CN115552004A - 用于治疗ssRNA病毒感染的诱饵转录物 - Google Patents

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Abstract

提供了源自ssRNA病毒(WV)的诱饵转录物，该转录物包含WV的5’UTR、WV的基因组包装信号(GPS)、WV的3'UTR和外源终止密码子中的至少一个。

Description

用于治疗ssRNA病毒感染的诱饵转录物
技术领域
本文提供了用于减弱/治疗病毒感染，特别是用于治疗单链(ss)RNA病毒感染的诱饵转录物和包含其的载体。
背景
病毒对人类健康构成威胁，并且有时甚至可以导致世界范围的大流行，如动物源性冠状病毒(CoV)，例如SARS-CoV-2的情况。
CoV是正义单链(ss)RNA病毒大家族，引起从普通感冒到伴有细胞因子释放综合征的致命肺炎的人类呼吸道疾病。CoV是动物源性的，并且在动物和人之间传播。在过去十年中，发生了两次具有高致死率的这样的动物源性CoV的初步爆发，中东呼吸综合征(MERS-CoV)和严重急性呼吸综合征(SARS-CoV)。
COVID-19疾病是由一种被命名为SARS-CoV-2、先前未在人类中鉴定的新毒株引起，这种新毒株最有可能来源于蝙蝠。2020年，全球经济和大众交通使人类暴露于新的动物源性RNA病毒，诸如SARS-Cov1/2(埃博拉病毒和其他)，绝大多数人类没有对其免疫，这提供了大流行的可能性，正如在2019年动物源性CoV爆发中所观察到的。
目前的抗病毒疗法的重点是疫苗接种和靶向特定的病毒蛋白。这种方法的主要缺陷是病毒的快速进化使得它逃避疫苗接种，并对抗病毒药物发展出抗性。在抗性毒株或新流行的情况下，开发新的传统疫苗或治疗花费宝贵的时间。此外，由于病毒感染通常包括相对长的潜伏期，并且大部分受感染的个体是无症状的，因此通常难以有效治疗有相应需要的所有受试者，无论是作为治疗还是作为预防新感染的手段。
因此，迫切需要新颖的非传统的抗病毒治疗剂来治疗这些目前还没有可用的疫苗和有效的抗病毒疗法的新引入的动物源性病毒。
发明概述
本文提供了一种寄生性假病毒转录物(parasitic pseudo-viral transcript，PSCT，本文中也称为“诱饵转录物”或称为“PSCT颗粒”)，该寄生性假病毒转录物在不存在由它作为诱饵的野生型病毒的情况下是无害的并且不能复制，并且它包含用于有效复制和包装的所有必需的序列。
PSCT的目的是充当与野生型病毒(WV)竞争其复制和包封机制的寄生物。因此，在几个病毒复制周期内，大多数病毒体将主要包封诱饵转录物，从而减缓WV的扩散，甚至潜在地减缓到其被宿主免疫系统根除。
PSCT可以有利地用于治疗由利用RdRp进行复制的ssRNA病毒(诸如例如冠状病毒)引起的感染。此外，PSCT还可以为其他病毒提供解决方案，特别是在全球爆发(例如大流行)的背景下。
任选地，PSCT可以包含靶向WV基因组mRNA(gRNA)的短反义序列，如下文进一步阐述的。
总之，本公开内容提供了利用劫持在宿主内扩散以及向其他感染了WV的个体扩散的WV机制的寄生性短合成mRNA载体，可以以最小的干预潜在地治疗大的群体的可行、高效和安全的治疗。
根据一些实施方案，本文公开的治疗可以克服病毒抗性(例如，通过比病毒进化更快的PSCT的自发进化(spontaneous evolution)，或者通过基于新发现的突变重新设计PSCT转录物)，允许对引起大流行的新趋异毒株的快速响应。
PSCT具有以下有益特征中的至少一个(也参见图1)：
1.PSCT是一种短的合成RNA转录物，与相关ssRNA WV的gRNA的预先选择的一小部分同源。根据一些实施方案，PSCT是一种“专性寄生物(obligate parasite)”，即完全依赖于WV编码的蛋白来复制和包装成新生的病毒衣壳，并且重要的是在未被WV病毒共感染的细胞中缺乏复制和/或产生病毒颗粒的能力。在实施方案中，在未被感染的细胞内，PSCT将被普遍存在的RNA降解的细胞途径消除。
2.PSCT包含WV复制识别序列。在实施方案中，WV复制识别序列可以介导由WV编码的蛋白，诸如例如RdRp、核衣壳(N)蛋白和膜(M)蛋白进行的最佳识别。在实施方案中，PSCT与WV竞争病毒复制和病毒包装功能中的至少一种。
3.根据一些实施方案，PSCT可以比WT gRNA以更高的速率复制。在实施方案中，PSCT包含对WV RdRp和N蛋白具有最佳亲和力的短序列(参见图1)。
4.任选地，PSCT可以包含编码小亚基因组(sg)序列的序列。在实施方案中，这些sg转录物包含与WV gRNA互补的反义10-35nt长的序列。在实施方案中，反义sg序列可以与WVgRNA内的保守序列杂交。不受任何理论约束，反义转录物可以干扰WV基因组复制和/或诱导WV gRNA降解。在实施方案中，sg反义转录物对PSCT功能，诸如例如使PSCT包装成病毒衣壳具有最小的影响。在实施方案中，由反义转录物诱导的WV gRNA降解可以由宿主细胞RNA酶介导。
此外，PSCT可以通过下文详述的结构元件中的至少一个来表征。
a)转录物的5′末端源自WV。该5′末端包含以下中的至少一个：WV前导序列；以及包含茎环结构的WV非翻译区(UTR)和WV的基因组包装信号(GPS)的至少一个部分或多于一个部分。
通过RdRp复制RNA需要茎环结构，而通过N蛋白进行有效识别和随后的包封需要GPS。
相对于WV修饰了PSCT的5′末端，以包含以下中的一个或更多个：
i.位于第一起始密码子下游约6-500个、50-500个、100-300个或150-250个(例如207个)核苷酸的终止密码子。每种可能性是单独的实施方案。第一终止密码子或任何终止密码子将位于会保留病毒蛋白识别所必需的二级结构的位置。终止密码子确保PSCT本身不产生任何WV蛋白。终止密码子可以位于最可能接近起始密码子的位置，以便核糖体从PSCT快速拆解(disassemble)，使细胞资源不浪费在合成无关的长肽上。根据一些实施方案，终止密码子允许核糖体拆解(disassembly)而不改变RNA二级结构。
ii.5′末端任选地包含相对于第一终止密码子移码(in frame shift to thefirst stop codon)的一个或更多个另外的终止密码子。在第一终止密码子下游发生移码突变的情况下，移码的终止密码子可能是一种保护机制。
iii.5'末端任选地还包括用于被N蛋白识别的GPS序列。
iv.任选地，转录物还可以包含一个或更多个短反义序列。在实施方案中，每一个短反义序列的侧翼可以是前导序列和指导RdRp合成sg序列(也称为短链)所需的转录调节序列(TRS)。根据一些实施方案，短链将不包含起始密码子，并且不会翻译成蛋白。或者，至少一些sg链可以被翻译成能够抑制病毒和/或促进PSCT扩散的肽或蛋白。短链可以抑制WV的复制，例如通过与WV gRNA配对，并形成dsRNA二级结构，这些结构不能被仅识别ssRNA的病毒RdRp转录。任选地，反义序列还可以用作细胞dsRNA酶的底物。
b)PSCT转录物的3′末端源自WV。在实施方案中，PSCT的3′末端包含WV 3'UTR的至少一部分。在实施方案中，PSCT的3′末端是多A尾。3′UTR还可以包含被预测是PSCT最佳复制所需的RNA序列。
c)PSCT通常不编码WV蛋白。不由PSCT编码的WV蛋白包括但不限于RdPd和各种结构蛋白，诸如N蛋白、刺突(S)蛋白等。此外，PSCT通常不编码非结构蛋白，诸如参与病毒在宿主中的毒力的辅助蛋白。
PSCT循环在下文简述。
PSCT进入宿主细胞(下文将讨论第一次进入)。
如果宿主细胞未被感染，则PSCT转录物被宿主细胞降解。
如果宿主细胞被WV(例如SARS-CoV-2)感染，则WV的RdRp会识别PSCT并实现PSCT复制。任选地，在携带WV反义序列的PSCT变体中，反义序列可以被转录。这些定制设计的sg链可以作为WV gRNA复制的部分抑制剂发挥功能和/或诱导其降解。
复制的PSCT链可以被识别并结合WV的N蛋白，然后N蛋白将与M蛋白和其他相关病毒蛋白结合。PSCT链与N蛋白、M蛋白和其他WV蛋白的结合导致含PSCT的病毒体被组装。由于PSCT的快速复制，PSCT减少了WV转录物可用的RdRp蛋白、N蛋白和M蛋白的量，并从而减缓了gRNA WV复制和包封。通过从宿主细胞分泌含PSCT的病毒体和感染其他细胞，WV抑制在另外的宿主细胞中继续进行。感染另外的细胞可以减少宿主中总WV gRNA载量。
作为另一个优点，PSCT是可传播的，例如它可以通过感染从一个受试者传播到另一个受试者。也就是说，如果一个家庭或大的群体被感染，通过用PSCT治疗一个家庭成员或群体中的少数个体，整个家庭/群体(或至少其大部分)可以被含PSCT的非致病病毒体感染，这些病毒体可以在家庭/群体的成员内与WV同时传播，或独立于WV传播。因此，在实施方案中，PSCT可用作针对一大群受试者，诸如例如群体的治疗。在实施方案中，当治疗第三世界国家和/或迅速出现的流行/大流行时，特别是当病毒感染的特征是具有长潜伏期和/或涉及无症状感染的受试者，使得难以鉴定感染的受试者以限制进一步传播时，PSCT可以是有效的。
此外，由于高复制率，RdPd诱导的突变率在快速复制的PSCT中与长得多(例如20倍长)的WV gRNA相比可以更高。因此，在实施方案中，PSCT可以是自适应的，并且它可以与突变体WV gRNA竞争。在另外的实施方案中，用PSCT治疗可以是自给自足的，并且避免对重复治疗的需要，或者避免对用新版本的PSCT治疗的需要。
根据一些实施方案，提供了源自ssRNA病毒(WV)的病毒诱饵转录物，该转录物包含含有WV的5′UTR的5′末端、WV的基因组包装信号(GPS)、WV的3′UTR、外源终止密码子和多A尾。应理解，所使用的终止密码子可以是UAG、UAA、UGA终止密码子中的任一个。因此，本文列出的任何序列中公开的任何特定终止密码子可以用遗传密码的任何其他终止密码子取代。根据一些实施方案，转录物可以包含终止密码子重复序列(stop-codon repeat)。根据一些实施方案，终止密码子重复序列可包括不在同一阅读框中的至少两个终止密码子。
根据一些实施方案，诱饵转录物不编码WV RdRp和/或WV N蛋白。根据一些实施方案，诱饵转录物不编码任何WV蛋白。
根据一些实施方案，诱饵转录物的5′末端是加帽的。根据一些实施方案，诱饵转录物包含与SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:6中列出的核苷酸序列具有至少80％序列相似性的核苷酸序列。
根据一些实施方案，诱饵转录物包含与SEQ ID NO:3-5和SEQ ID NO:7中列出的核苷酸序列中的任一个或更多个具有至少80％序列相似性的核苷酸序列。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以源自SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:9-13中的任一个。
根据一些实施方案，诱饵转录物还包含相对于第一终止密码子移码的一个或更多个另外的终止密码子。
根据一些实施方案，诱饵转录物还包含一个或更多个另外的GPS序列。
根据一些实施方案，诱饵转录物还包含一个或更多个WV特异性短反义序列。根据一些实施方案，反义序列的侧翼是前导序列和转录调节序列(TRS)中的至少一个。
根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV的基因组包含至少20,000个核苷酸。根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV具有20-40千碱基的病毒基因组。
根据一些实施方案，诱饵转录物相对于WV的长度之比为至少1:15。
根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV是动物源性病毒。根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV是正义单链RNA病毒。根据一些实施方案，WV可以是以下中的任一种或更多种：严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、中东呼吸综合征相关冠状病毒(MERS-CoV)、严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)、丙型肝炎病毒(HCV)、西尼罗病毒、登革病毒、普通感冒鼻病毒、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒、流感病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒。每种可能性是单独的实施方案。根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV是冠状病毒。根据一些实施方案，冠状病毒可以是SARS-CoV、SARS-CoV-2病毒或MERS-CoV中的任一种。根据一些实施方案，冠状病毒是SARS-CoV-2病毒。
根据一些实施方案，诱饵转录物是分离的RNA分子。
根据一些实施方案，提供了包含本文公开的诱饵转录物的载体。
根据一些实施方案，载体还包含与诱饵转录物在转录上相关的启动子。根据一些实施方案，启动子是组成型活性启动子、诱导型启动子和/或组织特异性启动子。每种可能性是单独的实施方案。
根据一些实施方案，提供了包含本文公开的诱饵转录物或本文公开的载体的细胞或细胞群体。
根据一些实施方案，细胞或细胞群体是上皮细胞或病毒的任何其他靶细胞。根据一些实施方案，细胞或细胞群体是表面表达血管紧张素转换酶2(ACE2)(或二肽基肽酶4(DPP4)或氨基肽酶N(APN)或被病毒靶向的任何受体)的细胞/细胞群体。
根据一些实施方案，提供了包含本文公开的诱饵转录物和合适的转运媒介物和/或载体的组合物。
根据一些实施方案，载体是水。
根据一些实施方案，组合物适于通过气溶胶施用。
根据一些实施方案，转运媒介物是转录载体。根据一些实施方案，转录载体是腺病毒载体或慢病毒载体中的任一种。
根据一些实施方案，转运媒介物是体外产生的病毒体。
根据一些实施方案，转运媒介物是脂质体或脂质纳米颗粒。
根据一些实施方案，组合物被配制用于口服和/或鼻施用。根据一些实施方案，组合物被配制用于经由吸入施用。
根据一些实施方案，提供了一种用于治疗、减弱和/或抑制受试者中ssRNA病毒感染的扩散的方法，该方法包括向受试者提供本文公开的诱饵转录物或本文公开的组合物。
根据一些实施方案，所治疗的受试者是感染了WV的受试者。
根据一些实施方案，提供了用于治疗感染了ssRNA病毒的细胞或细胞群体的方法，该方法包括向细胞提供本文公开的诱饵转录物或本文公开的组合物。
根据一些实施方案，细胞或细胞群体感染了WV。
根据一些实施方案，向细胞提供诱饵转录物包括在细胞中表达诱饵转录物。
根据一些实施方案，提供了用于治疗、减弱和/或抑制ssRNA病毒感染的扩散的试剂盒，该试剂盒包含本文公开的诱饵转录物或本文公开的组合物的剂型，以及用于在治疗、减弱和/或抑制ssRNA病毒感染的扩散中使用其的说明。
根据一些实施方案，剂型可以是滴鼻剂、鼻喷雾剂、喉喷雾剂、可喷雾液体或吸入剂中的任一种。每种可能性是单独的实施方案。
根据一些实施方案，试剂盒还包含用于递送剂型的装置。根据一些实施方案，装置可以是喷雾器、吸入器或雾化器。每种可能性是单独的实施方案。
本公开内容的某些实施方案可以包括上述一些优点、上述所有优点或不包括上述优点。根据本文包括的附图、说明书和权利要求书，一种或更多种技术优点对本领域技术人员来说可以是明显的。此外，虽然上文已经列举了具体的优点，但是多种实施方案可以包括所有列举的优点、一些列举的优点或不包括列举的优点。
除了上文描述的示例性方面和实施方案以外，通过参考附图和研究以下详细描述，另外的方面和实施方案将变得明显。
附图简述
现在将参考下面的说明性附图，结合某些实例和实施方案描述本发明，以便使本发明可以被更充分地理解。
图1是SARS样CoV基因组(和其他ssRNA病毒基因组)以及本文公开的诱饵转录物(PSCT)的两种实施方案，即诱饵转录物(选项1)和诱饵转录物(选项2)的示意图。术语“ORF1a和ORF 1b”是指转录物中编码对gRNA复制和转录至关重要的蛋白(例如RdRp)的部分。ORF1a和ORF 1b中的每一个编码多于一种转录物。ORF 1b通常相对于ORF 1a移码。“S蛋白”是指转录物中编码刺突蛋白的部分，“E蛋白”是指转录物中编码包膜蛋白的部分，“M蛋白”是指转录物中编码膜蛋白的部分，并且“N蛋白”是指转录物中编码核衣壳蛋白的部分。在实施方案中，诱饵转录物不含SARS-CoV蛋白编码序列，例如编码结构蛋白、RdR或辅助蛋白的序列。诱饵转录物包含一个或更多个在WV基因组中没有发现的终止密码子。任选地，诱饵转录物(选项2)可以包含侧接WV靶向互补TRS的抑制性反义或肽序列。
图2是描绘本文公开的诱饵转录物的治疗效果的关键特征的图。
详述
在以下描述中，将描述本公开内容的多个方面。为了说明的目的，列出具体配置和细节以提供对本公开内容的不同方面的透彻理解。然而，对本领域技术人员还将明显的是，本公开内容可在没有本文呈现的具体细节的情况下实践。此外，熟知的特征可被省略或简化以不使本公开内容晦涩。
定义
提供以下定义和方法以更好地定义本发明并指导本领域普通技术人员实施本发明。除非另有说明，术语应根据相关领域的普通技术人员的常规用法来理解。
除非另外定义，否则本文使用的所有技术术语和科学术语具有与本发明所属领域的技术人员通常理解的相同的含义。除非另外注明，否则遍及本文整个公开内容提及的所有专利、专利申请、公布的申请和出版物、GenBank序列、数据库、网站和其他出版材料均通过引用以其整体并入。在对于本文的术语存在多个定义的情况下，以本章节的那些为准。当参考URL或其他这样的标识符或地址时，应当理解，这样的标识符可以变化，并且在因特网上的特定信息可更换，但等效信息可通过检索互联网找到。对其的参考证明此类信息的可得性和公共传播。
在以单数形式提供术语的情况下，发明人还设想了用该术语的复数形式描述的本发明的方面。
CoV-SARS-2是一种正义ssRNA病毒(参见PMID 25720466或PMID 31987001)，具有由SEQ ID NO:1所示的序列作为遗传物质；NCBI参考序列：NC_045512.2、genbankMN908947.3或其任何变异株或突变株。
CoV-SARS-2的病毒周期阶段在下文简述：
1.病毒ssRNA插入宿主细胞的胞质溶胶中。
2.ssRNA最初由细胞核糖体翻译以编码长多聚蛋白pp1a和pp1ab，它们被进一步加工成一组包含重要的酶(RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp))和其他非结构蛋白的成熟产物。
3.然后RdRp合成基因组(复制酶蛋白)转录物和亚基因组RNA(sgRNA)转录物(编码结构蛋白和辅助蛋白)两者，导致病毒的复制和至关重要的病毒结构基因(包括N蛋白和其他结构基因)的表达。sgRNA是通过需要保守的TRS序列的机制合成的。
4.N蛋白以串珠型构象结合病毒基因组。短的顺式作用基因组包装信号(GPS)对于促进核衣壳(N)蛋白进行识别和介导特异性gRNA包封是必需的，也是足够的。
5.然后病毒颗粒被组装，并且新形成的病毒体(包含含有允许病毒体感染其他细胞的刺突蛋白的包膜)出芽以感染另外的细胞。
术语“受试者”、“患者”或“个体”通常是指人类，尽管本发明的方法不必须限于人类并且应该可用于其他哺乳动物。
如本文提及的，术语“多核苷酸分子”、“寡核苷酸”、“多核苷酸”、“核酸”和“核苷酸”序列可以可互换使用。这些术语涉及脱氧核糖核苷酸(DNA)、核糖核苷酸(RNA)及其修饰形式的聚合物，所述聚合物呈单独的片段，或作为更大的构建体的组分、线性或支链、单链(ss)、双链(ds)、三链(ts)或其杂合体的形式。该术语还涵盖RNA/DNA杂合体。多核苷酸可以是例如DNA或RNA的有义和反义寡核苷酸或多核苷酸序列。DNA或RNA分子可以是例如但不限于：互补DNA(cDNA)、基因组DNA、合成DNA、重组DNA、或其杂合体，或者RNA分子诸如例如mRNA、shRNA、siRNA、miRNA等。因此，如本文使用的，术语“多核苷酸分子”、“寡核苷酸”、“多核苷酸”、“核酸”和“核苷酸”序列意在指DNA和RNA分子两者。该术语还包括由天然存在的碱基、糖和共价的核苷间键组成的寡核苷酸，以及具有非天然存在的部分的寡核苷酸，所述非天然存在的部分发挥类似于相应的天然存在的部分的功能。
除非另有说明，本说明书正文中的核苷酸序列是从左到右阅读时以5'到3'方向给出的。本文使用的命名是美国联邦法规法典(United States Code of FederalRegulations)第37章§1.822规定的术语，并载于WIPO标准ST.25(1998)附录2、表1和表3。
如本文使用的，术语“上游”和“下游”是指在核苷酸序列，诸如例如DNA序列或RNA序列中的相对位置。如众所周知的，核苷酸序列具有5'末端和3'末端，这样的命名是针对核苷酸骨架的糖(脱氧核糖或核糖)环上的碳的。因此，相对于核苷酸序列上的位置，术语下游涉及朝向序列的3'末端的区域。术语上游涉及朝向链的5'末端的区域。
如本文使用的，术语“同源物”可指与参考多核苷酸分子的参考核苷酸序列具有基本上约70％至约99％序列同一性，或更优选地约80％至约99％序列同一性，或最优选地约90％至约99％序列同一性，至约99％序列同一性的多核苷酸。每种可能性是单独的实施方案。
如本文使用的，术语“序列同一性”、“序列相似性”或“同源性”用于描述两个或更多个核苷酸序列之间的序列关系。两个序列之间的“序列同一性”百分比是通过比较两个最佳对齐的序列来确定的。与参考序列相比，在每个位置处都相同的序列称为与参考序列相同，并且反之亦然。如果在以5′至3′方向观察时第一核苷酸序列与在以3′至5′方向观察时的第二核苷酸序列或参考核苷酸序列表现出完全互补性，则第一核苷酸序列被称为第二序列或参考序列的“互补物”或与第二序列或参考序列互补。如本文使用的，当以5′至3′阅读的一个序列的每个核苷酸与以3′至5′阅读的另一个序列的每个核苷酸互补时，核酸序列分子被称为表现出“完全互补性”。与参考核苷酸序列互补的核苷酸序列将表现出与参考核苷酸序列的反向互补序列相同的序列。这些术语和描述在本领域中是充分定义的，并且容易被本领域普通技术人员理解。
如本文提及的，术语“互补性”是指核酸链之间的碱基配对。如本领域已知的，核酸的每一条链可以与另一条链互补，因为链之间的碱基对经由两个或三个氢键非共价连接。在相对的互补的核酸链上通过氢键连接的两个核苷酸被称为碱基对。根据Watson-CrickDNA碱基配对，腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)形成碱基对，且鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)形成碱基对。在RNA中，胸腺嘧啶被尿嘧啶(U)替换。两条核酸链之间的互补性程度可以根据在链之间形成碱基对的核苷酸的数目(或百分比)而变化。例如，“100％互补性”指示每条链中的所有核苷酸都与互补链形成碱基对。例如，“95％互补性”指示每条链中95％的核苷酸与互补链形成碱基对。术语充分互补性可包括约30％至约100％的任何百分比的互补性。
如本文使用的，术语“移码”是指添加或缺失DNA和/或RNA链中一个或更多个核苷酸，这移动了遗传密码的密码子三联体。由于由密码子进行基因表达的三联体性质，插入或缺失可以改变阅读框。因此，具体提及相对于彼此移码的终止密码子是指各自在不同的可能的读取框中识别的终止密码子。
如本文使用的，“病毒”是指没有宿主细胞就不能生长或复制的一大群感染性实体中的任一种。病毒通常包含包围遗传物质的RNA或DNA核心的蛋白外壳(protein coat)，但没有半透膜，并且只能在活细胞中生长和繁殖。
如本文使用的，术语“野生型病毒”和“WV”是指本文公开的诱饵转录物源自其的病毒。“野生型病毒”和“WV”还指在感染的受试者中产生疾病，并且该疾病可以在施用治疗剂量的本文描述的PSCT后得到治疗的感染性病毒。
根据一些实施方案，WV是正义单链RNA病毒。如本文使用的，术语“正义单链RNA病毒”和“(+)ssRNA病毒”是指使用正义单链RNA作为其遗传物质的病毒。单链RNA病毒根据RNA的有义性(sense)或极性分为正或负。正义病毒RNA基因组可以用作信使RNA，并且可以在宿主细胞的胞质溶胶中翻译成蛋白而不进入宿主的细胞核。正义RNA病毒占已知病毒的一大部分，包括许多病原体，诸如丙型肝炎病毒、西尼罗病毒、登革病毒、SARS和MERS冠状病毒和SARS-CoV-2，以及临床上不太严重的病原体，诸如引起普通感冒的鼻病毒。在实施方案中，WV病毒是来自病毒的黄病毒科(Flaviviridae)的病毒。在实施方案中，WV病毒是来自病毒的冠状病毒科(Coronaviridae)的病毒。
根据一些实施方案，WV是冠状病毒。如本文使用的，术语“冠状病毒”是指具有长度为26-32千碱基的病毒基因组的具包膜的、正义、单链RNA病毒的科。根据一些实施方案，冠状病毒可以是SARS、MERS和/或SARS-CoV-2病毒。
如本文使用的，术语“SARS-CoV-2”是指冠状病毒科的冠状病毒(Corona)属冠状病毒的多形性RNA病毒。当感染人类时，SARS-CoV-2病毒可以导致COVID-19状况。SARS-CoV-2基因组由登录号:NC_045512.2并且在本文中作为SEQ ID NO:1列出的核酸序列表示。
如本文使用的，“病毒在宿主细胞中的扩增”意指病毒在细胞中复制以维持病毒或增加细胞中病毒的量。如本文使用的，“宿主细胞”或“靶细胞”可互换地使用来意指可以被病毒感染的细胞。根据一些实施方案，宿主细胞是在其细胞表面表达ACE2或其同源物的细胞。根据一些实施方案，细胞是上皮细胞。
根据一些实施方案，WV可以是杀细胞(cytocidal)病毒。如本文使用的，术语“杀细胞病毒”是指当感染宿主细胞时，病毒通过改变细胞形态、细胞生理和/或生物合成事件杀死宿主细胞的病毒。根据一些实施方案，对宿主细胞的改变对于有效的病毒复制是必需的。根据一些实施方案，WV可以对大量细胞具有杀细胞作用。
根据一些实施方案，WV感染具有致细胞病变(cytopathic)作用。如本文使用的，术语“致细胞病变(cytopathic)作用”、“致细胞病变(cytopathogenic)作用”和CPE可互换地使用，并指由病毒入侵引起的宿主细胞的结构变化。在一些实施方案中，感染病毒引起宿主细胞裂解或者细胞死亡而不裂解。根据一些实施方案，CPE可以表现为宿主细胞的形态变化。CPE的常见实例包括被感染的细胞变圆、与邻近细胞融合形成合胞体和/或出现核或细胞质包涵体。
如本文使用的，术语“转录物”是指RNA序列。转录物可用作蛋白合成的模板。
如本文使用的，术语“诱饵转录物”和“寄生性假病毒转录物”是指源自寻求针对其的保护的病毒的RNA转录物，该转录物能够由WV复制和包装机制复制和包装。
如本文使用的，术语“构建体”是指人工组装或分离的核酸分子，其可以包含一个或更多个核酸序列，其中核酸序列可以是编码序列(即，编码终产物(即蛋白)的序列)、调控序列、非编码序列或其任何组合。术语构建体包括，例如，载体、质粒，但不应被视为限于此。
如本文使用的，术语“诱饵病毒粒”是指在其核心中包含诱饵转录物的病毒颗粒。根据一些实施方案，诱饵病毒体可以在宿主细胞内组装。根据一些实施方案，诱饵病毒体可以被人工组装，在这种情况下，它被称为“病毒体转运媒介物”。
如本文使用的，术语“转运媒介物”是指适于有效递送本文公开的诱饵转录物的剂。
根据一些实施方案，转运媒介物可以是载体。如本文使用的，术语“载体”是指被工程化成在靶细胞中编码或表达多核苷酸(诸如DNA、RNA、miRNA、shRNA、siRNA和反义寡核苷酸)的构建体。载体可以包括诸如但不限于病毒载体和非病毒载体的载体。术语“表达载体”是指具有将异源核酸片段(诸如DNA)整合到外来细胞中并使其在外来细胞中表达的能力的载体。换句话说，表达载体包含能够在靶细胞中转录或表达的核酸序列/片段(诸如DNA、mRNA、tRNA、rRNA)。许多病毒、原核和真核表达载体是已知的和/或商购可得的。选择适当的表达载体在本领域技术人员的知识范围内。
根据一些实施方案，转运媒介物可以是脂质体。如本文使用的，术语“脂质体”是指具有由一个或更多个双层的膜将内部水性空间与外部介质隔离的微观囊泡。脂质体的双层膜通常由包含空间上分开的亲水结构域和疏水结构域的两亲分子，诸如合成的或天然来源的脂质形成。诱饵转录物可以完全或部分位于脂质体的内部空间、脂质体的双层膜内、或与脂质体膜的外表面缔合。脂质体可以促进或协助将诱饵转录物递送到靶细胞中。脂质体还可以保护核酸免受包含降解核酸的酶或化学物质和/或引起核酸的快速排出的系统或受体的环境的影响。
根据一些实施方案，转运媒介物可以是纳米颗粒。如本文使用的，“纳米颗粒”是指用于递送分子或剂的胶体颗粒，其微观尺寸在1纳米和1000纳米(nm)之间或约在1纳米和1000纳米(nm)之间，诸如在1nm和100nm之间，并且在转运和特性方面表现为一个完整单元。纳米颗粒包括尺寸均匀的纳米颗粒。纳米颗粒包括包含附接到外侧的靶向分子的纳米颗粒。
根据一些实施方案，纳米颗粒可以是脂质纳米颗粒。如本文使用的，术语“脂质纳米颗粒”是指包含一种或更多种脂质(例如阳离子脂质、非阳离子脂质和PEG修饰的脂质)的转移媒介物。优选地，脂质纳米颗粒被配制为将诱饵转录物递送到靶细胞中。合适的脂质的实例包括，例如，磷脂酰化合物(例如，磷脂酰甘油、磷脂酰胆碱、磷脂酰丝氨酸、磷脂酰乙醇胺、鞘脂、脑苷脂和神经节苷脂)。还设想了无论是单独还是与其他转移媒介物组合地使用聚合物作为转移媒介物。合适的聚合物可以包括，例如，聚丙烯酸酯、聚烷基氰基丙烯酸酯、聚丙交酯、聚丙交酯-聚乙交酯共聚物、聚己内酯、右旋糖酐、白蛋白、明胶、海藻酸盐(alginate)、胶原、壳聚糖、环糊精、树状大分子和聚乙烯亚胺。
根据一些实施方案，转运媒介物可以是病毒体。如本文使用的，术语“病毒体”是指包封诱饵转录物并能够感染宿主细胞的衣壳。根据一些实施方案，衣壳可以是WV衣壳，而内核包含诱饵转录物。
本公开内容的核酸可以包含作为非翻译区或发挥非翻译区的功能的一个或更多个区域或部分。5′UTR从转录起始位点开始，并延续到起始密码子，但不包括起始密码子；而3′UTR紧接着终止密码子开始，并延续直到转录终止信号。UTR的调节特征可以被整合到本公开内容的多核苷酸中，以尤其增强分子的稳定性。
在本公开内容的一些实施方案中，5′UTR源自WV。或者，5′UTR可以是异源UTR，例如不同病毒的UTR。在另一种实施方案中，5′UTR是合成的UTR，即在自然界中不存在。合成的UTR包括已被突变的UTR。合成的UTR可以具有改进的性质，例如，增加的基因表达。
