CN115125291B - 一种核酸固定方法及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种核酸固定方法及其应用,将固定核酸的基片置于基片处理液中浸泡,取出后烘烤,基片处理液包括:5~20wt%3‑氨丙基三甲氧基硅烷,0.2~2 wt%甲醇、0.5~5wt%乙醇、0.5~4mol/L氯化钠、5~100mg/mL聚乙二醇400、0.1~0.5mmol/L EDTA、余量为DEPC处理水;将待固定核酸溶液与核酸固定液混合,点于烘烤处理后的基片上,烘烤,核酸固定液包括:0.1~0.5 wt%甲醇、0.1~1wt%乙醇、0.01~0.5 wt%糖原、1.5~3 mol/L氯化钠、1~10mg/mL聚乙二醇6000,余量为DEPC处理水;将固定核酸的基片置于封闭液中进行封闭处理完成核酸的固定。本发明核酸固定效率高、固定和封闭过程快速、背景好、固定成本低、无需依赖昂贵的仪器设备、核酸本身无需任何修饰,且核酸固定后稳定性好,能够室温条件长期储存。
Description
技术领域
本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种核酸固定方法及其应用。
背景技术
伴随着基因检测在现代临床医学诊断中的推广应用,核酸固定越来越广泛地被应用在各种诊断检测方法学中,如基因芯片、反向点杂交、二代测序、核酸捕获、核酸适配体筛选、Southern杂交、Northern杂交等等。
目前常见核酸固定方法有原位合成法、共价键结合法、物理吸附法等。
原位合成法,基片材质要求高,同时需要依赖昂贵的仪器设备,合成成本高,限制了其的推广应用。共价键结合法,需要进行基片预修饰处理、待固定的核酸需要预修饰处理,成本相对原位合成较低些,目前在市场上应用较多,但是固定后的核酸基片储存条件需要冷藏或冷冻储存,且储存周期较短,并且存在着核酸稳定性不好,容易降解的问题。物理吸附法,因其固定效率低,稳定性差,很少见有商业应用。
因此,研发一种操作简单、成本低、稳定性好、存储周期长的核酸固定方法具有重要意义。
发明内容
针对现有技术中存在的核酸固定方法操作复杂,成本高、稳定性差的问题,本发明提供了一种核酸固定方法及其应用,固定效率高、固定和封闭过程快速、背景好、固定成本低、无需依赖昂贵的仪器设备、核酸本身无需任何修饰,且核酸固定后稳定性好,能够室温条件长期储存。
本发明通过以下技术方案实现:
一种核酸固定方法,包括以下步骤:
(1)将固定核酸的基片置于基片处理液中浸泡,取出后烘烤;
所述的基片处理液包括以下成分:5~20wt% 3-氨丙基三甲氧基硅烷,0.2~2 wt%甲醇、0.5~5wt%乙醇、0.5~4mol/L氯化钠、5~100mg/mL聚乙二醇400、0.1~0.5mmol/L EDTA、余量为DEPC处理水;
(2)将待固定核酸溶液与核酸固定液混合,点于步骤(1)中烘烤处理后的基片上,烘烤;
所述的核酸固定液包括以下组分:0.1~0.5 wt %甲醇、0.1~1wt %乙醇、0.01~0.5wt %糖原、1.5~3 mol/L氯化钠、1~10mg/mL聚乙二醇6000,余量为DEPC处理水;
(3)步骤(2)烘烤完毕后,将固定核酸的基片置于封闭液中进行封闭处理完成核酸的固定。
进一步地,步骤(1)中所述的固定核酸的基片在基片处理液中的浸泡时间为1~3min,烘烤温度为40~90℃,烘烤时间为3~10min。
进一步地,步骤(2)所述的烘烤温度为于40~90℃,烘烤时间为5-20min。
进一步地,所述的封闭液包括以下组分:15~550mg/mL牛血清白蛋白、5~30mg/mL脱脂奶粉、1~15mg/mL酪蛋白、0.1~1wt%聚山梨醇酯-20、3~10mg/mL氯化钠、0.1~0.5mg/mL氯化锂,余量为DEPC处理水。
进一步地,步骤(3)中封闭处理的温度为40~70℃,处理时间为5~20min。
进一步地,所述的待固定的核酸的结构形式为单链DNA、双链DNA、单链RNA、双链RNA中的一种以上;所述的待固定的核酸长度为8 ~300 bp。
进一步地,所述的核酸溶液的浓度为0.1~50 μM,所述的核酸溶液与核酸固定液的体积比为1:3~1:6。
进一步地,所述的固定核酸的基片材质为纸张、尼龙膜、硝酸纤维素膜、塑料材质和二氧化硅材质中的一种。
进一步地,所述的固定核酸的基片材质硝酸纤维素膜。
本发明中,所述的核酸固定方法在基因检测中的应用。
有益效果
本发明固定核酸的方法固定效率高、固定和封闭过程快速、背景好、固定成本低、无需依赖昂贵的仪器设备、核酸本身无需任何修饰,且核酸固定后稳定性好,能够室温条件长期储存,有利于推广应用。
