CN114957459A - 抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体及应用 - Google Patents

Abstract

本发明属于生物免疫技术领域，具体涉及一种抗SARS‑CoV‑2spike蛋白S2的单克隆抗体及应用。该抗SARS‑CoV‑2spike蛋白S2的单克隆抗体包含氨基酸序列如SEQ ID NO：1‑3所示的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3，和氨基酸序列如SEQ ID NO：4‑6所示的VLCDR1、VLCDR2、VLCDR3。本发明的单克隆抗体能够特异性识别SARS‑CoV‑2spike蛋白上的¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³序列区域，具有良好的特异性；通过多序列比对分析表明该表位是保守的，因此该单克隆抗体在检测SARS‑CoV‑2上具有良好的应用前景。

Description

抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体及应用

技术领域

本发明属于生物免疫技术领域，具体涉及一种抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体及应用。

背景技术

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的病原体是新型冠状病毒(SARS-CoV-2)，可引起严重的急性呼吸系统疾病。SARS-CoV-2属冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus)，是一类有包膜的单股正链RNA病毒。病毒基因编码包含多个结构蛋白，如S蛋白、N蛋白、M蛋白和E蛋白等；S蛋白(spike蛋白)、M蛋白和E蛋白参与病毒细胞囊膜的形成，而N蛋白则参与病毒的核酸装配。研究表明，S蛋白是病毒入侵宿主细胞的关键蛋白，承担病毒与宿主细胞膜受体结合及膜融合功能，决定了病毒的宿主范围和特异性，可通过其受体结合域(RBD)的基因重组或突变实现不同宿主间传播，并导致较高的死亡率和传染率。

S蛋白在宿主细胞蛋白酶的作用下被裂解为S1和S2两部分，S1主要功能是与宿主细胞表面受体结合，S2亚基介导病毒-细胞以及细胞-细胞膜融合。S2区域氨基酸序列的相对保守。

B细胞表位是抗原分子表面的氨基酸簇，可被特异性识别并与分泌的抗体和B细胞受体结合，诱导宿主的细胞和体液免疫反应。B细胞表位的鉴定具有许多重要的生物学意义，如深化对免疫反应和自身免疫性疾病的认识，为多肽疫苗的开发和疾病诊断方法的建立提供候选表位，并有助于揭示治疗性抗体的作用机制。筛选出S2亚基免疫显性表位区域，对该病的诊断和多肽疫苗的研制具有重要价值。

发明内容

本发明的目的是提供一种抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体，其能够特异性识别SARS-CoV-2 spike蛋白上的¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³序列区域。

本发明的第二个目的是提供编码上述单克隆抗体的核酸分子。

本发明的第三个目的是提供上述单克隆抗体的应用。

为了实现以上目的，本发明所采用的技术方案是：

抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体，其包含氨基酸序列如SEQ ID NO：1-3所示的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3，和氨基酸序列如SEQ ID NO：4-6所示的VLCDR1、VLCDR2、VLCDR3。

本发明提供的抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体，能够特异性识别SARS-CoV-2spike蛋白上的¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³序列区域，具有良好的特异性；通过多序列比对分析表明该表位是保守的，因此该单克隆抗体在检测SARS-CoV-2上具有良好的应用前景。

优选地，所述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体的重链可变区氨基酸序列、轻链可变区氨基酸序列分别如SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8所示。

进一步优选地，所述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体的重链为IgG2b型，轻链为Kappa型。

编码上述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体的核酸分子。

利用上述核酸分子编码得到的单克隆抗体可特异性识别并结合S蛋白的¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³区域，从而有效诱导宿主的细胞和体液免疫反应。

优选地，编码所述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体的重链可变区的基因核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示，编码所述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体的轻链可变区的基因核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示。

上述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体在制备诊断、检测或预防SARS-CoV-2试剂中的应用。

以所述单克隆抗体作为检测抗体，可以利用Western blotting，ELISA，IFA，IPMA，免疫层析试纸等方法检测SARS-CoV-2抗原。

优选地，所述抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体特异性识别SARS-CoV-2spike蛋白S2的B细胞表位，所述B细胞表位的氨基酸序列如SEQ ID NO：11所示。所述B细胞表位与所述单克隆抗体结合的关键氨基酸为^K1205、^Q1208、^Y1209。