类似地，引入、去除或修饰3′UTR富含AU的元件(ARE)可用于调节本公开内容的核酸(例如，RNA)的稳定性。3′UTR可以是异源的或合成的，如关于5′UTR描述的。
本领域普通技术人员将理解，异源的或合成的5′UTR可与任何期望的3'UTR序列一起使用。例如，异源5′UTR可以与具有异源3″UTR的合成的3′UTR一起使用。
UTR或其部分可以以与其所选自的转录物中相同的方向放置，或者可以改变的方向或位置。因此，5′UTR或3′UTR可以倒置、缩短、加长，用一个或更多个其他5'UTR或3'UTR制成。如本文使用的，当与UTR序列有关时，术语“改变的”意指UTR已经相对于参考序列以某种方式被改变。例如，相对于野生型或天然UTR，3′UTR或5′UTR可以通过如上文教导的改变方向或位置来改变，或者可以通过包含另外的核苷酸、核苷酸缺失、核苷酸交换或转座来改变。产生“改变的”UTR(无论是3′还是5′)的任何这些变化包括变体UTR。
在一些实施方案中，可以使用双UTR、三UTR或四UTR，诸如5'UTR或3'UTR。如本文使用的，“双”UTR是其中相同UTR的两个拷贝被串联或基本上串联编码的UTR。
本文公开的转录物可以是使用如本领域已知的体外转录(IVT)系统产生的RNA。体外转录系统通常包括转录缓冲液、三磷酸核苷酸(NTP)、RNA酶抑制剂和聚合酶。在一些实施方案中，使用在体外转录反应中产生RNA转录物的非扩增的线性化DNA模板来产生RNA转录物。在本公开内容的方法中可以使用任何数目的RNA聚合酶或变体。聚合酶可以选自但不限于噬菌体RNA聚合酶，例如T7 RNA聚合酶、T3 RNA聚合酶、SP6 RNA聚合酶，和/或突变型聚合酶，诸如但不限于能够掺入修饰的核酸和/或修饰的核苷酸(包括化学修饰的核酸和/或核苷酸)的聚合酶。一些实施方案排除了DNA酶的使用。在一些实施方案中，经由酶促加帽使RNA转录物加帽。在一些实施方案中，RNA包含5′末端帽，例如7mG(5′)ppp(5′)NlmpNp。
在实施方案中，PSCT的RNA转录物可以使用RdRp在体内或体外合成。
本公开内容的转录物可以全部或部分使用固相技术制造。核酸的固相化学合成是其中分子被固定在固体支持物上，并在反应物溶液中一步一步地合成的自动化方法。固相合成可用于在核酸序列中位点特异性地引入化学修饰。
本公开内容的转录物可以通过添加单体构建模块(building block)来合成，并且可以在液相中进行。
上文讨论的合成方法各自具有其优点和局限性。已经尝试将这些方法组合起来以克服局限性。这样的方法的组合在本公开内容的范围内。使用与酶促连接组合的固相或液相化学合成提供了一种有效产生不能通过单独的化学合获得的长链核酸的方法。
本文描述的核酸的纯化可以包括但不限于核酸清理、质量保证和质量控制。清理可以通过本领域已知的方法进行，诸如但不限于AGENCOURT.RTM.珠(Beckman CoulterGenomics,Danvers,Mass.)、多T珠、LNATM寡T捕获探针(EXIQON.RTM.Inc,Vedbaek,Denmark)或基于HPLC的纯化方法，诸如但不限于强阴离子交换HPLC、弱阴离子交换HPLC、反相HPLC(RP-HPLC)和疏水相互作用HPLC(HIC-HPLC)。当关于核酸使用时，术语“纯化的”，诸如“纯化的核酸”是指与至少一种污染物分离的核酸。“污染物”是任何使另一种物质不合格(unfit)、不纯或劣等(inferior)的物质。因此，纯化的核酸(例如，DNA和RNA)以不同于其在自然界中发现的形式或环境呈现，或者以不同于在使其经历处理或纯化方法之前存在的形式或环境呈现。
根据一些实施方案，本文公开的诱饵转录物可以以组合物(例如药物组合物)施用。
在一些实施方案中，组合物呈适于吸入的形式。在一些实施方案中，组合物的形式选自由滴鼻剂、鼻喷雾剂、可喷雾液体组合物、吸入剂和喉喷雾剂组成的组。在一些实施方案中，组合物以加压气溶胶剂型提供。
在一些实施方案中，提供了包括本文公开的任一种组合物的加压气溶胶剂型，并被配置成从加压气溶胶剂型产生气溶胶的装置。在一些实施方案中，装置选自由喷雾器、MESH超声喷雾器、吸入器和雾化器组成的组。在一些实施方案中，所述装置是手持设备。每种可能性是单独的实施方案。
在一些实施方案中，所述施用是经由吸入进行，例如利用配置用于产生蒸气和/或气溶胶的设备。
吸入施用可以包括鼻内喷雾。适于通过吸入施用的多种形式包括气溶胶、薄雾剂(mist)或粉剂。每种可能性是单独的实施方案。
包括本文公开的组合物的药物组合物可以以气溶胶喷雾呈现的形式从加压包装或喷雾器递送，例如使用推进剂(例如，二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳等)。
在一些实施方案中，气溶胶剂型被包封在筒(cartridge)或胶囊中。
在一些实施方案中，本文公开的组合物呈用于在加压递送系统内使用的胶囊或筒的形式。
在一些实施方案中，本文公开的组合物可以被配制成可从非气溶胶包装喷雾的液体组合物。
如本文使用的术语“气溶胶”是指液体或固体颗粒在气体中的悬浮物。通常，液滴(也称为颗粒)的直径在10-9m至10-4m的范围内。
在一些实施方案中，组合物适于经由氧气机、氧气吸入器、氧气袋或氧气瓶施用。在一些实施方案中，通过连接到设备的面罩来进行吸入。在一些实施方案中，组合物与氧气并行提供。
在一些实施方案中，抗病毒组合物用于全身使用，诸如用于静脉内、肌肉内或腹膜内注射。每种可能性是单独的实施方案。
根据一些实施方案，本文公开的诱饵转录物可用于治疗病毒感染。根据一些实施方案，本文公开的诱饵转录物可用于防止病毒感染的扩散。根据一些实施方案，本文公开的诱饵转录物可用于减弱病毒感染。
根据一些实施方案，本文公开的诱饵转录物可以以有效量向受试者(例如，哺乳动物受试者，诸如人类受试者)施用。
本公开内容提供了包括向有相应需要的受试者施用诱饵转录物的方法。所需的确切量可以因受试者而异，这取决于受试者的物种、年龄和一般状况、疾病的严重性、特定组成、其施用方式、其活性方式等。使群体有广泛效果的具体的治疗有效、预防有效、或适当的剂量水平可以取决于多种因素，包括正在治疗的紊乱和紊乱的严重性；所采用的具体组合物；受试者的年龄、体重、一般健康状况、性别和饮食；施用时间、施用途径、与所采用的具体化合物组合或协同(coincidental)施用的药物；和医学领域熟知的类似因素。
如本文使用的，除非上下文另外清楚指明，否则单数形式“一(a)”、“一(an)”和“该(the)”包括复数指代物。
如本文使用的，范围和量可以被表述为“约(about)”或“大约(approximately)”特定值或范围。“约”或“大约”也包括确切的量。通常，“约”包括将被预期在实验误差内的量。
如本文使用的，“大致相同(about the same)”是指在本领域技术人员会认为相同或在可接受的误差范围内的量。例如，通常，对于药物组合物，在至少1％、2％、3％、4％、5％或10％内被认为是大致相同的。这样的量可以根据受试者对特定组合物的变化的容忍度而变化。
如本文使用的，“任选的”或“任选地”意指随后描述的事件或情形发生或不发生，并且该描述包括所述事件或情形发生的情况和其不发生的情况。
本发明的实施方案
根据一些实施方案，提供了一种寄生性假病毒转录物(PSCT)，当被施用至受试者时，其能够治疗、减弱和/或预防病毒诱导的感染和/或疾病的扩散。诱饵转录物源自ssRNA病毒(WV)，并且包含WV的5′UTR(或其一部分、其同源物和/或其修饰版本)、WV的基因组包装信号(GPS)(或其一部分、其同源物和/或其修饰版本)、WV的3′UTR、至少一个外源的非天然存在的和/或人工引入的终止密码子、以及多A尾(或其一部分、其同源物和/或其修饰版本)。应理解，所使用的终止密码子可以是UAG、UAA、UGA终止密码子中的任一个。因此，当一个或更多个特定终止密码子作为本文列出的序列的一部分被公开时，这样的终止密码子可以被遗传密码的任何其他终止密码子取代。
在实施方案中，至少一个外源终止密码子位于整个诱饵转录物序列的任何位置。在实施方案中，诱饵转录物不产生任何WV蛋白。在实施方案中，诱饵转录物产生短肽。在实施方案中，由诱饵转录物产生的短肽是非功能性肽。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以是稳定化的。根据一些实施方案，诱饵转录物的5′末端可以是加帽的。
根据一些实施方案，本文公开的转录物可以是稳定化的。如本文使用的，“稳定化的RNA”分子可指可以包含稳定化元件，包括但不限于5′帽结构或3′多(A)尾的RNA分子。
对多核苷酸的5′加帽可以在体外转录反应期间伴随地完成，例如根据制造商的方案，使用以下化学RNA帽类似物来产生5′鸟苷帽结构：3′-O-Me-m7G(5′)ppp(5′)G[ARCA帽]；G(5′)ppp(5′)A；G(5′)ppp(5′)G；m7G(5′)ppp(5′)A；m7G(5′)ppp(5′)G(New EnglandBioLabs,Ipswich,Mass.)。对修饰的RNA的5′加帽可以在转录后使用痘苗病毒加帽酶产生“Cap0”结构m7G(5′)ppp(5′)G(New England BioLabs,Ipswich,Mass.)来完成。Cap1结构可以使用痘苗病毒加帽酶和2′-O甲基转移酶产生m7G(5′)ppp(5′)G-2′-O-甲基来产生。Cap2结构可以在使用2′-O甲基转移酶对5′倒数第二个核苷酸进行2′-O-甲基化后，从Cap1结构产生。Cap3结构可以在使用2′-O甲基转移酶对5′倒数第三个核苷酸进行2'-O-甲基化后从Cap2结构产生。每种可能性是单独的实施方案。根据一些实施方案，加帽包括7-甲基鸟苷帽(m7G)或m7G类似物。
根据一些实施方案，可以使用
Figure GDA0003961496550000211
TriLink共转录加帽法使5′UTR加帽。这可以产生天然存在的Cap1结构。
根据一些实施方案，还可以用5-甲氧基尿苷修饰转录物。不受任何理论约束，这可以提供针对哺乳动物系统的优化的转录物稳定性，同时模拟WV mRNA。
根据一些实施方案，3′UTR包含3′多(A)尾。3′多(A)尾通常是添加到转录的RNA的3′末端的腺苷核苷酸的链段(stretch)。在一些情况下，它可以包含多达约400个腺苷核苷酸。在一些实施方案中，3′多(A)尾的长度可以是关于单个RNA的稳定性的基本元件。
根据一些实施方案，诱饵转录物包含与SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:6(诱饵转录物)中列出的核苷酸序列相同或具有至少80％、至少90％、至少95％或至少99％序列相似性的核苷酸序列。参见下表1(起始密码子和终止密码子以粗体强调)。应理解，终止密码子可以根据遗传密码进行修饰，如本文进一步阐述的。
根据一些实施方案，诱饵转录物包含与SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:7(诱饵转录物的5'UTR)中列出的核苷酸序列相同或具有至少80％、至少90％、至少95％或至少99％序列相似性的核苷酸序列。参见下表1。
根据一些实施方案，诱饵转录物包含与SEQ ID NO:4(诱饵转录物的GPS)中列出的核苷酸序列相同或具有至少80％、至少90％、至少95％或至少99％序列相似性的核苷酸序列。参见下表1。
根据一些实施方案，诱饵转录物包含与SEQ ID NO:5(诱饵转录物的3′UTR)中列出的核苷酸序列相同或具有至少80％、至少90％、至少95％或至少99％序列相似性的核苷酸序列。
表1-诱饵转录物相关序列
Figure GDA0003961496550000212
Figure GDA0003961496550000221
Figure GDA0003961496550000231
Figure GDA0003961496550000241
根据一些实施方案，诱饵转录物可以源自具有SEQ ID NO:9(NC_004718.3)中列出的核苷酸序列的SARS-CoV或其任何变体或突变株。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以源自具有SEQ ID NO:10(NC_019843.3)中列出的核苷酸序列的MERS-CoV病毒或突变株。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以源自具有SEQ ID NO:11(NC_002549.1)中列出的核苷酸序列的埃博拉病毒或其任何变体或突变株。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以源自黄病毒，诸如具有SEQ ID NO:12(NC_001477.1)中列出的核苷酸序列的登革病毒，或具有SEQ ID NO:13(登录:M12294.2 GI:11497619)中列出的核苷酸序列的西尼罗热病毒。
根据一些实施方案，终止密码子位于5′UTR和GPS之间。根据一些实施方案，终止密码子位于5'UTR内。根据一些实施方案，终止密码子位于GPS内。根据一些实施方案，终止密码子位于GPS和3'UTR之间。根据一些实施方案，终止密码子位于距WV的起始密码子几个核苷酸(例如2-5个核苷酸)处，以确保核糖体从诱饵转录物中快速拆解。
根据一些实施方案，诱饵转录物还包含相对于第一终止密码子移码的一个或更多个另外的终止密码子。根据一些实施方案，诱饵转录物还包含一个或更多个用于增强N蛋白结合的另外的GPS序列(或其部分)。
根据一些实施方案，诱饵转录物还包含与WV基因组中的序列互补的一个或更多个序列，优选地在转录物的3'UTR之前。互补序列(本文中也称为“反义序列”)可以结合WV，并从而干扰WV复制。序列的设计使得它们会干扰病毒基因组的复制，同时对诱饵转录物的复制具有最小的影响。根据一些实施方案，反义序列与WV gRNA在不编码重要蛋白(vitalprotein)的基因组区域的序列配对，以便不干扰组装诱饵病毒体所需的蛋白的产生。根据一些实施方案，反义序列的每一个的侧翼是病毒的前导序列和转录调节序列(TRS)，以便增强其转录。
根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV具有20-40千碱基之间的病毒基因组。这可以有利地确保诱饵转录物的复制显著快于WV的复制，从而提供竞争优势。
根据一些实施方案，诱饵转录物相对于WV的核苷酸长度之比为至少1:5(即WV是诱饵转录物至少5倍长)。根据一些实施方案，诱饵转录物相对于WV的核苷酸长度之比为至少1:10(即WV是诱饵转录物至少10倍长)。根据一些实施方案，诱饵转录物相对于WV的核苷酸长度之比为至少1:15(即WV是诱饵转录物至少15倍长)。根据一些实施方案，诱饵转录物相对于WV的核苷酸长度之比为至少1:20(即WV是诱饵转录物至少20倍长)。
根据一些实施方案，诱饵转录物为约500-2500个或约1000-2000个核苷酸(nt)长。根据一些实施方案，诱饵转录物为约1500nt长。
根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV是动物源性病毒。根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV是正链ssRNA病毒。
根据一些实施方案，诱饵转录物源自其的WV是冠状病毒。根据一些实施方案，冠状病毒是严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS)、严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2病毒)或中东呼吸综合征相关冠状病毒(MERS)。每种可能性是单独的实施方案。应理解，其他病毒，包括上述病毒的变体和/或目前未知的病毒也可以类似地被诱饵转录物靶向，如本文实质上描述的。
根据一些实施方案，WV可以是以下致病性正义ssRNA病毒中的任一种：冠状病毒科、丙型肝炎病毒、西尼罗病毒、登革病毒和普通感冒鼻病毒。
根据一些实施方案，WV可以是以下致病性负链ssRNA病毒中的任一种：RSV、副流感病毒、流感病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒等。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以根据所期望靶向的病毒“定制”。根据一些实施方案，诱饵转录物可以基于期望靶向的病毒的基因组序列构建。
根据一些实施方案，诱饵转录物是纯化的RNA分子。因此，诱饵转录物可以适于直接递送，例如通过使稀释在水或其他合适载体中的转录物气溶胶化。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以被整合到转录载体，诸如但不限于腺病毒载体或慢病毒载体中。
根据一些实施方案，载体包含与诱饵转录物在转录上相关的启动子。根据一些实施方案，启动子可以是组成型启动子。根据一些实施方案，启动子可以是诱导型启动子。根据一些实施方案，启动子可以是组织特异性启动子。根据一些实施方案，组织特异性启动子可以是肺组织特异性启动子。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以被包封在病毒感染性颗粒(本文中也称为诱饵病毒体转运媒介物)中。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以被包封到、附接到脂质体或脂质纳米颗粒或以其他方式与脂质体或脂质纳米颗粒缔合。根据一些实施方案，包封的诱饵转录物可适于通过注射，例如静脉内注射施用。
根据一些实施方案，诱饵转录物可以被配制用于口服和/或鼻施用。根据一些实施方案，诱饵转录物被配制用于经由吸入施用。在一些实施方案中，抗病毒组合物的形式选自由滴鼻剂、鼻喷雾剂、可喷雾液体组合物、吸入剂和喉喷雾剂组成的组。
根据一些实施方案，诱饵转录物被配制用于经由注射或本领域已知的其他递送方法施用。
根据一些实施方案，提供了用于治疗、减弱ssRNA病毒的严重性和/或抑制ssRNA病毒在个体受试者或受试者群体中的扩散的方法。根据一些实施方案，该方法包括向受试者施用本文公开的诱饵转录物。这可以为所治疗的受试者提供缓解(治疗或改善症状)，这在本文中称为“直接治疗”。此外，治疗还可以通过将在PSCT治疗的受试者中产生的诱饵病毒体传播给周围的个体，间接治疗受试者周围的个体(家人、同事等)，这在本文中称为“间接治疗”。根据一些实施方案，诱饵转录物仅在感染了WV的受试者中有效，并且在未受影响的细胞中会被破坏。因此，诱饵转录物适于直接或间接治疗感染了诱饵转录物源自其的WV的受试者。因此，诱饵转录物对治疗感染个体的大的群体，诸如在大流行期间，特别有效。还应理解，由于所治疗的受试者(无论是直接的还是间接的)的WV载量大幅减少的事实，可以减弱WV的扩散。
包括以下实施例以展示本发明的某些优选实施方案的实例。本领域技术人员应理解，在以下实施例中公开的技术代表了发明人在本发明的实践中已经发现的良好地发挥功能的方法，并且因此可以被认为构成用于该实践的优选模式的实例。然而，根据本公开内容，本领域的技术人员应理解，在所公开的特定实施方案中可以做出许多改变，并仍然获得类似或相似的结果，而不偏离本发明的精神和范围。
现在参考图2，其图示地描绘了直接和间接诱饵转录物治疗的步骤。
最初，群体中的病毒感染被鉴定出来。在被鉴定后，群体中的一个或更多个体可以被施用诱饵转录物。施用形式可以是吸入、雾化、口服施用(例如作为液体)、注射等。施用诱饵转录物的受试者可以是随机的(例如第一个进入诊所的)。或者，可以基于风险因素、病毒载量、年龄、活动(例如，他/她遇到另外的感染的受试者的可能性)等来选择受试者。
在感染的受试者被施用诱饵转录物后，WV的RdRp会将诱饵转录物识别为WV转录物，并启动其复制。任选地，在诱饵转录物包含反义序列的情况下，这些将被转录并用作WVgRNA复制的抑制剂。
复制的诱饵转录物将被WV包装机制识别，从而产生诱饵病毒体。由于诱饵转录物的快速复制，诱饵转录物限制了WV转录物可用的RdRp蛋白、N蛋白和M蛋白的量，并从而减缓了WV的复制和组装。这导致形成比WV病毒体多得多的诱饵病毒体，并减弱(并任选地甚至消除)所治疗的受试者的WV感染。
在所治疗的受试者遇到其他感染的受试者后，诱饵病毒将与WV共同传播至其他感染的个体，从而减少群体中的整体WV载量。
提供以下实施例以更充分地说明本发明的一些实施方案。然而，其绝不应以任何方式被解释为限制本发明的宽范围。本领域技术人员可以容易地设想本文公开的原理的许多变化形式和修改，而不背离本发明的范围。
实施例
实施例1-PSCT构建体的制造
PSCT是由TriLink BioTechnologies,San Diego,CA商业化制造的。首先，将采用改善的专有的固相化学合成寡核苷酸DNA合成的方法来获得PSCT的核心序列。接下来，线性化的DNA序列被用作模板，经由T7 RNA聚合酶合成来产生加帽的RNA。体外RNA转录制造加帽和多腺苷化的信使RNA(mRNA)，通过专有的
Figure GDA0003961496550000291
技术实现共转录加帽。另外，使用多A聚合酶添加多A尾。
实施例2-病毒处理和滴定
通过使用标准噬斑测定来确定冷冻培养物上清中的病毒滴度。简单地说，一式两份地向24孔板中的单层Vero E6细胞添加100μL的10倍连续稀释的病毒。在37℃孵育1小时后，吸取病毒接种物，并向每孔中添加1mL羧甲基纤维素(CMC)覆盖物(overlay)和补充有5％ FCS的DMEM培养基(或199)。在培养2-4天后，通过标准结晶紫染色使噬斑可视化并计数，并计算以噬斑形成单位/mL(PFU/mL)计的病毒滴度。
实施例3-mRNA-脂质复合物的制备和转染过程
如制造商所推荐地使用LipofectamineTM MessengerMAX转染试剂(Thermo FisherScientific Inc.)制备mRNA-脂质复合物，作为优化的起点。接下来，将mRNA-脂质复合物添加到在96孔板中铺板的Vero E6细胞；所有都按照制造商的推荐。
实施例4-噬斑减少测定
将胰蛋白酶解的Vero E6细胞重悬于生长培养基中，并以每孔20,000个细胞在96孔板中铺板，1小时后用先前制备的合成的SARS2诱饵mRNA-脂质复合物(每孔将0.3μL的lipofectamine MessengerMAXTM试剂和100ng相关mRNA预混合)预孵育培养物。EGFP mRNA-脂质复合物被用作监测转染效力的阳性对照(所有mRNA来自TriLink BioTechnologies)。用单独的转染试剂(媒介物)处理的培养物用作噬斑减少测定的阴性对照。
SARS2诱饵mRNA和对照的抑制作用将在96孔板中的孔中一式三份地测试。在孵育6-12小时后，吸取培养基，并将100μL病毒以100PFU/孔的滴度添加到每个孔。在孵育1小时后，吸取病毒接种物，并将添加含有标准维持培养基的CMC-覆盖物。在培养3天后，固定平板并用结晶紫染色，并对噬斑数目进行目测计数。每个孔中的噬斑的抑制％按先前描述的确定。
实施例5-感染了IBCoV和PSCT的鸡的死亡率
合成了针对禽类感染性支气管炎CoV(IBCoV)的PSCT。
用IB CoV感染20只鸡。
在表现出疾病症状之前和/或之后，向10只鸡施用PSCT。
十只鸡或者未被处理，或者用不能被包装成病毒颗粒的对照转录物处理。
比较了两组之间的由病毒感染诱导的鸡的死亡率。
实施例6-感染了MHV的小鼠的死亡率
合成了针对鼠CoV(MHV)的PSCT。
用MHV感染20只小鼠。
在表现出疾病症状之前和/或之后，向10只小鼠施用PSCT。
十只小鼠或者未被处理，或者用不能被包装成病毒颗粒的对照转录物处理。
比较了两组之间的由病毒感染诱导的小鼠的死亡率。
虽然已经说明和描述了本发明的某些实施方案，但是很明显，本发明不限于本文描述的实施方案。不偏离如所附权利要求书所描述的本发明的精神和范围的许多修改、改变、变化、替代和等同物对于本领域技术人员将是明显的。
序列表
<110> 堤乐哈修门医学研究基础建设及服务有限公司
<120> 用于治疗ssRNA病毒感染的诱饵转录物
<130> TSH/002
<160> 13
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 10735
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)
<400> 1
agttgttagt ctacgtggac cgacaagaac agtttcgaat cggaagcttg cttaacgtag 60
ttctaacagt tttttattag agagcagatc tctgatgaac aaccaacgga aaaagacggg 120
tcgaccgtct ttcaatatgc tgaaacgcgc gagaaaccgc gtgtcaactg tttcacagtt 180
ggcgaagaga ttctcaaaag gattgctttc aggccaagga cccatgaaat tggtgatggc 240
ttttatagca ttcctaagat ttctagccat acctccaaca gcaggaattt tggctagatg 300
gggctcattc aagaagaatg gagcgatcaa agtgttacgg ggtttcaaga aagaaatctc 360
aaacatgttg aacataatga acaggaggaa aagatctgtg accatgctcc tcatgctgct 420
gcccacagcc ctggcgttcc atctgaccac ccgaggggga gagccgcaca tgatagttag 480
caagcaggaa agaggaaaat cacttttgtt taagacctct gcaggtgtca acatgtgcac 540
ccttattgca atggatttgg gagagttatg tgaggacaca atgacctaca aatgcccccg 600
gatcactgag acggaaccag atgacgttga ctgttggtgc aatgccacgg agacatgggt 660
gacctatgga acatgttctc aaactggtga acaccgacga gacaaacgtt ccgtcgcact 720
ggcaccacac gtagggcttg gtctagaaac aagaaccgaa acgtggatgt cctctgaagg 780
cgcttggaaa caaatacaaa aagtggagac ctgggctctg agacacccag gattcacggt 840
gatagccctt tttctagcac atgccatagg aacatccatc acccagaaag ggatcatttt 900
tattttgctg atgctggtaa ctccatccat ggccatgcgg tgcgtgggaa taggcaacag 960
agacttcgtg gaaggactgt caggagctac gtgggtggat gtggtactgg agcatggaag 1020
ttgcgtcact accatggcaa aagacaaacc aacactggac attgaactct tgaagacgga 1080
ggtcacaaac cctgccgtcc tgcgcaaact gtgcattgaa gctaaaatat caaacaccac 1140
caccgattcg agatgtccaa cacaaggaga agccacgctg gtggaagaac aggacacgaa 1200
ctttgtgtgt cgacgaacgt tcgtggacag aggctggggc aatggttgtg ggctattcgg 1260
aaaaggtagc ttaataacgt gtgctaagtt taagtgtgtg acaaaactgg aaggaaagat 1320
agtccaatat gaaaacttaa aatattcagt gatagtcacc gtacacactg gagaccagca 1380
ccaagttgga aatgagacca cagaacatgg aacaactgca accataacac ctcaagctcc 1440
cacgtcggaa atacagctga cagactacgg agctctaaca ttggattgtt cacctagaac 1500
agggctagac tttaatgaga tggtgttgtt gacaatgaaa aaaaaatcat ggctcgtcca 1560
caaacaatgg tttctagact taccactgcc ttggacctcg ggggcttcaa catcccaaga 1620
gacttggaat agacaagact tgctggtcac atttaagaca gctcatgcaa aaaagcagga 1680
agtagtcgta ctaggatcac aagaaggagc aatgcacact gcgttgactg gagcgacaga 1740
aatccaaacg tctggaacga caacaatttt tgcaggacac ctgaaatgca gattaaaaat 1800
ggataaactg attttaaaag ggatgtcata tgtaatgtgc acagggtcat tcaagttaga 1860
gaaggaagtg gctgagaccc agcatggaac tgttctagtg caggttaaat acgaaggaac 1920
agatgcacca tgcaagatcc ccttctcgtc ccaagatgag aagggagtaa cccagaatgg 1980
gagattgata acagccaacc ccatagtcac tgacaaagaa aaaccagtca acattgaagc 2040
ggagccacct tttggtgaga gctacattgt ggtaggagca ggtgaaaaag ctttgaaact 2100
aagctggttc aagaagggaa gcagtatagg gaaaatgttt gaagcaactg cccgtggagc 2160
acgaaggatg gccatcctgg gagacactgc atgggacttc ggttctatag gaggggtgtt 2220
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cggtgtttct tggaccatga agataggaat agggattctg ctgacatggc taggattaaa 2340
