CN115461445A - 细胞外囊泡的回收方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供能够高效地回收细胞外囊泡的、代替以往技术的方法。更具体而言,本发明提供包含以下(a)和(b)的细胞外囊泡的回收方法:(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;和(b)从所述混合液中分离所述目标粒子。在所述工序(a)和(b)之间,优选进一步包含:使所述混合液的粘度降低的步骤。
Description
技术领域
本发明涉及细胞外囊泡的回收方法等。
背景技术
细胞外囊泡(extracellular vesicles:EV)是从各种细胞中分泌的、具有膜结构的微小的囊泡,存在于血液等体液中或细胞培养液中。被分泌至细胞外的细胞外囊泡中包括:外泌体(exosome)、核外颗粒体(ectosome)、凋亡小泡(apo ptotic bleb)。由于细胞外囊泡是含有承担细胞间的信息传达等功能的各种物质的多样的集团,因此出于诊断、制药等目的而正在被解析。因此,需要开发对这样的解析有用的细胞外囊泡的回收方法。例如,专利文献1中记载了使用了螯合剂的细胞外囊泡的回收方法。专利文献2中记载了,在2种包含聚乙烯吡咯烷酮的聚合物的存在下将含细胞外囊泡的试样离心分离,通过离心分离使2种聚合物二层化,使细胞外囊泡浓缩至其二层的边界,从而分离细胞外囊泡的方法。专利文献3中记载了,在使用了包含聚乙烯吡咯烷酮的细胞外基质形成聚合物的细胞外囊泡的共沉淀法中,通过使聚阳离子性物质共存,而分离细胞外囊泡的方法。
现有技术文献
专利文献
专利文献1:国际公开第2018/070479号
专利文献2:美国专利申请公开第2018/0164197号说明书
专利文献3:国际公开第2017/178472号
发明内容
发明所解决的技术问题
如果能够高效地从含细胞外囊泡的试样中回收细胞外囊泡,则在诊断、制药等的应用中是有希望的。然而,以往的方法中,存在不一定能够高效地回收细胞外囊泡这样的问题。
因此,本发明的目的在于:开发能够高效地回收细胞外囊泡的、代替以往技术的方法。
解决问题的技术手段
本发明人等进行了深入研究的结果,发现通过组合使用聚合物和粒子(固相)的方法,能够以高效率回收细胞外囊泡。更具体而言,通过以下(a)和(b),能够以高效率回收细胞外囊泡,(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;(b)从该混合液中分离所述目标粒子。上述现有技术没有记载或暗示组合使用聚合物和粒子(固相)的方法。
本发明人等还发现:通过在从混合液中分离粒子之前使混合液的粘度降低,能够以更高效率回收细胞外囊泡。超声波处理在均质化(homogenization)等操作中一直被用于脂质双层膜(例如,细胞膜)的破坏。因此,当为了使包含具备脂质双层膜的细胞外囊泡的混合液的粘度降低而进行超声波处理的情况下,预计会引起细胞外囊泡的破坏,其结果,可能使细胞外囊泡的回收率降低。然而,本发明人等发现,即使在为了使包含细胞外囊泡的混合液的粘度降低而进行超声波处理的情况下,也能够出乎意料地提高细胞外囊泡的回收率等,从而完成了本发明。
即,本发明如下。
[1]一种细胞外囊泡的回收方法,其包含以下(a)和(b):
(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;
(b)从所述混合液中分离所述目标粒子。
[2]根据[1]的方法,其包含以下(a)~(c):
(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;
(b)使所述混合液的粘度降低;
(c)从所述(b)中得到的溶液中分离所述目标粒子。
[3]根据[1]或[2]的方法,其在所述目标粒子的分离后,包含:(I)清洗所述目标粒子和/或(II)使细胞外囊泡从所述目标粒子游离。
[4]根据[2]或[3]的方法,其中,通过基于超声波或具有聚合物分解能力的酶的处理来进行粘度的降低。
[5]根据[4]的方法,其中,超声波为干式或水浴式。
[6]根据[4]或[5]的方法,其中,超声波的频率为40kHz以下或950kHz以上的范围内。
[7]根据[1]~[6]中的任一种方法,其中,聚合物为多糖、蛋白质或具有含羰基的亲水性基团的聚乙烯衍生物。
[8]根据[7]的方法,其中,多糖为纤维素中的至少一个羟基的氢原子被羧基烷基或羟基烷基所取代的纤维素衍生物。
[9]根据[1]~[8]中的任一种方法,其中,聚合物具有10kDa以上的重均分子量。
[10]根据[1]~[9]中的任一种方法,其中,(a)的混合液中的聚合物浓度为0.01~10.00重量%。
[11]根据[1]~[10]中的任一种方法,其中,在(a)中,进一步混合(iv)螯合剂。
[12]根据[1]~[11]中的任一种方法,与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为针对四跨膜蛋白的抗体或针对细胞外基质金属蛋白酶诱导物质的抗体。
[13]根据[1]~[12]中的任一种方法,其中,含细胞外囊泡的试样为培养上清试样或来源于动物的液体试样。
[14]一种细胞外囊泡的分析方法,其包含以下(1)和(2):
(1)通过[1]~[13]中的任一种方法,从含细胞外囊泡的试样中分离细胞外囊泡;
(2)对分离得到的细胞外囊泡进行分析。
[15]一种试剂盒,其包含:(a)聚合物、(b)与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质和(c)具有聚合物分解能力的酶,
所述物质为游离形态或固定于粒子的形态,
在所述物质为游离形态的情况下,可以进一步包含粒子。
[16]根据[15]的试剂盒,其中,聚合物为多糖或蛋白质,并且,具有聚合物分解能力的酶为糖分解酶或蛋白质分解酶。
发明效果
通过本发明,能够以更高效率回收细胞外囊泡。因此,与以往的方法相比,本发明能够迅速制备期望的量的细胞外囊泡和高效地制备大量的细胞外囊泡。此外,通过本发明,能够以高纯度回收细胞外囊泡。
附图说明
[图1]图1是表示用PBS、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或各浓度的各种CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图2]图2是表示使以PBS或各浓度的CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料在4℃下一晚或者37℃下1小时的条件下与抗CD9抗体进行免疫沉淀而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图3]图3是表示用PBS、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料的通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于纳米颗粒跟踪分析的粒子数测定结果的图。
[图4]图4是表示将血清和含有5种抗凝固剂(肝素、EDTA、柠檬酸(citrate)、ACD(酸-柠檬酸-葡萄糖,acid-citrate-dextrose)、CPD(柠檬酸-磷酸-葡萄糖,citratephosphate dextrose))的血浆用PBS、CMC-PBS、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(“ED/EG/C”)进行了稀释的检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图5A]图5A是表示用PBS、CMC-PBS、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(“ED/EG/C”)进行了稀释的血清检查材料的、通过使用抗四跨膜蛋白抗体(抗CD63抗体和抗CD81抗体)进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于抗四跨膜蛋白抗体(抗CD63抗体和抗CD81抗体)的免疫印迹的图。
[图5B]图5B是表示用PBS、CMC-PBS、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(“ED/EG/C”)进行了稀释的血清检查材料的通过使用抗CD147抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图6]图6是表示将体液(尿和唾液分别为2个样品。表示为“#1”和“#2”)用PBS、CMC-PBS、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(“ED/EG/C”)进行了稀释的检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图7A]图7A是表示用PBS、各浓度的各种HEC-PBS或CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图7B]图7B是表示用PBS、各浓度的各种HPC-PBS或CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图7C]图7C是表示用PBS、各浓度的各种HPMC-PBS或CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图8]图8是表示用PBS或各浓度的各种PVP-PBS进行了稀释的血清检查材料的、通过使用抗CD9抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图9A]图9A是表示使以PBS或CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料在35~60℃的各温度下与抗CD9抗体进行免疫沉淀而得到的样品的、基于生物素化抗CD9抗体的免疫印迹的图。
