通式(VIc)
Figure BDA0003884477230000541
其中R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIIc)和/或(VIIIc))所定义,且A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2。在式(VIc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)和(Vc)的那些),A可以是S、O或N(CH3)2。在式(VIc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)和(Vc)的那些),优选A为S。
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物具有通式(VIIc)
Figure BDA0003884477230000542
其中R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”和A如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下(特别是关于式(VIIIc))所定义,E是O或S(优选为O)且B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基基团中每个都任选地被独立选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2。在式(VIIc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)和(VIc)的那些),E是O或S(优选为O)且B是N或CR1d,其中R1d可以选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2。在式(VIIc)的化合物的任何上述实施例中(包括式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)和(VIc)的那些),优选B是N且更优选E是O且B是N。
在一个实施例中,根据第五方面式(Ic)的特定用途的化合物具有通式(VIIIc)
Figure BDA0003884477230000543
其中R1a、R1b、R1c、R2、R3、R4、R5”、A、B和E如上(特别是关于式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、(IIIa)、(IVa)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))或如下所定义,且L是键。在具有通式(VIIIc)的化合物的优选实施例中:
(A)R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,其中每个烷基和杂环基基团任选地被一个或多个(例如,一个、两个或三个)独立选择的R30取代。优选地,每个R30独立地是如本文所定义的一级取代基、二级取代基或三级取代基,例如烷基(例如,C1-6烷基)、-(CH2)1-3OH、烯基(例如,C2-6烯基)、炔基(例如,C2-6炔基)、卤素、-CN、硝基、-OR11(例如,-OH)、-SR11(例如,-SH)、-N(R12)(R13)(例如,-NH2)和-C(=O)R11(例如,-C(=O)(C1-3烷基));
(B)R1b和R1c中的每一个独立地选自H、甲基、乙基、丙基、或异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z为0、1或2;且苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基基团中的每一个任选地被独立选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z中的一个、两个或三个部分取代,其中z为0、1或2;
(C)R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为0、1或2且其中C1-6烷基、C2-6烯基C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代;
(D)R6”如上所定义(特别是关于式(Vc)),且优选为3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代;
(E)A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2
(F)B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基基团中的每一个任选地被独立选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;和/或
(G)E是O或S,优选是O。
在具有通式(VIIIc)的化合物的优选实施例中,R1a如上文(A)项所指定;R1b和R1c如上文(B)项所定义;R3如上文(C)项所定义;R6”如上文所指定(特别是关于式(Vc))且优选为3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代;A如上文(E)项所指定;B如上文(F)项所指定;且E如上文(G)项所指定。
在具有式(VIIIc)的化合物的更优选实施例中:
(A')R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至7元杂环基,其中3至7元杂环基基团任选地被独立选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;且C1-3烷基基团中的每一个任选地被独立选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;
(B')R1b和R1c中至少一个选自H、甲基、乙基、丙基、或异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2且R1b和R1c中的另一个如上文(B)项所定义;
(C')R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中苯基基团任选地被一个、两个或独立选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;且z为0、1或2;
(D')R6”如上所定义(特别是关于式(Vc)),且优选为3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”是单环或双环杂芳基或单环或双环杂环基,以上中每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代;
(E')A是S、O或N(CH3)2;和/或
(F’)B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2;和/或
(G')E是O或S,优选为O。
在具有通式(VIIIc)的化合物的优选实施例中,R1a如上文(A')项所定义;R1b和R1c如上文(B')项所定义;R3如上文(C')项所定义;R6”如上项所定义(特别是关于式(Vc)),且优选为3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”为单环或双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或单环或双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代;A如上文(E')项所定义;B如上文(F')项所定义;且E如上文(G')项所定义。
在具有通式(VIIIc)的化合物的更优选实施例中:
(A”)R1a选自-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基和吡咯烷基,其中哌嗪基基团任选地被独立选自2-羟乙基、甲基、-CH2COOH和-C(=O)CH3的一个或两个部分取代;哌啶基基团任选地被独立选自-NH2和4-甲基哌嗪基的一个或两个部分取代;吡咯烷基基团任选地被一个或两个-OH取代;且C1-3烷基基团中的每一个任选地被独立选自-OH、-OCH3和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;
(B”)(a)R1b是甲基、乙基、丙基、或异丙基,优选甲基;且R1c是H;或(b)R1b是H;且R1c是甲基、乙基、丙基、异丙基、或苯基,优选甲基;
(C”)R3选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基和卤素;
(D')R6”如上所定义(特别是关于式(Vc)),且优选为3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”为单环或双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或单环或双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”选自5至6元单环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)、4至6元单环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)、7至9元双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)和7至9元双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三)个独立选择的R7’取代,更优选R6”为5至6元单环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或7至9元双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代;
(E”)A是S;
(F”)B是N;和/或
(G”)E是O。
在具有通式(VIIIc)的化合物的优选实施例中,R1a如上文(A”)项所指定,R1b和R1c如上(B”)项所定义;R3如上文(C”)项所指定;R6”如上所定义(特别是关于式(Vc))且优选为3至10元杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或3至10元杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”是单环或双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或单环或双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”是选自5至6元单环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)、4至6元单环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)、7至9元双环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)和7至9元双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上中的每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代,更优选R6”是5至6元单环杂芳基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O)或7至9元双环杂环基(例如,包含至少一个选自N、O和S的环杂原子,例如选自N和O),以上的中每一个任选地被一个或多个(例如一个、两个或三个)独立选择的R7’取代;A如上文(E”)项所指定;B如上文(F”)项所指定;且E如上文(G”)项所指定。
在一个实施例中,本发明的化合物是选自在表A所示和/或那些如图1E中所示的化合物。
在一个实施例中,本发明中应用的化合物(特别地,在本发明的第五方面)是选自在表A所示(和/或在图1E中描绘的那些)和在图1B、图1C和/或图1D所示的那些化合物。
意图是本发明的化合物(特别是式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和(VIIIa)中的任意一项化合物,例如下表A所示;和/或在图1E中的化合物)和/或本发明中所用的化合物(特别是式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和(VIIIc)中的任意一项化合物,例如在图1B、图1C和/或图1D中所示的化合物)不仅包括所示的化合物,还包括它们的溶剂化物(例如,水合物)、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a和/或R6”的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、非结晶形式、无定形形式、外消旋混合物、非-外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其任何组合。
在本发明的范围内或在本发明的方法中使用的化合物的选择,包括已经合成和测试的那些——和/或代表各种示例性或优选的Hy取代基、R1a取代基、R1b取代基、R1c取代基、R1d取代基、R1e取代基、R2取代基、R3取代基、R4取代基、R5部分、A部分、B部分和/或E部分,每个单独或以任何组合可用于合成本发明的其他化合物——列于下表A中。
表A:式(Ia)的激酶抑制剂。
Figure BDA0003884477230000571
Figure BDA0003884477230000581
Figure BDA0003884477230000591
在特定实施例中,本发明的化合物选自E4、E9、E10和E16;以及它们的溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
在某些实施例中,本发明的化合物是E9,或其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药或其组合。
在某些其他实施例中,本发明的化合物是E4,或其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药或其组合。
在某些其他实施例中,本发明的化合物是E10,或其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药或其组合。
在某些其他实施例中,本发明的化合物是E16,或其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药或其组合。
在某些实施例中,本发明可以涉及本发明的任何化合物或本发明使用的任何化合物的溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药或其组合;例如这些化合物的溶剂化物、盐、络合物、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合。
在一个实施例中,本发明使用的化合物不包含式(Ic)的以下组(1)至(6)中的一个或多个的化合物(在组(1)至(6)中,部分(例如甲基)未被取代,除非明确说明所述部分被取代):
(1)当R1a是4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基或Cl,R1b是H;R1c是甲基;B是N;E是O;R3是H;A是S;以及L是键时;那么R6”不是4-氯-2-甲基吡啶-3-基;
(2)当R1a是甲氧基;R1b是H;R1c是甲氧基;B是N;E是O;R3是H;A是S;以及L是键时;那么R6”不是2,2-二氟-5H-1,3-二恶唑[4,5-f]苯并咪唑-6-基;
(3)当R3是H;A是S;L是键;R6”是1-甲基-4-哌啶基;R1b是H;B是N;E是O;且
(i)R1a是甲基时;那么R1c不是N-叔-丁氧羰基哌啶-4-基;或
(ii)R1c是甲基时;那么R1a不是N-叔-丁氧羰基哌啶-4-基或N-叔-丁氧羰基哌啶-3-基;
(4)当E是O;B是CR1d和R1d是H、F、Cl或Br时,那么R1a不是H;
(5)当R1a是甲基;R1b和R1c均是H;B是CH;E是O;A是S;且R3是甲基时;那么R5”不是1,3-苯并二恶醇-5-基甲基、2-呋喃甲基、1,3-苯并二氧戊环-5-基、2-(2-噻吩基)乙基、2-(4-吗啉基)乙基、2-(2-吡啶基)乙基、2-吡啶基甲基、或四氢-2-呋喃基甲基;且
(6)当A是S;R3是H;E是O;L是键;R6”是1-[2,4-双(三氟甲基)苄基]-1H-吡唑-4-基;R1a是H,R1b是H,R1c是H;且B是CR1d时;那么R1d不是H。
在一个实施例中,本发明使用的化合物不包含式(Ib)的以下组(7)至(10)中的一个或多个的化合物(在组(7)至(10)中的部分(例如甲基)未被取代,除非明确说明所述部分被取代):
(7)当Hy是:
Figure BDA0003884477230000601
(i)当R1a是4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基或Cl;R1b是H;R1c是甲基;B是N;E是O;R2是H;R3是H;R4是H;且A是S时;那么R6'不是4-氯-2-甲基吡啶-3-基;或
(ii)当E是O;B是CR1d且R1d是H、F、Cl或Br时;那么R1a不是H;
(8)当Hy是1-{(2E)-4-[(2-甲氧基乙基)氨基]-1-氧代-2-丁烯-1-基}哌啶-4-基;R2是H;R3是H;R4是H;A是O;E是O时;那么R6'不是5-甲基-吡啶-2-基;
(9)当R2是H;R3是三氟甲基;R4是H;A是O;E是O;且
(i)R6'是6-{4-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]哌嗪-1-基}吡啶-3-基时;那么Hy不是1-(苯基甲基)-哌啶-4-基、1-(苯基甲基)吡咯烷-3-基或四氢-2H-吡喃-4-基;或
(ii)Hy是1-(苯基甲基)哌啶-4-基时;那么R6'不是6-(3-{[(2-氟苯基)氨基甲酰基]氨基}-吡咯烷-1-基)吡啶-3-基或6-({1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]哌啶-4-基}氨基)吡啶-3-基;或
(iii)Hy是1-(苯基甲基)吡咯烷-3-基时;那么R6'不是6-({(3S)-1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]-吡咯烷-3-基}氨基)吡啶-3-基或6-({(3R)-1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]吡咯烷-3-基}-氨基)吡啶-3-基;
(10)当A是S;R3是H;E是O;且R6'是1-[2,4-双(三氟甲基)苄基]-1H-吡唑-4-基时;那么Hy不是2-吡啶基。
在某些其他实施例中,本发明使用的化合物不是选自以下的一种:
·5-噻唑甲酰胺,2-[(6-氯-2-甲基-4-嘧啶基)氨基]-N-[2-[4-(2-羟乙基)-1-哌嗪基]-6-甲基苯基]-(CAS登记号:2048106-50-7),
·5-噻唑甲酰胺,2-[[7-[4-氰基-3-(三氟甲基)苯基]-5,6,7,8-四氢吡啶[3,4-d]嘧啶-4-基]氨基]-N-[(1R)-1-(1,3,4-恶二唑-2-基)乙基]-4-(三氟甲基)-(CAS登记号:1831086-00-0),
·5-噻唑甲酰胺,2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-N-(2-吡嗪基甲基)-(CAS登记号:385780-87-0),
·5-噻唑甲酰胺,2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-N-[2-(3-吡啶基)乙基]-(CAS登记号:385780-82-5),
·5-噻唑甲酰胺,N-1H-吲哚-5-基-2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-(CAS登记号:385780-79-0),
·5-噻唑甲酰胺,2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-N-(2-噻吩甲基)-(CAS登记号:385780-69-8),
·5-噻唑甲酰胺,N-(2-呋喃甲基)-2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-(CAS登记号:385780-66-5),
·5-噻唑甲酰胺,2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-N-2-吡啶基-(CAS登记号:385780-57-4)且
·5-噻唑甲酰胺,2-[[6-甲氧基-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-4-喹唑啉基]氨基]-N-4-吡啶基-(CAS登记号:385779-93-1)。
在某些其他实施例中,本发明使用的化合物不是选自以下的一种:
·咪唑啉[4,5-d]吡咯[2,3-b]吡啶-7-甲酰胺,N,N-二环丙基-6-乙基-1,6-二氢-1-甲基-4-[[4-甲基-5-[[(四氢-2H-吡喃-4-基)氨基]羰基]-2-噻唑基]氨基]-(CAS登记号:1271022-78-6),
·咪唑啉[4,5-d]吡咯[2,3-b]吡啶-7-甲酰胺,N,N-二环丙基-6-乙基-1,6-二氢-1-甲基-4-[[4-甲基-5-[[(四氢-1,1-二氧化-3-噻吩)氨基]羰基]-2-噻唑基]氨基]-(CAS登记号:1271022-57-1),
·咪唑啉[4,5-d]吡咯[2,3-b]吡啶-7-甲酰胺,N,N-二环丙基-6-乙基-1,6-二氢-1-甲基-4-[[4-甲基-5-[[[2-(4-吗啉基)乙基]氨基]羰基]-2-噻唑基]氨基]-(CAS登记号:1271022-45-7)且
·咪唑啉[4,5-d]吡咯[2,3-b]吡啶-7-甲酰胺,N,N-二环丙基-6-乙基-1、6-二氢-1-甲基-4-[[5-[[甲基(四氢-1,1-二氧化-3-噻吩)氨基]羰基]-2-噻唑基]氨基]-(CAS登记号:1271021-43-2)
·2-[(6-{[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]氨基}吡啶-2-基)氨基]-4-甲基-N-[1-(苯基甲基)-1H-吲唑-5-基]-1,3-噻唑-5-甲酰胺(CAS登记号:302963-64-0)
·2-[(6-{[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]氨基}吡啶-2-基)氨基]-N-[1-(苯基甲基)-1H-吲唑-5-基]-1,3-噻唑-5-甲酰胺(CAS登记号:302963-55-9)
在本文的一个或多个方面的某些替代例中(特别是本发明的第五方面),化合物是N-(2-氯-6-甲基苯基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-甲酰胺(A8;图1A),特别是其一水合物(达沙替尼)。
在本文的一个或多个方面的某些其他替代例中(特别是本发明的第五方面),化合物是ARN-3261(Vankayalapati et al 2017,AACR Cancer Res 77(13Suppl):Abstract nrLB-296;US 9,260,426,US 9,890,153,US 9,951,062)。
含有碱性官能团的本发明化合物(和/或本发明使用的化合物)可以与多种无机或有机酸形成盐。含有酸性官能团的本发明化合物(和/或本发明使用的化合物)可以与多种无机或有机碱形成盐。本发明化合物(或本发明使用的化合物)的示例性无机和有机酸/碱以及示例性酸/碱加成盐在以下“药物组合物”部分中“药学上可接受的盐”的定义中给出。包含碱性和酸性官能团的本发明化合物(和/或本发明使用的化合物)可以转化成碱或酸加成盐。本发明化合物(或本发明使用的化合物)的中性形式可以通过使盐与碱或酸接触并以常规方式分离母体化合物而再生。
本发明化合物(和/或本发明使用的化合物)可以是N-氧化物的形式,即,它们可以包含官能团官能团≡N+-O-(例如,(Rn)3N+-O-,即N-O配位共价键,其中Rn独立选自氢、烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基的每一个基团都任选地被一个或多个(例如与烷基、烯基、氯基、芳基、杂芳基、环烷基、或杂环基结合的最大氢原子数为1至最大数目,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,如介于1到5、1到4、或1到3、或1或2)独立选择的R30取代,R30优选为本文指定的一级取代基、二级取代基、或三级取代基)。本发明化合物(或本发明使用的化合物)的N-氧化物的具体实施例是其中R1a和/或R6(或R6'或R6”)包含官能团≡N+-O-的那些。可以作为N-氧化物出现的R1a取代基的非限制性实施例包括以下:
Figure BDA0003884477230000621
Figure BDA0003884477230000622
其中
Figure BDA0003884477230000625
代表R1a取代基与化合物的其余部分结合的键。可以作为N-氧化物出现的R6”取代基的非限制性实施例包括以下:
Figure BDA0003884477230000623
Figure BDA0003884477230000624
其中
Figure BDA0003884477230000626
代表R6”取代基与化合物的其余部分结合的键。
本发明的化合物可以是前药形式。本发明化合物的前药是那些在给药个体后在生理条件下发生化学转化以提供本发明化合物的化合物。此外,前药可以在体外环境中通过化学或生物化学方法转化为本发明的化合物(或本发明使用的化合物)。例如,前药可以缓慢地转化为本发明的化合物(或本发明使用的化合物),例如,当将其置于具有合适酶或化学试剂的透皮贴剂储库中时。示例性前药是酯类(使用包含在本发明激酶抑制剂(或本发明使用的化合物中)中的醇或羧基)或酰胺(使用包含在本发明激酶抑制剂(或在本发明中使用的化合物)),它们在体内可水解。具体地,包含在本发明(或在本发明使用的化合物中)的激酶抑制剂中并且带有至少一个氢原子的任何氨基基团可以转化为前药形式。典型的N-前药形式包括氨基甲酸酯(1)、曼尼希碱(2)、烯胺(3)和烯胺酮(4)。
Figure BDA0003884477230000631
其中R18独立选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个都任选地被一个或多个(例如与烷基、烯基、塑料基、环烷基、芳基、杂芳基、或杂环基结合的最大氢原子数为1至最大数目,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,如介于1到5、1到4、或1到3、或1或2)独立选择的R30取代,其中R30如本文所定义(优选地,如本文所述每个R30独立地是一级取代基、二级取代基或三级取代基)。前药特性(如溶解性、渗透性、稳定性、裂解速度、在什么条件下在体内裂解、靶点特异性等)可以通过修饰R18进行微调。
本发明化合物的具体前药形式(或本发明使用的化合物)是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)(或(IXb)、(Xb)、(IXc)或(Xc))的那些(前药):
Figure BDA0003884477230000632
Figure BDA0003884477230000641
以及溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,其中R1a、R1b、R1c、R3、R5、R5'、R5”、A、B、E和Hy如上(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)、(VIIIa)、(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))或如下所定义,并且R2和R4中的每一个都独立选自H、-P(O)(OR11a)2、-(CH2)1-3-R19、-C(=Xa)R11a和-C(=Xa)XaR11a,条件为不是R2和R4都是H,其中R11a独立选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个都可选地被一个或多个(例如与烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基或杂环基基团结合的最大氢原子数为1到最大数目,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,如介于1到5、1到4、或1到3、或1或2)独立选择的R30取代;R19独立选自-OP(O)(OR11a)2、-XaC(=Xa)R11a、-XaC(=Xa)XaR11a和5-烷基-2-氧-1,3-二恶唑-4-基;Xa独立选自O、S和NH;且-(CH2)1-3-基团任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中R30如本文所定义(优选地,每个R30独立选自如本文所指定的一级取代基、二级取代基和三级取代基)。在式(IXa)、(Xa)、(XIa)、(XIIa)、(IXb)、(Xb)、(IXc)或(Xc)的前药形式的一个实施例中,R1a、R1b、R1c、R3、R5、R5'、R5”、A、B、E和Hy如上(特别是关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)、(VIIIa)、(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)和/或(VIIIc))或如下所定义,且R2和R4中的每一个都独立选自H、-P(O)(OR11a)2、-(CH2)1-3-R19、-C(=O)R11a和-C(=O)OR11a,条件为不是R2和R4都是H,其中R11a独立选自H和C1-6烷基(优选C1-3烷基),其中烷基基团任选地被选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH3、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z基团中的一个或两个部分取代,其中z为0,1或2;R19独立选自-OP(O)(OR11a)2、-OC(=O)R11a、-OC(=O)OR11a和5-(C1-3烷基)-2-氧-1,3-二恶唑-4-基;且-(CH2)1-3-基团任选地被独立选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH3、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0,1或2。
对于具有任何一个式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)、(VIIIa)、(IXa)、(Xa)、(XIa)和(XIIa)的本发明化合物(或对于具有任何一个式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(IXb)、(Xb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、(VIIIc)、(IXc)和(Xc)的本发明使用的化合物)并带有一个或多个羟基(即-OH)基团,另一项特定前药形式是其中这两个或更多个羟基中的至少一个衍生为选自-OP(O)(OR11a)2、-O(CH2)1-3-R19、-OC(=Xa)R11a和-OC(=Xa)XaR11a的部分,其中R11a独立选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基中的每一个任选地被一个或多个(如与烷基、烯基、塑料基、环烷基、芳基、杂芳基或杂环基基团结合的氢原子的1至最大数目,例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或最多10,例如介于1到5、1到4、或1到3、或1或2)独立选择的R30取代;R19独立选自-OP(O)(OR11a)2、-XaC(=Xa)R11a、-XaC(=Xa)XaR11a和5-烷基-2-氧-1,3-二恶唑-4-基;Xa独立选自O、S和NH;且-(CH2)1-3-基团任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中R30如本文所定义(优选地,每个R30独立地选自本文所指定的一级取代基、二级取代基和三级取代基)。在本发明化合物(或本发明使用的化合物)的这种前药形式的一个实施例中,至少一个衍生化的羟基选自-OP(O)(OR11a)2、-O(CH2)1-3-R19、-OC(=O)R11a和-OC(O)OR11a,其中R11a独立选自H和C1-6烷基(优选地C1-3烷基),其中烷基基团任选地被独立选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH3、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的基团的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2;R19独立选自-OP(O)(OR11a)2、-OC(=O)R11a、-OC(=O)OR11a和5-(C1-3烷基)-2-氧-1、3-二恶唑-4-基;且-(CH2)1-3-基团任选地被独立选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH3、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的一个或两个部分取代,其中z为0、1或2。
在某些实施例中,本发明(或本发明中使用的化合物,例如本发明的第五方面中使用的)可以涉及具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)(或(IXb)、(Xb)、(IXc)、或(Xc))的前药的溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合;例如这些前药的溶剂化物、盐、络合物、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合。
在一个特定的实施例中,本发明的化合物(或用于本发明的化合物)是水合物,合适地是激酶抑制剂的一水合物或二水合物,如标题“化合物”下所述(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂(或具有通式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、或(VIIIc)的化合物),或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a和/或R6”的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)(或(IXb)、(Xb)、(IXc)或(Xc))的前药和/或具有至少一个衍生化的羟基,如上文所指定的,或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合)或其组合)。在另一个合适的实施例中,本发明的化合物(或用于本发明的化合物)是这种激酶抑制剂的半水合物。
在某些实施例中,本发明的化合物(例如,如标题“化合物”下所指定的)可以是(例如,提供为)纯化的或(例如,基本上)纯的形式。例如,该化合物的纯度可以大于约50%,例如大于约60%、70%或80%,适当地大于约90%(特别是大于约95%、97%或98%)甚至99%)。即,在某些这样的实施例中,这样的化合物仅与有限量的杂质(例如,在制造过程中引入的那些)一起存在,例如仅存在少量的杂质,包括其中化合物存在于基本上不存在杂质的形式。化合物的纯度(例如,不存在或存在杂质的程度)可以通过常规程序来测定,例如,由HLPC来测定。
在一个实施例中,本发明提供了这样的化合物,其含有小于约50%、40%、30%和合适地10%或5%HPLC面积,优选小于约3%和2%HPLC面积,更多地优选小于1%HPLC面积的总杂质。如本文所用的术语“%HPLC面积”指的是HPLC色谱图中的一个或多个峰在HPLC色谱图中的面积与所有峰的总面积相比的以总面积的百分比表示的面积。此外,化合物的纯度在本文中可以表示为“HPLC”纯度。因此,“HPLC纯度”是用化合物峰下面积除以HPLC色谱图中曲线下的总面积的一项计算。更为合适地,该化合物含有小于约10%HPLC总杂质面积。更优选地,总杂质的HPLC面积小于约5%。
在相关方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明提供一个或多个容器,其中容器(每个独立地或全部共同地)包含第一方面的激酶抑制剂或第五方面中所用的化合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)、或(VIIIa)的激酶抑制剂(或具有通式的化合物(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、或(VIIIc)的化合物),或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a和/或R6”的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)(或(IXb)、(Xb)、(IXc)、或(Xc)中的前药和/或具有至少一个衍生化的羟基,如上所指定的,或溶剂化物、盐、N-氧化物、复合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式(或它们的组合)的量超过约10mg;特别是超过约50mg或100mg的量;合适的量大于约1g、10g、50g或100g;或超过约500g或1Kg。
在另一方面,本发明提供了本发明的化合物(特别是上文关于式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和(VIIIa))用作药物,例如用于治疗。在第五方面的一个实施例中,用于本发明的化合物不包括具有式(Ic)且属于如上所指定的组(1)、(2)、(3)、(4)、(5)和/或(6)中的一个或多个的化合物(例如组(1)(尤其是当R1a为4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基时组(1)的化合物)、(2)和/或(4)(特别是化合物2-[(6-{[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]氨基}吡啶-2-基)氨基]-4-甲基-N-[1-(苯基甲基)-1H-吲唑-5-基]-1,3-噻唑-5-甲酰胺和2-[(6-{[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]氨基}丙基-2-基)氨基]-N-[1-(苯基甲基)-1H-吲唑-5-基]-1,3-噻唑-5-甲酰胺)中的一个或多个的化合物。在该方面的一个实施例中,本发明第五方面中使用的化合物不包括具有式(Ib)并且属于如上所述的组(7)(例如,特别是当R1a为4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基时的组(7)(i)、(8)、(9)和/或(10)中的一个或多个的化合物。
从实施例可以明显看出,本发明人已经发现本发明的化合物以及其他结构相似的化合物抑制一种或多种蛋白质酪氨酸激酶,包括选自SIK3、ABL/BCR-ABL和CSF1R,或选自SRC、HCK、PDGFR和KIT,或选自ABL1/BCR-ABL、SRC、LCK、KIT、FLT3及其突变体,和/或SIK1、SIK2和SIK3,和/或PHA2、EPHA4、CSFR1、HCK和ACK1;和/或NEK11、WEE1、WNK2、Aurora-A、Aurora-B和TBK1中的任一种。在一个实施例中,本发明的化合物表现出的药理特性(选择性、生物利用度、毒性、副作用、剂量、患者依从性、相容性、稳定性、半衰期等)至少在一方面优于达沙替尼表现出的药理特性。
在一个实施例中,本发明的化合物尤其表现出与达沙替尼和/或化合物B3(WO2018/193084)抑制的激酶不同的激酶谱。在一个实施例中,本发明的化合物是激酶抑制剂,其:(i)相对于其他激酶,对一种或多种关键疾病相关激酶(例如,ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或CSF1R,和/或EPHA2、EPHA4、ACK1和/或KIT,和/或LCK)的特异性比达沙替尼(和/或化合物B3)对一种或多种此类其他激酶显示的特异性更强;(ii)以不同于达沙替尼(例如对KIT和/或对FLT3)和/或化合物B3的图谱抑制关键的疾病或副作用相关激酶;和/或(iii)抑制一种或多种疾病相关激酶的突变体,特别是对一种或其他激酶抑制剂具有抗性的突变体,例如ABL/BCR-ABL或KIT的突变体。
在另一个实施例中,本发明的化合物表现出一种或多种不同于达沙替尼、化合物B3(WO 2018/193084)和/或化合物C7(PCT/EP2019/078751)的药理学特性。药理学性质的这种差异可导致以不同于例如达沙替尼的治疗方案施用本发明化合物。此类特性可以是一种或多种改进的DMPK特性,例如实施例5.2中描述的那些特性(例如AUC、血浆浓度和/或游离血浆浓度)。
药物组合物
本发明所述的化合物(特别是上文那些指定的如式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的那些的化合物,特别是表A)中给出的那些或本发明所用的化合物(特别是上文那些指定的如式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、或(VIIIc)的那些)优选地通过药物组合物给药于有需要的患者。因此,在第二方面,本发明提供了一种药物组合物,其包含如上文在标题“化合物”下指定的激酶抑制剂(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)、或溶剂化物、盐(在特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是式(IXa)、(Xa)、(XIa)、或(XIIa)和/或具有至少一个衍生化羟基的前药,如上文所指定,或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合)或其组合)和任选地一种或多种药学上可接受的赋形剂。
因此,在一个实施例中,药物组合物包含如上文标题“化合物”下指定的激酶抑制剂(特别是本发明第一方面的化合物)和一种或多种药学上可接受的赋形剂。此外,药物组合物还可包含一种或多种附加的治疗剂。因此,在特定实施例中,药物组合物包含(i)如上文标题“化合物”下指定的激酶抑制剂(特别是本发明第一方面的化合物)和一种或多种另外的治疗剂;或(ii)如上文标题“化合物”下指定的激酶抑制剂(特别是本发明第一方面的化合物)、一种或多种另外的治疗剂和一种或多种药学上可接受的赋形剂。
术语“药学上可接受的”是指不与药物组合物(例如,本发明的激酶抑制剂(或用于本发明的化合物),单独或与一种或多种附加治疗剂组合)的活性成分的(例如,治疗)作用相互作用的材料的无毒性物。
药物组合物可以通过任何途径例如肠内或肠胃外施用至个体。
如本文所用,表述“肠内给药”和“给药于肠内”是指给药的药物被胃和/或肠吸收。肠内给药的实施例包括口服和直肠给药。本文所用的表述“肠胃外给药”和“给药于肠胃外”是指肠内给药以外的给药方式,通常通过注射或局部应用,包括但不限于静脉内、肌肉内、动脉内、鞘内、囊内、骨内、眶内、心内、皮内、腹膜内、经气管、皮下、表皮下、关节内、包膜下、脑内、脑室内、蛛网膜下、椎管内、硬膜外和胸骨内给药(例如通过注射和/或输注)以及局部给药(例如,皮下、吸入、或通过粘膜(如口腔、舌下或阴道))。
用于本文所述化合物的局部和/或透皮给药的剂型可包括软膏剂、糊剂、乳膏剂、洗剂、凝胶剂、粉剂、溶液剂、喷雾剂、吸入剂和/或贴剂。通常,活性成分在无菌条件下与药学上可接受的赋形剂(例如一种或多种药用载体和/或任何需要的防腐剂和/或缓冲剂)混合。此外,本文公开考虑使用透皮贴剂,其通常具有提供活性成分向身体的受控递送的附加优势。这样的剂型可以例如通过将活性成分溶解和/或分散在适当的介质中来制备。或者,或另外,可以通过提供速率控制膜和/或通过将活性成分分散在聚合物基质和/或凝胶中来控制速率。
用于递送本文所述的皮内药物组合物的合适装置包括短针装置。皮内组合物可以通过限制针头进入皮肤的有效穿透长度的装置给药。或者,或另外,常规注射器可用于皮内给药的经典曼托方法。通过液体射流注射器和/或通过刺穿角质层并产生到达真皮的射流的针将液体制剂递送至真皮的射流注射装置是合适的。使用压缩气体来加速粉末形式的化合物通过皮肤外层到达真皮的弹道粉末/颗粒递送装置是合适的。
适用于局部给药的制剂包括但不限于液体和/或半液体制剂,例如搽剂、洗剂、水包油和/或油包水乳剂,例如乳膏、软膏、和/或糊剂,和/或溶液和/或悬浮液。可局部给药的制剂可例如包含约1%至约10%(w/w)活性成分,但活性成分的浓度可与活性成分在溶剂中的溶解度极限一样高。用于局部给药的制剂还可包含一种或多种本文所述的附加成分。
本发明的化合物(或用于本发明的化合物)通常以“药学上可接受的量”和“药学上可接受的制剂”应用。此类组合物可包含盐、缓冲剂、防腐剂、载体和任选地其他治疗剂。“药学上可接受的盐”包括例如酸加成盐,其可以例如通过将化合物溶液与药学上可接受的酸(例如盐酸、硫酸、富马酸、马来酸、琥珀酸、醋酸、苯甲酸、柠檬酸、酒石酸、碳酸或磷酸)的溶液混合而形成。此外,当化合物带有酸性部分时,其合适的药学上可接受的盐可以包括碱金属盐(例如钠盐或钾盐);碱土金属盐(例如钙盐或镁盐);和与合适的有机配体形成的盐(例如,铵、季铵和胺阳离子,这些阳离子使用抗衡阴离子如卤化物、氢氧化物、羧酸盐、硫酸盐、磷酸盐、硝酸盐、烷基磺酸盐和芳基磺酸盐形成)。药学上可接受的盐的示例性实施例包括但不限于乙酸盐、己二酸盐、藻酸盐、精氨酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、碳酸氢盐、硫酸氢盐、酒石酸氢盐、硼酸盐、溴化物、丁酸盐、依地酸钙、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、右旋樟脑磺酸盐、碳酸盐、氯化物、柠檬酸盐、克拉维酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡萄糖酸盐、二盐酸盐、十二烷基硫酸盐、乙二胺四乙酸盐(edetate)、乙二磺酸盐(edisylate)、依托酸盐(estolate)、乙磺酸盐(esylate)、乙磺酸酯(ethanesulfonate)、甲酸盐、富马酸盐、半乳糖酸盐(galactate)、半乳糖醛酸盐(galacturonate)、葡庚糖酸盐(gluceptate)、葡庚糖酸盐(glucoheptonate)、葡萄糖庚酸盐(gluconate)、谷氨酸盐(glutamate)、甘油磷酸盐(glycerophosphate)、对α-羟乙酰氨基苯胂酸盐(glycolylarsanilate)、半硫酸盐(hemisulfate)、庚酸盐、己酸盐、己基间苯二酸酯、哈胺(hydrabamine)、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-羟基乙磺酸盐、羟基萘甲酸盐、碘化物、异丁酸盐、异硫磺酸盐、乳酸盐、乳糖酸盐、月桂酸盐、硫酸十二烷基酯、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、扁桃酸盐、甲磺酸盐、甲磺酸甲酯、硫酸甲酯、粘酸盐、2-萘磺酸盐、萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、N-甲基葡糖胺铵盐、油酸盐、草酸盐、帕莫酸盐(双羟萘酸盐)、棕榈酸盐、泛酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-环丙酸盐、磷酸盐/二磷酸盐、邻苯二甲酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、聚半乳糖醛酸盐、丙酸盐、水杨酸盐、硬脂酸盐、硫酸盐、辛二酸盐、琥珀酸盐、丹宁酸盐、酒石酸盐、8-氯茶碱盐、甲苯磺酸盐、三乙基碘、十一烷酸盐、戊酸盐等(见,例如,Berge et al.,"Pharmaceutical Salts",J.Pharm.Sci.,66,pp.1-19(1977))。
本文使用的术语“赋形剂”旨在表示药物组合物中所有不是活性成分的物质(例如,它们是在所使用的量/浓度上不表现出任何治疗效果的无治疗活性成分),例如,载体、粘合剂、润滑剂、增稠剂、表面活性剂、防腐剂、稳定剂、乳化剂、缓冲剂、调味剂、着色剂或抗氧化剂。
本发明中描述的组合物可包含药学上可接受的载体。如本文所用,“药学上可接受的载体”包括生理学相容的任何和所有溶剂、分散介质、包衣、等渗剂和吸收延迟剂等。“药学上可接受的载体”可以是固体、半固体、液体或其组合的形式。优选地,该载体适用于肠内(如口服)或肠胃外给药(如静脉内、肌肉内、皮下、脊髓或表皮给药(如注射或输注))。根据给药途径,活性化合物,例如本发明的化合物(或用于本发明的化合物),可以单独或与一种或多种另外的治疗剂组合,包被在材料中以保护活性化合物免受酸和其他可能使活性化合物失活的自然条件的作用。
可用于根据本发明的药物组合物的合适的水性和非水性载体的实施例包括水(例如注射用水)、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇、聚乙二醇等)、盐的水溶液、碳水化合物、糖醇、或氨基酸的水溶液(如盐水或氨基酸水溶液)及其合适的混合物和/或其缓冲形式、植物油(如橄榄油)和可注射的有机酯(如油酸乙酯)。例如,通过使用包衣材料,如卵磷脂,通过在分散体的情况下保持所需的粒度,以及通过使用表面活性剂,可以保持适当的流动性。
药学上可接受的载体包括无菌水溶液或分散体和用于临时制备无菌可注射溶液或分散体的无菌粉末。此类介质和药剂用于药物活性化合物的用途是本领域已知的。除非任何常规介质或药剂与活性化合物不相容,否则考虑其在根据本发明的药物组合物中的用途。
另外的治疗剂可以与本发明的化合物一起、在其之前或之后,或者与在本发明中使用的化合物(特别是上文指定的,如式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)、(VIIIa)、(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、或(VIIIc)的那些)一起、在其之前或之后给药,或掺入组合物中。在一个实施例中,本文所述的药物组合物包含如上所述的本发明的激酶抑制剂(或如本发明中使用的化合物)(例如具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)、(VIIIa)、(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)、或(VIIIc)或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a、R6'和/或R6”的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是式(IXa)、(Xa)、(XIa)、(XIIa)、(IXb)、(Xb)、(IXc)、或(Xc)和/或具有至少一个衍生羟基的前药,如上所指定,或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合),或上述任何一种的组合)、至少一种另外的治疗剂和一种或多种药学上可接受的赋形剂。
“另外的治疗剂”(其在一个实施例中不是如本文所述的式(Ia)的激酶抑制剂,或在另一实施例中(i)不是如本文所述的式(Ia)的激酶抑制剂;(ii)不是如本文所述的式(Ib);和(iii)不是如本文所述的式(IIIa)化合物,或在另一个实施例中可以是式(Ia)的不同激酶抑制剂,或在另一个实施例中可以是分子式或(Ia)、(Ib)和/或(Ic)的不同激酶抑制剂)可选自可用于治疗作为增殖性病症和/或由以下原因引起或与之相关的的病症、疾病或病状的任何化合物:(i)激酶的(例如,错误的)表达和/或活性,例如SRC、ABL/BCR-ABL、HCK、PDGFR CSFR1、LCK、SIK1、SIK2、SIK3、FLT3和/或KIT;和/或PHA2、EPHA4和ACK1;和/或NEK11、WEE1、WNK2、Aurora-A、Aurora-B和TBK1和/或(ii)对(例如细胞介导的)免疫反应的细胞抗性。合适的另外的治疗剂的实施例在本文别处定义或公开,包括EGFR抑制剂、吉西他滨、多西他赛和免疫检查点抑制剂(例如PD1、PDL1、CTLA-4、LAG3或IDO1的抑制剂,特别是选自纳武单抗、瑞拉利单抗、易普利姆玛和BMS-986205的免疫检查点抑制剂)、TNF或TNFR1-或TNFR2-信号传导的激动剂、过继细胞疗法(包括针对肿瘤抗原的CAR T细胞)、疫苗(包括基于树突状细胞(DC)的疫苗接种)、或者将能够诱导或诱导涉及增殖性疾病的细胞暴露于TNF或TNFR1-信号传导的激动剂的药剂给药于受试者。另外的治疗剂可诱导叠加或协同治疗效果。
除了本发明的激酶抑制剂(和/或本发明使用的化合物)之外,本文所描述的药物组合物可以包含至少一种,例如,1、2、3、4、5、6、7或8种另外的治疗剂。根据本文教导,至少一种另外的治疗剂可以与本发明的激酶抑制剂(和/或与本发明中使用的化合物)一起配制在单一药物组合物中。或者,该药物组合物可以被构造为试剂盒,其中本发明的激酶抑制剂(或本发明中使用的化合物)在第一制剂中提供并且至少一种另外的治疗剂在第二制剂(即,第二药物组合物)中提供。第一和第二药物组合物可以在使用前组合。换言之,在给药药物组合物之前,可以将包含另外的治疗剂的制剂加入包含本发明激酶抑制剂(或本发明中使用的化合物)的第一药物组合物中。或者,本文教导设想给药配制在第一药物组合物中的本发明的激酶抑制剂(或用于本发明的化合物)和给药配制在第二药物组合物中的至少一种另外的治疗剂。药物组合物可以同时或依次给药。例如,第一药物组合物可以在第一时间点给药,第二药物组合物可以在第二时间点给药,其中时间点可以间隔例如0或最多1、2、3、4、5或10分钟,最多1、2、3、4、5或10小时,最多1、2、3、4、5或10天,最多1、2、3、4、5或10周,最多1、2、3、4、5或10个月或最多1、2、3、4、5或10年。
组合物还可以含有防腐剂、稳定剂、润湿剂、乳化剂、pH缓冲剂和分散剂等辅料。可以通过灭菌程序和/或通过包含各种抗菌剂和抗真菌剂(例如对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚山梨酸等)来防止微生物的存在。还可能希望在组合物中包括等渗剂,例如糖、氯化钠等。此外,可注射药物形式的延长吸收可能是由于包含延迟吸收的试剂,例如单硬脂酸铝和明胶。
不管选择的给药途径如何,都可以以合适的水合形式使用的活性化合物和/或根据本发明的药物组合物通过本领域技术人员已知的常规方法配制成药学上可接受的剂型(参见例如Remington,"The Science and Practice of Pharmacy"edited by Allen,LoydV.,Jr.,22nd edition,Pharmaceutical Sciences,September 2012;Ansel et al.,"Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems",7th edition,LippincottWilliams&Wilkins Publishers,1999)。
药物组合物可以通过本领域已知的多种方法给药。正如本领域技术人员的理解,给药途径和/或给药方式将根据所需结果而变化。含有一种或多种活性化合物的药物组合物可以与保护一种或多种活性化合物免于快速释放的载体一起制备,例如控释制剂,包括植入物、透皮贴剂和微囊化递送系统。可使用生物可降解、生物相容性聚合物,如乙烯醋酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、胶原蛋白、聚原酸酯和聚乳酸。制备这种组合物的方法通常是本领域技术人员已知的。参见,例如,Sustained and Controlled Release Drug DeliverySystems,J.R.Robinson,ed.,Marcel Dekker,Inc.,New York,1978。
为了通过某些给药途径给药本发明的化合物(或本发明中使用的化合物),可能需要用材料包被该化合物,或将化合物与材料共同给药以防止其失活。例如,化合物可以在适当的载体(例如脂质体或稀释剂)中给药个体。药学上可接受的稀释剂包括盐水和缓冲水溶液。脂质体包括水包油包水型CGF乳剂以及常规脂质体(Strejan et al.,J.Neuroimmunol.7:27(1984))。
药物组合物在制造和储存条件下通常是无菌和稳定的。该组合物可配制成溶液、微乳、脂质体或其他适合高药物浓度的有序结构。载体可以是含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇和液态聚乙二醇等)及其合适混合物的溶剂或分散介质。可以例如,通过使用诸如卵磷脂的包衣,在分散的情况下通过保持所需的粒度以及通过使用表面活性剂,以保持适当的流动性。在许多情况下,优选在组合物中包含等渗剂,例如糖类、多元醇如甘露糖醇、山梨糖醇或氯化钠。可注射组合物的延长吸收可以通过在组合物中包含延迟吸收的试剂(例如单硬脂酸盐和明胶)来实现。
可注射组合物应该是无菌的并且是流动的,达到该组合物可通过注射器递送的程度。除了水之外,载体可以是等渗缓冲盐水溶液、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等)及其合适的混合物。可以通过将所需量的活性化合物掺入具有所需的上面列举的一种或多种成分的适当溶剂中,然后灭菌微滤来制备无菌可注射溶液。
通常,通过将活性化合物掺入包含基本分散介质和来自上面列举的那些所需的其他成分的无菌载体中来制备分散体。在用于制备无菌注射液的无菌粉末的情况下,优选的制备方法是真空干燥和冷冻干燥(冻干),从其先前无菌过滤的溶液中产生活性成分加上任何其他所需成分的粉末。
调整剂量方案以提供最佳的所需反应(例如治疗反应)。例如,可以给药单次推注,可以随着时间的推移给药若干分次剂量,或者可以根据治疗情况的紧急情况按比例减少或增加剂量。以剂量单位形式配制肠胃外组合物以易于给药和剂量均匀是特别有利的。如本文所用的剂量单位形式是指适合作为待治疗个体的单位剂量的物理离散单位;每个单元含有预定量的活性化合物,其经计算可与所需的药物载体一起产生所需的治疗效果。根据本发明使用的剂量单位形式的规格由并直接取决于(a)活性化合物的独特特性和要达到的特定治疗效果和(b)复合这种活性化合物用于治疗个体敏感性的技术中固有的局限性。
药学上可接受的抗氧化剂的例子包括:(1)水溶性抗氧化剂,如抗坏血酸、半胱氨酸盐酸盐、硫酸氢钠、焦亚硫酸钠、亚硫酸钠等;(2)油溶性抗氧化剂,如抗坏血酸棕榈酸酯、丁基羟基茴香醚(BHA)、丁基羟基甲苯(BHT)、卵磷脂、没食子酸丙酯、α-生育酚等;(3)金属螯合剂,如柠檬酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、山梨糖醇、酒石酸、磷酸等。
对于治疗/药物制剂,根据本发明的组合物包括适合肠内给药(例如口服或直肠)或肠胃外给药(例如鼻、局部(包括阴道、口腔和舌下))的那些。组合物可以方便地以单位剂型存在并且可以通过药学领域已知的任何方法制备。可与载体材料组合以产生药物组合物(例如单一剂型)的活性成分的量(特别是根据本发明的化合物的量)将根据所治疗的个体以及特定的给药方式而变化。可与载体材料组合以产生单一剂型的活性成分的量通常是产生治疗效果的组合物的量。
通常,在100%(对于药物制剂/组合物)中,活性成分的量(特别是根据本发明的化合物(或用于本发明的化合物)的量,任选地连同其他治疗活性剂(如果存在于药物制剂/组合物中)的范围为约0.01%至约99%,优选地为约0.1%至约70%,最优选地为约1%至约30%,其中剩余部分优选地由一种或多种药学上可接受的赋形剂组成。
活性成分(例如,根据本发明的化合物(或用于本发明的化合物))的量,在单位剂型中和/或当给药于个体或用于治疗时,可以在每个单位、每次给药或治疗约0.1mg至约1000mg的范围内(例如,约1mg至约500mg,例如约10mg至约200mg)。在某些实施例中,可使用个体的质量或体表面积计算此类活性成分的合适量,包括介于约1mg/kg和10mg/kg之间(例如介于约2mg/kg和5mg/kg之间),或约1mg/m2和约400mg/m2之间(例如约3mg/m2和约350mg/m2之间或约10mg/m2和约200mg/m2之间)。
根据本发明的药物组合物中活性成分的实际剂量水平可以变化以获得有效实现对特定患者、组合物和给药方式的期望治疗反应而对患者无毒的活性成分的量。选择的剂量水平将取决于多种药代动力学因素,包括所用特定组合物的活性、给药途径、给药时间、所用特定化合物的排泄速率、治疗持续时间、其他药物、化合物和/或与所采用的特定组合物组合使用的材料、被治疗患者的年龄、性别、体重、状况、一般健康状况和既往病史以及医学领域众所周知的类似因素。
具有本领域普通技术的医师或兽医可以容易地确定和开出所需的(例如,治疗上)有效量的药物组合物。例如,医生或兽医可以从低于达到预期治疗效果所需水平的本发明化合物(或本发明所用化合物)的剂量开始,并逐渐增加剂量直至达到了预期的效果。通常,根据本发明的组合物的合适日剂量将是有效产生治疗效果的最低剂量的化合物的量。这种有效剂量通常取决于上述因素。优选地给药是口服、静脉内、肌肉内、腹膜内、或皮下,优选地在目标部位附近给药。如果需要,则药物组合物的(例如,治疗)有效日剂量可以作为二、三、四、五、六或更多个亚剂量在全天以适当的间隔分开给药,任选地,以单位剂型给药。虽然根据本发明的化合物(或用于本发明的化合物)可以单独给药,但优选将化合物作为药物制剂/组合物给药。
对于口服给药,根据本发明的药物组合物可以采用例如通过常规方法与药学上可接受的赋形剂制备的片剂或胶囊剂的形式,所述赋形剂例如是粘合剂(例如预胶化玉米淀粉、聚乙烯吡咯烷酮、羟丙基甲基纤维素)、填充剂(如乳糖、微晶纤维素、磷酸氢钙)、润滑剂(如硬脂酸镁、滑石、二氧化硅)、崩解剂(如马铃薯淀粉、羟基乙酸淀粉钠)或润湿剂(如十二烷基硫酸钠)。用于口服给药的液体制剂可以是例如溶液剂、糖浆剂、或混悬剂的形式,或者可以作为在使用前用水或其他合适的赋形剂配制的干燥产品提供。这种液体制剂可以通过常规方法加入药学上可接受的添加剂制备,如悬浮剂(如山梨糖醇、糖浆、纤维素衍生物、氢化食用脂肪)、乳化剂(如卵磷脂、阿拉伯胶)、非水性赋形剂(如杏仁)油、油性酯、乙醇、分馏植物油)、防腐剂(例如甲基或丙基对羟基碳酸酯、山梨酸)。如果认为合适,制剂还可以包含缓冲盐、调味剂、着色剂和甜味剂。可以适当地配制用于口服给药的制剂以控制释放本发明的药物组合物。
在一个实施例中,所述化合物以例如最多100mg/kg体重的浓度口服给药(如最多50mg/kg体重、最多40mg/kg体重、最多30mg/kg体重、最多20mg/kg体重、最多10mg/kg体重、最多5mg/kg体重、最多4mg/kg体重、最多3mg/kg体重、最多2mg/kg体重、最多1mg/kg体重)。
在一个实施例中,化合物以例如最多10mg/kg体重的浓度肠胃外给药(例如,静脉内、肌肉内或皮下)(如最多5mg/kg体重,最多4mg/kg体重,最多3mg/kg体重,最多2mg/kg体重,最多1mg/kg体重,最多0.5mg/kg体重、最多0.4mg/kg体重、最多0.3mg/kg体重、最多0.2mg/kg体重、最多0.1mg/kg体重)。
该药物组合物可以与传统的粘合剂和载体(如甘油三酯)一起配制成栓剂。口服制剂可包括标准载体,如药用级甘露醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、纤维素、碳酸镁等。
