CN114487188A - 基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,该方法为非疾病的治疗目的的方法,采用苯甲酸雌二醇和缩宫素联用复制原发性痛经大鼠模型,使用加味没竭片对原发性痛经大鼠模型进行干预治疗,基于气相色谱‑飞行时间质谱仪采集治疗后大鼠血清样品的代谢图谱信息;对数据进行处理分析,筛选出有显著性差异的生物标志物,通过网站分析其参与的代谢通路,探讨加味没竭片治疗原发性痛经的作用机制。本发明从整体的角度研究外界刺激对生物体内源性小分子的影响及变化规律,代谢组学方法与中药整体观相吻合,为中医证候和中药整体作用机制研究提供了新的研究思路和方法。
Description
技术领域
本发明属于生物信息学技术领域,具体涉及一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法。
背景技术
痛经系指经期前后或行经期间,出现下腹部痉挛性疼痛,并有全身不适,严重影响日常生活。分原发性和继发性两种。原发性痛经即功能性痛经,是指月经期疼痛,常呈痉挛性,集中在下腹部。其他症状包括头痛乏力、头晕、恶心呕吐、腹泻、腰腿痛,是年轻女性十分常见的病症,严重影响育龄期女性的正常工作生活。原发性痛经的临床治疗提倡尽快实施有效治疗措施,探讨对原发性痛经的干预作用及机制显得尤为重要。
原发性痛经主要由于生理期间前列腺素分泌较多,引起子宫肌层收缩剧烈,加味没竭片能够显著缓解原发性痛经患者的疼痛症状。目前对加味没竭片治疗原发性痛经的作用机制研究较少。中医讲究辨证论治,在疾病发生发展过程中,其生理、病理不断变化,疾病治疗应对症治疗。
加味没竭片对原发性痛经有破气行滞,活血化瘀的功效,在临床运用广泛。
发明内容
针对现有技术中的不足,本发明的目的是提供一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法。即一种基于非靶向代谢组学判定加味没竭片作用于原发性痛经大鼠的代谢变化方法,具体地,研究加味没竭片对原发性痛经模型大鼠血清代谢物的影响,寻找可能的生物标志物,探讨加味没竭片治疗原发性痛经的作用机制。
为达到上述目的,本发明的解决方案是:
一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,该方法为非疾病的治疗目的的方法,其包括如下步骤:
(1)、给大鼠皮下注射苯甲酸雌二醇,腹腔注射缩宫素得到原发性痛经大鼠模型,灌胃给药加味没竭片;
(2)、通过气相色谱-飞行时间质谱仪(GC-TOF/MS),造模后,采用加味没竭片对原发性痛经大鼠模型干预治疗,获得的血清进行代谢图谱信息的采集;
(3)、对步骤(2)中的代谢图谱信息进行数据预处理;
(4)、进行多变量统计分析,筛选有显著性差异的生物标志物群;
(5)、分析所述生物标志物群参与的代谢通路,探讨加味没竭片制备治疗原发性痛经的作用机制。
作为本发明的优选实施例,步骤(1)中,加味没竭片的制备过程为:按处方,将血竭、蒲黄、乳香、没药粉碎成细粉后备用;莪术粉碎成粗粉后,用水蒸气提取挥发油,蒸馏后的水溶液过滤,药渣、滤液分别收集;挥发油与β-环糊精、水混合并研磨进行包合,过滤,包合物真空干燥;药渣与浸泡的地龙、赤芍、三棱、土鳖虫加水煎煮,过滤,合并两次滤液,与上述莪术滤液合并后浓缩,加乙醇,静置,过滤,滤液回收乙醇并浓缩得流浸膏。
作为本发明的优选实施例,步骤(2)中,代谢图谱信息的采集过程具体包括:
(2.1)、血清样品制备:将冻存的原发性痛经大鼠模型的血清室温解冻,离心,加入甲醇/氯仿溶剂涡旋,再次离心,取上清液,回收即可;
(2.2)、设定气相色谱-飞行时间质谱仪中的质谱条件:接口温度:220℃;离子源温度:220℃;溶剂延时为6min,电离方式为电子电离,电子能量为70eV,全扫描方式,质谱扫描范围为30-550m/z,以每秒10张谱方式采集;
色谱条件:进样温度:270℃;不分流进样1.0μL;柱温:起始温度为90℃,保留1min,以8℃/min的速度升至170℃,然后,以5℃/min的速度升至240℃,最后,以25℃/min的速度升至290℃,保留9min;流速为1.0mL/min,载气为浓度≥99.999%的氦气;
通过GC-TOF/MS采集大鼠原发性痛经治疗血清样品的代谢图谱。
作为本发明的优选实施例,步骤(3)中,数据预处理的过程为:对采集的代谢图谱信息进行峰提取、峰对齐、峰匹配和峰强度的校正,获得包含化合物保留时间和峰面积信息的csv格式文件。
