CN114144190A - 对T细胞受体的δ1链具有特异性的抗体 - Google Patents

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Abstract

本文公开了对γδT细胞受体的δ‑1链特异性的抗体和使用此类抗体用于调控γδT细胞的生物活性的方法。还可以将此类抗δ1抗体用于治疗与γδT细胞激活相关的疾病,例如实体瘤,或用于检测γδ1T细胞的存在。

Description

对T细胞受体的δ1链具有特异性的抗体
发明背景
免疫检查点阻断在过去几年中作为癌症治疗取得了空前的成功。抗体通常用于阻断免疫抑制通路,例如细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA-4)和程序性死亡1(PD-1)通路。虽然靶向这两种通路的疗法已显示在治疗几种癌症类型方面取得成功,但抗CTLA-4和抗PD-1疗法对治疗患者的应答率取决于癌症类型为10%至60%,但尚未显示能够超过60%的应答率,即使在组合使用时也是如此(Kyvistborg等人,Enhancing responses to cancerimmunotherapy;Science.2018Feb 2;359(6375):516-517)。此外,大量的癌症类型对于这些疗法来说是难治性的。
γδT细胞是T细胞的亚群,在其表面上具有不同的T细胞受体(TCR)γ和δ链。这将它们与CD4+辅助T细胞和CD8+细胞毒性T细胞区分开来,后两者在它们的细胞表面上表达αβTCR。最近的研究已经发现γδT细胞具有促肿瘤活性(Zhao等人J Transl Med(2018)16:3)。例如,在人胰腺导管癌中,已发现γδT细胞构成肿瘤浸润性T细胞的很大一部分,并抑制由阿尔法贝塔(αβ)T细胞介导的抗癌免疫应答(Daley等人,Cell,2016,166:1485-1499)。在肿瘤微环境(TME)中,已显示γδT细胞表达IL-4、IL-10和TGF-β,导致对抗肿瘤应答的抑制(Kuhl等人,Immunol.,2009,128(4):580-588)。已显示IL-10和TGF-β两者的表达在多种癌症类型中增加(Lafont等人,Front Immunol.,2014,5:622)。γδT17细胞是肿瘤微环境中IL-17的主要来源,它们在多种癌症类型中起到促进血管生成的作用(Silva-Santos B.EurJ Immunol.2010;40:1873-6;Zhao等人J Transl Med(2018)16:3,以及其中的参考资料)。此外,已发现γδT细胞诱导幼稚T细胞和效应T细胞的衰老,这些T细胞在TME中变得是抑制性的并增加TME中的免疫抑制(Ye等人,J Immunol.,2013,190(5):2403-2414)。最后,研究已经表明γδT细胞增加了TME中髓源性抑制细胞(MDSC)的存在,从而促进促肿瘤微环境(Yan和Huang,Oncoimmunology.2014;3:e953423;.Qu P,等人,Cancer Lett.2016;380:253–6,以及其中的参考资料)。
鉴于平均应答率和当前治疗难治的大量癌症类型,仍然需要新的癌症疗法。调节γδT细胞和/或其T细胞受体中一种或多种的活性提供了一种新的癌症治疗方法。
发明概述
对γδT细胞活性和/或其T细胞受体中一种或多种的调节可以单独使用或与现有疗法组合使用作为癌症治疗的手段。本文描述了结合人γδT细胞受体的新型人抗体及其在治疗癌症中的治疗用途。本公开至少部分地基于特异性结合γδT细胞受体(TCR)的δ-1链的抗体的开发。发现此类抗体有效地抑制γδT细胞,从而挽救由γδT细胞介导的免疫抑制。
因此,本公开的一个方面提供了一种分离的抗体,其特异性结合T细胞受体的δ-1链。在一些情况下,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3。在一些实施方案中,HC CDR1包含FTX1X2X3X4X5IH(SEQ ID NO:46)的基序,其中X1是F或V,X2是S或T,X3是G、A或S,X4是T、N或S,并且X5是D或S。在一些实施方案中,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53)。替代地或另外,在一些实施方案中,HC CDR3包含PGX6YYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:48),其中X6包含S或M。
替代地或另外,本文公开的分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LCCDR2和LC CDR3。在一些实施方案中,LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)。在一些实施方案中,LC CDR2包含X7ASSLX8S(SEQ ID NO:50),其中X7是S或A并且X8是Y或Q。替代地或另外,在一些实施方案中,LC CDR3包含QQX9X10X11X12X13X14LIT(SEQ ID NO:51),其中X9是S或Q,X10是G、S或T,X11是D、K或S,X12是Y、W或不存在,X13是P或不存在,并且X14是D、F或Y。在一些情况下,分离的抗体不包含与δ1-17相同的重链和轻链CDR。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1包含FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:93)的基序,其中X1是S或T,X2是S、G或A,X3是T、N或S,并且X4是D或S。替代地或另外,在一些实施方案中,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53)。替代地或另外,HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。替代地或另外,在一些实施方案中,本文公开的分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)。替代地或另外,在一些实施方案中,LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56)。替代地或另外,在一些实施方案中,LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1包含FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:93)的基序,其中X1是S或T,X2是S、G或A,X3是T、N或S,并且X4是D或S,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53),并且HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。在一些实施方案中,分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55),LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56),并且LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1选自由SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQID NO:65、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQID NO:71和SEQ ID NO:72组成的组。替代地或另外,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQID NO:53)。替代地或另外,HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。替代地或另外,本文公开的分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)。替代地或另外,LC CDR2包含AASSLQS(SEQID NO:56)。替代地或另外,LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1选自由SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQID NO:65、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQID NO:71和SEQ ID NO:72组成的组,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53),并且HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。在一些实施方案中,分离的抗体进一步包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55),LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56),并且LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1包含FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:94)的基序,其中X1是S或T,X2是S或A,X3是N或S,并且X4是D或S,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53),并且HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。在一些实施方案中,分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55),LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56),并且LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1选自由SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71和SEQ ID NO:72组成的组。替代地或另外,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53)。替代地或另外,HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。替代地或另外,本文公开的分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)。替代地或另外,LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56)。替代地或另外,LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1选自由SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71和SEQ ID NO:72组成的组,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53),并且HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。在一些实施方案中,分离的抗体进一步包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ IDNO:55),LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56),并且LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,相对于参考抗体的HC CDR,本文公开的抗δ1抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共包含不超过10个氨基酸变异(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸变化)。替代地或另外,相对于参考抗体的轻链CDR,抗体的LC CDR1、LC CDR2和LCCDR3总共包含不超过8个氨基酸变异(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1个氨基酸变异),所述参考抗体选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组。
在一些实施方案中,相对于参考抗体的HC CDR,本文公开的抗δ1抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共包含不超过10个氨基酸变异(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸变异)。替代地或另外,相对于参考抗体的轻链CDR,抗体的LC CDR1、LC CDR2和LCCDR3总共包含不超过8个氨基酸变异(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1个氨基酸变异),所述参考抗体选自由δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组。
在一些实施方案中,相对于参考抗体的HC CDR,本文公开的抗δ1抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共包含不超过10个氨基酸变化(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸变化)。替代地或另外,相对于参考抗体的轻链CDR,抗体的LC CDR1、LC CDR2和LCCDR3总共包含不超过8个氨基酸变化(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1个氨基酸变化),所述参考抗体选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组。
在一些实施方案中,抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3与参考抗体的重链CDR具有为至少90%(例如,至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)的同一性和/或CDR1、CDR2、CDR3总共共享为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)同一性。
在一些示例中,抗δ1抗体可以包含与参考抗体相同的重链互补决定区(CDR)及相同的轻链CDR。在一个具体示例中,抗δ1抗体包含与参考抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体结合人δ1链。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体。这些抗体中的每一种在本文中被称为“参考抗体”。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体与δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的任何一个结合相同的表位和/或与刚提到的参考抗体中的任何一种竞争与表位结合。
在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体。这些抗体中的每一种在本文中被称为“参考抗体”。在一些实施方案中,本文所公开的抗δ1抗体与δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的任何一种结合相同的表位和/或与刚提到的参考抗体中的任何一种竞争与表位结合。
在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体。这些抗体中的每一种在本文中被称为“参考抗体”。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体与δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体中的任何一种结合相同的表位和/或与刚提到的参考抗体中的任何一种竞争与表位结合。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3),它们总共与参考抗体的重链CDR为至少90%(例如,至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同;和/或抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与参考抗体的轻链CDR为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3),它们总共与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体的重链CDR为至少90%(例如,至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同;和/或所述抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体的轻链CDR为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3),它们总共与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体的重链CDR为至少90%(例如,至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同;和/或所述抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体的轻链CDR为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3),它们总共与选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体中的抗体的重链CDR为至少90%(例如,至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同;和/或所述抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体的轻链CDR为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含与参考抗体相同的重链互补决定区(CDR)和相同的轻链CDR。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体中的抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
在一个具体实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含与δ1-39的重链CDR相同的重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3)。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含与δ1-39的轻链CDR相同的轻链CDR1、轻CDR2和轻链CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链互补决定区1(HC CDR1)、重链互补决定区2(HC CDR2)和重链互补决定区3(HC CDR3),它们总共与δ1-39的重链CDR为至少90%(例如,至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同;和/或所述抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与δ1-39的轻链CDR为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:52、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列的VH CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68的序列的VH CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:53的序列的VHCDR2。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68的序列的VH CDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VHCDR2和具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:68、53和54的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%,97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗-δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VL CDR1。在一些实施方案中,抗-δ1抗体包含具有SEQ ID NO:56或58的序列的VL CDR2。在一些实施方案中,抗-δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:83、84、85、86、87、57、88、89、90、91、92、59和60中任一个的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VLCDR1、具有SEQ ID NO:56或58的序列的VL CDR2和具有选自SEQ ID NO:83、84、85、86、87、57、88、89、90、91、92、59和60中任一个的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VL CDR1、具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2和具有选自SEQID NO:57中任一个的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列的VH CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68的序列的VH CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68的序列的VH CDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VHCDR2和具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:68、53和54的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%,97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VL CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ IDNO:55的序列的VL CDR1、具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2和具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:67、68、69和70的序列的VHCDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68的序列的VH CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ IDNO:68的序列的VH CDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2和具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:68、53和54的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%,97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VL CDR1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ IDNO:55的序列的VL CDR1、具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2和具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:52、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列的VH CDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2和具有SEQ IDNO:54的序列的VH CDR3。替代地或另外,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VLCDR1、具有SEQ ID NO:56或58的序列的VL CDR2和具有选自SEQ ID NO:83、84、85、86、87、57、88、89、90、91、92、59和60中任一个的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:52、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72(CDR1)、53(CDR2)和54(CDR3)的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。替代地或另外,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55(CDR1)、56或58(CDR2)和83、84、85、86、87、57、88、89、90、91、92、59和60(CDR3)的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列的VH CDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2和具有SEQ IDNO:54的序列的VH CDR3。替代地或另外,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VLCDR1、具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2和具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72(CDR1)、53(CDR2)和54(CDR3)的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。替代地或另外,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:67、68、69和70的序列的VHCDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2和具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。替代地或另外,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的VL CDR1、具有SEQ ID NO:56序列的VL CDR2和具有SEQ ID NO:57序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:67、68、69和70(CDR1)、53(CDR2)和54(CDR3)的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。替代地或另外,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68中所示序列的VH CDR1、具有SEQ ID NO:53的序列的VH CDR2和具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3。替代地或另外,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:55的序列的VL CDR1,具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2和具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含重链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NOL 68(CDR1)、53(CDR2)和54(CDR3)的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。替代地或另外,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:68的序列的VH CDR1、具有SEQID NO:53的序列的VH CDR2和具有SEQ ID NO:54的序列的VH CDR3,并且进一步包含具有SEQ ID NO:55的序列的VL CDR1、具有SEQ ID NO:56的序列的VL CDR2和具有SEQ ID NO:57的序列的VL CDR3。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含轻链可变结构域(VH),其包含重链CDR1、重链CDR2和重链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:68、53和54的重链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同,并且进一步包括轻链可变结构域(VL),其包含轻链CDR1、轻链CDR2和轻链CDR3,它们总共与SEQ ID NO:55、56和57的轻链CDR分别为至少80%(例如,至少81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%,97%、98%、99%或100%)相同。
在这些实施方案的任何一个中,抗δ1抗体结合δ1。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3,其相对于参考抗体的HC CDR,总共包含不超过10(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异;和/或其中抗体包含LC CDR1、LC CDR2和LCCDR3,其相对于所述参考抗体的轻链CDR,总共包含不超过8(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异。在一些实施方案中,参考抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3,其相对于选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43的抗体的HCCDR,总共包含不超过10(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异;和/或其中抗体包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其相对于选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43的抗体的轻链CDR,总共包含不超过8个(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1)氨基酸变异。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3,其相对于选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43的抗体的HC CDR,总共包含不超过10(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异;和/或其中抗体包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其相对于选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43的抗体的轻链CDR,总共包含不超过8(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3,其相对于选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41的抗体的HC CDR,总共包含不超过10(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异,和/或其中抗体包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其相对于选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41的抗体的轻链CDR,总共包含不超过8(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3,其相对于δ1-39的HC CDR,总共包含不超过10(例如,不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异;和/或其中抗体包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其相对于δ1-39的轻链CDR,总共包含不超过8(例如,不超过7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸变异。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含与参考抗体的VL为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL,和/或与参考抗体的VH为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、98%、99%或100%)相同的VH
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43 7抗体的抗体的VH序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列,和/或与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体的VL序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43 7抗体的抗体的VH序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列,和/或与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体的VL序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体的抗体的VH序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列,和/或与选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体的抗体的VL序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与δ1-39的VL序列为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列,和/或与δ1-39抗体的VH为至少85%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH
在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体具有相同的VL序列。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体是与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体具有相同VL序列的抗体。在一些实施方案中,所公开的抗δ1抗体与选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体具有相同的VH序列和相同的VL序列。
在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体具有相同的VL序列。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体是与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体具有相同的VL序列的抗体。在一些实施方案中,所公开的抗δ1抗体与选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43抗体的抗体具有相同的VH序列和相同的VL序列。
在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体与选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体的抗体具有相同的VL序列。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1抗体是与选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41抗体的抗体具有相同的VL序列的抗体。在一些实施方案中,所公开的抗δ1抗体与选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-4抗体的抗体具有相同的VH序列和相同的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41。在一个具体实施方案中,抗δ-1抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ IDNO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区和具有选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:9的序列的VL区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含选自具有选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区和具有SEQ ID NO:9序列的VL区。
在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:24的序列的VH区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:9的序列的VL区。在一些实施方案中,抗δ1抗体包含具有SEQ ID NO:24的序列的VH区和具有SEQ ID NO:9的序列的VL区。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列组成的VH序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列和具有与选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有包含选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH序列和包含选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由选自SEQ IDNO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列组成的VH序列和基本上由选自SEQID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列组成的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有由选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列组成的VH序列和由选自SEQ ID NO:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:9的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:9的序列的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列组成的VH序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由SEQ IDNO:9的序列组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列和具有与SEQ ID NO:9的序列为至少80或85%(例如,至少80%、81%、82%,83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有包含选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH序列和包含SEQ IDNO:9的序列的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列组成的VH序列和基本上由SEQ ID NO:9的序列组成的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有由选自SEQ ID NO:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列组成的VH序列以及由SEQ ID NO:9的序列组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:9的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:9的序列的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列组成的VH序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由SEQ ID NO:9的序列组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列和具有与SEQ ID NO:9的序列为至少80或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有包含选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列的VH序列和包含SEQ ID NO:9的序列的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列组成的VH序列和基本上由SEQ IDNO:9的序列组成的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有由选自SEQ ID NO:22、23、24、25和43的序列组成的VH序列和由SEQ ID NO:9的序列组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:24为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:9为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:24的VH序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:9的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由SEQ ID NO:24组成的VH序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由或由SEQ ID NO:9组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:24为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VH序列和具有与SEQ ID NO:9为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有包含SEQ ID NO:24的VH序列和包含SEQ ID NO:9的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:24组成的VH序列和基本上由SEQ IDNO:9组成的VL序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有由SEQ ID NO:24组成的VH序列和由SEQ ID NO:9组成的VL序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:78为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的轻链序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:79为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的重链序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:78的轻链序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:79的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:78组成或由SEQ ID NO:78组成的轻链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:79组成或由SEQ ID NO:79组成的重链序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:78为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的轻链序列和具有与SEQ ID NO:79为至少80%或85%(例如,至少80%、81%、82%、83%84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有包含SEQ ID NO:78的轻链序列和包含SEQ ID NO:79的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:78组成的轻链序列和基本上由SEQ ID NO:79组成的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有由SEQ ID NO:78组成的轻链序列和由SEQ ID NO:79组成的重链序列。