[图9B]图9B是表示使以CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料在35~60℃的各温度下与抗CD63抗体进行免疫沉淀而得到的样品的、基于抗CD63抗体的免疫印迹的图。
[图9C]图9C是表示使以CMC-PBS进行了稀释的血清检查材料在35~60℃的各温度下与抗CD81抗体进行免疫沉淀而得到的样品的、基于抗CD81抗体的免疫印迹的图。
[图10]图10是表示用PBS、CMC-PBS(“CMC”)、EDTA/EGTA-PBS(“ED/EG”)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(“ED/EG/C”)进行了稀释的人肺癌细胞H2228的培养上清的、通过使用抗CD9抗体或抗CD63抗体进行的免疫沉淀法而得到的样品的、EML4-ALK mRNA检测量(表示相对于用PBS进行了稀释的样品的倍率变化)的图。
[图11]图11是表示使用了羧甲基纤维素(CMC)的情况下的残留磁粒子量的相对比较的图。Cellulase:纤维素酶处理;Non-US:无超声波处理。照射的超声波的频率为100kHz、200kHz、950kHz和1.6MHz。
[图12A]图12A是表示使用了CMC的情况下的残留磁粒子量的相对比较的图。Non-US:无超声波处理;US:超声波处理(30kHz)。
[图12B]图12B是表示使用了CMC的情况下的CD9的计数的相对比较的图。Non-US:无超声波处理;US:超声波处理(30kHz)。
[图12C]图12C是表示对于通过集磁操作从含CMC的溶液中回收得到的磁粒子,基于通过使用抗CD9抗体的免疫印迹法进行的CD9的检测的、EV回收效率的相对比较的图。Non-US:无超声波处理;US:超声波处理(30kHz)。
[图13]图13是表示使用了CMC的情况下的残留磁粒子量的相对比较的图。Cellulase:纤维素酶处理;Non-US:无超声波处理。作为含CMC的溶液,使用了包含不同的最终浓度的CMC的溶液。
[图14]图14是表示使用了CMC以外的纤维素衍生物的情况下的残留磁粒子量的相对比较的图。Cellulase:纤维素酶处理;Non-US:无超声波处理。作为纤维素衍生物,使用了不同的最终浓度的羟丙基纤维素80kDa(HPC80K)或羟乙基纤维素380kDa(HEC380K)DRICH(ドリッチ)公司)。
[图15]图15是表示基于不同超声波处理的残留磁粒子量的相对比较的图。Cellulase:纤维素酶处理;Non-US:无超声波处理。超声波处理的频率为30kHz(输出10w、20w或者35w)或频率为40kHz(输出70w)。
[图16]图16是表示对于糖分解酶处理后的通过集磁操作回收得到的磁粒子,基于通过使用抗CD9抗体的免疫印迹法进行的CD9的检测的、EV回收效率的相对比较的图。
[图17]图17是表示从磁性粒子游离得到的细胞外囊泡的纳米颗粒跟踪分析的图。Non-US:无超声波处理;CMC:超声波处理(使用CMC);HEC:超声波处理(使用HEC)。
[图18]图18是表示对于通过集磁操作而从含纤维素衍生物的溶液中回收得到的磁粒子,基于通过使用抗CD9抗体的免疫印迹法进行的CD9的检测的、EV回收效率的相对比较的图。Non-US:无超声波处理;CMC:羧甲基纤维素;HEC:羟乙基纤维素。
具体实施方式
1.细胞外囊泡的回收方法
本发明提供细胞外囊泡的回收方法。
细胞外囊泡是由各种细胞分泌的、具有膜结构的微小囊泡。作为细胞外囊泡,例如可举出:外泌体、核外颗粒体和凋亡小泡。优选细胞外囊泡为外泌体。细胞外囊泡还可根据其尺寸而规定。细胞外囊泡的尺寸,例如为30~1000nm,优选为50~300nm,更优选为80~200nm。细胞外囊泡的尺寸的测定,例如,可通过基于细胞外囊泡的布朗运动的方法、光散射法和电阻法等而进行。优选细胞外囊泡的尺寸的测定通过NanoSight(MalvernInstruments公司制)进行。
本发明的回收方法包含以下(a)和(b)的工序:
(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助该物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;
(b)从所述混合液中分离所述目标粒子。
所述工序(a)中,混合(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物。通过混合,(i)的试样中的细胞外囊泡与被固定于(ii)的粒子并且与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质结合,生成借助该物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子。因此,得到包含(i’)借助与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质而与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液。
所述工序(a)中,(i)~(iii)的混合只要能够得到包含(i’)借助该物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液,就没有特别限定。例如,(i)~(iii)的混合可同时或分开进行。在(i)~(iii)的混合分开进行的情况下,可以将(i)~(iii)中的两个进行混合,接下来,将得到的混合液添加至剩余的一个中并进行混合。或,可以将(i)~(iii)中的两个添加至剩余的一个中并进行混合。可以优选将(i)和(ii)添加至(iii)并进行混合。混合可通过转倒混合或搅拌来进行。
(i)的含细胞外囊泡的试样为含有细胞外囊泡的任意试样。优选含细胞外囊泡的试样为生物学性的液体试样。含细胞外囊泡的试样可以在用于本发明的方法前,进行其他处理。作为这样的处理,例如可举出:离心分离、提取、过滤、沉淀、加热、冷冻、冷藏和搅拌。
一个实施方式中,含细胞外囊泡的试样为培养上清试样。培养上清试样可以是细胞培养上清试样,也可以是组织培养上清试样。作为培养的细胞或组织的生物来源,例如可举出:哺乳动物(例如,人、猴等灵长类;小鼠、大鼠、兔子等啮齿类;牛、猪、山羊等家畜;以及马、绵羊等使役动物)、鸟类(例如,鸡)等动物、昆虫、微生物(例如,细菌类)、植物和鱼类。优选地,生物为哺乳动物,优选为人。
另一实施方式中,含细胞外囊泡的试样为来源于动物的液体试样。来源于动物的液体试样是来源于如上所述的生物的体液试样。作为体液试样,例如可举出:血液试样(例如,全血、血清和血浆)、尿、唾液、淋巴液、组织液、脑脊髓液、腹水、汗、精液、泪液、粘液、乳汁、胸腔液、支气管肺泡灌洗液和羊水。优选体液为血液试样、尿或唾液。作为血浆,例如可举出:肝素血浆、柠檬酸血浆、氟化钠血浆、含有ACD(acid-citrate-dextrose)或CPD(citrate phosphate dextrose))的血浆。通常,与培养上清相比,细胞外囊泡的回收在混入比培养上清更多量的蛋白质(例如,白蛋白、溶菌酶、乳铁蛋白、组氨素、过氧化物酶、凝集素、防御素、免疫球蛋白)的体液(例如,血液、尿、唾液)中更为困难。另一方面,通过本发明的方法,从含细胞外囊泡的试样中回收的细胞外囊泡的回收量增加,即使从这样的体液中也能够高效率并且高纯度地回收细胞外囊泡。
作为(ii)的粒子,可使用固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的任意粒子。粒子只要是能够固定与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质,并且,能够从所述工序(a)中得到的混合液中回收(例如,磁性操作或离心分离),就没有特别限定。作为粒子,例如可举出:微粒、纳米粒子、微珠、纳米珠、微球、纳米球。此外,作为粒子,例如可举出:无机粒子(例如,金属粒子、二氧化硅粒子)、有机粒子(例如,聚合物粒子)和有机无机复合粒子。粒子的形状可以是球形,可以是非球形(例如,椭圆形)。
粒子的平均一次粒径没有特别限定。从回收的容易度等观点出发,例如可以为0.001~1000μm,优选为0.01~100μm,更优选为0.1~10μm,进一步优选为0.5~5μm,特别优选为1~3μm。粒子的平均一次粒径可通过BET法进行测定。
