CN111471743A - 一种基于脲酶的microRNA检测试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种microRNA let‑7a的检测试剂盒,属于分子检测领域。所述试剂盒包括分子识别试剂和信号转换试剂;所述分子识别试剂是一类嵌有银离子的DNA双链分子,所述DNA双链分子由底物链和错配链碱基互补配对而成,其中底物链与错配链各有一个胞嘧啶碱基C,在银离子的作用下相互配对;所述信号转换试剂由脲酶、尿素和苯酚红组成。当样品中存在let‑7a时,let‑7a与错配链竞争性结合底物链,置换出错配链,银离子游离出来,抑制脲酶活性,尿素‑苯酚红溶液体系始终保持黄色;若没有let‑7a,尿素‑苯酚红溶液体系呈红色。本发明的试剂盒具有良好的稳定性、灵敏度和便捷性。
Description
技术领域
本发明属于分子检测领域。
背景技术
癌症又称恶性肿瘤,是威胁世界健康的一个关键因素,是世界范围内由疾病引起死亡的一个主要原因。microRNAs是一种序列长度为18nt~24nt的小型非编RNA基因产物。microRNA通常通过与靶信使RNA(mRNAs)的3’端非翻译区相互作用来调节蛋白质水平,而且往往在癌症组织中的表达是异常的。
let-7族的microRNA能够下调RAS、HMGA2和MYC等致癌蛋白的表达,因而通常被认为是抑癌基因,在非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤组织中的表达远远低于正常组织中表达,常常被作为肺癌生物传感器的目标检测物。
成熟microRNA的长度较短,加之其具有序列同源性,序列差异只有一到两个碱基,因此,microRNA检测具有很大的挑战性。目前,microRNA的检测方法主要有实时荧光定量RT-PCR、定量即时聚合酶链锁反应qRT-PCR、Northern印迹分析和微阵列芯片技术。但是,这些检测所需的仪器设备价格昂贵、实验室条件要求严格,检测过程操作复杂、检测时间长,操作技术要求高,难以在一般条件的科研机构或者临床单位开展。近年来,恒温核酸扩增技术在microRNA检测领域逐渐发展起来。滚环扩增(RCA)、环介导恒温扩增(LAMP)以及指数扩增反应(EXPAR)等恒温扩增技术的发展使得microRNA的检测达到了较高的灵敏度,检测成本也降低了,但大多数恒温扩增技术反应时间较长,反应机理较为复杂,难以满足临床检测的需求。因此,开发操作简单、便携,能对样品进行实时现场分析,适用于临床应用和个体医疗的microRNA检测的研究热点。
DNA碱基与重金属离子间存在错配反应,其基本原理是:原本不配对的碱基X与X,在加入离子M后,会形成X-M-X的结构而形成化学键,互补配对。比较常见的配对方式包括T-Hg2+-T配对,以及C-Ag+-C配对。该原理经常用于检测重金属离子,例如:文献【A simple“molecular beacon”-based fluorescent sensing strategy for sensitive andselective detection of mercury(ii).Chemical Communications,2011,47(44):12158.】公开了一种汞离子检测方法,用到两种分子:茎环结构DNA分子甲和单链DNA分子乙;分子甲的茎部分2个末端分别修饰荧光基团和淬灭基团,正常情况下不会发出荧光。但当汞离子存在时,对前述两种分子的混合溶液进行加热变性,再降温复性,即可得到T-Hg2+-T碱基对,部分分子甲无法恢复成原来的发夹结构,其荧光基团和淬灭基团相互远离,荧光基团即可释放荧光。
目前,DNA碱基与重金属离子间的错配反应原理尚未见用于核酸分子的检测。
发明内容
本发明要解决的问题是:提供一种全新的let-7a检测试剂盒。
本发明的技术方案如下:
一种microRNA let-7a的检测试剂盒,它包括分子识别试剂和信号转换试剂;
所述分子识别试剂是一类嵌有银离子的DNA双链分子,所述DNA双链分子由底物链和错配链碱基互补配对而成,其中底物链与错配链各有一个胞嘧啶碱基C,在银离子的作用下相互配对(即形成C-Ag+-C碱基对);所述嵌有银离子的DNA双链分子中,银离子、底物链和错配链的终浓度物质的量之比为1:1:1;
所述底物链序列如SEQ ID NO.1所示,或在SEQ ID NO.1基础上向5’端延伸2~8个碱基;所述错配链序列如SEQ ID NO.6所示,或在SEQ ID NO.6基础上向3’端延伸2~8个碱基;错配链延伸的长度与底物链延伸的长度一致;
所述信号转换试剂包括:a)脲酶;b)尿素和苯酚红的混合溶液;
脲酶和尿素的摩尔浓度比例为1:(107~2×107);苯酚红和尿素的摩尔浓度比为:1:(5×102~3×103)。
如前述的检测试剂盒,脲酶浓度为100mM;
和/或,每50μL尿素和苯酚红的混合溶液的配置方法为:取10μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,10μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到30μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。
如前述的检测试剂盒,所述底物链序列如SEQ ID NO.1所示,错配链序列如SEQ IDNO.6所示;
或,所述底物链序列如SEQ ID NO.2所示,错配链序列如SEQ ID NO.7所示。
如前述的检测试剂盒,所述底物链序列如SEQ ID NO.3所示,错配链序列如SEQ IDNO.8所示。
如前述的检测试剂盒,所述底物链序列如SEQ ID NO.4所示,错配链序列如SEQ IDNO.9所示。