在一些实施方案中,相对于γδ2 TCR或a或γδ3 TCR,抗δ1抗体优先地结合γδ1TCR。在一个特定实施方案中,抗δ1抗体不结合包含δ-2链和γ链的T细胞受体。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体与人δ-1链和非人哺乳动物δ-1链;例如,非人灵长类动物δ-1链发生交叉反应。在一个特定示例中,非人灵长类动物δ-1链是食蟹猴δ-1链。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体能够结合包含各种γ链,包括γ3、4、5、8或9的γδ1 TCR。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体能够结合包含各种γ链,包括γ3、4、5和8的γδ1 TCR。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体与人δ-1链和非人哺乳动物δ-1链,例如非人灵长类δ-1链发生交叉反应,并且能够结合包含各种γ链,包括γ3、4、5和8的γδ1 TCR。本文描述的此类抗体的非限制性示例包括δ1-39和δ1-41。在一些示例中,此类抗体是δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41。
本文所述的任何抗δ1抗体可以是全长抗体(例如,IgG分子)或其抗原结合片段。在一些示例中,抗体是Fab、F(ab’)2或单链抗体。在任何情况下,抗体可以是人抗体或人源化抗体。在一些实施方案中,抗体是抗体药物缀合物。在一些实施方案中,抗体是抗体模拟物。
在另一方面,本公开提供了编码或共同编码本文公开的任何抗δ1抗体的分离的核酸或核酸组。在一些情况下,抗体的重链和轻链由两个分别的核酸分子(一组核酸)编码。在其他情况下,抗体的重链和轻链由一个核酸分子编码,其可以是多顺反子形式,或在不同启动子的控制下。因此,在一个方面,本公开提供了一种分离的核酸分子,其包含编码本文所述的抗δ1抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的一个或多个核酸序列。在一些实施方案中,核酸分子包含编码本文所述的抗δ1抗体的重链可变区(VH)的一个或多个核酸序列。替代地或另外,在一些实施方案中,核酸分子包含编码本文所述的抗δ1抗体的轻链可变区(VL)的一个或多个核酸序列。在一个具体实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL(或重链和/或轻链)的一个或多个核酸序列,所述抗体包含SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1)、SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2)和SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1)、SEQ IDNO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2)和SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。因此,在一些实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL(或重链和/或轻链)的一个或多个核酸序列,所述抗体包含SEQ ID NO:24所示的VH和/或SEQ ID NO:9所示的VL。在一个示例中,一个或多个核酸序列编码G9.2-17的VH和/或VL(或重链和/或轻链)。
在一些实施方案中,核酸或核酸组位于一种或两种载体上,例如,一种或两种载体可以是一种或两种表达载体。因此,载体可以包含本文所述的任何分离的一种或多种核酸分子。此外,本公开提供了包含编码本文所述的抗-δ1抗体的任何分离的核酸或核酸组的宿主细胞。在一些实施方案中,宿主细胞选自大肠杆菌细胞、猿猴COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞。
本文还提供了一种产生抗δ1抗体的方法,包括在允许抗体表达的合适条件下培养本文所述的宿主细胞,并从细胞培养物(例如,从培养基)收获由此产生的抗体。
此外,本公开提供了一种药物组合物,其包含任何抗δ1抗体或编码此类抗体的核酸(一种或多种),以及药学上可接受的载体。
在又一方面,本公开的特征在于抑制受试者中的免疫抑制性γδT细胞,例如γδ1T细胞的活性和功能的方法,该方法包括向有此需要的受试者施用有效量的本文公开的任何抗δ1抗体或包含此类抗体的药物组合物。替代地或另外,本公开的特征在于消除或消耗受试者中的免疫抑制性γδT细胞,例如γδ1T细胞的方法,该方法包括向有此需要的受试者施用有效量的本文公开的任何抗δ1抗体或包含此类抗体的药物组合物。在一些实施方案中,有此需要的受试者是患有、怀疑患有实体癌或有患实体癌的风险的人患者。在一些实施方案中,本公开的特征在于治疗受试者中的癌症的方法,该方法包括向有此需要的受试者施用有效量的本文公开的任何抗δ1抗体或包含此类抗体的药物组合物。示例性实体瘤包括但不限于胰腺导管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、上消化道和下消化道恶性肿瘤、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、卵巢癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、神经内分泌癌、肾上腺皮质癌或肉瘤。在一些示例中,有效量的药物组合物足以抑制或阻断免疫抑制性γδT细胞例如γδ1 T细胞的活性和功能。
本文所述的任何治疗方法还可包括向受试者施用检查点分子的抑制剂、共刺激受体的激活剂、先天免疫细胞靶标的抑制剂、化疗剂和/或任何其他抗癌症治疗剂,包括但不限于生物制剂、小分子抑制剂和/或任何形式的放射疗法和/或基于细胞的疗法。检查点分子的示例包括但不限于PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、LAG3、TIM-3、A2aR、TIGIT和VISTA。共刺激受体的示例包括但不限于OX40、GITR、CD137、CD40、CD27和ICOS。先天免疫细胞靶标的示例包括但不限于KIR、NKG2A、CD96、TLR、IDO和半乳糖凝集素-9。
本公开的范围还包括(i)用于治疗与免疫抑制性γδT细胞(例如,γδ1 T细胞)的激活相关的疾病的药物组合物,其中药物组合物包含本文所述的任何抗-δ1抗体或编码它们的核酸(一种或多种),以及药学上可接受的载体;和(ii)抗δ1抗体或编码核酸在制备用于治疗本文所述的靶疾病的药物中的用途。
本公开的另一方面提供了一种用于分析来自怀疑患有实体瘤(例如,转移性实体瘤或者复发性或难治性实体瘤)的受试者的生物样品的方法,该方法包括:(i)提供怀疑患有实体瘤的受试者的生物样品;和(ii)用特异性结合δ1的抗体测量生物样品中δ1的水平。在一些实施方案中,受试者被怀疑患有实体瘤,例如转移性实体瘤或者复发性或难治性实体瘤。示例包括但不限于胰腺腺癌(PDA)、结肠直肠癌(CRC)、肝细胞癌(HCC)、乳腺癌(例如导管癌)和胆管癌。在一些实施方案中,受试者被怀疑患有转移性实体瘤。在其他实施方案中,受试者被怀疑患有复发性或难治性实体瘤。示例包括但不限于转移性胰腺腺癌(PDA)、转移性结直肠癌(CRC)、转移性肝细胞癌(HCC)、乳腺癌(例如导管癌)和胆管癌。
在一些实施方案中,生物样品可以是血清样品或血浆样品。在其他实施方案中,生物样品可以是肿瘤活检样品。例如,在一些实施方案中,肿瘤活检样品包含源自患者的器官型肿瘤球体(PDOT)。例如,在一些实施方案中,肿瘤活检样品包含TIL。
抗体可以是本文所述的任何抗体,例如,包含与参考抗体δ1-39相同的重链和轻链互补决定区(CDR),例如,包含SEQ ID NO:24的重链可变结构域,和/或SEQ ID NO:9的轻链可变结构域。在一些情况下,抗体可以是Fab分子。在一些实施方案中,抗体是本领域已知的不同抗δ1抗体。
在一些实施方案中,使用免疫测定来确定生物样品中的δ1水平。在一些实施方案中,测定是流式细胞术。
在一些实施方案中,如果步骤(ii)中测量的δ1水平相对于对照水平升高,则本文公开的方法进一步包括将受试者鉴定为涉及抗δ1抗体的治疗的合适候选者。给予合适的候选者有效量的抗δ1抗体,例如本文所述的那些,单独施用或与检查点抑制剂如本文所述的那些组合施用。
在一些实施方案中,步骤(ii)中测量的δ1水平用于鉴定或选择可能对抗δ1靶向疗法有应答的癌症患者。在一些实施方案中,在血液、血清和/或血浆中测量δ1水平。在一些实施方案中,在源自肿瘤和/或癌症患者的血液的癌细胞或免疫细胞的表面上测量δ1水平。在一些示例中,癌细胞在源自人患者的肿瘤类器官中。在一些示例中,免疫细胞在源自人患者的肿瘤类器官中。在一些实施方案中,免疫细胞包括巨噬细胞、α/βT细胞和/或γ/δT细胞。
本发明的一个或多个实施方案的细节在以下描述中阐述。本发明的其他特征或优点将从以下附图和几个实施方案的详细描述以及从所附权利要求中明显了解。
附图简述
下列附图构成本说明书的一部分,并被包括在内以进一步说明本公开内容的某些方面,通过参考附图并结合本文提出的具体实施方案的详细描述,可以更好地理解本公开的某些方面。
图1是人胰腺癌组织与正常胰腺相比的免疫组织化学分析照片,表明与正常组织相比,胰腺癌组织中γδT细胞的富集。
图2是描绘外周血和肿瘤中的总T细胞百分比的柱状图,表明与外周血相比,胰腺癌组织中的γδT细胞的富集。
图3A-3C描绘了显示γδ(gdT)和αβT细胞(abT)的共培养测定的柱状图。γδ细胞来源于肿瘤或血液,如所示,αβT细胞来源于同一患者的血液。该图描绘了单独培养血液αβT细胞或与肿瘤内和血液γδT细胞共培养时获得的%TNF-α+细胞。通过与CD3/CD28连接来激活血液αβT细胞,导致FACS测量的TNF-α增加。柱1:未激活的αβT细胞;柱2:激活的αβT细胞;柱3:与血液γδT细胞共培养的激活的αβT细胞;柱4:与肿瘤γδT细胞共培养的激活的αβT细胞。图3A:源自结肠直肠癌患者的细胞。图3B和3C:源自两个个体胰腺癌患者的细胞。
图4A-4C描绘的柱状图显示了与两种抗δ1IgG1抗体(δ1-23和δ1-17作为示例)相比,未经处理(Utx)和用同种型(hIgG1)处理的胃肠神经内分泌肿瘤样品(PDOTS)中的免疫谱表达。显示了CD8+ T细胞中的TNF-α百分比(图4A)、CD8+ T细胞中的IFNγ百分比(图4B)和CD8+ T细胞中的CD44百分比(图4C)。
图5A和5B描绘的柱状图显示了与两种抗δ1IgG1抗体(δ1-23和δ1-17作为示例)相比,未经处理(Utx)和用同种型(hIgG1)处理的乳腺癌肝转移肿瘤样本(PDOTS)中的免疫谱表达。显示了CD3+ T细胞中的TNF-α百分比(图5A)和CD3+ T细胞中的CD44百分比(图5B)。
图6A-6N描绘了抗δ1抗体对纯化的γ/δTCR的结合滴定,如使用珠结合测定所测量的。测试了人γ9/δ1C(表示为“人D1”)、食蟹猴γ/δ1A(“食蟹猴D1”)和食蟹猴γ/δ2(“食蟹猴D2”)。
图7A-7L描绘了抗δ1抗体δ1-17和δ1-23与由不同亚基组成的纯化的γ/δTCR的结合滴定。
图8显示了用于确定δ1特异性IgG的热稳定性的热位移测定的迹线。
图9A-9I显示了抗δ1抗体对纯化的γ/δTCR的结合滴定,如通过珠结合测定所测量的。测试了人γ9/δ1C(表示为“人D1”)和食蟹猴γ/δ1A(“食蟹猴D1”)。
图10A-10D显示本文公开的抗δ1抗体对δ1具有高亲和力和特异性。图10A是表面等离子体共振(SPR)图,显示例如抗δ1-17抗体对人δ1 TCR具有高亲和力。图10B是显示δ1-17抗体对δ1 TCR具有特异性并且不与δ2 TCR结合(交叉反应)的图。产生了三种不同的δ1变体(D1A、D1B和D1C),它们仅在CDR3环中彼此不同。δ1和δ2Fc融合蛋白附接到链霉亲和素包被的珠子上,并用δ1-17hIgG1执行结合滴定。图10C是显示δ1-41抗体在人和猴(“食蟹猴”)之间交叉反应的图。图10D是显示相对于δ2 TCR,δ1抗体δ1-17、δ1-39和δ1-41对δ1 TCR具有特异性的图。
图11A和11B显示了本文公开的抗δ1抗体不依赖于γ。图11A是显示与纯化的δγTCR中的γ链无关,δ1-17是δ1特异性的图。图11B是证明使用细胞表面δγTCR,几种抗δ1抗体(包括δ1-39和δ1-41)是δ1特异性的图。未转导的J.RT3-T3.5(TIB153)用作对照,以表明不存在与T细胞上发现的任何其他细胞表面受体的背景结合(数据未显示)。
图12A-12D包括柱状图,显示了与抗δ1IgG1抗体(δ1-17作为示例)相比,用同种型(hIgG1)处理的肿瘤样品(PDOTS)中的免疫谱表达。对于结肠直肠癌肝转移(图12A)、肝神经内分泌肿瘤(图12B)、结肠直肠癌神经内分泌肿瘤(图12C)和肝细胞癌(图12D)显示CD3+ T细胞中的TNF-α百分比、CD3+ T细胞中的IFNγ百分比和CD3+ T细胞中的CD44百分比。
图13A-13D包括显示γδT细胞对肺(LLC)和黑色素瘤(B16F10)皮下同源模型中检查点抑制应答的影响的图。图13A和13B:显示与野生型对应物相比,在γδ敲除Lewis肺癌小鼠模型中抗CTLA-4抗体对比未处理(13A)或IgG同种型对照(13B)的抗肿瘤作用的图。图13C和13D:显示与野生型对应物相比,在γδ敲除黑色素瘤小鼠模型中抗PD-1抗体对比未处理(13C)或IgG同种型对照(13D)的抗肿瘤作用的图。
图14A-14G包括显示抗δ1抗体δ1-17、δ1-41和δ1-39在冷冻/解冻、浓缩和过滤后的稳定性的图。图14A和14B分别是δ1-41和δ1-17的稳定性曲线。从顶部图到底部图:冷冻/解冻1次,3mg/ml;冷冻/解冻1次,浓缩至12mg/ml;和冷冻/解冻1次,浓缩至12mg/ml,以及过滤。图14C和14D分别是δ1-41和δ1-17在4℃孵育10天后的稳定性曲线。从顶部图到底部图:冷冻/解冻1次,3mg/ml;冷冻/解冻1次,浓缩至12mg/ml;和冷冻/解冻1次,浓缩至12mg/ml,以及过滤。图14E和图14F分别是δ1-41和δ1-17在高温储存以及冷冻和解冻后的稳定性曲线。从顶部图到底部图:冻结/解冻1次;37℃过夜(O/N);室温(RT)过夜(O/N);和冻结/解冻4次。图14G显示δ1-39新鲜的、冷冻解冻5次、以及24℃18小时后的稳定性曲线。
图15A-15C包括显示δ1-17和δ1-41针对固定在珠子上的靶标的抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)效应的图。15A:珠上的1000nM靶标。15B:珠上的100nM靶标。15C:珠上的10nM靶标。
图16A-16C包括显示δ1-17和δ1-41在不同时间点,包括1小时(16A)、4小时(16B)和24小时(16C)在所示不同抗体浓度的ADCP效应的图。
图17是显示各种抗δ1抗体(例如δ1-17、δ1-39和δ1-41)针对不同靶蛋白在基于珠子的ADCP测定中观察到的ADCP效应的图。
图18A和18B包括显示在基于细胞的ADCP测定中抗δ1抗体的ADCP效应的图。图18A:在所示的不同时间点的ADCP效应。图18B:不同抗体浓度的ADCP效应。
图19包括显示δ1-41在所示不同抗体浓度的抗体依赖性细胞毒性(ADCC)效应的图。
图20A-20B包括柱状图,显示与抗δ1IgG1抗体(δ1-41作为示例)或抗PD1抗体相比,用同种型(hIgG1)处理的肿瘤样品(PDOTS)中的αβT细胞激活水平。显示了对于结肠直肠癌(图20A)和肝细胞癌(图20B),CD8+ T细胞中的TNF-α百分比、CD8+ T细胞中的IFNγ百分比和CD8+ T细胞中的CD44百分比。
图21A-21C包括柱状图,显示了与同种型(hIgG1)(作为对照)相比,在共刺激受体激动剂(ICOS激动剂)存在下,用抗δ1IgG1抗体(δ1-17作为示例)处理的肝细胞癌的肿瘤样品(PDOTS)中的αβT细胞激活水平。显示CD3+ T细胞中的CD44百分比(图21A)、CD3+ T细胞中的TNF-α百分比(图21B)和CD3+ T细胞中的IFNγ百分比(图21C)。
图22A-22C显示本文公开的抗δ1抗体δ1-39在人和猴之间具有交叉反应性并且对δ1具有高亲和力。图22A:δ1-39抗体与人δ-1链的结合。图22B:抗δ1-39与猴(“食蟹猴”)δ-1链的结合。图22C:列出KD值、速率常数和拟合参数的表格。
图23显示δ1-39是δ1特异性的,与纯化的δγTCR中的γ链无关。
图24A-24H显示本文公开的抗δ1抗体是特异性的,而与细胞表面上的δγTCR中使用的γ组合无关。图24A-24F:显示δ1-39抗体分别与细胞表面表达的δ1γ2、δ1γ3、δ1γ4、δ1γ5、δ1γ8和δ1γ9的结合的图。图24G和24H:显示结合研究的图,其中细胞表面表达的δ2γ9和TCR αβ(来自亲本Jurkat(E6-1)细胞系)用作阴性对照并且显示没有被δ1-39结合。
图25A和25B包括显示与同种型处理和未处理细胞相比,δ1-17、δ1-39和δ1-41的抗体依赖性细胞毒性(ADCC)效应的图表。以表达额外FcγR的NK-92细胞作为效应细胞。以表达δ1/γ9的Jurkat(J.RT3-T3.5)细胞系作为靶细胞系并用CFSE染料标记。以4:1效应子与靶标的比例混合细胞,并以100nM添加抗δ1抗体或同种型1小时(图25A)或3.5小时(图25B)。培养后,用固定活力染料(fixable viability dye)(FVD660)对细胞染色,并通过流式细胞术进行定量。
图26包括柱状图,显示在使用抗δ抗体、同种型或媒介物对表达δ1/γ-4、δ1/γ-9、δ2/γ-9或无TCR的细胞进行基于细胞的ADCP分析中,抗δ1抗体的ADCP效应。对于每组柱,从左至右为:δ1-17、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、同种型和无抗体的柱。
图27包括的图显示了从健康人供体分离的外周血单核细胞(PBMC)中的特异性细胞杀伤,所述细胞在分离后经δ1-39、同种型处理或未处理。从Stemcell(货号70025.1)购买的健康PBMC在37℃处理1小时,并进行染色和流式处理。
图28A-C包括显示各种患者样品中δ1-39介导的杀伤的图。图28A-28包括显示患者样品中特异性细胞杀伤的图。将肺腺癌(图28A),胰腺导管癌(PDA;图28B)和胃肠神经内分泌肿瘤(GI-NET;图28C)单细胞肿瘤悬液如所示的在37℃用δ1-39、同种型处理过夜或未处理,并进行处理用于染色和流式细胞术。
图29显示了受体内化测定的结果。将在表面上表达δ1/γ9T细胞受体的细胞在100nMδ-39、同种型抗体、抗CD3(克隆OKT3)(无叠氮化物)抗体或无抗体存在下孵育。在孵育后1、3.5和24小时收集细胞,并处理以用抗δ1(克隆TS8.2)抗体染色用于流式细胞术。
图30显示了柱状图,显示了与表达猴γ/δTCR的稳定细胞系结合的如所示的各种δ1克隆。将在表面上缺乏TCR表达的Jurkat细胞转导为表达猴δ1/γ或δ2/γ受体。仅表达γ链或不表达TCR的细胞作为阴性对照进行染色。抗δ1-17与任何食蟹猴TCR显示无结合,而抗δ1-23和抗δ1-32-41显示与细胞表面上含有TCR的猴δ1的特异性结合。
图31A-31B包括显示使用抗δ1抗体(抗δ-39作为示例)从患有结直肠癌的人供体(图31A)和健康人供体(图31B)分离的PBMC中特异性δ1检测的图。
图32描绘了三个柱状图,显示PBMC的Dylight-650缀合的抗δ1-39以及商购抗δ1(克隆TS8.2)、抗δ2-PE(克隆B6)、抗CD3(克隆UCHT-1)、抗TCR AB(克隆IP26)的流式细胞术分析。结果表明,直接缀合的抗δ1-39和抗δ1(克隆TS8.2)的染色谱相似。
图33描述了商购抗δ1(克隆TS8.2)的流式细胞术分析,以确定健康和患者PBMC中δ1阳性T细胞的水平。对于大多数受试患者,δ1水平高于健康供体。δ1 T细胞的百分比计算为总的活的单细胞的分数。
图34描述了健康PBMC对比肿瘤中δ1 T细胞水平的流式细胞术分析。通过商购抗δ1抗体(克隆TS8.2)染色来测量δ1水平。结果显示肿瘤单细胞悬液中的δ1水平高于健康供体PBMC。δ1 T细胞的百分比计算为总的活的CD3阳性单细胞的分数。
发明详述
T细胞受体(TCR)是在T细胞表面表达的二硫键连接的膜锚定异二聚体蛋白,在该处它们识别抗原呈递细胞(APC)上主要组织相容性复合体(MHC)分子呈递的抗原的片段或在细胞表面上呈递的其他类型配体。大多数T细胞具有包含阿尔法(α)链和贝塔(β)链的TCR(称为αβT细胞),而少数T细胞具有由伽马(γ)链和德尔塔(δ)链构成的TCR(称为γδT细胞)。
γδTCT识别多种自身和非自身抗原,如小肽、可溶性或膜蛋白、磷脂、焦磷酸戊烯酯和硫苷脂。由于其抗原多样性,γδT细胞可以发挥广泛的不同作用。例如,由于γδT细胞激活不需要抗原呈递细胞(APC)进行抗原加工和呈递,因此γδT细胞可以在免疫应答的早期被迅速激活并发挥作用。与自然杀伤(NK)细胞类似,γδT细胞也对应激和/或感染诱导的配体的刺激作出应答(Lafont等人,Front Immunol.,2014,5:622)。这种配体通常在正常状态下弱表达或不表达,因为它们仅在存在应激(DNA损伤、热应激)或感染时被上调。此外,人γδT细胞还表达模式识别受体(PRR),如Toll样受体(TLR),其调节它们的激活(Shojaei等人,Cancer Res.,2009,69(22):8710-8717)。
已发现取决于广泛不同的条件,γδT细胞是抗肿瘤发生性和促肿瘤发生性的(Lafont等人,Front Immunol.,2014,5:622)。关于胰腺导管腺癌(PDA),已发现γδT细胞在肿瘤浸润性T细胞中占相当大的部分,它们对αβT细胞介导的抗癌免疫具有抑制功能。在小鼠模型中,发现γδT细胞募集的缺失、耗竭或阻断针对PDA有保护,并导致αβT细胞的浸润、激活和Th1极化的增加(Daley等人,Cell,2016,166:1485-1499)。特别是,发现γδT细胞受体的δ1亚型在肿瘤浸润性T细胞中富集。
因此,对γδT细胞具有特异性的抗体(例如,对包含δ-1链和γ链的TCR的δ-1链具有特异性;“抗δ-1抗体”)可以是治疗与肿瘤浸润性γδT细胞(例如,其中肿瘤浸润性γδT细胞发挥免疫抑制作用的疾病)或循环γδT细胞相关疾病的有希望的治疗剂,这些γδT细胞可以阻断常规T细胞激活并从而阻断对病理细胞(如癌细胞)的免疫应答。在不受理论约束的情况下,抗δ1抗体可阻断表达这类的γδT细胞的抑制功能,从而增强抗肿瘤免疫应答。因此,抗体可防止α-βT细胞活性受到直接或间接抑制。该抗体可抑制γδT细胞细胞因子分泌(例如,IL-17),从而阻止对血管生成的诱导以及MDSC、中性粒细胞和TAM的吸引。该抗体可抑制γδT细胞的Treg/Th2型活性,从而防止抗肿瘤γδT细胞受到限制。此外,该抗体可阻止促肿瘤γδT细胞与树突状细胞(DC)的界面,从而防止DC成熟的抑制、DC和/或T细胞衰老的诱导,并防止由于γδT细胞的存在而导致的DC抗原呈递的限制。替代地另外,抗δ1抗体也可以通过诱导针对靶γδT细胞的细胞毒性(例如,ADCC、ADCP和/或CDC)来发挥其治疗作用。病理细胞是指直接或间接促进疾病启动和/或发展的细胞。在一些实施方案中,抗δ1抗体是抗体药物缀合物,并通过将化疗剂靶向肿瘤部位来发挥其作用。
因此,本文描述了对γδT细胞具有特异性的抗体(例如,抗δ1抗体)及其用于挽救由γδT细胞介导的常规T细胞活性的抑制和/或治疗与γδT细胞激活相关的疾病的治疗用途。
与γδT细胞δ1链结合的抗体
本公开提供了对适当物种(例如,人或非人灵长类动物,如猴子、黑猩猩或猿)的γδT细胞具有特异性的抗体,例如,对γδ1 T细胞具有特异性的抗体。这种抗体可以特异性结合在γδ1 T细胞上表达的TCR的δ1链。在一些实施方案中,本文所述抗体结合可在γδ1 T细胞的表面上表达的γδ1异二聚体(例如δ1/和γ链,例如γ9的异二聚体)中的δ1链。
本文公开的抗δ1链抗体可展示一个或多个优越特征,包括但不限于:(i)对多种人δ1 TCR的高结合亲和力,而无论其CDR序列如何,尤其是无论其CDR3序列如何(例如,低于12nM的KD,例如克隆δ1-19、δ1-26、δ1-29和δ-39);(ii)人δ1 TCR和非人灵长类δ1 TCR,如食蟹猴δ1 TCR的交叉反应性(例如,对人和食蟹猴δ1 TCR的KD值的差异)在一个数量级以内,例如克隆δ1-18、δ1-19、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-25、δ1-26、δ1-28、δ1-39);(iii)能够结合含有各种γ链,包括γ3、4、5、8或9的γδ1 TCR,例如δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41;和/或(iv)以高特异性结合δ-1,例如与其他靶标很少或没有结合,例如通过蛋白质阵列分析确定的;(v)抑制γδ-T细胞活性,即抑制γδ-T细胞介导的对T细胞激活例如CD4+和/或CD8+细胞的抑制(例如δ1-23,δ1-39)(vi)促进炎性T细胞激活(即促进CD4+辅助细胞和/或CD8+效应细胞的激活)(vii)消耗γδ-T细胞,例如通过ADCC、CDC和/或ADCP。
相应地,在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体(在本文中也称为“抗δ1抗体”)表现出一个或多个优越特征。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体对多种人δ1TCR具有高结合亲和力,而无论其CDR序列,尤其是无论其CDR3序列如何。在一些实施方案中,对于人δ-1的KD值低于10nM。在一些实施方案中,对于人δ-1的KD值低于5nM或低于2nM。在一些实施方案中,对于人δ-1的KD值低于1nM。对于人δ-1的KD值低于1nM的抗体的非限制性示例为δ1-39。在一些实施方案中,人δ1 TCR和非人灵长类δ1 TCR例如食蟹猴δ1 TCR的交叉反应性(例如,对人和食蟹猴δ1 TCR的KD值的差异)在一个数量级以内。对于人的KD值与对于食蟹猴δ1 TCR的KD值的差异在一个数量级以内的抗体的非限制性示例为δ1-39。在一些实施方案中,本文所公开的抗δ1链抗体与多种食蟹猴δ1 TCR具有高结合亲和力,而无论其CDR序列,尤其是无论其CDR3序列如何。在一些实施方案中,对于食蟹猴δ-1的KD值低于10nM。在一些实施方案中,对于食蟹猴δ-1的KD值低于5nm或低于2nm。在一些实施方案中,对于食蟹猴δ-1的KD值低于1nm。对于食蟹猴δ-1的KD值低于1nm的抗体的非限制性示例是δ1-39。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体能够结合含有各种γ链的γδ1 TCR。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体能够结合含有γ链3、4、5、8和/或9的γδ1 TCR。例如,在一个特定实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体能够结合含有γ链3、4、5和8的γδ1 TCR,例如,包括δ-38,δ1-39、δ1-40和δ1-41。本文公开的能够结合含有γ链3、4、5和8以及9的γδ1 TCR的抗δ1抗体的非限制性示例是δ1-39。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体与人δ-1链和非人哺乳动物δ-1链(例如非人灵长类δ-1链)交叉反应,并且能够结合含有各种γ链,包括γ3、4、5和8的γδ1 TCR。本文所述的此类抗体的非限制性示例包括δ1-39和δ1-41。其他示例包括δ1-38和δ1-40。在一些实施方案中,抗体以高度特异性结合δ-1,例如通过蛋白质阵列分析来确定的。此类和抗体的非限制性示例为克隆δ1-39。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体抑制γδ-T细胞介导的对T细胞激活的抑制或压制。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体抑制γδ-T细胞的抑制性活性。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体能够促进炎症性T细胞激活,例如,如本文针对δ1-39所示。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体能够激活例如在肿瘤或外周血中的CD4+辅助细胞和/或CD8+效应细胞。在一些实施方案中,本文公开的抗δ1链抗体能够例如通过ADCC、CDC和/或ADCP消耗γδ-T细胞。
抗体(单数和复数形式可互换使用)是免疫球蛋白分子,其能够通过位于免疫球蛋白分子可变区中的至少一个抗原识别位点特异性结合靶标,例如碳水化合物、多核苷酸、脂质、多肽等。如本文所用,术语“抗体”不仅包括完整(即全长)多克隆或单克隆抗体,还包括其抗原结合片段(例如Fab,Fab',F(ab')2,Fv)、单链(scFv)、其突变体、包含抗体部分的融合蛋白、人源化抗体、嵌合抗体、双抗体、纳米体、线性抗体、单链抗体、多特异性抗体(例如,双特异性抗体)和包含所需特异性的抗原识别位点的免疫球蛋白分子的任何其他修饰构型,包括抗体的糖基化变体、抗体的氨基酸序列变体和共价修饰的抗体。抗体包括任何类别的抗体,例如IgD、IgE、IgG、IgA或IgM(或其子类别),并且抗体不需要是任何特定类别。根据其重链的恒定结构域的抗体氨基酸序列,免疫球蛋白可被分配到不同的类。免疫球蛋白有五大类:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,并且其中一些可进一步分为亚类(同种型),例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2。与不同类的免疫球蛋白相对应的重链恒定结构域分别称为α、δ、ε、γ和μ。不同类的免疫球蛋白的亚基结构和三维构型是众所周知的。
术语“抗体”还意味着包括所谓的抗体模拟物。抗体模拟物是指小分子,例如3-30kDa,可以是单氨基酸链分子,可以特异性结合抗原但不具有抗体相关结构。抗体模拟物及其蛋白质支架,包括但不限于Affibody分子(蛋白质A的Z结构域)、Affilin(γ-B晶体)、泛素、Affimer(半胱氨酸蛋白酶抑制剂)、Affitin(Sac7d(来自嗜酸热硫化叶菌(Sulfolobus acidocaldarius)))、Alphabodies(三螺旋卷曲螺旋)、Anticalin(脂溶蛋白)、Avimers(各种膜受体的结构域)、DARPin(锚蛋白重复基序)、Fynomer(Fyn的SH3结构域)、Kunitz结构域肽(各种蛋白酶抑制剂的Kunitz结构域)、Ecalantide(Kalbitor)和单体(纤连蛋白III型结构域)。因此,在一些实施方案中,抗δ1抗体是抗体模拟物。
在一些实施方案中,抗δ1抗体是抗体药物缀合物(ADC)。ADC通常包括针对细胞上存在的靶标的单克隆抗体、细胞毒性药物和将抗体附接到药物的接头。Carter&Senter(2008),Cancer J.14(3):154-69和Chari et al(2014)Angewandte ChemieInternational Edition 53:3751综述了用于癌症疗法的抗体药物缀合物。细胞毒性部分可以是多肽,其可以直接地或间接地具有细胞毒性。当间接具有细胞毒性时,该多肽可具有酶活性并可将相对无毒的前药转化为细胞毒性药物(例如,抗体导向的酶前药疗法;ADEPT)。细胞毒性部分可以包含选自以下的药物:细胞抑制剂(例如紫杉烷(例如,多西他赛,尤其是紫杉醇));烷基化剂(如顺铂、卡铂);抗代谢物(如25硫唑嘌呤、甲氨蝶呤);抗有丝分裂药(如长春新碱);拓扑异构酶抑制剂(如多柔比星、依托泊甙等)。细胞毒性部分可以是任何已知的化疗剂。细胞毒性部分可以是肠道细菌毒素,尤其是假单胞菌外毒素20A或卡利霉素(calicheamicin)。细胞毒性部分还可以包含放射性原子。放射性原子通常选自由以下组成的组:碘-123;碘-125;碘-131;铟-111;溴-77;铜-67;砷-77;砹-211;锕-15225;铋-212;铋-213;铋-217;镥-177;钬-166;磷-33;铂-193;铂-195;铼-186;铼-188;锶-89;钇-90。金-199,钯-100;和锑-211。在一些实施方案中,细胞毒性部分能够抑制表达δ1 TCR的细胞的至少一种活性。在一些实施方案中,细胞毒性部分能够使细胞失活或杀死细胞。为了促进细胞毒性部分和抗体之间的偶联,可以直接缀合两种试剂,或在它们之间引入间隔物分子。合适的间隔物包括聚(亚烷基)二醇(例如聚乙二醇)和肽接头。许多合适的偶联技术在本领域是众所周知的。允许部分与抗体共价、静电或非共价结合的合适试剂包括苯醌、碳二亚胺和更具体地EDC(1-乙基-3-[3-二甲基-氨基丙基]-碳二亚胺盐酸盐)、二马来酰亚胺、二硫代二硝基苯甲酸(DTNB)、N-琥珀酰亚胺S-乙酰硫代乙酸(SATA),具有一个或多个苯叠氮化物基团的与紫外线(U.V.)反应的桥接剂和优选地N-[-4-(叠氮水杨基氨基)丁基]-3'-(2'-吡啶基二硫代)-丙酰胺(APDP)、N-琥珀酰亚胺-基-3-(2-25吡啶基二硫代)丙酸酯(SPDP)、6-肼基烟酰胺(HYNIC)。另一种偶联形式,特别是对于放射性元素的,包括使用双功能离子螯合剂。例如,从EDTA或DTPA衍生的螯合物,已开发用于结合金属,特别是放射性金属和免疫球蛋白。因此,DTPA及其衍生物可以被碳链上的不同基团取代以增加配体-金属络合物的稳定性和刚性,这在本领域是众所周知的。
在一些实施方案中,抗δ1抗体与药物缀合以产生抗体药物缀合物(ADC)。在一些实施方案中,抗δ1抗体是抗体药物缀合物(ADC)。可与抗δ1抗体缀合的合适的细胞毒性剂在本文进行了描述并且是本领域已知的。在一些实施方案中,接头是可切割的。接头的非限制性示例包括可通过二硫键交换切割的含二硫键的接头,可在酸性pH切割的不耐酸接头以及可被水解酶(例如,糖基水解酶,例如葡萄糖醛酸糖苷酶)、酯酶和肽酶切割的接头(例如,肽接头和葡萄糖苷酸接头)。在一些实施方案中,接头是不可切割的。在一些实施方案中,药物经由蛋白水解性抗体降解机制而释放。
典型的抗体分子包括重链可变区(VH)和轻链可变区(VL),它们通常参与抗原结合。VH和VL区可进一步细分为高变异性的区域,也称为“互补性决定区域”(“CDR”),中间散布着更保守的区域,称为“框架区域”(“FR”)。每个VH和VL通常由三个CDR和四个FR构成,按以下顺序从氨基末端到羧基末端排列:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。框架区和CDR的范围可以使用本领域已知的方法精确识别,例如,通过Kabat定义、Chothia定义、AbM定义、EU定义和/或接触定义,所有这些在本领域都是众所周知的。例如,见Kabat,E.A.,等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,U.S.Departmentof Health and Human Services,NIH Publication No.91-3242,Chothia等人,(1989)Nature 342:877;Chothia,C.等人(1987)J.Mol.Biol.196:901-917,Al-lazikani等(1997)J.Molec.Biol.273:927-948;Edelman等人,Proc Natl Acad Sci U S A.1969May;63(1):78-85;和Almagro,J.Mol.Recognit.17:132-143(2004)。另见hgmp.mrc.ac.uk和bioinf.org.uk/abs)。例如,根据不同定义的C编号之间的对应或比对可以参见http://www.imgt.org/。
本文所述抗体可以能够与T细胞受体δ-1多肽结合(抗δ-1抗体),T细胞受体δ-1多肽可具有适当来源,例如人或非人哺乳动物(例如,兔、灵长类动物例如猴子等)。
如本文所述的抗δ1抗体可以是全长抗体,其含有两条重链和两条轻链,每一条包括可变结构域和恒定结构域。替代地,抗δ1抗体可以是全长抗体的抗原结合片段。全长抗体的术语“抗原结合片段”中包括的结合片段的示例包括(i)Fab片段,由VL、VH、CL和CH1结构域组成的单价片段;(ii)F(ab')2片段,包括通过在铰链区的二硫键连接的两个Fab片段的二价片段;(iii)由VH和CH1结构域组成的Fd片段;(iv)由抗体单臂的VL和VH结构域组成的Fv片段;(v)dAb片段(Ward等人,(1989)Nature 341:544-546),其由一个或多个VH结构域组成(例如,包括但不限于VHH结构域(骆驼科或纳米抗体);和(vi)保留功能性的分离的互补性决定区(CDR)。此外,尽管Fv片段的两个结构域VL和VH是由单独的基因编码的,但它们可以通过合成的接头使用重组方法连接起来,使它们能够形成单个蛋白质链,其中VL和VH区配对形成称为单链Fv(scFv)的单价分子。例如,见Bird等人(1988)Science 242:423-426;和Huston等人(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883。
在一些实施方案中,本文所述的抗体特异性结合相应的靶抗原或其表位,例如,特异性结合T细胞γδ1受体的δ-1链。“特异性结合”抗原或表位的抗体是本领域熟知的术语。如果分子与特定的靶抗原的反应比其与其他靶标的反应更频繁、更迅速、持续时间更长和/或亲和力更高,则称该分子显示出“特异性结合”。如果抗体与靶标抗原或表位结合比其与其他物质结合的亲和力更高、亲合力更高、更容易和/或持续时间更长,则该抗体“特异性结合”靶标抗原或表位。例如,特异地(或优先地)结合抗原(例如,人TCR的δ-1链)或其中抗原表位的抗体是以比其结合其他抗原(例如,人TCR的δ-2链)或同一抗原中的其他表位的亲和力更高、亲合力更高、更容易和/或持续时间更长结合该靶标抗原的抗体。根据该定义还可以理解,例如,特异性结合第一靶标抗原的抗体可以或可以不特异性地或优先地结合第二靶标抗原。因此,“特异性结合”或“优先结合”不一定要求(尽管它可以包括)排他性结合。在一些示例中,“特异性结合”靶标抗原或其表位的抗体可以不结合其他抗原或同一抗原中的其他表位,即,在常规方法中只能检测到基线结合活性。基线结合活性是指在未使用抗原(空白对照)或不同抗原(阴性对照)时,在常规方法中检测到的结合活性。
可使用蛋白质阵列测量本文所述的抗δ1抗体的特异性,从而得出本文所述和本领域已知的特异性得分(S得分)(参见,例如Jeong等人,Mol Cell Proteomics.2012Jun;11(6):O111.016253)。此外,通过比较抗δ1抗体与d1结合的KD和与d2结合的KD,评估本文所述抗δ1抗体的特异性。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体结合TCRδ-1链共有的基序。TCRδ-1链(例如,人TCRδ-1链、食蟹猴TCRδ-1链或来自其他物种的TCRδ链)的序列在本领域中是众所周知的,并且可以从公开可用的数据库中找到,例如,
Figure BDA0003238211330000371
数据库(imgt.org)或GenBank。在一些示例中,抗δ1抗体可与不同的人或食蟹猴δ1链交叉反应。
如下提供δ1链(人和食蟹猴)的细胞外区域(缺乏跨膜结构域和细胞质尾部)的示例性氨基酸序列:
人TCR:
AQKVTQAQSSVSMPVRKAVTLNCLYETSWWSYYIFWYKQLPSKEMIFLIRQGSDEQNAKSGRYSVNFKKAAKSVALTISALQLEDSAKYFCALGVYAHSLTGGYRGGADKLIFGKGTRVTVEPRSQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTVHSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKS(SEQ ID NO:26)
人TCR:
AQKVTQAQSSVSMPVRKAVTLNCLYETSWWSYYIFWYKQLPSKEMIFLIRQGSDEQNAKSGRYSVNFKKAAKSVALTISALQLEDSAKYFCALGPRPSYSEELGDTHRADKLIFGKGTRVTVEPRSQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTVHSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKS(SEQ ID NO:27)
人TCR:
AQKVTQAQSSVSMPVRKAVTLNCLYETSWWSYYIFWYKQLPSKEMIFLIRQGSDEQNAKSGRYSVNFKKAAKSVALTISALQLEDSAKYFCALGEPNHFLNTDKLIFGKGTRVTVEPRSQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTVHSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKS(SEQ ID NO:28)
食蟹猴TCR:
AQKVTQAQSSVSMPVEKAVTLNCQYETSSWSYDLFWYKQLPGKEMIFLIRQGSSEQNARDGRYSVNFKKEASFIALTISALQLEDSATYFCALRRPFTAQLFFGKGTQLIVEPERQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKDFYPKDIRINLESSKKITEFDPAIVVSPSGKYNAVKLGQYADSNSVTCSVQHNKEVVYSTDFEVKTNSTDHLKPTETENTKQPSKS(SEQ ID NO:32)
食蟹猴TCR:
AQKVTQAQSSVSMPVGKAVTLNCQYETSSWSYYLFWYKQLPGKEMIFLIHQGSSQQNARNGRYSVNFQKAASSITLTISALQLEDSATYFCALRERPPNPGPFVLGVYATAQLFFGKGTQLIVEPERQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKDFYPKDIRINLESSKKITEFDPAIVVSPSGKYNAVKLGQYADSNSVTCSVQHNKEVVYSTDFEVKTNSTDHLKPTETENTKQPSKS(SEQ ID NO:33)
食蟹猴TCR:
AQKVTQAQSSVSMPVEKAVTLNCQYETSWWSYDLFWYKQLPGKEMIFLIRQSSSEQNARDGRYSANFKKEASSKSFIALTISALQLEDSATYFCALPLQVRGPTGGIRVYDKLIFGKGTRVTVEPKRQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKDFYPKDIRINLESSKKITEFDPAIVVSPSGKYNAVKLGQYADSNSVTCSVQHNKEVVYSTDFEVKTNSTDHLKPTETENTKQPSKS(SEQ ID NO:34)
如本文所用,“交叉反应”是指抗体显示出对两个或更多个不同抗原序列(例如,人δ1和δ2)的结合活性(通过常规测定可检测)。此类抗体可具有与这些抗原基本相似的结合亲和力,例如,具有在相同测定条件下确定的对一种抗原的结合亲和力高于对另一种抗原的结合亲和力的<10倍(例如<5倍或<2倍)。替代地,这种抗体可以对这些抗原中的一种具有相对于另一种基本上更高的结合亲和力,例如,具有在相同测定条件下确定的对一种抗原的结合亲和力比对另一种抗原的结合亲和力高至少10倍(例如,高20倍、高50倍、高100倍或高1000倍)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体优先地结合单个人δ1链。在一些实施方案中,抗体结合δ1链,无论CDR区(例如CDR3区)的序列如何。在一些实施方案中,抗δ1抗体相对于人δ-2链、人δ-3链、γ链(例如γ-9链)和/或非人δ1链,优先地结合人δ1。如本文所用,与第二抗原或另一表位相比,抗体“优先地结合”第一抗原或其表位意味着在相同测定条件下测定的,抗体与第一抗原或其表位的结合亲和力相对于第二抗原或另一表位显著更高,例如至少高10倍(例如,>20倍、>50倍、>100倍、>1000倍或更高)。