进一步优选地，利用所述B细胞表位制备诊断或预防SARS-CoV-2试剂。

附图说明

图1为本发明中SDS-PAGE鉴定S2；图中从左到右编号为1～4，其中，1为蛋白Marker，2为S2细胞上清，3为S2细胞沉淀，4为S2纯化后；

图2为本发明中Western Blot鉴定S2蛋白表达；图中从左到右编号为1～2，其中，1为蛋白Marker，2为S2纯化后孵育HRP标记的His单抗；

图3为本发明中S2蛋白免疫小鼠融合前血清效价；

图4为本发明制备的12-8F单抗的腹水效价；

图5为本发明制备的单抗12-8F抗体可变区序列；

图6为本发明中IFA实验验证S2蛋白与其制备的单抗12-8F可以特异性结合；

图7为本发明制备的单抗12-8F与设计的肽池、肽及截短肽Dot-Blot实验反应结果；

图8为本发明制备的单抗12-8F与丙氨酸突变的序列peptide-Elisa和Dot-Blot实验结果。

具体实施方式

本发明提供的SARS-CoV-2 spike蛋白单克隆抗体，是基于设计并构建能够表达具有良好空间构象的S2蛋白。S2蛋白免疫原是通过瞬时转染方法，利用HEK293F细胞系表达S蛋白的S2部分，获得具有活性的蛋白。

以S2蛋白作为免疫原免疫小鼠，利用细胞融合技术，以S2蛋白作为检测原，通过间接ELISA，筛选得到了抗SARS-CoV-2S2蛋白的单克隆细胞株12-8F，该细胞株产生的单克隆抗体可特异性识别并结合S蛋白的¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³区域。上述抗SARS-CoV-2S2蛋白单克隆抗体经IFA及WB实验证实能够特异性识别SARS-CoV-2S2上的具有

¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³序列区域。

本发明将表达SARS-CoV-2S2蛋白作为免疫原免疫小鼠，结果显示获得的单克隆抗体效价高的可达1:1024000，并具有良好的特异性，并利用重叠多肽方法鉴定到了抗原抗体的作用位点，多序列比对分析表明该表位是保守的，因此该单克隆抗体在检测SARS-CoV-2上具有良好的应用前景。

实施例1抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体

本实施例的抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体，命名为12-8F单抗，包含氨基酸序列如SEQ ID NO：1-3所示的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3，和氨基酸序列如SEQ ID NO：4-6所示的VLCDR1、VLCDR2、VLCDR3。该单克隆抗体的重链可变区氨基酸序列如SEQ ID NO：7所示，轻链可变区氨基酸序列如SEQ ID NO：8所示。

经鉴定，该单克隆抗体的重链为IgG2b型，轻链为Kappa型。

本实施例的抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体的制备过程如下：

(1)免疫原制备

针对S蛋白的胞外区设计并构建了S2，并利用真核表达系统HEK293F细胞来制备抗原蛋白。SARS-CoV-2S2亚基的氨基酸序列如SEQ ID NO：12所示。

具体的，免疫原的制备包括如下步骤：

1.1引物设计

根据NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)上的SARS-CoV-2S蛋白的基因序列信息(GenBank accession number MN908947.3)，设计引物，选择BamHⅠ/XbaⅠ两个酶切位点(划线部分)，添加保护性碱基(斜体部分)，扩增SARS-CoV-2S2基因，并构建至pcDNA3.1(+)载体上，引物序列如表1所示：

表1引物序列表

1.2 S2基因的PCR扩增

以合成的S2基因序列为模板进行PCR扩增。PCR扩增体系如下：

表2 PCR扩增体系

1.3纯化回收PCR产物

扩增目的基因完成之后，用1％的核酸凝胶对PCR产物进行核酸电泳鉴定。最后利用DNA胶回收试剂盒选择和目的条带位置的PCR产物切胶进行纯化回收。使用Nano Drop测定回收的DNA溶液浓度，-20℃保存备用。

1.4目的基因和载体的双酶切

1.4.1将S2基因/pcDNA3.1(+)载体进行双酶切，酶切反应体系如下表所示：

表3双酶切反应体系

1.4.2各组分混匀后放置于37℃恒温仪上3h酶切。

1.5酶切产物的回收

使用DNA胶回收纯化试剂盒回收双酶切产物并吸取1.5μL的回收产物测定DNA的浓度，放于-20℃备用。

1.6重组质粒的构建

1.6.1 S2基因与pcDNA3.1(+)载体连接

在小EP管中加入下列组分：

表4连接体系

将离心管中的上述溶液混匀后，置于16℃连接仪中进行过夜连接。

1.6.2转化

将10μL连接产物都加入100μL DH5α感受态细胞中，冰浴30min后，42℃热激90s后，冰浴2-5min，加入500μL无抗性LB液体培养基，37℃，220r/min震荡培养45min；复苏后吸取150μL菌液均匀涂布在含有氨苄抗性的LB固体平板上，倒置于37℃恒温培养箱中培养12h。

