CN114990203B - 测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用 - Google Patents

测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用 Download PDF

Info

Publication number
CN114990203B
CN114990203B CN202210269847.4A CN202210269847A CN114990203B CN 114990203 B CN114990203 B CN 114990203B CN 202210269847 A CN202210269847 A CN 202210269847A CN 114990203 B CN114990203 B CN 114990203B
Authority
CN
China
Prior art keywords
diabetic nephropathy
urine
podocytes
mfap4
reagent
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN202210269847.4A
Other languages
English (en)
Other versions
CN114990203A (zh
Inventor
梁宏伟
李丽民
赵坤
张衡
惠斌
邱黄君
张怡然
黄一婧
焦柯程
李静
孙傲雪
张婷
李乐琪
陈家仪
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Nanjing Yijian Medical Technology Co ltd
Original Assignee
Nanjing Yijian Medical Technology Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Nanjing Yijian Medical Technology Co ltd filed Critical Nanjing Yijian Medical Technology Co ltd
Priority to CN202210269847.4A priority Critical patent/CN114990203B/zh
Publication of CN114990203A publication Critical patent/CN114990203A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN114990203B publication Critical patent/CN114990203B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了测定来自尿液的足细胞内的RNA在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用。定量检测尿液的足细胞内的MFAP4的试剂在制备糖尿病肾病诊断试剂或辅助诊断试剂中的应用。定量检测尿液的足细胞内的MFAP4的试剂为检测MFAP4的引物、探针或基因芯片。本专利通过单细胞测序鉴定了糖尿病肾病进展过程中尿液中的足细胞内一系列特异性基因,随后通过ddPCR技术构建了基于尿液足细胞的能够用于糖尿病肾病诊断的方法,MFAP4作为检测靶标用于糖尿病肾病的诊断,根据尿液足细胞内MFAP4mRNA含量鉴别糖尿病肾病与非糖尿病肾病的ROC曲线显示其准确率和精确率分别为100%和92%。