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aggagtcatg gttcaggcgg actcgggatg tgtaatcaac tggaaaggca gagaactcaa 2460
atgtggaagc ggcatttttg tcaccaatga agtccacacc tggacagagc aatataaatt 2520
ccaggccgac tcccctaaga gactatcagc ggccattggg aaggcatggg aggagggtgt 2580
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gtggaaaagc tggggaaaag ccaaaatcat aggagcagat gtacagaata ccaccttcat 2820
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ccatgctgac atggggtact ggatagaaag tgaaaagaac gagacttgga agttggcaag 3060
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tggagtcctg gaaagtgaga tgataatccc aaagatatat ggaggaccaa tatctcagca 3180
caactacaga ccaggatatt tcacacaaac agcagggccg tggcacttgg gcaagttaga 3240
actagatttt gatttatgtg aaggtaccac tgttgttgtg gatgaacatt gtggaaatcg 3300
aggaccatct cttagaacca caacagtcac aggaaagaca atccatgaat ggtgctgtag 3360
atcttgcacg ttaccccccc tacgtttcaa aggagaagac gggtgctggt acggcatgga 3420
aatcagacca gtcaaggaga aggaagagaa cctagttaag tcaatggtct ctgcagggtc 3480
aggagaagtg gacagttttt cactaggact gctatgcata tcaataatga tcgaagaggt 3540
aatgagatcc agatggagca gaaaaatgct gatgactgga acattggctg tgttcctcct 3600
tctcacaatg ggacaattga catggaatga tctgatcagg ctatgtatca tggttggagc 3660
caacgcttca gacaagatgg ggatgggaac aacgtaccta gctttgatgg ccactttcag 3720
aatgagacca atgttcgcag tcgggctact gtttcgcaga ttaacatcta gagaagttct 3780
tcttcttaca gttggattga gtctggtggc atctgtagaa ctaccaaatt ccttagagga 3840
gctaggggat ggacttgcaa tgggcatcat gatgttgaaa ttactgactg attttcagtc 3900
acatcagcta tgggctacct tgctgtcttt aacatttgtc aaaacaactt tttcattgca 3960
ctatgcatgg aagacaatgg ctatgatact gtcaattgta tctctcttcc ctttatgcct 4020
gtccacgact tctcaaaaaa caacatggct tccggtgttg ctgggatctc ttggatgcaa 4080
accactaacc atgtttctta taacagaaaa caaaatctgg ggaaggaaaa gctggcctct 4140
caatgaagga attatggctg ttggaatagt tagcattctt ctaagttcac ttctcaagaa 4200
tgatgtgcca ctagctggcc cactaatagc tggaggcatg ctaatagcat gttatgtcat 4260
atctggaagc tcggccgatt tatcactgga gaaagcggct gaggtctcct gggaagaaga 4320
agcagaacac tctggtgcct cacacaacat actagtggag gtccaagatg atggaaccat 4380
gaagataaag gatgaagaga gagatgacac actcaccatt ctcctcaaag caactctgct 4440
agcaatctca ggggtatacc caatgtcaat accggcgacc ctctttgtgt ggtatttttg 4500
gcagaaaaag aaacagagat caggagtgct atgggacaca cccagccctc cagaagtgga 4560
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tcaagtagga gtaggagttt ttcaagaagg cgtgttccac acaatgtggc acgtcaccag 4680
gggagctgtc ctcatgtacc aagggaagag actggaacca agttgggcca gtgtcaaaaa 4740
agacttgatc tcatatggag gaggttggag gtttcaagga tcctggaacg cgggagaaga 4800
agtgcaggtg attgctgttg aaccggggaa gaaccccaaa aatgtacaga cagcgccggg 4860
taccttcaag acccctgaag gcgaagttgg agccatagct ctagacttta aacccggcac 4920
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ggtgacaaca agtggtacct acgtcagtgc catagctcaa gctaaagcat cacaagaagg 5040
gcctctacca gagattgagg acgaggtgtt taggaaaaga aacttaacaa taatggacct 5100
acatccagga tcgggaaaaa caagaagata ccttccagcc atagtccgtg aggccataaa 5160
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ggcgctcaag ggaatgccaa taaggtatca gacaacagca gtgaagagtg aacacacggg 5280
aaaggagata gttgacctta tgtgtcacgc cactttcact atgcgtctcc tgtctcctgt 5340
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cgccgcccag aggagaggaa gaattggaag gaaccaaaat aaggaaggcg atcagtatat 5940
ttacatggga cagcctctaa acaatgatga ggaccacgcc cattggacag aagcaaaaat 6000
gctccttgac aacataaaca caccagaagg gattatccca gccctctttg agccggagag 6060
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ccgctggctg gatgccagaa catactctga cccactggct ctgcgcgaat tcaaagagtt 6360
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acaaggagga aaagcctata gacacgccat ggaagaacta ccagacacca tagaaacgtt 6540
aatgctccta gctttgatag ctgtgctgac tggtggagtg acgttgttct tcctatcagg 6600
aaggggtcta ggaaaaacat ccattggcct actctgcgtg attgcctcaa gtgcactgtt 6660
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tgctgcaatg ctggacgtag acctacatcc agcttcagcc tggactctct atgcagtggc 6960
cacaacaatt atcactccca tgatgagaca cacaattgaa aacacaacgg caaatatttc 7020
cctgacagct attgcaaacc aggcagctat attgatggga cttgacaagg gatggccaat 7080
atcaaagatg gacataggag ttccacttct cgccttgggg tgctattctc aggtgaaccc 7140
gctgacgctg acagcggcgg tattgatgct agtggctcat tatgccataa ttggacccgg 7200
actgcaagca aaagctacta gagaagctca aaaaaggaca gcagccggaa taatgaaaaa 7260
cccaactgtc gacgggatcg ttgcaataga tttggaccct gtggtttacg atgcaaaatt 7320
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gagaggaacg gccaaactga ggtggtttgt ggagaggaac cttgtgaaac cagaagggaa 7800
agtcatagac ctcggttgtg gaagaggtgg ctggtcatat tattgcgctg ggctgaagaa 7860
agtcacagaa gtgaaaggat acacgaaagg aggacctgga catgaggaac caatcccaat 7920
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gcaaagaaaa catggaggaa tgctagtgcg aaatccactc tcaagaaact ccactcatga 8220
aatgtactgg gtttcatgtg gaacaggaaa cattgtgtca gcagtaaaca tgacatctag 8280
aatgctgcta aatcgattca caatggctca caggaagcca acatatgaaa gagacgtgga 8340
cttaggcgct ggaacaagac atgtggcagt agaaccagag gtggccaacc tagatatcat 8400
tggccagagg atagagaata taaaaaatga acacaaatca acatggcatt atgatgagga 8460
caatccatac aaaacatggg cctatcatgg atcatatgag gtcaagccat caggatcagc 8520
ctcatccatg gtcaatggtg tggtgagact gctaaccaaa ccatgggatg tcattcccat 8580
ggtcacacaa atagccatga ctgacaccac accctttgga caacagaggg tgtttaaaga 8640
gaaagttgac acgcgtacac caaaagcgaa acgaggcaca gcacaaatta tggaggtgac 8700
agccaggtgg ttatggggtt ttctctctag aaacaaaaaa cccagaatct gcacaagaga 8760
ggagttcaca agaaaagtca ggtcaaacgc agctattgga gcagtgttcg ttgatgaaaa 8820
tcaatggaac tcagcaaaag aggcagtgga agatgaacgg ttctgggacc ttgtgcacag 8880
agagagggag cttcataaac aaggaaaatg tgccacgtgt gtctacaaca tgatgggaaa 8940
gagagagaaa aaattaggag agttcggaaa ggcaaaagga agtcgcgcaa tatggtacat 9000
gtggttggga gcgcgctttt tagagtttga agcccttggt ttcatgaatg aagatcactg 9060
gttcagcaga gagaattcac tcagtggagt ggaaggagaa ggactccaca aacttggata 9120
catactcaga gacatatcaa agattccagg gggaaatatg tatgcagatg acacagccgg 9180
atgggacaca agaataacag aggatgatct tcagaatgag gccaaaatca ctgacatcat 9240
ggaacctgaa catgccctat tggccacgtc aatctttaag ctaacctacc aaaacaaggt 9300
agtaagggtg cagagaccag cgaaaaatgg aaccgtgatg gatgtcatat ccagacgtga 9360
ccagagagga agtggacagg ttggaaccta tggcttaaac accttcacca acatggaggc 9420
ccaactaata agacaaatgg agtctgaggg aatcttttca cccagcgaat tggaaacccc 9480
aaatctagcc gaaagagtcc tcgactggtt gaaaaaacat ggcaccgaga ggctgaaaag 9540
aatggcaatc agtggagatg actgtgtggt gaaaccaatc gatgacagat ttgcaacagc 9600
cttaacagct ttgaatgaca tgggaaaggt aagaaaagac ataccgcaat gggaaccttc 9660
aaaaggatgg aatgattggc aacaagtgcc tttctgttca caccatttcc accagctgat 9720
tatgaaggat gggagggaga tagtggtgcc atgccgcaac caagatgaac ttgtaggtag 9780
ggccagagta tcacaaggcg ccggatggag cttgagagaa actgcatgcc taggcaagtc 9840
atatgcacaa atgtggcagc tgatgtactt ccacaggaga gacttgagat tagcggctaa 9900
tgctatctgt tcagccgttc cagttgattg ggtcccaacc agccgcacca cctggtcgat 9960
ccatgcccac catcaatgga tgacaacaga agacatgttg tcagtgtgga atagggtttg 10020
gatagaggaa aacccatgga tggaggacaa gactcatgtg tccagttggg aagacgttcc 10080
atacctagga aaaagggaag atcaatggtg tggttcccta ataggcttaa cagcacgagc 10140
cacctgggcc accaacatac aagtggccat aaaccaagtg agaaggctca ttgggaatga 10200
gaattatcta gacttcatga catcaatgaa gagattcaaa aacgagagtg atcccgaagg 10260
ggcactctgg taagccaact cattcacaaa ataaaggaaa ataaaaaatc aaacaaggca 10320
agaagtcagg ccggattaag ccatagcacg gtaagagcta tgctgcctgt gagccccgtc 10380
caaggacgta aaatgaagtc aggccgaaag ccacggttcg agcaagccgt gctgcctgta 10440
gctccatcgt ggggatgtaa aaacccggga ggctgcaaac catggaagct gtacgcatgg 10500
ggtagcagac tagtggttag aggagacccc tcccaagaca caacgcagca gcggggccca 10560
acaccagggg aagctgtacc ctggtggtaa ggactagagg ttagaggaga ccccccgcac 10620
aacaacaaac agcatattga cgctgggaga gaccagagat cctgctgtct ctacagcatc 10680
attccaggca cagaacgcca aaaaatggaa tggtgctgtt gaatcaacag gttct 10735
<210> 2
<211> 1441
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)来源的序列
<400> 2
auuaaagguu uauaccuucc cagguaacaa accaaccaac uuucgaucuc uuguagaucu 60
guucucuaaa cgaacuuuaa aaucugugug gcugucacuc ggcugcaugc uuagugcacu 120
cacgcaguau aauuaauaac uaauuacugu cguugacagg acacgaguaa cucgucuauc 180
uucugcaggc ugcuuacggu uucguccgug uugcagccga ucaucagcac aucuagguuu 240
cguccgggug ugaccgaaag guaagaugga gagccuuguc ccugguuuca acgagaaaac 300
acacguccaa cucaguuugc cuguuuuaca gguucgcgac gugcucguac guggcuuugg 360
agacuccgug gaggaggucu uaucagaggc acgucaacau cuuaaagaug gcacuugugg 420
cuuaguagaa guugaaaaag gcguuuugcc ucaacuugaa cagcccuaug uguucuagau 480
agauaggaca cuuugaugga caacagggug aaguaccagu uucuaucauu aauaacacug 540
uuuacacaaa aguugauggu guugauguag aauuguuuga aaauaaaaca acauuaccug 600
uuaauguagc auuugagcuu ugggcuaagc gcaacauuaa accaguacca gaggugaaaa 660
uacucaauaa uuugggugug gacauugcug cuaauacugu gaucugggac uacaaaagag 720
augcuccagc acauauaucu acuauuggug uuuguucuau gacugacaua gccaagaaac 780
caacugaaac gauuugugca ccacucacug ucuuuuuuga ugguagaguu gauggucaag 840
uagacuuauu uagaaaugcc cguaauggug uucuuauuac agaagguagu guuaaagguu 900
uacaaccauc uguagguccc aaacaagcua gucuuaaugg agucacauua auuggagaag 960
ccguaaaaac acaguucaau uauuauaaga aaguugaugg uguuguccaa caauuaccug 1020
aaacuuacuu uacucagagu agaaauuuac aagaauuuaa acccaggagu caaauggaaa 1080
uugauuucuu agaauuagcu auggaugaau ucauugaacg guauaaauua gaaggcuaug 1140
ccuucgaaca uaucguuuau ggagauuuua gucauaguca guuagguggu uuacaucuac 1200
ugauuggacu agcaaucuca cauagcaauc uuuaaucagu guguaacauu agggaggacu 1260
ugaaagagcc accacauuuu caccgaggcc acgcggagua cgaucgagug uacagugaac 1320
aaugcuaggg agagcugccu auauggaaga gcccuaaugu guaaaauuaa uuuuaguagu 1380
gcuaucccca ugugauuuua auagcuucuu aggagaauga caaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440
a 1441
<210> 3
<211> 475
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)来源的序列
<400> 3
auuaaagguu uauaccuucc cagguaacaa accaaccaac uuucgaucuc uuguagaucu 60
guucucuaaa cgaacuuuaa aaucugugug gcugucacuc ggcugcaugc uuagugcacu 120
cacgcaguau aauuaauaac uaauuacugu cguugacagg acacgaguaa cucgucuauc 180
uucugcaggc ugcuuacggu uucguccgug uugcagccga ucaucagcac aucuagguuu 240
cguccgggug ugaccgaaag guaagaugga gagccuuguc ccugguuuca acgagaaaac 300
acacguccaa cucaguuugc cuguuuuaca gguucgcgac gugcucguac guggcuuugg 360
agacuccgug gaggaggucu uaucagaggc acgucaacau cuuaaagaug gcacuugugg 420
cuuaguagaa guugaaaaag gcguuuugcc ucaacuugaa cagcccuaug uguuc 475
<210> 4
<211> 727
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)来源的序列
<400> 4
gacacuuuga uggacaacag ggugaaguac caguuucuau cauuaauaac acuguuuaca 60
caaaaguuga ugguguugau guagaauugu uugaaaauaa aacaacauua ccuguuaaug 120
uagcauuuga gcuuugggcu aagcgcaaca uuaaaccagu accagaggug aaaauacuca 180
auaauuuggg uguggacauu gcugcuaaua cugugaucug ggacuacaaa agagaugcuc 240
cagcacauau aucuacuauu gguguuuguu cuaugacuga cauagccaag aaaccaacug 300
aaacgauuug ugcaccacuc acugucuuuu uugaugguag aguugauggu caaguagacu 360
uauuuagaaa ugcccguaau gguguucuua uuacagaagg uaguguuaaa gguuuacaac 420
caucuguagg ucccaaacaa gcuagucuua auggagucac auuaauugga gaagccguaa 480
aaacacaguu caauuauuau aagaaaguug augguguugu ccaacaauua ccugaaacuu 540
acuuuacuca gaguagaaau uuacaagaau uuaaacccag gagucaaaug gaaauugauu 600
ucuuagaauu agcuauggau gaauucauug aacgguauaa auuagaaggc uaugccuucg 660
aacauaucgu uuauggagau uuuagucaua gucaguuagg ugguuuacau cuacugauug 720
gacuagc 727
<210> 5
<211> 228
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)来源的序列
<400> 5
aaucucacau agcaaucuuu aaucagugug uaacauuagg gaggacuuga aagagccacc 60
acauuuucac cgaggccacg cggaguacga ucgaguguac agugaacaau gcuagggaga 120
gcugccuaua uggaagagcc cuaaugugua aaauuaauuu uaguagugcu auccccaugu 180
gauuuuaaua gcuucuuagg agaaugacaa aaaaaaaaaa aaaaaaaa 228
<210> 6
<211> 1441
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)来源的序列
<400> 6
auuaaagguu uauaccuucc cagguaacaa accaaccaac uuucgaucuc uuguagaucu 60
guucucuaaa cgaacuuuaa aaucugugug gcugucacuc ggcugcaugc uuagugcacu 120
cacgcaguau aauuaauaac uaauuacugu cguugacagg acacgaguaa cucgucuauc 180
uucugcaggc ugcuuacggu uucguccgug uugcagccga ucaucagcac aucuagguuu 240
cguccgggug ugaccgaaag guaagaugga gagccuuguc ccugguuuca acgagaaaac 300
acacguccaa cucaguuugc cuguuuuaca gguucgcgac gugcucguac guggcuuugg 360
agacuccgug gaggaggucu uaucagaggc acgucaacau cuuaaagaug gcacuugugg 420
cuuaguagaa guugaaaaag gcguuuugcc ucaacuugaa cagcccuaug uguucuagau 480
agauaggaca cuuugaugga caacagggug aaguaccagu uucuaucauu aauaacacug 540
uuuacacaaa aguugauggu guugauguag aauuguuuga aaauaaaaca acauuaccug 600
uuaauguagc auuugagcuu ugggcuaagc gcaacauuaa accaguacca gaggugaaaa 660
uacucaauaa uuugggugug gacauugcug cuaauacugu gaucugggac uacaaaagag 720
augcuccagc acauauaucu acuauuggug uuuguucuau gacugacaua gccaagaaac 780
caacugaaac gauuugugca ccacucacug ucuuuuuuga ugguagaguu gauggucaag 840
uagacuuauu uagaaaugcc cguaauggug uucuuauuac agaagguagu guuaaagguu 900
uacaaccauc uguagguccc aaacaagcua gucuuaaugg agucacauua auuggagaag 960
ccguaaaaac acaguucaau uauuauaaga aaguugaugg uguuguccaa caauuaccug 1020
aaacuuacuu uacucagagu agaaauuuac aagaauuuaa acccaggagu caaauggaaa 1080
uugauuucuu agaauuagcu auggaugaau ucauugaacg guauaaauua gaaggcuaug 1140
ccuucgaaca uaucguuuau ggagauuuua gucauaguca guuagguggu uuacaucuac 1200
ugauuggacu agcaaucuca cauagcaauc uuuaaucagu guguaacauu agggaggacu 1260
ugaaagagcc accacauuuu caccgaggcc acgcggagua cgaucgagug uacagugaac 1320
aaugcuaggg agagcugccu auauggaaga gcccuaaugu guaaaauuaa uuuuaguagu 1380
gcuaucccca ugugauuuua auagcuucuu aggagaauga caaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440