1.6.3菌液PCR筛选阳性克隆

挑取圆滑的单个菌落，并将其接种在含有氨苄抗性的LB液体培养基中，37℃，220r/min培养4-6h，吸取浑浊的菌液作为PCR的模板。

按照下列组分加入EP管中：

表5菌液PCR反应体系

将上述反应组分混匀后，置于PCR仪中进行PCR扩增。菌液PCR结束后将产物用1％的核酸凝胶进行鉴定，选择条带大小与SARS-CoV-2S2目的基因相符的单克隆菌株送至上海生工生物有限公司测序。

1.6.4重组质粒的提取

选择测序成功的阳性菌株，接种至500ml氨苄抗性的LB液体培养基中，37℃，220rpm培养12h。用康为去内毒素质粒大量提取试剂盒，按试剂盒说明书操作步骤提取pcDNA3.1-S2重组质粒。

1.7目的蛋白的表达(瞬时转染HEK293F细胞)

以20ml培养体系(100ml培养瓶)举例如下：

a.材料准备

新鲜的SMM293-TⅡ培养基；转染试剂(义翘神州Sinofection，货号STF02)；携带目的基因的质粒DNA；150mM NaCl(无菌过滤，用于制备转染复合物)；处在对数生长期且活率高于90％的HEK293F细胞；

b.转染前一天，取样计数细胞密度，计算细胞活率；

c.以2×10⁶cell/ml的密度将细胞密度接种到新鲜培养基中，至于37℃，5％CO₂，175rpm转速的恒温摇床中培养；

d.转染当天，取样计数细胞密度和活率。细胞密度应该在3-5×10⁶cell/ml，活率高于90％。调整细胞密度至3×10⁶cell/ml，每瓶细胞液体体积为20ml；

e.转染液的配制：

用150mM的NaCl稀释20ug DNA至总体积为0.5ml，温和混匀；

用150mM的NaCl稀释100ul Sinofection转染试剂至总体积为0.5ml，温和混匀；

将稀释好的DNA和转染试剂同时单独静置约5分钟后温和混匀，总体积1ml，室温静置10min。

f.将转染试剂逐滴加入到细胞培养液中，滴加的同时轻轻摇动培养瓶，摇匀后放回摇床继续培养；

g.转染24h后悬松瓶后满足后续细胞密度生长的溶氧以及CO₂的排放需求，防止因CO₂累积导致培养液PH值过低(溶液呈黄色)，影响细胞生长。

h.转染后48-72h可用WB检测目的基因的表达。

1.8目的蛋白的鉴定及纯化

收集转染后72h的细胞，12000rpm，20min，收取沉淀，用缓冲Buffer(20mM Tris，150mM NaCl，pH 8.0)重悬细胞(按1:100加入蛋白酶抑制剂)，超声破碎后，12000rpm，20min，收取上清，取100μL破碎后上清液加入5×SDS上样缓冲液15μL，煮沸10min后进行SDS-PAGE及WesternBlot鉴定。WB鉴定中使用HRP标记的Goat-Mouse 6×His单抗以1：5000的比例进行稀释，室温孵育1h。孵育结束后，用PBST洗涤PVDF膜5遍，使用ECL化学发光液(新赛美)对PVDF膜进行曝光。

破碎后上清液经0.45μm滤膜过滤后采用镍离子亲和层析法进行纯化。纯化条件为：以20mM Tris+150mM NaCl，pH8.0为平衡液，20mM Tris+150mM NaCl+20mM咪唑，pH8.0为洗涤液，20mM Tris+150mM NaCl+200mM咪唑，pH8.0为目的蛋白洗脱液。依次收集破碎后上清原液、柱穿出液、平衡液、洗涤液以及目的蛋白洗脱液，各取100μL，加入5×SDS上样缓冲液15μL，煮沸10min后进行SDS-PAGE，如图1所示。SDS-PAGE结果显示洗脱液中纯化的目的蛋白纯度约达到90％。

收集洗脱液，使用透析袋，以20mM Tris+150mM NaCl为透析液对其进行过夜透析处理，透析后12000rpm离心1min收集上清液并取其100μL，加5×SDS上样缓冲液15μL，煮沸0min后进行SDS-PAGE及Western Blot鉴定，如图1、图2所示。Western Blot鉴定中使用HRP标记的Goat-Mouse 6×His单抗1:5000作为一抗，室温孵育1h。孵育结束后，用PBST洗涤PVDF膜5遍，使用ECL化学发光液(新赛美)对PVDF膜进行曝光。SDS-PAGE及Western Blot结果显示，透析后的SARS-CoV-2S2重组蛋白纯度可达98％。

(2)SARS-CoV-2S2重组蛋白小鼠免疫及免疫效果分析

2.1小鼠免疫及免疫效果初步评价

取3只6-8周龄的Balb/c小鼠，每只免疫10μg的S2蛋白，共免疫三次，每隔两周免疫一次，首免用弗氏完全佐剂和蛋白/PBS混合乳化，二免和三免均用弗氏不完全佐剂和蛋白/PBS混合乳化。在首次免疫后14d、21d、28d、35d、42d尾静脉采血，以间接ELISA、评价免疫效果。