Description

测定来自尿液的足细胞内的RNA在制备糖尿病肾病疾病诊断 试剂盒中的应用
技术领域
本发明属于医学诊断领域,涉及测定来自尿液的足细胞内的RNA在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用。
背景技术
糖尿病肾病是糖尿病最主要的并发症之一,它不仅是导致终末期肾脏病的首要因素,也是糖尿病患者死亡的主要原因之一。糖尿病肾病早期无明显症状,且目前也无方便快捷准确的诊断方法,因此在日常检测中极容易被忽略。糖尿病肾病患者往往一旦被诊断即已经进入不可逆状态,只能进行有限的干预性治疗,肾脏依然会持续恶化,直至进展为终末期肾病,严重影响患者生活质量、大幅增加经济负担甚至导致寿命缩短。研究表明,若糖尿病肾病患者能够在早期筛查过程中得以确认并进行有效的治疗,糖尿病肾病患者终末期肾病的发生风险和死亡风险都会显著降低。因此,亟需研发可用于糖尿病肾病早期诊断的方便快捷准确的方法。
在糖尿病患者体内,足细胞会因为长期处于高血糖等恶劣环境中会出现密度和数量减少、足突增宽、足细胞脱落等改变,且可从尿中丢失,继而导致糖尿病肾病的发生。足细胞损伤是糖尿病肾病发生发展的早期事件,因此检测尿液中的足细胞可能是糖尿病肾病早期诊断最有效的方法之一。然而,囿于在糖尿病肾病早期,脱落的足细胞很少且很难捕获,再加上其它肾脏损伤也会导致足细胞脱落,因此在应用尿液中的足细胞作为糖尿病肾病早期诊断的过程中面临极大的困难。本专利首先通过单细胞测序鉴定了糖尿病肾病进展过程中尿液中的足细胞内一系列特异性基因,随后通过ddPCR技术构建了基于尿液足细胞的能够用于糖尿病肾病诊断的方法。
发明内容
本发明的目的是提供与糖尿病肾病相关的尿液的足细胞内的RNA标志物。
本发明的另一目的是提供所述标志物的应用。
本发明的又一目的是提供检测所述标志物的试剂及其应用。
本发明的目的可通过以下技术方案实现:
与糖尿病肾病相关的尿液的足细胞内的RNA标志物,其特征在于选自下列RNA:MFAP4。
本发明所述的尿液的足细胞内的RNA标志物在制备糖尿病肾病诊断试剂中的应用。
定量检测尿液的足细胞内的MFAP4的试剂在制备糖尿病肾病诊断试剂或辅助诊断试剂中的应用。
作为本发明的一种优选,定量检测尿液的足细胞内的MFAP4的试剂为检测MFAP4的引物、探针或基因芯片。
作为本发明的进一步优选,检测MFAP4 mRNA的引物如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
有益效果:
本专利通过单细胞测序鉴定了糖尿病肾病进展过程中尿液中的足细胞内一系列特异性基因,随后通过ddPCR技术构建了基于尿液足细胞的能够用于糖尿病肾病诊断的方法,MFAP4作为检测靶标用于糖尿病肾病的诊断,根据尿液足细胞内MFAP4 mRNA含量鉴别糖尿病肾病与非糖尿病肾病的ROC曲线显示其准确率和精确率分别为100%和92%。
附图说明
图1显示了podocalyxin抗体偶联的磁珠捕获尿液足细胞的示意图。
图2显示了利用流式细胞仪检测分离的尿液足细胞纯度。
图3显示了高通量测序检测的糖尿病肾病和非糖尿病肾病尿液足细胞内RNA含量(A)及MFAP4 mRNA含量(B)。
图4显示了ddPCR检测到的糖尿病肾病和非糖尿病肾病尿液足细胞内MFAP4 mRNA含量。
图5显示了尿液足细胞内MFAP4 mRNA含量鉴别糖尿病肾病与非糖尿病肾病的ROC曲线。
实施例1 尿液足细胞分离
1.收集糖尿病肾病患者和非糖尿病肾病患者尿液各50毫升,1000rpm离心5分钟,弃去上清,保留沉淀;
2.向沉淀中加入5毫升PBS溶液(137mM NaCl,2.7mM KCl,10mM Na2HPO4,2mMKH2PO4),混合均匀后,1000rpm离心5分钟,弃去上清,保留沉淀;
3.重复上述操作两次后向沉淀中加入1毫升PBS溶液,混合均匀后,转入1.5ml EP管中,加入100微升偶联podocalyxin抗体的磁珠,混合均匀后,室温孵育1h;
4.利用磁铁进行磁性分离,去除溶液,保留被磁铁吸附在管壁的细胞,撤去磁铁,加入1毫升PBS溶液充分洗涤后,利用磁铁进行磁性分离,去除溶液,保留被磁铁吸附在管壁的细胞;
5.重复上述操作两次后,撤去磁铁,用500微升PBS溶液重悬细胞,通过podocalyxin抗体,利用流式细胞仪观察足细胞纯度。
检测结果由流式细胞仪分析结果表明,我们分离的足细胞纯度接近99%(图2)。
实施例2 尿液足细胞RNA分离与高通量测序
1.收集糖尿病肾病患者和非糖尿病肾病患者尿液各50毫升,1000rpm离心5分钟,弃去上清,保留沉淀;
2.向沉淀中加入5毫升PBS溶液(137mM NaCl,2.7mM KCl,10mM Na2HPO4,2mMKH2PO4),混合均匀后,1000rpm离心5分钟,弃去上清,保留沉淀;
3.重复上述操作两次后向沉淀中加入1毫升PBS溶液,混合均匀后,转入1.5ml EP管中,加入100微升偶联podocalyxin抗体的磁珠,混合均匀后,室温孵育1h;
4.利用磁铁进行磁性分离,去除溶液,保留被磁铁吸附在管壁的细胞,撤去磁铁,加入1毫升PBS溶液充分洗涤后,利用磁铁进行磁性分离,去除溶液,保留被磁铁吸附在管壁的细胞;
5.重复上述操作两次后,撤去磁铁,用500微升PBS溶液重悬细胞,利用微量样本总RNA提取试剂盒(TIANGEN,DP420)提取样本中的RNA,随后进行高通量测序。
检测结果由高通量测序结果表明,糖尿病肾病患者尿液中含有较多的足细胞RNA,而非糖尿病肾病患者尿液中足细胞含量较少RNA(图3A),并且MFAP4 mRNA在来自糖尿病肾病患者尿液足细胞中显著上升(图3B)。
实施例3 尿液足细胞RNA作为糖尿病肾病诊断标志物
1.收集50例糖尿病肾病患者和50例非糖尿病肾病患者尿液各10毫升,1000rpm离心5分钟,弃去上清,保留沉淀;
2.向沉淀中加入5毫升PBS溶液(137mM NaCl,2.7mM KCl,10mM Na2HPO4,2mMKH2PO4),混合均匀后,1000rpm离心5分钟,弃去上清,保留沉淀;
3.重复上述操作两次后向沉淀中加入1毫升PBS溶液,混合均匀后,转入1.5ml EP管中,加入100微升偶联podocalyxin抗体的磁珠,混合均匀后,室温孵育1h;
4.利用磁铁进行磁性分离,去除溶液,保留被磁铁吸附在管壁的细胞,撤去磁铁,加入1毫升PBS溶液充分洗涤后,利用磁铁进行磁性分离,去除溶液,保留被磁铁吸附在管壁的细胞;
5.重复上述操作两次后,撤去磁铁,用500微升PBS溶液重悬细胞,利用微量样本总RNA提取试剂盒(TIANGEN,DP420)提取样本中的RNA,随后利用RNA特异性引物(表1)进行ddPCR检测。
检测结果
对分离的尿液微囊泡提取RNA后,利用RNA特异性引物对RNA进行ddPCR检测,检测结果表明MFAP4 mRNA含量在糖尿病肾病患者尿液足细胞中显著高表达(图4)。利用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,简称ROC曲线)分析MFAP4mRNA区分糖尿病肾病和非糖尿病肾病的曲线下面积为0.9272(95%CI:0.8584-0.9960),准确率和精确率分别为100%和92%。
序列表
<110> 南京羿检医学检验实验室有限公司
中国药科大学
<120> 测定来自尿液的足细胞内的RNA 在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用
<160> 2
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
ctttgagaac aacacggcct a 21
<210> 2
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
tcccggtcga aggtagagaa c 21