从基于磁性操作的回收的容易度等观点出发,优选粒子为磁性粒子。磁性粒子为包含铁、镍、钴或这些的合金(例如,铁氧体)等磁性材料的粒子。磁性粒子优选具有1~3μm的平均一次粒径。
固定于粒子并且与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为具有针对细胞外囊泡的表面标志物的结合能力的物质。作为细胞外囊泡的表面标志物,例如可举出:四跨膜蛋白(EV膜特异性4次贯穿膜蛋白,例如,CD9、CD63、CD81)、细胞外基质金属蛋白酶诱导物质(例如,CD147)、热休克蛋白(HSP)70、HSP90、主要组织相容性复合体(MHC)I、溶酶体关联膜蛋白(LAMP)1、细胞间粘附分子(ICAM)-1、整联蛋白、神经酰胺、胆固醇、磷脂酰丝氨酸、Annexins、Caveolin-I、EpCAM。细胞外囊泡的表面标志物优选为四跨膜蛋白(例如,CD9、CD63)或细胞外基质金属蛋白酶诱导物质(例如,CD81或CD147)。
作为与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质,例如可举出:针对所述细胞外囊泡的表面标志物的抗体、适体、磷脂酰丝氨酸结合蛋白、神经酰胺结合蛋白。本发明中,作为针对细胞外囊泡的表面标志物的亲和性物质,可使用单一的物质或多种(例如,2种、3种、4种)物质。
从针对细胞外囊泡的表面标志物的特异性的确保和制备的简便性等观点出发,优选与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质可以是针对细胞外囊泡膜的表面标志物的抗体。作为抗体,例如可举出:全长抗体(例如,单克隆抗体、多克隆抗体)和其抗原结合性片段。就抗原结合性片段而言,是保持针对作为对象的EV表面标志物的结合性的抗体片段即可,可举出Fab、Fab’、F(ab’)2、scFv等。本发明中,可使用单一的抗体或多种(例如,2种、3种、4种)抗体。
作为(iii)的聚合物,可以使用聚合物本身,但由于使粘度降低易于进行混合,因此优选为使用将聚合物溶解于水溶液(例如,缓冲液)而得到的聚合物水溶液。聚合物水溶液中的聚合物浓度根据聚合物的种类和聚合度等因子而变动,例如可以为0.01~30重量%,优选为0.02~25重量%,更优选为0.05~20重量%,进一步优选为0.1~15重量%,特别优选为0.2~10重量%。优选地,聚合物可以为水溶性聚合物。水溶性聚合物是指,4~80℃(优选为4~37℃)中的任一温度下针对水的溶解度为0.01重量%以上的聚合物。水溶性聚合物在4~80℃(优选为4~37℃)下针对水的溶解度可以优选为0.05重量%以上,更优选为0.1重量%以上。
就聚合物而言,为了达成本发明的目的,例如,作为20~30℃下的1~20重量%水溶液中的粘度,可以具有1.5mPa·s以上的值。作为聚合物在上述条件下的粘度,可以优选为5mPa·s以上,更优选为10mPa·s以上,进一步优选为20mPa·s以上,并且进一步优选为30mPa·s以上,特别优选为35mPa·s以上。作为聚合物在上述条件下的粘度,可以优选为30000mPa·s以下,更优选为20000mPa·s以下,进一步优选为10000mPa·s以下,并且进一步优选为5000mPa·s以下,特别优选为1000mPa·s以下。更具体而言,作为聚合物在上述条件下的粘度,可以优选为5~30000mPa·s,更优选为10~20000mPa·s,进一步优选为20~10000mPa·s,并且进一步优选为30~5000mPa·s,特别优选为35~1000mPa·s。
此外,就聚合物而言,为了达成本发明的目的,例如,作为以使得聚合物成为2重量%的方式溶解在磷酸缓冲生理盐水(PBS)中的PBS溶液中的30℃下的粘度,可以具有1.5mPa·s以上的值。作为聚合物在上述条件下的粘度,可以优选为5mPa·s以上,更优选为10mPa·s以上,进一步优选为20mPa·s以上,并且进一步优选为30mPa·s以上,特别优选为35mPa·s以上。作为聚合物在上述条件下的粘度,可以优选为30000mPa·s以下,更优选为20000mPa·s以下,进一步优选为10000mPa·s以下,并且进一步优选为5000mPa·s以下,特别优选为1000mPa·s以下。更具体而言,作为聚合物在上述条件下的粘度,可以优选为5~30000mPa·s,更优选为10~20000mPa·s,进一步优选为20~10000mPa·s,并且进一步优选为30~5000mPa·s,特别优选为35~1000mPa·s。
聚合物的粘度,例如,可通过以下方法进行测定:对使液体试样通过旋转体旋转时在转子的外周产生的液体的粘度摩擦扭矩进行检测的方法(使用旋转粘度计的方法)或在充满试样的测定管内,使落下锤自由落下,对其落下时间进行测量的方法(使用落球粘度计的方法)。此外,聚合物的粘度,例如,可通过以下方法进行测定:在液体试样中放入振动体(粘度传感器)并使其振动时,传感器的振动振幅随着液体粘度增大而因其粘性电阻而受到抑制、降低,以克服该进行抑制的力并保持恒定振幅的方式增加振动子驱动电流,对此时的输入电流量进行测定的方法(使用振运动黏度计的方法)。聚合物的粘度可优选使用粘性解析装置(例如,RHEOLOGY SPECTROMETER SKR100,YAMATO SCIENTIFIC公司)进行测定。
此外,为了达成本发明的目的,聚合物例如可以具有10kDa以上的重均分子量。作为聚合物的重均分子量,可以优选为12kDa以上,更优选为14kDa以上,进一步优选为16kDa以上,并且进一步优选为18kDa以上,特别优选为20kDa以上。作为聚合物的重均分子量,优选为5000kDa以下,更优选为3000kDa以下,进一步优选为2000kDa以下,并且进一步优选为1000kDa以下,特别优选为500kDa以下。更具体而言,作为聚合物的重均分子量,优选为12~5000kDa,更优选为14~3000kDa,进一步优选为16~2000kDa,并且进一步优选为18~1000kDa,特别优选为20~500kDa。
作为聚合物,可使用具有如上所述的特性的任意聚合物。作为这样的聚合物,例如可举出:多糖、蛋白质、聚醚化合物、具有亲水性基团的聚乙烯衍生物。
多糖为糖聚合物。作为多糖,例如可举出:单纯多糖(例如,纤维素、纤维素衍生物、淀粉、糖原)和复合多糖(例如,透明质酸、硫酸软骨素、肝素)。从细胞外囊泡的回收效率的提高、水溶性的提高、入手的容易性等观点出发,多糖优选为纤维素衍生物。
纤维素衍生物为纤维素的至少一个羟基的氢原子被亲水性基团所取代的纤维素衍生物。作为纤维素衍生物中的亲水性基团,例如可举出:羧基烷基(例如,羧基C1~6烷基)、羟基烷基(例如,羟基C1~6烷基)。纤维素衍生物中的亲水性基团优选为羧基烷基或羟基烷基。
作为羧基烷基,例如可举出:羧甲基、羧基乙基(1-羧基乙基、2-羧基乙基)、羧基丙基(1-羧基丙基、2-羧基丙基、3-羧基丙基)、羧基异丙基(1-羧基-2-甲基乙基、2-羧基-2-甲基乙基)、羧基丁基(1-羧基丁基、2-羧基丁基、3-羧基丁基、4-羧基丁基)、羧基叔丁基、羧基戊基(1-羧基戊基、2-羧基戊基、3-羧基戊基、4-羧基戊基、5-羧基戊基)、羧基己基(1-羧基己基、2-羧基己基、3-羧基己基、4-羧基己基、5-羧基己基、6-羧基己基)。
作为羟基烷基,例如可举出:羟甲基、羟乙基(1-羟乙基、2-羟乙基)、羟丙基(1-羟丙基、2-羟丙基、3-羟丙基)、羟基异丙基(1-羟基-2-甲基乙基、2-羟基-2-甲基乙基)、羟基丁基(1-羟基丁基、2-羟基丁基、3-羟基丁基、4-羟基丁基)、羟基叔丁基、羟基戊基(1-羟基戊基、2-羟基戊基、3-羟基戊基、4-羟基戊基、5-羟基戊基)、羟基己基(1-羟基己基、2-羟基己基、3-羟基己基、4-羟基己基、5-羟基己基、6-羟基己基)。
作为纤维素衍生物的具体例,可举出:羧甲基纤维素(CMC)、羟乙基纤维素(HEC)、羟丙基纤维素(HPC)或羟丙基甲基纤维素(HPMC)。
此外,纤维素衍生物还包含纳米纤维素衍生物。纳米纤维素衍生物为纳米纤维素的衍生物。纳米纤维素是指,具有纳米量级的纤维宽度的纤维状纤维素。纳米纤维素的纤维宽度,例如可以为500nm以下,优选为200nm以下,更优选为100nm以下,进一步优选为50nm以下,并且进一步优选为10nm以下,特别是更优选为5nm以下。
蛋白质是也被称为多肽的氨基酸聚合物。作为蛋白质,例如可举出:明胶、酪蛋白、白蛋白、胶原蛋白、海藻酸。
聚醚化合物是重复单元的主链中包含醚结构的聚合物。作为聚醚化合物,例如可举出聚亚烷基氧基化合物(例如,聚C1~6亚烷基氧基化合物)。作为聚亚烷基氧基化合物,例如可举出:聚乙二醇、聚丙二醇。聚亚烷基氧基化合物优选为聚乙二醇。
具有亲水性基团的聚乙烯衍生物是至少一个氢原子被亲水性基团所取代的聚乙烯衍生物,优选为亚甲基单元中的1个氢原子被亲水性基团所取代的聚乙烯衍生物。作为聚乙烯衍生物的亲水性基团,例如可举出:含羰基的亲水性基团、含羧基的亲水性基团、含氮亲水性基团、含环(碳环或杂环)的亲水性基团。聚乙烯衍生物的亲水性基团优选为含羰基的亲水性基团、含氮亲水性基团或含杂环的亲水性基团,更优选为内酰胺(例如,α-内酰胺、β-内酰胺、γ-内酰胺、δ-内酰胺、ε-内酰胺)。作为具有亲水性基团的聚乙烯衍生物的具体例,可举出聚乙烯吡咯烷酮。
