CN114231625A - Qser1基因的用途及其相关药物 - Google Patents
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Abstract
本发明主要阐述了QSER1蛋白在多种肿瘤中作为多种肿瘤的诊断和预测预后的生物标志物的应用及方法。本发明阐述了QSER1在预测多种癌症，例如肝癌、肉瘤、肾癌、胃腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、胰腺癌、乳腺癌、胃癌等癌症的诊断。本发明还构建了特异性干扰QSER1基因表达的shRNA、能够干扰QSER1基因表达的质粒、干扰QSER1基因表达的慢病毒和QSER1特异性识别的抗体。本发明提供的特异性shRNA序列的质粒、慢病毒能够降低QSER1基因的表达水平，从而能够抑制细胞的生长、细胞克隆的形成，促进肿瘤细胞的凋亡，对肿瘤的诊断和治疗有非常重大的意义。并且根据本发明的研究成果，可以开发用于多种癌症诊断和预测预后的试剂盒，该试剂盒在临床上具有广泛的应用前景。
Description
技术领域
本发明涉及医药生物领域，具体涉及QSER1基因的用途及其相关药物。
背景技术
癌症治疗的一个重要反应是诱导细胞死亡程序。癌细胞通过逃避细胞凋亡过程无限增值，导致患者死亡。因此，无法激活细胞的凋亡程序是癌症治疗失败的标志。然而，癌细胞中程序性细胞死亡的信号途径通常是异常的。细胞凋亡是防止肿瘤发生的重要原因。不受调节的细胞凋亡导致肿瘤形成和对抗癌疗法的反应减弱。
近年来，分子分析领域发展迅速。现在的重点正在从一些小的、预测性的、疾病特异性的、基于证据的测试转向更广泛的测试，以测量无数“基因或基因产物”的变化。这些基因组变化可用作反应预测和患者预后的生物标志物。已经鉴定出越来越多的生物标志物，并且这些生物标志物正在被发现和治疗开发。但是由于一些基因的具体作用机制不明，很大程度上阻碍了在肿瘤研究及治疗方面的应用。
发明内容
针对现有技术的不足，本发明提出了QSER1基因的用途及其相关药物。
本发明的目的可以通过以下技术方案实现：
一种用于肿瘤检测或肿瘤病人生存期和预后诊断的试剂盒，包括：
能够检测QSER1基因表达或QSER1基因翻译的蛋白质表达水平的试剂。
可选地，所述试剂包括：能够特异性扩增QSER1基因的引物、与QSER1 DNA序列杂交的探针或能与QSER1表达的蛋白质结合的特异性抗体中的一种或多种。
可选地，所述的能够特异性检测QSER1基因表达的引物的序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2。
QSER1的干扰RNA在用于制作治疗癌症的药物中的应用，所描述的QSER1基因特异性的靶序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4，对应降低QSER1基因表达的核酸分子，所述的干扰RNA的核酸序列是SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6。
一种治疗肿瘤的药物组合物，有效成分包括：
序列为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6的shRNA；
携带所述shRNA的质粒；
所述质粒克隆的慢病毒载体所释放的干扰慢病毒；或者
药学上可接受的所述shRNA的载体或稀释剂。
可选地，所述质粒由将编码所述shRNA的核酸序列克隆到慢病毒载体中获得。
QSER基因表达的抑制剂在制备抑制肿瘤中细胞的侵袭、增殖能力的药物中的应用。
一种QSER1特异性抗体，由SEQ ID NO.7作为抗原序列制得。
上述的抗体在免疫组织化学染色、酶联免疫吸附、Western Blot、高通量测序技术、芯片或原位杂交方面的应用。
可选地，所述肿瘤包括胰腺癌、肝癌、胃癌、肉瘤、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、乳腺癌、胆管癌、食管癌、肺鳞状细胞癌、多形胶质母细胞瘤、头颈鳞状细胞瘤、结肠癌、膀胱尿路上皮癌或肺腺癌中的任意一种。本发明的有益效果：
在本发明中，将QSER1作为一个生物标志物能够在肿瘤的检查、监测以及癌症的治疗中的作用。本发明发现了QSER1是肿瘤学中的一个生物标志物，QSER1可以用来检查疾病，而且根据QSER1的表达量等相关资料，可以监测肿瘤的变化、选择合适的治疗方式。
附图说明
下面结合附图对本发明作进一步的说明。
图1.显示了在多种癌症中(如：胆管癌，食管癌，肉瘤，胃腺癌，肺鳞状细胞癌，多形胶质母细胞瘤，头颈鳞状细胞瘤，肝细胞瘤，结肠癌，膀胱尿路上皮癌，肺腺癌)，QSER1在癌组织及正常组织中的表达水平；
图2.显示了在多种癌症中(例如胰腺癌，肝癌，肉瘤，胃癌，嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、乳腺癌等癌症)QSER1的高表达的患者存活率低；
图3.显示了在胰腺癌中不同病人的正常组织切片中QSER1的免疫印迹结果及其统计；