如前述的检测试剂盒,所述底物链序列如SEQ ID NO.5所示,错配链序列如SEQ IDNO.10所示。
如前述的检测试剂盒,所述试剂盒还包括let-7a标准品。
如前述的检测试剂盒,所述试剂盒中的试剂被固定到试纸上,试纸分为不同区域,尿素和苯酚红、分子识别试剂、脲酶分别位于3个不同区域;
所述试纸为滤纸,优选的,为水性微孔滤纸。
优选的,试纸以普鲁兰多糖为保护剂,以隔绝氧气。
一种非诊断目的的microRNA let-7a的检测方法,它是使用权利要求1~8任一所述试剂盒检测let-7a的方法。
如前述的方法,包括如下步骤:
1)分子识别试剂与样本在室温接触30~90min;
2)脲酶与步骤1)中分子识别试剂在室温接触40min;
3)尿素和苯酚红溶液与步骤2)中脲酶接触30min;
4)肉眼观察颜色变化,或测定560nm波长下的紫外吸收强度值;
步骤2)中,脲酶和银离子的摩尔浓度比例为1:(10~50)。
本发明的试剂盒工作原理是:分子识别试剂中,底物链和错配链通过Ag+错配形成C-Ag+-C碱基对,分子识别试剂与let-7a接触后,let-7a会与错配链竞争性结合底物链(无需加热变性再降温复性),置换出错配链,打开C-Ag+-C碱基对,释放Ag+。Ag+会使脲酶活性降低,此时尿素得不到有效降解,含有尿素、苯酚红的混合溶液保持原有的黄色;当环境中没有let-7a,Ag+无法得到释放,脲酶活性正常,含有尿素、苯酚红的混合溶液的颜色会转为红色。
本发明的试剂盒是对DNA碱基与重金属离子间的错配反应原理的创新运用。其与现有技术的区别主要在于:现有技术中检测信号的产生依赖错配碱基从无到有;而本发明借助逆向思维,其检测信号的产生依赖错配碱基从有到无。
本发明的试剂盒具有如下有益效果:
1)灵敏度高。可检测浓度低至2.808pM的let-7a。
2)特异性好。可特异性识别错配2个碱基以上的目标分子。
3)检测方便。检测过程不需要加热,检测结果肉眼可见,且能将试剂固定到试纸上,进一步简化操作。
需要指出的是,本发明中“置换”、“置换反应”指由正确配对的碱基置换出错配碱基(C-Ag+-C)的过程,并非化学领域中定义的“置换反应是单质与化合物反应生成另外的单质和化合物的化学反应”。
显然,根据本发明的上述内容,按照本领域的普通技术知识和惯用手段,在不脱离本发明上述基本技术思想前提下,还可以做出其它多种形式的修改、替换或变更。
以下通过实施例形式的具体实施方式,对本发明的上述内容再作进一步的详细说明。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实例。凡基于本发明上述内容所实现的技术均属于本发明的范围。
附图说明
图1是采用本发明提供的比色感器检测let-7a的原理示意图。
图2是实施例2绘制的标准曲线。
图3是实施例3中检测病人肺癌组织和癌旁组织中let-7a的结果。
图4是实施例4中比色传感器对不同的C-C错配数量的测试结果。
图5是实施例5中该比色传感器对let-7a的特异性选择性测试结果。
图6是试纸检测原理示意图。
图7是实施例6中检测病人肺癌组织和癌旁组织中let-7a的结果。
具体实施方式
实施例1制备双链DNA溶液
本实施例中,制备双链DNA溶液,该双链DNA在检测miRNA过程中起到分子识别的作用。
首先合成底物链和错配链,其序列如表1所示。
toehold结构,指双链DNA末端无法配对的单链部分。表1中,底物链/错配链序列的划线部分为toehold结构,链的序号均以toehold长度定义。具有相同序号的底物链和错配链各自成对,相互配合使用,例如序号3nt的底物链(sSub-3nt)与序号3nt的错配链(mSub-3nt)配合使用。
toehold紧靠未划线序列的碱基都是C,C与C无法互补配对,因此整个每对sSub和mSub的toehold区域无法进行碱基互补配对,除非加入了银离子。
表1 底物链(sSub)和错配链(mSub)的序列
合成双链DNA(分子识别试剂)的具体方法如下:
将5μL浓度为2μM的Ag+,5μL浓度为1μM的DNA底物链(sSub-5nt),5μL浓度为1μM的DNA错配链(mSub-5nt)加入到15μL缓冲液(1M NaNO3,pH=6.9)中,置于PCR管中,保持总体积30μL。在90℃下孵育5min,室温下孵育30min,使银离子参与反应,形成C-C结构(银离子作用下胞嘧啶配对),底物链和错配链互补形成双链结构,该过程如图1中第一个箭头所示。
重复前述操作,制备得到若干份双链DNA溶液,每份30μL。
实施例2绘制标准曲线
本实施例中,绘制标准溶液曲线,步骤如下:
①取实施例1制备的含有C-C结构的双链DNA溶液30μL,向其中加入10μL浓度为0nM的let-7a溶液,在室温放置30min进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL超纯水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育30min,得到反应混合液。
②取10μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,10μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到30μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。
③将①,②制得的溶液混合,室温下反应20min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录该let-7a浓度下的紫外吸收强度值;