a 1441
<210> 7
<211> 475
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)来源的序列
<400> 7
auuaaagguu uauaccuucc cagguaacaa accaaccaac uuucgaucuc uuguagaucu 60
guucucuaaa cgaacuuuaa aaucugugug gcugucacuc ggcugcaugc uuagugcacu 120
cacgcaguau aauuaauaac uaauuacugu cguugacagg acacgaguaa cucgucuauc 180
uucugcaggc ugcuuacggu uucguccgug uugcagccga ucaucagcac aucuagguuu 240
cguccgggug ugaccgaaag guaagaugga gagccuuguc ccugguuuca acgagaaaac 300
acacguccaa cucaguuugc cuguuuuaca gguucgcgac gugcucguac guggcuuugg 360
agacuccgug gaggaggucu uaucagaggc acgucaacau cuuaaagaug gcacuugugg 420
cuuaguagaa guugaaaaag gcguuuugcc ucaacuugaa cagcccuaug uguuc 475
<210> 8
<211> 11
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 终止密码子
<400> 8
uagauagaua g 11
<210> 9
<211> 29751
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<220>
<223> SARS冠状病毒，全基因组
<400> 9
atattaggtt tttacctacc caggaaaagc caaccaacct cgatctcttg tagatctgtt 60
ctctaaacga actttaaaat ctgtgtagct gtcgctcggc tgcatgccta gtgcacctac 120
gcagtataaa caataataaa ttttactgtc gttgacaaga aacgagtaac tcgtccctct 180
tctgcagact gcttacggtt tcgtccgtgt tgcagtcgat catcagcata cctaggtttc 240
gtccgggtgt gaccgaaagg taagatggag agccttgttc ttggtgtcaa cgagaaaaca 300
cacgtccaac tcagtttgcc tgtccttcag gttagagacg tgctagtgcg tggcttcggg 360
gactctgtgg aagaggccct atcggaggca cgtgaacacc tcaaaaatgg cacttgtggt 420
ctagtagagc tggaaaaagg cgtactgccc cagcttgaac agccctatgt gttcattaaa 480
cgttctgatg ccttaagcac caatcacggc cacaaggtcg ttgagctggt tgcagaaatg 540
gacggcattc agtacggtcg tagcggtata acactgggag tactcgtgcc acatgtgggc 600
gaaaccccaa ttgcataccg caatgttctt cttcgtaaga acggtaataa gggagccggt 660
ggtcatagct atggcatcga tctaaagtct tatgacttag gtgacgagct tggcactgat 720
cccattgaag attatgaaca aaactggaac actaagcatg gcagtggtgc actccgtgaa 780
ctcactcgtg agctcaatgg aggtgcagtc actcgctatg tcgacaacaa tttctgtggc 840
ccagatgggt accctcttga ttgcatcaaa gattttctcg cacgcgcggg caagtcaatg 900
tgcactcttt ccgaacaact tgattacatc gagtcgaaga gaggtgtcta ctgctgccgt 960
gaccatgagc atgaaattgc ctggttcact gagcgctctg ataagagcta cgagcaccag 1020
acacccttcg aaattaagag tgccaagaaa tttgacactt tcaaagggga atgcccaaag 1080
tttgtgtttc ctcttaactc aaaagtcaaa gtcattcaac cacgtgttga aaagaaaaag 1140
actgagggtt tcatggggcg tatacgctct gtgtaccctg ttgcatctcc acaggagtgt 1200
aacaatatgc acttgtctac cttgatgaaa tgtaatcatt gcgatgaagt ttcatggcag 1260
acgtgcgact ttctgaaagc cacttgtgaa cattgtggca ctgaaaattt agttattgaa 1320
ggacctacta catgtgggta cctacctact aatgctgtag tgaaaatgcc atgtcctgcc 1380
tgtcaagacc cagagattgg acctgagcat agtgttgcag attatcacaa ccactcaaac 1440
attgaaactc gactccgcaa gggaggtagg actagatgtt ttggaggctg tgtgtttgcc 1500
tatgttggct gctataataa gcgtgcctac tgggttcctc gtgctagtgc tgatattggc 1560
tcaggccata ctggcattac tggtgacaat gtggagacct tgaatgagga tctccttgag 1620
atactgagtc gtgaacgtgt taacattaac attgttggcg attttcattt gaatgaagag 1680
gttgccatca ttttggcatc tttctctgct tctacaagtg cctttattga cactataaag 1740
agtcttgatt acaagtcttt caaaaccatt gttgagtcct gcggtaacta taaagttacc 1800
aagggaaagc ccgtaaaagg tgcttggaac attggacaac agagatcagt tttaacacca 1860
ctgtgtggtt ttccctcaca ggctgctggt gttatcagat caatttttgc gcgcacactt 1920
gatgcagcaa accactcaat tcctgatttg caaagagcag ctgtcaccat acttgatggt 1980
atttctgaac agtcattacg tcttgtcgac gccatggttt atacttcaga cctgctcacc 2040
aacagtgtca ttattatggc atatgtaact ggtggtcttg tacaacagac ttctcagtgg 2100
ttgtctaatc ttttgggcac tactgttgaa aaactcaggc ctatctttga atggattgag 2160
gcgaaactta gtgcaggagt tgaatttctc aaggatgctt gggagattct caaatttctc 2220
attacaggtg tttttgacat cgtcaagggt caaatacagg ttgcttcaga taacatcaag 2280
gattgtgtaa aatgcttcat tgatgttgtt aacaaggcac tcgaaatgtg cattgatcaa 2340
gtcactatcg ctggcgcaaa gttgcgatca ctcaacttag gtgaagtctt catcgctcaa 2400
agcaagggac tttaccgtca gtgtatacgt ggcaaggagc agctgcaact actcatgcct 2460
cttaaggcac caaaagaagt aacctttctt gaaggtgatt cacatgacac agtacttacc 2520
tctgaggagg ttgttctcaa gaacggtgaa ctcgaagcac tcgagacgcc cgttgatagc 2580
ttcacaaatg gagctatcgt tggcacacca gtctgtgtaa atggcctcat gctcttagag 2640
attaaggaca aagaacaata ctgcgcattg tctcctggtt tactggctac aaacaatgtc 2700
tttcgcttaa aagggggtgc accaattaaa ggtgtaacct ttggagaaga tactgtttgg 2760
gaagttcaag gttacaagaa tgtgagaatc acatttgagc ttgatgaacg tgttgacaaa 2820
gtgcttaatg aaaagtgctc tgtctacact gttgaatccg gtaccgaagt tactgagttt 2880
gcatgtgttg tagcagaggc tgttgtgaag actttacaac cagtttctga tctccttacc 2940
aacatgggta ttgatcttga tgagtggagt gtagctacat tctacttatt tgatgatgct 3000
ggtgaagaaa acttttcatc acgtatgtat tgttcctttt accctccaga tgaggaagaa 3060
gaggacgatg cagagtgtga ggaagaagaa attgatgaaa cctgtgaaca tgagtacggt 3120
acagaggatg attatcaagg tctccctctg gaatttggtg cctcagctga aacagttcga 3180
gttgaggaag aagaagagga agactggctg gatgatacta ctgagcaatc agagattgag 3240
ccagaaccag aacctacacc tgaagaacca gttaatcagt ttactggtta tttaaaactt 3300
actgacaatg ttgccattaa atgtgttgac atcgttaagg aggcacaaag tgctaatcct 3360
atggtgattg taaatgctgc taacatacac ctgaaacatg gtggtggtgt agcaggtgca 3420
ctcaacaagg caaccaatgg tgccatgcaa aaggagagtg atgattacat taagctaaat 3480
ggccctctta cagtaggagg gtcttgtttg ctttctggac ataatcttgc taagaagtgt 3540
ctgcatgttg ttggacctaa cctaaatgca ggtgaggaca tccagcttct taaggcagca 3600
tatgaaaatt tcaattcaca ggacatctta cttgcaccat tgttgtcagc aggcatattt 3660
ggtgctaaac cacttcagtc tttacaagtg tgcgtgcaga cggttcgtac acaggtttat 3720
attgcagtca atgacaaagc tctttatgag caggttgtca tggattatct tgataacctg 3780
aagcctagag tggaagcacc taaacaagag gagccaccaa acacagaaga ttccaaaact 3840
gaggagaaat ctgtcgtaca gaagcctgtc gatgtgaagc caaaaattaa ggcctgcatt 3900
gatgaggtta ccacaacact ggaagaaact aagtttctta ccaataagtt actcttgttt 3960
gctgatatca atggtaagct ttaccatgat tctcagaaca tgcttagagg tgaagatatg 4020
tctttccttg agaaggatgc accttacatg gtaggtgatg ttatcactag tggtgatatc 4080
acttgtgttg taataccctc caaaaaggct ggtggcacta ctgagatgct ctcaagagct 4140
ttgaagaaag tgccagttga tgagtatata accacgtacc ctggacaagg atgtgctggt 4200
tatacacttg aggaagctaa gactgctctt aagaaatgca aatctgcatt ttatgtacta 4260
ccttcagaag cacctaatgc taaggaagag attctaggaa ctgtatcctg gaatttgaga 4320
gaaatgcttg ctcatgctga agagacaaga aaattaatgc ctatatgcat ggatgttaga 4380
gccataatgg caaccatcca acgtaagtat aaaggaatta aaattcaaga gggcatcgtt 4440
gactatggtg tccgattctt cttttatact agtaaagagc ctgtagcttc tattattacg 4500
aagctgaact ctctaaatga gccgcttgtc acaatgccaa ttggttatgt gacacatggt 4560
tttaatcttg aagaggctgc gcgctgtatg cgttctctta aagctcctgc cgtagtgtca 4620
gtatcatcac cagatgctgt tactacatat aatggatacc tcacttcgtc atcaaagaca 4680
tctgaggagc actttgtaga aacagtttct ttggctggct cttacagaga ttggtcctat 4740
tcaggacagc gtacagagtt aggtgttgaa tttcttaagc gtggtgacaa aattgtgtac 4800
cacactctgg agagccccgt cgagtttcat cttgacggtg aggttctttc acttgacaaa 4860
ctaaagagtc tcttatccct gcgggaggtt aagactataa aagtgttcac aactgtggac 4920
aacactaatc tccacacaca gcttgtggat atgtctatga catatggaca gcagtttggt 4980
ccaacatact tggatggtgc tgatgttaca aaaattaaac ctcatgtaaa tcatgagggt 5040
aagactttct ttgtactacc tagtgatgac acactacgta gtgaagcttt cgagtactac 5100
catactcttg atgagagttt tcttggtagg tacatgtctg ctttaaacca cacaaagaaa 5160
tggaaatttc ctcaagttgg tggtttaact tcaattaaat gggctgataa caattgttat 5220
ttgtctagtg ttttattagc acttcaacag cttgaagtca aattcaatgc accagcactt 5280
caagaggctt attatagagc ccgtgctggt gatgctgcta acttttgtgc actcatactc 5340
gcttacagta ataaaactgt tggcgagctt ggtgatgtca gagaaactat gacccatctt 5400
ctacagcatg ctaatttgga atctgcaaag cgagttctta atgtggtgtg taaacattgt 5460
ggtcagaaaa ctactacctt aacgggtgta gaagctgtga tgtatatggg tactctatct 5520
tatgataatc ttaagacagg tgtttccatt ccatgtgtgt gtggtcgtga tgctacacaa 5580
tatctagtac aacaagagtc ttcttttgtt atgatgtctg caccacctgc tgagtataaa 5640
ttacagcaag gtacattctt atgtgcgaat gagtacactg gtaactatca gtgtggtcat 5700
tacactcata taactgctaa ggagaccctc tatcgtattg acggagctca ccttacaaag 5760
atgtcagagt acaaaggacc agtgactgat gttttctaca aggaaacatc ttacactaca 5820
accatcaagc ctgtgtcgta taaactcgat ggagttactt acacagagat tgaaccaaaa 5880
ttggatgggt attataaaaa ggataatgct tactatacag agcagcctat agaccttgta 5940
ccaactcaac cattaccaaa tgcgagtttt gataatttca aactcacatg ttctaacaca 6000
aaatttgctg atgatttaaa tcaaatgaca ggcttcacaa agccagcttc acgagagcta 6060
tctgtcacat tcttcccaga cttgaatggc gatgtagtgg ctattgacta tagacactat 6120
tcagcgagtt tcaagaaagg tgctaaatta ctgcataagc caattgtttg gcacattaac 6180
caggctacaa ccaagacaac gttcaaacca aacacttggt gtttacgttg tctttggagt 6240
acaaagccag tagatacttc aaattcattt gaagttctgg cagtagaaga cacacaagga 6300
atggacaatc ttgcttgtga aagtcaacaa cccacctctg aagaagtagt ggaaaatcct 6360
accatacaga aggaagtcat agagtgtgac gtgaaaacta ccgaagttgt aggcaatgtc 6420
atacttaaac catcagatga aggtgttaaa gtaacacaag agttaggtca tgaggatctt 6480
atggctgctt atgtggaaaa cacaagcatt accattaaga aacctaatga gctttcacta 6540
gccttaggtt taaaaacaat tgccactcat ggtattgctg caattaatag tgttccttgg 6600
agtaaaattt tggcttatgt caaaccattc ttaggacaag cagcaattac aacatcaaat 6660
tgcgctaaga gattagcaca acgtgtgttt aacaattata tgccttatgt gtttacatta 6720
ttgttccaat tgtgtacttt tactaaaagt accaattcta gaattagagc ttcactacct 6780
acaactattg ctaaaaatag tgttaagagt gttgctaaat tatgtttgga tgccggcatt 6840
aattatgtga agtcacccaa attttctaaa ttgttcacaa tcgctatgtg gctattgttg 6900
ttaagtattt gcttaggttc tctaatctgt gtaactgctg cttttggtgt actcttatct 6960
aattttggtg ctccttctta ttgtaatggc gttagagaat tgtatcttaa ttcgtctaac 7020
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aatcgtgcca cacgcgttga gtgtacaact attgttaatg gcatgaagag atctttctat 7500
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catccgctct cccattttgt caatttagac aatttgagag ctaacaacac taaaggttca 7800
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acctataata aggttgaaaa catgacgccc agagatcttg gcgcatgtat tgactgtaat 8280
gcaaggcata tcaatgccca agtagcaaaa agtcacaatg tttcactcat ctggaatgta 8340
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gccacattat tgtgcgttct tgctgcattg gtttgttata tcgttatgcc agtacataca 8580
ttgtcaatcc atgatggtta cacaaatgaa atcattggtt acaaagccat tcaggatggt 8640
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gcatggttta gccagcgtgg tggttcatac aaaaatgaca aaagctgccc tgtagtagct 8760
gctatcatta caagagagat tggtttcata gtgcctggct taccgggtac tgtgctgaga 8820
gcaatcaatg gtgacttctt gcattttcta cctcgtgttt ttagtgctgt tggcaacatt 8880
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gctgctgagt gtacaatttt taaggatgct atgggcaaac ctgtgccata ttgttatgac 9000
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gtaacaactt ttgatgctga gtactgtaga catggtacat gcgaaaggtc agaagtaggt 9180
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gtgccttttt ggataacagc aatctatgta ttctgtattt ctctgaagca ctgccattgg 9660
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gagacactgt tgccacttac acagtataac aggtatcttg ctctatataa caagtacaag 9840
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gttgaagggt gcatggtaca agtaacctgt ggaactacaa ctcttaatgg attgtggttg 10080
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cttggtatta tggcaattgc tgcatgtgct atgctgcttg ttaagcataa gcacgcattc 11100
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acacttgttt acaaagtcta ctatggtaat gctttagatc aagctatttc catgtgggcc 11400
ttagttattt ctgtaacctc taactattct ggtgtcgtta cgactatcat gtttttagct 11460
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ttacagtgta tcatgcttgt ttattgtttc ttaggctatt gttgctgctg ctactttggc 11580
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tttccatcat taataatgct gtttacacaa aggtagatgg tattgatgtg gagatctttg 19680
aaaataagac aacacttcct gttaatgttg catttgagct ttgggctaag cgtaacatta 19740
aaccagtgcc agagattaag atactcaata atttgggtgt tgatatcgct gctaatactg 19800
taatctggga ctacaaaaga gaagccccag cacatgtatc tacaataggt gtctgcacaa 19860
tgactgacat tgccaagaaa cctactgaga gtgcttgttc ttcacttact gtcttgtttg 19920
atggtagagt ggaaggacag gtagaccttt ttagaaacgc ccgtaatggt gttttaataa 19980
cagaaggttc agtcaaaggt ctaacacctt caaagggacc agcacaagct agcgtcaatg 20040
gagtcacatt aattggagaa tcagtaaaaa cacagtttaa ctactttaag aaagtagacg 20100
gcattattca acagttgcct gaaacctact ttactcagag cagagactta gaggatttta 20160
agcccagatc acaaatggaa actgactttc tcgagctcgc tatggatgaa ttcatacagc 20220
gatataagct cgagggctat gccttcgaac acatcgttta tggagatttc agtcatggac 20280
aacttggcgg tcttcattta atgataggct tagccaagcg ctcacaagat tcaccactta 20340
aattagagga ttttatccct atggacagca cagtgaaaaa ttacttcata acagatgcgc 20400
aaacaggttc atcaaaatgt gtgtgttctg tgattgatct tttacttgat gactttgtcg 20460
agataataaa gtcacaagat ttgtcagtga tttcaaaagt ggtcaaggtt acaattgact 20520
atgctgaaat ttcattcatg ctttggtgta aggatggaca tgttgaaacc ttctacccaa 20580
aactacaagc aagtcaagcg tggcaaccag gtgttgcgat gcctaacttg tacaagatgc 20640
aaagaatgct tcttgaaaag tgtgaccttc agaattatgg tgaaaatgct gttataccaa 20700
aaggaataat gatgaatgtc gcaaagtata ctcaactgtg tcaatactta aatacactta 20760
ctttagctgt accctacaac atgagagtta ttcactttgg tgctggctct gataaaggag 20820
ttgcaccagg tacagctgtg ctcagacaat ggttgccaac tggcacacta cttgtcgatt 20880
cagatcttaa tgacttcgtc tccgacgcag attctacttt aattggagac tgtgcaacag 20940
tacatacggc taataaatgg gaccttatta ttagcgatat gtatgaccct aggaccaaac 21000
atgtgacaaa agagaatgac tctaaagaag ggtttttcac ttatctgtgt ggatttataa 21060
agcaaaaact agccctgggt ggttctatag ctgtaaagat aacagagcat tcttggaatg 21120
ctgaccttta caagcttatg ggccatttct catggtggac agcttttgtt acaaatgtaa 21180
atgcatcatc atcggaagca tttttaattg gggctaacta tcttggcaag ccgaaggaac 21240
aaattgatgg ctataccatg catgctaact acattttctg gaggaacaca aatcctatcc 21300
agttgtcttc ctattcactc tttgacatga gcaaatttcc tcttaaatta agaggaactg 21360