对于吸入给药,根据本发明的药物组合物可方便地以气溶胶喷雾形式从加压包或雾化器中递送,使用合适的推进剂(例如,二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳、氮气或其他合适的气体)。在加压气雾剂的情况下,剂量单位可以通过提供阀门以输送计量的量来确定。用于吸入器或吹入器的例如明胶的胶囊和药筒可以配制为含有根据本发明的药物组合物和合适的粉末基质(例如乳糖或淀粉)的粉末混合物。
根据本发明的药物组合物可以配制成通过注射,例如通过推注或连续输注进行肠胃外给药。在一个实施例中,本发明的化合物或组合物可以通过长时间缓慢连续输注给药,例如超过24小时,以减少毒副作用。给药也可以通过在2到24小时(例如2到12小时)的时间段内连续输注进行。这种方案可以根据需要重复一次或多次,例如在6个月或12个月后。
在又一个实施例中,根据本发明的化合物或组合物通过维持疗法给药,例如每周一次,持续6个月或更长时间。
注射剂可以以单位剂型(例如,小瓶、多剂量容器)和添加防腐剂的形式存在。根据本发明的药物组合物可以采用油性或水性载体中的混悬剂、溶液剂或乳剂等形式,并且可以包含配制剂,例如悬浮剂、稳定剂或分散剂。或者,该药剂可以是粉末形式,以便在使用前用合适的载体(例如无菌无热原水)配制。通常,用于静脉内给药的组合物是无菌等渗水性缓冲液中的溶液。必要时,该组合物还可包含增溶剂和局部麻醉剂如利多卡因以缓解注射部位的疼痛。通常,成分以单位剂型单独或混合在一起提供,例如,作为干冻干粉或无水浓缩物在密封容器(如安瓿或小袋)中指示活性剂的数量。当组合物通过输注给药时,可以用装有无菌药用级水或盐水的输液瓶分配。当组合物通过注射给药时,可提供一安瓿无菌注射用水或盐水,以便在给药前混合成分。
适用于阴道给药的本发明组合物还包括子宫托、棉塞、乳膏、凝胶、糊剂、泡沫或喷雾制剂,其含有本领域已知的合适的载体。用于根据本发明的组合物的局部或经皮给药的剂型包括粉剂、喷雾剂、软膏剂、糊剂、霜剂、洗剂、凝胶剂、溶液剂、贴剂和吸入剂。活性化合物可以在无菌条件下与药学上可接受的载体以及可能需要的任何防腐剂、缓冲剂或推进剂混合。
治疗/药物组合物可以与本领域已知的医疗装置一起给药。例如,在一个优选的实施例中,根据本发明的治疗/药物组合物可以用无针皮下注射装置给药,例如在US 5,399,163;US 5,383,851;US 5,312,335;US 5,064,413;US4,941,880;US 4,790,824;或US 4,596,556中公开的装置。可用于本发明的众所周知的植入物和模块的例子包括在以下文献中描述的:US 4,487,603,其公开了一种用于以受控速率分配药物的可植入微型输液泵;US4,486,194,其公开了一种用于通过皮肤给药的治疗装置;US 4,447,233,其公开了一种以精确的输液速度输送药物的药物输液泵;US4,447,224,其公开了一种用于连续给药的可变流量植入式输液装置;US 4,439,196,其公开了具有多室隔室的渗透药物递送系统;以及US4,475,916,其公开了一种渗透性药物递送系统。
许多其他这样的植入物、递送系统和模块是本领域技术人员已知的。在某些实施例中,可以配制根据本发明的化合物以确保适当的体内分布。例如,血脑屏障(BBB)排除了许多高度亲水的化合物。为了确保根据本发明的化合物穿过血脑屏障(如果需要),它们可以被配制在例如脂质体中。对于制造脂质体的方法,见,例如,US 4,522,811;US5,374,548;和US 5,399,331。脂质体可以包含一个或多个部分,这些部分被选择性地转运到特定的细胞或器官中,从而增强靶向药物递送(见,例如,V.V.Ranade(1989)J.Clin.Pharmacol.29:685)。示例性靶向部分包括叶酸或生物素(见,例如,US 5,416,016to Low et al.);甘露糖苷(Umezawa et al.,(1988)Biochem.Biophys.Res.Commun.153:1038);抗体(P.G.Bloemanet al.(1995)FEBS Lett.357:140;M.Owais et al.(1995)Antimicrob.AgentsChemother.39:180);和表面活性蛋白A受体(Briscoe et al.(1995)Am.J.Physiol.1233:134)。
在一个实施例中,根据本发明的化合物(或本发明中使用的化合物)被配制在脂质体中。在一个更优选的实施例中,该脂质体包括靶向部分。在一个最优选的实施例中,脂质体中的化合物通过弹丸式注射到所需区域附近的部位。这种基于脂质体的组合物应具有流动性,以至于易于注射,在制造和储存条件下应是稳定的,并应能防止微生物如细菌和真菌的污染作用。
疗法/治疗的“治疗有效剂量”可以通过完全的或部分的客观反应来衡量。完全反应(CR)定义为没有病状、病症或疾病的临床的、放射学的或其他证据。部分反应(PR)源于疾病减少超过50%。中位进展时间是描述客观肿瘤反应的持久性的度量。
疗法/治疗的“治疗有效剂量”也可以通过其稳定病状、病症或疾病进展的能力来测量。化合物抑制一种或多种蛋白激酶或降低与增殖性疾病相关的细胞(例如癌细胞)的活力的能力可以通过使用熟练的技术人员已知的适当体外测定法进行评估,例如本文所述的那些(尤其是在下面的例子中)。或者,本发明中描述的化合物的特性可以通过检查化合物在熟练的技术人员已知的适当动物模型系统中的能力来评估,例如本文所描述的那些(尤其是在下面的例子中)。使用治疗有效量的本发明中的化合物可以治疗、治愈、减轻、缓解、改变、补救、改善、改进或影响个人的病状、病症或疾病,以及病状、病症或疾病的症状,以及对该病状、病症或疾病的倾向。本领域的普通技术人员将能够基于诸如个体的大小、个体症状的严重程度和所选择的特定组合物或给药途径等因素来确定这样的量。
如果需要,则本发明的药物组合物还可以以包装或自动售卖机的形式存在,其中可以包含一个或多个(例如,单位)含有活性成分的剂型。例如该包装可包含金属或塑料箔,例如泡罩包装。包装或自动售卖机可以附有传单或其他信息;特别是,描述(向患者和/或给药医生)有关包装中的药物组合物的重要信息或细节,例如如何给药、推荐的剂量、安全性和/或副作用信息。
在一个特定的实施例中,本发明的药物组合物被配制用于口服给药,并且在一个替代的特定实施例中,本发明的药物组合物被配制用于静脉内给药。
在一个实施例中,本发明的药物组合物是单位剂量形式,尤其可以是配制用于口服给药的单位剂量形式。
每个这样的单位剂型可以含有(例如,它可以包含)介于1到950mg之间的化合物,例如第一方面的激酶抑制剂或用于第五方面的化合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂(或具有通式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)或(VIIIc)的化合物),或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a、R6'和/或R6”的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(在特别是式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)(或(IXb)、(Xb)、(IXc)或(Xc))和/或具有至少一个如上文所指定的衍生化羟基的前药,或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体,同位素标记形式或其组合),或其组合)。特别地,(例如,每个)这样的单位剂型可以含有(例如,它可以包含)2到150mg之间的这样的化合物;并且合适地,在10到150mg之间的这种化合物。
特别是在此类实施例中,单位剂量形式的本发明的药物组合物(尤其是被配制用于口服给药的单位剂量形式)可以含有(例如,它可以包含)——对于每个单位剂量形式——约一定量的此类化合物,其选自下列量的列表:2mg、5mg、15mg、20mg、50mg、70mg、80mg、100mg和140mg;特别是,含有(例如,包含)约20mg、50mg、70mg或100mg的本发明化合物(或用于本发明的化合物)。
在一个特定的实施例中,本发明的药物组合物是(例如,形成为)片剂、囊片或胶囊;合适地,本发明的药物组合物(例如,其单位剂型)是囊片。例如,形成(例如,制造)片剂和囊片的方法在本文别处描述。
特别是当形成为片剂或囊片时,用于本发明中的药物组合物的合适的赋形剂包括,并且本发明中的此类药物组合物的特定实施例含有那些进一步包含一种或多种(例如,所有)选自以下的赋形剂:乳糖(例如乳糖一水合物)、微晶纤维素、交联羧甲基纤维素钠、羟丙基纤维素和硬脂酸镁。
治疗和其他应用
在第三方面,本申请提供用作药物(例如用于治疗)的如上文在“化合物”标题下指定的化合物或如上文在“药用组合物”标题下指定的药物组合物。
预期上述标题为“化合物”下的化合物可用于抑制:(i)激酶,例如本文所述的一种,特别是SRC、ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、CSFR1、LCK、SIK1、SIK2、SIK3、FLT3和/或KIT、和/或PHA2、EPHA4和ACK1、和/或NEK11、WEE1、WNK2、Aurora-A、Aurora-B和TBK1,例如SIK3、ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR和/或CSF1R;和/或(ii)细胞对(例如细胞介导的)免疫反应的抗性。例如,在相关的方面,该化合物(特别是,当该化合物是本发明的第一方面之一时)可以用于治疗对象(特别是人类患者)的疾病、病症或病状的方法,该方法包括向该对象施用所述化合物,其中该疾病或病状与这种激酶有关。
特别地(并且如以下第五方面中进一步描述的),预期上文在标题“化合物”下指定的化合物可用于治疗增殖性疾病(例如MPAL),该疾病的特征在于(或与增殖性疾病有关的细胞的特征在于),尤其是存在MEF2C蛋白(例如磷酸化的MEF2C蛋白和/或作为活性转录因子的MEF2C蛋白)、在11q23的人类染色体易位、和/或KMT2A融合癌蛋白。
本发明的化合物(或用于本发明第五方面的化合物)可单独或与一种或多种其他治疗剂联合治疗,例如与本文其他地方定义或公开的治疗剂联合使用,包括EGFR抑制剂、吉西他滨、多西他赛、以及免疫检查点抑制剂(例如PD1、PDLL、CTLA-4、LAG3或IDO1的抑制剂,特别是选自纳武单抗(nivolumab)、瑞拉利单抗(relatlimab)、伊匹单抗(ipilimumab)和BMS-986205的免疫检查点抑制剂)、TNF或TNFR1或TNFR2信号激动剂、过继细胞疗法(包括针对肿瘤抗原的CAR T细胞)、疫苗(包括基于树突细胞(DC)的疫苗接种)或当对对象施用时能够诱导或诱导与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF或TNFR1信号传导激动剂的试剂。
可以在家里、医生办公室、诊所、医院的门诊部或医院提供包括或使用此类化合物的治疗方法。通常在医疗监督下开始治疗,以便医务人员可以密切观察治疗效果并进行必要的调整。治疗的持续时间取决于患者的年龄和状况,以及患者对治疗的反应方式。
患有病状、病症或疾病的风险较高的人可能会接受预防性治疗,以抑制或延迟该病状、病症或疾病的症状。
术语“治疗”是本领域技术人员已知的,并且包括对患者的治疗剂(例如,包含所述试剂的药物组合物)或程序的应用或给药、或对从患有病状、病症或疾病、病状、病症或疾病的症状或病状、病症或疾病的倾向的患者分离的细胞、细胞培养物、细胞系、样品、组织或器官的治疗剂(例如,包含所述试剂的药物组合物)或程序的应用或给药,目的在于治愈、疗愈、缓解、减缓、改变、补救、改善、改进、影响或预防该病状、病症或疾病、病状、病症或疾病的症状或病状、病症或疾病的倾向。因此,术语“治疗”可以包括病状、病症或疾病或者病状、病症或疾病的症状的预防性治疗。当用于治疗中时,治疗剂包括本发明的激酶抑制剂(或用于本发明第五方面的化合物),并且包括但不限于其他治疗剂,其可以是小分子、肽、拟肽、多肽/蛋白质、抗体、核苷酸(例如DNA或RNA)、细胞、病毒、核酶、siRNA和反义寡核苷酸。
因此,在第四方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及在标题“化合物”下指定的化合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合),用于治疗对象的增殖性疾病。
在另一个第四方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及如上所述的药物组合物(例如,包含标题为“化合物”中指定的化合物的药物组合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合),用于治疗对象的增殖性疾病。
在相关的第四方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,该方法包括向该对象施用(例如治疗有效量的):(X)在“化合物”标题下指定的化合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合);或(Y)如上所述的药物组合物(例如,包含标题为“化合物”下指定的化合物的药物组合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合)。
在另一个相关的第四方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开,本发明涉及标题为“化合物”标题下指定的化合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合),用于制备用于治疗对象的增殖性疾病的药物。
在此类第四方面,这种用途或方法的治疗包括向对象施用(例如,治疗有效量的)本发明的化合物或药物组合物。
此外,在第五方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开,本发明涉及一种用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向所述对象施用所述化合物或药物组合物,其中所述化合物选自(a)第一方面的化合物(例如,具有通式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的激酶抑制剂、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合);(b)如本文定义的式(Ib)的化合物(例如,具有通式(Ib)、(IIb)或(IIIb)的化合物、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a和/或R6'的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXb)或(Xb)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合);以及(c)如本文定义的式(Ic)的化合物(例如,具有通式(Ic)、(IIc)、(IIIc)、(IVc)、(Vc)、(VIc)、(VIIc)或(VIIIc)的化合物、或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a和/或R6”的N-氧化物)、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXc)或(Xc)和/或具有至少一个上述衍生化的羟基的前药、或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记的形式或其组合)或其组合),或药物组合物包含这样的化合物和任选的药学上可接受的赋形剂;其中所述增殖性疾病选自(α)至(γ)中的一种或多种:(α)增殖性疾病的特征在于(或与所述增殖性疾病相关的细胞的特征在于),存在(或存在一定量的)肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白,例如存在磷酸化的MEF2C蛋白和/或存在作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地其中所述增殖性疾病的进一步特征在于(或与所述增殖性疾病相关的细胞的进一步特征在于),存在(或存在一定量的)磷酸化的组蛋白脱乙酰基酶4(HDAC4)蛋白,例如存在被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或(β)增殖性疾病的特征在于:(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)存在(或存在一定量的)KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变;和/或(γ)混合表型急性白血病(MPAL)。在相关方面,本发明提供了一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,包括向所述对象施用如第五方面所定义的化合物或药物组合物,其中所述增殖性疾病如第五方面所定义。在第五方面的一个实施方案中,式(Ic)的化合物不包括属于在上文标题“化合物”下指定的群组(1)、(2)、(3)、(4)、(5)和/或(6)中的一个或多个的化合物(例如群组(1)(特别是当R1a是4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基时的群组(1)的化合物)、(2)和/或(4)(特别是化合物2-[(6-{[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]氨基}吡啶-2-基)氨基]-4-甲基-N-[1-(苯基甲基)-1H-吲唑-5-基]-1,3-噻唑-5-甲酰胺和2-[(6-{[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]氨基}吡啶-2-基)氨基]-N-[1-(苯基甲基)-1H-吲唑-5-基]-1,3-噻唑-5-甲酰胺)中的一个或多个的化合物)。在第五方面的一个实施方案中,式(Ib)的化合物不包括属于如在上文标题“化合物”下指定的群组(7)(例如,特别地,当R1a为4-(2-)羟乙基)哌嗪-1-基时的群组(7)(i)的化合物)、(8)、(9)和/或(10)中的一个或多个的化合物。
在该方面的一个特定实施方案中,所述对象是人类,合适地是成年人类。例如,年龄在18(或16)岁以上的人类,例如年龄在18(或16)至90岁之间,或18(或16)至80岁之间的人类。在某些此类实施例中,成人大约20岁或以上、30岁或以上、35岁或以上、40岁或以上、45岁或以上、50岁或以上或55岁或以上。在这样的实施例的更具体的实施例中,成人是轻年人(例如约18(或16)至45(或40)、或约30至45(或40)岁),中年人(例如约45(或40)至65(或60)、或大约45(或40)至55(或50)、或大约55(或50)至65(或60)岁),或者是老年人(例如约60至90(或更年长,例如92、95或98)、约65到85至约70至88岁)。
作为此类实施方案的替代方案,所治疗的对象是小儿,例如小于约18岁(或16岁)的小儿。例如,这样的人可以大约3至18(或16)岁,例如大约5至16或大约10至16或12至17岁。小儿(儿科)人类可以是婴儿(例如在大约两个月至约2岁)、婴幼儿(例如约2岁至约4岁)、幼儿(例如约4岁至约9岁)、青春期前(例如约9岁至约12或13岁(或11或14岁)、或青春期(例如约12或13岁(或11或14岁)至15岁(或16或17岁))。
在该方面的一个实施方案中,所述治疗包括每天向需要其的成年对象施用少于约140mg的本发明的化合物(例如,包含在药物组合物中)。例如,任选地,在增殖性疾病不是(例如,该对象患有的增殖性疾病不是)慢性阶段Ph+CML的情况下。在该方面的替代实施方案中,所述治疗包括向有此需要的成年人类对象施用每天大于约140mg(例如每天大于150mg)的量的此类化合物(例如,包含在药物组合物中)。
在该方面的另一个实施方案中,所述治疗包括每天向需要其的成年对象施用少于约100mg的本发明的化合物(例如,包含在药物组合物中)。例如,任选地,在增殖性疾病不是(例如,该对象患有的)慢性阶段Ph+CML的情况下。在该方面的替代实施方案中,所述治疗包括向有此需要的成年人类对象施用每天大于约100mg(例如每天大于120mg)的量的此类化合物(例如,包含在药物组合物中)。
在一个可供选择的实施方案中,所述治疗包括向有此需要的儿科人类对象施用以下量的本发明化合物(或用于本发明的化合物):
·对于体重在10kg至20kg之间的儿科患者,每日少于40mg;
·对于体重在20kg至30kg之间的儿科患者,每日少于60mg;
·对于体重在30kg至45kg之间的儿科患者,每日少于70mg;或者
·对于体重至少为45kg的儿科患者,每日少于约100mg。
在另一个可供选择的实施方案中,所述治疗包括向有此需要的儿科人类对象施用以下量的本发明化合物(或用于本发明的化合物):
·对于体重在10kg至20kg之间的儿科患者,每日大于约40mg;
·对于体重在20kg至30kg之间的儿科患者,每日大于约60mg;
·对于体重在30kg至45kg之间的儿科患者,每日大于约70mg;或者
·对于体重至少为45kg的儿科患者,每天大于约100mg。
对于将一定量的这类化合物(例如待施用)施用至人对象的实施方案,该量的施用频率可能比每天更少。例如,给定的量“每天少于40mg”可以通过每天例如每天35、30或20mg或每两天一次(或更低频率)一次75、65或40mg来实现。
在一个特定的实施方案中,在这样(例如治疗有效量)的本发明化合物(或用于本发明的化合物)的施用时(或之后),该对象不太可能(例如没有)发生(或遭受)不良反应,例如骨髓抑制。
在这样的特定实施方案之一中,在这样(例如治疗有效量)的本发明化合物的施用时(或之后),该对象不太可能(例如没有)发生(或遭受)非血液学不良反应,例如心脏病学不良反应。
在这样的实施方案中更具体地,在向对象施用(例如治疗有效)量的化合物时(或之后),该对象不太可能(例如没有)发生(或遭受)QT延长。
在一个实施方案中,所述对象的特征在于不同时使用强CYP3A4抑制剂。例如,不同时使用酮康唑、伊曲康唑、红霉素、克拉霉素、利托那韦、泰利霉素或摄入葡萄柚汁。
在某些实施方案中,在本文描述的发明的上下文中,所述疾病、病症或病状是增殖性疾病(包括与此类病症有关的病状或症状)。
“增殖性疾病”是指以细胞异常增殖为特征的疾病。增殖性疾病并不意味着对细胞生长速率的任何限制,而仅表示丧失了影响生长和细胞分裂的正常对照。因此,在一些实施方案中,增殖性疾病的细胞可以具有与正常细胞相同的细胞分裂速率,但是不响应于限制这种生长的信号。在“增殖性疾病”的范围内的是肿瘤或肿瘤,这是组织或细胞的异常生长。癌症是本领域已知的,并且包括以细胞增殖为特征的各种恶性肿瘤中的任何一种,这些细胞具有侵袭周围组织和/或转移至新的定殖位点的能力。增殖性疾病包括癌症、动脉粥样硬化、类风湿性关节炎、特发性肺纤维化和肝硬化。非癌性增殖性疾病还包括皮肤细胞过度增生,例如牛皮癣及其各种临床形式,雷特氏(Reiter's)综合征、红斑性糠疹、角质化失调的过度增生变体(例如光化性角化病、老年性角化病)、硬皮病等。
在更具体的实施方案中,增殖性疾病是癌症或肿瘤,特别是实体瘤(包括与这种癌症或肿瘤有关的病症或症状)。这类增殖性疾病包括但不限于头颈癌、鳞状细胞癌、多发性骨髓瘤、孤立性浆细胞瘤、肾细胞癌、视网膜母细胞瘤、生殖细胞肿瘤、肝母细胞瘤、肝细胞癌、黑素瘤、肾脏的横纹肌瘤、尤因肉瘤、软骨肉瘤、任何血液系统恶性肿瘤(例如慢性淋巴细胞性白血病、慢性骨髓单核细胞性白血病、急性淋巴母细胞性白血病、急性淋巴细胞性白血病、急性骨髓性白血病、急性成肌细胞白血病、慢性粒细胞性白血病、霍奇金氏病、非霍奇金氏白血病、慢性淋巴细胞性白血病、慢性粒细胞性白血病、骨髓增生异常综合症、毛细胞白血病、肥大细胞白血病、肥大细胞肿瘤、滤泡性淋巴瘤、弥漫性大细胞淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、边缘区淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、真菌病、丝裂综合征、皮肤T细胞淋巴瘤、外周T细胞淋巴瘤、慢性骨髓增殖性疾病、骨髓炎肉芽肿、髓样化生、系统性肥大细胞增多症)和中枢神经系统肿瘤(例如脑癌、胶质母细胞瘤、非胶质母细胞瘤脑癌、脑膜瘤、垂体腺瘤、前庭神经鞘瘤、原始神经外胚层肿瘤、髓母细胞瘤、星形细胞瘤、间质星形胶质细胞瘤、少突胶质细胞瘤、室管膜瘤和脉络丛乳头状瘤)、骨髓增殖性疾病(例如真性红细胞增多症、血小板增多症、特发性骨髓纤维化)、软组织肉瘤、甲状腺癌、子宫内膜癌、类癌或肝癌。
在一个特定的实施方案中,本发明的各个方面涉及(例如本发明的化合物或药物组合物用于)增殖性疾病的治疗,所述增殖性疾病包括本文所述的那些。因此,在这样的实施方案中,增殖性疾病可以是癌症或肿瘤。
在本发明各个方面的某些实施方案中,增殖性疾病选自以下的一种或多种:
·混合表型急性白血病(MPAL),尤其是具有MLL(KMT2A)重排的MPAL;和/或
·增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于):(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变;和/或
·增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于)存在肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白。
在特定的实施方案中,增殖性疾病可以是混合表型急性白血病(MPAL);也称为“混合谱系白血病”(MLL)。MPAL是一种侵袭性很强的血癌,主要发生在儿科患者中,并且与其他类型的儿童急性白血病不同,预后不佳(Slany2009综述,Haematologica 94:984)。MPAL的一种形式的特征是存在赖氨酸甲基转移酶2A(MPAL)融合蛋白(也称为MLL融合蛋白),这是染色体易位影响11q23处KMT2A基因(也称为MLL1基因)的结果。这种KMT2A/MLL重排是MPAL(MPAL MLL+)中第二常见的遗传病变。这些11q23翻译事件将组蛋白甲基转移酶KMT2A的氨基末端与各种不同的(易位)融合伴侣并置,这些融合伴侣破坏了KMT2A的正常组蛋白甲基转移酶功能,并将其取代为(易位)融合伴侣贡献的异源功能。由此产生的蛋白质嵌合体是转录调节因子,可以控制通常由KMT2A控制的靶标。特别是,转录因子MEF2C可以由KMT2A控制,并被描述为儿童急性白血病中的致癌基因。MEF2C表达与AML中的KMT2A融合基因重排相关(Schwieger et al 2009,Blood 114:2476),并且MEF2C表达定义了具有较差生存结果的AML患者的一个子集(Lazlo et al 2015,J Hematol&Oncol 8:115)。在这样的实施方案之一中,增殖性疾病是具有MLL(KMT2A)重排的MPAL。
在特定的实施方案中,增殖性疾病的特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于)在11q23处存在人染色体易位,例如选自以下的人染色体易位:t(4,11),t(9,11),t(11,19),t(10,11)和t(6,11),特别是t(4;11)(q21;q23)[TPG:AF4],t(9;11)(p22;q23)[TPG:AF9],t(11;19)(q23;p13.3)[TPG:ENL],ins(10;11)(p12;q23q13)[TPG:AF10],t(11;19)(q23;p13.1)[TPG:ELL]和t(6;11)(q27;q23)[TPG:AF6]。在其他实施方案中,人类染色体易位可以是Meyer et al2018的表2中鉴定的任何一种。
人类染色体11q23上的赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因(以前称为混合谱系白血病1基因,MLL1)可以被这种易位破坏;产生与90多个(已知)易位伴侣基因之一的融合((Meyer et al 2018,Leukemia 32:273)。大多数白血病是由KMT2A与大约六种常见(易位)伴侣基因之一融合引起的(如Winters&Bernt 2017年综述,Front Ped 5:4),其中九种特定基因融合占KMT2A融合的所有非法重组的90%以上(Meyer et al 2018)。大约10%或所有的白血病都含有这种易位(并因此含有KMT2A融合基因)。
在某些实施方案中,增殖性疾病的特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排,和/或存在KMT2A融合癌蛋白。例如,KMT2A融合癌蛋白可以以一定量(例如定量量)存在,例如超过生理量(例如,对于该细胞类型和/或该时间/阶段)的量,包括来自蛋白质的表达或过度表达。在另一个实施方案中,这种蛋白质可以以超过阈值或者是这种蛋白质的量的参考分布的异常值的量(例如定量量)存在。在此类实施方案中特别是,所述KMT2A基因的重排包含以下融合或所述KMT2A融合癌蛋白表达自包含以下融合的重排:KMT2A基因与易位伴侣基因(TPG)的融合,所述易位伴侣基因选自:AF4,AF9,ENL,AF10,ELL和AF6,特别是选自AF4、AF9和ENL。其他TPG可以包括EPS15或AF1Q,或Meyer et al 2018的表1的第10至20、21至30、31至40、41至50、51至60、61至70、71至80、81、82和/或83行中鉴定的TPG中的任意一种。
某些TPG可以与某些增殖性疾病相关,并且在本文的特定实施方案中,KMT2A基因的增殖性疾病和TPG是选自图23(来自Meyer et al 2018)中所示的群组的一个。
Tarumoto及其同事(2018,Mol Cell 69:1017)表明,AML中的MEF2C活性是由HDAC4的SIK3磷酸化驱动的,并且SIK3敲除或小分子工具化合物HG-9-91-01的化学抑制强烈降低几种MPAL相关AML细胞系(包括MOLM-13和MV4-11)的活力:因为SIK3磷酸化HDAC4的细胞质滞留调节MEF2C活性,通过阻止核定位(未磷酸化)的HDAC4用作MEF2C的抑制辅因子,MEF2C是与AML增殖相关的肿瘤存活/维持基因的交易因子(图19)。
因此,在某些实施方案中,增殖性疾病的特征(或与增殖性疾病有关的细胞的特征)的一种(或多种)可以是存在肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白。例如,MEF2C蛋白可以以一定量(例如定量量)存在,例如超过生理量(例如,对于该细胞类型和/或该时间/阶段)的量,包括来自蛋白质的表达或过度表达。在另一个实施方案中,这种蛋白质可以以超过阈值或者是这种蛋白质的量的参考分布的异常值的量(例如定量量)存在。特别是在此类实施方案中,MEF2C蛋白是磷酸化的MEF2C蛋白,例如一种被MARK激酶磷酸化的蛋白(Vakoc&Kentis2018,Oncotarget9:32276),例如在S222处磷酸化的MEF2C蛋白。MEF2C蛋白可以是充当(例如,作为)活性转录因子的蛋白。在特定实施方案中,增殖性疾病的特征还在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征还在于)存在组蛋白脱乙酰酶4(HDAC4)蛋白,优选在细胞核和/或磷酸化的HDAC4蛋白(例如,被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白质)中。任何此类HDAC4蛋白可以以一定量(例如定量量)存在,例如超过生理量(例如,对于该细胞类型和/或该时间/阶段)的量,包括来自蛋白质的表达或过度表达。在另一个实施方案中,这种蛋白质可以以超过阈值或者是这种蛋白质的量的参考分布的异常值的量(例如定量量)存在。
此外,Tarumoto及其同事(2020,Blood 135:56)指出,与其他癌细胞系相比,多发性骨髓瘤和AML细胞系表达最高水平的MEF2C和SIK3。在他们对TCGA1中162个基因组特征的人类AML样本的分析中,他们发现MEF2C表达不仅与MLL(11q23)易位的存在相关,而且还与K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)突变和RUNX家族转录因子1(RUNX1)突变相关。
因此,在某些实施方案中,增殖性疾病的特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于)在KRAS基因和/或RUNX1基因中存在突变。
MPAL的另一种形式的特征在于BCR/ABL重排。具有t(9;22)(q34;q11.2)(或BCR/ABL1重排)的MPAL被视为单独的实体(Arber et al 2016,Blood 127:2391)。t(9;22)(q34;q11.2易位导致位于费城染色体(Ph)上的BCR/ABL1融合基因,导致组成型活性BCR/ABL1酪氨酸激酶。
因此,在本发明的各个方面的另一个某些实施方案中,增殖性疾病选自以下的一个或多个:
·混合表型急性白血病(MPAL),特别是具有BCR/ABL1融合基因的MPAL;和/或
·增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于):(i)存在人类染色体易位t(9;22)(q34;q11.2);(ii)存在BCR/ABL1重排基因;(iii)存在BCR/ABL1融合癌蛋白。
因此,在另一方面,本发明涉及用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向对象施用所述化合物或药物组合物,其中化合物选自以下化合物(a)至(c)或(d)或(e),或药物组合物包含此类化合物和任选的药学上可接受的赋形剂:(a)式(Ia)的化合物,例如上述的其任何实施方案;(b)式(Ib)的化合物,例如上述的其任何实施方案;以及(c)式(Ic)的化合物,例如上述的其任何实施方案,以及在每种情况下,其盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;或(d)达沙替尼,特别是N-(2-氯-6-甲基苯基)-2-[[6-[4-(2-羟乙基)-1-哌嗪基]-2-甲基-4-嘧啶基]氨基]-5-噻唑甲酰胺,一水合物(图1A);或(e)ARN-3261(Vankayalapati et al 2017,AACR Cancer Res 77(13Suppl):Abstract nr LB-296;US 9,260,426,US 9,890,153,US 9,951,062)。
在相关方面,本发明涉及一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,包括向对象施用这样的化合物或药物组合物。
在此类进一步和相关方面的一个特定实施方案中,增殖性疾病选自(X)至(Z)中的一个或多个:
(X)增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于)存在(和/或存在一定量的)肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白,例如磷酸化的MEF2C蛋白和/或作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地,其中增殖性疾病的进一步特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的进一步特征在于)存在(和/或存在一定量的)磷酸化组蛋白脱乙酰酶4(HDAC4)蛋白,例如被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(Y)增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于):(i)在11q23处存在人类染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)存在(和/或存在一定量的)KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变;和/或
(Z)混合表型急性白血病(MPAL),尤其是具有MLL(KMT2A)重排的MPAL。
在此类进一步和相关方面的另一个特定实施方案中,增殖性疾病选自(X')和(Y')中的一个或多个:
(X’)混合表型急性白血病(MPAL),尤其是具有BCR/ABL1融合基因的MPAL;和/或
(Y’)增殖性疾病,其特征在于(或与增殖性疾病相关的细胞的特征在于):(i)存在人类染色体易位t(9;22)(q34;q11.2);(ii)存在BCR/ABL1重排基因;(iii)存在BCR/ABL1融合癌蛋白。
在这些方面的进一步实施方案中,化合物是具有式(Ib)或(Ic)的化合物,其中L是键并且R6是5元杂芳基,其任选地被一个或多个独立地选择的R7取代。在某些这样的实施方案中,化合物不是5-噻唑甲酰胺、N-[1-[[2,4-双(三氟甲基)苯基]甲基]-1H-吡唑-4-基]-2-(2-吡啶基氨基)-(CAS 2377755-04-7)。
在这些方面的进一步实施方案中,化合物是具有式(Ib)或(Ic)的化合物,其中L是键并且R6是5或6元单环杂芳基,其包含至少一个S环原子并且任选地被一个、两个或三个独立地选择的R7取代,特别是在那些实施方案中,R6是任选地被一个、两个或三个独立地选择的R7取代的噻吩基。
在此类实施方案中,此类R6被一个、两个或三个独立地选择的R7取代,包括其中R7独立地选自卤素和C1-2烷基的那些实施方案,其中C1-2烷基任选地被一个、两个或三个独立地选择的R30取代。
在这些方面的某些实施方案中,化合物具有式(Ia),例如选自表A中所示(或图1E中所示)的中的一种。在其他方面,所述化合物可以是选自C7、E4、E9、E10和E16中的一个,例如选自化合物E4、E9或E10。在其他方面,该化合物可以是A8(达沙替尼),或可以是ARN-3261(Vankayalapati et al 2017,AACR Cancer Res 77(13Suppl):Abstract nr LB-296;US9,260,426,US 9,890,153,US 9,951,062)。
在任何这样的方面中,增殖性病症是例如症或肿瘤,例如本文别处描述的癌症或肿瘤。在特定的实施方案中,增殖性疾病是造血系统恶性肿瘤。增殖性疾病可以是淋巴恶性肿瘤。
在此类实施方案中,增殖性疾病可以是:(i)骨髓瘤,优选多发性骨髓瘤;或(ii)白血病,优选急性髓细胞性白血病(AML)或急性淋巴细胞性白血病(ALL),更优选T细胞急性淋巴细胞性白血病(T-ALL)、MLL-AML或MLL-ALL。在其他实施方案中,增殖性疾病可以是选自图23中列出的组中的一种。
与这些方面相关的治疗对象可以适当地是人类儿科患者,例如小于约18岁(或16岁)的人类个体。例如,这样的人可以是大约3至18(或16)岁,例如大约5至16岁或在大约10至16或12至17岁。儿科人类可以是婴儿(例如大约两个月至约2岁)、婴幼儿(例如约2岁至约4岁)、幼儿(例如约4岁至约9岁)、青春期前(例如约9岁至约12或13岁(或11或14岁)、或青春期(例如约12或13岁(或11或14岁)至15岁(或16或17岁))。
在进一步的实施方案中,对象携带KMT2A重排(KMT2A-r)。例如,对象可以是患有KMT2A-r白血病的患者,尤其是如本文别处所述的(例如儿科)人类患者。
在一个特定的实施方案中,所述癌症是造血或淋巴样癌,并且在一个这样的实施方案中,所述增殖性疾病是(例如,对象患有或怀疑患有)费城染色体阳性白血病;例如,费城染色体阳性的慢性髓细胞性白血病(Ph+CML)或费城染色体阳性的急性淋巴细胞性白血病(Ph+ALL)。
在某个实施方案中,该增殖性疾病是(例如,该对象(例如成年人类对象)患有或怀疑患有):
·慢性期的新诊断的(Ph+CML);
·对包括伊马替尼(例如甲磺酸伊马替尼)在内的先前治疗有耐药性或耐受性的慢性、加速或爆炸性CML;或者
·对先前的治疗有耐药性或不耐受性的Ph+急性淋巴细胞白血病(ALL)和淋巴母细胞性CML。
在另一个特定的实施方案中,所述对象是儿科人类并且所述增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有):
·对以前的治疗(包括伊马替尼)有抗药性或耐受性的新诊断的慢性期Ph+CML(Ph+CML-CP)或Ph+CML-CP。
在另一个特定的实施方案中,癌症是实体瘤,并且在一个这样的实施方案中,增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)本文其他各处所述的实体瘤之一的实体瘤,例如胰腺癌、乳腺癌、肺癌、前列腺癌、黑色素瘤、卵巢癌、食道癌、肉瘤和结直肠癌。在某些这样的实施方案中,增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)胰腺癌;在这样的实施方案的另一个中,所述增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)前列腺癌;在此类实施方案的又一个中,增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)肺癌(例如,非小细胞肺癌)。
如其他地方所述,本发明的化合物(或药物组合物)(或用于本发明的化合物)可以通过另一种医学程序(例如另外的治疗剂,例如本文其他地方描述的,手术或放射疗法)施用于对象(例如,作为联合疗法或方案)。然后,这样的组合治疗方案可以包括其中这样的暴露/施用同时发生的实施方案。在替代实施方案中,这样的施用可以是按顺序的;特别是在这样的其他程序之前施用本发明的化合物(或药物组合物)(或用于本发明的化合物)的那些实施方案中。例如,化合物(或药物组合物)可以在其他程序(例如之前)的约14天之内,例如在其他程序(例如之前)的约10天、7天、5天、2天或1天之内按顺序施用;并且进一步包括其中化合物(或药物组合物)可以在其他程序(例如之前)约48小时、24小时、12小时、8小时、6小时、4小时、2小时、1小时、30分钟、15分钟或5分钟内依次给药。
这种联合治疗方案可以包括(例如进一步)对所述对象施用:
·EGFR抑制剂和/或吉西他滨——特别是当增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)胰腺癌时;
·多西紫杉醇——特别是当增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)前列腺癌时;和/或
·免疫检查点抑制剂——特别是当增殖性疾病是(例如,所述对象患有或怀疑患有)肺癌(例如非小细胞肺癌)时。
可能包含此类联合疗法或方案的示例性免疫检查点抑制剂在其他地方进行了描述,包括PD1、PDL1、CTLA-4、LAG3或IDO1的抗体或小分子抑制剂,尤其是此类免疫检查点抑制剂可以选自由下列组成的列表中的一种:纳武单抗,瑞拉利单抗,伊匹单抗和BMS-986205,特别是纳武单抗。
在其他实施方案中,组合方案可包括(例如进一步)向所述对象施用:
·免疫激活剂(例如,激动剂)抗体,例如针对OX40(例如,Yang et al 2012,Blood120:4533)、41BB、CD40或ICOS(例如,Deng et al 2004,Hybrid Hybridomics 23:176)的抗体,特别是通过刺激/刺激T细胞而增加TNF水平的;和/或
·基于树突状细胞(DC)的疫苗接种(例如,Lowe et al 2014,Oncoimmunology 3:e27589)。
在一个特定的实施方案中,增殖性疾病(例如,在对象中)已经在(例如尽管)标准疗法下发展,或者在另一实施方案中,对象可能无法接受标准疗法,例如由于对象不对其耐受。在任何一个这样的实施方案中,对象可以被表征(例如,分层)为已经在标准疗法下进展或不能接受(例如,不耐受)标准疗法。
作为标准疗法的例子,可以是伊马替尼(例如,对于CML或ALL)、多西他赛(例如,对于前列腺癌)或免疫疗法,例如在此描述的免疫检查点抑制剂(例如,对于黑素瘤或肺癌)。
对免疫反应和抑制激酶的敏感化
本发明的化合物可使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应敏感。
因此,在一个实施方案中,包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物)的治疗涉及(例如,被介导或被支持)使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应敏感。
在一个替代的实施方案中,包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物)的治疗涉及(例如,被介导或被支持)抑制参与对细胞介导的免疫响应的抗性的激酶(例如抑制SIK3)。
在一个相关的实施方案中,包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物)的治疗涉及(例如,被介导或被支持)抑制参与对细胞介导的免疫响应的抗性的激酶(例如抑制SIK3),并且(例如由此)使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫应答敏感。
在另一个方面,并且如本文中可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种用于在对象的增殖性疾病治疗中与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫应答的敏化的方法,该方法包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物);在另一个方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种抑制在对象的增殖性疾病治疗中与细胞介导的免疫反应(例如抑制)的抗性有关的激酶的方法,该方法包括向所述对象施用本发明的化合物(或药物组合物)。
在相关的进一步方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及用作药物的本发明的化合物(或药物组合物),用于:(i)致敏与细胞介导的免疫反应的增殖性疾病有关的细胞;和/或(ii)抑制涉及对细胞介导的免疫反应的抗性的激酶,例如(在对象中)抑制SIK。
在又一个相关的进一步方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及用作药物(例如免疫肿瘤药物药物)的本发明化合物(或药物组合物),该药物使与增殖性疾病(例如肿瘤或癌症)有关的细胞对细胞介导的免疫反应敏感,例如使与增殖性疾病有关的细胞对可能由细胞介导的免疫反应诱导的杀伤(细胞死亡)敏感。“免疫肿瘤”药物是本领域普通技术人员会认可的药物,并且包括旨在(例如,专门设计用于)增强生物体(例如人)的免疫系统的一种或多种成分抵抗该生物体中存在的癌细胞或肿瘤细胞的能力。免疫肿瘤药物可以是与外部免疫(抑制性)检查点分子(例如本文其他地方所述)结合的药物(例如抗体),并且(例如直接)抑制针对癌细胞或肿瘤细胞的T细胞功能,或免疫肿瘤药物可以是抑制癌细胞或肿瘤细胞所固有的免疫调节剂(如本发明中的SIK3)的药物,其中这种内在的免疫调节剂不能主动(例如直接)抑制T细胞,而是通过抗性机制保护肿瘤或癌细胞免受免疫反应。
在这些方面的特定实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞可以对通过细胞介导的免疫应答(例如由其诱导)的杀死(细胞死亡)敏感。
“盐诱导型激酶3”或“SIK3”(同义词QSK和KIAA0999)是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶亚家族的成员,包括属于AMP激活蛋白激酶(AMPK)家族的SIK1、SIK2和SIK3。在本发明的上下文中,SIK3蛋白通常是蛋白激酶。关于人SIK3蛋白的相关信息可在UniProt:Q9Y2K2(2017年3月15日条目版本138)上获得,并且在本发明的上下文中,SIK3蛋白优选具有SIK3 2017年3月15日的条目版本138或2018年3月28日的条目版本144中所示的氨基酸序列,这些序列通过引用合并在此。SIK3是具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性的细胞质蛋白,其通过LKB1复合物通过激酶结构域T环中保守的苏氨酸残基(163位)的磷酸化来调节。据报道,磷酸化是SIK3催化活性必不可少的(Lizcano,J.M.et al.;EMBO J.23,833–843(2004))。为了本文公开的发明的目的,术语“磷酸化的SIK3”应表示基本上被磷酸化的SIK3蛋白,因为SIK3蛋白可以被(例如被)LKB1磷酸化,其中优选地,这种磷酸化的SIK3在氨基酸位置163包含磷酸苏氨酸。在本发明的上下文中,磷酸化的SIK3是在其细胞生物学环境中被激活的SIK3蛋白。通过SIK3基因产物的可变剪接产生的至少四种蛋白质同种型(SIK3-001至SIK3-004)是已知的。人SIK3基因位于染色体位置11q23.3(HGNC基因Symbol Acc:HGNC:29165),在许多物种中都具有保守性,例如黑猩猩、恒河猴、狗、牛、小鼠、大鼠、鸡、斑马鱼和青蛙。在本发明的一些实施方案中,术语SIK3也可以涉及具有与上述SIK3的氨基酸序列基本相同或至少80%、优选85%、更优选90、95、96、97、98、99或100%序列同一性的氨基酸序列的人SIK3蛋白的变体,上述同一性使用例如由Tatusova&Madden 1999(FEMS Microbiol Lett 174:247-250)描述的“Blast 2序列”算法确定,并且其(优选地)保持与相应参考SIK3相同或基本相同的生物学活性(例如磷酸化一种或多种II类(例如IIa)HDAC,例如HDAC4)。SIK3蛋白的优选变体包含其序列变体,这是由于各个物种的种群之间和之中的序列多态性,以及与SIK3的野生型序列相比位于活性环或激活环中或紧邻活性环或激活环的突变(T环)SIK3。SIK3蛋白的优选变体是SIK3 T163突变,例如影响SIK3激活的突变。在优选的实施方案中,本发明的SIK3蛋白不是SIK1(同义词:SIK和SNF1LK)蛋白和/或不是SIK2(同义词:QIK、KIAA0781和SNF1LK2)蛋白。通过引用将人SIK1(UniProt:P57059;2017年3月15日的条目版本168)和人SIK2(UniProt:Q9H0K1;2017年3月15日的条目版本153)的氨基酸序列并入本文。如适用于上下文(如果没有更具体指出的话),术语SIK3可以指SIK3蛋白(例如上述的一种)或编码这种SIK3蛋白的mRNA分子。应当理解关于“SIK1”和“SIK2”的类似含义。
作为“SIK3的抑制剂”(或“SIK3抑制剂”)的化合物是抑制SIK3的任何部分,这可能意味着抑制SIK3的活性,尤其是SIK3的蛋白,特别是磷酸化的SIK3的活性。SIK3抑制剂可能会损害(例如,诱导或减少)SIK3一种或多种活性的效率、效力、数量或速率,例如本文所述的活性中的一种或多种,例如,SIK3的活性磷酸化II类(例如IIa)HDAC(例如HDAC4)和/或使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应敏感。
这种抑制SIK3的部分可以直接发挥作用,例如,通过与SIK3结合并降低SIK3的一种或多种特性(例如其功能,特别是其作为激酶的能力)的量或比率(例如磷酸化HDAC4),例如,通过降低细胞中磷酸化的SIK3的活性。
作为SIK3抑制剂的化合物在本文其他地方描述,包括可以通过本文列出的适用的功能和/或结构特征来表征的那些。
在优选的实施方案中,特别地,“对象”还意指包括所有哺乳动物,包括但不限于人类,但也包括非人类的灵长类,例如食蟹猴。它还包括狗、猫、马、绵羊、山羊、牛、兔子、猪和啮齿动物(例如小鼠和大鼠)。应当理解,根据本发明的特别优选的对象是人类对象,例如患有病况、疾病或病状(或有风险患有病况、疾病或病状的人类),例如人类患者。
如本文所用,“疗法”与治疗疾病、病症或病状同义,其包括减轻疾病、病症或病状的症状,抑制疾病、病症或病状的进展,引起疾病、病症或病状的消退和/或治愈疾病、病症或病状。
在优选的实施方案中,本发明中的“治疗”,特别是还包括例如疗法(例如疗法治疗)以及疾病(或病症或病状)的预防或抑制措施。因此,例如,在疾病发作之前成功施用本发明的化合物(或药物组合物)可导致疾病的治疗。“治疗”还涵盖在疾病出现之后给予本发明的化合物(或药物组合物)以改善或根除疾病(或其症状)。在发作后和临床症状后给予本发明的化合物(或药物组合物),可能减轻临床症状并可能改善疾病,也包括疾病的治疗。“需要治疗”的对象包括已经患有该疾病、病症或病状的对象(例如人类对象),以及易于或怀疑患有该疾病、病症或病状的对象者,包括预防其中患有该疾病、病症或病状的对象。
对细胞介导的免疫应答敏感的细胞合适地是(在对象中)与增殖性疾病有关的一种细胞(例如,与增殖性疾病有关的细胞),在某些实施方案中,这种细胞是与增殖性疾病有关的一种细胞(例如,异常增殖的细胞,例如过度增殖的细胞)。例如,这种细胞可以是特征在于失去影响其生长和细胞分裂的正常对照的细胞,例如肿瘤或肿瘤细胞。在特定的实施方案中,这样的细胞可以是癌细胞,或者是衍生自癌细胞或肿瘤细胞的细胞。在其他实施方案中,这样的细胞可以是皮肤细胞,例如显示过度增殖的细胞,例如涉及牛皮癣、雷特氏(Reiter's)综合征、毛疹糠疹或硬皮病的皮肤细胞。
例如,如果细胞与细胞增殖相关,例如它是该细胞增殖性疾病的致病因素,或者受到细胞增殖性疾病的影响,则该细胞可能“与增殖性疾病有关”。如果该细胞的特征在于诸如异常细胞生长或细胞分裂的异常增殖,并且如果该异常细胞生长或细胞分裂是该增殖性疾病的病理学或引起原因,则该细胞特别是“与增殖性疾病有关”。在其中增殖性疾病是肿瘤或癌症的实施方案中,“与增殖性疾病有关”的细胞的非限制性例子可以是肿瘤(或癌细胞)细胞或源自于这样的肿瘤或癌症的(组织)的细胞;特别是实体瘤。
在某些实施方案中,本发明的化合物可以在与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)中抑制SIK3。特别地,在这样的实施方案中,化合物可以在这样的细胞中抑制SIK3优先于在这样的细胞中抑制SIK1和/或SIK2;和/或可以在这样的细胞中抑制SIK3优先于在一种或多种类型的免疫细胞中抑制SIK1和/或SIK2和/或SIK3。例如,本发明的化合物可以在与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)中抑制SIK3,优先于抑制巨噬细胞和/或树突状细胞中的SIK1和/或SIK2和/或SIK3(特别是能够或产生IL-10的)。
本发明的化合物(或药物组合物)(或用于本发明的化合物)可以特别以有效抑制SIK3和/或有效使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应敏感的量施用至对象。用于这种施用的合适的量、制剂和方式在本文其他地方描述。
在特定的实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)(或用于本发明的化合物)以有效降低SIK3(优选在与增殖性疾病相关的细胞中的SIK3)活性的量(例如治疗有效量)施用。在这样的实施方案中,化合物(或药物组合物)的“治疗有效量”可以是能够将SIK3的活性降低至适用水平,但是就化合物(或药物组合物)的其他活性而言,其不会导致明显的(例如,不能忍受的)副作用或过量。
优选地,SIK3的活性被有效地抑制(降低),优选是指与增殖性疾病有关的细胞中的SIK3激酶。例如,“有效”抑制(或降低)可包括其中活性降低具有生理作用(例如降低至治疗有效水平)的程度(或水平)的行为,例如降低各个激酶活性的约10%、20%、50%或大于50%,例如70%或90%。关于SIK3,可能需要这样的减少之一以引起治疗反应。
术语“免疫细胞”是本领域公认的描述与该生物体的免疫系统有关的生物体的任何细胞,特别是哺乳动物如人的细胞。白细胞(白色血液细胞)是先天免疫系统中涉及的免疫细胞,而适应性免疫系统的细胞是特殊类型的白细胞,称为淋巴细胞。B细胞和T细胞是淋巴细胞的主要类型,它们来源于骨髓中的造血干细胞。B细胞参与体液免疫反应,而T细胞参与细胞介导的免疫反应。在本发明的优选实施方案中,免疫细胞可以是髓样细胞,例如T细胞,并且特别地(例如当需要增加细胞介导的免疫应答例如治疗癌症时),T细胞可以是细胞毒性T细胞(也称为TC、细胞毒性T淋巴细胞、CTL、T杀伤细胞、溶细胞性T细胞、CD8+T细胞或杀伤性T细胞)。CTL是一种T细胞,参与杀死癌细胞,被感染的细胞(尤其是被病毒感染)或以其他方式损坏的细胞。用于此类实施方案的其他优选的免疫细胞可包括肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)。TIL是已经离开血液并迁移到肿瘤中的白细胞。通常,TIL是可变比例的不同类型细胞(例如,T细胞、B细胞、NK细胞、巨噬细胞)的混合物,T细胞是最丰富的细胞。TIL通常可以在基质和肿瘤本身中发现,并与杀死肿瘤细胞有关。肿瘤中淋巴细胞的存在通常与更好的临床结果相关。
如本文所用,术语“细胞介导的免疫应答”可包括但不限于宿主生物中的反应,其涉及、利用和/或促进T细胞的成熟、增殖、活化、迁移、浸润和/或分化,和/或巨噬细胞、天然杀伤细胞、T淋巴细胞(或T细胞)、辅助性T淋巴细胞、记忆性T淋巴细胞、抑制性T淋巴细胞、调节性T淋巴细胞和/或细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的激活、迁移、浸润和/或分化,和/或一种或多种细胞可分泌或细胞分泌因子(例如细胞因子或自体抗体(特别是促炎性细胞因子,例如TNF)的产生、释放和/或作用,和/或任何此类过程的一种或多种组分(例如,细胞因子或自体抗体,特别是促炎性细胞因子,例如TNF)。如本文所用,术语“细胞介导的免疫应答”可以包括涉及基因工程改造、体外培养、自体、异源、修饰和/或转移的T淋巴细胞的细胞应答,或者可以包括可细胞分泌的或通过基因工程产生的细胞分泌因子(例如细胞因子或自体抗体,特别是促炎性细胞因子,例如TNF)。细胞介导的免疫应答优选不是体液免疫应答,例如涉及抗体释放的免疫应答。在某些实施方案中,特别是当增殖性疾病是癌症或肿瘤时,细胞介导的免疫应答是抗肿瘤细胞介导的免疫应答。例如,导致肿瘤(细胞)生长减少的,例如杀死癌细胞或肿瘤的细胞毒性细胞介导的免疫反应(例如细胞毒性T细胞和/或TNF暴露)。
在某些实施方案中,细胞介导的免疫应答可以由能够分泌(例如分泌)促炎性细胞因子的细胞(例如免疫细胞)介导,例如选自:白介素-1(IL-1)、IL-8和IL-12,肿瘤坏死因子(TNF)、干扰素γ(IFN-γ)和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子。特别地,在这样的实施方案中,促炎细胞因子是肿瘤坏死因子(TNF)α。
在其他实施方案中,细胞介导的免疫反应可以是细胞可分泌的或细胞分泌的因子(例如细胞因子或自体抗体),尤其是免疫细胞可分泌或分泌的一种因子。特别地,在此类实施方案中,细胞介导的免疫反应是促炎细胞因子,特别是肿瘤坏死因子(TNF)。
如本文在用于细胞对细胞介导的免疫反应敏感的上下文中所使用的,术语“对……敏感”、“致敏”和“敏感化/敏化”(等等)将被本领域技术人员理解,并且包括这样的含义,即这种细胞对细胞介导的免疫应答可能对这种细胞表现出的一种或多种作用(例如治疗作用)表现出更高的敏感性。特别地,当存在(例如暴露于)细胞介导的免疫反应时,与尚未如此“敏化”的类似细胞相比,如此敏化的细胞可以被更容易地杀死(例如,更快地、更大比例的细胞死亡或被杀死和/或细胞介导的免疫应答的数量或暴露更低)。例如,当暴露于较少数量的T细胞或较低浓度的TNF(例如约10%、20%、30%、40%、50%或多于50%更少的T细胞或更低浓度的TNF)时,如此敏化的细胞可被诱导进入细胞死亡(例如凋亡)。本文例如在实施例中描述了确定此类细胞是否已经对细胞介导的免疫反应敏感(以及程度如何)的方法。因此,在本发明的某些实施方案中,可以通过细胞介导的免疫应答(例如CTL或促炎性细胞因子,例如TNF)使与增殖性疾病有关的细胞对细胞死亡/杀伤(例如通过进入凋亡)敏感。
在本文公开的发明的上下文中,术语“肿瘤坏死因子”和“TNF”(以前并因此可替代地称为肿瘤坏死因子α和TNF-α)应当理解为是指在本领域中以这些名称已知的任何蛋白质。特别地,术语TNF涵盖存在该生物的任何生物的内源性TNF,并且优选地包括动物或哺乳动物,例如人的内源性TNF。通过举例而非限制的方式,人TNF可以涵盖特别是Pennica etal.1984(Nature 312:724-9)以及UniProtKB/Swiss-Prot数据库中的条目号P01375(例如,2017年3月15日的条目版本224)以及由由于人群之间和人群中的正常序列多态性的任何序列变体的内源性蛋白质。借助其他非限制性实例,该术语可涵盖UniProtKB/Swiss-Prot数据库中注释的牛(Q06599)、狗(P51742)、山羊(P13296)、豚鼠(P51435)、猫(P19101)、马(P29553)、小鼠(P06804)、黑猩猩(Q8HZD9)、猪(P23563)、兔(P04924)、大鼠(P16599)等以及由于各个物种种群之间和之内的序列多态性的其任何序列变体的内源性TNF蛋白。此外,术语TNF特别地包括TNF的可溶性、分泌的细胞因子形式,包括其单体形式以及优选地其通常更具活性的三聚体形式(参见,例如Smith&Baglioni 1987.J Biol Chem 262:6951-4)。内源性TNF的可溶形式的一级氨基酸序列在上述UniProtKB/Swiss-Prot数据库条目中针对各个示例性生物指示。另外,术语TNF还可以包括在某些细胞类型的表面上表达的TNF的膜结合形式(参见,例如Kriegler et al.1988.Cell 53:45-53)。此外,术语TNF还可以包括这样的合成或重组蛋白,其一级氨基酸序列与内源性TNF的序列相同或基本相同(“基本相同”,如贯穿本说明书所使用的,通常指≥80%,例如≥85%,优选≥90优选≥95%,甚至更优选≥98%或≥99%序列同一性),如使用例如Tatusova&Madden 1999(FEMS Microbiol Lett174:247-250)描述的“Blast 2序列”算法确定的,其(优选)保留与各自内源性TNF相同或基本相同的生物活性,如使用例如Flick&Gifford 1984(J Immunol Methods 68:167-75)所述的细胞毒性试验确定的。如从本发明的方面和实施方案的上下文中将清楚的,术语TNF在本文中可以特别地指由细胞、组织、器官或生物产生的可溶和/或膜结合的(优选可溶的)内源性TNF,优选人类。然而,术语“TNF”也预见了肿瘤坏死因子的外源形式,特别是通过重组技术产生的那些,并且在某些实施方案中,可以在本发明的各个方面和实施方案中施用于对象,或使其暴露于细胞或与细胞接触。在某些这样的实施方案中,所述TNF可以是用作治疗剂的重组TNF,例如他森敏(BEROMUN)。
在某些实施方案中,细胞介导的免疫反应可以由促炎性细胞因子分泌细胞(例如淋巴细胞(例如T细胞),特别是细胞毒性T淋巴细胞(CTL))介导。
在特定的实施方案中,细胞介导的免疫应答可以诱导与增殖性疾病有关的细胞的杀伤(例如细胞死亡,例如通过凋亡)。例如,治疗(方法)可以包括(例如可以涉及)细胞介导的免疫应答(或由其介导)诱导与增殖性疾病有关的细胞的这种杀伤。
与增殖性疾病有关的细胞可以通过一种或多种细胞毒性过程被杀死(例如,诱导进入细胞死亡),特别是这种细胞内源性的那些,例如程序性细胞死亡(PCD)。细胞死亡过程可包括但不限于坏死(特别是坏死病)、细胞凋亡、神经衰弱、自噬、肥大症、有丝分裂灾难和激活诱导的细胞死亡。在某些优选的实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)通过细胞介导的免疫应答(例如通过TNF)被诱导为凋亡。在另一个实施方案中,在不存在细胞介导的免疫应答(例如,不存在TNF)的情况下,施用本发明的化合物(或药物组合物)以不杀死此类细胞。特别地,在这样的其他实施方案中,化合物(或药物组合物)可以在不存在细胞介导的免疫应答的情况下不有效杀死此类细胞的量(例如,剂量)施用。本文的实施例描述了各种测定法,通过这些测定法,可以确定本发明的化合物(或药物组合物)的量,该量仅或优选在细胞介导的免疫应答的存在下有效地杀死此类细胞。
在其他特定的实施方案中,细胞介导的免疫应答可涉及至少一种免疫细胞效应分子,特别是免疫细胞可分泌或分泌的效应分子。特别地,在这样的实施方案中,效应分子可以是促炎细胞因子,优选是肿瘤坏死因子(TNF)。
在某些实施方案中,效应分子不是选自Fas配体(FasL或CD95L)和TNF相关凋亡诱导配体(TRAIL、CD253或TNFSF10)的细胞效应分子。