④依次使用let-7a浓度分别为100fM、1pM、10pM、100pM、1nM、10nM、100nM、200nM、500nM、1000nM的乙let-7a溶液代替步骤①中的使用的let-7a溶液,重复步骤①,②,③的操作,测定紫外吸收值,以let-7a溶液浓度为横坐标,以该let-7a溶液浓度下的紫外吸收为为纵坐标绘制标准曲线。拟合出的标准曲线的回归方程为y=-0.064x+0.4907,LOD(最低检测限)=2.808pM其中,y代表紫外吸收度,x代表let-7a浓度,标准曲线如图2所示。
小结:本实施例一方面得到了标准曲线;另一方面验证了本发明试剂盒灵敏度高,LOD为2.808pM。
实施例3临床检测
本实施例中,检测来自5位肺癌病人癌症组织和癌旁组织中let-7a的浓度,并分析其显著性差异,步骤如下:
(1)取5位的肺癌病人癌症组织和癌旁组织的,依次记作1#~5#,癌症组织记为C,癌旁组织记为A,提取1#~5#组织的总RNA,制成RNA水溶液。
(2)RNA水溶液的let-7a检测
①取实施例1中制备的含有C-C结构的双链DNA溶液两份(30μL),依次向其中加入1#A和1#C样品溶液,在室温放置30min进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL超纯水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育30min,得到反应混合液。
②取10μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,10μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到30μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。
③将①,②制得的溶液混合,室温下反应20min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录该肺癌病人1#A和1#C组织let-7a的紫外吸收强度值;
④依次使用2#~5#肺癌病人的癌症组织和癌旁组织代替步骤①中的1#样品溶液,重复步骤①,②,③的操作,得到2#~12#肺癌病人样品的紫外吸收光度值并记录;
⑤将1#~5#肺癌病人的癌症和癌旁组织总RNA溶液的紫外吸收光度值分别代入标准曲线的回归方程中,计算出各病人癌症组织和癌旁组织中let-7a的浓度。
结果:如图3所示,其中有十个病人的癌症组织和癌旁组织中let-7a的含量具有显著性差异。由图中误差条(error bar)还可知晓,每次重复检测的结果差别很小,表明检测可重复性良好。
结论:本发明的方法或者其衍生的试剂盒可用于临床检测,得到可靠的检测结果。
实施例4双链DNA C-C错配数量对结果的影响
本实施例中,检测不同的C-C错配数量的紫外吸光度值
①将5μL浓度为2μM的Ag+,5μL浓度为1μM的DNA底物链,5μL浓度为1μM的DNA错配链加入到15μL缓冲液(1M NaNO3,pH=6.9)中,置于PCR管中,保持总体积30μL。在90℃下孵育5min,室温下孵育30min,使银离子参与反应,底物链和错配链互补形成双链结构形成含有一个C-C结构的双链DNA溶液,底物链和错配链的序列如表1中sSub-5nt,mSub-5nt。
②取①中制备的含有C-C结构的双链DNA溶液一份(30μL),依次向其中加入溶液10μL浓度为2μM的let-7a溶液,在室温放置30min进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL超纯水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育30min,得到反应混合液。
③取10μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,10μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到30μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。
④将①,②制得的溶液混合,室温下反应20min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录let-7a的紫外吸收强度值;
⑤依次使用sSub-C2、sSub-C3代替①中的mSub-5nt,mSub-C2、mSub-C3代替①中mSub-5nt,重复步骤①,②,③,④的操作,得到紫外吸收光度值并记录。sSub-C2、sSub-C3、mSub-C2、mSub-C3的序列如表2所示。
表2 C-C错配数为2或3的序列
名称 | SEQ ID NO. | 序列 |
sSub-C<sub>2</sub> | 11 | <u>TGCAC</u>AACTATACAACCTACTACCTCA |
sSub-C<sub>3</sub> | 12 | <u>CGCAC</u>AACTATACAACCTACTACCTCA |
mSub-C<sub>2</sub> | 13 | TAGGTTGTATAGTT<u>CTCCA</u> |
mSub-C<sub>3</sub> | 14 | TAGGTTGTATAGTT<u>CTCCC</u> |
注:划线部分为toehold。
结果:实验结果如图4所示,C-C错配数量越高,阳性对照和阴性对照之间的信号差别就越小。
结论:C-C错配数越低,检测信噪比越高;C-C错配数为1时,检测检测信噪比最高。
实施例5对靶分子的选择特异性