多糖、蛋白质、具有亲水性基团的聚乙烯衍生物和聚醚化合物等聚合物中还包含它们的盐。作为盐,例如可举出:金属(例如,锂、钠、钾、铷和铯等一价的金属和钙、镁和锌等二价的金属)的盐和无机碱(例如,氨)的盐。
聚合物优选为多糖、蛋白质或聚醚化合物,更优选为多糖或蛋白质,进一步优选为多糖,特别优选为纤维素衍生物。
就混合液中的聚合物的浓度而言,只要是与不包含聚合物的情况相比,能够以高效率回收细胞外囊泡,并且能够将聚合物溶解在混合液中的浓度,就没有特别限定。这样的浓度根据聚合物的种类而不同,例如可以为0.01~10.00重量%,优选为0.05~7.50重量%,更优选为0.10~5.00重量%。
所述工序(a)中的混合在足以生成借助与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质而与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子的条件下进行。这样的温度条件,例如为4~60℃,优选为15~50℃,更优选为20~45℃。混合液的制备所需要的时间,例如为30秒以下,优选为20秒以下,更优选为15秒以下。通过在这样的条件下进行混合,能够增加与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子的量。
本发明的方法在所述工序(a)的混合后,进一步包含孵育混合液的步骤。就孵育时间而言,根据混合液的制备所需要的时间、细胞外囊泡的期望的回收量、孵育温度等因子而变动,例如为48小时以下,优选为24小时以下,更优选为120分钟以下,进一步优选为60分钟以下。从迅速处理等观点出发,孵育时间可以进一步优选为30分钟以下,特别优选为20分钟以下、10分钟以下或5分钟以下。孵育温度与上述混合中的温度条件同样。
在所述工序(b)中,从所述工序(a)中得到的混合液中分离目标粒子。目标粒子借助与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质而与细胞外囊泡进行了结合。因此,通过目标粒子的分离,能够分离与目标粒子进行了结合的细胞外囊泡。
从混合液中的目标粒子的分离可通过任意的方法进行。通过该分离,能够实现将固定于固相(目标粒子)的因子与不固定于固相(目标粒子)的因子分离的、所谓的B(结合(bound))/F(游离(free))分离。例如,可通过对工序(a)中得到的混合液进行离心分离,接着除去上清,而从混合液中分离目标粒子。此外,在工序(a)中使用磁性粒子的情况下,可通过以集磁操作回收目标粒子,来从工序(a)中得到的混合液中分离目标粒子。
优选的实施方式中,本发明的方法可以进一步包含使上述工序(a)中得到的混合液的粘度降低的步骤。即,本实施方式中,本发明的方法可以包含以下(a)~(c):
(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;
(b)使所述混合液的粘度降低;
(c)从所述(b)中得到的溶液中分离所述目标粒子。
本实施方式中的工序(a)和(c)可分别与上述方法中的工序(a)和(b)同样地进行。
所述优选的实施方式中的工序(b)可通过能够使所述工序(a)中得到的混合液的粘度降低的任意方法来进行。从简便的实施等观点出发,该工序(b)优选通过基于超声波或具有聚合物分解能力的酶的处理进行。
基于超声波的处理可通过干式或水浴式进行。基于干式超声波的处理是指,可通过不通过水浴等而将超声波的产生部分与包含目标溶液(例如,本发明中为(a)中得到的混合液)的容器(例如,管)直接或者间接性地接触来达成的直接性的超声波处理。基于水浴式超声波的处理是指,可通过将包含目标溶液的容器(例如,管)浸泡在超声波的产生装置的水浴中来达成的间接性的超声波处理。超声波的处理时间只要能降低混合液的粘度,就没有特别限定,根据超声波的条件等因子而变动,例如为10秒~30分钟,优选为20秒~20分钟,更优选为30秒~10分钟。
就超声波的频率(Hz)和输出(w)而言,只要能够降低混合液的粘度,进而,在所述工序(c)中,易于从所述工序(b)中得到的溶液中分离目标粒子,就没有特别限定。这样的频率例如为5kHz~5.0MHz。从任意的超声波的产生振动子或产生装置能够广泛利用的频率区域的采用等的观点出发,频率可以优选为10kHz~3.0MHz,更优选为20kHz~2.5MHz,进一步优选为30kHz~2.0MHz。输出例如为5~300w。从与频率同样的观点出发,输出可以优选为10~200w。
特定的实施方式中,超声波的频率(Hz)可以以使得能够显著提高与目标粒子进行了结合的细胞外囊泡的回收效率的方式进行设定。这样的频率例如可以为40kHz以下的范围(优选为10kHz~40kHz,更优选为20kHz~40kHz,进一步优选为30kHz~40kHz)或950kHz以上的范围(优选为950kHz~3.0MHz,更优选为950kHz~2.5MHz,进一步优选为950kHz~2.0MHz)。
基于具有聚合物分解能力的酶的处理可根据所述工序(a)中使用的聚合物的种类,通过适宜选择并使用具有该聚合物的分解能力的酶来进行。
例如,(a)中使用的聚合物为纤维素衍生物等多糖时,可使用糖分解酶。作为糖分解酶,例如可举出:纤维素酶、糖苷酶、木聚糖酶、乳糖酶、淀粉酶、几丁质酶、蔗糖酶、麦芽糖酶、神经氨酸苷酶、转化酶、透明质酸酶、溶菌酶。此外,作为糖分解酶,可使用内切(endo)型酶或外切(exo)型酶。从短时间内效率良好地切断聚合物,进而效率良好地降低粘度的观点出发,糖分解酶优选为内切型酶。糖分解酶可根据多糖的种类而进行选择。例如,(a)中使用的聚合物为纤维素衍生物时,可使用纤维素酶、内切葡聚糖酶等分解纤维素衍生物的糖分解酶。
此外,(b)中使用的聚合物为蛋白质时,可使用蛋白质分解酶。作为蛋白质分解酶,例如可举出:天冬氨酸蛋白酶、丝氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶、金属蛋白酶。此外,作为蛋白质分解酶,可使用内切蛋白酶(例如,胰朊酶、糜蛋白酶、弹性蛋白酶、胶原酶)或外切蛋白酶(例如,亮氨酸氨基肽酶、羧基肽酶、二肽氨基肽酶)。从短时间内效率良好地切断聚合物,进而效率良好地降低粘度的观点出发,蛋白质分解酶可以优选为内切蛋白酶。
在本发明中使用的与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为具有针对细胞外囊泡的表面标志蛋白的结合能力的物质的情况下,从防止表面标志蛋白的分解的观点出发,具有聚合物分解能力的酶优选为糖分解酶。
作为基于具有聚合物分解能力的酶的处理的条件,例如可应用通常的酶反应的条件(例如,25~40℃下1~60分钟)。
本发明中使用的聚合物可以根据使混合液的粘度降低的处理的种类而适宜选择。例如,在使混合液的粘度降低的处理为超声波处理的情况下,作为聚合物,例如可适宜选择多糖、蛋白质、具有亲水性基团的聚乙烯衍生物或聚醚化合物。另一方面,在使混合液的粘度降低的处理为基于具有聚合物分解能力的酶的处理的情况下,从这样的酶的入手的容易性等观点出发,聚合物优选为多糖(优选为纤维素衍生物)或蛋白质。在本发明中使用的与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为具有针对细胞外囊泡的表面标志蛋白的结合能力的物质的情况下,从防止表面标志蛋白的分解的观点出发,聚合物优选为多糖。
就本发明的方法而言,为了提高细胞外囊泡的回收率,在所述工序(a)的混合中,可以组合使用螯合剂。可通过用螯合剂处理含细胞外囊泡的试样,来提高细胞外囊泡的回收率(例如,国际公开第2018/070479号)。
螯合剂为具有能够与金属离子配位结合的配位部分的化合物或其盐。配位部分的个数优选为2个以上,更优选为3个以上(例如,3个或6个)。作为充当配位部分的配位原子,例如可举出:氧原子、磷原子、氮原子、硫原子和氯原子。配位原子优选为氧原子或磷原子,更优选为氧原子。作为充当配位部分的配位基团,例如可举出具有所述配位原子的基团。配位基团优选为羧酸基或磷酸基,更优选为羧酸基。
作为螯合剂,例如可举出:羟乙基亚氨基二乙酸(HIDA)、氨三乙酸(NTA)、羟乙基乙二胺三乙酸(HEDTA)、乙二胺四乙酸(EDTA)、乙二胺四(亚甲基膦酸)(EDTMP)、乙二醇醚二胺四乙酸(EGTA)、以及它们的盐。作为盐,例如可举出:金属盐(例如,钠盐、钾盐等一价的金属盐和钙盐、镁盐等二价的金属盐)、无机盐(例如,氟化物、氯化物、溴化物、碘化物等卤化物盐和铵盐)、有机盐(例如,被烷基所取代的铵盐)和酸加成盐(例如,与硫酸、盐酸、氢溴酸、硝酸、磷酸等无机酸形成的盐和乙酸、草酸、乳酸、柠檬酸、三氟甲磺酸、三氟乙酸等有机酸等的盐)。
螯合剂也可以是通常用作临床检查用的采血管中包含的成分的螯合剂。作为这样的螯合剂,例如可举出:EDTA、EGTA、NTA、HEDTA、EDTMP、HIDA、柠檬酸和它们的盐。本发明中,这样的螯合剂的使用从临床应用的观点出发也是优选的。
本发明中,可以单独使用1种螯合剂,可以组合使用多种(例如,2种、3种、4种)螯合剂。螯合剂的浓度也根据与螯合剂组合使用的其他成分的种类和浓度等因子而变动,例如为10mM~1000mM。