作为本发明的优选实施例,步骤(4)中,多变量统计分析的过程为:将分组后的数据进行无监督的主成分分析和有监督的偏最小二乘回归分析,对组别进行分类并判别组间差异,选择显著性差异P值小于0.05、VIP值大于1的变量作为生物标志物群。
一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型,其由上述的方法得到。
一种上述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型在筛选抗痛经药物中的应用。
一种上述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型在筛选抗原发性痛经药物中的应用。
由于采用上述方案,本发明的有益效果是:
本发明从整体的角度研究外界刺激对生物体内源性小分子的影响及变化规律,代谢组学方法与中药整体观相吻合,为中医证候和中药整体作用机制研究提供了新的研究思路和方法。
具体实施方式
本发明提供了一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法。
本发明的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,该方法为非疾病的治疗目的的方法,包括如下步骤:
(1)、给大鼠皮下注射苯甲酸雌二醇,腹腔注射缩宫素得到(即复制)原发性痛经大鼠模型,灌胃给药加味没竭片;
(2)、通过GC-TOF/MS,造模后,采用加味没竭片对原发性痛经大鼠模型干预治疗,获得的血清进行代谢图谱信息的采集;
(3)、对步骤(2)中的代谢图谱信息进行数据预处理;
(4)、进行多变量统计分析,筛选有显著性差异的生物标志物群;
(5)、分析所述生物标志物群参与的代谢通路,探讨加味没竭片制备治疗原发性痛经的作用机制。
其中,在步骤(1)中,加味没竭片的制备过程为:按处方,将血竭、蒲黄、乳香、没药粉碎成细粉后备用;莪术粉碎成粗粉后,用水蒸气提取挥发油,蒸馏后的水溶液过滤,药渣、滤液分别收集;挥发油与β-环糊精、水混合并研磨进行包合,过滤,包合物真空干燥;药渣与浸泡的地龙、赤芍、三棱、土鳖虫加水煎煮,过滤,合并两次滤液,与上述莪术滤液合并后浓缩,加乙醇,静置,过滤,滤液回收乙醇并浓缩得流浸膏。
在步骤(2)中,代谢图谱信息的采集过程具体包括:
(2.1)、血清样品制备:取50μL血清,置于离心管中,加入200μL甲醇/氯仿溶剂(3:1,V/V),涡旋振荡混匀,在4℃下,以12000rpm转速离心10min,取200μL上清液,置于高回收进样瓶中,进行GC-TOF/MS分析,既得;
(2.2)、设定GC-TOF/MS中的条件:
质谱仪:美国LECO公司Pegsus BT型TOF-MS仪器,质谱条件:接口温度:220℃;离子源温度:220℃;溶剂延时为6min,电离方式为电子电离,电子能量为70eV,全扫描方式,质谱扫描范围为30-550m/z,以每秒10张谱方式采集;
使用质控样品进行方法验证,质控样品由每个正常样品各取10μL混合而得;样品的检测过程中,每检测10个正常样品后运行1次QC样品以衡量系统的稳定性,样品的检测顺序为随机进行;
色谱柱:美国Agilent公司7890B GC的DB-5MS色谱柱,色谱条件:进样温度:270℃;不分流进样1.0μL;柱温:起始温度为90℃,保留1min,以8℃/min的速度升至170℃,然后,以5℃/min的速度升至240℃,最后,以25℃/min的速度升至290℃,保留9min;流速为1.0mL/min,载气为超纯氦气(≥99.999%);
通过ChromaTOF for BT软件采集大鼠原发性痛经治疗血清样品的代谢图谱。
在步骤(3)中,数据预处理的过程为:基于ChromaTOF for BT软件对采集的代谢图谱信息进行峰提取、峰对齐、峰匹配和峰强度的校正等,获得包含化合物保留时间和峰面积信息的csv格式文件。
在步骤(4)中,多变量统计分析的过程为:设计好实验分组,将处理后的数据矩阵使用SIMCA 21.0软件进行多变量统计分析,进行无监督的主成分分析和有监督的偏最小二乘回归分析,对组别进行分类并判别组间差异,选择显著性差异P值小于0.05、VIP值大于1的变量作为生物标志物群,此时得到其保留时间和峰面积信息,基于生物学数据库筛选出加味没竭片治疗大鼠原发性痛经的内源性生物标志物并对其进行鉴定。
在步骤(5)中,通过Metaboanalyst网站分析其参与的代谢通路,探讨加味没竭片制备治疗原发性痛经的作用机制。