附图说明
图1为实施例1核酸固定方法检测结果图;
图2为实施例2核酸固定方法检测结果图;
图3为A公司硝酸纤维素膜基片10 μM、1 μM、0.1 μM、0.01 μM浓度时的检测结果;
图4为B公司尼龙膜基片10 μM、1 μM、0.1 μM、0.01 μM浓度时的检测结果;
图5为C公司载玻片基片10 μM、1 μM、0.1 μM、0.01 μM浓度时的检测结果;
图6为本发明方法硝酸纤维素膜基片10 μM、1 μM、0.1 μM、0.01 μM浓度时的检测结果;
图7为A公司硝酸纤维素膜基片储存4、8、10、15、18个月的检测结果图;
图8为B公司尼龙膜基片储存4、8、10、15、18个月的检测结果图;
图9为C公司载玻片基片储存4、8、10、15、18个月的检测结果图;
图10为本发明方法硝酸纤维素膜基片储存4、8、10、15、18个月的检测结果图。
具体实施方式
下面将对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整的描述,所描述的实施例仅仅是本发明部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
实施例1
1.试剂准备:
(1) 8 bp单链DNA序列:5’-TCGACTCC-3’,300 bp单链DNA序列:5’-GGTGAGTGGCCCGCTACCTCTTCTGGTGGCCGCCTCCCTCCTTCCTGGCCTCCCGGAGCTGCGCCCTTTCTCACTGGTTCTCTCTTCTGCCGTTTTCCGTAGGACTCTCTTCTCTGACCTGAGTCTCCTTTGGAACTCTGCAGGTTCTATTTGCTTTTTCCCAGATGAGCTCTTTTTCTGGTGTTTGTCTCTCTGACTAGGTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTACTAACACTGGCTCGTGTGACAAGGCCATGAGGCTGGTGTAAAGCGGCCTTGGAGTGTGTATTAAGTAGGT-3’,由上海生工生物工程有限公司合成;
(2) 基片处理液:3-氨丙基三甲氧基硅烷(6wt%)、甲醇(0.4 wt %)、乙醇(1 wt%)、氯化钠(2.5 mol/L)、聚乙二醇400(80 mg/mL)、EDTA(0.2mmol/L)、DEPC处理水配;
(3) 核酸固定液:按照配方甲醇(0.1 wt %)、乙醇(0.2 wt %)、氯化钠(1.5 mol/L)、糖原(0.04 wt %)、聚乙二醇6000(5 mg/mL)、DEPC处理水配制;
(4)封闭液:按照配方牛血清白蛋白(100 mg/mL)、脱脂奶粉(30 mg/mL)、酪蛋白(15 mg/mL)、聚山梨醇酯-20(0.3wt%)、氯化钠(8 mg/mL)、氯化锂(0.2 mg/mL)、DEPC处理水配制;
(5)杂交试剂盒(生物素-链霉亲和素-碱性磷酸酶法),源自山东鲁抗好丽友生物技术开发有限公司;
(6)与8 bp单链DNA 序列互补的Biotin-5’- GGAGTCGA -3’,与300 bp单链DNA 序列互补的一段序列Biotin-5’-TAGACACCTAGTCAGAGAGACAAA-3’,由上海生工生物工程有限公司合成,用DEPC处理水分别稀释至10 μM浓度。
2.核酸固定步骤
(1) 取固定核酸的硝酸纤维素膜基片用基片处理液浸没浸泡1min,然后80℃烘烤5min;
(2) 分别将8 bp单链DNA和300 bp单链DNA用DEPC处理水溶液,测定浓度,分别稀释至50 μM浓度;将稀释好的50 μM的8 bp单链DNA、50 μM的300 bp单链DNA分别与核酸固定液按照体积比1:4的比例混合混匀,得核酸混合液;
(3) 用移液器分别将混合好的核酸混合液点在步骤(1)处理好的硝酸纤维素膜基片上,50℃烘烤10min ;
(4)将步骤(3)烘烤处理完的硝酸纤维素膜基片,浸没在封闭液中,50℃浸泡10min,取出硝酸纤维素膜,即得到固定有核酸的硝酸纤维素膜。
3.核酸固定效果检测
(1)
(2)检测
核酸固定检测结果如图1所示,由图1可知点有核酸长度8 bp单链DNA、300 bp单链DNA的位置均有明显的斑点出现,未点核酸的位置,未有斑点出现,说明核酸长度8 bp至300bp的单链DNA均能够成功固定在硝酸纤维素膜上。
实施例2
1.试剂准备