本发明的方法在借助与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质而与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子的分离后,可以进一步包含:(I)清洗该目标粒子和/或(II)使细胞外囊泡从该目标粒子游离。
目标粒子的清洗可使用水溶液(例如,缓冲液)进行。清洗次数通常为1~3次。
细胞外囊泡从目标粒子的游离,可通过能够使与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质和细胞外囊泡之间的结合解离的任意方法来进行。作为这样的方法,例如可举出:使用了酸、碱的处理、热处理。
2.细胞外囊泡的分析方法
本发明还提供包含以下(1)和(2)的细胞外囊泡的分析方法:
(1)从含细胞外囊泡的试样中分离细胞外囊泡;
(2)对分离得到的细胞外囊泡进行分析。
本发明的分析方法中的工序(1)可与本发明的细胞外囊泡的回收方法同样地进行。
在所述工序(2)中,作为细胞外囊泡的分析中的分析对象,例如可举出:细胞外囊泡中包含的成分(例如,细胞外囊泡的内部中包含的成分、细胞外囊泡的膜成分、存在于细胞外囊泡的膜表面的成分)和细胞外囊泡本身。
细胞外囊泡中包含的成分的分析可定性或定量地进行。这样的分析也是一个成分或多个成分的分析。作为待分析的成分,例如可举出:蛋白质、核酸(例如,RNA、DNA)、糖、脂质、氨基酸、维生素类、聚胺和肽。通过本发明,由于细胞外囊泡的回收量增加,因此能够以高精度分析细胞外囊泡中的成分。
成分的分析可通过任意的方法进行。
在待分析的成分为蛋白质的情况下,作为分析方法,例如可举出免疫测定、质谱法。作为免疫测定,例如可举出:直接竞争法、间接竞争法和夹心法。此外,作为这样的免疫测定,可举出:化学发光免疫测定(CLIA)[例如,化学发光酶免疫测定法(CLEIA)]、免疫比浊法(TIA)、酶免疫测定法(EIA)(例如,直接竞争ELISA、间接竞争ELISA和夹心ELISA)、放射免疫测定(RIA)、乳胶凝集反应法、荧光免疫测定(FIA)和免疫层析法、免疫印迹、免疫染色、荧光激活细胞分选(fluorescence activated cell sorting,FACS)。在分析多个成分的情况下,可以进行蛋白质组学分析。
在待分析的成分为核酸的情况下,作为分析方法,例如可举出:使用探针的杂交法、使用引物(例如,2、3或4个引物)的基因扩增法、质谱法。
在待分析的成分为蛋白质和核酸以外的成分的情况下,作为分析方法,例如可举出:免疫测定、质谱法。在分析多个成分的情况下,可以进行代谢组学分析。
细胞外囊泡本身的分析还可定性或定量地进行。例如,细胞外囊泡的分析可通过粒子分析机器、电子显微镜、流式细胞仪(Flowcytometer)等机器进行。该情况下,可对细胞外囊泡的粒子数、粒子的尺寸和形状、以及它们的分布进行分析。
据报道,细胞外囊泡可能参与癌等各种疾病(国际公开第2014/003053号;国际公开第2014/152622号;Taylor et al.,Gynecologic Oncol,100(2008)pp13-21)。因此,本发明例如可用于基于细胞外囊泡的诊断和制药。
3.试剂盒
本发明还提供能够用于所述本发明的方法的试剂盒。
本发明的试剂盒包含以下(a)~(c):
(a)聚合物;
(b)与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质;
(c)具有聚合物分解能力的酶。
本发明的试剂盒中,与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为游离形态或固定于粒子的形态。在与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为游离形态的情况下,本发明的试剂盒可以进一步包含粒子。本发明的试剂盒还可以进一步包含螯合剂。聚合物、与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质、具有聚合物分解能力的酶和螯合剂的定义、实例和优选的实例与本发明的方法中所述的同样。本发明的试剂盒例如可用于简便并且迅速地实施本发明的方法。
实施例
以下,将通过实施例对本发明详细地进行说明,但本发明不限于这些实施例。
(实施例1)
对市售的3种CMC钠盐(以下,简称为“CMC”。CAS No.9004-32-4,NACALAI TESQUE公司#07326-95(平均分子量不明),SIGMA-ALDRICH公司#C5678(平均分子量90kDa),#C4888(平均分子量250kDa))的、EV回收的效果进行了探讨。EV回收使用抗CD9抗体进行。
将健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,将200μL的血清用200μL的PBS(2.9mM NaH2PO4,9.0mM Na2HPO4,137mM NaCl)、EDTA/EGTA-PBS(以使得将血清稀释后的各终浓度为50mM的方式包含EDTA和EGTA的PBS)(ED/EG)或终浓度0.2~2.5重量%的CMC-PBS(以使得将血清稀释后的终浓度为0.2~2.5重量%的方式溶解有CMC的PBS)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFETECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在4℃下旋转反应一晚后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。在免疫印迹用样品中,通过用SDS处理包含外泌体的样品,而破坏外泌体,外泌体的标志蛋白(例如,CD9)被放出至样品溶液中。通过使用进行了生物素化的抗CD9抗体(本公司制)的免疫印迹法对免疫沉淀效率进行了解析(图1)。在全部的3种CMC中,与PBS稀释样品相比,观察到EV回收效率提高的效果。
实施例中使用的CMC的各物理性质值总结于以下的表1中。
[表1]
表1.实施例中使用的CMC的列表
(实施例2)
对CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888)的浓度(0.06重量%~1.0重量%的终浓度)和反应温度(4℃,37℃)对EV回收的效果进行了探讨。
将健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,将200μL的血清用200μL的PBS或者CMC-PBS(以使得血清稀释后的终浓度为0.06~1.0重量%的方式溶解有CMC的PBS)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在4℃下旋转反应一晚或者在37℃下旋转反应1小时后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过使用进行了生物素化的抗CD9抗体的免疫印迹法对EV的回收效率进行了解析(图2)。在反应温度4℃和37℃下,CMC的终浓度0.25重量%~1重量%的范围内,与PBS稀释样品相比,观察到EV回收效率提高的效果。
(实施例3)
通过纳米颗粒跟踪分析(NanoSight LM10,QUANTUM DESIGN公司)对CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888)对EV回收的效果进行了探讨。
将200μL的健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,在其上清中用200μL的PBS、EDTA/EGTA-PBS(以使得血清稀释后的各终浓度为50mM的方式包含EDTA和EGTA的PBS)(ED/EG)或CMC-PBS(以使得血清稀释后的终浓度为0.5重量%的方式溶解有CMC的PBS)(CMC)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在37℃下旋转反应30分钟后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用40μL BRUB(Britton&Robinson Universal Buffer)(pH2.6)进行5分钟反应后,用20μL的1M Tris-HCl(pH8.0)进行中和而使细胞外囊泡从抗体磁性粒子游离。通过Qubit protein assay(LIFE TECHNOLOGIES公司)对总蛋白质浓度进行定量后,添加PBS450μL通过NanoSight对粒子数进行了解析(图3)。在用CMC进行稀释的条件下,观察到EV的总回收粒子数和总蛋白质单位重量的粒子数的增加,显示了以高纯度回收了细胞外囊泡。
(实施例4)
在血清和含有5种抗凝固剂(肝素、EDTA、柠檬酸(citrate)、ACD(酸-柠檬酸-葡萄糖;acid-citrate-dextrose)、CPD(柠檬酸-磷酸-葡萄糖;citrate phosphate dextrose))的血浆中,对CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888)的EV回收的效果进行了探讨。
