具体实施方式
下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为从商业渠道购买得到的。
实验材料
1.病毒株
A/duck/Fujian/S1424/2020(H5N6)(简称DK/FJ/S1424/20)为2020年在我国福建活禽市场鸭中分离得到,由中国农业科学院哈尔滨兽医研究所国家禽流感参考实验室分离、鉴定和保存,该毒株记载文献:“现用重组禽流感病毒(H5+H7)三价灭活疫苗对近期H5和H7病毒抗原变异株的免疫效力研究”,刘艳晶等,《中国预防兽医学报》,2021年9月知网在线发表。申请人保证从申请日起二十年内可开放提供该生物材料。
2.SPF鸡胚及细胞
SPF鸡胚和SPF鸡,购自中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/国家禽类实验动物资源库,293T细胞(人胚肾细胞,SCSP-502)购自中国科学院典型培养物保藏委员会细胞库。
3.质粒载体
pBD载体(Zejun Li,Hualan Chen,Peirong Jiao,Guohua Deng,Guobin Tian,Yanbing Li, Erich Hoffmann,Robert G.Webster,Yumiko Matsuoka,and KangzhenYu.Molecular Basis of Replication of Duck H5N1 Influenza Viruses in aMammalian Mouse Model.J.Virol.2005, 79:12058-12064)由陈化兰研究员构建,将单向转录质粒载体pPolIsapIRib中包含聚合酶I 启动子-SapI克隆位点-鼠源核酶序列的XbaI酶切片段,反向插入pCI(Promega)质粒的 XbaI位点,形成RNA聚合酶II启动子(CMV)→病毒RNA转录终止信号序列Rib→流感病毒基因组cDNA(5’→3’)→人RNA聚合酶I启动子→mRNA转录终止PolyA信号序列 (SV40)构成的双向转录表达质粒载体,利用该载体可同时转录出流感病毒负链vRNA和正链 mRNA。插入A/PR/8/34(H1N1)毒株PB2,PB1,PA,NP,M和NS等6个内部基因的 pBD-PB2、pBD-PB1、pBD-PA、pBD-NP、pBD-M和pBD-NS载体由中国农业科学院哈尔滨兽医研究所国家禽流感参考实验室鉴定和保存(Guobin Tian,Suhua Zhang,YanbingLi, Zhigao Bu,Peihong Liu,Jiyong Zhou,Chengjun Li,Jianzhong Shi,Kangzhen Yu,Hualan Chen. Protective efficacy in chickens,geese and ducks of an H5N1inactivated vaccine developed by reverse genetics.Virology,2005,341:153-162)。
4.主要试剂
病毒RNA提取试剂盒购自北京天根生化科技有限公司;反转录试剂盒(ReverTraAce RT Kit)购自日本Toyobo公司;Ex-taq酶购自Takara公司;PCR产物纯化试剂盒(CYCLE-PURE-KIT)购自Omega公司;胶回收试剂盒(Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System)购自 Promega公司;测序试剂盒(ABI BigDye Terminator v3.1)购自美国Thermo Fisher公司;质粒提取试剂盒(QIAGEN Plasmid Midi Kit)购自QIAGEN公司。
5.引物
分析比较,设计合成H5N6流感分离株DK/FJ/S1424/20(H5N6)HA1、HA2和NA基因的特异性引物,合成引物序列见表1。
表1 H5N6禽流感病毒DK/FJ/S1424/20(H5N6)的HA和NA基因特异性引物序列
分析比较,设计合成A/PR/8/34(H1N1)的PB2、PB1、PA、NP、M、NS基因的特异性引物,合成引物序列见表2。
表2 流感病毒A/PR/8/34(H1N1)的6个内部基因片段的特异性引物序列
实施例1:重组H5N6流感病毒H5-Re13的制备与鉴定
1.重组病毒2个表面基因(HA和NA)的构建和鉴定:
提取H5N6亚型高致病性禽流感分离株DK/FJ/S1424/20(H5N6)的RNA,并将其反转录为cDNA,使用HA基因的HA1片段特异性引物(HA1-U:atg gag aaa ata gta ctt ctt cttt; HA1-L:gct cca aac agt cct cta gtt tcc ctt aga gga cta ttt ctg agc,其中HA1-L为突变HA裂解位点为低致病性病毒分子特征的引物)和HA2片段特异性引物(HA2-U:actaga gga ctg ttt gga gct ata gca gga t;HA2-L:tta aat gca aat tct gca ttg taac),利用RT-PCR方法,分别扩增出HA 基因的HA1和HA2片段(图1中A),并在扩增HA1基因片段的同时对HA裂解位点进行致弱突变修饰;然后以HA1、HA2为模板,HA1-U/HA2-L为引物,用phusion高保真聚合酶进行重叠延伸反应(SOE-PCR),扩增出裂解位点呈典型低致病性禽流感病毒分子特征(- RETR-)的HA片段(图1中A)。并将其克隆于pBD载体中,构建成pBD-HA重组质粒。