2.2间接ELISA测定S2蛋白免疫小鼠血清效价

以2μg/mL的S2重组蛋白CBS稀释后包被96孔反应板，每孔100μL，4℃包被过夜；弃去包被液，PBST洗涤三次，5％脱脂奶封闭，37℃孵育1h；弃去封闭液，PBST洗涤三次；首孔分别加入起始浓度为1:1000稀释的首次免疫42d的小鼠血清，同时以PBS免疫小鼠血清作为阴性对照，从左到右依次倍比稀释，37℃孵育1h；PBST洗涤三次，加入1:1000稀释的HRP标记的羊抗鼠为二抗，37℃孵育1h；PBST洗涤三次，加入TMB显色液，避光显色5min后加入2mol/LH2SO4终止显色；测定OD450nm值，评价免疫效果。如图3所示，针对S2蛋白产生较高效价的特异性抗体。

(3)S2重组蛋白单克隆抗体制备与鉴定

3.1细胞融合

细胞融合前3-4d进行超免，超免时直接进行腹腔注射：根据间接ELISA测定S2免疫小鼠血清效价结果，选择效价最好的S2-3号小鼠，吸取20μg S2重组蛋白，不添加佐剂，进行腹腔注射超免。超免完成三天后进行细胞融合。取1.5mL EP管收集小鼠眼球血液，将血液放置37℃静置2h后，4000rpm，离心10min，吸取上清作为阳性血清，分装后﹣20℃储存备用。收集生长良好的小鼠骨髓瘤SP2/0细胞2～5×10⁷个于50mL无菌的离心管中备用。超免后小鼠脱颈处死后用75％酒精浸泡消毒。在超净台内用无菌剪刀和镊子剪开表皮，更换第二套刀剪开腹膜，取出脾脏放在200目无菌尼龙网上，用剪刀研磨，加GNK洗液冲洗，使脾细胞单个滤入无菌烧杯中。将脾细胞悬液移入离心管中，补加GNK到40mL，与瘤细胞一起离心，1000rpm离心10min。弃上清，弹虚细胞团，各加GNK 10mL，将脾细胞悬液转入瘤细胞瓶中，加GNK至40mL，1000rpm离心10min，弃尽上清。将细胞团微微打散，滴加1mL 50％PEG1500，1min内加完，静置90s，然后慢慢滴加15mL GNK终止融合，37℃水浴稳定5min，补加GNK至40mL，1000rpm离心10min，弃上清，将细胞团微微打散，加500mL含HAT和10％胎牛血清的RPMI-1640培养基，轻轻混悬细胞，平均铺在96孔细胞培养板中，每孔加250μL细胞悬液，在培养箱中培养7天。

3.2杂交瘤细胞阳性孔的筛选

细胞融合后7天，观察到细胞团长至比较大时，用间接ELISA测其细胞上清。细胞融合前小鼠眼球采血血清为阳性对照，PBS免疫的小鼠血清为阴性对照。用2μg/mL S2的蛋白作为检测用的抗原，CBS稀释后每孔包被100μL，4℃过夜。5％脱脂奶每孔加入200μL，37℃封闭2h；吸取细胞上清50μL作为一抗，37℃孵育30min；HRP标记羊抗鼠作为二抗1:1000稀释后每孔50μL，37℃孵育30min；PBST洗板3次后加入TMB显色液，100μL/孔，遮光反应5min；加入100μL 2mol/L H2SO4终止反应，选取显色反应最强的孔转至48孔板和24孔板中扩大培养，再以同样的方法对其测定，反复测定三次之后将能稳定反应的阳性杂交瘤细胞孔进行亚克隆。通过有限稀释法进行单克隆化，确保获得稳定分泌单克隆抗体的杂交瘤细胞株。

3.3单克隆抗体的大量制备及腹水的纯化

亚克隆后用间接ELISA以上述同样的方法再次进行筛选，将筛选出的阳性孔杂交瘤细胞孔12-8F扩大培养。对经产Balb/c小鼠腹腔中注射灭菌的液体石蜡，注射石蜡一周后，将阳性孔杂交瘤细胞用RPMI-1640基础培养基稀释后计数，每只小鼠注射细胞量约为1.0×10⁶个。注射天小鼠腹部明显的增大，说明有腹水产生，将小鼠拖颈处死，收集腹水。

3.4单克隆抗体的亚类鉴定

使用Mouse单克隆抗体亚型鉴定试剂盒(Proteintech)，按照说明书步骤对12-8F单抗进行亚型鉴定。结果表明本发明中的12-8F重链为IgG2b型，轻链为Kappa型。