将200μL的健康人血清和含抗凝固剂的健康人血浆在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,在其上清中用200μL的PBS、EDTA/EGTA-PBS(以使得血清或血浆稀释后的各终浓度为50mM的方式包含EDTA和EGTA的PBS)(ED/EG)、CMC-PBS(以使得血清或血浆稀释后的终浓度为0.5重量%的方式溶解有CMC的PBS)(CMC)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(以使得血清或血浆稀释后的各个终浓度为37.5mM/37.5mM/0.5重量%的方式包含EDTA、EGTA和CMC的PBS)(ED/EG/C)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在37℃下旋转反应1小时后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过使用进行了生物素化的抗CD9抗体的免疫印迹法对免疫沉淀效率进行了解析(图4)。无论是哪种抗凝固剂,都在血浆检查材料中观察到基于CMC的EV回收效率提高的效果。此外,通过将CMC和螯合剂组合,EV回收效率进一步提高。
(实施例5)
对CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888)对EV回收的效果进行了探讨,所述EV回收使用了针对CD9以外的2种四跨膜蛋白(CD63和CD81)和细胞外基质金属蛋白酶诱导物质(CD147)的抗体。
将200μL的健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,将其上清用200μL的PBS、EDTA/EGTA-PBS(血清稀释后的各终浓度为50mM)(ED/EG),CMC-PBS(血清稀释后的终浓度为0.5重量%)(CMC)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(血清稀释后的各个终浓度为37.5mM/37.5mM/0.5重量%)(ED/EG/C)进行稀释,添加固定有抗CD63抗体(8A12:COSMO BIO公司)、抗CD81抗体(M38:ABCAM公司)和抗CD147抗体(MEM-M6/1:ABCAM公司)的各抗体的磁性粒子(Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在4℃下旋转反应一晚后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过基于抗CD63抗体(本公司制)、抗CD81抗体(12C4:COSMO BIO公司)和生物素化抗CD9抗体(本公司制)的免疫印迹法对EV回收效率进行了解析(图5A和图5B)。在使用了针对CD63、CD81和CD147的抗体的情况下,也观察到基于CMC的EV回收效率提高的效果。此外,通过将CMC和螯合剂组合,EV回收效率进一步提高。
(实施例6)
在2种体液(尿和唾液)中,对CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888)对EV回收的效果进行了探讨。
将200μL的健康人尿和唾液(分别为2个样品。表示为“#1”和“#2”)在15000×g、4℃下进行15分钟离心,通过0.22μm过滤器进行过滤后,用200μL的PBS、EDTA/EGTA-PBS(尿或唾液稀释后的各终浓度为50mM)(ED/EG)、CMC-PBS(尿或唾液稀释后的终浓度为0.5重量%)(CMC)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(尿或唾液稀释后的各个终浓度为37.5mM/37.5mM/0.5重量%)(ED/EG/C)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在37℃下旋转反应1小时后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过使用进行了生物素化的抗CD9抗体的免疫印迹法对免疫沉淀效率进行了解析(图6)。不仅在血清、血浆中,在尿和唾液中也观察到基于CMC的EV回收效率提高的效果。
(实施例7)
对下述表2表示的纤维素衍生物(0.13重量%~4.0重量%的各终浓度)的、EV回收的效果进行了探讨。
将健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,将200μL的血清用200μL的PBS、CMC-PBS(血清稀释后的终浓度为0.5重量%)(CMC)或溶解于PBS中的纤维素衍生物(血清稀释后的各终浓度为0.13~4.0重量%)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在37℃下旋转反应1小时后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过使用进行了生物素化的抗CD9抗体的免疫印迹法对EV的回收效率进行了解析(图7A~C)。即使在CMC以外的3种纤维素衍生物中,与PBS稀释样品相比,都观察到EV回收效率提高的效果(HEC在0.13重量%~2.0重量%的范围,HPC在0.25重量%~4.0重量%的范围,HPMC在0.25重量%~2.0重量%的范围中)。
[表2]
表2.实施例中使用的纤维素衍生物的列表(制造者都是SIGMA-ALDRICH公司)
(实施例8)
对下述表3表示的聚乙烯吡咯烷酮(1重量%、2重量%、4重量%的各终浓度)的、EV回收的效果进行了探讨。
将健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,将200μL的血清用200μL的PBS或溶解于PBS中的聚乙烯吡咯烷酮(血清稀释后的各终浓度为1.0~4.0重量%)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)的磁性粒子(Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在37℃下旋转反应1小时后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过使用进行了生物素化的抗CD9抗体的免疫印迹法对EV的回收效率进行了解析(图8)。聚乙烯吡咯烷酮在1.0重量%~4.0重量%的范围内,与PBS稀释样品相比,观察到EV回收效率提高的效果。
[表3]
表3.实施例中使用的聚乙烯吡咯烷酮(PVP)的列表
(实施例9)
对于CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888),对35℃~60℃的各反应温度下的EV回收的效果进行了探讨。
将健康人血清在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,将100μL的血清用100μL的PBS或CMC-PBS(血清稀释后的终浓度为0.5重量%)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体(本公司制)、抗CD63抗体(8A12:COSMO BIO公司)或抗CD81抗体(12C4:COSMO BIO公司)的磁性粒子(Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司))并使其为0.26mg/mL。在各反应温度下反应5分钟后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行稀释而作为免疫印迹用样品。通过基于进行了生物素化的抗CD9抗体(本公司制)、抗CD63抗体(本公司制)和抗CD81抗体(12C4:COSMO BIO公司)的免疫印迹法对EV的回收效率进行了解析(图9A~图9C)。通过CMC添加而在35℃~60℃的各反应温度下观察到EV回收效率提高的效果。进而在40℃以上的高温条件下通过CMC添加而观察到EV回收效率提高的、更高的效果。此外,观察到基于CMC的EV回收效率提高效果在短时间的反应中也有效果。
(实施例10)
对实施例7中使用的纤维素衍生物和实施例8中使用的聚乙烯吡咯烷酮的PBS溶液中的粘度进行测定。具体而言,将以成为2重量%的方式将各纤维素衍生物或聚乙烯吡咯烷酮溶解于PBS中而制备的各PBS溶液,使用粘性解析装置RHEOLOGY SPECTROMETER SKR100(YAMATO SCIENTIFIC公司),作为在30℃、测定时间60秒下,在200rpm、400rpm、600rpm、800rpm的各旋转速度下测定得到的结果的平均而求得(表4)。
[表4]
表4.实施例中使用的纤维素衍生物和聚乙烯吡咯烷酮的粘度
(实施例11)
对通过使用了CMC(SIGMA-ALDRICH公司#C4888)和针对四跨膜蛋白(CD9和CD63)的抗体的免疫沉淀法进行的EV回收和来自EV的标志物(EML4-ALK融合基因)RNA的检测的效果进行了探讨。