(1) 8 bp单链RNA序列:5’- UCGACUCC -3’,300 bp单链RNA序列:5’- GGUGAGUGGCCCGCUACCUCUUCUGGUGGCCGCCUCCCUCCUUCCUGGCCUCCCGGAGCUGCGCCCUUUCUCACUGGUUCUCUCUUCUGCCGUUUUCCGUAGGACUCUCUUCUCUGACCUGAGUCUCCUUUGGAACUCUGCAGGUUCUAUUUGCUUUUUCCCAGAUGAGCUCUUUUUCUGGUGUUUGUCUCUCUGACUAGGUGUCUAAGACAGUGUUGUGGGUGUAGGUACUAACACUGGCUCGUGUGACAAGGCCAUGAGGCUGGUGUAAAGCGGCCUUGGAGUGUGUAUUAAGUAGGU-3’,由上海生工生物工程有限公司合成;
(2)基片处理液、核酸固定液、封闭液与实施例1相同;
(3)杂交试剂盒与实施例1相同;
(4) 与8 bp单链RNA 序列互补的Biotin-5’- GGAGTCGA -3’,与300 bp单链RNA序列互补的序列Biotin-5’-TAGACACCTAGTCAGAGAGACAAA-3’,由上海生工生物工程有限公司合成,用DEPC处理水分别稀释至10 μM浓度。
2.核酸固定步骤
(1)取固定核酸的硝酸纤维素膜基片用基片处理液浸没浸泡1min,然后80℃烘烤5min;
(2)分别将8 bp单链RNA和300 bp单链RNA用DEPC处理水溶液,测定浓度,分别稀释至50 μM浓度;将稀释好的50 μM的8 bp单链DNA、50 μM的300 bp单链DNA分别与核酸固定液按照体积比1:4的比例混合混匀,得核酸混合液;
(3)用移液器分别将混合好的核酸混合液点在步骤(1)处理好的硝酸纤维素膜基片上,50℃烘烤10min;
(4) 将步骤(3)烘烤处理完的硝酸纤维素膜基片,浸没在封闭液中,50℃浸泡10min,取出硝酸纤维素膜,即得到固定有核酸的硝酸纤维素膜。
3. 核酸固定效果检测
(1)
(2)检测
实施例2核酸固定检测结果如图2所示,由图2可知点有核酸长度8 bp单链RNA、300bp单链RNA的位置均有明显的斑点出现,未点核酸的位置,未有斑点出现,说明核酸长度8bp至300 bp的单链RNA均能够成功固定在硝酸纤维素膜上。
实施例3
1.试剂准备:
(1) 30 bp单链DNA序列:5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’,由上海生工生物工程有限公司合成;
(2) 基片处理液、核酸固定液、封闭液组成与实施例1相同;
(3)杂交试剂盒与实施例1相同;
(4)与5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’ 序列互补的Biotin-5’-TACCTACACCCACAACACTGTCTTAGACAC -3’,由上海生工生物工程有限公司合成,用DEPC处理水分别稀释至10 μM、1 μM、0.1 μM、0.01 μM浓度。
2. 核酸固定步骤
(1)取固定核酸的硝酸纤维素膜基片用基片处理液浸没浸泡1min,然后80℃烘烤5min;
(2)分别将30 bp单链DNA用DEPC处理水溶液稀释至50 μM浓度;将稀释好的50 μM的30bp单链DNA与核酸固定液按照体积比1:4的比例混合混匀,得核酸混合液;
(3)用移液器将混合好的核酸混合液点在步骤(1)处理好的硝酸纤维素膜基片上,50℃烘烤10min ;
(4)将步骤(3)烘烤处理完的硝酸纤维素膜基片,浸没在封闭液中,50℃浸泡10min,取出硝酸纤维素膜,即得到固定有核酸的硝酸纤维素膜。
3.将30 bp单链DNA序列5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’委托商业A公司稀释成10 μM终浓度,固定在硝酸纤维素膜上。
4.将30 bp单链DNA序列5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’ 委托商业B公司稀释成10 μM终浓度,固定在尼龙膜上。
5.将30 bp单链DNA序列5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’ 委托商业C公司稀释成10 μM终浓度,固定在载玻片上。
6.核酸固定效果检测
(1)
(2)检测
商业A公司、B公司、C公司以及本发明核酸固定方法检测结果图分别如图3~6所示;由图3~6可知,本发明核酸固定方法与其它三种商业固定方法均可成功固定核酸。在固定核酸互补序列不同浓度下,尤其是在0.01 μM浓度条件下反应时,本核酸固定方法检测结果优于其它三种商业固定方法。
实施例4
1.试剂准备:
(1) 30 bp单链DNA序列:5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’,由上海生工生物工程有限公司合成;
(2) 基片处理液、核酸固定液、封闭液组成与实施例1相同;
(3)杂交试剂盒与实施例1相同;
(4)与5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’ 序列互补的Biotin-5’-TACCTACACCCACAACACTGTCTTAGACAC -3’,由上海生工生物工程有限公司合成,用DEPC处理水分别稀释至1 μM浓度。
2. 核酸固定步骤
(1)取固定核酸的硝酸纤维素膜基片用基片处理液浸没浸泡1min,然后80℃烘烤5min;
(2)分别将30 bp单链DNA用DEPC处理水溶液稀释至50 μM浓度;将稀释好的50 μM的30bp单链DNA与核酸固定液按照体积比1:4的比例混合混匀,得核酸混合液;
(3)用移液器分别将混合好的核酸混合液点在步骤(1)处理好的硝酸纤维素膜基片上,50℃烘烤10min ;
(4) 将步骤(3)烘烤处理完的硝酸纤维素膜基片,浸没在封闭液中,50℃浸泡10min,取出硝酸纤维素膜,即得到固定有核酸的硝酸纤维素膜。
3.将30 bp单链DNA序列5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’委托商业A公司稀释成10 μM终浓度,固定在硝酸纤维素膜上。
4. 将30 bp单链DNA序列5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’ 委托商业B公司稀释成10 μM终浓度,固定在尼龙膜上。
5.将30 bp单链DNA序列5’-GTGTCTAAGACAGTGTTGTGGGTGTAGGTA-3’ 委托商业C公司稀释成10 μM终浓度,固定在载玻片上。
6. 核酸固定效果检测
(1)将商业A公司、B公司、C公司以及本发明核酸固定方法固定的核酸基片,在相同的室温条件下,放置储存4个月、8个月、10个月、15个月、18个月,然后进行检测:
(2)检测结果
商业A公司、B公司、C公司以及本发明核酸固定方法在不同储存时间下的检测结果图分别如图3~6所示,由图3~6可知,本发明核酸固定方法与其它三种商业固定方法均可成功固定核酸。在固定核酸互补序列不同浓度下,尤其是在0.01 μM浓度条件下反应时,本核酸固定方法检测结果优于其它三种商业固定方法。
Claims (2)
1.一种核酸固定方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将固定核酸的基片置于基片处理液中浸泡,取出后烘烤;
所述的基片处理液包括以下成分:6wt% 3-氨丙基三甲氧基硅烷,0.4wt%甲醇、1wt%乙醇、2.5mol/L氯化钠、80mg/mL聚乙二醇400、0.2mmol/L EDTA、余量为DEPC处理水;
(2)将待固定核酸溶液与核酸固定液混合,点于步骤(1)中烘烤处理后的基片上,烘烤;
所述的核酸固定液包括以下组分:0.1wt %甲醇、0.2wt %乙醇、0.04 wt %糖原、1.5mol/L氯化钠、5mg/mL聚乙二醇6000,余量为DEPC处理水;
(3)步骤(2)烘烤完毕后,将固定核酸的基片置于封闭液中进行封闭处理完成核酸的固定;
步骤(1)中所述的固定核酸的基片在基片处理液中的浸泡时间为1min,烘烤温度为80℃,烘烤时间为5min;
步骤(2)所述的烘烤温度为于50℃,烘烤时间为10min;
所述的封闭液包括以下组分:100mg/mL牛血清白蛋白、30mg/mL脱脂奶粉、15mg/mL酪蛋白、0.3wt%聚山梨醇酯-20、8mg/mL氯化钠、0.2mg/mL氯化锂,余量为DEPC处理水;
步骤(3)中封闭处理的温度为50℃,处理时间为10min;
所述的待固定的核酸的结构形式为单链DNA或单链RNA;所述的待固定的核酸长度为8~300 bp;
所述的核酸溶液的浓度为50 μM,所述的核酸溶液与核酸固定液的体积比为1:4;
所述的固定核酸的基片材质为硝酸纤维素膜。
2.一种权利要求1所述的核酸固定方法在基因检测中的应用,其特征在于,所述的应用为非疾病诊断目的。
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GR01 | Patent grant | ||
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