图4.显示了QSER1在肠癌患者的癌组织和癌旁组织中的表达量；
图5.QSER1敲低后，细胞死亡率升高；
图6.QSER1敲低后，细胞生长状态；
图7.克隆形成实验显示，QSER1敲低后影响细胞克隆形成；
图8.流式细胞仪检测显示，QSER1敲低后细胞凋亡增加；
图9.WB结果展示，QSER1敲低后细胞内凋亡执行蛋白升高。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其它实施例，都属于本发明保护的范围。
在本发明的一些示例中，公开了在多种癌症中，QSER1在癌组织及正常组织中表达量分析。
数据采集：TCGA数据库
分析软件：Kaplan-Meier
如图1所示，在多种癌症中，QSER1在正常组织中的表达量低于癌组织中的表达量；如图2所示，在本示例的多种癌症中(如胰腺癌，肝癌，肉瘤，胃癌，嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、乳腺癌)，QSER1高表达病患的死亡率高与QSER1低表达病患的死亡率。P<0.05代表结果具有生物学意义。
在本发明的一些示例中，公开了QSER1在病人癌组织中的表达量检测实验。
实验样本：通过从上海芯超生物购买胰腺癌肿瘤组织芯片
实验方法：肿瘤组织芯片，由60对胰腺癌和相匹配的相邻正常胰腺组织组成。与针对QSER1的抗体在4℃下孵育12小时。所有染色均通过定量成像方法进行评估；记录免疫染色百分比和染色强度。IHC评分是通过将染色强度水平(0、1、2或3级分别表示阴性、弱阳性、中度阳性或强阳性)乘以阳性率得分(1、2、3或4的分数代表阳性区域)来计算的0–25％、26–50％、51–75％或76–100％)。所用抗体为QSER1特异性识别抗体，制备其抗体所用的抗原序列例如为SEQ ID NO.7：
FATTSPLVLQDSTFNTTSNGILSHHDPLLQIKTSQGTVPTALAFERLGSSVLSNSIPPQSSTYRSAQESAPHLLQPQFSLLPSALGGSQQTPQAYSSTLFTSSTASIERALLRECSVIKHHQRPSGTQSIQAQLTG。
如图3A，3B所示，IHC评分显示，在大多数情况下，癌组织中QSER1的表达高于邻近组织。通过ROC曲线分析，确定了最佳截止值，并将所有样品分为两组：QSER1高表达样品和QSER1低表达样品。癌组织中具有高QSER1表达的样本数量较多(图3C)。通过TMA队列的IHC染色图发现QSER1蛋白水平在胰腺癌组织中也显着上调。如图3D所示，对结直肠癌患者样本的IHC分析还表明，与邻近组织相比，癌组织中的QSER1也显著增加(图3)。
综上，上述数据表明QSER1在多种癌症的癌组织中相对于癌旁组织表达量比较高，并且QSER1的高表达与其不良预后密切相关。
在本发明的一些示例中，公开了一种QSER1敲低后影响细胞死亡率的验证实验。
实验样本：通过培养HCT116后，用慢病毒感染HCT116，获取QSER1特异性敲低的细胞。
实验方法：构建pLKO.1-shRNA载体：
在Sigma官网输入基因名进行查找，获得针对目的基因的shRNA的基因序列，按照以下原则进行初步筛选：(1)尽量不出现连续3个及其以上的A；(2)shRNA序列的以G为首，如若不是，则需另加一个G在正义链上游；(3)30％～60％的GC含量。并记录对应的TRC号。在The Broad Institute官网搜索TRC号，便可获取靶向目的基因shRNA的反义链序列。随后在UCSC官网对选好的序列进行BLAST比对，确保靶点特异性。拿到引物后进行退火连接到pLKO.1的载体骨架上。通过测序得到正确载体克隆。
所得到的QSER1靶序列如下：
SEQ ID NO.3GCTCCTGTTGATAGTACATTA
SEQ ID NO.4AGCACTCCTTACATAGTTATC
SEQ ID NO.5：
CCGGGCTCCTGTTGATAGTACATTACTCGAGTAATGTACTATCAACAGGAGCTTTTTTG
SEQ ID NO.6：
CCGGAGCACTCCTTACATAGTTATCCTCGAGGATAACTATGTAAGGAGTGCTTTTTTTG
细胞系和培养条件：
HCT-116、HEK293T细胞系在加有10％FBS(Ex-Cell Bio)和1％Penicillin-Streptomycin(HyClone)的DMEM(HyClone)中培养。细胞培养条件37℃和5％CO2的加湿培养箱中，每周常规传代2-3次。
慢病毒包装与感染：
将目的质粒与psPAX2，pMD2以4：3：1加入DMEM，与转染试剂共同孵育，最后加入HEK293T中，转染后12-16h更换新的完全培养基，放入培养箱，继续培养。换液24h后，收集上清，其上清中含病毒颗粒，将收取的病毒颗粒上清，离心4000rpm 10min，去除上清中的细胞碎片。将病毒上清和终浓度为8μg/mL的Polybrene加入需要感染的细胞中，放入培养箱，在37℃5％CO2条件下继续培养。感染后8-10h，更换新的完全培养基，感染24小时后加入Puromycin进行筛选，72h后收取细胞，进行实验。