在本发明的特定实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)可以施用于对象(例如以有效量或剂量),其意图(或从而)(有效地)使与增殖性疾病有关的细胞对TNF引起的杀伤敏感。例如,化合物(或药物组合物)可以治疗有效量施用,例如有效使与增殖性疾病有关的细胞对由TNF诱导的杀伤(细胞死亡)敏感的量。
例如,可以将本发明的化合物(或药物组合物)施用于对象(例如以有效量或有效剂量)以诱导由TNF介导的此类细胞的凋亡,例如当此类细胞存在或接触TNF时。在进一步的实施方案中,可以将本发明的化合物(或药物组合物)施用于对象(例如以有效量或剂量)以诱导减少量的细胞毒性(例如凋亡)——例如诱导这样的细胞的杀伤(例如凋亡)——在没有TNF的情况下;例如,化合物(或药物组合物)可以在没有TNF的情况下以对细胞毒性(例如细胞凋亡)那么有效(例如对诱导这种杀伤效)的量或剂量施用。
TNF可以通过与肿瘤坏死因子受体1(TNFR1)和/或肿瘤坏死因子受体2(TNFR2)结合和/或通过信号传导来诱导促凋亡过程。因此,在某些实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)可以(例如有效的量或剂量)施用于对象以(有效地)使与增殖性疾病有关的细胞对由肿瘤坏死因子受体1(TNFR1)信号和/或肿瘤坏死因子受体2(TNFR2)信号介导的细胞凋亡敏感。优选地,可以将化合物(或药物组合物)施用于对象(例如以有效的量或剂量)以(有效地)使与增殖性疾病有关的细胞对由此介导的细胞凋亡特别是由TNFR1介导的细胞凋亡敏感。例如,可以以有效介导TNFR1-和/或TNFR2-信号转导和/或由此介导的细胞凋亡的治疗有效量来施用化合物(或药物组合物)。
例如,在某些实施方案中,可以施用本发明的化合物(或药物组合物)(例如以有效的量或剂量)以通过TNFR1和/或TNFR2信号传导(例如在活性TNFR1信号传导时)诱导此类细胞的凋亡。特别地,在这样的实施方案中,可以将化合物(或药物组合物)施用至对象(例如以一定量或剂量,例如治疗有效量)以(有效)诱导减少量的细胞毒性(例如细胞凋亡)——例如不诱导此类细胞的凋亡——在不存在TNFR1和/或TNFR2信号传导的情况下,例如在不存在活性TNFR1信号传导的情况下。例如,化合物(或药物组合物)可以以对细胞毒性(例如细胞凋亡)不那么有效的量或剂量给药——例如不能有效地诱导这种细胞凋亡——在没有这种信号传导的情况下。
因此,在某些实施方案中,可以将本发明的化合物(或药物组合物)施用于对象(例如以一定量或剂量)以在没有细胞介导的免疫反应的情况下,对与增殖性疾病有关的细胞诱导减少量的细胞毒性(例如细胞凋亡),例如不具有细胞毒性。
在特定的实施方案中,即使在治疗过程中对象的肿瘤增大,本发明的化合物(或药物组合物)也可以继续给予对象。不受理论的束缚,即使在这样的治疗过程中观察到肿瘤大小增加,也可能表明针对肿瘤细胞的(增强的)免疫反应(例如,细胞已变得对细胞介导的免疫反应敏感;和由于这种免疫应答,肿瘤的大小在增加),因此,在这样的实施方案中,化合物(或药物组合物)的施用可以继续施用,以维持这种敏感性和相关的(增强的)免疫反应。
如PCT/EP2018/060172中所述,SIK3的抑制与许多关键的生物学过程或表型相关,包括令人惊奇地参与控制和/或触发细胞固有的细胞毒性过程,例如细胞凋亡。例如,通过抑制SIK3,肿瘤细胞可以对TNF的凋亡/细胞毒性作用敏感,通过途径及其成分其作用,包括肝激酶B1(LKB1、STK11或NY-REN-19)、组蛋白脱乙酰基酶4(HDAC4)、激活的B细胞核因子κ轻链增强子(NF-kappaB)和受NF-kappaB调节的促凋亡基因,例如Caspase 8和Caspase9。c-JunN末端激酶(JNK)是通过抑制SIK3与TNF的凋亡/细胞毒作用致敏相关的信号传导成分。
在本实施例(和其他适用的实施例)的上下文中,术语“与……相关”可以表示两个组件、变量、效果或表型相互关联,和/或彼此相关(例如关联),和/或第一和第二成分、变量、效果或表型之间存在因果关系(例如第二个是对第一个的响应,第二个是第一个的结果,或第二个是由第一个引起的)。
因此,在一个这样的实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)的施用可以与在与增殖性疾病有关的细胞中NF-κB活性的损害相关(例如,通过增强或增加NF-κB从细胞核外转运)。
特别是在此类实施方案中,此类NF-κB活性受损(例如,由于NF-κB增强或从细胞核外转运)可能与这些细胞中(激活的)TNF-和/或TNFR1介导的信号传导(或TNFR2介导的信号传导)相关。
在某些实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)可以(例如以有效的量或剂量)施用于对象以损害或抑制与增殖性疾病有关的细胞中的NF-κB活性,用于例如增强或增加NF-κB从此类细胞核外转运的例子。例如,化合物(或药物组合物)可以以特定的(例如治疗有效)量给予对象,该量有效(高效)削弱与增殖性疾病有关的细胞中NF-κB活性,特别是有效(高效)增强或增加NF-κB从与增殖性疾病有关的细胞核外转运。
在替代或进一步的实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)的施用可以与增加与增殖性疾病有关的细胞中的II类(例如IIa)HDAC(例如HDAC4)的活性有关(例如,以有效的量或剂量施用化合物(或药物组合物),从而增加),例如其在此类细胞核中的移位或定位或在其细胞核中的活性;尤其是在此类细胞中由TNF和/或TNFR1介导的信号传导(或TNFR2介导的信号传导)时。
在其他替代或进一步的实施方案中,本发明化合物(或药物组合物)的施用可以与核NF-κB的去酰化(例如在其p65亚基上的去酰化)和/或一种或多种抗凋亡因子的反式激活减少有关,特别是在与增殖性疾病有关的细胞中由TNF-和/或TNFR1介导的信号传导(或TNFR2介导的信号传导)时。例如,可以施用化合物(或药物组合物)(例如以有效的量或剂量)以引起核NF-κB(例如在其p65亚基处)的去酰化和/或减少一种或多种抗凋亡因子的反式激活。
在另一个替代或进一步的实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)的施用可以与Caspase 8和/或Caspase 9在与增殖性疾病有关的细胞中的裂解的增加有关(例如以有效的量或剂量施用该化合物(或药物组合物),从而增加),特别是在此类细胞中由TNF-和/或TNFR1介导(或TNFR2介导的信号转导)时。
在其他替代或进一步的实施方案中,本发明化合物(或药物组合物)的施用可以与一种或多种抗凋亡因子的转录降低有关,特别是在与增殖性疾病有关的细胞中TNF-和/或TNFR1介导的信号传导(或TNFR2介导的信号传导)时,例如减少此类细胞中一种或多种NF-κB靶基因的转录。特别地,可以施用化合物(或药物组合物)(例如以有效剂量的剂量)以减少一种或多种这样的抗凋亡因子的转录,特别是在与增殖性疾病有关的细胞中TNF-和/或TNFR1介导的信号传导(或TNFR2介导的信号传导)时。
在一个实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)的施用可以与增加与增殖性疾病有关的细胞中的JNK活化(例如通过磷酸化)有关(例如,以有效的量或剂量施用化合物(或药物组合物),从而增加),特别是在此类细胞中的TNF-和/或TNFR1介导的信号传导(或TNFR2介导的信号传导)时。
在另一个实施方案中,本发明化合物(或药物组合物)的施用可能与CREB途径信号的显著变化和/或CREB和/或CREB调节介导的基因表达的显著变化不相关。
在一个特定的实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞中TNF-(TNFR2-)和/或TNFR1介导的信号传导可能与此类细胞中pLKB1水平的增加有关。
如对本领域普通技术人员来说,根据本发明的知识现在将显而易见的是,本发明的治疗方面可以进一步包括施用一个或多个其他部分的步骤,所述其他部分适当地修饰了上述一个或多个这些其他途径成分中的表达、活性、功能或稳定性,以累加或协同地有助于治疗效果。例如,在一个这样的实施方案中,本发明的治疗方面可以进一步包括施用LKB1抑制剂的步骤。在另一个这样的实施方案中,本发明的治疗方面可以进一步包括以下步骤:施用促进、增强或增加与增殖性疾病有关的细胞核中一种或多种II类(例如IIa)HDAC(组蛋白脱乙酰基酶),例如HDAC4。在此类实施方案的又一个中,本发明的治疗方面可以进一步包括施用NF-κB抑制剂(激活)的步骤。本发明还预想了可以将两种或更多种其他这样的部分的组合与本发明的化合物(或药物组合物)一起使用和/或与化合物(或药物组合物)一起使用其他(例如抗癌)治疗活性剂(例如另外的治疗剂,如本文别处所述的治疗剂)。
在另一方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫应答敏感的方法,该方法包括将与增殖性疾病有关的细胞暴露(例如接触)至本发明的化合物(或药物组合物)。通常可以将这种方法实践为体外和/或离体方法。
在一个特定的实施方案中,细胞介导的免疫应答包括杀死与增殖性疾病有关的细胞,例如其中所述杀死涉及TNF(TNF)、TNFR2-和/或TNFR1-介导的信号传导(例如由其介导,或被其支持)。例如,杀死此类细胞可能涉及由TNF、TNFR2和/或TNFR1介导的信号传导诱导的此类细胞的凋亡。在本发明各个方面的该实施方案和其他适用实施方案中,TNFR2和/或TNFR1介导的信号传导可通过任何合适的触发分子(例如TNF,TNF的变体和/或TNFR2、TNFR1激动剂)触发(例如激活);特别是通过将与增殖性疾病相关的细胞暴露(例如接触)到触发分子(例如TNF、TNF变体或TNFR1激动剂)。这样的暴露可以导致触发分子(例如TNF、TNF变体或TNFR1激动剂)与TNFR2和/或TNFR1结合,尤其是TNFR1信号的触发(例如激活)。
在另一方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种杀死与增殖性疾病有关的细胞的方法,该方法包括使与增殖性疾病有关的细胞暴露于(例如接触):(i)TNF、TNF变体和/或TNFR1或TNFR2信号转导的激动剂(优选TNFR1信号转导);使与增殖性疾病有关的细胞暴露于(例如接触)(ii)本发明的化合物(或药物组合物)。如本领域技术人员或普通技术人员将理解的那样,通常可以将这种方法实践为体外和/或离体方法。
在相关方面,本发明涉及本发明的化合物(或药物组合物),其用于治疗涉及杀死与所述增殖性疾病有关的细胞的增殖性疾病,所述治疗包括将所述细胞暴露于:(i)TNF、TNF变体和/或TNFR1或TNFR2激动剂;以及(ii)本发明的化合物(或药物组合物)。
在这些方面的特定实施方案中,通过使这种细胞对细胞介导的免疫反应敏感,特别是通过诱导对涉及(例如,由其介导或由其支持)TNF、TNFR2和/或TNFR1介导的信号传导的细胞凋亡的敏感性来介导与增殖性疾病有关的细胞的杀伤。
与增殖性疾病有关的细胞可通过使该细胞与该触发分子接触而暴露于TNF、TNF变体和/或TNFR1或TNFR2激动剂;和/或通过使这种细胞与本发明的化合物(或药物组合物)接触(或引入),可以使这些细胞暴露于本发明的化合物(或药物组合物)。(i)TNF、TNF变体和/或TNFR1或TNFR2激动剂;和/或(ii)本发明的化合物(或药物组合物)的量(或剂量)通常是有效量;这是在例如使细胞对由TNF、TNFR2和/或TNFR1介导的信号传导诱导的细胞凋亡敏感(例如通过杀死细胞)有效的量(或剂量)。在其他地方公开了可以掺入本发明的这些方面的合适量的这些活性剂(或确定它们的方法),本发明化合物(或药物组合物)的其他特定特征也一样。因此,在某些实施方案中:(i)TNF、TNF变体和/或TNFR1或TNFR2激动剂;和(ii)本发明的化合物(或药物组合物)可以施用于患有增殖性疾病的对象(例如,治疗可以包括施用:(i)TNF、TNF变体和/或TNFR1或TNFR2激动剂;和(ii)本发明的化合物(或药物组合物)可以施用于对象)。
与增殖性疾病有关的细胞可以是如本文其他地方所述的细胞,并且特别地,这种细胞可以是癌细胞或肿瘤细胞。例如,这样的细胞可以是实体瘤或源自实体瘤的细胞。
在这些方面的某些实施方案中,该方法是体外(和/或离体)方法。在此类方法的替代实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)存在于此类对象中,特别是在需要对其进行治疗的对象中。
在这些方面的方法的其他实施方案中,该方法的(例如,对与增殖性疾病有关的细胞)的(治疗)作用可以由(例如,治疗可以包括、涉及或由其介导)抑制SIK3;特别地,通过抑制SIK3蛋白质(例如,磷酸化的SIK3蛋白质和/或如本文其他地方所述的)的功能和/或活性介导。特别地,在这样的实施方案中,SIK3活性被降低(例如有效),例如降低到治疗有效水平。
在此类方法的某些实施方案中,在不存在(例如有效量或剂量)本发明的化合物(或药物组合物)的情况下,与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)不会在TNF、TNFR2和/或TNFR1介导的信号传导和/或暴露于(例如有效量或剂量的)TNF、TNF变体、TNFR2或TNFR1激动剂时被杀死或诱导进入凋亡(例如,它们增殖)。
如上所述,在这些方法的某些实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)可以抑制与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)中的SIK3。特别地,在此类实施方案中,化合物(或药物组合物)可优先于抑制此类细胞中的SIK1和/或SIK2而抑制这种细胞中的SIK3;和/或可以优先于抑制一种或多种类型的免疫细胞中的SIK1和/或SIK2和/或SIK3而抑制这种细胞中的SIK3。例如,本发明的化合物(或药物组合物)可以在与增殖性疾病有关的细胞(例如,肿瘤细胞)中抑制SIK3,优先于抑制巨噬细胞和/或树突状细胞(特别是能够或产生IL-10的)中的SIK1和/或SIK2和/或SIK3。在特定的实施方案中,(治疗)作用是由(例如,该治疗包括、涉及、由其介导)抑制与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)中的SIK3介导的;并且在这样的实施方案的进一步中,(治疗)作用不是由(或该效果不是由其介导)(例如,该治疗不包括、不涉及或不由其介导)抑制SIK2、特别是在其他细胞(例如,与增殖性疾病或免疫细胞有关的细胞)中/的SIK2介导的,和/或(治疗)作用不是由(或该效果不是由其介导)抑制SIK1(例如,该治疗不包括、不涉及或不由抑制SIK1介导)、特别是在其他细胞(例如,与增殖性疾病或免疫细胞有关的细胞)中/的SIK1介导的。
因此,在一个实施方案中,(例如,通过本发明的化合物或药物组合物)抑制了与增殖性疾病有关的细胞(例如,在其内)的SIK3。在另一个(或进一步的)实施方案中,(例如,在其内)免疫细胞(例如CTL)中的另一种激酶(例如SIK2,特别是SIK2)被抑制的程度小于SIK3(例如在涉及增殖性疾病的细胞中)的抑制程度。在又一个(或进一步的)实施方案中,SIK1,特别是(例如在其内)免疫细胞(例如CTL)中的SIK1被抑制的程度小于这种SIK3的。
在某些此类实施方案中,选自以下的激酶中的一种或多种:SIK3、SIK1、SIK2、JAK1、RET、ERBB4 PDGFR-α和EPHB2被抑制(例如,被本发明的化合物或药物抑制)的程度小于选自以下的激酶中的一种或多种:ABL1、SRC、BCR-ABL、LCK、LYN、YES、FYN、KIT和FLT3。
在某些这样的实施方案中,选自以下的激酶中的一种或多种:PDGFR-α、TGFB-R1、B-RA、p38-β、ACV-R1、BMPR1A和RET被抑制(例如,被本发明的化合物或药物抑制)的程度小于以下的激酶的一种或多种:EPHA2、EPHA4、CSF1-R、HCK和ACK1。
在某些这样的实施方案中,选自以下的激酶中的一种或多种:NEK11、WEE1、WNK2、Aurora-A、Aurora-B和TBK1被抑制(例如,被本发明的化合物或药物抑制)的程度小于以下的激酶的一种或多种:ABL1、SRC、BCR-ABL、LCK、LYN、YES、FYN和KIT。
如果例如另一种激酶(例如SIK3)的抑制量大于给定激酶的约2倍,例如抑制量比给定的激酶多约5、10、20、50、75或100倍,则给定的激酶(例如SIK1或SIK2)与另一种激酶(例如SIK3)相比的抑制“程度更少”。特别地,其他激酶(例如SIK3)的抑制量可以比给定激酶多约5至20倍、20至50或50至100倍。例如,相对于SIK1和/或SIK2(即给定的激酶),SIK3(即另一种激酶)可被抑制约20至50倍。举例来说,本发明的化合物(或药物组合物)可以将另一种激酶(例如,SIK3)抑制80%(即,仅具有其未抑制活性的20%),但是抑制给定的激酶(例如,SIK1)仅4%,SIK2仅8%。因此,另一种激酶(例如SIK3)的抑制比给定激酶(例如SIK1)多约20倍,比另一种给定激酶(例如SIK2)多约10倍。在特定实施方案中,另一种激酶(例如SIK3)可以被抑制至与例如SIK1相同的程度(例如彼此之间约2至53倍之间),并且例如SIK2被抑制的程度小于例如SIK3和SIK1的其中任一个(或两者):例如,在这种实施方案中,例如SIK3和SIK1的抑制比中SIK2(例如在免疫细胞中的)的抑制多约20至50倍。
本发明的化合物(特别是式(Ia)的那些)和/或本发明中使用的化合物(特别是式(Ib)或(Ic)的那些)显示为一种或多种激酶的有效抑制剂(如“实施例”所示,特别是图16、图17和图3所示)。特别地,图16、图17和图3中的激酶中的任何一种(或它们的任何组合)具有约50%至约25%的残余活性,或小于约25%的残余活性(特别是,具有小于10%的残余活性的激酶),被认为是被本发明的各个化合物抑制的“关键激酶”。其中也考虑了此类激酶的突变体。作为特定实例,关键激酶包括选自以下的一种或多种激酶:SIK1、SIK2、SIK3、ABL1/BCR-ABL、SRC、FLT3、KIT、YES、LYN、FYN和LCK;和/或EPHA2、EPHA4、CSF1-R、HCK、ACK1;和/或PDGFR-α、TGFB-R1、B-RAF和/或p38-β;和/或ACV-R1和/或BMPR1A;和/或RET;和/或NEK11、WEE1和/或WNK2;和/或Aurora-A和/或Aurora-B;和/或TBK1;特别是SIK3、ABL1/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和CSF1R,例如SIK3、SRC、HCK和CSF1R。
本发明人发现,尽管与达沙替尼(A8)和化合物B3(WO2018/193084A1)相比存在显著的结构差异,但本发明的化合物是多种疾病相关激酶的有效抑制剂,例如选自以下中的一种:SIK3、ABL/BCR-ABL SRC、HCK、PDGFR、KIT和CSF1R。因此,在一个实施方案中,本发明的化合物(或用于其方法的)是激酶SIK3、ABL/BCR-ABL、SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或CSF1R中的一种或多种的抑制剂。在一个特定的实施方案中,这种化合物可以是SIK3激酶的抑制剂。在另一个(或替代)特定实施方案中,此类化合物可以是CSF1R激酶的抑制剂,和/或例如是能够消耗(例如会消耗)MC38同基因小鼠肿瘤模型(例如类似于本文实施例8中所述的模型)中的M2样肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的化合物。在另一个进一步(或替代)的特定实施方案中,此类化合物可以是HCK激酶的抑制剂,和/或例如是能够抑制TAM(例如与本文实施例8中描述的模型类似的MC38同基因小鼠肿瘤模型中的TAM)内足体形成的化合物。
发明人发现,与其他激酶抑制剂相比,本文公开的化合物抑制不同组的激酶和/或在不同程度上抑制每一种激酶。例如,化合物B3和A8是ABL1和SRC(以及ABL1突变体)的等效抑制剂。然而,如“实施例”中所示,它们在不同程度上抑制SIK1、SIK2、SIK3,尤其是FLT3、KIT和SYK。
在实施例中还显示,与达沙替尼相比,本发明的化合物对ABL1和(特别是)对SRC激酶具有更高的选择性,并且该选择性也适用于蛋白质-酪氨酸激酶类别。
特别地,并且如实施例中所示,本发明的化合物似乎比化合物C7更弱地抑制MAP3K11,并且比化合物C7更强烈地抑制NEK11。
抑制不同激酶和/或不同程度抑制激酶的化合物在体内具有不同的性质,可用于不同的医学适应症或相同的医学适应症,但在功效和副作用方面表现出不同的性质。可以理解,对激酶具有不同特异性的化合物可以具有令人惊讶的不同性质和应用。
因此,在一个实施方案中,该治疗包括(例如,涉及、通过或由其介导)抑制一种或多种关键激酶(例如,ABL1/BCR-ABL和/或SRC激酶和/或HCK和/或PDGFR和/或KIT和/或CSF1R)。特别地,在这样的实施方案中,所述治疗包括对所述关键激酶的抑制(例如,涉及、通过或由其介导)大于其他键激酶中的一种或多种(例如SIK3和/或SIK1和/或SIK2)的抑制(例如,涉及、通过或由其介导)。例如,治疗可涉及抑制SIK3、r SRC、HCK、PDGFR、KIT和/或CSF1R激酶,和/或一种或多种选自以下的激酶:BCR-ABL、LCK、LYN、YES、FYN和KIT。
在一个特定的(替代的或另外的)实施方案中,该治疗不包括(例如,不涉及、不是或不由其介导)一种或多种关键激酶的抑制。特别地,在这样的实施方案中,所述治疗不包括(例如,不涉及、不是或不由其介导)对SIK3的抑制,和/或治疗不包括(例如,不涉及、不是或不由其介导)抑制SIK1和/或SIK2。
在进一步的实施方案中,所述治疗可以不包含(例如,可以不涉及、不是或不由其介导)抑制以下一种或多种激酶:JAK1、RET、ERBB4、PDGFR-α或EPHB2、或MAP3K11。
在另一个特定的(替代的或另外的)实施方案中,所述治疗不包括(例如,不涉及、不是或不由其介导)SYK的抑制。例如,化合物B3抑制SYK的IC50超过25uM,而化合物A8抑制SYK的IC50小于5uM。
在又一个特定的(替代的或另外的)实施方案中,所述治疗包括(例如,涉及、是或由其介导)KIT抑制。例如,化合物B3抑制KIT的IC50小于50nM,化合物A8对KIT的IC50也小于50nM。
在另一个特定的(替代的或另外的)实施方案中,所述治疗包括(例如,涉及、是或由其介导)抑制FLT3。例如,化合物B3抑制FLT3的IC50小于10uM,而化合物A8对FLT3的IC50大于25uM。
在又一个特定的(替代的或另外的)实施方案中,所述治疗包括(例如,涉及、是或由其介导)NEK11抑制。例如,式(Ia)化合物似乎比化合物C7更强烈地抑制NEK11。
的确,在某些特定的(替代的或另外的)实施方案中,所述治疗包括(例如,涉及、是由或由其介导)抑制KIT和FLT3;例如,通过向对象施用化合物B3,并且例如,该治疗包括(例如,涉及、是由或由其介导)抑制ABL1、SRC和/或SIK3。
在另一个实施方案中,所述治疗包括(例如,涉及、是由或由其介导)ABL1或KIT激酶的突变体的抑制;例如,对BCR-ABL的抑制,或对ABL1的另一种突变,例如选自以下中的一种:G250E、Q252H、Y253F、E255K、F317I、M351T和H396P。
如本文其他地方所述,在一个(替代或另外的)实施方案中,本发明的化合物使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应(例如TNF)敏感(例如,该治疗包括、涉及、或由其敏化介导)。然而,在替代的(替代的或另外的)实施方案中,化合物不使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应(例如TNF)敏感(例如,该治疗不包括、不涉及、或不由其敏化介导)。
与其他使用激酶(例如SIK)抑制剂的研究相反,在某些实施方案中,用根据本发明的本发明的化合物(或药物组合物)进行的治疗可能与一种或多种抗炎细胞因子的产生(例如抗炎细胞因子可以选自IL-1ra、IL-4、IL-10、IL-11、IL-13和TGF-β)的(有效)增加不相关,尤其可能与IL-10产生的(有效)增加不相关。相应地,在其他或进一步的实施方案中,用根据本发明的本发明的化合物(或药物组合物)进行的治疗可能与一种或多种促炎细胞因子的产生的(有效)减少不相关。例如,选自以下的一种:IL-1-β、IL-6、IL-12和TNF、IFN-γ和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子,并且在特定的实施方案中可能与TNF的产生的(有效)减少不相关。因此,在某些实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)可以以下量施用于对象:(i)对(有效)增加一种或多种(例如此类)抗炎细胞因子的产生无效的(治疗有效)量;和/或(ii)不能有效(有效)减少一种或多种(例如此类)促炎细胞因子的产生的(治疗有效)量。
在某些实施方案中,在本发明的各个方面中,预期与增殖性疾病有关的某些细胞(例如肿瘤细胞)可以对本发明的化合物(或药物组合物)的敏化作用更敏感。例如,这样的细胞可以是表现出(例如经受)TNFR2和/或TNFR1信号传导的激活,特别是活化的TNFR1的细胞。在某些实施方案中,此类细胞是表达TNFR2和/或TNFR1的细胞,特别是表达TNFR1的肿瘤细胞。因此,在某些实施方案中,此类细胞通过活化的TNFR1和/或TNFR2信号传导来区分或表征(或通过如此区分或表征具有与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)的方式来区分或表征对象)。本领域普通技术人员将知道用于确定此类细胞(例如对象的细胞)中TNFR1和/或TNFR2活化状态的技术。例如,通过检测或监测TNFR1和/或TNFR2信号通路中的一种或多种下游蛋白。这样的蛋白质在本文其他地方描述,并且包括NF-κB和/或HDAC4。
在一个相关方面,本发明涉及一种用于治疗对象的增殖性疾病(例如肿瘤)的方法,该(治疗)方法包括将本发明的化合物(或药物组合物)施用于所述对象,通过抑制激酶/关键激酶(例如SIK3),其中与增殖性疾病有关的细胞的特征在于(例如,表现出或经受)活化的TNFR2和/或TNFR1信号传导(例如,活化的TNFR1信号传导)。在另一个相关的方面,本发明涉及用于治疗增殖性疾病的本发明的化合物(或药物组合物),其中与该增殖性疾病有关的细胞的特征在于(例如表现出或经受)活化的TNFR2和/或TNFR1信号传导(例如激活的TNFR1信号传导)。
在本发明各个方面的某些实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞是暴露于合适的触发或活化分子(例如TNF、TNF的变体和/或TNFR2-或TNFR1-信号激动剂(优选TNFR1信号传导激动剂)的细胞,特别是暴露于有效量的这种触发或活化分子中。
在特定的实施方案中,当触发或激活分子是TNF时,它是人TNF。在某些这样的实施方案中,TNF是重组人TNF(rHuTNF)。然而,在其他实施方案中,TNF是内源性TNF,例如由对象(例如人类患者)产生或以其他方式存在于对象中。
研究表明,多种类型的癌症(包括卵巢癌)中的血浆TNF水平升高(Dobrzycka etal 2009,Eur Cytokine Netw20:131),例如,如使用Quantikine人类TNF-α免疫测定PDTA00C测得的,健康人群中总TNF的正常上限对象为1.8pg/mL。在其他癌症和检测方法中(例如TNF-alpha-EASIA Kit,DIAsource),食道癌患者和对照组的TNF血浆水平分别为12.35±9.69和4.62±3.06pg/mL(Aydin et al 2012,Turk J Med Sci 42:762)。因此,在其他实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞是(例如肿瘤是)对象中的细胞,该对象的TN F血浆浓度大于约1.5、2.5或4pg/mL,例如大于约5pg/mL,特别是大于约10pg/mL(例如,通过Quantikine人TNF-α免疫测定PDTA00C或TNF-α-ELISA试剂盒,DIAsource测量)。
因此,在一个特定的实施方案中,本发明的治疗方法中涉及的对象可以具有(即,该对象可以通过例如适合于本发明的治疗方法的对象来区分,例如通过显示、拥有或展示)大于约2pg/mL或大于约5pg/mL的TNF血浆浓度(例如,与增殖性疾病有关的细胞存在于TNF的血浆浓度大于约2pg/mL或5pg/mL的对象中)。
实际上,在增殖性疾病是肿瘤的实施方案中,TNF的肿瘤内浓度可能是肿瘤的特征,例如当肿瘤是实体瘤并且可以进行活检时(Reissfelder et al 2015,J Clin Inv125:739)。例如,在本发明的一些实施方案中,肿瘤(例如实体瘤,例如结肠直肠癌)可以具有大于约0.2、0.5或1pg/mL,例如大于约2pg/mL,特别是大于约5pg/mL的TNF的肿瘤内浓度(例如,在肿瘤组织内)(例如,通过Quantikine人TNF-α免疫测定法测量)。
因此,在这样的实施方案中,当增殖性疾病是肿瘤(例如实体瘤)时,则实体瘤(例如,对象体内)可以具有(即,该对象可以通过例如适合于本发明的治疗方法的对象来区分,例如通过显示、拥有或展示)TNF的肿瘤内浓度大于(约)0.5pg/mL或大于约1pg/mL。
因此,在相关方面,本发明可以涉及一种在通过具有以下特征来区分的治疗对象中的增殖性疾病(或用于这种治疗的本发明化合物(或药物组合物))的方法:(i)TNF的血浆浓度大于约2pg/mL(优选大于约5pg/mL);和/或(ii)TNF的肿瘤内浓度大于约0.5pg/mL,优选大于约1pg/mL,所述治疗方法包括向所述对象施用本发明的化合物(或药物组合物),其中所述化合物(或药物组合物):(a)抑制与增殖性疾病有关的细胞中的激酶/关键激酶(例如SIK3);和/或(b)使与增殖性疾病有关的对象的细胞对细胞介导的免疫反应敏感。
特别是在这样的实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)的暴露于与增殖性疾病有关的细胞或施用于对象的量(或剂量)与TNF的血浆或肿瘤内浓度相关(或关联),其中在TNF的血浆或肿瘤内浓度较高的情况下,较大量(或剂量)的化合物(或药物组合物)暴露于此类细胞(或施用于此类对象)。
在其他或进一步的实施方式中,肿瘤可以存在于外周血或骨髓中具有肿瘤反应性T细胞的对象中,例如可以通过IFN-γELISPOT确定的。在其他或其他实施方案中,肿瘤显示出Treg、CD4+Tconv和/或CD8+T细胞的浸润。
在其他实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞在TNF的启动子区域中包含单核苷酸多态性(SNP),其与TNF的表达增加和癌症敏感性相关,例如与TNF的启动子区域中的-308G/A SNP处的AA或GA基因型有关;在替代实施方案中,在每种情况下,在TNF的启动子区,肿瘤均不包含与TNF表达降低和癌症风险降低相关的SNP,例如不包含在-238G/A SNP或-857T等位基因处的AA或GA基因型(Wang and Lin 2008,Acta Pharmacol Sin 28:1275)。
因此,本发明基于本发明人的令人惊讶的发现提供了替代的联合治疗方案,即本发明的化合物对一种或多种激酶(例如一种或多种关键激酶,例如SIK3)的抑制可影响细胞对TNF的凋亡/细胞毒性作用的敏感性。因此,在进一步的方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,该方法包括使对象中与增殖性疾病有关的细胞暴露于(例如接触)(i)TNF、TNF变体和/或TNFR2或TNFR1信号传导激动剂;以及使对象中与增殖性疾病有关的细胞暴露于(ii)本发明的化合物(或药物组合物)。在某些实施方案中,这种方法的步骤(i)不包括使对象中与增殖性疾病有关的细胞暴露(例如接触)TNF变体。
在某些实施方案中,增殖性疾病和/或此类细胞是肿瘤的,并且在其他实施方案中,组分(i)是TNF,特别是人TNF(例如rHuTNF);和/或组分(i)是TNFR1信号传导的激动剂。
在特定的实施方案中,该方法包括(例如,该治疗包括、涉及、是由或由其介导)增加暴露于对象中与增殖性疾病有关的细胞的TNF的量。
在此类方面的某些实施方案中,治疗可包括(例如,涉及、是由或由其介导)增加对象中的与增殖性疾病有关的细胞中TNFR1-和/或TNFR2-信号转导。因此,在相关方面,本发明涉及一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,该方法包括:(i)增加与该增殖性疾病有关的细胞中的TNFR1和/或TNFR2信号转导;以及(ii)使对象中与增殖性疾病有关的细胞暴露于(例如接触)本发明的化合物(或药物组合物)。
特别地,该方法可以例如通过抑制激酶(例如,关键激酶,例如SIK3)的抑制的结果来实现(例如,抑制磷酸化的SIK3的功能和/或活性),尤其是与TNFR1和/或TNFR2信号激活的结果结合在一起,例如在TNF、TNF变体和/或TNFR1激动剂与TNFR1或TNFR2结合时。
因此,在某些实施方案中,治疗效果可以涉及或通过抑制激酶(例如,关键激酶,如SIK3)和/或通过使与增殖性疾病相关的细胞对TNFR1或TNFR2信号转导的细胞毒性(例如凋亡)作用敏感来介导(例如,引起)。特别地,在这样的实施方案中,激酶/关键激酶活性可以被(有效地)降低至例如治疗有效水平。
如上所述,本文也是可设想的实施方案,其中肿瘤细胞中的激酶(例如关键激酶(例如SIK3))被抑制,以及任选地,其中一种或多种其他激酶/关键激酶(例如SIK2和/或SIK1)被抑制的程度较小,例如免疫细胞的其他激酶(例如SIK2或SIK1)。
如上所述,本文也是设想的实施方案,其中所述治疗包括、涉及、是由或由激酶/关键激酶活性的抑制(例如本发明的化合物(或药物组合物)以有例如有效抑制的治疗有效量的量施用)来介导,从而使其(例如有效地)降低,例如降低至治疗有效水平。
在该方面的某些实施方案中,可以给对象施用本发明的化合物(或药物组合物)和/或可以给对象施用TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2信号转导激动剂。
在这样的实施方案中,本发明的化合物(或药物组合物)和TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂可以暴露于(例如以该量施用)有效量(或剂量)施用,包括在本文其他地方所述的制剂或行政途径中。特别地,设想了其中将TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂封装为脂质体或其他纳米颗粒制剂的实施方案。
当暴露/施用TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂并且暴露/施用本发明的化合物(或药物组合物)时,则此类联合治疗方案可包括其中此类暴露/施用伴随的实施方案。在替代实施例中,这样的暴露/给药可以是按顺序的;尤其是在暴露/施用TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂之前,暴露/施用本发明的化合物(或药物组合物)的那些实施方案。例如,本发明的化合物(或药物组合物)可以在另一组分的约14天之内(例如之前),例如在另一组分的约10天、7天、5天、2天或1天之内(例如之前)按顺序暴露/施用;并且进一步包括化合物(或药物组合物)可以在另一组分的约48小时、24小时、12小时、8小时、6小时、4小时、2小时、1小时、30分钟、15分钟或5分钟内(例如之前)按顺序暴露/施用。
TNF或TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂可通过常规途径给药,例如s.c.、i.v.或i.m.。在某些实施方案中,可以肿瘤内给药或通过孤立的肢体灌注(ILP)(例如孤立的肝脏灌注(IHP))进行给药;和/或可以约5-500μg/m2/天的剂量施用(特别是,rHuTNF可以这样施用)。例如,可以约25至250μg/m2/天,例如约50至150μg/m2/天或约75至100μg/m2/天施用TNF;或当s.c.给予TNF时,MTD最高可达约50和75μg/m2/天;或者i.v.或i.m.给药时,MTD最高可达150和200μg/m2/天。因此,特别是在这样的实施方案中,可以以约5至500μg/m2/天,特别是约20至200μg/m2/天的剂量向对象施用TNF。
在特定的实施方案中,可以暴露/施用TNF变体,例如具有比rHuTNF的更高的抗肿瘤活性和更低的全身毒性的TNF变体。例如,TNF变体可以是选自以下的一种:(i)TNF的-K90R变体;(ii)与TNF缀合的肿瘤归巢肽;以及(iii)TNF-抗体缀合物。
在涉及TNF变体的本发明的那些实施方案中,它可以是具有较高细胞毒性活性和较低全身毒性的TNF的变体形式。
在其他实施方式中,可以暴露/施用TNFR1或TNFR2激动剂,例如抗TNFR1单克隆抗体htr-9(Ferrero et al 2001,Am J Physiol Cell Physiol 281:C1173),在其他实施方式中,可以暴露/施用淋巴毒素-α(Etemadi et al 2013,FEBS J280:5283)或其变体。
在替代实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)可通过以下方式暴露于TNF(或增加的TNFR1-和/或TNFR2-信号传导),即通过施用可能导致此类细胞暴露于(例如内源性)TNF、或暴露于另一种触发分子(例如TNF或TNFR1或TNFR2激动剂的变体的试剂(例如,向具有该细胞的对象))。此类试剂可以是例如能够诱导(例如诱导)此类细胞暴露于(例如升高水平的)TNF的试剂,特别是诱导此类细胞暴露于TNF水平的试剂,例如关于有效量的(例如内源性)TNF,例如血浆或肿瘤内TNF的水平大于一种或本文其他各处所述的水平。
因此,本发明包括其中向对象施用能够诱导(例如诱导)与增殖性疾病有关的细胞暴露于(所述)TNF、(所述)TNF变体或TNFR1或TNFR2信号转导的激动剂的试剂的实施方案。本发明还包括其中向对象施用能够增加与所述增殖性疾病相关的细胞的TNFR1信号传导(和/或TNFR2信号传导)和/或增加暴露于其中的TNF的量的试剂的实施方案。
在某些这样的实施方案中,所述试剂是病毒,特别是已经被工程化以产生触发分子的病毒,所述触发分子是TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂(特别是被工程化以产生人TNF的病毒)。此类实施方案的进一步包括那些这样的病毒,其中这些病毒优先感染与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)和/或优先在(例如当其感染)此类细胞的情况下产生触发分子。现在将显而易见的是,这种病毒的施用可以导致与增殖性疾病有关的细胞暴露于这种触发分子,特别是有效量的这种触发分子如TNF。
因此,在某些此类方法中,该试剂可以是能够诱导(例如诱导)与增殖性疾病相关的细胞暴露于TNFR1、TNF变体或TNFR1或TNFR2信号转导激动剂的病毒。
这样的病毒可以是适于诱导触发分子暴露的任何病毒,并且特别地可以是重组病毒;例如一种经工程改造以感染肿瘤细胞和/或表达TNF的病毒(例如在感染肿瘤细胞之后)。可以如此改造的病毒的例子包括溶瘤病毒(例如基于腺病毒、HSV、牛痘病毒、水泡性口炎病毒或新城疫病毒的溶瘤病毒),例如肿瘤内注射腺病毒载体以增加促炎细胞因子以及趋化因子的血浆水平,包括TNF(Bernt et al 2005,Cancer Res 65:4343)。特别地,在这样的实施方式中,溶瘤病毒可以是基于Kaufman et al 2015(Nature Rev Drug Disc 14:642)的表1中描述的DNA病毒的一种、基于Kaufman et al 2015的表2中描述的RNA病毒的一种,优选地,是在Kaufman et al 2015的表3中描述的溶瘤病毒,其处于临床试验中。
在其他这样的实施方案中,所施用的试剂(并因此导致与增殖性疾病有关的细胞暴露于触发分子TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂)是免疫细胞。在某些这样的实施方案中,免疫细胞可以不是产生IL10的巨噬细胞,例如免疫细胞可以是促炎性免疫细胞。特别地,在这样的实施方案中,所给予的免疫细胞可以是淋巴样细胞,例如T细胞或天然杀伤(NK)细胞,例如产生TNF的这种细胞。
当在本发明的此类实施方案中作为试剂施用时,可以通过过继细胞转移(ACT)施用免疫细胞;意思是免疫细胞转移到对象体内(例如,通过输注或其他递送技术)。通常以改善对象的免疫功能和特性为目标进行该过程,并且尽管常规上转移的免疫细胞将起源于同一对象,但是它们也可以源自另一(合适的)个体。
当在本发明的该实施方案中使用时,免疫细胞可以是从对象中提取的T细胞,经基因修饰和体外培养并返回相同的对象,例如在本发明的治疗方法中。这样的遗传修饰可以包括增强免疫细胞的特异性或靶向性的那些,例如将免疫细胞靶向(例如提高其特异性)与增殖性疾病有关的细胞(例如肿瘤细胞)的靶向性。例如,可以修饰在此类实施方案中使用的T细胞,以改变T细胞受体(TCR)的特异性或在嵌合抗原受体(CAR)中引入抗体样识别。尤其设想将CAR免疫细胞用于此类实施方案。CAR免疫细胞是展示工程化受体的免疫细胞,其将任意特异性(例如对肿瘤细胞)移植到免疫效应细胞(例如T细胞)上。通常,这些受体用于将单克隆抗体的特异性移植到T细胞上。通过逆转录病毒载体促进其编码序列的转移。CART细胞是一种有前途的癌症治疗方法(Song et al 2015,Oncotarget.6:21533):使用ACT,可从个体(通常是对象)中去除T细胞并对其进行修饰,使其表达针对患者特定癌症的特异性受体。然后可以将这些可以识别对象的癌细胞的T细胞(重新)引入对象中,导致TNF(例如由CAR T细胞产生的)暴露于肿瘤细胞,从而杀死这种细胞,特别通过暴露于本发明的化合物(或药物组合物)(例如向对象施用后)而对此类TNF介导的细胞毒性敏感的此类细胞。因此,特别是在这样的实施方案中,免疫细胞可以是CAR T细胞,例如一种经工程改造以对与增殖性疾病有关的受试者细胞(例如肿瘤细胞)具有增加的特异性的细胞。
在替代实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF(例如内源性TNF)可以通过其他方式或程序来诱导。因此,在这样的实施方案中,与增殖性疾病有关的细胞暴露于(例如有效量的)TNF可以通过增加对象血浆和/或此类细胞环境中TNF的量的药物、治疗或其他方法诱导(和/或TNFR1信号转导(和/或TNFR2信号转导)的增加)引起(和/或与增殖性疾病有关的细胞中TNFR1信号转导(和/或TNFR2信号转导)的增加)。
在某些实施方案中,可以通过施用癌症免疫疗法来引起对TNF的这种诱导暴露。
在一个实例中,这种诱导的TNF暴露是通过抗肿瘤疫苗(例如,癌症疫苗)引起的。此类癌症疫苗包括将抗原(例如,对癌细胞特异或优先由癌细胞表达的抗原)直接或间接引入对象以在设想对癌细胞具有(更多)特异性的对象中增强或增强免疫应答(通常是适应性免疫应答)的疫苗。癌症疫苗可以包括例如减毒病毒,特别是用于抵抗由这种病毒引起的癌症(例如宫颈癌或肝癌)(例如HPV或HBV)。癌症疫苗可以替代地代表特定肿瘤抗原的个体(或组合)(例如,对癌细胞具有特异性或优先表达的抗原),例如用于免疫对象以提高或增强对象的免疫反应的肿瘤相关抗原(TAA)。所述癌症疫苗可以包含代表TAA(例如来自TAA的肽)的重组蛋白,或者可以是肿瘤特异性碳水化合物抗原,并因此在给药后直接引入对象。或者,所述癌症疫苗可包含编码所述蛋白质(或肽)TAA的核酸(例如DNA或mRNA),并且在将所述核酸疫苗施用给所述对象后,编码的TAA由对象中的细胞靶标表达,因此被间接引入对象中。TAA可以分为两类:共有的肿瘤抗原;和独特的肿瘤抗原。共有的抗原由许多肿瘤表达。独特的肿瘤抗原是由物理或化学致癌物(也称为新抗原)诱导的突变产生的;因此,它们仅由个体肿瘤表达。本领域普通技术人员将知道在临床试验中或已批准使用的癌症疫苗的实例,包括PROSTVAC(Bavarian Nordic)、PROVENGE(Dendreon)和CV9104(CureVac),以及知道各种TAA(包括新抗原)和这种肿瘤抗原的方法可用于癌症疫苗。作为进一步的例子:(1)已证明,与受体孔戚血蓝蛋白(KLH)结合的受体来源的克隆骨髓瘤免疫球蛋白独特型(Id))作为肿瘤抗原进行免疫可产生大量或促炎性细胞因子,包括TNF(Foglietta et al 2013,Bone Marrow Transplant 48:269);(2)WT1抗原的合成微共识SynCon DNA疫苗诱导了新的新抗原样反应优于天然WT1 DNA免疫原诱导的反应,例如强CD4和CD8 T细胞反应(包括IFN-γ、CD107a和TNF响应)。
在另一个实例中,可以通过施用配体(例如抗体,例如单克隆抗体)来引起对TNF的这种诱导暴露,所述配体例如是结合至与增殖性疾病相关的细胞(例如肿瘤细胞)的一种,例如通过与TAA或这种细胞表面的受体结合。细胞表面受体是此类配体(抗体)疗法的常见靶标,包括CD52和CD20。一旦与这样的癌症抗原结合,例如抗体就可以诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性,激活补体系统或阻止受体与其配体相互作用,所有这些均可导致细胞死亡。批准的这类抗体配体包括阿仑单抗(alemtuzumab)、奥法木单抗(ofatumumab)和利妥昔单抗(rituximab)。在某些实施方案中,与本发明的化合物(或药物组合物)组合使用的此类配体可以包括激活T细胞或其他细胞介导的免疫应答的配体。例如:(1)抗CD137单克隆抗体可以显著促进细胞因子诱导的杀伤(CIK)细胞的增殖和TNF的表达(Zhu et al2009,BiomedPharmacother 63:509);(2)激动剂抗OX40单克隆抗体可通过增强T细胞分化来增强抗肿瘤免疫反应(Redmond et al 2014,Cancer Immunol Res.2014,2:142);以及(3)激活T细胞的抗ICOS抗体(例如Deng et al 2004,Hybrid Hybridomics 23:176)。
在另一个实例中,施用于对象的配体是与免疫(抑制)检查点分子结合的配体。例如,这种检查点分子可以是选自以下的一种:A2AR、B7-H3、B7-H4、CTLA-4、IDO、KIR、LAG3、PD-1(或其配体PD-L1和PD-L2中的一种)、TIM-3(或其配体galectin-9)、TIGIT和VISTA。特别地,在这样的实施方案中,配体与选自以下的检查点分子结合:CTLA-4、PD-1和PD-L1。在其他更具体的实施方案中,所述配体是选自以下的抗体:伊匹单抗(ipilimumab)、纳武单抗(nivolumab)、派姆单抗(pembrolizumab)、BGB-A317、阿特朱单抗(atezolizumab)、阿伐单抗(avelumab)和杜鲁门单抗(durvaluma)。特别地,抗体选自:伊匹单抗(YERVOY)、纳武单抗(OPDIVO)、派姆单抗(KEYTRUDA)和阿特朱单抗(TECENTRIQ)。在其他实施方案中,与免疫(抑制)检查点分子结合的配体可以是非抗体肽,例如高亲和力PD-1变体(例如,Maute et al,2015;PNAS 112:E6506)、靶向免疫检查点分子的肽(例如AUNP-12of Aurigene DiscoveryTechnologies,US 2011/0318373)或阻断免疫检查点分子之间的相互作用(例如PDL1-PD1相互作用)的D肽和(D)PPA-1,Chang et al,2015;Anyeg Chem Int 54:11760)。在其他实施方案中,与免疫(抑制)检查点分子结合的配体可以是小分子,例如靶向PDL1的BMS-202或BMS-8(Zak et al 2016;Oncotarget 7:30323)、称为BMS-1001或BMS-1166的PDL1/D1(Skalniak et al,2017;Oncotarget 8:72167)、正在进行1期试验的Curis/Aurigen的PDL1和VISTA拮抗剂CA-170(Powderly et al,Ann Onc 28:Issue suppl 5,mdx376.007)或fCuris/Aurigen的CA-327,其靶向PDL1和TIM3。
在又一个特定的实施方案中,可以通过放射疗法引起这种对TNF的诱导暴露。
放射疗法是一种局部治疗癌症或肿瘤的方法,利用放射线通过阻断癌细胞的繁殖和/或刺激针对它们的免疫反应(例如对已死亡或垂死的癌细胞的存在而引起的反应)来破坏癌细胞。在本发明的上下文中,放射疗法特别地由电离辐射的治疗用途组成。所述放射疗法和相关的电离辐射是本领域技术人员通常使用和已知的那些。放射疗法尤其包括使用电离辐射,例如伽马射线、X射线和/或从放射性同位素发出的辐射。在本发明的上下文中,更特别地是X射线辐射。放射治疗可以在一个或多个周期内,例如可以在1至4周、更特别地3周的周期内,以分级形式给予。该周期定义了施用方案开始和结束之间的时间间隔。当周期需要三周时,放疗可以在三周内进行,间隔一周。放射疗法可以特别地以每天一次的辐射的速率进行,即7天内的5天,持续所需的周数。(光子)放射治疗中使用的放射量以戈瑞(Gy)为单位,并根据所治疗癌症的类型和阶段而有所不同。对于治愈性病例,实体上皮肿瘤的典型剂量范围为60至80Gy,而淋巴瘤的治疗剂量为20至40Gy。
当本发明的化合物(或药物组合物)与任何其他此类其他程序(例如,其他药剂、癌症免疫疗法、癌症疫苗、抗体或放射疗法)一起用于联合治疗时(如本文所述),则这样的组合治疗方案可以包括其中这样的暴露/给药同时发生的实施方案。在替代实施方案中,这样的施用可以是按顺序的。特别是在化合物(或药物组合物)在这样的其他程序之前给药的那些实施方案中。例如,本发明的化合物(或药物组合物)可以在其他程序的约14天之内(例如之前),例如在其他程序的约10天、7天、5天、2天或1天之内(例如之前)按顺序施用;并且进一步包括其中化合物(或药物组合物)可以在约其他程序的48小时、24小时、12小时、8小时、6小时、4小时、2小时、1小时、30分钟、15分钟或5分钟内按顺序施用。
不受理论的束缚,本发明化合物(或药物组合物)的施用(并因此抑制激酶/关键激酶例如SIK3的表达、量、功能、活性或稳定性,例如在肿瘤细胞中)在TNF、TNF变体或TNFR1或TNFR2激动剂的施用之前,或在此类其他程序(例如,其他药物)的施用之前,癌症免疫疗法、癌症疫苗、抗体或放射疗法预期在使与增殖性疾病有关的细胞对细胞介导的免疫反应的细胞毒性作用敏感方面特别有效。
如上所述,涉及给予TNF和/或使用抗TNF分子的现有疗法(或临床试验中的疗法)具有某些已知的缺点;以及特殊的副作用。本发明提供了可用于减轻(或减少)这种缺点和/或特定副作用的方法。
在第六方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种用于在用其治疗增殖性疾病(例如癌症疾病或肿瘤)的对象中增加用TNF治疗的治疗指数的方法,该方法包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物)。
在相关方面,本发明涉及一种用于在患有增殖性疾病(例如癌症或肿瘤)的对象中支持TNF治疗的方法,该方法包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物)。
在第七方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种使患有增殖性疾病(例如癌症或肿瘤)的对象对涉及向该对象施用TNF的治疗敏感的方法,该方法包括向所述对象施用本发明的化合物(或药物组合物)。
如本文所用,术语“致敏/使……敏感(化)”(等)在对象对疗法敏感的情况下使用(例如,涉及TNF的给药),本领域普通技术人员将理解该术语,并且包括意思是对象增加对这种疗法可能对对象产生的一种或多种(治疗)效果(特别是功效效果)的敏感性。特别地,如此敏感的对象在经历这样的治疗时,可以显示出比被有被如此“敏感”的类似对象更高的反应(例如更快、更大程度的反应和/或在这种治疗的较低剂量或暴露下)。
在第八方面,并且如本文可以进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及一种用于在用抗TNF剂治疗的对象中降低(发展)血液学增殖性疾病(例如继发性疾病)的风险的方法,该方法包括向对象施用本发明的化合物(或药物组合物)。例如,该方面可替代地被认为是用于在用抗TNF剂治疗的对象中预防血液学增殖性疾病(作为继发性疾病)的方法,该方法包括向所述对象施用本发明的化合物(或药物组合物)。
本发明的该方面基于如上所述的观察,即有报道接受抗TNF生物制剂发展为淋巴瘤和其他血液系统恶性肿瘤的患者。实际上,此类疾病通常在包装单张/处方信息中描述为使用抗TNF剂治疗的可能的副作用(但很少见)。由于人们普遍认为血液系统恶性肿瘤增加,以及这些药物和其他免疫抑制剂的广泛使用,WHO对肿瘤的分类现在包括“医源性免疫缺陷相关性淋巴增殖性疾病”类别。
因此,通常在此类情况下,患者正在接受抗TNF药物治疗增殖性疾病以外的适应症,尤其是在此类实施方案中,在开始抗TNF治疗后,患者不进行患有血液学增殖性疾病。实际上,通常该对象会患有和/或正在接受抗TNF药物治疗自身免疫疾病。优选自身免疫性疾病选自:类风湿性关节炎,银屑病关节炎,强直性脊柱炎,斑块状银屑病,炎性肠病,溃疡性结肠炎,克罗恩氏病,牛皮癣,化脓性汗道炎和难治性哮喘;例如选自以下的一种:类风湿性关节炎,牛皮癣性关节炎,强直性脊柱炎,斑块状银屑病和克罗恩氏病;特别是类风湿关节炎。
在某些实施方案中,抗TNF剂选自:英夫利昔单抗(infliximab)、阿达木单抗(adalimumab)、戈利木单抗(golimumab)、humicade、依那西普(etanercept)、奥那西普(onercept)和西妥珠单抗聚乙二醇,特别是英夫利昔单抗或humicade。
在某些实施方案中,血液系统恶性肿瘤增殖性疾病可以是淋巴增殖性疾病,特别是与医源性免疫缺陷相关的淋巴增殖性疾病。
在此类第六至第八方面的某些实施方案中,(治疗)效果(例如治疗指数的增加,对象的致敏性或风险的降低)是由(例如,该治疗包括、是由、由其介导或涉及)以下介导的:(i)抑制激酶(例如,关键激酶如SIK3)(例如通过抑制磷酸化SIK3的功能和/或活性),特别是通过在与增殖性疾病有关的细胞中抑制这种激酶(例如关键激酶);和/或(ii)使此类细胞对TNF的杀伤(凋亡/细胞毒性)作用敏感。在进一步的实施方案中,(治疗)作用可以不通过抑制一种或多种其他关键激酶(例如,ABL1和/或SRC,或SIK2和/或SIK1)来介导(例如,治疗可以不包括或不涉及),尤其是不由免疫细胞中的抑制或更多种其他关键激酶(例如SIK2和/或SIK1(和/或SIK3))介导(例如,治疗不包括或不涉及)。
临床前和临床试验
在某些实施方案中,对象是人类志愿者;例如已经选择(例如同意)给予本发明化合物(或药物组合物)用于该化合物的临床试验或其他实验用途的人。这样的人类志愿者可以是健康人(例如,健康志愿者)或可能患有诸如增殖性病症的病症(例如,癌症患者)。在另一个实施方案中,对象是实验动物,特别是选自以下的动物:小鼠、大鼠、兔、猪和猴子。
在这样的(例如实验治疗)实施方案中,可以治疗多个这样的对象;尤其是5个或更多的对象,例如约5到20、10到50、25和200或75到250个对象,或多于约250个对象。
此类实验(或临床试验)治疗可包括:(i)向此类对象中的至少一个施用一剂本发明的化合物和/或本发明的药物组合物的一种制剂;以及(ii)向此类对象中的至少另一个施用不同剂量的化合物和/或不同制剂的药物组合物。
在此类实施方案的进一步中,此类实验(或临床试验)治疗可包括:(i)向此类对象中的至少一个施用一剂本发明化合物和/或本发明的药物组合物的一种制剂;以及(ii)向此类对象中的至少另一个施用(a)安慰剂;(b)(i)的对象的化合物的剂量和/或药物组合物的制剂,以及另外的药物、治疗或其他方法。
术语“安慰剂”是本领域公认的,并且包括无预期治疗价值的物质或治疗。在这样的实施方案中,可以使安慰剂类似于另一种给药方式,以使其充当对照,例如在盲法试验中。
在某些此类实施方案中,此类实验(或临床试验)治疗是专门设计用于调查和/或确定本发明化合物的治疗有效剂量和/或鉴定本发明的药物组合物的治疗有效剂量。
诊断
在第九方面,本发明涉及一种诊断和治疗疾病、病症或病状的方法,所述疾病、病症或疾病的特征在于对象(例如人类患者)中一种或多种蛋白质适用的生物标记物(例如激酶)的存在或数量和/或特征在于其(例如,异常的)表达或活性,包括:
·从所述对象的生物学样品中检测一种或多种此类适用的生物标记物,从而诊断该对象是否正在遭受(或可能遭受)这种疾病、病症或病状;和
·向如此诊断的对象施用有效量的本发明的化合物(和/或包含该化合物的药物组合物),尤其是对该对象实施本发明的治疗方法。
在这样的实施方案之一中,所述疾病、病症或病状是增殖性疾病,例如本文其他地方公开的一种(例如肿瘤或癌症)。
术语“适用的生物标志物”是指与增殖性疾病有关的细胞表达的任何一个(或多个)基因,这些基因与(例如激酶/关键激酶介导的)细胞对免疫反应的抵抗力有关(例如细胞介导的免疫反应(例如TNF)。此类基因包括:(X)一种或多种激酶,特别是本文所述的一种或多种关键激酶,例如SIK1、SIK2、SIK3、ABL1(BCR-ABL)、SRC、HCK、PDGFR、FLT3、KIT、YES、LYN和FYN(和LCK);特别地,CSF1R、ABL1(BCR-ABL)、HCK、PDGFR和FLT3、尤其是磷酸化的SIK3;(Y)激酶的突变体,例如突变体ABL1激酶(例如,BCR-ABL)或KIT激酶的突变体;和/或(Z)以下(a)至(f)中的一个或多个:
(a)TNFR1(或TNFR2),例如TNFR1(或TNFR2)(特别是TNFR1)的存在(或含量)或表达和/或活性;
(b)LKB1,例如LKB1的存在(或含量)或表达和/或活性,特别是LKB1或pLKB1的含量或活性增加;
(c)一种或多种II类(例如IIa)HDAC,例如HDAC4,例如这种HDAC的存在(或含量)或表达和/或活性,特别是这种HDAC或pHDAC的含量或活性增加,特别是在肿瘤细胞的细胞质中;
(d)NF-κB的表达,特别是NF-κB的组成型表达;
(e)NF-κB,例如NF-κB的存在(或含量)或表达和/或活性,尤其是NF-κB或乙酰化NF-κB的含量或活性增加,特别是在肿瘤细胞核中;和/或
(f)一种或多种抗凋亡基因,例如一种或多种抗凋亡基因的存在(或含量)或表达和/或活性,特别是一种或多种受NF-κ-B转录控制的此类基因。
在某些实施方案中,适用的生物标记是选自以下的一种或多种关键激酶:EPHA2,EPHA4,CSF1-R,HCK,ACK1(特别是CSF1R);和/或PDGFR-α,TGFB-R1,B-RAF和/或p38-β;和/或ACV-R1和/或BMPR1A;和/或RET;和/或NEK11、WEE1和/或WNK2;和/或Aurora-A和/或Aurora-B;和/或TBK1;以及也特别是NEK11。
在某些这样的实施方案中,适用的生物标志物是CSF1R或NEK11。
在上述诊断和治疗方法的另一个实施方案中,“适用的生物标志物”或者是TGFβ。具体而言,具有高TGF含量的肿瘤类型(Hsing et al 1996,Cancer Res 56:5146)(例如乳腺癌、肺癌、前列腺癌、肝癌或淋巴瘤)的对象可能适合用本文公开的化合物进行治疗,例如式(Ia)、(Ib)或(Ic)中任一个的化合物,例如通过抑制SIK3并使肿瘤细胞对凋亡敏感的化合物。最近,SIK(特别是SIK3)已被证明还可以调节TGFβ介导的转录活性和细胞凋亡,Hutchinson等人(2010,Cell Death and Disease 11:49)表明SIK3表达或活性导致对TGFβ介导的细胞凋亡的抵抗。TGFβ是细胞因子家族的成员,可与其细胞上的同源受体结合并介导多种细胞过程,从增殖、分化、迁移、凋亡到上皮间充质转化(Massaguéet al 2012,NatRev Mol Cell Biol 13:616)。在肿瘤环境中,TGFβ轴可能被错误调节;导致致癌过程(Drabsch&ten Dijke 2012,Cancer Metastasis Rev 31:553)。TGFβ轴可通过抑制T细胞或NK细胞中促凋亡和细胞溶解因子(如颗粒酶、穿孔素、IFNγ)的表达来限制免疫反应。因此,最近在肿瘤学中靶向TGFβ变得突出。然而,TGFβ也可以通过半胱天冬酶途径诱导肿瘤细胞凋亡。事实上,来自淋巴瘤(Inman&Allday 2000,J Immunol 165:2500)、肝癌(Kim et al2002,Mol Cell Biol 22:1369)和前列腺癌(http Hsing et al 1996,Cancer Res 56:5146)的肿瘤细胞系已被证明对TGFβ介导的细胞凋亡敏感。
在一个方面,本发明涉及一种用于确定患有增殖性疾病的对象适合用本文别处定义的化合物或药物组合物治疗的方法,特别是其中所述化合物选自以下化合物(a)至(c)或(d)或(e),或药物组合物包含此类化合物和任选的药学上可接受的赋形剂:(a)式(Ia)的化合物,例如上述的其任何实施方案;(b)式(Ib)的化合物,例如上述的其任何实施方案;以及(c)式(Ic)的化合物,例如上述的其任何实施方案,以及在每种情况下,其盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;或(d)达沙替尼,特别是N-(2-氯-6-甲基苯基)-2-[[6-[4-(2-羟乙基)-1-哌嗪基]-2-甲基-4-嘧啶基]氨基]-5-噻唑甲酰胺,一水合物(图1A);或(e)ARN-3261(Vankayalapati et al 2017,AACR Cancer Res 77(13Suppl):Abstract nr LB-296;US 9,260,426,US 9,890,153,US 9,951,062)。
这样的确定方法可以包括,在已经(先前)从所述对象获得的生物样品中,确定:(X)存在(和/或存在一定量)MEF2C蛋白,例如存在磷酸化的MEF2C蛋白和/或存在作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地其中所述增殖性疾病的特征还在于存在(和/或存在一定量)磷酸化的HDAC4蛋白,例如存在被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或(Y)(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在KRAS基因和/或RUNX1基因中存在突变。例如,蛋白质或癌蛋白可以以一定量(例如定量量)存在,例如超过生理量(例如,对于该细胞类型和/或该时间/阶段)的量,包括来自蛋白质的表达或过度表达。在另一个实施方案中,这种蛋白质可以以超过阈值或者是这种蛋白质/癌蛋白的量的参考分布的异常值的量(例如定量量)存在。
在这种方法的一个实施方案中,已经(先前)从对象获得的生物样品包含与增殖性疾病有关的细胞(例如,癌症或肿瘤细胞)。
这种方法例如作为体外方法进行;例如未在人体或动物体上实施的方法(例如,未在此类对象的身体上实施)。
所述生物样品中所述蛋白质、易位、重排、癌蛋白和/或突变(如适用)的存在(和/或含量),可以表明所述对象适合用所述化合物或药物组合物治疗。
此类确定方法的某些实施方案包括如本文别处所述的所述蛋白质、易位、重排、癌蛋白和/或突变的那些实施方案。
在其他实施方案中(并且如本文其他地方可以进一步说明),增殖性疾病可以是癌症或肿瘤,例如造血系统恶性肿瘤和/或淋巴系统恶性肿瘤。特别地,增殖性疾病可以是:(i)骨髓瘤,优选多发性骨髓瘤;或(ii)白血病,优选急性髓细胞性白血病(AML)或急性淋巴细胞性白血病(ALL),更优选T细胞急性淋巴细胞性白血病(T-ALL)、MLL-AML或MLL-ALL。增殖性疾病可以是图23中列出的一种。
此类确定方法中的对象可以是例如人类儿科患者和/或可以是携带KMT2A重排(KMT2A-r)的对象;在特定实施方案中,对象可以是患有KMT2A-r白血病的患者,尤其是如本文别处所述的(例如儿科)人类患者。
在某些实施方案中,这种确定方法可以进一步包括向对象施用化合物(例如,选自化合物(a)至(c)、或(d)或(e)的化合物),特别是当在已从所述对象获得的生物样品中确定所述蛋白质、易位、癌蛋白和/或突变的存在(和/或含量)时。或者,此类实施例可被描述为本发明的附加方面,其提供了确定(适合性)和治疗对象的方法,此类方法包括此类实施例的步骤。