单克隆抗体12-8F的可变区序列如图5所示。

3.5单抗效价测定

间接ELISA实验测定单克隆抗体的效价，用2μg/mL S2蛋白包板CBS稀释后每孔包被100μL，4℃过夜。5％脱脂奶每孔加入200μL封闭，37℃，2h；以纯化后单克隆抗体1:1000稀释后加入首孔，然后从左至右依次倍比稀释，同时以PBS免疫小鼠血清作为阴性对照，37℃，1h；HRP标记羊抗鼠作为二抗1:1000稀释后每孔100μL，37℃，1h；PBST洗板3次后加入TMB显色液，100μL/孔，遮光反应5min；加入100μL 2mol/L H2SO4终止反应，最后读取OD450nm值。结果如图4所示。

3.6间接免疫荧光(IFA)试验

将HEK293T细胞铺于6孔板中，细胞密度在70-80％，共2mL。转染1.6制备的质粒，培养48小时，弃去上清，每孔加入1mL预冷甲醇，固定20min后小心吸出甲醇并晾干6孔板。吸取1mL PBS清洗6孔板后每孔加2mL 5％脱脂奶37℃封闭1h；单克隆抗体12-8F按照1:2000稀释后分别加入细胞孔，以融合小鼠眼眶血清1:1000稀释作为阳性对照，37℃，1h；AF488荧光二抗1:1000稀释，37℃，1h；PBS洗3次后每孔加入800μL DAPI孵育15min，弃去，PBS再洗3次，每孔加入1mL ddH2O，荧光显微镜下观察结果。如图6所示。结果表明，本发明中的单克隆抗体12-8F可与S2重组蛋白发生特异性反应。

实施例2核酸分子

本实施例的核酸分子，能够编码得到实施例1的单克隆抗体，其中编码重链可变区的基因核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示，编码轻链可变区的基因核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示。

实施例3 SARS-CoV-2Spike重组蛋白线性B细胞表位的定位

本实施例进行SARS-CoV-2Spike重组蛋白线性B细胞表位的定位确认，具体过程如下：

(1)SARS-CoV-2Spike蛋白S2区域氨基酸序列截短合成及鉴定

对SARS-CoV-2Spike蛋白的胞外区(686-1213aa)的氨基酸序列按照表6进行截短合成一系列连续重叠肽段(吉尔生化)，合成后的S28-S49共23条多肽稀释成4mg/mL，每条多肽按照每孔包被4μg分别包被9个孔(针对每个mAb，分别做3次重复实验)，S2重组蛋白作为阳性对照包被原，PBS作为阴性对照。按照表7组合成肽池进行反应，Dot-blot显示肽池#12与单抗12-8F反应(图7)。再将每个反应的肽池中的肽分别与抗体反应，发现S49是单抗12-8F的识别表位肽，结果如图7。进而将肽S49继续截短合成(表8)，同上述的方法，Dot-blot显示S49.4可与对应的单抗发生特异性结合(图7)。

表6 SARS-CoV-2Spike蛋白胞外区重叠多肽设计序列

表7肽池设计

表8肽S49截短序列设计

(2)SARS-CoV-2Spike蛋白S2区域线性B细胞表位关键氨基酸的确定

由上述实验可得S49.4为12个氨基酸的肽¹²⁰²ELGKYEQYIKWP¹²¹³，我们采用了丙氨酸扫描法来确定肽S49.4的具体起作用的氨基酸残基。具体地，将每条多肽的每个氨基酸残基分别逐个替换成丙氨酸(A)，原来是丙氨酸的则替换为甘氨酸(G)，具体肽设计见表9，按照上述方法进行实验，结果显示^K1205、^Q1208、^Y1209是肽S49.4与单抗12-8F反应的关键氨基酸(图8)。

表9肽S19.2和S49.4丙氨酸突变序列设计

实施例4单克隆抗体及SARS-CoV-2的表位肽作为检测靶标的应用

本实施例的单克隆抗体的应用，具体说明如下：

利用上述实施例的单抗12-8F检测SARS-CoV-2；以单克隆抗体作为检测抗体，通过Western blotting，ELISA，IFA，IPMA，免疫层析试纸等方法检测SARS-CoV-2抗原。具体的检测方法可在本发明公开的抗原表位肽的基础上参考现有技术常规构建，例如，参考“《免疫学实验》，余平等，2012”或“《免疫诊断试剂实用技术》，唐秋艳等，2009”记载的实验方法。