本文所述的抗δ1抗体可相对于非人对应物(例如,非人灵长类δ1链)优先地结合人δ1链,或反之亦然。在其它情况下,本文所述的抗δ1抗体可与人和非人δ1链交叉反应。例如,抗体可与人δ1链和非人灵长类δ1链交叉反应。
在一些情况下,本文所述的抗δ1抗体不结合人δ-2链、人δ-3链或γ链(例如γ-9链)。在一些实施方案中,抗δ1抗体不结合δ-2链(本文称为δ2)。在一些实施方案中,抗δ1抗体不结合δ-3链(本文称为δ3)。在一些实施方案中,抗δ1抗体既不结合δ-2链也不结合δ-3链。不结合抗原的抗体意味着使用常规测定(例如ELISA或表面等离子体共振)无法检测到有意义的结合(例如,仅背景结合或根本没有结合)。
在一些实施方案中,本文所述的抗体-抗δ1抗体结合包含δ1链和γ链的T细胞受体。本领域已知γ链的序列(例如,参见imgt.org/IMGTrepertoire)。γ链的非限制性示例包括γ1、γ2、γ3、γ4、γ5、γ5P、γ8、γ9、γ10、γ11、γ-a。γ链的非限制性示例由以下基因编码:·TRGV1、TRGV2、TRGV3、TRGV4、TRGV5、TRGV5P、TRGV8、TRGV9、TRGV10、TRGV11和TRGVA。在一些实施方案中,本文所述的抗体-抗δ1抗体结合包含本领域已知的δ1链和γ链的T细胞受体。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可结合包含任何γ链的TCR。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可结合包含γ3、4、5、8和9的TCR。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可结合包含γ3、4、5和8的TCR。本文所述的抗δ1抗体优选地对靶标抗原(例如,人δ1链)或其抗原表位具有合适的结合亲和力。如本文所用,“结合亲和力”指表观结合常数或KA。KA是解离常数(KD)的倒数。本文所述的抗δ1抗体对于靶标抗原或抗原表位可具有为至少10-5、10-6、10-7、10-8、10-9、10-10M或更低的结合亲和力(KD)。结合亲和力的增加对应于KD的减少。与用于结合第二抗原的KA(或数值KD)相比,用于结合第一抗原的KA更高(或数值KD更小),表明抗体相对于第二抗原对第一抗原的更高亲和力结合。在这种情况下,抗体相对于第二抗原(例如,以第二构象的相同第一蛋白质或其模拟物;或者第二种蛋白质),对第一抗原(例如,以第一构象的第一蛋白质或其模拟物)具有特异性。结合亲和力的差异(例如,对于特异性或其他比较)可以为至少1.5、2、3、4、5、10、15、20、37.5、50、70、80、91、100、500、1000、10000或105倍。在一些实施方案中,任何抗δ1抗体可进一步亲和力成熟以增加抗体对靶标抗原或其抗原表位的结合亲和力。
结合亲和力(或结合特异性)可通过多种方法确定,包括平衡透析、平衡结合、凝胶过滤、ELISA、表面等离子体共振或光谱(例如,使用荧光分析)。评估结合亲和力的示例性条件是在HBS-P缓冲液(10mM HEPES pH7.4、150mM NaCl、0.005%(v/v)表面活性剂P20)中。这些技术可用于测量已结合的结合蛋白的浓度作为靶标蛋白浓度的函数。已结合的结合蛋白([已结合])的浓度通常通过以下等式与游离靶蛋白([游离])的浓度相关:
[已结合]=[游离]/(Kd+[游离])
然而并不总是需要精确测定KA,因为有时获得亲和力的定量测量(例如,使用ELISA或FACS分析等方法测定)与KA成比例并且因此可用于比较就已经足够了,例如确定亲和力是否更高,例如,高2倍,以获得亲和力的定性测量,或获得亲和力的推断,例如通过功能测定例如体外或体内测定中的活性。
本文所述的抗δ1抗体可抑制γδT细胞激活,即降低γδT细胞(例如免疫抑制性γδT细胞)的总体活性。在不受理论约束的情况下,本文所述的抗δ1抗体可经由直接阻断在T细胞上表达的γδ1 TCR的活性来抑制γδ1 T细胞的生物活性。替代地或另外,经由结合γδ1TCR,抗δ1抗体可触发细胞毒性,例如ADCC和/或ADCP和/或CDC,以消除表达γδ1 TCR的T细胞,导致γδ1 T细胞的消耗。因此,本文所述的抗δ1抗体可在例如癌症环境下挽救由γδT细胞介导的免疫抑制。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体抑制γδ1 T细胞的活性。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体将γδ1 T细胞的活性抑制至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。在一些实施方案中,通过检查抗体从γδT细胞的抑制活性中“挽救”免疫细胞例如αβT细胞的能力来测量抗δ1抗体的抑制或压制效力。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以挽救由γδ1 T细胞诱导的免疫抑制。本文所述的抗δ1抗体可以挽救由γδ1 T细胞诱导的免疫抑制至少10%(例如,至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)。
在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体能够消除γδ1 T细胞,即消耗γδ1 T细胞,例如从肿瘤微环境和/或血清、血液或循环中。在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体能够从肿瘤微环境中消除γδ1 T细胞,即消耗γδ1 T细胞。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体使γδ1 T细胞消耗至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。在一些实施方案中,通过检查抗体从γδT细胞的抑制活性中“拯救”免疫细胞例如αβT细胞的能力来测量抗δ1抗体的能力。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以挽救由γδ1 T细胞诱导的免疫抑制。本文所述的抗δ1抗体可以挽救由γδ1 T细胞诱导的免疫抑制至少10%(例如,至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体能够从肿瘤微环境中消除γδ1 T细胞,即消耗γδ1 T细胞。在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体消耗γδ1 T细胞至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。在一些实施方案中,通过检查抗体从γδT细胞的抑制活性中“拯救”免疫细胞例如αβT细胞的能力来测量抗δ1抗体的抑制或压制效力。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以挽救由γδ1 T细胞诱导的免疫抑制。本文所述的抗δ1抗体可以挽救由γδ1 T细胞诱导的免疫抑制至少10%(例如,至少20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体激活ADCC。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体将ADCC激活至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。在一些实施方案中,根据本文所述的一种或多种方法测量抗体激活ADCC的能力。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体激活ADCP。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体将ADCP激活至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。在一些实施方案中,根据本文所述的一种或多种方法测量抗体激活ADCP的能力。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体激活或重新激活在肿瘤和/或在外周血中的CD4+辅助细胞和/或CD8+效应细胞。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体将肿瘤和/或外周血中的CD4+辅助细胞和/或CD8+效应细胞激活或重新激活至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。在一些实施方案中,通过检查促炎细胞因子的水平来测量抗δ1抗体激活CD4+和/或CD8+细胞的能力。在一些实施方案中,抗δ1抗体能够增加肿瘤中促炎细胞因子的产生,促炎细胞因子包括但不限于IFNγ、TNF-α和CD44。在一些实施方案中,抗δ1抗体能够将肿瘤中促炎细胞因子的产生增加至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量),促炎细胞因子包括但不限于IFNγ、TNF-α和CD44。
在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体可以调节例如降低γδ1 T细胞与γδ2T细胞的比率。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体调节例如将γδ1 T细胞与γδ2 T细胞的比率降低至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更多,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以调节,例如减少PBMC中存在的γδ1T细胞的分数和/或肿瘤局部的免疫细胞中存在的γδ1 T细胞的分数。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体调节,例如,减少PBMC中存在的γδ1 T细胞的分数和/或肿瘤局部免疫细胞中存在的γδ1 T细胞的分数至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体可消耗肿瘤的γδT细胞。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体将肿瘤的γδT细胞消耗至少10%(例如,10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可防止α-βT细胞活性的直接或间接抑制。在一些实施方案中,如本文所述的抗δ1抗体可以抑制γδT细胞细胞因子分泌(例如IL-17),从而阻止血管生成的诱导以及MDSC、中性粒细胞和TAM的吸引。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以抑制γδT细胞的Treg/Th2型活性,从而防止抗肿瘤γδT细胞受到限制。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以阻止促肿瘤γδT细胞与树突细胞(DC)的接合界面,并因此阻止DC成熟的抑制和/或DC或T细胞衰老的诱导。在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以防止因存在γδT细胞而导致的DC抗原呈递的限制。
表观抑制常数(Kiapp或Ki,app)提供抑制剂效力的量度,与降低酶活性所需的抑制剂浓度有关并且不依赖于酶浓度。本文所述的抗δ1抗体的抑制活性可以通过本领域已知的常规方法确定。
抗体的Ki, app值可以通过测量不同浓度的抗体对反应程度(例如酶活性)的抑制作用来确定;将伪一级速率常数(v)的变化作为抑制剂浓度的函数与修改的莫里森方程(方程1)进行拟合,得出表观Ki值的估计值。对于竞争性抑制剂,Kiapp可以获得自从Ki, app与底物浓度图的线性回归分析中提取的y截距。
Figure BDA0003238211330000431
其中A等于vo/E,即不存在抑制剂(I)时酶促反应的初始速度(vo)除以总酶浓度(E)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体对于靶抗原或抗原表位可具有1000、900、800、700、600、500、400、300、200、100、50、40、30、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5pM或更少的Kiapp值。在一些实施方案中,相对于第二靶标(例如,δ1的不同特异性表位),抗δ1抗体对于第一靶标(例如,δ1的特异性表位)可以具有更低的Kiapp。Kiapp的差异(例如,对于特异性或其他比较)可以为至少1.5、2、3、4、5、10、15、20、37.5、50、70、80、91、100、500、1000、10,000或105倍。在一些示例中,相对于第二抗原(例如,以第二构象的相同第一蛋白质或其模拟物;或第二种蛋白质),抗δ1抗体更好地抑制第一抗原(例如,以第一构象的第一蛋白质或其模拟物)。在一些实施方案中,任何抗δ1抗体可以进一步亲和力成熟以降低抗体对靶抗原或其抗原表位的Kiapp
本文所述的抗体可以是鼠、大鼠、猴、人或任何其他来源的(包括嵌合或人源化抗体)。此类抗体是非天然存在的,即在没有人行为(例如,用所需抗原或其片段免疫此类动物或从抗体文库中分离)的情况下不会在动物中产生。
本文所述的任何抗体可以是单克隆的或多克隆的。“单克隆抗体”是指同质抗体群体,而“多克隆抗体”是指异质抗体群体。这两个术语不限制抗体的来源或其制造方式。
在一个示例中,本文所述的方法中使用的抗体是人源化抗体。人源化抗体是指非人(例如鼠)抗体的形式,其是特异性嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其抗原结合片段,其包含源自非人免疫球蛋白的最少序列。对于大多数部分,人源化抗体是人免疫球蛋白(接受体抗体),其中来自接受体的CDR的残基被来自非人物种(供体抗体)(例如小鼠、大鼠或兔)的具有所需的特异性、亲和力和能力的CDR的残基替换。在一些情况下,人免疫球蛋白的Fv框架区(FR)残基被相应的非人残基替换。此外,人源化抗体可以包含既不在接受体抗体中也不在导入的CDR或框架序列中发现的残基,但被包括在内以进一步改进和优化抗体性能。一般而言,人源化抗体将包含基本上所有的至少一个、通常为两个可变结构域,其中所有或基本上所有的CDR区对应于非人免疫球蛋白的那些并且所有或基本上所有的FR区是人免疫球蛋白共有序列的那些。人源化抗体最好还包含免疫球蛋白恒定区或结构域(Fc)的至少一部分,通常是人免疫球蛋白的恒定区或结构域。抗体可具有如WO99/58572中所述经修饰的Fc区。其他形式的人源化抗体具有一个或多个CDR(1、2、3、4、5或6个),所述CDR相对于原始抗体发生了改变,也称为“源自”来自原始抗体的一个或多个CDR的一个或多个CDR。人源化抗体也可以涉及亲和力成熟。
构建人源化抗体的方法也是本领域公知的。参见,例如,Queen等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,86:10029-10033(1989)。在一个示例中,按照本领域已知的方法,对亲本非人抗体的VH和VL的可变区进行三维分子建模分析。接下来,使用相同的分子建模分析来鉴定预测对形成正确的CDR结构重要的框架氨基酸残基。同时,使用亲本VH和VL序列作为搜索查询,从任何抗体基因数据库中鉴定具有与亲本非人抗体的氨基酸序列同源的氨基酸序列的人VH和VL链。然后选择人VH和VL接受体基因。
所选人接受体基因内的CDR区可以用来自亲本非人抗体或其功能性变体的CDR区替换。必要时,可以使用亲本链的框架区内的、预测在与CDR区相互作用中重要的残基来替换人接受体基因中的相应残基。
在另一个示例中,本文所述的抗体是嵌合抗体,其可包括来自人抗体的重链恒定区和轻链恒定区。嵌合抗体是指具有来自第一物种的可变区或可变区的部分和来自第二物种的恒定区的抗体。通常,在这些嵌合抗体中,轻链和重链两者的可变区模拟源自一种哺乳动物(例如,非人哺乳动物,例如小鼠、兔和大鼠)的抗体的可变区,而恒定部分与源自另一种哺乳动物(例如人)的抗体中的序列同源。在一些实施方案中,可以在可变区和/或恒定区中进行氨基酸修饰。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可以包含重链可变区(VH),其包含重链(HC)CDR1、HC CDR2和HC CDR3。HC CDRl可以包含FTX1X2X3X4X5IH(SEQ ID NO:46)所示的基序,其中X1可以是F或V,X2可以是S或T,X3可以是G、A或S,X4可以是T、N或S,并且X5可为D或S。在具体示例中,HC CDR1可以是FTVSSSSIH(SEQ ID NO:52)。HC CDR2可以包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53)所示的基序。替代地或另外,HC CDR3可以包含PGX6YYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:48)所示的基序,其中X6可以是S或M。在具体示例中,HCCDR3可以包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)的序列。
替代地或另外,本文所述的抗δ1抗体可以包含轻链可变区(VL),其包含轻链(LC)CDR1、LC CDR2和LC CDR3。在一些情况下,LC CDR1可以包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)所示的基序。LC CDR2可以包含X7ASSLX8S(SEQ ID NO:50)所示的基序,其中X7可以是S或A,并且X8可以是Y或Q。在一些示例中,LC CDR2可以包含AASSLQS(SEQ ID NO:56)的序列。替代地或另外,LC CDR3可以包含QQX9X10X11X12X13X14LIT(SEQ ID NO:51)所示的基序,其中X9可以是S或Q,X10可以是G、S或T,X11可以是D、K或S,X12可以是Y、W或不存在,X13可以是P或不存在,并且X14可以是D、F或Y。在一些示例中,LC CDR3可以包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)的序列。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1包含FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:93)的基序,其中X1是S或T,X2是S、G或A,X3是T、N或S,并且X4是D或S。替代地或另外,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53)。替代地或另外,HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。替代地或另外,本文公开的分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LCCDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)。替代地或另外,LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56)。替代地或另外,LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1包含FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:93)的基序,其中X1是S或T,X2是S、G或A,X3是T、N或S,并且X4是D或S,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53),并且HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。在一些实施方案中,分离的抗体进一步包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQID NO:55),LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56),并且LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ IDNO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1包含FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:94)的基序,其中X1是S或T,X2是S或A,X3是N或S,并且X4是D或S,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53),并且HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。在一些实施方案中,分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55),LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56),并且LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,抗体包含重链可变区(VH),其包含HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3,其中HC CDR1选自由SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71和SEQ ID NO:72组成的组。替代地或另外,HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53)。替代地或另外,HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54)。替代地或另外,本文公开的分离的抗体包含轻链可变区(VL),其包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3,其中LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55)。替代地或另外,LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56)。替代地或另外,LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:57)。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体包含本文所述的所有重链和/或所有轻链CDR基序。在一些示例中,抗体不具有与δ1-17相同的重链和轻链CDR或不具有与δ1-17相同的重链和轻链可变区。
下面提供了许多示例性抗δ1抗体(基于Kabat编号的CDR残基由粗体表示)。表1中提供了CDR列表。
δ1-17
VH:
Figure BDA0003238211330000471
VL:
Figure BDA0003238211330000472
δ1-18
VH:
Figure BDA0003238211330000473
VL:
Figure BDA0003238211330000474
δ1-19
VH:
Figure BDA0003238211330000475
Figure BDA0003238211330000481
VL:
Figure BDA0003238211330000482
δ1-20
VH:
Figure BDA0003238211330000483
VL:
Figure BDA0003238211330000484
δ1-21
VH:
Figure BDA0003238211330000485
Figure BDA0003238211330000491
VL:
Figure BDA0003238211330000492
δ1-22
VH:
Figure BDA0003238211330000493
VL:
Figure BDA0003238211330000494
δ1-23
VH:
Figure BDA0003238211330000495
VL:
Figure BDA0003238211330000501
δ1-24
VH:
Figure BDA0003238211330000502
VL:
Figure BDA0003238211330000503
δ1-25
VH:
Figure BDA0003238211330000504
VL:
Figure BDA0003238211330000505
Figure BDA0003238211330000511
δ1-26
VH:
Figure BDA0003238211330000512
VL:
Figure BDA0003238211330000513
δ1-27
VH:
Figure BDA0003238211330000514
VL:
Figure BDA0003238211330000515
δ1-28
VH:
Figure BDA0003238211330000521
VL:
Figure BDA0003238211330000522
δ1-29
VH:
Figure BDA0003238211330000523
VL:
Figure BDA0003238211330000524
δ1-30
VH:
Figure BDA0003238211330000531
VL:
Figure BDA0003238211330000532
δ1-31
VH:
Figure BDA0003238211330000533
VL:
Figure BDA0003238211330000534
δ1-32
VH:
Figure BDA0003238211330000535
Figure BDA0003238211330000541
VL:
Figure BDA0003238211330000542
δ1-33
VH:
Figure BDA0003238211330000543
VL:
Figure BDA0003238211330000544
δ1-34
VH:
Figure BDA0003238211330000545
Figure BDA0003238211330000551
VL:
Figure BDA0003238211330000552
δ1-35
VH:
Figure BDA0003238211330000553
VL:
Figure BDA0003238211330000554
δ1-36
VH:
Figure BDA0003238211330000555
VL:
Figure BDA0003238211330000561
δ1-37
VH:
Figure BDA0003238211330000562
VL:
Figure BDA0003238211330000563
δ1-38
VH:
Figure BDA0003238211330000564
VL:
Figure BDA0003238211330000571
δ1-39
VH:
Figure BDA0003238211330000572
VL:
Figure BDA0003238211330000573
δ1-40
VH:
Figure BDA0003238211330000574
VL:
Figure BDA0003238211330000575
Figure BDA0003238211330000581
δ1-41
VH:
Figure BDA0003238211330000582
VL:
Figure BDA0003238211330000583
δ1-42
VH:
Figure BDA0003238211330000584
VL:
Figure BDA0003238211330000585
δ1-43
VH:
Figure BDA0003238211330000591
VL:
Figure BDA0003238211330000592
表1.选择的抗体CDR序列
Figure BDA0003238211330000593
Figure BDA0003238211330000601
Figure BDA0003238211330000611
Figure BDA0003238211330000621
Figure BDA0003238211330000631
Figure BDA0003238211330000641
在一些实施方案中,本文所述的抗-δ1抗体与上面列出的任何示例性抗体结合相同的表位或与示例性抗体竞争结合δ-1链。“表位”是指被抗体识别并结合的靶抗原上的位点。该位点可以完全由氨基酸组分组成,完全由蛋白质的氨基酸的化学修饰(例如,糖基部分)组成,或由它们的组合组成。重叠表位包括至少一个共同的氨基酸残基。表位可以是线性的,其长度通常为6-15个氨基酸。替代地,表位可以是构象性的。抗体结合的表位可以通过常规技术确定,例如,表位作图方法(参见,例如如下所述)。与本文描述的示例性抗体结合相同的表位的抗体可以与示例性抗体结合完全相同的表位或基本重叠的表位(例如,含有少于3个非重叠氨基酸残基、少于2个非重叠氨基酸残基,或仅1个非重叠氨基酸残基)。两种抗体是否相互竞争结合同类抗原可以通过本领域公知的竞争测定法来确定。
在一些示例中,本文所述的抗δ1抗体包含与上文所列示例性抗体相同的VH和/或VLCDR。具有相同VH和/或VL CDR的两种抗体意味着当通过相同方法(例如本领域已知的Kabat方法或Chothia方法)确定时,它们的CDR是相同的。与本文所述的示例性抗体相比,此类抗δ1抗体可具有相同的VH、相同的VL或两者。
在本公开内容的范围内还有本文公开的任何示例性抗-δ1抗体的功能性变体。此类功能性变体在结构和功能上均与示例性抗体基本上相似。功能性变体包含与示例性抗体基本上相同的VH和/或VL CDR。例如,它可以在抗体的总CDR区中仅包含多至10(例如,9、8、7、6、5、4、3、2或1)个氨基酸残基变异,并以基本上相似的亲和力(例如,具有相同数量级的KD值)结合δ1的相同表位。替代地或另外,氨基酸残基变异是保守的氨基酸残基取代。如本文所用,“保守氨基酸取代”是指不改变其中进行氨基酸取代的蛋白质的相对电荷或大小特征的氨基酸取代。变体可以根据本领域普通技术人员已知的改变多肽序列的方法来制备,例如在汇编这些方法的参考文献中可见的,例如Molecular Cloning:A Laboratory Manual,J.Sambrook,等人编,Second Edition,Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor,New York,1989或Current Protocols in Molecular Biology,F.M.Ausubel,等人编,John Wiley&Sons,Inc.,New York。氨基酸的保守取代包括在以下组内的氨基酸之间进行的取代:(a)M、I、L、V;(b)F、Y、W;(c)K、R、H;(d)A、G;(e)S、T;(f)Q、N;和(g)E、D。
在一些实施方案中,抗δ1抗体可包含与本文所述的示例性抗体的VH CDR相比,单独地或共同地具有为至少80%(例如,85%、90%、95%或98%)序列同一性的重链CDR。替代地或另外,抗δ1抗体可包含与本文所述的示例性抗体的VL CDR相比,单独地或共同地具有为至少80%(例如,85%、90%、95%或98%)序列同一性的轻链CDR。“单独地”是指抗体的一个特定重链或轻链CDR与示例性抗体(例如,本文公开的)的相应重链或轻链CDR共享所描述的序列同一性。“共同地”是指抗体的三个重链或轻链CDR组合与示例性抗体(例如,本文所述的那些)的三个相应的重链或轻链CDR共享所描述的序列同一性。此类抗体还可包含本文所述的重链CDR1、CDR2和CDR3基序中的一个或多个和/或轻链CDR1、CDR2和CDR3基序中的一个或多个,例如本文所述的重链CDR1、CDR2和CDR3基序的全部和/或轻链CDR1、CDR2和CDR3基序的全部。
在一些实施方案中,本文所述的抗δ1抗体可包含与本文所述的示例性抗体的VH具有至少80%(例如,85%、90%、95%或98%)序列同一性的VH。替换地或另外,抗δ1抗体可包含与本文所述的示例性抗体的VL具有至少80%(例如,85%、90%、95%或98%)序列同一性的VL。此类抗体还可包含本文所述的重链CDR1、CDR2和CDR3基序中的一个或多个和/或轻链CDR1、CDR2和CDR3基序中的一个或多个,例如本文所述的重链CDR1、CDR2和CDR3基序的全部和/或轻链CDR1、CDR2和CDR3基序的全部。
两个氨基酸序列的“同一性百分比”是使用Karlin和AltschulProc.Natl.Acad.Sci.USA 87:2264-68,1990的算法,如Karlin和AltschulProc.Natl.Acad.Sci.USA 90:5873-77,1993中修改的那样来确定的。这样的算法并入到Altschul,等人J.Mol.Biol.215:403-10,1990的NBLAST和XBLAST程序(2.0版)中。可以使用XBLAST程序进行BLAST蛋白质搜索,得分=50,字长=3,以获得与目的蛋白质分子同源的氨基酸序列。在两个序列之间存在缺口的情况下,可以如Altschul等人,Nucleic AcidsRes.25(17):3389-3402,1997所述使用缺口BLAST。当使用BLAST和缺口BLAST程序时,可以使用各程序(例如XBLAST和NBLAST)的默认参数。
在一些实施方案中,如本文所述的任何抗δ1抗体的重链还可包含重链恒定区(CH)或其部分(例如,CH1、CH2、CH3或其组合)。重链恒定区可以来自任何合适的来源,例如人、小鼠、大鼠或兔。在一个具体示例中,重链恒定区来自如本文所述的任何IgG亚家族的人IgG(γ重链),例如IgG1。用于调节效应器功能的抗体重链中的几种突变是本领域已知的(例如,如表1中所列和Wang等人,Protein Cell 2018,9(1):63–73中所述,其内容以引用方式全部并入本文)。
按照要包括的特定突变,存在许多已知的突变可用于增强ADCC、ADCP和CDC。我附上一篇综述文章,其中详细说明了所有这些情况(参见表1)。人IgG1重链突变的非限制性示例包括(1)E333A突变(与FcγRIIIa的结合提高,并且ADCC和CDC增强);(2)S239D/A330L/I332E突变(与FcγRIIIa的结合提高,并且ADCC增强);(3)K326W/E333S突变(与C1q的结合提高,并且CDC增强);(4)S239D/I332E/G236A突变(FcγRIIa/FcγRIIb比值增加,并且巨噬细胞吞噬作用增强)。备选地,LALA突变阻止了所有的效应器功能,即基本上是对ADCC、ADCP和CDC的功能。hIgG1的LALA序列包括抑制FcgR结合的两个突变L234A和L235A(EU编号),以及P329G突变(EU编号)以消除补体C1q结合,从而消除所有的免疫效应器功能。IgG4中的示例性突变是hIgG4的Fab臂交换突变体序列,其中包括用以抑制Fab臂交换的突变(S228P;EU编号)。出于制造的目的,可能期望删除以下重链序列中的C-末端赖氨酸(“K”)残基。因此,在一些实施方案中,C-末端赖氨酸(“K”)残基可能不存在于下面给出的每个重链序列中。在一个示例中,恒定区来自人IgG1,下文提供了其示例性的重链氨基酸序列(SEQ ID NO:31)。在一些实施方案中,引入了上文1-4中所述的一个或多个突变。在一些实施方案中,本文描述的抗δ1抗体的重链恒定区可以包含恒定区(如,SEQ ID NO:31、74-77)的单一结构域(如,CH1、CH2或CH3)或任何单一结构域的组合。在一些实施方案中,本文描述的抗体的轻链恒定区可以包含恒定区(如,SEQ ID NO:73)的单一结构域(如,CL)。下面列出了示例性的轻链和重链序列。
示例性的恒定区序列
Igκ型轻链(LC)(SEQ ID NO:73):
TVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
IgG1重链(HC)(SEQ ID NO:31):
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
IgG1重链(HC)LALA(SEQ ID NO:74):
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
IgG4 HC(SEQ ID NO:75):
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
IgG4 HC Fab臂交换突变体(SEQ ID NO:76):
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
hIgG4 HC Fab臂交换突变恒定区(SEQ ID NO:77)
ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
δ1-39,具有Igκ型轻链(LC)(SEQ ID NO:78)
Figure BDA0003238211330000691
δ1-39,具有IgG1重链(HC)(SEQ ID NO:79)
Figure BDA0003238211330000692
δ1-39,具有IgG4 HC(SEQ ID NO:47)
Figure BDA0003238211330000693
δ1-39,具有IgG4 HC Fab臂交换突变体HC(SEQ ID NO:49)
Figure BDA0003238211330000694
Figure BDA0003238211330000701
δ1-39,具有IgG4 HC Fab臂交换突变体(SEQ ID NO:80)
Figure BDA0003238211330000702
在本文描述的任何实施方案中,本公开的抗δ1抗体可以包含具有序列SEQ ID NO:73的轻链恒定区。在本文描述的任何实施方案中,本公开的抗δ1抗体可以包含具有序列SEQID NO:31的重链恒定区。在本文描述的任何实施方案中,本公开的抗δ1抗体可以包含具有序列SEQ ID NO:74的重链恒定区。在本文描述的任何实施方案中,本公开的抗δ1抗体可以包含具有序列SEQ ID NO:75的重链恒定区。在本文描述的任何实施方案中,本公开的抗δ1抗体可以包含具有序列SEQ ID NO:76的重链恒定区。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:78至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的轻链序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:79至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的重链序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:78的轻链序列。在一些实施方案中,抗δ1抗体具有包含SEQ ID NO:79的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:78组成或由SEQ ID NO:78组成的轻链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:79组成或由SEQ ID NO:79组成的重链序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有与SEQ ID NO:78至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的轻链序列,并具有与SEQ ID NO:79至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有包含SEQ ID NO:78的轻链序列,并具有包含SEQ ID NO:79的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有基本上由SEQ ID NO:78组成的轻链序列,并具有基本上由SEQ ID NO:79组成的重链序列。在一些实施方案中,分离的抗体具有由SEQID NO:78组成的轻链序列,并具有由SEQ ID NO:79组成的重链序列。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有重链序列,该重链序列包含具有序列SEQ IDNO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区。在一些实施方案中,抗体具有这样的重链序列,该重链序列与包含具有序列SEQ IDNO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NO:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区的重链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,抗δ1抗体具有轻链序列,该轻链序列包含具有序列SEQ IDNO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区。在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有这样的轻链序列,该轻链序列与包含具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区的轻链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有重链序列,该重链序列包含具有序列SEQID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区。在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有轻链序列,该轻链序列包含具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列,该重链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成,或由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成。在一些实施方案中,分离的抗体具有轻链序列,该轻链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区组成,或由具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区组成。
在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有这样的重链序列,该重链序列与包含具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区的重链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同,并具有这样的轻链序列,该轻链序列与包含具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区的轻链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列和轻链序列,其中该重链序列包含具有序列SEQID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区,该轻链序列包含具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列和轻链序列,其中该重链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成,该轻链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区组成。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列和轻链序列,其中该重链序列由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ IDNOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成,该轻链序列由具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区组成。
在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有重链序列,该重链序列包含具有序列SEQID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区。在一些实施方案中,所述抗体具有这样的重链序列,该重链序列与包含具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区的重链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有轻链序列,该轻链序列包含具有序列SEQID NO:73的恒定区和具有序列SEQ ID NO:9的VL区。在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有这样的轻链序列,该轻链序列与包含具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有序列SEQ IDNO:9的VL区的轻链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。