RNA提取：
在上述细胞沉淀中加入1mL RNA isolater Total RNA Extraction Reagent。振荡均匀后，冰上上静置5min。然后加入200μL的三氯甲烷，振荡混匀冰上静置5min。4℃以12000g/min的速度离心15min。此时，EP管中的溶液分为三层，最上面透明无色水相、白色中间层以及最下面红色有机层。取上层水相至新的提前预冷的EP管中。将预先冷却，取和水相等体积的异丙醇，混匀，冰上静置5min。4℃以12000g/min的速度离心15min。管底部有白色沉淀，用抽吸泵去除上清，用75％乙醇1mL洗，室温晾2-3min。然后跑qPCR来检测QSER1的表达量。SEQ ID NO.1：Forward Primer：ACTGGCGGTAACAGTCCATC；SEQ ID NO.2:ReversePrimer：ACCCACAGTGGTTGAGGAAG
细胞凋亡测定。
HCT116细胞用编码NonT shRNA、QSER1 shRNA-1和QSER1 shRNA-2的病毒感染，来敲低内源性QSER1。24小时后，将细胞以每孔2×105个细胞接种在六孔培养皿中。在24h，48h，72h，96h后用血细胞计数器一式三份测量漂浮(凋亡)和附着(活)细胞的数量。结果报告为死细胞数除以总细胞数乘以100(即死细胞的百分比)。
实验结论：如图4所示，QSER1敲低后，细胞生长状况如图5，细胞死亡率升高。
在本发明的一些示例中，公开了一种QSER1敲低后影响细胞克隆形成能力的验证实验。
实验样本：通过培养HCT116后，用慢病毒感染HCT116，获取QSER1特异性敲低的细胞。
实验方法：克隆存活试验
用编码NonT shRNA、QSER1 shRNA-1和QSER1 shRNA-2的病毒感染HCT116细胞，敲低内源性QSER1，然后用PBS洗涤，胰酶消化形成单细胞悬液，200个细胞/孔接种于6孔板。接种后11天，用4％甲醛(生工生物技术)固定菌落并用0.1％结晶紫溶液(生工生物技术)染色。计数来自两个生物学重复(每个接种到一式三份孔中)的菌落。
实验结论：如图6所示，QSER1敲低后影响细胞克隆形成能力。
在本发明的一些示例中，公开了一种QSER1敲低后激活细胞的凋亡程序的验证实验。
实验方法：Annexin V-PE凋亡检测
HCT116细胞用编码NonT shRNA、QSER1 shRNA-1和QSER1 shRNA-2的病毒感染，来敲低内源性QSER1。用不含EDTA的胰蛋白酶消化收集，用PBS(hyclone)洗涤细胞两次(1000rpm离心5分钟)收集1～5×105个细胞，然后加入500μL Binding Buffer和1μLAnnexinV-PE(KeyGen Biotech)混合。室温避光反应5-15分钟后用流式细胞仪观察检测。
蛋白质印迹
制备全细胞裂解物并用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳进行分析。将蛋白质转移到免疫印迹PVDF膜(BIO-RAD)。一抗4℃孵育过夜。HRP偶联的二抗(sigma)以1:10000的稀释度使用。将增强的化学发光底物(Millipore)应用于膜以通过放射自显影进行成像。
实验结论：如图7所示，QSER敲低后，流式结果显示细胞凋亡水平增加。图8的WB显示，在多种癌细胞中，细胞内凋亡程序被激活，细胞内执行凋亡蛋白被激活。
根据上述示例的验证与结论，本发明的一些示例中，公开了一种肿瘤治疗药物组合物，其有效成分可以是能够干扰QSER1表达的shRNA，更具体地说，所述的shRNA的序列可以是SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6。基于上述的实验，本发明的一些示例药物组合物的有效成分还可以是，携带所述shRNA的质粒或者所述质粒克隆的慢病毒载体所释放的干扰慢病毒。并且，本发明的另一些示例中，药物组合物的有效成分，可以包括有助于shRNA导入的细胞的药学上可以接收的载体或者稀释剂，载体例如为纳米粒、脂质体等，稀释剂例如为水、缓冲液、无血清培养基等。上述示例中的药物组合物可干扰或者影响QSER1的表达，从而实现对肿瘤或癌症的治疗。可以理解的是，在前述实验的揭示下，其他的能够干扰或者抑制QSER1表达的试剂，以及所述的试剂与其载体的结合，也能够应用在治疗肿瘤的药物或者药物组合物中。
本示例中所针对的肿瘤例如为但不限于胰腺癌、肝癌、胃癌、肉瘤、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、乳腺癌、胆管癌、食管癌、肺鳞状细胞癌、多形胶质母细胞瘤、头颈鳞状细胞瘤、结肠癌、膀胱尿路上皮癌、肺腺癌等。
在本发明的另一些示例中，公开了一种肿瘤检测试剂盒，包含有能够检测QSER1基因或QSER1基因翻译的蛋白质的试剂。该试剂的应用载体还可以是RT-PCR、免疫组织化学染色、酶联免疫吸附、Northern Blot、高通量测序平台、芯片或原位杂交等等。更具体地说，该试剂可以是，能够特异性扩增QSER1基因的引物、与QSER1 DNA序列杂交的探针或能与QSER1表达的蛋白质结合的特异性抗体中的一种或多种。针对于所述的能够特异性检测QSER1基因表达的引物，其序列例如为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