利用上述实施例确定的SARS-CoV-2表位的氨基酸序列作为抗原去检测SARS-CoV-2抗体。具体操作为：将表位肽与载体蛋白偶联，偶联方法为利用水溶性的氨基-巯基交联剂Sulfo-SMCC进行偶联。Sulfo-SMCC具有sulfo-NHS酯和马来酰亚胺两个反应基团，可以在在伯氨基与巯基之间发生反应。首先，在pH7-9的条件下，Sulfo-SMCC与载体蛋白BSA的伯胺基发生反应，形成稳定的酰胺键，得到活化的载体蛋白BSA。其次，活化的BSA经PBS(pH7.2-7.4)透析，换三次透析液，每次间隔6个小时。收集透析好的溶液，用PBS调整蛋白浓度至5mg/ml。最后，在pH 6.5-7.5的条件下，活化好的BSA与阳性反应肽段的巯基发生反应，形成稳定的硫醚键，形成免疫原性载体蛋白BSA与阳性反应肽段偶联物，以用于抗体生产，偶联后的表位肽可以作为包被原通过ELISA检测SARS-CoV-2抗体，待检抗体作为一抗；作为固定原通过Westernblotting检测SARS-CoV-2抗体。此外，也可以作为标记抗原或捕获抗原用于免疫层析试纸等。

以上所述仅为本发明较佳的实施例，对于本领域的技术人员来说，本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

<110> 郑州大学 河南农业大学

<120> 抗SARS-CoV-2 spike蛋白S2的单克隆抗体及应用

<160> 52

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> VHCDR1

<400> 1

Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Trp

1 5

<210> 2

<211> 7

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> VHCDR2

<400> 2

Ile Leu Glu Met Val Ile Leu

1 5

<210> 3

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> VHCDR3

<400> 3

Asn Trp Tyr Leu Val Cys Leu Leu

1 5

<210> 4

<211> 9

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> VLCDR1

<400> 4

Lys Ser Val Ser Thr Ser Gly Tyr Ser

1 5

<210> 5

<211> 3

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> VLCDR2

<400> 5

Leu Val Ser

1

<210> 6

<211> 8

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> VLCDR3

<400> 6

Gln His Ile Arg Glu Leu Thr Arg

1 5

<210> 7

<211> 108

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> 重链可变区

<400> 7

Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala Ser

1 5 10 15

Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Trp

20 25 30

Met Gln Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Trp Ile Ile Leu

35 40 45

Glu Met Val Ile Leu Gly Thr Leu Arg Ser Ser Arg Ala Arg Pro His

50 55 60

Leu Gln Ile Asn Pro Pro Ala Gln Pro Thr Cys Asn Ser Ala Ala Trp

65 70 75 80

His Leu Arg Thr Leu Arg Ser Ile Thr Val Asn Trp Tyr Leu Val Cys

85 90 95

Leu Leu Gly Pro Arg Asp His Gly His Arg Leu Leu

100 105

<210> 8

<211> 109

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> 轻链可变区

<400> 8

Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly

1 5 10 15

Gln Arg Ala Thr Ile Ser Tyr Arg Ala Ser Lys Ser Val Ser Thr Ser

20 25 30

Gly Tyr Ser Tyr Met His Trp Asn Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro

35 40 45

Arg Leu Leu Ile Tyr Leu Val Ser Asn Leu Glu Ser Gly Val Pro Ala

50 55 60

Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His

65 70 75 80

Pro Val Glu Glu Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln His Ile Arg

85 90 95

Glu Leu Thr Arg Ser Glu Gly Gly Pro Ser Trp Lys Asn

100 105

<210> 9

<211> 324

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> 重链可变区编码基因

<400> 9

gtgcaactgc agcagtctgg ggctgagctg gcaagacctg gggcttcagt gaagttgtcc 60

tgcaaggctt ctggctacac ctttactagc tactggatgc agtgggtaaa acagaggcct 120

ggacagggtc tgtggattat cctggagatg gtgatactag gtacactcag aagttcaagg 180

gcaaggccac atctgcagat aaatcctcca gcacagccta catgcaactc agcagcttgg 240

catctgagga ctctgcggtc tattactgtg aactggtacc tggtttgctt actggggcca 300

agggaccacg gtcaccgtct cctc 324

<210> 10

<211> 327

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> 轻链可变区编码基因

<400> 10

gacattgtgc tgacacagtc tcctgcttcc ttagctgtat ctctggggca gagggccacc 60

atctcataca gggccagcaa aagtgtcagt acatctggct atagttatat gcactggaac 120

caacagaaac caggacagcc acccagactc ctcatctatc ttgtatccaa cctagaatct 180

ggggtccctg ccaggttcag tggcagtggg tctgggacag acttcaccct caacatccat 240

cctgtggagg aggaggatgc tgcaacctat tactgtcagc acattaggga gcttacacgt 300

tcggaggggg gaccaagctg gaaaaac 327

<210> 11

<211> 12

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> B细胞表位

<400> 11

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 12

<211> 528

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S2亚基氨基酸序列

<400> 12

Ser Val Ala Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala

1 5 10 15

Glu Asn Ser Val Ala Tyr Ser Asn Asn Ser Ile Ala Ile Pro Thr Asn

20 25 30

Phe Thr Ile Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser Met Thr Lys

35 40 45

Thr Ser Val Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys

50 55 60

Ser Asn Leu Leu Leu Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg

65 70 75 80

Ala Leu Thr Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr Gln Glu Val

85 90 95

Phe Ala Gln Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile Lys Asp Phe

100 105 110

Gly Gly Phe Asn Phe Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Ser Lys Pro Ser