在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有重链序列,该重链序列包含具有序列SEQID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区。在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有轻链序列,该轻链序列包含具有序列SEQID NO:73的恒定区和具有序列SEQ ID NO:9的VL区。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列,该重链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成,或由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成。在一些实施方案中,这分离的抗体具有轻链序列,该轻链序列基本上由具有序列SEQ IDNO:73的恒定区和具有序列SEQ ID NO:9的VL区组成,或由具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有序列SEQ ID NO:9的VL区组成。
在一些实施方案中,这种抗δ1抗体具有这样的重链序列,该重链序列与包含具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区的重链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同,并具有这样的轻链序列,该轻链序列与包含具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区的轻链序列至少80%或85%(如,至少80%、81%、82%、83%、84%或至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)相同。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列和轻链序列,其中该重链序列包含具有序列SEQID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区,该轻链序列包含具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列和轻链序列,其中该重链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成,该轻链序列基本上由具有序列SEQ ID NO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区组成。在一些实施方案中,分离的抗体具有重链序列和轻链序列,其中该重链序列由具有序列SEQ ID NO:31的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的序列的VH区组成,该轻链序列由具有序列SEQ IDNO:73的恒定区和具有选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的序列的VL区组成。
必要时,本文描述的抗δ1抗体可以包含修饰的恒定区。例如,该抗体可以包含免疫惰性的修饰恒定区,如不触发补体介导的裂解,或不刺激抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)。在其它实施方案中,如Eur.J.Immunol.(1999)29:2613-2624;PCT申请号PCT/GB99/01441;和/或第9809951.8号英国专利申请中所述,对恒定区进行修饰。在其它示例中,本文描述的这抗体可以包含具有增强的ADCC活性的修饰恒定区。相应地,本文描述的抗δ1抗体可以包含改进效应器功能的修饰恒定区,即,改进补体介导的裂解,改进对抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)的刺激。在一些实施方案中,抗体是IgG1分子,并包含上文1-4或Wang等人中所述的一个或多个突变。可以使用第5,500,362号美国专利中公开的方法对ADCC活性进行评估。
本文描述的任何抗δ1抗体可以包含轻链,该轻链进一步包含轻链恒定区,该轻链恒定区可以是本领域中已知的任何CL。在一些示例中,CL是κ型轻链。在其它示例中,CL是λ型轻链。
抗体重链和轻链恒定区在本领域是众所周知的,如在IMGT数据库(www.imgt.org)中或www.vbase2.org/vbstat.php.上提供的恒定区,这二者均通过引用方式并入本文。
抗δ1抗体的制备
如本文描述的能够结合γδTCR的δ-1链的抗体可以通过本领域已知的任何方法制备。例如,参见Harlow和Lane,(1998)Antibodies:A Laboratory Manual,Cold SpringHarbor Laboratory,New York。
在一些实施方案中,可以通过常规的杂交瘤技术制备针对靶抗原(例如,合适的物种如人类的δ-1链或其片段)的特异性抗体。全长靶抗原或其片段,任选地与载体蛋白如KLH偶联,可用于免疫宿主动物以产生与该抗原结合的抗体。如本文进一步描述的,宿主动物的免疫途径和免疫程序通常与用于抗体刺激和产生的确立且常规的技术保持一致。用于生产小鼠抗体、人源化抗体和人类抗体的通用技术在本领域中是已知的,并在本文中进行了描述。涵盖对任何哺乳动物受试者,包括人类或其产生抗体的细胞进行操作,以作为生产哺乳动物,包括人杂交瘤细胞系的基础。通常,以一定量的免疫原,包括如本文描述的免疫原,对宿主动物进行腹膜内、肌内、经口、皮下、足底内和/或皮内接种。
可以使用Kohler,B.和Milstein,C.(1975)Nature 256:495-497的一般体细胞杂交技术或经Buck,D.W.等人,In Vitro,18:377-381(1982)改进的技术从淋巴细胞和永生化骨髓瘤细胞制备杂交瘤。可以将现有的骨髓瘤细胞系,包括但不限于X63-Ag8.653和来自Salk Institute,Cell Distribution Center,San Diego,Calif.,USA的骨髓瘤细胞系用于杂交。一般来说,这种技术涉及使用融合剂如聚乙二醇或通过本领域技术人员熟知的电学手段,将骨髓瘤细胞和淋巴细胞融合。融合后,将细胞从融合培养基中分离出来,并置于选择性生长培养基如次黄嘌呤-氨基喋呤-胸苷(HAT)培养基中生长,以去除未杂交的亲本细胞。本文描述的任何培养基,无论是否补充有血清,都可以用于培养分泌单克隆抗体的杂交瘤。作为细胞融合技术的另一种备选,可以将EBV永生化B细胞用于产生本文所述的抗δ1单克隆抗体。将杂交瘤细胞进行扩增和亚克隆(如果期望的话),并通过常规的免疫测定程序(如,放射免疫测定法、酶免疫测定法或荧光免疫测定法)来测定上清液的抗免疫原活性。
可用作抗体来源的杂交瘤包括产生能够干扰δ1(γδT细胞)活性的单克隆抗体的亲本杂交瘤的所有衍生物、后代细胞。可以使用已知的程序将产生这类抗体的杂交瘤在体外或体内生长。如果期望,可以通过常规的免疫球蛋白纯化程序,如硫酸铵沉淀、凝胶电泳、透析、层析和超滤,将单克隆抗体从培养基或体液中分离出来。如果存在不期望的活性,可以通过以下方法去除,例如,将制剂运行通过由附着于固定相的免疫原制成的吸附剂,并从免疫原上洗脱或释放所需的抗体。用使用双官能或衍生化剂(例如马来酰亚胺基苯甲酰磺基琥珀酰亚胺酯(通过半胱氨酸残基缀合)、N-羟基琥珀酰亚胺(通过赖氨酸残基缀合)、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl或R1N=C=NR,其中R和R1是不同的烷基)缀合于在待免疫物种中免疫原性的蛋白质(如匙孔血蓝蛋白、血清白蛋白、牛甲状腺球蛋白或大豆胰蛋白酶抑制剂)的靶抗原或含有靶氨基酸序列的片段免疫宿主动物可以得到抗体(如单克隆抗体)的群体。
如果期望,可以对感兴趣的抗体(单克隆或多克隆)(如,由杂交瘤产生)进行测序,然后将多核苷酸序列克隆到载体中进行表达或扩增。编码感兴趣抗体的序列可以保持在宿主细胞的载体中,然后可以将该宿主细胞进行扩增和冷冻,以备将来使用。在一种备选中,可以将多核苷酸序列用于基因操作,以对该抗体进行“人源化”或改进抗体的亲和力(亲和力成熟)或其它特性。例如,如果将抗体用于人体临床试验和治疗,可以将恒定区工程化改造成更类似于人的恒定区,以避免免疫应答。可能需要对抗体序列进行基因操作,以获得对靶抗原的更高亲和力,并以更大功效抑制靶γδ1 TCR的活性(从而抑制靶γδT细胞的活性)。对本领域技术人员来说明显的是,可以对抗体进行一种或多种多核苷酸改变,并且仍然保持其对靶抗原的结合特异性。
在其它实施方案中,全人抗体可以通过使用商购小鼠来获得,这些小鼠已经被工程化改造成表达特定的人类免疫球蛋白。经设计用于产生更期望(如,全人抗体)或更强大的免疫应答的转基因动物也可用于产生人源化或人抗体。此类技术的示例为来自Amgen,Inc.(Fremont,Calif.)的XenomouseRTM以及来自Medarex,Inc.(Princeton,N.J.)的HuMAb-MouseRTM和TC MouseTM。在另一备选中,抗体可以通过噬菌体展示或酵母技术重组制备。例如,参见第5,565,332号;第5,580,717号;第5,733,743号;和第6,265,150号美国专利;以及Winter等人,(1994)Annu.Rev.Immunol.12:433-455。或者,可以将噬菌体展示技术(McCafferty等人,(1990)Nature 348:552-553)用于在体外从来自未免疫供体的免疫球蛋白可变(V)结构域基因储库中产生人抗体和抗体片段。
备选地,可以通过常规操作从合适的抗体库中分离出能够结合如本文所述的靶抗原的抗体。按照本领域已知的常规选择过程,可以将包含多种抗体组分的抗体库用于鉴定与特定靶抗原(如,在这种情况下的δ-1链的表位)结合的抗体。在选择过程中,可以用靶抗原或其片段来探测抗体库,并且可以分离能够与靶抗原结合的抗体库成员,通常通过在支持物上保留来进行。这种筛选过程可以进行多轮(如,包括阳性和阴性选择),以丰富能够与靶抗原结合的抗体池。然后,可以将富集池的个体克隆分离出来并进一步表征,以鉴定那些具有所需结合活性和生物活性的克隆。还可以通过常规方法学来确定重链和轻链可变结构域的序列。
有许多本领域已知的常规方法来鉴定和分离能够与本文所述的靶抗原结合的抗体,包括噬菌体展示、酵母展示、核糖体展示或哺乳动物展示技术。
作为示例,噬菌体展示通常使用共价键将蛋白质(如,抗体)组分与噬菌体外壳蛋白结合。这种连接是由编码与外壳蛋白融合的抗体组分的核酸的翻译生成的。这种连接可以包括柔性肽接头、蛋白酶位点或由于终止密码子的抑制而并入的氨基酸。噬菌体展示描述于例如,第5,223,409号美国专利;Smith(1985)Science 228:1315-1317;WO 92/18619;WO 91/17271;WO 92/20791;WO 92/15679;WO 93/01288;WO 92/01047;WO 92/09690;WO90/02809;de Haard等人(1999)J.Biol.Chem 274:18218-30;Hoogenboom等人(1998)Immunotechnology 4:1-20;Hoogenboom等人(2000)Immunol Today2:371-8以及Hoet等人(2005)Nat Biotechnol.23(3)344-8。展示蛋白质组分的噬菌体可以使用标准的噬菌体制备方法进行培养和收获,如,从生长培养基中进行PEG沉淀。在选择单个展示噬菌体后,编码选定蛋白质组分的核酸可以从经选定噬菌体感染的细胞中或从噬菌体本身中分离出来(在扩增后)。可以选择单个的菌落或菌斑,然后可以对核酸进行分离并测序。
其它的展示形式包括基于细胞的展示(如参见,WO 03/029456),蛋白质-核酸融合(如参见,第6,207,446号美国专利),核糖体展示(如参见,Mattheakis等人(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91:9022和Hanes等人(2000)Nat Biotechnol.18:1287-92;Hanes等人(2000)Methods Enzymol.328:404-30;和Schaffitzel等人(1999)J ImmunolMethods.231(1-2):119-35),和大肠杆菌周质展示(J Immunol Methods.2005年11月22日;PMID:16337958),以及酵母展示(Feldhaus等人,Nat Biotechnol.2003;21:163-70)。在根据与靶抗原的结合分离出展示库成员后,还可以测试每种分离的库成员与非靶分子结合的能力,以评估其结合特异性。非靶分子的示例包括磁珠上的链霉亲和素、封闭剂如牛血清白蛋白、无脂肪牛乳、大豆蛋白、任何捕获性或固定靶标的单克隆抗体,或不表达靶标的非转染细胞。例如,可以使用高通量ELISA筛选来获得数据。ELISA筛选还可以用来获得每种库成员与靶标结合以及与相关靶标或靶抗原亚基的跨物种反应性的定量数据。对非靶标和靶标结合数据进行比较(如,使用计算机和软件),以鉴定与靶标特异性结合的库成员。
在选定与靶标结合的候选库成员后,可以进一步分析每种候选库成员,如,以进一步表征其对靶标如δ1链(在本文中被称为δ1)的结合特性。每种候选库成员都可以进行一次或多次次级筛选测定。该测定可以针对结合特性、催化特性、抑制特性、生理特性(如,细胞毒性、肾清除率、免疫原性)、结构特性(如,稳定性、构象、寡聚化状态)或其它功能特性。相同的测定可以重复使用但条件不同,例如用以测定pH、离子或热敏感性。
在适当的情况下,测定可以直接使用展示库成员、由编码选定多肽的核酸产生的重组多肽或基于选定多肽的序列而合成的合成肽。对于选定的Fab,可以对Fab进行评估或者可以对其进行修饰并作为完整的IgG蛋白产生。下文描述了针对结合特性的示例性测定。
结合蛋白还可以使用ELISA测定法进行评估。例如,将每种蛋白质与微孔板接触,该微孔板的底面已经用靶标(如限定量的靶标)包被。用缓冲液洗涤板以除去非特异性结合的多肽。然后,通过采用可识别结合蛋白(如标签或结合蛋白的恒定部分)的抗体来探测板以确定板上与靶标结合的结合蛋白的量。该抗体连接于检测系统(例如,当提供合适的底物时产生比色产物的酶,如碱性磷酸酶或辣根过氧化物酶(HRP))。
备选地,可以使用均相测定法对本文所述的结合蛋白结合靶抗原的能力进行分析,即,在加入测定法的所有成分后,不再需要额外的液体操作。例如,可以将荧光共振能量转移(FRET)用作均相测定法(如参见,Lakowicz等人,第5,631,169号美国专利;Stavrianopoulos等人,第4,868,103号美国专利)。选定第一分子(如,在级分中鉴定的分子)上的荧光团标记物,使得如果第二分子(如,靶标)在第一分子附近时,其发射的荧光能量可被第二分子上的荧光标记物吸收。第二分子上的荧光标记物在吸收转移的能量时发出荧光。由于标记物之间能量转移的效率与分子之间分开的距离有关,因此可以评估分子之间的空间关系。在分子之间发生结合的情况下,测定法中“接受体”分子标记物的荧光发射应该是最大的。可以通过标准的荧光计量检测手段(如,使用荧光计)方便地测量配置为通过FRET监测的结合事件。通过滴定第一或第二结合分子的量,可以生成结合曲线来估算平衡结合常数。
表面等离子共振(SPR)可用于分析结合蛋白和靶抗原的相互作用。SPR或生物分子相互作用分析(BIA)实时检测生物特异性相互作用,而不用标记任何相互作用物。BIA芯片的结合表面处的质量变化(表明发生了结合事件)引起表面附近的光的折射率改变(SPR的光学现象)。折射率的变化产生可检测的信号,将该信号作为生物分子之间实时反应的指标进行测量。使用SPR的方法描述于例如,第5,641,640号美国专利;Raether,1988,SurfacePlasmons Springer Verlag;Sjolander和Urbaniczky,1991,Anal.Chem.63:2338-2345;Szabo等人,1995,Curr.Opin.Struct.Biol.5:699-705以及由BIAcore International AB(Uppsala,Sweden)提供的在线资源。
来自SPR的信息可用于提供结合蛋白与靶标结合的平衡解离常数(KD)和动力学参数(包括Kon和Koff)的精确和定量量度。此类数据可以用来比较不同的生物分子。例如,可以比较从表达库中选定的蛋白质,以鉴定对靶标具有高亲和力或具有慢Koff的蛋白质。该信息还可以用来建立结构-活性关系(SAR)。例如,可以将亲本蛋白质的成熟型的动力学和平衡结合参数与亲本蛋白质的参数进行比较。可以鉴定出在给定位置上的变异氨基酸与特定的结合参数如高亲和力和慢Koff相关。该信息可以与结构建模(如,采用同源建模、能量最小化,或通过X射线晶体学或NMR确定结构)相结合。因此,可以系统地阐述对蛋白质和其靶标之间的物理相互作用的理解,并用于指导其它设计过程。
作为另一示例,可使用细胞测定法。可以根据与细胞结合的能力来筛选结合蛋白,该细胞在细胞表面瞬时或稳定地表达并展示感兴趣的靶标。例如,可以对δ1结合蛋白进行荧光标记,然后使用流式细胞仪(如,FACS仪器)通过荧光强度的变化来检测存在或不存在拮抗性抗体的情况下与δ1的结合。
完整抗体(全长抗体)的抗原结合片段可以经由常规方法制备。例如,F(ab')2片段可以通过胃蛋白酶消化抗体分子产生,而Fab片段可以通过还原F(ab')2片段的二硫桥生成。
可以经由如常规重组技术产生基因工程抗体,例如人源化抗体、嵌合抗体、单链抗体和双特异性抗体。在一个示例中,使用常规程序(如,通过使用能够特异性结合编码单克隆抗体的重链和轻链的基因的寡核苷酸探针),可以容易地分离和测序编码对靶抗原特异性的单克隆抗体的DNA。一旦分离出来,可以将DNA置于一个或多个表达载体中,然后将其转染到宿主细胞如大肠杆菌细胞、猿猴COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或不以其它方式产生免疫球蛋白的骨髓瘤细胞中,以在重组宿主细胞中获得单克隆抗体的合成。参见例如,PCT公布号WO 87/04462。然后,例如可以通过以人重链和轻链恒定结构域的编码序列来替换同源的鼠类序列,Morrison等人,(1984)Proc.Nat.Acad.Sci.81:6851,或通过将免疫球蛋白的编码序列与非免疫球蛋白多肽的全部或部分编码序列共价连接,来对DNA进行修饰。通过这种方式,可以制备具有对靶抗原结合特异性的基因工程化抗体,如“嵌合”或“杂合”抗体。
为生产“嵌合抗体”而开发的技术在本领域是众所周知的。例如,参见Morrison等人(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81,6851;Neuberger等人(1984)Nature 312,604;和Takeda等人(1984)Nature 314:452。
用于构建人源化抗体的方法在本领域也是众所周知的。例如,参见Queen等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,86:10029-10033(1989)。在一个示例中,按照本领域已知的方法,对亲本非人抗体的VH和VL可变区进行三维分子建模分析。接着,利用同样的分子建模分析,鉴定了经预测为对形成正确的CDR结构很重要的框架氨基酸残基。同时,使用亲本VH和VL序列作为搜索查询,从任何抗体基因数据库中鉴定具有与亲本非人抗体的氨基酸序列同源的氨基酸序列的人VH和VL链。然后,选定人VH和VL接受体基因。
选定的人接受体基因内的CDR区可以用来自亲本非人抗体的CDR区或其功能性变体替换。必要时,经预测在与CDR区相互作用中很重要的亲本链框架区内的残基(参见上文描述)可用于替代人接受体基因中的相应残基。
可以经由重组技术将编码重链可变区的核苷酸序列和编码轻链可变区的核苷酸序列连接起来以制备单链抗体。优选地,在两个可变区之间加入柔性接头。或者,所描述的用于生产单链抗体的技术(第4,946,778号和第4,704,692号美国专利)可以适应于生产噬菌体或酵母scFv库,并且可以按照常规程序从该库中鉴定出对δ1特异性的scFv克隆。可以对阳性克隆进行进一步筛选,以鉴定那些抑制γδT细胞活性的克隆。
在一些示例中,本文描述的任何抗δ1抗体可以是双特异性或三特异性抗体的结合部分。在其它示例中,可以将任何抗δ1抗体用于构建嵌合抗原受体(CAR),该受体可在免疫细胞如T细胞上表达。包含抗δ1抗体的任何双特异性抗体或CAR-T细胞也在本公开的范围内。
按照本领域已知的方法获得并在本文中描述的抗体可以使用本领域众所周知的方法进行表征。例如,一种方法是鉴定抗原结合的表位,或称为“表位作图”。本领域中有许多已知的方法用来鉴定和表征蛋白质上表位的定位,包括解析抗体-抗原复合物的晶体结构、竞争性测定法、基因片段表达测定法和基于合成肽的测定法,如例如Harlow和Lane,Using Antibodies,a Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor,N.Y.,1999的第11章中描述的。在另一示例中,可以将表位作图用于确定抗体结合的序列。这种表位可以是线性表位,即包含在单区段氨基酸中,或者是由氨基酸的三维相互作用形成的构象表位,该构象表位不一定包含在单区段氨基酸(一级结构线性序列)中。可以分离或合成(如,重组)不同长度的肽(如,至少4-6个氨基酸长),并将其用于与抗体的结合测定。在另一示例中,抗体结合的表位可以在系统筛选中通过使用源自靶抗原序列的重叠肽并确定抗体的结合来确定。根据基因片段表达测定法,编码靶抗原的开放阅读框随机地或通过特定的基因构建进行片段化,并测定抗原的表达片段与待测抗体的反应性。基因片段可以通过例如PCR产生,然后在放射性氨基酸的存在下,在体外转录并翻译成蛋白质。接下来,通过免疫沉淀和凝胶电泳确定抗体与放射性标记的抗原片段的结合。某些表位也可以通过使用展示在噬菌体颗粒表面的大容量随机肽序列库(噬菌体库)来鉴定。备选地,可以在简单的结合测定中测试重叠肽片段所定义的库与待测抗体的结合。在另一示例中,可以进行抗原结合结构域的诱变、结构域交换实验和丙氨酸扫描诱变,以鉴定表位结合所需的、足够的和/或必需的残基。例如,可以使用靶抗原的突变体进行结构域交换实验,其中δ1多肽的各种片段已经被来自密切相关但抗原性不同的蛋白质(如,可溶性β-半乳糖苷结合性凝集素家族的另一成员)的序列替换(交换)。通过评估抗体与突变体δ1的结合,就可以评估特定抗原片段对抗体结合的重要性。
备选地,可以使用已知与相同抗原结合的其它抗体进行竞争性测定法,以确定抗体是否与其它抗体结合相同的表位。竞争性测定法是本领域技术人员所熟知的。
在一些示例中,抗δ1抗体通过如下文所例示的重组技术制备。
可以将编码如本文所述的抗δ1抗体的重链和轻链的核酸克隆到一个表达载体中,每个核苷酸序列可操作地连接至合适的启动子。在一个示例中,将编码重链和轻链的核苷酸序列各自可操作地连接至不同的启动子。可选地,可以将编码重链和轻链的核苷酸序列与单一启动子可操作地连接,使得重链和轻链都从同一启动子表达。必要时,可以在重链和轻链编码序列之间插入内部核糖体进入位点(IRES)。
在一些示例中,将编码抗体两条链的核苷酸序列克隆到两种载体中,可以将这两种载体导入相同或不同的细胞中。当这两条链在不同的细胞中表达时,可以从表达这种链的宿主细胞中分离出它们中的每一条,然后可以将分离出的重链和轻链进行混合并在适当的条件下孵育,从而形成抗体。
通常,可以使用本领域已知的方法将编码抗体的一条或所有链的核酸序列克隆到合适的表达载体中,与合适的启动子可操作地连接。例如,可以将核苷酸序列和载体在适当的条件下与限制性酶接触,以在每个分子上产生互补的末端,这些末端可以相互配对并通过连接酶连接在一起。备选地,可以将合成的核酸接头连接到基因的末端。这些合成的接头含有对应于载体中特定限制性位点的核酸序列。表达载体/启动子的选择将取决于用于产生抗体的宿主细胞的类型。
可以将多种启动子用于表达本文所述的抗体,包括但不限于巨细胞病毒(CMV)即刻早期启动子、病毒LTR(如,劳斯肉瘤病毒LTR、HIV-LTR、HTLV-1LTR)、猿猴病毒40(SV40)早期启动子、大肠杆菌lac UV5启动子,以及单纯疱疹tk病毒启动子。
还可以使用可调控启动子。这类可调控启动子包括那些使用来自大肠杆菌的lac阻遏物作为转录调控子来调节从携带lac操纵基因的哺乳动物细胞启动子的转录的启动子[Brown,M.等人,Cell,49:603-612(1987)],那些使用四环素阻遏物(tetR)的启动子[Gossen,M.和Bujard,H.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:5547-5551(1992);Yao,F.等人,Human Gene Therapy,9:1939-1950(1998);Shockelt,P.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,92:6522-6526(1995)]。其它系统包括FK506二聚体,VP16或p65,使用雌二醇(astradiol),RU486,联苯酚米乐甾酮(diphenol murislerone)或雷帕霉素(rapamycin)。诱导性系统可从Invitrogen、Clontech和Ariad获取。
可以使用包含带有操纵子的阻遏物的可调控启动子。在一个实施方案中,来自大肠杆菌的lac阻遏物可以作为转录调控子来调节从携带lac操纵基因的哺乳动物细胞启动子的转录[M.Brown等人,Cell,49:603-612(1987)];Gossen和Bujard(1992);[M.Gossen等人,Natl.Acad.Sci.USA,89:5547-5551(1992)]将四环素阻遏物(tetR)与转录激活子(VP16)组合以生成tetR-哺乳动物细胞转录激活子融合蛋白,即tTa(tetR-VP 16),具有源自人巨细胞病毒(hCMV)主要即刻早期启动子的携带tetO的最小启动子,以生成tetR-tet操纵基因系统来控制在哺乳动物细胞中的基因表达。在一个实施方案中,使用了四环素诱导性开关。当四环素操纵基因适当地定位于CMVIE启动子的TATA元件下游时,四环素阻遏物(tetR)本身而非tetR-哺乳动物细胞转录因子融合衍生物可以作为强效反式调控子来调节在哺乳动物细胞中的基因表达(Yao等人,Human Gene Therapy,10(16):1392-1399(2003))。这种四环素诱导性开关的一个特别的优势是其不需要使用四环素阻遏物-哺乳动物细胞反式激活子或阻遏物融合蛋白(在某些情况下可能对细胞有毒)来实现其可调控作用(Gossen等人,Natl.Acad.Sci.USA,89:5547-5551(1992);Shockett等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,92:6522-6526(1995))。
此外,载体可以包含例如下列中的一些或全部:选择性标志基因,如用于在哺乳动物细胞中选择稳定或瞬时转染子的新霉素基因;用于高水平转录的来自人CMV的即刻早期基因的增强子/启动子序列;用于mRNA稳定的来自SV40的转录终止和RNA加工信号;用于适当的附加型复制的SV40多瘤病毒复制起点和ColE1;内部核糖体结合位点(IRES)、通用多克隆位点;以及用于正义和反义RNA的体外转录的T7和SP6 RNA启动子。用于产生含有转基因的载体的合适载体和方法是本领域熟知并且可获取的。
可用于实践本文描述的方法的多腺苷酸化信号的示例包括但不限于人I型胶原蛋白多腺苷酸化信号、人II型胶原蛋白多腺苷酸化信号和SV40多腺苷酸化信号。
可以将一种或多种包含编码任何抗体的核酸的载体(如,表达载体)导入适当的宿主细胞以产生抗体。可以在适当的条件下培养宿主细胞以用于表达抗体或其任何多肽链。可以经由常规方法如亲和纯化,通过培养的细胞(如,从细胞或培养上清液)回收这种抗体或其多肽链。如有必要,可以在适当的条件下对抗体的多肽链进行孵育并持续合适的时间,从而产生抗体。
在一些实施方案中,用于制备本文描述的抗体的方法涉及重组表达载体,其编码抗δ1抗体的重链和轻链两者,如本文还描述的。可以通过常规方法如磷酸钙介导的转染将重组表达载体导入到合适的宿主细胞(如,dhfr-CHO细胞)中。可以选择阳性转化子宿主细胞并在适当条件下培养,以表达形成抗体的两条多肽链,其可以从细胞或从培养基中回收。在必要的时候,可以在适当的条件下对从宿主细胞回收的两条链进行孵育,以便形成抗体。
在一个示例中,提供了两种重组表达载体,一种编码抗δ1抗体的重链,另一种编码抗δ1抗体的轻链。可以通过常规方法如磷酸钙介导的转染将这两种重组表达载体都导入到合适的宿主细胞(如,dhfr-CHO细胞)中。备选地,可以将每种表达载体导入到合适的宿主细胞中。可以选择阳性转化子并在适当条件下培养,以表达抗体的多肽链。当将这两种表达载体导入到相同的宿主细胞中时,可以从宿主细胞或从培养基中回收其中产生的抗体。如有必要,可以从宿主细胞或从培养基中回收多肽链,然后在适当的条件下进行孵育,从而形成抗体。当将这两种表达载体导入到不同的宿主细胞中时,可以从相应的宿主细胞或从相应的培养基中回收这两条多肽链中的每条链。然后可以在适当的条件下对两条多肽链进行孵育以用于形成抗体。
使用标准的分子生物学技术来制备重组表达载体、转染宿主细胞、选择转化子、培养宿主细胞并从培养基中回收抗体。例如,可以使用蛋白A或蛋白G偶联基质通过亲和层析来分离一些抗体。
编码如本文描述的抗δ1抗体的重链、轻链或这两条链的任何核酸,含有这类核酸的载体(如,表达载体);以及包含这些载体的宿主细胞都在本公开的范围内。
如此制备的抗δ1抗体可以使用本领域已知的方法进行表征,据此检测和/或测量γδT细胞生物活性的降低、改善或中和。例如,ELISA型测定法可适用于定性或定量测量γδT细胞对αβT细胞激活的抑制或缺乏这种抑制。
抗δ1抗体的生物活性可以通过将候选抗体与受刺激的常规(αβ)T细胞和分离的γδT细胞一起孵育,并监测以下任何一个或多个特征来验证:(a)候选抗体和γδT细胞之间的结合;(b)随后T细胞激活标志物水平的升高;(c)预防、改善或治疗实体瘤的任何方面;(c)阻断或降低γδT细胞的激活;以及(d)抑制(减少)γδT细胞的合成、产生或释放,(e)降低或消耗γδT细胞水平。
因此,在一个方面中,本公开提供了编码或共同编码本文公开的任何抗δ1抗体的分离的一种核酸或一组核酸。在某些情况下,抗体的重链和轻链由两个分别的核酸分子(一组核酸)编码。在其它情况下,抗体的重链和轻链由一种核酸分子编码,这种核酸分子可以是多顺反子形式,或者在不同启动子的控制下。相应地,在一个方面中,本公开提供了分离的核酸分子,其包含编码本文描述的抗δ1抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的一种或多种核酸序列。在一些实施方案中,该核酸分子包含一种或多种编码本文描述的抗δ1抗体的重链可变区(VH)的核酸序列。备选地或另外地,在一些实施方案中,该核酸分子包含一种或多种编码本文描述的抗δ1抗体的轻链可变区(VL)的核酸序列。
在一些实施方案中,分离的核酸编码结合δ1(而与γ链无关)的抗体。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码全长抗体或其抗原结合片段的VH和/或VL的一种或多种核酸序列。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码单链抗体的VH和/或VL区的一种或多种核酸序列。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码人类抗体或人源化抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码IgG分子,如IgG1分子的VH和/或VL的一种或多种核酸序列。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,该抗体包含如SEQ ID NO:31所示的HC恒定区和/或如SEQ ID NO:71所示的轻链恒定区。
在一些实施方案中,分离的核酸包含一种或多种编码抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:选自SEQ ID NOs:52、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列中所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQID NO:56或58所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如选自SEQ ID NO:83、84、85、86、87、57、88、89、90、91、92、59和60的序列所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
在一些实施方案中,分离的核酸包含一种或多种编码抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:选自SEQ ID NOs:5 61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列中所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
在一些实施方案中,分离的核酸包含一种或多种编码抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如SEQ IDNO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH的一种或多种核酸序列,该抗体包含选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的VH和/或VL和/或选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的VL。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH的一种或多种核酸序列,该抗体包含选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的VH和/或VL和/或SEQ ID NO:9中所示的VL。
在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,该抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和/或VL和/或如SEQ ID NO:9所示的VL。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,该抗体包含如SEQ ID NO:55所示的VH和/或VL和/或如SEQ ID NO:54所示的VL。
在一些实施方案中,一种或多种核酸序列编码抗体的VH和/或VL,该抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL,以及如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:71所示的轻链恒定区。在一些实施方案中,一种或多种核酸序列编码抗体的VH和/或VL,该抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。在一些实施方案中,一种或多种核酸序列编码δ1-39的VH和/或VL。
在一些实施方案中,分离的核酸包含一种或多种编码抗体的重链和/或轻链的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:由选自SEQ ID NOs:52、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列中所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ IDNO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:56或58所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如选自SEQ ID NO:83、84、85、86、87、57、88、89、90、91、92、59和60的序列所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
在一些实施方案中,分离的核酸包含一种或多种编码抗体的重链和/或轻链的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:由选自SEQ ID NOs:5 61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71和72的序列中所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ IDNO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
在一些实施方案中,分离的核酸包含一种或多种编码抗体的重链和/或轻链的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的重链的一种或多种核酸序列,该抗体包含选自SEQ ID NOs:3、17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的VH和/或VL和/或选自SEQ ID NOs:4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、2、16和9的轻链。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的重链的一种或多种核酸序列,该抗体包含选自SEQ ID NOs:17、18、19、20、21、22、23、24、25、43、44和45的VH和/或VL和/或SEQID NO:9中所示的轻链。
在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的重链和/或轻链的一种或多种核酸序列,该抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和/或VL和/或如SEQ ID NO:9所示的VL。在本文描述的一些核酸实施方案中,核酸分子包含编码抗体的重链和/或轻链的一种或多种核酸序列,该抗体包含如SEQ ID NO:55所示的VH和/或VL和/或如SEQ ID NO:54所示的VL。
在一些实施方案中,一种或多种核酸序列编码抗体的重链和/或轻链,该抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL,以及如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:71所示的轻链恒定区。在一些实施方案中,一种或多种核酸序列编码抗体的重链和/或轻链,该抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。在一些实施方案中,一种或多种核酸序列编码δ1-39的重链和/或轻链。
本文描述的任何分离的核酸都适合克隆到载体中。在一些实施方案中,载体是表达载体。在一些实施方案中,载体包含分离的核酸,该核酸包含一种或多种编码抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的核酸序列,该抗体结合γ/δT细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3)和/或包含如SEQID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1),如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2),和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。在一些实施方案中,载体包含编码VH的分离的核酸。在一些实施方案中,载体包含编码VL的分离的核酸。在一些实施方案中,载体包含同时编码VL和VH的分离的核酸。本公开中还涵盖包含本文描述的任何分离的核酸或载体,包括但不限于例如在本段落中描述的载体或核酸的组合物。本公开中还涵盖包含本文描述的任何分离的核酸或载体,包括但不限于在本段落中描述的载体和核酸的宿主细胞。在一些实施方案中,宿主细胞选自由大肠杆菌细胞、猿猴COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞组成的组。
本文还提供了产生本文描述的结合人δ-1的抗体或其抗原结合片段的方法,包括在宿主细胞中表达一种或多种本文描述的核酸分子(包括但不限于上一段中所述的那些核酸分子),从而产生抗体。在一个实施方案中,产生结合人半乳糖凝集素-9(Galectin-9)的单克隆抗体或其抗原结合片段的方法包括(i)在允许表达抗δ1抗体的条件下培养宿主细胞;并(ii)从细胞培养物中收获由此产生的抗δ1抗体。还涵盖根据这种方法产生的抗体。
药物组合物及其用途
本公开提供了包含本文描述的抗δ1抗体的药物组合物及其用于抑制由γδ1 T细胞介导的信号传导或抑制由γδ1 T细胞介导的活性,和/或消除δ1阳性细胞的用途。此类抗体可用于治疗与激活的γδ1 T细胞相关的疾病,或用于确定生物样品中γδT细胞的存在/水平。
药物组合物
如本文所述的抗体,以及编码核酸或核酸组、包含这些核酸的载体或包含这些载体的宿主细胞可以与药学上可接受的载体(赋形剂)混合,以形成用于治疗靶向疾病的药物组合物。“可接受的”意味着载体必须与组合物的活性成分相容(并且优选地,能够稳定活性成分),而对接受治疗的受试者无害。药学上可接受的赋形剂(载体)包含本领域中熟知的缓冲剂。例如,参见Remington:The Science and Practice of Pharmacy第20版(2000)Lippincott Williams和Wilkins,编K.E.Hoover。
用于本发明的方法中的药物组合物可以包含冻干制剂或水溶液形式的药学上可接受的载体、赋形剂或稳定剂。(Remington:The Science and Practice of Pharmacy第20版(2000)Lippincott Williams和Wilkins,编者K.E.Hoover)。可接受的载体、赋形剂或稳定剂在使用的剂量和浓度对接受者无毒,并且可以包括:缓冲剂,如磷酸盐、柠檬酸盐和其它有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸和甲硫氨酸;防腐剂(如,十八烷基二甲基苄基氯化铵;氯化六甲双铵;苯扎氯铵、苄索氯铵;苯酚、丁醇或苯甲醇;烷基对羟基苯甲酸酯类,如甲基或丙基对羟基苯甲酸酯;邻苯二酚;间苯二酚;环己醇;3-戊醇;以及间甲酚);低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、精氨酸或赖氨酸;单糖、双糖和其它碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或葡聚糖;螯合剂,如EDTA;糖,如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨醇;成盐反离子,如钠;金属络合物(如,Zn-蛋白络合物);和/或非离子表面活性剂,如TWEENTM、PLURONICSTM或聚乙二醇(PEG)。
在一些示例中,本文描述的药物组合物包括含有抗体(或编码核酸)的脂质体,其可通过本领域已知的方法制备,例如描述于Epstein等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3688(1985);Hwang等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4030(1980);以及第4,485,045号和第4,544,545号美国专利。第5,013,556号美国专利中公开了具有延长的循环时间的脂质体。可以采用包含磷脂酰胆碱、胆固醇和PEG衍生化磷脂酰乙醇胺(PEG-PE)的脂质组合物通过反相蒸发法来生成特别有用的脂质体。通过限定孔径的过滤器将脂质体挤出,以产生具有所需直径的脂质体。
还可以将抗体或编码核酸(一种或多种)包封于例如通过凝聚技术或通过界面聚合制备的微胶囊(例如,分别是羟甲基纤维素或明胶微胶囊和聚(甲基丙烯酸甲酯)微胶囊)中、胶态药物递送系统(如,脂质体、白蛋白微球、微乳剂、纳米颗粒和纳米胶囊)中、或粗乳液中。这类技术是本领域已知的,例如参见Remington,The Science and Practice ofPharmacy第20版Mack Publishing(2000)。
在其它示例中,本文所述的药物组合物可以以缓释形式配制。缓释制剂的合适示例包括含有抗体的固体疏水性聚合物的半透性基质,该基质为成型制品的形式,如薄膜或微胶囊。缓释基质的示例包括聚酯、水凝胶(例如,聚(2-羟乙基-甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇))、聚丙交酯(第3,773,919号美国专利)、L-谷氨酸和7-乙基-L-谷氨酸酯的共聚物、不可降解的乙烯-乙酸乙烯酯、可降解的乳酸-乙醇酸共聚物,如LUPRON DEPOTTM(由乳酸-乙醇酸共聚物和醋酸亮丙瑞林组成的可注射微球)、乙酸异丁酸蔗糖酯和聚-D-(-)-3-羟基丁酸。
用于体内施用的药物组合物必须是无菌的。这很容易通过例如无菌过滤膜进行过滤来实现。通常将治疗性抗体组合物置于具有无菌接入口的容器中,例如静脉注射液袋或具有可经皮下注射针刺穿的塞子的小瓶。
本文描述的药物组合物可以是单位剂型,如片剂、丸剂、胶囊剂、粉剂、颗粒剂、溶液剂或混悬剂、或栓剂,以用于经口、胃肠外或直肠施用,或者通过吸入或吹入施用。