在本发明的又一些示例中，公开了QSER1作为肿瘤的生物标志物，可用作检查病人体内的肿瘤的存在、肿瘤的形成或肿瘤的转移性的方法。
所描述的方法例如为：从病人体内分离一种及其以上生物样品，通过实验得到QSER1在此生物样品的细胞中的表达量，和将此表达量与旁边没有肿瘤的生物样品，或者健康的器官或组织的一部分的生物样品，又或者健康人的生物样品中的QSER1的表达量进行对比，或与参考值来对比，其中，与旁边无肿瘤存在的生物样品，或者健康的器官或组织的一部分的生物样品，又或者健康人的生物样品中的QSER1的表达量进行对比，或与参考值对比，所表达量增加则表示患者中的肿瘤的存在、肿瘤的形成或肿瘤的转移性存在。
所描述的方法还可以是，从病人体内分离一种及其以上生物样品，通过实验得到QSER1在此样品的细胞中的表达量，和将此表达量与得到此生物样品的时间以前得到的同一个病人的生物样品中的QSER1的表达量进行对比，或与参考值来对比，此表达量升高则显示病人的临床演变是消极的。进而，本示例所述的方法能够用作检查病人体内的肿瘤的存在、肿瘤的形成或肿瘤的转移性的病人的临床病程、肿瘤的转移性对治疗的响应中。
上述示例中所述的治疗的目的是预防或减慢(减轻)不希望的生理情况、病症或疾病，或获得有益的或期望的结果。该结果可以是，例如医学的、生理学的、临床的、物理治疗、职业治疗，面向保健人员或患者；或本领域理解为“生活品质”或日常生活活动的参数。本公开中，有益的或期望的临床结果包括但不限于，减轻症状；减小/缩小该情况、病症或疾病的程度；稳定(即非恶化)该情况、病症或疾病。在公开的一些示例中，治疗还可以包括引发临床有效响应而没有过度水平的副作用。
在上述的示例中，治疗也包括与如果不接受治疗的预期的存活期相比延长存活期。治疗还可以指给药药物或对患者执行医疗程度。
上述示例中所称的治疗还可以是预防(防止)、治愈虚弱或病、或改良患者的临床情况，包括降低病程或疾病严重度，或主观改善患者的生活品质或延长患者的存活期。
在本说明书的描述中，参考术语“一个实施例”、“示例”、“具体示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中，对上述术语的示意性表述不一定指的是相同的实施例或示例。而且，描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任何的一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。以上显示和描述了本发明的基本原理、主要特征和本发明的优点。本行业的技术人员应该了解，本发明不受上述实施例的限制，上述实施例和说明书中描述的只是说明本发明的原理，在不脱离本发明精神和范围的前提下，本发明还会有各种变化和改进，这些变化和改进都落入要求保护的本发明范围内。
序列表
<110> 林承棋，罗卓娟，赵西茹
<120> QSRE1基因的用途及其相关药物
<141> 2021-10-13
<160> 7
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> human
<400> 3
actggcggta acagtccatc 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> human
<400> 2
acccacagtg gttgaggaag 20
<210> 3
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 3
gctcctgttg atagtacatt a 21
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 4
agcactcctt acatagttat c 21
<210> 5
<211> 59
<212> DNA
<213> human
<400> 5
ccgggctcct gttgatagta cattactcga gtaatgtact atcaacagga gcttttttg 59
<210> 6
<211> 59
<212> DNA
<213> human
<400> 6
ccggagcact ccttacatag ttatcctcga ggataactat gtaaggagtg ctttttttg 59
<210> 7
<211> 136
<212> PRT
<213> human
<400> 7
Phe Ala Thr Thr Ser Pro Leu Val Leu Gln Asp Ser Thr Phe Asn Thr
1 5 10 15
Thr Ser Asn Gly Ile Leu Ser His His Asp Pro Leu Leu Gln Ile Lys