115 120 125

Lys Arg Ser Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala

130 135 140

Asp Ala Gly Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile Ala

145 150 155 160

Ala Arg Asp Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu

165 170 175

Pro Pro Leu Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala Leu

180 185 190

Leu Ala Gly Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala

195 200 205

Leu Gln Ile Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile

210 215 220

Gly Val Thr Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn

225 230 235 240

Gln Phe Asn Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser Thr

245 250 255

Ala Ser Ala Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala Gln

260 265 270

Ala Leu Asn Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile

275 280 285

Ser Ser Val Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala

290 295 300

Glu Val Gln Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln Ser Leu Gln

305 310 315 320

Thr Tyr Val Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala Ser

325 330 335

Ala Asn Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly Gln Ser

340 345 350

Lys Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His Leu Met Ser Phe Pro

355 360 365

Gln Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu His Val Thr Tyr Val Pro

370 375 380

Ala Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala Ile Cys His Asp Gly

385 390 395 400

Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe Val Ser Asn Gly Thr His

405 410 415

Trp Phe Val Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu Pro Gln Ile Ile Thr Thr

420 425 430

Asp Asn Thr Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp Val Val Ile Gly Ile Val

435 440 445

Asn Asn Thr Val Tyr Asp Pro Leu Gln Pro Glu Leu Asp Ser Phe Lys

450 455 460

Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn His Thr Ser Pro Asp Val Asp

465 470 475 480

Leu Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn Ala Ser Val Val Asn Ile Gln Lys

485 490 495

Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys Asn Leu Asn Glu Ser Leu

500 505 510

Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

515 520 525

<210> 13

<211> 51

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> pCS2-F

<400> 13

cgcggatcca tgcaccacca ccaccatcac tctgttgcta gccagtcaat c 51

<210> 14

<211> 34

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> pCS2-R

<400> 14

gctctagatt atggccactt aatgtactgc tcgt 34

<210> 15

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S28

<400> 15

Cys Ala Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala Arg Ser

1 5 10 15

Val Ala Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly

20 25 30

<210> 16

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S29

<400> 16

Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala Glu Asn Ser Val Ala Tyr Ser Asn Asn

1 5 10 15

Ser Ile Ala Ile Pro Thr Asn Phe Thr Ile Ser Val Thr Thr

20 25 30

<210> 17

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S30

<400> 17

Thr Ile Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser Met Thr Lys Thr

1 5 10 15

Ser Val Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu

20 25 30

<210> 18

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S31

<400> 18

Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys Ser Asn Leu Leu Leu Gln Tyr Gly Ser

1 5 10 15

Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg Ala Leu Thr Gly Ile Ala Val

20 25 30

<210> 19

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S32

<400> 19

Leu Thr Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr Gln Glu Val Phe

1 5 10 15

Ala Gln Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile Lys Asp

20 25 30

<210> 20

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S33

<400> 20

Thr Pro Pro Ile Lys Asp Phe Gly Gly Phe Asn Phe Ser Gln Ile Leu

1 5 10 15

Pro Asp Pro Ser Lys Pro Ser Lys Arg Ser Phe Ile Glu Asp

20 25 30

<210> 21

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S34

<400> 21

Arg Ser Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala Asp

1 5 10 15

Ala Gly Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile

20 25 30

<210> 22

<211> 30

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> S35

<400> 22

Asp Cys Leu Gly Asp Ile Ala Ala Arg Asp Leu Ile Cys Ala Gln Lys

1 5 10 15

Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu Leu Thr Asp Glu

20 25 30

<210> 23

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S36

<400> 23

Pro Leu Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala Leu Leu

1 5 10 15

Ala Gly Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala

20 25 30

<210> 24

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S37

<400> 24

Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile Pro Phe Ala Met Gln Met

1 5 10 15

Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly Val Thr Gln Asn Val Leu

20 25 30

<210> 25

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S38

<400> 25

Val Thr Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Gln

1 5 10 15

Phe Asn Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser

20 25 30

<210> 26

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S39

<400> 26

Gln Asp Ser Leu Ser Ser Thr Ala Ser Ala Leu Gly Lys Leu Gln Asp

1 5 10 15

Val Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn Thr Leu Val Lys

20 25 30

<210> 27

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S40

<400> 27

Leu Asn Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser

1 5 10 15

Ser Val Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu

20 25 30

<210> 28

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S41

<400> 28

Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln Ile Asp Arg Leu Ile Thr

1 5 10 15

Gly Arg Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val Thr Gln Gln Leu

20 25 30

<210> 29

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S42

<400> 29

Tyr Val Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala Ser Ala

1 5 10 15

Asn Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly Gln

20 25 30

<210> 30

<211> 29

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S43

<400> 30

Glu Cys Val Leu Gly Gln Ser Lys Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly

1 5 10 15

Tyr His Leu Met Ser Phe Pro Gln Ser Ala Pro His Val

20 25

<210> 31

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S44

<400> 31

Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu His Val Thr Tyr Val Pro Ala

1 5 10 15

Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala Ile Cys His Asp

20 25 30

<210> 32

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S45

<400> 32

Pro Ala Ile Cys His Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val

1 5 10 15

Phe Val Ser Asn Gly Thr His Trp Phe Val Thr Gln Arg Asn

20 25 30

<210> 33

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S46

<400> 33

Phe Val Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu Pro Gln Ile Ile Thr Thr Asp

1 5 10 15

Asn Thr Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp Val Val Ile Gly Ile

20 25 30

<210> 34

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S47

<400> 34

Asp Val Val Ile Gly Ile Val Asn Asn Thr Val Tyr Asp Pro Leu Gln

1 5 10 15

Pro Glu Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe

20 25 30

<210> 35

<211> 30

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S48

<400> 35

Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn His Thr Ser Pro Asp Val Asp Leu

1 5 10 15

Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn Ala Ser Val Val Asn Ile Gln

20 25 30

<210> 36

<211> 39

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S49

<400> 36

Ser Val Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala

1 5 10 15

Lys Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly Lys Tyr

20 25 30

Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

35

<210> 37

<211> 12

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S49.1

<400> 37

Ser Val Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu

1 5 10

<210> 38

<211> 12

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S49.2

<400> 38

Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys Asn Leu Asn Glu

1 5 10

<210> 39

<211> 12

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S49.3

<400> 39

Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly

1 5 10

<210> 40

<211> 12

<212> PRT

<213> SARS-CoV-2

<221> S49.4

<400> 40

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 41

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> E1202A

<400> 41

Ala Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 42

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> L1203A

<400> 42

Glu Ala Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 43

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> G1204A

<400> 43

Glu Leu Ala Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 44

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> K1205A

<400> 44

Glu Leu Gly Ala Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 45

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> Y1206A

<400> 45

Glu Leu Gly Lys Ala Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 46

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> E1207A

<400> 46

Glu Leu Gly Lys Tyr Ala Gln Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 47

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> Q1208A

<400> 47

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Ala Tyr Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 48

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> Y1209A

<400> 48

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Ala Ile Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 49

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> I1210A

<400> 49

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ala Lys Trp Pro

1 5 10

<210> 50

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> K1211A

<400> 50

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Ala Trp Pro

1 5 10

<210> 51

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> W1212A

<400> 51

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Ala Pro

1 5 10

<210> 52

<211> 12

<212> PRT

<213> 人工序列

<221> P1213A

<400> 52

Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Ala

1 5 10

Claims (9)

1.抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体，其特征在于，其包含氨基酸序列如SEQ IDNO：1-3所示的VHCDR1、VHCDR2、VHCDR3，和氨基酸序列如SEQ ID NO：4-6所示的VLCDR1、VLCDR2、VLCDR3。

2.如权利要求1所述的抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体，其特征在于，所述抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体的重链可变区氨基酸序列、轻链可变区氨基酸序列分别如SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8所示。

3.如权利要求2所述的抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体，其特征在于，所述抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体的重链为IgG2b型，轻链为Kappa型。

4.编码如权利要求1～3中任一项所述的抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体的核酸分子。

5.如权利要求4所述的核酸分子，其特征在于，编码所述抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体的重链可变区的基因核苷酸序列如SEQ ID NO：9所示，编码所述抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体的轻链可变区的基因核苷酸序列如SEQ ID NO：10所示。

6.如权利要求1～3中任一项所述的抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体在制备诊断、检测或预防SARS-CoV-2试剂中的应用。

7.如权利要求6所述的应用，其特征在于，所述抗SARS-CoV-2spike蛋白S2的单克隆抗体特异性识别SARS-CoV-2spike蛋白S2的B细胞表位，所述B细胞表位的氨基酸序列如SEQID NO：11所示。

8.如权利要求7所述的应用，其特征在于，所述B细胞表位与所述单克隆抗体结合的关键氨基酸为^K1205、^Q1208、^Y1209。

9.如权利要求7或8所述的应用，其特征在于，利用所述B细胞表位制备诊断或预防SARS-CoV-2试剂。

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