HA基因裂解位点的突变引物(HA1-L)根据HA基因多个连续碱性氨基酸位点的特异性序列设计,扩增后的HA基因裂解位点由-RERRRKR-突变为-RETR-,使其由高致病性禽流感病毒分子特征突变为典型低致病性禽流感病毒分子特征(图2)。
再利用RT-PCR方法,扩增上述高致病性H5N6毒株的NA基因全长(图1中A),按上述方法插入pBD载体中,构建成pBD-NA重组质粒。
2.重组病毒的拯救:
利用脂质体转染法,将上述HA、NA基因2个重组质粒和含有A/PR/8/34(H1N1)病毒内部基因的pBD-PB2、pBD-PB1、pBD-PA、pBD-NP、pBD-M、pBD-NS等6个重组质粒同时导入单层的293T细胞,48小时后收获细胞及上清,接种9~11日龄鸡胚尿囊腔,48小时后收获尿囊液并检测血凝(HA)活性。HA阳性样品即为救获的H5N6亚型低致病性重组病毒,将获得的重组病毒命名为A/Harbin/H5-Re13/2021(H5N6),株号为H5-Re13,保藏于位于中国武汉的武汉大学的中国典型培养物保藏中心,其保藏号为CCTCC NO:V202159。
3.重组病毒的序列鉴定
提取重组病毒H5-Re13的RNA,利用RT-PCR方法,分别扩增出重组病毒H5-Re13全基因组的8个片段,对PCR产物进行核酸凝胶电泳(图1中B),胶回收后测定每一片段的特定序列。
H5-Re13株HA基因序列如SEQ ID No.1所示,H5-Re13株NA基因序列如SEQ ID No.2所示,H5-Re13株PB2基因序列如SEQ ID No.3所示,H5-Re13株PB1基因序列如 SEQ ID No.4所示,H5-Re13株PA基因序列如SEQ ID No.5所示,H5-Re13株NP基因序列如SEQ ID No.6所示,H5-Re13株M基因序列如SEQ ID No.7所示,H5-Re13株NS基因序列如SEQ ID No.8所示。
利用DNAStar软件(DNAStar Lasergene V7.1),对测定的序列与野生毒株H5N6流感病毒国内分离株DK/FJ/S1424/20(H5N6)和流感病毒A/PR/8/34(H1N1)的序列进行序列比较,发现重组病毒H5-Re13的HA和NA来自于高致病性H5N6流感病毒国内分离株 DK/FJ/S1424/20(H5N6),但HA裂解位点呈典型低致病性流感病毒分子特征(-RETR-);6 个内部基因PB2、PB1、PA、NP、M及NS来自于鸡胚高度适应性的流感病毒 A/PR/8/34(H1N1)。
4.重组病毒H5-Re13生长曲线的测定
禽流感疫苗常用鸡胚生产,要求疫苗株在接种的鸡胚中具有良好的生长特性。本研究进行H5-Re13株病毒在鸡胚中的生长特性研究。将亲本病毒H5N6流感病毒流行株 DK/FJ/S1424/20(H5N6)和重组病毒H5-Re13接种2组SPF鸡胚各20枚,在最适36℃条件下分别培养24、48、72和96小时,分别取上述培养不同时间的各5枚鸡胚进行血凝测定,检测亲本毒株DK/FJ/S1424/20(H5N6)和重组病毒H5-Re13的生长曲线。
从试验结果可以看出重组病毒在36℃培养条件下,重组病毒的血凝效价远高于野生毒株H5N6流感病毒国内分离株A/duck/Fujian/S1424/2020(H5N6),72h时平均血凝效价最高 (9log2,即1:512),较野生病毒的平均最高血凝价(5.6log2,即1:48.5)高出10.6倍(图 3)。这说明本发明制备出了一株高生长滴度的重组病毒,将为以后的疫苗批量生产带来巨大的经济利益。
5.重组病毒H5-Re13的抗原性分析
抗原性是病毒是否可以作为疫苗株的关键指标。本研究将亲本H5N6流感病毒国内分离株DK/FJ/S1424/20(H5N6)与人工重组的H5N6流感病毒灭活后制备油乳剂灭活疫苗,免疫 SPF鸡制备抗血清,使用HI试验进行抗原性分析,HI试验方法参考高致病性禽流感诊断技术国家标准(GB)(GB/T118936-2020))。HI试验结果显示,亲本H5N6流感病毒国内分离株DK/FJ/S1424/20(H5N6)与人工重组的H5N6流感病毒与对应血清之间的交叉HI滴度无差异,表明H5N6病毒重组为鸡胚适应性的H5-Re13株后,病毒依然保持着亲本毒株的抗原性 (见表3)。
表3:亲本毒株DK/FJ/S1424/20(H5N6)与重组病毒H5-Re13株的抗原性分析
6.重组病毒H5-Re13株对鸡胚和鸡的致病力试验
疫苗毒株的低致病性是具有生物安全性的前提条件。9~11日龄SPF鸡胚和4~8周龄 SFP鸡经常作为禽流感病毒致病性评估模型。