20 25 30
Thr Ser Gln Gly Thr Val Pro Thr Ala Leu Ala Phe Glu Arg Leu Gly
35 40 45
Ser Ser Val Leu Ser Asn Ser Ile Pro Pro Gln Ser Ser Thr Tyr Arg
50 55 60
Ser Ala Gln Glu Ser Ala Pro His Leu Leu Gln Pro Gln Phe Ser Leu
65 70 75 80
Leu Pro Ser Ala Leu Gly Gly Ser Gln Gln Thr Pro Gln Ala Tyr Ser
85 90 95
Ser Thr Leu Phe Thr Ser Ser Thr Ala Ser Ile Glu Arg Ala Leu Leu
100 105 110
Arg Glu Cys Ser Val Ile Lys His His Gln Arg Pro Ser Gly Thr Gln
115 120 125
Ser Ile Gln Ala Gln Leu Thr Gly
130 135
Claims (10)
1.一种用于肿瘤检测或肿瘤病人生存期和预后诊断的试剂盒，包括：
能够检测QSER1基因表达或QSER1基因翻译的蛋白质表达水平的试剂。
2.根据权利要求1所述的试剂盒，所述试剂包括：能够特异性扩增QSER1基因的引物、与QSER1 DNA序列杂交的探针或能与QSER1表达的蛋白质结合的特异性抗体中的一种或多种。
3.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述的能够特异性检测QSER1基因表达的引物的序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2。
4.QSER1的干扰RNA在用于制作治疗癌症的药物中的应用，所描述的QSER1基因特异性的靶序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4，对应降低QSER1基因表达的核酸分子，所述的干扰RNA的核酸序列是SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6。
5.一种治疗肿瘤的药物组合物，有效成分包括：
序列为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6的shRNA；
携带所述shRNA的质粒；
所述质粒克隆的慢病毒载体所释放的干扰慢病毒；或者
药学上可接受的所述shRNA的载体或稀释剂。
6.根据权利要求5所述的药物组合物，其特征在于，所述质粒由将编码所述shRNA的核酸序列克隆到慢病毒载体中获得。
7.QSER基因表达的抑制剂在制备抑制肿瘤中细胞的侵袭、增殖能力的药物中的应用。
8.一种QSER1特异性抗体，由SEQ ID NO.7作为抗原序列制得。
9.权利要求8所述的抗体在免疫组织化学染色、酶联免疫吸附、Western Blot、高通量测序技术、芯片或原位杂交方面的应用。
10.根据权利要求5所述的药物组合物，其特征在于，所述肿瘤包括胰腺癌、肝癌、胃癌、肉瘤、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、乳腺癌、胆管癌、食管癌、肺鳞状细胞癌、多形胶质母细胞瘤、头颈鳞状细胞瘤、结肠癌、膀胱尿路上皮癌或肺腺癌中的任意一种。
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Non-Patent Citations (3)
| Title |
|---|
| ANDRÉ MÖLLER ET AL: "Proteomic Analysis of Mitotic RNA Polymerase II Reveals Novel Interactors and Association With Proteins Dysfunctional in Disease", MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, vol. 11, no. 6, pages 10 * |
| GARY DIXON ET AL: "QSER1 protects DNA methylation valleys from de novo methylation", SCIENCE, vol. 372, no. 6538, pages 14 - 15 * |
| XIRU ZHAO ET AL: "QSER1 preserves the suppressive status of the pro-apoptotic genes to prevent apoptosis", CELL DEATH & DIFFERENTIATION, vol. 30, pages 779 - 793 * |
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