为了制备固体组合物如片剂,可以将主要活性成分与药物载体(例如,常规压片成分如玉米淀粉、乳糖、蔗糖、山梨醇、滑石、硬脂酸、硬脂酸镁、磷酸二钙或树胶)以及其它药物稀释剂(如,水)混合,以形成含有本发明的化合物或其药学上可接受的无毒盐的均质混合物的固体预配制组合物。当将这些预配制组合物称为均质时,这就意味着活性成分均匀地分散在整个组合物中,使得可以容易地将组合物细分成等效的单位剂型,如片剂、丸剂和胶囊剂。然后将这种固体预配制组合物细分为上述类型的单位剂型,该单位剂型含有0.1至约500mg本发明的活性成分。这种新型组合物的片剂或丸剂可以经包衣或以其它方式复合配制,以提供具有长效作用优势的剂型。例如,片剂或丸剂可以包含内剂量组分和外剂量组分,后者以包膜的形式覆盖在前者之上。这两种组分可以通过肠溶层隔开,该肠溶层用于抵抗在胃中的崩解,并允许内组分完整地进入十二指肠或延迟释放。多种材料可以用于这种肠溶层或包衣,这类材料包括一些聚合酸以及聚合酸与虫胶、十六醇和乙酸纤维素等材料的混合物。
适当的表面活性剂尤其包括非离子剂,例如聚氧乙烯山梨聚糖(如,TweenTM 20、40、60、80或85)和其它山梨聚糖(如,SpanTM 20、40、60、80或85)。含有表面活性剂的组合物将方便地包含0.05%至5%的表面活性剂,并且可以是0.1%至2.5%。应当理解,如有必要,还可以加入其它成分,例如甘露醇或其它药学上可接受的媒介物。
可以使用可商购的脂肪乳剂如IntralipidTM、LiposynTM、InfonutrolTM、LipofundinTM和LipiphysanTM,来制备适当的乳剂。可以将活性成分溶解在预混合的乳剂组合物中,或者活性成分还可以溶解在油(如,大豆油、红花油、棉籽油、芝麻油、玉米油或杏仁油)中以及在与磷脂(如,蛋磷脂、大豆磷脂或大豆卵磷脂)和水混合后形成的乳剂中。应当理解,还可以加入其它成分,例如甘油或葡萄糖,以调整乳剂的张力。合适的乳剂通常含有高达20%的油,例如5%至20%。
乳剂组合物可以是通过将抗体与IntralipidTM或其组分(大豆油、蛋磷脂、甘油和水)混合而制备的那些乳剂组合物。
用于吸入或吹入的药物组合物包括在药学上可接受的水性或有机溶剂中的溶液和混悬剂,或其混合物以及粉剂。液体或固体组合物可以含有如上所述的适当的药学上可接受的赋形剂。在一些实施方案中,通过经口或鼻腔呼吸途径施用组合物,以产生局部或全身作用。
可以通过使用气体来雾化优选无菌的药学上可接受的溶剂中的组合物。可以直接从雾化装置中吸入雾化溶液,或者可以将雾化装置连接到面罩、面帐或间歇式正压呼吸机。可以从以适当方式递送制剂的装置中施用溶液、混悬剂或粉剂组合物,优选地通过经口或鼻腔施用。
治疗性应用
本公开提供了包含本文描述的至少一种抗δ1抗体或其抗原结合片段的药物组合物以及这类组合物用于抑制和/或降低由表达γδ1 TCR的T细胞介导的活性和/或降低由表达γδ1 TCR的T细胞介导的信号传导和/或清除或减少γδ1 T细胞数量的用途。在一些实施方案中,抗体可用于治疗与γδ1 T细胞相关的疾病。在一些实施方案中,抗体可用于治疗与γδ1 T细胞相关的疾病。可以将本文描述的任何抗δ1抗体用于本文描述的方法中。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-30、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其组合。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其组合。这类抗体的非限制性示例包括例如δ1-23。在另一方面中,抗体是δ1-41。在另一方面中,抗体是δ1-39。在一些方面中,本发明提供了治疗癌症的方法。在一些实施方案中,本公开提供了用于减少、改善或消除一种或多种与癌症相关的症状和/或延长与癌症相关的生存(无病生存、无进展生存、总生存)的方法。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中癌症的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中癌症的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的包含本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段的药物组合物。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其组合。这类抗体的非限制性示例包括δ1-23。在特定示例中,抗δ1抗体是如本文公开的δ1-17或其功能性变体。在其它特定示例中,抗δ1抗体是如本文公开的δ1-39或其功能性变体。在又一些特定示例中,抗δ1抗体是如本文公开的δ1-41或其功能性变体。
本公开提供了抑制受试者中γδ1 TCR介导的细胞信号传导的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的包含本文所述的抗δ1抗体(包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39和/或δ1-41)的药物组合物。在一方面中,抗体是δ1-41。在另一方面中,抗体是δ1-39。
为了实践本文所公开的方法,经由适当的途径给需要治疗的受试者(如,人)施用有效量的本文描述的药物组合物,这些适当的途径如静脉内施用(例如,用作推注或通过持续一段时间的连续输注)、通过肌内、腹膜内、脑脊髓内、皮下、关节内、滑膜内、鞘内、经口、吸入或局部途径。可商购的用于液体制剂的雾化器,包括喷射式雾化器和超声波雾化器,都可用于施用。可以将液体制剂直接雾化,而冻干粉可以在重构之后雾化。或者,使用碳氟化合物制剂和计量吸入器将如本文描述的抗δ1抗体进行雾化,或者以冻干粉和研磨粉的形式吸入。
在一些实施方案中,接受本文描述的方法治疗的受试者是哺乳动物,更优选地是人。哺乳动物包括但不限于农畜、运动型动物、宠物、灵长类动物、马、狗、猫、小鼠和大鼠。需要治疗的人类受试者可以是患有、有风险患有或怀疑患有目标疾病/病症如实体瘤的人类患者。
在一些实施方案中,癌症选自肾上腺癌、肾上腺皮质癌、肛门癌、阑尾癌、胆管癌(bile duct cancer)、膀胱癌、骨癌(如,尤文氏肉瘤肿瘤、骨肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤)、脑癌(如,星形细胞瘤、脑干胶质瘤、颅咽管瘤、室鼓膜瘤)、支气管肿瘤、胆管癌(cholangiocarcinoma)、胆管肉瘤、中枢神经系统肿瘤、乳腺癌、卡斯尔门病(Castlemandisease)、宫颈癌、结肠癌、直肠癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管癌、眼癌、胆囊癌、胃肠道癌、胃肠道类癌肿瘤、胃肠道间质瘤、泌尿生殖系统癌、妊娠滋养细胞疾病、心脏癌、卡波西肉瘤、肾癌、喉癌、下咽癌、白血病(如,急性成淋巴细胞白血病、急性髓系白血病、慢性淋巴细胞白血病、慢性髓性白血病)、肝癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、淋巴瘤(如AIDS相关淋巴瘤、Burkitt淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、原发性中枢神经系统淋巴瘤)、恶性间皮瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征、鼻腔癌、副鼻窦癌、胰管腺癌(PDA)、鼻咽癌、神经母细胞瘤、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤、脂肪肉瘤、脂肪肌肉瘤、卵巢癌、胰腺癌、阴茎癌、垂体瘤、前列腺癌、视网膜母细胞瘤、横纹肌肉瘤、横纹肌样瘤、唾液腺癌、肉瘤、皮肤癌(如,基底细胞癌、黑色素瘤)、鳞状细胞头颈癌、小肠癌、胃癌、畸胎瘤、睾丸癌、喉癌、胸腺癌、甲状腺癌、罕见的儿童癌症、上下胃肠道恶性肿瘤(包括但不限于食管癌、胃癌和肝胆癌)、尿道癌、子宫癌、子宫肉瘤、阴道癌、外阴癌、原发不明性癌、Waldenstrom巨球蛋白血症和Wilms瘤。在一些实施方案中,癌症选自血液系统恶性肿瘤,其包括急性成淋巴细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性髓性白血病、慢性髓性白血病、骨髓增生异常综合征和骨髓增生性肿瘤,如原发性血小板增多症、真性红细胞增多症和骨髓纤维化。在一些实施方案中,与此相关的症状包括但不限于贫血、食欲不振、膀胱内膜刺激、出血和瘀伤(血小板减少)、味觉或嗅觉改变、便秘、腹泻、口干、吞咽困难、水肿、乏力、毛发脱落(脱发)、感染、不孕不育、淋巴水肿、口腔溃疡、恶心、疼痛、外周神经病变、蛀牙、尿路感染和/或记忆力和注意力问题。所述方法可以包括用本文描述的抗δ1抗体制备药物组合物,并将该药物组合物以治疗有效量施用于受试者。在某些实施方案中,给受试者施用该药物组合物,例如本文所述的一种或多种抗δ1抗体,包括但不限于抗体δ1-23,降低受试者中的细胞增殖、肿瘤生长和/或肿瘤体积,或者随着时间的推移减少转移病灶的数量。在一些实施方案中,施用该组合物引起完全应答、部分应答或疾病稳定。
实体瘤癌症的示例包括胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、胶质母细胞瘤、上下胃肠道恶性肿瘤(包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管癌(胆管细胞癌)和肝胆癌)、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、神经内分泌癌(类癌和胰腺神经内分泌肿瘤)、肾上腺皮质癌和肉瘤。血液系统恶性包括急性成淋巴细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性髓性白血病、慢性髓性白血病、骨髓增生异常综合征和骨髓增生性肿瘤,如原发性血小板增多症、真性红细胞增多症和骨髓纤维化。患有实体瘤或血液系统恶性的受试者可以通过常规医学检查,如实验室测试、器官功能测试相关的成像模式来鉴定。在一些实施方案中,要通过本文描述的方法治疗的受试者可以是已经进行或正在接受抗癌治疗(例如化疗、放疗、免疫治疗、基于细胞的治疗、手术或其任意组合)的人类癌症患者。
在许多癌症中已经发现γδT细胞数量的增加,包括但不限于胶质瘤、黑色素瘤、食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、肝癌、神经内分泌肿瘤(如,类癌肿瘤)、乳腺癌、肺癌、卵巢癌、肾癌、膀胱癌和前列腺癌。在某些情况下,正如下文解释的一样,相对于非癌性对照,癌症中γδ1 T细胞的比例或数量增加,和/或相对于非癌性对照,癌症中γδ2 T细胞的比例或数量减少。不希望受到理论的束缚,例如通过使用或施用抗δ1抗体,阻断或靶向δ1链TCR并由此降低表达δ1 TCR的γδT细胞(γδ1细胞)的免疫抑制功能,可为治疗某些癌症,如具有高水平γδT细胞的癌症提供有效的新治疗手段。相应地,本文公开的任何抗δ-1抗体都适用于抑制γδT细胞的免疫抑制,并重新激活效应T细胞应答。相应地,本文描述的抗δ1抗体适用于治疗癌症,例如与γδT细胞相关的癌症(如,γδT细胞在癌症发生和进展中起作用的癌症)。相应地,本文提供治疗癌症的方法,包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,给受试者施用的抗δ1抗体选自如本文公开的δ1-17、δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
下文提供了由本文公开的抗δ1抗体治疗的非限制性示例性癌症。
胶质瘤,即大脑或脊椎的胶质细胞肿瘤,是一种致命的脑癌形式,约占所有恶性脑肿瘤的80%和原发性脑肿瘤的50%(Goodenberger和Jenkins,Genetics of adultglioma.Cancer Genet.2012年12月;205(12):613-21)。这种癌症的特征在于,肿瘤在脑中无边界地浸润性生长,留下广泛性坏死,并经常破坏血脑屏障。胶质母细胞瘤(多形性胶质母细胞瘤,GBM)是侵袭性最强的胶质瘤类型。即使完全手术切除,高分级胶质瘤通常还会再生。虽然已经采用了其它治疗手段,如放疗和化疗,但是都收效甚微。
研究发现,虽然胶质瘤患者外周血中的总γδT细胞比率与健康对照没有显著差异,但与健康对照相比,胶质瘤患者外周血中的γδ1 T细胞比率显著升高,而γδ2 T细胞比率则显著降低(Liu等人,γδT Cells in Peripheral Blood of Glioma Patients.MedSci Monit.2018;24:1784-92)。不希望受到理论的束缚,例如通过施用结合δ1的抗体,阻断或靶向δ1并由此可能降低γδ1细胞的免疫抑制功能,可为治疗胶质瘤提供新的治疗手段。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中胶质瘤(如,胶质母细胞瘤)的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一方面中,抗体是δ1-41。在另一方面中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是胶质瘤(如,胶质母细胞瘤)。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
黑色素瘤是最致命的皮肤癌形式,在过去30年中其发病率一直在上升,尤其是在年轻的成年人中。黑色素细胞中基因紊乱的积累,最常见的是B-Raf和N-Ras中的突变,是黑色素瘤的标志(Rodríguez-Cerdeira等人,Advances in Immunotherapy for Melanoma:AComprehensive Review;Mediators Inflamm.2017;2017:3264217,以及其中的参考文献)。随后,这些改变导致发育异常的黑色素细胞转化为黑色素瘤细胞,然后发生侵袭和转移。
与胶质瘤类似,黑色素瘤患者中γδ1细胞的频数高于健康对照(Wistuba-Hamprecht等人,Eur J Cancer.2016年9月;64:116-26)。无论患者是否受过伊匹单抗(ipilimumab)治疗,都发现了这一点。相反,与健康对照相比,黑色素瘤患者中的γδ2细胞水平较低,而且伊匹单抗降低了具有更差结果的患者中的γδ2细胞水平。在这项研究中,γδ2细胞的高频数和γδ1细胞的低频数与黑色素瘤患者良好的总生存期(OS)相关。不希望受到理论的束缚,例如通过施用结合δ1的抗体,阻断或靶向δ1并潜在地降低γδ1细胞的免疫抑制功能,可能为黑色素瘤提供新的治疗手段,这可以延长患者(包括但不限于经伊匹单抗治疗的患者)的总生存。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中黑色素瘤的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是黑色素瘤。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
肉瘤是间充质(结缔)组织的肿瘤,并且包括骨(如,骨肉瘤)、软骨(软骨肉瘤)、脂肪(脂肪肉瘤)、肌肉(如,平滑肌肉瘤)、血管和造血组织的恶性肿瘤。肉瘤通常采用手术治疗,但也可在术前和/或术后进行化疗和放射以改善结果。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中肉瘤的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是肉瘤。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
胃肠道(GI)癌包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管细胞癌和肝癌。与身体的任何其它系统相比,GI癌代表了数量最多的癌症和最高的癌症致死人数。
食管癌是全球第六大最常见的癌症,其发病率正在上升。食管癌主要有两种类型:食管鳞状细胞癌(ESCC)和食管腺癌(EAC),虽然这种癌症的病因不明,但已经确定了某些危险因素,如吸烟或饮酒,以及反流、Barrett’s食管、失弛缓症、Plummer-Vinson综合征或食管瘢痕(American Cancer Society,Esophageal Cancer,2017年6月14日)。目前的治疗通常包括手术,以及化疗、放疗和/或支架置入术(Short等人,Esophageal Cancer.Am FamPhysician.2017年1月1日;95(1):22-28)。
研究发现,粘附分子将γδ1 T细胞从食管癌患者的外周血募集到肿瘤组织,正如发现γδ1 T细胞被扣留在食管癌患者的肿瘤组织中(Thomas等人,Role of adhesionmolecules in recruitment ofγδ1 T cells from the peripheral blood to thetumor tissue of esophageal cancer patients.Cancer Immunol Immunother.2001年6月;50(4):218-25)。考虑到γδ1 T细胞水平的升高,例如通过施用结合δ1的抗体,阻断或靶向δ1可能为食管癌提供新的治疗手段,这可以延长患者的总体生存。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中食管癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是食管癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
胃癌在胃的内壁形成,在20世纪80年代之前一直是癌症死亡的主要原因,目前是世界上癌症相关死亡的第三大最常见原因(World Health Organization,Fact Sheets–Cancer,2018年9月12日)。导致胃癌的因素有很多,包括幽门螺旋杆菌感染、吸烟、饮食和遗传。胃癌的一个遗传危险因素是CDH1基因的遗传缺陷。一般来讲,胃癌的治疗包括手术、化疗和放射治疗,但是治愈的几率很小。研究发现,以人表皮生长因子受体2(HER2)抑制剂曲妥珠单抗治疗具有无法手术的局部晚期或转移性胃癌(过度表达HER2/neu基因)的患者,可延长患者的总体生存(Orditura等人,Treatment of gastric cancer.World JGastroenterol.2014年2月21日;20(7):1635–1649)。然而,需要进一步的抵抗性治疗策略来改善胃癌患者的结果。
已经发现γδT细胞促进胃癌的形成。尤其是,γδT细胞在肿瘤微环境中是IL-17的主要来源,并且IL-17推动胃癌中血管生成,从而促进癌症生长(Wu等人,IL-17promotestumor angiogenesis through Stat3 pathway mediated upregulation of VEGF ingastric cancer.Tumour Biol.2016年4月;37(4):5493-501)。因此,不希望受到理论的束缚,γδT细胞是胃癌中免疫抑制性细胞因子的关键产生者,并为免疫治疗提出新的靶标。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中胃癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是胃癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
结直肠癌(CRC),也称为肠癌、结肠癌或直肠癌,是任何影响结肠和直肠的癌症。据悉,CRC是由肿瘤细胞的基因改变所驱动的,同时也受到肿瘤-宿主相互作用的影响。最近的报道已经证明了某些T淋巴细胞亚群的密度与CRC良好的临床结果之间的直接相关性,这就支持了T细胞介导的免疫在抑制CRC肿瘤进展中的主要作用。与大多数癌症一样,目前对于CRC的治疗包括手术、化疗和放射。此外,可以施用靶向特定突变的药物(如,贝伐单抗、西妥昔单抗、帕尼单抗、雷莫芦单抗(ramucirumab)、瑞格菲尼(regorafenib)和阿柏西普(ziv-aflibercept))。还可以施用免疫治疗抗体,例如派姆单抗(pembrolizumab)和纳武单抗(nivolumab),但不限于派姆单抗和纳武单抗。然而,还需要进一步的抗肿瘤治疗来改善患者的结果。
在直肠癌患者的直肠肿瘤组织中,γδ1细胞的频数较高,并且发现其与T分期呈正相关(Rong等人,Analysis of tumor-infiltrating gamma delta T cells in rectalcancer.World J Gastroenterol.2016年4月7日;22(13):3573–3580)。相反,与健康对照相比,直肠癌患者的γδ2细胞水平较低,并与T分期呈负相关。研究发现,肿瘤浸润性γδ1 T细胞具有较强的抑制作用,并且因此认为直肠癌患者中γδ1 T细胞和γδ2 T细胞的比例失衡可能促进直肠癌的发生。不希望受到理论的束缚,例如通过施用结合δ1的抗体,阻断或靶向δ1并潜在地降低γδ1细胞的抑制功能,可能为CRC提出新的治疗手段,这可以延长患者的总体生存。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中结直肠癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是结直肠癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
胰腺癌,包括胰管腺癌(PDA),在美国约占所有癌症的3%和所有癌症死亡人数的7%(American Cancer Socienty,2019)。在占所有胰腺癌约85%的PDA中,已经在大多数病例中发现有四个基因发生了突变:KRAS、CDKN2A、TP53和SMAD4(Wolfgang等人,CA Cancer JClin.2013年9月;63(5):318–348)。胰腺癌的治疗通常由手术切除和辅助治疗组成;目前,胰腺癌切除患者的中位总体生存期仍约为20-22个月。因此,需要其它的抗肿瘤策略来进一步改善胰腺癌患者的结果。
在人胰管腺癌(PDA)中,激活的γδT细胞群占肿瘤浸润性T细胞的多达75%(Daley等人,Cell.2016年9月8日;166(6):1485-1499.e15),并且γδT细胞在PDA中产生高水平的促瘤的IL-17(McAllister等人,Cancer Cell.2014年5月12日;25(5):621-37)。胰腺内γδT细胞的消耗可明显防止体内肿瘤发生,并导致免疫原性Th1细胞和CD8+ T细胞流入肿瘤微环境(TME)。不希望受到理论的束缚,胰腺浸润性γδT细胞通过诱导适应性免疫抑制而促进PDA进展,并且相应地,γδT细胞是胰腺癌中效应T细胞激活的关键调节器,也是癌症免疫治疗的新靶标。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中胰腺癌(如,PDA)的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是胰腺癌(如,PDA)。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
胆管细胞癌(Cholangiocarcinoma)(CCA)是一种形成于胆管中的上皮癌,并是最常见的胆管恶性肿瘤,也是仅次于肝细胞癌的第二大最常见的肝脏恶性肿瘤。在过去的四十年里,胆管细胞癌的总发病率在世界范围内逐步升高。将CCA根据其解剖学位置分为三种亚型:即肝内胆管细胞癌(iCCA)、肝门周围CCA(pCCA)和远端CCA(dCCA)(例如参见,Loeuillard等人,Animal models of cholangiocarcinoma;Biochim Biophys Acta MolBasis Dis.2018年4月5日,和Rizvi等人,Cholangiocarcinoma—evolving concepts andtherapeutic strategies;Nat Rev Clin Oncol.2018年2月;15(2):95–111)。目前,这种疾病是无法治愈和致命的,除非肿瘤可以在早期完全切除。其它治疗手段包括辅助化疗和放射治疗。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中胆管细胞癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是胆管细胞癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝癌类型。它是第六大最常见的癌症,也是癌症死亡的第二大原因。肝细胞癌最常发生在患有慢性肝病,如由乙型肝炎或丙型肝炎感染导致的肝硬化的人群中。HCC经常伴有慢性病毒感染造成的肝硬化及广泛性淋巴细胞浸润。目前对于肝癌的治疗手段包括部分手术切除、肝移植、经皮消融、局部和全身化疗(如,经动脉化疗栓塞术)、小分子TKI和免疫疗法。然而,还需要其它的抗肿瘤治疗策略以进一步改善肝癌患者的结果。
已经发现,γδT细胞在肝脏肿瘤中聚集,因为与健康对照相比,肝脏恶性肿瘤患者的γδT细胞水平升高(Kenna等人,Distinct subpopulations of gamma delta T cellsare present in normal and tumor-bearing human liver.Clin Immunol.2004;113:56–63和Hammerich等人,World J Gastrointest Pathophysiol.2014年5月15日;5(2):107–113)。此外,不同的γδ链可以导致γδT细胞产生保护作用或损害作用。研究发现,在丙型肝炎病毒患者中,γδ1 T细胞与较高的坏死性炎症评分相关,这可能表明此类细胞如何在肝癌中表现(Rajoriya等人,Front Immunol.2014;5:400)。不希望受到理论的束缚,例如通过用抗δ1抗体阻断γδT细胞的某些群体,可能会为肝癌提出一种新的治疗手段,这有可能延长患者的总体生存。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中肝癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是肝癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
起源于神经内分泌细胞的神经内分泌肿瘤(NET),最常发生在肠道中,但也可能发生在胰腺、肺和身体的其它部位。类癌肿瘤是发生在胃肠道系统和支气管肺系统的肠嗜铬细胞中的生长缓慢的神经内分泌肿瘤,虽然罕见,但却是最常见的胃肠道神经内分泌肿瘤的类型。类癌肿瘤有许多不同的类型,包括支气管肺类癌、胃类癌、小肠类癌、阑尾类癌和结直肠类癌肿瘤。通常,治疗包括手术切除、肝化疗栓塞术(如果适用)和医药治疗(Pinchot等人,Carcinoid tumors.Oncologist.2008年12月;13(12):1255–1269)。除了一些化疗药物(Maroun等人,J Curr Oncol.2006年4月;13(2):67-76)和数量有限的小分子抑制剂外,已经发现患者对促生长素抑制素类似物有应答(Aparicio等人,Antitumor activity ofsomatostatin analogues in progressive metastatic neuroendocrinegastroenteropancreatic tumors.Gut.1996;38:430–438)。然而,还需要其它的抗肿瘤策略来改善NET和类癌肿瘤患者的结果。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中神经内分泌肿瘤(如,类癌肿瘤)的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是神经内分泌肿瘤(如,类癌肿瘤)。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
乳腺癌是女性中癌症死亡的第二大原因。它是由乳腺癌细胞DNA的基因突变造成的,也是女性最常见的癌症类型。根据癌症的严重程度,治疗可以包括手术、化疗、激素治疗(如,激素阻断疗法、选择性雌激素受体调节剂、芳香化酶抑制剂)和/或放射。然而,还需要其它的抗肿瘤策略来改善NET和类癌肿瘤患者的结果。
研究发现,与正常对照相比,γδ1细胞是乳腺癌患者的肿瘤细胞中占优势的肿瘤浸润性T细胞(Peng等人,Tumor-infiltratingγδT cells suppress T and dendriticcell function via mechanisms controlled by a unique toll-like receptorsignaling pathway.Immunity.2007年8月;27(2):334-48)。相反,与健康对照相比,乳腺癌患者中的γδ2细胞的水平较低。另一项专门考察三阴性乳腺癌的研究发现,与正常乳腺组织中的水平相比,γδT细胞的数量有所增加(Hidalgo等人,Histological analysis ofγδT lymphocytes infiltrating human triple-negative breast carcinomas.FrontImmunol.2014;5:632)。事实上,已经发现γδ1 T细胞亚型通过其免疫抑制作用促进肿瘤生长和扩散(Morrow等人,The role of gamma delta T lymphocytes in breast cancer:areview.Transl Res.2019年1月;203:88-96)。不希望受到理论的束缚,例如通过施用结合δ1的抗体,阻断或靶向δ1并潜在地降低乳腺癌中γδ1 T细胞的免疫抑制作用,可能为乳腺癌提出新的治疗手段,这可以改善患者的总体生存。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中乳腺癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是乳腺癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
肺癌是男性中癌症相关死亡的最常见原因,也是女性中癌症相关死亡的第二大最常见原因。大约30%的癌症牵涉到Kras原癌基因的突变,而c-MET、NKX2-1、LIB1、PIK3CA和BRAF中的突变也牵涉到癌症(Herbst等人,Lung cancer.N Eng J Med.2008.359(13):1367–80)。肺癌的治疗因其严重程度而异,也可以包括手术、放疗、化疗、靶向药物治疗(如,厄洛替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、阿法替尼(afatinib)、地诺单抗(denosumab))和支气管镜治疗。然而,患有肺癌的人群在确诊后五年的预后不到20%。因此,需要其它的抗肿瘤策略来进一步改善患者的结果。
在一项对非小细胞肺癌(NSCLC)患者的研究中,发现相对于γδ2 T细胞群,γδ1 T细胞群存在富集(Bao等人,Characterization ofγδT cells in patients with non-small cell lung cancer.Oncol Lett.2017年7月;14(1):1133–1140)。在另一项研究中,已经证明肺癌细胞过表达肿瘤浸润性γδT淋巴细胞,并且这些细胞在肺癌的肿瘤浸润细胞中占“相当大的一部分”(Ferrarini等人,Killing of laminin receptor-positive humanlung cancers by tumor infiltrating lymphocytes bearing gammadelta(+)t-cellreceptors.J Natl Cancer Inst.1996年4月3日;88(7):436-41)。不希望受到理论的束缚,例如通过施用结合δ1的抗体,阻断或靶向δ1并潜在地降低乳腺癌中γδ1 T细胞的抑制作用,可能为肺癌提出新的治疗手段,这可以改善患者的总体生存。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中肺癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是肺癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
泌尿生殖系统癌包括例如卵巢癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌和前列腺癌。
卵巢癌是欧洲和北美最常见的妇科死因,其具有多样化的进展,使其治疗和控制变得困难。通常,治疗是先手术,然后化疗(如,以铂为基础的化疗)。同样,子宫癌(如,子宫内膜癌、子宫肉瘤)是美国最常见的妇科癌症,呈现出各种疾病进展。治疗通常包括手术、化疗、激素疗法和放疗。肾癌(如,肾细胞癌、移行细胞癌)约占全球所有癌症的2%,同时在北美患病率最高。治疗通常由手术、生物疗法(如,依维莫司(everolimus)、替西莫罗司(torisel)、索拉非尼(nexavar)、索坦(sutent)、阿昔替尼(axitinib))、免疫疗法(如,干扰素、白介素-2)以及舒尼替尼(sunitinib)和帕唑帕尼(pazopanib)组成。肾癌一般对化疗或放疗没有应答。膀胱癌是最常见的癌症之一,如果及早确诊,其可治疗性很高。目前的治疗包括手术、化疗、放射治疗和免疫疗法(如,卡介苗(BCG)、干扰素α-2b、阿特珠单抗(atezolizumab))。前列腺癌是美国男性中最常见的癌症,也是导致癌症死亡的第二大原因,可通过手术、放射治疗、激素疗法、化疗和/或免疫疗法进行治疗。因此,需要进一步的抗肿瘤策略以改善泌尿生殖系统癌患者的结果。
在一项研究中,发现γδT细胞存在于未经治疗的原发性晚期卵巢浆液性癌的瘤内T细胞中,而αβT细胞则不存在(Raspollini等人,Tumour-infiltrating gamma/delta T-lymphocytes are correlated with a brief disease-free interval in advancedovarian serous carcinoma.Ann Oncol.2005年4月;16(4):590-6)。在鼠卵巢癌模型中,发现δγT细胞在肿瘤进展的后期聚集(Rei等人Murine CD27(-)Vgamma6(+)gammadelta Tcells producing IL-17A promote ovarian cancer growth via mobilization ofprotumor small peritoneal macrophages.Proc Natl Acad Sci USA 2014;111:E3562–E3570)。在肾细胞癌以及前列腺癌中发现了γδ1 T细胞水平的升高(Groh等人,Broadtumor-associated expression and recognition by tumor-derivedγδT cells ofMICA and MICB.Proc Natl Acad Sci U S A.1999年6月8日;96(12):6879–6884)。相反,发现施用BCG后Vδ2 T细胞的增加对膀胱癌是有益的(Pauza等人,Gamma Delta T CellTherapy for Cancer:It Is Good to be Local.Front Immunol.2018;9:1305)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中泌尿生殖系统癌(如,卵巢癌、子宫内膜(子宫)癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌)的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是泌尿生殖系统癌(如,卵巢癌、子宫内膜(子宫)癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌)。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
淋巴瘤是淋巴细胞的癌症,包括慢性淋巴细胞白血病、皮肤B细胞淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤(霍奇金病)、非霍奇金淋巴瘤和Waldenstrom巨球蛋白血症。淋巴瘤的治疗包括化疗、放射治疗和免疫疗法。一种罕见的淋巴瘤类型,即γδT细胞淋巴瘤,经常是致命的,尽管可以用同种异体干细胞移植进行治疗。然而,需要其它的抗肿瘤疗法来进一步改善淋巴瘤患者的结果。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中淋巴瘤的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是淋巴瘤。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
肾上腺皮质癌是一种罕见但具有侵袭性的癌症形式。这种癌症是通过手术切除来治疗的,尽管大多数患者不适合这种治疗,而是通过放射和射频消融进行治疗。也可以施用化疗(如,米托坦、顺铂、多柔比星、依托泊苷和米托坦、链脲霉素和米托坦);然而,总体生存率仍然很低。因此,还需要其它的抗肿瘤策略以进一步改善肾上腺皮质癌患者的结果。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于治疗受试者中肾上腺皮质癌的方法,该方法包括给有此需要的受试者施用有效量的本文所述的抗δ1抗体或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文公开的抗δ1抗体中的一种或多种,如选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在一些实施方案中,本公开提供了抗δ1抗体作为用于治疗癌症的药剂的用途,其中抗δ1抗体选自本文描述的任何抗体中的一种或多种(如,δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其功能性变体,例如本文描述的那些),并且其中的癌症是肾上腺皮质癌。在一个示例中,抗体是δ1-23。在另一示例中,抗体是δ1-17。在又一示例中,抗体是δ1-39。在再一示例中,抗体是δ1-41。
在特定的示例中,使用本文公开的方法给有此需要的受试者施用有效量的δ1-17可以治疗胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、胶质母细胞瘤、上下胃肠道恶性(包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管癌(胆管细胞癌)和肝胆癌)、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、神经内分泌癌(类癌和胰腺神经内分泌肿瘤)、肾上腺皮质癌、肉瘤或其组合。
在其它特定的示例中,采用本文公开的方法给有此需要的受试者施用有效量的δ1-39,可以治疗胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、胶质母细胞瘤、上下胃肠道恶性肿瘤(包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管癌(胆管细胞癌)和肝胆癌)、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、神经内分泌癌(类癌和胰腺神经内分泌肿瘤)、肾上腺皮质癌、肉瘤或其组合。
在另外其它特定的示例中,采用本文公开的方法给有此需要的受试者施用有效量的δ1-41,可以治疗胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、胶质母细胞瘤、上下胃肠道恶性肿瘤(包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管癌(胆管细胞癌)和肝胆癌)、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、神经内分泌癌(类癌和胰腺神经内分泌肿瘤)、肾上腺皮质癌、肉瘤或其组合。
在另外其它特定的示例中,采用本文公开的方法给有此需要的受试者施用有效量的δ1-39,可以治疗胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、胶质母细胞瘤、上下胃肠道恶性肿瘤(包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管癌(胆管细胞癌)和肝胆癌)、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、神经内分泌癌(类癌和胰腺神经内分泌肿瘤)、肾上腺皮质癌、肉瘤或其组合。
怀疑患有任何此类目标疾病/病症的受试者可能会或可能不会表现出该疾病/病症的一种或多种症状。处于该疾病/病症风险的受试者可以是具有该疾病/病症的一个或多个风险因素的受试者。
如本文所用的,“有效量”指的是单独地或与一种或多种其它活性剂联合地,赋予受试者治疗效果所需的每种活性剂的量。在一些实施方案中,治疗效果是在肿瘤微环境中降低γδT细胞活性和/或数量/表达或提高抗肿瘤免疫应答(如,αβT细胞的激活和/或活性增加)。确定抗体的量是否达到治疗效果,对于本领域技术人员来说将会是明显的。正如本领域技术人员所认识到的,有效量有所不同,这取决于所治疗的特定病况、病况的严重程度、个体患者参数(包括年龄、身体状况、体型、性别和体重)、治疗的持续时间、共同疗法(如果有的话)的性质、具体施用途径以及在健康从业者的知识和专业技能范围内的类似因素。这些因素是本领域普通技术人员所熟知的,并且只需通过常规实验就可以解决。通常优选使用单个组分或其组合的最大剂量,即根据合理医学判断的最高安全剂量。
经验性考虑如半衰期,通常会有助于确定剂量。例如,可以使用与人类免疫系统相容的抗体,如人源化抗体或全人抗体,以延长抗体的半衰期并防止抗体受到宿主免疫系统的攻击。施用频率可以在治疗过程中确定并进行调整,并且通常但不一定是基于目标疾病/病症的治疗和/或抑制和/或改善和/或延迟。备选地,抗体的持续性连续释放制剂可能是合适的。用于实现缓释的各种制剂和装置是本领域已知的。
在一个示例中,可以在已经给予了一次或多次抗体施用的个体中凭经验确定如本文描述的抗δ1抗体的剂量。给予个体递增剂量的拮抗剂。为了评估拮抗剂的疗效,可以随访疾病/病症的指标。
通常,对于本文描述的任何抗δ1抗体的施用,初始候选剂量可以是约2mg/kg至约10mg/kg或1mg/kg至约20mg/kg。出于本公开的目的,典型的剂量根据上述因素可以约为从0.1μg/kg至3μg/kg至30μg/kg至300μg/kg至3mg/kg、至30mg/kg至100mg/kg或更高中的任何剂量。在一些实施方案中,可以将本文描述的任何抗δ1抗体以一个或多个固定剂量给予需要治疗的受试者,即不依赖于受试者的体重、体表面积或其它类似因素。对于在数天或更长时间内的重复施用,根据病况,进行持续治疗直至出现期望的症状抑制或直至达到足够的治疗水平以缓解目标疾病或病症或其症状。示例性的给药方案包括施用约3mg/kg的初始剂量,之后施用约1mg/kg的抗体每周维持剂量或者之后每隔一周施用约1mg/kg的维持剂量。但是,根据从业者希望实现的药代动力学衰减模式,其它剂量方案也可能是有用的。例如,考虑每周给药一到四次。在一些实施方案中,可以使用的剂量范围为约3μg/mg至约2mg/kg(例如,约3μg/mg、约10μg/mg、约30μg/mg、约100μg/mg、约300μg/mg、约1mg/kg和约2mg/kg)。在其它实施方案中,可以使用固定剂量(在不考虑体重、体表面积和其它类似因素的情况下,给予患者确定量的抗体)以治疗如本文描述的目标疾病。
在一些实施方案中,给药频率为每周一次、每2周一次、每4周一次、每5周一次、每6周一次、每7周一次、每8周一次、每9周一次或每10周一次;或每月一次、每2个月一次或每3个月一次或更长时间一次。通过常规技术和测定法,轻松监测这种疗法的进程。给药方案(包括所用的抗体)可以随时间推移而变化。
在一些实施方案中,对于正常体重的成年患者,可以施用的剂量范围为约0.3mg/kg至5.00mg/kg。在一些示例中,本文描述的抗δ1抗体的剂量可以是10mg/kg。具体的给药方案,即剂量、时机和重复,将取决于特定的个体和该个体的病史以及各个药剂的性质(如,药剂的半衰期和本领域所熟知的其它考虑)。
出于本公开的目的,如本文描述的抗体的适当剂量将取决于所采用的特定抗体、抗体和/或非抗体肽(或其组合物)、疾病/病症的类型和严重程度、施用抗体是出于预防还是治疗目的、既往疗法、患者的临床病史和对拮抗剂的应答、以及主治医生的判定。临床医生通常会施用抗体,直至达到实现期望结果的剂量。在一些实施方案中,期望的结果是在肿瘤微环境中抗肿瘤免疫应答的提高。确定剂量是否产生期望结果的方法对于本领域技术人员而言会是显然的。一种或多种抗体的施用可以是连续性的或间歇性的,这取决于例如接受者的生理状况、施用的目的是治疗性的还是预防性的以及熟练从业者已知的其它因素。抗体的施用可以在预选时间段内基本上是连续性的,或者可以采用一系列间隔剂量,例如在目标疾病或病症形成之前、期间或之后。
如本文所用的,术语“治疗”指的是对受试者施加或施用包含一种或多种活性剂的组合物,该受试者患有目标疾病或病症、所述疾病/病症的症状或对所述疾病/病症有易感性,其目的是为了治疗、治愈、缓解、减轻、改变、补救、改进、改善或影响病症、疾病的症状或对疾病或病症的易感性。
缓解目标疾病/病症包括延迟疾病的形成或进展,或者降低疾病严重程度,或者延长生存。缓解疾病或延长生存不一定需要治愈效果。如本文所用的,“延迟”目标疾病或病症的形成意味着推迟、阻碍、放慢、放缓、稳定和/或展缓疾病的进展。这种延迟的时间可以长短不一,这取决于疾病的历史和/或接受治疗的个体。“延迟”或缓解疾病的形成或者延迟疾病发作的方法是与未使用该方法相比,在给定时间范围内减少形成疾病的一种或多种症状的概率和/或在给定时间范围内降低症状的程度的方法。这种比较通常是基于临床研究,使用的受试者数量足以给出具有统计学意义的结果。
疾病的“形成/发生”或“进展”意指疾病的初始表现和/或后续进展。疾病的形成可以使用如本领域熟知的标准临床技术进行检测和评估。然而,形成还指的是可能无法检测到的进展。出于本公开的目的,形成或进展指的是症状的生物学进程。“形成”包括出现、复发和发作。如本文所用的,目标疾病或病症的“发作”或“出现”包括初始发作和/或复发。