Claims (3)

1.定量检测尿液的足细胞内的MFAP4的试剂在制备糖尿病肾病诊断试剂或辅助诊断试剂中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于定量检测尿液的足细胞内的MFAP4的试剂为检测MFAP4的引物、探针或基因芯片。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于检测MFAP4 mRNA的引物如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
CN202210269847.4A 2022-03-18 2022-03-18 测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用 Active CN114990203B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202210269847.4A CN114990203B (zh) 2022-03-18 2022-03-18 测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202210269847.4A CN114990203B (zh) 2022-03-18 2022-03-18 测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN114990203A CN114990203A (zh) 2022-09-02
CN114990203B true CN114990203B (zh) 2024-02-20

Family

ID=83023343

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202210269847.4A Active CN114990203B (zh) 2022-03-18 2022-03-18 测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN114990203B (zh)

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101278059A (zh) * 2005-07-28 2008-10-01 肿瘤疗法科学股份有限公司 诊断和治疗肾细胞癌的方法
CN102901790A (zh) * 2012-09-21 2013-01-30 中国人民解放军南京军区南京总医院 糖尿病肾病早期诊断的尿液代谢标志物测定方法
CN111020035A (zh) * 2019-12-31 2020-04-17 武汉大学 结直肠癌术后复发危险分层检测方法
CN114574573A (zh) * 2022-03-15 2022-06-03 南京羿检医学科技有限公司 测定尿液微囊泡中rna含量的试剂在制备糖尿病肾病诊断试剂中的应用

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20140213638A1 (en) * 2013-01-25 2014-07-31 Duke University Compositions and Biomarkers for Heart Disease, Injury and Failure and Methods of Use

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101278059A (zh) * 2005-07-28 2008-10-01 肿瘤疗法科学股份有限公司 诊断和治疗肾细胞癌的方法
CN102901790A (zh) * 2012-09-21 2013-01-30 中国人民解放军南京军区南京总医院 糖尿病肾病早期诊断的尿液代谢标志物测定方法
CN111020035A (zh) * 2019-12-31 2020-04-17 武汉大学 结直肠癌术后复发危险分层检测方法
CN114574573A (zh) * 2022-03-15 2022-06-03 南京羿检医学科技有限公司 测定尿液微囊泡中rna含量的试剂在制备糖尿病肾病诊断试剂中的应用