本实施例中,检测本发明方法对let-7a的选择特异性。
(1)用超纯水分别配制2μM的sSub-1nt、sSub-3nt、sSub-5nt、sSub-7nt、sSub-9nt、mSub-1nt、mSub-3nt、mSub-5nt、mSub-7nt、mSub-9nt的DNA溶液和2μM的let-7a、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7g核酸溶液;并使用实施例1的方法将所有的sSub和mSub成对制备成双链DNA溶液。
②取①中制备的含有C-C结构的双链DNA溶液一份(30μL),依次向其中加入溶液10μL浓度为2μM的let-7a溶液,在室温放置30min进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL超纯水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育30min,得到反应混合液。
③取10μL浓度为2.5mM苯酚红的溶液,10μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到30μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。
④将①,②制得的溶液混合,室温下反应20min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录let-7a的紫外吸收强度值;
⑤依次使用let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7g和超纯水代替②中的let-7a,重复步骤②,③,④的操作,得到紫外吸收光度值并记录。
let-7a、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7g的序列如表3所示。
表3 被检miRNA的序列
名称 | SEQ ID NO. | 序列 |
let-7a | 15 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
let-7b | 16 | UGAGGUAGUAGGUUGUgUgGUU |
let-7c | 17 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUgGUU |
let-7d | 18 | aGAGGUAGUAGGUUGcAUAGU |
let-7e | 19 | UGAGGUAGgAGGUUGUAUAGU |
let-7f | 20 | UGAGGUAGUAGaUUGUAUAGUU |
let-7g | 21 | UGAGGUAGUAGuUUGUAcAGU |
注:序列中小写字母为相对于let-7a突变的碱基。
结果:
如图5所示,在检测正确的miRNA样本(let-7a)时,随着toehold长度的增加,检测信号强度逐渐降低;其中,toehold长度在1~7nt时,检测信号强度都处于高位。对于不同toehold长度的双链DNA,均能够有效区分水和miRNA样本。
当用于辨别正确的miRNA样本(let-7a)与双碱基突变的错误miRNA样本(let-7b,let-7g)时,本发明仍具有较好的特异性。
当用于辨别正确的miRNA样本(let-7a)与单碱基突变的错误miRNA样本(let-7c,d,e,f)时,本发明的特异性明显降低,仅能区分let-7a与某些特定单碱基突变的miRNA,例如let-7d。
结论:
本发明对2碱基以上突变的miRNA样本能有效辨别,具有良好的特异性。
实施例6试纸的制备与检测
本实施例中,使用试纸检测取自12个肺癌病人癌症组织和癌旁组织中let-7a的浓度。
1.试纸的制备
(1)在滤纸上打孔,制作如图6所示的折纸。
(2)制备反应液。
①制备50μL浓度为400nM的Ag+溶液。
②将5μL浓度为4μM的Ag+,5μL浓度为4μM的DNA底物链,5μL浓度为4μM的DNA错配链加入到15μL缓冲液(1M NaNO3,pH=6.9)中,加水20μL置于PCR管中,保持总体积50μL。在90℃下孵育5min,室温下孵育30min,使银离子参与反应,形成C-C结构,底物链和错配链互补形成双链结构。
③制备50μL浓度为12nM的脲酶溶液。
④取20μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,20μL浓度为5M的尿素水溶液,5g普鲁兰多糖室温下加入到10μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。当尿素-苯酚红混合溶液加入到试纸中时,普鲁兰多糖起到隔绝氧气,减缓氧化,延长试纸有效期限的作用。
(3)将反应液加到相应的孔中,制作检测试纸。
在②面相应的孔中分别加入4μL超纯水,4μL步骤①制得的Ag+溶液,剩余两个孔中分别加入4μL步骤②制得的含有C-C结构的DNA双链。在③面的四个孔中分别加入4μL步骤③制得的脲酶溶液。在④面的四个孔中分别加入4μL步骤④制得的尿素-苯酚红混合溶液,制成检测试纸。
制备过程如图6左栏所示。
2.检测(如图6右栏所示)
1)加水到试纸的①面和②面的孔里;
2)折叠试纸,使②面和③面上面的孔成对贴紧,室温静置30min;此步骤目的是混合DNA双链和脲酶;
3)加样到①面的其中两个孔里,将①面折叠到②③面上,室温静置30min;此步骤目的是将样本与DNA双链混合,如有let-7a存在,let-7a会将DNA双链中的错配链置换掉,C-C中嵌合的银离子会逃离双链结构,进而抑制脲酶活性;
4)折叠①②③面到④面,室温静置20min;此步骤引入尿素-苯酚红混合溶液,使其与脲酶接触;
5)观察颜色,黄色表示检测到let-7a,红色表示未检测到let-7a。
3.结果
实验结果如图7所示,3~5#病人癌旁组织检测到let-7a,其癌组织未检测到let-7a;1~2#病人癌旁组织和癌组织均未检测到let-7a。
4.结论
本发明方法中的试剂集成到试纸后,操作简便,结果可读性强。
实施例7置换反应条件测试
本实施例中,对比本专利let-7a置换条件与其他置换条件的置换效果。
A组:
①取实施例1制备的含有C-C结构的双链DNA溶液一份(30μL),向其中加入10μL浓度为2μM的let-7a溶液,在室温放置30min进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL分子水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育40min,得到反应混合液。
②取30μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,30μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到90μL分子水中,得到尿素-苯酚红混合溶液150μL。
③取50μL②制得的尿素-苯酚红溶液与①混合,室温下反应20min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录该let-7a浓度下的紫外吸收强度值为0.108±0.002。
B组:
④取实施例1制备的含有C-C结构的双链DNA溶液一份(30μL),向其中加入10μL浓度为2μM的let-7a溶液,在室温放置15min(本专利置换时间为30~90min)进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL分子水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育40min,得到反应混合液。
⑤取50μL②制得的尿素-苯酚红溶液与④混合,室温下反应20min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录该let-7a浓度下的紫外吸收强度值0.638±0.011。
C组:
⑥取实施例1制备的含有C-C结构的双链DNA溶液一份(30μL),向其中加入10μL超纯水,在室温放置30min进行置换反应。然后加入6μL浓度为100nM的脲酶,4μL分子水混匀,保持总体积50μL,后在室温下孵育40min,得到反应混合液。
⑦取50μL②制得的尿素-苯酚红溶液与④混合,室温下反应30min,在560nm的波长下测定反应混合液的紫外吸收,记录不加let-7a时反应混合液的紫外吸收强度值0.742±0.012。
对比A、C组的紫外吸收强度值,发现在本发明的置换条件(置换时间为30~90min)下,置换效果明显;而对比B、C组,在本发明的置换条件外,置换效果很差,几乎不发生置换;结合A、B、C三组,发现,在本发明探索出的置换条件可以得到理想的置换效果。
综上,本发明的miRNA检测方法具有较高的灵敏度、特异性和稳定性;无需借助可编程加热装置、荧光检测装置,检测过程方便快捷;可集成到试纸上,可进一步简化检测操作。
SEQUENCE LISTING
<110> 四川大学华西医院
<120> 一种基于脲酶的microRNA检测试剂盒
<130> GYKH1094-2020P019902CC20JS023
<160> 21
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
caactataca acctactacc tca 23
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
cacaactata caacctacta cctca 25
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
tgcacaacta tacaacctac tacctca 27
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
gatgcacaac tatacaacct actacctca 29
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
acgatacaca actatacaac ctactacctc a 31
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<400> 6
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taggttgtat agttctgcat cgt 23
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tgcacaacta tacaacctac tacctca 27
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cgcacaacta tacaacctac tacctca 27
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taggttgtat agttctccc 19
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<211> 22