ctgtaatgtc tcttaaggag aatcaaatca atgatatgat ttattctctt ctggaaaaag 21420
gtaggcttat cattagagaa aacaacagag ttgtggtttc aagtgatatt cttgttaaca 21480
actaaacgaa catgtttatt ttcttattat ttcttactct cactagtggt agtgaccttg 21540
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tgaggggggt ttactatcct gatgaaattt ttagatcaga cactctttat ttaactcagg 21660
atttatttct tccattttat tctaatgtta cagggtttca tactattaat catacgtttg 21720
gcaaccctgt catacctttt aaggatggta tttattttgc tgccacagag aaatcaaatg 21780
ttgtccgtgg ttgggttttt ggttctacca tgaacaacaa gtcacagtcg gtgattatta 21840
ttaacaattc tactaatgtt gttatacgag catgtaactt tgaattgtgt gacaaccctt 21900
tctttgctgt ttctaaaccc atgggtacac agacacatac tatgatattc gataatgcat 21960
ttaattgcac tttcgagtac atatctgatg ccttttcgct tgatgtttca gaaaagtcag 22020
gtaattttaa acacttacga gagtttgtgt ttaaaaataa agatgggttt ctctatgttt 22080
ataagggcta tcaacctata gatgtagttc gtgatctacc ttctggtttt aacactttga 22140
aacctatttt taagttgcct cttggtatta acattacaaa ttttagagcc attcttacag 22200
ccttttcacc tgctcaagac atttggggca cgtcagctgc agcctatttt gttggctatt 22260
taaagccaac tacatttatg ctcaagtatg atgaaaatgg tacaatcaca gatgctgttg 22320
attgttctca aaatccactt gctgaactca aatgctctgt taagagcttt gagattgaca 22380
aaggaattta ccagacctct aatttcaggg ttgttccctc aggagatgtt gtgagattcc 22440
ctaatattac aaacttgtgt ccttttggag aggtttttaa tgctactaaa ttcccttctg 22500
tctatgcatg ggagagaaaa aaaatttcta attgtgttgc tgattactct gtgctctaca 22560
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tttgcttctc caatgtctat gcagattctt ttgtagtcaa gggagatgat gtaagacaaa 22680
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attataaata taggtatctt agacatggca agcttaggcc ctttgagaga gacatatcta 22860
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cattaaatga ttatggtttt tacaccacta ctggcattgg ctaccaacct tacagagttg 22980
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ctgaccttat taagaaccag tgtgtcaatt ttaattttaa tggactcact ggtactggtg 23100
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atttcactga ttccgttcga gatcctaaaa catctgaaat attagacatt tcaccttgcg 23220
cttttggggg tgtaagtgta attacacctg gaacaaatgc ttcatctgaa gttgctgttc 23280
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ttactacaga caatacattt gtctcaggaa attgtgatgt cgttattggc atcattaaca 24840
acacagttta tgatcctctg caacctgagc ttgactcatt caaagaagag ctggacaagt 24900
acttcaaaaa tcatacatca ccagatgttg atcttggcga catttcaggc attaacgctt 24960
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aatcactcat tgaccttcaa gaattgggaa aatatgagca atatattaaa tggccttggt 25080
atgtttggct cggcttcatt gctggactaa ttgccatcgt catggttaca atcttgcttt 25140
gttgcatgac tagttgttgc agttgcctca agggtgcatg ctcttgtggt tcttgctgca 25200
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cgaacttatg gatttgttta tgagattttt tactcttaga tcaattactg cacagccagt 25320
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agcctcactc cctttcggat ggcttgttat tggcgttgca tttcttgctg tttttcagag 25440
cgctaccaaa ataattgcgc tcaataaaag atggcagcta gccctttata agggcttcca 25500
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caacgcatgt agaattatta tgagatgttg gctttgttgg aagtgcaaat ccaagaaccc 25680
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aaaactcaaa gaagactacc aaattggtgg ttattctgag gataggcact caggtgttaa 25860
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tactaaaaga accttgccca tcaggaacat acgagggcaa ttcaccattt caccctcttg 27420
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gcgctgtgca tctaataaac ctcatgtgct tgaagatcct tgtaaggtac aacactaggg 27900
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ggcacactat ggttcaaaca tgcacaccta atgttactat caactgtcaa gatccagctg 28020
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ggggaccaag acctaatcag acaaggaact gattacaaac attggccgca aattgcacaa 29040
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gagcctaaaa aggacaaaaa gaaaaagact gatgaagctc agcctttgcc gcagagacaa 29280
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tactcttgtg cagaatgaat tctcgtaact aaacagcaca agtaggttta gttaacttta 29520
atctcacata gcaatcttta atcaatgtgt aacattaggg aggacttgaa agagccacca 29580
cattttcatc gaggccacgc ggagtacgat cgagggtaca gtgaataatg ctagggagag 29640
ctgcctatat ggaagagccc taatgtgtaa aattaatttt agtagtgcta tccccatgtg 29700
attttaatag cttcttagga gaatgacaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa a 29751
<210> 10
<211> 30119
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<220>
<223> 中东呼吸综合征冠状病毒，全基因组
<400> 10
gatttaagtg aatagcttgg ctatctcact tcccctcgtt ctcttgcaga actttgattt 60
taacgaactt aaataaaagc cctgttgttt agcgtatcgt tgcacttgtc tggtgggatt 120
gtggcattaa tttgcctgct catctaggca gtggacatat gctcaacact gggtataatt 180
ctaattgaat actatttttc agttagagcg tcgtgtctct tgtacgtctc ggtcacaata 240
cacggtttcg tccggtgcgt ggcaattcgg ggcacatcat gtctttcgtg gctggtgtga 300
ccgcgcaagg tgcgcgcggt acgtatcgag cagcgctcaa ctctgaaaaa catcaagacc 360
atgtgtctct aactgtgcca ctctgtggtt caggaaacct ggttgaaaaa ctttcaccat 420
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cacttctcta tgtgcccatc cggctggctg gacacactag acacctccca ggtcctcgtg 540
tgtacctggt tgagaggctc attgcttgtg aaaatccatt catggttaac caattggctt 600
atagctctag tgcaaatggc agcctggttg gcacaacttt gcagggcaag cctattggta 660
tgttcttccc ttatgacatc gaacttgtca caggaaagca aaatattctc ctgcgcaagt 720
atggccgtgg tggttatcac tacaccccat tccactatga gcgagacaac acctcttgcc 780
ctgagtggat ggacgatttt gaggcggatc ctaaaggcaa atatgcccag aatctgctta 840
agaagttgat tggcggtgat gtcactccag ttgaccaata catgtgtggc gttgatggaa 900
aacccattag tgcctacgca tttttaatgg ccaaggatgg aataaccaaa ctggctgatg 960
ttgaagcgga cgtcgcagca cgtgctgatg acgaaggctt catcacatta aagaacaatc 1020
tatatagatt ggtttggcat gttgagcgta aagacgttcc atatcctaag caatctattt 1080
ttactattaa tagtgtggtc caaaaggatg gtgttgaaaa cactcctcct cactatttta 1140
ctcttggatg caaaatttta acgctcaccc cacgcaacaa gtggagtggc gtttctgact 1200
tgtccctcaa acaaaaactc ctttacacct tctatggtaa ggagtcactt gagaacccaa 1260
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cagggaatgc tatccaaggg tttgcctgtg gatgtggggc atcatataca gctaatgatg 1380
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ttgctaaggg tgatagctgt tcttctaatt gcaaacattc agttgctcag ttggttagtt 1500
acctttctga acgctgtaat gttattgctg attctaagtc cttcacactt atctttggtg 1560
gcgtagctta cgcctacttt ggatgtgagg aaggtactat gtactttgtg cctagagcta 1620
agtctgttgt ctcaaggatt ggagactcca tctttacagg ctgtactggc tcttggaaca 1680
aggtcactca aattgctaac atgttcttgg aacagactca gcattccctt aactttgtgg 1740
gagagttcgt tgtcaacgat gttgtcctcg caattctctc tggaaccaca actaatgttg 1800
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cctttaagaa agttgcaacc ataccgtata aggtttgcaa ctctgttaag gatactctgg 2040
cttattatgc tcacagcgtg ttgtacagag tttttcctta tgacatggat tctggtgtgt 2100
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ttgctgttat ctacagcggc agggagtctc taatattccc atcgggaacc tattactgtg 2520
tcaccactaa ggctaagtcc gttcaacaag atcttgacgt tattttgcct ggtgagtttt 2580
ccaagaagca gttaggactg ctccaaccta ctgacaattc tacaactgtt agtgttactg 2640
tatccagtaa catggttgaa actgttgtgg gtcaacttga gcaaactaat atgcatagtc 2700
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aggttgctgc tgtaagaagt gttactgtcg agtacaacat tcatgctgta ttagacacac 2940
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ttgctgacgt agtaaaggaa caagtctcag acttgcttgt taaattactg cgtggaatgc 3060
cgattccaga ttttgattta gacgatttta ttgacgcacc atgctattgc tttaacgctg 3120
agggtgatgc atcctggtct tctactatga tcttctctct tcaccccgtc gagtgtgacg 3180
aggagtgttc tgaagtagag gcttcagatt tagaagaagg tgaatcagag tgcatttctg 3240
agacttcaac tgaacaagtt gacgtttctc atgagacttc tgacgacgag tgggctgctg 3300
cagttgatga agcgttccct ctcgatgaag cagaagatgt tactgaatct gtgcaagaag 3360
aagcacaacc agtagaagta cctgttgaag atattgcgca ggttgtcata gctgacacct 3420
tacaggaaac tcctgttgtg cctgatactg ttgaagtccc accgcaagtg gtgaaacttc 3480
cgtctgcacc tcagactatc cagcccgagg taaaagaagt tgcacctgtc tatgaggctg 3540
ataccgaaca gacacagaat gttactgtta aacctaagag gttacgcaaa aagcgtaatg 3600
ttgacccttt gtccaatttt gaacataagg ttattacaga gtgcgttacc atagttttag 3660
gtgacgcaat tcaagtagcc aagtgctatg gggagtctgt gttagttaat gctgctaaca 3720
cacatcttaa gcatggcggt ggtatcgctg gtgctattaa tgcggcttca aaaggggctg 3780
tccaaaaaga gtcagatgag tatattctgg ctaaagggcc gttacaagta ggagattcag 3840
ttctcttgca aggccattct ctagctaaga atatcctgca tgtcgtaggc ccagatgccc 3900
gcgctaaaca ggatgtttct ctccttagta agtgctataa ggctatgaat gcatatcctc 3960
ttgtagtcac tcctcttgtt tcagcaggca tatttggtgt aaaaccagct gtgtcttttg 4020
attatcttat tagggaggct aagactagag ttttagtcgt cgttaattcc caagatgtct 4080
ataagagtct taccatagtt gacattccac agagtttgac tttttcatat gatgggttac 4140
gtggcgcaat acgtaaagct aaagattatg gttttactgt ttttgtgtgc acagacaact 4200
ctgctaacac taaagttctt aggaacaagg gtgttgatta tactaagaag tttcttacag 4260
ttgacggtgt gcaatattat tgctacacgt ctaaggacac tttagatgat atcttacaac 4320
aggctaataa gtctgttggt attatatcta tgcctttggg atatgtgtct catggtttag 4380
acttaatgca agcagggagt gtcgtgcgta gagttaacgt gccctacgtg tgtctcctag 4440
ctaataaaga gcaagaagct attttgatgt ctgaagacgt taagttaaac ccttcagaag 4500
attttataaa gcacgtccgc actaatggtg gttacaattc ttggcattta gtcgagggtg 4560
aactattggt gcaagactta cgcttaaata agctcctgca ttggtctgat caaaccatat 4620
gctacaagga tagtgtgttt tatgttgtaa agaatagtac agcttttcca tttgaaacac 4680
tttcagcatg tcgtgcgtat ttggattcac gcacgacaca gcagttaaca atcgaagtct 4740
tagtgactgt cgatggtgta aattttagaa cagtcgttct aaataataag aacacttata 4800
gatcacagct tggatgcgtt ttctttaatg gtgctgatat ttctgacacc attcctgatg 4860
agaaacagaa tggtcacagt ttatatctag cagacaattt gactgctgat gaaacaaagg 4920
cgcttaaaga gttatatggc cccgttgatc ctactttctt acacagattc tattcactta 4980
aggctgcagt ccatgggtgg aagatggttg tgtgtgataa ggtacgttct ctcaaattga 5040
gtgataataa ttgttatctt aatgcagtta ttatgacact tgatttattg aaggacatta 5100
aatttgttat acctgctcta cagcatgcat ttatgaaaca taagggcggt gattcaactg 5160
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ctcggttact tcataccgtg cttgcaaagg ctgagttatg ctgttctgca cgcatggttt 5280
ggagagagtg gtgcaatgtc tgtggcataa aagatgttgt tctacaaggc ttaaaagctt 5340
gttgttacgt gggtgtgcaa actgttgaag atctgcgtgc tcgcatgaca tatgtatgcc 5400
agtgtggtgg tgaacgtcat cggcaattag tcgaacacac caccccctgg ttgctgctct 5460
caggcacacc aaatgaaaaa ttggtgacaa cctccacggc gcctgatttt gtagcattta 5520
atgtctttca gggcattgaa acggctgttg gccattatgt tcatgctcgc ctgaagggtg 5580
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tgacagatgt acttttcccc ggccaaaaat acagtagcga ttgtaatgtc gtacggtatt 5700
ctttggacgg taatttcaga acagaggttg atcccgacct atctgctttc tatgttaagg 5760
atggtaaata ctttacaagt gaaccacccg taacatattc accagctaca attttagctg 5820
gtagtgtcta cactaatagc tgccttgtat cgtctgatgg acaacctggc ggtgatgcta 5880
ttagtttgag ttttaataac cttttagggt ttgattctag taaaccagtc actaagaaat 5940
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atgaccctat ttataagaat ggtgccatgt ataaaggcaa accaattctt tgggtcaata 6060
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acgtagcccc cattgaactc gaaaataaat tcacaccttt gagtgtggag tctacaccag 6180
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agggtttaaa taaacctttc gtgaaggaca atgtcagttt cgttgctgat gattcaggta 6300
ctcccgttgt tgagtatctg tctaaagaag acctacatac attgtatgta gaccctaagt 6360
atcaagtcat tgtcttaaaa gacaatgtac tttcttctat gcttagattg cacaccgttg 6420
agtcaggtga tattaacgtt gttgcagctt ccggatcttt gacacgtaaa gtgaagttac 6480
tatttagggc ttcattttat ttcaaagaat ttgctacccg cactttcact gctaccactg 6540
ctgtaggtag ttgtataaag agtgtagtgc ggcatctagg tgttactaaa ggcatattga 6600
caggctgttt tagttttgcc aagatgttat ttatgcttcc actagcttac tttagtgatt 6660
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gtaatgttgt aaaacagtgt tgcactgctg ctgttgattt aagtatggat aagttgcgcc 6780
gtgtggattg gaaatcaacc ctacggttgt tacttatgtt atgcacaact atggtattgt 6840
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ctgcttgtga cggtcttgct tcagcttata gggcgaattc ctttgatgta cctacattct 7020
gcgcaaaccg ttctgcaatg tgtaattggt gcttgattag ccaagattcc ataactcact 7080
acccagctct taagatggtt caaacacatc ttagccacta tgttcttaac atagattggt 7140
tgtggtttgc atttgagact ggtttggcat acatgctcta tacctcggcc ttcaactggt 7200
tgttgttggc aggtacattg cattatttct ttgcacagac ttccatattt gtagactggc 7260
ggtcatacaa ttatgctgtg tctagtgcct tctggttatt cacccacatt ccaatggcgg 7320
gtttggtacg aatgtataat ttgttagcat gcctttggct tttacgcaag ttttatcagc 7380
atgtaatcaa tggttgcaaa gatacggcat gcttgctctg ctataagagg aaccgactta 7440
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atggcggtat ttcattctgt cgtaggcata attggaattg tgtggattgt gacactgcag 7560
gtgtggggaa taccttcatc tgtgaagaag tcgcaaatga cctcactacc gccctacgca 7620
ggcctattaa cgctacggat agatcacatt attatgtgga ttccgttaca gttaaagaga 7680
ctgttgttca gtttaattat cgtagagacg gtcaaccatt ctacgagcgg tttcccctct 7740
gcgcttttac aaatctagat aagttgaagt tcaaagaggt ctgtaaaact actactggta 7800
tacctgaata caactttatc atctacgact catcagatcg tggccaggaa agtttagcta 7860
ggtctgcatg tgtttattat tctcaagtct tgtgtaaatc aattcttttg gttgactcaa 7920
gtttggttac ttctgttggt gattctagtg aaatcgccac taaaatgttt gattcctttg 7980
ttaatagttt cgtctcgctg tataatgtca cacgcgataa gttggaaaaa cttatctcta 8040
ctgctcgtga tggcgtaagg cgaggcgata acttccatag tgtcttaaca acattcattg 8100
acgcagcacg aggccccgca ggtgtggagt ctgatgttga gaccaatgaa attgttgact 8160
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taccctcata tgttaaacct gatagtgtgt ctaccagcga tttaggtagt ctcattgatt 8280
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gtaagtgtaa tttagctttc cggttaacca cctcaaagct acgcgctaat gataatatct 8460