为了解重组毒株的致病性,本发明首先使用SPF鸡胚进行病毒致病性的评估。9日龄的 SPF鸡胚(购自中国农业科学院哈尔滨兽医研究所/国家禽类实验动物资源库)20枚,随机分为 2组,每组10枚,第一组通过尿囊腔接种10-4倍稀释的重组H5-Re13株病毒液,第二组通过尿囊腔接种10-4倍稀释的亲本毒株DK/FJ/S1424/20(H5N6)的病毒液。接种后72小时内观察和记录鸡胚死亡情况。
本发明同时使用SPF鸡进行病毒致病性和感染能力的评估。6周龄的SPF鸡20只,随机分为2组,每组10只,将重组毒株H5-Re13和亲本毒株DK/FJ/S1424/20(H5N6)尿囊液分别稀释10倍后,静脉途径接种6周龄SPF鸡,接种后每日观察发病死亡情况,连续观察10 日,计算鸡静脉内接种致病指数(IVPI)。若IVPI大于1.2,则表明该毒株为高致病性毒株;若IVPI小于1.2,HA裂解位点为高致病性禽流感病毒分子特征,则为高致病性禽流感毒株;若IVPI小于1.2,HA裂解位点为低致病性流感病毒分子特征,则为低致病性禽流感毒株。
6周龄的SPF鸡20只,随机分为2组,每组10只,将重组毒株H5-Re13和亲本毒株 DK/FJ/S1424/20(H5N6)尿囊液分别稀释至106EID50/ml后,分别鼻腔途径接种6周龄SPF鸡各10只,0.1ml/只。接种后每日观察发病死亡情况,连续观察14日,同时采集喉头和泄殖腔拭子进行病毒滴定,评估病毒对鸡的感染能力。
所有的试验鸡均在拥有独立通风系统的负压隔离器里饲养,所有涉及H5N6高致病性病毒的试验均在生物安全三级实验室内进行。
SPF鸡胚致病试验结果显示,接种亲本毒株DK/FJ/S1424/20(H5N6)病毒液的鸡胚在接种后26~30小时内全部发病死亡,接种重组毒株H5-Re13株病毒液的所有鸡胚在接种后72 小时内均全部存活,表明H5-Re13株重组病毒对鸡胚无致病性。
SPF鸡静脉内接种致病指数(IVPI)测定试验结果显示,接种亲本毒株 DK/FJ/S1424/20(H5N6)病毒液的鸡在接种后1日内全部发病死亡,其IVPI为3.0;接种重组毒株H5-Re13株病毒液的所有鸡10日内均无任何不良反应发生,构建的H5-Re13株重组病毒IVPI为0(见表4)。表明H5-Re13株重组病毒为低致病性毒株,对鸡无致病性。
SPF鸡鼻腔感染试验结果显示,鼻腔接种亲本毒株DK/FJ/S1424/20(H5N6)病毒液的所有鸡在接种后2~3日内全部发病死亡;而鼻腔接种重组毒株H5-Re13株病毒液的所有鸡在14 日观察期内均无任何不良反应发生;感染DK/FJ/S1424/20(H5N6)病毒死亡的所有鸡喉头和泄殖腔拭子病毒检测均呈阳性,而感染H5-Re13株重组病毒的鸡在3日和5日拭子样品病毒检测均为阴性,表明H5-Re13株重组病毒为对鸡无感染和致病能力(见表4)。
以上结果表明,H5-Re13株重组病毒对鸡胚和鸡均无致病性,生物安全性高。
表4 H5-Re13株重组病毒的致病性和感染能力测定
*该组鸡在攻毒后2~3日内全部发病死亡,所有死亡鸡均排毒均计入攻毒后3日排毒结果;/该组鸡在攻毒后5日无存活。
7.重组病毒H5-Re13株的免疫原性评估
将HA价为8log2的重组病毒H5-Re13株以0.2%甲醛灭活后,以美国sornneborn品牌- 40(Lytol)白油为佐剂制备油乳剂灭活疫苗,以10只3周龄的SPF鸡为模型动物,0.3ml/只肌肉注射免疫,同时设10只不免疫对照鸡。免疫后21日检测所有鸡血清中HI抗体滴度,同时以100CLD50(CLD50为鸡半数致死量)的剂量攻击DK/FJ/S1424/20(H5N6)强毒,攻毒后观察14日,观察存活情况,并在攻毒后3日和5日采集喉头和泄殖腔拭子,接种鸡胚检测排毒情况。死亡鸡拭子样品随时采集。
结果显示,免疫21日时免疫鸡血清中针对重组病毒H5-Re13株的HI抗体滴度在7.0log2~10.0log2之间,平均滴度为8.1log2,而对照鸡血清针对重组病毒H5-Re13株的HI抗体滴度均<2.0log2(HI<2log2判定为HI抗体阴性);免疫后21日以鼻腔感染途径攻击DK/FJ/S1424/20(H5N6)强毒后14日内,所有免疫鸡健活,攻毒后3日和5日拭子样品病毒检测均为阴性;而对照鸡在攻毒后2~4日全部发病死亡,而且死亡鸡喉头和泄殖腔拭子样品病毒分离结果均为阳性(见表5)。
表5 H5-Re13株重组病毒制备疫苗免疫鸡后HI抗体和攻毒后存活及排毒情况
*该组鸡在攻毒后2~4日全部发病死亡,所有死亡鸡均检测排毒,排毒结果计入攻毒后3日排毒结果;/该组鸡在攻毒后5日无存活鸡。
以上结果表明,人工重组H5N6流感病毒H5-Re13株具有良好的免疫原性,能够预防H5N6亚型禽流感。
序列表
<110> 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心)
<120> 人工重组的H5N6流感病毒及其制备方法和应用
<160> 12
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1692
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