在一些实施方案中,本公开提供了用于抑制γδT细胞活性的方法。在一些实施方案中,以足以抑制γδT细胞活性的量给需要治疗的受试者施用本文描述的抗δ1抗体。在一些实施方案中,以足以在体内将γδT细胞活性抑制至少10%(如,20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量给需要治疗的受试者施用本文描述的抗δ1抗体。在其它实施方案中,以有效挽救γδT细胞诱导的免疫抑制的量施用抗δ1抗体。在其它实施方案中,以有效挽救γδT细胞诱导的免疫抑制至少10%(如,20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量施用抗δ1抗体。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以用于抑制γδT细胞的活性。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以抑制γδT细胞活性的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内将γδT细胞活性抑制至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于减小肿瘤体积、肿瘤大小和/或肿瘤负荷的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1和/或表2中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,该方法使肿瘤体积、肿瘤大小和/或肿瘤负荷减小至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,用于减小肿瘤体积、肿瘤大小和/或肿瘤负荷。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以减小肿瘤体积、肿瘤大小和/或肿瘤负荷的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内减小肿瘤体积、肿瘤大小和/或肿瘤负荷至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在肿瘤和/或血液中消耗靶细胞(例如γδT细胞,如Vδ1 T细胞)的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1和/或表2中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,该方法使γδT细胞,如Vδ1 T细胞消耗至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,用于在肿瘤和/或血液中消耗靶细胞,例如γδT细胞,如γδ1 T细胞。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在肿瘤和/或血液中消耗γδT细胞如γδ1 T细胞的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内将肿瘤和/或血液中的γδT细胞如γδ1 T细胞消耗至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于调控肿瘤中γδT细胞的比率,例如调控如降低γδ1 T细胞与γδ2 T细胞的比率的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1和/或表2中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,该方法调控例如将肿瘤中γδ1 T细胞与γδ2 T细胞的比率降低至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于调控肿瘤中γδT细胞的比率,例如调控如降低Vδ1 T细胞与Vδ2 T细胞的比率。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以调控例如降低肿瘤中γδ1 T细胞与γδ2 T细胞的比率的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内调控例如将肿瘤中γδ1 T细胞与γδ2 T细胞的比率降低至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于调控PBMC中γδ1 T细胞的比率和/或存在于肿瘤中的免疫细胞中的γδ1 T细胞的比率(例如从患有癌症的受试者中分离),例如调控如降低PBMC中γδ1 T细胞的比率和/或存在于肿瘤中的免疫细胞中γδ1 T细胞的比率的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,该方法调控例如将PBMC中γδ1 T细胞的比率和/或存在于肿瘤中的免疫细胞中的γδ1 T细胞的比率降低至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于调控PBMC中γδ1 T细胞的比率和/或存在于肿瘤中的免疫细胞中γδ1 T细胞的比率,例如调控如降低γδ1与PBMC或与肿瘤中免疫细胞的比率。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以调控例如降低PBMC中γδ1 T细胞的比率和/或存在于肿瘤中的免疫细胞中γδ1 T细胞的比率的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内调控例如降低PBMC中γδ1 T细胞的比率和/或存在于肿瘤中的免疫细胞中γδ1 T细胞的比率至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于清除或消耗靶细胞的方法,其中所述靶细胞是免疫抑制性免疫细胞,例如γδT细胞,如γδ1 T细胞,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1和/或表2中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,该方法使靶细胞(例如免疫抑制性免疫细胞,如γδT细胞,如γδ1 T细胞)的清除或消耗促进至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于清除或消耗靶细胞,其中所述靶细胞是免疫抑制性免疫细胞,例如γδT细胞,如γδ1 T细胞。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以清除或消耗肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中的γδT细胞如γδ1 T细胞的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内清除或消耗肿瘤中的γδT细胞如γδ1 T细胞至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在靶细胞中诱导细胞毒性例如ADCC的方法,其中所述靶细胞是免疫抑制性免疫细胞,例如γδT细胞,如γδ1 T细胞,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1和/或表2中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,该方法在γδT细胞(如,γδ1 T细胞)中诱导细胞毒性例如ADCC至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于在靶细胞中诱导细胞毒性例如ADCC,其中所述靶细胞是免疫抑制性免疫细胞,例如γδT细胞,如γδ1 T细胞。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中的γδT细胞如γδ1 T细胞中促进ADCC的量施用于有此需要的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内在肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中的γδT细胞如γδ1 T细胞中促进ADCC至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在受试者中诱导针对表达δ1的靶细胞(即γδT细胞,如γδ1 T细胞)的细胞毒性例如补体依赖性细胞毒性(CDC)的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。在一些实施方案中,该方法诱导对γδT细胞如γδ1 T细胞产生出至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)的细胞毒性例如补体依赖性细胞毒性(CDC)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于诱导对表达δ1的靶细胞(即,γδT细胞,如γδ1 T细胞)产生细胞毒性例如补体依赖性细胞毒性(CDC)。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中的γδT细胞如γδ1 T细胞中促进CDC的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中的γδT细胞如γδ1 T细胞中促进产生出至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者的水平相比)的CDC的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于诱导表达δ1的靶细胞的吞噬作用(ADCP)的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体将γδT细胞如γδ1 T细胞的吞噬提高至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中的γδT细胞如γδ1 T细胞中促进ADCP的量施用于需要治疗的受试者。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于诱导表达δ1的靶细胞的吞噬(ADCP)。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在体内促进肿瘤和/或循环(如,血清或血液)中γδT细胞如γδ1 T细胞的ADCP至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量施用于需要治疗的受试者(与治疗前或对照受试者的水平相比)。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于例如通过靶向肿瘤浸润性γδT细胞(如,γδ1 T细胞)在肿瘤和/或在血液中诱导T细胞激活的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,在表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。在一些实施方案中,该方法在肿瘤和/或在血液中促进T细胞激活至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于在肿瘤和/或在血液中诱导T细胞激活。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在肿瘤和/或在血液中促进T细胞激活的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在体内在肿瘤和/或血液中促进T细胞激活至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量施用于需要治疗的受试者(与治疗前或对照受试者的水平相比)。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在肿瘤和/或在血液中促进CD4+细胞激活的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,在表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。在一些实施方案中,该方法在肿瘤和/或在血液中促进CD4+细胞激活至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,用于在肿瘤和/或在血液中促进CD4+细胞激活。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在肿瘤和/或在血液中促进CD4+细胞激活的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在体内在肿瘤和/或血液中促进CD4+细胞激活至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量施用于需要治疗的受试者(与治疗前或对照受试者中的水平相比)。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在CD4+细胞中诱导CD44表达的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,该方法在肿瘤和/或在血液中将促炎细胞因子的表达(如,在CD4+细胞中CD44、IFNγ和/或TNF-α的表达)增加至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于在CD4+细胞中诱导CD44表达。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在肿瘤和/或血液中诱导促炎细胞因子的表达(例如,在肿瘤中CD4+细胞中CD44、IFNγ和/或TNF-α的表达)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在体内在肿瘤和/或血液中CD4+细胞中诱导促炎细胞因子的表达(例如,CD44、IFNγ和/或TNF-α的表达)至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量施用于需要治疗的受试者(与治疗前或对照受试者中的水平相比)。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在肿瘤和/或在血液中促进CD8+细胞激活的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,在表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。在一些实施方案中,该方法在肿瘤和/或在血液中将CD8+细胞激活促进至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以用于在肿瘤和/或在血液中促进CD8+细胞激活。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在肿瘤和/或在血液中促进CD8+T细胞激活的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在体内在肿瘤和/或血液中将CD8+ T细胞激活促进至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)的量施用于需要治疗的受试者(与治疗前或对照受试者中的水平相比)。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了一种用于在肿瘤和/或在血液中诱导CD8+细胞中CD44表达的方法,该方法包括向受试者提供或施用本文所述的抗δ1抗体(如,在表1中)或其抗原结合片段。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-23、δ1-39和δ1-41。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。在一些实施方案中,该方法在肿瘤和/或在血液中将CD8+细胞中促炎细胞因子的表达(如,CD44、IFNγ和/或TNF-α的表达)增加至少30%(如,31%、35%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%或更高,包括其中的任何增量)。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以用于在肿瘤和/或在血液的CD8+细胞中诱导CD44表达。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在肿瘤和/或在血液的CD8+细胞中诱导CD44表达的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在体内在肿瘤和/或血液的CD8+细胞中将CD44表达诱导至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
在一些实施方案中,本公开提供了用于防止直接或间接抑制α-βT细胞活性的方法。在一些实施方案中,本公开提供了用于抑制γδT细胞分泌细胞因子(如,IL-17),并相应地防止血管生成的诱导,以及防止对MDSC、中性粒细胞和TAM的吸引的方法。在一些实施方案中,本公开提供了用于抑制γδT细胞的Treg/Th2型活性,并进而防止抗肿瘤γδT细胞受到限制的方法。在一些实施方案中,本公开提供了用于防止促肿瘤γδT细胞与树突状细胞(DC)接合,并相应地防止抑制DC成熟和/或防止诱导DC或T细胞衰老的方法。在一些实施方案中,本公开提供了用于防止DC抗原呈递(由于γδT细胞的存在)受到限制的方法。
在一些实施方案中,本公开提供了一种或多种本文描述的抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,用于在肿瘤和/或在血液的CD8+细胞中诱导CD44表达。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,以足以在肿瘤和/或在血液的CD8+细胞中诱导促炎细胞因子的表达(例如,CD44、IFNγ和/或TNF-α的表达)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,将本文描述的抗体,如在表1中,包括但不限于δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,以足以在体内在肿瘤和/或血液的CD8+细胞中诱导促炎细胞因子的表达(例如,CD44、IFNγ和/或TNF-α的表达)至少20%(如,30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更高)(与治疗前或对照受试者中的水平相比)的量施用于需要治疗的受试者。在一些实施方案中,抗体是δ1-39。
根据待治疗疾病的类型或疾病的部位,可以采用医学领域普通技术人员已知的常规方法向受试者施用药物组合物。这种组合物还可以经由其它常规途径施用,例如经口、胃肠外、通过雾化吸入、局部、直肠、经鼻、经颊、阴道或经由植入式储库施用。如本文所用的术语“胃肠外”包括皮下、皮内、静脉内、肌内、关节内、动脉内、滑膜内、胸骨内、鞘内、病灶内和颅内注射或输注技术。此外,也可以经由注射型贮库施用途径将组合物施用于受试者,例如使用1个月、3个月或6个月贮库可注射或可生物降解的材料和方法。在一些示例中,将药物组合物经由眼内或玻璃体内施用。
注射用组合物可以含有多种载剂,如植物油、二甲基乙酰胺、二甲基甲酰胺、乳酸乙酯、碳酸乙酯、肉豆蔻酸异丙酯、乙醇和多元醇类(甘油、丙二醇、液态聚乙二醇等)。对于静脉内注射,可以通过滴注法施用水溶性抗体,藉此输注含有抗体和生理上可接受的赋形剂的药物制剂。生理上可接受的赋形剂可以包括例如5%的葡萄糖、0.9%的盐水、林格氏溶液或其它合适的赋形剂。肌内用制剂,例如抗体的合适的可溶性盐形式的无菌制剂,可以溶解于药用赋形剂(如,注射用水、0.9%的盐水或5%的葡萄糖溶液)中并施用。
在一个实施方案中,将抗体经由部位特异性或靶向性局部递送技术施用。部位特异性或靶向性局部递送技术的示例包括多种抗体的植入式贮库源或局部递送导管,例如输注导管、留置导管或针刺导管、合成移植物、外膜包裹物(adventitial wraps)、分流器和支架或其它植入式装置、部位特异性载剂,直接注射或直接应用。例如,参见PCT公布号WO 00/53211和第5,981,568号美国专利。
还可以采用含有反义多核苷酸、表达载体或亚基因组多核苷酸的治疗性组合物的靶向递送。受体介导的DNA递送技术描述于,例如Findeis等人,Trends Biotechnol.(1993)11:202;Chiou等人,Gene Therapeutics:Methods and Applications of Direct GeneTransfer(编者,J.A.Wolff)(1994);Wu等人,J.Biol.Chem.(1988)263:621;Wu等人,J.Biol.Chem.(1994)269:542;Zenke等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1990)87:3655;Wu等人,J.Biol.Chem.(1991)266:338。
在基因治疗方案中,以约100ng至约200mg范围的DNA施用含有多核苷酸(如,编码本文描述的抗体的多核苷酸)的治疗性组合物,以供局部施用。在一些实施方案中,在基因治疗方案期间也可以使用浓度范围为约500ng至约50mg、约1μg至约2mg、约5μg至约500μg,以及约20μg至约100μg或更多的DNA。
可以采用基因递送媒介物来递送本文描述的治疗性多核苷酸和多肽。这种基因递送媒介物可以是病毒或非病毒源的(总体上参见,Jolly,Cancer Gene Therapy(1994)1:51;Kimura,Human Gene Therapy(1994)5:845;Connelly,Human Gene Therapy(1995)1:185;以及Kaplitt,Nature Genetics(1994)6:148)。可以使用内源性哺乳动物或异源性启动子和/或增强子来诱导此类编码序列的表达。编码序列的表达可以是组成性的,也可以是可调控的。
用于递送所需多核苷酸并在所需细胞中表达的基于病毒的载体在本领域中是众所周知的。示例性的基于病毒的媒介物包括但不限于重组逆转录病毒(例如,参见公布号为WO 90/07936;WO 94/03622;WO 93/25698;WO 93/25234;WO 93/11230;WO 93/10218;WO91/02805的PCT专利;第5,219,740号和4,777,127号美国专利;第2,200,651号英国专利;以及第0 345 242号欧洲专利)、基于甲病毒的载体(如,Sindbis病毒载体、Semliki森林病毒(ATCC VR-67;ATCC VR-1247)、罗斯河病毒(ATCC VR-373;ATCC VR-1246)和委内瑞拉马脑炎病毒(ATCC VR-923;ATCC VR-1250;ATCC VR 1249;ATCC VR-532))和腺相关病毒(AAV)载体(例如,参见PCT公布号WO 94/12649,WO 93/03769;WO 93/19191;WO 94/28938;WO 95/11984和WO 95/00655)。还可以采用如Curiel,Hum.Gene Ther.(1992)3:147中所述的连接至灭活腺病毒的DNA施用方式。
也可以采用非病毒递送媒介物和方法,包括但不限于,连接至或未连接至灭活的腺病毒的(单独的)聚阳离子紧密DNA(例如,参见Curiel,Hum.Gene Ther.(1992)3:147);配体连接的DNA(例如,参见Wu,J.Biol.Chem.(1989)264:16985);真核细胞递送媒介物细胞(例如,参见第5,814,482号美国专利;公布号为WO 95/07994;WO 96/17072;WO 95/30763和WO 97/42338的PCT专利);以及核酸电荷中和或与细胞膜融合。也可以采用裸DNA。示例性的导入裸DNA的方法描述于公布号为WO 90/11092的PCT专利和第5,580,859号美国专利。可以作为基因递送媒介物的脂质体描述于第5,422,120号美国专利;公布号为WO 95/13796;WO94/23697;WO 91/14445的PCT专利和第0524968号欧洲专利。其它手段描述于Philip,Mol.Cell.Biol.(1994)14:2411和Woffendin,Proc.Natl.Acad.Sci.(1994)91:1581。
本文描述的方法中使用的特定给药方案,即剂量、时机和重复,将取决于特定的受试者和该受试者的病史。
在一些实施方案中,可以给需要治疗的受试者施用多于一种抗体或抗体与另一种适当治疗剂的组合。抗体也可以与其它用于增强和/或补充药剂有效性的药剂结合使用。
可以通过本领域熟知的方法对靶疾病/病症的治疗功效进行评估。
联合疗法
本文描述的任何抗δ1抗体可与其它类型的癌症疗法结合使用,例如化疗、手术、放射、基因治疗、小分子抑制剂、基于细胞的治疗、抗激素药物、免疫疗法、抗代谢药物、生物制剂包括生物仿制药和/或其任意组合等等。此类疗法可以与根据本公开的免疫疗法同时或序贯地(以任何顺序)施用。
当与其它的治疗剂共施用时,由于累加作用或协同效应,可以降低每种药剂的适当的治疗有效剂量。
在一些实施方案中,抗δ1抗体可以与其它免疫调节治疗联合,例如,检查点分子(如PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、LAG3、TIM-3、A2aR、TIGIT或VISTA)的抑制剂、共刺激受体(如DX40、GITR、CD137、CD40、CD27和ICOS)的激活剂、和/或固有免疫细胞靶标(如KIR、NKG2A、CD96、TLR、IDO和/或半乳糖凝集素-9)的抑制剂。在不受理论束缚的情况下,认为抗δ1抗体可以经由例如抑制浸润到肿瘤微环境中的γδT细胞的活性来重塑针对肿瘤细胞的免疫应答。因此,联合应用抗δ1抗体和免疫调节剂(如本文所述的那些免疫调节剂),将有望显著增强抗肿瘤功效。
在一些实施方案中,治疗方法还包括给受试者施用检查点分子的抑制剂、共刺激受体的激活剂、和/或固有免疫细胞靶标的抑制剂。在一些实施方案中,治疗方法还包括给受试者施用检查点分子的抑制剂。在一些实施方案中,检查点分子选自由PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、LAG3、TIM-3和A2aR、TIGIT和VISTA组成的组。在一些实施方案中,治疗方法还包括给受试者施用共刺激受体的激活剂的抑制剂和/或固有免疫细胞靶标的抑制剂。在一些实施方案中,共刺激受体选自由OX40、GITR、CD137、CD40、CD27和ICOS组成的组。在一些实施方案中,治疗方法还包括给受试者施用固有免疫细胞靶标的抑制剂。在一些实施方案中,固有免疫细胞靶标选自由KIR、NKG2A、CD96、TLR和IDO组成的组。在一些实施方案中,抗δ1抗体选自δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42或δ1-43或其组合。这类抗体的非限制性示例包括例如抗体δ1-23。在这些治疗方法中的任何一种中,抗δ1抗体是抗体δ1-23。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-17。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-39。在一些实施方案中,抗δ1抗体是δ1-41。
在一些示例中,本文公开的治疗方法包括给患有肺癌的人类患者施用CTLA-4的抑制剂(如,抗CTLA-4抗体)以及本文公开的任何抗δ1抗体。在其它示例中,本文公开的治疗方法包括给患有皮肤癌(如,黑色素瘤)的人类患者施用PD-1的抑制剂(如,抗PD-1抗体或抗PDL1抗体)以及本文公开的任何抗δ1抗体。
示例性的抗CTLA-4抗体包括伊匹单抗(ipilimumab)。示例性的抗PD-1抗体包括派姆单抗(pembrolizumab)、纳武单抗(nivolumab)、西米普利单抗(cemiplimab)、AMP-224、AMP-514和PDR001。示例性的抗PD-L1抗体包括阿维鲁单抗(avelumab)、阿特珠单抗(atezolizumab)、德瓦鲁单抗(durvalumab)、BMS-936559和CK-301。
在其它实施方案中,还可以将本文描述的抗δ1抗体与化疗剂共同使用,包括烷化剂、蒽环类药物、细胞骨架破坏剂(紫杉烷类)、埃博霉素、组蛋白去乙酰化酶抑制剂、拓扑异构酶I抑制剂、拓扑异构酶II抑制剂、激酶抑制剂、核苷酸类似物和前体类似物、肽类抗生素、基于铂的药剂、类维生素A、长春花生物碱及其衍生物。非限制性示例包括:(i)抗血管生成剂(例如,TNP-470、血小板因子4、血小板反应蛋白-1、金属蛋白酶组织抑制剂(TIMP1和TIMP2)、促乳素(16-Kd片段)、血管抑素(纤维蛋白溶酶原的38-Kd片段)、内皮抑素、bFGF可溶性受体、转化生长因子β、干扰素α、可溶性KDR和FLT-1受体、胎盘增生相关蛋白,以及由Carmeliet和Jain(2000)列出的那些);(ii)VEGF拮抗剂或VEGF受体拮抗剂,例如抗VEGF抗体、VEGF变体、可溶性VEGF受体片段、能够阻断VEGF或VEGFR的适配体、中和性抗VEGFR抗体、VEGFR酪氨酸激酶的抑制剂及其任何组合;以及(iii)化疗化合物,例如嘧啶类似物(5-氟尿嘧啶、氟尿苷、卡培他滨、吉西他滨和阿糖胞苷)、嘌呤类似物、叶酸拮抗剂和相关抑制剂(巯基嘌呤、硫鸟嘌呤、喷司他丁和2-氯脱氧腺苷(克拉屈滨));抗增殖/抗有丝分裂剂,包括天然产物,例如长春花生物碱(长春碱、长春新碱和长春瑞滨)、微管破坏剂如紫杉烷(紫杉醇、纳米颗粒白蛋白结合型紫杉醇
Figure BDA0003238211330001291
多西他赛)、艾日布林(eribulin)、长春新碱、长春碱、诺考达唑(nocodazole)、埃博霉素和诺维本、表鬼臼毒素(依托泊苷和替尼泊苷)、DNA损伤剂(放线菌素、胺苯吖啶(amsacrine)、蒽环类药物、博来霉素、白消安(busulfan)、喜树碱、卡铂、苯丁酸氮芥、顺铂、环磷酰胺、癌得星(cytoxan)、更生霉素、柔红霉素、多柔比星、表柔比星(epirubicin)、六甲蜜胺(hexamethyhnelamine)、奥沙利铂、异环磷酰胺、美法仑、二氯甲基二乙胺(mechlorethamine)、丝裂霉素、米托蒽醌、亚硝基脲、普卡霉素、丙卡巴肼(procarbazine)、泰素(taxol)、泰素帝(taxotere)、替尼泊苷、三乙烯硫代磷酰胺和依托泊苷(VP16));抗生素,例如更生霉素(放线菌素D)、柔红霉素、多柔比星(阿霉素)、伊达比星(idarubicin)、蒽环类药物、米托蒽醌、博来霉素、普卡霉素(光神霉素)和丝裂霉素;酶类(L-天冬酰胺酶,其系统地代谢L-天冬酰胺并使没有能力合成自身天冬酰胺的细胞丧失功能);抗血小板药物;抗增殖/抗有丝分裂烷化剂,例如氮芥(二氯甲基二乙胺、环磷酰胺及类似物、美法仑、苯丁酸氮芥)、乙烯亚胺和甲基蜜胺(六甲蜜胺和噻替派)、烷基磺酸盐-白消安、亚硝基脲(卡莫司汀(BCNU)及类似物、链脲霉素)、三嗪类-达卡巴嗪(DTIC);抗增殖/抗有丝分裂的抗代谢药物,例如叶酸类似物(甲氨蝶呤);铂配位络合物(顺铂、卡铂)、丙卡巴肼、羟基脲、米托坦、氨鲁米特(aminoglutethimide);激素类、激素类似物(雌激素、他莫昔芬、戈舍瑞林(goserelin)、比卡鲁胺、尼鲁米特)和芳香化酶抑制剂(来曲唑、阿那曲唑);抗凝血药(肝素、合成肝素盐和其它凝血酶抑制剂);纤维蛋白溶解剂(如,组织纤维蛋白溶酶原激活剂、链激酶和尿激酶)、阿司匹林、双嘧达莫、噻氯匹定、氯吡格雷、阿昔单抗(abciximab);抗迁移剂;抗分泌剂(布雷菲德菌素(breveldin));免疫抑制剂(环孢菌素、他克莫司(FK-506)、西罗莫司(雷帕霉素)、硫唑嘌呤、霉酚酸酯);抗血管生成化合物(如,TNP-470、染料木黄酮(genistein)、贝伐单抗(bevacizumab))和生长因子抑制剂(如,成纤维细胞生长因子(FGF)抑制剂);血管紧张素受体阻断剂;一氧化氮供体;反义寡核苷酸;抗体(曲妥珠单抗(trastuzumab));细胞周期抑制剂和分化诱导剂(维甲酸);mTOR抑制剂、拓扑异构酶抑制剂(多柔比星(阿霉素)、胺苯吖啶、喜树碱、柔红霉素、更生霉素、替尼泊苷、表柔比星、依托泊苷、伊达比星、米托蒽醌、拓扑替康(topotecan)、伊立替康(如,伊立替康脂质体注射剂例如
Figure BDA0003238211330001303
)、皮质类固醇(可的松、地塞米松、氢化可的松、甲基强的松龙、强的松和泼尼松龙);生长因子信号转导激酶抑制剂;核苷酸类似物和胸苷磷酸化酶抑制剂(如,曲氟尿苷-替匹嘧啶或
Figure BDA0003238211330001304
);线粒体功能异常诱导剂和半胱天冬酶激活剂;以及染色质破坏剂。本文描述的治疗剂包括含有所列有效成分及其衍生物的任何药物产品,以及包括本领域内已知制剂的任何制剂(例如,缓释制剂)。
备选地或另外地,还可以将本文描述的抗δ1抗体与抗高血压剂共同使用,抗高血压剂包括但不限于血管紧张素转换酶(ACE)抑制剂(例如,贝那普利、卡托普利、依那普利、福辛普利、赖诺普利、莫西普利、培哚普利、喹那普利、雷米普利或群多普利)、血管紧张素II受体阻断剂(亦称ARB或沙坦类药物,例如,阿齐沙坦、坎地沙坦、依普沙坦、伊贝沙坦、替米沙坦、缬沙坦、氯沙坦或奥美沙坦)、β阻断剂(例如,β1选择性药剂,如醋丁洛尔(acebutolol)、阿替洛尔、倍他洛尔、比索洛尔(bisoprolol)、西利洛尔(celiprolol)、美托洛尔、奈必洛尔(nebivolol);β2选择性药剂,如布他沙明(butaxamine)或ICI-118,551;β3选择性药剂,如SR 59230A;以及非选择性药剂,如普萘洛尔、布新洛尔、卡替洛尔、卡维地洛、拉贝洛尔、纳多洛尔、氧烯洛尔(oxprenolol)、喷布洛尔(penbutolol)、吲哚洛尔、索他洛尔、噻吗洛尔)、钙通道阻断剂(例如,氨氯地平、地尔硫卓(diltiazem)、非洛地平、伊拉地平(isradipine)、尼卡地平、硝苯地平、尼索地平或维拉帕米)、直接肾素抑制剂(如,阿利吉仑(aliskiren))或利尿剂。另参见US20130287688和Pinter等人,Sci Transl Med(2017)9(410)。
其它有用的药剂还可以见于,例如Physician's Desk Reference,第59增补版,(2005),Thomson P D R,Montvale N.J.;Gennaro等人编,Remington's The Science andPractice of Pharmacy第20增补版,(2000),Lippincott Williams和Wilkins,BaltimoreMd.;Braunwald等人编,Harrison's Principles of Internal Medicine,第15增补版,(2001),McGraw Hill,NY;Berkow等人编,The Merck Manual of Diagnosis and Therapy,(1992),Merck Research Laboratories,Rahway N.J.。
据报道,实体瘤的化疗和/或免疫治疗能提高免疫调节物如检查点分子的水平,从而导致对肿瘤细胞的免疫力受到抑制。Erissond等人,J.Translational Medicine(2016),14:282;Grabosch等人,J.ImmunoTherapy of Cancer(2015),3(增刊2):P302;以及Azad等人,EMBO J.(2016)。已经发现抗δ1抗体抑制γδT细胞的活性,引起T细胞激活增加,尤其是在实体瘤中。因此,预期将抗δ1抗体与化疗剂(如,吉西他滨)或免疫治疗剂(如,抗PD-L1抗体)共同应用会显著增强对实体瘤(如PDA或CRC)的治疗活性。
在一些实施方案中,提供了方法,其中本文描述的抗δ1抗体能够改进共同施用的检查点抑制剂的抗肿瘤活性。在一些实施方案中,提供了方法,其中抗δ1抗体例如本文表1中和别处描述的任何抗δ1抗体如δ1-23,与在相同条件下单独的检查点抑制剂治疗相比,能够改进共同施用的检查点抑制剂(例如,PD-1、PD-L1和/或CTLA-4或者本文列出的或本领域已知的其它)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如改进10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,抗δ1抗体,例如本文表1中和别处描述的任何抗δ1抗体,如δ1-23,与在相同条件下单独的检查点抑制剂治疗相比,能够改进共同施用的检查点抑制剂(例如,PD-1、PD-L1和/或CTLA-4或者本文列出的或本领域已知的其它)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如改进1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,共同施用的检查点抑制剂(例如,PD-1、PD-L1和/或CTLA-4或者本文列出的或本领域已知的其它)能够提高本文描述的抗δ1抗体的抗肿瘤活性。在一些实施方案中,共同施用的检查点抑制剂(例如,PD-1、PD-L1和/或CTLA-4或者本文列出的或本领域已知的其它),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体(例如,本文表1中和别处描述的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,共同施用的检查点抑制剂(例如,PD-1、PD-L1和/或CTLA-4或者本文列出的或本领域已知的其它),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体(例如,本文表1中和别处描述的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,提供了方法,其中本文描述的抗δ1抗体能够提高免疫疗法激活T细胞的能力。在一些实施方案中,提供了方法,其中抗δ1抗体,例如本文表1中和别处描述的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39,与在相同条件下单独的免疫疗法治疗相比,能够提高免疫疗法激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量)(例如,本文描述的或本领域已知的),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,抗δ1抗体与在相同条件下单独的免疫疗法治疗相比,能够提高免疫疗法激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量)(例如,本文描述的或本领域已知的),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,提供了方法,其中共同施用的免疫疗法能够提高本文描述的抗δ1抗体激活T细胞的能力。在一些实施方案中,提供了方法,其中共同施用的免疫疗法(例如,本文描述的或本领域已知的),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体(例如,本文表1中和别处描述的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-23、δ1-41和δ1-39)激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,共同施用的免疫疗法(例如,本文描述的或本领域已知的),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,提供了方法,其中抗δ1抗体能够提高共同施用的化疗剂和/或其它抗癌剂的抗肿瘤活性。在一些实施方案中,提供了方法,其中抗δ1抗体例如本文表1中和别处描述的任何抗体如δ1-23,与在相同条件下单独的化疗剂治疗相比,能够提高共同施用的化疗剂(例如,本文描述的或本领域已知的)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,与在相同条件下单独的化疗剂治疗相比,抗δ1抗体能够提高共同施用的化疗剂(例如,本文描述的或本领域已知的)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,抗δ1抗体作为维持疗法施用。
在一些实施方案中,提供了方法,其中这些共同施用的化疗剂能够提高抗δ1抗体的抗肿瘤活性。在一些实施方案中,提供了方法,其中共同施用的化疗剂(例如,本文描述的或本领域已知的),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体(例如,本文表1中和别处描述的任何抗体,如δ1-23)的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,共同施用的化疗剂(例如,本文描述的或本领域已知的),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体的抗肿瘤活性,即功效(降低肿瘤增殖、大小、体积、重量、负担或负荷或者减少随着时间的转移病灶的数量,促使病情稳定,提高生存率),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,提供了方法,其中抗δ1抗体能够提高化疗剂激活T细胞的能力。在一些实施方案中,提供了方法,其中抗δ1抗体,例如本文表1中和别处描述的任何抗体,如δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41,与在相同条件下单独的化疗剂治疗相比,能够提高化疗剂激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量)(例如,本文描述的或本领域已知的),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,抗δ1抗体与在相同条件下单独的化疗剂治疗相比,能够提高化疗剂激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量)(例如,本文描述的或本领域已知的),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在一些实施方案中,提供了方法,其中共同施用的化疗剂能够提高抗δ1抗体激活T细胞的能力。在一些实施方案中,提供了方法,其中共同施用的化疗剂(例如,本文描述的或本领域已知的),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体(例如本文表1中和别处描述的任何抗体,如δ1-23、δ1-17、δ1-39或δ1-41)激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量),例如提高10%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或更多。在一些实施方案中,共同施用的化疗剂(例如,本文描述的或本领域已知的),与在相同条件下单独的抗δ1治疗相比,能够提高抗δ1抗体激活T细胞的能力(例如,通过本文描述的细胞因子标志物进行测量),例如提高1.0-1.2倍、1.2-1.4倍、1.4-1.6倍、1.6-1.8倍、1.8-2倍,或2倍、3倍、4倍、10倍或更多。
在这些联合治疗方法中的任何一种中,待治疗的癌症选自于实体瘤癌症的示例包括:胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌(例如,非小细胞肺癌NSCLC和小细胞肺癌SCLC)、胶质母细胞瘤、上下胃肠道恶性肿瘤(包括但不限于食管癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、胆管癌(胆管细胞癌)和肝胆癌)、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、子宫内膜癌、肾癌、膀胱癌、前列腺癌、卵巢癌、神经内分泌癌(类癌和胰腺神经内分泌肿瘤)、肾上腺皮质癌和肉瘤。血液系统恶性包括急性成淋巴细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性髓性白血病、慢性髓性白血病、骨髓增生异常综合征和骨髓增生性肿瘤,如原发性血小板增多症、真性红细胞增多症和骨髓纤维化,以及本文描述的其它。
其它应用
本文描述的任何抗δ1抗体也可用于在样品如生物样品中使用常规免疫测定法(例如,Western印迹、FACS、免疫组织化学、免疫细胞化学等)检测γδ1 T细胞的存在和/或测量γδ1 T细胞的水平。简而言之,可以将抗体在适当的条件下与样品孵育合适的时间,如果样品中存在靶γδ1,即允许该抗体与靶γδ1结合。然后,可以使用常规方法检测这种结合,例如使用结合抗δ1抗体的经标记的二抗。进行这种免疫测定以检测靶γδ1 TCR或表达这种TCR的靶T细胞,完全在本领域技术人员的知识范畴内。
本文还提供了鉴定癌症患者的方法和选择癌症患者进行免疫治疗的方法,例如包含给受试者施用抗δ1抗体,并且任选地治疗癌症患者的免疫治疗。在一些实施方案中,鉴定是基于在受试者中测量的δ1水平,例如来自受试者的生物样品中的δ1水平。在一些实施方案中,测量患者的血清或血浆中的δ1水平。在一些实施方案中,测量来自患者的生物样品例如肿瘤或肿瘤来源的类器官中的δ1水平。在一些实施方案中,使用抗体来测量δ1水平,例如,如本文所述的抗体,包括但不限于δ1-39。在一些实施方案中,使用本领域已知的一种不同抗体来检测样品中的δ1。
相应地,在一些实施方案中,所述方法包括:(i)提供有此需要的受试者(例如人类受试者)的生物样品,(ii)测量生物样品中的δ1水平,以及(iii)根据生物样品中的δ1水平将受试者鉴定为患有癌症或处于癌症风险中。在一些实施方案中,受试者生物样品中升高的δ1水平是相对于对照而言的,并且表明该受试者患有癌症或处于癌症风险中。在一些实施方案中,受试者生物样品中升高的δ1水平是相对于对照而言的,并且表明该受试者可能是适合免疫疗法的癌症患者,例如包括给受试者施用抗δ1抗体的免疫疗法。在一些实施方案中,对照包括来自未患癌症的受试者的生物样品。在一些实施方案中,对照包括预先确定的参考值或值范围。在一些实施方案中,生物样品是血清样品或血浆样品。在一些实施方案中,将本领域已知的其它诊断测试与方法结合使用。在一些实施方案中,对照是参考值,即已经建立的范围,并反映健康人群中的δ1范围。相应地,高于参考值的水平表示水平升高。
相应地,在一些实施方案中,所述方法包括:(i)提供有此需要的受试者(例如人类受试者)的血液样品,(ii)测量血液样品中的δ1水平,以及(iii)根据血液样品中的δ1水平将受试者鉴定为患有癌症或处于癌症风险中。在一些实施方案中,受试者血液样品中升高的δ1水平是相对于对照而言的,并且表明该受试者患有癌症或处于癌症风险中。在一些实施方案中,受试者血液样品中升高的δ1水平是相对于对照而言的,并且表明该受试者可能是适合免疫疗法的癌症患者,例如包括给受试者施用抗δ1抗体的免疫疗法。在一些实施方案中,对照包括来自未患癌症的受试者的血液样品。在一些实施方案中,对照包括预先确定的参考值或值范围。在一些实施方案中,血液样品是血清样品或血浆样品。在一些实施方案中,将本领域已知的其它诊断测试与所述方法结合使用。在一些实施方案中,对照是参考值,即已经建立的范围,并反映健康人群中的δ1范围。相应地,高于参考值的水平表示水平升高。
在一些实施方案中,所述方法包括:(i)提供有此需要的受试者(例如人类受试者)的活检样品,(ii)测量来自受试者的活检样品中或源自受试者生物样品的样品(例如患者来源的器官型肿瘤球体(PDOTs)、单细胞肿瘤悬液,例如按照本文所述制备的)中的δ1水平,以及(iii)根据样品中的δ1水平将受试者鉴定为患有癌症或处于癌症风险中。在一些实施方案中,受试者样品中升高的δ1水平是相对于对照而言的,并且表明该受试者患有癌症或处于癌症风险中。在一些实施方案中,受试者生物样品如活检样品中升高的δ1水平是相对于对照而言的,并且表明该受试者可能是适合免疫疗法的癌症患者,例如包括给受试者施用抗δ1抗体的免疫疗法。在一些实施方案中,对照是来自同一受试者的癌症阴性组织。在一些实施方案中,对照是参考值或值范围。在一些实施方案中,对照源自健康受试者。在一些实施方案中,测量涉及测定δ1蛋白或基因表达的水平,例如mRNA水平。在一些实施方案中,测量涉及检测δ1蛋白,例如使用本文描述的一种或多种抗δ1抗体,包括但不限于δ1-39。
在另一方面中,本文提供了用于预测癌症患者对于抗δ1免疫疗法的应答性的方法。相应地,在一些实施方案中,所述方法包括:(i)测定来自患者的生物样品例如血浆、血清、活检或活检来源样品(如,PDOTs、单细胞肿瘤悬液或其它组织)中的δ1水平;(ii)将生物样品中的δ1水平与对照水平进行比较,其中生物样品中的δ1水平高于对照水平,表明患者可能应答抗δ1免疫疗法,而水平低于对照水平表明患者不大可能应答抗δ1免疫疗法;(iii)如果δ1水平高于对照水平,则预测患者应答抗δ1免疫疗法。在一些实施方案中,对照水平对应于在来自健康受试者的血液或组织中观察到的水平。在一些实施方案中,对照水平对应于在患有癌症的受试者的肿瘤邻近的健康组织中观察到的水平。在一些实施方案中,将本领域已知的其它诊断测试与所述方法结合使用。
在另一方面中,本文提供了用于预测癌症患者对于抗δ1免疫疗法的应答性的方法。相应地,在一些实施方案中,所述方法包括:(i)使用抗δ1抗体来测定来自患者的生物样品例如血浆、血清、活检或活检来源样品(如,PDOTs、单细胞肿瘤悬液或其它组织)中的δ1水平;(ii)使用抗δ1抗体将生物样品中的δ1水平与对照水平进行比较,其中δ1水平高于对照水平,表明患者可能应答抗δ1免疫疗法,而水平低于对照水平表明患者不大可能应答抗δ1免疫疗法;(iii)如果δ1水平高于对照水平,则预测患者应答抗δ1免疫疗法。在一些实施方案中,抗δ1抗体是本文提供的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-39。在一些实施方案中,所述抗体是本领域已知的一种不同的抗体。在一些实施方案中,采用流式细胞术,例如使用本文提供的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-39,来测定δ1水平。在一些实施方案中,采用流式细胞术,例如使用本领域已知的一种不同的抗体,来测定δ1水平。在一些实施方案中,采用免疫组织化学,例如使用本文描述的δ1抗体或本领域已知的一种不同抗体,来测定δ1水平。在一些实施方案中,对照水平对应于在来自健康受试者的血液或组织中观察到的水平。在一些实施方案中,对照水平对应于在患有癌症的受试者的肿瘤邻近的健康组织中观察到的水平。在一些实施方案中,将本领域已知的其它诊断测试与所述方法结合使用。
在另一方面中,本文提供了用于治疗对于抗δ1免疫疗法具有预测应答性的癌症患者的方法。相应地,在一些实施方案中,所述方法包括:(i)测定来自患者的生物样品例如血浆、血清、活检或活检来源样品(如,PDOTs、单细胞肿瘤悬液或其它组织)中的δ1水平;(ii)将生物样品中的δ1水平与对照水平进行比较,其中生物样品中的δ1水平高于对照水平,表明患者可能应答抗δ1免疫疗法,而水平低于对照水平表明患者不大可能应答抗δ1免疫疗法;(iii)如果δ1水平高于对照水平,则预测患者应答抗δ1免疫疗法;以及(iv)如果预测患者应答抗δ1免疫疗法,那么就对该癌症患者进行治疗。在一些实施方案中,治疗包括施用抗δ1抗体,例如本文提供的任何抗δ1抗体。在一些实施方案中,治疗包括施用δ1-39。在一些实施方案中,对照水平对应于在来自健康受试者的血液或组织中观察到的水平。在一些实施方案中,对照水平对应于在患有癌症的受试者的肿瘤邻近的健康组织中观察到的水平。在一些实施方案中,将本领域已知的其它诊断测试与所述方法结合使用。在一些实施方案中,采用流式细胞术,例如使用本文提供的任何抗δ1抗体,包括但不限于δ1-39,来测定δ1水平。
用于治疗与γδT细胞激活相关的疾病的试剂盒
本公开还提供了用于治疗或缓解与γδT细胞激活相关的疾病的试剂盒。示例包括实体瘤,例如本文描述的PDA和其它疾病。此类试剂盒可以包括一个或多个容器,该容器包含抗δ1抗体,例如本文描述的抗δ1抗体中任何一种,并且任选地包含要与抗δ1抗体共同使用的第二治疗剂,其也在本文中描述。
在一些实施方案中,试剂盒可以包含根据本文描述的任何方法的使用说明书。所包括的说明书可以包含对施用抗δ1抗体和任选的第二治疗剂,以治疗、延迟发作或缓解如本文所述的那些的靶疾病的描述。试剂盒还可以包含对于根据鉴别个体是否患有靶疾病(例如,应用如本文所述的诊断方法)来选择适合治疗的个体的描述。在另外的其它实施方案中,说明书包含对给处于靶疾病风险的个体施用抗体的描述。
与抗δ1抗体的使用相关的说明书通常包括有关意图治疗的剂量、给药方案和施用途径的信息。容器可以是单位剂量、量贩包装(如,多剂量包装)或次单位剂量。本发明的试剂盒中提供的说明书通常是在标签或包装插页(例如,试剂盒中包含的纸页)上的书面说明,但是机器可读型说明书(例如,磁性或光学存储盘上承载的说明书)也是可以接受的。
标签或包装插页指示组合物用于治疗、延迟发作和/或缓解与γδT细胞激活相关的疾病。可以提供用于实践本文描述的任何方法的说明书。
本发明的试剂盒采用合适的包装。合适的包装包括但不限于小瓶、瓶子、罐子、软包装(例如,密封的迈拉(Mylar)或塑料袋)等。还涵盖与特定装置组合使用的包装,这种特定装置例如吸入器、鼻腔施用装置(如,雾化器)或输注装置,如微型泵。试剂盒可以具有无菌接入口(例如,容器可以是具有可经皮下注射针刺穿的塞子的静脉注射液袋或小瓶)。容器也可以具有无菌接入口(例如,容器可以是具有可经皮下注射针刺穿的塞子的静脉注射液袋或小瓶)。组合物中至少有一种活性剂是如本文描述的抗δ1抗体。
试剂盒可以任选地提供另外的组件,例如缓冲剂以及解释信息。通常情况下,试剂盒包含容器和容器上或与容器关联的标签或包装插页。在一些实施方案中,本发明提供了包含上文描述的试剂盒的内容物的制品。
通用技术
除非另有说明,否则本发明的实践将采用分子生物学(包括重组技术)、微生物学、细胞生物学、生物化学和免疫学的常规技术,这些常规技术都在本领域的技术范围内。此类技术在下列文献中进行了充分地解释,例如Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第二版(Sambrook等人,1989)Cold Spring Harbor Press;Oligonucleotide Synthesis(编者为M.J.Gait,1984);Methods in Molecular Biology,Humana Press;Cell Biology:ALaboratory Notebook(编者为J.E.Cellis,1998)Academic Press;Animal Cell Culture(编者为R.I.Freshney,1987);Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.Mather和P.E.Roberts,1998)Plenum Press;Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(编者为A.Doyle、J.B.Griffiths和D.G.Newell,1993-8)J.Wiley and Sons;Methods inEnzymology(Academic Press,Inc.);Handbook of Experimental Immunology(编者为D.M.Weir和C.C.Blackwell);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(编者为J.M.Miller和M.P.Calos,1987);Current Protocols in Molecular Biology(编者为F.M.Ausubel等人,1987);PCR:The Polymerase Chain Reaction,(编者为Mullis等人,1994);Current Protocols in Immunology(编者为J.E.Coligan等人,1991);ShortProtocols in Molecular Biology(Wiley and Sons,1999);Immunobiology(C.A.Janeway和P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,1997);Antibodies:a practical approach(编者为D.Catty.,IRL Press,1988-1989);Monoclonal antibodies:a practical approach(编者为P.Shepherd和C.Dean,Oxford University Press,2000);Using antibodies:alaboratory manual(E.Harlow和D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999);The Antibodies(编者为M.Zanetti和J.D.Capra,Harwood Academic Publishers,1995)。
无需进一步详尽阐述,相信本领域技术人员可以基于以上描述最大程度地利用本发明。因此,以下具体实施方案应当被理解为仅仅是说明性的,而不是以任何方式限制本公开的其余内容。本文所引用的所有出版物均通过引用方式并入用于本文所提及的目的或主题。
实施例
实施例1:抗δ1抗体的产生
抗原产生
利用标准的重组DNA方法构建了与小鼠免疫球蛋白G(IgG)的Fc部分融合的人和食蟹猴T细胞受体(TCR)的γ和δ链的表达载体。为了使纯化和固定更有效,进一步修饰了δ链的表达载体,使其包含附接至Fc部分C-末端的AviTagTM和His6标签。产生了六种不同的δ1克隆(人δ1A(SEQ ID NO:26)、人δ1B(SEQ ID NO:27)、人δ1C(SEQ ID NO:28)、食蟹猴δ1A(SEQID NO:32)、食蟹猴δ1B(SEQ ID NO:33)和食蟹猴δ1C(SEQ ID NO:34))、四种δ2克隆(人δ2A(SEQ ID NO:29)、人δ2B(SEQ ID NO:35)、人δ2C(SEQ ID NO:36)和食蟹猴δ2(SEQ ID NO:37))和六种γ9克隆(人γ9(SEQ ID NO:30)、人γ3(SEQ ID NO:38)、人γ4(SEQ ID NO:39)、人γ5(SEQ ID NO:40)、人γ8(SEQ ID NO:41)、食蟹猴γ(SEQ ID NO:42))的表达载体。上文提供了δ1链胞外区的氨基酸序列,下文给出了δ2和γ链的氨基酸序列。用δ链克隆的载体(上述十种载体之一)和γ链(六种γ链之一)的载体转染哺乳动物细胞,以产生γ/δ异二聚体。从培养上清液中提取得到γ/δTCR-Fc融合蛋白,再利用Ni
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层析法进行纯化,然后在体外利用重组BirA和凝胶过滤至表观均质性。
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AIELVPEHQTVPVSIGVPATLRCSMKGEAIGNYYINWYRKTQGNTMTFIYREKDIYGPGFKDNFQGDIDIAKNLAVLKILAPSERDEGSYYCACDTSSSSGTDKLIFGKGTRVTVEPRSQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTVHSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKS(SEQ ID NO:35)
人TCRδ2C:
AIELVPEHQTVPVSIGVPATLRCSMKGEAIGNYYINWYRKTQGNTMTFIYREKDIYGPGFKDNFQGDIDIAKNLAVLKILAPSERDEGSYYCACDILGDKGNTDKLIFGKGTRVTVEPRSQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTVHSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKS(SEQ ID NO:36)
食蟹猴TCRδ2:
AVELVPEHQTVIVSVGDPATLKCSMKGEAISNYYINWYRKTQGNTMTFIYREKGIYGPGFKDNFQGDIDTEENQAVLKILAPSERDEGSYYCASDILSWVDSYTDKLIFGKGTRVTVEPKRQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKDFYGKDIRINLESSKKITEFDPAIVVSPSGKYNAVKLGQYADSNSVTCSVQHNKEVVYSTDFEVKTNSTDHLKPTETENTKQPSKS(SEQ ID NO:37)
人TCRγ3:
SSNLEGRTKSVTRQTGSSAEITCDLTVTNTFYIHWYLHQEGKAPQRLLYYDVSTARDVLESGLSPGKYYTHTPRRWSWILRLQNLIENDSGVYYCATWDRPLNAWIKTFAKGTRLIVTSPDKQLDADVSPKPTIFLPSIAETKLQKAGTYLCLLEKFFPDVIKIHWQEKKSNTILGSQEGNTMKTNDTYMKFSWLTVPEKSLDKEHRCIVRHENNKNGVDQEIIFPPIKTDVITMDPKDN(SEQ ID NO:38)
人TCRγ4:
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人TCRγ5:
SSNLEGGTKSVTRPTRSSAEITCDLTVINAFYIHWYLHQEGKAPQRLLYYDVSNSKDVLESGLSPGKYYTHTPRRWSWILILRNLIENDSGVYYCATWDRLRKKLFGSGTTLVVTDKQLDADVSPKPTIFLPSIAETKLQKAGTYLCLLEKFFPDVIKIHWQEKKSNTILGSQEGNTMKTNDTYMKFSWLTVPEKSLDKEHRCIVRHENNKNGVDQEIIFPPIKTDVITMDPKDN(SEQ ID NO:40)
人TCRγ8:
SSNLEGRTKSVTRPTGSSAVITCDLPVENAVYTHWYLHQEGKAPQRLLYYDSYNSRVVLESGISREKYHTYASTGKSLKFILENLIERDSGVYYCATWDWGKKLFGSGTTLVVTDKQLDADVSPKPTIFLPSIAETKLQKAGTYLCLLEKFFPDVIKIHWQEKKSNTILGSQEGNTMKTNDTYMKFSWLTVPEKSLDKEHRCIVRHENNKNGVDQEIIFPPIKTDVITMDPKDN(SEQ ID NO:41)
人TCRγ9:
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食蟹猴TCRγ:
AGHLEQPQISSTKMLSKTARLECVVSGVTISETSIYWYRERPGEVIQFLVCIFYDGTVKKESSIPSGKFEVDRIPKTSTSTLTIHNVEKQDIATYYCALWEVQQFGRKVKLFGPGTKLIITDKHLDADVSPKPTIFLPSIAETNLHKAGTYLCLLENFFPDVIKIHWQEKKSNTILGSQEGNTVKTNDTYMKFSWLTVPEKSLDKEHRCIVRHENNKNGVDQEIIFPPIKTDVTTMDPKDN(SEQ ID NO:42)
合成抗体产生
按照早期描述的文库的设计(Miller等人,PloS One.2012,7:e43746)并经过改进,从Fab形式的噬菌体展示库中分离出具有意图的结合特异性的抗体克隆。噬菌体库的分选基本上按照已公开的程序进行(Miller等人,PloS One.2012,7:e43746;Fellouse等人,JMol Biol.2007,373:924-940)。为了富集与δ1链的共同区域结合的克隆,在连续几轮库分选中使用由不同δ1链组成的TCR样品。为了消除与δ2链或γ链结合的克隆,还引入了使用由δ2链组成的样品进行的阴性分选。为了消除与TCR构建体的Fc部分结合的克隆,在分选过程中将纯化的Fc用作竞争物。进行了四轮噬菌体选择。
通过噬菌体ELISA测定与TCR克隆的结合(Sidhu等人,Methods Enzymol.2000,328:333-363.)。将生物素化的TCR样品(“靶标”;TCR(δ1A/γ9)、TCR(δ1B/γ9)、TCR(δ1C/γ9)、TCR(δ2/γ9)或Fc)固定在用中性亲和素包被的孔中,并用过量的生物素进行封闭。将孔与展示单个Fab克隆的噬菌体一起孵育。以HRP缀合的抗M13噬菌体抗体来检测结合的噬菌体。
亲和力成熟
为了提高Fab克隆的亲和力和跨物种反应性(人和食蟹猴的TCR),采用酵母表面展示来构建库,然后对该库进行定量分选,其基本上通过遵循已公布的程序进行(Boder等人,Nat Biotechnol.1997;15:553-7;Koide等人,J Mol Biol.2007;373:941-53)。
简而言之,使用δ1-17作为亲本克隆进行CDR-H3的亲和力成熟。从CDR-H3的亲和力成熟中鉴定出δ1-30,其包含相对于δ1-17的CDR-H3内的S→M突变。将δ1-30转换为单链Fv(scFv)形式,与酵母Aga2蛋白和V5标签融合,并将其置于Pgal启动子的控制之下。将CDR-L2转换成预测的种系序列,该种系序列源于与NCBI种系(www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)和V-BASE(www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/vbase/)中条目的比对,从而产生δ1-29。然后,在CDR-L3中引入了如(Miller等人,PloS One,2012;7:e43746.PMCID:3423377)中描述的序列多样性。将生物素化的TCR靶标与DyLight 650标记的链霉亲和素(Thermo Fisher Scientific)缀合,并通过流式细胞术用于库的分选和结合测定。根据与δ1结合的活性,经由酵母展示鉴定了δ1-18至δ1-28和δ1-31的克隆。上文提供了它们的VH和VL链(VH/VL)的氨基酸序列。随后,将序列多样性引入至δ1-23的CDR-H1部分。按上述方法进行亲和力成熟,产生了δ1-32至δ1-43。
IgG蛋白的产生
将上述抗体克隆的基因转移到哺乳动物表达载体中用于产生人IgG。通过瞬时转染ExpiCHO或Expi293细胞(ThermoFisher)产生蛋白质,并使用蛋白G琼脂糖凝胶层析进行纯化,然后使用Superdex S200或ResourceS层析(GE Healthcare)进行纯化。
实施例2:抗δ1抗体克隆的表征
亲和力测量
采用表面等离子共振(SPR)评估抗体的亲和力。将生物素化的TCR样品固定于Avicap芯片(Pall ForteBio)上,该芯片已预载了中性亲和素(ThermoFisher)。采用一步法将IgG样品流动通过Pioneer SPR分析仪(Pall ForteBio)上。所分析的IgG样品对于它们各自的靶标具有低纳摩尔范围内的解离常数(KD)值(图10A)。在某些情况下,使用生物膜干涉法(BLI)测量亲和力。同样,将生物素化的TCR样品固定于链霉亲和素传感器上,并在溶液中与抗体一起孵育(图22A和22B)。
或者,如前所述(Nishikori S,Hattori T,Fuchs SM,Yasui N,Wojcik J,KoideA,Strahl BD,Koide S.Broad ranges of affinity and specificity of anti-histoneantibodies revealed by a quantitative Peptide immunoprecipitation assay.J MolBiol.2012;424:391-9.PMCID:3502729.),使用微珠结合测定法评估了亲和力。将生物素化的TCR样品固定于经链霉亲和素包被的微珠(Thermo Fisher)上,并将微珠与不同浓度的IgG样品一起孵育。洗涤后,用荧光标记的二抗对结合于微珠的IgG染色,并使用流式细胞仪(例如,图6、7、9)和其它进行定量。
KD值如表2所示。
表2.采用微珠结合测定法测定的已鉴定抗体克隆的食蟹猴和人δ1 TCR(IgG形式)的表观解离常数
Figure BDA0003238211330001451
所示误差是三次重复实验的标准差。没有显示误差的地方只做了一次测量。将生物素化的TCR样品固定于经链霉亲和素包被的微珠上,进行抗体滴定,并采用流式细胞术对其结合进行定量。
δ1相对于δ2的特异性的基于细胞的分析
检测了抗δ1抗体δ1-17对于δ1相对于δ2的特异性。产生了三种不同的δ1变体(D1A、D1B、D1C),它们仅在CDR3环内彼此不同。将δ1和δ2Fc融合蛋白附着于经链霉亲和素包被的微珠,并使用δ1-17hIgG1进行结合滴定。如图10B所示,δ1-17对δ1(所有三种变体)均具有高度特异性,并且不与δ2发生交叉反应。对δ1-41也观察到类似的特异性。如图10D所示,相对于δ2,δ1-41对δ1具有高度特异性。
γ结合的基于细胞的分析
检测了不同γ链对于抗δ1抗体结合的影响。产生了含有γ3、γ4、γ5、γ8和γ9的Fc融合蛋白,并将其附着于经链霉亲和素包被的微珠。使用抗δ1-17抗体进行结合滴定。如图11A所示,抗δ1-17结合与γ无关;也就是说,无论在δγTCR中使用的是哪种γ链,结合都是δ1特异性的。
使用以抗δ1-39抗体进行的结合滴定来检测不同的γ链对于抗δ1抗体结合的影响。产生了含有γ3、γ4、γ5、γ8和γ9的Fc融合蛋白,并将其附着于经链霉亲和素包被的微珠。如图23所示,抗δ1-39结合也与γ无关。
对J.RT3-T3.5(
Figure BDA0003238211330001461
TIB-153)细胞系进行病毒转导,以表达如图11B所示的各种δ和γ组合。将TIB153细胞系用作阴性对照,因为它是不表达CD3或任何TCR的Jurkat细胞系。相应地,它可以用来确认与T细胞上发现的任何其它细胞表面受体没有背景结合。用商品化抗人CD3 FITC(克隆UCHT1,Biolegend#300440)、抗人δ1 APC(克隆TS8.2,eBioscience#17-5679-42)以及抗人TCRγ/δAlexa Fluor 647(克隆B1,Biolegend#331214)对这些细胞进行染色。使用抗人IgG Fc APC(克隆M1310G05,Biolegend#410712)检测所选的本文所述抗δ1抗体的染色,如图11B所示。发现δ1-39和δ1-41是比所测试的其它克隆更好的广谱γ结合物。它们的结合概况与市售的抗δ1抗体的结合概况相当。
制备稳定的Jurkat(J.RT3-T3.5;
Figure BDA0003238211330001462
TIB-153)细胞系(与图11B中相同),以表达以下γ链与抗δ1抗体相组合:1)抗δ1和γ2;2)抗δ1和γ3;3)抗δ1和γ4;5)抗δ1和γ5;6)抗δ1和γ8;7)抗δ1和γ9;8)抗δ2抗体和γ9。使用δ1-39的递增滴定来检测结合。对于结合研究,使用表达αβTCR的亲本Jurakat(E6-1)细胞系作为对照。如图24A-24H所示,δ1-39结合是特异性的,无论在细胞表面上的δγTCR中使用何种γ组合,并且它与含有d2的TCR或αβTCR没有结合(图24G-H)。
食蟹猴结合的基于细胞的分析
检测了δ1-41抗体与人和食蟹猴的反应性。将人和食蟹猴δ1Fc融合蛋白附着于经链霉亲和素包被的微珠,并用δ1-41进行结合滴定。如图10C所示,δ1-41抗体以与食蟹猴δ1基本相同的亲和力对人δ1结合。亦参见图10D。
还检测了δ1-39抗体与人和食蟹猴的反应性。将人和食蟹猴δ1Fc融合蛋白附着于经链霉亲和素包被的微珠,并用δ1-39进行结合滴定(图9H)。如图22A所示,δ1-39抗体结合人δ1的亲和力(KD=0.23nM)与图22B中所示的与食蟹猴δ1的亲和力(KD=0.28nM)基本相同。使用Octet生物膜干涉法(BLI)进行亲和力的测量。将生物素化的人或猴受体固定于链霉亲和素传感器尖端,并如图所示滴定δ1.1单抗。
热稳定性
将纯化的蛋白质与SYPRO橙在25℃至99℃的温度范围内以0.5℃的增量进行孵育。在每个增量处测量荧光。绘制了在40℃至90℃范围内荧光随温度的平均变化(即,一阶导数),并如图8所示。为清晰起见,将曲线在垂直方向上偏移。
实施例3:患者肿瘤样品的球体制备和微流控培养
接收新鲜的肿瘤标本(人类患者)置于冰上的培养基(DMEM)中,再用无菌镊子和解剖刀在10-cm的培养皿(在冰上)中切碎。将切碎的肿瘤重悬于DMEM(4.5mmol/L的葡萄糖、100mmol/L的丙酮酸钠、1:100的青霉素-链霉素;Corning CellGro)+10%的FBS(GeminiBio-Products)、100U/mL的IV型胶原酶(Life Technologies)和15mmol/L的HEPES(LifeTechnologies)中。将样品沉淀并重悬于10至20mL的培养基中。使用RBC裂解缓冲液(BostonBio-Products)从带有明显血色的样品中去除红细胞(RBC)。将样品沉淀,然后重悬于新鲜的DMEM+10%的FBS中,并经过100-μm过滤器和40-μm过滤器进行过滤,生成S1(>100μm)、S2(40–100μm)和S3(<40μm)球体级分,随后将其在超低吸附组织培养板中维持培养。将S2级分用于离体培养。在加入含有酚红的10×PBS,并以NaOH调节pH值后,将S2级分的一个等分样进行沉淀并重悬于I型鼠尾胶原(Corning)(浓度为2.5mg/mL)中。使用PANPEHA Whatman试纸(Sigma-Aldrich)确认pH值为7.0–7.5。然后将球体-胶原蛋白混合物注入3-D微流控培养装置的中心凝胶区,如Jenkins等人,Cancer Discov.2018年2月;8(2):196-215;Ex VivoProfiling of PD-1Blockade Using Organotypic Tumor Spheroids中所述,其内容通过引用方式全文并入于此。含有患者来源的器官型肿瘤球体(PDOTS)的胶原蛋白水凝胶在37℃30分钟后,用含有或未含抗γδ单克隆抗体的培养基进行水合。
在某些情况下,为了测试与检查点抑制剂或其它免疫治疗剂的协同效应,用抗PD-1(派姆单抗,250μg/mL)、抗CTLA4(伊匹单抗,50μg/mL)或二者联合(250μg/mL的派姆单抗+50μg/mL的伊匹单抗)来处理PDOTS。对于指定的PDOTS研究,抗人PD-L1是600μg/mL的阿特珠单抗+人干扰素γ。
如Jenkins等人所述,通过流式细胞术进行免疫谱分析。
实施例4:共培养物的制备、处理和分析
利用来自胰腺癌患者的细胞进行体外培养测定,以考察γδT细胞对αβT细胞的影响。将血液αβT细胞单独培养或者与瘤内或血液γδT细胞共培养。通过与CD3/CD28连接而激活血液αβT细胞,导致通过FACS测量的TNF-α增加。如图2所示,与激活的αβT细胞(柱2)相比,激活的αβT细胞与血液和肿瘤的γδT细胞(分别是柱3和柱4)的共培养显示出TNF-α信号受到显著抑制。柱1代表未激活的αβT细胞。结果表明,来自胰腺癌患者的γδT细胞是免疫抑制性的。
从手术切除的人肿瘤标本和配对血液样品(在接收时都是新鲜的)中分选出γδT细胞(GDT)和传统T细胞(αβT细胞)。对于基于抗体的T细胞增殖测定,使用人T细胞激活试剂盒(130-091-441,Miltenyi Biotec,MA)在96孔板中激活血液或肿瘤的CD3+ T细胞。在选定的孔中,以1:5的GDT:T细胞比率加入γδT细胞。通过流式细胞术在72小时处测定由TNF-α和IFNγ所指示的T细胞激活。将激活的αβT细胞与血液和肿瘤的γδT细胞共培养,导致TNF-α和IFNγ信号传导受到抑制,表明来自3例癌症患者(结直肠癌,图3A、胰腺癌,图3B和胰腺癌,图3C)的γδT细胞是免疫抑制性的。
实施例5:PDOTS制备、处理和分析
PDOTS的制备如上文的实施例所述,并稍作修改(Jenkins等人,2017,Ex VivoProfiling of PD-1Blockade Using Organotypic Tumor Spheroids.Cancer Discov2月;8(2):196-215)。简而言之,接收新鲜的手术切除的人肿瘤标本置于冰上的DMEM培养基中,并在10cm的培养皿中切碎。将切碎的肿瘤重悬于DMEM+10%的FBS并含有100U/mL的IV型胶原酶中以获得球体。将部分消化的样品沉淀,然后重悬于新鲜的DMEM+10%的FBS中,并经过100mm过滤器和40mm过滤器进行过滤,生成S1(>100mm)、S2(40-100mm)和S3(<40mm)球体级分,随后将其在超低吸附组织培养板中维持培养。在加入含有酚红的10×PBS并使用NaOH调节pH值后,将S2级分的一个等分样进行沉淀并重悬于I型鼠尾胶原(浓度为2.5mg/mL)中。将S2级分的一个等分样进行沉淀并重悬于I型鼠尾胶原溶液中,然后将球体-胶原蛋白混合物注入DAX-1型3D微流控细胞培养芯片(Aim Biotech,Singapore)的中心凝胶区。在37℃30分钟后,以含有所示处理物,包括两种抗δ1抗体(以δ1-17和δ1-23为示例)和相关同种型的培养基对含有PDOTS的胶原蛋白水凝胶进行水合。将PDOTS保存在无菌容器中,并在标准的细胞培养箱中孵育。孵育持续3天后收集PDOTS,并通过流式细胞术进一步分析免疫变化。
如下表3所示,处理了20例PDOTS。“应答者”是指与同种型对照相比,对于三种标志物(CD44、TNFα和IFNγ)中的其中两种,显示出应答增加超过20%的PDOTS。代表性的结果显示在图4、5和12中。用本文描述的抗δ1抗体处理PDOTS引起胃肠道神经内分泌肿瘤样品(图4)、乳腺癌肝转移肿瘤样品(图5)、结直肠癌肝转移肿瘤样品(图12A)、肝神经内分泌肿瘤样品(图12B)、结直肠癌神经内分泌肿瘤样品(图12C)、肝细胞癌肿瘤样品(图12D)和结直肠癌(CRC)样品(图12E)中激活的T细胞增加。在结直肠癌肿瘤样品(图20A)和肝转移肿瘤样品(图20B)中,使用δ1-41获得了类似的激活的T细胞增加。
这些结果表明,抗δ1抗体阻断了γδT细胞的抑制功能,并使肿瘤球体内的CD4+和CD8+ T细胞得以激活。进过并列比较,测试的两种抗体都获得了类似程度的T细胞激活(图4和5)。
表3:PDOTS的数据汇总
诊断 总例数 应答者的数量 应答率(%)
CRC肝转移 7 5 71
HCC 6 5 83
CRC 4 3 75
CRC NET 1 1 100
肝NET 1 1 100
PDA 1 0 0
合计 20 15 75
实施例6:食蟹猴和恒河猴全血的免疫表型分析
为了进一步表征本文描述的抗δ1抗体,开发了用于食蟹猴和恒河猴全血的γ/δT细胞FACS方案。然后,将该方案用于评价抗δ1抗体的结合特异性。
将食蟹猴和/或恒河猴的全血样品抽取到NaHep管中并储存过夜。样品来源于正常或胰腺癌模型动物。首先,开发并优化了用于评价NHP全血中γ/δT细胞的FACS方案,然后将其用于评估本文描述的抗δ1抗体的结合特异性。
将商购抗体用作对照(AF647-抗广谱γ/δT:Biolegend 331214(据报道,与食蟹猴/恒河猴交叉反应);APC-抗vδ2 T:Biolegend 331418(阴性对照;与恒河猴交叉反应))。为了开发和优化对照方案,从生产商建议的2倍开始,使用8点滴定法,以2倍稀释,对来自患病的NHP受试者的新鲜全血滴定商购抗体。选定最佳滴定后,如下所示以完整的经优化对照方案对食蟹猴(n=6)和恒河猴受试者(n=6)(各有三只正常受试者和三只患病受试者)的全血进行染色:CD45/CD3/CD4/CD8/AF647-广谱γ/δT/APC-vδ2T/存活-死亡。使用合适的对照管进行门控。
在确认用商购抗体染色后,将来自2只患病受试者(1只恒河猴和1只食蟹猴)的全血用于以本文所述的抗δ1抗体染色。抗δ1抗体例如克隆δ1-39是荧光缀合的,并使用8点滴定曲线对全血进行滴定。包括对照染色,其使用完整的经优化方案组用商购抗体进行。在确认抗体结合后,如下所示以完整的经优化方案对6只食蟹猴和6只恒河猴受试者(各有三只正常受试者和三只患病受试者)的全血进行染色:对照方案:CD45/CD3/CD4/CD8/AF647-广谱γ/δT/APC-vδ2T/存活-死亡;测试方案:CD45/CD3/CD4/CD8/δ1 1-23γ/δT/APC-vδ2T/存活-死亡;染色对照:CD45/CD3/CD4/CD8/同种型对照/APC-vδ2T/存活-死亡。所有样品均在3激光器或5激光器Fortessa细胞仪上采集,并用FlowJo软件进行分析。
实施例7:在B6-TCRδ和对照C57BL/6J小鼠中,在小鼠Lewis肺癌和皮肤黑色素瘤的同源模型中,对两种免疫检查点抑制剂的体内评估
本研究旨在利用雌性(LLC)和雄性(B16F10)B6-TCRδ和对照C57BL/6J小鼠,评估两种免疫检查点抑制剂抗PD1和抗CTLA-4在小鼠Lewis肺癌(LLC)和皮肤黑色素瘤(B16F10)的同源模型中的抗肿瘤活性。
测试药剂:
本研究中使用的测试药剂(如下表5所示)按照Champions提供的说明书配制,并在研究期间的给药当天制备。
表5.测试药剂
Figure BDA0003238211330001511
实验设计:
预研究性动物
将重悬于100μl PBS中的3x105个LLC细胞单侧皮下移植到预研究性动物(雌性C57BL/6J小鼠或雌性γδKO C57BL/6J小鼠)的左侧胁腹部。
将重悬于100μl PBS中的5x105个B16F10细胞单侧皮下移植到预研究性动物(雄性C57BL/6J小鼠或雄性C57BL/6JγδKO小鼠)的左侧胁腹部。
研究性动物
移植后2-3天,记录每个实验的预研究肿瘤体积。当肿瘤达到50-100mm3(优选50-75mm3)的平均肿瘤体积时,根据肿瘤体积将动物匹配到治疗组或对照组中用于给药,并且在第0天开始给药。
将野生型C57BL/6J小鼠或γδKO小鼠随机分为五组,每组按下表6所示进行处理:
表6.处理情况
Figure BDA0003238211330001521
*每组最多9或10只小鼠
功效肿瘤体积
每周测量三次肿瘤体积。在研究达到终点的当天测量最终的肿瘤体积。如有可能,如果发现动物处于濒死状态,也测量最终的肿瘤体积。
肿瘤溃疡
肿瘤可以在早期时间点开始形成溃疡。在测量肿瘤体积后,每周三次对所有肿瘤应用三联抗生素软膏。溃疡超过肿瘤总表面积的50%或对总体健康状况和康乐有影响的小鼠将被实施安乐死。
功效动物体重
动物每周称重三次。在研究达到终点的当天测量最终体重,或者如有可能,如果发现动物处于濒死状态,也测量最终体重。与第0天相比,对表现出体重减轻≥10%的动物提供
Figure BDA0003238211330001531
并自由采食。任何动物在持续7天的时间内表现出超过20%的净体重减轻,或者如果小鼠与第0天相比显示出超过30%的净体重减轻,将被视为濒死并实施安乐死。
研究终止
功效:将研究终点定义为对照组(未删失(uncensored))的平均肿瘤体积达到1500mm3的时候。如果在第28天之前发生这种情况,对治疗组和个体小鼠的给药和测量将持续到第28天。如果对照组(未删失)的平均肿瘤体积在第28天未达到1500mm3,则将所有动物的终点均设为当对照组(未删失)的平均肿瘤体积达到1500mm3的那一天,最长为到第60天。
活体阶段采血收集:从下颌下静脉采集150μL血液。将血液转移至血清分离管,并在室温凝结至少15分钟。将样品在室温以3500RPM离心10分钟。分离得到的血清,转移到独特标记的透明聚丙烯管中,并立即在干冰上或在冷冻设备中冷冻以保持-80℃,直到装运。
数据收集、分析和报告
药剂毒性:从第0天开始,每天对动物进行观察,并使用电子秤每周称重三次;记录每组的数据,包括个体和平均克重(平均We±SD)、与第0天相比的平均体重变化百分比(%vD0),以及研究完成时绘制的%vD0。在研究完成时报告了每个治疗组的最大平均%vD0(体重最低点)。
结果
从第0天开始,每周用电子卡尺测量三次肿瘤尺寸,并记录每组的数据,包括个体和平均估算肿瘤体积(平均TV±SEM)。使用公式(1)计算肿瘤体积:TV=宽度2x长度x0.52。在研究完成时,使用初始(i)和最终(f)肿瘤测量值,通过公式(2)计算并报告每个治疗组(T)相对于对照组(C)的肿瘤生长抑制百分比(%TGI)值:%TGI=1-(Tf-Ti)/(Cf-Ci)。在连续两次测量中,将报告肿瘤体积=第0天测量值的30%的个体小鼠视为部分应答者(PR)。将缺乏可触及肿瘤(连续两次测量为0.00mm3)的个体小鼠归类为完全应答者(CR)。将持续到研究完成时的CR视为无肿瘤存活者(TFS)。使用以下公式测定媒介物处理组的肿瘤倍增时间(DT),DT=(Di-Df)*log2/(logTVi–logTV)f,其中的D=天,而TV=肿瘤体积。
如图13A和图13B所示,与未治疗小鼠或以所示的同种型对照治疗的小鼠相比,抗CTLA-4抗体成功地减小了γδ敲除LCC小鼠中的肿瘤体积,而在野生型小鼠中未观察到这种抗肿瘤效果。
在γδ敲除的黑色素瘤小鼠中,在给药后约第14天及以后(例如,给药后第17天)观察到抗PD-1抗体的抗肿瘤效果。如图13C和图13D所示。对于B16F10模型,对于4c组(抗PD-1C57BL/6J)与4d组(抗PD-1γδKO)的比较,使用非均衡双因素ANOVA(Bonferroni多重比较检验),直到第17天。在p<0.05的水平上(p=0.0410;交互因素)观察到的平均TV的减小是显著的。在第17天时,治疗效果显著(Bonferroni多重比较检验)。
这些数据表明,在缺乏γδT细胞的情况下,检查点抑制剂更有效。这些数据还表明,联合检查点抑制剂(抗PD1、抗CTLA4、抗PDL1)和阻断/抑制/消耗免疫抑制性的γδT细胞的治疗剂将有助于癌症治疗,例如,通过启用、挽救和增强抗癌免疫应答。被γδT细胞抑制的这种抗癌免疫应答包括但不限于由αβT细胞和其它抗癌效应器通路介导的应答,例如肿瘤微环境中的巨噬细胞、NK细胞、树突细胞。
实施例8.抗δ1抗体的稳定性分析
在使用之前将抗δ1抗体δ1-17和δ1-41储存在-80℃。在分析之前,将样品在37℃的水浴中解冻,并储存在冰上直至分析。在处理之前,使用Nanodrop在280nm处测量吸光度。然后,将样品浓缩至12mg/ml,并通过0.22μm的过滤器(Millipore;SLGV004SL)进行过滤。使用TOSOH TSKgel SuperSW mAb HR柱,通过SEC分析样品。通过SEC评估不同的解冻、储存和处理条件,并监测较高分子量峰的出现。
在本研究中,分析了经过一个周期的冷冻和解冻、浓缩和/或过滤的抗体克隆的稳定性。图14A和14B中显示的结果表明,δ1-17和δ1-41在高浓度(12mg/ml)都保持无聚集状态,并且可以经受单次冻融循环以及通过0.22uM过滤器的过滤。在4℃下储存10天后,δ1-17和δ1-41在相同条件下保持无聚集状态,如图14C和14D所示。而且,如图14E和14F所示,δ1-17和δ1-41在37℃和室温(24℃)储存过夜后,以及经过4次冷冻/解冻循环后,仍保持无聚集状态。克隆δ1-39也进行了类似的实验,并显示在图14G中。
实施例9.δ1-17和δ1-41的抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)和抗体依赖性细胞毒性(ADCC)分析
如下所述,使用基于微珠的ADCP测定法和基于细胞的ADCP测定法来评估δ1-17和δ1-41的抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)效应。
(i)使用磁珠进行ADCP测定法
以1:100的稀释度使用中性亲和素FluoSpheres黄/绿色荧光(505/515)(Invitrogen#F8776),并与10nM的生物素化的γ/δ复合物缀合。每孔共使用5ul的微珠悬浮液。将THP-1单核细胞系(ATCC#TIB-202)用作效应细胞,并以CellTraceTM远红外细胞增殖染料(Thermo cat#C34572)进行染色。将2x104个效应细胞加入到含有不同浓度的δ1-17和δ1-41的每个孔中,并在37℃孵育1小时。孵育后,将细胞重悬于含0.1%BSA的PBS中,并通过FACS进行分析。
如图15A-15C所示,δ1-17和δ1-41都能够在所有3种靶标固定化比率下介导ADCP,其中的10nM相对于同种型提供了最佳的特异性。结果表明,使用微珠作为靶标并在不同的靶标包被密度下,δ1-17和δ1-41能介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)。
此外,在1小时、4小时和24小时的时间点考察了ADCP效应。如图16A-16C所示,孵育1小时显示出最佳的吞噬概况,从而可以区分两种抗体克隆的功效。将吞噬评分计算为(%微珠阳性细胞×阳性群体的MFI)/106。结果表明,使用微珠作为靶标并在广泛的时间范围内,δ1-17和δ1-41可以介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)。
而且,将不同的生物素化靶标以10nM固定在用中性亲和素包被的荧光微珠上。δ1-17、δ1-39和δ1-41能够通过包被有人δ1和猴δ1受体的微珠介导ADCP,而同种型抗体未产生应答。图17所示。将吞噬评分计算为(%微珠阳性细胞×阳性群体的MFI)/106。结果显示,使用包被有人和猴靶标的微珠,δ1-17和δ1-41可以介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)。
(ii)基于细胞的ADCP测定法
以羧基荧光素琥珀酰亚胺酯(CFSE;eBioscience#65-0850-84)对细胞表面表达不同的δ和γ链组合的靶细胞进行染色。将THP-1单核细胞系(ATCC#TIB-202)用作效应细胞,并以CellTraceTM远红外细胞增殖染料(Thermo cat#C34572)进行染色。将靶细胞和效应细胞以1:1的比例混合(各2×104个细胞),并在37℃与所示不同浓度的δ1-17和δ1-41一起孵育1小时。孵育后,将细胞重悬于含0.1%BSA的PBS中,并通过FACS进行分析。
将表面上表达δ1/γ9TCR的靶细胞与抗体和THP-1效应细胞一起孵育不同的时间段,如图18A所示。孵育1小时显示出最佳的吞噬概况,从而可以区分两种抗体克隆的功效。结果表明,δ1-17和δ1-41可以使用表面表达δ1 TCR的靶细胞来介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)。
进一步地,将表面上表达δ1/γ9TCR的靶细胞与抗体和THP-1效应细胞一起孵育1小时。从测试的不同抗体浓度来看,5nM的浓度显示出最佳应答。如图18B所示。结果表明,δ1-17和δ1-41可以在广泛的抗体浓度范围内,使用表面表达δ1 TCR的靶细胞来介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)。
而且,将表面上表达不同TCR的靶细胞与5nM的抗体和THP-1效应细胞一起孵育1小时。所有测试的抗体克隆都显示出使用表达δ1而非表达δ2的靶细胞来介导ADCP的高度特异性。如图18C所示。结果显示,δ1-17和δ1-41可以使用表达δ1 TCR而非δ2 TCR的靶细胞来特异性介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)。
进行了类似的实验,以评估δ1-39是否可以介导抗体依赖性细胞吞噬(ADCP),以及由δ1-39介导的抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)是否对含有δ1 TCR的细胞具有特异性。将表达δ1/γ4、δ1/γ9或δ2/γ9的Jurkat细胞系用作靶细胞系。将细胞以1:1的效应细胞(THP-1单核细胞)与靶细胞的比例混合。以5nM的浓度加入δ1-39抗体、同种型或媒介物,并孵育1小时。通过流式细胞术测量吞噬程度,其通过首先对FarRed阳性效应细胞门控,然后对CFSE阳性靶细胞门控。如图26所示,无论γ与δ1的组合情况如何,由δ1-39介导的抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)对δ1 TCR具有特异性,但对δ2 TCR没有特异性。
(iii)抗体依赖性细胞毒性(ADCC)
以羧基荧光素琥珀酰亚胺酯(CFSE;eBioscience#65-0850-84)对细胞表面上表达不同的δ和γ组合的靶细胞进行染色。将THP-1单核细胞系(ATCC#TIB-202)用作效应细胞,并且不进行染色。在开始ADCC测定法之前,将效应细胞在Ficoll Paque Plus梯度(Sigma#GE17-1440-02)上分离以去除死细胞。将靶细胞和效应细胞以1:8的比例混合,并在37℃与如所示的100nM的δ1-17、δ1-39、δ1-41或同种型对照孵育1小时。孵育后,用PBS洗涤细胞,再以固定活力染料660(FVD660;eBioscience#65-0864-14)在4℃染色30分钟。然后,以含有0.1%BSA的PBS洗涤细胞,并通过FACS进行分析。
将表面上表达δ1/γ9TCR的靶细胞与抗体和NK92+CD16效应细胞一起孵育1小时和3.5小时。δ1-17、δ1-39和δ1-41能够介导ADCC(图19A和19B)。
还进行了类似的基于细胞的ADCC测定法,以评估δ1-39的ADCC效应。将表达额外FcγR的NK-92细胞用作效应细胞。将表达δ1/γ9的Jurkat(J.RT3-T3.5)细胞系用作靶细胞系,并以CFSE染料进行标记。将细胞以4:1的效应细胞与靶细胞的比例混合,并加入100nM的抗体(δ1-39抗体或同种型),一起孵育3.5小时(图25A和25B)。孵育后,用固定活力染料(FVD660)对细胞进行染色,并通过流式细胞术进行定量。如图25所示,δ1-39抗体促进抗体依赖性细胞毒性(ADCC)。
实施例10.中和δ1细胞在人HCC PDOTS中实现基于ICOS的免疫治疗
如以上实施例中所述制备人HCC PDOTS。与抗δ1IgG1抗体(以δ1-41为示例)或抗PD1抗体相比,测量了以同种型(hIgG1)处理的肿瘤样品(PDOTS)中的T细胞激活水平。在以δ1-41处理的PDOTS中,CD8+ T细胞中TNF-α的百分比和CD8+ T细胞中IFNγ的百分比都增加了。
接下来,在抗δ1抗体和PD-1抗体处理之间比较激活T细胞的能力。与PD-1抗体和同种型对照相比,以抗δ1抗体(以δ1-17为示例)处理来自肝细胞癌肿瘤样品的PDOTS引起激活的T细胞增加,这表明靶向γδT细胞比靶向单一检查点分子更有效地阻断γδT细胞的抑制功能。(图20B)。
检测了在共刺激受体激动剂(以ICOS激动剂为示例)存在的情况下激活T细胞的能力。与单独使用抗δ1抗体相比,以抗δ1抗体(以δ1-17为示例)与ICOS激动剂联合处理来自肝细胞癌肿瘤样品的PDOTS,引起激活的T细胞增加(图21A-21C)。
实施例11.抗δ1抗体介导外周血单核细胞(PBMC)的特异性细胞杀伤
首先,从健康人供体中分离出PBMC,然后与10nM的抗δ1抗体(以δ1-39为示例)一起孵育1小时。孵育之后,使用商购的试剂用DAPI、抗CD3、抗TCR抗体以及用δ1对细胞进行染色。图27所示的总存活细胞百分比表明,与同种型处理的细胞或未处理的细胞相比,δ1抗体对于PBMC中的杀伤作用更有效。
接着,从健康人供体和被诊断为结直肠癌的人类受试者中采集PBMC。将抗δ1-39用于特异性地鉴定健康人的PBMC(图31B)和来自患有结直肠癌的人类供体的PBMC(图31A)中的δT细胞,表明抗δ1-39mAb(例如本文所述的那些)可用于特异性地鉴定患者中的δ1 T细胞。
实施例12.测试δ1抗体用于流式细胞术
评估了δ1-39用于流式细胞术来检测δ1阳性细胞的的效用。采用胺反应性NHS酯染料试剂盒(Thermo货号62266),将抗δ1-39与Dylight650缀合。将缀合抗体脱盐,并使用固定于微珠上的δ1以及在细胞上表达的δ1来评估纯度、缀合程度和结合特性(数据未显示)。
从Stemcell获取健康的PBMC(货号70025.1)并处理以用于使用Dylight-650缀合的抗δ1-39以及市售的抗δ1(克隆TS8.2)、抗δ2-PE(克隆B6)、抗CD3(克隆UCHT-1)、抗TCR AB(克隆IP26)的染色。如图32所示的流式细胞术分析表明,仅在CD3+/TCR AB-细胞亚群(Q3门,方框区域)中观察到δ1阳性染色。在TCR AB+/CD3+或TCR AB-/CD3-门中,均未观察到以任何抗δ1特异性抗体进行的染色。而且,以抗δ1-39–Dylight-650获得的染色谱再现了以市售的抗δ1(克隆TS8.2)获得的染色谱。结果显示,抗δ1-39特异性地鉴定了健康人PBMC中的δT细胞,这表明抗δ1mAb(例如本文描述的那些,包括但不限于δ1-39)可以用于特异性地鉴定患者中的δ1 T细胞。
其它实施方案
本说明书中公开的所有特征可以以任何组合方式进行组合。本说明书中公开的每种特征可以由用于相同、等同或类似目的的备选的特征所替换。因此,除非另有明确说明,否则所公开的每种特征仅仅是通用系列的等同或类似特征的示例。
根据以上描述,本领域技术人员可以很容易地确定本发明的本质特性,并且在不脱离本发明的精神和范围的情况下,可以对本发明进行各种改变和修改,以使其适于各种用途和条件。因此,其它实施方案也在权利要求的范围内。
等同形式
尽管本文已经描述和说明了若干本发明的实施方案,但是本领域普通技术人员会很容易地设想出多种其它的途径和/或结构,以用于实现本文所述的功能和/或用于获得本文所述的结果和/或一种或多种有益效果,并且此类变更和/或修改中的任何一种都应视为处于本文所述的本发明实施方案的范围之内。更通常而言,本领域技术人员会很容易地理解到,本文所述的所有参数、尺寸、材料和构型仅意在示例性的,并且这些实际参数、尺寸、材料和/或构型将取决于特定应用或使用本发明所教导的应用。本领域技术人员会认识到或能够确定,仅采用常规实验就能够得到的本文所述特定的本发明实施方案的许多等同形式。因此,应当理解的是,上述实施方案仅以示例的方式呈现,并且处于所附权利要求及其等同形式的范围之内,除了所具体描述和要求保护的之外,还可以其它方式来实施本发明的实施方案。本公开的发明实施方案涉及本文所述的每种独特的特征、系统、物品、材料、试剂盒和/或方法。此外,如果此类特征、系统、物品、材料、试剂盒和/或方法并不互相抵触的话,两种或多种此类特征、系统、物品、材料、试剂盒和/或方法的任意组合依然包括在本公开的发明范围之内。
如本文所定义且使用的所有定义应当理解为优先于字典的定义、以引用方式并入的文件中的定义和/或所定义的术语的一般含义。
本文所公开的所有参考文献、专利和专利申请以引用方式结合到每一项所引用的主题,其中在某些情况下,所述主题可能包括整个文件的内容。
如在本文说明书和权利要求书中所用的,不定冠词“一个”和“一种”,除非有明确的相反说明,应当理解为意指“至少一个/种”。
如在本文说明书和权利要求书中所用的,短语“和/或”应当理解为意思是这样相结合的要素的“任一个或二者都”,即,在某些情况下这些要素以结合性的方式存在,而在其它情况下这些要素以分离的方式存在。使用“和/或”列出的多个要素应当以同样的方式来解释,即,这样相结合的要素的“一个或多个”。无论与那些明确指出的要素相关还是不相关,其它要素可以在除了通过“和/或”分句明确指出的要素之外任选地存在。因此,作为非限制性示例,当与开放式语言如“包括/包含”一起使用时,提及“A和/或B”在一个实施方案中可以指的是仅A(任选地包括除了B之外的要素);在另一实施方案中,可以指的是仅B(任选地包括除了A之外的要素);在又一实施方案中,指的是A和B二者(任选地包括其它要素);等等。
如在本文说明书和权利要求书中所用的,“或”应理解为与上文定义的“和/或”具有相同的含义。例如,当在列表中隔开项目时,“或”或“和/或”应解释为包含,即,包含至少一个,但也包括超过一个的要素数目或列表,以及任选地其它未列出的项目。只有明确指出与此相反的术语,例如“仅其中之一”或“恰好其中之一”,或者在权利要求中使用时,“由……组成”,才指的是包含要素数目或列表中的正好一个要素。一般而言,本文中使用的术语“或”,当前面有排他性的术语时,例如“任一”、“其中之一”、“仅其中之一”或“恰好其中之一”,仅应解释为表示排他性备选(即,“一个或另一个,但不是两个”)。“基本上由……组成”,当在权利要求中使用时,应具有如专利法领域中使用的一般含义。
如在本文说明书和权利要求书中所用的,在提及一个或多个要素的列表中,短语“至少一个”,应当理解为意指选自要素列表的任何一个或多个要素中的至少一个要素,而不必包括在要素列表内具体列出的各个和每个要素的至少一个并且不排除要素列表内的要素的任意组合。无论与那些明确指出的要素相关还是不相关,除了在短语“至少一个”涉及的要素列表内具体指出的要素之外,该定义还允许要素可以任选地存在。因此,作为非限制性示例,“A和B中的至少一个”(或等同地,“A或B中的至少一个”,或等同地,“A和/或B中的至少一个”)在一个实施方案中可以指的是至少一个(任选地包括不止一个)A,不存在B(并且任选地包括除了B之外的要素);在另一实施方案中,可以指的是至少一个(任选地包括不止一个)B,不存在A(并且任选地包括除了A之外的要素);在再一实施方案中,可以指的是至少一个(任选地包括不止一个)A和至少一个(任选地包括不止一个)B(并且任选地包括其它要素);等等。
还应理解的是,除非明确指出相反的情况,否则在本文要求保护的包括不止一个步骤或动作的任何方法中,该方法的步骤或动作的顺序不一定限于所记载的该方法的步骤或动作的顺序。

Claims (162)

1.一种分离的抗体,其结合T细胞受体的δ1链,其中所述抗体包含:
(i)包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3的重链可变区(VH),其中所述HC CDR1包含FTX1X2X3X4X5IH(SEQ ID NO:46),其中X1是F或V,X2是S或T,X3是G、A或S,X4是T、N或S,并且X5是D或S;其中所述HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53);并且其中所述HC CDR3包含PGX6YYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:48),其中X6包含S或M;和/或
(ii)包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3的轻链可变区(VL),其中所述LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55);其中所述LC CDR2包含X7ASSLX8S(SEQ ID NO:50),其中X7是S或A,并且X8是Y或Q;并且其中所述LC CDR3包含QQX9X10X11X12X13X14LIT(SEQ ID NO:51),其中X9是S或Q,X10是G、S或T,X11是D、K或S,X12是Y、W或不存在,X13是P或不存在,并且X14是D、F或Y,
其中所述分离的抗体不包含与δ1-17相同的重链和轻链CDR。
2.权利要求1所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共含有不超过10个氨基酸的相对于参照抗体的HC CDR的变异;和/或其中所述抗体的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3总共含有不超过8个氨基酸的相对于参照抗体的轻链CDR的变异,并且其中所述参照抗体选自下组:δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43。
3.权利要求1或权利要求2所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3总共与参照抗体重链的CDR共享至少90%的序列同一性,和/或其中所述抗体的LCCDR1、LC CDR2和LC CDR3总共与参照抗体的轻链CDR共享至少80%的序列同一性。
4.权利要求1-3中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与参照抗体的VH至少85%相同的VH,和/或与参照抗体的VL至少85%相同的VL
5.权利要求2-4中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与参照抗体相同的重链互补决定区和/或相同的轻链互补决定区。
6.权利要求5所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与参照抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
7.权利要求1所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共含有不超过10个氨基酸的相对于选自下组的抗体的HC CDR的变异:δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43;和/或其中所述抗体的LC CDR1、LCCDR2和LC CDR3总共含有不超过8个氨基酸的相对于选自下组的抗体的轻链CDR的变异:δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43。
8.权利要求7所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共与选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组的抗体的重链CDR共享至少90%的序列同一性,和/或其中所述抗体的LC CDR1、LCCDR2和LC CDR3总共与选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组的抗体的轻链CDR共享至少80%的序列同一性。
9.权利要求7或权利要求8所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组的抗体的VH至少85%相同的VH,和/或与选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组的抗体的VL至少85%相同的VL
10.权利要求7-9中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组的抗体相同的重链互补决定区和/或相同的轻链互补决定区。
11.权利要求5所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-18、δ1-19、δ1-20、δ1-21、δ1-22、δ1-23、δ1-24、δ1-25、δ1-26、δ1-27、δ1-28、δ1-31、δ1-32、δ1-33、δ1-34、δ1-35、δ1-36、δ1-37、δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41、δ1-42和δ1-43组成的组的抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
12.权利要求1所述的抗体,其中所述抗体包括:
(i)包含HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3的重链可变区(VH),其中所述HC CDR1包含基序FTFX1X2X3X4IH(SEQ ID NO:94),其中X1是S或T,X2是S或A,X3是N或S,并且X4是D或S,其中所述HC CDR2包含SIYSSSGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:53);并且其中所述HC CDR3包含DPGSYYWYYSGSAYEGYGLDY(SEQ ID NO:54);和/或
(ii)包含LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3的轻链可变区(VL),其中所述LC CDR1包含RASQSVSSAVA(SEQ ID NO:55);其中所述LC CDR2包含AASSLQS(SEQ ID NO:56);并且其中所述LC CDR3包含QQQSKYPFLIT(SEQ ID NO:51)。
13.权利要求12所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共含有不超过10个氨基酸的相对于参照抗体的HC CDR的变异;和/或其中所述抗体的LCCDR1、LC CDR2和LC CDR3总共含有不超过8个氨基酸的相对于参照抗体的轻链CDR的变异,并且其中所述参照抗体选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组。
14.权利要求12或权利要求13所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共与参照抗体的重链CDR共享至少90%的序列同一性,和/或其中所述抗体的LCCDR1、LC CDR2和LC CDR3总共与参照抗体的轻链CDR共享至少80%的序列同一性。
15.权利要求12-14中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与参照抗体的VH至少85%相同的VH,和/或与参照抗体的VL至少85%相同的VL
16.权利要求12-15中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与参照抗体相同的重链互补决定区和/或相同的轻链互补决定区。
17.权利要求16所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与参照抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
18.权利要求1所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共含有不超过10个氨基酸的相对于选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体的HCCDR的变异;和/或其中所述抗体的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3总共含有不超过8个氨基酸的相对于选自于δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体的轻链CDR的变异。
19.权利要求18所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共与选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体的重链CDR共享至少90%的序列同一性,和/或其中所述抗体的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3总共与选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40、δ1-41和δ1-42组成的组的抗体的轻链CDR共享至少80%的序列同一性。
20.权利要求18或权利要求19所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体的VH至少85%相同的VH,和/或与选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体的VL至少85%相同的VL
21.权利要求18-20中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体相同的重链互补决定区和/或相同的轻链互补决定区。
22.权利要求21所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-38、δ1-39、δ1-40和δ1-41组成的组的抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
23.权利要求1-22中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HCCDR3总共含有不超过10个氨基酸的相对于δ1-39的HC CDR的变异;和/或其中所述抗体的LCCDR1、LC CDR2和LC CDR3总共含有不超过8个氨基酸的相对于δ1-39的轻链CDR的变异。
24.权利要求23所述的分离的抗体,其中所述抗体的HC CDR1、HC CDR2和HC CDR3总共与δ1-39的重链CDR共享至少90%的序列同一性,和/或其中所述抗体的LC CDR1、LC CDR2和LC CDR3总共与选自由δ1-39组成的组的抗体的轻链CDR共享至少80%的序列同一性。
25.权利要求23或权利要求24中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与δ1-39的VH至少85%相同的VH,和/或与δ1-39的VL至少85%相同的VL
26.权利要求23-25中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与δ1-39相同的重链互补决定区和/或相同的轻链互补决定区。
27.权利要求26所述的分离的抗体,其中所述抗体包含与选自由δ1-39组成的组的抗体相同的重链可变区和相同的轻链可变区。
28.权利要求1-27中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体与人δ-1链和非人哺乳动物δ-1链交叉反应。
29.权利要求28所述的分离的抗体,其中所述非人哺乳动物δ-1链是非人灵长类动物δ-1链。
30.权利要求29所述的分离的抗体,其中所述非人灵长类动物δ-1链是食蟹猴δ-1链。
31.权利要求1-30中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体能够结合含有超过一条γ链的γδ1TCR。
32.权利要求1-31中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是全长抗体或其抗原结合片段。
33.权利要求32所述的分离的抗体,其中所述抗体是Fab、(Fab’)2或单链抗体。
34.权利要求1-32中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是人抗体或人源化抗体。
35.权利要求1-32和34所述的分离的抗体,其中所述抗体是全长抗体,其是IgG分子。
36.权利要求35所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1或IgG4分子。
37.权利要求36所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1分子。
38.权利要求36或权利要求37所述的分离的抗体,其中所述IgG1具有选自以下的一个或多个突变:(1)E333A突变;(2)S239D/A330L/I332E突变;(3)K326W/E333S突变;(4)S239D/I332E/G236A突变。
39.一种包含权利要求1-38所述的任一种抗体和药学上可接受的载体的药物组合物。
40.权利要求1所述的分离的抗体,其中所述抗体包括如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3),和/或包括如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
41.权利要求40所述的分离的抗体,其中所述抗体与人δ-1链和非人哺乳动物δ-1链交叉反应。
42.权利要求41所述的分离的抗体,其中所述非人哺乳动物δ-1链是非人灵长类动物δ-1链。
43.权利要求42所述的分离的抗体,其中所述非人灵长类动物δ-1链是食蟹猴δ-1链。
44.权利要求1-30中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体能够结合含有超过一条γ链的γδ1TCR。
45.权利要求40-44中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是全长抗体或其抗原结合片段。
46.权利要求40-45中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是人抗体或人源化抗体。
47.权利要求40-45中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是Fab、(Fab’)2或单链抗体。
48.权利要求40-45中任一项所述的分离的抗体,其是IgG分子。
49.权利要求40-46和48所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1或IgG4分子。
50.权利要求49所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1分子。
51.权利要求49或权利要求50所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1分子,其中所述IgG1具有选自以下的一个或多个突变:(1)E333A突变;(2)S239D/A330L/I332E突变;(3)K326W/E333S突变;(4)S239D/I332E/G236A突变。
52.权利要求50所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区,和/或如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
53.权利要求40或权利要求52中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体具有如SEQID NO:55所示的VL CDR1、如SEQ ID NO:56所示的VL CDR2、如SEQ ID NO:57所示的VLCDR3、如SEQ ID NO:56所示的VH CDR1、如SEQ ID NO:53所示的VH CDR2、如SEQ ID NO:54所示的VH CDR3,以及具有如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
54.权利要求40-46、48-50、52-53中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链,和/或如SEQ ID NO:78所示的轻链。
55.权利要求40-54中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL。
56.权利要求55所述的分离的抗体,其中所述抗体是全长抗体或其抗原结合片段。
57.权利要求55或权利要求56所述的分离的抗体,其中所述抗体是人抗体或人源化抗体。
58.权利要求57所述的分离的抗体,其中所述抗体是单链抗体。
59.权利要求55-57中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG分子。
60.权利要求59所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1或IgG4分子。
61.权利要求60所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1分子。
62.权利要求61所述的分离的抗体,其中所述抗体是IgG1分子,其中所述IgG1具有选自以下的一个或多个突变:(1)E333A突变;(2)S239D/A330L/I332E突变;(3)K326W/E333S突变;(4)S239D/I332E/G236A突变。
63.权利要求55-61中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区,和/或如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
64.权利要求63所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL,并具有如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
65.权利要求64所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。
66.权利要求65所述的分离的抗体,其中所述抗体是δ1-39。
67.权利要求55-66中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体与人δ-1链和非人哺乳动物δ-1链交叉反应。
68.权利要求67所述的分离的抗体,其中所述非人哺乳动物δ-1链是非人灵长类动物δ-1链。
69.权利要求68所述的分离的抗体,其中所述非人灵长类动物δ-1链是食蟹猴δ-1链。
70.权利要求1-69中任一项所述的分离的抗体,其中所述抗体能够结合含有超过一条γ链的γδ1TCR。
71.权利要求70、70A或70B所述的分离的抗体,其中所述抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。
72.一种包含权利要求1-71所述的任一种抗体和药学上可接受的载体的药物组合物。
73.一种包含权利要求1所述的抗体和药学上可接受的载体的药物组合物。
74.一种包含权利要求40所述的抗体和药学上可接受的载体的药物组合物。
75.一种包含权利要求53或55所述的抗体和药学上可接受的载体的药物组合物。
76.一种包含权利要求71所述的抗体和药学上可接受的载体的药物组合物。
77.一种分离的核酸分子,其包含编码权利要求1-71中任一项的抗体的重链可变区(VH)和/或轻链可变区(VL)的一种或多种核酸序列。
78.权利要求77所述的分离的核酸分子,其包含编码权利要求1-62中任一项的抗体的重链可变区(VH)的一种或多种核酸序列。
79.权利要求77所述的分离的核酸分子,其包含编码权利要求1-62中任一项的抗体的轻链可变区(VL)的一种或多种核酸序列。
80.权利要求77所述的分离的核酸分子,其包含编码权利要求1-71中任一项的抗体的重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的一种或多种核酸序列。
81.权利要求77-80中任一项所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码抗体的VH和/或VL,所述抗体包含如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1)、如SEQID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3),和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
82.权利要求77-81中任一项所述的分离的核酸分子,其包含编码以下抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和/或如SEQ ID NO:9所示的VL。
83.权利要求77-82中任一项所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码以下抗体的VH和/或VL,所述抗体包含如SEQ ID NO:31所示的HC恒定区和/或如SEQ IDNO:73所示的轻链恒定区。
84.权利要求83所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码G9.2-17的VH和/或VL。
85.一种分离的核酸分子,其包含编码权利要求1-71中任一项的抗体的重链(HC)和/或轻链(LC)的一种或多种核酸序列。
86.权利要求85所述的分离的核酸分子,其包含编码抗体的重链(HC)和/或轻链(LC)的一种或多种核酸序列,其中所述抗体包含:如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3),和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1)、如SEQ IDNO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
87.权利要求86所述的分离的核酸分子,其包含编码如SEQ ID NO:24所示的VH和/或如SEQ ID NO:3所示的VL的一种或多种核酸序列。
88.权利要求86-87中任一项所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码以下抗体的HC和/或LC,所述抗体包含如SEQ ID NO:31所示的HC恒定区和/或如SEQ IDNO:73所示的轻链恒定区。
89.权利要求88所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码以下抗体的HC和/或LC,所述抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL,以及如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
90.权利要求89所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码以下抗体的HC和/或LC,所述抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。
91.权利要求90所述的分离的核酸分子,其中所述一种或多种核酸序列编码G9.2-17的HC和/或LC。
92.一种载体,其包含权利要求77-91中任一项所述的分离的核酸分子。
93.权利要求91所述的载体,其中所述载体是表达载体。
94.权利要求92或权利要求93所述的载体,其中所述分离的核酸包含VH。
95.权利要求92或权利要求93所述的载体,其中所述分离的核酸包含VL。
96.权利要求92或权利要求93所述的载体,其中所述分离的核酸包含VL和VH。
97.权利要求92或权利要求93所述的载体,其中所述分离的核酸包含重链。
98.权利要求92或权利要求93所述的载体,其中所述分离的核酸包含轻链。
99.权利要求92或权利要求93所述的载体,其中所述分离的核酸包含轻链和重链。
100.权利要求92-99中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:31所示的HC恒定区和/或如SEQ IDNO:73所示的轻链恒定区。
101.权利要求92-100中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,其中所述抗体包含:如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3),和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1)、如SEQ IDNO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
102.权利要求92-101中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL,以及如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
103.权利要求92-102中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的VH和/或VL的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。
104.权利要求102或权利要求103所述的载体,其中所述核酸分子包含编码G9.2-17的VH和/或VL的一种或多种核酸序列。
105.权利要求92-104中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的HC和/或LC的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:31所示的HC恒定区和/或如SEQID NO:73所示的轻链恒定区。
106.权利要求104或权利要求105所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的重链(HC)和/或轻链(LC)的一种或多种核酸序列,其中所述抗体包含:如SEQ ID NO:68所示的重链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:53所示的重链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:54所示的重链互补决定区3(CDR3),和/或包含如SEQ ID NO:55所示的轻链互补决定区1(CDR1)、如SEQ ID NO:56所示的轻链互补决定区2(CDR2)和如SEQ ID NO:57所示的轻链互补决定区3(CDR3)。
107.权利要求104-106中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的HC和/或LC的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:24所示的VH和如SEQ ID NO:9所示的VL,以及如SEQ ID NO:31所示的重链恒定区和如SEQ ID NO:73所示的轻链恒定区。
108.权利要求104-107中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码抗体的HC和/或LC的一种或多种核酸序列,所述抗体包含如SEQ ID NO:79所示的重链和如SEQ ID NO:78所示的轻链。
109.权利要求104-108中任一项所述的载体,其中所述核酸分子包含编码G9.2-17的HC和/或LC的一种或多种核酸序列。
110.一种包含权利要求92-109中任一项所述载体的组合物。
111.一种包含权利要求92-109中任一项所述载体的宿主细胞。
112.根据权利要求111所述的宿主细胞,其中所述宿主细胞选自由大肠杆菌细胞、猿猴COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞组成的组。
113.一种抑制受试者中γδT细胞激活的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的权利要求62-77中任一项的药物组合物。
114.一种抑制受试者中γδT细胞激活的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的权利要求74-76中任一项的药物组合物。
115.一种抑制受试者中γδT细胞激活的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的包含δ1-39的药物组合物。
116.一种抑制受试者中γδT细胞激活的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的包含权利要求77-109中任一项的分离的核酸和/或载体的药物组合物。
117.权利要求113-116中任一项所述的方法,其中所述有需要的受试者是患有、怀疑患有或有风险患有实体癌的人类患者。
118.权利要求117所述的方法,其中所述受试者是患有选自下组的实体瘤的人类患者:胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌、上下胃肠道恶性肿瘤、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、卵巢癌和肉瘤。
119.权利要求113-118中任一项所述的方法,其还包括给受试者施用检查点分子的抑制剂、共刺激受体的激活剂、固有免疫细胞靶标的抑制剂、化疗剂或抗高血压剂。
120.权利要求119所述的方法,其中所述检查点分子选自由PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、LAG3、TIM-3、A2aR、TIGIT和VISTA组成的组。
121.权利要求119所述的方法,其中所述共刺激受体选自由OX40、GITR、CD137、CD40、CD27和ICOS组成的组。
122.权利要求119所述的方法,其中所述固有免疫细胞靶标选自由KIR、NKG2A、CD96、TLR、IDO和半乳糖凝集素-9组成的组。
123.权利要求113-122中任一项所述的方法,其中所述药物组合物的有效量足以在受试者中阻断γδT细胞的激活。
124.权利要求120所述的方法,其中所述检查点分子是PD-1且人类患者患有皮肤癌。
125.权利要求124所述的方法,其中所述皮肤癌是黑色素瘤。
126.权利要求120所述的方法,其中所述检查点分子CTLA-4且人类患者患有肺癌。
127.一种用于产生对T细胞受体的δ-1链特异性的抗体的方法,其包括:
(i)在允许表达所述抗体的条件下培养权利要求111或权利要求112所述的宿主细胞;然后
(ii)从细胞培养物中收获由此产生的所述抗体。
128.一种消耗和/或清除受试者中gd T细胞的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的权利要求62-77中任一项的药物组合物。
129.一种消耗和/或清除受试者中gd T细胞的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的权利要求74-76中任一项的药物组合物。
130.一种消耗和/或清除受试者中gd T细胞的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的包含δ1-39的药物组合物。
131.一种消耗和/或清除受试者中gd T细胞的方法,所述方法包括给有需要的受试者施用有效量的包含权利要求77-109中任一项的分离的核酸和/或载体的药物组合物。
132.权利要求131所述的方法,其中所述有需要的受试者是患有、怀疑患有或有风险患有实体癌的人类患者。
133.权利要求132所述的方法,其中所述受试者是患有选自下组的实体瘤的人类患者:胰管腺癌(PDA)、结直肠癌(CRC)、黑色素瘤、乳腺癌、肺癌、上下胃肠道恶性肿瘤、鳞状细胞头颈癌、泌尿生殖系统癌、卵巢癌和肉瘤。
134.权利要求131-133中任一项所述的方法,其还包括给受试者施用检查点分子的抑制剂、共刺激受体的激活剂、固有免疫细胞靶标的抑制剂、化疗剂或抗高血压剂。
135.权利要求134所述的方法,其中所述检查点分子选自由PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、LAG3、TIM-3、A2aR、TIGIT和VISTA组成的组。
136.权利要求135所述的方法,其中所述共刺激受体选自由OX40、GITR、CD137、CD40、CD27和ICOS组成的组。
137.权利要求135所述的方法,其中所述固有免疫细胞靶标选自由KIR、NKG2A、CD96、TLR、IDO和半乳糖凝集素-9组成的组。
138.权利要求128-137中任一项所述的方法,其中所述药物组合物的有效量足以消耗和/或清除受试者中的γδT细胞。
139.权利要求135所述的方法,其中所述检查点分子是PD-1且人类患者患有皮肤癌。
140.权利要求139所述的方法,其中所述皮肤癌是黑色素瘤。
141.权利要求135所述的方法,其中所述检查点分子是CTLA-4且人类患者患有肺癌。
142.一种用于鉴定或选择癌症患者并且任选地治疗所述癌症患者的方法,所述方法包括:
(i)提供有需要的受试者的血液样品,
(ii)测量血液样品中的δ1水平,和
(iii)根据血液样品中的δ1水平,将受试者鉴定为患有癌症或处于癌症风险中,其中受试者血液样品中的δ1水平相对于对照升高表明所述受试者患有癌症或处于癌症风险中。
143.权利要求142所述的方法,其中所述对照包括来自未患癌症的受试者的血液样品。
144.权利要求142所述的方法,其中所述对照包括预先设定的参考值。
145.权利要求142或权利要求143所述的方法,其中所述血液样品是血清样品或血浆样品。
146.权利要求142-145中任一项所述的方法,其中所述受试者是人类受试者。
147.权利要求142-146中任一项所述的方法,其中所述癌症选自由胰腺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)和结直肠癌组成的组。
148.权利要求142-147中任一项所述的方法,其中δ1的水平通过免疫测定法测量。
149.权利要求142-147中任一项所述的方法,其中所述免疫测定法是流式细胞术。
150.权利要求142-149中任一项所述的方法,其中所述免疫测定法使用权利要求1-71任一项所述的抗体。
151.权利要求142-150中任一项所述的方法,其中所述免疫测定法是流式细胞术并使用δ1-39。
152.权利要求142-151中任一项所述的方法,其中所述方法还包括进行一种或多种另外的诊断测定以确认所述癌症的存在。
153.权利要求142-152中任一项所述的方法,其中所述方法还包括给受试者施用抗癌疗法以治疗所述癌症。
154.权利要求153所述的方法,其中所述抗癌疗法包括给受试者施用有效量的抗δ1抗体。
155.权利要求154所述的方法,其中所述抗癌疗法包括给受试者施用有效量的权利要求1-71中任一项的抗δ1抗体。
156.权利要求155所述的方法,其中所述抗癌疗法包括给受试者施用有效量的δ1-39。
157.权利要求31所述的分离的抗体,其中所述抗体结合选自γ链3、4、5、8或9的一条或多条γ链。
158.权利要求31或权利要求31A所述的分离的抗体,其中所述抗体结合γ链3、4、5、8和9。
159.权利要求44所述的分离的抗体,其中所述抗体结合选自γ链3、4、5、8或9的一条或多条γ链。
160.权利要求44所述的分离的抗体,其中所述抗体结合γ链3、4、5、8和9。
161.权利要求70所述的分离的抗体,其中所述抗体结合选自γ链3、4、5、8或9的一条或多条γ链。
162.权利要求70或70A所述的分离的抗体,其中所述抗体结合γ链3、4、5、8和9。
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