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tgcgtgactt tacgttaaag ggttatgttc ttgctaccat tattgtgttt ctgtgtgctg 8580
tactgatgta tttgtgttta cctacatttt ctatggcacc tgttgaattt tatgaagacc 8640
gcatcttgga ctttaaagtt cttgataatg gtatcattag ggatgtaaat cctgatgata 8700
agtgctttgc taataagcac cggtccttca cacaatggta tcatgagcat gttggtggtg 8760
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cagagggccg tatgacacca tactgccatg atcctactgt tttgcctggg gcttttgcgt 9060
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ttgacattgt caggcggtta gcagtatcac tgttccagcc tattacttat ttccaattga 9360
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ttaataaagt aaaacgtgct tttgcagatt acacccagtg tgctgtaatt gctgttgttg 9480
ctgctgttct taatagcttg tgcatctgct ttgttacctc tataccattg tgtatagtac 9540
cttacactgc attgtactat tatgctacat tctattttac taatgagcct gcatttatta 9600
tgcatgtttc ttggtacatt atgttcgggc ctatcgttcc catatggatg acctgcgtct 9660
atacagttgc aatgtgcttt agacacttct tctgggtttt agcttatttt agtaagaaac 9720
atgtagaagt ttttactgat ggtaagctta attgtagttt ccaggacgct gcctctaata 9780
tctttgttat taacaaggac acttatgcag ctcttagaaa ctctttaact aatgatgcct 9840
attcacgatt tttggggttg tttaacaagt ataagtactt ctctggtgct atggaaacag 9900
ccgcttatcg tgaagctgca gcatgtcatc ttgctaaagc cttacaaaca tacagcgaga 9960
ctggtagtga tcttctttac caaccaccca actgtagcat aacctctggc gtgttgcaaa 10020
gcggtttggt gaaaatgtca catcccagtg gagatgttga ggcttgtatg gttcaggtta 10080
cctgcggtag catgactctt aatggtcttt ggcttgacaa cacagtctgg tgcccacgac 10140
acgtaatgtg cccggctgac cagttgtctg atcctaatta tgatgccttg ttgatttcta 10200
tgactaatca tagtttcagt gtgcaaaaac acattggcgc tccagcaaac ttgcgtgttg 10260
ttggtcatgc catgcaaggc actcttttga agttgactgt cgatgttgct aaccctagca 10320
ctccagccta cacttttaca acagtgaaac ctggcgcagc atttagtgtg ttagcatgct 10380
ataatggtcg tccgactggt acattcactg ttgtaatgcg ccctaactac acaattaagg 10440
gttcctttct gtgtggttct tgtggtagtg ttggttacac caaggagggt agtgtgatca 10500
atttctgtta catgcatcaa atggaacttg ctaatggtac acataccggt tcagcatttg 10560
atggtactat gtatggtgcc tttatggata aacaagtgca ccaagttcag ttaacagaca 10620
aatactgcag tgttaatgta gtagcttggc tttacgcagc aatacttaat ggttgcgctt 10680
ggtttgtaaa acctaatcgc actagtgttg tttcttttaa tgaatgggct cttgccaacc 10740
aattcactga atttgttggc actcaatccg ttgacatgtt agctgtcaaa acaggcgttg 10800
ctattgaaca gctgctttat gcgatccaac aactgtatac tgggttccag ggaaagcaaa 10860
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tgggtgtggt tatgcagagt ggtgtgagaa aagttacata tggtactgcg cattggttgt 10980
ttgcgaccct tgtctcaacc tatgtgataa tcttacaagc cactaaattt actttgtgga 11040
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atattggtgt ctacattagt atgtcacttg tattagtcat tgtagtgaag agattgtaca 11340
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atagcattgg agaagcctca agccccattg cctatctggt ttttgtcact acactcacta 11460
gtgattatac gattacagtc tttgttactg tcaaccttgc aaaagtttgc acttatgcca 11520
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tatacacatg tttaggtttc atgtgtactt gctattttgg tgtcttctct cttttgaacc 11640
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agaaagcaaa aattgtcagt gctatgcaaa ctatgttgtt tggtatgatt aagaagctcg 12360
acaacgatgt tcttaatggt atcatttcta acgctaggaa tggttgtata cctcttagtg 12420
tcatcccact gtgtgcttca aataaacttc gcgttgtaat tcctgacttc accgtctgga 12480
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taaacaatgt ggacaatgaa attgttaagt cttcagatgt tgtagacagc aatgaaaatt 12600
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ataatgagat caaaccttca ggtctaaaaa ccatggttgt gtctgcgggt caagagcaaa 12720
ctaactgtaa tactagttcc ttagcttatt acgaacctgt gcagggtcgt aaaatgctga 12780
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cctcggtgtt gtcacttgtt aacttcaccg ttgatcctca aaaagcttat ctcgatttcg 13080
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cttcagtgtg tctctattgc cgtgcgcata tagaacatcc tgatgtctct ggtgtttgta 13260
aatataaggg taagtttgtc caaatccctg ctcagtgtgt ccgtgaccct gtgggatttt 13320
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aaagcatgaa gatatagaat accagaatgt attctgggtc tacttacagt atatagaaaa 16080
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ttcagaatac cagtacgtta tcttctgtca aacagcagat acggcacatg ctaacaacat 17880
taacagattt aatgttgcaa tcactcgtgc ccaaaaaggt attctttgtg ttatgacatc 17940
tcaggcactc tttgagtcct tagagtttac tgaattgtct tttactaatt acaagctcca 18000
gtctcagatt gtaactggcc tttttaaaga ttgctctaga gaaacttctg gcctctcacc 18060
tgcttatgca ccaacatatg ttagtgttga tgacaagtat aagacgagtg atgagctttg 18120
cgtgaatctt aatttacccg caaatgtccc atactctcgt gttatttcca ggatgggctt 18180
taaactcgat gcaacagttc ctggatatcc taagcttttc attactcgtg aagaggctgt 18240
aaggcaagtt cgaagctgga taggcttcga tgttgagggt gctcatgctt cccgtaatgc 18300
atgtggcacc aatgtgcctc tacaattagg attttcaact ggtgtgaact ttgttgttca 18360
gccagttggt gttgtagaca ctgagtgggg taacatgtta acgggcattg ctgcacgtcc 18420
tccaccaggt gaacagttta agcacctcgt gcctcttatg cataaggggg ctgcgtggcc 18480
tattgttaga cgacgtatag tgcaaatgtt gtcagacact ttagacaaat tgtctgatta 18540
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gataggtaag gaacagaagt gttgcatgtg caatagacgc gctgcagcgt actcttcacc 18660
tctgcaatct tatgcctgct ggactcattc ctgcggttat gattatgtct acaacccttt 18720
ctttgtcgat gttcaacagt ggggttatgt aggcaatctt gctactaatc acgatcgtta 18780
ttgctctgtc catcaaggag ctcatgtggc ttctaatgat gcaataatga ctcgttgttt 18840
agctattcat tcttgtttta tagaacgtgt ggattgggat atagagtatc cttatatctc 18900
acatgaaaag aaattgaatt cctgttgtag aatcgttgag cgcaacgtcg tacgtgctgc 18960
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ttggaactgt aatgtaccaa aatatcctaa taatgcaatt gtatgcaggt ttgacacacg 19200
tgtgcattct gagttcaatt tgccaggttg tgatggcggt agtttgtatg ttaacaagca 19260
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cttttattat tctactacac catgtgaagt gcatggtaat ggtagtatga tagaggatat 19380
tgattatgta cccctaaaat ctgcagtctg tattacagct tgtaatttag ggggcgctgt 19440
ttgtaggaag catgctacag agtacagaga gtatatggaa gcatataatc ttgtctctgc 19500
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tacaaaagtt caaggtttgg aaaacattgc ttttaatgtt gttaaacaag gccattttat 19620
tggtgttgag ggtgaactac ctgtagctgt agtcaatgat aagatcttca ccaagagtgg 19680
cgttaatgac atttgtatgt ttgagaataa aaccactttg cctactaata tagcttttga 19740
actctatgct aagcgtgctg tacgctcgca tcccgatttc aaattgctac acaatttaca 19800
agcagacatt tgctacaagt tcgtcctttg ggattatgaa cgtagcaata tttatggtac 19860
tgctactatt ggtgtatgta agtacactga tattgatgtt aattcagctt tgaatatatg 19920
ttttgacata cgcgataatt gttcattgga gaagttcatg tctactccca atgccatctt 19980
tatttctgat agaaaaatca agaaataccc ttgtatggta ggtcctgatt atgcttactt 20040
caatggtgct atcatccgtg atagtgatgt tgttaaacaa ccagtgaagt tctacttgta 20100
taagaaagtc aataatgagt ttattgatcc tactgagtgt atttacactc agagtcgctc 20160
ttgtagtgac ttcctacccc tttctgacat ggagaaagac tttctatctt ttgatagtga 20220
tgttttcatt aagaagtatg gcttggaaaa ctatgctttt gagcacgtag tctatggaga 20280
cttctctcat actacgttag gcggtcttca cttgcttatt ggtttataca agaagcaaca 20340
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cctctttaaa gttcaaaatg taaaccttga acgttgtgag cttgctaatt acaagcaatc 20700
tattcctatg cctcgcggtg tgcacatgaa catcgctaaa tatatgcaat tgtgccagta 20760
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ttctgataaa ggtatcgctc ctggtacctc agttttacga cagtggcttc ctacagatgc 20880
cattattata gataatgatt taaatgagtt cgtgtcagat gctgacataa ctttatttgg 20940
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gtgtaacctc attaataata atcttgctct tggtgggtct gttgctatta aaataacaga 21120
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tactattaaa gaaaatatag atggtggtgc tatgcacgcc aactatatat tttggagaaa 21300
ttccactcct atgaatctga gtacttactc actttttgat ttatccaagt ttcaattaaa 21360
attaaaagga acaccagttc ttcaattaaa ggagagtcaa attaacgaac tcgtaatatc 21420
tctcctgtcg cagggtaagt tacttatccg tgacaatgat acactcagtg tttctactga 21480
tgttcttgtt aacacctaca gaaagttacg ttgatgtagg gccagattct gttaagtctg 21540
cttgtattga ggttgatata caacagactt tctttgataa aacttggcct aggccaattg 21600
atgtttctaa ggctgacggt attatatacc ctcaaggccg tacatattct aacataacta 21660
tcacttatca aggtcttttt ccctatcagg gagaccatgg tgatatgtat gtttactctg 21720
caggacatgc tacaggcaca actccacaaa agttgtttgt agctaactat tctcaggacg 21780
tcaaacagtt tgctaatggg tttgtcgtcc gtataggagc agctgccaat tccactggca 21840
ctgttattat tagcccatct accagcgcta ctatacgaaa aatttaccct gcttttatgc 21900
tgggttcttc agttggtaat ttctcagatg gtaaaatggg ccgcttcttc aatcatactc 21960
tagttctttt gcccgatgga tgtggcactt tacttagagc tttttattgt attctagagc 22020
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ggtatgttga tttgtacggc ggcaatatgt ttcaatttgc caccttgcct gtttatgata 22320
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ataaacagtc cttttctaat cccacatgtt tgattttagc gactgttcct cataacctta 22920
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actcccgttc tacgcgatca atgcttaaac ggcgagattc tacatatggc ccccttcaga 23580
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ccaaaataaa ccaggctctc catggtgcca atttacgcca ggatgattct gtacgtaatt 24000
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catctttgct tggcagcata gcaggtgttg gctggactgc tggcttatcc tcctttgctg 24360
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ttctttcaga gaaccaaaag cttattgcca ataagtttaa tcaggctctg ggagctatgc 24480
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atgctttaga acttaccctc aacaaatgtt tgttactcct ttggccgtag atgttgtctc 26760
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ttgatagcta tgctttatta aagtgtgtag ctgtagagag aatgttaaag actgtcacct 30000
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aaaaaatagc tattattcaa ttagattagg ctaattagat gatttgcaaa aaaaaaaaa 30119
<210> 11
<211> 18959
<212> DNA
<213> 埃博拉病毒(Ebola virus)
<400> 11
cggacacaca aaaagaaaga agaattttta ggatcttttg tgtgcgaata actatgagga 60
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taatcacacc tggtttgttt cagagccaca tcacaaagat agagaacaac ctaggtctcc 180
gaagggagca agggcatcag tgtgctcagt tgaaaatccc ttgtcaacac ctaggtctta 240
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gatacaatat ccaacagctt ggcaatcagt aggacacatg atggtgattt tccgtttgat 1080
gcgaacaaat tttctgatca aatttctcct aatacaccaa gggatgcaca tggttgccgg 1140
gcatgatgcc aacgatgctg tgatttcaaa ttcagtggct caagctcgtt tttcaggctt 1200
attgattgtc aaaacagtac ttgatcatat cctacaaaag acagaacgag gagttcgtct 1260
ccatcctctt gcaaggaccg ccaaggtaaa aaatgaggtg aactccttta aggctgcact 1320
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agaggctgcc actgaggctg agaagcaact ccaacaatat gcagagtctc gcgaacttga 1560
ccatcttgga cttgatgatc aggaaaagaa aattcttatg aacttccatc agaaaaagaa 1620
cgaaatcagc ttccagcaaa caaacgctat ggtaactcta agaaaagagc gcctggccaa 1680
gctgacagaa gctatcactg ctgcgtcact gcccaaaaca agtggacatt acgatgatga 1740
tgacgacatt ccctttccag gacccatcaa tgatgacgac aatcctggcc atcaagatga 1800
tgatccgact gactcacagg atacgaccat tcccgatgtg gtggttgatc ccgatgatgg 1860
aagctacggc gaataccaga gttactcgga aaacggcatg aatgcaccag atgacttggt 1920
cctattcgat ctagacgagg acgacgagga cactaagcca gtgcctaata gatcgaccaa 1980
gggtggacaa cagaagaaca gtcaaaaggg ccagcatata gagggcagac agacacaatc 2040
caggccaatt caaaatgtcc caggccctca cagaacaatc caccacgcca gtgcgccact 2100
cacggacaat gacagaagaa atgaaccctc cggctcaacc agccctcgca tgctgacacc 2160
aattaacgaa gaggcagacc cactggacga tgccgacgac gagacgtcta gccttccgcc 2220
cttggagtca gatgatgaag agcaggacag ggacggaact tccaaccgca cacccactgt 2280
cgccccaccg gctcccgtat acagagatca ctctgaaaag aaagaactcc cgcaagacga 2340
gcaacaagat caggaccaca ctcaagaggc caggaaccag gacagtgaca acacccagtc 2400
agaacactct tttgaggaga tgtatcgcca cattctaaga tcacaggggc catttgatgc 2460
tgttttgtat tatcatatga tgaaggatga gcctgtagtt ttcagtacca gtgatggcaa 2520
agagtacacg tatccagact cccttgaaga ggaatatcca ccatggctca ctgaaaaaga 2580
ggctatgaat gaagagaata gatttgttac attggatggt caacaatttt attggccggt 2640
gatgaatcac aagaataaat tcatggcaat cctgcaacat catcagtgaa tgagcatgga 2700
acaatgggat gattcaaccg acaaatagct aacattaagt agtcaaggaa cgaaaacagg 2760
aagaattttt gatgtctaag gtgtgaatta ttatcacaat aaaagtgatt cttatttttg 2820
aatttaaagc tagcttatta ttactagccg tttttcaaag ttcaatttga gtcttaatgc 2880
aaataggcgt taagccacag ttatagccat aattgtaact caatattcta actagcgatt 2940
tatctaaatt aaattacatt atgcttttat aacttaccta ctagcctgcc caacatttac 3000
acgatcgttt tataattaag aaaaaactaa tgatgaagat taaaaccttc atcatcctta 3060
cgtcaattga attctctagc actcgaagct tattgtcttc aatgtaaaag aaaagctggt 3120
ctaacaagat gacaactaga acaaagggca ggggccatac tgcggccacg actcaaaacg 3180
acagaatgcc aggccctgag ctttcgggct ggatctctga gcagctaatg accggaagaa 3240
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aaatgcaaca aacgaagcca aacccgaaga cgcgcaacag tcaaacccaa acggacccaa 3360
tttgcaatca tagttttgag gaggtagtac aaacattggc ttcattggct actgttgtgc 3420
aacaacaaac catcgcatca gaatcattag aacaacgcat tacgagtctt gagaatggtc 3480
taaagccagt ttatgatatg gcaaaaacaa tctcctcatt gaacagggtt tgtgctgaga 3540
tggttgcaaa atatgatctt ctggtgatga caaccggtcg ggcaacagca accgctgcgg 3600
caactgaggc ttattgggcc gaacatggtc aaccaccacc tggaccatca ctttatgaag 3660
aaagtgcgat tcggggtaag attgaatcta gagatgagac cgtccctcaa agtgttaggg 3720
aggcattcaa caatctaaac agtaccactt cactaactga ggaaaatttt gggaaacctg 3780
acatttcggc aaaggatttg agaaacatta tgtatgatca cttgcctggt tttggaactg 3840
ctttccacca attagtacaa gtgatttgta aattgggaaa agatagcaac tcattggaca 3900
tcattcatgc tgagttccag gccagcctgg ctgaaggaga ctctcctcaa tgtgccctaa 3960