由上述的方法得到本发明的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型。
本发明的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型可以在筛选抗痛经药物中得以应用。
本发明的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型可以在筛选抗原发性痛经药物中得以应用。
下面结合实施例对本发明的技术内容做进一步的说明。下述实施例是说明性的,不是限定性的,不能以下述实施例来限定本发明的保护范围。下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
本实施例的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,该方法为非疾病的治疗目的的方法,包括如下步骤:
(1)、采用皮下注射苯甲酸雌二醇、腹腔注射缩宫素复制原发性痛经大鼠模型。取未孕雌性SD大鼠60只,在SPF级动物房中分笼适应性饲养1周后。从第1天开始,皮下注射苯甲酸雌二醇,连续10天,每日1次,末次给药1h后,腹腔注射缩宫素(10U/只)。
(2)、基于GC-TOF/MS联用技术,利用气相色谱的高灵敏度特性,采集大鼠原发性痛经血清样品的代谢图谱信息。
该图谱信息获取具体过程包括:
(2.1)、血清样品制备方法
将冻存大鼠血清室温解冻,取100μL血清,置于离心管中,加入300μL甲醇/氯仿溶剂(3:1,V/V),涡旋振荡混匀,在4℃下,以12000rpm转速离心10min,取300μL上清液,置于1.5mL高回收进样瓶中,进行GC-TOF/MS分析,既得。
(2.2)、血清样品测定条件
(2.2.1)、质谱仪:美国LECO公司Pegsus BT型TOF-MS仪器,质谱条件:
接口温度:220℃;离子源温度:220℃;溶剂延时6min,电离方式EI,电子能量70eV,全扫描方式,质谱扫描范围为30-550m/z,以每秒10张谱方式采集;
使用质控样品进行方法验证,质控样品由每个正常样品各取10μL混合而得;样品的检测过程中,每检测10个正常样品后运行1次QC样品以衡量系统的稳定性,样品的检测顺序为随机进行;
(2.2.2)、色谱柱:美国Agilent公司7890B GC的DB-5MS色谱柱,色谱条件:
进样温度:270℃;不分流进样1.0μL;柱温:起始温度90℃,保留1min,以8℃/min的速度升至170℃,然后,以5℃/min的速度升至240℃,最后,以25℃/min的速度升至290℃,保留9min;流速1.0mL/min,载气为超纯氦气(≥99.999%)。
(2.2.3)、图谱采集软件
通过ChromaTOF for BT软件采集大鼠原发性痛经治疗血清样品的代谢图谱。
(3)、运用ChromaTOF for BT软件进行数据预处理;
基于ChromaTOF for BT软件对采集得到的谱图进行峰提取、峰对齐、峰匹配和峰强度的校正等,获得包含化合物保留时间和峰面积信息的csv格式文件。
(4)、利用SIMCA 21.0统计软件进行多变量统计分析,筛选出又显著性差异的生物标志物群。
设计好实验分组,将处理后的数据矩阵导入SIMCA 21.0统计软件进行多变量统计分析,进行无监督的主成分分析和有监督的偏最小二乘回归分析,对组别进行分类并判别组间差异,选择显著性差异P值小于0.05、VIP值大于1的变量作为生物标志物群,此时得到其保留时间和峰面积信息,基于生物学数据库筛选出加味没竭片治疗大鼠原发性痛经的内源性生物标志物并对其进行鉴定。
原发性痛经大鼠模型使得15个病理性生物标志物发生了显著波动,最终鉴定出3个病理性标志物,分别为亚油酸、延胡索酸和天冬氨酸。与正常组相比较,原发性痛经模型组病理性标志物均表现为上升趋势。
(5)、对步骤(4)筛选出的并确认的差异代谢标志物通过Metaboanalyst网站分析其参与的代谢通路,探讨加味没竭片治疗原发性痛经的作用机制。把差异代谢标志物放入Metaboanalyst网站自动给出代谢通路,然后结合相关代谢物数据库如HMBD(Human Metabolome Data base)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes andGenomes)等查询差异生物标志物的生物学功能并作出解释即可。原发性痛经模型引起大鼠体内的亚油酸、延胡索酸和天冬氨酸的差异性表达,根据其生物学功能,推测可能影响大鼠体内的脂质代谢和氨基酸合成。