该诊断和治疗方法的给药(或治疗)步骤的其他实施方案在其他地方有更详细的描述;如该方法的检测、确定或诊断方法步骤的方法的特定实施例一样。这样的实施方案的具体包括其中向对象施用的本发明的化合物(和/或药物组合物)的量与血浆或肿瘤内TNF浓度(在对象中)相关的那些,其中在血浆或肿瘤内TNF的浓度更高的情况下,更大的量(或剂量)化合物(和/或药物组合物)被施用至这样的对象。
在某些实施方案中,生物学样品将(优选地)包含对象的细胞或组织,或此类细胞或组织的提取物,特别是当此类细胞是(通常,典型地;或在这种情况下或在特定情况下)与增殖性疾病(例如肿瘤细胞,例如实体瘤细胞)有关的。所述肿瘤或其细胞可以是本文别处所述的肿瘤之一或源自该肿瘤之一。
在该方面的特定实施例中,该方法还将包括以下步骤:
·提供(例如通过获取)来自对象的生物样品,特别是在检测步骤之前执行该步骤的情况下。
在特定实施例中,可以将这种检测和/或确定方法实践为诊断方法,例如诊断哺乳动物对象(例如人类对象或患者)是否患有疾病、病症或病状的方法,特别是增殖性疾病(例如癌症或肿瘤)(的存在)(或有风险发展为此类疾病、疾病或病症),其与针对细胞介导的免疫反应的细胞抗性相关和/或与适用的生物标志物(例如SIK3)的表达或活性相关(例如异常);特别是(实体)肿瘤,例如对细胞介导的免疫反应具有细胞抗性的。
在这些检测、确定和/或诊断方法的某些实施方案中,针对细胞介导的免疫应答的细胞抗性是针对T细胞介导的免疫应答的细胞抗性,特别是对TNF和/或TNFR1或TNFR2信号传导的杀伤(细胞凋亡/细胞毒性)作用的细胞抗性。
因此,这些检测和/或诊断方法的特定实施方式还可包括确定样品中TNF的存在或含量的步骤,其中样品中TNF的存在(或含量)表示与对象中与针对细胞介导的免疫反应的细胞抗性有关和/或与激酶(例如SIK3)的(异常)表达或活性有关的增殖性疾病(或发展成增殖性疾病的风险)。特别地,在此类实施方案中,定性确定样品中TNF的量。优选地,所述对象被区分为具有:(i)来自所述对象的血浆样品中的TNF的血浆浓度大于约2pg/mL或5pg/mL;和/或(ii)来自对象组织样品的TNF的肿瘤内浓度大于约0.5pg/mL或1pg/mL,表明在对象中存在与针对细胞介导的免疫应答的细胞抗性和/或与激酶(例如SIK3)的表达或活性有关的增殖性疾病或发展这种增殖性疾病的风险。
本文其他地方介绍了确定样品中TNF的存在或含量的方法(尤其是使用ELISA分析(例如QuantitkineTNF-α免疫测定)定量检测TNF);同样如果样本中存在的TNF超出的TNF量,则表明对象中与针对细胞介导的免疫反应的细胞抗性有关和/或与激酶的(异常)表达或活性有关的增殖性疾病(例如SIK3)。
在某些实施方案中,生物样品是从哺乳动物对象(例如人类患者)获得的样品。术语“生物样品”以其最广义使用,并且可以指获自对象(例如人类患者)的身体样品。例如,生物样品可以包括临床样品,即源自对象的样品。这样的样品可以包括但不限于:外周体液,其可以包含或可以不包含细胞,例如血液、尿液、血浆、粘液、胆汁、胰液、上清液和血清;组织或细针活检样本;具有已知诊断、治疗和/或结果历史的肿瘤活检样品或切片(或其细胞)以及档案样品。生物样品还可以包括组织切片,例如出于组织学目的而采取的冷冻切片。术语“生物样品”还可以包括通过处理样品得到的任何材料。衍生材料可包括但不限于从生物样品中分离的细胞(或其后代)、从样品中提取的核酸和/或蛋白质。生物样品的处理可涉及以下一项或多项:过滤,蒸馏,提取,扩增,浓缩,固定,干扰组分失活,添加试剂等。在某些实施方案中,生物样品可以包含与病症(例如,增生性病症)(例如癌症或肿瘤细胞)有关的细胞。
在一些实施例中,这些检测、确定和/或诊断方法可以是计算机实现的方法,或者是由计算机辅助或支持的方法。在一些实施方案中,通过至少一个处理器获得反映样品中待确定(或其活性)的适用生物标志物(例如关键激酶,例如ABL1/BCR-ABL、SRC和/或SIK3)的存在或数量的信息:和/或由另一处理器以用户可读的格式提供反映样品中此类标记物的存在或数量(或其活性)的信息。一个或多个处理器可以耦合到在计算机操作系统的控制下或与计算机操作系统结合操作的随机存取存储器。处理器可以被包括在一个或多个服务器、群集或其他计算机或硬件资源中,或者可以使用基于云的资源来实现。操作系统可以是例如LinuxTM操作系统、UnixTM操作系统或其他开源或专有操作系统或平台的发行版。处理器可以与数据存储设备(例如存储在硬盘驱动器或驱动器阵列上的数据库)进行通信,以访问或存储程序指令中的其他数据。处理器可以进一步通过网络接口进行通信,该网络接口又可以通过一个或多个网络(例如Internet或其他公共或专用网络)进行通信,从而可以从客户端或其他设备或服务器接收查询或其他请求。在一些实施方案中,检测试剂盒中适用的生物标志物的存在或数量(或其活性)的计算机实现的方法作为试剂盒提供。
这样的检测、确定和/或诊断方法可以作为体外(例如离体)方法来进行,并且可以例如使用本发明的试剂盒(或其组分)来实践。体外方法可以在永生化细胞系(例如在动物或人类体外复制、培养或无限期保存的永生化细胞系)上使用、参与或实践,或者可以使用直接或从人类动物体内新鲜获得的细胞(例如原代细胞)来使用、参与或体外实践(例如,实践为所谓的“离体”方法)。
在这些检测、确定和/或诊断方法的一些实施方案中,生物样品是来自对象的组织样品,例如来自对象的肿瘤或癌症的样品。如上所述,这样的组织样本可以是肿瘤或癌症的活检样本,例如针头活检样本,或肿瘤活检切片或其档案样本。这样的组织样品可以包括活的、死的或固定的细胞,例如来自肿瘤或癌症的细胞,并且可以怀疑这种细胞表达(例如异常地或定位地)待确定的适用生物标记物。
在一些实施方案中,本发明的确定和/或诊断方法可以包括,例如在进一步的步骤中,将适用的生物标志物(例如激酶/关键激酶,例如SIK3,尤其是磷酸化的SIK3)(例如其蛋白或mRNA)的检测量(或活性)与标准值或临界值进行比较;其中大于标准值或临界值的检测量表示与对象中针对细胞介导的免疫反应的细胞抗性有关和/或与激酶/关键激酶(例如SIK3)的(异常)表达或活性相关的表型(或发展表型的风险)。这样的标准或截断值可以通过使用对照测定法来确定,或者可以根据从一项研究中获得的一个或多个值或具有已知表型的多个样品来预先确定。例如,可以通过在受控临床研究的背景下对从患者身上采集的样品进行分析,并根据所需(或获得的)测试的灵敏度和/或特异性确定临界值。
在某些实施方案中,可通过检测适用的生物标记物的蛋白质或通过检测编码适用的生物标记物的mRNA来检测适用的生物标记物。检测蛋白质(例如,尤其是通过免疫组织化学的抗体检测)和mRNA(例如,通过杂交、qPCR或测序)的方法是众所周知的。
可用于检测适用的生物标记物(例如SIK3的激酶/关键激酶,特别是磷酸化的SIK3)(例如存在或不存在或其含量)的方法的例子包括免疫测定,例如酶联免疫吸附测定(ELISA)和放射免疫测定(RIA),其采用了抗原结合蛋白(“ABP”),例如抗体或其抗原结合片段,其特异性结合这种可适用的生物标记物。
皮肤色素沉着及相关方面
Kumagai等人(2011)描述了盐诱导激酶2(SIK2)通过抑制cAMP反应元件结合蛋白(CREB)特异性辅激活因子1(TORC1)作为黑色素生成抑制剂的作用,以及SIK2的强效抑制剂能够促进B16F10黑色素瘤细胞中的黑色素生成。Mujahid等人(2017)能够证实,用SIK2抑制剂HG-9-91-01(以及与本发明的结构相关的其他SIK2抑制剂)局部治疗人类皮肤外植体能够诱导此类人类皮肤的真黑化(eumelanisation)。本文的实施例12描述了对式(Ia)、(Ib)和(Ic)化合物促进(人)皮肤细胞中黑素生成的类似研究。
因此,在另一方面,本发明涉及一种增加对象的皮肤色素沉着(或增加皮肤色素沉着的出现)的方法,该方法包括向对象施用(例如有效)量的如标题“化合物”下所指定的激酶抑制剂,或其药物组合物。在本文中,化合物(或药物组合物)的量(例如有效量)是指足以引发所需生物反应(例如皮肤色素沉着的程度或皮肤色素沉着的出现)的量。
在该方面的一个实施方案中,该方法不作为通过对人体或动物体实施的手术或疗法(或诊断方法)来治疗人体或动物体的方法来实施。例如,该方法用于美容目的,例如出于审美原因增加对象的皮肤中黑色素的产生(并因此增加皮肤颜色)。
在该方面的另一个实施方案中,它作为一种增加对象皮肤色素沉着(或增加皮肤色素沉着的出现)的方法用于医学目的(例如治疗,包括预防)。例如,可以实施该方法以增加皮肤色素沉着(例如,不需要紫外线照射),以改善紫外线防护和例如降低患皮肤癌的风险。例如,在这样的上下文中,术语“预防”可以指对没有和未曾患病但有发展该疾病的风险或曾患疾病但没有患病但处于疾病消退的风险中的对象的预防性治疗。在某些这样的实施方案中,化合物或药物组合物的给药量可以是“预防有效”的量。本文所述的化合物(或药物组合物)的“预防有效量”可以是足以预防病症或与病症相关的一种或多种症状或防止其复发的量。例如,本文中的预防有效量可以指单独或与其他试剂(或存在于一种或多种药物组合物中的那些)组合的治疗剂的量,其提供预防皮肤癌的预防益处。术语“预防有效量”可以包括改善总体预防或增强另一种预防剂的预防功效的量。
因此,在相关方面,本发明涉及用于治疗对象中增加的皮肤色素沉着(或增加的皮肤色素沉着的出现)的化合物或药物组合物,所述治疗包括给予向对象施用化合物或药物组合物,其中所述化合物选自在标题“化合物”下指定的激酶抑制剂。
在这些方面的某些实施方案中,化合物是式(Ia)、或式(Ib)或式(Ic)的任何化合物及其在标题“化合物”下指定的任何实施方案。
在这样的另一个和相关方面的某些实施方案中,化合物(或包含该化合物的药物组合物)可以局部(或经皮)施用于对象。术语“局部”在本文中是本领域公认的,其含义包括将本文所述的化合物局部应用于人或非人动物的体表。在某些实施例中,体表是皮肤。在某些实施例中,皮肤在身体部位上。在某些实施例中,皮肤在脸上。在某些实施例中,皮肤在颈上。在某些实施例中,皮肤在躯干上。在某些实施例中,皮肤在胸部上。在某些实施例中,皮肤在背部上。在某些实施例中,皮肤在手臂上。在某些实施例中,皮肤在腿上。
中间体、合成、制造等方面
本文公开的化合物可以如下所述制备或通过与其类似的方法制备,这些方法是有机合成领域的普通技术人员容易知道和可获得的。
在第十方面,并且如本文可进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及选自具有式(Id)的化合物的中间体:
Figure BDA0003884477230001001
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,其中:
R40中的一个是F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代,并且另一个R40选自卤素、-Me、-OMe、-Et和-OEt;并且
R41选自H和氨基保护基团。
在第十方面的中间体的一个实施方案中,两个R40彼此不同。
在第十方面的中间体的一个实施方案中,一个R40选自F、-CH2F、-CHF2和-CF3,另一个R40选自卤素、-Me、-OMe、-Et和-OEt,优选地另一个R40选自Cl、Br、F和-Me。例如,一个R40可以选自F、-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2,另一个R40(任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40)可以是Cl。
在第十方面的中间体的另一个实施方案中,一个R40(任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40)是F,并且另一个R40选自卤素、-Me和-Et,优选另一个R40选自Cl、Br、F、-Me和-Et,更优选选自Cl、-Me和-Et。例如,一个R40(任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40)可以是F,而另一个R40可以是Cl。
在第十方面的中间体的一个实施方案中,与R40结合的C环原子和S环原子是相邻的环原子,R40为F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代。
在第十方面的中间体的替代实施方案中,与R40结合的C环原子和S环原子被C环原子隔开,R40为F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代。
在第十方面的中间体的一个实施方案中,R41是氨基保护基团。例如,氨基保护基团可以选自:叔丁氧羰基(BOC),9-芴基甲氧羰基(FMOC),苄氧羰基(Cbz),对甲氧苄氧羰基(MOZ),乙酰基(Ac),三氟乙酰基,苯甲酰基(Bz),苄基(Bn),对甲氧基苄基(PMB),3,4-二甲氧基苯基(DMPM),对甲氧基苯基(PMP),2,2,2-三氯乙氧羰基(Troc),三苯甲基(trityl;Tr),甲苯磺酰基(tosyl;Ts),对溴苯磺酰基(brosyl),4-硝基苯磺酰基(nosyl)和2-硝基苯磺酰基(Nps)。
在第十方面的中间体的一个替代实施方案中,R41是H。
在第十方面的中间体的一个实施方案中,中间体选自:
Figure BDA0003884477230001011
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合。例如,中间体选自:
Figure BDA0003884477230001012
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合。
在一个实施方案中,本发明的中间体不包括以下组(1)至(3)中的一个或多个的化合物(在组(1)至(3)中,部分(例如甲基)是未被取代,除非明确说明所述部分被取代):
(1)中间体不是2-溴-4-(三氟甲基)噻吩-3-胺;[CAS 1369240-59-4]
(2)当噻吩环第4位C环原子上连接的R40为-Me,且另一个R40为-CHF2时,则R41不是(1-丙基哌啶-2-基)羰基;以及[CAS 2099704-46-6,2099704-17-1,2099703-62-3,2099703-17-8]
(3)当噻吩环第4位C环原子上连接的R40为-Me,且另一个R40为F时,则R41不是4,5-二氢-1H-咪唑-2-基。[CAS 1369494-03-0]
在第十一方面,并且如可在本文中进一步描述、定义、要求保护或以其他方式公开的,本发明涉及式(Id)的中间体在制备包含酰胺部分(特别是激酶抑制剂)的化合物中的用途,所述激酶抑制剂尤其是一种或多种选自以下的蛋白激酶的抑制剂:SIK(优选SIK3)、CSFR1、ABL/BCR-ABL、HCK、PDGRF、LCK、SRC和KIT;优选选自以下的一种或多种蛋白激酶:SIK3、ABL/BCR-ABL、HCK和CSF1R激酶,所述化合物例如是本发明的化合物(例如式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的化合物,或溶剂化物、盐(特别是药学上可接受的盐)、N-氧化物(特别是R1a的N-氧化物)、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药(特别是具有式(IXa)、(Xa)、(XIa)或(XIIa)和/或具有至少一个如上所述的衍生化羟基的前药),或溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、结晶形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式或其组合),或其组合),其中该方法包括使式(Id)的中间体与相应的羧酸反应,并且任选地除去氨基保护基团。
在第十一方面的方法的一个实施方案中,使中间体与相应的羧酸反应的步骤在(i)碱和/或(ii)偶联剂的存在下进行。
在第十一方面的方法的一个实施方案中,中间体与相应羧酸的反应在溶剂中进行,例如非质子溶剂,例如乙腈。因此,在第十一方面的优选实施方案中,该方法包括在(i)碱和/或(ii)偶联剂的存在下在溶剂中使式(Id)的中间体与相应的羧酸反应。
确定合适的反应参数(例如中间体和相应羧酸的量,任选地,碱、偶联剂和/或溶剂的量;反应温度;反应时间;等)以获得所需的产品在本领域技术人员的技能范围内。优选地,使用相对于羧酸的摩尔量过量的碱(例如碱以羧酸的摩尔量的至少约1.5倍、例如至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3倍、至少约3.5倍、或至少约4倍、和至多约5倍的量使用)。此外,中间体和羧酸可以以约0.8:1至约1:1.2,例如约0.9:1至约1:1.1,或以约等摩尔量的中间体与羧酸的摩尔比反应。使用时偶联剂的量优选为羧酸的摩尔量的约至少约1.0倍,例如至少约1.1倍、至少约1.2倍、至少约1.3倍和至多约2倍。
在第十一方面的方法的一个实施方案中,所述碱为非亲核碱,优选选自N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)、2,2,6,6-四甲基哌啶、三乙胺、三丁胺、1,8-二氮杂双环十一碳-7-烯(DBU)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯(TBD)、7-甲基-1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯(MTBD)、1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷(TED)、可力丁、1,1,3,3-四甲基胍(TMG)、奎宁环、2,2,6,6-四甲基哌啶(TMP)、哌啶(PMP)、2,6-二叔丁基吡啶、2,6-二甲基吡啶、磷腈碱(例如t-Bu-P4)、二异丙基氨基锂(LDA)、双(三甲基甲硅烷基)氨基钠(NaHMDS)、双(三甲基甲硅烷基)氨基钾(KHMDS)、叔丁醇钠和叔丁醇钾。
在第十一方面的方法的一个实施方案中,偶联剂选自N,N,N',N'-四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(TCFH)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺(EDCI)、二环己基碳二亚胺(DCC)、二异丙基碳二亚胺(DIC)、1-[双(二甲氨基)亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化六氟磷酸盐(HATU)、2-(1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸盐(HBTU)、2-(1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基四氟硼酸铵(TBTU)、1-丙烷膦酸酐(T3P)、苯并三唑-1-基-氧三吡咯烷鏻六氟磷酸盐(PyBOP)、7-氮杂苯并三唑-1-基氧基)三吡咯烷鏻六氟磷酸盐(PyAOP)和(6-氯苯并三唑-1-基氧基)三吡咯烷鏻六氟磷酸盐(TPTDP)。
在羧酸为硫代羧酸的实施方案中(例如,当式(Ie)中的E为S时),则与式(Id)的中间体的反应可以在合适的条件下进行(例如Mitsunobu条件)以有利于形成所得硫代酰胺化合物。
在第十一方面的方法的一个实施方案中,相应的羧酸具有通式(Ie):
Figure BDA0003884477230001031
其中Hy、R2、R3、A和E如本文所定义(特别是关于式(Ia)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)和/或(VIIIa))。优选地,在这样的实施方案中,E是O。
在相关方面,本发明还涉及选自以下的化合物(例如中间体)(的物质的组合物):
Figure BDA0003884477230001032
及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,特别是其中此类化合物(例如中间体)的量大于约1g或10g,例如大于约100g,和/或为纯化形式(例如,如本文别处所定义)。
在此类相关方面的一个实施方案中,化合物(例如中间体)选自:
Figure BDA0003884477230001033
及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,特别是其中此类化合物(例如中间体)的量大于约1g或10g,例如大于约100g,和/或为纯化形式(例如,如本文别处所定义)。
在另一个相关方面,本发明还涉及选自以下的化合物(例如中间体)(的物质的组合物):
Figure BDA0003884477230001041
及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,特别是其中此类化合物(例如中间体)的量大于约1g或10g,例如大于约100g,和/或为纯化形式(例如,如本文别处所定义)。
在此类相关方面的一个实施方案中,化合物(例如中间体)选自:
Figure BDA0003884477230001042
及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,特别是其中此类化合物(例如中间体)的量大于约1g或10g,例如大于约100g,和/或为纯化形式(例如,如本文别处所定义)。在此类相关方面的一个实施方案中,化合物(例如中间体)选自:
Figure BDA0003884477230001043
及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、结晶形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,特别是其中此类化合物(例如中间体)的量大于约1g或10g,例如大于约100g,和/或为纯化形式(例如,如本文别处所定义)。
在第十二方面,本发明涉及一种用于制备本发明的化合物(例如式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的化合物)(其为(例如基本上)纯的形式)的方法,该方法包括以下步骤:
·提供在具有一种或多种杂质的混合物中的化合物(例如E4、E9、E10或E16);和
·从混合物中去除至少一部分杂质。
在该方面的某些实施方案中,除去一部分杂质的合适方法是众所周知的,包括例如柱色谱法、选择性沉淀、用所需溶剂不溶于其中的合适溶剂对杂质进行研磨和洗脱等。
去除的杂质比例可以使得该化合物以基本上纯的形式制备;也就是说,例如以如上所述的百分比纯度。
在其他实施方案中,通过合成不纯形式的化合物来提供混合物。
在第十三方面,本发明还涉及一种用于制备药物组合物的方法,所述方法包括与药学上可接受的赋形剂(例如本文其他地方所述的赋形剂,例如载体的药学上可接受的稳定剂)一起配制本发明的化合物(例如式(Ia)、(IIa)、(IIIa)、(IVa)、(Va)、(VIa)、(VIIa)或(VIIIa)的化合物)的步骤。
在这样的实施方案的一个具体实施方案中,所述药物组合物的制造量大于约10g;例如大于约100g,并且适当地大于约1Kg(或大于10Kg)。
在该方面的一个实施方案中,药物组合物以单位剂型制造。
在某些这样的实施方案中,药物组合物形成为片剂、囊片或胶囊剂,特别是作为片剂或胶囊剂。
在此类实施方案的另一个中,所述药物组合物形成为薄膜衣片或薄膜衣囊片。例如,该方法可以进一步包括用薄膜(特别是用药物有效的薄膜)包衣片剂或囊片的步骤。
在第十四方面,本发明还涉及一种制备药物包装的方法,包括以下步骤:
·将本发明的药物组合物插入包装中,从而形成包含药物组合物的包装;以及任选的
·在包装中插入说明药物组合物处方信息的单张。
在这样的实施方案之一中,药物组合物为成品药物形式。例如,其形式为将被施用(或最终准备被施用)给对象。
包装可以是初级包装和/或二次包装。例如,初级包装可以是玻璃小瓶或泡罩带。典型的(但非限制性)二次包装可以是盒子或纸箱,在某些实施例中,可以用其所包含的药物组合物的名称、强度和/或品牌进行标记。
包装可能还包含单张或其他信息。特别地,描述(向患者和/或主治医师)关于包装中包含的药物组合物的重要信息或细节,例如如何施用、推荐剂量、安全性和/或副作用信息。
在第十五方面,本发明还涉及包含本发明的药物组合物的药物包装。优选地,其中药物组合物为成品药物形式。在该方面的某些实施方案中,药物包装可进一步包含描述药物组合物的处方信息的单张。
鉴于上述情况,应当理解,本发明还涉及以下逐项实施方案:
项目1.一种化合物,选自下式的激酶抑制剂:
Figure BDA0003884477230001051
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;
其中:
Hy为杂芳基或杂环基,其任选地被一个或多个独立地选择的R1e取代;
每个R1e独立地选自R1a、R1b、R1c和R1d
R1a和R1d中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R1b和R1c中的每一个独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-7环烷基、C6-10芳基、3至7元杂芳基、3至7元杂环基、O(CH2)0-2(C3-7环烷基)、-O(CH2)0-2(C6-10芳基)、-O(CH2)0-2(3至7元杂芳基)、-O(CH2)0-2(3至7元杂环基)、-NH(CH2)0-2(C3-7环烷基)、-NH(CH2)0-2(C6-10芳基)、-NH(CH2)0-2(3至7元杂芳基)、-NH(CH2)0-2(3至7元杂环基)、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为0、1或2,并且C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-7环烷基、C6-10芳基、3至7元杂芳基和3至7元杂环基基团中的每一个任选地被1、2或3个独立地选自-OH、甲基、乙基、-OCH3、-SCH3和-NH2-z(CH3)z的部分取代;
R2为H;
R3选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1- 2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R4为H;
R5为-L-R6
L选自键、C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基和-(CH2)m-[Y-(CH2)n]o-,其中m是1至6之间的整数,n是0至3之间的整数,o是1至3之间的整数,其中如果n为0则o为1;Y独立地选自O、S和-N(R13)-;并且C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基、-(CH2)m-和-(CH2)n-基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选择的R30取代;
R6是5元单环杂芳基,其含有至少一个S环原子并且被一个或多个独立地选择的R7取代;
R7独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代,其中R7中的至少一个为F和/或R7中的至少一个被一个或多个F原子取代;
A选自S、O、NR8和C(R9)2
R8选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R9独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1- 2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
X独立地选自O、S和N(R14);
E是O或S;
R11独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R12和R13中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,或者R12和R13能够与它们所连接的氮原子连接在一起以形成基团-N=CR15R16,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R14独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基和-OR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R15和R16中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基和-NHyR20 2-y,或者R15和R16能够与它们所连接的原子连接在一起以形成任选地被一个或多个独立地选择的R30取代的环,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
y是0到2之间的整数;
R20独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;并且
R30是一级取代基,并且在每种情况下独立地选自烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR71、-N(R72)(R73)、-S(O)0-2R71、-S(O)1-2OR71、-OS(O)1-2R71、-OS(O)1-2OR71、-S(O)1-2N(R72)(R73)、-OS(O)1-2N(R72)(R73)、-N(R71)S(O)1-2R71、-NR71S(O)1-2OR71、-NR71S(O)1-2N(R72)(R73)、-OP(O)(OR71)2、-C(=X1)R71、-C(=X1)X1R71、-X1C(=X1)R71和-X1C(=X1)X1R71,和/或与环烷基或杂环基基团的相同碳原子结合的任何两个R30能够连接在一起形成=X1,其中作为一级取代基的烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个二级取代基取代,其中所述二级取代基在每种情况下独立地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OR81、-N(R82)(R83)、-S(O)0-2R81、-S(O)1-2OR81、-OS(O)1-2R81、-OS(O)1-2OR81、-S(O)1-2N(R82)(R83)、-OS(O)1-2N(R82)(R83)、-N(R81)S(O)1-2R81、-NR81S(O)1-2OR81、-NR81S(O)1-2N(R82)(R83)、-OP(O)(OR81)2、-C(=X2)R81、-C(=X2)X2R81、-X2C(=X2)R81和-X2C(=X2)X2R81,和/或与作为一级取代基的环烷基或杂环基基团的相同碳原子结合的任何两个二级取代基能够连接在一起形成=X2,其中作为二级取代基的C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个三级取代基取代,其中所述三级取代基在每种情况下独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基,和/或与作为二级取代基的3至14元环烷基或杂环基基团的相同碳原子结合的任何两个三级取代基能够连接在一起形成=O、=S、=NH或=N(C1-3烷基);
其中
R71、R72和R73中的每一个独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至7元杂环基,其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至7元杂环基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z的取代基取代,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;
R81、R82和R83中的每一个独立地选自H、C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至6元杂环基,其中C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至6元杂环基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z的取代基取代,其中每个z独立为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;并且
X1和X2中的每一个独立地选自O、S和N(R84),其中R84为H或C1-3烷基。
项目2.根据项目1所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基基团以及-N(C1-3烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代。
项目3.根据项目1或2所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自烷基、-O(烷基)、-NH(烷基)和-N(烷基)2,其中烷基、-O(烷基)和-NH(烷基)的烷基基团和-N(烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代。
项目4.根据项目1至3中任一项所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基基团和-N(C1-3烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代。
项目5.根据项目1至4中任一项所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个是C1-3烷基,其中C1-3烷基的烷基基团被一个或多个F原子取代。
项目6.根据项目1至5中任一项所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2
项目7.根据项目1至6中任一项所述的化合物,其中一个R7在相对于R6与所述化合物的其余部分结合的环原子的位置2处与C环原子连接,优选地其中所述R7为F和/或所述R7被一个或多个F原子取代。
项目8.根据项目1至7中任一项所述的化合物,其中一个R7在相对于R6与所述化合物的其余部分结合的环原子的位置5处与C环原子连接,优选地其中所述R7为F和/或所述R7被一个或多个F原子取代。
项目9.根据项目1至8中任一项所述的化合物,其中R6选自
Figure BDA0003884477230001081
其中
Figure BDA0003884477230001082
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
项目10.根据项目1至9中任一项所述的化合物,其中R6被至少两个R7取代。
项目11.根据项目1至10中任一项所述的化合物,其中R6被两个彼此不同的R7取代。
项目12.根据项目1至11中任一项所述的化合物,其中一个R7在相对于R6与所述化合物的其余部分结合的环原子的位置2处与C环原子连接,并且一个R7在相对于R6与所述化合物的其余部分结合的环原子的位置5处与C环原子连接,优选其中所述R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个被一个或多个F原子取代。
项目13.根据项目1至12中任一项所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,并且一个R7选自卤素、-CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选地选自Cl、Br、F、CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3
项目14.根据项目1至13中任一项所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选地选自-CH2F和-CHF2,并且一个R7是Cl。
项目15.根据项目1至12中任一项所述的化合物,其中一个R7是F,并且一个R7选自卤素、CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选选自Cl、Br、F、CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3
项目16.根据项目1至12和15中任一项所述的化合物,其中一个R7为F且一个R7为Cl。
项目17.根据项目1至16中任一项所述的化合物,其中R6选自噻吩基、噻唑基和噻二唑基,其各自被一个或多个独立选择的R7取代。
项目18.根据项目1至17中任一项所述的化合物,其中R6选自噻吩基和噻唑基,其各自被一个或多个独立选择的R7取代。
项目19.根据项目1至18中任一项所述的化合物,其中R6是被一个或多个独立选择的R7取代的噻吩基。
项目20.根据项目1至19中任一项所述的化合物,其中R6通过其与所述化合物的其余部分结合的R6的环原子是C原子。
项目21.根据项目1至20中任一项所述的化合物,其中R6的S环原子不与R6与所述化合物的其余部分结合的环原子相邻。
项目22.根据项目1至21中任一项所述的化合物,其中R6选自:
Figure BDA0003884477230001091
其中
Figure BDA0003884477230001092
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
项目23.根据项目1至22中任一项所述的化合物,其中R6选自:
Figure BDA0003884477230001093
其中
Figure BDA0003884477230001094
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
项目23a.根据项目1至22中任一项所述的化合物,其中R6选自:
Figure BDA0003884477230001095
其中
Figure BDA0003884477230001096
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
项目24.根据项目1至23a中任一项所述的化合物,其中L选自L选自键、C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基和-(CH2)m-[Y-(CH2)n]o-,其中m为1、2或3,n为0、1或2,o为1、2或3,其中如果n为0则o为1;Y独立地选自O、S和NH,其中C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基、-(CH2)m-和-(CH2)n-基团中的每一个任选地被一个或两个独立选择的R30取代。
项目25.根据项目1至24中任一项所述的化合物,其中L选自:键;C1亚烷基,任选地被一个R30取代;C2亚烷基(特别是1,2-亚乙基或1,1-亚乙基),任选地被一个R30取代;C3亚烷基(特别是三亚甲基),任选地被一个R30取代;C4亚烷基(特别是四亚甲基或2,4-丁二基),任选地被一个R30取代;-(CH2)mO-;和-(CH2)mNH-,其中m为1、2或3。
项目26.根据项目1至25中任一项所述的化合物,其中L选自:键;C1亚烷基,任选地被一个R30取代;C2亚烷基(特别是1,2-亚乙基或1,1-亚乙基),任选地被一个R30取代;-(CH2)O-;和-(CH2)NH-;优选地,其中L选自键、-(CH2)-和-(CH2)2-。
项目27.根据项目1至26中任一项所述的化合物,其中L是键。
项目28.根据项目1至27中任一项所述的化合物,其中E为O。
项目29.根据项目1至28中任一项所述的化合物,其中A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2
项目30.根据项目1至29中任一项所述的化合物,其中A是S、O或N(CH3)2
项目31.根据项目1至30中任一项所述的化合物,其中A是S。
项目32.根据项目1至31中任一项所述的化合物,其中Hy是3至10元杂芳基或3至10元杂环基,其各自任选地被一个或多个独立选择的R1e取代。
项目33.根据项目1至32中任一项所述的化合物,其中Hy选自5至6元单环杂芳基、5至6元单环杂环基、9至10元单环杂环基和8至10元双环杂环基,其各自任选地被一个或多个独立选择的R1e取代。
项目34.根据项目1至33中任一项所述的化合物,其中Hy是杂芳基或杂环基,其包含至少一个N环原子并且任选地被一个或多个独立选择的R1e取代。
项目35.根据项目1至34中任一项所述的化合物,其中Hy为:
Figure BDA0003884477230001101
其中
Figure BDA0003884477230001102
代表Hy与所述化合物的其余部分结合的键;R1a、R1b和R1c如在权利要求1中所定义;并且B是N或CR1d
项目36.根据项目1至35中任一项所述的化合物,其中R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,其中烷基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代。
项目37.根据项目36所述的化合物,其中任选地取代R1a的一个或两个独立地选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2。
项目38.根据项目1至37中任一项所述的化合物,其中R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至11元杂环基,其中3至11元杂环基任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立地选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2。
项目39.根据项目1至38中任一项所述的化合物,其中R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、六氢嘧啶基、六氢哒嗪基、吗啉基、1,2-恶嗪烷基、1,3-恶嗪烷基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基、氮杂螺酮基、二氮杂螺酮基、氮杂螺癸烷基、二氮杂螺癸烷基、氮杂螺十一烷基和二氮杂螺十一烷基,其中哌嗪基、哌啶基、六氢嘧啶基、六氢哒嗪基、吗啉基、1,2-恶嗪烷基、1,3-恶嗪烷基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基、氮杂螺酮基、二氮杂螺酮基、氮杂螺癸烷基、二氮杂螺癸烷基、氮杂螺十一烷基和二氮杂螺十一烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选择的R30取代,其中任选地取代R1a的所述一个或两个独立地选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2。
项目40.根据项目1至39中任一项所述的化合物,其中R1a选自-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基、二氮杂螺酮基,其中哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选择的R30取代,其中任选地取代R1a的所述一个或两个独立地选择的R30独立地选自甲基、-OH、=O、-OCH3、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙氧基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。
项目41.根据项目1至40中任一项所述的化合物,其中R1a选自:4-(2-羟乙基)哌嗪基,4-甲基哌嗪基,3,4-二甲基哌嗪基,4-甲基-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,3-氧代哌嗪-1-基,2-甲基吗啉-4-基,3-甲基哌嗪-1-基,3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基,3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基,3-(二甲基氨基)哌啶-1-基,3-(甲氧基)哌啶-1-基,3-(羟基)哌啶-1-基,3-(二甲基氨基)吡咯烷-1-基,3-(羟基)吡咯烷-1-基,3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基,3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基,3-(甲基磺酰基氨基)吡咯烷-1-基,7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基,4-[2-(二甲基氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
项目42.根据项目1至41中任一项所述的化合物,其中R1a是非对称的。
项目43.根据项目42所述的化合物,其中R1a选自3,4-二甲基哌嗪基、4-甲基-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、3-氧代哌嗪-1-基、2-甲基吗啉-4-基、3-甲基哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基、3-(二甲基氨基)哌啶-1-基、3-(甲氧基)哌啶-1-基、3-(羟基)哌啶-1-基、3-(二甲基氨基)吡咯烷-1-基、3-(羟基)吡咯烷-1-基、3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基、3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基、3-(甲基磺酰基氨基)吡咯烷-1-基、7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基、4-[2-(二甲基氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
项目44.根据项目1至43中任一项所述的化合物,其中R1a通过其与所述化合物的其余部分结合的R1a的原子是除C以外的原子,优选为N原子。
项目45.根据项目44所述的化合物,其中R1a选自杂环基、杂芳基、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中杂环基和杂芳基基团中的每一个通过除C之外的原子与化合物的其余部分结合并且任选地被一个或多个独立选择的R30取代。
项目46.根据项目44或45所述的化合物,其中R1a是杂环基,其包含至少一个N环原子并且通过N环原子与化合物的其余部分结合。
项目47.根据项目44至46中任一项所述的化合物,其中R1a选自:
Figure BDA0003884477230001121
其中
Figure BDA0003884477230001122
代表R1a与所述化合物的其余部分结合的键。
项目48.根据项目47所述的化合物,其中R1a选自:
Figure BDA0003884477230001123
其中
Figure BDA0003884477230001124
代表R1a与所述化合物的其余部分结合的键。
项目49.根据项目1至48中任一项所述的化合物,其中R1b和R1c中的每一个独立地选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z为0、1或2;并且苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2。
项目50.根据项目1至49中任一项所述的化合物,其中R1b和R1c中的至少一个选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2。
项目51.根据项目1至50中任一项所述的化合物,其中R1b为H;R1c是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,优选甲基。
项目52.根据项目1至51中任一项所述的化合物,其中R1c通过其与所述化合物的其余部分结合的R1c的原子是C原子。
项目53.根据项目52所述的化合物,其中R1c独立地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、-CF3、-CN、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)和-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z是0、1或2并且C1-6烷基、C2-6烯基和C2-6炔基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自-OH、甲基、乙基、-OCH3、-SCH3和-NH2-z(CH3)z的部分取代。
项目54.根据项目1至50中任一项所述的化合物,其中R1b为甲基、乙基、丙基或异丙基,优选甲基;并且R1c是H。
项目55.根据项目1至54中任一项所述的化合物,其中B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH和NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2。
项目56.根据项目1至55中任一项所述的化合物,其中B是N。
项目57.根据项目1至56中任一项所述的化合物,其中R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基),-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z是0、1或2,并且其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基基团中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代。
项目58.根据项目1至57中任一项所述的化合物,其中R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中苯基基团任选地被一个、两个或三个独立地选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;并且其中z为0、1或2。
项目59.根据项目1至58中任一项所述的化合物,其中R3选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基和卤素。
项目60.根据项目1至59中任一项所述的化合物,其中R3是H。
项目61.根据项目1或35所述的化合物,其中:
L是键;并且
(A)R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,优选经由除C之外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中烷基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代,其中,优选地,每个R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基,2-(N,N-二甲氨基)乙氧基,和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2;和/或
(B)R1b和R1c中的每一个独立地选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z为0、1或2;并且苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z是0、1或2,优选其中R1b和R1c中的一个是H;R1b和R1c中的另一个是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选R1b和R1c中的另一个是甲基;和/或
(C)R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z是0、1或2并且其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基基团中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代,优选其中R3是H;和/或
(D)R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自烷基、-OR11和-N(R12)(R13),其中烷基和R11基团中的每一个以及R12和R13基团中的至少一个被一个或多个F原子取代;和/或
(E)A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2,优选其中A为S;和/或
(F)B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2,优选其中B为N;和/或
(G)E是O或S,优选O。
项目62.根据项目1或35所述的化合物,其中:
L是键;并且
(A)R1a选自烷基、-O(烷基)、-S(烷基)、-NH(烷基)、-N(烷基)2和杂环基,优选经由除C之外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中烷基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代,其中,优选地,每个R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基,2-(N,N-二甲氨基)乙氧基,和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2;并且
(B)R1b和R1c中的每一个独立地选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z为0、1或2;并且苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z是0、1或2,优选其中R1b和R1c中的一个是H;R1b和R1c中的另一个是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选R1b和R1c中的另一个是甲基;并且
(C)R3选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z是0、1或2并且其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-6环烷基和苯基基团中的每一个任选地被一个或多个独立选择的R30取代,优选其中R3是H;并且
(D)R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自烷基、-OR11和-N(R12)(R13),其中烷基和R11基团中的每一个以及R12和R13基团中的至少一个被一个或多个F原子取代;并且
(E)A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2,优选其中A为S;并且
(F)B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自卤素、-OH、-OCH3、-SCH和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2,优选其中B为N;并且
(G)E是O或S,优选O。
项目63.根据项目1或35所述的化合物,其中:
L是键;并且
(A')R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至11元杂环基,优选通过除C之外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中3至11元杂环基任选地被一个或两个独立地选择的R30取代,其中任选取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2;和/或
(B')R1b和R1c中的至少一个选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z是0、1或2,并且R1b和R1c中的另一个如上文项目61中(B)中所定义,优选其中R1b和R1c中的一个是H;并且R1b和R1c中的另一个是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选R1b和R1c中的另一个是甲基;和/或
(C')R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中苯基基团任选地被一个、两个或三个独立地选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;并且其中z是0、1或2,优选地其中R3是H;和/或
(D')R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基基团和-N(C1-3烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代;
(E')A为S、O或N(CH3)2,优选其中A为S;和/或
(F')B为N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,优选其中B是N;和/或
(G')E是O或S,优选O。
项目64.根据项目1或35所述的化合物,其中:
L是键;并且
(A')R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至11元杂环基,优选通过除C之外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中3至11元杂环基任选地被一个或两个独立地选择的R30取代,其中任选取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1-3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2;并且
(B')R1b和R1c中的至少一个选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z是0、1或2,并且R1b和R1c中的另一个如上文项目61中(B)中所定义,优选其中R1b和R1c中的一个是H;并且R1b和R1c中的另一个是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选R1b和R1c中的另一个是甲基;并且
(C')R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中苯基基团任选地被一个、两个或三个独立地选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;并且其中z是0、1或2,优选地其中R3是H;并且
(D')R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基基团和-N(C1-3烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代;
(E')A为S、O或N(CH3)2,优选其中A为S;并且
(F')B为N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,优选其中B是N;并且
(G')E是O或S,优选O。
项目65.根据项目61至64中任一项所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2
项目66.根据项目61至65中任一项所述的化合物,其中一个R7在相对于R6结合到化合物的其余部分的环原子的位置2处连接到C环原子,优选地其中所述R7是F和/或所述R7被一个或多个F原子取代。
项目67.根据项目61至66中任一项所述的化合物,其中一个R7在相对于R6结合到化合物的其余部分的环原子的位置5处连接到C环原子,优选地其中所述R7是F和/或所述R7被一个或多个F原子取代。
项目68.根据项目61至67中任一项所述的化合物,其中R6被至少两个R7取代。
项目69.根据项目61至68中任一项所述的化合物,其中R6被两个彼此不同的R7取代。
项目70.根据项目61至69中任一项所述的化合物,其中一个R7在相对于R6结合到化合物的其余部分的环原子的位置2处连接到C环原子,并且一个R7在相对于R6结合到化合物的其余部分的环原子的位置5处连接到C环原子,优选其中所述R7中的至少一个是F和/或所述R7中的至少一个被一个或多个F原子取代。
项目71.根据项目61至70中任一项所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,并且一个R7选自卤素、-CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选地选自Cl、Br、F、-CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3
项目72.根据项目61至71中任一项所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2,并且一个R7为Cl。
项目73.根据项目61至70中任一项所述的化合物,其中一个R7是F,并且一个R7选自卤素、CH3、-CH2(hal)、-CH(hal)2和-C(hal)3,更优选选自Cl、Br、F、CH3、-CH2F、-CHF2和-CF3
项目74.根据项目61至70和73中任一项所述的化合物,其中一个R7为F且一个R7为Cl。
项目75.根据项目61至74中任一项所述的化合物,其中R6选自噻吩基、噻唑基和噻二唑基,优选选自噻吩基和噻唑基,更优选R6为噻吩基,其中噻吩基、噻唑基和噻二唑基基团中的每一个被一个或多个独立选择的R7取代。
项目76.根据项目61至75中任一项所述的化合物,其中R6通过其与化合物的其余部分结合的R6的环原子是C原子。
项目77.根据项目61至76中任一项所述的化合物,其中R6的S环原子不与R6通过其结合到化合物的其余部分的环原子相邻。
项目78.根据项目61至64中任一项所述的化合物,其中R6选自
Figure BDA0003884477230001171
其中
Figure BDA0003884477230001172
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
项目79.根据项目61至64中任一项所述的化合物,其中R6选自
Figure BDA0003884477230001181
其中
Figure BDA0003884477230001182
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
项目80.根据项目61至79中任一项所述的化合物,其中R1a选自-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基,其中哌嗪基、哌啶基、吗啉基、吡咯烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基和二氮杂螺酮基基团中的每一个任选地被一个或两个独立选择的R30取代,其中任选地取代R1a的一个或两个独立选择的R30独立地选自甲基、-OH、=O、-OCH3、2-羟乙基、2-(N,N-二甲氨基)乙基、2-(甲氧基)乙氧基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2。