ttcaaattac aaaaagagtt ccaatcttcc aagatgctgc tccacctgtc atccacatcc 4020
gctctcgagg tgacattccc cgagcttgcc agaaaagctt gcgtccagtc ccaccatcgc 4080
ccaagattga tcgaggttgg gtatgtgttt ttcagcttca agatggtaaa acacttggac 4140
tcaaaatttg agccaatctc ccttccctcc gaaagaggcg aataatagca gaggcttcaa 4200
ctgctgaact atagggtacg ttacattaat gatacacttg tgagtatcag ccctggataa 4260
tataagtcaa ttaaacgacc aagataaaat tgttcatatc tcgctagcag cttaaaatat 4320
aaatgtaata ggagctatat ctctgacagt attataatca attgttatta agtaacccaa 4380
accaaaagtg atgaagatta agaaaaacct acctcggctg agagagtgtt ttttcattaa 4440
ccttcatctt gtaaacgttg agcaaaattg ttaaaaatat gaggcgggtt atattgccta 4500
ctgctcctcc tgaatatatg gaggccatat accctgtcag gtcaaattca acaattgcta 4560
gaggtggcaa cagcaataca ggcttcctga caccggagtc agtcaatggg gacactccat 4620
cgaatccact caggccaatt gccgatgaca ccatcgacca tgccagccac acaccaggca 4680
gtgtgtcatc agcattcatc cttgaagcta tggtgaatgt catatcgggc cccaaagtgc 4740
taatgaagca aattccaatt tggcttcctc taggtgtcgc tgatcaaaag acctacagct 4800
ttgactcaac tacggccgcc atcatgcttg cttcatacac tatcacccat ttcggcaagg 4860
caaccaatcc acttgtcaga gtcaatcggc tgggtcctgg aatcccggat catcccctca 4920
ggctcctgcg aattggaaac caggctttcc tccaggagtt cgttcttccg ccagtccaac 4980
taccccagta tttcaccttt gatttgacag cactcaaact gatcacccaa ccactgcctg 5040
ctgcaacatg gaccgatgac actccaacag gatcaaatgg agcgttgcgt ccaggaattt 5100
catttcatcc aaaacttcgc cccattcttt tacccaacaa aagtgggaag aaggggaaca 5160
gtgccgatct aacatctccg gagaaaatcc aagcaataat gacttcactc caggacttta 5220
agatcgttcc aattgatcca accaaaaata tcatgggaat cgaagtgcca gaaactctgg 5280
tccacaagct gaccggtaag aaggtgactt ctaaaaatgg acaaccaatc atccctgttc 5340
ttttgccaaa gtacattggg ttggacccgg tggctccagg agacctcacc atggtaatca 5400
cacaggattg tgacacgtgt cattctcctg caagtcttcc agctgtgatt gagaagtaat 5460
tgcaataatt gactcagatc cagttttata gaatcttctc agggatagtg ataacatcta 5520
tttagtaatc cgtccattag aggagacact tttaattgat caatatacta aaggtgcttt 5580
acaccattgt cttttttctc tcctaaatgt agaacttaac aaaagactca taatatactt 5640
gtttttaaag gattgattga tgaaagatca taactaataa cattacaaat aatcctacta 5700
taatcaatac ggtgattcaa atgttaatct ttctcattgc acatactttt tgcccttatc 5760
ctcaaattgc ctgcatgctt acatctgagg atagccagtg tgacttggat tggaaatgtg 5820
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taattaagaa aaaatcggcg atgaagatta agccgacagt gagcgtaatc ttcatctctc 5940
ttagattatt tgttttccag agtaggggtc gtcaggtcct tttcaatcgt gtaaccaaaa 6000
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agttacctcg tgatcgattc aagaggacat cattctttct ttgggtaatt atccttttcc 6120
aaagaacatt ttccatccca cttggagtca tccacaatag cacattacag gttagtgatg 6180
tcgacaaact agtttgtcgt gacaaactgt catccacaaa tcaattgaga tcagttggac 6240
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gctacaatct tgaaatcaaa aaacctgacg ggagtgagtg tctaccagca gcgccagacg 6420
ggattcgggg cttcccccgg tgccggtatg tgcacaaagt atcaggaacg ggaccgtgtg 6480
ccggagactt tgccttccat aaagagggtg ctttcttcct gtatgatcga cttgcttcca 6540
cagttatcta ccgaggaacg actttcgctg aaggtgtcgt tgcatttctg atactgcccc 6600
aagctaagaa ggacttcttc agctcacacc ccttgagaga gccggtcaat gcaacggagg 6660
acccgtctag tggctactat tctaccacaa ttagatatca ggctaccggt tttggaacca 6720
atgagacaga gtacttgttc gaggttgaca atttgaccta cgtccaactt gaatcaagat 6780
tcacaccaca gtttctgctc cagctgaatg agacaatata tacaagtggg aaaaggagca 6840
ataccacggg aaaactaatt tggaaggtca accccgaaat tgatacaaca atcggggagt 6900
gggccttctg ggaaactaaa aaaacctcac tagaaaaatt cgcagtgaag agttgtcttt 6960
cacagttgta tcaaacggag ccaaaaacat cagtggtcag agtccggcgc gaacttcttc 7020
cgacccaggg accaacacaa caactgaaga ccacaaaatc atggcttcag aaaattcctc 7080
tgcaatggtt caagtgcaca gtcaaggaag ggaagctgca gtgtcgcatc taacaaccct 7140
tgccacaatc tccacgagtc cccaatccct cacaaccaaa ccaggtccgg acaacagcac 7200
ccataataca cccgtgtata aacttgacat ctctgaggca actcaagttg aacaacatca 7260
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acccccaaaa gcagagaaca ccaacacgag caagagcact gacttcctgg accccgccac 7380
cacaacaagt ccccaaaacc acagcgagac cgctggcaac aacaacactc atcaccaaga 7440
taccggagaa gagagtgcca gcagcgggaa gctaggctta attaccaata ctattgctgg 7500
agtcgcagga ctgatcacag gcgggagaag aactcgaaga gaagcaattg tcaatgctca 7560
acccaaatgc aaccctaatt tacattactg gactactcag gatgaaggtg ctgcaatcgg 7620
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gcacaatcaa gatggtttaa tctgtgggtt gagacagctg gccaacgaga cgactcaagc 7740
tcttcaactg ttcctgagag ccacaactga gctacgcacc ttttcaatcc tcaaccgtaa 7800
ggcaattgat ttcttgctgc agcgatgggg cggcacatgc cacattctgg gaccggactg 7860
ctgtatcgaa ccacatgatt ggaccaagaa cataacagac aaaattgatc agattattca 7920
tgattttgtt gataaaaccc ttccggacca gggggacaat gacaattggt ggacaggatg 7980
gagacaatgg ataccggcag gtattggagt tacaggcgtt ataattgcag ttatcgcttt 8040
attctgtata tgcaaatttg tcttttagtt tttcttcaga ttgcttcatg gaaaagctca 8100
gcctcaaatc aatgaaacca ggatttaatt atatggatta cttgaatcta agattacttg 8160
acaaatgata atataataca ctggagcttt aaacatagcc aatgtgattc taactccttt 8220
aaactcacag ttaatcataa acaaggtttg acatcaatct agttatctct ttgagaatga 8280
taaacttgat gaagattaag aaaaaggtaa tctttcgatt atctttaatc ttcatccttg 8340
attctacaat catgacagtt gtctttagtg acaagggaaa gaagcctttt tattaagttg 8400
taataatcag atctgcgaac cggtagagtt tagttgcaac ctaacacaca taaagcattg 8460
gtcaaaaagt caatagaaat ttaaacagtg agtggagaca acttttaaat ggaagcttca 8520
tatgagagag gacgcccacg agctgccaga cagcattcaa gggatggaca cgaccaccat 8580
gttcgagcac gatcatcatc cagagagaat tatcgaggtg agtaccgtca atcaaggagc 8640
gcctcacaag tgcgcgttcc tactgtattt cataagaaga gagttgaacc attaacagtt 8700
cctccagcac ctaaagacat atgtccgacc ttgaaaaaag gatttttgtg tgacagtagt 8760
ttttgcaaaa aagatcacca gttggagagt ttaactgata gggaattact cctactaatc 8820
gcccgtaaga cttgtggatc agtagaacaa caattaaata taactgcacc caaggactcg 8880
cgcttagcaa atccaacggc tgatgatttc cagcaagagg aaggtccaaa aattaccttg 8940
ttgacactga tcaagacggc agaacactgg gcgagacaag acatcagaac catagaggat 9000
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gcactatggc aacaatggga ccgacaatcc ctaattatgt ttatcactgc attcttgaat 9240
attgctctcc agttaccgtg tgaaagttct gctgtcgttg tttcagggtt aagaacattg 9300
gttcctcaat cagataatga ggaagcttca accaacccgg ggacatgctc atggtctgat 9360
gagggtaccc cttaataagg ctgactaaaa cactatataa ccttctactt gatcacaata 9420
ctccgtatac ctatcatcat atatttaatc aagacgatat cctttaaaac ttattcagta 9480
ctataatcac tctcgtttca aattaataag atgtgcatga ttgccctaat atatgaagag 9540
gtatgataca accctaacag tgatcaaaga aaatcataat ctcgtatcgc tcgtaatata 9600
acctgccaag catacctctt gcacaaagtg attcttgtac acaaataatg ttttactcta 9660
caggaggtag caacgatcca tcccatcaaa aaataagtat ttcatgactt actaatgatc 9720
tcttaaaata ttaagaaaaa ctgacggaac ataaattctt tatgcttcaa gctgtggagg 9780
aggtgtttgg tattggctat tgttatatta caatcaataa caagcttgta aaaatattgt 9840
tcttgtttca agaggtagat tgtgaccgga aatgctaaac taatgatgaa gattaatgcg 9900
gaggtctgat aagaataaac cttattattc agattaggcc ccaagaggca ttcttcatct 9960
ccttttagca aagtactatt tcagggtagt ccaattagtg gcacgtcttt tagctgtata 10020
tcagtcgccc ctgagatacg ccacaaaagt gtctctaagc taaattggtc tgtacacatc 10080
ccatacattg tattaggggc aataatatct aattgaactt agccgtttaa aatttagtgc 10140
ataaatctgg gctaacacca ccaggtcaac tccattggct gaaaagaagc ttacctacaa 10200
cgaacatcac tttgagcgcc ctcacaatta aaaaatagga acgtcgttcc aacaatcgag 10260
cgcaaggttt caaggttgaa ctgagagtgt ctagacaaca aaatattgat actccagaca 10320
ccaagcaaga cctgagaaaa aaccatggct aaagctacgg gacgatacaa tctaatatcg 10380
cccaaaaagg acctggagaa aggggttgtc ttaagcgacc tctgtaactt cttagttagc 10440
caaactattc aggggtggaa ggtttattgg gctggtattg agtttgatgt gactcacaaa 10500
ggaatggccc tattgcatag actgaaaact aatgactttg cccctgcatg gtcaatgaca 10560
aggaatctct ttcctcattt atttcaaaat ccgaattcca caattgaatc accgctgtgg 10620
gcattgagag tcatccttgc agcagggata caggaccagc tgattgacca gtctttgatt 10680
gaacccttag caggagccct tggtctgatc tctgattggc tgctaacaac caacactaac 10740
catttcaaca tgcgaacaca acgtgtcaag gaacaattga gcctaaaaat gctgtcgttg 10800
attcgatcca atattctcaa gtttattaac aaattggatg ctctacatgt cgtgaactac 10860
aacggattgt tgagcagtat tgaaattgga actcaaaatc atacaatcat cataactcga 10920
actaacatgg gttttctggt ggagctccaa gaacccgaca aatcggcaat gaaccgcatg 10980
aagcctgggc cggcgaaatt ttccctcctt catgagtcca cactgaaagc atttacacaa 11040
ggatcctcga cacgaatgca aagtttgatt cttgaattta atagctctct tgctatctaa 11100
ctaaggtaga atacttcata ttgagctaac tcatatatgc tgactcaata gttatcttga 11160
catctctgct ttcataatca gatatataag cataataaat aaatactcat atttcttgat 11220
aatttgttta accacagata aatcctcact gtaagccagc ttccaagttg acacccttac 11280
aaaaaccagg actcagaatc cctcaaacaa gagattccaa gacaacatca tagaattgct 11340
ttattatatg aataagcatt ttatcaccag aaatcctata tactaaatgg ttaattgtaa 11400
ctgaacccgc aggtcacatg tgttaggttt cacagattct atatattact aactctatac 11460
tcgtaattaa cattagataa gtagattaag aaaaaagcct gaggaagatt aagaaaaact 11520
gcttattggg tctttccgtg ttttagatga agcagttgaa attcttcctc ttgatattaa 11580
atggctacac aacataccca atacccagac gctaggttat catcaccaat tgtattggac 11640
caatgtgacc tagtcactag agcttgcggg ttatattcat catactccct taatccgcaa 11700
ctacgcaact gtaaactccc gaaacatatc taccgtttga aatacgatgt aactgttacc 11760
aagttcttga gtgatgtacc agtggcgaca ttgcccatag atttcatagt cccagttctt 11820
ctcaaggcac tgtcaggcaa tggattctgt cctgttgagc cgcggtgcca acagttctta 11880
gatgaaatca ttaagtacac aatgcaagat gctctcttct tgaaatatta tctcaaaaat 11940
gtgggtgctc aagaagactg tgttgatgaa cactttcaag agaaaatctt atcttcaatt 12000
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aggggtagat taaatcgagg aaactctaga tcaacatggt ttgttcatga tgatttaata 12120
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aaagatttaa ttacatgtcg attcaacaca actctaatct caaaaatagc agagattgag 12360
gatccagttt gttctgatta tcccaatttt aagattgtgt ctatgcttta ccagagcgga 12420
gattacttac tctccatatt agggtctgat gggtataaaa ttattaagtt cctcgaacca 12480
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tttggaaaaa aacaatattt gaatggggtc caattgcctc agtcccttaa aacggctaca 14040
agaatggcac cattgtctga tgcaattttt gatgatcttc aagggaccct ggctagtata 14100
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gcagctttcc atacgttttt ttcggtgaga atcttgcaat atcatcatct cgggttcaat 14220
aaaggttttg accttggaca gttaacactc ggcaaacctc tggatttcgg aacaatatca 14280
ttggcactag cggtaccgca ggtgcttgga gggttatcct tcttgaatcc tgagaaatgt 14340
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gaattggcgt cccgtttaac atgggtaact caaggcagtt cgaacagtga cttgctaata 15300
aaaccatttt tggaagcacg agtaaattta agtgttcaag aaatacttca aatgacccct 15360
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tataatcgtg ctcaccttca tctaactaag tgttgcaccc gggaagtacc agctcagtat 15660
ttaacataca catctacatt ggatttagat ttaacaagat accgagaaaa cgaattgatt 15720
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<210> 13
<211> 10962
<212> DNA
<213> 西尼罗病毒(West Nile virus)
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gctcttttgg cgtttttcag attcactgca atcgctccga ctcgtgcggt gctggacaga 300
tggagaggcg tcaacaaaca aacagcaatg aagcatctct tgagtttcaa gaaagaacta 360
ggaactctga ccagtgccat caaccgccgg agcacaaaac aaaagaaaag aggaggcaca 420
gcgggcttta ctatcttgct tgggctgatc gcctgtgctg gagctgtgac cctctcgaac 480
ttccagggca aagtgatgat gacagtcaat gcaaccgatg tcactgacgt gattaccatt 540
ccaacagctg ctgggaaaaa cctgtgcatc gtaagggcta tggacgtagg atacctttgt 600
gaggatacta tcacttatga atgtccggtc ctagctgctg gaaatgaccc tgaagacatt 660
gactgctggt gcacgaaatc atctgtttac gtgcgctatg gaagatgcac aaaaactcgg 720
cattcccgtc gaagcagaag gtctctgaca gtccagacac atggagaaag tacactggcc 780
aacaagaaag gagcttggtt ggacagcaca aaagccacga gatatctggt gaagacagaa 840
tcatggatac tgagaaaccc gggctacgcc ctcgttgcag ctgtcattgg atggatgcta 900
ggaagcaaca caatgcaacg cgtcgtgttt gccattctat tgctcctggt ggcaccagca 960
tacagcttca actgtttagg aatgagtaac agagacttcc tggagggagt gtctggagct 1020
acatgggttg atctggtact ggaaggcgat agttgtgtga ccataatgtc aaaagacaag 1080
ccaaccattg atgtcaaaat gatgaacatg gaagcagcca acctcgcaga tgtgcgcagt 1140
tactgttacc tagcttcggt cagtgacttg tcaacaagag ctgcgtgtcc aaccatgggt 1200
gaagcccaca acgagaaaag agctgacccc gccttcgttt gcaagcaagg cgttgtggac 1260
agaggatggg gaaatggctg cggactgttt ggaaagggga gcattgacac atgtgcgaag 1320
tttgcctgta caaccaaagc aactggatgg atcatccaga aggaaaacat caagtatgag 1380
gttgccatat ttgtgcatgg cccgacgacc gttgaatctc atggcaagat aggggccacc 1440
caggctggaa gattcagtat aactccatcg gcgccatctt acacgctaaa gttgggtgag 1500
tatggtgagg ttacggttga ttgtgagcca cggtcaggaa tagacaccag cgcctattac 1560
gttatgtcag ttggtgagaa gtccttcctg gttcaccgag aatggtttat ggatctgaac 1620
ctgccatgga gcagtgctgg aagcaccacg tggaggaacc gggaaacact gatggagttt 1680
gaagaacctc atgccaccaa acaatctgtt gtggctctag ggtcgcagga aggtgcgttg 1740
caccaagctc tggccggagc gattcctgtt gagttctcaa gcaacactgt gaagttgaca 1800
tcaggacatc tgaagtgtcg ggtgaagatg gagaagttgc agctgaaggg aacaacatat 1860
ggagtatgtt caaaagcgtt caaattcgct aggactcccg ctgacactgg ccacggaacg 1920
gtggtgttgg aactgcaata taccggaaca gacggtccct gcaaagtgcc catttcttcc 1980
gtagcttccc tgaatgacct cacacctgtt ggaagactgg tgaccgtgaa tccatttgtg 2040
tctgtggcca cagccaactc gaaggttttg attgaactcg aacccccgtt tggtgactct 2100
tacatcgtgg tgggaagagg agaacagcag ataaaccatc actggcacaa atctgggagc 2160
agcattggaa aggcctttac caccacactc agaggagctc aacgactcgc agctcttgga 2220
gatactgctt gggattttgg atcagttgga ggggttttca cctcagtggg gaaagccata 2280
caccaagtct ttggaggagc ttttagatca ctctttggag ggatgtcctg gatcacacag 2340
ggacttctgg gagctcttct gttgtggatg ggaatcaatg cccgtgacag gtcaattgct 2400
atgacgtttc ttgcggttgg aggagttttg ctcttccttt cggtcaacgt ccatgctgac 2460