<212> RNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 15
ugagguagua gguugugugg uu 22
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<212> RNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 16
ugagguagua gguugugugg uu 22
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<211> 22
<212> RNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 17
ugagguagua gguuguaugg uu 22
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<212> RNA
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agagguagua gguugcauag u 21
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<211> 21
<212> RNA
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ugagguagga gguuguauag u 21
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<212> RNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 20
ugagguagua gauuguauag uu 22
<210> 21
<211> 21
<212> RNA
<213> 人类(Homo sapiens)
<400> 21
ugagguagua guuuguacag u 21
Claims (10)
1.一种microRNA let-7a的检测试剂盒,其特征在于:它包括分子识别试剂和信号转换试剂;
所述分子识别试剂是一类嵌有银离子的DNA双链分子,所述DNA双链分子由底物链和错配链碱基互补配对而成,其中底物链与错配链各有一个胞嘧啶碱基C,在银离子的作用下相互配对;银离子、底物链和错配链的终浓度物质的量之比为1:1:1;
所述底物链序列如SEQ ID NO.1所示,或在SEQ ID NO.1基础上向5’端延伸2~8个碱基;所述错配链序列如SEQ ID NO.6所示,或在SEQ ID NO.6基础上向3’端延伸2~8个碱基;错配链延伸的长度与底物链延伸的长度一致;
所述信号转换试剂包括:a)脲酶;b)尿素和苯酚红的混合溶液;
脲酶和尿素的摩尔浓度比例为1:(107~2×107);苯酚红和尿素的摩尔浓度比为:1:(5×102~3×103)。
2.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:
脲酶浓度为100mM;
和/或,每50μL尿素和苯酚红的混合溶液的配置方法为:取10μL浓度为2.5mM的苯酚红溶液,10μL浓度为5M的尿素水溶液室温下加入到30μL超纯水中,得到尿素-苯酚红混合溶液50μL。
3.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:
所述底物链序列如SEQ ID NO.1所示,错配链序列如SEQ ID NO.6所示;
或,所述底物链序列如SEQ ID NO.2所示,错配链序列如SEQ ID NO.7所示。
4.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:所述底物链序列如SEQ ID NO.3所示,错配链序列如SEQ ID NO.8所示。
5.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:所述底物链序列如SEQ ID NO.4所示,错配链序列如SEQ ID NO.9所示。
6.如权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:所述底物链序列如SEQ ID NO.5所示,错配链序列如SEQ ID NO.10所示。
7.如权利要求1~6任一所述的检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括let-7a标准品。
8.如权利要求1~6任一所述的检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中的试剂被固定到试纸上,试纸分为不同区域,尿素和苯酚红、分子识别试剂、脲酶分别位于3个不同区域;
所述试纸为滤纸,优选的,为水性微孔滤纸;
优选的,试纸以普鲁兰多糖为保护剂,以隔绝氧气。
9.一种非诊断目的的microRNA let-7a的检测方法,其特征在于:它是使用权利要求1~8任一所述试剂盒检测let-7a的方法。
10.如权利要求9所述的方法,其特征在于:包括如下步骤:
1)分子识别试剂与样本在室温接触30~90min;
2)脲酶与步骤1)中分子识别试剂在室温接触40min;
3)尿素和苯酚红溶液与步骤2)中脲酶接触30min;
4)肉眼观察颜色变化,或测定560nm波长下的紫外吸收强度值;
步骤2)中,脲酶和银离子的摩尔浓度比例为1:(10~50)。
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