项目81.根据项目61至80中任一项所述的化合物,其中R1a选自:4-(2-羟乙基)哌嗪基,4-甲基哌嗪基,3,4-二甲基哌嗪基,4-甲基-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,3-氧代哌嗪-1-基,2-甲基吗啉-4-基,3-甲基哌嗪-1-基,3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基,3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基,3-(二甲基氨基)哌啶-1-基,3-(甲氧基)哌啶-1-基,3-(羟基)哌啶-1-基,3-(二甲基氨基)吡咯烷-1-基,3-(羟基)吡咯烷-1-基,3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基,3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基,3-(甲基磺酰基氨基)吡咯烷-1-基,7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基,4-[2-(二甲基氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
项目82.根据项目61至81中任一项所述的化合物,其中R1a是非对称的。
项目83.根据项目61至82所述的化合物,其中R1a通过其与所述化合物的其余部分结合的R1a的原子是除C以外的原子,优选为N原子。
项目84.根据项目61至83中任一项所述的化合物,其中R1c通过其与所述化合物的其余部分结合的R1c的原子是C原子。
项目85.根据项目61至84中任一项所述的化合物,其中R1b是H;R1c是甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,优选甲基。
项目86.根据项目61至85中任一项所述的化合物,其中A是S;B是N;和/或E是O。
项目87.根据项目61至86中任一项所述的化合物,其中A是S;B是N;E是O。
项目88.根据项目61至87中任一项所述的化合物,其中R3选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、苯基和卤素,优选H。
项目89.根据项目61至88中任一项所述的化合物,其中R3是H。
项目90.根据项目1至89中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001191
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目91.根据项目1至90中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001192
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目92.根据项目1至90中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001201
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目93.根据项目1至90中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001202
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目94.根据项目1至90中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001203
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目95.根据项目1至89中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001211
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目96.根据项目1至95中任一项所述的化合物,其中所述化合物为基本上纯的形式,特别是大于约90%、95%、98%或99%的纯形式。
项目97.一种药物组合物,其包含项目1至96中任一项所述的化合物,并且任选地还包含药学上可接受的赋形剂。
项目98.根据项目97所述的药物组合物,其被配制用于口服给药。
项目99.根据项目97或98所述的药物组合物,其为单位剂型。
项目100.项目1至96中任一项所述的化合物或项目97至99中任一项所述的药物组合物,其用于治疗。
项目101.一种用于治疗对象的疾病、病症或病状的方法,其包括向所述对象施用项目1至96中任一项所述的化合物或项目97至99中任一项所述的药物组合物,任选地其中所述疾病、病症或病状与激酶有关。
项目102.一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,包括向所述对象施用项目1至96中任一项所述的化合物或项目97至99中任一项所述的药物组合物。
项目103.一种用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向所述对象施用所述化合物或药物组合物,其中,所述化合物是项目1至96中任一项所述的化合物,并且所述药物组合物是项目97至99中任一项所述的药物组合物。
项目104.根据项目103所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述增殖性疾病是癌症或肿瘤。
项目105.根据项目104所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述癌症是实体瘤。
项目106.根据项目100和103至105中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中治疗还包括向所述对象施用免疫检查点抑制剂。
项目107.根据项目100和103至106中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中:(i)增殖性疾病在对象的标准治疗中进展;或(ii)对象无法接受标准治疗。
项目108.根据项目100和103至107中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括抑制对象中的SIK3。
项目109.根据项目100和103至108中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗涉及使所述对象中与增殖性疾病相关的细胞对细胞介导的免疫应答敏感。
项目110.根据项目100和103至109中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中向对象施用所述化合物或药物组合物以使与增殖性疾病相关的细胞对由TNF诱导的杀伤敏感。
项目111.根据项目100和103至110中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中治疗包括将所述对象中与增殖性疾病有关的细胞暴露于:(i)TNF、TNF变体、和/或TNFR12或TNFR1信号传导的激动剂;以及(ii)所述化合物或药物组合物。
项目112.根据项目111所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中暴露于所述对象中与增殖性疾病有关的细胞的TNF的量增加。
项目113.根据项目111或112所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中:(i)向所述对象施用TNF、TNF变体、或TNFR1或TNFR2信号传导的激动剂;(ii)向所述对象施用能够诱导或诱导了与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF、TNF变体、或TNFR1或TNFR2信号传导的激动剂的试剂;或(iii)通过增加对象血浆和/或此类细胞环境中的TNF量的药物、治疗或其他方法诱导与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF。
项目114.根据项目111至113中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中通过增加对象血浆和/或此类细胞环境中的TNF量的药物、治疗或其他方法诱导与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF。
项目114a.根据项目100和103至114中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括在给定的二十四小时内一次或多于一次施用化合物或药物组合物,例如一天一次或多于一次。
项目114b.根据项目114a所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括在给定的二十四小时内两次或多于两次施用化合物或药物组合物,例如一天两次或多于两次。
项目114c.根据项目100和103至114b中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括每天两次(bis in die;BID)施用所述化合物或所述药物组合物。
项目114d.根据项目100和103至114中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括每二十四小时时段一次或多于一次施用化合物或药物组合物,持续两个或多于两个连续的二十四小时时段,例如每天一次或多于一次,持续连续的两天或多于两天,并且任选地多达约二十八(例如多达约十八或约十四)个连续的二十四小时时段或连续天数。
项目114e.根据项目100和103至114d中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括每二十四小时时段一次或多于一次施用化合物或药物组合物,持续约28、21 18、14、7、5或3个或更少的连续的二十四小时时段,例如每天一次或多于一次,持续约28、21、18、14、7、5或3或更少的连续的连续两天。
项目114f.根据项目100和103至114e中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括每天两次(bis in die;BID)施用化合物或药物组合物,持续约十八或约十四或约七(或在每种情况下,更多)个连续的二十四小时时段,例如每天两次(bisin die;bid),持续约十八或约十四或约七个连续的(或在每种情况下,更多)天数。
项目115.一种用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向所述所述施用所述化合物或药物组合物,其中所述化合物选自以下化合物(a)至(c),并且所述药物组合物包含这样的化合物和任选的药学上可接受的赋形剂:
(a)项目1至96中任一项所述的化合物;以及
(b)具有下式的化合物:
Figure BDA0003884477230001231
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合,
其中:
Hy、R2、R3、A、E和R4如项目1所定义;
R5'是-L-R6'
L是键;
R6'是5或6元杂芳基,其任选地被一个或多个独立地选择的R7'取代;
R7'独立地选自R7、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;并且
R11、R12、R13、X和R30如项目1所定义,
任选地,附带条件是
(I)当A为S,R3为H,E为O,并且R6'为1-[2,4-双(三氟甲基)苄基]-1H-吡唑-4-基时,则Hy不是2-吡啶基;
(II)当Hy为1-{(2E)-4-[(2-2-甲氧基乙基)氨基]-1-氧代-2-丁烯-1-基}哌啶-4-基,R3为H,A为O,E为O时,则R6'不是5-甲基-吡啶-2-基;
(III)当R3为三氟甲基,A为O,E为O,并且
(i)R6'是6-{4-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]哌嗪-1-基}吡啶-3-基时,则Hy不是1-(苯甲基)-哌啶-4-基、1-(苯甲基)吡咯烷-3-基或四氢-2H-吡喃-4-基;或者
(ii)Hy为1-(苯甲基)哌啶-4-基时,则R6'不是6-(3-{[(2-氟苯基)氨基甲酰基]氨基}-吡咯烷-1-基)吡啶-3-基或6-({1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]哌啶-4-基}氨基)吡啶-3-基;或者
(iii)Hy为1-(苯甲基)吡咯烷-3-基时,则R6'不是6-({(3S)-1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]-吡咯烷-3-基}氨基)吡啶-3-基或6-({(3R)-1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]吡咯烷-3-基}-氨基)吡啶-3-基;和/或
(IV)当Hy为
Figure BDA0003884477230001241
并且
(1)R1a为4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基或Cl,R1b为H,R1c为甲基,B为N,E为O,R3为H,并且A为S时,则R6'不是4-氯-2-甲基吡啶-3-基;
(2)E为O,B为CR1d,并且R1d为H、F、Cl或Br时,则R1a不是H;
(c)具有以下式(Ic)的化合物:
Figure BDA0003884477230001242
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合,
其中:
R1a、R1b、R1c、R2、R3、A、E和R4如项目1所定义;
B为N或CR1d,其中R1d如项目1所定义;
R5”是-L-R6”
L如项目1所定义;
R6”为杂芳基或杂环基,其各自任选地被一个或多个独立地选择的R7'取代;
R7'独立地选自R7、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,和/或与作为杂环基基团的R6”的相同原子结合的任何两个R7'能够结合在一起形成=O,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;并且
R11、R12、R13、X和R30如项目1所定义,
任选地,附带条件是
(1)当R1a为4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基或Cl,R1b为H,R1c为甲基,B为N,E为O,R3为H,A为S,并且L为键时,则R6”不是4-氯-2-甲基吡啶-3-基;
(2)当R1a为甲氧基,R1b为H,R1c为甲氧基,B为N,E为O,R3为H,A为S,并且L为键时,则R6”不是2,2-二氟-5H-1,3-二氧杂[4,5-f]苯并咪唑-6-基;
(3)当R3为H,A为S,L为键,R6”为1-甲基-4-哌啶基,R1b为H,B为N,E为O,并且
(i)R1a为甲基时,则R1c不是N-叔丁氧基羰基哌啶-4-基;或者
(ii)R1c为甲基时,则R1a不是N-叔丁氧基羰基哌啶-4-基或N-叔丁氧基羰基哌啶-3-基;
(4)当E为O,B为CR1d,并且R1d为H、F、Cl或Br时,则R1a不是H;和/或
(5)当R1a为甲基,R1b和R1c各自为H,B为CH,E为O,A为S,并且R3为甲基时,则R5”不是1,3-苯并二恶唑-5-基甲基、2-呋喃基甲基、1,3-苯并二恶唑-5-基、2-(2-噻吩基)乙基、2-(4-吗啉基)乙基、2-(2-吡啶基)乙基、2-吡啶基甲基或四氢-2-呋喃基甲基;
(6)当A为S,R3为H,E为O,L为键,R6”是1-[2,4-双(三氟甲基)苄基]-1H-吡唑-4-基,R1a为H,R1b为H,R1c为H,并且B是CR1d时,则R1d不是H;并且
其中所述增殖性疾病选自(α)至(γ)中的一种或多种:
(α)增殖性疾病或与所述增殖性疾病相关的细胞的特征在于,存在肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白,例如存在磷酸化的MEF2C蛋白和/或存在作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地其中所述增殖性疾病或与所述增殖性疾病相关的细胞的进一步特征在于,存在磷酸化的组蛋白脱乙酰基酶4(HDAC4)蛋白,例如存在被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(β)增殖性疾病或与所述增殖性疾病相关的细胞的特征在于:(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变;和/或
(γ)混合表型急性白血病(MPAL)。
项目115a.根据项目115所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述化合物是如项目115的(a)中所定义的化合物。
项目115b.根据项目115所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述化合物是如项目115的(b)中所定义的化合物,并且R6’是5元单环杂芳基,其包含至少一个选自N、O和S的环杂原子并且任选地被一个、两个或三个独立地选择的R7’取代。
项目115c.根据项目115所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述化合物是如项目115的(c)中所定义的化合物,并且R6”是5或6元杂芳基,其含有至少一个S环原子并且任选地被一个、两个或三个独立地选择的R7’取代。
项目116.根据项目115至115c中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述化合物选自:
Figure BDA0003884477230001261
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
项目117.一种用于治疗对象的增殖性疾病的方法,包括向所述对象施用如项目115至115c项中任一项所定义的化合物或药物组合物,其中所述增殖性疾病如项目115中所定义。
项目118.根据项目115至115c中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物或项目117所述的方法,其中所述增殖性疾病的特征在于,或与所述增殖性疾病有关的细胞的特征在于:(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因的重排;和/或(iii)存在KMT2A融合癌蛋白,优选地其中:
(a)人类染色体易位是选自以下中的一种:t(4,11)、t(9,11)、t(11,19)、t(10,11)和t(6,11);和/或
(b)所述KMT2A基因的重排包含以下融合或所述KMT2A融合癌蛋白表达自包含以下融合的重排:KMT2A基因与易位伴侣基因的融合,所述易位伴侣基因选自:AF4,AF9,ENL,AF10,ELL和AF6。
项目119.根据项目115至116和118中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物或项目117或118所述的方法,其中所述增殖性疾病是癌症或肿瘤,优选造血系统恶性肿瘤和/或淋巴系统恶性肿瘤。
项目120.根据项目115至116、118和119中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物或项目117至119中任一项所述的方法,其中所述增殖性疾病为:(i)骨髓瘤,优选多发性骨髓瘤;或(ii)白血病,优选急性髓细胞性白血病(AML)或急性淋巴细胞性白血病(ALL),更优选T细胞急性淋巴细胞性白血病(T-ALL)、MLL-AML或MLL-ALL。
项目121.根据项目115至116、118和120中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物或项目117至120中任一项所述的方法,其中所述对象是人类儿科患者和/或是携带KMT2A重排(KMT2A-r)的对象;优选地其中这样的对象是患有KMT2A-r白血病的患者。
项目122.一种用于确定患有增殖性疾病的对象适合项目115至115c中的任一项中定义的化合物或药物组合物治疗的方法,该方法包括:在已经从所述对象获得并且优选包含与所述增殖性疾病有关的细胞的生物样品中,确定:
(X)存在MEF2C蛋白,例如存在磷酸化的MEF2C蛋白和/或存在作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地其中所述增殖性疾病的特征还在于存在磷酸化的HDAC4蛋白,例如存在被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(Y)(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在KRAS基因和/或RUNX1基因中存在突变,
其中,所述生物样品中所述蛋白质、易位、重排、癌蛋白和/或突变的存在,表明所述对象适合用所述化合物或药物组合物治疗。
项目123.根据项目122所述的方法,包括在已经从所述对象获得的生物样品中确定:(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因的重排;和/或(iii)存在KMT2A融合癌蛋白,优选地其中:
(a)所述人类染色体易位是选自t(4,11)、t(9,11)、t(11,19)、t(10,11)和t(6,11)中的一种;和/或
(b)所述KMT2A基因的重排包含以下融合或所述KMT2A融合癌蛋白表达自包含以下融合的重排:KMT2A基因与易位伴侣基因的融合,所述易位伴侣基因选自:AF4,AF9,ENL,AF10,ELL和AF6。
项目124.根据项目122或123所述的方法,其中所述增殖性疾病是癌症或肿瘤,优选造血系统恶性肿瘤和/或淋巴系统恶性肿瘤。
项目125.根据项目122至124中任一项所述的方法,其中所述增殖性疾病为:(i)骨髓瘤,优选多发性骨髓瘤;或(ii)白血病,优选急性髓细胞性白血病(AML)或急性淋巴细胞性白血病(ALL),更优选T细胞急性淋巴细胞性白血病(T-ALL)、MLL-AML或MLL-ALL。
项目126.根据项目122至125中任一项所述的方法,其中所述对象是人类儿科患者和/或是携带KMT2A重排(KMT2A-r)的对象;优选地其中这样的对象是患有KMT2A-r白血病的患者。
项目127.根据项目122至126中任一项所述的方法,其进一步包括以下步骤:向对象施用项目115或116中定义的化合物或药物组合物,其中在已经从所述对象获得的生物样品中确定了所述蛋白质、易位、癌蛋白和/或突变的存在或数量。
项目128.一种中间体,其选自具有式(Id)的化合物:
Figure BDA0003884477230001271
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,
其中:
R40中的一个是F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代,并且另一个R40选自卤素、-Me、-OMe、-Et和-OEt;并且
R41选自H和氨基保护基团,
附带条件是
(1)该中间体不是2-溴-4-(三氟甲基)噻吩-3-胺;
(2)当在噻吩基环的4位与C环原子相连的R40为-Me,并且另一个R40为-CHF2时,则R41不是(1-丙基哌啶-2-基)羰基;并且
(3)当在噻吩基环的4位与C环原子相连的R40为-Me,并且另一个R40为F时,则R41不是4,5-二氢-1H-咪唑-2-基。
项目129.根据项目128所述的中间体,其中两个R40彼此不同。
项目130.根据项目128或129所述的中间体,其中一个R40选自F、-CH2F、-CHF2和-CF3,并且另一个R40选自卤素、-Me、-OMe、-Et和-OEt,更优选选自Cl、Br、F和-Me。
项目131.根据项目128至130中任一项所述的中间体,其中一个R40选自F、-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2,并且另一个R40(任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40)是Cl。
项目132.根据项目128至130中任一项所述的中间体,其中一个R40(任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40)是F,并且另一个R40选自卤素、-Me和-Et,优选选自Cl、Br、F、-Me和-Et,更优选选自Cl、-Me和-Et。
项目133.根据项目128至130和132中任一项所述的中间体,其中一个R40(任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40)是F,另一个R40是Cl。
项目134.根据项目128至133中任一项所述的中间体,其中与R40结合的C环原子和S环原子是相邻的环原子,R40为F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代。
项目135.根据项目128至133中任一项所述的中间体,其中与R40结合的C环原子和S环原子被C环原子隔开,R40为F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代。
项目136.根据项目128至135中任一项所述的中间体,其中R41是氨基保护基团。
项目137.根据项目128至136中任一项所述的中间体,其中氨基保护基团选自:叔丁氧羰基(BOC),9-芴基甲氧羰基(FMOC),苄氧羰基(Cbz),对甲氧苄氧羰基(MOZ),乙酰基(Ac),三氟乙酰基,苯甲酰基(Bz),苄基(Bn),对甲氧基苄基(PMB),3,4-二甲氧基苯基(DMPM),对甲氧基苯基(PMP),2,2,2-三氯乙氧羰基(Troc),三苯甲基(trityl;Tr),甲苯磺酰基(tosyl;Ts),对溴苯磺酰基(brosyl),4-硝基苯磺酰基(nosyl)和2-硝基苯磺酰基(Nps)。
项目138.根据项目128至135中任一项所述的中间体,其中R41是H。
项目139.根据项目128所述的中间体,选自:
Figure BDA0003884477230001281
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合。
项目140.根据项目128所述的中间体,选自:
Figure BDA0003884477230001291
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合。
项目141.一种制备包含酰胺部分的化合物的方法,该方法包括以下步骤:使项目128至140中任一项所述的中间体与相应的羧酸反应,并且任选地除去氨基保护基。
项目142.根据项目141所述的方法,其中所述化合物是激酶抑制剂,特别是选自以下的一种或多种蛋白激酶的抑制剂:SIK(优选SIK3)、CSFR1、ABL、SRC、HCK、PDGFR和KIT;优选地选自:SIK3、ABL/BCR-ABL、HCK和CSF1R激酶。
项目143.根据项目141或142所述的方法,其中使中间体与相应的羧酸反应的步骤在(i)碱和/或(ii)偶联剂的存在下进行。
项目144.根据项目143所述的方法,其中所述碱为非亲核碱,优选选自N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)、2,2,6,6-四甲基哌啶、三乙胺、三丁胺、1,8-二氮杂双环十一碳-7-烯(DBU)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯(TBD)、7-甲基-1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯(MTBD)、1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷(TED)、可力丁、1,1,3,3-四甲基胍(TMG)、奎宁环、2,2,6,6-四甲基哌啶(TMP)、哌啶(PMP)、2,6-二叔丁基吡啶、2,6-二甲基吡啶、磷腈碱(例如t-Bu-P4)、二异丙基氨基锂(LDA)、双(三甲基甲硅烷基)氨基钠(NaHMDS)、双(三甲基甲硅烷基)氨基钾(KHMDS)、叔丁醇钠和叔丁醇钾。
项目145.根据项目143或144所述的方法,其中所述偶联剂选自N,N,N',N'-四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(TCFH)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺(EDCI)、二环己基碳二亚胺(DCC)、二异丙基碳二亚胺(DIC)、1-[双(二甲氨基)亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化六氟磷酸盐(HATU)、2-(1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸盐(HBTU)、2-(1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基四氟硼酸铵(TBTU)、1-丙烷膦酸酐(T3P)、苯并三唑-1-基-氧三吡咯烷鏻六氟磷酸盐(PyBOP)、7-氮杂苯并三唑-1-基氧基)三吡咯烷鏻六氟磷酸盐(PyAOP)和(6-氯苯并三唑-1-基氧基)三吡咯烷鏻六氟磷酸盐(TPTDP)。
项目146.一种制备项目96所述的化合物的方法,其包括以下步骤:
·提供在具有一种或多种杂质的混合物中的项目1至95中任一项所述的化合物;以及
·从所述混合物中去除至少一部分杂质。
项目147.一种制备药物组合物的方法,其包括以下步骤:将项目1至96中任一项所述的化合物与药学上可接受的赋形剂一起配制。
项目148.一种制备药物组合物的方法,其包括:
·实施或已经实施了项目141至145中任一项所述的方法来制造化合物;以及
·将制造的化合物与药学上可接受的赋形剂一起配制。
项目149.一种制备药物包装的方法,其包括以下步骤:
·将项目97至99中任一项所述的药物组合物(优选以成品药物形式)插入包装中,从而形成包含所述药物组合物的包装;以及任选地,
·在包装盒中插入说明药物组合物处方信息的单张。
项目150.一种药物包装,其包含项目97至99中任一项所述的药物组合物;优选地,其中所述药物组合物为成品药物形式。
实施例
在本发明的范围内或在本发明的方法中使用的化合物的选择和/或代表各种示例性或优选的Hy取代基、R1a取代基、R1b取代基、R1c取代基、R1d取代基、R1e取代基、R2取代基、R3取代基、R4取代基、R5部分、A部分、B部分和/或E部分的实例,各自单独或以任何组合地可用于合成本发明的另外的化合物,其在表A(和/或在图1E中描述)中列出。在表A中的化合物(和/或在图1E中描述的化合物)和/或在图1B、图1C和/或图1D中描述的化合物如本文所述合成和/或测试。
实施例示出了:
实施例1.1:激酶抑制剂的合成,包括式(Ia)和化合物C7的激酶抑制剂
具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物的合成:
通用方法和材料:
使用Biotage Isolera Four系统进行MPLC纯化,使用KP-Sil柱和工业级有机溶剂,即二氯甲烷和甲醇、3-4N NH3的MeOH溶液。在10CV上从0%到25%的DCM比3N NH3(在MeOH中)的梯度用于纯化最终化合物。
1H NMR光谱记录在Bruker DPX 400MHz光谱仪上,并以ppm记录,溶剂共振用作内标[CDCl3在7.26ppm,DMSO-d6在2.50ppm]。峰报告为(s=单峰,d=双重峰,t=三重峰,q=四重峰,m=多重峰或未分离峰,bs=宽信号,耦合常数(Hz),积分)。
使用以下系统在Shimadzu HPLC系统上进行反相HPLC[溶剂A:乙腈,溶剂B:0.1%的甲酸水溶液]。甲酸用作HPLC级。所有分离均在环境温度下进行。对于分析型RP-HPLC分析[Interchim:Uptisphere Strategy
Figure BDA0003884477230001301
5μm,100x4.6mm],流速为1.0ml.min-1;进样量:20μL,检测波长:220nm和254nm。使用以下梯度:2.0分钟100%B,历时8分钟至10%B,5分钟10%B。
使用以下系统在Dionex Ultimate 3000系统上记录LC-MS光谱[溶剂A:乙腈,溶剂B:0.1%甲酸的水溶液]。甲酸用作HPLC级。所有分离均在环境温度下进行。对于分析型RP-HPLC分析[Interchim:Uptisphere Strategy C18,2.6μm,50x4.6 mm],流速为1.0ml.min-1;检测波长:220nm和254nm。使用以下梯度:90%B,历时5分钟至5%B。使用以下设置记录MS:Dionex Surveyor MSQ plus,ESI+,Probe T(℃)350,Cone 30(v),Needle(KV)3.0。
缩写:Boc2O:脱碳酸二叔丁酯;1-BuOH:1-丁醇;cHex:环己烷;CV:列值;d:双峰(doublet)(NMR);d:天;dd:双二重峰(doublet of doublets);DCM=CH2Cl2:二氯甲烷;DIPEA:N,N-二乙基异丙基胺;DMF:N,N-二甲基甲酰胺;DMSO:二甲基亚砜;EDC HCl:1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺;equiv.:当量;Et2O:二乙醚;EtOAc:乙酸乙酯;g:克;h:小时;H:质子;HCl:盐酸;H2O:水;HOBT:1-羟基苯并三氮唑;Hz:赫兹;IPA:异丙醇;J:标量1H-1H偶合常数;K2CO3:碳酸钾;KOH:氢氧化钾;LC-MS:液相色谱-质谱;m:多重峰;M:摩尔;mAU:毫吸收单位;Me:甲基;MeCN:乙腈;MeOH:甲醇;mg:毫克;MHz:兆赫兹;min:分钟;μw:微波;N2:氮气;NaH:氢化钠;NaHCO3:碳酸氢钠;NaOH:氢氧化钠;Na2SO4:硫酸钠;NBS:N-溴代琥珀酰亚胺;NCS:N-氯代琥珀酰亚胺;NMR:核磁共振;PdCl2(dppf):[1,1'-双(二苯基膦)二茂铁]二氯钯(II);Pd2dba3:三(二亚苄基丙酮)二钯(0);quant.:定量;Rf:保留因子(TLC);rt:室温;s:单重峰;SiO2:二氧化硅;TCFH:四甲基氯代脲六氟磷酸酯;TFA:三氟乙酸;THF:四氢呋喃;TLC:薄层色谱法;XantPhos:4,5-双(二苯基膦)-9,9-二甲基氧杂蒽。
通用方案:
Figure BDA0003884477230001311
化合物E2:
N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E2)的合成
Figure BDA0003884477230001312
步骤-1:(4-氯-2-氟噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯:
Figure BDA0003884477230001313
在70℃将SelectfluorTM(1.51g,4.3mmol)溶于CH3CN(30mL)。在氮气氛下,在室温下,用(4-氯噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯17(1.0g,4.3mmol)处理该溶液并搅拌1小时。反应混合物用乙醚稀释,用水洗涤,然后用饱和NaHCO3溶液洗涤,用Na2SO4干燥,浓缩并通过柱色谱纯化,得到(4-氯-2-氟噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯21(0.59g,产率55%),为白色固体。
LCMS:m/z=152.07[M-100]+,83.74%(3.70分钟)。
步骤-2:4-氯-2-氟噻吩-3-胺盐酸盐
Figure BDA0003884477230001314
向(4-氯-2-氟噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯21(252mg,1.0mmol,1.0当量)在无水二恶烷(1.0mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入二恶烷中的4.0N HCl(2.5mL,10.0mmol,10.0当量)。将反应混合物在室温搅拌6小时。过滤沉淀的固体并用己烷洗涤,得到4-氯-2-氟噻吩-3-胺盐酸盐22(141mg,75%),为灰白色固体。
步骤-3:N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001315
向4-氯-2-氟噻吩-3-胺盐酸盐22(100mg,0.53mmol,1.0当量)和2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸4(187mg,0.69mmol,1.3当量)在乙腈(3mL)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入DIPEA(240mg 1.86mmol,3.5当量)和TCFH(171mg,0.61mmol,1.15当量)。将反应混合物在室温搅拌24小时。通过LCMS监测反应。在真空下浓缩反应混合物,并且将获得的残余物通过柱,得到粗N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺23(230mg,纯度约74%),为黄色固体。
LCMS:m/z=403.99[M-100]+,(3.29分钟)。
步骤-4:N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E2)
Figure BDA0003884477230001321
将2-(哌嗪-1-基)乙醇10(370mg,2.84mmol,5.0当量)和DIPEA(30mg,0.23mmol,0.4当量)加入充分搅拌的N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺23(230mg,0.57mmol,1.0当量)在n-BuOH中的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,并且将获得的残余物通过RP C18纯化,得到N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E2,图1E)(69mg,2个步骤的产率为26%)为白色固体。该合成的化合物E2的分析数据如表1.1所示。
化合物E5:
N-(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E5)的合成
Figure BDA0003884477230001322
步骤-1:2-氨基-4-羟基-4-(三氟甲基)-4,5-二氢噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001323
将NaOH水溶液(1M,20mL),于0℃,缓慢加入至硫化氢钠水合物(4.1g,73mmol,1.4当量)在水(16mL)中的溶液中。将反应混合物脱气并用氮气冲洗,然后加入1-溴-3,3,3-三氟丙酮25(10g,52mmol,1.0当量)。在0℃搅拌50分钟后,加入氰基乙酸甲酯24(3.8mL,54mmol,1.04当量),接着加入三乙胺(7.6mL,54mmol,1.04当量),并使反应混合物升温至室温。反应混合物在室温下搅拌1.5小时,然后过滤,通过过滤收集的固体用水洗涤并在真空中干燥,得到2-氨基-4-羟基-4-(三氟甲基)-4,5-二氢噻吩-3-羧酸甲酯26(4.12g,产率32%),为灰白色固体。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δ8.01(bs,2H),6.19(s,1H),3.59(s,3H),3.48(d,J=12.6Hz,1H),3.17(d,J=12.6Hz,1H).LCMS:m/z=244.18[M+H]+,99.02(2.73分钟)。
步骤-2:2-氨基-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001331
将2-氨基-4-羟基-4-(三氟甲基)-4,5-二氢噻吩-3-羧酸甲酯26(4g)加热至175℃直至熔化并搅拌10分钟然后冷却。加入EtOAc,有机物用盐水洗涤、干燥并在真空中浓缩,得到2-氨基-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸甲酯27(3.7g,产率99%),为棕色固体状。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ6.75(s,1H),3.84(s,3H).LCMS:m/z=226.05[M+H]+,98.85(3.37分钟)。
步骤-3:2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001332
在20分钟内将NaNO2(1ml水中0.20g,2.68mmol,1.4当量)溶液,于0℃,加入至2-氨基-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸甲酯27(0.5g,1.92mmol,1.0当量)、水(7ml)和浓HCl(3ml)的混合物中。在冰浴中再过30分钟后,将混合物过滤,并于0℃将重氮盐溶液逐滴加到在浓HCl(20ml)中的CuCl溶液(0.80g,8.08mmol,4.2当量)中。将反应混合物搅拌30分钟,用Et2O萃取、干燥(Na2SO4)并蒸发。粗残余物经柱层析纯化得到2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸甲酯28(201mg,产率37%)。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.57(s,1H),3.92(s,3H)。
步骤-4:2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸
Figure BDA0003884477230001333
向2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸甲酯28在水(12ml)中的悬浮液加入KOH(413mg,7.37mmol,3.0当量)并将所得反应混合物回流一小时。将反应混合物冷却至0℃并通过加入浓HCl酸化至pH为2。在真空下过滤形成的沉淀物,得到2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸29(550mg,产率97%),为白色固体。
步骤-5:(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003884477230001334
向2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-羧酸29(1.00g,4.35mmol,1.0当量)在无水二甲基甲酰胺(25mL)中的溶液中,于0℃,加入叠氮磷酸二苯酯(1.19g,4.35mmol,1.0当量)并将混合物在室温下搅拌2小时。原料消失后,加入叔丁醇(4.2mL,43.5mmol,10.0当量),并将混合物搅拌回流17小时。将反应混合物浓缩,并且通过硅胶快速柱色谱纯化粗残余物,得到(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯30(0.65g,50%)。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.51(s,1H),5.83(bs,1H),1.48(s,9H)。
步骤-6:2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐
Figure BDA0003884477230001341
向(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯30(302mg,1.0mmol,1.0当量)在无水二恶烷(1.0mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入二恶烷中的4.0N HCl(2.5mL,10.0mmol,10.0当量)。将反应混合物在室温搅拌6小时。过滤沉淀的固体并用己烷洗涤,得到2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐31(181mg,76%),为灰白色固体。
步骤-7:2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001342
向2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐31(114mg,0.48mmol,1.0当量)和2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸4(170mg,0.63mmol,1.3当量)在乙腈(3mL)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入DIPEA(217mg 1.68mmol,3.5当量)和TCFH(154mg,0.55mmol,1.15当量)。将反应混合物在室温搅拌24小时。通过LCMS监测反应。在真空下浓缩反应混合物,并且将所得残余物过柱,得到粗2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺32(230mg,纯度约73%),为黄色固体。
步骤-8:N-(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E5)
Figure BDA0003884477230001343
将2-(哌嗪-1-基)乙醇10(329mg,2.53mmol,5.0当量)和DIPEA(26mg,0.20mmol,0.4当量)加入至2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺(230mg,0.51mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(三氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E5,图1E)(52mg,两步产率20%),为白色固体。该合成化合物E5的分析数据如表1.1所示。
化合物E4:
N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E4)的合成
Figure BDA0003884477230001351
步骤-1:3-((2-甲氧基-2-氧代乙基)硫代)丙酸甲酯
Figure BDA0003884477230001352
将丙烯酸甲酯34(99.16mL,1.1mol)缓慢加入至2-巯基乙酸甲酯33(91mL,1mol)和哌啶(2mL)的溶液中,并在温度50℃下搅拌反应混合物2小时。通过TLC检测原料完全消失后,在高真空下蒸馏出过量的丙烯酸甲酯和哌啶,得到3-((2-甲氧基-2-氧代乙基)硫代)丙酸甲酯35(190g,产率99%),为无色粘稠液体油。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ3.73(s,3H),3.69(s,3H),3.25(s,2H),2.9(t,J=7.2Hz,2H),2.64(t,J=7.2Hz,2H)。
步骤-2:4-氧代四氢噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001353
在2小时内向60%NaH(13.2g,330mmol,1.1当量)在THF中的溶液中缓慢加入在无水THF(800mL)中的3-((2-甲氧基-2-氧代乙基)硫代)丙酸甲酯35(58g,300mmol,1.0当量),并将反应混合物回流5小时。然后,减压浓缩溶剂,向残余物中加入H2O(300mL)。通过冷的1MHCl溶液将溶液的pH值调节至1并用DCM萃取。合并的有机层经Na2SO4干燥并在真空下浓缩。残余物经柱层析纯化,得到4-氧代四氢噻吩-3-羧酸甲酯36(17g,35%),为无色粘稠油。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ10.94(s,1H),3.75-3.82(m,7H)。
步骤-3:4-氨基噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001354
4-氧代四氢噻吩-3-羧酸甲酯36(3.9g,24.4mmol,1.0当量)、盐酸羟胺(1.69g,24.4mmol,1.0当量)和乙腈(20mL)的混合物在回流温度下搅拌1小时。然后冷却反应混合物,过滤出分离的固体,用无水乙醚洗涤,得到4-氨基噻吩-3-羧酸甲酯37(2.9g,75%),为无色粘稠液体油。
步骤-4:4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001361
向4-氨基噻吩-3-羧酸甲酯37(6.57g,41.8mmol,1.0当量)在1,4-二恶烷(25mL)中的溶液中,于0℃,加入5%Na2CO3水溶液,然后加入二碳酸二叔丁酯(18.26g,83.7mmol,2.0当量)在二恶烷(25ml)中的溶液。除去冷浴,使反应混合物达到室温并搅拌24小时,然后用水和EtOAc稀释。用EtOAc萃取水层,合并的有机层用水和盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并在真空下浓缩。所得残余物经柱层析纯化,得到4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻吩-3-羧酸甲酯38(6.45g,60%产率)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ9.06(s,1H),8.34(d,J=3.6Hz,1H),7.58(s,1H),3.83(s,3H),1.47(s,9H)。
步骤-5:4-((叔丁氧基羰基)氨基)-5-氯噻吩-3-羧酸甲酯
Figure BDA0003884477230001362
将N-氯代琥珀酰亚胺(8.3g 62.2mmol,1.0当量)加入到4-((叔丁氧基羰基)氨基)噻吩-3-羧酸甲酯38(16g 62.2mmol,1.0当量)在冰醋酸(80mL)中的溶液中,并将所得反应混合物在50℃搅拌45分钟。在减压下蒸馏乙酸,所得残余物用水处理。混合物用氢氧化钠溶液调至碱性,然后用乙酸乙酯萃取。有机萃取液被合并,经水洗,经Na2SO4干燥,浓缩,通过柱层析纯化,得到4-((叔丁氧基羰基)氨基)-5-氯噻吩-3-羧酸甲酯39(14.4g,80%产率),为无色液体。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δ8.78(s,1H),8.13(s,1H),3.73(s,3H),1.41(s,9H).LCMS:m/z:192.16[M-100]+,99.40%(3.71分钟)。
步骤-6:(2-氯-4-羟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003884477230001363
于0℃,将在甲苯(51.4ml,51.4mmol,3.0当量)中的1M DIBAL缓慢加入到4-((叔丁氧基羰基)氨基)-5-氯噻吩-3-羧酸甲酯39(5g,17.14mmol,1.0当量)在DCM中的溶液中,并且反应混合物在室温下搅拌4小时。反应混合物用2N NaOH溶液稀释并用DCM萃取。合并的有机层被浓缩并通过柱色谱被纯化,得到(2-氯-4-羟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯40(4g,88%产率)。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.12(s,1H),6.18(s,1H),4.43(s,2H),1.51(s,9H).LCMS:m/z:190.13[M-56-18]+,(3.14分钟)。
步骤-7:(2-氯-4-甲酰噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003884477230001364
将MnO2(3.69g,42.4mmol,8.0当量)加入到(2-氯-4-羟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯40(1.4g,5.3mmol,1.0当量)在CAN中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌24小时,通过TLC检测原料完全消失后,然后过滤反应混合物,减压蒸馏滤液,得到(2-氯-4-甲酰噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯41(1.32g,95%产率),为无色液体。
LCMS:m/z:162.06[M+H-100]+,96.53%(3.45分钟)。
步骤-8:(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003884477230001371
于0℃,在含有二氯甲烷(20ml)中的(2-氯-4-甲酰噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯41(0.9g,3.44mmol,1.0当量)的惰性气氛下,将三氟化二乙氨基硫(0.9ml,6.88mmol,2.0当量)逐滴加到圆底烧瓶中。将混合物在环境温度下搅拌3小时,然后冷却至0℃,然后加入饱和碳酸氢钠水溶液直至达到中性状态。然后用二氯甲烷萃取混合物。在低压下蒸馏有机相,所得残余物经柱层析纯化,得到(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯42(432mg,44%产率),为无色液体。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.35(s,1H),6.78(t,J=56.4Hz 1H),6.14(bs,1H),1.41(s,9H).LCMS:m/z:282.13[M-H]+,82.84%(3.87分钟)。
步骤-9:2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐
Figure BDA0003884477230001372
向(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯42(284mg,1.0mmol,1.0当量)在无水二恶烷(1.0mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入二恶烷中的4.0N HCl(2.5mL,10.0mmol,10.0当量)。将反应混合物在室温搅拌6小时。过滤沉淀的固体并用己烷洗涤,得到白色固体的2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐43(165mg,75%),为灰白色固体。
LCMS:m/z:164.16[M-19]+,95.36%(2.88分钟)。
步骤-10:2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001373
向2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐43(106mg,0.48mmol,1.0当量)和2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸4(170mg,0.63mmol,1.3当量)在乙腈(3mL)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入DIPEA(217mg 1.68mmol,3.5当量)和TCFH(154mg,0.55mmol,1.15当量)。将反应混合物在室温搅拌24小时。通过LCMS监测反应。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物过柱,得到粗2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺44(225mg,纯度约74%),为黄色固体。
LC-MS:m/z:436.05[M+H]+,(3.46分钟)。
步骤-11:N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E4)
Figure BDA0003884477230001381
将2-(哌嗪-1-基)乙醇10(329mg,2.53mmol,5.0当量)和DIPEA(26mg,0.20mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺44(225mg,0.51mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E4,图1E)(51mg,两步产率20%),为白色固体。该合成化合物E4的分析数据如表1.1所示。
化合物E3:
N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E3)的合成
Figure BDA0003884477230001382
步骤-1:(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0003884477230001383
于0℃,将三氟化二乙氨基硫(DAST)(0.9ml,6.82mmol,2.0当量)逐滴加入(2-氯-4-羟甲基)噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯40(0.9g,3.41mmol,1.0当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液中。将反应混合物在环境温度下搅拌3小时,然后冷却至0℃,然后加入饱和碳酸氢钠水溶液直至达到中性状态。然后用二氯甲烷萃取混合物。在低压下蒸馏有机相,所得残余物经柱层析纯化,得到(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯45(408mg,45%产率),为无色液体。
1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.14(d,J=2.7Hz,1H),6.09(bs,1H),5.27(d,J=47.7Hz,2H),1.49(s,9H).LCMS:m/z:264.19[M+H]+,98.14%(3.75分钟)。
步骤-2:2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐
Figure BDA0003884477230001384
向(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯45(266mg,1.0mmol,1.0当量)在无水二恶烷(1.0mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入二恶烷中的4.0N HCl(2.5mL,10.0mmol,10.0当量)。将反应混合物在室温搅拌6小时。过滤沉淀的固体并用己烷洗涤,得到2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐46(157mg,78%),为灰白色固体。
步骤-3:2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001391
向2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-胺盐酸盐46(100mg,0.49mmol,1.0当量)和2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸4(173mg,0.64mmol,1.3当量)在乙腈(3mL)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入DIPEA(224mg1.73mmol,3.5当量)和TCFH(160mg,0.57mmol,1.15当量)。将反应混合物在室温搅拌24小时。通过LCMS监测反应。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物过柱,得到粗2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺47(220mg,纯度约72%),为黄色固体。
LCMS:m/z:418.07[M+H]+,(3.33分钟)。
步骤-4:N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E3)
Figure BDA0003884477230001392
将2-(哌嗪-1-基)乙醇10(343mg,2.63mmol,5.0当量)和DIPEA(27mg,0.21mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺47(220mg,0.52mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E3,图1E)(55mg,两步产率22%),为白色固体。该合成化合物E3的分析数据如表1.1所示。
化合物E9:
N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E9)的合成
Figure BDA0003884477230001393
将1-甲基哌嗪49(263mg,2.63mmol,5.0当量)和DIPEA(27mg,0.21mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺47(220mg,0.52mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E9,图1E)(55mg),为白色固体。该合成化合物E9的分析数据如表1.1所示。
化合物E10(外消旋的):
N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(3,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E10)的合成
Figure BDA0003884477230001401
将1,2-二甲基哌嗪50(300mg,2.63mmol,5.0当量)和DIPEA(27mg,0.21mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺47(220mg,0.52mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(3,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E10,图1E)(50mg),为白色固体。该合成化合物E10的分析数据如表1.1所示。
化合物10的对映异构体:
N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(3,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E10)的手性分离
Figure BDA0003884477230001402
外消旋的E10的分析手性HPLC方法:
柱:CHIRAL PAK IG,250x 4.6mm,20μm
流动相:正己烷:DCM:MtOH:IPAm(35:60:5:0.10)
流速:2.0mL/min。
柱温:40℃
保留时间:5.067分钟和6.445分钟
外消旋的E10的分析细节:
LCMS:m/z:496.24[M+H]+,97.75%(13.73分钟)。
柱:LUNA 5μC18(4.6x 100mm),
流动相:A-0.1%NH3水溶液;B-CAN,(TB:0.01/10,2/10,20/90,30/90),