使用在无血清培养基中培养了3天的人肺癌细胞H2228的培养上清作为样品。将培养上清在2000×g、4℃下进行5分钟离心,通过0.22μm过滤器(MILLIPORE公司制)过滤后,使用Amicon Ultra-15(MILLIPORE公司制)浓缩至100倍。
将浓缩物用等量的PBS、EDTA/EGTA-PBS(稀释了浓缩物后的各终浓度为50mM)(ED/EG)、CMC-PBS(稀释了浓缩物后的终浓度为0.5重量%)(CMC)或EDTA/EGTA/CMC-PBS(稀释了浓缩物后的各个终浓度为37.5mM/37.5mM/0.5重量%)(ED/EG/C)进行稀释,分别添加固定有抗CD9抗体(本公司制)、抗CD63抗体(本公司制)的各抗体的Dynabeads M-280tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司)并使其为0.26mg/mL。在4℃下旋转反应一晚后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),将分离得到的磁性粒子用PBS-T清洗3次,使用miRNeasy micro kit(QIAGEN公司制)纯化总RNA。使用SuperScript(商标)IVFirst-Strand Synthesis System(Thermo Fisher Scientific公司制)从纯化的总RNA制成cDNA,使用Droplet Digital PCR(BioRad公司制)对EML4-ALK mRNA进行了定量(图10)。
EML4-ALK mRNA的检测使用了以下的表5表示的序列的引物和荧光探针。作为荧光探针,使用了在5’末端具有荧光物质HEX、在探针的内部具有ZEN猝灭剂以及在3’末端具有Iowa Black(注册商标)猝灭剂(IABkFQ)的双猝灭剂探针。通过使用表5表示的序列的引物和荧光探针,可检测EML4-ALK融合基因的变体3a和3b。
[表5]
表5.EML4-ALK mRNA的检测用探针和引物
对通过免疫沉淀法回收的EV中包含的EML4-ALK进行了检测。通过使用CMC,观察到EML4-ALK mRNA检测量增大、EV回收效率的提高效果。此外,通过添加螯合剂,观察到EML4-ALK mRNA检测量进一步增大、EV回收效率进一步提高的效果。
(实施例12)
超声波对磁性粒子的集磁效率的效果的探讨(1)
通过在羧甲基纤维素(CMC)存在下使细胞外囊泡(EV)和抗体结合磁性粒子反应后,照射(水槽)超声波,而对超声波对磁性粒子的集磁效率的效果进行了探讨。
将从固定有抗CD9抗体的磁性粒子(Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFETECHNOLOGIES公司#14204))final 1.2mg/mL和DU145(人前列腺癌细胞株)而回收的EV35.4ng添加至2mL管中的EDTA/EGTA/CMC-PBS(分别为终浓度50mM/50mM/0.5重量%)溶液600μL中,在37℃下反应1小时而使其结合,使用超声波产生装置(水浴式)((株式会社)KAIJO QUAVAmini QR-001和QR-003),在100kHz(50w)、200kHz(100w)、950kHz(100w)、1.6MHz(100w)的各频率下对管照射3分钟。作为阴性对照,准备不照射的组。此外,准备代替超声波的照射而添加溶液的1/150分量的纤维素酶(Cellulase from Asp ergillussp.SIGMA#C2605-50ML),在37℃下进行5分钟反应而得到物质。作为超声波装置的振动子,使用了水浴式的振动子。各条件均为超声波的照射后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),回收分离得到的溶液,通过分光光度计(波长500nm)(JASCO(株式会社)V-650)的测定值评价磁性粒子的混入程度。使用的CMC为平均分子量250kDa#C4888(SIGMA-ALDRICH公司)。
其结果,950kHz以上的照射中,与不照射相比,B/F分离后的溶液中混入的磁性粒子的量大幅减少。由此,950kHz以上的照射中,集磁效率显著提高,观察到较高的集磁效率(图11)。此外,通过纤维素酶添加也观察到同等的较高的集磁效率。
(实施例13)
超声波对磁性粒子的集磁效率的效果的探讨(2)
通过在CMC存在下使EV和抗体结合粒子反应后照射超声波,而对超声波的集磁效率改善对EV的回收的效果进行了探讨。
将从固定有抗CD9抗体的Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司#14204)final 1.2mg/mL和BxPC3(人胰脏线癌细胞株)而回收的EV 1.3μg添加至2mL管中的EDTA/EGTA/CMC-PBS(分别为终浓度50mM/50mM/0.5重量%)溶液600μL中,在37℃下反应1小时而使其结合,对得到的物质以频率30kHz(35w)((株式会社)KAIJO QUAVAmini QR-001)照射3分钟。作为阴性对照,准备不照射的组。作为超声波装置的振动子,使用了干式的振动子。超声波的照射后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),回收(回收上清)分离得到的溶液,通过分光光度计(波长500nm)(JASCO(株式会社)V-650)的测定值对回收上清中的磁粒子的混入进行了比较评价(图12A)。
此外,通过使用了抗CD9抗体的夹心CLEIA法,对回收的溶液中包含的CD9的量进行了评价(图12B)。
此外,对于B/F分离后的磁性粒子,通过基于使用抗CD9抗体的免疫印迹法的检测(25kDa),对EV的回收效率进行了解析(图12C)。
所述使用了抗CD9抗体的夹心CLEIA法,具体而言,通过以下的方法进行。首先,将固定有抗CD9抗体的Dynabeads和回收的溶液混合,将得到的混合液在37℃下孵育8分钟。在B/F分离·清洗后,进一步添加用碱性磷酸酶进行了标识的抗CD9抗体50μL,搅拌后在37℃下孵育8分钟,进行B/F分离·清洗。然后,分注包含作为化学发光基质的3-(2’-螺金刚烷)-4-甲氧基-4-(3’-磷酰氧基)苯基-1,2-二氧杂环丁烷·2钠盐的LUMIPULSE(注册商标)基质液(FUJIREBIO公司)200μL,搅拌后在37℃下孵育4分钟后,使用光度计测定发光量。作为测定值,得到计数值。发光量的测定通过全自动化学发光酶免疫测定系统(LUMIPULSE L2400(FUJIREBIO公司))进行。可以说回收的溶液中包含的CD9的量越少(CD9的计数值越小),EV的回收效率越高。
其结果,超声波照射样品与不照射相比,观察到集磁效率和EV的回收效率的提高(图12A~12C)。
(实施例14)
CMC浓度对磁性粒子的集磁效率的影响的探讨
对CMC浓度对磁性粒子的集磁效率的影响进行了探讨。
在将CMC浓度设为1重量%、0.5重量%、0.25重量%这3种的EDTA/EGTA/CMC-PBS(分别为终浓度50mM/50mM/1重量%、0.5重量%、0.25重量%)溶液600μL中,添加从固定有抗CD9抗体的Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司#14204)final1.2mg/mL和BxPC3(人胰脏线癌细胞株)而回收的EV 1.3μg,在37℃下反应1小时而使其结合,对得到的物质以频率30kHz(35w)((株式会社)KAIJO QUAVAmini QR-001)照射3分钟。作为阴性对照,准备使用添加了0.5重量%CMC浓度的EDTA/EGTA/CMC-PBS溶液并且不照射超声波的组。作为超声波装置的振动子,使用了干式的振动子。超声波的照射后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),回收分离得到的溶液,通过分光光度计(波长500nm)(JASCO(株式会社)V-650)的测定值对磁性粒子的混入进行了比较。
其结果,在将CMC浓度设定为0.5重量%以下的EDTA/EGTA/CMC溶液中,超声波照射样品与不照射相比,观察到集磁效率的提高(图13)。
(实施例15)
超声波对包含CMC以外的纤维素衍生物的溶液中的磁性粒子的集磁效率的效果的探讨
对在包含CMC以外的纤维素衍生物的溶液中,通过超声波是否提高磁性粒子的集磁效率进行了比较探讨。
向溶解于PBS的纤维素衍生物溶液(0.25重量%-4.0重量%)600μL中添加从固定有抗CD9抗体的Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司#14204)final1.2mg/mL和BxPC3(人胰脏线癌细胞株)而回收的EV 1.3μg。在37℃下反应1小时而使其结合,对得到的物质以频率30kHz(35w)((株式会社)KAIJO QUAVAmini QR-001)照射3分钟。作为阴性对照,准备使用添加了0.5重量%CMC浓度的EDTA/EGTA/CMC-PBS溶液并且不照射的组。作为超声波装置的振动子,使用了干式的振动子。超声波的照射后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),回收分离得到的溶液,通过分光光度计(波长500nm)(JASCO(株式会社)V-650)的测定值对磁性粒子的混入进行了比较。使用的纤维素衍生物为羟丙基纤维素(HPC):平均分子量80kDa#435007和羟乙基纤维素(HEC):平均分子量380kDa#308633(均为SIGMA-ALDRICH公司)。