atggagaaaa tagtacttct tctttcagtg gttggccttg ttaaaagtga tcagatctgc 60
attggttacc atgcaaacaa ctcgacagag caggttgaca caataatgga aaaaaacgtc 120
actgttacgc atgcccaaga catactggaa aagacacaca acgggaagct ctgcgatctg 180
aatggagtga aacctctgat tttaaagaat tgtagtgtgg ctggatggct tcttggaaac 240
ccaatgtgcg atgagttcat cagcgtaccg gaatggtctt atatagtgga gagggccaac 300
ccagccaatg acctctgtta cccagggaac ctcaatgact atgaagaact gaaacaccta 360
ttgagcagaa taaatcattt tgagaagact cagatcatcc ccaaggagtc ttggtccaat 420
catacaacat caggagtgag cgcagcatgt ccataccaag gagtggcctc cttttttaga 480
aatgtggtat ggcttaccaa gaagaatgaa acatacccga caataaagaa gagctacaat 540
aataccaata aagaggacct tttgatacta tggggaattc atcattccaa cagtgtagag 600
gagcagacag atctctacaa gaacccaacc acctatgttt ccgttgggac atcaacacta 660
aatcagaggt tggtgccaaa aatagctacc agatcccaag taaatgggca acgtggaaga 720
atggatttct tctggacaat tttaagaccg aatgatgcaa tccacttcgg gagtaatgga 780
aattttatcg ctcctgaata tgcatacaaa atcatcaaga caggagactc aacaattatg 840
aaaagtgaaa tagaatatgg cgactgcaac agcaagtgtc aaactccgat aggggcgata 900
aactctagta tgccattcca caatatacac cctctcacta tcggggagtg ccccaaatat 960
gtgaaatcaa acaaattagt ccttgcgact gggctcagaa atagtcctct aagggaaact 1020
agaggactgt ttggagctat agcaggattt atagagggag gatggcaagg aatggtagat 1080
ggttggtatg ggtaccatca tagtaatgaa caggggagtg ggtacgctgc agacagagaa 1140
tccactcaaa aggcaataga tggggtcacc aacaaggtca actcgataat agacaaaatg 1200
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ttaaataaga aaatggaaga cggattccta gatgtctgga cttataatgc tgaactttta 1320
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gcaatcattg tggctggtct atctttatgg atgtgctcca atgggtcgtt acaatgcaga 1680
atttgcattt aa 1692
<210> 2
<211> 1380
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
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agcctgctaa taggaatcac caatttgggc ctaaatatcg gactacacta caaagtgagt 120
gattcaacaa ctataaacat tccaaacatg aatgagacca acccaacaac aacaaacatc 180
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tgtgaagtca actcatggca cattctatcg aaagacaatg cgataagaat aggtgaggat 300
gctcatatac tggtcacaag ggagccttac ctgtcctgtg atccacaagg ctgcagaatg 360
tttgctctga gtcagggcac aacactcaga gggcaacatg cgaatggaac catacatgat 420