流速:0.8mL/min。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ11.62(s,1H),9.99(s,1H),8.24(s,1H),7.67(d,J=2.8Hz,1H),6.15(s,1H),5.25(d,J=47.6Hz,2H),4.34(bs,2H),3.08(bs,2H),2.80(bs,2H),2.45(s,6H),1.34(bs,3H)。
外消旋的E10的手性制备型HPLC方法:
柱:CHIRAL PAK IG,250x 50mm,20μm
流动相:正己烷:DCM:MtOH:IPAm(35:60:5:0.10)
流速:50mL/min
E10-对映体-I(第一个洗脱的对映体)的手性HPLC:
柱:CHIRAL PAK IG,250x 4.6mm,20μm
流动相:正己烷:DCM:MtOH:IPAm(35:60:5:0.10)
流速:2.0mL/min。
柱温:40℃
保留时间:5.067分钟
手性纯度:98.77%
E10-对映体-I(第一个洗脱的对映体)的分析细节:
LCMS:m/z:496.28[M+H]+,99.53%(8.08分钟)。
柱:LUNA 5μC18(4.6x 100mm),
流动相:A-0.1%FA水溶液;B-ACN,
(T/%B:0.01/10,2/10,20/90,30/90),
流速:0.8mL/min
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ11.46(s,1H),9.95(s,1H),8.21(s,1H),7.67(d,J=3.2Hz,1H),6.06(s,1H),5.25(d,J=47.6Hz,2H),4.01(m,2H),3.01(bs,1H),2.82(bs,1H),2.67–2.64(m,1H),2.41(s,3H),2.22(bs,3H),2.1-2.07(m,2H),1.05(d,J=4Hz,3H)。
E10-对映体-II(第二个洗脱的对映体)的手性HPLC:
柱:CHIRAL PAK IG,250x 4.6mm,20μm
流动相:正己烷:DCM:MtOH:IPAm(35:60:5:0.10)
流速:2.0mL/min。
柱温:40℃
保留时间:6.445分钟
手性纯度:99.70%
E10-对映体-II(第二个洗脱的对映体)的分析细节:
LCMS:m/z:496.24[M+H]+,99.62%(8.10分钟)。
柱:LUNA 5μC18(4.6x 100mm),
流动相:A-0.1%FA水溶液;B-CAN,(T/%B:0.01/10,2/10,20/90,30/90),
流速:0.8mL/min
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ11.46(s,1H),9.94(s,1H),8.21(s,1H),7.67(d,J=2.8Hz,1H),6.06(s,1H),5.25(d,J=48Hz,2H),4.02(bs,2H),3.02(bs,1H),2.82(bs,1H),2.66–2.64(m,1H),2.41(s,3H),2.22(bs,3H),2.1-2.07(m,2H),1.06(s,3H)。
化合物E10的这些分离的对映异构体的分析数据如表1.1所示。
化合物E11:
N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基-1,4-二氮杂烷-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E11)的合成
Figure BDA0003884477230001411
将1-甲基-1,4-二氮杂烷51(300mg,2.63mmol,5.0当量)和DIPEA(27mg,0.21mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺47(220mg,0.52mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基-1,4-二氮杂烷-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E11,图1E)(54mg),为白色固体。该合成化合物E11的分析数据如表1.1所示。
化合物E12:
N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(3-氧代哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E12)的合成
Figure BDA0003884477230001421
将哌嗪-2-酮52(263mg,2.63mmol,5.0当量)和DIPEA(27mg,0.21mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺10(220mg,0.52mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(3-氧代哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E12,图1E)(50mg),为白色固体。该合成化合物E12的分析数据如表1.1所示。
化合物E13:
N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E13)的合成
Figure BDA0003884477230001422
将1-甲基哌嗪49(253mg,2.53mmol,5.0当量)和DIPEA(26mg,0.20mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺44(225mg,0.51mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E13,图1E)(50mg),为白色固体。该合成化合物E13的分析数据如表1.1所示。
化合物E15:
N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E15)的合成
Figure BDA0003884477230001423
将1-甲基哌嗪49(284mg,2.84mmol,5.0当量)和DIPEA(30mg,0.23mmol,0.4当量)添加到N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺23(230mg,0.57mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到60mg的N-(4-氯-2-氟噻吩-3-基)-2-((2-甲基-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E15,图1E),为白色固体。该合成化合物E15的分析数据如表1.1所示。
化合物E16:
N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(3,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E16)的合成
Figure BDA0003884477230001431
将1,2-二甲基哌嗪50(291mg,2.55mmol,5.0当量)和DIPEA(26mg,0.20mmol,0.4当量)添加到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺44(225mg,0.51mmol,1.0当量)在n-BuOH中的充分搅拌的溶液中。然后将反应温度升至100℃3小时。在真空下浓缩反应混合物,所得残余物通过RP C18纯化,得到40mg的N-(2-氯-4-(二氟甲基)噻吩-3-基)-2-((6-(3,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(E16,图1E),为白色固体。该合成化合物E16的分析数据如表1.1所示。
化合物C7:
N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(C7)
Figure BDA0003884477230001432
步骤-1:2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸乙酯(3)
Figure BDA0003884477230001433
向4,6-二氯-2-甲基嘧啶1(10g,61.4mmol,1.0当量)和2-氨基噻唑-5-羧酸乙酯2(10.6g,61.4mmol,1.0当量)在DMF(210ml)中的溶液中,在惰性气氛下,于0℃,分批加入60%氢化钠(4.9g,122.8mmol,2.0当量),并将反应混合物缓慢温热至室温,并搅拌3天。通过加入饱和氯化铵溶液淬灭过量的NaH,并将反应混合物用水(3000ml)稀释,并在室温下搅拌1h。滤出获得的沉淀物并风干以得到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸酯3(18g,98%产率),为米色固体。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ1.34–1.51(t,3H),2.75(s,3H),4.41(q,J=7.1Hz,2H),6.73(s,1H),8.14(s,1H).LCMS:m/z=299.17[M+H]+,(3.45分钟)。
步骤-2:2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(4)
Figure BDA0003884477230001441
向2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸乙酯3(36.0g,120.5mmol,1.0当量)在甲醇(350ml)和水(150ml)中的悬浮液中,在室温下,加入氢氧化钠(38.6g,964mmol,8.0当量),并将混合物在室温下搅拌16小时。LCMS分析表明原料完全转化为产物。浓缩反应混合物以除去大部分溶剂,然后使用6M HCl水溶液酸化水层。滤出所得沉淀物,并用水洗涤,在高真空下干燥3天,得到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸4(27.0g,83%产率),为米色粉末。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ2.57(s,3H),6.93(s,1H),8.04(s,1H),12.46(bs.1H).LCMS:m/z=271.05[M+H]+,99.19%(2.51分钟)。
步骤-3:(4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯(6)
Figure BDA0003884477230001442
向3-氨基-4-甲基噻吩-2-羧酸甲酯5(1.71g,10.0mmol,1.0当量)在H2O(5.1mL)中的溶液中,在室温下,加入KOH溶液(45%,1.75mL,14.0mmol,1.4当量)。将反应混合物在80℃下搅拌30分钟,然后冷却至室温。将该溶液在50℃下缓慢加入到6M HCl溶液(5.50mL,33.0mmol,3.3当量)中,并将所得反应混合物在60℃下搅拌15分钟(放出气体,获得澄清溶液)。将反应用己烷(3.5mL)稀释并冷却至-10℃,加入KOH溶液(45%,3.4mL,27.0mmol,2.7当量)和二碳酸二叔丁酯(2.40mL,10.5mmol,1.05当量)并在该温度下搅拌过夜。将反应混合物温热至室温并用EtOAc萃取。合并的有机层用饱和NaHCO3水溶液洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩,获得叔(4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸丁酯6(2.32g,定量产率),为橙色固体,其无需进一步纯化即可使用。
1H NMR(CDCl3,400MHz):δ7.40(s,1H),6.86(dq,J=3.3Hz,J=1.1Hz,1H),6.36(s,1H),2.14(d,J=1.1Hz,3H),1.53(s,9H).LCMS:m/z=158.16[M+H-56]+,97.82%(3.85分钟)。
步骤-4:(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯(7)
Figure BDA0003884477230001443
向(4-甲基-噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯6(1.07g,5.00mmol,1.0当量)在无水EtOAc(8mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入NCS(0.70g,5.25mmol,1.05当量)和在EtOH中的盐酸溶液(1.25N,200μL,0.25mmol,0.05当量)。将反应混合物搅拌5小时并通过添加1.0N氢氧化钠溶液(5.50mL,5.50mmol,1.1当量)和亚硫酸氢钠(40%,0.065mL,0.25mmol,0.05当量)的溶液淬灭。丢弃下面的水层。有机相用水(10mL)洗涤。有机层经Na2SO4干燥,过滤并在减压下浓缩。粗产物通过柱色谱法纯化,获得(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯7(734mg,2.96mmol,59%),为橙色固体。
1H NMR(CDCl3,300MHz):δ6.71(s,1H),5.83(s,1H),2.14(s,3H),1.49(s,9H).LCMS:m/z=233.11[M+H-56]+,98.14%(3.88分钟)。
步骤-5:2-氯-4-甲基噻吩-3-胺盐酸盐(8)
Figure BDA0003884477230001444
向(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯7(567mg,2.29mmol,1.0当量)在无水二恶烷(2.0mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入二恶烷中的4.0N HCl(5.70mL,22.9mmol,10.0当量)。将反应混合物在室温搅拌16小时。过滤沉淀的固体并用己烷洗涤,得到2-氯-4-甲基噻吩-3-胺盐酸盐8(360mg,86%),为灰色固体。
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ7.06(s,1H),5.54(s,3H),2.14(d,J=1.2Hz,3H).LCMS:m/z=148.18[M+H]+,(3.18分钟)。
步骤-6:2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺(9)
Figure BDA0003884477230001451
向2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸4(367mg,1.36mmol,1.0当量)和2-氯-4-甲基噻吩-3-胺盐酸盐8(275mg,1.5mmol,1.1当量)在乙腈(0.2mL)中的悬浮液中,在氮气氛下,于在室温下,加入DIPEA(703mg,5.44mmol,4.0当量)和TCFH(457mg,1.63mmol,1.2当量)。将反应混合物在室温搅拌过夜。在真空下除去乙腈,然后将反应物倒入水中。过滤出所得沉淀,用水洗涤,风干得到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺9,为黄色固体,无需进一步纯化即可直接用于下一步(462mg,纯度约70%)。
LCMS:m/z=400.05[M+H]+,(3.41分钟)。
步骤-7:N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(C7)
Figure BDA0003884477230001452
向2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺9(230mg,0.575mmol,1.0当量)在正丁醇(2mL)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇10(374mg,2.87mmol,5.0当量)和DIPEA(30mg,0.23mmol,0.4当量)。将反应混合物回流12小时。冷却至室温后,将反应混合物倒入水中并搅拌30分钟。过滤出所得沉淀,用水洗涤,通过柱并在Et2O中研磨,得到N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(C7,图1C),为灰白色固体(92mg,2个步骤的产率为33%)。
从E1至E16和化合物C7合成的那些化合物的特征如下表1.1所示。
表1.1:式(Ia)的化合物和化合物C7的合成。
Figure BDA0003884477230001453
Figure BDA0003884477230001461
实施例1.2[比较性的]:激酶抑制剂(包括式(Ib)和(Ic)的激酶抑制剂)和其他化合物的合成。
本文公开的其他化合物的合成:
通用方法和材料。
使用Biotage Isolera Four系统进行MPLC纯化,使用KP-Sil柱和工业级有机溶剂,即二氯甲烷和甲醇、3-4N NH3的MeOH溶液。在10CV上从0%到25%的DCM比3N NH3(在MeOH中)的梯度用于纯化最终化合物。
1H NMR光谱记录在Bruker DPX 400MHz光谱仪上,并以ppm记录,溶剂共振用作内标[CDCl3在7.26ppm,DMSO-d6在2.50ppm]。峰报告为(s=单峰,d=双重峰,t=三重峰,q=四重峰,m=多重峰或未分离峰,bs=宽信号,耦合常数(Hz),积分)。
使用以下系统在Shimadzu HPLC系统上进行反相HPLC[溶剂A:乙腈,溶剂B:0.1%的甲酸水溶液]。甲酸用作HPLC级。所有分离均在环境温度下进行。对于分析型RP-HPLC分析[Interchim:Uptisphere Strategy
Figure BDA0003884477230001474
5μm,100x4.6mm],流速为1.0ml.min-1;进样量:20μL,检测波长:220nm和254nm。使用以下梯度:2.0分钟100%B,历时8分钟至10%B,5分钟10%B。
使用以下系统在Dionex Ultimate 3000系统上记录LC-MS光谱[溶剂A:乙腈,溶剂B:0.1%甲酸的水溶液]。甲酸用作HPLC级。所有分离均在环境温度下进行。对于分析型RP-HPLC分析[Interchim:Uptisphere Strategy C18,2.6μm,50x4.6 mm],流速为1.0ml.min-1;检测波长:220nm和254nm。使用以下梯度:90%B,历时5分钟至5%B。使用以下设置记录MS:Dionex Surveyor MSQ plus,ESI+,Probe T(℃)350,Cone 30(v),Needle(KV)3.0。
程序:
I.2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸乙酯:
Figure BDA0003884477230001471
向4,6-二氯-2-甲基嘧啶(10g,61.4mmol,1.0当量)和乙基2-氨基噻唑-5-羧酸酯(10.6g,61.4mmol,1.0当量)在DMF(210ml)中的溶液中,在惰性气氛下,于0℃,分批加入氢化钠(5.40g,135mmol,2.0当量),并将反应混合物缓慢温热至室温,并搅拌3天。通过加入饱和氯化铵溶液淬灭过量的NaH,并将反应混合物倒入水(3000ml)中,并在室温下搅拌1小时。滤出获得的沉淀物并风干以得到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸乙酯(18g,60.0mmol,98%产率),为米色固体。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ1.34–1.51(t,3H),2.75(s,3H),4.41(q,J=7.1Hz,2H),6.73(s,1H),8.14(s,1H).LCMS:m/z=297.1[M-H]-
II.2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸:
Figure BDA0003884477230001472
向2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸乙酯(36.0g,121mmol,1.0当量)在甲醇(350ml)和水(150ml)中的悬浮液中,在室温下,加入氢氧化钠(38.6g,964mmol,8.0当量),并将混合物在室温下搅拌16小时。LCMS分析表明原料完全转化为产物。浓缩反应混合物以除去大部分溶剂,然后使用6M HCl水溶液酸化水层。滤出所得沉淀物,并用水洗涤,在高真空下干燥3天,得到2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(27.0g,99.7mmol,83%产率),为米色粉末。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ2.57(s,3H),6.93(s,1H),8.04(s,1H),12.46(bs.1H).LCMS:m/z=269.0[M-H]-。通用程序A1–GP A1–酰胺的形成:
Figure BDA0003884477230001473
向2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(1.0当量和苯胺(1.1当量)在乙腈(0.2M)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入N,N-二异丙基乙胺(3.5当量)和四甲基氯甲脒六氟磷酸盐(1.2当量)。将反应混合物在室温搅拌过夜。在真空下除去乙腈,然后将反应倒入水中(100mL/mmol)。滤出所得沉淀物,用水[5x]洗涤,风干并在高真空下干燥,得到相应的酰胺,为黄色粉末,其无需进一步纯化即可直接用于下一步。所有物质均通过1H NMR分析确认。
通用程序B-GP B:
Figure BDA0003884477230001481
向氯嘧啶衍生物(1.0当量)在正丁醇(2ml)中的悬浮液中,在氮气氛下,在室温下,加入2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(5.0当量)和N,N-二异丙基乙胺(0.4当量)。将管密封并在微波条件下(Biotage Initiator+)在120℃下辐照30分钟。冷却至室温后,将反应混合物倒入水(200ml/mmol)中,并搅拌至少30分钟。滤出所得沉淀物,用水[5x]洗涤,风干以提供相应的靶标。如果没有或<10%沉淀,则用DCM/IPA(2:1,3*)萃取水层。合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并在减压下浓缩。粗产物或纯度小于95%的粗产物通过快速色谱法(Biotage柱,DCM 100%1CV至80%DCM/3N NH3,在MeOH中,在10CV上,80%DCM/3N NH3)纯化。对于某些纯度小于95%的物质,除非另外说明,否则在Et2O中进行研磨,并将所有物质在高真空下干燥(如果需要,最高可达到65℃),直到获得大于95%的纯度。所有物质均通过1H NMR和LC-MS分析确认。
化合物A8:
N-(2-氯-6-甲基苯基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001482
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(750mg,2.77mmol)、2-氯-6-甲基苯胺(959mg,6.77mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(959mg,3.42mmol)、N,N-二异丙基乙胺(1.25g,9.70mmol)和乙腈(6.0mL,0.42M)。从水中沉淀出来后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-6-甲基苯基)噻唑-5-羧酰胺(480mg,1.22mmol),为黄色固体,无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-6-甲基苯基)噻唑-5-羧酰胺(250mg,0.634mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(413mg,3.17mmol)、N,N-二异丙基乙胺(33mg,0.25mmol)和1-丁醇(2.0mL,0.3M)。A8(图1A)。
化合物B3:
N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001491
方案1:B3的合成
步骤1:2-溴-4-氯吡啶-3-胺(化合物IaB3):
向4-氯吡啶-3-胺(7.00g,54.0mmol,1.0当量)在无水TFA(200mL,0.27M)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,在加入NBS(10.7g,60.1mmol,1.1当量)。将该溶液在室温下搅拌18小时。减压除去溶剂,并将残余物溶于2N NaOH(200mL)。用EtOAc(3×200mL)萃取水层。合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并在减压下浓缩。粗产物通过快速色谱法纯化(340gbiotage柱,在10CV上用cHex 100%1CV至40%EtOAc,2CV 40%EtOAc),得到2-溴-4-氯吡啶-3-胺(3.07g,14.8mmol,27%),为米色固体。IaB3。
Rf=0.82(cHex/EtOAc 1:1,UV 254nm).1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ5.70(s,2H),7.35(d,J=5.0Hz,1H),7.56(d,J=5.0Hz,1H)。
步骤2:4-氯-2-甲基吡啶-3-胺(化合物IbB3):
在10mL微波小瓶中,放入2-溴-4-氯吡啶-3-胺(200mg,0.96mmol,1.0当量)、三甲基环硼氧烷(141μL,1.01mmol,1.05当量)、K2CO3(466mg,3.37mmol,3.5当量)和PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(79mg,0.096mmol,0.1当量)在1,4-二恶烷:H2O(10:1,3.3mL,0.28M)中的混合物,抽真空并回充氮气3次,并用铝/特氟龙压接顶部密封。然后将反应混合物在120℃下照射45分钟。反应完成后,将小瓶冷却至室温并打开。将反应混合物用EtOAc稀释,加入二氧化硅(2g),并将反应混合物在减压下浓缩。粗产物通过快速色谱法纯化(25gbiotage柱,在10CV上100%cHex 1CV至100%EtOAc,5CV 100%EtOAc),得到4-氯-2-甲基吡啶-3-胺(58mg,0.041mmol,42%),为紫罗兰色油。IbB3。
Rf=0.24(UV 254nm,cHex/EtOAc 1:1).1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ2.34(s,3H),5.28(s,2H),7.11(d,J=5.2Hz,1H),7.61(d,J=5.2Hz,1H)。
步骤3和4:N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(化合物B3,图1B):
步骤3按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(530mg,1.96mmol)、4-氯-2-甲基吡啶-3-胺(363mg,2.55mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(659mg,2.35mmol)、N,N-二异丙基乙胺(886mg,6.85mmol)和乙腈(5.8mL,0.3M)。在从H2O中沉淀出来后,得到N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(化合物IcB3)(326mg,0.825mmol),为黄色固体,其无需进一步纯化即可用于下一步骤。IcB3。
步骤4按照GP B进行,使用N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(320mg,0.810mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(527mg,4.05mmol)、N,N-二异丙基乙胺(42mg,0.32mmol)和1-丁醇(2.5
mL,0.3M)。在用EtOAc萃取,快速纯化(100%DCM到85%DCM/3N NH3,在MeOH中,在10CV上)并在Et2O中研磨后,获得B3(90mg,0.18mmol,2个步骤的产率为10%),为白色固体。
化合物C1:
N-(2,4-二甲基吡啶-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001501
步骤1按照GP A 1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(266mg,0.982mmol)、2,4-二甲基吡啶-3-胺(120mg,0.982mmol,1.0当量)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(331mg,1.18mmol),N,N-二异丙基乙胺(444mg,3.44mmol)和乙腈(5.0mL,0.2M)。在快速纯化后(在10CV上100%DCM至75%DCM/MeOH),获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2,4-二甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺(123mg,0.328mmol,33%),为黄色固体。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2,4-二甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺(118mg,0.315mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(0.205g,1.57mmol)、N,N-二异丙基乙胺(16mg,0.13mmol)和1-丁醇(2.5mL,0.1M)。快速纯化后(10CV上100%DCM至75%DCM/MeOH),获得C1(图1C,133mg,0.284mmol,2个步骤的产率为21%),为米色固体。
纯度(HPLC,254nm):90%(不能通过研磨、第二硅胶柱或RP柱除去)。
化合物C2:
N-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3-甲基吡啶-2-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001502
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(530mg,1.96mmol)、3-甲基吡啶-2-胺(275mg,2.55mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(659mg,2.35mmol)、N,N-二异丙基乙胺(886mg,6.85mmol)和乙腈(5.8mL,0.3M)。用EtOAc萃取后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3-甲基吡啶-2-基)噻唑-5-羧酰胺(326mg,0.903mmol),为黄色固体,不经进一步纯化用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3-甲基吡啶-2-基)噻唑-5-羧酰胺(510mg,1.41mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(920mg,7.07mmol)、N,N-二异丙基乙胺(73mg,0.57mmol)和1-丁醇(4.3mL,0.3M)。快速纯化后(在10CV上于MeOH中100%DCM至85%DCM/3N NH3),获得C2(图1C,105mg,0.231mmol,2个步骤的产率为8%),为灰白色固体。
化合物C3:
N-(4-溴-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001503
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(145mg,0.535mmol)、4-溴-2-甲基吡啶-3-胺(100mg,0.535mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(180mg,0.642mmol)、N,N-二异丙基乙胺(242mg,1.87mmol)和乙腈(2.7mL,0.2M)。用EtOAc萃取后,获得N-(4-溴-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(67mg,0.15mmol),为黄色固体,无需进一步纯化即可用于下一步骤。
步骤2按照GP B进行,使用N-(4-溴-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(65mg,0.15mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(96mg,0.74mmol)、N,N-二异丙基乙胺(7.6mg,0.059mmol)和1-丁醇(0.50mL,0.3M)。快速纯化(在10CV上MeOH中100%DCM到85%DCM/3N NH3)并在Et2O中研磨后,获得C3(图1C,68mg,0.13mmol,2个步骤的产率为24%),为淡黄色固体。
化合物C4:
N-(3-氯-5-甲基吡啶-4-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001511
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(530mg,1.96mmol)、3-氯-5-甲基吡啶-4-胺(363mg,2.55mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(659mg,2.35mmol)、N,N-二异丙基乙胺(886mg,6.85mmol)和乙腈(5.8mL,0.3M)。用EtOAc萃取后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3-氯-5-甲基吡啶-4-基)噻唑-5-羧酰胺(113mg,纯度约60%),为黄色固体,其无需进一步纯化即可用于下一步骤。
步骤2按照GP B进行,2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3-氯-5-甲基吡啶-4-基)噻唑-5-羧酰胺(110mg,0.278mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇
(181mg,1.39mmol)、N,N-二异丙基乙胺(14mg,0.11mmol)和1-丁醇(0.84mL,0.3M)。快速纯化(在10CV上100%DCM到80%DCM/MeOH)并在Et2O中研磨后,获得C4(图1C,28mg,0.058mmol,2个步骤的产率为12%,纯度88%),为黄色固体。
化合物C5:
N-(3,5-二甲基吡啶-4-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001512
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(500mg,1.85mmol)、3,5-二甲基吡啶-4-胺(271mg,2.22mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(622mg,2.22mmol)、N,N-二异丙基乙胺(836mg,6.46mmol)和乙腈(10mL,0.2M)。从H2O中沉淀后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3,5-二甲基吡啶-4-基)噻唑-5-羧酰胺(273mg),为绿色固体,无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3,5-二甲基吡啶-4-基)噻唑-5-羧酰胺(270mg,0.720mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(469mg,3.60mmol)、N,N-二异丙基乙胺(37mg,0.29mmol)和1-丁醇(2.5mL,0.3M)。快速纯化(在10CV上从100%DCM至80%DCM/MeOH)并在Et2O中研磨后,获得C5(图1C,110mg,0.235mmol,2个步骤的产率为12%),为淡黄色固体。
化合物C6:
2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001513
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(530mg,1.96mmol)、2-甲基吡啶-3-胺(275mg,2.55mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(659mg,2.35mmol)、N,N-二异丙基乙胺(886mg,6.85mmol)和乙腈(5.8mL,0.3m)。从H2O中沉淀后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺(442mg,1.22mmol),为黄色固体,其无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺(440mg,1.41mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(920mg,7.07mmol)、N,N-二异丙基乙胺(73mg,0.57mmol)和1-丁醇(4.3mL,0.3m)。从H2O中沉淀后,获得C6(图1C,355mg,0.781mmol,2个步骤的产率为40%),为灰白色固体。
化合物C7:
N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001521
方案2:C7的合成
步骤1:(4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯:
向3-氨基-4-甲基噻吩-2-羧酸甲酯(1.71g,10.0mmol)在H2O(5.1mL)中的溶液中,在室温下加入KOH溶液(45%,1.90mL,14.0mmol,1.4当量)。将反应在80℃下搅拌30分钟,然后冷却至室温。将该溶液在50℃下缓慢加入到6M HCl溶液(5.50mL,33.0mmol,3.3当量)中。添加完成后,将反应在60℃下搅拌15分钟(放出气体,获得澄清溶液)。将溶液冷却至5℃(冰浴),加入己烷(3.5mL),并将溶液冷却至-10℃(丙酮,干冰)。在-10℃下加入KOH(45%,3.70mL,27.0mmol,2.7当量)和二碳酸二叔丁酯(2.40mL,10.5mmol,1.05当量)的溶液。将反应溶液搅拌过夜,并缓慢温热至室温。形成的悬浮液用EtOAc(3×15mL)萃取。合并的有机层用饱和NaHCO3水溶液(1×25mL)洗涤,经Na2SO4干燥,浓缩并过滤。获得叔丁基(4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸酯(2.32g,定量产率),为橙色固体,其无需进一步纯化即可使用。
Rf=0.68(cHex/EtOAc 9:1,UV 254nm).1H NMR(CDCl3,400MHz):δ7.40(s,1H),6.86(dq,J=3.3Hz,J=1.1Hz,1H),6.36(s,1H),2.14(d,J=1.1Hz,3H),1.53(s,9H)。
步骤2:(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯:
向(4-甲基-噻吩-3-基)-氨基甲酸叔丁酯(1.07g,5.00mmol,1.0当量)在无水EtOAc(8mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入N-氯琥珀酰亚胺(0.700g,5.25mmol,1.05当量)和在EtOH中的盐酸溶液(1.25N,200uL,0.05当量)。5小时后,TLC指示原料仍然存在(cHex/EtOAc 9:1:稍微多的极性斑点:0.76原料,产物:0.68,更长的反应时间未带来更好的转化率)。通过添加1.0N氢氧化钠(5.50mL,5.50mmol,1.1当量)和亚硫酸氢钠(40%,0.05当量)的溶液淬灭反应。丢弃下面的水层。有机相用水(10mL)洗涤。有机层经Na2SO4干燥,过滤并在减压下浓缩。粗产物通过快速色谱法纯化(100g biotage柱,cHex 100%1CV,在10CV上至15%EtOAc,在5CV上至100%EtOAc),获得(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯(734mg,2.96mmol,59%),为橙色固体。
Rf=0.76(cHex/EtOAc 9:1,UV 254nm).1H NMR(CDCl3,400MHz):δ6.71(s,1H),5.91(s,1H),2.13(d,J=1.2Hz,3H),1.49(s,9H)。
步骤3:2-氯-4-甲基噻吩-3-胺盐酸盐:
向(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)氨基甲酸叔丁酯(567mg,2.29mmol,1.0当量)在无水二恶烷(4.6mL)中的溶液中,在氮气氛下,在室温下,加入HCl溶液(二恶烷中的4.0N,1.70mL,6.80mmol,3.0当量)。将反应混合物在室温搅拌16小时。TLC(cHex/EtOAc 9:1,UV254nm)显示仍然存在起始原料。HCl溶液(二恶烷中的4.0N,1.20mL,4.80mmol,2.1当量)和悬浮液在室温下搅拌5小时。减压除去溶剂,并将粗产物在Et2O(5mL)中研磨,超声处理5分钟,在室温下搅拌3小时。过滤并在高真空下干燥后,获得2-氯-4-甲基噻吩-3-胺盐酸盐(360mg,1.89mmol,86%),为灰色固体。
Rf=0.00(cHex/EtOAc 9:1,UV 254nm).1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ7.06(s,1H),5.54(s,3H),2.14(d,J=1.2Hz,3H)。
步骤4按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(367mg,1.35mmol)、2-氯-4-甲基噻吩-3-胺盐酸盐(200mg,1.16mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(456mg,1.63mmol)、N,N-二异丙基乙胺(700mg,5.42mmol,4.0当量)和乙腈(6.9mL,0.3M)。用EtOAc萃取后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺(462mg,1.15mmol,纯度约为70%),为黄色固体,无需进一步纯化即可用于下一步骤。
步骤5按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-氯-4-甲基噻吩-3-基)噻唑-5-羧酰胺(230mg,0.575mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(374mg,2.87mmol)、N,N-二异丙基乙胺(30mg,0.23mmol)和1-丁醇(2.0mL,0.3M)。快速纯化(在10CV上从100%DCM到25%DCM/MeOH)并在Et2O中研磨后,获得C7(图1C,92mg,0.19mmol,2个步骤的产率33%),为灰白色固体。Rf=0.15(DCM/MeOH 9:1,UV 254nm)。
化合物C8:
2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(1,3,5-三甲基-1H-吡唑-4-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001531
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(530mg,1.96mmol)、1,3,5-三甲基-1H-吡唑-4-胺(319mg,2.55mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(659mg,2.35mmol)、N,N-二异丙基乙胺(886mg,6.85mmol)和乙腈(5.8mL,0.3M)。从H2O沉淀后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(1,3,5-三甲基-1H-吡唑-4-基)噻唑-5-羧酰胺(177mg,0.468mmol),为黄色固体,其无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(1,3,5-三甲基-1H-吡唑-4-基)噻唑-5-羧酰胺(175mg,0.463mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(301mg,2.32mmol)、N,N-二异丙基乙胺(24mg,0.19mmol)和1-丁醇(1.4mL,0.3M)。快速纯化(在10CV上从100%DCM到85%DCM/3N NH3的MeOH溶液,在10CV上85%DCM/3N NH3 MeOH溶液)并在Et2O中研磨后,得到C8(图1C,142mg,0.301mmol,2个步骤的产率为16%),为灰白色固体状。
化合物C9:
N-(3,5-二甲基-1,2-异恶唑基)-3-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001532
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(530mg,1.96mmol)、3,5-二甲基异恶唑-4-胺(285mg,2.55mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(659mg,2.35mmol)、N,N-二异丙基乙胺(886mg,6.85mmol)和乙腈(5.8mL,0.3M)。从H2O中沉淀并用Et2O洗涤后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3,5-二甲基异恶唑-4-基)噻唑-5-羧酰胺(525mg,1.44mmol),为黄色固体,其无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(3,5-二甲基异恶唑-4-基)噻唑-5-羧酰胺(530mg,1.45mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(946mg,7.26mmol)、N,N-二异丙基乙胺(75mg,0.58mmol)和1-丁醇(4.4mL,0.3M)。快速纯化后(10CV上100%DCM到75%DCM/MeOH,75%DCM/MeOH 5CV),获得C9(图1C,280mg,0.611mmol,2个步骤的产率为31%),为灰白色固体。
化合物C10:
N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((2-甲基)-6-(4-甲基哌嗪-1-基)嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001541
根据B3的程序进行步骤1-3。
步骤4按照GP B进行,使用N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(206mg,0.521mmol)、1-甲基哌嗪(261mg,2.61mmol)、N,N-二异丙基乙胺(27mg,0.21mmol)和1-丁醇(1.5mL,0.3M)。用EtOAc萃取,快速纯化(在10CV上从100%DCM到80%DCM/3N NH3的MeOH溶液)后,得到C10(图1C,50mg,0.11mmol,2个步骤的产率为6%),为白色固体。
化合物C11:
N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-((2-羟乙基)氨基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001542
根据B3的程序进行步骤1-3。
步骤4按照GP B进行,使用N-(4-氯-2-甲基吡啶-3-基)-2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺(200mg,0.506mmol)、2-氨基乙-1-醇(155mg,2.30mmol)、N,N-二异丙基乙胺(26mg,0.20mmol)和1-丁醇(1.5mL,0.3M)。用EtOAc萃取,快速纯(在10CV上从100%DCM到80%DCM/3N NH3的MeOH溶液),并在DCM/MeOH(96/4)中研磨后,获得C11(图1C,15mg,0.036mmol,2个步骤的产率为1%),为灰色固体。
化合物C12:
(R)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(奎尼丁-3-基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001543
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(500mg,1.85mmol)、(R)-奎尼丁-3-胺二盐酸盐(441mg,2.22mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(622mg,2.22mmol)、N,N-二异丙基乙胺(1.31g,10.2mmol,5.5当量)和乙腈(10mL,0.2M)。从H2O沉淀后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(奎尼丁-3-基)噻唑-5-羧酰胺(250mg,0.491mmol),为黄色固体,无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(奎尼丁-3-基)噻唑-5-羧酰胺(222mg,0.540mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(553mg,4.25mmol)、N,N-二异丙基乙胺(44mg,0.34mmol)和1-丁醇(2.5mL,0.3M)。制备型TLC(DCM/MeOH 4:1,Rf=0.00,UV 254nm)后,获得C12(图1C,30mg,0.063mmol,2个步骤的产率3%),为白色固体。
化合物C13:
N-(2-乙基-4-甲基吡啶-3-基)-2-((6-(4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基)-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酰胺
Figure BDA0003884477230001551
步骤1按照GP A1进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)噻唑-5-羧酸(170mg,0.628mmol)、2-乙基-4-甲基吡啶-3-胺(103mg,0.754mmol)、四甲基氯甲脒六氟磷酸酯(211mg,0.754mmol),N,N-二异丙基乙胺(284mg,2.20mmol)和乙腈(5.0mL,0.1M)。用EtOAc萃取后,获得2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-乙基-4-甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺(90mg,0.23mmol),为绿色固体后,无需进一步纯化即可用于下一步。
步骤2按照GP B进行,使用2-((6-氯-2-甲基嘧啶-4-基)氨基)-N-(2-乙基-4-甲基吡啶-3-基)噻唑-5-羧酰胺(87mg,0.22mmol)、2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(150mg,1.10mmol)、N,N-二异丙基乙胺(12mg,0.089mmol)和1-丁醇(0.7mL,0.3M)。快速纯化后(10CV上100%DCM至75%DCM/MeOH),获得C13(图1C,48mg,0.099mmol,2个步骤的产率为16%),为灰白色固体。
化合物C1至C15、B3和化合物A8(达沙替尼)的特征如下表1A所示。
表A:激酶抑制剂的合成。
Figure BDA0003884477230001552
Figure BDA0003884477230001561
化合物D1至D10:
通过方案2与化合物C7类似地制备化合物D1至D10(图1D),不同之处在于在步骤4(GP A1)中使用了适用的胺,在步骤5(GP B)中使用了适用的哌嗪基衍生物。
由表B合成的化合物的特征如下表1B所示。
表1B:进一步的激酶抑制剂的合成。
Figure BDA0003884477230001562
*使用Bruker AV300机器在300MHz处确定。
实施例1.3[预见的]:式(Ia)、(Ib)和(Ic)的其他激酶抑制剂的合成。
基于达沙替尼(A8)的构效关系(SAR)的其他激酶抑制剂:
合成另外的激酶抑制剂(特别是式(Ia)、(Ib)和/或(Ic)的那些)以举例说明式(Ia)、(Ib)和(Ic)(如适用)的另一组不同的取代基(特别是在Hy、R1a、R1b、R1c、R1d、R1e、R2、R3、R4、R5、R6、R7、E和B处)提供作为激酶抑制剂和/或具有细胞抗增殖活性的化合物。
例如:(i)参照图8A(来自Lombardo et al 2004,J Med Chem 47:6658的表1),制备式(Ia)、(Ib)和/或(Ic)的化合物,其在R1a、R1c和B处的取代基类似于分别独立地选自R2、R1和X的那些,如图8A所示;和/或(ii)参考图8B(来自Das et al 2006,J Med Chem 49:6819的表4),制备式(Ia)、(Ib)和/或(Ic)的化合物,其在B/R1a/R1c和R7处的取代基类似于分别独立地选自R1和R的那些,如图8B所示。
实施例2.1:式(Ia)的激酶抑制剂对SIK3、SIK2、CSF1R和其他激酶的抑制。
具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物的SIK2/3抑制活性:
合成式(Ia)化合物(即化合物C7的氟化变体),并且使用诸如本文所述的那些测定法,本发明人表明,尽管有显著的结构变化,但本发明的氟化C7变体(例如E4、E9和E10)也有效地抑制SIK激酶,许多化合物以较低的两位数nM IC50抑制SIK3和/或SIK2,并且一些化合物甚至以较低的一位数nM IC50抑制SIK2。发明人惊讶地观察到激酶抑制剂E4在抑制SIK2和SIK3方面与达沙替尼和C7相当,并且氟化化合物E9在抑制SIK3方面甚至优于达沙替尼和C7(表2.1)。
表2.1与本文公开的其他化合物相比,式(Ia)的激酶抑制剂的生物活性
Figure BDA0003884477230001571
还测试了化合物E10的两种分离的对映异构体中的每一种对SIK2和SIK3的抑制活性。对映异构体E10-Ent-I和E10-Ent-II对SIK2表现出与外消旋E10相似的IC50,但是迹象表明与E10-Ent-II相比,E10-Ent-I可能是一种对SIK2更有效的抑制剂。相比之下,令人惊讶的是,结果表明,E10-Ent-II对SIK3的IC50约为E10-Ent-I对SIK3的IC50的一半,且外消旋E10的IC50大约介于其两个对映体的IC50之间。
具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物的选择性:
本文所述的其他化合物还对一组不同的335种野生型蛋白质(ProQinase“KinaseProfiler”;ProQinase,Freiburg,Germany)进行单点(0.1uM或1uM)抑制试验的测试。
除了它们的R1a部分(被认为是暴露在溶剂中,并且因此预计对激酶选择性几乎没有影响),化合物E9和E10具有相同的结构——特别是在它们的R6具有氟化取代基——并且这些化合物显示出几乎相同的激酶组谱(图16A)。相比之下,与化合物E4相比,化合物C7(没有R6的氟化取代基)显示出其抑制的激酶的谱显著不同,除了E4在R6处的二氟化-CHF2取代基与C7的-CH3相比E4与C7结构上相同(图16B)。此外,有迹象表明R6的氟化取代基可能比其他取代基更能影响某些激酶。例如,具有R6的氟化取代基的式(Ia)的化合物似乎比不具有R6的氟化取代基的高度相似的化合物C7更少地抑制激酶MAP3K11,相反,具有R6氟化取代基的式(Ia)的化合物似乎比C7更强烈地抑制激酶NEK11。这在1uM(图17A)和0.1M(图17B)的化合物浓度下均可见。这种迹象得到了本文公开的其他化合物的激酶谱的类似比较的进一步支持(数据未显示)。随后进行IC50测试以进一步调查这些差异,特别是具有R6的氟化取代基的化合物E4、E9、E10和/或E16与例如不具有R6的氟化取代基的化合物C7相比,尤其是激酶例如MAP311、NEK11和/或一种或多种本文公开的其他激酶(例如下文的实施例3)方面。
本文公开的化合物(包括具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物)对CSFlR的抑制
本文公开的化合物(包括式(Ia)以及式(Ib)和(Ic)的化合物)也是集落刺激因子1受体(CSF1R)的有效抑制剂。尤其是,当针对CSF1R激酶测试作为本文所述的“激酶分析仪分析”的一部分时,化合物E4、E9和E10,以及化合物C7、A8(达沙替尼)和B3,均导致激酶CSF1R(以及类似的HCK)的残留活性低于1%。发明人由此证明了本文中的化合物(包括式(Ia)和式(Ib)和(Ic)的化合物)作为该疾病相关激酶抑制剂的效用。除了使用CSF1R(和/或HCK)酶及其(各自)适用的肽底物外,通过在与表3E中描述的那些类似的测定中测定它们对CSF1R(和/或HCK)的IC50,进一步显示本文公开的化合物(尤其是化合物E4、E9和E10,以及化合物C7和B3)是CSF1R(以及类似的HCK)的有效抑制剂。
CSF1R与其配体CSF1结合,产生的下游信号导致表达CSF1R受体的骨髓细胞分化和存活。特别是,CSF1-CSF1R信号传导对于巨噬细胞分化为更具抑制性的M2表型很重要(Lenzo et al 2012,Immunol Cell Bio 90:429)。事实上,肿瘤中CSF1R+巨噬细胞的存在与各种适应症(包括胃癌、乳腺癌、卵巢癌、膀胱癌等)的不良生存率相关(Zhang etal2012,PLoS One 7:e50946)。
不受理论束缚,在实施例8.1(特别是图21H)中描述的MC38同源小鼠肿瘤模型中,化合物E9对(抑制性)M2肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的特异性消耗可能是由于化合物E9对CSF1R的抑制。
在TAM中,HCK刺激促进细胞外基质降解的足体形成,从而增强免疫和上皮细胞侵袭(Poh et al 2015,Oncotarget6:15742)。在用式(Ia)和式(Ib)和(Ic)的化合物处理后,在动物模型(例如本文所述的那些)中研究TAM内足体的形成。
实施例2.2[比较性的]:通过本文公开的其他激酶抑制剂抑制SIK;Abl和Src激酶。
已证明式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C1至C12和B3,以及表B的化合物D1至D10)有效抑制SIK、ABL1和/或SRC激酶(表3A和表3A1),许多化合物以较低的一位数nM IC50抑制SRC,并以较低的两位数nM IC50抑制SIK(特别是SIK3和/或SIK2)和/或ABL1。类似地测试了化合物C13。
达沙替尼、C7和B3抑制ABL1的IC50约为1.5nM、5.1nM和1.6nM,而SRC的为1.5nM、1.5nM和1.5nM;每个分别用达沙替尼、C7和B3(表3A)。化合物C12还是SRC的强抑制剂(<100nM IC50),并且与ABL1相比对SRC的选择性。
简而言之,使用放射性蛋白质激酶测定法(
Figure BDA0003884477230001591
Assay)来测量这5种蛋白激酶的激酶活性。所有激酶测定均在反应体积为50uL的PerkinElmer(Boston,MA,USA)的96孔FlashPlatesTM中进行。按照以下顺序分四个步骤将反应混合物移液:
·25uL测定缓冲液(标准缓冲液/[γ-33P]-ATP)
·10uL ATP溶液(在水中)
·5uL的测试化合物(在10%DMSO中)
·20uL酶/底物混合物。
所有蛋白激酶的测定均包含70mM HEPES-NaOH pH7.5、3mM MgCl2、3mM MnCl2、3μM原钒酸钠、1.2mM DTT、ATP(浓度可变,分别对应于各自的表观ATP-Km激酶,见表2A)、[γ-33P]-ATP(每孔约8x 105cpm)、蛋白激酶(可变量,见表2A)和底物(可变量,见表2A)。
每孔使用以下量的酶和适用的底物:
表2A:用于测试的蛋白激酶的测定参数。
Figure BDA0003884477230001592
*最大摩尔酶测定浓度,意味着酶制剂仅含有100%的活性酶
反应混合物在30℃下孵育60分钟。用50uL的2%(v/v)的H3PO4终止反应,吸出板并用200μL的0.9%(w/v)的NaCl洗涤两次。用微量滴定板闪烁计数器(Microbeta,Wallac)确定33Pi的掺入。所有测定均使用BeckmanCoulter/SAGIAN(TM)核心系统进行。
实施例3[比较性的]:式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的改善的激酶选择性。
已证明式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C1至C12和B3,以及表B的化合物D1至D10)似乎是与酪蛋白激酶抑制剂达沙替尼相比,具有选择性(尤其是SRC选择性)的蛋白酪氨酸激酶抑制剂(有利于抑制例如ABL1,特别是SRC激酶)。类似地测试了化合物C13。
特别是,尽管许多这些激酶抑制剂抑制了SIK激酶家族(SIK1、SIK2和SIK3)的每个(或一个或多个),一些即使在亚微摩尔浓度下,但是与达沙替尼相比,它们对这些蛋白-丝氨酸/苏氨酸激酶的抑制作用较弱(表3A和表3A1)。
特别地,举例来说,与达沙替尼相比,化合物C3、C8和C12是至少SIK1、SIK2和SIK3的活性更少的抑制剂,但仍是SRC和ABL1尤其是SRC的强抑制剂(IC50分别:<2nM,<25nM和<100nM)。
表3A:式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的生物活性
Figure BDA0003884477230001593
Figure BDA0003884477230001601
表3A1:式(Ib)/(Ic)的进一步的激酶抑制剂的生物活性。
Figure BDA0003884477230001602