其结果,即使在包含CMC以外的纤维素衍生物的溶液中,超声波照射样品与不照射超声波相比,也观察到磁性粒子的集磁效率的提高。特别是,HPC为2.0重量%以下,HEC为0.5重量%以下时其效果显著(图14)。
(实施例16)
超声波输出对磁性粒子的集磁效率的影响的探讨
对超声波输出是否影响磁性粒子的集磁效率进行了探讨。
将从固定有抗CD9抗体的Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司#14204)final 1.2mg/mL和BxPC3(人胰脏线癌细胞株)而回收的EV 1.3μg添加至2mL管中的EDTA/EGTA/CMC-PBS(分别为终浓度50mM/50mM/0.5重量%)溶液600μL中,在37℃下1小时使其结合。以频率30kHz,将输出设定为10w、20w、35w,照射了3分钟((株式会社)KAIJOQUA VAmini QR-001)。此外,代替干式超声波装置,还进行了水槽式(频率40kHz,输出70w,EMERSON BRANSONIC M1800-J)的照射。作为阴性对照,准备不照射的组。超声波的照射后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),回收分离得到的溶液,通过分光光度计(波长500nm)(JASCO(株式会社)V-650)的测定值对磁性粒子的混入进行了比较。
其结果,超声波照射样品在任一输出条件下,都与不照射相比,观察到集磁效率的提高(图15)。
(实施例17)
糖分解酶对EV回收效率的效果的探讨
对在含纤维素衍生物的溶液中,糖分解酶是否提高EV回收效率进行了探讨。
将200μL的健康人血浆在20000×g、4℃下进行15分钟离心后,用200μL的EDTA/EGTA/CMC-PBS(分别为终浓度37.5mM/37.5mM/0.5重量%)进行稀释,添加固定有抗CD9抗体的Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFE TECHNOLOGIES公司)并使其为0.26mg/mL。在4℃下旋转反应一晚后,通过添加内切葡聚糖酶分解CMC以降低溶液的粘度。然后,从溶液中回收磁性粒子(B/F分离),在37℃下用PBS-T清洗3次。接下来,以用于免疫印迹的样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行样品化,通过基于抗CD9抗体的免疫印迹法对EV回收效率进行了解析。
其结果,观察到糖分解酶提高EV回收效率(图16)。认为糖分解酶通过磁性粒子的集磁效率的提高而显示EV回收效率的提高。
(实施例18)
检查材料的种类对EV回收效率的效果的探讨
对基于超声波的集磁效率的提高效果是否也在血清检查材料中观察到进行了探讨。
向管中添加血清检查材料300μL和CMC(终浓度0.5重量%)、HEC(终浓度0.25重量%溶液)300μL,添加固定有抗CD9抗体的Dynabeads M-280 tosylactivated(LIFETECHNOLOGIES公司#14204)final 1.2mg/mL。在4℃下旋转反应一晚,以频率30kHz(35w)((株式会社)KAIJO QUAVAmini QR-001)照射3分钟。作为阴性对照,准备在CMC(终浓度0.5重量%)的条件下,不照射的组。超声波的照射后,通过集磁将磁性粒子和其以外的溶液分离(B/F分离),回收分离得到的溶液,通过分光光度计(波长500nm)(JASCO(株式会社)V-650)的测定值对磁性粒子的混入进行了比较(表6,磁性粒子混入度)。此外,将除去分离得到的溶液后的管中的磁性粒子用PBS-T清洗3次后,分为2根,1根用40μL BRUB(Britton&Robinson Universal Buffer)(pH2.6)反应5分钟后,用20μL的1M Tris-HCl(pH8.0)中和,从而使细胞外囊泡从抗体粒子游离,用于纳米颗粒跟踪分析(NanoSight LM10,QUANTUMDESIGN公司)(图17)。另1根用样品缓冲液(BIO-RAD公司)进行免疫印迹的样品化,通过基于抗CD9抗体的免疫印迹法对EV回收效率进行了解析(图18)。
图17表示从磁性粒子游离得到的细胞外囊泡的纳米颗粒跟踪分析,在横轴上描绘了粒径,在纵轴描绘了粒子数/mL。将从图17的结果计算得到的、从磁性粒子游离得到的细胞外囊泡的浓度示于表6(粒子数/mL)。其结果,即使在血清检查材料中,与不照射超声波相比,通过进行超声波处理,也观察到集磁效率的提高和EV的回收效率的提高(表6、图17、18)。
[表6]
表6.使用了血清检查材料的情况下的磁性粒子的混入的评价和回收得到的细胞外囊泡浓度
序列表
<110> 合同会社予幸集团中央研究所
<120> 细胞外囊泡的回收方法
<130> PRBA-22342
<150> JP 2020-073131
<151> 2020-04-15
<160> 3
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 用于检测EML4-ALK mRNA的正向引物
<400> 1
cagatgatag ccgtaataaa ttgtcg 26
<210> 2
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 用于检测EML4-ALK mRNA的反向引物
<400> 2
cttccggcgg tacacttgg 19
<210> 3
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 用于检测EML4-ALK mRNA的荧光探针
<400> 3
actgcagaca agcataaaga tgtca 25
Claims (16)
1.一种细胞外囊泡的回收方法,其包含以下(a)和(b):
(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;
(b)从所述混合液中分离所述目标粒子。
2.根据权利要求1所述的方法,其包含以下(a)~(c):
(a)将(i)含细胞外囊泡的试样、(ii)固定有与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质的粒子和(iii)聚合物进行混合,得到包含(i’)借助所述物质与细胞外囊泡进行了结合的目标粒子和(ii’)聚合物的混合液;
(b)使所述混合液的粘度降低;
(c)从所述(b)中得到的溶液中分离所述目标粒子。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其在所述目标粒子的分离后,包含:(I)清洗所述目标粒子和/或(II)使细胞外囊泡从所述目标粒子游离。
4.根据权利要求2或3所述的方法,其中,
通过基于超声波或具有聚合物分解能力的酶的处理来进行粘度的降低。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,
超声波为干式或水浴式。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其中,
超声波的频率为40kHz以下或950kHz以上的范围内。
7.根据权利要求1~6中任一项所述的方法,其中,
聚合物为多糖、蛋白质或具有含羰基的亲水性基团的聚乙烯衍生物。
8.根据权利要求7所述的方法,其中,
多糖为纤维素中的至少一个羟基的氢原子被羧基烷基或羟基烷基所取代的纤维素衍生物。
9.根据权利要求1~8中任一项所述的方法,其中,
聚合物具有10kDa以上的重均分子量。
10.根据权利要求1~9中任一项所述的方法,其中,
(a)的混合液中的聚合物浓度为0.01~10.00重量%。
11.根据权利要求1~10中任一项所述的方法,其中,
在(a)中,进一步混合(iv)螯合剂。
12.根据权利要求1~11中任一项所述的方法,其中,
与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质为针对四跨膜蛋白的抗体或针对细胞外基质金属蛋白酶诱导物质的抗体。
13.根据权利要求1~12中任一项所述的方法,其中,
含细胞外囊泡的试样为培养上清试样或来源于动物的液体试样。
14.一种细胞外囊泡的分析方法,其包含以下(1)和(2):
(1)通过权利要求1~13中任一项所述的方法,从含细胞外囊泡的试样中分离细胞外囊泡;
(2)对分离得到的细胞外囊泡进行分析。
15.一种试剂盒,其包含:(a)聚合物、(b)与细胞外囊泡膜具有亲和性的物质和(c)具有聚合物分解能力的酶,
所述物质为游离形态或固定于粒子的形态,
在所述物质为游离形态的情况下,可以进一步包含粒子。
16.根据权利要求15所述的试剂盒,其中,
聚合物为多糖或蛋白质,并且,具有聚合物分解能力的酶为糖分解酶或蛋白质分解酶。
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