本发明通过复制原发性痛经大鼠模型,观察给药后大鼠的痛经症状,检测内源性小分子代谢物的变化,并与前人的研究、临床的指标相对比,来判断模型研究的准确性,初步表明,大鼠进行苯甲酸雌二醇和缩宫素注射后各指标组间存在显著差异,因此判定原发性痛经模型成功建立。
上述对实施例的描述是为了便于该技术领域的普通技术人员能理解和使用本发明。熟悉本领域技术人员显然可以容易的对这些实施例做出各种修改,并把在此说明的一般原理应用到其他实施例中,而不必经过创造性的劳动。因此,本发明不限于上述实施例。本领域技术人员根据本发明的原理,不脱离本发明的范畴所做出的改进和修改都应该在本发明的保护范围之内。
Claims (8)
1.一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,该方法为非疾病的治疗目的的方法,其特征在于:其包括如下步骤:
(1)、给大鼠皮下注射苯甲酸雌二醇,腹腔注射缩宫素得到原发性痛经大鼠模型,灌胃给药加味没竭片;
(2)、通过气相色谱-飞行时间质谱仪,采用加味没竭片对原发性痛经大鼠模型干预治疗,获得的血清进行代谢图谱信息的采集;
(3)、对步骤(2)中的代谢图谱信息进行数据预处理;
(4)、进行多变量统计分析,筛选有显著性差异的生物标志物群;
(5)、分析所述生物标志物群参与的代谢通路,探讨加味没竭片制备治疗原发性痛经的作用机制。
2.根据权利要求1所述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,其特征在于:步骤(1)中,所述加味没竭片的制备过程为:将血竭、蒲黄、乳香、没药粉碎成细粉后备用;莪术粉碎成粗粉后,用水蒸气提取挥发油,蒸馏后的水溶液过滤,药渣、滤液分别收集;挥发油与β-环糊精、水混合并研磨进行包合,过滤,包合物真空干燥;药渣与浸泡的地龙、赤芍、三棱、土鳖虫加水煎煮,过滤,合并滤液,与莪术滤液合并后浓缩,加乙醇,静置,过滤,滤液回收乙醇并浓缩。
3.根据权利要求1所述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,其特征在于:步骤(2)中,所述代谢图谱信息的采集过程具体包括:
(2.1)、血清样品制备:将冻存的原发性痛经大鼠模型的血清室温解冻,离心,加入甲醇/氯仿溶剂涡旋,再次离心,取上清液,回收即可;
(2.2)、设定气相色谱-飞行时间质谱仪中的质谱条件:接口温度:220℃;离子源温度:220℃;溶剂延时为6min,电离方式为电子电离,电子能量为70eV,全扫描方式,质谱扫描范围为30-550m/z,以每秒10张谱方式采集;
色谱条件:进样温度:270℃;不分流进样1.0μL;柱温:起始温度为90℃,保留1min,以8℃/min的速度升至170℃,然后,以5℃/min的速度升至240℃,最后,以25℃/min的速度升至290℃,保留9min;流速为1.0mL/min,载气为浓度≥99.999%的氦气;
通过气相色谱-飞行时间质谱仪采集大鼠原发性痛经治疗血清样品的代谢图谱。
4.根据权利要求1所述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,其特征在于:步骤(3)中,所述数据预处理的过程为:对采集的代谢图谱信息进行峰提取、峰对齐、峰匹配和峰强度的校正,获得包含化合物保留时间和峰面积信息的csv格式文件。
5.根据权利要求1所述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型的代谢组学方法,其特征在于:步骤(4)中,所述多变量统计分析的过程:将分组后的数据进行无监督的主成分分析和有监督的偏最小二乘回归分析,对组别进行分类并判别组间差异,选择显著性差异P值小于0.05、VIP值大于1的变量作为生物标志物群。
6.一种基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型,其特征在于:其由权利要求1-5任一项所述的方法得到。
7.一种如权利要求6所述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型在筛选抗痛经药物中的应用。
8.一种如权利要求6所述的基于加味没竭片制备治疗原发性痛经动物模型在筛选抗原发性痛经药物中的应用。
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