如实施例2中所述测定化合物对蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶SIK家族(SIK1、SIK2和SIK3)的IC50,并且B3和A8的抑制曲线如图2(A至E)所示,以及C3和C12的如图2(F至J)所示。例如(图2F至J),化合物C3和C12保留了对SRC的有效抑制活性(分别为IC50:<2nM和<100nM),但与达沙替尼相比(参见图2A至E,右栏)是针对ABL1的明显更少活性的抑制剂,尤其是对SIK1、SIK2和SIK3的活性较低。
此外,对一组320种野生型蛋白质(ProQinase“Kinase Profiler”;ProQinase,Freiburg,Germany)进行单点(1uM)抑制试验(一式两份)显示,式(Ib)/(Ic)的化合物比达沙替尼更具选择性(图3和4,表3AA)。类似地测试了式(Ib)/(Ic)的其他化合物(例如,化合物D1至D10中的一种或多种)。实际上,总的(以及式(Ib)/(Ic)的一个示例化合物)激酶抑制剂B3在数值上比达沙替尼(A8)更具选择性,其中B3的选择性得分为0.163,而达沙替尼为0.188。根据Karaman et al(2008;Nat Biotech 26:127),选择性得分是一种化合物浓度依赖性参数,描述了被抑制超过预定程度(例如,超过50%)的激酶部分,相对于特定项目的所有测试激酶。
表3AA:对于式(Ib)/(Ic)和达沙替尼(A8)的化合物在320种激酶中的选择性得分。
Figure BDA0003884477230001603
*TK:酪氨酸激酶;TKL:酪氨酸激酶样;CAMK:钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶。
计算残留浓度<50%时,测试浓度下化合物的选择性得分;即,抑制率>50%。使用以下公式计算特定浓度下特定化合物的选择性得分:
选择性得分=(数据点数<50%)/(数据点总数)
实际上,几乎所有测试过的式(Ib)/(Ic)的化合物都显示出比达沙替尼显著提高的选择性得分(即,它们抑制的激酶数量减少了50%以上)。不仅在所有320种激酶中都显示出这种选择性,而且还通过激酶家族特异的选择性得分得以显示。并且,例如,几乎所有测试的式(Ib)/(Ic)的化合物甚至在蛋白酪氨酸和类似蛋白酪氨酸的激酶家族中都比达沙替尼具有更高的选择性,并且所有(包括C7)对CAMK激酶家族都具有比达沙替尼更高的选择性。实际上,已显示化合物C9不会抑制任何CAMK激酶(即使SIK1、SIK2或SIK3)超过50%。
作为式(Ib)/(Ic)的一种特定激酶抑制剂的进一步实施例,化合物B3,特别是,除了少数例外(例如,FLT3,在用1μM的化合物B3处理后仅显示32%的残留活性,但是在用1uM达沙替尼治疗后,其活性的80%仍保留),与两种化合物均同等抑制的激酶(例如ABL1和SRC)不同,这种式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂在大多数测试的这些激酶中抑制效力较弱(图3和4)。例如,WNK2不受B3抑制(在1μM B3时残留活性为100%),但是在用1μM达沙替尼治疗后,仅保留了62%的WNK2活性;同样,JAK1不受1μM B3的抑制,但用1μM达沙替尼治疗后仅保留41%的活性;用1μM B3处理后,几乎100%的RET活性仍然保留,而用1μM达沙替尼处理后,其活性的40%保留。同样,用1μM的达沙替尼处理丝氨酸/苏氨酸激酶MAP4K5显示残留活性仅为3%,而用1μM的B3处理则显示28%的残留活性。确实,许多激酶在用1μM达沙替尼抑制后具有不到20%的残留活性,但是在用1μM B3抑制时仍保留了近50%的活性。例如,当用1μM B3抑制时,B-RAF保留几乎50%的活性,而当使用1μM达沙替尼抑制时,仅保留15%的活性。
式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂对达沙替尼抑制的许多其他激酶和激酶家族成员显示出不同的抑制作用;例如,并且特别是通过式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂化合物B3抑制KIT和EphA/B亚家族的某些成员(表3B)。
表3B:某些激酶/激酶亚家族在式(Ib)/(Ic)的化合物和达沙替尼(A8)之间显示出不同的抑制作用。
Figure BDA0003884477230001611
*TK:酪氨酸激酶;STE:Yeast Sterile 7、Sterile 11、Sterile 20激酶的同系物
总体而言,1μM达沙替尼抑制23种激酶至残留活性低于1%,而1μM B3仅抑制13种激酶至残留活性低于1%。同样,在残留活性阈值<5%的情况下,达沙替尼抑制38种激酶,而1μM B3仅抑制30种激酶。而对于残留活性<10%的阈值,达沙替尼抑制43种激酶,而1μM B3仅抑制34种激酶。
表3C显示了在用一种化合物处理时保持大于50%的活性,而在用另一种化合物处理时显示出小于或等于50%的残留活性的激酶。化合物A8(达沙替尼)抑制9种激酶超过50%,其中当用式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂化合物B3处理时,这种激酶保留其活性的50%以上。相反,在所有测试的激酶中,式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(B3)仅抑制了一种激酶(FLT3)大于50%,而达沙替尼也未抑制该激酶大于50%。
表3C:显示在式(Ib)/(Ic)的化合物B3和达沙替尼(A8)之间的差异抑制(残留活性为50%)的激酶。
Figure BDA0003884477230001621
*TK:酪氨酸激酶;STE:Yeast Sterile 7、Sterile 11Sterile 20激酶的同系物;TKL:酪氨酸激酶样;CMGC:包含CDK、MAPK、GSK3和CLK家族。
实际上,与达沙替尼(A8)相比,已证实式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C2、C4、C7、C8和C9和B3)显示出对一种或多种以上激酶的不同生物学抑制活性,当在生化测定中测试以确定IC 50时(表3D),相应的IC50曲线示于图5A至D(类似地测试了式(Ib)/(Ic)的其他化合物)。的确,尽管化合物B3和A8都是(同时也是)LCK和KIT激酶的强抑制剂,但与达沙替尼(A8)相比,化合物B3抑制FLT3的作用远强于SYK(对于B3,IC50分别为6.9μM和26.0μM;对于A8,分别为25.7μM和4.8μM)。
因此,尽管B3(式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂)通常比激酶抑制剂A8(达沙替尼)具有更高的选择性,但B3被证明比化合物A8更有力地抑制FLT3(并反映在图4A中单个离点上,其代表FLT3)。
表3D:与达沙替尼(A8)相比,式(Ib)/(Ic)的化合物对其他激酶的生物活性
Figure BDA0003884477230001622
与上述实施例2中所述的IC50分析类似,对每种化合物针对这些激酶的IC50进行了测试,不同之处在于每孔使用以下量的酶和适用底物(表3E):
表3E:其他测试的蛋白激酶的测定参数。
Figure BDA0003884477230001623
*最大摩尔酶测定浓度,意味着酶制剂仅含有100%的活性酶
实际上,一种本文公开的化合物(C7)具有另一种激酶抑制特征(图3);表现出不同于化合物A8和化合物B3的特性。图9显示了一组320种野生型蛋白激酶(如上所述的ProQuinase“Kinase Profiler”)的残留活性%(均值,重复1uM单点抑制测定的)的散点图,其中在每个Y轴上显示化合物C7的残留活性%,分别在图9A和9B的X轴上显示化合物A8和B3的残留活性%。
此外,化合物C7在抑制多种激酶方面比化合物A8(达沙替尼)和B3分别显著更有效(分别见表3F.1和3F.2),例如,虚线框中包含的激酶在图9A和9B中标识。此外,化合物C7与化合物B3的显著区别在于C7在抑制FLT3方面的相对无活性(C7的残留活性为60%,而B3的残留活性为32%)。
表3F.1:某些激酶/激酶亚家族在化合物C7和达沙替尼(A8)之间显示出不同的抑制作用。
Figure BDA0003884477230001631
表3F.2:某些激酶/激酶亚家族在化合物C7和化合物B3之间显示出不同的抑制作用。
Figure BDA0003884477230001632
实际上,特别重要的是,化合物C7与化合物A8和B3相比对以下激酶的抑制作用差异模式(表3G)。事实证明,化合物C7比现有技术化合物A8(达沙替尼)对表3G中列出的许多关键激酶更有效,特别是作为TKL的此类激酶(例如,激酶的ACV家族,RAF1和BRAF和TBFB-R1),以及对CMGC激酶p38-α和-β。此外,化合物C7(式(Ib)/(Ic)的化合物作为这类激酶的抑制剂明显比化合物B3(也是式(Ib)/(Ic)的化合物)更有效。还应特别注意的是,化合物C7是NEK11的强效抑制剂(仅10%的残留活性),而这种激酶仅被达沙替尼中度抑制(超过50%的残留活性),而几乎不受化合物B3的抑制(几乎90%的残留活性)。
表3G:与达沙替尼(A8)和化合物B3相比,化合物C7表现出的不同抑制作用
Figure BDA0003884477230001633
Figure BDA0003884477230001641
IC50测试反映了这些(或其他)差异中的一个或多个,并证实与化合物A8(达沙替尼)[和/或与化合物B3]相比,式(Ib)/(Ic)的化合物C7显示出对许多上述激酶具有不同的抑制活性。例如,确定化合物C7对激酶TGFB-R1的IC50对C7为约490nM,对A8为880nM(International Centre for Kinase Profiling,Dundee)。
实施例4[比较性的]:式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂和达沙替尼对Abl1激酶突变体的抑制。
已证明了式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C、C4和C7和B3)也能够抑制临床相关的ABL1突变体,例如与CLL对伊马替尼(一种对CLL的护理标准)的耐药性有关的突变体(表4A)。例如,不仅式(Ib)/(Ic)的抑制剂是比伊马替尼更有力的ABL1野生型(wt)抑制剂(2.60μM对1,060nM),它们还是ABL所有这些相关突变体的有效抑制剂(T315I除外),并显示出可与A8媲美的IC50。对式(Ib)/(Ic)的其他化合物进行类似的测试。
表4A:Abl 1激酶突变体的抑制。
Figure BDA0003884477230001642
简而言之,如实施例1所述进行了ABL1放射蛋白激酶测定,不同的是[γ-33P]-ATP活性约为每孔7x 105cpm,每种形式的ABL1激酶的量和底物如表4B所示。
表4B:ABL1突变蛋白激酶的测定参数。
Figure BDA0003884477230001643
Figure BDA0003884477230001651
*最大摩尔酶测定浓度,意味着酶制剂仅含有100%的活性酶
实施例5.1:式(Ia)的激酶抑制剂的改善的ADMET特性。
具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物的ADMET特性:
使用诸如本文别处描述的那些测定法(例如下面的实施例5.1,例如与表5A中提供的数据有关),发明人证明式(Ia)的激酶抑制剂(氟化C7类化合物,例如E4、E9和E10)在许多体外ADMET测定法中显示出可比较的,并且在某些方面甚至改进的药物样性能,包括血浆蛋白结合、稳定性和细胞渗透作用(表5.1A和5.1B)。
总体而言,他们表明氟化C7系列化合物表现出较高的人和小鼠血浆蛋白结合(>95%)。然而,C7和所有氟化C7类化合物以及达沙替尼在人和小鼠血浆中表现出优异的血浆稳定性,T1/2>150分钟。
因此,氟化C7样激酶抑制剂(例如E4、E9和E10)在人和小鼠肝微粒体中不稳定(半衰期在10-20分钟范围内,固有清除率在70-250μL/分钟/毫克之间;表5.1)。这些微粒体稳定性将这些化合物归类为高清除率药物。
事实上,在人肝细胞存在的情况下,E9和E10的半衰期为21-30分钟,因此证实它们是高清除率药物。然而,C7和E4显示出更高的稳定性,半衰期约为1小时,将它们归类为中高清除率药物(表5.1A)。
氟化C7样衍生物在小鼠肝细胞存在下表现出更高的稳定性,能够被归类为中清除率药物,典型的半衰期为50-78分钟(表5.1A)。
表5.1A:与C7相比,式(Ia)的激酶抑制剂的稳定性和溶解性相当。
Figure BDA0003884477230001652
NT=未测试
在相同、相似或类似的测定中,测试如下所述的MDR1-MDCK流出比(例如,结合表5D中显示的数据),研究人员表明,式(Ia)的激酶抑制剂(氟化C7类衍生物)的流出比(MDCK野生型)在2-4的范围内,而E9和E10的MDCK-MDR1流出比在20-30的较低范围内,C7和E4的在40-50的范围内。由于所有这些化合物表现出>10的有效的MDCK-MDR1流出比,它们很可能是P-gp底物(表5.1B)。
表5.1B:C7和式(Ia)的激酶抑制剂在MDCK野生型和MDCK-MDR1细胞中的平均流出比
Figure BDA0003884477230001661
式(Ia)的其他氟化C7样激酶抑制剂在相同、相似或类似的测定中进行测试。
本文公开的其他化合物(包括式(Ib)/(Ic))的ADMET特性:[比较性的]
已证明式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C2、C4、C8、C9和C12以及B3)在许多体外ADMET(吸收、分布、代谢、排泄、毒性)分析中表现出改善的药物样性质,包括溶解度、稳定性、血浆蛋白结合、CYP450抑制和hERG抑制分析(表5A、5B、5C和5D)。对式(Ib)/(Ic)的其他化合物进行了类似的测试。
对于口服药物,达沙替尼是一种难溶性化合物,测得的动力学溶解度甚至低于5μM。但是,激酶抑制剂B3显示了82μM的显著提高的溶解度。
在另一个实验中,对式(Ib)/(Ic)的化合物C2、C4、C7、C8、C9和C12进行了类似的测试,所有化合物(C7除外)显示了进一步提高的动力学溶解度,介于128至195μM(对于化合物C12)之间。
而且,如上所述,达沙替尼在人体内的半衰期非常短(总体平均终末半衰期仅为3-5小时;SPRYCEL完整处方信息第12.3节“药代动力学”)。这反映在人体(h)和小鼠(m)的活体微粒(LM)稳定性测定中,显示出非常短的半衰期。相比之下,激酶抑制剂B3在hLM和mLM分析中均显示出显著改善的稳定性,在孵育40分钟后,半衰期、固有清除率和化合物残留百分比显著提高,在hLM分析中,与达沙替尼相比,半衰期延长了近6倍,而在40分钟时10倍以上的药物剩余。
在单独的实验中,对化合物C2、C4、C7、C、C9和C12进行了类似的测试,所有化合物(C7除外)在人和小鼠肝微粒体中均显示出更高的稳定性,其中化合物C8、C9和C12的半衰期超过100分钟。
已证明达沙替尼和式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C2、C4、C8和C9和B3)显示出与人和鼠血浆蛋白均适度结合,其中与未结合的达沙替尼相比,某些式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C2、C8、C9和B3)在人血浆中的游离药物量(即未与血浆蛋白结合,并且可能可用于药理活性)显著增加(最多2至5倍),在鼠血浆中这种作用甚至更为明显。实际上,某些式(Ib)/(Ic)的化合物显示出非常低的血浆-蛋白质结合:化合物C12在人和鼠血浆中都保持超过90%的未结合。
因此,在某些情况下(例如C2、C8、C9和C12和B3),对于这些体外ADMET参数,式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂比达沙替尼具有高度改善的药物样特性(表5A)。类似地研究了其他式(Ib)/(Ic)的化合物,例如化合物D1至D10中的一种或多种。
表5A:包括式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的改善的溶解度和稳定性。
Figure BDA0003884477230001662
Figure BDA0003884477230001671
Figure BDA0003884477230001672
溶解度和稳定性测试是由Charles River Inc.在其UK Discovery站点(Cambridge,UK)根据适用的标准操作程序进行的(ADME-SOP-01用于溶解度;AMDE-SOP-100用于微粒体稳定性;AMDE-SOP-90用于血浆蛋白结合)。
已知达沙替尼会抑制某些细胞色素P450(CYP450)酶;包括参与其新陈代谢的那些。实际上,尽管达沙替尼主要通过细胞色素P450酶3A4(CYP3A4)在人体内代谢,但它也是CYP3A4的时间依赖性抑制剂。的确,如果患者同时服用强效CYP3A4抑制剂(见上文),则必须显著降低达沙替尼的剂量(例如,从每天100mg降至每天20mg)。但是,已证明激酶抑制剂B3不能显著抑制所测试的任何CYP450酶,重要的是B3并非已知也被达沙替尼抑制的CYP3A4或CYP2C8抑制剂(表5B)。
在相同、相似或类似的CYP450抑制测定中测试了式(Ib)/(Ic)的其他激酶抑制剂(例如C1至C13和/或D1至D10中的一个或多个)。
表5B:激酶抑制剂B3不抑制CYP450酶2C8和3A4。
Figure BDA0003884477230001673
*从NDA 21-986SPRYCEL(达沙替尼)临床前评价第33页获得的值
CYP450抑制测定法(非针对A8)是由Charles River Inc在其UK Discovery站点(Cambridge,UK)根据适用的标准操作程序(ADME-SOP-97)进行的。达沙替尼的CYP450抑制值取自NDA 21-986的SPRYCEL(达沙替尼)的临床前综述的第33页。
达沙替尼的一种“警告和注意事项”(SPRYCEL的完整处方信息)是它有可能延长心脏心室复极化(QT间隔)。实际上,据其中报道:在临床试验中,多达1%的CML患者经历了QT延长,在258名服用达沙替尼的患者中,有5.8%的人报告了心脏不良反应,其中包括1.6%的患有心肌病、充血性心力衰竭、舒张功能不全、致命的心肌梗塞和左心室功能不全的患者。
在NDA过程中已经认识到达沙替尼的潜在心脏风险,其第3页总结了NDA 21-986的药理/毒性审查和评估:“基于体外hERG和兔Purkinje纤维测定,达沙替尼可能导致QT延长”,其中第31页报道达沙替尼在3、10和3uM时分别抑制hERG电流约6%、36%和77%,计算出的IC50为14.3uM。
形成鲜明对比的是,如表5C所示,激酶抑制剂B3本质上不显示hERG依赖性,产生的IC50值大于或等于测试的最高浓度(30uM),而在30uM时,hERG的抑制率仅为7.7%(+/-1.0%),相比之下据报道在30uM达沙替尼时对hERG的抑制率为76.8%(+/-4.5%)。
在相同、相似或类似的试验中测试了其他式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如,C1至C13和/或D1至D10中的一个或多个)的hERG抑制。
表5C:激酶抑制剂B3不抑制hERFG。
Figure BDA0003884477230001681
*从NDA 21-986SPRYCEL药理/毒性审查和评估第31页获得的值
hERG抑制试验(非针对A8)是由Charles River Inc.在其UK Discovery站点(Cambridge,UK)进行的。简而言之,使用Sophion Qube自动化电生理平台上的CharlesRiver
Figure BDA0003884477230001682
hERG-HEK稳定转染的细胞系,确定了测试化合物抑制hERG钾通道的潜力。该测定在室温下进行,并使用单孔QChips记录单个细胞的hERG尾电流。将电池保持在-80mV的电压下,然后升至+40mV 2秒钟,然后再升至-40mV 2秒钟,这表示进行了1次实验扫描。在实验过程中,每15秒钟应用一次此电压方案。溶媒和第二化合物的添加期都应用了20次扫描。将第一个化合物添加期扫描10次。根据浓度响应曲线确定受试化合物抑制hERG通道的能力(IC50),该曲线由最多8种受试化合物浓度(每个浓度最多重复4次)生成。将化合物浓度两次加到测试孔中,以确保外部缓冲液与测试化合物完全交换。总共将化合物施加到孔中450秒钟。使用的质量控制过滤器为:全细胞膜电阻≥200MOhm,溶媒电流幅度≥400pA。分析方法包括:测量该步骤诱发到-40mV的峰尾电流,以分析受试化合物的抑制百分比。首先将峰尾电流标准化为同一孔中的溶媒添加量(0.3%DMSO)。绘制抑制百分率对Log10化合物浓度数据的图,并使用S形剂量响应方程式确定IC50。达沙替尼的hERG抑制值取自NDA 21-986的SPRYCEL(达沙替尼)的药理/毒性研究与评估第31页。
测定MDR1-MDCK有效流出比的分析表明,达沙替尼是MDR1泵的底物,并从表达该流出泵的细胞中活跃(有效流出比为18.3)。尽管无法确定B3的相对流出量,但由于在MDCK-MDR1细胞中A>B方向的检测极限,式(Ib)/(Ic)的化合物(有效流出比>9.6),有迹象表明,与达沙替尼相比,激酶抑制剂B3在该试验中显示出明显不同的参数(表5D)。
在相同、相似或类似的测定法中,测试了式(Ib)/(Ic)的其他激酶抑制剂(例如,C1至C13和/或D1至D10中的一个或多个)的MDR1-MDCK有效流出比。
表5D:在MDCK野生型和MDCK-MDR1细胞中的平均流出比。
Figure BDA0003884477230001691
MDR1-MDCK有效流出试验是由Charles River Inc在其UK Discovery站点(Cambridge,UK)根据适用的标准操作程序(ADME-SOP-56)进行的。
实施例5.2:本文公开的激酶抑制剂的药代动力学和耐受性研究。
具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物的药代动力学和耐受性研究:
测试筛选式(Ia)的激酶抑制剂(氟化C7类化合物,例如E4、E9和E10)的PK特性(例如通过使用与下表5.2B相关的分析),并可以与C7和A8(达沙替尼)的PK特性进行比较。
在口服30mg/Kg(po,per os)剂量后,研究人员出人意料地证明,与C7、B3和达沙替尼(C8)相比,式(Ia)的激酶抑制剂(例如E4和E9)在小鼠中的暴露有所改善。E4和E9均显示出药物清除率降低,因此其PK特性优于C7(表5.2C)。
因此,与C7相比,E4显示出药物清除率降低。与C7相比,6小时时间点的血清水平表明,总血清浓度和游离血清浓度分别提高了9.6倍和5倍。此外,与达沙替尼相比,6小时时E4的浓度增加了3倍。
另一方面,与C7相比,E9和E11的药物清除率略有提高。与C7相比,E9显示出总血清浓度和游离血清浓度分别提高了4.5倍和2倍;与C7相比,E11显示出总血清浓度和游离血清浓度分别提高了3.1倍和2倍。然而,E9和E11的血清浓度与达沙替尼相当。
与A8(达沙替尼)和C7相比,E4以及在一定程度上E3显示出Cmax略有增加,而E9、E10和E11显示出Cmax没有增加。筛选的E9的PK特性似乎并不优于E4。
表5.2C:与达沙替尼和C7相比,筛选小鼠中式(Ia)的激酶抑制剂的PK特性
Figure BDA0003884477230001692
Figure BDA0003884477230001701
类似地测试了筛选式(Ia)的其他激酶抑制剂的PK特性,并且可以与本文公开的其他化合物(例如C7、A8(达沙替尼)和B3)的PK特性进行比较。
为了进一步研究式(Ia)的激酶抑制剂(氟化C7样变体)的这些有利PK特性,在口服施用(per os,po)的完整药代动力学研究中测试化合物E4、E9和E10。
实验程序和药代动力学参数的确定是使用如下所述的测定法进行的(结合下表5.2A中提供的数据)。
本发明人特别惊讶的是,当口服施用时,所测试的式(Ia)的激酶抑制剂表现出改善的体内药物暴露和效力(表5.2D)。
的确令人惊讶的是,发明人观察到游离的式(Ia)的化合物的Cmax显著高于达沙替尼(A8)的Cmax,并且尤其高于现有技术杂环化合物B2以及结构相关化合物C7。更令人惊讶的是,所测试的化合物的PK参数似乎表现出两种形状的PK曲线:化合物E4显示出与C7相似形状的曲线(但总体上提高了游离化合物的水平),而化合物E9和E10表现出较短的半衰期,但具有血浆中游离化合物的Cmax(图24)。这些不同形状的PK曲线提供了开发不同剂量和治疗方案的机会,这些式(Ia)的化合物作为具有其他相同作用机制的候选药物。
特别是,在口服施用这些化合物时,与C7相比,E4、E9和E10的总血浆水平和游离血浆水平的AUC显著提高。然而,游离血浆水平的差异并不像总血浆水平那样显著(表5.2D),因为E4、E9和E10的血浆蛋白结合更高(参见表5.1A)。此外,与E4和C7相比,E9和E10的吸收和/或清除是不同的。一般而言,发明人惊讶地观察到与C7相比化合物E9尤其显示出显著改善的DMPK特性。
表5.2D:与C7、B3和A8(达沙替尼)相比,式(Ia)的激酶抑制剂(E4、E9和E10)的DMPK特性
Figure BDA0003884477230001702
Figure BDA0003884477230001703
Figure BDA0003884477230001711
NC=未计算
在C57BL/6小鼠中研究(例如,通过使用结合图10A、B和C描述的测定)式(Ia)的激酶抑制剂(例如E4、E9和E10)的最大耐受剂量(MTD),并如表5.2E所示。研究的剂量尤其由特定化合物的溶解度决定。考虑到获得的结果、每种化合物观察到的DMPK特性和SIK3 IC50值,提出了小鼠体内功效研究(使用MC38肿瘤)的BID剂量。
表5.2E:与C7相比,DLT对式(Ia)的激酶抑制剂的施用
Figure BDA0003884477230001712
n.d.=未检测到;DLT=剂量限制性毒性;HRD=最高推荐剂量
本文公开的其他化合物(包括式(Ib)/(Ic))的药代动力学和耐受性研究:[比较性的]
据观察,尽管与达沙替尼或化合物B3(也是(Ib)/(Ic)化合物)相比,化合物C7(式(Ib)/(Ic)的化合物)在体外ADMET方面显示出较差的体外ADMET性能,但在体内测试时,与化合物B3相比,化合物C7显示出显著改善的药代动力学性质(以及与达沙替尼有关的合适的药代动力学特征)。例如,表5A(实施例5.1)表明,在与人或小鼠肝微粒体体外测试时,化合物C7具有降低的代谢稳定性,并且在每种情况下与达沙替尼(以及与化合物B3相比)与人和小鼠血浆蛋白的结合更高。然而,当进行体内测试时,化合物C7表现出的药物代谢和药代动力学(DMPK)特性比结构上相关的化合物B3显著提高(表5.2A)。
还观察到,与达沙替尼(A8)相比,化合物C7的合适药代动力学特性仍然不同,并且与使用达沙替尼的机会相比,这为给药该活性化合物C7提供了新的机会。例如,口服施用后,化合物C7显示出与达沙替尼相似的半衰期和生物利用度,但显示出与达沙替尼相比更高的清除率和约1/3的AUC(表5.2A)。
众所周知,剂量方案,尤其是与其他疗法的组合(其顺序和时机),是许多重要且成功的抗癌疗法的基础。因此,拥有一种具有与达沙替尼相似的激酶活性但又不同的药代动力学特征的化合物(例如C7),可以设计、研究和(临床)测试新的(可能)治疗有效的癌症治疗方案。
特别地,最近已显示达沙替尼可以作为CAR T细胞的药理开/关开关(Mestermannet al 2019,Sci Transl Med 11:eaau5907)。CAR T细胞作为单次“活体药物”治疗进行施用。它们能够在患者体内持续数年,并在(再)暴露于抗原后在体内进行顺序的扩增、收缩和再扩增,因此,CAR T细胞疗法已与大量的急性和慢性副作用相关,在高度专业化的癌症中心限制了临床利用,以使患者适应医学需求。与CAR T细胞疗法相关的最常见的急性毒性是细胞因子释放综合征(CRS),这是由CAR T细胞以及随后产生关键CRS细胞因子白介素6(IL-6)的先天免疫细胞释放炎性细胞因子触发的。梅斯特曼(Mestermann)显示,在体外和体内,使用达沙替尼治疗可中止细胞溶解活性、细胞因子产生和CAR T细胞增殖。达沙替尼的剂量可以进行滴定,以实现对CAR T细胞功能的部分或完全抑制。停用达沙替尼后,抑制作用迅速而完全逆转,CAR T细胞恢复了其抗肿瘤功能。作为与达沙替尼具有类似抑制特征但具有不同药效特性的激酶抑制剂,可以利用化合物C7实时控制CAR T细胞在“功能-开-关-开”序列中的活性,并具有与达沙替尼相比不同解析度的时机。通过进一步的(临床前和临床)测试,将确定化合物C7的哪种剂量对这种CAR T细胞的“功能转换”作用有效。并且该剂量可能与C7抑制单药疗法(以及免疫反应的相关修饰)中的肿瘤生长所需的剂量相差很大(例如,更低),如实施例8所示。
表5.2A:与达沙替尼和B3相比,化合物C7的DMPK特性。
Figure BDA0003884477230001721
在雄性CD1小鼠(Charles River Inc,UK Discovery站点)中,每管每次施用每种化合物一次后,研究了C7、B3和A8的药代动力学特征。将化合物在丙二醇:水1:1的混合物(v:v)中稀释。用LC-MS/MS分析C7、A8和B3的血浆水平(药物施用后的0、25h;0,5h;1h;1、5h;2h;4h;7h;24h取样),并使用非隔室分析和30mg/kg的名义剂量水平确定药代动力学参数。每个时间点分析三只动物,每只小鼠总共用于三次血浆采样。
类似地测试筛选本文公开的其他激酶抑制剂(例如,来自表B、D1至D10的那些)的PK特性,并且可以将其与C、A8(达沙替尼)和B3的进行比较。例如,可以在施用后的某些时间点测定30mg/kg po(每os)给药剂量的小鼠后化合物的游离浓度(表5.2B)。
表5.2B:与达沙替尼和B3相比,筛选某些式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的PK特性。
Figure BDA0003884477230001722
Figure BDA0003884477230001731
ND=不可确定
NT=未测试
在雌性C57Bl/6小鼠中连续7天通过强饲法对不同浓度(33和100mg/kg)的C7进行每天一次(QD)或每天两次(BID)施用,研究了化合物C7的最大耐受剂量(MTD)。将化合物C7稀释在4%(v/v)的DMSO、72%(v/v)的丙二醇+24%(v/v)的dd-水中。在雌性C57BL/6动物中,化合物C7的最高耐受BID为100mg/kg,可耐受7天。化合物C7是安全的,没有任何不耐受的迹象(姿势、发声、易于操作、流泪、色带、流涎、完整的皮毛/外层、饲养、唤醒、立毛、正常的运动、尾巴捏、腹泻)。与未治疗的对照动物相比,在所有给药组中均观察到体重的轻度降低,这是由第2天的血浆采样引起的(图10A和B)。通过LC-MS/MS测量血浆C7水平,结果显示血浆浓度呈剂量依赖性增加(图10C)。
实施例5.3[预见的]:本文公开的激酶抑制剂的代谢谱。
发明人研究了本文公开的化合物(特别是式(Ia)、(Ib)和(Ic)的化合物)的代谢特征,并将这种特征(和个体代谢物)与已知的达沙替尼的代谢特征进行比较(例如Christopher et al 2008,Drug Metab&Disp 36:1357)。例如,在式(Ia)、(Ib)和(Ic)的化合物的相应杂环的代谢期间,尤其例如在化合物C7、E4、E9、E10和E17(例如E4或E9)的代谢期间,未观察到在达沙替尼的氯/甲基苯基或哌嗪基基团处观察到的修饰。例如,在(基于噻吩的)化合物(例如C7、E4、E9、E10和E17)中未观察到达沙替尼(A8)的醌-亚胺反应性代谢物(Duckett&Cameron 2010)。
式(Ia)、(Ib)和(Ic)的化合物(例如E4和E9)的代谢物谱与达沙替尼(A8)的代谢物谱简要比较如下。对于体外分析,将化合物与来自不同物种(例如小鼠、大鼠、狗、小型猪、食蟹猴和/或人)的肝细胞以两种不同浓度(例如,2uM用于清除研究,10uM用于代谢物生成)孵育(37℃)。确定2uM孵育的多个时间点的剩余母体化合物百分比(相对于t0),并选择单一时间点用于从10uM孵育的样品中进行代谢物分析/鉴定。使用高分辨率质谱法鉴定代谢物。对于体内分析,Christopher等人(2008)描述的方法可以被用于在人或类似地在动物物种(例如如上所述的一种或多种)中跟踪代谢物研究。
实施例6:激酶抑制剂的体外基于细胞的抗癌和抗白血病功效,尤其是SIK3抑制剂的抗MPAL活性。
本文描述的激酶抑制剂对混合表型急性白血病(MPAL)相关细胞系的活性:
发明人证明本文公开的化合物(特别是式(Ia)、(Ib)和(Ic)的化合物)对急性髓性白血病(AML)细胞系的特定亚群显示出显著的抗癌活性。特别是在被其他人描述为磷酸化肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白阳性的那些细胞系(例如KASUMI-1、MOLM-13和MV4-11)的细胞系的该子集中(例如,Brown et al 2018,Cancer Discov 8:478,尤其是其中的补充图S6a;Tarumoto et al 2020,尤其是其中的图2D);或者与pMEF2C阴性细胞系(例如HL-60和HEL)或对照PBMC(图18A)相反。特别是,化合物C7对pMEF2C阳性KASUMI-1细胞系显示出约2nM的高效GI50,而对pMEF2C阴性HEL细胞系的GI50高达约5uM(图18B和C)。事实上,化合物A8(达沙替尼)也显示出针对pMEF2C阳性KASUMI-1细胞系的有效GI50,几乎与化合物C7(化合物C7 1.6nM且A8 2.8nM)一样有效,和针对pMEF2C阳性MV4-11细胞系的有效GI50(化合物C7 480nM和A8 325nM)。
转录因子MEF2C的表达是混合表型急性白血病(MPAL)(也称为“混合表型白血病”,MLL)的特征之一。MPAL的其他特征包括:(i)在11q23处存在人染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)KMT2A融合癌蛋白的存在(或一定量);和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变(Slany 2009;Schwieger et al 2009;Laszlo et al 2015;Meyer et al 2018;Tarumotoet al 2020),以及特别是MEF2C的表达受作为辅助因子HDAC4的控制,当被激酶SIK3磷酸化时,HDAC4反过来能够被保留在细胞质中(Tarumoto et al 2018;图19)。
本文公开的化合物,尤其是式(Ia)、(Ib)和(Ic)的化合物(例如化合物E4、E9、E10和/或E16)是SIK3(和SIK2)的抑制剂,并且因此发明人表明此类化合物适用于治疗增殖性疾病(例如MPAL),其特征在于转录因子MEF2C的表达,和/或特征在于:(i)在11q23处存在人染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)KMT2A融合癌蛋白的存在(或一定量);和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变。
还测试了本文公开的其他化合物对过表达MEF2C的癌细胞系的效力。例如,针对pMEF2C阳性细胞系(例如KASUMI-1和MV4-11细胞系)测试有效的SIK3抑制剂E4、E9、E10和/或E16的抗癌作用。事实上,化合物E4对KASUMI-1细胞的GI50被确定为小于7.5nM,其对MV4-11细胞的GI50被确定为小于750nM。
本文所述的其他激酶抑制剂对其他癌症和白血病相关细胞系的活性:[比较性的]
在一种或多种基于细胞的试验中,测试了式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C1至C13或B3和/或D1至D10中的一种或多种)的抗癌活性,及其在这种测定法中将其活性与达沙替尼(A8)进行比较以确定其不同和/或优越性。
在一种方法中,使用
Figure BDA0003884477230001741
(CTG)发光细胞生存力测定法(Promega,Cat.G7570)在体外测试一种或多种此类化合物对实体瘤细胞系的直接细胞毒性作用。将肿瘤细胞,例如MDA-MB-231(乳腺癌)、M579原发性黑色素瘤培养物(如Khandelwal et al,2015,EMBO Mol Med 7:540中所述)、PANC-1(胰腺癌)、SW480(结肠直肠癌)、DMS273(肺癌)或鼠类肿瘤细胞系(例如B16.ova、MC38、4T1和1956等)在微量滴定板的孔中与达沙替尼(A8)或式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C2、C8、C9或C12或B3,和/或D1至D10中的一个或多个)在浓度系列(例如,以0、1、10、100、1,000和10,000nM)一起孵育(37℃/5%CO2)48小时。蛋白酪氨酸激酶抑制剂(TKI)敏感的K562细胞系用作100nM达沙替尼的对照。通过向孔中加入100uL CTG试剂并在室温下孵育10分钟,然后使用Tecan Spark 10M发光计读出发光,来确定活细胞。
实际上,已经对化合物C7在代表大量血液癌症和细胞系的细胞组中测试了其抗癌活性(Oncolead,Karlsfeld Germany),发现该化合物能够抑制许多此类细胞系的生长。在约5个这样的细胞系上显示出亚纳摩尔的GI50活性,在另外10个这样的细胞系上显示出小于10nM的GI50活性。例如,在96小时后,化合物C7在WSU-NKL B细胞淋巴瘤细胞系的生长上显示出大约8nM的GI50(图15A),而在DIHH-2B细胞淋巴瘤细胞系的生长上显示出大约9nM的GI50(图15B)。类似地研究了式(Ib)/(Ic)的其他激酶抑制剂(例如,C1至C13或B3和/或D1至D10中的一个或多个)。
在其他或替代方法中,测试一种或多种此类化合物的抗白血病活性,尤其是在由BCR-ABL或其突变体驱动的一种或多种细胞系中进行测试(例如Gibbons et al 2014,PNAS111:3550所述)。如先前所述(Donato et al 2004,Cancer Res64:672),构建野生型(wt)和T315I突变体Bcr-Abl(C末端用eGFP标记)的基因构建体。wt或T351I单突变体pMX/eGFP-Bcr-Abl模板用于为BCR-ABL的其他或双突变体生成模板,这些模板也与多种白血病的TKI对药物治疗的耐药性相关(例如,T315I/V299L、T315I/F317L、T315I/F359V或表6A)中列出的其他突变)(通过定点诱变)(Stratagene)。诱变后,对携带突变体(或双重突变体)的4-kbXhoI/SgrAI序列进行测序,并将其亚克隆到pMX/eGFP-BcrAbl模板中(在XhoI/SgrAI位点),以确保在诱变过程中不引入其他突变。
表6A:*BCR-ABL突变与对TKI的耐药性和治疗选择有关。从报告使用细胞系模型得出的IC50值的研究编制而成。
Figure BDA0003884477230001742
Figure BDA0003884477230001751
*取自Pophali&Patnik 2016,Canc J 22:40
将亲代Ba/F3细胞(鼠IL-3依赖的鼠pro B细胞系)维持在含有10%FBS和1ng/mL小鼠IL-3的RPMI培养基中。使用Amaxa Nucleofector系统用2.5μg质粒对2.5×106的Ba/F3亲本细胞进行电穿孔。电穿孔后,将Ba/F3细胞静置过夜,然后将嘌呤霉素以1μg/mL的终浓度加入培养基中。将转染的Ba/F3细胞在RPMI培养基/IL-3/嘌呤霉素培养基中培养一周以上。为了确保BCR-ABL1在野生型和突变型细胞之间的等效表达,通过流式细胞仪对Ba/F3细胞进行eGFP阳性分选。在没有IL-3的培养基中进一步选择分选的eGFP阳性Ba/F3细胞。在所有BCR-ABL1转化的细胞中,细胞生长速率均被证实是相同的。在没有IL-3的情况下维持超过1周的细胞用于检查抑制剂的活性。为此,将细胞与适用的TKI孵育72小时,以确定它们对BaF3细胞生长和存活的影响,如先前所述(Wu et al 2010,Leukemia 24:869);例如,通过使用如上所述浓度系列的式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂或达沙替尼。
类似地,可以测试式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C1至C13或B3和/或D1至D10中的一个或多个)或达沙替尼在携带KIT突变的白血病细胞模型中的作用。例如,可以将携带KIT wt或突变(例如与耐药相关的)的载体转染到转染的FDC-P1鼠骨髓细胞中,并研究化合物对FDC-P1/KIT(wt或突变)增殖和克隆活性的影响,例如基于Liu et al(2010,CancerCell 17:333)所描述的细胞。
实施例7[预见的]:式(Ia)、(Ib)和(Ic)的激酶抑制剂和达沙替尼的体内抗白血病功效。
2006年欧洲、中东和非洲(EMEA)的人用药用产品委员会(CMHP)关于达沙替尼的科学讨论中描述了达沙替尼的体内药理活性以及用于证明其活性的实验。特别是,如下:
在SCID小鼠皮下(SC)生长的人CML异种移植模型中评估了达沙替尼的抑瘤活性。治愈被定义为在停止治疗后大于肿瘤体积加倍时间十倍的时间不存在可检测到的肿瘤。
使用“5天给药2天停止”治疗方案,每天一次口服10天后,一定剂量水平(8-50mg/kg)的达沙替尼在携带K562人CML肿瘤的小鼠中具有治愈作用。当肿瘤达到200至500mg时开始治疗。高剂量的伊马替尼未能产生比较反应。达沙替尼的最小有效剂量确定为2.5mg/kg。此外,静脉内注射达沙替尼在该模型中非常有效。当以50mg/kg/天的剂量治疗5天时,达沙替尼对患有大KU812肿瘤(肿瘤大至>1g)的小鼠具有治愈作用。
在从携带人前列腺癌细胞(PC-3)的小鼠中收集的外周单核细胞(PBMC)中研究了SRC磷酸化,该小鼠接受了1、5、15或50mg/kg达沙替尼的治疗。达沙替尼治疗导致剂量依赖性抑制SRC磷酸化,并在15和50mg/kg施用后5小时内几乎完全抑制。施用5mg/kg导致SRC磷酸化的抑制率为44%,而1mg/kg几乎没有活性。根据AUC 0-24h值,5mg/kg和15mg/kg剂量组的动物:人血浆暴露比率分别为0.8和1.9。根据药代动力学数据,估计PBMC中抑制50%磷酸-SRC所需的达沙替尼血浆浓度为91nM。
达沙替尼治疗(10mg/kg/天)增加了颅内注射K562 CML细胞的小鼠的存活率,其存活功效优于伊马替尼(300mg/kg/天)中观察到的。在一项类似的研究中,观察到用10和30mg/kg/天的达沙替尼治疗后存活率增加,而200mg/kg/天的伊马替尼治疗不能抑制颅内肿瘤的生长。因此,在颅内CML的治疗中,达沙替尼似乎比伊马替尼具有治疗优势。
无论每天连续治疗10天,还是在给药方案中引入了短暂的治疗中断(5天给药和2停止),达沙替尼均对小鼠的人CML模型具有活性。此外,每天两次的给药方案产生的功效优于每天一次的给药方案。因此,在带有K562人CML肿瘤的小鼠中,与每天一次方案上给药2.5mg/kg达沙替尼的剂量组相比(抑制生长),在每天两次给药1.25mg/kg的剂量组中,观察到了优异的抗肿瘤活性(治愈)。
一种或多种式(Ia)、(Ib)和(Ic)的激酶抑制剂(例如E1至E16、C1至C13或B3和/或D1至D10)在一项或多项此类研究中进行了测试(例如剂量为1、1.25、2.5、5、10、25、30或50mg/Kg/天),以确定其与达沙替尼(A8)的区别和/或优越性;特别地,如此测试C7、E9、E10和/或E16、或C2、C8、C9或C12或B3中的一个或多个。
另外或作为替代,在Puttini et al(2006,Cancer Res 66:11314)描述的动物模型中对一种或多种此类化合物进行了比较,简述如下:
五至七周大的CD1 nu/nu雌性小鼠购自Charles River Breeding Laboratories,并保持在标准实验室条件下。将人KU812Bcr-Abl+细胞悬浮于0.5mL PBS中的5000万个细胞中,并在每只动物的左胁经皮下注射该细胞。在另一组小鼠中,将表达Bcr-Abl WT或伊马替尼抗性点突变体(Y253F、E255K、D276G和T315I)的鼠Ba/F3 pro-B细胞悬浮于0.4mL PBS中的1000万个细胞中,并皮下注射至同系裸鼠。每周两次或三次监测肿瘤重量和体重。肿瘤重量通过公式肿瘤重量(mg)=(d2 D/2)计算,其中d和D分别是以毫米为单位测量的肿瘤的最短直径和最长直径。仅考虑荷瘤动物来计算肿瘤重量。达沙替尼(A8)或式(Ia)、(Ib)和(Ic)的激酶抑制剂(例如C7、E9、E10和/或E16、或C2、C8、C9或C12或B3)从细胞输注后第二天开始通过口服管饲法给予(例如剂量为1.25、2.5、5、10、30或50mg/Kg/天),在肿瘤进入生长阶段时注射细胞后的第8天,或对患有可测量肿瘤的小鼠在第15天时给予。安慰剂治疗的动物仅使用溶媒的相同的治疗方案。
作为另一种附加或替代方法,在Fauvel et al(2013,Am J Can Sci 2:28)描述的动物模型中比较了一种或多种此类化合物,简述如下:
通过将Ba/F3 BCR-ABLT315I(1x108个细胞/mL无菌PBS)皮下注射到无胸腺裸鼠(HSD,6-7周龄)的右胁腹中,制备出抗伊马替尼白血病的异种移植小鼠模型。当肿瘤体积达到约50mm3时,将小鼠随机分为单独的溶媒或治疗(达沙替尼或化合物B3)组(每组五只小鼠)。用溶媒(例如,DMSO或丙二醇:水1:1)或在溶媒中的化合物(例如5、10或40mg/kg q.d.;口服,连续11天)治疗小鼠。用数字卡尺每周三次,确定以mm3为单位的肿瘤体积,并使用以下公式计算:肿瘤体积(mm3)=长度(mm)x宽度(mm)x宽度(mm)x1/2。每周测量三次体重,每天观察小鼠以监测压力迹象,以检测可能的毒性。使用Bonferroni post hoc通过单向ANOVA使用Prism 5.0b(GraphPad软件),使用单向ANOVA进行统计比较。
实施例8.1:式(Ia)和本文公开的其他化合物的激酶抑制剂(包括化合物C7)和达沙替尼的体内抗癌(实体瘤)功效
具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物的体内抗癌(实体瘤)功效:
使用诸如本文别处描述的那些测定法(例如下文所描述的实施例8.2),发明人发现式(Ia)的激酶抑制剂(氟化C7样变体,例如E4、E9和E10)显示出令人惊讶的显著的体内抗癌功效。
与表8A(见实施例8.2)中所述的相似,使用以下研究概要(表8.1A)。所测试的式(Ia)的激酶抑制剂的剂量和施用方案根据它们各自的SIK3激酶抑制和DMPK特性(参见前面的实施例)进行调整,使得它们的血浆游离药物浓度与其SIK3 IC50值的关系与C7的相当。
表8.1A:示例治疗组。
Figure BDA0003884477230001761
Figure BDA0003884477230001771
*=10%DMSO+5%Solutol+40%PEG+45%水
此外,肿瘤和血液样品被用于分析各种免疫反应标记物,例如在下表8.1B中列出的那些(以及如下文结合实施例8.2中的表8D所述)。
表8.1B:示例免疫表型标记物。
Figure BDA0003884477230001772
发明人惊讶地观察到所有测试的式(Ia)的激酶抑制剂的每天两次施用诱导强烈的肿瘤生长抑制。事实上,化合物E10显示出46%的TGI,而C7、E9和E10显示出甚至60%至80%的TGI(表8.1C)。发明人还观察到非常令人惊讶的结果,即这些化合物的抗癌功效甚至优于仅产生4%TGI的抗PD-1疗法(图20A和B,以及表8.1C)事实上,与抗PD1治疗组和对照组(图20F至H)中只有少数有反应的动物相比,在化合物治疗组(图20C至E)的几乎所有治疗的小鼠中都观察到了抑制剂的肿瘤生长抑制作用。
事实上,与达沙替尼(A8,以30mg/kg给药)的比较研究中的变异性增加相比,式(Ia)的化合物(E9,以25mg/kg BID给药)的一致性显示出治疗组中所有个体小鼠的肿瘤生长抑制(平均TGI=72%),在某些情况下,达沙替尼治疗中的个体小鼠(平均TGI=56%)长出了明显的肿瘤(图27)。
此外,提供了式(Ia)的激酶抑制剂(尤其是E4、E9和E10)在口服施用时表现出药物样特性的进一步证据,未观察到与治疗相关的直接副作用和临床症状,例如体重减轻。
表8.1C:与PD-1相比,式(Ia)的激酶抑制剂的体内数据
Figure BDA0003884477230001781
此外,式(Ia)的这些激酶抑制剂对存在于肿瘤微环境中的免疫细胞表现出令人惊讶的显著影响(图21)。每天两次用氟化C7样激酶抑制剂治疗诱导了显著的抗肿瘤免疫表型。即使与抗PD-1治疗相比,也可以证明激活的细胞毒性T淋巴细胞(CD3+CD8+)显著增加(图21A和B),以及由CD25和颗粒酶B(图21C和D)以及CD69和CD107(未示出)指示的细胞毒性T淋巴细胞的激活增加。
当用化合物E9处理动物时,特别令人惊讶的是观察到颗粒酶B的增加(CTL的增加)和免疫抑制细胞(Treg和M1 TAM)的减少。
因此,E4和E9以及C7也诱导了免疫抑制性调节性T细胞(CD3+CD4+CD25+FoxP3+)的减少(图21E)。
此外,发明人观察到免疫抑制性骨髓免疫区室的令人惊讶的减少(图21F至H)。在用E4和E9(以25mg/kg)以及C7处理后,能够检测到骨髓细胞的消耗(图21F)。事实上,发明人证明通过每天两次用式(Ia)的激酶抑制剂治疗,免疫抑制性M2巨噬细胞(CD206+MHC-II-)显著减少,同样的与抗PD-1相比也是如此(图21H)。还证明了抗肿瘤M1巨噬细胞(CD206-MHC-II+)的维持(图21G)。
此外,尽管观察到gMDSCs适度减少,但发明人证明在用E4和E9、E10以及C7治疗后mMDSC'适度增加(图21I和J)。
式(Ia)的化合物(例如E9)在其他同系小鼠肿瘤模型中进行了类似测试,包括具有从选自以下细胞系产生的肿瘤的那些模型:CT26、RENCA;EMT6和4T1。
实施例8.2[比较性的]:式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂和达沙替尼的体内抗癌(实体瘤)功效
本文公开的其他化合物(包括(Ib)/(Ic)的化合物)的体内抗癌(实体瘤)功效:[比较性的]
在体内同系小鼠模型中研究了式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C1至C13或B3)和达沙替尼(A8)对实体瘤的抗癌活性,从而将鼠结肠直肠癌细胞MC38皮下植入C57Bl/6N小鼠的腹侧,并用受试化合物(例如C2、C8、C9或C12或B3或A8)处理,剂量范围为例如2.5mg/mL/天直至50、60或100mg/Kg/天*)。详细地,将雌性C57Bl/6N小鼠(4-6周大)植入1x106个MC38结直肠癌细胞(PBS中100μl)。在达到150mm3肿瘤体积后,将小鼠随机分为治疗组,并且治疗组可以例如包括表8A中列出的那些,其中治疗在随机化的24h内开始。
表8A:示例性治疗组。
Figure BDA0003884477230001791
*根据上一次体重测量;**po=经os,通过管饲口服
#至少持续3周,最长约5-8周。C2、C8、C9和C12的较低剂量(例如10、15或20mg/Kg)可以根据其ADMET/PK特性进行调整。
**丙二醇:水1:1
每周两次用卡尺测量小鼠的体重和肿瘤体积(mm3),最多8周,直到达到终止标准(肿瘤体积>2000mm3)为止。
此外,在首次治疗的第9天后,每组杀死5只小鼠,以分析肿瘤和血液样本中的各种免疫反应标记,例如下表8B所示的标记(以及使用Aqua Zombie(BioLegend))确定活/死细胞)。
简而言之,通过在小鼠尾巴上切开一个切口,将外周血样本从这些小鼠收集(然而,在处死前一天)到肝素涂层的试管中。用氯化铵-钾(ACK)裂解缓冲液(LifeTechnologies,Cat.A10492-01)处理血样后,将细胞用荧光染料偶联的mAb染色至一种或多种示例性免疫表型标记物(例如表8B)。
为了对肿瘤进行免疫表型分析,在处死当天用手术刀将肿瘤切除,然后一分为二。对于一种或多种示例性免疫表型标记物,将肿瘤的一部分固定在4%多聚甲醛(PFA)中以进行免疫组化。对于IHC,将PFA固定的肿瘤组织嵌入石蜡块中,并切成4mm厚。固定在载玻片上和抗原回收步骤后,将切片用抗CD8抗体染色并用Mayer-苏木精复染。肿瘤浸润性CD8 T细胞的计数是从胶囊区域开始以50倍的放大倍数进行的,并向组织的核心计数3个视野。重复相同的过程3次。将所有计数相加,并计算中位数(如Hekim et al 2017,Can Imm Res 5:157中所述)。
将另一半肿瘤转移到装有RPMI 1640培养基的1.5mL试管中,然后使用微管沉淀杵手动匀浆。以300xg离心后,弃去上清液,将细胞重悬于等于肿瘤重量的RPMI培养基中。将肿瘤匀浆在PBS中以1:1稀释,并用荧光染料标记的抗体对一种或多种示例性免疫表型标记进行染色。对于所有Foxp3特异性染色(周围或肿瘤内),用抗CD4抗体标记细胞,然后按照制造商(eBioscience)的建议使用细胞内固定和通透试剂盒与抗Foxp3抗体一起孵育。
表8B:示例免疫表型标记。
Figure BDA0003884477230001792
Figure BDA0003884477230001801
证实了与达沙替尼(A8)相比,激酶抑制剂C7在体内同基因小鼠模型中对实体瘤的抗癌活性以及该式(Ib)/(Ic)的化合物的免疫肿瘤学作用。式(Ib)/(Ic)的化合物(例如C7)的剂量和施用方案,根据其各自的SIK3激酶抑制和DMPK特性(参见前面的实施例)进行调整,以使它们的血浆游离药物浓度相对于其SIK3 IC50值与达沙替尼相当。如先前所述(Hekim等人2017)处理化合物A8(达沙替尼)。类似地研究了一种或多种其他式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如,C1至C13或B3和/或D1至D10)。
每天两次用C7(100mg/kg)治疗显示出显著的肿瘤生长延缓(44%TGI),而每天一次C7治疗显示出与溶媒对照相比29%的肿瘤生长抑制作用(图11A)。相比之下,每天用A8(30mg/kg)进行治疗可抑制38%的肿瘤生长。每周至少两次对动物称重,直到完成研究。没有观察到与治疗有关的副作用和临床症状,例如体重减轻(图11B)。
此外,已证明化合物C7对存在于肿瘤微环境中的免疫细胞具有显著作用(图12)。每天两次用C7进行治疗,可诱导出显著的抗肿瘤免疫表型。细胞毒性T淋巴细胞(CD3+CD8+)与调节性T细胞(CD3+CD4+CD25+FoxP3+)的比率(图12A)显著增加,以及CD25+CD69+(图12B)和颗粒酶B(图12C)表达表示细胞毒性T淋巴细胞活化增加。此外,每天用C7和A8处理一次和两次,免疫抑制性M2巨噬细胞(CD206+MHC-II+)明显减少(图12D)。
体内同源小鼠模型如下进行:雌性C57Bl/6N小鼠(4-6周龄)植入5x10e5个MC38结直肠癌细胞(PBS中100ul)。将小鼠分为治疗组(表8C),以达到100mm3的平均肿瘤体积,并在随机化的24小时内开始通过管饲法进行经口的口服治疗。
表8C:治疗组。
资料 剂量* 给药 途径 给药数量 动物
1 PBS 10ml/kg QD x 18 **p.o 18 10
2 溶媒<sup>#</sup> 10ml/kg QD x 18 p.o 18 10
3 达沙替尼 30mg/kg QD x 18 p.o 18 10
4 C7 100mg/kg QD x 18 p.o 18 10
5 C7 100mg/kg BID x 18 p.o 36 10
*根据上一次体重测量;**p.o.=经os,通过管饲口服;#4%(v/v)DMSO,72%(v/v)丙二醇和24%(v/v)
dd-水
在第18天的末次给药后两小时,通过流式细胞术分析了每组六只动物的至少100uL全血以及肿瘤组织中的CD4+和CD8+T细胞、Treg、粒细胞和单核细胞MDSC、M1和M2巨噬细胞以及NK细胞。采血后立即切除肿瘤并进行流式细胞术分析。分析了肿瘤和血液样品中的各种免疫反应标记物(表8D),以及使用了Zombie染料(BioLegend)来确定活/死细胞。用PMA/离子霉素/布雷菲德菌素A体外刺激T细胞后,检测到淋巴样细胞内的细胞内细胞因子。
表8D:免疫表型标记。
Figure BDA0003884477230001811
流式细胞术的样品制备方法如下:通过在环境温度下添加10倍体积的氯化铵钾(ACK)缓冲液处理全血样品,轻轻混合并在室温下孵育3-5分钟。温育后,立即加入10倍体积的冷PBS以终止裂解反应,并将细胞以400g沉淀5分钟,并再次在PBS中洗涤。使用gentleMACSTM方案“Tumor Dissociation Kit”,按照制造商的说明解离小鼠肿瘤样品。简要地,切除肿瘤,切成小块(2-4mm),置于酶缓冲液中,并在gentleMACS Dissociator上处理,在37℃下连续旋转孵育20分钟。样品通过70um细胞过滤器过滤,并在PBS/2.5%FBS缓冲液中漂洗两次以除去酶缓冲液。所有的单细胞悬浮液均以PBS中的~1x10e7个细胞/mL制备,并保存在冰上。用PMA/ionomycin/Brefeldin A.对T细胞标志物面板群体进行离体刺激样品。将100uL单细胞悬液添加到96孔板中,染色并用LSRFortessaTM(BD)分析并用FlowJo分析软件(Tree Star,Inc.;版本10.0.7r2)分析。
实施例9.1:通过式(Ia)和(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂和达沙替尼使肿瘤细胞对体外TNF攻击的敏感化
通过具有式(Ia)的化合物的R6的氟化取代基的化合物使肿瘤细胞对体外TNF攻击的敏感化:
使用例如结合表9B描述的那些测定(参见实施例9.2),发明人使用式(Ia)的激酶抑制剂(氟化C7样变体,例如E4、E9和E10)来证明肿瘤细胞对重组小鼠TNF的细胞毒性作用的令人惊讶的敏感化。这是在使用下文所述的MC38小鼠肿瘤细胞系的TNF敏化(100ng/mL)细胞活力测定中进行的(表9B)。化合物针对人癌细胞系HCT116和PANC1进行类似的测试。事实上,与A8(达沙替尼)和C7相比,通过式(Ia)的激酶抑制剂E4、E9、E10和E16使MC38肿瘤细胞以及HCT116和PANC1肿瘤细胞对TNF细胞毒性作用令人惊讶的敏感(表9.1A)。除了分别使用10ng/ml和100ng/ml人TNF之外,与MC38细胞中的测定类似地测量HCT116和PANC1细胞中TNF诱导的细胞杀伤。
表9.1A:与C7和达沙替尼相比,通过氟化C7样化合物对TNF介导的MC38和HCT116细胞杀伤的敏感化
Figure BDA0003884477230001812
++=<100nM;+=<200nM;
NT=未测试
研究人员还证明,与A8和C7相比,化合物E4、E9和E10在MC38和PANC1细胞中表现出对TNF诱导的NFkB活性的抑制令人惊讶地增加(表9.1C和图14A以及图28A和B)。实际上,图25示出式(Ia)激酶抑制剂E4、E9和E10在使MC38肿瘤细胞对TNF介导的杀伤敏感方面始终更有效,与结构相似的化合物C7的几乎150nM相比,平均EC50远低于100nM。
式(Ia)的化合物(E9)在使不同小鼠肿瘤细胞对TNF介导的杀伤敏感方面也是有效的,通常比结构相似的化合物C7更有效(图25)。类似地测试其他式(Ia)的化合物。
考虑到生化和关键药代动力学特性,从表9.1B可以清楚地看出,与结构相似的化合物C7相比,式(Ia)的化合物表现出相对优越的药物样特性,C7(与上述相比)本身优于现有技术的杂环化合物B3。事实上,化合物E9作为SIK3抑制剂的效力令人惊讶,与其他测试的化合物(以及达沙替尼,A8)相比,显示出令人惊讶的优秀的PK特性。
表9.1B:与化合物C7相比,式(Ia)的化合物的相对优越性
Figure BDA0003884477230001821
此外,这些化合物还令人惊讶地显示出对HDAC4(SIK3激酶的直接底物和NFkB活性的关键介质)磷酸化的抑制增加(表9.1C、图14B和图28C)。除了使用10ng/ml rMuTNF之外,与结合表9C(实施例9.2)描述的PANC-1细胞中的测定类似地测量MC38细胞中TNF诱导的NFκB活性。
总体而言,研究人员证明,式(Ia)的化合物(尤其是化合物E9)显示出对SIK3激酶的生化抑制增强(表9.1B),导致在不同细胞中对TNF诱导的HDAC4磷酸化和NFkB活性的抑制比结构相关的化合物C7更强(表9.1C)。此外,化合物E4和E10表现出,尤其是化合物E9表现出比化合物C7更好的体内药物样药代动力学特征,如表9.1B中总结的。
表9.1C:与C7和达沙替尼相比,通过式(Ia)的激酶抑制剂对NFKB活性和HDAC4磷酸化的抑制增加
化合物 NFKB活性的抑制(MC38) NFKB活性的抑制(PANC-1) HDAC4磷酸化的抑制
A8 + + ++
C7 + + +
E4 ++ ++ ++
E9 ++ ++ ++
E10 ++ ++ ++
+=显著抑制;++=强烈且显著抑制
证明了C7和式(Ia)的激酶抑制剂E9靶向SIK3抑制。野生型(WT)和SIK3敲除(KO)MC38克隆用次优浓度的TNF(即<10ng/ml以允许SIK3 KO细胞有足够的检测窗口,无论抑制剂滴定如何,SIK3 KO细胞都对更高剂量的TNF完全敏感)和SIK3抑制剂C7、E4、E9和E10处理,随后确定细胞的活力。因此发明人表明这些化合物仅在SIK3 WT克隆中诱导TNF介导的杀伤,而在KO克隆中不诱导(图22,C7和E9),从而证明抑制剂在介导TNF诱导的杀伤中的SIK3依赖性作用。
测定按如下进行:使用CRISPR产生MC38 SIK3 KO克隆。用含有靶向SIK3或非靶向序列(对照)的gRNAS的RNP复合物(Cas9+gRNA)转染细胞。转染后72小时使用qPCR验证大量SIK3表达。随后,通过有限稀释产生单细胞克隆。通过下一代测序检测单个克隆中CRISPR衍生的突变,并使用CRISPResso进行分析。选择敲除和野生型克隆并铺板过夜。KO和WT细胞用rMuTNF和不同浓度的抑制剂处理72小时。用不同浓度的抑制剂但没有TNF处理的细胞作为无TNF对照。通过CTG分析测量细胞活力。
实施例9.2[比较性的]:通过式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂和达沙替尼使肿瘤细胞对体外TNF攻击的敏感化
通过本文公开的其他化合物(包括(Ib)/(Ic)的化合物)使肿瘤细胞对体外TNF攻击的敏感化:
研究了式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如C2、C8、C9或C12或C4或C7或B3;或者特别是C7;和/或D1至D10中的一个或多个)以及用于比较的达沙替尼(A8)对于TNF在体外对肿瘤细胞的杀灭(凋亡/细胞毒性)作用的作用,并确定了式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂对修饰的PANC1或M579-A2细胞系对TNF的攻击的敏感性。类似地测试了其他式(Ib)/(Ic)的化合物,例如C5。
用激酶抑制剂(例如C7或B3)进行的治疗(以一种或多种浓度测试,例如约1nM至10,000nM,例如约10nM、25nM、50nM、100nM、150nM、500nM、1,000nM、2,500nM和/或5,000nM,在DMSO中)用于研究PANC-1-luc或M579-A2-luc肿瘤细胞对重组人TNF(rHuTNF;R&DSystems)的细胞毒性作用的敏感化,以及这种效应的发作速度。PANC1-luc是表达HLA-A2.1+荧光素酶的胰腺腺癌细胞(PDAC)肿瘤细胞系,而M579-A2-luc是表达HLA-A2.1+荧光素酶的黑色素瘤细胞系。
rHuTNF治疗对所指示的PANC-1-luc细胞活力的剂量反应显示为在用各自浓度的rHuTNF治疗后,分别用相应的测试化合物(例如B3或A8)或对照(例如DMSO)治疗的肿瘤细胞的相对(细胞毒性/生存力)图(图6),以及Y轴是使用基于萤光素酶的杀灭测定法进行测量的+TNF(细胞毒性)/相对于没有TNF(生存力)的标准化RLU(作为细胞毒性的量度):将细胞、测试化合物然后将rHuTNF(10ng/mL)在37℃,5%CO2下孵育24小时,在培养后去除上清液,并用萤光素酶细胞裂解裂解剩余的PANC-1-Luc细胞试剂(0.3%Triton-X在水中)10分钟。裂解后,添加萤光素酶测定缓冲液,并立即使用TECAN-Spark微孔板读数器测量萤光素酶强度。