acaggctgtg ccattgatat tggcaggcaa gagctccggt gcggaagtgg agtgtttatc 2520
cacaacgatg tggaagcctg gatggatcgt tacaagttct acccggagac gccacagggc 2580
ctagcaaaaa ttatccagaa agcacatgca gaaggagtct gcggcttgcg ttccgtttcc 2640
agactcgagc accaaatgtg ggaagccatt aaggatgagc tgaacaccct gttgaaagag 2700
aatggagtcg acttgagtgt cgtggtggaa aaacagaatg ggatgtacaa agcagcacca 2760
aaacgtttgg ctgccaccac cgaaaaactg gagatgggtt ggaaggcttg gggcaagagt 2820
atcatctttg cgccagaact agctaacaac acctttgtca tcgacggtcc tgagactgag 2880
gaatgcccaa cggccaaccg agcatggaac agtatggagg tagaggactt tggatttgga 2940
ctgacaagca ctcgcatgtt cctgaggatt cgggaaacga acacaacgga atgcgactcg 3000
aagatcatag gaaccgccgt caagaacaac atggctgtgc atagtgatct atcatactgg 3060
atagagagcg gactcaacga cacctggaag cttgagaggg cggttctagg agaagtcaaa 3120
tcatgcacct ggccagaaac ccacactctg tggggtgatg gagttctgga aagtgatctc 3180
atcataccca tcaccttggc aggacccaga agcaaccaca acaggagacc agggtacaaa 3240
actcagaacc aaggcccatg ggatgagggg cgcgtcgaga ttgactttga ctattgccca 3300
ggaacaacag taactataag tgacagttgc gaacaccgtg gacctgcggc acgcacaacc 3360
actgagagtg ggaagctcat cacagactgg tgctgcagaa gttgcaccct ccctccactg 3420
cgcttccaga ctgagaatgg ctgttggtat ggaatggaaa ttcgacctac gcggcacgac 3480
gaaaagaccc tcgtgcaatc gagagtgaat gcatacaacg ccgacatgat tgatcctttt 3540
cagttgggcc ttatggtcgt gttcttggcc acccaggagg tccttcgcaa gaggtggacg 3600
gccaagatca gcattccagc tatcatgctt gcactcctag tcctagtgtt tgggggtatt 3660
acgtacactg atgtcctgcg atatgtcatt ctcgtcggcg ccgcgtttgc tgaagcaaac 3720
tcaggaggag acgtcgtgca cttggcactt atggctacat tcaagattca accagtcttt 3780
ctggtggctt cctttttgaa ggcaaggtgg accaaccaag agagtatttt gctcatgctt 3840
gcagctgctt tcttccaaat ggcttactat gacgccaaga atgttctgtc atgggaagtg 3900
cctgacgttt tgaactctct ctccgttgcg tggatgattc tcagagctat aagcttcacc 3960
aacacttcaa atgtggtggt gccgctgctg gcccttttga cacctggatt gaaatgctta 4020
aaccttgatg tgtacagaat tttgctactc atggttggag ttggaagcct catcaaagaa 4080
aaaaggagct ctgcagcaaa aaagaaagga gcttgcctca tctgcctagc gctggcgtct 4140
acaggagtgt tcaatccaat gatacttgca gctgggctaa tggcttgcga ccccaaccgc 4200
aagcggggct ggcctgctac agaagtgatg actgcagttg gactcatgtt tgccatcgtt 4260
gggggtctgg cagaacttga catagattct atggctatcc ccatgaccat cgccggactt 4320
atgttcgcgg catttgtcat ctctggaaag tcaacagaca tgtggattga gaggacggct 4380
gacattactt gggagagtga tgctgaaatc acaggctcta gcgaaagagt agatgtgagg 4440
ctggatgatg atggaaattt tcaactgatg aatgaccccg gggcaccatg gaaaatttgg 4500
atgcttagga tggcctgcct ggcgataagt gcctacacac cttgggcaat tctcccctcg 4560
gtcatcggat tctggataac ccttcagtac acaaagagag gaggtgttct ttgggacaca 4620
ccatcaccca aggagtacaa gaagggtgat accaccactg gcgtttacag aatcatgact 4680
cgaggtctgc ttggcagtta ccaagctgga gccggagtga tggtagaggg ggtgttccac 4740
acactatggc acaccactaa gggagctgct ctcatgagtg gtgagggacg tctggatccc 4800
tactggggga gcgtgaaaga ggaccgactt tgctatgggg ggccatggaa actccaacat 4860
aaatggaatg gacatgatga ggtccaaatg attgtcgtgg agccagggaa aaatgtgaaa 4920
aacgtccaga ccaagcccgg agtgtttaag acaccagaag gagaaattgg ggcagttacg 4980
ctagactatc ctaccggaac gtcaggttcc cccattgtag acaaaaatgg agatgtgatt 5040
ggattgtatg ggaacggcgt catcatgcct aatggttcat acataagcgc cattgtgcaa 5100
ggagagagaa tggaagaacc ggcaccagct ggcttcgaac ctgaaatgtt gaggaagaaa 5160
cagatcactg tccttgatct gcaccccgga gcaggaaaga cacgcaagat acttccccaa 5220
atcatcaagg aggccatcaa caaaagattg aggacggctg tgctggcacc caccagggtc 5280
gttgctgctg agatgtctga ggccctgaga ggacttccca ttcggtacca aacctcagca 5340
gtgcacagag agcacagtgg aaatgagatc gttgatgtca tgtgccatgc caccctcaca 5400
cacaggctga tgtctccaca cagagtcccc aactacaacc tgttcataat ggatgaagcc 5460
catttcacgg atccagcgag catcgcagcc agaggataca tagcaaccaa ggttgaattg 5520
ggcgaagccg ccgcgatttt catgacggca acgccacccg ggacttctga cccctttcca 5580
gagtctaatg ctcctatctc ggacatgcaa acagagatcc cagacagagc ctggaacact 5640
ggatatgaat ggataactga gtatgttgga aagaccgttt ggtttgttcc aagtgtgaaa 5700
atgggaaatg agattgccct ctgtctgcaa cgggcgggga agaaggttat ccagctgaac 5760
agaaagtcct atgagacaga gtaccccaag tgtaagaacg atgattggga ttttgtcatc 5820
accacagaca tatcagaaat gggagccaac ttcaaggcga gcagagtgat cgacagccgc 5880
aaaagcgtga aacccaccat cattgaggaa ggtgatggaa gagtcatcct gggggaaccc 5940
tcagccatca cggctgccag cgctgctcag cggagaggac gcataggaag aaacccatca 6000
caagttggtg atgagtattg ctatggaggg cacacaaatg aggatgattc caactttgct 6060
cactggacag aggctcgcat catgctagac aacatcaaca tgccgaatgg tctggtggct 6120
caactatatc agcctgagcg cgagaaggtg tacaccatgg acggggaata caggctcaga 6180
ggggaagaac ggaagaactt ccttgaattc ctgagaacag ctgatttacc agtctggctc 6240
gcttacaaag tggcagcagc aggaatatca taccatgacc ggaaatggtg ctttgatgga 6300
cctcgaacca acacgattct tgaagacaac aatgaagttg aagtcatcac gaagttgggt 6360
gagagaaaga tcctaagacc caggtgggca gatgctagag tgtactcaga ccatcaagct 6420
ctaaagtcct tcaaagattt tgcatcgggg aaacgatcac aaatcgggct cgttgaggtg 6480
ctcgggagaa tgcctgaaca cttcatggtg aaaacttggg aggcattgga cacgatgtat 6540
gtggtggcga ccgctgaaaa aggaggccga gctcacagga tggctcttga ggagctaccg 6600
gacgcccttc agacaatagt tttgattgca ctattgagtg tgatgtcctt aggtgtgttt 6660
tttctactca tgcaaaggaa gggcattggt aagattggct tgggaggagt aatcttagga 6720
gctgccacat tcttctgctg gatggctgaa gtcccaggaa cgaaaatagc aggcatgctc 6780
ctgctttccc tgctgctcat gattgttttg attccggagc cggaaaagca gcgctcacag 6840
actgataacc agctcgccgt gttcttgatc tgtgtgctca cactggtcgg cgccgtggct 6900
gccaatgaaa tgggctggct ggacaagacc aagaatgaca ttggcagcct gttggggcac 6960
aggccagaag ctagagagac gaccctggga gttgagagct tcttacttga tctgcggccg 7020
gccacggcat ggtcgctcta tgccgtaacg acagccgttc tcaccccttt gctgaagcat 7080
ctaatcacgt cagactacat caacacttcg ttgacctcaa taaacgtcca agccagcgcg 7140
ttgttcactt tggccagagg cttccctttt gtggacgttg gtgtgtcagc tctcttgctg 7200
gcggtcgggt gctggggtca ggtgactctg actgtgactg tgactgcagc tgctctgctc 7260
ttttgccact atgcttacat ggtgccaggc tggcaagcgg aagccatgcg atctgcccag 7320
cggcggacag ctgctggcat catgaaaaat gtagtggtgg atgggatcgt ggccactgat 7380
gtacctgaac ttgaacgaac aactccagtc atgcagaaaa aagttggaca gatcatattg 7440
atcttggtat caatggccgc ggtggtcgtc aatccatcag tgagaaccgt cagagaggcc 7500
ggaattctga ctacagcagc agcagtcacc ctatgggaga atggtgctag ttcagtgtgg 7560
aatgcaacga cagctattgg cctttgtcac atcatgcgag gaggatggct ctcgtgtctc 7620
tccatcatgt ggactctcat caaaaacatg gagaaaccag gcctcaagag gggtggagcc 7680
aaaggacgca cgctagggga agtttggaag gagagactca accacatgac gaaggaagaa 7740
tttaccagat acagaaaaga agccatcact gaagttgacc gctccgcagc aaaacatgct 7800
aggagagagg gaaacatcac tggaggccac ccagtctcac ggggaaccgc gaaattacgg 7860
tggttagtgg aaaggcgttt cctcgagcca gtgggaaagg ttgtggatct cgggtgtggt 7920
agaggcggct ggtgctatta catggctacc cagaagaggg tacaggaagt gaaagggtac 7980
acgaaaggag gacctggcca tgaagaacca caactggtgc agagctatgg ttggaatatt 8040
gttaccatga agagtggagt cgacgtcttc tacagaccat cagaagcgag cgacacactg 8100
ctctgtgaca ttggagagtc atcgtcaagt gccgaggtag aagaacaccg caccgtccgt 8160
gtcctggaga tggtggaaga ttggttgcac agaggaccga aggaattctg catcaaagtg 8220
ctatgccctt acatgcccaa agtgattgag aagatggaaa cactccaaag gcgatatgga 8280
ggtggcctta taagaaaccc cctttcacgc aactctaccc atgagatgta ctgggtgagc 8340
cacgcttcag gcaatatcgt ccactccgtc aacatgacaa gccaggtgct tctggggagg 8400
atggaaaaga aaacatggaa gggaccccag tttgaggaag atgtcaactt gggaagtgga 8460
acgcgggcag tagggaagcc tctcctcaat tctgatacta gcaagatcaa gaaccgaatt 8520
gagaggctga agaaagaata cagctccaca tggcaccagg atgcgaacca cccctacagg 8580
acctggaact accacggaag ctatgaagtg aaaccaaccg gctcagccag ctcccttgtg 8640
aatggggtag tcagattact ctcaaaacca tgggacacta tcaccaatgt gaccacgatg 8700
gccatgacag acaccactcc tttcggtcaa caacgagtgt tcaaggaaaa ggtggacaca 8760
aaggctccag agcctccaga aggagtcaaa tacgtcctca atgagaccac gaactggctg 8820
tgggcttttt tagcccgcga taagaaaccc aggatgtgtt cccgggagga atttattgga 8880
aaagtcaaca gtaatgccgc cctaggagcg atgtttgaag aacagaacca atggaagaac 8940
gcccgggaag ctgtagagga tccaaagttt tgggagatgg tggatgagga gcgtgaagcg 9000
catctccgtg gagaatgcaa cacctgcatc tacaacatga tgggaaagag agagaagaag 9060
cctggagagt tcggcaaagc taaaggcagc agagccatct ggttcatgtg gctgggggcc 9120
cgcttcctgg agtttgaagc tctcggattc ctcaatgaag accactggct gggtaggaag 9180
aactcaggag gaggagttga aggcttagga ctgcagaagc tcgggtacat cttgaaggaa 9240
gttggaacaa agcctggagg aaaggtttac gctgatgata ccgcaggctg ggacacacgc 9300
atcaccaaag ctgacctcga gaatgaagcg aaggttcttg aactgctgga tggagaacat 9360
cgacgtttag cgcggtccat catcgagctc acataccgac acaaagtcgt gaaagtgatg 9420
aggccagcgg ccgacgggaa aactgtgatg gacgtcatct ctagagagga tcagagagga 9480
agcggtcagg tagtgactta cgccctgaac accttcacca atctagcagt tcagctggtc 9540
agaatgatgg agggggaggg ggtcattgga cccgatgatg ttgaaaaact gggaaaagga 9600
aaaggcccta aggtcagaac ctggctgttt gagaatggcg aggagcgtct cagtcgcatg 9660
gccgtcagcg gtgatgactg cgtggtgaaa cctttggacg accgcttcgc cacatcacta 9720
cacttcctaa atgctatgtc aaaggtccgc aaagacatcc aggaatggaa accctcgacg 9780
gggtggtatg actggcagca ggttccattc tgttcaaacc atttcacgga actgatcatg 9840
aaggacggca ggacgctggt ggtcccgtgt cgtggacaag acgagttgat tggacgtgcc 9900
aggatctctc caggggctgg atggaatgtg cgcgacaccg cctgcctggc gaagtcatac 9960
gcgcagatgt ggctgctgct ttatttccac cgtagagacc tgagattgat ggccaatgcc 10020
atctgttccg ctgtgcctgc caactgggtt cccacagggc gtaccacttg gtcgatccac 10080
gcaaaaggag aatggatgac gacggaagac atgctcgcag tctggaacag agtgtggatt 10140
gaggagaatg agtggatgga agacaaaaca ccagttgaga ggtggagtga tgttccatac 10200
tctggaaaga gagaggacat ttggtgtggc agtttgatcg gcacacgaac ccgcgccact 10260
tgggctgaaa atatccatgt ggcaatcaat caggtccgtt cagtgattgg agaagagaag 10320
tatgtggatt acatgagctc cttgaggagg tatgaagaca ccattgtagt ggaggacact 10380
gttttgtaaa agatagtatt atagttagtt tagtgtaaat aggatttatt gagaatggaa 10440
gtcaggccag attaatgctg ccaccggaag ttgagtagac ggtgctgcct gcggctcaac 10500
cccaggagga ctgggtgacc aaagctgcga ggtgatccac gtaagccctc agaaccgtct 10560
cggaaggagg accccacgtg ctttagcctc aaagcccagt gtcagaccac actttaatgt 10620
gccactctgc ggagagtgca gtctgcgata gtgccccagg tggactgggt taacaaaggc 10680
aaaacatcgc cccacgcggc cataaccctg gctatggtgt taaccaggga gaagggacta 10740
gaggttagag gagaccccgc gtaaaaaagt gcacggccca acttggctga agctgtaagc 10800
caagggaagg actagaggtt agaggagacc ccgtgccaaa aacaccaaaa gaaacagcat 10860
attgacacct gggatagact aggggatctt ctgctctgca caaccagcca cacggcacag 10920
tgcgccgaca taggtggctg gtggtgctag aacacaggat ct 10962

Claims (45)

1.一种源自ssRNA病毒(WV)的病毒诱饵转录物，所述转录物包含含有所述WV的5′UTR的5′末端、所述WV的基因组包装信号(GPS)、所述WV的3′UTR、外源终止密码子和多A尾。
2.根据权利要求1所述的病毒诱饵转录物，其中所述诱饵转录物不编码WV RdRp和/或WV N蛋白。
3.根据权利要求1或2所述的病毒诱饵转录物，其中所述诱饵转录物不编码任何WV蛋白。
4.根据权利要求1所述的诱饵转录物，其中所述5′末端是加帽的。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的诱饵转录物，所述诱饵转录物包含与SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:6中列出的核苷酸序列具有至少80％序列相似性的核苷酸序列。
6.根据权利要求1-4中任一项所述的诱饵转录物，所述诱饵转录物包含与SEQ ID NO:3-5和SEQ ID NO:7中列出的核苷酸序列中的任何一个或更多个具有至少80％序列相似性的核苷酸序列。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的诱饵转录物，所述诱饵转录物源自SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:9-13中的任一个。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的诱饵转录物，还包含相对于第一终止密码子移码的一个或更多个另外的终止密码子。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的诱饵转录物，所述诱饵转录物还包含一个或更多个另外的GPS序列。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的诱饵转录物，所述诱饵转录物还包含一个或更多个WV特异性的短反义序列。
11.根据权利要求10所述的诱饵转录物，其中所述反义序列的侧翼是前导序列和转录调节序列(TRS)中的至少一个。
12.根据权利要求1-11中任一项所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物源自其的所述WV的基因组包含至少20,000个核苷酸。
13.根据权利要求1-12中任一项所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物相对于所述WV的长度之比为至少1:15。
14.根据权利要求1-13中任一项所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物源自其的所述WV是动物源性病毒。
15.根据权利要求1-14中任一项所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物源自其的所述WV具有20-40千碱基的病毒基因组。
16.根据权利要求1-15中任一项所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物源自其的所述WV是正义单链RNA病毒。
17.根据权利要求16所述的诱饵转录物，其中所述WV可以是以下中的任一种或更多种：SARS-CoV、MERS-CoV、SARS-CoV-2、HCV、西尼罗病毒、登革病毒、普通感冒鼻病毒、RSV、副流感病毒、流感病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒。
18.根据权利要求17所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物源自其的所述WV是冠状病毒。
19.根据权利要求18所述的诱饵转录物，其中所述冠状病毒可以是严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS)、严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2病毒)或中东呼吸综合征相关冠状病毒(MERS)。
20.根据权利要求19所述的诱饵转录物，其中所述冠状病毒是SARS-CoV-2病毒。
21.根据权利要求1-20中任一项所述的诱饵转录物，其中所述诱饵转录物是分离的RNA分子。
22.一种载体，所述载体包含权利要求1-21中任一项所述的诱饵转录物。
23.根据权利要求22所述的载体，所述载体包含与诱饵转录物在转录上相关的启动子。
24.根据权利要求23所述的载体，其中所述启动子是组成型活性启动子、诱导型启动子和/或组织特异性启动子。
25.一种细胞，所述细胞包含权利要求1-21中任一项所述的诱饵转录物或权利要求22-24中任一项所述的载体。
26.根据权利要求25所述的细胞，其中所述细胞或细胞群体是上皮细胞。
27.根据权利要求25或26所述的细胞或细胞群体，其中所述细胞或细胞群体是表面表达ACE2的细胞/细胞群体。
28.一种组合物，所述组合物包含权利要求1-21中任一项所述的诱饵转录物以及合适的转运媒介物和/或载体。
29.根据权利要求28所述的组合物，其中所述载体是水。
30.根据权利要求28-29中任一项所述的组合物，其中所述组合物适于通过气溶胶施用。
31.根据权利要求28-30中任一项所述的组合物，其中所述转运媒介物是转录载体。
32.根据权利要求31所述的组合物，其中所述转录载体是腺病毒载体或慢病毒载体中的任一种。
33.根据权利要求31所述的组合物，其中所述转运媒介物是体外产生的病毒体。
34.根据权利要求33所述的组合物，其中所述转运媒介物是脂质体或脂质纳米颗粒。
35.根据权利要求28-34中任一项所述的组合物，所述组合物被配制用于口服和/或鼻施用。
36.根据权利要求28-35中任一项所述的组合物，所述组合物被配制用于经由吸入施用。
37.一种用于治疗、减弱和/或抑制受试者中ssRNA病毒感染的扩散的方法，所述方法包括向所述受试者提供权利要求1-21中任一项所述的诱饵转录物或权利要求28-36中任一项所述的组合物。
38.根据权利要求37所述的方法，其中所治疗的受试者是感染了WV的受试者。
39.一种用于治疗感染ssRNA病毒的细胞或细胞群体的方法，所述方法包括向所述细胞提供权利要求1-20中任一项所述的诱饵转录物或权利要求21-29中任一项所述的组合物。
40.根据权利要求39所述的方法，其中所述细胞或细胞群体感染了WV。
41.根据权利要求39或40所述的方法，其中向所述细胞提供所述诱饵转录物包括在所述细胞中表达所述诱饵转录物。
42.一种用于治疗、减弱和/或抑制ssRNA病毒感染的扩散的试剂盒，所述试剂盒包含权利要求1-20中任一项所述的诱饵转录物或权利要求21-29中任一项所述的组合物的剂型，以及在治疗、减弱和/或抑制ssRNA病毒感染的扩散中使用其的说明。
43.根据权利要求42所述的试剂盒，其中所述剂型可以是以下中的任一种：滴鼻剂、鼻喷雾剂、喉喷雾剂、可喷雾液体或吸入剂。
44.根据权利要求42或43所述的试剂盒，所述试剂盒还包含用于递送所述剂型的装置。
45.根据权利要求44所述的试剂盒，其中所述装置包括喷雾器、吸入器或雾化器。
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