aggagcccat ttcgagctct tataagttgg gaaatgggtc aagcacccag tccatacaat 480
actagggtcg aatgcatagg atggtcaagc acgtcatgcc atgatggcat atcgaggatg 540
tcagtatgca tatcaggacc taataacaat gcatcggcag tagtgtggta ccggggaaga 600
ccagtaacag aaatcccatc atgggctggg aacattctca gaactcaaga atcagaatgt 660
gtgtgccata aaggaatctg cccagtagtc atgacagatg gtccagcaaa caacaaggca 720
gctactaaaa tagtctactt aaaagaggga aagatacaaa agactgaaga actgcaaggg 780
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gactattggg caaacaagga gtgcttcaac ccttgttttt atgtggagct gatcaggggg 1260
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<211> 2280
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
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aagaggataa cggaaatgat tcctgagaga aatgagcaag gacaaacttt atggagtaaa 240
atgaatgatg ccggatcaga ccgagtgatg gtatcacctc tggctgtgac atggtggaat 300
aggaatggac caatgacaaa tacagttcat tatccaaaaa tctacaaaac ttattttgaa 360
agagtcgaaa ggctaaagca tggaaccttt ggccctgtcc attttagaaa ccaagtcaaa 420
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tcgcaactaa cgataaccaa agagaagaaa gaagaactcc aggattgcaa aatttctcct 600
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gaggaagagg tgcttacggg caatcttcaa acattgaaga taagagtgca tgagggatct 1080
gaagagttca caatggttgg gagaagagca acagccatac tcagaaaagc aaccaggaga 1140
ttgattcagc tgatagtgag tgggagagac gaacagtcga ttgccgaagc aataattgtg 1200
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attgggatat tgcccgacat gactccaagc atcgagatgt caatgagagg agtgagaatc 1440
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caacaaatga gggatgtgct tgggacattt gataccgcac agataataaa acttcttccc 1860
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<211> 2274
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
atggatgtca atccgacctt acttttctta aaagtgccag cacaaaatgc tataagcaca 60
actttccctt ataccggaga ccctccttac agccatggga caggaacagg atacaccatg 120
gatactgtca acaggacaca tcagtactca gaaaagggaa gatggacaac aaacaccgaa 180
actggagcac cgcaactcaa cccgattgat gggccactgc cagaagacaa tgaaccaagt 240
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ggtatttttg aaaactcgtg tattgaaacg atggaggttg ttcagcaaac acgagtagac 360
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