为确定细胞死亡的发作速度,将肿瘤细胞掺入YOYO-1染料进行预先核标记,并按上述方法用抑制剂和TNF处理。通过实时活细胞显微镜和IncuCyte Zoom(EssenBioScience)评估肿瘤死亡动力学,该图显示刺激6小时后图像的YOYO-1+细胞/孔面积(μm2/孔)的面积(即凋亡细胞面积),并具有来自同一实验的(例如5-10)张不同图片的累积数据。实际上,在这样的实时活细胞测定中(图13A),以及在上述基于荧光素酶的肿瘤细胞生存力读出中(数据未显示),化合物C7显示出使PANC-1细胞对rHuTNF的作用敏感。
PANC1-luc细胞系的构建如下:从American Type Cell Culture(ATCC)获得PANC-1细胞。使用TransIT-LT1(Mirus)作为转染试剂,用pEGFP-Luc质粒转染肿瘤细胞。用1mg/mL的G418/Geneticin选择转染的细胞,并且在选择后14天,使用例如BD FACSARIA II细胞分选仪分选EGFP+细胞。
肿瘤免疫肿瘤作用被证明是由SIK家族成员,特别是SIK3介导的。使用上述基于荧光素酶的肿瘤细胞生存力读数,在TNF(10ng/mL)和浓度约10至100nM(圆圈)的pan-SIK和ABL1&SRC抑制剂(化合物B1)存在下,与单独存在抑制剂的情况相比(正方形),肿瘤细胞显示出更高的细胞毒性(图7A)。相反,与之相比,化合物B8是有效的ABL1和SRC抑制剂,但对SIK家族成员(特别是SIK3)的抑制活性较低,与单独使用抑制剂(正方形)相比,与TNF(圆圈)组合在这样的浓度范围内未能表现出M579 A2细胞的细胞毒性(图7B)。实际上,与单独使用抑制剂(正方形)相比,与TNF组合的化合物B4(圆圈)在该浓度范围内也没有表现出M579 A2细胞的细胞毒性(图7C),尽管化合物B4不仅是ABL1和SRC的有效抑制剂也是SIK1和SIK2的强抑制剂,而只是SIK3的弱抑制剂。
这些数据合起来暗示SIK家族成员(特别是SIK3)是抗肿瘤免疫肿瘤作用的介质,而不是其他激酶ABL1或SRC。
化合物B1、B4和B8如PCT/EP2018/060172中所述,包括其合成,并在表9A中显示。
表9A:化合物B1、B4和B8
Figure BDA0003884477230001831
Figure BDA0003884477230001841
其他式(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如,C1至C13中的一种或多种,例如C7,和/或表B中的一种或多种化合物,D1至D10)用于研究肿瘤细胞对重组人TNF的细胞毒性作用的敏感化,包括在使用MC38鼠肿瘤细胞系的TNF致敏(100ng/mL)细胞活力测定中的作用(表9B)。实际上,化合物C7使MC38肿瘤细胞对TNF的细胞毒性作用敏感(图13B)。
表9B:由式(Ib)/(Ic)化合物引起的MC38细胞对TNF介导的杀伤的敏感化
Figure BDA0003884477230001842
++=<100nM;+=<200nM;/=>200nM
证明式(Ib)/(Ic)的化合物使MC38细胞对TNF介导的杀伤敏感的测定法如下进行。根据制造商的程序,使用CellTiter-Glo(CTG)发光细胞活力测定(Promega,Madison,USA)测量MC38肿瘤细胞的细胞活力。简而言之,将1x103个MC38细胞接种到384孔板中24小时,然后在37℃和5%CO2下用不同浓度的式(Ib)/(Ic)化合物/C7和100ng/ml rMuTNF处理72小时。孵育后,将CTG试剂添加到孔中,并将细胞裂解10分钟。使用Tecan读取器以0.1秒的计数时间进行读取。
还显示化合物C7以剂量依赖性方式抑制TNF诱导的NFkB活性(图14A),并且还抑制NFkB活性的关键介质HDAC4的磷酸化(图14B)。研究了本文公开的其他化合物,例如达沙替尼(A8)和/或选自化合物C2至C12和/或D1至D10的化合物的类似活性(表9C)。
表9C:式(Ib)/(Ic)化合物对NFKB活性和HDAC4磷酸化的抑制
Figure BDA0003884477230001843
+=显著抑制;++=强烈且显著抑制
使用NFKB依赖的萤光素酶活性测量了PANC-1细胞中TNF诱导的NFKB活性。在NFKB启动子的控制下产生PANC-1克隆以表达萤光素酶。将NFKB报告基因PANC-1细胞(每孔1,250个)接种在384孔板中24小时。然后,在37℃和5%CO2下用不同浓度的式(Ib)/(Ic)的化合物/C7/氟化C7样变体(式(Ia))的处理细胞1小时,然后加入10ng/ml rHuTNF。温育7小时后,裂解细胞,并如前测量荧光素酶活性。
使用Meso Scale Discovery(MSD)测定法测量PANC-1细胞中的HDAC4磷酸化水平。将PANC-1细胞(6x 104)接种在96孔板中过夜,然后在37℃和5%CO2的条件下用不同浓度的式(Ib)/(Ic)的化合物/C7/氟化C7样变体(在10ng/mL rHuTNF存在下)处理3小时。使用RIPA裂解缓冲液(Thermo Scientific)产生全细胞裂解液,并在涂有抗-总HDAC4抗体(Abcamab12171)的GAM平板上于4℃孵育过夜。之后,使用pHDAC4抗体(CST#3443)检测到磷酸化的HDAC4。使用MSD读取器测量ECL信号。
实施例10:式(Ia)和(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的体内免疫肿瘤活性
在体内同系小鼠模型中研究了激酶抑制剂E9和抗PD-1mAb(鼠抗PD1-mIgGe3,克隆:RMP1-14,Invivogen;货号:mpd1-mab15)单独和以组合对抗实体瘤的抗癌活性,基本上如实施例8.2中所述,其中将鼠结肠直肠癌细胞MC38皮下植入C57Bl/6N小鼠的侧腹,并用测试化合物E9以剂量25mg/Kg处理,每天两次。然而,在该研究中,平均肿瘤体积为100mm3的MC38荷瘤动物被随机分为4组,每组18只动物,总结在表10(a)中。对于组随机化,在单个组中使用了强大的自动随机数生成(MS-Excel 2016)。在研究过程中,每组8只动物在治疗21天后终止用于免疫PD分析(PD研究),与上述类似,并进行尸体剖检。对于研究动物的总体生存分析,在它们达到伦理流产标准后被单独实施安乐死。所有动物均通过颈椎脱臼安乐死而不进行尸体剖检。
表10(a):治疗组。
Figure BDA0003884477230001851
*根据上一次体重测量;**p.o.=经os,通过管饲口服,***i.p.=腹膜内
#溶媒=10%DMSO+5%Solutol+40%PEG+45%水;##至少3周,最长约5-8周;###小鼠抗-β-Gal-mIgG1e3,Invivogen;货号:bgal-mab15。
与溶媒治疗的动物相比,化合物E9的每日两次应用诱导强烈的肿瘤生长抑制(表10(b)和图29A)和显著延长的中位总生存期(表10(b)和图29B)。化合物E9在所有治疗动物中显示出73%TGI和同类反应(图29C);而用免疫检查点抑制剂抗PD-1治疗仅达到59%TGI(表10(b)和图29A),其在不同动物中具有不同的抗肿瘤功效(图29D)。E9和抗PD-1的组合显示出81%TGI,50天的总生存期。尽管其没有显著优于E9单一疗法(p=0.0905),但与抗PD-1疗法相比,其能够显著改善TGI(p<0.0001),并且在所有治疗的动物中显示出同类反应(图29E)。
表10(b):Tukey的多重比较检验
Figure BDA0003884477230001852
Figure BDA0003884477230001861
ns=不显著
为了研究TNF诱导疗法(例如抗PD1抗体,例如鼠类抗PD1克隆:RMP1-14,BioLegend或Invivogen)与式(Ia)和(Ib)/(Ic)的另一个激酶抑制剂(例如E10或E16、或C2、C7、C8、C9或C12或B3;和/或化合物D1至D10中的一种或多种)以及E9和/或作为比较的达沙替尼(A8)(剂量范围为例如2.5mg/Km/天,直至50、60或100mg/Kg/天*)的协同效应,进行实施例8.2中所述的另一种体内同基因小鼠模型,但使用治疗组处理适用的组合(和对照),例如治疗组可包括例如以下下表10A所述的。
表10A:示例性治疗组。
Figure BDA0003884477230001862
*根据上一次体重测量;
**po=经os,通过管饲口服,ip=腹膜内
#化合物给药至少3周,最多5至8周。抗PD-1和媒介治疗持续时间。C2、C7、C8、C9和C12的较低剂量(例如10、15或20mg/Kg)或较高剂量(例如50、75或100mg/Kg)可以根据其ADMET/PK特性进行调整。
**丙二醇:水1:1
如实施例8.2中所述:(i)每周两次用卡尺测量小鼠的体重和肿瘤体积(mm3),持续8周,直到达到终止标准(肿瘤体积>2000mm3)为止;以及(ii)在第一次治疗的第9天后,每组杀死5只小鼠,以分析肿瘤和血液样品中的各种免疫应答标记物(例如,如实施例8.2中所述)。
实施例10.1:免疫排除肿瘤模型中式(Ia)和(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的体内免疫肿瘤活性
研究了本文公开的化合物(例如化合物E9)针对免疫排除(“冷”)肿瘤模型的体内抗肿瘤活性。这种“冷”肿瘤的特征是缺乏或只有很少的肿瘤T细胞浸润,并对免疫疗法提出了特殊的治疗挑战(Bonaventura et al 1019,Frontiers in Immunology 10:article168;doi:10.3389/fimmu.2019.00168)。化合物E9在体内模型中对EMT6“冷”肿瘤表现出显著的抗肿瘤活性(图30A和B;表10.1B):事实上,甚至每天两次(DIB)仅以5mg/kg向小鼠施用时,可导致24%的肿瘤生长抑制。
在体内同系小鼠模型中研究了激酶抑制剂E9对抗实体“冷”肿瘤的抗癌活性,其中将鼠乳腺癌细胞EMT6植入BALB/c小鼠的左侧乳腺脂肪垫中,并用测试化合物E9以剂量25mg/kg、12.5mg/kg、5mg/kg每天两次以及剂量25mg/kg每天一次处理。雌性BALB/c小鼠(5-6周龄)被植入1x10^6EMT6乳腺癌细胞(PBS中100ul)。肿瘤体积达到100mm3后,将小鼠随机分为治疗组,治疗组包含表10.1A中所列的那些,治疗在随机分组后24小时内开始。
在众所周知的免疫排除肿瘤模型EMT6中,与溶媒对照动物相比,化合物E9在三种不同剂量水平(5mg/kg、12.5mg/kg和25mg/kg)表现出显著的剂量依赖性、抗肿瘤功效(图30A)。有趣的是,以12.5mg/kg施用化合物E9显示出与25mg/kg基本相同的功效(肿瘤生长抑制;TGI)(40%vs 37%TGI;各自,每天两次给药;BID),甚至仅以5mg/kg BID施用化合物E9也显示出令人惊讶的25%TGI。此外,以25mg/kg施用化合物E9,每天施用两次(BID)比每天施用一次(QD)实质上更有效,显示TGI分别为37%和9%(图30B)。
表10.1A:治疗组。
测试样品 剂量(mg/kg)* 剂量体积(ml/kg) 途径 方案 动物的数量
1 溶媒<sup>#</sup> - 10.0 p.o.** BID,7q7d<sup>##</sup> 16
2 E9 25.0 10.0 p.o.** QD,7q7d<sup>##</sup> 16
3 E9 25.0 10.0 p.o.** BID,7q7d<sup>##</sup> 16
4 E9 12.5 10.0 p.o.** BID,7q7d<sup>##</sup> 16
5 E9 5.0 10.0 p.o.** BID,7q7d<sup>##</sup> 16
*根据上一次体重测量;**po=经os,通过管饲口服;##至少3周,最长约5-8周;#溶媒=10%DMSO+5%Solutol+40%PEG+45%水
表10.1B:Tukey的多重比较检验
比较 显著性总结 校正P值
溶媒vs.E9 25mg/kg bid **** <0.0001
溶媒vs.E9 25mg/kg qd ns 0.6366
溶媒vs.E9 12.5mg/kg bid **** <0.0001
溶媒vs.E9 5mg/kg bid ** 0.008
E9 25mg/kg bid vs.E9 25mg/kg qd **** <0.0001
E9 25mg/kg bid vs.E9 12.5mg/kg bid ns 0.9811
E9 25mg/kg bid vs.E9 5mg/kg bid * 0.0291
E9 25mg/kg qd vs.E9 12.5mg/kg bid **** <0.0001
E9 25mg/kg qd vs.E9 5mg/kg bid ns 0.2782
E9 12.5mg/kg bid vs.E9 5mg/kg bid ** 0.0048
ns=不显著
实施例11[预见的]:用于口服施用的式(Ia)和(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂的单位剂量形式的制剂和制备。
简短地如下制备药物组合物的囊片单位剂型。
首先,通过将一定量的E4、E9、E10或E16或C7或C8(或B3)与一种或多种赋形剂一起干法制粒来制备包含式(Ia)和(Ib)/(Ic)的激酶抑制剂(例如,E4、E9、E10或E16或C7,C8或B3)的压片混合物。压片混合物中的赋形剂实例可以包括粘合剂,例如乳糖(一水合物)、微晶纤维素和/或羟丙基纤维素,以及任选地与崩解剂(例如淀粉)一起。该混合物还可以包含润滑剂,例如硬脂酸镁。替代地,通过湿法制粒然后干燥来制备压片混合物。
第二,使用旋转式压片机,将混合物从上方填充到合适形状的模具中,并通过将上冲头降低到模具中而将其压缩至约5%至20%的孔隙率。压缩可以分一个阶段或两个阶段进行(主压缩,以及可选的预压缩或夯实),对于规模化生产,压缩会迅速发生(例如,每片500ms以内)。拉起上冲头,将其从模具中取出(减压),然后将囊片从模具中弹出。
第三,使用自动涂布机涂布囊片。该涂层可以包含羟丙甲纤维素、二氧化钛、聚乙二醇和纯净水。
压片混合物包含一定量的激酶抑制剂(如使用的E4、E9、E10或E16或C7、C8或B3),以使每个囊片均包含治疗有效量的C7或C8(或B3),并且不同剂量的囊片可以帮助施用正确的E4、E9、E10或E16或C7或C8(或B3)总剂量。例如,每个囊片可以包含约20mg、50mg或70mg的E4、E9、E10或E16或C7或C8(或B3,如适用),或可以包含少于这些量的诸如约5mg、10mg或40mg的E4、E9、E10或E16或C7或C8(或B3,如适用的)。实施例12[预见的]:通过式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的化合物在人皮肤中产生黑色素
按照Kumagai et al(2011,PLoS ONE 6(10):e26148)描述的方法,首先测试式Ia)和/或(Ib)/(Ic)的化合物在B16F10黑色素瘤细胞中诱导黑色素生成的能力。
B16F10鼠黑色素瘤细胞和HEK293细胞从美国典型培养物保藏中心(Manassas,VA,USA)获得。B16F10细胞在补充有10%胎牛血清(FBS)、青霉素(100U/mL)和链霉素(50mg/mL)的Dulbecco改良的Eagle培养基(DMEM;高葡萄糖)(Wako)中于37℃、5%CO2中生长。B16F10以3.4x10**5细胞/孔的密度接种在6孔板中。24小时后,培养基更换为补充有测试化合物的新鲜培养基,48小时后,培养基再次更换为含有相同化合物的新鲜培养基。再过24小时后,收获细胞用于黑色素或mRNA/蛋白质测定。为了测量黑色素,将细胞用磷酸盐缓冲盐水(PBS)洗涤两次,悬浮在PBS中,并通过以8,000rpm离心1.5分钟回收。将细胞沉淀悬浮于300mL 1N NaOH中,45℃孵育2小时,然后用氯仿-甲醇混合物(2:1)萃取黑色素。用分光光度计(BIO-RAD Model 680MICRO PLATE READER;Bio-Rad,Hercules,CA,USA)在405nm处检测黑色素。使用纯化的黑色素(0–1,000mg/mL)获得标准曲线。使用Bradford试剂(Bio-Rad)确定细胞沉淀的蛋白质浓度,并用于黑色素含量的标准化。
使用Mujahid et al(2017,Cell Reports 19:2177)描述的方法,第二次测试式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的化合物对具有无活性黑皮质素1受体的小鼠恢复黑素生成I的能力。
简而言之,利用先前描述的小鼠“红发(red hair)”模型,该模型携带失活的Mc1re /e突变等位基因和转基因K14-SCF,其中干细胞因子表达由keratin-14启动子驱动,允许黑色素细胞在表皮归巢(D’Orazio et al 2006,Nature 443:430;Kunisada et al 1998,JExp Med 187:1565)。将酪氨酸酶基因突变的白化小鼠与K14-SCF转基因结合(Tyrc/c;K14-SCF小鼠)并作为对照以评估局部SIK抑制剂提供的色素沉积是否依赖于经典的酪氨酸酶-黑色素通路。每日应用式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的SIK抑制剂,持续7天能够导致Mc1re/e;K14-SCF小鼠变黑。在用溶媒治疗的Mc1re/e;K14-SCF小鼠,或者用溶媒或式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的SIK抑制剂治疗的Tyrc/c;K14-SCF小鼠中未观察到皮肤色素沉积的明显变化。
在第三项研究中,使用WO2018/160774中描述的方法研究式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的化合物诱导人皮肤真黑色素化的能力。
全厚度人乳房皮肤外植体在培养皿中培养,培养皿中含有固相和液相不含酚红的DMEM培养基,培养基中含有20%青霉素链霉素、5%真菌
Figure BDA0003884477230001881
和10%FBS。外植体每天用溶媒、HG 9-91-01(从MedChemExpress LLC,Monmouth Junction,NJ,USA获得)或式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的SIK抑制剂治疗。被动应用是指简单地将治疗应用到皮肤上,而无需进一步摩擦或操作。机械应用是指将药剂应用到皮肤上,并用带手套的棉签涂抹器顺时针旋转10圈进一步摩擦治疗。收获、固定和处理皮肤以进行石蜡包埋。切片从石蜡块上切下,切片使用苏木精和曙红(形态学)和Fontana-Masson(对于黑色素)染色。被动局部应用式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的SIK抑制剂治疗人皮肤外植体,治疗8天(1x/天)后无需任何额外治疗就能够诱导显著色素沉积,但在用HG 9-91-01治疗的皮肤中没有观察到明显的色素沉积。Fontanna Mason染色显示,与对照相比,用式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的SIK抑制剂治疗的皮肤中黑色素含量增加,而用HG 9-91-01治疗的皮肤中黑色素含量略有增加。HG 9-91-01的机械应用(通过涂抹器摩擦)诱导显著的总色素沉积,并且在皮肤切片的Fontana Masson染色时观察到黑色素含量增加。因此HG 9-91-01对人皮肤的有限渗透能够通过机械应用至少部分地克服。式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的SIK抑制剂在治疗8天(1x/天)后能够不需要机械应用(摩擦)来诱导显著的人表皮变黑。黑色素的Fontanna Mason染色进一步说明了式(Ia)和/或(Ib)/(Ic)的示例性SIK抑制剂是否诱导人皮肤外植体中的色素沉积。

Claims (57)

1.一种化合物,选自下式的激酶抑制剂:
Figure FDA0003884477220000011
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;
其中:
Hy为杂芳基或杂环基,其任选地被一个或多个独立地选择的R1e取代;
每个R1e独立地选自R1a、R1b、R1c和R1d
R1a和R1d中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R1b和R1c中的每一个独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-7环烷基、C6-10芳基、3至7元杂芳基、3至7元杂环基、O(CH2)0-2(C3-7环烷基)、-O(CH2)0-2(C6-10芳基)、-O(CH2)0-2(3至7元杂芳基)、-O(CH2)0-2(3至7元杂环基)、-NH(CH2)0-2(C3-7环烷基)、-NH(CH2)0-2(C6-10芳基)、-NH(CH2)0-2(3至7元杂芳基)、-NH(CH2)0-2(3至7元杂环基)、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-6烷基)、-OCF3、-S(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-NHS(O)2(C1-6烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-6烷基)z、-C(=O)(C1-6烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-6烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-6烷基)z、-NHC(=O)(C1-6烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-6烷基)z和-N(C1-6烷基)C(=NH)NH2-z(C1-6烷基)z,其中z为0、1或2,并且C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、C3-7环烷基、C6-10芳基、3至7元杂芳基和3至7元杂环基基团中的每一个任选地被1、2或3个独立地选自-OH、甲基、乙基、-OCH3、-SCH3和-NH2-z(CH3)z的部分取代;
R2为H;
R3选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R4为H;
R5为-L-R6
L选自键、C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基和-(CH2)m-[Y-(CH2)n]o-,其中m是1至6的整数,n是0至3的整数,o是1至3的整数,其中如果n为0则o为1;Y独立地选自O、S和-N(R13)-;并且C1-6亚烷基、C2-6亚烯基、C2-6亚炔基、-(CH2)m-和-(CH2)n-基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选择的R30取代;
R6是5元单环杂芳基,其含有至少一个S环原子并且被一个或多个独立地选择的R7取代;
R7独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1- 2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代,其中R7中的至少一个为F和/或R7中的至少一个被一个或多个F原子取代;
A选自S、O、NR8和C(R9)2
R8选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R9独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
X独立地选自O、S和N(R14);
E是O或S;
R11独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R12和R13中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,或者R12和R13能够与它们所连接的氮原子连接在一起以形成基团-N=CR15R16,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R14独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基和-OR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
R15和R16中的每一个独立地选自H、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环基和-NHyR20 2-y,或者R15和R16能够与它们所连接的原子连接在一起以形成任选地被一个或多个独立地选择的R30取代的环,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;
y是0到2的整数;
R20独立地选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;并且
R30是一级取代基,并且在每种情况下独立地选自烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR71、-N(R72)(R73)、-S(O)0-2R71、-S(O)1-2OR71、-OS(O)1- 2R71、-OS(O)1-2OR71、-S(O)1-2N(R72)(R73)、-OS(O)1-2N(R72)(R73)、-N(R71)S(O)1-2R71、-NR71S(O)1-2OR71、-NR71S(O)1-2N(R72)(R73)、-OP(O)(OR71)2、-C(=X1)R71、-C(=X1)X1R71、-X1C(=X1)R71和-X1C(=X1)X1R71,和/或与环烷基或杂环基基团的相同碳原子结合的任何两个R30能够连接在一起以形成=X1,其中作为一级取代基的烷基、烯基、炔基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个二级取代基取代,其中所述二级取代基在每种情况下独立地选自C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OR81、-N(R82)(R83)、-S(O)0-2R81、-S(O)1- 2OR81、-OS(O)1-2R81、-OS(O)1-2OR81、-S(O)1-2N(R82)(R83)、-OS(O)1-2N(R82)(R83)、-N(R81)S(O)1- 2R81、-NR81S(O)1-2OR81、-NR81S(O)1-2N(R82)(R83)、-OP(O)(OR81)2、-C(=X2)R81、-C(=X2)X2R81、-X2C(=X2)R81和-X2C(=X2)X2R81,和/或与作为一级取代基的环烷基或杂环基基团的相同碳原子结合的任何两个二级取代基能够连接在一起以形成=X2,其中作为二级取代基的C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至14元芳基、3至14元杂芳基、3至14元环烷基、3至14元杂环基基团中的每一个任选地被一个或多个三级取代基取代,其中所述三级取代基在每种情况下独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基,和/或与作为二级取代基的3至14元环烷基或杂环基基团的相同碳原子结合的任何两个三级取代基能够连接在一起以形成=O、=S、=NH或=N(C1-3烷基);
其中
R71、R72和R73中的每一个独立地选自H、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至7元杂环基,其中C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、3至7元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至7元杂环基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z的取代基取代,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;
R81、R82和R83中的每一个独立地选自H、C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至6元杂环基,其中C1-4烷基、C2-4烯基、C2-4炔基、3至6元环烷基、5或6元芳基、5或6元杂芳基和3至6元杂环基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自C1-3烷基、卤素、-CF3、-CN、叠氮基、-NO2、-OH、-O(C1-3烷基)、-OCF3、=O、-S(C1-3烷基)、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-S(O)2NH2-z(C1-3烷基)z、-C(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-3烷基)z和-N(C1-3烷基)C(=NH)NH2-z(C1-3烷基)z的取代基取代,其中每个z独立地为0、1或2,并且每个C1-3烷基独立地为甲基、乙基、丙基或异丙基;并且
X1和X2中的每一个独立地选自O、S和N(R84),其中R84为H或C1-3烷基。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基基团以及-N(C1-3烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代。
3.根据权利要求1或2所述的化合物,其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个是C1-3烷基,其中C1-3烷基的烷基基团被一个或多个F原子取代;和/或,
其中R7中的至少一个是F和/或R7中的至少一个选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2;和/或
其中一个R7在相对于R6与所述化合物的其余部分结合的环原子的位置2处与C环原子连接,优选地其中所述R7为F和/或所述R7被一个或多个F原子取代;和/或
其中一个R7在相对于R6与所述化合物的其余部分结合的环原子的位置5处与C环原子连接,优选地其中所述R7为F和/或所述R7被一个或多个F原子取代。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中R6选自噻吩基、噻唑基和噻二唑基,它们各自被一个或多个独立地选择的R7取代;和/或,
其中R6选自噻吩基和噻唑基,它们各自被一个或多个独立地选择的R7取代。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物,其中R6是被一个或多个独立地选择的R7取代的噻吩基。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的化合物,其中R6通过其与所述化合物的其余部分结合的R6的环原子是C原子;和/或
其中R6的S环原子不与R6与所述化合物的其余部分结合的环原子相邻。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的化合物,其中R6选自:
Figure FDA0003884477220000031
其中
Figure FDA0003884477220000032
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键;和/或,
其中R6选自:
Figure FDA0003884477220000041
其中
Figure FDA0003884477220000042
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键;或者
其中R6选自:
Figure FDA0003884477220000043
其中
Figure FDA0003884477220000044
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的化合物,其中L是键;E是O;和/或A选自S、O、NH、N(C1-6烷基)和C(C1-6烷基)2
9.根据权利要求1至8中任一项所述的化合物,其中L是键;E是O;A是S。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中Hy选自5至6元单环杂芳基、5至6元单环杂环基、9至10元双环杂芳基和8至10元双环杂环基,它们各自任选地被一个或多个独立地选择的R1e取代。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的化合物,其中Hy为:
Figure FDA0003884477220000045
其中
Figure FDA0003884477220000046
代表Hy与所述化合物的其余部分结合的键;R1a、R1b和R1c如在权利要求1中所定义;并且B是N或CR1d
12.根据权利要求1至11中任一项所述的化合物,其中R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、哌嗪基、哌啶基、六氢嘧啶基、六氢哒嗪基、吗啉基、1,2-恶嗪烷基、1,3-恶嗪烷基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基、氮杂螺酮基、二氮杂螺酮基、氮杂螺癸烷基、二氮杂螺癸烷基、氮杂螺十一烷基和二氮杂螺十一烷基,其中哌嗪基、哌啶基、六氢嘧啶基、六氢哒嗪基、吗啉基、1,2-恶嗪烷基、1,3-恶嗪烷基、吡咯烷基、咪唑啉基、吡唑烷基、二氮杂环庚烷基、氧杂氮杂环庚烷基、氮杂螺酮基、二氮杂螺酮基、氮杂螺癸烷基、二氮杂螺癸烷基、氮杂螺十一烷基和二氮杂螺十一烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选择的R30取代,其中任选地取代R1a的所述一个或两个独立地选择的R30独立地选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1- 3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物,其中R1a是非对称的;任选地,
其中R1a选自3,4-二甲基哌嗪基、4-甲基-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、3-氧代哌嗪-1-基、2-甲基吗啉-4-基、3-甲基哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基、3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基、3-(二甲基氨基)哌啶-1-基、3-(甲氧基)哌啶-1-基、3-(羟基)哌啶-1-基、3-(二甲基氨基)吡咯烷-1-基、3-(羟基)吡咯烷-1-基、3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基、3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基、3-(甲基磺酰基氨基)吡咯烷-1-基、7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基、4-[2-(二甲基氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基、5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基和1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的化合物,其中R1a通过其与所述化合物的其余部分结合的R1a的原子是除C以外的原子,优选为N原子;任选地,
其中R1a选自杂环基、杂芳基、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1- 2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1-2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1- 2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中杂环基和杂芳基基团中的每一个通过除C以外的原子结合至所述化合物的其余部分,并且任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;和/或
其中R1a是杂环基,其含有至少一个N环原子并且通过N环原子与所述化合物的其余部分结合。
15.根据权利要求14所述的化合物,其中R1a选自:
Figure FDA0003884477220000051
其中
Figure FDA0003884477220000052
代表R1a与所述化合物的其余部分结合的键;任选地,
其中R1a选自:
Figure FDA0003884477220000053
其中
Figure FDA0003884477220000054
代表R1a与所述化合物的其余部分结合的键。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的化合物,其中R1b是甲基、乙基、丙基或异丙基,优选地是甲基;并且R1c是H。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的化合物,其中B是N。
18.根据权利要求1至17中任一项所述的化合物,其中R1b是H;R1c是甲基;B是N;并且R3是H。
19.根据权利要求11所述的化合物,其中:
L是键;并且
(A')R1a选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2和3至11元杂环基,优选通过除C以外的原子与化合物的其余部分结合的杂环基,其中3至11元杂环基基团任选地被一个或两个独立地选择的R30取代,其中任选地取代R1a的所述一个或两个独立地选择的R30选自甲基、乙基、-OH、=O、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-(甲氧基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、4-甲基哌嗪基、-C(=O)(C1-3烷基)、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)C(=O)(C1-3烷基)、-NHS(O)2(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)S(O)2(C1-3烷基)、-(CH2)1- 3COOH和-NH2-z(CH3)z,其中z为0、1或2;并且C1-3烷基基团中的每一个任选地被一个或两个独立地选自-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、哌嗪基、4-甲基-哌嗪基、4-(2-羟乙基)哌嗪基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2;并且
(B')R1b和R1c中的至少一个选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z和苯基,其中z为0、1或2,并且R1b和R1c中的另一个独立地选自H、甲基、乙基、丙基、异丙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基、-NH2-z(CH3)z、苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基,其中z为0、1或2;并且苯基、吡啶基、吡唑基、苯氧基、吡啶基氧基、咪唑基氨基和四氢呋喃基甲氧基基团中的每一个任选地被一个、两个或三个独立地选自甲基、乙基、-OH、-OCH3、-SCH3、环丙基、2-羟乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙基、2-(N,N-二甲基氨基)乙氧基、2-氨基乙基、2-(N-甲基氨基)乙基、2-(甲氧基)乙基和-NH2-z(CH3)z的部分取代,其中z为0、1或2,优选地其中R1b和R1c中的一个为H;并且R1b和R1c中的另一个为甲基、乙基、丙基、异丙基或苯基,更优选地R1b和R1c中的另一个为甲基;并且
(C')R3选自H、C1-4烷基、C3-6环烷基、苯基、卤素、-CN、-O(C1-4烷基)、-OCF3、-S(C1-4烷基)、-NH2、-NH(C1-4烷基)、-N(C1-4烷基)2、-C(=O)(C1-4烷基)、-C(=O)OH、-C(=O)O(C1-4烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-4烷基)z、-NHC(=O)(C1-4烷基)、-NHC(=NH)NHz-2(C1-4烷基)z和-N(C1-4烷基)C(=NH)NH2-z(C1-4烷基)z,其中苯基基团任选地被一个、两个或三个独立地选自卤素、甲基、异丙基、-CN、-CF3、-OCF3、-OH、-NH2、-NH(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-NHC(=O)(C1-3烷基)、-C(=O)NH2-z(C1-3烷基)z、-(CH2)1-3NH2、-(CH2)1-3NH(C1-3烷基)、-(CH2)1-3N(C1-3烷基)2、-(CH2)1-3OH和-(CH2)1-3O(C1-3烷基)的基团取代;并且其中z为0、1或2,优选其中R3为H;并且
(D')R7中的至少一个为F和/或R7中的至少一个选自C1-3烷基、-O(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)或-N(C1-3烷基)2,其中C1-3烷基、-NH(C1-3烷基)和-O(C1-3烷基)的烷基基团和-N(C1-3烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个或多个F原子取代;
(E')A为S、O或N(CH3)2,优选地其中A为S;并且
(F')B是N或CR1d,其中R1d选自C1-3烷基、卤素、-O(C1-3烷基)、-S(C1-3烷基)、-NH(C1-3烷基)和-N(C1-3烷基)2,优选地其中B为N;并且
(G')E为O或S,优选为O。
20.根据权利要求19所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2
21.根据权利要求19或20所述的化合物,其中一个R7选自-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2,并且一个R7为Cl。
22.根据权利要求19所述的化合物,其中一个R7为F且一个R7为Cl。
23.根据权利要求19所述的化合物,其中R6选自:
Figure FDA0003884477220000071
其中
Figure FDA0003884477220000072
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键;或者
其中R6选自:
Figure FDA0003884477220000073
其中
Figure FDA0003884477220000074
代表R6与所述化合物的其余部分结合的键。
24.根据权利要求19至23中任一项所述的化合物,其中R1a选自:4-(2-羟乙基)哌嗪基,4-甲基哌嗪基,3,4-二甲基哌嗪基,4-甲基-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,3-氧代哌嗪-1-基,2-甲基吗啉-4-基,3-甲基哌嗪-1-基,3-(2-羟乙基)哌嗪-1-基,3-(2-羟乙基)-4-甲基哌嗪-1-基,3-(二甲基氨基)哌啶-1-基,3-(甲氧基)哌啶-1-基,3-(羟基)哌啶-1-基,3-(二甲基氨基)吡咯烷-1-基,3-(羟基)吡咯烷-1-基,3-(2-甲氧基乙氧基)吡咯烷-1-基,3-(乙酰氨基)吡咯烷-1-基,3-(甲基磺酰基氨基)吡咯烷-1-基,7-甲基-2,7-二氮杂螺[4.4]酮-2-基,4-[2-(二甲基氨基)乙基]-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,4-(乙酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,5-氧代-1,4-二氮杂环庚烷-1-基,以及1,4-氧杂氮杂环庚烷-4-基。
25.根据权利要求19至24中任一项所述的化合物,其中R1a是非对称的。
26.根据权利要求19至25中任一项所述的化合物,其中R1a通过其与所述化合物的其余部分结合的R1a的原子是除C以外的原子,优选为N原子。
27.根据权利要求19至26中任一项所述的化合物,其中R1b是H;R1c是甲基;A是S;B是N;E是O;并且R3是H。
28.根据权利要求1至27中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000075
Figure FDA0003884477220000081
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
29.根据权利要求1至28中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000082
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;或者
其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000083
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;或者
其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000084
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合;或者
其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000091
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
30.根据权利要求1至27中任一项所述的化合物,其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000092
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
31.根据权利要求1至30中任一项所述的化合物,其中所述化合物为基本上纯的形式,特别是大于约90%、95%、98%或99%的纯形式。
32.一种药物组合物,其包含权利要求1至31中任一项所述的化合物,并且任选地还包含药学上可接受的赋形剂;任选地,
其中所述药物组合物被配制用于口服给药;和/或
其中所述药物组合物为单位剂型。
33.权利要求1至31中任一项的化合物或权利要求32的药物组合物,其用于治疗。
34.一种用于治疗对象的疾病、病症或病状的方法,其包括向所述对象施用权利要求1至31中任一项所述的化合物或权利要求32所述的药物组合物,任选地其中所述疾病、病症或病状与激酶有关。
35.一种用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向所述对象施用所述化合物或所述药物组合物,其中,所述化合物是权利要求1至31中任一项所述的化合物,并且所述药物组合物是权利要求32所述的药物组合物。
36.根据权利要求35所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述增殖性疾病是癌症或肿瘤;任选地,其中所述癌症是实体瘤。
37.根据权利要求35或36所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中治疗还包括向所述对象施用免疫检查点抑制剂。
38.根据权利要求35至37中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,所述治疗包括将所述对象中与增殖性疾病有关的细胞暴露于:(i)TNF、TNF变体、和/或TNFR12或TNFR1信号传导的激动剂;以及(ii)所述化合物或所述药物组合物;任选地:
其中暴露于所述对象中与增殖性疾病有关的细胞的TNF的量增加;和/或
其中:(i)向所述对象施用TNF、TNF变体、或TNFR1或TNFR2信号传导的激动剂;(ii)向所述对象施用能够诱导或诱导了与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF、TNF变体、或TNFR1或TNFR2信号传导的激动剂的试剂;或(iii)通过增加对象血浆和/或此类细胞环境中的TNF量的药物、治疗或其他方法诱导与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF;和/或
其中通过增加对象血浆和/或此类细胞环境中的TNF量的药物、治疗或其他方法诱导与增殖性疾病有关的细胞暴露于TNF。
39.根据权利要求35至38中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述治疗包括每天两次(bis in die;BID)施用所述化合物或所述药物组合物。
40.一种用于治疗对象的增殖性疾病的化合物或药物组合物,所述治疗包括向所述所述施用所述化合物或所述药物组合物,其中所述化合物选自以下化合物(a)至(c),并且所述药物组合物包含这样的化合物和任选的药学上可接受的赋形剂:
(a)权利要求1至31中任一项所述的化合物;以及
(b)具有下式的化合物:
Figure FDA0003884477220000101
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合,
其中:
Hy、R2、R3、A、E和R4如权利要求1所定义;
R5'是-L-R6'
L是键;
R6'是5或6元杂芳基,其任选地被一个或多个独立地选择的R7'取代;
R7'独立地选自R7、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1- 2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;并且
R11、R12、R13、X和R30如权利要求1所定义,
任选地,附带条件是
(I)当A为S,R3为H,E为O,并且R6'为1-[2,4-双(三氟甲基)苄基]-1H-吡唑-4-基时,则Hy不是2-吡啶基;
(II)当Hy为1-{(2E)-4-[(2-2-甲氧基乙基)氨基]-1-氧代-2-丁烯-1-基}哌啶-4-基,R3为H,A为O,E为O时,则R6'不是5-甲基-吡啶-2-基;
(III)当R3为三氟甲基,A为O,E为O,并且
(i)R6'是6-{4-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]哌嗪-1-基}吡啶-3-基时,则Hy不是1-(苯甲基)-哌啶-4-基、1-(苯甲基)吡咯烷-3-基或四氢-2H-吡喃-4-基;或者
(ii)Hy为1-(苯甲基)哌啶-4-基时,则R6'不是6-(3-{[(2-氟苯基)氨基甲酰基]氨基}-吡咯烷-1-基)吡啶-3-基或6-({1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]哌啶-4-基}氨基)吡啶-3-基;或者
(iii)Hy为1-(苯甲基)吡咯烷-3-基时,则R6'不是6-({(3S)-1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]-吡咯烷-3-基}氨基)吡啶-3-基或6-({(3R)-1-[(2-氟苯基)氨基甲酰基]吡咯烷-3-基}-氨基)吡啶-3-基;和/或
(IV)当Hy为
Figure FDA0003884477220000111
并且
(1)R1a为4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基或Cl,R1b为H,R1c为甲基,B为N,E为O,R3为H,并且A为S时,则R6'不是4-氯-2-甲基吡啶-3-基;
(2)E为O,B为CR1d,并且R1d为H、F、Cl或Br时,则R1a不是H;
(c)具有以下式(Ic)的化合物:
Figure FDA0003884477220000112
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合,
其中:
R1a、R1b、R1c、R2、R3、A、E和R4如权利要求1所定义;
B为N或CR1d,其中R1d如权利要求1所定义;
R5”是-L-R6”
L如权利要求1所定义;
R6”为杂芳基或杂环基,其各自任选地被一个或多个独立地选择的R7'取代;
R7'独立地选自R7、烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基、杂芳基、卤素、-CN、叠氮基、-NO2、-OR11、-N(R12)(R13)、-N(R11)(OR11)、-S(O)0-2R11、-S(O)1-2OR11、-OS(O)1-2R11、-OS(O)1- 2OR11、-S(O)1-2N(R12)(R13)、-OS(O)1-2N(R12)(R13)、-N(R11)S(O)1-2R11、-NR11S(O)1-2OR11、-NR11S(O)1-2N(R12)(R13)、-P(O)(OR11)2、-OP(O)(OR11)2、-C(=X)R11、-C(=X)XR11、-XC(=X)R11和-XC(=X)XR11,和/或与作为杂环基基团的R6”的相同原子结合的任何两个R7'能够结合在一起以形成=O,其中烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂环基和杂芳基基团中的每一个任选地被一个或多个独立地选择的R30取代;并且
R11、R12、R13、X和R30如权利要求1所定义,
任选地,附带条件是
(1)当R1a为4-(2-羟乙基)哌嗪-1-基或Cl,R1b为H,R1c为甲基,B为N,E为O,R3为H,A为S,并且L为键时,则R6”不是4-氯-2-甲基吡啶-3-基;
(2)当R1a为甲氧基,R1b为H,R1c为甲氧基,B为N,E为O,R3为H,A为S,并且L为键时,则R6”不是2,2-二氟-5H-1,3-二氧杂[4,5-f]苯并咪唑-6-基;
(3)当R3为H,A为S,L为键,R6”为1-甲基-4-哌啶基,R1b为H,B为N,E为O,并且
(i)R1a为甲基时,则R1c不是N-叔丁氧基羰基哌啶-4-基;或者
(ii)R1c为甲基时,则R1a不是N-叔丁氧基羰基哌啶-4-基或N-叔丁氧基羰基哌啶-3-基;
(4)当E为O,B为CR1d,并且R1d为H、F、Cl或Br时,则R1a不是H;和/或
(5)当R1a为甲基,R1b和R1c各自为H,B为CH,E为O,A为S,并且R3为甲基时,则R5”不是1,3-苯并二恶唑-5-基甲基、2-呋喃基甲基、1,3-苯并二恶唑-5-基、2-(2-噻吩基)乙基、2-(4-吗啉基)乙基、2-(2-吡啶基)乙基、2-吡啶基甲基或四氢-2-呋喃基甲基;
(6)当A为S,R3为H,E为O,L为键,R6”是1-[2,4-双(三氟甲基)苄基]-1H-吡唑-4-基,R1a为H,R1b为H,R1c为H,并且B是CR1d时,则R1d不是H;并且
其中所述增殖性疾病选自(α)至(γ)中的一种或多种:
(α)增殖性疾病或与所述增殖性疾病相关的细胞的特征在于,存在肌细胞增强因子2C(MEF2C)蛋白,例如存在磷酸化的MEF2C蛋白和/或存在作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地其中所述增殖性疾病或与所述增殖性疾病相关的细胞的进一步特征在于,存在磷酸化的组蛋白脱乙酰基酶4(HDAC4)蛋白,例如存在被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(β)增殖性疾病或与所述增殖性疾病相关的细胞的特征在于:(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在赖氨酸甲基转移酶2A(KMT2A)基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在K-RAS原癌基因GTPase(KRAS)基因和/或RUNX家族转录因子1(RUNX1)基因中存在突变;和/或
(γ)混合表型急性白血病(MPAL)。
41.根据权利要求40所述的特定用途的化合物或药物组合物:
其中所述化合物是如权利要求19的(b)中所定义的化合物,并且R6’是5元单环杂芳基,其包含至少一个选自N、O和S的环杂原子并且任选地被一个、两个或三个独立地选择的R7’取代;或者
其中所述化合物是如权利要求19的(c)中所定义的化合物,并且R6”是5或6元杂芳基,其含有至少一个S环原子并且任选地被一个、两个或三个独立地选择的R7’取代。
42.根据权利要求40或41所述的特定用途的化合物或药物组合物,其中所述化合物选自:
Figure FDA0003884477220000121
以及其溶剂化物、盐、N-氧化物、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式、前药及其组合。
43.一种用于确定患有增殖性疾病的对象适合用权利要求40至42中的任一项中定义的化合物或药物组合物治疗的方法,该方法包括:在已经从所述对象获得并且优选包含与所述增殖性疾病有关的细胞的生物样品中,确定:
(X)存在MEF2C蛋白,例如存在磷酸化的MEF2C蛋白和/或存在作为活性转录因子的MEF2C蛋白;优选地其中所述增殖性疾病的特征还在于存在磷酸化的HDAC4蛋白,例如存在被SIK3磷酸化的HDAC4蛋白;和/或
(Y)(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因的重排;(iii)存在KMT2A融合癌蛋白;和/或(iv)在KRAS基因和/或RUNX1基因中存在突变,
其中,所述生物样品中所述蛋白质、易位、重排、癌蛋白和/或突变的存在,表明所述对象适合用所述化合物或药物组合物治疗。
44.根据权利要求40至42中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,或根据权利要求43所述的方法,其中所述增殖性疾病或与所述增殖性疾病有关的细胞的特征在于:(i)在11q23存在人类染色体易位;(ii)存在KMT2A基因的重排;和/或(iii)存在KMT2A融合癌蛋白,优选地其中:
(a)所述人类染色体易位是选自t(4,11)、t(9,11)、t(11,19)、t(10,11)和t(6,11)中的一种;和/或
(b)所述KMT2A基因的重排包含以下融合或所述KMT2A融合癌蛋白表达自包含以下融合的重排:KMT2A基因与易位伴侣基因的融合,所述易位伴侣基因选自:AF4,AF9,ENL,AF10,ELL和AF6。
45.根据权利要求40至42和44中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,或根据权利要求43或44所述的方法,其中所述增殖性疾病为:(i)骨髓瘤,优选多发性骨髓瘤;或(ii)白血病,优选急性髓细胞性白血病(AML)或急性淋巴细胞性白血病(ALL),更优选T细胞急性淋巴细胞性白血病(T-ALL)、MLL-AML或MLL-ALL。
46.根据权利要求40至42、44和45中任一项所述的特定用途的化合物或药物组合物,或根据权利要求43至45中任一项所述的方法,其中所述对象是携带KMT2A重排(KMT2A-r)的对象;优选地其中这样的对象是患有KMT2A-r白血病的患者。
47.根据权利要求43所述的方法,其进一步包括以下步骤:向对象施用权利要求40至42中的任一项中定义的化合物或药物组合物,其中在已经从所述对象获得的生物样品中确定了所述蛋白质、易位、癌蛋白和/或突变的存在或数量。
48.一种中间体,其选自具有式(Id)的化合物:
Figure FDA0003884477220000131
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、外消旋混合物、非对映异构体、对映异构体、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合,
其中:
R40中的一个是F或选自C1-3烷基、-O(C1-2烷基)、-NH(C1-2烷基)和-N(C1-2烷基)2,其中C1-3烷基、-O(C1-2烷基)和-NH(C1-2烷基)的烷基基团和-N(C1-2烷基)2的烷基基团中的至少一个被一个、两个或三个F原子取代,并且另一个R40选自卤素、-Me、-OMe、-Et和-OEt;并且
R41选自H和氨基保护基团,
附带条件是
(1)该中间体不是2-溴-4-(三氟甲基)噻吩-3-胺;
(2)当在噻吩基环的4位与C环原子相连的R40为-Me,并且另一个R40为-CHF2时,则R41不是(1-丙基哌啶-2-基)羰基;并且
(3)当在噻吩基环的4位与C环原子相连的R40为-Me,并且另一个R40为F时,则R41不是4,5-二氢-1H-咪唑-2-基。
49.根据权利要求48所述的中间体,其中一个R40选自F、-CH2F、-CHF2和-CF3,并且另一个R40选自卤素、-Me、-OMe、-Et和-OEt,更优选选自Cl、Br、F和-Me;和/或
其中一个R40选自F、-CH2F、-CHF2和-CF3,优选选自-CH2F和-CHF2,并且另一个R40是Cl,任选地结合至与S环原子相邻的C环原子的R40是Cl。
50.根据权利要求48或49所述的中间体,其中所述氨基保护基团选自:叔丁氧羰基(BOC),9-芴基甲氧羰基(FMOC),苄氧羰基(Cbz),对甲氧苄氧羰基(MOZ),乙酰基(Ac),三氟乙酰基,苯甲酰基(Bz),苄基(Bn),对甲氧基苄基(PMB),3,4-二甲氧基苯基(DMPM),对甲氧基苯基(PMP),2,2,2-三氯乙氧羰基(Troc),三苯甲基(trityl;Tr),甲苯磺酰基(tosyl;Ts),对溴苯磺酰基(brosyl),4-硝基苯磺酰基(nosyl)和2-硝基苯磺酰基(Nps)。
51.根据权利要求48至50中任一项所述的中间体,其中所述中间体选自:
Figure FDA0003884477220000141
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合;或者
其中所述中间体选自:
Figure FDA0003884477220000142
以及其溶剂化物、盐、络合物、多晶型物、晶体形式、互变异构体、构象异构体、同位素标记形式及其组合。
52.一种制备包含酰胺部分的化合物的方法,该方法包括以下步骤:使权利要求48或49所述的中间体与相应的羧酸反应,并且任选地除去氨基保护基团;任选地,
其中所述化合物是激酶抑制剂,特别是选自以下的一种或多种蛋白激酶的抑制剂:SIK(优选SIK3)、CSFR1、ABL、SRC、HCK、PDGFR和KIT;优选地选自:SIK3、ABL/BCR-ABL、HCK和CSF1R激酶。
53.一种制备权利要求31所述的化合物的方法,其包括以下步骤:
·提供在具有一种或多种杂质的混合物中的权利要求1至30中任一项所述的化合物;以及
·从所述混合物中去除至少一部分杂质。
54.一种制备药物组合物的方法,其包括以下步骤:将权利要求1至31中任一项所述的化合物与药学上可接受的赋形剂一起配制。
55.一种制备药物组合物的方法,其包括以下步骤:将权利要求1至29中任一项所述的化合物与药学上可接受的赋形剂一起配制;或者
包括:
·实施或已经实施了权利要求52所述的方法来制造化合物;以及
·将制造的化合物与药学上可接受的赋形剂一起配制。
56.一种制备药物包装的方法,其包括以下步骤:
·将权利要求32所述的药物组合物(优选以成品药物形式)插入包装中,从而形成包含所述药物组合物的包装;以及
任选地,
·在包装中插入说明药物组合物处方信息的单张。
57.一种药物包装,其包含权利要求32所述的药物组合物;优选地,其中所述药物组合物为成品药物形式。
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