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Association between microfibrillar-associated protein 4 (MFAP4) and micro- and macrovascular complications in long-term type 1 diabetes mellitus;S.L. Blindbæk,等;Acta Diabetol;20161230;第54卷;367-372 *
MFAP4 deficiency alleviates renal fibrosis through inhibition of NF-κB and TGF-β/Smad signaling pathways;Zhou Pan,等;The FASEB Journal;20201130;第34卷(第11期);14250–14263 *
微纤丝相关蛋白4在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义;杨康,等;中华实验外科杂志;20221231(第5期);885-887 *
染色体外环状DNA的研究进展;王冯娟, 渠爽, 梁宏伟;中国细胞生物学学报;20211231;第43卷(第12期);2393–2401 *
血液生物标志物对慢性阻塞性肺疾病临床应用价值的研究进展;冯恩志;杨生岳;黄宁侠;;中华肺部疾病杂志(电子版);20160620;第9卷(第03期);334-336 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN114990203A (zh) 2022-09-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP4219743A1 (en) Sample nucleic acid measurement test kit, reagent, and application thereof
CN112501268A (zh) 一种基于纳米孔测序的快速鉴别呼吸道微生物引物组、试剂盒及其应用
CN108796074B (zh) 检测环状RNA circRNF13的试剂在制备肿瘤辅助诊断制剂上的应用及试剂盒
CN108796075B (zh) 检测circRNF13和LOC284454试剂的应用及试剂盒
CN103710338A (zh) 一种人类全血白细胞中dna提取试剂盒
CN108949961A (zh) 用于检测腺病毒肺炎的试剂盒及其筛选
CN112226538A (zh) 用于新型冠状病毒检测的引物探针组合、试剂盒及方法
CN111487404A (zh) 体液肿瘤细胞dna提取试剂盒
CN114574573B (zh) 测定尿液微囊泡中rna含量的试剂在制备糖尿病肾病诊断试剂中的应用
CN114621948A (zh) 一种高效核酸提取试剂盒及其使用方法
CN111662901A (zh) 一种从动物低核酸含量样品中提取病毒核酸的方法
CN114015815B (zh) 猪非典型瘟病毒的微滴数字pcr试剂盒及其检测方法
CN112538537A (zh) 检测家畜呼吸道病原菌的高通量微流控lamp芯片及检测方法
CN114990203B (zh) 测定来自尿液的足细胞内的rna在制备糖尿病肾病疾病诊断试剂盒中的应用
CN103122387B (zh) 循环肿瘤细胞(CTCs)荧光PCR快速超敏检测试剂盒及其应用
CN105624166B (zh) 一种检测人膀胱移行细胞癌细胞的核酸适配体及其在制备检测制剂中的应用
CN102242204B (zh) 一种单细胞分子生物学鉴定法
CN110632217A (zh) 一种hplc-icp-ms法测定粒细胞中四种砷化合物浓度的方法及应用
CN107326092A (zh) 大肠癌相关的miRNA作为生物标志物的应用及大肠癌检测试剂盒
CN108977436A (zh) 生物核酸dna快速释放提取试剂以及制备方法和应用
CN113913554A (zh) 一种实时荧光定量pcr检测jc多瘤病毒的方法
CN113817837B (zh) 一段来源于细粒棘球绦虫的游离dna序列及其应用
CN109439655B (zh) 适用于超微量细胞核酸提取的试剂盒及方法
CN111855984A (zh) 一种利用小鼠肠道菌群进行生物安全性评估的方法
CN111154836A (zh) 靶向核酸捕获和检测方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
TA01 Transfer of patent application right

Effective date of registration: 20231119

Address after: Room 204, floor 2, building D-2, building 16, tree house, No. 73, tanmi Road, Jiangbei new area, Nanjing, Jiangsu 210000

Applicant after: Nanjing Yijian Medical Technology Co.,Ltd.

Address before: Room 204, floor 2, building D-2, building 16, tree house, No. 73, tanmi Road, Jiangbei new area, Nanjing, Jiangsu 210000

Applicant before: Nanjing Yijian Medical Technology Co.,Ltd.

Applicant before: CHINA PHARMACEUTICAL University

TA01 Transfer of patent application right
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant